lowQualScore : 111111111111111111 2222222 111 333333333333333333333333333 1111111111 1111111111 11111111111 1 1
lowQualScore : 11 222222222222222222 5555555 4 0 0 2 11 222 000000000000000000000000000 2222 7777777777 44444 444444 555 5555 0000000000 333333 222 1 11111111111 3 1 11 777777 1 3 55 7 888 555 4 6 6 4 4 5 3
lowQualScore : .. .................. ....... . . . . .. ... ........................... .... .......... ..... ...... ... .... .......... ...... ... . ........... . . .. ...... . . .. . ... ... . . . . . . .
lowQualScore : 22 777777777777777777 7777777 7 9 9 0 22 999 555555555555555555555555555 7777 6666666666 88888 555555 666 3333 5555555555 666666 222 2 33333333333 9 3 88 666666 5 0 22 5 888 000 4 0 0 8 8 5 1
consensus : ATACAGTCAAACC--TGT-GTNA-------G-----CGGTCACCT---TTA-T-AA-GCA-GCCACCTGTCTTAAGCAGCC--A-N-TTT---C-AN---A-------------C--CC----TCCC---G--TCG-AAA-----TTTAC----T--ATA----T----------A------AT---T-TAA-----------C-T-GC--A-----NTAAGCGGTCACCTGNTC-GACGCGGCCAGCGGCCAA--CATTTTTGGTCCCAAA---TGCATTAAAAACCTCCTAAAACGGCCACCAAATGAACAAATTTTACCGTAAAATATCGATTTTGGCATATAAAAATTTCATTACGGCCACAGAATTAATATTTAATTAAAGTACTAAAAACCAAATAAATCAAATAATTATAATATATCTTTAATTTAAAATAAGTTTCTTTTAGTTTAAACTTTCTTAATTGGCCGTAAACAAACCAAACAAAGCTGTTATTGTGTTCTACATAATCGCCATTTTTCCGACTCAAACCAAACAAAGCTGTTATTGTGTTCTACATAATCGCAATTTTTCCGACTCAAACACGAGTGTAGTGCGTGATAATTTTCACATCTCTATTTTTAGCTCGCGT
Reference ( gi|43895 ) : ATACAGTCAAACC--TGT-ACTA-------A-----CGGTCACCT--GTTA-T-AA-GCA-GCCACCTGTCTTAAGCGGCC--A-G-TTT---C-AG---A-------------C--CC----TCCC---G--TCG-AAA-----TTTAC----T--ATA----T----------A------AT---T-TAA-----------C-T-GC--A-----ATAGGCGGTCACCTGGTC-GACGCGGCCACCGGCCAA--CATTTTTGGTCCCAAA---TGCATTAAAAACCTCCTAAAACGGCCACCAAATGAACAAATTTTACCGTAAAATATCGATTTTGGCATATAAAAATTTCATTACGGCCGCAGAACTAATATTTAATTAAAGTACTAAAAACCAAATAAATCAAATAATTATAATATATCTTTAATTCAAAATAAGTTTCTTTTAGTTTAAACTTTCTTAATTGGCCGTAAACAAACCAAACAAAGCCGTTGTTGTATTCTACATAATCGCCATTTTTCCGACTCAAACCAAACAAAGCTGTTATTGTGTTCTACATAATCGGAATTTTTCCGACTCAAACACGAGTGTAGTGCGTGATAATTTTCACATCTCTATTTTTAGCTCGCGT
gi|43705 : ATACAGTCAAACC--TGT-ACTA-------A-----CGGTCACCT--GTTA-T-AA-GCA-GCCACCTGCCTTAAGCGGCC--A-G-TTT---C-AG---A-------------C--CC----TCCC---G--TCG-AAA-----TTTAC----T--ATA----T----------A------AT---T-TAA-----------C-T-GC--A-----ATAGGCGGTCACCTGGTC-GACGCGGCCAGCGGCCAA--CATTTTTGGTCCCAAA---TGCATTAAAAACCAGCTAAAACGGCCACCAAATGAACAAATTTTACCGTAAAATATCGATTTTGGCATATAAAAATTTCATTACGGCCGCAGAATTAATATTTAATTAAAGTACTAAAAACCAAATAAATCAAATAATTATAATATATCTTTAATTTAAAATAAGTTTCTTTTAGTTTAAACTTTCTTAATTGGCCGTAAACAAACTAAACAAAGCCGTTGTTGTATTCTACATAATCGCCATTTTTCCGACTCAAACCAAACAAAGCTGTTATTGTGTTCTACATAATCGGAATTTTTCCGACTCAAACACGAGTGTAGTGCATGATAATTTTCACATCTCTATTTTTAGCTCGCGT
gi|43702 : atATACAGTCAAACC--TGT-ACTA-------A-----CGGTCACCT--GTTA-T-AA-GCA-GCCACCTGCCTTAAGCG-CC--A-G-TTT---C-AT---A-------------C--CC----TCCC---G--TCG-AAA-----TTTAC----T--ATA----T----------A------AT---T-TAA-----------C-T-GC--A-----ATAGGCGGTCACCTGGTC-GACGCGGCCAGCGGCCAA--CATTTTTGGTCCCAAA---TGCATTAAAAACCTCCTAAAACGGCCACCAAATGAACAAATTTTACCGTAAAATATTGATTTTGGCATATAAAAATTTCATTACGGCCACAGAATTAATATTTAATTAAAGTACTAAAAACCAAATAAATCAAATAATTATAATATATCTTTAATTTAAAATAAGTTTCCTTTAGTTTAAACTTTCTTAATTGGCCGTAAACAAACCAAACAAAGCTATTATTGTGTTCTACATAATCGCCATTTTTCCGACTCAAACCAAACAAAGCTGTTATTGTGTTCTACATAATCGCAATTTTTCCGACTCAAACACGAGTGTAGTGCGTGATAATTTTCACATCTCTATTTTTAGCTCGCGT
gi|43706 : acACACAGTCAAACC--TGT-ACTA-------A-----CGGTCACCT--GTTA-T-AA-GCA-GCCACCTGCCTTAAGCGGCC--A-G-TTT---C-AG---A-------------C--CC----TCCC---G--TCG-AAA-----TTTAC----T--ATA----T----------A------AT---T-TAA-----------C-T-GC--A-----ATAGGCGGTCACCTGGCC-GACGCGGCCAGCGGCCAA--CATTTTTGGTCCCAAA---TGCATTAAAAACCTCCTAAAACGGCCACCAAATGAACAAATTTAACCGTTAAATATCGATTTTGGCATATAAAAATTTCATTACGGCCACATAATTAATATTTAATTAAAGTACTAAAAACCAAATAAATCAAATAATTATAATAAATCTTTAATTTAAAATAAGTTTCTTTTAGTTTAAACTTTCTTGATTGGCCGTAAACAAACCAAACAAAGCTGTTATTGTGCTCTACATATTCGCCATTTTTCTGACTCAAACCAAACAAAACTGTTATTGTGTTCTACATAATCGCAATTTTTTCGACTCAAACACGAGTGTAGTGCGTGATAATTTTCACATCTCTATTTTTAGCTCGCGT
gi|43707 : atATACAGTCAAACC--TGT-ACTA-------A-----CGGTCACCT--GTTA-T-AA-GCA-GCCACCTGCCTTAAGCGGCC--A-G-TTT---C-AG---A-------------C--CC----TCCC---G--TCG-AAA-----TTCGC----A--ATA----T----------A------AT---T-TAA-----------C-T-GC--A-----ATAGGCGGTTACCTGGTC-GACGCGGCCAGTGGCCAA--CATTTTTGGTCCAAAA---TGCATTAAAAACCTCCTAAAACGGCCACCAAATGAACAAATTTTACCGTAAAATATCGATTTTGGCATATAAAAATTTCATTACGGCCACAGAATTAATATTTAATTGAAGTACTAAAAACCAAATAAATCAAATAATTATAATATATCTTTAATTTAAAATAAGTTTCTTTTAGTTAAAACTTTCTAAATTGGCCGTAAACAAACCAAACAAAGCTGTTATTGTGTTCTACATAATCGCCATTTTTCCGACTCAAACCAAACAAACCTGTTATTG---------CAATCACAATTTTTCCGACTCAAACACGAGTGTAGTGCGTGATAATTTTCACATCTCTATTTTTAGCTCGCGT
gi|43843 : atATACAGTCAAACC--TAT-ACTA-------A-----CGGTCACCT--GTTA-T-AA-GCA-GCCACCTGCCTTAAGCGGCC--A-G-TTT---C-AG---A-------------C--CC----TCCC---G--TCG-AAA-----TTTAC----T--ATA----T----------A------AT---T-TAA-----------C-T-GC--A-----ATAGGCGGTCACCTGGTC-GACGCAGCCAGTGGCCAA--CATTTTTGGTCCCAAA---TGCATTAAAAACCTCCTAAAACGGCCACCAAATGAACAAATTTTACCGTAAAATATCGATTTTGGCATATAAAAATTTCATTACGGCCACAGAATTAATATTTAATTAAAGTACTAAAAACCAAATAAATCAAATAATTATAATATATCTTTAATTTAAAATAAGTTTCTTTTAGTTTAAACTTTCTTAATTGGCCGTAAACAAACCAAACAAAGCTGTTATTGTGTTCTACATAATCACAATTTTTCCGACTCAAAC
gi|43896 : tATACAGTCAAACC--TGT-ACTA-------A-----CGGTCACCT--GTTA-T-AA-GCA-GCCACCTGCCTTAAGCGGTC--A-G-CTT---C-AG---A-------------C--CC----TCCC---G--TCG-AAA-----TTTAC----T--ATA----T----------A------AT---T-TAA-----------C-T-GC--A-----ATAGGCGGTCACCTGGTC-GACGCGGCCAGCGGCCAA--CATTTTTGGTCCCAAA---TGCATTAAAAACCTCCTAAAACGGCCACCAAATGAACAAATTTTACCGTAAAATATCGATTTTGGCATATAAAAAGTTCATTACGGCCACAGAATTAATATTTAATTAAAGTACTAATAACCAAATAAATCAAATAATTATAATATATCTTTAATTTAAAATAAGTTTCTTTTAGTTTAAACTTTCTTAATTGGCCGTAAACAAACCAAACAAAGCTGTTATTGTGTTCTACATAATCGCAATTTTTCCGACTCAAAC
gi|43710 : ATACAGTCTAACC--TGTTCCTT-------G-----CGGCCACCT--CTTA-T-AA-GCA-GTCACCTGTGTTAAACGGCC--A-C-TTT---A-AA---G-------------T--CC----CCCC---G--TGT-AAA-----TTGCC----T--ATA----T----------A------AA---G-TAC-----------A-T-GT--A-----TTAAAGGGTCACCTCTTT-AACCTGGCCAGTGGCCAGTCCATTTC--ATCCCAAA---
gi|43844 : atATACAGTCAAACT--TGC-AGTA-------G-----CGACCACTT--GTTA-T-AA-GCG-ACCCCCTGATGTAAGCGACC--A-C-ATT---A-AA---T-------------T--CC----CCCC---A--ATG-AAT-----TTCAT----T---CA----T----------A------AT---T-ACA-----------CAT-GC--A-----ATAAGCGACCACTTGCTC-TCTGCGACCAGCGACC
gi|43898 : tATACAGTCTAACC--TGT-CCTT-------G-----AGGCCACCT--CTTA-T-AA-GCG-GTCACCTGTGTTAAGCGGCC----T-CTT---C-AA---A-----------------A----TGCC---G--TTGTTAA-----TTGCC----T--GTA----T----------A------AA---G-TAC-----------A-T-GT--A-----TTAAACCATCACCTCTTT-AACGCGGCCA--GTCCA-------TTTCATCCCAAA---
gi|43712 : ATACAGTCTAACC--TGT-CCTT-------G-----CGGCCACCT--CTTA-T-AA-GCA-GTCACCTGTGTTAAGCGGCC--A---CTT---C-AA------------------------------------------------------------ATA----T----------A------AA---G-TAC-----------A-T-GT--A-----TTAAACGGTCAACTCTTT-AACGTGACCAGCGGCCAAACCATTCC--ATTCCAAA---
gi|43845 : atATACAGTCAAACT--TGC-AGAA-------C-----CGACCACTT--GTTA-T-AA-GCG-ACCCCCTGATGTAAGCGACC--A-C-ATT---A-AA---T-------------C--CC----CCCC---A--ACG-AAT-----TTCAT----T---CA----T----------A------AT---T-ACA-----------CAT-GC--A-----ATATGCGACCACTTGCTC-TCTGCAACCAGCGACC
gi|43899 : tATATAGTCAAACC--TGT-ATAA-------G-----CGGTCACCT---CTATT-AA-GCA-GCCACCTGTCTTAAGTAGCC--A-T-TTTTTCC-A---------------------CT----TCCC------------A-----TTT-C----T--ATG----C------------------T---T-TAA-----------C-T-GCTTA-----ATA
gi|43900 : ATACAGTCAAACC--TGT-GTGA-------A-----CGGTCACCT---CTATT-AA-GCA-GCCACTTGTCTTAAGCAGCC--ACA-TTT---G-AT---A----------------CT----TCCC---A--T
gi|43713 : ATACAGTCAAACT--TGT-ACTA-------A-----CGGGCACCT--GTAA-T-AA-GCGTGTC-CCTCCATTAAG-GGCC--A-T-TTT---A-TT---A-------------C--CC----CCAA---G--ATG-AAA-----ATCAT----T--CTA----T----------A------AT---T-GAC-----------C-T-GT--A-----TTAAGT-GTGAACTTGTCTAACGTGACCAACAGC
gi|43847 : acATACAGTAAAACC--TGT-ATAA-------G-----TGGTCACCT--GTAT-T-AA-GCA-GCCACCTGTCTTAAGTGACCATA-G-TTT---CTA---------------------TT----TCCC---ATTTC----------TTTGCT---T--TTA----T----------A------ATTAAT-TAAC----------C-T-GC--A-----TTAAGC
gi|43901 : tATACAGTAAAACC--TGT-ATAA-------A-----TGGTCACCT--CTTT-T-AA-GCA-GCCACTTGTCTTAAGCAGCC--A-
gi|43717 : ATACAGTCAAACC--TGT-ATAA-------G-----CGGTCACCT---CTATT-AA-GCA-GCCACTTGTCTTAAGCAGCC--A-
gi|43715 : atATACAGTCAAACT--TGC-AGTA-------G-----CGACCACTT--GTTA-T-AA-GCG-ACCTCCTGATGTAAGCGACC--ACG-TT------AA---ATCCCCCCCCCCCCC--CC----CCCC---C--CCA-AAACGAATTTCAT----T---CA----T----------A------AT---T-ACA-----------CAT-GC--A-----ATAAGCGACCACTTGCTC-TCTGCGACCAGCGACC
gi|43721 : acATACAGTTAAACC--TGT-GATA-------G-----TGGTCACCT---CTATT-AA-GCA-ACCACTTGTCTTAAACAGCCATA-T-TTT---C-TATTTA-------------C--CA----TTTT---T--TTA-AAT-----TTTAG----T---TA----T----------A------AT---C-AAC-----------C-T-GT--A-----TTAAGCAGCCACCTG
gi|43905 : atATACAGTCAAATC--TGT-TTTA-------C-----TGGTCACCT--GTAT-T-AA-GCA-ACCACTTGTCTTAAACAGAC--ACA-TTT---------------------------------TC-------------AA-----TTTACCATTT--ATA----T----------A------AT---T-TAGATTTCTTCAACC-T-GT--A-----TTAAGCAGTCACCTG
gi|43731 : ATACAGTCAAACC--TGT-GTAA-------G-----TGGTCACCT--CTGT-T-AA-GCA-GCCACCTGTCTTAAGCAACC--ATG-TTT---T-CT---A----------------TT----TCCC---AT-TC----A-----TATGC----T--TTAAGAGT----------A------AA---T-TAAC----------C-T-GT--A-----TTAAGCAACCACCT
gi|43907 : acATACAGTCAAATC--TGT-GTAA-------G-----AGGTCACCT--CTTT-T-AA-GCA-GCCACCTGTCTTAAGCAGCC--A-
gi|43911 : ATACAGTCAAACC--TGT-GCAA-------G-----CGGTCATCT---CTATT-AA-GCA-GCCACCTGTCTTAAGCAACC--A-
gi|43909 : ATACAGTCAAACC--TGT-ACAA-------G-----CAGCCACCT---CTATT-AA-GCA-GCCACTTGTCTTAAGCAGCC--A-
gi|43722 : ATACAGTCAAACC--TGT-GTAA-------G-----CGGTCACCT---CTATT-AA-GCA-GCCATTTGTCTTAAGCAGCC--A-T-TTT---
gi|43848 : atATACAGTCAAACC--TGT-GTAA-------G-----TGGTCACCT---TTATT-AA-GCA-GCCACTTGTCTTAAGTGGCC--A-
gi|43724 : tATACAGTCAAACC--TGT-ATAA-------G-----TGGTCACCT---CTATT-AA-GCA-GCCACTTGTCTTAAGCAGCC--A-
gi|43723 : atATATAGTCAAACC--TGT-ATAA-------G-----CGGTCACCT---CTATT-AA-GCA-GCCACTTGTCTTAAGCAGCC--A-
gi|43735 : atATACAGTCAAACC--TGT-A-TA-------AT----CAGTCACCT---TTATT-AA-GCA-GCCACTTGTCTTAAACAGCC--A-
gi|43727 : acATACAGCCAAACC--TGT--TTA-------AG----TGGTCACCT--GTAT-T-AA-GCA-GCCACCTGTCTTAAGCAACC--A-
gi|43729 : atATACAGTAAAACC--TGT-GTAA-------G-----CGGCCACCT---TTA-TTAA-GCA-GCCACCTGTCTTAAGCAGCC--A-
gi|43912 : atATACAGTCAAACC--AGT-GCAA-------G-----CGGTCACCT---CTATT-AA-GCA-GCCACTTGTCATAAGCAGCC--ACA-TTT---G-CT---A----------------TT----TCCC---A--TTT-ATATG---TTTGT----TGAATA---------------A------AT---T-CAC-----------C-T-GC--A-----TTAAGCAATAACCTG
gi|43913 : ATACAGTCATACC--TGT-ATAA-------G-----TGGTCACCT---TTA-TTAA-GCA-GCCACTTGTCTTAAGCAGCC--A-
gi|43914 : ATGTAGTCAAACC--TGT-ACAA-------G-----CGGTCACCT--CTCT-T-AA-GCA-GCCACTTTTCTTAAGCAGCC--A-
gi|43916 : ATACAGTCAAACC--TGT-GTAA-------G-----GGGTCATCT--CTAA-T-AA-GCA-GCCACCTGTCTTAAGCAACC--A-
gi|43733 : ATACAGTCAAACC--TGT-GTAA-------G-----CGGCCACCT---CTATT-AA-GCG-GCCACCTGTCTTAAGCAACC--A-T-TTT---
gi|43917 : atATACAGTCAAACT--TGT-GTAA-------G-----CGGTCACCT---CTATT-AA-GCA-GCCACTTGTCTTAAGCAGCC--A-
gi|43852 : ATACAGTCAAACC--TGT-GTAA-------G-----CGGTCACCT---CTATT-AA-GCA-GCCACTTGTCTTAAGCAACC--A-
gi|43734 : tATACAGTCAAACC--TGT-ATAA-------G-----TGGCCACCT---CTATT-AA-GCA-GCCACTTGTCTTAAGCAGCC--A-
gi|43904 : atATACAGTCAAACC--TGT-ATAA-------G-----TGGTCACCT---CTATT-AA-GCA-GCCACTTGCCTTAAGCAGCC--A-
gi|43853 : ATACAGTCAAACC--TGC-GCAA-------A-----CGGTCACCT---CTATT-AA-GCA-GCCACTTGTCTTAAGC
gi|43850 : tATACAGTCAAACC--TGT-GTAA-------G-----CGGTCAC-T--ATTA----A-GCA-GCCACCTGTCTTAAACAGCC--A-
gi|43920 : tATACAGTCAAACC--TGT-GTTA-------G-----TGGCCACCT--ATAT-T-AA-GCA-GCCACCTGTCATAAGCAACC--A-
gi|43855 : ATACAGTCAAACC--TGT-GTAA-------G-----CGGTCACCT--CTGT-C-AA-GCA-GCCACTTGTCTTAAGCAGCC--
gi|43740 : tATACAGTCAAACCTTTGT-A--A-------G-----TGGTCACCT---CTATT-AA-GCA-GCCACCTGTCTTAAGCAGCC--A-
gi|43765 : atATACAGTCAAACC--TGT-GTAA-------G-----CGGTCACCT---CTATT-AA-GCA-GTCACTTGTCTTAAGCGGTC--
gi|43766 : acATACAGTCAAACC--TGT-GTAA-------G-----CGGTCACCT---CTATT-AA-GCA-GCAACTTGTCTTAAGCAGCC--A-
gi|43746 : acACACAGTAAAACC--TGT-ATAA-------G-----TGGTCACCT---CTA-TTAA-GCA-GCCACCTGTCTTAAGCAGTC--ATG-TTT---
gi|43745 : atATACAGTAAAACC--TGT-GTAA-------G-----TGGTCACCT---CTA-TTAA-GCA-GCCACCTGTCTTAAGCAACC--ATG-TTT---
gi|43743 : atATACAGTAAAACC--TGT-GTAA-------G-----CAGTCACCT---CTA-TTAA-GCA-GCCACCTGTCTTAAGCAACC--ATG-TTT---
gi|43747 : atATACAGTCAAATC--TGT-GCAA-------G-----TGGCCATCT---CTATT-AA-GCA-GCCACTTGTCTTAAGCAGCC--ATG-TTT----------G-------------C--GCTATTTCCC------------A-----TTT-C----T--ATA----TTTTCAGAGC-A------AA---T-TAAC----------C-T-GT--A-----TTAAGCAACCACCTG
gi|43754 : atATACAGTCAAACC--TGT-GTAA-------G-----TGGTCACCT--CTTT-T-GA-GCA-GCCACTTGTCATAAGCAGCC--A-
gi|43751 : atATACAGTCAGACC--TGT--TTA-------AGTGGTCGGTCACCT---CTA-TTAA-GCA-GCCACTTGTCTTAAGCAGCC--A-C-ATT---C-A
gi|43750 : atATACAGTCAAACC--TGT-GTGA-------A-----CAGTCACCC---CTATT-AA-GCA-GCCACTTGTCTTAAGCAGTC--A-
gi|43756 : atATACAGTCAAATC--TGT-GTTA-------G-----CGGCCACCT---TTATT-AA-GCA-TTCACTTGTCTTAAGCAGCC--A-
gi|43755 : atATACAGTCAAGCC--TGT-GTAA-------G-----TGGTCACCT---CTA-TTAA-GCA-GCCACTTGTCTTAAGCAGCC--A-
gi|43718 : atATATAGTCAAACC--TGT--TTA-------AG----CACTCACCT--CTAG-T-AA-GCA-GCCACCTGTCTTAAGCAGCC--A-
gi|43741 : atATACAGTCTAACT--TGT--CCAT------G-----TGTTCACCT--CTTA-T-AA-GCA-GTCCCCTTTGTTAAGCGGCC--A-C-TTC---C-A---------------------TC----TCCCCATG--TC---AA-----TTTCC----T--AT-----T----------A------AA---G-TAC-----------A-T-GT--A-----TGAAATGGTCACCTCTTT-AATGTGGC
gi|43758 : atATACAGTAAAACC--TGT-GTAA-------G-----CCGTCACCT---CTA-TTAA-ACA-GCCACCTGTCTTAAGCAGCC--A-T-TTT---aagtacatttcacccaaat
gi|43759 : atATACAGTCAAACCAGTGT-A--A-------G-----AGGTCACCT--CCAA-T-AA-GCA-GCCACTTGTCTTAAGCAGCC--A-
gi|43760 : atATACAGTAAAACC--TGT-ATAA-------G-----TGGTCACCT---CTA-TTAA-GCA-GCCACTTGTCTTATGCAGCC--A-C-TTT---
gi|43761 : atATACAGTCAAACC--TGT-GTTA--------------GGTCACCT---CTATT-AA-GCA-ACCACTTGTCTTAAACAGCC--A-
gi|43763 : atATACAGTCAAACC--TGT-GTTA-------G-----CGATCATCT---CTATT-AA-GCA-GCTATCTGTCTTAAACAGCC--A-
gi|43764 : atATACAGTCAAACC--TGT-GTAA-------G-----CCGTCACCT--CTTT-T-AA-GAA-ACCACTTGTCTTAAGCAGCC--A-
gi|43769 : atATACAGTCGAACC--TGT-GTAA-------G-----CAATCACCTCTATTA-T-AAAGCA-ACCACCTGTCTTAAGCAGCC--A-
gi|43768 : atATACAGTCGAACC--TGT-GTAA-------G-----CAATCACCTCTATTA-T-AAAGCA-ACCACCTGTCTTAAGCAGCC--A-
gi|43767 : atATACAGTCAAACC--TGT-ATAA-------G-----TGGTCACCT---CTATT-AA-GCA-GCCACTTGACTTAGGCAGCC--A-
gi|43703 : acTACAGTCAAACC--TGT-ACTA-------A-----CGGTTACCT--GTTA-T-AA-GCA-GCCACCTGCCTTAAGCGGCC--A-G-TTT---C-AG---A-------------C--CC----TCCC---G--GCG-AAA-----TTTAC----T--ATA----T----------A------AT---T-TAA-----------C-T-GC--A-----ATAGGCGGTCACCTGGTC-GACGCGGCCAGCGGCCAA--CATTTTTGGTCCCAAA---TGCATTAAAAACCTCCTAAAACGGCCACCAAATGAACAAATTTTACCGTAAAATATCGATTTTGGCATATAAAAATTT-ATTACGGCCACAGAATTAATATTTAATTAAAGTACTAAAAACCAAATAAATCAAATAATTATAATATATCTTTAATTTAAAATAAGTTTCTTTTAGTTTAAACTTTCTTAATTGGCCGTAAACAAACCAAACAAAGCTGTTATTGTGTTCTACATAATCGCCATTTTTCCGACCCAAACCAAACAAAGCTGTTATTGTGTTCTACATAATCGCAATTTTTCCGACTCAAACACGAGTGTAGTGTGTGATAATTTTCACATCTCTATTTTTAGCTCGCGT
gi|43963 : atcTACAGTCAAACC--TGT-ACTA-------A-----CAGTCACCT--GTTA-T-AA-GCA-GCCACCTGCCTTAAGCGGCC--A-G-TTT---C-AT---A-------------C--CC----TCCC---G--TCA-AAA-----TTTAC----T--ATA----T----------ACATGTAAT---T-TAA-----------C-T-GC--A-----ATAGGCGGTCACCTGGTC-GACGCGGCCAGCGGCCAA--CATTTTTGGTCCCAAA---TGCATTAAAAACCTTCTAAAACGGCCACCAAATGAATAAATTTTACCGTAAAAAATCGATTTTGGCATA-AAAAATTTCATTACGGCCACTAAATTAATATTTAATTAAAGTACTAAAAACCAAATAAATCAAATAATTATAATATATCTTTAATTTAGAATAAGTTTCCTTTAGTTTAAACTTTCTTAACTGGCCGTAAACCAACCAAACAAAGCTGTTAT-----------TAATCGCCATTTTTCCGACTCGAACCAAACAAAGCTGTTATTGTGTTCTACATAATCGCAATTTTTCCGACTCAAACACGAGTGTAGTGTGTGATAATTTTCACATCTCTATTTTTAGCCCGCGT
gi|43711 : TACAGTCTAACT--TGT-CCTT-------G-----CGGTCACCT--CTTA-T-AA-GTG-GTCACCTGTGTTAAGTGGCC--A---CTT---C-AA---A-------------A--TC----CCCC---G--TGT-AAA-----TTGCC----T--ATA----T----------A------AA---G-TAC-----------A-T-GT--A-----TTAAACGGTCACCTCTTT-AACGCGGCCA--GTCTA-------TTTCATCCCAAA---
gi|43846 : atgTACAGTCTAACT--TGT-CCTT-------G-----CGGCCACCT--CTTA-T-AA-GCG-GTCACCTGTGTTAAGCAGTC--A-C-TTC---A-AA---A-------------T--CC----CCCC---T--TGT-AAA-----TTGCC----T--ATA----T----------A--------------AA-----------G-T-AC--ATGTTTTTAAACGGTCGTCTTTTT-AATGTGACCAGTGGCCAT--TCTATTTCACCCCAAAGAGTGCTTTAA
gi|43966 : tgTACAGTCAAACT--TGC-AGTA-------G-----CGACCACTT--GTTA-T-AA-GCG-ACCCCCTGATGTAAGCGACC--A-C-ATT-----AA---A-------------T--CC----CCCC---A--ACG--AA-----TTTAA----T--TCA----T----------A------AT---T-ATA-----------C-TCGC--A-----ATAAGGGACCACTTGCTC-TCTGCGATCA
gi|43972 : TACAGTCAAACC--TGT-ATAA-------A-----CTGTCACCT--GTAG-T-AA-GCA-GCCACATGTCTTAAGCAGCC--A-gc
gi|43716 : TACAGTCAAACT--TGT--TTA-------AG----CGGTCACCT--CTTT-T-AA-GCA-GCCACTTGTCTTAAGCAGCC--ACA-TTT----------A-------------CTATT----TCCC---G--T---GAA-----TATGC----T--TTAAGAGC----------A------AA---T-TAAC----------C-T-GT--A-----TTAAGCAACAACCTGTCT-GAAAAGGCCA
gi|43720 : atgTACAGTCAAACC--TAT-A-TA-------AC----CGGTCACCT--CTTT-T-AA-GCA-GCCACTTGTCTTAAGCAGCC--A-
gi|43978 : atgTACAGTCAAACC--TGT-GTTA-------G-----CGGTCTCCT---CTATT-AA-GCA-GCCACCTGTCTTAAGCAGCC--A-
gi|43974 : TACAGTCAAACC--TGT-ACTA-------A-----CAGTCACCT--GTTA-T-AA-GCA-GCCAC
gi|43974 : TACAGTCAAACC--TGT-ACTA-------A-----C----------------------A-GTCACCTGTTATAAGCAGCC--A-
gi|43980 : TACAGTCAAACC--TGT-ATTA-------G-----CAGTCACCT---CTATT-AA-GCA-GTCACCTGTCTTAAGCAACC--A-c
gi|43983 : TACATTCAAACC--TGT-GTTA-------A-----CGGTAACCT---TTA-TTAA-GCA-GCCACCTGTCTTAAGCAACC--A-
gi|43984 : TGCAGTCAAACC--TGT-GCAA-------G-----CGGTCACCT--CTGT-T-AA-GCA-GCCACTTGTCTTAAGCAGCC--A-
gi|43988 : TACAGTCAAACC--TGT-GTAA-------G-----CGGACACCT--CTTT-T-AA-GCA-GCCACTTGTCTTAAGCAGCC--A-
gi|43987 : TACATTCAAACC--TGT-GTTA-------T-----TGGTCACCT--CTTT-T-AA-GCA-GCCACTTGTCTTAAGCAGCC--A-
gi|43989 : TACAGTCAAACC--TGT-ATAA-------G-----CGGTCACTT---CTATT-AA-GCA-GTCACCTGTCTTAAGCAGCC--A-
gi|43990 : TACAGTCAAACC--TGT-GTTA-------G-----CAGTCACCT--CTTT-T-AG-GCA-GCCACCTGTCTTAAGAAACC--A-
gi|43854 : TACAGTCAAACC--TGT-ATAA-------G-----TGGTCACCT--CTAC-T-AA-GCA-GCCACTTGTCTTAAGCAGCC--A-C-ATT---C--G---C-------------T--TT----TTCC-----------AA-----TTT-C----T--ATG----TTTTCAGAGCAA------AT---T-TAC-----------C-T-GT--A-----TTAAGC
gi|43991 : tgTACAGTCAAACC--TGT-GTAA-------G-----CGGTCACCT---CTATT-AG-GCA-GCCACCTGTCTTAAGCAACC--ATA-TTT---C-
gi|43742 : TACAGTCAAACC--TGT-GTAA-------G-----TGGTCACCT---CTATT-AA-GCA-GCCACCTGTCTTAAGCATCC--A-GATTT---
gi|43971 : atgTACAGTCAAACT--TGC-AGTA-------G-----CGACCACTT--GTTA-T-AA-G---------TGATGTAAGTGACC--A-C-ATT-----AA---A-------------T--CC----CCCC---A--ATG-AAT-----TTCAT----T---CA----T----------A------AT---TATAC-----------A-T-GC--A-----ATAAGCGACCACTTGCTC-TCTGCGACCAGCGACC
gi|43992 : TACAGTCAAACC--TGT-GAAA-------G-----TGGTCACCT--GTAT-T-AA-GCA-TCCACTTGTCTTAAGCAGCC--ACA-TTTG--C-TG--------------------TT----TGCC---A--T---AAA-----TTT------T--ATA----T----------G------AT---T-T
gi|43858 : TACAGTCAAACC--TGT-GTAA-------G-----TGGTCACCT--CTAA-T-AA-GCA-GCCACTTGTCTTAACCAGCC--A-
gi|43736 : tgTATAGTTAAACC--TGT-GTAA-------G-----CGGCCACCT---CTA-TTAA-GCA-GCCACTTGCCTTAAGCAGCC--A-C-TTT---C-
gi|43757 : atgTACAGTCAAACT--TGT-GTTA-------G-----TGGTCACCT--CTAC-T-AA-GCA-ACCACCTACCTTAAACAGTC--ACA-TTT---C-A
gi|44044 : atg--TGT-ACTACAATCAAA-----CAGGCACCT--GTAA-T-AA-GCGTGTC-CCTCCGTTAAGCGGCC--A---TTT---T-AT---T-------------T--CC----CCCC---G--ATG-AAA-----ATCAT----T--CTA----T----------A------AT---T-GAC-----------C-T-GT--A-----TTAAGCG-TGAACTTGTCTAACGCGGCCAATGGC
gi|44058 : --TCG-AAA-----TTTAC----T--ATA----T----------A------AT---T-TAA-----------C-T-GC--A-----ATAGGCGGTCACCTGGTC-AACGCGGCCAGCGGCCAA--CATTTTTGGTCCCAAA---TGCATTAAAAACCTTCTAAAACGGCCACCAAATGAACAAATCTTACCGTAAAATATCGATTTTGGCATATAAAAATTTCATTACAGCCACAGAATTAATATTTAATTAAAGTACTTAAAACCAAATAAATCAAATAATTATAATATATCTTTAATTTAAAATAAGTTTC-TTTAGTTTCAACTTTCTTAATTGGCCGTAAACAAAACAAACAAAGCTGTTATTGTGTTCTACATAATTGCCATTTTTCCGACTCAAACagcctaaatttgtcc
gi|44059 : TCGGCATATAAAAATTTCATTATGGCCACAGAATTAATATTTAATTAAAGTACTAAAAACCAAATAAATCAAATAATTATAATATATCTTTAATTTGAAATAAATTTCTTTTAGTTTAAACTTTCTTTATTGGCCGTAAACAAACCAAACAAAGCTGTTATTGTGTTCTACATAATCGCCATTTTTCacgagtgttgtgcgtgataattttcacatctc
gi|44060 : TCTTAATTGGCCGTAAACAAACCAAACAAAGCTGTTATTGTGTTCTACATAATCGCCATTTCTCCGACTCAAACCAAACAAAGCTGTTATTGTGTTCTACATAATCTCAATTTTTCCGACTCAAACACGAGTGTAGTGCGTGATAATTTTCACATCTCTATTTTTAGCTTGTGT
gi|44061 : CAAACCAAACAAAGCTGTTATTGTGTTCTACATAATCGCAATTTTTCCGACTCAAAC
gi|44062 : CAAACCAAACAAAGCTGTTATTGTGTTCTACATAATCGCCATTTTTatgagtgtagcgcgtgacaattttcacatctctatttttagcctgcgt
gi|43843 : CAAACCAAACAAAGCTGTTATTGTGTTCTACATAATCACAATTTTTCCGACTCAAAC
gi|43896 : tatacagtcaaacctatactaacggtcacctgttataagcagccacctgccttaagcggccagtttcagaccctcccgtcgaaatttactatataatttaactgcaataggcggtcacctggtcgacgcagccagtggccaacatttttggtcccaaatgcattaaaaacctcctaaaacggccaccaaatgaacaaattttaccgtaaaatatcgattttggcatataaaaatttcattacggccacagaattaatatttaattaaagtactaaaaaccaaataaatcaaataattataatatatctttaatttaaaataagtttcttttagtttaaactttcttaattggccgtaaaCAAACCAAACAAAGCTGTTATTGTGTTCTACATAATCGCAATTTTTCCGACTCAAAC
gi|44058 : atacagtcaaacctgtactaacggtcacctgttataagcagccacctgccttaagcggtcagcttcagaccctcccgtcgaaatttactatataatttaactgcaataggcggtcacctggtcgacgcggccagcggccaacatttttggtcccaaatgcattaaaaacctcctaaaacggccaccaaatgaacaaattttaccgtaaaatatcgattttggcatataaaaagttcattacggccacagaattaatatttaattaaagtactaataaccaaataaatcaaataattataatatatctttaatttaaaataagtttcttttagtttaaactttcttaattggccgtaaaCAAAACAAACAAAGCTGTTATTGTGTTCTACATAATTGCCATTTTTCCGACTCAAACACGAGTGTTGTGCGTGATAATTTTCACATCTC
gi|44059 : tcgaaatttactatataatttaactgcaataggcggtcacctggtcaacgcggccagcggccaacatttttggtcccaaatgcattaaaaaccttctaaaacggccaccaaatgaacaaatcttaccgtaaaatatcgattttggcatataaaaatttcattacagccacagaattaatatttaattaaagtacttaaaaccaaataaatcaaataattataatatatctttaatttaaaataagtttctttagtttcaactttcttaattggccgtaaaCAAACCAAACAAAGCTGTTATTGTGTTCTACATAATCGCCATTTTTC
gi|44061 : tcggcatataaaaatttcattatggccacagaattaatatttaattaaagtactaaaaaccaaataaatcaaataattataatatatctttaatttgaaataaatttcttttagtttaaactttctttattggccgtaaaCAAACCAAACAAAGCTGTTATTGTGTTCTACATAATCGCAATTTTTCCGACTCAAACATGAGTGTAGCGCGTGACAATTTTCACATCTCTATTTTTAGCCTGCGT
gi|44062 : CAAACCAAACAAAGCTGTTATTGTGTTCTACATAATCGCCATTTTT
gi|44063 : CGACTCAAACATGAGTGTAGTGCATGATAATTTTCACATCTCTATTTTTAGCTCGCAT
Alignments
lowQualScore : 111111 22222222222222222222222222 1111111 1111111111 11111111111
lowQualScore : 00 1 0000 999999 7777 0 0 0 11 5555 00000000000000000000000000 3333333 44444 3 3333 555 5555 0000000000 333333 222 1 00000000000 3 1 444444 1 1 222 66 11 444
lowQualScore : .. . .... ...... .... . . . .. .... .......................... ....... ..... . .... ... .... .......... ...... ... . ........... . . ...... . . ... .. .. ...
lowQualScore : 66 1 9999 777777 8888 9 4 4 22 1111 33333333333333333333333333 0000000 77777 6 8888 222 2222 2222222222 555555 111 2 99999999999 8 2 111111 0 2 999 55 44 444
consensus : ATACAGTCAAACCTGTG--TAAG----CGGTCACCT-CT-ATT----AAGCA-GCCACCTGTCTTAAGCAG-C-C--A--CTTT---C-A--NA-------------C--CCTCCCG--TCG-AAA-----TTTAC----T--ATA----T----------A------AT---T-TAA-----------C-T-GCA-----NTAAGCGGTCACCTGNTCGACGCGGCCA---GCGGCCAA--CATTTTTGGTCCCAAA---TGCATTAAAAACCTCCTAAAACGGCCACCAAATGAACAAATTTTACCGTAAAATATCGATTTTGGCATATAAAAATTTCATTACGGCCACAGAATTAATATTTAATTAAAGTACTAAAAACCAAATAAATCAAATAATTATAATATATCTTTAATTTAAAATAAGTTTCTTTTAGTTTAAACTTTCTTAATTGGCCGTAAACAAACCAAACAAAGCTGTTATTGTGTTCTACATAATCGCCATTTTTCCGACTCAAACCAAACAAAGCTGTTATTGTGTTCTACATAATCGCAATTTTTCCGACTCAAACACGAGTGTAGTGCGTGATAATTTTCACATCTCTATTTTTAGCTCGCGT
Reference ( family-117 ) : ATACAGTCAAACCTGTG--TNAG----CGGTCACCT-TT-A-T----AAGCA-GCCACCTGTCTTAAGCAG-C-C--A--NTTT---C-A--NA-------------C--CCTCCCG--TCG-AAA-----TTTAC----T--ATA----T----------A------AT---T-TAA-----------C-T-GCA-----NTAAGCGGTCACCTGNTCGACGCGGCCA---GCGGCCAA--CATTTTTGGTCCCAAA---TGCATTAAAAACCTCCTAAAACGGCCACCAAATGAACAAATTTTACCGTAAAATATCGATTTTGGCATATAAAAATTTCATTACGGCCACAGAATTAATATTTAATTAAAGTACTAAAAACCAAATAAATCAAATAATTATAATATATCTTTAATTTAAAATAAGTTTCTTTTAGTTTAAACTTTCTTAATTGGCCGTAAACAAACCAAACAAAGCTGTTATTGTGTTCTACATAATCGCCATTTTTCCGACTCAAACCAAACAAAGCTGTTATTGTGTTCTACATAATCGCAATTTTTCCGACTCAAACACGAGTGTAGTGCGTGATAATTTTCACATCTCTATTTTTAGCTCGCGT
gi|43702 : ATACAGTCAAACCTGTA--CTAA----CGGTCACCTGTT-A-T----AAGCA-GCCACCTGCCTTAAGC-G-C-C--A--GTTT---C-A--TA-------------C--CCTCCCG--TCG-AAA-----TTTAC----T--ATA----T----------A------AT---T-TAA-----------C-T-GCA-----ATAGGCGGTCACCTGGTCGACGCGGCCA---GCGGCCAA--CATTTTTGGTCCCAAA---TGCATTAAAAACCTCCTAAAACGGCCACCAAATGAACAAATTTTACCGTAAAATATTGATTTTGGCATATAAAAATTTCATTACGGCCACAGAATTAATATTTAATTAAAGTACTAAAAACCAAATAAATCAAATAATTATAATATATCTTTAATTTAAAATAAGTTTCCTTTAGTTTAAACTTTCTTAATTGGCCGTAAACAAACCAAACAAAGCTATTATTGTGTTCTACATAATCGCCATTTTTCCGACTCAAACCAAACAAAGCTGTTATTGTGTTCTACATAATCGCAATTTTTCCGACTCAAACACGAGTGTAGTGCGTGATAATTTTCACATCTCTATTTTTAGCTCGCGT
gi|43703 : acTACAGTCAAACCTGTA--CTAA----CGGTTACCTGTT-A-T----AAGCA-GCCACCTGCCTTAAGCGG-C-C--A--GTTT---C-A--GA-------------C--CCTCCCG--GCG-AAA-----TTTAC----T--ATA----T----------A------AT---T-TAA-----------C-T-GCA-----ATAGGCGGTCACCTGGTCGACGCGGCCA---GCGGCCAA--CATTTTTGGTCCCAAA---TGCATTAAAAACCTCCTAAAACGGCCACCAAATGAACAAATTTTACCGTAAAATATCGATTTTGGCATATAAAAATTT-ATTACGGCCACAGAATTAATATTTAATTAAAGTACTAAAAACCAAATAAATCAAATAATTATAATATATCTTTAATTTAAAATAAGTTTCTTTTAGTTTAAACTTTCTTAATTGGCCGTAAACAAACCAAACAAAGCTGTTATTGTGTTCTACATAATCGCCATTTTTCCGACCCAAACCAAACAAAGCTGTTATTGTGTTCTACATAATCGCAATTTTTCCGACTCAAACACGAGTGTAGTGTGTGATAATTTTCACATCTCTATTTTTAGCTCGCGT
gi|43705 : atcATACAGTCAAACCTGTA--CTAA----CGGTCACCTGTT-A-T----AAGCA-GCCACCTGCCTTAAGCGG-C-C--A--GTTT---C-A--GA-------------C--CCTCCCG--TCG-AAA-----TTTAC----T--ATA----T----------A------AT---T-TAA-----------C-T-GCA-----ATAGGCGGTCACCTGGTCGACGCGGCCA---GCGGCCAA--CATTTTTGGTCCCAAA---TGCATTAAAAACCAGCTAAAACGGCCACCAAATGAACAAATTTTACCGTAAAATATCGATTTTGGCATATAAAAATTTCATTACGGCCGCAGAATTAATATTTAATTAAAGTACTAAAAACCAAATAAATCAAATAATTATAATATATCTTTAATTTAAAATAAGTTTCTTTTAGTTTAAACTTTCTTAATTGGCCGTAAACAAACTAAACAAAGCCGTTGTTGTATTCTACATAATCGCCATTTTTCCGACTCAAACCAAACAAAGCTGTTATTGTGTTCTACATAATCGGAATTTTTCCGACTCAAACACGAGTGTAGTGCATGATAATTTTCACATCTCTATTTTTAGCTCGCGT
gi|43706 : atACACAGTCAAACCTGTA--CTAA----CGGTCACCTGTT-A-T----AAGCA-GCCACCTGCCTTAAGCGG-C-C--A--GTTT---C-A--GA-------------C--CCTCCCG--TCG-AAA-----TTTAC----T--ATA----T----------A------AT---T-TAA-----------C-T-GCA-----ATAGGCGGTCACCTGGCCGACGCGGCCA---GCGGCCAA--CATTTTTGGTCCCAAA---TGCATTAAAAACCTCCTAAAACGGCCACCAAATGAACAAATTTAACCGTTAAATATCGATTTTGGCATATAAAAATTTCATTACGGCCACATAATTAATATTTAATTAAAGTACTAAAAACCAAATAAATCAAATAATTATAATAAATCTTTAATTTAAAATAAGTTTCTTTTAGTTTAAACTTTCTTGATTGGCCGTAAACAAACCAAACAAAGCTGTTATTGTGCTCTACATATTCGCCATTTTTCTGACTCAAACCAAACAAAACTGTTATTGTGTTCTACATAATCGCAATTTTTTCGACTCAAACACGAGTGTAGTGCGTGATAATTTTCACATCTCTATTTTTAGCTCGCGT
gi|43707 : atATACAGTCAAACCTGTA--CTAA----CGGTCACCTGTT-A-T----AAGCA-GCCACCTGCCTTAAGCGG-C-C--A--GTTT---C-A--GA-------------C--CCTCCCG--TCG-AAA-----TTCGC----A--ATA----T----------A------AT---T-TAA-----------C-T-GCA-----ATAGGCGGTTACCTGGTCGACGCGGCCA---GTGGCCAA--CATTTTTGGTCCAAAA---TGCATTAAAAACCTCCTAAAACGGCCACCAAATGAACAAATTTTACCGTAAAATATCGATTTTGGCATATAAAAATTTCATTACGGCCACAGAATTAATATTTAATTGAAGTACTAAAAACCAAATAAATCAAATAATTATAATATATCTTTAATTTAAAATAAGTTTCTTTTAGTTAAAACTTTCTAAATTGGCCGTAAACAAACCAAACAAAGCTGTTATTGTGTTCTACATAATCGCCATTTTTCCGACTCAAACCAAACAAACCTGTTATTG---------CAATCACAATTTTTCCGACTCAAACACGAGTGTAGTGCGTGATAATTTTCACATCTCTATTTTTAGCTCGCGT
gi|43710 : atATACAGTCTAACCTGTTCCTT-G----CGGCCACCTCTT-A-T----AAGCA-GTCACCTGTGTTAAACGG-C-C--A--CTTT---A-A--AG-------------T--CCCCCCG--TGT-AAA-----TTGCC----T--ATA----T----------A------AA---G-TAC-----------A-T-GTA-----TTAAAGGGTCACCTCTTTAACCTGGCCA---GTGGCCAGTCCATTTC--ATCCCAAA---
gi|43711 : atTACAGTCTAACTTGTC--CTTG----CGGTCACCTCTT-A-T----AAGTG-GTCACCTGTGTTAAGTGG-C-C--A--C-TT---C-A--AA-------------A--TCCCCCG--TGT-AAA-----TTGCC----T--ATA----T----------A------AA---G-TAC-----------A-T-GTA-----TTAAACGGTCACCTCTTTAACGCGGCCA---GT--CTA-------TTTCATCCCAAA---
gi|43712 : atgATACAGTCTAACCTGTC--CTTG----CGGCCACCTCTT-A-T----AAGCA-GTCACCTGTGTTAAGCGG-C-C--A--C-TT---C-A--A--------------------------------------------------ATA----T----------A------AA---G-TAC-----------A-T-GTA-----TTAAACGGTCAACTCTTTAACGTGACCA---GCGGCCAAACCATTCC--ATTCCAAA---
gi|43713 : atATACAGTCAAACTTGTA--CTAA----CGGGCACCT-GTAA-T----AAGCGTGTC-CCTCCATTAAG-GG-C-C--A--TTTT---A-T--TA-------------C--CCCCAAG--ATG-AAA-----ATCAT----T--CTA----T----------A------AT---T-GAC-----------C-T-GTA-----TTAAGTGTGAACTTGTCTAACGTGACCA---ACAGC
gi|43715 : acATACAGTCAAACTTGCA--GTAG----CGACCACTTGTT-A-T----AAGCG-ACCTCCTGATGTAAGCGA-C-C--A--CGTT-----A--AATCCCCCCCCCCCCC--CCCCCCC--CCA-AAACGAATTTCAT----T---CA----T----------A------AT---T-ACA-----------CAT-GCA-----ATAAGCGACCACTTGCTCTCTGCGACCA---GCGACC
gi|43716 : acTACAGTCAAACTTGTT--TAAG----CGGTCACCTCTT-T-T----AAGCA-GCCACTTGTCTTAAGCAG-C-C--A--CATT---T-A--CT-------------A--TTTCCCG--T---GAA-----TATGC----T--TTAAGAGC----------A------AA---T-TAAC----------C-T-GTA-----TTAAGCAACAACCTGTCTGAAAAGGCCA---
gi|43717 : atgATACAGTCAAACCTGTA--TAAG----CGGTCACCT-CT-ATT----AAGCA-GCCACTTGTCTTAAGCAG-C-C--A--
gi|43718 : atATATAGTCAAACCTGTT--TAAG----CACTCACCT-CT-AGT----AAGCA-GCCACCTGTCTTAAGCAG-C-C--A--
gi|43720 : atTACAGTCAAACCTATA--TAAC----CGGTCACCTCTT-T-T----AAGCA-GCCACTTGTCTTAAGCAG-C-C--A--
gi|43721 : atgATACAGTTAAACCTGTG--ATAG----TGGTCACCT-CT-ATT----AAGCA-ACCACTTGTCTTAAACAG-C-CATA--TTTT---CTATTTA-------------C--CATTTTT--TTA-AAT-----TTTAG----T---TA----T----------A------AT---C-AAC-----------C-T-GTA-----TTAAGCAGCCACCTG
gi|43722 : atATACAGTCAAACCTGTG--TAAG----CGGTCACCT-CT-ATT----AAGCA-GCCATTTGTCTTAAGCAG-C-C--A--TTTT---
gi|43723 : atATATAGTCAAACCTGTA--TAAG----CGGTCACCT-CT-ATT----AAGCA-GCCACTTGTCTTAAGCAG-C-C--A--
gi|43724 : atATACAGTCAAACCTGTA--TAAG----TGGTCACCT-CT-ATT----AAGCA-GCCACTTGTCTTAAGCAG-C-C--A--
gi|43727 : atATACAGCCAAACCTGTT--TAAG----TGGTCACCT-GT-A-TT---AAGCA-GCCACCTGTCTTAAGCAA-C-C--A--
gi|43729 : atATACAGTAAAACCTGTG--TAAG----CGGCCACCT-TT-ATT----AAGCA-GCCACCTGTCTTAAGCAG-C-C--A--
gi|43731 : atATACAGTCAAACCTGTG--TAAG----TGGTCACCT-CT-GTT----AAGCA-GCCACCTGTCTTAAGCAA-C-C--ATGTTTT---C----TA----------------TTTCCCAT-TC----A-----TATGC----T--TTAAGAGT----------A------AA---T-TAAC----------C-T-GTA-----TTAAGCAACCACCT
gi|43733 : acATACAGTCAAACCTGTG--TAAG----CGGCCACCT-CT-ATT----AAGCG-GCCACCTGTCTTAAGCAA-C-C--A--TTTT---
gi|43734 : atATACAGTCAAACCTGTA--TAAG----TGGCCACCT-CT-ATT----AAGCA-GCCACTTGTCTTAAGCAG-C-C--A--
gi|43735 : atATACAGTCAAACCTGTA--TAAT----CAGTCACCT-TT-ATT----AAGCA-GCCACTTGTCTTAAACAG-C-C--A--
gi|43736 : acTATAGTTAAACCTGTG--TAAG----CGGCCACCT-CT-A-TT---AAGCA-GCCACTTGCCTTAAGCAG-C-C--A--CTTT---C-
gi|43740 : atgATACAGTCAAACCTTTG--TAAG----TGGTCACCT-CT-A-TT---AAGCA-GCCACCTGTCTTAAGCAG-C-C--A--
gi|43741 : atATACAGTCTAACTTGTC--CATG----TGTTCACCTCTT-A-T----AAGCA-GTCCCCTTTGTTAAGCGG-C-C--A--CTTC---C-A--TC-------------T--CCCCATG--TC---AA-----TTTCC----T--AT-----T----------A------AA---G-TAC-----------A-T-GTA-----TGAAATGGTCACCTCTTTAATGTGGCAA---GT-----A--CATTTC---ACCCAAA---
gi|43742 : atTACAGTCAAACCTGTG--TAAG----TGGTCACCT-CT-ATT----AAGCA-GCCACCTGTCTTAAGCAT-C-C--AG-ATTT---
gi|43743 : atgATACAGTAAAACCTGTG--TAAG----CAGTCACCT-CT-ATT----AAGCA-GCCACCTGTCTTAAGCAA-C-C--A--TGTT---
gi|43745 : atATACAGTAAAACCTGTG--TAAG----TGGTCACCT-CT-ATT----AAGCA-GCCACCTGTCTTAAGCAA-C-C--A--TGTT---t
gi|43746 : atACACAGTAAAACCTGTA--TAAG----TGGTCACCT-CT-A-TT---AAGCA-GCCACCTGTCTTAAGCAG-T-C--A--TGTT---t
gi|43747 : atATACAGTCAAATCTGTG--CAAG----TGGCCATCT-CT-A-TT---AAGCA-GCCACTTGTCTTAAGCAG-C-C--A--TGTT---T-G--CG-------------CTATTTCCC---------A-----TTT-C----T--ATA----TTTTCAGAGC-A------AA---T-TAAC----------C-T-GTA-----TTAAGCAACCACCTGt
gi|43750 : atATACAGTCAAACCTGTG--TGAA----CAGTCACCC-CT-ATT----AAGCA-GCCACTTGTCTTAAGCAG-T-C--A--
gi|43751 : atATACAGTCAGACCTGTT--TAAGTGGTCGGTCACCT-CT-A-TT---AAGCA-GCCACTTGTCTTAAGCAG-C-C--A--CATT---C-A--
gi|43754 : atATACAGTCAAACCTGTG--TAAG----TGGTCACCTCTT-T-T----GAGCA-GCCACTTGTCATAAGCAG-C-C--A--
gi|43755 : atATACAGTCAAGCCTGTG--TAAG----TGGTCACCT-CT-ATT----AAGCA-GCCACTTGTCTTAAGCAG-C-C--A--
gi|43756 : atATACAGTCAAATCTGTG--TTAG----CGGCCACCT-TT-ATT----AAGCA-TTCACTTGTCTTAAGCAG-C-C--A--
gi|43757 : atTACAGTCAAACTTGTG--TTAG----TGGTCACCT-CT-ACT----AAGCA-ACCACCTACCTTAAACAG-T-C--AC-ATTT---C-A--
gi|43758 : atgATACAGTAAAACCTGTG--TAAG----CCGTCACCT-CT-A-TT---AAACA-GCCACCTGTCTTAAGCAG-C-C--A--TTTT---
gi|43759 : atATACAGTCAAACCAGTG--TAAG----AGGTCACCT-CC-AAT----AAGCA-GCCACTTGTCTTAAGCAG-C-C--A--
gi|43760 : atATACAGTAAAACCTGTA--TAAG----TGGTCACCT-CT-ATT----AAGCA-GCCACTTGTCTTATGCAG-C-C--A--CTTT---
gi|43761 : atATACAGTCAAACCTGTG--TTAG------GTCACCT-CT-A-TT---AAGCA-ACCACTTGTCTTAAACAG-C-C--A--
gi|43763 : atATACAGTCAAACCTGTG--TTAG----CGATCATCT-CT-ATT----AAGCA-GCTATCTGTCTTAAACAG-C-C--A--
gi|43764 : atATACAGTCAAACCTGTG--TAAG----CCGTCACCTCTT-T-T----AAGAA-ACCACTTGTCTTAAGCAG-C-C--A--
gi|43765 : atATACAGTCAAACCTGTG--TAAG----CGGTCACCT-CT-ATT----AAGCA-GTCACTTGTCTTAAGCGG-T-C--
gi|43766 : acATACAGTCAAACCTGTG--TAAG----CGGTCACCT-CT-ATT----AAGCA-GCAACTTGTCTTAAGCAG-C-C--A--
gi|43767 : acATACAGTCAAACCTGTA--TAAG----TGGTCACCT-CT-ATT----AAGCA-GCCACTTGACTTAGGCAG-C-C--A--
gi|43768 : acATACAGTCGAACCTGTG--TAAG----CAATCACCT-CT-A-TTATAAAGCA-ACCACCTGTCTTAAGCAG-C-C--A--
gi|43769 : atATACAGTCGAACCTGTG--TAAG----CAATCACCT-CT-A-TTATAAAGCA-ACCACCTGTCTTAAGCAG-C-C--A--
gi|43843 : atATACAGTCAAACCTATA--CTAA----CGGTCACCTGTT-A-T----AAGCA-GCCACCTGCCTTAAGCGG-C-C--A--GTTT---C-A--GA-------------C--CCTCCCG--TCG-AAA-----TTTAC----T--ATA----T----------A------AT---T-TAA-----------C-T-GCA-----ATAGGCGGTCACCTGGTCGACGCAGCCA---GTGGCCAA--CATTTTTGGTCCCAAA---TGCATTAAAAACCTCCTAAAACGGCCACCAAATGAACAAATTTTACCGTAAAATATCGATTTTGGCATATAAAAATTTCATTACGGCCACAGAATTAATATTTAATTAAAGTACTAAAAACCAAATAAATCAAATAATTATAATATATCTTTAATTTAAAATAAGTTTCTTTTAGTTTAAACTTTCTTAATTGGCCGTAAACAAACCAAACAAAGCTGTTATTGTGTTCTACATAATCACAATTTTTCCGACTCAAAC
gi|43844 : tATACAGTCAAACTTGCA--GTAG----CGACCACTTGTT-A-T----AAGCG-ACCCCCTGATGTAAGCGA-C-C--A--CATT---A-A--AT-------------T--CCCCCCA--ATG-AAT-----TTCAT----T---CA----T----------A------AT---T-ACA-----------CAT-GCA-----ATAAGCGACCACTTGCTCTCTGCGACCA---GCGACC
gi|43845 : tATACAGTCAAACTTGCA--GAAC----CGACCACTTGTT-A-T----AAGCG-ACCCCCTGATGTAAGCGA-C-C--A--CATT---A-A--AT-------------C--CCCCCCA--ACG-AAT-----TTCAT----T---CA----T----------A------AT---T-ACA-----------CAT-GCA-----ATATGCGACCACTTGCTCTCTGCAACCA---GCGACC
gi|43846 : tTACAGTCTAACTTGTC--CTTG----CGGCCACCTCTT-A-T----AAGCG-GTCACCTGTGTTAAGCAG-T-C--A--CTTC---A-A--AA-------------T--CCCCCCT--TGT-AAA-----TTGCC----T--ATA----T----------A--------------AA-----------G-T-ACATGTTTTTAAACGGTCGTCTTTTTAATGTGACCA---GTGGCCAT--TCTATTTCACCCCAAAGAGTGCTTTAA
gi|43847 : tgATACAGTAAAACCTGTA--TAAG----TGGTCACCT-GT-ATT----AAGCA-GCCACCTGTCTTAAGTGA-C-CATA--GTTT---C----TA----------------TTTCCCATTTC----------TTTGCT---T--TTA----T----------A------ATTAAT-TAAC----------C-T-GCA-----TTAAGC
gi|43848 : tATACAGTCAAACCTGTG--TAAG----TGGTCACCT-TT-ATT----AAGCA-GCCACTTGTCTTAAGTGG-C-C--A--
gi|43850 : tATACAGTCAAACCTGTG--TAAG----CGGTCAC----T-ATT----AAGCA-GCCACCTGTCTTAAACAG-C-C--A--
gi|43852 : tATACAGTCAAACCTGTG--TAAG----CGGTCACCT-CT-ATT----AAGCA-GCCACTTGTCTTAAGCAA-C-C--A--
gi|43853 : tATACAGTCAAACCTGCG--CAAA----CGGTCACCT-CT-ATT----AAGCA-GCCACTTGTCTTAAGC
gi|43854 : tTACAGTCAAACCTGTA--TAAG----TGGTCACCT-CT-ACT----AAGCA-GCCACTTGTCTTAAGCAG-C-C--A--CATT---C-G--CT-------------T--TTTCC---------AA-----TTT-C----T--ATG----TTTTCAGAGCAA------AT---T-TAC-----------C-T-GTA-----TTAAGC
gi|43855 : tgATACAGTCAAACCTGTG--TAAG----CGGTCACCT-CT-G-TC---AAGCA-GCCACTTGTCTTAAGCAG-C-C--
gi|43858 : tTACAGTCAAACCTGTG--TAAG----TGGTCACCT-CTAA-T----AAGCA-GCCACTTGTCTTAACCAG-C-C--A--
gi|43895 : tgATACAGTCAAACCTGTA--CTAA----CGGTCACCTGTT-A-T----AAGCA-GCCACCTGTCTTAAGCGG-C-C--A--GTTT---C-A--GA-------------C--CCTCCCG--TCG-AAA-----TTTAC----T--ATA----T----------A------AT---T-TAA-----------C-T-GCA-----ATAGGCGGTCACCTGGTCGACGCGGCCA---CCGGCCAA--CATTTTTGGTCCCAAA---TGCATTAAAAACCTCCTAAAACGGCCACCAAATGAACAAATTTTACCGTAAAATATCGATTTTGGCATATAAAAATTTCATTACGGCCGCAGAACTAATATTTAATTAAAGTACTAAAAACCAAATAAATCAAATAATTATAATATATCTTTAATTCAAAATAAGTTTCTTTTAGTTTAAACTTTCTTAATTGGCCGTAAACAAACCAAACAAAGCCGTTGTTGTATTCTACATAATCGCCATTTTTCCGACTCAAACCAAACAAAGCTGTTATTGTGTTCTACATAATCGGAATTTTTCCGACTCAAACACGAGTGTAGTGCGTGATAATTTTCACATCTCTATTTTTAGCTCGCGT
gi|43896 : ATACAGTCAAACCTGTA--CTAA----CGGTCACCTGTT-A-T----AAGCA-GCCACCTGCCTTAAGCGG-T-C--A--GCTT---C-A--GA-------------C--CCTCCCG--TCG-AAA-----TTTAC----T--ATA----T----------A------AT---T-TAA-----------C-T-GCA-----ATAGGCGGTCACCTGGTCGACGCGGCCA---GCGGCCAA--CATTTTTGGTCCCAAA---TGCATTAAAAACCTCCTAAAACGGCCACCAAATGAACAAATTTTACCGTAAAATATCGATTTTGGCATATAAAAAGTTCATTACGGCCACAGAATTAATATTTAATTAAAGTACTAATAACCAAATAAATCAAATAATTATAATATATCTTTAATTTAAAATAAGTTTCTTTTAGTTTAAACTTTCTTAATTGGCCGTAAACAAACCAAACAAAGCTGTTATTGTGTTCTACATAATCGCAATTTTTCCGACTCAAAC
gi|43898 : ATACAGTCTAACCTGTC--CTTG----AGGCCACCTCTT-A-T----AAGCG-GTCACCTGTGTTAAGCGG-C-C-----TCTT---C-A--AA-----------------ATGCCG--TTGTTAA-----TTGCC----T--GTA----T----------A------AA---G-TAC-----------A-T-GTA-----TTAAACCATCACCTCTTTAACGCGGCCA---GT--CCA-------TTTCATCCCAAA---
gi|43899 : ATATAGTCAAACCTGTA--TAAG----CGGTCACCT-CT-ATT----AAGCA-GCCACCTGTCTTAAGTAG-C-C--A--TTTTTTCC-A--------------------CTTCCC---------A-----TTT-C----T--ATG----C------------------T---T-TAA-----------C-T-GC------TTAA
gi|43900 : ATACAGTCAAACCTGTG--TGAA----CGGTCACCT-CT-ATT----AAGCA-GCCACTTGTCTTAAGCAG-C-C--AC-ATTT---G-A--TA----------------CTTCCCA--Tta
gi|43901 : ATACAGTAAAACCTGTA--TAAA----TGGTCACCTCTT-T-T----AAGCA-GCCACTTGTCTTAAGCAG-C-C--A--
gi|43904 : ATACAGTCAAACCTGTA--TAAG----TGGTCACCT-CT-ATT----AAGCA-GCCACTTGCCTTAAGCAG-C-C--A--
gi|43905 : ATACAGTCAAATCTGTT--TTAC----TGGTCACCT-GT-ATT----AAGCA-ACCACTTGTCTTAAACAGACAC--A--TTTT---C------------------------------------AA-----TTTACCATTT--ATA----T----------A------AT---T-TAGATTTCTTCAACC-T-GTA-----TTAAGCAGTCACCTG
gi|43907 : ATACAGTCAAATCTGTG--TAAG----AGGTCACCTCTT-T-T----AAGCA-GCCACCTGTCTTAAGCAG-C-C--A--
gi|43909 : ATACAGTCAAACCTGTA--CAAG----CAGCCACCT-CT-A-TT---AAGCA-GCCACTTGTCTTAAGCAG-C-C--A--
gi|43911 : ATACAGTCAAACCTGTG--CAAG----CGGTCATCT-CT-ATT----AAGCA-GCCACCTGTCTTAAGCAA-C-C--A--
gi|43912 : ATACAGTCAAACCAGTG--CAAG----CGGTCACCT-CT-ATT----AAGCA-GCCACTTGTCATAAGCAG-C-C--A--CATT---T-G--CT-------------A--TTTCCCA--TTT-ATATG---TTTGT----TGAATA---------------A------AT---T-CAC-----------C-T-GCA-----TTAAGCAATAACCTG
gi|43913 : ATACAGTCATACCTGTA--TAAG----TGGTCACCT-TT-ATT----AAGCA-GCCACTTGTCTTAAGCAG-C-C--A--
gi|43914 : ATGTAGTCAAACCTGTA--CAAG----CGGTCACCT-CT-C-TT---AAGCA-GCCACTTTTCTTAAGCAG-C-C--A--
gi|43916 : ATACAGTCAAACCTGTG--TAAG----GGGTCATCT-CT-AAT----AAGCA-GCCACCTGTCTTAAGCAA-C-C--A--
gi|43917 : ATACAGTCAAACTTGTG--TAAG----CGGTCACCT-CT-ATT----AAGCA-GCCACTTGTCTTAAGCAG-C-C--A--
gi|43920 : ATACAGTCAAACCTGTG--TTAG----TGGCCACCT-AT-ATT----AAGCA-GCCACCTGTCATAAGCAA-C-C--A--
gi|43963 : TACAGTCAAACCTGTA--CTAA----CAGTCACCTGTT-A-T----AAGCA-GCCACCTGCCTTAAGCGG-C-C--A--GTTT---C-A--TA-------------C--CCTCCCG--TCA-AAA-----TTTAC----T--ATA----T----------ACATGTAAT---T-TAA-----------C-T-GCA-----ATAGGCGGTCACCTGGTCGACGCGGCCA---GCGGCCAA--CATTTTTGGTCCCAAA---TGCATTAAAAACCTTCTAAAACGGCCACCAAATGAATAAATTTTACCGTAAAAAATCGATTTTGGCATA-AAAAATTTCATTACGGCCACTAAATTAATATTTAATTAAAGTACTAAAAACCAAATAAATCAAATAATTATAATATATCTTTAATTTAGAATAAGTTTCCTTTAGTTTAAACTTTCTTAACTGGCCGTAAACCAACCAAACAAAGCTGTTAT-----------TAATCGCCATTTTTCCGACTCGAACCAAACAAAGCTGTTATTGTGTTCTACATAATCGCAATTTTTCCGACTCAAACACGAGTGTAGTGTGTGATAATTTTCACATCTCTATTTTTAGCCCGCGT
gi|43966 : TACAGTCAAACTTGCA--GTAG----CGACCACTTGTT-A-T----AAGCG-ACCCCCTGATGTAAGCGA-C-C--A--CATT-----A--AA-------------T--CCCCCCA--ACG--AA-----TTTAA----T--TCA----T----------A------AT---T-ATA-----------C-TCGCA-----ATAAGGGACCACTTGCTCTCTGCGATCA---GC
gi|43971 : TACAGTCAAACTTGCA--GTAG----CGACCACTTGTT-A-T----AAG---------TGATGTAAGTGA-C-C--A--CATT-----A--AA-------------T--CCCCCCA--ATG-AAT-----TTCAT----T---CA----T----------A------AT---TATAC-----------A-T-GCA-----ATAAGCGACCACTTGCTCTCTGCGACCA---GCGACC
gi|43972 : TACAGTCAAACCTGTA--TAAA----CTGTCACCT-GT-AGT----AAGCA-GCCACATGTCTTAAGCAG-C-C--A--
gi|43974 : TACAGTCAAACCTGTA--CTAA----CAGTCACCTGTT-A-T----AAGCA-GCCAC
gi|43978 : TACAGTCAAACCTGTG--TTAG----CGGTCTCCT-CT-A-TT---AAGCA-GCCACCTGTCTTAAGCAG-C-C--A--
gi|43980 : TACAGTCAAACCTGTA--TTAG----CAGTCACCT-CT-ATT----AAGCA-GTCACCTGTCTTAAGCAA-C-C--A--
gi|43983 : TACATTCAAACCTGTG--TTAA----CGGTAACCT-TT-A-TT---AAGCA-GCCACCTGTCTTAAGCAA-C-C--A--
gi|43984 : TGCAGTCAAACCTGTG--CAAG----CGGTCACCT-CT-G-TT---AAGCA-GCCACTTGTCTTAAGCAG-C-C--A--
gi|43987 : TACATTCAAACCTGTG--TTAT----TGGTCACCTCTT-T-T----AAGCA-GCCACTTGTCTTAAGCAG-C-C--A--
gi|43988 : TACAGTCAAACCTGTG--TAAG----CGGACACCTCTT-T-T----AAGCA-GCCACTTGTCTTAAGCAG-C-C--A--
gi|43989 : TACAGTCAAACCTGTA--TAAG----CGGTCACTT-CT-ATT----AAGCA-GTCACCTGTCTTAAGCAG-C-C--A--
gi|43990 : TACAGTCAAACCTGTG--TTAG----CAGTCACCTCTT-T-T----AGGCA-GCCACCTGTCTTAAGAAA-C-C--A--
gi|43991 : TACAGTCAAACCTGTG--TAAG----CGGTCACCT-CT-ATT----AGGCA-GCCACCTGTCTTAAGCAA-C-C--AT-ATTT---C-
gi|43992 : TACAGTCAAACCTGTG--AAAG----TGGTCACCT-GT-ATT----AAGCA-TCCACTTGTCTTAAGCAG-C-C--A--CATT---T-G--CT-------------G--TTTGCCA--T---AAA-----TTT------T--ATA----T----------G------AT---T-T
gi|44044 : TACAATCAAAC----------------AGGCACCT-GT-AAT----AAGCGTGTC-CCTCCGTTAAGCGG-C-C--A--TTTT-----A--TT-------------T--CCCCCCG--ATG-AAA-----ATCAT----T--CTA----T----------A------AT---T-GAC-----------C-T-GTA-----TTAAGCGTGAACTTGTCTAACGCGGCCAATGGCAGCCTA--AATTT---GTCC
gi|44058 : tgtac--TCG-AAA-----TTTAC----T--ATA----T----------A------AT---T-TAA-----------C-T-GCA-----ATAGGCGGTCACCTGGTCAACGCGGCCA---GCGGCCAA--CATTTTTGGTCCCAAA---TGCATTAAAAACCTTCTAAAACGGCCACCAAATGAACAAATCTTACCGTAAAATATCGATTTTGGCATATAAAAATTTCATTACAGCCACAGAATTAATATTTAATTAAAGTACTTAAAACCAAATAAATCAAATAATTATAATATATCTTTAATTTAAAATAAGTTTC-TTTAGTTTCAACTTTCTTAATTGGCCGTAAACAAAACAAACAAAGCTGTTATTGTGTTCTACATAATTGCCATTTTTCCGACTCAAAC
gi|44058 : CAAAACAAACAAAGCTGTTATTGTGTTCTACATAATTGCCATTTTTCCGACTCAAACACGAGTGTTGTGCGTGATAATTTTCACATCTCacgagtgttgtgcgtgataattttcacatctc
gi|44059 : tcgaaatttactatataatttaactgcaataggcggtcacctggtcaacgcggccagcggccaacatttttggtcccaaatgcattaaaaaccttctaaaacggccaccaaatgaacaaatcttaccgtaaaatatcgattttggcatataaaaatttcattacagccacagaattaatatttaattaaagtacttaaaaccaaataaatcaaataattataatatatctttaatttaaaataagtttctttagtttcaactttcttaattggccgtaaaTCGGCATATAAAAATTTCATTATGGCCACAGAATTAATATTTAATTAAAGTACTAAAAACCAAATAAATCAAATAATTATAATATATCTTTAATTTGAAATAAATTTCTTTTAGTTTAAACTTTCTTTATTGGCCGTAAACAAACCAAACAAAGCTGTTATTGTGTTCTACATAATCGCCATTTTTC
gi|44060 : TCTTAATTGGCCGTAAACAAACCAAACAAAGCTGTTATTGTGTTCTACATAATCGCCATTTCTCCGACTCAAACCAAACAAAGCTGTTATTGTGTTCTACATAATCTCAATTTTTCCGACTCAAACACGAGTGTAGTGCGTGATAATTTTCACATCTCTATTTTTAGCTTGTGT
gi|44061 : CAAACCAAACAAAGCTGTTATTGTGTTCTACATAATCGCAATTTTTCCGACTCAAACATGAGTGTAGCGCGTGACAATTTTCACATCTCTATTTTTAGCCTGCGT
gi|44062 : CAAACCAAACAAAGCTGTTATTGTGTTCTACATAATCGCCATTTTT
gi|44063 : CGACTCAAACATGAGTGTAGTGCATGATAATTTTCACATCTCTATTTTTAGCTCGCAT
Alignments
lowQualScore : 22222222222222222222222222 1111111 1111111111 11111111111
lowQualScore : 1 000 1 0000 6 1 111 0 00 666666 11111111111111111111111111 3333333 44444 3 3333 555 5555 0000000000 333333 222 1 00000000000 3 1 444444 1 1 222 66 11 444
lowQualScore : . ... . .... . . ... . .. ...... .......................... ....... ..... . .... ... .... .......... ...... ... . ........... . . ...... . . ... .. .. ...
lowQualScore : 7 888 4 9999 4 1 555 9 66 666666 22222222222222222222222222 0000000 77777 6 8888 222 2222 2222222222 555555 111 2 99999999999 8 2 111111 0 2 999 55 44 444
consensus : ATACAGTCAAACCTGT-G---TAAG----CGGTCACCT-CTATT---AAGCA-GCCACCTGTCTTAAGCAGCC--A--C--TTT---C-A--NA-------------C--CCTCCCG--TCG-AAA-----TTTAC----T--ATA----T----------A------AT---T-TAA-----------C-T-GCA-----NTAAGCGGTCACCTGNTCGACGCGGCCA---GCGGCCAA--CATTTTTGGTCCCAAA---TGCATTAAAAACCTCCTAAAACGGCCACCAAATGAACAAATTTTACCGTAAAATATCGATTTTGGCATATAAAAATTTCATTACGGCCACAGAATTAATATTTAATTAAAGTACTAAAAACCAAATAAATCAAATAATTATAATATATCTTTAATTTAAAATAAGTTTCTTTTAGTTTAAACTTTCTTAATTGGCCGTAAACAAACCAAACAAAGCTGTTATTGTGTTCTACATAATCGCCATTTTTCCGACTCAAACCAAACAAAGCTGTTATTGTGTTCTACATAATCGCAATTTTTCCGACTCAAACACGAGTGTAGTGCGTGATAATTTTCACATCTCTATTTTTAGCTCGCGT
Reference ( family-117 ) : ATACAGTCAAACCTGT-G---TAAG----CGGTCACCT-CTATT---AAGCA-GCCACCTGTCTTAAGCAGCC--A--C--TTT---C-A--NA-------------C--CCTCCCG--TCG-AAA-----TTTAC----T--ATA----T----------A------AT---T-TAA-----------C-T-GCA-----NTAAGCGGTCACCTGNTCGACGCGGCCA---GCGGCCAA--CATTTTTGGTCCCAAA---TGCATTAAAAACCTCCTAAAACGGCCACCAAATGAACAAATTTTACCGTAAAATATCGATTTTGGCATATAAAAATTTCATTACGGCCACAGAATTAATATTTAATTAAAGTACTAAAAACCAAATAAATCAAATAATTATAATATATCTTTAATTTAAAATAAGTTTCTTTTAGTTTAAACTTTCTTAATTGGCCGTAAACAAACCAAACAAAGCTGTTATTGTGTTCTACATAATCGCCATTTTTCCGACTCAAACCAAACAAAGCTGTTATTGTGTTCTACATAATCGCAATTTTTCCGACTCAAACACGAGTGTAGTGCGTGATAATTTTCACATCTCTATTTTTAGCTCGCGT
gi|43702 : ATACAGTCAAACCTGT-A---CTAA----CGGTCACCTGTTAT----AAGCA-GCCACCTGCCTTAAGC-GCC--A--G--TTT---C-A--TA-------------C--CCTCCCG--TCG-AAA-----TTTAC----T--ATA----T----------A------AT---T-TAA-----------C-T-GCA-----ATAGGCGGTCACCTGGTCGACGCGGCCA---GCGGCCAA--CATTTTTGGTCCCAAA---TGCATTAAAAACCTCCTAAAACGGCCACCAAATGAACAAATTTTACCGTAAAATATTGATTTTGGCATATAAAAATTTCATTACGGCCACAGAATTAATATTTAATTAAAGTACTAAAAACCAAATAAATCAAATAATTATAATATATCTTTAATTTAAAATAAGTTTCCTTTAGTTTAAACTTTCTTAATTGGCCGTAAACAAACCAAACAAAGCTATTATTGTGTTCTACATAATCGCCATTTTTCCGACTCAAACCAAACAAAGCTGTTATTGTGTTCTACATAATCGCAATTTTTCCGACTCAAACACGAGTGTAGTGCGTGATAATTTTCACATCTCTATTTTTAGCTCGCGT
gi|43703 : acTACAGTCAAACCTGT-A---CTAA----CGGTTACCTGTTAT----AAGCA-GCCACCTGCCTTAAGCGGCC--A--G--TTT---C-A--GA-------------C--CCTCCCG--GCG-AAA-----TTTAC----T--ATA----T----------A------AT---T-TAA-----------C-T-GCA-----ATAGGCGGTCACCTGGTCGACGCGGCCA---GCGGCCAA--CATTTTTGGTCCCAAA---TGCATTAAAAACCTCCTAAAACGGCCACCAAATGAACAAATTTTACCGTAAAATATCGATTTTGGCATATAAAAATTT-ATTACGGCCACAGAATTAATATTTAATTAAAGTACTAAAAACCAAATAAATCAAATAATTATAATATATCTTTAATTTAAAATAAGTTTCTTTTAGTTTAAACTTTCTTAATTGGCCGTAAACAAACCAAACAAAGCTGTTATTGTGTTCTACATAATCGCCATTTTTCCGACCCAAACCAAACAAAGCTGTTATTGTGTTCTACATAATCGCAATTTTTCCGACTCAAACACGAGTGTAGTGTGTGATAATTTTCACATCTCTATTTTTAGCTCGCGT
gi|43705 : atcATACAGTCAAACCTGT-A---CTAA----CGGTCACCTGTTA-T---AAGCA-GCCACCTGCCTTAAGCGGCC--A--G--TTT---C-A--GA-------------C--CCTCCCG--TCG-AAA-----TTTAC----T--ATA----T----------A------AT---T-TAA-----------C-T-GCA-----ATAGGCGGTCACCTGGTCGACGCGGCCA---GCGGCCAA--CATTTTTGGTCCCAAA---TGCATTAAAAACCAGCTAAAACGGCCACCAAATGAACAAATTTTACCGTAAAATATCGATTTTGGCATATAAAAATTTCATTACGGCCGCAGAATTAATATTTAATTAAAGTACTAAAAACCAAATAAATCAAATAATTATAATATATCTTTAATTTAAAATAAGTTTCTTTTAGTTTAAACTTTCTTAATTGGCCGTAAACAAACTAAACAAAGCCGTTGTTGTATTCTACATAATCGCCATTTTTCCGACTCAAACCAAACAAAGCTGTTATTGTGTTCTACATAATCGGAATTTTTCCGACTCAAACACGAGTGTAGTGCATGATAATTTTCACATCTCTATTTTTAGCTCGCGT
gi|43706 : atACACAGTCAAACCTGT-A---CTAA----CGGTCACCTGTTA-T---AAGCA-GCCACCTGCCTTAAGCGGCC--A--G--TTT---C-A--GA-------------C--CCTCCCG--TCG-AAA-----TTTAC----T--ATA----T----------A------AT---T-TAA-----------C-T-GCA-----ATAGGCGGTCACCTGGCCGACGCGGCCA---GCGGCCAA--CATTTTTGGTCCCAAA---TGCATTAAAAACCTCCTAAAACGGCCACCAAATGAACAAATTTAACCGTTAAATATCGATTTTGGCATATAAAAATTTCATTACGGCCACATAATTAATATTTAATTAAAGTACTAAAAACCAAATAAATCAAATAATTATAATAAATCTTTAATTTAAAATAAGTTTCTTTTAGTTTAAACTTTCTTGATTGGCCGTAAACAAACCAAACAAAGCTGTTATTGTGCTCTACATATTCGCCATTTTTCTGACTCAAACCAAACAAAACTGTTATTGTGTTCTACATAATCGCAATTTTTTCGACTCAAACACGAGTGTAGTGCGTGATAATTTTCACATCTCTATTTTTAGCTCGCGT
gi|43707 : atATACAGTCAAACCTGT-A---CTAA----CGGTCACCTGTTA-T---AAGCA-GCCACCTGCCTTAAGCGGCC--A--G--TTT---C-A--GA-------------C--CCTCCCG--TCG-AAA-----TTCGC----A--ATA----T----------A------AT---T-TAA-----------C-T-GCA-----ATAGGCGGTTACCTGGTCGACGCGGCCA---GTGGCCAA--CATTTTTGGTCCAAAA---TGCATTAAAAACCTCCTAAAACGGCCACCAAATGAACAAATTTTACCGTAAAATATCGATTTTGGCATATAAAAATTTCATTACGGCCACAGAATTAATATTTAATTGAAGTACTAAAAACCAAATAAATCAAATAATTATAATATATCTTTAATTTAAAATAAGTTTCTTTTAGTTAAAACTTTCTAAATTGGCCGTAAACAAACCAAACAAAGCTGTTATTGTGTTCTACATAATCGCCATTTTTCCGACTCAAACCAAACAAACCTGTTATTG---------CAATCACAATTTTTCCGACTCAAACACGAGTGTAGTGCGTGATAATTTTCACATCTCTATTTTTAGCTCGCGT
gi|43710 : atATACAGTCTAACCTGT-TCCTT--G----CGGCCACCT-CTTAT---AAGCA-GTCACCTGTGTTAAACGGCC--A--C--TTT---A-A--AG-------------T--CCCCCCG--TGT-AAA-----TTGCC----T--ATA----T----------A------AA---G-TAC-----------A-T-GTA-----TTAAAGGGTCACCTCTTTAACCTGGCCA---GTGGCCAGTCCATTTC--ATCCCAAA---
gi|43711 : atTACAGTCTAACTTGT-C---CTTG----CGGTCACCT-CTTAT---AAGTG-GTCACCTGTGTTAAGTGGCC--A--C---TT---C-A--AA-------------A--TCCCCCG--TGT-AAA-----TTGCC----T--ATA----T----------A------AA---G-TAC-----------A-T-GTA-----TTAAACGGTCACCTCTTTAACGCGGCCA---GT--CTA-------TTTCATCCCAAA---
gi|43712 : atgATACAGTCTAACCTGT-C---CTTG----CGGCCACCT-CTTAT---AAGCA-GTCACCTGTGTTAAGCGGCC--A--C---TT---C-A--A--------------------------------------------------ATA----T----------A------AA---G-TAC-----------A-T-GTA-----TTAAACGGTCAACTCTTTAACGTGACCA---GCGGCCAAACCATTCC--ATTCCAAA---
gi|43713 : atATACAGTCAAACTTGT-A---CTAA----CGGGCACCT-GTAAT---AAGCGTGTC-CCTCCATTAAG-GGCC--A--T--TTT---A-T--TA-------------C--CCCCAAG--ATG-AAA-----ATCAT----T--CTA----T----------A------AT---T-GAC-----------C-T-GTA-----TTAAGTGTGAACTTGTCTAACGTGACCA---ACAGC
gi|43715 : acATACAGTCAAACTTGCAG---T-AG----CGACCACTTGTTA-T---AAGCG-ACCTCCTGATGTAAGCGACC--A--C--GTT-----A--AATCCCCCCCCCCCCC--CCCCCCC--CCA-AAACGAATTTCAT----T---CA----T----------A------AT---T-ACA-----------CAT-GCA-----ATAAGCGACCACTTGCTCTCTGCGACCA---GCGACC
gi|43716 : acTACAGTCAAACTTGT-T---TAAG----CGGTCACCT-CTTTT---AAGCA-GCCACTTGTCTTAAGCAGCC--A--C--ATT---T-A--CT-------------A--TTTCCCG--T---GAA-----TATGC----T--TTAAGAGC----------A------AA---T-TAAC----------C-T-GTA-----TTAAGCAACAACCTGTCTGAAAAGGCCA---
gi|43717 : atgATACAGTCAAACCTGT-A---TAAG----CGGTCACCT-CTATT---AAGCA-GCCACTTGTCTTAAGCAGCC--A--
gi|43718 : atATATAGTCAAACCTGT-T---TAAG----CACTCACCT-CTAGT---AAGCA-GCCACCTGTCTTAAGCAGCC--A--
gi|43720 : atTACAGTCAAACCTAT-A---TAAC----CGGTCACCT-CTTTT---AAGCA-GCCACTTGTCTTAAGCAGCC--A--
gi|43721 : atgATACAGTTAAACCTGT-G---ATAG----TGGTCACCT-CTATT---AAGCA-ACCACTTGTCTTAAACAGCCATA--T--TTT---CTATTTA-------------C--CATTTTT--TTA-AAT-----TTTAG----T---TA----T----------A------AT---C-AAC-----------C-T-GTA-----TTAAGCAGCCACCTG
gi|43722 : atATACAGTCAAACCTGT-G---TAAG----CGGTCACCT-CTATT---AAGCA-GCCATTTGTCTTAAGCAGCC--A--T--TTT---
gi|43723 : atATATAGTCAAACCTGT-A---TAAG----CGGTCACCT-CTATT---AAGCA-GCCACTTGTCTTAAGCAGCC--A--
gi|43724 : atATACAGTCAAACCTGT-A---TAAG----TGGTCACCT-CTATT---AAGCA-GCCACTTGTCTTAAGCAGCC--A--
gi|43727 : atATACAGCCAAACCTGT-T---TAAG----TGGTCACCT-GTATT---AAGCA-GCCACCTGTCTTAAGCAACC--A--
gi|43729 : atATACAGTAAAACCTGT-G---TAAG----CGGCCACCT-TTATT---AAGCA-GCCACCTGTCTTAAGCAGCC--A--
gi|43731 : atATACAGTCAAACCTGT-G---TAAG----TGGTCACCT-CTGTT---AAGCA-GCCACCTGTCTTAAGCAACC--ATGT--TTT---C----TA----------------TTTCCCAT-TC----A-----TATGC----T--TTAAGAGT----------A------AA---T-TAAC----------C-T-GTA-----TTAAGCAACCACCT
gi|43733 : acATACAGTCAAACCTGT-G---TAAG----CGGCCACCT-CTATT---AAGCG-GCCACCTGTCTTAAGCAACC--A--T--TTT---
gi|43734 : atATACAGTCAAACCTGT-A---TAAG----TGGCCACCT-CTATT---AAGCA-GCCACTTGTCTTAAGCAGCC--A--
gi|43735 : atATACAGTCAAACCTGT-A---TAAT----CAGTCACCT-TTATT---AAGCA-GCCACTTGTCTTAAACAGCC--A--
gi|43736 : acTATAGTTAAACCTGT-G---TAAG----CGGCCACCT-CTATT---AAGCA-GCCACTTGCCTTAAGCAGCC--A--C--TTT---C-
gi|43740 : atgATACAGTCAAACCTTT-G---TAAG----TGGTCACCT-CTATT---AAGCA-GCCACCTGTCTTAAGCAGCC--A--
gi|43741 : atATACAGTCTAACTTGT-C---CATG----TGTTCACCT-CTTAT---AAGCA-GTCCCCTTTGTTAAGCGGCC--A--C--TTC---C-A--TC-------------T--CCCCATG--TC---AA-----TTTCC----T--AT-----T----------A------AA---G-TAC-----------A-T-GTA-----TGAAATGGTCACCTCTTTAATGTGGCAA---GT-----A--CATTTC---ACCCAAA---
gi|43742 : atTACAGTCAAACCTGT-G---TAAG----TGGTCACCT-CTATT---AAGCA-GCCACCTGTCTTAAGCATCC--A--
gi|43743 : atgATACAGTAAAACCTGT-G---TAAG----CAGTCACCT-CTATT---AAGCA-GCCACCTGTCTTAAGCAACC--A--gattt
gi|43745 : atATACAGTAAAACCTGT-G---TAAG----TGGTCACCT-CTATT---AAGCA-GCCACCTGTCTTAAGCAACC--A--tgttt
gi|43746 : atACACAGTAAAACCTGT-A---TAAG----TGGTCACCT-CTATT---AAGCA-GCCACCTGTCTTAAGCAGTC--A--tgttt
gi|43747 : atATACAGTCAAATCTGT-G---CAAG----TGGCCATCT-CTATT---AAGCA-GCCACTTGTCTTAAGCAGCC--A--T--GTT---T-G--CG-------------CTATTTCCC---------A-----TTT-C----T--ATA----TTTTCAGAGC-A------AA---T-TAAC----------C-T-GTA-----TTAAGCAACCACCTGtgttt
gi|43750 : atATACAGTCAAACCTGT-G---TGAA----CAGTCACCC-CTATT---AAGCA-GCCACTTGTCTTAAGCAGTC--A--
gi|43751 : atATACAGTCAGACCTGT-T---TAAGTGGTCGGTCACCT-CTATT---AAGCA-GCCACTTGTCTTAAGCAGCC--A--C--ATT---C-A--
gi|43754 : atATACAGTCAAACCTGT-G---TAAG----TGGTCACCT-CTTTT---GAGCA-GCCACTTGTCATAAGCAGCC--A--
gi|43755 : atATACAGTCAAGCCTGT-G---TAAG----TGGTCACCT-CTATT---AAGCA-GCCACTTGTCTTAAGCAGCC--A--
gi|43756 : atATACAGTCAAATCTGT-G---TTAG----CGGCCACCT-TTATT---AAGCA-TTCACTTGTCTTAAGCAGCC--A--
gi|43757 : atTACAGTCAAACTTGT-G---TTAG----TGGTCACCT-CTACT---AAGCA-ACCACCTACCTTAAACAGTC--A--CA-TTT---C-A--
gi|43758 : atgATACAGTAAAACCTGT-G---TAAG----CCGTCACCT-CTATT---AAACA-GCCACCTGTCTTAAGCAGCC--A--T--TTT---
gi|43759 : atATACAGTCAAACCAGT-G---TAAG----AGGTCACCT-CCAAT---AAGCA-GCCACTTGTCTTAAGCAGCC--A--
gi|43760 : atATACAGTAAAACCTGT-A---TAAG----TGGTCACCT-CTATT---AAGCA-GCCACTTGTCTTATGCAGCC--A--C--TTT---
gi|43761 : atATACAGTCAAACCTGT-G---TTAG------GTCACCT-CTATT---AAGCA-ACCACTTGTCTTAAACAGCC--A--
gi|43763 : atATACAGTCAAACCTGT-G---TTAG----CGATCATCT-CTATT---AAGCA-GCTATCTGTCTTAAACAGCC--A--
gi|43764 : atATACAGTCAAACCTGT-G---TAAG----CCGTCACCT-CTTTT---AAGAA-ACCACTTGTCTTAAGCAGCC--A--
gi|43765 : atATACAGTCAAACCTGT-G---TAAG----CGGTCACCT-CTATT---AAGCA-GTCACTTGTCTTAAGCGGTC--
gi|43766 : acATACAGTCAAACCTGT-G---TAAG----CGGTCACCT-CTATT---AAGCA-GCAACTTGTCTTAAGCAGCC--A--
gi|43767 : acATACAGTCAAACCTGT-A---TAAG----TGGTCACCT-CTATT---AAGCA-GCCACTTGACTTAGGCAGCC--A--
gi|43768 : acATACAGTCGAACCTGT-G---TAAG----CAATCACCT-CTATTATAAAGCA-ACCACCTGTCTTAAGCAGCC--A--
gi|43769 : atATACAGTCGAACCTGT-G---TAAG----CAATCACCT-CTATTATAAAGCA-ACCACCTGTCTTAAGCAGCC--A--
gi|43843 : atATACAGTCAAACCTAT-A---CTAA----CGGTCACCTGTTA-T---AAGCA-GCCACCTGCCTTAAGCGGCC--A--G--TTT---C-A--GA-------------C--CCTCCCG--TCG-AAA-----TTTAC----T--ATA----T----------A------AT---T-TAA-----------C-T-GCA-----ATAGGCGGTCACCTGGTCGACGCAGCCA---GTGGCCAA--CATTTTTGGTCCCAAA---TGCATTAAAAACCTCCTAAAACGGCCACCAAATGAACAAATTTTACCGTAAAATATCGATTTTGGCATATAAAAATTTCATTACGGCCACAGAATTAATATTTAATTAAAGTACTAAAAACCAAATAAATCAAATAATTATAATATATCTTTAATTTAAAATAAGTTTCTTTTAGTTTAAACTTTCTTAATTGGCCGTAAACAAACCAAACAAAGCTGTTATTGTGTTCTACATAATCACAATTTTTCCGACTCAAAC
gi|43844 : tATACAGTCAAACTTGCAG---T-AG----CGACCACTTGTTA-T---AAGCG-ACCCCCTGATGTAAGCGACC--A--C--ATT---A-A--AT-------------T--CCCCCCA--ATG-AAT-----TTCAT----T---CA----T----------A------AT---T-ACA-----------CAT-GCA-----ATAAGCGACCACTTGCTCTCTGCGACCA---GCGACC
gi|43845 : tATACAGTCAAACTTGC-A---GAAC----CGACCACTTGTTA-T---AAGCG-ACCCCCTGATGTAAGCGACC--A--C--ATT---A-A--AT-------------C--CCCCCCA--ACG-AAT-----TTCAT----T---CA----T----------A------AT---T-ACA-----------CAT-GCA-----ATATGCGACCACTTGCTCTCTGCAACCA---GCGACC
gi|43846 : tTACAGTCTAACTTGT-C---CTTG----CGGCCACCT-CTTAT---AAGCG-GTCACCTGTGTTAAGCAGTC--A--C--TTC---A-A--AA-------------T--CCCCCCT--TGT-AAA-----TTGCC----T--ATA----T----------A--------------AA-----------G-T-ACATGTTTTTAAACGGTCGTCTTTTTAATGTGACCA---GTGGCCAT--TCTATTTCACCCCAAAGAGTGCTTTAA
gi|43847 : tgATACAGTAAAACCTGT-A---TAAG----TGGTCACCT-GTATT---AAGCA-GCCACCTGTCTTAAGTGACC--A--TAGTTT---C----TA----------------TTTCCCATTTC----------TTTGCT---T--TTA----T----------A------ATTAAT-TAAC----------C-T-GCA-----TTAAGC
gi|43848 : tATACAGTCAAACCTGT-G---TAAG----TGGTCACCT-TTATT---AAGCA-GCCACTTGTCTTAAGTGGCC--A--
gi|43850 : tATACAGTCAAACCTGT-G---TAAG----CGGTCAC----TATT---AAGCA-GCCACCTGTCTTAAACAGCC--A--
gi|43852 : tATACAGTCAAACCTGT-G---TAAG----CGGTCACCT-CTATT---AAGCA-GCCACTTGTCTTAAGCAACC--A--
gi|43853 : tATACAGTCAAACCTGC-G---CAAA----CGGTCACCT-CTATT---AAGCA-GCCACTTGTCTTAAGC
gi|43854 : tTACAGTCAAACCTGT-A---TAAG----TGGTCACCT-CTACT---AAGCA-GCCACTTGTCTTAAGCAGCC--A--C--ATT---C-G--CT-------------T--TTTCC---------AA-----TTT-C----T--ATG----TTTTCAGAGCAA------AT---T-TAC-----------C-T-GTA-----TTAAGC
gi|43855 : tgATACAGTCAAACCTGT-G---TAAG----CGGTCACCT-CTGTC---AAGCA-GCCACTTGTCTTAAGCAGCC--
gi|43858 : tTACAGTCAAACCTGT-G---TAAG----TGGTCACCT-CTAAT---AAGCA-GCCACTTGTCTTAACCAGCC--A--
gi|43895 : tgATACAGTCAAACCTGT-A---CTAA----CGGTCACCTGTTA-T---AAGCA-GCCACCTGTCTTAAGCGGCC--A--G--TTT---C-A--GA-------------C--CCTCCCG--TCG-AAA-----TTTAC----T--ATA----T----------A------AT---T-TAA-----------C-T-GCA-----ATAGGCGGTCACCTGGTCGACGCGGCCA---CCGGCCAA--CATTTTTGGTCCCAAA---TGCATTAAAAACCTCCTAAAACGGCCACCAAATGAACAAATTTTACCGTAAAATATCGATTTTGGCATATAAAAATTTCATTACGGCCGCAGAACTAATATTTAATTAAAGTACTAAAAACCAAATAAATCAAATAATTATAATATATCTTTAATTCAAAATAAGTTTCTTTTAGTTTAAACTTTCTTAATTGGCCGTAAACAAACCAAACAAAGCCGTTGTTGTATTCTACATAATCGCCATTTTTCCGACTCAAACCAAACAAAGCTGTTATTGTGTTCTACATAATCGGAATTTTTCCGACTCAAACACGAGTGTAGTGCGTGATAATTTTCACATCTCTATTTTTAGCTCGCGT
gi|43896 : ATACAGTCAAACCTGT-A---CTAA----CGGTCACCTGTTA-T---AAGCA-GCCACCTGCCTTAAGCGGTC--A--G--CTT---C-A--GA-------------C--CCTCCCG--TCG-AAA-----TTTAC----T--ATA----T----------A------AT---T-TAA-----------C-T-GCA-----ATAGGCGGTCACCTGGTCGACGCGGCCA---GCGGCCAA--CATTTTTGGTCCCAAA---TGCATTAAAAACCTCCTAAAACGGCCACCAAATGAACAAATTTTACCGTAAAATATCGATTTTGGCATATAAAAAGTTCATTACGGCCACAGAATTAATATTTAATTAAAGTACTAATAACCAAATAAATCAAATAATTATAATATATCTTTAATTTAAAATAAGTTTCTTTTAGTTTAAACTTTCTTAATTGGCCGTAAACAAACCAAACAAAGCTGTTATTGTGTTCTACATAATCGCAATTTTTCCGACTCAAAC
gi|43898 : ATACAGTCTAACCTGT-C---CTTG----AGGCCACCT-CTTAT---AAGCG-GTCACCTGTGTTAAGCGGCC--T--C--TTC---A-A--AA------------------TGCCG--TTGTTAA-----TTGCC----T--GTA----T----------A------AA---G-TAC-----------A-T-GTA-----TTAAACCATCACCTCTTTAACGCGGCCA---GT--CCA-------TTTCATCCCAAA---
gi|43899 : ATATAGTCAAACCTGT-A---TAAG----CGGTCACCT-CTATT---AAGCA-GCCACCTGTCTTAAGTAGCC--A--T--TTTTTCC-A--------------------CTTCCC---------A-----TTT-C----T--ATG----C------------------T---T-TAA-----------C-T-GC------TTAA
gi|43900 : ATACAGTCAAACCTGT-G---TGAA----CGGTCACCT-CTATT---AAGCA-GCCACTTGTCTTAAGCAGCC--A--CA-TTT---G-A--TA----------------CTTCCCA--Tta
gi|43901 : ATACAGTAAAACCTGT-A---TAAA----TGGTCACCT-CTTTT---AAGCA-GCCACTTGTCTTAAGCAGCC--A--
gi|43904 : ATACAGTCAAACCTGT-A---TAAG----TGGTCACCT-CTATT---AAGCA-GCCACTTGCCTTAAGCAGCC--A--
gi|43905 : ATACAGTCAAATCTGT-T---TTAC----TGGTCACCT-GTATT---AAGCA-ACCACTTGTCTTAAACAGAC--A--CATTTT---C------------------------------------AA-----TTTACCATTT--ATA----T----------A------AT---T-TAGATTTCTTCAACC-T-GTA-----TTAAGCAGTCACCTG
gi|43907 : ATACAGTCAAATCTGT-G---TAAG----AGGTCACCT-CTTTT---AAGCA-GCCACCTGTCTTAAGCAGCC--A--
gi|43909 : ATACAGTCAAACCTGT-A---CAAG----CAGCCACCT-CTATT---AAGCA-GCCACTTGTCTTAAGCAGCC--A--
gi|43911 : ATACAGTCAAACCTGT-G---CAAG----CGGTCATCT-CTATT---AAGCA-GCCACCTGTCTTAAGCAACC--A--
gi|43912 : ATACAGTCAAACCAGT-G---CAAG----CGGTCACCT-CTATT---AAGCA-GCCACTTGTCATAAGCAGCC--A--C--ATT---T-G--CT-------------A--TTTCCCA--TTT-ATATG---TTTGT----TGAATA---------------A------AT---T-CAC-----------C-T-GCA-----TTAAGCAATAACCTG
gi|43913 : ATACAGTCATACCTGT-A---TAAG----TGGTCACCT-TTATT---AAGCA-GCCACTTGTCTTAAGCAGCC--A--
gi|43914 : ATGTAGTCAAACCTGT-A---CAAG----CGGTCACCT-CTCTT---AAGCA-GCCACTTTTCTTAAGCAGCC--A--
gi|43916 : ATACAGTCAAACCTGT-G---TAAG----GGGTCATCT-CTAAT---AAGCA-GCCACCTGTCTTAAGCAACC--A--
gi|43917 : ATACAGTCAAACTTGT-G---TAAG----CGGTCACCT-CTATT---AAGCA-GCCACTTGTCTTAAGCAGCC--A--
gi|43920 : ATACAGTCAAACCTGT-G---TTAG----TGGCCACCT-ATATT---AAGCA-GCCACCTGTCATAAGCAACC--A--
gi|43963 : TACAGTCAAACCTGT-A---CTAA----CAGTCACCTGTTAT----AAGCA-GCCACCTGCCTTAAGCGGCC--A--G--TTT---C-A--TA-------------C--CCTCCCG--TCA-AAA-----TTTAC----T--ATA----T----------ACATGTAAT---T-TAA-----------C-T-GCA-----ATAGGCGGTCACCTGGTCGACGCGGCCA---GCGGCCAA--CATTTTTGGTCCCAAA---TGCATTAAAAACCTTCTAAAACGGCCACCAAATGAATAAATTTTACCGTAAAAAATCGATTTTGGCATA-AAAAATTTCATTACGGCCACTAAATTAATATTTAATTAAAGTACTAAAAACCAAATAAATCAAATAATTATAATATATCTTTAATTTAGAATAAGTTTCCTTTAGTTTAAACTTTCTTAACTGGCCGTAAACCAACCAAACAAAGCTGTTAT-----------TAATCGCCATTTTTCCGACTCGAACCAAACAAAGCTGTTATTGTGTTCTACATAATCGCAATTTTTCCGACTCAAACACGAGTGTAGTGTGTGATAATTTTCACATCTCTATTTTTAGCCCGCGT
gi|43966 : TACAGTCAAACTTGCAG---T-AG----CGACCACTTGTTA-T---AAGCG-ACCCCCTGATGTAAGCGACC--A--C--ATT-----A--AA-------------T--CCCCCCA--ACG--AA-----TTTAA----T--TCA----T----------A------AT---T-ATA-----------C-TCGCA-----ATAAGGGACCACTTGCTCTCTGCGATCA---GC
gi|43971 : TACAGTCAAACTTGCAG---T-AG----CGACCACTTGTTA-T---AAG---------TGATGTAAGTGACC--A--C--ATT-----A--AA-------------T--CCCCCCA--ATG-AAT-----TTCAT----T---CA----T----------A------AT---TATAC-----------A-T-GCA-----ATAAGCGACCACTTGCTCTCTGCGACCA---GCGACC
gi|43972 : TACAGTCAAACCTGT-A---TAAA----CTGTCACCT-GTAGT---AAGCA-GCCACATGTCTTAAGCAGCC--A--
gi|43974 : TACAGTCAAACCTGT-A---CTAA----CAGTCACCTGTTA-T---AAGCA-GCCAC
gi|43978 : TACAGTCAAACCTGT-G---TTAG----CGGTCTCCT-CTATT---AAGCA-GCCACCTGTCTTAAGCAGCC--A--
gi|43980 : TACAGTCAAACCTGT-A---TTAG----CAGTCACCT-CTATT---AAGCA-GTCACCTGTCTTAAGCAACC--A--
gi|43983 : TACATTCAAACCTGT-G---TTAA----CGGTAACCT-TTATT---AAGCA-GCCACCTGTCTTAAGCAACC--A--
gi|43984 : TGCAGTCAAACCTGT-G---CAAG----CGGTCACCT-CTGTT---AAGCA-GCCACTTGTCTTAAGCAGCC--A--
gi|43987 : TACATTCAAACCTGT-G---TTAT----TGGTCACCT-CTTTT---AAGCA-GCCACTTGTCTTAAGCAGCC--A--
gi|43988 : TACAGTCAAACCTGT-G---TAAG----CGGACACCT-CTTTT---AAGCA-GCCACTTGTCTTAAGCAGCC--A--
gi|43989 : TACAGTCAAACCTGT-A---TAAG----CGGTCACTT-CTATT---AAGCA-GTCACCTGTCTTAAGCAGCC--A--
gi|43990 : TACAGTCAAACCTGT-G---TTAG----CAGTCACCT-CTTTT---AGGCA-GCCACCTGTCTTAAGAAACC--A--
gi|43991 : TACAGTCAAACCTGT-G---TAAG----CGGTCACCT-CTATT---AGGCA-GCCACCTGTCTTAAGCAACC--A--TA-TTT---C-
gi|43992 : TACAGTCAAACCTGT-G---AAAG----TGGTCACCT-GTATT---AAGCA-TCCACTTGTCTTAAGCAGCC--A--C--ATT---T-G--CT-------------G--TTTGCCA--T---AAA-----TTT------T--ATA----T----------G------AT---T-T
gi|44044 : AAA----CAGGCACCT-GTAAT---AAGCGTGTC-CCTCCGTTAAGCGGCC--A--T--TTT-----A--TT-------------T--CCCCCCG--ATG-AAA-----ATCAT----T--CTA----T----------A------AT---T-GAC-----------C-T-GTA-----TTAAGCGTGAACTTGTCTAACGCGGCCAATGGCAGCCTA--AATTT---GTCC
gi|44058 : tgtactacaatc--TCG-AAA-----TTTAC----T--ATA----T----------A------AT---T-TAA-----------C-T-GCA-----ATAGGCGGTCACCTGGTCAACGCGGCCA---GCGGCCAA--CATTTTTGGTCCCAAA---TGCATTAAAAACCTTCTAAAACGGCCACCAAATGAACAAATCTTACCGTAAAATATCGATTTTGGCATATAAAAATTTCATTACAGCCACAGAATTAATATTTAATTAAAGTACTTAAAACCAAATAAATCAAATAATTATAATATATCTTTAATTTAAAATAAGTTTC-TTTAGTTTCAACTTTCTTAATTGGCCGTAAACAAAACAAACAAAGCTGTTATTGTGTTCTACATAATTGCCATTTTTCCGACTCAAAC
gi|44058 : CAAAACAAACAAAGCTGTTATTGTGTTCTACATAATTGCCATTTTTCCGACTCAAACACGAGTGTTGTGCGTGATAATTTTCACATCTCacgagtgttgtgcgtgataattttcacatctc
gi|44059 : tcgaaatttactatataatttaactgcaataggcggtcacctggtcaacgcggccagcggccaacatttttggtcccaaatgcattaaaaaccttctaaaacggccaccaaatgaacaaatcttaccgtaaaatatcgattttggcatataaaaatttcattacagccacagaattaatatttaattaaagtacttaaaaccaaataaatcaaataattataatatatctttaatttaaaataagtttctttagtttcaactttcttaattggccgtaaaTCGGCATATAAAAATTTCATTATGGCCACAGAATTAATATTTAATTAAAGTACTAAAAACCAAATAAATCAAATAATTATAATATATCTTTAATTTGAAATAAATTTCTTTTAGTTTAAACTTTCTTTATTGGCCGTAAACAAACCAAACAAAGCTGTTATTGTGTTCTACATAATCGCCATTTTTC
gi|44060 : TCTTAATTGGCCGTAAACAAACCAAACAAAGCTGTTATTGTGTTCTACATAATCGCCATTTCTCCGACTCAAACCAAACAAAGCTGTTATTGTGTTCTACATAATCTCAATTTTTCCGACTCAAACACGAGTGTAGTGCGTGATAATTTTCACATCTCTATTTTTAGCTTGTGT
gi|44061 : CAAACCAAACAAAGCTGTTATTGTGTTCTACATAATCGCAATTTTTCCGACTCAAACATGAGTGTAGCGCGTGACAATTTTCACATCTCTATTTTTAGCCTGCGT
gi|44062 : CAAACCAAACAAAGCTGTTATTGTGTTCTACATAATCGCCATTTTT
gi|44063 : CGACTCAAACATGAGTGTAGTGCATGATAATTTTCACATCTCTATTTTTAGCTCGCAT
Alignments
lowQualScore : 22222222222222222222222222 1111111 1111111111 11111111111
lowQualScore : 1 000 1 0000 6 1 111 0 00 666666 11111111111111111111111111 3333333 44444 3 3333 555 5555 0000000000 333333 222 1 00000000000 3 1 444444 1 1 222 66 11 444
lowQualScore : . ... . .... . . ... . .. ...... .......................... ....... ..... . .... ... .... .......... ...... ... . ........... . . ...... . . ... .. .. ...
lowQualScore : 7 888 4 9999 4 1 555 9 66 666666 22222222222222222222222222 0000000 77777 6 8888 222 2222 2222222222 555555 111 2 99999999999 8 2 111111 0 2 999 55 44 444
consensus : ATACAGTCAAACCTGT-G---TAAG----CGGTCACCT-CTATT---AAGCA-GCCACCTGTCTTAAGCAGCC--A--C--TTT---C-A--NA-------------C--CCTCCCG--TCG-AAA-----TTTAC----T--ATA----T----------A------AT---T-TAA-----------C-T-GCA-----NTAAGCGGTCACCTGNTCGACGCGGCCA---GCGGCCAA--CATTTTTGGTCCCAAA---TGCATTAAAAACCTCCTAAAACGGCCACCAAATGAACAAATTTTACCGTAAAATATCGATTTTGGCATATAAAAATTTCATTACGGCCACAGAATTAATATTTAATTAAAGTACTAAAAACCAAATAAATCAAATAATTATAATATATCTTTAATTTAAAATAAGTTTCTTTTAGTTTAAACTTTCTTAATTGGCCGTAAACAAACCAAACAAAGCTGTTATTGTGTTCTACATAATCGCCATTTTTCCGACTCAAACCAAACAAAGCTGTTATTGTGTTCTACATAATCGCAATTTTTCCGACTCAAACACGAGTGTAGTGCGTGATAATTTTCACATCTCTATTTTTAGCTCGCGT
Reference ( family-117 ) : ATACAGTCAAACCTGT-G---TAAG----CGGTCACCT-CTATT---AAGCA-GCCACCTGTCTTAAGCAGCC--A--C--TTT---C-A--NA-------------C--CCTCCCG--TCG-AAA-----TTTAC----T--ATA----T----------A------AT---T-TAA-----------C-T-GCA-----NTAAGCGGTCACCTGNTCGACGCGGCCA---GCGGCCAA--CATTTTTGGTCCCAAA---TGCATTAAAAACCTCCTAAAACGGCCACCAAATGAACAAATTTTACCGTAAAATATCGATTTTGGCATATAAAAATTTCATTACGGCCACAGAATTAATATTTAATTAAAGTACTAAAAACCAAATAAATCAAATAATTATAATATATCTTTAATTTAAAATAAGTTTCTTTTAGTTTAAACTTTCTTAATTGGCCGTAAACAAACCAAACAAAGCTGTTATTGTGTTCTACATAATCGCCATTTTTCCGACTCAAACCAAACAAAGCTGTTATTGTGTTCTACATAATCGCAATTTTTCCGACTCAAACACGAGTGTAGTGCGTGATAATTTTCACATCTCTATTTTTAGCTCGCGT
gi|43702 : ATACAGTCAAACCTGT-A---CTAA----CGGTCACCTGTTAT----AAGCA-GCCACCTGCCTTAAGC-GCC--A--G--TTT---C-A--TA-------------C--CCTCCCG--TCG-AAA-----TTTAC----T--ATA----T----------A------AT---T-TAA-----------C-T-GCA-----ATAGGCGGTCACCTGGTCGACGCGGCCA---GCGGCCAA--CATTTTTGGTCCCAAA---TGCATTAAAAACCTCCTAAAACGGCCACCAAATGAACAAATTTTACCGTAAAATATTGATTTTGGCATATAAAAATTTCATTACGGCCACAGAATTAATATTTAATTAAAGTACTAAAAACCAAATAAATCAAATAATTATAATATATCTTTAATTTAAAATAAGTTTCCTTTAGTTTAAACTTTCTTAATTGGCCGTAAACAAACCAAACAAAGCTATTATTGTGTTCTACATAATCGCCATTTTTCCGACTCAAACCAAACAAAGCTGTTATTGTGTTCTACATAATCGCAATTTTTCCGACTCAAACACGAGTGTAGTGCGTGATAATTTTCACATCTCTATTTTTAGCTCGCGT
gi|43703 : acTACAGTCAAACCTGT-A---CTAA----CGGTTACCTGTTAT----AAGCA-GCCACCTGCCTTAAGCGGCC--A--G--TTT---C-A--GA-------------C--CCTCCCG--GCG-AAA-----TTTAC----T--ATA----T----------A------AT---T-TAA-----------C-T-GCA-----ATAGGCGGTCACCTGGTCGACGCGGCCA---GCGGCCAA--CATTTTTGGTCCCAAA---TGCATTAAAAACCTCCTAAAACGGCCACCAAATGAACAAATTTTACCGTAAAATATCGATTTTGGCATATAAAAATTT-ATTACGGCCACAGAATTAATATTTAATTAAAGTACTAAAAACCAAATAAATCAAATAATTATAATATATCTTTAATTTAAAATAAGTTTCTTTTAGTTTAAACTTTCTTAATTGGCCGTAAACAAACCAAACAAAGCTGTTATTGTGTTCTACATAATCGCCATTTTTCCGACCCAAACCAAACAAAGCTGTTATTGTGTTCTACATAATCGCAATTTTTCCGACTCAAACACGAGTGTAGTGTGTGATAATTTTCACATCTCTATTTTTAGCTCGCGT
gi|43705 : atcATACAGTCAAACCTGT-A---CTAA----CGGTCACCTGTTA-T---AAGCA-GCCACCTGCCTTAAGCGGCC--A--G--TTT---C-A--GA-------------C--CCTCCCG--TCG-AAA-----TTTAC----T--ATA----T----------A------AT---T-TAA-----------C-T-GCA-----ATAGGCGGTCACCTGGTCGACGCGGCCA---GCGGCCAA--CATTTTTGGTCCCAAA---TGCATTAAAAACCAGCTAAAACGGCCACCAAATGAACAAATTTTACCGTAAAATATCGATTTTGGCATATAAAAATTTCATTACGGCCGCAGAATTAATATTTAATTAAAGTACTAAAAACCAAATAAATCAAATAATTATAATATATCTTTAATTTAAAATAAGTTTCTTTTAGTTTAAACTTTCTTAATTGGCCGTAAACAAACTAAACAAAGCCGTTGTTGTATTCTACATAATCGCCATTTTTCCGACTCAAACCAAACAAAGCTGTTATTGTGTTCTACATAATCGGAATTTTTCCGACTCAAACACGAGTGTAGTGCATGATAATTTTCACATCTCTATTTTTAGCTCGCGT
gi|43706 : atACACAGTCAAACCTGT-A---CTAA----CGGTCACCTGTTA-T---AAGCA-GCCACCTGCCTTAAGCGGCC--A--G--TTT---C-A--GA-------------C--CCTCCCG--TCG-AAA-----TTTAC----T--ATA----T----------A------AT---T-TAA-----------C-T-GCA-----ATAGGCGGTCACCTGGCCGACGCGGCCA---GCGGCCAA--CATTTTTGGTCCCAAA---TGCATTAAAAACCTCCTAAAACGGCCACCAAATGAACAAATTTAACCGTTAAATATCGATTTTGGCATATAAAAATTTCATTACGGCCACATAATTAATATTTAATTAAAGTACTAAAAACCAAATAAATCAAATAATTATAATAAATCTTTAATTTAAAATAAGTTTCTTTTAGTTTAAACTTTCTTGATTGGCCGTAAACAAACCAAACAAAGCTGTTATTGTGCTCTACATATTCGCCATTTTTCTGACTCAAACCAAACAAAACTGTTATTGTGTTCTACATAATCGCAATTTTTTCGACTCAAACACGAGTGTAGTGCGTGATAATTTTCACATCTCTATTTTTAGCTCGCGT
gi|43707 : atATACAGTCAAACCTGT-A---CTAA----CGGTCACCTGTTA-T---AAGCA-GCCACCTGCCTTAAGCGGCC--A--G--TTT---C-A--GA-------------C--CCTCCCG--TCG-AAA-----TTCGC----A--ATA----T----------A------AT---T-TAA-----------C-T-GCA-----ATAGGCGGTTACCTGGTCGACGCGGCCA---GTGGCCAA--CATTTTTGGTCCAAAA---TGCATTAAAAACCTCCTAAAACGGCCACCAAATGAACAAATTTTACCGTAAAATATCGATTTTGGCATATAAAAATTTCATTACGGCCACAGAATTAATATTTAATTGAAGTACTAAAAACCAAATAAATCAAATAATTATAATATATCTTTAATTTAAAATAAGTTTCTTTTAGTTAAAACTTTCTAAATTGGCCGTAAACAAACCAAACAAAGCTGTTATTGTGTTCTACATAATCGCCATTTTTCCGACTCAAACCAAACAAACCTGTTATTG---------CAATCACAATTTTTCCGACTCAAACACGAGTGTAGTGCGTGATAATTTTCACATCTCTATTTTTAGCTCGCGT
gi|43710 : atATACAGTCTAACCTGT-TCCTT--G----CGGCCACCT-CTTAT---AAGCA-GTCACCTGTGTTAAACGGCC--A--C--TTT---A-A--AG-------------T--CCCCCCG--TGT-AAA-----TTGCC----T--ATA----T----------A------AA---G-TAC-----------A-T-GTA-----TTAAAGGGTCACCTCTTTAACCTGGCCA---GTGGCCAGTCCATTTC--ATCCCAAA---
gi|43711 : atTACAGTCTAACTTGT-C---CTTG----CGGTCACCT-CTTAT---AAGTG-GTCACCTGTGTTAAGTGGCC--A--C---TT---C-A--AA-------------A--TCCCCCG--TGT-AAA-----TTGCC----T--ATA----T----------A------AA---G-TAC-----------A-T-GTA-----TTAAACGGTCACCTCTTTAACGCGGCCA---GT--CTA-------TTTCATCCCAAA---
gi|43712 : atgATACAGTCTAACCTGT-C---CTTG----CGGCCACCT-CTTAT---AAGCA-GTCACCTGTGTTAAGCGGCC--A--C---TT---C-A--A--------------------------------------------------ATA----T----------A------AA---G-TAC-----------A-T-GTA-----TTAAACGGTCAACTCTTTAACGTGACCA---GCGGCCAAACCATTCC--ATTCCAAA---
gi|43713 : atATACAGTCAAACTTGT-A---CTAA----CGGGCACCT-GTAAT---AAGCGTGTC-CCTCCATTAAG-GGCC--A--T--TTT---A-T--TA-------------C--CCCCAAG--ATG-AAA-----ATCAT----T--CTA----T----------A------AT---T-GAC-----------C-T-GTA-----TTAAGTGTGAACTTGTCTAACGTGACCA---ACAGC
gi|43715 : acATACAGTCAAACTTGCAG---T-AG----CGACCACTTGTTA-T---AAGCG-ACCTCCTGATGTAAGCGACC--A--C--GTT-----A--AATCCCCCCCCCCCCC--CCCCCCC--CCA-AAACGAATTTCAT----T---CA----T----------A------AT---T-ACA-----------CAT-GCA-----ATAAGCGACCACTTGCTCTCTGCGACCA---GCGACC
gi|43716 : acTACAGTCAAACTTGT-T---TAAG----CGGTCACCT-CTTTT---AAGCA-GCCACTTGTCTTAAGCAGCC--A--C--ATT---T-A--CT-------------A--TTTCCCG--T---GAA-----TATGC----T--TTAAGAGC----------A------AA---T-TAAC----------C-T-GTA-----TTAAGCAACAACCTGTCTGAAAAGGCCA---
gi|43717 : atgATACAGTCAAACCTGT-A---TAAG----CGGTCACCT-CTATT---AAGCA-GCCACTTGTCTTAAGCAGCC--A--
gi|43718 : atATATAGTCAAACCTGT-T---TAAG----CACTCACCT-CTAGT---AAGCA-GCCACCTGTCTTAAGCAGCC--A--
gi|43720 : atTACAGTCAAACCTAT-A---TAAC----CGGTCACCT-CTTTT---AAGCA-GCCACTTGTCTTAAGCAGCC--A--
gi|43721 : atgATACAGTTAAACCTGT-G---ATAG----TGGTCACCT-CTATT---AAGCA-ACCACTTGTCTTAAACAGCCATA--T--TTT---CTATTTA-------------C--CATTTTT--TTA-AAT-----TTTAG----T---TA----T----------A------AT---C-AAC-----------C-T-GTA-----TTAAGCAGCCACCTG
gi|43722 : atATACAGTCAAACCTGT-G---TAAG----CGGTCACCT-CTATT---AAGCA-GCCATTTGTCTTAAGCAGCC--A--T--TTT---
gi|43723 : atATATAGTCAAACCTGT-A---TAAG----CGGTCACCT-CTATT---AAGCA-GCCACTTGTCTTAAGCAGCC--A--
gi|43724 : atATACAGTCAAACCTGT-A---TAAG----TGGTCACCT-CTATT---AAGCA-GCCACTTGTCTTAAGCAGCC--A--
gi|43727 : atATACAGCCAAACCTGT-T---TAAG----TGGTCACCT-GTATT---AAGCA-GCCACCTGTCTTAAGCAACC--A--
gi|43729 : atATACAGTAAAACCTGT-G---TAAG----CGGCCACCT-TTATT---AAGCA-GCCACCTGTCTTAAGCAGCC--A--
gi|43731 : atATACAGTCAAACCTGT-G---TAAG----TGGTCACCT-CTGTT---AAGCA-GCCACCTGTCTTAAGCAACC--ATGT--TTT---C----TA----------------TTTCCCAT-TC----A-----TATGC----T--TTAAGAGT----------A------AA---T-TAAC----------C-T-GTA-----TTAAGCAACCACCT
gi|43733 : acATACAGTCAAACCTGT-G---TAAG----CGGCCACCT-CTATT---AAGCG-GCCACCTGTCTTAAGCAACC--A--T--TTT---
gi|43734 : atATACAGTCAAACCTGT-A---TAAG----TGGCCACCT-CTATT---AAGCA-GCCACTTGTCTTAAGCAGCC--A--
gi|43735 : atATACAGTCAAACCTGT-A---TAAT----CAGTCACCT-TTATT---AAGCA-GCCACTTGTCTTAAACAGCC--A--
gi|43736 : acTATAGTTAAACCTGT-G---TAAG----CGGCCACCT-CTATT---AAGCA-GCCACTTGCCTTAAGCAGCC--A--C--TTT---C-
gi|43740 : atgATACAGTCAAACCTTT-G---TAAG----TGGTCACCT-CTATT---AAGCA-GCCACCTGTCTTAAGCAGCC--A--
gi|43741 : atATACAGTCTAACTTGT-C---CATG----TGTTCACCT-CTTAT---AAGCA-GTCCCCTTTGTTAAGCGGCC--A--C--TTC---C-A--TC-------------T--CCCCATG--TC---AA-----TTTCC----T--AT-----T----------A------AA---G-TAC-----------A-T-GTA-----TGAAATGGTCACCTCTTTAATGTGGCAA---GT-----A--CATTTC---ACCCAAA---
gi|43742 : atTACAGTCAAACCTGT-G---TAAG----TGGTCACCT-CTATT---AAGCA-GCCACCTGTCTTAAGCATCC--A--
gi|43743 : atgATACAGTAAAACCTGT-G---TAAG----CAGTCACCT-CTATT---AAGCA-GCCACCTGTCTTAAGCAACC--A--gattt
gi|43745 : atATACAGTAAAACCTGT-G---TAAG----TGGTCACCT-CTATT---AAGCA-GCCACCTGTCTTAAGCAACC--A--tgttt
gi|43746 : atACACAGTAAAACCTGT-A---TAAG----TGGTCACCT-CTATT---AAGCA-GCCACCTGTCTTAAGCAGTC--A--tgttt
gi|43747 : atATACAGTCAAATCTGT-G---CAAG----TGGCCATCT-CTATT---AAGCA-GCCACTTGTCTTAAGCAGCC--A--T--GTT---T-G--CG-------------CTATTTCCC---------A-----TTT-C----T--ATA----TTTTCAGAGC-A------AA---T-TAAC----------C-T-GTA-----TTAAGCAACCACCTGtgttt
gi|43750 : atATACAGTCAAACCTGT-G---TGAA----CAGTCACCC-CTATT---AAGCA-GCCACTTGTCTTAAGCAGTC--A--
gi|43751 : atATACAGTCAGACCTGT-T---TAAGTGGTCGGTCACCT-CTATT---AAGCA-GCCACTTGTCTTAAGCAGCC--A--C--ATT---C-A--
gi|43754 : atATACAGTCAAACCTGT-G---TAAG----TGGTCACCT-CTTTT---GAGCA-GCCACTTGTCATAAGCAGCC--A--
gi|43755 : atATACAGTCAAGCCTGT-G---TAAG----TGGTCACCT-CTATT---AAGCA-GCCACTTGTCTTAAGCAGCC--A--
gi|43756 : atATACAGTCAAATCTGT-G---TTAG----CGGCCACCT-TTATT---AAGCA-TTCACTTGTCTTAAGCAGCC--A--
gi|43757 : atTACAGTCAAACTTGT-G---TTAG----TGGTCACCT-CTACT---AAGCA-ACCACCTACCTTAAACAGTC--A--CA-TTT---C-A--
gi|43758 : atgATACAGTAAAACCTGT-G---TAAG----CCGTCACCT-CTATT---AAACA-GCCACCTGTCTTAAGCAGCC--A--T--TTT---
gi|43759 : atATACAGTCAAACCAGT-G---TAAG----AGGTCACCT-CCAAT---AAGCA-GCCACTTGTCTTAAGCAGCC--A--
gi|43760 : atATACAGTAAAACCTGT-A---TAAG----TGGTCACCT-CTATT---AAGCA-GCCACTTGTCTTATGCAGCC--A--C--TTT---
gi|43761 : atATACAGTCAAACCTGT-G---TTAG------GTCACCT-CTATT---AAGCA-ACCACTTGTCTTAAACAGCC--A--
gi|43763 : atATACAGTCAAACCTGT-G---TTAG----CGATCATCT-CTATT---AAGCA-GCTATCTGTCTTAAACAGCC--A--
gi|43764 : atATACAGTCAAACCTGT-G---TAAG----CCGTCACCT-CTTTT---AAGAA-ACCACTTGTCTTAAGCAGCC--A--
gi|43765 : atATACAGTCAAACCTGT-G---TAAG----CGGTCACCT-CTATT---AAGCA-GTCACTTGTCTTAAGCGGTC--
gi|43766 : acATACAGTCAAACCTGT-G---TAAG----CGGTCACCT-CTATT---AAGCA-GCAACTTGTCTTAAGCAGCC--A--
gi|43767 : acATACAGTCAAACCTGT-A---TAAG----TGGTCACCT-CTATT---AAGCA-GCCACTTGACTTAGGCAGCC--A--
gi|43768 : acATACAGTCGAACCTGT-G---TAAG----CAATCACCT-CTATTATAAAGCA-ACCACCTGTCTTAAGCAGCC--A--
gi|43769 : atATACAGTCGAACCTGT-G---TAAG----CAATCACCT-CTATTATAAAGCA-ACCACCTGTCTTAAGCAGCC--A--
gi|43843 : atATACAGTCAAACCTAT-A---CTAA----CGGTCACCTGTTA-T---AAGCA-GCCACCTGCCTTAAGCGGCC--A--G--TTT---C-A--GA-------------C--CCTCCCG--TCG-AAA-----TTTAC----T--ATA----T----------A------AT---T-TAA-----------C-T-GCA-----ATAGGCGGTCACCTGGTCGACGCAGCCA---GTGGCCAA--CATTTTTGGTCCCAAA---TGCATTAAAAACCTCCTAAAACGGCCACCAAATGAACAAATTTTACCGTAAAATATCGATTTTGGCATATAAAAATTTCATTACGGCCACAGAATTAATATTTAATTAAAGTACTAAAAACCAAATAAATCAAATAATTATAATATATCTTTAATTTAAAATAAGTTTCTTTTAGTTTAAACTTTCTTAATTGGCCGTAAACAAACCAAACAAAGCTGTTATTGTGTTCTACATAATCACAATTTTTCCGACTCAAAC
gi|43844 : tATACAGTCAAACTTGCAG---T-AG----CGACCACTTGTTA-T---AAGCG-ACCCCCTGATGTAAGCGACC--A--C--ATT---A-A--AT-------------T--CCCCCCA--ATG-AAT-----TTCAT----T---CA----T----------A------AT---T-ACA-----------CAT-GCA-----ATAAGCGACCACTTGCTCTCTGCGACCA---GCGACC
gi|43845 : tATACAGTCAAACTTGC-A---GAAC----CGACCACTTGTTA-T---AAGCG-ACCCCCTGATGTAAGCGACC--A--C--ATT---A-A--AT-------------C--CCCCCCA--ACG-AAT-----TTCAT----T---CA----T----------A------AT---T-ACA-----------CAT-GCA-----ATATGCGACCACTTGCTCTCTGCAACCA---GCGACC
gi|43846 : tTACAGTCTAACTTGT-C---CTTG----CGGCCACCT-CTTAT---AAGCG-GTCACCTGTGTTAAGCAGTC--A--C--TTC---A-A--AA-------------T--CCCCCCT--TGT-AAA-----TTGCC----T--ATA----T----------A--------------AA-----------G-T-ACATGTTTTTAAACGGTCGTCTTTTTAATGTGACCA---GTGGCCAT--TCTATTTCACCCCAAAGAGTGCTTTAA
gi|43847 : tgATACAGTAAAACCTGT-A---TAAG----TGGTCACCT-GTATT---AAGCA-GCCACCTGTCTTAAGTGACC--A--TAGTTT---C----TA----------------TTTCCCATTTC----------TTTGCT---T--TTA----T----------A------ATTAAT-TAAC----------C-T-GCA-----TTAAGC
gi|43848 : tATACAGTCAAACCTGT-G---TAAG----TGGTCACCT-TTATT---AAGCA-GCCACTTGTCTTAAGTGGCC--A--
gi|43850 : tATACAGTCAAACCTGT-G---TAAG----CGGTCAC----TATT---AAGCA-GCCACCTGTCTTAAACAGCC--A--
gi|43852 : tATACAGTCAAACCTGT-G---TAAG----CGGTCACCT-CTATT---AAGCA-GCCACTTGTCTTAAGCAACC--A--
gi|43853 : tATACAGTCAAACCTGC-G---CAAA----CGGTCACCT-CTATT---AAGCA-GCCACTTGTCTTAAGC
gi|43854 : tTACAGTCAAACCTGT-A---TAAG----TGGTCACCT-CTACT---AAGCA-GCCACTTGTCTTAAGCAGCC--A--C--ATT---C-G--CT-------------T--TTTCC---------AA-----TTT-C----T--ATG----TTTTCAGAGCAA------AT---T-TAC-----------C-T-GTA-----TTAAGC
gi|43855 : tgATACAGTCAAACCTGT-G---TAAG----CGGTCACCT-CTGTC---AAGCA-GCCACTTGTCTTAAGCAGCC--
gi|43858 : tTACAGTCAAACCTGT-G---TAAG----TGGTCACCT-CTAAT---AAGCA-GCCACTTGTCTTAACCAGCC--A--
gi|43895 : tgATACAGTCAAACCTGT-A---CTAA----CGGTCACCTGTTA-T---AAGCA-GCCACCTGTCTTAAGCGGCC--A--G--TTT---C-A--GA-------------C--CCTCCCG--TCG-AAA-----TTTAC----T--ATA----T----------A------AT---T-TAA-----------C-T-GCA-----ATAGGCGGTCACCTGGTCGACGCGGCCA---CCGGCCAA--CATTTTTGGTCCCAAA---TGCATTAAAAACCTCCTAAAACGGCCACCAAATGAACAAATTTTACCGTAAAATATCGATTTTGGCATATAAAAATTTCATTACGGCCGCAGAACTAATATTTAATTAAAGTACTAAAAACCAAATAAATCAAATAATTATAATATATCTTTAATTCAAAATAAGTTTCTTTTAGTTTAAACTTTCTTAATTGGCCGTAAACAAACCAAACAAAGCCGTTGTTGTATTCTACATAATCGCCATTTTTCCGACTCAAACCAAACAAAGCTGTTATTGTGTTCTACATAATCGGAATTTTTCCGACTCAAACACGAGTGTAGTGCGTGATAATTTTCACATCTCTATTTTTAGCTCGCGT
gi|43896 : ATACAGTCAAACCTGT-A---CTAA----CGGTCACCTGTTA-T---AAGCA-GCCACCTGCCTTAAGCGGTC--A--G--CTT---C-A--GA-------------C--CCTCCCG--TCG-AAA-----TTTAC----T--ATA----T----------A------AT---T-TAA-----------C-T-GCA-----ATAGGCGGTCACCTGGTCGACGCGGCCA---GCGGCCAA--CATTTTTGGTCCCAAA---TGCATTAAAAACCTCCTAAAACGGCCACCAAATGAACAAATTTTACCGTAAAATATCGATTTTGGCATATAAAAAGTTCATTACGGCCACAGAATTAATATTTAATTAAAGTACTAATAACCAAATAAATCAAATAATTATAATATATCTTTAATTTAAAATAAGTTTCTTTTAGTTTAAACTTTCTTAATTGGCCGTAAACAAACCAAACAAAGCTGTTATTGTGTTCTACATAATCGCAATTTTTCCGACTCAAAC
gi|43898 : ATACAGTCTAACCTGT-C---CTTG----AGGCCACCT-CTTAT---AAGCG-GTCACCTGTGTTAAGCGGCC--T--C--TTC---A-A--AA------------------TGCCG--TTGTTAA-----TTGCC----T--GTA----T----------A------AA---G-TAC-----------A-T-GTA-----TTAAACCATCACCTCTTTAACGCGGCCA---GT--CCA-------TTTCATCCCAAA---
gi|43899 : ATATAGTCAAACCTGT-A---TAAG----CGGTCACCT-CTATT---AAGCA-GCCACCTGTCTTAAGTAGCC--A--T--TTTTTCC-A--------------------CTTCCC---------A-----TTT-C----T--ATG----C------------------T---T-TAA-----------C-T-GC------TTAA
gi|43900 : ATACAGTCAAACCTGT-G---TGAA----CGGTCACCT-CTATT---AAGCA-GCCACTTGTCTTAAGCAGCC--A--CA-TTT---G-A--TA----------------CTTCCCA--Tta
gi|43901 : ATACAGTAAAACCTGT-A---TAAA----TGGTCACCT-CTTTT---AAGCA-GCCACTTGTCTTAAGCAGCC--A--
gi|43904 : ATACAGTCAAACCTGT-A---TAAG----TGGTCACCT-CTATT---AAGCA-GCCACTTGCCTTAAGCAGCC--A--
gi|43905 : ATACAGTCAAATCTGT-T---TTAC----TGGTCACCT-GTATT---AAGCA-ACCACTTGTCTTAAACAGAC--A--CATTTT---C------------------------------------AA-----TTTACCATTT--ATA----T----------A------AT---T-TAGATTTCTTCAACC-T-GTA-----TTAAGCAGTCACCTG
gi|43907 : ATACAGTCAAATCTGT-G---TAAG----AGGTCACCT-CTTTT---AAGCA-GCCACCTGTCTTAAGCAGCC--A--
gi|43909 : ATACAGTCAAACCTGT-A---CAAG----CAGCCACCT-CTATT---AAGCA-GCCACTTGTCTTAAGCAGCC--A--
gi|43911 : ATACAGTCAAACCTGT-G---CAAG----CGGTCATCT-CTATT---AAGCA-GCCACCTGTCTTAAGCAACC--A--
gi|43912 : ATACAGTCAAACCAGT-G---CAAG----CGGTCACCT-CTATT---AAGCA-GCCACTTGTCATAAGCAGCC--A--C--ATT---T-G--CT-------------A--TTTCCCA--TTT-ATATG---TTTGT----TGAATA---------------A------AT---T-CAC-----------C-T-GCA-----TTAAGCAATAACCTG
gi|43913 : ATACAGTCATACCTGT-A---TAAG----TGGTCACCT-TTATT---AAGCA-GCCACTTGTCTTAAGCAGCC--A--
gi|43914 : ATGTAGTCAAACCTGT-A---CAAG----CGGTCACCT-CTCTT---AAGCA-GCCACTTTTCTTAAGCAGCC--A--
gi|43916 : ATACAGTCAAACCTGT-G---TAAG----GGGTCATCT-CTAAT---AAGCA-GCCACCTGTCTTAAGCAACC--A--
gi|43917 : ATACAGTCAAACTTGT-G---TAAG----CGGTCACCT-CTATT---AAGCA-GCCACTTGTCTTAAGCAGCC--A--
gi|43920 : ATACAGTCAAACCTGT-G---TTAG----TGGCCACCT-ATATT---AAGCA-GCCACCTGTCATAAGCAACC--A--
gi|43963 : TACAGTCAAACCTGT-A---CTAA----CAGTCACCTGTTAT----AAGCA-GCCACCTGCCTTAAGCGGCC--A--G--TTT---C-A--TA-------------C--CCTCCCG--TCA-AAA-----TTTAC----T--ATA----T----------ACATGTAAT---T-TAA-----------C-T-GCA-----ATAGGCGGTCACCTGGTCGACGCGGCCA---GCGGCCAA--CATTTTTGGTCCCAAA---TGCATTAAAAACCTTCTAAAACGGCCACCAAATGAATAAATTTTACCGTAAAAAATCGATTTTGGCATA-AAAAATTTCATTACGGCCACTAAATTAATATTTAATTAAAGTACTAAAAACCAAATAAATCAAATAATTATAATATATCTTTAATTTAGAATAAGTTTCCTTTAGTTTAAACTTTCTTAACTGGCCGTAAACCAACCAAACAAAGCTGTTAT-----------TAATCGCCATTTTTCCGACTCGAACCAAACAAAGCTGTTATTGTGTTCTACATAATCGCAATTTTTCCGACTCAAACACGAGTGTAGTGTGTGATAATTTTCACATCTCTATTTTTAGCCCGCGT
gi|43966 : TACAGTCAAACTTGCAG---T-AG----CGACCACTTGTTA-T---AAGCG-ACCCCCTGATGTAAGCGACC--A--C--ATT-----A--AA-------------T--CCCCCCA--ACG--AA-----TTTAA----T--TCA----T----------A------AT---T-ATA-----------C-TCGCA-----ATAAGGGACCACTTGCTCTCTGCGATCA---GC
gi|43971 : TACAGTCAAACTTGCAG---T-AG----CGACCACTTGTTA-T---AAG---------TGATGTAAGTGACC--A--C--ATT-----A--AA-------------T--CCCCCCA--ATG-AAT-----TTCAT----T---CA----T----------A------AT---TATAC-----------A-T-GCA-----ATAAGCGACCACTTGCTCTCTGCGACCA---GCGACC
gi|43972 : TACAGTCAAACCTGT-A---TAAA----CTGTCACCT-GTAGT---AAGCA-GCCACATGTCTTAAGCAGCC--A--
gi|43974 : TACAGTCAAACCTGT-A---CTAA----CAGTCACCTGTTA-T---AAGCA-GCCAC
gi|43978 : TACAGTCAAACCTGT-G---TTAG----CGGTCTCCT-CTATT---AAGCA-GCCACCTGTCTTAAGCAGCC--A--
gi|43980 : TACAGTCAAACCTGT-A---TTAG----CAGTCACCT-CTATT---AAGCA-GTCACCTGTCTTAAGCAACC--A--
gi|43983 : TACATTCAAACCTGT-G---TTAA----CGGTAACCT-TTATT---AAGCA-GCCACCTGTCTTAAGCAACC--A--
gi|43984 : TGCAGTCAAACCTGT-G---CAAG----CGGTCACCT-CTGTT---AAGCA-GCCACTTGTCTTAAGCAGCC--A--
gi|43987 : TACATTCAAACCTGT-G---TTAT----TGGTCACCT-CTTTT---AAGCA-GCCACTTGTCTTAAGCAGCC--A--
gi|43988 : TACAGTCAAACCTGT-G---TAAG----CGGACACCT-CTTTT---AAGCA-GCCACTTGTCTTAAGCAGCC--A--
gi|43989 : TACAGTCAAACCTGT-A---TAAG----CGGTCACTT-CTATT---AAGCA-GTCACCTGTCTTAAGCAGCC--A--
gi|43990 : TACAGTCAAACCTGT-G---TTAG----CAGTCACCT-CTTTT---AGGCA-GCCACCTGTCTTAAGAAACC--A--
gi|43991 : TACAGTCAAACCTGT-G---TAAG----CGGTCACCT-CTATT---AGGCA-GCCACCTGTCTTAAGCAACC--A--TA-TTT---C-
gi|43992 : TACAGTCAAACCTGT-G---AAAG----TGGTCACCT-GTATT---AAGCA-TCCACTTGTCTTAAGCAGCC--A--C--ATT---T-G--CT-------------G--TTTGCCA--T---AAA-----TTT------T--ATA----T----------G------AT---T-T
gi|44044 : AAA----CAGGCACCT-GTAAT---AAGCGTGTC-CCTCCGTTAAGCGGCC--A--T--TTT-----A--TT-------------T--CCCCCCG--ATG-AAA-----ATCAT----T--CTA----T----------A------AT---T-GAC-----------C-T-GTA-----TTAAGCGTGAACTTGTCTAACGCGGCCAATGGCAGCCTA--AATTT---GTCC
gi|44058 : tgtactacaatc--TCG-AAA-----TTTAC----T--ATA----T----------A------AT---T-TAA-----------C-T-GCA-----ATAGGCGGTCACCTGGTCAACGCGGCCA---GCGGCCAA--CATTTTTGGTCCCAAA---TGCATTAAAAACCTTCTAAAACGGCCACCAAATGAACAAATCTTACCGTAAAATATCGATTTTGGCATATAAAAATTTCATTACAGCCACAGAATTAATATTTAATTAAAGTACTTAAAACCAAATAAATCAAATAATTATAATATATCTTTAATTTAAAATAAGTTTC-TTTAGTTTCAACTTTCTTAATTGGCCGTAAACAAAACAAACAAAGCTGTTATTGTGTTCTACATAATTGCCATTTTTCCGACTCAAAC
gi|44058 : CAAAACAAACAAAGCTGTTATTGTGTTCTACATAATTGCCATTTTTCCGACTCAAACACGAGTGTTGTGCGTGATAATTTTCACATCTCacgagtgttgtgcgtgataattttcacatctc
gi|44059 : tcgaaatttactatataatttaactgcaataggcggtcacctggtcaacgcggccagcggccaacatttttggtcccaaatgcattaaaaaccttctaaaacggccaccaaatgaacaaatcttaccgtaaaatatcgattttggcatataaaaatttcattacagccacagaattaatatttaattaaagtacttaaaaccaaataaatcaaataattataatatatctttaatttaaaataagtttctttagtttcaactttcttaattggccgtaaaTCGGCATATAAAAATTTCATTATGGCCACAGAATTAATATTTAATTAAAGTACTAAAAACCAAATAAATCAAATAATTATAATATATCTTTAATTTGAAATAAATTTCTTTTAGTTTAAACTTTCTTTATTGGCCGTAAACAAACCAAACAAAGCTGTTATTGTGTTCTACATAATCGCCATTTTTC
gi|44060 : TCTTAATTGGCCGTAAACAAACCAAACAAAGCTGTTATTGTGTTCTACATAATCGCCATTTCTCCGACTCAAACCAAACAAAGCTGTTATTGTGTTCTACATAATCTCAATTTTTCCGACTCAAACACGAGTGTAGTGCGTGATAATTTTCACATCTCTATTTTTAGCTTGTGT
gi|44061 : CAAACCAAACAAAGCTGTTATTGTGTTCTACATAATCGCAATTTTTCCGACTCAAACATGAGTGTAGCGCGTGACAATTTTCACATCTCTATTTTTAGCCTGCGT
gi|44062 : CAAACCAAACAAAGCTGTTATTGTGTTCTACATAATCGCCATTTTT
gi|44063 : CGACTCAAACATGAGTGTAGTGCATGATAATTTTCACATCTCTATTTTTAGCTCGCAT
blockSeqs : A T G T ATA TGTT AAATCCCCCCCCCCCCC ATTTC CGAAT A CATT GAA AGAG TTTCAGAGCA CATGTA TAA A ATTTCTTCAAC A C TGTTTT G G ATG TC TG GAG
blockSeqs : A T G A ATA TAGT CTATTTAC GTTGT TG A T A AGAG TTTCAGAGC . . . C A . A G G . AC TG .
blockSeqs : A T G A . CATT TGCGCTA GGCG . A . A . . . . . C A . A G G . . TG .
blockSeqs : A T G A . CAT CAGAC GTCG . G . A . . . . . C . . A G G . . TG .
blockSeqs : . T G A . CAT CAGAC GTCG . C . A . . . . . C . . A T A . . TC .
blockSeqs : . T G T . TAT CAGAC GTCG . C . A . . . . . . . . T T A . . TG .
blockSeqs : . T G T . GT CAGAC GTGT . A . A . . . . . . . . T T A . . TC .
blockSeqs : . A G G . GT AAAGT GTGT . A . A . . . . . . . . T T A . . TG .
blockSeqs : . A G T . GT CAAAA GATG . G . C . . . . . . . . T C T . . TG .
blockSeqs : . A G T . GT ATTAC CCCA . A . T . . . . . . . . A T G . . TC .
blockSeqs : . A G T . CT TACTA TTTA . G . T . . . . . . . . T T A . . TG .
blockSeqs : . T G T . TT CATCT ATTC . C . A . . . . . . . . T G G . . TG .
blockSeqs : . A G T . CG CAGAC GTCG . A . A . . . . . . . . T C T . . . .
blockSeqs : . A G T . CA AAATT AATG . A . A . . . . . . . . T C T . . . .
blockSeqs : . A . T . TT AAATC AACG . A . A . . . . . . . . T T A . . . .
blockSeqs : . A . T . TT AAAAT TTGT . C . T . . . . . . . . A G G . . .
blockSeqs : . A . T . TT CGCTT GTCG . G . A . . . . . . . . A G G .
blockSeqs : . A . T . CT CAGAC GTCG . A . A . . . . . . . . A T A .
blockSeqs : . A . T . CT CAGAC ATTT . A . A . . . . . . . . T G G .
blockSeqs : . A . T . TG TTCCA GTCA . C . G . . . . . . . . T C T .
blockSeqs : . A . T . CA TGCTA AACG . A . A . . . . . . . . A C T .
blockSeqs : . A . A . TT CATAC AATG . G . A . . . . . . . . A T A .
blockSeqs : . A . T . CT TGCTG GATG . A . A . . . . . . . . T G A .
blockSeqs : . A . T . GT AAAA GTC . A . T . . . . . . . . T
blockSeqs : . A . T . CA GATA GT . A . A . . . . . . . . T
blockSeqs : . A . T . CA AAAT AT . A . C . . . . . . . . T
blockSeqs : . A . T . CT AAAT . . A . A . . . . . . . . A
blockSeqs : . A . T . CA ATTT . . . . . . . . . . . . . A
blockSeqs : . A . T . GT CAA . . . . . . . . . . . . . A
blockSeqs : . G . T . GC CTA . . . . . . . . . . . . . T
blockSeqs : . A . T . CT CTA . . . . . . . . . . . . . A
blockSeqs : . A . T . TT C . . . . . . . . .
blockSeqs : . A . C . CA
blockSeqs : . T . T . GT
blockSeqs : . T . A . CA
blockSeqs : . A . T . CA
blockSeqs : . A . T . CA
blockSeqs : . A . T . TT
blockSeqs : . T . T . C
blockSeqs : . T . T . C
blockSeqs : . A . T .
blockSeqs : . A . T .
blockSeqs : . A . T .
blockSeqs : . A . T .
blockSeqs : . A . A .
blockSeqs : . A . T .
blockSeqs : . T . T .
blockSeqs : . A . T .
blockSeqs : . T . T .
blockSeqs : . A . T .
blockSeqs : . A . C .
blockSeqs : . A . T .
blockSeqs : . A . A .
blockSeqs : . A . A .
blockSeqs : . A . T .
blockSeqs : . A . T .
blockSeqs : . A . T .
blockSeqs : . T . T .
blockSeqs : . T . T .
blockSeqs : . T . T .
blockSeqs : . A . T .
blockSeqs : . G . T .
blockSeqs : . A . T .
blockSeqs : . A . T .
blockSeqs : . T . T .
blockSeqs : . A . A .
blockSeqs : . A . T .
blockSeqs : . A . T .
blockSeqs : . A . T .
blockSeqs : . A . G .
blockSeqs : . A . T .
blockSeqs : . A . T .
blockSeqs : . A . T .
blockSeqs : . T . T .
blockSeqs : . T . T .
blockSeqs : . A . T .
blockSeqs : . T . T .
blockSeqs : . T . T .
blockSeqs : . T . T .
blockSeqs : . T . T .
blockSeqs : . A . A .
blockSeqs : . T . . .
blockSeqs : . A . . .
blockSeqs : . A . . .
blockSeqs : . T . . .
blockSeqs : . A . . .
blockSeqs : . A . . .
blockSeqs : . A . . .
blockSeqs : . . . . .
blockSeqs : . . . . .
blockSeqs : . . . . .
blockSeqs : . . . . .
blockSeqs : . . . .
blockSeqCons :
originalCons : ATACAGTCAAACCTGT-G---TAAG----CGGTCACCT-CTATT---AAGCA-GCCACCTGTCTTAAGCAGCC--A--C--TTT---C-A--NA-------------C--CCTCCCG--TCG-AAA-----TTTAC----T--ATA----T----------A------AT---T-TAA-----------C-T-GCA-----NTAAGCGGTCACCTGNTCGACGCGGCCA---GCGGCCAA--CATTTTTGGTCCCAAA---TGCATTAAAAACCTCCTAAAACGGCCACCAAATGAACAAATTTTACCGTAAAATATCGATTTTGGCATATAAAAATTTCATTACGGCCACAGAATTAATATTTAATTAAAGTACTAAAAACCAAATAAATCAAATAATTATAATATATCTTTAATTTAAAATAAGTTTCTTTTAGTTTAAACTTTCTTAATTGGCCGTAAACAAACCAAACAAAGCTGTTATTGTGTTCTACATAATCGCCATTTTTCCGACTCAAACCAAACAAAGCTGTTATTGTGTTCTACATAATCGCAATTTTTCCGACTCAAACACGAGTGTAGTGCGTGATAATTTTCACATCTCTATTTTTAGCTCGCGT
finalCons : ATACAGTCAAACCTGT-G---TAAG----CGGTCACCT-CTATT---AAGCA-GCCACCTGTCTTAAGCAGCC--A--C--TTT---C-A--NA-------------C--CCTCCCG--TCG-AAA-----TTTAC----T--ATA----T----------A------AT---T-TAA-----------C-T-GCA-----NTAAGCGGTCACCTGNTCGACGCGGCCA---GCGGCCAA--CATTTTTGGTCCCAAA---TGCATTAAAAACCTCCTAAAACGGCCACCAAATGAACAAATTTTACCGTAAAATATCGATTTTGGCATATAAAAATTTCATTACGGCCACAGAATTAATATTTAATTAAAGTACTAAAAACCAAATAAATCAAATAATTATAATATATCTTTAATTTAAAATAAGTTTCTTTTAGTTTAAACTTTCTTAATTGGCCGTAAACAAACCAAACAAAGCTGTTATTGTGTTCTACATAATCGCCATTTTTCCGACTCAAACCAAACAAAGCTGTTATTGTGTTCTACATAATCGCAATTTTTCCGACTCAAACACGAGTGTAGTGCGTGATAATTTTCACATCTCTATTTTTAGCTCGCGT
Alignments
lowQualScore : 22222222222222222222222222 1111111 1111111111 11111111111
lowQualScore : 1 000 1 0000 6 1 111 0 00 666666 11111111111111111111111111 3333333 44444 3 3333 555 5555 0000000000 333333 222 1 00000000000 3 1 444444 1 1 222 66 11 444
lowQualScore : . ... . .... . . ... . .. ...... .......................... ....... ..... . .... ... .... .......... ...... ... . ........... . . ...... . . ... .. .. ...
lowQualScore : 7 888 4 9999 4 1 555 9 66 666666 22222222222222222222222222 0000000 77777 6 8888 222 2222 2222222222 555555 111 2 99999999999 8 2 111111 0 2 999 55 44 444
consensus : ATACAGTCAAACCTGT-G---TAAG----CGGTCACCT-CTATT---AAGCA-GCCACCTGTCTTAAGCAGCC--A--C--TTT---C-A--NA-------------C--CCTCCCG--TCG-AAA-----TTTAC----T--ATA----T----------A------AT---T-TAA-----------C-T-GCA-----NTAAGCGGTCACCTGNTCGACGCGGCCA---GCGGCCAA--CATTTTTGGTCCCAAA---TGCATTAAAAACCTCCTAAAACGGCCACCAAATGAACAAATTTTACCGTAAAATATCGATTTTGGCATATAAAAATTTCATTACGGCCACAGAATTAATATTTAATTAAAGTACTAAAAACCAAATAAATCAAATAATTATAATATATCTTTAATTTAAAATAAGTTTCTTTTAGTTTAAACTTTCTTAATTGGCCGTAAACAAACCAAACAAAGCTGTTATTGTGTTCTACATAATCGCCATTTTTCCGACTCAAACCAAACAAAGCTGTTATTGTGTTCTACATAATCGCAATTTTTCCGACTCAAACACGAGTGTAGTGCGTGATAATTTTCACATCTCTATTTTTAGCTCGCGT
Reference ( family-117 ) : ATACAGTCAAACCTGT-G---TAAG----CGGTCACCT-CTATT---AAGCA-GCCACCTGTCTTAAGCAGCC--A--C--TTT---C-A--NA-------------C--CCTCCCG--TCG-AAA-----TTTAC----T--ATA----T----------A------AT---T-TAA-----------C-T-GCA-----NTAAGCGGTCACCTGNTCGACGCGGCCA---GCGGCCAA--CATTTTTGGTCCCAAA---TGCATTAAAAACCTCCTAAAACGGCCACCAAATGAACAAATTTTACCGTAAAATATCGATTTTGGCATATAAAAATTTCATTACGGCCACAGAATTAATATTTAATTAAAGTACTAAAAACCAAATAAATCAAATAATTATAATATATCTTTAATTTAAAATAAGTTTCTTTTAGTTTAAACTTTCTTAATTGGCCGTAAACAAACCAAACAAAGCTGTTATTGTGTTCTACATAATCGCCATTTTTCCGACTCAAACCAAACAAAGCTGTTATTGTGTTCTACATAATCGCAATTTTTCCGACTCAAACACGAGTGTAGTGCGTGATAATTTTCACATCTCTATTTTTAGCTCGCGT
gi|43702 : ATACAGTCAAACCTGT-A---CTAA----CGGTCACCTGTTAT----AAGCA-GCCACCTGCCTTAAGC-GCC--A--G--TTT---C-A--TA-------------C--CCTCCCG--TCG-AAA-----TTTAC----T--ATA----T----------A------AT---T-TAA-----------C-T-GCA-----ATAGGCGGTCACCTGGTCGACGCGGCCA---GCGGCCAA--CATTTTTGGTCCCAAA---TGCATTAAAAACCTCCTAAAACGGCCACCAAATGAACAAATTTTACCGTAAAATATTGATTTTGGCATATAAAAATTTCATTACGGCCACAGAATTAATATTTAATTAAAGTACTAAAAACCAAATAAATCAAATAATTATAATATATCTTTAATTTAAAATAAGTTTCCTTTAGTTTAAACTTTCTTAATTGGCCGTAAACAAACCAAACAAAGCTATTATTGTGTTCTACATAATCGCCATTTTTCCGACTCAAACCAAACAAAGCTGTTATTGTGTTCTACATAATCGCAATTTTTCCGACTCAAACACGAGTGTAGTGCGTGATAATTTTCACATCTCTATTTTTAGCTCGCGT
gi|43703 : acTACAGTCAAACCTGT-A---CTAA----CGGTTACCTGTTAT----AAGCA-GCCACCTGCCTTAAGCGGCC--A--G--TTT---C-A--GA-------------C--CCTCCCG--GCG-AAA-----TTTAC----T--ATA----T----------A------AT---T-TAA-----------C-T-GCA-----ATAGGCGGTCACCTGGTCGACGCGGCCA---GCGGCCAA--CATTTTTGGTCCCAAA---TGCATTAAAAACCTCCTAAAACGGCCACCAAATGAACAAATTTTACCGTAAAATATCGATTTTGGCATATAAAAATTT-ATTACGGCCACAGAATTAATATTTAATTAAAGTACTAAAAACCAAATAAATCAAATAATTATAATATATCTTTAATTTAAAATAAGTTTCTTTTAGTTTAAACTTTCTTAATTGGCCGTAAACAAACCAAACAAAGCTGTTATTGTGTTCTACATAATCGCCATTTTTCCGACCCAAACCAAACAAAGCTGTTATTGTGTTCTACATAATCGCAATTTTTCCGACTCAAACACGAGTGTAGTGTGTGATAATTTTCACATCTCTATTTTTAGCTCGCGT
gi|43705 : atcATACAGTCAAACCTGT-A---CTAA----CGGTCACCTGTTA-T---AAGCA-GCCACCTGCCTTAAGCGGCC--A--G--TTT---C-A--GA-------------C--CCTCCCG--TCG-AAA-----TTTAC----T--ATA----T----------A------AT---T-TAA-----------C-T-GCA-----ATAGGCGGTCACCTGGTCGACGCGGCCA---GCGGCCAA--CATTTTTGGTCCCAAA---TGCATTAAAAACCAGCTAAAACGGCCACCAAATGAACAAATTTTACCGTAAAATATCGATTTTGGCATATAAAAATTTCATTACGGCCGCAGAATTAATATTTAATTAAAGTACTAAAAACCAAATAAATCAAATAATTATAATATATCTTTAATTTAAAATAAGTTTCTTTTAGTTTAAACTTTCTTAATTGGCCGTAAACAAACTAAACAAAGCCGTTGTTGTATTCTACATAATCGCCATTTTTCCGACTCAAACCAAACAAAGCTGTTATTGTGTTCTACATAATCGGAATTTTTCCGACTCAAACACGAGTGTAGTGCATGATAATTTTCACATCTCTATTTTTAGCTCGCGT
gi|43706 : atACACAGTCAAACCTGT-A---CTAA----CGGTCACCTGTTA-T---AAGCA-GCCACCTGCCTTAAGCGGCC--A--G--TTT---C-A--GA-------------C--CCTCCCG--TCG-AAA-----TTTAC----T--ATA----T----------A------AT---T-TAA-----------C-T-GCA-----ATAGGCGGTCACCTGGCCGACGCGGCCA---GCGGCCAA--CATTTTTGGTCCCAAA---TGCATTAAAAACCTCCTAAAACGGCCACCAAATGAACAAATTTAACCGTTAAATATCGATTTTGGCATATAAAAATTTCATTACGGCCACATAATTAATATTTAATTAAAGTACTAAAAACCAAATAAATCAAATAATTATAATAAATCTTTAATTTAAAATAAGTTTCTTTTAGTTTAAACTTTCTTGATTGGCCGTAAACAAACCAAACAAAGCTGTTATTGTGCTCTACATATTCGCCATTTTTCTGACTCAAACCAAACAAAACTGTTATTGTGTTCTACATAATCGCAATTTTTTCGACTCAAACACGAGTGTAGTGCGTGATAATTTTCACATCTCTATTTTTAGCTCGCGT
gi|43707 : atATACAGTCAAACCTGT-A---CTAA----CGGTCACCTGTTA-T---AAGCA-GCCACCTGCCTTAAGCGGCC--A--G--TTT---C-A--GA-------------C--CCTCCCG--TCG-AAA-----TTCGC----A--ATA----T----------A------AT---T-TAA-----------C-T-GCA-----ATAGGCGGTTACCTGGTCGACGCGGCCA---GTGGCCAA--CATTTTTGGTCCAAAA---TGCATTAAAAACCTCCTAAAACGGCCACCAAATGAACAAATTTTACCGTAAAATATCGATTTTGGCATATAAAAATTTCATTACGGCCACAGAATTAATATTTAATTGAAGTACTAAAAACCAAATAAATCAAATAATTATAATATATCTTTAATTTAAAATAAGTTTCTTTTAGTTAAAACTTTCTAAATTGGCCGTAAACAAACCAAACAAAGCTGTTATTGTGTTCTACATAATCGCCATTTTTCCGACTCAAACCAAACAAACCTGTTATTG---------CAATCACAATTTTTCCGACTCAAACACGAGTGTAGTGCGTGATAATTTTCACATCTCTATTTTTAGCTCGCGT
gi|43710 : atATACAGTCTAACCTGT-TCCTT--G----CGGCCACCT-CTTAT---AAGCA-GTCACCTGTGTTAAACGGCC--A--C--TTT---A-A--AG-------------T--CCCCCCG--TGT-AAA-----TTGCC----T--ATA----T----------A------AA---G-TAC-----------A-T-GTA-----TTAAAGGGTCACCTCTTTAACCTGGCCA---GTGGCCAGTCCATTTC--ATCCCAAA---
gi|43711 : atTACAGTCTAACTTGT-C---CTTG----CGGTCACCT-CTTAT---AAGTG-GTCACCTGTGTTAAGTGGCC--A--C---TT---C-A--AA-------------A--TCCCCCG--TGT-AAA-----TTGCC----T--ATA----T----------A------AA---G-TAC-----------A-T-GTA-----TTAAACGGTCACCTCTTTAACGCGGCCA---GT--CTA-------TTTCATCCCAAA---
gi|43712 : atgATACAGTCTAACCTGT-C---CTTG----CGGCCACCT-CTTAT---AAGCA-GTCACCTGTGTTAAGCGGCC--A--C---TT---C-A--A--------------------------------------------------ATA----T----------A------AA---G-TAC-----------A-T-GTA-----TTAAACGGTCAACTCTTTAACGTGACCA---GCGGCCAAACCATTCC--ATTCCAAA---
gi|43713 : atATACAGTCAAACTTGT-A---CTAA----CGGGCACCT-GTAAT---AAGCGTGTC-CCTCCATTAAG-GGCC--A--T--TTT---A-T--TA-------------C--CCCCAAG--ATG-AAA-----ATCAT----T--CTA----T----------A------AT---T-GAC-----------C-T-GTA-----TTAAGTGTGAACTTGTCTAACGTGACCA---ACAGC
gi|43715 : acATACAGTCAAACTTGCAG---T-AG----CGACCACTTGTTA-T---AAGCG-ACCTCCTGATGTAAGCGACC--A--C--GTT-----A--AATCCCCCCCCCCCCC--CCCCCCC--CCA-AAACGAATTTCAT----T---CA----T----------A------AT---T-ACA-----------CAT-GCA-----ATAAGCGACCACTTGCTCTCTGCGACCA---GCGACC
gi|43716 : acTACAGTCAAACTTGT-T---TAAG----CGGTCACCT-CTTTT---AAGCA-GCCACTTGTCTTAAGCAGCC--A--C--ATT---T-A--CT-------------A--TTTCCCG--T---GAA-----TATGC----T--TTAAGAGC----------A------AA---T-TAAC----------C-T-GTA-----TTAAGCAACAACCTGTCTGAAAAGGCCA---
gi|43717 : atgATACAGTCAAACCTGT-A---TAAG----CGGTCACCT-CTATT---AAGCA-GCCACTTGTCTTAAGCAGCC--A--
gi|43718 : atATATAGTCAAACCTGT-T---TAAG----CACTCACCT-CTAGT---AAGCA-GCCACCTGTCTTAAGCAGCC--A--
gi|43720 : atTACAGTCAAACCTAT-A---TAAC----CGGTCACCT-CTTTT---AAGCA-GCCACTTGTCTTAAGCAGCC--A--
gi|43721 : atgATACAGTTAAACCTGT-G---ATAG----TGGTCACCT-CTATT---AAGCA-ACCACTTGTCTTAAACAGCCATA--T--TTT---CTATTTA-------------C--CATTTTT--TTA-AAT-----TTTAG----T---TA----T----------A------AT---C-AAC-----------C-T-GTA-----TTAAGCAGCCACCTG
gi|43722 : atATACAGTCAAACCTGT-G---TAAG----CGGTCACCT-CTATT---AAGCA-GCCATTTGTCTTAAGCAGCC--A--T--TTT---
gi|43723 : atATATAGTCAAACCTGT-A---TAAG----CGGTCACCT-CTATT---AAGCA-GCCACTTGTCTTAAGCAGCC--A--
gi|43724 : atATACAGTCAAACCTGT-A---TAAG----TGGTCACCT-CTATT---AAGCA-GCCACTTGTCTTAAGCAGCC--A--
gi|43727 : atATACAGCCAAACCTGT-T---TAAG----TGGTCACCT-GTATT---AAGCA-GCCACCTGTCTTAAGCAACC--A--
gi|43729 : atATACAGTAAAACCTGT-G---TAAG----CGGCCACCT-TTATT---AAGCA-GCCACCTGTCTTAAGCAGCC--A--
gi|43731 : atATACAGTCAAACCTGT-G---TAAG----TGGTCACCT-CTGTT---AAGCA-GCCACCTGTCTTAAGCAACC--ATGT--TTT---C----TA----------------TTTCCCAT-TC----A-----TATGC----T--TTAAGAGT----------A------AA---T-TAAC----------C-T-GTA-----TTAAGCAACCACCT
gi|43733 : acATACAGTCAAACCTGT-G---TAAG----CGGCCACCT-CTATT---AAGCG-GCCACCTGTCTTAAGCAACC--A--T--TTT---
gi|43734 : atATACAGTCAAACCTGT-A---TAAG----TGGCCACCT-CTATT---AAGCA-GCCACTTGTCTTAAGCAGCC--A--
gi|43735 : atATACAGTCAAACCTGT-A---TAAT----CAGTCACCT-TTATT---AAGCA-GCCACTTGTCTTAAACAGCC--A--
gi|43736 : acTATAGTTAAACCTGT-G---TAAG----CGGCCACCT-CTATT---AAGCA-GCCACTTGCCTTAAGCAGCC--A--C--TTT---C-
gi|43740 : atgATACAGTCAAACCTTT-G---TAAG----TGGTCACCT-CTATT---AAGCA-GCCACCTGTCTTAAGCAGCC--A--
gi|43741 : atATACAGTCTAACTTGT-C---CATG----TGTTCACCT-CTTAT---AAGCA-GTCCCCTTTGTTAAGCGGCC--A--C--TTC---C-A--TC-------------T--CCCCATG--TC---AA-----TTTCC----T--AT-----T----------A------AA---G-TAC-----------A-T-GTA-----TGAAATGGTCACCTCTTTAATGTGGCAA---GT-----A--CATTTC---ACCCAAA---
gi|43742 : atTACAGTCAAACCTGT-G---TAAG----TGGTCACCT-CTATT---AAGCA-GCCACCTGTCTTAAGCATCC--A--
gi|43743 : atgATACAGTAAAACCTGT-G---TAAG----CAGTCACCT-CTATT---AAGCA-GCCACCTGTCTTAAGCAACC--A--gattt
gi|43745 : atATACAGTAAAACCTGT-G---TAAG----TGGTCACCT-CTATT---AAGCA-GCCACCTGTCTTAAGCAACC--A--tgttt
gi|43746 : atACACAGTAAAACCTGT-A---TAAG----TGGTCACCT-CTATT---AAGCA-GCCACCTGTCTTAAGCAGTC--A--tgttt
gi|43747 : atATACAGTCAAATCTGT-G---CAAG----TGGCCATCT-CTATT---AAGCA-GCCACTTGTCTTAAGCAGCC--A--T--GTT---T-G--CG-------------CTATTTCCC---------A-----TTT-C----T--ATA----TTTTCAGAGC-A------AA---T-TAAC----------C-T-GTA-----TTAAGCAACCACCTGtgttt
gi|43750 : atATACAGTCAAACCTGT-G---TGAA----CAGTCACCC-CTATT---AAGCA-GCCACTTGTCTTAAGCAGTC--A--
gi|43751 : atATACAGTCAGACCTGT-T---TAAGTGGTCGGTCACCT-CTATT---AAGCA-GCCACTTGTCTTAAGCAGCC--A--C--ATT---C-A--
gi|43754 : atATACAGTCAAACCTGT-G---TAAG----TGGTCACCT-CTTTT---GAGCA-GCCACTTGTCATAAGCAGCC--A--
gi|43755 : atATACAGTCAAGCCTGT-G---TAAG----TGGTCACCT-CTATT---AAGCA-GCCACTTGTCTTAAGCAGCC--A--
gi|43756 : atATACAGTCAAATCTGT-G---TTAG----CGGCCACCT-TTATT---AAGCA-TTCACTTGTCTTAAGCAGCC--A--
gi|43757 : atTACAGTCAAACTTGT-G---TTAG----TGGTCACCT-CTACT---AAGCA-ACCACCTACCTTAAACAGTC--A--CA-TTT---C-A--
gi|43758 : atgATACAGTAAAACCTGT-G---TAAG----CCGTCACCT-CTATT---AAACA-GCCACCTGTCTTAAGCAGCC--A--T--TTT---
gi|43759 : atATACAGTCAAACCAGT-G---TAAG----AGGTCACCT-CCAAT---AAGCA-GCCACTTGTCTTAAGCAGCC--A--
gi|43760 : atATACAGTAAAACCTGT-A---TAAG----TGGTCACCT-CTATT---AAGCA-GCCACTTGTCTTATGCAGCC--A--C--TTT---
gi|43761 : atATACAGTCAAACCTGT-G---TTAG------GTCACCT-CTATT---AAGCA-ACCACTTGTCTTAAACAGCC--A--
gi|43763 : atATACAGTCAAACCTGT-G---TTAG----CGATCATCT-CTATT---AAGCA-GCTATCTGTCTTAAACAGCC--A--
gi|43764 : atATACAGTCAAACCTGT-G---TAAG----CCGTCACCT-CTTTT---AAGAA-ACCACTTGTCTTAAGCAGCC--A--
gi|43765 : atATACAGTCAAACCTGT-G---TAAG----CGGTCACCT-CTATT---AAGCA-GTCACTTGTCTTAAGCGGTC--
gi|43766 : acATACAGTCAAACCTGT-G---TAAG----CGGTCACCT-CTATT---AAGCA-GCAACTTGTCTTAAGCAGCC--A--
gi|43767 : acATACAGTCAAACCTGT-A---TAAG----TGGTCACCT-CTATT---AAGCA-GCCACTTGACTTAGGCAGCC--A--
gi|43768 : acATACAGTCGAACCTGT-G---TAAG----CAATCACCT-CTATTATAAAGCA-ACCACCTGTCTTAAGCAGCC--A--
gi|43769 : atATACAGTCGAACCTGT-G---TAAG----CAATCACCT-CTATTATAAAGCA-ACCACCTGTCTTAAGCAGCC--A--
gi|43843 : atATACAGTCAAACCTAT-A---CTAA----CGGTCACCTGTTA-T---AAGCA-GCCACCTGCCTTAAGCGGCC--A--G--TTT---C-A--GA-------------C--CCTCCCG--TCG-AAA-----TTTAC----T--ATA----T----------A------AT---T-TAA-----------C-T-GCA-----ATAGGCGGTCACCTGGTCGACGCAGCCA---GTGGCCAA--CATTTTTGGTCCCAAA---TGCATTAAAAACCTCCTAAAACGGCCACCAAATGAACAAATTTTACCGTAAAATATCGATTTTGGCATATAAAAATTTCATTACGGCCACAGAATTAATATTTAATTAAAGTACTAAAAACCAAATAAATCAAATAATTATAATATATCTTTAATTTAAAATAAGTTTCTTTTAGTTTAAACTTTCTTAATTGGCCGTAAACAAACCAAACAAAGCTGTTATTGTGTTCTACATAATCACAATTTTTCCGACTCAAAC
gi|43844 : tATACAGTCAAACTTGCAG---T-AG----CGACCACTTGTTA-T---AAGCG-ACCCCCTGATGTAAGCGACC--A--C--ATT---A-A--AT-------------T--CCCCCCA--ATG-AAT-----TTCAT----T---CA----T----------A------AT---T-ACA-----------CAT-GCA-----ATAAGCGACCACTTGCTCTCTGCGACCA---GCGACC
gi|43845 : tATACAGTCAAACTTGC-A---GAAC----CGACCACTTGTTA-T---AAGCG-ACCCCCTGATGTAAGCGACC--A--C--ATT---A-A--AT-------------C--CCCCCCA--ACG-AAT-----TTCAT----T---CA----T----------A------AT---T-ACA-----------CAT-GCA-----ATATGCGACCACTTGCTCTCTGCAACCA---GCGACC
gi|43846 : tTACAGTCTAACTTGT-C---CTTG----CGGCCACCT-CTTAT---AAGCG-GTCACCTGTGTTAAGCAGTC--A--C--TTC---A-A--AA-------------T--CCCCCCT--TGT-AAA-----TTGCC----T--ATA----T----------A--------------AA-----------G-T-ACATGTTTTTAAACGGTCGTCTTTTTAATGTGACCA---GTGGCCAT--TCTATTTCACCCCAAAGAGTGCTTTAA
gi|43847 : tgATACAGTAAAACCTGT-A---TAAG----TGGTCACCT-GTATT---AAGCA-GCCACCTGTCTTAAGTGACC--A--TAGTTT---C----TA----------------TTTCCCATTTC----------TTTGCT---T--TTA----T----------A------ATTAAT-TAAC----------C-T-GCA-----TTAAGC
gi|43848 : tATACAGTCAAACCTGT-G---TAAG----TGGTCACCT-TTATT---AAGCA-GCCACTTGTCTTAAGTGGCC--A--
gi|43850 : tATACAGTCAAACCTGT-G---TAAG----CGGTCAC----TATT---AAGCA-GCCACCTGTCTTAAACAGCC--A--
gi|43852 : tATACAGTCAAACCTGT-G---TAAG----CGGTCACCT-CTATT---AAGCA-GCCACTTGTCTTAAGCAACC--A--
gi|43853 : tATACAGTCAAACCTGC-G---CAAA----CGGTCACCT-CTATT---AAGCA-GCCACTTGTCTTAAGC
gi|43854 : tTACAGTCAAACCTGT-A---TAAG----TGGTCACCT-CTACT---AAGCA-GCCACTTGTCTTAAGCAGCC--A--C--ATT---C-G--CT-------------T--TTTCC---------AA-----TTT-C----T--ATG----TTTTCAGAGCAA------AT---T-TAC-----------C-T-GTA-----TTAAGC
gi|43855 : tgATACAGTCAAACCTGT-G---TAAG----CGGTCACCT-CTGTC---AAGCA-GCCACTTGTCTTAAGCAGCC--
gi|43858 : tTACAGTCAAACCTGT-G---TAAG----TGGTCACCT-CTAAT---AAGCA-GCCACTTGTCTTAACCAGCC--A--
gi|43895 : tgATACAGTCAAACCTGT-A---CTAA----CGGTCACCTGTTA-T---AAGCA-GCCACCTGTCTTAAGCGGCC--A--G--TTT---C-A--GA-------------C--CCTCCCG--TCG-AAA-----TTTAC----T--ATA----T----------A------AT---T-TAA-----------C-T-GCA-----ATAGGCGGTCACCTGGTCGACGCGGCCA---CCGGCCAA--CATTTTTGGTCCCAAA---TGCATTAAAAACCTCCTAAAACGGCCACCAAATGAACAAATTTTACCGTAAAATATCGATTTTGGCATATAAAAATTTCATTACGGCCGCAGAACTAATATTTAATTAAAGTACTAAAAACCAAATAAATCAAATAATTATAATATATCTTTAATTCAAAATAAGTTTCTTTTAGTTTAAACTTTCTTAATTGGCCGTAAACAAACCAAACAAAGCCGTTGTTGTATTCTACATAATCGCCATTTTTCCGACTCAAACCAAACAAAGCTGTTATTGTGTTCTACATAATCGGAATTTTTCCGACTCAAACACGAGTGTAGTGCGTGATAATTTTCACATCTCTATTTTTAGCTCGCGT
gi|43896 : ATACAGTCAAACCTGT-A---CTAA----CGGTCACCTGTTA-T---AAGCA-GCCACCTGCCTTAAGCGGTC--A--G--CTT---C-A--GA-------------C--CCTCCCG--TCG-AAA-----TTTAC----T--ATA----T----------A------AT---T-TAA-----------C-T-GCA-----ATAGGCGGTCACCTGGTCGACGCGGCCA---GCGGCCAA--CATTTTTGGTCCCAAA---TGCATTAAAAACCTCCTAAAACGGCCACCAAATGAACAAATTTTACCGTAAAATATCGATTTTGGCATATAAAAAGTTCATTACGGCCACAGAATTAATATTTAATTAAAGTACTAATAACCAAATAAATCAAATAATTATAATATATCTTTAATTTAAAATAAGTTTCTTTTAGTTTAAACTTTCTTAATTGGCCGTAAACAAACCAAACAAAGCTGTTATTGTGTTCTACATAATCGCAATTTTTCCGACTCAAAC
gi|43898 : ATACAGTCTAACCTGT-C---CTTG----AGGCCACCT-CTTAT---AAGCG-GTCACCTGTGTTAAGCGGCC--T--C--TTC---A-A--AA------------------TGCCG--TTGTTAA-----TTGCC----T--GTA----T----------A------AA---G-TAC-----------A-T-GTA-----TTAAACCATCACCTCTTTAACGCGGCCA---GT--CCA-------TTTCATCCCAAA---
gi|43899 : ATATAGTCAAACCTGT-A---TAAG----CGGTCACCT-CTATT---AAGCA-GCCACCTGTCTTAAGTAGCC--A--T--TTTTTCC-A--------------------CTTCCC---------A-----TTT-C----T--ATG----C------------------T---T-TAA-----------C-T-GC------TTAA
gi|43900 : ATACAGTCAAACCTGT-G---TGAA----CGGTCACCT-CTATT---AAGCA-GCCACTTGTCTTAAGCAGCC--A--CA-TTT---G-A--TA----------------CTTCCCA--Tta
gi|43901 : ATACAGTAAAACCTGT-A---TAAA----TGGTCACCT-CTTTT---AAGCA-GCCACTTGTCTTAAGCAGCC--A--
gi|43904 : ATACAGTCAAACCTGT-A---TAAG----TGGTCACCT-CTATT---AAGCA-GCCACTTGCCTTAAGCAGCC--A--
gi|43905 : ATACAGTCAAATCTGT-T---TTAC----TGGTCACCT-GTATT---AAGCA-ACCACTTGTCTTAAACAGAC--A--CATTTT---C------------------------------------AA-----TTTACCATTT--ATA----T----------A------AT---T-TAGATTTCTTCAACC-T-GTA-----TTAAGCAGTCACCTG
gi|43907 : ATACAGTCAAATCTGT-G---TAAG----AGGTCACCT-CTTTT---AAGCA-GCCACCTGTCTTAAGCAGCC--A--
gi|43909 : ATACAGTCAAACCTGT-A---CAAG----CAGCCACCT-CTATT---AAGCA-GCCACTTGTCTTAAGCAGCC--A--
gi|43911 : ATACAGTCAAACCTGT-G---CAAG----CGGTCATCT-CTATT---AAGCA-GCCACCTGTCTTAAGCAACC--A--
gi|43912 : ATACAGTCAAACCAGT-G---CAAG----CGGTCACCT-CTATT---AAGCA-GCCACTTGTCATAAGCAGCC--A--C--ATT---T-G--CT-------------A--TTTCCCA--TTT-ATATG---TTTGT----TGAATA---------------A------AT---T-CAC-----------C-T-GCA-----TTAAGCAATAACCTG
gi|43913 : ATACAGTCATACCTGT-A---TAAG----TGGTCACCT-TTATT---AAGCA-GCCACTTGTCTTAAGCAGCC--A--
gi|43914 : ATGTAGTCAAACCTGT-A---CAAG----CGGTCACCT-CTCTT---AAGCA-GCCACTTTTCTTAAGCAGCC--A--
gi|43916 : ATACAGTCAAACCTGT-G---TAAG----GGGTCATCT-CTAAT---AAGCA-GCCACCTGTCTTAAGCAACC--A--
gi|43917 : ATACAGTCAAACTTGT-G---TAAG----CGGTCACCT-CTATT---AAGCA-GCCACTTGTCTTAAGCAGCC--A--
gi|43920 : ATACAGTCAAACCTGT-G---TTAG----TGGCCACCT-ATATT---AAGCA-GCCACCTGTCATAAGCAACC--A--
gi|43963 : TACAGTCAAACCTGT-A---CTAA----CAGTCACCTGTTAT----AAGCA-GCCACCTGCCTTAAGCGGCC--A--G--TTT---C-A--TA-------------C--CCTCCCG--TCA-AAA-----TTTAC----T--ATA----T----------ACATGTAAT---T-TAA-----------C-T-GCA-----ATAGGCGGTCACCTGGTCGACGCGGCCA---GCGGCCAA--CATTTTTGGTCCCAAA---TGCATTAAAAACCTTCTAAAACGGCCACCAAATGAATAAATTTTACCGTAAAAAATCGATTTTGGCATA-AAAAATTTCATTACGGCCACTAAATTAATATTTAATTAAAGTACTAAAAACCAAATAAATCAAATAATTATAATATATCTTTAATTTAGAATAAGTTTCCTTTAGTTTAAACTTTCTTAACTGGCCGTAAACCAACCAAACAAAGCTGTTAT-----------TAATCGCCATTTTTCCGACTCGAACCAAACAAAGCTGTTATTGTGTTCTACATAATCGCAATTTTTCCGACTCAAACACGAGTGTAGTGTGTGATAATTTTCACATCTCTATTTTTAGCCCGCGT
gi|43966 : TACAGTCAAACTTGCAG---T-AG----CGACCACTTGTTA-T---AAGCG-ACCCCCTGATGTAAGCGACC--A--C--ATT-----A--AA-------------T--CCCCCCA--ACG--AA-----TTTAA----T--TCA----T----------A------AT---T-ATA-----------C-TCGCA-----ATAAGGGACCACTTGCTCTCTGCGATCA---GC
gi|43971 : TACAGTCAAACTTGCAG---T-AG----CGACCACTTGTTA-T---AAG---------TGATGTAAGTGACC--A--C--ATT-----A--AA-------------T--CCCCCCA--ATG-AAT-----TTCAT----T---CA----T----------A------AT---TATAC-----------A-T-GCA-----ATAAGCGACCACTTGCTCTCTGCGACCA---GCGACC
gi|43972 : TACAGTCAAACCTGT-A---TAAA----CTGTCACCT-GTAGT---AAGCA-GCCACATGTCTTAAGCAGCC--A--
gi|43974 : TACAGTCAAACCTGT-A---CTAA----CAGTCACCTGTTA-T---AAGCA-GCCAC
gi|43978 : TACAGTCAAACCTGT-G---TTAG----CGGTCTCCT-CTATT---AAGCA-GCCACCTGTCTTAAGCAGCC--A--
gi|43980 : TACAGTCAAACCTGT-A---TTAG----CAGTCACCT-CTATT---AAGCA-GTCACCTGTCTTAAGCAACC--A--
gi|43983 : TACATTCAAACCTGT-G---TTAA----CGGTAACCT-TTATT---AAGCA-GCCACCTGTCTTAAGCAACC--A--
gi|43984 : TGCAGTCAAACCTGT-G---CAAG----CGGTCACCT-CTGTT---AAGCA-GCCACTTGTCTTAAGCAGCC--A--
gi|43987 : TACATTCAAACCTGT-G---TTAT----TGGTCACCT-CTTTT---AAGCA-GCCACTTGTCTTAAGCAGCC--A--
gi|43988 : TACAGTCAAACCTGT-G---TAAG----CGGACACCT-CTTTT---AAGCA-GCCACTTGTCTTAAGCAGCC--A--
gi|43989 : TACAGTCAAACCTGT-A---TAAG----CGGTCACTT-CTATT---AAGCA-GTCACCTGTCTTAAGCAGCC--A--
gi|43990 : TACAGTCAAACCTGT-G---TTAG----CAGTCACCT-CTTTT---AGGCA-GCCACCTGTCTTAAGAAACC--A--
gi|43991 : TACAGTCAAACCTGT-G---TAAG----CGGTCACCT-CTATT---AGGCA-GCCACCTGTCTTAAGCAACC--A--TA-TTT---C-
gi|43992 : TACAGTCAAACCTGT-G---AAAG----TGGTCACCT-GTATT---AAGCA-TCCACTTGTCTTAAGCAGCC--A--C--ATT---T-G--CT-------------G--TTTGCCA--T---AAA-----TTT------T--ATA----T----------G------AT---T-T
gi|44044 : AAA----CAGGCACCT-GTAAT---AAGCGTGTC-CCTCCGTTAAGCGGCC--A--T--TTT-----A--TT-------------T--CCCCCCG--ATG-AAA-----ATCAT----T--CTA----T----------A------AT---T-GAC-----------C-T-GTA-----TTAAGCGTGAACTTGTCTAACGCGGCCAATGGCAGCCTA--AATTT---GTCC
gi|44058 : tgtactacaatc--TCG-AAA-----TTTAC----T--ATA----T----------A------AT---T-TAA-----------C-T-GCA-----ATAGGCGGTCACCTGGTCAACGCGGCCA---GCGGCCAA--CATTTTTGGTCCCAAA---TGCATTAAAAACCTTCTAAAACGGCCACCAAATGAACAAATCTTACCGTAAAATATCGATTTTGGCATATAAAAATTTCATTACAGCCACAGAATTAATATTTAATTAAAGTACTTAAAACCAAATAAATCAAATAATTATAATATATCTTTAATTTAAAATAAGTTTC-TTTAGTTTCAACTTTCTTAATTGGCCGTAAACAAAACAAACAAAGCTGTTATTGTGTTCTACATAATTGCCATTTTTCCGACTCAAAC
gi|44058 : CAAAACAAACAAAGCTGTTATTGTGTTCTACATAATTGCCATTTTTCCGACTCAAACACGAGTGTTGTGCGTGATAATTTTCACATCTCacgagtgttgtgcgtgataattttcacatctc
gi|44059 : tcgaaatttactatataatttaactgcaataggcggtcacctggtcaacgcggccagcggccaacatttttggtcccaaatgcattaaaaaccttctaaaacggccaccaaatgaacaaatcttaccgtaaaatatcgattttggcatataaaaatttcattacagccacagaattaatatttaattaaagtacttaaaaccaaataaatcaaataattataatatatctttaatttaaaataagtttctttagtttcaactttcttaattggccgtaaaTCGGCATATAAAAATTTCATTATGGCCACAGAATTAATATTTAATTAAAGTACTAAAAACCAAATAAATCAAATAATTATAATATATCTTTAATTTGAAATAAATTTCTTTTAGTTTAAACTTTCTTTATTGGCCGTAAACAAACCAAACAAAGCTGTTATTGTGTTCTACATAATCGCCATTTTTC
gi|44060 : TCTTAATTGGCCGTAAACAAACCAAACAAAGCTGTTATTGTGTTCTACATAATCGCCATTTCTCCGACTCAAACCAAACAAAGCTGTTATTGTGTTCTACATAATCTCAATTTTTCCGACTCAAACACGAGTGTAGTGCGTGATAATTTTCACATCTCTATTTTTAGCTTGTGT
gi|44061 : CAAACCAAACAAAGCTGTTATTGTGTTCTACATAATCGCAATTTTTCCGACTCAAACATGAGTGTAGCGCGTGACAATTTTCACATCTCTATTTTTAGCCTGCGT
gi|44062 : CAAACCAAACAAAGCTGTTATTGTGTTCTACATAATCGCCATTTTT
gi|44063 : CGACTCAAACATGAGTGTAGTGCATGATAATTTTCACATCTCTATTTTTAGCTCGCAT