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Reference ( gi|10 )           :        TTACAT--GTGT-TG-------AC-C-T-A-C-A-AT-CTT-G-A-C---C-AAC------A-TTT---AA--AA----C--T-T-TC-AAT-GTCT-T------------A-AAC---T----A----T----T----T---T---------TT----T---------C---T---TT-C-A---AA--A-C-AG---GG-T-TA-G-------C-ATAAATTCT-G--AAG---T------GT-AT------T----GTC----A-ACA-AAT--------TA---T-T-----------GAATT--TAA-TCC-A---T-T-T-T----AA-G--A----A---C------TA------T---G-CAAGAACTA--------TT--TT---A-A------G-C----A-A--G--T----G-CTG-TG--T-T-T-TC-C-C--T-AA-GC-GG----T-----TAAC-AG------G-T-GG-G--CAG--A-TC-AC---AAA---------T-----GTAA-----------GA-CG-G-ATA-------C--A-C--AT---AT--C----A-A------GCA--CTA----TCA------TA--CA-GC-CGA----G--A--T-A--T--G-A--T---G-TAG-GTT------CCG-G---AA-TCAG-CC-GA-GGTT-GGCCG
gi|6                          :        TTACAT--GTGT-TG-------AC-C-T-A-C-A-AT-CTT-G-A-C---C-AAT------A-TCT---AA--AA----C--T-T-CC-AAT-GTCT-T------------A-AAC---T----G----T----TGTTTT---T---------TT----C---------C---T---TT-C-A---AA--A-C-AG---GG-T-TA-G-------T-ATCAATTCT-A--TAG---C------GT-AA------T----GTT----A-ACA-AAT--------TA---T-TATCAAATTATTGAATT--TAC-TCC-A---T-T-T-TT---AA-G--A----A---C------TA------T---G-CAAGAACTA--------TT--TT---A-A------G-C----A-A--G--C----G-CTG-TG--T-T-T-TC-C-C--T-AA-GC-GG----T-----TAAC-AG------G-C-GG-G--CAG--A-TC-AC---AAA---------T-----GTAA-----------GG-CG-G-ATA-------C--G-C--AT---AT--C----A-A------GTA--CTA----TCA------TA--CA-GC-AGA----G--G--C-A--T--G-A--T---G-TAG-CTT------CCG-G---AA-TCAG-TC-GA-
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gi|9                          :         TACAT--GTGT-TG-------AC-C-T-A-C-A-AT-CTT-G-A-C---C-AAC------A-TTT---TA--AA----C--T-T-TC-AAT-GTCT-T------------A-AAC---T---------------------------------------T---------T---T---TT-C-A---AA--A-C-AT---GG-T-TA-G-------T-ATCAATTTT-G--AAG---T------GT-GA------A----GTC----A-ACA-AAT--------TA---T-T-----------GAATA--TAA-TCC-A---T-T-T-TT---AA-G--A----A---C------TA------T---G-CAAGAACTA--------TT--TT---A-ATTAA--G-A----A-A--G--C----G-CTG-TG--T-T-T-TC-T-C--T-AA-GC-GG----T-----TAAC-AG------G-C-GG-G--CAG--A-TC-AC---AAA---------T-----GTAA-----------GG-CG-G-ATA-------C--G-C--AT---AT--G----A-AGTACATGTA--CTA----TCA------TA--CA-GC-TGA----G--G--T-A--T--G-A--T---G-TAG-GTT------CCG-G----A-TCAG-CC-GA-AGTT-GGCCG
gi|14                         :       caTACAT--GTGC-TG-------GC-C-T-A-C-A-AC-CTT-G-A-C---A-AAC------A-TTT---AA--AA----C--T-T-TC-AAT-GTCT-T------------A-AATG--T----A----T----T----T---T---------TTCT--T---------C---T---TT-C-A---AA--A-C-AG---GG-T-TA-G-------C-ATCAATTCT-G--AAG---T------GT-AA------A----GTC----G-ACA-TAT--------TA---T-T-----------GAATT--TAA-TCC-A---T-T-T-T----------------------------------------TAAGAACTA--------TT--TC---A-A------G-C----A-A--G--C----G-CTG-TG--T-T-T-TC-C-G--T-AA-AC-GG----T-----TAAC-AG------G-C-GG-G--CAG--A-TC-AC---ATA---------T-----GTTA-----------GG-CG-G-ATA-------C--G-C--AT---AT--C----A-A------GTA--TTA----TCA------TA--CA-GC-CGA----G--G--T-A--T--G-A--T---A-TAG-GTT------CCG-G---AA-TCAG-CC-GA-GGTT-GG
gi|16                         :         TACAT--GTGC-TG-------AC-T-T-A-C-A-AC-CTT-G-A-C---C-AAC------A-TGT---AA--AA----C--T-T--C-AAT-GTCT-T------------A-AAC---T----G----G----T----C---T---------TT----T---------CCCTT---TT-C-A---AA--A-C-AG---GG-T-TA-G-------C-ATCAATTCT-G--AAG---T------GT-AA------A----GTC----A-ACA-AAT--------CA---T-T-----------TAAAA--TAA-TCC-A---T-T-T-T----AA-G--A----------------------------------ACTA--------TT--TT---G-A------G-C----A-A--G--C----G-CTG-TG--T-C-T-CC-C-C--T-AA-GC-GG----T-----TAAC-AG------G-C-GG-G--CAT--A-TC-AC---AAA---------T-----GTAA-----------GG-CG-G-ATA-------C--G-C--AT---AT--C----A-A------GTA--ATA----TCA------TA--CA-TC-CGA----G--G--T-A--T--G-A--T---G-TAG-GTT------TCT-G---AA-TCAG-CC-GA-GGTT-GGCCGgcaa
gi|22                         :         TACAT--GTACATG------------T-A-C-A-AT-CTT-G-A-T---C-AAC------A-TTTTAAAA--AA----C--T-T-AT-AAT-GTCT-T------------A-AAC---T----A----T----T----T---TT--------TT----T---------C---T---TT-C-A---AA--A-C-AG---GG-T-TA-G-------C-ATCAATTCT-G--AAG---T------GT-AA------C----GTC----A-AC--AAT--------TA---T-T-----------GAATT--TAA-TCC-A---T-T-T-TA---AA-G--A----A---C------TA------T---G-CAAGAACTA--------TT--TC---A-A------G-C----G-A--G--C----G-CTG-TG--T-T-T-TC-T-C--T-AA-GC-GG----T-----TAAC-AG------G-C-GG-G--CAG--A-TC-AC---AAA---------T-----GTAA-----------GG-CG-G-ATA-------C--A-C--AT---AT--C----A-A------GTA--CTA----TCA------TA--CA-AC-CGA----G--G--T-A--T--G-a
gi|39                         :         TACAT--GTGT-TG-------AC-C-T-C-C-A-AT-CTT-G-A-C---C-AAC------A-TTT---AA--AA----C--T-T-TC-AAT-GTCT-T------------A-AAC---T----G----T----T----T---T---------TTCTCTT---------C---T---TT-C-A---AA--A-C-AG---GG-T-TA-G-------C-ATCAATTCT-G--AAG---T------GT-AA------A----GTC----A-ACA-GAT--------TA---T-T-----------GAATT--TGA-TCC-AT--T-T-T-T----AA-G--A----A---C------TG------T---G-CAAGAACTA--------TT--CTA--A-A------G-C----A-A--G--G----G-CTG-TG--T-T-T-TC-T-C--T-AA-GC-GG----T-----TAAC-AG------G-C-GG-G--CA
gi|3                          :         TACAT--GTGT--G-------AC-CGT-A-C-A-AT-CTT-G-A-C---CCAAC------A-TTT---GGTTAA----C--TGT-TC-AAT-ATGT-TCGTGTA------G-AAC---T----G----C----C----C---CCCCCGCCCCTT----T---------C---T---TT-CCA---AAGGA-C-AG---GG-T-TA-G-------C-ATCAATTCT-G--CAA---T------GT-----------------------------T--------T----T-T-----------GAATT--TAA-TCC-T---T-TGT-T----AA-AGAA----A---C------TA------T---GGCAAGAACTA--------TT--TTCA-A-A------G-C----A----G--C----G-CTG-T-----T-T-TC-T-C--T-A--GC-GA----CG----TAAC-AG------GGC-GG-G--CAG--A-TC-AC---AGA---------T-----GTGA-----------GG-CG-G-ATA-------C--G-C--AT---ATATC----A-A------GTA--CTA----TCA------TA--CAGGC-CGA----A--AG-T-A--T--G-T--T---G-TAG-GTT------ACG-G---AATTCAG-CC-GA-GGGT-TGCC
gi|57                         :         TACAT--GTGT-TG-------AC-T-TTA-A-A-AT-CTT-G-A-C---C-ATC------A-TGT---CA--AG----C--T-C-TC-ATT-GT------------------------T----A----T----T----C----------------------------------------------AA--A-T-AG---TG-T-AA-G-------CAATCAATTCT-G--AAG---TTGTAAAGT-AA------A----GTG----A-ACACACT--------TG---T-T-----------GAA
gi|15                         :          ACAT--ATGA-TG-------AC-G-T-A-C-A-AT-CTT-G-A-C---A-AAC------A-TTT---AA--AA----C--T-T-TC-AGT-GTCT-G------------T-AAT---T----G----T----G----T---T---------TT----T---------C---T---TT-C-G---AA--A-C-AA---TG-T-TA-G-------C-ATCAATTCT-A--AAG---T------GT-AA------A----GTC----A-TCA-AAT--------TA---T-T-----------GAATT--TAA-TCC-A---T-T-T-T----AA-G--A----A---A------TA------T---G-CAGGAACTA--------TT--TT---A-A------G-CAAATA-A--G--C----G-CTG-TG--T-T-T-TC-T-C--T-AA-GT-GGTTAAT-----TAAC-AG------A-C-GG-G--CGG--A-AC-AC---AAA---------C-----GTAA-----------GG-CG-G-ATA-------C--G-C-------------------------------------TCA------TA--CA-GC-CGA----G--G--T-T--T--G-A--T---G-TAG-GTT------CCG-G---AA-TCAC-CT-GA-GGTT--GCCGatga
gi|12                         :         aACAC--GTGT-TG-------AC-T-T-A-C-A-GT-CTT-G-A-C---C-ATC------A-TGT---AA--AG----C--T-T-TC-AAT-GTCT-G------------T-AAC---T----C----T----T----TGTTT---------TT----T---------C---A---TT-C-A---AA--A-C-AC---TG-C-TA-A-------C-ATCAATTCT-G--AAG---T------GT-AA------A----ATC----A-ACA-CAC--------TG---T-T-----------GAAGT--GAC-CCC-A---TCT-T-T----AT-A--A----A---C------TA------T---A-TAAGAACTA--------TT--TT---A-A------G-C----A-A--G--C----G-CTG-TG--T-T-T-TC-C----T-AA-AT-GG----T-----TAAC-AG------G-T-GG-T--TGG--A-TG-AC---AAA---------T-----GTGA-----------GG-CG-G-ATA-------C--G-C--AT---AT--C----A-A------ATA--CTG----TCA------TA--CC-GC-CGA----G--G--T-T--T--G-A--T---G-TAG-GTT------CCG-G---AA-TCAA-CC-GA-GG-T-GGC
gi|20                         :            AT--GTGC-T--------AC-C-T-A-C-A-AC-CTT-G-A-C---C-AAC------A-TGT---AA--AA----C--T-T-TC-AAT-GT-T-T------------A-AAC---T----GGACCT----T----T---T---------CC----C---------C---T---TT-C-A---AA--A-C-AG---GG-T-TA-G-------C-ATCAATTCT-G--AAG---T------GT-A-------A----GTC----A-ACA-AAT--------AA---T-T-----------TAATA--TAA-TCC-----T-T-T-T----AA-G--A----A---C------TA------T----------------------TT--T------A------G-C----A-A--G--C----G-CTG-CG--T-T-T-TTAC-C--TAAA-GC-GG----T-----TAAC-AG------G-C-GG-G--CAG----TC-A----AAA---------T------TAA-----------GG--G-G-ATA-------C--G-C--AT---AT--C------A------GTA--CTA----TCA------TA--CA-TC-CGA----G--G--T-A--T--G-A--T---G-TGC-G-T------CCG-G---AA-TCAG-CC-G--GGTT-CGC
gi|2                          :          taAT--ATGT-TG-------AC-T-T-A-C-A-CA-CTT-G-A-C---C-ATC------A-TGT---AA--AG----C--C-T-TC-ATT-GTCT-G------------T-AACAGTT----G----T----T----T---T---------TT----T---------G---T---Tg
gi|18                         :             T--GTAT-TG-------AC-T-T-A-C-A-AT-CTG-G-A-C---C-ATC------A-TGT---AA--AA----C--T-T-TC-AAT-GTCTGT------------A-AAA--------A----A----A----A---T---------TT----T---------C---T---TT-C-A---AA--A-C-AG---GG-T-TA-G-------C-ATCAATTCT-G--AAG---G------GT-AA------A----GTC----A-ACA-AACTACATGTATA---T-T-----------GAAAT--GAC-TCC-A---T-C-T-T----------------------------------------TAAGAACTA--------TT--TT---A-A------A-C----A-A--G--C----G-CT--TG--T-T-T-TC-T-C--T-AA-GC-GG----T-----TAAC-AG------G-C-GG-T--CGA--A-TC-GC---AAA---------T-----GTAA-----------GG-CG-G-ATA-------C--G-C--AT---AT--C----A-A------ATC--CTG----TCA------TA--CA-GC-CAA----G--G--T-T--T--G-A--T---G-TAG-GTT------CCG-G---AA-CCAG-CC-CA-GGTT-GGggttttttttatgttgttgttgtttttcattcaaaacagcattagcagaaattccgaagtgtaaagttaacacactgttgaaatgaactctaggaactactaggatgtaggaacttatttaagatagcgctgtgttttccctaaacggttaacaggcggtcgaattccaaatgtaaggcgcatacgcatatcaaaaactgtcatacagccgaagtttgatgtaggttccggaatcagccgaggttggct
gi|38                         :             T--GTGT-TG-------AC-C-T-AGC-A-AT-CT--G-A-CG--C-AAC------A-TTT---AA--AAAAAGC--T-T-TC-C-T-GTCT-T------------A-AGC---T----G----T----G----T---T---------TT----T---------C---T---TT-T-C---AA--A-C-AGA--GG-G-TA---------C-ATAA-TTCT-G--AAG---T------TT-AA------GA---GTC----A-ACA-A-T--------CA---G-T-----------GAATT--TAA-TCC-A---T-T-T-TTA--AA-G--A----A---C------TA------T---G-CAAGAGCTG--------TT--TT---A-T------G-C----A-A--G--C----G-CTGTTG--T-T-T-TC-CTC--T-CG-GC--G----T-----TAAC-AG------G-C-AGTG--CAG--G-TC-A
gi|46                         :       ttaaacT--ATGT-TG-------AC-C-T-A-C-A-AT-CTT-G-A-C---C-AAC------A-TTT---AA--AA----C--T-T-TC-AAT-GTCT-T------------A-AAC---T----G----T----T----G---T---------GT----T---------T---T---CC-C-T---AA--G-C------GG-T-TA-
gi|63                         :            tc--GTGT-TG-------AC-T-T-A-C-A-AT-CTT-GCATC---C-TTC------A-TAT---AA--AA----C--T-T-TC-AAT-GTCT-G------------T-AAC---T----GGT--T----T----T---T---------TT----T---------T---T---TT-C-A---ataggcgggcggatcacaaatgtaaggcggatacgcatatcaagtactatcatacagccgaggtatgatg
gi|1                          :                cTGT-TGG------ACGC-T-A-C-ATAT-CTTTG-A-C---C-AAC------ACTTT---AA--AA----CGAT-TGTC-AATTGTCT-A------------T-AAC---T----G----C----T----T---T---------T---------------C---T---TT-C-A---AA----C-AG---GGGT-TA-G-------C-ATCAGTTCTAG--AAG---T------GC-AT------AAA--GTCGTTGA-ACA-ATT--------TA---T-T-----------GAATT--TAA-ATA-A---T-T-T-T----AG-G--ACATAA---T------CA------T---A-CAAGA-CTA--------TTCTTT---ATA------G-C----ATA--G--T----G-CGGCTG--T-T-T-TC-CTC--T-AA-GCCGG----TCTGAGTAACTAG------G-C-GG-GAGCAGC-A-TC-AC---AAA---------T-----GTAA-----------GG-CG-G-ATA-------C----C--AT---AT--C----ACA------GTA--CAA----TCA------TA--CA-GC-CGA----G--G--C-A--T--G-A--T---GTTAGTATT------CCG-GGGAAA-TCAGTCC-GA-GG-T-GGC
gi|8                          : cgtttacgatgcaggtTGT-TG-------AC-T-T-A-TGA-AT-CTT-G-A-C---C-AAT------G-TTA---AA--GG----C--T-T-TCAAAT-GTCC-T------------GTAAC---T----GGT--T----T----T---T---------TT----T---------T---T---TT-CAA---AA--A-C-AG---TG-T-TATG-------C-ACAAAATCT-G--AAG---T------AT-AT------CAA--ATC----A-ACA-TAC--------CA---A-T-----------GAAACGGCAC-TCC-A---T-C-T-T----TA-G--A---------------------------------AACTA--------TT--TT---A-A------GCC----A-A--G--C----G-CTG-TG--TGC-T-TT-C-C--T-AA-AC-GG----T-----TAACAAG------G-C-AG-G--CAG--A-ACAACA--AAA---------T-----GTAAT----------GG-CG-G-ATA-------C--GCC--AT---TT--C----A-A------ATA--TTG----TCA------TA--CA-GC-CGA----G-----T-A--T--G-A--TTCAA-TAC-GGT------CCG-G---AA-TCAT-CC-GA-GGg
gi|23                         :         ctgtttaccGT-TG-------AC-C-T-G-C-A-AT-CTT-G-A-C---C-ATC------G-TGT---AA--AA----C--T-G-TC-GAT-TTCT-A------------T-TAC---T----T----T----T----T---T---------TT----T---------C---T---TT-T-A---AA--G-T-AA---CA-T-TA-G-------C-ATCCATTTT-G--ACG---T------GT-GA------A----GTA----A-ACA-CAC--------GG---T-T-----------GAAAT--TAG-TCC-A---TCT-T-T----AA--------------------TT------T-----------TTT--------TC--TT---A-A------G-T----A-A--T--C----G-T---TG--T-T-A-TC-A-T--T-AA-AC-GG----T-----TAAC-AA------G-C-AG-T--CGA--A-TC-GC---AAA---------T-----GTAT-----------GG-CG-G-ATA-------C--G-C--AT---GT--T----A-A------ATA--CTG----TCA------TA--CA-GC-CGA----G--G--T-gc
gi|24                         :    tgtacagtttctgaga-TG-------AC-C-T-A-C-A-AT-CTT-G-A-C---C-AAC------A-TTT---AA--AA----C--T-T-TC-AAT-GTCT-T------------A-AAC---T----GG---TA---T----T---T---------TT----T---------C---T---TT-C-A---AA--A-C-AG---GG-T-TA-G-------C-ATCAATTCT-G--AAA---T------GT-AA------A----GTC----A-ACA-AAT--------TA---T-T-----------GAATT--TAA-TCC-A---T-T-T-T----AA-C--A----A---C------TA------T---G-CAAGAACTA-------------------------------------------------TG-TG--T-T-T-TC-C-C--T-AA-GC-GG----T-----TAAC-AG------G-C-GG-G--CAG--A-TC-AC---AAA---------T-----GTAA-----------GG-CG-A-AT----------------------------------------TA--CTA----TCA------TA--CA-GC-CGA----G--C--T-A--T--G-T--T---G-TAG-GTT------CCG-G---AA-TCAG-CC-GA-GGT
gi|43                         :                    -TG-------AC-C-T-A-C-A-AT-CTT-G-A-C---C-AAC------A-TTT---AA--AA----C--T-T-TC-AAT-GTCT-T------------A-AAC---T----G----T----T----T---T---------TT----TTTTCTTTCTC---T---TT-C-A---AA--A-C-AG---GG-T-TA-G-------C-ATCAATTAT-G--AAG---T------GT-AA------A----GTC----A-ACA-AAT--------TA---T-T-----------GAATT--TAA-TCC-A---T-T-T-TTTTAAA-G--A----A---CTACATGTA------T---G-CAAGAAATA--------
gi|34                         :                                            T-CTT-G-G-C---C-ATC------A-TAT---AA--AG----C--T-T-TC-AAT-GTCT-G------------T-AAC---T----A----T----T----T---T---------TT----T---------C---T---TT-C-A---AA--A-C-AA---TG-T-TA-G-------C-ATCAATTCT-G--AAG---T------GT-AC------TGAAAGTC----A-ACA-CAC--------TG---T-T-----------GA------AA-T---------------------G--A----C---C------TA------T---G-CAAGAACTA--------TT--TT---A-A------G-C----A-A--G--A----G-C---TG--T-T-T-TC-C-C--T-AA-AT-GG----T-----CAAC-AG------G-C-GG-T--CGA--A-TC-AC---AAA---------T-----GTAA-----------GG-CG-G-ATA-------T--G-C--AT---AT--C----A-
gi|48                         :                          tgtttactggttacacatg-CTT-G-A-C---C-ATC------C-TAT---AT--TG----C--T-T--C-AAT-GTCTGT------------A-------T---------T----T----T---T---------TT----T---------C---T---TT-C-A---AA--A-C-AGTTTGT-T-TA-G-------CAATCAATTCT-G--AAG---TG-----GT-AA------A----GTC----A-ACA-CAT--------TG---T-T-----------GAAAA--TGACTCT-A---T-C-T-T-----C-GCCA----A---CA-----TC------T---G-GAAGAACTA--------
gi|45                         :                                             -CTT-G-A-C---C-ATC------A-TAT---AA--AA----C--T-T-TC-AAT-GTTT-G------------T-AAC---TGG--G----T----T----T---T---------TT----T---------T---T---TT-
gi|27                         :                                              tttaatgtttatacgAC------A-TGT---AA--AA----C--T-T-TC-AAT-GGTT-T------------A-AAC---T----G----G----T----C---T---------TT----T---------CCCTT---TT-C-A---AA--A-C-AG---GG-T-TA-G-------C-ATCAATTCT-G--AAGCCGT------GT-AA------A----GTC----A-ACA-AAA--------TA---T-T-----------TAATA--TAA-TCC-AA--T-T-T-T----AA-G--A----A---C------TA------T---G-TAAGAACTA--------TT--TT---A-A------G-C----A-A--G--C----G-CTG-CG--T-T-T-TC-C-C--T-GA-GC-GG----T-----TAAC-AG------G-C-GG-G--CAG--A-TC-AC---AAA---------T-----GTAA-----------GG-CG-G-ATA-------C--G-C--AT---AT--C----A-A------GTA--CTA----TCA------TA--CA-TC-CGA----G--G--T-A--T--G-A--T---ttggtttgtttgttttttcttttctttcaaaacaacgttagtatcaattctaaagtgaaaagtcaacaaactatctaaatgact
gi|33                         :                                                                          ---AA--AA----C--G-T-TC-AAT-GTCT-G------------T-AAT---T----G----T----T----T---T----------T----T---------C---T---TT-C-A---AA--T-C-AA---TG-T-TA-A-------C-ATCAATTCT-G--AAG---T------GT-AA------A----GT-----A-AAA-AATG-------TG---T-T-----------GAATT--TAA-TCCAA---T-T-T-T----Aac
gi|60                         :                                                                                        --T-T-TC-AAT-GTCT-T------------A-AAC---T----GGT--T----T----T---T---------TT----T---------C---T---TTTC-A---AA--A-T-AT---GG-T-TA-C-------C-ATCAATTTT-G--AAG---T------GTAAT------TGAA-GTC----A-ACA-AAT--------TA---T-T-----------GAATT--TAA-TCC-A---T-T-tcacttctacagtaaagtattgtattttacaattagcagctacttttctttctccgaactattttaagcaagcgctgtgttttctctaaatggttaacgggcgggcagatcacatatt
gi|45                         :                                                                                                                                     ----T----T----C---T---------TT----T---------C---T---TT-C-A---AA--A-C-AA---CG-T-TA-G-------T-ATCAATTCT-A--AAG---T------GA-AA------A----GTC----A-ACA-AAC--------TA---TCT-----------AAAT
gi|2                          :                                                              tttaatgtttatacgcttgaccatcatataaaactttcaatgtttgtaactgggtttttttttttttggtttgtttgtttt----T---T---------TT----T---------C---A---TT-C-A---AA--A-C-AG---CA-T-TA-G-------C-AGAAATTCC-G--AAG---T------GT-AA------A----GTT----A-ACA-CAC--------TG---T-T-----------GAA------A-TGA-A---C-T-C-T----AG-G--A----A---C------TACTAGGAT---G-TAGGAACTT--------AT--TT---A-A------G-A----T-A--G--C----G-CTG-TG--T-T-T-TC-C-C--T-AA-AC-GG----T-----TAAC-AG------G-C-GG-T--CGA--A-TT-CC---AAA---------T-----GTAA-----------GG-CG-C-ATA-------C--G-C--AT---AT--C----A-A------AAA--CTG----TCA------TA--CA-GC-CGA----A--G--T-T--T--G-A--T---G-TAG-GTT------CCG-G---AA-TCAG-CC-GA-GGTT-GGCgact
gi|25                         :                                                           atatgttgacttacacacttgaccatcatgtaaagccttcattgtctgtaacagttgtttttttgttggttttttttatgttgttgttg---T---------TG----T---------C---T---TT-C-AGGAAA--A-C-AG---AGAT-GA-G-------C-ATCAAGTCC-A--GAC---T-----------------------T-----------AAT--------TA---T-TT----------GAGAT--TAA-TCA-AGGAT-T-T-T----AA-G--A----A----------TA----------G-CAACAATAA--------TT--TT---A-A------G-C----A-AAGG--C----G-CTGGTGGGT-T-T-TC-TGC--T-AA-GC-AG----T-----TACC-AA------G-C-GGTG--CAG--A-TC-AC---AAA---------T-----GGAA-----------GG-CGCG-ATA-------C--G-C--AT---AT--G----A-A------GTA--CTGAC--TCA------TAGACA-GAGCGA----G--AG-T-A--TTGG-A--T---G---G-GTTGCGTGCCCG-A---AA-TCAG-CC-GA-GGTT-GGCCGt
gi|44                         :                                                                                                                                                                                           ca-A---AA--A-C-AG------T-TA-GAGACGAAC-ATCA-TTCT-GTGAAG---T------GT-AT------AAA--GTC----A-ACA---C--------TAGCGT-T-----------GAAAT--GAT-TCC-G---T-C-T-T----AA-G--A----A---C------AA------T---G-TAAGAAATA--------TC--TT---G-A------T-T----A-A--G--T----a
gi|37                         :                                                                                                                                                                                               ---AA--A-C-AA---GG-T-TA-G-------C-ATAAATTCT-G--AAG---T------GT-AA------T----GTC----A-ACA-AAT--------TA---T-T-----------GAATT--TAA-TCC-A---T-C-T-T----AA-G--A----A---C------TA------T---G-CAAGAACTA--------TT--TT---A-A------G-C----A-A--G--C----G-CTG-TG--T-T-T-TC-C-C--T-AA-GC-GG----T-----TAAC-A-------G-C-GG-G--CAG--A-TC-AC---AAA---------T-----GTAA-----------GG-CG-G-TTA-------C--G-C--AT---AT--C----A-A------GTA--CTA----TCA------TA--CA-GC-CGA----G--G--T-A--T--G-A--T---G-TAG-GTT------CCA-G---AA-TCAA-CC-GA-GGTT-GGCtaagatacgcataatacagccaaggttgatgtaggttccagaatcagccgagttgg
gi|35                         :                                                                                                                                                                                                                G-T-TA-G-------C-ACCAATTCT-GTTCAG---G------GT-AA------A----GTC----A-A-A-CAC--------TG---T-T-----------GAAAT--GAC-TCC-------T-T-T----AA-T--A----A---T------TACATGTAT---G-CAAGAACTAATTTAATTTT--TT---A-A------G-C----A-A--G--C----G-CTG-TG--T-T-T-TC-C-C--T-AA--C-GG----T-----TAAT-AGC-----G-TCGG-G--CAGGAG-CC-GCGCGAAA---------T-----GTAA-----------GG-CA-G-ATAGTATAC-C--G-C--ATAGAAT--C----A-AT-----ACA--GTA------A------TA--CA--C-C-A----G-----T-T--T--G-A--T---G-TA--GTT------CCG-G---A
gi|31                         :                                                                                                                                                                                                                                  gtAATTCT-G--AAG---T------GT-ATAATTAAT----GTC----A-ACA-CAC--------TG---T-T-----------GAAAT--GAC-TCC-A---TCT-T-T----AA-G--A----A---G------TA------T---G-TAAGAATTA--------TT--TTTT-A-A------G-C----A-A--G--TACGTG-CTG-TGCTT-T-T-TC-C-C--T-AA-AT-GG----T-----TAAC-AGCGAGGCG-T-TG-G--C------TC-GC---AAA---------T-----GTAA-----------GG-CG-G-ATATGTAATGC--A-T--AT---AT--C----A-A-------------A----T-A------TA--CA-GC-GGA----G--G--T-T--T--G-A--T---G-TAG-GTT------CCA-G---AA-TCAG-CC-AA-GGTT-GGCTG
gi|40                         :                                                                                                                                                                                                                                                                 ccatgc----GTC----A-ACA-AAT--------TA---T-T-----------GAATT--TAA-TCC-A---T-T-TGT----AA-G--A----A---C------TA------T---G-CAAGAATTA--------TT--TTTAAA-ATACGCGG-C----A-A-----C----G-CTG-TG--T-T-T-TC-T-C--T-AA-GC-GG----T-----TAAC-AG------G-C-GG-G--CAG--A-TC-AC---AAAATTAATTAAT-----GTAA-----------GG-CG-G-ATA-------C--G-C--AT---AT--C----A-A------GTA--CTA----TCA------TA--AA-GC-TGA----G--G--T-T--T--G-A--T---G-TAG-GTT------ACG-G---AA-TCAG-CC-GA-GGTT-GGa
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gi|42                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              gtaaaC-A---T-C-T-T----AAAG--A----T---T------TA------TTTAG-TGA-AACCA--------TT--TC---A-AT-----G-TT---A-A--G--C----GATTG-TG--T-T-T-TA-C-C--T-AT-GC-AG----T-----TAAC-AG------G-C-GT-A--CGG--G-TC-AC---ACA---------T-----GTAATATGTAAAGGCGG-CG-G-ATA-------CGAG-C--AT---CT--C----A-A-------CA--ATACGTGCCA------TA--CA-GC-TAA----A--A--G-AGTT--GCA--A---A-TGG-GTTCA----CCGCG---GA-TCAG-CC-GA-AGTT-GACC
gi|46                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         t-T-T-T----AA----A----A---C------T-------T---T-CAA----TG--------TC--TT---A-A------A-C------------T----G-TTG-TG--T-T-T-TC-C-C--T-AA-GC-GG----T-----TAAT-AG------G-C-GG-G--CGG--A-TC-AC---AAA---------T-----GTAA-----------GG-CG-G-ATA-------C--G-C--AT---AT--C----A-A------GTA--CTA----TCA------TA--CA-GC-CGA----G--G--T-A--T--G-A--T---G-cg
gi|59                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   tctatgttgacctacaatcttgaccaaca----AA-T--A----A---C------TA------T---G-CAAGAATT---------TT--TT---A-A------G-C----A-A--G--C----A-C-G-TG--T-T-T-TT-CTC--T-AG-G---G----T-----TAAC-AG------G-T-GG-T--CA---A-TC-AC---AAA---------T-----GTAA-----------GG-TG-G-ATA-------C--G-C--AT---AT--C----A-A------G
gi|33                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           GAACTA--------TT--TT---A-A------G-C----A-A--G--C----G-CTG-TG--T-T-T-TC-T-C--T-AA-AT-GG----T-----TAAC-GG------G-C-GG-G--CAG--A-TC-AC---ATA---------T-----tgcatgtactatc
gi|49                         :                                                                                                                                                                                                                                       aaaacgttcaatgtctgtaattgttttttctttcaaatcaatgttaacatcaattctgaagtgtaaagtaaaaaatgtgttgaatttaatccaattttatcacttctacagtaaagtattgtattttacaattagcagctacttttctttctcc--------TT--TT---A-A------G-C----A-A--A--A----G-CTG-T-----T-T-TC-C-C--T-AA-AC-GG----T-----GAAC-AG------G-C-TG-G--CAG--A-CC-AC---AAAAA-------T-----GTAA-----------GG-CG-G-ATA-------C--G-C--AT---AT--C----A-A------ATA--CTG----TTA------TA--CT-GC-TGA----G--G--T-T--T--G-A--T---G-TAG-GTT------CCG-G---GA-TCAG-CT-GA-GATT-GATCGt
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gi|47                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          T--TT---A-A------A-C----A-A--G--C----G-CTG--G--T-T-TCTC-T-C--T-AA-GC-GG----A-----AAAC-AG------G-C-GG-G--CAG--AATC-AC---AAAA--------T-----GTAA-----------GGGCG-GGATA-------C--G-C--AT---AT--C----A--------GTA--CTA----TCA------TA--CA-GC-CGA----A--T--T-A--T--G-A--T---G-TAG-GTT------CCG-G---AA-TCAG-C---A-AGTT-GGCCG
gi|41                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         aacata---A-A------G-T----C-A--G--C----G-CTG-TG--T-T-T-TC-C-T--T-AT-AC-GG----T-----TAAC-AG------G-C-GG-T--CGA--A-TA-AC---AAA---------TTAAATGTAA-----------GG-CG-G-ATA-------C--G-C--AT---AT--C----A-A------ATA--CTG----TCA------CA--CA-GC-GGA----G--T--T-T--T--G-G--T---G-TAG-GTT------CCG-G---AA-TCAG-CC-GA-GGTT-GG
gi|51                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     tcatataaagctttcaatgcatgtggctgttttttcattcaaaaattccgaagtgta----A-A--G--C----G-CTG--G--T-T-TCTC-T-C--T-AAAGC-GG----A-----AAAC-AG------G-C-GG-G--CAG--A-TC-AC---AAA---------T-----GTAA-----------GG-CG-G-ATA-------C--G-C--AT---AT--C----A-A------GTA--CTA----TCA------TA--CA-GC-CGA----A--T--T-A--T--G-A--T-----TAG-GTT------CCG-G---AA-TCAG-CC-AA-GGTT-GGCCGt
gi|50                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   -A--G--C----G-TTA-GG--T-T-T-TT-C-T--G-AA-TG-AG----T-----AAAG-AG------G-T-GA-C--CGA--A-TC-CC---AAAA--------T-----GTCC------------A-CG-T-GTA-------T--G-TTGAT---AT--C----A-A------ATC--CTG----TCA------TA--CA-AC-CAA----G--A--T-A--T--G-A--C---G-TA
gi|61                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  aattataaacacattacgcacttaatttctgt------G-C-GG-G--CAG--A-TC-AC---AAA---------T-----GTAG-----------G--CG-G-ATA-------C--G-C--AT---AT--C----A-A------GTA--CTA----TCA------TA--CACGC-CGA----G--A--T-A--T--G-A--T---G-TAG-GTT------CCG-G---AA-TAGG-CC-GA-GGTG-TGCCG
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     --A-TT-AC---AAA---------T-----GCTG-----------GG-C----ATAGC-----T--A-C--AA---AT--C----A-A------TTA--ACA----TTA------TA--CA-TC-CGA----G--G--T-A--A--G-C--T---G-TAG-GGTA-----CCG-G---AA-TC
gi|52                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      aaaggcacaaaaagatgacagccctacaatcctttacatcatgtaacaataactgctcctcaatgcatatgaaattttttttttctcgaaatactaaaatattttcgagggcaagcgcgacacattcacatcaaaagaaggcattttgatcaccaaaagcggcagtgtttctgagagagtaaatagaaaattgc-TC-CC---AAA---------T-----GTAA-----------GA--G-G-------------------AT---AT--C----A-A------ATC--CTG----TCATATATGTA--CA-GC-AGA----G--T--T-T--T--A-A--T---G-TAT-GTT------CCA-G---AA-TTAG-CC-AA-AATT-GGCCtactgaatg
gi|74                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              cttcacacggaacacttctaagcgaccaaattacaaat-CG-G-ATA-------C--G-C--AT---ATATC----A-A------GTA--CTA----TCA------TA--CA-TC-CG
gi|62                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       -G-ATA-------C--G-C--AT---AT--C----A-A------GTA--TCA----TCA------TA--CA-GC-CGA----G--G--T-A--T--G-A--T---G-TAG-GTT------CCG-G---AA-TCAG-CC-GA-GGTT-GGCCG
gi|58                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  cagatcat--AT---AT--C----A-A------ATC--CTG----TCA------TA--AA-GC-CGA----G--G--T-A--T--G-A--T---G-T
gi|26                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         aatttctgtagcgttagtttttttctcaatgagtaaagaagccgccgaatcacacatgtccaattgtatggggT--C----A-A------ATA--CTG----TCA------TG--CA-GC-CGA----A--G--T-T--T--G-A--T---G-TAG-ATT------CCG-G---AA-CCAG-CC-GA-GGTT-GGCCG
gi|44                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     actgtttacatgtcttgaccatcatgtaaagcttacaatgtttgtaacagtttagtgttaacaccaattcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngttaacaagcggA----TAA------TA--CA-GC-CAA----G--G--T----T--G-A--T---G-TAG-GTT------CCA-G---AA-TCAG-CC-GA--GTT-GG
gi|70                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          aaaacagttagagacgaacatcattctgtgaagtgtataaagtcaacactagcgttgaaatgattccgtcttaagaacaatgtaagaaatatcttgattaagttaagatacgc----TCA------TA--CA-GC-CGA----G--G--T-T--T--G-A--T---A-TAG-ATT------CCG-G---AA-TCAG-CC-GA-GGTT-
gi|71                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                g-CGA----G--G--T-A--T--G-A--T---G-TAG-GTT------ACG-G---AA-TCAG-TC-GA-GGTT-GGCC
gi|66                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                -A--T--G-A--T---G-TTG-GTT------CTG-G---AAATCAG-CC-GA-GGTT-GGCCGt
gi|72                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              cagaatccgagggtggccta--T--G-A--T---G-TAG-GTT------CCG-G---AA-TCAG-TC-GA-TGTT-GGCCGaa
gi|76                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     --G-A--T---G-TAG-GTT------CCG-G---AA-TCAG-CC-GA-GGTT-GGCCGaa
gi|73                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     --G-G--T---G-TAG-CTT------CCG-G---AA-TCAG-CC-GA-GGTT-GGCCGa
gi|75                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        -A--T---G-TAG-GTT------TCA-G---AA-TCAG-CC-GA-GGTT-GGCCGaa
gi|64                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        -A--T---G-TAG-GTT------CCA-G---AA-TCAG-CCTGACGGTT-GGCCGaa
gi|79                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                aggaatattccgtacctccatataac--T---G-TAG-GTT------CCA-G---AA-TCAG-CC-GA-GGTT-GGCCGa
gi|77                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          --T---G-TAG-GTT------CCG-G---AA-TCAG-CC-GA-GGTT-TGCCaa
gi|81                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     -GTT------TCG-A---AA-TCAG-CC-GA-GGTT-GGCCGaaa
gi|80                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       TT------CCG-G---AA-TCAG-CC-GC-GGTT-TGCCGaatgaa
5 sequences could not be aligned to this particular reference sequence:
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Unaligned ( gi|36 ): TAACAATAGCTACTACTAGCATGTGTTTTACTCGAAATGGAGGACAATTTTCTAAGTCAAGCTCGACAGGCACTTCGATCACTACTTTCTGAAAGCGACCGTATTTTCAGGAAAGTTAATTAATAGATGAAAGCATTACAAATATATTATGTATCAATTTACGTCATGCGTCATACATCTAAGATTAGACGTAGGATGCTGAAGTTTGCCGAAT
Unaligned ( gi|53 ): AAAAAGGCACAAAAAGATGACATCCTTTACGTCATGTAACACTAACTGTTTCTCTCTGAATTATATGTTTTCTCGAATACAGGACAATTTTTAAAGCAAGCTCGATACATTCTTATCAA
Unaligned ( gi|69 ): AAATTAGTAAATTCTAAACATATTACGAACTTAATTTCTGTAGCGTAA
Unaligned ( gi|78 ): GGTACGCATGCGTGAAGAAAACTAAGTCATACC






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Reference ( family-216 )      :                                                                                                                                TTACAT--GTGT-TG-------AC-C-T-A-C-A-AT-C-TT-G-A-C---C-AAC------A-TNT---AA----AA----C--T----T-TCAA-T-G--TCT-T------------A-AAC---T--G-----T----T----T-----T---------TT----T---------C---T---TT-C-A---AA--A-CA-G---GG-TTA-G-------C-AT-CAATTCT-G--AAG---T------G--T----A-----A-A-GTC----A-ACA-AAT--------T---A---T-----------T-GAANT--TAA-TCC-A---T-T-T-T----AA-G--A----AC------TA------T---G-CAAGAACTA--------TT--TT---A-A------GC----A-A--GC----G-CT----G-TG--T-T-T-TC-C-C--TAA-GC-G-G----T-----TAAC-A-G----G-CG--G--G--CAG--A-TCA-C---AAA---------T-----GTA-A-----------GG-CG-G-ATA------C--GC--A-------T---AT----C----A--A------GTAC-TA--TCA------TA--CA-GC-C----G-A----G-G--T-AT--GA--T---G-TAG-GTT------CCG-G---AA-TCAG-CC-GA-GGTT-GGCCG
gi|1                          :                                                                                                                                         TGT-TGG------ACGC-T-A-C-ATAT-C-TTTG-A-C---C-AAC------ACTTT---AA----AA----CGAT----TGTCAA-TTG--TCT-A------------T-AAC---T--G-----C----T----T-----T---------T---------------C---T---TT-C-A---AA----CA-G---GGGTTA-G-------C-AT-CAGTTCTAG--AAG---T------GCAT----A-----A-A-GTCGTTGA-ACA-ATT--------T---A---T-----------T-GAATT--TAA-ATA-A---T-T-T-T----AG-G--ACATAAT------CA------T---A-CAAGA-CTA--------TTCTTT---ATA------GC----ATA--GT----G-CG----GCTG--T-T-T-TC-CTC--TAA-GCCG-G----TCTGAGTAACTA-G----G-CG--G--GAGCAGC-A-TCA-C---AAA---------T-----GTA-A-----------GG-CG-G-ATA------C---C--A-------T---AT----C----AC-A------GTAC-AA--TCA------TA--CA-GC-C----G-A----G-G--C-AT--GA--T---GTTAGTATT------CCG-GGGAAA-TCAGTCC-GA-GG-T-GGC
gi|10                         :                                                                                                                cgtttacgatgcaggtTTACAT--GTGT-TG-------AC-C-T-A-C-A-AT-C-TT-G-A-C---C-AAC------A-TTT---AA----AA----C--T----T-TCAA-T-G--TCT-T------------A-AAC---T--A-----T----T----T-----T---------TT----T---------C---T---TT-C-A---AA--A-CA-G---GG-TTA-G-------C-AT-AAATTCT-G--AAG---T------G--T----A-----T-T-GTC----A-ACA-AAT--------T---A---T-----------T-GAATT--TAA-TCC-A---T-T-T-T----AA-G--A----AC------TA------T---G-CAAGAACTA--------TT--TT---A-A------GC----A-A--GT----G-CT----G-TG--T-T-T-TC-C-C--TAA-GC-G-G----T-----TAAC-A-G----G-TG--G--G--CAG--A-TCA-C---AAA---------T-----GTA-A-----------GA-CG-G-ATA------C--AC--A-------T---AT----C----A--A------GCAC-TA--TCA------TA--CA-GC-C----G-A----G-A--T-AT--GA--T---G-TAG-GTT------CCG-G---AA-TCAG-CC-GA-GGTT-GGCCGg
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gi|24                         :                                                                                                                            tgtacagtttctgaga-TG-------AC-C-T-A-C-A-AT-C-TT-G-A-C---C-AAC------A-TTT---AA----AA----C--T----T-TCAA-T-G--TCT-T------------A-AAC---T--GG----TA---T----T-----T---------TT----T---------C---T---TT-C-A---AA--A-CA-G---GG-TTA-G-------C-AT-CAATTCT-G--AAA---T------G--T----A-----A-A-GTC----A-ACA-AAT--------T---A---T-----------T-GAATT--TAA-TCC-A---T-T-T-T----AA-C--A----AC------TA------T---G-CAAGAACTA--------T------------------------------------------G-TG--T-T-T-TC-C-C--TAA-GC-G-G----T-----TAAC-A-G----G-CG--G--G--CAG--A-TCA-C---AAA---------T-----GTA-A-----------GG-CG-A-AT------------------------------------------------TAC-TA--TCA------TA--CA-GC-C----G-A----G-C--T-AT--GT--T---G-TAG-GTT------CCG-G---AA-TCAG-CC-GA-GGT
gi|25                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                   -----T---------TG----T---------C---T---TT-C-AGGAAA--A-CA-G---AGATGA-G-------C-AT-CAAGTCC-A--GAC---T-------------------------T-----------AAT--------T---A---T-----------TTGAGAT--TAA-TCA-AGGAT-T-T-T----AA-G--A----A-------TA----------G-CAACAATAA--------TT--TT---A-A------GC----A-AAGGC----G-CT----GGTGGGT-T-T-TC-TGC--TAA-GC-A-G----T-----TACC-A-A----G-CG--GT-G--CAG--A-TCA-C---AAA---------T-----GGA-A-----------GG-CGCG-ATA------C--GC--A-------T---AT----G----A--A------GTAC-TGACTCA------TAGACA-GAGC----G-A----GAG--T-ATTGGA--T---G---G-GTTGCGTGCCCG-A---AA-TCAG-CC-GA-GGTT-GGCCG
gi|26                         :                                                                                                                                                        ca-T-A-C-ATGT-C-TT-G-A-C---C-ATC------A-TGT---AA----AG----C--T----T-ACAA-T-G--TTT-G------------T-AAC---A--G-----T----T----T-------------------------------------------------------A-G---TG-TTA-A-------C-AC-CAATTCa
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gi|27                         : actgtttacatgtcttgaccatcatgtaaagcttacaatgtttgtaacagtttagtgttaacaccaattcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngttaacaagcggAC------A-TGT---AA----AA----C--T----T-TCAA-T-G--GTT-T------------A-AAC---T--G-----G----T----C-----T---------TT----T---------CCCTT---TT-C-A---AA--A-CA-G---GG-TTA-G-------C-AT-CAATTCT-G--AAGCCGT------G--T----A-----A-A-GTC----A-ACA-AAA--------T---A---T-----------T-TAATA--TAA-TCC-AA--T-T-T-T----AA-G--A----AC------TA------T---G-TAAGAACTA--------TT--TT---A-A------GC----A-A--GC----G-CT----G-CG--T-T-T-TC-C-C--TGA-GC-G-G----T-----TAAC-A-G----G-CG--G--G--CAG--A-TCA-C---AAA---------T-----GTA-A-----------GG-CG-G-ATA------C--GC--A-------T---AT----C----A--A------GTAC-TA--TCA------TA--CA-TC-C----G-A----G-G--T-AT--GA--T---
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gi|29                         :                                                                                                                             tgtTTACAC--GTGT-TG-------AC-T-T-A-C-A-AT-C-TT-G-A-C---T-ATA------A-TGC---AA----A---------------------------T-T------------A---C---T--GGGGATT----T----T-----T---------TT----T---------A---TAAATT-C-G---AA--A-CA-G---TG-TTA-C-------C-AC-CAATTCT-G--AA---------------------------------------CA---C--------T---G---T-----------T-GAAAT--GAC-TCC-A---T-C-T-TC---AA-G--T----AA------TA------T---G-TAAGAGCTG--------AT--TG---A-A------GC----A-A--GC----G-CT----G-TG--T-T------------AA-GT--------T-----TAAC-A-G----G-CG--G--T--CAA--A-TCA-C---AAA---------T-----GTA-A-----------GG-CG-G-ATA------C--GC--A-------T---ATCGAAC----A--A------GT---TG--TCA------TA--CA-GC-C----G-A----G-
gi|3                          :                                                                                                                             ctgtTACAT--GTGT--G-------AC-CGT-A-C-A-AT-C-TT-G-A-C---CCAAC------A-TTT---GGTT--AA----C--TG---T-TCAA-T-A--TGT-TCGTGTA------G-AAC---T--G-----C----C----C-----CCCCCGCCCCTT----T---------C---T---TT-CCA---AAGGA-CA-G---GG-TTA-G-------C-AT-CAATTCT-G--CAA---T------G--T-----------------------------T--------T-------T-----------T-GAATT--TAA-TCC-T---T-TGT-T----AA-AGAA----AC------TA------T---GGCAAGAACTA--------TT--TTCA-A-A------GC------A--GC----G-C-------TG--T-T-T-TC-T-C--T-A-GC-G-A----CG----TAAC-AGG----G-CG--G--G--CAG--A-TCA-C---AGA---------T-----GTG-A-----------GG-CG-G-ATA------C--GCATA-------T---AT----C----A--A------GTAC-TA--TCA------TA--CAGGC-C----GAA----A-G--T-AT--GT--T---G-TAG-GTT------ACG-G---AATTCAG-CC-GA-GGGT-TGCC
gi|30                         :                                                                                                                                TTACAC--GTGT-------------C-T-A-G------C-TT-G-G-C---T-ATC------A-TAT---AA----AG----C--T----T-TCAA-T-A--TCT-G------------T-AAC---T--A-----T----T----T-----T---------TT----T---------C---T---TT-C-A---AA--A-CA-A---TG-TTA-G-------C-AT-CAATTCT-G--AAG---T------G--T----ACTGT-A-A-GTC----A-ACA-CAT--------A---G---T-----------T-GAAAT--GAT-TCC-A---TCT-T-T----AA-G--A----AC------TA------T---G-CAAGAACTA--------TT--TT---A-A------GC----A-A--GA----G-C-------TG--T-T-T-TC-C-C--TAA-AT-G-G----T-----TAAC-A-G----G-CG--G--T--CGA--A-TCA-C---AAA---------T-----GTA-A-----------GG-CA-G-ATA------T--GC--A-------T---AT----
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gi|43                         :                                                                                                                                           t-TG-------AC-C-T-A-C-A-AT-C-TT-G-A-C---C-AAC------A-TTT---AA----AA----C--T----T-TCAA-T-G--TCT-T------------A-AAC---T--G-----T----T----T-----T---------TT----TTTTCTTTCTC---T---TT-C-A---AA--A-CA-G---GG-TTA-G-------C-AT-CAATTAT-G--AAG---T------G--T----A-----A-A-GTC----A-ACA-AAT--------T---A---T-----------T-GAATT--TAA-TCC-A---T-T-T-TTTTAAA-G--A----ACTACATGTA------T---G-CAAGAAATA--------cg
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gi|45                         :                                                                                                                                                                                                                                                    tttaatgtttatacg-----T----T----C-----T---------TT----T---------C---T---TT-C-A---AA--A-CA-A---CG-TTA-G-------T-AT-CAATTCT-A--AAG---T------G--A----A-----A-A-GTC----A-ACA-AAC--------T---A---T-----------C-TAAAT--ttggtttgtttgttttttcttttctttcaaaacaacgttagtatcaattctaaagtgaaaagtcaacaaactatctaaatgact
gi|46                         :                                                    tttaatgtttatacgcttgaccatcatataaaactttcaatgtttgtaactgggtttttttttttttggtttgtttgttttT--ATGT-TG-------AC-C-T-A-C-A-AT-C-TT-G-A-C---C-AAC------A-TTT---AA----AA----C--T----T-TCAA-T-G--TCT-T------------A-AAC---T--G-----T----T----G-----T---------GT----T---------T---T---CC-C-T---AA--G-C------GG-TTA-gact
gi|46                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              tc-T-T-T----AA----A----AC------T-------T---T-CAA----TG--------TC--TT---A-A------AC----------T----G-TT----G-TG--T-T-T-TC-C-C--TAA-GC-G-G----T-----TAAT-A-G----G-CG--G--G--CGG--A-TCA-C---AAA---------T-----GTA-A-----------GG-CG-G-ATA------C--GC--A-------T---AT----C----A--A------GTAC-TA--TCA------TA--CA-GC-C----G-A----G-G--T-AT--GA--T---G-ataggcgggcggatcacaaatgtaaggcggatacgcatatcaagtactatcatacagccgaggtatgatg
gi|47                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                tctatgttgacctacaatcttgaccaacaT--TT---A-A------AC----A-A--GC----G-CT----G--G--T-T-TCTC-T-C--TAA-GC-G-G----A-----AAAC-A-G----G-CG--G--G--CAG--AATCA-C---AAAA--------T-----GTA-A-----------GGGCG-GGATA------C--GC--A-------T---AT----C----A---------GTAC-TA--TCA------TA--CA-GC-C----G-A----A-T--T-AT--GA--T---G-TAG-GTT------CCG-G---AA-TCAG-C---A-AGTT-GGCCG
gi|48                         :                                                                                                                                                               aacata-C-TT-G-A-C---C-ATC------C-TAT---AT----TG----C--T----T--CAA-T-G--TCTGT------------A-------T--------T----T----T-----T---------TT----T---------C---T---TT-C-A---AA--A-CA-GTTTGT-TTA-G-------CAAT-CAATTCT-G--AAG---TG-----G--T----A-----A-A-GTC----A-ACA-CAT--------T---G---T-----------T-GAAAA--TGACTCT-A---T-C-T-T-----C-GCCA----ACA-----TC------T---G-GAAGAACTA--------
gi|49                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    --------TT--TT---A-A------GC----A-A--AA----G-CT----G-T-----T-T-TC-C-C--TAA-AC-G-G----T-----GAAC-A-G----G-CT--G--G--CAG--A-CCA-C---AAAAA-------T-----GTA-A-----------GG-CG-G-ATA------C--GC--A-------T---AT----C----A--A------ATAC-TG--TTA------TA--CT-GC-T----G-A----G-G--T-TT--GA--T---G-TAG-GTT------CCG-G---GA-TCAG-CT-GA-GATT-GATCG
gi|5                          :                                                                                                                                TTACAC--GTGT-TG-------AC-C-T-T-T-A-AT-C-TT-G-A-C---C-AATTATTATA-TTT---AA----AA----C--T----T-TCAA-T-G--TTT-T------------A-AAC---T--G-----T----T----T-----T---------TT--------------C---T---TT-C-A---AA--AACA-G---GG-TTA-G-------C-TT-AAATTCT-G--AAG---T------G--T----A-----A-A-GTC----A-ACA-AAT--------T---A---T-----------T-GAATT--TAA-TTA-A---T-T-CGT----AA-G--A----AC------TA------T---G-CAAGAACTA--------TT--AT---A-G------GC----A-A--AC----C-CT----A-TG--T-TCT-TC-T-C--AAA-GC-A-G----T-----TAAC-A-G----G-T---A--G--CAG--A-TCA-C---AAA---------T-----ATA-A-----------GG-CA-G-ATA------C--AC--A-------T---AT----C----A--A------GTAC-TA--TCA------TA--CA-AC-T----G-A----G-G--T-AT--GA--T---G-TAG-ATT------CTG-G---AA-TCAG-TC-AA-ATCT-GG
gi|50                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 ctgt-A--GC----G-TT----A-GG--T-T-T-TT-C-T--GAA-TG-A-G----T-----AAAG-A-G----G-TG--A--C--CGA--A-TCC-C---AAAA--------T-----GTCCA-----------CG-TG-T-ATG------T--TG--A-------T---AT----C----A--A------ATCC-TG--TCA------TA--CA-AC-C----A-A----G-A--T-AT--GA--C---G-TA
gi|51                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                aattataaacacattacgcacttaatttctgt----A-A--GC----G-CT----G--G--T-T-TCTC-T-C--TAAAGC-G-G----A-----AAAC-A-G----G-CG--G--G--CAG--A-TCA-C---AAA---------T-----GTA-A-----------GG-CG-G-ATA------C--GC--A-------T---AT----C----A--A------GTAC-TA--TCA------TA--CA-GC-C----G-A----A-T--T-AT--GA--T-----TAG-GTT------CCG-G---AA-TCAG-CC-AA-GGTT-GGCCG
gi|52                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             -TCC-C---AAA---------T-----GTA-A-----------GA--G-G-ATA--------------------------T----C----A--A------ATCC-TG--TCATATATGTA--CA-GC-A----G-A----G-T--T-TT--AA--T---G-TAT-GTT------CCA-G---AA-TTAG-CC-AA-AATT-GGCC
gi|54                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                cttcacacggaacacttctaagcgaccaaattacaaat------G--T----A-----A-A-GTC----A-ACA-AAT--------T---A---T-----------T-GAATA--TAA-TCT-A---T-T-T-TT---AA-G--A----AC------TA------T---G-AAAGAACTACATGTA--TT--TT---A-A------GC----A-A--GC----G-CT----G-TG--T-T-T--C-C-C--TAA-GC-G-G----T-----TAAC-A-G----G-CG--G--A--CAG--A-TCA-C---AAA---------T-----G
gi|55                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    --------TT--TT---A-T------GC----A-A--GC----G-CT----G-TG--T-T-T-TC-T-C--TTC-GC-G-G----T-----TAAC-A-G----G-CA--G--G--CAG--G-TCA-C---AAA---------T-----GTA-A-----------GG-CG-G-GTA------C--GC--A-------T---AT----TTTAAA--A------GTAC-TA--CC------------------------------------------------------GTT------CCG-G---AA-TCAG-CC-GA-GGTT-GGCCG
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gi|57                         :                                                                                                                                 TACAT--GTGT-TG-------AC-T-TTA-A-A-AT-C-TT-G-A-C---C-ATC------A-TGT---CA----AG----C--T----C-TCAT-T-G----T-T------------A-------------------------------------------T----T---------C----------------AA--A-TA-G---TG-TAA-G-------CAAT-CAATTCT-G--AAG---TTGTAAAG--T----A-----A-A-GTG----A-ACACACT--------T---G---T-----------T-GAAAT--
gi|58                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     -A--GC----G-TTA---G-TT--T-T-T-TT-C-T--CAA-TG-A-G----T-----AAAG-A-A----G-CC--G--C--CGA--A-TCA-C---ACA---------T-----GTCCA-----------AT-TG-T-ATG------G--GG--A-------T---AT----C----A--A------ATCC-TG--TCA------TA--AA-GC-C----G-A----G-G--T-AT--GA--T---G-Tga
gi|59                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             aatttctgt----AA-T--A----AC------TA------T---G-CAAGAATT---------TT--TT---A-A------GC----A-A--GC----A-C-----G-TG--T-T-T-TT-CTC--TAG-G----G----T-----TAAC-A-G----G-TG--G--T--CA---A-TCA-C---AAA---------T-----GTA-A-----------GG-TG-G-ATA------C--GC--A-------T---AT----C----A--AGTGCATGTAC-TA--TC
gi|6                          :                                                                                                                                TTACAT--GTGT-TG-------AC-C-T-A-C-A-AT-C-TT-G-A-C---C-AAT------A-TCT---AA----AA----C--T----T-CCAA-T-G--TCT-T------------A-AAC---T--G-----T----TGTTTT-----T---------TT----C---------C---T---TT-C-A---AA--A-CA-G---GG-TTA-G-------T-AT-CAATTCT-A--TAG---C------G--T----A-----A-T-GTT----A-ACA-AAT--------T---A---TTATCAAATTATT-GAATT--TAC-TCC-A---T-T-T-TT---AA-G--A----AC------TA------T---G-CAAGAACTA--------TT--TT---A-A------GC----A-A--GC----G-CT----G-TG--T-T-T-TC-C-C--TAA-GC-G-G----T-----TAAC-A-G----G-CG--G--G--CAG--A-TCA-C---AAA---------T-----GTA-A-----------GG-CG-G-ATA------C--GC--A-------T---AT----C----A--A------GTAC-TA--TCA------TA--CA-GC-A----G-A----G-G--C-AT--GA--T---G-TAG-CTT------CCG-G---AA-TCAG-TC-GA-
gi|60                         :                                                                                                                                                                                                                   --T----T-TCAA-T-G--TCT-T------------A-AAC---T--GGT---T----T----T-----T---------TT----T---------C---T---TTTC-A---AA--A-TA-T---GG-TTA-C-------C-AT-CAATTTT-G--AAG---T------G--T----AATTG-A-A-GTC----A-ACA-AAT--------T---A---T-----------T-GAATT--TAA-TCC-A---T-T-
gi|61                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       ----G-CG--G--G--CAG--A-TCA-C---AAA---------T-----GTA-------------GG-CG-G-ATA------C--GC--A-------T---AT----C----A--A------GTAC-TA--TCA------TA--CACGC-C----G-A----G-A--T-AT--GA--T---G-TAG-GTT------CCG-G---AA-TAGG-CC-GA-GGTG-TGCCG
gi|62                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             -G-ATA------C--GC--A-------T---AT----C----A--A------GTAT-CA--TCA------TA--CA-GC-C----G-A----G-G--T-AT--GA--T---G-TAG-GTT------CCG-G---AA-TCAG-CC-GA-GGTT-GGCCG
gi|63                         :                                                                                                                              cagatcat--GTGT-TG-------AC-T-T-A-C-A-AT-C-TT-GCATC---C-TTC------A-TAT---AA----AA----C--T----T-TCAA-T-G--TCT-G------------T-AAC---T--GGT---T----T----T-----T---------TT----T---------T---T---TT-C-A---
gi|64                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    cA--T---G-TAG-GTT------CCA-G---AA-TCAG-CCTGACGGTT-GGCCG
gi|65                         :                                                                                                      aggaatattccgtacctccatataacTTACATATGTGT-TG-------AA-C-T-A-C-A-AC-C-TT-G-A-C---C-AAC------A-TTT---AT----TA----C--T----T-TCAA-T-G--TCT-T------------A-AAC---T--a
gi|66                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               -AT--GA--T---G-TTG-GTT------CTG-G---AAATCAG-CC-GA-GGTT-GGCCG
gi|67                         :                                                                                                            cagaatccgagggtggcctaTTACAT--GTGC-GG-------AC-C-T-A-C-A-ACAT-TT-G-A-C---C-AAC------A-TGT---AA----AA-------T----T-TCAA-T-G--GTT-T------------A-AAC---aa
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gi|7                          :                                                                                                                           actgtTTACAT--GTGCCTG-------AC-T-TTA-C-A-AC-C-TTTG-A-C---C-AAC------A-TGT---AA----AA----A--C----T-TCAA-T-G--TCT-TT-----------A-AAC---T--GG----T----T----C-----T---------TT----T---------CCCTT---TT-C-A---AA--A-CA-G---GT-TTA-G-------C-AT-CAATTCT-G--AAG---T------G--T----A-----A-A-GTC----A-ACA-AAT--------C---A---T-----------T-TAAAT---AA-TCC-A---T-T-T-A----AA-G--A----AC------TA------T---G----------------------TT---G-A------GC----A----GC----G-CTTGTTG-TG--T-C-T-CC-C-C--TAA-GC-G-G----T-----TAAC-A-G----G-CG--G--G--CAT--A-TCA-C---AAA---------T-----GTA-A-----------GG-CG-G-ATA------C--GC--A-------T---AT----C----A--A------GTAA-TAT-TCA------TA--CA-TC-C----G-A----G-GTTT-AT--GATTT---G-TAG-GTT------TCT-G---AA-TCAG-CC-GA-GGTTGGGCCGaactgt
gi|70                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       t--TCA------TA--CA-GC-C----G-A----G-G--T-TT--GA--T---A-TAG-ATT------CCG-G---AA-TCAG-CC-GA-GGTT-t
gi|71                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           g-C----G-A----G-G--T-AT--GA--T---G-TAG-GTT------ACG-G---AA-TCAG-TC-GA-GGTT-GGCC
gi|72                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 T--GA--T---G-TAG-GTT------CCG-G---AA-TCAG-TC-GA-TGTT-GGCCGt
gi|73                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  --GG--T---G-TAG-CTT------CCG-G---AA-TCAG-CC-GA-GGTT-GGCCGaa
gi|74                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          -CG-G-ATA------C--GC--A-------T---ATAT--C----A--A------GTAC-TA--TCA------TA--CA-TC-C----G-aa
gi|75                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     A--T---G-TAG-GTT------TCA-G---AA-TCAG-CC-GA-GGTT-GGCCG
gi|76                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  --GA--T---G-TAG-GTT------CCG-G---AA-TCAG-CC-GA-GGTT-GGCCGaa
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5 sequences could not be aligned to this reference sequence:
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Unaligned ( gi|53 ): AAAAAGGCACAAAAAGATGACATCCTTTACGTCATGTAACACTAACTGTTTCTCTCTGAATTATATGTTTTCTCGAATACAGGACAATTTTTAAAGCAAGCTCGATACATTCTTATCAA
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Reference ( family-216 )      :                                                                                                                                TTACAT--GTGT-TG-------AC-C-T-A-C-A-AT-C-TT-G-A-C---C-AAC------A-TNT---AA----AA----C--T----T-TCAA-T-G--TCT-T------------A-AAC---T--G-----T----T----T-----T---------TT----T---------C---T---TT-C-A---AA--A-CA-G---GG-TTA-G-------C-AT-CAATTCT-G--AAG---T------G--T----A-----A-A-GTC----A-ACA-AAT--------T---A---T-----------T-GAANT--TAA-TCC-A---T-T-T-T----AA-G--A----AC------TA------T---G-CAAGAACTA--------TT--TT---A-A------GC----A-A--GC----G-CT----G-TG--T-T-T-TC-C-C--TAA-GC-G-G----T-----TAAC-A-G----G-CG--G--G--CAG--A-TCA-C---AAA---------T-----GTA-A-----------GG-CG-G-ATA------C--GC--A-------T---AT----C----A--A------GTAC-TA--TCA------TA--CA-GC-C----G-A----G-G--T-AT--GA--T---G-TAG-GTT------CCG-G---AA-TCAG-CC-GA-GGTT-GGCCG
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gi|30                         :                                                                                                                                TTACAC--GTGT-------------C-T-A-G------C-TT-G-G-C---T-ATC------A-TAT---AA----AG----C--T----T-TCAA-T-A--TCT-G------------T-AAC---T--A-----T----T----T-----T---------TT----T---------C---T---TT-C-A---AA--A-CA-A---TG-TTA-G-------C-AT-CAATTCT-G--AAG---T------G--T----ACTGT-A-A-GTC----A-ACA-CAT--------A---G---T-----------T-GAAAT--GAT-TCC-A---TCT-T-T----AA-G--A----AC------TA------T---G-CAAGAACTA--------TT--TT---A-A------GC----A-A--GA----G-C-------TG--T-T-T-TC-C-C--TAA-AT-G-G----T-----TAAC-A-G----G-CG--G--T--CGA--A-TCA-C---AAA---------T-----GTA-A-----------GG-CA-G-ATA------T--GC--A-------T---AT----
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gi|33                         :                                                                                                                                                                                                  c---AA----AA----C--G----T-TCAA-T-G--TCT-G------------T-AAT---T--G-----T----T----T-----T----------T----T---------C---T---TT-C-A---AA--T-CA-A---TG-TTA-A-------C-AT-CAATTCT-G--AAG---T------G--T----A-----A-A-GT-----A-AAA-AATG-------T---G---T-----------T-GAATT--TAA-TCCAA---T-T-T-T----Aa
gi|33                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              GAACTA--------TT--TT---A-A------GC----A-A--GC----G-CT----G-TG--T-T-T-TC-T-C--TAA-AT-G-G----T-----TAAC-G-G----G-CG--G--G--CAG--A-TCA-C---ATA---------T-----tcacttctacagtaaagtattgtattttacaattagcagctacttttctttctccgaactattttaagcaagcgctgtgttttctctaaatggttaacgggcgggcagatcacatatt
gi|34                         :          aaaacgttcaatgtctgtaattgttttttctttcaaatcaatgttaacatcaattctgaagtgtaaagtaaaaaatgtgttgaatttaatccaattttatcacttctacagtaaagtattgtattttacaattagcagctacttttctttctccT-C-TT-G-G-C---C-ATC------A-TAT---AA----AG----C--T----T-TCAA-T-G--TCT-G------------T-AAC---T--A-----T----T----T-----T---------TT----T---------C---T---TT-C-A---AA--A-CA-A---TG-TTA-G-------C-AT-CAATTCT-G--AAG---T------G--TACTGA-----A-A-GTC----A-ACA-CAC--------T---G---T-----------T-GAAAT----------------------------G--A----CC------TA------T---G-CAAGAACTA--------TT--TT---A-A------GC----A-A--GA----G-C-------TG--T-T-T-TC-C-C--TAA-AT-G-G----T-----CAAC-A-G----G-CG--G--T--CGA--A-TCA-C---AAA---------T-----GTA-A-----------GG-CG-G-ATA------T--GC--A-------T---AT----C----A--t
gi|35                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              tgtttactggttacacatgG-TTA-G-------C-AC-CAATTCT-GTTCAG---G------G--T----A-----A-A-GTC----A-A-A-CAC--------T---G---T-----------T-GAAAT--GAC-TCC-------T-T-T----AA-T--A----AT------TACATGTAT---G-CAAGAACTAATTTAATTTT--TT---A-A------GC----A-A--GC----G-CT----G-TG--T-T-T-TC-C-C--TAA--C-G-G----T-----TAAT-A-GC---GTCG--G--G--CAGGAG-CCG-CGCGAAA---------T-----GTA-A-----------GG-CA-G-ATAGTATACC--GC--A-------TAGAAT----C----A--A-------TAC-AG--TAA------TA--CA--C-C-----------A-G--T-TT--GA--T---G-TA--GTT------CCG-G---A
gi|37                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              gt---AA--A-CA-A---GG-TTA-G-------C-AT-AAATTCT-G--AAG---T------G--T----A-----A-T-GTC----A-ACA-AAT--------T---A---T-----------T-GAATT--TAA-TCC-A---T-C-T-T----AA-G--A----AC------TA------T---G-CAAGAACTA--------TT--TT---A-A------GC----A-A--GC----G-CT----G-TG--T-T-T-TC-C-C--TAA-GC-G-G----T-----TAAC-A------G-CG--G--G--CAG--A-TCA-C---AAA---------T-----GTA-A-----------GG-CG-G-TTA------C--GC--A-------T---AT----C----A--A------GTAC-TA--TCA------TA--CA-GC-C----G-A----G-G--T-AT--GA--T---G-TAG-GTT------CCA-G---AA-TCAA-CC-GA-GGTT-GGC
gi|38                         :                                                                                                                                     T--GTGT-TG-------AC-C-T-AGC-A-AT-C-T--G-A-CG--C-AAC------A-TTT---AA----AAAAAGC--T----T-TCC--T-G--TCT-T------------A-AGC---T--G-----T----G----T-----T---------TT----T---------C---T---TT-T-C---AA--A-CA-GA--GG-GTA---------C-AT--AATTCT-G--AAG---T------T--T----A-----AGA-GTC----A-ACA-A-T--------C---A---G-----------T-GAATT--TAA-TCC-A---T-T-T-TTA--AA-G--A----AC------TA------T---G-CAAGAGCTG--------TT--TT---A-T------GC----A-A--GC----G-CT----GTTG--T-T-T-TC-CTC--TCG-GC---G----T-----TAAC-A-G----G-CA--GT-G--CAG--G-TCA-
gi|39                         :                                                                                                                           ttaaacTACAT--GTGT-TG-------AC-C-T-C-C-A-AT-C-TT-G-A-C---C-AAC------A-TTT---AA----AA----C--T----T-TCAA-T-G--TCT-T------------A-AAC---T--G-----T----T----T-----T---------TTCTCTT---------C---T---TT-C-A---AA--A-CA-G---GG-TTA-G-------C-AT-CAATTCT-G--AAG---T------G--T----A-----A-A-GTC----A-ACA-GAT--------T---A---T-----------T-GAATT--TGA-TCC-AT--T-T-T-T----AA-G--A----AC------TG------T---G-CAAGAACTA--------TT--CTA--A-A------GC----A-A--GG----G-CT----G-TG--T-T-T-TC-T-C--TAA-GC-G-G----T-----TAAC-A-G----G-CG--G--G--CA
gi|4                          :                                                                                                                                 TACAT--GTGC-TGCATGCTGAC-C-T-A-C-A-AC-C-TT-G-A-C---C-AAC------A-TTT---AA----GA----C--T----T-TATA-T-G--TCT-T------------A-AAC---T--A-----T----T----T-----T---------TT----T---------CCC-T---TT-C-A---AA--A-CA-G---GA-TTA-G-------C-AT-CAATTCT-G--AAG---T------G--T----A-----A-A-ATC----A-ACA-AAT--------T---A---T-----------T-GAATT--TAA-TCC-A---T-T-T-TT---AA-G--A----AC------TT------T---G-CAAGAACTA--------TT--TT---A-A------GC----A-A--GC----G-CT----G-TG------T-TC-C-TAATAA-AT-G-G----T-----TAAC-A-G----A-CA--G--G--CAG--A-TCA-C---AAA---------T-----GTA-A-----------GG-CG-G-ATA------C--GC--A-------T---AT----C----A--A------GTAC-TA--TCA------TA--CA-GC-C----G-A----G-G--T-AT--GA--T---G-TAG-GTT------TCG-G---AA-TCAG-CC-GA-GATT-GGCC
gi|40                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             -GTC----A-ACA-AAT--------T---A---T-----------T-GAATT--TAA-TCC-A---T-T-TGT----AA-G--A----AC------TA------T---G-CAAGAATTA--------TT--TTTAAA-ATACGCGGC----A-A---C----G-CT----G-TG--T-T-T-TC-T-C--TAA-GC-G-G----T-----TAAC-A-G----G-CG--G--G--CAG--A-TCA-C---AAAATTAATTAAT-----GTA-A-----------GG-CG-G-ATA------C--GC--A-------T---AT----C----A--A------GTAC-TA--TCA------TA--AA-GC-T----G-A----G-G--T-TT--GA--T---G-TAG-GTT------ACG-G---AA-TCAG-CC-GA-GGTT-GG
gi|41                         :                                                                                                                                                                                       C------A-TAT---AA----AG----C--T----T-TCAA-T-G--CAT-G------------T-GGC---T--G----------T----T-----T---------TT----T---------C---A---TT-C-A---AA--------------------------------AATTCC-G--AAG---T------G--T----A-----A-A-GTC----A-GCttga
gi|41                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 t---A-A------GT----C-A--GC----G-CT----G-TG--T-T-T-TC-C-T--TAT-AC-G-G----T-----TAAC-A-G----G-CG--G--T--CGA--A-TAA-C---AAA---------TTAAATGTA-A-----------GG-CG-G-ATA------C--GC--A-------T---AT----C----A--A------ATAC-TG--TCA------CA--CA-GC-G----G-A----G-T--T-TT--GG--T---G-TAG-GTT------CCG-G---AA-TCAG-CC-GA-GGTT-GGgctgtgttttccttatacggttaacaggcggtcgaataacaaattaaatgtaaggcggatacgcatatcaaatactgtcacacagcggagttttggtgtaggttccggaatcagccgaggttggt
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gi|43                         :                                                                                                                                           t-TG-------AC-C-T-A-C-A-AT-C-TT-G-A-C---C-AAC------A-TTT---AA----AA----C--T----T-TCAA-T-G--TCT-T------------A-AAC---T--G-----T----T----T-----T---------TT----TTTTCTTTCTC---T---TT-C-A---AA--A-CA-G---GG-TTA-G-------C-AT-CAATTAT-G--AAG---T------G--T----A-----A-A-GTC----A-ACA-AAT--------T---A---T-----------T-GAATT--TAA-TCC-A---T-T-T-TTTTAAA-G--A----ACTACATGTA------T---G-CAAGAAATA--------cg
gi|44                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              -A---AA--A-CA-G------TTA-GAGACGAAC-AT-CA-TTCT-GTGAAG---T------G--T----ATA---A-A-GTC----A-ACA---C--------T---AGCGT-----------T-GAAAT--GAT-TCC-G---T-C-T-T----AA-G--A----AC------AA------T---G-TAAGAAATA--------TC--TT---G-A------TT----A-A--G
gi|44                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             -G-ATA------C--GC--A-------T---A-------------------------------A------TA--CA-GC-C----A-A----G-G--T--T--GA--T---G-TAG-GTT------CCA-G---AA-TCAG-CC-GA--GTT-GGttaagatacgcataatacagccaaggttgatgtaggttccagaatcagccgagttgg
gi|45                         :                                                           aaaacagttagagacgaacatcattctgtgaagtgtataaagtcaacactagcgttgaaatgattccgtcttaagaacaatgtaagaaatatcttgattaagttaa-C-TT-G-A-C---C-ATC------A-TAT---AA----AA----C--T----T-TCAA-T-G--TTT-G------------T-AAC---TGGG-----T----T----T-----T---------TT----T---------T---T---TT-
gi|45                         :                                                                                                                                                                                                                                                    tttaatgtttatacg-----T----T----C-----T---------TT----T---------C---T---TT-C-A---AA--A-CA-A---CG-TTA-G-------T-AT-CAATTCT-A--AAG---T------G--A----A-----A-A-GTC----A-ACA-AAC--------T---A---T-----------C-TAAAT--ttggtttgtttgttttttcttttctttcaaaacaacgttagtatcaattctaaagtgaaaagtcaacaaactatctaaatgact
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gi|46                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              tc-T-T-T----AA----A----AC------T-------T---T-CAA----TG--------TC--TT---A-A------AC----------T----G-TT----G-TG--T-T-T-TC-C-C--TAA-GC-G-G----T-----TAAT-A-G----G-CG--G--G--CGG--A-TCA-C---AAA---------T-----GTA-A-----------GG-CG-G-ATA------C--GC--A-------T---AT----C----A--A------GTAC-TA--TCA------TA--CA-GC-C----G-A----G-G--T-AT--GA--T---G-ataggcgggcggatcacaaatgtaaggcggatacgcatatcaagtactatcatacagccgaggtatgatg
gi|47                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                tctatgttgacctacaatcttgaccaacaT--TT---A-A------AC----A-A--GC----G-CT----G--G--T-T-TCTC-T-C--TAA-GC-G-G----A-----AAAC-A-G----G-CG--G--G--CAG--AATCA-C---AAAA--------T-----GTA-A-----------GGGCG-GGATA------C--GC--A-------T---AT----C----A---------GTAC-TA--TCA------TA--CA-GC-C----G-A----A-T--T-AT--GA--T---G-TAG-GTT------CCG-G---AA-TCAG-C---A-AGTT-GGCCG
gi|48                         :                                                                                                                                                               aacata-C-TT-G-A-C---C-ATC------C-TAT---AT----TG----C--T----T--CAA-T-G--TCTGT------------A-------T--------T----T----T-----T---------TT----T---------C---T---TT-C-A---AA--A-CA-GTTTGT-TTA-G-------CAAT-CAATTCT-G--AAG---TG-----G--T----A-----A-A-GTC----A-ACA-CAT--------T---G---T-----------T-GAAAA--TGACTCT-A---T-C-T-T-----C-GCCA----ACA-----TC------T---G-GAAGAACTA--------
gi|49                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    --------TT--TT---A-A------GC----A-A--AA----G-CT----G-T-----T-T-TC-C-C--TAA-AC-G-G----T-----GAAC-A-G----G-CT--G--G--CAG--A-CCA-C---AAAAA-------T-----GTA-A-----------GG-CG-G-ATA------C--GC--A-------T---AT----C----A--A------ATAC-TG--TTA------TA--CT-GC-T----G-A----G-G--T-TT--GA--T---G-TAG-GTT------CCG-G---GA-TCAG-CT-GA-GATT-GATCG
gi|5                          :                                                                                                                                TTACAC--GTGT-TG-------AC-C-T-T-T-A-AT-C-TT-G-A-C---C-AATTATTATA-TTT---AA----AA----C--T----T-TCAA-T-G--TTT-T------------A-AAC---T--G-----T----T----T-----T---------TT--------------C---T---TT-C-A---AA--AACA-G---GG-TTA-G-------C-TT-AAATTCT-G--AAG---T------G--T----A-----A-A-GTC----A-ACA-AAT--------T---A---T-----------T-GAATT--TAA-TTA-A---T-T-CGT----AA-G--A----AC------TA------T---G-CAAGAACTA--------TT--AT---A-G------GC----A-A--AC----C-CT----A-TG--T-TCT-TC-T-C--AAA-GC-A-G----T-----TAAC-A-G----G-T---A--G--CAG--A-TCA-C---AAA---------T-----ATA-A-----------GG-CA-G-ATA------C--AC--A-------T---AT----C----A--A------GTAC-TA--TCA------TA--CA-AC-T----G-A----G-G--T-AT--GA--T---G-TAG-ATT------CTG-G---AA-TCAG-TC-AA-ATCT-GG
gi|50                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 ctgt-A--GC----G-TT----A-GG--T-T-T-TT-C-T--GAA-TG-A-G----T-----AAAG-A-G----G-TG--A--C--CGA--A-TCC-C---AAAA--------T-----GTCCA-----------CG-TG-T-ATG------T--TG--A-------T---AT----C----A--A------ATCC-TG--TCA------TA--CA-AC-C----A-A----G-A--T-AT--GA--C---G-TA
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gi|52                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             -TCC-C---AAA---------T-----GTA-A-----------GA--G-G-ATA--------------------------T----C----A--A------ATCC-TG--TCATATATGTA--CA-GC-A----G-A----G-T--T-TT--AA--T---G-TAT-GTT------CCA-G---AA-TTAG-CC-AA-AATT-GGCC
gi|54                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                cttcacacggaacacttctaagcgaccaaattacaaat------G--T----A-----A-A-GTC----A-ACA-AAT--------T---A---T-----------T-GAATA--TAA-TCT-A---T-T-T-TT---AA-G--A----AC------TA------T---G-AAAGAACTACATGTA--TT--TT---A-A------GC----A-A--GC----G-CT----G-TG--T-T-T--C-C-C--TAA-GC-G-G----T-----TAAC-A-G----G-CG--G--A--CAG--A-TCA-C---AAA---------T-----G
gi|55                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    --------TT--TT---A-T------GC----A-A--GC----G-CT----G-TG--T-T-T-TC-T-C--TTC-GC-G-G----T-----TAAC-A-G----G-CA--G--G--CAG--G-TCA-C---AAA---------T-----GTA-A-----------GG-CG-G-GTA------C--GC--A-------T---AT----TTTAAA--A------GTAC-TA--CC------------------------------------------------------GTT------CCG-G---AA-TCAG-CC-GA-GGTT-GGCCG
gi|56                         :                                                                                                                                TTACAT--GTGT-TG-------AC-C-T-A-C-A-AT-C-TT-G-A-CATGC-AAC------A-TTT---AA----AA----C--T----T-TCAA-T-G--TCT-TAGACAGTTTAAAA-AAC---T--G-----TTGGGT----T-----T---------TT----T---------T---T---TT-C-A---AA--A-CA-G---GG-TTA-G-------C-AT-CAATCCT-G--AA
gi|57                         :                                                                                                                                 TACAT--GTGT-TG-------AC-T-TTA-A-A-AT-C-TT-G-A-C---C-ATC------A-TGT---CA----AG----C--T----C-TCAT-T-G----T-T------------A-------------------------------------------T----T---------C----------------AA--A-TA-G---TG-TAA-G-------CAAT-CAATTCT-G--AAG---TTGTAAAG--T----A-----A-A-GTG----A-ACACACT--------T---G---T-----------T-GAAAT--
gi|58                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     -A--GC----G-TTA---G-TT--T-T-T-TT-C-T--CAA-TG-A-G----T-----AAAG-A-A----G-CC--G--C--CGA--A-TCA-C---ACA---------T-----GTCCA-----------AT-TG-T-ATG------G--GG--A-------T---AT----C----A--A------ATCC-TG--TCA------TA--AA-GC-C----G-A----G-G--T-AT--GA--T---G-Tga
gi|59                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             aatttctgt----AA-T--A----AC------TA------T---G-CAAGAATT---------TT--TT---A-A------GC----A-A--GC----A-C-----G-TG--T-T-T-TT-CTC--TAG-G----G----T-----TAAC-A-G----G-TG--G--T--CA---A-TCA-C---AAA---------T-----GTA-A-----------GG-TG-G-ATA------C--GC--A-------T---AT----C----A--AGTGCATGTAC-TA--TC
gi|6                          :                                                                                                                                TTACAT--GTGT-TG-------AC-C-T-A-C-A-AT-C-TT-G-A-C---C-AAT------A-TCT---AA----AA----C--T----T-CCAA-T-G--TCT-T------------A-AAC---T--G-----T----TGTTTT-----T---------TT----C---------C---T---TT-C-A---AA--A-CA-G---GG-TTA-G-------T-AT-CAATTCT-A--TAG---C------G--T----A-----A-T-GTT----A-ACA-AAT--------T---A---TTATCAAATTATT-GAATT--TAC-TCC-A---T-T-T-TT---AA-G--A----AC------TA------T---G-CAAGAACTA--------TT--TT---A-A------GC----A-A--GC----G-CT----G-TG--T-T-T-TC-C-C--TAA-GC-G-G----T-----TAAC-A-G----G-CG--G--G--CAG--A-TCA-C---AAA---------T-----GTA-A-----------GG-CG-G-ATA------C--GC--A-------T---AT----C----A--A------GTAC-TA--TCA------TA--CA-GC-A----G-A----G-G--C-AT--GA--T---G-TAG-CTT------CCG-G---AA-TCAG-TC-GA-
gi|60                         :                                                                                                                                                                                                                   --T----T-TCAA-T-G--TCT-T------------A-AAC---T--GGT---T----T----T-----T---------TT----T---------C---T---TTTC-A---AA--A-TA-T---GG-TTA-C-------C-AT-CAATTTT-G--AAG---T------G--T----AATTG-A-A-GTC----A-ACA-AAT--------T---A---T-----------T-GAATT--TAA-TCC-A---T-T-
gi|61                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       ----G-CG--G--G--CAG--A-TCA-C---AAA---------T-----GTA-------------GG-CG-G-ATA------C--GC--A-------T---AT----C----A--A------GTAC-TA--TCA------TA--CACGC-C----G-A----G-A--T-AT--GA--T---G-TAG-GTT------CCG-G---AA-TAGG-CC-GA-GGTG-TGCCG
gi|62                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             -G-ATA------C--GC--A-------T---AT----C----A--A------GTAT-CA--TCA------TA--CA-GC-C----G-A----G-G--T-AT--GA--T---G-TAG-GTT------CCG-G---AA-TCAG-CC-GA-GGTT-GGCCG
gi|63                         :                                                                                                                              cagatcat--GTGT-TG-------AC-T-T-A-C-A-AT-C-TT-GCATC---C-TTC------A-TAT---AA----AA----C--T----T-TCAA-T-G--TCT-G------------T-AAC---T--GGT---T----T----T-----T---------TT----T---------T---T---TT-C-A---
gi|64                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    cA--T---G-TAG-GTT------CCA-G---AA-TCAG-CCTGACGGTT-GGCCG
gi|65                         :                                                                                                      aggaatattccgtacctccatataacTTACATATGTGT-TG-------AA-C-T-A-C-A-AC-C-TT-G-A-C---C-AAC------A-TTT---AT----TA----C--T----T-TCAA-T-G--TCT-T------------A-AAC---T--a
gi|66                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               -AT--GA--T---G-TTG-GTT------CTG-G---AAATCAG-CC-GA-GGTT-GGCCG
gi|67                         :                                                                                                            cagaatccgagggtggcctaTTACAT--GTGC-GG-------AC-C-T-A-C-A-ACAT-TT-G-A-C---C-AAC------A-TGT---AA----AA-------T----T-TCAA-T-G--GTT-T------------A-AAC---aa
gi|68                         :                                                                                                                               cTTACAC--ATGT-TG-------AC-T-T-A-C-A-AT-C-AT-G-A-C---C-ATC------A-TGT---AA----AG----C--T----
gi|7                          :                                                                                                                           actgtTTACAT--GTGCCTG-------AC-T-TTA-C-A-AC-C-TTTG-A-C---C-AAC------A-TGT---AA----AA----A--C----T-TCAA-T-G--TCT-TT-----------A-AAC---T--GG----T----T----C-----T---------TT----T---------CCCTT---TT-C-A---AA--A-CA-G---GT-TTA-G-------C-AT-CAATTCT-G--AAG---T------G--T----A-----A-A-GTC----A-ACA-AAT--------C---A---T-----------T-TAAAT---AA-TCC-A---T-T-T-A----AA-G--A----AC------TA------T---G----------------------TT---G-A------GC----A----GC----G-CTTGTTG-TG--T-C-T-CC-C-C--TAA-GC-G-G----T-----TAAC-A-G----G-CG--G--G--CAT--A-TCA-C---AAA---------T-----GTA-A-----------GG-CG-G-ATA------C--GC--A-------T---AT----C----A--A------GTAA-TAT-TCA------TA--CA-TC-C----G-A----G-GTTT-AT--GATTT---G-TAG-GTT------TCT-G---AA-TCAG-CC-GA-GGTTGGGCCGaactgt
gi|70                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       t--TCA------TA--CA-GC-C----G-A----G-G--T-TT--GA--T---A-TAG-ATT------CCG-G---AA-TCAG-CC-GA-GGTT-t
gi|71                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           g-C----G-A----G-G--T-AT--GA--T---G-TAG-GTT------ACG-G---AA-TCAG-TC-GA-GGTT-GGCC
gi|72                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 T--GA--T---G-TAG-GTT------CCG-G---AA-TCAG-TC-GA-TGTT-GGCCGt
gi|73                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  --GG--T---G-TAG-CTT------CCG-G---AA-TCAG-CC-GA-GGTT-GGCCGaa
gi|74                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          -CG-G-ATA------C--GC--A-------T---ATAT--C----A--A------GTAC-TA--TCA------TA--CA-TC-C----G-aa
gi|75                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     A--T---G-TAG-GTT------TCA-G---AA-TCAG-CC-GA-GGTT-GGCCG
gi|76                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  --GA--T---G-TAG-GTT------CCG-G---AA-TCAG-CC-GA-GGTT-GGCCGaa
gi|77                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      --T---G-TAG-GTT------CCG-G---AA-TCAG-CC-GA-GGTT-TGCCa
gi|79                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      --T---G-TAG-GTT------CCA-G---AA-TCAG-CC-GA-GGTT-GGCCGaaa
gi|8                          :                                                                                                                                         TGT-TG-------AC-T-T-A-TGA-AT-C-TT-G-A-C---C-AAT------G-TTA---AA----GG----C--T----T-TCAAAT-G--TCC-T------------GTAAC---T--GGT---T----T----T-----T---------TT----T---------T---T---TT-C-A---AA--AACA-G---TG-TTATG-------C-AC-AAAATCT-G--AAG---T------A--T----ATC---A-A-ATC----A-ACA-TAC--------C---A---A-----------T-GAAACGGCAC-TCC-A---T-C-T-T----TA-G--A----A--------------------------ACTA--------TT--TT---A-A------GCC---A-A--GC----G-CT----G-TG--TGC-T-TT-C-C--TAA-AC-G-G----T-----TAAC-AAG----G-CA--G--G--CAG--A-ACAAC---AAAA--------T-----GTA-AT----------GG-CG-G-ATA------C--GCC-A-------T---TT----C----A--A------ATAT-TG--TCA------TA--CA-GC-C----G-A------G--T-AT--GA--TTCAA-TAC-GGT------CCG-G---AA-TCAT-CC-GA-GGaa
gi|80                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          ctgtttaccTT------CCG-G---AA-TCAG-CC-GC-GGTT-TGCCGgc
gi|81                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            actac-GTT------TCG-A---AA-TCAG-CC-GA-GGTT-GGCCGaat
gi|9                          :                                                                                                                                 TACAT--GTGT-TG-------AC-C-T-A-C-A-AT-C-TT-G-A-C---C-AAC------A-TTT---TA----AA----C--T----T-TCAA-T-G--TCT-T------------A-AAC---T----------------------------------------T---------T---T---TT-C-A---AA--A-CA-T---GG-TTA-G-------T-AT-CAATTTT-G--AAG---T------G--T----G-----A-A-GTC----A-ACA-AAT--------T---A---T-----------T-GAATA--TAA-TCC-A---T-T-T-TT---AA-G--A----AC------TA------T---G-CAAGAACTA--------TT--TT---A-ATTAA--GA----A-A--GC----G-CT----G-TG--T-T-T-TC-T-C--TAA-GC-G-G----T-----TAAC-A-G----G-CG--G--G--CAG--A-TCA-C---AAA---------T-----GTA-A-----------GG-CG-G-ATA------C--GC--A-------T---AT----G----A--AGTACATGTAC-TA--TCA------TA--CA-GC-T----G-A----G-G--T-AT--GA--T---G-TAG-GTT------CCG-G----A-TCAG-CC-GA-AGTT-GGCCGaatgaa


blockSeqs                     :                                                                                                                                      AT    A  CATGCTG  . G T G G T       T     ATG   A TATTAT   T TAA  CAAT  AAAG .  GCTC          CA   TAGACAGTTTAAAA     AGT GG GGGAT TGGG GTTT AAAAA CCCCGCCCC  CTCT TTTCTTTCT CCT AAA      GGA  GG A    TTTG A     AGACGAA A            TT   CCG TGTAAA .  ACTG TAATT       .        CA  TACATGTA CAC GCG TATCAAATTAT     T GGC      A GGA C   G TTTA    GA AAT   TACATG  CTAGGA TTA           ATTTAATT  .   TAA   TACGCG  AAAT   AG  ACGT    TGTT G  GG     C    G AA   A      TTAA G          G CGAG    TT TT .    GA       GCG   ATTAATTAA TAAAT   C TATGTAAAGGC           GTATAC GA  AT ATGCATA AGA  CGAA TTAA AC GTGCAT       AC   TATATG  GA  G    AAAA   TACC   TA CA TG  TT TCA         GCGTGC     .    T
blockSeqs                     :                                                                                                                                      .     C  .        . . T . . .       .     G     A .        T .    TT    .    .  G             .    TCGTGTAG           G   .  GACC  A    G    GTT   T          CT   .         CCT .        .    .  A    AG   .     .       A            TG   .   G      .  .    CTGT        .        A   G        .   .   .               T T        A A   C   G TA      CC .     TAG     CATGTA .             CATGTA    .   CA    TTAA    T      .   .       A    T  CT     C    T .    A      .    .          A C       .  T  .    .        .     AA        .       C T                     GC     .   C  .       .    AT   AA   .  GTACAT       T    .       .   C    .      .      TT A  .   .  .           CA         .    A
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blockSeqs                     :                                                                                                                                      .     .  .        . . . . . .       .     .     T .        G .    .     .    .  .             .    GT                 .   .  .     .    .    .     .          .    .         .   .        .    .  .    C    .     .       .            .    .   .      .  .    .           .        A   .        .   .   .               T T        . .   .   . .       .  .     .       .      .             .         .   .     .       .      .   .       .    .  .      .    . .    .      .    .          . .       .  .  .    .        .     .         .       . .                     .      .   .  .       .    .    .    .  .            .    .       .   .    .      .      .  A  .   .  .           .          .    .
blockSeqs                     :                                                                                                                                      .     .  .        . . . . . .       .     .     A .        G .    .     .    .  .             .    TA                 .   .  .     .    .    .     .          .    .         .   .        .    .  .    G    .     .       .            .    .   .      .  .    .           .        C   .        .   .   .               A G        . .   .   . .       .  .     .       .      .             .         .   .     .       .      .   .       .    .  .      .    . .    .      .    .          . .       .  .  .    .        .     .         .       . .                     .      .   .  .       .    .    .    .  .            .    .       .   .    .      .      .  A  .   .  .           .          .    .
blockSeqs                     :                                                                                                                                      .     .  .        . . . . . .       .     .     T .        T .    .     .    .  .             .    GA                 .   .  .     .    .    .     .          .    .         .   .        .    .  .    G    .     .       .            .    .   .      .  .    .           .        A   .        .   .   .               T T        . .   .   . .       .  .     .       .      .             .         .   .     .       .      .   .       .    .  .      .    . .    .      .    .          . .       .  .  .    .        .     .         .       . .                     .      .   .  .       .    .    .    .  .            .    .       .   .    .      .      .  A  .   .  .           .          .    .
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blockSeqs                     :                                                                                                                                      .     .  .        . . . . . .       .     .     A .        G .    .     .    .  .             .    AT                 .   .  .     .    .    .     .          .    .         .   .        .    .  .    G    .     .       .            .    .   .      .  .    .           .        C   .        .   .   .               A G        . .   .   . .       .  .     .       .      .             .         .   .     .       .      .   .       .    .  .      .    . .    .      .    .          . .       .  .  .    .        .     .         .       . .                     .      .   .  .       .    .    .    .  .            .    .       .   .    .      .      .  T  .   .  .           .          .    .
blockSeqs                     :                                                                                                                                      .     .  .        . . . . . .       .     .     T .        T .    .     .    .  .             .    TA                 .   .  .     .    .    .     .          .    .         .   .        .    .  .    T    .     .       .            .    .   .      .  .    .           .        C   .        .   .   .               T T        . .   .   . .       .  .     .       .      .             .         .   .     .       .      .   .       .    .  .      .    . .    .      .    .          . .       .  .  .    .        .     .         .       . .                     .      .   .  .       .    .    .    .  .            .    .       .   .    .      .      .  T  .   .  .           .          .    .
blockSeqs                     :                                                                                                                                      .     .  .        . . . . . .       .     .     T .        A .    .     .    .  .             .    GT                 .   .  .     .    .    .     .          .    .         .   .        .    .  .    G    .     .       .            .    .   .      .  .    .           .        A   .        .   .   .               A G        . .   .   . .       .  .     .       .      .             .         .   .     .       .      .   .       .    .  .      .    . .    .      .    .          . .       .  .  .    .        .     .         .       . .                     .      .   .  .       .    .    .    .  .            .    .       .   .    .      .      .  A  .   .  .           .          .    .
blockSeqs                     :                                                                                                                                      .     .  .        . . . . . .       .     .     A .        A .    .     .    .  .             .    TA                 .   .  .     .    .    .     .          .    .         .   .        .    .  .    T    .     .       .            .    .   .      .  .    .           .        C   .        .   .   .               A G        . .   .   . .       .  .     .       .      .             .         .   .     .       .      .   .       .    .  .      .    . .    .      .    .          . .       .  .  .    .        .     .         .       . .                     .      .   .  .       .    .    .    .  .            .    .       .   .    .      .      .  A  .   .  .           .          .    .
blockSeqs                     :                                                                                                                                      .     .  .        . . . . . .       .     .     A .        T .    .     .    .  .             .    AT                 .   .  .     .    .    .     .          .    .         .   .        .    .  .    T    .     .       .            .    .   .      .  .    .           .        C   .        .   .   .               T T        . .   .   . .       .  .     .       .      .             .         .   .     .       .      .   .       .    .  .      .    . .    .      .    .          . .       .  .  .    .        .     .         .       . .                     .      .   .  .       .    .    .    .  .            .    .       .   .    .      .      .  T  .   .  .           .          .    .
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blockSeqs                     :                                                                                                                                      .     .  .        . . . . . .       .     .     T .        A .    .     .    .  .             .    TA                 .   .  .     .    .    .     .          .    .         .   .        .    .  .    G    .     .       .            .    .   .      .  .    .           .        A   .        .   .   .               T T        . .   .   . .       .  .     .       .      .             .         .   .     .       .      .   .       .    .  .      .    . .    .      .    .          . .       .  .  .    .        .     .         .       . .                     .      .   .  .       .    .    .    .  .            .    .       .   .    .      .      .  T  .   .  .           .          .    .
blockSeqs                     :                                                                                                                                      .     .  .        . . . . . .       .     .     A .        T .    .     .    .  .             .    TA                 .   .  .     .    .    .     .          .    .         .   .        .    .  .    C    .     .       .            .    .   .      .  .    .           .        A   .        .   .   .               T T        . .   .   . .       .  .     .       .      .             .         .   .     .       .      .   .       .    .  .      .    . .    .      .    .          . .       .  .  .    .        .     .         .       . .                     .      .   .  .       .    .    .    .  .            .    .       .   .    .      .      .  A  .   .  .           .          .    .
blockSeqs                     :                                                                                                                                            .  .        . . . . . .       .     .     A .        A .    .     .    .  .             .    TA                 .   .  .     .    .    .     .          .    .         .   .        .    .  .    G    .     .       .            .    .   .      .  .    .           .        A   .        .   .   .               T T        . .   .   . .       .  .     .       .      .             .         .   .     .       .      .   .       .    .  .      .    . .    .      .    .          . .       .  .  .    .        .     .         .       . .                     .      .   .  .       .    .    .    .  .            .    .       .   .    .      .      .  A  .   .  .           .          .    .
blockSeqs                     :                                                                                                                                            .  .        . . . . . .       .     .     T .        T .    .     .    .  .             .    GT                 .   .  .     .    .    .     .          .    .         .   .        .    .  .    G    .     .       .            .    .   .      .  .    .           .        C   .        .   .   .               T G        . .   .   . .       .  .     .       .      .             .         .   .     .       .      .   .       .    .  .      .    . .    .      .    .          . .       .  .  .    .        .     .         .       . .                     .      .   .  .       .    .    .    .  .            .    .       .   .    .      .      .  A  .   .  .           .          .    .
blockSeqs                     :                                                                                                                                            .  .        . . . . . .       .     .     A .        T .    .     .    .  .             .    TA                 .   .  .     .    .    .     .          .    .         .   .        .    .  .    G    .     .       .            .    .   .      .  .    .           .        A   .        .   .   .               A T        . .   .   . .       .  .     .       .      .             .         .   .     .       .      .   .       .    .  .      .    . .    .      .    .          . .       .  .  .    .        .     .         .       . .                     .      .   .  .       .    .    .    .  .            .    .       .   .    .      .      .  T  .   .  .           .          .    .
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blockSeqs                     :                                                                                                                                                          . . . . .       .     .     T .        T .    .     .    .  .             .    TA                 .   .  .     .    .    .     .          .    .         .   .        .    .  .    G    .     .       .            .    .   .      .  .    .           .        A   .        .   .   .               T T        . .   .   . .       .  .     .       .      .             .         .   .     .       .      .   .       .    .  .      .    . .    .      .    .          . .       .  .  .    .        .     .         .       . .                     .      .   .  .       .    .    .    .  .            .    .       .   .    .      .      .  A  .   .  .           .          .    .
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                          .     .     A .        G .    .     .    .  .             .    TA                 .   .  .     .    .    .     .          .    .         .   .        .    .  .    T    .     .       .            .    .   .      .  .    .           .        T   .        .   .   .               A T        . .   .   . .       .  .     .       .      .             .         .   .     .       .      .   .       .    .  .      .    . .    .      .    .          . .       .  .  .    .        .     .         .       . .                     .      .   .  .       .    .    .    .  .            .    .       .   .    .      .      .  A  .   .  .           .          .    .
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                          .     .     A .        G .    .     .    .  .             .    TA                 .   .  .     .    .    .     .          .    .         .   .        .    .  .    G    .     .       .            .    .   .      .  .    .           .        A   .        .   .   .               T .        . .   .   . .       .  .     .       .      .             .         .   .     .       .      .   .       .    .  .      .    . .    .      .    .          . .       .  .  .    .        .     .         .       . .                     .      .   .  .       .    .    .    .  .            .    .       .   .    .      .      .  A  .   .  .           .          .    .
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                          .     .     A .        G .    .     .    .  .             .    GT                 .   .  .     .    .    .     .          .    .         .   .        .    .  .    .    .     .       .            .    .   .      .  .    .           .        .   .        .   .   .               T .        . .   .   . .       .  .     .       .      .             .         .   .     .       .      .   .       .    .  .      .    . .    .      .    .          . .       .  .  .    .        .     .         .       . .                     .      .   .  .       .    .    .    .  .            .    .       .   .    .      .      .  T  .   .  .           .          .    .
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                      . .        T .    .     .    .  .             .    TA                 .   .  .     .    .    .     .          .    .         .   .        .    .  .    .    .     .       .            .    .   .      .  .    .           .        .   .        .   .   .               A .        . .   .   . .       .  .     .       .      .             .         .   .     .       .      .   .       .    .  .      .    . .    .      .    .          . .       .  .  .    .        .     .         .       . .                     .      .   .  .       .    .    .    .  .            .    .       .   .    .      .      .  A  .   .  .           .          .    .
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                        .        T .    .     .    .  .             .    TA                 .   .  .     .    .    .     .          .    .         .   .        .    .  .    .    .     .       .            .    .   .      .  .    .           .        .   .        .   .   .               A          . .   .   . .       .  .     .       .      .             .         .   .     .       .      .   .       .    .  .      .    . .    .      .    .          . .       .  .  .    .        .     .         .       . .                     .      .   .  .       .    .    .    .  .            .    .       .   .    .      .      .  A  .   .  .           .          .    .
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                   .    .     .    .  .             .    TA                 .   .  .     .    .    .     .          .    .         .   .        .    .  .    .    .     .       .            .        .      .  .    .           .        .   .        .   .   .               T                .     .                                             .         .   .     .       .      .   .       .    .  .      .    . .    .      .    .          . .       .  .  .    .        .     .         .       . .                     .      .   .  .       .    .    .    .  .            .    .       .   .    .      .      .  A  .   .  .           .          .    .
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                   .  .                                     .                      .     .          .    .         .   .        .                 .     .       .                                                .                                                                                                                  .         .   .     .       .      .   .       .    .  .      .    . .    .      .    .          . .       .  .  .    .        .     .         .       . .                     .      .   .  .       .    .    .    .  .            .    .       .   .    .      .      .  .  .   .  .           .          .    .
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5 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|32 ): AAAGGCACGAAAAGATGACGTACAATCCCCACAATACTTTAAATCATGCGACAAAGTTTCTCACTGAGAATTACTGGCTTTTTTCTAGAAATATAAGTAAGCTCAAGACCTCATCAAAAGGTGTTTTGATAACTACTTTCTGAAAGCGGCAGTTTTTCTGGCAGAGTACGCAGATGACCGCATTATGTTAGCGTTGCTACATGTAGAGTACCGGAATCTGCCGA
Unaligned ( gi|36 ): TAACAATAGCTACTACTAGCATGTGTTTTACTCGAAATGGAGGACAATTTTCTAAGTCAAGCTCGACAGGCACTTCGATCACTACTTTCTGAAAGCGACCGTATTTTCAGGAAAGTTAATTAATAGATGAAAGCATTACAAATATATTATGTATCAATTTACGTCATGCGTCATACATCTAAGATTAGACGTAGGATGCTGAAGTTTGCCGAAT
Unaligned ( gi|53 ): AAAAAGGCACAAAAAGATGACATCCTTTACGTCATGTAACACTAACTGTTTCTCTCTGAATTATATGTTTTCTCGAATACAGGACAATTTTTAAAGCAAGCTCGATACATTCTTATCAA
Unaligned ( gi|69 ): AAATTAGTAAATTCTAAACATATTACGAACTTAATTTCTGTAGCGTAA
Unaligned ( gi|78 ): GGTACGCATGCGTGAAGAAAACTAAGTCATACC






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Reference ( family-216 )      :                                                                                                                                TTACAT--GTGT-TG-------AC-C-T-A-C-A-AT-C-TT-G-A-C---C-AAC------A-TNT---AA----AA----C--T----T-TCAA-T-G--TCT-T------------A-AAC---T--G-----T----T----T-----T---------TT----T---------C---T---TT-C-A---AA--A-CA-G---GG-TTA-G-------C-AT-CAATTCT-G--AAG---T------G--T----A-----A-A-GTC----A-ACA-AAT--------T---A---T-----------T-GAANT--TAA-TCC-A---T-T-T-T----AA-G--A----AC------TA------T---G-CAAGAACTA--------TT--TT---A-A------GC----A-A--GC----G-CT----G-TG--T-T-T-TC-C-C--TAA-GC-G-G----T-----TAAC-A-G----G-CG--G--G--CAG--A-TCA-C---AAA---------T-----GTA-A-----------GG-CG-G-ATA------C--GC--A-------T---AT----C----A--A------GTAC-TA--TCA------TA--CA-GC-C----G-A----G-G--T-AT--GA--T---G-TAG-GTT------CCG-G---AA-TCAG-CC-GA-GGTT-GGCCG
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gi|17                         :                                                                                                                                                       C-C-T-A-C-A-AT-CCTT-T-A-C-----ATC------A-TGT---AACAATAA----C--TGCTCC-TCAA-T-GCATAT-G------------A-AAT---T--T-----T----T----T-----T---------TT----T---------C---T------C-G---AA--A-TA--------CTA-A-------A-AT---ATTTT-C--GAG---G------G--C----A-----A-G-CGC----G-ACA-CAT--------TCACA---T-----------C-AAAAG---AA-GGC-A---T-T-T-T----GA-T--C----AC--------------------CAA-----------------------A-A------GC----G----------G-CA----G-TG--T-T-T------C--TGA-GA-GAG----T-----AAAT-A-G----A-AA--ATTG--CA-----TTA-C---AAA---------T-----GCT-G-----------GG-C----ATAGC----T--AC--A-------A---AT----C----A--A------TTAA-CA--TTA------TA--CA-TC-C----G-A----G-G--T-AA--GC--T---G-TAG-GGTA-----CCG-G---AA-TCa
gi|18                         :                                                                                                               aaaggcacaaaaagatgacagcT--GTAT-TG-------AC-T-T-A-C-A-AT-C-TG-G-A-C---C-ATC------A-TGT---AA----AA----C--T----T-TCAA-T-G--TCTGT------------A-AA------------------------AAAAAT---------TT----T---------C---T---TT-C-A---AA--A-CA-G---GG-TTA-G-------C-AT-CAATTCT-G--AAG---G------G--T----A-----A-A-GTC----A-ACA-AACTACATGTAT---A---T-----------T-GAAAT--GAC-TCC-A---T-C-T-T-------------------------------------TAAGAACTA--------TT--TT---A-A------AC----A-A--GC----G-CT------TG--T-T-T-TC-T-C--TAA-GC-G-G----T-----TAAC-A-G----G-CG--G--T--CGA--A-TCG-C---AAA---------T-----GTA-A-----------GG-CG-G-ATA------C--GC--A-------T---AT----C----A--A------ATCC-TG--TCA------TA--CA-GC-C----A-A----G-G--T-TT--GA--T---G-TAG-GTT------CCG-G---AA-CCAG-CC-CA-GGTT-GGtactgaatg
gi|19                         :                                                                                                                                TTACAC--GTGT-TG-------AC-T-A-A-C-A-AT-C-TT-G-A-C---C-ATC------A-TGT---AA----AG----C--T----T-CCAG-T-G--TCT-G------------T-AAC---T--A-----T----T----T-----T---------T---------------C---A---TT-C-A---AA----CA-G---TG-TTA-G-------C-AC-CAATTCT-A--AGG---T------G--T----A-----------C----ACAC---------------------T-----------T-GAAAT--GAC-TCC-A---T-C-T-T-------------------------------------TAAGAACTA--------TT--CT---A-A------GA----A-A--GA----G-CT----G-TT--T-T-T-CC-C-C--TAT-AC-G-G----T-----TAAC-A-G----G-CG--G--T--CGG--A-TCA-C---AAA---------T-----GTC-A-----------GG-CG-G-ATA------C--GC--A-------T---AT----CAA--A--A------ACAC-TG--TCA------TA--CC-GC-C----G-A----G-G--T-TT--GA--T---G-TAG-GTT------CCG-G---AA-TCAG-CC-GA-GGTT-GGCC
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gi|21                         :                                                                                                                              taTTACAC--GTGT-TG-------AC-T-T-A-C-A-AT-C-TT-G-A-C---A-ATC------A-TGT---GA----AG----C--T----T-TTAA-T-G--TCT-C------------A-G-----T--G-----T--------------------------------------------------------------A-TA----------A-G-------C-AC-CAATTCT-G--ATA---T------A--T----A-----A-A-GTC----A-ACC-CAC--------T---T---T-----------T-GAAAT--GAC-CCT-A---TCT-T-T----AA-G--A----CC------TA------T---G-TTAGAACTA--------TT--TT---A-A------GC----A-A--GC----G-CT----G-TG--T-T-T-CC-C-T--TAA-AC-G-G----T-----TAAC-A-G----G-CG--G--G--CAG--A-CC----------------------------A-----------GG-CG-G-ACA------C--GC--A-------T---AT----C----A--A------ATGC-TG--TCA------TA--CA-GC-C----G-A----G-GTAT-AT--GA--T---G-TAG-GTT------CAG-G---AA-TCAG-CC-GA-GGTT-GGCCGg
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gi|3                          :                                                                                                                             ctgtTACAT--GTGT--G-------AC-CGT-A-C-A-AT-C-TT-G-A-C---CCAAC------A-TTT---GGTT--AA----C--TG---T-TCAA-T-A--TGT-TCGTGTA------G-AAC---T--G-----C----C----C-----CCCCCGCCCCTT----T---------C---T---TT-CCA---AAGGA-CA-G---GG-TTA-G-------C-AT-CAATTCT-G--CAA---T------G--T-----------------------------T--------T-------T-----------T-GAATT--TAA-TCC-T---T-TGT-T----AA-AGAA----AC------TA------T---GGCAAGAACTA--------TT--TTCA-A-A------GC------A--GC----G-C-------TG--T-T-T-TC-T-C--T-A-GC-G-A----CG----TAAC-AGG----G-CG--G--G--CAG--A-TCA-C---AGA---------T-----GTG-A-----------GG-CG-G-ATA------C--GCATA-------T---AT----C----A--A------GTAC-TA--TCA------TA--CAGGC-C----GAA----A-G--T-AT--GT--T---G-TAG-GTT------ACG-G---AATTCAG-CC-GA-GGGT-TGCC
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gi|40                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             -GTC----A-ACA-AAT--------T---A---T-----------T-GAATT--TAA-TCC-A---T-T-TGT----AA-G--A----AC------TA------T---G-CAAGAATTA--------TT--TTTAAA-ATACGCGGC----A-A---C----G-CT----G-TG--T-T-T-TC-T-C--TAA-GC-G-G----T-----TAAC-A-G----G-CG--G--G--CAG--A-TCA-C---AAAATTAATTAAT-----GTA-A-----------GG-CG-G-ATA------C--GC--A-------T---AT----C----A--A------GTAC-TA--TCA------TA--AA-GC-T----G-A----G-G--T-TT--GA--T---G-TAG-GTT------ACG-G---AA-TCAG-CC-GA-GGTT-GG
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gi|41                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 t---A-A------GT----C-A--GC----G-CT----G-TG--T-T-T-TC-C-T--TAT-AC-G-G----T-----TAAC-A-G----G-CG--G--T--CGA--A-TAA-C---AAA---------TTAAATGTA-A-----------GG-CG-G-ATA------C--GC--A-------T---AT----C----A--A------ATAC-TG--TCA------CA--CA-GC-G----G-A----G-T--T-TT--GG--T---G-TAG-GTT------CCG-G---AA-TCAG-CC-GA-GGTT-GGgctgtgttttccttatacggttaacaggcggtcgaataacaaattaaatgtaaggcggatacgcatatcaaatactgtcacacagcggagttttggtgtaggttccggaatcagccgaggttggt
gi|42                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                tcatataaagctttcaatgcatgtggctgttttttcattcaaaaattccgaagtgtaC-A---T-C-T-T----AAAG--A----TT------TA------TTTAG-TGA-AACCA--------TT--TC---A-AT-----GTT---A-A--GC----GATT----G-TG--T-T-T-TA-C-C--TAT-GC-A-G----T-----TAAC-A-G----G-CG--T--A--CGG--G-TCA-C---ACA---------T-----GTA-ATATGTAAAGGCGG-CG-G-ATA------CGAGC--A-------T---CT----C----AACA------ATACGTG--CCA------TA--CA-GC-TAAAAG-A----G-T--T-GC--AA------A-TGG-GTTCA----CCGCG---GA-TCAG-CC-GA-AGTT-GACCt
gi|43                         :                                                                                                                                           t-TG-------AC-C-T-A-C-A-AT-C-TT-G-A-C---C-AAC------A-TTT---AA----AA----C--T----T-TCAA-T-G--TCT-T------------A-AAC---T--G-----T----T----T-----T---------TT----TTTTCTTTCTC---T---TT-C-A---AA--A-CA-G---GG-TTA-G-------C-AT-CAATTAT-G--AAG---T------G--T----A-----A-A-GTC----A-ACA-AAT--------T---A---T-----------T-GAATT--TAA-TCC-A---T-T-T-TTTTAAA-G--A----ACTACATGTA------T---G-CAAGAAATA--------cg
gi|44                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              -A---AA--A-CA-G------TTA-GAGACGAAC-AT-CA-TTCT-GTGAAG---T------G--T----ATA---A-A-GTC----A-ACA---C--------T---AGCGT-----------T-GAAAT--GAT-TCC-G---T-C-T-T----AA-G--A----AC------AA------T---G-TAAGAAATA--------TC--TT---G-A------TT----A-A--G
gi|44                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             -G-ATA------C--GC--A-------T---A-------------------------------A------TA--CA-GC-C----A-A----G-G--T--T--GA--T---G-TAG-GTT------CCA-G---AA-TCAG-CC-GA--GTT-GGttaagatacgcataatacagccaaggttgatgtaggttccagaatcagccgagttgg
gi|45                         :                                                           aaaacagttagagacgaacatcattctgtgaagtgtataaagtcaacactagcgttgaaatgattccgtcttaagaacaatgtaagaaatatcttgattaagttaa-C-TT-G-A-C---C-ATC------A-TAT---AA----AA----C--T----T-TCAA-T-G--TTT-G------------T-AAC---TGGG-----T----T----T-----T---------TT----T---------T---T---TT-
gi|45                         :                                                                                                                                                                                                                                                    tttaatgtttatacg-----T----T----C-----T---------TT----T---------C---T---TT-C-A---AA--A-CA-A---CG-TTA-G-------T-AT-CAATTCT-A--AAG---T------G--A----A-----A-A-GTC----A-ACA-AAC--------T---A---T-----------C-TAAAT--ttggtttgtttgttttttcttttctttcaaaacaacgttagtatcaattctaaagtgaaaagtcaacaaactatctaaatgact
gi|46                         :                                                    tttaatgtttatacgcttgaccatcatataaaactttcaatgtttgtaactgggtttttttttttttggtttgtttgttttT--ATGT-TG-------AC-C-T-A-C-A-AT-C-TT-G-A-C---C-AAC------A-TTT---AA----AA----C--T----T-TCAA-T-G--TCT-T------------A-AAC---T--G-----T----T----G-----T---------GT----T---------T---T---CC-C-T---AA--G-C------GG-TTA-gact
gi|46                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              tc-T-T-T----AA----A----AC------T-------T---T-CAA----TG--------TC--TT---A-A------AC----------T----G-TT----G-TG--T-T-T-TC-C-C--TAA-GC-G-G----T-----TAAT-A-G----G-CG--G--G--CGG--A-TCA-C---AAA---------T-----GTA-A-----------GG-CG-G-ATA------C--GC--A-------T---AT----C----A--A------GTAC-TA--TCA------TA--CA-GC-C----G-A----G-G--T-AT--GA--T---G-ataggcgggcggatcacaaatgtaaggcggatacgcatatcaagtactatcatacagccgaggtatgatg
gi|47                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                tctatgttgacctacaatcttgaccaacaT--TT---A-A------AC----A-A--GC----G-CT----G--G--T-T-TCTC-T-C--TAA-GC-G-G----A-----AAAC-A-G----G-CG--G--G--CAG--AATCA-C---AAAA--------T-----GTA-A-----------GGGCG-GGATA------C--GC--A-------T---AT----C----A---------GTAC-TA--TCA------TA--CA-GC-C----G-A----A-T--T-AT--GA--T---G-TAG-GTT------CCG-G---AA-TCAG-C---A-AGTT-GGCCG
gi|48                         :                                                                                                                                                               aacata-C-TT-G-A-C---C-ATC------C-TAT---AT----TG----C--T----T--CAA-T-G--TCTGT------------A-------T--------T----T----T-----T---------TT----T---------C---T---TT-C-A---AA--A-CA-GTTTGT-TTA-G-------CAAT-CAATTCT-G--AAG---TG-----G--T----A-----A-A-GTC----A-ACA-CAT--------T---G---T-----------T-GAAAA--TGACTCT-A---T-C-T-T-----C-GCCA----ACA-----TC------T---G-GAAGAACTA--------
gi|49                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    --------TT--TT---A-A------GC----A-A--AA----G-CT----G-T-----T-T-TC-C-C--TAA-AC-G-G----T-----GAAC-A-G----G-CT--G--G--CAG--A-CCA-C---AAAAA-------T-----GTA-A-----------GG-CG-G-ATA------C--GC--A-------T---AT----C----A--A------ATAC-TG--TTA------TA--CT-GC-T----G-A----G-G--T-TT--GA--T---G-TAG-GTT------CCG-G---GA-TCAG-CT-GA-GATT-GATCG
gi|5                          :                                                                                                                                TTACAC--GTGT-TG-------AC-C-T-T-T-A-AT-C-TT-G-A-C---C-AATTATTATA-TTT---AA----AA----C--T----T-TCAA-T-G--TTT-T------------A-AAC---T--G-----T----T----T-----T---------TT--------------C---T---TT-C-A---AA--AACA-G---GG-TTA-G-------C-TT-AAATTCT-G--AAG---T------G--T----A-----A-A-GTC----A-ACA-AAT--------T---A---T-----------T-GAATT--TAA-TTA-A---T-T-CGT----AA-G--A----AC------TA------T---G-CAAGAACTA--------TT--AT---A-G------GC----A-A--AC----C-CT----A-TG--T-TCT-TC-T-C--AAA-GC-A-G----T-----TAAC-A-G----G-T---A--G--CAG--A-TCA-C---AAA---------T-----ATA-A-----------GG-CA-G-ATA------C--AC--A-------T---AT----C----A--A------GTAC-TA--TCA------TA--CA-AC-T----G-A----G-G--T-AT--GA--T---G-TAG-ATT------CTG-G---AA-TCAG-TC-AA-ATCT-GG
gi|50                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 ctgt-A--GC----G-TT----A-GG--T-T-T-TT-C-T--GAA-TG-A-G----T-----AAAG-A-G----G-TG--A--C--CGA--A-TCC-C---AAAA--------T-----GTCCA-----------CG-TG-T-ATG------T--TG--A-------T---AT----C----A--A------ATCC-TG--TCA------TA--CA-AC-C----A-A----G-A--T-AT--GA--C---G-TA
gi|51                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                aattataaacacattacgcacttaatttctgt----A-A--GC----G-CT----G--G--T-T-TCTC-T-C--TAAAGC-G-G----A-----AAAC-A-G----G-CG--G--G--CAG--A-TCA-C---AAA---------T-----GTA-A-----------GG-CG-G-ATA------C--GC--A-------T---AT----C----A--A------GTAC-TA--TCA------TA--CA-GC-C----G-A----A-T--T-AT--GA--T-----TAG-GTT------CCG-G---AA-TCAG-CC-AA-GGTT-GGCCG
gi|52                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             -TCC-C---AAA---------T-----GTA-A-----------GA--G-G-ATA--------------------------T----C----A--A------ATCC-TG--TCATATATGTA--CA-GC-A----G-A----G-T--T-TT--AA--T---G-TAT-GTT------CCA-G---AA-TTAG-CC-AA-AATT-GGCC
gi|54                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                cttcacacggaacacttctaagcgaccaaattacaaat------G--T----A-----A-A-GTC----A-ACA-AAT--------T---A---T-----------T-GAATA--TAA-TCT-A---T-T-T-TT---AA-G--A----AC------TA------T---G-AAAGAACTACATGTA--TT--TT---A-A------GC----A-A--GC----G-CT----G-TG--T-T-T--C-C-C--TAA-GC-G-G----T-----TAAC-A-G----G-CG--G--A--CAG--A-TCA-C---AAA---------T-----G
gi|55                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    --------TT--TT---A-T------GC----A-A--GC----G-CT----G-TG--T-T-T-TC-T-C--TTC-GC-G-G----T-----TAAC-A-G----G-CA--G--G--CAG--G-TCA-C---AAA---------T-----GTA-A-----------GG-CG-G-GTA------C--GC--A-------T---AT----TTTAAA--A------GTAC-TA--CC------------------------------------------------------GTT------CCG-G---AA-TCAG-CC-GA-GGTT-GGCCG
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gi|57                         :                                                                                                                                 TACAT--GTGT-TG-------AC-T-TTA-A-A-AT-C-TT-G-A-C---C-ATC------A-TGT---CA----AG----C--T----C-TCAT-T-G----T-T------------A-------------------------------------------T----T---------C----------------AA--A-TA-G---TG-TAA-G-------CAAT-CAATTCT-G--AAG---TTGTAAAG--T----A-----A-A-GTG----A-ACACACT--------T---G---T-----------T-GAAAT--
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gi|6                          :                                                                                                                                TTACAT--GTGT-TG-------AC-C-T-A-C-A-AT-C-TT-G-A-C---C-AAT------A-TCT---AA----AA----C--T----T-CCAA-T-G--TCT-T------------A-AAC---T--G-----T----TGTTTT-----T---------TT----C---------C---T---TT-C-A---AA--A-CA-G---GG-TTA-G-------T-AT-CAATTCT-A--TAG---C------G--T----A-----A-T-GTT----A-ACA-AAT--------T---A---TTATCAAATTATT-GAATT--TAC-TCC-A---T-T-T-TT---AA-G--A----AC------TA------T---G-CAAGAACTA--------TT--TT---A-A------GC----A-A--GC----G-CT----G-TG--T-T-T-TC-C-C--TAA-GC-G-G----T-----TAAC-A-G----G-CG--G--G--CAG--A-TCA-C---AAA---------T-----GTA-A-----------GG-CG-G-ATA------C--GC--A-------T---AT----C----A--A------GTAC-TA--TCA------TA--CA-GC-A----G-A----G-G--C-AT--GA--T---G-TAG-CTT------CCG-G---AA-TCAG-TC-GA-
gi|60                         :                                                                                                                                                                                                                   --T----T-TCAA-T-G--TCT-T------------A-AAC---T--GGT---T----T----T-----T---------TT----T---------C---T---TTTC-A---AA--A-TA-T---GG-TTA-C-------C-AT-CAATTTT-G--AAG---T------G--T----AATTG-A-A-GTC----A-ACA-AAT--------T---A---T-----------T-GAATT--TAA-TCC-A---T-T-
gi|61                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       ----G-CG--G--G--CAG--A-TCA-C---AAA---------T-----GTA-------------GG-CG-G-ATA------C--GC--A-------T---AT----C----A--A------GTAC-TA--TCA------TA--CACGC-C----G-A----G-A--T-AT--GA--T---G-TAG-GTT------CCG-G---AA-TAGG-CC-GA-GGTG-TGCCG
gi|62                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             -G-ATA------C--GC--A-------T---AT----C----A--A------GTAT-CA--TCA------TA--CA-GC-C----G-A----G-G--T-AT--GA--T---G-TAG-GTT------CCG-G---AA-TCAG-CC-GA-GGTT-GGCCG
gi|63                         :                                                                                                                              cagatcat--GTGT-TG-------AC-T-T-A-C-A-AT-C-TT-GCATC---C-TTC------A-TAT---AA----AA----C--T----T-TCAA-T-G--TCT-G------------T-AAC---T--GGT---T----T----T-----T---------TT----T---------T---T---TT-C-A---
gi|64                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    cA--T---G-TAG-GTT------CCA-G---AA-TCAG-CCTGACGGTT-GGCCG
gi|65                         :                                                                                                      aggaatattccgtacctccatataacTTACATATGTGT-TG-------AA-C-T-A-C-A-AC-C-TT-G-A-C---C-AAC------A-TTT---AT----TA----C--T----T-TCAA-T-G--TCT-T------------A-AAC---T--a
gi|66                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               -AT--GA--T---G-TTG-GTT------CTG-G---AAATCAG-CC-GA-GGTT-GGCCG
gi|67                         :                                                                                                            cagaatccgagggtggcctaTTACAT--GTGC-GG-------AC-C-T-A-C-A-ACAT-TT-G-A-C---C-AAC------A-TGT---AA----AA-------T----T-TCAA-T-G--GTT-T------------A-AAC---aa
gi|68                         :                                                                                                                               cTTACAC--ATGT-TG-------AC-T-T-A-C-A-AT-C-AT-G-A-C---C-ATC------A-TGT---AA----AG----C--T----
gi|7                          :                                                                                                                           actgtTTACAT--GTGCCTG-------AC-T-TTA-C-A-AC-C-TTTG-A-C---C-AAC------A-TGT---AA----AA----A--C----T-TCAA-T-G--TCT-TT-----------A-AAC---T--GG----T----T----C-----T---------TT----T---------CCCTT---TT-C-A---AA--A-CA-G---GT-TTA-G-------C-AT-CAATTCT-G--AAG---T------G--T----A-----A-A-GTC----A-ACA-AAT--------C---A---T-----------T-TAAAT---AA-TCC-A---T-T-T-A----AA-G--A----AC------TA------T---G----------------------TT---G-A------GC----A----GC----G-CTTGTTG-TG--T-C-T-CC-C-C--TAA-GC-G-G----T-----TAAC-A-G----G-CG--G--G--CAT--A-TCA-C---AAA---------T-----GTA-A-----------GG-CG-G-ATA------C--GC--A-------T---AT----C----A--A------GTAA-TAT-TCA------TA--CA-TC-C----G-A----G-GTTT-AT--GATTT---G-TAG-GTT------TCT-G---AA-TCAG-CC-GA-GGTTGGGCCGaactgt
gi|70                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       t--TCA------TA--CA-GC-C----G-A----G-G--T-TT--GA--T---A-TAG-ATT------CCG-G---AA-TCAG-CC-GA-GGTT-t
gi|71                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           g-C----G-A----G-G--T-AT--GA--T---G-TAG-GTT------ACG-G---AA-TCAG-TC-GA-GGTT-GGCC
gi|72                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 T--GA--T---G-TAG-GTT------CCG-G---AA-TCAG-TC-GA-TGTT-GGCCGt
gi|73                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  --GG--T---G-TAG-CTT------CCG-G---AA-TCAG-CC-GA-GGTT-GGCCGaa
gi|74                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          -CG-G-ATA------C--GC--A-------T---ATAT--C----A--A------GTAC-TA--TCA------TA--CA-TC-C----G-aa
gi|75                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     A--T---G-TAG-GTT------TCA-G---AA-TCAG-CC-GA-GGTT-GGCCG
gi|76                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  --GA--T---G-TAG-GTT------CCG-G---AA-TCAG-CC-GA-GGTT-GGCCGaa
gi|77                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      --T---G-TAG-GTT------CCG-G---AA-TCAG-CC-GA-GGTT-TGCCa
gi|79                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      --T---G-TAG-GTT------CCA-G---AA-TCAG-CC-GA-GGTT-GGCCGaaa
gi|8                          :                                                                                                                                         TGT-TG-------AC-T-T-A-TGA-AT-C-TT-G-A-C---C-AAT------G-TTA---AA----GG----C--T----T-TCAAAT-G--TCC-T------------GTAAC---T--GGT---T----T----T-----T---------TT----T---------T---T---TT-C-A---AA--AACA-G---TG-TTATG-------C-AC-AAAATCT-G--AAG---T------A--T----ATC---A-A-ATC----A-ACA-TAC--------C---A---A-----------T-GAAACGGCAC-TCC-A---T-C-T-T----TA-G--A----A--------------------------ACTA--------TT--TT---A-A------GCC---A-A--GC----G-CT----G-TG--TGC-T-TT-C-C--TAA-AC-G-G----T-----TAAC-AAG----G-CA--G--G--CAG--A-ACAAC---AAAA--------T-----GTA-AT----------GG-CG-G-ATA------C--GCC-A-------T---TT----C----A--A------ATAT-TG--TCA------TA--CA-GC-C----G-A------G--T-AT--GA--TTCAA-TAC-GGT------CCG-G---AA-TCAT-CC-GA-GGaa
gi|80                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          ctgtttaccTT------CCG-G---AA-TCAG-CC-GC-GGTT-TGCCGgc
gi|81                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            actac-GTT------TCG-A---AA-TCAG-CC-GA-GGTT-GGCCGaat
gi|9                          :                                                                                                                                 TACAT--GTGT-TG-------AC-C-T-A-C-A-AT-C-TT-G-A-C---C-AAC------A-TTT---TA----AA----C--T----T-TCAA-T-G--TCT-T------------A-AAC---T----------------------------------------T---------T---T---TT-C-A---AA--A-CA-T---GG-TTA-G-------T-AT-CAATTTT-G--AAG---T------G--T----G-----A-A-GTC----A-ACA-AAT--------T---A---T-----------T-GAATA--TAA-TCC-A---T-T-T-TT---AA-G--A----AC------TA------T---G-CAAGAACTA--------TT--TT---A-ATTAA--GA----A-A--GC----G-CT----G-TG--T-T-T-TC-T-C--TAA-GC-G-G----T-----TAAC-A-G----G-CG--G--G--CAG--A-TCA-C---AAA---------T-----GTA-A-----------GG-CG-G-ATA------C--GC--A-------T---AT----G----A--AGTACATGTAC-TA--TCA------TA--CA-GC-T----G-A----G-G--T-AT--GA--T---G-TAG-GTT------CCG-G----A-TCAG-CC-GA-AGTT-GGCCGaatgaa
5 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|32 ): AAAGGCACGAAAAGATGACGTACAATCCCCACAATACTTTAAATCATGCGACAAAGTTTCTCACTGAGAATTACTGGCTTTTTTCTAGAAATATAAGTAAGCTCAAGACCTCATCAAAAGGTGTTTTGATAACTACTTTCTGAAAGCGGCAGTTTTTCTGGCAGAGTACGCAGATGACCGCATTATGTTAGCGTTGCTACATGTAGAGTACCGGAATCTGCCGA
Unaligned ( gi|36 ): TAACAATAGCTACTACTAGCATGTGTTTTACTCGAAATGGAGGACAATTTTCTAAGTCAAGCTCGACAGGCACTTCGATCACTACTTTCTGAAAGCGACCGTATTTTCAGGAAAGTTAATTAATAGATGAAAGCATTACAAATATATTATGTATCAATTTACGTCATGCGTCATACATCTAAGATTAGACGTAGGATGCTGAAGTTTGCCGAAT
Unaligned ( gi|53 ): AAAAAGGCACAAAAAGATGACATCCTTTACGTCATGTAACACTAACTGTTTCTCTCTGAATTATATGTTTTCTCGAATACAGGACAATTTTTAAAGCAAGCTCGATACATTCTTATCAA
Unaligned ( gi|69 ): AAATTAGTAAATTCTAAACATATTACGAACTTAATTTCTGTAGCGTAA
Unaligned ( gi|78 ): GGTACGCATGCGTGAAGAAAACTAAGTCATACC