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gi|4537                       :                               GAAA-CTACGACGGTGAAA--------A-GT--------CG---------A--------A--------A--------C------------------AA------------------CG---------AAA--------CA--------AC--------G--------A--------TGG---TG---AAAAGACGCAACTA
gi|4594                       :                               GAAA-CAACGATGGTGAAA--------A-GTCAAAACAACG---------A--------A--------A--------C--------AACGATGGTGAAA------AGT--------CG---------AAA--------
gi|4593                       :                               GAAA-CAACGATGGTGAAA--------A-GTCAAAACAACG---------A--------A--------A--------C--------AACGATGGTGAAA------AGT--------CG---------AAA--------
gi|4592                       :                               GAAA-CAACGATGGTGAAA--------A-GTCAAAACAACG---------A--------A--------A--------C--------AACGATGGTGAAA------AGT--------CG---------AAA--------
gi|4568                       :                               GAAA-CTACGACAGTGAAA--------A-GT--------CGAAACAACA-A--------A--------A--------C--------TACTATGGTGAAA------AGT--------CG---------AAA--------
gi|4663                       :                               GAAA-CTACAATAGTGAAA--------A-GTCGAAACAACG---------A--------A--------A--------C--------TACGATGGTAAAA------AAT--------CG---------AAA--------
gi|4703                       :                               GAAA-TTACGATGGTGAAA--------A-GT--------CGAAACAACA-A--------A--------A--------C--------TACGATGGTTAAA------AGT--------C
gi|4542                       :                               GAAA-CTACGATGTTGAAA--------A-GTTGAAATGTCG---------A--------A--------A--------C--------TACGATGGCGAAA------AGT--------AG---------AAA--------
gi|4704                       :                               GAAA-CTACGATGTTGAAT--------A-GC--------CG---------A--------A--------A--------CAACGAAATTACGATGGTGAAA------AGT--------CG---------AAA--------tcatct
gi|4633                       :                               GAAA-TTACGATGATGAAA--------A-GT--------CG---------AAACAACGCA--------A--------C--------TACGATGATGAAA------AAT--------CG---------A
gi|4512                       :                               GAAA-CTGTGATGATGAAAAGTCGAAAA-GT--------CG---------A--------A--------A--------C--------TAAGATGGTGAAA------AGT--------CG---------AAA--------
gi|4684                       :                               GAAA-CTACAATGGTGAAA--------A-GT--------CG---------A--------A--------A--------C------------------AA------------------CG---------AAA--------CA--------AC--------G--------A--------TAG---TG---AAAAGTAG-AACTAtgattt
gi|4627                       :                               GAAA-CAACGACTGTGAAA--------A-GT--------CG---------A--------A--------A--------T--------TAattt
gi|4634                       : gaaactacgatggtgtaaagccgaaacaacGAAA-TTACGATAGTGAAA--------A-GT--------CG---------A--------A--------A--------CAACAAAATTACGATGATG-AA------AGT--------CG---------AAA--------ttt
gi|4528                       :                               GGAA-CTATGATGGTGAAA--------A-GT--------CGCAAAAATCGA--------A--------A--------C--------TACGAGGGTGAAA------AAT--------CG---------AAA--------
gi|4507                       :                               GAAA-CTACGGTGGTAAAA--------A-GT--------CG---------A--------A--------AAGATGAAAC--------TACGATGATGGAA------AAT--------CG---------AAA--------
gi|4610                       :                               GGAA-CTACGATGGTGAAA--------G-GT--------CG---------A--------AAAAACGAAA--------C--------TACGAATGTGAAA------AGT--------CG---------AAA--------tcattt
gi|4560                       :                               GAAA-CTACGATACTGAAA--------A-GT--------CG---------A--------A--------A--------T--------TA
gi|4613                       : gaaaatacgatgctgaaaagtcgaaacaacGAAA-CTGCGCTGGTAAAA--------A-GTCGAAACAACG---------A--------A--------A--------C--------TACGATGGGTAAA------AGT--------CG---------AAA--------ttt
gi|4606                       :                               GAAA-CTGCGATGATGAAA--------A-GT--------CG---------A--------A--------A--------T-------------------AA------AGT--------CG---------AAA--------TT--------AC--------G--------A--------CAG---TG---AAAAGACGAAAttattt
gi|4680                       :                               GACA-CTACCATGGTAGAA--------A-GT--------CA---------A--------A--------A--------C--------TACGA-------------------------------------AA--------CT--------AT--------G--------A--------TGA---TG---AAAAGTCGAAAtaattt
gi|4768                       :                                AAA-CTACGGTGGTGAAA--------A-GT--------CG---------A--------A--------A--------C--------TACAATGGCGAAA------AGT--------CG---------AAA--------CA--------AC--------G--------A--------TGG---TG---AAAAGTCGAAAtcattt
gi|4766                       :                                AAA-CTACGATGGCGAAA--------A-GT--------CG---------A--------A--------A--------T--------TACGATGGTGAAA------AGT--------CG---------AAA--------CT--------AC--------G--------A--------TGG---TG---AAAAGTCGAtaattt
gi|4764                       :                                AAA-CAACGATGGTGAAA--------A-GT--------CG---------A--------A--------A--------C--------AACGCTGGTGAAA------AAT--------CG---------AAA--------CT--------AC--------G--------A--------TAG---TG---AAAAGTTGAAA
gi|4777                       :                                AAA-CTATGATGGTGAAA--------A-GT--------TG---------A--------A--------A--------T--------TACTATGGTAAAA------ATC--------CG---------AAA--------CT--------AT--------G--------A--------TGG---CG---AAAAGTCGAAATTAt
gi|4774                       :                                AAATCTACGATGGTAAAA--------G-GT--------CG---------A--------AACAACGAAA--------C--------TACGATGGTGAAA------AGT--------CG---------AAA--------Ct
gi|4781                       :                                AAA-CTACGATGATGAAA--------A-GC--------CG---------A--------AACAACGACA--------C--------TACGATGGTGAAA------AGT--------TG---------AAA--------ta
gi|4769                       :                                AAA-CTATGATGGTGAAAAGTCGAAAA-GT--------CG---------A--------A--------A--------C--------TACGATGGTGAAA------AGT--------agttgttt
gi|4775                       :                                AAA-TTACGATGATGAAA----------GT--------CG---------A--------A--------A--------CAACGAAATTACGATGATGAAA------AGT--------CG---------AAA--------
gi|4778                       :                                AAA-CTACAATGGTGAAT--------A-GT--------CG---------A--------A--------A--------CAGCGAAACTATGATGGTGAAA------AGT--------CG---------CAA--------TA--------
gi|4795                       :                                 AA-CTACGATAGAGAAA--------A-GT--------CG---------T--------A--------A--------C--------TACGATGATGAAA------AAT--------CG---------AAA--------CT--------AC--------G--------A--------TGA---TG---AAAAGTAGAAACTAttt
gi|4791                       :                                 AA-CTACGATGGTGAAA--------A-GT--------CG---------A--------A--------A--------C------------------AA------------------CG---------AAA--------CA--------AC--------G--------A--------TGG---TG---AAAAGTCGAAA
gi|4584                       :                                                                       G---------A--------A--------A--------C--------TACGATGGTGAAA------AGT--------CG---------AAA--------CT--------AC--------G--------A--------TGG---TG---AAAAGTCGAAACTAtaattt
gi|4527                       :                                                                       G---------A--------A--------A--------C--------TACGATGGTGAAA------AGT--------CG---------AAA--------CT--------AC--------G--------A--------TGA---TG---AAAAGTCGAAACTA
gi|4538                       :                                                                       G---------G--------A--------A--------C--------TACGATGGTGAAA------AGT--------CG---------AAA--------CA--------AC--------G--------A--------TGG---TG---AAAAGTCGAAACTAct
gi|4534                       :                                                                       G---------A--------A--------A--------C--------TACGATGGTGAAA------AGT--------CG---------AAA--------CT--------AC--------G--------A--------TGG---TG---AAAAGTTGAAATTA
gi|4529                       :                                                                       G---------A--------A--------A--------C--------TACGAGGGTGAAA------AAT--------CG---------AAA--------CA--------AC--------G--------A--------TGA---TG---AAAAGTCGAAACTAttt
gi|4519                       :                                                                       G---------A--------A--------A--------C--------TACGATGGTGAAA------AGC--------CG---------AAA--------CT--------AC--------G--------A--------TGG---TG---AAATGTCGAAACTA
gi|4565                       :                                                                       G---------A--------T--------A--------C--------TACGATGGTGAAA------AGT--------CG---------AAA--------CT--------AC--------G--------A--------TGG---TG---AAAAGTCGAAA
gi|4590                       :                                                                       G---------A--------A--------A--------C--------TACGATGGTGAAA------AGT--------TG---------AAA--------CA--------AC--------G--------A--------TGG---TG---AAAAGTTGAAACTA
gi|4509                       :                                                                       G---------A--------A--------A--------C--------TACGATGGTGAAA------AGT--------CG---------AAA--------CT--------AC--------G--------G--------TGG---TA---AAAAGTCGAAA
gi|4498                       :                                                                       G---------A--------A--------A--------C--------TATGATGGTGAAA------AGT--------CG---------AAA--------CT--------AC--------G--------A--------TGG---TG---AAAAGCCGAAA
gi|4510                       :                                                                       G---------A--------A--------A--------C--------TACGATGGTAAAA------AGT--------CG---------AAA--------TT--------AC--------G--------A--------TGG---TG---AAAAGTCGAAA
gi|4687                       :                                                                       G---------A--------A--------A--------C--------TACCATGGTGAAA------AGT--------CG---------AAA--------CA--------AC--------G--------A--------TGG---TG---AAAAGTCGAAATTA
gi|4591                       :                                                                       G---------A--------A--------A--------C--------AACGATGGTGAAA------AGT--------CG---------AAA--------CA--------AC--------G--------A--------TGG---TG---AAAAGTTGAAACTA
gi|4646                       :                                                                       G---------A--------A--------A--------C--------TACGATGGTGAAA------AGT--------CG---------CAA--------CT--------AT--------G--------A--------TGG---TG---AAAAGTCGAAA
gi|4508                       :                                                                       G---------A--------A--------A--------C--------TACGATGGTGAAA------AGT--------CG---------AAA--------CT--------AC--------T--------A--------TGG---TG---AGAAGTCGAAAtgattt
gi|4642                       :                                                                       G---------A--------A--------A--------C--------TACGATGGTGAAA------AAT--------CG---------AAA--------CT--------AC--------G--------A--------TGA---TG---AAAAGTCGTAACTAtgattt
gi|4549                       :                                                                       G---------A--------A--------A--------C--------TATGATGGTGAAA------AGT--------CG---------AAA--------CA--------AC--------G--------A--------TGG---TG---AAAAGTCGAA
gi|4514                       :                                                                       G---------A--------A--------A--------C--------TACGATGATGAAA------AGT--------CG---------AAA--------CT--------AC--------A--------A--------TGA---CG---AAAAGTCGAAACTgtgattt
gi|4619                       :                                                                       G---------A--------A--------A--------C--------TACGATGGTGAAA------A-T--------CG---------AAA--------CT--------AC--------G--------A--------TGA---TG---AAAAGTCGAAAGTAgt
gi|4544                       :                                                                       G---------A--------A--------A--------C--------TACGATGGTGAAC------AGT--------TG---------AAA--------CT--------AC--------G--------G--------TGG---TG---AAAAGTTGAAACTA
gi|4516                       :                                                                       G---------A--------A--------A--------C--------TACGATGGTGAAA------AGT--------CG---------AAA--------CAACGAAACTAC--------G--------A--------TGG---TG---AAAAGCCGAAACTA
gi|4526                       :                                                                       G---------A--------A--------A--------C--------TACGATAGTGAAA------AGT--------CG---------AAA--------CAACGAAACTAC--------G--------A--------TGG---TG---AAAAGTCGAAACTA
gi|4517                       :                                                                       G---------A--------A--------A--------C--------TACGATGGTGAAA------AAT--------TA---------AAA--------CT--------AC--------G--------A--------TGA---TG---AAAAGTCGAAATTA
gi|4506                       :                                                                       G---------A--------A--------A--------T--------TACGATGGTGAAA------AGT--------CG---------AAA--------CAACGAAACTAC--------G--------A--------TGG---TG---AAAAGTCGAAACTA
gi|4695                       :                                                                       G---------A--------A--------A--------C--------TACGATGGTGAAA------AGT--------CG---------AAA--------CT--------AC--------G--------A--------TGG---TG---AAAGTCCGAGAct
gi|4500                       :                                                                       G---------A--------A--------A--------C--------TACGATGGTGAAA------AGT--------CG---------AAA--------CAACGAAACTAC--------G--------A--------CGG---TG---AAAAGTCGAAATTAtcattt
gi|4635                       :                                                                       G---------A--------A--------A--------C--------TACGATGGTGTAA------AGTAGAAACAACG---------AAA--------CA--------AC--------G--------A--------TGG---TG---AAAAGTCGAAACTA
gi|4664                       :                                                                       G---------A--------A--------A--------C--------TACGATGGTAAAA------AAT--------CG---------AAA--------CA--------AC--------G--------A--------TGG---TG---AAAATTTGAAATTA
gi|4564                       :                                                                       G---------A--------A--------A--------C--------TACGATGGTGAAA------AGT--------CG---------AAA--------CA--------AC--------GAAACT---A--------CGATTGTG---AAAAGTCGAAAttt
gi|4603                       :                                                                       G---------A--------A--------A--------C--------TACGACGGTGAAA------AGC--------CG---------AAA--------CAGCGAAACGAC--------G--------A--------TGG---TG---AAAAGTCGAAACT
gi|4569                       :                                                                       G---------A--------A--------A--------C--------TTCGATGGTGAAA------AGC--------CG---------AAA--------CT--------AA--------G--------A--------TGG---TG---AAAACTCGAAATTAgt
gi|4567                       :                                                                       G---------A--------A--------A--------T--------TACGATGGTGAAA------AGTAGAAACAACG---------AAA--------CC--------AC--------G--------A--------TGG---TG---AAAAGTCGAAAttt
gi|4497                       :                                                                       G---------A--------A--------A--------C--------TACGATGGTGAAA------AGC--------CG---------AAAAGTCGGATCT--------AT--------G--------A--------TGG---TG---AAAAGTCGAAATTAtgat
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gi|4648                       :                                                                       G---------A--------A--------A--------C--------TACGATGGTGAAAGTCGAAAGT--------CG---------AAA--------CC--------AC--------G--------A--------TGG---TG----AAAGTCGAAA
gi|4617                       :                                                                       G---------A--------A--------A--------C--------TTCGATGGTGAAA------AGT--------CG---------AAACAACGAAGCA--------AC--------G--------A--------TGG---TG---AAAAATCGAAACTAtca
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gi|4543                       :                                                                       G---------A--------A--------A--------C--------TACGATGATGAAA------AGT--------CG---------AAA--------GAACGAAACTAC--------G--------A--------TGG---TG---AACAGTTGAAACTA
gi|4513                       :                                                                       G---------A--------A--------A--------C--------TGCGATGATGAAA-------GT--------CG---------AAA--------CA--------AC--------G--------AAACTACGATGA---TG---AAAAGTCGAAACTA
gi|4502                       :                                                                       G---------A--------A--------A--------C--------AACGATGGTGAAA------AGT--------CG---------AAA--------CAACGAAACTAC--------G--------A--------CGG---TG---AAAAGTCGAAA
gi|4496                       :                                                                       G---------A--------A--------A--------C--------TACGATAGTGAAA------AGTTGAAATATCG---------AAA--------CA--------AC--------A--------A--------TGA---TG---AAAAGTCGAAAtca
gi|4665                       :                                                                       G---------A--------A--------A--------C--------TACGATGGTGAAAGTCAAAAGT--------CG---------AAA--------CC--------AC--------G--------A--------TGG---TG----AAAGTCAAAAtcattt
gi|4548                       :                                                                       G---------A--------A--------A--------C--------TACGATGGTGAAA------ACG--------CG---------AAA--------CA--------ACGAAACTATG--------A--------TGG---TG---AAAAGTCGAAAtcat
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gi|4568                       :                                                                       G---------A--------A--------A--------C--------TACGACAGTGAAA------AGT--------CG---------AAA--------CA--------AC--------AAAACTACTA--------TGG---TG---AAAAGTCGAAA
gi|4663                       :                                                                       G---------A--------A--------A--------C--------TACAATAGTGAAA------AGT--------CG---------AAA--------CAACGAAACTAC--------G--------A--------TGG---TA---AAAAATCGAAA
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gi|4633                       :                                                                       G---------A--------A--------A--------T--------TACGATGATGAAA------AGT--------CG---------AAA--------CAACGCAACTAC--------G--------A--------TGA---TG---AAAAATCGA
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gi|4528                       :                                                                       G---------G--------A--------A--------C--------TATGATGGTGAAA------AGT--------CGCAAAAATCGAAA--------CT--------AC--------G--------A--------GGG---TG---AAAAATCGAAA
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gi|4613                       :                                                                       G---------A--------A--------A--------C--------TGCGCTGGTAAAA------AGT--------CG---------AAA--------CA--------AC--------GAAACT---A--------CGA---TGGGTAAAAGTCGAAATTAttt
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gi|4778                       :                                                                        ---------A--------A--------A--------C--------TACAATGGTGAAT------AGT--------CG---------AAA--------CA--------GCGAAACTATG--------A--------TGG---TG---AAAAGTCGCAA





Alignments
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lowQualScore                  :     .              ........ .  ........  ........ ........ ........ ........ .........    ........           ........     ........ .   .                    
lowQualScore                  :     5              44444444 5  99999999  99999999 00000000 88888888 55555555 222222222    55555555           22222222     55555555 0   6                    
consensus                     : GAAA-CTACGATGGTGAAA--------A-GT--------CG--------A--------A--------A--------C--------TACGA--------TGGTGAAAAGT--------CGAAA--------CTACG-ATGGTGAAAAGTCGAAACTA
Reference ( family-142 )      : GAAA-CTACGATGGTGAAA--------A-GT--------CG--------A--------A--------A--------C--------TACGA--------TGGTGAAAAGT--------CGAAA--------CNACG-ATGGTGAAAAGTCGAAACTA
gi|4496                       : GAAA-CTACGATAGTGAAA--------A-GTTGAAATATCG--------A--------A--------A--------C--------AACAA--------TGATGAAAAGT--------CGAAA--------TC
gi|4497                       : GAAA-CTACGATGGTGAAA--------A-GC--------CG--------A--------A--------A--------------------------------------AGT--------CGGAT--------CTATG-ATGGTGAAAAGTCGAAATTAttt
gi|4498                       : GAAA-CTATGATGGTGAAA--------A-GT--------CG--------A--------A--------A--------C--------TACGA--------TGGTGAAAAGC--------CGAAA--------ttt
gi|4500                       : GAAA-CTACGATGGTGAAA--------A-GT--------CG--------A--------A--------A--------C--------------------------AA------------CGAAA--------CTACG-ACGGTGAAAAGTCGAAATTA
gi|4501                       : GAAA-CTACGATGGTGAAA--------A-GT--------CG--------A--------A--------A--------C--------------------------AA------------CGAAA--------CAACG-ATGGTGAAAAGTCGAAA
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gi|4527                       : GAAA-CTACGATGGTGAAA--------A-GT--------CG--------A--------A--------A--------C--------TACGA--------TGATGAAAAGT--------CGAAA--------CTAC
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gi|4537                       : GAAA-CTACGACGGTGAAA--------A-GT--------CG--------A--------A--------A--------C--------------------------AA------------CGAAA--------CAACG-ATGGTGAAAAGACGCAACTA
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gi|4542                       : GAAA-CTACGATGTTGAAA--------A-GTTGAAATGTCG--------A--------A--------A--------C--------TACGA--------TGGCGAAAAGT--------AGAAA--------TC
gi|4543                       : GAAA-CTACGATGATGAAA--------A-GT--------CG--------A--------A--------A----------------------------------GAA------------CGAAA--------CTACG-ATGGTGAACAGTTGAAACTAtct
gi|4544                       : GAAA-CTACGATGGTGAAC--------A-GT--------TG--------A--------A--------A--------C--------TACGG--------TGGTGAAAAGT--------TGAAA--------CT
gi|4547                       : GAAA-CTACGACGGTGAAA--------A-GT--------CG--------A--------A--------A--------C--------------------------AA------------CGAAA--------CAACG-ATGGTGAAAAGTCGAAA
gi|4548                       : GAAA-CTACGATGGTGAAA--------ACGCGAAACAA-CG--------A--------A--------A--------C--------TATGA--------TGGTGAAAAGT--------CGAAA--------tcactt
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gi|4550                       : GAAA-CTACGATGGTGAAA--------A-GT--------CG--------A--------A--------A--------C--------AATGA--------TGGTGTTAACG--------CGAAA--------TTACG-ATGGTGAAAAGTCGAAAgtgattt
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gi|4565                       : GATA-CTACGATGGTGAAA--------A-GT--------CG--------A--------A--------A--------C--------TACGA--------TGGTGAAAAGT--------CGAAA--------
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gi|4589                       : GAAA-CTACGATGGTGAAA--------A-GT--------CG--------A--------A--------A--------C--------AACGA--------TGATGAAAAGT--------CGAAA--------CTACG-ATGGTTAAAAGTCGAAACTA
gi|4590                       :                                         G--------A--------A--------A--------C--------TACGA--------TGGTGAAAAGT--------TGAAA--------CAACG-ATGGTGAAAAGTTGAAACTA
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Alignments
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lowQualScore                  :     4              555555 4  22222222   66 55555555 55555555 000000000      5    5   33333333  99999999 55555555 55555555 55555555 77777777    6                    
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Reference ( family-142 )      : GAAA-CTACGATGGTGAAA------A-GT--------CGA--A--------A--------C--------TACGATGGTGAAAAGT--------CG--------A--------A--------A--------C--------TACG-ATGGTGAAAAGTCGAAACTA
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gi|4537                       : GAAA-CTACGACGGTGAAA------A-GT--------CGA--A--------A--------C------------------AA------------CG--------A--------A--------A--------C--------AACG-ATGGTGAAAAGACGCAACTA
gi|4538                       : GGAA-CTACGATGGTGAAA------A-GT--------CGA--A--------A--------C--------AACGATGGTGAAAAGT--------CG--------A--------A--------A--------C--------TA
gi|4542                       : GAAA-CTACGATGTTGAAA------A-GT------------------------------------------------TGAAATGT--------CG--------A--------A--------A--------C--------TACG-ATGGCGAAAAGTAGAAA
gi|4543                       : GAAA-CTACGATGATGAAA------A-GT--------CGA--A--------A--------------------------GAA------------CG--------A--------A--------A--------C--------TACG-ATGGTGAACAGTTGAAACTAtcatct
gi|4544                       : GAAA-CTACGATGGTGAAC------A-GT--------TGA--A--------A--------C--------TACGGTGGTGAAAAGT--------TG--------A--------A--------A--------C--------TA
gi|4547                       : GAAA-CTACGACGGTGAAA------A-GT--------CGA--A--------A--------C------------------AA------------CG--------A--------A--------A--------C--------AACG-ATGGTGAAAAGTCGAAA
gi|4548                       : GAAA-CTACGATGGTGAAA------ACGCGAAACAA-CGA--A--------A--------C--------TATGATGGTGAAAAGT--------CG--------A--------A--------A--------tcactt
gi|4549                       : GAAA-CTATGATGGTGAAA------A-GT--------CGA--A--------A--------C--------AACGATGGTGAAAAGT--------CG--------A--------A--------
gi|4550                       : GAAA-CTACGATGGTGAAA------A-GT--------CGA--A--------A--------C--------AATGATGGTGTTAACG--------CG--------A--------A--------A--------T--------TACG-ATGGTGAAAAGTCGAAAgtgattt
gi|4551                       : GAAA-CTACGATGGTGAAA------A-GT--------AGA--A--------A--------C--------TA-GATAGGGAAAACG--------CG--------A--------A--------A--------C--------TACG-ATGGTGAAAAGTCGAAA
gi|4553                       : GAAA-CAACGATGGTGAAA------A-GT--------CGA--A--------A--------C--------TA-----------AGT--------CG--------A--------A--------A--------C--------TACG-ATGGTGAAAAGTCGAAACTA
gi|4560                       : GAAA-ATACGATGCTGAAA------A-GT--------CGA--A--------A--------C------------------AA------------CG--------A--------A--------A--------C--------TACG-ATACTGAAAAGTCGAAATTA
gi|4564                       : GAAA-CTACGATGGTGAAA------A-GT--------CGA--A--------A--------C------------------AA------------CG--------A--------A--------A--------C--------TACG-ATTGTGAAAAGTCGAAAttt
gi|4565                       : GATA-CTACGATGGTGAAA------A-GT--------CGA--A--------A--------C--------TACGATGGTGAAAAGT--------CG--------A--------A--------A--------
gi|4567                       : GAAA-TTACGATGGTGAAA------A-GTAGAAACAACGA--A--------A--------C--------CACGATGGTGAAAAGT--------CG--------A--------A--------A--------
gi|4568                       :                                       GA--A--------A--------C--------TACGACAGTGAAAAGT--------CGAAACAACAA--------A--------A--------C--------TACT-ATGGTGAAAAGTCGAAAtgat
gi|4569                       : GAAA-CTTCGATGGTGAAA------A-GC--------CGA--A--------A--------C--------TAAGATGGTGAAAACT--------CG--------A--------A--------A--------T--------TA
gi|4578                       : GAAA-CTACGATGGTGAAA------A-CG--------CGA--A--------A--------C--------TACGACGGTGAAAAGT--------CG--------A--------A--------A--------C--------TACG-ATGATGAAAAGTCGAAACTAttt
gi|4583                       : GAAA-CTACGATGGTGAAA------A-GT--------CGA--A--------A--------C--------AACGATGGTGAAAAGT--------CG--------A--------A--------A--------C--------TAAG-ATGGTGAAAAATCGAAA
gi|4584                       : GAAA-CTACGATGGTGAAA------A-GT--------CGA--A--------A--------C--------TACGATGGTGAAAAGT--------CG--------A--------A--------A--------C--------TAtcattt
gi|4585                       : GAAA-CTACGATGGTGAAA------A-GT--------CAA--A--------A--------C--------AACGATGGTGAAAAGT--------CG--------C--------A--------A--------C--------TACG-ATGGTGAAAAGTCGAAACTA
gi|4588                       : GAAA-CTACGATGGTGAAA------A-GT--------CGA--A--------A--------C--------TACGATGGTGAAAAGT--------CG--------A--------A--------A--------C--------AACG-ATGATGAAAAGTCGAAACTAt
gi|4589                       : GAAA-CTACGATGGTGAAA------A-GT--------CGA--A--------A--------C--------AACGATGATGAAAAGT--------CG--------A--------A--------A--------C--------TACG-ATGGTTAAAAGTCGAAACTA
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gi|4593                       :                                       GA--A--------A--------C--------AACGATGGTGAAAAGTCAAAACAACG--------A--------A--------A--------C--------AACG-ATGGTGAAAAGTCGAAA
gi|4594                       :                                       GA--A--------A--------C--------AACGATGGTGAAAAGTCAAAACAACG--------A--------A--------A--------C--------AACG-ATGGTGAAAAGTCGAAA
gi|4595                       : GAAA-CTACGATGGTGAAA------A-GT--------TGA--A--------A--------C--------AACGATGGTGAAAAGT--------TG--------A--------A--------A--------C--------TACG-ATGGTGAAAAGTCAAAA
gi|4602                       : GAAA-CTACGATGGTGAAA------A-GT--------CGA--A--------T--------C--------AACGATGGTGAAAAGT--------CG--------A--------A--------A--------C--------TACG-ATGGTGAACAGTCGAAACTA
gi|4603                       : GAAA-CTACGACGGTGAAA------A-GC--------CGA--A--------A--------C---------------------AG---------CG--------A--------A--------A--------C--------GACG-ATGGTGAAAAGTCGAAACTt
gi|4605                       : GAAA-CTACGATAGTGAAA------A-GT--------CGA--A--------A--------C--------------GGTG-AAAGT--------CG--------A--------A--------A--------C--------TACGAATAGTGAAAAGACGAAATTAgt
gi|4606                       : GAAA-CTGCGATGATGAAA------A-GT--------CGA--A--------A--------T-------------------AAAGT--------CG--------A--------A--------A--------T--------TACG-ACAGTGAAAAGACGAAAttt
gi|4608                       : GAAA-CTACGATGGTGAAA------A-GT--------CGA--A--------A--------C------------------AA------------CG--------A--------A--------A--------C--------AACG-ATGGTGAAAAATCAAAACTAtaattt
gi|4610                       : GGAA-CTACGATGGTGAAA------G-GT--------CGA--A--------A----------------------------AAA----------CG--------A--------A--------A--------C--------TACG-AATGTGAAAAGTCGAAA
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gi|4617                       :                                       GA--A--------A--------C--------TTCGATGGTGAAAAGT--------CG--------A--------A--------ACAACGAAGC--------AACG-ATGGTGAAAAATCGAAACTA
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gi|4627                       : GAAA-CTACGATGGTGTAA------A-GC--------CGA--A--------A--------C------------------AA------------CG--------A--------A--------A--------C--------AACG-ACTGTGAAAAGTCGAAATTA
gi|4632                       :                                       GA--A--------A--------C--------TACGATGATGAAAAGT--------CG--------A--------A--------A--------CAACGAAATTACG-ATAGTGAAAAGTCGAAAttt
gi|4633                       :                                       GA--A--------A--------T--------TACGATGATGAAAAGT--------CG--------AAACAACGCA--------A--------C--------TACG-ATGATGAAAAATCGA
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gi|4635                       : GAAA-CTACGATGGTGTAA------A-GTAGAAACAACGA--A--------A--------C--------AACGATGGTGAAAAGT--------CG--------A--------A--------A--------C--------TA
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gi|4648                       : GAAA-CTACGATGGTGAAAGTCGAAA-GT--------CGA--A--------A--------C--------CACGATGGTG-AAAGT--------CG--------A--------A--------A--------tgattt
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gi|4664                       : GAAA-CTACGATGGTAAAA------A-AT--------CGA--A--------A--------C--------AACGATGGTGAAAATT--------TG--------A--------A--------A--------T--------TA
gi|4665                       : GAAA-CTACGATGGTGAAAGTCAAAA-GT--------CGA--A--------A--------C--------CACGATGGTG-AAAGT--------CA--------A--------A--------A--------ttt
gi|4680                       : GACA-CTACCATGGTAGAA------A-GT--------CAA--A--------A--------C--------TACGA--------------------------------------A--------A--------C--------TATG-ATGATGAAAAGTCGAAAtcat
gi|4684                       : GAAA-CTACAATGGTGAAA------A-GT--------CGA--A--------A--------C------------------AA------------CG--------A--------A--------A--------C--------AACG-ATAGTGAAAAGTAG-AACTAtcattt
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gi|4690                       : GAAA-CCACGATGGTGAAA--------GT--------CGA--A--------A--------C--------TATGATGATGAAA-GT--------CG--------A--------A--------A--------C--------TACG-ATGATGAAAAGTCGAAAGTA
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gi|4696                       : GAAA-CTACGATAGTGAAA------A-TG--------CGA--A--------A--------A--------TACGATGAT--AAAGT--------CG--------A--------A--------A--------C--------TACG-ATGGTGAAAAGTCGAAACTAtcattt
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gi|4768                       :  AAA-CTACGGTGGTGAAA------A-GT--------CGA--A--------A--------C--------TACAATGGCGAAAAGT--------CG--------A--------A--------A--------C--------AACG-ATGGTGAAAAGTCGAAA
gi|4769                       :  AAA-CTATGATGGTGAAA------A-GT--------CGA--A--------A------------------------------AGT--------CG--------A--------A--------A--------C--------TACG-ATGGTGAAAAGTtaattt
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gi|4775                       :  AAA-TTACGATGATGAAA--------GT--------CGA--A--------A--------CAACGAAATTACGATGATGAAAAGT--------CG--------A--------A--------A--------
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gi|4778                       :  AAA-CTACAATGGTGAAT------A-GT--------CGA--A--------A--------C---------------------AG---------CG--------A--------A--------A--------C--------TATG-ATGGTGAAAAGTCGCAAt
gi|4781                       :                                        A--A--------A--------C--------TACGATGATGAAAAGC--------CG--------A--------AACAACGACA--------C--------TACG-ATGGTGAAAAGTTGAAAtattt
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Alignments
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Reference ( family-142 )      : GAAA-CTACGATGGTGAAA------A-GT--------CGA--A--------A--------C--------TACGATGGTGAAAAGT--------CG--------A--------A--------A--------C--------TACG-ATGGTGAAAAGTCGAAACTA
gi|4496                       : GAAA-CTACGATAGTGAAA------A-GTTGAAATATCGA--A--------A--------C--------AACAATGATGAAAAGT--------CG--------A--------A--------A--------
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gi|4517                       : GAAA-CTACGATGGTGAAA------A-AT--------TAA--A--------A--------C--------TACGATGATGAAAAGT--------CG--------A--------A--------A--------T--------TA
gi|4518                       : GAAA-CTACGATGGTAAAA------A-----------CGATTA--------A--------C--------TAAGATGGTGAAAAAT--------CG--------A--------A--------A--------C--------TACG-ATGGTGAAAAGTCGAAA
gi|4519                       : GAAA-CTACGATGGTGAAA------A-GC--------CGA--A--------A--------C--------TACGATGGTGAAATGT--------CG--------A--------A--------A--------C--------TA
gi|4520                       : GAAA-CTACGATGGTGAAA------A-GT--------CGA--T--------A--------C--------GACAATCGTGAAAAGT--------CG--------G--------A--------A--------C--------AACG-ATGGTGAAAAGTCGAAA
gi|4521                       : GAAA-CTACGATGGTGAAA------A-GT--------CGA--A--------A--------C--------AACATTGGTGAAAAGT--------CG--------A--------A--------A--------C--------AACG-ATGGTGAAAAATCGAAA
gi|4526                       : GAAA-CTACGATAGTGAAA------A-GT--------CGA--A--------A--------C--------------------AA----------CG--------A--------A--------A--------C--------TACG-ATGGTGAAAAGTCGAAACTA
gi|4527                       : GAAA-CTACGATGGTGAAA------A-GT--------CGA--A--------A--------C--------TACGATGATGAAAAGT--------CG--------A--------A--------A--------C--------TAC
gi|4528                       : GGAA-CTATGATGGTGAAA------A-GT--------CG--------------------------------C-------AAAAAT--------CG--------A--------A--------A--------C--------TACG-AGGGTGAAAAATCGAAAt
gi|4529                       : GAAA-CTACGAGGGTGAAA------A-AT--------CGA--A--------A--------C--------AACGATGATGAAAAGT--------CG--------A--------A--------A--------C--------TA
gi|4534                       : GAAA-CTACGATGGTGAAA------A-GT--------CGA--A--------A--------C--------TACGATGGTGAAAAGT--------TG--------A--------A--------A--------T--------TA
gi|4535                       : GACA-CTATGATGGTGAGA------A-GT--------CGA--A--------A--------C--------------------AA----------CG--------A--------A--------A--------C--------TACG-ATGGTGAAAAGTCGAAACTAttt
gi|4537                       : GAAA-CTACGACGGTGAAA------A-GT--------CGA--A--------A--------C------------------AA------------CG--------A--------A--------A--------C--------AACG-ATGGTGAAAAGACGCAACTA
gi|4538                       : GGAA-CTACGATGGTGAAA------A-GT--------CGA--A--------A--------C--------AACGATGGTGAAAAGT--------CG--------A--------A--------A--------C--------TA
gi|4542                       : GAAA-CTACGATGTTGAAA------A-GT------------------------------------------------TGAAATGT--------CG--------A--------A--------A--------C--------TACG-ATGGCGAAAAGTAGAAA
gi|4543                       : GAAA-CTACGATGATGAAA------A-GT--------CGA--A--------A--------------------------GAA------------CG--------A--------A--------A--------C--------TACG-ATGGTGAACAGTTGAAACTAtcatct
gi|4544                       : GAAA-CTACGATGGTGAAC------A-GT--------TGA--A--------A--------C--------TACGGTGGTGAAAAGT--------TG--------A--------A--------A--------C--------TA
gi|4547                       : GAAA-CTACGACGGTGAAA------A-GT--------CGA--A--------A--------C------------------AA------------CG--------A--------A--------A--------C--------AACG-ATGGTGAAAAGTCGAAA
gi|4548                       : GAAA-CTACGATGGTGAAA------ACGCGAAACAA-CGA--A--------A--------C--------TATGATGGTGAAAAGT--------CG--------A--------A--------A--------tcactt
gi|4549                       : GAAA-CTATGATGGTGAAA------A-GT--------CGA--A--------A--------C--------AACGATGGTGAAAAGT--------CG--------A--------A--------
gi|4550                       : GAAA-CTACGATGGTGAAA------A-GT--------CGA--A--------A--------C--------AATGATGGTGTTAACG--------CG--------A--------A--------A--------T--------TACG-ATGGTGAAAAGTCGAAAgtgattt
gi|4551                       : GAAA-CTACGATGGTGAAA------A-GT--------AGA--A--------A--------C--------TA-GATAGGGAAAACG--------CG--------A--------A--------A--------C--------TACG-ATGGTGAAAAGTCGAAA
gi|4553                       : GAAA-CAACGATGGTGAAA------A-GT--------CGA--A--------A--------C--------TA-----------AGT--------CG--------A--------A--------A--------C--------TACG-ATGGTGAAAAGTCGAAACTA
gi|4560                       : GAAA-ATACGATGCTGAAA------A-GT--------CGA--A--------A--------C------------------AA------------CG--------A--------A--------A--------C--------TACG-ATACTGAAAAGTCGAAATTA
gi|4564                       : GAAA-CTACGATGGTGAAA------A-GT--------CGA--A--------A--------C------------------AA------------CG--------A--------A--------A--------C--------TACG-ATTGTGAAAAGTCGAAAttt
gi|4565                       : GATA-CTACGATGGTGAAA------A-GT--------CGA--A--------A--------C--------TACGATGGTGAAAAGT--------CG--------A--------A--------A--------
gi|4567                       : GAAA-TTACGATGGTGAAA------A-GTAGAAACAACGA--A--------A--------C--------CACGATGGTGAAAAGT--------CG--------A--------A--------A--------
gi|4568                       :                                       GA--A--------A--------C--------TACGACAGTGAAAAGT--------CGAAACAACAA--------A--------A--------C--------TACT-ATGGTGAAAAGTCGAAAtgat
gi|4569                       : GAAA-CTTCGATGGTGAAA------A-GC--------CGA--A--------A--------C--------TAAGATGGTGAAAACT--------CG--------A--------A--------A--------T--------TA
gi|4578                       : GAAA-CTACGATGGTGAAA------A-CG--------CGA--A--------A--------C--------TACGACGGTGAAAAGT--------CG--------A--------A--------A--------C--------TACG-ATGATGAAAAGTCGAAACTAttt
gi|4583                       : GAAA-CTACGATGGTGAAA------A-GT--------CGA--A--------A--------C--------AACGATGGTGAAAAGT--------CG--------A--------A--------A--------C--------TAAG-ATGGTGAAAAATCGAAA
gi|4584                       : GAAA-CTACGATGGTGAAA------A-GT--------CGA--A--------A--------C--------TACGATGGTGAAAAGT--------CG--------A--------A--------A--------C--------TAtcattt
gi|4585                       : GAAA-CTACGATGGTGAAA------A-GT--------CAA--A--------A--------C--------AACGATGGTGAAAAGT--------CG--------C--------A--------A--------C--------TACG-ATGGTGAAAAGTCGAAACTA
gi|4588                       : GAAA-CTACGATGGTGAAA------A-GT--------CGA--A--------A--------C--------TACGATGGTGAAAAGT--------CG--------A--------A--------A--------C--------AACG-ATGATGAAAAGTCGAAACTAt
gi|4589                       : GAAA-CTACGATGGTGAAA------A-GT--------CGA--A--------A--------C--------AACGATGATGAAAAGT--------CG--------A--------A--------A--------C--------TACG-ATGGTTAAAAGTCGAAACTA
gi|4590                       : GAAA-CTACGATGGTGAAA------A-GT--------TGA--A--------A--------C--------AACGATGGTGAAAAGT--------TG--------A--------A--------A--------C--------TA
gi|4591                       : GAAA-CAACGATGGTGAAA------A-GT--------CGA--A--------A--------C--------AACGATGGTGAAAAGT--------TG--------A--------A--------A--------C--------TA
gi|4592                       :                                       GA--A--------A--------C--------AACGATGGTGAAAAGTCAAAACAACG--------A--------A--------A--------C--------AACG-ATGGTGAAAAGTCGAAA
gi|4593                       :                                       GA--A--------A--------C--------AACGATGGTGAAAAGTCAAAACAACG--------A--------A--------A--------C--------AACG-ATGGTGAAAAGTCGAAA
gi|4594                       :                                       GA--A--------A--------C--------AACGATGGTGAAAAGTCAAAACAACG--------A--------A--------A--------C--------AACG-ATGGTGAAAAGTCGAAA
gi|4595                       : GAAA-CTACGATGGTGAAA------A-GT--------TGA--A--------A--------C--------AACGATGGTGAAAAGT--------TG--------A--------A--------A--------C--------TACG-ATGGTGAAAAGTCAAAA
gi|4602                       : GAAA-CTACGATGGTGAAA------A-GT--------CGA--A--------T--------C--------AACGATGGTGAAAAGT--------CG--------A--------A--------A--------C--------TACG-ATGGTGAACAGTCGAAACTA
gi|4603                       : GAAA-CTACGACGGTGAAA------A-GC--------CGA--A--------A--------C---------------------AG---------CG--------A--------A--------A--------C--------GACG-ATGGTGAAAAGTCGAAACTt
gi|4605                       : GAAA-CTACGATAGTGAAA------A-GT--------CGA--A--------A--------C--------------GGTG-AAAGT--------CG--------A--------A--------A--------C--------TACGAATAGTGAAAAGACGAAATTAgt
gi|4606                       : GAAA-CTGCGATGATGAAA------A-GT--------CGA--A--------A--------T-------------------AAAGT--------CG--------A--------A--------A--------T--------TACG-ACAGTGAAAAGACGAAAttt
gi|4608                       : GAAA-CTACGATGGTGAAA------A-GT--------CGA--A--------A--------C------------------AA------------CG--------A--------A--------A--------C--------AACG-ATGGTGAAAAATCAAAACTAtaattt
gi|4610                       : GGAA-CTACGATGGTGAAA------G-GT--------CGA--A--------A----------------------------AAA----------CG--------A--------A--------A--------C--------TACG-AATGTGAAAAGTCGAAA
gi|4613                       : GAAA-CTGCGCTGGTAAAA------A-GT--------CGA--A--------A--------C------------------AA------------CG--------A--------A--------A--------C--------TACG-ATGGGTAAAAGTCGAAATTA
gi|4616                       : GAAA-CTACGATGGTGAAA------A-GT--------CGA--A--------A--------C--------AATGATGGTGAAAACG--------CG--------A--------A--------A--------C--------TACG-ATGATGAAAAGTCGAAAttt
gi|4617                       :                                       GA--A--------A--------C--------TTCGATGGTGAAAAGT--------CG--------A--------A--------ACAACGAAGC--------AACG-ATGGTGAAAAATCGAAACTA
gi|4619                       : GAAA-CTACGATGGTGAAA------A--T--------CGA--A--------A--------C--------TACGATGATGAAAAGT--------CG--------A--------A--------A--------G--------TAt
gi|4627                       : GAAA-CTACGATGGTGTAA------A-GC--------CGA--A--------A--------C------------------AA------------CG--------A--------A--------A--------C--------AACG-ACTGTGAAAAGTCGAAATTA
gi|4632                       :                                       GA--A--------A--------C--------TACGATGATGAAAAGT--------CG--------A--------A--------A--------CAACGAAATTACG-ATAGTGAAAAGTCGAAAttt
gi|4633                       :                                       GA--A--------A--------T--------TACGATGATGAAAAGT--------CG--------AAACAACGCA--------A--------C--------TACG-ATGATGAAAAATCGA
gi|4634                       : GAAA-TTACGATAGTGAAA------A-GT--------CGA--A--------A--------CAACAAAATTACGATGATG-AAAGT--------CG--------A--------A--------A--------
gi|4635                       : GAAA-CTACGATGGTGTAA------A-GTAGAAACAACGA--A--------A--------C--------AACGATGGTGAAAAGT--------CG--------A--------A--------A--------C--------TA
gi|4640                       : GAAA-CTACGATGGTGAAA------A-GT--------CGA--A--------T--------C--------AACGATGGTGAAAAGT--------CG--------A--------A--------A--------C--------TACG-ATGGTGAACAGTCGAAACTA
gi|4641                       : GAAA-CTATGATGGTGAAA------A-GT--------TAA--A--------A--------C--------AATGATGGTGAAAAGT--------CA--------A--------A--------A--------C--------TATG-ATGCTGAAAAGTCGAAATTA
gi|4642                       : GAAA-CTACGATGGTGAAA------A-AT--------CGA--A--------A--------C--------TACGATGATGAAAAGT--------CG--------T--------A--------A--------C--------TActt
gi|4643                       : GAAA-ATACGATGGTGAAA------A-GT--------CGT--A--------T--------C--------TACGATAGTGAAAAGT--------CG--------A--------A--------A--------C--------TACG-ATGGTGAAAAATCGAAACTA
gi|4644                       : GAAA-CTACGATGATGAAA------A-GT--------CGT--A--------A--------C--------TACGATGGTGAAAAAT--------CG--------A--------A--------A--------C--------TACT-ATAGTGAAAAGTCGAAACTA
gi|4646                       : GAAA-CTACGATGGTGAAA------A-GT--------CGC--A--------A--------C--------TATGATGGTGAAAAGT--------CG--------A--------A--------A--------
gi|4648                       : GAAA-CTACGATGGTGAAAGTCGAAA-GT--------CGA--A--------A--------C--------CACGATGGTG-AAAGT--------CG--------A--------A--------A--------tgattt
gi|4663                       : GAAA-CTACAATAGTGAAA------A-GT--------CGA--A--------A--------C------------------AA------------CG--------A--------A--------A--------C--------TACG-ATGGTAAAAAATCGAAAtca
gi|4664                       : GAAA-CTACGATGGTAAAA------A-AT--------CGA--A--------A--------C--------AACGATGGTGAAAATT--------TG--------A--------A--------A--------T--------TA
gi|4665                       : GAAA-CTACGATGGTGAAAGTCAAAA-GT--------CGA--A--------A--------C--------CACGATGGTG-AAAGT--------CA--------A--------A--------A--------ttt
gi|4680                       : GACA-CTACCATGGTAGAA------A-GT--------CAA--A--------A--------C--------TACGA--------------------------------------A--------A--------C--------TATG-ATGATGAAAAGTCGAAAtcat
gi|4684                       : GAAA-CTACAATGGTGAAA------A-GT--------CGA--A--------A--------C------------------AA------------CG--------A--------A--------A--------C--------AACG-ATAGTGAAAAGTAG-AACTAtcattt
gi|4687                       : GAAA-CTACCATGGTGAAA------A-GT--------CGA--A--------A--------C--------AACGATGGTGAAAAGT--------CG--------A--------A--------A--------T--------TAattt
gi|4690                       : GAAA-CCACGATGGTGAAA--------GT--------CGA--A--------A--------C--------TATGATGATGAAA-GT--------CG--------A--------A--------A--------C--------TACG-ATGATGAAAAGTCGAAAGTA
gi|4695                       : GAAA-CTACGATGGTGAAA------A-GT--------CGA--A--------A--------C--------TACGATGGTGAAAGTC--------CG--------A--------G--------A--------
gi|4696                       : GAAA-CTACGATAGTGAAA------A-TG--------CGA--A--------A--------A--------TACGATGAT--AAAGT--------CG--------A--------A--------A--------C--------TACG-ATGGTGAAAAGTCGAAACTAtcattt
gi|4699                       : GAAA-CTACGATGGTGAAA------A-GT--------CGA--A--------A--------C------------------AA------------CG--------A--------A--------A--------C--------AACG-ATGGTGAAAGCGCGAAACTA
gi|4703                       :                                       GA--A--------A--------T--------TACGATGGTGAAAAGT--------CGAAACAACAA--------A--------A--------C--------TACG-ATGGTTAAAAGTC
gi|4704                       : GAAA-CTACGATGTTGAAT------A-GC--------CGA--A--------A--------CAACGAAATTACGATGGTGAAAAGT--------CG--------A--------A--------A--------
gi|4764                       :  AAA-CAACGATGGTGAAA------A-GT--------CGA--A--------A--------C--------AACGCTGGTGAAAAAT--------CG--------A--------A--------A--------C--------TACG-ATAGTGAAAAGTTGAAA
gi|4766                       :  AAA-CTACGATGGCGAAA------A-GT--------CGA--A--------A--------T--------TACGATGGTGAAAAGT--------CG--------A--------A--------A--------C--------TACG-ATGGTGAAAAGTCGAt
gi|4768                       :  AAA-CTACGGTGGTGAAA------A-GT--------CGA--A--------A--------C--------TACAATGGCGAAAAGT--------CG--------A--------A--------A--------C--------AACG-ATGGTGAAAAGTCGAAA
gi|4769                       :  AAA-CTATGATGGTGAAA------A-GT--------CGA--A--------A------------------------------AGT--------CG--------A--------A--------A--------C--------TACG-ATGGTGAAAAGTtaattt
gi|4774                       :  AAATCTACGATGGTAAAA------G-GT--------CGA--A--------A--------C--------------------AA----------CG--------A--------A--------A--------C--------TACG-ATGGTGAAAAGTCGAAACTA
gi|4775                       :  AAA-TTACGATGATGAAA--------GT--------CGA--A--------A--------CAACGAAATTACGATGATGAAAAGT--------CG--------A--------A--------A--------
gi|4777                       :  AAA-CTATGATGGTGAAA------A-GT--------TGA--A--------A--------T--------TACTATGGTAAAAATC--------CG--------A--------A--------A--------C--------TATG-ATGGCGAAAAGTCGAAATTA
gi|4778                       :  AAA-CTACAATGGTGAAT------A-GT--------CGA--A--------A--------C---------------------AG---------CG--------A--------A--------A--------C--------TATG-ATGGTGAAAAGTCGCAAt
gi|4781                       :                                        A--A--------A--------C--------TACGATGATGAAAAGC--------CG--------A--------AACAACGACA--------C--------TACG-ATGGTGAAAAGTTGAAAtattt
gi|4791                       :   AA-CTACGATGGTGAAA------A-GT--------CGA--A--------A--------C------------------AA------------CG--------A--------A--------A--------C--------AACG-ATGGTGAAAAGTCGAAAagttgttt
gi|4795                       :   AA-CTACGATAGAGAAA------A-GT--------CGT--A--------A--------C--------TACGATGATGAAAAAT--------CG--------A--------A--------A--------C--------TACG-ATGATGAAAAGTAGAAACTAtaattt


blockSeqs                     :                    GTCGAA    AGAAACAA      ACAACGAA AGATGAAA AACAAAATT               CAAAACAA  AAACAACA AACAACGC ACAACGAC CAACGAAG AACGAAAT
blockSeqs                     :                    GTCAAA    AGAAACAA      .        .        AACGAAATT               CAAAACAA  AAACAACA .        .        .        .       
blockSeqs                     :                    .         GAAACAA       .        .        AACGAAATT               CAAAACAA  .        .        .        .        .       
blockSeqs                     :                    .         .             .        .        T                       .         .        .        .        .        .       
blockSeqs                     :                    .         .             .        .        T                       .         .        .        .        .        .       
blockSeqs                     :                    .         .             .        .        T                       .         .        .        .        .        .       
blockSeqs                     :                    .         .             .        .        T                       .         .        .        .        .        .       
blockSeqs                     :                    .         .             .        .        T                       .         .        .        .        .        .       
blockSeqs                     :                    .         .             .        .        T                       .         .        .        .        .        .       
blockSeqs                     :                    .         .             .        .        T                       .         .        .        .        .        .       
blockSeqs                     :                    .         .             .        .        T                       .         .        .        .        .        .       
blockSeqs                     :                    .         .             .        .        T                       .         .        .        .        .        .       
blockSeqs                     :                    .         .             .        .        T                       .         .        .        .        .        .       
blockSeqs                     :                    .         .             .        .        G                       .         .        .        .        .        .       
blockSeqs                     :                    .         .             .        .        A                       .         .        .        .        .        .       
blockSeqs                     :                    .         .             .        .        T                       .         .        .        .        .        .       
blockSeqs                     :                    .         .             .        .        A                       .         .        .        .        .        .       
blockSeqs                     :                    .         .             .        .        T                       .         .        .        .        .        .       
blockSeqs                     :                    .         .             .        .        A                       .         .        .        .        .        .       
blockSeqs                     :                    .         .             .        .        T                       .         .        .        .        .        .       
blockSeqs                     :                    .         .             .        .        T                       .         .        .        .        .        .       
blockSeqs                     :                    .         .             .        .        A                       .         .        .        .        .        .       
blockSeqs                     :                    .         .             .        .        A                       .         .        .        .        .        .       
blockSeqs                     :                    .         .             .        .        T                       .         .        .        .        .        .       
blockSeqs                     :                    .         .             .        .        T                       .         .        .        .        .        .       
blockSeqs                     :                    .         .             .        .        T                       .         .        .        .        .        .       
blockSeqs                     :                    .         .             .        .        C                       .         .        .        .        .        .       
blockSeqs                     :                    .         .             .        .        T                       .         .        .        .        .        .       
blockSeqs                     :                    .         .             .        .        T                       .         .        .        .        .        .       
blockSeqs                     :                    .         .             .        .        T                       .         .        .        .        .        .       
blockSeqs                     :                    .         .             .        .        A                       .         .        .        .        .        .       
blockSeqs                     :                    .         .             .        .        T                       .         .        .        .        .        .       
blockSeqs                     :                    .         .             .        .        A                       .         .        .        .        .        .       
blockSeqs                     :                    .         .             .        .        T                       .         .        .        .        .        .       
blockSeqs                     :                    .         .             .        .        A                       .         .        .        .        .        .       
blockSeqs                     :                    .         .             .        .        A                       .         .        .        .        .        .       
blockSeqs                     :                    .         .             .        .        A                       .         .        .        .        .        .       
blockSeqs                     :                    .         .             .        .        A                       .         .        .        .        .        .       
blockSeqs                     :                    .         .             .        .        A                       .         .        .        .        .        .       
blockSeqs                     :                    .         .             .        .        A                       .         .        .        .        .        .       
blockSeqs                     :                    .         .             .        .        A                       .         .        .        .        .        .       
blockSeqs                     :                    .         .             .        .        A                       .         .        .        .        .        .       
blockSeqs                     :                    .         .             .        .        A                       .         .        .        .        .        .       
blockSeqs                     :                    .         .             .        .        T                       .         .        .        .        .        .       
blockSeqs                     :                    .         .             .        .        T                       .         .        .        .        .        .       
blockSeqs                     :                    .         .             .        .        T                       .         .        .        .        .        .       
blockSeqs                     :                    .         .             .        .        T                       .         .        .        .        .        .       
blockSeqs                     :                    .         .             .        .        A                       .         .        .        .        .        .       
blockSeqs                     :                    .         .             .        .        A                       .         .        .        .        .        .       
blockSeqs                     :                    .         .             .        .        A                       .         .        .        .        .        .       
blockSeqs                     :                    .         .             .        .        T                       .         .        .        .        .        .       
blockSeqs                     :                    .         .             .        .        T                       .         .        .        .        .        .       
blockSeqs                     :                    .         .             .        .        T                       .         .        .        .        .        .       
blockSeqs                     :                    .         .             .        .        T                       .         .        .        .        .        .       
blockSeqs                     :                    .         .             .        .        C                       .         .        .        .        .        .       
blockSeqs                     :                    .         .             .        .        A                       .         .        .        .        .        .       
blockSeqs                     :                    .         .             .        .        C                       .         .        .        .        .        .       
blockSeqs                     :                    .         .             .        .        T                       .         .        .        .        .        .       
blockSeqs                     :                    .         .             .        .        A                       .         .        .        .        .        .       
blockSeqs                     :                    .         .             .        .        T                       .         .        .        .        .        .       
blockSeqs                     :                    .         .             .        .        T                       .         .        .        .        .        .       
blockSeqs                     :                    .         .             .        .        T                       .         .        .        .        .        .       
blockSeqs                     :                    .         .             .        .        T                       .         .        .        .        .        .       
blockSeqs                     :                    .         .             .        .        A                       .         .        .        .        .        .       
blockSeqs                     :                    .         .             .        .        T                       .         .        .        .        .        .       
blockSeqs                     :                    .         .             .        .        T                       .         .        .        .        .        .       
blockSeqs                     :                    .         .             .        .        T                       .         .        .        .        .        .       
blockSeqs                     :                    .         .             .        .        T                       .         .        .        .        .        .       
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blockSeqs                     :                    .         .             .        .        .                       .         .        .        .        .        .       
blockSeqs                     :                    .         .             .        .        .                       .         .        .        .        .        .       
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blockSeqs                     :                    .         .             .        .        .                       .         .        .        .        .        .       
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blockSeqs                     :                    .         .             .        .        .                       .         .        .        .        .        .       
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blockSeqs                     :                    .         .             .        .        .                       .         .        .        .        .                
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blockSeqCons                  :                              ********
originalCons                  : GAAA-CTACGATGGTGAAA------A-GT--------CGA--A--------A--------C--------TACGATGGTGAAAAGT--------CG--------A--------A--------A--------C--------TACG-ATGGTGAAAAGTCGAAACTA
finalCons                     : GAAA-CTACGATGGTGAAA------A-GT--------CGA--A--------A--------C--------TACGATGGTGAAAAGT--------CG--------A--------A--------A--------C--------TACG-ATGGTGAAAAGTCGAAACTA





Alignments
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lowQualScore                  :     4              555555 4  22222222   66 55555555 55555555 000000000      5    5   33333333  99999999 55555555 55555555 55555555 77777777    6                    
consensus                     : GAAA-CTACGATGGTGAAA------A-GT--------CGA--A--------A--------C--------TACGATGGTGAAAAGT--------CG--------A--------A--------A--------C--------TACG-ATGGTGAAAAGTCGAAACTA
Reference ( family-142 )      : GAAA-CTACGATGGTGAAA------A-GT--------CGA--A--------A--------C--------TACGATGGTGAAAAGT--------CG--------A--------A--------A--------C--------TACG-ATGGTGAAAAGTCGAAACTA
gi|4496                       : GAAA-CTACGATAGTGAAA------A-GTTGAAATATCGA--A--------A--------C--------AACAATGATGAAAAGT--------CG--------A--------A--------A--------
gi|4497                       : GAAA-CTACGATGGTGAAA------A-GC--------CGA--A--------A------------------------------AGT--------CG--------G--------A--------T--------C--------TATG-ATGGTGAAAAGTCGAAATTAtcattt
gi|4498                       : GAAA-CTATGATGGTGAAA------A-GT--------CGA--A--------A--------C--------TACGATGGTGAAAAGC--------CG--------A--------A--------A--------ttt
gi|4500                       : GAAA-CTACGATGGTGAAA------A-GT--------CGA--A--------A--------C------------------AA------------CG--------A--------A--------A--------C--------TACG-ACGGTGAAAAGTCGAAATTA
gi|4501                       : GAAA-CTACGATGGTGAAA------A-GT--------CGA--A--------A--------C------------------AA------------CG--------A--------A--------A--------C--------AACG-ATGGTGAAAAGTCGAAA
gi|4502                       : GAAA-CAACGATGGTGAAA------A-GT--------CGA--A--------A--------C------------------AA------------CG--------A--------A--------A--------C--------TACG-ACGGTGAAAAGTCGAAA
gi|4506                       : GAAA-TTACGATGGTGAAA------A-GT--------CGA--AACAACGAAA--------C--------TACGATGGTGAAAAGT--------CG--------A--------A--------A--------C--------TACtca
gi|4507                       : GAAA-CTACGGTGGTAAAA------A-GT--------CGA--A--------AAGATGAAAC--------TACGATGATGGAAAAT--------CG--------A--------A--------A--------t
gi|4508                       : GAAA-CTACGATGGTGAAA------A-GT--------CGA--A--------A--------C--------TACTATGGTGAGAAGT--------CG--------A--------A--------A--------tcattt
gi|4509                       : GAAA-CTACGATGGTGAAA------A-GT--------CGA--A--------A--------C--------TACGGTGGTAAAAAGT--------CG--------A--------A--------A--------tgattt
gi|4510                       : GAAA-CTACGATGGTAAAA------A-GT--------CGA--A--------A--------T--------TACGATGGTGAAAAGT--------CG--------A--------A--------A--------
gi|4512                       : GAAA-CTGTGATGATGAAA------A-GT--------CGA--A--------A------------------------------AGT--------CG--------A--------A--------A--------C--------TAAG-ATGGTGAAAAGTCGAAA
gi|4513                       : GAAA-CTGCGATGATGAAA--------GT--------CGA--A--------A--------C--------------------AA----------CG--------A--------A--------A--------C--------TACG-ATGATGAAAAGTCGAAACTAtgattt
gi|4514                       : GAAA-CTACGATGATGAAA------A-GT--------CGA--A--------A--------C--------TACAATGACGAAAAGT--------CG--------A--------A--------A--------C--------
gi|4516                       : GAAA-CTACGATGGTGAAA------A-GT--------CGA--A--------A--------C------------------AA------------CG--------A--------A--------A--------C--------TACG-ATGGTGAAAAGCCGAAACTAgt
gi|4517                       : GAAA-CTACGATGGTGAAA------A-AT--------TAA--A--------A--------C--------TACGATGATGAAAAGT--------CG--------A--------A--------A--------T--------TA
gi|4518                       : GAAA-CTACGATGGTAAAA------A-----------CGATTA--------A--------C--------TAAGATGGTGAAAAAT--------CG--------A--------A--------A--------C--------TACG-ATGGTGAAAAGTCGAAA
gi|4519                       : GAAA-CTACGATGGTGAAA------A-GC--------CGA--A--------A--------C--------TACGATGGTGAAATGT--------CG--------A--------A--------A--------C--------TA
gi|4520                       : GAAA-CTACGATGGTGAAA------A-GT--------CGA--T--------A--------C--------GACAATCGTGAAAAGT--------CG--------G--------A--------A--------C--------AACG-ATGGTGAAAAGTCGAAA
gi|4521                       : GAAA-CTACGATGGTGAAA------A-GT--------CGA--A--------A--------C--------AACATTGGTGAAAAGT--------CG--------A--------A--------A--------C--------AACG-ATGGTGAAAAATCGAAA
gi|4526                       : GAAA-CTACGATAGTGAAA------A-GT--------CGA--A--------A--------C--------------------AA----------CG--------A--------A--------A--------C--------TACG-ATGGTGAAAAGTCGAAACTA
gi|4527                       : GAAA-CTACGATGGTGAAA------A-GT--------CGA--A--------A--------C--------TACGATGATGAAAAGT--------CG--------A--------A--------A--------C--------TAC
gi|4528                       : GGAA-CTATGATGGTGAAA------A-GT--------CG--------------------------------C-------AAAAAT--------CG--------A--------A--------A--------C--------TACG-AGGGTGAAAAATCGAAAt
gi|4529                       : GAAA-CTACGAGGGTGAAA------A-AT--------CGA--A--------A--------C--------AACGATGATGAAAAGT--------CG--------A--------A--------A--------C--------TA
gi|4534                       : GAAA-CTACGATGGTGAAA------A-GT--------CGA--A--------A--------C--------TACGATGGTGAAAAGT--------TG--------A--------A--------A--------T--------TA
gi|4535                       : GACA-CTATGATGGTGAGA------A-GT--------CGA--A--------A--------C--------------------AA----------CG--------A--------A--------A--------C--------TACG-ATGGTGAAAAGTCGAAACTAttt
gi|4537                       : GAAA-CTACGACGGTGAAA------A-GT--------CGA--A--------A--------C------------------AA------------CG--------A--------A--------A--------C--------AACG-ATGGTGAAAAGACGCAACTA
gi|4538                       : GGAA-CTACGATGGTGAAA------A-GT--------CGA--A--------A--------C--------AACGATGGTGAAAAGT--------CG--------A--------A--------A--------C--------TA
gi|4542                       : GAAA-CTACGATGTTGAAA------A-GT------------------------------------------------TGAAATGT--------CG--------A--------A--------A--------C--------TACG-ATGGCGAAAAGTAGAAA
gi|4543                       : GAAA-CTACGATGATGAAA------A-GT--------CGA--A--------A--------------------------GAA------------CG--------A--------A--------A--------C--------TACG-ATGGTGAACAGTTGAAACTAtcatct
gi|4544                       : GAAA-CTACGATGGTGAAC------A-GT--------TGA--A--------A--------C--------TACGGTGGTGAAAAGT--------TG--------A--------A--------A--------C--------TA
gi|4547                       : GAAA-CTACGACGGTGAAA------A-GT--------CGA--A--------A--------C------------------AA------------CG--------A--------A--------A--------C--------AACG-ATGGTGAAAAGTCGAAA
gi|4548                       : GAAA-CTACGATGGTGAAA------ACGCGAAACAA-CGA--A--------A--------C--------TATGATGGTGAAAAGT--------CG--------A--------A--------A--------tcactt
gi|4549                       : GAAA-CTATGATGGTGAAA------A-GT--------CGA--A--------A--------C--------AACGATGGTGAAAAGT--------CG--------A--------A--------
gi|4550                       : GAAA-CTACGATGGTGAAA------A-GT--------CGA--A--------A--------C--------AATGATGGTGTTAACG--------CG--------A--------A--------A--------T--------TACG-ATGGTGAAAAGTCGAAAgtgattt
gi|4551                       : GAAA-CTACGATGGTGAAA------A-GT--------AGA--A--------A--------C--------TA-GATAGGGAAAACG--------CG--------A--------A--------A--------C--------TACG-ATGGTGAAAAGTCGAAA
gi|4553                       : GAAA-CAACGATGGTGAAA------A-GT--------CGA--A--------A--------C--------TA-----------AGT--------CG--------A--------A--------A--------C--------TACG-ATGGTGAAAAGTCGAAACTA
gi|4560                       : GAAA-ATACGATGCTGAAA------A-GT--------CGA--A--------A--------C------------------AA------------CG--------A--------A--------A--------C--------TACG-ATACTGAAAAGTCGAAATTA
gi|4564                       : GAAA-CTACGATGGTGAAA------A-GT--------CGA--A--------A--------C------------------AA------------CG--------A--------A--------A--------C--------TACG-ATTGTGAAAAGTCGAAAttt
gi|4565                       : GATA-CTACGATGGTGAAA------A-GT--------CGA--A--------A--------C--------TACGATGGTGAAAAGT--------CG--------A--------A--------A--------
gi|4567                       : GAAA-TTACGATGGTGAAA------A-GTAGAAACAACGA--A--------A--------C--------CACGATGGTGAAAAGT--------CG--------A--------A--------A--------
gi|4568                       :                                       GA--A--------A--------C--------TACGACAGTGAAAAGT--------CGAAACAACAA--------A--------A--------C--------TACT-ATGGTGAAAAGTCGAAAtgat
gi|4569                       : GAAA-CTTCGATGGTGAAA------A-GC--------CGA--A--------A--------C--------TAAGATGGTGAAAACT--------CG--------A--------A--------A--------T--------TA
gi|4578                       : GAAA-CTACGATGGTGAAA------A-CG--------CGA--A--------A--------C--------TACGACGGTGAAAAGT--------CG--------A--------A--------A--------C--------TACG-ATGATGAAAAGTCGAAACTAttt
gi|4583                       : GAAA-CTACGATGGTGAAA------A-GT--------CGA--A--------A--------C--------AACGATGGTGAAAAGT--------CG--------A--------A--------A--------C--------TAAG-ATGGTGAAAAATCGAAA
gi|4584                       : GAAA-CTACGATGGTGAAA------A-GT--------CGA--A--------A--------C--------TACGATGGTGAAAAGT--------CG--------A--------A--------A--------C--------TAtcattt
gi|4585                       : GAAA-CTACGATGGTGAAA------A-GT--------CAA--A--------A--------C--------AACGATGGTGAAAAGT--------CG--------C--------A--------A--------C--------TACG-ATGGTGAAAAGTCGAAACTA
gi|4588                       : GAAA-CTACGATGGTGAAA------A-GT--------CGA--A--------A--------C--------TACGATGGTGAAAAGT--------CG--------A--------A--------A--------C--------AACG-ATGATGAAAAGTCGAAACTAt
gi|4589                       : GAAA-CTACGATGGTGAAA------A-GT--------CGA--A--------A--------C--------AACGATGATGAAAAGT--------CG--------A--------A--------A--------C--------TACG-ATGGTTAAAAGTCGAAACTA
gi|4590                       : GAAA-CTACGATGGTGAAA------A-GT--------TGA--A--------A--------C--------AACGATGGTGAAAAGT--------TG--------A--------A--------A--------C--------TA
gi|4591                       : GAAA-CAACGATGGTGAAA------A-GT--------CGA--A--------A--------C--------AACGATGGTGAAAAGT--------TG--------A--------A--------A--------C--------TA
gi|4592                       :                                       GA--A--------A--------C--------AACGATGGTGAAAAGTCAAAACAACG--------A--------A--------A--------C--------AACG-ATGGTGAAAAGTCGAAA
gi|4593                       :                                       GA--A--------A--------C--------AACGATGGTGAAAAGTCAAAACAACG--------A--------A--------A--------C--------AACG-ATGGTGAAAAGTCGAAA
gi|4594                       :                                       GA--A--------A--------C--------AACGATGGTGAAAAGTCAAAACAACG--------A--------A--------A--------C--------AACG-ATGGTGAAAAGTCGAAA
gi|4595                       : GAAA-CTACGATGGTGAAA------A-GT--------TGA--A--------A--------C--------AACGATGGTGAAAAGT--------TG--------A--------A--------A--------C--------TACG-ATGGTGAAAAGTCAAAA
gi|4602                       : GAAA-CTACGATGGTGAAA------A-GT--------CGA--A--------T--------C--------AACGATGGTGAAAAGT--------CG--------A--------A--------A--------C--------TACG-ATGGTGAACAGTCGAAACTA
gi|4603                       : GAAA-CTACGACGGTGAAA------A-GC--------CGA--A--------A--------C---------------------AG---------CG--------A--------A--------A--------C--------GACG-ATGGTGAAAAGTCGAAACTt
gi|4605                       : GAAA-CTACGATAGTGAAA------A-GT--------CGA--A--------A--------C--------------GGTG-AAAGT--------CG--------A--------A--------A--------C--------TACGAATAGTGAAAAGACGAAATTAgt
gi|4606                       : GAAA-CTGCGATGATGAAA------A-GT--------CGA--A--------A--------T-------------------AAAGT--------CG--------A--------A--------A--------T--------TACG-ACAGTGAAAAGACGAAAttt
gi|4608                       : GAAA-CTACGATGGTGAAA------A-GT--------CGA--A--------A--------C------------------AA------------CG--------A--------A--------A--------C--------AACG-ATGGTGAAAAATCAAAACTAtaattt
gi|4610                       : GGAA-CTACGATGGTGAAA------G-GT--------CGA--A--------A----------------------------AAA----------CG--------A--------A--------A--------C--------TACG-AATGTGAAAAGTCGAAA
gi|4613                       : GAAA-CTGCGCTGGTAAAA------A-GT--------CGA--A--------A--------C------------------AA------------CG--------A--------A--------A--------C--------TACG-ATGGGTAAAAGTCGAAATTA
gi|4616                       : GAAA-CTACGATGGTGAAA------A-GT--------CGA--A--------A--------C--------AATGATGGTGAAAACG--------CG--------A--------A--------A--------C--------TACG-ATGATGAAAAGTCGAAAttt
gi|4617                       :                                       GA--A--------A--------C--------TTCGATGGTGAAAAGT--------CG--------A--------A--------ACAACGAAGC--------AACG-ATGGTGAAAAATCGAAACTA
gi|4619                       : GAAA-CTACGATGGTGAAA------A--T--------CGA--A--------A--------C--------TACGATGATGAAAAGT--------CG--------A--------A--------A--------G--------TAt
gi|4627                       : GAAA-CTACGATGGTGTAA------A-GC--------CGA--A--------A--------C------------------AA------------CG--------A--------A--------A--------C--------AACG-ACTGTGAAAAGTCGAAATTA
gi|4632                       :                                       GA--A--------A--------C--------TACGATGATGAAAAGT--------CG--------A--------A--------A--------CAACGAAATTACG-ATAGTGAAAAGTCGAAAttt
gi|4633                       :                                       GA--A--------A--------T--------TACGATGATGAAAAGT--------CG--------AAACAACGCA--------A--------C--------TACG-ATGATGAAAAATCGA
gi|4634                       : GAAA-TTACGATAGTGAAA------A-GT--------CGA--A--------A--------CAACAAAATTACGATGATG-AAAGT--------CG--------A--------A--------A--------
gi|4635                       : GAAA-CTACGATGGTGTAA------A-GTAGAAACAACGA--A--------A--------C--------AACGATGGTGAAAAGT--------CG--------A--------A--------A--------C--------TA
gi|4640                       : GAAA-CTACGATGGTGAAA------A-GT--------CGA--A--------T--------C--------AACGATGGTGAAAAGT--------CG--------A--------A--------A--------C--------TACG-ATGGTGAACAGTCGAAACTA
gi|4641                       : GAAA-CTATGATGGTGAAA------A-GT--------TAA--A--------A--------C--------AATGATGGTGAAAAGT--------CA--------A--------A--------A--------C--------TATG-ATGCTGAAAAGTCGAAATTA
gi|4642                       : GAAA-CTACGATGGTGAAA------A-AT--------CGA--A--------A--------C--------TACGATGATGAAAAGT--------CG--------T--------A--------A--------C--------TActt
gi|4643                       : GAAA-ATACGATGGTGAAA------A-GT--------CGT--A--------T--------C--------TACGATAGTGAAAAGT--------CG--------A--------A--------A--------C--------TACG-ATGGTGAAAAATCGAAACTA
gi|4644                       : GAAA-CTACGATGATGAAA------A-GT--------CGT--A--------A--------C--------TACGATGGTGAAAAAT--------CG--------A--------A--------A--------C--------TACT-ATAGTGAAAAGTCGAAACTA
gi|4646                       : GAAA-CTACGATGGTGAAA------A-GT--------CGC--A--------A--------C--------TATGATGGTGAAAAGT--------CG--------A--------A--------A--------
gi|4648                       : GAAA-CTACGATGGTGAAAGTCGAAA-GT--------CGA--A--------A--------C--------CACGATGGTG-AAAGT--------CG--------A--------A--------A--------tgattt
gi|4663                       : GAAA-CTACAATAGTGAAA------A-GT--------CGA--A--------A--------C------------------AA------------CG--------A--------A--------A--------C--------TACG-ATGGTAAAAAATCGAAAtca
gi|4664                       : GAAA-CTACGATGGTAAAA------A-AT--------CGA--A--------A--------C--------AACGATGGTGAAAATT--------TG--------A--------A--------A--------T--------TA
gi|4665                       : GAAA-CTACGATGGTGAAAGTCAAAA-GT--------CGA--A--------A--------C--------CACGATGGTG-AAAGT--------CA--------A--------A--------A--------ttt
gi|4680                       : GACA-CTACCATGGTAGAA------A-GT--------CAA--A--------A--------C--------TACGA--------------------------------------A--------A--------C--------TATG-ATGATGAAAAGTCGAAAtcat
gi|4684                       : GAAA-CTACAATGGTGAAA------A-GT--------CGA--A--------A--------C------------------AA------------CG--------A--------A--------A--------C--------AACG-ATAGTGAAAAGTAG-AACTAtcattt
gi|4687                       : GAAA-CTACCATGGTGAAA------A-GT--------CGA--A--------A--------C--------AACGATGGTGAAAAGT--------CG--------A--------A--------A--------T--------TAattt
gi|4690                       : GAAA-CCACGATGGTGAAA--------GT--------CGA--A--------A--------C--------TATGATGATGAAA-GT--------CG--------A--------A--------A--------C--------TACG-ATGATGAAAAGTCGAAAGTA
gi|4695                       : GAAA-CTACGATGGTGAAA------A-GT--------CGA--A--------A--------C--------TACGATGGTGAAAGTC--------CG--------A--------G--------A--------
gi|4696                       : GAAA-CTACGATAGTGAAA------A-TG--------CGA--A--------A--------A--------TACGATGAT--AAAGT--------CG--------A--------A--------A--------C--------TACG-ATGGTGAAAAGTCGAAACTAtcattt
gi|4699                       : GAAA-CTACGATGGTGAAA------A-GT--------CGA--A--------A--------C------------------AA------------CG--------A--------A--------A--------C--------AACG-ATGGTGAAAGCGCGAAACTA
gi|4703                       :                                       GA--A--------A--------T--------TACGATGGTGAAAAGT--------CGAAACAACAA--------A--------A--------C--------TACG-ATGGTTAAAAGTC
gi|4704                       : GAAA-CTACGATGTTGAAT------A-GC--------CGA--A--------A--------CAACGAAATTACGATGGTGAAAAGT--------CG--------A--------A--------A--------
gi|4764                       :  AAA-CAACGATGGTGAAA------A-GT--------CGA--A--------A--------C--------AACGCTGGTGAAAAAT--------CG--------A--------A--------A--------C--------TACG-ATAGTGAAAAGTTGAAA
gi|4766                       :  AAA-CTACGATGGCGAAA------A-GT--------CGA--A--------A--------T--------TACGATGGTGAAAAGT--------CG--------A--------A--------A--------C--------TACG-ATGGTGAAAAGTCGAt
gi|4768                       :  AAA-CTACGGTGGTGAAA------A-GT--------CGA--A--------A--------C--------TACAATGGCGAAAAGT--------CG--------A--------A--------A--------C--------AACG-ATGGTGAAAAGTCGAAA
gi|4769                       :  AAA-CTATGATGGTGAAA------A-GT--------CGA--A--------A------------------------------AGT--------CG--------A--------A--------A--------C--------TACG-ATGGTGAAAAGTtaattt
gi|4774                       :  AAATCTACGATGGTAAAA------G-GT--------CGA--A--------A--------C--------------------AA----------CG--------A--------A--------A--------C--------TACG-ATGGTGAAAAGTCGAAACTA
gi|4775                       :  AAA-TTACGATGATGAAA--------GT--------CGA--A--------A--------CAACGAAATTACGATGATGAAAAGT--------CG--------A--------A--------A--------
gi|4777                       :  AAA-CTATGATGGTGAAA------A-GT--------TGA--A--------A--------T--------TACTATGGTAAAAATC--------CG--------A--------A--------A--------C--------TATG-ATGGCGAAAAGTCGAAATTA
gi|4778                       :  AAA-CTACAATGGTGAAT------A-GT--------CGA--A--------A--------C---------------------AG---------CG--------A--------A--------A--------C--------TATG-ATGGTGAAAAGTCGCAAt
gi|4781                       :                                        A--A--------A--------C--------TACGATGATGAAAAGC--------CG--------A--------AACAACGACA--------C--------TACG-ATGGTGAAAAGTTGAAAtattt
gi|4791                       :   AA-CTACGATGGTGAAA------A-GT--------CGA--A--------A--------C------------------AA------------CG--------A--------A--------A--------C--------AACG-ATGGTGAAAAGTCGAAAagttgttt
gi|4795                       :   AA-CTACGATAGAGAAA------A-GT--------CGT--A--------A--------C--------TACGATGATGAAAAAT--------CG--------A--------A--------A--------C--------TACG-ATGATGAAAAGTAGAAACTAtaattt