lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                                                                                                            0  1 11 0   0  0      8888 00        0                1               0     0 11        3        0     0  00 00   0    
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                                                                                                            .  . .. .   .  .      .... ..        .                .               .     . ..        .        .     .  .. ..   .    
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                                                                                                            9  9 55 5   5  5      4444 66        4                9               4     8 00        1        4     4  66 66   8    
consensus                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                      TGGTAT-AA-G--C-GGG-GC-GGTAGT---CT--AATGGATA-GAGTGTTGGCCGCTCACGCCAGAGGTTGCGGG-TTCGA-T--CCCCAGCTCGACCCGAT-GCCTC-TC--A--TAA-AACA
Reference ( gi|28790 )        :                                                                                                                                                                                                                                                                                      TAGTAT-AA-G--C-GGG-GC-GGTAGT---GT--AATGGATA-GAGTGTTGGCCGCTCATGCCAGAGGTTGCGGG-TTCGA-T--CCCCAGCTTGACCCGAT-GCCTC-TC--A--TAA-AACA
gi|28799                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                      TAATGT-AA-G--C-GTA-------AGT---CT--AATGGATA-GAGTGTTGGCCGCTCACGCCAAAGGTTGCGGG-TTCGA-T--CCCTCGGTTGACCCGAT-GCCTC-TC--A--TAA-AACA
gi|28696                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                    taTGGTAG-AATG--T-GGG-GC-GGAAGT---CA--AATGGATA-GAGTGTTGGCTGCTCATGCATGAGGTTGCGGG-TTTAA-T--CCCCAGCTCGATCAGAT-GCCTC-TC--A--TAA-AACA
gi|28695                      :        atttaatgtatttaagtgtattcatttcatttttaatggatattctttaaattacaatggttaccctaaataataacacattatttcttttaaacaattgtaaagtattctcagtgactcttatgtcattctttttaaactctatttataagaatttattttaacaattaaactaccattatagttgtgctcatcagaaaaaaaaccaacacaatgacaggatctgaaaacataaattacaatggatacaattaaaccattttcaaagatTGGTAG-AATG--T-GGG-GC-GGAAGT---CA--AATGGATA-GAATGTTGGCTGCTCATGCATGAGGTTGCGGG-TTTAA-T--CCCCAGCTCGATCAGAT-GCCTC-TC--A--TAA-AACA
gi|28776                      :        atttaatgtatttaagtgtattcatttcatttttaatggatattctttatcttacaatggttaccctaaataataacacattatttcttttaaacaattgtaaagtattctcagtgactatcctgtcattctttataaactctatttataagaatttattttaacaattaaactaccattatagttgtgttcatcagaaaaaaaataaacacaatgacaggctctgaaaacataaattacaatggatacaattaaacaattttcaaagatTATTAA-AA-G--T-GGG-GTTGGTAGT---CA--AATGGACA-GAGTGTTGGCCACTCACGCTAGAGGTTGCTGG-TTTGA-T--TCCCATCTTGACCTGAT-GCCTC-TT--A--TAA-AGCA
gi|28698                      :                                                                                                                                                                                                                                                                            ttaaagaaatTGGTAG-AATG--T-GGG-GC-AGAAGT---CA--AATGGATA-G--TGTTGGCTGCTCATGCCTGAGGTTGCGGG-TTCAA-T--CCCCAG-TTGACCAGAT-GCCCC-AT--A--TAA-AACA
gi|28784                      : atttaatgtatttaagtgtattcatttttttattttatttttaatggatattctttatcttacaatggttaccctaaataataacacattatttcttttaaacaattgtaaaagtattctcagtgacaatcctgtctttctttttaaactctatttataagaatttattataacagttaaacttacattatagttgtgctcatcagcaaaaaataaacacaatgacaggagctgaaaacataaattacaatggatacaattaaaccattttcaaagatAGTAT-G-------GGG-GT-GGTAGT---GT--AATGAATA-GAGTGTTGGCTGCTCACACCAGAGGTTGCGGG-TTCGA-T--CCCCAGCTCGACACTAT-GCCTC-TC--A--TAA-AACA
gi|28704                      :                                                                                                                                                                                                                                                                            aaattaggtaaAATAC-AG-A--C-GGG-GC-GGTAGT---GT--AATGGATA-GAGTGTTGG-CGCTCATGTCTGGGGTTCCGGG-TTCGA-TCCCCCCAGCTTGACCCTAT-GCCTC-TC--A--TAA-AACA
gi|28774                      :                                                                                                                                                                                                              gtgtcattgataaaaacaataaagataataaaaagttcaagcagaaataagtgatataattttaccaaattttcGTTT-AA-GG-T-GGG-GC-GGTAGT---CT--AATGGATA-GAGTGTTGGCTGCTCATGCCAGAGGTTGCGGG-TTCGA-T--CCCCAGCTCGACCCGAT-GCCTC-TC--A--TAT-AACA
gi|28734                      :                                                                                                                                                                                                                                                                        tcaaattggtatctggGTTT-AA-G--C-GGG-GT-GGTAGT---CT--AATAGATA-GAGTGTTGGCCGCTCAAGCCAGAGGTTACGGG-TTCGA-T--CCCAAGCTCGACCCGAT-GCCTT-TC--A--TAA-AACA
gi|28730                      :                                                                                                                                                                                                                                                 ggatacaatttacctatagaaccatgactcagcagttttGTAT----G--C-GGG-GC-GGTAGT---CT--AATTGATA-GAGTGTTGGCCGCTTACGCCAAAAGTTGCAGG-TTCGA-T--CCCCAGCTTGATCCGAT-GCCTC-TC--A--TAG-AACA
gi|28706                      :                                                                                                                                                                                                                                                        aatgagacacaagtcgaatcttgaaagttgagGTATCAA-G--C-GCG-GA-GGTAGT---CA--AATTGATA-GAATGTCGGCTGCTCATGCCAGAGGTTGCAGG-TTTGA-T--CCCCAGCTCGA--TGAT-GCCTC-TC--A--TAACAACA
gi|28724                      :                                                                                                                                                                                                                    aaaacaatacaggaactgattctcagatatatatagtttagactgctaccagtgataactggcaaatatTAC-AA-G--C-GGG-GC-GGTAGT---CT--AATGCATA-GAGTGTTTGCCGTTCATGCCAGAGGTTGCTGG-TTTGA-T--CCCCAGCTCGACCCGAT-GCCTC-TC--A--TAA-AACA
gi|28711                      :                                                                                                                                                                                                                                                   attgccaaaaggatatctatttaaacatgtaaccattaTAC-AA-T--C-GGG-GC-GGTAGT---CT--TATGGATA-GAGTGTTGGCCGGTGACGCTAGAGGTTGCAGG-TTCGA-T--CCCCAGCTCTACCCGAT-GCCTC-TC--A---AA-AACA
gi|28714                      :                                                                                                                                                                                                                            tgaaaacagatagctaaattaacggctaacacttattgattataaatatttacagccaaattAT-AA----C-GGG-GC-GGTAGT---GC--AATGGATA-GAGTGTTGGCCGCTCAAGCCAGAGGTTGCGGG-TTCGA-T--CCCCAGCTCGACCCGAT-GCCTC-TC--A--TAA-AGCA
gi|28765                      :                                                                                                                                                                                                                                             aaacacgataagttacatcttaaaatacaatgagacagttccaaaAT-AA-G--C-GGG-GC-GGTAGT---CT--AGTGGAAA-GAGTGTTGGCCGCTCACGCAAGAGGCTGTGGG-TTCGA-T--CCCGAGCTCGACCCGAT-GCCTC-TC--A--TAA-AACA
gi|28782                      :                                                                                                                                                                                                                                                                 ttttcgcgaagataatgtagccataAC-AA-G--C-GGA-GC-GGCAGT---TT--AATGGATA-GAGTGTTGACCGCTCACGCCAGAGGTTGCGGA-TTCGA-T--CCCCAGTTCGACCTGCT-GCCTC-TC--A--TAA-AACA
gi|28773                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                   aagattaAT-AA-G--C-GGG-GC-AATAGT---GT--AATCGATA-GAGTGTTGGCCGCTCACGTGAAATGTTGCGGG-TTCGA-T--CCCCAGCTCGACCCGAT-TTCTC-TC--A--TAA-AACA
gi|28707                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                ttcaatggagAT-AA-GTGC-GGT-GC-GGTTAT---GT--AATGGATA-GAGTGCTGGCCGCTCACGCCAGAGGTTGCGGG-TTCGA-T--CCCCAGCTCGGTCCGAA-GTCTC-TC--A--TAA-AACA
gi|28742                      :                                                                                                                                                                                                                                  gggttgaaaacgaaaaatgttagaatgttgacgaaatatttatttttttaacaaaaAT-AA-G--C-AGT-GT-GGTAGT---CC--AATGGATA-GAGTGTTGGCCGCTCTCGCCAGAGGTTGCGGG-TTCAA-T--CCCCTGGTCGACCAGGT-GCCTT-TC--A--TA
gi|28741                      :                                                                                                                                                                                                                                                                           ataattaaatccaaaAT-AA-G--C-AGT-GT-GGTAGT---CC--AATGGATA-GAGTGTTGGCCGCTCTCGCCAGAGGTTGCGGG-TTCAA-T--CCCCTGGTCGACCAGGT-GCCTT-TC--A--TA
gi|28747                      :                                                                                                                                                                                                                                                                            ataattaaatccaaaT-AA-G----GGG-GC-GGTAGT---GT--AATGGATA-GAGTGTTGGCCGCTCACGCCAGAGGTTGTGGG-TTCGA-T--CCCCAGCTCGACCTGAT-GCCTC-TC--A--TAA-AATA
gi|28791                      :                                                                                                                                                                                                                                                               ttaacatttctaaagcaatgactggtgtT-AA-G--C-AGG-GT-GGTAGT---GT--AATGGATA-GAGTGTTGGCAACTCACGCCAGAGGTTGCGGG-TTCGA-T--CCCCAGCTCGACCCGAT-GCTTC-TC--A--TAA-AAC
gi|28757                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                  tggtgaattT-AA-G--CTGGA-GA-GATAGT---GT--AATGAATA-GAGTGTTTGCTGCTCACGCAAGAGGTTGCGGA-TTCCA-T--CCCCAACTCGACCCTAT-GCCTC-TC--A--TAA-AACA
gi|28818                      :                                                                                                                                                                                                                                                                       cattttcatgctaagctcgat-AA-G--C-GGG-GC-GGTAGT---CT--AATGGATA-GAGTGTTGGCCGCTCACGCCAGAGGTTGCGGGTTTCGA-T--CCCCAGCTCGACCCGAT-GCCTC-TC--A--TAA-AACA
gi|28823                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                           g-AA-G--C-GGG-GT-GGTAGT---CT--AATGGATA-GAGTGTTGGCCGCTCACGCGAGAAGTTGCGGG-TTCGA-T--CCCCAGCTCGACCCGAT-GCCTC-TC--A--TAA-AACA
gi|28827                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                           a-AA-G--T-GGG-GC-GGTAAT---CT--AACGGAAA-GAGTGTTGGCCGCTCATGCCAGAGGTTGCGGG-TTCGA-T--CCCCAGCTTGACCCGAT-GCCTC-TC--A--TAA-AA
gi|28825                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                           a-AA-G--C-GGGTGC-GGTAGT---TT--AATGGATA-GAGTGTTGGCCGCTCACAGCAGAGGTTGCGGG-TTCGA-T--CCCCAGCTCGACCCGAT-GCCTC-TC--A--TAA-AAC
gi|28829                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                           a-AA-G--C-GGG-GC-GGTAGT---CT--AATGGATA-AAGTGTTGGCCGCTCACGCCAGAGGTTATGGG-TTCGA-T--TCCCAGCTCGACCCGAT-ACCTC-TC--A--TAA-AACA
gi|28786                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                           a-AA-G--C-GGG-GC-GGTAGT---CT--AATGGATA-GAGTGCTTGCCGCTCACGCCAGAGGTTGCGGG-TTCGA-T--TCCCAGCTCGACCCGAT-GCCTC-TC--A--TTA-AACA
gi|28819                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                     attgatg-AA-G--C-AGG-GC-GGTGGT---CT--AATGGATA-GAGTGTTGGCTGCTCACGCCAGAGGTTGCGGG-TTCGA-T--CCCCAGCTCGATCCGAT-GCCTC-TC--A--TTA-AACA
gi|28824                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                           g-AA-G--T-GGG-GC-GGTAAT---CT--AATGGATA-GAGTGTTGGCCGCTCATGCCAGAGGTTGCGGG-TTTGA-T--CCTAAGCTGGACCCAAT-GCCTC-TC--A--TAA-AACA
gi|28813                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                           a-AA-G--C-GGG-GC-AGTAAT---GT--AATGAATA-GAGTATTGGCCGCTCACGCCAGAGGTTGCGGG-TTCGA-T--CCCCCGATTGACCTAAT-GCCTC-TC--A--TAA-AACA
gi|28780                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                         aaa-AA-G--T-GGG-GC-GGTAGT---CT--AATGGATA-GAGTGTTGGCCGCTCACGCCAGAAGTTGCGGG-TTCGA-T--CCCAAACTCGACCCGAT-GCCTC-TT--T--TAA-AACA
gi|28745                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                 aaagattgata-AA-G--C-GGG-GC-GGTAGT---CT--AATGGATA-GAGTGTTGGCCGCTCACGGTAGGGGTTGTGGG-TTCGG-T--CCCCCGGTCGACCCGAT-GCCTC-TC--A--TAA-AACA
gi|28777                      :                                                                                                                                                                                                                                                                    catttaagaccataagagtgtaaa-AG-G--C-GGG-GC-GGTAGT---CT--AATGGATA-GAGTGTTGGCCGTTCACGCCAGAGGTAGCGGG-TTCGA-T--TCCCCGGTCAACCCGAT-GCCTC-TC--A--TAA-AACA
gi|28831                      :                                                                                                                                                                                                                                                                         tcaatgatcgcaagagccg-AA-G--C-GGG-GC-GGCAGT---CT--CATGGATA-GAGTGTTGGCCGCTCACGCAAAAGGTTACGGG-TTCGA-T--TCCCTGGTTGACCCGAT-GCCTC-TC--A--TAA-AACA
gi|28820                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                           a-AA-G--C-GGG-AT-GGTAGT---CT-----GGATA-GAGTGTTGGCCGCTCACGCCAGAAGTTGCGGG-TTCGA-T--CCCCCGGTCGACCCGAT-GCCTC-TC--A--TAA-AACA
gi|28759                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                          ga-AA-G--C-GGG-GC-AGTAGT---CT--AATGGATA-GAGTATTGACCGCTCACGCCAGAGGTTGCGGG-TTTGA-T---CCCACCTCGGCCCGAT-GCCTCTTC--A--TAA-AACA
gi|28832                      :                                                                                                                                                                                                                                                                      attttcaaagacgaattctaca-AG-G--T-GGG-GC-GGTATT---GT--AATGGATA-GAGTGTTGGTCGCTCACGCCAGATGTTGTGGG-TTCGA-T--CCCCAGCTTGACCAAAT-GCCTC-TC------AA-AACA
gi|28766                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                           a-AA-G--C-GGG-GC-AGTAGT---AT--AATGGATA-G--TGTTGGCTGCTCATGCTAAGGGTTACAGG-TTTGA-T--CCCCCGATTGACCCGAT-GCCTC-TC--A--TAA-AACA
gi|28830                      :                                                                                                                                                                                                                                                                             ttctcaaattgaaaa-AA-G--C-GGG-GC-GGTAGT---CT--AATGGATA-GAGTGTTGACTGCTCACGCCAGAGGTTGCGGG-TTAAA-T--CCCCCGGTCAACCCCAT-TCCTC-TC--A--TAA-AACA
gi|28749                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                           a-AA-G--C-GGG-GT-GCTAGT---CT--AATGGGTG-GAGTGTTGGTCGCTCATGCCAGAGATTGAGAG-TTCGA-T--CCGCAGCTCGACCCAAT-GCCTC-TC--A--TAA-AA
gi|28708                      :                                                                                                                                                                                                                                                                    ttagacctctttcaagtggtaaaa-AA-G--T-GGG-GC-AGTAGTCTAGTTTAATGGATAAGAGTGCTGGCTGCTCATGCCAGAGAATGCGGG-TTTGA-T--CCCCGGTTCGACCCGAT-GCCTC-TC--A--TAA-AACA
gi|28850                      :                                                                                                                                                                                                                                                 agctgacaaaagtacagattaatgtagatactgccaaacaattttc-G--C-GGG-GC-GGTAGT---CT--AATGGATA-GAGTGTTGGCCGCTCATGCCAGAGGTTGCGGG-TTCGA-T--CCCCAGCTCGGCCCGAT-GCCTC-TC--A--TAA-ATCA
gi|28849                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                               -G--C-GGG-GC-GGTAGT---CT--AATGGATA-GAGTGTTGGCCGCTCACGCCAGAGGTTGCGGG-TTCAA-T--CCCCAGCTCGACCCGAT-GCCTC-TC--A--TTA-AACA
gi|28844                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                               -G--C-GGG-GC-GGTAGT---CT--AATGGATA-GAGTGTTGGCCGCTCACGCCAGAGGTTGCGGG-GTCGA-T--CCCCATCTCGACCCGAT-GCCTC-TC--A--TAA-AACA
gi|28851                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                              t-G--C-GGG-GC-GGCAGT---AT--AATGGATA-AAGTGTTGGTCGCTCACGCCAGAGGTTGCGGG-TTCGA-T--CCCCAGCTCGACCTGAT-GCCTC-TC--A--TAA-AACA
gi|28854                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                               -G--C-GGG-GC-GGTAGT---CT--AATGGATA-AAGTGTTGGCCGCTCACGCCAGAGGTTGCCGG-TTCGA-T--CCCCAACTCGACCCGAT-GCTTC-TC--A--TAA-AACA
gi|28856                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                               -G--C-GGG-GC-GGTAGT---CT--TATGGATA-GAGTGTTGGCCGCTCACACCAGAGGTTGCGGG-TTCGA-T--CCCCAGGTCGACCCGAT-GCCTC-TG--A--TAA-AACA
gi|28855                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                               -G--C-GGG-GC-GGTAGG---CT--AGTGGATA-GAGTGTTGACCGCTCACGCCAGAGGTTACGGG-TTCGA-T--CCCCAGCTCGACCCGAT-GCCTC-TC--A--TAA-AA
gi|28853                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                               -G--C-GGG-GC-ATTAGT---CT--TATGGATA-GAGTGTTGGCCGCTCACGCCAGAGGTTGCGGG-TTCGA-T--CCCGAGCTCGACCCGAT-GCCTC-TC--A--TAA-AACA
gi|28852                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                               -G--C-GGG-GC-GGTAGT---CT--AATGGATA-GAGTGTTGGCCGCTCACGCCAGAGGTTGCAGG-TTCGA-T--CCCCTGGTCGACCGGAT-GCCTC-TC--A--TAA-AACA
gi|28859                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                               -G--C-GGG-GC-GGTAGT---CT--AATGGATA-GAGTGTTGGCCGCTCACGCCAGAGGTTGCGGG-TTCTA-TC-CCCCAG-TCGACCCGAA-GCCTC-TC--A--TAA-AACA
gi|28842                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                               -G--T-GAG-GC-GGCTGT---CT--AATGGATA-GAATGTTGGCCGCTCATGTTAGAGGTTGTGGG-TTTGA-T--CCCCAGCTTGACCCGAT-GCCTC-TC--A--TAA-AACA
gi|28810                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                             at-G--C-AGG-GC-GGTAAT---CT--AATGGATA-GAGTGTTGGCTGCTCACGCCAGAGATTGCGGG-TTCGATT--CCCCAG-TTGACCCAAT-GCCTC-TC--A--TAA-AACA
gi|28864                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                          agacc-G--C-GGG-GC-GGTAGT---GA--AATGGATA-GAGTGTTGGCCGCTCACGCCAGAGGTTGGGGG-TTCGA-T--TCCATGATCGACCCAAT-GCCTC-TC--A--TAA-AACA
gi|28863                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                               -G--T-GGG-GC-GGTGGT---CT--AATGAATG-GAGTGTTGGCTGCTCATGCCAGAGGTTGCGAG-TTCGA-T---CCCAAATTGACCCGAT-GCCTC-TC--A--TAA-AA
gi|28826                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                               -G--T-GGG-GC-TGTAGT---CT--AATGGATA-AAGTGTTGGCCACTCACACCAGAGATTGCGGG-TTTGA-T--CCCCAACTCTACCCGAT-GCCTC-TC--A--TAA-AACA
gi|28861                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                            aat-G--C-GGG-GC-AGAAGT---CT--AATGGATA-GAGTGTTGGCCGCTCTCGCCAGAGATTGCCGG-TTCGA-T--CCCTTG-TTGACCCGAT-GCCTC-TC--A--TAA-AACA
gi|28862                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                               -G--C-GGG-AT-GGTAGT---CT--AATGGATA-G--TGTTGGCTGCTCACACCAGAGGTTGCGAG-TTTGA-T--CCCCAGCTAGACCCGAT-GCCTT-TC--A--TAA-AACA
gi|28846                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                               -G--T-GGG-GC-GGGTGT---CT--AATGGACA-GAGTGTTGGCCACTCACACCAGAGGTAGCTGG-TTCAA-T--CCCCAGCTCGACCCGAT-GCCTC-TC--A--TAA-AACA
gi|28697                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                              t-G--T-GGG-GC-AGAAGT---CA--AATGGATA-GAGTGTTGGCTGCTCATGCCTGAGGTTGCGGG-TTAAA-T--CCCCAGCTCGATCAGAT-GCCTC-TT--A--TAA-AACA
gi|28748                      :              atttaatgtatttaagtgtattcattttattattaatggatattctttatcttacaatggttaccctaaataataacacattatttcttttaaacaattgtaaagtattctcagtgacaatcctgtcattctttttaaactctatttataacaatttattataacagttaaacttacattatagttgtgctcataagcaaaaaataaacacaatgacaggagctgaaaacataaattacaatggatacaattaaaccattttcaaagattggcagaat-GGG-GC-AGTAGT---GT--AATGGATA-GAGCATTGGTCGCTCATGCAAGAGGTTGCAGG-TTCGA-T--CCCCAGCTTGACCCGAT-GCCTC-TC--A--TAA-AACA
gi|28902                      :                                                                                                                                                                                                                                                                      ttaacagtttaaaacaatgaaataatacag-GGG-GC-GGTATT---GT--AATGGATA-GAGTGTTGGCCGCTCACGCCAGAGGTTGCGGC-TTCGA-T--CCCCCGGTCGACCCGAT-GCCTC-TC--A--TAA-AACA
gi|28900                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                    -GGG-GC-GGTAGT---GT--AATGGATA-GATTGTTGGCTGCTCATGCCAGAGGTTGTGGG-TTCGA-T--CCCCTGATTGACCTAAT-GCCTC-TC--A--TAA-AACA
gi|28775                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                    -GGG-GT-GGTAGT---CT--AATGGATA-GAGGGTTGGCCGCTCACGCCAGAGGCTACGGG-TTCGA-T--CCCGAGCTCGACCCGAT-GCCTC-TC--A--TAA-AACA
gi|28898                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                     tcaaaagttaatgcg-GGG-GT-GGTAGT---AT--AATGGATA-GAGTGTTGGCCGATCATGCCAGAGGTTGTGGG-TTCGA-T--CCCCAGCTCGA-CCGAC-GTCTC-TC--A--TAA-AACA
gi|28893                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                    -GGG-AC-AGTAGT---GT--AATGGATA-TAGTGTTGGCCGTCCATGCCAGAGGTTACGGG-TTCTA-T--CCCCAGCTCGACCTGAT-GCCTC-TC--A--TAA-AACA
gi|28892                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                    -GGG-GC-CGTAGT---GT--AATGGATA-GAGTGTTGGCCACTCACGCCAGACGTTGCCGG-TTTAA-T--CCCCAGCTCGACCTGAT-GCCTC-TC--A--TAA-AACA
gi|28897                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                    -GGG-GC-GATAAT---CT--TATGGATA-GAGTGTTGGCCGCTCAAGCCAGAGGTTGTGGG-ATTGA-T--CCCCAGCTCGACCCGAT-GCCTC-TC--A--TAA-AAC
gi|28896                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                    -GGG-GT-GGTAGT---CT--AATGGATA-GAGTGTTGGCCGTTCACGCCAGAGGTTGCGGG-TTCAA-T--TCCAAGTTCGACCTTAT-GCCTC-TC--A--TAA-AACA
gi|28891                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                    -GGG-GC-GGTAGG---CT--AATGGATA-GAGTGTTGGCCGCTCATGCCAGAGGTTGTGGG-TTCAA-T--CCCCTGGTCAACCAAAT-GCCTC-TC--A--TAA-AACA
gi|28901                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                    -GGG-AC-GGTAGT---GT--AGTGGATA-AAGTGTTGGCTGCTCATGCCAGAGGTTACGGG-TTTGA-T--TCCCAACTCAATCTGAT-ACCTC-TCCGA--TAA-AACA
gi|28899                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                    -GGG-GC-GGTAGT---GA--AATAGTTA-GAGTGTTGGTCGTTCATGCCAGTGGTTACGAG-TTTAA-T--CTCCAGCTCGACTCGAT-GCCTC-TC--A--TAA-AACA
gi|28903                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                    -GGG-AC-AGTAGT---GA--AATGGATA-GTGTGTTAGCTGCTCACGCCAGAGGTTGCAGG-TTTGA-T--CCCCAACTCAACCTGTT-GCCAC-TC--A--CAA-AACA
gi|28927                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                      GG-GC-GGTAGT---CT--AATGGAGA-GACTGTTGGCCGCTCACGCCAGAGGTTGCGAG-TTCGA-T--CCCCAGCTCGACTCGAT-GCCTC-TC--A--TAA-AACA
gi|28926                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                      GG-GC-GGTAGT---CT--AATGGATA-GAGTGTTGGCCGCTCGCGCCAGAGGTTGCGGG-TTCGA-T--TCCCCGATCGACCAGAT-GCCTC-TC--A--TAA-AACA
gi|28929                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                      GG-GC-TGTAGT---CT--AATGGATA-ATGTGTTGGTCGCTAATGCCAGAGGTTGCGGG-TTCGA-T--CCCCAGCTTGAACTGAT-GCCTC-TC--A--TAA-AACA
gi|28930                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                      GG-GT-GGTAGT---CT--AATGGATA-GAGTGCTGGCCGCTCACGCCAGAGGTTGCGGG-TTCGA-T--CCCCCTGTCGACCCGGT-GCCTC-TC--A--TAA-AACA
gi|28928                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                      GG-GC-GGTAGT---CT--AATGGATA-GAGCGTTGGC-----A-GCCAGAGGTTGCGGG-TTCGA-T--CCCCAGCTCGACCCGAT-GCCTC-TC--A--CAA-AACA
gi|28931                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                      GG-GC-AGTAGT---GT--AATGGATA-GAGTGTTGGCCGCTCATGCCAGAGGTTGCGGG-TTCAATT--CCCCAA-TCAACCCGAT-GCCTC-TC--AGTTAA-CAC
gi|28811                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                      GG-TC-AGTAGT---AG--AATGGATA-GAGTGTTGGCCGCTCACGCCAGAAGTTGCGGG-TTCGA-T--CCCAAGCTCGGCCTGAT-GCCTC-CC--A--TAC-AACA
gi|28949                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                  agaatG-GC-GGTAGT---GT--GATGGATA-GAGTGTTGGCCGCTCACACCAGAGGTTGCAGG-TTCGA-T--CCCCAGCTTGACGCGAT-GCCTC-TC--A--TAA-AACA
gi|28886                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                       G-GC-GGTAAT---CT--AATGTATA-GAGTGTTGGCCGCTCAAGCCAGAGGTTGCGGA-TTTGA-T--CATCAGCTCGACCCGAT-GCCTC-TC--A--TAA-AACA
gi|28946                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                   tggtG-GC-GGAAGT---CT--AATGGATA-G--TGTTGGCCACTAATGCCAGAGGTTGGGGG-TTCAA-T--CCCCAGCTTGACCCGAT-GCCTC-TC--A--TAA-AACA
gi|28950                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                       G-GC-AGTAGT---GT--TATGAATA-CAGTGTCGGCCGCTCATGCCAGAGGTTACAGG-TTCAA-T--ACCCAGCTCGACCCGAT-GCCTC-TC--A--TAA-AACA
gi|28947                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                       G-GC-GGCAGT---GT--AACGGAAA-GAGTGTTGACCGATCACGCAAGAGGTTGCGGG-TTCGT-T--CCCCAGCTCGATCCGAT-GCCTC-TC--A--TAA-AACA
gi|28952                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                       G-GC-GGAAGT---GT--AATGGGTA-GTGTGTTTGCCGCTCACGCCAGAGGTTACAGT-TTCGA-T--CCCCTGCTCGACCAGAT-GCCTC-TC--A--TAA-AACA
gi|28971                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                               AGT---CT--AATGGATA-GAGTATTGGCCGCTCACGCCAGAGGTTGCGGG-TTCGA-T--CCCCAGCTCGACCCGAT-GCCTC-TC--A--TAA-AACA
gi|28974                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                               AGT---CT--AATTGATA-TAGTGTTGGCCGCTCACGCCAGAAGTTGTGGG-TTCGA-T--CCCCAGCTCGACCCGAC-GCCTC-TC--A--TAA-AACA
gi|28991                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       --AATGGATA-GAATGTTTGCCGCTCATGCCAGAGGTTGCGAG-TTCGA-T--CCCCAGCTCGACCCGAT-GCCTC-TC--A--TAA-AACA
gi|28989                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       --AATGGATA-GAGTGTTGGCCACTCTTGCTAGAGGTTGCGGG-TTTAA-T--CCTCAGCTTGGCTCGAT-GCCTC-TC--A--TAA-TACA
gi|28968                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      a--AATGGATA-GAGTGTTGGCTGCTAATGCCTGAGGTTGTGGG-TTTAA-T--CCCCAGCTCGATCAGAT-GCCTC-TC--A--TAA-AACA
gi|28993                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                gaagtca--AATGGAAA-CAGTGTTGGCCGCTCACGCCTGAGATTGCGGG-TTCAA-T--CCCCCGATCGACCCGAT-GCCTC-TC--A--TAA-AACA
gi|28994                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       --AATGAAGA-GAGTGTTGGCTGCTCACGCCTGAGGTTACTGG-TTCGA-T--CTCCAGCTCTACCCGAT-GCCTC-TC--A--TAA-AACA
gi|28972                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       --AATTGATA-GAATGTTGGCTGCTCATGCCGGAGGTTGCAGG-TTTGA-T--CCCCAGCTCGA--TGAT-GCCTC-TC--A--TAACAACA
gi|29017                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     agtcaATAGATA-GAGTGTTGGCTGCTCACGCCAGAGGTTGCAGG-TTCGA-T--CCCCCCCTCGACCTGAT-GCCTC-TC--A--TAA-AACA
gi|28779                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           TGGATA-GAGTGTTGACCATTCATGTAAGAGGTTGCAGG-TTTGA-T--CCCAAGCTCAAACTGATGGCCTC-TC--A---AA-AATA
1 sequences could not be aligned to this particular reference sequence:
Unaligned ( gi|28699 ): ATTTAATGTATTTAAGTGTTTTCATTTTATTTTTAATTGATATTCTTTATCTTACAACGGTTACCCTAAATACTATAACAACACATTATTTCTTTTAAACAATTGCAAAGTATTCTCAGTGACATTCCTGTCATTCTTTTTAAACTTTATTTATAAGAATTGATTATAACAGTTAAACTTACATAACCGTTGTGCTCATCAGCAAAATATAAACACAATGACAGGAGCTGAAAACACATAAATTACAAAATTGGAAACCAAATT






Alignments
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                                                                                                         22  2 11 0   0  0       0  11111       0                                0     0 11                 0     0  00 00   0    
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                                                                                                         ..  . .. .   .  .       .  .....       .                                .     . ..                 .     .  .. ..   .    
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                                                                                                         11  6 55 5   4  4       4  00000       4                                4     8 00                 4     4  66 66   8    
consensus                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                    TGGTAT-AA-G--C-GGG-GC-GGTAGTC-TA-----ATGGATA-GAGTGTTGGCCGCTCACGCCAGAGGTTGCGGG-TTCGA-T--CCCCAGCTCGACCCGAT-GCCTC-TC--A--TAA-AACA
Reference ( family-115 )      :                                                                                                                                                                                                                                                                                    TGGTAT-AA-G--C-GGG-GC-GGTAGTC-TA-----ATGGATA-GAGTGTTGGCCGCTCACGCCAGAGGTTGCGGG-TTCGA-T--CCCCAGCTCGACCCGAT-GCCTC-TC--A--TAA-AACA
gi|28695                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                    TGGTAG-AATG--T-GGG-GC-GGAAGTC-AA-----ATGGATA-GAATGTTGGCTGCTCATGCATGAGGTTGCGGG-TTTAA-T--CCCCAGCTCGATCAGAT-GCCTC-TC--A--TAA-AACA
gi|28696                      :      atttaatgtatttaagtgtattcatttcatttttaatggatattctttatcttacaatggttaccctaaataataacacattatttcttttaaacaattgtaaagtattctcagtgactatcctgtcattctttataaactctatttataagaatttattttaacaattaaactaccattatagttgtgttcatcagaaaaaaaataaacacaatgacaggctctgaaaacataaattacaatggatacaattaaacaattttcaaagatTGGTAG-AATG--T-GGG-GC-GGAAGTC-AA-----ATGGATA-GAGTGTTGGCTGCTCATGCATGAGGTTGCGGG-TTTAA-T--CCCCAGCTCGATCAGAT-GCCTC-TC--A--TAA-AACA
gi|28697                      :      atttaatgtatttaagtgtattcatttcatttttaatggatattctttaaattacaatggttaccctaaataataacacattatttcttttaaacaattgtaaagtattctcagtgactcttatgtcattctttttaaactctatttataagaatttattttaacaattaaactaccattatagttgtgctcatcagaaaaaaaaccaacacaatgacaggatctgaaaacataaattacaatggatacaattaaaccattttcaaagatTGGCAG-AATG--T-GGG-GC-AGAAGTC-AA-----ATGGATA-GAGTGTTGGCTGCTCATGCCTGAGGTTGCGGG-TTAAA-T--CCCCAGCTCGATCAGAT-GCCTC-TT--A--TAA-AACA
gi|28698                      :       atttaatgtatttaagtgtattcattttattattaatggatattctttatcttacaatggttaccctaaataataacacattatttcttttaaacaattgtaaagtattctcagtgacaatcctgtcattctttttaaactctatttataacaatttattataacagttaaacttacattatagttgtgctcataagcaaaaaataaacacaatgacaggagctgaaaacataaattacaatggatacaattaaaccattttcaaagatTGGTAG-AATG--T-GGG-GC-AGAAGTC-AA-----ATGGATA-G--TGTTGGCTGCTCATGCCTGAGGTTGCGGG-TTCAA-T--CCCCAG-TTGACCAGAT-GCCCC-AT--A--TAA-AACA
gi|28704                      : atttaatgtatttaagtgtattcatttttttattttatttttaatggatattctttatcttacaatggttaccctaaataataacacattatttcttttaaacaattgtaaaagtattctcagtgacaatcctgtctttctttttaaactctatttataagaatttattataacagttaaacttacattatagttgtgctcatcagcaaaaaataaacacaatgacaggagctgaaaacataaattacaatggatacaattaaaccattttcaaagatTAC-AG-A--C-GGG-GC-GGTAGTG-TA-----ATGGATA-GAGTGTTGG-CGCTCATGTCTGGGGTTCCGGG-TTCGA-TCCCCCCAGCTTGACCCTAT-GCCTC-TC--A--TAA-AACA
gi|28706                      :                                                                                                                                                                                                          gtgtcattgataaaaacaataaagataataaaaagttcaagcagaaataagtgatataattttaccaaattttcaaGTATCAA-G--C-GCG-GA-GGTAGTC-AA-----ATTGATA-GAATGTCGGCTGCTCATGCCAGAGGTTGCAGG-TTTGA-T--CCCCAGCTCGA--TGAT-GCCTC-TC--A--TAACAACA
gi|28707                      :                                                                                                                                                                                                                   aaaacaatacaggaactgattctcagatatatatagtttagactgctaccagtgataactggcaaatatAT-AA-GTGC-GGT-GC-GGTTATG-TA-----ATGGATA-GAGTGCTGGCCGCTCACGCCAGAGGTTGCGGG-TTCGA-T--CCCCAGCTCGGTCCGAA-GTCTC-TC--A--TAA-AACA
gi|28708                      :                                                                                                                                                                                                                                  gggttgaaaacgaaaaatgttagaatgttgacgaaatatttatttttttaacaaaa-AA-G--T-GGG-GC-AGTAGTC-TAGTTTAATGGATAAGAGTGCTGGCTGCTCATGCCAGAGAATGCGGG-TTTGA-T--CCCCGGTTCGACCCGAT-GCCTC-TC--A--TAA-AACA
gi|28711                      :                                                                                                                                                                                                                                         agctgacaaaagtacagattaatgtagatactgccaaacaattttcTAC-AA-T--C-GGG-GC-GGTAGTC-TT-----ATGGATA-GAGTGTTGGCCGGTGACGCTAGAGGTTGCAGG-TTCGA-T--CCCCAGCTCTACCCGAT-GCCTC-TC--A---AA-AACA
gi|28714                      :                                                                                                                                                                                                                          tgaaaacagatagctaaattaacggctaacacttattgattataaatatttacagccaaattAT-AA----C-GGG-GC-GGTAGTG-CA-----ATGGATA-GAGTGTTGGCCGCTCAAGCCAGAGGTTGCGGG-TTCGA-T--CCCCAGCTCGACCCGAT-GCCTC-TC--A--TAA-AGCA
gi|28724                      :                                                                                                                                                                                                                                          aaacacgataagttacatcttaaaatacaatgagacagttccaaaTAC-AA-G--C-GGG-GC-GGTAGTC-TA-----ATGCATA-GAGTGTTTGCCGTTCATGCCAGAGGTTGCTGG-TTTGA-T--CCCCAGCTCGACCCGAT-GCCTC-TC--A--TAA-AACA
gi|28730                      :                                                                                                                                                                                                                                               attgccaaaaggatatctatttaaacatgtaaccattaGGTAT----G--C-GGG-GC-GGTAGTC-TA-----ATTGATA-GAGTGTTGGCCGCTTACGCCAAAAGTTGCAGG-TTCGA-T--CCCCAGCTTGATCCGAT-GCCTC-TC--A--TAG-AACA
gi|28734                      :                                                                                                                                                                                                                                                       aatgagacacaagtcgaatcttgaaagttgaGTTT-AA-G--C-GGG-GT-GGTAGTC-TA-----ATAGATA-GAGTGTTGGCCGCTCAAGCCAGAGGTTACGGG-TTCGA-T--CCCAAGCTCGACCCGAT-GCCTT-TC--A--TAA-AACA
gi|28741                      :                                                                                                                                                                                                                                                 ggatacaatttacctatagaaccatgactcagcagttttAT-AA-G--C-AGT-GT-GGTAGTC-CA-----ATGGATA-GAGTGTTGGCCGCTCTCGCCAGAGGTTGCGGG-TTCAA-T--CCCCTGGTCGACCAGGT-GCCTT-TC--A--TA
gi|28742                      :                                                                                                                                                                                                                                                                         ataattaaatccaaaAT-AA-G--C-AGT-GT-GGTAGTC-CA-----ATGGATA-GAGTGTTGGCCGCTCTCGCCAGAGGTTGCGGG-TTCAA-T--CCCCTGGTCGACCAGGT-GCCTT-TC--A--TA
gi|28745                      :                                                                                                                                                                                                                                                                           ataattaaatccaaa-AA-G--C-GGG-GC-GGTAGTC-TA-----ATGGATA-GAGTGTTGGCCGCTCACGGTAGGGGTTGTGGG-TTCGG-T--CCCCCGGTCGACCCGAT-GCCTC-TC--A--TAA-AACA
gi|28747                      :                                                                                                                                                                                                                                                            catttaagaccataagagtgtaaaTGGTGTTAA-G----GGG-GC-GGTAGTG-TA-----ATGGATA-GAGTGTTGGCCGCTCACGCCAGAGGTTGTGGG-TTCGA-T--CCCCAGCTCGACCTGAT-GCCTC-TC--A--TAA-AATA
gi|28748                      :                                                                                                                                                                                                                                                                            ttaacatttctaaagcaatgac-GGG-GC-AGTAGTG-TA-----ATGGATA-GAGCATTGGTCGCTCATGCAAGAGGTTGCAGG-TTCGA-T--CCCCAGCTTGACCCGAT-GCCTC-TC--A--TAA-AACA
gi|28749                      :                                                                                                                                                                                                                                                            ttaacagtttaaaacaatgaaataatacag-AA-G--C-GGG-GT-GCTAGTC-TA-----ATGGGTG-GAGTGTTGGTCGCTCATGCCAGAGATTGAGAG-TTCGA-T--CCGCAGCTCGACCCAAT-GCCTC-TC--A--TAA-AA
gi|28757                      :                                                                                                                                                                                                                                                                 ttagacctctttcaagtggtaaaaT-AA-G--CTGGA-GA-GATAGTG-TA-----ATGAATA-GAGTGTTTGCTGCTCACGCAAGAGGTTGCGGA-TTCCA-T--CCCCAACTCGACCCTAT-GCCTC-TC--A--TAA-AACA
gi|28759                      :                                                                                                                                                                                                                                                                     cattttcatgctaagctcgat-AA-G--C-GGG-GC-AGTAGTC-TA-----ATGGATA-GAGTATTGACCGCTCACGCCAGAGGTTGCGGG-TTTGA-T---CCCACCTCGGCCCGAT-GCCTCTTC--A--TAA-AACA
gi|28765                      :                                                                                                                                                                                                                                                                  attttcaaagacgaattctacaAT-AA-G--C-GGG-GC-GGTAGTC-TA-----GTGGAAA-GAGTGTTGGCCGCTCACGCAAGAGGCTGTGGG-TTCGA-T--CCCGAGCTCGACCCGAT-GCCTC-TC--A--TAA-AACA
gi|28766                      :                                                                                                                                                                                                                                                                 ttttcgcgaagataatgtagccata-AA-G--C-GGG-GC-AGTAGTA-TA-----ATGGATA-G--TGTTGGCTGCTCATGCTAAGGGTTACAGG-TTTGA-T--CCCCCGATTGACCCGAT-GCCTC-TC--A--TAA-AACA
gi|28773                      :                                                                                                                                                                                                                                                                         ttctcaaattgaaaaAT-AA-G--C-GGG-GC-AATAGTG-TA-----ATCGATA-GAGTGTTGGCCGCTCACGTGAAATGTTGCGGG-TTCGA-T--CCCCAGCTCGACCCGAT-TTCTC-TC--A--TAA-AACA
gi|28774                      :                                                                                                                                                                                                                                                                           ttcaatggagGGTTT-AA-GG-T-GGG-GC-GGTAGTC-TA-----ATGGATA-GAGTGTTGGCTGCTCATGCCAGAGGTTGCGGG-TTCGA-T--CCCCAGCTCGACCCGAT-GCCTC-TC--A--TAT-AACA
gi|28775                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                   tcaaattggtatctg-GGG-GT-GGTAGTC-TA-----ATGGATA-GAGGGTTGGCCGCTCACGCCAGAGGCTACGGG-TTCGA-T--CCCGAGCTCGACCCGAT-GCCTC-TC--A--TAA-AACA
gi|28776                      :                                                                                                                                                                                                                                                                        tcaaaagttaatgcgTAA-AA-G--T-GGG-GTTGGTAGTC-AA-----ATGGACA-GAGTGTTGGCCACTCACGCTAGAGGTTGCTGG-TTTGA-T--TCCCATCTTGACCTGAT-GCCTC-TT--A--TAA-AGCA
gi|28777                      :                                                                                                                                                                                                                                                                             ttaaagaaattat-AG-G--C-GGG-GC-GGTAGTC-TA-----ATGGATA-GAGTGTTGGCCGTTCACGCCAGAGGTAGCGGG-TTCGA-T--TCCCCGGTCAACCCGAT-GCCTC-TC--A--TAA-AACA
gi|28779                      :                                                                                                                                                                                                                                                                    tcaatgatcgcaagagccgTAT-AA-G--------GC-AGAAATCACA-----TTGGATA-GAGTGTTGACCATTCATGTAAGAGGTTGCAGG-TTTGA-T--CCCAAGCTCAAACTGATGGCCTC-TC--A---AA-AATA
gi|28780                      :                                                                                                                                                                                                                                                                caaaaaatggtagatgttcaTGATA--AA-G--T-GGG-GC-GGTAGTC-TA-----ATGGATA-GAGTGTTGGCCGCTCACGCCAGAAGTTGCGGG-TTCGA-T--CCCAAACTCGACCCGAT-GCCTC-TT--T--TAA-AACA
gi|28782                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                  aaagatAC-AA-G--C-GGA-GC-GGCAGTT-TA-----ATGGATA-GAGTGTTGACCGCTCACGCCAGAGGTTGCGGA-TTCGA-T--CCCCAGTTCGACCTGCT-GCCTC-TC--A--TAA-AACA
gi|28784                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                           aagatta-GGG-GT-GGTAGTG-TA-----ATGAATA-GAGTGTTGGCTGCTCACACCAGAGGTTGCGGG-TTCGA-T--CCCCAGCTCGACACTAT-GCCTC-TC--A--TAA-AACA
gi|28786                      :                                                                                                                                                                                                                                                                         aaattaggtaaagtatg-AA-G--C-GGG-GC-GGTAGTC-TA-----ATGGATA-GAGTGCTTGCCGCTCACGCCAGAGGTTGCGGG-TTCGA-T--TCCCAGCTCGACCCGAT-GCCTC-TC--A--TTA-AACA
gi|28790                      :                                                                                                                                                                                                                                                                             attgatgTAGTAT-AA-G--C-GGG-GC-GGTAGTG-TA-----ATGGATA-GAGTGTTGGCCGCTCATGCCAGAGGTTGCGGG-TTCGA-T--CCCCAGCTTGACCCGAT-GCCTC-TC--A--TAA-AACA
gi|28791                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                         T-AA-G--C-AGG-GT-GGTAGTG-TA-----ATGGATA-GAGTGTTGGCAACTCACGCCAGAGGTTGCGGG-TTCGA-T--CCCCAGCTCGACCCGAT-GCTTC-TC--A--TAA-AAC
gi|28799                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                    tggtgaattAGTC-TA-----ATGGATA-GAGTGTTGGCCGCTCACGCCAAAGGTTGCGGG-TTCGA-T--CCCTCGGTTGACCCGAT-GCCTC-TC--A--TAA-AACA
gi|28810                      :                                                                                                                                                                                                                                                                              tataatgtaagcgta-G--C-AGG-GC-GGTAATC-TA-----ATGGATA-GAGTGTTGGCTGCTCACGCCAGAGATTGCGGG-TTCGATT--CCCCAG-TTGACCCAAT-GCCTC-TC--A--TAA-AACA
gi|28811                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                               agaccGG-TC-AGTAGTA-GA-----ATGGATA-GAGTGTTGGCCGCTCACGCCAGAAGTTGCGGG-TTCGA-T--CCCAAGCTCGGCCTGAT-GCCTC-CC--A--TAC-AACA
gi|28813                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                     agaat-AA-G--C-GGG-GC-AGTAATG-TA-----ATGAATA-GAGTATTGGCCGCTCACGCCAGAGGTTGCGGG-TTCGA-T--CCCCCGATTGACCTAAT-GCCTC-TC--A--TAA-AACA
gi|28818                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                       aaa-AA-G--C-GGG-GC-GGTAGTC-TA-----ATGGATA-GAGTGTTGGCCGCTCACGCCAGAGGTTGCGGGTTTCGA-T--CCCCAGCTCGACCCGAT-GCCTC-TC--A--TAA-AACA
gi|28819                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                         g-AA-G--C-AGG-GC-GGTGGTC-TA-----ATGGATA-GAGTGTTGGCTGCTCACGCCAGAGGTTGCGGG-TTCGA-T--CCCCAGCTCGATCCGAT-GCCTC-TC--A--TTA-AACA
gi|28820                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                         g-AA-G--C-GGG-AT-GGTAGTC-T--------GGATA-GAGTGTTGGCCGCTCACGCCAGAAGTTGCGGG-TTCGA-T--CCCCCGGTCGACCCGAT-GCCTC-TC--A--TAA-AACA
gi|28823                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                        ga-AA-G--C-GGG-GT-GGTAGTC-TA-----ATGGATA-GAGTGTTGGCCGCTCACGCGAGAAGTTGCGGG-TTCGA-T--CCCCAGCTCGACCCGAT-GCCTC-TC--A--TAA-AACA
gi|28824                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                         a-AA-G--T-GGG-GC-GGTAATC-TA-----ATGGATA-GAGTGTTGGCCGCTCATGCCAGAGGTTGCGGG-TTTGA-T--CCTAAGCTGGACCCAAT-GCCTC-TC--A--TAA-AACA
gi|28825                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                         a-AA-G--C-GGGTGC-GGTAGTT-TA-----ATGGATA-GAGTGTTGGCCGCTCACAGCAGAGGTTGCGGG-TTCGA-T--CCCCAGCTCGACCCGAT-GCCTC-TC--A--TAA-AAC
gi|28826                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                            a-G--T-GGG-GC-TGTAGTC-TA-----ATGGATA-AAGTGTTGGCCACTCACACCAGAGATTGCGGG-TTTGA-T--CCCCAACTCTACCCGAT-GCCTC-TC--A--TAA-AACA
gi|28827                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                       aat-AA-G--T-GGG-GC-GGTAATC-TA-----ACGGAAA-GAGTGTTGGCCGCTCATGCCAGAGGTTGCGGG-TTCGA-T--CCCCAGCTTGACCCGAT-GCCTC-TC--A--TAA-AA
gi|28829                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                         a-AA-G--C-GGG-GC-GGTAGTC-TA-----ATGGATA-AAGTGTTGGCCGCTCACGCCAGAGGTTATGGG-TTCGA-T--TCCCAGCTCGACCCGAT-ACCTC-TC--A--TAA-AACA
gi|28830                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                         a-AA-G--C-GGG-GC-GGTAGTC-TA-----ATGGATA-GAGTGTTGACTGCTCACGCCAGAGGTTGCGGG-TTAAA-T--CCCCCGGTCAACCCCAT-TCCTC-TC--A--TAA-AACA
gi|28831                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                         a-AA-G--C-GGG-GC-GGCAGTC-TC-----ATGGATA-GAGTGTTGGCCGCTCACGCAAAAGGTTACGGG-TTCGA-T--TCCCTGGTTGACCCGAT-GCCTC-TC--A--TAA-AACA
gi|28832                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                         a-AG-G--T-GGG-GC-GGTATTG-TA-----ATGGATA-GAGTGTTGGTCGCTCACGCCAGATGTTGTGGG-TTCGA-T--CCCCAGCTTGACCAAAT-GCCTC-TC------AA-AACA
gi|28842                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                            a-G--T-GAG-GC-GGCTGTC-TA-----ATGGATA-GAATGTTGGCCGCTCATGTTAGAGGTTGTGGG-TTTGA-T--CCCCAGCTTGACCCGAT-GCCTC-TC--A--TAA-AACA
gi|28844                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                           at-G--C-GGG-GC-GGTAGTC-TA-----ATGGATA-GAGTGTTGGCCGCTCACGCCAGAGGTTGCGGG-GTCGA-T--CCCCATCTCGACCCGAT-GCCTC-TC--A--TAA-AACA
gi|28846                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                            t-G--T-GGG-GC-GGGTGTC-TA-----ATGGACA-GAGTGTTGGCCACTCACACCAGAGGTAGCTGG-TTCAA-T--CCCCAGCTCGACCCGAT-GCCTC-TC--A--TAA-AACA
gi|28849                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                            t-G--C-GGG-GC-GGTAGTC-TA-----ATGGATA-GAGTGTTGGCCGCTCACGCCAGAGGTTGCGGG-TTCAA-T--CCCCAGCTCGACCCGAT-GCCTC-TC--A--TTA-AACA
gi|28850                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                             -G--C-GGG-GC-GGTAGTC-TA-----ATGGATA-GAGTGTTGGCCGCTCATGCCAGAGGTTGCGGG-TTCGA-T--CCCCAGCTCGGCCCGAT-GCCTC-TC--A--TAA-ATCA
gi|28851                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                             -G--C-GGG-GC-GGCAGTA-TA-----ATGGATA-AAGTGTTGGTCGCTCACGCCAGAGGTTGCGGG-TTCGA-T--CCCCAGCTCGACCTGAT-GCCTC-TC--A--TAA-AACA
gi|28852                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                             -G--C-GGG-GC-GGTAGTC-TA-----ATGGATA-GAGTGTTGGCCGCTCACGCCAGAGGTTGCAGG-TTCGA-T--CCCCTGGTCGACCGGAT-GCCTC-TC--A--TAA-AACA
gi|28853                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                             -G--C-GGG-GC-ATTAGTC-TT-----ATGGATA-GAGTGTTGGCCGCTCACGCCAGAGGTTGCGGG-TTCGA-T--CCCGAGCTCGACCCGAT-GCCTC-TC--A--TAA-AACA
gi|28854                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                             -G--C-GGG-GC-GGTAGTC-TA-----ATGGATA-AAGTGTTGGCCGCTCACGCCAGAGGTTGCCGG-TTCGA-T--CCCCAACTCGACCCGAT-GCTTC-TC--A--TAA-AACA
gi|28855                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                             -G--C-GGG-GC-GGTAGGC-TA-----GTGGATA-GAGTGTTGACCGCTCACGCCAGAGGTTACGGG-TTCGA-T--CCCCAGCTCGACCCGAT-GCCTC-TC--A--TAA-AA
gi|28856                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                             -G--C-GGG-GC-GGTAGTC-TT-----ATGGATA-GAGTGTTGGCCGCTCACACCAGAGGTTGCGGG-TTCGA-T--CCCCAGGTCGACCCGAT-GCCTC-TG--A--TAA-AACA
gi|28859                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                             -G--C-GGG-GC-GGTAGTC-TA-----ATGGATA-GAGTGTTGGCCGCTCACGCCAGAGGTTGCGGG-TTCTA-TC-CCCCAG-TCGACCCGAA-GCCTC-TC--A--TAA-AACA
gi|28861                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                             -G--C-GGG-GC-AGAAGTC-TA-----ATGGATA-GAGTGTTGGCCGCTCTCGCCAGAGATTGCCGG-TTCGA-T--CCCTTG-TTGACCCGAT-GCCTC-TC--A--TAA-AACA
gi|28862                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                             -G--C-GGG-AT-GGTAGTC-TA-----ATGGATA-G--TGTTGGCTGCTCACACCAGAGGTTGCGAG-TTTGA-T--CCCCAGCTAGACCCGAT-GCCTT-TC--A--TAA-AACA
gi|28863                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                             -G--T-GGG-GC-GGTGGTC-TA-----ATGAATG-GAGTGTTGGCTGCTCATGCCAGAGGTTGCGAG-TTCGA-T---CCCAAATTGACCCGAT-GCCTC-TC--A--TAA-AA
gi|28864                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                             -G--C-GGG-GC-GGTAGTG-AA-----ATGGATA-GAGTGTTGGCCGCTCACGCCAGAGGTTGGGGG-TTCGA-T--TCCATGATCGACCCAAT-GCCTC-TC--A--TAA-AACA
gi|28886                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                     G-GC-GGTAATC-TA-----ATGTATA-GAGTGTTGGCCGCTCAAGCCAGAGGTTGCGGA-TTTGA-T--CATCAGCTCGACCCGAT-GCCTC-TC--A--TAA-AACA
gi|28891                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                              tggt-GGG-GC-GGTAGGC-TA-----ATGGATA-GAGTGTTGGCCGCTCATGCCAGAGGTTGTGGG-TTCAA-T--CCCCTGGTCAACCAAAT-GCCTC-TC--A--TAA-AACA
gi|28892                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                  -GGG-GC-CGTAGTG-TA-----ATGGATA-GAGTGTTGGCCACTCACGCCAGACGTTGCCGG-TTTAA-T--CCCCAGCTCGACCTGAT-GCCTC-TC--A--TAA-AACA
gi|28893                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                  -GGG-AC-AGTAGTG-TA-----ATGGATA-TAGTGTTGGCCGTCCATGCCAGAGGTTACGGG-TTCTA-T--CCCCAGCTCGACCTGAT-GCCTC-TC--A--TAA-AACA
gi|28896                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                  -GGG-GT-GGTAGTC-TA-----ATGGATA-GAGTGTTGGCCGTTCACGCCAGAGGTTGCGGG-TTCAA-T--TCCAAGTTCGACCTTAT-GCCTC-TC--A--TAA-AACA
gi|28897                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                  -GGG-GC-GATAATC-TT-----ATGGATA-GAGTGTTGGCCGCTCAAGCCAGAGGTTGTGGG-ATTGA-T--CCCCAGCTCGACCCGAT-GCCTC-TC--A--TAA-AAC
gi|28898                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                  -GGG-GT-GGTAGTA-TA-----ATGGATA-GAGTGTTGGCCGATCATGCCAGAGGTTGTGGG-TTCGA-T--CCCCAGCTCGA-CCGAC-GTCTC-TC--A--TAA-AACA
gi|28899                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                  -GGG-GC-GGTAGTG-AA-----ATAGTTA-GAGTGTTGGTCGTTCATGCCAGTGGTTACGAG-TTTAA-T--CTCCAGCTCGACTCGAT-GCCTC-TC--A--TAA-AACA
gi|28900                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                  -GGG-GC-GGTAGTG-TA-----ATGGATA-GATTGTTGGCTGCTCATGCCAGAGGTTGTGGG-TTCGA-T--CCCCTGATTGACCTAAT-GCCTC-TC--A--TAA-AACA
gi|28901                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                  -GGG-AC-GGTAGTG-TA-----GTGGATA-AAGTGTTGGCTGCTCATGCCAGAGGTTACGGG-TTTGA-T--TCCCAACTCAATCTGAT-ACCTC-TCCGA--TAA-AACA
gi|28902                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                  -GGG-GC-GGTATTG-TA-----ATGGATA-GAGTGTTGGCCGCTCACGCCAGAGGTTGCGGC-TTCGA-T--CCCCCGGTCGACCCGAT-GCCTC-TC--A--TAA-AACA
gi|28903                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                  -GGG-AC-AGTAGTG-AA-----ATGGATA-GTGTGTTAGCTGCTCACGCCAGAGGTTGCAGG-TTTGA-T--CCCCAACTCAACCTGTT-GCCAC-TC--A--CAA-AACA
gi|28926                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                    GG-GC-GGTAGTC-TA-----ATGGATA-GAGTGTTGGCCGCTCGCGCCAGAGGTTGCGGG-TTCGA-T--TCCCCGATCGACCAGAT-GCCTC-TC--A--TAA-AACA
gi|28927                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                    GG-GC-GGTAGTC-TA-----ATGGAGA-GACTGTTGGCCGCTCACGCCAGAGGTTGCGAG-TTCGA-T--CCCCAGCTCGACTCGAT-GCCTC-TC--A--TAA-AACA
gi|28928                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                    GG-GC-GGTAGTC-TA-----ATGGATA-GAGCGTTGGC-----A-GCCAGAGGTTGCGGG-TTCGA-T--CCCCAGCTCGACCCGAT-GCCTC-TC--A--CAA-AACA
gi|28929                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                    GG-GC-TGTAGTC-TA-----ATGGATA-ATGTGTTGGTCGCTAATGCCAGAGGTTGCGGG-TTCGA-T--CCCCAGCTTGAACTGAT-GCCTC-TC--A--TAA-AACA
gi|28930                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                    GG-GT-GGTAGTC-TA-----ATGGATA-GAGTGCTGGCCGCTCACGCCAGAGGTTGCGGG-TTCGA-T--CCCCCTGTCGACCCGGT-GCCTC-TC--A--TAA-AACA
gi|28931                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                    GG-GC-AGTAGTG-TA-----ATGGATA-GAGTGTTGGCCGCTCATGCCAGAGGTTGCGGG-TTCAATT--CCCCAA-TCAACCCGAT-GCCTC-TC--AGTTAA-CAC
gi|28946                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                     G-GC-GGAAGTC-TA-----ATGGATA-G--TGTTGGCCACTAATGCCAGAGGTTGGGGG-TTCAA-T--CCCCAGCTTGACCCGAT-GCCTC-TC--A--TAA-AACA
gi|28947                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                     G-GC-GGCAGTG-TA-----ACGGAAA-GAGTGTTGACCGATCACGCAAGAGGTTGCGGG-TTCGT-T--CCCCAGCTCGATCCGAT-GCCTC-TC--A--TAA-AACA
gi|28949                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                     G-GC-GGTAGTG-TG-----ATGGATA-GAGTGTTGGCCGCTCACACCAGAGGTTGCAGG-TTCGA-T--CCCCAGCTTGACGCGAT-GCCTC-TC--A--TAA-AACA
gi|28950                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                     G-GC-AGTAGTG-TT-----ATGAATA-CAGTGTCGGCCGCTCATGCCAGAGGTTACAGG-TTCAA-T--ACCCAGCTCGACCCGAT-GCCTC-TC--A--TAA-AACA
gi|28952                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                     G-GC-GGAAGTG-TA-----ATGGGTA-GTGTGTTTGCCGCTCACGCCAGAGGTTACAGT-TTCGA-T--CCCCTGCTCGACCAGAT-GCCTC-TC--A--TAA-AACA
gi|28968                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                             AGTC-AA-----ATGGATA-GAGTGTTGGCTGCTAATGCCTGAGGTTGTGGG-TTTAA-T--CCCCAGCTCGATCAGAT-GCCTC-TC--A--TAA-AACA
gi|28971                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                           gaAGTC-TA-----ATGGATA-GAGTATTGGCCGCTCACGCCAGAGGTTGCGGG-TTCGA-T--CCCCAGCTCGACCCGAT-GCCTC-TC--A--TAA-AACA
gi|28972                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                             AGTC-AA-----ATTGATA-GAATGTTGGCTGCTCATGCCGGAGGTTGCAGG-TTTGA-T--CCCCAGCTCGA--TGAT-GCCTC-TC--A--TAACAACA
gi|28974                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                             AGTC-TA-----ATTGATA-TAGTGTTGGCCGCTCACGCCAGAAGTTGTGGG-TTCGA-T--CCCCAGCTCGACCCGAC-GCCTC-TC--A--TAA-AACA
gi|28989                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   A-----ATGGATA-GAGTGTTGGCCACTCTTGCTAGAGGTTGCGGG-TTTAA-T--CCTCAGCTTGGCTCGAT-GCCTC-TC--A--TAA-TACA
gi|28991                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  aA-----ATGGATA-GAATGTTTGCCGCTCATGCCAGAGGTTGCGAG-TTCGA-T--CCCCAGCTCGACCCGAT-GCCTC-TC--A--TAA-AACA
gi|28993                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   A-----ATGGAAA-CAGTGTTGGCCGCTCACGCCTGAGATTGCGGG-TTCAA-T--CCCCCGATCGACCCGAT-GCCTC-TC--A--TAA-AACA
gi|28994                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   A-----ATGAAGA-GAGTGTTGGCTGCTCACGCCTGAGGTTACTGG-TTCGA-T--CTCCAGCTCTACCCGAT-GCCTC-TC--A--TAA-AACA
gi|29017                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    -----ATAGATA-GAGTGTTGGCTGCTCACGCCAGAGGTTGCAGG-TTCGA-T--CCCCCCCTCGACCTGAT-GCCTC-TC--A--TAA-AACA
1 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|28699 ): ATTTAATGTATTTAAGTGTTTTCATTTTATTTTTAATTGATATTCTTTATCTTACAACGGTTACCCTAAATACTATAACAACACATTATTTCTTTTAAACAATTGCAAAGTATTCTCAGTGACATTCCTGTCATTCTTTTTAAACTTTATTTATAAGAATTGATTATAACAGTTAAACTTACATAACCGTTGTGCTCATCAGCAAAATATAAACACAATGACAGGAGCTGAAAACACATAAATTACAAAATTGGAAACCAAATT






Alignments
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                                                                                                         22  2 11 0   0  0       0  11111       0                                0     0 11                 0     0  00 00   0    
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                                                                                                         ..  . .. .   .  .       .  .....       .                                .     . ..                 .     .  .. ..   .    
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                                                                                                         11  6 55 5   4  4       4  00000       4                                4     8 00                 4     4  66 66   8    
consensus                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                    TGGTAT-AA-G--C-GGG-GC-GGTAGTC-TA-----ATGGATA-GAGTGTTGGCCGCTCACGCCAGAGGTTGCGGG-TTCGA-T--CCCCAGCTCGACCCGAT-GCCTC-TC--A--TAA-AACA
Reference ( family-115 )      :                                                                                                                                                                                                                                                                                    TGGTAT-AA-G--C-GGG-GC-GGTAGTC-TA-----ATGGATA-GAGTGTTGGCCGCTCACGCCAGAGGTTGCGGG-TTCGA-T--CCCCAGCTCGACCCGAT-GCCTC-TC--A--TAA-AACA
gi|28695                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                    TGGTAG-AATG--T-GGG-GC-GGAAGTC-AA-----ATGGATA-GAATGTTGGCTGCTCATGCATGAGGTTGCGGG-TTTAA-T--CCCCAGCTCGATCAGAT-GCCTC-TC--A--TAA-AACA
gi|28696                      :      atttaatgtatttaagtgtattcatttcatttttaatggatattctttatcttacaatggttaccctaaataataacacattatttcttttaaacaattgtaaagtattctcagtgactatcctgtcattctttataaactctatttataagaatttattttaacaattaaactaccattatagttgtgttcatcagaaaaaaaataaacacaatgacaggctctgaaaacataaattacaatggatacaattaaacaattttcaaagatTGGTAG-AATG--T-GGG-GC-GGAAGTC-AA-----ATGGATA-GAGTGTTGGCTGCTCATGCATGAGGTTGCGGG-TTTAA-T--CCCCAGCTCGATCAGAT-GCCTC-TC--A--TAA-AACA
gi|28697                      :      atttaatgtatttaagtgtattcatttcatttttaatggatattctttaaattacaatggttaccctaaataataacacattatttcttttaaacaattgtaaagtattctcagtgactcttatgtcattctttttaaactctatttataagaatttattttaacaattaaactaccattatagttgtgctcatcagaaaaaaaaccaacacaatgacaggatctgaaaacataaattacaatggatacaattaaaccattttcaaagatTGGCAG-AATG--T-GGG-GC-AGAAGTC-AA-----ATGGATA-GAGTGTTGGCTGCTCATGCCTGAGGTTGCGGG-TTAAA-T--CCCCAGCTCGATCAGAT-GCCTC-TT--A--TAA-AACA
gi|28698                      :       atttaatgtatttaagtgtattcattttattattaatggatattctttatcttacaatggttaccctaaataataacacattatttcttttaaacaattgtaaagtattctcagtgacaatcctgtcattctttttaaactctatttataacaatttattataacagttaaacttacattatagttgtgctcataagcaaaaaataaacacaatgacaggagctgaaaacataaattacaatggatacaattaaaccattttcaaagatTGGTAG-AATG--T-GGG-GC-AGAAGTC-AA-----ATGGATA-G--TGTTGGCTGCTCATGCCTGAGGTTGCGGG-TTCAA-T--CCCCAG-TTGACCAGAT-GCCCC-AT--A--TAA-AACA
gi|28704                      : atttaatgtatttaagtgtattcatttttttattttatttttaatggatattctttatcttacaatggttaccctaaataataacacattatttcttttaaacaattgtaaaagtattctcagtgacaatcctgtctttctttttaaactctatttataagaatttattataacagttaaacttacattatagttgtgctcatcagcaaaaaataaacacaatgacaggagctgaaaacataaattacaatggatacaattaaaccattttcaaagatTAC-AG-A--C-GGG-GC-GGTAGTG-TA-----ATGGATA-GAGTGTTGG-CGCTCATGTCTGGGGTTCCGGG-TTCGA-TCCCCCCAGCTTGACCCTAT-GCCTC-TC--A--TAA-AACA
gi|28706                      :                                                                                                                                                                                                          gtgtcattgataaaaacaataaagataataaaaagttcaagcagaaataagtgatataattttaccaaattttcaaGTATCAA-G--C-GCG-GA-GGTAGTC-AA-----ATTGATA-GAATGTCGGCTGCTCATGCCAGAGGTTGCAGG-TTTGA-T--CCCCAGCTCGA--TGAT-GCCTC-TC--A--TAACAACA
gi|28707                      :                                                                                                                                                                                                                   aaaacaatacaggaactgattctcagatatatatagtttagactgctaccagtgataactggcaaatatAT-AA-GTGC-GGT-GC-GGTTATG-TA-----ATGGATA-GAGTGCTGGCCGCTCACGCCAGAGGTTGCGGG-TTCGA-T--CCCCAGCTCGGTCCGAA-GTCTC-TC--A--TAA-AACA
gi|28708                      :                                                                                                                                                                                                                                  gggttgaaaacgaaaaatgttagaatgttgacgaaatatttatttttttaacaaaa-AA-G--T-GGG-GC-AGTAGTC-TAGTTTAATGGATAAGAGTGCTGGCTGCTCATGCCAGAGAATGCGGG-TTTGA-T--CCCCGGTTCGACCCGAT-GCCTC-TC--A--TAA-AACA
gi|28711                      :                                                                                                                                                                                                                                         agctgacaaaagtacagattaatgtagatactgccaaacaattttcTAC-AA-T--C-GGG-GC-GGTAGTC-TT-----ATGGATA-GAGTGTTGGCCGGTGACGCTAGAGGTTGCAGG-TTCGA-T--CCCCAGCTCTACCCGAT-GCCTC-TC--A---AA-AACA
gi|28714                      :                                                                                                                                                                                                                          tgaaaacagatagctaaattaacggctaacacttattgattataaatatttacagccaaattAT-AA----C-GGG-GC-GGTAGTG-CA-----ATGGATA-GAGTGTTGGCCGCTCAAGCCAGAGGTTGCGGG-TTCGA-T--CCCCAGCTCGACCCGAT-GCCTC-TC--A--TAA-AGCA
gi|28724                      :                                                                                                                                                                                                                                          aaacacgataagttacatcttaaaatacaatgagacagttccaaaTAC-AA-G--C-GGG-GC-GGTAGTC-TA-----ATGCATA-GAGTGTTTGCCGTTCATGCCAGAGGTTGCTGG-TTTGA-T--CCCCAGCTCGACCCGAT-GCCTC-TC--A--TAA-AACA
gi|28730                      :                                                                                                                                                                                                                                               attgccaaaaggatatctatttaaacatgtaaccattaGGTAT----G--C-GGG-GC-GGTAGTC-TA-----ATTGATA-GAGTGTTGGCCGCTTACGCCAAAAGTTGCAGG-TTCGA-T--CCCCAGCTTGATCCGAT-GCCTC-TC--A--TAG-AACA
gi|28734                      :                                                                                                                                                                                                                                                       aatgagacacaagtcgaatcttgaaagttgaGTTT-AA-G--C-GGG-GT-GGTAGTC-TA-----ATAGATA-GAGTGTTGGCCGCTCAAGCCAGAGGTTACGGG-TTCGA-T--CCCAAGCTCGACCCGAT-GCCTT-TC--A--TAA-AACA
gi|28741                      :                                                                                                                                                                                                                                                 ggatacaatttacctatagaaccatgactcagcagttttAT-AA-G--C-AGT-GT-GGTAGTC-CA-----ATGGATA-GAGTGTTGGCCGCTCTCGCCAGAGGTTGCGGG-TTCAA-T--CCCCTGGTCGACCAGGT-GCCTT-TC--A--TA
gi|28742                      :                                                                                                                                                                                                                                                                         ataattaaatccaaaAT-AA-G--C-AGT-GT-GGTAGTC-CA-----ATGGATA-GAGTGTTGGCCGCTCTCGCCAGAGGTTGCGGG-TTCAA-T--CCCCTGGTCGACCAGGT-GCCTT-TC--A--TA
gi|28745                      :                                                                                                                                                                                                                                                                           ataattaaatccaaa-AA-G--C-GGG-GC-GGTAGTC-TA-----ATGGATA-GAGTGTTGGCCGCTCACGGTAGGGGTTGTGGG-TTCGG-T--CCCCCGGTCGACCCGAT-GCCTC-TC--A--TAA-AACA
gi|28747                      :                                                                                                                                                                                                                                                            catttaagaccataagagtgtaaaTGGTGTTAA-G----GGG-GC-GGTAGTG-TA-----ATGGATA-GAGTGTTGGCCGCTCACGCCAGAGGTTGTGGG-TTCGA-T--CCCCAGCTCGACCTGAT-GCCTC-TC--A--TAA-AATA
gi|28748                      :                                                                                                                                                                                                                                                                            ttaacatttctaaagcaatgac-GGG-GC-AGTAGTG-TA-----ATGGATA-GAGCATTGGTCGCTCATGCAAGAGGTTGCAGG-TTCGA-T--CCCCAGCTTGACCCGAT-GCCTC-TC--A--TAA-AACA
gi|28749                      :                                                                                                                                                                                                                                                            ttaacagtttaaaacaatgaaataatacag-AA-G--C-GGG-GT-GCTAGTC-TA-----ATGGGTG-GAGTGTTGGTCGCTCATGCCAGAGATTGAGAG-TTCGA-T--CCGCAGCTCGACCCAAT-GCCTC-TC--A--TAA-AA
gi|28757                      :                                                                                                                                                                                                                                                                 ttagacctctttcaagtggtaaaaT-AA-G--CTGGA-GA-GATAGTG-TA-----ATGAATA-GAGTGTTTGCTGCTCACGCAAGAGGTTGCGGA-TTCCA-T--CCCCAACTCGACCCTAT-GCCTC-TC--A--TAA-AACA
gi|28759                      :                                                                                                                                                                                                                                                                     cattttcatgctaagctcgat-AA-G--C-GGG-GC-AGTAGTC-TA-----ATGGATA-GAGTATTGACCGCTCACGCCAGAGGTTGCGGG-TTTGA-T---CCCACCTCGGCCCGAT-GCCTCTTC--A--TAA-AACA
gi|28765                      :                                                                                                                                                                                                                                                                  attttcaaagacgaattctacaAT-AA-G--C-GGG-GC-GGTAGTC-TA-----GTGGAAA-GAGTGTTGGCCGCTCACGCAAGAGGCTGTGGG-TTCGA-T--CCCGAGCTCGACCCGAT-GCCTC-TC--A--TAA-AACA
gi|28766                      :                                                                                                                                                                                                                                                                 ttttcgcgaagataatgtagccata-AA-G--C-GGG-GC-AGTAGTA-TA-----ATGGATA-G--TGTTGGCTGCTCATGCTAAGGGTTACAGG-TTTGA-T--CCCCCGATTGACCCGAT-GCCTC-TC--A--TAA-AACA
gi|28773                      :                                                                                                                                                                                                                                                                         ttctcaaattgaaaaAT-AA-G--C-GGG-GC-AATAGTG-TA-----ATCGATA-GAGTGTTGGCCGCTCACGTGAAATGTTGCGGG-TTCGA-T--CCCCAGCTCGACCCGAT-TTCTC-TC--A--TAA-AACA
gi|28774                      :                                                                                                                                                                                                                                                                           ttcaatggagGGTTT-AA-GG-T-GGG-GC-GGTAGTC-TA-----ATGGATA-GAGTGTTGGCTGCTCATGCCAGAGGTTGCGGG-TTCGA-T--CCCCAGCTCGACCCGAT-GCCTC-TC--A--TAT-AACA
gi|28775                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                   tcaaattggtatctg-GGG-GT-GGTAGTC-TA-----ATGGATA-GAGGGTTGGCCGCTCACGCCAGAGGCTACGGG-TTCGA-T--CCCGAGCTCGACCCGAT-GCCTC-TC--A--TAA-AACA
gi|28776                      :                                                                                                                                                                                                                                                                        tcaaaagttaatgcgTAA-AA-G--T-GGG-GTTGGTAGTC-AA-----ATGGACA-GAGTGTTGGCCACTCACGCTAGAGGTTGCTGG-TTTGA-T--TCCCATCTTGACCTGAT-GCCTC-TT--A--TAA-AGCA
gi|28777                      :                                                                                                                                                                                                                                                                             ttaaagaaattat-AG-G--C-GGG-GC-GGTAGTC-TA-----ATGGATA-GAGTGTTGGCCGTTCACGCCAGAGGTAGCGGG-TTCGA-T--TCCCCGGTCAACCCGAT-GCCTC-TC--A--TAA-AACA
gi|28779                      :                                                                                                                                                                                                                                                                    tcaatgatcgcaagagccgTAT-AA-G--------GC-AGAAATCACA-----TTGGATA-GAGTGTTGACCATTCATGTAAGAGGTTGCAGG-TTTGA-T--CCCAAGCTCAAACTGATGGCCTC-TC--A---AA-AATA
gi|28780                      :                                                                                                                                                                                                                                                                caaaaaatggtagatgttcaTGATA--AA-G--T-GGG-GC-GGTAGTC-TA-----ATGGATA-GAGTGTTGGCCGCTCACGCCAGAAGTTGCGGG-TTCGA-T--CCCAAACTCGACCCGAT-GCCTC-TT--T--TAA-AACA
gi|28782                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                  aaagatAC-AA-G--C-GGA-GC-GGCAGTT-TA-----ATGGATA-GAGTGTTGACCGCTCACGCCAGAGGTTGCGGA-TTCGA-T--CCCCAGTTCGACCTGCT-GCCTC-TC--A--TAA-AACA
gi|28784                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                           aagatta-GGG-GT-GGTAGTG-TA-----ATGAATA-GAGTGTTGGCTGCTCACACCAGAGGTTGCGGG-TTCGA-T--CCCCAGCTCGACACTAT-GCCTC-TC--A--TAA-AACA
gi|28786                      :                                                                                                                                                                                                                                                                         aaattaggtaaagtatg-AA-G--C-GGG-GC-GGTAGTC-TA-----ATGGATA-GAGTGCTTGCCGCTCACGCCAGAGGTTGCGGG-TTCGA-T--TCCCAGCTCGACCCGAT-GCCTC-TC--A--TTA-AACA
gi|28790                      :                                                                                                                                                                                                                                                                             attgatgTAGTAT-AA-G--C-GGG-GC-GGTAGTG-TA-----ATGGATA-GAGTGTTGGCCGCTCATGCCAGAGGTTGCGGG-TTCGA-T--CCCCAGCTTGACCCGAT-GCCTC-TC--A--TAA-AACA
gi|28791                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                         T-AA-G--C-AGG-GT-GGTAGTG-TA-----ATGGATA-GAGTGTTGGCAACTCACGCCAGAGGTTGCGGG-TTCGA-T--CCCCAGCTCGACCCGAT-GCTTC-TC--A--TAA-AAC
gi|28799                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                    tggtgaattAGTC-TA-----ATGGATA-GAGTGTTGGCCGCTCACGCCAAAGGTTGCGGG-TTCGA-T--CCCTCGGTTGACCCGAT-GCCTC-TC--A--TAA-AACA
gi|28810                      :                                                                                                                                                                                                                                                                              tataatgtaagcgta-G--C-AGG-GC-GGTAATC-TA-----ATGGATA-GAGTGTTGGCTGCTCACGCCAGAGATTGCGGG-TTCGATT--CCCCAG-TTGACCCAAT-GCCTC-TC--A--TAA-AACA
gi|28811                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                               agaccGG-TC-AGTAGTA-GA-----ATGGATA-GAGTGTTGGCCGCTCACGCCAGAAGTTGCGGG-TTCGA-T--CCCAAGCTCGGCCTGAT-GCCTC-CC--A--TAC-AACA
gi|28813                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                     agaat-AA-G--C-GGG-GC-AGTAATG-TA-----ATGAATA-GAGTATTGGCCGCTCACGCCAGAGGTTGCGGG-TTCGA-T--CCCCCGATTGACCTAAT-GCCTC-TC--A--TAA-AACA
gi|28818                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                       aaa-AA-G--C-GGG-GC-GGTAGTC-TA-----ATGGATA-GAGTGTTGGCCGCTCACGCCAGAGGTTGCGGGTTTCGA-T--CCCCAGCTCGACCCGAT-GCCTC-TC--A--TAA-AACA
gi|28819                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                         g-AA-G--C-AGG-GC-GGTGGTC-TA-----ATGGATA-GAGTGTTGGCTGCTCACGCCAGAGGTTGCGGG-TTCGA-T--CCCCAGCTCGATCCGAT-GCCTC-TC--A--TTA-AACA
gi|28820                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                         g-AA-G--C-GGG-AT-GGTAGTC-T--------GGATA-GAGTGTTGGCCGCTCACGCCAGAAGTTGCGGG-TTCGA-T--CCCCCGGTCGACCCGAT-GCCTC-TC--A--TAA-AACA
gi|28823                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                        ga-AA-G--C-GGG-GT-GGTAGTC-TA-----ATGGATA-GAGTGTTGGCCGCTCACGCGAGAAGTTGCGGG-TTCGA-T--CCCCAGCTCGACCCGAT-GCCTC-TC--A--TAA-AACA
gi|28824                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                         a-AA-G--T-GGG-GC-GGTAATC-TA-----ATGGATA-GAGTGTTGGCCGCTCATGCCAGAGGTTGCGGG-TTTGA-T--CCTAAGCTGGACCCAAT-GCCTC-TC--A--TAA-AACA
gi|28825                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                         a-AA-G--C-GGGTGC-GGTAGTT-TA-----ATGGATA-GAGTGTTGGCCGCTCACAGCAGAGGTTGCGGG-TTCGA-T--CCCCAGCTCGACCCGAT-GCCTC-TC--A--TAA-AAC
gi|28826                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                            a-G--T-GGG-GC-TGTAGTC-TA-----ATGGATA-AAGTGTTGGCCACTCACACCAGAGATTGCGGG-TTTGA-T--CCCCAACTCTACCCGAT-GCCTC-TC--A--TAA-AACA
gi|28827                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                       aat-AA-G--T-GGG-GC-GGTAATC-TA-----ACGGAAA-GAGTGTTGGCCGCTCATGCCAGAGGTTGCGGG-TTCGA-T--CCCCAGCTTGACCCGAT-GCCTC-TC--A--TAA-AA
gi|28829                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                         a-AA-G--C-GGG-GC-GGTAGTC-TA-----ATGGATA-AAGTGTTGGCCGCTCACGCCAGAGGTTATGGG-TTCGA-T--TCCCAGCTCGACCCGAT-ACCTC-TC--A--TAA-AACA
gi|28830                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                         a-AA-G--C-GGG-GC-GGTAGTC-TA-----ATGGATA-GAGTGTTGACTGCTCACGCCAGAGGTTGCGGG-TTAAA-T--CCCCCGGTCAACCCCAT-TCCTC-TC--A--TAA-AACA
gi|28831                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                         a-AA-G--C-GGG-GC-GGCAGTC-TC-----ATGGATA-GAGTGTTGGCCGCTCACGCAAAAGGTTACGGG-TTCGA-T--TCCCTGGTTGACCCGAT-GCCTC-TC--A--TAA-AACA
gi|28832                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                         a-AG-G--T-GGG-GC-GGTATTG-TA-----ATGGATA-GAGTGTTGGTCGCTCACGCCAGATGTTGTGGG-TTCGA-T--CCCCAGCTTGACCAAAT-GCCTC-TC------AA-AACA
gi|28842                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                            a-G--T-GAG-GC-GGCTGTC-TA-----ATGGATA-GAATGTTGGCCGCTCATGTTAGAGGTTGTGGG-TTTGA-T--CCCCAGCTTGACCCGAT-GCCTC-TC--A--TAA-AACA
gi|28844                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                           at-G--C-GGG-GC-GGTAGTC-TA-----ATGGATA-GAGTGTTGGCCGCTCACGCCAGAGGTTGCGGG-GTCGA-T--CCCCATCTCGACCCGAT-GCCTC-TC--A--TAA-AACA
gi|28846                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                            t-G--T-GGG-GC-GGGTGTC-TA-----ATGGACA-GAGTGTTGGCCACTCACACCAGAGGTAGCTGG-TTCAA-T--CCCCAGCTCGACCCGAT-GCCTC-TC--A--TAA-AACA
gi|28849                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                            t-G--C-GGG-GC-GGTAGTC-TA-----ATGGATA-GAGTGTTGGCCGCTCACGCCAGAGGTTGCGGG-TTCAA-T--CCCCAGCTCGACCCGAT-GCCTC-TC--A--TTA-AACA
gi|28850                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                             -G--C-GGG-GC-GGTAGTC-TA-----ATGGATA-GAGTGTTGGCCGCTCATGCCAGAGGTTGCGGG-TTCGA-T--CCCCAGCTCGGCCCGAT-GCCTC-TC--A--TAA-ATCA
gi|28851                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                             -G--C-GGG-GC-GGCAGTA-TA-----ATGGATA-AAGTGTTGGTCGCTCACGCCAGAGGTTGCGGG-TTCGA-T--CCCCAGCTCGACCTGAT-GCCTC-TC--A--TAA-AACA
gi|28852                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                             -G--C-GGG-GC-GGTAGTC-TA-----ATGGATA-GAGTGTTGGCCGCTCACGCCAGAGGTTGCAGG-TTCGA-T--CCCCTGGTCGACCGGAT-GCCTC-TC--A--TAA-AACA
gi|28853                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                             -G--C-GGG-GC-ATTAGTC-TT-----ATGGATA-GAGTGTTGGCCGCTCACGCCAGAGGTTGCGGG-TTCGA-T--CCCGAGCTCGACCCGAT-GCCTC-TC--A--TAA-AACA
gi|28854                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                             -G--C-GGG-GC-GGTAGTC-TA-----ATGGATA-AAGTGTTGGCCGCTCACGCCAGAGGTTGCCGG-TTCGA-T--CCCCAACTCGACCCGAT-GCTTC-TC--A--TAA-AACA
gi|28855                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                             -G--C-GGG-GC-GGTAGGC-TA-----GTGGATA-GAGTGTTGACCGCTCACGCCAGAGGTTACGGG-TTCGA-T--CCCCAGCTCGACCCGAT-GCCTC-TC--A--TAA-AA
gi|28856                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                             -G--C-GGG-GC-GGTAGTC-TT-----ATGGATA-GAGTGTTGGCCGCTCACACCAGAGGTTGCGGG-TTCGA-T--CCCCAGGTCGACCCGAT-GCCTC-TG--A--TAA-AACA
gi|28859                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                             -G--C-GGG-GC-GGTAGTC-TA-----ATGGATA-GAGTGTTGGCCGCTCACGCCAGAGGTTGCGGG-TTCTA-TC-CCCCAG-TCGACCCGAA-GCCTC-TC--A--TAA-AACA
gi|28861                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                             -G--C-GGG-GC-AGAAGTC-TA-----ATGGATA-GAGTGTTGGCCGCTCTCGCCAGAGATTGCCGG-TTCGA-T--CCCTTG-TTGACCCGAT-GCCTC-TC--A--TAA-AACA
gi|28862                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                             -G--C-GGG-AT-GGTAGTC-TA-----ATGGATA-G--TGTTGGCTGCTCACACCAGAGGTTGCGAG-TTTGA-T--CCCCAGCTAGACCCGAT-GCCTT-TC--A--TAA-AACA
gi|28863                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                             -G--T-GGG-GC-GGTGGTC-TA-----ATGAATG-GAGTGTTGGCTGCTCATGCCAGAGGTTGCGAG-TTCGA-T---CCCAAATTGACCCGAT-GCCTC-TC--A--TAA-AA
gi|28864                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                             -G--C-GGG-GC-GGTAGTG-AA-----ATGGATA-GAGTGTTGGCCGCTCACGCCAGAGGTTGGGGG-TTCGA-T--TCCATGATCGACCCAAT-GCCTC-TC--A--TAA-AACA
gi|28886                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                     G-GC-GGTAATC-TA-----ATGTATA-GAGTGTTGGCCGCTCAAGCCAGAGGTTGCGGA-TTTGA-T--CATCAGCTCGACCCGAT-GCCTC-TC--A--TAA-AACA
gi|28891                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                              tggt-GGG-GC-GGTAGGC-TA-----ATGGATA-GAGTGTTGGCCGCTCATGCCAGAGGTTGTGGG-TTCAA-T--CCCCTGGTCAACCAAAT-GCCTC-TC--A--TAA-AACA
gi|28892                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                  -GGG-GC-CGTAGTG-TA-----ATGGATA-GAGTGTTGGCCACTCACGCCAGACGTTGCCGG-TTTAA-T--CCCCAGCTCGACCTGAT-GCCTC-TC--A--TAA-AACA
gi|28893                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                  -GGG-AC-AGTAGTG-TA-----ATGGATA-TAGTGTTGGCCGTCCATGCCAGAGGTTACGGG-TTCTA-T--CCCCAGCTCGACCTGAT-GCCTC-TC--A--TAA-AACA
gi|28896                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                  -GGG-GT-GGTAGTC-TA-----ATGGATA-GAGTGTTGGCCGTTCACGCCAGAGGTTGCGGG-TTCAA-T--TCCAAGTTCGACCTTAT-GCCTC-TC--A--TAA-AACA
gi|28897                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                  -GGG-GC-GATAATC-TT-----ATGGATA-GAGTGTTGGCCGCTCAAGCCAGAGGTTGTGGG-ATTGA-T--CCCCAGCTCGACCCGAT-GCCTC-TC--A--TAA-AAC
gi|28898                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                  -GGG-GT-GGTAGTA-TA-----ATGGATA-GAGTGTTGGCCGATCATGCCAGAGGTTGTGGG-TTCGA-T--CCCCAGCTCGA-CCGAC-GTCTC-TC--A--TAA-AACA
gi|28899                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                  -GGG-GC-GGTAGTG-AA-----ATAGTTA-GAGTGTTGGTCGTTCATGCCAGTGGTTACGAG-TTTAA-T--CTCCAGCTCGACTCGAT-GCCTC-TC--A--TAA-AACA
gi|28900                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                  -GGG-GC-GGTAGTG-TA-----ATGGATA-GATTGTTGGCTGCTCATGCCAGAGGTTGTGGG-TTCGA-T--CCCCTGATTGACCTAAT-GCCTC-TC--A--TAA-AACA
gi|28901                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                  -GGG-AC-GGTAGTG-TA-----GTGGATA-AAGTGTTGGCTGCTCATGCCAGAGGTTACGGG-TTTGA-T--TCCCAACTCAATCTGAT-ACCTC-TCCGA--TAA-AACA
gi|28902                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                  -GGG-GC-GGTATTG-TA-----ATGGATA-GAGTGTTGGCCGCTCACGCCAGAGGTTGCGGC-TTCGA-T--CCCCCGGTCGACCCGAT-GCCTC-TC--A--TAA-AACA
gi|28903                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                  -GGG-AC-AGTAGTG-AA-----ATGGATA-GTGTGTTAGCTGCTCACGCCAGAGGTTGCAGG-TTTGA-T--CCCCAACTCAACCTGTT-GCCAC-TC--A--CAA-AACA
gi|28926                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                    GG-GC-GGTAGTC-TA-----ATGGATA-GAGTGTTGGCCGCTCGCGCCAGAGGTTGCGGG-TTCGA-T--TCCCCGATCGACCAGAT-GCCTC-TC--A--TAA-AACA
gi|28927                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                    GG-GC-GGTAGTC-TA-----ATGGAGA-GACTGTTGGCCGCTCACGCCAGAGGTTGCGAG-TTCGA-T--CCCCAGCTCGACTCGAT-GCCTC-TC--A--TAA-AACA
gi|28928                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                    GG-GC-GGTAGTC-TA-----ATGGATA-GAGCGTTGGC-----A-GCCAGAGGTTGCGGG-TTCGA-T--CCCCAGCTCGACCCGAT-GCCTC-TC--A--CAA-AACA
gi|28929                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                    GG-GC-TGTAGTC-TA-----ATGGATA-ATGTGTTGGTCGCTAATGCCAGAGGTTGCGGG-TTCGA-T--CCCCAGCTTGAACTGAT-GCCTC-TC--A--TAA-AACA
gi|28930                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                    GG-GT-GGTAGTC-TA-----ATGGATA-GAGTGCTGGCCGCTCACGCCAGAGGTTGCGGG-TTCGA-T--CCCCCTGTCGACCCGGT-GCCTC-TC--A--TAA-AACA
gi|28931                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                    GG-GC-AGTAGTG-TA-----ATGGATA-GAGTGTTGGCCGCTCATGCCAGAGGTTGCGGG-TTCAATT--CCCCAA-TCAACCCGAT-GCCTC-TC--AGTTAA-CAC
gi|28946                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                     G-GC-GGAAGTC-TA-----ATGGATA-G--TGTTGGCCACTAATGCCAGAGGTTGGGGG-TTCAA-T--CCCCAGCTTGACCCGAT-GCCTC-TC--A--TAA-AACA
gi|28947                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                     G-GC-GGCAGTG-TA-----ACGGAAA-GAGTGTTGACCGATCACGCAAGAGGTTGCGGG-TTCGT-T--CCCCAGCTCGATCCGAT-GCCTC-TC--A--TAA-AACA
gi|28949                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                     G-GC-GGTAGTG-TG-----ATGGATA-GAGTGTTGGCCGCTCACACCAGAGGTTGCAGG-TTCGA-T--CCCCAGCTTGACGCGAT-GCCTC-TC--A--TAA-AACA
gi|28950                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                     G-GC-AGTAGTG-TT-----ATGAATA-CAGTGTCGGCCGCTCATGCCAGAGGTTACAGG-TTCAA-T--ACCCAGCTCGACCCGAT-GCCTC-TC--A--TAA-AACA
gi|28952                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                     G-GC-GGAAGTG-TA-----ATGGGTA-GTGTGTTTGCCGCTCACGCCAGAGGTTACAGT-TTCGA-T--CCCCTGCTCGACCAGAT-GCCTC-TC--A--TAA-AACA
gi|28968                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                             AGTC-AA-----ATGGATA-GAGTGTTGGCTGCTAATGCCTGAGGTTGTGGG-TTTAA-T--CCCCAGCTCGATCAGAT-GCCTC-TC--A--TAA-AACA
gi|28971                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                           gaAGTC-TA-----ATGGATA-GAGTATTGGCCGCTCACGCCAGAGGTTGCGGG-TTCGA-T--CCCCAGCTCGACCCGAT-GCCTC-TC--A--TAA-AACA
gi|28972                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                             AGTC-AA-----ATTGATA-GAATGTTGGCTGCTCATGCCGGAGGTTGCAGG-TTTGA-T--CCCCAGCTCGA--TGAT-GCCTC-TC--A--TAACAACA
gi|28974                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                             AGTC-TA-----ATTGATA-TAGTGTTGGCCGCTCACGCCAGAAGTTGTGGG-TTCGA-T--CCCCAGCTCGACCCGAC-GCCTC-TC--A--TAA-AACA
gi|28989                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   A-----ATGGATA-GAGTGTTGGCCACTCTTGCTAGAGGTTGCGGG-TTTAA-T--CCTCAGCTTGGCTCGAT-GCCTC-TC--A--TAA-TACA
gi|28991                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  aA-----ATGGATA-GAATGTTTGCCGCTCATGCCAGAGGTTGCGAG-TTCGA-T--CCCCAGCTCGACCCGAT-GCCTC-TC--A--TAA-AACA
gi|28993                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   A-----ATGGAAA-CAGTGTTGGCCGCTCACGCCTGAGATTGCGGG-TTCAA-T--CCCCCGATCGACCCGAT-GCCTC-TC--A--TAA-AACA
gi|28994                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   A-----ATGAAGA-GAGTGTTGGCTGCTCACGCCTGAGGTTACTGG-TTCGA-T--CTCCAGCTCTACCCGAT-GCCTC-TC--A--TAA-AACA
gi|29017                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    -----ATAGATA-GAGTGTTGGCTGCTCACGCCAGAGGTTGCAGG-TTCGA-T--CCCCCCCTCGACCTGAT-GCCTC-TC--A--TAA-AACA


blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                         TC  T TG                   GTTTA
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                         TT  T G                    .    
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                         G   T .                    .    
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                         G   . .                    .    
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                         G   . .                    .    
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                         C   . .                    .    
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                         T   . .                    .    
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                         C   . .                    .    
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                         T   . .                    .    
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                         C   . .                    .    
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                         T   . .                    .    
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                         T   . .                    .    
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                         T   . .                    .    
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                         T   . .                    .    
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                         T   . .                    .    
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                         T   . .                    .    
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                         T   . .                    .    
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                         T   . .                    .    
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                         A   . .                    .    
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                         T   . .                    .    
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                         C   . .                    .    
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                         T   . .                    .    
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                         T   . .                    .    
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                         .   . .                    .    
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                             . .                    .    
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                             . .                    .    
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                             . .                    .    
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                             . .                    .    
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                             . .                    .    
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                             . .                    .    
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                             . .                    .    
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                             . .                    .    
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                             . .                    .    
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                             . .                    .    
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                             . .                    .    
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                             . .                    .    
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                             . .                    .    
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                             . .                    .    
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                             . .                    .    
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                             . .                    .    
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                             . .                    .    
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                             . .                    .    
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                             . .                    .    
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                             . .                    .    
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                             . .                    .    
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                             . .                    .    
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                             . .                    .    
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                             . .                    .    
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                             . .                    .    
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                             . .                    .    
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                             . .                    .    
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                             . .                    .    
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                             . .                    .    
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                             . .                    .    
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                             . .                    .    
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                             . .                    .    
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                             . .                    .    
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                             . .                    .    
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                             . .                    .    
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                             . .                    .    
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                             . .                    .    
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    .    
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    .    
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    .    
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    .    
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    .    
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    .    
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    .    
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    .    
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    .    
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    .    
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    .    
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    .    
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    .    
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    .    
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    .    
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    .    
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    .    
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    .    
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    .    
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    .    
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    .    
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    .    
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    .    
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    .    
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    .    
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    .    
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    .    
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    .    
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    .    
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    .    
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    .    
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    .    
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    .    
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    .    
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    .    
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    .    
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    .    


blockSeqCons                  :                                                                                                                                                                                                                                                                                    
originalCons                  :                                                                                                                                                                                                                                                                                    TGGTAT-AA-G--C-GGG-GC-GGTAGTC-TA-----ATGGATA-GAGTGTTGGCCGCTCACGCCAGAGGTTGCGGG-TTCGA-T--CCCCAGCTCGACCCGAT-GCCTC-TC--A--TAA-AACA
finalCons                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                    TGGTAT-AA-G--C-GGG-GC-GGTAGTC-TA-----ATGGATA-GAGTGTTGGCCGCTCACGCCAGAGGTTGCGGG-TTCGA-T--CCCCAGCTCGACCCGAT-GCCTC-TC--A--TAA-AACA
1 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|28699 ): ATTTAATGTATTTAAGTGTTTTCATTTTATTTTTAATTGATATTCTTTATCTTACAACGGTTACCCTAAATACTATAACAACACATTATTTCTTTTAAACAATTGCAAAGTATTCTCAGTGACATTCCTGTCATTCTTTTTAAACTTTATTTATAAGAATTGATTATAACAGTTAAACTTACATAACCGTTGTGCTCATCAGCAAAATATAAACACAATGACAGGAGCTGAAAACACATAAATTACAAAATTGGAAACCAAATT






Alignments
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                                                                                                         22  2 11 0   0  0       0  11111       0                                0     0 11                 0     0  00 00   0    
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                                                                                                         ..  . .. .   .  .       .  .....       .                                .     . ..                 .     .  .. ..   .    
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                                                                                                         11  6 55 5   4  4       4  00000       4                                4     8 00                 4     4  66 66   8    
consensus                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                    TGGTAT-AA-G--C-GGG-GC-GGTAGTC-TA-----ATGGATA-GAGTGTTGGCCGCTCACGCCAGAGGTTGCGGG-TTCGA-T--CCCCAGCTCGACCCGAT-GCCTC-TC--A--TAA-AACA
Reference ( family-115 )      :                                                                                                                                                                                                                                                                                    TGGTAT-AA-G--C-GGG-GC-GGTAGTC-TA-----ATGGATA-GAGTGTTGGCCGCTCACGCCAGAGGTTGCGGG-TTCGA-T--CCCCAGCTCGACCCGAT-GCCTC-TC--A--TAA-AACA
gi|28695                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                    TGGTAG-AATG--T-GGG-GC-GGAAGTC-AA-----ATGGATA-GAATGTTGGCTGCTCATGCATGAGGTTGCGGG-TTTAA-T--CCCCAGCTCGATCAGAT-GCCTC-TC--A--TAA-AACA
gi|28696                      :      atttaatgtatttaagtgtattcatttcatttttaatggatattctttatcttacaatggttaccctaaataataacacattatttcttttaaacaattgtaaagtattctcagtgactatcctgtcattctttataaactctatttataagaatttattttaacaattaaactaccattatagttgtgttcatcagaaaaaaaataaacacaatgacaggctctgaaaacataaattacaatggatacaattaaacaattttcaaagatTGGTAG-AATG--T-GGG-GC-GGAAGTC-AA-----ATGGATA-GAGTGTTGGCTGCTCATGCATGAGGTTGCGGG-TTTAA-T--CCCCAGCTCGATCAGAT-GCCTC-TC--A--TAA-AACA
gi|28697                      :      atttaatgtatttaagtgtattcatttcatttttaatggatattctttaaattacaatggttaccctaaataataacacattatttcttttaaacaattgtaaagtattctcagtgactcttatgtcattctttttaaactctatttataagaatttattttaacaattaaactaccattatagttgtgctcatcagaaaaaaaaccaacacaatgacaggatctgaaaacataaattacaatggatacaattaaaccattttcaaagatTGGCAG-AATG--T-GGG-GC-AGAAGTC-AA-----ATGGATA-GAGTGTTGGCTGCTCATGCCTGAGGTTGCGGG-TTAAA-T--CCCCAGCTCGATCAGAT-GCCTC-TT--A--TAA-AACA
gi|28698                      :       atttaatgtatttaagtgtattcattttattattaatggatattctttatcttacaatggttaccctaaataataacacattatttcttttaaacaattgtaaagtattctcagtgacaatcctgtcattctttttaaactctatttataacaatttattataacagttaaacttacattatagttgtgctcataagcaaaaaataaacacaatgacaggagctgaaaacataaattacaatggatacaattaaaccattttcaaagatTGGTAG-AATG--T-GGG-GC-AGAAGTC-AA-----ATGGATA-G--TGTTGGCTGCTCATGCCTGAGGTTGCGGG-TTCAA-T--CCCCAG-TTGACCAGAT-GCCCC-AT--A--TAA-AACA
gi|28704                      : atttaatgtatttaagtgtattcatttttttattttatttttaatggatattctttatcttacaatggttaccctaaataataacacattatttcttttaaacaattgtaaaagtattctcagtgacaatcctgtctttctttttaaactctatttataagaatttattataacagttaaacttacattatagttgtgctcatcagcaaaaaataaacacaatgacaggagctgaaaacataaattacaatggatacaattaaaccattttcaaagatTAC-AG-A--C-GGG-GC-GGTAGTG-TA-----ATGGATA-GAGTGTTGG-CGCTCATGTCTGGGGTTCCGGG-TTCGA-TCCCCCCAGCTTGACCCTAT-GCCTC-TC--A--TAA-AACA
gi|28706                      :                                                                                                                                                                                                          gtgtcattgataaaaacaataaagataataaaaagttcaagcagaaataagtgatataattttaccaaattttcaaGTATCAA-G--C-GCG-GA-GGTAGTC-AA-----ATTGATA-GAATGTCGGCTGCTCATGCCAGAGGTTGCAGG-TTTGA-T--CCCCAGCTCGA--TGAT-GCCTC-TC--A--TAACAACA
gi|28707                      :                                                                                                                                                                                                                   aaaacaatacaggaactgattctcagatatatatagtttagactgctaccagtgataactggcaaatatAT-AA-GTGC-GGT-GC-GGTTATG-TA-----ATGGATA-GAGTGCTGGCCGCTCACGCCAGAGGTTGCGGG-TTCGA-T--CCCCAGCTCGGTCCGAA-GTCTC-TC--A--TAA-AACA
gi|28708                      :                                                                                                                                                                                                                                  gggttgaaaacgaaaaatgttagaatgttgacgaaatatttatttttttaacaaaa-AA-G--T-GGG-GC-AGTAGTC-TAGTTTAATGGATAAGAGTGCTGGCTGCTCATGCCAGAGAATGCGGG-TTTGA-T--CCCCGGTTCGACCCGAT-GCCTC-TC--A--TAA-AACA
gi|28711                      :                                                                                                                                                                                                                                         agctgacaaaagtacagattaatgtagatactgccaaacaattttcTAC-AA-T--C-GGG-GC-GGTAGTC-TT-----ATGGATA-GAGTGTTGGCCGGTGACGCTAGAGGTTGCAGG-TTCGA-T--CCCCAGCTCTACCCGAT-GCCTC-TC--A---AA-AACA
gi|28714                      :                                                                                                                                                                                                                          tgaaaacagatagctaaattaacggctaacacttattgattataaatatttacagccaaattAT-AA----C-GGG-GC-GGTAGTG-CA-----ATGGATA-GAGTGTTGGCCGCTCAAGCCAGAGGTTGCGGG-TTCGA-T--CCCCAGCTCGACCCGAT-GCCTC-TC--A--TAA-AGCA
gi|28724                      :                                                                                                                                                                                                                                          aaacacgataagttacatcttaaaatacaatgagacagttccaaaTAC-AA-G--C-GGG-GC-GGTAGTC-TA-----ATGCATA-GAGTGTTTGCCGTTCATGCCAGAGGTTGCTGG-TTTGA-T--CCCCAGCTCGACCCGAT-GCCTC-TC--A--TAA-AACA
gi|28730                      :                                                                                                                                                                                                                                               attgccaaaaggatatctatttaaacatgtaaccattaGGTAT----G--C-GGG-GC-GGTAGTC-TA-----ATTGATA-GAGTGTTGGCCGCTTACGCCAAAAGTTGCAGG-TTCGA-T--CCCCAGCTTGATCCGAT-GCCTC-TC--A--TAG-AACA
gi|28734                      :                                                                                                                                                                                                                                                       aatgagacacaagtcgaatcttgaaagttgaGTTT-AA-G--C-GGG-GT-GGTAGTC-TA-----ATAGATA-GAGTGTTGGCCGCTCAAGCCAGAGGTTACGGG-TTCGA-T--CCCAAGCTCGACCCGAT-GCCTT-TC--A--TAA-AACA
gi|28741                      :                                                                                                                                                                                                                                                 ggatacaatttacctatagaaccatgactcagcagttttAT-AA-G--C-AGT-GT-GGTAGTC-CA-----ATGGATA-GAGTGTTGGCCGCTCTCGCCAGAGGTTGCGGG-TTCAA-T--CCCCTGGTCGACCAGGT-GCCTT-TC--A--TA
gi|28742                      :                                                                                                                                                                                                                                                                         ataattaaatccaaaAT-AA-G--C-AGT-GT-GGTAGTC-CA-----ATGGATA-GAGTGTTGGCCGCTCTCGCCAGAGGTTGCGGG-TTCAA-T--CCCCTGGTCGACCAGGT-GCCTT-TC--A--TA
gi|28745                      :                                                                                                                                                                                                                                                                           ataattaaatccaaa-AA-G--C-GGG-GC-GGTAGTC-TA-----ATGGATA-GAGTGTTGGCCGCTCACGGTAGGGGTTGTGGG-TTCGG-T--CCCCCGGTCGACCCGAT-GCCTC-TC--A--TAA-AACA
gi|28747                      :                                                                                                                                                                                                                                                            catttaagaccataagagtgtaaaTGGTGTTAA-G----GGG-GC-GGTAGTG-TA-----ATGGATA-GAGTGTTGGCCGCTCACGCCAGAGGTTGTGGG-TTCGA-T--CCCCAGCTCGACCTGAT-GCCTC-TC--A--TAA-AATA
gi|28748                      :                                                                                                                                                                                                                                                                            ttaacatttctaaagcaatgac-GGG-GC-AGTAGTG-TA-----ATGGATA-GAGCATTGGTCGCTCATGCAAGAGGTTGCAGG-TTCGA-T--CCCCAGCTTGACCCGAT-GCCTC-TC--A--TAA-AACA
gi|28749                      :                                                                                                                                                                                                                                                            ttaacagtttaaaacaatgaaataatacag-AA-G--C-GGG-GT-GCTAGTC-TA-----ATGGGTG-GAGTGTTGGTCGCTCATGCCAGAGATTGAGAG-TTCGA-T--CCGCAGCTCGACCCAAT-GCCTC-TC--A--TAA-AA
gi|28757                      :                                                                                                                                                                                                                                                                 ttagacctctttcaagtggtaaaaT-AA-G--CTGGA-GA-GATAGTG-TA-----ATGAATA-GAGTGTTTGCTGCTCACGCAAGAGGTTGCGGA-TTCCA-T--CCCCAACTCGACCCTAT-GCCTC-TC--A--TAA-AACA
gi|28759                      :                                                                                                                                                                                                                                                                     cattttcatgctaagctcgat-AA-G--C-GGG-GC-AGTAGTC-TA-----ATGGATA-GAGTATTGACCGCTCACGCCAGAGGTTGCGGG-TTTGA-T---CCCACCTCGGCCCGAT-GCCTCTTC--A--TAA-AACA
gi|28765                      :                                                                                                                                                                                                                                                                  attttcaaagacgaattctacaAT-AA-G--C-GGG-GC-GGTAGTC-TA-----GTGGAAA-GAGTGTTGGCCGCTCACGCAAGAGGCTGTGGG-TTCGA-T--CCCGAGCTCGACCCGAT-GCCTC-TC--A--TAA-AACA
gi|28766                      :                                                                                                                                                                                                                                                                 ttttcgcgaagataatgtagccata-AA-G--C-GGG-GC-AGTAGTA-TA-----ATGGATA-G--TGTTGGCTGCTCATGCTAAGGGTTACAGG-TTTGA-T--CCCCCGATTGACCCGAT-GCCTC-TC--A--TAA-AACA
gi|28773                      :                                                                                                                                                                                                                                                                         ttctcaaattgaaaaAT-AA-G--C-GGG-GC-AATAGTG-TA-----ATCGATA-GAGTGTTGGCCGCTCACGTGAAATGTTGCGGG-TTCGA-T--CCCCAGCTCGACCCGAT-TTCTC-TC--A--TAA-AACA
gi|28774                      :                                                                                                                                                                                                                                                                           ttcaatggagGGTTT-AA-GG-T-GGG-GC-GGTAGTC-TA-----ATGGATA-GAGTGTTGGCTGCTCATGCCAGAGGTTGCGGG-TTCGA-T--CCCCAGCTCGACCCGAT-GCCTC-TC--A--TAT-AACA
gi|28775                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                   tcaaattggtatctg-GGG-GT-GGTAGTC-TA-----ATGGATA-GAGGGTTGGCCGCTCACGCCAGAGGCTACGGG-TTCGA-T--CCCGAGCTCGACCCGAT-GCCTC-TC--A--TAA-AACA
gi|28776                      :                                                                                                                                                                                                                                                                        tcaaaagttaatgcgTAA-AA-G--T-GGG-GTTGGTAGTC-AA-----ATGGACA-GAGTGTTGGCCACTCACGCTAGAGGTTGCTGG-TTTGA-T--TCCCATCTTGACCTGAT-GCCTC-TT--A--TAA-AGCA
gi|28777                      :                                                                                                                                                                                                                                                                             ttaaagaaattat-AG-G--C-GGG-GC-GGTAGTC-TA-----ATGGATA-GAGTGTTGGCCGTTCACGCCAGAGGTAGCGGG-TTCGA-T--TCCCCGGTCAACCCGAT-GCCTC-TC--A--TAA-AACA
gi|28779                      :                                                                                                                                                                                                                                                                    tcaatgatcgcaagagccgTAT-AA-G--------GC-AGAAATCACA-----TTGGATA-GAGTGTTGACCATTCATGTAAGAGGTTGCAGG-TTTGA-T--CCCAAGCTCAAACTGATGGCCTC-TC--A---AA-AATA
gi|28780                      :                                                                                                                                                                                                                                                                caaaaaatggtagatgttcaTGATA--AA-G--T-GGG-GC-GGTAGTC-TA-----ATGGATA-GAGTGTTGGCCGCTCACGCCAGAAGTTGCGGG-TTCGA-T--CCCAAACTCGACCCGAT-GCCTC-TT--T--TAA-AACA
gi|28782                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                  aaagatAC-AA-G--C-GGA-GC-GGCAGTT-TA-----ATGGATA-GAGTGTTGACCGCTCACGCCAGAGGTTGCGGA-TTCGA-T--CCCCAGTTCGACCTGCT-GCCTC-TC--A--TAA-AACA
gi|28784                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                           aagatta-GGG-GT-GGTAGTG-TA-----ATGAATA-GAGTGTTGGCTGCTCACACCAGAGGTTGCGGG-TTCGA-T--CCCCAGCTCGACACTAT-GCCTC-TC--A--TAA-AACA
gi|28786                      :                                                                                                                                                                                                                                                                         aaattaggtaaagtatg-AA-G--C-GGG-GC-GGTAGTC-TA-----ATGGATA-GAGTGCTTGCCGCTCACGCCAGAGGTTGCGGG-TTCGA-T--TCCCAGCTCGACCCGAT-GCCTC-TC--A--TTA-AACA
gi|28790                      :                                                                                                                                                                                                                                                                             attgatgTAGTAT-AA-G--C-GGG-GC-GGTAGTG-TA-----ATGGATA-GAGTGTTGGCCGCTCATGCCAGAGGTTGCGGG-TTCGA-T--CCCCAGCTTGACCCGAT-GCCTC-TC--A--TAA-AACA
gi|28791                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                         T-AA-G--C-AGG-GT-GGTAGTG-TA-----ATGGATA-GAGTGTTGGCAACTCACGCCAGAGGTTGCGGG-TTCGA-T--CCCCAGCTCGACCCGAT-GCTTC-TC--A--TAA-AAC
gi|28799                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                    tggtgaattAGTC-TA-----ATGGATA-GAGTGTTGGCCGCTCACGCCAAAGGTTGCGGG-TTCGA-T--CCCTCGGTTGACCCGAT-GCCTC-TC--A--TAA-AACA
gi|28810                      :                                                                                                                                                                                                                                                                              tataatgtaagcgta-G--C-AGG-GC-GGTAATC-TA-----ATGGATA-GAGTGTTGGCTGCTCACGCCAGAGATTGCGGG-TTCGATT--CCCCAG-TTGACCCAAT-GCCTC-TC--A--TAA-AACA
gi|28811                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                               agaccGG-TC-AGTAGTA-GA-----ATGGATA-GAGTGTTGGCCGCTCACGCCAGAAGTTGCGGG-TTCGA-T--CCCAAGCTCGGCCTGAT-GCCTC-CC--A--TAC-AACA
gi|28813                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                     agaat-AA-G--C-GGG-GC-AGTAATG-TA-----ATGAATA-GAGTATTGGCCGCTCACGCCAGAGGTTGCGGG-TTCGA-T--CCCCCGATTGACCTAAT-GCCTC-TC--A--TAA-AACA
gi|28818                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                       aaa-AA-G--C-GGG-GC-GGTAGTC-TA-----ATGGATA-GAGTGTTGGCCGCTCACGCCAGAGGTTGCGGGTTTCGA-T--CCCCAGCTCGACCCGAT-GCCTC-TC--A--TAA-AACA
gi|28819                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                         g-AA-G--C-AGG-GC-GGTGGTC-TA-----ATGGATA-GAGTGTTGGCTGCTCACGCCAGAGGTTGCGGG-TTCGA-T--CCCCAGCTCGATCCGAT-GCCTC-TC--A--TTA-AACA
gi|28820                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                         g-AA-G--C-GGG-AT-GGTAGTC-T--------GGATA-GAGTGTTGGCCGCTCACGCCAGAAGTTGCGGG-TTCGA-T--CCCCCGGTCGACCCGAT-GCCTC-TC--A--TAA-AACA
gi|28823                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                        ga-AA-G--C-GGG-GT-GGTAGTC-TA-----ATGGATA-GAGTGTTGGCCGCTCACGCGAGAAGTTGCGGG-TTCGA-T--CCCCAGCTCGACCCGAT-GCCTC-TC--A--TAA-AACA
gi|28824                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                         a-AA-G--T-GGG-GC-GGTAATC-TA-----ATGGATA-GAGTGTTGGCCGCTCATGCCAGAGGTTGCGGG-TTTGA-T--CCTAAGCTGGACCCAAT-GCCTC-TC--A--TAA-AACA
gi|28825                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                         a-AA-G--C-GGGTGC-GGTAGTT-TA-----ATGGATA-GAGTGTTGGCCGCTCACAGCAGAGGTTGCGGG-TTCGA-T--CCCCAGCTCGACCCGAT-GCCTC-TC--A--TAA-AAC
gi|28826                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                            a-G--T-GGG-GC-TGTAGTC-TA-----ATGGATA-AAGTGTTGGCCACTCACACCAGAGATTGCGGG-TTTGA-T--CCCCAACTCTACCCGAT-GCCTC-TC--A--TAA-AACA
gi|28827                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                       aat-AA-G--T-GGG-GC-GGTAATC-TA-----ACGGAAA-GAGTGTTGGCCGCTCATGCCAGAGGTTGCGGG-TTCGA-T--CCCCAGCTTGACCCGAT-GCCTC-TC--A--TAA-AA
gi|28829                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                         a-AA-G--C-GGG-GC-GGTAGTC-TA-----ATGGATA-AAGTGTTGGCCGCTCACGCCAGAGGTTATGGG-TTCGA-T--TCCCAGCTCGACCCGAT-ACCTC-TC--A--TAA-AACA
gi|28830                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                         a-AA-G--C-GGG-GC-GGTAGTC-TA-----ATGGATA-GAGTGTTGACTGCTCACGCCAGAGGTTGCGGG-TTAAA-T--CCCCCGGTCAACCCCAT-TCCTC-TC--A--TAA-AACA
gi|28831                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                         a-AA-G--C-GGG-GC-GGCAGTC-TC-----ATGGATA-GAGTGTTGGCCGCTCACGCAAAAGGTTACGGG-TTCGA-T--TCCCTGGTTGACCCGAT-GCCTC-TC--A--TAA-AACA
gi|28832                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                         a-AG-G--T-GGG-GC-GGTATTG-TA-----ATGGATA-GAGTGTTGGTCGCTCACGCCAGATGTTGTGGG-TTCGA-T--CCCCAGCTTGACCAAAT-GCCTC-TC------AA-AACA
gi|28842                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                            a-G--T-GAG-GC-GGCTGTC-TA-----ATGGATA-GAATGTTGGCCGCTCATGTTAGAGGTTGTGGG-TTTGA-T--CCCCAGCTTGACCCGAT-GCCTC-TC--A--TAA-AACA
gi|28844                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                           at-G--C-GGG-GC-GGTAGTC-TA-----ATGGATA-GAGTGTTGGCCGCTCACGCCAGAGGTTGCGGG-GTCGA-T--CCCCATCTCGACCCGAT-GCCTC-TC--A--TAA-AACA
gi|28846                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                            t-G--T-GGG-GC-GGGTGTC-TA-----ATGGACA-GAGTGTTGGCCACTCACACCAGAGGTAGCTGG-TTCAA-T--CCCCAGCTCGACCCGAT-GCCTC-TC--A--TAA-AACA
gi|28849                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                            t-G--C-GGG-GC-GGTAGTC-TA-----ATGGATA-GAGTGTTGGCCGCTCACGCCAGAGGTTGCGGG-TTCAA-T--CCCCAGCTCGACCCGAT-GCCTC-TC--A--TTA-AACA
gi|28850                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                             -G--C-GGG-GC-GGTAGTC-TA-----ATGGATA-GAGTGTTGGCCGCTCATGCCAGAGGTTGCGGG-TTCGA-T--CCCCAGCTCGGCCCGAT-GCCTC-TC--A--TAA-ATCA
gi|28851                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                             -G--C-GGG-GC-GGCAGTA-TA-----ATGGATA-AAGTGTTGGTCGCTCACGCCAGAGGTTGCGGG-TTCGA-T--CCCCAGCTCGACCTGAT-GCCTC-TC--A--TAA-AACA
gi|28852                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                             -G--C-GGG-GC-GGTAGTC-TA-----ATGGATA-GAGTGTTGGCCGCTCACGCCAGAGGTTGCAGG-TTCGA-T--CCCCTGGTCGACCGGAT-GCCTC-TC--A--TAA-AACA
gi|28853                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                             -G--C-GGG-GC-ATTAGTC-TT-----ATGGATA-GAGTGTTGGCCGCTCACGCCAGAGGTTGCGGG-TTCGA-T--CCCGAGCTCGACCCGAT-GCCTC-TC--A--TAA-AACA
gi|28854                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                             -G--C-GGG-GC-GGTAGTC-TA-----ATGGATA-AAGTGTTGGCCGCTCACGCCAGAGGTTGCCGG-TTCGA-T--CCCCAACTCGACCCGAT-GCTTC-TC--A--TAA-AACA
gi|28855                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                             -G--C-GGG-GC-GGTAGGC-TA-----GTGGATA-GAGTGTTGACCGCTCACGCCAGAGGTTACGGG-TTCGA-T--CCCCAGCTCGACCCGAT-GCCTC-TC--A--TAA-AA
gi|28856                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                             -G--C-GGG-GC-GGTAGTC-TT-----ATGGATA-GAGTGTTGGCCGCTCACACCAGAGGTTGCGGG-TTCGA-T--CCCCAGGTCGACCCGAT-GCCTC-TG--A--TAA-AACA
gi|28859                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                             -G--C-GGG-GC-GGTAGTC-TA-----ATGGATA-GAGTGTTGGCCGCTCACGCCAGAGGTTGCGGG-TTCTA-TC-CCCCAG-TCGACCCGAA-GCCTC-TC--A--TAA-AACA
gi|28861                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                             -G--C-GGG-GC-AGAAGTC-TA-----ATGGATA-GAGTGTTGGCCGCTCTCGCCAGAGATTGCCGG-TTCGA-T--CCCTTG-TTGACCCGAT-GCCTC-TC--A--TAA-AACA
gi|28862                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                             -G--C-GGG-AT-GGTAGTC-TA-----ATGGATA-G--TGTTGGCTGCTCACACCAGAGGTTGCGAG-TTTGA-T--CCCCAGCTAGACCCGAT-GCCTT-TC--A--TAA-AACA
gi|28863                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                             -G--T-GGG-GC-GGTGGTC-TA-----ATGAATG-GAGTGTTGGCTGCTCATGCCAGAGGTTGCGAG-TTCGA-T---CCCAAATTGACCCGAT-GCCTC-TC--A--TAA-AA
gi|28864                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                             -G--C-GGG-GC-GGTAGTG-AA-----ATGGATA-GAGTGTTGGCCGCTCACGCCAGAGGTTGGGGG-TTCGA-T--TCCATGATCGACCCAAT-GCCTC-TC--A--TAA-AACA
gi|28886                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                     G-GC-GGTAATC-TA-----ATGTATA-GAGTGTTGGCCGCTCAAGCCAGAGGTTGCGGA-TTTGA-T--CATCAGCTCGACCCGAT-GCCTC-TC--A--TAA-AACA
gi|28891                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                              tggt-GGG-GC-GGTAGGC-TA-----ATGGATA-GAGTGTTGGCCGCTCATGCCAGAGGTTGTGGG-TTCAA-T--CCCCTGGTCAACCAAAT-GCCTC-TC--A--TAA-AACA
gi|28892                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                  -GGG-GC-CGTAGTG-TA-----ATGGATA-GAGTGTTGGCCACTCACGCCAGACGTTGCCGG-TTTAA-T--CCCCAGCTCGACCTGAT-GCCTC-TC--A--TAA-AACA
gi|28893                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                  -GGG-AC-AGTAGTG-TA-----ATGGATA-TAGTGTTGGCCGTCCATGCCAGAGGTTACGGG-TTCTA-T--CCCCAGCTCGACCTGAT-GCCTC-TC--A--TAA-AACA
gi|28896                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                  -GGG-GT-GGTAGTC-TA-----ATGGATA-GAGTGTTGGCCGTTCACGCCAGAGGTTGCGGG-TTCAA-T--TCCAAGTTCGACCTTAT-GCCTC-TC--A--TAA-AACA
gi|28897                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                  -GGG-GC-GATAATC-TT-----ATGGATA-GAGTGTTGGCCGCTCAAGCCAGAGGTTGTGGG-ATTGA-T--CCCCAGCTCGACCCGAT-GCCTC-TC--A--TAA-AAC
gi|28898                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                  -GGG-GT-GGTAGTA-TA-----ATGGATA-GAGTGTTGGCCGATCATGCCAGAGGTTGTGGG-TTCGA-T--CCCCAGCTCGA-CCGAC-GTCTC-TC--A--TAA-AACA
gi|28899                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                  -GGG-GC-GGTAGTG-AA-----ATAGTTA-GAGTGTTGGTCGTTCATGCCAGTGGTTACGAG-TTTAA-T--CTCCAGCTCGACTCGAT-GCCTC-TC--A--TAA-AACA
gi|28900                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                  -GGG-GC-GGTAGTG-TA-----ATGGATA-GATTGTTGGCTGCTCATGCCAGAGGTTGTGGG-TTCGA-T--CCCCTGATTGACCTAAT-GCCTC-TC--A--TAA-AACA
gi|28901                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                  -GGG-AC-GGTAGTG-TA-----GTGGATA-AAGTGTTGGCTGCTCATGCCAGAGGTTACGGG-TTTGA-T--TCCCAACTCAATCTGAT-ACCTC-TCCGA--TAA-AACA
gi|28902                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                  -GGG-GC-GGTATTG-TA-----ATGGATA-GAGTGTTGGCCGCTCACGCCAGAGGTTGCGGC-TTCGA-T--CCCCCGGTCGACCCGAT-GCCTC-TC--A--TAA-AACA
gi|28903                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                  -GGG-AC-AGTAGTG-AA-----ATGGATA-GTGTGTTAGCTGCTCACGCCAGAGGTTGCAGG-TTTGA-T--CCCCAACTCAACCTGTT-GCCAC-TC--A--CAA-AACA
gi|28926                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                    GG-GC-GGTAGTC-TA-----ATGGATA-GAGTGTTGGCCGCTCGCGCCAGAGGTTGCGGG-TTCGA-T--TCCCCGATCGACCAGAT-GCCTC-TC--A--TAA-AACA
gi|28927                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                    GG-GC-GGTAGTC-TA-----ATGGAGA-GACTGTTGGCCGCTCACGCCAGAGGTTGCGAG-TTCGA-T--CCCCAGCTCGACTCGAT-GCCTC-TC--A--TAA-AACA
gi|28928                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                    GG-GC-GGTAGTC-TA-----ATGGATA-GAGCGTTGGC-----A-GCCAGAGGTTGCGGG-TTCGA-T--CCCCAGCTCGACCCGAT-GCCTC-TC--A--CAA-AACA
gi|28929                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                    GG-GC-TGTAGTC-TA-----ATGGATA-ATGTGTTGGTCGCTAATGCCAGAGGTTGCGGG-TTCGA-T--CCCCAGCTTGAACTGAT-GCCTC-TC--A--TAA-AACA
gi|28930                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                    GG-GT-GGTAGTC-TA-----ATGGATA-GAGTGCTGGCCGCTCACGCCAGAGGTTGCGGG-TTCGA-T--CCCCCTGTCGACCCGGT-GCCTC-TC--A--TAA-AACA
gi|28931                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                    GG-GC-AGTAGTG-TA-----ATGGATA-GAGTGTTGGCCGCTCATGCCAGAGGTTGCGGG-TTCAATT--CCCCAA-TCAACCCGAT-GCCTC-TC--AGTTAA-CAC
gi|28946                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                     G-GC-GGAAGTC-TA-----ATGGATA-G--TGTTGGCCACTAATGCCAGAGGTTGGGGG-TTCAA-T--CCCCAGCTTGACCCGAT-GCCTC-TC--A--TAA-AACA
gi|28947                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                     G-GC-GGCAGTG-TA-----ACGGAAA-GAGTGTTGACCGATCACGCAAGAGGTTGCGGG-TTCGT-T--CCCCAGCTCGATCCGAT-GCCTC-TC--A--TAA-AACA
gi|28949                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                     G-GC-GGTAGTG-TG-----ATGGATA-GAGTGTTGGCCGCTCACACCAGAGGTTGCAGG-TTCGA-T--CCCCAGCTTGACGCGAT-GCCTC-TC--A--TAA-AACA
gi|28950                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                     G-GC-AGTAGTG-TT-----ATGAATA-CAGTGTCGGCCGCTCATGCCAGAGGTTACAGG-TTCAA-T--ACCCAGCTCGACCCGAT-GCCTC-TC--A--TAA-AACA
gi|28952                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                     G-GC-GGAAGTG-TA-----ATGGGTA-GTGTGTTTGCCGCTCACGCCAGAGGTTACAGT-TTCGA-T--CCCCTGCTCGACCAGAT-GCCTC-TC--A--TAA-AACA
gi|28968                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                             AGTC-AA-----ATGGATA-GAGTGTTGGCTGCTAATGCCTGAGGTTGTGGG-TTTAA-T--CCCCAGCTCGATCAGAT-GCCTC-TC--A--TAA-AACA
gi|28971                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                           gaAGTC-TA-----ATGGATA-GAGTATTGGCCGCTCACGCCAGAGGTTGCGGG-TTCGA-T--CCCCAGCTCGACCCGAT-GCCTC-TC--A--TAA-AACA
gi|28972                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                             AGTC-AA-----ATTGATA-GAATGTTGGCTGCTCATGCCGGAGGTTGCAGG-TTTGA-T--CCCCAGCTCGA--TGAT-GCCTC-TC--A--TAACAACA
gi|28974                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                             AGTC-TA-----ATTGATA-TAGTGTTGGCCGCTCACGCCAGAAGTTGTGGG-TTCGA-T--CCCCAGCTCGACCCGAC-GCCTC-TC--A--TAA-AACA
gi|28989                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   A-----ATGGATA-GAGTGTTGGCCACTCTTGCTAGAGGTTGCGGG-TTTAA-T--CCTCAGCTTGGCTCGAT-GCCTC-TC--A--TAA-TACA
gi|28991                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  aA-----ATGGATA-GAATGTTTGCCGCTCATGCCAGAGGTTGCGAG-TTCGA-T--CCCCAGCTCGACCCGAT-GCCTC-TC--A--TAA-AACA
gi|28993                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   A-----ATGGAAA-CAGTGTTGGCCGCTCACGCCTGAGATTGCGGG-TTCAA-T--CCCCCGATCGACCCGAT-GCCTC-TC--A--TAA-AACA
gi|28994                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   A-----ATGAAGA-GAGTGTTGGCTGCTCACGCCTGAGGTTACTGG-TTCGA-T--CTCCAGCTCTACCCGAT-GCCTC-TC--A--TAA-AACA
gi|29017                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    -----ATAGATA-GAGTGTTGGCTGCTCACGCCAGAGGTTGCAGG-TTCGA-T--CCCCCCCTCGACCTGAT-GCCTC-TC--A--TAA-AACA
1 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|28699 ): ATTTAATGTATTTAAGTGTTTTCATTTTATTTTTAATTGATATTCTTTATCTTACAACGGTTACCCTAAATACTATAACAACACATTATTTCTTTTAAACAATTGCAAAGTATTCTCAGTGACATTCCTGTCATTCTTTTTAAACTTTATTTATAAGAATTGATTATAACAGTTAAACTTACATAACCGTTGTGCTCATCAGCAAAATATAAACACAATGACAGGAGCTGAAAACACATAAATTACAAAATTGGAAACCAAATT