lowQualScore : 11111 00 0 0 44 1 00 0 00 0 0 0000 00 6
lowQualScore : ..... .. . . .. . .. . .. . . .... .. .
lowQualScore : 44444 66 4 4 88 6 66 8 66 4 8 9999 66 1
consensus : AAAATC-----CTCCCG--CCC-TCCC-C-GTTTT-TAAG--AAAA-A--T-TT-GGATGA----TAATCTAGCAA--TTAATTTATAAT
Reference ( gi|44883 ) : AAAATC-----CTCCCG--CCC-TCCC-C-ATTTT-TAAG--AAAA-A--T-TT-GGATGA----TAATCTAGCAA--TTAATTTGTAAT
gi|44879 : AAAATC-----CTCCCG--CCC-TCCC-C-TTTTT-TAAG--AAAA-A--T-TT-GGATGA----TAATCTAGCAA--TTAATTTATAAT
gi|44908 : AAAATC-----CTCCCG--CCC-TTCC-C-ATTTT-TAAG--AAAA-A--T-TT-GGATGA----TAATCTAGCAA--TTAATTTATA
gi|44880 : AAAATC-----CTCCCT--CCC-TCCC-C-GTTTT-TAAG--AAAA-A--T-TT-GGATGA----TAATCTAGCAA--TTAATTTATAAT
gi|44881 : AAAATC-----CTCCTG--CCC-TCCC-C-ATTTT-TAAG--AAAA-A--T-TT-GGATGA----TAATCTAGCAA--TTAATTTAAAAT
gi|44886 : AAAATC-----CTCCCA--CCC-TTCC-C-GTTTT-TAAG--AAAA-A--T-TT-GGATGA----TAATCTAGCAA--TTAATTTATAAT
gi|44885 : AAAATC-----CTCCCG--CCC-TCCC-T-GTTTT-TAAG--AAAA-A--T-TT-GGATGA----TAATCTAGTAA--TTAATTTATAAT
gi|44884 : AAAATC-----CTCCCA--TCC-TCCC-C-GTTTT-TAAG--AAAA-A--T-TT-GGATGA----TAATCTAGCAA--TTAATTTATAAT
gi|44873 : AAAATC-----CTCCTG--CCC-TTCC-C-GTTTT-TAAG--AAAA-A--T-TT-GGATGA----TAATCTAGCAA--TTAATTTATAAT
gi|44920 : AAAATC-----CTCCCG--CCC-TCCC-CCATTTT-TAAG--AAAA-A--T-TT-GGATGA----TAATCTAGCAA--TTAATTTAGAAT
gi|44926 : AAATTC-----CTCCCG--CCC-TCCC-C-ATTTT-TAAG--AAAA-A--T-TT-GGATGA----TAATCTAGCAA--TAAATTTATAAT
gi|44872 : AAAATC-----CTTCCG--CCC-TCAC-C-GTTTT-TAAG--AAAA-A--T-TT-GGATGA----TAATCTAGCAA--TTAATTTATAAT
gi|44902 : AAAATC-----CTCCCA--TCA-TCCC-C-ATTTT-TAAG--AAAA-A--T-TT-GGATGA----TAATCTAGCAA--TTAATTTATAAT
gi|44903 : AAAATC-----CTCCCG--CTC-TCCC-C-GTTTT-TAAG--AAAA-A--T-TT-GGATGA----AAATCTAGCAA--TTAATTTATAAT
gi|44900 : AAAATC-----CTCCCG--TCC-TCCC-C-GTTTT-TAAG--AAAA-A--T-TT-GGTTGA----TAATCTAGCAA--TTAATTTATAAT
gi|44931 : AAAATC-----CTCCCG--CTC-TCCC-C-ATTTT-TAAG--AAAA-A--T-TT-GAATGA----TATTCTAGCAA--TTAATTTATAAT
gi|44876 : AAAATC-----CTCCTG--CCC-TCCC-T-GTTTT-TAAG--AAAA-A--T-TT-GAATGA----TAATCTAGCAA--TTAATTTATAAT
gi|44875 : AAAATC-----TTCCTG--TCC-TCCC-C-GTTTT-TAAG--AAAA-A--T-TT-GGATGA----TAATCTAGCAA--TTAATTTATAAT
gi|44936 : AAAATC-----CTCCCG--TCC-TCCC-C-ATTTT-TAAG--AAAA-A--T-GT-GGATGA----TAATCTAGAAA--TTAATTTATAAT
gi|44912 : AAAATC-----CTCCAG--CCC-TCCC-C-CTTTT-TAAG--AAAA-A--T-TT-GAATGA----TAATCTAGCAA--TTAATTTATAAT
gi|44887 : AAAATA-----CTCCCG--CCC-TCTC-C-ATTTTTTAAG--AAAA-A--T-TT-GGATGA----TAATCTAGCAA--TTAATTTATAAT
gi|44911 : AAAATC-----CTCCCG--CCC-TCCC-C-GTTTT-TAAG--ATTA-A--T-TT-GGATGA----TAATCTAGCAA--TTAATTTATAAT
gi|44871 : AAAATC-----CTCCTG--CCC-TCAC-C-TTTTT-TAAG--AAAA-A--T-TT-GGATGA----TAATCTAGCAA--TTAATTTATAAT
gi|44914 : AAAATC-----CTCCCA--CCC-TCCC-C-GTTTT-TAAG--AAAA-A--T-TT-GGATGATAATTAATCTAGCAA--TTAATTTATAAT
gi|44913 : AAAATC-----CTCCCG--CCC-TCCC-T-GTTTT-TAAG--AAAA-A--T-TT-TGATGA----TAATCTAGCAA--TTAATCTATAAT
gi|44888 : AAAACT-----CTCCCG--CAC-TCCC-C-ATTTT-TAAG--AAAA-A--T-TT-AGATGA----TAATCTAGCAA--TTAATTTATAAT
gi|44907 : AAAATC-----CTCCCG--CCC-TTTC-C-GTTTT-AAAG--AAAA-A--T-TT-GGATGA----TAATCTAGCAA--TTAATTTATAAT
gi|44934 : AAAATC-----CTCCCC--CAC-TCCC-C-CTTTT-TAAG--AAAA-A--T-TT-GGATGA----TAATCTAGCAA--TTAATTTATAAT
gi|44948 : AAAATC-----CTCCCG--CCT-TCCT-C-ATTTT-TAAG--AAAA----T-TT-GGATGA----TAATCTAGCAA--TTGATTTATAAT
gi|44956 : AAAATC-----CTGCCG--CCC-TCCC-C-ATTTT-TAAA--AAAA-A--T-TT-GGATGA----TAATGCAGCAA--TTAATTTATAAT
gi|44958 : AAAATC-----CTCCCA--CCC-TCCC-C-ATTTT-TAAG--AAAA-A--A-TT-TGATGA----TAATCTAGCAA--TTAATTTACAAT
gi|44924 : AAAATC-----CTCCCG--CCG-TCCC-C-GTTTT-TAAG--AAAA-A--T-TT-GGATGA----TAATCTAGTTA--TTAATTTATAAT
gi|44923 : AAAATC-----CTCCCG--CCC-TCCC-C-GTTTT-TAAG--AAAA-A--A-TT-GGATGA----TAATTTAGGAA--TTAATTTATAAT
gi|44922 : AAAATC-----CTCCCG--CCC-TCCC-T-GTTTT-TAAG--AAAA-A--AATT-GGATGA----TAATCTAGCAA--TTAATTTATAAT
gi|44890 : AAAAAC-----CTCCTG--CCC-ACCC-C-GTTTT-TAAG--AAAA-A--T-TT-GGATGA----TAATCTAGCAA--TTAATTTATAAT
gi|44893 : AAAATC-----CTCCTG--CCC-TCCC-T-GTTTT-TAAG--AACA-A--T-TT-GGATGA----TAACCTAGCAA--TTAATTTATAAT
gi|44929 : AAAATT-----CTTCCG--CCG-TCCC-C-GTTTT-CAAG--AAAA-A--T-TT-GGATGA----TAATCTAGCAA--TTAATTTATAAT
gi|44899 : AAAATC-----CTCCTG--CCT-TCCC-T-GTTTT-TAAG--AAAAAA--T-TT-GGATGA----TAATCTAGCAA--TTAATTTATAAT
gi|44930 : AAAATC-----CTCTCG--CCC-TCCC-T-GTTTT-TAAG--AAAA-A--A-TT-GGATGA----TAATCTAGTAA--TTAATTTATAAT
gi|44906 : AAAATC-----CTCCTG--CTC-TCCC-T-GTTTT-TAAG--AAAT-A--T-TT-GGATGA----TAATCTAGCAA--TTAATTTATAAT
gi|44904 : AAAATC-----CTCCTG--CTC-TCCC-T-GTTTT-TAAG--AAAT-A--T-TT-GGATGA----TAATCTAGCAA--TTAATTTATAAT
gi|44965 : AAAATC-----CTCCCA--CCC-TCCC-C-ATTTT-TAAGTTAAAA-A-----T-GGATGA----TAATCTAGCAA--TTAATTTATAAT
gi|44933 : AAAATC-----CTCCCG--CCC-TCCC-C-GTTTT-TAAC--AAAA-A--T-TG-GGATGA----TAATCTAGCAA--TTAAATTATAAT
gi|44909 : AAAATT-----CTCCTG--CCC-TCCC-T-GTTTT-TAAG--AAAA-A--T-TT-AGATGA----TAATCTAGCAA--TTAACTTATAAT
gi|44935 : AAAATC-----CTCCCA--CTT-TCCC-C-GTTTT-TAAG--AAAA-A--T-TTTGGATGA----TAATCTAGCAA--TTAATTTATAA
gi|44895 : AAAATC-----T---CG--CCC-TCCC-C-GTTTT-TAAG--AAAA-A--T-TT-GGATGA----TAATCTAGCAA--TTAATTTATAAT
gi|44957 : AAAATC-----CTCCCG--CCC-TTCC-C-GTTTT-TAAG--AAAC-A--T-TT-GGATGA----T-ATCTAGCAA--TTAATTTTTAAT
gi|44925 : AAAATC-----CTCCAG--CCC-TCCC-T-GTTTT-TAAG--AAAA-A--T-TT-CGATGG----TAATCTAGCAA--TTAATTTATAAT
gi|44968 : AAAATC-----CTCCCT--CCCATCCC-C--TTTT-TAAG--AAAA-G--T-TT-GGATGA----TAATCTAGCAA--TTAATTTATAAT
gi|44939 : AAAATC-----TTCCCG--CCC-TCCC-A-GTTTT-TAAG--AAAA-A--T-TT-GGATGA----AAATCTAGCAA--TTAGTTTATAAT
gi|44938 : AAAATC-----CTCTCG--GCC-TCCC-C-GTTTT-TAAG--AAAA-A--T-TT-GGATGA----TAATCTAGCAA--TTAATACATAAT
gi|44937 : AAAGTC-----CTCCCG--CCC-TCCC-T-GTTTTTTAAG--AAAA-T--T-TT-GGATGA----TAATCTAGCAA--TTAATTTATAAT
gi|44961 : AAAATC-----CTCCCG--CCC-TCTC-T-ATTTT-TAAG--AAAA-A--T-TT-GGATGA----TAATCTAAGAA--TTAATTTAAAAT
gi|44962 : AAAATCTTCCTCCCCCC--CCC-TCCC-C-ATTTT-TAAG--GAAA-A--T-TT-GGATGA----TAATCTAGCAA--TTAATTTATAAT
gi|44917 : AAAATC-----CTCCTG--CAC-TCCC-T-GTTTT-TAAG--AAAA-A--T-TT-GGATGA----TAATCTAGCAA--TTAATTT
gi|44905 : AAAATC-----CTCCTG--CCC-GTTC-T-GTTTT-TAAG--AAAA-A--T-TT-GGATGA----TAATCTAGCAA--TTAATTTATAATaaat
gi|44918 : AAAATC-----CTACTG--CCC-TCCC-A-GTTTT-TAAG--AAAA-A--T-TT-GGATTA----TAATCTAGCAA--TTAATTTATAAT
gi|44946 : AAAATC-----CTCCCA--CCC-TCCC-C-GTTTTTTAAG--AAAA-A--T-TT-GGATGA----TAATCTAGGAT--TTAATTTATAAT
gi|44950 : AAAATC-----CTCTCG--TCT-TCCC-A-GTTTT-TAAG--AAAA-A--T-TT-GGATGA----TAACCTAGCAA--TTAATTTATAA
gi|44954 : AAAATC-----CTTGTG--CCC-TCCC-C-ATTGT-TAAG--AAGA-A--T-TT-GGATGA----TAATCTAGCAA--TTAATTTATAGT
gi|44951 : AAAATC-----CTACCA--CCC-TCCA-C-GTTTT-TAAG--AAAA-A--T-CT-GGATGA----TAATCTAGCAA--CTAATTTATAAT
gi|44896 : AAAATTG----CTCCCG--CCC-TCCC-A-GTTTT-TAAG--AAAA-G--T-TT-GGATGA----TAACCTAGCAA--TTAATTTATAAT
gi|44955 : AAAACC-----CTCCCA--CCC-TCCC-T-GTTTT-TAAG--AAAA-A--T-TT-GGATGA----TAATCTAGCAA--TTACTATATAAT
gi|44959 : AAAGTC-----TTCCCA--CCC-TCCC-C-GTTTT-TAAG--AAAA-A--A-TT-GGATGA----TAATCTAGCAA--TTTATTTATAAT
gi|44953 : AAAATC-----CTTTCG--CCC-TACT-C-GTTTT-TAAG--AAAT-A--T-TT-GGATGA----TAATCTAGCAA--TTAATTTATAAT
gi|44901 : AAAATC-----CTCCTG--CCC-TCCTGT-TTTTT-TGAG--AAAA-A--T-TT-GGATGA----TAATCTAGCAA--TTAATTTATAAT
gi|44960 : AAAATC-----CTCCCG--CCC-TCCC-T-GTTTT-TAAG--AAAA-A--A-TT-GGATAA----AAATCTAGTAA--TTAATTTATAAT
gi|44940 : AAAATC-----CTCCCAAATCC-TCAC-C-ATTTT-TAAG--AAAA-A--T-TT-GGATGA----TAATCTAGCAATTTTAATTTATAAT
gi|44928 : AAAATC-----CTCCTG--CTC-TCCC-T-GTTTT-TAAG--AAAA-C--G-TT-GGATGA----TAATCTAGCAA--TTAATTTATAA
gi|44964 : AAAATC-----C-CCCG--CCC-TCCC-T-GTTTT-TAAG--AAAA-G--T-TT-GGATGA----TAATCCAGCAA--TTAATTTAAAAT
gi|44963 : AAAATC-----CTTCCA--CCC-TCCC-C-GTTTT-TAAG--AAAA----T-TT-GGATGA----TAATCTAGCAA--TCAATTTATTAT
gi|44915 : AAAATC-----CTTCCG--CCC---AC-C-GTTTT-TAAG--AAAA-A--T-TT-AGATGA----TAATCTAGCAA--TTAATTTATAAT
gi|44966 : AAAATC-----TTCCCA--CCC-TCCC-T-GTTTT--AAG--AAAA-A--T-TT-GGATGA----TAATCTTGCAA--TTAATTTATAAT
gi|44894 : AAAATC-----CTCCTG--CCC-TCAT-C-CTTTT-TAAG--AAAA-A--T-TT-GTATGA----TAATCTGGCAA--TTAATTTATAAT
gi|44919 : AAAATC-----CTCCTG--CCC-TCTC-C-GTTTT-TAAG--AAAA-C--A-TT-GGAAGA----TAATCTAGCAA--TTAATTTATAAT
gi|44949 : AAAATT-----CTCTTG--CCC-TCCC-C-CTTTT-TAAG--TAAA-A--A-TT-GGATGA----TAATCTAGCAA--TTAATTTATAAT
gi|44971 : AAAATC-----CTCCCG--CTC-TCCC-C-GTTTT-TAAG--AAAA-AATT-TT-TTATGA----TAATCTAGCAA--TCAATTTATAAT
gi|44882 : AAAATA-----CTTCCA--CTC-TCCC-C-GTTTT-TAAG--AAAA-A--T-TT-GGATGG----TAATCTAGAAA--TTAATTTATAAT
gi|44942 : AAGATC-----CTCCTG--CCC-TCCT-C-GTTTT-TAAG--AAAA-A--T-TT-GGATGA----TAAATTAGCAA--TTTATTTATAAT
gi|44944 : AAAATC-----TTCCTG--CCC-TCCC-C-GTTTT-AAAG--AAAA-A--T-TT-AAAAGA----TAATCTAGCAA--TTAATTTATAAT
gi|44945 : AAAATC-----CTCCTG--CCC-TCCT-C-GTATT-TAAG--AAAA-A--A-TT-GGATAA----TAATCTAGCAA--TTAATTTATGA
gi|44947 : AAAATC-----CTCCTG--CCC-TCCA-T-GTTTT-TAAG--AAAA-A--A-TT-GGATGA----TATTCTAGCAA--TTAATTCATAAT
gi|44972 : AAAATC-----CTCCCA--CCC-TCTC-C-GTTTT-TAAA--ATAA-A--A-TT-GGATGA----TAATCTAGCAA--TTTATTTATAAT
gi|44970 : AAGATA-----CTCCCG--CTC-TCC----GTTTT-TAAG--AAAA-A--T-TT-GGATGA----TAATCAAGCAA--TTAATTTATAAT
gi|44877 : AGAATC-----CTCCTT--CTC-TCCC-A-GTTTT-TAA---AAAA-A--T-TT-GGATGA----TAATCTAGCAA--TTAATTTATAAT
gi|44967 : AAAATA-----CTCCCG--CCC-TCAC-C-CTCTT-TTAG--AAAA-A--T-TTTGGGTGA----TAATCTAGCAA--TTAATTTATAAT
gi|45101 : AAATC-----CTCCCA--CCC-TCCC-C-GTTTT-TAAG--AAAA-A--T-TT-GGATGA----TAATCTAACAA--TTAATTTATAAT
gi|45100 : AAATC-----CTCCCA--CTC-TCCC-C-GTTTT-TAAG--AAAA-A--T-TT-GGATGA----TAATCTAGCAA--TTAATTTATAAT
gi|45104 : AAATC-----CTCCCG--CCC-TCCC-C-GTTTT-TAAG--AAAA-A--T-TT-GAATGT----TAATCTAGCAA--TTAATTTATAAT
gi|45102 : AAATC-----CTCCTG--CTC-TCCC-C-GTTTT-TAAG--AAAA-A--T-TT-GGATGA----TAATCTAACAG--TTAATTTATAAT
gi|45107 : AAATC-----CTCCCA--CCC-TCCC-C-GTTTT-TAAG--AAAA-A--A-AT-GGATGA----TAATCTAGCAA--TTAATTTATAAT
gi|45105 : AAATC-----CTCCTG--CCC-TCCC-T-GTTTT-TAAG--AAAA-A--T-TT-GGATGA----TAATCTAGCAA--TTAATT
gi|45109 : AAATC-----CTCTCG--CCC-TCCC-C-GTTTTTTAAG--AAAA-A--T-TT-GAACGA----TAATCTAGCAA--TTAATTTATAATgaaaat
gi|45106 : AAATC-----CTCATG--CAC-TCCC-C-GTTTT-TAAG--AAAA-A--T-TT-GGATGA----TAATCTAGCAA--TTAATTTAAAAT
gi|45111 : AAACT-----CTACCG--CCC-TCCC-T-GTTTT-TAAG--AAAA-A--T-TT-GGATGA----TAAACTAGCAA--TTAATTTATAAT
gi|45112 : AAATC-----CTTCTT--CCC-TCCC-C-GTTTT-TAAG--AAAA-A--T-TT-GGATGA----TAATCTAGTAA--TTA
gi|45127 : AATC-----CTCCCG--CTT-TCCC---GTTTT-TAAG--AAAA-A--T-TT-GGATGA----TAATCTAGCAA--TTAATTTATAAT
gi|45137 : TC-----CTCCCG--CCC-TCCC-A-GTTTT-TAAG--AAAAAA--T-TT-GGATGA----TAATCTAGCAA--TTAATTTATAAT
gi|45143 : C-----CTCCTG--CCC-TCCC-C-ATTTT-TAAG--AAAA-A--T-TT-GGATGA----TAATCTAGCAA--TTAATTTATAAT
gi|45154 : CCTG--CCC-TCCC-C-GTTTT-TAAG--AAAA-A--T-TT-GGATGA----TAATCTAGCAA--TTAATTTATAA
Alignments
lowQualScore : 11111 00 0 0 1 00 00 0 00 0 0 0000 00
lowQualScore : ..... .. . . . .. .. . .. . . .... ..
lowQualScore : 44444 66 4 4 6 66 66 8 55 4 8 8888 55
consensus : AAAATC-----CTCCCG--CCC-TCCCC-GTTTT-T--AAG--AAAA-A--T-TT-GGATGA----TAATCTAGCAA--TTAATTTATAAT
Reference ( family-138 ) : AAAATC-----CTCCCG--CCC-TCCCC-GTTTT-T--AAG--AAAA-A--T-TT-GGATGA----TAATCTAGCAA--TTAATTTATAAT
gi|44871 : AAAATC-----CTCCTG--CCC-TCACC-TTTTT-T--AAG--AAAA-A--T-TT-GGATGA----TAATCTAGCAA--TTAATTTATAAT
gi|44872 : AAAATC-----CTTCCG--CCC-TCACC-GTTTT-T--AAG--AAAA-A--T-TT-GGATGA----TAATCTAGCAA--TTAATTTATAAT
gi|44873 : AAAATC-----CTCCTG--CCC-TTCCC-GTTTT-T--AAG--AAAA-A--T-TT-GGATGA----TAATCTAGCAA--TTAATTTATAAT
gi|44875 : AAAATC-----TTCCTG--TCC-TCCCC-GTTTT-T--AAG--AAAA-A--T-TT-GGATGA----TAATCTAGCAA--TTAATTTATAAT
gi|44876 : AAAATC-----CTCCTG--CCC-TCCCT-GTTTT-T--AAG--AAAA-A--T-TT-GAATGA----TAATCTAGCAA--TTAATTTATAAT
gi|44877 : AGAATC-----CTCCTT--CTC-TCCCA-GTTTT-T--AA---AAAA-A--T-TT-GGATGA----TAATCTAGCAA--TTAATTTATAAT
gi|44879 : AAAATC-----CTCCCG--CCC-TCCCC-TTTTT-T--AAG--AAAA-A--T-TT-GGATGA----TAATCTAGCAA--TTAATTTATAAT
gi|44880 : AAAATC-----CTCCCT--CCC-TCCCC-GTTTT-T--AAG--AAAA-A--T-TT-GGATGA----TAATCTAGCAA--TTAATTTATAAT
gi|44881 : AAAATC-----CTCCTG--CCC-TCCCC-ATTTT-T--AAG--AAAA-A--T-TT-GGATGA----TAATCTAGCAA--TTAATTTAAAAT
gi|44882 : AAAATA-----CTTCCA--CTC-TCCCC-GTTTT-T--AAG--AAAA-A--T-TT-GGATGG----TAATCTAGAAA--TTAATTTATAAT
gi|44883 : AAAATC-----CTCCCG--CCC-TCCCC-ATTTT-T--AAG--AAAA-A--T-TT-GGATGA----TAATCTAGCAA--TTAATTTGTAAT
gi|44884 : AAAATC-----CTCCCA--TCC-TCCCC-GTTTT-T--AAG--AAAA-A--T-TT-GGATGA----TAATCTAGCAA--TTAATTTATAAT
gi|44885 : AAAATC-----CTCCCG--CCC-TCCCT-GTTTT-T--AAG--AAAA-A--T-TT-GGATGA----TAATCTAGTAA--TTAATTTATAAT
gi|44886 : AAAATC-----CTCCCA--CCC-TTCCC-GTTTT-T--AAG--AAAA-A--T-TT-GGATGA----TAATCTAGCAA--TTAATTTATAAT
gi|44887 : AAAATA-----CTCCCG--CCC-TCTCC-ATTTTTT--AAG--AAAA-A--T-TT-GGATGA----TAATCTAGCAA--TTAATTTATAAT
gi|44888 : AAAACT-----CTCCCG--CAC-TCCCC-ATTTT-T--AAG--AAAA-A--T-TT-AGATGA----TAATCTAGCAA--TTAATTTATAAT
gi|44890 : AAAAAC-----CTCCTG--CCC-ACCCC-GTTTT-T--AAG--AAAA-A--T-TT-GGATGA----TAATCTAGCAA--TTAATTTATAAT
gi|44893 : AAAATC-----CTCCTG--CCC-TCCCT-GTTTT-T--AAG--AACA-A--T-TT-GGATGA----TAACCTAGCAA--TTAATTTATAAT
gi|44894 : AAAATC-----CTCCTG--CCC-TCATC-CTTTT-T--AAG--AAAA-A--T-TT-GTATGA----TAATCTGGCAA--TTAATTTATAAT
gi|44895 : AAAATC-----T---CG--CCC-TCCCC-GTTTT-T--AAG--AAAA-A--T-TT-GGATGA----TAATCTAGCAA--TTAATTTATAAT
gi|44896 : AAAATTG----CTCCCG--CCC-TCCCA-GTTTT-T--AAG--AAAA-G--T-TT-GGATGA----TAACCTAGCAA--TTAATTTATAAT
gi|44899 : AAAATC-----CTCCTG--CCT-TCCCT-GTTTT-T--AAG--AAAAAA--T-TT-GGATGA----TAATCTAGCAA--TTAATTTATAAT
gi|44900 : AAAATC-----CTCCCG--TCC-TCCCC-GTTTT-T--AAG--AAAA-A--T-TT-GGTTGA----TAATCTAGCAA--TTAATTTATAAT
gi|44901 : AAAATC-----CTCCTG--CCC-TCCT--GTTTT-TTTGAG--AAAA-A--T-TT-GGATGA----TAATCTAGCAA--TTAATTTATAAT
gi|44902 : AAAATC-----CTCCCA--TCA-TCCCC-ATTTT-T--AAG--AAAA-A--T-TT-GGATGA----TAATCTAGCAA--TTAATTTATAAT
gi|44903 : AAAATC-----CTCCCG--CTC-TCCCC-GTTTT-T--AAG--AAAA-A--T-TT-GGATGA----AAATCTAGCAA--TTAATTTATAAT
gi|44904 : AAAATC-----CTCCTG--CTC-TCCCT-GTTTT-T--AAG--AAAT-A--T-TT-GGATGA----TAATCTAGCAA--TTAATTTATAAT
gi|44905 : AAAATC-----CTCCTG--CCC-GTTCT-GTTTT-T--AAG--AAAA-A--T-TT-GGATGA----TAATCTAGCAA--TTAATTTATAAT
gi|44906 : AAAATC-----CTCCTG--CTC-TCCCT-GTTTT-T--AAG--AAAT-A--T-TT-GGATGA----TAATCTAGCAA--TTAATTTATAAT
gi|44907 : AAAATC-----CTCCCG--CCC-TTTCC-GTTTT-A--AAG--AAAA-A--T-TT-GGATGA----TAATCTAGCAA--TTAATTTATAAT
gi|44908 : AAAATC-----CTCCCG--CCC-TTCCC-ATTTT-T--AAG--AAAA-A--T-TT-GGATGA----TAATCTAGCAA--TTAATTTATA
gi|44909 : AAAATT-----CTCCTG--CCC-TCCCT-GTTTT-T--AAG--AAAA-A--T-TT-AGATGA----TAATCTAGCAA--TTAACTTATAAT
gi|44911 : AAAATC-----CTCCCG--CCC-TCCCC-GTTTT-T--AAG--ATTA-A--T-TT-GGATGA----TAATCTAGCAA--TTAATTTATAAT
gi|44912 : AAAATC-----CTCCAG--CCC-TCCCC-CTTTT-T--AAG--AAAA-A--T-TT-GAATGA----TAATCTAGCAA--TTAATTTATAAT
gi|44913 : AAAATC-----CTCCCG--CCC-TCCCT-GTTTT-T--AAG--AAAA-A--T-TT-TGATGA----TAATCTAGCAA--TTAATCTATAAT
gi|44914 : AAAATC-----CTCCCA--CCC-TCCCC-GTTTT-T--AAG--AAAA-A--T-TT-GGATGATAATTAATCTAGCAA--TTAATTTATAAT
gi|44915 : AAAATC-----CTTCCG--CCC---ACC-GTTTT-T--AAG--AAAA-A--T-TT-AGATGA----TAATCTAGCAA--TTAATTTATAAT
gi|44917 : AAAATC-----CTCCTG--CAC-TCCCT-GTTTT-T--AAG--AAAA-A--T-TT-GGATGA----TAATCTAGCAA--TTAATTTA-AAT
gi|44918 : AAAATC-----CTACTG--CCC-TCCCA-GTTTT-T--AAG--AAAA-A--T-TT-GGATTA----TAATCTAGCAA--TTAATTTATAAT
gi|44919 : AAAATC-----CTCCTG--CCC-TCTCC-GTTTT-T--AAG--AAAA-C--A-TT-GGAAGA----TAATCTAGCAA--TTAATTTATAAT
gi|44920 : AAAATC-----CTCCCG--CCC-TCCCCCATTTT-T--AAG--AAAA-A--T-TT-GGATGA----TAATCTAGCAA--TTAATTTAGAAT
gi|44922 : AAAATC-----CTCCCG--CCC-TCCCT-GTTTT-T--AAG--AAAA-A--AATT-GGATGA----TAATCTAGCAA--TTAATTTATAAT
gi|44923 : AAAATC-----CTCCCG--CCC-TCCCC-GTTTT-T--AAG--AAAA-A--A-TT-GGATGA----TAATTTAGGAA--TTAATTTATAAT
gi|44924 : AAAATC-----CTCCCG--CCG-TCCCC-GTTTT-T--AAG--AAAA-A--T-TT-GGATGA----TAATCTAGTTA--TTAATTTATAAT
gi|44925 : AAAATC-----CTCCAG--CCC-TCCCT-GTTTT-T--AAG--AAAA-A--T-TT-CGATGG----TAATCTAGCAA--TTAATTTATAAT
gi|44926 : AAATTC-----CTCCCG--CCC-TCCCC-ATTTT-T--AAG--AAAA-A--T-TT-GGATGA----TAATCTAGCAA--TAAATTTATAAT
gi|44928 : AAAATC-----CTCCTG--CTC-TCCCT-GTTTT-T--AAG--AAAA-C--G-TT-GGATGA----TAATCTAGCAA--TTAATTTATAA
gi|44929 : AAAATT-----CTTCCG--CCG-TCCCC-GTTTT-C--AAG--AAAA-A--T-TT-GGATGA----TAATCTAGCAA--TTAATTTATAAT
gi|44930 : AAAATC-----CTCTCG--CCC-TCCCT-GTTTT-T--AAG--AAAA-A--A-TT-GGATGA----TAATCTAGTAA--TTAATTTATAAT
gi|44931 : AAAATC-----CTCCCG--CTC-TCCCC-ATTTT-T--AAG--AAAA-A--T-TT-GAATGA----TATTCTAGCAA--TTAATTTATAAT
gi|44933 : AAAATC-----CTCCCG--CCC-TCCCC-GTTTT-T--AAC--AAAA-A--T-TG-GGATGA----TAATCTAGCAA--TTAAATTATAAT
gi|44934 : AAAATC-----CTCCCC--CAC-TCCCC-CTTTT-T--AAG--AAAA-A--T-TT-GGATGA----TAATCTAGCAA--TTAATTTATAAT
gi|44935 : AAAATC-----CTCCCA--CTT-TCCCC-GTTTT-T--AAG--AAAA-A--T-TTTGGATGA----TAATCTAGCAA--TTAATTTATAA
gi|44936 : AAAATC-----CTCCCG--TCC-TCCCC-ATTTT-T--AAG--AAAA-A--T-GT-GGATGA----TAATCTAGAAA--TTAATTTATAAT
gi|44937 : AAAGTC-----CTCCCG--CCC-TCCCT-GTTTTTT--AAG--AAAA-T--T-TT-GGATGA----TAATCTAGCAA--TTAATTTATAAT
gi|44938 : AAAATC-----CTCTCG--GCC-TCCCC-GTTTT-T--AAG--AAAA-A--T-TT-GGATGA----TAATCTAGCAA--TTAATACATAAT
gi|44939 : AAAATC-----TTCCCG--CCC-TCCCA-GTTTT-T--AAG--AAAA-A--T-TT-GGATGA----AAATCTAGCAA--TTAGTTTATAAT
gi|44940 : AAAATC-----CTCCCAAATCC-TCACC-ATTTT-T--AAG--AAAA-A--T-TT-GGATGA----TAATCTAGCAATTTTAATTTATAAT
gi|44942 : AAGATC-----CTCCTG--CCC-TCCTC-GTTTT-T--AAG--AAAA-A--T-TT-GGATGA----TAAATTAGCAA--TTTATTTATAAT
gi|44944 : AAAATC-----TTCCTG--CCC-TCCCC-GTTTT-A--AAG--AAAA-A--T-TT-AAAAGA----TAATCTAGCAA--TTAATTTATAAT
gi|44945 : AAAATC-----CTCCTG--CCC-TCCTC-GTATT-T--AAG--AAAA-A--A-TT-GGATAA----TAATCTAGCAA--TTAATTTATGA
gi|44946 : AAAATC-----CTCCCA--CCC-TCCCC-GTTTTTT--AAG--AAAA-A--T-TT-GGATGA----TAATCTAGGAT--TTAATTTATAAT
gi|44947 : AAAATC-----CTCCTG--CCC-TCCAT-GTTTT-T--AAG--AAAA-A--A-TT-GGATGA----TATTCTAGCAA--TTAATTCATAAT
gi|44948 : AAAATC-----CTCCCG--CCT-TCCTC-ATTTT-T--AAG--AAAA----T-TT-GGATGA----TAATCTAGCAA--TTGATTTATAAT
gi|44949 : AAAATT-----CTCTTG--CCC-TCCCC-CTTTT-T--AAG--TAAA-A--A-TT-GGATGA----TAATCTAGCAA--TTAATTTATAAT
gi|44950 : AAAATC-----CTCTCG--TCT-TCCCA-GTTTT-T--AAG--AAAA-A--T-TT-GGATGA----TAACCTAGCAA--TTAATTTATAA
gi|44951 : AAAATC-----CTACCA--CCC-TCCAC-GTTTT-T--AAG--AAAA-A--T-CT-GGATGA----TAATCTAGCAA--CTAATTTATAAT
gi|44953 : AAAATC-----CTTTCG--CCC-TACTC-GTTTT-T--AAG--AAAT-A--T-TT-GGATGA----TAATCTAGCAA--TTAATTTATAAT
gi|44954 : AAAATC-----CTTGTG--CCC-TCCCC-ATTGT-T--AAG--AAGA-A--T-TT-GGATGA----TAATCTAGCAA--TTAATTTATAGT
gi|44955 : AAAACC-----CTCCCA--CCC-TCCCT-GTTTT-T--AAG--AAAA-A--T-TT-GGATGA----TAATCTAGCAA--TTACTATATAAT
gi|44956 : AAAATC-----CTGCCG--CCC-TCCCC-ATTTT-T--AAA--AAAA-A--T-TT-GGATGA----TAATGCAGCAA--TTAATTTATAAT
gi|44957 : AAAATC-----CTCCCG--CCC-TTCCC-GTTTT-T--AAG--AAAC-A--T-TT-GGATGA----T-ATCTAGCAA--TTAATTTTTAAT
gi|44958 : AAAATC-----CTCCCA--CCC-TCCCC-ATTTT-T--AAG--AAAA-A--A-TT-TGATGA----TAATCTAGCAA--TTAATTTACAAT
gi|44959 : AAAGTC-----TTCCCA--CCC-TCCCC-GTTTT-T--AAG--AAAA-A--A-TT-GGATGA----TAATCTAGCAA--TTTATTTATAAT
gi|44960 : AAAATC-----CTCCCG--CCC-TCCCT-GTTTT-T--AAG--AAAA-A--A-TT-GGATAA----AAATCTAGTAA--TTAATTTATAAT
gi|44961 : AAAATC-----CTCCCG--CCC-TCTCT-ATTTT-T--AAG--AAAA-A--T-TT-GGATGA----TAATCTAAGAA--TTAATTTAAAAT
gi|44962 : AAAATCTTCCTCCCCCC--CCC-TCCCC-ATTTT-T--AAG--GAAA-A--T-TT-GGATGA----TAATCTAGCAA--TTAATTTATAAT
gi|44963 : AAAATC-----CTTCCA--CCC-TCCCC-GTTTT-T--AAG--AAAA----T-TT-GGATGA----TAATCTAGCAA--TCAATTTATTAT
gi|44964 : AAAATC-----C-CCCG--CCC-TCCCT-GTTTT-T--AAG--AAAA-G--T-TT-GGATGA----TAATCCAGCAA--TTAATTTAAAAT
gi|44965 : AAAATC-----CTCCCA--CCC-TCCCC-ATTTT-T--AAGTTAAAA-A-----T-GGATGA----TAATCTAGCAA--TTAATTTATAAT
gi|44966 : AAAATC-----TTCCCA--CCC-TCCCT-GTTTT----AAG--AAAA-A--T-TT-GGATGA----TAATCTTGCAA--TTAATTTATAAT
gi|44967 : AAAATA-----CTCCCG--CCC-TCACC-CTCTT-T--TAG--AAAA-A--T-TTTGGGTGA----TAATCTAGCAA--TTAATTTATAAT
gi|44968 : AAAATC-----CTCCCT--CCCATCCCC--TTTT-T--AAG--AAAA-G--T-TT-GGATGA----TAATCTAGCAA--TTAATTTATAAT
gi|44970 : AAGATA-----CTCCCG--CTC-TCC---GTTTT-T--AAG--AAAA-A--T-TT-GGATGA----TAATCAAGCAA--TTAATTTATAAT
gi|44971 : AAAATC-----CTCCCG--CTC-TCCCC-GTTTT-T--AAG--AAAA-AATT-TT-TTATGA----TAATCTAGCAA--TCAATTTATAAT
gi|44972 : AAAATC-----CTCCCA--CCC-TCTCC-GTTTT-T--AAA--ATAA-A--A-TT-GGATGA----TAATCTAGCAA--TTTATTTATAAT
gi|45100 : AAATC-----CTCCCA--CTC-TCCCC-GTTTT-T--AAG--AAAA-A--T-TT-GGATGA----TAATCTAGCAA--TTAATTTATAAT
gi|45101 : AAATC-----CTCCCA--CCC-TCCCC-GTTTT-T--AAG--AAAA-A--T-TT-GGATGA----TAATCTAACAA--TTAATTTATAAT
gi|45102 : AAATC-----CTCCTG--CTC-TCCCC-GTTTT-T--AAG--AAAA-A--T-TT-GGATGA----TAATCTAACAG--TTAATTTATAAT
gi|45104 : AAATC-----CTCCCG--CCC-TCCCC-GTTTT-T--AAG--AAAA-A--T-TT-GAATGT----TAATCTAGCAA--TTAATTTATAAT
gi|45105 : AAATC-----CTCCTG--CCC-TCCCT-GTTTT-T--AAG--AAAA-A--T-TT-GGATGA----TAATCTAGCAA--TTAATTGAAAAT
gi|45106 : AAATC-----CTCATG--CAC-TCCCC-GTTTT-T--AAG--AAAA-A--T-TT-GGATGA----TAATCTAGCAA--TTAATTTAAAAT
gi|45107 : AAATC-----CTCCCA--CCC-TCCCC-GTTTT-T--AAG--AAAA-A--A-AT-GGATGA----TAATCTAGCAA--TTAATTTATAAT
gi|45109 : AAATC-----CTCTCG--CCC-TCCCC-GTTTTTT--AAG--AAAA-A--T-TT-GAACGA----TAATCTAGCAA--TTAATTTATAAT
gi|45111 : AAACT-----CTACCG--CCC-TCCCT-GTTTT-T--AAG--AAAA-A--T-TT-GGATGA----TAAACTAGCAA--TTAATTTATAAT
gi|45112 : AAATC-----CTTCTT--CCC-TCCCC-GTTTT-T--AAG--AAAA-A--T-TT-GGATGA----TAATCTAGTAA--TTA
gi|45127 : AATC-----CTCCCG--CTT-TCCC--GTTTT-T--AAG--AAAA-A--T-TT-GGATGA----TAATCTAGCAA--TTAATTTATAAT
gi|45137 : TC-----CTCCCG--CCC-TCCCA-GTTTT-T--AAG--AAAAAA--T-TT-GGATGA----TAATCTAGCAA--TTAATTTATAAT
gi|45143 : C-----CTCCTG--CCC-TCCCC-ATTTT-T--AAG--AAAA-A--T-TT-GGATGA----TAATCTAGCAA--TTAATTTATAAT
gi|45154 : CCTG--CCC-TCCCC-GTTTT-T--AAG--AAAA-A--T-TT-GGATGA----TAATCTAGCAA--TTAATTTATAA
Alignments
lowQualScore : 11111 00 0 0 1 00 00 0 00 0 0 0000 00
lowQualScore : ..... .. . . . .. .. . .. . . .... ..
lowQualScore : 44444 66 4 4 6 66 66 8 55 4 8 8888 55
consensus : AAAATC-----CTCCCG--CCC-TCCCC-GTTTT-T--AAG--AAAA-A--T-TT-GGATGA----TAATCTAGCAA--TTAATTTATAAT
Reference ( family-138 ) : AAAATC-----CTCCCG--CCC-TCCCC-GTTTT-T--AAG--AAAA-A--T-TT-GGATGA----TAATCTAGCAA--TTAATTTATAAT
gi|44871 : AAAATC-----CTCCTG--CCC-TCACC-TTTTT-T--AAG--AAAA-A--T-TT-GGATGA----TAATCTAGCAA--TTAATTTATAAT
gi|44872 : AAAATC-----CTTCCG--CCC-TCACC-GTTTT-T--AAG--AAAA-A--T-TT-GGATGA----TAATCTAGCAA--TTAATTTATAAT
gi|44873 : AAAATC-----CTCCTG--CCC-TTCCC-GTTTT-T--AAG--AAAA-A--T-TT-GGATGA----TAATCTAGCAA--TTAATTTATAAT
gi|44875 : AAAATC-----TTCCTG--TCC-TCCCC-GTTTT-T--AAG--AAAA-A--T-TT-GGATGA----TAATCTAGCAA--TTAATTTATAAT
gi|44876 : AAAATC-----CTCCTG--CCC-TCCCT-GTTTT-T--AAG--AAAA-A--T-TT-GAATGA----TAATCTAGCAA--TTAATTTATAAT
gi|44877 : AGAATC-----CTCCTT--CTC-TCCCA-GTTTT-T--AA---AAAA-A--T-TT-GGATGA----TAATCTAGCAA--TTAATTTATAAT
gi|44879 : AAAATC-----CTCCCG--CCC-TCCCC-TTTTT-T--AAG--AAAA-A--T-TT-GGATGA----TAATCTAGCAA--TTAATTTATAAT
gi|44880 : AAAATC-----CTCCCT--CCC-TCCCC-GTTTT-T--AAG--AAAA-A--T-TT-GGATGA----TAATCTAGCAA--TTAATTTATAAT
gi|44881 : AAAATC-----CTCCTG--CCC-TCCCC-ATTTT-T--AAG--AAAA-A--T-TT-GGATGA----TAATCTAGCAA--TTAATTTAAAAT
gi|44882 : AAAATA-----CTTCCA--CTC-TCCCC-GTTTT-T--AAG--AAAA-A--T-TT-GGATGG----TAATCTAGAAA--TTAATTTATAAT
gi|44883 : AAAATC-----CTCCCG--CCC-TCCCC-ATTTT-T--AAG--AAAA-A--T-TT-GGATGA----TAATCTAGCAA--TTAATTTGTAAT
gi|44884 : AAAATC-----CTCCCA--TCC-TCCCC-GTTTT-T--AAG--AAAA-A--T-TT-GGATGA----TAATCTAGCAA--TTAATTTATAAT
gi|44885 : AAAATC-----CTCCCG--CCC-TCCCT-GTTTT-T--AAG--AAAA-A--T-TT-GGATGA----TAATCTAGTAA--TTAATTTATAAT
gi|44886 : AAAATC-----CTCCCA--CCC-TTCCC-GTTTT-T--AAG--AAAA-A--T-TT-GGATGA----TAATCTAGCAA--TTAATTTATAAT
gi|44887 : AAAATA-----CTCCCG--CCC-TCTCC-ATTTTTT--AAG--AAAA-A--T-TT-GGATGA----TAATCTAGCAA--TTAATTTATAAT
gi|44888 : AAAACT-----CTCCCG--CAC-TCCCC-ATTTT-T--AAG--AAAA-A--T-TT-AGATGA----TAATCTAGCAA--TTAATTTATAAT
gi|44890 : AAAAAC-----CTCCTG--CCC-ACCCC-GTTTT-T--AAG--AAAA-A--T-TT-GGATGA----TAATCTAGCAA--TTAATTTATAAT
gi|44893 : AAAATC-----CTCCTG--CCC-TCCCT-GTTTT-T--AAG--AACA-A--T-TT-GGATGA----TAACCTAGCAA--TTAATTTATAAT
gi|44894 : AAAATC-----CTCCTG--CCC-TCATC-CTTTT-T--AAG--AAAA-A--T-TT-GTATGA----TAATCTGGCAA--TTAATTTATAAT
gi|44895 : AAAATC-----T---CG--CCC-TCCCC-GTTTT-T--AAG--AAAA-A--T-TT-GGATGA----TAATCTAGCAA--TTAATTTATAAT
gi|44896 : AAAATTG----CTCCCG--CCC-TCCCA-GTTTT-T--AAG--AAAA-G--T-TT-GGATGA----TAACCTAGCAA--TTAATTTATAAT
gi|44899 : AAAATC-----CTCCTG--CCT-TCCCT-GTTTT-T--AAG--AAAAAA--T-TT-GGATGA----TAATCTAGCAA--TTAATTTATAAT
gi|44900 : AAAATC-----CTCCCG--TCC-TCCCC-GTTTT-T--AAG--AAAA-A--T-TT-GGTTGA----TAATCTAGCAA--TTAATTTATAAT
gi|44901 : AAAATC-----CTCCTG--CCC-TCCT--GTTTT-TTTGAG--AAAA-A--T-TT-GGATGA----TAATCTAGCAA--TTAATTTATAAT
gi|44902 : AAAATC-----CTCCCA--TCA-TCCCC-ATTTT-T--AAG--AAAA-A--T-TT-GGATGA----TAATCTAGCAA--TTAATTTATAAT
gi|44903 : AAAATC-----CTCCCG--CTC-TCCCC-GTTTT-T--AAG--AAAA-A--T-TT-GGATGA----AAATCTAGCAA--TTAATTTATAAT
gi|44904 : AAAATC-----CTCCTG--CTC-TCCCT-GTTTT-T--AAG--AAAT-A--T-TT-GGATGA----TAATCTAGCAA--TTAATTTATAAT
gi|44905 : AAAATC-----CTCCTG--CCC-GTTCT-GTTTT-T--AAG--AAAA-A--T-TT-GGATGA----TAATCTAGCAA--TTAATTTATAAT
gi|44906 : AAAATC-----CTCCTG--CTC-TCCCT-GTTTT-T--AAG--AAAT-A--T-TT-GGATGA----TAATCTAGCAA--TTAATTTATAAT
gi|44907 : AAAATC-----CTCCCG--CCC-TTTCC-GTTTT-A--AAG--AAAA-A--T-TT-GGATGA----TAATCTAGCAA--TTAATTTATAAT
gi|44908 : AAAATC-----CTCCCG--CCC-TTCCC-ATTTT-T--AAG--AAAA-A--T-TT-GGATGA----TAATCTAGCAA--TTAATTTATA
gi|44909 : AAAATT-----CTCCTG--CCC-TCCCT-GTTTT-T--AAG--AAAA-A--T-TT-AGATGA----TAATCTAGCAA--TTAACTTATAAT
gi|44911 : AAAATC-----CTCCCG--CCC-TCCCC-GTTTT-T--AAG--ATTA-A--T-TT-GGATGA----TAATCTAGCAA--TTAATTTATAAT
gi|44912 : AAAATC-----CTCCAG--CCC-TCCCC-CTTTT-T--AAG--AAAA-A--T-TT-GAATGA----TAATCTAGCAA--TTAATTTATAAT
gi|44913 : AAAATC-----CTCCCG--CCC-TCCCT-GTTTT-T--AAG--AAAA-A--T-TT-TGATGA----TAATCTAGCAA--TTAATCTATAAT
gi|44914 : AAAATC-----CTCCCA--CCC-TCCCC-GTTTT-T--AAG--AAAA-A--T-TT-GGATGATAATTAATCTAGCAA--TTAATTTATAAT
gi|44915 : AAAATC-----CTTCCG--CCC---ACC-GTTTT-T--AAG--AAAA-A--T-TT-AGATGA----TAATCTAGCAA--TTAATTTATAAT
gi|44917 : AAAATC-----CTCCTG--CAC-TCCCT-GTTTT-T--AAG--AAAA-A--T-TT-GGATGA----TAATCTAGCAA--TTAATTTA-AAT
gi|44918 : AAAATC-----CTACTG--CCC-TCCCA-GTTTT-T--AAG--AAAA-A--T-TT-GGATTA----TAATCTAGCAA--TTAATTTATAAT
gi|44919 : AAAATC-----CTCCTG--CCC-TCTCC-GTTTT-T--AAG--AAAA-C--A-TT-GGAAGA----TAATCTAGCAA--TTAATTTATAAT
gi|44920 : AAAATC-----CTCCCG--CCC-TCCCCCATTTT-T--AAG--AAAA-A--T-TT-GGATGA----TAATCTAGCAA--TTAATTTAGAAT
gi|44922 : AAAATC-----CTCCCG--CCC-TCCCT-GTTTT-T--AAG--AAAA-A--AATT-GGATGA----TAATCTAGCAA--TTAATTTATAAT
gi|44923 : AAAATC-----CTCCCG--CCC-TCCCC-GTTTT-T--AAG--AAAA-A--A-TT-GGATGA----TAATTTAGGAA--TTAATTTATAAT
gi|44924 : AAAATC-----CTCCCG--CCG-TCCCC-GTTTT-T--AAG--AAAA-A--T-TT-GGATGA----TAATCTAGTTA--TTAATTTATAAT
gi|44925 : AAAATC-----CTCCAG--CCC-TCCCT-GTTTT-T--AAG--AAAA-A--T-TT-CGATGG----TAATCTAGCAA--TTAATTTATAAT
gi|44926 : AAATTC-----CTCCCG--CCC-TCCCC-ATTTT-T--AAG--AAAA-A--T-TT-GGATGA----TAATCTAGCAA--TAAATTTATAAT
gi|44928 : AAAATC-----CTCCTG--CTC-TCCCT-GTTTT-T--AAG--AAAA-C--G-TT-GGATGA----TAATCTAGCAA--TTAATTTATAA
gi|44929 : AAAATT-----CTTCCG--CCG-TCCCC-GTTTT-C--AAG--AAAA-A--T-TT-GGATGA----TAATCTAGCAA--TTAATTTATAAT
gi|44930 : AAAATC-----CTCTCG--CCC-TCCCT-GTTTT-T--AAG--AAAA-A--A-TT-GGATGA----TAATCTAGTAA--TTAATTTATAAT
gi|44931 : AAAATC-----CTCCCG--CTC-TCCCC-ATTTT-T--AAG--AAAA-A--T-TT-GAATGA----TATTCTAGCAA--TTAATTTATAAT
gi|44933 : AAAATC-----CTCCCG--CCC-TCCCC-GTTTT-T--AAC--AAAA-A--T-TG-GGATGA----TAATCTAGCAA--TTAAATTATAAT
gi|44934 : AAAATC-----CTCCCC--CAC-TCCCC-CTTTT-T--AAG--AAAA-A--T-TT-GGATGA----TAATCTAGCAA--TTAATTTATAAT
gi|44935 : AAAATC-----CTCCCA--CTT-TCCCC-GTTTT-T--AAG--AAAA-A--T-TTTGGATGA----TAATCTAGCAA--TTAATTTATAA
gi|44936 : AAAATC-----CTCCCG--TCC-TCCCC-ATTTT-T--AAG--AAAA-A--T-GT-GGATGA----TAATCTAGAAA--TTAATTTATAAT
gi|44937 : AAAGTC-----CTCCCG--CCC-TCCCT-GTTTTTT--AAG--AAAA-T--T-TT-GGATGA----TAATCTAGCAA--TTAATTTATAAT
gi|44938 : AAAATC-----CTCTCG--GCC-TCCCC-GTTTT-T--AAG--AAAA-A--T-TT-GGATGA----TAATCTAGCAA--TTAATACATAAT
gi|44939 : AAAATC-----TTCCCG--CCC-TCCCA-GTTTT-T--AAG--AAAA-A--T-TT-GGATGA----AAATCTAGCAA--TTAGTTTATAAT
gi|44940 : AAAATC-----CTCCCAAATCC-TCACC-ATTTT-T--AAG--AAAA-A--T-TT-GGATGA----TAATCTAGCAATTTTAATTTATAAT
gi|44942 : AAGATC-----CTCCTG--CCC-TCCTC-GTTTT-T--AAG--AAAA-A--T-TT-GGATGA----TAAATTAGCAA--TTTATTTATAAT
gi|44944 : AAAATC-----TTCCTG--CCC-TCCCC-GTTTT-A--AAG--AAAA-A--T-TT-AAAAGA----TAATCTAGCAA--TTAATTTATAAT
gi|44945 : AAAATC-----CTCCTG--CCC-TCCTC-GTATT-T--AAG--AAAA-A--A-TT-GGATAA----TAATCTAGCAA--TTAATTTATGA
gi|44946 : AAAATC-----CTCCCA--CCC-TCCCC-GTTTTTT--AAG--AAAA-A--T-TT-GGATGA----TAATCTAGGAT--TTAATTTATAAT
gi|44947 : AAAATC-----CTCCTG--CCC-TCCAT-GTTTT-T--AAG--AAAA-A--A-TT-GGATGA----TATTCTAGCAA--TTAATTCATAAT
gi|44948 : AAAATC-----CTCCCG--CCT-TCCTC-ATTTT-T--AAG--AAAA----T-TT-GGATGA----TAATCTAGCAA--TTGATTTATAAT
gi|44949 : AAAATT-----CTCTTG--CCC-TCCCC-CTTTT-T--AAG--TAAA-A--A-TT-GGATGA----TAATCTAGCAA--TTAATTTATAAT
gi|44950 : AAAATC-----CTCTCG--TCT-TCCCA-GTTTT-T--AAG--AAAA-A--T-TT-GGATGA----TAACCTAGCAA--TTAATTTATAA
gi|44951 : AAAATC-----CTACCA--CCC-TCCAC-GTTTT-T--AAG--AAAA-A--T-CT-GGATGA----TAATCTAGCAA--CTAATTTATAAT
gi|44953 : AAAATC-----CTTTCG--CCC-TACTC-GTTTT-T--AAG--AAAT-A--T-TT-GGATGA----TAATCTAGCAA--TTAATTTATAAT
gi|44954 : AAAATC-----CTTGTG--CCC-TCCCC-ATTGT-T--AAG--AAGA-A--T-TT-GGATGA----TAATCTAGCAA--TTAATTTATAGT
gi|44955 : AAAACC-----CTCCCA--CCC-TCCCT-GTTTT-T--AAG--AAAA-A--T-TT-GGATGA----TAATCTAGCAA--TTACTATATAAT
gi|44956 : AAAATC-----CTGCCG--CCC-TCCCC-ATTTT-T--AAA--AAAA-A--T-TT-GGATGA----TAATGCAGCAA--TTAATTTATAAT
gi|44957 : AAAATC-----CTCCCG--CCC-TTCCC-GTTTT-T--AAG--AAAC-A--T-TT-GGATGA----T-ATCTAGCAA--TTAATTTTTAAT
gi|44958 : AAAATC-----CTCCCA--CCC-TCCCC-ATTTT-T--AAG--AAAA-A--A-TT-TGATGA----TAATCTAGCAA--TTAATTTACAAT
gi|44959 : AAAGTC-----TTCCCA--CCC-TCCCC-GTTTT-T--AAG--AAAA-A--A-TT-GGATGA----TAATCTAGCAA--TTTATTTATAAT
gi|44960 : AAAATC-----CTCCCG--CCC-TCCCT-GTTTT-T--AAG--AAAA-A--A-TT-GGATAA----AAATCTAGTAA--TTAATTTATAAT
gi|44961 : AAAATC-----CTCCCG--CCC-TCTCT-ATTTT-T--AAG--AAAA-A--T-TT-GGATGA----TAATCTAAGAA--TTAATTTAAAAT
gi|44962 : AAAATCTTCCTCCCCCC--CCC-TCCCC-ATTTT-T--AAG--GAAA-A--T-TT-GGATGA----TAATCTAGCAA--TTAATTTATAAT
gi|44963 : AAAATC-----CTTCCA--CCC-TCCCC-GTTTT-T--AAG--AAAA----T-TT-GGATGA----TAATCTAGCAA--TCAATTTATTAT
gi|44964 : AAAATC-----C-CCCG--CCC-TCCCT-GTTTT-T--AAG--AAAA-G--T-TT-GGATGA----TAATCCAGCAA--TTAATTTAAAAT
gi|44965 : AAAATC-----CTCCCA--CCC-TCCCC-ATTTT-T--AAGTTAAAA-A-----T-GGATGA----TAATCTAGCAA--TTAATTTATAAT
gi|44966 : AAAATC-----TTCCCA--CCC-TCCCT-GTTTT----AAG--AAAA-A--T-TT-GGATGA----TAATCTTGCAA--TTAATTTATAAT
gi|44967 : AAAATA-----CTCCCG--CCC-TCACC-CTCTT-T--TAG--AAAA-A--T-TTTGGGTGA----TAATCTAGCAA--TTAATTTATAAT
gi|44968 : AAAATC-----CTCCCT--CCCATCCCC--TTTT-T--AAG--AAAA-G--T-TT-GGATGA----TAATCTAGCAA--TTAATTTATAAT
gi|44970 : AAGATA-----CTCCCG--CTC-TCC---GTTTT-T--AAG--AAAA-A--T-TT-GGATGA----TAATCAAGCAA--TTAATTTATAAT
gi|44971 : AAAATC-----CTCCCG--CTC-TCCCC-GTTTT-T--AAG--AAAA-AATT-TT-TTATGA----TAATCTAGCAA--TCAATTTATAAT
gi|44972 : AAAATC-----CTCCCA--CCC-TCTCC-GTTTT-T--AAA--ATAA-A--A-TT-GGATGA----TAATCTAGCAA--TTTATTTATAAT
gi|45100 : AAATC-----CTCCCA--CTC-TCCCC-GTTTT-T--AAG--AAAA-A--T-TT-GGATGA----TAATCTAGCAA--TTAATTTATAAT
gi|45101 : AAATC-----CTCCCA--CCC-TCCCC-GTTTT-T--AAG--AAAA-A--T-TT-GGATGA----TAATCTAACAA--TTAATTTATAAT
gi|45102 : AAATC-----CTCCTG--CTC-TCCCC-GTTTT-T--AAG--AAAA-A--T-TT-GGATGA----TAATCTAACAG--TTAATTTATAAT
gi|45104 : AAATC-----CTCCCG--CCC-TCCCC-GTTTT-T--AAG--AAAA-A--T-TT-GAATGT----TAATCTAGCAA--TTAATTTATAAT
gi|45105 : AAATC-----CTCCTG--CCC-TCCCT-GTTTT-T--AAG--AAAA-A--T-TT-GGATGA----TAATCTAGCAA--TTAATTGAAAAT
gi|45106 : AAATC-----CTCATG--CAC-TCCCC-GTTTT-T--AAG--AAAA-A--T-TT-GGATGA----TAATCTAGCAA--TTAATTTAAAAT
gi|45107 : AAATC-----CTCCCA--CCC-TCCCC-GTTTT-T--AAG--AAAA-A--A-AT-GGATGA----TAATCTAGCAA--TTAATTTATAAT
gi|45109 : AAATC-----CTCTCG--CCC-TCCCC-GTTTTTT--AAG--AAAA-A--T-TT-GAACGA----TAATCTAGCAA--TTAATTTATAAT
gi|45111 : AAACT-----CTACCG--CCC-TCCCT-GTTTT-T--AAG--AAAA-A--T-TT-GGATGA----TAAACTAGCAA--TTAATTTATAAT
gi|45112 : AAATC-----CTTCTT--CCC-TCCCC-GTTTT-T--AAG--AAAA-A--T-TT-GGATGA----TAATCTAGTAA--TTA
gi|45127 : AATC-----CTCCCG--CTT-TCCC--GTTTT-T--AAG--AAAA-A--T-TT-GGATGA----TAATCTAGCAA--TTAATTTATAAT
gi|45137 : TC-----CTCCCG--CCC-TCCCA-GTTTT-T--AAG--AAAAAA--T-TT-GGATGA----TAATCTAGCAA--TTAATTTATAAT
gi|45143 : C-----CTCCTG--CCC-TCCCC-ATTTT-T--AAG--AAAA-A--T-TT-GGATGA----TAATCTAGCAA--TTAATTTATAAT
gi|45154 : CCTG--CCC-TCCCC-GTTTT-T--AAG--AAAA-A--T-TT-GGATGA----TAATCTAGCAA--TTAATTTATAA
blockSeqs : TTCCT T
blockSeqs : G T
blockSeqs : . T
blockSeqs : . T
blockSeqs : . .
blockSeqs : . .
blockSeqs : . .
blockSeqs : . .
blockSeqs : . .
blockSeqs : . .
blockSeqs : . .
blockSeqs : . .
blockSeqs : . .
blockSeqs : . .
blockSeqs : . .
blockSeqs : . .
blockSeqs : . .
blockSeqs : . .
blockSeqs : . .
blockSeqs : . .
blockSeqs : . .
blockSeqs : . .
blockSeqs : . .
blockSeqs : . .
blockSeqs : . .
blockSeqs : . .
blockSeqs : . .
blockSeqs : . .
blockSeqs : . .
blockSeqs : . .
blockSeqs : . .
blockSeqs : . .
blockSeqs : . .
blockSeqs : . .
blockSeqs : . .
blockSeqs : . .
blockSeqs : . .
blockSeqs : . .
blockSeqs : . .
blockSeqs : . .
blockSeqs : . .
blockSeqs : . .
blockSeqs : . .
blockSeqs : . .
blockSeqs : . .
blockSeqs : . .
blockSeqs : . .
blockSeqs : . .
blockSeqs : . .
blockSeqs : . .
blockSeqs : . .
blockSeqs : . .
blockSeqs : . .
blockSeqs : . .
blockSeqs : . .
blockSeqs : . .
blockSeqs : . .
blockSeqs : . .
blockSeqs : . .
blockSeqs : . .
blockSeqs : . .
blockSeqs : . .
blockSeqs : . .
blockSeqs : . .
blockSeqs : . .
blockSeqs : . .
blockSeqs : . .
blockSeqs : . .
blockSeqs : . .
blockSeqs : . .
blockSeqs : . .
blockSeqs : . .
blockSeqs : . .
blockSeqs : . .
blockSeqs : . .
blockSeqs : . .
blockSeqs : . .
blockSeqs : . .
blockSeqs : . .
blockSeqs : . .
blockSeqs : . .
blockSeqs : . .
blockSeqs : . .
blockSeqs : . .
blockSeqs : . .
blockSeqs : . .
blockSeqs : . .
blockSeqs : . .
blockSeqs : . .
blockSeqs : . .
blockSeqs : . .
blockSeqs : . .
blockSeqs : . .
blockSeqs : . .
blockSeqs : . .
blockSeqs : . .
blockSeqs : . .
blockSeqs : . .
blockSeqs : .
blockSeqCons :
originalCons : AAAATC-----CTCCCG--CCC-TCCCC-GTTTT-T--AAG--AAAA-A--T-TT-GGATGA----TAATCTAGCAA--TTAATTTATAAT
finalCons : AAAATC-----CTCCCG--CCC-TCCCC-GTTTT-T--AAG--AAAA-A--T-TT-GGATGA----TAATCTAGCAA--TTAATTTATAAT
Alignments
lowQualScore : 11111 00 0 0 1 00 00 0 00 0 0 0000 00
lowQualScore : ..... .. . . . .. .. . .. . . .... ..
lowQualScore : 44444 66 4 4 6 66 66 8 55 4 8 8888 55
consensus : AAAATC-----CTCCCG--CCC-TCCCC-GTTTT-T--AAG--AAAA-A--T-TT-GGATGA----TAATCTAGCAA--TTAATTTATAAT
Reference ( family-138 ) : AAAATC-----CTCCCG--CCC-TCCCC-GTTTT-T--AAG--AAAA-A--T-TT-GGATGA----TAATCTAGCAA--TTAATTTATAAT
gi|44871 : AAAATC-----CTCCTG--CCC-TCACC-TTTTT-T--AAG--AAAA-A--T-TT-GGATGA----TAATCTAGCAA--TTAATTTATAAT
gi|44872 : AAAATC-----CTTCCG--CCC-TCACC-GTTTT-T--AAG--AAAA-A--T-TT-GGATGA----TAATCTAGCAA--TTAATTTATAAT
gi|44873 : AAAATC-----CTCCTG--CCC-TTCCC-GTTTT-T--AAG--AAAA-A--T-TT-GGATGA----TAATCTAGCAA--TTAATTTATAAT
gi|44875 : AAAATC-----TTCCTG--TCC-TCCCC-GTTTT-T--AAG--AAAA-A--T-TT-GGATGA----TAATCTAGCAA--TTAATTTATAAT
gi|44876 : AAAATC-----CTCCTG--CCC-TCCCT-GTTTT-T--AAG--AAAA-A--T-TT-GAATGA----TAATCTAGCAA--TTAATTTATAAT
gi|44877 : AGAATC-----CTCCTT--CTC-TCCCA-GTTTT-T--AA---AAAA-A--T-TT-GGATGA----TAATCTAGCAA--TTAATTTATAAT
gi|44879 : AAAATC-----CTCCCG--CCC-TCCCC-TTTTT-T--AAG--AAAA-A--T-TT-GGATGA----TAATCTAGCAA--TTAATTTATAAT
gi|44880 : AAAATC-----CTCCCT--CCC-TCCCC-GTTTT-T--AAG--AAAA-A--T-TT-GGATGA----TAATCTAGCAA--TTAATTTATAAT
gi|44881 : AAAATC-----CTCCTG--CCC-TCCCC-ATTTT-T--AAG--AAAA-A--T-TT-GGATGA----TAATCTAGCAA--TTAATTTAAAAT
gi|44882 : AAAATA-----CTTCCA--CTC-TCCCC-GTTTT-T--AAG--AAAA-A--T-TT-GGATGG----TAATCTAGAAA--TTAATTTATAAT
gi|44883 : AAAATC-----CTCCCG--CCC-TCCCC-ATTTT-T--AAG--AAAA-A--T-TT-GGATGA----TAATCTAGCAA--TTAATTTGTAAT
gi|44884 : AAAATC-----CTCCCA--TCC-TCCCC-GTTTT-T--AAG--AAAA-A--T-TT-GGATGA----TAATCTAGCAA--TTAATTTATAAT
gi|44885 : AAAATC-----CTCCCG--CCC-TCCCT-GTTTT-T--AAG--AAAA-A--T-TT-GGATGA----TAATCTAGTAA--TTAATTTATAAT
gi|44886 : AAAATC-----CTCCCA--CCC-TTCCC-GTTTT-T--AAG--AAAA-A--T-TT-GGATGA----TAATCTAGCAA--TTAATTTATAAT
gi|44887 : AAAATA-----CTCCCG--CCC-TCTCC-ATTTTTT--AAG--AAAA-A--T-TT-GGATGA----TAATCTAGCAA--TTAATTTATAAT
gi|44888 : AAAACT-----CTCCCG--CAC-TCCCC-ATTTT-T--AAG--AAAA-A--T-TT-AGATGA----TAATCTAGCAA--TTAATTTATAAT
gi|44890 : AAAAAC-----CTCCTG--CCC-ACCCC-GTTTT-T--AAG--AAAA-A--T-TT-GGATGA----TAATCTAGCAA--TTAATTTATAAT
gi|44893 : AAAATC-----CTCCTG--CCC-TCCCT-GTTTT-T--AAG--AACA-A--T-TT-GGATGA----TAACCTAGCAA--TTAATTTATAAT
gi|44894 : AAAATC-----CTCCTG--CCC-TCATC-CTTTT-T--AAG--AAAA-A--T-TT-GTATGA----TAATCTGGCAA--TTAATTTATAAT
gi|44895 : AAAATC-----T---CG--CCC-TCCCC-GTTTT-T--AAG--AAAA-A--T-TT-GGATGA----TAATCTAGCAA--TTAATTTATAAT
gi|44896 : AAAATTG----CTCCCG--CCC-TCCCA-GTTTT-T--AAG--AAAA-G--T-TT-GGATGA----TAACCTAGCAA--TTAATTTATAAT
gi|44899 : AAAATC-----CTCCTG--CCT-TCCCT-GTTTT-T--AAG--AAAAAA--T-TT-GGATGA----TAATCTAGCAA--TTAATTTATAAT
gi|44900 : AAAATC-----CTCCCG--TCC-TCCCC-GTTTT-T--AAG--AAAA-A--T-TT-GGTTGA----TAATCTAGCAA--TTAATTTATAAT
gi|44901 : AAAATC-----CTCCTG--CCC-TCCT--GTTTT-TTTGAG--AAAA-A--T-TT-GGATGA----TAATCTAGCAA--TTAATTTATAAT
gi|44902 : AAAATC-----CTCCCA--TCA-TCCCC-ATTTT-T--AAG--AAAA-A--T-TT-GGATGA----TAATCTAGCAA--TTAATTTATAAT
gi|44903 : AAAATC-----CTCCCG--CTC-TCCCC-GTTTT-T--AAG--AAAA-A--T-TT-GGATGA----AAATCTAGCAA--TTAATTTATAAT
gi|44904 : AAAATC-----CTCCTG--CTC-TCCCT-GTTTT-T--AAG--AAAT-A--T-TT-GGATGA----TAATCTAGCAA--TTAATTTATAAT
gi|44905 : AAAATC-----CTCCTG--CCC-GTTCT-GTTTT-T--AAG--AAAA-A--T-TT-GGATGA----TAATCTAGCAA--TTAATTTATAAT
gi|44906 : AAAATC-----CTCCTG--CTC-TCCCT-GTTTT-T--AAG--AAAT-A--T-TT-GGATGA----TAATCTAGCAA--TTAATTTATAAT
gi|44907 : AAAATC-----CTCCCG--CCC-TTTCC-GTTTT-A--AAG--AAAA-A--T-TT-GGATGA----TAATCTAGCAA--TTAATTTATAAT
gi|44908 : AAAATC-----CTCCCG--CCC-TTCCC-ATTTT-T--AAG--AAAA-A--T-TT-GGATGA----TAATCTAGCAA--TTAATTTATA
gi|44909 : AAAATT-----CTCCTG--CCC-TCCCT-GTTTT-T--AAG--AAAA-A--T-TT-AGATGA----TAATCTAGCAA--TTAACTTATAAT
gi|44911 : AAAATC-----CTCCCG--CCC-TCCCC-GTTTT-T--AAG--ATTA-A--T-TT-GGATGA----TAATCTAGCAA--TTAATTTATAAT
gi|44912 : AAAATC-----CTCCAG--CCC-TCCCC-CTTTT-T--AAG--AAAA-A--T-TT-GAATGA----TAATCTAGCAA--TTAATTTATAAT
gi|44913 : AAAATC-----CTCCCG--CCC-TCCCT-GTTTT-T--AAG--AAAA-A--T-TT-TGATGA----TAATCTAGCAA--TTAATCTATAAT
gi|44914 : AAAATC-----CTCCCA--CCC-TCCCC-GTTTT-T--AAG--AAAA-A--T-TT-GGATGATAATTAATCTAGCAA--TTAATTTATAAT
gi|44915 : AAAATC-----CTTCCG--CCC---ACC-GTTTT-T--AAG--AAAA-A--T-TT-AGATGA----TAATCTAGCAA--TTAATTTATAAT
gi|44917 : AAAATC-----CTCCTG--CAC-TCCCT-GTTTT-T--AAG--AAAA-A--T-TT-GGATGA----TAATCTAGCAA--TTAATTTA-AAT
gi|44918 : AAAATC-----CTACTG--CCC-TCCCA-GTTTT-T--AAG--AAAA-A--T-TT-GGATTA----TAATCTAGCAA--TTAATTTATAAT
gi|44919 : AAAATC-----CTCCTG--CCC-TCTCC-GTTTT-T--AAG--AAAA-C--A-TT-GGAAGA----TAATCTAGCAA--TTAATTTATAAT
gi|44920 : AAAATC-----CTCCCG--CCC-TCCCCCATTTT-T--AAG--AAAA-A--T-TT-GGATGA----TAATCTAGCAA--TTAATTTAGAAT
gi|44922 : AAAATC-----CTCCCG--CCC-TCCCT-GTTTT-T--AAG--AAAA-A--AATT-GGATGA----TAATCTAGCAA--TTAATTTATAAT
gi|44923 : AAAATC-----CTCCCG--CCC-TCCCC-GTTTT-T--AAG--AAAA-A--A-TT-GGATGA----TAATTTAGGAA--TTAATTTATAAT
gi|44924 : AAAATC-----CTCCCG--CCG-TCCCC-GTTTT-T--AAG--AAAA-A--T-TT-GGATGA----TAATCTAGTTA--TTAATTTATAAT
gi|44925 : AAAATC-----CTCCAG--CCC-TCCCT-GTTTT-T--AAG--AAAA-A--T-TT-CGATGG----TAATCTAGCAA--TTAATTTATAAT
gi|44926 : AAATTC-----CTCCCG--CCC-TCCCC-ATTTT-T--AAG--AAAA-A--T-TT-GGATGA----TAATCTAGCAA--TAAATTTATAAT
gi|44928 : AAAATC-----CTCCTG--CTC-TCCCT-GTTTT-T--AAG--AAAA-C--G-TT-GGATGA----TAATCTAGCAA--TTAATTTATAA
gi|44929 : AAAATT-----CTTCCG--CCG-TCCCC-GTTTT-C--AAG--AAAA-A--T-TT-GGATGA----TAATCTAGCAA--TTAATTTATAAT
gi|44930 : AAAATC-----CTCTCG--CCC-TCCCT-GTTTT-T--AAG--AAAA-A--A-TT-GGATGA----TAATCTAGTAA--TTAATTTATAAT
gi|44931 : AAAATC-----CTCCCG--CTC-TCCCC-ATTTT-T--AAG--AAAA-A--T-TT-GAATGA----TATTCTAGCAA--TTAATTTATAAT
gi|44933 : AAAATC-----CTCCCG--CCC-TCCCC-GTTTT-T--AAC--AAAA-A--T-TG-GGATGA----TAATCTAGCAA--TTAAATTATAAT
gi|44934 : AAAATC-----CTCCCC--CAC-TCCCC-CTTTT-T--AAG--AAAA-A--T-TT-GGATGA----TAATCTAGCAA--TTAATTTATAAT
gi|44935 : AAAATC-----CTCCCA--CTT-TCCCC-GTTTT-T--AAG--AAAA-A--T-TTTGGATGA----TAATCTAGCAA--TTAATTTATAA
gi|44936 : AAAATC-----CTCCCG--TCC-TCCCC-ATTTT-T--AAG--AAAA-A--T-GT-GGATGA----TAATCTAGAAA--TTAATTTATAAT
gi|44937 : AAAGTC-----CTCCCG--CCC-TCCCT-GTTTTTT--AAG--AAAA-T--T-TT-GGATGA----TAATCTAGCAA--TTAATTTATAAT
gi|44938 : AAAATC-----CTCTCG--GCC-TCCCC-GTTTT-T--AAG--AAAA-A--T-TT-GGATGA----TAATCTAGCAA--TTAATACATAAT
gi|44939 : AAAATC-----TTCCCG--CCC-TCCCA-GTTTT-T--AAG--AAAA-A--T-TT-GGATGA----AAATCTAGCAA--TTAGTTTATAAT
gi|44940 : AAAATC-----CTCCCAAATCC-TCACC-ATTTT-T--AAG--AAAA-A--T-TT-GGATGA----TAATCTAGCAATTTTAATTTATAAT
gi|44942 : AAGATC-----CTCCTG--CCC-TCCTC-GTTTT-T--AAG--AAAA-A--T-TT-GGATGA----TAAATTAGCAA--TTTATTTATAAT
gi|44944 : AAAATC-----TTCCTG--CCC-TCCCC-GTTTT-A--AAG--AAAA-A--T-TT-AAAAGA----TAATCTAGCAA--TTAATTTATAAT
gi|44945 : AAAATC-----CTCCTG--CCC-TCCTC-GTATT-T--AAG--AAAA-A--A-TT-GGATAA----TAATCTAGCAA--TTAATTTATGA
gi|44946 : AAAATC-----CTCCCA--CCC-TCCCC-GTTTTTT--AAG--AAAA-A--T-TT-GGATGA----TAATCTAGGAT--TTAATTTATAAT
gi|44947 : AAAATC-----CTCCTG--CCC-TCCAT-GTTTT-T--AAG--AAAA-A--A-TT-GGATGA----TATTCTAGCAA--TTAATTCATAAT
gi|44948 : AAAATC-----CTCCCG--CCT-TCCTC-ATTTT-T--AAG--AAAA----T-TT-GGATGA----TAATCTAGCAA--TTGATTTATAAT
gi|44949 : AAAATT-----CTCTTG--CCC-TCCCC-CTTTT-T--AAG--TAAA-A--A-TT-GGATGA----TAATCTAGCAA--TTAATTTATAAT
gi|44950 : AAAATC-----CTCTCG--TCT-TCCCA-GTTTT-T--AAG--AAAA-A--T-TT-GGATGA----TAACCTAGCAA--TTAATTTATAA
gi|44951 : AAAATC-----CTACCA--CCC-TCCAC-GTTTT-T--AAG--AAAA-A--T-CT-GGATGA----TAATCTAGCAA--CTAATTTATAAT
gi|44953 : AAAATC-----CTTTCG--CCC-TACTC-GTTTT-T--AAG--AAAT-A--T-TT-GGATGA----TAATCTAGCAA--TTAATTTATAAT
gi|44954 : AAAATC-----CTTGTG--CCC-TCCCC-ATTGT-T--AAG--AAGA-A--T-TT-GGATGA----TAATCTAGCAA--TTAATTTATAGT
gi|44955 : AAAACC-----CTCCCA--CCC-TCCCT-GTTTT-T--AAG--AAAA-A--T-TT-GGATGA----TAATCTAGCAA--TTACTATATAAT
gi|44956 : AAAATC-----CTGCCG--CCC-TCCCC-ATTTT-T--AAA--AAAA-A--T-TT-GGATGA----TAATGCAGCAA--TTAATTTATAAT
gi|44957 : AAAATC-----CTCCCG--CCC-TTCCC-GTTTT-T--AAG--AAAC-A--T-TT-GGATGA----T-ATCTAGCAA--TTAATTTTTAAT
gi|44958 : AAAATC-----CTCCCA--CCC-TCCCC-ATTTT-T--AAG--AAAA-A--A-TT-TGATGA----TAATCTAGCAA--TTAATTTACAAT
gi|44959 : AAAGTC-----TTCCCA--CCC-TCCCC-GTTTT-T--AAG--AAAA-A--A-TT-GGATGA----TAATCTAGCAA--TTTATTTATAAT
gi|44960 : AAAATC-----CTCCCG--CCC-TCCCT-GTTTT-T--AAG--AAAA-A--A-TT-GGATAA----AAATCTAGTAA--TTAATTTATAAT
gi|44961 : AAAATC-----CTCCCG--CCC-TCTCT-ATTTT-T--AAG--AAAA-A--T-TT-GGATGA----TAATCTAAGAA--TTAATTTAAAAT
gi|44962 : AAAATCTTCCTCCCCCC--CCC-TCCCC-ATTTT-T--AAG--GAAA-A--T-TT-GGATGA----TAATCTAGCAA--TTAATTTATAAT
gi|44963 : AAAATC-----CTTCCA--CCC-TCCCC-GTTTT-T--AAG--AAAA----T-TT-GGATGA----TAATCTAGCAA--TCAATTTATTAT
gi|44964 : AAAATC-----C-CCCG--CCC-TCCCT-GTTTT-T--AAG--AAAA-G--T-TT-GGATGA----TAATCCAGCAA--TTAATTTAAAAT
gi|44965 : AAAATC-----CTCCCA--CCC-TCCCC-ATTTT-T--AAGTTAAAA-A-----T-GGATGA----TAATCTAGCAA--TTAATTTATAAT
gi|44966 : AAAATC-----TTCCCA--CCC-TCCCT-GTTTT----AAG--AAAA-A--T-TT-GGATGA----TAATCTTGCAA--TTAATTTATAAT
gi|44967 : AAAATA-----CTCCCG--CCC-TCACC-CTCTT-T--TAG--AAAA-A--T-TTTGGGTGA----TAATCTAGCAA--TTAATTTATAAT
gi|44968 : AAAATC-----CTCCCT--CCCATCCCC--TTTT-T--AAG--AAAA-G--T-TT-GGATGA----TAATCTAGCAA--TTAATTTATAAT
gi|44970 : AAGATA-----CTCCCG--CTC-TCC---GTTTT-T--AAG--AAAA-A--T-TT-GGATGA----TAATCAAGCAA--TTAATTTATAAT
gi|44971 : AAAATC-----CTCCCG--CTC-TCCCC-GTTTT-T--AAG--AAAA-AATT-TT-TTATGA----TAATCTAGCAA--TCAATTTATAAT
gi|44972 : AAAATC-----CTCCCA--CCC-TCTCC-GTTTT-T--AAA--ATAA-A--A-TT-GGATGA----TAATCTAGCAA--TTTATTTATAAT
gi|45100 : AAATC-----CTCCCA--CTC-TCCCC-GTTTT-T--AAG--AAAA-A--T-TT-GGATGA----TAATCTAGCAA--TTAATTTATAAT
gi|45101 : AAATC-----CTCCCA--CCC-TCCCC-GTTTT-T--AAG--AAAA-A--T-TT-GGATGA----TAATCTAACAA--TTAATTTATAAT
gi|45102 : AAATC-----CTCCTG--CTC-TCCCC-GTTTT-T--AAG--AAAA-A--T-TT-GGATGA----TAATCTAACAG--TTAATTTATAAT
gi|45104 : AAATC-----CTCCCG--CCC-TCCCC-GTTTT-T--AAG--AAAA-A--T-TT-GAATGT----TAATCTAGCAA--TTAATTTATAAT
gi|45105 : AAATC-----CTCCTG--CCC-TCCCT-GTTTT-T--AAG--AAAA-A--T-TT-GGATGA----TAATCTAGCAA--TTAATTGAAAAT
gi|45106 : AAATC-----CTCATG--CAC-TCCCC-GTTTT-T--AAG--AAAA-A--T-TT-GGATGA----TAATCTAGCAA--TTAATTTAAAAT
gi|45107 : AAATC-----CTCCCA--CCC-TCCCC-GTTTT-T--AAG--AAAA-A--A-AT-GGATGA----TAATCTAGCAA--TTAATTTATAAT
gi|45109 : AAATC-----CTCTCG--CCC-TCCCC-GTTTTTT--AAG--AAAA-A--T-TT-GAACGA----TAATCTAGCAA--TTAATTTATAAT
gi|45111 : AAACT-----CTACCG--CCC-TCCCT-GTTTT-T--AAG--AAAA-A--T-TT-GGATGA----TAAACTAGCAA--TTAATTTATAAT
gi|45112 : AAATC-----CTTCTT--CCC-TCCCC-GTTTT-T--AAG--AAAA-A--T-TT-GGATGA----TAATCTAGTAA--TTA
gi|45127 : AATC-----CTCCCG--CTT-TCCC--GTTTT-T--AAG--AAAA-A--T-TT-GGATGA----TAATCTAGCAA--TTAATTTATAAT
gi|45137 : TC-----CTCCCG--CCC-TCCCA-GTTTT-T--AAG--AAAAAA--T-TT-GGATGA----TAATCTAGCAA--TTAATTTATAAT
gi|45143 : C-----CTCCTG--CCC-TCCCC-ATTTT-T--AAG--AAAA-A--T-TT-GGATGA----TAATCTAGCAA--TTAATTTATAAT
gi|45154 : CCTG--CCC-TCCCC-GTTTT-T--AAG--AAAA-A--T-TT-GGATGA----TAATCTAGCAA--TTAATTTATAA