lowQualScore : 00 00 0 00 7
lowQualScore : .. .. . .. .
lowQualScore : 66 66 8 66 7
consensus : TATGTGTGGTGT--C--CTTGAGCAAGACAC-TTTTTCCGC--ATATGCTTAGTACTGGTTCTACCCAG
Reference ( gi|121571 ) : TATGTGTGGTGT--C--CTTGAGCAAGACAC-TTTTTCCGC--ATATGCTTAGTACTGGTTCTATCCAG
gi|121574 : TATGTGTGGTGT--C--CTTGAGCAAGACAC-TTTTTCCGC--ATATGCTAAGTACTGGTTCTACCCAG
gi|121573 : TATGTGTGGTGT--C--CTTGAGCAAGACAC-TTTTTCCGC--ATATGCTTTGTACTGGTTCTACCCAG
gi|121575 : TATGTGTGGTGT--C--CTTAAGCAAGACAC-TTTTTCTGC--ATATGCTTAGTACTGGTTCTACCCAG
gi|121629 : TATGTGTG-TGT--C--CTTGAGCAAGATAC-TTTTTCCGC--ATATGCTTAGTACTGGTTCTATCCAG
gi|121591 : TATGTGTGGTGT--C--CTTGAGCAAGACAC-CTTTCCCGC--ATATGCTTAGTACTGGTTCTAACCAG
gi|121590 : TATGTGTGGTGT--C--CTTGAGCAAGGCAC-CTTTTCCGC--ATATGCTTAGTACTGGTTCTAACCAG
gi|121604 : TATGTGTGGTGT--C--CTTGAGCAAGACAC--TTTTCCGC--ATATGCTTAGTACTGGTTCTAACCAG
gi|121603 : TATGTGTGGTGT--C--CTTGAGCAAGACAC--TTTTCCGC--ATATGCTTAGTACTGGTTCTAACCAG
gi|121599 : TATGTGTGGTGT--C--CTTGAGCAAGACAC--TTTTCCGC--ATATGCTTAGTACTGGTTCTAACCAG
gi|121597 : TATGTGTGGTGT--C--CTTGAGCAAGACAC--TTTTCCGC--ATATGCTTAGTACTGGTTCTAACCAG
gi|121592 : TATGTGTGGTGT--C--CTTGAGCAAGACAC--TTTTCCGC--ATATGCTTAGTACTGGTTCTAACCAG
gi|121578 : TATGTGTGGTGT--C--CTTGAGCAAGACAC-TTTTTCTGC--ATATGCTTTGTACTGGTTCTACCCAG
gi|121576 : TATGTGTGGTGT--C--CTTGAGCAAGACAC-TTTATCCGC--ATATACTTAGTACTGGTTCTACCCAG
gi|121616 : TATGTGTGGTGT--C--CTTGAGCAAGACAC-TTTTT-CGC--ATATGCTTAGTACTGGTTCTAACCAG
gi|121580 : TATGTATGGTGT--C--CTTGAGCAAGACAC-TTCTTCCGT--ATATGCTTAGTACTGGTTCTACCCAG
gi|121662 : TATGTGTGGTGT--C--CTTGAGCATGACAC-CTTTTCCGC--ATATGCTTAGTACTGGTTCTATCC
gi|121582 : TATGTGTGGTGT--C--CTTGAGCAAGACAC-TTTTTCCAT--ATATGTTTAGTACTGGTTCTACCCAG
gi|121583 : TATTTGTGGTGT--C--CTTGAGCAAGACAC-TTTTTCCGC--ATATGCTTTGTACTGGTTCTACCCAG
gi|121679 : TATGTGTGGTGT--C--CTTGAGCATGACAC-TTTTTCCGC--AAATGCTTAGTACTGGCTCTATCCAG
gi|121586 : TATGTGTGGTGT--C--CTTGAGCAAGACAC-ATTTTCCGC--ATATGCTTTGTACTGGTTCTACCCAG
gi|121584 : TATGTGTGGTGT--C--CTTGAGCAAGACAC-TTTTTCCGC--ATATGCTTTGTACTGGTACTACCCAG
gi|121587 : TGTGTGTGGTGT--C--CTTGAGCAAGACAC-TTTTTCCAC--ATATGCTTAGTACTGGTTCTACCC
gi|121589 : TAGGTGTGGTGT--C--CTTGAGCAAGACAC-TTTTTCTGC--ATATGCTTGGTACTGGTTCTACCCAG
gi|121601 : TATGTGTGGTGT--C--CTTGAGCAAGACAC-CTTTTCCAC--ATATGCTTAGTACTCGTTCTACCCAG
gi|121600 : TATGTGTGGTGT--C--CTTGAGTAAGACGC-TTTTTCCGC--ATATGCTTAGTACTGGTTCTACCAAG
gi|121596 : TATGTGTGGTGT--C--CTTGAGTAAGACGC-TTTTTCCGC--ATATGCTTAGTACTGGTTCTACCAAG
gi|121636 : TATGTGTGGCGT--C--CTTGAGCAAGACAC-TTTT-CCGC--ATATGCTTAGTACTGGTTCTAACCAG
gi|121635 : TACGTGTGGTGT--C--CTTGAGCAAGACAC-TTTT-CCGC--ATATGCTTAGTACTGGTTCTAACCAG
gi|121634 : TATGTGTGGTGT--C--CTTGAGCAAGACAC--TTTCCCGC--ATATGCTTAGTACTGGTTCTAACCAG
gi|121607 : TATGTGTTGTAT--C--CTTGAGCAAGACAC-TTTTTCCGC--ATATGCTTAGTACTGATTCTACCCAG
gi|121606 : TATGTGTGGCGT--C--CTTGAGTAAGACAC-TTTTTCCGC--ATATGCTTTGTACTGGTTCTACCCAG
gi|121605 : TATGTGTGGTGT--C--CTTGAGCAAGACAC-TTTATCCAC--ATATGCTTAGTACTGGTTCTACCCGG
gi|121641 : TATGTGTGGTGT--C--CTTGAACAAGACAC-TTTT-CCGC--ATATGCTTAGTACTGGTTCTAACCAG
gi|121640 : TATGTGTGGTGT--C--CTTGAGTAAGACAC-TTTT-CCGC--ATATGCTTAGTACTGGTTCTAACCAG
gi|121614 : TATGTGTGGTGT--C--CTTGAGCAAGACAC-TTTTTCTGC--ATATACTTAGAACTGGTTCTACCCAG
gi|121613 : TATGTGTGGTGT--C--CTTGAGCAAGACAT-TTTTTCTGC--ATATGCTTTGTACTGGTTCTACCCAG
gi|121612 : TATGTGTAGTGT--C--CTTGAGCAAGACAC-TTTTTCCAC--ATATGCTTTGTACTGGTTCTACCCAG
gi|121610 : TATGTGTGGTGT--C--CTTGAGCAAGACAC-TTTTTTCAC--ATATGCTTTGTACTGGTTCTACCCAG
gi|121609 : TATGTGTGGTGT--C--CTTGAGTAAGACAC-TTTTTCTGC--ATATGCTTTGTACTGGTTCTACCCAG
gi|121608 : TATGTGTGGTGT--C--CTTGAGCAAGACAT-TTTTTCTGC--ATATGCTTTGTACTGGTTCTACCCAG
gi|121660 : TATGTGTGGTTT--C--CTTGAGCAAGACAC-TTTTTCCGC--ATATGCTTTGTACTGGTTCTAACCAG
gi|121665 : TATGTGGGGTGT--C--CTTGAGCAAGACAC-TTTT-CCGC--ATATGCTTAGTACTGGTTCTAACCAG
gi|121622 : TATGTGTGGTGT--C--CTTGAGAAAGACAC-TTTTTCCAC--ATATGCTTAGTACTGGTTATACCCAG
gi|121621 : TATGTGTGGTGT--C--CTTGAGCAAGACAC-CTTTTCCGC--ATATGCTTAGTACTGGTCATACCCA
gi|121667 : TATGTTTGGTGT--C--CTTGAGCAAGACAC-TTTT-CCGC--ATATGCTTAGTACTGGTTCTAACCAG
gi|121628 : TATGTGTGGTGT--C--CATGAGCAAGACAC-TTTTTCCGC--ATATGCTTTGTACTGGCTCTACCCAG
gi|121627 : TATGTGTGGTGT--C--CTTGAGCAAGTCAC-TTTTTCCAC--ATATGCTTAGTACTGGTTATACCCAG
gi|121626 : TATGTGTGGTGT--C--CTTGAGCAAGACAC-TTTTTACAC--ATATGCTTTGTACTGGTTCTACCCAG
gi|121625 : TATGTGTGGTGT--C--CTTGAGCAAGGCAC-TTTTTCCGC--ATATGCTTTGTACTGGTACTACCCAG
gi|121676 : TATGTGTGGTGT--C--CTTGAGCAAGACACTTTTTTTCGT--ATATGCTTAGTACTGGTTCTAACCAG
gi|121631 : TATGTGTGGTGT--C--CTTGAGCAAGACAC-TTTTTCCACATATATGCTTAGTACTGGTTATACCCAG
gi|121685 : TATGTGTGGTGTATC--CTTGAGCAAGACAC-TTTT-CCGC--ATATGCTTAGTACTGGTTCTAACCAG
gi|121644 : TATGTATGTTGT--C--CTTGAGCAAGACAC-TTTTTCCGC--GTATGCTTAGTACTGGTTCTACCTAG
gi|121643 : TATGTGTGGTGC--C--CTTGAGCAAGGTAC-TTTTTCCGC--ATATGCTTTGTACTGGTTCTACCCAG
gi|121642 : TGTGTGTGGTAT--C--CTTGAGCAAGACAC-CTTTTCCGC--ATATGCTTAGTACTGGTACTACCCAG
gi|121690 : TATGTGTGGTGT--C--CTTGAGCAAGACAC-ATTTT-CGC--ATATGCTTAGTACTGGTTCTAACCAG
gi|121687 : TATGTGCGGTGT--C--CTTGAGCAAGACAC--TTTTCCGC--ATATGTTTAGTACTGGTTCTAACCAG
gi|121655 : TATGTGTGGTGT--C--CTTGAACAAGACAC-TTTTTTCTC--ATATGTTTAGTACTGGTTCTACCCAG
gi|121654 : TATGTGTAGTGT--C--TTTGAGCAAGACAC-CTTTTCCGC--ATATGCTTTGTACTGGTTCTACCCAG
gi|121649 : TATGTGTGGTAT--C--CTTGAGCAAGACAC-CTTTTCCAC--ATATGCTTAGTACTGGTACTACCCAG
gi|121647 : TATGTGTAGTGT--C--CTTGAGCAAGACAC-TTTTTCCAC--ATATACTTAGTACTGGTTCTACACAG
gi|121646 : TATGTGCGGTGT--C--CTTGAGCAAGACAT-TTTATCCAC--ATATGCTTAGTACTGGTTCTACCCAG
gi|121645 : TATGTATGGTGT--C--CTTGAGCAAGACAC-TTTTTTCGC--ATAAGCTTAGTACTGGTTCCACCCAG
gi|121659 : TATGTGTGGTGT--C--ATTGAGCAAGACAC-TTTATCCGC--ATATGCTTAGTACTGGTTATACCCAG
gi|121669 : TATGGGTGGTGT--C--CTTGAGCAAGACAC-TTTTTCCAC--ATGTGCTTAGTACTGGTTATACCCAG
gi|121670 : TATGTGTTGTGT--C--CTTGAGCAAGACAC-TTTTTTCGC--ATATGCTTAGTACTGGTTCTGCCAAG
gi|121678 : TATGTGTGGTGT--C--CTTGAGCAAGACAC-TTTTTCCGC--ATAGACTTTGTATTGGTTCTACCCAG
gi|121677 : TATGTGCGGTGT--C--CATGAGCTAGACAC-CTTTTCCGC--ATATGCTTAGTACTGGTTCTACCCAG
gi|121675 : TATGTGGGGTGT--C--CTTGAGTAAGACGC-TTTTTCCAC--ATATGCTTAGTACTGGTTCTACCCA
gi|121674 : TATGTGTGGTGC--C--CTTGAGCATGACAT-TTTTTCCGC--ATATTCTTAGTACTGGTTCTACCCAG
gi|121673 : TATGTGTGGTGT--C--CTTGAGCAAGACAC-TTTATCTAC--ATATGCTTAGTACGGGTTCTACCCAG
gi|121671 : TATGTGTGGTGT--C--CTTGAGCAAGACAC-TTGTTCCAT--ATATGCTTTGTACTGGTTCTACCCAG
gi|121680 : TATGTGTGGTGT--C--CTTGTGCAAGACAC-TTTTTCCAT--ATATGCTTAGTACTGGTTATACCCAG
gi|121620 : TATGTGTGGTGT--T--ATTGAGCAAGACAC-TTTT-CCGC--ATATGCTTAGTACTGGTTCTAACCAG
gi|121683 : TATGTGTGATGT--C--CTTGAGCAAGACAC-ATTTTCCAC--ATATGCTTTGTACTGGTTCTACCCAG
gi|121681 : TATATGTGGTGT--C--CTTGAGCAAGACAC-TTTTTCCAC--ATATGCTTTGTACTGGATCTACCCAG
gi|121684 : TATGTGTGGTGT--C--CTTGGGCAAAACAC-TTCTTCCGC--ATATGCTTAGTACTGGTGCTACCCGG
gi|121689 : TATGTGTGGTGT--C--CTTGAGCAAGACAC--CTTTCCAC--ATATGCTTAGTACTGGTTATACCCAG
gi|121695 : TATATGTGGTGT--C--CTTAAGTAAGACAC-TTTTTCTGC--ATATGCGTAGTACTGGTTCTACCCAG
gi|121694 : TACGTGTGGTAT--C--CTTGAGCAAGACAC-ATTT-CCGC--ATATGCTTAGTACTGGTTCTACCCAG
gi|121692 : TATGTGTGGTGT--C--CTTGAGCAAGTCA--TTTTTCCGC--ATATGCTTAGAACTGGTTCTACCCAG
gi|121691 : TATGTGTGGTGT--C--ATTGAGCAAGACAC-CTTTTCCGC--ATACGCTTAGTACTGGTTCTAC
gi|121615 : TATGTGTGGTGT--T--CTTAAGCAAAACAC-TTTTTCCAC--TTATGCTTAGTACTGGTTCTACCCAG
gi|121617 : TATGTGTGGTGT--T--CTTGAGCAAGACAC-TTTTTCAGC--ATATGCAAAGTACTGGTTCTACCCAG
gi|121618 : TATGTGTGGTGT--T--CTTGAGCACGACAC-TTTT-CAGC--ATATGCTTAGTACTGGTTCTACCCAG
gi|121624 : TATGTGTGGTGT--T--CTTGAGCAAGAAAC-TTTTTCCAC--ACATGCTTAGTACTGGTTATACCCAG
gi|121651 : TATGTGTGGTGT--TTTCTTGAGCAAGACAC-TTTTTCTGC--ATATGCATAGTACTGATTCTACCCAG
gi|121658 : TATGTGTGATGT--T--CTCGAGCAAGACAC-TTTATCTAC--ATATGCTTAGTACTGGTTCTACCCAG
gi|121661 : TATGTGTGGTGT--T--CTTGAGCAAGGCACTTTTTTCCGC--ATATGCTTTGTACTGGTACTACCCAG
gi|121664 : TATGTATGGTGT--T--CTTGAGCAAGACAC-TTTTTCCGC--AAATGCTTAGTACTGGTACTTCCCAG
gi|121663 : TGTGTGTGGTGT--T--CTTGAGCAAGATAC-TTTTTCTGC--ATGTGCTTAGTATTGGTTCTACTCAG
gi|121666 : TATGTGTGGTGT--T--CTTGAGCAAGACAT-TTTTTTCGC--ATATGTTTAGTACTAGTTC-ACCCAG
gi|121572 : TATGTGTGATGT--T--CTTGAACAAGACAC-CCTTTCTGC--ATATGCTTAGTACTGGTTCTACCC
gi|121696 : TACGTGTGG-AT--T--CTTGAGCAAGACAC-CTTTTCCGC--ATATGCTAAGTACTGGTTCTACCCAG
gi|121859 : ATGTGTGGTGT--C--CTTTAGCAAGACAC-TTTTTCCGC--ATATGCTTTGTACTGGTTCTACCCAG
gi|121893 : TGTGAGGTGT--C--CTTGAGCAAGACAC-TTTTGCCGC--ATATGCTTAGTACTGGTTCTATCCAG
gi|121894 : TGTGTGGTGT--C--CTTGAGCAAGACAC-TTTTTCCAC--TTATGCTTAGTACTGGTTATACCCAG
gi|121926 : TGTGGTGT--C--CTTCAGCAAGACAC-TTTTTCCGC--ATATGCTTAGTACTGGTTCCACCCAG
gi|121932 : GTGGTGT--C--ATTGAGCAAGGCAC-TTTTTCCGC--ATATGCTTAGTACTGGTTCTACCCAG
Alignments
lowQualScore : 00 00 0 0 00
lowQualScore : .. .. . . ..
lowQualScore : 66 66 4 4 55
consensus : TATGTGTGGTGT--C--CTTGAGCAAGACAC-TTTT-TCCGC--ATATGCTTAGTACTGGTTCTACCCAG
Reference ( family-105 ) : TATGTGTGGTGT--C--CTTGAGCAAGACAC-TTTT-TCCGC--ATATGCTTAGTACTGGTTCTACCCAG
gi|121571 : TATGTGTGGTGT--C--CTTGAGCAAGACAC-TTTT-TCCGC--ATATGCTTAGTACTGGTTCTATCCAG
gi|121572 : TATGTGTGATGT--T--CTTGAACAAGACAC-CCTT-TCTGC--ATATGCTTAGTACTGGTTCTACCC
gi|121573 : TATGTGTGGTGT--C--CTTGAGCAAGACAC-TTTT-TCCGC--ATATGCTTTGTACTGGTTCTACCCAG
gi|121574 : TATGTGTGGTGT--C--CTTGAGCAAGACAC-TTTT-TCCGC--ATATGCTAAGTACTGGTTCTACCCAG
gi|121575 : TATGTGTGGTGT--C--CTTAAGCAAGACAC-TTTT-TCTGC--ATATGCTTAGTACTGGTTCTACCCAG
gi|121576 : TATGTGTGGTGT--C--CTTGAGCAAGACAC-TTTA-TCCGC--ATATACTTAGTACTGGTTCTACCCAG
gi|121578 : TATGTGTGGTGT--C--CTTGAGCAAGACAC-TTTT-TCTGC--ATATGCTTTGTACTGGTTCTACCCAG
gi|121580 : TATGTATGGTGT--C--CTTGAGCAAGACAC-TTCT-TCCGT--ATATGCTTAGTACTGGTTCTACCCAG
gi|121582 : TATGTGTGGTGT--C--CTTGAGCAAGACAC-TTTT-TCCAT--ATATGTTTAGTACTGGTTCTACCCAG
gi|121583 : TATTTGTGGTGT--C--CTTGAGCAAGACAC-TTTT-TCCGC--ATATGCTTTGTACTGGTTCTACCCAG
gi|121584 : TATGTGTGGTGT--C--CTTGAGCAAGACAC-TTTT-TCCGC--ATATGCTTTGTACTGGTACTACCCAG
gi|121586 : TATGTGTGGTGT--C--CTTGAGCAAGACAC-ATTT-TCCGC--ATATGCTTTGTACTGGTTCTACCCAG
gi|121587 : TGTGTGTGGTGT--C--CTTGAGCAAGACAC-TTTT-TCCAC--ATATGCTTAGTACTGGTTCTACCC
gi|121589 : TAGGTGTGGTGT--C--CTTGAGCAAGACAC-TTTT-TCTGC--ATATGCTTGGTACTGGTTCTACCCAG
gi|121590 : TATGTGTGGTGT--C--CTTGAGCAAGGCAC-CTTT-TCCGC--ATATGCTTAGTACTGGTTCTAACCAG
gi|121591 : TATGTGTGGTGT--C--CTTGAGCAAGACAC-CTTT-CCCGC--ATATGCTTAGTACTGGTTCTAACCAG
gi|121592 : TATGTGTGGTGT--C--CTTGAGCAAGACAC--TTT-TCCGC--ATATGCTTAGTACTGGTTCTAACCAG
gi|121596 : TATGTGTGGTGT--C--CTTGAGTAAGACGC-TTTT-TCCGC--ATATGCTTAGTACTGGTTCTACCAAG
gi|121597 : TATGTGTGGTGT--C--CTTGAGCAAGACAC--TTT-TCCGC--ATATGCTTAGTACTGGTTCTAACCAG
gi|121599 : TATGTGTGGTGT--C--CTTGAGCAAGACAC--TTT-TCCGC--ATATGCTTAGTACTGGTTCTAACCAG
gi|121600 : TATGTGTGGTGT--C--CTTGAGTAAGACGC-TTTT-TCCGC--ATATGCTTAGTACTGGTTCTACCAAG
gi|121601 : TATGTGTGGTGT--C--CTTGAGCAAGACAC-CTTT-TCCAC--ATATGCTTAGTACTCGTTCTACCCAG
gi|121603 : TATGTGTGGTGT--C--CTTGAGCAAGACAC--TTT-TCCGC--ATATGCTTAGTACTGGTTCTAACCAG
gi|121604 : TATGTGTGGTGT--C--CTTGAGCAAGACAC--TTT-TCCGC--ATATGCTTAGTACTGGTTCTAACCAG
gi|121605 : TATGTGTGGTGT--C--CTTGAGCAAGACAC-TTTA-TCCAC--ATATGCTTAGTACTGGTTCTACCCGG
gi|121606 : TATGTGTGGCGT--C--CTTGAGTAAGACAC-TTTT-TCCGC--ATATGCTTTGTACTGGTTCTACCCAG
gi|121607 : TATGTGTTGTAT--C--CTTGAGCAAGACAC-TTTT-TCCGC--ATATGCTTAGTACTGATTCTACCCAG
gi|121608 : TATGTGTGGTGT--C--CTTGAGCAAGACAT-TTTT-TCTGC--ATATGCTTTGTACTGGTTCTACCCAG
gi|121609 : TATGTGTGGTGT--C--CTTGAGTAAGACAC-TTTT-TCTGC--ATATGCTTTGTACTGGTTCTACCCAG
gi|121610 : TATGTGTGGTGT--C--CTTGAGCAAGACAC-TTTT-TTCAC--ATATGCTTTGTACTGGTTCTACCCAG
gi|121612 : TATGTGTAGTGT--C--CTTGAGCAAGACAC-TTTT-TCCAC--ATATGCTTTGTACTGGTTCTACCCAG
gi|121613 : TATGTGTGGTGT--C--CTTGAGCAAGACAT-TTTT-TCTGC--ATATGCTTTGTACTGGTTCTACCCAG
gi|121614 : TATGTGTGGTGT--C--CTTGAGCAAGACAC-TTTT-TCTGC--ATATACTTAGAACTGGTTCTACCCAG
gi|121615 : TATGTGTGGTGT--T--CTTAAGCAAAACAC-TTTT-TCCAC--TTATGCTTAGTACTGGTTCTACCCAG
gi|121616 : TATGTGTGGTGT--C--CTTGAGCAAGACAC-TTTT-T-CGC--ATATGCTTAGTACTGGTTCTAACCAG
gi|121617 : TATGTGTGGTGT--T--CTTGAGCAAGACAC-TTTT-TCAGC--ATATGCAAAGTACTGGTTCTACCCAG
gi|121618 : TATGTGTGGTGT--T--CTTGAGCACGACAC-TTTT--CAGC--ATATGCTTAGTACTGGTTCTACCCAG
gi|121620 : TATGTGTGGTGT--T--ATTGAGCAAGACAC-TTTT--CCGC--ATATGCTTAGTACTGGTTCTAACCAG
gi|121621 : TATGTGTGGTGT--C--CTTGAGCAAGACAC-CTTT-TCCGC--ATATGCTTAGTACTGGTCATACCCA
gi|121622 : TATGTGTGGTGT--C--CTTGAGAAAGACAC-TTTT-TCCAC--ATATGCTTAGTACTGGTTATACCCAG
gi|121624 : TATGTGTGGTGT--T--CTTGAGCAAGAAAC-TTTT-TCCAC--ACATGCTTAGTACTGGTTATACCCAG
gi|121625 : TATGTGTGGTGT--C--CTTGAGCAAGGCAC-TTTT-TCCGC--ATATGCTTTGTACTGGTACTACCCAG
gi|121626 : TATGTGTGGTGT--C--CTTGAGCAAGACAC-TTTT-TACAC--ATATGCTTTGTACTGGTTCTACCCAG
gi|121627 : TATGTGTGGTGT--C--CTTGAGCAAGTCAC-TTTT-TCCAC--ATATGCTTAGTACTGGTTATACCCAG
gi|121628 : TATGTGTGGTGT--C--CATGAGCAAGACAC-TTTT-TCCGC--ATATGCTTTGTACTGGCTCTACCCAG
gi|121629 : TATGTGTG-TGT--C--CTTGAGCAAGATAC-TTTT-TCCGC--ATATGCTTAGTACTGGTTCTATCCAG
gi|121631 : TATGTGTGGTGT--C--CTTGAGCAAGACAC-TTTT-TCCACATATATGCTTAGTACTGGTTATACCCAG
gi|121634 : TATGTGTGGTGT--C--CTTGAGCAAGACAC--TTT-CCCGC--ATATGCTTAGTACTGGTTCTAACCAG
gi|121635 : TACGTGTGGTGT--C--CTTGAGCAAGACAC-TTTT--CCGC--ATATGCTTAGTACTGGTTCTAACCAG
gi|121636 : TATGTGTGGCGT--C--CTTGAGCAAGACAC-TTTT--CCGC--ATATGCTTAGTACTGGTTCTAACCAG
gi|121640 : TATGTGTGGTGT--C--CTTGAGTAAGACAC-TTTT--CCGC--ATATGCTTAGTACTGGTTCTAACCAG
gi|121641 : TATGTGTGGTGT--C--CTTGAACAAGACAC-TTTT--CCGC--ATATGCTTAGTACTGGTTCTAACCAG
gi|121642 : TGTGTGTGGTAT--C--CTTGAGCAAGACAC-CTTT-TCCGC--ATATGCTTAGTACTGGTACTACCCAG
gi|121643 : TATGTGTGGTGC--C--CTTGAGCAAGGTAC-TTTT-TCCGC--ATATGCTTTGTACTGGTTCTACCCAG
gi|121644 : TATGTATGTTGT--C--CTTGAGCAAGACAC-TTTT-TCCGC--GTATGCTTAGTACTGGTTCTACCTAG
gi|121645 : TATGTATGGTGT--C--CTTGAGCAAGACAC-TTTT-TTCGC--ATAAGCTTAGTACTGGTTCCACCCAG
gi|121646 : TATGTGCGGTGT--C--CTTGAGCAAGACAT-TTTA-TCCAC--ATATGCTTAGTACTGGTTCTACCCAG
gi|121647 : TATGTGTAGTGT--C--CTTGAGCAAGACAC-TTTT-TCCAC--ATATACTTAGTACTGGTTCTACACAG
gi|121649 : TATGTGTGGTAT--C--CTTGAGCAAGACAC-CTTT-TCCAC--ATATGCTTAGTACTGGTACTACCCAG
gi|121651 : TATGTGTGGTGT--TTTCTTGAGCAAGACAC-TTTT-TCTGC--ATATGCATAGTACTGATTCTACCCAG
gi|121654 : TATGTGTAGTGT--C--TTTGAGCAAGACAC-CTTT-TCCGC--ATATGCTTTGTACTGGTTCTACCCAG
gi|121655 : TATGTGTGGTGT--C--CTTGAACAAGACAC-TTTT-TTCTC--ATATGTTTAGTACTGGTTCTACCCAG
gi|121658 : TATGTGTGATGT--T--CTCGAGCAAGACAC-TTTA-TCTAC--ATATGCTTAGTACTGGTTCTACCCAG
gi|121659 : TATGTGTGGTGT--C--ATTGAGCAAGACAC-TTTA-TCCGC--ATATGCTTAGTACTGGTTATACCCAG
gi|121660 : TATGTGTGGTTT--C--CTTGAGCAAGACAC-TTTT-TCCGC--ATATGCTTTGTACTGGTTCTAACCAG
gi|121661 : TATGTGTGGTGT--T--CTTGAGCAAGGCAC-TTTTTTCCGC--ATATGCTTTGTACTGGTACTACCCAG
gi|121662 : TATGTGTGGTGT--C--CTTGAGCATGACAC-CTTT-TCCGC--ATATGCTTAGTACTGGTTCTATCC
gi|121663 : TGTGTGTGGTGT--T--CTTGAGCAAGATAC-TTTT-TCTGC--ATGTGCTTAGTATTGGTTCTACTCAG
gi|121664 : TATGTATGGTGT--T--CTTGAGCAAGACAC-TTTT-TCCGC--AAATGCTTAGTACTGGTACTTCCCAG
gi|121665 : TATGTGGGGTGT--C--CTTGAGCAAGACAC-TTTT--CCGC--ATATGCTTAGTACTGGTTCTAACCAG
gi|121666 : TATGTGTGGTGT--T--CTTGAGCAAGACAT-TTTT-TTCGC--ATATGTTTAGTACTAGTTC-ACCCAG
gi|121667 : TATGTTTGGTGT--C--CTTGAGCAAGACAC-TTTT--CCGC--ATATGCTTAGTACTGGTTCTAACCAG
gi|121669 : TATGGGTGGTGT--C--CTTGAGCAAGACAC-TTTT-TCCAC--ATGTGCTTAGTACTGGTTATACCCAG
gi|121670 : TATGTGTTGTGT--C--CTTGAGCAAGACAC-TTTT-TTCGC--ATATGCTTAGTACTGGTTCTGCCAAG
gi|121671 : TATGTGTGGTGT--C--CTTGAGCAAGACAC-TTGT-TCCAT--ATATGCTTTGTACTGGTTCTACCCAG
gi|121673 : TATGTGTGGTGT--C--CTTGAGCAAGACAC-TTTA-TCTAC--ATATGCTTAGTACGGGTTCTACCCAG
gi|121674 : TATGTGTGGTGC--C--CTTGAGCATGACAT-TTTT-TCCGC--ATATTCTTAGTACTGGTTCTACCCAG
gi|121675 : TATGTGGGGTGT--C--CTTGAGTAAGACGC-TTTT-TCCAC--ATATGCTTAGTACTGGTTCTACCCA
gi|121676 : TATGTGTGGTGT--C--CTTGAGCAAGACACTTTTT-TTCGT--ATATGCTTAGTACTGGTTCTAACCAG
gi|121677 : TATGTGCGGTGT--C--CATGAGCTAGACAC-CTTT-TCCGC--ATATGCTTAGTACTGGTTCTACCCAG
gi|121678 : TATGTGTGGTGT--C--CTTGAGCAAGACAC-TTTT-TCCGC--ATAGACTTTGTATTGGTTCTACCCAG
gi|121679 : TATGTGTGGTGT--C--CTTGAGCATGACAC-TTTT-TCCGC--AAATGCTTAGTACTGGCTCTATCCAG
gi|121680 : TATGTGTGGTGT--C--CTTGTGCAAGACAC-TTTT-TCCAT--ATATGCTTAGTACTGGTTATACCCAG
gi|121681 : TATATGTGGTGT--C--CTTGAGCAAGACAC-TTTT-TCCAC--ATATGCTTTGTACTGGATCTACCCAG
gi|121683 : TATGTGTGATGT--C--CTTGAGCAAGACAC-ATTT-TCCAC--ATATGCTTTGTACTGGTTCTACCCAG
gi|121684 : TATGTGTGGTGT--C--CTTGGGCAAAACAC-TTCT-TCCGC--ATATGCTTAGTACTGGTGCTACCCGG
gi|121685 : TATGTGTGGTGTATC--CTTGAGCAAGACAC-TTTT--CCGC--ATATGCTTAGTACTGGTTCTAACCAG
gi|121687 : TATGTGCGGTGT--C--CTTGAGCAAGACAC--TTT-TCCGC--ATATGTTTAGTACTGGTTCTAACCAG
gi|121689 : TATGTGTGGTGT--C--CTTGAGCAAGACAC--CTT-TCCAC--ATATGCTTAGTACTGGTTATACCCAG
gi|121690 : TATGTGTGGTGT--C--CTTGAGCAAGACAC-ATTT-T-CGC--ATATGCTTAGTACTGGTTCTAACCAG
gi|121691 : TATGTGTGGTGT--C--ATTGAGCAAGACAC-CTTT-TCCGC--ATACGCTTAGTACTGGTTCTACC
gi|121692 : TATGTGTGGTGT--C--CTTGAGCAAGTCA--TTTT-TCCGC--ATATGCTTAGAACTGGTTCTACCCAG
gi|121694 : TACGTGTGGTAT--C--CTTGAGCAAGACAC-ATTT--CCGC--ATATGCTTAGTACTGGTTCTACCCAG
gi|121695 : TATATGTGGTGT--C--CTTAAGTAAGACAC-TTTT-TCTGC--ATATGCGTAGTACTGGTTCTACCCAG
gi|121696 : TACGTGTGG-AT--T--CTTGAGCAAGACAC-CTTT-TCCGC--ATATGCTAAGTACTGGTTCTACCCAG
gi|121859 : ATGTGTGGTGT--C--CTTTAGCAAGACAC-TTTT-TCCGC--ATATGCTTTGTACTGGTTCTACCCAG
gi|121893 : TGTGAGGTGT--C--CTTGAGCAAGACAC-TTTT-GCCGC--ATATGCTTAGTACTGGTTCTATCCAG
gi|121894 : TGTGTGGTGT--C--CTTGAGCAAGACAC-TTTT-TCCAC--TTATGCTTAGTACTGGTTATACCCAG
gi|121926 : TGTGGTGT--C--CTTCAGCAAGACAC-TTTT-TCCGC--ATATGCTTAGTACTGGTTCCACCCAG
gi|121932 : GTGGTGT--C--ATTGAGCAAGGCAC-TTTT-TCCGC--ATATGCTTAGTACTGGTTCTACCCAG
Alignments
lowQualScore : 00 00 0 0 00
lowQualScore : .. .. . . ..
lowQualScore : 66 66 4 4 55
consensus : TATGTGTGGTGT--C--CTTGAGCAAGACAC-TTTT-TCCGC--ATATGCTTAGTACTGGTTCTACCCAG
Reference ( family-105 ) : TATGTGTGGTGT--C--CTTGAGCAAGACAC-TTTT-TCCGC--ATATGCTTAGTACTGGTTCTACCCAG
gi|121571 : TATGTGTGGTGT--C--CTTGAGCAAGACAC-TTTT-TCCGC--ATATGCTTAGTACTGGTTCTATCCAG
gi|121572 : TATGTGTGATGT--T--CTTGAACAAGACAC-CCTT-TCTGC--ATATGCTTAGTACTGGTTCTACCC
gi|121573 : TATGTGTGGTGT--C--CTTGAGCAAGACAC-TTTT-TCCGC--ATATGCTTTGTACTGGTTCTACCCAG
gi|121574 : TATGTGTGGTGT--C--CTTGAGCAAGACAC-TTTT-TCCGC--ATATGCTAAGTACTGGTTCTACCCAG
gi|121575 : TATGTGTGGTGT--C--CTTAAGCAAGACAC-TTTT-TCTGC--ATATGCTTAGTACTGGTTCTACCCAG
gi|121576 : TATGTGTGGTGT--C--CTTGAGCAAGACAC-TTTA-TCCGC--ATATACTTAGTACTGGTTCTACCCAG
gi|121578 : TATGTGTGGTGT--C--CTTGAGCAAGACAC-TTTT-TCTGC--ATATGCTTTGTACTGGTTCTACCCAG
gi|121580 : TATGTATGGTGT--C--CTTGAGCAAGACAC-TTCT-TCCGT--ATATGCTTAGTACTGGTTCTACCCAG
gi|121582 : TATGTGTGGTGT--C--CTTGAGCAAGACAC-TTTT-TCCAT--ATATGTTTAGTACTGGTTCTACCCAG
gi|121583 : TATTTGTGGTGT--C--CTTGAGCAAGACAC-TTTT-TCCGC--ATATGCTTTGTACTGGTTCTACCCAG
gi|121584 : TATGTGTGGTGT--C--CTTGAGCAAGACAC-TTTT-TCCGC--ATATGCTTTGTACTGGTACTACCCAG
gi|121586 : TATGTGTGGTGT--C--CTTGAGCAAGACAC-ATTT-TCCGC--ATATGCTTTGTACTGGTTCTACCCAG
gi|121587 : TGTGTGTGGTGT--C--CTTGAGCAAGACAC-TTTT-TCCAC--ATATGCTTAGTACTGGTTCTACCC
gi|121589 : TAGGTGTGGTGT--C--CTTGAGCAAGACAC-TTTT-TCTGC--ATATGCTTGGTACTGGTTCTACCCAG
gi|121590 : TATGTGTGGTGT--C--CTTGAGCAAGGCAC-CTTT-TCCGC--ATATGCTTAGTACTGGTTCTAACCAG
gi|121591 : TATGTGTGGTGT--C--CTTGAGCAAGACAC-CTTT-CCCGC--ATATGCTTAGTACTGGTTCTAACCAG
gi|121592 : TATGTGTGGTGT--C--CTTGAGCAAGACAC--TTT-TCCGC--ATATGCTTAGTACTGGTTCTAACCAG
gi|121596 : TATGTGTGGTGT--C--CTTGAGTAAGACGC-TTTT-TCCGC--ATATGCTTAGTACTGGTTCTACCAAG
gi|121597 : TATGTGTGGTGT--C--CTTGAGCAAGACAC--TTT-TCCGC--ATATGCTTAGTACTGGTTCTAACCAG
gi|121599 : TATGTGTGGTGT--C--CTTGAGCAAGACAC--TTT-TCCGC--ATATGCTTAGTACTGGTTCTAACCAG
gi|121600 : TATGTGTGGTGT--C--CTTGAGTAAGACGC-TTTT-TCCGC--ATATGCTTAGTACTGGTTCTACCAAG
gi|121601 : TATGTGTGGTGT--C--CTTGAGCAAGACAC-CTTT-TCCAC--ATATGCTTAGTACTCGTTCTACCCAG
gi|121603 : TATGTGTGGTGT--C--CTTGAGCAAGACAC--TTT-TCCGC--ATATGCTTAGTACTGGTTCTAACCAG
gi|121604 : TATGTGTGGTGT--C--CTTGAGCAAGACAC--TTT-TCCGC--ATATGCTTAGTACTGGTTCTAACCAG
gi|121605 : TATGTGTGGTGT--C--CTTGAGCAAGACAC-TTTA-TCCAC--ATATGCTTAGTACTGGTTCTACCCGG
gi|121606 : TATGTGTGGCGT--C--CTTGAGTAAGACAC-TTTT-TCCGC--ATATGCTTTGTACTGGTTCTACCCAG
gi|121607 : TATGTGTTGTAT--C--CTTGAGCAAGACAC-TTTT-TCCGC--ATATGCTTAGTACTGATTCTACCCAG
gi|121608 : TATGTGTGGTGT--C--CTTGAGCAAGACAT-TTTT-TCTGC--ATATGCTTTGTACTGGTTCTACCCAG
gi|121609 : TATGTGTGGTGT--C--CTTGAGTAAGACAC-TTTT-TCTGC--ATATGCTTTGTACTGGTTCTACCCAG
gi|121610 : TATGTGTGGTGT--C--CTTGAGCAAGACAC-TTTT-TTCAC--ATATGCTTTGTACTGGTTCTACCCAG
gi|121612 : TATGTGTAGTGT--C--CTTGAGCAAGACAC-TTTT-TCCAC--ATATGCTTTGTACTGGTTCTACCCAG
gi|121613 : TATGTGTGGTGT--C--CTTGAGCAAGACAT-TTTT-TCTGC--ATATGCTTTGTACTGGTTCTACCCAG
gi|121614 : TATGTGTGGTGT--C--CTTGAGCAAGACAC-TTTT-TCTGC--ATATACTTAGAACTGGTTCTACCCAG
gi|121615 : TATGTGTGGTGT--T--CTTAAGCAAAACAC-TTTT-TCCAC--TTATGCTTAGTACTGGTTCTACCCAG
gi|121616 : TATGTGTGGTGT--C--CTTGAGCAAGACAC-TTTT-T-CGC--ATATGCTTAGTACTGGTTCTAACCAG
gi|121617 : TATGTGTGGTGT--T--CTTGAGCAAGACAC-TTTT-TCAGC--ATATGCAAAGTACTGGTTCTACCCAG
gi|121618 : TATGTGTGGTGT--T--CTTGAGCACGACAC-TTTT--CAGC--ATATGCTTAGTACTGGTTCTACCCAG
gi|121620 : TATGTGTGGTGT--T--ATTGAGCAAGACAC-TTTT--CCGC--ATATGCTTAGTACTGGTTCTAACCAG
gi|121621 : TATGTGTGGTGT--C--CTTGAGCAAGACAC-CTTT-TCCGC--ATATGCTTAGTACTGGTCATACCCA
gi|121622 : TATGTGTGGTGT--C--CTTGAGAAAGACAC-TTTT-TCCAC--ATATGCTTAGTACTGGTTATACCCAG
gi|121624 : TATGTGTGGTGT--T--CTTGAGCAAGAAAC-TTTT-TCCAC--ACATGCTTAGTACTGGTTATACCCAG
gi|121625 : TATGTGTGGTGT--C--CTTGAGCAAGGCAC-TTTT-TCCGC--ATATGCTTTGTACTGGTACTACCCAG
gi|121626 : TATGTGTGGTGT--C--CTTGAGCAAGACAC-TTTT-TACAC--ATATGCTTTGTACTGGTTCTACCCAG
gi|121627 : TATGTGTGGTGT--C--CTTGAGCAAGTCAC-TTTT-TCCAC--ATATGCTTAGTACTGGTTATACCCAG
gi|121628 : TATGTGTGGTGT--C--CATGAGCAAGACAC-TTTT-TCCGC--ATATGCTTTGTACTGGCTCTACCCAG
gi|121629 : TATGTGTG-TGT--C--CTTGAGCAAGATAC-TTTT-TCCGC--ATATGCTTAGTACTGGTTCTATCCAG
gi|121631 : TATGTGTGGTGT--C--CTTGAGCAAGACAC-TTTT-TCCACATATATGCTTAGTACTGGTTATACCCAG
gi|121634 : TATGTGTGGTGT--C--CTTGAGCAAGACAC--TTT-CCCGC--ATATGCTTAGTACTGGTTCTAACCAG
gi|121635 : TACGTGTGGTGT--C--CTTGAGCAAGACAC-TTTT--CCGC--ATATGCTTAGTACTGGTTCTAACCAG
gi|121636 : TATGTGTGGCGT--C--CTTGAGCAAGACAC-TTTT--CCGC--ATATGCTTAGTACTGGTTCTAACCAG
gi|121640 : TATGTGTGGTGT--C--CTTGAGTAAGACAC-TTTT--CCGC--ATATGCTTAGTACTGGTTCTAACCAG
gi|121641 : TATGTGTGGTGT--C--CTTGAACAAGACAC-TTTT--CCGC--ATATGCTTAGTACTGGTTCTAACCAG
gi|121642 : TGTGTGTGGTAT--C--CTTGAGCAAGACAC-CTTT-TCCGC--ATATGCTTAGTACTGGTACTACCCAG
gi|121643 : TATGTGTGGTGC--C--CTTGAGCAAGGTAC-TTTT-TCCGC--ATATGCTTTGTACTGGTTCTACCCAG
gi|121644 : TATGTATGTTGT--C--CTTGAGCAAGACAC-TTTT-TCCGC--GTATGCTTAGTACTGGTTCTACCTAG
gi|121645 : TATGTATGGTGT--C--CTTGAGCAAGACAC-TTTT-TTCGC--ATAAGCTTAGTACTGGTTCCACCCAG
gi|121646 : TATGTGCGGTGT--C--CTTGAGCAAGACAT-TTTA-TCCAC--ATATGCTTAGTACTGGTTCTACCCAG
gi|121647 : TATGTGTAGTGT--C--CTTGAGCAAGACAC-TTTT-TCCAC--ATATACTTAGTACTGGTTCTACACAG
gi|121649 : TATGTGTGGTAT--C--CTTGAGCAAGACAC-CTTT-TCCAC--ATATGCTTAGTACTGGTACTACCCAG
gi|121651 : TATGTGTGGTGT--TTTCTTGAGCAAGACAC-TTTT-TCTGC--ATATGCATAGTACTGATTCTACCCAG
gi|121654 : TATGTGTAGTGT--C--TTTGAGCAAGACAC-CTTT-TCCGC--ATATGCTTTGTACTGGTTCTACCCAG
gi|121655 : TATGTGTGGTGT--C--CTTGAACAAGACAC-TTTT-TTCTC--ATATGTTTAGTACTGGTTCTACCCAG
gi|121658 : TATGTGTGATGT--T--CTCGAGCAAGACAC-TTTA-TCTAC--ATATGCTTAGTACTGGTTCTACCCAG
gi|121659 : TATGTGTGGTGT--C--ATTGAGCAAGACAC-TTTA-TCCGC--ATATGCTTAGTACTGGTTATACCCAG
gi|121660 : TATGTGTGGTTT--C--CTTGAGCAAGACAC-TTTT-TCCGC--ATATGCTTTGTACTGGTTCTAACCAG
gi|121661 : TATGTGTGGTGT--T--CTTGAGCAAGGCAC-TTTTTTCCGC--ATATGCTTTGTACTGGTACTACCCAG
gi|121662 : TATGTGTGGTGT--C--CTTGAGCATGACAC-CTTT-TCCGC--ATATGCTTAGTACTGGTTCTATCC
gi|121663 : TGTGTGTGGTGT--T--CTTGAGCAAGATAC-TTTT-TCTGC--ATGTGCTTAGTATTGGTTCTACTCAG
gi|121664 : TATGTATGGTGT--T--CTTGAGCAAGACAC-TTTT-TCCGC--AAATGCTTAGTACTGGTACTTCCCAG
gi|121665 : TATGTGGGGTGT--C--CTTGAGCAAGACAC-TTTT--CCGC--ATATGCTTAGTACTGGTTCTAACCAG
gi|121666 : TATGTGTGGTGT--T--CTTGAGCAAGACAT-TTTT-TTCGC--ATATGTTTAGTACTAGTTC-ACCCAG
gi|121667 : TATGTTTGGTGT--C--CTTGAGCAAGACAC-TTTT--CCGC--ATATGCTTAGTACTGGTTCTAACCAG
gi|121669 : TATGGGTGGTGT--C--CTTGAGCAAGACAC-TTTT-TCCAC--ATGTGCTTAGTACTGGTTATACCCAG
gi|121670 : TATGTGTTGTGT--C--CTTGAGCAAGACAC-TTTT-TTCGC--ATATGCTTAGTACTGGTTCTGCCAAG
gi|121671 : TATGTGTGGTGT--C--CTTGAGCAAGACAC-TTGT-TCCAT--ATATGCTTTGTACTGGTTCTACCCAG
gi|121673 : TATGTGTGGTGT--C--CTTGAGCAAGACAC-TTTA-TCTAC--ATATGCTTAGTACGGGTTCTACCCAG
gi|121674 : TATGTGTGGTGC--C--CTTGAGCATGACAT-TTTT-TCCGC--ATATTCTTAGTACTGGTTCTACCCAG
gi|121675 : TATGTGGGGTGT--C--CTTGAGTAAGACGC-TTTT-TCCAC--ATATGCTTAGTACTGGTTCTACCCA
gi|121676 : TATGTGTGGTGT--C--CTTGAGCAAGACACTTTTT-TTCGT--ATATGCTTAGTACTGGTTCTAACCAG
gi|121677 : TATGTGCGGTGT--C--CATGAGCTAGACAC-CTTT-TCCGC--ATATGCTTAGTACTGGTTCTACCCAG
gi|121678 : TATGTGTGGTGT--C--CTTGAGCAAGACAC-TTTT-TCCGC--ATAGACTTTGTATTGGTTCTACCCAG
gi|121679 : TATGTGTGGTGT--C--CTTGAGCATGACAC-TTTT-TCCGC--AAATGCTTAGTACTGGCTCTATCCAG
gi|121680 : TATGTGTGGTGT--C--CTTGTGCAAGACAC-TTTT-TCCAT--ATATGCTTAGTACTGGTTATACCCAG
gi|121681 : TATATGTGGTGT--C--CTTGAGCAAGACAC-TTTT-TCCAC--ATATGCTTTGTACTGGATCTACCCAG
gi|121683 : TATGTGTGATGT--C--CTTGAGCAAGACAC-ATTT-TCCAC--ATATGCTTTGTACTGGTTCTACCCAG
gi|121684 : TATGTGTGGTGT--C--CTTGGGCAAAACAC-TTCT-TCCGC--ATATGCTTAGTACTGGTGCTACCCGG
gi|121685 : TATGTGTGGTGTATC--CTTGAGCAAGACAC-TTTT--CCGC--ATATGCTTAGTACTGGTTCTAACCAG
gi|121687 : TATGTGCGGTGT--C--CTTGAGCAAGACAC--TTT-TCCGC--ATATGTTTAGTACTGGTTCTAACCAG
gi|121689 : TATGTGTGGTGT--C--CTTGAGCAAGACAC--CTT-TCCAC--ATATGCTTAGTACTGGTTATACCCAG
gi|121690 : TATGTGTGGTGT--C--CTTGAGCAAGACAC-ATTT-T-CGC--ATATGCTTAGTACTGGTTCTAACCAG
gi|121691 : TATGTGTGGTGT--C--ATTGAGCAAGACAC-CTTT-TCCGC--ATACGCTTAGTACTGGTTCTACC
gi|121692 : TATGTGTGGTGT--C--CTTGAGCAAGTCA--TTTT-TCCGC--ATATGCTTAGAACTGGTTCTACCCAG
gi|121694 : TACGTGTGGTAT--C--CTTGAGCAAGACAC-ATTT--CCGC--ATATGCTTAGTACTGGTTCTACCCAG
gi|121695 : TATATGTGGTGT--C--CTTAAGTAAGACAC-TTTT-TCTGC--ATATGCGTAGTACTGGTTCTACCCAG
gi|121696 : TACGTGTGG-AT--T--CTTGAGCAAGACAC-CTTT-TCCGC--ATATGCTAAGTACTGGTTCTACCCAG
gi|121859 : ATGTGTGGTGT--C--CTTTAGCAAGACAC-TTTT-TCCGC--ATATGCTTTGTACTGGTTCTACCCAG
gi|121893 : TGTGAGGTGT--C--CTTGAGCAAGACAC-TTTT-GCCGC--ATATGCTTAGTACTGGTTCTATCCAG
gi|121894 : TGTGTGGTGT--C--CTTGAGCAAGACAC-TTTT-TCCAC--TTATGCTTAGTACTGGTTATACCCAG
gi|121926 : TGTGGTGT--C--CTTCAGCAAGACAC-TTTT-TCCGC--ATATGCTTAGTACTGGTTCCACCCAG
gi|121932 : GTGGTGT--C--ATTGAGCAAGGCAC-TTTT-TCCGC--ATATGCTTAGTACTGGTTCTACCCAG
blockSeqCons :
originalCons : TATGTGTGGTGT--C--CTTGAGCAAGACAC-TTTT-TCCGC--ATATGCTTAGTACTGGTTCTACCCAG
finalCons : TATGTGTGGTGT--C--CTTGAGCAAGACAC-TTTT-TCCGC--ATATGCTTAGTACTGGTTCTACCCAG
Alignments
lowQualScore : 00 00 0 0 00
lowQualScore : .. .. . . ..
lowQualScore : 66 66 4 4 55
consensus : TATGTGTGGTGT--C--CTTGAGCAAGACAC-TTTT-TCCGC--ATATGCTTAGTACTGGTTCTACCCAG
Reference ( family-105 ) : TATGTGTGGTGT--C--CTTGAGCAAGACAC-TTTT-TCCGC--ATATGCTTAGTACTGGTTCTACCCAG
gi|121571 : TATGTGTGGTGT--C--CTTGAGCAAGACAC-TTTT-TCCGC--ATATGCTTAGTACTGGTTCTATCCAG
gi|121572 : TATGTGTGATGT--T--CTTGAACAAGACAC-CCTT-TCTGC--ATATGCTTAGTACTGGTTCTACCC
gi|121573 : TATGTGTGGTGT--C--CTTGAGCAAGACAC-TTTT-TCCGC--ATATGCTTTGTACTGGTTCTACCCAG
gi|121574 : TATGTGTGGTGT--C--CTTGAGCAAGACAC-TTTT-TCCGC--ATATGCTAAGTACTGGTTCTACCCAG
gi|121575 : TATGTGTGGTGT--C--CTTAAGCAAGACAC-TTTT-TCTGC--ATATGCTTAGTACTGGTTCTACCCAG
gi|121576 : TATGTGTGGTGT--C--CTTGAGCAAGACAC-TTTA-TCCGC--ATATACTTAGTACTGGTTCTACCCAG
gi|121578 : TATGTGTGGTGT--C--CTTGAGCAAGACAC-TTTT-TCTGC--ATATGCTTTGTACTGGTTCTACCCAG
gi|121580 : TATGTATGGTGT--C--CTTGAGCAAGACAC-TTCT-TCCGT--ATATGCTTAGTACTGGTTCTACCCAG
gi|121582 : TATGTGTGGTGT--C--CTTGAGCAAGACAC-TTTT-TCCAT--ATATGTTTAGTACTGGTTCTACCCAG
gi|121583 : TATTTGTGGTGT--C--CTTGAGCAAGACAC-TTTT-TCCGC--ATATGCTTTGTACTGGTTCTACCCAG
gi|121584 : TATGTGTGGTGT--C--CTTGAGCAAGACAC-TTTT-TCCGC--ATATGCTTTGTACTGGTACTACCCAG
gi|121586 : TATGTGTGGTGT--C--CTTGAGCAAGACAC-ATTT-TCCGC--ATATGCTTTGTACTGGTTCTACCCAG
gi|121587 : TGTGTGTGGTGT--C--CTTGAGCAAGACAC-TTTT-TCCAC--ATATGCTTAGTACTGGTTCTACCC
gi|121589 : TAGGTGTGGTGT--C--CTTGAGCAAGACAC-TTTT-TCTGC--ATATGCTTGGTACTGGTTCTACCCAG
gi|121590 : TATGTGTGGTGT--C--CTTGAGCAAGGCAC-CTTT-TCCGC--ATATGCTTAGTACTGGTTCTAACCAG
gi|121591 : TATGTGTGGTGT--C--CTTGAGCAAGACAC-CTTT-CCCGC--ATATGCTTAGTACTGGTTCTAACCAG
gi|121592 : TATGTGTGGTGT--C--CTTGAGCAAGACAC--TTT-TCCGC--ATATGCTTAGTACTGGTTCTAACCAG
gi|121596 : TATGTGTGGTGT--C--CTTGAGTAAGACGC-TTTT-TCCGC--ATATGCTTAGTACTGGTTCTACCAAG
gi|121597 : TATGTGTGGTGT--C--CTTGAGCAAGACAC--TTT-TCCGC--ATATGCTTAGTACTGGTTCTAACCAG
gi|121599 : TATGTGTGGTGT--C--CTTGAGCAAGACAC--TTT-TCCGC--ATATGCTTAGTACTGGTTCTAACCAG
gi|121600 : TATGTGTGGTGT--C--CTTGAGTAAGACGC-TTTT-TCCGC--ATATGCTTAGTACTGGTTCTACCAAG
gi|121601 : TATGTGTGGTGT--C--CTTGAGCAAGACAC-CTTT-TCCAC--ATATGCTTAGTACTCGTTCTACCCAG
gi|121603 : TATGTGTGGTGT--C--CTTGAGCAAGACAC--TTT-TCCGC--ATATGCTTAGTACTGGTTCTAACCAG
gi|121604 : TATGTGTGGTGT--C--CTTGAGCAAGACAC--TTT-TCCGC--ATATGCTTAGTACTGGTTCTAACCAG
gi|121605 : TATGTGTGGTGT--C--CTTGAGCAAGACAC-TTTA-TCCAC--ATATGCTTAGTACTGGTTCTACCCGG
gi|121606 : TATGTGTGGCGT--C--CTTGAGTAAGACAC-TTTT-TCCGC--ATATGCTTTGTACTGGTTCTACCCAG
gi|121607 : TATGTGTTGTAT--C--CTTGAGCAAGACAC-TTTT-TCCGC--ATATGCTTAGTACTGATTCTACCCAG
gi|121608 : TATGTGTGGTGT--C--CTTGAGCAAGACAT-TTTT-TCTGC--ATATGCTTTGTACTGGTTCTACCCAG
gi|121609 : TATGTGTGGTGT--C--CTTGAGTAAGACAC-TTTT-TCTGC--ATATGCTTTGTACTGGTTCTACCCAG
gi|121610 : TATGTGTGGTGT--C--CTTGAGCAAGACAC-TTTT-TTCAC--ATATGCTTTGTACTGGTTCTACCCAG
gi|121612 : TATGTGTAGTGT--C--CTTGAGCAAGACAC-TTTT-TCCAC--ATATGCTTTGTACTGGTTCTACCCAG
gi|121613 : TATGTGTGGTGT--C--CTTGAGCAAGACAT-TTTT-TCTGC--ATATGCTTTGTACTGGTTCTACCCAG
gi|121614 : TATGTGTGGTGT--C--CTTGAGCAAGACAC-TTTT-TCTGC--ATATACTTAGAACTGGTTCTACCCAG
gi|121615 : TATGTGTGGTGT--T--CTTAAGCAAAACAC-TTTT-TCCAC--TTATGCTTAGTACTGGTTCTACCCAG
gi|121616 : TATGTGTGGTGT--C--CTTGAGCAAGACAC-TTTT-T-CGC--ATATGCTTAGTACTGGTTCTAACCAG
gi|121617 : TATGTGTGGTGT--T--CTTGAGCAAGACAC-TTTT-TCAGC--ATATGCAAAGTACTGGTTCTACCCAG
gi|121618 : TATGTGTGGTGT--T--CTTGAGCACGACAC-TTTT--CAGC--ATATGCTTAGTACTGGTTCTACCCAG
gi|121620 : TATGTGTGGTGT--T--ATTGAGCAAGACAC-TTTT--CCGC--ATATGCTTAGTACTGGTTCTAACCAG
gi|121621 : TATGTGTGGTGT--C--CTTGAGCAAGACAC-CTTT-TCCGC--ATATGCTTAGTACTGGTCATACCCA
gi|121622 : TATGTGTGGTGT--C--CTTGAGAAAGACAC-TTTT-TCCAC--ATATGCTTAGTACTGGTTATACCCAG
gi|121624 : TATGTGTGGTGT--T--CTTGAGCAAGAAAC-TTTT-TCCAC--ACATGCTTAGTACTGGTTATACCCAG
gi|121625 : TATGTGTGGTGT--C--CTTGAGCAAGGCAC-TTTT-TCCGC--ATATGCTTTGTACTGGTACTACCCAG
gi|121626 : TATGTGTGGTGT--C--CTTGAGCAAGACAC-TTTT-TACAC--ATATGCTTTGTACTGGTTCTACCCAG
gi|121627 : TATGTGTGGTGT--C--CTTGAGCAAGTCAC-TTTT-TCCAC--ATATGCTTAGTACTGGTTATACCCAG
gi|121628 : TATGTGTGGTGT--C--CATGAGCAAGACAC-TTTT-TCCGC--ATATGCTTTGTACTGGCTCTACCCAG
gi|121629 : TATGTGTG-TGT--C--CTTGAGCAAGATAC-TTTT-TCCGC--ATATGCTTAGTACTGGTTCTATCCAG
gi|121631 : TATGTGTGGTGT--C--CTTGAGCAAGACAC-TTTT-TCCACATATATGCTTAGTACTGGTTATACCCAG
gi|121634 : TATGTGTGGTGT--C--CTTGAGCAAGACAC--TTT-CCCGC--ATATGCTTAGTACTGGTTCTAACCAG
gi|121635 : TACGTGTGGTGT--C--CTTGAGCAAGACAC-TTTT--CCGC--ATATGCTTAGTACTGGTTCTAACCAG
gi|121636 : TATGTGTGGCGT--C--CTTGAGCAAGACAC-TTTT--CCGC--ATATGCTTAGTACTGGTTCTAACCAG
gi|121640 : TATGTGTGGTGT--C--CTTGAGTAAGACAC-TTTT--CCGC--ATATGCTTAGTACTGGTTCTAACCAG
gi|121641 : TATGTGTGGTGT--C--CTTGAACAAGACAC-TTTT--CCGC--ATATGCTTAGTACTGGTTCTAACCAG
gi|121642 : TGTGTGTGGTAT--C--CTTGAGCAAGACAC-CTTT-TCCGC--ATATGCTTAGTACTGGTACTACCCAG
gi|121643 : TATGTGTGGTGC--C--CTTGAGCAAGGTAC-TTTT-TCCGC--ATATGCTTTGTACTGGTTCTACCCAG
gi|121644 : TATGTATGTTGT--C--CTTGAGCAAGACAC-TTTT-TCCGC--GTATGCTTAGTACTGGTTCTACCTAG
gi|121645 : TATGTATGGTGT--C--CTTGAGCAAGACAC-TTTT-TTCGC--ATAAGCTTAGTACTGGTTCCACCCAG
gi|121646 : TATGTGCGGTGT--C--CTTGAGCAAGACAT-TTTA-TCCAC--ATATGCTTAGTACTGGTTCTACCCAG
gi|121647 : TATGTGTAGTGT--C--CTTGAGCAAGACAC-TTTT-TCCAC--ATATACTTAGTACTGGTTCTACACAG
gi|121649 : TATGTGTGGTAT--C--CTTGAGCAAGACAC-CTTT-TCCAC--ATATGCTTAGTACTGGTACTACCCAG
gi|121651 : TATGTGTGGTGT--TTTCTTGAGCAAGACAC-TTTT-TCTGC--ATATGCATAGTACTGATTCTACCCAG
gi|121654 : TATGTGTAGTGT--C--TTTGAGCAAGACAC-CTTT-TCCGC--ATATGCTTTGTACTGGTTCTACCCAG
gi|121655 : TATGTGTGGTGT--C--CTTGAACAAGACAC-TTTT-TTCTC--ATATGTTTAGTACTGGTTCTACCCAG
gi|121658 : TATGTGTGATGT--T--CTCGAGCAAGACAC-TTTA-TCTAC--ATATGCTTAGTACTGGTTCTACCCAG
gi|121659 : TATGTGTGGTGT--C--ATTGAGCAAGACAC-TTTA-TCCGC--ATATGCTTAGTACTGGTTATACCCAG
gi|121660 : TATGTGTGGTTT--C--CTTGAGCAAGACAC-TTTT-TCCGC--ATATGCTTTGTACTGGTTCTAACCAG
gi|121661 : TATGTGTGGTGT--T--CTTGAGCAAGGCAC-TTTTTTCCGC--ATATGCTTTGTACTGGTACTACCCAG
gi|121662 : TATGTGTGGTGT--C--CTTGAGCATGACAC-CTTT-TCCGC--ATATGCTTAGTACTGGTTCTATCC
gi|121663 : TGTGTGTGGTGT--T--CTTGAGCAAGATAC-TTTT-TCTGC--ATGTGCTTAGTATTGGTTCTACTCAG
gi|121664 : TATGTATGGTGT--T--CTTGAGCAAGACAC-TTTT-TCCGC--AAATGCTTAGTACTGGTACTTCCCAG
gi|121665 : TATGTGGGGTGT--C--CTTGAGCAAGACAC-TTTT--CCGC--ATATGCTTAGTACTGGTTCTAACCAG
gi|121666 : TATGTGTGGTGT--T--CTTGAGCAAGACAT-TTTT-TTCGC--ATATGTTTAGTACTAGTTC-ACCCAG
gi|121667 : TATGTTTGGTGT--C--CTTGAGCAAGACAC-TTTT--CCGC--ATATGCTTAGTACTGGTTCTAACCAG
gi|121669 : TATGGGTGGTGT--C--CTTGAGCAAGACAC-TTTT-TCCAC--ATGTGCTTAGTACTGGTTATACCCAG
gi|121670 : TATGTGTTGTGT--C--CTTGAGCAAGACAC-TTTT-TTCGC--ATATGCTTAGTACTGGTTCTGCCAAG
gi|121671 : TATGTGTGGTGT--C--CTTGAGCAAGACAC-TTGT-TCCAT--ATATGCTTTGTACTGGTTCTACCCAG
gi|121673 : TATGTGTGGTGT--C--CTTGAGCAAGACAC-TTTA-TCTAC--ATATGCTTAGTACGGGTTCTACCCAG
gi|121674 : TATGTGTGGTGC--C--CTTGAGCATGACAT-TTTT-TCCGC--ATATTCTTAGTACTGGTTCTACCCAG
gi|121675 : TATGTGGGGTGT--C--CTTGAGTAAGACGC-TTTT-TCCAC--ATATGCTTAGTACTGGTTCTACCCA
gi|121676 : TATGTGTGGTGT--C--CTTGAGCAAGACACTTTTT-TTCGT--ATATGCTTAGTACTGGTTCTAACCAG
gi|121677 : TATGTGCGGTGT--C--CATGAGCTAGACAC-CTTT-TCCGC--ATATGCTTAGTACTGGTTCTACCCAG
gi|121678 : TATGTGTGGTGT--C--CTTGAGCAAGACAC-TTTT-TCCGC--ATAGACTTTGTATTGGTTCTACCCAG
gi|121679 : TATGTGTGGTGT--C--CTTGAGCATGACAC-TTTT-TCCGC--AAATGCTTAGTACTGGCTCTATCCAG
gi|121680 : TATGTGTGGTGT--C--CTTGTGCAAGACAC-TTTT-TCCAT--ATATGCTTAGTACTGGTTATACCCAG
gi|121681 : TATATGTGGTGT--C--CTTGAGCAAGACAC-TTTT-TCCAC--ATATGCTTTGTACTGGATCTACCCAG
gi|121683 : TATGTGTGATGT--C--CTTGAGCAAGACAC-ATTT-TCCAC--ATATGCTTTGTACTGGTTCTACCCAG
gi|121684 : TATGTGTGGTGT--C--CTTGGGCAAAACAC-TTCT-TCCGC--ATATGCTTAGTACTGGTGCTACCCGG
gi|121685 : TATGTGTGGTGTATC--CTTGAGCAAGACAC-TTTT--CCGC--ATATGCTTAGTACTGGTTCTAACCAG
gi|121687 : TATGTGCGGTGT--C--CTTGAGCAAGACAC--TTT-TCCGC--ATATGTTTAGTACTGGTTCTAACCAG
gi|121689 : TATGTGTGGTGT--C--CTTGAGCAAGACAC--CTT-TCCAC--ATATGCTTAGTACTGGTTATACCCAG
gi|121690 : TATGTGTGGTGT--C--CTTGAGCAAGACAC-ATTT-T-CGC--ATATGCTTAGTACTGGTTCTAACCAG
gi|121691 : TATGTGTGGTGT--C--ATTGAGCAAGACAC-CTTT-TCCGC--ATACGCTTAGTACTGGTTCTACC
gi|121692 : TATGTGTGGTGT--C--CTTGAGCAAGTCA--TTTT-TCCGC--ATATGCTTAGAACTGGTTCTACCCAG
gi|121694 : TACGTGTGGTAT--C--CTTGAGCAAGACAC-ATTT--CCGC--ATATGCTTAGTACTGGTTCTACCCAG
gi|121695 : TATATGTGGTGT--C--CTTAAGTAAGACAC-TTTT-TCTGC--ATATGCGTAGTACTGGTTCTACCCAG
gi|121696 : TACGTGTGG-AT--T--CTTGAGCAAGACAC-CTTT-TCCGC--ATATGCTAAGTACTGGTTCTACCCAG
gi|121859 : ATGTGTGGTGT--C--CTTTAGCAAGACAC-TTTT-TCCGC--ATATGCTTTGTACTGGTTCTACCCAG
gi|121893 : TGTGAGGTGT--C--CTTGAGCAAGACAC-TTTT-GCCGC--ATATGCTTAGTACTGGTTCTATCCAG
gi|121894 : TGTGTGGTGT--C--CTTGAGCAAGACAC-TTTT-TCCAC--TTATGCTTAGTACTGGTTATACCCAG
gi|121926 : TGTGGTGT--C--CTTCAGCAAGACAC-TTTT-TCCGC--ATATGCTTAGTACTGGTTCCACCCAG
gi|121932 : GTGGTGT--C--ATTGAGCAAGGCAC-TTTT-TCCGC--ATATGCTTAGTACTGGTTCTACCCAG