lowQualScore : 1
lowQualScore : 0 00 0 4 11 0 222222 5555 111111 11111 0 000 000 0 0
lowQualScore : . .. . . .. . ...... .... ...... ..... . ... ... . .
lowQualScore : 4 66 4 0 00 8 222222 5555 222222 00000 4 777 777 4 4
consensus : TTTATTTGAAC-A--AAC-TTG--AAACCCC-TAC------TCATAGGGA---TCAT------TT-----ATACC-AAA---TATG---AAC-A-AATTT
Reference ( gi|56509 ) : TTTATTTGAAC-A--AAC-TGG--AAACCCC-TAC------TCATAGGGA---CCAT------TT-----ATACC-AAA---TATG---AAC-A-AATTT
gi|56511 : TTCATTTGAAC-A--AAC-TTG--AAAACCC-TAC------TCATAGGGA---TCAT------TT-----ATACCAAAA---TATG---AAC-A-AATTT
gi|56512 : TTTATTTGAAC-A--AAC-TTC--AAACTCC-TAC------TCATATGGA---CTAT------TT-----ATACC-AAA---TATG---AAC-A-AATTT
gi|56516 : TTCGTTTGAAC-A--AAC-ATG--AAACCCC-TAT------TCATAGGGA---TCAT------TT-----ATACC-AAA---TATG---AAC-A-AATTT
gi|56521 : TTTATTTGAAA-C--AAC-TTG--AAACCCC-TAC------TCATAAGGA---TCAT------TT-----ATACC-AAA---TATA---AAC-A-AATTT
gi|56519 : TTTATTTCAAC-A--AAA-TTG--AAACCAC-TAC------TCATAGGGA---CCAT------TT-----ATACC-AAA---AATG---AAC-A-AATT
gi|56536 : TTAATTTGAAC-A--AAC-TTG--AAACCCC-TAC------TCATGGGGA---CTAT------TT-----ATACC-AAA---TATA---AAC-
gi|56550 : TTTATTTAAAC-A--AAC-TTG--AAACCCC-TAT------GCATACAGA---CCAT------TT-----ATACC-AAT---TATG---AAC-A-AATTT
gi|56528 : TTTATTTGAAC-A--AAC-ATG--AAACCCC-TAC------TAATAGGAA---TCAT------TT-----ATACT-AAA---TATG---TAC-A-AATTT
gi|56514 : TTTATTTCAAC-A--AAT-TTG--GAACTCC-TAG------TCATAGGGA---TCAT------TT-----ATACC-AAA---TATG---AAC-G-AATTT
gi|56510 : TTTATTTGAAC-A--AAT-TG---AAACTCC-TTG------TCATAGGGA---TTAT------TT-----ATACC-AAA---TATG---AAC-A-AATTT
gi|56520 : TTTACTTGAAC-A--AAC-TAG--AAACCC--TAG------TCATAGAGA---TCAT------TT-----AAACC-AAA---TATA---AAC-A-AATTT
gi|56537 : TTTATTTGAAC-T--AAC-TTG--AAACTGC-TAC------AAATAGGGA---CCAT------TT-----ATACC-AAA---TAAG---AAC-A-AATTT
gi|56539 : TTCATTTGATC-A--AAC-TTG--AAACCCC-TAC------TCAGAGGGA---TCAT------TT-----ACCCA-AAA---TATG---AAC-A-AATTT
gi|56544 : TTTATTTGAAC-A--AAC-ATG--AAATCCC-TGT------TCATAAGGA---TCAT------TT-----ATACA-AAA---TATA---AAC-A-AATTT
gi|56538 : TTTATTTAAAC-A--AAC-TTG--AAATCTC-TAT------TCATAGAGA---TCAT------TT-----AAACC-AAA---TATA---AAC-A-AATT
gi|56522 : TTTATTTGAAC-A--AAT-TTG--AAACTCC-TAG------TTATATGGG---TCAT------TT-----ATACC-AAA---TATG---AAC-A-AAT
gi|56548 : TTTTTTTGAAC-A--AAC-TGAC-CAACGCC-TAC------TCACAGGG----TCAT------TT-----ATACC-AAA---TATG---AAC-A-AATTT
gi|56553 : TTTATTTGAAT-A--CAC-TTA--AAAACCC-TAC------TCATAGGGA---TCAT------TT-----ACATC-TAA---TATG---AAC-A-AATTT
gi|56583 : TTTATGTAAAC-A--AAC-TTG--AACCCCC-TAC------TCATTAGGA---CCAT------TT-----ATACC-AAA---TGTG---AAC-A-
gi|56529 : TTCATTGGAGC-A--ATC-TTA--AAACTCC-TAC------TCACAGGGA---TCAT------CT-----ATACC-AAA---TATG---AAC-A-AATTT
gi|56594 : TTTAACTAAAC-A--AAC-TTG--AAACCGC-TAC------TCATAGGGA---CCAT------TT-----ATACA-AAC---TATG---AAC-G-AAT
gi|56599 : TTTATTTGAAC-A--AAC-TTG--AAACCAC-TGC------TCACAGGGA---CCA-------TT-----ATTCA-AAA---TTTG---AAC-A-AATTT
gi|56559 : TTTATTTGAAC-A--AGC-TTG--AAACCTC-TACCAGTACTCATAGGGA---TCAT------TA-----AAACC-AAA---TATA---AAC-A-AATTT
gi|56555 : TTTATTTGAAT-A--AAC-CTG--AA-TCCC-TAC------TCACAAGGA---TCAT------TT-----ATACC-AAA---TATG---AAT-A-AA
gi|56527 : TTTATTTGTAC-A--AAT-TTG--AAACTCC-TAG------TCATAGAGA---TCAT------TT-----ATACC-AAA---TACG---AAC-G-AACT
gi|56563 : TTGATTTGTAC-A--AAC-TTC--AAGCCCC-TAC------TCATAAGGA---TAAT------TT-----ATATC-AAA---TATG---AAC-A-AATT
gi|56562 : TTTATATGAAC-A--AAC-TTG--AAACCCC-TAT------TCGTAGGGA---TCCT------TT-----ATACC-AAA---TATT---AAA-A-AA
gi|56534 : TTTATTTGAAC-A--AAC-TTG--AAACTCG-TAC------ACATGTGGA---TCAT------GT-----ATACA-AAA---TATG---AAC-A-AATTT
gi|56517 : TTTATTTGAAA-A--AAA-TTG--AAACTCC-TACCGTAA-TCATACGGA---TCAT------TT-----ATACA-AAA---TATG---AAC-A-AATTT
gi|56574 : TTCATTTGAAT-A--AAC-TTA--AAACCCC-TTC------TCATAGAGA---TCAT------TC-----ATATG-AAA---TATG---AAC-A-AAT
gi|56587 : TTCATTTGAAA-A--AAC-ACG--AAACCCTGTTC------TCATAGGGA---TCAT------TC-----ATACC-AAA---TATG---AAC-G-AATTT
gi|56577 : TTTGTTTCAAC-A--AAC-TTG--AAACCCC-TAC------CCTTAGAGA---TCAT------TT-----ATACC-AAA---TACAAACAAC-A-AATTT
gi|56569 : TTTACT-GAAT-A--AAC-TTG--AAACCCC-TAT------CCATAGAGA---TCAT------TT-----ACACC-AAT---TATA---AAC-A-AATTT
gi|56530 : TTTATTAGAAC-A--CAT-TTG--GAACTCC-TAG------TCATAGAGA---TCAT------TT-----ATACC-AAA---TATG---AAC-G-AATCT
gi|56584 : TTCATCTGAAC-A--AAC-TTG--AACCCCCATAG------TCATAGGGA---TGAT------TT-----ATAGC-AAA---TATG---AAC-G-AATTT
gi|56531 : TTTACTTGAAC-A--AA---AGTTAAACCTC-TAT------TCATAGGGA---TCAT------TT-----AAACC-AAA---TATG---AAC-A-TATTT
gi|56533 : TTTACTGGAAC-A--AAT-TTG--AAACTCC-TAG------TCATAGGGA---TCAT------TT-----TTATA-AAA---TATG---AAC-A-AATT
gi|56592 : TTGATTTGTAC-A--AAC-TTC--AAATCCC-TAT------TCATAGGGA---TAAT------TT-----ATATC-AAA---TATG---AAC-T-AATTT
gi|56590 : TCTATTTAAAC-A--ATC-TTG--ATATCCC-TTC------TCATATGGA---TCAT------TT-----ATACC-AAA---TATG---CAC-A-AATTT
gi|56557 : TTTATTTGAAC-A--ACT-TTG--AAACCCC-TAC------TCATAGGGA---ACAT------TT-----AAGCC-AAA---TATT---AAT-A-TAT
gi|56547 : TTTATTTGAAT-A--AAT-TTG--GAACTCC-TGG------TCACAAGGA---TCAT------TT-----ATACC-AAA---TATA---AAC-T-AATTT
gi|56570 : TTTGTTTGAAC-A--AAT-CTG--AAACGCC-TAC------ATAAAAGGA---CCAT------TT-----ATACC-AAA---TATG---ACC-A-AGTTT
gi|56598 : TTGATTTGTAT-A--AAC-TTT--AAATCCC-TAC------CCATAGGGA---TAAT------CT-----ATATC-AAA---TATG---AAC-A-AATTT
gi|56593 : TTTATTTGAAT-A--AAC-TTG--AAACTCC-TTC------TTATGGGGA---CCAT------GT-----ATATC-AAA---TATA---ACC-A-AA
gi|56601 : TTCATTTGTAC-A--AAC-TTC--AAACCCT-TAC------TCATAGGGA---TAAC------TT-----GTATC-AAA---TATG---AAC-T-AATTT
gi|56556 : TTCATTTGAAT-A--AAC-ATG--AAACTCC-TAT------ACATAAGGA---TCAT------TT-----ATACA-AAA---TATG---AAC-A-CATTT
gi|56607 : TTCATTTGAAC-A--AAC-TTG--AAACCCC-TTT------TCATAGGGA----TAT------CT-----ATACT-GAA---TAAA---AAC-A-AATTT
gi|56606 : TTCATTTGAAC-A--AAC-TTG--AAACCCC-TTT------TCATAGGGA----TAT------CT-----ATACT-GAA---TAAA---AAC-A-AATTT
gi|56595 : TTCATTTGAAT-T--AGC-TTG--AAACCCC-TTC------TCATAGGGA---TCAT------TT-----ATACT-ACA---AATG---AAC-A-AAT
gi|56605 : TTTAATTGTAC-A--AAC-TTG--AAAGCCC-TAT------TCATAGAGA---TCAT------TT-----AAACT-AAA---TATA---AAC-G-AATTT
gi|56604 : TTGATTTGTAC-A--AAC-TTT--AAACCCA-TAC------TCATTGGGA---TAAT------CT-----ATATC-AAA---TATG---AAC-A-AATTT
gi|56549 : TTTACTTGAAC-A--AAA-TTG--AAAACCC-TAT------TCA--GAGA---TCAT------TT-----AAACC-AAA---TATA---AAC-A-AATTT
gi|56561 : TTTATTTGAAC-A--ACT-TTG--AAACCCC-TAT------TCATAGAGG---ACAT------TT-----AAACC-AAA---TATT---AAT-A-CATTT
gi|56572 : TTGATTTGTAC-A--AAC-TTT--AAACCCA-TAC------TCATTGGGA---TTAT------CC-----ATATC-AAA---TATG---AAC-A-AATTT
gi|56571 : TTGATTTGTAC-A--AAC-TTA--AAACTCT-TAA------TCATAGGGA---TAAT------TT-----ATATC-AAA---TATG---AAC-A-CATTT
gi|56613 : TTGATTTGTAC-A--AAC-TTC--AAACCCC-TAT------TCATAGGAA---TAAT------TT-----ATATC-AGA---TATG---AAC-T-AATTT
gi|56578 : TTCATTTGAAC-ATTAAC-TTA--AAACCTT-TAC------TTATAGCGA---TCAT------TT-----ACACT-AAA---TATA---AAC-A-AATT
gi|56610 : TTCATTTAAAC-T--AAC-ATG--AAAACCC-TAC------TCCCAGGGA---TCAT------TT-----ATACC-AAA---TATG---AAC-ATAAT
gi|56608 : TTGATTTGAAC-A--AAC-TTC--AAATCCC-AAC------TCATAGGGA---TAAT------TC-----ATATC-AAA---TATG---AAA-A-AAT
gi|56588 : TTGATTTGAAC-A--AAC-TTC--AAATCCC-AAC------TCATAGGGA---TAAT------TC-----ATATC-AAA---TATG---AAA-A-AAT
gi|56573 : TTGATTTTTAC-A--AAC-TTA--AAACTCT-TAA------TCATAGGGA---TAAT------TT-----ATATC-AAA---TATG---AAC-A-AATTT
gi|56523 : TTGATTTTTAC-A--AAC-TTA--AAACTCT-TAA------TCATAGGGA---TAAT------TT-----ATATC-AAA---TATG---AAC-A-AATTT
gi|56566 : TTGATTTGTAC-A--AAC-TTC--AAACTCC-TAC------TCATAAGGA---TAAC------TT-----ATAGC-AAA---TATG---AAC-A-AAT
gi|56591 : TTCATTTGACC-A--AAC-TTA--AAAACC--TGC------TCACAGGGA---TTAT------TT-----ACACT-AAA---TATG---AAC-A-AATTT
gi|56579 : TTGATTTGTAC-A--AAC-TTA--GAACTCT-TAA------TCATAGGGA---TAAT------TC-----ATATC-AAA---TATG---AAC-A-AATTT
gi|56560 : TTTATTTGAAC-A--AAT-TTG--GAATTCC-TTG------TCATAGGGA---TCAT------TT-----ACGCC-AAA---AATG---AAC-T-AATTT
gi|56542 : TTCATTTGAACTA--AAT-TG----AACTCC-TAC------TCATAGGAAGAATCAT------TT-----ATGCC-AAA---TATG---AAT-G-AATTT
gi|56552 : TTCATTTGAAC-A--AAG-TTG--AAACTCC-GGC------TCATAGGAA---TCAT------TT-----ATATG-AAA---TATA---AAT-G-AATTT
gi|56568 : TTTACTGGAAC-A--AAT-TTG--AAACTCC-TAG------TCATAGGAA---TCAT------TT-----TTGTA-AAA---TATG---AAC-A-AATT
gi|56567 : TTTATTTGAAC-A--AAA-TTC--AAAACTG-TAC------TTATAGGGA---TTCT------TT-----TTACC-AAA---TATG---AAC-A-AATT
gi|56596 : TTGATTTGTAC-A--AAC-TTA--AAACTCT-TAA------TCATAGGGA---TAAT------TT-----ACATC-AAA---CATG---AAC-A-AATCT
gi|56611 : TTGATTTGTAC-A--AAC-TT----AACTCT-TAA------TCATAGGGA---TAAT------TT-----ATATC-AAA---TATG---AAC-A-AATCT
gi|56585 : TTT-TTTAAAC-A--AAT-TTG--GAACTCT-TAG------TCATACAGA---TCAT------TT-----ATACA-AAA---TATG---AAC-G-AATTT
gi|56614 : TTGATTTGTAC-A--AAC-TTA--GATTTCT-TAA------TCATAGGGA---TAAT------TT-----ATATC-AAA---TATG---AAC-A-AATTT
gi|56615 : TTAATTTGTAC-A--AAC-TTA--GATTTCT-TAA------TCATAGGGA---TAAT------TT-----ATATC-AAA---TATG---AAC-A-AATTT
gi|56540 : TTCATTTAAGC-A--AAC-TTG--AGACTCT-TAC------ACAAATGGA---TCAT------TTATAATATACC-AAA---TATG---AAC-A-AATT
gi|56576 : TTTATTTGAAC-A--AAG-TTG--AAACTCC-T---------CATAGGGA---TCAT------AT-----ATGCC-ATA---TTTG---AAT-G-AATTT
gi|56551 : TTCATTTCAAT-A--AAA-TTG--AAACACA-TAC------TCATAGGGA---TCAT------TC-----ATGTC-AAA---TATG---AAT-G-AAT
gi|56558 : TTTATTTAAAC-A--AAT-TTG--AAACTAT-TAG------TCAGTGGGA---TCAC------TT-----ATACC-AAA---TATC---AAC-C-AATTT
gi|56602 : TTGATTTGTAC-A--TAA-TTT--AAACCCT-TAC------CCATAGGGA---TAAT------CT-----ATACC-AAA---TATA---AAC-A-CATTT
gi|56581 : TTTATTTGAAC-A--AAA-TTA--ATTCTTC-TAT------TCATAGGCA---TCATAAAATTTT-----ATACC-AAG---TATG---AAC-G-AATTT
gi|56681 : TTATTTCAAC-A--AAC-TTG--AAACCGC-TAC------TCATAGGGA---TCAT------TT-----ATATC-AAA---TATG---AAA-A-AAATT
gi|56697 : TTATCTG--C-A--ATC------AAACCCC-TAC------ACATAGGGA---TAAT------TT-----ATACC-AAA---TATG---AAC-A-AATCT
gi|56686 : TTATCTGAAT-T--AAG-TTT--AAATTCC-TAC------TCATAGAGA---TCAT------TT-----ATACC-AAA---TATA---AATGA-AATTT
gi|56682 : TTATTCAAAA-A--AAAATTT--AAACTCT-TAG------TCAAAGGGA---TCAT------TT-----ATACC-AAA---TATA---AAC-C-AATT
gi|56775 : TATTTGGAC-A--AAC-TTG--AAACCTC-TAT------TCATAGAGA---CCAT------TT-----ATACA-AAA---TATA---AAC-A-
gi|56774 : TATTTGAAA-A--AAA-TTG--AAACCCC-AAC------TAAAAGGGA---CCAT------TT-----ATATC-AAA---TATG---AAC-A-AATTT
gi|56776 : TATTTGAAC-A--AAC-TTG--AAAC----TAC------TCATAAGGA---CCAT------TT-----ATACC-AAA---TATA-------A-AATTT
gi|56779 : ATATGAAC-A--AAC-TTG--AAACCTC-TAC------TCATAGGGA---TAAT------TT-----ATACC-AAACATTATA---AAA-A-AATT
gi|56778 : ATTTGTAC-A--AAC-TCA--GAACTCA-TAA------TCATAGGGA---TAAT------TT-----ATATC-AAA---TATG---AAC-A-AATTT
gi|56785 : TTTGAAC-A--AAA-TTG--AAACTCC-TAC------TCAAAGGGA---TCAT------TT-----ATGTT-AAA---AATG---ACT-G-GATTT
gi|56789 : TTGAAC-A--AAC-TTG--AAATCCC-TAT------TCATAGAGA---TGAT------TT-----AAACC-AAA---TATT---GAC-A-AATCT
gi|56795 : AC-A--AAC-TTA--ACACTCT-TAA------TCATAGGGA---TAAT------TT-----ATATC-AAA---TATG---AAC-A-AATTT
gi|56830 : G--AAACCCC-TAC------TCAAAGAGA---TCAT------GT-----ATACC-AAA---TATG---AAC-T-AATTT
gi|56812 : t--AAACCCC-TAA------TCATAGAGA---TAAT------TT-----ATGCC-AAA---TATG---AAC-A-AATTT
gi|56809 : attc--AAACCCC-TAC------ACATAGGGA---TAAT------TT-----ATGCC-AAA---TATG---AAC-A-AATCT
gi|56835 : attc--AAACTCC-TAC------ACATAGGGA---TAAT------TT-----ATGCC-AAA---TATG---AAC-A-AATCT
gi|56807 : --AAACTCC-TAA------TCATAGTGA---TAAT------TT-----ATGCC-AAA---TATG---AAC-A-AATTT
gi|56798 : attcAACTCT-TAA------TCATAGGGA---TAAT------TT-----ATATC-AAA---TATG---AAC-A-AATTT
Alignments
lowQualScore : 00 0 00 0 222222 000 111111 11111 0 000 000 0 0
lowQualScore : .. . .. . ...... ... ...... ..... . ... ... . .
lowQualScore : 66 4 66 8 222222 777 222222 00000 4 777 777 4 4
consensus : TTTATTTGAACA--AAC-TTGA--AACCCC-TAC------TCATAGGGA---TCA------TT-----TATACC-AAA---TATG---AAC-A-AATTT
Reference ( family-126 ) : TTTATTTGAACA--AAC-TTGA--AACCCC-TAC------TCATAGGGA---TCA------TT-----TATACC-AAA---TATG---AAC-A-AATTT
gi|56509 : TTTATTTGAACA--AAC-TGGA--AACCCC-TAC------TCATAGGGA---CCA------TT-----TATACC-AAA---TATG---AAC-A-AATTT
gi|56510 : TTTATTTGAACA--AA--TTGA--AACTCC-TTG------TCATAGGGA---TTA------TT-----TATACC-AAA---TATG---AAC-A-AATTT
gi|56511 : TTCATTTGAACA--AAC-TTGA--AAACCC-TAC------TCATAGGGA---TCA------TT-----TATACCAAAA---TATG---AAC-A-AATTT
gi|56512 : TTTATTTGAACA--AAC-TTCA--AACTCC-TAC------TCATATGGA---CTA------TT-----TATACC-AAA---TATG---AAC-A-AATTT
gi|56514 : TTTATTTCAACA--AAT-TTGG--AACTCC-TAG------TCATAGGGA---TCA------TT-----TATACC-AAA---TATG---AAC-G-AATTT
gi|56516 : TTCGTTTGAACA--AAC-ATGA--AACCCC-TAT------TCATAGGGA---TCA------TT-----TATACC-AAA---TATG---AAC-A-AATTT
gi|56517 : TTTATTTGAAAA--AAA-TTGA--AACTCC-TACCGTAA-TCATACGGA---TCA------TT-----TATACA-AAA---TATG---AAC-A-AATTT
gi|56519 : TTTATTTCAACA--AAA-TTGA--AACCAC-TAC------TCATAGGGA---CCA------TT-----TATACC-AAA---AATG---AAC-A-AATT
gi|56520 : TTTACTTGAACA--AAC-TAGA--AACCC--TAG------TCATAGAGA---TCA------TT-----TAAACC-AAA---TATA---AAC-A-AATTT
gi|56521 : TTTATTTGAAAC--AAC-TTGA--AACCCC-TAC------TCATAAGGA---TCA------TT-----TATACC-AAA---TATA---AAC-A-AATTT
gi|56522 : TTTATTTGAACA--AAT-TTGA--AACTCC-TAG------TTATATGGG---TCA------TT-----TATACC-AAA---TATG---AAC-A-AAT
gi|56523 : TTGATTTTTACA--AAC-TTAA--AACTCT-TAA------TCATAGGGA---TAA------TT-----TATATC-AAA---TATG---AAC-A-AATTT
gi|56527 : TTTATTTGTACA--AAT-TTGA--AACTCC-TAG------TCATAGAGA---TCA------TT-----TATACC-AAA---TACG---AAC-G-AACT
gi|56528 : TTTATTTGAACA--AAC-ATGA--AACCCC-TAC------TAATAGGAA---TCA------TT-----TATACT-AAA---TATG---TAC-A-AATTT
gi|56529 : TTCATTGGAGCA--ATC-TTAA--AACTCC-TAC------TCACAGGGA---TCA------TC-----TATACC-AAA---TATG---AAC-A-AATTT
gi|56530 : TTTATTAGAACA--CAT-TTGG--AACTCC-TAG------TCATAGAGA---TCA------TT-----TATACC-AAA---TATG---AAC-G-AATCT
gi|56531 : TTTACTTGAACA--AAA-GTTA--AACCTC-TAT------TCATAGGGA---TCA------TT-----TAAACC-AAA---TATG---AAC-A-TATTT
gi|56533 : TTTACTGGAACA--AAT-TTGA--AACTCC-TAG------TCATAGGGA---TCA------TT-----TTTATA-AAA---TATG---AAC-A-AATT
gi|56534 : TTTATTTGAACA--AAC-TTGA--AACTCG-TAC------ACATGTGGA---TCA------TG-----TATACA-AAA---TATG---AAC-A-AATTT
gi|56536 : TTAATTTGAACA--AAC-TTGA--AACCCC-TAC------TCATGGGGA---CTA------TT-----TATACC-AAA---TATA---AAC-
gi|56537 : TTTATTTGAACT--AAC-TTGA--AACTGC-TAC------AAATAGGGA---CCA------TT-----TATACC-AAA---TAAG---AAC-A-AATTT
gi|56538 : TTTATTTAAACA--AAC-TTGA--AATCTC-TAT------TCATAGAGA---TCA------TT-----TAAACC-AAA---TATA---AAC-A-AATT
gi|56539 : TTCATTTGATCA--AAC-TTGA--AACCCC-TAC------TCAGAGGGA---TCA------TT-----TACCCA-AAA---TATG---AAC-A-AATTT
gi|56540 : TTCATTTAAGCA--AAC-TTGA--GACTCT-TAC------ACAAATGGA---TCA------TTTATAATATACC-AAA---TATG---AAC-A-AATT
gi|56542 : TTCATTTGAACT--AAA-TTGA--A-CTCC-TAC------TCATAGGAAGAATCA------TT-----TATGCC-AAA---TATG---AAT-G-AATTT
gi|56544 : TTTATTTGAACA--AAC-ATGA--AATCCC-TGT------TCATAAGGA---TCA------TT-----TATACA-AAA---TATA---AAC-A-AATTT
gi|56547 : TTTATTTGAATA--AAT-TTGG--AACTCC-TGG------TCACAAGGA---TCA------TT-----TATACC-AAA---TATA---AAC-T-AATTT
gi|56548 : TTTTTTTGAACA--AAC--TGACCAACGCC-TAC------TCACAGGG----TCA------TT-----TATACC-AAA---TATG---AAC-A-AATTT
gi|56549 : TTTACTTGAACA--AAA-TTGA--AAACCC-TAT------TCA--GAGA---TCA------TT-----TAAACC-AAA---TATA---AAC-A-AATTT
gi|56550 : TTTATTTAAACA--AAC-TTGA--AACCCC-TAT------GCATACAGA---CCA------TT-----TATACC-AAT---TATG---AAC-A-AATTT
gi|56551 : TTCATTTCAATA--AAA-TTGA--AACACA-TAC------TCATAGGGA---TCA------TT-----CATGTC-AAA---TATG---AAT-G-AAT
gi|56552 : TTCATTTGAACA--AAG-TTGA--AACTCC-GGC------TCATAGGAA---TCA------TT-----TATATG-AAA---TATA---AAT-G-AATTT
gi|56553 : TTTATTTGAATA--CAC-TTAA--AAACCC-TAC------TCATAGGGA---TCA------TT-----TACATC-TAA---TATG---AAC-A-AATTT
gi|56555 : TTTATTTGAATA--AAC-CTGA--A-TCCC-TAC------TCACAAGGA---TCA------TT-----TATACC-AAA---TATG---AAT-A-AA
gi|56556 : TTCATTTGAATA--AAC-ATGA--AACTCC-TAT------ACATAAGGA---TCA------TT-----TATACA-AAA---TATG---AAC-A-CATTT
gi|56557 : TTTATTTGAACA--ACT-TTGA--AACCCC-TAC------TCATAGGGA---ACA------TT-----TAAGCC-AAA---TATT---AAT-A-TAT
gi|56558 : TTTATTTAAACA--AAT-TTGA--AACTAT-TAG------TCAGTGGGA---TCA------CT-----TATACC-AAA---TATC---AAC-C-AATTT
gi|56559 : TTTATTTGAACA--AGC-TTGA--AACCTC-TACCAGTACTCATAGGGA---TCA------TT-----AAAACC-AAA---TATA---AAC-A-AATTT
gi|56560 : TTTATTTGAACA--AAT-TTGG--AATTCC-TTG------TCATAGGGA---TCA------TT-----TACGCC-AAA---AATG---AAC-T-AATTT
gi|56561 : TTTATTTGAACA--ACT-TTGA--AACCCC-TAT------TCATAGAGG---ACA------TT-----TAAACC-AAA---TATT---AAT-A-CATTT
gi|56562 : TTTATATGAACA--AAC-TTGA--AACCCC-TAT------TCGTAGGGA---TCC------TT-----TATACC-AAA---TATT---AAA-A-AA
gi|56563 : TTGATTTGTACA--AAC-TTCA--AGCCCC-TAC------TCATAAGGA---TAA------TT-----TATATC-AAA---TATG---AAC-A-AATT
gi|56566 : TTGATTTGTACA--AAC-TTCA--AACTCC-TAC------TCATAAGGA---TAA------CT-----TATAGC-AAA---TATG---AAC-A-AAT
gi|56567 : TTTATTTGAACA--AAA-TTCA--AAACTG-TAC------TTATAGGGA---TTC------TT-----TTTACC-AAA---TATG---AAC-A-AATT
gi|56568 : TTTACTGGAACA--AAT-TTGA--AACTCC-TAG------TCATAGGAA---TCA------TT-----TTTGTA-AAA---TATG---AAC-A-AATT
gi|56569 : TTTACT-GAATA--AAC-TTGA--AACCCC-TAT------CCATAGAGA---TCA------TT-----TACACC-AAT---TATA---AAC-A-AATTT
gi|56570 : TTTGTTTGAACA--AAT-CTGA--AACGCC-TAC------ATAAAAGGA---CCA------TT-----TATACC-AAA---TATG---ACC-A-AGTTT
gi|56571 : TTGATTTGTACA--AAC-TTAA--AACTCT-TAA------TCATAGGGA---TAA------TT-----TATATC-AAA---TATG---AAC-A-CATTT
gi|56572 : TTGATTTGTACA--AAC-TTTA--AACCCA-TAC------TCATTGGGA---TTA------TC-----CATATC-AAA---TATG---AAC-A-AATTT
gi|56573 : TTGATTTTTACA--AAC-TTAA--AACTCT-TAA------TCATAGGGA---TAA------TT-----TATATC-AAA---TATG---AAC-A-AATTT
gi|56574 : TTCATTTGAATA--AAC-TTAA--AACCCC-TTC------TCATAGAGA---TCA------TT-----CATATG-AAA---TATG---AAC-A-AAT
gi|56576 : TTTATTTGAACA--AAG-TTGA--AACTCC-T---------CATAGGGA---TCA------TA-----TATGCC-ATA---TTTG---AAT-G-AATTT
gi|56577 : TTTGTTTCAACA--AAC-TTGA--AACCCC-TAC------CCTTAGAGA---TCA------TT-----TATACC-AAA---TACAAACAAC-A-AATTT
gi|56578 : TTCATTTGAACATTAAC-TTAA--AACCTT-TAC------TTATAGCGA---TCA------TT-----TACACT-AAA---TATA---AAC-A-AATT
gi|56579 : TTGATTTGTACA--AAC-TTAG--AACTCT-TAA------TCATAGGGA---TAA------TT-----CATATC-AAA---TATG---AAC-A-AATTT
gi|56581 : TTTATTTGAACA--AAA-TTAA--TTCTTC-TAT------TCATAGGCA---TCATAAAATTT-----TATACC-AAG---TATG---AAC-G-AATTT
gi|56583 : TTTATGTAAACA--AAC-TTGA--ACCCCC-TAC------TCATTAGGA---CCA------TT-----TATACC-AAA---TGTG---AAC-A-
gi|56584 : TTCATCTGAACA--AAC-TTGA--ACCCCCATAG------TCATAGGGA---TGA------TT-----TATAGC-AAA---TATG---AAC-G-AATTT
gi|56585 : TTT-TTTAAACA--AAT-TTGG--AACTCT-TAG------TCATACAGA---TCA------TT-----TATACA-AAA---TATG---AAC-G-AATTT
gi|56587 : TTCATTTGAAAA--AAC-ACGA--AACCCTGTTC------TCATAGGGA---TCA------TT-----CATACC-AAA---TATG---AAC-G-AATTT
gi|56588 : TTGATTTGAACA--AAC-TTCA--AATCCC-AAC------TCATAGGGA---TAA------TT-----CATATC-AAA---TATG---AAA-A-AAT
gi|56590 : TCTATTTAAACA--ATC-TTGA--TATCCC-TTC------TCATATGGA---TCA------TT-----TATACC-AAA---TATG---CAC-A-AATTT
gi|56591 : TTCATTTGACCA--AAC-TTAA--AAACC--TGC------TCACAGGGA---TTA------TT-----TACACT-AAA---TATG---AAC-A-AATTT
gi|56592 : TTGATTTGTACA--AAC-TTCA--AATCCC-TAT------TCATAGGGA---TAA------TT-----TATATC-AAA---TATG---AAC-T-AATTT
gi|56593 : TTTATTTGAATA--AAC-TTGA--AACTCC-TTC------TTATGGGGA---CCA------TG-----TATATC-AAA---TATA---ACC-A-AA
gi|56594 : TTTAACTAAACA--AAC-TTGA--AACCGC-TAC------TCATAGGGA---CCA------TT-----TATACA-AAC---TATG---AAC-G-AAT
gi|56595 : TTCATTTGAATT--AGC-TTGA--AACCCC-TTC------TCATAGGGA---TCA------TT-----TATACT-ACA---AATG---AAC-A-AAT
gi|56596 : TTGATTTGTACA--AAC-TTAA--AACTCT-TAA------TCATAGGGA---TAA------TT-----TACATC-AAA---CATG---AAC-A-AATCT
gi|56598 : TTGATTTGTATA--AAC-TTTA--AATCCC-TAC------CCATAGGGA---TAA------TC-----TATATC-AAA---TATG---AAC-A-AATTT
gi|56599 : TTTATTTGAACA--AAC-TTGA--AACCAC-TGC------TCACAGGGA---CCA-------T-----TATTCA-AAA---TTTG---AAC-A-AATTT
gi|56601 : TTCATTTGTACA--AAC-TTCA--AACCCT-TAC------TCATAGGGA---TAA------CT-----TGTATC-AAA---TATG---AAC-T-AATTT
gi|56602 : TTGATTTGTACA--TAA-TTTA--AACCCT-TAC------CCATAGGGA---TAA------TC-----TATACC-AAA---TATA---AAC-A-CATTT
gi|56604 : TTGATTTGTACA--AAC-TTTA--AACCCA-TAC------TCATTGGGA---TAA------TC-----TATATC-AAA---TATG---AAC-A-AATTT
gi|56605 : TTTAATTGTACA--AAC-TTGA--AAGCCC-TAT------TCATAGAGA---TCA------TT-----TAAACT-AAA---TATA---AAC-G-AATTT
gi|56606 : TTCATTTGAACA--AAC-TTGA--AACCCC-TTT------TCATAGGGA---T-A------TC-----TATACT-GAA---TAAA---AAC-A-AATTT
gi|56607 : TTCATTTGAACA--AAC-TTGA--AACCCC-TTT------TCATAGGGA---T-A------TC-----TATACT-GAA---TAAA---AAC-A-AATTT
gi|56608 : TTGATTTGAACA--AAC-TTCA--AATCCC-AAC------TCATAGGGA---TAA------TT-----CATATC-AAA---TATG---AAA-A-AAT
gi|56610 : TTCATTTAAACT--AAC-ATGA--AAACCC-TAC------TCCCAGGGA---TCA------TT-----TATACC-AAA---TATG---AAC-ATAAT
gi|56611 : TTGATTTGTACA--AAC-TT----AACTCT-TAA------TCATAGGGA---TAA------TT-----TATATC-AAA---TATG---AAC-A-AATCT
gi|56613 : TTGATTTGTACA--AAC-TTCA--AACCCC-TAT------TCATAGGAA---TAA------TT-----TATATC-AGA---TATG---AAC-T-AATTT
gi|56614 : TTGATTTGTACA--AAC-TTAG--ATTTCT-TAA------TCATAGGGA---TAA------TT-----TATATC-AAA---TATG---AAC-A-AATTT
gi|56615 : TTAATTTGTACA--AAC-TTAG--ATTTCT-TAA------TCATAGGGA---TAA------TT-----TATATC-AAA---TATG---AAC-A-AATTT
gi|56681 : TTATTTCAACA--AAC-TTGA--AACCGC-TAC------TCATAGGGA---TCA------TT-----TATATC-AAA---TATG---AAA-A-AAATT
gi|56682 : TTATTCAAAAA--AAAATTTA--AACTCT-TAG------TCAAAGGGA---TCA------TT-----TATACC-AAA---TATA---AAC-C-AATT
gi|56686 : TTATCTGAATT--AAG-TTTA--AATTCC-TAC------TCATAGAGA---TCA------TT-----TATACC-AAA---TATA---AATGA-AATTT
gi|56697 : TTATCTG--CA--A----TCA--AACCCC-TAC------ACATAGGGA---TAA------TT-----TATACC-AAA---TATG---AAC-A-AATCT
gi|56774 : TATTTGAAAA--AAA-TTGA--AACCCC-AAC------TAAAAGGGA---CCA------TT-----TATATC-AAA---TATG---AAC-A-AATTT
gi|56775 : TATTTGGACA--AAC-TTGA--AACCTC-TAT------TCATAGAGA---CCA------TT-----TATACA-AAA---TATA---AAC-A-
gi|56776 : TATTTGAACA--AAC-TTGA--AAC----TAC------TCATAAGGA---CCA------TT-----TATACC-AAA---TATA-------A-AATTT
gi|56778 : ATTTGTACA--AAC-TCAG--AACTCA-TAA------TCATAGGGA---TAA------TT-----TATATC-AAA---TATG---AAC-A-AATTT
gi|56779 : ATATGAACA--AAC-TTGA--AACCTC-TAC------TCATAGGGA---TAA------TT-----TATACC-AAACATTATA---AAA-A-AATT
gi|56785 : TTTGAACA--AAA-TTGA--AACTCC-TAC------TCAAAGGGA---TCA------TT-----TATGTT-AAA---AATG---ACT-G-GATTT
gi|56789 : TTGAACA--AAC-TTGA--AATCCC-TAT------TCATAGAGA---TGA------TT-----TAAACC-AAA---TATT---GAC-A-AATCT
gi|56795 : ACA--AAC-TTAA--CACTCT-TAA------TCATAGGGA---TAA------TT-----TATATC-AAA---TATG---AAC-A-AATTT
gi|56798 : -TTAG--AACTCT-TAA------TCATAGGGA---TAA------TT-----TATATC-AAA---TATG---AAC-A-AATTT
gi|56807 : aga-TTCA--AACTCC-TAA------TCATAGTGA---TAA------TT-----TATGCC-AAA---TATG---AAC-A-AATTT
gi|56809 : a-TTCA--AACCCC-TAC------ACATAGGGA---TAA------TT-----TATGCC-AAA---TATG---AAC-A-AATCT
gi|56812 : a-TTCA--AACCCC-TAA------TCATAGAGA---TAA------TT-----TATGCC-AAA---TATG---AAC-A-AATTT
gi|56830 : aTGA--AACCCC-TAC------TCAAAGAGA---TCA------TG-----TATACC-AAA---TATG---AAC-T-AATTT
gi|56835 : A--AACTCC-TAC------ACATAGGGA---TAA------TT-----TATGCC-AAA---TATG---AAC-A-AATCT
Alignments
lowQualScore : 00 0 00 0 222222 000 111111 11111 0 000 000 0 0
lowQualScore : .. . .. . ...... ... ...... ..... . ... ... . .
lowQualScore : 66 4 66 8 222222 777 222222 00000 4 777 777 4 4
consensus : TTTATTTGAACA--AAC-TTGA--AACCCC-TAC------TCATAGGGA---TCA------TT-----TATACC-AAA---TATG---AAC-A-AATTT
Reference ( family-126 ) : TTTATTTGAACA--AAC-TTGA--AACCCC-TAC------TCATAGGGA---TCA------TT-----TATACC-AAA---TATG---AAC-A-AATTT
gi|56509 : TTTATTTGAACA--AAC-TGGA--AACCCC-TAC------TCATAGGGA---CCA------TT-----TATACC-AAA---TATG---AAC-A-AATTT
gi|56510 : TTTATTTGAACA--AA--TTGA--AACTCC-TTG------TCATAGGGA---TTA------TT-----TATACC-AAA---TATG---AAC-A-AATTT
gi|56511 : TTCATTTGAACA--AAC-TTGA--AAACCC-TAC------TCATAGGGA---TCA------TT-----TATACCAAAA---TATG---AAC-A-AATTT
gi|56512 : TTTATTTGAACA--AAC-TTCA--AACTCC-TAC------TCATATGGA---CTA------TT-----TATACC-AAA---TATG---AAC-A-AATTT
gi|56514 : TTTATTTCAACA--AAT-TTGG--AACTCC-TAG------TCATAGGGA---TCA------TT-----TATACC-AAA---TATG---AAC-G-AATTT
gi|56516 : TTCGTTTGAACA--AAC-ATGA--AACCCC-TAT------TCATAGGGA---TCA------TT-----TATACC-AAA---TATG---AAC-A-AATTT
gi|56517 : TTTATTTGAAAA--AAA-TTGA--AACTCC-TACCGTAA-TCATACGGA---TCA------TT-----TATACA-AAA---TATG---AAC-A-AATTT
gi|56519 : TTTATTTCAACA--AAA-TTGA--AACCAC-TAC------TCATAGGGA---CCA------TT-----TATACC-AAA---AATG---AAC-A-AATT
gi|56520 : TTTACTTGAACA--AAC-TAGA--AACCC--TAG------TCATAGAGA---TCA------TT-----TAAACC-AAA---TATA---AAC-A-AATTT
gi|56521 : TTTATTTGAAAC--AAC-TTGA--AACCCC-TAC------TCATAAGGA---TCA------TT-----TATACC-AAA---TATA---AAC-A-AATTT
gi|56522 : TTTATTTGAACA--AAT-TTGA--AACTCC-TAG------TTATATGGG---TCA------TT-----TATACC-AAA---TATG---AAC-A-AAT
gi|56523 : TTGATTTTTACA--AAC-TTAA--AACTCT-TAA------TCATAGGGA---TAA------TT-----TATATC-AAA---TATG---AAC-A-AATTT
gi|56527 : TTTATTTGTACA--AAT-TTGA--AACTCC-TAG------TCATAGAGA---TCA------TT-----TATACC-AAA---TACG---AAC-G-AACT
gi|56528 : TTTATTTGAACA--AAC-ATGA--AACCCC-TAC------TAATAGGAA---TCA------TT-----TATACT-AAA---TATG---TAC-A-AATTT
gi|56529 : TTCATTGGAGCA--ATC-TTAA--AACTCC-TAC------TCACAGGGA---TCA------TC-----TATACC-AAA---TATG---AAC-A-AATTT
gi|56530 : TTTATTAGAACA--CAT-TTGG--AACTCC-TAG------TCATAGAGA---TCA------TT-----TATACC-AAA---TATG---AAC-G-AATCT
gi|56531 : TTTACTTGAACA--AAA-GTTA--AACCTC-TAT------TCATAGGGA---TCA------TT-----TAAACC-AAA---TATG---AAC-A-TATTT
gi|56533 : TTTACTGGAACA--AAT-TTGA--AACTCC-TAG------TCATAGGGA---TCA------TT-----TTTATA-AAA---TATG---AAC-A-AATT
gi|56534 : TTTATTTGAACA--AAC-TTGA--AACTCG-TAC------ACATGTGGA---TCA------TG-----TATACA-AAA---TATG---AAC-A-AATTT
gi|56536 : TTAATTTGAACA--AAC-TTGA--AACCCC-TAC------TCATGGGGA---CTA------TT-----TATACC-AAA---TATA---AAC-
gi|56537 : TTTATTTGAACT--AAC-TTGA--AACTGC-TAC------AAATAGGGA---CCA------TT-----TATACC-AAA---TAAG---AAC-A-AATTT
gi|56538 : TTTATTTAAACA--AAC-TTGA--AATCTC-TAT------TCATAGAGA---TCA------TT-----TAAACC-AAA---TATA---AAC-A-AATT
gi|56539 : TTCATTTGATCA--AAC-TTGA--AACCCC-TAC------TCAGAGGGA---TCA------TT-----TACCCA-AAA---TATG---AAC-A-AATTT
gi|56540 : TTCATTTAAGCA--AAC-TTGA--GACTCT-TAC------ACAAATGGA---TCA------TTTATAATATACC-AAA---TATG---AAC-A-AATT
gi|56542 : TTCATTTGAACT--AAA-TTGA--A-CTCC-TAC------TCATAGGAAGAATCA------TT-----TATGCC-AAA---TATG---AAT-G-AATTT
gi|56544 : TTTATTTGAACA--AAC-ATGA--AATCCC-TGT------TCATAAGGA---TCA------TT-----TATACA-AAA---TATA---AAC-A-AATTT
gi|56547 : TTTATTTGAATA--AAT-TTGG--AACTCC-TGG------TCACAAGGA---TCA------TT-----TATACC-AAA---TATA---AAC-T-AATTT
gi|56548 : TTTTTTTGAACA--AAC--TGACCAACGCC-TAC------TCACAGGG----TCA------TT-----TATACC-AAA---TATG---AAC-A-AATTT
gi|56549 : TTTACTTGAACA--AAA-TTGA--AAACCC-TAT------TCA--GAGA---TCA------TT-----TAAACC-AAA---TATA---AAC-A-AATTT
gi|56550 : TTTATTTAAACA--AAC-TTGA--AACCCC-TAT------GCATACAGA---CCA------TT-----TATACC-AAT---TATG---AAC-A-AATTT
gi|56551 : TTCATTTCAATA--AAA-TTGA--AACACA-TAC------TCATAGGGA---TCA------TT-----CATGTC-AAA---TATG---AAT-G-AAT
gi|56552 : TTCATTTGAACA--AAG-TTGA--AACTCC-GGC------TCATAGGAA---TCA------TT-----TATATG-AAA---TATA---AAT-G-AATTT
gi|56553 : TTTATTTGAATA--CAC-TTAA--AAACCC-TAC------TCATAGGGA---TCA------TT-----TACATC-TAA---TATG---AAC-A-AATTT
gi|56555 : TTTATTTGAATA--AAC-CTGA--A-TCCC-TAC------TCACAAGGA---TCA------TT-----TATACC-AAA---TATG---AAT-A-AA
gi|56556 : TTCATTTGAATA--AAC-ATGA--AACTCC-TAT------ACATAAGGA---TCA------TT-----TATACA-AAA---TATG---AAC-A-CATTT
gi|56557 : TTTATTTGAACA--ACT-TTGA--AACCCC-TAC------TCATAGGGA---ACA------TT-----TAAGCC-AAA---TATT---AAT-A-TAT
gi|56558 : TTTATTTAAACA--AAT-TTGA--AACTAT-TAG------TCAGTGGGA---TCA------CT-----TATACC-AAA---TATC---AAC-C-AATTT
gi|56559 : TTTATTTGAACA--AGC-TTGA--AACCTC-TACCAGTACTCATAGGGA---TCA------TT-----AAAACC-AAA---TATA---AAC-A-AATTT
gi|56560 : TTTATTTGAACA--AAT-TTGG--AATTCC-TTG------TCATAGGGA---TCA------TT-----TACGCC-AAA---AATG---AAC-T-AATTT
gi|56561 : TTTATTTGAACA--ACT-TTGA--AACCCC-TAT------TCATAGAGG---ACA------TT-----TAAACC-AAA---TATT---AAT-A-CATTT
gi|56562 : TTTATATGAACA--AAC-TTGA--AACCCC-TAT------TCGTAGGGA---TCC------TT-----TATACC-AAA---TATT---AAA-A-AA
gi|56563 : TTGATTTGTACA--AAC-TTCA--AGCCCC-TAC------TCATAAGGA---TAA------TT-----TATATC-AAA---TATG---AAC-A-AATT
gi|56566 : TTGATTTGTACA--AAC-TTCA--AACTCC-TAC------TCATAAGGA---TAA------CT-----TATAGC-AAA---TATG---AAC-A-AAT
gi|56567 : TTTATTTGAACA--AAA-TTCA--AAACTG-TAC------TTATAGGGA---TTC------TT-----TTTACC-AAA---TATG---AAC-A-AATT
gi|56568 : TTTACTGGAACA--AAT-TTGA--AACTCC-TAG------TCATAGGAA---TCA------TT-----TTTGTA-AAA---TATG---AAC-A-AATT
gi|56569 : TTTACT-GAATA--AAC-TTGA--AACCCC-TAT------CCATAGAGA---TCA------TT-----TACACC-AAT---TATA---AAC-A-AATTT
gi|56570 : TTTGTTTGAACA--AAT-CTGA--AACGCC-TAC------ATAAAAGGA---CCA------TT-----TATACC-AAA---TATG---ACC-A-AGTTT
gi|56571 : TTGATTTGTACA--AAC-TTAA--AACTCT-TAA------TCATAGGGA---TAA------TT-----TATATC-AAA---TATG---AAC-A-CATTT
gi|56572 : TTGATTTGTACA--AAC-TTTA--AACCCA-TAC------TCATTGGGA---TTA------TC-----CATATC-AAA---TATG---AAC-A-AATTT
gi|56573 : TTGATTTTTACA--AAC-TTAA--AACTCT-TAA------TCATAGGGA---TAA------TT-----TATATC-AAA---TATG---AAC-A-AATTT
gi|56574 : TTCATTTGAATA--AAC-TTAA--AACCCC-TTC------TCATAGAGA---TCA------TT-----CATATG-AAA---TATG---AAC-A-AAT
gi|56576 : TTTATTTGAACA--AAG-TTGA--AACTCC-T---------CATAGGGA---TCA------TA-----TATGCC-ATA---TTTG---AAT-G-AATTT
gi|56577 : TTTGTTTCAACA--AAC-TTGA--AACCCC-TAC------CCTTAGAGA---TCA------TT-----TATACC-AAA---TACAAACAAC-A-AATTT
gi|56578 : TTCATTTGAACATTAAC-TTAA--AACCTT-TAC------TTATAGCGA---TCA------TT-----TACACT-AAA---TATA---AAC-A-AATT
gi|56579 : TTGATTTGTACA--AAC-TTAG--AACTCT-TAA------TCATAGGGA---TAA------TT-----CATATC-AAA---TATG---AAC-A-AATTT
gi|56581 : TTTATTTGAACA--AAA-TTAA--TTCTTC-TAT------TCATAGGCA---TCATAAAATTT-----TATACC-AAG---TATG---AAC-G-AATTT
gi|56583 : TTTATGTAAACA--AAC-TTGA--ACCCCC-TAC------TCATTAGGA---CCA------TT-----TATACC-AAA---TGTG---AAC-A-
gi|56584 : TTCATCTGAACA--AAC-TTGA--ACCCCCATAG------TCATAGGGA---TGA------TT-----TATAGC-AAA---TATG---AAC-G-AATTT
gi|56585 : TTT-TTTAAACA--AAT-TTGG--AACTCT-TAG------TCATACAGA---TCA------TT-----TATACA-AAA---TATG---AAC-G-AATTT
gi|56587 : TTCATTTGAAAA--AAC-ACGA--AACCCTGTTC------TCATAGGGA---TCA------TT-----CATACC-AAA---TATG---AAC-G-AATTT
gi|56588 : TTGATTTGAACA--AAC-TTCA--AATCCC-AAC------TCATAGGGA---TAA------TT-----CATATC-AAA---TATG---AAA-A-AAT
gi|56590 : TCTATTTAAACA--ATC-TTGA--TATCCC-TTC------TCATATGGA---TCA------TT-----TATACC-AAA---TATG---CAC-A-AATTT
gi|56591 : TTCATTTGACCA--AAC-TTAA--AAACC--TGC------TCACAGGGA---TTA------TT-----TACACT-AAA---TATG---AAC-A-AATTT
gi|56592 : TTGATTTGTACA--AAC-TTCA--AATCCC-TAT------TCATAGGGA---TAA------TT-----TATATC-AAA---TATG---AAC-T-AATTT
gi|56593 : TTTATTTGAATA--AAC-TTGA--AACTCC-TTC------TTATGGGGA---CCA------TG-----TATATC-AAA---TATA---ACC-A-AA
gi|56594 : TTTAACTAAACA--AAC-TTGA--AACCGC-TAC------TCATAGGGA---CCA------TT-----TATACA-AAC---TATG---AAC-G-AAT
gi|56595 : TTCATTTGAATT--AGC-TTGA--AACCCC-TTC------TCATAGGGA---TCA------TT-----TATACT-ACA---AATG---AAC-A-AAT
gi|56596 : TTGATTTGTACA--AAC-TTAA--AACTCT-TAA------TCATAGGGA---TAA------TT-----TACATC-AAA---CATG---AAC-A-AATCT
gi|56598 : TTGATTTGTATA--AAC-TTTA--AATCCC-TAC------CCATAGGGA---TAA------TC-----TATATC-AAA---TATG---AAC-A-AATTT
gi|56599 : TTTATTTGAACA--AAC-TTGA--AACCAC-TGC------TCACAGGGA---CCA-------T-----TATTCA-AAA---TTTG---AAC-A-AATTT
gi|56601 : TTCATTTGTACA--AAC-TTCA--AACCCT-TAC------TCATAGGGA---TAA------CT-----TGTATC-AAA---TATG---AAC-T-AATTT
gi|56602 : TTGATTTGTACA--TAA-TTTA--AACCCT-TAC------CCATAGGGA---TAA------TC-----TATACC-AAA---TATA---AAC-A-CATTT
gi|56604 : TTGATTTGTACA--AAC-TTTA--AACCCA-TAC------TCATTGGGA---TAA------TC-----TATATC-AAA---TATG---AAC-A-AATTT
gi|56605 : TTTAATTGTACA--AAC-TTGA--AAGCCC-TAT------TCATAGAGA---TCA------TT-----TAAACT-AAA---TATA---AAC-G-AATTT
gi|56606 : TTCATTTGAACA--AAC-TTGA--AACCCC-TTT------TCATAGGGA---T-A------TC-----TATACT-GAA---TAAA---AAC-A-AATTT
gi|56607 : TTCATTTGAACA--AAC-TTGA--AACCCC-TTT------TCATAGGGA---T-A------TC-----TATACT-GAA---TAAA---AAC-A-AATTT
gi|56608 : TTGATTTGAACA--AAC-TTCA--AATCCC-AAC------TCATAGGGA---TAA------TT-----CATATC-AAA---TATG---AAA-A-AAT
gi|56610 : TTCATTTAAACT--AAC-ATGA--AAACCC-TAC------TCCCAGGGA---TCA------TT-----TATACC-AAA---TATG---AAC-ATAAT
gi|56611 : TTGATTTGTACA--AAC-TT----AACTCT-TAA------TCATAGGGA---TAA------TT-----TATATC-AAA---TATG---AAC-A-AATCT
gi|56613 : TTGATTTGTACA--AAC-TTCA--AACCCC-TAT------TCATAGGAA---TAA------TT-----TATATC-AGA---TATG---AAC-T-AATTT
gi|56614 : TTGATTTGTACA--AAC-TTAG--ATTTCT-TAA------TCATAGGGA---TAA------TT-----TATATC-AAA---TATG---AAC-A-AATTT
gi|56615 : TTAATTTGTACA--AAC-TTAG--ATTTCT-TAA------TCATAGGGA---TAA------TT-----TATATC-AAA---TATG---AAC-A-AATTT
gi|56681 : TTATTTCAACA--AAC-TTGA--AACCGC-TAC------TCATAGGGA---TCA------TT-----TATATC-AAA---TATG---AAA-A-AAATT
gi|56682 : TTATTCAAAAA--AAAATTTA--AACTCT-TAG------TCAAAGGGA---TCA------TT-----TATACC-AAA---TATA---AAC-C-AATT
gi|56686 : TTATCTGAATT--AAG-TTTA--AATTCC-TAC------TCATAGAGA---TCA------TT-----TATACC-AAA---TATA---AATGA-AATTT
gi|56697 : TTATCTG--CA--A----TCA--AACCCC-TAC------ACATAGGGA---TAA------TT-----TATACC-AAA---TATG---AAC-A-AATCT
gi|56774 : TATTTGAAAA--AAA-TTGA--AACCCC-AAC------TAAAAGGGA---CCA------TT-----TATATC-AAA---TATG---AAC-A-AATTT
gi|56775 : TATTTGGACA--AAC-TTGA--AACCTC-TAT------TCATAGAGA---CCA------TT-----TATACA-AAA---TATA---AAC-A-
gi|56776 : TATTTGAACA--AAC-TTGA--AAC----TAC------TCATAAGGA---CCA------TT-----TATACC-AAA---TATA-------A-AATTT
gi|56778 : ATTTGTACA--AAC-TCAG--AACTCA-TAA------TCATAGGGA---TAA------TT-----TATATC-AAA---TATG---AAC-A-AATTT
gi|56779 : ATATGAACA--AAC-TTGA--AACCTC-TAC------TCATAGGGA---TAA------TT-----TATACC-AAACATTATA---AAA-A-AATT
gi|56785 : TTTGAACA--AAA-TTGA--AACTCC-TAC------TCAAAGGGA---TCA------TT-----TATGTT-AAA---AATG---ACT-G-GATTT
gi|56789 : TTGAACA--AAC-TTGA--AATCCC-TAT------TCATAGAGA---TGA------TT-----TAAACC-AAA---TATT---GAC-A-AATCT
gi|56795 : ACA--AAC-TTAA--CACTCT-TAA------TCATAGGGA---TAA------TT-----TATATC-AAA---TATG---AAC-A-AATTT
gi|56798 : -TTAG--AACTCT-TAA------TCATAGGGA---TAA------TT-----TATATC-AAA---TATG---AAC-A-AATTT
gi|56807 : aga-TTCA--AACTCC-TAA------TCATAGTGA---TAA------TT-----TATGCC-AAA---TATG---AAC-A-AATTT
gi|56809 : a-TTCA--AACCCC-TAC------ACATAGGGA---TAA------TT-----TATGCC-AAA---TATG---AAC-A-AATCT
gi|56812 : a-TTCA--AACCCC-TAA------TCATAGAGA---TAA------TT-----TATGCC-AAA---TATG---AAC-A-AATTT
gi|56830 : aTGA--AACCCC-TAC------TCAAAGAGA---TCA------TG-----TATACC-AAA---TATG---AAC-T-AATTT
gi|56835 : A--AACTCC-TAC------ACATAGGGA---TAA------TT-----TATGCC-AAA---TATG---AAC-A-AATCT
blockSeqs : CAGTAC TAAAAT
blockSeqs : CGTAA .
blockSeqs : . .
blockSeqs : . .
blockSeqs : . .
blockSeqs : . .
blockSeqs : . .
blockSeqs : . .
blockSeqs : . .
blockSeqs : . .
blockSeqs : . .
blockSeqs : . .
blockSeqs : . .
blockSeqs : . .
blockSeqs : . .
blockSeqs : . .
blockSeqs : . .
blockSeqs : . .
blockSeqs : . .
blockSeqs : . .
blockSeqs : . .
blockSeqs : . .
blockSeqs : . .
blockSeqs : . .
blockSeqs : . .
blockSeqs : . .
blockSeqs : . .
blockSeqs : . .
blockSeqs : . .
blockSeqs : . .
blockSeqs : . .
blockSeqs : . .
blockSeqs : . .
blockSeqs : . .
blockSeqs : . .
blockSeqs : . .
blockSeqs : . .
blockSeqs : . .
blockSeqs : . .
blockSeqs : . .
blockSeqs : . .
blockSeqs : . .
blockSeqs : . .
blockSeqs : . .
blockSeqs : . .
blockSeqs : . .
blockSeqs : . .
blockSeqs : . .
blockSeqs : . .
blockSeqs : . .
blockSeqs : . .
blockSeqs : . .
blockSeqs : . .
blockSeqs : . .
blockSeqs : . .
blockSeqs : . .
blockSeqs : . .
blockSeqs : . .
blockSeqs : . .
blockSeqs : . .
blockSeqs : . .
blockSeqs : . .
blockSeqs : . .
blockSeqs : . .
blockSeqs : . .
blockSeqs : . .
blockSeqs : . .
blockSeqs : . .
blockSeqs : . .
blockSeqs : . .
blockSeqs : . .
blockSeqs : . .
blockSeqs : . .
blockSeqs : . .
blockSeqs : . .
blockSeqs : . .
blockSeqs : . .
blockSeqs : . .
blockSeqs : . .
blockSeqs : . .
blockSeqs : . .
blockSeqs : . .
blockSeqs : . .
blockSeqs : . .
blockSeqs : . .
blockSeqs : . .
blockSeqs : . .
blockSeqs : . .
blockSeqs : . .
blockSeqs : . .
blockSeqs : . .
blockSeqs : . .
blockSeqs : . .
blockSeqs : . .
blockSeqs : . .
blockSeqs : . .
blockSeqs : . .
blockSeqs : . .
blockSeqs : . .
blockSeqCons :
originalCons : TTTATTTGAACA--AAC-TTGA--AACCCC-TAC------TCATAGGGA---TCA------TT-----TATACC-AAA---TATG---AAC-A-AATTT
finalCons : TTTATTTGAACA--AAC-TTGA--AACCCC-TAC------TCATAGGGA---TCA------TT-----TATACC-AAA---TATG---AAC-A-AATTT
Alignments
lowQualScore : 00 0 00 0 222222 000 111111 11111 0 000 000 0 0
lowQualScore : .. . .. . ...... ... ...... ..... . ... ... . .
lowQualScore : 66 4 66 8 222222 777 222222 00000 4 777 777 4 4
consensus : TTTATTTGAACA--AAC-TTGA--AACCCC-TAC------TCATAGGGA---TCA------TT-----TATACC-AAA---TATG---AAC-A-AATTT
Reference ( family-126 ) : TTTATTTGAACA--AAC-TTGA--AACCCC-TAC------TCATAGGGA---TCA------TT-----TATACC-AAA---TATG---AAC-A-AATTT
gi|56509 : TTTATTTGAACA--AAC-TGGA--AACCCC-TAC------TCATAGGGA---CCA------TT-----TATACC-AAA---TATG---AAC-A-AATTT
gi|56510 : TTTATTTGAACA--AA--TTGA--AACTCC-TTG------TCATAGGGA---TTA------TT-----TATACC-AAA---TATG---AAC-A-AATTT
gi|56511 : TTCATTTGAACA--AAC-TTGA--AAACCC-TAC------TCATAGGGA---TCA------TT-----TATACCAAAA---TATG---AAC-A-AATTT
gi|56512 : TTTATTTGAACA--AAC-TTCA--AACTCC-TAC------TCATATGGA---CTA------TT-----TATACC-AAA---TATG---AAC-A-AATTT
gi|56514 : TTTATTTCAACA--AAT-TTGG--AACTCC-TAG------TCATAGGGA---TCA------TT-----TATACC-AAA---TATG---AAC-G-AATTT
gi|56516 : TTCGTTTGAACA--AAC-ATGA--AACCCC-TAT------TCATAGGGA---TCA------TT-----TATACC-AAA---TATG---AAC-A-AATTT
gi|56517 : TTTATTTGAAAA--AAA-TTGA--AACTCC-TACCGTAA-TCATACGGA---TCA------TT-----TATACA-AAA---TATG---AAC-A-AATTT
gi|56519 : TTTATTTCAACA--AAA-TTGA--AACCAC-TAC------TCATAGGGA---CCA------TT-----TATACC-AAA---AATG---AAC-A-AATT
gi|56520 : TTTACTTGAACA--AAC-TAGA--AACCC--TAG------TCATAGAGA---TCA------TT-----TAAACC-AAA---TATA---AAC-A-AATTT
gi|56521 : TTTATTTGAAAC--AAC-TTGA--AACCCC-TAC------TCATAAGGA---TCA------TT-----TATACC-AAA---TATA---AAC-A-AATTT
gi|56522 : TTTATTTGAACA--AAT-TTGA--AACTCC-TAG------TTATATGGG---TCA------TT-----TATACC-AAA---TATG---AAC-A-AAT
gi|56523 : TTGATTTTTACA--AAC-TTAA--AACTCT-TAA------TCATAGGGA---TAA------TT-----TATATC-AAA---TATG---AAC-A-AATTT
gi|56527 : TTTATTTGTACA--AAT-TTGA--AACTCC-TAG------TCATAGAGA---TCA------TT-----TATACC-AAA---TACG---AAC-G-AACT
gi|56528 : TTTATTTGAACA--AAC-ATGA--AACCCC-TAC------TAATAGGAA---TCA------TT-----TATACT-AAA---TATG---TAC-A-AATTT
gi|56529 : TTCATTGGAGCA--ATC-TTAA--AACTCC-TAC------TCACAGGGA---TCA------TC-----TATACC-AAA---TATG---AAC-A-AATTT
gi|56530 : TTTATTAGAACA--CAT-TTGG--AACTCC-TAG------TCATAGAGA---TCA------TT-----TATACC-AAA---TATG---AAC-G-AATCT
gi|56531 : TTTACTTGAACA--AAA-GTTA--AACCTC-TAT------TCATAGGGA---TCA------TT-----TAAACC-AAA---TATG---AAC-A-TATTT
gi|56533 : TTTACTGGAACA--AAT-TTGA--AACTCC-TAG------TCATAGGGA---TCA------TT-----TTTATA-AAA---TATG---AAC-A-AATT
gi|56534 : TTTATTTGAACA--AAC-TTGA--AACTCG-TAC------ACATGTGGA---TCA------TG-----TATACA-AAA---TATG---AAC-A-AATTT
gi|56536 : TTAATTTGAACA--AAC-TTGA--AACCCC-TAC------TCATGGGGA---CTA------TT-----TATACC-AAA---TATA---AAC-
gi|56537 : TTTATTTGAACT--AAC-TTGA--AACTGC-TAC------AAATAGGGA---CCA------TT-----TATACC-AAA---TAAG---AAC-A-AATTT
gi|56538 : TTTATTTAAACA--AAC-TTGA--AATCTC-TAT------TCATAGAGA---TCA------TT-----TAAACC-AAA---TATA---AAC-A-AATT
gi|56539 : TTCATTTGATCA--AAC-TTGA--AACCCC-TAC------TCAGAGGGA---TCA------TT-----TACCCA-AAA---TATG---AAC-A-AATTT
gi|56540 : TTCATTTAAGCA--AAC-TTGA--GACTCT-TAC------ACAAATGGA---TCA------TTTATAATATACC-AAA---TATG---AAC-A-AATT
gi|56542 : TTCATTTGAACT--AAA-TTGA--A-CTCC-TAC------TCATAGGAAGAATCA------TT-----TATGCC-AAA---TATG---AAT-G-AATTT
gi|56544 : TTTATTTGAACA--AAC-ATGA--AATCCC-TGT------TCATAAGGA---TCA------TT-----TATACA-AAA---TATA---AAC-A-AATTT
gi|56547 : TTTATTTGAATA--AAT-TTGG--AACTCC-TGG------TCACAAGGA---TCA------TT-----TATACC-AAA---TATA---AAC-T-AATTT
gi|56548 : TTTTTTTGAACA--AAC--TGACCAACGCC-TAC------TCACAGGG----TCA------TT-----TATACC-AAA---TATG---AAC-A-AATTT
gi|56549 : TTTACTTGAACA--AAA-TTGA--AAACCC-TAT------TCA--GAGA---TCA------TT-----TAAACC-AAA---TATA---AAC-A-AATTT
gi|56550 : TTTATTTAAACA--AAC-TTGA--AACCCC-TAT------GCATACAGA---CCA------TT-----TATACC-AAT---TATG---AAC-A-AATTT
gi|56551 : TTCATTTCAATA--AAA-TTGA--AACACA-TAC------TCATAGGGA---TCA------TT-----CATGTC-AAA---TATG---AAT-G-AAT
gi|56552 : TTCATTTGAACA--AAG-TTGA--AACTCC-GGC------TCATAGGAA---TCA------TT-----TATATG-AAA---TATA---AAT-G-AATTT
gi|56553 : TTTATTTGAATA--CAC-TTAA--AAACCC-TAC------TCATAGGGA---TCA------TT-----TACATC-TAA---TATG---AAC-A-AATTT
gi|56555 : TTTATTTGAATA--AAC-CTGA--A-TCCC-TAC------TCACAAGGA---TCA------TT-----TATACC-AAA---TATG---AAT-A-AA
gi|56556 : TTCATTTGAATA--AAC-ATGA--AACTCC-TAT------ACATAAGGA---TCA------TT-----TATACA-AAA---TATG---AAC-A-CATTT
gi|56557 : TTTATTTGAACA--ACT-TTGA--AACCCC-TAC------TCATAGGGA---ACA------TT-----TAAGCC-AAA---TATT---AAT-A-TAT
gi|56558 : TTTATTTAAACA--AAT-TTGA--AACTAT-TAG------TCAGTGGGA---TCA------CT-----TATACC-AAA---TATC---AAC-C-AATTT
gi|56559 : TTTATTTGAACA--AGC-TTGA--AACCTC-TACCAGTACTCATAGGGA---TCA------TT-----AAAACC-AAA---TATA---AAC-A-AATTT
gi|56560 : TTTATTTGAACA--AAT-TTGG--AATTCC-TTG------TCATAGGGA---TCA------TT-----TACGCC-AAA---AATG---AAC-T-AATTT
gi|56561 : TTTATTTGAACA--ACT-TTGA--AACCCC-TAT------TCATAGAGG---ACA------TT-----TAAACC-AAA---TATT---AAT-A-CATTT
gi|56562 : TTTATATGAACA--AAC-TTGA--AACCCC-TAT------TCGTAGGGA---TCC------TT-----TATACC-AAA---TATT---AAA-A-AA
gi|56563 : TTGATTTGTACA--AAC-TTCA--AGCCCC-TAC------TCATAAGGA---TAA------TT-----TATATC-AAA---TATG---AAC-A-AATT
gi|56566 : TTGATTTGTACA--AAC-TTCA--AACTCC-TAC------TCATAAGGA---TAA------CT-----TATAGC-AAA---TATG---AAC-A-AAT
gi|56567 : TTTATTTGAACA--AAA-TTCA--AAACTG-TAC------TTATAGGGA---TTC------TT-----TTTACC-AAA---TATG---AAC-A-AATT
gi|56568 : TTTACTGGAACA--AAT-TTGA--AACTCC-TAG------TCATAGGAA---TCA------TT-----TTTGTA-AAA---TATG---AAC-A-AATT
gi|56569 : TTTACT-GAATA--AAC-TTGA--AACCCC-TAT------CCATAGAGA---TCA------TT-----TACACC-AAT---TATA---AAC-A-AATTT
gi|56570 : TTTGTTTGAACA--AAT-CTGA--AACGCC-TAC------ATAAAAGGA---CCA------TT-----TATACC-AAA---TATG---ACC-A-AGTTT
gi|56571 : TTGATTTGTACA--AAC-TTAA--AACTCT-TAA------TCATAGGGA---TAA------TT-----TATATC-AAA---TATG---AAC-A-CATTT
gi|56572 : TTGATTTGTACA--AAC-TTTA--AACCCA-TAC------TCATTGGGA---TTA------TC-----CATATC-AAA---TATG---AAC-A-AATTT
gi|56573 : TTGATTTTTACA--AAC-TTAA--AACTCT-TAA------TCATAGGGA---TAA------TT-----TATATC-AAA---TATG---AAC-A-AATTT
gi|56574 : TTCATTTGAATA--AAC-TTAA--AACCCC-TTC------TCATAGAGA---TCA------TT-----CATATG-AAA---TATG---AAC-A-AAT
gi|56576 : TTTATTTGAACA--AAG-TTGA--AACTCC-T---------CATAGGGA---TCA------TA-----TATGCC-ATA---TTTG---AAT-G-AATTT
gi|56577 : TTTGTTTCAACA--AAC-TTGA--AACCCC-TAC------CCTTAGAGA---TCA------TT-----TATACC-AAA---TACAAACAAC-A-AATTT
gi|56578 : TTCATTTGAACATTAAC-TTAA--AACCTT-TAC------TTATAGCGA---TCA------TT-----TACACT-AAA---TATA---AAC-A-AATT
gi|56579 : TTGATTTGTACA--AAC-TTAG--AACTCT-TAA------TCATAGGGA---TAA------TT-----CATATC-AAA---TATG---AAC-A-AATTT
gi|56581 : TTTATTTGAACA--AAA-TTAA--TTCTTC-TAT------TCATAGGCA---TCATAAAATTT-----TATACC-AAG---TATG---AAC-G-AATTT
gi|56583 : TTTATGTAAACA--AAC-TTGA--ACCCCC-TAC------TCATTAGGA---CCA------TT-----TATACC-AAA---TGTG---AAC-A-
gi|56584 : TTCATCTGAACA--AAC-TTGA--ACCCCCATAG------TCATAGGGA---TGA------TT-----TATAGC-AAA---TATG---AAC-G-AATTT
gi|56585 : TTT-TTTAAACA--AAT-TTGG--AACTCT-TAG------TCATACAGA---TCA------TT-----TATACA-AAA---TATG---AAC-G-AATTT
gi|56587 : TTCATTTGAAAA--AAC-ACGA--AACCCTGTTC------TCATAGGGA---TCA------TT-----CATACC-AAA---TATG---AAC-G-AATTT
gi|56588 : TTGATTTGAACA--AAC-TTCA--AATCCC-AAC------TCATAGGGA---TAA------TT-----CATATC-AAA---TATG---AAA-A-AAT
gi|56590 : TCTATTTAAACA--ATC-TTGA--TATCCC-TTC------TCATATGGA---TCA------TT-----TATACC-AAA---TATG---CAC-A-AATTT
gi|56591 : TTCATTTGACCA--AAC-TTAA--AAACC--TGC------TCACAGGGA---TTA------TT-----TACACT-AAA---TATG---AAC-A-AATTT
gi|56592 : TTGATTTGTACA--AAC-TTCA--AATCCC-TAT------TCATAGGGA---TAA------TT-----TATATC-AAA---TATG---AAC-T-AATTT
gi|56593 : TTTATTTGAATA--AAC-TTGA--AACTCC-TTC------TTATGGGGA---CCA------TG-----TATATC-AAA---TATA---ACC-A-AA
gi|56594 : TTTAACTAAACA--AAC-TTGA--AACCGC-TAC------TCATAGGGA---CCA------TT-----TATACA-AAC---TATG---AAC-G-AAT
gi|56595 : TTCATTTGAATT--AGC-TTGA--AACCCC-TTC------TCATAGGGA---TCA------TT-----TATACT-ACA---AATG---AAC-A-AAT
gi|56596 : TTGATTTGTACA--AAC-TTAA--AACTCT-TAA------TCATAGGGA---TAA------TT-----TACATC-AAA---CATG---AAC-A-AATCT
gi|56598 : TTGATTTGTATA--AAC-TTTA--AATCCC-TAC------CCATAGGGA---TAA------TC-----TATATC-AAA---TATG---AAC-A-AATTT
gi|56599 : TTTATTTGAACA--AAC-TTGA--AACCAC-TGC------TCACAGGGA---CCA-------T-----TATTCA-AAA---TTTG---AAC-A-AATTT
gi|56601 : TTCATTTGTACA--AAC-TTCA--AACCCT-TAC------TCATAGGGA---TAA------CT-----TGTATC-AAA---TATG---AAC-T-AATTT
gi|56602 : TTGATTTGTACA--TAA-TTTA--AACCCT-TAC------CCATAGGGA---TAA------TC-----TATACC-AAA---TATA---AAC-A-CATTT
gi|56604 : TTGATTTGTACA--AAC-TTTA--AACCCA-TAC------TCATTGGGA---TAA------TC-----TATATC-AAA---TATG---AAC-A-AATTT
gi|56605 : TTTAATTGTACA--AAC-TTGA--AAGCCC-TAT------TCATAGAGA---TCA------TT-----TAAACT-AAA---TATA---AAC-G-AATTT
gi|56606 : TTCATTTGAACA--AAC-TTGA--AACCCC-TTT------TCATAGGGA---T-A------TC-----TATACT-GAA---TAAA---AAC-A-AATTT
gi|56607 : TTCATTTGAACA--AAC-TTGA--AACCCC-TTT------TCATAGGGA---T-A------TC-----TATACT-GAA---TAAA---AAC-A-AATTT
gi|56608 : TTGATTTGAACA--AAC-TTCA--AATCCC-AAC------TCATAGGGA---TAA------TT-----CATATC-AAA---TATG---AAA-A-AAT
gi|56610 : TTCATTTAAACT--AAC-ATGA--AAACCC-TAC------TCCCAGGGA---TCA------TT-----TATACC-AAA---TATG---AAC-ATAAT
gi|56611 : TTGATTTGTACA--AAC-TT----AACTCT-TAA------TCATAGGGA---TAA------TT-----TATATC-AAA---TATG---AAC-A-AATCT
gi|56613 : TTGATTTGTACA--AAC-TTCA--AACCCC-TAT------TCATAGGAA---TAA------TT-----TATATC-AGA---TATG---AAC-T-AATTT
gi|56614 : TTGATTTGTACA--AAC-TTAG--ATTTCT-TAA------TCATAGGGA---TAA------TT-----TATATC-AAA---TATG---AAC-A-AATTT
gi|56615 : TTAATTTGTACA--AAC-TTAG--ATTTCT-TAA------TCATAGGGA---TAA------TT-----TATATC-AAA---TATG---AAC-A-AATTT
gi|56681 : TTATTTCAACA--AAC-TTGA--AACCGC-TAC------TCATAGGGA---TCA------TT-----TATATC-AAA---TATG---AAA-A-AAATT
gi|56682 : TTATTCAAAAA--AAAATTTA--AACTCT-TAG------TCAAAGGGA---TCA------TT-----TATACC-AAA---TATA---AAC-C-AATT
gi|56686 : TTATCTGAATT--AAG-TTTA--AATTCC-TAC------TCATAGAGA---TCA------TT-----TATACC-AAA---TATA---AATGA-AATTT
gi|56697 : TTATCTG--CA--A----TCA--AACCCC-TAC------ACATAGGGA---TAA------TT-----TATACC-AAA---TATG---AAC-A-AATCT
gi|56774 : TATTTGAAAA--AAA-TTGA--AACCCC-AAC------TAAAAGGGA---CCA------TT-----TATATC-AAA---TATG---AAC-A-AATTT
gi|56775 : TATTTGGACA--AAC-TTGA--AACCTC-TAT------TCATAGAGA---CCA------TT-----TATACA-AAA---TATA---AAC-A-
gi|56776 : TATTTGAACA--AAC-TTGA--AAC----TAC------TCATAAGGA---CCA------TT-----TATACC-AAA---TATA-------A-AATTT
gi|56778 : ATTTGTACA--AAC-TCAG--AACTCA-TAA------TCATAGGGA---TAA------TT-----TATATC-AAA---TATG---AAC-A-AATTT
gi|56779 : ATATGAACA--AAC-TTGA--AACCTC-TAC------TCATAGGGA---TAA------TT-----TATACC-AAACATTATA---AAA-A-AATT
gi|56785 : TTTGAACA--AAA-TTGA--AACTCC-TAC------TCAAAGGGA---TCA------TT-----TATGTT-AAA---AATG---ACT-G-GATTT
gi|56789 : TTGAACA--AAC-TTGA--AATCCC-TAT------TCATAGAGA---TGA------TT-----TAAACC-AAA---TATT---GAC-A-AATCT
gi|56795 : ACA--AAC-TTAA--CACTCT-TAA------TCATAGGGA---TAA------TT-----TATATC-AAA---TATG---AAC-A-AATTT
gi|56798 : -TTAG--AACTCT-TAA------TCATAGGGA---TAA------TT-----TATATC-AAA---TATG---AAC-A-AATTT
gi|56807 : aga-TTCA--AACTCC-TAA------TCATAGTGA---TAA------TT-----TATGCC-AAA---TATG---AAC-A-AATTT
gi|56809 : a-TTCA--AACCCC-TAC------ACATAGGGA---TAA------TT-----TATGCC-AAA---TATG---AAC-A-AATCT
gi|56812 : a-TTCA--AACCCC-TAA------TCATAGAGA---TAA------TT-----TATGCC-AAA---TATG---AAC-A-AATTT
gi|56830 : aTGA--AACCCC-TAC------TCAAAGAGA---TCA------TG-----TATACC-AAA---TATG---AAC-T-AATTT
gi|56835 : A--AACTCC-TAC------ACATAGGGA---TAA------TT-----TATGCC-AAA---TATG---AAC-A-AATCT