lowQualScore : 111111111111111111111 11111111111111111111111111111111111111111111 111111111111111111111 111111 222222222222222222
lowQualScore : 0 0 111 0 222 22222 3 0 22 1111 11 2222 8888 0 444444 33 11 22 666666 0 0 33333 3333333 11 333 1 5555555 666666 1 3333 333333 222 0 22 444444 7777 0 11 33 11 2222222 444 11 2222 11 333333333333333333333 22 0 222 777777777777777 111 0 0 1 4444444444 11 44444 22 55555 11 2222 555555 22 0 0 222 55555 2 22 11 66666666666666666666666666666666666666666666 11 1 1111 0 11 22 555555555 555555555555 11 4444444 11 33 0 0 4444444 3333333333 22222 0 4444444 1111 0 55 444 11 0 1 33333 22 1 0 11 22 0 2 222 3333333 1 0 222 66666666666666 111 0 11 222 1 11 222 1 11 33 33333 2 444444 33 0 2222 22222 0 222222222222222222222 33333 55555555 1 11 44444 111 4444 0 111 33333 0 77777 0 5555555 22222 333333 11 0 0 0 222 333333 11 0 4444 1 11 0 99999 1111 11 33333 00 0 2 00 3333 222222222222222222 1 111 33333 22 1 111 0 0 222 111 0 2222 1 1
lowQualScore : . . ... . ... ..... . . .. .... .. .... .... . ...... .. .. .. ...... . . ..... ....... .. ... . ....... ...... . .... ...... ... . .. ...... .... . .. .. .. ....... ... .. .... .. ..................... .. . ... ............... ... . . . .......... .. ..... .. ..... .. .... ...... .. . . ... ..... . .. .. ............................................ .. . .... . .. .. ......... ............ .. ....... .. .. . . ....... .......... ..... . ....... .... . .. ... .. . . ..... .. . . .. .. . . ... ....... . . ... .............. ... . .. ... . .. ... . .. .. ..... . ...... .. . .... ..... . ..................... ..... ........ . .. ..... ... .... . ... ..... . ..... . ....... ..... ...... .. . . . ... ...... .. . .... . .. . ..... .... .. ..... .. . . .. .... .................. . ... ..... .. . ... . . ... ... . .... . .
lowQualScore : 8 8 444 8 111 99999 0 7 55 6666 88 5555 5555 8 222222 55 99 66 555555 8 8 22222 9999999 88 111 5 0000000 222222 5 9999 333333 999 8 66 111111 2222 8 99 00 11 4444444 444 99 5555 99 111111111111111111111 77 8 222 555555555555555 444 8 8 6 9999999999 22 11111 11 00000 22 7777 222222 99 9 9 444 44444 7 33 33 99999999999999999999999999999999999999999999 22 8 9999 9 22 22 888888888 777777777777 22 2222222 22 00 9 9 9999999 8888888888 22222 9 8888888 9999 9 00 000 22 9 7 00000 11 7 9 22 99 8 5 333 5555555 6 8 333 77777777777777 444 8 99 222 6 11 222 6 11 66 55555 4 333333 66 8 5555 99999 8 222222222222222222222 55555 11111111 6 99 44444 444 0000 8 555 22222 8 66666 9 1111111 99999 666666 11 8 8 8 222 111111 11 8 2222 6 99 8 11111 6666 00 11111 99 7 1 99 1111 222222222222222222 4 222 66666 00 5 333 8 8 222 444 8 0000 2 3
consensus : GGGTCCG-GGT-T---A-G---A-----A-T-A--G----G--TC----C-T--C-AG------C--AT--CC--C---C--T-T-G-----C-----G-TG--T---C-G-------T------AAG-A----G------G---CG-A--C------T--G-A-A--T-GG--G-----G-C---G--G----T--C-----------A---------T--T-C---GG---------------A---T-G-A-G----------A--C-----C--G---G-A--A----AA------AC--C-GA-G---G---T-C-C--C--G--------------------------------------------T--G-T----C-A--C--A---------G------------C--A-------G--G--T-G-T-------GG----------C-----ACG-A--T----A----A-AG-A---T--C-C-C-----T--C-C-C--TG--C-T-CA---A-------A-GG-C---C--------------C---T-G--A---G-T--G---CC-G--A--G-----C-A------T--AGGCC-T----A-----A-A-T-------------------T-----T--------T-GC--A-----G---CC----C-TT---CA-----C-C-----G-G-------C-----A----N-TGG--T-GA-C-G---TC------T--C-C----A-T--ATG-AG----TG----A--AA--T--A--T-T-C--T----C----------G-G---T-G-G---GA-----C--G-T---A-A-AAC---A---A-T----AA-AT-AATCA
Reference ( gi|12 ) : GGGTCCG-GGT-T---A-G---A-----A-T-A--G----G--TC----C-T--C-AG------C--AT--CC--C---C--T-T-G-----C-----G-TG--T---C-G-------T------AAG-A----G------G---CG-A--C------T--G-A-A--T-GG--G-----G-C---G--G----T--C-----------A---------T--T-C---GG---------------A---T-G-A-G----------A--C-----C--G---G-A--A----AA------AC--C-GA-G---G---T-C-C--C--G--------------------------------------------T--G-T----C-A--C--A---------G------------C--A-------G--G--T-G-T-------GG----------C-----ACG-A--T----A----A-AA-A---T--C-C-C-----T--C-C-C--TG--C-T-CA---A-------A-GG-C---C--------------C---T-G--A---G-T--G---CC-G--A--G-----C-A------T--AGGCC-T----A-----A-A-T-------------------T-----T--------T-GC--A-----G---CC----C-TT---CA-----C-C-----G-G-------C-----A----T-TGG--T-GA-C-G---TC------T--C-C----A-T--ATG-AG----CG----A--AA--T--A--T-T-C--T----C----------G-G---T-G-G---GA-----C--G-T---A-A-AAC---A---A-T----AA-AT-AATCA
gi|10 : GGATCCG-GGT-T---A-G---A-----A-T-A--G----G--TC----T-T--C-AG------C--AT--CC--C---C--T-T-G-----C-----G-TG--T---C-G-------T------AAG-A----G------G---CG-A--C------T--G-A-A--T-AG--G-----G-C---G--G----T--C-----------A---------T--T-C---GG---------------A---T-G-A-G----------A--C-----C--G---G-A--A----AA------AA--T-GT-G---G---C-T-C--C--G--------------------------------------------T--G-T----C-A--A--G---------G------------C--A-------G--A--T-G-T-------GG----------C-----ACA-A--T----A----A-AG-A---T--C-C-C-----T--C-C-C--TG--C-T-CA---A-------A-GG-C---C--------------C---T-G--A---G-T--G---CC-G--A--G-----C-A------T--AGGCC-T----A-----A-A-T-------------------T-----T--------T-GC--A-----A---CC----C-TT---CA-----C-C-----G-G-------C-----A----T-TGG--T-GA-C-G---TA------T--C-C----G-T--ATG-AG----TG----A--AA--T--A--T-T-C--T----C----------A-G---T-G-A---GA-----C--G-T---A-A-AAC---A---A-T----AA-AT-AATC
gi|30 : gtggGGGTCCG-GGT-T---A-G---A-----A-T-A--G----G--TC----C-C--C-AG------C--AT--CC--C---C--T-T-G-----C-----G-TG--T---C-G-------T------------------------------------------------------------------------------------------A---------T--T-C---GG---------------A---T-G-A-G----------A--C-----C--G---G-A--A----AA------AC--C-GA-A---G---T-C-C--C--G--------------------------------------------T--G-T----C-A--C--A---------G------------C--A-------G--G--T-G-T-------GG----------C-----ACG-A--A----A----A-AG-A---T--C-C-C-----T--C-C-C--TG--C-T-CA---A-------A-GG-C---C--------------C---T-G--A---G-T--G---CC-G--A--G-----C-A------T--AGGCC-T----A-----A-A-T-------------------T-----T--------T-GC--A-----G---CC----C-TT---CA-----C-T-----G-G-------T-----A----A-TGG--T-GA-C-G---TC------T--C-C----A-T--ATG-AG----TG----A--AA--T--A--T-T-C--T----C----------G-G---T-G-G---GA-----C--G-T---A-A-AAC---A---A-G----AA-AT-AATCA
gi|9 : GGGTCCG-GGT-T---A-G---A-----A-T-A--G----G--TC----T-T--C-AG------C--AT--CC--C---C--T-T-G-----C-----G-TG--T---C-G-------T------AAG-A----G------G---CG-AC-C------T--G-A-A--T--G--G-----G-C---G--G----T--C-----------A---------T--T-C---GG---------------A---T-G-A-G----------A--C-----C--G---A-AACA----GA------AC--C-GA-G---G---C-CGC--C--G--------------------------------------------T--G-T----C-A--C--A---------G------------T--A-------G--G--T-G-T-------GG----------C-----ACG-A-------A----A-AG-A---T----C-C-----T--C-C-C--TG--C-T-AA---A-------A-GG-C---C--------------C---T-G--A---G-T--G---CC-G--AG-G-----C-A------T--AGGCC-T----A-----A-A-T-------------------T-----T--------TCGC--A-----G----C----C-TT---CA-----C-C-----G-G-------C-----A----A-TGG--T-GT-C-G---TC---------C-C----A-T--ATG-AG----TG----A--AA--T--A--T-T-C--T----C----------G-G---T-G-G---GA-----CGTG-T---A-A-AAC---A---A-T----AA-TT-AATCat
gi|21 : cgtggGGATCCG-GGT-T---A-A---T-----A-T-A--G----T--TC----C----C-AG------C--AT--CC--C------T-T-G-----C-----G-TG--T---C-G-------C------AAG-A----G------G---CG-A--C------T--G-A-A--T-AA--G-----G-C---G--GG---T--C-----------A---------T--T-C---GG---------------A---T-G-A-G----------A--CG----C--G---G-A--A----AA------AC--C-GA-G---G---C-C-C--C--G--------------------------------------------T--G-T----C-A--C--A---------G------------C--A-------G--G--T-G-T-------GG----------C-----ACG-A--T----A----A-AG-A---T--C-C-C-----T--C-C-C--TG--C-T-CA---A-------A-GG-----C--------------C---T-G--A---G-T--G---TC-A--A--T-----C-A------T--AGGCC-T----A-----A-T-T-------------------T-----T--------T-TT--A-----G---CC----C-TT---CA-----C-C-----G-G-------C-----A----T-TGG--T-GA-T-G---TC------C--C-C----A-T--ATG-AG----TG----A--AA--T--A--T-TCC--T----T----------G-G---G-G-G---AA-----C----T---A-A-AAC---A---A-
gi|27 : tggGGGTCCG-GGT-T---A-G---A-----A-T-A--G----G--TC----C----C-AG------C--AT--CC--C---C--T-T-G-----C-----A-TG--T---T-G-------T------AAG-A----G------G---CG-A--C------T--G--------------------------------T--C-----------A---------T--T-C---AG---------------A---C-G-A-G----------A--C-----C--G---G-A--A----AA-------C--C-GA-G---G---T-C-C--C--G--------------------------------------------T--G-T----C-A--C--ATAAATGACAG------------C--A-------G--G--T-G-T-------GG----------C-----ACG-A--T----A----A-AG-A---T--C-C-C-----T--C-A-C--TG--C-T-CA---A-------A-GG-C---A--------------C---T-G--A---G-T--G---CC-G--A--G-----C-A------C--AGGCC-T----A-----A-A-T-------------------T-----T------------------------------------------------------A-------C-----A----A-TGG--T-GA-T-G---TC------T--C-C----G-T--ATG-AG----TG----A--AA--T--A--T-T-C--T----C----------GAG---T-G-G---GA-----T--G-T---A-A-AAC---A---A-T----AA-AT-AATC
gi|26 : tggGGACCTG-GGT-T---A-G---A-----A-T-A--G----G--TC----C-T--C-AG------T--AT--CC--C------T-T-G-----C-----T-TG--T---C-A-------T------AAT-A----G------G---TG-A--C------T------A--T-------------T---A--G----T--T-----------C---------T--T-C---GG---------------A---T-G-A-G----------A--C-------------------------------------------A---T-C-C--C--G--------------------------------------------T--G-T----C-A--C--A---------G------------C--ACTGAGCAG--G--T-G-T-------GG----------C-----ACG-A--T----A----A-AG-A---T--C-C-C-----T--T-C-C--TG--C-T-CA---A-------A-GG-C---C--------------A---C-A--A---G-C--A---CT-G--A--G-----C-A------C--AAGCC-T----T-----A-A---------------------T-----T--------C-AC--A-----G---TC----C-TT---AA-----C-C-----C-A-------C-----A----A-TAA--A-AA-C-G---TC------T--C-G----A-T--TAG-AG----TG----A--AA--T--A--T-T-C--T----CA---------A-G---A-G-G---GA-----T--G-T---A-A-AAC---A---A-T----AC-AC-AA
gi|32 : GGATCCG-GGT-C---A-G---A-----A-T-A--T----A--TC----C-T--C-AG------A--AG--AC--C---T--T-T-T-----T-----T-TA--T---C-A-------T------AAA-A----G------G---CG-A--T------T--A-A-A--C-TG--G-----A-C---A--G----T--C-----------C---------T--T-T---GG---------------A---A-A-A-G----------A--C-----C--G---C-A--A----AA------AC--C-GA-T---G---T-A-C--C--G--------------------------------------------T--T-T----C-A--C--A----------------------------------------------------G----------C-----ACG-A--T----A----A-AG-A---C--C-C-C-----T--C-C-T--TG--C-T-CA---A-------A-GG-G---T--------------C--------A---G-A--G---AT-G--A--G-----C-A------T--ACGTC-T----c
gi|55 : tGGATCCA-GGT-T---A-G---A-----A-T-A--G----G--TC----C-C--A-AG------T--AT--CC--C------T-C-A-----C-----T-TG--C---T-G-------T------AAG-A----G------G---CG-A--C------T--A-A-G--T-GG--G-----G-C---A--G----T--C-----------C---------T--TAT---GG---------------A---T-G-A-G----------A--C-----T--G---C-A--A----AA------AC--C-GA-G---G---ccatgtgattgaaagattctagggctcaacgttaaacaatgtatgtaattataaacaacc
gi|8 : gGGATCTG-GGT-A---A-G---A-----A-T-A--T----G--TC----C-C--T-AG------T--A---CC--C---C--T-T-C-----C-----T-TG--T---C-G-------A------CCG-A----G------G---CG-A--ctttaataagtctacaag
gi|92 : gGGGTCCG-GGT-T---A-G---AAC---A-T-A--G--------------------AG------C--AT--AC--C---G--T-T-G-----C-----G-TG--C---C-gttgtaagaaaaaaaaacccagtggtaatcgtctaaggatataacaggaataagatagcaatggacgcgcagagcttggacggtccttcggatgagaccgcaattttaaaccgaggtcgagcatggaaataaattttgcagcccttcaatggcaatggtgacatatccatatatatgtgtgaaaacttctcaagtgggacgtacaacaatatgcaatcaa
gi|70 : gttttgaattcgtgGGGTCAGCGATAT---A-T---A-----A-T-A--G----T--CT----C-G--C-AG------C--AT--TC--C------T-T-G-----C-------TG--T---TTG-------T------AAG-A-----------G---TG-A--C------T--G-A-AATT-AG--G-----C-T---G--G----T--C---------------------C--T-C---GGA--------------A---T-G-A-a
gi|47 : ggccgtGGATCCG-GCT-T---A-G---A-----A-TAA--G----G--TCTAGTC-A--C-AG------C--AT--CCG-C---CATT-T-A-----C-----G-TG--T---
gi|116 : acccccccccccccccccccccccccccccctttcgagtcaaataacttgagtccgccagaatctgattacacatttgcataattgtttcgaacccgtGGACCTG-GGT-T---A-G---A-----A-T-A--G----G--TC----C-T--C-ta
gi|112 : cccatgaGGGTCCA-GGT-T---A-G---A-----A-T-A--G----G--TC----
gi|108 : ttcacacccgtggGGGTCTG-GGT-T---A-G---A-----A-T-A--A----G--TC----C-
gi|104 : ttgacatccgtgaGGGTCCG-GGT-T---A-G---A-----A-T-A--G----G--c
gi|60 : atcacccgtgcaacccgtggGGGTCCG-GGT-T---A-A---A-----A-T-A--G----G--T
gi|64 : aaagtaaaatttaaaacaaaaactcaatttttttaaatatcaataattatttagtatcaattctccagctgtggcgacccgtggGGGTCCG-GGT-T---A-G---A-----A-T-A--
gi|16 : aaaataagaaacacaaaacatgatagaacttcgaagtttcttataaatacttcattttcattccatcgcggtacccgtggGATCCG-GGT-T---A-G---A-----A-T-A--G----G--TC----C-T--C-AG------C--AT--CT--C---C--T-T-G-----C-----G-TG--T---C-G-------C------AAG-A----G------G---CG-A--C------T--G-A-A--T-GG--G-----G-T---G--G----T--C-----------A---------T--T-C---GG---------------A---T-G-A-G----------A--C-----C--G---A-A--A----AA------AC--C-GA-G---G---C-C-C--C--G--------------------------------------------T--G-T----C-A--C--A---------G------------C--A-------G--G--T-G-T-------GG----------C-----ACG-A--T----A----A-AG-A---T--C-C-C-----T--C-C-C--TG--C-T-CA---A-------A-GG-C---C--------------C---T-G--A---G-T--G---CC-G--A--G-----C-A------T--AGGCC-T----A-----A-A-T-------------------T-----T--------T-GC--A-----G---CC----C-TT---CA-----C-C-----G-G-------C-----A----T-TGG--T-GA-C-G---TC------T--C-C----A-T--ATG-AG----TG----A--AA--T--A--T-T-C--T----C----------G-G---T-G-G---GA-----C--G-T---A-A-AAC---A---A-T----AA-AT-AAT
gi|11 : GGTTCG-GGT-T---A-G---A-----A-T-A--G----G--TC----C-C--C-AG------C--AT--CC--C---C--T-T-G-----T-----G-TG--T---C-GGCTGTGTT------CAG-A----G------G---CG-A--C------T--G-A-A--T-GG--G-----A-C---G--G----T--C-----------C---------T--T-C---GA---------------A---T-G-A-G----------A--C-----C--G---G-A--A----AA------AT--C-GA-G---G---T-C-C--C--G--------------------------------------------T--G-T----T-A--C--A---------G------------C--A-------G--A--T-G-T-------GG----------C-----ACG-T--T----A----A-AG-A---T--C-C-C-----T--C-C-T--TG--C-T-CA---A-------A-GG-C---C--------------C---T-G--A---G-T--G---CC-G--A--G-----C-A------T--AGGCC-T----A-----A-A-T-------------------T-----T--------T-GC--A-----G---CC----C-TT---CA-----C-C-----G-G-------C-----A----T-TGG--T-GA-C-G---TC------T--C-C----A-T--ATG-AA----TG----A--AA--T--A--A-T-C--T----C----------GAG---T-G-G---GA-----C--G-T---A-A-AAC---A---A-T----A
gi|56 : aGGTCCG-GGT-T---A-G---A-----A-T-A--G----G--TC----T-C--C-AG------C--AT--CC--C---C--T-T-G-----C-----G-TG--T---C-G-------T------AAG-A----G------G---CG-A--C------T--G-A-A--T-GG--G-----G-C---G--G----T--C-----------A---------T--T-C---GA---------------A---T-G-A-G----------A--C-----C--G---C-A--A----AA------AC--C-GA-G---G---T-C-C--C--G--------------------------------------------T--G-T----C-A--C--A---------G------------C--A-------G--G--T-G-caa
gi|102 : GGTCCG-GGT-T---A-G---A-----A-T-T--T----G--CC----C-C--C-AG------C--AT--CC--
gi|14 : tacccttagaGTCCG-GGT-T---A-G---A-----A-T-A--G----G--TC----C-C--C-AG------C--AT--CC--C---C--A-T-G-----C-----C-TG--T---C-G-------C------AAG-A----G------G---CG-A--C------T--G-A-A--T-GG--G-----G-C---G--G----T--C-----------A---------T--T-C---GG---------------A---T-G-A-G----------A--C-----C--G---C-A--A----AA------AC--C-GA-G---G---T-C-C--C--G--------------------------------------------T--G-T----C-A--C--A---------G------------C--G-------G--G--T-G-T-------GG----------C-----ACG-A--T----A----A-AG-A---T--C-C-C-----T--C-C-C--TG--C-T-CA---A-------A-GG-C---C--------------C---T-G--A---G-T--G---CC-G--A--G-----C-A------T--AGGCC-T----A-----A-A-T-------------------T-----T--------T-GC--A-----G---CC----C-TT---CA-----C-C-----G-G-------C-----A----T-TGG--T-GA-C-G---TC------T--C-C----A-T--ATG-AG----TG----A--AA--T--A--T-T-C--T----C----------G-G---T-G-G---GA-----A--G-T---A-A-AAC---A---A-T----AA-AT-AATCA
gi|68 : GCCCG-TGT-T---A-G---A-----A-T-A--G----G--TC----C----A-AG------CA-ATG-CG--C---A--T-T-G-----CCAGTGG-TG--TA--C-G-------TTA----AAG-A----G------G---GG-A--C------T----A-A--T-GG--GTAATTG-C---G--G----T--C-----------A------------T-C---GG---------------A---
gi|15 : gtTCCG-GGT-T---A-G---A-----C-T-A--G----G--TC----C-T--C-AG------C--AT--CC--C---C--T-T-G-----C-----G-TG--T---C-G-------T------AAG-A----G------G---CG-A--C------T--G-A-A--T-GG--G-----G-C---G--G----T--C-----------A---------T--T-C---GG---------------A---T-G-A-G----------A--C-----C--G---G-A--A----AA------AC--C-GA-G---G---T-C-C--C--G--------------------------------------------T--G-T----C-A--C--A---------G------------C--A-------G--G--T-G-T-------GG----------C-----ACG-A--T----A----A-AG-A---T--C-C-C-----T--C-C-C--TG--C-T-CA---A-------A-GG-C---C--------------C---T-G--A---G-T--G---CC-G--A--G-----T-A------T--AGGCC-T----A-----A-A-T-------------------T-----T--------T-GC--A-----G---CC----C-TT---CA-----C-C-----G-G-------C-----A----A-TGG--T-GA-C-G---TC------T--C-C----A-T--ATG-AG----TG----A--AA--T--A--T-T-C--T----C----------G-G---T-G-G---GA-----C--T-T---A-A-AAC---A---A-T----AA-AT-AATCA
gi|41 : aTCCG-GGT-T---A-G---A-----A-T-A--G----G--TC----C-C--C-AG------C--AT--CC--C---C--T-T-G-----C-----G-TG--T---C-G-------T------AAG-A----G------G---CG-A--C------T--G-A-A--T-GG--G-----G-C---G--G----T--C-----------A---------T--T-C---GG---------------A---T-G-A-G----------A--C-----C--G---G-A--A----AA------AC--C-GA-G---G---T-C-C--C--G--------------------------------------------T--G-T----C-A--C--A---------G------------C--A-------G--G--T-G-T-------GG----------C-----ACG-A--T----A----A-AG-A---T--C-C-C-----T--C-C-C--TG--C-T-CA---A-------A-GG-C---C--------------C---T-G--A---G-T--G---CC-G--A--G-----C-A------T--AGGCC-T----
gi|6 : TTCG-AGT-C---A-G---A-----A-T-A--G----G--TC----C-C--C-AG------C--AT--CC--C---C--T-T-G-----C-----A-TG--T---C-G-------T------AAG-A----G------G---CG-A--C------T--G-A-A--T-GG--G-----G-A---G--G----T--C-----------C---------T--T-C---AA---------------A---T-G-A-G----------A--C-----A--G---G-A--A----AA------AC--C-GG-G---G---C-C-C--C--GTGTCACAGTAGGCGAGACCCCGTGTCACAGTAGGTGAGACCCCGT--G-T----C-A--C--A---------G------------C--A-------G--G--T-G-T-------GG----------C-----ACG-A--T----A----A-AG-A---T--C-C-C-----T--C-C-C--TG--C-T-CA---A-------A-CA-C---C--------------C---T-G--G---G-T--G---TC-G--A--G-----C-A------T--TGGTC-T----A-----A-A-TTTGCGAGCATTGGTCTAAAT-----T--------T-GC--A-----G---CC----A-TT---CA-----C-C-----G-G-------C-----A----A-TGG--T-AA-C-G---TC------T--C-C----T-C--ATG-AG----TG----A--AA--T--A--T-T-C--T----C----------GAG---C-G-G---GA-----C--G-T---A-A-
gi|40 : TCCG-GGC-T---A-G---A-----A-T-A--G----G--TC----C-T--C-AG------C--AT--TT--C---C--T-T-G-----C-----G-TG--T---C-G-------T------TAG------G------G---CG-A--C------T--G-A-A--T-----------------------------------------------------T-C---GG---------------A---T-G-A-G----------A--C-----C--G---C-A--T----AC------AT--C-GA-G---G---T-C-C--C--G--------------------------------------------T--G-T----C-A--C--A---------G------------C--A-------G--A--T-G-T-------GG----------C-----ACG-A--A----A----A-AG-A---T--C-C-C-----T--C-CTT--TC--C-T-CA---A-------A-GG-C---C--------------C---C-G--A---G-T--G---CC-G--A--G-----C-A------C--AGGCC-T----A-----A-ATT-------------------T-----T--------T-GC--A-----G---CC----C-
gi|93 : aTCCA-GAT-T---A-G---A-----A-T-A--G----G--TC----C-T--C-AG------C--A---AC--T---C--T-T-G-----T-----G-TA--T---C-A-------T------AAG-A----A------G---CT-A--C------T--
gi|94 : TCCA-GAT-T---A-G---A-----ATT-A--G----G--TC----C----A-AG------C--AA--CT--C---C--T-T-G-----T-----G-TA--T---C-A-------T------AAG-A----A------G---CT-A--C------
gi|17 : CCG-GGT-T---A-----A-----A-T-A--G----G--TC----C-C--C-AG------C--AT--CC--C---G--T-T-C-----C-----G-TG--T---C-G-------T------AAG-A----G------G---CG-A--C------T--G-A-A--T-GG--G-----G-C---G--G----T--C-----------A---------T--T-C---GG-------------------C-G-A-G----------A--C-----C--G---T-A--A----AA------AC--C-GA-G---G---T-C-C--C--G--------------------------------------------T--G-T----C-A--C--A---------G------------C--A-------G--G--T-G-T-------GG----------C-----ACG-A--A----A----A-AAGA---T--C-C-C-----T--C-C-C--TG--C-T-CA---A-------A-GG-----C--------------C---T-G--A---G-T--G---CC-G--A--G-----C-A------T--AGGCC-T----A-----A-A-T-------------------T-----T--------T-GC--A-----G---CC----C-TT---CA-----C-C-----G-G-------C-----A----A-TGG--T-GA-C-G---TC------T--C-C----A-T--ATG-AG----TG----A--AA--T--A--T-T-C--T----C----------GAG---T-G-G---GA-----C--G-T---A-A-AAC---A---G-T----AA-AT-AA
gi|18 : atggCCG-GGT-T---A-T---A-----A-T-A--G----T--TC----C-C--C-AG------C--AT--CC--C---C--T-T-G-----C-----G-TG--T---C-G-------T------AAG-A----G------G---CG-A--C------T--G-A-A--T-AA--G-----G-C---G--G----T--C-----------A---------T--T-C---GG---------------A---T-G-A-G----------A--C-----C--G---G-A--A----AA------AC--C-GA-G---G---C-C-C--C--G--------------------------------------------T--G-T----C-A--C--A---------G------------C--A-------G--G--T-G-T-------GG----------C-----ACG-A--T----A----A-AG-A---T--C-C-C-----T--C-C-C--TG--C-T-CA---A-------A-GG-C---C--------------C---T-G--A---G-T--G---TC-G--A--T-----C-A------T--AGGCC-G----A-----A-T-T-------------------T-----T--------T-AT--A-----G---CC----C-TT---CA-----C-C-----G-G-------C-----A----T-TGG--T-GA-T-G---TC------C--T-C----A-T--ATT-AG----TG----A--AA--T--A--T-T-T--T----T----------G-G---A-G-G---GA-----A--G-T---A-A-AAT---A---A-T----AA-AT-AATCAc
gi|20 : CCG-GGT-T---A-G---A-----AAT-A--G----G--TC----C-T--C-AG------T--AT--CG--C---C--T-T-G-----C-----T-TG--T---C-G-------T------AAG-AG---G------G---TG-A--C------T----A-A--T-GG--G-----G-C---G--G----T--C-----------T---------T--T-A---GG---------------A---T-G-A-G----------A--C-----C------G-C--A----AA------AT--T-GA-A---GT--T-C-T--T--G--------------------------------------------T--T-T----CAA--C--A---------G------------C--A-------G--G--TGG-T-------GA----------C------CG-A-------A----A-AG-A---T----C-C-----T--C-T-C--TG--C-T-CA---A-------A-GA-C---C--------------A---T-T--A---GCT--G---CC-G--A--G-----C-A------A--AGGCC-T----A-----A-A---------------------T-----G--------T-GC--A-----G---CC----C-TT---CA-----C-C-----G-G-------C-----A----A-TGG--T-GA-C-G---TC------T--C-C----A-T--ATG-AG----TG----A--AA--T--A--T-T----T----C----------A-A---G-A-A---GA-----C--G-T-----A-AAC---A---A-a
gi|28 : gaCCG-GGT-T---A-G---A-----A-T-A--G----G--TC----C-T--C-AG------TT-ATTACA--C---C--C-A-G-----C-----T-TG--T---C-G-------T------ATG-A----G------G---AG-A--C------T--A-A-A--T-GG--G-----G-T---G--G----T--C-----------C---------T--T-T---GG---------------A---T-G-A-G----------A--C-----C--G---T-A--A----AA------AT--C-AA-G---G---C-C-C--C--T--------------------------------------------T--G-T----C-A--T--G---------G------------C--A-------A--G--T-G-T-------TG----------C-----ACA-A--T----A----T-AG-A---T--C-C-C-----T--C-C-C--TG--C-T-TA---A-------A-GG-C---TG-------------T---T-A--A---G-T--G---CT-G--A--G-----C-A------T--AGGCC-T----A-----A---------------------------------------------------------------T---CA-----C-T-----G-G-------C-----A----G-TGG--T-CA-C-G---TC------T------------------------------A--AA-----A--T-T-C--T----T----------GAG---C-A-G---GA-----C--A-T---T-A-AGC---A---A-TACACAA-AT-AATCAacatatcaa
gi|52 : cCCA-GGT-T---G-G---A-----A-T-A--G----G--TC----C-C--CTAG------C--AT--CC--C---C--T-T-G-----T-----G-TG--T---C-G-------T------AAG-A----G------G---CG-A--C------T--G-A-A--T-GG--G-----G-C---G--G----T--C-----------C---------T--T-C---GT---------------A---T-G-A-G----------A--C-----C--G---C-A--A----AA------AC--C-GA-G---G---T-C-C--C--G--------------------------------------------T--G-T----C-A--C--A---------G------------C--A-------T--G--T-G-T-------GC----------C-----ACG-A-------A----A-Aat
gi|34 : CCG-GGT-T---A-G---A-----A-T-A--G----G--CC----C------AG------C--A---CC--C---C--T-T-G-----C-----T-TG--T---C-G-------T------AAG-A----G------G---CG-A--C------T----A-A--T-GG--G-----G-C---G--G----T--C-----------C---------T--T-C---GG---------------A---T-G-A-G-------------C-----C--G---C-A--A----AA------AC--C-
gi|3 : acCCG-GGT-TGAGA-G---A-----AAT-AT-G----G--TCG---C-T--C-AG------CTGGT--TC--C---C--G-T-G-----T-----G-TA--G---C-G-------TGTCTCAAAG-A----G------G---CGGA--C------T--C-A-A--TAGG--G-----G-C---G--A----G--CTTA--------A---------T--T-G---GG---------------A---T-G-A-A----------G--C-----C--G---G-A--AG---AA------AC--C-GA-G---GA--G-C-C--C--G--------------------------------------------T--GGT----C-A--T--AT--------G------------C--A-------GAGG--T-G-TTG-----AG----------C-----ACG-AATC----A----ATAG-A---T--C-C-C-----T--C-C-T--AGGAC-T-GA---A-------A-GGAT---C--------------CGCGT-G--A---G-CTAG---CC-GTGA--G-----C-AGA----T--AGGCT-T----A-----A-T-T-------------------T-----T--------T-GCG-A-----G---TT----C-CT---TG-----C-------G-G-------C-----A----T--GG--T-GA-C-G---TCA-----T--C-C----ATT--ATG-AG----TG--------A--T--A--C-T-C--T----CTTCGGGAGTTG-G---T---G---GA-----CGTG-T---G-A-AAC---A---ATT----AA-AT-ttttaaaggccatgagcgccgagcaaaggcctaaatctgcagcccttcaccggcaatggtgatgtctccatatggatgaaatattctcaagagggacgtaaaacgacatataatca
gi|38 : ctggtggggttccgctaCCG-GAT-T---A-C---A-------C-A--A----G--CC----C-C--C-GG------C--AG--TA--C---C--T---G-----C-----T-TG--T---C-G-------TC-----AAG-A----------------------------T----A-A--T-G-----------C---T--G----T--C---------------------T--T------G---------------T---C-G-C-G----------A--C------------G-A--A----AA------AC-----------G-------C--C--G--------------------------------------------C--A------A-A--C--G---------G------------C--A-------G-----T-G-T-------G-----------C-----ACG-A-------A----A-GA-AGACT--C-C-C-----T--CTC-C--TG--C-T-CA---A-------AAGG-C---C--------------A---T-A--A---A-T--G---CC-G--A--------C-A------T---GGCC-T----G-----A-A-T-------------------T-----T--------C-AC--A-----G---Ctgtaatacaat
gi|39 : tacgaacctgtgaagatcgCG-GGT-T---T-G---A-------T-A--G----A--TC------T--C-AG------T--AA--CCG-C---C--T-------------------------C-G-------T------AAG-AT---G------G---CG-A--C------T--A-A-T--C-GG--A-----G-C---G--GCTCCT--C-----------A---------T--A-C---GG---------------A---T-A-ACG----------A--G-----T--A---G-A--A----AACAT---AC--C-GA-G---G---C-C-CA-C--A--------------------------------------------T--G-T----T-ATCC--A---------A------------A--A-------A--G--C------------G----------A-----ACG-A--T--------------A---T--C-C-C-----T----C-C--TG--CTT-CA---A-------A-A---------------------C---T-GGAA---G-T--GA--CC-A--G--G-----C-T------A--AGGCC-T----A-----T-A-T-------------------T-----T--------gtt
gi|72 : cgtgggaatCG-GGT-T---A-GTACA-----ACT-G--G----A--TC----C-TT-C-AGA-----T--AT--CC--CTTAC--T-T-G--------------G--T---T-G-------T------AAG-AG---G------G---CG-A--A------T----A-A--T--A--G-----G-CTAAG--A----T--C---------------------T--T-A---GG---------------A---T-G-A-
gi|2 : gaG-GAT-T---A-G---ATCTTTA-T-G--G----GCTTT----T-T--C-AG------G--AT--CC--CT--C--T-C-G-----T-----G-TG--T---C-GGTT----T------AGG-A----GTTCGTAGTCTCG-A--AG-----T--G-A-G--T-GA--G-------C---G--G----TATT-----------A---------C--T-CTTGGG---------------C---T-G-A-C----------G--CATACTC--GTGTG-A--T----AA------ACA-C-GATG---G---T-C-T--C--GG-------------------------------------------T--G-T----C-A--CC-A---------G------------C--A-------G--G--T-G-T-------GGGCGAAAGAAGC-----ATA-G--T----A----A-GG-A---TGAT-C-C-----TG-C-C-C--TGG-C-T-CATAAG-------A-GG-C---CTT------------C---T-G--A---G-T--GGTACC-A--A--T--------------T--AGGCC-T----ACTGTTA-A-T-------------------T-----TCCGTTT--T-GC--A-----T---GC----C-TT---CA-----C-C-----G-A-------T-----A----T-TGG--T-GA-A-T---TC------T---------A-A--GTT-GG----TG----A--AA--T--A--T-T-C--T----C----------GAG---T-A-G---GATATCGC--G-T---ATA-AAC---A---A-T----AA-AT-AATa
gi|4 : gtggggagttcgaaG-GGT-T---A-G---A-----A-T-A--GTAGGA--TC----CGT--C-AG------C--AG--CC--T---CGGTGT-G-----C-----G-TG--TTG-C-G-------T------ACG-A----GCG----G---CG-AGGC------T--GCA-A--T-GG--G-----G-AA--G--G----TG-C-----------A---------TG-T-C---GGGGATGTCCGCGTGCCA---T-G-A-GGAGCGTGGATA--C-----A--G---G-A--A----A-----------C-GA-A---G---TGCGC--C--G--------------------------------------------C--G-TTGTCC-A--C------------G------------C--A-------G--G--T-G-G-------TG----------C------CG-A--A----A----A-AG-A---T--C-C-TCGAGAT--C-C-CGGTG--C-G-TA---AG------A-GG-CG--C--------------C---T-G--A---GGT--G---CC-G--A--GAGA--C-A------T--AGGCT-A----G-----A-A-TAA-----------------G-----T--------T-GC--A-----G---CG----C-CTGTGCA-----A-C-----G-G-------C-----A----G-ATG--T-GA-C-G---TC------T--CGC----A-TAAAGG-AG----TG--------A--T--A--G-T-TGGT----C----------G-G---T-G-G---AAACGCTC--G-T---A-A-
gi|44 : G-GGT-T---A-G---A-----A-T-T--G----G--CG----C----C-AG------C--AC--CTAAT---T--T-C-G-----C-----C-TG--T---C-G-------T------AAGTA----G------G---CG-A--C---------G-A-A--T-GG--G-----G-C------G----T--C-----------A---------T--T-C----G---------------A---T-G-G---------------------C--GT--G----------A------AC--C-GA-A-----------C--C--G-----------------------------------------------A-T----C----C--A---------G------------C--A-------G--G--T---T-------A-----------------------------A----A-AA-A---G--G-A-C-----C--C-C-C--CG----T-CG---A-------A-G------C--------------C---T-G--A---G-T--G---gcatatataa
gi|76 : ggagtcacgaG-GGT-T---A-GG--A-----A-T-A--G----AA-TC----C-TTCC-A-------C--AT--CC--C------T-T-GTAA--C-----G-TGA-T---C-G-------T------AAG-A-----------G---CG-A--C------TCGG-A-A--T--G--G-----G-C---G--G----T--gattttccaagtgggacctaa
gi|22 : ccgtggagatcga-GGT-T---A-G---A-----A-T-A--G----G--TC----C-T--C-AG------C--AT--CC--C------T-T-G-----C-----G-TG--T---C-G-------T------AAG-A----G------G---CG-A--C------T--G-A-A--T-AG--G-----G-C---G--G----T--C-----------A---------T--T-C---GG---------------A---T-G-A-G----------A--C-----C--G---G-A--A----AA------AT--C-GA-G---G---G-C-C--C--G--------------------------------------------G--A-T------A--C--A---------G------------C--A-------G--G--T-G-T-------GG----------C-----ACG-A--T----A----A-AG-A---T--C-C-C-----T--T-C-T--TG--C-T-CA---A-------A-GG-C---C--------------C---T-G--A---G-T--G---CC-G--A--G-----T-A------T--AGGTC-T----A-----A-A---------------------T-----T--------T-GC--A-----G---CC----C-TT---CA-----C-C-----G-G-------C-----A----T-TGG--T-GA-C-G---TC------T--C-C----A-T--ATG-AG----TG----A--AA--T--A--T-T-C--T----C----------A-G---T-G-G---GA-----C--G-T-----A-AAC---A---A-T----AA-AT-AATCA
gi|25 : -GGT-T---A-G---C-----A-A-A--G----G--TC----G-C--C-AG------T--A---CC--C---C--T-G-G-----C-----T-TG--T---C-G-------T------AAG-A----G------G---CG-A--C------T--A-A-A--T-GG--G-----GGC---G--G----T--C-----------C---------C--T-A---GG---------------A---T-G-A-G----------A--C-----C--G---T-A--A----AC------AT--T-GA-T---G---C-C-C--C--T--------------------------------------------T--G-T----C-A--C--A---------G------------T--A-------G--G--T-G-T-------GG----------C-----ACA-A--T----A----A-AG-A----------------T--C-C-C--TG--C-T-CA---A-------A-GG-C---T--------------G---T-A--A---G-C--G---CC-G--G--G-----C-A------T--AGACC-T----A-----A-A-T-------------------T-----T--------T-GC--A-----G---CCCTGGC-TT---CA-------C-----G-G-------A-----A----A-TGG--T-AA-T-G---TC------T--C-C----A-TA-ATG-AG----CA----A--AA---------------------------------------------GA-----C--GCT---A-ATAAC---A---A-T----AT-AC-AATCAa
gi|19 : a-GGT-T---A-G---A-----A-T-A-------G--TC----C-TC-C-AG------T--AC--CC--C---T--T-T-C-----T-----T-TT--T---T-G-------T------GAG-A----G------G---C-----C------T--A-A-A--T-GG--G-----G-G---GC-G----T--C-----------C---------T--T-C----G---------------A---T-G-A-G-------------C-----C--A---C-A--A----A-----------C-GA-G---T---C-C-T--C--G-----------------------------------------------G-T------A--C--A---------GA-----------C----------------T-G-T-------GG----------------AC--A--T----A----A-AG-A---T--C-CTC-----T--C-C-T--TG--C-T-CAT--A-------A-GG-C---CAAAGCTGCTCAAGAC---T-A--A---G-T--G----C-A--A--G-----C-A------T--AGGCC-T----A-----A-A-T-------------------T-----T--------T-TG--A-----A---CC----C-GT---CA-------C-----G-G-------CA----A----A-TGG--T-GA-C-G---TC------T--C-T----A-T--ATC-AG----TG----A--GG-----A--T-T-T--C----A----------A-G---T-G-G----------C--A-T---T-A-AAT---AGATA-T----AT-AC-AATCa
gi|5 : t-GGT-T---AAG---A-----A-T-AACG----G--TC----C-TA-C-GC------C--AC--CT--C---CAGT-G-G-----C-----GGTGAAT---C-GAG-----T------AAGTA----G------GA--CG-A--C------T--G-ATAC-T-GG--G-----G-CT--GCCG----T--C-----------A---------C--T-C---GAGGTA-----------A---T-G-A-G----------A--C-----CC-G---G-A--A----AATA----AC--C-GA-G---G---T-A-CTAC--A--------------------------------------------T--G-T----C-A--C--ACA-------G------------C--A-------A--GA-T-GAG-------GG----------C-----ACG-A--T----A----A-AG-G---C--C-CAT-----T--T-C-C--AG--C-T-TA---A-------A-AG-CGCGC--------------C---T--------G-T--G---CCAG--A--T-----A-A------TA-AGGCC-T----AT----A-A-T-------------------TA----T--------T-GC--AT----G---GC----T-AA---CA-----C-CACGGAG-G-------A-----A----C-AGGGTT-GA-T-G---TC------T--C-CCATAA-T--AGA-AGT---CG----A--AA--T--A--T-T-C--TGC--C----------G-GGTAT-GAG---AA-----C--G-T---T-A-AAC---A---A-T----AA-CTCAATCA
gi|1 : GC-T---A-G---A-----A-T-AC-G----A--TC----C-T--C-AGTGAGCCC--AT--GC--C---T--T-T-G-----C-----T-TG--T---CCG-------C------ACG-A----G------G---CG-A--G------T--ATA-A--T-CG--A-------C---G--G----C--CCT---------G---------T--C-C---GT---------------A---TCG-ACG----------A--C-----A--A---G-G--A----AAGATAAGAC--TTGA-G---GCTGT-G-C--C--A--------------------------------------------T--G-T----C-A--C--A---------G------------CAAA-------G--G--A-G-T-------GA----------------ACG-A--T----A----A-AG-AAT-T--C-C-CT----T--C-C-C--AGC-C-C-CA---A-------A-Gacctca
gi|29 : ttacacaagccattatcactaccgtgaagaggctaccagaa-T---A-G---A-----A-T-A--G----G--TC----C-A--C-AG------T--AC--CC--C---C--T-C-G-----C-----T-TG--T---C-G-------T------AAG-A----G------A---CG-A--C------T--------------------------------------------------A---------T--T-C---GG---------------A---T-G-A-G----------A--C-----C--A---C-A--A----AA------AC--C-GA-A---G---T-C-C--C--G--------------------------------------------T--G-T----C-A--C--A---------G------------C--A-------G--G--T-G-T-------GG----------C-----ACG-A--T----A----A-AG-A---T--T-C-C-----T--C-C-C--TG--C-T-CA---A-------T-GG-T---C--------------A---T-G--A---G-C--G---CC-G--A--G-----C-A------T--AGGCA-T----A-----------------------------T-----T--------T-GC--A-----G---CC----C-TT---CA-----A-C-----G-GC------C-----A----A-TGG--T-GA-C-G---TC------T--C-C----A-T--ATG-AG----TG----A--AG--T--A--T-T-C--T----T----------GAG---A-G-G---GA-----T--G-T---A-A-AAT---A---atcgatatacgagcttcgcgacaaataagaaaaattggcacctcttttaccgcgcgaaatgagaaatgttatcacgcatacggactgaaacattgatcaacgtcgggcctagcaacaattaaaacaatcaatc
gi|58 : -T---A-G---A-----A-T-A--G-------TC----C-TG-C-AAGT----C--AT--CC--C---C------G-----C-----G-TG--T---C-G-------T------AAG------------------G-A--T------T-----------------------C---G--G----T--T-----------------------------------------------A---T-G-A-G----------A--C-----C--G---GCC--A----AA------AC--A-GA-G---G-----C-C--C--G--------------------------------------------T--A-T----tacaaccaacaaca
gi|24 : acccgtggggatatccggaattaagaatagaa---A-----A-T-A--G----G--TA----C-T--A-AG------G--A---CC--T---A--T-T-AAAGACC-----T-TG--T---T-G-------T------AAG-A----G------A---TG-A--C------G--G-A-A--T-GG--G-----G-T---G--G----T--C-----------G---------T--C-C---AG---------------A-----G-A-G----------A--C-----gtt
gi|67 : -----A-T-A--G----G--TC----C-T--C-AG------C--AT--CT--C---C--T-T-G-----C-----G-TG--T---G-G-------T------TAG-G----G------G---CG-A--C------T--G-A-A--T-----------------------------------------------------T-C---TG---------------A---T-G-A-G----------A--C-----C--G---C-A--T----AC------AC--C-GA-G---G---T-C-C--C--G--------------------------------------------T--G-T----C-A--C--A---------G------------C--A-------G--G--T-G-T-------tnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngggacgttaaacaataaataattgat
gi|7 : -A--G----G--TG----C-C--C-AG------CC-AT--GC--C---CGGT-CAG-----C-------TG--G---C-G-------G------AAG-AATGAG------G---TA-A--CGC----T--G-A-A--T-AG--G-----GTC---G--T----T--CCGAGCCTGCCTA---------TGAT-C---GG---------------A---T-G-C-GGA--------A--C-----CCGG---G-A--A----AA------AC--C-GA-C---G-----C-C--C--G--------------------------------------------T----T----C-A--C--A---------G------------C--A-------C--G--C-G-TCCCATCTGG----------CCACTGACG-A--CTATCA----A-CA-C---T--A-C-C-----TTCC-C-C--CG--C-TGCA---A-------A-GG-C---C--------------C---C-G--ACTCG-T--G----C-G--A--G-----CGA------T--AG--C-G----A-----A-A-TAG-----------------T-----T--------C-GC--A-----T---CA----T-CC---CATT---C-C-----G-G-------G-----AAGTGC-TGG----GA-C-G---TT------T--C-C----A-G--AGG-AG-----G----A--AA-----G--T-C-C--TA---C--------------------G---GA-----C--G-A---A-A-AACAGAA---A-T----AA-GC-AATCA
gi|107 : -T--C-AG------A--AT--CC--T------T-T-G-----C-----G-TG--T---C-G-------T------AAG-A----C------G---CA-A--C------T--A-A-A--T-
gi|86 : G------T--AT--CA--C---C--T---A-----C-----G-TG--T---C-G-------C------AAG-A----G------G---CG-A--T------T--T-A-A--T-GA--G-----
gi|51 : gttacacacccgttgggatccgg--C---C--T-T-G-----C-----G-TG--T---C-G-------CCGTACAAAG-A----G------G---CG-A--CGTCTCGT--A-A-A--T-GC--G-----A-CCATG--C----T--C-----------AGCCAGTCTCT--T-CA--GG---------------ACGTT-G-A-G----------A--C-----C--G---A-A--A----AA------ACGGC-GA-GTGAG---C-C-C--CTGA--------------------------------------------T--G-T----C-A--C--A---------
gi|63 : ttt---C--T-T-G-----T-----GGTT--T---C-A-------G------AAG-T----G------A---TG-G--C------T------A--T-TG--G-----G-T---T--G----T--T-----------A---------T---------G---------------A---T-G-A-G----------A--C-----C--T---C-A--A----AA------AT--C-AA-G---G---T-T-C--C--G--------------------------------------------T--G-G----C-A--C--A---------GTAAACATCGGACC--A-------G--G--T-G-T-------GA----------C-----ATG-A--tgaaggcag
gi|46 : --T-T-G-----T-----G-TA--TGAAC-G-------C------AAG-A----G------GG--CG-AA-C------T--GGA-A--T-GAAAG-----T-C---G--G-------------------A---------TG-T-C---GA---------------C---T-G-A-G----------AAGCAG---C--A---A-A--A----GA------ACA-C-GA-GT--G----------C--G--------------------------------------------TAAG-T----C-A--C--A---------G------------C--ATG-----G--A--T-G-T-------GG----------C-----A-G-A--A----A----A-AG-A---T--CAA-C-----T--CTC-C--TG--C-T-CA---ATAATGAGA-GG-C---C--------------T---G-G--AG--G-T--G---CA-G--AC-G-----C-A------
gi|53 : -----C-----G-TG--T---C-G-------T------AAG-A----G------G---CG-A--A------T--G-A-A--T-GG--G-----A-C---G--G----C--C-----------A---------T--T-C---GG---------------A---T-G-A-G----------A--C-----C--G---C-A--A----AA------AC--C-GA-G---G---T-C-C--C--G--------------------------------------------T--G-T----C-A--C--A---------G------------C--A-------G--G--T-G-T-------GG----------C-----ACG-A--A----A----A-AG-A---T--C-T-T-----T--C-C-C--TG--C-T-CA---A-------A-GG-C---C--------------T---T-G--A---G-A--G---CC-G--
gi|35 : ------AAG-A----G------G---CG-A--C------T--A-A-A--T-CG--G-----G-C---G--G----T--C-----------C---------T--T-T---AG---------------A---T-G-A-G----------C--C-----C--A---C-A--A----AA------AC--T-GA-G---G---C-T-A--C--A--------------------------------------------T--A-T----T-A--C--A---------G------------C--A-------T--G--T-G-C-------GG----------T-----ACG-A--T----A----A-AG-G---C--C-C-A-----T--C-T-A--AG--C-T-TA---A-------A-AG-C---C--------------C---T-A--A---G-T--T---AC-A--A--A-----C-A------T--AGGCC-T----A-----A-A-G-------------------T-----T--------T-GC--A-----G---CC----C-CC---TA-----C-C-----G-A-------C-----A----A-TGG--T-GT-C-GC--TC------T--C-
gi|23 : gttgagatcgggtcagtactactagcttggta--G-A-T--T-GG--G-----G-C---G--T----T--C-----------C---------T--T-C---GG---------------A---T-GTA-G----------A--C-----T--G---G-A--A----CA----------C-TA-G---G---T-CTC--T--G--------------------------------------------T--GTT----C-A--T------------G------------C--A-------G--GGTT-T-T-------GG----------C-----ga
gi|8 : aaataggtccagcaatgcccgtttggtctcgtcttggtttacatattcggtaaG--G-----A-C---G--G----T--C-----------C---------T--T-C---GG---------------A---T-G-A-G----------A--C-----C--G---C-A--ATTTTAA------AC--C-GA-G---G---T-C-taatatgtttattttcagtttcttccttccgctttaattagtttgcgtgagtgcctgtgctgtgtttttgttctttcaccggcatgatgagttctgatcatatgatgatattctcttgtggggc
gi|37 : gggatctgggtaagaatatgtccctagtaccccttccttgtcgaccgaggcgagttgtaagaaaaaaaaacccagtggtaatcgtctaaggatataacaggaataagatagcaatggacgcgcagagctt---G--G----T--C-----------A---------T--T-C---GG---------------A---T-G-A-G----------A--C------------G-A--A----AA------AC--C-GA-G---G---T-C-C--C--G--------------------------------------------T--G-T----C-A--C--A---------G------------C--A-------G--GT-T-G-T-------GG----------C-----ACG-A-------A----A-AG-A---T--C-C-T-----C--C-C-T--TG----T-C----A-------A-GG-C---C--------------C---T-G--A---G-T--gagcatggaaataaattttgcagcccttcaatggcaatggtgacatatccatatatatgtgtgaaaacttctcaagtgggacgtacaacaatatgcaatcaa
gi|118 : ---------T--T-C---GG---------------A---T-G-A-G----------A--C-----C--G---C-A--A----AA------AC--C-GA-G---G---T-C-ccataccacattaagtatatctcacgaggtatatcaagatcaatgactcaaattcaggtatattataccataagtagagcttgtggatgtgttta
gi|54 : --G--------------------------------------------T--G-T----C-A--C--A---------G------------T--A----------G--T-G-T--------G----------C-----ACGAA--T----AAATTA-AA-A---T----C-C-----T--T-C-C--TG--C-C-CA---A-------A-GG---------------------------------------------------G-----C-AC-----T--AGGTC-T------------A-T-------------------T-----T--------TGGC--A-----G----C----C-TT---TA-----C-T-----G-T-------C-----A----T-GTG--T-GA-C-----------------------------TG-AG----TG----A--AA--CA-A--T-T-C--T----
gi|31 : cgatgccactg--G-T----C-A--CCCA---------G------------C--A-------G--G--T-G-T--------G----------T-----GCG-A--C----A----A-GA-AAC-T--C-T-C-----A--C-C-C--TG--C-G-CA---A-------AGGG-C---A--------------G---T-AT-A---G-C--A---CG-G--A--T-----CAA------C--AGACC-T----A-----ACA---------------------------T--------T-GC--A-----GTATCC----G-TT---CAAACAGT-C-----A-GCTA----C-----G----T-CGA----GG-T-G---TC------A--C-C----A-T--ATC-AA----TG----A--AA--TTAA--A-T-C--T----CGA--------G-G---TCG-G---AA-----C--G-
gi|45 : gtgtgactgatagaacggtcttttaataacaaggtccttctaaa-A--C--A---------G------------C--A-------G--G--T-A-T-------GG----------C-----ACG-A--T----A----A-AG-A---C--C-C-C-----T--T-C-C--TG--C-T-GG---A-------A-AG-C---C--------------A---T-G--G---A-C--A---TT-G--A--G-----C-A------C--AGGCT-T----A-----A-G---------------------T-----T--------T-GT--G-----G---CC----C-TT---CA-----C-C-----A-G-------C-----A----A-TGG--T-GATT-G---TC------T--C-T----A-T--ATC-AG----TG----A--AA--T--A--T-T-C--T----CA---------A-G---A-G-G---GA-----C--T-T---A-A-AAC---A---G-T----attcgttattgaataataacaacca
gi|50 : --A-------G--G--C-G-TT------GG----------C-----ACG-C--T----A----A-CG-A---A--C-C-C-----T--C-G-C--TG--C-TACA--------------G-C---C--------------C---T-G--A---G-T--G---CT-A--A--G-----C-A--------------------------------------------------T-----T--------T-GT--G-----G---TA----T-TC---CA-----C-C-----T-A-------C-----A----G-CTA--C-AA-T-G---TC------T--T-A----A-T--ATG-AG----TG----A--AA--G--A--T-C-T--T----T----------G-A---C-A-G---AA-----C--G-T---A-A-AAC---A---A-ttacaaccaacc
gi|65 : --T-A-T-------GG----------C-----ACG-A--T----A----G-AG-A---A--C-C-T-----T--T-T-C--TG--C-C------A-------A-GT-C---C--------------C---T-G--A---G-C--G---CC-T--------------------T--ACGTCAT----A-----A-----------------------T-----T--------A-GT--G-----G---AA----C-TT---TG-----T-C-----T-G-------T-----AG---C-TGG--T-GA-T-G---TC------T--C-T----A-T--aca
gi|48 : a-G-T-------TG----------C-----ACG-A--T----T----C-AG-A---A--C-C-C-----T--G-G-C--TG--C-T------A-------C-GG-C---C---------------------------G-T------------A--G-----A-A------TC-AGGCC-T----C-----G-A-T-------------------TAATATT--------T-CT--A-----G---CA----T-TT---CA-----C-CTAA--A-G-------C------------TGG--T-AA-C-G---AA------T--C-T----A-C--AAG-AA----TG----A--AA--T--A--T-T-C--T----cgaga
gi|33 : -T-------GG----------C-----ACG-A--T----G----A-AG-A---A--C-C-T-----T--C-A-C--TG--C-T------A-------C-GG-C---C--------------C---T-G------G-T--C---CC-C--AT-G-----C-A------TACAGGTA-C----G-----T-A-T-------------------T-----TCTCATACAT-GC--ATTTTGG---TA----C-TT---CA-----C-CTATAGA-G-------CTCCCAA----T-TGC--T-TA-C-G---TT------T--T-A----A-A--ATG-AGT---CGGTGCA--AA--T-----T-T-C--T----C----------A-A---A-C-A---GA-----C--G-T---A-A-AACA--A---A-C----AA-A--AACCAttaagggtccattcaaaccaacataccaaacaaaa
gi|13 : gcgcG----------C-----ATG-A--T----A----A-AG-A---A--C-T-C-----G--C-T-T--TG--C-TACA--------------G-C---C--------------T---T-G--A---A---------C-G--A--AAGTCAT-A------T--AGGTC------A-----A-A-C-------------------T-----T--------C-G---A-----G---CTA---C-TT---CA-----A-A-----GTA-------C-----AA---T-TGG--T-GT-C-----TCAGAAATT--C-C----AGT--ATG-AA----TG----T--TG--T--A--A-T-G--T----T----------G-GA--T-G-A---GA-----C--G-T---A-A-AAC---A---G-C----AA-Aaacaaaacagtctttgattataaatcattttggatt
gi|73 : ggagataatggagaatgtcacgtgacttttaacagtcatactttgcgtca----A----A-AG-A---T--C-C-C--------C-C-C--T---C-T-CA---G-------A-GG-G---A--------------A---T-A--A---G-C--T---CT-A--A--G-----CGA------T--AGGTC-TC---A-----A-A-T-------------------T-----T--------T-GC--AG----G---CC----C-TT---CA-----CTC-----A-G-------C-----A----A-TGG--T-Ggacactaaatacttgtaaattagcattatgtgtttccagttcggacgcacgggcaatttattt
gi|49 : gaaa-A---T--T-C-C-----T--T-G-T--TG--C-T------A-------C-GG-C---T--------------C---T-G--A---G-T--G---TC-A--T--A-----C-A------G--AAGTC-T----G-----A-A-TCTGAA--------------T-----T--------T-AT--A-----------------TT---TA-----C-A-----G--------------------T-TGA--T-TG-C-T---TC------T--T-T----A-T--ATG-AGTTATCG----A--TA--A--A--T-TAT--T----C----------A-A-----G-G---GA-----C--GTT---A-A-ATC---A---A-T----GA-A
gi|78 : -C-C-----T--C-C----TG--C-T-CA---A---------GG-C---C--------------A---TAG--A---G-C--G---TCTG--A--G-----C-A------T--AGACC-G----A-----A-A-T-------------------G-----T--------T-GC--A-----G---CT----C-TT----A-----C-C-----G-G-------C-----A----T-gcaaaatc
gi|34 : gat-T-TA---A-------A-GG-C---C--------------A---T-G--A---G-C--G---CC-G--A--G-----C-A------A--AGGCC-T----A-----A-A-T-------------------C-----T----------GC--A-----G---CC----C-TT---CA-----C-C-----G-G-------C-----A----A-TGG--T-GA-T-G---TC------T--C-C----A-T--ATG-GA----TG----A--AA--T--A--T-T-C--T----CA---------A-G---A-G-G---GA-----C--G-T---A-A-AAC---G---A-C----AT-AT-AATCAgttaaccgtcc
gi|82 : acccgggttagaataggcccagcaccccttgcttgtcgtaagaggcgactaatggggcggtccttcggatgagccgcaaaaacctt-T-CT---A-------A-GG-C---C--------------A---T-G--A---G-T--G---CC-G--A--G-----C-A------T--AGGCC-T----A-----C-ATT-------------------T-----T--------T-GTTAA-----G---CC----C-T
gi|36 : taaataatcatttaa-GA-C---C--------------C---T-G--A---G---------C-G--AATG-----C-ATACATGT--AGAAC-A----A-----A-C-T-------------------TA----T--------T-GT--G-----G---TA----C-TT---CG-----C-CTATA-G-A-------C-----A------CGA--T-GA-C-G---TT------T--C-A----A-T--AT--AG----CG----T--AG--A--G--T-G-C--T----C----------A-AAC-T-G-G---AA-----C--A-T---A-A-TAA---G---A-T----GA-AC-AATCA
gi|8 : cgacgtaggaaccttactgttgt--------------C---C-G--A---G----G---TC-G--A--G-----C-A------T--GGAAA-T----A-----A-A-T-------------------T-----T--------T-GC--A-----G---CC----C-TT---CA-----A-T-----G-G-------C-----A----A-TGG--T-GA-C-A---TA------T--C-CATATA-T--ATG-TG----TG----A--AA--A--C--T-T-C--T----CA---------A-G---T-G-G---GA-----C--G-T---A-C-AAC---A---A-T----AT-GC-AATCAaaagaaatattagtttagatccataaagaatttcagatt
gi|106 : gggatctgggtaagaatatgtccctagtaccccttccttgtcgaccgaggcgagttgtaagaaaaaaaaacccagtggtaatcgtctaaggatataacaggaataagatagcaatggacgcgcagagcttggacggtccttcggatgagaccgcaattttaaa---G-T--G---CC-G--A--G-----C-A------T--AGGCC-T----A-----A-A-G-------------------T-----T--------T-GC--A-----G---TC----C-CT---CA-----C-a
gi|61 : ---CT-G--A--A-----C-A------TT-AGGA--T----A-----A-A-T-------------------T-----T--------T-GC--A-----G---GC----CATT---CA-----C-C-----G-G-------C-----AT---T-TGG--TGGA-C-G---TC------T--C-CA---A-T--TTGAAG----TT----G--AA--T--A--T-TCC--T----C----------A-A---T-G-G---AG-----C--T-G---A-A-AAC---------T----AA-A
gi|81 : gagac--A--G-----C-A------T--AGCCC-TTTATA-----A-A-TGT-----------------T-----T--------T-GC--AC----G---CCTCC-C-TT---CC-----A-C-----G-G-------C-----AA---TATGG--T-GA-C-G---TC------T--C-T----A-
gi|71 : CT-T----A-----A-A-T-------------------T-----T--------T-AT--A-----G---CC----C-TT---CA-----C-C-----G-C-------C-----A----A-TAA--T-GA-CAG---TT------T--A-C----A-T--AT---------------------C--A--T-T-C--T----C----------G-A---G-A-G---GA-----atc
gi|66 : C-T----A-----A-----------------------------T--------T-GC--A-----G---CC----T-TT---CA-----C-C-----G-AACAGCTCC-----A----T-TAG--T-GA-A-GATCTC------T--C-A----A-T--ATG-AATT--CG----A--AA--A--AGTT-T-C--T----CTA--------A-G---T-G-G---GA-----C--A-T---aaatgaaagtttaattacaaccaac
gi|80 : -A-T-------------------T-----T--------T-GC--A-----G---TC----C---------------------------------------------GG--T-GA-C-G---TC------T--T-C----A----GTG-AA----AA----A--AA--A--A--A-T-C--T----T----------GAG---T-G-G---GA-----G--G-T---T-A-AAC---A---A-T----gtctaataaaca
gi|59 : -T-------------------C-----T--------T-GC--A-----G---GA----C-TT---TA-----C-C-----T-A-------C-----AAA--T-TC---T-GA-C-G---TC------T--T-A----A-T--ATG-TC----TG----A--AA--A--A--T-T-C--T----C----------C-A---A-G-A---GA-----T--A-T---G-A-AAC---A---A-tttcaacaaacc
gi|23 : cgcatatctcagtacagtcagg-T-------------------T-----T--------T-GT------------TC----T-TT---CA-----C-C-----G-G-------C-----A------TGA--T-GA-G-T---TC------TGAT-C----A-T--ATG-A-----TG--------A--T--A--T-T-C--T----CT---------T-G---T-G-G---GG-----C--acacaaactaaac
gi|84 : aaataggtccagcaatgcccgtttggtctcgtcttggtttacatattcggtaagattggggcgttccttcggatgtagactggaacactaggtctctgtgttcatgcagggttttggctaatatgtttattttcagtttcttccttccgctttaattagtttgcgtgagtgcctgtgctgtgtA-----C-C-----T-A-------C-----AG---T-TTG--T-GC-C-A---TC------T--T-A----A-T--ATG-AG----TG----A--AA--A--A--T-T-C--C----C----------C-A---A-C-G---AA-----A--G-T---C-A-AAC---A---A-
gi|83 : -----A----T-TGT--T-GA-T-G---TC------T--T-A----G-A--ATG-AG----TG----A--AA-----A--TCT-T--T----C----------G-AA--T-A-A---AA-----C--G-T---A-A-AAC---A---A-C----GA-AT-aca
gi|85 : -TGG--T-GA-T-T---TC------T--G-A----G-T--ATG-AG----CG----A--CA--A--A--T-T-G--T----C----------G-A---G-G-T---GA-----T--G-T---A-A-AAC---A---A-T----Acaa
gi|90 : atctacacg-TGG--T-GA-T-G---TT------T--T-C----A-T--GTG-AG----TG----ATTAA--T--A--C-T--------------------G-AAA-T-G-G---GA-----A--G-T---A-A-AAC---A---G-T----
gi|32 : A-C-G---TC------T--C-C----A-T--GTG-AT----TG----A--AA--G--A--T-T-C--T----A----------G-------G-GCTCAA-----C--G-T---T-A-AAC---A---A-T----gca
gi|89 : tggatccgggtcagaatatatcctcagaagacctttttttatcataaaaggcgattaaactggacagtcctttggaaaagaccgcaaaaaccgatgtaccgtttcacagcacgataaagacccctccttgctcaaagggtcagagatgagcatA-C-G---TC------T--C-C----A-T--ATG-AG----CG----A--TA--T--A--T-T-C--T----C----------GAG---T-G-G---GA-----C--G-T---A-A-AAC---A---A-T----AA-AT-AATCAgtatgtaattataaacaacc
gi|95 : tgt----A-T--ATG-AG----TG----A--AA--T--A--T-T-C--T----CA---------A-G---A-G-G---GA-----C--A-A---A-A-AAC---A---T-T----GATAT-AA
gi|111 : t--ATG-GG----TG----A--AA--T--A--T-T-C--T----CA---------A-G---T-G-T---GA-----C--G-T---A-A-AAC---A---aacc
gi|87 : G-AG----TG----A--AAGAT--A--T-C-A--T----C----------G-AGT-T-GCG---GA-----C--G-TTTTA-A-AAC---A---A-T----AA-AT-AATCA
gi|103 : G----A--AA--T--A--T-T-T--TTTTTC----------G-G---T-G-G---GA-----C--G-T---A-A-AAC---A---A-T----AA-AT-tcatcgttc
gi|110 : tG----A--AA--T--A--A-T-C--T----T----------GAG---T-G-G---GA-----C--G-T---A-A-AAC---A---G-T----AA-A
gi|98 : t--AA--T--A--T---C--T----C----------G-ACC-T-G-G---GA-----C--G-T---A-A-AAC---A---A-T----AA-AT-a
gi|101 : g--T--A--T-T-C--T----C----------GAG---A-G-G---GA-----C--T-T---A-A-AAC---A---A-T----Acatatg
gi|100 : --T--A--T-T-C--T----C----------GAG---A-G-G---GA-----C--T-T---A-A-AAC---A---A-T----Attcaaccaaccaa
gi|99 : --T--A--T-T-C--T----C----------GAG---A-G-G---GA-----C--T-T---A-A-AAC---A---A-T----Attcaaccaaccaa
gi|109 : --A--T-T-C--T----C----------G-G---T-G-G---GA-----C--G-T---A-A-AAC---A---A-T----TA-AT-AATttcaaccaaccaa
gi|114 : --T-T-C--T----C----------AAG---A-G-G---GA-----C--G-T---A-A-AAC---A---A-C----AT-AC-AATCAaatca
17 sequences could not be aligned to this particular reference sequence:
Unaligned ( gi|42 ): CGTGTCACGGCAGAAACATTCACTGCTGCGGACCCCGCGTTTTACATGTGTAGGTCTGAATTTGTGGTACTTGTGGTACTTCACTTACAGTTGGCGACGTATTGATTTTTTCCAGAAGGGGAGTAAAACAAGCAAACAAACAAACAAACAAACCGTTGAATAT
Unaligned ( gi|43 ): CGTGGCACGATGAAGAACTTCACTGCTACGGCCCTGGTCCCTGCCATACAGGTACGTTATTTCTGATACATGTGTTTGTACTTCCCTATAGAGCTTCACATGCTTACGTTTTTAAAAAGATCGGTCAAATTTCTCAAACAGACGATAAAAACAAACAAA
Unaligned ( gi|57 ): ACCCTTCAACGGTATACATGTAGATGACGTCTGTACACAATGCATATGAGTGGAATACTAGTATTTTTGAGAGTGATGCTAAGCATTACACAATCAATCACGTATTGAATG
Unaligned ( gi|62 ): AAGGATTCACTCTGCTATGGCCCTGAGCGCCAAAATCTAAAGATGATGATGGCTGTACGTTGGGCGTTTTTGAGTGGGACGTAAAACTACAAACAAACTA
Unaligned ( gi|69 ): TTTTGTAGTGTACCTTGAATTACGGTTACATATATCCATAGGAATGACACATTTCTCAAGCTGGACGTTAAACAATATGCAACCAA
Unaligned ( gi|74 ): AGCATGCCATTATCAGTCATAAAAGGAGACCTTTGGAATGGTCGTCCTTCTTATGTGGCTGCAAAGACAGGAGTCTTGTGTC
Unaligned ( gi|75 ): AGGTGTTGGCACAATAAAGATCCTTCACCGCTAAGGAGTCAATTGCATACATGTATATGGATTTGTGTCATTTCATCTAC
Unaligned ( gi|77 ): GTGTCCAGGGTCCGTGGTTGCCCAGCTCTTGTTTTTGTATTCTATTTAAGACTTGCGAGATTGGTCCTGTGTCGTTATA
Unaligned ( gi|79 ): CAGGAGTTGGCACGTTAAATAACCCCCGCTATAGAATGAGTTCTCATTTATGGTGCTTCACCCACAACCGGTG
Unaligned ( gi|88 ): CAAAGGTAATTTCTATATAAGTGAAGTAGTTTGGAATCGGATGTAAAATCAACCAACA
Unaligned ( gi|91 ): AACTTGAAAATACGGATATATATTTCATTGCAGTGGTAGAATAAGAAATTTATT
Unaligned ( gi|96 ): TAACGACCCTTCATGAGTGAAATATACTAGAGCTGGACGATAAAC
Unaligned ( gi|97 ): CATGTGAGTGAAAATTATCAAGCGGGGACGAAACACAAATTCAAT
Unaligned ( gi|105 ): TCTTCAACAACGACCCGTGGGGATCCGGGTTAGAATA
Unaligned ( gi|113 ): CATATCTACGACCCGTGGGGGTCCGGGTTAGAAT
Unaligned ( gi|115 ): ATTGCATGAAACCCGTGGGGGTCCGGGTTAGAA
Unaligned ( gi|117 ): GACCCGTGGGGGTCCAGGTTAAAATAGG
Alignments
lowQualScore : 111111111111111111111 1111111111111111111111 111111111111111111111 111111111111
lowQualScore : 0 0 111 0 222 22222 3 0 22 1111 11 2222 7777 1 444444 33 11 22 666666 0 0 33333 3333333 11 333 0 4444444 666666 1 3333 333333 333 0 22 444444 7777 0 11 11 11 2222222 444 11 2222 11 222222222222222222222 22 0 222 777777777777777 111 0 0 1 4444444444 11 44444 22 55555 11 2222 555555 22 0 7777777777777777777777 0 222 44444 2 22 22 0 11 0 1111 333333333 22 22 33 555555555555 11 4444444 11 0000000000000000000000 1 5555555 3333333333 33333 1 222 3333 22222 33 11 0 1 22222 11 1 11 11 22 0 2 222 3333333 22 0 333 777777777777777777 0 11 222 1 11 222 0 2 11 33 33333 5555555555 444444 33 0 2222 22222 0 111111111111111111111 1 55555555 1 11 55555 111 11 3333 11 111 22222 11 55555 1 5555555 44444 8888888 11 11 0 0 22 0 222 333333 33333 444444444 1 11 1 0 22 1111 11 333333333 00 0 2 222 3333 999999999999 22 111 33333 11 0 111 0 1 222 111 0 3333 1 1
lowQualScore : . . ... . ... ..... . . .. .... .. .... .... . ...... .. .. .. ...... . . ..... ....... .. ... . ....... ...... . .... ...... ... . .. ...... .... . .. .. .. ....... ... .. .... .. ..................... .. . ... ............... ... . . . .......... .. ..... .. ..... .. .... ...... .. . ...................... . ... ..... . .. .. . .. . .... ......... .. .. .. ............ .. ....... .. ...................... . ....... .......... ..... . ... .... ..... .. .. . . ..... .. . .. .. .. . . ... ....... .. . ... .................. . .. ... . .. ... . . .. .. ..... .......... ...... .. . .... ..... . ..................... . ........ . .. ..... ... .. .... .. ... ..... .. ..... . ....... ..... ....... .. .. . . .. . ... ...... ..... ......... . .. . . .. .... .. ......... .. . . ... .... ............ .. ... ..... .. . ... . . ... ... . .... . .
lowQualScore : 8 8 333 8 111 99999 0 7 55 6666 88 4444 3333 6 111111 44 99 66 222222 8 8 11111 5555555 88 111 8 9999999 111111 5 1111 222222 666 8 55 000000 8888 8 99 77 11 2222222 333 99 5555 99 222222222222222222222 66 8 222 444444444444444 444 8 8 6 8888888888 11 11111 00 22222 22 7777 111111 99 9 7777777777777777777777 9 444 22222 7 22 22 9 22 9 9999 666666666 11 11 00 666666666666 22 0000000 22 4444444444444444444444 6 4444444 6666666666 88888 6 000 7777 99999 99 11 8 6 99999 99 6 99 11 88 8 4 222 3333333 66 8 555 111111111111111111 8 88 111 5 11 111 8 4 11 44 33333 8888888888 111111 55 8 4444 88888 8 444444444444444444444 5 00000000 6 99 11111 333 88 8888 11 444 00000 99 33333 7 6666666 00000 3333333 99 99 8 8 66 8 111 777777 00000 777777777 5 88 5 8 55 6666 00 999999999 99 7 7 111 0000 111111111111 33 222 44444 99 7 222 7 5 111 333 8 0000 1 1
consensus : GGGTCCG-GGT-T---A-G---A-----A-T-A--G----G--TC----C-T--C-AG------C--AT--CC--C---C--T-T-G-----C-----G-TG--T---C-G-------T------AAG-A----G------G---CG-A--C------T--G-A-A--T-GG--G-----G-C---G--G----T--C-----------A---------T--T-C---GG---------------A---T-G-A-G----------A--C-----C--G---G-A--A----AA------AC--C-G----------------------A-G---G---T-C-C--C--G-T--G-T----C---------A--C--A--G------------C--A-------G--G----------------------TG-T-------GG----------C-----ACG-A--TA----A-----AGA--T--C-C-C-----T--C-C--C--TG--C-T-CA---A-------A--GG-C---C--------------C---T-G--A---G-T--G---C-C-G--A--G-----C----------A------T--AGGCC-T----A-----A-A-T-------------------T-T--------T-GC--A-----G---C--C----C--TT---CA-----C--C-----G-G-------C-----A-N-----T--G--G-T-GA--C-G---TC------T-----C----C----A-T--AT-G-AGT--G----A--AA------T--A--T-T-C---T----C--G--G----T-G--G---GA-----C--G-T---A-A-AAC---A---A-T----AA-AT-AATCA
Reference ( family-1360 ) : GGGTCCG-GGT-T---A-G---A-----A-T-A--G----G--TC----C-T--C-AG------C--AT--CC--C---C--T-T-G-----C-----G-TG--T---C-G-------T------AAG-A----G------G---CG-A--C------T--G-A-A--T-GG--G-----G-C---G--G----T--C-----------A---------T--T-C---GG---------------A---T-G-A-G----------A--C-----C--G---G-A--A----AA------AC--C-G----------------------A-G---G---T-C-C--C--G-T--G-T----C---------A--C--A--G------------C--A-------G--G----------------------TG-T-------GG----------C-----ACG-A--TA----A-----AGA--T--C-C-C-----T--C-C--C--TG--C-T-CA---A-------A--GG-C---C--------------C---T-G--A---G-T--G---C-C-G--A--G-----C----------A------T--AGGCC-T----A-----A-A-T-------------------T-T--------T-GC--A-----G---C--C----C--TT---CA-----C--C-----G-G-------C-----A-N-----T--G--G-T-GA--C-G---TC------T-----C----C----A-T--AT-G-AGT--G----A--AA------T--A--T-T-C---T----C--G--G----T-G--G---GA-----C--G-T---A-A-AAC---A---A-T----AA-AT-AATCA
gi|1 : GC-T---A-G---A-----A-T-AC-G----A--TC----C-T--C-AGTGAGCCC--AT--GC--C---T--T-T-G-----C-----T-TG--T---CCG-------C------ACG-A----G------G---CG-A--G------T--ATA-A--T-CG--A-------C---G--G----C--CCT---------G---------T--C-C---GT---------------A---TCG-ACG----------A--C-----A--A---G-G--A----AAGATAAGAC--TTG----------------------A-G---GCTGT-G-C--C--A-T--G-T----C---------A--C--A--G------------CAAA-------G--G----------------------AG-T-------GA----------------ACG-A--TA----A-----AGAATT--C-C-CT----T--C-C--C--AGC-C-C-CA---A-------A--GA-T---C--------------------G--A-----T--A---TAC-G--A--G-----CTTCGCGACAAA------T--AAGA-------A-----A-A-A-------------------T-T--------G-GC--A-----C---CT-C----T--TT---TA-----C--C-----GCG-------CGA---A-A-----T--GA-G-A-AA--T-G---TTA-----T-----CACG-C----A-T--ACGG-ACT--G----A--AA------C--A--T-TGA---T----C--AACG----T-C--G---GG-----C--C-T---A-GCAAC---A---A-TTA--AA-AC-AATCA
gi|10 : ttacacaagccattatcactaccgtgaagaggctaccagaaGGATCCG-GGT-T---A-G---A-----A-T-A--G----G--TC----T-T--C-AG------C--AT--CC--C---C--T-T-G-----C-----G-TG--T---C-G-------T------AAG-A----G------G---CG-A--C------T--G-A-A--T-AG--G-----G-C---G--G----T--C-----------A---------T--T-C---GG---------------A---T-G-A-G----------A--C-----C--G---G-A--A----AA------AA--T-G----------------------T-G---G---C-T-C--C--G-T--G-T----C---------A--A--G--G------------C--A-------G--A----------------------TG-T-------GG----------C-----ACA-A--TA----A-----AGA--T--C-C-C-----T--C-C--C--TG--C-T-CA---A-------A--GG-C---C--------------C---T-G--A---G-T--G---C-C-G--A--G-----C----------A------T--AGGCC-T----A-----A-A-T-------------------T-T--------T-GC--A-----A---C--C----C--TT---CA-----C--C-----G-G-------C-----A-T-----T--G--G-T-GA--C-G---TA------T-----C----C----G-T--AT-G-AGT--G----A--AA------T--A--T-T-C---T----C--A--G----T-G--A---GA-----C--G-T---A-A-AAC---A---A-T----AA-AT-AATCatc
gi|100 : gtgg------T--A--T-T-C---T----C--GA-G----A-G--G---GA-----C--T-T---A-A-AAC---A---A-T----A
gi|101 : ------T--A--T-T-C---T----C--GA-G----A-G--G---GA-----C--T-T---A-A-AAC---A---A-T----Attcaaccaaccaa
gi|102 : GGTCCG-GGT-T---A-G---A-----A-T-T--T----G--CC----C-C--C-AG------C--AT--CC--ttcaaccaaccaa
gi|103 : tacccttagaT--G----A--AA------T--A--T-T-T---TTTTTC--G--G----T-G--G---GA-----C--G-T---A-A-AAC---A---A-T----AA-AT-
gi|104 : GGGTCCG-GGT-T---A-G---A-----A-T-A--G----G--
gi|106 : atcacccgtgcaacccgtgg---G-T--G---C-C-G--A--G-----C----------A------T--AGGCC-T----A-----A-A-G-------------------T-T--------T-GC--A-----G---T--C----C--CT---CA-----C--
gi|107 : -T--C-AG------A--AT--CC--T------T-T-G-----C-----G-TG--T---C-G-------T------AAG-A----C------G---CA-A--C------T--A-A-A--T-
gi|108 : GGGTCTG-GGT-T---A-G---A-----A-T-A--A----G--TC----C-
gi|109 : ttgacatccgtga--A--T-T-C---T----C--G--G----T-G--G---GA-----C--G-T---A-A-AAC---A---A-T----TA-AT-AATc
gi|11 : GGTTCG-GGT-T---A-G---A-----A-T-A--G----G--TC----C-C--C-AG------C--AT--CC--C---C--T-T-G-----T-----G-TG--T---C-GGCTGTGTT------CAG-A----G------G---CG-A--C------T--G-A-A--T-GG--G-----A-C---G--G----T--C-----------C---------T--T-C---GA---------------A---T-G-A-G----------A--C-----C--G---G-A--A----AA------AT--C-G----------------------A-G---G---T-C-C--C--G-T--G-T----T---------A--C--A--G------------C--A-------G--A----------------------TG-T-------GG----------C-----ACG-T--TA----A-----AGA--T--C-C-C-----T--C-C--T--TG--C-T-CA---A-------A--GG-C---C--------------C---T-G--A---G-T--G---C-C-G--A--G-----C----------A------T--AGGCC-T----A-----A-A-T-------------------T-T--------T-GC--A-----G---C--C----C--TT---CA-----C--C-----G-G-------C-----A-T-----T--G--G-T-GA--C-G---TC------T-----C----C----A-T--AT-G-AAT--G----A--AA------T--A--A-T-C---T----C--GA-G----T-G--G---GA-----C--G-T---A-A-AAC---A---A-T----Aaatca
gi|110 : aT--G----A--AA------T--A--A-T-C---T----T--GA-G----T-G--G---GA-----C--G-T---A-A-AAC---A---G-T----AA-Acaa
gi|111 : --AT-G-GGT--G----A--AA------T--A--T-T-C---T----CA-A--G----T-G--T---GA-----C--G-T---A-A-AAC---A---a
gi|112 : GGGTCCA-GGT-T---A-G---A-----A-T-A--G----G--TC----
gi|114 : ttcacacccgtgg--T-T-C---T----C--AA-G----A-G--G---GA-----C--G-T---A-A-AAC---A---A-C----AT-AC-AATCA
gi|116 : GGACCTG-GGT-T---A-G---A-----A-T-A--G----G--TC----C-T--C-a
gi|118 : cccatga---------T--T-C---GG---------------A---T-G-A-G----------A--C-----C--G---C-A--A----AA------AC--C-G----------------------A-G---G---T-C-
gi|12 : GGGTCCG-GGT-T---A-G---A-----A-T-A--G----G--TC----C-T--C-AG------C--AT--CC--C---C--T-T-G-----C-----G-TG--T---C-G-------T------AAG-A----G------G---CG-A--C------T--G-A-A--T-GG--G-----G-C---G--G----T--C-----------A---------T--T-C---GG---------------A---T-G-A-G----------A--C-----C--G---G-A--A----AA------AC--C-G----------------------A-G---G---T-C-C--C--G-T--G-T----C---------A--C--A--G------------C--A-------G--G----------------------TG-T-------GG----------C-----ACG-A--TA----A-----AAA--T--C-C-C-----T--C-C--C--TG--C-T-CA---A-------A--GG-C---C--------------C---T-G--A---G-T--G---C-C-G--A--G-----C----------A------T--AGGCC-T----A-----A-A-T-------------------T-T--------T-GC--A-----G---C--C----C--TT---CA-----C--C-----G-G-------C-----A-T-----T--G--G-T-GA--C-G---TC------T-----C----C----A-T--AT-G-AGC--G----A--AA------T--A--T-T-C---T----C--G--G----T-G--G---GA-----C--G-T---A-A-AAC---A---A-T----AA-AT-AATCA
gi|13 : G----------C-----ATG-A--TA----A-----AGA--A--C-T-C-----G--C-T--T--TG--C-TACA---------------G-C---C--------------T---T-G--A---A----------C-G--A--AAGTCAT----------A------T--AGGTC------A-----A-A-C-------------------T-T--------C-G---A-----G---C--TA---C--TT---CA-----A--A-----GTA-------C-----A-A-----TT-G--G-T-GT--C-----TCAGAAATT-----C----C----AGT--AT-G-AAT--G----T--TG------T--A--A-T-G---T----T--G--GA---T-G--A---GA-----C--G-T---A-A-AAC---A---G-C----AA-A
gi|14 : ggagataatggagaatgtcacgtgacttttaacagtcatactttgcgtcaGTCCG-GGT-T---A-G---A-----A-T-A--G----G--TC----C-C--C-AG------C--AT--CC--C---C--A-T-G-----C-----C-TG--T---C-G-------C------AAG-A----G------G---CG-A--C------T--G-A-A--T-GG--G-----G-C---G--G----T--C-----------A---------T--T-C---GG---------------A---T-G-A-G----------A--C-----C--G---C-A--A----AA------AC--C-G----------------------A-G---G---T-C-C--C--G-T--G-T----C---------A--C--A--G------------C--G-------G--G----------------------TG-T-------GG----------C-----ACG-A--TA----A-----AGA--T--C-C-C-----T--C-C--C--TG--C-T-CA---A-------A--GG-C---C--------------C---T-G--A---G-T--G---C-C-G--A--G-----C----------A------T--AGGCC-T----A-----A-A-T-------------------T-T--------T-GC--A-----G---C--C----C--TT---CA-----C--C-----G-G-------C-----A-T-----T--G--G-T-GA--C-G---TC------T-----C----C----A-T--AT-G-AGT--G----A--AA------T--A--T-T-C---T----C--G--G----T-G--G---GA-----A--G-T---A-A-AAC---A---A-T----AA-AT-AATCAgacactaaatacttgtaaattagcattatgtgtttccagttcggacgcacgggcaatttattt
gi|15 : TCCG-GGT-T---A-G---A-----C-T-A--G----G--TC----C-T--C-AG------C--AT--CC--C---C--T-T-G-----C-----G-TG--T---C-G-------T------AAG-A----G------G---CG-A--C------T--G-A-A--T-GG--G-----G-C---G--G----T--C-----------A---------T--T-C---GG---------------A---T-G-A-G----------A--C-----C--G---G-A--A----AA------AC--C-G----------------------A-G---G---T-C-C--C--G-T--G-T----C---------A--C--A--G------------C--A-------G--G----------------------TG-T-------GG----------C-----ACG-A--TA----A-----AGA--T--C-C-C-----T--C-C--C--TG--C-T-CA---A-------A--GG-C---C--------------C---T-G--A---G-T--G---C-C-G--A--G-----T----------A------T--AGGCC-T----A-----A-A-T-------------------T-T--------T-GC--A-----G---C--C----C--TT---CA-----C--C-----G-G-------C-----A-A-----T--G--G-T-GA--C-G---TC------T-----C----C----A-T--AT-G-AGT--G----A--AA------T--A--T-T-C---T----C--G--G----T-G--G---GA-----C--T-T---A-A-AAC---A---A-T----AA-AT-AATCA
gi|16 : aGATCCG-GGT-T---A-G---A-----A-T-A--G----G--TC----C-T--C-AG------C--AT--CT--C---C--T-T-G-----C-----G-TG--T---C-G-------C------AAG-A----G------G---CG-A--C------T--G-A-A--T-GG--G-----G-T---G--G----T--C-----------A---------T--T-C---GG---------------A---T-G-A-G----------A--C-----C--G---A-A--A----AA------AC--C-G----------------------A-G---G---C-C-C--C--G-T--G-T----C---------A--C--A--G------------C--A-------G--G----------------------TG-T-------GG----------C-----ACG-A--TA----A-----AGA--T--C-C-C-----T--C-C--C--TG--C-T-CA---A-------A--GG-C---C--------------C---T-G--A---G-T--G---C-C-G--A--G-----C----------A------T--AGGCC-T----A-----A-A-T-------------------T-T--------T-GC--A-----G---C--C----C--TT---CA-----C--C-----G-G-------C-----A-T-----T--G--G-T-GA--C-G---TC------T-----C----C----A-T--AT-G-AGT--G----A--AA------T--A--T-T-C---T----C--G--G----T-G--G---GA-----C--G-T---A-A-AAC---A---A-T----AA-AT-AAT
gi|17 : CCG-GGT-T---A-----A-----A-T-A--G----G--TC----C-C--C-AG------C--AT--CC--C---G--T-T-C-----C-----G-TG--T---C-G-------T------AAG-A----G------G---CG-A--C------T--G-A-A--T-GG--G-----G-C---G--G----T--C-----------A---------T--T-C---GG-------------------C-G-A-G----------A--C-----C--G---T-A--A----AA------AC--C-G----------------------A-G---G---T-C-C--C--G-T--G-T----C---------A--C--A--G------------C--A-------G--G----------------------TG-T-------GG----------C-----ACGAA--AA----A-----AGA--T--C-C-C-----T--C-C--C--TG--C-T-CA---A-------A--GG-----C--------------C---T-G--A---G-T--G---C-C-G--A--G-----C----------A------T--AGGCC-T----A-----A-A-T-------------------T-T--------T-GC--A-----G---C--C----C--TT---CA-----C--C-----G-G-------C-----A-A-----T--G--G-T-GA--C-G---TC------T-----C----C----A-T--AT-G-AGT--G----A--AA------T--A--T-T-C---T----C--GA-G----T-G--G---GA-----C--G-T---A-A-AAC---A---G-T----AA-AT-AA
gi|18 : atggCCG-GGT-T---A-T---A-----A-T-A--G----T--TC----C-C--C-AG------C--AT--CC--C---C--T-T-G-----C-----G-TG--T---C-G-------T------AAG-A----G------G---CG-A--C------T--G-A-A--T-AA--G-----G-C---G--G----T--C-----------A---------T--T-C---GG---------------A---T-G-A-G----------A--C-----C--G---G-A--A----AA------AC--C-G----------------------A-G---G---C-C-C--C--G-T--G-T----C---------A--C--A--G------------C--A-------G--G----------------------TG-T-------GG----------C-----ACG-A--TA----A-----AGA--T--C-C-C-----T--C-C--C--TG--C-T-CA---A-------A--GG-C---C--------------C---T-G--A---G-T--G---T-C-G--A--T-----C----------A------T--AGGCC-G----A-----A-T-T-------------------T-T--------T-AT--A-----G---C--C----C--TT---CA-----C--C-----G-G-------C-----A-T-----T--G--G-T-GA--T-G---TC------C-----T----C----A-T--AT-T-AGT--G----A--AA------T--A--T-T-T---T----T--G--G----A-G--G---GA-----A--G-T---A-A-AAT---A---A-T----AA-AT-AATCAc
gi|19 : -GGT-T---A-G---A-----A-T-A--G-------TC----C-T--CCAG------T--AC--CC--C---T--T-T-C-----T-----T-TT--T---T-G-------T------GAG-A----G------G---C-----C------T--A-A-A--T-GG--G-----G-G---GC-G----T--C-----------C---------T--T-C---G----------------A---T-G-A-G-------------C-----C--A---C-A--A----A-----------C-G----------------------A-G---T---C-C-T--C--G----G-T--------------A--C--A--GA-----------C------------------------------------TG-T-------GG----------------AC--A--TA----A-----AGA--T--C-CTC-----T--C-C--T--TG--C-T-CAT--A-------A--GG-C---CAAAGCTGCTCAAGAC---T-A--A---G-T--G---C---A--A--G-----C----------A------T--AGGCC-T----A-----A-A-T-------------------T-T--------T-TG--A-----A---C--C----C--GT---CA--------C-----G-G-------CA----A-A-----T--G--G-T-GA--C-G---TC------T-----C----T----A-T--AT-C-AGT--G----A--GG---------A--T-T-T---C----A--A--G----T-G--G----------C--A-T---T-A-AAT---AGATA-T----AT-AC-AATCa
gi|2 : tG-GAT-T---A-G---ATCTTTA-T-G--G----GCTTT----T-T--C-AG------G--AT--CC--CT--C--T-C-G-----T-----G-TG--T---C-GGTT----T------AGG-A----GTTCGTAGTCTCG-A--AG-----T--G-A-G--T-GA--G-------C---G--G----TATT-----------A---------C--T-CTTGGG---------------C---T-G-A-C----------G--CATACTC--GTGTG-A--T----AA------ACA-C-G----------------------ATG---G---T-C-T--C--GGT--G-T----C---------A--CC-A--G------------C--A-------G--G----------------------TG-T-------GGGCGAAAGAAGC-----ATA-G--TA----A-----GGA--TGAT-C-C-----TG-C-C--C--TGG-C-T-CATAAG-------A--GG-C---CTT------------C---T-G--A---G-T--GGTAC-C-A--A--T-----------------------T--AGGCC-T----ACTGTTA-A-T-------------------T-TCCGTTT--T-GC--A-----T---G--C----C--TT---CA-----C--C-----G-A-------T-----A-T-----T--G--G-T-GA--A-T---TC------T---------------A-A--GT-T-GGT--G----A--AA------T--A--T-T-C---T----C--GA-G----T-A--G---GATATCGC--G-T---ATA-AAC---A---A-T----AA-AT-AAT
gi|20 : gtggggagttcgaaCCG-GGT-T---A-G---A-----AAT-A--G----G--TC----C-T--C-AG------T--AT--CG--C---C--T-T-G-----C-----T-TG--T---C-G-------T------AAG-A----G------GG--TG-A--C------T----A-A--T-GG--G-----G-C---G--G----T--C-----------T---------T--T-A---GG---------------A---T-G-A-G----------A--C-----C--G---C-A--A----AA-------T--T-G----------------------A-A---G---T-T-C--TT-G-T--T-T----C---------AA-C--A--G------------C--A-------G--G----------------------TGGT-------GA----------C------CG-A---A----A-----AGA--T--C-C-------T--C-T--C--TG--C-T-CA---A-------A--GA-C---C--------------A---T-T--A---GCT--G---C-C-G--A--G-----C----------A------A--AGGCC-T----A-----A-A-T-------------------G-T----------GC--A-----G---C--C----C--TT---CA-----C--C-----G-G-------C-----A-A-----T--G--G-T-GA--C-G---TC------T-----C----C----A-T--AT-G-AGT--G----A--AA------T--A--T-T-----T----C--A--A----G-A--A---GA-----C--G-T-----A-AAC---A---A-
gi|21 : gaGGATCCG-GGT-T---A-A---T-----A-T-A--G----T--TC----C----C-AG------C--AT--CC--C------T-T-G-----C-----G-TG--T---C-G-------C------AAG-A----G------G---CG-A--C------T--G-A-A--T-AA--G-----G-C---G--GG---T--C-----------A---------T--T-C---GG---------------A---T-G-A-G----------A--CG----C--G---G-A--A----AA------AC--C-G----------------------A-G---G---C-C-C--C--G-T--G-T----C---------A--C--A--G------------C--A-------G--G----------------------TG-T-------GG----------C-----ACG-A--TA----A-----AGA--T--C-C-C-----T--C-C--C--TG--C-T-CA---A-------A--GG-----C--------------C---T-G--A---G-T--G---T-C-A--A--T-----C----------A------T--AGGCC-T----A-----A-T-T-------------------T-T--------T-TT--A-----G---C--C----C--TT---CA-----C--C-----G-G-------C-----A-T-----T--G--G-T-GA--T-G---TC------C-----C----C----A-T--AT-G-AGT--G----A--AA------T--A--T-TCC---T----T--G--G----G-G--G---AA-----C----T---A-A-AAC---A---A-acatatcaa
gi|22 : tgg-GGT-T---A-G---A-----A-T-A--G----G--TC----C-T--C-AG------C--AT--CC--C------T-T-G-----C-----G-TG--T---C-G-------T------AAG-A----G------G---CG-A--C------T--G-A-A--T-AG--G-----G-C---G--G----T--C-----------A---------T--T-C---GG---------------A---T-G-A-G----------A--C-----C--G---G-A--A----AA------AT--C-G----------------------A-G---G---G-C-C--C--G-G--A-T--------------A--C--A--G------------C--A-------G--G----------------------TG-T-------GG----------C-----ACG-A--TA----A-----AGA--T--C-C-C-----T--T-C--T--TG--C-T-CA---A-------A--GG-C---C--------------C---T-G--A---G-T--G---C-C-G--A--G-----T----------A------T--AGGTC-T----A-----A-A---------------------T-T--------T-GC--A-----G---C--C----C--TT---CA-----C--C-----G-G-------C-----A-T-----T--G--G-T-GA--C-G---TC------T-----C----C----A-T--AT-G-AGT--G----A--AA------T--A--T-T-C---T----C--A--G----T-G--G---GA-----C--G-T-----A-AAC---A---A-T----AA-AT-AATCA
gi|23 : --G-A-T--T-GG--G-----G-C---G--T----T--C-----------C---------T--T-C---GG---------------A---T-GTA-G----------A--C-----T--G---G-A--A----CA----------C-T----------------------A-G---G---T-CTC--T--G-T--G-T----T------------C--AT-G------------C--A-------G--GGT--------------------TT-T-------GG----------CTAAT-ATG-T--TT----ATTTTCAGT--T--T-C-T-----T--C-CTTC--CG--C-T-TT---A-------ATTAG-TTTGC--------------G---T-G--A---G-T--G---C-CTG--T--G-----C-----------------T--GTGT-----------------T-------------------T-T--------T-GT------------T--C----T--TT---CA-----C--C-----G-G-------C-----A-------T--G--A-T-GA--G-T---TC------TGA---T----C----A-T--AT-G-A-T--G--------A------T--A--T-T-C---T----CT-T--G----T-G--G---GG-----C--a
gi|24 : aaataggtccagcaatgcccgtttggtctcgtcttggtttacatattcggtaa---A-----A-T-A--G----G--TA----C-T--A-AG------G--A---CC--T---A--T-T-AAAGACC-----T-TG--T---T-G-------T------AAG-A----G------A---TG-A--C------G--G-A-A--T-GG--G-----G-T---G--G----T--C-----------G---------T--C-C---AG---------------A-----G-A-G----------A--C-----
gi|24 : -G--G---GA-----C--G-T---T-A-AAC---A---A-T----AA-AT-AATtnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngggacgttaaacaataaataattgat
gi|25 : aataggtactaaggacctattaaagaccttgttgtaagagatgacggaatggggtggtcgtccagagagactnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn-GGT-T---A-G---C-----A-A-A--G----G--TC----G-C--C-AG------T--A---CC--C---C--T-G-G-----C-----T-TG--T---C-G-------T------AAG-A----G------G---CG-A--C------T--A-A-A--T-GG--G-----GGC---G--G----T--C-----------C---------C--T-A---GG---------------A---T-G-A-G----------A--C-----C--G---T-A--A----AC------AT--T-G----------------------A-T---G---C-C-C--C--T-T--G-T----C---------A--C--A--G------------T--A-------G--G----------------------TG-T-------GG----------C-----ACA-A--TA----A-----AGA---------------T--C-C--C--TG--C-T-CA---A-------A--GG-C---T--------------G---T-A--A---G-C--G---C-C-G--G--G-----C----------A------T--AGACC-T----A-----A-A-T-------------------T-T--------T-GC--A-----G---C--CCTGGC--TT---CA--------C-----G-G-------A-----A-A-----T--G--G-T-AA--T-G---TC------T-----C----C----A-TA-AT-G-AGC--A----A--AA---------------------------------------------GA-----C--GCT---A-ATAAC---A---A-T----AT-AC-AATCAtgat
gi|26 : aGGACCTG-GGT-T---A-G---A-----A-T-A--G----G--TC----C-T--C-AG------T--AT--CC--C------T-T-G-----C-----T-TG--T---C-A-------T------AAT-A----G------G---TG-A--C------T------A--T-------------T---A--G----T--T-----------C---------T--T-C---GG---------------A---T-G-A-G----------A--C-----------------------------------------------------------------A---T-C-C--C--G-T--G-T----C---------A--C--A--G------------C--ACTGAGCAG--G----------------------TG-T-------GG----------C-----ACG-A--TA----A-----AGA--T--C-C-C-----T--T-C--C--TG--C-T-CA---A-------A--GG-C---C--------------A---C-A--A---G-C--A---C-T-G--A--G-----C----------A------C--AAGCC-T----T-----A-A---------------------T-T--------C-AC--A-----G---T--C----C--TT---AA-----C--C-----C-A-------C-----A-A-----T--A--A-A-AA--C-G---TC------T-----C----G----A-T--TA-G-AGT--G----A--AA------T--A--T-T-C---T----CA-A--G----A-G--G---GA-----T--G-T---A-A-AAC---A---A-T----AC-AC-AAa
gi|27 : GGGTCCG-GGT-T---A-G---A-----A-T-A--G----G--TC----C----C-AG------C--AT--CC--C---C--T-T-G-----C-----A-TG--T---T-G-------T------AAG-A----G------G---CG-A--C------T------------------------------G----T--C-----------A---------T--T-C---AG---------------A---C-G-A-G----------A--C-----C--G---G----A----AA------AC--C-G----------------------A-G---G---T-C-C--C--G-T--G-T----CACATAAATGA--C--A--G------------C--A-------G--G----------------------TG-T-------GG----------C-----ACG-A--TA----A-----AGA--T--C-C-C-----T--C-A--C--TG--C-T-CA---A-------A--GG-C---A--------------C---T-G--A---G-T--G---C-C-G--A--G-----C----------A------C--AGGCC-T----A-----A-A-T-------------------T-T----------------------------------------------------------A-------C-----A-A-----T--G--G-T-GA--T-G---TC------T-----C----C----G-T--AT-G-AGT--G----A--AA------T--A--T-T-C---T----C--GA-G----T-G--G---GA-----T--G-T---A-A-AAC---A---A-T----AA-AT-AATCc
gi|28 : tggCCG-GGT-T---A-G---A-----A-T-A--G----G--TC----C-T--C-AG------TT-ATTACA--C---C--C-A-G-----C-----T-TG--T---C-G-------T------ATG-A----G------G---AG-A--C------T--A-A-A--T-GG--G-----G-T---G--G----T--C-----------C---------T--T-T---GG---------------A---T-G-A-G----------A--C-----C--G---T-A--A----AA------AT--C-A----------------------A-G---G---C-C-C--C--T-T--G-T----C---------A--T--G--G------------C--A-------A--G----------------------TG-T-------TG----------C-----ACA-A--TA----T-----AGA--T--C-C-C-----T--C-C--C--TG--C-T-TA---A-------A--GG-C---TG-------------T---T-A--A---G-T--G---C-T-G--A--G-----C----------A------T--AGGCC-T----A-----A--------------------------------------------------------------T---CA-----C--T-----G-G-------C-----A-G-----T--G--G-T-CA--C-G---TC------T-----------------------------------A--AA---------A--T-T-C---T----T--GA-G----C-A--G---GA-----C--A-T---T-A-AGC---A---A-TACACAA-AT-AATCA
gi|29 : c-T---A-G---A-----A-T-A--G----G--TC----C-A--C-AG------T--AC--CC--C---C--T-C-G-----C-----T-TG--T---C-G-------T------AAG-A----G------A---CG-A--C------T--------------------------------------------------A---------T--T-C---GG---------------A---T-G-A-G----------A--C-----C--A---C-A--A----AA------AC--C-G----------------------A-A---G---T-C-C--C--G-T--G-T----C---------A--C--A--G------------C--A-------G--G----------------------TG-T-------GG----------C-----ACG-A--TA----A-----AGA--T--T-C-C-----T--C-C--C--TG--C-T-CA---A-------T--GG-T---C--------------A---T-G--A---G-C--G---C-C-G--A--G-----C----------A------T--AGGCA-T----A-----------------------------T-T--------T-GC--A-----G---C--C----C--TT---CA-----A--C-----G-GC------C-----A-A-----T--G--G-T-GA--C-G---TC------T-----C----C----A-T--AT-G-AGT--G----A--AG------T--A--T-T-C---T----T--GA-G----A-G--G---GA-----T--G-T---A-A-AAT---A---at
gi|3 : CCG-GGT-TGAGA-G---A-----AAT-AT-G----G--TCG---C-T--C-AG------CTGGT--TC--C---C--G-T-G-----T-----G-TA--G---C-G-------TGTCTCAAAG-A----G------G---CGGA--C------T--C-A-A--TAGG--G-----G-C---G--A----G--CTTA--------A---------T--T-G---GG---------------A---T-G-A-A----------G--C-----C--G---G-A--AG---AA------AC--C-G----------------------A-G---GA--G-C-C--C--G-T--GGT----C---------A--T--AT-G------------C--A-------GAGG----------------------TG-TTG-----AG----------C-----ACG-AATCA----AT----AGA--T--C-C-C-----T--C-C--T--AGGAC-T-GA---A-------A--GGAT---C--------------CGCGT-G--A---G-CTAG---C-C-GTGA--G-----C----------AGA----T--AGGCT-T----A-----A-T-T-------------------T-T--------T-GCG-A-----G---T--T----C--CT---TG-----C--------G-G-------C-----A-------T--G--G-T-GA--C-G---TCA-----T-----C----C----ATT--AT-G-AGT--G--------A------T--A--C-T-CTCTT----C--G--GGAGTT-GGTG---GA-----CGTG-T---G-A-AAC---A---ATT----AA-AT-tacaaccaacaaca
gi|30 : ctggtggggttccgctaGGGTCCG-GGT-T---A-G---A-----A-T-A--G----G--TC----C-C--C-AG------C--AT--CC--C---C--T-T-G-----C-----G-TG--T---C-G-------T------A---------------------------------------------------------------------------------------------T--T-C---GG---------------A---T-G-A-G----------A--C-----C--G---G-A--A----AA------AC--C-G----------------------A-A---G---T-C-C--C--G-T--G-T----C---------A--C--A--G------------C--A-------G--G----------------------TG-T-------GG----------C-----ACG-A--AA----A-----AGA--T--C-C-C-----T--C-C--C--TG--C-T-CA---A-------A--GG-C---C--------------C---T-G--A---G-T--G---C-C-G--A--G-----C----------A------T--AGGCC-T----A-----A-A-T-------------------T-T--------T-GC--A-----G---C--C----C--TT---CA-----C--T-----G-G-------T-----A-A-----T--G--G-T-GA--C-G---TC------T-----C----C----A-T--AT-G-AGT--G----A--AA------T--A--T-T-C---T----C--G--G----T-G--G---GA-----C--G-T---A-A-AAC---A---A-G----AA-AT-AATCAtgtaatacaat
gi|31 : --G-T----C---------A--CCCA--G------------C--A-------G--G----------------------TG-T--------G----------T-----GCG-A--CA----A-----GAAACT--C-T-C-----A--C-C--C--TG--C-G-CA---A-------AG-GG-C---A--------------G---T-AT-A---G-C--A---C-G-G--A--T-----CA---------A------C--AGACC-T----A-----ACA-----------------------T--------T-GC--A-----GTATC--C----G--TT---CAAACAGT--C-----A-G-------C-----T-A-----C--G--T-C-GAGGT-G---TC------A-----C----C----A-T--AT-C-AAT--G----A--AA------TTAA--A-T-C---T----CGAG--G----TCG--G---AA-----C--G-at
gi|32 : gtgtgactgatagaacggtcttttaataacaaggtccttctaaaGGATCCG-GGT-C---A-G---A-----A-T-A--T----A--TC----C-T--C-AG------A--AG--AC--C---T--T-T-T-----T-----T-TA--T---C-A-------T------AAA-A----G------G---CG-A--T------T--A-A-A--C-TG--G-----A-C---A--G----T--C-----------C---------T--T-T---GG---------------A---A-A-A-G----------A--C-----C--G---C-A--A----AA------AC--C-G----------------------A-T---G---T-A-C--C--G-T--T-T----C---------A--C--A----------------------------------------------------------------G----------C-----ACG-A--TA----A-----AGA--C--C-C-C-----T--C-C--T--TG--C-T-CA---A-------A--GG-G---T--------------C--------A---G-A--G---A-T-G--A--G-----C----------A------T--ACGTC-T----attcgttattgaataataacaacca
gi|32 : tA--C-G---TC------T-----C----C----A-T--GT-G-ATT--G----A--AA------G--A--T-T-C---T----A--G---------G--GCTCAA-----C--G-T---T-A-AAC---A---A-T----ccatgtgattgaaagattctagggctcaacgttaaacaatgtatgtaattataaacaacc
gi|33 : tggatccgggtcagaatatatcctcagaagacctttttttatcataaaaggcgattaaactggacagtcctttggaaaagaccgcaaaaaccgatgtaccgtttcacagcacgataaagacccctccttgctcaaagggtcagagatgagcat-T-------GG----------C-----ACG-A--TG----A-----AGA--A--C-C-T-----T--C-A--C--TG--C-T------A-------C--GG-C---C--------------C---T-G------G-T--C---C-C-C--AT-G-----C----------A------TACAGGTA-C----G-----T-A-T-------------------T-TCTCATACAT-GC--ATTTTGG---T--A----C--TT---CA-----C--CTATAGA-G-------CTCCCAA-T-----T--G--C-T-TA--C-G---TT------T-----T----A----A-A--AT-G-AGTC-GGTGCA--AA------T-----T-T-C---T----C--A--A----A-C--A---GA-----C--G-T---A-A-AACA--A---A-C----AA-A--AACCAgtatgtaattataaacaacc
gi|34 : gcgcCCG-GGT-T---A-G---A-----A-T-A--G----G--CC----C------AG------C--A---CC--C---C--T-T-G-----C-----T-TG--T---C-G-------T------AAG-A----G------G---CG-A--C------T----A-A--T-GG--G-----G-C---G--G----T--C-----------C---------T--T-C---GG---------------A---T-G-A-G-------------C-----C--G---C-A--A----AA------AC--C-aacaaaacagtctttgattataaatcattttggatt
gi|34 : ac-T-TA---A-------A--GG-C---C--------------A---T-G--A---G-C--G---C-C-G--A--G-----C----------A------A--AGGCC-T----A-----A-A-T-------------------C-T----------GC--A-----G---C--C----C--TT---CA-----C--C-----G-G-------C-----A-A-----T--G--G-T-GA--T-G---TC------T-----C----C----A-T--AT-G-GAT--G----A--AA------T--A--T-T-C---T----CA-A--G----A-G--G---GA-----C--G-T---A-A-AAC---G---A-C----AT-AT-AATCAttttaaaggccatgagcgccgagcaaaggcctaaatctgcagcccttcaccggcaatggtgatgtctccatatggatgaaatattctcaagagggacgtaaaacgacatataatca
gi|35 : acccgggttagaataggcccagcaccccttgcttgtcgtaagaggcgactaatggggcggtccttcggatgagccgcaaaaacctt------AAG-A----G------G---CG-A--C------T--A-A-A--T-CG--G-----G-C---G--G----T--C-----------C---------T--T-T---AG---------------A---T-G-A-G----------C--C-----C--A---C-A--A----AA------AC--T-G----------------------A-G---G---C-T-A--C--A-T--A-T----T---------A--C--A--G------------C--A-------T--G----------------------TG-C-------GG----------T-----ACG-A--TA----A-----AGG--C--C-C-A-----T--C-T--A--AG--C-T-TA---A-------A--AG-C---C--------------C---T-A--A---G-T--T---A-C-A--A--A-----C----------A------T--AGGCC-T----A-----A-A-G-------------------T-T--------T-GC--A-----G---C--C----C--CC---TA-----C--C-----G-A-------C-----A-A-----T--G--G-T-GT--C-GC--TC------T-----C----
gi|36 : gttgagatcgggtcagtactactagcttggta--GA-C---C--------------C---T-G--A---G----------C-G--AATG-----C----------ATACATGT--AGAAC-A----A-----A-C-T-------------------TAT--------T-GT--G-----G---T--A----C--TT---CG-----C--CTATA-G-A-------C-----A-C--------G--A-T-GA--C-G---TT------T-----C----A----A-T--ATAG-CGT--A----G--AG------T--G--C-T-C---A----A--A--C----T-G--G---AA-----C--A-T---A-A-TAA---G---A-T----GA-AC-AATCAga
gi|37 : cgacgtaggaaccttactgttgt---G--G----T--C-----------A---------T--T-C---GG---------------A---T-G-A-G----------A--C------------G-A--A----AA------AC--C-G----------------------A-G---G---T-C-C--C--G-T--G-T----C---------A--C--A--G------------C--A-------G--GT---------------------TG-T-------GG----------C-----ACG-A---A----A-----AGA--T--C-C-T-----C--C-C--T--TG----T-C----A-------A--GG-C---C--------------C---T-G--A---G-T--aaagaaatattagtttagatccataaagaatttcagatt
gi|38 : CCG-GAT-T---A-C---A-------C-A--A----G--CC----C-C--C-GG------C--AG--TA--C---C--T---G-----C-----T-TG--T---C-G-------TC-----AAG-A----------------------------T----A-A--T-G-----------C---T--G----T--C---------------------T--T------G---------------T---C-G-C-G----------A--C------------G-A--A----AA------AC---------------------------------G-------C--C--G-C--A------A---------A--C--G--G------------C--A-------G-------------------------TG-T-------G-----------C-----ACG-A--AAG---A-----AGAC-T--C-C-C-----T--CTC--C--TG--C-T-CA---A-------AA-GG-C---C--------------A---T-A--A---A-T--G---C-C-G--A--------C----------A------T---GGCC-T----G-----A-A-T-------------------T-T--------C-AC--A-----G---C--ccataccacattaagtatatctcacgaggtatatcaagatcaatgactcaaattcaggtatattataccataagtagagcttgtggatgtgttta
gi|39 : tacgaacctgtgaagatcgCG-GGT-T---T-G---A-------T-A--G----A--TC------T--C-AG------T--AA--CCG-C---C--T-------------------------C-G-------T------AAG-AT---G------G---CG-A--C------T--A-A-T--C-GG--A-----G-C---G--GCTCCT--C-----------A---------T--A-C---GG---------------A---T-A-ACG----------A--G-----T--A---G-A--A----AACAT---AC--C-G----------------------A-G---G---C-C-CA-C--A-T--G-T----T---------ATCC--A--A------------A--A-------A--G----------------------C-----------G----------A-----ACG-A--T-------------A--T--C-C-C-----T----C--C--TG--CTT-CA---A-------A--A---------------------C---T-GGAA---G-T--GA--C-C-A--G--G-----C----------T------A--AGGCC-T----A-----T-A-T-------------------T-T--------gtt
gi|4 : cgtgggaatG-GGT-T---A-G---A-----A-T-A--GTAGGA--TC----CGT--C-AG------C--AG--CC--T---CGGTGT-G-----C-----G-TG--TTG-C-G-------T------ACG-A----GCG----G---CG-AGGC------T--GCA-A--T-GG--G-----G-AA--G--G----TG-C-----------A---------TG-T-C---GGGGATGTCCGCGTGCCA---T-G-A-GGAGCGTGGATA--C-----A--G---G-A--A----A-----------C-G----------------------A-A---G---TGCGC--C--G-C--G-TTGTCC---------A--C-----G------------C--A-------G--G----------------------TG-G-------TG----------C------CG-A--AA----A-----AGA--T--C-C-TCGAGAT--C-C--CGGTG--C-G-TA---AG------A--GG-CG--C--------------C---T-G--A---GGT--G---C-C-G--A--GAGA--C----------A------T--AGGCT-A----G-----A-A-TAA-----------------G-T--------T-GC--A-----G---C--G----C--CTGTGCA-----A--C-----G-G-------C-----A-G-----A--T--G-T-GA--C-G---TC------T-----CG---C----A-TAAAG-G-AGT--G--------A------T--A--G-T-TGG-T----C--G--G----T-G--G---AAACGCTC--G-T---A-A-
gi|40 : TCCG-GGC-T---A-G---A-----A-T-A--G----G--TC----C-T--C-AG------C--AT--TT--C---C--T-T-G-----C-----G-TG--T---C-G-------T------TAG------G------G---CG-A--C------T--G-A---------------------------------------------A---------T--T-C---GG---------------A---T-G-A-G----------A--C-----C--G---C-A--T----AC------AT--C-G----------------------A-G---G---T-C-C--C--G-T--G-T----C---------A--C--A--G------------C--A-------G--A----------------------TG-T-------GG----------C-----ACG-A--AA----A-----AGA--T--C-C-C-----T--C-CT-T--TC--C-T-CA---A-------A--GG-C---C--------------C---C-G--A---G-T--G---C-C-G--A--G-----C----------A------C--AGGCC-T----A-----A-ATT-------------------T-T--------T-GC--A-----G---C--C----C--gcatatataa
gi|41 : aTCCG-GGT-T---A-G---A-----A-T-A--G----G--TC----C-C--C-AG------C--AT--CC--C---C--T-T-G-----C-----G-TG--T---C-G-------T------AAG-A----G------G---CG-A--C------T--G-A-A--T-GG--G-----G-C---G--G----T--C-----------A---------T--T-C---GG---------------A---T-G-A-G----------A--C-----C--G---G-A--A----AA------AC--C-G----------------------A-G---G---T-C-C--C--G-T--G-T----C---------A--C--A--G------------C--A-------G--G----------------------TG-T-------GG----------C-----ACG-A--TA----A-----AGA--T--C-C-C-----T--C-C--C--TG--C-T-CA---A-------A--GG-C---C--------------C---T-G--A---G-T--G---C-C-G--A--G-----C----------A------T--AGGCC-T----
gi|43 : G-T-------GG----------C-----ACG-A--TG----A-----AGA-----A-C-T-----T--C-A--C--TG--C-T------A-------C--GG-C---C--------------C---T-G--
gi|44 : cG-GGT-T---A-G---A-----A-T-T--G----G--CG----C----C-AG------C--AC--CTAAT---T--T-C-G-----C-----C-TG--T---C-G-------T------AAGTA----G------G---CG-A--C---------G-A-A--T-GG--G-----G-C------G----T--C-----------A---------T--T-C----G---------------A---T-G-G---------------------C--GT--G----------A------AC--C-G----------------------A-A-----------C--C--G----A-T----C------------C--A--G------------C--A-------G--G----------------------T-----------------------------TA-A--AA----A-----AGG--A--C-C----------C-C--C--CG----T-CG---A-------A--G------C--------------C---T-G--A---G-T--G---gtccctgccatacaggtacgttatttctgatacatgtgtttgtacttccctatagagcttcacatgcttacgtttttaaaaagatcggtcaaatttctcaaacagacgataaaaacaaacaaa
gi|45 : ggagtcacga---------A--C--A--G------------C--A-------G--G----------------------TA-T-------GG----------C-----ACG-A--TA----A-----AGA--C--C-C-C-----T--T-C--C--TG--C-T-GG---A-------A--AG-C---C--------------A---T-G--G---A-C--A---T-T-G--A--G-----C----------A------C--AGGCT-T----A-----A-G---------------------T-T--------T-GT--G-----G---C--C----C--TT---CA-----C--C-----A-G-------C-----A-A-----T--G--G-T-GAT-T-G---TC------T-----C----T----A-T--AT-C-AGT--G----A--AA------T--A--T-T-C---T----CA-A--G----A-G--G---GA-----C--T-T---A-A-AAC---A---G-T----gattttccaagtgggacctaa
gi|46 : --T-T-G-----T-----G-TA--TGAAC-G-------C------AAG-A----G------GG--CG-AA-C------T--GGA-A--T-GAAAG-----T-C---G--G-------------------A---------TG-T-C---GA---------------C---T-G-A-G----------AAGCAG---C--A---A-A--A----GA------ACA-C-G----------------------A-GT--G----------C--G-TAAG-T----C---------A--C--A--G------------C--ATG-----G--A----------------------TG-T-------GG----------C-----A-G-A--AA----A-----AGA--T--CAA-C-----T--CTC--C--TG--C-T-CA---ATAATGAGA--GG-C---C--------------T---G-G--AG--G-T--G---C-A-G--AC-G-----C----------A------ttacaaccaacc
gi|47 : GGATCCG-GCT-T---A-G---A-----A-TAA--G----G--TCTAGTC-A--C-AG------C--AT--CCG-C---CATT-T-A-----C-----G-TG--T---
gi|48 : acccccccccccccccccccccccccccccctttcgagtcaaataacttgagtccgccagaatctgattacacatttgcataattgtttcgaacccgtG-T-------TG----------C-----ACG-A--TT----C-----AGA--A--C-C-C-----T--G-G--C--TG--C-T------A-------C--GG-C---C---------------------------G-T-------------A--G-----A----------A------TC-AGGCC-T----C-----G-A-TTAATA--------------T-T--------T-CT--A-----G---C--A----T--TT---CA-----C--CTAA--A-G-------C-------------T--G--G-T-AA--C-G---AA------T-----C----T----A-C--AA-G-AAT--G----A--AA------T--A--T-T-C---T----ta
gi|5 : -GGT-T---AAG---A-----A-T-AACG----G--TC----C-TA-C-GC------C--AC--CT--C---CAGT-G-G-----C-----GGTGAAT---C-GAG-----T------AAGTA----G------GA--CG-A--C------T--G-ATAC-T-GG--G-----G-CT--GCCG----T--C-----------A---------C--T-C---GAGGTA-----------A---T-G-A-G----------A--C-----CC-G---G-A--A----AATA----AC--C-G----------------------A-G---G---T-A-CTAC--A-T--G-T----C---------A--C--ACAG------------C--A-------A--GA---------------------TGAG-------GG----------C-----ACG-A--TA----A-----AGG--C--C-CAT-----T--T-C--C--AG--C-T-TA---A-------A--AG-CGCGC--------------C---T--------G-T--G---C-CAG--A--T-----A----------A------TA-AGGCC-T----AT----A-A-T-------------------TAT--------T-GC--AT----G---G--C----T--AA---CA-----CCAC-----G-GAGGAA--C-----A-G-----G--G--T-T-GA--T-G---TC------T-----C----CCATAA-T--AG-A-AGTC-G----A--AA------T--A--T-T-C---TGC--C--G--GGTA-T-GA-G---AA-----C--G-T---T-A-AAC---A---A-T----AA-CTCAATCAttaagggtccattcaaaccaacataccaaacaaaa
gi|50 : --A-------G--G----------------------CG-TT------GG----------C-----ACG-C--TA----A-----CGA--A--C-C-C-----T--C-G--C--TG--C-TACA---------------G-C---C--------------C---T-G--A---G-T--G---C-T-A--A--G-----C----------A------T---------------------------------------------T--------T-GT--G-----G---T--A----T--TC---CA-----C--C-----T-A-------C-----A-G-----C--T--A-C-AA--T-G---TC------T-----T----A----A-T--AT-G-AGT--G----A--AA------G--A--T-C-T---T----T--G--A----C-A--G---AA-----C--G-T---A-A-AAC---A---A-acctca
gi|51 : --C---C--T-T-G-----C-----G-TG--T---C-G-------CCGTACAAAG-A----G------G---CG-A--CGTCTCGT--A-A-A--T-GC--G-----A-CCATG--C----T--C-----------AGCCAGTCTCT--T-CA--GG---------------ACGTT-G-A-G----------A--C-----C--G---A-A--A----AA------ACGGC-G----------------------A-GTGAG---C-C-C--CTGA-T--G-T----C---------A--C--A--aca
gi|52 : tttCCA-GGT-T---G-G---A-----A-T-A--G----G--TC----C-C--CTAG------C--AT--CC--C---C--T-T-G-----T-----G-TG--T---C-G-------T------AAG-A----G------G---CG-A--C------T--G-A-A--T-GG--G-----G-C---G--G----T--C-----------C---------T--T-C---GT---------------A---T-G-A-G----------A--C-----C--G---C-A--A----AA------AC--C-G----------------------A-G---G---T-C-C--C--G-T--G-T----C---------A--C--A--G------------C--A-------T--G----------------------TG-T-------GC----------C-----ACG-A---A----A-----Atgaaggcag
gi|53 : -----C-----G-TG--T---C-G-------T------AAG-A----G------G---CG-A--A------T--G-A-A--T-GG--G-----A-C---G--G----C--C-----------A---------T--T-C---GG---------------A---T-G-A-G----------A--C-----C--G---C-A--A----AA------AC--C-G----------------------A-G---G---T-C-C--C--G-T--G-T----C---------A--C--A--G------------C--A-------G--G----------------------TG-T-------GG----------C-----ACG-A--AA----A-----AGA--T--C-T-T-----T--C-C--C--TG--C-T-CA---A-------A--GG-C---C--------------T---T-G--A---G-A--G---C-C-G--
gi|54 : --G-T--G-T----C---------A--C--A--G------------T--A----------G----------------------TG-T--------G----------C-----ACGAA--TAAATTA-----AAA--T----C-C-----T--T-C--C--TG--C-C-CA---A-------A--GG----------------------------------------------------G-----C----------AC-----T--AGGTC-T------------A-T-------------------T-T--------TGGC--A-----G------C----C--TT---TA-----C--T-----G-T-------C-----A-T-----G--T--G-T-GA--C-----------------------------------T-G-AGT--G----A--AA------CA-A--T-T-C---T----
gi|55 : cgatgccactgGGATCCA-GGT-T---A-G---A-----A-T-A--G----G--TC----C-C--A-AG------T--AT--CC--C------T-C-A-----C-----T-TG--C---T-G-------T------AAG-A----G------G---CG-A--C------T--A-A-G--T-GG--G-----G-C---A--G----T--C-----------C---------T--TAT---GG---------------A---T-G-A-G----------A--C-----T--G---C-A--A----AA------AC--C-G----------------------A-G---G---
gi|56 : gGGTCCG-GGT-T---A-G---A-----A-T-A--G----G--TC----T-C--C-AG------C--AT--CC--C---C--T-T-G-----C-----G-TG--T---C-G-------T------AAG-A----G------G---CG-A--C------T--G-A-A--T-GG--G-----G-C---G--G----T--C-----------A---------T--T-C---GA---------------A---T-G-A-G----------A--C-----C--G---C-A--A----AA------AC--C-G----------------------A-G---G---T-C-C--C--G-T--G-T----C---------A--C--A--G------------C--A-------G--G----------------------TG-ctttaataagtctacaag
gi|57 : ---C--C----C--TT---CA-----A--C-----G-G-------T-----A-TACATGT--A--GAT-GA--C-G---TC------TGTACACAATGC----A-T--AT-G-AGT--G----G--AATACTAGT--A--T-T-T---T----T--GA-G----A-G--T---GA-----T--G-C---T-A-AGC---A---T-T----AC-AC-AATCA
gi|58 : a-T---A-G---A-----A-T-A--G-------TC----C-TG-C-AAGT----C--AT--CC--C---C------G-----C-----G-TG--T---C-G-------T------AAG------------------G-A--T------T-----------------------C---G--G----T--T-----------------------------------------------A---T-G-A-G----------A--C-----C--G---GCC--A----AA------AC--A-G----------------------A-G---G-----C-C--C--G-T--A-T----atcacgtattgaatg
gi|59 : acccgtggggatatccggaattaagaatagaa-T-------------------C-T--------T-GC--A-----G---G--A----C--TT---TA-----C--C-----T-A-------C-----A-AA----T--T--C-T-GA--C-G---TC------T-----T----A----A-T--AT-G-TCT--G----A--AA------A--A--T-T-C---T----C--C--A----A-G--A---GA-----T--A-T---G-A-AAC---A---A-gtt
gi|6 : cgcatatctcagtacagtcaggTTCG-AGT-C---A-G---A-----A-T-A--G----G--TC----C-C--C-AG------C--AT--CC--C---C--T-T-G-----C-----A-TG--T---C-G-------T------AAG-A----G------G---CG-A--C------T--G-A-A--T-GG--G-----G-A---G--G----T--C-----------C---------T--T-C---AA---------------A---T-G-A-G----------A--C-----A--G---G-A--A----AA------AC--C-GGGGCCCCGTGTCACAGTAGGCGA-G---A---C-C-C--C--G-T--G-T----C---------A--C--A--G------------T--A-------G--GTGAGACCCCGTGTCACAGCAGGTG-T-------GG----------C-----ACG-A--TA----A-----AGA--T--C-C-C-----T--C-C--C--TG--C-T-CA---A-------A--CA-C---C--------------C---T-G--G---G-T--G---T-C-G--A--G-----C----------A------T--TGGTC-T----A-----A-A-TTTGCGAGCATTGGTCTAAAT-T--------T-GC--A-----G---C--C----A--TT---CA-----C--C-----G-G-------C-----A-A-----T--G--G-T-AA--C-G---TC------T-----C----C----T-C--AT-G-AGT--G----A--AA------T--A--T-T-C---T----C--GA-G----C-G--G---GA-----C--G-T---A-A-acacaaactaaac
gi|60 : GGGTCCG-GGT-T---A-A---A-----A-T-A--G----G--T
gi|61 : aaagtaaaatttaaaacaaaaactcaatttttttaaatatcaataattatttagtatcaattctccagctgtggcgacccgtgg---C-T-G--A--A-----C----------A------TT-AGGA--T----A-----A-A-T-------------------T-T--------T-GC--AG----G---C--C----A--TT---CA-----C--C-----G-G-------C-----ATT-----T--G--G-TGGA--C-G---TC------T-----C----CA---A-T--TT-GAAGT--T----G--AA------T--A--T-TCC---T----C--A--A----T-G--G---AG-----C--T-G---A-A-AAC---------T----AA-A
gi|63 : gagac---C--T-T-G-----T-----GGTT--T---C-A-------G------AAG-T----G------A---TG-G--C------T------A--T-TG--G-----G-T---T--G----T--T-----------A---------T---------G---------------A---T-G-A-G----------A--C-----C--T---C-A--A----AA------AT--C-A----------------------A-G---G---T-T-C--C--G-T--G-G----C---------A--C--A--GTAAACATCGGACC--A-------G--G----------------------TG-T-------GA----------C-----ATG-A--
gi|64 : GGGTCCG-GGT-T---A-G---A-----A-T-A--
gi|65 : aaaataagaaacacaaaacatgatagaacttcgaagtttcttataaatacttcattttcattccatcgcggtacccgtgg----------------------TA-T-------GG----------C-----ACG-A--TA----G-----AGA--A--C-C-T-----T--T-T--C--TG--C-C------A-------A--GT-C---C--------------C---T-G--A---G-C--G---C-C-T-----------------------------T--ACGTCAT----A-----A-----------------------T-T--------A-GT--G-----G---A--A----C--TT---TG-----T--C-----T-G-------T-----AGC-----T--G--G-T-GA--T-G---TC------T-----C----T----A-T--
gi|66 : aC-T----A-----A-------------------------T--------T-GC--A-----G---C--C----T--TT---CA-----C--C-----G-AACAGCTCC-----A-T-----T--A--G-T-GA--A-GATCTC------T-----C----A----A-T--AT-G-AATTCG----A--AA------A--AGTT-T-C---T----CTAA--G----T-G--G---GA-----C--A-T---cgaga
gi|67 : -----A-T-A--G----G--TC----C-T--C-AG------C--AT--CT--C---C--T-T-G-----C-----G-TG--T---G-G-------T------TAG-G----G------G---CG-A--C------T--G-A---------------------------------------------A---------T--T-C---TG---------------A---T-G-A-G----------A--C-----C--G---C-A--T----AC------AC--C-G----------------------A-G---G---T-C-C--C--G-T--G-T----C---------A--C--A--G------------C--A-------G--G----------------------TG-T-------gtctaataaaca
gi|68 : GCCCG-TGT-T---A-G---A-----A-T-A--G----G--TC----C----A-AG------CA-ATG-CG--C---A--T-T-G-----CCAGTGG-TG--TA--C-G-------TTA----AAG-A----G------G---GG-A--C------T----A-A--T-GG--GTAATTG-C---G--G----T--C-----------A------------T-C---GG---------------A---
gi|69 : gt------T-----C----C----A-T--AG-G-AAT--G----A--CA------C--A--T-TTC---T----C--AA-G----C-T--G---GA-----C--G-T---T-A-AAC---A---A-T----AT-GC-AACCA
gi|7 : ttttgtagtgtaccttgaattacggttacatata-A--G----G--TG----C-C--C-AG------CC-AT--GC--C---CGGT-CAG-----C-------TG--G---C-G-------G------AAG-AATGAG------G---TA-A--CGC----T--G-A-A--T-AG--G-----GTC---G--T----T--CCGAGCCTGCCTA---------TGAT-C---GG---------------A---T-G-C-GGA--------A--C-----CCGG---G-A--A----AA------AC--C-G----------------------A-C---G-----C-C--C--G-T----T----C---------A--C--A--G------------C--A-------C--G----------------------CG-TCCCATCTGG----------CCACTGACG-AC-TATC--A-----ACAC-T--A-C-C-----TTCC-C--C--CG--C-TGCA---A-------A--GG-C---C--------------C---C-G--ACTCG-T--G-----C-G--A--G-----CG---------A------T--AG--C-G----A-----A-A-TAG-----------------T-T--------C-GC--A-----T---CATC----CCATT---C------C--G-----G-G-------A-----A-G-----T--GCTG-G-GA--C-G---TT------T-----C----C----A-G--AG-G-AG---G----A--AA---------G--T-C-C---TA---C---------------G---GA-----C--G-A---A-A-AACAGAA---A-T----AA-GC-AATCAa
gi|70 : GGGTCAGCGATAT---A-T---A-----A-T-A--G----T--CT----C-G--C-AG------C--AT--TC--C------T-T-G-----CT----G-T---T---T-G-------T------AAG-A-----------G---TG-A--C------T--G-A-AATT-AG--G-----C-T---G--G----T--C---------------------C--T-C---GGA--------------A---T-G-A-
gi|71 : ggccgtCT-T----A-----A-A-T-------------------T-T--------T-AT--A-----G---C--C----C--TT---CA-----C--C-----G-C-------C-----A-A-----T--A--A-T-GA--CAG---TT------T-----A----C----A-T--AT------------------------C--A--T-T-C---T----C--G--A----G-A--G---GA-----
gi|72 : CG-GGT-T---A-GTACA-----ACT-G--G----A--TC----C-TT-C-AGA-----T--AT--CC--CTTAC--T-T-G--------------G--T---T-G-------T------AAG-AG---G------G---CG-A--A------T----A-A--T--A--G-----G-CTAAG--A----T--C---------------------T--T-A---GG---------------A---T-G-A-aaatgaaagtttaattacaaccaac
gi|73 : gaA----A-----AGA--T--C-C-C--------C-C--C--T---C-T-CA---G-------A--GG-G---A--------------A---T-A--A---G-C--T---C-T-A--A--G-----CG---------A------T--AGGTC-TC---A-----A-A-T-------------------T-T--------T-GC--AG----G---C--C----C--TT---CA-----CT-C-----A-G-------C-----A-A-----T--G--G-T-Ga
gi|75 : gaaa--A-------G--G----------------------TG-TT------GG----------C-----ACA-A--TA----A-----AGA--T--C-C-T-----T--C-A--C--CG--C-T------A-------A--GG-
gi|76 : G-GGT-T---A-GG--A-----A-T-A--G----AA-TC----C-TTCC-A-------C--AT--CC--C------T-T-GTAA--C-----G-TGA-T---C-G-------T------AAG-A-----------G---CG-A--C------TCGG-A-A--T--G--G-----G-C---G--G----T--agtcaattgcatacatgtatatggatttgtgtcatttcatctac
gi|78 : ccgtggagatcgaGA--T--C-C-T----------C--C--TG--C-T-CA---A----------GG-C---C--------------A---TAG--A---G-C--G---T-CTG--A--G-----C----------A------T--AGACC-G----A-----A-A-T-------------------G-T--------T-GC--A-----G---C--T----C--TT----A-----C--C-----G-G-------C-----A-------T--G--T-T-AAC-C-G---TC------
gi|8 : GGATCTG-GGT-A---A-G---A-----A-T-A--T----G--TC----C-C--T-AG------T--A---CC--C---C--T-T-C-----C-----T-TG--T---C-G-------A------CCG-A----G------G---CG-A--c
gi|8 : gG--G-----A-C---G--G----T--C-----------C---------T--T-C---GG---------------A---T-G-A-G----------A--C-----C--G---C-A--ATTTTAA------AC--C-G----------------------A-G---G---T-C-gttgtaagaaaaaaaaacccagtggtaatcgtctaaggatataacaggaataagatagcaatggacgcgcagagcttggacggtccttcggatgagaccgcaattttaaaccgaggtcgagcatggaaataaattttgcagcccttcaatggcaatggtgacatatccatatatatgtgtgaaaacttctcaagtgggacgtacaacaatatgcaatcaa
gi|8 : gggatctgggtaagaatatgtccctagtaccccttccttgtcgaccgaggcgagttgtaagaaaaaaaaacccagtggtaatcgtctaaggatataacaggaataagatagcaatggacgcgcagagctt--------------C---C-G--A---G----G---T-C-G--A--G-----C----------A------T--GGAAA-T----A-----A-A-T-------------------T-T--------T-GC--A-----G---C--C----C--TT---CA-----A--T-----G-G-------C-----A-A-----T--G--G-T-GA--C-A---TA------T-----C----CATATA-T--AT-G-TGT--G----A--AA------A--C--T-T-C---T----CA-A--G----T-G--G---GA-----C--G-T---A-C-AAC---A---A-T----AT-GC-AATCAgagcatggaaataaattttgcagcccttcaatggcaatggtgacatatccatatatatgtgtgaaaacttctcaagtgggacgtacaacaatatgcaatcaa
gi|80 : gggatctgggtaagaatatgtccctagtaccccttccttgtcgaccgaggcgagttgtaagaaaaaaaaacccagtggtaatcgtctaaggatataacaggaataagatagcaatggacgcgcagagcttggacggtccttcggatgagaccgcaattttaaa-A-T-------------------T-T--------T-GC--A-----G---T--C----C--------------------------------------------------G--G-T-GA--C-G---TC------T-----T----C----A----GT-G-AAA--A----A--AA------A--A--A-T-C---T----T--GA-G----T-G--G---GA-----G--G-T---T-A-AAC---A---A-T----a
gi|81 : --A--G-----C----------A------T--AGCCC-TTTATA-----A-A-TGT-----------------T-T--------T-GC--AC----G---C--CTCC-C--TT---CC-----A--C-----G-G-------C-----A-A-----TATG--G-T-GA--C-G---TC------T-----C----T----A-tttcaacaaacc
gi|82 : -T-CT---A-------A--GG-C---C--------------A---T-G--A---G-T--G---C-C-G--A--G-----C----------A------T--AGGCC-T----A-----C-ATT-------------------T-T--------T-GTTAA-----G---C--C----C--Tatc
gi|83 : taaataatcatttaa-----A-T-----T--G--T-T-GA--T-G---TC------T-----T----A----G-A--AT-G-AGT--G----A--AA---------A--TCT-T---T----C--G--AA---T-A--A---AA-----C--G-T---A-A-AAC---A---A-C----GA-AT-
gi|85 : -----T--G--G-T-GA--T-T---TC------T-----G----A----G-T--AT-G-AGC--G----A--CA------A--A--T-T-G---T----C--G--A----G-G--T---GA-----T--G-T---A-A-AAC---A---A-T----Acaa
gi|86 : atctacacgG------T--AT--CA--C---C--T---A-----C-----G-TG--T---C-G-------C------AAG-A----G------G---CG-A--T------T--T-A-A--T-GA--G-----
gi|87 : gttacacacccgttgggatccgg-G-AGT--G----A--AAGA----T--A--T-C-A---T----C--G--AGT--T-GC-G---GA-----C--G-TTTTA-A-AAC---A---A-T----AA-AT-AATCA
gi|89 : A--C-G---TC------T-----C----C----A-T--AT-G-AGC--G----A--TA------T--A--T-T-C---T----C--GA-G----T-G--G---GA-----C--G-T---A-A-AAC---A---A-T----AA-AT-AATCAtcatcgttc
gi|9 : tgtGGGTCCG-GGT-T---A-G---A-----A-T-A--G----G--TC----T-T--C-AG------C--AT--CC--C---C--T-T-G-----C-----G-TG--T---C-G-------T------AAG-A----G------G---CG-AC-C------T--G-A-A--T--G--G-----G-C---G--G----T--C-----------A---------T--T-C---GG---------------A---T-G-A-G----------A--C-----C--G---A-AACA----GA------AC--C-G----------------------A-G---G---C-CGC--C--G-T--G-T----C---------A--C--A--G------------T--A-------G--G----------------------TG-T-------GG----------C-----ACG-A---A----A-----AGA--T----C-C-----T--C-C--C--TG--C-T-AA---A-------A--GG-C---C--------------C---T-G--A---G-T--G---C-C-G--AG-G-----C----------A------T--AGGCC-T----A-----A-A-T-------------------T-T--------TCGC--A-----G------C----C--TT---CA-----C--C-----G-G-------C-----A-A-----T--G--G-T-GT--C-G---TC------------C----C----A-T--AT-G-AGT--G----A--AA------T--A--T-T-C---T----C--G--G----T-G--G---GA-----CGTG-T---A-A-AAC---A---A-T----AA-TT-AATC
gi|90 : cgtgg-----T--G--G-T-GA--T-G---TT------T-----T----C----A-T--GT-G-AGT--G----ATTAA------T--A--C-T-------------GAAA----T-G--G---GA-----A--G-T---A-A-AAC---A---G-T----
gi|92 : GGGTCCG-GGT-T---A-G---AAC---A-T-A--G--------------------AG------C--AT--AC--C---G--T-T-G-----C-----G-TG--C---C-gca
gi|93 : gttttgaattcgtgTCCA-GAT-T---A-G---A-----A-T-A--G----G--TC----C-T--C-AG------C--A---AC--T---C--T-T-G-----T-----G-TA--T---C-A-------T------AAG-A----A------G---CT-A--C------T--a
gi|94 : TCCA-GAT-T---A-G---A-----ATT-A--G----G--TC----C----A-AG------C--AA--CT--C---C--T-T-G-----T-----G-TA--T---C-A-------T------AAG-A----A------G---CT-A--C------
gi|95 : ----A-T--AT-G-AGT--G----A--AA------T--A--T-T-C---T----CA-A--G----A-G--G---GA-----C--A-A---A-A-AAC---A---T-T----GATAT-AA
gi|98 : t--AA------T--A--T---C---T----C--G--ACC--T-G--G---GA-----C--G-T---A-A-AAC---A---A-T----AA-AT-aacc
gi|99 : g------T--A--T-T-C---T----C--GA-G----A-G--G---GA-----C--T-T---A-A-AAC---A---A-T----Acatatg
15 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|42 ): CGTGTCACGGCAGAAACATTCACTGCTGCGGACCCCGCGTTTTACATGTGTAGGTCTGAATTTGTGGTACTTGTGGTACTTCACTTACAGTTGGCGACGTATTGATTTTTTCCAGAAGGGGAGTAAAACAAGCAAACAAACAAACAAACAAACCGTTGAATAT
Unaligned ( gi|49 ): ATTCCTTGTTGCTACGGCTCTGAGTGTCATACAGAAGTCTGAATCTGAATTTATATTTACAGTTGATTGCTTCTTTATATGAGTTATCGATAAATTATTCAAGGGACGTTAAATCAATGAAGCAAAATC
Unaligned ( gi|62 ): AAGGATTCACTCTGCTATGGCCCTGAGCGCCAAAATCTAAAGATGATGATGGCTGTACGTTGGGCGTTTTTGAGTGGGACGTAAAACTACAAACAAACTA
Unaligned ( gi|74 ): AGCATGCCATTATCAGTCATAAAAGGAGACCTTTGGAATGGTCGTCCTTCTTATGTGGCTGCAAAGACAGGAGTCTTGTGTC
Unaligned ( gi|77 ): GTGTCCAGGGTCCGTGGTTGCCCAGCTCTTGTTTTTGTATTCTATTTAAGACTTGCGAGATTGGTCCTGTGTCGTTATA
Unaligned ( gi|79 ): CAGGAGTTGGCACGTTAAATAACCCCCGCTATAGAATGAGTTCTCATTTATGGTGCTTCACCCACAACCGGTG
Unaligned ( gi|84 ): ACCTACAGTTTGTGCCATCTTAATATGAGTGAAAAATTCCCCAACGAAAGTCAAACAAACA
Unaligned ( gi|88 ): CAAAGGTAATTTCTATATAAGTGAAGTAGTTTGGAATCGGATGTAAAATCAACCAACA
Unaligned ( gi|91 ): AACTTGAAAATACGGATATATATTTCATTGCAGTGGTAGAATAAGAAATTTATT
Unaligned ( gi|96 ): TAACGACCCTTCATGAGTGAAATATACTAGAGCTGGACGATAAAC
Unaligned ( gi|97 ): CATGTGAGTGAAAATTATCAAGCGGGGACGAAACACAAATTCAAT
Unaligned ( gi|105 ): TCTTCAACAACGACCCGTGGGGATCCGGGTTAGAATA
Unaligned ( gi|113 ): CATATCTACGACCCGTGGGGGTCCGGGTTAGAAT
Unaligned ( gi|115 ): ATTGCATGAAACCCGTGGGGGTCCGGGTTAGAA
Unaligned ( gi|117 ): GACCCGTGGGGGTCCAGGTTAAAATAGG
Alignments
lowQualScore : 111111111111111111111 1111111111111111111111 111111111111111111111 111111111111
lowQualScore : 0 0 111 0 222 22222 3 0 22 1111 11 2222 7777 1 444444 33 11 22 666666 0 0 33333 3333333 11 333 0 4444444 666666 1 3333 333333 333 0 22 444444 7777 0 11 11 11 2222222 444 11 2222 11 222222222222222222222 22 0 222 777777777777777 111 0 0 1 4444444444 11 44444 22 55555 11 2222 555555 22 0 7777777777777777777777 0 222 44444 2 22 22 0 11 0 1111 333333333 22 22 33 555555555555 11 4444444 11 0000000000000000000000 1 5555555 3333333333 33333 1 222 3333 22222 33 11 0 1 22222 11 1 11 11 22 0 2 222 3333333 22 0 333 777777777777777777 0 11 222 1 11 222 0 2 11 33 33333 5555555555 444444 33 0 2222 22222 0 111111111111111111111 1 55555555 1 11 55555 111 11 3333 11 111 22222 11 55555 1 5555555 44444 8888888 11 11 0 0 22 0 222 333333 33333 444444444 1 11 1 0 22 1111 11 333333333 00 0 2 222 3333 999999999999 22 111 33333 11 0 111 0 1 222 111 0 3333 1 1
lowQualScore : . . ... . ... ..... . . .. .... .. .... .... . ...... .. .. .. ...... . . ..... ....... .. ... . ....... ...... . .... ...... ... . .. ...... .... . .. .. .. ....... ... .. .... .. ..................... .. . ... ............... ... . . . .......... .. ..... .. ..... .. .... ...... .. . ...................... . ... ..... . .. .. . .. . .... ......... .. .. .. ............ .. ....... .. ...................... . ....... .......... ..... . ... .... ..... .. .. . . ..... .. . .. .. .. . . ... ....... .. . ... .................. . .. ... . .. ... . . .. .. ..... .......... ...... .. . .... ..... . ..................... . ........ . .. ..... ... .. .... .. ... ..... .. ..... . ....... ..... ....... .. .. . . .. . ... ...... ..... ......... . .. . . .. .... .. ......... .. . . ... .... ............ .. ... ..... .. . ... . . ... ... . .... . .
lowQualScore : 8 8 333 8 111 99999 0 7 55 6666 88 4444 3333 6 111111 44 99 66 222222 8 8 11111 5555555 88 111 8 9999999 111111 5 1111 222222 666 8 55 000000 8888 8 99 77 11 2222222 333 99 5555 99 222222222222222222222 66 8 222 444444444444444 444 8 8 6 8888888888 11 11111 00 22222 22 7777 111111 99 9 7777777777777777777777 9 444 22222 7 22 22 9 22 9 9999 666666666 11 11 00 666666666666 22 0000000 22 4444444444444444444444 6 4444444 6666666666 88888 6 000 7777 99999 99 11 8 6 99999 99 6 99 11 88 8 4 222 3333333 66 8 555 111111111111111111 8 88 111 5 11 111 8 4 11 44 33333 8888888888 111111 55 8 4444 88888 8 444444444444444444444 5 00000000 6 99 11111 333 88 8888 11 444 00000 99 33333 7 6666666 00000 3333333 99 99 8 8 66 8 111 777777 00000 777777777 5 88 5 8 55 6666 00 999999999 99 7 7 111 0000 111111111111 33 222 44444 99 7 222 7 5 111 333 8 0000 1 1
consensus : GGGTCCG-GGT-T---A-G---A-----A-T-A--G----G--TC----C-T--C-AG------C--AT--CC--C---C--T-T-G-----C-----G-TG--T---C-G-------T------AAG-A----G------G---CG-A--C------T--G-A-A--T-GG--G-----G-C---G--G----T--C-----------A---------T--T-C---GG---------------A---T-G-A-G----------A--C-----C--G---G-A--A----AA------AC--C-G----------------------A-G---G---T-C-C--C--G-T--G-T----C---------A--C--A--G------------C--A-------G--G----------------------TG-T-------GG----------C-----ACG-A--TA----A-----AGA--T--C-C-C-----T--C-C--C--TG--C-T-CA---A-------A--GG-C---C--------------C---T-G--A---G-T--G---C-C-G--A--G-----C----------A------T--AGGCC-T----A-----A-A-T-------------------T-T--------T-GC--A-----G---C--C----C--TT---CA-----C--C-----G-G-------C-----A-N-----T--G--G-T-GA--C-G---TC------T-----C----C----A-T--AT-G-AGT--G----A--AA------T--A--T-T-C---T----C--G--G----T-G--G---GA-----C--G-T---A-A-AAC---A---A-T----AA-AT-AATCA
Reference ( family-1360 ) : GGGTCCG-GGT-T---A-G---A-----A-T-A--G----G--TC----C-T--C-AG------C--AT--CC--C---C--T-T-G-----C-----G-TG--T---C-G-------T------AAG-A----G------G---CG-A--C------T--G-A-A--T-GG--G-----G-C---G--G----T--C-----------A---------T--T-C---GG---------------A---T-G-A-G----------A--C-----C--G---G-A--A----AA------AC--C-G----------------------A-G---G---T-C-C--C--G-T--G-T----C---------A--C--A--G------------C--A-------G--G----------------------TG-T-------GG----------C-----ACG-A--TA----A-----AGA--T--C-C-C-----T--C-C--C--TG--C-T-CA---A-------A--GG-C---C--------------C---T-G--A---G-T--G---C-C-G--A--G-----C----------A------T--AGGCC-T----A-----A-A-T-------------------T-T--------T-GC--A-----G---C--C----C--TT---CA-----C--C-----G-G-------C-----A-N-----T--G--G-T-GA--C-G---TC------T-----C----C----A-T--AT-G-AGT--G----A--AA------T--A--T-T-C---T----C--G--G----T-G--G---GA-----C--G-T---A-A-AAC---A---A-T----AA-AT-AATCA
gi|1 : GC-T---A-G---A-----A-T-AC-G----A--TC----C-T--C-AGTGAGCCC--AT--GC--C---T--T-T-G-----C-----T-TG--T---CCG-------C------ACG-A----G------G---CG-A--G------T--ATA-A--T-CG--A-------C---G--G----C--CCT---------G---------T--C-C---GT---------------A---TCG-ACG----------A--C-----A--A---G-G--A----AAGATAAGAC--TTG----------------------A-G---GCTGT-G-C--C--A-T--G-T----C---------A--C--A--G------------CAAA-------G--G----------------------AG-T-------GA----------------ACG-A--TA----A-----AGAATT--C-C-CT----T--C-C--C--AGC-C-C-CA---A-------A--GA-T---C--------------------G--A-----T--A---TAC-G--A--G-----CTTCGCGACAAA------T--AAGA-------A-----A-A-A-------------------T-T--------G-GC--A-----C---CT-C----T--TT---TA-----C--C-----GCG-------CGA---A-A-----T--GA-G-A-AA--T-G---TTA-----T-----CACG-C----A-T--ACGG-ACT--G----A--AA------C--A--T-TGA---T----C--AACG----T-C--G---GG-----C--C-T---A-GCAAC---A---A-TTA--AA-AC-AATCA
gi|10 : ttacacaagccattatcactaccgtgaagaggctaccagaaGGATCCG-GGT-T---A-G---A-----A-T-A--G----G--TC----T-T--C-AG------C--AT--CC--C---C--T-T-G-----C-----G-TG--T---C-G-------T------AAG-A----G------G---CG-A--C------T--G-A-A--T-AG--G-----G-C---G--G----T--C-----------A---------T--T-C---GG---------------A---T-G-A-G----------A--C-----C--G---G-A--A----AA------AA--T-G----------------------T-G---G---C-T-C--C--G-T--G-T----C---------A--A--G--G------------C--A-------G--A----------------------TG-T-------GG----------C-----ACA-A--TA----A-----AGA--T--C-C-C-----T--C-C--C--TG--C-T-CA---A-------A--GG-C---C--------------C---T-G--A---G-T--G---C-C-G--A--G-----C----------A------T--AGGCC-T----A-----A-A-T-------------------T-T--------T-GC--A-----A---C--C----C--TT---CA-----C--C-----G-G-------C-----A-T-----T--G--G-T-GA--C-G---TA------T-----C----C----G-T--AT-G-AGT--G----A--AA------T--A--T-T-C---T----C--A--G----T-G--A---GA-----C--G-T---A-A-AAC---A---A-T----AA-AT-AATCatc
gi|100 : gtgg------T--A--T-T-C---T----C--GA-G----A-G--G---GA-----C--T-T---A-A-AAC---A---A-T----A
gi|101 : ------T--A--T-T-C---T----C--GA-G----A-G--G---GA-----C--T-T---A-A-AAC---A---A-T----Attcaaccaaccaa
gi|102 : GGTCCG-GGT-T---A-G---A-----A-T-T--T----G--CC----C-C--C-AG------C--AT--CC--ttcaaccaaccaa
gi|103 : tacccttagaT--G----A--AA------T--A--T-T-T---TTTTTC--G--G----T-G--G---GA-----C--G-T---A-A-AAC---A---A-T----AA-AT-
gi|104 : GGGTCCG-GGT-T---A-G---A-----A-T-A--G----G--
gi|106 : atcacccgtgcaacccgtgg---G-T--G---C-C-G--A--G-----C----------A------T--AGGCC-T----A-----A-A-G-------------------T-T--------T-GC--A-----G---T--C----C--CT---CA-----C--
gi|107 : -T--C-AG------A--AT--CC--T------T-T-G-----C-----G-TG--T---C-G-------T------AAG-A----C------G---CA-A--C------T--A-A-A--T-
gi|108 : GGGTCTG-GGT-T---A-G---A-----A-T-A--A----G--TC----C-
gi|109 : ttgacatccgtga--A--T-T-C---T----C--G--G----T-G--G---GA-----C--G-T---A-A-AAC---A---A-T----TA-AT-AATc
gi|11 : GGTTCG-GGT-T---A-G---A-----A-T-A--G----G--TC----C-C--C-AG------C--AT--CC--C---C--T-T-G-----T-----G-TG--T---C-GGCTGTGTT------CAG-A----G------G---CG-A--C------T--G-A-A--T-GG--G-----A-C---G--G----T--C-----------C---------T--T-C---GA---------------A---T-G-A-G----------A--C-----C--G---G-A--A----AA------AT--C-G----------------------A-G---G---T-C-C--C--G-T--G-T----T---------A--C--A--G------------C--A-------G--A----------------------TG-T-------GG----------C-----ACG-T--TA----A-----AGA--T--C-C-C-----T--C-C--T--TG--C-T-CA---A-------A--GG-C---C--------------C---T-G--A---G-T--G---C-C-G--A--G-----C----------A------T--AGGCC-T----A-----A-A-T-------------------T-T--------T-GC--A-----G---C--C----C--TT---CA-----C--C-----G-G-------C-----A-T-----T--G--G-T-GA--C-G---TC------T-----C----C----A-T--AT-G-AAT--G----A--AA------T--A--A-T-C---T----C--GA-G----T-G--G---GA-----C--G-T---A-A-AAC---A---A-T----Aaatca
gi|110 : aT--G----A--AA------T--A--A-T-C---T----T--GA-G----T-G--G---GA-----C--G-T---A-A-AAC---A---G-T----AA-Acaa
gi|111 : --AT-G-GGT--G----A--AA------T--A--T-T-C---T----CA-A--G----T-G--T---GA-----C--G-T---A-A-AAC---A---a
gi|112 : GGGTCCA-GGT-T---A-G---A-----A-T-A--G----G--TC----
gi|114 : ttcacacccgtgg--T-T-C---T----C--AA-G----A-G--G---GA-----C--G-T---A-A-AAC---A---A-C----AT-AC-AATCA
gi|116 : GGACCTG-GGT-T---A-G---A-----A-T-A--G----G--TC----C-T--C-a
gi|118 : cccatga---------T--T-C---GG---------------A---T-G-A-G----------A--C-----C--G---C-A--A----AA------AC--C-G----------------------A-G---G---T-C-
gi|12 : GGGTCCG-GGT-T---A-G---A-----A-T-A--G----G--TC----C-T--C-AG------C--AT--CC--C---C--T-T-G-----C-----G-TG--T---C-G-------T------AAG-A----G------G---CG-A--C------T--G-A-A--T-GG--G-----G-C---G--G----T--C-----------A---------T--T-C---GG---------------A---T-G-A-G----------A--C-----C--G---G-A--A----AA------AC--C-G----------------------A-G---G---T-C-C--C--G-T--G-T----C---------A--C--A--G------------C--A-------G--G----------------------TG-T-------GG----------C-----ACG-A--TA----A-----AAA--T--C-C-C-----T--C-C--C--TG--C-T-CA---A-------A--GG-C---C--------------C---T-G--A---G-T--G---C-C-G--A--G-----C----------A------T--AGGCC-T----A-----A-A-T-------------------T-T--------T-GC--A-----G---C--C----C--TT---CA-----C--C-----G-G-------C-----A-T-----T--G--G-T-GA--C-G---TC------T-----C----C----A-T--AT-G-AGC--G----A--AA------T--A--T-T-C---T----C--G--G----T-G--G---GA-----C--G-T---A-A-AAC---A---A-T----AA-AT-AATCA
gi|13 : G----------C-----ATG-A--TA----A-----AGA--A--C-T-C-----G--C-T--T--TG--C-TACA---------------G-C---C--------------T---T-G--A---A----------C-G--A--AAGTCAT----------A------T--AGGTC------A-----A-A-C-------------------T-T--------C-G---A-----G---C--TA---C--TT---CA-----A--A-----GTA-------C-----A-A-----TT-G--G-T-GT--C-----TCAGAAATT-----C----C----AGT--AT-G-AAT--G----T--TG------T--A--A-T-G---T----T--G--GA---T-G--A---GA-----C--G-T---A-A-AAC---A---G-C----AA-A
gi|14 : ggagataatggagaatgtcacgtgacttttaacagtcatactttgcgtcaGTCCG-GGT-T---A-G---A-----A-T-A--G----G--TC----C-C--C-AG------C--AT--CC--C---C--A-T-G-----C-----C-TG--T---C-G-------C------AAG-A----G------G---CG-A--C------T--G-A-A--T-GG--G-----G-C---G--G----T--C-----------A---------T--T-C---GG---------------A---T-G-A-G----------A--C-----C--G---C-A--A----AA------AC--C-G----------------------A-G---G---T-C-C--C--G-T--G-T----C---------A--C--A--G------------C--G-------G--G----------------------TG-T-------GG----------C-----ACG-A--TA----A-----AGA--T--C-C-C-----T--C-C--C--TG--C-T-CA---A-------A--GG-C---C--------------C---T-G--A---G-T--G---C-C-G--A--G-----C----------A------T--AGGCC-T----A-----A-A-T-------------------T-T--------T-GC--A-----G---C--C----C--TT---CA-----C--C-----G-G-------C-----A-T-----T--G--G-T-GA--C-G---TC------T-----C----C----A-T--AT-G-AGT--G----A--AA------T--A--T-T-C---T----C--G--G----T-G--G---GA-----A--G-T---A-A-AAC---A---A-T----AA-AT-AATCAgacactaaatacttgtaaattagcattatgtgtttccagttcggacgcacgggcaatttattt
gi|15 : TCCG-GGT-T---A-G---A-----C-T-A--G----G--TC----C-T--C-AG------C--AT--CC--C---C--T-T-G-----C-----G-TG--T---C-G-------T------AAG-A----G------G---CG-A--C------T--G-A-A--T-GG--G-----G-C---G--G----T--C-----------A---------T--T-C---GG---------------A---T-G-A-G----------A--C-----C--G---G-A--A----AA------AC--C-G----------------------A-G---G---T-C-C--C--G-T--G-T----C---------A--C--A--G------------C--A-------G--G----------------------TG-T-------GG----------C-----ACG-A--TA----A-----AGA--T--C-C-C-----T--C-C--C--TG--C-T-CA---A-------A--GG-C---C--------------C---T-G--A---G-T--G---C-C-G--A--G-----T----------A------T--AGGCC-T----A-----A-A-T-------------------T-T--------T-GC--A-----G---C--C----C--TT---CA-----C--C-----G-G-------C-----A-A-----T--G--G-T-GA--C-G---TC------T-----C----C----A-T--AT-G-AGT--G----A--AA------T--A--T-T-C---T----C--G--G----T-G--G---GA-----C--T-T---A-A-AAC---A---A-T----AA-AT-AATCA
gi|16 : aGATCCG-GGT-T---A-G---A-----A-T-A--G----G--TC----C-T--C-AG------C--AT--CT--C---C--T-T-G-----C-----G-TG--T---C-G-------C------AAG-A----G------G---CG-A--C------T--G-A-A--T-GG--G-----G-T---G--G----T--C-----------A---------T--T-C---GG---------------A---T-G-A-G----------A--C-----C--G---A-A--A----AA------AC--C-G----------------------A-G---G---C-C-C--C--G-T--G-T----C---------A--C--A--G------------C--A-------G--G----------------------TG-T-------GG----------C-----ACG-A--TA----A-----AGA--T--C-C-C-----T--C-C--C--TG--C-T-CA---A-------A--GG-C---C--------------C---T-G--A---G-T--G---C-C-G--A--G-----C----------A------T--AGGCC-T----A-----A-A-T-------------------T-T--------T-GC--A-----G---C--C----C--TT---CA-----C--C-----G-G-------C-----A-T-----T--G--G-T-GA--C-G---TC------T-----C----C----A-T--AT-G-AGT--G----A--AA------T--A--T-T-C---T----C--G--G----T-G--G---GA-----C--G-T---A-A-AAC---A---A-T----AA-AT-AAT
gi|17 : CCG-GGT-T---A-----A-----A-T-A--G----G--TC----C-C--C-AG------C--AT--CC--C---G--T-T-C-----C-----G-TG--T---C-G-------T------AAG-A----G------G---CG-A--C------T--G-A-A--T-GG--G-----G-C---G--G----T--C-----------A---------T--T-C---GG-------------------C-G-A-G----------A--C-----C--G---T-A--A----AA------AC--C-G----------------------A-G---G---T-C-C--C--G-T--G-T----C---------A--C--A--G------------C--A-------G--G----------------------TG-T-------GG----------C-----ACGAA--AA----A-----AGA--T--C-C-C-----T--C-C--C--TG--C-T-CA---A-------A--GG-----C--------------C---T-G--A---G-T--G---C-C-G--A--G-----C----------A------T--AGGCC-T----A-----A-A-T-------------------T-T--------T-GC--A-----G---C--C----C--TT---CA-----C--C-----G-G-------C-----A-A-----T--G--G-T-GA--C-G---TC------T-----C----C----A-T--AT-G-AGT--G----A--AA------T--A--T-T-C---T----C--GA-G----T-G--G---GA-----C--G-T---A-A-AAC---A---G-T----AA-AT-AA
gi|18 : atggCCG-GGT-T---A-T---A-----A-T-A--G----T--TC----C-C--C-AG------C--AT--CC--C---C--T-T-G-----C-----G-TG--T---C-G-------T------AAG-A----G------G---CG-A--C------T--G-A-A--T-AA--G-----G-C---G--G----T--C-----------A---------T--T-C---GG---------------A---T-G-A-G----------A--C-----C--G---G-A--A----AA------AC--C-G----------------------A-G---G---C-C-C--C--G-T--G-T----C---------A--C--A--G------------C--A-------G--G----------------------TG-T-------GG----------C-----ACG-A--TA----A-----AGA--T--C-C-C-----T--C-C--C--TG--C-T-CA---A-------A--GG-C---C--------------C---T-G--A---G-T--G---T-C-G--A--T-----C----------A------T--AGGCC-G----A-----A-T-T-------------------T-T--------T-AT--A-----G---C--C----C--TT---CA-----C--C-----G-G-------C-----A-T-----T--G--G-T-GA--T-G---TC------C-----T----C----A-T--AT-T-AGT--G----A--AA------T--A--T-T-T---T----T--G--G----A-G--G---GA-----A--G-T---A-A-AAT---A---A-T----AA-AT-AATCAc
gi|19 : -GGT-T---A-G---A-----A-T-A--G-------TC----C-T--CCAG------T--AC--CC--C---T--T-T-C-----T-----T-TT--T---T-G-------T------GAG-A----G------G---C-----C------T--A-A-A--T-GG--G-----G-G---GC-G----T--C-----------C---------T--T-C---G----------------A---T-G-A-G-------------C-----C--A---C-A--A----A-----------C-G----------------------A-G---T---C-C-T--C--G----G-T--------------A--C--A--GA-----------C------------------------------------TG-T-------GG----------------AC--A--TA----A-----AGA--T--C-CTC-----T--C-C--T--TG--C-T-CAT--A-------A--GG-C---CAAAGCTGCTCAAGAC---T-A--A---G-T--G---C---A--A--G-----C----------A------T--AGGCC-T----A-----A-A-T-------------------T-T--------T-TG--A-----A---C--C----C--GT---CA--------C-----G-G-------CA----A-A-----T--G--G-T-GA--C-G---TC------T-----C----T----A-T--AT-C-AGT--G----A--GG---------A--T-T-T---C----A--A--G----T-G--G----------C--A-T---T-A-AAT---AGATA-T----AT-AC-AATCa
gi|2 : tG-GAT-T---A-G---ATCTTTA-T-G--G----GCTTT----T-T--C-AG------G--AT--CC--CT--C--T-C-G-----T-----G-TG--T---C-GGTT----T------AGG-A----GTTCGTAGTCTCG-A--AG-----T--G-A-G--T-GA--G-------C---G--G----TATT-----------A---------C--T-CTTGGG---------------C---T-G-A-C----------G--CATACTC--GTGTG-A--T----AA------ACA-C-G----------------------ATG---G---T-C-T--C--GGT--G-T----C---------A--CC-A--G------------C--A-------G--G----------------------TG-T-------GGGCGAAAGAAGC-----ATA-G--TA----A-----GGA--TGAT-C-C-----TG-C-C--C--TGG-C-T-CATAAG-------A--GG-C---CTT------------C---T-G--A---G-T--GGTAC-C-A--A--T-----------------------T--AGGCC-T----ACTGTTA-A-T-------------------T-TCCGTTT--T-GC--A-----T---G--C----C--TT---CA-----C--C-----G-A-------T-----A-T-----T--G--G-T-GA--A-T---TC------T---------------A-A--GT-T-GGT--G----A--AA------T--A--T-T-C---T----C--GA-G----T-A--G---GATATCGC--G-T---ATA-AAC---A---A-T----AA-AT-AAT
gi|20 : gtggggagttcgaaCCG-GGT-T---A-G---A-----AAT-A--G----G--TC----C-T--C-AG------T--AT--CG--C---C--T-T-G-----C-----T-TG--T---C-G-------T------AAG-A----G------GG--TG-A--C------T----A-A--T-GG--G-----G-C---G--G----T--C-----------T---------T--T-A---GG---------------A---T-G-A-G----------A--C-----C--G---C-A--A----AA-------T--T-G----------------------A-A---G---T-T-C--TT-G-T--T-T----C---------AA-C--A--G------------C--A-------G--G----------------------TGGT-------GA----------C------CG-A---A----A-----AGA--T--C-C-------T--C-T--C--TG--C-T-CA---A-------A--GA-C---C--------------A---T-T--A---GCT--G---C-C-G--A--G-----C----------A------A--AGGCC-T----A-----A-A-T-------------------G-T----------GC--A-----G---C--C----C--TT---CA-----C--C-----G-G-------C-----A-A-----T--G--G-T-GA--C-G---TC------T-----C----C----A-T--AT-G-AGT--G----A--AA------T--A--T-T-----T----C--A--A----G-A--A---GA-----C--G-T-----A-AAC---A---A-
gi|21 : gaGGATCCG-GGT-T---A-A---T-----A-T-A--G----T--TC----C----C-AG------C--AT--CC--C------T-T-G-----C-----G-TG--T---C-G-------C------AAG-A----G------G---CG-A--C------T--G-A-A--T-AA--G-----G-C---G--GG---T--C-----------A---------T--T-C---GG---------------A---T-G-A-G----------A--CG----C--G---G-A--A----AA------AC--C-G----------------------A-G---G---C-C-C--C--G-T--G-T----C---------A--C--A--G------------C--A-------G--G----------------------TG-T-------GG----------C-----ACG-A--TA----A-----AGA--T--C-C-C-----T--C-C--C--TG--C-T-CA---A-------A--GG-----C--------------C---T-G--A---G-T--G---T-C-A--A--T-----C----------A------T--AGGCC-T----A-----A-T-T-------------------T-T--------T-TT--A-----G---C--C----C--TT---CA-----C--C-----G-G-------C-----A-T-----T--G--G-T-GA--T-G---TC------C-----C----C----A-T--AT-G-AGT--G----A--AA------T--A--T-TCC---T----T--G--G----G-G--G---AA-----C----T---A-A-AAC---A---A-acatatcaa
gi|22 : tgg-GGT-T---A-G---A-----A-T-A--G----G--TC----C-T--C-AG------C--AT--CC--C------T-T-G-----C-----G-TG--T---C-G-------T------AAG-A----G------G---CG-A--C------T--G-A-A--T-AG--G-----G-C---G--G----T--C-----------A---------T--T-C---GG---------------A---T-G-A-G----------A--C-----C--G---G-A--A----AA------AT--C-G----------------------A-G---G---G-C-C--C--G-G--A-T--------------A--C--A--G------------C--A-------G--G----------------------TG-T-------GG----------C-----ACG-A--TA----A-----AGA--T--C-C-C-----T--T-C--T--TG--C-T-CA---A-------A--GG-C---C--------------C---T-G--A---G-T--G---C-C-G--A--G-----T----------A------T--AGGTC-T----A-----A-A---------------------T-T--------T-GC--A-----G---C--C----C--TT---CA-----C--C-----G-G-------C-----A-T-----T--G--G-T-GA--C-G---TC------T-----C----C----A-T--AT-G-AGT--G----A--AA------T--A--T-T-C---T----C--A--G----T-G--G---GA-----C--G-T-----A-AAC---A---A-T----AA-AT-AATCA
gi|23 : --G-A-T--T-GG--G-----G-C---G--T----T--C-----------C---------T--T-C---GG---------------A---T-GTA-G----------A--C-----T--G---G-A--A----CA----------C-T----------------------A-G---G---T-CTC--T--G-T--G-T----T------------C--AT-G------------C--A-------G--GGT--------------------TT-T-------GG----------CTAAT-ATG-T--TT----ATTTTCAGT--T--T-C-T-----T--C-CTTC--CG--C-T-TT---A-------ATTAG-TTTGC--------------G---T-G--A---G-T--G---C-CTG--T--G-----C-----------------T--GTGT-----------------T-------------------T-T--------T-GT------------T--C----T--TT---CA-----C--C-----G-G-------C-----A-------T--G--A-T-GA--G-T---TC------TGA---T----C----A-T--AT-G-A-T--G--------A------T--A--T-T-C---T----CT-T--G----T-G--G---GG-----C--a
gi|24 : aaataggtccagcaatgcccgtttggtctcgtcttggtttacatattcggtaa---A-----A-T-A--G----G--TA----C-T--A-AG------G--A---CC--T---A--T-T-AAAGACC-----T-TG--T---T-G-------T------AAG-A----G------A---TG-A--C------G--G-A-A--T-GG--G-----G-T---G--G----T--C-----------G---------T--C-C---AG---------------A-----G-A-G----------A--C-----
gi|24 : -G--G---GA-----C--G-T---T-A-AAC---A---A-T----AA-AT-AATtnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngggacgttaaacaataaataattgat
gi|25 : aataggtactaaggacctattaaagaccttgttgtaagagatgacggaatggggtggtcgtccagagagactnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn-GGT-T---A-G---C-----A-A-A--G----G--TC----G-C--C-AG------T--A---CC--C---C--T-G-G-----C-----T-TG--T---C-G-------T------AAG-A----G------G---CG-A--C------T--A-A-A--T-GG--G-----GGC---G--G----T--C-----------C---------C--T-A---GG---------------A---T-G-A-G----------A--C-----C--G---T-A--A----AC------AT--T-G----------------------A-T---G---C-C-C--C--T-T--G-T----C---------A--C--A--G------------T--A-------G--G----------------------TG-T-------GG----------C-----ACA-A--TA----A-----AGA---------------T--C-C--C--TG--C-T-CA---A-------A--GG-C---T--------------G---T-A--A---G-C--G---C-C-G--G--G-----C----------A------T--AGACC-T----A-----A-A-T-------------------T-T--------T-GC--A-----G---C--CCTGGC--TT---CA--------C-----G-G-------A-----A-A-----T--G--G-T-AA--T-G---TC------T-----C----C----A-TA-AT-G-AGC--A----A--AA---------------------------------------------GA-----C--GCT---A-ATAAC---A---A-T----AT-AC-AATCAtgat
gi|26 : aGGACCTG-GGT-T---A-G---A-----A-T-A--G----G--TC----C-T--C-AG------T--AT--CC--C------T-T-G-----C-----T-TG--T---C-A-------T------AAT-A----G------G---TG-A--C------T------A--T-------------T---A--G----T--T-----------C---------T--T-C---GG---------------A---T-G-A-G----------A--C-----------------------------------------------------------------A---T-C-C--C--G-T--G-T----C---------A--C--A--G------------C--ACTGAGCAG--G----------------------TG-T-------GG----------C-----ACG-A--TA----A-----AGA--T--C-C-C-----T--T-C--C--TG--C-T-CA---A-------A--GG-C---C--------------A---C-A--A---G-C--A---C-T-G--A--G-----C----------A------C--AAGCC-T----T-----A-A---------------------T-T--------C-AC--A-----G---T--C----C--TT---AA-----C--C-----C-A-------C-----A-A-----T--A--A-A-AA--C-G---TC------T-----C----G----A-T--TA-G-AGT--G----A--AA------T--A--T-T-C---T----CA-A--G----A-G--G---GA-----T--G-T---A-A-AAC---A---A-T----AC-AC-AAa
gi|27 : GGGTCCG-GGT-T---A-G---A-----A-T-A--G----G--TC----C----C-AG------C--AT--CC--C---C--T-T-G-----C-----A-TG--T---T-G-------T------AAG-A----G------G---CG-A--C------T------------------------------G----T--C-----------A---------T--T-C---AG---------------A---C-G-A-G----------A--C-----C--G---G----A----AA------AC--C-G----------------------A-G---G---T-C-C--C--G-T--G-T----CACATAAATGA--C--A--G------------C--A-------G--G----------------------TG-T-------GG----------C-----ACG-A--TA----A-----AGA--T--C-C-C-----T--C-A--C--TG--C-T-CA---A-------A--GG-C---A--------------C---T-G--A---G-T--G---C-C-G--A--G-----C----------A------C--AGGCC-T----A-----A-A-T-------------------T-T----------------------------------------------------------A-------C-----A-A-----T--G--G-T-GA--T-G---TC------T-----C----C----G-T--AT-G-AGT--G----A--AA------T--A--T-T-C---T----C--GA-G----T-G--G---GA-----T--G-T---A-A-AAC---A---A-T----AA-AT-AATCc
gi|28 : tggCCG-GGT-T---A-G---A-----A-T-A--G----G--TC----C-T--C-AG------TT-ATTACA--C---C--C-A-G-----C-----T-TG--T---C-G-------T------ATG-A----G------G---AG-A--C------T--A-A-A--T-GG--G-----G-T---G--G----T--C-----------C---------T--T-T---GG---------------A---T-G-A-G----------A--C-----C--G---T-A--A----AA------AT--C-A----------------------A-G---G---C-C-C--C--T-T--G-T----C---------A--T--G--G------------C--A-------A--G----------------------TG-T-------TG----------C-----ACA-A--TA----T-----AGA--T--C-C-C-----T--C-C--C--TG--C-T-TA---A-------A--GG-C---TG-------------T---T-A--A---G-T--G---C-T-G--A--G-----C----------A------T--AGGCC-T----A-----A--------------------------------------------------------------T---CA-----C--T-----G-G-------C-----A-G-----T--G--G-T-CA--C-G---TC------T-----------------------------------A--AA---------A--T-T-C---T----T--GA-G----C-A--G---GA-----C--A-T---T-A-AGC---A---A-TACACAA-AT-AATCA
gi|29 : c-T---A-G---A-----A-T-A--G----G--TC----C-A--C-AG------T--AC--CC--C---C--T-C-G-----C-----T-TG--T---C-G-------T------AAG-A----G------A---CG-A--C------T--------------------------------------------------A---------T--T-C---GG---------------A---T-G-A-G----------A--C-----C--A---C-A--A----AA------AC--C-G----------------------A-A---G---T-C-C--C--G-T--G-T----C---------A--C--A--G------------C--A-------G--G----------------------TG-T-------GG----------C-----ACG-A--TA----A-----AGA--T--T-C-C-----T--C-C--C--TG--C-T-CA---A-------T--GG-T---C--------------A---T-G--A---G-C--G---C-C-G--A--G-----C----------A------T--AGGCA-T----A-----------------------------T-T--------T-GC--A-----G---C--C----C--TT---CA-----A--C-----G-GC------C-----A-A-----T--G--G-T-GA--C-G---TC------T-----C----C----A-T--AT-G-AGT--G----A--AG------T--A--T-T-C---T----T--GA-G----A-G--G---GA-----T--G-T---A-A-AAT---A---at
gi|3 : CCG-GGT-TGAGA-G---A-----AAT-AT-G----G--TCG---C-T--C-AG------CTGGT--TC--C---C--G-T-G-----T-----G-TA--G---C-G-------TGTCTCAAAG-A----G------G---CGGA--C------T--C-A-A--TAGG--G-----G-C---G--A----G--CTTA--------A---------T--T-G---GG---------------A---T-G-A-A----------G--C-----C--G---G-A--AG---AA------AC--C-G----------------------A-G---GA--G-C-C--C--G-T--GGT----C---------A--T--AT-G------------C--A-------GAGG----------------------TG-TTG-----AG----------C-----ACG-AATCA----AT----AGA--T--C-C-C-----T--C-C--T--AGGAC-T-GA---A-------A--GGAT---C--------------CGCGT-G--A---G-CTAG---C-C-GTGA--G-----C----------AGA----T--AGGCT-T----A-----A-T-T-------------------T-T--------T-GCG-A-----G---T--T----C--CT---TG-----C--------G-G-------C-----A-------T--G--G-T-GA--C-G---TCA-----T-----C----C----ATT--AT-G-AGT--G--------A------T--A--C-T-CTCTT----C--G--GGAGTT-GGTG---GA-----CGTG-T---G-A-AAC---A---ATT----AA-AT-tacaaccaacaaca
gi|30 : ctggtggggttccgctaGGGTCCG-GGT-T---A-G---A-----A-T-A--G----G--TC----C-C--C-AG------C--AT--CC--C---C--T-T-G-----C-----G-TG--T---C-G-------T------A---------------------------------------------------------------------------------------------T--T-C---GG---------------A---T-G-A-G----------A--C-----C--G---G-A--A----AA------AC--C-G----------------------A-A---G---T-C-C--C--G-T--G-T----C---------A--C--A--G------------C--A-------G--G----------------------TG-T-------GG----------C-----ACG-A--AA----A-----AGA--T--C-C-C-----T--C-C--C--TG--C-T-CA---A-------A--GG-C---C--------------C---T-G--A---G-T--G---C-C-G--A--G-----C----------A------T--AGGCC-T----A-----A-A-T-------------------T-T--------T-GC--A-----G---C--C----C--TT---CA-----C--T-----G-G-------T-----A-A-----T--G--G-T-GA--C-G---TC------T-----C----C----A-T--AT-G-AGT--G----A--AA------T--A--T-T-C---T----C--G--G----T-G--G---GA-----C--G-T---A-A-AAC---A---A-G----AA-AT-AATCAtgtaatacaat
gi|31 : --G-T----C---------A--CCCA--G------------C--A-------G--G----------------------TG-T--------G----------T-----GCG-A--CA----A-----GAAACT--C-T-C-----A--C-C--C--TG--C-G-CA---A-------AG-GG-C---A--------------G---T-AT-A---G-C--A---C-G-G--A--T-----CA---------A------C--AGACC-T----A-----ACA-----------------------T--------T-GC--A-----GTATC--C----G--TT---CAAACAGT--C-----A-G-------C-----T-A-----C--G--T-C-GAGGT-G---TC------A-----C----C----A-T--AT-C-AAT--G----A--AA------TTAA--A-T-C---T----CGAG--G----TCG--G---AA-----C--G-at
gi|32 : gtgtgactgatagaacggtcttttaataacaaggtccttctaaaGGATCCG-GGT-C---A-G---A-----A-T-A--T----A--TC----C-T--C-AG------A--AG--AC--C---T--T-T-T-----T-----T-TA--T---C-A-------T------AAA-A----G------G---CG-A--T------T--A-A-A--C-TG--G-----A-C---A--G----T--C-----------C---------T--T-T---GG---------------A---A-A-A-G----------A--C-----C--G---C-A--A----AA------AC--C-G----------------------A-T---G---T-A-C--C--G-T--T-T----C---------A--C--A----------------------------------------------------------------G----------C-----ACG-A--TA----A-----AGA--C--C-C-C-----T--C-C--T--TG--C-T-CA---A-------A--GG-G---T--------------C--------A---G-A--G---A-T-G--A--G-----C----------A------T--ACGTC-T----attcgttattgaataataacaacca
gi|32 : tA--C-G---TC------T-----C----C----A-T--GT-G-ATT--G----A--AA------G--A--T-T-C---T----A--G---------G--GCTCAA-----C--G-T---T-A-AAC---A---A-T----ccatgtgattgaaagattctagggctcaacgttaaacaatgtatgtaattataaacaacc
gi|33 : tggatccgggtcagaatatatcctcagaagacctttttttatcataaaaggcgattaaactggacagtcctttggaaaagaccgcaaaaaccgatgtaccgtttcacagcacgataaagacccctccttgctcaaagggtcagagatgagcat-T-------GG----------C-----ACG-A--TG----A-----AGA--A--C-C-T-----T--C-A--C--TG--C-T------A-------C--GG-C---C--------------C---T-G------G-T--C---C-C-C--AT-G-----C----------A------TACAGGTA-C----G-----T-A-T-------------------T-TCTCATACAT-GC--ATTTTGG---T--A----C--TT---CA-----C--CTATAGA-G-------CTCCCAA-T-----T--G--C-T-TA--C-G---TT------T-----T----A----A-A--AT-G-AGTC-GGTGCA--AA------T-----T-T-C---T----C--A--A----A-C--A---GA-----C--G-T---A-A-AACA--A---A-C----AA-A--AACCAgtatgtaattataaacaacc
gi|34 : gcgcCCG-GGT-T---A-G---A-----A-T-A--G----G--CC----C------AG------C--A---CC--C---C--T-T-G-----C-----T-TG--T---C-G-------T------AAG-A----G------G---CG-A--C------T----A-A--T-GG--G-----G-C---G--G----T--C-----------C---------T--T-C---GG---------------A---T-G-A-G-------------C-----C--G---C-A--A----AA------AC--C-aacaaaacagtctttgattataaatcattttggatt
gi|34 : ac-T-TA---A-------A--GG-C---C--------------A---T-G--A---G-C--G---C-C-G--A--G-----C----------A------A--AGGCC-T----A-----A-A-T-------------------C-T----------GC--A-----G---C--C----C--TT---CA-----C--C-----G-G-------C-----A-A-----T--G--G-T-GA--T-G---TC------T-----C----C----A-T--AT-G-GAT--G----A--AA------T--A--T-T-C---T----CA-A--G----A-G--G---GA-----C--G-T---A-A-AAC---G---A-C----AT-AT-AATCAttttaaaggccatgagcgccgagcaaaggcctaaatctgcagcccttcaccggcaatggtgatgtctccatatggatgaaatattctcaagagggacgtaaaacgacatataatca
gi|35 : acccgggttagaataggcccagcaccccttgcttgtcgtaagaggcgactaatggggcggtccttcggatgagccgcaaaaacctt------AAG-A----G------G---CG-A--C------T--A-A-A--T-CG--G-----G-C---G--G----T--C-----------C---------T--T-T---AG---------------A---T-G-A-G----------C--C-----C--A---C-A--A----AA------AC--T-G----------------------A-G---G---C-T-A--C--A-T--A-T----T---------A--C--A--G------------C--A-------T--G----------------------TG-C-------GG----------T-----ACG-A--TA----A-----AGG--C--C-C-A-----T--C-T--A--AG--C-T-TA---A-------A--AG-C---C--------------C---T-A--A---G-T--T---A-C-A--A--A-----C----------A------T--AGGCC-T----A-----A-A-G-------------------T-T--------T-GC--A-----G---C--C----C--CC---TA-----C--C-----G-A-------C-----A-A-----T--G--G-T-GT--C-GC--TC------T-----C----
gi|36 : gttgagatcgggtcagtactactagcttggta--GA-C---C--------------C---T-G--A---G----------C-G--AATG-----C----------ATACATGT--AGAAC-A----A-----A-C-T-------------------TAT--------T-GT--G-----G---T--A----C--TT---CG-----C--CTATA-G-A-------C-----A-C--------G--A-T-GA--C-G---TT------T-----C----A----A-T--ATAG-CGT--A----G--AG------T--G--C-T-C---A----A--A--C----T-G--G---AA-----C--A-T---A-A-TAA---G---A-T----GA-AC-AATCAga
gi|37 : cgacgtaggaaccttactgttgt---G--G----T--C-----------A---------T--T-C---GG---------------A---T-G-A-G----------A--C------------G-A--A----AA------AC--C-G----------------------A-G---G---T-C-C--C--G-T--G-T----C---------A--C--A--G------------C--A-------G--GT---------------------TG-T-------GG----------C-----ACG-A---A----A-----AGA--T--C-C-T-----C--C-C--T--TG----T-C----A-------A--GG-C---C--------------C---T-G--A---G-T--aaagaaatattagtttagatccataaagaatttcagatt
gi|38 : CCG-GAT-T---A-C---A-------C-A--A----G--CC----C-C--C-GG------C--AG--TA--C---C--T---G-----C-----T-TG--T---C-G-------TC-----AAG-A----------------------------T----A-A--T-G-----------C---T--G----T--C---------------------T--T------G---------------T---C-G-C-G----------A--C------------G-A--A----AA------AC---------------------------------G-------C--C--G-C--A------A---------A--C--G--G------------C--A-------G-------------------------TG-T-------G-----------C-----ACG-A--AAG---A-----AGAC-T--C-C-C-----T--CTC--C--TG--C-T-CA---A-------AA-GG-C---C--------------A---T-A--A---A-T--G---C-C-G--A--------C----------A------T---GGCC-T----G-----A-A-T-------------------T-T--------C-AC--A-----G---C--ccataccacattaagtatatctcacgaggtatatcaagatcaatgactcaaattcaggtatattataccataagtagagcttgtggatgtgttta
gi|39 : tacgaacctgtgaagatcgCG-GGT-T---T-G---A-------T-A--G----A--TC------T--C-AG------T--AA--CCG-C---C--T-------------------------C-G-------T------AAG-AT---G------G---CG-A--C------T--A-A-T--C-GG--A-----G-C---G--GCTCCT--C-----------A---------T--A-C---GG---------------A---T-A-ACG----------A--G-----T--A---G-A--A----AACAT---AC--C-G----------------------A-G---G---C-C-CA-C--A-T--G-T----T---------ATCC--A--A------------A--A-------A--G----------------------C-----------G----------A-----ACG-A--T-------------A--T--C-C-C-----T----C--C--TG--CTT-CA---A-------A--A---------------------C---T-GGAA---G-T--GA--C-C-A--G--G-----C----------T------A--AGGCC-T----A-----T-A-T-------------------T-T--------gtt
gi|4 : cgtgggaatG-GGT-T---A-G---A-----A-T-A--GTAGGA--TC----CGT--C-AG------C--AG--CC--T---CGGTGT-G-----C-----G-TG--TTG-C-G-------T------ACG-A----GCG----G---CG-AGGC------T--GCA-A--T-GG--G-----G-AA--G--G----TG-C-----------A---------TG-T-C---GGGGATGTCCGCGTGCCA---T-G-A-GGAGCGTGGATA--C-----A--G---G-A--A----A-----------C-G----------------------A-A---G---TGCGC--C--G-C--G-TTGTCC---------A--C-----G------------C--A-------G--G----------------------TG-G-------TG----------C------CG-A--AA----A-----AGA--T--C-C-TCGAGAT--C-C--CGGTG--C-G-TA---AG------A--GG-CG--C--------------C---T-G--A---GGT--G---C-C-G--A--GAGA--C----------A------T--AGGCT-A----G-----A-A-TAA-----------------G-T--------T-GC--A-----G---C--G----C--CTGTGCA-----A--C-----G-G-------C-----A-G-----A--T--G-T-GA--C-G---TC------T-----CG---C----A-TAAAG-G-AGT--G--------A------T--A--G-T-TGG-T----C--G--G----T-G--G---AAACGCTC--G-T---A-A-
gi|40 : TCCG-GGC-T---A-G---A-----A-T-A--G----G--TC----C-T--C-AG------C--AT--TT--C---C--T-T-G-----C-----G-TG--T---C-G-------T------TAG------G------G---CG-A--C------T--G-A---------------------------------------------A---------T--T-C---GG---------------A---T-G-A-G----------A--C-----C--G---C-A--T----AC------AT--C-G----------------------A-G---G---T-C-C--C--G-T--G-T----C---------A--C--A--G------------C--A-------G--A----------------------TG-T-------GG----------C-----ACG-A--AA----A-----AGA--T--C-C-C-----T--C-CT-T--TC--C-T-CA---A-------A--GG-C---C--------------C---C-G--A---G-T--G---C-C-G--A--G-----C----------A------C--AGGCC-T----A-----A-ATT-------------------T-T--------T-GC--A-----G---C--C----C--gcatatataa
gi|41 : aTCCG-GGT-T---A-G---A-----A-T-A--G----G--TC----C-C--C-AG------C--AT--CC--C---C--T-T-G-----C-----G-TG--T---C-G-------T------AAG-A----G------G---CG-A--C------T--G-A-A--T-GG--G-----G-C---G--G----T--C-----------A---------T--T-C---GG---------------A---T-G-A-G----------A--C-----C--G---G-A--A----AA------AC--C-G----------------------A-G---G---T-C-C--C--G-T--G-T----C---------A--C--A--G------------C--A-------G--G----------------------TG-T-------GG----------C-----ACG-A--TA----A-----AGA--T--C-C-C-----T--C-C--C--TG--C-T-CA---A-------A--GG-C---C--------------C---T-G--A---G-T--G---C-C-G--A--G-----C----------A------T--AGGCC-T----
gi|43 : G-T-------GG----------C-----ACG-A--TG----A-----AGA-----A-C-T-----T--C-A--C--TG--C-T------A-------C--GG-C---C--------------C---T-G--
gi|44 : cG-GGT-T---A-G---A-----A-T-T--G----G--CG----C----C-AG------C--AC--CTAAT---T--T-C-G-----C-----C-TG--T---C-G-------T------AAGTA----G------G---CG-A--C---------G-A-A--T-GG--G-----G-C------G----T--C-----------A---------T--T-C----G---------------A---T-G-G---------------------C--GT--G----------A------AC--C-G----------------------A-A-----------C--C--G----A-T----C------------C--A--G------------C--A-------G--G----------------------T-----------------------------TA-A--AA----A-----AGG--A--C-C----------C-C--C--CG----T-CG---A-------A--G------C--------------C---T-G--A---G-T--G---gtccctgccatacaggtacgttatttctgatacatgtgtttgtacttccctatagagcttcacatgcttacgtttttaaaaagatcggtcaaatttctcaaacagacgataaaaacaaacaaa
gi|45 : ggagtcacga---------A--C--A--G------------C--A-------G--G----------------------TA-T-------GG----------C-----ACG-A--TA----A-----AGA--C--C-C-C-----T--T-C--C--TG--C-T-GG---A-------A--AG-C---C--------------A---T-G--G---A-C--A---T-T-G--A--G-----C----------A------C--AGGCT-T----A-----A-G---------------------T-T--------T-GT--G-----G---C--C----C--TT---CA-----C--C-----A-G-------C-----A-A-----T--G--G-T-GAT-T-G---TC------T-----C----T----A-T--AT-C-AGT--G----A--AA------T--A--T-T-C---T----CA-A--G----A-G--G---GA-----C--T-T---A-A-AAC---A---G-T----gattttccaagtgggacctaa
gi|46 : --T-T-G-----T-----G-TA--TGAAC-G-------C------AAG-A----G------GG--CG-AA-C------T--GGA-A--T-GAAAG-----T-C---G--G-------------------A---------TG-T-C---GA---------------C---T-G-A-G----------AAGCAG---C--A---A-A--A----GA------ACA-C-G----------------------A-GT--G----------C--G-TAAG-T----C---------A--C--A--G------------C--ATG-----G--A----------------------TG-T-------GG----------C-----A-G-A--AA----A-----AGA--T--CAA-C-----T--CTC--C--TG--C-T-CA---ATAATGAGA--GG-C---C--------------T---G-G--AG--G-T--G---C-A-G--AC-G-----C----------A------ttacaaccaacc
gi|47 : GGATCCG-GCT-T---A-G---A-----A-TAA--G----G--TCTAGTC-A--C-AG------C--AT--CCG-C---CATT-T-A-----C-----G-TG--T---
gi|48 : acccccccccccccccccccccccccccccctttcgagtcaaataacttgagtccgccagaatctgattacacatttgcataattgtttcgaacccgtG-T-------TG----------C-----ACG-A--TT----C-----AGA--A--C-C-C-----T--G-G--C--TG--C-T------A-------C--GG-C---C---------------------------G-T-------------A--G-----A----------A------TC-AGGCC-T----C-----G-A-TTAATA--------------T-T--------T-CT--A-----G---C--A----T--TT---CA-----C--CTAA--A-G-------C-------------T--G--G-T-AA--C-G---AA------T-----C----T----A-C--AA-G-AAT--G----A--AA------T--A--T-T-C---T----ta
gi|5 : -GGT-T---AAG---A-----A-T-AACG----G--TC----C-TA-C-GC------C--AC--CT--C---CAGT-G-G-----C-----GGTGAAT---C-GAG-----T------AAGTA----G------GA--CG-A--C------T--G-ATAC-T-GG--G-----G-CT--GCCG----T--C-----------A---------C--T-C---GAGGTA-----------A---T-G-A-G----------A--C-----CC-G---G-A--A----AATA----AC--C-G----------------------A-G---G---T-A-CTAC--A-T--G-T----C---------A--C--ACAG------------C--A-------A--GA---------------------TGAG-------GG----------C-----ACG-A--TA----A-----AGG--C--C-CAT-----T--T-C--C--AG--C-T-TA---A-------A--AG-CGCGC--------------C---T--------G-T--G---C-CAG--A--T-----A----------A------TA-AGGCC-T----AT----A-A-T-------------------TAT--------T-GC--AT----G---G--C----T--AA---CA-----CCAC-----G-GAGGAA--C-----A-G-----G--G--T-T-GA--T-G---TC------T-----C----CCATAA-T--AG-A-AGTC-G----A--AA------T--A--T-T-C---TGC--C--G--GGTA-T-GA-G---AA-----C--G-T---T-A-AAC---A---A-T----AA-CTCAATCAttaagggtccattcaaaccaacataccaaacaaaa
gi|50 : --A-------G--G----------------------CG-TT------GG----------C-----ACG-C--TA----A-----CGA--A--C-C-C-----T--C-G--C--TG--C-TACA---------------G-C---C--------------C---T-G--A---G-T--G---C-T-A--A--G-----C----------A------T---------------------------------------------T--------T-GT--G-----G---T--A----T--TC---CA-----C--C-----T-A-------C-----A-G-----C--T--A-C-AA--T-G---TC------T-----T----A----A-T--AT-G-AGT--G----A--AA------G--A--T-C-T---T----T--G--A----C-A--G---AA-----C--G-T---A-A-AAC---A---A-acctca
gi|51 : --C---C--T-T-G-----C-----G-TG--T---C-G-------CCGTACAAAG-A----G------G---CG-A--CGTCTCGT--A-A-A--T-GC--G-----A-CCATG--C----T--C-----------AGCCAGTCTCT--T-CA--GG---------------ACGTT-G-A-G----------A--C-----C--G---A-A--A----AA------ACGGC-G----------------------A-GTGAG---C-C-C--CTGA-T--G-T----C---------A--C--A--aca
gi|52 : tttCCA-GGT-T---G-G---A-----A-T-A--G----G--TC----C-C--CTAG------C--AT--CC--C---C--T-T-G-----T-----G-TG--T---C-G-------T------AAG-A----G------G---CG-A--C------T--G-A-A--T-GG--G-----G-C---G--G----T--C-----------C---------T--T-C---GT---------------A---T-G-A-G----------A--C-----C--G---C-A--A----AA------AC--C-G----------------------A-G---G---T-C-C--C--G-T--G-T----C---------A--C--A--G------------C--A-------T--G----------------------TG-T-------GC----------C-----ACG-A---A----A-----Atgaaggcag
gi|53 : -----C-----G-TG--T---C-G-------T------AAG-A----G------G---CG-A--A------T--G-A-A--T-GG--G-----A-C---G--G----C--C-----------A---------T--T-C---GG---------------A---T-G-A-G----------A--C-----C--G---C-A--A----AA------AC--C-G----------------------A-G---G---T-C-C--C--G-T--G-T----C---------A--C--A--G------------C--A-------G--G----------------------TG-T-------GG----------C-----ACG-A--AA----A-----AGA--T--C-T-T-----T--C-C--C--TG--C-T-CA---A-------A--GG-C---C--------------T---T-G--A---G-A--G---C-C-G--
gi|54 : --G-T--G-T----C---------A--C--A--G------------T--A----------G----------------------TG-T--------G----------C-----ACGAA--TAAATTA-----AAA--T----C-C-----T--T-C--C--TG--C-C-CA---A-------A--GG----------------------------------------------------G-----C----------AC-----T--AGGTC-T------------A-T-------------------T-T--------TGGC--A-----G------C----C--TT---TA-----C--T-----G-T-------C-----A-T-----G--T--G-T-GA--C-----------------------------------T-G-AGT--G----A--AA------CA-A--T-T-C---T----
gi|55 : cgatgccactgGGATCCA-GGT-T---A-G---A-----A-T-A--G----G--TC----C-C--A-AG------T--AT--CC--C------T-C-A-----C-----T-TG--C---T-G-------T------AAG-A----G------G---CG-A--C------T--A-A-G--T-GG--G-----G-C---A--G----T--C-----------C---------T--TAT---GG---------------A---T-G-A-G----------A--C-----T--G---C-A--A----AA------AC--C-G----------------------A-G---G---
gi|56 : gGGTCCG-GGT-T---A-G---A-----A-T-A--G----G--TC----T-C--C-AG------C--AT--CC--C---C--T-T-G-----C-----G-TG--T---C-G-------T------AAG-A----G------G---CG-A--C------T--G-A-A--T-GG--G-----G-C---G--G----T--C-----------A---------T--T-C---GA---------------A---T-G-A-G----------A--C-----C--G---C-A--A----AA------AC--C-G----------------------A-G---G---T-C-C--C--G-T--G-T----C---------A--C--A--G------------C--A-------G--G----------------------TG-ctttaataagtctacaag
gi|57 : ---C--C----C--TT---CA-----A--C-----G-G-------T-----A-TACATGT--A--GAT-GA--C-G---TC------TGTACACAATGC----A-T--AT-G-AGT--G----G--AATACTAGT--A--T-T-T---T----T--GA-G----A-G--T---GA-----T--G-C---T-A-AGC---A---T-T----AC-AC-AATCA
gi|58 : a-T---A-G---A-----A-T-A--G-------TC----C-TG-C-AAGT----C--AT--CC--C---C------G-----C-----G-TG--T---C-G-------T------AAG------------------G-A--T------T-----------------------C---G--G----T--T-----------------------------------------------A---T-G-A-G----------A--C-----C--G---GCC--A----AA------AC--A-G----------------------A-G---G-----C-C--C--G-T--A-T----atcacgtattgaatg
gi|59 : acccgtggggatatccggaattaagaatagaa-T-------------------C-T--------T-GC--A-----G---G--A----C--TT---TA-----C--C-----T-A-------C-----A-AA----T--T--C-T-GA--C-G---TC------T-----T----A----A-T--AT-G-TCT--G----A--AA------A--A--T-T-C---T----C--C--A----A-G--A---GA-----T--A-T---G-A-AAC---A---A-gtt
gi|6 : cgcatatctcagtacagtcaggTTCG-AGT-C---A-G---A-----A-T-A--G----G--TC----C-C--C-AG------C--AT--CC--C---C--T-T-G-----C-----A-TG--T---C-G-------T------AAG-A----G------G---CG-A--C------T--G-A-A--T-GG--G-----G-A---G--G----T--C-----------C---------T--T-C---AA---------------A---T-G-A-G----------A--C-----A--G---G-A--A----AA------AC--C-GGGGCCCCGTGTCACAGTAGGCGA-G---A---C-C-C--C--G-T--G-T----C---------A--C--A--G------------T--A-------G--GTGAGACCCCGTGTCACAGCAGGTG-T-------GG----------C-----ACG-A--TA----A-----AGA--T--C-C-C-----T--C-C--C--TG--C-T-CA---A-------A--CA-C---C--------------C---T-G--G---G-T--G---T-C-G--A--G-----C----------A------T--TGGTC-T----A-----A-A-TTTGCGAGCATTGGTCTAAAT-T--------T-GC--A-----G---C--C----A--TT---CA-----C--C-----G-G-------C-----A-A-----T--G--G-T-AA--C-G---TC------T-----C----C----T-C--AT-G-AGT--G----A--AA------T--A--T-T-C---T----C--GA-G----C-G--G---GA-----C--G-T---A-A-acacaaactaaac
gi|60 : GGGTCCG-GGT-T---A-A---A-----A-T-A--G----G--T
gi|61 : aaagtaaaatttaaaacaaaaactcaatttttttaaatatcaataattatttagtatcaattctccagctgtggcgacccgtgg---C-T-G--A--A-----C----------A------TT-AGGA--T----A-----A-A-T-------------------T-T--------T-GC--AG----G---C--C----A--TT---CA-----C--C-----G-G-------C-----ATT-----T--G--G-TGGA--C-G---TC------T-----C----CA---A-T--TT-GAAGT--T----G--AA------T--A--T-TCC---T----C--A--A----T-G--G---AG-----C--T-G---A-A-AAC---------T----AA-A
gi|63 : gagac---C--T-T-G-----T-----GGTT--T---C-A-------G------AAG-T----G------A---TG-G--C------T------A--T-TG--G-----G-T---T--G----T--T-----------A---------T---------G---------------A---T-G-A-G----------A--C-----C--T---C-A--A----AA------AT--C-A----------------------A-G---G---T-T-C--C--G-T--G-G----C---------A--C--A--GTAAACATCGGACC--A-------G--G----------------------TG-T-------GA----------C-----ATG-A--
gi|64 : GGGTCCG-GGT-T---A-G---A-----A-T-A--
gi|65 : aaaataagaaacacaaaacatgatagaacttcgaagtttcttataaatacttcattttcattccatcgcggtacccgtgg----------------------TA-T-------GG----------C-----ACG-A--TA----G-----AGA--A--C-C-T-----T--T-T--C--TG--C-C------A-------A--GT-C---C--------------C---T-G--A---G-C--G---C-C-T-----------------------------T--ACGTCAT----A-----A-----------------------T-T--------A-GT--G-----G---A--A----C--TT---TG-----T--C-----T-G-------T-----AGC-----T--G--G-T-GA--T-G---TC------T-----C----T----A-T--
gi|66 : aC-T----A-----A-------------------------T--------T-GC--A-----G---C--C----T--TT---CA-----C--C-----G-AACAGCTCC-----A-T-----T--A--G-T-GA--A-GATCTC------T-----C----A----A-T--AT-G-AATTCG----A--AA------A--AGTT-T-C---T----CTAA--G----T-G--G---GA-----C--A-T---cgaga
gi|67 : -----A-T-A--G----G--TC----C-T--C-AG------C--AT--CT--C---C--T-T-G-----C-----G-TG--T---G-G-------T------TAG-G----G------G---CG-A--C------T--G-A---------------------------------------------A---------T--T-C---TG---------------A---T-G-A-G----------A--C-----C--G---C-A--T----AC------AC--C-G----------------------A-G---G---T-C-C--C--G-T--G-T----C---------A--C--A--G------------C--A-------G--G----------------------TG-T-------gtctaataaaca
gi|68 : GCCCG-TGT-T---A-G---A-----A-T-A--G----G--TC----C----A-AG------CA-ATG-CG--C---A--T-T-G-----CCAGTGG-TG--TA--C-G-------TTA----AAG-A----G------G---GG-A--C------T----A-A--T-GG--GTAATTG-C---G--G----T--C-----------A------------T-C---GG---------------A---
gi|69 : gt------T-----C----C----A-T--AG-G-AAT--G----A--CA------C--A--T-TTC---T----C--AA-G----C-T--G---GA-----C--G-T---T-A-AAC---A---A-T----AT-GC-AACCA
gi|7 : ttttgtagtgtaccttgaattacggttacatata-A--G----G--TG----C-C--C-AG------CC-AT--GC--C---CGGT-CAG-----C-------TG--G---C-G-------G------AAG-AATGAG------G---TA-A--CGC----T--G-A-A--T-AG--G-----GTC---G--T----T--CCGAGCCTGCCTA---------TGAT-C---GG---------------A---T-G-C-GGA--------A--C-----CCGG---G-A--A----AA------AC--C-G----------------------A-C---G-----C-C--C--G-T----T----C---------A--C--A--G------------C--A-------C--G----------------------CG-TCCCATCTGG----------CCACTGACG-AC-TATC--A-----ACAC-T--A-C-C-----TTCC-C--C--CG--C-TGCA---A-------A--GG-C---C--------------C---C-G--ACTCG-T--G-----C-G--A--G-----CG---------A------T--AG--C-G----A-----A-A-TAG-----------------T-T--------C-GC--A-----T---CATC----CCATT---C------C--G-----G-G-------A-----A-G-----T--GCTG-G-GA--C-G---TT------T-----C----C----A-G--AG-G-AG---G----A--AA---------G--T-C-C---TA---C---------------G---GA-----C--G-A---A-A-AACAGAA---A-T----AA-GC-AATCAa
gi|70 : GGGTCAGCGATAT---A-T---A-----A-T-A--G----T--CT----C-G--C-AG------C--AT--TC--C------T-T-G-----CT----G-T---T---T-G-------T------AAG-A-----------G---TG-A--C------T--G-A-AATT-AG--G-----C-T---G--G----T--C---------------------C--T-C---GGA--------------A---T-G-A-
gi|71 : ggccgtCT-T----A-----A-A-T-------------------T-T--------T-AT--A-----G---C--C----C--TT---CA-----C--C-----G-C-------C-----A-A-----T--A--A-T-GA--CAG---TT------T-----A----C----A-T--AT------------------------C--A--T-T-C---T----C--G--A----G-A--G---GA-----
gi|72 : CG-GGT-T---A-GTACA-----ACT-G--G----A--TC----C-TT-C-AGA-----T--AT--CC--CTTAC--T-T-G--------------G--T---T-G-------T------AAG-AG---G------G---CG-A--A------T----A-A--T--A--G-----G-CTAAG--A----T--C---------------------T--T-A---GG---------------A---T-G-A-aaatgaaagtttaattacaaccaac
gi|73 : gaA----A-----AGA--T--C-C-C--------C-C--C--T---C-T-CA---G-------A--GG-G---A--------------A---T-A--A---G-C--T---C-T-A--A--G-----CG---------A------T--AGGTC-TC---A-----A-A-T-------------------T-T--------T-GC--AG----G---C--C----C--TT---CA-----CT-C-----A-G-------C-----A-A-----T--G--G-T-Ga
gi|75 : gaaa--A-------G--G----------------------TG-TT------GG----------C-----ACA-A--TA----A-----AGA--T--C-C-T-----T--C-A--C--CG--C-T------A-------A--GG-
gi|76 : G-GGT-T---A-GG--A-----A-T-A--G----AA-TC----C-TTCC-A-------C--AT--CC--C------T-T-GTAA--C-----G-TGA-T---C-G-------T------AAG-A-----------G---CG-A--C------TCGG-A-A--T--G--G-----G-C---G--G----T--agtcaattgcatacatgtatatggatttgtgtcatttcatctac
gi|78 : ccgtggagatcgaGA--T--C-C-T----------C--C--TG--C-T-CA---A----------GG-C---C--------------A---TAG--A---G-C--G---T-CTG--A--G-----C----------A------T--AGACC-G----A-----A-A-T-------------------G-T--------T-GC--A-----G---C--T----C--TT----A-----C--C-----G-G-------C-----A-------T--G--T-T-AAC-C-G---TC------
gi|8 : GGATCTG-GGT-A---A-G---A-----A-T-A--T----G--TC----C-C--T-AG------T--A---CC--C---C--T-T-C-----C-----T-TG--T---C-G-------A------CCG-A----G------G---CG-A--c
gi|8 : gG--G-----A-C---G--G----T--C-----------C---------T--T-C---GG---------------A---T-G-A-G----------A--C-----C--G---C-A--ATTTTAA------AC--C-G----------------------A-G---G---T-C-gttgtaagaaaaaaaaacccagtggtaatcgtctaaggatataacaggaataagatagcaatggacgcgcagagcttggacggtccttcggatgagaccgcaattttaaaccgaggtcgagcatggaaataaattttgcagcccttcaatggcaatggtgacatatccatatatatgtgtgaaaacttctcaagtgggacgtacaacaatatgcaatcaa
gi|8 : gggatctgggtaagaatatgtccctagtaccccttccttgtcgaccgaggcgagttgtaagaaaaaaaaacccagtggtaatcgtctaaggatataacaggaataagatagcaatggacgcgcagagctt--------------C---C-G--A---G----G---T-C-G--A--G-----C----------A------T--GGAAA-T----A-----A-A-T-------------------T-T--------T-GC--A-----G---C--C----C--TT---CA-----A--T-----G-G-------C-----A-A-----T--G--G-T-GA--C-A---TA------T-----C----CATATA-T--AT-G-TGT--G----A--AA------A--C--T-T-C---T----CA-A--G----T-G--G---GA-----C--G-T---A-C-AAC---A---A-T----AT-GC-AATCAgagcatggaaataaattttgcagcccttcaatggcaatggtgacatatccatatatatgtgtgaaaacttctcaagtgggacgtacaacaatatgcaatcaa
gi|80 : gggatctgggtaagaatatgtccctagtaccccttccttgtcgaccgaggcgagttgtaagaaaaaaaaacccagtggtaatcgtctaaggatataacaggaataagatagcaatggacgcgcagagcttggacggtccttcggatgagaccgcaattttaaa-A-T-------------------T-T--------T-GC--A-----G---T--C----C--------------------------------------------------G--G-T-GA--C-G---TC------T-----T----C----A----GT-G-AAA--A----A--AA------A--A--A-T-C---T----T--GA-G----T-G--G---GA-----G--G-T---T-A-AAC---A---A-T----a
gi|81 : --A--G-----C----------A------T--AGCCC-TTTATA-----A-A-TGT-----------------T-T--------T-GC--AC----G---C--CTCC-C--TT---CC-----A--C-----G-G-------C-----A-A-----TATG--G-T-GA--C-G---TC------T-----C----T----A-tttcaacaaacc
gi|82 : -T-CT---A-------A--GG-C---C--------------A---T-G--A---G-T--G---C-C-G--A--G-----C----------A------T--AGGCC-T----A-----C-ATT-------------------T-T--------T-GTTAA-----G---C--C----C--Tatc
gi|83 : taaataatcatttaa-----A-T-----T--G--T-T-GA--T-G---TC------T-----T----A----G-A--AT-G-AGT--G----A--AA---------A--TCT-T---T----C--G--AA---T-A--A---AA-----C--G-T---A-A-AAC---A---A-C----GA-AT-
gi|85 : -----T--G--G-T-GA--T-T---TC------T-----G----A----G-T--AT-G-AGC--G----A--CA------A--A--T-T-G---T----C--G--A----G-G--T---GA-----T--G-T---A-A-AAC---A---A-T----Acaa
gi|86 : atctacacgG------T--AT--CA--C---C--T---A-----C-----G-TG--T---C-G-------C------AAG-A----G------G---CG-A--T------T--T-A-A--T-GA--G-----
gi|87 : gttacacacccgttgggatccgg-G-AGT--G----A--AAGA----T--A--T-C-A---T----C--G--AGT--T-GC-G---GA-----C--G-TTTTA-A-AAC---A---A-T----AA-AT-AATCA
gi|89 : A--C-G---TC------T-----C----C----A-T--AT-G-AGC--G----A--TA------T--A--T-T-C---T----C--GA-G----T-G--G---GA-----C--G-T---A-A-AAC---A---A-T----AA-AT-AATCAtcatcgttc
gi|9 : tgtGGGTCCG-GGT-T---A-G---A-----A-T-A--G----G--TC----T-T--C-AG------C--AT--CC--C---C--T-T-G-----C-----G-TG--T---C-G-------T------AAG-A----G------G---CG-AC-C------T--G-A-A--T--G--G-----G-C---G--G----T--C-----------A---------T--T-C---GG---------------A---T-G-A-G----------A--C-----C--G---A-AACA----GA------AC--C-G----------------------A-G---G---C-CGC--C--G-T--G-T----C---------A--C--A--G------------T--A-------G--G----------------------TG-T-------GG----------C-----ACG-A---A----A-----AGA--T----C-C-----T--C-C--C--TG--C-T-AA---A-------A--GG-C---C--------------C---T-G--A---G-T--G---C-C-G--AG-G-----C----------A------T--AGGCC-T----A-----A-A-T-------------------T-T--------TCGC--A-----G------C----C--TT---CA-----C--C-----G-G-------C-----A-A-----T--G--G-T-GT--C-G---TC------------C----C----A-T--AT-G-AGT--G----A--AA------T--A--T-T-C---T----C--G--G----T-G--G---GA-----CGTG-T---A-A-AAC---A---A-T----AA-TT-AATC
gi|90 : cgtgg-----T--G--G-T-GA--T-G---TT------T-----T----C----A-T--GT-G-AGT--G----ATTAA------T--A--C-T-------------GAAA----T-G--G---GA-----A--G-T---A-A-AAC---A---G-T----
gi|92 : GGGTCCG-GGT-T---A-G---AAC---A-T-A--G--------------------AG------C--AT--AC--C---G--T-T-G-----C-----G-TG--C---C-gca
gi|93 : gttttgaattcgtgTCCA-GAT-T---A-G---A-----A-T-A--G----G--TC----C-T--C-AG------C--A---AC--T---C--T-T-G-----T-----G-TA--T---C-A-------T------AAG-A----A------G---CT-A--C------T--a
gi|94 : TCCA-GAT-T---A-G---A-----ATT-A--G----G--TC----C----A-AG------C--AA--CT--C---C--T-T-G-----T-----G-TA--T---C-A-------T------AAG-A----A------G---CT-A--C------
gi|95 : ----A-T--AT-G-AGT--G----A--AA------T--A--T-T-C---T----CA-A--G----A-G--G---GA-----C--A-A---A-A-AAC---A---T-T----GATAT-AA
gi|98 : t--AA------T--A--T---C---T----C--G--ACC--T-G--G---GA-----C--G-T---A-A-AAC---A---A-T----AA-AT-aacc
gi|99 : g------T--A--T-T-C---T----C--GA-G----A-G--G---GA-----C--T-T---A-A-AAC---A---A-T----Acatatg
blockSeqs : GAG TAC TCTTT A AC TAGG CT TAGT TTC C GT TG TA AA TTAC AAGAC CAGTGG AA GAA GCTGTGT GTCTCA T ATGA TTCGTA TCT GG GTCTCG CGG AT AG AA TAATTG CAT CC CTCC AT CGAGCCTGCCTA GA TTG GGATGTCCGCGTGCC CGT C GAGCGTGGAT AG ATACT CG TGTG AC TTTT CAT GG GGGCCCCGTGTCACAGTAGGCG TGA AG T TA TG AA TGTC ACATAAATG TC CC CA TAAACATCGGAC . CTGAGCA AG TGAGACCCCGTGTCACAGCAGG G CCCATCT GCGAAAGAAG CACTG A ATC AATT TTTTC AC GA T CGAGA TC T TT GG GA A TAA TAATGAG TT TTG AAAGCTGCTCAAGAC GA CTC C TA GTA T TG AT AGTCA A TACATG AC TTAT CTGTT TTTGCGAGCATTGGTCTAAA A CTCATACA G TA TTTTG TAT AT CTGG CA GTG AACAG CA TATAG T ACAGCTC TCCCA TACATG AT CT GG ATC AGAAAT GTACA CCATA G AA A TC GTGC TT TACTAGT C TCT TTTT GGGAGTT GT CTC TATCG GT TTT T AGA GAT ACAC T C
blockSeqs : . G AC A T . A G GT T A T G G CGG TAA GG A TG GTT CGTACA T T CG G A GC GC C A . GG TAA C G G AGCCAGTCTC G A GGTA . . GA . AG C TG . G TA A . T TG G A T . . . A C T A . TG . GT A TG . TAAT A CT TC T C . A . G T T . G A T G G GCG CGCG T G G . A A . T AGA G GA C C T TTAATA A CCGTTT C G T . . TCC . . . T TATA . AGGAA A AA T . T C A GA AATGC T A . C . . TTA C GG GC GAGGTC A . ACGCT GT . . A . . . .
blockSeqs : . . . C . . . . TA . . A . G CAT . GG . A AG TA . G . G C G GG . G . GT A . . . TTAA G . A . . . . G . GC . . . A . . C G . . . . . . . T . . . . T . T . . . T G . C . . . . . . . . G . . A G TTC . . . . . T . C . G C A . . TAA . . . . G . . A . . . . TAA . C . TT . . C . . . CATAT . . . C . . GAT T . A GGGTAT C . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . T . . . . TG . . C . . CAG . TG . . . C . . . A . . G . G . G T . . . A . . . . . . . . . G . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . A . T . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . GT . . . . . . . G . . . T . . TAG . . . . G . . . . . . . . . . . GC . . . . . . GC . . . . . . CA . . . TAAGT . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . TT . . . . . CGG . G . . . . . . . . . . A . G . A . . . . C . . . . . . . . . G . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . . . . . TGT . . . . C . . . . . . . . . . . T . . . . . . CA . . . . . . T . . . GAGTT . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . T . . . . . TC . G . . . . . . . . . . G . G . G . . . . A . . . . . . . . . C . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . . . . . TT . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . C . . . . . . T . . . GAAAT . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . C . . . . . C . G . . . . . . . . . . G . G . G . . . . A . . . . . . . . . G . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . . . . . TT . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . C . . . . . . T . . . GACCT . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . T . . . . . C . G . . . . . . . . . . G . G . G . . . . A . . . . . . . . . C . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . C . . . . . . T . . . GAGA . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . C . . . . . C . C . . . . . . . . . . G . A . G . . . . A . . . . . . . . . G . . . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . C . . . . . . T . . . GAGA . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . T . . . . . C . G . . . . . . . . . . G . G . G . . . . A . . . . . . . . . A . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . C . . . . . . T . . . GAGT . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . T . . . . . C . G . . . . . . . . . . G . G . G . . . . A . . . . . . . . . T . . . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . C . . . . . . T . . . GAGT . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . C . . . . . C . G . . . . . . . . . . G . G . G . . . . C . . . . . . . . . G . . . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . C . . . . . . T . . . AAGT . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . T . . . . . G . G . . . . . . . . . . A . A . G . . . . A . . . . . . . . . C . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . C . . . . . . T . . . AAGA . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . T . . . . . C . T . . . . . . . . . . G . A . G . . . . T . . . . . . . . . C . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . C . . . . . . T . . . GGAT . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . C . . . . . T . G . . . . . . . . . . G . G . G . . . . A . . . . . . . . . G . . . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . T . . . . . . T . . . GAGT . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . C . . . . . C . T . . . . . . . . . . G . G . G . . . . A . . . . . . . . . G . . . . . . G . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . C . . . . . . T . . . GAGT . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . T . . . . . A . G . . . . . . . . . . G . G . G . . . . C . . . . . . . . . G . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . C . . . . . . T . . . TTGT . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . T . . . . . C . G . . . . . . . . . . G . G . G . . . . G . . . . . . . . . T . . . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . C . . . . . . T . . . AAGA . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . T . . . . . C . T . . . . . . . . . . A . T . G . . . . C . . . . . . . . . G . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . C . . . . . . T . . . GAGT . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . T . . . . . C . T . . . . . . . . . . A . G . A . . . . C . . . . . . . . . T . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . C . . . . . . T . . . GAGC . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . T . . . . . C . T . . . . . . . . . . C . C . G . . . . A . . . . . . . . . C . . . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . G . . . . . . T . . . GAGA . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . C . . . . . C . A . . . . . . . . . . A . G . G . . . . C . . . . . . . . . G . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . G . . . . . . C . . . . . . T . . . AAGA . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . T . . . . . C . T . . . . . . . . . . A . G . G . . . . A . . . . . . . . . G . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . C . . . . . . T . . . AAGA . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . T . . . . . T . T . . . . . . . . . . A . G . G . . . . C . . . . . . . . . C . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . C . . . . . . T . . . GAGA . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . A . . . . . C . G . . . . . . . . . . G . G . G . . . . C . . . . . . . . . C . . . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . C . . . . . . T . . . GAGC . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . T . . . . . C . G . . . . . . . . . . G . G . G . . . . C . . . . . . . . . C . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . C . . . . . . T . . . AAGC . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . C . . . . . C . T . . . . . . . . . . G . G . T . . . . A . . . . . . . . . G . . . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . C . . . . . . T . . . AAGT . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . T . . . . . C . T . . . . . . . . . . G . G . G . . . . A . . . . . . . . . G . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . A . . . . . . T . . . GAGT . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . C . . . . . C . T . . . . . . . . . . A . G . A . . . . A . . . . . . . . . G . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . C . . . . . . G . . . GAAT . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . T . . . . . T . G . . . . . . . . . . G . G . G . . . . A . . . . . . . . . G . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . G . . . . . . A . . . . . . T . . . GAGT . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . T . . . . . C . G . . . . . . . . . . G . G . A . . . . A . . . . . . . . . C . . . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . T . . . . . . T . . . AAGA . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . C . . . . . C . G . . . . . . . . . . A . G . G . . . . A . . . . . . . . . G . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . G . . . . . . T . . . . . . T . . . GAGA . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . A . . . . . C . C . . . . . . . . . . G . G . G . . . . A . . . . . . . . . A . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . G . . . . . . A . . . . . . T . . . AGT . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . C . . . . . C . G . . . . . . . . . . G . G . G . . . . A . . . . . . . . . G . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . A . . . . . . T . . . GGT . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . C . . . . . C . G . . . . . . . . . . G . T . G . . . . C . . . . . . . . . A . . . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . C . . . . . . T . . . GGT . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . C . . . . . C . G . . . . . . . . . . G . G . C . . . . A . . . . . . . . . C . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . T . . . . . . T . . . GGT . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . C . . . . . C . G . . . . . . . . . . G . A . G . . . . C . . . . . . . . . C . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . G . . . . . . A . . . . . . G . . . GGT . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . T . . . . . A . G . . . . . . . . . . T . A . G . . . . A . . . . . . . . . C . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . C . . . . . . A . . . GGT . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . C . . . . . C . T . . . . . . . . . . G . G . A . . . . C . . . . . . . . . C . . . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . C . . . . . . T . . . GGT . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . G . . . . . C . G . . . . . . . . . . . . . . G . . . . A . . . . . . . . . G . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . C . . . . . . T . . . GGA . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . C . . . . . C . G . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . C . . . . . . A . . . AGT . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . T . . . . . G . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . T . . . . . . C . . . AAG . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . T . . . . . C . G . . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . . . G . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . A . . . . . . C . . . GGG . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . C . G . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . A . . . AGT . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . A . . . GGT . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . A . . . AAA . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . T . . . ACT . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . GGT . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . GAC . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . CAA . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . AAT . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . GAG . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . GAG . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . GGT . . . . . .
blockSeqs : . . . . G . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . .
blockSeqs : . . .
blockSeqCons : ** ****** G*** G****** A******************** ****** T**** ** ** ***** ** C***************** ********** ** ***** ** ****** C******** GAGT******** ****
originalCons : GGGTCCG-GGT-T---A-G---A-----A-T-A--G----G--TC----C-T--C-AG------C--AT--CC--C---C--T-T-G-----C-----G-TG--T---C-G-------T------AAG-A----G------G---CG-A--C------T--G-A-A--T-GG--G-----G-C---G--G----T--C-----------A---------T--T-C---GG---------------A---T-G-A-G----------A--C-----C--G---G-A--A----AA------AC--C-G----------------------A-G---G---T-C-C--C--G-T--G-T----C---------A--C--A--G------------C--A-------G--G----------------------TG-T-------GG----------C-----ACG-A--TA----A-----AGA--T--C-C-C-----T--C-C--C--TG--C-T-CA---A-------A--GG-C---C--------------C---T-G--A---G-T--G---C-C-G--A--G-----C----------A------T--AGGCC-T----A-----A-A-T-------------------T-T--------T-GC--A-----G---C--C----C--TT---CA-----C--C-----G-G-------C-----A-N-----T--G--G-T-GA--C-G---TC------T-----C----C----A-T--AT-G-AGT--G----A--AA------T--A--T-T-C---T----C--G--G----T-G--G---GA-----C--G-T---A-A-AAC---A---A-T----AA-AT-AATCA
finalCons : GGGTCCG-GGT-T---A-G---A-----A-T-A--G----G--TC----C-T--C-AG------C--AT--CC--C---C--T-T-G-----C-----G-TG--T---C-G-------T------AAG-A----G------G---CG-A--C------TG---A-A--T-GG--GG------C---G--G----T--CA--------------------T--T-C---GG---------------A---T-G-A-G----------A--C-----C--G---G-A--A----AA------AC--C-G----------------------A-G---GT----C-C--C--G-T--G-T----C---------A--C--A--G------------C--A-------G--G----------------------TG-T-------GG----------C-----ACG-A--TA----A-----AGA--T--C-C-C-----T--C-C--C--TG--C-T-CA---A-------A--GG-C---CC-----------------T-G--A---G-T--G---C-C-G--A--G-----C----------A------T--AGGCC-T----A-----A-A-T-------------------T-T--------T-GC--A-----G---C--C----C--TT---CA-----C--C-----G-G-------C-----A-N-----T--G--G-T-GA--C-G---TC------T-----CC--------A-T--AT-G-AGT--G----A--AA------T--A--T-T-C---T----CGAGT--------G--G---GA-----C--G-T---A-A-AAC---A---A-T----AA-AT-AATCA
15 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|42 ): CGTGTCACGGCAGAAACATTCACTGCTGCGGACCCCGCGTTTTACATGTGTAGGTCTGAATTTGTGGTACTTGTGGTACTTCACTTACAGTTGGCGACGTATTGATTTTTTCCAGAAGGGGAGTAAAACAAGCAAACAAACAAACAAACAAACCGTTGAATAT
Unaligned ( gi|49 ): ATTCCTTGTTGCTACGGCTCTGAGTGTCATACAGAAGTCTGAATCTGAATTTATATTTACAGTTGATTGCTTCTTTATATGAGTTATCGATAAATTATTCAAGGGACGTTAAATCAATGAAGCAAAATC
Unaligned ( gi|62 ): AAGGATTCACTCTGCTATGGCCCTGAGCGCCAAAATCTAAAGATGATGATGGCTGTACGTTGGGCGTTTTTGAGTGGGACGTAAAACTACAAACAAACTA
Unaligned ( gi|74 ): AGCATGCCATTATCAGTCATAAAAGGAGACCTTTGGAATGGTCGTCCTTCTTATGTGGCTGCAAAGACAGGAGTCTTGTGTC
Unaligned ( gi|77 ): GTGTCCAGGGTCCGTGGTTGCCCAGCTCTTGTTTTTGTATTCTATTTAAGACTTGCGAGATTGGTCCTGTGTCGTTATA
Unaligned ( gi|79 ): CAGGAGTTGGCACGTTAAATAACCCCCGCTATAGAATGAGTTCTCATTTATGGTGCTTCACCCACAACCGGTG
Unaligned ( gi|84 ): ACCTACAGTTTGTGCCATCTTAATATGAGTGAAAAATTCCCCAACGAAAGTCAAACAAACA
Unaligned ( gi|88 ): CAAAGGTAATTTCTATATAAGTGAAGTAGTTTGGAATCGGATGTAAAATCAACCAACA
Unaligned ( gi|91 ): AACTTGAAAATACGGATATATATTTCATTGCAGTGGTAGAATAAGAAATTTATT
Unaligned ( gi|96 ): TAACGACCCTTCATGAGTGAAATATACTAGAGCTGGACGATAAAC
Unaligned ( gi|97 ): CATGTGAGTGAAAATTATCAAGCGGGGACGAAACACAAATTCAAT
Unaligned ( gi|105 ): TCTTCAACAACGACCCGTGGGGATCCGGGTTAGAATA
Unaligned ( gi|113 ): CATATCTACGACCCGTGGGGGTCCGGGTTAGAAT
Unaligned ( gi|115 ): ATTGCATGAAACCCGTGGGGGTCCGGGTTAGAA
Unaligned ( gi|117 ): GACCCGTGGGGGTCCAGGTTAAAATAGG
Alignments
lowQualScore : 111111111111111111111 1111111111111111111111 111111111111111111111
lowQualScore : 0 0 111 0 222 22222 3 0 22 1111 11 2222 7777 1 444444 33 11 22 666666 0 0 33333 3333333 11 333 0 4444444 666666 1 3333 333333 333 0 22 444444 7777 0 11 11 11 2222222 444 11 2222 11 222222222222222222222 22 0 222 777777777777777 111 0 0 1 4444444444 11 44444 22 55555 11 2222 555555 22 0 7777777777777777777777 0 222 44444 2 22 22 0 11 0 1111 333333333 22 22 22 555555555555 11 3333333 11 0000000000000000000000 1 5555555 3333333333 33333 1 222 3333 22222 33 11 0 1 22222 11 1 11 11 22 0 3 222 3333333 22 0 333 666666666666666666 0 11 222 1 11 222 11 2 11 33 33333 5555555555 444444 33 0 2222 22222 0 111111111111111111111 1 77777777 1 11 55555 111 11 3333 11 111 22222 11 55555 1 5555555 33333 8888888 22 11 0 0 22 0 222 333333 22222 444444444 1 11 0 0 22 1111 00 444444444 00 0 1 2222 22222 00 888888 11 11111 11 1 111 0 1 111 111 1 2222 1 1
lowQualScore : . . ... . ... ..... . . .. .... .. .... .... . ...... .. .. .. ...... . . ..... ....... .. ... . ....... ...... . .... ...... ... . .. ...... .... . .. .. .. ....... ... .. .... .. ..................... .. . ... ............... ... . . . .......... .. ..... .. ..... .. .... ...... .. . ...................... . ... ..... . .. .. . .. . .... ......... .. .. .. ............ .. ....... .. ...................... . ....... .......... ..... . ... .... ..... .. .. . . ..... .. . .. .. .. . . ... ....... .. . ... .................. . .. ... . .. ... .. . .. .. ..... .......... ...... .. . .... ..... . ..................... . ........ . .. ..... ... .. .... .. ... ..... .. ..... . ....... ..... ....... .. .. . . .. . ... ...... ..... ......... . .. . . .. .... .. ......... .. . . .... ..... .. ...... .. ..... .. . ... . . ... ... . .... . .
lowQualScore : 8 8 333 8 111 99999 0 7 55 6666 88 4444 3333 6 111111 44 99 66 222222 8 8 11111 5555555 88 111 8 9999999 111111 5 1111 222222 666 8 55 000000 8888 8 99 77 11 2222222 333 99 5555 99 222222222222222222222 66 8 222 444444444444444 444 8 8 6 8888888888 11 11111 00 22222 22 7777 111111 99 9 7777777777777777777777 9 444 22222 7 22 11 9 22 9 8888 555555555 11 11 99 444444444444 22 9999999 22 2222222222222222222222 6 3333333 5555555555 77777 6 222 6666 88888 88 11 8 6 88888 99 6 99 11 77 8 1 111 3333333 55 8 555 888888888888888888 8 88 111 5 00 111 88 3 00 44 33333 7777777777 000000 44 8 4444 77777 8 000000000000000000000 5 66666666 5 88 00000 333 88 8888 11 444 00000 99 22222 6 5555555 99999 2222222 66 88 8 8 55 7 000 555555 99999 999999999 5 77 7 7 33 5555 99 999999999 99 6 9 8888 33333 99 000000 55 66666 77 3 111 7 3 999 222 5 9999 0 1
consensus : GGGTCCG-GGT-T---A-G---A-----A-T-A--G----G--TC----C-T--C-AG------C--AT--CC--C---C--T-T-G-----C-----G-TG--T---C-G-------T------AAG-A----G------G---CG-A--C------T--G-A-A--T-GG--G-----G-C---G--G----T--C-----------A---------T--T-C---GG---------------A---T-G-A-G----------A--C-----C--G---G-A--A----AA------AC--C-G----------------------A-G---G---T-C-C--C--G-T--G-T----C---------A--C--A--G------------C--A-------G--G----------------------TG-T-------GG----------C-----ACG-A--TA----A-----AGA--T--C-C-C-----T--C-C--C--TG--C-T-CA---A-------A--GG-C---C--------------C---T-G--A---G-T--G---C--C-G--A--G-----C----------A------T--AGGCC-T----A-----A-A-T-------------------T-T--------T-GC--A-----G---C--C----C--TT---CA-----C--C-----G-G-------C-----A-N-----T--G--G-T-GA--C-G---TC------T-----C----C----A-T--AT-G-AGT--G----A--AA------T--A--T-T-CT----C-----GA-G--T---G--GGA-----C--G-T---A-A-AAC---A---A-T----AA-AT-AATCA
Reference ( family-1360 ) : GGGTCCG-GGT-T---A-G---A-----A-T-A--G----G--TC----C-T--C-AG------C--AT--CC--C---C--T-T-G-----C-----G-TG--T---C-G-------T------AAG-A----G------G---CG-A--C------T--G-A-A--T-GG--G-----G-C---G--G----T--C-----------A---------T--T-C---GG---------------A---T-G-A-G----------A--C-----C--G---G-A--A----AA------AC--C-G----------------------A-G---G---T-C-C--C--G-T--G-T----C---------A--C--A--G------------C--A-------G--G----------------------TG-T-------GG----------C-----ACG-A--TA----A-----AGA--T--C-C-C-----T--C-C--C--TG--C-T-CA---A-------A--GG-C---C--------------C---T-G--A---G-T--G---C--C-G--A--G-----C----------A------T--AGGCC-T----A-----A-A-T-------------------T-T--------T-GC--A-----G---C--C----C--TT---CA-----C--C-----G-G-------C-----A-N-----T--G--G-T-GA--C-G---TC------T-----C----C----A-T--AT-G-AGT--G----A--AA------T--A--T-T-CT----C-----GA-G--T---G--GGA-----C--G-T---A-A-AAC---A---A-T----AA-AT-AATCA
gi|1 : GC-T---A-G---A-----A-T-AC-G----A--TC----C-T--C-AGTGAGCCC--AT--GC--C---T--T-T-G-----C-----T-TG--T---CCG-------C------ACG-A----G------G---CG-A--G------T--ATA-A--T-CG--A-------C---G--G----C--CCT---------G---------T--C-C---GT---------------A---TCG-ACG----------A--C-----A--A---G-G--A----AAGATAAGAC--TTG----------------------A-G---GCTGT-G-C--C--A-T--G-T----C---------A--C--A--G------------CAAA-------G--G----------------------AG-T-------GA----------------ACG-A--TA----A-----AGAATT--C-C-CT----T--C-C--C--AGC-C-C-CA---A-------A--GA-T---C--------------------G--A-----T--A---TA-C-G--A--G-----CTTCGCGACAAA------T--AAGA-------A-----A-A-A-------------------T-T--------G-GC--A-----C---CT-C----T--TT---TA-----C--C-----GCG-------CGA---A-A-----T--GA-G-A-AA--T-G---TTA-----T-----CACG-C----A-T--ACGG-ACT--G----A--AA------C--A--T-TGAT----C-----AACG--T---C--GGG-----C--C-T---A-GCAAC---A---A-TTA--AA-AC-AATCA
gi|10 : ttacacaagccattatcactaccgtgaagaggctaccagaaGGATCCG-GGT-T---A-G---A-----A-T-A--G----G--TC----T-T--C-AG------C--AT--CC--C---C--T-T-G-----C-----G-TG--T---C-G-------T------AAG-A----G------G---CG-A--C------T--G-A-A--T-AG--G-----G-C---G--G----T--C-----------A---------T--T-C---GG---------------A---T-G-A-G----------A--C-----C--G---G-A--A----AA------AA--T-G----------------------T-G---G---C-T-C--C--G-T--G-T----C---------A--A--G--G------------C--A-------G--A----------------------TG-T-------GG----------C-----ACA-A--TA----A-----AGA--T--C-C-C-----T--C-C--C--TG--C-T-CA---A-------A--GG-C---C--------------C---T-G--A---G-T--G---C--C-G--A--G-----C----------A------T--AGGCC-T----A-----A-A-T-------------------T-T--------T-GC--A-----A---C--C----C--TT---CA-----C--C-----G-G-------C-----A-T-----T--G--G-T-GA--C-G---TA------T-----C----C----G-T--AT-G-AGT--G----A--AA------T--A--T-T-CT----C------A-G--T---G--AGA-----C--G-T---A-A-AAC---A---A-T----AA-AT-AATCatc
gi|100 : gtgg------T--A--T-T-CT----C-----GA-G--A---G--GGA-----C--T-T---A-A-AAC---A---A-T----A
gi|101 : ------T--A--T-T-CT----C-----GA-G--A---G--GGA-----C--T-T---A-A-AAC---A---A-T----Attcaaccaaccaa
gi|102 : GGTCCG-GGT-T---A-G---A-----A-T-T--T----G--CC----C-C--C-AG------C--AT--CC--ttcaaccaaccaa
gi|103 : tacccttagaT--G----A--AA------T--A--T-T-TTTTTTC-----G--G--T---G--GGA-----C--G-T---A-A-AAC---A---A-T----AA-AT-
gi|104 : GGGTCCG-GGT-T---A-G---A-----A-T-A--G----G--
gi|106 : atcacccgtgcaacccgtgg---G-T--G---C--C-G--A--G-----C----------A------T--AGGCC-T----A-----A-A-G-------------------T-T--------T-GC--A-----G---T--C----C--CT---CA-----C--
gi|107 : -T--C-AG------A--AT--CC--T------T-T-G-----C-----G-TG--T---C-G-------T------AAG-A----C------G---CA-A--C------T--A-A-A--T-
gi|108 : GGGTCTG-GGT-T---A-G---A-----A-T-A--A----G--TC----C-
gi|109 : ttgacatccgtga--A--T-T-CT----C-----G--G--T---G--GGA-----C--G-T---A-A-AAC---A---A-T----TA-AT-AATc
gi|11 : GGTTCG-GGT-T---A-G---A-----A-T-A--G----G--TC----C-C--C-AG------C--AT--CC--C---C--T-T-G-----T-----G-TG--T---C-GGCTGTGTT------CAG-A----G------G---CG-A--C------T--G-A-A--T-GG--G-----A-C---G--G----T--C-----------C---------T--T-C---GA---------------A---T-G-A-G----------A--C-----C--G---G-A--A----AA------AT--C-G----------------------A-G---G---T-C-C--C--G-T--G-T----T---------A--C--A--G------------C--A-------G--A----------------------TG-T-------GG----------C-----ACG-T--TA----A-----AGA--T--C-C-C-----T--C-C--T--TG--C-T-CA---A-------A--GG-C---C--------------C---T-G--A---G-T--G---C--C-G--A--G-----C----------A------T--AGGCC-T----A-----A-A-T-------------------T-T--------T-GC--A-----G---C--C----C--TT---CA-----C--C-----G-G-------C-----A-T-----T--G--G-T-GA--C-G---TC------T-----C----C----A-T--AT-G-AAT--G----A--AA------T--A--A-T-CT----C-----GA-G--T---G--GGA-----C--G-T---A-A-AAC---A---A-T----Aaatca
gi|110 : aT--G----A--AA------T--A--A-T-CT----T-----GA-G--T---G--GGA-----C--G-T---A-A-AAC---A---G-T----AA-Acaa
gi|111 : --AT-G-GGT--G----A--AA------T--A--T-T-CT----C-----AA-G--T---G--TGA-----C--G-T---A-A-AAC---A---a
gi|112 : GGGTCCA-GGT-T---A-G---A-----A-T-A--G----G--TC----
gi|114 : ttcacacccgtgg--T-T-CT----C-----AA-G--A---G--GGA-----C--G-T---A-A-AAC---A---A-C----AT-AC-AATCA
gi|116 : GGACCTG-GGT-T---A-G---A-----A-T-A--G----G--TC----C-T--C-a
gi|118 : cccatga---------T--T-C---GG---------------A---T-G-A-G----------A--C-----C--G---C-A--A----AA------AC--C-G----------------------A-G---G---T-C-
gi|12 : GGGTCCG-GGT-T---A-G---A-----A-T-A--G----G--TC----C-T--C-AG------C--AT--CC--C---C--T-T-G-----C-----G-TG--T---C-G-------T------AAG-A----G------G---CG-A--C------T--G-A-A--T-GG--G-----G-C---G--G----T--C-----------A---------T--T-C---GG---------------A---T-G-A-G----------A--C-----C--G---G-A--A----AA------AC--C-G----------------------A-G---G---T-C-C--C--G-T--G-T----C---------A--C--A--G------------C--A-------G--G----------------------TG-T-------GG----------C-----ACG-A--TA----A-----AAA--T--C-C-C-----T--C-C--C--TG--C-T-CA---A-------A--GG-C---C--------------C---T-G--A---G-T--G---C--C-G--A--G-----C----------A------T--AGGCC-T----A-----A-A-T-------------------T-T--------T-GC--A-----G---C--C----C--TT---CA-----C--C-----G-G-------C-----A-T-----T--G--G-T-GA--C-G---TC------T-----C----C----A-T--AT-G-AGC--G----A--AA------T--A--T-T-CT----C-----G--G--T---G--GGA-----C--G-T---A-A-AAC---A---A-T----AA-AT-AATCA
gi|13 : G----------C-----ATG-A--TA----A-----AGA--A--C-T-C-----G--C-T--T--TG--C-TACA---------------G-C---C--------------T---T-G--A---A-----------C-G--A--AAGTCAT----------A------T--AGGTC------A-----A-A-C-------------------T-T--------C-G---A-----G---C--TA---C--TT---CA-----A--A-----GTA-------C-----A-A-----TT-G--G-T-GT--C-----TCAGAAATT-----C----C----AGT--AT-G-AAT--G----T--TG------T--A--A-T-GT----T-----GG-A--T---G--AGA-----C--G-T---A-A-AAC---A---G-C----AA-A
gi|14 : ggagataatggagaatgtcacgtgacttttaacagtcatactttgcgtcaGTCCG-GGT-T---A-G---A-----A-T-A--G----G--TC----C-C--C-AG------C--AT--CC--C---C--A-T-G-----C-----C-TG--T---C-G-------C------AAG-A----G------G---CG-A--C------T--G-A-A--T-GG--G-----G-C---G--G----T--C-----------A---------T--T-C---GG---------------A---T-G-A-G----------A--C-----C--G---C-A--A----AA------AC--C-G----------------------A-G---G---T-C-C--C--G-T--G-T----C---------A--C--A--G------------C--G-------G--G----------------------TG-T-------GG----------C-----ACG-A--TA----A-----AGA--T--C-C-C-----T--C-C--C--TG--C-T-CA---A-------A--GG-C---C--------------C---T-G--A---G-T--G---C--C-G--A--G-----C----------A------T--AGGCC-T----A-----A-A-T-------------------T-T--------T-GC--A-----G---C--C----C--TT---CA-----C--C-----G-G-------C-----A-T-----T--G--G-T-GA--C-G---TC------T-----C----C----A-T--AT-G-AGT--G----A--AA------T--A--T-T-CT----C-----G--G--T---G--GGA-----A--G-T---A-A-AAC---A---A-T----AA-AT-AATCAgacactaaatacttgtaaattagcattatgtgtttccagttcggacgcacgggcaatttattt
gi|15 : TCCG-GGT-T---A-G---A-----C-T-A--G----G--TC----C-T--C-AG------C--AT--CC--C---C--T-T-G-----C-----G-TG--T---C-G-------T------AAG-A----G------G---CG-A--C------T--G-A-A--T-GG--G-----G-C---G--G----T--C-----------A---------T--T-C---GG---------------A---T-G-A-G----------A--C-----C--G---G-A--A----AA------AC--C-G----------------------A-G---G---T-C-C--C--G-T--G-T----C---------A--C--A--G------------C--A-------G--G----------------------TG-T-------GG----------C-----ACG-A--TA----A-----AGA--T--C-C-C-----T--C-C--C--TG--C-T-CA---A-------A--GG-C---C--------------C---T-G--A---G-T--G---C--C-G--A--G-----T----------A------T--AGGCC-T----A-----A-A-T-------------------T-T--------T-GC--A-----G---C--C----C--TT---CA-----C--C-----G-G-------C-----A-A-----T--G--G-T-GA--C-G---TC------T-----C----C----A-T--AT-G-AGT--G----A--AA------T--A--T-T-CT----C-----G--G--T---G--GGA-----C--T-T---A-A-AAC---A---A-T----AA-AT-AATCA
gi|16 : aGATCCG-GGT-T---A-G---A-----A-T-A--G----G--TC----C-T--C-AG------C--AT--CT--C---C--T-T-G-----C-----G-TG--T---C-G-------C------AAG-A----G------G---CG-A--C------T--G-A-A--T-GG--G-----G-T---G--G----T--C-----------A---------T--T-C---GG---------------A---T-G-A-G----------A--C-----C--G---A-A--A----AA------AC--C-G----------------------A-G---G---C-C-C--C--G-T--G-T----C---------A--C--A--G------------C--A-------G--G----------------------TG-T-------GG----------C-----ACG-A--TA----A-----AGA--T--C-C-C-----T--C-C--C--TG--C-T-CA---A-------A--GG-C---C--------------C---T-G--A---G-T--G---C--C-G--A--G-----C----------A------T--AGGCC-T----A-----A-A-T-------------------T-T--------T-GC--A-----G---C--C----C--TT---CA-----C--C-----G-G-------C-----A-T-----T--G--G-T-GA--C-G---TC------T-----C----C----A-T--AT-G-AGT--G----A--AA------T--A--T-T-CT----C-----G--G--T---G--GGA-----C--G-T---A-A-AAC---A---A-T----AA-AT-AAT
gi|17 : CCG-GGT-T---A-----A-----A-T-A--G----G--TC----C-C--C-AG------C--AT--CC--C---G--T-T-C-----C-----G-TG--T---C-G-------T------AAG-A----G------G---CG-A--C------T--G-A-A--T-GG--G-----G-C---G--G----T--C-----------A---------T--T-C---GG-------------------C-G-A-G----------A--C-----C--G---T-A--A----AA------AC--C-G----------------------A-G---G---T-C-C--C--G-T--G-T----C---------A--C--A--G------------C--A-------G--G----------------------TG-T-------GG----------C-----ACGAA--AA----A-----AGA--T--C-C-C-----T--C-C--C--TG--C-T-CA---A-------A--GG-----C--------------C---T-G--A---G-T--G---C--C-G--A--G-----C----------A------T--AGGCC-T----A-----A-A-T-------------------T-T--------T-GC--A-----G---C--C----C--TT---CA-----C--C-----G-G-------C-----A-A-----T--G--G-T-GA--C-G---TC------T-----C----C----A-T--AT-G-AGT--G----A--AA------T--A--T-T-CT----C-----GA-G--T---G--GGA-----C--G-T---A-A-AAC---A---G-T----AA-AT-AA
gi|18 : atggCCG-GGT-T---A-T---A-----A-T-A--G----T--TC----C-C--C-AG------C--AT--CC--C---C--T-T-G-----C-----G-TG--T---C-G-------T------AAG-A----G------G---CG-A--C------T--G-A-A--T-AA--G-----G-C---G--G----T--C-----------A---------T--T-C---GG---------------A---T-G-A-G----------A--C-----C--G---G-A--A----AA------AC--C-G----------------------A-G---G---C-C-C--C--G-T--G-T----C---------A--C--A--G------------C--A-------G--G----------------------TG-T-------GG----------C-----ACG-A--TA----A-----AGA--T--C-C-C-----T--C-C--C--TG--C-T-CA---A-------A--GG-C---C--------------C---T-G--A---G-T--G---T--C-G--A--T-----C----------A------T--AGGCC-G----A-----A-T-T-------------------T-T--------T-AT--A-----G---C--C----C--TT---CA-----C--C-----G-G-------C-----A-T-----T--G--G-T-GA--T-G---TC------C-----T----C----A-T--AT-T-AGT--G----A--AA------T--A--T-T-TT----T-----G--G--A---G--GGA-----A--G-T---A-A-AAT---A---A-T----AA-AT-AATCAc
gi|19 : -GGT-T---A-G---A-----A-T-A--G-------TC----C-T--CCAG------T--AC--CC--C---T--T-T-C-----T-----T-TT--T---T-G-------T------GAG-A----G------G---C-----C------T--A-A-A--T-GG--G-----G-G---GC-G----T--C-----------C---------T--T-C---G----------------A---T-G-A-G-------------C-----C--A---C-A--A----A-----------C-G----------------------A-G---T---C-C-T--C--G----G-T--------------A--C--A--GA-----------C------------------------------------TG-T-------GG----------------AC--A--TA----A-----AGA--T--C-CTC-----T--C-C--T--TG--C-T-CAT--A-------A--GG-C---CAAAGCTGCTCAAGAC---T-A--A---G-T--G---C----A--A--G-----C----------A------T--AGGCC-T----A-----A-A-T-------------------T-T--------T-TG--A-----A---C--C----C--GT---CA--------C-----G-G-------CA----A-A-----T--G--G-T-GA--C-G---TC------T-----C----T----A-T--AT-C-AGT--G----A--GG---------A--T-T--T----C-----AA-G--T---G--G-------C--A-T---T-A-AAT---AGATA-T----AT-AC-AATCa
gi|2 : tG-GAT-T---A-G---ATCTTTA-T-G--G----GCTTT----T-T--C-AG------G--AT--CC--CT--C--T-C-G-----T-----G-TG--T---C-GGTT----T------AGG-A----GTTCGTAGTCTCG-A--AG-----T--G-A-G--T-GA--G-------C---G--G----TATT-----------A---------C--T-CTTGGG---------------C---T-G-A-C----------G--CATACTC--GTGTG-A--T----AA------ACA-C-G----------------------ATG---G---T-C-T--C--GGT--G-T----C---------A--CC-A--G------------C--A-------G--G----------------------TG-T-------GGGCGAAAGAAGC-----ATA-G--TA----A-----GGA--TGAT-C-C-----TG-C-C--C--TGG-C-T-CATAAG-------A--GG-C---CTT------------C---T-G--A---G-T--GGTAC--C-A--A--T-----------------------T--AGGCC-T----ACTGTTA-A-T-------------------T-TCCGTTT--T-GC--A-----T---G--C----C--TT---CA-----C--C-----G-A-------T-----A-T-----T--G--G-T-GA--A-T---TC------T---------------A-A--GT-T-GGT--G----A--AA------T--A--T-T-CT----C-----GA-G--T---A--GGATATCGC--G-T---ATA-AAC---A---A-T----AA-AT-AAT
gi|20 : gtggggagttcgaaCCG-GGT-T---A-G---A-----AAT-A--G----G--TC----C-T--C-AG------T--AT--CG--C---C--T-T-G-----C-----T-TG--T---C-G-------T------AAG-A----G------GG--TG-A--C------T----A-A--T-GG--G-----G-C---G--G----T--C-----------T---------T--T-A---GG---------------A---T-G-A-G----------A--C-----C--G---C-A--A----AA-------T--T-G----------------------A-A---G---T-T-C--TT-G-T--T-T----C---------AA-C--A--G------------C--A-------G--G----------------------TGGT-------GA----------C------CG-A---A----A-----AGA--T--C-C-------T--C-T--C--TG--C-T-CA---A-------A--GA-C---C--------------A---T-T--A---GCT--G---C--C-G--A--G-----C----------A------A--AGGCC-T----A-----A-A-T-------------------G-T----------GC--A-----G---C--C----C--TT---CA-----C--C-----G-G-------C-----A-A-----T--G--G-T-GA--C-G---TC------T-----C----C----A-T--AT-G-AGT--G----A--AA------T--A--T-T--T----C-----AA-G------A--AGA-----C--G-T-----A-AAC---A---A-
gi|21 : gaGGATCCG-GGT-T---A-A---T-----A-T-A--G----T--TC----C----C-AG------C--AT--CC--C------T-T-G-----C-----G-TG--T---C-G-------C------AAG-A----G------G---CG-A--C------T--G-A-A--T-AA--G-----G-C---G--GG---T--C-----------A---------T--T-C---GG---------------A---T-G-A-G----------A--CG----C--G---G-A--A----AA------AC--C-G----------------------A-G---G---C-C-C--C--G-T--G-T----C---------A--C--A--G------------C--A-------G--G----------------------TG-T-------GG----------C-----ACG-A--TA----A-----AGA--T--C-C-C-----T--C-C--C--TG--C-T-CA---A-------A--GG-----C--------------C---T-G--A---G-T--G---T--C-A--A--T-----C----------A------T--AGGCC-T----A-----A-T-T-------------------T-T--------T-TT--A-----G---C--C----C--TT---CA-----C--C-----G-G-------C-----A-T-----T--G--G-T-GA--T-G---TC------C-----C----C----A-T--AT-G-AGT--G----A--AA------T--A--T-TCCT----T-----GG-G------G--GAA-----C----T---A-A-AAC---A---A-acatatcaa
gi|22 : tgg-GGT-T---A-G---A-----A-T-A--G----G--TC----C-T--C-AG------C--AT--CC--C------T-T-G-----C-----G-TG--T---C-G-------T------AAG-A----G------G---CG-A--C------T--G-A-A--T-AG--G-----G-C---G--G----T--C-----------A---------T--T-C---GG---------------A---T-G-A-G----------A--C-----C--G---G-A--A----AA------AT--C-G----------------------A-G---G---G-C-C--C--G-G--A-T--------------A--C--A--G------------C--A-------G--G----------------------TG-T-------GG----------C-----ACG-A--TA----A-----AGA--T--C-C-C-----T--T-C--T--TG--C-T-CA---A-------A--GG-C---C--------------C---T-G--A---G-T--G---C--C-G--A--G-----T----------A------T--AGGTC-T----A-----A-A---------------------T-T--------T-GC--A-----G---C--C----C--TT---CA-----C--C-----G-G-------C-----A-T-----T--G--G-T-GA--C-G---TC------T-----C----C----A-T--AT-G-AGT--G----A--AA------T--A--T-T-CT----C------A-G--T---G--GGA-----C--G-T-----A-AAC---A---A-T----AA-AT-AATCA
gi|23 : --G-A-T--T-GG--G-----G-C---G--T----T--C-----------C---------T--T-C---GG---------------A---T-GTA-G----------A--C-----T--G---G-A--A----CA----------C-T----------------------A-G---G---T-CTC--T--G-T--G-T----T------------C--AT-G------------C--A-------G--GGT--------------------TT-T-------GG----------CTAAT-ATG-T--TT----ATTTTCAGT--T--T-C-T-----T--C-CTTC--CG--C-T-TT---A-------ATTAG-TTTGC--------------G---T-G--A---G-T--G---C--CTG--T--G-----C-----------------T--GTGT-----------------T-------------------T-T--------T-GT------------T--C----T--TT---CA-----C--C-----G-G-------C-----A-------T--G--A-T-GA--G-T---TC------TGA---T----C----A-T--AT-G-A-T--G--------A------T--A--T-T-CT----C-----TT-G--T---G--GGG-----C--a
gi|24 : aaataggtccagcaatgcccgtttggtctcgtcttggtttacatattcggtaa---A-----A-T-A--G----G--TA----C-T--A-AG------G--A---CC--T---A--T-T-AAAGACC-----T-TG--T---T-G-------T------AAG-A----G------A---TG-A--C------G--G-A-A--T-GG--G-----G-T---G--G----T--C-----------G---------T--C-C---AG---------------A-----G-A-G----------A--C-----
gi|24 : ---G--GGA-----C--G-T---T-A-AAC---A---A-T----AA-AT-AATtnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngggacgttaaacaataaataattgat
gi|25 : aataggtactaaggacctattaaagaccttgttgtaagagatgacggaatggggtggtcgtccagagagactnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn-GGT-T---A-G---C-----A-A-A--G----G--TC----G-C--C-AG------T--A---CC--C---C--T-G-G-----C-----T-TG--T---C-G-------T------AAG-A----G------G---CG-A--C------T--A-A-A--T-GG--G-----GGC---G--G----T--C-----------C---------C--T-A---GG---------------A---T-G-A-G----------A--C-----C--G---T-A--A----AC------AT--T-G----------------------A-T---G---C-C-C--C--T-T--G-T----C---------A--C--A--G------------T--A-------G--G----------------------TG-T-------GG----------C-----ACA-A--TA----A-----AGA---------------T--C-C--C--TG--C-T-CA---A-------A--GG-C---T--------------G---T-A--A---G-C--G---C--C-G--G--G-----C----------A------T--AGACC-T----A-----A-A-T-------------------T-T--------T-GC--A-----G---C--CCTGGC--TT---CA--------C-----G-G-------A-----A-A-----T--G--G-T-AA--T-G---TC------T-----C----C----A-TA-AT-G-AGC--A----A--AA------------------------------------------GA-----C--GCT---A-ATAAC---A---A-T----AT-AC-AATCAtgat
gi|26 : aGGACCTG-GGT-T---A-G---A-----A-T-A--G----G--TC----C-T--C-AG------T--AT--CC--C------T-T-G-----C-----T-TG--T---C-A-------T------AAT-A----G------G---TG-A--C------T------A--T-------------T---A--G----T--T-----------C---------T--T-C---GG---------------A---T-G-A-G----------A--C-----------------------------------------------------------------A---T-C-C--C--G-T--G-T----C---------A--C--A--G------------C--ACTGAGCAG--G----------------------TG-T-------GG----------C-----ACG-A--TA----A-----AGA--T--C-C-C-----T--T-C--C--TG--C-T-CA---A-------A--GG-C---C--------------A---C-A--A---G-C--A---C--T-G--A--G-----C----------A------C--AAGCC-T----T-----A-A---------------------T-T--------C-AC--A-----G---T--C----C--TT---AA-----C--C-----C-A-------C-----A-A-----T--A--A-A-AA--C-G---TC------T-----C----G----A-T--TA-G-AGT--G----A--AA------T--A--T-T-CT----C-----AA-G--A---G--GGA-----T--G-T---A-A-AAC---A---A-T----AC-AC-AAa
gi|27 : GGGTCCG-GGT-T---A-G---A-----A-T-A--G----G--TC----C----C-AG------C--AT--CC--C---C--T-T-G-----C-----A-TG--T---T-G-------T------AAG-A----G------G---CG-A--C------T------------------------------G----T--C-----------A---------T--T-C---AG---------------A---C-G-A-G----------A--C-----C--G---G----A----AA------AC--C-G----------------------A-G---G---T-C-C--C--G-T--G-T----CACATAAATGA--C--A--G------------C--A-------G--G----------------------TG-T-------GG----------C-----ACG-A--TA----A-----AGA--T--C-C-C-----T--C-A--C--TG--C-T-CA---A-------A--GG-C---A--------------C---T-G--A---G-T--G---C--C-G--A--G-----C----------A------C--AGGCC-T----A-----A-A-T-------------------T-T----------------------------------------------------------A-------C-----A-A-----T--G--G-T-GA--T-G---TC------T-----C----C----G-T--AT-G-AGT--G----A--AA------T--A--T-T-CT----C-----GA-G--T---G--GGA-----T--G-T---A-A-AAC---A---A-T----AA-AT-AATCc
gi|28 : tggCCG-GGT-T---A-G---A-----A-T-A--G----G--TC----C-T--C-AG------TT-ATTACA--C---C--C-A-G-----C-----T-TG--T---C-G-------T------ATG-A----G------G---AG-A--C------T--A-A-A--T-GG--G-----G-T---G--G----T--C-----------C---------T--T-T---GG---------------A---T-G-A-G----------A--C-----C--G---T-A--A----AA------AT--C-A----------------------A-G---G---C-C-C--C--T-T--G-T----C---------A--T--G--G------------C--A-------A--G----------------------TG-T-------TG----------C-----ACA-A--TA----T-----AGA--T--C-C-C-----T--C-C--C--TG--C-T-TA---A-------A--GG-C---TG-------------T---T-A--A---G-T--G---C--T-G--A--G-----C----------A------T--AGGCC-T----A-----A--------------------------------------------------------------T---CA-----C--T-----G-G-------C-----A-G-----T--G--G-T-CA--C-G---TC------T-----------------------------------A--AA---------A--T-T-CT----T-----GA-G--C---A--GGA-----C--A-T---T-A-AGC---A---A-TACACAA-AT-AATCA
gi|29 : c-T---A-G---A-----A-T-A--G----G--TC----C-A--C-AG------T--AC--CC--C---C--T-C-G-----C-----T-TG--T---C-G-------T------AAG-A----G------A---CG-A--C------T--------------------------------------------------A---------T--T-C---GG---------------A---T-G-A-G----------A--C-----C--A---C-A--A----AA------AC--C-G----------------------A-A---G---T-C-C--C--G-T--G-T----C---------A--C--A--G------------C--A-------G--G----------------------TG-T-------GG----------C-----ACG-A--TA----A-----AGA--T--T-C-C-----T--C-C--C--TG--C-T-CA---A-------T--GG-T---C--------------A---T-G--A---G-C--G---C--C-G--A--G-----C----------A------T--AGGCA-T----A-----------------------------T-T--------T-GC--A-----G---C--C----C--TT---CA-----A--C-----G-GC------C-----A-A-----T--G--G-T-GA--C-G---TC------T-----C----C----A-T--AT-G-AGT--G----A--AG------T--A--T-T-CT----T-----GA-G--A---G--GGA-----T--G-T---A-A-AAT---A---at
gi|3 : CCG-GGT-TGAGA-G---A-----AAT-AT-G----G--TCG---C-T--C-AG------CTGGT--TC--C---C--G-T-G-----T-----G-TA--G---C-G-------TGTCTCAAAG-A----G------G---CGGA--C------T--C-A-A--TAGG--G-----G-C---G--A----G--CTTA--------A---------T--T-G---GG---------------A---T-G-A-A----------G--C-----C--G---G-A--AG---AA------AC--C-G----------------------A-G---GA--G-C-C--C--G-T--GGT----C---------A--T--AT-G------------C--A-------GAGG----------------------TG-TTG-----AG----------C-----ACG-AATCA----AT----AGA--T--C-C-C-----T--C-C--T--AGGAC-T-GA---A-------A--GGAT---C--------------CGCGT-G--A---G-CTAG---C--C-GTGA--G-----C----------AGA----T--AGGCT-T----A-----A-T-T-------------------T-T--------T-GCG-A-----G---T--T----C--CT---TG-----C--------G-G-------C-----A-------T--G--G-T-GA--C-G---TCA-----T-----C----C----ATT--AT-G-AGT--G--------A------T--A--C-T-CT----CTTCGGGA-GT-T---GGTGGA-----CGTG-T---G-A-AAC---A---ATT----AA-AT-tacaaccaacaaca
gi|30 : ctggtggggttccgctaGGGTCCG-GGT-T---A-G---A-----A-T-A--G----G--TC----C-C--C-AG------C--AT--CC--C---C--T-T-G-----C-----G-TG--T---C-G-------T------A---------------------------------------------------------------------------------------------T--T-C---GG---------------A---T-G-A-G----------A--C-----C--G---G-A--A----AA------AC--C-G----------------------A-A---G---T-C-C--C--G-T--G-T----C---------A--C--A--G------------C--A-------G--G----------------------TG-T-------GG----------C-----ACG-A--AA----A-----AGA--T--C-C-C-----T--C-C--C--TG--C-T-CA---A-------A--GG-C---C--------------C---T-G--A---G-T--G---C--C-G--A--G-----C----------A------T--AGGCC-T----A-----A-A-T-------------------T-T--------T-GC--A-----G---C--C----C--TT---CA-----C--T-----G-G-------T-----A-A-----T--G--G-T-GA--C-G---TC------T-----C----C----A-T--AT-G-AGT--G----A--AA------T--A--T-T-CT----C-----G--G--T---G--GGA-----C--G-T---A-A-AAC---A---A-G----AA-AT-AATCAtgtaatacaat
gi|31 : --G-T----C---------A--CCCA--G------------C--A-------G--G----------------------TG-T--------G----------T-----GCG-A--CA----A-----GAAACT--C-T-C-----A--C-C--C--TG--C-G-CA---A-------AG-GG-C---A--------------G---T-AT-A---G-C--A---C--G-G--A--T-----CA---------A------C--AGACC-T----A-----ACA-----------------------T--------T-GC--A-----GTATC--C----G--TT---CAAACAGT--C-----A-G-------C-----T-A-----C--G--T-C-GAGGT-G---TC------A-----C----C----A-T--AT-C-AAT--G----A--AA------TTAA--A-T-CT----C-----GA-GGTC---G--GAA-----C--G-at
gi|32 : gtgtgactgatagaacggtcttttaataacaaggtccttctaaaGGATCCG-GGT-C---A-G---A-----A-T-A--T----A--TC----C-T--C-AG------A--AG--AC--C---T--T-T-T-----T-----T-TA--T---C-A-------T------AAA-A----G------G---CG-A--T------T--A-A-A--C-TG--G-----A-C---A--G----T--C-----------C---------T--T-T---GG---------------A---A-A-A-G----------A--C-----C--G---C-A--A----AA------AC--C-G----------------------A-T---G---T-A-C--C--G-T--T-T----C---------A--C--A----------------------------------------------------------------G----------C-----ACG-A--TA----A-----AGA--C--C-C-C-----T--C-C--T--TG--C-T-CA---A-------A--GG-G---T--------------C--------A---G-A--G---A--T-G--A--G-----C----------A------T--ACGTC-T----attcgttattgaataataacaacca
gi|32 : tA--C-G---TC------T-----C----C----A-T--GT-G-ATT--G----A--AA------G--A--T-T-CT----A-----GG-G--C---T--CAA-----C--G-T---T-A-AAC---A---A-T----ccatgtgattgaaagattctagggctcaacgttaaacaatgtatgtaattataaacaacc
gi|33 : tggatccgggtcagaatatatcctcagaagacctttttttatcataaaaggcgattaaactggacagtcctttggaaaagaccgcaaaaaccgatgtaccgtttcacagcacgataaagacccctccttgctcaaagggtcagagatgagcat-T-------GG----------C-----ACG-A--TG----A-----AGA--A--C-C-T-----T--C-A--C--TG--C-T------A-------C--GG-C---C--------------C---T-G------G-T--C---C--C-C--AT-G-----C----------A------TACAGGTA-C----G-----T-A-T-------------------T-TCTCATACAT-GC--ATTTTGG---T--A----C--TT---CA-----C--CTATAGA-G-------CTCCCAA-T-----T--G--C-T-TA--C-G---TT------T-----T----A----A-A--AT-G-AGTC-GGTGCA--AA------T-----T-T-CT----C-----AA-A--C------AGA-----C--G-T---A-A-AACA--A---A-C----AA-A--AACCAgtatgtaattataaacaacc
gi|34 : gcgcCCG-GGT-T---A-G---A-----A-T-A--G----G--CC----C------AG------C--A---CC--C---C--T-T-G-----C-----T-TG--T---C-G-------T------AAG-A----G------G---CG-A--C------T----A-A--T-GG--G-----G-C---G--G----T--C-----------C---------T--T-C---GG---------------A---T-G-A-G-------------C-----C--G---C-A--A----AA------AC--C-aacaaaacagtctttgattataaatcattttggatt
gi|34 : ac-T-TA---A-------A--GG-C---C--------------A---T-G--A---G-C--G---C--C-G--A--G-----C----------A------A--AGGCC-T----A-----A-A-T-------------------C-T----------GC--A-----G---C--C----C--TT---CA-----C--C-----G-G-------C-----A-A-----T--G--G-T-GA--T-G---TC------T-----C----C----A-T--AT-G-GAT--G----A--AA------T--A--T-T-CT----C-----AA-G--A---G--GGA-----C--G-T---A-A-AAC---G---A-C----AT-AT-AATCAttttaaaggccatgagcgccgagcaaaggcctaaatctgcagcccttcaccggcaatggtgatgtctccatatggatgaaatattctcaagagggacgtaaaacgacatataatca
gi|35 : acccgggttagaataggcccagcaccccttgcttgtcgtaagaggcgactaatggggcggtccttcggatgagccgcaaaaacctt------AAG-A----G------G---CG-A--C------T--A-A-A--T-CG--G-----G-C---G--G----T--C-----------C---------T--T-T---AG---------------A---T-G-A-G----------C--C-----C--A---C-A--A----AA------AC--T-G----------------------A-G---G---C-T-A--C--A-T--A-T----T---------A--C--A--G------------C--A-------T--G----------------------TG-C-------GG----------T-----ACG-A--TA----A-----AGG--C--C-C-A-----T--C-T--A--AG--C-T-TA---A-------A--AG-C---C--------------C---T-A--A---G-T--T---A--C-A--A--A-----C----------A------T--AGGCC-T----A-----A-A-G-------------------T-T--------T-GC--A-----G---C--C----C--CC---TA-----C--C-----G-A-------C-----A-A-----T--G--G-T-GT--C-GC--TC------T-----C----
gi|36 : gttgagatcgggtcagtactactagcttggta--GA-C---C--------------C---T-G--A---G-----------C-G--AATG-----C----------ATACATGT--AGAAC-A----A-----A-C-T-------------------TAT--------T-GT--G-----G---T--A----C--TT---CG-----C--CTATA-G-A-------C-----A-C--------G--A-T-GA--C-G---TT------T-----C----A----A-T--AT---AGC--G----T--AG------A--G--T-G-CT----C-----AA-AC-T---G--GAA-----C--A-T---A-A-TAA---G---A-T----GA-AC-AATCAga
gi|37 : cgacgtaggaaccttactgttgt---G--G----T--C-----------A---------T--T-C---GG---------------A---T-G-A-G----------A--C------------G-A--A----AA------AC--C-G----------------------A-G---G---T-C-C--C--G-T--G-T----C---------A--C--A--G------------C--A-------G--GT---------------------TG-T-------GG----------C-----ACG-A---A----A-----AGA--T--C-C-T-----C--C-C--T--TG----T-C----A-------A--GG-C---C--------------C---T-G--A---G-T--aaagaaatattagtttagatccataaagaatttcagatt
gi|38 : CCG-GAT-T---A-C---A-------C-A--A----G--CC----C-C--C-GG------C--AG--TA--C---C--T---G-----C-----T-TG--T---C-G-------TC-----AAG-A----------------------------T----A-A--T-G-----------C---T--G----T--C---------------------T--T------G---------------T---C-G-C-G----------A--C------------G-A--A----AA------AC---------------------------------G-------C--C--G-C--A------A---------A--C--G--G------------C--A-------G-------------------------TG-T-------G-----------C-----ACG-A--AAG---A-----AGAC-T--C-C-C-----T--CTC--C--TG--C-T-CA---A-------AA-GG-C---C--------------A---T-A--A---A-T--G---C--C-G--A--------C----------A------T---GGCC-T----G-----A-A-T-------------------T-T--------C-AC--A-----G---C--ccataccacattaagtatatctcacgaggtatatcaagatcaatgactcaaattcaggtatattataccataagtagagcttgtggatgtgttta
gi|39 : tacgaacctgtgaagatcgCG-GGT-T---T-G---A-------T-A--G----A--TC------T--C-AG------T--AA--CCG-C---C--T-------------------------C-G-------T------AAG-AT---G------G---CG-A--C------T--A-A-T--C-GG--A-----G-C---G--GCTCCT--C-----------A---------T--A-C---GG---------------A---T-A-ACG----------A--G-----T--A---G-A--A----AACAT---AC--C-G----------------------A-G---G---C-C-CA-C--A-T--G-T----T---------ATCC--A--A------------A--A-------A--G----------------------C-----------G----------A-----ACG-A--T-------------A--T--C-C-C-----T----C--C--TG--CTT-CA---A-------A--A---------------------C---T-GGAA---G-T--GA--C--C-A--G--G-----C----------T------A--AGGCC-T----A-----T-A-T-------------------T-T--------gtt
gi|4 : cgtgggaatG-GGT-T---A-G---A-----A-T-A--GTAGGA--TC----CGT--C-AG------C--AG--CC--T---CGGTGT-G-----C-----G-TG--TTG-C-G-------T------ACG-A----GCG----G---CG-AGGC------T--GCA-A--T-GG--G-----G-AA--G--G----TG-C-----------A---------TG-T-C---GGGGATGTCCGCGTGCCA---T-G-A-GGAGCGTGGATA--C-----A--G---G-A--A----A-----------C-G----------------------A-A---G---TGCGC--C--G-C--G-TTGTCC---------A--C-----G------------C--A-------G--G----------------------TG-G-------TG----------C------CG-A--AA----A-----AGA--T--C-C-TCGAGAT--C-C--CGGTG--C-G-TA---AG------A--GG-CG--C--------------C---T-G--A---GGT--G---C--C-G--A--GAGA--C----------A------T--AGGCT-A----G-----A-A-TAA-----------------G-T--------T-GC--A-----G---C--G----C--CTGTGCA-----A--C-----G-G-------C-----A-G-----A--T--G-T-GA--C-G---TC------T-----CG---C----A-TAAAG-G-AGT--G----A--
gi|40 : TCCG-GGC-T---A-G---A-----A-T-A--G----G--TC----C-T--C-AG------C--AT--TT--C---C--T-T-G-----C-----G-TG--T---C-G-------T------TAG------G------G---CG-A--C------T--G-A---------------------------------------------A---------T--T-C---GG---------------A---T-G-A-G----------A--C-----C--G---C-A--T----AC------AT--C-G----------------------A-G---G---T-C-C--C--G-T--G-T----C---------A--C--A--G------------C--A-------G--A----------------------TG-T-------GG----------C-----ACG-A--AA----A-----AGA--T--C-C-C-----T--C-CT-T--TC--C-T-CA---A-------A--GG-C---C--------------C---C-G--A---G-T--G---C--C-G--A--G-----C----------A------C--AGGCC-T----A-----A-ATT-------------------T-T--------T-GC--A-----G---C--C----C--tagttggtcggtggaaacgctcgtaagcatatataa
gi|41 : aTCCG-GGT-T---A-G---A-----A-T-A--G----G--TC----C-C--C-AG------C--AT--CC--C---C--T-T-G-----C-----G-TG--T---C-G-------T------AAG-A----G------G---CG-A--C------T--G-A-A--T-GG--G-----G-C---G--G----T--C-----------A---------T--T-C---GG---------------A---T-G-A-G----------A--C-----C--G---G-A--A----AA------AC--C-G----------------------A-G---G---T-C-C--C--G-T--G-T----C---------A--C--A--G------------C--A-------G--G----------------------TG-T-------GG----------C-----ACG-A--TA----A-----AGA--T--C-C-C-----T--C-C--C--TG--C-T-CA---A-------A--GG-C---C--------------C---T-G--A---G-T--G---C--C-G--A--G-----C----------A------T--AGGCC-T----
gi|42 : --C--G-T--G-T----C---------A--C--G--G------------C--A-------G--------------------------------------------------------------A----A-----ACA--T------------T--C-A--C--TG--C-TGCG--------------GA-C---C--------------C---C-G--C---G-T--T---TTAC-A--T--G-----T----------G------T--AGGTC-T----G-----A-A-T-------------------T-TGTGGTACTT-GT--G-----G---T--A----C--TT---CA-----C--T-----T-A-------C-----A-G-----TT-G--G-C-GA--C-G---T-----------------------A-T---T-G-ATT------------------T--T--T-T-CC----A-----GA-A--G---G--GGA--------G-T---A-A-AAC---A---AGC----AA-AC-AAACA
gi|43 : G-T-------GG----------C-----ACG-A--TG----A-----AGA-----A-C-T-----T--C-A--C--TG--C-T------A-------C--GG-C---C--------------C---T-G--aacaaacaaaccgttgaatat
gi|44 : cG-GGT-T---A-G---A-----A-T-T--G----G--CG----C----C-AG------C--AC--CTAAT---T--T-C-G-----C-----C-TG--T---C-G-------T------AAGTA----G------G---CG-A--C---------G-A-A--T-GG--G-----G-C------G----T--C-----------A---------T--T-C----G---------------A---T-G-G---------------------C--GT--G----------A------AC--C-G----------------------A-A-----------C--C--G----A-T----C------------C--A--G------------C--A-------G--G----------------------T-----------------------------TA-A--AA----A-----AGG--A--C-C----------C-C--C--CG----T-CG---A-------A--G------C--------------C---T-G--A---G-T--G---gtccctgccatacaggtacgttatttctgatacatgtgtttgtacttccctatagagcttcacatgcttacgtttttaaaaagatcggtcaaatttctcaaacagacgataaaaacaaacaaa
gi|45 : ggagtcacga---------A--C--A--G------------C--A-------G--G----------------------TA-T-------GG----------C-----ACG-A--TA----A-----AGA--C--C-C-C-----T--T-C--C--TG--C-T-GG---A-------A--AG-C---C--------------A---T-G--G---A-C--A---T--T-G--A--G-----C----------A------C--AGGCT-T----A-----A-G---------------------T-T--------T-GT--G-----G---C--C----C--TT---CA-----C--C-----A-G-------C-----A-A-----T--G--G-T-GAT-T-G---TC------T-----C----T----A-T--AT-C-AGT--G----A--AA------T--A--T-T-CT----C-----AA-G--A---G--GGA-----C--T-T---A-A-AAC---A---G-T----gattttccaagtgggacctaa
gi|46 : --T-T-G-----T-----G-TA--TGAAC-G-------C------AAG-A----G------GG--CG-AA-C------T--GGA-A--T-GAAAG-----T-C---G--G-------------------A---------TG-T-C---GA---------------C---T-G-A-G----------AAGCAG---C--A---A-A--A----GA------ACA-C-G----------------------A-GT--G----------C--G-TAAG-T----C---------A--C--A--G------------C--ATG-----G--A----------------------TG-T-------GG----------C-----A-G-A--AA----A-----AGA--T--CAA-C-----T--CTC--C--TG--C-T-CA---ATAATGAGA--GG-C---C--------------T---G-G--AG--G-T--G---C--A-G--AC-G-----C----------A------ttacaaccaacc
gi|47 : GGATCCG-GCT-T---A-G---A-----A-TAA--G----G--TCTAGTC-A--C-AG------C--AT--CCG-C---CATT-T-A-----C-----G-TG--T---
gi|48 : acccccccccccccccccccccccccccccctttcgagtcaaataacttgagtccgccagaatctgattacacatttgcataattgtttcgaacccgtG-T-------TG----------C-----ACG-A--TT----C-----AGA--A--C-C-C-----T--G-G--C--TG--C-T------A-------C--GG-C---C---------------------------G-T--------------A--G-----A----------A------TC-AGGCC-T----C-----G-A-TTAATA--------------T-T--------T-CT--A-----G---C--A----T--TT---CA-----C--CTAA--A-G-------C-------------T--G--G-T-AA--C-G---AA------T-----C----T----A-C--AA-G-AAT--G----A--AA------T--A--T-T-CT----ta
gi|5 : -GGT-T---AAG---A-----A-T-AACG----G--TC----C-TA-C-GC------C--AC--CT--C---CAGT-G-G-----C-----GGTGAAT---C-GAG-----T------AAGTA----G------GA--CG-A--C------T--G-ATAC-T-GG--G-----G-CT--GCCG----T--C-----------A---------C--T-C---GAGGTA-----------A---T-G-A-G----------A--C-----CC-G---G-A--A----AATA----AC--C-G----------------------A-G---G---T-A-CTAC--A-T--G-T----C---------A--C--ACAG------------C--A-------A--GA---------------------TGAG-------GG----------C-----ACG-A--TA----A-----AGG--C--C-CAT-----T--T-C--C--AG--C-T-TA---A-------A--AG-CGCGC--------------C---T--------G-T--G---C--CAG--A--T-----A----------A------TA-AGGCC-T----AT----A-A-T-------------------TAT--------T-GC--AT----G---G--C----T--AA---CA-----CCAC-----G-GAGGAA--C-----A-G-----G--G--T-T-GA--T-G---TC------T-----C----CCATAA-T--AG-A-AGTC-G----A--AA------T--A--T-T-CTGC--C-----GG-G--TATGA--GAA-----C--G-T---T-A-AAC---A---A-T----AA-CTCAATCAttaagggtccattcaaaccaacataccaaacaaaa
gi|50 : --A-------G--G----------------------CG-TT------GG----------C-----ACG-C--TA----A-----CGA--A--C-C-C-----T--C-G--C--TG--C-TACA---------------G-C---C--------------C---T-G--A---G-T--G---C--T-A--A--G-----C----------A------T---------------------------------------------T--------T-GT--G-----G---T--A----T--TC---CA-----C--C-----T-A-------C-----A-G-----C--T--A-C-AA--T-G---TC------T-----T----A----A-T--AT-G-AGT--G----A--AA------G--A--T-C-TT----T-----GA----C---A--GAA-----C--G-T---A-A-AAC---A---A-acctca
gi|51 : --C---C--T-T-G-----C-----G-TG--T---C-G-------CCGTACAAAG-A----G------G---CG-A--CGTCTCGT--A-A-A--T-GC--G-----A-CCATG--C----T--C-----------AGCCAGTCTCT--T-CA--GG---------------ACGTT-G-A-G----------A--C-----C--G---A-A--A----AA------ACGGC-G----------------------A-GTGAG---C-C-C--CTGA-T--G-T----C---------A--C--A--aca
gi|52 : tttCCA-GGT-T---G-G---A-----A-T-A--G----G--TC----C-C--CTAG------C--AT--CC--C---C--T-T-G-----T-----G-TG--T---C-G-------T------AAG-A----G------G---CG-A--C------T--G-A-A--T-GG--G-----G-C---G--G----T--C-----------C---------T--T-C---GT---------------A---T-G-A-G----------A--C-----C--G---C-A--A----AA------AC--C-G----------------------A-G---G---T-C-C--C--G-T--G-T----C---------A--C--A--G------------C--A-------T--G----------------------TG-T-------GC----------C-----ACG-A---A----A-----Atgaaggcag
gi|53 : -----C-----G-TG--T---C-G-------T------AAG-A----G------G---CG-A--A------T--G-A-A--T-GG--G-----A-C---G--G----C--C-----------A---------T--T-C---GG---------------A---T-G-A-G----------A--C-----C--G---C-A--A----AA------AC--C-G----------------------A-G---G---T-C-C--C--G-T--G-T----C---------A--C--A--G------------C--A-------G--G----------------------TG-T-------GG----------C-----ACG-A--AA----A-----AGA--T--C-T-T-----T--C-C--C--TG--C-T-CA---A-------A--GG-C---C--------------T---T-G--A---G-A--G---C--C-G--
gi|54 : --G-T--G-T----C---------A--C--A--G------------T--A----------G----------------------TG-T--------G----------C-----ACGAA--TAAATTA-----AAA--T----C-C-----T--T-C--C--TG--C-C-CA---A-------A--GG-----------------------------------------------------G-----C----------AC-----T--AGGTC-T------------A-T-------------------T-T--------TGGC--A-----G------C----C--TT---TA-----C--T-----G-T-------C-----A-T-----G--T--G-T-GA--C-----------------------------------T-G-AGT--G----A--AA------CA-A--T-T-CT----
gi|55 : cgatgccactgGGATCCA-GGT-T---A-G---A-----A-T-A--G----G--TC----C-C--A-AG------T--AT--CC--C------T-C-A-----C-----T-TG--C---T-G-------T------AAG-A----G------G---CG-A--C------T--A-A-G--T-GG--G-----G-C---A--G----T--C-----------C---------T--TAT---GG---------------A---T-G-A-G----------A--C-----T--G---C-A--A----AA------AC--C-G----------------------A-G---G---
gi|56 : gGGTCCG-GGT-T---A-G---A-----A-T-A--G----G--TC----T-C--C-AG------C--AT--CC--C---C--T-T-G-----C-----G-TG--T---C-G-------T------AAG-A----G------G---CG-A--C------T--G-A-A--T-GG--G-----G-C---G--G----T--C-----------A---------T--T-C---GA---------------A---T-G-A-G----------A--C-----C--G---C-A--A----AA------AC--C-G----------------------A-G---G---T-C-C--C--G-T--G-T----C---------A--C--A--G------------C--A-------G--G----------------------TG-ctttaataagtctacaag
gi|57 : ---C--C----C--TT---CA-----A--C-----G-G-------T-----A-TACATGT--A--GAT-GA--C-G---TC------TGTACACAATGC----A-T--AT-G-AGT--G----G--AATACTAGT--A--T-T-TT----T-----GA-G--A---G--TGA-----T--G-C---T-A-AGC---A---T-T----AC-AC-AATCA
gi|58 : a-T---A-G---A-----A-T-A--G-------TC----C-TG-C-AAGT----C--AT--CC--C---C------G-----C-----G-TG--T---C-G-------T------AAG------------------G-A--T------T-----------------------C---G--G----T--T-----------------------------------------------A---T-G-A-G----------A--C-----C--G---GCC--A----AA------AC--A-G----------------------A-G---G-----C-C--C--G-T--A-T----atcacgtattgaatg
gi|59 : acccgtggggatatccggaattaagaatagaa-T-------------------C-T--------T-GC--A-----G---G--A----C--TT---TA-----C--C-----T-A-------C-----A-AA----T--T--C-T-GA--C-G---TC------T-----T----A----A-T--AT-G-TCT--G----A--AA------A--A--T-T-CT----C-----CA-A------G--AGA-----T--A-T---G-A-AAC---A---A-gtt
gi|6 : cgcatatctcagtacagtcaggTTCG-AGT-C---A-G---A-----A-T-A--G----G--TC----C-C--C-AG------C--AT--CC--C---C--T-T-G-----C-----A-TG--T---C-G-------T------AAG-A----G------G---CG-A--C------T--G-A-A--T-GG--G-----G-A---G--G----T--C-----------C---------T--T-C---AA---------------A---T-G-A-G----------A--C-----A--G---G-A--A----AA------AC--C-GGGGCCCCGTGTCACAGTAGGCGA-G---A---C-C-C--C--G-T--G-T----C---------A--C--A--G------------T--A-------G--GTGAGACCCCGTGTCACAGCAGGTG-T-------GG----------C-----ACG-A--TA----A-----AGA--T--C-C-C-----T--C-C--C--TG--C-T-CA---A-------A--CA-C---C--------------C---T-G--G---G-T--G---T--C-G--A--G-----C----------A------T--TGGTC-T----A-----A-A-TTTGCGAGCATTGGTCTAAAT-T--------T-GC--A-----G---C--C----A--TT---CA-----C--C-----G-G-------C-----A-A-----T--G--G-T-AA--C-G---TC------T-----C----C----T-C--AT-G-AGT--G----A--AA------T--A--T-T-CT----C-----GA-G--C---G--GGA-----C--G-T---A-A-acacaaactaaac
gi|60 : GGGTCCG-GGT-T---A-A---A-----A-T-A--G----G--T
gi|61 : aaagtaaaatttaaaacaaaaactcaatttttttaaatatcaataattatttagtatcaattctccagctgtggcgacccgtgg---C--T-G--A--A-----C----------A------TT-AGGA--T----A-----A-A-T-------------------T-T--------T-GC--AG----G---C--C----A--TT---CA-----C--C-----G-G-------C-----ATT-----T--G--G-TGGA--C-G---TC------T-----C----CA---A-T--TT-GAAGT--T----G--AA------T--A--T-T-CC----T-----CA-A--T---G--GAG-----C--T-G---A-A-AAC---------T----AA-A
gi|62 : gagac--T-T-TT----T-----GA-G--T---G--GGA-----C--G-T---A-A-AAC---T---A-C----AA-AC-AA
gi|63 : aaggattcactctgctatggccctgagcgccaaaatctaaagatgatgatggctgtacgttgggcg---C--T-T-G-----T-----GGTT--T---C-A-------G------AAG-T----G------A---TG-G--C------T------A--T-TG--G-----G-T---T--G----T--T-----------A---------T---------G---------------A---T-G-A-G----------A--C-----C--T---C-A--A----AA------AT--C-A----------------------A-G---G---T-T-C--C--G-T--G-G----C---------A--C--A--GTAAACATCGGACC--A-------G--G----------------------TG-T-------GA----------C-----ATG-A--acta
gi|64 : GGGTCCG-GGT-T---A-G---A-----A-T-A--
gi|65 : aaaataagaaacacaaaacatgatagaacttcgaagtttcttataaatacttcattttcattccatcgcggtacccgtgg----------------------TA-T-------GG----------C-----ACG-A--TA----G-----AGA--A--C-C-T-----T--T-T--C--TG--C-C------A-------A--GT-C---C--------------C---T-G--A---G-C--G---C--C-T-----------------------------T--ACGTCAT----A-----A-----------------------T-T--------A-GT--G-----G---A--A----C--TT---TG-----T--C-----T-G-------T-----AGC-----T--G--G-T-GA--T-G---TC------T-----C----T----A-T--
gi|66 : aC-T----A-----A-------------------------T--------T-GC--A-----G---C--C----T--TT---CA-----C--C-----G-AACAGCTCC-----A-T-----T--A--G-T-GA--A-GATCTC------T-----C----A----A-T--AT-G-AATTCG----A--AA------A--AGTT-T-CT----CT----AA-G--T---G--GGA-----C--A-T---cgaga
gi|67 : -----A-T-A--G----G--TC----C-T--C-AG------C--AT--CT--C---C--T-T-G-----C-----G-TG--T---G-G-------T------TAG-G----G------G---CG-A--C------T--G-A---------------------------------------------A---------T--T-C---TG---------------A---T-G-A-G----------A--C-----C--G---C-A--T----AC------AC--C-G----------------------A-G---G---T-C-C--C--G-T--G-T----C---------A--C--A--G------------C--A-------G--G----------------------TG-T-------gtctaataaaca
gi|68 : GCCCG-TGT-T---A-G---A-----A-T-A--G----G--TC----C----A-AG------CA-ATG-CG--C---A--T-T-G-----CCAGTGG-TG--TA--C-G-------TTA----AAG-A----G------G---GG-A--C------T----A-A--T-GG--GTAATTG-C---G--G----T--C-----------A------------T-C---GG---------------A---
gi|69 : gt------T-----C----C----A-T--AG-G-AAT--G----A--CA------C--A--T-TTCT----C-----AA-G--C---T--GGA-----C--G-T---T-A-AAC---A---A-T----AT-GC-AACCA
gi|7 : ttttgtagtgtaccttgaattacggttacatata-A--G----G--TG----C-C--C-AG------CC-AT--GC--C---CGGT-CAG-----C-------TG--G---C-G-------G------AAG-AATGAG------G---TA-A--CGC----T--G-A-A--T-AG--G-----GTC---G--T----T--CCGAGCCTGCCTA---------TGAT-C---GG---------------A---T-G-C-GGA--------A--C-----CCGG---G-A--A----AA------AC--C-G----------------------A-C---G-----C-C--C--G-T----T----C---------A--C--A--G------------C--A-------C--G----------------------CG-TCCCATCTGG----------CCACTGACG-AC-TATC--A-----ACAC-T--A-C-C-----TTCC-C--C--CG--C-TGCA---A-------A--GG-C---C--------------C---C-G--ACTCG-T--G------C-G--A--G-----CG---------A------T--AG--C-G----A-----A-A-TAG-----------------T-T--------C-GC--A-----T---CATC----CCATT---C------C--G-----G-G-------A-----A-G-----T--GCTG-G-GA--C-G---TT------T-----C----C----A-G--AG-G-AG---G----A--AA---------G--T-C-CTA---C------------------GGA-----C--G-A---A-A-AACAGAA---A-T----AA-GC-AATCAa
gi|70 : GGGTCAGCGATAT---A-T---A-----A-T-A--G----T--CT----C-G--C-AG------C--AT--TC--C------T-T-G-----CT----G-T---T---T-G-------T------AAG-A-----------G---TG-A--C------T--G-A-AATT-AG--G-----C-T---G--G----T--C---------------------C--T-C---GGA--------------A---T-G-A-
gi|71 : ggccgtCT-T----A-----A-A-T-------------------T-T--------T-AT--A-----G---C--C----C--TT---CA-----C--C-----G-C-------C-----A-A-----T--A--A-T-GA--CAG---TT------T-----A----C----A-T--AT------------------------C--A--T-T-CT----C-----GA-G--A---G--GAA-----A--A-T---G-A-AA
gi|72 : CG-GGT-T---A-GTACA-----ACT-G--G----A--TC----C-TT-C-AGA-----T--AT--CC--CTTAC--T-T-G--------------G--T---T-G-------T------AAG-AG---G------G---CG-A--A------T----A-A--T--A--G-----G-CTAAG--A----T--C---------------------T--T-A---GG---------------A---T-G-A-gtttaattacaaccaac
gi|73 : gaA----A-----AGA--T--C-C-C--------C-C--C--T---C-T-CA---G-------A--GG-G---A--------------A---T-A--A---G-C--T---C--T-A--A--G-----CG---------A------T--AGGTC-TC---A-----A-A-T-------------------T-T--------T-GC--AG----G---C--C----C--TT---CA-----CT-C-----A-G-------C-----A-A-----T--G--G-T-Ga
gi|75 : gaaa--A-------G--G----------------------TG-TT------GG----------C-----ACA-A--TA----A-----AGA--T--C-C-T-----T--C-A--C--CG--C-T------A-------A--GG-
gi|76 : G-GGT-T---A-GG--A-----A-T-A--G----AA-TC----C-TTCC-A-------C--AT--CC--C------T-T-GTAA--C-----G-TGA-T---C-G-------T------AAG-A-----------G---CG-A--C------TCGG-A-A--T--G--G-----G-C---G--G----T--agtcaattgcatacatgtatatggatttgtgtcatttcatctac
gi|78 : ccgtggagatcgaGA--T--C-C-T----------C--C--TG--C-T-CA---A----------GG-C---C--------------A---TAG--A---G-C--G---T--CTG--A--G-----C----------A------T--AGACC-G----A-----A-A-T-------------------G-T--------T-GC--A-----G---C--T----C--TT----A-----C--C-----G-G-------C-----A-------T--G--T-T-AAC-C-G---TC------
gi|8 : GGATCTG-GGT-A---A-G---A-----A-T-A--T----G--TC----C-C--T-AG------T--A---CC--C---C--T-T-C-----C-----T-TG--T---C-G-------A------CCG-A----G------G---CG-A--c
gi|8 : gG--G-----A-C---G--G----T--C-----------C---------T--T-C---GG---------------A---T-G-A-G----------A--C-----C--G---C-A--ATTTTAA------AC--C-G----------------------A-G---G---T-C-gttgtaagaaaaaaaaacccagtggtaatcgtctaaggatataacaggaataagatagcaatggacgcgcagagcttggacggtccttcggatgagaccgcaattttaaaccgaggtcgagcatggaaataaattttgcagcccttcaatggcaatggtgacatatccatatatatgtgtgaaaacttctcaagtgggacgtacaacaatatgcaatcaa
gi|8 : gggatctgggtaagaatatgtccctagtaccccttccttgtcgaccgaggcgagttgtaagaaaaaaaaacccagtggtaatcgtctaaggatataacaggaataagatagcaatggacgcgcagagctt--------------C---C-G--A---G----G---T--C-G--A--G-----C----------A------T--GGAAA-T----A-----A-A-T-------------------T-T--------T-GC--A-----G---C--C----C--TT---CA-----A--T-----G-G-------C-----A-A-----T--G--G-T-GA--C-A---TA------T-----C----CATATA-T--AT-G-TGT--G----A--AA------A--C--T-T-CT----C-----AA-G--T---G--GGA-----C--G-T---A-C-AAC---A---A-T----AT-GC-AATCAgagcatggaaataaattttgcagcccttcaatggcaatggtgacatatccatatatatgtgtgaaaacttctcaagtgggacgtacaacaatatgcaatcaa
gi|80 : gggatctgggtaagaatatgtccctagtaccccttccttgtcgaccgaggcgagttgtaagaaaaaaaaacccagtggtaatcgtctaaggatataacaggaataagatagcaatggacgcgcagagcttggacggtccttcggatgagaccgcaattttaaa-A-T-------------------T-T--------T-GC--A-----G---T--C----C--------------------------------------------------G--G-T-GA--C-G---TC------T-----T----C----A----GT-G-AAA--A----A--AA------A--A--A-T-CT----T-----GA-G--T---G--GGA-----G--G-T---T-A-AAC---A---A-T----a
gi|81 : --A--G-----C----------A------T--AGCCC-TTTATA-----A-A-TGT-----------------T-T--------T-GC--AC----G---C--CTCC-C--TT---CC-----A--C-----G-G-------C-----A-A-----TATG--G-T-GA--C-G---TC------T-----C----T----A-tttcaacaaacc
gi|82 : -T-CT---A-------A--GG-C---C--------------A---T-G--A---G-T--G---C--C-G--A--G-----C----------A------T--AGGCC-T----A-----C-ATT-------------------T-T--------T-GTTAA-----G---C--C----C--Tatc
gi|83 : taaataatcatttaa-----A-T-----T--G--T-T-GA--T-G---TC------T-----T----A----G-A--AT-G-AGT--G----A--AA---------A--TCT-TT----C-----GA-A--T---A--AAA-----C--G-T---A-A-AAC---A---A-C----GA-AT-
gi|84 : --G-T-GC--C-A---TC------T-----T----A----A-T--AT-G-AGT--G----A--AA------A--A--T-T-CC----C-----CA-A--C---G--AAA--------G-T---C-A-AAC---A---A-caa
gi|85 : acctacagttt-----T--G--G-T-GA--T-T---TC------T-----G----A----G-T--AT-G-AGC--G----A--CA------A--A--T-T-GT----C-----GA-G------G--TGA-----T--G-T---A-A-AAC---A---A-T----Aaca
gi|86 : atctacacgG------T--AT--CA--C---C--T---A-----C-----G-TG--T---C-G-------C------AAG-A----G------G---CG-A--T------T--T-A-A--T-GA--G-----
gi|87 : gttacacacccgttgggatccgg-G-AGT--G----A--AAGA----T--A--T-C-AT----C-----GA-G--TT--GC-GGA-----C--G-TTTTA-A-AAC---A---A-T----AA-AT-AATCA
gi|89 : A--C-G---TC------T-----C----C----A-T--AT-G-AGC--G----A--TA------T--A--T-T-CT----C-----GA-G--T---G--GGA-----C--G-T---A-A-AAC---A---A-T----AA-AT-AATCAtcatcgttc
gi|9 : tgtGGGTCCG-GGT-T---A-G---A-----A-T-A--G----G--TC----T-T--C-AG------C--AT--CC--C---C--T-T-G-----C-----G-TG--T---C-G-------T------AAG-A----G------G---CG-AC-C------T--G-A-A--T--G--G-----G-C---G--G----T--C-----------A---------T--T-C---GG---------------A---T-G-A-G----------A--C-----C--G---A-AACA----GA------AC--C-G----------------------A-G---G---C-CGC--C--G-T--G-T----C---------A--C--A--G------------T--A-------G--G----------------------TG-T-------GG----------C-----ACG-A---A----A-----AGA--T----C-C-----T--C-C--C--TG--C-T-AA---A-------A--GG-C---C--------------C---T-G--A---G-T--G---C--C-G--AG-G-----C----------A------T--AGGCC-T----A-----A-A-T-------------------T-T--------TCGC--A-----G------C----C--TT---CA-----C--C-----G-G-------C-----A-A-----T--G--G-T-GT--C-G---TC------------C----C----A-T--AT-G-AGT--G----A--AA------T--A--T-T-CT----C-----G--G--T---G--GGA-----CGTG-T---A-A-AAC---A---A-T----AA-TT-AATC
gi|90 : cgtgg-----T--G--G-T-GA--T-G---TT------T-----T----C----A-T--GT-G-AGT--G----ATTAA------T--A------CT----G-----AA-A--T---G--GGA-----A--G-T---A-A-AAC---A---G-T----
gi|92 : GGGTCCG-GGT-T---A-G---AAC---A-T-A--G--------------------AG------C--AT--AC--C---G--T-T-G-----C-----G-TG--C---C-gca
gi|93 : gttttgaattcgtgTCCA-GAT-T---A-G---A-----A-T-A--G----G--TC----C-T--C-AG------C--A---AC--T---C--T-T-G-----T-----G-TA--T---C-A-------T------AAG-A----A------G---CT-A--C------T--a
gi|94 : TCCA-GAT-T---A-G---A-----ATT-A--G----G--TC----C----A-AG------C--AA--CT--C---C--T-T-G-----T-----G-TA--T---C-A-------T------AAG-A----A------G---CT-A--C------
gi|95 : ----A-T--AT-G-AGT--G----A--AA------T--A--T-T-CT----C-----AA-G--A---G--GGA-----C--A-A---A-A-AAC---A---T-T----GATAT-AA
gi|96 : t--AT-G-AGT--G----A--AA------T--A--T-A-CT----A-----GA-G--C---T--GGA-----C--GAT---A-A-Aaacc
gi|97 : taacgacccttc----C----A-T--GT-G-AGT--G----A--AA---------A--T-T-AT----C-----AA-G--CG--G--GGA-----C--G-A---A-A-CAC---A---A-c
gi|98 : --AA------T--A--T---CT----C-----GA-CC-T---G--GGA-----C--G-T---A-A-AAC---A---A-T----AA-AT-attcaat
gi|99 : g------T--A--T-T-CT----C-----GA-G--A---G--GGA-----C--T-T---A-A-AAC---A---A-T----Acatatg
10 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|49 ): ATTCCTTGTTGCTACGGCTCTGAGTGTCATACAGAAGTCTGAATCTGAATTTATATTTACAGTTGATTGCTTCTTTATATGAGTTATCGATAAATTATTCAAGGGACGTTAAATCAATGAAGCAAAATC
Unaligned ( gi|74 ): AGCATGCCATTATCAGTCATAAAAGGAGACCTTTGGAATGGTCGTCCTTCTTATGTGGCTGCAAAGACAGGAGTCTTGTGTC
Unaligned ( gi|77 ): GTGTCCAGGGTCCGTGGTTGCCCAGCTCTTGTTTTTGTATTCTATTTAAGACTTGCGAGATTGGTCCTGTGTCGTTATA
Unaligned ( gi|79 ): CAGGAGTTGGCACGTTAAATAACCCCCGCTATAGAATGAGTTCTCATTTATGGTGCTTCACCCACAACCGGTG
Unaligned ( gi|88 ): CAAAGGTAATTTCTATATAAGTGAAGTAGTTTGGAATCGGATGTAAAATCAACCAACA
Unaligned ( gi|91 ): AACTTGAAAATACGGATATATATTTCATTGCAGTGGTAGAATAAGAAATTTATT
Unaligned ( gi|105 ): TCTTCAACAACGACCCGTGGGGATCCGGGTTAGAATA
Unaligned ( gi|113 ): CATATCTACGACCCGTGGGGGTCCGGGTTAGAAT
Unaligned ( gi|115 ): ATTGCATGAAACCCGTGGGGGTCCGGGTTAGAA
Unaligned ( gi|117 ): GACCCGTGGGGGTCCAGGTTAAAATAGG