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gi|102436                     : aaaactttaatatgttaaagtagggcctgaagtaaatgacgtctgtgtgactatgggagcgatgggtaatctatttgtaaaacactcgggagagatgttggtatttgacacaggcaatgatataggtTTAG-TTT--AT---AACA---ATTT--AAAT----AGCAAGACTGC-AA--GT-AAGATCAGAA--TCT--A------TA----T--G-AA-T-CA--CCC-TG--TA-G-T-------CTCTT-TTCT-A---GGT---------AAAA---CCAG-A------------GTTG--AT---TT-------T---GAG-AG-ACC--AGA---G-GA-TCAAGT-T-T-G-GA-TTCG-AA--------------CTCTTGCAT---GAGTGGC---C-AA----------T------CA-AAGC-ACTA-C-TG-C-CCCT-CTTGTCAagtcatgtccgaaaggcagatcatgccttgttttgaagaaaagacaccagcttctctccatcaagtgaaatatgcgcattg
gi|102443                     : aaaattttaatgtgttaaagtaagctctgaagtaaatgacctctgtgtgactatgggagcgatgggtaatctatttgtaaaatactctggaaatatgttggtattggacactagcaatgatataggtTTAG-TTT--AT---AACA---ATCT--ATTT----AGCAAGTCTGC-GAA-GT-AAGATCAGAA--TTT--A------TA----T--G-AA-T-CA--CTA-T---GA-A-TCACTATCCCTTT-TTCT-A---GAT---------AAAA---CCA-CA------------GTTG--TT---TT-------T---GAG-AG-GCC--AGA---G-GG-TCTAGT-T-T-G-GA-TTCG-AA--------------CTCTGGCAT---GAACGACTTAT-AA-C------ATC------CAAGAC--ACTT-C-TT-T-CCTG-CTTGTCAactcatgtccgaaaggcagatcttgcctagttttgaagaagaaacaccatttcctctacatcaagtgaaatatgcgcattg
gi|102439                     :          aatgtgttaaactaaggccagaagtaaatgaactctgtgttactatggaaaaaaagggaaagccatttgttgaacactctgaaatatgtttgtataagacacaggtaataatataggtTTAG-TTT--AT---AACA---ATTT--AAAT----AGCTAGACTGC-AA--GT-AAGATAATAA--TTT--A------TA----T--G-AA-T-CA--CTC-TG--GA-G-T-------ACCTT-TTCG-A---GAT---------AGAA---CTA-----------GAGT-TAA--TT---TT-------------G-AG-G-G--ACCAGAG-GA-TCAAGT-T-T-G-GA-TTCG-AA--------------CTCTGGCAT---GAATGGC---C-AA-----TC-------------AAGACACTA-T-TA-T-CCCG-CTTGTCAagtgctaaaggcacggcattatctgatgcctattttgttctgacaccaaaacaccagttcctcccccagcaagtgaaatatgcacattg
gi|102442                     :  aacgtttaatgtgttaaagtaaggcctgaagcaaatggctgctgtgtgactatgggagcgatgggtaatctatttgtaaaacactctggagatatgttggtttttgacacaggcaatgatataggtTTAG-TTT--AT---AACA---ATTT--ATAT----AGCTAGACTGC-GAA-GT-AAGATCAGAA--TTT--A------TA----T--G-TA-T-CA--CTC-TG--GA-GTT-------CCTCT-T-CT-A---GGT---------AGAA---ACA-----------GAGT------TT---TT---T---T---GAG-AG-ACC--AAA---G-GG-TCAAagtcatgtccgaaaggcaagtcttgcctagtttgaaaaaaaaccaccagttcctctccatcaagtgaaatatgcgcattg
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gi|102677                     :                                                                                                                                 TAG-TTTT-AT---ACTA---ATTT--ATTTT---AGCTCAATTGC-GAT-GA-AAGCTCAGAG--CTT--A------TA----T--C-AA-T-TG--CTC-TC--GA-G-T-------CCGCT-TCCT-A---TAT---------AGAA---CCAGTA------CTGAGTGTTG--TT---TA---A---T---GAG-AG-G-C--ATC---G-GG-TCGAGC-T-G-G-GA-ATCG-AACCCGC---AAC---CTCTGGCGT---GAGCGGC---A-AG-CA-CTCTATC------CATTAG--ACTA-C-CG-C-CCCG-CTT
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Reference ( family-144 )      :                                                                                                                                  TTAG-TTT--AT---ACTA---ATTT-AT---TTT-AGC---TCGATTGC-GAT-GA-AAGCTCAGAG--CT------T--ATA----T--G-AACCGCTC-T----CGAG-T-------CCGCT-TC---CT-GGGT---------AGAA---CCAGTA------CTGAGTGTTG--T---TTT---A---T---GAG-AG-G-C--ATC---G-GG-TCGAGC-T-G-GG-G-ATCG-AACCCGC---AAC---CTCTGGCGT---GAGCGGC---C-AA-CA-CTCTATC------CATTA------NAC--TACCG-C-CCCG-CTTGTCA
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gi|102461                     :                                                                                               ctctggaggccggtcatttggattaaatgtgaggccTAG-TTT--AT---ATTA---ATTT-AT---TTT-AGC---TCAATTGC-GAT-GA-AAGCTCAGAG--CT------T--ATA----T--G-AACGGCTC-T----CGAG-T-------CTGCT-TC---CT-TGGT---------AGAA---CCAGCA------CTGAGTGTAC--T---TTT---A---T---GAG-AG-G-C--ATC---G-GG-TCAAGC-T-G-GG-G-ATCG-AACCCGC---AAC---CTCTGGCAT---GAGCGGC---C-AA-aacaccagtcat
gi|102464                     :                                                                                               gagattgtgttcagttatttggtagatgttgggctgTAG-TTT--AT---ACTG---ATTT-AT---TTA-TGC---TTGATTGC-GAT-GA-A-GCTT-GAG--CT------T--ATA----T--G-AACTGCTT-T-----GAG-T-------CCTGT-TC---AT-GGGT---------AGAA---CCAGTA------CTGAGTGTTG--T---TTA---A---T---GAG-AG-G-C--ATC---G-GG-TCAAGC-T-A-GG-A-ATCG-AACCGGC---AAC---CTTAGGCGT---GAGTGGC---C-AG-CATTTCTATC------CATTA-C-----ACTACCG-C-CCCG-CTTGT
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Reference ( family-144 )      :                                                                                                                                  TTAG-TTT--AT---ACTA---ATTT-AT---TTT-AGC---TCGATTGC-GAT-GA-AAGCTCAGAG--CT------T--ATA----T--G-AACCGCTC-T----CGAG-T-------CCGCT-TC---CT-GGGT---------AGAA---CCAGTA------CTGAGTGTTG--T---TTT---A---T---GAG-AG-G-C--ATC---G-GG-TCGAGC-T-G-GG-G-ATCG-AACCCGC---AAC---CTCTGGCGT---GAGCGGC---C-AA-CA-CTCTATC------CATTA-C-----ACTACCG-C-CCCG-CTTGTCA
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gi|102440                     :      aacgtttaatgtgttaaagtaaggcctgaagcaaatggctgctgtgtgactatgggagcgatgggtaatctatttgtaaaacactctggagatatgttggtttttgacacaggcaatgatataggtAG-TTT--AT---AACA---ACGT-AT---ATA-A-----TAGACTGC-GAA-GT-AAGATCAGAA--TT------T--ATA----T--G-AATCACTC-T----GGAG-T-------CCCTT-TT---CT-AGGT---------AGAagtcatgtccgaaaggcaagtcttgcctagtttgaaaaaaaaccaccagttcctctccatcaagtgaaatatgcgcattg
gi|102441                     : aaaatattaatgtgttaaagtaaggcatgaagtaaatgacatctgtgttactaatggagcaatgggtcattcaactgtaaagcactcaggagatatgttggtatatgacacaggtaatgatataaattgTTAG-TTT--AT---AACA---ATTT-AT---AT--AGC---TAGATTGC-GAA-GT-AAGATCAGAA--TT------T--ATA----T--G-TAACACAC-T----TGAG-T-------CCCTT-TT---C-----T---------AGAA---CCGG-A------------GTTG--T---TTT-------T---GAG-AGTC-C--AGA---G-CG-TCGAGT-T-T-GG-G-TTGG-AA--------A------TCTGGCAT---GAGCGGA---C-AA-CG---ATATC------AAAGG-T-----ACTACTA-T-CCCG-CTTGTCAttttgagtgaccagaggatcaaataccacgcttgtcaagtcatgtccgaaagacagatcttgcctattgttgaagaaaaaacaacagttcctccccatcaagtgaaataagcgcattg
gi|102442                     :             aatgtgttaaattgaggcctgaagtaaatgacctctgtgtgacatgaagtaatgggtaatccatttgtaaagcactctggagatatgttggtatacaacacaggcagtgatataggtTTAG-TTT--AT---AACA---ATTT-AT---AT--AGC---TAGACTGC-GAA-GT-AAGATCAGAA--TT------T--ATA----T--G-TATCACTC-T----GGAGTT-------CCTCT-T----CT-AGGT---------AGAA---ACA-----------GAGT------T---TTT---T---T---GAG-AG-ACC--AAA---G-GG-TCAAagtcttgtgcaaatcgcagaaaaaacaccagttcctctccatcaagtgaaatgtgcacattg
gi|102443                     :           aatgtgttaaattaaggcctgaagtatataacctctttgttactatggaagcaatggatggtccatttgtaaagcactgtggagatatgttggtatacgacacaggcaatgatataagtTTAG-TTT--AT---AACA---ATCT-AT---TT--AGC---AAGTCTGC-GAA-GT-AAGATCAGAA--TT------T--ATA----T--G-AATCACTA-T-----GAA-TCACTATCCCTTT-TT---CT-AGAT---------AAAA---CCA-CA------------GTTG--T---TTT-------T---GAG-AG-GCC--AGA---G-GG-TCTAGT-T-T-GG-A-TTCG-AA--------------CTCTGGCAT---GAACGACTTAT-AA-C------ATC------CAAGA-C-----ACTTCTT-T-CCTG-CTTGTCAatgatatcaaaggcactacttcctcgattgtcaagtcttgtgcgaaaggcagtaaaaaacactaattcctatacatcaattgaaatatgcgcatt
gi|102446                     :               aatgtgttaaactaaggccagaagtaaatgaactctgtgttactatggaaaaaaagggaaagccatttgttgaacactctgaaatatgtttgtataagacacaggtaataatataggtG-TTT--AT---ACCA---ATTT-AT---AT--AGC---TAGACTGC-GA--AA-AAGATCAAGA--TT------T--ATA----T--G-AATCGCTC-T----GGAG-T-------CCTGT-TT---CT-AGGT---------AGAA---CCAG-A------C------TTG--T---TTT-------T---AAG-AG-GCC--AGA---A-GG-TCGAGT-T-T-GG-A-TTCA-AA--------------CTCTGGTAT---GAACGGT---C-AA-TA---ATACC------CAAGG-C-----GATACCA-C-CCAG-CATGCCagtgctaaaggcacggcattatctgatgcctattttgttctgacaccaaaacaccagttcctcccccagcaagtgaaatatgcacattg
gi|102447                     :              ttaaatcaagtacagaagtaaatgacctctttgtggctgtggaagcaatggaaaatccatttgttgagcgctctggagatatgttggtacaagacacaggtaatactatacgtattTTAG-TTT--AT---A------ATTT-AT---TTA-AAC---TCGACTGC-GAG-GT-AAGTTCAGAG--CT------T--ATA----T--G-AACCGCTC-T----GGAG-T-------CTGCT-TT---CT-GGGG---------AGAA---CCAGTA------TTGAGTGTTG--T---TTC-------C---GAG-AG-G-CAAAT----G-GG-TCAAGC-T-G-GG-G-ATTG-AACACGC---AAC-----CTAGCGT---GAGCGGC---A-AA-CA-CTCTATC------gagcaacgtacgaaaggccgatcttgcctagattttcttgaaccaccaaaaaaaacagtttcttttcctcaaggaaaaaaagcgaatt
gi|102448                     :                                                                atgggtgatttgtttaaggtaaaactactcgttacagtatgttcacattaaggcatattaataaccTTGG-TTT--G----AATG---ATTT-AT---TTT-AGC---TCGATTGC-AAA-AT-AAGCTTAGAG--CT------T--A-A----TC-G-AACCACTC-T----TGAG-T-------TCACT-TC---CT-GGAT---------AGAA---AGAGTT------CTGAGTGTT---T---TTT-------T---GAG-AG-ACC--AAC---A-GG-TCAAGC-T-G-GG-G-ATCA-AA-CTGA---AAC---CTATAGCAT---GAGCGAC---C-AA-CA-CTCTATC------CACTG-C-----ACTACCA-T-CCTG-CTT
gi|102450                     :                                                                                      atggatgatgtcactattggctatgaaagactgtgatttaaattttatgtttattttgataag---ATTT-AT---ATT-AGC---TTGATTTC-AAA-GT-AAGGTCAGGGAACT------T--ATA----TATG-AATCGGTC------AAAG-T-------CCCTT-TC---CT-AGGC---------AGAA---CCAGCA------TTGAGTGATG--TTAATTT---T---C---GAG--G-C-C--ATT---G-AA-TCAAAC-C-C-GG-G-GTCA-AACTTTT---GAC---CTCTGGCAT---GAATGGT---C-AA-CA-
gi|102457                     :                                                               ctatctgtaaaacaggaataacatacactagaatttactttcagtaaaagtttaaaattgagcaaagTTGG-TTT--AT---ATTA---ATGT-AT---TTT-AGC---TTGGTTTC-AAA-GT-AAGCTCAGAA--AT------TCTATA----T--G-AACTGATT-T----TGAG-T-------CCACT-TC---CT-GGGT---------AGAA---CCAGTA------CTGAGTTTTG--T---TTTG--G---T---GAG--G-C-C--AAC---A-GA-TTAAAT-T-T-GG-G-ATCA-AATCAGC---AAC---CTCTAGCAC---CAGTGGC---C-AG-CA-CCCTATC------CATAG-G-----ACTACCA-C-TTTA-CTTa
gi|102458                     :                                                                                         ctctgcagatcatgtatgccaggtaaagattttgttgacatTTAG-TTA--AT---AATA---ATTC-AT---TTT-AGC---TCGATTGC-GAT-GA-AAACTCAGAG--CT------T--ATA----T--A-AACCGCTC-T----CAAG-T-------CTGCT-TC---CT-GGGT---------AGAA---CCAGCA------CTAAGTGTTA--T---TTT---A---T---GAG-AG-G-C--ATC---A-GG-TCGAGC-T-G-GG-G-ATCG-AACCCAC---AAC---CTCTGGCGT---GAGCGGC---C-AA-CA-CTCTATC------CATTA-C-----ACTACCG-C-CCC--CTTttaaacatgttgaaacttgttgaatggagaaaaaata
gi|102461                     :                                                                                               ctctggaggccggtcatttggattaaatgtgaggccTAG-TTT--AT---ATTA---ATTT-AT---TTT-AGC---TCAATTGC-GAT-GA-AAGCTCAGAG--CT------T--ATA----T--G-AACGGCTC-T----CGAG-T-------CTGCT-TC---CT-TGGT---------AGAA---CCAGCA------CTGAGTGTAC--T---TTT---A---T---GAG-AG-G-C--ATC---G-GG-TCAAGC-T-G-GG-G-ATCG-AACCCGC---AAC---CTCTGGCAT---GAGCGGC---C-AA-aacaccagtcat
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blockSeqs                     :                                                                                                                                          .                                            A                  .                                        .                        .                     .                        T       TT         C C                  T                                                                   .          C      
blockSeqs                     :                                                                                                                                          .                                            A                  .                                        .                        .                     .                        T       .          C .                  T                                                                   .          C      
blockSeqs                     :                                                                                                                                          .                                            A                  .                                        .                        .                     .                        A       .          C .                  A                                                                   .          T      
blockSeqs                     :                                                                                                                                          .                                            A                  .                                        .                        .                     .                        A       .          C .                  .                                                                   .          C      
blockSeqs                     :                                                                                                                                          .                                            A                  .                                        .                        .                     .                        A       .          C .                  .                                                                   .          C      
blockSeqs                     :                                                                                                                                          .                                            G                  .                                        .                        .                     .                        A       .          C .                  .                                                                   .          C      
blockSeqs                     :                                                                                                                                          .                                            A                  .                                        .                        .                     .                        A       .          . .                  .                                                                   .          G      
blockSeqs                     :                                                                                                                                          .                                            A                  .                                        .                        .                     .                        A       .          . .                  .                                                                   .          C      
blockSeqs                     :                                                                                                                                          .                                            A                  .                                        .                        .                     .                        A       .          . .                  .                                                                   .          C      
blockSeqs                     :                                                                                                                                          .                                            T                  .                                        .                        .                     .                        A       .          . .                  .                                                                   .          T      
blockSeqs                     :                                                                                                                                          .                                            T                  .                                        .                        .                     .                        T       .          . .                  .                                                                   .          C      
blockSeqs                     :                                                                                                                                          .                                            T                  .                                        .                        .                     .                        A       .          . .                  .                                                                   .          C      
blockSeqs                     :                                                                                                                                          .                                            A                  .                                        .                        .                     .                        T       .          . .                  .                                                                   .          C      
blockSeqs                     :                                                                                                                                          .                                            T                  .                                        .                        .                     .                        A       .          . .                  .                                                                   .          A      
blockSeqs                     :                                                                                                                                          .                                            T                  .                                        .                        .                     .                        A       .          . .                  .                                                                   .          G      
blockSeqs                     :                                                                                                                                          .                                            T                  .                                        .                        .                     .                        A       .          . .                  .                                                                   .          C      
blockSeqs                     :                                                                                                                                          .                                            T                  .                                        .                        .                     .                        A       .          . .                  .                                                                   .          C      
blockSeqs                     :                                                                                                                                          .                                            T                  .                                        .                        .                     .                        A       .          . .                  .                                                                   .          C      
blockSeqs                     :                                                                                                                                          .                                            A                  .                                        .                        .                     .                        A       .          . .                  .                                                                   .          G      
blockSeqs                     :                                                                                                                                          .                                            A                  .                                        .                        .                     .                        A       .          . .                  .                                                                   .          C      
blockSeqs                     :                                                                                                                                          .                                            A                  .                                        .                        .                     .                        A       .          . .                  .                                                                   .          C      
blockSeqs                     :                                                                                                                                          .                                            T                  .                                        .                        .                     .                        A       .          . .                  .                                                                   .          C      
blockSeqs                     :                                                                                                                                          .                                            T                  .                                        .                        .                     .                        A       .          . .                  .                                                                   .          C      
blockSeqs                     :                                                                                                                                          .                                            T                  .                                        .                        .                     .                        A       .          . .                  .                                                                   .          G      
blockSeqs                     :                                                                                                                                          .                                            T                  .                                        .                        .                     .                        A       .          . .                  .                                                                   .          C      
blockSeqs                     :                                                                                                                                          .                                            A                  .                                        .                        .                     .                        A       .          . .                  .                                                                   .          G      
blockSeqs                     :                                                                                                                                          .                                            T                  .                                        .                        .                     .                        A       .          . .                  .                                                                   .          G      
blockSeqs                     :                                                                                                                                          .                                            G                  .                                        .                        .                     .                        A       .          . .                  .                                                                   .          C      
blockSeqs                     :                                                                                                                                          .                                            T                  .                                        .                        .                     .                        A       .          . .                  .                                                                   .          G      
blockSeqs                     :                                                                                                                                          .                                            A                  .                                        .                        .                     .                        A       .          . .                  .                                                                   .          C      
blockSeqs                     :                                                                                                                                          .                                            A                  .                                        .                        .                     .                        A       .          . .                  .                                                                   .          C      
blockSeqs                     :                                                                                                                                          .                                            T                  .                                        .                        .                     .                        A       .          . .                  .                                                                   .          C      
blockSeqs                     :                                                                                                                                          .                                            T                  .                                        .                        .                     .                        A       .          . .                  .                                                                   .          C      
blockSeqs                     :                                                                                                                                          .                                            A                  .                                        .                        .                     .                        A       .          . .                  .                                                                   .          C      
blockSeqs                     :                                                                                                                                          .                                            T                  .                                        .                        .                     .                        A       .          . .                  .                                                                   .          T      
blockSeqs                     :                                                                                                                                          .                                            T                  .                                        .                        .                     .                        A       .          . .                  .                                                                   .          T      
blockSeqs                     :                                                                                                                                          .                                            T                  .                                        .                        .                     .                        A       .          . .                  .                                                                   .          G      
blockSeqs                     :                                                                                                                                          .                                            T                  .                                        .                        .                     .                        T       .          . .                  .                                                                   .          G      
blockSeqs                     :                                                                                                                                          .                                            A                  .                                        .                        .                     .                        T       .          . .                  .                                                                   .          G      
blockSeqs                     :                                                                                                                                          .                                            T                  .                                        .                        .                     .                        A       .          . .                  .                                                                   .          G      
blockSeqs                     :                                                                                                                                          .                                            T                  .                                        .                        .                     .                        A       .          . .                  .                                                                   .          G      
blockSeqs                     :                                                                                                                                          .                                            T                  .                                        .                        .                     .                        A       .          . .                  .                                                                   .          G      
blockSeqs                     :                                                                                                                                          .                                            T                  .                                        .                        .                     .                        A       .          . .                  .                                                                   .          A      
blockSeqs                     :                                                                                                                                          .                                            T                  .                                        .                        .                     .                        A       .          . .                  .                                                                   .          T      
blockSeqs                     :                                                                                                                                          .                                            T                  .                                        .                        .                     .                        A       .          . .                  .                                                                   .          C      
blockSeqs                     :                                                                                                                                          .                                            T                  .                                        .                        .                     .                        A       .          . .                  .                                                                   .          C      
blockSeqs                     :                                                                                                                                          .                                            T                  .                                        .                        .                     .                        A       .          . .                  .                                                                   .          T      
blockSeqs                     :                                                                                                                                          .                                            T                  .                                        .                        .                     .                        A       .          . .                  .                                                                   .          C      
blockSeqs                     :                                                                                                                                          .                                            T                  .                                        .                        .                     .                        T       .          . .                  .                                                                   .          C      
blockSeqs                     :                                                                                                                                          .                                            T                  .                                        .                        .                     .                        A       .          . .                  .                                                                   .          C      
blockSeqs                     :                                                                                                                                          .                                            T                  .                                        .                        .                     .                        A       .          . .                  .                                                                   .          G      
blockSeqs                     :                                                                                                                                          .                                            T                  .                                        .                        .                     .                        A       .          . .                  .                                                                   .          G      
blockSeqs                     :                                                                                                                                          .                                            A                  .                                        .                        .                     .                        A       .          . .                  .                                                                   .          G      
blockSeqs                     :                                                                                                                                          .                                            A                  .                                        .                        .                     .                        A       .          . .                  .                                                                   .          G      
blockSeqs                     :                                                                                                                                          .                                            T                  .                                        .                        .                     .                        A       .          . .                  .                                                                   .          A      
blockSeqs                     :                                                                                                                                          .                                            T                  .                                        .                        .                     .                        A       .          . .                  .                                                                   .          G      
blockSeqs                     :                                                                                                                                          .                                            T                  .                                        .                        .                     .                        A       .          . .                  .                                                                   .          G      
blockSeqs                     :                                                                                                                                          .                                            T                  .                                        .                        .                     .                        A       .          . .                  .                                                                   .          C      
blockSeqs                     :                                                                                                                                          .                                            T                  .                                        .                        .                     .                        A       .          . .                  .                                                                   .          G      
blockSeqs                     :                                                                                                                                          .                                            T                  .                                        .                        .                     .                        A       .          . .                  .                                                                   .          C      
blockSeqs                     :                                                                                                                                          .                                            T                  .                                        .                        .                     .                        A       .          . .                  .                                                                   .          C      
blockSeqs                     :                                                                                                                                          .                                            T                  .                                        .                        .                     .                        A       .          . .                  .                                                                   .          C      
blockSeqs                     :                                                                                                                                          .                                            A                  .                                        .                        .                     .                        A       .          . .                  .                                                                   .          .      
blockSeqs                     :                                                                                                                                          .                                            T                  .                                        .                        .                     .                        T       .          . .                  .                                                                   .                 
blockSeqs                     :                                                                                                                                          .                                            T                  .                                        .                        .                     .                        A       .          . .                  .                                                                   .                 
blockSeqs                     :                                                                                                                                          .                                            T                  .                                        .                        .                     .                        A       .          . .                  .                                                                   .                 
blockSeqs                     :                                                                                                                                          .                                            T                  .                                        .                        .                     .                        A       .          . .                  .                                                                   .                 
blockSeqs                     :                                                                                                                                          .                                            T                  .                                        .                        .                     .                        A       .          . .                  .                                                                   .                 
blockSeqs                     :                                                                                                                                          .                                            G                  .                                        .                        .                     .                        A       .          . .                  .                                                                   .                 
blockSeqs                     :                                                                                                                                          .                                            T                  .                                        .                        .                     .                        A       .          . .                  .                                                                   .                 
blockSeqs                     :                                                                                                                                          .                                            T                  .                                        .                        .                     .                        A       .          . .                  .                                                                   .                 
blockSeqs                     :                                                                                                                                          .                                            T                  .                                        .                        .                     .                        C       .          . .                  .                                                                   .                 
blockSeqs                     :                                                                                                                                          .                                            T                  .                                        .                        .                     .                        .       .          . .                  .                                                                   .                 
blockSeqs                     :                                                                                                                                          .                                            T                  .                                        .                        .                     .                        .       .          . .                  .                                                                   .                 
blockSeqs                     :                                                                                                                                          .                                            T                  .                                        .                        .                     .                        .       .          . .                  .                                                                   .                 
blockSeqs                     :                                                                                                                                          .                                            T                  .                                        .                        .                     .                        .       .          . .                  .                                                                   .                 
blockSeqs                     :                                                                                                                                          .                                            T                  .                                        .                        .                     .                        .       .          . .                  .                                                                                     
blockSeqs                     :                                                                                                                                          .                                            T                  .                                        .                        .                     .                        .       .          . .                  .                                                                                     
blockSeqs                     :                                                                                                                                          .                                            T                  .                                        .                        .                     .                        .       .          . .                  .                                                                                     
blockSeqs                     :                                                                                                                                          .                                            T                  .                                        .                        .                     .                        .       .          . .                  .                                                                                     
blockSeqs                     :                                                                                                                                          .                                            T                  .                                        .                        .                     .                        .       .          . .                  .                                                                                     
blockSeqs                     :                                                                                                                                          .                                            T                  .                                        .                        .                     .                        .       .          . .                  .                                                                                     
blockSeqs                     :                                                                                                                                          .                                            A                  .                                        .                        .                     .                        .       .          . .                  .                                                                                     
blockSeqs                     :                                                                                                                                          .                                            T                  .                                        .                        .                     .                        .       .          . .                  .                                                                                     
blockSeqs                     :                                                                                                                                          .                                            T                  .                                        .                        .                     .                        .       .          . .                  .                                                                                     
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                       A                  .                                        .                        .                     .                        .       .          . .                  .                                                                                     
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                       A                  .                                        .                        .                     .                        .       .          . .                  .                                                                                     
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                       .                  .                                        .                        .                     .                        .       .          . .                  .                                                                                     
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                       .                  .                                        .                        .                     .                        .       .          . .                  .                                                                                     
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                       .                  .                                        .                        .                     .                        .       .          . .                  .                                                                                     
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                       .                  .                                        .                        .                     .                        .       .          . .                  .                                                                                     
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                       .                  .                                        .                        .                     .                        .       .          . .                  .                                                                                     
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                       .                  .                                        .                        .                                                                                                                                                                            


blockSeqCons                  :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  C******
originalCons                  :                                                                                                                                  TTAG-TTT--AT---ACTA---ATTT-AT---TTT-AGC---TCGATTGC-GAT-GA-AAGCTCAGAG--CT------T--ATA----T--G-AACCGCTC-T----CGAG-T-------CCGCT-TC---CT-GGGT---------AGAA---CCAGTA------CTGAGTGTTG--T---TTT---A---T---GAG-AG-G-C--ATC---G-GG-TCGAGC-T-G-GG-G-ATCG-AACCCGC---AAC---CTCTGGCGT---GAGCGGC---C-AA-CA-CTCTATC------CATTA-C-----ACTACCG-C-CCCG-CTTGTCA
finalCons                     :                                                                                                                                  TTAG-TTT--AT---ACTA---ATTT-AT---TTT-AGC---TCGATTGC-GAT-GA-AAGCTCAGAG--CT------T--ATA----T--G-AACCGCTC-T----CGAG-T-------CCGCT-TC---CT-GGGT---------AGAA---CCAGTA------CTGAGTGTTG--T---TTT---A---T---GAG-AG-G-C--ATC---G-GG-TCGAGC-T-G-GG-G-ATCG-AACCCGC---AAC---CTCTGGCGT---GAGCGGC---C-AA-CA-CTCTATC------CATTAC------ACTACCG-C-CCCG-CTTGTCA
3 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|102438 ): AAAATTTTAACTTGTTAAAGTAAGTCCTAGGTAAATGACCTCTATGTGACTACTGGTAGTGATGGGTAATCTATTTGTAAAACAATCTGGAGATATGTTGGTATTTGATACAGGCAATGATATAGGTTTAGTTTATAACAATTTAAATAGCTAGACTG
Unaligned ( gi|102444 ): AATGTGTAAAACTAAGGTCAGAAGTAAATGACCTCTGAAATTACCTCTGTGTGACTATGAAAGCAATGGGAAATCCATTTATAGAACACTCTGGATATATGTTGGTATGCGGCACAGGTAATAATATAGGTTTAGTTTATAACAATTTAT
Unaligned ( gi|102445 ): AATGTGCTCAGATTGAGTTAAGGCCAGAAGTAAATGACCTCTGTGAGACTATGGAAGCAATGGGAAATAGAGTTGAAGGGAATCCTGAAGATTTGTTGGTAAAAGAAACAGGTAATGGTATAGGTTAAGTTTATACTAATT






Alignments
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Reference ( family-144 )      :                                                                                                                                  TTAG-TTT--AT---ACTA---ATTT-AT---TTT-AGC---TCGATTGC-GAT-GA-AAGCTCAGAG--CT------T--ATA----T--G-AACCGCTC-T----CGAG-T-------CCGCT-TC---CT-GGGT---------AGAA---CCAGTA------CTGAGTGTTG--T---TTT---A---T---GAG-AG-G-C--ATC---G-GG-TCGAGC-T-G-GG-G-ATCG-AACCCGC---AAC---CTCTGGCGT---GAGCGGC---C-AA-CA-CTCTATC------CATTA-C-----ACTACCG-C-CCCG-CTTGTCA
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gi|102731                     :                                                                                                                                                                       GC---TGGATTGC-AAA-GT-AAGCTCAAAG--CT------T--TAA----A--G-AATGGC-C-T----CGAG-T-------TCGTT-TT---CT-CGGT---------AGAA---CCAGTA------CCGGTTGTTA--T---TTT-------T---AAG-AG-G-CC-ATC---G-GA-TCAAACAT-G-GGTG---CG-AACCCGTGAAAATAGGCTCTGGCGT---GACGGGC---T-AA-CA-CCCTATC------CACTG-C-----ACCACCG-C-TCCG-CTTGTaa
gi|102746                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            -TCGAGT-T-T-GA---ATCG-AAC--------------TCCGGCAT---AAGCGGC---C-AA-TG-AT--ATC------CAAGG-C-----ATTACCG-C-TCCG-CTTGTCAaatgttatgtc
3 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|102438 ): AAAATTTTAACTTGTTAAAGTAAGTCCTAGGTAAATGACCTCTATGTGACTACTGGTAGTGATGGGTAATCTATTTGTAAAACAATCTGGAGATATGTTGGTATTTGATACAGGCAATGATATAGGTTTAGTTTATAACAATTTAAATAGCTAGACTG
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Unaligned ( gi|102445 ): AATGTGCTCAGATTGAGTTAAGGCCAGAAGTAAATGACCTCTGTGAGACTATGGAAGCAATGGGAAATAGAGTTGAAGGGAATCCTGAAGATTTGTTGGTAAAAGAAACAGGTAATGGTATAGGTTAAGTTTATACTAATT