lowQualScore : 11111111111111111111111111111111111111111111111111111111
lowQualScore : 1 2222222 2222 3333 55555555555555555 1 4444444444444444444444444444444444 11 3333 2222 11 222222 4444444 1 1 333333 11 1 11 1 1 1 22222222 1 1111 11111111 1 11 22222 11111 88888888888888888888888888 111111 111111111 1111 222222 33333 11 1 2222222 2222222222222 666666666666666666666666666666666 11111 1111 22222222222222 1 444444444444 2222 2222222 1 1111 11111111111111 55555555555555555555555555 1 11111 1 1111 11111111111 111 66666666666666666666666666666666666666666666666666 44444444444444444444444444 1 2222 222 1111 1 222222222 111 22 77777777777777777 1111 1111111111 111 4444444444444444444444 111111 111 1111111 1111111111111 55555555555555555555555555555555555555555555555555555555 111111111 4444444444444444444444444444444444444444444 1111 222222222 222222222222222222222 1111 1111 2222222222222 222222222222222 55555555555555 111111111111 1111111 11111 222222222222222 11 111111111 11111111 111 111111 222 1111111111 11111 333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333 222 1
lowQualScore : 5 3 0 88 9 99 77 99 6 5555555 2 88 3 6 4444 88888 3 4444 8 4 6 9999 44444444444444444 0 3 5 9999999999999999999999999999999999 5 3 77 5555 6 1111 6 22 999 8 333333 4 6 0000000 6 1 4 44 0 66 1 77 999999 88 8888 00 3 11 2 0 66 0 55555555 2 2 0 8 3 6666 2 5 0 77 44444444 2 33 33333 999 3 44444 3 0 5 1 66 0 5 99 88888888888888888888888888 77 44 8888 1 4 999999 8 666666666 2 5 8888 66 3 0 555555 2 0 2 1 3 11111 5 00 4 0 2 55 5555555 2 6 777 1 2222222222222 11 111111111111111111111111111111111 2 55555 99 2 8888 9 2 666 2 66666666666666 22 66 77777 1 8 555555555555 0 2222 5 0 5 5 5555555 0 5 4 7777 99999999999999 55555555555555555555555555 99 6 2 88 66 7 8 1 33333 99 1 7 6 0 4444 1 1 99999999999 000 66666666666666666666666666666666666666666666666666 2 22222222222222222222222222 0 4444 111 3 6 3333 6 3 3 0 222222222 77 66 2 9999 1 55 888 4 33 66666666666666666 2 0 1 0 1111 2 1 6 2222222222 3 3 3 5 888 33 3 4 1111111111111111111111 4 444444 333 3 0000000 6666666666666 1 22222222222222222222222222222222222222222222222222222222 444 2 33 2 33 000000000 6666 3 2 5555 66 77 333 33 6666 9999999999999999999999999999999999999999999 1 77777 3 1111 1 888 000000000 0 66 555555555555555555555 7777 0000 444 3 0000000000000 555 222222222222222 3 3 999 11111111111111 1 3 44 2 555 44 6 3 555555555555 5555 3 3 888 7777777 3 00000 1 3 777777777777777 33 333333333 55555555 0 000 333333 1 111 1 6666666666 2 22222 999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999 0 0 5 111 66 4 66 66 0 2 6 1
lowQualScore : . . . .. . .. .. .. . ....... . .. . . .... ..... . .... . . . .... ................. . . . .................................. . . .. .... . .... . .. ... . ...... . . ....... . . . .. . .. . .. ...... .. .... .. . .. . . .. . ........ . . . . . .... . . . .. ........ . .. ..... ... . ..... . . . . .. . . .. .......................... .. .. .... . . ...... . ......... . . .... .. . . ...... . . . . . ..... . .. . . . .. ....... . . ... . ............. .. ................................. . ..... .. . .... . . ... . .............. .. .. ..... . . ............ . .... . . . . ....... . . . .... .............. .......................... .. . . .. .. . . . ..... .. . . . . .... . . ........... ... .................................................. . .......................... . .... ... . . .... . . . . ......... .. .. . .... . .. ... . .. ................. . . . . .... . . . .......... . . . . ... .. . . ...................... . ...... ... . ....... ............. . ........................................................ ... . .. . .. ......... .... . . .... .. .. ... .. .... ........................................... . ..... . .... . ... ......... . .. ..................... .... .... ... . ............. ... ............... . . ... .............. . . .. . ... .. . . ............ .... . . ... ....... . ..... . . ............... .. ......... ........ . ... ...... . ... . .......... . ..... ............................................................ . . . ... .. . .. .. . . . .
lowQualScore : 8 0 0 44 3 22 33 22 7 5555555 2 88 5 7 3333 33333 2 4444 6 0 0 9999 33333333333333333 6 3 7 0000000000000000000000000000000000 6 3 22 8888 7 5555 7 88 333 3 000000 8 7 8888888 3 3 0 55 0 88 0 77 333333 33 3333 33 3 55 8 0 88 0 55555555 0 0 5 8 7 8888 5 0 8 55 33333333 0 00 11111 000 7 00000 3 4 3 7 99 4 7 22 33333333333333333333333333 99 44 4444 4 0 000000 7 000000000 2 0 5555 99 2 1 888888 2 4 4 7 7 11111 0 66 4 6 0 33 4444444 7 4 666 1 2222222222222 33 444444444444444444444444444444444 4 77777 99 2 8888 0 9 222 2 88888888888888 55 99 11111 4 1 000000000000 8 3333 7 4 7 7 9999999 1 0 1 4444 33333333333333 22222222222222222222222222 77 6 6 11 44 1 1 0 11111 22 2 8 7 2 2222 0 0 77777777777 000 55555555555555555555555555555555555555555555555555 5 55555555555555555555555555 0 8888 000 2 7 7777 0 2 0 0 555555555 44 22 5 7777 1 33 444 4 66 66666666666666666 4 7 1 6 7777 5 0 2 3333333333 6 6 3 7 777 88 5 5 1111111111111111111111 1 222222 333 1 0000000 9999999999999 2 00000000000000000000000000000000000000000000000000000000 999 9 44 9 99 999999999 1111 9 9 5555 66 33 777 77 4444 1111111111111111111111111111111111111111111 8 33333 3 7777 4 555 333333333 1 88 555555555555555555555 7777 8888 999 1 0000000000000 444 777777777777777 6 6 000 11111111111111 6 6 99 4 444 22 2 1 222222222222 2222 1 8 000 5555555 6 99999 2 6 111111111111111 00 333333333 44444444 8 999 888888 2 666 1 6666666666 0 33333 111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 1 2 0 666 11 4 11 11 7 3 6 4
consensus : GCTCACCGACAGCTCTCGGACGAACGCTTT--TAT-A--AA-AAGTTACAGTTTGACCC-TACCA-AAG-G-TTCT-CCACCAAGATCA--C-GAAACNCTTCAGGAAATG---TA----CGA--A--GGGCGAAATCGGTGACAA-CGT-CTTCGAAAC---GCT-TCGTC---CCAAC-GACTGTAGACCNGGGCAATTTTATNTACTGCCTAAAAT-C--AC-AAG-A-AAGA-CATGCCNGGCCGCCC-T-ATAGTC-GNGCCATTGG-GC-------ATCCCACGGAGAAAATCTCNGAATTCATTGACCT-ACACCTCCGCCCGCA-----TGTAANANANCTACCGTCATA-CTTGAAGGACACCACT-GACTACCTNAAC-GAAACCCCN-CTTCG-GACCTACCTGACGACACNCTNCTCGTGACCATGGATGTNACTTCA----CTNTACAC-TAACGTT--CCGCA-CGACGAGGAC-ATCGAGGCNTGCAGGGAGGTT-TGGA--AT----ANAAG--TC---TC---AANA-TC--CTTCCACTGAATCGCTNGTCCAGCTCCT-----T-G-AACGTGTCCTCA-AGCTCAA--TAACTTCATGTTC----AACGGCGANCACTACTTGCAAA-T-A-GTG-GCAC-NGCTATGGG-AACCAAAATGGCNCC--NTCN-TACGCCAACATCTT-T-ATGGGAAGACTC-----GAACGTAA---NCTCCT-GC-AT---CGNT--C-ACCATNTAAACCCCTC-AGTTGGCTACGTTTCA-TNGATGACATTGAGATG--AAGTG----GGT-TGACGGTCGTGAA--AGCCNCGACGACTTTAT--CGA---GNTNGCGAACTCTTTCCAC-NNTTCCA-TCAAG-T-TTAC----NGTGGANA-TTTCCGCATCCAG-GAACACNTTN--TTGGATACC-ACN-N--C-CACACT--TA-NGAACGGAGAAATCGAGTTCAGCCTCCAT-A-CNAAACCCACCGACTCTCATT--TATACCNTA-TGCCATCC----AGCTGTC-----ATCCGNCCCAT-A-CNTTCA------------AAGGNGT-GCC--GCC---CG-CGTCC------GCCGCATCTNCTCT-ATTCCCACCACTTTCC-NA--GAGGCA-AGGACACNTCCT-N-AAAGTCCATCCGACAAACAGAGGNTAT-GA--TCCTCGCAAGGTGCAGTCCGCAATTGATGAGATGTCACAACANGACNGACAGTCCCT---CCTCCA-ATA-TNA-AGAAAAACCT-C--AGA--A-T---GACAGAGTTCCACTGGTCACTAC-T--TACCACCCTGTCCTNAA-G-GA---CC-TC-AACANTAT-TCC-GAGAAAGCAT---NTGC-C-CATTCTGCATGCCAATAAAC---GAATGGC--TGAT-GTT-------TTCA-------------AGGAACC----------T-------------C---------G------TT--C--N----G--AC-GCCC-CAGA-AAC--CTG--------AAG----GACATG-GTGGTG--AGGACCAGACTGGATA--ACCC-TTTAC--CTAATGG---AGGTTTCAAAAC--------AT--GC-TCAGAC--CT---CA--AG---A-----TGTCAA--TC-GTG-CAA----ATAT---AGC-T--C----AGAC--ACT-------GAGANCTTCA-G-CAGTCCTGT--N-ACA-GGTCG-C-A-GTT-------------ATA---AA---------------A-TATTG-GG--GAACTA---CNT-----CCTGTAA-AACCGACA---AC--T-G-CAT-C----------TA-C--CTC-ATCAGT--TG-T--AANGTC-TG---CCAGAAA-CAGTACGT-------N-GG-NGA---------AA--------CTACG-GACC---TNCGCAGAAGGGT--CAACAACCACCGGTCCN-CCG-T-C-AAAACCAAAA-A---GG--------ATT-CGC-CG-GTA-N-CTACG--------CA--TTTCAA----T-----G-GTAGCAATCA-CCG--NTGG--GAGG-ACA--TGACAA--TANTAGTTATTGATCAT
Reference ( gi|1 ) : GCTCACAGACAGTTGTCAGACGAACGTTTT--TAC-A--AA-AAGTTGCAGTCTGACCC-CACTA-AAA-A-TTCT-CCATCAAGATCA--C-GAGACCCTTCAGAAAATG---CA----TGA--A--GAGTGAAATCGGTGATAA-TGT-ACTTGGAGC---GCT-TTGTC---CCAAC-GACTGTAGACCTGGACAATTCTACTTACTGCCTAAAAT-T--AC-AAG-A-AAGA-CATGCCAGGCCGTCC-T-ATTGTCAGTGCCATCGG-AC-------ACCCCACGGAGAAAATCTCTGAATTCATTGATTT-ACATCTCCGTCAGCA-----CGTAGAAGATTTACCGTCATA-CTTGAAGGATACGACT-GATTACCTAAAT-AAAACCCCA-CATCG-GGCCTGCCAGACCATACCCTCCTTGTGACTATGGATGTGACGTCA----CTCTACAC-CAACAAT--CCACA-TGATGAGGGT-ATTGAGGCCTGTAAAGAGGTT-TGGA--AT----CAAAGGGTCA-GTC---AACA-TC--CCTCAACTGAGTCACTCATTCGGCTTCT-----T-G-AACATGTCCTCA-AGTGTAA--TAACTTCATGTTT----GACGGTGAACACTACCTGCAAA-C-A-GTG-GCAC-TGCTATGGG-AACAAAAATGGCACC--TTCC-TATGCCAACATCTT-T-ATGGGAAGATTG-----GAACGTAG---ACTCCT-GC-AT---CACT--C-ACTAGTTAAACCTCTC-AGTTGGCTACGTTTCA-TAGATGACATCGAGATG--AAGTG----GGT-TGATGGTCGTGAA--AGCCTCAACGAGTTTAT--TAA---GATGGCAAACTCTTTCCAC-GATTCCA-TCAAG-T-TT-C----TGTGGATA-TTTCAACATCCAG-GAATACGTTT--TTGGATA-C-ACA-G--C-AACACT--TA-AGGACGGAGAAATCGAGTTTAATCTTCAC-A-CGAAACCCACAGATTCTCATT--TGTACCTTA-TGCCATCC----AGCTGTC-----ATCCACCCCAT-A-CTTTCA------------AAGGTGT-GCC--ACC---TG-CATCC------GCCGCATCTGCTCT-TTTCATACTAGTTTCC-TA--GA-ACA-AGGAAATATCCT-C-AAAGTCCATCTAACCAGCAGAGGATAT-AA--TCCTTGTAAAGTACAGTCCGTAATTGATGAGATGTCACAACAGGACCGACAATCCCT---CCTCCA-ATA-TCA-AGTGAAACC--C--AGG--A-T--CAACAGGGTCCCACTAGTCACTAC-T--TACCACCCTGCCCTTAG-G-GA---TC-TC-AATAGTAT-CAT-AAGAAAACAT---TTGT-C-TATCCTGTATGCCAACAAAC---GTATGGC--GGAT-GTT-------TTCA-------------AGGA-------------T-------------C---------G------TT--C--C----G--GC-GCCC-CAGA-AAC--CTG--------AAG----GATATG-GTGGTA--AGGACCAGGCTGGATA--ACCC-TCTAC--CTAATGG---AGGTTTCAAAAC--------AT--GC-TCAGAT--CT---TA--AA---A-----TGTCAA--TT-ATG-CAA----ACAT---AGC-T--T----AGAC--ACT-------GAGACTTCCA-G-AAGTCCTGT--G-ACA-GATCG-C-A-GTT-------------ATA---AA---------------A-TATTG-GG--GAACTA---CA------CCTGCAA-AACCAATA---AC--T-G-CAT-C----------TA-T--CTC-ATCAAT--TG-T--GATGTC-TG---CCAGAAA-CAGGACGT-------T-GG-AGA---------AA--------CTACA-GACC---TTCGTAAAAGGGT--AAACAATCACCGGTCCT-CCG-T-T-AGGACCAAAA-A---GG--------ACT-TGC-CG-GTA-T-CTACG--------CA--TTTCAA----T-----G-GTAGCAATCA-CCG--TTGG--GAGG-ACA--TGACAA--TATTAGTGATTGATCAT
gi|2 : GCGCACAGACAGCTCT-GGATGAACGGTTT--TAC-ACTAA-AA----C--TCCGACCC-TACCA-AAACG-TTTT-CCGCTACTATCA--CCGACACTCTTGAGCAAATGTTACA----AAA--AACGAGGAAAATTGGTAATAA-TGT-CTTTGAAACAGTGCT-GCCTC---TCAAC----TGTACAC-TGGGCAATTTTATCTCCTGCCTAAATC-C--AC-AA--A-AAGG-CATTCC-TGCCGCCC-C-ATTG--------------GC-------ACCCCACGGAGAAAATCTCAGAATTTATTGACCT-ACACCTCTGCCCATA-----TGTTGTAAAACTACCATCATA-CTTGAAGGACACCACT-GATTACCTTAACAAAAACCCCT-CTTCG-AACCTACCTGACAATACCCTTCTCGTGACCATGGATGTGACTTCG----CTTTACACAAAACATC--CCCCA-CGATGAAGAC-ATTGAAACCTGCTGGGAGG-T-TGGG--AT----AAAAGGATCCTGAA---AACA-TC--CTTCCACAGAATCA-TTGTCAAGCTCCT-----T-G-AACATGTCCTCA-AACTAAA--TAACTTCATGTTC----CAAGGCAACCATTACTTACAAGTT-A-GGG-GCACAAGCAATGGGAAACGAAGATGGATCC--TTTCATATGCCAACATTTT-T-ATGGGAAGACTT-----GAACGCAACTTACTCAG-GCAAT---CGCC-----CT--TTAAACCCCAT-AATTG--TGTGTTTCATTTGATGACATTGA-ATG--AAATGAAATGGC-GGAGGGCCGAGAT--A--CTTGACAACTTTAT--CTC---CTTTACCAACTCATTTCAC-CATTCCATTTAAA-T-TTAC----AGTGGAAA-TTTCCAGCTCCAA-GAACATATTC--TTGGATACC-GCT-T--C-CACTCT--CT-TGGATGGTGAAATTGAATTCAGCTTCCAT-ACCAAAACCCGCTGACTCACATT--TGTA-CTTATTGCCTTGA----AGCTGTC-----ACCCACCTCAT-A-CCTTCA------------AAGGAGT-ACC--
gi|16 : gacaaacttaagcatagaagaagagcttagccttataagagcttaaaaaaaaactcggatgacattgctatcaaaaaggcagacaaggtcaacagtggttgtattagacaagacagcatacatagcggaaGCTCATCGACAACTCTCAGACGAACGCTTT--TAT-A--AA-AAGTTATAGTTTGACCC-TACCA-AAG-AGTTCT-CTCCTAAGATAAT-C-AAAACCCTTCATGAAATG---TA----CAACAA--GGGTGAAATCGGTGACAA-CGT-TTTCGACAT---GCT-TTGTC---CTAAC-GACTGCAGACCAGGACAATTTTATATACTGCCTAAAATCC--AC-AAA-G-TAGA-CATGCCACGCCGTCT-T-ATAGTCCGAGCCATTGG-ACCGTCATGATCCCAAGGAGAAAATCTCTGAATTCATTGtaaggtttagctacacgagttcgtctatctgttcctctggctcggaattcgaaaaaacaaatcaaactctatcttgaaaagccacctttgtaaaaggggctgtaaagttgttcctgttcacaacagcaattgacgattgtccagaacaagcaaaactctaaattttcacccgccctgaagaacctcaataccatccttaaagccattgtcctatctgtataacaaagaacgaatggctagggtctcttaaagaccatccaatggcagctttcagacaacctagaatttaaaaggatattgtagttagaattaggctggataacccattacccaacggggcgggttttcccacgtgctctgaaagagatgtctccagtgcaaattcagcgggccaactgacgctttcag
gi|29 : agataatctcaccaaagaagaaagattggcgttgcaaacattgatattgtcattaaaaggacagacaaaggttctacttaagttgtcttggacaaagacgggtacttgacggagGCTCATTGACAGCTTTCGGACGAACGCTTAAATAT-A--AA-AAGTCACTGCCTGACCCTCGCCACAGA-G-TTCT-AGACCAAGATCAGCC-GAAAAATTCCAAGCATTG---TA----C-A--A--TGGCGAGATCAGTGACAA-CGTTAC-----------CT-T---------AAC-GCCTGTGGACCAGGATATTTTTATGTACTGCCAAATGT-TC-AC-AAACACAAGA-CATGTTAAACTGTCC-T-GTAGTCGGTGACTTCGG-GC-------ATCAAACGAGGAGAATTTCTTAATTCATT
gi|44 : tagacaagtactcaacaaattaaaGCTCACCAACAGCTCTTGGACGAACGCTTT--TAT-A--AA-A---------------C-TACCA-AAGTG-TTCT-CTACCAAGATCA--CCGAAACGCTCCAGGATATA---CA---------A--GGGTGAGATCGGTGACAA-CGT-TTTCGAAGT---GCT-TTGTA---TTTAC-GACTGTTGACCGGGACA
gi|46 : tttactttattattatcattataaaggcagagaaagtctctaacataaGCTAACAGACAGTTGTCTGATGAGCGATTT--TAC-A--GA-AAGCTGGATTTTGATCC-CACTG-AGG-A-GTTT-TCA
gi|17 : acaatctcagcaaagaagagagatctgccctccaattgctaaaaaaccgtgacgacatagtcataaaaaacagacaaaggttccacggtcgttgttctagacaaagattcgtacttagccgaaGACGAACGCTTT--TATTA--AATAAGTTATAGTTTGACCT-AACCA-AAG-AGTTCT-TCTCTAAGATAAT-C-AAAACCCTTCATGAAATG---TA----CAACAA--GGGTGAAATCGGTGACAA-CGT-TTTCGACAT---GCT-TT------CCTAC-GACTGCAGACCAGGACAATTTTATATACTGCCTAAAAA-TCCACAAAG-T-AGAA-CATGCACGGCCGTCT-TAATAGTCCGAG-CATTGGAACGTCATG-ATCCCAAGGAG-AAATCTCTGAATTCATTg
gi|33 : gagataatctcaccaaagaagaaagattggcgttgcaacatttgatattgcattaaaaggaaacaaagttctaacttaagtgtcttggacagaagacgggtacttgacggagctctcgcaactctcaat-TTCTGCCACCA---TCAG-T-GAAACTCTACAAA---------------GA--C--GAG-GAAATTGGTGAAAA-TGT-CTTTGAAACATTGCT-TCCTC---TCAACTG--TATATACCTGGGCAATTCTATCTACTGCCTAAAATCC--AC-AAG-G-AGGG-TGTGCCTGGTCACCCAT-AGTGT--GTGCCATTGG-GC-------ACCCCACGGAGCAAATCTCAGAATTGATTGACCT-ACATCTCTG
gi|27 : gaccaacgattctatggaaggatgttcaaagcgttATCA--CTGACACTCT-AAGCAGATG---TACAAATGA--C--GAG-GAATTTGGTAATAAATGT-CTTTGAAAC---ATTGCTGTCTCTCCAA-----TGTAGACCTGGGCAATTTTATCCACTGCCTAAAAT-----C-CAC-A-AAGAGTATGCCTGGCCGCCC-C-ATAGTGATGGCCATTGG-AC-------A-CCCACGGAG-AAATCTCAGAATTTATTGACCCAACACCT--GCCCACAAATGTTGTAACATACCTAC--TCATATCTTGAAGG--ACCACTAGATTACCTAAAC-AAAACCCCA-TCTCC-AACCTACCTGACAATcatgtccatatgctatgaagctaccatca
gi|69 : caATTT-ACATCTCCGTCAGCA-----TGTAAAAGCTTTACCGTCATA-CCTG
gi|13 : TTAAAAGACACAACA-GACTTTC-AAAT-GTAACTCCA-AAGCAAGGCCCACCAGACCACACACT---------TATAAATA--AC--------CTTGACAT-TAACGTTTTCCATA-TGACAAAAAT-ATCAATGGCTGCAGGGAAGTT-TGAA--ATGA--CAA----TC----C---AAAA-TC--CT---AGTAAATCACTCATTCAGCCTC---------------ATC----------AA--CAACTTCTTGTCA----GACAGCAAACATT------------A-GTG-GTCT-CGCTAT-GA-AACCAATATGGCACCAATT-T-TA----AACAT------------AAACTC-----AAACGTAG---CCCATT-AA-AC---CAAA--C-ATCATGCAAATCCCT---GT---CTACTTTTCA-AAGATGACATAGAGAT---AAGC---------------CCATAAG--AGTCGGAAGGA-TTT--------------GCAAACTCTTTCCA------CCA-TCAAG-C-TTAA----AGTGGAAA-TT--------------ATACTCTC--TTGGTCACC-ACT-G--C-CACATC--TACAGAATTTA-AAATCAATTTCAGCCTCCCC-A-CTAAGTCCACA
gi|10 : AGGACACCACT-GACTACCTCAAT-GATACTTCTTCTTCA-GACCTGCATGAAGACACTTTGTTGGTTACAATGGACATCACTTCA----TTGTATAC-CAATATT--CCACA-CCAGGAGGGC-ATTGAGGCATGCAGAGAGGTC-TGGA--AA----ACAAGAACCA-CCCCTAAACC-TT--CCACAA---AATTATTGGTTCTACTCCT-----T-G-AGCATGTCCTTA-AGTTCAA--TAACTTTATGTTC----AATGGTGAACACTATCTACAAA-T-AAGTG-GCAC-TCCCATGGG-CACCAAAATGGCTCC--CTCT-TACGCTAACATCTT-T-ATGGGTAAACTT-----AAACATAA---TCTGCT-AC-AA---CAAG--C-ACCTGTTAAGTCGTTC-AGCTGGTTACGATTCA-TTGATGACATTGAAATG--AAATG----GGC-GAACAGTC--GAAGCAGTCTTGACAACTTCAT--TGA---ACTTGCAAACGCTTTTCAT-ATTTCCA-TCAAG-T-TCAC----AGTGGATA-TTTCCGCATCTAG-CAACGTCTTT--CTGGAa
gi|66 : CCTTGTGACCATGG-TGTTACTTCA----CT--------AACATT--TCAAAATGAAGAGGTTTATCAAGGCTTATAGAGAGGTT-c
gi|31 : TGGATGTCACGTCA----TTCTACAT-TGGCTA-----GCA-T-----------TCAAAGCGTGCAGCGAAGTTATGGATAAT------AAG---CT-GTC---CATAGCC--CCTCCGCTGAGTCACT--TTCAACT-CT-----T-ACAACGTGATCTTATAGTCCAA--TA-CTTCGTG-----------GCGATCACTATTTCCAAA-TTA-TCC-ACAA-TTCTATGAG-AACCAGAACATCACT--CTCA-AAAGCCAACATATT-C-AT-GGAAAAGTG-----AAACCTCT---GCTTCT-GCAAT---CGCT--G-A-------------------TGACT--GTTTCA-TGGATGATATGGA-ATG--
gi|48 : GACGTTAATTTCTGTACAC-TAGCGTC--CTGCA-AGATGACCAC-ATCGAGGCATTTAGGGAAGTT-TAGA--AG----AGAAATTT----TC---TAAA-TCATCTTCCACTGAATTGTTGGTAAAGCTCCT-----T-G-GACATGTCCTCA-AACTTAA--TCA--TCA----------ACAGTGAGGACTACTTGCtatgg
gi|35 : tcttgtcagaataT--CCACA-TCATGAGGAT-ATAAAAGCTTGCAGAGACGTA-TGAT--ATAGTACTTACAGCCA-TTC---ATAG-TT--CATCAATTGAGTCACTTACCCTGCTCCTACATGTAG-AACATGTTTTGT-AATGCAA--TG---TCACTTTTCAAAAATGGTGATCACTGCCTTCAAA-TTA-GTG-ACAC-TGCTATGGG-AACCAAACTGAGACC--CCCA-TCTGCCGATATGTTCT-TTTGAAAAAGTG-----GAATACAA---ATTGCT-
gi|43 : A-TC--CTTCCATAGAATCGTTGGTCAAGCTCCT-----T-G-AACATGTCCCCA-ACCTCAA--CAACTTCATGTTC----AATGGCGAACATTATTTAGAAG-T-AAGTG-GCAC-ATCTACGGG-AACGAAGTTGGTTCC--ATCG-TATGCCAATATTTT-C-ATGGGAAGACTT-----GAACG-AA---A--CAT-GC-TTAGACAAT--C-ACCCTGTAAGCCCCTT-AGTTGaat
gi|36 : CGTATCCTTA-AGTTTAAAATAACTTCATGTTC----AACGGCAAACACTATCTGCAAA-TGA-GTG-GCAC-AGCTTTAGG-AACAAAA-----------------TGACATCATCTT-T-ATGGG--GACTGTCCCAGAACGTA----ACCCCT-AC-AC---TGGT--C-ACCATGTAAACCTTGT-AGCTGGCTATGTTTCC-TGGATGACATTCAGATATAGAGTG----GGT-TGATGGTCGTGGA--AGCCTTAACGACTTTAT--CAA---GATAGCAAACTTT
gi|14 : ACTTGCAAATC-A-GTTCGCAT-GGCTAAGTT-AACTAAAATGGCAAA--ATCT-TATGCCAACATCTG-C-ATGG------------------TAG------------------CACC--CTATTTGTTAG-----CC-AGTTGGCTATGTTTC--------ACATTGAGATG--AAGTG---------AATGATCATGAA--AAATCCGA-GACTTCGT--CAC---GGTTCCGAACTCTTTCCTT-TATTTGA-TGAAG-T-TCACTGCATGTGGCAA-TTCCATC-TCCA--AAATAC--TA--TCGGATACC-ACA-G--C-TACACT--TA-TAAATGG-GAAACTGAGTTCAATCCCCATAA-CTCAACCCACCGACTCTCATTAATATACCATA-T--CATCC----AACCATCCTAAAATGTGTCCTAA-G-CTTT--------------------T-GTC--GTC---CA-AATTT------GCTGCATCTTCTCTATTACCCACCACTTTCC-AA--GAGGCA-AGGACACTTCCTAA-AAAGTCata
gi|41 : CCATGGA-CACCAAAATGACTCC--AAGC-TACGCCAACATTTT-TTATGGGA-GACCT-----GAATACAA------CCTAGT-AA---CGTTGGC-ACAAAGAAAACCTTTTTAGATGATTTCTATTCA-T---TGGCATTTGGATG--AAATG----GGTGTCA-ACTCGGGGA--AACCTTGGCAACTTTAT--TTA---AATAGCCCGTGCATTTCAT-ACTCTCA-TTAAG-T-TT-C----
gi|52 : TAG---CCTCCT-AC-AT---TATT--C-ACCATTTAAACCTCTC-ATTTG---ACATTC----AAATGA-----AGAAC--AA-----------TGACAATCATGAA--AGATGAAACAACTTTATA-TAAAGAGAAAACAAACTCTTCCCACTGGTTCAA-TCAAGAT-CA-C----TGTGAA-A-TTACAACCTCTAGAGAAac
gi|40 : ATTGCGACG--AAGTG----GGT-TGATGAGCGTAAA--ATCCACAATGACTTTATCGCAA---G-T-GTGAGCTATTTCGAC-TATTCCA-TTCTG-TCCT-C----TGAGGAAATTTTCAAC-TTTAG-GAATATTCTA--TGGGATACC-ACA-T--T-CGCACT--TA-CAAACGGGG-----------AGCCTTCAC-ATCGA----CA-------TCATT--TGTA-CGTA-TGCCATTC----ACCTTTC-----ATCCACCC
gi|3 : -C----TGTTGATA-TTTCCGCATCCAG-TAACGTATTT--TTAGACA-C--TATGTCC-AAGATTGTTA-A---CGGAAAAGTCGAGNNNNNNNNNNNN-N-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--NNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNAGTTGTC-----ATCCTACTCAT-A-CATTCATAGGAGAAACTAAAGGTTTAGCC--ACC---AG-TGTCG------GCCGTATCTGCTCC-ACTCCTGC-ACTTTA--TAAAGA-ACAGAGCACCCATCTA-G-AAAA-CCATCTGTGCAAGAGAGGCTATCAA--GCCCCA-AAAGTGCAAGCAGCTATTGATGAAATGTCAGAACACGACAGAGAACCCCT---ACTACA-ATA--CA-ACAACAAAT--C--GGT--A-TG-TGACAGAGTCCCAATGGTTACTACGTAGTACCACCCTGTCTTAAA-A-GA---CT-TG-AACAAAAT-TCT-GAAGAGGCAT---ATCC-C-CATTCTTCA---CAATAACC---CTA------GGAT-CTTCAAGATCTTCA-------------AAGAACC----------T-------------CCCAT-----GGCGGCCTT--C--A----G--AC-GCCC-CAGA-AAT--CTG--------AAA----GACATG-GTGGAG--CGGACTAAATTGGACA--ACCC-GATAC--TTAACGA---GGGCTTTATCAC--------AT--GT-TCTGATGGC--------AG---A-----TGCCTG--AC-GTG-CAA----ACAC---AGCAT--T----AG-C--ATA-------AACATTTTTA-A-GAGCCCTGT--T-ACA-GGCCGAC-A-CCT-------------ACC---GA---------------ATTCTCA-GG--GAA--A---CAT-----CCTGTCG-CGCGGATG---AT--T-G-CAT-C----------TA-C--CTC-ATAAGC--TG-T--AAGGTC-TG---TGATCAA-CAATACGT-------G-GG-TGA---------AA--------CTGGG-GACC---TACGTAGGAGGAT--CAATAACCACCGCTCTA-CCA-T-C-AAAACCAAAt
gi|45 : gttcaGTTGATA-TTCCCGCATCCAGTGG---CGTCTATTTAGATA-CTACG-T--CGAATACTGTTA-A---CGGAAATGTCGAGTTCAAACGCCAT-A-CCAAAGCAATTAACTCCCATT--TATATCCTG-TGCCATCT----AGCTGTC-----AT-CAGCTCAT-ATCGTTCA------------TAGGAGT-AC
gi|54 : agttcatgGTTCAATCC-CAT-AACTCAACCCACCGACTCTTATA--TATACCATA-TGCCATCC----AA----------------CCCATGA-CT---A------------AATGTGT-GCCTAAGCTTTTGTCGTCCAAATTTGCTGCATCTTCTCT-ATTCCCACCACTTTCC-AA--GAGGCA-AGGACACTTCCT-A-AAAttattttattagccactagagtccgtcatata
gi|47 : CC--TCC---CG-AATCC------TCCGCATTTGATCT-AACGCTACTACTTTCCATA--G---CA-AGGACAAATCGT-C-AAAATTCATTTCACAAACACAGGATAT-GA--TCATTGCAAGGTACAGTCCGCAATTGATGAGATGTCACGGCATAACCGACAGT--------------ACA---A-AGAAAAACCT-C--AGA--AGT----ACAGGGTTCCACCAGTAACTAT-T--TAagt
gi|12 : CCT-CGAAAGTC-ATCCGACAAACAG--GATAT-GA--TCCTTGCAGGGCACAGTCCGCAGTTGATAAGATGCCACAACAG-ACCGACAGTCCCT---CCTCCA-GTA--CACAG-AAAACC--CTTAAA--A-T---GACAGAGTTCCGCTAATCACTAC-T--TACCATCCCGCCCTCAA-G-A-----C-TC-CACATTAT-TCT-GAGAAAGTAT---CTAC-C-CATTCTGCAAGCCAATAAAC---GAATGGC--TGAT-GTT-------TTCA-------------AGTAACC----------T-------------CCAATGACATGC-----TT--C--A----G--AC-GCCC-TAGA-AAC--TTG--------AAG----GACATG-GTAATA--AGGACCAGACTGGATA--ACCT-TTTAC--CTAATGG---AGGTTTCAAAAC--------TT--GC-ACTGGC--CT---C---AG---A-----TGTCAA--CT-ATG-CAA----ATAT---AGT-T--C----AGAC--ACT-------CAGAGCTTTA-G-CAGTCCTGC--C-ACA-GGTCG-T-A-GTT-------------ATA---GA---------------A-TATTG-GG--AAACTT---TT------CCTGCAA-AACTATTA---ACAAT-GTCAT-C----------TA-T--CTC-A
gi|9 : AGAGGCTAT-AAAGTC--TCAAAAGTGCAATCAGCTATTGATGAGATGTCACAAa
gi|19 : gaaaaaccaccaatgtaagTCCGCAACTGATGAAATGTCGCAATAAGGCCGACAGCCCCT---TCTCCA-TTT-TAA-AGAAAAACCG-C--AA---A-T---GACAGGGTTTTGCTTGTCACTAA-C--TATCACC--GGTCTTGA-A-GA---TCCTC-AGCTGTAT-TCT-GTAAAAGCAT---CAAC-C-CATTCTGCATACCAGTAAAT---GAATGGC--TGAT-GTT-------T-CA-------------GGGA-------------------------------------A------TC--C--CCTATA--GC-ACCA-GAGA-AAC--CCC--------AAG----GATACG-ATAGTA--AGGACAACACTATATA--ACCCTTTTAC--CTAATGG---------TAAAAC--------AT--AC-TCAGAC--TTCAGTA--CATGTA-----TGTCAA--TT-GCA-CAAAT--ACATGTAAGC-T--C----AGAC--ACA-------GATAGCTTTA-G-CAGTCCTGTTCG-ACA-GGTCG-TGA-GCT-------------ATA---AG---------------A-TATTG-GG--AAAtccatactacaatgtaaagaaaaattggtggatgacagtttccatggtaacaacgaaccatctcatcttgaaatacattctatcttgaaagaaaacaaaattctaaagaagtatattcccattaatatcttcactctagtcgcagaatgacttaggttttcaaccagcctccaatggctatcttcggagtaccaaaatcttagacatggtgatgtgaaccaaattggaattctttgcccaaagagagctttaaaacttgttctgatgccagatctatgcctgacgtgcaaacacagcgcgagcacagacagccctgtgaccggcatattctaccgaattcttgaggacacatcctgtcgcacggacaactgcatcattctgtaattattttgtaagttgcgtggtctgtgaacaaaattacgtaggtgaaactggggtcctacgtacatgtagaagga
gi|24 : ATTGATGTGATGTCAGAACACGACATATTATCCCT---ACTACA-ATT-TAA-AGGTAAATTGTT--AGATTA-T--GAACAGAGACCTAACGGTTGCAAC-G--CACCACCCTGTCTTGAA-A-GA---CC-TA-AACAATAT-TGT-GAGAGAGCATATATTCC-C-AATCTT-CATACTAACAtct
gi|4 : aagaacagagcacccgactgaaaaacccatttgtgcaaaagaagctatgaagccccaacaatgcaagcagctTGAATTGT-ACAAC-GGACCGACAATCCCCTCACTTCCATATATTCA-AATctagaatggtcaatgaacctcccattgcggcctctgctaccgaattcttgggaagaca
gi|20 : ACAGACAGGTCCT---CTTCCA-CTA-TGA-AGAAAAACCT-C--AAA--A-T---GACAGAGTTCCACTAGTCACTAC-T--AACCGTCCTGTGCTCAA-A-AA---CC-TC-AACACTGT-TCC-AAGAAAACAT-----GT---------GTATGCCAATAAAT---GAATGGC--TGAT-GTT-------TACA-------------AGGAACCCCTATGGCA-T-------------C---------C------TT--T--T----G--AT-GTCC-CAGA-GAC--CAG--------AAG----GACATG-GCAGTA--AGGGTTAGACTGAATATAACCC-TCTAC--CTAATGG---AGGTTTC-ATAT--------AT--------GAC--CT---C---AC---A-----TGTCAA--TC-ATG-CAA----ATAT---AGC-T--C----AGAC--ACTGGCCAGGGAGATTT--A-G-CAGTCTTGT--C-AGG-GGTTG-C-A-GTT-------------ATA---ttgcacttctccaccttcatatctcgaatatcttgcaactcaactatcgattcccgtgccgaccctgcccttagtgcgaccttctctaatagtatgtacaagaaaacatttgcctatccgtatccacaaacgtagcgatagttttcataaaccgctcctgatgacatcgtttaccgcagcgcccagaaaacctgaaaaagcgacattgtgtaaaagaccaggttgagtaaccctctacctctaatggaggtttcaaatcatgtatcagatctcgagtcaagtttatgtcaaaattaaatactccagaaactgagaccttcaggaagtcctgtgaacaatcacagttcataaaatattgtggatgaacttaccgttaaaaccaaaactcgtatactatctctatcaatgtgagtctgccagaaacagtcgttggagaaactacgaacctttttcgtaaaagggtacaagcaatacctcctccgtgcaggaccaaaatatgcggactccgcacggtagctacgcagtttccaagttctgtgtagacatcaccgaatgggttgaggaacatgtgacaacgtgttagtatgatcatgtacctactctggtcaactattcaaagaaaaaagaagagaatttctggatgaccaggttgaagtcattcgagcctcagtgtcaatccacaaatctaagctactttcccagtagatgaacacgggttagac
gi|21 : aaACAGACAGGTCCT---CTTCCA-CTA-TGA-AGAAAAACCT-C--AAA--A-T---GACAGAGTTCCACTAGTCACTAC-A--TACCG---TGCTC--AA-G-AA---CC-TC-AACACTGT-TCC-AG--AAACAT---GTGTAC-T-----------CAATAAAT---GAATGGC--TGAT-GTT-------TACA-------------AGGAACCCCTATGGCA-T-------------C---------C------TT--T--T----G--AT-GTCC-CAGA-GAC--CAG--------AAG----GACATGCGCAGTA--AGGGTTAA-CTGAATAT-AACC-TCTAC--CTAATG----AGGTTTCATA-T--------AT--G------AC--CT---CA--CA---G-----TGTCAA--TC-ATG-CAA----ATAT---AGC-T--C----AGAC--ACTGCCAGG-GAGATTT--A-G-CAGTCTTGT-----CAGGGTTG-C-A-GTT-------------ATA---
gi|50 : aCAATCCCT---TTTGCA-ATA-TAA-AGAAAGATC------GA--A-TGGTGACAGAGTCCCAATGGTCACCAC-A--TACCACCCGGTTTTGAA-G-GA---TC-TC-AACACTAT-TCT-AAAGAAACAT---ATCC-C-CATTCTTCATGCCAATAAAA---GAATGAC--TGAT-GTT-------TTCA-------------AAGA-------------
gi|34 : CAGAGATTCAATGGTTACTAC-T--TTCCACTCTGTTTTCAA-A-GA---CA-TG-AACAAAAT-TCTGAAGAGG--------------TATTCCGCA---AAATAATCTTTGGATGGC--CAGT-ATC-------TTCA-------------AAGAACCTCCCATGTCAT-------------C---------C------TT--C--A----G--AC-ACTC-TGGA-AAT--CTG--------AAA----AACATG-GTGGCG--CGGACTAAATTGgccacctatggc
gi|2 : cgatatgtggCACCC-GCCCTGAA-G-AA---CC-TC-AATACCAT-CCT-TA-AAGCCAT---T-GT-CCTATC-TGTATAACAAAGAAC---GAATGGCTAGGGT-CTC-------TT-A-------------AAGA-------------C-------------C---------A------TC--CAAT----G--GCAGCTTTCAGACAAC--CTAGAATTTAAAAG----GATATT-GTAGTT--AGAATTAGGCTGGATA--ACCC-ATTAC--CCAACGGGGCGGGTTTTCCCAC--------GT--GC-TCTGA---------AAGAG---A-----TGTCTC--CA-GTG-CAA----ATTC---AGC---------GGGCCAACT-------GACGCTTTCA-G-ttctgttgggagatgactggtgtgcaaacatagcgctaacacaattagttttaagagccctgt
gi|30 : gacaaacttaagcatagaagaagagcttagccttataagagcttaaaaaaaaactcggatgacattgctatcaaaaaggcagacaaggtcaacagtggttgtattagacaagacagcatacatagcggaagcgcacagacagctctggatgaacggttttacactaaaactccgaccctaccaaaacgttttccgctactatcaccgacactcttgagcaaatgttacaaaaaacgaggaaaattggtaataatgtctttgaaacagtgctgcctctcaactgtacactgggcaattttatctcctgcctaaatccacaaaaaggcattcctgccgccccattggcaccccacggagaaaatctcagaatttattgacctacacctctgcccatatgttgtaaaactaccatcatacttgaaggacaccactgattaccttaacaaaaacccctcttcgaacctacctgacaatacccttctcgtgaccatggatgtgacttcgctttacacaaaacatcccccacgatgaagacattgaaacctgctgggaggttgggataaaaggatcctgaaaacatccttccacagaatcattgtcaagctccttgaacatgtcctcaaactaaataacttcatgttccaaggcaaccattacttacaagttaggggcacaagcaatgggaaacgaagatggatcctttcatatgccaacatttttatgggaagacttgaacgcaacttactcaggcaatcgccctttaaaccccataattgtgtgtttcatttgatgacattgaatgaaatgaaatggcggagggccgagatacttgacaactttatctcctttaccaactcatttcaccattccatttaaatttacagtggaaatttccagctccaagaacatattcttggataccgcttccactctcttggatggtgaaattgaattcagcttccataccaaaacccgctgactcacatttgtacttattgccttgaagctgtcacccacctcataccttcaaaggagtacctaaggtttagctacacgagttcgtctatctgttcctctggctcggaattcgaaaaaacaaatcaaactctatcttgaaaagccacctttgtaaaaggggctgtaaagttgttcctgttcacaacagcaattgacgattgtccagaacaagcaaaactctaaattttCACCCCGTCCTTAA-G-AG---CC-TT-AACAGAAT-CCT-GAGAGAGAAT---CTGC-C-GATTCTTCACAATAATGAAA---GAATGGC--GGAT-CTT-------TTCA-------------AGGA-------------TCTACCAATGGCTGC---------A------TT--T--A----G--AC-GGCC-TAGG-AAC--TTA--------TAG----GACATG-GTGGTG--AGAGTCAAATTAGATA--ACTC-ATTAC--CCAATGG---TGGCTT
gi|4 : tgtaggtacggcccgtaacatgataggcagattctctgtaaccacaaaggacaggaacacccttttgcaatacaaagagaaaaagaaaaaaagaACCCTGCCCTTAGTGCGACCTTC-TCTAATAGTATGTAC-AAGAAAACAT---TTGC-C-TATCC-GTAT-CCA-CAAAC---GTA--GC--G-ATAGTT-------TTCATAAACCGCTCCTGATGACA-----------T-------------C---------G------TTTAC--C----GCAGC-GCCC-AGAA-AAC--CTG--------AAAAAGCGACATT-GTGTAA--AAGACCAGGTTGAGTA--ACCC-TCTACCTCTAATGG---AGGTTTCAAATC--------AT--GTATCAGAT--CT---CG--A-----------GTCAAGTTT-ATGTCAAAATTAAAT---ACT-C--C----AGAA--ACT-------GAGACCTTCAGG-AAGTCCTGT--GAACA--ATCA-C-A-GTTC------------ATA---AA---------------A-TATTGTGGATGAACT----TA------CCGTTAA-AACCAA-A---AC--TCG-TATAC----------TA-T--CTCTATCAA---TG-T--GA-GTC-TG---CCAGAAA-CAGT-CGT-------T-GG-AGA---------AA--------CTACG-AACCTTTTTCGTAAAAGGGTACAAGCAAT-ACC--TCCT-CCG-TGC-AGGACCAAAATATGCGG--------ACTCCGCACG-GTA-G-CTACG--------CAGTTTCCAAGTTCT-----GTGTAGACATCA-CCGAATGGGTTGAGGAACATGTGACAACGTGTTAGTA--TGATCAT
gi|11 : tgaattgtacaacggaccgacaatcccctcacttccatatattcaaatttgcacttctccaccttcatatctcgaatatcttgcaactcaactatcgattcccgtgccgCAATAAA----GAATGGC--TGAT-GTT-------TTCA-------------AAGA-------------G-------------CCACACTATGG------CTG-C--CTTTAG--GC-GCCC-ACGA-AAC--CTG--------AAA----GACATG-GTGGTT--CGAACCAAGTTGGAAA--ATCC-TTTAC--CCAATGG---TGACTTTAAAAC--------CT--AT-TCAGA--------TA--AAAG-A-----TGTTTG--AT-GTG-CAA----ACAT---A-C-TTCT----AG-C--ACC--------ACAGTTTTG-A-AAGCCCTGT--C-ACC-GGTCG-A-T-CTT-------------ACA---GA---------------A-TATTG-GG--GAA--A---CGT-----CCTGTCG-AAGTGACA---AC--T-G-CAT-C----------TA-C--TTG-ATCAGC--TG-C--AAAA---TG---TCAGAAA-CAATATGC-------G-GG-TGA---------GA--------CTGGC-GATA---TACGCCGAAGG------ACGGTCACCA------------T-AAAAACAAAA-G---GGTCCAAGGAACC-CGT-CG-------CCAAG--------CA--TTTTAA----TCTCGAG-G-AACACTCA-------TGG--GAAG-ACA--TGACGG--TGGTGGTTA-TGACCAgtacctactctggtcaactattcaaagaaaaaagaagagaatttctggatgaccaggttgaagtcattcgagcctcagtgtcaatccacaaatctaagctactttcccagtagatgaacacgggttagac
gi|59 : atatatatatgacacgATGGC-----T-GTT-------TTCA---------------GA---------------------------C---------G------TT--C--A----------------AGA-AAC--CTT--------AGA----GACATG-GTGGTGCTAG--CCAAATTGGAgacatccactggacggatgcagacagaaaaggcaagaagttttggatgcataggctgtaaaag
gi|63 : cttgaaatattcaattagaatactgaaaagcatgctcccattcttcatactaactcatggagcctcccT-GTT-------TTCA-------------AAGAATTCCCTATGACAT-------------C---------C------TG--C--A----G--AC-ACCC-CAGA-AAC--CCA--------AAG----GACATG-GCAGTA--AGGACTATATTGGATA--ACGT-TTTAC--TCATTGG---AG
gi|28 : gT--T--C----G--AC-GGCC-CAGA-AATAAATC--------AAG----GACCTT-ATGGTA----GACCAGACTGGATA--ATCC--CTAC--CCAATGG---GGATTTTCCAAC-------------T-TC---T--CT---TA--AC---ACACGGTGCCTA--CT-CTG-CAA----ATAT---ATC-C--CCAAAAGAC--A-T-------GAGACATGCA-G--AGTC---T--G-AC-----CA-C-A-G---------------AAA---AA---------------G-TAT---AG--CAATTGGGCCAGGTTTTTCCGTAATGACCAACA---AC--T-G-TAT-T----------TACC--CTC-ATCAACA-TGTT--AACGTCGTG---C---AAA-CAATATGC-------TGGG-GGA---------AA--------CCA
gi|9 : gttttttagtgaacctccctgtcgtgtccT--T--C----G--GA-GTAC-CA-A-AAT--CTT--------A------GACATG-GTGATG--TGAACCAAATTGGA----ATTC-TTTGC--CCAAAGA---GAGCTTTAAAACTTGTTCTGAT--GC--CAGAT--CT------------A-----TGCCTG--AC-GTG-CAA----ACAC---AGC-G--C----GAGC--AC---------AGAC---------AGCCCTGT--G-ACC-G---G-C-ATATT-------------CTACCGAA---------------T-TCTTG-AG--GA--CA---CAT-----CCTGTCG-CACGGACA---AC--T-G-CAT-CATTCTGTAATTA-T--TTT-GTAAGT--TG-C--GTGGTC-TG---TGAACAA-AATTACGT-------A-GG-TGA---------AA--------CTGGG-GTCC---TACGTA
gi|61 : gaaaaaccaccaatgtaagagaggctataaagtctcaaaagtgcaatcagctattgatgagatgtcacaatccatactacaatgtaaagaaaaattggtggatgacagtttccatggtaacaacgaaccatctcatcttgaaatacattctatcttgaaagaaaacaaaattctaaagaagtatattcccattaatatcttcactctagtcgcagaatgacttaggttttcaaccagcctccaatggctatcATA--ACCC-TCTAT--CTAATGG---AGGCTTCAAAAC--------AT--GC-TCAGAC--CT---C---AG---A-----TGTCAA--TT-ATG-CAA----TTAT---AGC-C--C----AGAC--ACT-------GAGAGTTTTA-G-CAGACCTGT--C-ACA-GGTCG-T-A-catgtagaagga
gi|32 : -TTTAC--CTACCGG---AGGTTTCAAAAC--------ATTGGC-T-ATAC--CT---CA--AA---------TGTCAA--TTGATG-CAA----ATATT--AGC-A--C----AGATT-ACT-------GAGAGCTTTA-G-CAGTCCTGT--T--CACGGTCG-T-A-GTTATAAGATTTAGCTATA---AAGATATTAGCTTAAAGA-TATTG-GG--AAACTT---TTT-----CCTACAA-AACTAATATAAAC--TTG-CAT-C----------TA-T--CTC-ATCAGT--TG-CAAAATGTC-TGC--CCAGAAA-CGGTATG--------T-AG-AGA---------AC--------AAACAGGAC------CGCAAACAGGT--CGACAACCACAGGTC
gi|70 : --CTAATGG---AGGTTTCAAAAC--------AT--GC-TCAGAT--CT---CA--
gi|15 : AT---AGC-T--C----AGAC--ACT-------GAGAACTACA-A-CAGTCACAT--T-ACG-GGTCA-C-A-GTT-------------ACA---CA---------------A-TATTG-GG--GAATT----TT------CCCGTAA-AATTCATA---AT--T-G-CAT-T----------TA-T--CTC-AACAGC--TG-T--AATGTC-TG---CCAGATA-CA--ATGTATTCATAT-GG-GGGGGGGGGTGTAA--------CAACA-GACC---TTCCAAAACAGGC--TAACAACCACCGGTCCG-CTG-T-C-GAAACCGAGA-A---AG--------GTT-TGT-CA-GTA-G-CTACC--------CA---TTCAA----T-----G-ACAGTAATAT-CCG--ATTG--GAGG-CCG--TGACAA--TA
gi|6 : GAC--ACT-------G-----TTCA-GCAAGCCCGGT--GGACA-GGACA-G-A-GCT-------------ACA---AA---------------A-TTTTG-GG--AGTCTA---TGT-----CCTGCCG-TACTGACA---AC--T-G-CATAC----------TA-CACTTC-ATCAGT--TG-T--AA------GAAACCAAAAAGCAGTACGT-------A-GGTGGA---------AA--------CGGT--GACC---TCCGAAGAAGAGT--CAACAATCACCGGTCCA-CTACT-T-AAGACC-AAA-C---GG--------A-T-CAC-CG-A-A-C-C--CGTTGGGGAACA--TTTCAA----C-----A-CTGAGGGTCA-CAA--ATGG--GAAG-ACA--TGACAG--CG-TAGTTATTGACCAatggctatatattgaacatgacaaaagttttcagatacccagagaaaacaaaaggaaatgattagggatgcaaatattgaagtaattttatcagcaagatctaaacatgcccactaacttcacccggatgaata
gi|58 : TT-------------ATA---AA---------------A-TATTG-GGC-CAACT----CT------CGAGTAA-AATCAATA---AT--T-G-CTT-A----------TA-C--CTC-ATTGAT--caaccctaactggagtgactctgaaagaaaggaaccatagagaagattgctggtagtgcagcaggttactctcaaatagtacatctcttacggactgtcattgtcttcctccaaatggcacctcgaatgaatgaaaagtctctcatgaaatatggaacgttgcttgcccagaccaacgccggatactggatgcgttgagtggtggaaagcgagacgaaatgagcgtcgacccacagactttaactcatcgcctactcctcttcacaacctatactcggagtaaatttcattgatttct
gi|37 : actacaggcaaaacA---CC------CTTGTAA-AGCC-----------C-G-CAT-C----------AA-T--TTG-AAAAAT--TGAT--TATATT-AA---CCAGAA--CAG--TGTAA-----T-GG--GA---------AA--------CAAGA-GACA---T-CGCAAACGGGT--TAAAAACCACCGGTCTT-ACG-T-C-CAAACCAAGA-A---AA--------ATT-TGT-CA-GAA-G-CTAAA--------CC--T-----------------GTAGTAATCG-CCT--GTGG--GAGG-ACA--TGACAA--cacctgtaaacaatgtaacttacaatacgtgtgtgtgttaacgtggggggggggg
gi|8 : ACA---AC--T-G-CAT-C----------TA-T--CTC-ATAAGT--TG-C--AAGGTG-TG---TGAACAA-CAATACGA-------A-GG-TGA---------AATTGAGGGTCTACG-GACA---T--GTAGAAGGAT--CAATGACCACCGGTCTA-CCA-T-G-AAAACCAAgagcgctatgattattgaccccaaattattcatataccaaaacaaagcagaaggca
gi|53 : ctgaggtcttctagaagcctcctgtggctgccgtcatatatcctaggagtgctgggatccaaattgaaaaatgtttgcccagtggggattttaaaacttattctgatgcctgatgtagaatcacagcgcgaacacaaataatttttaagcgccgatgtcacggaatgtcctgtcgcgcggATG---AT--T-G-CAT-T----------TA-C--CTC-AT--ATGCTG-T--AACGCC-TG---TGATCAA-CAATACGT-------G-GG-TGA---------AA--------CTAGG-GACC---TACGCAGGAGGAT--CAATAACCACCtagagtgaaagcatttcaatctcgctggacgcaaatggggagacatatattgactactcagttcactggacgcattcatgaggagagaacgaacgagaaagacccaaatggcacgaacaatctcaatgactttactagaatgaatgtggcctagcttcccctcagtgttgttctgtctgttttacactttctactctcagcactattattagcagtcaatctttccgtggtttcctaatctatctttt
gi|5 : ccctgtcacagaccgacactaccgaactctcgcacggACGT-------T-GG-AGA---------AAA-------CTACA-GACC---TTCGTAAAAGGGTCAAAACAATCCACGGTCCTTCCG-T-CCAGGACCAAAA-A---GG--------A-T-TGC-CG-TTA-TGCTACG--------CA--TTTCAA----T-----G-GTAGCAATCATCCGA-TCGG--GAGG-ACA--TGACAA--TAATAGTGATTGATCATtaaattaaccagtcggaccaaagcacccg
gi|38 : cAAAA-A---GG--------ATC-TCC-CGTGTAGC-CTACA--------CA--TTTAAAA---T-----G-TTAGCAATCA-CAG--GTGG--GAGA-ACA--TTACAA--TATT-GTTATGGGTCgaccctagtttggtctgacattcaaagaaaaaagataggagaagttctggatgacaggttgacgtcattcgagcctcatgcatcaacaaatctgctgacttcaccaggagtgaacacggggttagaagcgattcaccggaaatcgaacactgatttacatgtaagactccccggcctgatcagtcccgaacatcctctattagattcaatcttcacaatgtatacttctcatgtgataaatttttttttttttctttctctttctatcttaaaaaaattttttttttttctcacggtctctttctctcgaaattaattgttttaattaaatctgatccacattgtgtataaattcagtattactttagaacttgacttaatagaatattcccgggtatgaactatccaatatatacctcctaattcgaatagtaagtcgttgcattattgtggatcagctaatggacgagtagggcgtatcctcattcgttccatatctaacattagatttgcaagccattaactcgaataccatgtgatttatatgtaatacggttgttacgttggagaccgatatatt
gi|7 : GCAATCA-CCG--ATGG--GAGG-ACA--TGACAA--TACTAGTGATTGATCATtgacccaagttttggtcagaaatgaggagaaatgcgaaaggaaaaaagccaggatacacaggttgttcaaaagtcatttgaagcttttgtcagggtataatcaaaccacttaagatgaaaacggaactaaaa
gi|25 : GG--GAGG-ACA--CGAC-A--TAGTGGTTATTAATCATgaccctagttggtgtgctactcaaagaaaaaggaaggagaagttctggatgcacaggttgaagtcatttgagcctcgtggcatcaacaaatctgctgacttcaccaggatgaacacgggttagaacgttcaccggaatcgaactctccttaaaccttcgcgcctgatcatccactcttagcttcaattttcacaatgtatacttctgtgataaaaaaaattttcttctctttctatctaaaaaaatttttttatttcttctaaattattgttttattagaattgatccattgtgtgatatattcaagtacttgactaaatagaatagttccgggtatgaactatcaattatacctcccaattcgaattagtaagtcgtgcatcattgtggatcagctaattggacgagtagggcgtatcctcattcgttccatatttaacatagatttgcaagccaataacccaataccatgtgatttataatgtaaatacggttttagt
17 sequences could not be aligned to this particular reference sequence:
Unaligned ( gi|18 ): GTCCCGAACATCCTCTATTAGATTCAATCTTCACATATATCTTCTTGTGATAAAAATTTTTTTTCTTTTTTTTTTCTTCTCTCTTTCTATCTAAAATTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTCTTTTCTCTCTCGAAATTATTGTTTTATTATAATTGATTCCATTGTGTGATAATTCAAGTTTTATCTTAGAACTTGACTTTAGAATAGTTCCGGGTATGAACTATCAATTATACCTCCTAATTCGAATTAGTAAGTCGTGCATTATTGTGGATCAGCTATTTGGAGAGTAGGGCGTATCCTCATCTGTTCCATATTAACATAGATTTGCAAGCCATTAACTCATACCATGTGATTTAATATGTAATACGGTTTTTAGTT
Unaligned ( gi|22 ): TTCTTTCTCTTGTCTATCTTAAAAATTTTTTTGTTCTCTTTCTCTCGAAATTATGTTTTTATGTATCAGAATGATTCCATGTGTGATTGAACTTCAAGTTATTTACTTAGAACTACTAATTAAATGAAGCTTCCGGGTAAAGCTATCAATCATACCGTCTAATCGAATCAGTAAGTCGCATATTGGATCAGCTAATTGGACGAGTAGGGCGTAAGTCCTCATTGTCGTTCCATATTAACATAGATTGCAGCCATTAACCTCAATACCGATGTATTTTTAAGTAAATACGGTTAGTTGTAGTAACTCAGATATATT
Unaligned ( gi|23 ): GGGTCAAAACCTGTTGCCAAGCATTTCAATCTAGCAGAAACAAATGGGAAAACATGAGAATGGAGAACATGACAATAGTATTTATGATCAGAACTCCCACTGGAAAGGAATAACAAAGAAAAAATCTGGATGCGTAGCCACTCCGCCCTGATGGCACGACTTCCCTAGAATGAATGTGACTTGGGTACTCTAGTTATTACTCAGTATTTACAATTTCTATTTGCCATTTACTTTGTGTAAAAGCACCATCATTAGCAGTCAATCTTTCCATACTTGTTCTGATTTTTTTTTTA
Unaligned ( gi|26 ): TTTTTTTTTTTTTTTTTTTGTTTTTTTTTCTCTTTTCTCTCGAAATTATTGTTTTATTATAATTGATCCATTGTTGTGATAAATTCAAGTTATTACTTTAGAACTTGACTAATAGAATAGTTCCGGGTATGAACTATCAATTATACCTCCTAATTCGAATAGTAAGTCGTGCATTATTGTGGATCAGCTAATTGTGGACGAGTAGGGCGTATTCCTCTCCATATTAAACATAGATTTGCAACCATTAACTCAGTATCCATGTGATTTTAATGTAAATACGGTTTTAGT
Unaligned ( gi|39 ): ACACTACTGTGCGAACCACAATGTCTCCATCATACGCCAATACTTTCTTTGGACGACAACGCAACTTACCTCTAATAGTAAATCGCCTTTCAAGTGCCTTACTTGGTTGTGCTAAGTTCCCGACATTCAAATAGGGTGGACTGACATCCAAAATAAGACAACTTTATTTCGTTTACGAACTCGTTTAACCATTCAATCAACTTCAC
Unaligned ( gi|42 ): CACTACTGTGCGAACCACAATGTCTCCATCATACGCCAATACTCTTTGGACGACAACGCAACTTACCTCTAATAGTAAATCCTTTCAAGTCCTTACTGGTTGTGCTAAGTCCCGGACATTCAAATAGGGTGGACTGACATCCAAAATAAGACAACTTTATTTCGTTTACGAACTCGTTTAACCATTCAATCAACTTCAC
Unaligned ( gi|49 ): TAATACATTCCTAATCGAATTAGTAGTTCGTGCATTATTGTGGATCAAGCTAATTGGACGGTAGGGTGATCCTCATTGGGTTCCTATGTAAAGAAGATTTGCAGCTTAACTTCAGATACCATGTGATTATAATGTAAAAACGGTTTATAGTTAGTACCAATATATTT
Unaligned ( gi|51 ): AGTAATCACTTACGGGAGGCGAACACATAAGTGGTTATAATAATGACCTAAATGGACAGATTCCTAAAGAAAGCAAAAGGAAATTCCGGATGCACAAGACGAAGTCGTTTGACTCCGGTGGAATCCTGACTTATCCCCAGTATAGCAGGCTAAACC
Unaligned ( gi|55 ): GAATTAGGTCAATCATTATCACATCGCACATTGCGGACTAGCTCATTGGACGAATAGCACTAGTCTCAATCTCTCCTCAAAAAAACATTTTAATTAGCAATTCAAAATCCAATAAACATGTACTTTATAGTGTTGATACGATTATAGAAT
Unaligned ( gi|56 ): GACATTAAAATAGTGATTACTGACCATTACCCAAGTTGTACATGTTATGCCACGAAAACGCAAAGAAAGGATTCTTATATACGGTTTTTTCAATAGTCATTCGACCCTCAAGGTATCAACAAAACAATTTAGTTCATCAGATTAAACG
Unaligned ( gi|57 ): GACAACCTCAACAAAGAAGAAAGATCGGCATTGCAGAGATTAAAAAACCGGGATGATATTGTAATAAAAAGGCAGACAAGGGTTCTACTGTTGTTGTTATGGACAAAGATAAGTACCTAACAGAGGCTCACAG
Unaligned ( gi|60 ): GATTTGAAACAAAAAATCTGAAGAAGCATTTTCCCACTCTTCACATTACCTCTAGAATGGCCATGGTCTTCAAAGAACCATCCATGGTGGCTTTCAGACGCCCAGGAAATCTGAAAAACGT
Unaligned ( gi|62 ): AACGAAACTTTTAGATACTCAGACTGAAGTCGTTCGACTTTCAAGGTATCGAAACACCTGATGAATTCACTAGGATCAACATGGGCTAAACATTTGTCACC
Unaligned ( gi|64 ): AGTGGTTATTCATTTTGACCTACGCCAAATACGCAAAGAAAGCCAAAGTGAAAATCTTTGCACACAAACCGAAGTCATCTGAT
Unaligned ( gi|65 ): AAAGCAAACCGAAAAGTTCTGGATGCACAAACAGAAGTCGTTCGACTATCTACTGACTTCACTAGGATAAAAA
Unaligned ( gi|67 ): TTGGGCCAGGTTTTTCCGTAATGACCAACAACTGTATTTACCCTCATCAACATGTTAACGTCGTGCAA
Unaligned ( gi|68 ): ACGTGGCGTTGAGAGCCAAATTAGTAACATATTACCTATTGGTGGTTTT
Alignments
lowQualScore : 111111111111111111111111111111111111111111
lowQualScore : 1111111 3 2222 1111 1111 111 111 111 33333 1111 11 3333333 3333333333 1111 22222 1 1111 1111111111 6666666666666666666666666666 1111111 1 11 1111 33333333333333333333333333333 1111111111 222222 111111111111111 11111 222222222 11 1 1111 11111 11 333333333333 1111 111111 222222 111 111 1 11 11111 1111 111 1111 1111111 1111111 11111 11111 11111 222222222222222222222222222222222222222222 11111111 2222222222222 11111111 11111 11111 1111 11111111111111 222222222222222222222222222 111111111111 11111111111 11111111 11111 1111111 11111111 22222222222 111111
lowQualScore : 1 1 77 77 5 77 5 9999999 44 66 4 22 8888 1 4 666 5 5555 4 1 7777 5 5 1 1 777 666 888 000 1 1 00000 5 9999 2 1 22 6666666 4 7777777777 4 8 1 8 1 7777 00000 1 1 1 1 1 0 0 8 11 8 1111 99 1 6 1 44 6 3 1 4 3 22 9999999999 6 4 4 777 5 5 5 1 5 1 1 0000000000000000000000000000 1 5 66 0 44 5 1 4444444 3 4 22 777777 8888 1 2 4 7 4 4 88888 3 1 0 4 22 3 5 6 3 1 1 6666 4444 11111111111111111111111111111 99999 44 8888888888 88 44 444444 0 3 44 555555555555555 88 55 44444 000000000 2 1 0 888 4 1 1 66 55 1 1 8888 11 5 1 22 5 0 888 55 0 3 2 5 44 77 8 1 5 2222 3 44444 00 666 1 2 444444444444 3 6 3333 666666 333333 1 8 6 8 99 8 1 333 1 777 0 1 6 88 2 999 4 0 5 888 22222 888 4 7 2 55 77 3 3 1 1 1111 55 3 000 3 4 0 0 0000 5 1 3 3 0000000 6666666 11 2 55 2 11111 66666 5 33333 2 44444 8888888 333 4 2 2 4 8888888 444444444444444444444444444444444444444444 33 444 2 0 2 33 5555 2 4444 3 33 2 22 33 6666 1 00000000 555 2 1 4 5555555555555 3 1 00000000 44 555 00000 2 6666 66 22222 88 0 2 0 2 0000 2 0 666 2 66666666666666 555 3 888888888888888888888888888 3 0 77 7777 5555 2 2 2 444444444444 7777 8888 99 6 44 4 6 3 2 0 3 44 44 3 44444444444 3 1 3 44444444 33 44 6666 8 0 3 3 88 3 55 4 888 00000 5 9999999 5 5 0 66 5 88888888 66 44444444444 1 4 55 4 666 3 55 55 000000 0 4
lowQualScore : . . .. .. . .. . ....... .. .. . .. .... . . ... . .... . . .... . . . . ... ... ... ... . . ..... . .... . . .. ....... . .......... . . . . . .... ..... . . . . . . . . .. . .... .. . . . .. . . . . . .. .......... . . . ... . . . . . . . ............................ . . .. . .. . . ....... . . .. ...... .... . . . . . . ..... . . . . .. . . . . . . .... .... ............................. ..... .. .......... .. .. ...... . . .. ............... .. .. ..... ......... . . . ... . . . .. .. . . .... .. . . .. . . ... .. . . . . .. .. . . . .... . ..... .. ... . . ............ . . .... ...... ...... . . . . .. . . ... . ... . . . .. . ... . . . ... ..... ... . . . .. .. . . . . .... .. . ... . . . . .... . . . . ....... ....... .. . .. . ..... ..... . ..... . ..... ....... ... . . . . ....... .......................................... .. ... . . . .. .... . .... . .. . .. .. .... . ........ ... . . . ............. . . ........ .. ... ..... . .... .. ..... .. . . . . .... . . ... . .............. ... . ........................... . . .. .... .... . . . ............ .... .... .. . .. . . . . . . .. .. . ........... . . . ........ .. .. .... . . . . .. . .. . ... ..... . ....... . . . .. . ........ .. ........... . . .. . ... . .. .. ...... . .
lowQualScore : 0 0 99 99 7 99 7 7777777 44 00 3 99 9999 0 1 000 0 2222 5 1 5555 0 0 1 1 555 000 888 555 0 0 33333 7 3333 3 0 99 0000000 3 0000000000 4 4 0 0 4 0000 00000 4 0 0 0 4 0 8 0 88 0 6666 44 4 4 0 22 4 2 0 9 6 44 3333333333 2 2 2 444 0 0 9 1 0 9 0 0000000000000000000000000000 0 0 99 8 22 9 1 8888888 4 4 66 333333 7777 0 3 4 8 4 4 11111 3 8 2 2 11 3 8 7 7 7 4 1111 5555 77777777777777777777777777777 22222 66 6666666666 77 88 444444 4 7 66 888888888888888 55 00 88888 555555555 3 8 1 888 0 0 0 11 66 0 0 8888 11 9 0 00 7 1 444 66 5 2 1 0 00 99 1 0 7 1111 0 33333 66 888 0 5 222222222222 3 7 1111 888888 000000 0 0 4 8 66 0 0 444 7 000 8 0 7 33 5 555 0 8 0 888 55555 888 5 6 4 55 44 5 6 3 0 0000 00 3 444 3 6 8 2 5555 7 0 1 1 0000000 5555555 22 9 44 7 77777 77777 0 99999 5 66666 1111111 999 7 2 2 6 1111111 555555555555555555555555555555555555555555 44 444 5 2 5 44 3333 5 8888 2 44 7 99 22 1111 4 44444444 111 9 9 6 6666666666666 1 9 66666666 22 000 00000 9 1111 33 33333 22 2 7 7 9 6666 9 9 888 9 88888888888888 000 3 888888888888888888888888888 1 2 00 9999 4444 9 9 9 666666666666 6666 9999 00 2 22 2 7 1 5 2 3 66 22 1 55555555555 1 0 1 22222222 88 66 2222 7 1 6 6 66 6 44 4 000 99999 0 5555555 0 0 4 00 0 11111111 99 99999999999 9 4 44 0 444 6 00 00 111111 9 4
consensus : GCTCACCGACAGCTCTCG--GACGAACGCTTT--TAT-A--AA-AAGTTACAGTCTGACCCT-ACCAAAGNGTTCTCCGCCAAGATCA--C-GAAACCCTTCAGGAAATGT-ACGA--AGGGCGA----AATC-GGTGACAA-CGTCTTCGAAAC---GCTTC-GTC---CCAAC-GACTGTAGACCNGGACAATTTTATNTACTGCCTAAAA---TCCAC-AAG-A-AAGACATGCCNGGCCGCCCT-ATAGT-C-G--NGCCATCGG-AC-------ACCCCACGGAGAAAATCTCNGAATTCATTGACCT-ACATCTCCGC----CCGCA-----TGTAANAGANCTACCGTCATA-CTTGAAGGACACCACT-GATTACCTAAAC-GAAACCCCA-CNTCG-GACCTACCTGACNACACCCTTCTCGTGACCATGGACGTNACTTCACTNTACAC-TAACGTT--CCACACGACGAGG-ACAT-CGA-GGCNTGCAGGGAGGTT-TGGAATANA--------AG-----TC--T-C-----AAAA-TC--CTTCCACTGAATCACTCGTCCAGCTCCT-----T-GAACATGTCCTCA-AGTTCAA--TA--ACTTCATGTTCGA---CGGCGAACACTACCTGCAAA-T-A-GTG-GCAC-NG--CTATGGG-AACCAAAATGGCNCC-NTCNTACGCCAACA-TCTTTATGGGAA--GACTC-GAACGTAACCT-CCT---GC--A----T---CGNT--CACC--NTTTA--AACC-CCTTA----GTTG-GCTACGTTTCA-T-GATGACATTGAGATG--AAGTG----G--GCTGACGGTCGCGAA--AGCCNCGACGACTTTATC----GCGNTTGCGAACTCTTTCCAC-NATTCCA-TCAAGTTCACNG--TG-GANATTTCC-GCATCCAG-GAACGTNTTTTTGGATACCACGTC-CACACTTA-TGAACGGAGAAATCGAGTTCAGCCTCCATA-CNAAACCCACCGACTCTCATT--TGTACCNTA-TGCCATCC----AGCTGTC-----ATCCGCCCCAT-A-CNTTCA------------AAGGTGT-GCC---GCCC--G-CGTCC------GCCGCATCTGCTCTATT-CCTACCACTTTCCAAGAGGCA-AGGACACATCCT-N-AAAGTCCATCTGTACAAACAGAGGNTAT-GA--TCCTCGCAAGGTGCAGTCCGCAAT-TGATG---AGAT-----GT---CACAACANGACAG--ACAGTCCCTCCTNCAATATAAAGAAAAACC-TCAGA--AT-G---A-CAGAGTTCCACTGGTCACTAC-T--TACCACCCCGTCCTNAA-G-GAC-------CTC-------AACANTAT-TCTGAGAAAG-CATNTN--CCCATT-----CTNCA---TACCAA-TAAAC---GA-------ATGGCT--GAT-GT-TTTCA-AGGA---A---CC-------------T-------CC-------G-----------TT--CA--GACGC-CCCAGAAA-CC--TGAAG----GACATG-GTGGTG--AGGACCAGACTGG--ATA-ACCC-TTTAC--CTAATGG---AGGTTTCAAAAC--------AT--GC-TCAGACCT-CA--A-----G-ATG-TCAA--TC--G-TGC--AAAT---AT-----AGC-TC----AGAC--ACT-----GAGAGCTTCA-GCA-GTCCTGT--C-ACA-GGTCG-C-AGTT-AT--------------A---AAA-TATTGG--------------GG-AACTA---CGTCCCG-TAA-AAC---CGAC---AAC-T-G-CAT-C----------TA-C--CTC----ATCAGC-TG-T--AANGTC-TG-CCAGAAA-CA--GTA--CG-T----------GG-GNGA-AA--------CTAC-GG--ACC---TNCGCAGAA-GGGT-CAA--CAA-CCACCGGTCCN-CCG-T-C-AAGACCAAAA-A---GGA-TCC-----GC-CG-GTA-GC-TACG--------CA--TTTCAA----T---G-GTAGCAATCA-CCG-AT-GG---GAGG-ACA--TGACAA--TA-----NTAGTTATTGATCAT
Reference ( family-868 ) : GCTCACCGACAGCTCTCG--GACGAACGCTTT--TAT-A--AA-AAGTTACAGTTTGACCCT-ACCAAAG-GTTCTCCACCAAGATCA--C-GAAACNCTTCAGGAAATGT-ACGA--AGGGCGA----AATC-GGTGACAA-CGTCTTCGAAAC---GCTTC-GTC---CCAAC-GACTGTAGACCNGGGCAATTTTATNTACTGCCTAAAA---T-CAC-AAG-A-AAGACATGCCNGGCCGCCCT-ATAGT-C-G--NGCCATTGG-GC-------ATCCCACGGAGAAAATCTCNGAATTCATTGACCT-ACACCTCCGC----CCGCA-----TGTAANANANCTACCGTCATA-CTTGAAGGACACCACT-GACTACCTNAAC-GAAACCCCN-CTTCG-GACCTACCTGACGACACNCTNCTCGTGACCATGGATGTNACTTCACTNTACAC-TAACGTT--CCGCACGACGAGG-ACAT-CGA-GGCNTGCAGGGAGGTT-TGGAATANA--------AG-----TC--T-C-----AANA-TC--CTTCCACTGAATCGCTNGTCCAGCTCCT-----T-GAACGTGTCCTCA-AGCTCAA--TA--ACTTCATGTTCAA---CGGCGANCACTACTTGCAAA-T-A-GTG-GCAC-NG--CTATGGG-AACCAAAATGGCNCC-NTCNTACGCCAACA-TCTTTATGGGAA--GACTC-GAACGTAANCT-CCT---GC--A----T---CGNT--CACC--ATNTA--AACC-CCTCA----GTTG-GCTACGTTTCA-TNGATGACATTGAGATG--AAGTG----G--GTTGACGGTCGTGAA--AGCCNCGACGACTTTATC----GAGNTNGCGAACTCTTTCCAC-NNTTCCA-TCAAGTTTACNG--TG-GANATTTCC-GCATCCAG-GAACACNTTNTTGGATACCACNNC-CACACTTA-NGAACGGAGAAATCGAGTTCAGCCTCCATA-CNAAACCCACCGACTCTCATT--TATACCNTA-TGCCATCC----AGCTGTC-----ATCCGNCCCAT-A-CNTTCA------------AAGGNGT-GCC---GCCC--G-CGTCC------GCCGCATCTNCTCTATT-CCCACCACTTTCCNAGAGGCA-AGGACACNTCCT-N-AAAGTCCATCCG-ACAAACAGAGGNTAT-GA--TCCTCGCAAGGTGCAGTCCGCAAT-TGATG---AGAT-----GT---CACAACANGACNG--ACAGTCCCTCCTCCAATATNAAGAAAAACC-TCAGA--AT-G---A-CAGAGTTCCACTGGTCACTAC-T--TACCACCCTGTCCTNAA-G-GAC-------CTC-------AACANTAT-TCCGAGAAAG-CATNTG--CCCATT-----CTGCA---TGCCAA-TAAAC---GA-------ATGGCT--GAT-GT-TTTCA-AGGA---A---CC-------------T-------C--------G-----------TT--CN--GACGC-CCCAGAAA-CC--TGAAG----GACATG-GTGGTG--AGGACCAGACTGG--ATA-ACCC-TTTAC--CTAATGG---AGGTTTCAAAAC--------AT--GC-TCAGACCT-CA--A-----G-ATG-TCAA--TC--G-TGC--AAAT---AT-----AGC-TC----AGAC--ACT-----GAGANCTTCA-GCA-GTCCTGT--N-ACA-GGTCG-C-AGTT-AT--------------A---AAA-TATTGG--------------GG-AACTA---CNTCCTG-TAA-AAC---CGAC---AAC-T-G-CAT-C----------TA-C--CTC----ATCAGT-TG-T--AANGTC-TG-CCAGAAA-CA--GTA--CG-T----------NG-GNGA-AA--------CTAC-GG--ACC---TNCGCAGAA-GGGT-CAA--CAA-CCACCGGTCCN-CCG-T-C-AAAACCAAAA-A---GGA-TTC-----GC-CG-GTA-NC-TACG--------CA--TTTCAA----T---G-GTAGCAATCA-CCG-NT-GG---GAGG-ACA--TGACAA--TA-----NTAGTTATTGATCAT
gi|1 : GCTCACAGACAGTTGTCA--GACGAACGTTTT--TAC-A--AA-AAGTTGCAGTCTGACCCC-ACTAAAA-ATTCTCCATCAAGATCA--C-GAGACCCTTCAGAAAATGC-ATGA--AGAGTGA----AATC-GGTGATAA-TGTACTTGGAGC---GCTTT-GTC---CCAAC-GACTGTAGACCTGGACAATTCTACTTACTGCCTAAAA---T-TAC-AAG-A-AAGACATGCCAGGCCGTCCT-ATTGT-CAG--TGCCATCGG-AC-------ACCCCACGGAGAAAATCTCTGAATTCATTGATTT-ACATCTCCGT----CAGCA-----CGTAGAAGATTTACCGTCATA-CTTGAAGGATACGACT-GATTACCTAAAT-AAAACCCCA-CATCG-GGCCTGCCAGACCATACCCTCCTTGTGACTATGGATGTGACGTCACTCTACAC-CAACAAT--CCACATGATGAGG-GTAT-TGA-GGCCTGTAAAGAGGTT-TGGAATCAA--------AGGG---TCAGT-C-----AACA-TC--CCTCAACTGAGTCACTCATTCGGCTTCT-----T-GAACATGTCCTCA-AGTGTAA--TA--ACTTCATGTTTGA---CGGTGAACACTACCTGCAAA-C-A-GTG-GCAC-TG--CTATGGG-AACAAAAATGGCACC-TTCCTATGCCAACA-TCTTTATGGGAA--GATTG-GAACGTAGACT-CCT---GC--A----T---CACT--CACT--AGTTA--AACC-TCTCA----GTTG-GCTACGTTTCA-TAGATGACATCGAGATG--AAGTG----G--GTTGATGGTCGTGAA--AGCCTCAACGAGTTTATT----AAGATGGCAAACTCTTTCCAC-GATTCCA-TCAAGTTT-CTG--TG-GATATTTCA-ACATCCAG-GAATACGTTTTTGGATA-CACAGC-AACACTTA-AGGACGGAGAAATCGAGTTTAATCTTCACA-CGAAACCCACAGATTCTCATT--TGTACCTTA-TGCCATCC----AGCTGTC-----ATCCACCCCAT-A-CTTTCA------------AAGGTGT-GCC---ACCT--G-CATCC------GCCGCATCTGCTCTTTT-CATACTAGTTTCCTAGA-ACA-AGGAAATATCCT-C-AAAGTCCATCTA-ACCAGCAGAGGATAT-AA--TCCTTGTAAAGTACAGTCCGTAAT-TGATG---AGAT-----GT---CACAACAGGACCG--ACAATCCCTCCTCCAATATCAAGTGAAACC--CAGG--ATCA---A-CAGGGTCCCACTAGTCACTAC-T--TACCACCCTGCCCTTAG-G-GAT-------CTC-------AATAGTAT-CATAAGAAAA-CATTTG--TCTATC-----CTGTA---TGCCAA-CAAAC---GT-------ATGGCG--GAT-GT-TTTCA-AGGA----------------------T-------C--------G-----------TT--CC--GGCGC-CCCAGAAA-CC--TGAAG----GATATG-GTGGTA--AGGACCAGGCTGG--ATA-ACCC-TCTAC--CTAATGG---AGGTTTCAAAAC--------AT--GC-TCAGATCT-TA--A-----A-ATG-TCAA--TT--A-TGC--AAAC---AT-----AGC-TT----AGAC--ACT-----GAGACTTCCA-GAA-GTCCTGT--G-ACA-GATCG-C-AGTT-AT--------------A---AAA-TATTGG--------------GG-AACTA---CA-CCTG-CAA-AAC---CAAT---AAC-T-G-CAT-C----------TA-T--CTC----ATCAAT-TG-T--GATGTC-TG-CCAGAAA-CA--GGA--CG-T----------TG-GAGA-AA--------CTAC-AG--ACC---TTCGTAAAA-GGGT-AAA--CAA-TCACCGGTCCT-CCG-T-T-AGGACCAAAA-A---GGA-CTT-----GC-CG-GTA-TC-TACG--------CA--TTTCAA----T---G-GTAGCAATCA-CCG-TT-GG---GAGG-ACA--TGACAA--TA-----TTAGTGATTGATCAT
gi|10 : AGGACACCACT-GACTACCTCAAT-GATACTTCTTCTTCA-GACCTGCATGAAGACACTTTGTTGGTTACAATGGACATCACTTCATTGTATAC-CAATATT--CCACACCAGGAGG-GCAT-TGA-GGCATGCAGAGAGGTC-TGGAAAACA--------AGAACCACC--C-C-----TAAA--C--CTTCCACAAAATTATTGGTTCTACTCCT-----T-GAGCATGTCCTTA-AGTTCAA--TA--ACTTTATGTTCAA---TGGTGAACACTATCTACAAA-T-AAGTG-GCAC-TC--CCATGGG-CACCAAAATGGCTCC-CTCTTACGCTAACA-TCTTTATGGGTA--AACTT-AAACATAATCT-GCT---AC--A----A---CAAG--CACC--TGTTA--AGTC-GTTCA----GCTG-GTTACGATTCA-TTGATGACATTGAAATG--AAATG----G--GCGAACAGTC--GAAGCAGTCTTGACAACTTCATT----GAACTTGCAAACGCTTTTCAT-ATTTCCA-TCAAGTTCACAG--TG-GATATTTCC-GCATCTAG-CAACGTCTTTCTGGA
gi|11 : CAA-TAAA----GA-------ATGGCT--GAT-GT-TTTCA-AAGA---G---CC-------------A-------C--------ACTATGGCTGCCTT--TA--GGCGC-CCACGAAA-CC--TGAAA----GACATG-GTGGTT--CGAACCAAGTTGG--AAA-ATCC-TTTAC--CCAATGG---TGACTTTAAAAC--------CT--AT-TCAGA--TAAA--A-----G-ATGTTTGA--T---G-TGC--AAAC---AT-----ACT-TC----TAGC--ACC------ACAGTTTTG-AAA-GCCCTGT--C-ACC-GGTCG-A-TCTT-AC--------------A---GAA-TATTGG--------------GG-AA--A---CGTCCTG-TCG-AAG---TGAC---AAC-T-G-CAT-C----------TA-C--TTG----ATCAGC-TG-C--AAAA---TG-TCAGAAA-CA--ATA--TG-C----------GG-GTGA-GA--------CTGG-CG--ATA---TACGCCGAA-GGA---------------CGGT-CA-CCA-T-A-AAAAC--AAA-A---GGG-TCCAAGGAAC-CC-GTC-GC-CAAG--------CA--TTTTAA----TCTCG---AGGAA-CA-CTC-AT-GG---GAAG-ACA--TGACGG--TG-----GTGGTTA-TGACCAc
gi|12 : atatatatatgacacgCCT-CGAAAGTC-ATCCG-ACAAACAG--GATAT-GA--TCCTTGCAGGGCACAGTCCGCAGT-TGATA---AGAT-----GC---CACAACA-GACCG--ACAGTCCCTCCTCCAGTACACAGAAAACCC-TTAAA--AT-G---A-CAGAGTTCCGCTAATCACTAC-T--TACCATCCCGCCCTCAA-G-A---------CTC-------CACATTAT-TCTGAGAAAG-TATCTA--CCCATT-----CTGCA---AGCCAA-TAAAC---GA-------ATGGCT--GAT-GT-TTTCA-AGTA---A---CC-------------T-------CCAAT----GACATGC-----TT--CA--GACGC-CCTAGAAA-CT--TGAAG----GACATG-GTAATA--AGGACCAGACTGG--ATA-ACCT-TTTAC--CTAATGG---AGGTTTCAAAAC--------TT--GC-ACTGGCCT-C---A-----G-ATG-TCAA--CT--A-TGC--AAAT---AT-----AGT-TC----AGAC--ACT-----CAGAGCTTTA-GCA-GTCCTGC--C-ACA-GGTCG-T-AGTT-AT--------------A---GAA-TATTGG--------------GA-AACT----TTTCCTG-CAA-AACTATTAAC---AA--T-GTCAT-C----------TA-T--CTC----Agacatccactggacggatgcagacagaaaaggcaagaagttttggatgcataggctgtaaaag
gi|13 : TTAAAAGACACAACA-GACTTTC-AAAT-GTAACTCCA-AAGCAAGGCCCACCAGACCACACACTT---------ATAAAT--AAC----CTTGACAT-TAACGTTTTCCATATGACAAAA-ATAT-CAATGGC-TGCAGGGAAGTT-TGAAATGAC--------AA-----TC----C-----AAAA-TC--CT---AGTAAATCACTCATTCAG--------------------CCTCA----TCAA--CA--ACTTCTTGTCAGA---CAGCAAACAT-----------T-A-GTG-GTCT-CG--CTAT-GA-AACCAATATGGCACCAATTTTA----AACA-T----------A--AACTC-AAACGTAGCCC-ATT---AA--A----C---CAAA--CATC--ATGCA--AATC-CCT------GT----CTACTTTTCA-AAGATGACATAGAGAT---AAGC----------------CCATAAG--AGTCGGAAGGATTT--------------GCAAACTCTTTCCA------CCA-TCAAGCTTAAAG--TG-GAAATT---------------ATACTCTCTTGGTCACCACTGC-CACATCTACAGAATTTA-AAATCAATTTCAGCCTCCCCA-CTAAGTCCACa
gi|14 : ACTTGCAAA-TCA-GTTCGCAT-GG--CTAAGTT-AACTAAAATGGC--------------AAAA-TCTT-ATG----------C-CAACAT-------CT---GC--A----T----GGTAGCACCCTATTTGTTAGCC-----A----GTTG-GCTATGTTTCA--------CATTGAGATG--AAGTG----A--AT----GATCATGAA--AAATCCGA-GACTTCGTC----ACGGTTCCGAACTCTTTCCTT-TATTTGA-TGAAGTTCACTGCATGTGGCAATTCC-ATCTCCAA--AATAC--TATCGGATACCACAGC-TACACTTA-TAAATGG-GAAACTGAGTTCAATCCCCATAACTCAACCCACCGACTCTCATTAATATACCATA-T--CATCC----AACCATCCTAAAATGTGTCCTAA-G-CTTT--------------------T-GTC---GTCC--A-AATTT------GCTGCATCTTCTCTATTACCCACCACTTTCCAAGAGGCA-AGGACACTTCCTAA-AAAGTCaa
gi|15 : ---AT-----AGC-TC----AGAC--ACT-----GAGAACTACA-ACA-GTCACAT--T-ACG-GGTCA-C-AGTT-AC--------------A---CAA-TATTGG--------------GG-AATT-----TTCCCG-TAA-AAT---TCAT---AAT-T-G-CAT-T----------TA-T--CTC----AACAGC-TG-T--AATGTC-TG-CCAGATA-CAATGTATTCA-TATGGGGGGGGGG-GTGT-AA--------CAAC-AG--ACC---TTC-CAAAACAGGC-TAA--CAA-CCACCGGTCCG-CTG-T-C-GAAACCGAGA-A---AGG-TTT-----GT-CA-GTA-GC-TACC--------CA---TTCAA----T---G-ACAGTAATAT-CCG-AT-TG---GAGG-CCG--TGACAA--TA-----ATGGCTAT
gi|16 : GCTCATCGACAACTCTCA--GACGAACGCTTT--TAT-A--AA-AAGTTATAGTTTGACCCT-ACCAAAGAGTTCTCTCCTAAGATAAT-C-AAAACCCTTCATGAAATGT-ACAACAAGGGTGA----AATC-GGTGACAA-CGTTTTCGACAT---GCTTT-GTC---CTAAC-GACTGCAGACCAGGACAATTTTATATACTGCCTAAAA---TCCAC-AAA-G-TAGACATGCCACGCCGTCTT-ATAGTCC-G--AGCCATTGG-ACCGTCATGATCCCAAGGAGAAAATCTCTGAATTCATTGatattgaacatgacaaaagttttcagatacccagagaaaacaaaaggaaatgattagggatgcaaatattgaagtaattttatcagcaagatctaaacatgcccactaacttcacccggatgaata
gi|17 : agataatctcaccaaagaagaaagattggcgttgcaaacattgatattgtcattaaaaggacagacaaaggttctacttaagttgtcttggacaaagacgggtacttgacggagGCTC-TCG-CAACTCTCAATGACGAACGCTTT--TATTA--AATAAGTTATAGTTTGACCTA-ACCAAAGAGTTCTTCTCTAAGATAAT-C-AAAACCCTTCATGAAATGT-ACAACAAGGGTGA----AATC-GGTGACAA-CGTTTTCGACAT---GCTT---TC---CTA-C-GACTGCAGACCAGGACAATTTTATATACTGCCTAAAAAT-C-CACAAAG-T-AGAACATGCACGGCCGTCTTAATAGTCC-G--AG-CATTGGAACGTCATG-ATCCCAAGGAG-AAATCTCTGAATTCATT
gi|19 : gagataatctcaccaaagaagaaagattggcgttgcaacatttgatattgcattaaaaggaaacaaagttctaacttaagtgtcttggacagaagacgggtacttgacggaTCCGCAAC-TGATG---AAAT-----GT---CGCAATAAGGCCG--ACAGCCCCTTCTCCATTTTAAAGAAAAACC-GCA-A--AT-G---A-CAGGGTTTTGCTTGTCACTAA-C--TATCACCG-GTCTTGAA-G-ATC-------CTC-------AGCTGTAT-TCTGTAAAAG-CATCAA--CCCATT-----CTGCA---TACCAG-TAAAT---GA-------ATGGCT--GAT-G--TTTCA-GGGA---A---TC-------------C-------C--------C-----------TA--TA--G-CAC-CAGAGAAA-CC--CCAAG----GATACG-ATAGTA--AGGACAACACTAT--ATA-ACCCTTTTAC--CTAATGG---------TAAAAC--------AT--AC-TCAGACTT-CA--GTACATGTATG-TCAA--TT--G-CAC--AAAT---ACATGTAAGC-TC----AGAC--ACA-----GATAGCTTTA-GCA-GTCCTGTTCG-ACA-GGTCG-TGAGCT-AT--------------A---AGA-TATTGG--------------GA-AA
gi|2 : GCGCACAGACAGCTCT-G--GATGAACGGTTT--TAC-ACTAA-AA----C--TCCGACCCT-ACCAAAACGTTTTCCGCTACTATCA--CCGACACTCTTGAGCAAATGTTACAA--AAAACGAGGAAAATT-GGTAATAA-TGTCTTTGAAACAGTGCTGC-CTC---TCAAC----TGTACAC-TGGGCAATTTTATCTCCTGCCTAAAT---C-CAC-AA--A-AAGGCATTCCTG-CCGCCC----------------CATTGG--C-------ACCCCACGGAGAAAATCTCAGAATTTATTGACCT-ACACCTCTGC----CCATA-----TGTTGTAAAACTACCATCATA-CTTGAAGGACACCACT-GATTACCTTAACAAAAACCCCT-CTTCG-AACCTACCTGACAATACCCTTCTCGTGACCATGGATGTGACTTCGCTTTACACAAAACATC--CCCCACGATGAAG-ACAT-TGA-AACCTGCTGGGAGG-T-TGGGATAAA--------AG-----GA--T-CCTGAAAACA-TC--CTTCCACAGAATCA-TTGTCAAGCTCCT-----T-GAACATGTCCTCA-AACTAAA--TA--ACTTCATGTTCCA---AGGCAACCATTACTTACAAGTT-A-GGG-GCACAAG--CAATGGGAAACGAAGATGGATCCTTTCATATGCCAACA-TTTTTATGGGAA--GACTT-GAACGCAACTT-ACTCAGGC--A----------AT--CGCC--CTTTA--AACC-CCATA----ATTG---TGTGTTTCATTTGATGACATTGA-ATG--AAATGAAATG--GCGGAGGGCCGAGAT--A--CTTGACAACTTTATC----TCCTTTACCAACTCATTTCAC-CATTCCATTTAAATTTACAG--TG-GAAATTTCCAGC-TCCAA-GAACATATTCTTGGATACCGCTTC-CACTCTCT-TGGATGGTGAAATTGAATTCAGCTTCCATACCAAAACCCGCTGACTCACATT--TGTA-CTTATTGCCTTGA----AGCTGTC-----ACCCACCTCAT-A-CCTTCA------------AAGGAGT-ACC---tct
gi|2 : gacaaacttaagcatagaagaagagcttagccttataagagcttaaaaaaaaactcggatgacattgctatcaaaaaggcagacaaggtcaacagtggttgtattagacaagacagcatacatagcggaaCACCC-GCCCTGAA-G-AAC-------CTC-------AATACCAT-CCT--TAAAGCCAT-TG--TCCTAT-----CTGTA---TAACAA-AGAAC---GA-------ATGGCT--AGG-GTCTCTTA-AAGA---C---CA-------------T-------CCAAT----GGCAGCT-----TT--CA--GACAA-CCTAGAAT-TT--AAAAG----GATATT-GTAGTT--AGAATTAGGCTGG--ATA-ACCC-ATTAC--CCAACGGGGCGGGTTTTCCCAC--------GT--GC-TCTGA-----AAGA-----G-ATG-TC----TCCAG-TGC--AAAT---TC-----AG---C----GGGCCAACT-----GACGCTTTCA-Gtaaggtttagctacacgagttcgtctatctgttcctctggctcggaattcgaaaaaacaaatcaaactctatcttgaaaagccacctttgtaaaaggggctgtaaagttgttcctgttcacaacagcaattgacgattgtccagaacaagcaaaactctaaattttcacccgccctgaagaacctcaataccatccttaaagccattgtcctatctgtataacaaagaacgaatggctagggtctcttaaagaccatccaatggcagctttcagacaacctagaatttaaaaggatattgtagttagaattaggctggataacccattacccaacggggcgggttttcccacgtgctctgaaagagatgtctccagtgcaaattcagcgggccaactgacgctttcag
gi|20 : gacaaacttaagcatagaagaagagcttagccttataagagcttaaaaaaaaactcggatgacattgctatcaaaaaggcagacaaggtcaacagtggttgtattagacaagacagcatacatagcggaagcgcacagacagctctggatgaacggttttacactaaaactccgaccctaccaaaacgttttccgctactatcaccgacactcttgagcaaatgttacaaaaaacgaggaaaattggtaataatgtctttgaaacagtgctgcctctcaactgtacactgggcaattttatctcctgcctaaatccacaaaaaggcattcctgccgccccattggcaccccacggagaaaatctcagaatttattgacctacacctctgcccatatgttgtaaaactaccatcatacttgaaggacaccactgattaccttaacaaaaacccctcttcgaacctacctgacaatacccttctcgtgaccatggatgtgacttcgctttacacaaaacatcccccacgatgaagacattgaaacctgctgggaggttgggataaaaggatcctgaaaacatccttccacagaatcattgtcaagctccttgaacatgtcctcaaactaaataacttcatgttccaaggcaaccattacttacaagttaggggcacaagcaatgggaaacgaagatggatcctttcatatgccaacatttttatgggaagacttgaacgcaacttactcaggcaatcgccctttaaaccccataattgtgtgtttcatttgatgacattgaatgaaatgaaatggcggagggccgagatacttgacaactttatctcctttaccaactcatttcaccattccatttaaatttacagtggaaatttccagctccaagaacatattcttggataccgcttccactctcttggatggtgaaattgaattcagcttccataccaaaacccgctgactcacatttgtacttattgccttgaagctgtcacccacctcataccttcaaaggagtacctaaggtttagctacacgagttcgtctatctgttcctctggctcggaattcgaaaaaacaaatcaaactctatcttgaaaagccacctttgtaaaaggggctgtaaagttgttcctgttcacaacagcaattgacgattgtccagaacaagcaaaactctaaattttACAG--ACAGGTCCTCTTCCACTATGAAGAAAAACC-TCAAA--AT-G---A-CAGAGTTCCACTAGTCACTAC-T--AACCGTCCTGTGCTCAA-A-AAC-------CTC-------AACACTGT-TCCAAGAAAA-CATG----------------TGTA---TGCCAA-TAAAT---GA-------ATGGCT--GAT-GT-TTACA-AGGA---A---CCCCTATGGCA----T-------C--------C-----------TT--TT--GATGT-CCCAGAGA-CC--AGAAG----GACATG-GCAGTA--AGGGTTAGACTGAATATA-ACCC-TCTAC--CTAATGG---AGGTTTC-ATAT--------AT--------GACCT-C---A-----C-ATG-TCAA--TC--A-TGC--AAAT---AT-----AGC-TC----AGAC--ACTGGCCAGGGAGATTTA-GCA-GTCTTGT--C-AGG-GGTTG-C-AGTT-AT--------------A---
gi|21 : aaACAG--ACAGGTCCTCTTCCACTATGAAGAAAAACC-TCAAA--AT-G---A-CAGAGTTCCACTAGTCACTAC-A--TACC-----GTGCTCAA-G-AAC-------CTC-------AACACTGT-TCC-AGAAA--CATGTG------TA-----CT---------CAA-TAAAT---GA-------ATGGCT--GAT-GT-TTACA-AGGA---A---CCCCTATGGCA----T-------C--------C-----------TT--TT--GATGT-CCCAGAGA-CC--AGAAG----GACATGCGCAGTA--AGGGTTA-ACTGA--ATATAACC-TCTAC--CTAAT-G---AGGTTTC-ATAT--------AT--------GACCT-CA--C-----A-GTG-TCAA--TC--A-TGC--AAAT---AT-----AGC-TC----AGAC--ACTGCCA-GGGAGATTTA-GCA-GTCTTGT--C-A-G-GGTTG-C-AGTT-AT--------------A---
gi|23 : aG---GAGA-ACA--TGACAA--TA-----GTATTTA-TGATCA
gi|24 : gggtcaaaacctgttgccaagcatttcaatctagcagaaacaaatgggaaaacatgagaat-AAAACCCATTTGTGCAAA-AGAAGCTAT-GAAGCCCCAACAA--TGCAAGCAGCTAT-TGATG---TGAT-----GT---CAGAACACGACAT--ATTATCCCTACTACAATTTAAAGGTAAATTGTTAGATTAT-G---AACAGAGACCTAACGGTTGCAAC-G--CACCACCCTGTCTTGAA-A-GAC-------CTA-------AACAATAT-TGTGAGAGAG-CATATATTCCCAAT-----CTTCA---TACTAA-CACTA---GA-------ATGG-------------TCA-ATGA---A---CC-------------T-------C--------gaactcccactggaaaggaataacaaagaaaaaatctggatgcgtagccactccgccctgatggcacgacttccctagaatgaatgtgacttgggtactctagttattactcagtatttacaatttctatttgccatttactttgtgtaaaagcaccatcattagcagtcaatctttccatacttgttctgatttttttttta
gi|25 : aagaacagagcacccgactga-GG---GAGG-ACA--CGAC-A--TA-----GTGGTTATTAATCATccattgcggcctctgctaccgaattcttgggaagaca
gi|27 : acATCA--CTGACACTCT-AAGCAGATGT-ACAA--ATGACGAGG--AATTTGGTAATAAATGTCTTTGAAAC---ATTGCTGTCTCTCCAA-----TGTAGACCTGGGCAATTTTATCCACTGCCTAAAA---TCCAC-AA--A-GAG-TATGCCTGGCCGCCCC-ATAGT---GATGGCCATTGG-AC-------A-CCCACGGAG-AAATCTCAGAATTTATTGACCCAACACCT--GC----CCACAAATGTTGTAACATACCTAC--TCATATCTTGAAGG--ACCACTAGATTACCTAAAC-AAAACCCCA-TCTCC-AACCTACCTGACAAgacctaaattggacagattcctaaagaaagcaaaaggaaaattccggatgcacagacagaagtcgtttgactccgggtgaatcactgactttcccagtatagcagggctaaacctacaaatgtttattattccggaactccatctactcttttgattcataccttcaacactatagccgtatttttcatttcatttttttaaaaatagttttacgcgctagactactttgttacatactagtttacaggaccgtgt
gi|28 : caT-TTTTA-GTGA---A---CC-------------T-------CCCTGTCGTG-----------TC--CTTCGACGG-CCCAGAAA-TAAATCAAG----GACCTT-ATGGTA----GACCAGACTGG--ATA-ATCC--CTAC--CCAATGG---GGATTTTCCAAC---------T--TC-TCTTAACA-CA--C-----G-GTG-CCTA--CT--C-TGC--AAAT---AT-----ATC-CCCAAAAGAC--A-T-----GAGACATGCA-G-A-GTCTGAC--C-ACA-GA--A-A-AAGT-AT--------------A---GCA--ATTGG--------------G----CCAGGTTTTTCCG-TAATGAC---CAAC---AAC-T-G-TAT-T----------TACC--CTC----ATCAACATGTT--AACGTCGTG-C---AAA-CA--ATA--TGCT----------GG-GGGA-AA--------CCAt
gi|29 : gtGCTCATTGACAGCTTTCG--GACGAACGCTTAAATAT-A--AA-AAGTCACTGCCTGACCCTCGCCACAGAGTTCTAGACCAAGATCAGCC-GAAAAATTCCAAGCATTGT-AC-A--ATGGCGA----GATC-AGTGACAA-CGTT------AC----CTT----------AAC-GCCTGTGGACCAGGATATTTTTATGTACTGCC--AAATGTT-CAC-AAACACAAGACATGTTAAACTGTCCT-GTAGT-CGG--TGACTTCGG-GC-------ATCAAACGAGGAGAATTTCTTAATTCATT
gi|3 : tagacaagtactcaacaaattaaaGTTCACTG--TT-GATATTTCC-GCATCCAG-TAACGTATTTTTAGACACTATGTC-CAAGATTG-TTAACGGAAAAGTCGAGNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--NNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNAGTTGTC-----ATCCTACTCAT-A-CATTCATAGGAGAAACTAAAGGTTTAGCC---ACCA--G-TGTCG------GCCGTATCTGCTCCACT-CCTGC-ACTTTATAAAGAACAGAGCACCCATCTA-G-AAAA-CCATCTGTGCAAG-AGAGGCTATCAA--GCCCCA-AAAGTGCAAGCAGCTAT-TGATG---AAAT-----GT---CAGAACACGACAG--AGAACCCCTACTACAATACAACAACAAA---TCGGT--AT-GTG-A-CAGAGTCCCAATGGTTACTACGTAGTACCACCCTGTCTTAAA-A-GAC-------TTG-------AACAAAAT-TCTGAAGAGG-CATATC--CCCATT-----CTTCA------CAA-TAACCCTAGG-------AT--CTTCAAG-AT-CTTCA-AAGA---A---CC-------------T-------CCCAT----GGCGGCC-----TT--CA--GACGC-CCCAGAAA-TC--TGAAA----GACATG-GTGGAG--CGGACTAAATTGG--ACA-ACCC-GATAC--TTAACGA---GGGCTTTATCAC--------AT--GT-TCTGATGG-C---A-----G-ATG-CCTG--AC--G-TGC--AAAC---AC-----AGCATT----AG-C--ATA-----AACATTTTTA-AGA-GCCCTGT--T-ACA-GGCCGAC-ACCT-AC--------------C---GAATTCTCAG--------------GG-AA--A---CATCCTG-TCG-CGC---GGAT---GAT-T-G-CAT-C----------TA-C--CTC----ATAAGC-TG-T--AAGGTC-TG-TGATCAA-CA--ATA--CG-T----------GG-GTGA-AA--------CTGG-GG--ACC---TACGTAGGA-GGAT-CAA--TAA-CCACCGCTCTA-CCA-T-C-AAAACCAAA
gi|30 : AGGTACGGCCCGTAACATGATAGGCAGATTCTCTGTAACCACAA-AGGACAGGAACA--CCCTTTTGCAATACAAAGAGAAAA----AGA--AA-A---A-AAGA------------------------CACCCCGTCCTTAA-G-AGC-------CTT-------AACAGAAT-CCTGAGAGAG-AATCTG--CCGATT-----CTTCA---CAATAA-TGAAA---GA-------ATGGCG--GAT-CT-TTTCA-AGGATCTA---CCAA-----------TGGCTG--C--------A-----------TT--TA--GACGG-CCTAGGAA-CT--TATAG----GACATG-GTGGTG--AGAGTCAAATTAG--ATA-ACTC-ATTAC--CCAATGG---TGGCTT
gi|31 : tgtTGGATGTCACGTCATTCTACAT-T--------------GGCTAG---CATTCAA-AGCGTGCAGCGAAGTTATGGATAATA--------AGC----TG--T-C-----CATAGCC--CCTCCGCTGAGTCACT--TTCAACTCTT-----A-CAACGTGATCTTATAGTCCAA--TA---CTTCGTG----------GCGATCACTATTTCCAAA-T-T-ATC--CAC-AATTCTATGAG-AACCAGAACATCACT-CTCAAAAGCCAACA-TATTCAT-GGAA--AAGTG-AAACCTCTGCT-TCT---GCA-A----T---CGCT--GA---------------------------TG-ACT--GTTTCA-TGGATGATATGGA-ATG--
gi|32 : -TTTAC--CTACCGG---AGGTTTCAAAAC--------ATTGGC-T-ATACCT-CA--A-------ATG-TCAA--TT--GATGC--AAAT---ATT----AGC-AC----AGATT-ACT-----GAGAGCTTTA-GCA-GTCCTGT--T--CACGGTCG-T-AGTT-ATAAGATTTAGCTATAA---AGA-TATTAGCTTAAAGATATTGGGA-AACTT---TTTCCTA-CAA-AAC---TAATATAAACTT-G-CAT-C----------TA-T--CTC----ATCAGT-TG-CAAAATGTC-TGCCCAGAAA-CG--GTA--TG-T----------AG-AGAACAA----------ACAGG--AC------CGCAAAC-AGGT-CGA--CAA-CCACAGGTCtatgg
gi|33 : --GACCAACGATTC--TAT-G--GA-AGGAT---GTT----------CAAAGCGTTTTCTGCCACCATCAG-T-GAAACTCTACA--AAG----ACGA--G----GA----AATT-GGTGAAAA-TGTCTTTGAAACATTGCTTC-CTC---TCAACTG--TATATACCTGGGCAATTCTATCTACTGCCTAAAA---TCCAC-AAG-G-AGGGTGTGCCTGGTCACCC--ATAGTGT-G--TGCCATTGG-GC-------ACCCCACGGAGCAAATCTCAGAATTGATTGACCT-ACATCTCTGCATGTCCATA-----TGCTATGAAGCTACCATCA
gi|34 : T-G---G-CAGAGATTCAATGGTTACTAC-T--TTCCACTCTGTTTTCAA-A-GAC-------ATG-------AACAAAAT-TCTGAAGAGG-----------TATT-----CCGCA------AAA-TAATCTTTGG-------ATGGCC--AGT-AT-CTTCA-AAGA---A---CC-------------T-------CCCAT----GTCATCC-----TT--CA--GACAC-TCTGGAAA-TC--TGAAA----AACATG-GTGGCG--CGGACTAAATTG
gi|35 : cgatatgT--CCACATCATGAGG-ATAT-AAA-AGCTTGCAGAGACGTA-TG--ATATAGTACTTACAG-----CCATT-C-----ATAG-TT--CATCAATTGAGTCACTTACCCTGCTCCTACATGTAGAACATGTTTTGT-AATGCAA--TGTCACTT----TTCAAAAATGGTGATCACTGCCTTCAAA-TTA-GTG-ACAC-TG--CTATGGG-AACCAAACTGAGACC-CCCATCTGCCGATA-TGTTttctgttgggagatgactggtgtgcaaacatagcgctaacacaattagttttaagagccctgt
gi|36 : CGTATCCTTA-AGTTTAAAATA--ACTTCATGTTCAA---CGGCAAACACTATCTGCAAA-TGA-GTG-GCAC-AG--CTTTAGG-AAC-AAAATGACATC--------------A-TCTTTATGGGGACTGTCCCAGAACGTAACC--CCT---AC--A----C---TGGT--CACC--ATGTA--AACC-TTGTA----GCTG-GCTATGTTTCC-TGGATGACATTCAGATATAGAGTG----G--GTTGATGGTCGTGGA--AGCCTTAACGACTTTATC----AAGATAGCAAACTTTcttttgaaaaagtggaatacaaattgctaat
gi|37 : -CCAGAA--CA--GT----G-T----------AATGGGA-AA--------CAAG-AG--ACA---T-CGCAAAC-GGGT-TAA--AAA-CCACCGGTCTT-ACG-T-C-CAAACCAAGA-A---AAA-TTT-----GT-CA-GAA-GC-TAAA--------CC--T---------------GTAGTAATCG-CCT-GT-GG---GAGG-ACA--TGACAA--GAGCGCTATGATTATTGACCata
gi|38 : acccttgtaaagcccgcatcaatttgaaaaattgattatattaaAAAA-A---GGA-TCT-----CC-CGTGTA-GCCTACA--------CA--TTTAAAA---T---G-TTAGCAATCA-CAG-GT-GG---GAGA-ACA--TTACAA--TA-----TT-GTTATGGGTCccaaattattcatataccaaaacaaagcagaaggca
gi|39 : CAC-TA--CTGTGCG-AACCACAATGTCTCC-ATCATACGCCAATA-CTTTCTTTGGAC--GAC----AACGCAACTTACCT---CT--AATAGT---AAAT--CGCC--TTTCA--AGTG-CCTTACTTGGTTGTGCTAAGTTCC------CGACATTCAAATA--GGGTG----G--ACTGAC-ATC-CAAA--A--TAAGACAACTTTATT----TCGTTTACGAACTCGTTTAAC-CATTCAA-TCAACTTCACtgacccaagttttggtcagaaatgaggagaaatgcgaaaggaaaaaagccaggatacacaggttgttcaaaagtcatttgaagcttttgtcagggtataatcaaaccacttaagatgaaaacggaactaaaa
gi|4 : aACCCTGCCCTTAGTGCGAC-------CTTCTCT---AATAGTATGTACAAGAAAA-CATTTG--CCTATC-----C-GTA---T-CCA--CAAAC---G---------TAGC---GATAGT-TTTCATA--A---A---CCGCTCCTGATGACAT-------C--------G-----------TTTACC--GCAGCGCCCAGAAAACC--TGAAAAAGCGACATT-GTGTAA--AAGACCAGGTTGA--GTA-ACCC-TCTACCTCTAATGG---AGGTTTCAAATC--------AT--GTATCAGATCT-CG--A---------G-TCAAGTTT--A-TGTCAAAATTAAAT-----ACT-CC----AGAA--ACT-----GAGACCTTCAGGAA-GTCCTGTG-A-ACA--ATCA-C-AGTTCAT--------------A---AAA-TATTGT--------------GG-ATGAA---CTTACCGTTAA-AAC---CAA----AAC-TCG-TATAC----------TA-T--CTCT---ATCAA--TG-T--GA-GTC-TG-CCAGAAA-CA--GT---CG-T----------TG-GAGA-AA--------CTAC-GA--ACCTTTTTCGTAAAA-GGGTACAAG-CAA--TACC--TCCT-CCG-TGC-AGGACCAAAATATGCGGACTCC-----GCACG-GTA-GC-TACG--------CAGTTTCCAAGTTCT---GTGTAGACATCA-CCGAAT-GGGTTGAGGAACATGTGACAACGTG-----TTAG-TA-TGATCAT
gi|40 : tgaattgtacaacggaccgacaatcccctcacttccatatattcaaatttgcacttctccaccttcatatctcgaatatcttgcaactcaactatcgattcccgtgccgATTGCGACG--AAGTG----G--GTTGATGAGCGTAAA--ATCCACAATGACTTTATC----GCAAGTGTGAGCTATTTCGAC-TATTCCA-TTCTGTCCTCTG--AG-GAAATTTTC-AACTTTAG-GAATATTCTATGGGATACCACATT-CGCACTTA-CAAACGGGG-----------AGCCTTCA----------CATCGAC-ATCATT--TGTA-CGTA-TGCCATTC----ACCTTTC-----ATCCACCCgtacctactctggtcaactattcaaagaaaaaagaagagaatttctggatgaccaggttgaagtcattcgagcctcagtgtcaatccacaaatctaagctactttcccagtagatgaacacgggttagac
gi|41 : --CCATGGA-CACCAAAATGACTCC-AAGCTACGCCAACATTTTTTATGGG-A--GACCT-GAATACAACCT-A-----GT--A----A---CGTTGGCACA--AAGAA--AACCTTTTTA----GATG-ATTTCTATTCA-T---TGGCATTTGGATG--AAATG----GGTGTCAAC--TCGGGGA--AACCTTGGCAACTTTATT----TAAATAGCCCGTGCATTTCAT-ACTCTCA-TTAAGTTTt
gi|42 : CAC-TA--CTGTGCG-AACCACAATGTCTCC-ATCATACGCCAATACTCTTT---GGAC--GAC----AACGCAACTTACCT----CTAA----T---AGTA--AATC--CTTTC--AAGT-CCTTACTG-GTTGTGCTAAGTCCCG------GACATTCAAATA--GGGTG----G--ACTGAC-ATC-CAAA--A--TAAGACAACTTTATT----TCGTTTACGAACTCGTTTAAC-CATTCAA-TCAACTTCACcac
gi|43 : A-TC--CTTCCATAGAATCGTTGGTCAAGCTCCT-----T-GAACATGTCCCCA-ACCTCAA--CA--ACTTCATGTTCAA---TGGCGAACATTATTTAGAAG-TAA-GTG-GCAC-AT--CTACGGG-AACGAAGTTGGTTCC-ATCGTATGCCAATA-TTTTCATGGGAA--GACTT-GAACGAAA----CAT---GC--T----TAGACAAT--CACC--CTGTA--AGCC-CCTTA----GTTG-
gi|44 : GCTCACCAACAGCTCTTG--GACGAACGCTTT--TAT-A--AA-A---------------CT-ACCAAAGTGTTCTCTACCAAGATCAC-C-GAAACGCTCCAGG--ATAT-AC-A--AGGGTGA----GATC-GGTGACAA-CGTTTTCGAAGT---GCTTT-GTA---TTTAC-GACTGTTGACCGGGACA
gi|45 : tttactttattattatcattataaaggcagagaaagtctctaacataaAGTTCATGG--TT-GATATTCCC-GCATCCAG-TGGCGTCTATTTAGATACTACGTCGAATAC-TG-TTAACGGAAATGTCGAGTTCAAACGCCATA-CCAAAGCAATTAACTCCCATT--TATATCCTG-TGCCATCT----AGCTGTC-----ATCAG-CTCAT-ATCGTTCA------------TAGGAGT-AC
gi|47 : CC---TCCC--G-AATCC------TCCGCATTTGATCTAAC-GCTACTACTTTCC-ATAG-CA-AGGACAAATCGT-C-AAAATTCATTTC-ACAAACACAGGATAT-GA--TCATTGCAAGGTACAGTCCGCAAT-TGATG---AGAT-----GT---CACGGCATAACCG--ACAG------------TACAAAGAAAAACC-TCAGA--AG-T---A-CAGGGTTCCACCAGTAACTAT-T--TAttattttattagccactagagtccgtcatata
gi|48 : ATAGACGTTAATTT-CTGTACAC-TAGCGTC--CTGCAAGATGACC-ACAT-CGA-GGCATTTAGGGAAGTT-TAGAAGAGA--------AA-----TT--TTC-----TAAA-TCATCTTCCACTGAATTGTTGGTAAAGCTCCT-----T-GGACATGTCCTCA-AACTTAA---------TCA---TCAA---CAGTGAGGACTACTTGC
gi|5 : tcttgtcagaA--CG-T----------TG-GAGA-AAA-------CTAC-AG--ACC---TTCGTAAAA-GGGT-CAAAACAATCCAC-GGTCCTTCCG-T-CCAGGACCAAAA-A---GGA-TT------GC-CG-TTATGC-TACG--------CA--TTTCAA----T---G-GTAGCAATCATCCG-ATCGG---GAGG-ACA--TGACAA--TA-----ATAGTGATTGATCAT
gi|50 : cCAATCCCTTTTGCAATATAAAGAAAGATC----GA--AT-GGTGA-CAGAGTCCCAATGGTCACCAC-A--TACCACCCGGTTTTGAA-G-GAT-------CTC-------AACACTAT-TCTAAAGAAA-CATATC--CCCATT-----CTTCA---TGCCAA-TAAAA---GA-------ATGACT--GAT-GT-TTTCA-AAGA---G---CC-------------gaccctagtttggtctgacattcaaagaaaaaagataggagaagttctggatgacaggttgacgtcattcgagcctcatgcatcaacaaatctgctgacttcaccaggagtgaacacggggttagaagcgattcaccggaaatcgaacactgatttacatgtaagactccccggcctgatcagtcccgaacatcctctattagattcaatcttcacaatgtatacttctcatgtgataaatttttttttttttctttctctttctatcttaaaaaaattttttttttttctcacggtctctttctctcgaaattaattgttttaattaaatctgatccacattgtgtataaattcagtattactttagaacttgacttaatagaatattcccgggtatgaactatccaatatatacctcctaattcgaatagtaagtcgttgcattattgtggatcagctaatggacgagtagggcgtatcctcattcgttccatatctaacattagatttgcaagccattaactcgaataccatgtgatttatatgtaatacggttgttacgttggagaccgatatatt
gi|52 : TAGCCT-CCT---AC--A----T---TATT--CACC--ATTTA--AACC-TCTCA----------------TT-------TGACATTCAAATG--AAGAA----C--AATGACAATCATGAA--AGATGAAACAACTTTATATAAAGAGAAAACAAACTCTTCCCACTGGTTCAA-TCAAGATCACTG--T--GAAATTACA-ACCTCTAGAGAAacctatggc
gi|53 : AC---GGAT---GAT-T-G-CAT-T----------TA-C--CTC----ATATGC-TG-T--AACGCC-TG-TGATCAA-CA--ATA--CG-T----------GG-GTGA-AA--------CTAG-GG--ACC---TACGCAGGA-GGAT-CAA--TAA-CCACC
gi|54 : ccctgtcacagaccgacactaccgaactctcgcGTTCAATC-CCATAACTCAACCCACCGACTCTTATA--TATACCATA-TGCCATCC----A----------------ACCCATGA-CT---A------------AATGTGT-GCCTAAGCTTTTGTCGTCCAAATTTGCTGCATCTTCTCTATT-CCCACCACTTTCCAAGAGGCA-AGGACACTTCCT-A-AAAtaaattaaccagtcggaccaaagcacccg
gi|58 : TT-AT--------------A---AAA-TATTGG--------------GCCAACT-----CTCGAG-TAA-AAT---CAAT---AAT-T-G-CTT-A----------TA-C--CTCATTGATCACC-TG-T--AAagt
gi|59 : actacaggcaaaacAAAG-CATGCT--CCCATT-----CTTCA---TACTAACTCATG---GAGCCTCCCATGGCT--G----T-TTTCA---GA------------------------------C--------G-----------TT--CA-----------AGAAA-CC--TTAGA----GACATG-GTGGTGCTAG--CCAAATTGG--Aacaatgtaacttacaatacgtgtgtgtgttaacgtggggggggggg
gi|6 : cttgaaatattcaattagaatactgaGAC--ACT-----G-----TTCA-GCAAGCCCGGT--GGACA-GGACA-G-AGCT-AC--------------A---AAA-TTTTGG--------------GA-GTCTA---TGTCCTG-CCG-TAC---TGAC---AAC-T-G-CATAC----------TA-CACTTC----ATCAGT-TG-T--AAGAA---A-CCAAAAAGCA--GTA--CG-T----------AG-GTGG-AA----------AC-GGTGACC---TCCGAAGAA-GAGT-CAA--CAA-TCACCGGTCCA-CTACT-T-AAGACCAAAC-----GGA-T-C-----AC-CG-A-A-CC---CGTTGGGGAACA--TTTCAA----C---A-CTGAGGGTCA-CAA-AT-GG---GAAG-ACA--TGACAG--C------GTAGTTATTGACCA
gi|60 : -TCTGAAGAAG-CATTTT--CCCACT-----CTTCACATTACCTC-TA------GA-------ATGGCC---ATGGT-CTTCA-AAGA---A---CCA------------T-------CCAT-----GGTGGCT-----TT--CA--GACGC-CCAGGAAA-TC--TGAAA----AACGTcaaccctaactggagtgactctgaaagaaaggaaccatagagaagattgctggtagtgcagcaggttactctcaaatagtacatctcttacggactgtcattgtcttcctccaaatggcacctcgaatgaatgaaaagtctctcatgaaatatggaacgttgcttgcccagaccaacgccggatactggatgcgttgagtggtggaaagcgagacgaaatgagcgtcgacccacagactttaactcatcgcctactcctcttcacaacctatactcggagtaaatttcattgatttct
gi|61 : gatttgaaacaaaaaa--ATA-ACCC-TCTAT--CTAATGG---AGGCTTCAAAAC--------AT--GC-TCAGACCT-CA--------G-ATG-TCAA--TT--A-TGC--AATT---AT-----AGC-CC----AGAC--ACT-----GAGAGTTTTA-GCA-GACCTGT--C-ACA-GGTCG-T-A
gi|63 : T-GT-TTTCA-AAGA---ATTCCC-------------TATGACATC--------C-----------TG--CA--GACAC-CCCAGAAA-CC--CAAAG----GACATG-GCAGTA--AGGACTATATTGG--ATA-ACGT-TTTAC--TCATTGG---AG
gi|66 : gCTTGTGACCATGG-TGTTACTTCACTA-ACAT------TT--CAAAATGAAGAGGTTTAT-CAA-GGCTTATAGAGAGGTT-
gi|67 : cTTCCG-TAATGAC---CAAC---AAC-T-G-TAT-T----------TACC--CTC----ATCAACATGTT--AACGTCGTG-C
gi|68 : ttgggccaggtttACGTG-GCGTTG--AGAGCCAAATTAG---TA-ACAT-ATTAC--CTATTGG---TGGTTTaa
gi|69 : T-ACATCTCCGT----CAGCA-----TGTAAAAGCTTTACCGTCATA-CCTGt
gi|7 : attGCAATCA-CCG-AT-GG---GAGG-ACA--TGACAA--TA-----CTAGTGATTGATCAT
gi|70 : --CTAATGG---AGGTTTCAAAAC--------AT--GC-TCAGATCT-CA--gaccctagttggtgtgctactcaaagaaaaaggaaggagaagttctggatgcacaggttgaagtcatttgagcctcgtggcatcaacaaatctgctgacttcaccaggatgaacacgggttagaacgttcaccggaatcgaactctccttaaaccttcgcgcctgatcatccactcttagcttcaattttcacaatgtatacttctgtgataaaaaaaattttcttctctttctatctaaaaaaatttttttatttcttctaaattattgttttattagaattgatccattgtgtgatatattcaagtacttgactaaatagaatagttccgggtatgaactatcaattatacctcccaattcgaattagtaagtcgtgcatcattgtggatcagctaattggacgagtagggcgtatcctcattcgttccatatttaacatagatttgcaagccaataacccaataccatgtgatttataatgtaaatacggttttagt
gi|8 : A---TGTCCTG-TCG-CGC---GGAC---AAC-T-G-CAT-C----------TA-T--CTC----ATAAGT-TG-C--AAGGTG-TG-TGAACAA-CA--ATA--CG-A----------AG-GTGA-AATTGAGGGTCTAC-GG--ACA---T--GTAGAA-GGAT-CAA--TGA-CCACCGGTCTA-CCA-T-G-AAAACCAA
gi|9 : ctgaggtcttctagaagcctcctgtggctgccgtcatatatcctaggagtgctgggatccaaattgaaaaatgtttgcccagtggggattttaaaacttattctgatgcctgatgtagaatcacagcgcgaacacaaataatttttaagcgccgatgtcacggaAAGAGAGGCTAT-AAAGTC-TCA-AAAGTGCAATCAGCTAT-TGATG---AGAT-----GT---CACAA--------------TCCATACTACAATGTAAAGAAAAATT-GGTGG--AT-G---A-CAG-TTTCCA-TGGTAACAAC-G--AACCATCTCATCTTGAA-A-TACATTCTATCTTGAAAGAAAACAAAAT-TCTAAAGAAG-TATATT--CCCATTAATATCTTCA---CTCTAG-TCGCA---GA-------ATGACT--TAG-GT-TTTCA-ACCA---G---CC-------------T-------CCAATG---GCTATC------TT--CG--GA-GT-ACCA-AAA-TC--TTA------GACATG-GTGATG--TGAACCAAATTGG--A---ATTC-TTTGC--CCAAAGA---GAGCTTTAAAACTTGTTCTGAT--GC--CAGATCT-------------ATG-CCTG--AC--G-TGC--AAAC---AC-----AGC-GC----GAGC--AC-------AGA--------CA-GCCCTGT--G-ACC-GG-CA-T-A-TT-CT--------------ACCGAAT-TCTTGA--------------GG-A--CA---CATCCTG-TCG-CAC---GGAC---AAC-T-G-CAT-CATTCTGTAATTA-T--TTT----GTAAGT-TG-C--GTGGTC-TG-TGAACAA-AA--TTA--CG-T----------AG-GTGA-AA--------CTGG-GG--TCC---TACGTAtagagtgaaagcatttcaatctcgctggacgcaaatggggagacatatattgactactcagttcactggacgcattcatgaggagagaacgaacgagaaagacccaaatggcacgaacaatctcaatgactttactagaatgaatgtggcctagcttcccctcagtgttgttctgtctgttttacactttctactctcagcactattattagcagtcaatctttccgtggtttcctaatctatctttt
12 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|18 ): GTCCCGAACATCCTCTATTAGATTCAATCTTCACATATATCTTCTTGTGATAAAAATTTTTTTTCTTTTTTTTTTCTTCTCTCTTTCTATCTAAAATTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTCTTTTCTCTCTCGAAATTATTGTTTTATTATAATTGATTCCATTGTGTGATAATTCAAGTTTTATCTTAGAACTTGACTTTAGAATAGTTCCGGGTATGAACTATCAATTATACCTCCTAATTCGAATTAGTAAGTCGTGCATTATTGTGGATCAGCTATTTGGAGAGTAGGGCGTATCCTCATCTGTTCCATATTAACATAGATTTGCAAGCCATTAACTCATACCATGTGATTTAATATGTAATACGGTTTTTAGTT
Unaligned ( gi|22 ): TTCTTTCTCTTGTCTATCTTAAAAATTTTTTTGTTCTCTTTCTCTCGAAATTATGTTTTTATGTATCAGAATGATTCCATGTGTGATTGAACTTCAAGTTATTTACTTAGAACTACTAATTAAATGAAGCTTCCGGGTAAAGCTATCAATCATACCGTCTAATCGAATCAGTAAGTCGCATATTGGATCAGCTAATTGGACGAGTAGGGCGTAAGTCCTCATTGTCGTTCCATATTAACATAGATTGCAGCCATTAACCTCAATACCGATGTATTTTTAAGTAAATACGGTTAGTTGTAGTAACTCAGATATATT
Unaligned ( gi|26 ): TTTTTTTTTTTTTTTTTTTGTTTTTTTTTCTCTTTTCTCTCGAAATTATTGTTTTATTATAATTGATCCATTGTTGTGATAAATTCAAGTTATTACTTTAGAACTTGACTAATAGAATAGTTCCGGGTATGAACTATCAATTATACCTCCTAATTCGAATAGTAAGTCGTGCATTATTGTGGATCAGCTAATTGTGGACGAGTAGGGCGTATTCCTCTCCATATTAAACATAGATTTGCAACCATTAACTCAGTATCCATGTGATTTTAATGTAAATACGGTTTTAGT
Unaligned ( gi|46 ): ACAATCTCAGCAAAGAAGAGAGATCTGCCCTCCAATTGCTAAAAAACCGTGACGACATAGTCATAAAAAACAGACAAAGGTTCCACGGTCGTTGTTCTAGACAAAGATTCGTACTTAGCCGAAGCTAACAGACAGTTGTCTGATGAGCGATTTTACAGAAAGCTGGATTTTGATCCCACTGAGGAGTTTTCAG
Unaligned ( gi|49 ): TAATACATTCCTAATCGAATTAGTAGTTCGTGCATTATTGTGGATCAAGCTAATTGGACGGTAGGGTGATCCTCATTGGGTTCCTATGTAAAGAAGATTTGCAGCTTAACTTCAGATACCATGTGATTATAATGTAAAAACGGTTTATAGTTAGTACCAATATATTT
Unaligned ( gi|51 ): AGTAATCACTTACGGGAGGCGAACACATAAGTGGTTATAATAATGACCTAAATGGACAGATTCCTAAAGAAAGCAAAAGGAAATTCCGGATGCACAAGACGAAGTCGTTTGACTCCGGTGGAATCCTGACTTATCCCCAGTATAGCAGGCTAAACC
Unaligned ( gi|55 ): GAATTAGGTCAATCATTATCACATCGCACATTGCGGACTAGCTCATTGGACGAATAGCACTAGTCTCAATCTCTCCTCAAAAAAACATTTTAATTAGCAATTCAAAATCCAATAAACATGTACTTTATAGTGTTGATACGATTATAGAAT
Unaligned ( gi|56 ): GACATTAAAATAGTGATTACTGACCATTACCCAAGTTGTACATGTTATGCCACGAAAACGCAAAGAAAGGATTCTTATATACGGTTTTTTCAATAGTCATTCGACCCTCAAGGTATCAACAAAACAATTTAGTTCATCAGATTAAACG
Unaligned ( gi|57 ): GACAACCTCAACAAAGAAGAAAGATCGGCATTGCAGAGATTAAAAAACCGGGATGATATTGTAATAAAAAGGCAGACAAGGGTTCTACTGTTGTTGTTATGGACAAAGATAAGTACCTAACAGAGGCTCACAG
Unaligned ( gi|62 ): AACGAAACTTTTAGATACTCAGACTGAAGTCGTTCGACTTTCAAGGTATCGAAACACCTGATGAATTCACTAGGATCAACATGGGCTAAACATTTGTCACC
Unaligned ( gi|64 ): AGTGGTTATTCATTTTGACCTACGCCAAATACGCAAAGAAAGCCAAAGTGAAAATCTTTGCACACAAACCGAAGTCATCTGAT
Unaligned ( gi|65 ): AAAGCAAACCGAAAAGTTCTGGATGCACAAACAGAAGTCGTTCGACTATCTACTGACTTCACTAGGATAAAAA
Alignments
lowQualScore : 11111111111111111111111111111111111111111111111111111
lowQualScore : 111111 2222 1111 1111 111 111 111 1111 11 3333333 3333333 1111 22222 1 1111111111 6666666666666666666666 1111111 1 1111 11 3333333333333333333 1111111111 33333333 1111111111 11 22222 111111111 1111 1111 11111 11 333333333333 5555555555555555555555555555555 11111 111 111 111 11 1 333333 11111111 11111 111 1111 1111 1111111 1111111 11111 00000000000000000000000000000000000000000000000000000 11111111 2222222222222 11111111 11111 11111 11111111111111 33333333333333333333333333333 111111111111 11111111111 11111111 222222222222222 3333333333333 111111111111 111111
lowQualScore : 1 1 99 99 6 99 6 111111 6 1 44 8888 2 4 55 5 5555 0 1 7777 5 5 1 1 777 666 888 000 1 0 1 5 0 5 9999 2 1 22 6666666 4 1 88 5555555 4 8 1 8 1 7777 00000 1 1 1 1 1 0 0 8 11 8 99 1 99 1 1 0 1 6 2 5 6 1 4 3 22 9999999999 4 4 777 5 5 5 1 5 1 1 6666666666666666666666 66 66 0 2 9 1 4444444 4 0 777777 4 8888 1 0 2 4 7 4 4 88888 3 0 1 88 2 5 6 3 6666 9999 0 11 3333333333333333333 555 3333333333 88 22 66666666 44 5 2222222222 7777 00 11111 1 999999999 0 77 1 4 1 66 55 1 1 6666 77 5 1 1 55 5 0 77 55 0 3 2222 44 77 8 1 5 2222 0 44444 00 666 1 2 444444444444 3 6 1111111111111111111111111111111 2 6 7 66666 6 111 6 111 6 111 3 55 5 0 1 5 222222 22222222 8 1 22 1 4 777 11111 222 2 6 3 55 77 3 2 1 1111 55 555 3 44 3 4 0 0 0000 3 1 3 3 0000000 6666666 11 2 0 3 66 666 888888 1 6666666 44444 6666 4 2 2 3 6666666 666666 55555555555555555555555555555555555555555555555555555 444 1 33 5555 2 4444 3 33 2 22 33 6666 1 00000000 555 2 1 4 5555555555555 3 1 00000000 44 555 00000 2 6666 2 33333 77 0 2 0 2 2 8888 0 1 999 0 2 55555555555555 444 3 3 66666666666666666666666666666 0 2 77 7777 5555 2 2 2 444444444444 7777 8888 6 6 44 4 6 3 2 0 3 44 44 3 55555555555 3 1 3 44444444 33 44 6666 8 0 3 3 88 3 55 55 444 666 3 4 777 4 999999999999999 4 44 4 4 5 55 3333333333333 2 3 333 3 555 777777777777 3 555 44 55 000000 0 4
lowQualScore : . . .. .. . .. . ...... . . .. .... . . .. . .... . . .... . . . . ... ... ... ... . . . . . . .... . . .. ....... . . .. ....... . . . . . .... ..... . . . . . . . . .. . .. . .. . . . . . . . . . . . .. .......... . . ... . . . . . . . ...................... .. .. . . . . ....... . . ...... . .... . . . . . . . ..... . . . .. . . . . .... .... . .. ................... ... .......... .. .. ........ .. . .......... .... .. ..... . ......... . .. . . . .. .. . . .... .. . . . .. . . .. .. . . .... .. .. . . . .... . ..... .. ... . . ............ . . ............................... . . . ..... . ... . ... . ... . .. . . . . ...... ........ . . .. . . ... ..... ... . . . .. .. . . . .... .. ... . .. . . . . .... . . . . ....... ....... .. . . . .. ... ...... . ....... ..... .... . . . . ....... ...... ..................................................... ... . .. .... . .... . .. . .. .. .... . ........ ... . . . ............. . . ........ .. ... ..... . .... . ..... .. . . . . . .... . . ... . . .............. ... . . ............................. . . .. .... .... . . . ............ .... .... . . .. . . . . . . .. .. . ........... . . . ........ .. .. .... . . . . .. . .. .. ... ... . . ... . ............... . .. . . . .. ............. . . ... . ... ............ . ... .. .. ...... . .
lowQualScore : 0 0 22 22 7 22 7 555555 7 0 44 9999 2 1 99 0 2222 2 1 5555 0 0 1 1 555 000 888 555 0 9 0 7 1 7 3333 3 0 99 0000000 3 4 00 0000000 0 4 0 0 4 0000 00000 4 0 4 0 4 0 8 0 88 0 44 0 44 4 0 2 0 3 5 2 3 0 9 6 44 3333333333 2 2 444 0 0 9 1 0 9 0 7777777777777777777777 99 99 8 2 6 1 8888888 4 9 333333 4 7777 1 5 3 4 8 4 4 11111 3 2 0 88 2 0 7 7 1111 8888 3 22 8888888888888888888 555 8888888888 77 55 55555555 66 8 5555555555 6666 66 55555 0 555555555 5 00 1 4 0 11 66 0 0 1111 33 4 0 2 33 7 1 44 66 5 2 4444 00 99 1 0 7 1111 1 33333 66 888 0 5 222222222222 7 7 0000000000000000000000000000000 5 7 8 77777 7 777 7 777 7 777 6 00 0 1 0 7 111111 11111111 5 1 99 1 4 888 11111 222 9 9 0 55 44 5 3 3 0000 00 888 3 66 3 6 8 2 5555 2 0 1 1 0000000 5555555 22 7 3 1 33 777 444444 9 2222222 55555 2222 7 2 2 2 2222222 444444 33333333333333333333333333333333333333333333333333333 555 8 44 3333 5 8888 2 44 7 99 22 1111 4 44444444 111 9 9 6 6666666666666 1 9 66666666 22 000 00000 9 5555 9 22222 11 9 9 7 9 7 9999 5 3 000 1 7 77777777777777 777 1 1 55555555555555555555555555555 9 9 66 9999 4444 9 9 9 666666666666 6666 9999 2 2 22 2 7 1 5 2 3 66 22 1 44444444444 1 0 1 22222222 88 66 2222 7 1 6 6 66 6 00 00 444 222 6 4 888 4 444444444444444 0 77 0 0 0 55 1111111111111 3 6 666 3 888 111111111111 3 888 66 00 111111 9 4
consensus : GCTCACCGACAGCTCTCG--GACGAACGCTTT--TAT-A--AA-AAGTTACAGTCTGACCCT-ACCAAAGAGTTCTCCGCCAAGATCA--C-GAAACCCTTCAGGAAATGT-ACGA--AGGGCGA----AATC-GGTGACAA-CGTCTTCGAAAC---GCTTC-GTC---CCAAC-GACTGTAGACCGGGACAATTTTATNTACTGCCT-AAAATCCAC-AAG-A-AAGACATGCCNGGCCGCCCT-ATAGT-C-G--NGCCATCGG-AC-------ACCCCACGGAGAAAATCTCNGAATTCATTGACCT-ACATCTCCGC----CCGCA-----TGTAANAGANCTACCGTCATA-CTTGAAGGACACCACT-GATTACCTAAAC-GAAACCCCA-CNTCG-GACCTACCTGACNACACCCTTCTTGTGACNATGGACGTNACTTCACTNTACAC-TAACGTT--CCACACGACGAGG-ACAT-CGA-GGCNTGCAGGGAGGTT-TGGAATANA--------A--G-----CC--TCAAA--ATC--CTTCCACTGAATCACTCGTCCAGCTCCT-----T-GAACATGTCCTCA-AGTTCAA--TA--ACTTCATGTTCGA---CGGCGAACACTACCTGCAAA-T-A-GTG-GCAC-NG--CTATGGG-AACCAAAATGGCNCC-NTCNTACGCCAACA-TCTTTATGGGAA--GACTC-GAACGTAACCT-CCT---GC--A----TCGNT--CACCNTTTAAACC-CCTTA----GTTG-GCTACGTTTC-A--T-GATGACATT--GAGATGAAGTG----GGC---TGACGG-TCGCGAAAGCCNCGACGACTTTAT----CGCGNTTGCGAACTCTTTCCAC-NATTCCA-TCAAGTTCACNG--TG-GANATTTCC-GCATCCAG-GAACGTNTTTTTGGATACCACGTC-CACACTTAC-GAACGGAGAAATCGAGTTCAGCCTCCAT-A-CNAAACCCACCGACTCTCATT--TGTACCNTA-TGCCATCC----AGCTGTC-----ATCCGCCCCAT-A-CNTTCA------------AAGGTGT-GCC---------GCC---C--G-CGTCC------GCCGCATCTGCTCTATT-CCTACCACT-----TTCCA-AGAGACA-A---GGACAC-ATCCT-N-AAAGTCCATCTGCGCAAACAGAGGCTAT-GAAG----TCC---TCGCAAGGTGCAGTCCGCAAT-TGATG---AGAT-----GT---CACAACANGACAG--ACAGTCCCTCCTNCAATATAAAGAAAAACC-TCAGA--A---T-G--A-CAGAGTTCCACTGGTCACTAC-T--TACCACCCCGTCCTNAA-G-GAC-------CTC-------AACANTAT-TCTGAGAAAGC--ATNTNCCCATT-----CTNCA---TAC-CAATAAAC---GAATGGCT--GAT-GTTT-TCA-AGGA---A---C------C----------T-------CC----------G---------T------T-----C--AGACGCCCCAGAAACC--TGAAG----GACATG-GTGGTG--AGGACCAGACTGG--ATA-ACCC-TTTAC--CTAATGG---AGGTTTCAAAAC--------AT--GC-TCAGACCT-CA--A-----G-ATG-TCAA--TC--G-TGC--AAAT---AT-----AGC-TC----AGAC-ACT-----GAGAGCTTTA-GCA-GTCCTG-T-C--ACAGGTCG-C-AGTT-AT--------------A---AAA-TATTG-G--------------G--G-AACTACG---TCCCG-TAA-AAC---CGAC---AAC-T-G-CAT-C----------TA-C--CTC----ATCAGC-TG-T--AANGTC-TG-CCAGAAA-CA--GTA--CG-T----------GG-GNGA-AA--------CTAC-GG--ACC---TNCGCAGAA-GGGT-CAA--CAA-CCACC--GGTCCN-CC-G-T-C-AAGACCAA-AA-A---G-GA-T--CC-----G---C-CG-GTA-GC-TACGCA--TTTCAA------T---G-GTAGCAATCA-CCG-AT-GG---GA------------GG-A---CA--TGACAA--TA-----NTAGTTATTGATCAT
Reference ( family-868 ) : GCTCACCGACAGCTCTCG--GACGAACGCTTT--TAT-A--AA-AAGTTACAGTCTGACCCT-ACCAAAGNGTTCTCCGCCAAGATCA--C-GAAACCCTTCAGGAAATGT-ACGA--AGGGCGA----AATC-GGTGACAA-CGTCTTCGAAAC---GCTTC-GTC---CCAAC-GACTGTAGACCNGGACAATTTTATNTACTGCCT-AAAATCCAC-AAG-A-AAGACATGCCNGGCCGCCCT-ATAGT-C-G--NGCCATCGG-AC-------ACCCCACGGAGAAAATCTCNGAATTCATTGACCT-ACATCTCCGC----CCGCA-----TGTAANAGANCTACCGTCATA-CTTGAAGGACACCACT-GATTACCTAAAC-GAAACCCCA-CNTCG-GACCTACCTGACNACACCCTTCTCGTGACCATGGACGTNACTTCACTNTACAC-TAACGTT--CCACACGACGAGG-ACAT-CGA-GGCNTGCAGGGAGGTT-TGGAATANA--------A--G-----TC--TCAAA--ATC--CTTCCACTGAATCACTCGTCCAGCTCCT-----T-GAACATGTCCTCA-AGTTCAA--TA--ACTTCATGTTCGA---CGGCGAACACTACCTGCAAA-T-A-GTG-GCAC-NG--CTATGGG-AACCAAAATGGCNCC-NTCNTACGCCAACA-TCTTTATGGGAA--GACTC-GAACGTAACCT-CCT---GC--A----TCGNT--CACCNTTTAAACC-CCTTA----GTTG-GCTACGTTTC-A--T-GATGACATT--GAGATGAAGTG----GGC---TGACGG-TCGCGAAAGCCNCGACGACTTTAT----CGCGNTTGCGAACTCTTTCCAC-NATTCCA-TCAAGTTCACNG--TG-GANATTTCC-GCATCCAG-GAACGTNTTTTTGGATACCACGTC-CACACTTAT-GAACGGAGAAATCGAGTTCAGCCTCCAT-A-CNAAACCCACCGACTCTCATT--TGTACCNTA-TGCCATCC----AGCTGTC-----ATCCGCCCCAT-A-CNTTCA------------AAGGTGT-GCC---------GCC---C--G-CGTCC------GCCGCATCTGCTCTATT-CCTACCACT-----TTCCA-AGAGGCA-A---GGACAC-ATCCT-N-AAAGTCCATCTGTACAAACAGAGGNTAT-GA------TCC---TCGCAAGGTGCAGTCCGCAAT-TGATG---AGAT-----GT---CACAACANGACAG--ACAGTCCCTCCTNCAATATAAAGAAAAACC-TCAGA--A---T-G--A-CAGAGTTCCACTGGTCACTAC-T--TACCACCCCGTCCTNAA-G-GAC-------CTC-------AACANTAT-TCTGAGAAAGC--ATNTNCCCATT-----CTNCA---TAC-CAATAAAC---GAATGGCT--GAT-GTTT-TCA-AGGA---A---C------C----------T-------CC----------G---------T------T-----C--AGACGCCCCAGAAACC--TGAAG----GACATG-GTGGTG--AGGACCAGACTGG--ATA-ACCC-TTTAC--CTAATGG---AGGTTTCAAAAC--------AT--GC-TCAGACCT-CA--A-----G-ATG-TCAA--TC--G-TGC--AAAT---AT-----AGC-TC----AGAC-ACT-----GAGAGCTTCA-GCA-GTCCTG-T-C--ACAGGTCG-C-AGTT-AT--------------A---AAA-TATTG-G--------------G--G-AACTACG---TCCCG-TAA-AAC---CGAC---AAC-T-G-CAT-C----------TA-C--CTC----ATCAGC-TG-T--AANGTC-TG-CCAGAAA-CA--GTA--CG-T----------GG-GNGA-AA--------CTAC-GG--ACC---TNCGCAGAA-GGGT-CAA--CAA-CCACC--GGTCCN-CC-G-T-C-AAGACCAA-AA-A---G-GA-T--CC-----G---C-CG-GTA-GC-TACGCA--TTTCAA------T---G-GTAGCAATCA-CCG-AT-GG---GA------------GG-A---CA--TGACAA--TA-----NTAGTTATTGATCAT
gi|1 : GCTCACAGACAGTTGTCA--GACGAACGTTTT--TAC-A--AA-AAGTTGCAGTCTGACCCC-ACTAAAAA-TTCTCCATCAAGATCA--C-GAGACCCTTCAGAAAATGC-ATGA--AGAGTGA----AATC-GGTGATAA-TGTACTTGGAGC---GCTTT-GTC---CCAAC-GACTGTAGACCTGGACAATTCTACTTACTGCCT-AAAAT-TAC-AAG-A-AAGACATGCCAGGCCGTCCT-ATTGT-CAG--TGCCATCGG-AC-------ACCCCACGGAGAAAATCTCTGAATTCATTGATTT-ACATCTCCGT----CAGCA-----CGTAGAAGATTTACCGTCATA-CTTGAAGGATACGACT-GATTACCTAAAT-AAAACCCCA-CATCG-GGCCTGCCAGACCATACCCTCCTTGTGACTATGGATGTGACGTCACTCTACAC-CAACAAT--CCACATGATGAGG-GTAT-TGA-GGCCTGTAAAGAGGTT-TGGAATCAA--------AGGG-----TCAGTCAAC--ATC--CCTCAACTGAGTCACTCATTCGGCTTCT-----T-GAACATGTCCTCA-AGTGTAA--TA--ACTTCATGTTTGA---CGGTGAACACTACCTGCAAA-C-A-GTG-GCAC-TG--CTATGGG-AACAAAAATGGCACC-TTCCTATGCCAACA-TCTTTATGGGAA--GATTG-GAACGTAGACT-CCT---GC--A----TCACT--CACTAGTTAAACC-TCTCA----GTTG-GCTACGTTTC-A--TAGATGACATC--GAGATGAAGTG----GGT---TGATGG-TCGTGAAAGCCTCAACGAGTTTAT----TAAGATGGCAAACTCTTTCCAC-GATTCCA-TCAAGTTT-CTG--TG-GATATTTCA-ACATCCAG-GAATACGTTTTTGGATA-CACAGC-AACACTTAA-GGACGGAGAAATCGAGTTTAATCTTCAC-A-CGAAACCCACAGATTCTCATT--TGTACCTTA-TGCCATCC----AGCTGTC-----ATCCACCCCAT-A-CTTTCA------------AAGGTGT-GCC---------ACC---T--G-CATCC------GCCGCATCTGCTCTTTT-CATACTAGT-----TTCCT-AGA-ACA-A---GGAAAT-ATCCT-C-AAAGTCCATCTA-ACCAGCAGAGGATAT-AA------TCC---TTGTAAAGTACAGTCCGTAAT-TGATG---AGAT-----GT---CACAACAGGACCG--ACAATCCCTCCTCCAATATCAAGTGAAACC--CAGG--A---TCA--A-CAGGGTCCCACTAGTCACTAC-T--TACCACCCTGCCCTTAG-G-GAT-------CTC-------AATAGTAT-CATAAGAAAAC--ATTTGTCTATC-----CTGTA---TGC-CAACAAAC---GTATGGCG--GAT-GTTT-TCA-AGGA---------------------------------TC----------G---------T------T-----C--CGGCGCCCCAGAAACC--TGAAG----GATATG-GTGGTA--AGGACCAGGCTGG--ATA-ACCC-TCTAC--CTAATGG---AGGTTTCAAAAC--------AT--GC-TCAGATCT-TA--A-----A-ATG-TCAA--TT--A-TGC--AAAC---AT-----AGC-TT----AGAC-ACT-----GAGACTTCCA-GAA-GTCCTG-T-G--ACAGATCG-C-AGTT-AT--------------A---AAA-TATTG-G--------------G--G-AACTACA----CCTG-CAA-AAC---CAAT---AAC-T-G-CAT-C----------TA-T--CTC----ATCAAT-TG-T--GATGTC-TG-CCAGAAA-CA--GGA--CG-T----------TG-GAGA-AA--------CTAC-AG--ACC---TTCGTAAAA-GGGT-AAA--CAA-TCACC--GGTCCT-CC-G-T-T-AGGACCAA-AA-A---G-GA-C--TT-----G---C-CG-GTA-TC-TACGCA--TTTCAA------T---G-GTAGCAATCA-CCG-TT-GG---GA------------GG-A---CA--TGACAA--TA-----TTAGTGATTGATCAT
gi|10 : AGGACACCACT-GACTACCTCAAT-GATACTTCTTCTTCA-GACCTGCATGAAGACACTTTGTTGGTTACAATGGACATCACTTCATTGTATAC-CAATATT--CCACACCAGGAGG-GCAT-TGA-GGCATGCAGAGAGGTC-TGGAAAACA--------A--GAACCACC--CCTAA--A-C--CTTCCACAAAATTATTGGTTCTACTCCT-----T-GAGCATGTCCTTA-AGTTCAA--TA--ACTTTATGTTCAA---TGGTGAACACTATCTACAAA-T-AAGTG-GCAC-TC--CCATGGG-CACCAAAATGGCTCC-CTCTTACGCTAACA-TCTTTATGGGTA--AACTT-AAACATAATCT-GCT---AC--A----ACAAG--CACCTGTTAAGTC-GTTCA----GCTG-GTTACGATTC-A--TTGATGACATT--GAAATGAAATG----GGC---GAACAG-TCGAAGCAGTCTTGACAACTTCAT----TGAACTTGCAAACGCTTTTCAT-ATTTCCA-TCAAGTTCACAG--TG-GATATTTCC-GCATCTAG-CAACGTCTTTCTGGA
gi|11 : -CAATAAA----GAATGGCT--GAT-GTTT-TCA-AAGA---G---C------CACACTATGGCT-------GC----------C---------T------T-----T--AGGCGCCCACGAAACC--TGAAA----GACATG-GTGGTT--CGAACCAAGTTGG--AAA-ATCC-TTTAC--CCAATGG---TGACTTTAAAAC--------CT--AT-TCAGA--TAAA--A-----G-ATGTTTGA--T---G-TGC--AAAC---AT-----ACT-TC----TAGC-ACC------ACAGTTTTG-AAA-GCCCTG-T-C--ACCGGTCG-A-TCTT-AC--------------A---GAA-TATTG-G--------------G--G-AA--ACG---TCCTG-TCG-AAG---TGAC---AAC-T-G-CAT-C----------TA-C--TTG----ATCAGC-TG-C--AAAA---TG-TCAGAAA-CA--ATA--TG-C----------GG-GTGA-GA--------CTGG-CG--ATA---TACGCCGAA-GGA---------------C--GGT-CA-CC-A-T-A-AAAAC--A-AA-A---G-GG-T--CCAAGGAA---C-CC-GTC-GC-CAAGCA--TTTTAA------TCTCG---AGGAA-CA-CTC-AT-GG---GA------------AG-A---CA--TGACGG--TG-----GTGGTTA-TGACCAc
gi|12 : atatatatatgacacgCCT-CGAAAGTC-ATCCG-ACAAACAG--GATAT-GA------TCC---TTGCAGGGCACAGTCCGCAGT-TGATA---AGAT-----GC---CACAACA-GACCG--ACAGTCCCTCCTCCAGTACACAGAAAACCC-TTAAA--A---T-G--A-CAGAGTTCCGCTAATCACTAC-T--TACCATCCCGCCCTCAA-G-A---------CTC-------CACATTAT-TCTGAGAAAGT--ATCTACCCATT-----CTGCA---AGC-CAATAAAC---GAATGGCT--GAT-GTTT-TCA-AGTA---A---C------C----------T-------CC----------AATGACATGCT------T-----C--AGACGCCCTAGAAACT--TGAAG----GACATG-GTAATA--AGGACCAGACTGG--ATA-ACCT-TTTAC--CTAATGG---AGGTTTCAAAAC--------TT--GC-ACTGGCCT-C---A-----G-ATG-TCAA--CT--A-TGC--AAAT---AT-----AGT-TC----AGAC-ACT-----CAGAGCTTTA-GCA-GTCCTG-C-C--ACAGGTCG-T-AGTT-AT--------------A---GAA-TATTG-G--------------G--A-AACT-TT---TCCTG-CAA-AACTATTAAC---AA--T-GTCAT-C----------TA-T--CTC----Agacatccactggacggatgcagacagaaaaggcaagaagttttggatgcataggctgtaaaag
gi|13 : TTAAAAGACACAACA-GACTTTC-AAAT-GTAACTCCA-AAGCAAGGCCCACCAGACCACACACTT---------ATAAA--TAAC----CTTGACAT-TAACGTTTTCCATATGACAAAA-ATAT-CAATGGC-TGCAGGGAAGTT-TGAAATGAC--------A--A-----TC---CAAA--ATC--CT---AGTAAATCACTCATTCAG--------------------CCTCA----TCAA--CA--ACTTCTTGTCAGA---CAGCAAACAT-----------T-A-GTG-GTCT-CG--CTAT-GA-AACCAATATGGCACCAATTTTA----AACA-T----------A--AACTC-AAACGTAGCCC-ATT---AA--A----CCAAA--CATCATGCAAATC-CCT------GT----CTACTTTTCAA--A-GATGACATA--GAGATAA---------GCCCATAAGAG-TCG-GAAGG-------------AT---------TTGCAAACTCTTTCCA------CCA-TCAAGCTTAAAG--TG-GAAATT------AT-------AC--TCTCTTGGTCACCACTGC-CACATCTACAGAATTTA-AAATCAATTTCAGCCTCCCC-A-CTAAGTCCACa
gi|14 : ACTTGCAAA-TCA-GTTCGCAT-GG--CTAAGTT-AACTAAAATGGCAAA-ATCTTATGCCAACA-TCTGCATG----------------GTAGCAC-CCT---AT-------TTGTT-----------AGCC-----A----GTTG-GCTATGTTTC-A---------CATT--GAGATGAAGTG----A-------ATGA-TCATGAAAAATCCGA-GACTTCGT----CACGGTTCCGAACTCTTTCCTT-TATTTGA-TGAAGTTCACTGCATGTGGCAATTCC-ATCTCCAA-AA---TACTATCGGATACCACAGC-TACACTTAT-AAATGG-GAAACTGAGTTCAATCCCCATAA-CTCAACCCACCGACTCTCATTAATATACCATA-T--CATCC----AACCATCCTAAAATGTGTCCTAA-G-CTTT--------------------T-GTC---------GTC---C--A-AATTT------GCTGCATCTTCTCTATTACCCACCACT-----TTCCA-AGAGGCA-A---GGACAC-TTCCTAA-AAAGTCaa
gi|15 : ---AT-----AGC-TC----AGAC-ACT-----GAGAACTACA-ACA-GTCACA-T-T--ACGGGTCA-C-AGTT-AC--------------A---CAA-TATTG-G--------------G--G-AATT--T---TCCCG-TAA-AAT---TCAT---AAT-T-G-CAT-T----------TA-T--CTC----AACAGC-TG-T--AATGTC-TG-CCAGATA-CAATGTATTCA-TATGGGGGGGGGG-GTGT-AA--------CAAC-AG--ACC---TTC-CAAAACAGGC-TAA--CAA-CCACC--GGTCCG-CT-G-T-C-GAAACCGA-GA-A---A-GG-T--TT-----G---T-CA-GTA-GC-TACCCA---TTCAA------T---G-ACAGTAATAT-CCG-AT-TG---GA------------GG-C---CG--TGACAA--TA-----ATGGCTAT
gi|16 : GCTCATCGACAACTCTCA--GACGAACGCTTT--TAT-A--AA-AAGTTATAGTTTGACCCT-ACCAAAGAGTTCTCTCCTAAGATAAT-C-AAAACCCTTCATGAAATGT-ACAACAAGGGTGA----AATC-GGTGACAA-CGTTTTCGACAT---GCTTT-GTC---CTAAC-GACTGCAGACCAGGACAATTTTATATACTGCCT-AAAATCCAC-AAA-G-TAGACATGCCACGCCGTCTT-ATAGTCC-G--AGCCATTGG-ACCGTCATGATCCCAAGGAGAAAATCTCTGAATTCATTGatattgaacatgacaaaagttttcagatacccagagaaaacaaaaggaaatgattagggatgcaaatattgaagtaattttatcagcaagatctaaacatgcccactaacttcacccggatgaata
gi|17 : agataatctcaccaaagaagaaagattggcgttgcaaacattgatattgtcattaaaaggacagacaaaggttctacttaagttgtcttggacaaagacgggtacttgacggagGCTC-TCG-CAACTCTCAATGACGAACGCTTT--TATTA--AATAAGTTATAGTTTGACCTA-ACCAAAGAGTTCTTCTCTAAGATAAT-C-AAAACCCTTCATGAAATGT-ACAACAAGGGTGA----AATC-GGTGACAA-CGTTTTCGACAT---GCTT---TC---CTA-C-GACTGCAGACCAGGACAATTTTATATACTGCCTAAAAATCCACAAAG-T-AGAACATGCACGGCCGTCTTAATAGTCC-G--AG-CATTGGAACGTCATG-ATCCCAAGGAG-AAATCTCTGAATTCATT
gi|19 : gagataatctcaccaaagaagaaagattggcgttgcaacatttgatattgcattaaaaggaaacaaagttctaacttaagtgtcttggacagaagacgggtacttgacggaTCCGCAAC-TGATG---AAAT-----GT---CGCAATAAGGCCG--ACAGCCCCTTCTCCATTTTAAAGAAAAACC-GCA-A--A---T-G--A-CAGGGTTTTGCTTGTCACTAA-C--TATCACCG-GTCTTGAA-G-ATC-------CTC-------AGCTGTAT-TCTGTAAAAGC--ATCAACCCATT-----CTGCA---TAC-CAGTAAAT---GAATGGCT--GAT-G-TT-TCA-GGGA---A---T------C----------C-------CC--------------------T------A-----T--AG-CACCAGAGAAACC--CCAAG----GATACG-ATAGTA--AGGACAACACTAT--ATA-ACCCTTTTAC--CTAATGG---------TAAAAC--------AT--AC-TCAGACTT-CA--GTACATGTATG-TCAA--TT--G-CAC--AAAT---ACATGTAAGC-TC----AGAC-ACA-----GATAGCTTTA-GCA-GTCCTG-T-TCGACAGGTCG-TGAGCT-AT--------------A---AGA-TATTG-G--------------G--A-AA
gi|2 : GCGCACAGACAGCTCT-G--GATGAACGGTTT--TAC-ACTAA-AA----C--TCCGACCCT-ACCAAAACGTTTTCCGCTACTATCA--CCGACACTCTTGAGCAAATGTTACAA--AAAACGAGGAAAATT-GGTAATAA-TGTCTTTGAAACAGTGCTGC-CTC---TCAAC----TGTACACTGGG-CAATTTTATCTCCTGCCT-AAA-TCCAC-AA--A-AAGGCATTCCTG-CCGCCC----------------CATTGG--C-------ACCCCACGGAGAAAATCTCAGAATTTATTGACCT-ACACCTCTGC----CCATA-----TGTTGTAAAACTACCATCATA-CTTGAAGGACACCACT-GATTACCTTAACAAAAACCCCT-CTTCG-AACCTACCTGACAATACCCTTCTCGTGACCATGGATGTGACTTCGCTTTACACAAAACATC--CCCCACGATGAAG-ACAT-TGA-AACCTGCTGGGAGG-T-TGGGATAAA--------A--GGAT--CC--TGAAAACATC--CTTCCACAGAATCA-TTGTCAAGCTCCT-----T-GAACATGTCCTCA-AACTAAA--TA--ACTTCATGTTCCA---AGGCAACCATTACTTACAAGTT-A-GGG-GCACAAG--CAATGGGAAACGAAGATGGATCCTTTCATATGCCAACA-TTTTTATGGGAA--GACTT-GAACGCAACTT-ACTCAGGC--A-------AT--CGCCCTTTAAACC-CCATA----ATTG---TGTGTTTC-ATTT-GATGACATT--GA-ATGAAATGAAATGGC---GGAGGG-CCGAGATA--CTTGACAACTTTAT----CTCCTTTACCAACTCATTTCAC-CATTCCATTTAAATTTACAG--TG-GAAATTTCCAGC-TCCAA-GAACATATTCTTGGATACCGCTTC-CACTCTCTT-GGATGGTGAAATTGAATTCAGCTTCCAT-ACCAAAACCCGCTGACTCACATT--TGTA-CTTATTGCCTTGA----AGCTGTC-----ACCCACCTCAT-A-CCTTCA------------AAGGAGT-ACCTAAGGTTTAGCTACAC--G-AGTTC------GTC-TATCTG-----TT-CCTCTGGCTCGGAATTCGA-AAAAACA-AATCAAACTCTATCTT-G-AAAAGCCACCTTTGTAAA-AGGGGCTGT-AAAGTTGTTCCTGTTCACAA----CA----GCAAT-TGACG---AT-T-----GTC--CAGAACAAGtct
gi|2 : gacaaacttaagcatagaagaagagcttagccttataagagcttaaaaaaaaactcggatgacattgctatcaaaaaggcagacaaggtcaacagtggttgtattagacaagacagcatacatagcggaaCCCGCCCTGAA-G-AAC-------CTC-------AATACCAT-CCTTA--AAGCC-ATTGTCCTAT------CTGTA---TAA-CAAAGAAC---GAATGGCT--AGG-GTCTCTTA-AAGA---C---C------A----------T-------CC----------AATGGCAGCTT------T-----C--AGACAACCTAGAATTT--AAAAG----GATATT-GTAGTT--AGAATTAGGCTGG--ATA-ACCC-ATTAC--CCAACGGGGCGGGTTTTCCCAC--------GT--GC-TCTGA-----AAGA-----G-ATG-TC----TCCAG-TGC--AAAT---TC-----AGC-caaaactctaaattttcacccgccctgaagaacctcaataccatccttaaagccattgtcctatctgtataacaaagaacgaatggctagggtctcttaaagaccatccaatggcagctttcagacaacctagaatttaaaaggatattgtagttagaattaggctggataacccattacccaacggggcgggttttcccacgtgctctgaaagagatgtctccagtgcaaattcagcgggccaactgacgctttcag
gi|20 : gacaaacttaagcatagaagaagagcttagccttataagagcttaaaaaaaaactcggatgacattgctatcaaaaaggcagacaaggtcaacagtggttgtattagacaagacagcatacatagcggaagcgcacagacagctctggatgaacggttttacactaaaactccgaccctaccaaaacgttttccgctactatcaccgacactcttgagcaaatgttacaaaaaacgaggaaaattggtaataatgtctttgaaacagtgctgcctctcaactgtacactgggcaattttatctcctgcctaaatccacaaaaaggcattcctgccgccccattggcaccccacggagaaaatctcagaatttattgacctacacctctgcccatatgttgtaaaactaccatcatacttgaaggacaccactgattaccttaacaaaaacccctcttcgaacctacctgacaatacccttctcgtgaccatggatgtgacttcgctttacacaaaacatcccccacgatgaagacattgaaacctgctgggaggttgggataaaaggatcctgaaaacatccttccacagaatcattgtcaagctccttgaacatgtcctcaaactaaataacttcatgttccaaggcaaccattacttacaagttaggggcacaagcaatgggaaacgaagatggatcctttcatatgccaacatttttatgggaagacttgaacgcaacttactcaggcaatcgccctttaaaccccataattgtgtgtttcatttgatgacattgaatgaaatgaaatggcggagggccgagatacttgacaactttatctcctttaccaactcatttcaccattccatttaaatttacagtggaaatttccagctccaagaacatattcttggataccgcttccactctcttggatggtgaaattgaattcagcttccataccaaaacccgctgactcacatttgtacttattgccttgaagctgtcacccacctcataccttcaaaggagtacctaaggtttagctacacgagttcgtctatctgttcctctggctcggaattcgaaaaaacaaatcaaactctatcttgaaaagccacctttgtaaaaggggctgtaaagttgttcctgttcacaacagcaattgacgattgtccagaacaagcaaaactctaaattttcaACAG--ACAGGTCCTCTTCCACTATGAAGAAAAACC-TCAAA--A---T-G--A-CAGAGTTCCACTAGTCACTAC-T--AACCGTCCTGTGCTCAA-A-AAC-------CTC-------AACACTGT-TCCAAGAAAAC--ATG--------------TGTA---TGC-CAATAAAT---GAATGGCT--GAT-GTTT-ACA-AGGA---A---C------CCCTATGGCA-T-------CC----------T---------T------T-----T---GATGTCCCAGAGACC--AGAAG----GACATG-GCAGTA--AGGGTTAGACTGAATATA-ACCC-TCTAC--CTAATGG---AGGTTTC-ATAT--------AT--------GACCT-C---A-----C-ATG-TCAA--TC--A-TGC--AAAT---AT-----AGC-TC----AGAC-ACTGGCCAGGGAGATTTA-GCA-GTCTTG-T-C--AGGGGTTG-C-AGTT-AT--------------A---gggccaactgacgctttcag
gi|21 : aaACAG--ACAGGTCCTCTTCCACTATGAAGAAAAACC-TCAAA--A---T-G--A-CAGAGTTCCACTAGTCACTAC-A--TA-----CCGTGCTCAA-G-AAC-------CTC-------AACACTGT-TCC-AGAAA-C--ATGTG-------------------TACTCAATAAAT---GAATGGCT--GAT-GTTT-ACA-AGGA---A---C------CCCTATGGCA-T-------CC----------T---------T------T-----T---GATGTCCCAGAGACC--AGAAG----GACATGCGCAGTA--AGGGTTA-ACTGA--ATATAACC-TCTAC--CTAAT-G---AGGTTTC-ATAT--------AT--------GACCT-CA--C-----A-GTG-TCAA--TC--A-TGC--AAAT---AT-----AGC-TC----AGAC-ACTGCCA-GGGAGATTTA-GCA-GTCTTG-T-C--A-GGGTTG-C-AGTT-AT--------------A---
gi|23 : a---C-CT-GTT-GC-CAAGCA--TTTCAA------T-----CTAGCAGAAA-CAA-AT-GG---GAAAACATGAGAATGG-AGAACA--TGACAA--TA-----GTATTTA-TGATCA
gi|24 : gggtcaaaa-AAAACCCATTTGTGCAAA-AGAAGCTAT-GAAG----CCC---CAACAA--TGCAAGCAGCTAT-TGATG---TGAT-----GT---CAGAACACGACAT--ATTATCCCTACTACAATTTAAAGGTAAATTGTTAGATTA---T-G--AACAGAGACCTAACGGTTGCAAC-G--CACCACCCTGTCTTGAA-A-GAC-------CTA-------AACAATAT-TGTGAGAGAGCATATATTCCCAAT-----CTTCA---TAC-TAACACTA---GAATGG-------------TCA-ATGA---A---C------C----------T-------CC----------gaactcccactggaaaggaataacaaagaaaaaatctggatgcgtagccactccgccctgatggcacgacttccctagaatgaatgtgacttgggtactctagttattactcagtatttacaatttctatttgccatttactttgtgtaaaagcaccatcattagcagtcaatctttccatacttgttctgatttttttttta
gi|25 : aagaacagagcacccgactga-AC-GG---GA------------GG-A---CA--CGAC-A--TA-----GTGGTTATTAATCATcattgcggcctctgctaccgaattcttgggaagaca
gi|27 : ATCA--CTGACACTCT-AAGCAGATGT-ACAA--ATGACGAGG--AATTTGGTAATAAATGTCTTTGAAAC---ATTGCTGTCTCTCCAA-----TGTAGACCTGGGCAATTTTATCCACTGCCT-AAAATCCAC-AA--A-GAG-TATGCCTGGCCGCCCC-ATAGT---GATGGCCATTGG-AC-------A-CCCACGGAG-AAATCTCAGAATTTATTGACCCAACACCT--GC----CCACAAATGTTGTAACATACCTAC--TCATATCTTGAAGG--ACCACTAGATTACCTAAAC-AAAACCCCA-TCTCC-AACCTACCTGACAAgacctaaattggacagattcctaaagaaagcaaaaggaaaattccggatgcacagacagaagtcgtttgactccgggtgaatcactgactttcccagtatagcagggctaaacctacaaatgtttattattccggaactccatctactcttttgattcataccttcaacactatagccgtatttttcatttcatttttttaaaaatagttttacgcgctagactactttgttacatactagtttacaggaccgtgt
gi|28 : caTTT-TTA-GTGA---A---C------C----------T-------CCCTGTCGT---G---------T------C-----CTTCGACGGCCCAGAAATAAATCAAG----GACCTT-ATGGTA----GACCAGACTGG--ATA-ATCC--CTAC--CCAATGG---GGATTTTCCAAC---------T--TC-TCTTAACA-CA--C-----G-GTG-CCTA--CT--C-TGC--AAAT---AT-----ATC-CCCAAAAGAC-A-T-----GAGACATGCA-G-A-GTCTGA-C-C--ACAGA--A-A-AAGT-AT--------------A---GCA--ATTG-G--------------G------CCAGGTTTTTCCG-TAATGAC---CAAC---AAC-T-G-TAT-T----------TACC--CTC----ATCAACATGTT--AACGTCGTG-C---AAA-CA--ATA--TGCT----------GG-GGGA-AA--------CCAt
gi|29 : gtGCTCATTGACAGCTTTCG--GACGAACGCTTAAATAT-A--AA-AAGTCACTGCCTGACCCTCGCCACAGAGTTCTAGACCAAGATCAGCC-GAAAAATTCCAAGCATTGT-AC-A--ATGGCGA----GATC-AGTGACAA-CGTT------AC----CTT----------AAC-GCCTGTGGACCAGGATATTTTTATGTACTGCCA-AATGTTCAC-AAACACAAGACATGTTAAACTGTCCT-GTAGT-CGG--TGACTTCGG-GC-------ATCAAACGAGGAGAATTTCTTAATTCATT
gi|3 : tagacaagtactcaacaaattaaaGTTCACTG--TT-GATATTTCC-GCATCCAG-TAACGTATTTTTAGACACTATGTC-CAAGATTGT-TAACGGAAAAGTCGAGNNNNNNNNNNNN-N-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--NNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNAGTTGTC-----ATCCTACTCAT-A-CATTCATAGGAGAAACTAAAGGTTTAGCC---------ACC---A--G-TGTCG------GCCGTATCTGCTCCACT-CCTGC-ACT-----TTATA-AAGAACAGA---GCACCC-ATCTA-G-AAAA-CCATCTGTGCAAG-AGAGGCTATCAA------GCC---CCA-AAAGTGCAAGCAGCTAT-TGATG---AAAT-----GT---CAGAACACGACAG--AGAACCCCTACTACAATACAACAACAAA---TCGGT--A---T-GTGA-CAGAGTCCCAATGGTTACTACGTAGTACCACCCTGTCTTAAA-A-GAC-------TTG-------AACAAAAT-TCTGAAGAGGC--ATATCCCCATT-----CTTCA-------CAATAACCCTAGGAT--CTTCAAG-ATCT-TCA-AAGA---A---C------C----------T-------CCCAT-------GGCGGCC---T------T-----C--AGACGCCCCAGAAATC--TGAAA----GACATG-GTGGAG--CGGACTAAATTGG--ACA-ACCC-GATAC--TTAACGA---GGGCTTTATCAC--------AT--GT-TCTGATGG-C---A-----G-ATG-CCTG--AC--G-TGC--AAAC---AC-----AGCATT----AG-C-ATA-----AACATTTTTA-AGA-GCCCTG-T-T--ACAGGCCGAC-ACCT-AC--------------C---GAATTCTCA-G--------------G--G-AA--ACA---TCCTG-TCG-CGC---GGAT---GAT-T-G-CAT-C----------TA-C--CTC----ATAAGC-TG-T--AAGGTC-TG-TGATCAA-CA--ATA--CG-T----------GG-GTGA-AA--------CTGG-GG--ACC---TACGTAGGA-GGAT-CAA--TAA-CCACC--GCTCTA-CC-A-T-C-AAAACCAA-A
gi|30 : AGGTACGGCCCGTAACATGATAGGCAGATTCTCTGTAACCACAA-AGGACAGGAACA--CCCTTTTGCAATACAAAGAGAAAA----AGA--A---A-A--A-AAGA------------------------CACCCCGTCCTTAA-G-AGC-------CTT-------AACAGAAT-CCTGAGAGAGA--ATCTGCCGATT-----CTTCA---CAA-TAATGAAA---GAATGGCG--GAT-CTTT-TCA-AGGATCTA---CCAATGGC----------T-------GC----------A---------T------T-----T--AGACGGCCTAGGAACT--TATAG----GACATG-GTGGTG--AGAGTCAAATTAG--ATA-ACTC-ATTAC--CCAATGG---TGGCTT
gi|31 : tgtTGGATGTCACGTCATTCTACAT-T--------------GGCTAG---CATTCAA-AGCGTGCAGCGAAGTTATGGATAATA--------A--GCTG--TC---CATA--GCC--CCTCCGCTGAGTCACT--TTCAACTCTT-----A-CAACGTGATCTTATAGTCCAA--TA---CTTCGTG----------GCGATCACTATTTCCAAA-T-T-ATC--CAC-AATTCTATGAG-AACCAGAACATCACT-CTCAAAAGCCAACA-TATTCATGGAAA---------AGTGAAACCT--CT---GC--T----TC-----------TGCAATC-GCTGA------TG-ACT--GTTTC-A--TGGATGATATG--GA-ATG
gi|32 : -TTTAC--CTACCGG---AGGTTTCAAAAC--------ATTGGC-T-ATACCT-CA--A-------ATG-TCAA--TT--GATGC--AAAT---ATT----AGC-AC----AGATTACT-----GAGAGCTTTA-GCA-GTCCTGTT-C--AC-GGTCG-T-AGTT-ATAAGATTTAGCTATAA---AGA-TATTA-GCTTAAAGATATTGGG--A-AACTTTT---TCCTA-CAA-AAC---TAATATAAACTT-G-CAT-C----------TA-T--CTC----ATCAGT-TG-CAAAATGTC-TGCCCAGAAA-CG--GTA--TG-T----------AG-AGAACAA----------ACAGG--AC------CGCAAAC-AGGT-CGA--CAA-CCACA--GGTCtatgg
gi|33 : CAAAGCGTTTTCTGCCACCATCAG-T-GAAACTCTACA--AAG----ACGA--GG----A----AATT-GGTGAAAA-TGTCTTTGAAACATTGCTTC-CTC---TCAACTG--TATATACCTGGGCAATTCTATCTACTGCCT-AAAATCCAC-AAG-G-AGGGTGTGCCTGGTCACCC--ATAGTGT-G--TGCCATTGG-GC-------ACCCCACGGAGCAAATCTCAGAATTGATTGACCT-ACATCTCTGCATGTCCATA-----TGCTATGAAGCTACCATCA
gi|34 : gaccaacgattctatggaaggatgtt---T-G--G-CAGAGATTCAATGGTTACTAC-T--TTCCACTCTGTTTTCAA-A-GAC-------ATG-------AACAAAAT-TCTGAAGAGGT--AT--------T-----CCGCA----A---AATAATCTTTGGATGGCC--AGT-ATCT-TCA-AAGA---A---C------C----------T-------CCCAT-------G---------TCATCCTT-----C--AGACACTCTGGAAATC--TGAAA----AACATG-GTGGCG--CGGACTAAATTG
gi|35 : cgatatgT--CCACATCATGAGG-ATAT-AAA-AGCTTGCAGAGACGTA-TG--ATATAGTACTTACA--G-----CCATTCATA--GTT--CATCAATTGAGTCACTTACCCTGCTCCTACATGTAGAACATGTTTTGT-AATGCAA--TGTCACTT----TTCAAAAATGGTGATCACTGCCTTCAAA-TTA-GTG-ACAC-TG--CTATGGG-AACCAAACTGAGACC-CCCATCTGCCGATA-TGTTttctgttgggagatgactggtgtgcaaacatagcgctaacacaattagttttaagagccctgt
gi|36 : CGTATCCTTA-AGTTTAAAATA--ACTTCATGTTCAA---CGGCAAACACTATCTGCAAA-TGA-GTG-GCAC-AG--CTTTAGG-AA-CAAAATGACAT--------------CA-TCTTTATGGGGACTGTCCCAGAACGTAACC--CCT---AC--A----CTGGT--CACCATGTAAACC-TTGTA----GCTG-GCTATGTTTC-C--TGGATGACATTCAGATATAGAGTG----GGT---TGATGG-TCGTGGAAGCCTTAACGACTTTAT----CAAGATAGCAAACTTTcttttgaaaaagtggaatacaaattgctaat
gi|37 : -CCAGAA--CA--GT----G-T----------AATGGGA-AA--------CAAG-AG--ACA---T-CGCAAAC-GGGT-TAA--AAA-CCACC--GGTCTT-AC-G-T-C-CAAACCAA-GA-A---A-AA-T--TT-----G---T-CA-GAA-GC-TAAACC--T-----------------GTAGTAATCG-CCT-GT-GG---GA------------GG-A---CA--TGACAA--GAGCGCTATGATTATTGACCata
gi|38 : acccttgtaaagcccgcatcaatttgaaaaattgattatattaaAA-AA-A---G-GA-T--CT-----C---C-CGTGTA-GCCTACACA--TTTAAAA-----T---G-TTAGCAATCA-CAG-GT-GG---GA------------GA-A---CA--TTACAA--TA-----TT-GTTATGGGTCccaaattattcatataccaaaacaaagcagaaggca
gi|39 : CAC-TA--CTGTGCG-AACCACAATGTCTCC-ATCATACGCCAATA-CTTTCTTTGGAC--GAC----AACGCAACTTACCT---CT--AATAGTAAAT--CGCCTTTCAAGTG-CCTTACTTGGTTGTGCTAAGTTCC--------CGACATT--CAAATAGGGTG----GAC---TGACA--TC-CAAAA--TAAGACAACTTTAT----TTCGTTTACGAACTCGTTTAAC-CATTCAA-TCAACTTCACtgacccaagttttggtcagaaatgaggagaaatgcgaaaggaaaaaagccaggatacacaggttgttcaaaagtcatttgaagcttttgtcagggtataatcaaaccacttaagatgaaaacggaactaaaa
gi|4 : aACCCTGCCCTTAGTGCGAC-------CTTCTCT---AATAGTATGTACAAGAAAAC--ATTTGCCTAT--------CCG---TAT-CCACAAAC---G--TAGC---GATAGTTT-TCATA--A---A---C------CGC--------T-------CCTGATGACATCG---------T------TTACCGC--AG-CGCCCAGAAAACC--TGAAAAAGCGACATT-GTGTAA--AAGACCAGGTTGA--GTA-ACCC-TCTACCTCTAATGG---AGGTTTCAAATC--------AT--GTATCAGATCT-CG--A---------G-TCAAGTTT--A-TGTCAAAATTAAAT-----ACT-CC----AGAA-ACT-----GAGACCTTCAGGAA-GTCCTG-TGA--ACA-ATCA-C-AGTTCAT--------------A---AAA-TATTGTG--------------GATG-AACT------TACCGTTAA-AAC---CAA----AAC-TCG-TATAC----------TA-T--CTCT---ATCAA--TG-T--GA-GTC-TG-CCAGAAA-CA--GT---CG-T----------TG-GAGA-AA--------CTAC-GA--ACCTTTTTCGTAAAA-GGGTACAAG-CAA--TACC----TCCT-CC-G-TGC-AGGACCAA-AATATGCG-GACT--CC-----G---CACG-GTA-GC-TACGCAGTTTCCAAGTTC--T---GTGTAGACATCA-CCGAAT-GGGTTGA------------GGAA---CATGTGACAACGTG-----TTAG-TA-TGATCAT
gi|40 : tgaattgtacaacggaccgacaatcccctcacttccatatattcaaatttgcacttctccaccttcatatctcgaatatcttgcaactcaactatcgattcccgtgccgATT--GCGACGAAGTG----GGT---TGATGA-GCGTAAAATCCACAATGACTTTAT----CGCAAGTGTGAGCTATTTCGAC-TATTCCA-TTCTGTCCTCTG--AG-GAAATTTTC-AACTTTAG-GAATATTCTATGGGATACCACATT-CGCACTTAC-AAACGGGG-----------AGCCTTCA-----------CATCGAC-ATCATT--TGTA-CGTA-TGCCATTC----ACCTTTC-----ATCCACCCgtacctactctggtcaactattcaaagaaaaaagaagagaatttctggatgaccaggttgaagtcattcgagcctcagtgtcaatccacaaatctaagctactttcccagtagatgaacacgggttagac
gi|41 : --CCATGGA-CACCAAAATGACTCC-AAGCTACGCCAACATTTTTTATGGG-A--GACCT-GAATACAACCT-A-----GT--A----ACGTTGGCACAAAGAAAACCTTTTTA----GATG-ATTTCTATTC-A--T---TGGCATT--TGGATGAAATG----GG----TGTCAACTCGGGGAAACCTTGGCAACTTTAT----t
gi|42 : CAC-TA--CTGTGCG-AACCACAATGTCTCC-ATCATACGCCAATACTCTTT---GGAC--GAC----AACGCAACTTACCT----CTAA----TAGTA--AATCCTTTCAAGT-CCTTACTG-GTTGTGCTAAGTCCC-G-------GACATT--CAAATAGGGTG----GAC---TGAC-A-TC-CAAAA--TAAGACAACTTTAT----TTCGTTTACGAACTCGTTTAAC-CATTCAA-TCAACTTCACttaaatagcccgtgcatttcatactctcattaagtttcac
gi|43 : --ATC--CTTCCATAGAATCGTTGGTCAAGCTCCT-----T-GAACATGTCCCCA-ACCTCAA--CA--ACTTCATGTTCAA---TGGCGAACATTATTTAGAAG-TAA-GTG-GCAC-AT--CTACGGG-AACGAAGTTGGTTCC-ATCGTATGCCAATA-TTTTCATGGGAA--GACTT-GAACGAAACAT-GCT---TA--G----ACAAT--CACCCTGTAAGCC-CCTTA----GTTG-
gi|44 : GCTCACCAACAGCTCTTG--GACGAACGCTTT--TAT-A--AA-A---------------CT-ACCAAAGTGTTCTCTACCAAGATCA--CCGAAACGCTCCAGGA--TAT-AC-A--AGGGTGA----GATC-GGTGACAA-CGTTTTCGAAGT---GCTTT-GTA---TTTAC-GACTGTTGACCGGGACA
gi|45 : tttactttattattatcattataaaggcagagaaagtctctaacataaAGTTCATGG--TT-GATATTCCC-GCATCCAG-TGGCGTCTATTTAGATACTACGTCGAATAC-TGT-TAACGGAAATGTCGAGTTCAAACGCCAT-A-CCAAAGCAATTAACTCCCATT--TATATCCTG-TGCCATCT----AGCTGTC-----ATCAG-CTCAT-ATCGTTCA------------TAGGAGT-AC
gi|47 : CC---------TCC---C--G-AATCC------TCCGCATTTGATCTAAC-GCTACTACT-----TTCCATAG---CA-A---GGACAA-ATCGT-C-AAAATTCATTT-CACAAACACAGGATAT-GA------TCA---TTGCAAGGTACAGTCCGCAAT-TGATG---AGAT-----GT---CACGGCATAACCG--ACAG------------TACAAAGAAAAACC-TCAGA--A---G-T--A-CAGGGTTCCACCAGTAACTAT-T--TAttattttattagccactagagtccgtcatata
gi|48 : TCTTGTCAGAATAGACGTTAATTT-CTGTACAC-TAGCGTC--CTGCAAGATGACC-ACAT-CGA-GGCATTTAGGGAAGTT-TAGAAGAGA--------A--AT----TT--TCTAA--ATCATCTTCCACTGAATTGTTGGTAAAGCTCCT-----T-GGACATGTCCTCA-AACTTAA---------TCA---TCAA---CAGTGAGGACTACTTGC
gi|5 : A--CG-T----------TG-GAGA-AAA-------CTAC-AG--ACC---TTCGTAAAA-GGGT-CAAAACAATCCAC---GGTCCTTCC-G-T-CCAGGACCAA-AA-A---G-GA-T---T-----G---C-CG-TTATGC-TACGCA--TTTCAA------T---G-GTAGCAATCATCCG-ATCGG---GA------------GG-A---CA--TGACAA--TA-----ATAGTGATTGATCAT
gi|50 : cCAATCCCTTTTGCAATATAAAGAAAGATC----GA--ATGGT-G--A-CAGAGTCCCAATGGTCACCAC-A--TACCACCCGGTTTTGAA-G-GAT-------CTC-------AACACTAT-TCTAAAGAAAC--ATATCCCCATT-----CTTCA---TGC-CAATAAAA---GAATGACT--GAT-GTTT-TCA-AAGA---G---C------C----------A-------CC----------gaccctagtttggtctgacattcaaagaaaaaagataggagaagttctggatgacaggttgacgtcattcgagcctcatgcatcaacaaatctgctgacttcaccaggagtgaacacggggttagaagcgattcaccggaaatcgaacactgatttacatgtaagactccccggcctgatcagtcccgaacatcctctattagattcaatcttcacaatgtatacttctcatgtgataaatttttttttttttctttctctttctatcttaaaaaaattttttttttttctcacggtctctttctctcgaaattaattgttttaattaaatctgatccacattgtgtataaattcagtattactttagaacttgacttaatagaatattcccgggtatgaactatccaatatatacctcctaattcgaatagtaagtcgttgcattattgtggatcagctaatggacgagtagggcgtatcctcattcgttccatatctaacattagatttgcaagccattaactcgaataccatgtgatttatatgtaatacggttgttacgttggagaccgatatatt
gi|52 : TAGCCT-CCT---AC--A----TTATT--CACCATTTAAACC-TCT---------------CATT----------TGACATT--CAAATGAAGAA----CAA---TGACAA-TCATGAAAGATGAAACAACTTTATATAAAGAGAAAACAAACTCTTCCCACTGGTTCAA-TCAAGATCACTG--T--GAAATTACA-ACCTCTAGAGAAtatggc
gi|53 : CCTG-T-C--ACAGACCG------------------------------A-CACTA-C--------------C--G-AACT-------CTCG-CA----C---GGAT---GAT-T-G-CAT-T----------TA-C--CTC----ATATGC-TG-T--AACGCC-TG-TGATCAA-CA--ATA--CG-T----------GG-GTGA-AA--------CTAG-GG--ACC---TACGCAGGA-GGAT-CAA--TAA-CCACCTAAATTAA-CCAG-T-C--GGACCAA-A
gi|54 : cGTTCAATC-CCAT-AACTCAACCCACCGACTCTTATA--TATACCATA-TGCCATCC----AAC----------------CCATGA-CT---A------------AATGTGT-GCCTAA------GCT---TTTGTCGTCCAAATTTGCTGCATCTTCTCTATT-CCCACCACT-----TTCCA-AGAGGCA-A---GGACAC-TTCCT-A-AAAgcacccg
gi|58 : TT-AT--------------A---AAA-TATTG-G--------------G--CCAACT-C----TCGAG-TAA-AAT---CAAT---AAT-T-G-CTT-A----------TA-C--CTCATTGATCACC-TG-T--AAagt
gi|59 : actacaggcaaaacAT-ACTGA-AAAGC--ATGCTCCCATT-----CTTCA---TAC-TAAC--------------------------TCA-TGGA---G---C------C----------T-------CCCATGGCT---G---------T------TTT---C--AGACGTTCAAGAAACC--TTAGA----GACATG-GTGGTGCTAG--CCAAATTGG--Aacaatgtaacttacaatacgtgtgtgtgttaacgtggggggggggg
gi|6 : cttgaaatattcaattagaGAC-ACT-----G-----TTCA-GCAAGCCCGG-T-GG-ACAGGACA-G-AGCT-AC--------------A---AAA-TTTTG-G--------------G--A-GTCTATG---TCCTG-CCG-TAC---TGAC---AAC-T-G-CATAC----------TA-CACTTC----ATCAGT-TG-T--AAGAA---A-CCAAAAAGCA--GTA--CG-T----------AG-GTGG-AA----------AC-GGTGACC---TCCGAAGAA-GAGT-CAA--CAA-TCACC--GGTCCA-CT-ACT-T-AAGACC-A-AA-C---G-GA-TCACC-----GAACC-CG-TTG-GG-GA-ACA--TTTCAA------C---A-CTGAGGGTCA-CAA-AT-GG---GA------------AG-A---CA--TGACAG--C------GTAGTTATTGACCA
gi|60 : -TCTGAAGAAGC--ATTTTCCCACT-----CTTCACATTAC-CTCTA------GAATGGCC---ATGGTCT-TCA-AAGA---A---C------CA---------T-------CC----------ATGGTGGCT-T------T-----C--AGACGCCCAGGAAATC--TGAAA----AACGTcaaccctaactggagtgactctgaaagaaaggaaccatagagaagattgctggtagtgcagcaggttactctcaaatagtacatctcttacggactgtcattgtcttcctccaaatggcacctcgaatgaatgaaaagtctctcatgaaatatggaacgttgcttgcccagaccaacgccggatactggatgcgttgagtggtggaaagcgagacgaaatgagcgtcgacccacagactttaactcatcgcctactcctcttcacaacctatactcggagtaaatttcattgatttct
gi|61 : gatttgaaacaaaaaa--ATA-ACCC-TCTAT--CTAATGG---AGGCTTCAAAAC--------AT--GC-TCAGACCT-CA--------G-ATG-TCAA--TT--A-TGC--AATT---AT-----AGC-CC----AGAC-ACT-----GAGAGTTTTA-GCA-GACCTG-T-C--ACAGGTCG-T-A
gi|63 : T-GTTT-TCA-AAGA---ATTCC------C----------TATGACATCC--------------------T------G-----C--AGACACCCCAGAAACC--CAAAG----GACATG-GCAGTA--AGGACTATATTGG--ATA-ACGT-TTTAC--TCATTGG---AG
gi|66 : gCTTGTGACCATGG-TGTTACTTCACTA-ACAT------TT--CAAAATGAAGAGGTTTAT-CAA-GGCTTATAGAGAGGTT-
gi|67 : c---TTCCG-TAATGAC---CAAC---AAC-T-G-TAT-T----------TACC--CTC----ATCAACATGTT--AACGTCGTG-C
gi|68 : ttgggccaggtttACGTG-GCGTTG--AGAGCCAAATTAG---TA-ACAT-ATTAC--CTATTGG---TGGTTTaa
gi|69 : T-ACATCTCCGT----CAGCA-----TGTAAAAGCTTTACCGTCATA-CCTGt
gi|7 : attGCAATCA-CCG-AT-GG---GA------------GG-A---CA--TGACAA--TA-----CTAGTGATTGATCAT
gi|70 : --CTAATGG---AGGTTTCAAAAC--------AT--GC-TCAGATCT-CA--gaccctagttggtgtgctactcaaagaaaaaggaaggagaagttctggatgcacaggttgaagtcatttgagcctcgtggcatcaacaaatctgctgacttcaccaggatgaacacgggttagaacgttcaccggaatcgaactctccttaaaccttcgcgcctgatcatccactcttagcttcaattttcacaatgtatacttctgtgataaaaaaaattttcttctctttctatctaaaaaaatttttttatttcttctaaattattgttttattagaattgatccattgtgtgatatattcaagtacttgactaaatagaatagttccgggtatgaactatcaattatacctcccaattcgaattagtaagtcgtgcatcattgtggatcagctaattggacgagtagggcgtatcctcattcgttccatatttaacatagatttgcaagccaataacccaataccatgtgatttataatgtaaatacggttttagt
gi|8 : ATG---TCCTG-TCG-CGC---GGAC---AAC-T-G-CAT-C----------TA-T--CTC----ATAAGT-TG-C--AAGGTG-TG-TGAACAA-CA--ATA--CG-A----------AG-GTGA-AATTGAGGGTCTAC-GG--ACA---T--GTAGAA-GGAT-CAA--TGA-CCACC--GGTCTA-CC-A-T-G-AAAACCAATAG-A---GTGA----------------------------AAGCA--TTTCAATCTCGCT---G-GACGCAA--------AT-GG---GG------------AG-A---CA--T
gi|9 : ctgaggtcttctagaagcctcctgtggctgccgtcatatatcctaggagtgctgggatccaaattgaaaaatgtttgcccagtggggattttaaaacttattctgatgcctgatgtagaatcacagcgcgaacacaaataatttttaagcgccgatgtcacggaAAGAGAGGCTAT-AAAG----TC----TCA-AAAGTGCAATCAGCTAT-TGATG---AGAT-----GT---CACAA--------------TCCATACTACAATGTAAAGAAAAATT-GGTGG--A---T-G--A-CAG-TTTCCA-TGGTAACAAC-G--AACCATCTCATCTTGAA-A-TACATTCTATCTTGAAAGAAAACAAAAT-TCTAAAGAAGT--ATATTCCCATTAATATCTTCA---CTC-TAGTCGCA---GAATGACT--TAG-GTTT-TCA-ACCA---G---C------C----------T-------CC----------AATGGCTATCT------T-----C--GGA-GTACCA-AAATC--TTA------GACATG-GTGATG--TGAACCAAATTGG----A-ATTC-TTTGC--CCAAAGA---GAGCTTTAAAACTTGTTCTGAT--GC--CAGATCT-------------ATG-CCTG--AC--G-TGC--AAAC---AC-----AGC-GC----GAGC-AC-------AGA--------CA-GCCCTG-T-G--ACCGG-CA-T-A-TT-CT--------------ACCGAAT-TCTTG-A--------------G--G-A--CACA---TCCTG-TCG-CAC---GGAC---AAC-T-G-CAT-CATTCTGTAATTA-T--TTT----GTAAGT-TG-C--GTGGTC-TG-TGAACAA-AA--TTA--CG-T----------AG-GTGA-AA--------CTGG-GG--TCC---TACGTAatattgactactcagttcactggacgcattcatgaggagagaacgaacgagaaagacccaaatggcacgaacaatctcaatgactttactagaatgaatgtggcctagcttcccctcagtgttgttctgtctgttttacactttctactctcagcactattattagcagtcaatctttccgtggtttcctaatctatctttt
12 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|18 ): GTCCCGAACATCCTCTATTAGATTCAATCTTCACATATATCTTCTTGTGATAAAAATTTTTTTTCTTTTTTTTTTCTTCTCTCTTTCTATCTAAAATTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTCTTTTCTCTCTCGAAATTATTGTTTTATTATAATTGATTCCATTGTGTGATAATTCAAGTTTTATCTTAGAACTTGACTTTAGAATAGTTCCGGGTATGAACTATCAATTATACCTCCTAATTCGAATTAGTAAGTCGTGCATTATTGTGGATCAGCTATTTGGAGAGTAGGGCGTATCCTCATCTGTTCCATATTAACATAGATTTGCAAGCCATTAACTCATACCATGTGATTTAATATGTAATACGGTTTTTAGTT
Unaligned ( gi|22 ): TTCTTTCTCTTGTCTATCTTAAAAATTTTTTTGTTCTCTTTCTCTCGAAATTATGTTTTTATGTATCAGAATGATTCCATGTGTGATTGAACTTCAAGTTATTTACTTAGAACTACTAATTAAATGAAGCTTCCGGGTAAAGCTATCAATCATACCGTCTAATCGAATCAGTAAGTCGCATATTGGATCAGCTAATTGGACGAGTAGGGCGTAAGTCCTCATTGTCGTTCCATATTAACATAGATTGCAGCCATTAACCTCAATACCGATGTATTTTTAAGTAAATACGGTTAGTTGTAGTAACTCAGATATATT
Unaligned ( gi|26 ): TTTTTTTTTTTTTTTTTTTGTTTTTTTTTCTCTTTTCTCTCGAAATTATTGTTTTATTATAATTGATCCATTGTTGTGATAAATTCAAGTTATTACTTTAGAACTTGACTAATAGAATAGTTCCGGGTATGAACTATCAATTATACCTCCTAATTCGAATAGTAAGTCGTGCATTATTGTGGATCAGCTAATTGTGGACGAGTAGGGCGTATTCCTCTCCATATTAAACATAGATTTGCAACCATTAACTCAGTATCCATGTGATTTTAATGTAAATACGGTTTTAGT
Unaligned ( gi|46 ): ACAATCTCAGCAAAGAAGAGAGATCTGCCCTCCAATTGCTAAAAAACCGTGACGACATAGTCATAAAAAACAGACAAAGGTTCCACGGTCGTTGTTCTAGACAAAGATTCGTACTTAGCCGAAGCTAACAGACAGTTGTCTGATGAGCGATTTTACAGAAAGCTGGATTTTGATCCCACTGAGGAGTTTTCAG
Unaligned ( gi|49 ): TAATACATTCCTAATCGAATTAGTAGTTCGTGCATTATTGTGGATCAAGCTAATTGGACGGTAGGGTGATCCTCATTGGGTTCCTATGTAAAGAAGATTTGCAGCTTAACTTCAGATACCATGTGATTATAATGTAAAAACGGTTTATAGTTAGTACCAATATATTT
Unaligned ( gi|51 ): AGTAATCACTTACGGGAGGCGAACACATAAGTGGTTATAATAATGACCTAAATGGACAGATTCCTAAAGAAAGCAAAAGGAAATTCCGGATGCACAAGACGAAGTCGTTTGACTCCGGTGGAATCCTGACTTATCCCCAGTATAGCAGGCTAAACC
Unaligned ( gi|55 ): GAATTAGGTCAATCATTATCACATCGCACATTGCGGACTAGCTCATTGGACGAATAGCACTAGTCTCAATCTCTCCTCAAAAAAACATTTTAATTAGCAATTCAAAATCCAATAAACATGTACTTTATAGTGTTGATACGATTATAGAAT
Unaligned ( gi|56 ): GACATTAAAATAGTGATTACTGACCATTACCCAAGTTGTACATGTTATGCCACGAAAACGCAAAGAAAGGATTCTTATATACGGTTTTTTCAATAGTCATTCGACCCTCAAGGTATCAACAAAACAATTTAGTTCATCAGATTAAACG
Unaligned ( gi|57 ): GACAACCTCAACAAAGAAGAAAGATCGGCATTGCAGAGATTAAAAAACCGGGATGATATTGTAATAAAAAGGCAGACAAGGGTTCTACTGTTGTTGTTATGGACAAAGATAAGTACCTAACAGAGGCTCACAG
Unaligned ( gi|62 ): AACGAAACTTTTAGATACTCAGACTGAAGTCGTTCGACTTTCAAGGTATCGAAACACCTGATGAATTCACTAGGATCAACATGGGCTAAACATTTGTCACC
Unaligned ( gi|64 ): AGTGGTTATTCATTTTGACCTACGCCAAATACGCAAAGAAAGCCAAAGTGAAAATCTTTGCACACAAACCGAAGTCATCTGAT
Unaligned ( gi|65 ): AAAGCAAACCGAAAAGTTCTGGATGCACAAACAGAAGTCGTTCGACTATCTACTGACTTCACTAGGATAAAAA
Alignments
lowQualScore : 111111111111111111111111111111111111111111111111111111111
lowQualScore : 111111 2222 111 1111 111 111 111 1111 11 3333333 3333333 1111 22222 1 1111111111 666666666666666666666 1 1111111 2 1111 11 3333333333333333333 1111111111 33333333 1111111111 11 22222 222222222 111 1111 11111 11 333333333333 5555555555555555555555555555555 11111 111 111 11 1 1111111111111 11111 111 1111 1111 1111111 1111111 11111 000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 111111111 2222222222222 11111111 11111 1111111111111111111 33333333333333333333333333333 111111111111 11111111111 11111111 222222222222222 3333333333333 222222222222222 111111
lowQualScore : 1 1 99 99 6 99 6 111111 6 1 44 8888 2 4 666 5 777 66 0 1 7777 5 5 1 1 777 666 888 0 000 5 0 1 5 0 5 9999 2 1 22 6666666 4 1 88 5555555 4 8 1 8 1 7777 00000 1 1 1 1 1 0 0 8 11 8 99 1 99 1 1 0 1 1 2 3 6 1 4 3 22 9999999999 4 4 777 5 5 5 1 5 77 1 555555555555555555555 66 66 0 3 1 4444444 4 0 777777 4 8888 1 0 2 2 4 4 88888 3 0 1 77 3 2 5 6 3 6666 9999 0 11 3333333333333333333 555 3333333333 88 22 66666666 0 3 44 2222222222 0 88 00 11111 1 000000000 0 77 1 4 1 66 55 1 1 6666 77 5 1 1 55 5 0 000 55 1 0 3 7777 44 5 77 66 5 2222 0 44444 00 666 1 2 444444444444 3 6 1111111111111111111111111111111 2 6 7 66666 6 99 6 111 6 111 3 99 5 0 0 5 5 9999999999999 8 1 3 1 4 777 11111 222 2 6 3 55 77 3 2 1 1111 55 555 3 44 3 4 0 0 0000 0 1 1 3 3 0000000 6666666 11 2 0 3 66 666 888888 1 6666666 44444 4444 4 2 2 2 6666666 666666 222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 2 2 1 2 33 1 5555 2 4444 3 33 2 2 33 6666 0 000000000 55555 2 777 7777777777777 2 44 11111111 33 444 99999 33 5555 55 11111 0 55 33 2 2 33 2 7777 2 2 999 1 2 5555555555555555555 2 2 99999999999999999999999999999 0 2 77 7777 5555 2 2 2 444444444444 7777 8888 6 6 44 4 6 3 2 0 3 44 44 3 55555555555 3 1 3 44444444 33 44 6666 8 0 3 3 88 3 55 55 444 666 3 4 777 4 999999999999999 4 44 4 4 5 55 3333333333333 2 3 333 3 555 000000000000000 3 44 55 000000 0 4
lowQualScore : . . .. .. . .. . ...... . . .. .... . . ... . ... .. . . .... . . . . ... ... ... . ... . . . . . . .... . . .. ....... . . .. ....... . . . . . .... ..... . . . . . . . . .. . .. . .. . . . . . . . . . . . .. .......... . . ... . . . . . .. . ..................... .. .. . . . ....... . . ...... . .... . . . . . . ..... . . . .. . . . . . .... .... . .. ................... ... .......... .. .. ........ . . .. .......... . .. .. ..... . ......... . .. . . . .. .. . . .... .. . . . .. . . ... .. . . . .... .. . .. .. . .... . ..... .. ... . . ............ . . ............................... . . . ..... . .. . ... . ... . .. . . . . . ............. . . . . . ... ..... ... . . . .. .. . . . .... .. ... . .. . . . . .... . . . . . ....... ....... .. . . . .. ... ...... . ....... ..... .... . . . . ....... ...... ......................................................... . . . . .. . .... . .... . .. . . .. .... . ......... ..... . ... ............. . .. ........ .. ... ..... .. .... .. ..... . .. .. . . .. . .... . . ... . . ................... . . ............................. . . .. .... .... . . . ............ .... .... . . .. . . . . . . .. .. . ........... . . . ........ .. .. .... . . . . .. . .. .. ... ... . . ... . ............... . .. . . . .. ............. . . ... . ... ............... . .. .. ...... . .
lowQualScore : 0 0 22 22 7 22 7 555555 7 6 44 9999 2 1 000 0 444 99 2 1 5555 0 0 1 1 555 000 888 4 555 4 9 0 7 1 7 3333 3 0 99 0000000 3 4 00 0000000 0 4 0 0 4 0000 00000 4 0 4 0 4 0 8 0 88 0 44 0 44 4 0 2 0 5 5 3 3 0 9 6 44 3333333333 2 2 444 0 0 9 1 0 66 0 333333333333333333333 99 99 8 9 1 8888888 4 9 333333 4 7777 1 5 3 2 4 4 11111 3 2 0 66 3 2 0 7 7 1111 8888 3 22 8888888888888888888 555 8888888888 77 55 55555555 4 7 66 5555555555 4 55 66 55555 0 333333333 5 00 1 4 0 11 66 0 0 1111 33 4 0 2 33 7 1 111 66 7 5 2 4444 00 0 99 99 7 1111 1 33333 66 888 0 5 222222222222 7 7 0000000000000000000000000000000 5 7 8 77777 7 55 7 777 7 777 6 88 0 1 7 3 0 1111111111111 5 1 4 1 4 888 11111 222 9 9 0 55 44 5 3 3 0000 00 888 3 66 3 6 8 2 5555 2 2 0 1 1 0000000 5555555 22 7 3 1 33 777 444444 9 2222222 55555 7777 4 1 1 5 2222222 111111 666666666666666666666666666666666666666666666666666666666 4 4 1 4 22 6 0000 4 2222 4 22 5 4 11 1111 7 000000000 55555 9 333 8888888888888 9 00 44444444 99 777 33333 22 7777 99 66666 9 88 44 7 7 44 5 7777 9 1 444 1 5 0000000000000000000 9 9 11111111111111111111111111111 9 9 66 9999 4444 9 9 9 666666666666 6666 9999 2 2 22 2 7 1 5 2 3 66 22 1 44444444444 1 0 1 22222222 88 66 2222 7 1 6 6 66 6 00 00 444 222 6 4 888 4 444444444444444 0 77 0 0 0 55 1111111111111 3 6 666 3 888 888888888888888 3 66 00 111111 9 4
consensus : GCTCACCGACAGCTCTCG--GACGAACGCTTT--TAT-A--AA-AAGTTACAGTCTGACCCT-ACCAAAGAGTTCTCCGCCAAGATCA--C-GAAACCCTTCAGGAAATGT-ACG--A--AGGGCGA----AATC-GGTGACAA-CGTCTTCGAAAC---GCTTC-GTC---CCAAC-GACTGTAGACCGGGACAATTTTATNTACTGCCT-AAAATCCAC-AAG-A-AAGACATGCCNGGCCGCCCT-ATAGT-C-G--NGCCATCGG-AC-------ACCCCACGGAGAAAATCTCNGAATTCATTGACCT-ACATCTCCGC----CCGCA-----TGTAANAGANCTACCGTCATA-CTTGAAGGACACCACT-GATTACCTAAACGAAA-CCCCA-CNTCG-GACCTACCTGACNACACCCTTCTTGTGACNATGGACGTNACTTCACTNTACACTAA-CGTT--CCACACGACGAGG-ACAT-CGA-GGCNTGCAGGGAGGTT-TGGAAT-ANA--------A--G-----CC--TCAAAA--TC--CTTCCACTGAATCACTCGTCCAGCTCCT-----T-GAACATGTCCTCA-AGTTCAA--TA--ACTTCATGTTCGA---CGGCGAACACTACCTGCAAAT-A-GTG-GCACN-G--CTATGGGAACCAAA-ATGGCNCC-NT-CNTACGCCAACA-TCTTTATGGGAA--GACTC-GAACGTAACCT-CCT---GC--A----TCGNT--CACCNTTTAAACC-CCTTA----GTTG-GCTACGTTTC-AT--G-ATGACATTGAGATG--AAGTG----GGC---TGACGG-TCGCGAAAGCCNCGACGACTTTATC----GCGNTTGCGAACTCTTTCCAC-NATTCCATC-AAGTTCACNG--TG-GANATTTCC-GCATCCAG-GAACGTNTTTTTGGATACCACGTC-CACACTTAC-GAACGGAGAAATCGAGTTCAGCCTCCAT-A-CTAAA-CCCACCGACTCTCATT--TGTACCNTAT-GCCATCC----AGCTGTC-----ATCCGCCCCAT-A-CNTTCA------------AAGGTGT-GCC---------GCC---C--G-CGTCC------GCCGCATCTGCTCTATT-CCTACCACT-----TTCCA-AGAGACA-AG---GACAC-ATCCT-N-AAAGTCCATCTGCGCAAACAGAGGCTATGAAGT----CCT---CGCAAGGTGCAGTCCGCAAT-TGATG---AGAT-----GT---CACAACANGACAG--ACAGTCCCTCCTNCAATATAAAGAAAAACC-TCAGA--A---T-G--A-CAGAGTTCCACTGGTCACTAC-T--TACCACCCCGTCCTNAA-G-GAC-------CTC-------AACANTAT-TCTGAGAAAGC--ATNTNCCCATT-----CTNCA---TAC-CAATAAAC---GAATGGCT--GAT-GTTT-TCA-AGGA---A---C------C----------T-------CC----------G---------T------T-----C--AGAC-GCC-CCAGAAA-CC--TGAAG----GACATG-GTGGTG--AGGACCAGATTGG--ATA-ACCC-TTTAC--CTAATGG---AGGTTTCAAAAC--------AT--GC-TCAGA--CCT-CA--A-----G-ATG-TC-AA--TC--G-TGC--AAAT---AT-----AGC-TC----AGAC--ACT-----GAGAGCTTT--A-GCA-GTCC--TG-T-C--ACAGGTCG-C-AGTT-AT--------------A---AAA-TATTG-G--------------G--G-AACTACG---TCCCG-TAA-AAC---CGAC---AAC-T-G-CAT-C----------TA-C--CTC----ATCAGC-TG-T--AANGTC-TG-CCAGAAA-CA--GTA--CG-T----------GG-GNGA-AA--------CTAC-GG--ACC---TNCGCAGAA-GGGT-CAA--CAA-CCACC--GGTCCN-CC-G-T-C-AAGACCAA-AA-A---G-GA-T--CC-----G---C-CG-GTA-GC-TACGCA--TTTCAA------T---G-GTAGCAATCA-CCG-AT-GG---GA---------------GG-ACA--TGACAA--TA-----NTAGTTATTGATCAT
Reference ( family-868 ) : GCTCACCGACAGCTCTCG--GACGAACGCTTT--TAT-A--AA-AAGTTACAGTCTGACCCT-ACCAAAGAGTTCTCCGCCAAGATCA--C-GAAACCCTTCAGGAAATGT-ACG--A--AGGGCGA----AATC-GGTGACAA-CGTCTTCGAAAC---GCTTC-GTC---CCAAC-GACTGTAGACCGGGACAATTTTATNTACTGCCT-AAAATCCAC-AAG-A-AAGACATGCCNGGCCGCCCT-ATAGT-C-G--NGCCATCGG-AC-------ACCCCACGGAGAAAATCTCNGAATTCATTGACCT-ACATCTCCGC----CCGCA-----TGTAANAGANCTACCGTCATA-CTTGAAGGACACCACT-GATTACCTAAACGAAA-CCCCA-CNTCG-GACCTACCTGACNACACCCTTCTTGTGACNATGGACGTNACTTCACTNTACACTAA-CGTT--CCACACGACGAGG-ACAT-CGA-GGCNTGCAGGGAGGTT-TGGAAT-ANA--------A--G-----CC--TCAAAA--TC--CTTCCACTGAATCACTCGTCCAGCTCCT-----T-GAACATGTCCTCA-AGTTCAA--TA--ACTTCATGTTCGA---CGGCGAACACTACCTGCAAAT-A-GTG-GCACN-G--CTATGGGAACCAAA-ATGGCNCC-NT-CNTACGCCAACA-TCTTTATGGGAA--GACTC-GAACGTAACCT-CCT---GC--A----TCGNT--CACCNTTTAAACC-CCTTA----GTTG-GCTACGTTTC-AT--G-ATGACATTGAGATG--AAGTG----GGC---TGACGG-TCGCGAAAGCCNCGACGACTTTATC----GCGNTTGCGAACTCTTTCCAC-NATTCCATC-AAGTTCACNG--TG-GANATTTCC-GCATCCAG-GAACGTNTTTTTGGATACCACGTC-CACACTTAC-GAACGGAGAAATCGAGTTCAGCCTCCAT-A-CNAAA-CCCACCGACTCTCATT--TGTACCNTAT-GCCATCC----AGCTGTC-----ATCCGCCCCAT-A-CNTTCA------------AAGGTGT-GCC---------GCC---C--G-CGTCC------GCCGCATCTGCTCTATT-CCTACCACT-----TTCCA-AGAGACA-AG---GACAC-ATCCT-N-AAAGTCCATCTGCGCAAACAGAGGCTATGAAGT----CCT---CGCAAGGTGCAGTCCGCAAT-TGATG---AGAT-----GT---CACAACANGACAG--ACAGTCCCTCCTNCAATATAAAGAAAAACC-TCAGA--A---T-G--A-CAGAGTTCCACTGGTCACTAC-T--TACCACCCCGTCCTNAA-G-GAC-------CTC-------AACANTAT-TCTGAGAAAGC--ATNTNCCCATT-----CTNCA---TAC-CAATAAAC---GAATGGCT--GAT-GTTT-TCA-AGGA---A---C------C----------T-------CC----------G---------T------T-----C--AGAC-GCC-CCAGAAA-CC--TGAAG----GACATG-GTGGTG--AGGACCAGACTGG--ATA-ACCC-TTTAC--CTAATGG---AGGTTTCAAAAC--------AT--GC-TCAGA--CCT-CA--A-----G-ATG-TC-AA--TC--G-TGC--AAAT---AT-----AGC-TC----AGAC--ACT-----GAGAGCTTT--A-GCA-GTCC--TG-T-C--ACAGGTCG-C-AGTT-AT--------------A---AAA-TATTG-G--------------G--G-AACTACG---TCCCG-TAA-AAC---CGAC---AAC-T-G-CAT-C----------TA-C--CTC----ATCAGC-TG-T--AANGTC-TG-CCAGAAA-CA--GTA--CG-T----------GG-GNGA-AA--------CTAC-GG--ACC---TNCGCAGAA-GGGT-CAA--CAA-CCACC--GGTCCN-CC-G-T-C-AAGACCAA-AA-A---G-GA-T--CC-----G---C-CG-GTA-GC-TACGCA--TTTCAA------T---G-GTAGCAATCA-CCG-AT-GG---GA---------------GG-ACA--TGACAA--TA-----NTAGTTATTGATCAT
gi|1 : GCTCACAGACAGTTGTCA--GACGAACGTTTT--TAC-A--AA-AAGTTGCAGTCTGACCCC-ACTAAAAA-TTCTCCATCAAGATCA--C-GAGACCCTTCAGAAAATGC-ATG--A--AGAGTGA----AATC-GGTGATAA-TGTACTTGGAGC---GCTTT-GTC---CCAAC-GACTGTAGACCTGGACAATTCTACTTACTGCCT-AAAAT-TAC-AAG-A-AAGACATGCCAGGCCGTCCT-ATTGT-CAG--TGCCATCGG-AC-------ACCCCACGGAGAAAATCTCTGAATTCATTGATTT-ACATCTCCGT----CAGCA-----CGTAGAAGATTTACCGTCATA-CTTGAAGGATACGACT-GATTACCTAAATAAAA-CCCCA-CATCG-GGCCTGCCAGACCATACCCTCCTTGTGACTATGGATGTGACGTCACTCTACACCAA-CAAT--CCACATGATGAGG-GTAT-TGA-GGCCTGTAAAGAGGTT-TGGAAT-CAA--------AGGG-----TCAGTCAACA--TC--CCTCAACTGAGTCACTCATTCGGCTTCT-----T-GAACATGTCCTCA-AGTGTAA--TA--ACTTCATGTTTGA---CGGTGAACACTACCTGCAAAC-A-GTG-GCACT-G--CTATGGGAACAAAA-ATGGCACC-TT-CCTATGCCAACA-TCTTTATGGGAA--GATTG-GAACGTAGACT-CCT---GC--A----TCACT--CACTAGTTAAACC-TCTCA----GTTG-GCTACGTTTC-ATA-G-ATGACATCGAGATG--AAGTG----GGT---TGATGG-TCGTGAAAGCCTCAACGAGTTTATT----AAGATGGCAAACTCTTTCCAC-GATTCCATC-AAGTTT-CTG--TG-GATATTTCA-ACATCCAG-GAATACGTTTTTGGATA-CACAGC-AACACTTAA-GGACGGAGAAATCGAGTTTAATCTTCAC-A-CGAAA-CCCACAGATTCTCATT--TGTACCTTAT-GCCATCC----AGCTGTC-----ATCCACCCCAT-A-CTTTCA------------AAGGTGT-GCC---------ACC---T--G-CATCC------GCCGCATCTGCTCTTTT-CATACTAGT-----TTCCT-AGA-ACA-AG---GAAAT-ATCCT-C-AAAGTCCATCTA-ACCAGCAGAGGATAT--AAT----CCT---TGTAAAGTACAGTCCGTAAT-TGATG---AGAT-----GT---CACAACAGGACCG--ACAATCCCTCCTCCAATATCAAGTGAAACC--CAGG--A---TCA--A-CAGGGTCCCACTAGTCACTAC-T--TACCACCCTGCCCTTAG-G-GAT-------CTC-------AATAGTAT-CATAAGAAAAC--ATTTGTCTATC-----CTGTA---TGC-CAACAAAC---GTATGGCG--GAT-GTTT-TCA-AGGA---------------------------------TC----------G---------T------T-----C--CGGC-GCC-CCAGAAA-CC--TGAAG----GATATG-GTGGTA--AGGACCAGGCTGG--ATA-ACCC-TCTAC--CTAATGG---AGGTTTCAAAAC--------AT--GC-TCAGA--TCT-TA--A-----A-ATG-TC-AA--TT--A-TGC--AAAC---AT-----AGC-TT----AGAC--ACT-----GAGACTTCC--A-GAA-GTCC--TG-T-G--ACAGATCG-C-AGTT-AT--------------A---AAA-TATTG-G--------------G--G-AACTACA----CCTG-CAA-AAC---CAAT---AAC-T-G-CAT-C----------TA-T--CTC----ATCAAT-TG-T--GATGTC-TG-CCAGAAA-CA--GGA--CG-T----------TG-GAGA-AA--------CTAC-AG--ACC---TTCGTAAAA-GGGT-AAA--CAA-TCACC--GGTCCT-CC-G-T-T-AGGACCAA-AA-A---G-GA-C--TT-----G---C-CG-GTA-TC-TACGCA--TTTCAA------T---G-GTAGCAATCA-CCG-TT-GG---GA---------------GG-ACA--TGACAA--TA-----TTAGTGATTGATCAT
gi|10 : AGGACACCACT-GACTACCTCAATGATA-CTTCTTCTTCA-GACCTGCATGAAGACACTTTGTTGGTTACAATGGACATCACTTCATTGTATACCAA-TATT--CCACACCAGGAGG-GCAT-TGA-GGCATGCAGAGAGGTC-TGGAAA-ACA--------A--GAACCACC--CCTAAA---C--CTTCCACAAAATTATTGGTTCTACTCCT-----T-GAGCATGTCCTTA-AGTTCAA--TA--ACTTTATGTTCAA---TGGTGAACACTATCTACAAAT-AAGTG-GCACT-C--CCATGGGCACCAAA-ATGGCTCC-CT-CTTACGCTAACA-TCTTTATGGGTA--AACTT-AAACATAATCT-GCT---AC--A----ACAAG--CACCTGTTAAGTC-GTTCA----GCTG-GTTACGATTC-ATT-G-ATGACATTGAAATG--AAATG----GGC---GAACAG-TCGAAGCAGTCTTGACAACTTCATT----GAACTTGCAAACGCTTTTCAT-ATTTCCATC-AAGTTCACAG--TG-GATATTTCC-GCATCTAG-CAACGTCTTTCTGGA
gi|11 : -CAATAAA----GAATGGCT--GAT-GTTT-TCA-AAGA---G---C------CACACTATGGCT-------GC----------C---------T------T-----T--AGGC-GCC-CACGAAA-CC--TGAAA----GACATG-GTGGTT--CGAACCAAGTTGG--AAA-ATCC-TTTAC--CCAATGG---TGACTTTAAAAC--------CT--AT-TCAGA----TAAA--A-----G-ATGTTT-GA--T---G-TGC--AAAC---AT-----ACT-TC----TAGC--ACC------ACAGTTTT--G-AAA-GCCC--TG-T-C--ACCGGTCG-A-TCTT-AC--------------A---GAA-TATTG-G--------------G--G-AA--ACG---TCCTG-TCG-AAG---TGAC---AAC-T-G-CAT-C----------TA-C--TTG----ATCAGC-TG-C--AAAA---TG-TCAGAAA-CA--ATA--TG-C----------GG-GTGA-GA--------CTGG-CG--ATA---TACGCCGAA-GGA---------------C--GGT-CA-CC-A-T-A-AAAAC--A-AA-A---G-GG-T--CCAAGGAA---C-CC-GTC-GC-CAAGCA--TTTTAA------TCTCG---AGGAA-CA-CTC-AT-GG---GA---------------AG-ACA--TGACGG--TG-----GTGGTTA-TGACCAc
gi|12 : atatatatatgacacgCCT-CGAAAGTC-ATCCG-ACAAACAG--GATATGA--T----CCT---TGCAGGGCACAGTCCGCAGT-TGATA---AGAT-----GC---CACAACA-GACCG--ACAGTCCCTCCTCCAGTACACAGAAAACCC-TTAAA--A---T-G--A-CAGAGTTCCGCTAATCACTAC-T--TACCATCCCGCCCTCAA-G-A---------CTC-------CACATTAT-TCTGAGAAAGT--ATCTACCCATT-----CTGCA---AGC-CAATAAAC---GAATGGCT--GAT-GTTT-TCA-AGTA---A---C------C----------T-------CC----------AATGACATGCT------T-----C--AGAC-GCC-CTAGAAA-CT--TGAAG----GACATG-GTAATA--AGGACCAGACTGG--ATA-ACCT-TTTAC--CTAATGG---AGGTTTCAAAAC--------TT--GC-ACTGG--CCT-C---A-----G-ATG-TC-AA--CT--A-TGC--AAAT---AT-----AGT-TC----AGAC--ACT-----CAGAGCTTT--A-GCA-GTCC--TG-C-C--ACAGGTCG-T-AGTT-AT--------------A---GAA-TATTG-G--------------G--A-AACT-TT---TCCTG-CAA-AACTATTAAC---AA--T-GTCAT-C----------TA-T--CTC----Agacatccactggacggatgcagacagaaaaggcaagaagttttggatgcataggctgtaaaag
gi|13 : TTAAAAGACACAACA-GACTTTC-AAATGTAA-CTCCA-AAGCAAGGCCCACCAGACCACACACTT---------ATAAA--TAAC----CTTGACATTAA-CGTTTTCCATATGACAAAA-ATAT-CAATGGC-TGCAGGGAAGTT-TGAAATGACA--------A--T-----C----CAAAA--TC--CT---AGTAAATCACTCATTCAG--------------------CCTCA----TCAA--CA--ACTTCTTGTCAGA---CAGCAAACAT----------T-A-GTG-GTCTC-G--CTAT-GAAACCAAT-ATGGCACCAAT-TTTA----AACA-T----------A--AACTC-AAACGTAGCCC-ATT---AA--A----CCAAA--CATCATGCAAATC-CCT------GT----CTACTTTTCAAA--G-ATGACATAGAGATA--A---------GCCCATAAGAG-TCG-GAAGG-------------AT---------TTGCAAACTCTTTCCA------CCATC-AAGCTTAAAG--TG-GAAATT------AT-------AC--TCTCTTGGTCACCACTGC-CACATCTACAGAATTTA-AAATCAATTTCAGCCTCCCC-A-CTAAG-TCCACa
gi|14 : ACTTGCAAATCA-GTTCGCATG-G--CTAAGTTAACTAAA-ATGGCAAA-AT-CTTATGCCAACA-TCTGCATG----------------GTAGCAC-CCT---AT-------TTGTT-----------AGCC-----A----GTTG-GCTATGTTTC-A---------CATTGAGATG--AAGTG----A-------ATGA-TCATGAAAAATCCGA-GACTTCGTC----ACGGTTCCGAACTCTTTCCTT-TATTTGATG-AAGTTCACTGCATGTGGCAATTCC-ATCTCCAA-AA---TACTATCGGATACCACAGC-TACACTTAT-AAATGG-GAAACTGAGTTCAATCCCCATAA-CTCAA-CCCACCGACTCTCATTAATATACCATAT---CATCC----AACCATCCTAAAATGTGTCCTAA-G-CTTT--------------------T-GTC---------GTC---C--A-AATTT------GCTGCATCTTCTCTATTACCCACCACT-----TTCCA-AGAGGCA-AG---GACAC-TTCCTAA-AAAGTCaa
gi|15 : ---AT-----AGC-TC----AGAC--ACT-----GAGAACTAC--A-ACA-GTCA--CA-T-T--ACGGGTCA-C-AGTT-AC--------------A---CAA-TATTG-G--------------G--G-AATT--T---TCCCG-TAA-AAT---TCAT---AAT-T-G-CAT-T----------TA-T--CTC----AACAGC-TG-T--AATGTC-TG-CCAGATA-CAATGTATTCA-TATGGGGGGGGGG-GTGT-AA--------CAAC-AG--ACC---TTC-CAAAACAGGC-TAA--CAA-CCACC--GGTCCG-CT-G-T-C-GAAACCGA-GA-A---A-GG-T--TT-----G---T-CA-GTA-GC-TACCCA---TTCAA------T---G-ACAGTAATAT-CCG-AT-TG---GA---------------GG-CCG--TGACAA--TA-----ATGGCTAT
gi|16 : GCTCATCGACAACTCTCA--GACGAACGCTTT--TAT-A--AA-AAGTTATAGTTTGACCCT-ACCAAAGAGTTCTCTCCTAAGATAAT-C-AAAACCCTTCATGAAATGT-ACA--ACAAGGGTGA----AATC-GGTGACAA-CGTTTTCGACAT---GCTTT-GTC---CTAAC-GACTGCAGACCAGGACAATTTTATATACTGCCT-AAAATCCAC-AAA-G-TAGACATGCCACGCCGTCTT-ATAGTCC-G--AGCCATTGG-ACCGTCATGATCCCAAGGAGAAAATCTCTGAATTCATTGatattgaacatgacaaaagttttcagatacccagagaaaacaaaaggaaatgattagggatgcaaatattgaagtaattttatcagcaagatctaaacatgcccactaacttcacccggatgaata
gi|17 : agataatctcaccaaagaagaaagattggcgttgcaaacattgatattgtcattaaaaggacagacaaaggttctacttaagttgtcttggacaaagacgggtacttgacggagGCTC-TCG-CAACTCTCAATGACGAACGCTTT--TATTA--AATAAGTTATAGTTTGACCTA-ACCAAAGAGTTCTTCTCTAAGATAAT-C-AAAACCCTTCATGAAATGT-ACAACA--AGGGTGA----AATC-GGTGACAA-CGTTTTCGACAT---GCTT---TC---CT-AC-GACTGCAGACCAGGACAATTTTATATACTGCCTAAAAATCCACAAAG-T-AGAACATGCACGGCCGTCTTAATAGTCC-G--AG-CATTGGAACGTCATG-ATCCCAAGGAG-AAATCTCTGAATTCATT
gi|19 : gagataatctcaccaaagaagaaagattggcgttgcaacatttgatattgcattaaaaggaaacaaagttctaacttaagtgtcttggacagaagacgggtacttgacggaTCCGCAAC-TGATG---AAAT-----GT---CGCAATAAGGCCG--ACAGCCCCTTCTCCATTTTAAAGAAAAACC-GCA-A--A---T-G--A-CAGGGTTTTGCTTGTCACTAA-C--TATCA-CCGGTCTTGAA-G-ATC-------CTC-------AGCTGTAT-TCTGTAAAAGC--ATCAACCCATT-----CTGCA---TAC-CAGTAAAT---GAATGGCT--GAT-G-TT-TCA-GGGA---A---T------C----------C-------CC--------------------T------A-----T--AG-C-ACC-AGAGAAA-CC--CCAAG----GATACG-ATAGTA--AGGACAACACTAT--ATA-ACCCTTTTAC--CTAATGG---------TAAAAC--------AT--AC-TCAGA--CTT-CA--GTACATGTATG-TC-AA--TT--G-CAC--AAAT---ACATGTAAGC-TC----AGAC--ACA-----GATAGCTTT--A-GCA-GTCC--TG-T-TCGACAGGTCG-TGAGCT-AT--------------A---AGA-TATTG-G--------------G--A-AA
gi|2 : GCGCACAGACAGCTCT-G--GATGAACGGTTT--TAC-ACTAA-AA----C--TCCGACCCT-ACCAAAACGTTTTCCGCTACTATCA--CCGACACTCTTGAGCAAATGTTACA--A--AAAACGAGGAAAATT-GGTAATAA-TGTCTTTGAAACAGTGCTGC-CTC---TCAAC----TGTACACTGGG-CAATTTTATCTCCTGCCT-AAA-TCCAC-AA--A-AAGGCATTCCTG-CCGCCC----------------CATTGG--C-------ACCCCACGGAGAAAATCTCAGAATTTATTGACCT-ACACCTCTGC----CCATA-----TGTTGTAAAACTACCATCATA-CTTGAAGGACACCACT-GATTACCTTAACAAAAACCCCT-CTTCG-AACCTACCTGACAATACCCTTCTCGTGACCATGGATGTGACTTCGCTTTACACAAAACATC--CCCCACGATGAAG-ACAT-TGA-AACCTGCTGGGAGGTT--GGGAT-AAA--------A--GGAT--CC--TGAAAACATC--CTTCCACAGAATCATT-GTCAAGCTCCT-----T-GAACATGTCCTCA-AACTAAA--TA--ACTTCATGTTCCA---AGGCAACCATTACTTACAAGTTA-GGG-GCACAAG--CAATGGGAAACGAAGATGGATCC-TTTCATATGCCAACA-TTTTTATGGGAA--GACTT-GAACGCAACTT-ACTCAGGC--A-------AT--CGCCCTTTAAACC-CCATA----ATTG---TGTGTTTC-ATTTG-ATGACATTGA-ATG--AAATGAAATGGC---GGAGGG-CCGAGATA--CTTGACAACTTTATC----TCCTTTACCAACTCATTTCAC-CATTCCATTTAAATTTACAG--TG-GAAATTTCCAGC-TCCAA-GAACATATTCTTGGATACCGCTTC-CACTCTCTT-GGATGGTGAAATTGAATTCAGCTTCCAT-A-CCAAAACCCGCTGACTCACATT--TGTAC-TTATTGCCTTGA----AGCTGTC-----ACCCACCTCAT-A-CCTTCA------------AAGGAGT-ACCTAAGGTTTAGCTACAC--G-AGTTC------GTC-TATCTG-----TT-CCTCTGGCTCGGAATTCGA-AAAAACA-AATCAAACTCTATCTT-G-AAAAGCCACCTTTGTAAA-AGGGGCTGTAAAGTTGTTCCTGTTCACAA----CAG----CAAT-TGACG---AT-T-----GTC--CAGAACAAGtct
gi|2 : gacaaacttaagcatagaagaagagcttagccttataagagcttaaaaaaaaactcggatgacattgctatcaaaaaggcagacaaggtcaacagtggttgtattagacaagacagcatacatagcggaaCCCGCCCTGAA-G-AAC-------CTC-------AATACCAT-CCTTA--AAGCC-ATTGTCCTAT------CTGTA---TAA-CAAAGAAC---GAATGGCT--AGG-GTCTCTTA-AAGA---C---C------A----------T-------CC----------AATGGCAGCTT------T-----C--AGAC-AAC-CTAGAAT-TT--AAAAG----GATATT-GTAGTT--AGAATTAGGCTGG--ATA-ACCC-ATTAC--CCAACGGGGCGGGTTTTCCCAC--------GT--GC-TCTGA-------AAGA-----G-ATG-TC-----TCCAG-TGC--AAAT---TC-----AG---C----GGGCCAACT-----GA-CGCTTT--caaaactctaaattttcacccgccctgaagaacctcaataccatccttaaagccattgtcctatctgtataacaaagaacgaatggctagggtctcttaaagaccatccaatggcagctttcagacaacctagaatttaaaaggatattgtagttagaattaggctggataacccattacccaacggggcgggttttcccacgtgctctgaaagagatgtctccagtgcaaattcagcgggccaactgacgctttcag
gi|20 : gacaaacttaagcatagaagaagagcttagccttataagagcttaaaaaaaaactcggatgacattgctatcaaaaaggcagacaaggtcaacagtggttgtattagacaagacagcatacatagcggaagcgcacagacagctctggatgaacggttttacactaaaactccgaccctaccaaaacgttttccgctactatcaccgacactcttgagcaaatgttacaaaaaacgaggaaaattggtaataatgtctttgaaacagtgctgcctctcaactgtacactgggcaattttatctcctgcctaaatccacaaaaaggcattcctgccgccccattggcaccccacggagaaaatctcagaatttattgacctacacctctgcccatatgttgtaaaactaccatcatacttgaaggacaccactgattaccttaacaaaaacccctcttcgaacctacctgacaatacccttctcgtgaccatggatgtgacttcgctttacacaaaacatcccccacgatgaagacattgaaacctgctgggaggttgggataaaaggatcctgaaaacatccttccacagaatcattgtcaagctccttgaacatgtcctcaaactaaataacttcatgttccaaggcaaccattacttacaagttaggggcacaagcaatgggaaacgaagatggatcctttcatatgccaacatttttatgggaagacttgaacgcaacttactcaggcaatcgccctttaaaccccataattgtgtgtttcatttgatgacattgaatgaaatgaaatggcggagggccgagatacttgacaactttatctcctttaccaactcatttcaccattccatttaaatttacagtggaaatttccagctccaagaacatattcttggataccgcttccactctcttggatggtgaaattgaattcagcttccataccaaaacccgctgactcacatttgtacttattgccttgaagctgtcacccacctcataccttcaaaggagtacctaaggtttagctacacgagttcgtctatctgttcctctggctcggaattcgaaaaaacaaatcaaactctatcttgaaaagccacctttgtaaaaggggctgtaaagttgttcctgttcacaacagcaattgacgattgtccagaacaagcaaaactctaaattttcaACAG--ACAGGTCCTCTTCCACTATGAAGAAAAACC-TCAAA--A---T-G--A-CAGAGTTCCACTAGTCACTAC-T--AACCGTCCTGTGCTCAA-A-AAC-------CTC-------AACACTGT-TCCAAGAAAAC--ATG--------------TGTA---TGC-CAATAAAT---GAATGGCT--GAT-GTTT-ACA-AGGA---A---C------CCCTATGGCA-T-------CC----------T---------T------T-----T---GAT-GTC-CCAGAGA-CC--AGAAG----GACATG-GCAGTA--AGGGTTAGACTGAATATA-ACCC-TCTAC--CTAATGG---AGGTTTC-ATAT--------AT--------GA--CCT-C---A-----C-ATG-TC-AA--TC--A-TGC--AAAT---AT-----AGC-TC----AGAC--ACTGGCCAGGGAGATTT--A-GCA-GTCT--TG-T-C--AGGGGTTG-C-AGTT-AT--------------A---cag
gi|21 : aaACAG--ACAGGTCCTCTTCCACTATGAAGAAAAACC-TCAAA--A---T-G--A-CAGAGTTCCACTAGTCACTAC-A--TA-----CCGTGCTCAA-G-AAC-------CTC-------AACACTGT-TCC-AGAAA-C--ATGTG-------------------TACTCAATAAAT---GAATGGCT--GAT-GTTT-ACA-AGGA---A---C------CCCTATGGCA-T-------CC----------T---------T------T-----T---GAT-GTC-CCAGAGA-CC--AGAAG----GACATGCGCAGTA--AGGGTTA-ACTGA--ATATAACC-TCTAC--CTAAT-G---AGGTTTC-ATAT--------AT--------GA--CCT-CA--C-----A-GTG-TC-AA--TC--A-TGC--AAAT---AT-----AGC-TC----AGAC--ACTGCCA-GGGAGATTT--A-GCA-GTCT--TG-T-C--A-GGGTTG-C-AGTT-AT--------------A---
gi|23 : a---C-CT-GTT-GC-CAAGCA--TTTCAA------T---C--TAGCAGAAA-CAA-AT-GG---GAAAACATGAGAATGGAGA-ACA--TGACAA--TA-----GTATTTA-TGATCA
gi|24 : gggtcaaaa-AAAACCCATTTGTGCAAA-AGAAGCTATGAAGC----CCC---AACAA--TGCAAGCAGCTAT-TGATG---TGAT-----GT---CAGAACACGACAT--ATTATCCCTACTACAATTTAAAGGTAAATTGTTAGATTA---T-G--AACAGAGACCTAACGGTTGCAAC-G--CACCACCCTGTCTTGAA-A-GAC-------CTA-------AACAATAT-TGTGAGAGAGCATATATTCCCAAT-----CTTCA---TAC-TAACACTA---GAATGG-------------TCA-ATGA---A---C------C----------T-------CC----------gaactcccactggaaaggaataacaaagaaaaaatctggatgcgtagccactccgccctgatggcacgacttccctagaatgaatgtgacttgggtactctagttattactcagtatttacaatttctatttgccatttactttgtgtaaaagcaccatcattagcagtcaatctttccatacttgttctgatttttttttta
gi|25 : aagaacagagcacccgactga-AC-GG---GA---------------GG-ACA--CGAC-A--TA-----GTGGTTATTAATCATcattgcggcctctgctaccgaattcttgggaagaca
gi|27 : ATCA--CTGACACTCT-AAGCAGATGT-ACA--A--ATGACGAGG--AATTTGGTAATAAATGTCTTTGAAAC---ATTGCTGTCTCTCCAA-----TGTAGACCTGGGCAATTTTATCCACTGCCT-AAAATCCAC-AA--A-GAG-TATGCCTGGCCGCCCC-ATAGT---GATGGCCATTGG-AC-------A-CCCACGGAG-AAATCTCAGAATTTATTGACCCAACACCT--GC----CCACAAATGTTGTAACATACCTAC--TCATATCTTGAAGG--ACCACTAGATTACCTAAACAAAA-CCCCA-TCTCC-AACCTACCTGACAAgacctaaattggacagattcctaaagaaagcaaaaggaaaattccggatgcacagacagaagtcgtttgactccgggtgaatcactgactttcccagtatagcagggctaaacctacaaatgtttattattccggaactccatctactcttttgattcataccttcaacactatagccgtatttttcatttcatttttttaaaaatagttttacgcgctagactactttgttacatactagtttacaggaccgtgt
gi|28 : caTTT-TTA-GTGA---A---C------C----------T-------CCCTGTCGT---G---------T------C-----CTTCGAC-GGC-CCAGAAA-TAAATCAAG----GACCTT-ATGGTA----GACCAGACTGG--ATA-ATCC--CTAC--CCAATGG---GGATTTTCCAAC---------T--TC-TCTTA--ACA-CA--C-----G-GTG-CC-TA--CT--C-TGC--AAAT---AT-----ATC-CCCAAAAGAC--A-T-----GAGACATGC--A-G-A-GTCT--GA-C-C--ACAGA--A-A-AAGT-AT--------------A---GCA--ATTG-G--------------G------CCAGGTTTTTCCG-TAATGAC---CAAC---AAC-T-G-TAT-T----------TACC--CTC----ATCAACATGTT--AACGTCGTG-C---AAA-CA--ATA--TGCT----------GG-GGGA-AA--------CCAt
gi|29 : gtGCTCATTGACAGCTTTCG--GACGAACGCTTAAATAT-A--AA-AAGTCACTGCCTGACCCTCGCCACAGAGTTCTAGACCAAGATCAGCC-GAAAAATTCCAAGCATTGT-AC---A--ATGGCGA----GATC-AGTGACAA-CGTT------AC----CTT----------AAC-GCCTGTGGACCAGGATATTTTTATGTACTGCCA-AATGTTCAC-AAACACAAGACATGTTAAACTGTCCT-GTAGT-CGG--TGACTTCGG-GC-------ATCAAACGAGGAGAATTTCTTAATTCATT
gi|3 : tagacaagtactcaacaaattaaaGTTCACTG--TT-GATATTTCC-GCATCCAG-TAACGTATTTTTAGACACTATGTC-CAAGATTGT-TAACGGAAAAGTCGAGNNNNNNNNNNNN-N-NNNNN-NNNNNNNNNNNNNNNN--NNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNAGTTGTC-----ATCCTACTCAT-A-CATTCATAGGAGAAACTAAAGGTTTAGCC---------ACC---A--G-TGTCG------GCCGTATCTGCTCCACT-CCTGC-ACT-----TTATA-AAGAACAGAG---CACCC-ATCTA-G-AAAA-CCATCTGTGCAAG-AGAGGCTATCAAGC----CC----CA-AAAGTGCAAGCAGCTAT-TGATG---AAAT-----GT---CAGAACACGACAG--AGAACCCCTACTACAATACAACAACAAA---TCGGT--A---T-GTGA-CAGAGTCCCAATGGTTACTACGTAGTACCACCCTGTCTTAAA-A-GAC-------TTG-------AACAAAAT-TCTGAAGAGGC--ATATCCCCATT-----CTTCA-------CAATAACCCTAGGAT--CTTCAAG-ATCT-TCA-AAGA---A---C------C----------T-------CCCAT-------GGCGGCC---T------T-----C--AGAC-GCC-CCAGAAA-TC--TGAAA----GACATG-GTGGAG--CGGACTAAATTGG--ACA-ACCC-GATAC--TTAACGA---GGGCTTTATCAC--------AT--GT-TCTGA--TGG-C---A-----G-ATG-CC-TG--AC--G-TGC--AAAC---AC-----AGCATT----AG-C--ATA-----AACATTTTT--A-AGA-GCCC--TG-T-T--ACAGGCCGAC-ACCT-AC--------------C---GAATTCTCA-G--------------G--G-AA--ACA---TCCTG-TCG-CGC---GGAT---GAT-T-G-CAT-C----------TA-C--CTC----ATAAGC-TG-T--AAGGTC-TG-TGATCAA-CA--ATA--CG-T----------GG-GTGA-AA--------CTGG-GG--ACC---TACGTAGGA-GGAT-CAA--TAA-CCACC--GCTCTA-CC-A-T-C-AAAACCAA-A
gi|30 : AGGTACGGCCCGTAACATGATAGGCAGATTCTCTGTAACCACAA-AGGACAGGAACA--CCCTTTTGCAATACAAAGAGAAAA----AGA--A---A-A--A-AAGA------------------------CACCCCGTCCTTAA-G-AGC-------CTT-------AACAGAAT-CCTGAGAGAGA--ATCTGCCGATT-----CTTCA---CAA-TAATGAAA---GAATGGCG--GAT-CTTT-TCA-AGGATCTA---CCAATGGC----------T-------GC----------A---------T------T-----T--AGAC-GGC-CTAGGAA-CT--TATAG----GACATG-GTGGTG--AGAGTCAAATTAG--ATA-ACTC-ATTAC--CCAATGG---TGGCTT
gi|31 : tgtTGGATGTCACGTCATTCTACATT---------------GGCTAG---CATTCAA-AGCGTGCAGCGAAGTTATGGATA-ATA--------A--G-----CTGTCCATAG--CC--CCTCCGCTGAGTCACT--TTCAACTCTT-----A-CAACGTGATCTTATAGTCCAA--TA---CTTCGTG----------GCGATCACTATTTCCAAAT-T-ATC--CACA-ATTCTATGAGAACCAGA-ACATCACT-CT-CAAAAGCCAACA-TATTCATGGAAA---------AGTGAAACCT--CT---GC--T----TC-----------TGCAATC-GCTGA------TG-ACT--GTTTC-ATG-G-ATGATATGGA-ATG--
gi|32 : -TTTAC--CTACCGG---AGGTTTCAAAAC--------ATTGGC-T-ATA--CCT-CA--A-------ATG-TC-AA--TT--GATGC--AAAT---ATT----AGC-AC----AGATT-ACT-----GAGAGCTTT--A-GCA-GTCC--TGTT-C--AC-GGTCG-T-AGTT-ATAAGATTTAGCTATAA---AGA-TATTA-GCTTAAAGATATTGGG--A-AACTTTT---TCCTA-CAA-AAC---TAATATAAACTT-G-CAT-C----------TA-T--CTC----ATCAGT-TG-CAAAATGTC-TGCCCAGAAA-CG--GTA--TG-T----------AG-AGAACAA----------ACAGG--AC------CGCAAAC-AGGT-CGA--CAA-CCACA--GGTCtatgg
gi|33 : CAAAGCGTTTTCTGCCACCATCAG-T-GAAACTCTACA--AAG----ACG--A--GG----A----AATT-GGTGAAAA-TGTCTTTGAAACATTGCTTC-CTC---TCAACTG--TATATACCTGGGCAATTCTATCTACTGCCT-AAAATCCAC-AAG-G-AGGGTGTGCCTGGTCACCC--ATAGTGT-G--TGCCATTGG-GC-------ACCCCACGGAGCAAATCTCAGAATTGATTGACCT-ACATCTCTGCATGTCCATA-----TGCTATGAAGCTACCATCA
gi|34 : gaccaacgattctatggaaggatgtt---T-G--G-CAGAGATTCAATGGTTACTAC-T--TTCCACTCTGTTTTCAA-A-GAC-------ATG-------AACAAAAT-TCTGAAGAGGT--AT--------T-----CCGCA----A---AATAATCTTTGGATGGCC--AGT-ATCT-TCA-AAGA---A---C------C----------T-------CCCAT-------G---------TCATCCTT-----C--AGAC-ACT-CTGGAAA-TC--TGAAA----AACATG-GTGGCG--CGGACTAAATTG
gi|35 : cgatatgT--CCACATCATGAGG-ATAT-AAA-AGCTTGCAGAGACGTA-TG--AT-ATAGTACTTACA--G-----CCATTCATAG--TT--CATCAATTGAGTCACTTACCCTGCTCCTACATGTAGAACATGTTTTGT-AATGCAA--TGTCACTT----TTCAAAAATGGTGATCACTGCCTTCAAATTA-GTG-ACACT-G--CTATGGGAACCAAA-CTGAGACC-CC-CATCTGCCGATA-TGTTttctgttgggagatgactggtgtgcaaacatagcgctaacacaattagttttaagagccctgt
gi|36 : CGTATCCTTA-AGTTTAAAATA--ACTTCATGTTCAA---CGGCAAACACTATCTGCAAATGA-GTG-GCACA-G--CTTTAGGAAC-AAA-ATGACATC---------------A-TCTTTATGGGGACTGTCCCAGAACGTAACC--CCT---AC--A----CTGGT--CACCATGTAAACC-TTGTA----GCTG-GCTATGTTTC-CT--GGATGACATTCAGATATAGAGTG----GGT---TGATGG-TCGTGGAAGCCTTAACGACTTTATC----AAGATAGCAAACTTTcttttgaaaaagtggaatacaaattgctaat
gi|37 : -CCAGAA--CA--GT----G-T----------AATGGGA-AA--------CAAG-AG--ACA---T-CGCAAAC-GGGT-TAA--AAA-CCACC--GGTCTT-AC-G-T-C-CAAACCAA-GA-A---A-AA-T--TT-----G---T-CA-GAA-GC-TAAACC--T-----------------GTAGTAATCG-CCT-GT-GG---GA---------------GG-ACA--TGACAA--GAGCGCTATGATTATTGACCata
gi|38 : acccttgtaaagcccgcatcaatttgaaaaattgattatattaaAA-AA-A---G-GA-T--CT-----C---C-CGTGTA-GCCTACACA--TTTAAAA-----T---G-TTAGCAATCA-CAG-GT-GG---GA---------------GA-ACA--TTACAA--TA-----TT-GTTATGGGTCccaaattattcatataccaaaacaaagcagaaggca
gi|39 : CACT-A--CTGTGCGAACCACA-ATGTCTCC-AT-CATACGCCAATA-CTTTCTTTGGAC--GAC----AACGCAACTTACCT---CT--AATAGTAAAT--CGCCTTTCAAGTG-CCTTACTTGGTTGTGCTAAGTTCC--------CGACATTCAAATA--GGGTG----GAC---TGACA--TC-CAAAA--TAAGACAACTTTATT----TCGTTTACGAACTCGTTTAAC-CATTCAATC-AACTTCACtgacccaagttttggtcagaaatgaggagaaatgcgaaaggaaaaaagccaggatacacaggttgttcaaaagtcatttgaagcttttgtcagggtataatcaaaccacttaagatgaaaacggaactaaaa
gi|4 : aACCCTGCCCTTAGTGCGAC-------CTTCTCT---AATAGTATGTACAAGAAAAC--ATTTGCCTAT--------CCG---TAT-CCACAAAC---G--TAGC---GATAGTTT-TCATA--A---A---C------CGC--------T-------CCTGATGACATCG---------T------TTACCGC--AG-C-GCC-CAGAAAA-CC--TGAAAAAGCGACATT-GTGTAA--AAGACCAGGTTGA--GTA-ACCC-TCTACCTCTAATGG---AGGTTTCAAATC--------AT--GTATCAGA--TCT-CG--A---------G-TC-AAGTTT--A-TGTCAAAATTAAAT-----ACT-CC----AGAA--ACT-----GAGACCTTC--AGGAA-GTCC--TG-TGA--ACA-ATCA-C-AGTTCAT--------------A---AAA-TATTGTG--------------GATG-AACT------TACCGTTAA-AAC---CAA----AAC-TCG-TATAC----------TA-T--CTCT---ATCAA--TG-T--GA-GTC-TG-CCAGAAA-CA--GT---CG-T----------TG-GAGA-AA--------CTAC-GA--ACCTTTTTCGTAAAA-GGGTACAAG-CAA--TACC----TCCT-CC-G-TGC-AGGACCAA-AATATGCG-GACT--CC-----G---CACG-GTA-GC-TACGCAGTTTCCAAGTTC--T---GTGTAGACATCA-CCGAAT-GGGTTGA---------------GGAACATGTGACAACGTG-----TTAG-TA-TGATCAT
gi|40 : tgaattgtacaacggaccgacaatcccctcacttccatatattcaaatttgcacttctccaccttcatatctcgaatatcttgcaactcaactatcgattcccgtgccgATTGCGACG--AAGTG----GGT---TGATGA-GCGTAAAATCCACAATGACTTTATC----GCAAGTGTGAGCTATTTCGAC-TATTCCATT-CTGTCCTCTG--AG-GAAATTTTC-AACTTTAG-GAATATTCTATGGGATACCACATT-CGCACTTAC-AAACGGGGA-----------GCCTTCA------------CATCGAC-ATCATT--TGTAC-GTAT-GCCATTC----ACCTTTC-----ATCCACCCgtacctactctggtcaactattcaaagaaaaaagaagagaatttctggatgaccaggttgaagtcattcgagcctcagtgtcaatccacaaatctaagctactttcccagtagatgaacacgggttagac
gi|41 : --CCATGGACACCAAA-ATGACTCC-AA-GCTACGCCAACATTTTTTATGGG-A--GACCT-GAATACAACCT-A-----GT--A----ACGTTGGCACAAAGAAAACCTTTTTA----GATG-ATTTCTATTC-AT-----TGGCATTTGGATG--AAATG----GG----TGTCAACTCGGGGAAACCTTGGCAACTTTATt
gi|42 : CACT-A--CTGTGCGAACCACA-ATGTCTCC-AT-CATACGCCAATACTCTTT---GGAC--GAC----AACGCAACTTACCT----CTAA----TAGTA--AATCCTTTCAAGT-CCTTACTG-GTTGTGCTAAGTCCC-G-------GACATTCAAATA--GGGTG----GAC---TGACA--TC-CAAAA--TAAGACAACTTTATT----TCGTTTACGAACTCGTTTAAC-CATTCAATC-AACTTCACttaaatagcccgtgcatttcatactctcattaagtttcac
gi|43 : A--TC--CTTCCATAGAATCGTTGGTCAAGCTCCT-----T-GAACATGTCCCCA-ACCTCAA--CA--ACTTCATGTTCAA---TGGCGAACATTATTTAGAAGTAA-GTG-GCACA-T--CTACGGGAACGAAG-TTGGTTCC-AT-CGTATGCCAATA-TTTTCATGGGAA--GACTT-GAACGAAACAT-GCT---TA--G----ACAAT--CACCCTGTAAGCC-CCTTA----GTTG-
gi|44 : GCTCACCAACAGCTCTTG--GACGAACGCTTT--TAT-A--AA-A---------------CT-ACCAAAGTGTTCTCTACCAAGATCAC-C-GAAACGCTCCAGG--ATAT-AC---A--AGGGTGA----GATC-GGTGACAA-CGTTTTCGAAGT---GCTTT-GTA---TTTAC-GACTGTTGACCGGGACA
gi|45 : tttactttattattatcattataaaggcagagaaagtctctaacataaAGTTCATGG--TT-GATATTCCC-GCATCCAG-TGGCGTCTATTTAGATACTACGTCGAATAC-TGT-TAACGGAAATGTCGAGTTCAAACGCCAT-A-CCAAA-GCAATTAACTCCCATT--TATATCCTGT-GCCATCT----AGCTGTC-----ATCAG-CTCAT-ATCGTTCA------------TAGGAGT-AC
gi|47 : CC---------TCC---C--G-AATCC------TCCGCATTTGATCTAAC-GCTACTACT-----TTCCATAG---CA-AG---GACAA-ATCGT-C-AAAATTCATTT-CACAAACACAGGATATGA--T----CAT---TGCAAGGTACAGTCCGCAAT-TGATG---AGAT-----GT---CACGGCATAACCG--ACAG------------TACAAAGAAAAACC-TCAGA--A---G-T--A-CAGGGTTCCACCAGTAACTAT-T--TAttattttattagccactagagtccgtcatata
gi|48 : TCTTGTCAGAATAGACGTTAATTT-CTGTACACTAG-CGTC--CTGCAAGATGACC-ACAT-CGA-GGCATTTAGGGAAGTT-TAGAAG-AGA--------A--AT----TT--TCTAAA--TCATCTTCCACTGAATTGTTGGTAAAGCTCCT-----T-GGACATGTCCTCA-AACTTAA---------TCA---TCAA---CAGTGAGGACTACTTGC
gi|5 : A--CG-T----------TG-GAGA-AAA-------CTAC-AG--ACC---TTCGTAAAA-GGGT-CAAAACAATCCAC---GGTCCTTCC-G-T-CCAGGACCAA-AA-A---G-GA-T---T-----G---C-CG-TTATGC-TACGCA--TTTCAA------T---G-GTAGCAATCATCCG-ATCGG---GA---------------GG-ACA--TGACAA--TA-----ATAGTGATTGATCAT
gi|50 : cCAATCCCTTTTGCAATATAAAGAAAGATC----GA--ATGGT-G--A-CAGAGTCCCAATGGTCACCAC-A--TACCACCCGGTTTTGAA-G-GAT-------CTC-------AACACTAT-TCTAAAGAAAC--ATATCCCCATT-----CTTCA---TGC-CAATAAAA---GAATGACT--GAT-GTTT-TCA-AAGA---G---C------C----------A-------CC----------gaccctagtttggtctgacattcaaagaaaaaagataggagaagttctggatgacaggttgacgtcattcgagcctcatgcatcaacaaatctgctgacttcaccaggagtgaacacggggttagaagcgattcaccggaaatcgaacactgatttacatgtaagactccccggcctgatcagtcccgaacatcctctattagattcaatcttcacaatgtatacttctcatgtgataaatttttttttttttctttctctttctatcttaaaaaaattttttttttttctcacggtctctttctctcgaaattaattgttttaattaaatctgatccacattgtgtataaattcagtattactttagaacttgacttaatagaatattcccgggtatgaactatccaatatatacctcctaattcgaatagtaagtcgttgcattattgtggatcagctaatggacgagtagggcgtatcctcattcgttccatatctaacattagatttgcaagccattaactcgaataccatgtgatttatatgtaatacggttgttacgttggagaccgatatatt
gi|52 : TAGCCT-CCT---AC--A----TTATT--CACCATTTAAACC-TCT---------------CATTT----------GACATTCAAATG--AAGAA----CAA---TGACAA-TCATGAAAGATGAAACAACTTTATATAAAGAGAAAACAAACTCTTCCCACTGGTTCAATC-AAGATCACTG--T--GAAATTACA-ACCTCTAGAGAAtatggc
gi|53 : CC--TG-T-C--ACAGACCG------------------------------A-CACTA-C--------------C--G-AACT-------CTCG-CA----C---GGAT---GAT-T-G-CAT-T----------TA-C--CTC----ATATGC-TG-T--AACGCC-TG-TGATCAA-CA--ATA--CG-T----------GG-GTGA-AA--------CTAG-GG--ACC---TACGCAGGA-GGAT-CAA--TAA-CCACCTAAATTAA-CCAG-T-C--GGACCAA-A
gi|54 : cGTTCAATC-CCAT-AACTCAA-CCCACCGACTCTTATA--TATACCATAT-GCCATCC----AAC----------------CCATGA-CT---A------------AATGTGT-GCCTAA------GCT---TTTGTCGTCCAAATTTGCTGCATCTTCTCTATT-CCCACCACT-----TTCCA-AGAGGCA-AG---GACAC-TTCCT-A-AAAgcacccg
gi|58 : TT-AT--------------A---AAA-TATTG-G--------------G--CCAACT-C----TCGAG-TAA-AAT---CAAT---AAT-T-G-CTT-A----------TA-C--CTCATTGATCACC-TG-T--AAagt
gi|59 : actacaggcaaaacAT-ACTGA-AAAGC--ATGCTCCCATT-----CTTCA---TAC-TAAC--------------------------TCA-TGGA---G---C------C----------T-------CCCATGGCT---G---------T------TTT---C--AGAC-GTT-CAAGAAA-CC--TTAGA----GACATG-GTGGTGCTAG--CCAAATTGG--Aacaatgtaacttacaatacgtgtgtgtgttaacgtggggggggggg
gi|6 : cttgaaatattcaattagaGAC--ACT-----G-----TTC--A-GCAAGCCC--GG-T-GG-ACAGGACA-G-AGCT-AC--------------A---AAA-TTTTG-G--------------G--A-GTCTATG---TCCTG-CCG-TAC---TGAC---AAC-T-G-CATAC----------TA-CACTTC----ATCAGT-TG-T--AAGAA---A-CCAAAAAGCA--GTA--CG-T----------AG-GTGG-AA----------AC-GGTGACC---TCCGAAGAA-GAGT-CAA--CAA-TCACC--GGTCCA-CT-ACT-T-AAGACC-A-AA-C---G-GA-TCACC-----GAACC-CG-TTG-GG-GA-ACA--TTTCAA------C---A-CTGAGGGTCA-CAA-AT-GG---GA---------------AG-ACA--TGACAG--C------GTAGTTATTGACCA
gi|60 : -TCTGAAGAAGC--ATTTTCCCACT-----CTTCACATTAC-CTCTA------GAATGGCC---ATGGTCT-TCA-AAGA---A---C------CA---------T-------CC----------ATGGTGGCT-T------T-----C--AGAC-GCC-CAGGAAA-TC--TGAAA----AACGTcaaccctaactggagtgactctgaaagaaaggaaccatagagaagattgctggtagtgcagcaggttactctcaaatagtacatctcttacggactgtcattgtcttcctccaaatggcacctcgaatgaatgaaaagtctctcatgaaatatggaacgttgcttgcccagaccaacgccggatactggatgcgttgagtggtggaaagcgagacgaaatgagcgtcgacccacagactttaactcatcgcctactcctcttcacaacctatactcggagtaaatttcattgatttct
gi|61 : gatttgaaacaaaaaa--ATA-ACCC-TCTAT--CTAATGG---AGGCTTCAAAAC--------AT--GC-TCAGA--CCT-CA--------G-ATG-TC-AA--TT--A-TGC--AATT---AT-----AGC-CC----AGAC--ACT-----GAGAGTTTT--A-GCA-GACC--TG-T-C--ACAGGTCG-T-A
gi|63 : T-GTTT-TCA-AAGA---ATTCC------C----------TATGACATCC--------------------T------G-----C--AGAC-ACC-CCAGAAA-CC--CAAAG----GACATG-GCAGTA--AGGACTATATTGG--ATA-ACGT-TTTAC--TCATTGG---AG
gi|66 : gCTTGTGACCATGG-TGTTACTTCACTA-ACAT------TT--CAAAATGAAGAGGTTTAT-CAA-GGCTTATAGAGAGGTT-
gi|67 : c---TTCCG-TAATGAC---CAAC---AAC-T-G-TAT-T----------TACC--CTC----ATCAACATGTT--AACGTCGTG-C
gi|68 : ttgggccaggtttACGTG-GCGTTG--AGAGCCAAATTAG---TA-ACAT-ATTAC--CTATTGG---TGGTTTaa
gi|69 : T-ACATCTCCGT----CAGCA-----TGTAAAAGCTTTACCGTCATA-CCTGt
gi|7 : attGCAATCA-CCG-AT-GG---GA---------------GG-ACA--TGACAA--TA-----CTAGTGATTGATCAT
gi|70 : --CTAATGG---AGGTTTCAAAAC--------AT--GC-TCAGA--TCT-CA--gaccctagttggtgtgctactcaaagaaaaaggaaggagaagttctggatgcacaggttgaagtcatttgagcctcgtggcatcaacaaatctgctgacttcaccaggatgaacacgggttagaacgttcaccggaatcgaactctccttaaaccttcgcgcctgatcatccactcttagcttcaattttcacaatgtatacttctgtgataaaaaaaattttcttctctttctatctaaaaaaatttttttatttcttctaaattattgttttattagaattgatccattgtgtgatatattcaagtacttgactaaatagaatagttccgggtatgaactatcaattatacctcccaattcgaattagtaagtcgtgcatcattgtggatcagctaattggacgagtagggcgtatcctcattcgttccatatttaacatagatttgcaagccaataacccaataccatgtgatttataatgtaaatacggttttagt
gi|8 : CT--GAG-GTCT-TCT-AGAA---G---C------C----------T-------CCT---------G---------T----------------GGCTGCCGTCATATATCC--T--AG----GA-----GTGCTG--GGATCCAAATTGA--A-A-AATG-TTTGC--CCAGTGG---GGATTTTAAAAC--------TT--AT-TCTGATGCCT-----------G-ATG-TAGAA--TC----------------AC-----AGC-GC----GAAC--ACA-----AATAATTTTTAA-GCG---CCGATG-T-C--AC-----------------------------------------------------------G--G-AAT---G---TCCTG-TCG-CGC---GGAC---AAC-T-G-CAT-C----------TA-T--CTC----ATAAGT-TG-C--AAGGTG-TG-TGAACAA-CA--ATA--CG-A----------AG-GTGA-AATTGAGGGTCTAC-GG--ACA---T--GTAGAA-GGAT-CAA--TGA-CCACC--GGTCTA-CC-A-T-G-AAAACCAATAG-A---GTGA----------------------------AAGCA--TTTCAATCTCGCT---G-GACGCAA--------AT-GG---GG---------------AG-ACA--T
gi|9 : AAGAGAGGCTATAAAGT----C-T---CA-AAAGTGCAATCAGCTAT-TGATG---AGAT-----GT---CACAA--------------TCCATACTACAATGTAAAGAAAAATT-GGTGG--A---T-G--A-CAG-TTTCCA-TGGTAACAAC-G--AACCATCTCATCTTGAA-A-TACATTCTATCTTGAAAGAAAACAAAAT-TCTAAAGAAGT--ATATTCCCATTAATATCTTCA---CTC-TAGTCGCA---GAATGACT--TAG-GTTT-TCA-ACCA---G---C------C----------T-------CC----------AATGGCTATCT------T-----C--GGA--GTA-CCA-AAA-TC--TTA------GACATG-GTGATG--TGAACCAAATTGG----A-ATTC-TTTGC--CCAAAGA---GAGCTTTAAAACTTGTTCTGAT--GC--CAGA--TCT-------------ATG-CC-TG--AC--G-TGC--AAAC---AC-----AGC-GC----GAGC--AC-------AGA----------CA-GCCC--TG-T-G--ACCGG-CA-T-A-TT-CT--------------ACCGAAT-TCTTG-A--------------G--G-A--CACA---TCCTG-TCG-CAC---GGAC---AAC-T-G-CAT-CATTCTGTAATTA-T--TTT----GTAAGT-TG-C--GTGGTC-TG-TGAACAA-AA--TTA--CG-T----------AG-GTGA-AA--------CTGG-GG--TCC---TACGTAatattgactactcagttcactggacgcattcatgaggagagaacgaacgagaaagacccaaatggcacgaacaatctcaatgactttactagaatgaatgtggcctagcttcccctcagtgttgttctgtctgttttacactttctactctcagcactattattagcagtcaatctttccgtggtttcctaatctatctttt
12 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|18 ): GTCCCGAACATCCTCTATTAGATTCAATCTTCACATATATCTTCTTGTGATAAAAATTTTTTTTCTTTTTTTTTTCTTCTCTCTTTCTATCTAAAATTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTCTTTTCTCTCTCGAAATTATTGTTTTATTATAATTGATTCCATTGTGTGATAATTCAAGTTTTATCTTAGAACTTGACTTTAGAATAGTTCCGGGTATGAACTATCAATTATACCTCCTAATTCGAATTAGTAAGTCGTGCATTATTGTGGATCAGCTATTTGGAGAGTAGGGCGTATCCTCATCTGTTCCATATTAACATAGATTTGCAAGCCATTAACTCATACCATGTGATTTAATATGTAATACGGTTTTTAGTT
Unaligned ( gi|22 ): TTCTTTCTCTTGTCTATCTTAAAAATTTTTTTGTTCTCTTTCTCTCGAAATTATGTTTTTATGTATCAGAATGATTCCATGTGTGATTGAACTTCAAGTTATTTACTTAGAACTACTAATTAAATGAAGCTTCCGGGTAAAGCTATCAATCATACCGTCTAATCGAATCAGTAAGTCGCATATTGGATCAGCTAATTGGACGAGTAGGGCGTAAGTCCTCATTGTCGTTCCATATTAACATAGATTGCAGCCATTAACCTCAATACCGATGTATTTTTAAGTAAATACGGTTAGTTGTAGTAACTCAGATATATT
Unaligned ( gi|26 ): TTTTTTTTTTTTTTTTTTTGTTTTTTTTTCTCTTTTCTCTCGAAATTATTGTTTTATTATAATTGATCCATTGTTGTGATAAATTCAAGTTATTACTTTAGAACTTGACTAATAGAATAGTTCCGGGTATGAACTATCAATTATACCTCCTAATTCGAATAGTAAGTCGTGCATTATTGTGGATCAGCTAATTGTGGACGAGTAGGGCGTATTCCTCTCCATATTAAACATAGATTTGCAACCATTAACTCAGTATCCATGTGATTTTAATGTAAATACGGTTTTAGT
Unaligned ( gi|46 ): ACAATCTCAGCAAAGAAGAGAGATCTGCCCTCCAATTGCTAAAAAACCGTGACGACATAGTCATAAAAAACAGACAAAGGTTCCACGGTCGTTGTTCTAGACAAAGATTCGTACTTAGCCGAAGCTAACAGACAGTTGTCTGATGAGCGATTTTACAGAAAGCTGGATTTTGATCCCACTGAGGAGTTTTCAG
Unaligned ( gi|49 ): TAATACATTCCTAATCGAATTAGTAGTTCGTGCATTATTGTGGATCAAGCTAATTGGACGGTAGGGTGATCCTCATTGGGTTCCTATGTAAAGAAGATTTGCAGCTTAACTTCAGATACCATGTGATTATAATGTAAAAACGGTTTATAGTTAGTACCAATATATTT
Unaligned ( gi|51 ): AGTAATCACTTACGGGAGGCGAACACATAAGTGGTTATAATAATGACCTAAATGGACAGATTCCTAAAGAAAGCAAAAGGAAATTCCGGATGCACAAGACGAAGTCGTTTGACTCCGGTGGAATCCTGACTTATCCCCAGTATAGCAGGCTAAACC
Unaligned ( gi|55 ): GAATTAGGTCAATCATTATCACATCGCACATTGCGGACTAGCTCATTGGACGAATAGCACTAGTCTCAATCTCTCCTCAAAAAAACATTTTAATTAGCAATTCAAAATCCAATAAACATGTACTTTATAGTGTTGATACGATTATAGAAT
Unaligned ( gi|56 ): GACATTAAAATAGTGATTACTGACCATTACCCAAGTTGTACATGTTATGCCACGAAAACGCAAAGAAAGGATTCTTATATACGGTTTTTTCAATAGTCATTCGACCCTCAAGGTATCAACAAAACAATTTAGTTCATCAGATTAAACG
Unaligned ( gi|57 ): GACAACCTCAACAAAGAAGAAAGATCGGCATTGCAGAGATTAAAAAACCGGGATGATATTGTAATAAAAAGGCAGACAAGGGTTCTACTGTTGTTGTTATGGACAAAGATAAGTACCTAACAGAGGCTCACAG
Unaligned ( gi|62 ): AACGAAACTTTTAGATACTCAGACTGAAGTCGTTCGACTTTCAAGGTATCGAAACACCTGATGAATTCACTAGGATCAACATGGGCTAAACATTTGTCACC
Unaligned ( gi|64 ): AGTGGTTATTCATTTTGACCTACGCCAAATACGCAAAGAAAGCCAAAGTGAAAATCTTTGCACACAAACCGAAGTCATCTGAT
Unaligned ( gi|65 ): AAAGCAAACCGAAAAGTTCTGGATGCACAAACAGAAGTCGTTCGACTATCTACTGACTTCACTAGGATAAAAA
Alignments
lowQualScore : 111111111111111111111111111111111111111111111111111111111
lowQualScore : 111111 2222 111 1111 111 111 111 1111 11 3333333 3333333 1111 22222 1 1111111111 666666666666666666666 1 1111111 2 1111 11 3333333333333333333 1111111111 33333333 1111111111 11 22222 222222222 111 1111 11111 11 333333333333 5555555555555555555555555555555 11111 111 111 11 1 1111111111111 11111 111 1111 1111 1111111 1111111 11111 000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 111111111 2222222222222 11111111 11111 1111111111111111111 33333333333333333333333333333 111111111111 11111111111 11111111 222222222222222 3333333333333 222222222222222 111111
lowQualScore : 1 1 99 99 6 99 6 111111 6 1 44 8888 2 4 666 5 777 66 0 1 7777 5 5 1 1 777 666 888 0 000 5 0 1 5 0 5 9999 2 1 22 6666666 4 1 88 5555555 4 8 1 8 1 7777 00000 1 1 1 1 1 0 0 8 11 8 99 1 99 1 1 0 1 1 2 3 6 1 4 3 22 9999999999 4 4 777 5 5 5 1 5 77 1 555555555555555555555 66 66 0 3 1 4444444 4 0 777777 4 8888 1 0 2 2 4 4 88888 3 0 1 77 3 2 5 6 3 6666 9999 0 11 3333333333333333333 555 3333333333 88 22 66666666 0 3 44 2222222222 0 88 00 11111 1 000000000 0 77 1 4 1 66 55 1 1 6666 77 5 1 1 55 5 0 000 55 1 0 3 7777 33 5 77 66 5 2222 0 44444 00 666 1 2 444444444444 3 6 1111111111111111111111111111111 2 6 7 66666 6 99 6 111 6 111 3 99 5 0 0 5 5 9999999999999 8 1 3 1 4 777 11111 222 2 6 3 55 77 3 2 1 1111 55 555 3 77 4 0 0 0000 3 1 3 3 0000000 6666666 11 2 0 3 66 3 1 888888 2 6666666 44444 4444 4 2 2 2 6666666 666666 222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 2 2 1 2 33 1 5555 2 555 3 33 2 2 33 6666 0 000000000 55555 2 777 7777777777777 2 44 11111111 33 444 99999 33 5555 55 11111 0 55 33 2 2 33 2 7777 2 2 999 1 2 5555555555555555555 2 2 99999999999999999999999999999 0 2 77 7777 5555 2 2 2 444444444444 7777 8888 6 6 44 4 6 3 2 0 3 44 44 3 55555555555 3 1 3 44444444 33 44 6666 8 0 3 3 88 3 55 55 444 666 3 4 777 4 999999999999999 4 44 4 4 5 55 3333333333333 2 3 333 3 555 000000000000000 3 44 55 000000 0 4
lowQualScore : . . .. .. . .. . ...... . . .. .... . . ... . ... .. . . .... . . . . ... ... ... . ... . . . . . . .... . . .. ....... . . .. ....... . . . . . .... ..... . . . . . . . . .. . .. . .. . . . . . . . . . . . .. .......... . . ... . . . . . .. . ..................... .. .. . . . ....... . . ...... . .... . . . . . . ..... . . . .. . . . . . .... .... . .. ................... ... .......... .. .. ........ . . .. .......... . .. .. ..... . ......... . .. . . . .. .. . . .... .. . . . .. . . ... .. . . . .... .. . .. .. . .... . ..... .. ... . . ............ . . ............................... . . . ..... . .. . ... . ... . .. . . . . . ............. . . . . . ... ..... ... . . . .. .. . . . .... .. ... . .. . . . .... . . . . ....... ....... .. . . . .. . . ...... . ....... ..... .... . . . . ....... ...... ......................................................... . . . . .. . .... . ... . .. . . .. .... . ......... ..... . ... ............. . .. ........ .. ... ..... .. .... .. ..... . .. .. . . .. . .... . . ... . . ................... . . ............................. . . .. .... .... . . . ............ .... .... . . .. . . . . . . .. .. . ........... . . . ........ .. .. .... . . . . .. . .. .. ... ... . . ... . ............... . .. . . . .. ............. . . ... . ... ............... . .. .. ...... . .
lowQualScore : 0 0 22 22 7 22 7 555555 7 6 44 9999 2 1 000 0 444 99 2 1 5555 0 0 1 1 555 000 888 4 555 4 9 0 7 1 7 3333 3 0 99 0000000 3 4 00 0000000 0 4 0 0 4 0000 00000 4 0 4 0 4 0 8 0 88 0 44 0 44 4 0 2 0 5 5 3 3 0 9 6 44 3333333333 2 2 444 0 0 9 1 0 66 0 333333333333333333333 99 99 8 9 1 8888888 4 9 333333 4 7777 1 5 3 2 4 4 11111 3 2 0 66 3 2 0 7 7 1111 8888 3 22 8888888888888888888 555 8888888888 77 55 55555555 4 7 66 5555555555 4 55 66 55555 0 333333333 5 00 1 4 0 11 66 0 0 1111 33 4 0 2 33 7 1 111 66 7 5 2 4444 22 0 99 99 7 1111 1 33333 66 888 0 5 222222222222 7 7 0000000000000000000000000000000 5 7 8 77777 7 55 7 777 7 777 6 88 0 1 7 3 0 1111111111111 5 1 4 1 4 888 11111 222 9 9 0 55 44 5 3 3 0000 00 888 3 99 6 8 2 5555 2 0 1 1 0000000 5555555 22 7 3 1 33 6 9 444444 9 2222222 55555 7777 4 1 1 5 2222222 111111 666666666666666666666666666666666666666666666666666666666 4 4 1 4 22 6 0000 4 777 4 22 5 4 11 1111 7 000000000 55555 9 333 8888888888888 9 00 44444444 99 777 33333 22 7777 99 66666 9 88 44 7 7 44 5 7777 9 1 444 1 5 0000000000000000000 9 9 11111111111111111111111111111 9 9 66 9999 4444 9 9 9 666666666666 6666 9999 2 2 22 2 7 1 5 2 3 66 22 1 44444444444 1 0 1 22222222 88 66 2222 7 1 6 6 66 6 00 00 444 222 6 4 888 4 444444444444444 0 77 0 0 0 55 1111111111111 3 6 666 3 888 888888888888888 3 66 00 111111 9 4
consensus : GCTCACCGACAGCTCTCG--GACGAACGCTTT--TAT-A--AA-AAGTTACAGTCTGACCCT-ACCAAAGAGTTCTCCGCCAAGATCA--C-GAAACCCTTCAGGAAATGT-ACG--A--AGGGCGA----AATC-GGTGACAA-CGTCTTCGAAAC---GCTTC-GTC---CCAAC-GACTGTAGACCGGGACAATTTTATNTACTGCCT-AAAATCCAC-AAG-A-AAGACATGCCNGGCCGCCCT-ATAGT-C-G--NGCCATCGG-AC-------ACCCCACGGAGAAAATCTCNGAATTCATTGACCT-ACATCTCCGC----CCGCA-----TGTAANAGANCTACCGTCATA-CTTGAAGGACACCACT-GATTACCTAAACGAAA-CCCCA-CNTCG-GACCTACCTGACNACACCCTTCTTGTGACNATGGACGTNACTTCACTNTACACTAA-CGTT--CCACACGACGAGG-ACAT-CGA-GGCNTGCAGGGAGGTT-TGGAAT-ANA--------A--G-----CC--TCAAAA--TC--CTTCCACTGAATCACTCGTCCAGCTCCT-----T-GAACATGTCCTCA-AGTTCAA--TA--ACTTCATGTTCGA---CGGCGAACACTACCTGCAAAT-A-GTG-GCACN-G--CTATGGGAACCAAA-ATGGCNCC-NT-CNTACGCCAACA-TCTTTATGGGAA--GACTC-GAACGTAACCT-CCT---GC--A----TCGNT--CACCNTTTAAACC-CCTTA----GTTG-GCTACGTTTC-AT--G-ATGACATTGAGATG--AAGTG----GGC---TGACGG-TCGCGAAAGCCNCGACGACTTTATC----GCGNTTGCGAACTCTTTCCAC-NATTCCATC-AAGTTCACNG--TG-GANATTTCC-GCATCCAG-GAACGTNTTTTTGGATACCACGTC-CACACTTAC-GAACGGAGAAATCGAGTTCAGCCTCCAT-A-CTAAA-CCCACCGACTCTCATT--TGTACCNTAT-GCCATCC----AGCTGTC-----ATCCGCCCCAT-A-CNTTCA------------AAGGTGT-GCC---------GCC---C--G-CGTCC------GCCGCATCTGCTCTATT-CCTACCACT-----TTCCA-AGAGACA-AG---GACAC-ATCCT-N-AAAGTCCATCTGCGCAAACAGAGGCTATGAAGT----CCT---CGCAAGGTGCAGTCCGCAAT-TGATG---AGAT-----GT---CACAACANGACAG--ACAGTCCCTCCTNCAATATAAAGAAAAACC-TCAGA--A---T-G--ACAGAGTTCCACTGGTCACTAC-T--TACCACCCCGTCCTNAA-G-GAC-------CTC-------AACANTAT-TCTGAGAAAGC--ATNTNCCCATT-----CTTCA---TAC-CAATAAAC---GAATGGCT--GAT-GTTT-TCA-AGGA---A---C------C----------T-------CC----------G---------T------T-----C--AGAC-GCC-CCAGAAA-C--CTGAAG----GACATG-GTGGTG--AGGACCAGATTGG--ATA-ACCC-TTTAC--CTAATGG---AGGTTTCAAAAC--------AT--GC-TCAGA--CCT-CA--A-----G-ATG-TC-AA--TC--G-TGC--AAAT---AT-----AGC-TC----AGAC--ACT-----GAGAGCTTT--A-GCA-GTCC--TG-T-C--ACAGGTCG-C-AGTT-AT--------------A---AAA-TATTG-G--------------G--G-AACTACG---TCCCG-TAA-AAC---CGAC---AAC-T-G-CAT-C----------TA-C--CTC----ATCAGC-TG-T--AANGTC-TG-CCAGAAA-CA--GTA--CG-T----------GG-GNGA-AA--------CTAC-GG--ACC---TNCGCAGAA-GGGT-CAA--CAA-CCACC--GGTCCN-CC-G-T-C-AAGACCAA-AA-A---G-GA-T--CC-----G---C-CG-GTA-GC-TACGCA--TTTCAA------T---G-GTAGCAATCA-CCG-AT-GG---GA---------------GG-ACA--TGACAA--TA-----NTAGTTATTGATCAT
Reference ( family-868 ) : GCTCACCGACAGCTCTCG--GACGAACGCTTT--TAT-A--AA-AAGTTACAGTCTGACCCT-ACCAAAGAGTTCTCCGCCAAGATCA--C-GAAACCCTTCAGGAAATGT-ACG--A--AGGGCGA----AATC-GGTGACAA-CGTCTTCGAAAC---GCTTC-GTC---CCAAC-GACTGTAGACCGGGACAATTTTATNTACTGCCT-AAAATCCAC-AAG-A-AAGACATGCCNGGCCGCCCT-ATAGT-C-G--NGCCATCGG-AC-------ACCCCACGGAGAAAATCTCNGAATTCATTGACCT-ACATCTCCGC----CCGCA-----TGTAANAGANCTACCGTCATA-CTTGAAGGACACCACT-GATTACCTAAACGAAA-CCCCA-CNTCG-GACCTACCTGACNACACCCTTCTTGTGACNATGGACGTNACTTCACTNTACACTAA-CGTT--CCACACGACGAGG-ACAT-CGA-GGCNTGCAGGGAGGTT-TGGAAT-ANA--------A--G-----CC--TCAAAA--TC--CTTCCACTGAATCACTCGTCCAGCTCCT-----T-GAACATGTCCTCA-AGTTCAA--TA--ACTTCATGTTCGA---CGGCGAACACTACCTGCAAAT-A-GTG-GCACN-G--CTATGGGAACCAAA-ATGGCNCC-NT-CNTACGCCAACA-TCTTTATGGGAA--GACTC-GAACGTAACCT-CCT---GC--A----TCGNT--CACCNTTTAAACC-CCTTA----GTTG-GCTACGTTTC-AT--G-ATGACATTGAGATG--AAGTG----GGC---TGACGG-TCGCGAAAGCCNCGACGACTTTATC----GCGNTTGCGAACTCTTTCCAC-NATTCCATC-AAGTTCACNG--TG-GANATTTCC-GCATCCAG-GAACGTNTTTTTGGATACCACGTC-CACACTTAC-GAACGGAGAAATCGAGTTCAGCCTCCAT-A-CTAAA-CCCACCGACTCTCATT--TGTACCNTAT-GCCATCC----AGCTGTC-----ATCCGCCCCAT-A-CNTTCA------------AAGGTGT-GCC---------GCC---C--G-CGTCC------GCCGCATCTGCTCTATT-CCTACCACT-----TTCCA-AGAGACA-AG---GACAC-ATCCT-N-AAAGTCCATCTGCGCAAACAGAGGCTATGAAGT----CCT---CGCAAGGTGCAGTCCGCAAT-TGATG---AGAT-----GT---CACAACANGACAG--ACAGTCCCTCCTNCAATATAAAGAAAAACC-TCAGA--A---T-G--ACAGAGTTCCACTGGTCACTAC-T--TACCACCCCGTCCTNAA-G-GAC-------CTC-------AACANTAT-TCTGAGAAAGC--ATNTNCCCATT-----CTNCA---TAC-CAATAAAC---GAATGGCT--GAT-GTTT-TCA-AGGA---A---C------C----------T-------CC----------G---------T------T-----C--AGAC-GCC-CCAGAAA-C--CTGAAG----GACATG-GTGGTG--AGGACCAGATTGG--ATA-ACCC-TTTAC--CTAATGG---AGGTTTCAAAAC--------AT--GC-TCAGA--CCT-CA--A-----G-ATG-TC-AA--TC--G-TGC--AAAT---AT-----AGC-TC----AGAC--ACT-----GAGAGCTTT--A-GCA-GTCC--TG-T-C--ACAGGTCG-C-AGTT-AT--------------A---AAA-TATTG-G--------------G--G-AACTACG---TCCCG-TAA-AAC---CGAC---AAC-T-G-CAT-C----------TA-C--CTC----ATCAGC-TG-T--AANGTC-TG-CCAGAAA-CA--GTA--CG-T----------GG-GNGA-AA--------CTAC-GG--ACC---TNCGCAGAA-GGGT-CAA--CAA-CCACC--GGTCCN-CC-G-T-C-AAGACCAA-AA-A---G-GA-T--CC-----G---C-CG-GTA-GC-TACGCA--TTTCAA------T---G-GTAGCAATCA-CCG-AT-GG---GA---------------GG-ACA--TGACAA--TA-----NTAGTTATTGATCAT
gi|1 : GCTCACAGACAGTTGTCA--GACGAACGTTTT--TAC-A--AA-AAGTTGCAGTCTGACCCC-ACTAAAAA-TTCTCCATCAAGATCA--C-GAGACCCTTCAGAAAATGC-ATG--A--AGAGTGA----AATC-GGTGATAA-TGTACTTGGAGC---GCTTT-GTC---CCAAC-GACTGTAGACCTGGACAATTCTACTTACTGCCT-AAAAT-TAC-AAG-A-AAGACATGCCAGGCCGTCCT-ATTGT-CAG--TGCCATCGG-AC-------ACCCCACGGAGAAAATCTCTGAATTCATTGATTT-ACATCTCCGT----CAGCA-----CGTAGAAGATTTACCGTCATA-CTTGAAGGATACGACT-GATTACCTAAATAAAA-CCCCA-CATCG-GGCCTGCCAGACCATACCCTCCTTGTGACTATGGATGTGACGTCACTCTACACCAA-CAAT--CCACATGATGAGG-GTAT-TGA-GGCCTGTAAAGAGGTT-TGGAAT-CAA--------AGGG-----TCAGTCAACA--TC--CCTCAACTGAGTCACTCATTCGGCTTCT-----T-GAACATGTCCTCA-AGTGTAA--TA--ACTTCATGTTTGA---CGGTGAACACTACCTGCAAAC-A-GTG-GCACT-G--CTATGGGAACAAAA-ATGGCACC-TT-CCTATGCCAACA-TCTTTATGGGAA--GATTG-GAACGTAGACT-CCT---GC--A----TCACT--CACTAGTTAAACC-TCTCA----GTTG-GCTACGTTTC-ATA-G-ATGACATCGAGATG--AAGTG----GGT---TGATGG-TCGTGAAAGCCTCAACGAGTTTATT----AAGATGGCAAACTCTTTCCAC-GATTCCATC-AAGTTT-CTG--TG-GATATTTCA-ACATCCAG-GAATACGTTTTTGGATA-CACAGC-AACACTTAA-GGACGGAGAAATCGAGTTTAATCTTCAC-A-CGAAA-CCCACAGATTCTCATT--TGTACCTTAT-GCCATCC----AGCTGTC-----ATCCACCCCAT-A-CTTTCA------------AAGGTGT-GCC---------ACC---T--G-CATCC------GCCGCATCTGCTCTTTT-CATACTAGT-----TTCCT-AGA-ACA-AG---GAAAT-ATCCT-C-AAAGTCCATCTA-ACCAGCAGAGGATAT--AAT----CCT---TGTAAAGTACAGTCCGTAAT-TGATG---AGAT-----GT---CACAACAGGACCG--ACAATCCCTCCTCCAATATCAAGTGAAACC--CAGG--A---TCA--ACAGGGTCCCACTAGTCACTAC-T--TACCACCCTGCCCTTAG-G-GAT-------CTC-------AATAGTAT-CATAAGAAAAC--ATTTGTCTATC-----CTGTA---TGC-CAACAAAC---GTATGGCG--GAT-GTTT-TCA-AGGA---------------------------------TC----------G---------T------T-----C--CGGC-GCC-CCAGAAA-C--CTGAAG----GATATG-GTGGTA--AGGACCAGGCTGG--ATA-ACCC-TCTAC--CTAATGG---AGGTTTCAAAAC--------AT--GC-TCAGA--TCT-TA--A-----A-ATG-TC-AA--TT--A-TGC--AAAC---AT-----AGC-TT----AGAC--ACT-----GAGACTTCC--A-GAA-GTCC--TG-T-G--ACAGATCG-C-AGTT-AT--------------A---AAA-TATTG-G--------------G--G-AACTACA----CCTG-CAA-AAC---CAAT---AAC-T-G-CAT-C----------TA-T--CTC----ATCAAT-TG-T--GATGTC-TG-CCAGAAA-CA--GGA--CG-T----------TG-GAGA-AA--------CTAC-AG--ACC---TTCGTAAAA-GGGT-AAA--CAA-TCACC--GGTCCT-CC-G-T-T-AGGACCAA-AA-A---G-GA-C--TT-----G---C-CG-GTA-TC-TACGCA--TTTCAA------T---G-GTAGCAATCA-CCG-TT-GG---GA---------------GG-ACA--TGACAA--TA-----TTAGTGATTGATCAT
gi|10 : AGGACACCACT-GACTACCTCAATGATA-CTTCTTCTTCA-GACCTGCATGAAGACACTTTGTTGGTTACAATGGACATCACTTCATTGTATACCAA-TATT--CCACACCAGGAGG-GCAT-TGA-GGCATGCAGAGAGGTC-TGGAAA-ACA--------A--GAACCACC--CCTAAA---C--CTTCCACAAAATTATTGGTTCTACTCCT-----T-GAGCATGTCCTTA-AGTTCAA--TA--ACTTTATGTTCAA---TGGTGAACACTATCTACAAAT-AAGTG-GCACT-C--CCATGGGCACCAAA-ATGGCTCC-CT-CTTACGCTAACA-TCTTTATGGGTA--AACTT-AAACATAATCT-GCT---AC--A----ACAAG--CACCTGTTAAGTC-GTTCA----GCTG-GTTACGATTC-ATT-G-ATGACATTGAAATG--AAATG----GGC---GAACAG-TCGAAGCAGTCTTGACAACTTCATT----GAACTTGCAAACGCTTTTCAT-ATTTCCATC-AAGTTCACAG--TG-GATATTTCC-GCATCTAG-CAACGTCTTTCTGGA
gi|11 : -CAATAAA----GAATGGCT--GAT-GTTT-TCA-AAGA---G---C------CACACTATGGCT-------GC----------C---------T------T-----T--AGGC-GCC-CACGAAA-C--CTGAAA----GACATG-GTGGTT--CGAACCAAGTTGG--AAA-ATCC-TTTAC--CCAATGG---TGACTTTAAAAC--------CT--AT-TCAGA----TAAA--A-----G-ATGTTT-GA--T---G-TGC--AAAC---AT-----ACT-TC----TAGC--ACC------ACAGTTTT--G-AAA-GCCC--TG-T-C--ACCGGTCG-A-TCTT-AC--------------A---GAA-TATTG-G--------------G--G-AA--ACG---TCCTG-TCG-AAG---TGAC---AAC-T-G-CAT-C----------TA-C--TTG----ATCAGC-TG-C--AAAA---TG-TCAGAAA-CA--ATA--TG-C----------GG-GTGA-GA--------CTGG-CG--ATA---TACGCCGAA-GGA---------------C--GGT-CA-CC-A-T-A-AAAAC--A-AA-A---G-GG-T--CCAAGGAA---C-CC-GTC-GC-CAAGCA--TTTTAA------TCTCG---AGGAA-CA-CTC-AT-GG---GA---------------AG-ACA--TGACGG--TG-----GTGGTTA-TGACCAc
gi|12 : atatatatatgacacgCCT-CGAAAGTC-ATCCG-ACAAACAG--GATATGA--T----CCT---TGCAGGGCACAGTCCGCAGT-TGATA---AGAT-----GC---CACAACA-GACCG--ACAGTCCCTCCTCCAGTACACAGAAAACCC-TTAAA--A---T-G--ACAGAGTTCCGCTAATCACTAC-T--TACCATCCCGCCCTCAA-G-A---------CTC-------CACATTAT-TCTGAGAAAGT--ATCTACCCATT-----CTGCA---AGC-CAATAAAC---GAATGGCT--GAT-GTTT-TCA-AGTA---A---C------C----------T-------CC----------AATGACATGCT------T-----C--AGAC-GCC-CTAGAAA-C--TTGAAG----GACATG-GTAATA--AGGACCAGACTGG--ATA-ACCT-TTTAC--CTAATGG---AGGTTTCAAAAC--------TT--GC-ACTGG--CCT-C---A-----G-ATG-TC-AA--CT--A-TGC--AAAT---AT-----AGT-TC----AGAC--ACT-----CAGAGCTTT--A-GCA-GTCC--TG-C-C--ACAGGTCG-T-AGTT-AT--------------A---GAA-TATTG-G--------------G--A-AACT-TT---TCCTG-CAA-AACTATTAAC---AA--T-GTCAT-C----------TA-T--CTC----Agacatccactggacggatgcagacagaaaaggcaagaagttttggatgcataggctgtaaaag
gi|13 : TTAAAAGACACAACA-GACTTTC-AAATGTAA-CTCCA-AAGCAAGGCCCACCAGACCACACACTT---------ATAAA--TAAC----CTTGACATTAA-CGTTTTCCATATGACAAAA-ATAT-CAATGGC-TGCAGGGAAGTT-TGAAATGACA--------A--T-----C----CAAAA--TC--CT---AGTAAATCACTCATTCAG--------------------CCTCA----TCAA--CA--ACTTCTTGTCAGA---CAGCAAACAT----------T-A-GTG-GTCTC-G--CTAT-GAAACCAAT-ATGGCACCAAT-TTTA----AACA-T----------A--AACTC-AAACGTAGCCC-ATT---AA--A----CCAAA--CATCATGCAAATC-CCT------GT----CTACTTTTCAAA--G-ATGACATAGAGATA--A---------GCCCATAAGAG-TCG-GAAGG-------------AT---------TTGCAAACTCTTTCCA------CCATC-AAGCTTAAAG--TG-GAAATT------AT-------AC--TCTCTTGGTCACCACTGC-CACATCTACAGAATTTA-AAATCAATTTCAGCCTCCCC-A-CTAAG-TCCACa
gi|14 : ACTTGCAAATCA-GTTCGCATG-G--CTAAGTTAACTAAA-ATGGCAAA-AT-CTTATGCCAACA-TCTGCATG----------------GTAGCAC-CCT---AT-------TTGTT-----------AGCC-----A----GTTG-GCTATGTTTC-A---------CATTGAGATG--AAGTG----A-------ATGA-TCATGAAAAATCCGA-GACTTCGTC----ACGGTTCCGAACTCTTTCCTT-TATTTGATG-AAGTTCACTGCATGTGGCAATTCC-ATCTCCAA-AA---TACTATCGGATACCACAGC-TACACTTAT-AAATGG-GAAACTGAGTTCAATCCCCATAA-CTCAA-CCCACCGACTCTCATTAATATACCATAT---CATCC----AACCATCCTAAAATGTGTCCTAA-G-CTTT--------------------T-GTC---------GTC---C--A-AATTT------GCTGCATCTTCTCTATTACCCACCACT-----TTCCA-AGAGGCA-AG---GACAC-TTCCTAA-AAAGTCaa
gi|15 : ---AT-----AGC-TC----AGAC--ACT-----GAGAACTAC--A-ACA-GTCA--CA-T-T--ACGGGTCA-C-AGTT-AC--------------A---CAA-TATTG-G--------------G--G-AATT--T---TCCCG-TAA-AAT---TCAT---AAT-T-G-CAT-T----------TA-T--CTC----AACAGC-TG-T--AATGTC-TG-CCAGATA-CAATGTATTCA-TATGGGGGGGGGG-GTGT-AA--------CAAC-AG--ACC---TTC-CAAAACAGGC-TAA--CAA-CCACC--GGTCCG-CT-G-T-C-GAAACCGA-GA-A---A-GG-T--TT-----G---T-CA-GTA-GC-TACCCA---TTCAA------T---G-ACAGTAATAT-CCG-AT-TG---GA---------------GG-CCG--TGACAA--TA-----ATGGCTAT
gi|16 : GCTCATCGACAACTCTCA--GACGAACGCTTT--TAT-A--AA-AAGTTATAGTTTGACCCT-ACCAAAGAGTTCTCTCCTAAGATAAT-C-AAAACCCTTCATGAAATGT-ACA--ACAAGGGTGA----AATC-GGTGACAA-CGTTTTCGACAT---GCTTT-GTC---CTAAC-GACTGCAGACCAGGACAATTTTATATACTGCCT-AAAATCCAC-AAA-G-TAGACATGCCACGCCGTCTT-ATAGTCC-G--AGCCATTGG-ACCGTCATGATCCCAAGGAGAAAATCTCTGAATTCATTGatattgaacatgacaaaagttttcagatacccagagaaaacaaaaggaaatgattagggatgcaaatattgaagtaattttatcagcaagatctaaacatgcccactaacttcacccggatgaata
gi|17 : agataatctcaccaaagaagaaagattggcgttgcaaacattgatattgtcattaaaaggacagacaaaggttctacttaagttgtcttggacaaagacgggtacttgacggagGCTC-TCG-CAACTCTCAATGACGAACGCTTT--TATTA--AATAAGTTATAGTTTGACCTA-ACCAAAGAGTTCTTCTCTAAGATAAT-C-AAAACCCTTCATGAAATGT-ACAACA--AGGGTGA----AATC-GGTGACAA-CGTTTTCGACAT---GCTT---TC---CT-AC-GACTGCAGACCAGGACAATTTTATATACTGCCTAAAAATCCACAAAG-T-AGAACATGCACGGCCGTCTTAATAGTCC-G--AG-CATTGGAACGTCATG-ATCCCAAGGAG-AAATCTCTGAATTCATT
gi|19 : gagataatctcaccaaagaagaaagattggcgttgcaacatttgatattgcattaaaaggaaacaaagttctaacttaagtgtcttggacagaagacgggtacttgacggaTCCGCAAC-TGATG---AAAT-----GT---CGCAATAAGGCCG--ACAGCCCCTTCTCCATTTTAAAGAAAAACC-GCA-A--A---T-G--ACAGGGTTTTGCTTGTCACTAA-C--TATCACCG-GTCTTGAA-G-ATC-------CTC-------AGCTGTAT-TCTGTAAAAGC--ATCAACCCATT-----CTGCA---TAC-CAGTAAAT---GAATGGCT--GAT-G-TT-TCA-GGGA---A---T------C----------C-------CC--------------------T------A-----T--AG-C-ACC-AGAGAAA-C--CCCAAG----GATACG-ATAGTA--AGGACAACACTAT--ATA-ACCCTTTTAC--CTAATGG---------TAAAAC--------AT--AC-TCAGA--CTT-CA--GTACATGTATG-TC-AA--TT--G-CAC--AAAT---ACATGTAAGC-TC----AGAC--ACA-----GATAGCTTT--A-GCA-GTCC--TG-T-TCGACAGGTCG-TGAGCT-AT--------------A---AGA-TATTG-G--------------G--A-AA
gi|2 : GCGCACAGACAGCTCT-G--GATGAACGGTTT--TAC-ACTAA-AA----C--TCCGACCCT-ACCAAAACGTTTTCCGCTACTATCA--CCGACACTCTTGAGCAAATGTTACA--A--AAAACGAGGAAAATT-GGTAATAA-TGTCTTTGAAACAGTGCTGC-CTC---TCAAC----TGTACACTGGG-CAATTTTATCTCCTGCCT-AAA-TCCAC-AA--A-AAGGCATTCCTG-CCGCCC----------------CATTGG--C-------ACCCCACGGAGAAAATCTCAGAATTTATTGACCT-ACACCTCTGC----CCATA-----TGTTGTAAAACTACCATCATA-CTTGAAGGACACCACT-GATTACCTTAACAAAAACCCCT-CTTCG-AACCTACCTGACAATACCCTTCTCGTGACCATGGATGTGACTTCGCTTTACACAAAACATC--CCCCACGATGAAG-ACAT-TGA-AACCTGCTGGGAGGTT--GGGAT-AAA--------A--GGAT--CC--TGAAAACATC--CTTCCACAGAATCATT-GTCAAGCTCCT-----T-GAACATGTCCTCA-AACTAAA--TA--ACTTCATGTTCCA---AGGCAACCATTACTTACAAGTTA-GGG-GCACAAG--CAATGGGAAACGAAGATGGATCC-TTTCATATGCCAACA-TTTTTATGGGAA--GACTT-GAACGCAACTT-ACTCAGGC--A-------AT--CGCCCTTTAAACC-CCATA----ATTG---TGTGTTTC-ATTTG-ATGACATTGA-ATG--AAATGAAATGGC---GGAGGG-CCGAGATA--CTTGACAACTTTATC----TCCTTTACCAACTCATTTCAC-CATTCCATTTAAATTTACAG--TG-GAAATTTCCAGC-TCCAA-GAACATATTCTTGGATACCGCTTC-CACTCTCTT-GGATGGTGAAATTGAATTCAGCTTCCAT-A-CCAAAACCCGCTGACTCACATT--TGTAC-TTATTGCCTTGA----AGCTGTC-----ACCCACCTCAT-A-CCTTCA------------AAGGAGT-ACCTAAGGTTTAGCTACAC--G-AGTTC------GTC-TATCTG-----TT-CCTCTGGCTCGGAATTCGA-AAAAACA-AATCAAACTCTATCTT-G-AAAAGCCACCTTTGTAAA-AGGGGCTGTAAAGTTGTTCCTGTTCACAA----CAG----CAAT-TGACG---AT-T-----GTC--CAGAACAAGtct
gi|2 : gacaaacttaagcatagaagaagagcttagccttataagagcttaaaaaaaaactcggatgacattgctatcaaaaaggcagacaaggtcaacagtggttgtattagacaagacagcatacatagcggaaCCCGCCCTGAA-G-AAC-------CTC-------AATACCAT-CCTTA--AAGCC-ATTGTCCTAT------CTGTA---TAA-CAAAGAAC---GAATGGCT--AGG-GTCTCTTA-AAGA---C---C------A----------T-------CC----------AATGGCAGCTT------T-----C--AGAC-AAC-CTAGAAT-T--TAAAAG----GATATT-GTAGTT--AGAATTAGGCTGG--ATA-ACCC-ATTAC--CCAACGGGGCGGGTTTTCCCAC--------GT--GC-TCTGA-------AAGA-----G-ATG-TC-----TCCAG-TGC--AAAT---TC-----AG---C----GGGCCAACT-----GA-CGCTTT--caaaactctaaattttcacccgccctgaagaacctcaataccatccttaaagccattgtcctatctgtataacaaagaacgaatggctagggtctcttaaagaccatccaatggcagctttcagacaacctagaatttaaaaggatattgtagttagaattaggctggataacccattacccaacggggcgggttttcccacgtgctctgaaagagatgtctccagtgcaaattcagcgggccaactgacgctttcag
gi|20 : gacaaacttaagcatagaagaagagcttagccttataagagcttaaaaaaaaactcggatgacattgctatcaaaaaggcagacaaggtcaacagtggttgtattagacaagacagcatacatagcggaagcgcacagacagctctggatgaacggttttacactaaaactccgaccctaccaaaacgttttccgctactatcaccgacactcttgagcaaatgttacaaaaaacgaggaaaattggtaataatgtctttgaaacagtgctgcctctcaactgtacactgggcaattttatctcctgcctaaatccacaaaaaggcattcctgccgccccattggcaccccacggagaaaatctcagaatttattgacctacacctctgcccatatgttgtaaaactaccatcatacttgaaggacaccactgattaccttaacaaaaacccctcttcgaacctacctgacaatacccttctcgtgaccatggatgtgacttcgctttacacaaaacatcccccacgatgaagacattgaaacctgctgggaggttgggataaaaggatcctgaaaacatccttccacagaatcattgtcaagctccttgaacatgtcctcaaactaaataacttcatgttccaaggcaaccattacttacaagttaggggcacaagcaatgggaaacgaagatggatcctttcatatgccaacatttttatgggaagacttgaacgcaacttactcaggcaatcgccctttaaaccccataattgtgtgtttcatttgatgacattgaatgaaatgaaatggcggagggccgagatacttgacaactttatctcctttaccaactcatttcaccattccatttaaatttacagtggaaatttccagctccaagaacatattcttggataccgcttccactctcttggatggtgaaattgaattcagcttccataccaaaacccgctgactcacatttgtacttattgccttgaagctgtcacccacctcataccttcaaaggagtacctaaggtttagctacacgagttcgtctatctgttcctctggctcggaattcgaaaaaacaaatcaaactctatcttgaaaagccacctttgtaaaaggggctgtaaagttgttcctgttcacaacagcaattgacgattgtccagaacaagcaaaactctaaattttcaACAG--ACAGGTCCTCTTCCACTATGAAGAAAAACC-TCAAA--A---T-G--ACAGAGTTCCACTAGTCACTAC-T--AACCGTCCTGTGCTCAA-A-AAC-------CTC-------AACACTGT-TCCAAGAAAAC--ATGTGT--------------A---TGC-CAATAAAT---GAATGGCT--GAT-GTTT-ACA-AGGA---A---C------CCCTATGGCA-T-------CC----------T---------T------T-----T---GAT-GTC-CCAGAGA-C--CAGAAG----GACATG-GCAGTA--AGGGTTAGACTGAATATA-ACCC-TCTAC--CTAATGG---AGGTTTC-ATAT--------AT--------GA--CCT-C---A-----C-ATG-TC-AA--TC--A-TGC--AAAT---AT-----AGC-TC----AGAC--ACTGGCCAGGGAGATTT--A-GCA-GTCT--TG-T-C--AGGGGTTG-C-AGTT-AT--------------A---cag
gi|21 : aaACAG--ACAGGTCCTCTTCCACTATGAAGAAAAACC-TCAAA--A---T-G--ACAGAGTTCCACTAGTCACTAC-A--TA-----CCGTGCTCAA-G-AAC-------CTC-------AACACTGT-TCC-AGAAA-C--ATGTG-------------------TACTCAATAAAT---GAATGGCT--GAT-GTTT-ACA-AGGA---A---C------CCCTATGGCA-T-------CC----------T---------T------T-----T---GAT-GTC-CCAGAGA-C--CAGAAG----GACATGCGCAGTA--AGGGTTA-ACTGA--ATATAACC-TCTAC--CTAAT-G---AGGTTTC-ATAT--------AT--------GA--CCT-CA--C-----A-GTG-TC-AA--TC--A-TGC--AAAT---AT-----AGC-TC----AGAC--ACTGCCA-GGGAGATTT--A-GCA-GTCT--TG-T-C--A-GGGTTG-C-AGTT-AT--------------A---
gi|23 : a---C-CT-GTT-GC-CAAGCA--TTTCAA------T---C--TAGCAGAAA-CAA-AT-GG---GAAAACATGAGAATGGAGA-ACA--TGACAA--TA-----GTATTTA-TGATCA
gi|24 : gggtcaaaa-AAAACCCATTTGTGCAAA-AGAAGCTATGAAGC----CCC---AACAA--TGCAAGCAGCTAT-TGATG---TGAT-----GT---CAGAACACGACAT--ATTATCCCTACTACAATTTAAAGGTAAATTGTTAGATTA---T-GA-ACAGAGACCTAACGGTTGCAAC-G--CACCACCCTGTCTTGAA-A-GAC-------CTA-------AACAATAT-TGTGAGAGAGCATATATTCCCAAT-----CTTCA---TAC-TAACACTA---GAATGG-------------TCA-ATGA---A---C------C----------T-------CC----------gaactcccactggaaaggaataacaaagaaaaaatctggatgcgtagccactccgccctgatggcacgacttccctagaatgaatgtgacttgggtactctagttattactcagtatttacaatttctatttgccatttactttgtgtaaaagcaccatcattagcagtcaatctttccatacttgttctgatttttttttta
gi|25 : aagaacagagcacccgactga-AC-GG---GA---------------GG-ACA--CGAC-A--TA-----GTGGTTATTAATCATcattgcggcctctgctaccgaattcttgggaagaca
gi|27 : ATCA--CTGACACTCT-AAGCAGATGT-ACA--A--ATGACGAGG--AATTTGGTAATAAATGTCTTTGAAAC---ATTGCTGTCTCTCCAA-----TGTAGACCTGGGCAATTTTATCCACTGCCT-AAAATCCAC-AA--A-GAG-TATGCCTGGCCGCCCC-ATAGT---GATGGCCATTGG-AC-------A-CCCACGGAG-AAATCTCAGAATTTATTGACCCAACACCT--GC----CCACAAATGTTGTAACATACCTAC--TCATATCTTGAAGG--ACCACTAGATTACCTAAACAAAA-CCCCA-TCTCC-AACCTACCTGACAAgacctaaattggacagattcctaaagaaagcaaaaggaaaattccggatgcacagacagaagtcgtttgactccgggtgaatcactgactttcccagtatagcagggctaaacctacaaatgtttattattccggaactccatctactcttttgattcataccttcaacactatagccgtatttttcatttcatttttttaaaaatagttttacgcgctagactactttgttacatactagtttacaggaccgtgt
gi|28 : caTTT-TTA-GTGA---A---C------C----------T-------CCCTGTCGT---G---------T------C-----CTTCGAC-GGC-CCAGAAA-TAAATCAAG----GACCTT-ATGGT----AGACCAGACTGG--ATA-ATCC--CTAC--CCAATGG---GGATTTTCCAAC---------T--TC-TCTTA--ACA-CA--C-----G-GTG-CC-TA--CT--C-TGC--AAAT---AT-----ATC-CCCAAAAGAC--A-T-----GAGACATGC--A-G-A-GTCT--GA-C-C--ACAGA--A-A-AAGT-AT--------------A---GCA--ATTG-G--------------G------CCAGGTTTTTCCG-TAATGAC---CAAC---AAC-T-G-TAT-T----------TACC--CTC----ATCAACATGTT--AACGTCGTG-C---AAA-CA--ATA--TGCT----------GG-GGGA-AA--------CCAt
gi|29 : gtGCTCATTGACAGCTTTCG--GACGAACGCTTAAATAT-A--AA-AAGTCACTGCCTGACCCTCGCCACAGAGTTCTAGACCAAGATCAGCC-GAAAAATTCCAAGCATTGT-AC---A--ATGGCGA----GATC-AGTGACAA-CGTT------AC----CTT----------AAC-GCCTGTGGACCAGGATATTTTTATGTACTGCCA-AATGTTCAC-AAACACAAGACATGTTAAACTGTCCT-GTAGT-CGG--TGACTTCGG-GC-------ATCAAACGAGGAGAATTTCTTAATTCATT
gi|3 : tagacaagtactcaacaaattaaaGTTCACTG--TT-GATATTTCC-GCATCCAG-TAACGTATTTTTAGACACTATGTC-CAAGATTGT-TAACGGAAAAGTCGAGNNNNNNNNNNNN-N-NNNNN-NNNNNNNNNNNNNNNN--NNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNAGTTGTC-----ATCCTACTCAT-A-CATTCATAGGAGAAACTAAAGGTTTAGCC---------ACC---A--G-TGTCG------GCCGTATCTGCTCCACT-CCTGC-ACT-----TTATA-AAGAACAGAG---CACCC-ATCTA-G-AAAA-CCATCTGTGCAAG-AGAGGCTATCAAGC----CC----CA-AAAGTGCAAGCAGCTAT-TGATG---AAAT-----GT---CAGAACACGACAG--AGAACCCCTACTACAATACAACAACAAA---TCGGT--A---T-GTGACAGAGTCCCAATGGTTACTACGTAGTACCACCCTGTCTTAAA-A-GAC-------TTG-------AACAAAAT-TCTGAAGAGGC--ATATCCCCATT-----CTTCA-------CAATAACCCTAGGAT--CTTCAAG-ATCT-TCA-AAGA---A---C------C----------T-------CCCAT-------GGCGGCC---T------T-----C--AGAC-GCC-CCAGAAA-T--CTGAAA----GACATG-GTGGAG--CGGACTAAATTGG--ACA-ACCC-GATAC--TTAACGA---GGGCTTTATCAC--------AT--GT-TCTGA--TGG-C---A-----G-ATG-CC-TG--AC--G-TGC--AAAC---AC-----AGCATT----AG-C--ATA-----AACATTTTT--A-AGA-GCCC--TG-T-T--ACAGGCCGAC-ACCT-AC--------------C---GAATTCTCA-G--------------G--G-AA--ACA---TCCTG-TCG-CGC---GGAT---GAT-T-G-CAT-C----------TA-C--CTC----ATAAGC-TG-T--AAGGTC-TG-TGATCAA-CA--ATA--CG-T----------GG-GTGA-AA--------CTGG-GG--ACC---TACGTAGGA-GGAT-CAA--TAA-CCACC--GCTCTA-CC-A-T-C-AAAACCAA-A
gi|30 : AGGTACGGCCCGTAACATGATAGGCAGATTCTCTGTAACCACAA-AGGACAGGAACA--CCCTTTTGCAATACAAAGAGAAAA----AGA--A---A-A--AAAGA------------------------CACCCCGTCCTTAA-G-AGC-------CTT-------AACAGAAT-CCTGAGAGAGA--ATCTGCCGATT-----CTTCA---CAA-TAATGAAA---GAATGGCG--GAT-CTTT-TCA-AGGATCTA---CCAATGGC----------T-------GC----------A---------T------T-----T--AGAC-GGC-CTAGGAA-C--TTATAG----GACATG-GTGGTG--AGAGTCAAATTAG--ATA-ACTC-ATTAC--CCAATGG---TGGCTT
gi|31 : tgtTGGATGTCACGTCATTCTACATT---------------GGCTAG---CATTCAA-AGCGTGCAGCGAAGTTATGGATA-ATA--------A--G-----CTGTCCATAG--CC--CCTCCGCTGAGTCACT--TTCAACTCTT-----A-CAACGTGATCTTATAGTCCAA--TA---CTTCGTG----------GCGATCACTATTTCCAAAT-T-ATC--CACA-ATTCTATGAGAACCAGA-ACATCACT-CT-CAAAAGCCAACA-TATTCATGGAAA---------AGTGAAACCT--CT---GC--T----TC-----------TGCAATC-GCTGA------TG-ACT--GTTTC-ATG-G-ATGATATGGA-ATG--
gi|32 : -TTTAC--CTACCGG---AGGTTTCAAAAC--------ATTGGC-T-ATA--CCT-CA--A-------ATG-TC-AA--TT--GATGC--AAAT---ATT----AGC-AC----AGATT-ACT-----GAGAGCTTT--A-GCA-GTCC--TGTT-C--AC-GGTCG-T-AGTT-ATAAGATTTAGCTATAA---AGA-TATTA-GCTTAAAGATATTGGG--A-AACTTTT---TCCTA-CAA-AAC---TAATATAAACTT-G-CAT-C----------TA-T--CTC----ATCAGT-TG-CAAAATGTC-TGCCCAGAAA-CG--GTA--TG-T----------AG-AGAACAA----------ACAGG--AC------CGCAAAC-AGGT-CGA--CAA-CCACA--GGTCtatgg
gi|33 : CAAAGCGTTTTCTGCCACCATCAG-T-GAAACTCTACA--AAG----ACG--A--GG----A----AATT-GGTGAAAA-TGTCTTTGAAACATTGCTTC-CTC---TCAACTG--TATATACCTGGGCAATTCTATCTACTGCCT-AAAATCCAC-AAG-G-AGGGTGTGCCTGGTCACCC--ATAGTGT-G--TGCCATTGG-GC-------ACCCCACGGAGCAAATCTCAGAATTGATTGACCT-ACATCTCTGCATGTCCATA-----TGCTATGAAGCTACCATCA
gi|34 : gaccaacgattctatggaaggatgtt---T-G--GCAGAGATTCAATGGTTACTAC-T--TTCCACTCTGTTTTCAA-A-GAC-------ATG-------AACAAAAT-TCTGAAGAGGT--AT--------T-----CCGCA----A---AATAATCTTTGGATGGCC--AGT-ATCT-TCA-AAGA---A---C------C----------T-------CCCAT-------G---------TCATCCTT-----C--AGAC-ACT-CTGGAAA-T--CTGAAA----AACATG-GTGGCG--CGGACTAAATTG
gi|35 : cgatatgT--CCACATCATGAGG-ATAT-AAA-AGCTTGCAGAGACGTA-TG--AT-ATAGTACTTACA--G-----CCATTCATAG--TT--CATCAATTGAGTCACTTACCCTGCTCCTACATGTAGAACATGTTTTGT-AATGCAA--TGTCACTT----TTCAAAAATGGTGATCACTGCCTTCAAATTA-GTG-ACACT-G--CTATGGGAACCAAA-CTGAGACC-CC-CATCTGCCGATA-TGTTttctgttgggagatgactggtgtgcaaacatagcgctaacacaattagttttaagagccctgt
gi|36 : CGTATCCTTA-AGTTTAAAATA--ACTTCATGTTCAA---CGGCAAACACTATCTGCAAATGA-GTG-GCACA-G--CTTTAGGAAC-AAA-ATGACATC---------------A-TCTTTATGGGGACTGTCCCAGAACGTAACC--CCT---AC--A----CTGGT--CACCATGTAAACC-TTGTA----GCTG-GCTATGTTTC-CT--GGATGACATTCAGATATAGAGTG----GGT---TGATGG-TCGTGGAAGCCTTAACGACTTTATC----AAGATAGCAAACTTTcttttgaaaaagtggaatacaaattgctaat
gi|37 : -CCAGAA--CA--GT----G-T----------AATGGGA-AA--------CAAG-AG--ACA---T-CGCAAAC-GGGT-TAA--AAA-CCACC--GGTCTT-AC-G-T-C-CAAACCAA-GA-A---A-AA-T--TT-----G---T-CA-GAA-GC-TAAACC--T-----------------GTAGTAATCG-CCT-GT-GG---GA---------------GG-ACA--TGACAA--GAGCGCTATGATTATTGACCata
gi|38 : acccttgtaaagcccgcatcaatttgaaaaattgattatattaaAA-AA-A---G-GA-T--CT-----C---C-CGTGTA-GCCTACACA--TTTAAAA-----T---G-TTAGCAATCA-CAG-GT-GG---GA---------------GA-ACA--TTACAA--TA-----TT-GTTATGGGTCccaaattattcatataccaaaacaaagcagaaggca
gi|39 : CACT-A--CTGTGCGAACCACA-ATGTCTCC-AT-CATACGCCAATA-CTTTCTTTGGAC--GAC----AACGCAACTTACCT---CT--AATAGTAAAT--CGCCTTTCAAGTG-CCTTACTTGGTTGTGCTAAGTTCC--------CGACATTCAAATA--GGGTG----GAC---TGACA--TC-CAAAA--TAAGACAACTTTATT----TCGTTTACGAACTCGTTTAAC-CATTCAATC-AACTTCACtgacccaagttttggtcagaaatgaggagaaatgcgaaaggaaaaaagccaggatacacaggttgttcaaaagtcatttgaagcttttgtcagggtataatcaaaccacttaagatgaaaacggaactaaaa
gi|4 : aACCCTGCCCTTAGTGCGAC-------CTTCTCT---AATAGTATGTACAAGAAAAC--ATTTGCCTAT--------CCG---TAT-CCACAAAC---G--TAGC---GATAGTTT-TCATA--A---A---C------CGC--------T-------CCTGATGACATCG---------T------TTACCGC--AG-C-GCC-CAGAAAA-C--CTGAAAAAGCGACATT-GTGTAA--AAGACCAGGTTGA--GTA-ACCC-TCTACCTCTAATGG---AGGTTTCAAATC--------AT--GTATCAGA--TCT-CG--A---------G-TC-AAGTTT--A-TGTCAAAATTAAAT-----ACT-CC----AGAA--ACT-----GAGACCTTC--AGGAA-GTCC--TG-TGA--ACA-ATCA-C-AGTTCAT--------------A---AAA-TATTGTG--------------GATG-AACT------TACCGTTAA-AAC---CAA----AAC-TCG-TATAC----------TA-T--CTCT---ATCAA--TG-T--GA-GTC-TG-CCAGAAA-CA--GT---CG-T----------TG-GAGA-AA--------CTAC-GA--ACCTTTTTCGTAAAA-GGGTACAAG-CAA--TACC----TCCT-CC-G-TGC-AGGACCAA-AATATGCG-GACT--CC-----G---CACG-GTA-GC-TACGCAGTTTCCAAGTTC--T---GTGTAGACATCA-CCGAAT-GGGTTGA---------------GGAACATGTGACAACGTG-----TTAG-TA-TGATCAT
gi|40 : tgaattgtacaacggaccgacaatcccctcacttccatatattcaaatttgcacttctccaccttcatatctcgaatatcttgcaactcaactatcgattcccgtgccgATTGCGACG--AAGTG----GGT---TGATGA-GCGTAAAATCCACAATGACTTTATC----GCAAGTGTGAGCTATTTCGAC-TATTCCATT-CTGTCCTCTG--AG-GAAATTTTC-AACTTTAG-GAATATTCTATGGGATACCACATT-CGCACTTAC-AAACGGGGA-----------GCCTTCA------------CATCGAC-ATCATT--TGTAC-GTAT-GCCATTC----ACCTTTC-----ATCCACCCgtacctactctggtcaactattcaaagaaaaaagaagagaatttctggatgaccaggttgaagtcattcgagcctcagtgtcaatccacaaatctaagctactttcccagtagatgaacacgggttagac
gi|41 : --CCATGGACACCAAA-ATGACTCC-AA-GCTACGCCAACATTTTTTATGGG-A--GACCT-GAATACAACCT-A-----GT--A----ACGTTGGCACAAAGAAAACCTTTTTA----GATG-ATTTCTATTC-AT-----TGGCATTTGGATG--AAATG----GG----TGTCAACTCGGGGAAACCTTGGCAACTTTATt
gi|42 : CACT-A--CTGTGCGAACCACA-ATGTCTCC-AT-CATACGCCAATACTCTTT---GGAC--GAC----AACGCAACTTACCT----CTAA----TAGTA--AATCCTTTCAAGT-CCTTACTG-GTTGTGCTAAGTCCC-G-------GACATTCAAATA--GGGTG----GAC---TGACA--TC-CAAAA--TAAGACAACTTTATT----TCGTTTACGAACTCGTTTAAC-CATTCAATC-AACTTCACttaaatagcccgtgcatttcatactctcattaagtttcac
gi|43 : A--TC--CTTCCATAGAATCGTTGGTCAAGCTCCT-----T-GAACATGTCCCCA-ACCTCAA--CA--ACTTCATGTTCAA---TGGCGAACATTATTTAGAAGTAA-GTG-GCACA-T--CTACGGGAACGAAG-TTGGTTCC-AT-CGTATGCCAATA-TTTTCATGGGAA--GACTT-GAACGAAACAT-GCT---TA--G----ACAAT--CACCCTGTAAGCC-CCTTA----GTTG-
gi|44 : GCTCACCAACAGCTCTTG--GACGAACGCTTT--TAT-A--AA-A---------------CT-ACCAAAGTGTTCTCTACCAAGATCAC-C-GAAACGCTCCAGG--ATAT-AC---A--AGGGTGA----GATC-GGTGACAA-CGTTTTCGAAGT---GCTTT-GTA---TTTAC-GACTGTTGACCGGGACA
gi|45 : tttactttattattatcattataaaggcagagaaagtctctaacataaAGTTCATGG--TT-GATATTCCC-GCATCCAG-TGGCGTCTATTTAGATACTACGTCGAATAC-TGT-TAACGGAAATGTCGAGTTCAAACGCCAT-A-CCAAA-GCAATTAACTCCCATT--TATATCCTGT-GCCATCT----AGCTGTC-----ATCAG-CTCAT-ATCGTTCA------------TAGGAGT-AC
gi|47 : CC---------TCC---C--G-AATCC------TCCGCATTTGATCTAAC-GCTACTACT-----TTCCATAG---CA-AG---GACAA-ATCGT-C-AAAATTCATTT-CACAAACACAGGATATGA--T----CAT---TGCAAGGTACAGTCCGCAAT-TGATG---AGAT-----GT---CACGGCATAACCG--ACAG------------TACAAAGAAAAACC-TCAGA--A---G-T--ACAGGGTTCCACCAGTAACTAT-T--TAttattttattagccactagagtccgtcatata
gi|48 : TCTTGTCAGAATAGACGTTAATTT-CTGTACACTAG-CGTC--CTGCAAGATGACC-ACAT-CGA-GGCATTTAGGGAAGTT-TAGAAG-AGA--------A--AT----TT--TCTAAA--TCATCTTCCACTGAATTGTTGGTAAAGCTCCT-----T-GGACATGTCCTCA-AACTTAA---------TCA---TCAA---CAGTGAGGACTACTTGC
gi|5 : A--CG-T----------TG-GAGA-AAA-------CTAC-AG--ACC---TTCGTAAAA-GGGT-CAAAACAATCCAC---GGTCCTTCC-G-T-CCAGGACCAA-AA-A---G-GA-T---T-----G---C-CG-TTATGC-TACGCA--TTTCAA------T---G-GTAGCAATCATCCG-ATCGG---GA---------------GG-ACA--TGACAA--TA-----ATAGTGATTGATCAT
gi|50 : cCAATCCCTTTTGCAATATAAAGAAAGATC----GA--ATGGT-G--ACAGAGTCCCAATGGTCACCAC-A--TACCACCCGGTTTTGAA-G-GAT-------CTC-------AACACTAT-TCTAAAGAAAC--ATATCCCCATT-----CTTCA---TGC-CAATAAAA---GAATGACT--GAT-GTTT-TCA-AAGA---G---C------C----------A-------CC----------gaccctagtttggtctgacattcaaagaaaaaagataggagaagttctggatgacaggttgacgtcattcgagcctcatgcatcaacaaatctgctgacttcaccaggagtgaacacggggttagaagcgattcaccggaaatcgaacactgatttacatgtaagactccccggcctgatcagtcccgaacatcctctattagattcaatcttcacaatgtatacttctcatgtgataaatttttttttttttctttctctttctatcttaaaaaaattttttttttttctcacggtctctttctctcgaaattaattgttttaattaaatctgatccacattgtgtataaattcagtattactttagaacttgacttaatagaatattcccgggtatgaactatccaatatatacctcctaattcgaatagtaagtcgttgcattattgtggatcagctaatggacgagtagggcgtatcctcattcgttccatatctaacattagatttgcaagccattaactcgaataccatgtgatttatatgtaatacggttgttacgttggagaccgatatatt
gi|52 : TAGCCT-CCT---AC--A----TTATT--CACCATTTAAACC-TCT---------------CATTT----------GACATTCAAATG--AAGAA----CAA---TGACAA-TCATGAAAGATGAAACAACTTTATATAAAGAGAAAACAAACTCTTCCCACTGGTTCAATC-AAGATCACTG--T--GAAATTACA-ACCTCTAGAGAAtatggc
gi|53 : CC--TG-T-C--ACAGACCG------------------------------A-CACTA-C--------------C--G-AACT-------CTCG-CA----C---GGAT---GAT-T-G-CAT-T----------TA-C--CTC----ATATGC-TG-T--AACGCC-TG-TGATCAA-CA--ATA--CG-T----------GG-GTGA-AA--------CTAG-GG--ACC---TACGCAGGA-GGAT-CAA--TAA-CCACCTAAATTAA-CCAG-T-C--GGACCAA-A
gi|54 : cGTTCAATC-CCAT-AACTCAA-CCCACCGACTCTTATA--TATACCATAT-GCCATCC----AAC----------------CCATGA-CT---A------------AATGTGT-GCCTAA------GCT---TTTGTCGTCCAAATTTGCTGCATCTTCTCTATT-CCCACCACT-----TTCCA-AGAGGCA-AG---GACAC-TTCCT-A-AAAgcacccg
gi|58 : TT-AT--------------A---AAA-TATTG-G--------------G--CCAACT-C----TCGAG-TAA-AAT---CAAT---AAT-T-G-CTT-A----------TA-C--CTCATTGATCACC-TG-T--AAagt
gi|59 : actacaggcaaaacAT-ACTGA-AAAGC--ATGCTCCCATT-----CTTCA---TAC-TAAC--------------------------TCA-TGGA---G---C------C----------T-------CCCATGGCT---G---------T------TTT---C--AGAC-GTT-CAAGAAA-C--CTTAGA----GACATG-GTGGTGCTAG--CCAAATTGG--Aacaatgtaacttacaatacgtgtgtgtgttaacgtggggggggggg
gi|6 : cttgaaatattcaattagaGAC--ACT-----G-----TTC--A-GCAAGCCC--GG-T-GG-ACAGGACA-G-AGCT-AC--------------A---AAA-TTTTG-G--------------G--A-GTCTATG---TCCTG-CCG-TAC---TGAC---AAC-T-G-CATAC----------TA-CACTTC----ATCAGT-TG-T--AAGAA---A-CCAAAAAGCA--GTA--CG-T----------AG-GTGG-AA----------AC-GGTGACC---TCCGAAGAA-GAGT-CAA--CAA-TCACC--GGTCCA-CT-ACT-T-AAGACC-A-AA-C---G-GA-TCACC-----GAACC-CG-TTG-GG-GA-ACA--TTTCAA------C---A-CTGAGGGTCA-CAA-AT-GG---GA---------------AG-ACA--TGACAG--C------GTAGTTATTGACCA
gi|60 : -TCTGAAGAAGC--ATTTTCCCACT-----CTTCACATTAC-CTCTA------GAATGGCC---ATGGTCT-TCA-AAGA---A---C------CA---------T-------CC----------ATGGTGGCT-T------T-----C--AGAC-GCC-CAGGAAA-T--CTGAAA----AACGTcaaccctaactggagtgactctgaaagaaaggaaccatagagaagattgctggtagtgcagcaggttactctcaaatagtacatctcttacggactgtcattgtcttcctccaaatggcacctcgaatgaatgaaaagtctctcatgaaatatggaacgttgcttgcccagaccaacgccggatactggatgcgttgagtggtggaaagcgagacgaaatgagcgtcgacccacagactttaactcatcgcctactcctcttcacaacctatactcggagtaaatttcattgatttct
gi|61 : gatttgaaacaaaaaa--ATA-ACCC-TCTAT--CTAATGG---AGGCTTCAAAAC--------AT--GC-TCAGA--CCT-CA--------G-ATG-TC-AA--TT--A-TGC--AATT---AT-----AGC-CC----AGAC--ACT-----GAGAGTTTT--A-GCA-GACC--TG-T-C--ACAGGTCG-T-A
gi|63 : T-GTTT-TCA-AAGA---ATTCC------C----------TATGACATCC--------------------T------G-----C--AGAC-ACC-CCAGAAA-C--CCAAAG----GACATG-GCAGTA--AGGACTATATTGG--ATA-ACGT-TTTAC--TCATTGG---AG
gi|66 : gCTTGTGACCATGG-TGTTACTTCACTA-ACAT------TT--CAAAATGAAGAGGTTTAT-CAA-GGCTTATAGAGAGGTT-
gi|67 : c---TTCCG-TAATGAC---CAAC---AAC-T-G-TAT-T----------TACC--CTC----ATCAACATGTT--AACGTCGTG-C
gi|68 : ttgggccaggtttACGTG-GCGTTG--AGAGCCAAATTAG---TA-ACAT-ATTAC--CTATTGG---TGGTTTaa
gi|69 : T-ACATCTCCGT----CAGCA-----TGTAAAAGCTTTACCGTCATA-CCTGt
gi|7 : attGCAATCA-CCG-AT-GG---GA---------------GG-ACA--TGACAA--TA-----CTAGTGATTGATCAT
gi|70 : --CTAATGG---AGGTTTCAAAAC--------AT--GC-TCAGA--TCT-CA--gaccctagttggtgtgctactcaaagaaaaaggaaggagaagttctggatgcacaggttgaagtcatttgagcctcgtggcatcaacaaatctgctgacttcaccaggatgaacacgggttagaacgttcaccggaatcgaactctccttaaaccttcgcgcctgatcatccactcttagcttcaattttcacaatgtatacttctgtgataaaaaaaattttcttctctttctatctaaaaaaatttttttatttcttctaaattattgttttattagaattgatccattgtgtgatatattcaagtacttgactaaatagaatagttccgggtatgaactatcaattatacctcccaattcgaattagtaagtcgtgcatcattgtggatcagctaattggacgagtagggcgtatcctcattcgttccatatttaacatagatttgcaagccaataacccaataccatgtgatttataatgtaaatacggttttagt
gi|8 : CT--GAG-GTCT-TCT-AGAA---G---C------C----------T-------CCT---------G---------T----------------GGCTGCCGTCATATATC--CT--AG----GA-----GTGCTG--GGATCCAAATTGA--A-A-AATG-TTTGC--CCAGTGG---GGATTTTAAAAC--------TT--AT-TCTGATGCCT-----------G-ATG-TAGAA--TC----------------AC-----AGC-GC----GAAC--ACA-----AATAATTTTTAA-GCG---CCGATG-T-C--AC-----------------------------------------------------------G--G-AAT---G---TCCTG-TCG-CGC---GGAC---AAC-T-G-CAT-C----------TA-T--CTC----ATAAGT-TG-C--AAGGTG-TG-TGAACAA-CA--ATA--CG-A----------AG-GTGA-AATTGAGGGTCTAC-GG--ACA---T--GTAGAA-GGAT-CAA--TGA-CCACC--GGTCTA-CC-A-T-G-AAAACCAATAG-A---GTGA----------------------------AAGCA--TTTCAATCTCGCT---G-GACGCAA--------AT-GG---GG---------------AG-ACA--T
gi|9 : AAGAGAGGCTATAAAGT----C-T---CA-AAAGTGCAATCAGCTAT-TGATG---AGAT-----GT---CACAA--------------TCCATACTACAATGTAAAGAAAAATT-GGTGG--A---T-G--ACAG-TTTCCA-TGGTAACAAC-G--AACCATCTCATCTTGAA-A-TACATTCTATCTTGAAAGAAAACAAAAT-TCTAAAGAAGT--ATATTCCCATTAATATCTTCA---CTC-TAGTCGCA---GAATGACT--TAG-GTTT-TCA-ACCA---G---C------C----------T-------CC----------AATGGCTATCT------T-----C--GGA--GTA-CCA-AAA-T--CTTA------GACATG-GTGATG--TGAACCAAATTGG--A---ATTC-TTTGC--CCAAAGA---GAGCTTTAAAACTTGTTCTGAT--GC--CAGA--TCT-------------ATG-CC-TG--AC--G-TGC--AAAC---AC-----AGC-GC----GAGC--AC-------AGA----------CA-GCCC--TG-T-G--ACCGG-CA-T-A-TT-CT--------------ACCGAAT-TCTTG-A--------------G--G-A--CACA---TCCTG-TCG-CAC---GGAC---AAC-T-G-CAT-CATTCTGTAATTA-T--TTT----GTAAGT-TG-C--GTGGTC-TG-TGAACAA-AA--TTA--CG-T----------AG-GTGA-AA--------CTGG-GG--TCC---TACGTAatattgactactcagttcactggacgcattcatgaggagagaacgaacgagaaagacccaaatggcacgaacaatctcaatgactttactagaatgaatgtggcctagcttcccctcagtgttgttctgtctgttttacactttctactctcagcactattattagcagtcaatctttccgtggtttcctaatctatctttt
12 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|18 ): GTCCCGAACATCCTCTATTAGATTCAATCTTCACATATATCTTCTTGTGATAAAAATTTTTTTTCTTTTTTTTTTCTTCTCTCTTTCTATCTAAAATTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTCTTTTCTCTCTCGAAATTATTGTTTTATTATAATTGATTCCATTGTGTGATAATTCAAGTTTTATCTTAGAACTTGACTTTAGAATAGTTCCGGGTATGAACTATCAATTATACCTCCTAATTCGAATTAGTAAGTCGTGCATTATTGTGGATCAGCTATTTGGAGAGTAGGGCGTATCCTCATCTGTTCCATATTAACATAGATTTGCAAGCCATTAACTCATACCATGTGATTTAATATGTAATACGGTTTTTAGTT
Unaligned ( gi|22 ): TTCTTTCTCTTGTCTATCTTAAAAATTTTTTTGTTCTCTTTCTCTCGAAATTATGTTTTTATGTATCAGAATGATTCCATGTGTGATTGAACTTCAAGTTATTTACTTAGAACTACTAATTAAATGAAGCTTCCGGGTAAAGCTATCAATCATACCGTCTAATCGAATCAGTAAGTCGCATATTGGATCAGCTAATTGGACGAGTAGGGCGTAAGTCCTCATTGTCGTTCCATATTAACATAGATTGCAGCCATTAACCTCAATACCGATGTATTTTTAAGTAAATACGGTTAGTTGTAGTAACTCAGATATATT
Unaligned ( gi|26 ): TTTTTTTTTTTTTTTTTTTGTTTTTTTTTCTCTTTTCTCTCGAAATTATTGTTTTATTATAATTGATCCATTGTTGTGATAAATTCAAGTTATTACTTTAGAACTTGACTAATAGAATAGTTCCGGGTATGAACTATCAATTATACCTCCTAATTCGAATAGTAAGTCGTGCATTATTGTGGATCAGCTAATTGTGGACGAGTAGGGCGTATTCCTCTCCATATTAAACATAGATTTGCAACCATTAACTCAGTATCCATGTGATTTTAATGTAAATACGGTTTTAGT
Unaligned ( gi|46 ): ACAATCTCAGCAAAGAAGAGAGATCTGCCCTCCAATTGCTAAAAAACCGTGACGACATAGTCATAAAAAACAGACAAAGGTTCCACGGTCGTTGTTCTAGACAAAGATTCGTACTTAGCCGAAGCTAACAGACAGTTGTCTGATGAGCGATTTTACAGAAAGCTGGATTTTGATCCCACTGAGGAGTTTTCAG
Unaligned ( gi|49 ): TAATACATTCCTAATCGAATTAGTAGTTCGTGCATTATTGTGGATCAAGCTAATTGGACGGTAGGGTGATCCTCATTGGGTTCCTATGTAAAGAAGATTTGCAGCTTAACTTCAGATACCATGTGATTATAATGTAAAAACGGTTTATAGTTAGTACCAATATATTT
Unaligned ( gi|51 ): AGTAATCACTTACGGGAGGCGAACACATAAGTGGTTATAATAATGACCTAAATGGACAGATTCCTAAAGAAAGCAAAAGGAAATTCCGGATGCACAAGACGAAGTCGTTTGACTCCGGTGGAATCCTGACTTATCCCCAGTATAGCAGGCTAAACC
Unaligned ( gi|55 ): GAATTAGGTCAATCATTATCACATCGCACATTGCGGACTAGCTCATTGGACGAATAGCACTAGTCTCAATCTCTCCTCAAAAAAACATTTTAATTAGCAATTCAAAATCCAATAAACATGTACTTTATAGTGTTGATACGATTATAGAAT
Unaligned ( gi|56 ): GACATTAAAATAGTGATTACTGACCATTACCCAAGTTGTACATGTTATGCCACGAAAACGCAAAGAAAGGATTCTTATATACGGTTTTTTCAATAGTCATTCGACCCTCAAGGTATCAACAAAACAATTTAGTTCATCAGATTAAACG
Unaligned ( gi|57 ): GACAACCTCAACAAAGAAGAAAGATCGGCATTGCAGAGATTAAAAAACCGGGATGATATTGTAATAAAAAGGCAGACAAGGGTTCTACTGTTGTTGTTATGGACAAAGATAAGTACCTAACAGAGGCTCACAG
Unaligned ( gi|62 ): AACGAAACTTTTAGATACTCAGACTGAAGTCGTTCGACTTTCAAGGTATCGAAACACCTGATGAATTCACTAGGATCAACATGGGCTAAACATTTGTCACC
Unaligned ( gi|64 ): AGTGGTTATTCATTTTGACCTACGCCAAATACGCAAAGAAAGCCAAAGTGAAAATCTTTGCACACAAACCGAAGTCATCTGAT
Unaligned ( gi|65 ): AAAGCAAACCGAAAAGTTCTGGATGCACAAACAGAAGTCGTTCGACTATCTACTGACTTCACTAGGATAAAAA
Alignments
lowQualScore : 111111111111111111111111111111111111111111111111111111111
lowQualScore : 111111 2222 111 1111 111 111 111 1111 11 3333333 3333333 1111 22222 1 1111111111 666666666666666666666 1 1111111 2 1111 11 3333333333333333333 1111111111 33333333 1111111111 11 22222 222222222 111 1111 11111 11 333333333333 5555555555555555555555555555555 11111 111 111 11 1 1111111111111 11111 111 1111 1111 1111111 1111111 11111 000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 111111111 2222222222222 11111111 11111 1111111111111111111 33333333333333333333333333333 111111111111 11111111111 11111111 222222222222222 3333333333333 222222222222222 111111
lowQualScore : 1 1 99 99 6 99 6 111111 6 1 44 8888 2 4 666 5 777 66 0 1 7777 5 5 1 1 777 666 888 0 000 5 0 1 5 0 5 9999 2 1 22 6666666 4 1 88 5555555 4 8 1 8 1 7777 00000 1 1 1 1 1 0 0 8 11 8 99 1 99 1 1 0 1 1 2 3 6 1 4 3 22 9999999999 4 4 777 5 5 5 1 5 77 1 555555555555555555555 66 66 0 3 1 4444444 4 0 777777 4 8888 1 0 2 2 4 4 88888 3 0 1 77 3 2 5 6 3 6666 9999 0 11 3333333333333333333 555 3333333333 88 22 66666666 0 3 44 2222222222 0 88 00 11111 1 000000000 0 77 1 4 1 66 55 1 1 6666 77 5 1 1 55 5 0 000 55 1 0 3 7777 33 5 77 66 5 2222 0 44444 00 666 1 2 444444444444 3 6 1111111111111111111111111111111 2 6 7 66666 6 99 6 111 6 111 3 99 5 0 0 5 5 9999999999999 8 1 3 1 4 777 11111 222 2 6 3 55 77 3 2 1 1111 55 555 3 77 4 0 0 0000 3 1 3 3 0000000 6666666 11 2 0 3 66 3 1 7777777 3 444 2 44444 4444 4 2 2 2 6666666 666666 222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 2 2 1 2 33 1 5555 2 555 3 33 2 2 33 6666 0 000000000 55555 2 777 7777777777777 2 44 11111111 33 444 99999 33 5555 55 11111 0 55 33 2 2 33 2 7777 2 2 999 1 2 5555555555555555555 2 2 99999999999999999999999999999 0 2 77 7777 5555 2 2 2 444444444444 7777 8888 6 6 44 4 6 3 2 0 3 44 44 3 55555555555 3 1 3 44444444 33 44 6666 8 0 3 3 88 3 55 55 444 666 3 4 777 4 999999999999999 4 44 4 4 5 55 3333333333333 2 3 333 3 555 000000000000000 3 44 55 000000 0 4
lowQualScore : . . .. .. . .. . ...... . . .. .... . . ... . ... .. . . .... . . . . ... ... ... . ... . . . . . . .... . . .. ....... . . .. ....... . . . . . .... ..... . . . . . . . . .. . .. . .. . . . . . . . . . . . .. .......... . . ... . . . . . .. . ..................... .. .. . . . ....... . . ...... . .... . . . . . . ..... . . . .. . . . . . .... .... . .. ................... ... .......... .. .. ........ . . .. .......... . .. .. ..... . ......... . .. . . . .. .. . . .... .. . . . .. . . ... .. . . . .... .. . .. .. . .... . ..... .. ... . . ............ . . ............................... . . . ..... . .. . ... . ... . .. . . . . . ............. . . . . . ... ..... ... . . . .. .. . . . .... .. ... . .. . . . .... . . . . ....... ....... .. . . . .. . . ....... . ... . ..... .... . . . . ....... ...... ......................................................... . . . . .. . .... . ... . .. . . .. .... . ......... ..... . ... ............. . .. ........ .. ... ..... .. .... .. ..... . .. .. . . .. . .... . . ... . . ................... . . ............................. . . .. .... .... . . . ............ .... .... . . .. . . . . . . .. .. . ........... . . . ........ .. .. .... . . . . .. . .. .. ... ... . . ... . ............... . .. . . . .. ............. . . ... . ... ............... . .. .. ...... . .
lowQualScore : 0 0 22 22 7 22 7 555555 7 6 44 9999 2 1 000 0 444 99 2 1 5555 0 0 1 1 555 000 888 4 555 4 9 0 7 1 7 3333 3 0 99 0000000 3 4 00 0000000 0 4 0 0 4 0000 00000 4 0 4 0 4 0 8 0 88 0 44 0 44 4 0 2 0 5 5 3 3 0 9 6 44 3333333333 2 2 444 0 0 9 1 0 66 0 333333333333333333333 99 99 8 9 1 8888888 4 9 333333 4 7777 1 5 3 2 4 4 11111 3 2 0 66 3 2 0 7 7 1111 8888 3 22 8888888888888888888 555 8888888888 77 55 55555555 4 7 66 5555555555 4 55 66 55555 0 333333333 5 00 1 4 0 11 66 0 0 1111 33 4 0 2 33 7 1 111 66 7 5 2 4444 22 0 99 99 7 1111 1 33333 66 888 0 5 222222222222 7 7 0000000000000000000000000000000 5 7 8 77777 7 55 7 777 7 777 6 88 0 1 7 3 0 1111111111111 5 1 4 1 4 888 11111 222 9 9 0 55 44 5 3 3 0000 00 888 3 99 6 8 2 5555 2 0 1 1 0000000 5555555 22 7 3 1 33 6 0 9999999 8 777 5 55555 7777 4 1 1 5 2222222 111111 666666666666666666666666666666666666666666666666666666666 4 4 1 4 22 6 0000 4 777 4 22 5 4 11 1111 7 000000000 55555 9 333 8888888888888 9 00 44444444 99 777 33333 22 7777 99 66666 9 88 44 7 7 44 5 7777 9 1 444 1 5 0000000000000000000 9 9 11111111111111111111111111111 9 9 66 9999 4444 9 9 9 666666666666 6666 9999 2 2 22 2 7 1 5 2 3 66 22 1 44444444444 1 0 1 22222222 88 66 2222 7 1 6 6 66 6 00 00 444 222 6 4 888 4 444444444444444 0 77 0 0 0 55 1111111111111 3 6 666 3 888 888888888888888 3 66 00 111111 9 4
consensus : GCTCACCGACAGCTCTCG--GACGAACGCTTT--TAT-A--AA-AAGTTACAGTCTGACCCT-ACCAAAGAGTTCTCCGCCAAGATCA--C-GAAACCCTTCAGGAAATGT-ACG--A--AGGGCGA----AATC-GGTGACAA-CGTCTTCGAAAC---GCTTC-GTC---CCAAC-GACTGTAGACCGGGACAATTTTATNTACTGCCT-AAAATCCAC-AAG-A-AAGACATGCCNGGCCGCCCT-ATAGT-C-G--NGCCATCGG-AC-------ACCCCACGGAGAAAATCTCNGAATTCATTGACCT-ACATCTCCGC----CCGCA-----TGTAANAGANCTACCGTCATA-CTTGAAGGACACCACT-GATTACCTAAACGAAA-CCCCA-CNTCG-GACCTACCTGACNACACCCTTCTTGTGACNATGGACGTNACTTCACTNTACACTAA-CGTT--CCACACGACGAGG-ACAT-CGA-GGCNTGCAGGGAGGTT-TGGAAT-ANA--------A--G-----CC--TCAAAA--TC--CTTCCACTGAATCACTCGTCCAGCTCCT-----T-GAACATGTCCTCA-AGTTCAA--TA--ACTTCATGTTCGA---CGGCGAACACTACCTGCAAAT-A-GTG-GCACN-G--CTATGGGAACCAAA-ATGGCNCC-NT-CNTACGCCAACA-TCTTTATGGGAA--GACTC-GAACGTAACCT-CCT---GC--A----TCGNT--CACCNTTTAAACC-CCTTA----GTTG-GCTACGTTTC-AT--G-ATGACATTGAGATG--AAGTG----GGC---TGACGG-TCGCGAAAGCCNCGACGACTTTATC----GCGNTTGCGAACTCTTTCCAC-NATTCCATC-AAGTTCACNG--TG-GANATTTCC-GCATCCAG-GAACGTNTTTTTGGATACCACGTC-CACACTTAC-GAACGGAGAAATCGAGTTCAGCCTCCAT-A-CTAAA-CCCACCGACTCTCATT--TGTACCNTAT-GCCATCC----AGCTGTC-----ATCCGCCCCAT-A-CNTTCA------------AAGGTGT-GCC---------GCC---C--G-CGTCC------GCCGCATCTGCTCTATT-CCTACCACT-----TTCCA-AGAGACA-AG---GACAC-ATCCT-N-AAAGTCCATCTGCGCAAACAGAGGCTATGAAGT----CCT---CGCAAGGTGCAGTCCGCAAT-TGATG---AGAT-----GT---CACAACANGACAG--ACAGTCCCTCCTNCAATATAAAGAAAAACC-TCAGA--A---T-G--ACAGAGTTCCACTGGTCACTAC-T--TACCACCCCGTCCTNAA-G-GAC-------CTC-------AACANTAT-TCTGAGAAAGC--ATNTNCCCATT-----CTTCA---TAC-CAATAAAC---GAATGGCT--GAT-GTTT-TCA-AGGA---A---C------C----------T-------CC----------G---------T------T-----C--AGAC-GCC-CCAGAAA-C--CTGAAG----GACATG-GTGGTG--AGGACCAGATTGG--ATA-ACCC-TTTAC--CTAATGG---AGGTTTCAAAAC--------AT--GC-TCAGA--CCT-CA--A-----G-ATG-TC-AA--TC--G-TGC--AAAT---AT-----AGC-TC----AGAC--ACT-----GAGAGCTTT--A-GCA-GTCC--TG-T-C--ACAGGTCG-C-AGTT-AT--------------A---AAA-TATTG-G--------------G--G-AACTACG---TCCCG-TAA-AAC---CGAC---AAC-T-G-CAT-C----------TA-C--CTC----ATCAGC-TG-T--AANGTC-TG-CCAGAAA-CA--GTA--CG-T----------GG-GNGA-AA--------CTAC-GG--ACC---TNCGCAGAA-GGGT-CAA--CAA-CCACC--GGTCCN-CC-G-T-C-AAGACCAA-AA-A---G-GA-T--CC-----G---C-CG-GTA-GC-TACGCA--TTTCAA------T---G-GTAGCAATCA-CCG-AT-GG---GA---------------GG-ACA--TGACAA--TA-----NTAGTTATTGATCAT
Reference ( family-868 ) : GCTCACCGACAGCTCTCG--GACGAACGCTTT--TAT-A--AA-AAGTTACAGTCTGACCCT-ACCAAAGAGTTCTCCGCCAAGATCA--C-GAAACCCTTCAGGAAATGT-ACG--A--AGGGCGA----AATC-GGTGACAA-CGTCTTCGAAAC---GCTTC-GTC---CCAAC-GACTGTAGACCGGGACAATTTTATNTACTGCCT-AAAATCCAC-AAG-A-AAGACATGCCNGGCCGCCCT-ATAGT-C-G--NGCCATCGG-AC-------ACCCCACGGAGAAAATCTCNGAATTCATTGACCT-ACATCTCCGC----CCGCA-----TGTAANAGANCTACCGTCATA-CTTGAAGGACACCACT-GATTACCTAAACGAAA-CCCCA-CNTCG-GACCTACCTGACNACACCCTTCTTGTGACNATGGACGTNACTTCACTNTACACTAA-CGTT--CCACACGACGAGG-ACAT-CGA-GGCNTGCAGGGAGGTT-TGGAAT-ANA--------A--G-----CC--TCAAAA--TC--CTTCCACTGAATCACTCGTCCAGCTCCT-----T-GAACATGTCCTCA-AGTTCAA--TA--ACTTCATGTTCGA---CGGCGAACACTACCTGCAAAT-A-GTG-GCACN-G--CTATGGGAACCAAA-ATGGCNCC-NT-CNTACGCCAACA-TCTTTATGGGAA--GACTC-GAACGTAACCT-CCT---GC--A----TCGNT--CACCNTTTAAACC-CCTTA----GTTG-GCTACGTTTC-AT--G-ATGACATTGAGATG--AAGTG----GGC---TGACGG-TCGCGAAAGCCNCGACGACTTTATC----GCGNTTGCGAACTCTTTCCAC-NATTCCATC-AAGTTCACNG--TG-GANATTTCC-GCATCCAG-GAACGTNTTTTTGGATACCACGTC-CACACTTAC-GAACGGAGAAATCGAGTTCAGCCTCCAT-A-CTAAA-CCCACCGACTCTCATT--TGTACCNTAT-GCCATCC----AGCTGTC-----ATCCGCCCCAT-A-CNTTCA------------AAGGTGT-GCC---------GCC---C--G-CGTCC------GCCGCATCTGCTCTATT-CCTACCACT-----TTCCA-AGAGACA-AG---GACAC-ATCCT-N-AAAGTCCATCTGCGCAAACAGAGGCTATGAAGT----CCT---CGCAAGGTGCAGTCCGCAAT-TGATG---AGAT-----GT---CACAACANGACAG--ACAGTCCCTCCTNCAATATAAAGAAAAACC-TCAGA--A---T-G--ACAGAGTTCCACTGGTCACTAC-T--TACCACCCCGTCCTNAA-G-GAC-------CTC-------AACANTAT-TCTGAGAAAGC--ATNTNCCCATT-----CTTCA---TAC-CAATAAAC---GAATGGCT--GAT-GTTT-TCA-AGGA---A---C------C----------T-------CC----------G---------T------T-----C--AGAC-GCC-CCAGAAA-C--CTGAAG----GACATG-GTGGTG--AGGACCAGATTGG--ATA-ACCC-TTTAC--CTAATGG---AGGTTTCAAAAC--------AT--GC-TCAGA--CCT-CA--A-----G-ATG-TC-AA--TC--G-TGC--AAAT---AT-----AGC-TC----AGAC--ACT-----GAGAGCTTT--A-GCA-GTCC--TG-T-C--ACAGGTCG-C-AGTT-AT--------------A---AAA-TATTG-G--------------G--G-AACTACG---TCCCG-TAA-AAC---CGAC---AAC-T-G-CAT-C----------TA-C--CTC----ATCAGC-TG-T--AANGTC-TG-CCAGAAA-CA--GTA--CG-T----------GG-GNGA-AA--------CTAC-GG--ACC---TNCGCAGAA-GGGT-CAA--CAA-CCACC--GGTCCN-CC-G-T-C-AAGACCAA-AA-A---G-GA-T--CC-----G---C-CG-GTA-GC-TACGCA--TTTCAA------T---G-GTAGCAATCA-CCG-AT-GG---GA---------------GG-ACA--TGACAA--TA-----NTAGTTATTGATCAT
gi|1 : GCTCACAGACAGTTGTCA--GACGAACGTTTT--TAC-A--AA-AAGTTGCAGTCTGACCCC-ACTAAAAA-TTCTCCATCAAGATCA--C-GAGACCCTTCAGAAAATGC-ATG--A--AGAGTGA----AATC-GGTGATAA-TGTACTTGGAGC---GCTTT-GTC---CCAAC-GACTGTAGACCTGGACAATTCTACTTACTGCCT-AAAAT-TAC-AAG-A-AAGACATGCCAGGCCGTCCT-ATTGT-CAG--TGCCATCGG-AC-------ACCCCACGGAGAAAATCTCTGAATTCATTGATTT-ACATCTCCGT----CAGCA-----CGTAGAAGATTTACCGTCATA-CTTGAAGGATACGACT-GATTACCTAAATAAAA-CCCCA-CATCG-GGCCTGCCAGACCATACCCTCCTTGTGACTATGGATGTGACGTCACTCTACACCAA-CAAT--CCACATGATGAGG-GTAT-TGA-GGCCTGTAAAGAGGTT-TGGAAT-CAA--------AGGG-----TCAGTCAACA--TC--CCTCAACTGAGTCACTCATTCGGCTTCT-----T-GAACATGTCCTCA-AGTGTAA--TA--ACTTCATGTTTGA---CGGTGAACACTACCTGCAAAC-A-GTG-GCACT-G--CTATGGGAACAAAA-ATGGCACC-TT-CCTATGCCAACA-TCTTTATGGGAA--GATTG-GAACGTAGACT-CCT---GC--A----TCACT--CACTAGTTAAACC-TCTCA----GTTG-GCTACGTTTC-ATA-G-ATGACATCGAGATG--AAGTG----GGT---TGATGG-TCGTGAAAGCCTCAACGAGTTTATT----AAGATGGCAAACTCTTTCCAC-GATTCCATC-AAGTTT-CTG--TG-GATATTTCA-ACATCCAG-GAATACGTTTTTGGATA-CACAGC-AACACTTAA-GGACGGAGAAATCGAGTTTAATCTTCAC-A-CGAAA-CCCACAGATTCTCATT--TGTACCTTAT-GCCATCC----AGCTGTC-----ATCCACCCCAT-A-CTTTCA------------AAGGTGT-GCC---------ACC---T--G-CATCC------GCCGCATCTGCTCTTTT-CATACTAGT-----TTCCT-AGA-ACA-AG---GAAAT-ATCCT-C-AAAGTCCATCTA-ACCAGCAGAGGATAT--AAT----CCT---TGTAAAGTACAGTCCGTAAT-TGATG---AGAT-----GT---CACAACAGGACCG--ACAATCCCTCCTCCAATATCAAGTGAAACC--CAGG--A---TCA--ACAGGGTCCCACTAGTCACTAC-T--TACCACCCTGCCCTTAG-G-GAT-------CTC-------AATAGTAT-CATAAGAAAAC--ATTTGTCTATC-----CTGTA---TGC-CAACAAAC---GTATGGCG--GAT-GTTT-TCA-AGGA---------------------------------TC----------G---------T------T-----C--CGGC-GCC-CCAGAAA-C--CTGAAG----GATATG-GTGGTA--AGGACCAGGCTGG--ATA-ACCC-TCTAC--CTAATGG---AGGTTTCAAAAC--------AT--GC-TCAGA--TCT-TA--A-----A-ATG-TC-AA--TT--A-TGC--AAAC---AT-----AGC-TT----AGAC--ACT-----GAGACTTCC--A-GAA-GTCC--TG-T-G--ACAGATCG-C-AGTT-AT--------------A---AAA-TATTG-G--------------G--G-AACTACA----CCTG-CAA-AAC---CAAT---AAC-T-G-CAT-C----------TA-T--CTC----ATCAAT-TG-T--GATGTC-TG-CCAGAAA-CA--GGA--CG-T----------TG-GAGA-AA--------CTAC-AG--ACC---TTCGTAAAA-GGGT-AAA--CAA-TCACC--GGTCCT-CC-G-T-T-AGGACCAA-AA-A---G-GA-C--TT-----G---C-CG-GTA-TC-TACGCA--TTTCAA------T---G-GTAGCAATCA-CCG-TT-GG---GA---------------GG-ACA--TGACAA--TA-----TTAGTGATTGATCAT
gi|10 : AGGACACCACT-GACTACCTCAATGATA-CTTCTTCTTCA-GACCTGCATGAAGACACTTTGTTGGTTACAATGGACATCACTTCATTGTATACCAA-TATT--CCACACCAGGAGG-GCAT-TGA-GGCATGCAGAGAGGTC-TGGAAA-ACA--------A--GAACCACC--CCTAAA---C--CTTCCACAAAATTATTGGTTCTACTCCT-----T-GAGCATGTCCTTA-AGTTCAA--TA--ACTTTATGTTCAA---TGGTGAACACTATCTACAAAT-AAGTG-GCACT-C--CCATGGGCACCAAA-ATGGCTCC-CT-CTTACGCTAACA-TCTTTATGGGTA--AACTT-AAACATAATCT-GCT---AC--A----ACAAG--CACCTGTTAAGTC-GTTCA----GCTG-GTTACGATTC-ATT-G-ATGACATTGAAATG--AAATG----GGC---GAACAG-TCGAAGCAGTCTTGACAACTTCATT----GAACTTGCAAACGCTTTTCAT-ATTTCCATC-AAGTTCACAG--TG-GATATTTCC-GCATCTAG-CAACGTCTTTCTGGA
gi|11 : -CAATAAA----GAATGGCT--GAT-GTTT-TCA-AAGA---G---C------CACACTATGGCT-------GC----------C---------T------T-----T--AGGC-GCC-CACGAAA-C--CTGAAA----GACATG-GTGGTT--CGAACCAAGTTGG--AAA-ATCC-TTTAC--CCAATGG---TGACTTTAAAAC--------CT--AT-TCAGA----TAAA--A-----G-ATGTTT-GA--T---G-TGC--AAAC---AT-----ACT-TC----TAGC--ACC------ACAGTTTT--G-AAA-GCCC--TG-T-C--ACCGGTCG-A-TCTT-AC--------------A---GAA-TATTG-G--------------G--G-AA--ACG---TCCTG-TCG-AAG---TGAC---AAC-T-G-CAT-C----------TA-C--TTG----ATCAGC-TG-C--AAAA---TG-TCAGAAA-CA--ATA--TG-C----------GG-GTGA-GA--------CTGG-CG--ATA---TACGCCGAA-GGA---------------C--GGT-CA-CC-A-T-A-AAAAC--A-AA-A---G-GG-T--CCAAGGAA---C-CC-GTC-GC-CAAGCA--TTTTAA------TCTCG---AGGAA-CA-CTC-AT-GG---GA---------------AG-ACA--TGACGG--TG-----GTGGTTA-TGACCAc
gi|12 : atatatatatgacacgCCT-CGAAAGTC-ATCCG-ACAAACAG--GATATGA--T----CCT---TGCAGGGCACAGTCCGCAGT-TGATA---AGAT-----GC---CACAACA-GACCG--ACAGTCCCTCCTCCAGTACACAGAAAACCC-TTAAA--A---T-G--ACAGAGTTCCGCTAATCACTAC-T--TACCATCCCGCCCTCAA-G-A---------CTC-------CACATTAT-TCTGAGAAAGT--ATCTACCCATT-----CTGCA---AGC-CAATAAAC---GAATGGCT--GAT-GTTT-TCA-AGTA---A---C------C----------T-------CC----------AATGACATGCT------T-----C--AGAC-GCC-CTAGAAA-C--TTGAAG----GACATG-GTAATA--AGGACCAGACTGG--ATA-ACCT-TTTAC--CTAATGG---AGGTTTCAAAAC--------TT--GC-ACTGG--CCT-C---A-----G-ATG-TC-AA--CT--A-TGC--AAAT---AT-----AGT-TC----AGAC--ACT-----CAGAGCTTT--A-GCA-GTCC--TG-C-C--ACAGGTCG-T-AGTT-AT--------------A---GAA-TATTG-G--------------G--A-AACT-TT---TCCTG-CAA-AACTATTAAC---AA--T-GTCAT-C----------TA-T--CTC----Agacatccactggacggatgcagacagaaaaggcaagaagttttggatgcataggctgtaaaag
gi|13 : TTAAAAGACACAACA-GACTTTC-AAATGTAA-CTCCA-AAGCAAGGCCCACCAGACCACACACTT---------ATAAA--TAAC----CTTGACATTAA-CGTTTTCCATATGACAAAA-ATAT-CAATGGC-TGCAGGGAAGTT-TGAAATGACA--------A--T-----C----CAAAA--TC--CT---AGTAAATCACTCATTCAG--------------------CCTCA----TCAA--CA--ACTTCTTGTCAGA---CAGCAAACAT----------T-A-GTG-GTCTC-G--CTAT-GAAACCAAT-ATGGCACCAAT-TTTA----AACA-T----------A--AACTC-AAACGTAGCCC-ATT---AA--A----CCAAA--CATCATGCAAATC-CCT------GT----CTACTTTTCAAA--G-ATGACATAGAGATA--A---------GCCCATAAGAG-TCG-GAAGG-------------AT---------TTGCAAACTCTTTCCA------CCATC-AAGCTTAAAG--TG-GAAATT------AT-------AC--TCTCTTGGTCACCACTGC-CACATCTACAGAATTTA-AAATCAATTTCAGCCTCCCC-A-CTAAG-TCCACa
gi|14 : ACTTGCAAATCA-GTTCGCATG-G--CTAAGTTAACTAAA-ATGGCAAA-AT-CTTATGCCAACA-TCTGCATG----------------GTAGCAC-CCT---AT-------TTGTT-----------AGCC-----A----GTTG-GCTATGTTTC-A---------CATTGAGATG--AAGTG----A-------ATGA-TCATGAAAAATCCGA-GACTTCGTC----ACGGTTCCGAACTCTTTCCTT-TATTTGATG-AAGTTCACTGCATGTGGCAATTCC-ATCTCCAA-AA---TACTATCGGATACCACAGC-TACACTTAT-AAATGG-GAAACTGAGTTCAATCCCCATAA-CTCAA-CCCACCGACTCTCATTAATATACCATAT---CATCC----AACCATCCTAAAATGTGTCCTAA-G-CTTT--------------------T-GTC---------GTC---C--A-AATTT------GCTGCATCTTCTCTATTACCCACCACT-----TTCCA-AGAGGCA-AG---GACAC-TTCCTAA-AAAGTCaa
gi|15 : ---AT-----AGC-TC----AGAC--ACT-----GAGAACTAC--A-ACA-GTCA--CA-T-T--ACGGGTCA-C-AGTT-AC--------------A---CAA-TATTG-G--------------G--G-AATT--T---TCCCG-TAA-AAT---TCAT---AAT-T-G-CAT-T----------TA-T--CTC----AACAGC-TG-T--AATGTC-TG-CCAGATA-CAATGTATTCA-TATGGGGGGGGGG-GTGT-AA--------CAAC-AG--ACC---TTC-CAAAACAGGC-TAA--CAA-CCACC--GGTCCG-CT-G-T-C-GAAACCGA-GA-A---A-GG-T--TT-----G---T-CA-GTA-GC-TACCCA---TTCAA------T---G-ACAGTAATAT-CCG-AT-TG---GA---------------GG-CCG--TGACAA--TA-----ATGGCTAT
gi|16 : GCTCATCGACAACTCTCA--GACGAACGCTTT--TAT-A--AA-AAGTTATAGTTTGACCCT-ACCAAAGAGTTCTCTCCTAAGATAAT-C-AAAACCCTTCATGAAATGT-ACA--ACAAGGGTGA----AATC-GGTGACAA-CGTTTTCGACAT---GCTTT-GTC---CTAAC-GACTGCAGACCAGGACAATTTTATATACTGCCT-AAAATCCAC-AAA-G-TAGACATGCCACGCCGTCTT-ATAGTCC-G--AGCCATTGG-ACCGTCATGATCCCAAGGAGAAAATCTCTGAATTCATTGatattgaacatgacaaaagttttcagatacccagagaaaacaaaaggaaatgattagggatgcaaatattgaagtaattttatcagcaagatctaaacatgcccactaacttcacccggatgaata
gi|17 : agataatctcaccaaagaagaaagattggcgttgcaaacattgatattgtcattaaaaggacagacaaaggttctacttaagttgtcttggacaaagacgggtacttgacggagGCTC-TCG-CAACTCTCAATGACGAACGCTTT--TATTA--AATAAGTTATAGTTTGACCTA-ACCAAAGAGTTCTTCTCTAAGATAAT-C-AAAACCCTTCATGAAATGT-ACAACA--AGGGTGA----AATC-GGTGACAA-CGTTTTCGACAT---GCTT---TC---CT-AC-GACTGCAGACCAGGACAATTTTATATACTGCCTAAAAATCCACAAAG-T-AGAACATGCACGGCCGTCTTAATAGTCC-G--AG-CATTGGAACGTCATG-ATCCCAAGGAG-AAATCTCTGAATTCATT
gi|19 : gagataatctcaccaaagaagaaagattggcgttgcaacatttgatattgcattaaaaggaaacaaagttctaacttaagtgtcttggacagaagacgggtacttgacggaTCCGCAAC-TGATG---AAAT-----GT---CGCAATAAGGCCG--ACAGCCCCTTCTCCATTTTAAAGAAAAACC-GCA-A--A---T-G--ACAGGGTTTTGCTTGTCACTAA-C--TATCACCG-GTCTTGAA-G-ATC-------CTC-------AGCTGTAT-TCTGTAAAAGC--ATCAACCCATT-----CTGCA---TAC-CAGTAAAT---GAATGGCT--GAT-G-TT-TCA-GGGA---A---T------C----------C-------CC--------------------T------A-----T--AG-C-ACC-AGAGAAA-C--CCCAAG----GATACG-ATAGTA--AGGACAACACTAT--ATA-ACCCTTTTAC--CTAATGG---------TAAAAC--------AT--AC-TCAGA--CTT-CA--GTACATGTATG-TC-AA--TT--G-CAC--AAAT---ACATGTAAGC-TC----AGAC--ACA-----GATAGCTTT--A-GCA-GTCC--TG-T-TCGACAGGTCG-TGAGCT-AT--------------A---AGA-TATTG-G--------------G--A-AA
gi|2 : GCGCACAGACAGCTCT-G--GATGAACGGTTT--TAC-ACTAA-AA----C--TCCGACCCT-ACCAAAACGTTTTCCGCTACTATCA--CCGACACTCTTGAGCAAATGTTACA--A--AAAACGAGGAAAATT-GGTAATAA-TGTCTTTGAAACAGTGCTGC-CTC---TCAAC----TGTACACTGGG-CAATTTTATCTCCTGCCT-AAA-TCCAC-AA--A-AAGGCATTCCTG-CCGCCC----------------CATTGG--C-------ACCCCACGGAGAAAATCTCAGAATTTATTGACCT-ACACCTCTGC----CCATA-----TGTTGTAAAACTACCATCATA-CTTGAAGGACACCACT-GATTACCTTAACAAAAACCCCT-CTTCG-AACCTACCTGACAATACCCTTCTCGTGACCATGGATGTGACTTCGCTTTACACAAAACATC--CCCCACGATGAAG-ACAT-TGA-AACCTGCTGGGAGGTT--GGGAT-AAA--------A--GGAT--CC--TGAAAACATC--CTTCCACAGAATCATT-GTCAAGCTCCT-----T-GAACATGTCCTCA-AACTAAA--TA--ACTTCATGTTCCA---AGGCAACCATTACTTACAAGTTA-GGG-GCACAAG--CAATGGGAAACGAAGATGGATCC-TTTCATATGCCAACA-TTTTTATGGGAA--GACTT-GAACGCAACTT-ACTCAGGC--A-------AT--CGCCCTTTAAACC-CCATA----ATTG---TGTGTTTC-ATTTG-ATGACATTGA-ATG--AAATGAAATGGC---GGAGGG-CCGAGATA--CTTGACAACTTTATC----TCCTTTACCAACTCATTTCAC-CATTCCATTTAAATTTACAG--TG-GAAATTTCCAGC-TCCAA-GAACATATTCTTGGATACCGCTTC-CACTCTCTT-GGATGGTGAAATTGAATTCAGCTTCCAT-A-CCAAAACCCGCTGACTCACATT--TGTAC-TTATTGCCTTGA----AGCTGTC-----ACCCACCTCAT-A-CCTTCA------------AAGGAGT-ACCTAAGGTTTAGCTACAC--G-AGTTC------GTC-TATCTG-----TT-CCTCTGGCTCGGAATTCGA-AAAAACA-AATCAAACTCTATCTT-G-AAAAGCCACCTTTGTAAA-AGGGGCTGTAAAGTTGTTCCTGTTCACAA----CAG----CAAT-TGACG---AT-T-----GTC--CAGAACAAGtct
gi|2 : gacaaacttaagcatagaagaagagcttagccttataagagcttaaaaaaaaactcggatgacattgctatcaaaaaggcagacaaggtcaacagtggttgtattagacaagacagcatacatagcggaaCCCGCCCTGAA-G-AAC-------CTC-------AATACCAT-CCTTA--AAGCC-ATTGTCCTAT------CTGTA---TAA-CAAAGAAC---GAATGGCT--AGG-GTCTCTTA-AAGA---C---C------A----------T-------CC----------AATGGCAGCTT------T-----C--AGAC-AAC-CTAGAAT-T--TAAAAG----GATATT-GTAGTT--AGAATTAGGCTGG--ATA-ACCC-ATTAC--CCAACGGGGCGGGTTTTCCCAC--------GT--GC-TCTGA-------AAGA-----G-ATG-TC-----TCCAG-TGC--AAAT---TC-----AG---C----GGGCCAACT-----GA-CGCTTT--caaaactctaaattttcacccgccctgaagaacctcaataccatccttaaagccattgtcctatctgtataacaaagaacgaatggctagggtctcttaaagaccatccaatggcagctttcagacaacctagaatttaaaaggatattgtagttagaattaggctggataacccattacccaacggggcgggttttcccacgtgctctgaaagagatgtctccagtgcaaattcagcgggccaactgacgctttcag
gi|20 : gacaaacttaagcatagaagaagagcttagccttataagagcttaaaaaaaaactcggatgacattgctatcaaaaaggcagacaaggtcaacagtggttgtattagacaagacagcatacatagcggaagcgcacagacagctctggatgaacggttttacactaaaactccgaccctaccaaaacgttttccgctactatcaccgacactcttgagcaaatgttacaaaaaacgaggaaaattggtaataatgtctttgaaacagtgctgcctctcaactgtacactgggcaattttatctcctgcctaaatccacaaaaaggcattcctgccgccccattggcaccccacggagaaaatctcagaatttattgacctacacctctgcccatatgttgtaaaactaccatcatacttgaaggacaccactgattaccttaacaaaaacccctcttcgaacctacctgacaatacccttctcgtgaccatggatgtgacttcgctttacacaaaacatcccccacgatgaagacattgaaacctgctgggaggttgggataaaaggatcctgaaaacatccttccacagaatcattgtcaagctccttgaacatgtcctcaaactaaataacttcatgttccaaggcaaccattacttacaagttaggggcacaagcaatgggaaacgaagatggatcctttcatatgccaacatttttatgggaagacttgaacgcaacttactcaggcaatcgccctttaaaccccataattgtgtgtttcatttgatgacattgaatgaaatgaaatggcggagggccgagatacttgacaactttatctcctttaccaactcatttcaccattccatttaaatttacagtggaaatttccagctccaagaacatattcttggataccgcttccactctcttggatggtgaaattgaattcagcttccataccaaaacccgctgactcacatttgtacttattgccttgaagctgtcacccacctcataccttcaaaggagtacctaaggtttagctacacgagttcgtctatctgttcctctggctcggaattcgaaaaaacaaatcaaactctatcttgaaaagccacctttgtaaaaggggctgtaaagttgttcctgttcacaacagcaattgacgattgtccagaacaagcaaaactctaaattttcaACAG--ACAGGTCCTCTTCCACTATGAAGAAAAACC-TCAAA--A---T-G--ACAGAGTTCCACTAGTCACTAC-T--AACCGTCCTGTGCTCAA-A-AAC-------CTC-------AACACTGT-TCCAAGAAAAC--ATGTGT--------------A---TGC-CAATAAAT---GAATGGCT--GAT-GTTT-ACA-AGGA---A---C------CCCTATGGCA-T-------CC----------T---------T------T-----T---GAT-GTC-CCAGAGA-C--CAGAAG----GACATG-GCAGTA--AGGGTTAGACTGAATATA-ACCC-TCTAC--CTAATGG---AGGTTTC-ATAT--------AT--------GA--CCT-C---A-----C-ATG-TC-AA--TC--A-TGC--AAAT---AT-----AGC-TC----AGAC--ACTGGCCAGGGAGATTT--A-GCA-GTCT--TG-T-C--AGGGGTTG-C-AGTT-AT--------------A---cag
gi|21 : aaACAG--ACAGGTCCTCTTCCACTATGAAGAAAAACC-TCAAA--A---T-G--ACAGAGTTCCACTAGTCACTAC-A--TA-----CCGTGCTCAA-G-AAC-------CTC-------AACACTGT-TCC-AGAAA-C--ATGTG-------------------TACTCAATAAAT---GAATGGCT--GAT-GTTT-ACA-AGGA---A---C------CCCTATGGCA-T-------CC----------T---------T------T-----T---GAT-GTC-CCAGAGA-C--CAGAAG----GACATGCGCAGTA--AGGGTTA-ACTGA--ATATAACC-TCTAC--CTAAT-G---AGGTTTC-ATAT--------AT--------GA--CCT-CA--C-----A-GTG-TC-AA--TC--A-TGC--AAAT---AT-----AGC-TC----AGAC--ACTGCCA-GGGAGATTT--A-GCA-GTCT--TG-T-C--A-GGGTTG-C-AGTT-AT--------------A---
gi|23 : a---C-CT-GTT-GC-CAAGCA--TTTCAA------T---C--TAGCAGAAA-CAA-AT-GG---GAAAACATGAGAATGGAGA-ACA--TGACAA--TA-----GTATTTA-TGATCA
gi|24 : gggtcaaaa-AAAACCCATTTGTGCAAA-AGAAGCTATGAAGC----CCC---AACAA--TGCAAGCAGCTAT-TGATG---TGAT-----GT---CAGAACACGACAT--ATTATCCCTACTACAATTTAAAGGTAAATTGTTAGATTA---T-GA-ACAGAGACCTAACGGTTGCAAC-G--CACCACCCTGTCTTGAA-A-GAC-------CTA-------AACAATAT-TGTGAGAGAGCATATATTCCCAAT-----CTTCA---TAC-TAACACTA---GAATGG-------------TCA-ATGA---A---C------C----------T-------CC----------gaactcccactggaaaggaataacaaagaaaaaatctggatgcgtagccactccgccctgatggcacgacttccctagaatgaatgtgacttgggtactctagttattactcagtatttacaatttctatttgccatttactttgtgtaaaagcaccatcattagcagtcaatctttccatacttgttctgatttttttttta
gi|25 : aagaacagagcacccgactga-AC-GG---GA---------------GG-ACA--CGAC-A--TA-----GTGGTTATTAATCATcattgcggcctctgctaccgaattcttgggaagaca
gi|27 : ATCA--CTGACACTCT-AAGCAGATGT-ACA--A--ATGACGAGG--AATTTGGTAATAAATGTCTTTGAAAC---ATTGCTGTCTCTCCAA-----TGTAGACCTGGGCAATTTTATCCACTGCCT-AAAATCCAC-AA--A-GAG-TATGCCTGGCCGCCCC-ATAGT---GATGGCCATTGG-AC-------A-CCCACGGAG-AAATCTCAGAATTTATTGACCCAACACCT--GC----CCACAAATGTTGTAACATACCTAC--TCATATCTTGAAGG--ACCACTAGATTACCTAAACAAAA-CCCCA-TCTCC-AACCTACCTGACAAgacctaaattggacagattcctaaagaaagcaaaaggaaaattccggatgcacagacagaagtcgtttgactccgggtgaatcactgactttcccagtatagcagggctaaacctacaaatgtttattattccggaactccatctactcttttgattcataccttcaacactatagccgtatttttcatttcatttttttaaaaatagttttacgcgctagactactttgttacatactagtttacaggaccgtgt
gi|28 : caTTT-TTA-GTGA---A---C------C----------T-------CCCTGTCGT---G---------T------C-----CTTCGAC-GGC-CCAGAAA-TAAATCAAG----GACCTT-ATGGT----AGACCAGACTGG--ATA-ATCC--CTAC--CCAATGG---GGATTTTCCAAC---------T--TC-TCTTA--ACA-CA--C-----G-GTG-CC-TA--CT--C-TGC--AAAT---AT-----ATC-CCCAAAAGAC--A-T-----GAGACATGC--A-G-A-GTCT--GA-C-C--ACAGA--A-A-AAGT-AT--------------A---GCA--ATTG-G--------------G------CCAGGTTTTTCCG-TAATGAC---CAAC---AAC-T-G-TAT-T----------TACC--CTC----ATCAACATGTT--AACGTCGTG-C---AAA-CA--ATA--TGCT----------GG-GGGA-AA--------CCAt
gi|29 : gtGCTCATTGACAGCTTTCG--GACGAACGCTTAAATAT-A--AA-AAGTCACTGCCTGACCCTCGCCACAGAGTTCTAGACCAAGATCAGCC-GAAAAATTCCAAGCATTGT-AC---A--ATGGCGA----GATC-AGTGACAA-CGTT------AC----CTT----------AAC-GCCTGTGGACCAGGATATTTTTATGTACTGCCA-AATGTTCAC-AAACACAAGACATGTTAAACTGTCCT-GTAGT-CGG--TGACTTCGG-GC-------ATCAAACGAGGAGAATTTCTTAATTCATT
gi|3 : tagacaagtactcaacaaattaaaGTTCACTG--TT-GATATTTCC-GCATCCAG-TAACGTATTTTTAGACACTATGTC-CAAGATTGT-TAACGGAAAAGTCGAGNNNNNNNNNNNN-N-NNNNN-NNNNNNNNNNNNNNNN--NNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNAGTTGTC-----ATCCTACTCAT-A-CATTCATAGGAGAAACTAAAGGTTTAGCC---------ACC---A--G-TGTCG------GCCGTATCTGCTCCACT-CCTGC-ACT-----TTATA-AAGAACAGAG---CACCC-ATCTA-G-AAAA-CCATCTGTGCAAG-AGAGGCTATCAAGC----CC----CA-AAAGTGCAAGCAGCTAT-TGATG---AAAT-----GT---CAGAACACGACAG--AGAACCCCTACTACAATACAACAACAAA---TCGGT--A---T-GTGACAGAGTCCCAATGGTTACTACGTAGTACCACCCTGTCTTAAA-A-GAC-------TTG-------AACAAAAT-TCTGAAGAGGC--ATATCCCCATT-----CTTCA-------CAATAACCCTAGGAT--CTTCAAG-ATCT-TCA-AAGA---A---C------C----------T-------CCCAT-------GGCGGCC---T------T-----C--AGAC-GCC-CCAGAAA-T--CTGAAA----GACATG-GTGGAG--CGGACTAAATTGG--ACA-ACCC-GATAC--TTAACGA---GGGCTTTATCAC--------AT--GT-TCTGA--TGG-C---A-----G-ATG-CC-TG--AC--G-TGC--AAAC---AC-----AGCATT----AG-C--ATA-----AACATTTTT--A-AGA-GCCC--TG-T-T--ACAGGCCGAC-ACCT-AC--------------C---GAATTCTCA-G--------------G--G-AA--ACA---TCCTG-TCG-CGC---GGAT---GAT-T-G-CAT-C----------TA-C--CTC----ATAAGC-TG-T--AAGGTC-TG-TGATCAA-CA--ATA--CG-T----------GG-GTGA-AA--------CTGG-GG--ACC---TACGTAGGA-GGAT-CAA--TAA-CCACC--GCTCTA-CC-A-T-C-AAAACCAA-A
gi|30 : AGGTACGGCCCGTAACATGATAGGCAGATTCTCTGTAACCACAA-AGGACAGGAACA--CCCTTTTGCAATACAAAGAGAAAA----AGA--A---A-A--AAAGA------------------------CACCCCGTCCTTAA-G-AGC-------CTT-------AACAGAAT-CCTGAGAGAGA--ATCTGCCGATT-----CTTCA---CAA-TAATGAAA---GAATGGCG--GAT-CTTT-TCA-AGGATCTA---CCAATGGC----------T-------GC----------A---------T------T-----T--AGAC-GGC-CTAGGAA-C--TTATAG----GACATG-GTGGTG--AGAGTCAAATTAG--ATA-ACTC-ATTAC--CCAATGG---TGGCTT
gi|31 : tgtTGGATGTCACGTCATTCTACATT---------------GGCTAG---CATTCAA-AGCGTGCAGCGAAGTTATGGATA-ATA--------A--G-----CTGTCCATAG--CC--CCTCCGCTGAGTCACT--TTCAACTCTT-----A-CAACGTGATCTTATAGTCCAA--TA---CTTCGTG----------GCGATCACTATTTCCAAAT-T-ATC--CACA-ATTCTATGAGAACCAGA-ACATCACT-CT-CAAAAGCCAACA-TATTCATGGAAA---------AGTGAAACCT--CT---GC--T----TC-----------TGCAATC-GCTGA------TG-ACT--GTTTC-ATG-G-ATGATATGGA-ATG--
gi|32 : -TTTAC--CTACCGG---AGGTTTCAAAAC--------ATTGGC-T-ATA--CCT-CA--A-------ATG-TC-AA--TT--GATGC--AAAT---ATT----AGC-AC----AGATT-ACT-----GAGAGCTTT--A-GCA-GTCC--TGTT-C--AC-GGTCG-T-AGTT-ATAAGATTTAGCTATAA---AGA-TATTA-GCTTAAAGATATTGGG--A-AACTTTT---TCCTA-CAA-AAC---TAATATAAACTT-G-CAT-C----------TA-T--CTC----ATCAGT-TG-CAAAATGTC-TGCCCAGAAA-CG--GTA--TG-T----------AG-AGAACAA----------ACAGG--AC------CGCAAAC-AGGT-CGA--CAA-CCACA--GGTCtatgg
gi|33 : CAAAGCGTTTTCTGCCACCATCAG-T-GAAACTCTACA--AAG----ACG--A--GG----A----AATT-GGTGAAAA-TGTCTTTGAAACATTGCTTC-CTC---TCAACTG--TATATACCTGGGCAATTCTATCTACTGCCT-AAAATCCAC-AAG-G-AGGGTGTGCCTGGTCACCC--ATAGTGT-G--TGCCATTGG-GC-------ACCCCACGGAGCAAATCTCAGAATTGATTGACCT-ACATCTCTGCATGTCCATA-----TGCTATGAAGCTACCATCA
gi|34 : gaccaacgattctatggaaggatgtt---T-G--GCAGAGATTCAATGGTTACTAC-T--TTCCACTCTGTTTTCAA-A-GAC-------ATG-------AACAAAAT-TCTGAAGAGGT--AT-TCCGCA----------------A---AATAATCTTTGGATGGCC--AGT-ATCT-TCA-AAGA---A---C------C----------T-------CCCAT-------G---------TCATCCTT-----C--AGAC-ACT-CTGGAAA-T--CTGAAA----AACATG-GTGGCG--CGGACTAAATTG
gi|35 : cgatatgT--CCACATCATGAGG-ATAT-AAA-AGCTTGCAGAGACGTA-TG--AT-ATAGTACTTACA--G-----CCATTCATAG--TT--CATCAATTGAGTCACTTACCCTGCTCCTACATGTAGAACATGTTTTGT-AATGCAA--TGTCACTT----TTCAAAAATGGTGATCACTGCCTTCAAATTA-GTG-ACACT-G--CTATGGGAACCAAA-CTGAGACC-CC-CATCTGCCGATA-TGTTttctgttgggagatgactggtgtgcaaacatagcgctaacacaattagttttaagagccctgt
gi|36 : CGTATCCTTA-AGTTTAAAATA--ACTTCATGTTCAA---CGGCAAACACTATCTGCAAATGA-GTG-GCACA-G--CTTTAGGAAC-AAA-ATGACATC---------------A-TCTTTATGGGGACTGTCCCAGAACGTAACC--CCT---AC--A----CTGGT--CACCATGTAAACC-TTGTA----GCTG-GCTATGTTTC-CT--GGATGACATTCAGATATAGAGTG----GGT---TGATGG-TCGTGGAAGCCTTAACGACTTTATC----AAGATAGCAAACTTTcttttgaaaaagtggaatacaaattgctaat
gi|37 : -CCAGAA--CA--GT----G-T----------AATGGGA-AA--------CAAG-AG--ACA---T-CGCAAAC-GGGT-TAA--AAA-CCACC--GGTCTT-AC-G-T-C-CAAACCAA-GA-A---A-AA-T--TT-----G---T-CA-GAA-GC-TAAACC--T-----------------GTAGTAATCG-CCT-GT-GG---GA---------------GG-ACA--TGACAA--GAGCGCTATGATTATTGACCata
gi|38 : acccttgtaaagcccgcatcaatttgaaaaattgattatattaaAA-AA-A---G-GA-T--CT-----C---C-CGTGTA-GCCTACACA--TTTAAAA-----T---G-TTAGCAATCA-CAG-GT-GG---GA---------------GA-ACA--TTACAA--TA-----TT-GTTATGGGTCccaaattattcatataccaaaacaaagcagaaggca
gi|39 : CACT-A--CTGTGCGAACCACA-ATGTCTCC-AT-CATACGCCAATA-CTTTCTTTGGAC--GAC----AACGCAACTTACCT---CT--AATAGTAAAT--CGCCTTTCAAGTG-CCTTACTTGGTTGTGCTAAGTTCC--------CGACATTCAAATA--GGGTG----GAC---TGACA--TC-CAAAA--TAAGACAACTTTATT----TCGTTTACGAACTCGTTTAAC-CATTCAATC-AACTTCACtgacccaagttttggtcagaaatgaggagaaatgcgaaaggaaaaaagccaggatacacaggttgttcaaaagtcatttgaagcttttgtcagggtataatcaaaccacttaagatgaaaacggaactaaaa
gi|4 : aACCCTGCCCTTAGTGCGAC-------CTTCTCT---AATAGTATGTACAAGAAAAC--ATTTGCCTATC-----C---G---TAT-CCACAAAC---G--TAGC---GATAGTTT-TCATA--A---A---C------CGC--------T-------CCTGATGACATCG---------T------TTACCGC--AG-C-GCC-CAGAAAA-C--CTGAAAAAGCGACATT-GTGTAA--AAGACCAGGTTGA--GTA-ACCC-TCTACCTCTAATGG---AGGTTTCAAATC--------AT--GTATCAGA--TCT-CG--A---------G-TC-AAGTTT--A-TGTCAAAATTAAAT-----ACT-CC----AGAA--ACT-----GAGACCTTC--AGGAA-GTCC--TG-TGA--ACA-ATCA-C-AGTTCAT--------------A---AAA-TATTGTG--------------GATG-AACT------TACCGTTAA-AAC---CAA----AAC-TCG-TATAC----------TA-T--CTCT---ATCAA--TG-T--GA-GTC-TG-CCAGAAA-CA--GT---CG-T----------TG-GAGA-AA--------CTAC-GA--ACCTTTTTCGTAAAA-GGGTACAAG-CAA--TACC----TCCT-CC-G-TGC-AGGACCAA-AATATGCG-GACT--CC-----G---CACG-GTA-GC-TACGCAGTTTCCAAGTTC--T---GTGTAGACATCA-CCGAAT-GGGTTGA---------------GGAACATGTGACAACGTG-----TTAG-TA-TGATCAT
gi|40 : tgaattgtacaacggaccgacaatcccctcacttccatatattcaaatttgcacttctccaccttcatatctcgaatatcttgcaactcaactatcgattcccgtgccgATTGCGACG--AAGTG----GGT---TGATGA-GCGTAAAATCCACAATGACTTTATC----GCAAGTGTGAGCTATTTCGAC-TATTCCATT-CTGTCCTCTG--AG-GAAATTTTC-AACTTTAG-GAATATTCTATGGGATACCACATT-CGCACTTAC-AAACGGGGA-----------GCCTTCA------------CATCGAC-ATCATT--TGTAC-GTAT-GCCATTC----ACCTTTC-----ATCCACCCgtacctactctggtcaactattcaaagaaaaaagaagagaatttctggatgaccaggttgaagtcattcgagcctcagtgtcaatccacaaatctaagctactttcccagtagatgaacacgggttagac
gi|41 : --CCATGGACACCAAA-ATGACTCC-AA-GCTACGCCAACATTTTTTATGGG-A--GACCT-GAATACAACCT-A-----GT--A----ACGTTGGCACAAAGAAAACCTTTTTA----GATG-ATTTCTATTC-AT-----TGGCATTTGGATG--AAATG----GG----TGTCAACTCGGGGAAACCTTGGCAACTTTATt
gi|42 : CACT-A--CTGTGCGAACCACA-ATGTCTCC-AT-CATACGCCAATACTCTTT---GGAC--GAC----AACGCAACTTACCT----CTAA----TAGTA--AATCCTTTCAAGT-CCTTACTG-GTTGTGCTAAGTCCC-G-------GACATTCAAATA--GGGTG----GAC---TGACA--TC-CAAAA--TAAGACAACTTTATT----TCGTTTACGAACTCGTTTAAC-CATTCAATC-AACTTCACttaaatagcccgtgcatttcatactctcattaagtttcac
gi|43 : A--TC--CTTCCATAGAATCGTTGGTCAAGCTCCT-----T-GAACATGTCCCCA-ACCTCAA--CA--ACTTCATGTTCAA---TGGCGAACATTATTTAGAAGTAA-GTG-GCACA-T--CTACGGGAACGAAG-TTGGTTCC-AT-CGTATGCCAATA-TTTTCATGGGAA--GACTT-GAACGAAACAT-GCT---TA--G----ACAAT--CACCCTGTAAGCC-CCTTA----GTTG-
gi|44 : GCTCACCAACAGCTCTTG--GACGAACGCTTT--TAT-A--AA-A---------------CT-ACCAAAGTGTTCTCTACCAAGATCAC-C-GAAACGCTCCAGG--ATAT-AC---A--AGGGTGA----GATC-GGTGACAA-CGTTTTCGAAGT---GCTTT-GTA---TTTAC-GACTGTTGACCGGGACA
gi|45 : tttactttattattatcattataaaggcagagaaagtctctaacataaAGTTCATGG--TT-GATATTCCC-GCATCCAG-TGGCGTCTATTTAGATACTACGTCGAATAC-TGT-TAACGGAAATGTCGAGTTCAAACGCCAT-A-CCAAA-GCAATTAACTCCCATT--TATATCCTGT-GCCATCT----AGCTGTC-----ATCAG-CTCAT-ATCGTTCA------------TAGGAGT-AC
gi|47 : CC---------TCC---C--G-AATCC------TCCGCATTTGATCTAAC-GCTACTACT-----TTCCATAG---CA-AG---GACAA-ATCGT-C-AAAATTCATTT-CACAAACACAGGATATGA--T----CAT---TGCAAGGTACAGTCCGCAAT-TGATG---AGAT-----GT---CACGGCATAACCG--ACAG------------TACAAAGAAAAACC-TCAGA--A---G-T--ACAGGGTTCCACCAGTAACTAT-T--TAttattttattagccactagagtccgtcatata
gi|48 : TCTTGTCAGAATAGACGTTAATTT-CTGTACACTAG-CGTC--CTGCAAGATGACC-ACAT-CGA-GGCATTTAGGGAAGTT-TAGAAG-AGA--------A--AT----TT--TCTAAA--TCATCTTCCACTGAATTGTTGGTAAAGCTCCT-----T-GGACATGTCCTCA-AACTTAA---------TCA---TCAA---CAGTGAGGACTACTTGC
gi|5 : A--CG-T----------TG-GAGA-AAA-------CTAC-AG--ACC---TTCGTAAAA-GGGT-CAAAACAATCCAC---GGTCCTTCC-G-T-CCAGGACCAA-AA-A---G-GA-T---T-----G---C-CG-TTATGC-TACGCA--TTTCAA------T---G-GTAGCAATCATCCG-ATCGG---GA---------------GG-ACA--TGACAA--TA-----ATAGTGATTGATCAT
gi|50 : cCAATCCCTTTTGCAATATAAAGAAAGATC----GA--ATGGT-G--ACAGAGTCCCAATGGTCACCAC-A--TACCACCCGGTTTTGAA-G-GAT-------CTC-------AACACTAT-TCTAAAGAAAC--ATATCCCCATT-----CTTCA---TGC-CAATAAAA---GAATGACT--GAT-GTTT-TCA-AAGA---G---C------C----------A-------CC----------gaccctagtttggtctgacattcaaagaaaaaagataggagaagttctggatgacaggttgacgtcattcgagcctcatgcatcaacaaatctgctgacttcaccaggagtgaacacggggttagaagcgattcaccggaaatcgaacactgatttacatgtaagactccccggcctgatcagtcccgaacatcctctattagattcaatcttcacaatgtatacttctcatgtgataaatttttttttttttctttctctttctatcttaaaaaaattttttttttttctcacggtctctttctctcgaaattaattgttttaattaaatctgatccacattgtgtataaattcagtattactttagaacttgacttaatagaatattcccgggtatgaactatccaatatatacctcctaattcgaatagtaagtcgttgcattattgtggatcagctaatggacgagtagggcgtatcctcattcgttccatatctaacattagatttgcaagccattaactcgaataccatgtgatttatatgtaatacggttgttacgttggagaccgatatatt
gi|52 : TAGCCT-CCT---AC--A----TTATT--CACCATTTAAACC-TCT---------------CATTT----------GACATTCAAATG--AAGAA----CAA---TGACAA-TCATGAAAGATGAAACAACTTTATATAAAGAGAAAACAAACTCTTCCCACTGGTTCAATC-AAGATCACTG--T--GAAATTACA-ACCTCTAGAGAAtatggc
gi|53 : CC--TG-T-C--ACAGACCG------------------------------A-CACTA-C--------------C--G-AACT-------CTCG-CA----C---GGAT---GAT-T-G-CAT-T----------TA-C--CTC----ATATGC-TG-T--AACGCC-TG-TGATCAA-CA--ATA--CG-T----------GG-GTGA-AA--------CTAG-GG--ACC---TACGCAGGA-GGAT-CAA--TAA-CCACCTAAATTAA-CCAG-T-C--GGACCAA-A
gi|54 : cGTTCAATC-CCAT-AACTCAA-CCCACCGACTCTTATA--TATACCATAT-GCCATCC----AAC----------------CCATGA-CT---A------------AATGTGT-GCCTAA------GCT---TTTGTCGTCCAAATTTGCTGCATCTTCTCTATT-CCCACCACT-----TTCCA-AGAGGCA-AG---GACAC-TTCCT-A-AAAgcacccg
gi|58 : TT-AT--------------A---AAA-TATTG-G--------------G--CCAACT-C----TCGAG-TAA-AAT---CAAT---AAT-T-G-CTT-A----------TA-C--CTCATTGATCACC-TG-T--AAagt
gi|59 : actacaggcaaaacAT-ACTGA-AAAGC--ATGCTCCCATT-----CTTCA---TAC-TAAC--------------------------TCA-TGGA---G---C------C----------T-------CCCATGGCT---G---------T------TTT---C--AGAC-GTT-CAAGAAA-C--CTTAGA----GACATG-GTGGTGCTAG--CCAAATTGG--Aacaatgtaacttacaatacgtgtgtgtgttaacgtggggggggggg
gi|6 : cttgaaatattcaattagaGAC--ACT-----G-----TTC--A-GCAAGCCC--GG-T-GG-ACAGGACA-G-AGCT-AC--------------A---AAA-TTTTG-G--------------G--A-GTCTATG---TCCTG-CCG-TAC---TGAC---AAC-T-G-CATAC----------TA-CACTTC----ATCAGT-TG-T--AAGAA---A-CCAAAAAGCA--GTA--CG-T----------AG-GTGG-AA----------AC-GGTGACC---TCCGAAGAA-GAGT-CAA--CAA-TCACC--GGTCCA-CT-ACT-T-AAGACC-A-AA-C---G-GA-TCACC-----GAACC-CG-TTG-GG-GA-ACA--TTTCAA------C---A-CTGAGGGTCA-CAA-AT-GG---GA---------------AG-ACA--TGACAG--C------GTAGTTATTGACCA
gi|60 : -TCTGAAGAAGC--ATTTTCCCACT-----CTTCACATTAC-CTCTA------GAATGGCC---ATGGTCT-TCA-AAGA---A---C------CA---------T-------CC----------ATGGTGGCT-T------T-----C--AGAC-GCC-CAGGAAA-T--CTGAAA----AACGTcaaccctaactggagtgactctgaaagaaaggaaccatagagaagattgctggtagtgcagcaggttactctcaaatagtacatctcttacggactgtcattgtcttcctccaaatggcacctcgaatgaatgaaaagtctctcatgaaatatggaacgttgcttgcccagaccaacgccggatactggatgcgttgagtggtggaaagcgagacgaaatgagcgtcgacccacagactttaactcatcgcctactcctcttcacaacctatactcggagtaaatttcattgatttct
gi|61 : gatttgaaacaaaaaa--ATA-ACCC-TCTAT--CTAATGG---AGGCTTCAAAAC--------AT--GC-TCAGA--CCT-CA--------G-ATG-TC-AA--TT--A-TGC--AATT---AT-----AGC-CC----AGAC--ACT-----GAGAGTTTT--A-GCA-GACC--TG-T-C--ACAGGTCG-T-A
gi|63 : T-GTTT-TCA-AAGA---ATTCC------C----------TATGACATCC--------------------T------G-----C--AGAC-ACC-CCAGAAA-C--CCAAAG----GACATG-GCAGTA--AGGACTATATTGG--ATA-ACGT-TTTAC--TCATTGG---AG
gi|66 : gCTTGTGACCATGG-TGTTACTTCACTA-ACAT------TT--CAAAATGAAGAGGTTTAT-CAA-GGCTTATAGAGAGGTT-
gi|67 : c---TTCCG-TAATGAC---CAAC---AAC-T-G-TAT-T----------TACC--CTC----ATCAACATGTT--AACGTCGTG-C
gi|68 : ttgggccaggtttACGTG-GCGTTG--AGAGCCAAATTAG---TA-ACAT-ATTAC--CTATTGG---TGGTTTaa
gi|69 : T-ACATCTCCGT----CAGCA-----TGTAAAAGCTTTACCGTCATA-CCTGt
gi|7 : attGCAATCA-CCG-AT-GG---GA---------------GG-ACA--TGACAA--TA-----CTAGTGATTGATCAT
gi|70 : --CTAATGG---AGGTTTCAAAAC--------AT--GC-TCAGA--TCT-CA--gaccctagttggtgtgctactcaaagaaaaaggaaggagaagttctggatgcacaggttgaagtcatttgagcctcgtggcatcaacaaatctgctgacttcaccaggatgaacacgggttagaacgttcaccggaatcgaactctccttaaaccttcgcgcctgatcatccactcttagcttcaattttcacaatgtatacttctgtgataaaaaaaattttcttctctttctatctaaaaaaatttttttatttcttctaaattattgttttattagaattgatccattgtgtgatatattcaagtacttgactaaatagaatagttccgggtatgaactatcaattatacctcccaattcgaattagtaagtcgtgcatcattgtggatcagctaattggacgagtagggcgtatcctcattcgttccatatttaacatagatttgcaagccaataacccaataccatgtgatttataatgtaaatacggttttagt
gi|8 : CT--GAG-GTCT-TCT-AGAA---G---C------C----------T-------CCT---------G---------T----------------GGCTGCCGTCATATATC--CT--AG----GA-----GTGCTG--GGATCCAAATTGA--A-A-AATG-TTTGC--CCAGTGG---GGATTTTAAAAC--------TT--AT-TCTGATGCCT-----------G-ATG-TAGAA--TC----------------AC-----AGC-GC----GAAC--ACA-----AATAATTTTTAA-GCG---CCGATG-T-C--AC-----------------------------------------------------------G--G-AAT---G---TCCTG-TCG-CGC---GGAC---AAC-T-G-CAT-C----------TA-T--CTC----ATAAGT-TG-C--AAGGTG-TG-TGAACAA-CA--ATA--CG-A----------AG-GTGA-AATTGAGGGTCTAC-GG--ACA---T--GTAGAA-GGAT-CAA--TGA-CCACC--GGTCTA-CC-A-T-G-AAAACCAATAG-A---GTGA----------------------------AAGCA--TTTCAATCTCGCT---G-GACGCAA--------AT-GG---GG---------------AG-ACA--T
gi|9 : AAGAGAGGCTATAAAGT----C-T---CA-AAAGTGCAATCAGCTAT-TGATG---AGAT-----GT---CACAA--------------TCCATACTACAATGTAAAGAAAAATT-GGTGG--A---T-G--ACAG-TTTCCA-TGGTAACAAC-G--AACCATCTCATCTTGAA-A-TACATTCTATCTTGAAAGAAAACAAAAT-TCTAAAGAAGT--ATATTCCCATTAATATCTTCA---CTC-TAGTCGCA---GAATGACT--TAG-GTTT-TCA-ACCA---G---C------C----------T-------CC----------AATGGCTATCT------T-----C--GGA--GTA-CCA-AAA-T--CTTA------GACATG-GTGATG--TGAACCAAATTGG----A-ATTC-TTTGC--CCAAAGA---GAGCTTTAAAACTTGTTCTGAT--GC--CAGA--TCT-------------ATG-CC-TG--AC--G-TGC--AAAC---AC-----AGC-GC----GAGC--AC-------AGA----------CA-GCCC--TG-T-G--ACCGG-CA-T-A-TT-CT--------------ACCGAAT-TCTTG-A--------------G--G-A--CACA---TCCTG-TCG-CAC---GGAC---AAC-T-G-CAT-CATTCTGTAATTA-T--TTT----GTAAGT-TG-C--GTGGTC-TG-TGAACAA-AA--TTA--CG-T----------AG-GTGA-AA--------CTGG-GG--TCC---TACGTAatattgactactcagttcactggacgcattcatgaggagagaacgaacgagaaagacccaaatggcacgaacaatctcaatgactttactagaatgaatgtggcctagcttcccctcagtgttgttctgtctgttttacactttctactctcagcactattattagcagtcaatctttccgtggtttcctaatctatctttt
blockSeqs : C C AT AA T CT T GTTATA C A TC GCC C T TGA T AAC CA T GGAA T A T C AGT CTG TCT GA A A A A ACAC A A TA CCGA C T AA CGTCATG T A T A T ATGT AATGT T T A A A T A TC A TT T AA T G T G T A C C T A GT TAACGTTTT C G GTT T T A A A TG C GTACTTACAGCCAT CA AT G T ACATGTA T TGTC A AAAT A A C A C AATT G T AA T T C T C GACT CCAG AC CTAATAGTAAAT TGT CCTTACTTG TG AC ATTTGA A TA AAATGGC AC GA GTCTT A ATAAAGAGA TG C T A CA GT T T GCA AG G C T TG G CAG TG A T TAA TA A AA CA T NNNN CTAAA GT AT T C TAGGAGAAACTA A A TAAGGTTTAGCTACACGAGTTC C A C CGGAA T AG G TCA T CG T TT C G A TGTTCCTGTTCAC G A T C A GGC TCTCT AAC C A C GA GT C C G TTGT TT TGG . TG C GTAG C C T C ATTCTAT GAAAGAA TT G G AT C A TTAATAT G CAT T CCCTA TTCA A C T A TCTA CAATGG GCTCCTGATGACATCGTTTACCGCA T G A T AA G AAGC C GCT A AT T T CT GGCG TTGTTCTGA TGGC A TGC CAGTACATGT T GA TCCAG CA TAA ATGTA AT CAAA CA GGCCA GT TA G A GA T TCG C T TG C C AAGATTTAGCTATAAA T T CTTAAAGATATTGGGAAACTTTT T TG TATT TATA T C T CATTCTGTAAT CAC ATTG A T AA A G C C G AT TT C ATGGGGGGGGG T T C TTGAGGGT CA TG CTTT A C A AA T TA TT AG GC T T TGC T TCCAAGGAA A GT T C A GT TCTCGCTGG T T CGA C GTT AAACATGAGAATGGA A TG CG GCGCTA T
blockSeqs : C C . . . . . GTTATA . A CT TC C T TGA . A . T GG . . T C ATT TG . GA A A . . AG A C T CCGA C T A GTCATG T A T . T . . A C T C A . . TT . A A A A C C C G C T A T G TG AAAACATC T C GG . . C G . A C AGAACCACC . . C T T . AATA G T A G T . . AAG . A C . T T C C TA TTA AC GTAACGTTGG ATG CCTTACTG TG AC ATTGA G . GCCCA G AT AATCC G TGAAC A C . A . G A T ATC C A T C AG . TA AA A C TAA TC . . NN . . . AC GA C C . T . TAAGCTTTTGTCGTCCAAATTT C . G . . AA . . . AA T GT C A A CCTTGC A G T C . . . C T A C . GC T C T CCT . . . A C T C G . . . CTCT GT . A C C A TT G . . TCTTT TG G . . G ATTC . ACACTATGGCTGCCTTTA . . T . . G . . T G . . . . T C GTA T C AAAAG . G GTTTA . . T T . T GCCA GC . . . . . GA A T AC G . ACCGA . . GCCAGGTTT . TG T C . . . AC CC T A T . T G . C . . . . G . T . A G . A T . . G . . A AC CC . . . . TCACCGAAC . C . . C . GTTCTGTG A . TC . . . . . . G T
blockSeqs : A C . . . . . GTCACT . C CG TC T T GCA . A . C . . . C T . CC . GC G C . . GT G T C GATG A T A . C A A . C . . T T A G G . . TA . T T G T A C T C A T G G A TT CAATATT C T AA . . G G . T A AGGATCC . . T C T . TA C C C A T . . TC . A A . T T . T AA TCA G CTAATAGTA CTT TTTTTA G AT AAAGA G . GGC G GA GCCTT A CACGG T G . T . G C T AGC A G A A TT . TG GG A T CA CA . . CC . . . TA G A C . A . GTCCAAATTT A . T . . GA . . . G G GT G G A CCCAAC G G G A . . . . C C A . GG C C C CCG . . . . C C T G . . . . CC . G . T T TT G . . AC TG . . . G G . TCCAATGACATGCTTCA . . G . . C . . A C . . . . A T AT A C AAGAG . A TTGA . . . T . . . AC . . . . . GG G T A G . AG . . GAGTCTATG . A T C . . . AC CC . . . . C . . G . . . . G . G . . C . C A . . . . . G A A . . . . CTCCG . A . . A . TCTCG T . CG . . . . . . A T
blockSeqs : T T . . . . . C . A GA CC T C GCA . A . C . . . C T . CC . TG T C . . GG A T T CGGT C T G . T C A . . . . A A G T . . A . A C C T A C T G C C C T A CT TAGCGTC T C GA . . T C . A T AGCTGT . . G T A . CA A A T C G . . CG . T T . A A . A AA TTG A ACAACAAG ATG GTTCA G GT ATGGA G . GGT A GT TCCAC G CTCCT C C . A . G A T GCA G A A C GT . TT AA A N TA NN . . CA . . . AC A G . . T . ACCAGTGTCG C . C . . AG . . . G C G . C A CATTGC G A G A . . . . C C A . GG C C C CCT . . . . C T C C . . . . CT . G . G G AT T . . AT TG . . . A A . TCCAATGGCAGCTTTCA . . T . . A . . A G . . . . A A GC T C CACA . A CTA . . . T . . . GC . . . . . C A T T G . AG . . GAAACTTT . A C T . . . C C . . . . G . . C . . . . G . T . . G . C T . . . . . A G C . . . . TTTG . T . . A . ATGT T . AA . . . . . . G T
blockSeqs : C . . . . . . . . C TG CT A A AGC . G . C . . . T T . TG . GA A G . . A G A . GTGT . C G . C . T . . . . T T T . GT TT A T GA . . A A . T T AATTT . . G C T . TA A C T T A . . GG . A C . A T . G AC CTG C AAACCAAA TTT CCATA A AT CTGGA A . GAC G GT ACCTT A CAAGA C A . T . T T T AAC T G A T AT . CA A T T NN CA . . T . . . G A T . . . . TCCCGAATCC . . . . . . . . . C T C . G . CCCA A A C C . . . . C G A . AT A A A CCT . . . . A A T C . . . . CT . G . G G TT T . . AC TA . . . G A . TCCCTGTCGTGTCCTTC . . C . . G . . T G . . . . A G AC T C CACG . A TTG . . . T . . . GC . . . . . C G T C G . AC . . GATGAACT . A G C . . . C T . . . . T . . C . . . . A . G . . G . A T . . . . . T A C . . . . TTTG . A . . C . TGA T . CT . . . . . . G T
blockSeqs : T TA GT T C GG . . . T . . . C C . . . . T C . . A . T . . . T . . . . A . T . . A T T T CA . . T G . G G ATC . . . C T . TA A T A G . . . TG . A C . A C . C AC TTG A CAGGCAAT AAG GCTGA G AA AT G . GGT G GG GATGA G TTCGT T C . T . G A C GCA G . T A GT . TT G . G TA TC . . G . . . . A . . A . CTCA . G T C . . . . C T A . AC A A A CCT . . . . A G T G . . . . AT . A . A T TT T . . AT TG . . . G C . TCCCATGGCGGCCTTCA . . C . . G . . A G . . . . G A GC T A CAG . A TCA . . . T . . . GA . . . . . T G T C G . AA . . GCCAACTC . C T T . . . T T . . . . C . . C . . . . A . G . . C . C A . . . . . T G C . . . . TCTC . G . . C . TGG T . AG . . . . . . T T
blockSeqs : CC G . A . . . . . . . T . . . . . G . A . . . . A . . . . A . . CA A C A A . . . AG . A A . A C . T AA . C ACACTGGT CTT TTGTA A TC A G . GAC A AT CTT A CGCAA C A . G . T T A ACC T . C T . . . . . . T A . . . . . . A . AT T G A TTG . . . . A T C A . . . . AA . G . A C TC T . . AT TG . . . T A . TCCCATGTCATCCTTCA . . C . . C . . A A . . . . G A TC A T CAC . T TCA . . . T . . . GA . . . . . C A C C A . AG . . GGAAACG . A C T . . . T C . . . . G . . G . . . . T . A . . C . C C . . . . . A G C . . . . TTG . G . . C . CAC T . CG . . . . . . T T
blockSeqs : . . . . G G . . . TA . T A . C C . T A . A TAGACAAT CTG CCTTA . AA G A . CAA A G TAA A TTCGT . A . T . . A . A . . . . . . . . . C . G T G A TC . . . . C T T T . . . . GA . A . C G TT T . . TA GG . . . T A . TCCCATGGCTGTTTTCA . . C . . G . . G A . . . . T A GT A C CAG . T CTC . . . C . . . CA . . . . . C A T A C . CG . . GGAATTT . A G T . . . C T . . . . C . . C . . . . T . A . . G . C A . . . . . A G T . . . . . . G . . A . TC T . AA . . . . . . A .
blockSeqs : . TA . T A . A T . C A . G ACATTATT ATT CCT . C . A . GG . C TAA A . . . T A A A T . . . . A A T C . . . . AA . G . T C TT T . . AA CA . . . A A . ATCCATGGTGGCTTTCA . . T . . A . . G A . . . . A A GC A T CAA . A ACG . . . A . . . TT . . . . . C A T T G . AA . . GGAAACA . A C C . . . C T . . . . G . . G . . . . G . T . . C . A . . . . . . A A G . . . . . . . G . . CG . . . . . . G .
blockSeqs : AT . T A . G . . T . . C ATTTGTT T TCT . . . . . A . C G . . . . . A . . . . . G G T . . . . GT . A . A G CT T . . AC TG . . . G A . TCCAATGGCTATCTTCG . . T . . G . . G G . . . . A A GC A C CGA . A TTA . . . C . . . GC . . . . . T A C C G . AA . . GGACACA . T T C . . . T C . . . . G . . G . . . . A . T . . C . C . . . . . . . . . . . . . . . . C .
blockSeqs : . T . . . . . . . GCTTC . A . . . . . . . C G . . . . CT . A . G C T . . . AA TG . . . A A . CCTATGGCATCCTTTT . . A . . G . . A A . . . . A A AT T T CAG . A ACG . . . C . . . CC . . . . . C A A G G . AA . . CGAACT . C C C . . . A C . . . . . . . . . . . . A . T . . G . . . . . . . .
blockSeqs : . G . . . . AA . A . T T . . . . CA TT . . . A A . CCTATGGCATCCTTTT . . A . . T . . A T . . . . A A GC A T G . T TG . . . G . . . GT . . . . . C A T T . . . . . GGAATG . C G C . . . T T . . . . . . . A . T . .
blockSeqs : . . . A T . . . . A G . . . G A . TATGACATCCTGCA . . A . . G . . G A . . . . T T . . . . . . TC . . . G . . . AT . . . . . C C . T . . . . . . . G . . . . C T .
blockSeqs : . . . . T . . . . . C . . . A G . TGCATTTA . . C . . A . . G A . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . .
blockSeqs : . . . . . . A G . CCCTATA . . C . . T . . G A . . . . G . . . . . . G . . . .
blockSeqs : . . . . G A . TCCTGT . . C . . . . . . . . . . G
blockSeqs : . . . C G . . .
blockSeqs : . . . G .
blockSeqCons : CC** AGCTCC*************** AG GT CCT* A****** CAG********** GGAANCT**********************
originalCons : GCTCACCGACAGCTCTCG--GACGAACGCTTT--TAT-A--AA-AAGTTACAGTCTGACCCT-ACCAAAGAGTTCTCCGCCAAGATCA--C-GAAACCCTTCAGGAAATGT-ACG--A--AGGGCGA----AATC-GGTGACAA-CGTCTTCGAAAC---GCTTC-GTC---CCAAC-GACTGTAGACCGGGACAATTTTATNTACTGCCT-AAAATCCAC-AAG-A-AAGACATGCCNGGCCGCCCT-ATAGT-C-G--NGCCATCGG-AC-------ACCCCACGGAGAAAATCTCNGAATTCATTGACCT-ACATCTCCGC----CCGCA-----TGTAANAGANCTACCGTCATA-CTTGAAGGACACCACT-GATTACCTAAACGAAA-CCCCA-CNTCG-GACCTACCTGACNACACCCTTCTTGTGACNATGGACGTNACTTCACTNTACACTAA-CGTT--CCACACGACGAGG-ACAT-CGA-GGCNTGCAGGGAGGTT-TGGAAT-ANA--------A--G-----CC--TCAAAA--TC--CTTCCACTGAATCACTCGTCCAGCTCCT-----T-GAACATGTCCTCA-AGTTCAA--TA--ACTTCATGTTCGA---CGGCGAACACTACCTGCAAAT-A-GTG-GCACN-G--CTATGGGAACCAAA-ATGGCNCC-NT-CNTACGCCAACA-TCTTTATGGGAA--GACTC-GAACGTAACCT-CCT---GC--A----TCGNT--CACCNTTTAAACC-CCTTA----GTTG-GCTACGTTTC-AT--G-ATGACATTGAGATG--AAGTG----GGC---TGACGG-TCGCGAAAGCCNCGACGACTTTATC----GCGNTTGCGAACTCTTTCCAC-NATTCCATC-AAGTTCACNG--TG-GANATTTCC-GCATCCAG-GAACGTNTTTTTGGATACCACGTC-CACACTTAC-GAACGGAGAAATCGAGTTCAGCCTCCAT-A-CTAAA-CCCACCGACTCTCATT--TGTACCNTAT-GCCATCC----AGCTGTC-----ATCCGCCCCAT-A-CNTTCA------------AAGGTGT-GCC---------GCC---C--G-CGTCC------GCCGCATCTGCTCTATT-CCTACCACT-----TTCCA-AGAGACA-AG---GACAC-ATCCT-N-AAAGTCCATCTGCGCAAACAGAGGCTATGAAGT----CCT---CGCAAGGTGCAGTCCGCAAT-TGATG---AGAT-----GT---CACAACANGACAG--ACAGTCCCTCCTNCAATATAAAGAAAAACC-TCAGA--A---T-G--ACAGAGTTCCACTGGTCACTAC-T--TACCACCCCGTCCTNAA-G-GAC-------CTC-------AACANTAT-TCTGAGAAAGC--ATNTNCCCATT-----CTTCA---TAC-CAATAAAC---GAATGGCT--GAT-GTTT-TCA-AGGA---A---C------C----------T-------CC----------G---------T------T-----C--AGAC-GCC-CCAGAAA-C--CTGAAG----GACATG-GTGGTG--AGGACCAGATTGG--ATA-ACCC-TTTAC--CTAATGG---AGGTTTCAAAAC--------AT--GC-TCAGA--CCT-CA--A-----G-ATG-TC-AA--TC--G-TGC--AAAT---AT-----AGC-TC----AGAC--ACT-----GAGAGCTTT--A-GCA-GTCC--TG-T-C--ACAGGTCG-C-AGTT-AT--------------A---AAA-TATTG-G--------------G--G-AACTACG---TCCCG-TAA-AAC---CGAC---AAC-T-G-CAT-C----------TA-C--CTC----ATCAGC-TG-T--AANGTC-TG-CCAGAAA-CA--GTA--CG-T----------GG-GNGA-AA--------CTAC-GG--ACC---TNCGCAGAA-GGGT-CAA--CAA-CCACC--GGTCCN-CC-G-T-C-AAGACCAA-AA-A---G-GA-T--CC-----G---C-CG-GTA-GC-TACGCA--TTTCAA------T---G-GTAGCAATCA-CCG-AT-GG---GA---------------GG-ACA--TGACAA--TA-----NTAGTTATTGATCAT
finalCons : GCTCACCGACAGCTCTCG--GACGAACGCTTT--TAT-A--AA-AAGTTACAGTCTGACCCT-ACCAAAGAGTTCTCCGCCAAGATCACC--GAAACCCTTCAGGAAATGT-ACG--A--AGGGCGA----AATC-GGTGACAA-CGTCTTCGAAAC---GCTTC-GTC---CCAAC-GACTGTAGACCGGGACAATTTTATNTACTGCCT-AAAATCCAC-AAG-A-AAGACATGCCNGGCCGCCCT-ATAGT-C-G--NGCCATCGG-AC-------ACCCCACGGAGAAAATCTCNGAATTCATTGACCT-ACATCTCCGC----CCGCA-----TGTAANAGANCTACCGTCATA-CTTGAAGGACACCACT-GATTACCTAAACGAAA-CCCCA-CNTCG-GACCTACCTGACNACACCCTTCTTGTGACNATGGACGTNACTTCACTNTACACTAA-CGTT--CCACACGACGAGG-ACAT-CGA-GGCNTGCAGGGAGGTT-TGGAAT-ANAAGCTCC---------------TCAAAA--TC--CTTCCACTGAATCACTCGTCCAGCTCCT-----T-GAACATGTCCTCA-AGTTCAA--TA--ACTTCATGTTCGA---CGGCGAACACTACCTGCAAAT-A-GTG-GCACN-G--CTATGGGAACCAAA-ATGGCNCC-NT-CNTACGCCAACA-TCTTTATGGGAA--GACTC-GAACGTAACCT-CCT---GC--A----TCGNT--CACCNTTTAAACC-CCTTA----GTTG-GCTACGTTTC-AT--G-ATGACATTGAGATG--AAGTG----GGC---TGACGG-TCGCGAAAGCCNCGACGACTTTATC----GCGNTTGCGAACTCTTTCCAC-NATTCCATC-AAGTTCACNG--TG-GANATTTCC-GCATCCAG-GAACGTNTTTTTGGATACCACGTC-CACACTTAC-GAACGGAGAAATCGAGTTCAGCCTCCAT-A-CTAAA-CCCACCGACTCTCATT--TGTACCNTAT-GCCATCC----AGCTGTC-----ATCCGCCCCAT-A-CNTTCA------------AAGGTGT-GCC---------GCC---C--G-CGTCC------GCCGCATCTGCTCTATT-CCTACCACT-----TTCCA-AGAGACA-AG---GACAC-ATCCT-N-AAAGTCCATCTGTGCAAACAGAGGCTATGAAGT----CCT---CGCAAGGTGCAGTCCGCAAT-TGATG---AGAT-----GT---CACAACANGACAG--ACAGTCCCTCCTNCAATATAAAGAAAAACCT-CAGA--A---T-G--ACAGAGTTCCACTGGTCACTAC-T--TACCACCCCGTCCTNAA-G-GAC-------CTC-------AACANTAT-TCTGAGAAAGC--ATNTNCCCATT-----CTTCA---TAC-CAATAAAC---GAATGGCT--GAT-GTTT-TCA-AGGAA------C------C----------T-------CC----------G---------T------T-----C--AGAC-GCC-CCAGAAA-C--CTGAAG----GACATG-GTGGTG--AGGACCAGATTGG--ATA-ACCC-TTTAC--CTAATGG---AGGTTTCAAAAC--------AT--GC-TCAGA--CCTCAG----------ATG-TC-AA--TC--G-TGC--AAAT---AT-----AGC-TC----AGAC--ACT-----GAGAGCTTT--A-GCA-GTCC--TG-T-C--ACAGGTCG-C-AGTT-AT--------------A---AAA-TATTG-GGGAANCT----------------------TCCCG-TAA-AAC---CGAC---AAC-T-G-CAT-C----------TA-C--CTC----ATCAGC-TG-T--AANGTC-TG-CCAGAAA-CA--GTA--CG-T----------GG-GNGA-AA--------CTAC-GG--ACC---TNCGCAGAA-GGGT-CAA--CAA-CCACC--GGTCCN-CC-G-T-C-AAGACCAA-AA-A---G-GA-T--CC-----G---C-CG-GTA-GC-TACGCA--TTTCAA------T---G-GTAGCAATCA-CCG-AT-GG---GA---------------GG-ACA--TGACAA--TA-----NTAGTTATTGATCAT
12 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|18 ): GTCCCGAACATCCTCTATTAGATTCAATCTTCACATATATCTTCTTGTGATAAAAATTTTTTTTCTTTTTTTTTTCTTCTCTCTTTCTATCTAAAATTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTCTTTTCTCTCTCGAAATTATTGTTTTATTATAATTGATTCCATTGTGTGATAATTCAAGTTTTATCTTAGAACTTGACTTTAGAATAGTTCCGGGTATGAACTATCAATTATACCTCCTAATTCGAATTAGTAAGTCGTGCATTATTGTGGATCAGCTATTTGGAGAGTAGGGCGTATCCTCATCTGTTCCATATTAACATAGATTTGCAAGCCATTAACTCATACCATGTGATTTAATATGTAATACGGTTTTTAGTT
Unaligned ( gi|22 ): TTCTTTCTCTTGTCTATCTTAAAAATTTTTTTGTTCTCTTTCTCTCGAAATTATGTTTTTATGTATCAGAATGATTCCATGTGTGATTGAACTTCAAGTTATTTACTTAGAACTACTAATTAAATGAAGCTTCCGGGTAAAGCTATCAATCATACCGTCTAATCGAATCAGTAAGTCGCATATTGGATCAGCTAATTGGACGAGTAGGGCGTAAGTCCTCATTGTCGTTCCATATTAACATAGATTGCAGCCATTAACCTCAATACCGATGTATTTTTAAGTAAATACGGTTAGTTGTAGTAACTCAGATATATT
Unaligned ( gi|26 ): TTTTTTTTTTTTTTTTTTTGTTTTTTTTTCTCTTTTCTCTCGAAATTATTGTTTTATTATAATTGATCCATTGTTGTGATAAATTCAAGTTATTACTTTAGAACTTGACTAATAGAATAGTTCCGGGTATGAACTATCAATTATACCTCCTAATTCGAATAGTAAGTCGTGCATTATTGTGGATCAGCTAATTGTGGACGAGTAGGGCGTATTCCTCTCCATATTAAACATAGATTTGCAACCATTAACTCAGTATCCATGTGATTTTAATGTAAATACGGTTTTAGT
Unaligned ( gi|46 ): ACAATCTCAGCAAAGAAGAGAGATCTGCCCTCCAATTGCTAAAAAACCGTGACGACATAGTCATAAAAAACAGACAAAGGTTCCACGGTCGTTGTTCTAGACAAAGATTCGTACTTAGCCGAAGCTAACAGACAGTTGTCTGATGAGCGATTTTACAGAAAGCTGGATTTTGATCCCACTGAGGAGTTTTCAG
Unaligned ( gi|49 ): TAATACATTCCTAATCGAATTAGTAGTTCGTGCATTATTGTGGATCAAGCTAATTGGACGGTAGGGTGATCCTCATTGGGTTCCTATGTAAAGAAGATTTGCAGCTTAACTTCAGATACCATGTGATTATAATGTAAAAACGGTTTATAGTTAGTACCAATATATTT
Unaligned ( gi|51 ): AGTAATCACTTACGGGAGGCGAACACATAAGTGGTTATAATAATGACCTAAATGGACAGATTCCTAAAGAAAGCAAAAGGAAATTCCGGATGCACAAGACGAAGTCGTTTGACTCCGGTGGAATCCTGACTTATCCCCAGTATAGCAGGCTAAACC
Unaligned ( gi|55 ): GAATTAGGTCAATCATTATCACATCGCACATTGCGGACTAGCTCATTGGACGAATAGCACTAGTCTCAATCTCTCCTCAAAAAAACATTTTAATTAGCAATTCAAAATCCAATAAACATGTACTTTATAGTGTTGATACGATTATAGAAT
Unaligned ( gi|56 ): GACATTAAAATAGTGATTACTGACCATTACCCAAGTTGTACATGTTATGCCACGAAAACGCAAAGAAAGGATTCTTATATACGGTTTTTTCAATAGTCATTCGACCCTCAAGGTATCAACAAAACAATTTAGTTCATCAGATTAAACG
Unaligned ( gi|57 ): GACAACCTCAACAAAGAAGAAAGATCGGCATTGCAGAGATTAAAAAACCGGGATGATATTGTAATAAAAAGGCAGACAAGGGTTCTACTGTTGTTGTTATGGACAAAGATAAGTACCTAACAGAGGCTCACAG
Unaligned ( gi|62 ): AACGAAACTTTTAGATACTCAGACTGAAGTCGTTCGACTTTCAAGGTATCGAAACACCTGATGAATTCACTAGGATCAACATGGGCTAAACATTTGTCACC
Unaligned ( gi|64 ): AGTGGTTATTCATTTTGACCTACGCCAAATACGCAAAGAAAGCCAAAGTGAAAATCTTTGCACACAAACCGAAGTCATCTGAT
Unaligned ( gi|65 ): AAAGCAAACCGAAAAGTTCTGGATGCACAAACAGAAGTCGTTCGACTATCTACTGACTTCACTAGGATAAAAA
Alignments
lowQualScore : 111111111111111111111111111111111111111111111111111111111
lowQualScore : 111111 111 1111 111 111 111 1111 11 3333333 3333333 1111 22222 1 1111111111 11 4444444444444444444 1 1111111 2 1111 11 3333333333333333333 1111111111 33333333 1111111111 11 22222 222222222 111 1111 11111 11 333333333333 5555555555555555555555555555555 11111 111 111 11 1 1111111111111 11111 111 1111 1111 1111111 1111111 11111 000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 11111111 11111 1111111111111111111 2222222222222222222222222222222 111111 111111111111 11111111111 11111111 222222222222222 3333333333333 222222222222222 111111
lowQualScore : 1 1 99 99 6 99 6 111111 6 1 44 5 0 2 4 55 5 777 66 0 1 7777 5 5 1 1 777 666 888 0 000 5 0 1 5 0 5 9999 2 1 22 6666666 4 1 88 5555555 4 8 1 8 1 7777 00000 1 1 1 1 1 0 0 8 11 8 99 1 99 1 1 0 1 1 2 3 6 1 4 3 22 9999999999 4 4 777 5 5 5 1 5 33 1 6666666666666666666 66 66 0 3 1 4444444 4 0 777777 4 8888 1 0 2 2 4 4 88888 3 0 1 77 3 2 5 6 3 6666 9999 0 11 3333333333333333333 555 3333333333 88 22 66666666 0 3 44 2222222222 0 88 00 11111 1 000000000 0 77 1 4 1 66 55 1 1 6666 77 5 1 1 55 5 0 000 55 1 0 3 7777 33 5 77 66 5 2222 0 44444 00 666 1 2 444444444444 3 6 1111111111111111111111111111111 2 6 7 66666 6 99 6 111 6 111 5 22 8 0 0 5 5 9999999999999 8 1 3 1 4 777 11111 222 2 6 3 55 77 3 2 1 1111 55 555 3 77 4 0 0 0000 3 1 3 3 0000000 6666666 11 2 0 3 66 3 1 7777777 3 444 2 44444 4444 4 2 2 2 6666666 666666 222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 2 2 1 2 33 1 5555 2 555 3 55 2 33 6666 2 44444 88888 33 2 2 9999999 2 6666 2 44 11111111 33 444 99999 33 5555 55 11111 0 55 33 2 2 33 2 7777 0 2 999 1 2 5555555555555555555 2 5555555555555555555555555555555 000000 7777 5555 2 2 2 444444444444 7777 8888 6 6 44 4 6 3 2 0 3 44 44 3 55555555555 3 1 3 44444444 33 44 6666 8 0 3 3 88 3 55 55 444 666 3 4 777 4 999999999999999 4 44 4 4 5 55 3333333333333 2 3 333 3 555 000000000000000 3 44 55 000000 0 4
lowQualScore : . . .. .. . .. . ...... . . .. . . . . .. . ... .. . . .... . . . . ... ... ... . ... . . . . . . .... . . .. ....... . . .. ....... . . . . . .... ..... . . . . . . . . .. . .. . .. . . . . . . . . . . . .. .......... . . ... . . . . . .. . ................... .. .. . . . ....... . . ...... . .... . . . . . . ..... . . . .. . . . . . .... .... . .. ................... ... .......... .. .. ........ . . .. .......... . .. .. ..... . ......... . .. . . . .. .. . . .... .. . . . .. . . ... .. . . . .... .. . .. .. . .... . ..... .. ... . . ............ . . ............................... . . . ..... . .. . ... . ... . .. . . . . . ............. . . . . . ... ..... ... . . . .. .. . . . .... .. ... . .. . . . .... . . . . ....... ....... .. . . . .. . . ....... . ... . ..... .... . . . . ....... ...... ......................................................... . . . . .. . .... . ... . .. . .. .... . ..... ..... .. . . ....... . .... . .. ........ .. ... ..... .. .... .. ..... . .. .. . . .. . .... . . ... . . ................... . ............................... ...... .... .... . . . ............ .... .... . . .. . . . . . . .. .. . ........... . . . ........ .. .. .... . . . . .. . .. .. ... ... . . ... . ............... . .. . . . .. ............. . . ... . ... ............... . .. .. ...... . .
lowQualScore : 0 0 22 22 7 22 7 555555 7 6 44 0 2 2 1 99 0 444 99 2 1 5555 0 0 1 1 555 000 888 4 555 4 9 0 7 1 7 3333 3 0 99 0000000 3 4 00 0000000 0 4 0 0 4 0000 00000 4 0 4 0 4 0 8 0 88 0 44 0 44 4 0 2 0 5 5 3 3 0 9 6 44 3333333333 2 2 444 0 0 9 1 0 33 0 4444444444444444444 99 99 8 9 1 8888888 4 9 333333 4 7777 1 5 3 2 4 4 11111 3 2 0 66 3 2 0 7 7 1111 8888 3 22 8888888888888888888 555 8888888888 77 55 55555555 4 7 66 5555555555 4 55 66 55555 0 333333333 5 00 1 4 0 11 66 0 0 1111 33 4 0 2 33 7 1 111 66 7 5 2 4444 22 0 99 99 7 1111 1 33333 66 888 0 5 222222222222 7 7 0000000000000000000000000000000 5 7 8 77777 7 55 7 777 7 222 2 44 6 1 7 3 0 1111111111111 5 1 4 1 4 888 11111 222 9 9 0 55 44 5 3 3 0000 00 888 3 99 6 8 2 5555 2 0 1 1 0000000 5555555 22 7 3 1 33 6 0 9999999 8 777 5 55555 7777 4 1 1 5 2222222 111111 666666666666666666666666666666666666666666666666666666666 4 4 1 4 22 6 0000 4 777 4 99 4 11 1111 1 99999 55555 77 7 7 3333333 9 1111 9 00 44444444 99 777 33333 22 7777 99 66666 9 88 44 7 7 44 5 7777 8 1 444 1 5 0000000000000000000 9 9999999999999999999999999999999 444444 9999 4444 9 9 9 666666666666 6666 9999 2 2 22 2 7 1 5 2 3 66 22 1 44444444444 1 0 1 22222222 88 66 2222 7 1 6 6 66 6 00 00 444 222 6 4 888 4 444444444444444 0 77 0 0 0 55 1111111111111 3 6 666 3 888 888888888888888 3 66 00 111111 9 4
consensus : GCTCACCGACAGCTCTCG--GACGAACGCTTT--TAT-A--AA-AAGTTACAGTCTGACCCT-ACCAAAGAGTTCTCCGCCAAGATCA-CCGAAACCCTTCAGGAAATGT-ACG--A--AGGGCGA----AATC-GGTGACAA-CGTCTTCGAAAC---GCTTC-GTC---CCAAC-GACTGTAGACCGGGACAATTTTATNTACTGCCT-AAAATCCAC-AAG-A-AAGACATGCCNGGCCGCCCT-ATAGT-C-G--NGCCATCGG-AC-------ACCCCACGGAGAAAATCTCNGAATTCATTGACCT-ACATCTCCGC----CCGCA-----TGTAANAGANCTACCGTCATA-CTTGAAGGACACCACT-GATTACCTAAACGAAA-CCCCA-CNTCG-GACCTACCTGACNACACCCTTCTTGTGACNATGGACGTNACTTCACTNTACACTAA-CGTT--CCACACGACGAGG-ACAT-CGA-GGCNTGCAGGGAGGTT-TGGAAT-ANA--------AG---C-TC-TTCAAAA--TC--CTTCCACTGAATCACTCGTCCAGCTCCT-----T-GAACATGTCCTCA-AGTTCAA--TA--ACTTCATGTTCGA---CGGCGAACACTACCTGCAAAT-A-GTG-GCACN-G--CTATGGGAACCAAA-ATGGCNCC-NT-CNTACGCCAACA-TCTTTATGGGAA--GACTC-GAACGTAACCT-CCT---GC--A----TCGNT--CACCNTTTAAACC-CCTTA----GTTG-GCTACGTTTC-AT--G-ATGACATTGAGATG--AAGTG----GGC---TGACGG-TCGCGAAAGCCNCGACGACTTTATC----GCGNTTGCGAACTCTTTCCAC-NATTCCATC-AAGTTCACNG--TG-GANATTTCC-GCATCCAG-GAACGTNTTTTTGGATACCACGTC-CACACTTAC-GAACGGAGAAATCGAGTTCAGCCTCCAT-A-CTAAA-CCCACCGACTCTCATT--TGTACCNTAT-GCCATCC----AGCTGTC-----ATCCGCCCCAT-A-CNTTCA------------AAGGTGT-GCC---------GCC---C--G-CGTCC------GCCGCATCTGCTCTATT-CCTACCACT-----TTCCA-AGAGACA-AG---GACAC-ATCCT-N-AAAATCCATCTGTGCAAGCAGAGGCTATGAAGT----CCT---CGCAAGGTGCAGTCCGCAAT-TGATG---AGAT-----GT---CACAACANGACAG--ACAGTCCCTCCTNCAATATAAAGAAAAACC-TCAGA--A---T-G--ACAGAGTTCCACTGGTCACTAC-T--TACCACCCCGTCCTNAA-G-GAC-------CTC-------AACANTAT-TCTGAGAAAGC--ATNTNCCCATT-----CTTCA---TAC-CAATAAAC---GAATGGCT--GAT-GTTT-TCA-AGGA---A---C------C----------T-------CC----------G---------T------T-----C--AGAC-GCC-CCAGAAA-C--CTGAAG----GACATG-GTGGTG--AGGACCAGATTGGATA--ACCC-TTTAC--CTAATGG---AGGTTTCAAAACAT--GC-TC----AGA--CCTC-A-G-------A-T----G-TC-AA--TC--G-TGC--AAAT---AT-----AGC-TC----AGAC--ACT-----GAGAGCTTT--A-GCA-GTCC--TG-T-C--ACGGGTCG-C-AGTT-AT--------------A---AAA-TATTGG-------------G--GA--A-NC---T---TCCCG-TAA-AAC---CGAC---AAC-T-G-CAT-C----------TA-C--CTC----ATCAGC-TG-T--AANGTC-TG-CCAGAAA-CA--GTA--CG-T----------GG-GNGA-AA--------CTAC-GG--ACC---TNCGCAGAA-GGGT-CAA--CAA-CCACC--GGTCCN-CC-G-T-C-AAGACCAA-AA-A---G-GA-T--CC-----G---C-CG-GTA-GC-TACGCA--TTTCAA------T---G-GTAGCAATCA-CCG-AT-GG---GA---------------GG-ACA--TGACAA--TA-----NTAGTTATTGATCAT
Reference ( family-868 ) : GCTCACCGACAGCTCTCG--GACGAACGCTTT--TAT-A--AA-AAGTTACAGTCTGACCCT-ACCAAAGAGTTCTCCGCCAAGATCA-CCGAAACCCTTCAGGAAATGT-ACG--A--AGGGCGA----AATC-GGTGACAA-CGTCTTCGAAAC---GCTTC-GTC---CCAAC-GACTGTAGACCGGGACAATTTTATNTACTGCCT-AAAATCCAC-AAG-A-AAGACATGCCNGGCCGCCCT-ATAGT-C-G--NGCCATCGG-AC-------ACCCCACGGAGAAAATCTCNGAATTCATTGACCT-ACATCTCCGC----CCGCA-----TGTAANAGANCTACCGTCATA-CTTGAAGGACACCACT-GATTACCTAAACGAAA-CCCCA-CNTCG-GACCTACCTGACNACACCCTTCTTGTGACNATGGACGTNACTTCACTNTACACTAA-CGTT--CCACACGACGAGG-ACAT-CGA-GGCNTGCAGGGAGGTT-TGGAAT-ANA--------AG---C-TC-CTCAAAA--TC--CTTCCACTGAATCACTCGTCCAGCTCCT-----T-GAACATGTCCTCA-AGTTCAA--TA--ACTTCATGTTCGA---CGGCGAACACTACCTGCAAAT-A-GTG-GCACN-G--CTATGGGAACCAAA-ATGGCNCC-NT-CNTACGCCAACA-TCTTTATGGGAA--GACTC-GAACGTAACCT-CCT---GC--A----TCGNT--CACCNTTTAAACC-CCTTA----GTTG-GCTACGTTTC-AT--G-ATGACATTGAGATG--AAGTG----GGC---TGACGG-TCGCGAAAGCCNCGACGACTTTATC----GCGNTTGCGAACTCTTTCCAC-NATTCCATC-AAGTTCACNG--TG-GANATTTCC-GCATCCAG-GAACGTNTTTTTGGATACCACGTC-CACACTTAC-GAACGGAGAAATCGAGTTCAGCCTCCAT-A-CTAAA-CCCACCGACTCTCATT--TGTACCNTAT-GCCATCC----AGCTGTC-----ATCCGCCCCAT-A-CNTTCA------------AAGGTGT-GCC---------GCC---C--G-CGTCC------GCCGCATCTGCTCTATT-CCTACCACT-----TTCCA-AGAGACA-AG---GACAC-ATCCT-N-AAAGTCCATCTGTGCAAACAGAGGCTATGAAGT----CCT---CGCAAGGTGCAGTCCGCAAT-TGATG---AGAT-----GT---CACAACANGACAG--ACAGTCCCTCCTNCAATATAAAGAAAAACC-TCAGA--A---T-G--ACAGAGTTCCACTGGTCACTAC-T--TACCACCCCGTCCTNAA-G-GAC-------CTC-------AACANTAT-TCTGAGAAAGC--ATNTNCCCATT-----CTTCA---TAC-CAATAAAC---GAATGGCT--GAT-GTTT-TCA-AGGA---A---C------C----------T-------CC----------G---------T------T-----C--AGAC-GCC-CCAGAAA-C--CTGAAG----GACATG-GTGGTG--AGGACCAGATTGGATA--ACCC-TTTAC--CTAATGG---AGGTTTCAAAACAT--GC-TC----AGA--CCTC-A-G-------A-T----G-TC-AA--TC--G-TGC--AAAT---AT-----AGC-TC----AGAC--ACT-----GAGAGCTTT--A-GCA-GTCC--TG-T-C--ACAGGTCG-C-AGTT-AT--------------A---AAA-TATTGG-------------G--GA--A-NC---T---TCCCG-TAA-AAC---CGAC---AAC-T-G-CAT-C----------TA-C--CTC----ATCAGC-TG-T--AANGTC-TG-CCAGAAA-CA--GTA--CG-T----------GG-GNGA-AA--------CTAC-GG--ACC---TNCGCAGAA-GGGT-CAA--CAA-CCACC--GGTCCN-CC-G-T-C-AAGACCAA-AA-A---G-GA-T--CC-----G---C-CG-GTA-GC-TACGCA--TTTCAA------T---G-GTAGCAATCA-CCG-AT-GG---GA---------------GG-ACA--TGACAA--TA-----NTAGTTATTGATCAT
gi|1 : GCTCACAGACAGTTGTCA--GACGAACGTTTT--TAC-A--AA-AAGTTGCAGTCTGACCCC-ACTAAAAA-TTCTCCATCAAGATCA-C-GAGACCCTTCAGAAAATGC-ATG--A--AGAGTGA----AATC-GGTGATAA-TGTACTTGGAGC---GCTTT-GTC---CCAAC-GACTGTAGACCTGGACAATTCTACTTACTGCCT-AAAAT-TAC-AAG-A-AAGACATGCCAGGCCGTCCT-ATTGT-CAG--TGCCATCGG-AC-------ACCCCACGGAGAAAATCTCTGAATTCATTGATTT-ACATCTCCGT----CAGCA-----CGTAGAAGATTTACCGTCATA-CTTGAAGGATACGACT-GATTACCTAAATAAAA-CCCCA-CATCG-GGCCTGCCAGACCATACCCTCCTTGTGACTATGGATGTGACGTCACTCTACACCAA-CAAT--CCACATGATGAGG-GTAT-TGA-GGCCTGTAAAGAGGTT-TGGAATCAAA--------GG---G-TCAGTCAACA--TC--CCTCAACTGAGTCACTCATTCGGCTTCT-----T-GAACATGTCCTCA-AGTGTAA--TA--ACTTCATGTTTGA---CGGTGAACACTACCTGCAAAC-A-GTG-GCACT-G--CTATGGGAACAAAA-ATGGCACC-TT-CCTATGCCAACA-TCTTTATGGGAA--GATTG-GAACGTAGACT-CCT---GC--A----TCACT--CACTAGTTAAACC-TCTCA----GTTG-GCTACGTTTC-ATA-G-ATGACATCGAGATG--AAGTG----GGT---TGATGG-TCGTGAAAGCCTCAACGAGTTTATT----AAGATGGCAAACTCTTTCCAC-GATTCCATC-AAGTTT-CTG--TG-GATATTTCA-ACATCCAG-GAATACGTTTTTGGATA-CACAGC-AACACTTAA-GGACGGAGAAATCGAGTTTAATCTTCAC-A-CGAAA-CCCACAGATTCTCATT--TGTACCTTAT-GCCATCC----AGCTGTC-----ATCCACCCCAT-A-CTTTCA------------AAGGTGT-GCC---------ACC---T--G-CATCC------GCCGCATCTGCTCTTTT-CATACTAGT-----TTCCT-AGA-ACA-AG---GAAAT-ATCCT-C-AAAGTCCATCTA-ACCAGCAGAGGATAT--AAT----CCT---TGTAAAGTACAGTCCGTAAT-TGATG---AGAT-----GT---CACAACAGGACCG--ACAATCCCTCCTCCAATATCAAGTGAAACC--CAGG--A---TCA--ACAGGGTCCCACTAGTCACTAC-T--TACCACCCTGCCCTTAG-G-GAT-------CTC-------AATAGTAT-CATAAGAAAAC--ATTTGTCTATC-----CTGTA---TGC-CAACAAAC---GTATGGCG--GAT-GTTT-TCA-AGGA---------------------------------TC----------G---------T------T-----C--CGGC-GCC-CCAGAAA-C--CTGAAG----GATATG-GTGGTA--AGGACCAGGCTGGATA--ACCC-TCTAC--CTAATGG---AGGTTTCAAAACAT--GC-TC----AGA--TCTTAA-A-------A-T----G-TC-AA--TT--A-TGC--AAAC---AT-----AGC-TT----AGAC--ACT-----GAGACTTCC--A-GAA-GTCC--TG-T-G--ACAGATCG-C-AGTT-AT--------------A---AAA-TATTGG-------------G--GA--A--C---TAC-ACCTG-CAA-AAC---CAAT---AAC-T-G-CAT-C----------TA-T--CTC----ATCAAT-TG-T--GATGTC-TG-CCAGAAA-CA--GGA--CG-T----------TG-GAGA-AA--------CTAC-AG--ACC---TTCGTAAAA-GGGT-AAA--CAA-TCACC--GGTCCT-CC-G-T-T-AGGACCAA-AA-A---G-GA-C--TT-----G---C-CG-GTA-TC-TACGCA--TTTCAA------T---G-GTAGCAATCA-CCG-TT-GG---GA---------------GG-ACA--TGACAA--TA-----TTAGTGATTGATCAT
gi|10 : AGGACACCACT-GACTACCTCAATGATA-CTTCTTCTTCA-GACCTGCATGAAGACACTTTGTTGGTTACAATGGACATCACTTCATTGTATACCAA-TATT--CCACACCAGGAGG-GCAT-TGA-GGCATGCAGAGAGGTC-TGGAAA-ACA--------AGAACC-AC-CCCTAAA---C--CTTCCACAAAATTATTGGTTCTACTCCT-----T-GAGCATGTCCTTA-AGTTCAA--TA--ACTTTATGTTCAA---TGGTGAACACTATCTACAAAT-AAGTG-GCACT-C--CCATGGGCACCAAA-ATGGCTCC-CT-CTTACGCTAACA-TCTTTATGGGTA--AACTT-AAACATAATCT-GCT---AC--A----ACAAG--CACCTGTTAAGTC-GTTCA----GCTG-GTTACGATTC-ATT-G-ATGACATTGAAATG--AAATG----GGC---GAACAG-TCGAAGCAGTCTTGACAACTTCATT----GAACTTGCAAACGCTTTTCAT-ATTTCCATC-AAGTTCACAG--TG-GATATTTCC-GCATCTAG-CAACGTCTTTCTGGA
gi|11 : -CAATAAA----GAATGGCT--GAT-GTTT-TCA-AAGA---G---C------CACACTATGGCT-------GC----------C---------T------T-----T--AGGC-GCC-CACGAAA-C--CTGAAA----GACATG-GTGGTT--CGAACCAAGTTGGAAA--ATCC-TTTAC--CCAATGG---TGACTTTAAAACCT--AT-TC----AGA--TAAA-A-G-------A-T----GTTT-GA--T---G-TGC--AAAC---AT-----ACT-TC----TAGC--ACC------ACAGTTTT--G-AAA-GCCC--TG-T-C--ACCGGTCG-A-TCTT-AC--------------A---GAA-TATTGG-------------G--GA--A-AC---G---TCCTG-TCG-AAG---TGAC---AAC-T-G-CAT-C----------TA-C--TTG----ATCAGC-TG-C--AAAA---TG-TCAGAAA-CA--ATA--TG-C----------GG-GTGA-GA--------CTGG-CG--ATA---TACGCCGAA-GGA---------------C--GGT-CA-CC-A-T-A-AAAAC--A-AA-A---G-GG-T--CCAAGGAA---C-CC-GTC-GC-CAAGCA--TTTTAA------TCTCG---AGGAA-CA-CTC-AT-GG---GA---------------AG-ACA--TGACGG--TG-----GTGGTTA-TGACCAc
gi|12 : atatatatatgacacgCCT-CGAAAGTC-ATCCG-ACAAACAG--GATATGA--T----CCT---TGCAGGGCACAGTCCGCAGT-TGATA---AGAT-----GC---CACAACA-GACCG--ACAGTCCCTCCTCCAGTACACAGAAAACCC-TTAAA--A---T-G--ACAGAGTTCCGCTAATCACTAC-T--TACCATCCCGCCCTCAA-G-A---------CTC-------CACATTAT-TCTGAGAAAGT--ATCTACCCATT-----CTGCA---AGC-CAATAAAC---GAATGGCT--GAT-GTTT-TCA-AGTA---A---C------C----------T-------CC----------AATGACATGCT------T-----C--AGAC-GCC-CTAGAAA-C--TTGAAG----GACATG-GTAATA--AGGACCAGACTGGATA--ACCT-TTTAC--CTAATGG---AGGTTTCAAAACTT--GC-AC----TGG--CCTC-A-G-------A-T----G-TC-AA--CT--A-TGC--AAAT---AT-----AGT-TC----AGAC--ACT-----CAGAGCTTT--A-GCA-GTCC--TG-C-C--ACAGGTCG-T-AGTT-AT--------------A---GAA-TATTGG-------------G--AA--ACTT---T---TCCTG-CAA-AACTATTAAC---AA--T-GTCAT-C----------TA-T--CTC----Agacatccactggacggatgcagacagaaaaggcaagaagttttggatgcataggctgtaaaag
gi|13 : TTAAAAGACACAACA-GACTTTC-AAATGTAA-CTCCA-AAGCAAGGCCCACCAGACCACACACTT---------ATAAA--TAAC----CTTGACATTAA-CGTTTTCCATATGACAAAA-ATAT-CAATGGC-TGCAGGGAAGTT-TGAAATGACA--------A------TC---CAAAA--TC--CT---AGTAAATCACTCATTCAG--------------------CCTCA----TCAA--CA--ACTTCTTGTCAGA---CAGCAAACAT----------T-A-GTG-GTCTC-G--CTAT-GAAACCAAT-ATGGCACCAAT-TTTA----AACA-T----------A--AACTC-AAACGTAGCCC-ATT---AA--A----CCAAA--CATCATGCAAATC-CCT------GT----CTACTTTTCAAA--G-ATGACATAGAGATA--A---------GCCCATAAGAG-TCG-GAAGG-------------AT---------TTGCAAACTCTTTCCA------CCATC-AAGCTTAAAG--TG-GAAATT------AT-------AC--TCTCTTGGTCACCACTGC-CACATCTACAGAATTTA-AAATCAATTTCAGCCTCCCC-A-CTAAG-TCCACa
gi|14 : ACTTGCAAATCA-GTTCGCATG-G--CTAAGTTAACTAAA-ATGGCAAA-AT-CTTATGCCAACA-TCTGCATG----------------GTAGCAC-CCT---AT-------TTGTT-----------AGCC-----A----GTTG-GCTATGTTTC-A---------CATTGAGATG--AAGTG----A-------ATGA-TCATGAAAAATCCGA-GACTTCGTC----ACGGTTCCGAACTCTTTCCTT-TATTTGATG-AAGTTCACTGCATGTGGCAATTCC-ATCTCCAA-AA---TACTATCGGATACCACAGC-TACACTTAT-AAATGG-GAAACTGAGTTCAATCCCCATAA-CTCAA-CCCACCGACTCTCATTAATATACCATAT---CATCC----AACCATCCTAAAATGTGTCCTAA-G-CTTT--------------------T-GTC---------GTC---C--A-AATTT------GCTGCATCTTCTCTATTACCCACCACT-----TTCCA-AGAGGCA-AG---GACAC-TTCCTAA-AAAGTCaa
gi|15 : ---AT-----AGC-TC----AGAC--ACT-----GAGAACTAC--A-ACA-GTCA--CA-T-T--ACGGGTCA-C-AGTT-AC--------------A---CAA-TATTGG-------------G--GA--A-TT---T---TCCCG-TAA-AAT---TCAT---AAT-T-G-CAT-T----------TA-T--CTC----AACAGC-TG-T--AATGTC-TG-CCAGATA-CAATGTATTCA-TATGGGGGGGGGG-GTGT-AA--------CAAC-AG--ACC---TTC-CAAAACAGGC-TAA--CAA-CCACC--GGTCCG-CT-G-T-C-GAAACCGA-GA-A---A-GG-T--TT-----G---T-CA-GTA-GC-TACCCA---TTCAA------T---G-ACAGTAATAT-CCG-AT-TG---GA---------------GG-CCG--TGACAA--TA-----ATGGCTAT
gi|16 : GCTCATCGACAACTCTCA--GACGAACGCTTT--TAT-A--AA-AAGTTATAGTTTGACCCT-ACCAAAGAGTTCTCTCCTAAGATAA-TCAAAACCCTTCATGAAATGT-ACA--ACAAGGGTGA----AATC-GGTGACAA-CGTTTTCGACAT---GCTTT-GTC---CTAAC-GACTGCAGACCAGGACAATTTTATATACTGCCT-AAAATCCAC-AAA-G-TAGACATGCCACGCCGTCTT-ATAGTCC-G--AGCCATTGG-ACCGTCATGATCCCAAGGAGAAAATCTCTGAATTCATTGatattgaacatgacaaaagttttcagatacccagagaaaacaaaaggaaatgattagggatgcaaatattgaagtaattttatcagcaagatctaaacatgcccactaacttcacccggatgaata
gi|17 : agataatctcaccaaagaagaaagattggcgttgcaaacattgatattgtcattaaaaggacagacaaaggttctacttaagttgtcttggacaaagacgggtacttgacggagGCTC-TCG-CAACTCTCAATGACGAACGCTTT--TATTA--AATAAGTTATAGTTTGACCTA-ACCAAAGAGTTCTTCTCTAAGATAA-TCAAAACCCTTCATGAAATGT-ACAACA--AGGGTGA----AATC-GGTGACAA-CGTTTTCGACAT---GCTT---TC---CT-AC-GACTGCAGACCAGGACAATTTTATATACTGCCTAAAAATCCACAAAG-T-AGAACATGCACGGCCGTCTTAATAGTCC-G--AG-CATTGGAACGTCATG-ATCCCAAGGAG-AAATCTCTGAATTCATT
gi|19 : gagataatctcaccaaagaagaaagattggcgttgcaacatttgatattgcattaaaaggaaacaaagttctaacttaagtgtcttggacagaagacgggtacttgacggaTCCGCAAC-TGATG---AAAT-----GT---CGCAATAAGGCCG--ACAGCCCCTTCTCCATTTTAAAGAAAAACC-GCA-A--A---T-G--ACAGGGTTTTGCTTGTCACTAA-C--TATCACCG-GTCTTGAA-G-ATC-------CTC-------AGCTGTAT-TCTGTAAAAGC--ATCAACCCATT-----CTGCA---TAC-CAGTAAAT---GAATGGCT--GAT-G-TT-TCA-GGGA---A---T------C----------C-------CC--------------------T------A-----T--AG-C-ACC-AGAGAAA-C--CCCAAG----GATACG-ATAGTA--AGGACAACACTATATA--ACCCTTTTAC--CTAATGG---------TAAAACAT--AC-TC----AGA--CTTC-A-GTACATGTA-T----G-TC-AA--TT--G-CAC--AAAT---ACATGTAAGC-TC----AGAC--ACA-----GATAGCTTT--A-GCA-GTCC--TG-T-TCGACAGGTCG-TGAGCT-AT--------------A---AGA-TATTGG-------------G--AA--A-TC---T---
gi|2 : GCGCACAGACAGCTCT-G--GATGAACGGTTT--TAC-ACTAA-AA----C--TCCGACCCT-ACCAAAACGTTTTCCGCTACTATCA-CCGACACTCTTGAGCAAATGTTACA--A--AAAACGAGGAAAATT-GGTAATAA-TGTCTTTGAAACAGTGCTGC-CTC---TCAAC----TGTACACTGGG-CAATTTTATCTCCTGCCT-AAA-TCCAC-AA--A-AAGGCATTCCTG-CCGCCC----------------CATTGG--C-------ACCCCACGGAGAAAATCTCAGAATTTATTGACCT-ACACCTCTGC----CCATA-----TGTTGTAAAACTACCATCATA-CTTGAAGGACACCACT-GATTACCTTAACAAAAACCCCT-CTTCG-AACCTACCTGACAATACCCTTCTCGTGACCATGGATGTGACTTCGCTTTACACAAAACATC--CCCCACGATGAAG-ACAT-TGA-AACCTGCTGGGAGGTT--GGGAT-AAA--------AG---GATC-CTGAAAACATC--CTTCCACAGAATCATT-GTCAAGCTCCT-----T-GAACATGTCCTCA-AACTAAA--TA--ACTTCATGTTCCA---AGGCAACCATTACTTACAAGTTA-GGG-GCACAAG--CAATGGGAAACGAAGATGGATCC-TTTCATATGCCAACA-TTTTTATGGGAA--GACTT-GAACGCAACTT-ACTCAGGC--A-------AT--CGCCCTTTAAACC-CCATA----ATTG---TGTGTTTC-ATTTG-ATGACATTGA-ATG--AAATGAAATGGC---GGAGGG-CCGAGATA--CTTGACAACTTTATC----TCCTTTACCAACTCATTTCAC-CATTCCATTTAAATTTACAG--TG-GAAATTTCCAGC-TCCAA-GAACATATTCTTGGATACCGCTTC-CACTCTCTT-GGATGGTGAAATTGAATTCAGCTTCCAT-A-CCAAAACCCGCTGACTCACATT--TGTAC-TTATTGCCTTGA----AGCTGTC-----ACCCACCTCAT-A-CCTTCA------------AAGGAGT-ACCTAAGGTTTAGCTACAC--G-AGTTC------GTC-TATCTG-----TT-CCTCTGGCTCGGAATTCGA-AAAAACA-AATCAAACTCTATCTT-G-AAAAGCCACCTTTGTAAA-AGGGGCTGTAAAGTTGTTCCTGTTCACAA----CAG----CAAT-TGACG---AT-T-----GTC--CAGAACAAG
gi|2 : gacaaacttaagcatagaagaagagcttagccttataagagcttaaaaaaaaactcggatgacattgctatcaaaaaggcagacaaggtcaacagtggttgtattagacaagacagcatacatagcggaaCCCGCCCTGAA-G-AAC-------CTC-------AATACCAT-CCTTA--AAGCC-ATTGTCCTAT------CTGTA---TAA-CAAAGAAC---GAATGGCT--AGG-GTCTCTTA-AAGA---C---C------A----------T-------CC----------AATGGCAGCTT------T-----C--AGAC-AAC-CTAGAAT-T--TAAAAG----GATATT-GTAGTT--AGAATTAGGCTGGATA--ACCC-ATTAC--CCAACGGGGCGGGTTTTCCCACGT--GC-TCTGAAAG--------A-G-------A-T----G-TC-----TCCAG-TGC--AAAT---TC-----AG---C----GGGCCAACT-----GA-CGCTTT--caaaactctaaattttcacccgccctgaagaacctcaataccatccttaaagccattgtcctatctgtataacaaagaacgaatggctagggtctcttaaagaccatccaatggcagctttcagacaacctagaatttaaaaggatattgtagttagaattaggctggataacccattacccaacggggcgggttttcccacgtgctctgaaagagatgtctccagtgcaaattcagcgggccaactgacgctttcag
gi|20 : gacaaacttaagcatagaagaagagcttagccttataagagcttaaaaaaaaactcggatgacattgctatcaaaaaggcagacaaggtcaacagtggttgtattagacaagacagcatacatagcggaagcgcacagacagctctggatgaacggttttacactaaaactccgaccctaccaaaacgttttccgctactatcaccgacactcttgagcaaatgttacaaaaaacgaggaaaattggtaataatgtctttgaaacagtgctgcctctcaactgtacactgggcaattttatctcctgcctaaatccacaaaaaggcattcctgccgccccattggcaccccacggagaaaatctcagaatttattgacctacacctctgcccatatgttgtaaaactaccatcatacttgaaggacaccactgattaccttaacaaaaacccctcttcgaacctacctgacaatacccttctcgtgaccatggatgtgacttcgctttacacaaaacatcccccacgatgaagacattgaaacctgctgggaggttgggataaaaggatcctgaaaacatccttccacagaatcattgtcaagctccttgaacatgtcctcaaactaaataacttcatgttccaaggcaaccattacttacaagttaggggcacaagcaatgggaaacgaagatggatcctttcatatgccaacatttttatgggaagacttgaacgcaacttactcaggcaatcgccctttaaaccccataattgtgtgtttcatttgatgacattgaatgaaatgaaatggcggagggccgagatacttgacaactttatctcctttaccaactcatttcaccattccatttaaatttacagtggaaatttccagctccaagaacatattcttggataccgcttccactctcttggatggtgaaattgaattcagcttccataccaaaacccgctgactcacatttgtacttattgccttgaagctgtcacccacctcataccttcaaaggagtacctaaggtttagctacacgagttcgtctatctgttcctctggctcggaattcgaaaaaacaaatcaaactctatcttgaaaagccacctttgtaaaaggggctgtaaagttgttcctgttcacaacagcaattgacgattgtccagaacaagcaaaactctaaattttcaACAG--ACAGGTCCTCTTCCACTATGAAGAAAAACC-TCAAA--A---T-G--ACAGAGTTCCACTAGTCACTAC-T--AACCGTCCTGTGCTCAA-A-AAC-------CTC-------AACACTGT-TCCAAGAAAAC--ATGTGT--------------A---TGC-CAATAAAT---GAATGGCT--GAT-GTTT-ACA-AGGA---A---C------CCCTATGGCA-T-------CC----------T---------T------T-----T---GAT-GTC-CCAGAGA-C--CAGAAG----GACATG-GCAGTA--AGGGTTAGACTGAATATAACCC-TCTAC--CTAATGG---AGGTTTCATA-TAT--G----------A--CCTC-A-C-------A-T----G-TC-AA--TC--A-TGC--AAAT---AT-----AGC-TC----AGAC--ACTGGCCAGGGAGATTT--A-GCA-GTCT--TG-T-C--AGGGGTTG-C-AGTT-AT--------------A---cag
gi|21 : aaACAG--ACAGGTCCTCTTCCACTATGAAGAAAAACC-TCAAA--A---T-G--ACAGAGTTCCACTAGTCACTAC-A--TA-----CCGTGCTCAA-G-AAC-------CTC-------AACACTGT-TCC-AGAAA-C--ATGTG-------------------TACTCAATAAAT---GAATGGCT--GAT-GTTT-ACA-AGGA---A---C------CCCTATGGCA-T-------CC----------T---------T------T-----T---GAT-GTC-CCAGAGA-C--CAGAAG----GACATGCGCAGTA--AGGGTTA-ACTGAATAT-AACC-TCTAC--CTAAT-G---AGGTTTC-ATATAT------------GA--CCTC-A-C-------AGT----G-TC-AA--TC--A-TGC--AAAT---AT-----AGC-TC----AGAC--ACTGCCA-GGGAGATTT--A-GCA-GTCT--TG-T-C--A-GGGTTG-C-AGTT-AT--------------A---
gi|23 : a---C-CT-GTT-GC-CAAGCA--TTTCAA------T---C--TAGCAGAAA-CAA-AT-GG---GAAAACATGAGAATGGAGA-ACA--TGACAA--TA-----GTATTTA-TGATCA
gi|24 : gggtcaaaa-AAAACCCATTTGTGCAAA-AGAAGCTATGAAGC----CCC---AACAA--TGCAAGCAGCTAT-TGATG---TGAT-----GT---CAGAACACGACAT--ATTATCCCTACTACAATTTAAAGGTAAATTGTTAGATTA---T-GA-ACAGAGACCTAACGGTTGCAAC-G--CACCACCCTGTCTTGAA-A-GAC-------CTA-------AACAATAT-TGTGAGAGAGCATATATTCCCAAT-----CTTCA---TAC-TAACACTA---GAATGG-------------TCA-ATGA---A---C------C----------T-------CC----------gaactcccactggaaaggaataacaaagaaaaaatctggatgcgtagccactccgccctgatggcacgacttccctagaatgaatgtgacttgggtactctagttattactcagtatttacaatttctatttgccatttactttgtgtaaaagcaccatcattagcagtcaatctttccatacttgttctgatttttttttta
gi|25 : aagaacagagcacccgactga-AC-GG---GA---------------GG-ACA--CGAC-A--TA-----GTGGTTATTAATCATcattgcggcctctgctaccgaattcttgggaagaca
gi|27 : ATCA-CTGACACTCT-AAGCAGATGT-ACA--A--ATGACGAGG--AATTTGGTAATAAATGTCTTTGAAAC---ATTGCTGTCTCTCCAA-----TGTAGACCTGGGCAATTTTATCCACTGCCT-AAAATCCAC-AA--A-GAG-TATGCCTGGCCGCCCC-ATAGT---GATGGCCATTGG-AC-------A-CCCACGGAG-AAATCTCAGAATTTATTGACCCAACACCT--GC----CCACAAATGTTGTAACATACCTAC--TCATATCTTGAAGG--ACCACTAGATTACCTAAACAAAA-CCCCA-TCTCC-AACCTACCTGACAAgacctaaattggacagattcctaaagaaagcaaaaggaaaattccggatgcacagacagaagtcgtttgactccgggtgaatcactgactttcccagtatagcagggctaaacctacaaatgtttattattccggaactccatctactcttttgattcataccttcaacactatagccgtatttttcatttcatttttttaaaaatagttttacgcgctagactactttgttacatactagtttacaggaccgtgt
gi|28 : caTTT-TTA-GTGA---A---C------C----------T-------CCCTGTCGT---G---------T------C-----CTTCGAC-GGC-CCAGAAA-TAAATCAAG----GACCTT-ATGGT----AGACCAGACTGGATA--ATCC--CTAC--CCAATGG---GGATTTTCCAAC-T--TC-TC----TTA--ACAC-ACG-------G-T----G-CC-TA--CT--C-TGC--AAAT---AT-----ATC-CCCAAAAGAC--A-T-----GAGACATGC--A-G-A-GTCT--GA-C-C--ACAGA--A-A-AAGT-AT--------------A---GCA--ATTGG-------------GCCAG--G-TT---T---TTCCG-TAATGAC---CAAC---AAC-T-G-TAT-T----------TACC--CTC----ATCAACATGTT--AACGTCGTG-C---AAA-CA--ATA--TGCT----------GG-GGGA-AA--------CCAt
gi|29 : gtGCTCATTGACAGCTTTCG--GACGAACGCTTAAATAT-A--AA-AAGTCACTGCCTGACCCTCGCCACAGAGTTCTAGACCAAGATCAGCCGAAAAATTCCAAGCATTGT-AC---A--ATGGCGA----GATC-AGTGACAA-CGTT------AC----CTT----------AAC-GCCTGTGGACCAGGATATTTTTATGTACTGCCA-AATGTTCAC-AAACACAAGACATGTTAAACTGTCCT-GTAGT-CGG--TGACTTCGG-GC-------ATCAAACGAGGAGAATTTCTTAATTCATT
gi|3 : tagacaagtactcaacaaattaaaGTTCACTG--TT-GATATTTCC-GCATCCAG-TAACGTATTTTTAGACACTATGTC-CAAGATTGT-TAACGGAAAAGTCGAGNNNNNNNNNNNN-N-NNNNN-NNNNNNNNNNNNNNNN--NNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNAGTTGTC-----ATCCTACTCAT-A-CATTCATAGGAGAAACTAAAGGTTTAGCC---------ACC---A--G-TGTCG------GCCGTATCTGCTCCACT-CCTGC-ACT-----TTATA-AAGAACAGAG---CACCC-ATCTA-G-AAAA-CCATCTGTGCAAG-AGAGGCTATCAAGC----CC----CA-AAAGTGCAAGCAGCTAT-TGATG---AAAT-----GT---CAGAACACGACAG--AGAACCCCTACTACAATACAACAACAAA---TCGGT--A---T-GTGACAGAGTCCCAATGGTTACTACGTAGTACCACCCTGTCTTAAA-A-GAC-------TTG-------AACAAAAT-TCTGAAGAGGC--ATATCCCCATT-----CTTCA-------CAATAACCCTAGGAT--CTTCAAG-ATCT-TCA-AAGA---A---C------C----------T-------CCCAT-------GGCGGCC---T------T-----C--AGAC-GCC-CCAGAAA-T--CTGAAA----GACATG-GTGGAG--CGGACTAAATTGGACA--ACCC-GATAC--TTAACGA---GGGCTTTATCACAT--GT-TC----TGA--TGGC-A-G-------A-T----G-CC-TG--AC--G-TGC--AAAC---AC-----AGCATT----AG-C--ATA-----AACATTTTT--A-AGA-GCCC--TG-T-T--ACAGGCCGAC-ACCT-AC--------------C---GAATTCTCAG-------------G--GA--A-AC---A---TCCTG-TCG-CGC---GGAT---GAT-T-G-CAT-C----------TA-C--CTC----ATAAGC-TG-T--AAGGTC-TG-TGATCAA-CA--ATA--CG-T----------GG-GTGA-AA--------CTGG-GG--ACC---TACGTAGGA-GGAT-CAA--TAA-CCACC--GCTCTA-CC-A-T-C-AAAACCAA-A
gi|30 : AGGTACGGCCCGTAACATGATAGGCAGATTCTCTGTAACCACAA-AGGACAGGAACA--CCCTTTTGCAATACAAAGAGAAAA----AGA--A---A-A--AAAGA------------------------CACCCCGTCCTTAA-G-AGC-------CTT-------AACAGAAT-CCTGAGAGAGA--ATCTGCCGATT-----CTTCA---CAA-TAATGAAA---GAATGGCG--GAT-CTTT-TCA-AGGATCTA---CCAATGGC----------T-------GC----------A---------T------T-----T--AGAC-GGC-CTAGGAA-C--TTATAG----GACATG-GTGGTG--AGAGTCAAATTAGATA--ACTC-ATTAC--CCAATGG---TGGCTT
gi|31 : tgtTGGATGTCACGTCATTCTACATT---------------GGCTAG---CATTCAA-AGCGTGCAGCGAAGTTATGGATA-ATA--------AG---C-TG-TCCATAG--CC--CCTCCGCTGAGTCACT--TTCAACTCTT-----A-CAACGTGATCTTATAGTCCAA--TA---CTTCGTG----------GCGATCACTATTTCCAAAT-T-ATC--CACA-ATTCTATGAGAACCAGA-ACATCACT-CT-CAAAAGCCAACA-TATTCATGGAAA---------AGTGAAACCT--CT---GC--T----TC-----------TGCAATC-GCTGA------TG-ACT--GTTTC-ATG-G-ATGATATGGA-ATG--
gi|32 : -TTTAC--CTACCGG---AGGTTTCAAAACATTGGC-T-----ATA--CCTC-A-A-------A-T----G-TC-AA--TT--GATGC--AAAT---ATT----AGC-AC----AGATT-ACT-----GAGAGCTTT--A-GCA-GTCC--TGTT-C--AC-GGTCG-T-AGTT-ATAAGATTTAGCTATAA---AGA-TATTAGCTTAAAGATATTGG--GA--A-ACTTTT---TCCTA-CAA-AAC---TAATATAAACTT-G-CAT-C----------TA-T--CTC----ATCAGT-TG-CAAAATGTC-TGCCCAGAAA-CG--GTA--TG-T----------AG-AGAACAA----------ACAGG--AC------CGCAAAC-AGGT-CGA--CAA-CCACA--GGTCtatgg
gi|33 : CAAAGCGTTTTCTGCCACCATCA-GTGAAACTCTACA--AAG----ACG--A--GG----A----AATT-GGTGAAAA-TGTCTTTGAAACATTGCTTC-CTC---TCAACTG--TATATACCTGGGCAATTCTATCTACTGCCT-AAAATCCAC-AAG-G-AGGGTGTGCCTGGTCACCC--ATAGTGT-G--TGCCATTGG-GC-------ACCCCACGGAGCAAATCTCAGAATTGATTGACCT-ACATCTCTGCATGTCCATA-----TGCTATGAAGCTACCATCA
gi|34 : gaccaacgattctatggaaggatgtt---T-G--GCAGAGATTCAATGGTTACTAC-T--TTCCACTCTGTTTTCAA-A-GAC-------ATG-------AACAAAAT-TCTGAAGAGGT--AT-TCCGCA----------------A---AATAATCTTTGGATGGCC--AGT-ATCT-TCA-AAGA---A---C------C----------T-------CCCAT-------G---------TCATCCTT-----C--AGAC-ACT-CTGGAAA-T--CTGAAA----AACATG-GTGGCG--CGGACTAAATTG
gi|35 : cgatatgT--CCACATCATGAGG-ATAT-AAA-AGCTTGCAGAGACGTA-TG--AT-ATAGTACTTACAG---C-CA-TTCATAG--TT--CATCAATTGAGTCACTTACCCTGCTCCTACATGTAGAACATGTTTTGT-AATGCAA--TGTCACTT----TTCAAAAATGGTGATCACTGCCTTCAAATTA-GTG-ACACT-G--CTATGGGAACCAAA-CTGAGACC-CC-CATCTGCCGATA-TGTTttctgttgggagatgactggtgtgcaaacatagcgctaacacaattagttttaagagccctgt
gi|36 : CGTATCCTTA-AGTTTAAAATA--ACTTCATGTTCAA---CGGCAAACACTATCTGCAAATGA-GTG-GCACA-G--CTTTAGGAAC-AAA-ATGACATC---------------A-TCTTTATGGGGACTGTCCCAGAACGTAACC--CCT---AC--A----CTGGT--CACCATGTAAACC-TTGTA----GCTG-GCTATGTTTC-CT--GGATGACATTCAGATATAGAGTG----GGT---TGATGG-TCGTGGAAGCCTTAACGACTTTATC----AAGATAGCAAACTTTcttttgaaaaagtggaatacaaattgctaat
gi|37 : -CCAGAA--CA--GT----G-T----------AATGGGA-AA--------CAAG-AG--ACA---T-CGCAAAC-GGGT-TAA--AAA-CCACC--GGTCTT-AC-G-T-C-CAAACCAA-GA-A---A-AA-T--TT-----G---T-CA-GAA-GC-TAAACC--T-----------------GTAGTAATCG-CCT-GT-GG---GA---------------GG-ACA--TGACAA--GAGCGCTATGATTATTGACCata
gi|38 : acccttgtaaagcccgcatcaatttgaaaaattgattatattaaAA-AA-A---G-GA-T--CT-----C---C-CGTGTA-GCCTACACA--TTTAAAA-----T---G-TTAGCAATCA-CAG-GT-GG---GA---------------GA-ACA--TTACAA--TA-----TT-GTTATGGGTCccaaattattcatataccaaaacaaagcagaaggca
gi|39 : CACT-A--CTGTGCGAACCACA-ATGTCTCC-AT-CATACGCCAATA-CTTTCTTTGGAC--GAC----AACGCAACTTACCT---CT--AATAGTAAAT--CGCCTTTCAAGTG-CCTTACTTGGTTGTGCTAAGTTCC--------CGACATTCAAATA--GGGTG----GAC---TGACA--TC-CAAAA--TAAGACAACTTTATT----TCGTTTACGAACTCGTTTAAC-CATTCAATC-AACTTCACtgacccaagttttggtcagaaatgaggagaaatgcgaaaggaaaaaagccaggatacacaggttgttcaaaagtcatttgaagcttttgtcagggtataatcaaaccacttaagatgaaaacggaactaaaa
gi|4 : aACCCTGCCCTTAGTGCGAC-------CTTCTCT---AATAGTATGTACAAGAAAAC--ATTTGCCTATC-----C---G---TAT-CCACAAAC---G--TAGC---GATAGTTT-TCATA--A---A---C------CGC--------T-------CCTGATGACATCG---------T------TTACCGC--AG-C-GCC-CAGAAAA-C--CTGAAAAAGCGACATT-GTGTAA--AAGACCAGGTTGAGTA--ACCC-TCTACCTCTAATGG---AGGTTTCAAATCAT--GTATC----AGA--TCTC---G-------A------G-TC-AAGTTT--A-TGTCAAAATTAAAT-----ACT-CC----AGAA--ACT-----GAGACCTTC--AGGAA-GTCC--TG-TGA--ACA-ATCA-C-AGTTCAT--------------A---AAA-TATTGT-------------G--GATGA-AC---T---TACCGTTAA-AAC---CAA----AAC-TCG-TATAC----------TA-T--CTCT---ATCAA--TG-T--GA-GTC-TG-CCAGAAA-CA--GT---CG-T----------TG-GAGA-AA--------CTAC-GA--ACCTTTTTCGTAAAA-GGGTACAAG-CAA--TACC----TCCT-CC-G-TGC-AGGACCAA-AATATGCG-GACT--CC-----G---CACG-GTA-GC-TACGCAGTTTCCAAGTTC--T---GTGTAGACATCA-CCGAAT-GGGTTGA---------------GGAACATGTGACAACGTG-----TTAG-TA-TGATCAT
gi|40 : tgaattgtacaacggaccgacaatcccctcacttccatatattcaaatttgcacttctccaccttcatatctcgaatatcttgcaactcaactatcgattcccgtgccgATTGCGACG--AAGTG----GGT---TGATGA-GCGTAAAATCCACAATGACTTTATC----GCAAGTGTGAGCTATTTCGAC-TATTCCATT-CTGTCCTCTG--AG-GAAATTTTC-AACTTTAG-GAATATTCTATGGGATACCACATT-CGCACTTAC-AAACGGGGA-----------GCCTTCA------------CATCGAC-ATCATT--TGTAC-GTAT-GCCATTC----ACCTTTC-----ATCCACCCgtacctactctggtcaactattcaaagaaaaaagaagagaatttctggatgaccaggttgaagtcattcgagcctcagtgtcaatccacaaatctaagctactttcccagtagatgaacacgggttagac
gi|41 : --CCATGGACACCAAA-ATGACTCC-AA-GCTACGCCAACATTTTTTATGGG-A--GACCT-GAATACAACCT-A-----GT--A----ACGTTGGCACAAAGAAAACCTTTTTA----GATG-ATTTCTATTC-AT-----TGGCATTTGGATG--AAATG----GG----TGTCAACTCGGGGAAACCTTGGCAACTTTATt
gi|42 : CACT-A--CTGTGCGAACCACA-ATGTCTCC-AT-CATACGCCAATACTCTTT---GGAC--GAC----AACGCAACTTACCT----CTAA----TAGTA--AATCCTTTCAAGT-CCTTACTG-GTTGTGCTAAGTCCC-G-------GACATTCAAATA--GGGTG----GAC---TGACA--TC-CAAAA--TAAGACAACTTTATT----TCGTTTACGAACTCGTTTAAC-CATTCAATC-AACTTCACttaaatagcccgtgcatttcatactctcattaagtttcac
gi|43 : A--TC--CTTCCATAGAATCGTTGGTCAAGCTCCT-----T-GAACATGTCCCCA-ACCTCAA--CA--ACTTCATGTTCAA---TGGCGAACATTATTTAGAAGTAA-GTG-GCACA-T--CTACGGGAACGAAG-TTGGTTCC-AT-CGTATGCCAATA-TTTTCATGGGAA--GACTT-GAACGAAACAT-GCT---TA--G----ACAAT--CACCCTGTAAGCC-CCTTA----GTTG-
gi|44 : GCTCACCAACAGCTCTTG--GACGAACGCTTT--TAT-A--AA-A---------------CT-ACCAAAGTGTTCTCTACCAAGATCA-CCGAAACGCTCCAGGA--TAT-AC---A--AGGGTGA----GATC-GGTGACAA-CGTTTTCGAAGT---GCTTT-GTA---TTTAC-GACTGTTGACCGGGACA
gi|45 : tttactttattattatcattataaaggcagagaaagtctctaacataaAGTTCATGG--TT-GATATTCCC-GCATCCAG-TGGCGTCTATTTAGATACTACGTCGAATAC-TGT-TAACGGAAATGTCGAGTTCAAACGCCAT-A-CCAAA-GCAATTAACTCCCATT--TATATCCTGT-GCCATCT----AGCTGTC-----ATCAG-CTCAT-ATCGTTCA------------TAGGAGT-AC
gi|47 : CC---------TCC---C--G-AATCC------TCCGCATTTGATCTAAC-GCTACTACT-----TTCCATAG---CA-AG---GACAA-ATCGT-C-AAAATTCATTT-CACAAACACAGGATATGA--T----CAT---TGCAAGGTACAGTCCGCAAT-TGATG---AGAT-----GT---CACGGCATAACCG--ACAG------------TACAAAGAAAAACC-TCAGA--A---G-T--ACAGGGTTCCACCAGTAACTAT-T--TAttattttattagccactagagtccgtcatata
gi|48 : TCTTGTCAGAATAGACGTTAATTT-CTGTACACTAG-CGTC--CTGCAAGATGACC-ACAT-CGA-GGCATTTAGGGAAGTT-TAGAAG-AGA--------AA-----TT-TTCTAAA--TCATCTTCCACTGAATTGTTGGTAAAGCTCCT-----T-GGACATGTCCTCA-AACTTAA---------TCA---TCAA---CAGTGAGGACTACTTGC
gi|5 : A--CG-T----------TG-GAGA-AAA-------CTAC-AG--ACC---TTCGTAAAA-GGGT-CAAAACAATCCAC---GGTCCTTCC-G-T-CCAGGACCAA-AA-A---G-GA-T---T-----G---C-CG-TTATGC-TACGCA--TTTCAA------T---G-GTAGCAATCATCCG-ATCGG---GA---------------GG-ACA--TGACAA--TA-----ATAGTGATTGATCAT
gi|50 : cCAATCCCTTTTGCAATATAAAGAAAGATC----GA--ATGGT-G--ACAGAGTCCCAATGGTCACCAC-A--TACCACCCGGTTTTGAA-G-GAT-------CTC-------AACACTAT-TCTAAAGAAAC--ATATCCCCATT-----CTTCA---TGC-CAATAAAA---GAATGACT--GAT-GTTT-TCA-AAGA---G---C------C----------A-------CC----------gaccctagtttggtctgacattcaaagaaaaaagataggagaagttctggatgacaggttgacgtcattcgagcctcatgcatcaacaaatctgctgacttcaccaggagtgaacacggggttagaagcgattcaccggaaatcgaacactgatttacatgtaagactccccggcctgatcagtcccgaacatcctctattagattcaatcttcacaatgtatacttctcatgtgataaatttttttttttttctttctctttctatcttaaaaaaattttttttttttctcacggtctctttctctcgaaattaattgttttaattaaatctgatccacattgtgtataaattcagtattactttagaacttgacttaatagaatattcccgggtatgaactatccaatatatacctcctaattcgaatagtaagtcgttgcattattgtggatcagctaatggacgagtagggcgtatcctcattcgttccatatctaacattagatttgcaagccattaactcgaataccatgtgatttatatgtaatacggttgttacgttggagaccgatatatt
gi|52 : TAGCCT-CCT---AC--A----TTATT--CACCATTTAAACC-TCT---------------CATTT----------GACATTCAAATG--AAGAA----CAA---TGACAA-TCATGAAAGATGAAACAACTTTATATAAAGAGAAAACAAACTCTTCCCACTGGTTCAATC-AAGATCACTG--T--GAAATTACA-ACCTCTAGAGAAtatggc
gi|53 : CC--TG-T-C--ACAGACCG------------------------------A-CACTAC-------------C--GA--A-C--------TCTCG-CA----C---GGAT---GAT-T-G-CAT-T----------TA-C--CTC----ATATGC-TG-T--AACGCC-TG-TGATCAA-CA--ATA--CG-T----------GG-GTGA-AA--------CTAG-GG--ACC---TACGCAGGA-GGAT-CAA--TAA-CCACCTAAATTAA-CCAG-T-C--GGACCAA-A
gi|54 : cGTTCAATC-CCAT-AACTCAA-CCCACCGACTCTTATA--TATACCATAT-GCCATCC----AAC----------------CCATGA-CT---A------------AATGTGT-GCCTAA------GCT---TTTGTCGTCCAAATTTGCTGCATCTTCTCTATT-CCCACCACT-----TTCCA-AGAGGCA-AG---GACAC-TTCCT-A-AAAgcacccg
gi|58 : TT-AT--------------A---AAA-TATTGG-------------G--CC--A-AC---TC--TCGAG-TAA-AAT---CAAT---AAT-T-G-CTT-A----------TA-C--CTCATTGATCACC-TG-T--AAagt
gi|59 : actacaggcaaaacAT-ACTGA-AAAGC--ATGCTCCCATT-----CTTCA---TAC-TAAC--------------------------TCA-TGGA---G---C------C----------T-------CCCATGGCT---G---------T------TTT---C--AGAC-GTT-CAAGAAA-C--CTTAGA----GACATG-GTGGTGCTAG--CCAAATTGGAacaatgtaacttacaatacgtgtgtgtgttaacgtggggggggggg
gi|6 : cttgaaatattcaattagaGAC--ACT-----G-----TTC--A-GCAAGCCC--GG-T-GG-ACAGGACA-G-AGCT-AC--------------A---AAA-T-TTTG-------------G--GA--G-TC---TATGTCCTG-CCG-TAC---TGAC---AAC-T-G-CATAC----------TA-CACTTC----ATCAGT-TG-T--AAGAA---A-CCAAAAAGCA--GTA--CG-T----------AG-GTGG-AA----------AC-GGTGACC---TCCGAAGAA-GAGT-CAA--CAA-TCACC--GGTCCA-CT-ACT-T-AAGACC-A-AA-C---G-GA-TCACC-----GAACC-CG-TTG-GG-GA-ACA--TTTCAA------C---A-CTGAGGGTCA-CAA-AT-GG---GA---------------AG-ACA--TGACAG--C------GTAGTTATTGACCA
gi|60 : -TCTGAAGAAGC--ATTTTCCCACT-----CTTCACATTAC-CTCTA------GAATGGCC---ATGGTCT-TCA-AAGA---A---C------CA---------T-------CC----------ATGGTGGCT-T------T-----C--AGAC-GCC-CAGGAAA-T--CTGAAA----AACGTcaaccctaactggagtgactctgaaagaaaggaaccatagagaagattgctggtagtgcagcaggttactctcaaatagtacatctcttacggactgtcattgtcttcctccaaatggcacctcgaatgaatgaaaagtctctcatgaaatatggaacgttgcttgcccagaccaacgccggatactggatgcgttgagtggtggaaagcgagacgaaatgagcgtcgacccacagactttaactcatcgcctactcctcttcacaacctatactcggagtaaatttcattgatttct
gi|61 : gatttgaaacaaaaaaATA--ACCC-TCTAT--CTAATGG---AGGCTTCAAAACAT--GC-TC----AGA--CCTC-A-G-------A-T----G-TC-AA--TT--A-TGC--AATT---AT-----AGC-CC----AGAC--ACT-----GAGAGTTTT--A-GCA-GACC--TG-T-C--ACAGGTCG-T-A
gi|63 : T-GTTT-TCA-AAGA---ATTCC------C----------TATGACATCC--------------------T------G-----C--AGAC-ACC-CCAGAAA-C--CCAAAG----GACATG-GCAGTA--AGGACTATATTGGATA--ACGT-TTTAC--TCATTGG---AG
gi|66 : gCTTGTGACCATGG-TGTTACTTCACTA-ACAT------TT--CAAAATGAAGAGGTTTAT-CAA-GGCTTATAGAGAGGTT-
gi|67 : c---T---TTCCG-TAATGAC---CAAC---AAC-T-G-TAT-T----------TACC--CTC----ATCAACATGTT--AACGTCGTG-C
gi|68 : ttgggccaggttACGTG-GCGTTG--AGAGCCAAATTAG-TA--ACAT-ATTAC--CTATTGG---TGGTTTaa
gi|69 : T-ACATCTCCGT----CAGCA-----TGTAAAAGCTTTACCGTCATA-CCTGt
gi|7 : attGCAATCA-CCG-AT-GG---GA---------------GG-ACA--TGACAA--TA-----CTAGTGATTGATCAT
gi|70 : --CTAATGG---AGGTTTCAAAACAT--GC-TC----AGA--TCTC-A-gaccctagttggtgtgctactcaaagaaaaaggaaggagaagttctggatgcacaggttgaagtcatttgagcctcgtggcatcaacaaatctgctgacttcaccaggatgaacacgggttagaacgttcaccggaatcgaactctccttaaaccttcgcgcctgatcatccactcttagcttcaattttcacaatgtatacttctgtgataaaaaaaattttcttctctttctatctaaaaaaatttttttatttcttctaaattattgttttattagaattgatccattgtgtgatatattcaagtacttgactaaatagaatagttccgggtatgaactatcaattatacctcccaattcgaattagtaagtcgtgcatcattgtggatcagctaattggacgagtagggcgtatcctcattcgttccatatttaacatagatttgcaagccaataacccaataccatgtgatttataatgtaaatacggttttagt
gi|8 : CT--GAG-GTCT-TCT-AGAA---G---C------C----------T-------CCT---------G---------T----------------GGCTGCCGTCATATATC--CT--AG----GA-----GTGCTG--GGATCCAAATTGAA-A--AATG-TTTGC--CCAGTGG---GGATTTTAAAACTT--AT-TC----TGATGCCT----G-------A-T----G-TAGAA--TC----------------AC-----AGC-GC----GAAC--ACA-----AATAATTTTTAA-GCG---CCGATG-T-C--ACGG---------------------------------AA-TGT-------------------------CC---TG--TCGCG-------C---GGAC---AAC-T-G-CAT-C----------TA-T--CTC----ATAAGT-TG-C--AAGGTG-TG-TGAACAA-CA--ATA--CG-A----------AG-GTGA-AATTGAGGGTCTAC-GG--ACA---T--GTAGAA-GGAT-CAA--TGA-CCACC--GGTCTA-CC-A-T-G-AAAACCAATAG-A---GTGA----------------------------AAGCA--TTTCAATCTCGCT---G-GACGCAA--------AT-GG---GG---------------AG-ACA--T
gi|9 : -AAAAACCACCAATGTAAG-AGAGGCTATAAAGT----C-T---CA-AAAGTGCAATCAGCTAT-TGATG---AGAT-----GT---CACAA--------------TCCATACTACAATGTAAAGAAAAATT-GGTGG--A---T-G--ACAG-TTTCCA-TGGTAACAAC-G--AACCATCTCATCTTGAA-A-TACATTCTATCTTGAAAGAAAACAAAAT-TCTAAAGAAGT--ATATTCCCATTAATATCTTCA---CTC-TAGTCGCA---GAATGACT--TAG-GTTT-TCA-ACCA---G---C------C----------T-------CC----------AATGGCTATCT------T-----C--GGA--GTA-CCA-AAA-T--CTTA------GACATG-GTGATG--TGAACCAAATTGGA----ATTC-TTTGC--CCAAAGA---GAGCTTTAAAACTT--GT-TC----TGA--TGCC-A-G-------A-TCTATG-CC-TG--AC--G-TGC--AAAC---AC-----AGC-GC----GAGC--AC-------AGA----------CA-GCCC--TG-T-G--ACCGG-CA-T-A-TT-CT--------------ACCGAAT-TCTTGA-------------G--GA--C-AC---A---TCCTG-TCG-CAC---GGAC---AAC-T-G-CAT-CATTCTGTAATTA-T--TTT----GTAAGT-TG-C--GTGGTC-TG-TGAACAA-AA--TTA--CG-T----------AG-GTGA-AA--------CTGG-GG--TCC---TACGTAatattgactactcagttcactggacgcattcatgaggagagaacgaacgagaaagacccaaatggcacgaacaatctcaatgactttactagaatgaatgtggcctagcttcccctcagtgttgttctgtctgttttacactttctactctcagcactattattagcagtcaatctttccgtggtttcctaatctatctttt
12 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|18 ): GTCCCGAACATCCTCTATTAGATTCAATCTTCACATATATCTTCTTGTGATAAAAATTTTTTTTCTTTTTTTTTTCTTCTCTCTTTCTATCTAAAATTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTCTTTTCTCTCTCGAAATTATTGTTTTATTATAATTGATTCCATTGTGTGATAATTCAAGTTTTATCTTAGAACTTGACTTTAGAATAGTTCCGGGTATGAACTATCAATTATACCTCCTAATTCGAATTAGTAAGTCGTGCATTATTGTGGATCAGCTATTTGGAGAGTAGGGCGTATCCTCATCTGTTCCATATTAACATAGATTTGCAAGCCATTAACTCATACCATGTGATTTAATATGTAATACGGTTTTTAGTT
Unaligned ( gi|22 ): TTCTTTCTCTTGTCTATCTTAAAAATTTTTTTGTTCTCTTTCTCTCGAAATTATGTTTTTATGTATCAGAATGATTCCATGTGTGATTGAACTTCAAGTTATTTACTTAGAACTACTAATTAAATGAAGCTTCCGGGTAAAGCTATCAATCATACCGTCTAATCGAATCAGTAAGTCGCATATTGGATCAGCTAATTGGACGAGTAGGGCGTAAGTCCTCATTGTCGTTCCATATTAACATAGATTGCAGCCATTAACCTCAATACCGATGTATTTTTAAGTAAATACGGTTAGTTGTAGTAACTCAGATATATT
Unaligned ( gi|26 ): TTTTTTTTTTTTTTTTTTTGTTTTTTTTTCTCTTTTCTCTCGAAATTATTGTTTTATTATAATTGATCCATTGTTGTGATAAATTCAAGTTATTACTTTAGAACTTGACTAATAGAATAGTTCCGGGTATGAACTATCAATTATACCTCCTAATTCGAATAGTAAGTCGTGCATTATTGTGGATCAGCTAATTGTGGACGAGTAGGGCGTATTCCTCTCCATATTAAACATAGATTTGCAACCATTAACTCAGTATCCATGTGATTTTAATGTAAATACGGTTTTAGT
Unaligned ( gi|46 ): ACAATCTCAGCAAAGAAGAGAGATCTGCCCTCCAATTGCTAAAAAACCGTGACGACATAGTCATAAAAAACAGACAAAGGTTCCACGGTCGTTGTTCTAGACAAAGATTCGTACTTAGCCGAAGCTAACAGACAGTTGTCTGATGAGCGATTTTACAGAAAGCTGGATTTTGATCCCACTGAGGAGTTTTCAG
Unaligned ( gi|49 ): TAATACATTCCTAATCGAATTAGTAGTTCGTGCATTATTGTGGATCAAGCTAATTGGACGGTAGGGTGATCCTCATTGGGTTCCTATGTAAAGAAGATTTGCAGCTTAACTTCAGATACCATGTGATTATAATGTAAAAACGGTTTATAGTTAGTACCAATATATTT
Unaligned ( gi|51 ): AGTAATCACTTACGGGAGGCGAACACATAAGTGGTTATAATAATGACCTAAATGGACAGATTCCTAAAGAAAGCAAAAGGAAATTCCGGATGCACAAGACGAAGTCGTTTGACTCCGGTGGAATCCTGACTTATCCCCAGTATAGCAGGCTAAACC
Unaligned ( gi|55 ): GAATTAGGTCAATCATTATCACATCGCACATTGCGGACTAGCTCATTGGACGAATAGCACTAGTCTCAATCTCTCCTCAAAAAAACATTTTAATTAGCAATTCAAAATCCAATAAACATGTACTTTATAGTGTTGATACGATTATAGAAT
Unaligned ( gi|56 ): GACATTAAAATAGTGATTACTGACCATTACCCAAGTTGTACATGTTATGCCACGAAAACGCAAAGAAAGGATTCTTATATACGGTTTTTTCAATAGTCATTCGACCCTCAAGGTATCAACAAAACAATTTAGTTCATCAGATTAAACG
Unaligned ( gi|57 ): GACAACCTCAACAAAGAAGAAAGATCGGCATTGCAGAGATTAAAAAACCGGGATGATATTGTAATAAAAAGGCAGACAAGGGTTCTACTGTTGTTGTTATGGACAAAGATAAGTACCTAACAGAGGCTCACAG
Unaligned ( gi|62 ): AACGAAACTTTTAGATACTCAGACTGAAGTCGTTCGACTTTCAAGGTATCGAAACACCTGATGAATTCACTAGGATCAACATGGGCTAAACATTTGTCACC
Unaligned ( gi|64 ): AGTGGTTATTCATTTTGACCTACGCCAAATACGCAAAGAAAGCCAAAGTGAAAATCTTTGCACACAAACCGAAGTCATCTGAT
Unaligned ( gi|65 ): AAAGCAAACCGAAAAGTTCTGGATGCACAAACAGAAGTCGTTCGACTATCTACTGACTTCACTAGGATAAAAA