lowQualScore : 11111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 1111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111
lowQualScore : 1 444444444444444 11 1 11 1111 22222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 111111111 5555555555555555555555555555555555555555555555 1111111111111 11 111111111111111111 11 777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777 1111 11111111 3333333333333333333333333333333333333333 77777777777777777777777777777777777777777 22222222222222 888888888888888888888888888888888888888888888888888 3333333333 11111 333333333333333333333 111 33333333333333333333333333 1 4444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444 22222222222222222 555555555555555 111 1 1 22222222 1 3 1 666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666 222 66666666666666666666666 111111 55555555555555555555555555555555555555555555555555 3333333333 11 22222222222222 2222222222
lowQualScore : 2 2 1 6 555555555555555 8 6 88 1 2 4444 555555 333 88 3 3333 333 1 22 4444 22 1 6 1 1 77777 2 66666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666 1 1 222222222 33 1 1 22 222 3333333333333333333333333333333333333333333333 555555555 1 55555 2222 5555555555555 6666666666 2 3333333 3333 1 77 22 0 555555555555555555 1 2 11 0 11 3 77 2222 444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444 222 1 0000 1 1 1 33 222222 2222 111 888888 0 33333333 11111111 1 1 22222 2 1 1 1 1 33 1 333 11 3333 22 44444 5555 7777777777777777777777777777777777777777 88888888 0 00000000000000000000000000000000000000000 44 3 1 33 222 8 1 1 3 1 22 44444444444444 44 444444444444444444444444444444444444444444444444444 22 1 5555555555 222 1 1 3333 1 222 88888 1 2 0 111111111111111111111 55 444 22 222 1 22 66666 222 44444 99999999999999999999999999 555 6666666 222 2 3333 2 66666 0 1 1 444 1 4444444 444444 1 1 4 1 666666666666 3 7777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777 555555 0 11111111111111111 333 44 2 000000000000000 2 999999 333 5 2 5 5 7 5 00000000 0 0 3 777 2 8888 1 999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999 44 3 6 6 111 3 66666666666666666666666 555 555 222222 3 999 1 8888 666 3 88888 3 3 66666666666666666666666666666666666666666666666666 0 2 1111111111 44 7777 3 11 3 3 22222222222222 0000000000 3 0 2 3 44 44 3 3 66 3
lowQualScore : . . . . ............... . . .. . . .... ...... ... .. . .... ... . .. .... .. . . . . ..... . ....................................................................................................................... . . ......... .. . . .. ... .............................................. ......... . ..... .... ............. .......... . ....... .... . .. .. . .................. . . .. . .. . .. .... ........................................................................ ... . .... . . . .. ...... .... ... ...... . ........ ........ . . ..... . . . . . .. . ... .. .... .. ..... .... ........................................ ........ . ......................................... .. . . .. ... . . . . . .. .............. .. ................................................... .. . .......... ... . . .... . ... ..... . . . ..................... .. ... .. ... . .. ..... ... ..... .......................... ... ....... ... . .... . ..... . . . ... . ....... ...... . . . . ............ . .......................................................................................................... ...... . ................. ... .. . ............... . ...... ... . . . . . . ........ . . . ... . .... . ........................................................................................................................................................................ .. . . . ... . ....................... ... ... ...... . ... . .... ... . ..... . . .................................................. . . .......... .. .... . .. . . .............. .......... . . . . .. .. . . .. .
lowQualScore : 0 5 5 7 777777777777777 0 6 00 4 1 5555 888888 555 11 4 8888 000 7 88 1111 66 9 5 3 9 99999 0 99999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999 4 4 666666666 88 4 4 00 555 7777777777777777777777777777777777777777777777 333333333 2 99999 7777 0000000000000 8888888888 2 6666666 9999 1 33 66 1 888888888888888888 1 3 55 6 66 4 22 3333 777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777 888 0 8888 1 0 0 55 777777 9999 777 111111 9 55555555 00000000 0 0 33333 0 0 0 0 0 33 0 222 44 8888 22 11111 0000 0000000000000000000000000000000000000000 66666666 2 88888888888888888888888888888888888888888 88 2 6 88 888 7 6 6 7 7 33 55555555555555 88 666666666666666666666666666666666666666666666666666 22 2 4444444444 777 5 5 3333 5 888 44444 5 4 6 777777777777777777777 44 444 22 999 6 22 77777 999 22222 33333333333333333333333333 000 1111111 777 4 1111 5 00000 6 5 5 111 5 8888888 333333 5 7 6 0 444444444444 2 3333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333 777777 4 55555555555555555 555 88 1 777777777777777 1 666666 222 0 1 0 6 1 7 55555555 7 2 3 888 2 5555 2 555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555 66 3 7 7 000 3 33333333333333333333333 888 888 999999 3 111 6 5555 888 3 33333 3 3 77777777777777777777777777777777777777777777777777 4 5 8888888888 66 1111 3 22 3 3 22222222222222 1111111111 1 2 0 3 66 66 3 3 33 6
consensus : GGAAAGGCATTTNATTT-GAAAANC-G-GA----T-ACAGAG-ANACACATGAGGACAC-AT----ACTG------GTG---A-NAAACC-T--T---A-T--AA----TGT--G-ATGTCT-GTGGGAAG----GCA-TT---C---CGT-C-G----CANG-NANAT-C-TTAAAG----A-GA-CAC-T------G-A-A--G---A-CA-CAT-A-CT----GGT---GATAAA-CCT-AT---A-AAT----ATAAATG-TG-AT--------GTC-TGTG-G-G--AAG---GCATT----C---AG---TN---AGA---N--A-GGA--T-A-C-----N-T-----AA--A-G-----ACA----CA--C---AT--GAGGA---------TAC-A-------T----A-CTGGTGAATAAA--CCTTA---TA-A---A-----ATGT-G-ATGTCT--GTG-GGAAG-G----CATTC----AG----TC-A--GAC--A-NG--NA----A-----C-----NT-----A--A--A--G----ACA-ACA---T-GA-N--GACA-C-AT--ACT------G----GT---GAN-----AAA-C--------C----T---T-AT-AA-----AT-G-T-G-A-TGTC-TGTG-GG---AA--GG----CATT-CAG----T----C-----G---G---G--C-A-N--AC-G-----A---C---TTANA-G----AGACACA--N-A-G---G----AGA--CA-TA-CA-TA-NTGG---TGA-TAAA-CC-TTAT--A---AAT-GTG-ATGTC-T--G-TGGGA---AGGCAT--TCAG-C--G-ANACG-GGAT-CA------T-----TACNN----A---GN-----CACAT--GAGGA---AN-----A---T-A-C----TG-GT---GAT-A-A-AACCTTA-------A--TA-----A--AT-GTG---ATG--TCTGTG-GG--AAGG---CAT---T-CAG-T---G--A-GAC-G-G--G-A--C---T--TA---C---AG---ACA----CACAT--G-AGG-ACA-C---ATA-C-------T------GGTG-ATAAA-CCTT-----A------T-AA-----------------------T-------C-----A-A-------T---------A---AG-A------CA--------G--AGA----A-A-------T----T--AC--AGAGACACA---TG-A-GAN---T--AC---A--TACTGGTGATAA-ACC-TT--TT-AA---T-TNATATATGT------GA-T-T-GTNT-TGGNAA-G-CGTTCA--TGT---AAAGGACACGTCGCATGTTTCTAAAC---TTNTT----TTATTTTT---------TA--GCAAAA------CTTT----GTATGCCT-----AAAAT--GA--CT----A--A-ATG------TGT----------AT--GT---------T-----------T--T------TG---------CT------TAG---T--TTT---A----AAGTTTG--AAA-G-C-AATGAAATTC-AAATCT---TTT--TGCG-ATATGCATAT---T---TT------T-CTC--GGTATTTTNC--GCGC--CATGAT-GTGT-----GACG-T-CATATAC---GTGACCT---TT--GCGA-------T---A-A--A--A---C---TGTTAGCCATATTATAA-AT--A--AATT--CGAT----TTAATGG-AC--A-A-AA----A-----G--NCAATTATCACGTT-------AA-CAGCTTG-C--AG--ATAACATT-ACGTT-CGG-GTGC
Reference ( gi|1 ) : GAAAGGGCATTTTATTT-GAAAAGC-G-GA----T-GCAGAG-AAACACTTGAGGACGC-AT----ACTG------GTG---A-GAGACC-T--T---A-T--AA----TGT--G-ACGTCT-GTGGGAAG----ACA-TT---C---CAT-T-G----CATG-TATAT-C-TTAAAG----A-AC-CAC-T------G-A-A--G---A-TA-CAT-A-CT----GGT---GATAAA-CCTCAT---A-AATTCTCATAAATG-TG-AC--------GTC-TGTG-G-G--AAG---GCATT----C---AG---TG---AGA---A--A-AGA--T-A-C-----G-T-----AA--A-G-----ACA----CA--T---AT--GAAGA---------TAC-A-------T----A-CTGGTGAATAAA--CCTTA---TA-A---A-----ATGT-G-ACATCT--GTG-GGAAA-G----CATTC----AA----TC-A--GAC--A-TG--TA----A-----C-----GT-----A--A--A--G----ACA-ACA---T-GA-T--GACA-C-AT--ACT------G----GT---GAT-----AAA-C--------C----T---T-AT-AA-----AT-G-T-G-A-TGTC-TGTG-GG---AA--GG----CATT-CAG----T----C-----G---G---G--C-A-T--AC-A-----A---T---TTAGA-G----AGACACA--A-A-G---G----AGAT-CA-TG-TA-TA-GTAG---T-A-TAAA-CC-TTAT--A---ATT-GTG-ATGCC-T--G-CAAAA---ATACTT--TCAG-C--A-ATATG-GGAT-CA------T-----TATTT----C---GC-----CACAT--GAAGA---AA-----A---T-A-C----TG-GT---GGT-A-A-AACCTTA-------A--TA-----T--AT-ATG---ATG--TCCATG-GG--AAAA---CAT---T-TAG-T---G--A-GAC-G-G-CG-A--C---T--CA---C---AG---ACA----CATAT--A-ACG-ATA-C---ATA-C-------T------GGTG-ATAAA-CCTT-----A------T-AA-----------------------T-------C-----A-A-------T---------A---AG-A------CA--------G--AGA----A-A-------T----T--AC--AGAGACACA---TG-G-GAT---T--AC---A--TACTGGTGATAA-ACC-TT--TT-GA---T-TTATATATGT------GA-T-T-GTAT-TGGTAA-G-CGTTCA--TGT---AAAGGACACGTCGAAT-TTTTTAAAC---TTGTT----TTATTTTT---------TA--G-------------TT----GTATGCCT-----AGATT--GA--CT----A--A-ATG------TGC----------AT--GT---------T-----------T--T------TG---------TT------T-----T--TTTA--A----AAGTTTG--AAA-G-C-A-TAAAATTC-AATTTT---TTT--TGTG-AT-TAAATAT---T---TT------T-CTT--GGTATTTTCT--GCGT--CATGAT-GTGT-----GACG-T-CATATAT---GTGACCT---TT--GCGA-------T---A-A--A--A---C---TGTTAGCCATATTATAG-A---A--AATT--CGAT----TTAATGG-AC--A-A-AA----A-----G--TCAATTATCACGAT-------AA-CAGCTCG-C--AG--ATGACATT-ACGTT-TGG-GTGC
gi|18 : GAAAGG--ATTGTATTT-GAAAACC-G--A----C-GCAGAG-AAACACATGAGGAC-C-AT----ACTT------GTG---A-GAGACC--------A-T--AA----
gi|11 : agcacaaacggaaaatataacggactttgttgaaactgttgaagcagtctgtgaaacaagtaaaaactcaagatctgaaaaatgatttacaggagtgtataaacaaaaatggaggtgaaaaacaaaatatcaatgtgatgtttttaaggtattatctcggcttacttaaacaaacacaagcggatacatacgggtgagaaaaccatataaatgtgcatgtttgtgggaaggcattcagtcagtcaggaatttgaaggcacatgtgacacatactggtgaataacctttaaatgtgatgtctgtgGGAAAGGCATTT-ATTG-GAAAACC-G--A----C-GCAGAGAAAACACATGAGaa
gi|38 : ttattagttttataatcaatttttattacttatgtgtgcagatagcccattagaaacagattaaattcatcagaacaggtcaaggttataatttgtcatcagagatatgttcaccaacactgacaacacgaatttagattgaatgaaacatcccattgcgaatagccctcctcagatgactattcttttcatcaaccaaccaatagctgcctgtgaaacaagtatgtatatctacccaaccaatggctgtctctgaaacaagtatcttctacacaaatcaaagactagcacaaacggaaaatataacggactttgtgaaactgttgaagcagtctgtgaaacaagtaaaaactcaagatctgaaaaatgatttacaggagtgtataaacaaaaatggaggtgaaaaacaaaaatatcaatgtgatgttgttttaaggtattatctcgggcttacttaaacaaacacaagcggaacatacgggtgagaaaccataaaaatgtgatgttgtgtggaaggcattcagtcagtcaggatatttgaagtgcacatgatgacactatacggtgataaacttttaaattgtgatgtctgtGGAAAGGCATTTGTCTT-GAAAGTA-G-AA----T--TAAAA-GCACATTTTGTGACTC-AC----ACTG------GTG---A-AAAACCAT--T---T-C--AA----TGT--G-GTGTCT-GTGGGAAG----GTA-T
gi|19 : gagaatatctgcgtatacatattagaagacatgctggtgataaaccttttaaatgtgatatatgtAAAAAGCATTCAATTG-GAGA--C-A-GAACATT-TTAAAA-AGACACAAGATGATACCAT----ACTG------GTGTTTA-AAC-CC-T--T---A-T--AAA---TGT--G-ATGTGT-GTGGGAAG----GCA-TT---C---CGT-GAG----AAAG-GACAT-T-TTAAAA----AGAC-AA---------G-ATT--G---A-TA-C-T-A-CT----GGT---G-TAAA-CCTTA-------------ATAAAT--TG-AT--------GTG-TGTG-G-GGAAAA---GCATT----C---atggtctaaaagttgtgttaaaga
gi|32 : aatgtgttgttgtgtgggtaggcttcagcgagacaggaagattttacagcacacaagtttgacaacatcttggtgataaacctataaatgtgatgtctgcgggaggttcagtcgtatgggaacattaaggggacataagagtatcatctgatgataaaaccatataatgtaaatgtttgtgggaTTTGAGTT-GTAAAGCTGCGT----T-ACTGAT-ACACAC--GAGGATCC-AT----ACTG------GTG---A-GAGACC-T--C---A-TG-AA----TGT--G-GTGTTT-GTGGGAAG----ACA-TT---C---AAT-C-AGA--CAGG--AGA--C-TTACAG----A-GA-CACAG------G-A-G--G---A-TA-CAT-A-CT----GGT---GAAAAA-CCTTAT---A-AAT----------G-TG-AT--------GTC-TGTG-G-A--AAG---GCATT----C---AG---TGCGAAGG---A--A-ACAT-T-A-C-------------AA--A-A-----ACA----C-------GT--GAGGA---------TAC-A-------T----A-CTGG
gi|20 : aaagcttataaatgtgatttttgtgggaaaacTTATTTCGAAGGGC-A-AC----TTACAGAG-ACACAGT----AACAC-AC----ACTG------GTG---A-CAAATC-T--T---A-CC-AA----TGT--G-ATGTTT-GTTGGAAG----ACA-TT---CAGTTAT-T------CAGG----AT-CATTGCAA----A-AG-CAC-A------GAA-A--G---A-CA-CAT-A--------------ATAAT-CCTAAT---G-AATT-----------TG-AA--------ATT-TGTC-G-G--AA-----CAT-----------------------------------T-A-C-----------------A-G-----ACA----CA--C---AT--GAGAA---------TAC-A-------C----A-CTGGT-AATAAA--CCAGA---T--A---T-----ATGA-G-ATATTA--ATG-TTAAC-G----CATTA----AG----CC-A--GAC--A-----TA----A-----C------------A--G--A--G----ACA-
gi|15 : ----T-ACAGAG-ACACAA--AAGGATAC-ATGTATAGTA------GTA---A-TAAATC-T--T---C-T--AA----TTC--GTATGCCT-TCGAGAAT----GCA-TT---CAGCCAGAT-GGGATCAT--TATTT-C------G----A----CA--T------A-A-A--G---A-TA-CAT-A-CT---------------------------------TTATATATG-TG-AT--------GTC-CGTG-G-G--AAA---ACATT----T---AG---TG---AGA---C--G-GGA--C-A-C-----T-T-----AC--A-G-----ACA----CA--T---AC--AAGGA---------TAC-A-------T----A-CTGGTG-ATAAA--CCTGA---TA-ATTCA-----ATAA-G-ACA-------G-GGAAA---------TT----A------C-A--G-----------------------------------------A--G----AC--ACA---T-GA-G--GATA-C-AT--ATT------G----GT---GAG-----AAA-CGTTGTTGAT----T---T-AT-AT-----AT-G-T-G-A-TTTG-TATG-GG---TA--AG----CGTT-ttcagtgagacgggatcattagaaaaacatatgaagacgcaaatggcattcgactcgaaagtccacttacaaatacacacgataacactcactggtgataatatttaaaaggtgatatatgtg
gi|29 : cagacaattGAGCAGACACATGAGGATAC-AT----ACTG------GTG---A-GAAACC-G--T---A-TA-AA----TGT--G-ATGTTT-GTGGGAAG----ACA-TT---C---aatttaaaagacatgtagcatgtttttaaacatttttttttatttttagttgtatgcctagaatgactacaaatgtaaatgtattttgaataaatcattatgctttggtgttaagttttaaagcaatcaatttcaaattttacgattaaatatattt
gi|2 : aaactcaagatctgaaaaatgatttacaggaatgtataaacaaaaatggaggtgaaaaacaaaaatatgaatgcgatgtttgttttaaggtattaactcgggcttacttAG-AGACACAGGAGGATAC-AT----A-TG------GTG---AAGAAATC-T--TCCAA-T--AA----TGTTGG-ATGTCTTGCGAAAAG----G-A-TT---C----AG-T-G----CGT------------AAGG----G-AT-CAT-TACAATCG-A-A--G---A-CA-CAA-A-CTTCAAGGT---GATAAA-CAT-AG---A-AATAACTGTAAGGG-TG-AAATTTATGAGTC-TGTC-GTG--AAG---CGATT----TCTTAG---TG---CGA---A--G-GGA--T---C-----A-T-----AC--A-A-----A-A----CA--T---AT--GAGGA---------TA--A-------T----A-CTGGT-AATAAC--CCTTA---TA-T---A-----ATGTTGTATGTCT---TGTGGAAG-A----CATTC----AC----TG-ACTGAG--A-GG---A----A-----C-----TT-----ATTA--A--C----ACA--CA---T-GA-G--GA-A---AT--ACT------G----GT---GAA-----AAA-C--------C----T---T-TT-AA-----AT-G-T-G-ATTGTC-TGTG-AG---AA---G----C-TT-CAG----T----CATCGAG---G---GACC-T-T--AC-A-----G---------AG--G----AGACACATGA-A-G---G----AAAT-C------A-TA-CTGG---TGA-GAGACCC-TTAT--A---ATT-G-A-ATGTC-TGGG-TAAAAG--ATGTTTTATTGA-C--A-ATA-G-AAAC-C-------------TATAG----A---GCA----CACAT--T-AGA---CA-----A---C-A-CATAATGCGT---TGA-A-A-GACCATT-------A--TG-----T--A--ATG---TTGATTTTGTG-GG---AGA---CATCAAT-TA--T---T--A-TAC-A-ACCG--------T--AA---A---AA---ACT----CACATTGA-AGG-ATA-CCAAAT--C-------T------AGTG-AC-AG-CCTT-----A------T-agtcagacaggatatttgaaggtacacatgattnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaaacaaaaatggaggtgaaaaacaaaaatatgaatgcgatgtttgttttaaggtattaactcggg
gi|55 : agccttagttcaagatatgtctttacgccactgtatttgattaagaaaacgtgatacagacttcatacaatgtatatttttgtgggaataacatatagttgtgtaaaggtgcgttatgtgatacacacgtgcgattatactgtggagacttctgacatgtgatagttatgtgaaatcacttgattaagttcagacaggagatttaAG-AGACACATAAGGACAC-AT----ACTATATGCAGTG---A-TTGATC-T--T---A-TAAAA----TTT--G-ATGTCT-cagtgtgatgcttgttcgaaacattcagtcagtagagaagacttactgtgtcacaaagataagacatcaacagtgaatgtagtgtctgtggaaagtgtacaccgatgggtcgcagacttagaagcaccatgggacacatac
gi|7 : cttacACACATGACAACAC-AC----ACTG------GTG---A-AAACCC-T--T---A-C--AAA---TGT--G-GTGTCT-GTGAAAAA----GCA-TT---C---CCT-C-A----CATA-AGTCC-T-TTACAG----A-GA-CACAT------A-A-T--G---A-TA-CAT-A-CT----GGT---GATAAA-C--------------CTTACAAATG-TG-AT--------ATC-TGTG-G-A--AAG---GCGTT----C---AC---TT---ATA---ATGG-AGACTT-G-C-----G-T---------A-G-----ACA----C-------AC--CAGGA---------CAN-N-------N----N-NNNNNNNNNNNN--NNNNN---NN-N---N-----NNNN-N-NNNNNN--NNN-NNNNN-N----NNNNN----NN----NN-N--NNN--N-NN--NN----N-----N-----NN-----N--N--N--N----NNN-NNN---N-NN-N--NNNN-N-NN--NNN------N----NN---NNN-----NNN-N--------N----N---N-NN-NN-----NN-N-N-N-N-NGTG-TGTG-GG---AG--GG----CATT-CAG----T----G-----A---G---A--C-A-aggtatgaaaagtgttc
gi|56 : cattccctaacacaggaagcttacaggcCACATGAGGACAC-AT----ACAG------GAG---A-ACGCCC-G--T---A-CA-AA----TGT--A-ACACGT-GCGGGAA-----ACAGTT---C---ggagccatgcggaagcacatgaagatacatgctnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngtgatgtctgtggaaaggcattcagccgtacgggaacattaaagagacacatgacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaaccatatcagtgtgatgtctgtgggaaggctttcaggcattcagtaacattatataagcata
gi|36 : TAAGGACAC-AT----ATTG------ATG---A-TAAACC-T--T---G-T--TA----T-T-------TCT-GTGGGAAG----GCA-----------------------------AT-C-----AG----A----CGC-T------A-G-ACTT---A-CA-CAT-A-AC----AGT---GATAGA-CC-------------CT-ACAAGTG-TA-----------GTT-TGTA-G-A--AAG---CCATT----A---GG---TC---GGA---C--A-GCA--C-A-CCAATTA-C-----AA--A-G-----TCA----CA--C---A----AGGA---------CAC-A-------TAA--A-CTGG---ATAAA--gctcagtacgggacactgta
gi|61 : caTGAGGACAC-AT----ACTG------GTG---A-GAAACC-A--T---A-T--AA----tggagatatgtgagagaggaa
gi|38 : aGAAGAC---AT----GCTG------GTG---A-TAAACC-T--T---T-T--AAA---TGT--G-ATATAT-GTGGAAAG----GCA-TTTG-T---C-T-T-G----AAAG-TAGAA-T-TAAAAG----C-AC-ATT-T------T-G-T--G---A-CT-CAC-A-CT----GGT---GAAAAA-C--CAT-------TTC-----AATG-TG-GT--------GTC-TGTG-G-G--AAG---GTATA----T---GG---T----CTA---A--A-AGT--T-G-T-----GTT-----AA--A-G-----Aa
gi|13 : gagaatatctgcgtatacatattaGATAC-AT----AGTG------GAG---A-AAAACT-T--T---ACT--TA----TGT--G-ATATTT-GTGGGAAG----ACA-TT---G---TCT-C-G----CAAAACAAATGC-GAAAAG----A----CACAT------G-A-G--G---A-AA-CAT-A-CT----GGT---GATAAA-CCTTAT---A-AAT----------G-TG-TT--------GTC-TCTG-G-A--AAG---GCATT----C---AG---TG---AGA---A--A-GGA--A-T-C-----T-T-----AC--A-G-----AAA----CA--C---AA--GAGGA---------TAC-A-------T----A-CTGATG--------C-------TA-A-----------GT-C-AC----------GGAAG-G----CAACC----AA----CC-A--GA---A-TGA-TA----G-----A-----GT-----A--C--AGTG----AC--ACA---T-GA-T--TATA-T-AT--AT-------------T---GAT-----A-----------------------AT-GA-----AT-G-T-G-A-TGTT-TTCG-GA---AA--GG----TATT-CAA----T----C-----A---G---A--C-A----AC-AC----A---C---TTATA-G----AATCACATTA-A-G---G---------CA-CG-TT-TG-GTA
gi|27 : aaggcatttaactcttcattgacattaacatacacatCAC-AT----ACTG------GTA---A-TAAACC-T--T---A-T--AAA---TGT--A-ATGTCT-GTGGGACG----GCA-TTTATC---CA----G----AATG-GAAA--C-TTAAA-----A-GCACACAT------G-A-G--G---A-CA-CAT-A-CT----GGT---GATAAG-CCTTAT---A-AAT----------G-TG-AT--------GTC-TGTG-G-G--AAG---GCATT----C---AG---TC---AAA---C--A-GGA--A-T-C-----T-T-----AC--A-C-----AGA----CA--T---AT--GAGGA---------TAC-A-------T----A-CTGGTGAG-AAA--CCTTA---T--A---A-----ATGT-G-AGGTCT--GTG-GAAAG-G----TGTTT----AG----CT-G--GGC--A-GG--AG----A-----C-----TT-----A--C--A--T----GCACACA---T-GA-G--AACA-C-AT--ACT------G----GT---AAC-----AAA-C--------C----A---T-AT-AA-----AT-G-T-G-A-TATA-TGTG-GG---Acacctgaaatacctgtgggacaggaaacttacagaaacacatgaggacatagaatggtgaccaaaacgtgtgttcctgcatagccaaactgacctagtattgtttctgcataactccttatcctatatattttgacaagctcagaaaa
gi|19 : C-AT----CTTG------GTG---A-TAAACC-T------A-T--AAA---TGT--G-ATGTCT-GCGGGAGG--------TT---C---AGT-C-G----TATG-GGAAC-A-TTAAGG----G-GA-CAT----------A-A--G---AGTATCAT---CT----GAT---GATAAA-AC-CAT---ATAAT----GTAAATG-T--------------T-TGTG-G-G--AAAAAAGCATT----C---AA---TT---GGA---G--ACAGA----A-C-----A-TTTTAAAA--A-G-----ACA----CA------A---GATGA---------TACCA-------T----A-CTGGTGTTTAAAC-CCTTA---T--A---A-----ATGT-G-ATGTGT--GTG-GGAAG-G----CATTC----CG----TG-A--GAA--A-GG--------A-----C-----ATTTTAAA--A--A--G----ACA-AGA---T----T--GATA-C--T--ACT------G----GT---G-T-----AAA-C--------C----T---TAAT-AA-----AT---T-G-A-TGTG-TGTG-GGGA-AA--AG----CATT-C
gi|33 : aatgtgttgttgtgtgggtaggcttcagcgagacaggaagattttacagcacacaagtttgacaa-AT----ACTG------GTG---A-TAAACC-T--T-------------------G-ATATCT-TTTGCAAGGTGTACA-TC---C---GGT-C-A----GATC-GATGA-C-TTCTAGTTCTA-AA-CACGT------G-A-A--G---A-TA-C-T-G-TTC---AGT---GAT-----CTTAC---A-AGTCCT-ATAAATG-TG-GT--------GCC-TGT
gi|39 : gaacagacaaatgcacatgaagacacaaaactggtgataaaaccaaatgaatgtgggaaagctttgatggaaacaagctag-AC----ACTG------GTG---A-CAAACCAT--T---C-A--AA----TGC--G-AGATCT-GTGGACGG----GCC-TT---C---Ctaacaag
gi|18 : G------GTG---A-AAAACA-AAAT---A-TC-AA----TGT--G-ATGTTT-TT---AAG----GTA-TT--------AT-C-T----CG-G-CTTA--C-TTAAAC----A-AA-CAC----------A-A--GCGGA-TA-CAT-A-CG----GGT---GAGAAA-AC-CAT---A---------TAAATG-TGCAT--------GTT-TGTG-G-G--AAG---GCATT----C---AG---TC---AGT---C--A-GGA----A-T-----T-T-----GA--A-G-----GCA----CA--T---GT-----GA---------CAC-A-------T----A-CTGGTGAATAAC--CTTT-------A---A-----ATGT-G-ATGTCT--GT--GGAAA-G----GATTG----TA----TT-T--GAA--A-AC--CG----A-----C-----GC-----A--G--A--G----AAACACA---T-GA-G--GAC--C-AT--ACT------T----GT---GAG-----AGA-C--------C----------AT-AA-----Agacaaccaggcaatttgacgcgtcatcgactgacccacaccacagtcaaaccttacgtctgcccaacctgcaacaaagcattcaaccgggcctccaacttacacacgcacatgcgcactcacac
gi|34 : agcacaaacggaaaatataacggactttgttgaaactgttgaagcagtctgtgaaacaagtaaaaactcaagatctgaaaaatgatttacaggagtgtataaacaaaaatggaAAACC-T--T---A-T--AAATAGTGT--G---GTTT-GTGGGAAGA---ACA-Ta
gi|32 : agtgtaaacagaaaaagtaatgaatgtagtgaacttaggaaacctgtttgtgaaataattcaactaaagatcagaaaaatgatttacagagaacgggtgaaagatattggagtaaaaacatgttttcactgtgatgatagatatgcacaaaaggcgcaaagaacttcaagaC-T--T---A-T--AAA---TGT--G-ATTTTT-GTGGGAAA----ACT-TT---G---AGT-T-G----TAAA-GCTGC-G-TTACTG----ATACACAC--------G-A-G--G---A-TC-CAT-A-CT----GGT---GAGAGA-CCTCAT---G-AAT----------G-TG-GT--------GTT-TGTG-G-G--AAG---ACATT----C---AA---TC---AGA---C--A-GGA--G-A-C-----T-T-----AC--A-G-----AGA----CA--C---AG--GAGGA---------TAC-A-------T----A-CTGGTGAA-AAA--CCTTA---T--A---A-----ATGT-G-ATGTCT--GTG-GAAAG-G----CATTC----AG----TG-C--GA---A-GG--AA----A-----C-----ATTAC--A--A--A--A----AC--ACG---T-GA-G--GATA-C-AT--ACT------G----Gcaat
gi|11 : aaag--T---A-TC-AA----TGT--G-ATGT-T-GTTTTAAG----GTA-TT--------AT-C-T----CGGG-CTTA--C-TTAAAC----A-AA-CAC----------A-A--GCGGA--A-CAT-A-CG----GGT---GAGAAA-CC--AT---A-AA--------AATG-TG-AT--------GT--TGTGTG-G--AAG---GCATT----C---AG---TC---AGT---C--A-GGA--T-A-T-----T-T-----GA--A-G------TG----CA--C---AT--GATGA---------CACTA-------T----A-C-GGTGA-TAAA--CTTT----TA-A---A-----TTGT-G-ATGTCT--GTG-GAAAG-G----CATTT-----A----TT-G--GAA--A-AC--CG----A-----C-----GC-----A--G--A--G----AAA-ACA---C--A-T--GA
gi|20 : ttattagttttataatcaatttttattacttatgtgtgcagatagcccattagaaacagattaaattcatcagaacaggtcaaggttataatttgtcatcagagatatgttcaccaacactgacaacacgaatttagattgaatgaaacatcccattgcgaatagccctcctcagatgactattcttttcatcaaccaaccaatagctgcctgtgaaacaagtatgtatatctacccaaccaatggctgtctctgaaacaagtatcttctacacaaatcaaagactagcacaaacggaaaatataacggactttgtgaaactgttgaagcagtctgtgaaacaagtaaaaactcaagatctgaaaaatgatttacaggagtgtataaacaaaaatggaggtgaaaaacaaaaa-C-TTACAG----A-GA-CAC-A------G-T-A------A-CA-CAC-A-CT----GGT---GACAAA---------------TCTTACCAATG-TG-AT--------GTT-TGTT-G-G--AAG---ACATT----C---AG---TT---ATT---C--A-GGA--TCATT-----G-C-----AA--A-A-----GCA----CA--G---A----AAGA---------CAC-A-------T------------AATAAT--CCTAA---T--G---A-----ATTT-G-AAATTT--GTC-GGAA-------CATT-----A------C-A--GAC--A-C----------------------------------------------ACA---T-GA-G--AATA-C-AC--ACT------G----GT---AAT-----AAA-C--------C----A---G-AT-AT-----AT-G-A-G-A-TATT-AATG-TT---AA--CG----CATT-AAG----C----C-----A---G---A--C-A-TA-AC-AGAGACA---T---TCAGT-G----AGAC-------------G----GGAT-CA-Tg
gi|30 : ttatttcgaagggcaaAG----A-GA-CACAT------G-A-AC-A---A-TA-CATTA-CT----GGTTTTGATATATCCTCATTATA-A---CTGATA--TGATG-AT--------GTC-TATG-G-G--AAT---TAGTT----G---AG---TA---GGG---C--A-GGA--T---C-----A-T-----TG--A-GGATATACA----AA--TCTGAT--AAAGGGTATACTTTTAC-A-------C----A-TAGGTGCATAAAAGCCTTAATATA-GG--A-----ATGT---ATGTCT--GTT-GGAAGTG----C-CTC----AA----TC-A----C--A-AA--CC----A-----C-----G------A--ATTA--C----ACA-ACAA--T-CA-TAGGGCA-C-ATT-ACT------GT---AT---GAT-----AAA-G--------C----CAA-T-AT-AA-----AT-G-T-A-A-TGTG-GTTG-GG---AA--GG----AGTT-TAA----T----tagaaaaacatatgaagacgcaaatggcattcgactcgaaagtccacttacaaatacacacgataacactcactggtgataatatttaaaaggtgatatatgtg
gi|33 : c-CACAT------G-A-A--G---A-CA-CAA-AACT----GGT---GATAAAACC------------------AAATG--A-A-------------TGTG-G-G--AAA---GCTTT------------------------------GA--T-G---------------------G-----AAA----CA------------AGC---------TAG-A-------T----A-CTGGTGA-TAAA--CCTT----------------------G-ATATCT--TTT-GCAAG-GTGTACATCC----GG----TC-A--GATCGA-TG--------A-----C-----TT-----C--T--A--GTTCTA-A-ACA---C-G--T--GA-A-G-AT--ACT------GTTCAGT---GATCTTACAAG-T--------C----C---T-AT-AA-----AT-G-T-G-G-TGCC-TGT
gi|36 : gaacagacaaatg-T------A-A-G--G---A-CA-CAT-A-TT----GAT---GATAAA-CCT--------------------TG-TT-AT--------TTC-TGTG-G-G--AAG---GCAAT----C---AG--------------------------A-C-----GCT-----AG--A-CTT---ACA----CA--T---A------------------AC-A-----------------GTGA-TAGA--CCCTA---CA-A-----------GT-G-TAGTTT--GTA-GAAAG-C----CATTA----GG----TC-G--GAC--A--G--CAC---A-----CCAATTAC-----A--A--A--G----TCA--CA---C-AA-G--GACA-C-ATAAACT------G---------GAT-----AAA-taacaag
gi|61 : ca-T------G-A-G--G---A-CA-CAT-A-CT----GGT---GAGAAA-CCATAT---A-AAtggagatatgtgagagaggaa
gi|38 : a------G-A-A--G---A----CAT-G-CT----GGT---GATAAA-CCT----------TT----TAAATG-TG-AT--------ATA-TGTG-G-A--AAG---GCATT----T----GTCTTG---AAA---G--T-AGA----A-T-------T-----AA--A-A-----GCA----CA--T---TT--TGTGA---------CTC-A-------C----A-CTGGTGAA-AAA--CCAT----TT-C---A-----ATGT-G-GTGTCT--GTG-GGAAG-G----TAT
gi|27 : gagaatatctgcgtatacatattaA-CAT-A-CT----GGT---AATAAA-CCTTAT---A-AAT----------G-TA-AT--------GTC-TGTG-G-G--ACG---GCATT----T---AT---CC---AGA---A--T-GGA--A-A-C-----T-T-----AA--A-A-----GCA----CA--C---AT--GAGGA---------CAC-A-------T----A-CTGGTGA-TAAG--CCTTA---TA-A---A------TGT-G-ATGTCT--GTG-GGAAG-G----CATTC----AG----TC-A--AAC--A-GG--AA----T-----C-----TT-----AC-AC-A--G----ACA--TA---T-GA-G--GATA-C-AT--ACT------G----GT---GAG-----AAA-C--------C----T---T-AT-AA-----AT-G-T-G-A-GGTC-TGTG-GA---AA--GG----TGTT-TAG----C----T-----G---G---G--C-A-G--GA-G-----A---C---TTACATG-------CACA--C-A-T---G----AGAA-CA-CA-TACTG-GTA------A-CAAA-CC-ATAT--A---AAT-GTG-ATatggtctaaaagttgtgttaaaga
gi|39 : cAC-A-CT----GGT---GACAAA-CC----------ATTC----AAATG-CG-AG--------ATC-TGTG-G-A--CGG---GCCTT----C---atatgtggga
gi|18 : ----GGT---GAAAAA-C---A----A-AAT----ATCAATG-TG-AT--------GTT-TTT-------AAG---GTATTATCTC---GG---CT-------------------T-A-C-----T-T-----AA--A-C-----AAA----CA--C---AA--GCGGA---------TAC-A-------T----A-CGGGTGAGAAAA--CCATA---T--A---A-----ATGT-GCATGTTT--GTG-GGAAG-G----CATTC----AG----TC-A--GTC--A--G--GA----A-----T-----TT-----G--A--A--G----GC--ACA---T-G--T--GACA-C-AT--ACT------G----GT---GAA-----TAA-C--------C----T---T--T-AA-----AT-G-T-G-A-TGTC-TGTG-GA---AA--GG-----ATTGTAT----T----T-----G---A---A--A-A-C---C-G-----A---C---GCAGA-G----AAACACAT-G-A-G---G----Acgacaaccaggcaatttgacgcgtcatcgactgacccacaccacagtcaaaccttacgtctgcccaacctgcaacaaagcattcaaccgggcctccaacttacacacgcacatgcgcactcacac
gi|11 : agcacaaacggaaaatataacggactttgttgaaactgttgaagcagtctgtgaaacaagtaaaaactcaagatctgaaaaatgatttacaggagtgtataaacaaaaatgga----GGT---GAAAAA-C---AA---A-AAT----ATCAATG-TG-AT--------GT--TGTT-T-T--AAG---GTATTATCTC---GGGC-T--------------------T-A-C-----T-T-----AA--A-C-----AAA----CA--C---AA--GCGGA----------AC-A-------T----A-CGGGTGAG-AAA--CCATA----A-A---A-----ATGT-G-ATGT-T--GTGTGGAAG-G----CATTC----AG----TC-A--GTC--A-GG--AT----A-----T-----TT-----G--A--A--GT---GCA--CA---T-GA-T--GACA-CTAT--AC-------G----GT---GAT-----AAA-C--------T----T---T--T-AA-----ATTG-T-G-A-TGTC-TGTG-GA---AA--GG----CATT-TA-----T----T-----G---G---A--A-A-A--CC-G-----A---C---GCAGA-GA---AAACACA--ccatacttgtgagagaccataaaa
gi|29 : ttattagttttataatcaatttttattacttatgtgtgcagatagcccattagaaacagattaaattcatcagaacaggtcaaggttataatttgtcatcagagatatgttcaccaacactgacaacacgaatttagattgaatgaaacatcccattgcgaatagccctcctcagatgactattcttttcatcaaccaaccaatagctgcctgtgaaacaagtatgtatatctacccaaccaatggctgtctctgaaacaagtatcttctacacaaatcaaagactagcacaaacggaaaatataacggactttgtgaaactgttgaagcagtctgtgaaacaagtaaaaactcaagatctgaaaaatgatttacaggagtgtataaacaaaaatgga----GGT---GAAAAA-C---AA---A-AAT----ATGAATG-CG-AT--------GTT-TGTT-T-T--AAG---GTATT----A---AC---TC---GG----------GC--TTA-C-----T-T-----GAGCA-G-----ACA----CA--T-------GAGGA---------TAC-A-------T----A-CTGGTGAG-AAA--CCGTA---TA-A---A------TGT-G-ATGTTT--GTG-GGAAG-A----CATTC----AG----TC-A--GAC--A-GG--AT----A-----T-----TT-----G--A--A--G----GTACACA---T-GA-T--tgag
gi|32 : aaactcaagatctgaaaaatgatttacaggaatgtataaacaaaaatggaCTTATAAATG-TG-AT--------TTT-TGTG-G-G--AAA---ACTTT----G---AG---TT----GT---A--A-AGC--T-G-C-----G-T-----TA--CTG-----ATA----CA--C---AC--GAGGA---------TCC-A-------T----A-CTGGTGAG-AGA--CCTCA---TG-A---A------TGT-G-GTGTTT--GTG-GGAAG-A----CATTC----AA----TC-A--GAC--A-GG--AG----A-----C-----TT-----A--C--A--G----AGACACA---G-GA-G--GATA-C-AT--ACT------G----GT---GAA-----AAA-C--------C----T---T-AT-AA-----AT-G-T-G-A-TGTC-TGTG-GA---AA--GG----CATT-CAG----TG---C-----GAA-G---G--A-A----AC-A-------------TTACA-A----AAACACGT-G-A-G---G----Atnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaaacaaaaatggaggtgaaaaacaaaaatatgaatgcgatgtttgttttaaggtattaactcggg
gi|48 : aaagCTCATAAGTG-TA-AC--------GTA-TGTG-G-A--AAA---GCCTT----C---AG---tacatactgg
gi|19 : gtgagaaacAATG-TG-TT--------GTTGTGTG-G-G--TAG---GC-TT----C---AG---CG---AGACAGG--A-AGA--T---T-----T-T-----AC--A-GC----ACA----CAAGT---TT--GACAA-----------C-A-------T----C-TTGGTGA-TAAA--CCT-A---TA-A---A------TGT-G-ATGTCT--GCG-GGAG--------GTTC----AG----TC-G--TAT--G--G--GA----A-----C-----AT-----T--A--A--G----GGG-ACA---T-AA-G--AGTATC-AT---CT------G----AT---GATA----AAA-C--------C----A---T-AT--A-----AT-G-TAA-A-TGTT-TGTG-GGAAAAA--AG----CATT-CAA----T----T-----G---G---A--G-A-C--AG-A-----ACATT---TTAAA-A----AGACACA--AGA-T---G----ATAC-CA-TA-C--TG-GT-G---T-T-TAAACCC-TTAT--A---AAT-GTG-ATGTG-T--G-TGGGA---AGGCAT--TCCG-T--G-AGAAA-GGA--CA------T-----T-TT-------------------AA--AAAGAC--AAGATTGA---T-A-C----TA-CT---GGT-GTA-AACCTTA-------A--TA-----A--AT--TG---ATG--TGTGTG-GGGAAAAG---CAT---T-ccagtcctccaaccttatcacacacagtcggaaacacaccggattcaagccatttaagtgtga
gi|5 : G-AC--------GTC-TGTG-G-G--AAG---GCATT----C---CG---TG---AGA---C--A-AGT--A-A-G-----G-T-----AA--A-G-----ACA----CA--C---AT--GAGGA---------TAC-A-------T----A-CTGGTGA-TGAA--CCTCA---TA-A---A------TGT-G-ACGTCT--GTG-GGAAG-G----CATGC----AG----TG-A--TAC--A-AG--TA----G-----C-----TT-----A--A--A--G----ACACACA---T-GA-G--GATA-C-AC--ACT------G----GT---GAT-----AAA-C--------C----T---T-AT-AA-----AT-G-T-G-A-TGTC-TGTG-GG---AA--GG----CATT-CAG----T----C-----G---G---G--C-A-T--AC-A-----A---T---TTAGA-G----AGACATA--A-A-A---G-----GATACA-TG-TA-TA-GTAG---TGA-TAAA-CC-TTAT--A---ATT-GTG-ATGCC-T--G-CGAAA---ATACTT--TCAG-C--A-ATATG-GGAT-CA------T-----TATTT----C---GC-----CTCAT--GAAGA---AAC----A---T-A-C----TG-GT---AAT-A-A-A-CCTTA----------TA-----T--AT-ATG---ATG--TCTGTG-GG--AAAA---CAT---T-TAG-T---G--A-GAC-G-G--G-A--CAC-T--CA---C---AG---ACA----CATAT--A-AGG-ATA-C---ATA-C-------T------GGTG-ATAAA-CCTT-----A------T-AA-----------------------TT------C-----A-A-------T---------A---AG-A------CA--------G--GGA----A-A-------T----T--AC--AGAGACACA---TA-G-GGA---T--AC---A--TACTGGTGATAA-ACC-TT--TT-GA---T-TTATATATGT------GA-T-TTGTAT-TGGTAA-G-CGTTCA--TGT---AAAGGACACGTCGAATGTTTTTAAAC---TTGTT----TTATTTTT---------TA--G-------------TT----GTATGCCT-----AGATT--GA--CT----ACAA-ATG------TGC----------AT--GTA--------T-----------T--T------TG---------TT------T-----T--TTTTTTA----AAGTTTG--AAA-G-C-AATAAAATTC-AAATTT---TTT---GTG-AT-TAAATAT---T---TT------T-CTT--GGTATTTTCT--GCGT--CATGAT-GTGT-----GACG-T-CATATAT---GTGACCT---TT--GCGA-------T---A-A--A--A---C---TGTTAGCCATATTATAG-A---A--AATT--CGAT----TTAATGG-AC--A-A-AA----A-----G--TCAATTATCACGAT-------AA-CAGCTCG-C--AG--ATGACATT-ACGTT-TGG-GTGCc
gi|7 : aaataaaatgccctttcCATT----C---CC---TA---ACA---C--A-GGA--A-G-C-----T-T-----AC--A-G-----GCA----CA--C---AT--GACAA---------CAC-A-------C----A-CTGGTGAA-AAC--CCTTA---CA-A---A------TGT-G-GTGTCT--GTG-AAAAA-G----CATTC----CC----TC-A--CAT--A-AG--TCCTTTA-----C------------A--G--A--G----ACA--CA---T-AA-T--GATA-C-AT--ACT------G----GT---GAT-----AAA-C--------C----T---T-AC-AA-----AT-G-T-G-A-TATC-TGTG-GA---AA--GG----CGTT-CAt
gi|29 : ---TG---AAA---A--A-TGA--T---------T-T-----AC--A-G-----GAA----TG--T---AT--AAACA---------AAA-A-------T----G-GAGGTGAA-AAA--C---A---AA-A---ATATGAATGC-G-ATGTTT--GTT-TTAAG-G----TATTA----AC----TC-G--GGC--T-T---------A-----C-----TT-----G--AGCA--G----ACA--CA---T-GA-G--GATA-C-AT--ACT------G----GT---GAG-----AAA-C--------C----G---T-AT-AA-----AT-G-T-G-A-TGTT-TGTG-GG---AA--GA----CATT-CAG----T----C-----A---G---A--C-A-G--GA-T-----A---T---TTGAA-G----GTACACA--cttataatggagacttgcgtagacacaccaggacannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngtgtgtgggagggcattcagtgagacaggagccatgcggaagcacatgaagatacatgctnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngtgatgtctgtggaaaggcattcagccgtacgggaacattaaagagacacatgacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaaccatatcagtgtgatgtctgtgggaaggctttcaggcattcagtaacattatataagcata
gi|38 : aaactcaagatcG---AGA---A--T-ATC--T-G-C-----G-T-----A------------TA----CA--T---ATTAGAAGA-----------C-A-------T----G-CTGGTGA-TAAA--CCTTT---TA-A---A------TGT-G-ATATAT--GTG-GAAAG-G----CATTT----GT----CT-T--GAA--A--G--TAG---A-----A-----TT-----A--A--A--A----GC--ACATTTT-G--T--GACT-C-AC--ACT------G----GT---GAA-----AAA-C--------C----A---T-TT-CA-----AT-G-T-G-G-TGTC-TGTG-GG---AA--GG----TATtgattnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaaacaaaaatggaggtgaaaaacaaaaatatgaatgcgatgtttgttttaaggtattaactcggg
gi|55 : ---A--G-AGA--C-A-C-----A-T-----AA--G-G-----ACA----CA--T---AC----------------TAT-A-------T----G-C-AGTG-ATTGA--TCTTA---TA-A---A-----ATTT-G-ATGTCTAGGTATGAAAA-G----TGTTC----atggtctaaaagttgtgttaaaga
gi|47 : cttac-T-----AC--A-G-----AGA----CA--C---AA--GAGGA---------TAC-ATACATGAT----A-CTGGTG-ATAAA--CATTAT--TA-A---A-----A----A-AAATAT---TG-G-----G----CACTT----AA-------A--GAC--A-CG--CA----A--------------------------------------------GA-T--GATA-C-CT--ACC------A----GT---GAA-----AAA-
gi|15 : gagatggggtcat-----AG--A-G-----ACA----CA--A---A----AGGA---------TAC-A-------TGTATA-GTAGT-AATAAA--TCTTC---TA-A---T-----TCGT---ATGCCT--TCG-AGAAT-G----CATTC----AG----CC-A--GA-----TG--GG----AT----C-----AT-----T--A--T--T----TCG-ACA---T-AA-A--GATA-C-AT--ACT------------------------------------------T---T-AT-AT-----AT-G-T-G-A-TGTC-CGTG-GG---AA--AA----CATT-TAG----TGAGAC-----G---G---G---------AC-------A---C---TTACA-G----ACACATAC-A-A-G---G----------A-TA-CA-TA-CTGG---TGA-TAAA-CC-TGAT--A---ATT----------------CAATA---AGA------CAG----------G-GAA---A------T-----TACAG----A---GA-----CACAT--GAGGAT--AC-----A---T-A-T----TG-GT---GA--G-A-AACGTTGTTGATTTA--TA-----T--AT-GTG---ATT--TGTATG-GG--TAAG---CGT---T-
gi|20 : cagacaatttac-----AG--A-G-----ACA----CAG-T---A-------A---------CAC-A-------C----A-CTGGTGA-CAAA--TCTTA---CC-A---A------TGT-G-ATGTTT--GTT-GGAAG-A----CATTC----AG----TT-A--TTC--A-GGATCA----T-----T-----GC-----A--A--A--A----GC--ACA---G-AA-A--GACA-C-AT--A-------------------AT-----AAT-C--------C----T---A-AT-GA-----AT-T-T-G-A-AATT-TGTC-GG---AA--------CATT--A----------C-----A---G---A--C-A-C--AC-A-------------TGAGA------ATACACA--C-T-G---GTAATAAAC-CA-GA-TA-TA-TGAGA--T-A-TTAA-TG-TTA---ACGCATT-----AAGCC-A--GACATAACAGAGACAT--TCAG-T--G-AGACG-GGAT-CA------T-----TAaatttaaaagacatgtagcatgtttttaaacatttttttttatttttagttgtatgcctagaatgactacaaatgtaaatgtattttgaataaatcattatgctttggtgttaagttttaaagcaatcaatttcaaattttacgattaaatatattt
gi|33 : ttatttcgaagggcaacttac--A-G-----ACAAATGCA--C---AT--GAAGA---------CAC-A-------A----AACTGGTGATAAAA--CC---------A---A-----ATG--A-A----T--GTG-GGAAA-G----CTTT-----------------G----A-TG--GA----A--------------------------------ACA-A-------------GCTA-G-AT--ACT------G----GT---GAT-----AAA-C--------C----T--------------------T-G-A-TATC-TTTT-GC---AA--GGTGTACATC-CGG----T----C-----A---G---A--T-C-G--AT-G-----A---C---TTCTA-GTTCTAAACAC---G-T-G---A----AGAT-AC-TG-TT-CA-GTGATCTT-A-CAAG-TC-CTAT--A---AAT-GTG-GTGCC-T--G-gaaaaacatatgaagacgcaaatggcattcgactcgaaagtccacttacaaatacacacgataacactcactggtgataatatttaaaaggtgatatatgtg
gi|36 : gaac---AT--AAGGA---------CAC-A-------T----A-TTGATGA-TAAA--CCTT-------------------GT-T-ATTTCT--GTG-GGAAG-G----CA--------A----TC-A--GAC--G-C----------------------T-----A--------G----AC-------------T--TACA-C-AT--AAC------A----GT---GAT-----AGA-C--------C----C---T-AC-AA-----GT-G-T-A----GTT-TGTA-GA---AA--GC----CATT-AGG----T----C-----G---GACAG--C-A-C--AC-C-----A---A---TTACA-A----AGTCACAC-A-A-G---G----Attaacaag
gi|61 : c---AT--GAGGA---------CAC-A-------T----A-CTGGTGAG-AAA--CCATA---TA-A---A-----cacataaactggataaatggagatatgtgagagaggaa
gi|27 : AC-A-------T----A-CTGGT-AATAAA--CCTTA---TA-A---A------TGT-A-ATGTCT--GTG-GGACG-G----CATTT----AT----CC-A--GA---A-TG--GA----AA----C-----TT-----A--A--A--A----GCACACA---T-GA-G--GACA-C-AT--ACT------G----GT---GAT-----AAG-C--------C----T---T-AT-AA-----AT-G-T-G-A-TGTC-TGTG-GG---AA--GG----CATT-CAG----T----C-----A---A---A--C-A----GG-A-----A---TC--TTACA-C----AGACATAT-G-A-G---G----------A-TA-CA-TA-CTGG---TGA-GAAA-CC-TTAT--A---AAT-GTG-AGGTC-T--G-TGGAA---AGGTGT--TTAG-C-------TG-GG---CAGGAGACT-----TACAT--------GCA----CACAT--GAGAAC--AC-----A---T-A-C----TG-GT---AAC---A-AACCAT--------A--TA-----A--AT-GTG---ATA--TATGTG-GG--A
gi|39 : c-A-------C----A-CTGGTGA-CAAA--CCAT----TC-A---A-----ATGC-G-AGATCT--GTG-GACGG-G----CCTTCCGACAA----CC-A--GGC--AATT--TG----A-----C-----G---------------------CG-TCA---TCGACT--GACC-C-AC--ACC------A----CA---GTC-----AAA-C--------C----T---T-AC-GT-----CT-G-C-C-C-AACC-TGCA-AC---AA--AG----CATT-CAA----C----C-----G---G---G--C-C-T--CC-A-----A---C---TTACA-C----ACGCACA--
gi|18 : GGTGAA-AAA--CAAAA---TATC---A-----ATGT-G-ATGTTT--TT----AAG-G----TATT------A----TCTC--GGC--T-T---------A-----C-----TT-----A--A--A--C----A-A-ACA---C-AA-GCGGATA-C-AT--ACG------G----GT---GAG-----AAAAC--------C----A---T-AT-AA-----AT-G-T-GCA-TGTT-TGTG-GG---AA--GG----CATT-CAG----T----C-----A---G---T--C-A----GG-A-----A---T---TT-GA------AGGCACA--T-G-T---G----A----CA-CA-TACTG-GT-G---A-A-T-AA-CC-TT-T--A---AAT-GTG-ATGTC-T--G-TGGAA---Atgcgcactcacac
gi|32 : agcacaaacggaaaatataacggactttgttgaaactgttgaagcagtctgtgaaacaagtaaaaactcaagatctgaaaaatgatttacaggagtgtataaacaaaaatggaAAA--GCTTA---TA-A---A------TGT-G-ATTTTT--GTG-GGAAA-A----CTTTG----AG----T------------TG--TA----AAGCTGC-----GT-----T--A--CT-G----ATACACA---C-GA-G--GATC-C-AT--ACT------G----GT---GAG-----AGA-C--------C----T---C-AT-GA-----AT-G-T-G-G-TGTT-TGTG-GG---AA--GA----CATT-CAA----T----C-----A---G---A--C-A-G--GA-G-----A---C---TTACA-G----AGACAC-----A-G---G----AGG---A-TA-CA-TA-CTGG---TGA-AAAA-CC-TTAT--A---AAT-GTG-ATGTC-T--G-TGGAA---AGGCAT--TCAG-T--G-CGAAG-GAAA-CA------T-----TACAA----A---AA-----CACGT--GAGGAT--AC-----A---T-A-C----TG-Gggattgtatttgaaaaccgacgcagagaaacacatgaggaccatacttgtgagagaccataaaa
gi|13 : AAG-G----CATTT----AACTCTTC-ATTGAC--A-T---TA----A-----C-----AT-----A--------------CA--CA---T-GA-T-----A-C-AT--AGT------G----GA---GAA-----AAA-C--------T----T---T-AC-TT-----AT-G-T-G-A-TATT-TGTG-GG---AA--GA----CATT---G----T----C-----T---C---G--CAA-A--ACAA-----A---T---GCGAA-A----AGACACAT-G-A-G---G----AAA--------CA-TA-CTGG---TGA-TAAA-CC-TTAT--A---AAT-GTG-TTGTC-T--C-TGGAA---AGGCAT--TCAG-T--G-AGAAA-GGA-----------------ATCT----T---ACAGAAACACAA--GAGGAT--AC-----A---T-A-C----TG-AT---GCT-A-A-
gi|7 : ----CATTC----CC----TA-A--CAC--A-GG--AA----G-----C-----TT-----A--C--A--G----GCACACA---T-GA-C--AACA-C-AC--ACT------G----GT---GAA-----AAC-C--------C----T---T-AC-AA-----AT-G-T-G-G-TGTC-TGTG-AA---AA--AG----CATT-CCC----T----C-----A----------C-A-T--A--A-----G---TCCTTTACA-G----AGACACA--T-A------------AT-GA-TA-CA-TA-CTGG---TGA-TAAA-CC-TTAC--A---AAT-GTG-ATATC-T--G-TGGAA---AGGCGT--TCAgtcacggaaggcaaccaaccagaatgatagagtacagtgacacatgattatatatattgataatgaatgtgatgttttcggaaaggtattcaatcagacaacacacttatagaatcacattaaggcacgtttggtacacctgaaatacctgtgggacaggaaacttacagaaacacatgaggacatagaatggtgaccaaaacgtgtgttcctgcatagccaaactgacctagtattgtttctgcataactccttatcctatatattttgacaagctcagaaaa
gi|20 : G--CA----A-----C-----TT-----A--C--A--G----A-G-ACA---C-AG-T--AACA-C-AC--ACT------G----GT---GAC-----AAA-T--------C----T---T-AC-CA-----AT-G-T-G-A-TGTT-TGTT-GG---AA--GA----CATT-CAGTTATT----C-----A---G---G----A-T---C-A-------------TTGCA-A----AAGCACA--G-A-----A----AGA--CA-CA-TA-------------A-TAAT-CC-TAATG-A---ATT--TG-AAATT-T--G-TCGGA---ACA-TT--ACAGAC--ACACATGAGAATACA------CACTGGTAATA----A---AC-----CAGAT--ATATG---AG-----A---T-A-T----TA-AT---GTT-A-A-CGCATTA-------AGCCA-----G--AC-ATA---A------CA-G-AG--A------CAT---T-CAG-T---G--A-GAC-G-G--G-A------T--CA---TTAGAA---AAA----CATAT--G-AAG-ACG-C---A-A-A-------T------GGCA-TTCGA-C------------------------------------------T-------C-----G-A-----------------A---AG-T------C--------------C----A-C-------T----T--AC--AAATACACA---C----GAT---A--AC---ACTCACTGGTGATAATA----T--TT-AAAAGG-TGATATATGT------Gcttataatggagacttgcgtagacacaccaggacannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngtgtgtgggagggcattcagtgagacaggagccatgcggaagcacatgaagatacatgctnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngtgatgtctgtggaaaggcattcagccgtacgggaacattaaagagacacatgacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaaccatatcagtgtgatgtctgtgggaaggctttcaggcattcagtaacattatataagcata
gi|11 : ttatttcgaagg----A-----C-----TT-----A--A--A--C----A-A-ACA---C-AAGC--GGAA-C-AT--ACG------G----GT---GAG-----AAA-C--------C----A---T-AA-AA-----AT-G-T-G-A-TGT--TGTGTGG---AA--GG----CATT-CAG----T----C-----A---G---T--C-A-G--GA-T-----A---T---TTGAA-G----TG-CACAT-G-A-T---G----A----CACTA-TA-CG-GTG------A-TAAA-CT-TTTA--A---ATT-GTG-ATGTC-T--G-TGGAA---A
gi|30 : ttattagttttataatcaatttttattacttatgtgtgcagatagcccattagaaacagattaaattcatcagaacaggtcaaggttataatttgtcatcagagatatgttcaccaacactgacaacacgaatttagattgaatgaaacatcccattgcgaatagccctcctcagatgactattcttttcatcaaccaaccaatagctgcctgtgaaacaagtatgtatatctacccaaccaatggctgtctctgaaacaagtatcttctacacaaatcaaagactagcacaaacggaaaatataacggactttgtgaaactgttgaagcagtctgtgaaacaagtaaaaactcaagatctgaaaaatgatttacaggagtgtataaacaaaaatggaggtgaaaaacaaaaatatcaatgtgatgttgttttaaggtattatctcgggctt-----A--G--A--G----ACA--CA---T-GAAC--AATA-C-ATT-ACT------G----GTTTTGAT-----ATA-T--------CCTCAT---T-AT-AACTGATAT-GAT-G-A-TGTC-TATG-GG---AA--TT----AGTT-GAG----T----A-----G---G---G--C-AGG--AT-C-----A---T---TGAG--G----ATATACA--A-A-ggcatttattggaaaaccgacgcagagaaaacacatgag
gi|55 : c-----A--G--A--G----ACA--CA---T-AA-G--GACA-C-AT--ACTATATGCA----GT---GAT-----TGA-T--------C----T---T-ATAAA-----AT-T-T-G-A-TGTC-Ttctgataaagggtatacttttacacataggtgcataaaagccttaatataggaatgtatgtctgttggaagtgcctcaatcacaaaccacgaattacacaacaatcatagggcacattactgtatgataaagccaatataaatgtaatgtggttgggaaggagtttaat
gi|56 : cttac-ACA---T-GA-G--GACA-C-AT--ACA------G----GA---GAA-----CGC-C--------C----G---T-AC-AA-----AT-G-T-A-A-CACG-TGCG-GG---AAACAGTT--CGCT-CAG----TA---C-----G---G---G--aggtatgaaaagtgttc
gi|61 : cA---T-GA-G--GACA-C-AT--ACT------G----GT---GAG-----AAA-C--------C----A---T-AT-AA-----Aacactgta
gi|27 : CA-C-AT--ACT------G----GT---AAT-----AAA-C--------C----T---T-AT-AA-----AT-G-T-A-A-TGTC-TGTG-GG---AC--GG----CATT-TA-----T----C-----C---A---G--A-A-TG-GA-A-----A---C---TTA-A-A----AG-CACA--C-A-T---G----AGGA-CA----CA-TA-CTGG---TGA-TAAG-CC-TTAT--A---AAT-GTG-ATGTC-T--G-TGGGA---AGGCAT--TCAG-TCAA-ACA-G-GAAT-C-------T-----TACAC----A---GA-----CATAT--GAGGAT--AC-----A---T-A-C----TG-GT---GA--G-A-AACCTT--------A--TA-----A--AT-GTG---AGG--TCTGTG-GA--AAGG---TGT---T-TAGCT---G--G-GCA-G-G-AG-A--C---T--TA---C---AT---GCA----CACAT--G-AGA-ACA-C---ATA-C-------T------GGTA-ACAAA-CCAT-----A------T-AA-----------------------
gi|18 : ------G----GT---GAA-----AAA-C--------A----AAA-T-AT-CA-----AT-G-T-G-A-TGTT-TTT-------AA--GG----TATT-ATC----T----C---------G---G--C-T-T--AC---------------TTAAA-C----AAACACA--A-GCG---G----ATA--CA-TA-CG--G-GTGA---G-A--AAA-CC-ATAT--A---AAT-GTGCATGTT-T--G-TGGGA---AGGCAT--TCAGTC--A-GT-CA-GGA-----------------ATTTGA--A---GG-----CACAT--GTGAC---AC-----A---T-A-C----TG-GT---G---A-ATAACCTT-----------TA-----A--AT-GTG---ATG--TCTGT--GG--AAAG---GAT---TGTAT-TTG-A--A-AAC-----CG-A--C---G--CA---G---AG---AAA----CACAT--G-AGG-AC--C---ATA-C-------T------TGTG-AGAGA-CC-------A------T-AA-----------------------atgtgatatatgtggga
gi|11 : agcacaaacggaaaatataacggactttgttgaaactgttgaagcagtctgtgaaacaagtaaaaactcaagatctgaaaaatgatttacaggagtgtataaacaaaaatgga------G----GT---GAA-----AAA-C--------A----AAAAT-AT-CA-----AT-G-T-G-A-TGT--TGTT-TT---AA--GG----TATT-ATC----T----C-----G---G---G--C-T-T--AC---------------TTAAA-C----AAACACA--A-GCG---G----A-----A-CA-TA-CG-G--G---TGA-GAAA-CC-ATAA--A---AAT-GTG-ATGTTGT--G-TGGAA---G-GCAT--TCAGTC--A-GT-CA-GGA----------------TATTTGAAGT---G------CACAT--GATGA---CACT---A---T-A-C-----G-GT---GAT-A-A-ACTTTTA-------A---A-----T---T-GTG---ATG--TCTGTG-GA--AAGG---CAT---T-TAT-T---GGAA-AAC-----CG-A--C---G--CA---G---AGAAAACA----CATaa
gi|29 : ttattagttttataatcaatttttattacttatgtgtgcagatagcccattagaaacagattaaattcatcagaacaggtcaaggttataatttgtcatcagagatatgttcaccaacactgacaacacgaatttagattgaatgaaacatcccattgcgaatagccctcctcagatgactattcttttcatcaaccaaccaatagctgcctgtgaaacaagtatgtatatctacccaaccaatggctgtctctgaaacaagtatcttctacacaaatcaaagactagcacaaacggaaaatataacggactttgtgaaactgttgaagcagtctgtgaaacaagtaaaaactcaagatctgaaaaatgatttacaggagtgtataaacaaaaatgga------G----GT---GAA-----AAA-C--------A----AAAAT-AT-GA-----AT-G-C-G-A-TGTT-TGTT-TT---AA--GG----TATT-AAC----T----C-----G---G---G--C-T-T--AC---------------TT-GA-GC---AGACACAT-G-A-G---G----A-------TA-CA-TA-CTGG---TGA-GAAA-CC-GTAT--A---AAT-GTG-ATGTT-T--G-TGGGA---AGACAT--TCAG-T--C-AGACA-GGAT--A------T-----Tgag
gi|16 : aaactcaagatctgaaaaatgatttacaggaatgtataaacaaaaatgga------G----GT---GAA-----AAA-C--------AAAG-T---T-AT-CA-----GT-G-T-C-A-TCTT-TGTT-GG---AA--GG----CATT-TAC----T----C-----tgaaggtacacatgattnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaaacaaaaatggaggtgaaaaacaaaaatatgaatgcgatgtttgttttaaggtattaactcggg
gi|32 : ttattagtattataattatttttattatttttcttgcagaaatcccattagaaacatattaggttaatcagaaacatgtcaatgttttaaattggcatcacagatgtgttcactatcactgacaacactagaatttagactgtaatgcaacatccaattggaaatagccctcctcgtatggctattcttttcacccaactaaccaatggctgactgtgaaacaagtatgtctatctacccaaccaatggctgcctgtgaaacaagaatgtcttctacacaatcaagggctagcacaaacggaaaatacaacggacttagtgagactgtagaggctgtctgtgaaacaagtaaaactaaagaccaggaaaatgatttacacgaatgtacaaacacaaatgga-----AAA-G--------C----T---T-AT-AA-----AT-G-T-G-A-TTTT-TGTG-GG---AA--AA----CTTT-GAG----T----T-----GTAAA---G--C---T--GC-G-------------TTACT-G----ATACACA--C-G-A---G-----GAT-C-----CA-TA-CTGG---TGA-GAGA-CC-TCAT--G---AAT-GTG-GTGTT-T--G-TGGGA---AGACAT--TCAA-T--C-AGACA-GGAG-AC------T-----TACAG----A---GA-----CACAG--GAGGAT--AC-----A---T-A-C----TG-GT---GA--A-A-AACCTTA----------TA-----A--AT-GTG---ATG--TCTGTG-GA--AAGG---CAT---T-CAG-T---G--C-GAA-G-G-AA-A--CA--T--TA---C---AA---AAA----CACGT--G-AGG-ATA-C---ATA-C-------T------GG
gi|34 : -----AAA-C--------C----T---T-AT-AA-----ATAG-T-G-T-GGTT-TGTG-GG---AA--G
gi|19 : agtgtaaacagaaaaagtaatgaatgtagtgaacttaggaaacctgtttgtgaaataattcaactaaagatcagaaaaatgatttacagagaacgggtgaaagatattggagtaaaaacatgttttcactgtgatgatagatatgcacaaaaggcgcaaagaacttcaagaA-----AT-G-T-G-T-TGTTGTGTG-GG---TA--GG----C-TT-CAG----C----G-----A---G---A--C-A-GGAAG-A-----T---T---TTACA-G-------CACAC-A-A-GTTTG----ACAA-CA-TC-T--TG-GTG------A-TAAA-CC-T-AT--A---AAT-GTG-ATGTC-T--G-CGGGA---GG---T--TCAG-T--C-GTATG-GGAA-CA------T-----TAAGG----G---G-------ACAT---AAGA---GT-----A---TCATC----TG-AT---GAT-A-A-AACC----------A--TA-----T--A--ATGTAAATG--TTTGTG-GG--AAAAAAGCAT---T-CAA-TTG-G--A-GAC-A-G--A-A--CATTT--TA---A---AA---AGA----CACAA--G-ATG-ATACC---ATA-C-------T------GGTGTTTAAACCCTT-----A------TAAA-----------------------TG------T-----G-A-------TGTGTGTGGGA---AG-G------CATTCCGT--G--AGA----A-AGGACATTT----T--AA--AAAGACA--------A-GAT---TG-AT---AC-TACTGGTG-TAA-ACC-TTAATA-AA---T-TGATGTGTGT------Gaacatcaat
gi|15 : --C-A-G--AC-A-----A---T---TTACA-G----AGACACA--A-A-A---G-----GATACA-TG-TA-TA-GTAG---T-AATAAA-TC-TTCT--A---ATTCGT--ATGCC-T--T-CGAGA---ATGCAT--TCAG-C--C-AGATG-GGAT-CA------T-----TATTT----C---G-------ACAT--AAAGA--------------T-A-C------------------A-TACTTTA----------TA-----T--AT-GTG---ATG--TCCGTG-GG--AAAA---CAT---T-TAG-T---G--A-GAC-G-G--G-A--CAC-T--TA---C---AG---ACA----CATAC--A-AGG-ATA-C---ATA-C-------T------GGTG-ATAAA-CCTG-----A------T-AA-----------------------TT------C-----A-A-------T---------A---AG-A------CA--------G--GGA----A-A-------T----T--AC--AGAGACACA---TG-A-GGA---T--AC---A--TATTGGTGAGAA-ACG-TTG-TT-GA---T-TTATATATGT------GATT-T-GTAT-GGGTAA-G-CGTTAA--TTT---AAAAGACATGTAGCATGTTTTTAAACATTTTTTT----TTA-TTTT---------TA--G-------------TT----GTATGCCT-----AGAAT--GA--CTAC--A--A-ATG------TAA----------AT--GTA--------T-----------T--T------TGAATAAATCATT------A-----TGCTTTG--GTGTTAAGTTTT--AAA-G-C-A--A----TC-AATTTCAAATTT--TACG-AT-TAAATAT---A---TT------T-gggaaaagcattc
gi|55 : ---TTACA-G----AGACACAT-A-A-G---G----ACA--CA-TACTA-TATGCAG---TGA-TTGA-TC-TTATAAA---ATT--TG-ATGTC-T--
gi|7 : c----AGGCACA--C-A-T---G----ACAA-CA-C---A-CA-CTGG---T-G-AAAA-CCCTTAC--A---AAT-GTG-GTGTC-T--G-TGAAA---AAGCAT--TCCC-T--C-ACATA-AGTC-CT------T-----TACAG----A---GA-----CACAT--AATGAT--AC-----A---T-A-C----TG-GT---GAT---A-AACCTT--------A--CA-----A--AT-GTG---ATA--TCTGTG-GA--AAGG---CGT---T-CAC-T---T--ATAAT-G-G-AG-A--C---TTGCG---T---AG---ACA----CAaggtatgaaaagtgttc
gi|27 : cattccctaacacaggaagcttacA-TA-CTGG---T-AATAAA-CC-TTAT--A---AAT-GTA-ATGTC-T--G-TGGGACG-GCATTTA-TC---C--A-GAATG-GAA-----------------ACTT----AAAAGCA----CACAT--GAGGA---CAC----A---T-A-C----TG-GT---GAT-A-A-G-CCTTA----------TA-----A--AT-GTG---ATG--TCTGTG-GG--AAGG---CAT---T-CAG-T---C--A-AAC-A-G--G-AATC---T--TA---C---AC---AGA----CATAT--G-AGG-ATA-C---ATA-C-------T------GGTG-AGAAA-CCTT-----A------T-AAATGTGAGG---------------T-------CTGTGGA-AAGGTGTTT---------AGCTGG-G------CA--------G--GAG----A-C-------T----T--AC--ATGCACACA---TG-A-GAA---C--AC---A--TACTGGTAACAA-ACCATA--TA-AA---TGTGATATATGT------Gccaggacannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngtgtgtgggagggcattcagtgagacaggagccatgcggaagcacatgaagatacatgctnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngtgatgtctgtggaaaggcattcagccgtacgggaacattaaagagacacatgacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaaccatatcagtgtgatgtctgtgggaaggctttcaggcattcagtaacattatataagcata
gi|32 : cacAAA-GC-TTAT--A---AAT-GTG-ATTTT-T--G-TGGGA---AAACTT--TGAG-T--T-GTA-A-AGCTGCG------T-----TACTG----A---TA-----CACAC--GAGGAT--CC-----A---T-A-C----TG-GT---GA--G-A-GACCTCA----------TG-----A--AT-GTG---GTG--TTTGTG-GG--AAGA---CAT---T-CAA-T---C--A-GACAG-G-AG-A--C---T--TA---C---AG---AGA----CACAG--G-AGG-ATA-C---ATA-C-------T------GGTG-AAAAA-CCTT-----A------T-AAATGTGATGTCTGTGGAAAGGCATT-------C-----A-G-------T---------G---CG-A------AG--------G--AAA----C-A-------T----T--AC--AAAAACACG---TG-A-GGA---T--AC---A--TACTGGgga
gi|13 : -----CACAT--GAGGA---AAC----A---T-A-C----TG-GT---GAT-A-A-A-CCTTA----------TA-----A--AT-GTG---TTG--TCTCTG-GA--AAGG---CAT---T-CAG-T---G--A-GAA-A-G--G-AATC---T--TA---C---AG---AAA----CACAA--G-AGG-ATA-C---ATA-C-------T------GATG-CTAAG-TCACGGAAGG------C-AA-----------------------C-------C-----A-A-------C---------C---AG-A------AT--------G--ATA----G-A-------G----T--AC--AGTGACACA---T----GAT---T--AT---A--TA-TATTGATAA-
gi|7 : aaggcatttaactcttcattgacattaacatacacatgatacatagtggagaaaaactttacttatgtgatatttgtgggaagacattgtctcgcaaaacaaatgcgaaaaga-----CACAT--GACAA---CAC----A---C-A-C----TG-GT---G---A-A-AACCCTT-------A--CA-----A--AT-GTG---GTG--TCTGTG-AA--AAAG---CAT---T-CCC-T---C--A-CAT-AAG-TC-C--T---T--TA---C---AG---AGA----CACAT--A-ATG-ATA-C---ATA-C-------T------GGTG-ATAAA-CCTT-----A------C-AA-----------------------tgaatgtgatgttttcggaaaggtattcaatcagacaacacacttatagaatcacattaaggcacgtttggtacacctgaaatacctgtgggacaggaaacttacagaaacacatgaggacatagaatggtgaccaaaacgtgtgttcctgcatagccaaactgacctagtattgtttctgcataactccttatcctatatattttgacaagctcagaaaa
gi|11 : cattccctaacacaggaagcttacaggca-----CACAA--GCGGA---AC-----A---T-A-C----GG-GT---GA--G-A-AACCATA-------A--AA--------AT-GTG---ATG--TT-GTGTGG--AAGG---CAT---T-CAG-T---C--A-GTCAG-G-AT-A--T---T--TG---A---AG----TG----CACAT--G-ATG-ACA-CT--ATA-C--------------GGTG-ATAAA-CTTT------------T-AA-----------------------atgtgatatctgtggaaaggcgttcacttataatggagacttgcgtagacacaccaggacannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngtgtgtgggagggcattcagtgagacaggagccatgcggaagcacatgaagatacatgctnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngtgatgtctgtggaaaggcattcagccgtacgggaacattaaagagacacatgacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaaccatatcagtgtgatgtctgtgggaaggctttcaggcattcagtaacattatataagcata
gi|38 : ttattagttttataatcaatttttattacttatgtgtgcagatagcccattagaaacagattaaattcatcagaacaggtcaaggttataatttgtcatcagagatatgttcaccaacactgacaacacgaatttagattgaatgaaacatcccattgcgaatagccctcctcagatgactattcttttcatcaaccaaccaatagctgcctgtgaaacaagtatgtatatctacccaaccaatggctgtctctgaaacaagtatcttctacacaaatcaaagactagcacaaacggaaaatataacggactttgtgaaactgttgaagcagtctgtgaaacaagtaaaaactcaagatctgaaaaatgatttacaggagtgtataaacaaaaatggaggtgaaaaacaaaaatatcaatgtgatgttgttttaaggtattatctcgggcttacttaaacaaa-----CATATTAGAAGA---CA---------T-G-C----TG-GT---GAT-A-A-ACCTTT-----------TA-----A--AT-GTG---ATA--TATGTG-GA--AAGG---CAT---T-T-G-TCTTG--A-AA--G-T-AG-A--A---T--TA---A---AA---GCA----CATTT--T-GTG-ACT-C---ACA-C-------T------GGTG-AAAAA-CCattgtgatgtctgtggaaaggcatttattggaaaaccgacgcagagaaaacacatgag
gi|29 : gagaatatctgcgtata-----CACAT--GAGGAT--AC-----A---T-A-C----TG-GT---GA--G-A-AACCGT--------A--TA-----A--AT-GTG---ATG--TTTGTG-GG--AAGA---CAT---T-CAG-T---C--A-GAC-A-G-atttcaatgtggtgtctgtgggaaggtatatggtctaaaagttgtgttaaaga
gi|30 : aaactcaagatctgaaaaatgatttacaggaatgtataaacaaaaatggaggtgaaaaacaaaaatatgaatgcgatgtttgttttaaggtattaactcgggcttacttgagcaga-----CACAT--GAACA---AT-----ACATT-A-C----TG-GTTTTGAT-A-T-ATCCTCATT-----A--TAACTGAT--ATGATG---ATG--TCTATG-GG--AA-----------T-TAGTT---G--A-Ggatatttgaaggtacacatgattnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaaacaaaaatggaggtgaaaaacaaaaatatgaatgcgatgtttgttttaaggtattaactcggg
gi|33 : cagaga-----CACAT--GAAGACACAA-----A-----A-C----TG-GT---GAT-A-A-AACC--A-------A---------------ATGA--ATG------TG-GG--AAAG---C-T---T-T------------GAT-G-G-----------------------AA---ACA-----------A-GC---TA-G---ATA-C-------T------GGTG-ATAAA-CCTTG----A------T-Atagggcaggatcattgaggatatacaaatctgataaagggtatacttttacacataggtgcataaaagccttaatataggaatgtatgtctgttggaagtgcctcaatcacaaaccacgaattacacaacaatcatagggcacattactgtatgataaagccaatataaatgtaatgtggttgggaaggagtttaat
gi|18 : gaacagacaaatgAT--AAACA---AA-----A-----A------TG-GA---GGTGA-A-AAACAAA-------A--TA-----TCAAT-GTG---ATG--TTTTTA-AG--GTAT---TAT---C-T--------------C-G-G-CTTA--C---T--TAAA-C---AA---ACA----CA-----A-GCGGATA-C---ATA-C-------G------GGTG-AGAAAACCAT-----A------T-AAATGTGCATGTTTG----------TGGGAAGGC-----A-T-------T---------C---AG-T------CA--------GTCAGG----A-A-------T----T---T--GAAGGCACA---TG-T-GAC------AC---A--TACTGGTGAATA-ACC-TT--TA-AA---TGTGATGTCTGTGGAAAGGA-T-T-GTAT-Ttcttttgcaaggtgtacatccggtcagatcgatgacttctagttctaaacacgtgaagatactgttcagtgatcttacaagtcctataaatgtggtgcctgttaacaag
gi|20 : agcacaaacggaaaatataacggactttgttgaaactgttgaagcagtctgtgaaacaagtaaaaactcaagatctgaaaaatgatttacaggagtgt-----A---C-A-C----TG-GT---GAC-A-A-A-TCTTA-------C--CA--------AT-GTG---ATG--TTTGTT-GG--AAGA---CAT---T-CAG-T---T--A-TTC-A-G--G-A------T--CATTGC---AA---AAG----CACAG--A-AAG-ACA-C---ATA---------------------ATAAT-CCTA-----A------TGAA-----------------------T-------TTGA--A-A-------T---------T---TG-T------CG--------G--A-A----C-A-------T----T--AC--AGACACACA---TG-A-GAA---T--AC---A--CACTGGTAATAA-ACC---------A------GATATATGA------GA-T-A-TTAA-TGTTAACG-CATTtgaaaaccgacgcagagaaacacatgaggaccatacttgtgagagaccataaaa
gi|32 : ttatttcgaagggcaacttacagagacacagtaacac-A-AAGCTTA----------TA-----A--AT-GTG---ATT--TTTGTG-GG--AAAA---CTT---T-GAG-TTGTA--A-AGC-T-G-CG--------T--TA---C---TG---ATA----CACAC--G-AGG-ATC-C---ATA-C-------T------GGTG-AGAGA-CCTC-----A------T-GAATGTGGTGTTTGTGGGAAGACATT-------C-----A-A-------T---------C---AG-A------CA--------G--GAG----A-C-------T----T--AC--AGAGACACA---GG-A-GGA---T--AC---A--TACTGGTGAAAA-ACC---------------TTATAAATGT------GA---T-GTCTGTGGAAAGG-CATTCAG-TGC---GAAGGAAACATaagccagacataacagagacattcagtgagacgggatcattagaaaaacatatgaagacgcaaatggcattcgactcgaaagtccacttacaaatacacacgataacactcactggtgataatatttaaaaggtgatatatgtg
gi|47 : ---G--A-GAT-G-G-GG-T--CA--T--TA---C---AG---AGA----CACAA--G-AGG-ATA-C---ATA-CATGATACT------GGTG-ATAAA-CATT-----A------T--------------------------T-------A-----A-A-------A---------A---AA-A------TATT------G--GGC----A-C-------T----T------AAAGACACG---CA-A-GATGA-T--AC---C--TACCAGTGAAAA-Atacaaaaacacgtgaggatacatactgg
gi|7 : --C---T--TA---C---AG---GCA----CACAT--G-ACA-ACA-C---ACA-C-------T------GGTG-AAAAC-CCTT-----A------C-AAATGTGGTG---------------T-------CTGTG-A-A-------A---------A---AGCATTCCCTCA--------C--ATA----A-G-------TCCTTT--AC--AGAGACACA---TA-ATGA----T--AC---A--TACTGGTGATAA-ACC---------------TTACAAATGT------GA-TAT-CTGT-GGAAAG-G-CGTTCACTTAT---AATGGAGAC
gi|55 : cattccctaacacaggaag--C---T--TA---C---AG---AGA----CACAT--A-AGG-ACA-C---ATA-C-------TATATGCAGTG-ATTGA-TCTT-----A------T-AA-----------------------ttgcgtagacacaccaggacannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngtgtgtgggagggcattcagtgagacaggagccatgcggaagcacatgaagatacatgctnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngtgatgtctgtggaaaggcattcagccgtacgggaacattaaagagacacatgacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaaccatatcagtgtgatgtctgtgggaaggctttcaggcattcagtaacattatataagcata
gi|33 : A---C---AG---ACAAATGCACAT--G-AAG-ACA-C---AAAAC-------T------GGTG-ATAAAACC-------A--------AA-----------------------T-------G-----A-A-------T---------G---TG-G----------------G--AAA----G-C-------T----TTGAT--GGAAACA----------AGC---T--AG---A--TACTGGTGATAA-ACC-TT--aatttgatgtctaggtatgaaaagtgttc
gi|29 : ga---C---AG---ACA----CATG-----AGG-ATA-C---ATA-C-------T------GGTG-AGAAA-CCGT-----A------T-AA-----------------------gatatcttttgcaaggtgtacatccggtcagatcgatgacttctagttctaaacacgtgaagatactgttcagtgatcttacaagtcctataaatgtggtgcctgttaacaag
gi|38 : aaactcaagatctgaaaaatgatttacaggaatgtataaacaaaaatggaggtgaaaaacaaaaatatgaatgcgatgtttgttttaaggtattaactcgggcttacttgag---ATA----CATAT--T-AGA-AGA-C---ATG-C-------T------GGTG-ATAAA-CCTT-----T------T-AAATG--------------------T-------G-----ATA-------TATGTGGA--A---AG-G------CATTTGTCTTG--AAAGTAGA-A-------T----T--A---AAAG-CACATTTTG-T-GAC---T---C---A--CACTGGTGAAAA-ACC-AT--TT-atgtgatgtttgtgggaagacattcagtcagacaggatatttgaaggtacacatgattnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaaacaaaaatggaggtgaaaaacaaaaatatgaatgcgatgtttgttttaaggtattaactcggg
gi|13 : gagaatatctgcgtA----CATAC--ACATG-ATA-C---ATA-G-------T------GGAG-AAAAA-CTTT-----ACTTATGT-GA-----------------------T---------------A-------TTTGTGGG--A---AG-A------CATTGTCTC-G--CAA----A-A-------CAAA-T--GCGAAAAGACACA---TG-A-GGA---A--AC---A--TACTGGTGATAA-ACC---------------TTATAAATGT------G--T-T-GTCTCTGGAAAGG-CATTCA---GTGAGAAAGGAcaatgtggtgtctgtgggaaggtatatggtctaaaagttgtgttaaaga
gi|36 : aaggcatttaactcttcattgacattaAT--A-AGG-ACA-C---ATA-T-------T------GATG-ATAAA-CCTT-----G------T-TATT---------------------T-------C-----T-G-------T---------G---GG-A-------A--------G---GC----A-A-------T----C--------AGACGC----TA-G-ACT---TACAC---A--TAACAGTGATAG-ACC-CT--atcttacagaaacacaagaggatacatactgatgctaagtcacggaaggcaaccaaccagaatgatagagtacagtgacacatgattatatatattgataatgaatgtgatgttttcggaaaggtattcaatcagacaacacacttatagaatcacattaaggcacgtttggtacacctgaaatacctgtgggacaggaaacttacagaaacacatgaggacatagaatggtgaccaaaacgtgtgttcctgcatagccaaactgacctagtattgtttctgcataactccttatcctatatattttgacaagctcagaaaa
gi|61 : cAT--G-AGG-ACA-C---ATA-C-------T------GGTG-AGAAA-CCAT-----A------T-AA-----------------------acaagtgtagtttgtagaaagccattaggtcggacagcacaccaattacaaagtcacacaaggacacataaactggataaatggagatatgtgagagaggaa
gi|38 : --------G--AGA----ATA-------TC---T--GC--GTATACATA---TT-A-GAA---G--AC---A--TGCTGGTGATAA-ACC-TT--TTAAA---TGTGATATATGT------Ga
gi|47 : -A-------T----T--AC--AGAGACACA---AGAG-GATACAT--ACATGA--TACTGGTGATAA-ACA-TT--gaaaggcatttgtcttgaaagtagaattaaaagcacattttgtgactcacactggtgaaaaaccatttcaatgtggtgtctgtgggaaggtatatggtctaaaagttgtgttaaaga
gi|29 : gagatggggtcAGACACA---TG-A-GGA---T--AC---A--TACTGGTGAGAA-ACC--------G-------TATAAATGT------GA---T-GTTTGTGGGAA-GACATTCA--attaaaaaaaatattgggcacttaaagacacgcaagatgatacctaccagtgaaaaa
gi|36 : aaactcaagatctgaaaaatgatttacaggaatgtataaacaaaaatggaggtgaaaaacaaaaatatgaatgcgatgtttgttttaaggtattaactcgggcttacttgagc--AC---A--TATTGATGATAA-ACC-TT--GT-TA---T-TTgtcagacaggatatttgaaggtacacatgattnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaaacaaaaatggaggtgaaaaacaaaaatatgaatgcgatgtttgttttaaggtattaactcggg
gi|57 : cataaggac---AAAGGACACATCGCATGTTTCTAAAC---TTTTT----GAATTTTG---------CA--GCAAAATTACTCCTTT----GTATGCCT-----AAActgtgggaaggcaatcagacgctagacttacacataacagtgatagaccctacaagtgtagtttgtagaaagccattaggtcggacagcacaccaattacaaagtcacacaaggacacataaactggataaatggagatatgtgagagaggaa
gi|9 : AAGGACATATCCCATGTTTCTAAAC---TTTAT----TAATTTTTATGCAAAATTA--C-------------TTCTCTGTATGCTT-----AAAAT--GA--CT----A--C-AGA------TAT----------AT--TT---------TAAATACATTAAT--T------CG---------CT------TAG---T--TTTC--A----AGTTTTG--AAA-G-C-AATGAAATTC-AAAATC---TG----GCA-ATATGCATAT---T---TT------T-CTC--GGTATTCTGC--GCGC--CATGGT-GTGT-----GACG-T-CATATAC---G---CCT---TT--G-GAATG----T---A-A--ACAA---C---TCTCAGGC-TA--ATAA-AT--A--GATT--CGA-----TTAATAG-AC--A-AGAA----A-----G--GCAATTAT-ACGTT-------AA-CAGATTG-C--AA--ATG-CATT-ACGTTACGA-GTG
gi|6 : AAGGACATATTGCATGTTTCTAAA----TTGTTAGATTTTTTTTT---------TA--ACAAAATTAGGTCTTT----GCATGACT-----AGAAT--GA--CTTT--A--G-ATG------TGTTTTAAATGAAAT--AT---------T-----------T--T------AA---------TTACGTAGT-----T--CTTG--A------GTTTG--AAA-GGT-A-CAAATCTC-AGTCTT---------GCG-ATATGCATAT---TAATTT------TACTTATGATATTTTAT--GTAC--GATGAA-GTGTCGTCTGACA-T-CATAT-----GTGACCTAGAGT--AAGG-------TCTGA-A--A--ACAGC---TGTTAGCCATTCTATAA-ATTTATTGATT--AGAT----TTAATTG-AC--A-A-AAT---A-----G--CCCATAGCTATG-T-------A------TTG-T--AG--ATAACTTT-GCATG-GGG-GTGCttatgtatctgctacgggtgtgtactagctgtaagaatagggtggcagtctgatttttttcaactttttcgaaggaaggtgcgaggaaattttgcctgtcgacacaaggaccttaccataaacaaaaacagtcgcctttgtcctcgtactgtctaaaaaaataattaaaataaaggaaaacataaacagttggacagcaacccagttaattgcgagagaggtgtttatatagaagcttaacacgactaggcgtacagcgtttattgcatggtgtccaggccattttcaagagaatactcgcccgcagtccaactgacctacataatgcataacaacaaataatgaagttcgtgttcctatttctaccaaatcgcacatttacaaaataatgataatataataatta
gi|25 : -TTTTCAAAC---TT-TT----TTATTTGT---------CAT-GCAAAATCACTTCTTT----GTATGCCT-----AAAAT--GA--CTAC--A--A-ATGTATTT-TGA----------ATAAATTA-------T-----------T--T------TG---------CT------TAG---T--TTT---C----AAGTTTG--AAA-G-CAA-TGAAATTC-AA---A---TCT--TGCA-ATATGCATAT---T---TT------T-CTC--GGTATTCTGC--GCGC--CATGGT-GTGT-----GACG-T-CATACAC---G---CC---------CGAATGAATGT---A-AACA--A---G---TCTCAGACATATTATAA-AT--A--AATA--CGAT----TTAATGG-ACA-A-A-AA----A-----G--GCAATAATCACGTT-------AA-CAGAATG-C--AG--ATAACATT-ACGTT-TGGTGTGtgtgcaccatttatgggtgcacatatactaagtgtcaaaagaagtgatgtatagactgaggtttttcaaatttttctaaagaaggtgtgaggaaaaagaagtgggtgatttttttgtcagcacattaaggacttggtcataacccctcccctctacagtcacctttgtccatgttctttttcaaaaaactattggacagagacccatttaactgtgaggaaatagttatgtagaagccaggcacagctaggcctacagtatatggattctgttctggtcgtcatcatttcacaaatactcactcgcaccttggaaataaaaacggacattgtaacagtatatacttgtgttcccagttcctgtaaacttgtagaattataaaaaaaaaaataaattaaagattgaaaataattgaactt
gi|4 : atgTTTCAAAC---TT-TT----TTATTTGT---------CACTGCAAAAATCATTCTTT----GTATGCTA-----AAAAT--GA--CTTACGA--A-ATGTATTT-TGA----------ATAAATTA-------T-----------T--T------TG---------CT------TAG---T--TTT---C----AAGTTTG--AAA-GAT-A-TGAAATTC-AA-------ATT--TGCA-AT-TAGCCATTTCT---TC------T-CTC--GGTATTGTCTGCGCGC--CATGGTGGTGT-----GACG-T-CATAT-C---ACGCCCTAG-TT----AA-------T---GTA--C--A---C---TTCTAGCCATATAAT----------AATT---GAT----TT-ATGG-AC--A-G-AAACAGA-----G--ACACTTATCA-GTT-------AATCAGCTTG-CAAAG--ATAACATT-ACGTT-CG
gi|23 : AAAC---TTGCT----TTGTGTGC---------TA--C-------------TTCTTTGTGTGCCTCCCCTAAAAT--GA--CT----ATAA-ATG-------GT----------AT--TTGAATTATTAT-----------T--T------TG---------CT------TAG---T--TTTC--A----A-GTTTG--AAAAG-C-AATTAAATTC-AAATCC---TTCAATATG----CAGAT-T---T---TT------T-C----GGTATTTGCT--GT-C--CATGAT-GAGT------ACG-T-CATATGCC--GT--CCT---TC--GCGA-------G---A-A--A--A---CAATTGTTAGCCA-ATCATGA-AC--A--AGAT--CGAT----T-AATGG-AA--A-A-AA----A-----GGGCAAAATATCAC-ATTACCGTAAA-CAGCTTG-C--AGTTATAACATT-ACGTT-CGG-ccctcttgtgttgtcattagcggatgtactacttgtcagaatagggtggtcctgagtagtcaactttttcgcaggaaggacgaggaaactttttgtgtcgactcaaggactttacgcataaataaaacaagtccgtttggtctttgtctgttaaaaaaaaataaaggaaaaagacagttggacagcaccccagattaatgcgcgaggaaaggttgtttttatatagaagctagacacagattaggtctacaagcgttttatatgtcagcctttcacgaaatacacgctcgcctcaactgacctacatcaatagcataattgttacaacaaatacttcaagttcctgttcccatttcctaccaaatgaaatgataataatacaatagttaaagattgaactgtataaaaatacaaaaagaaatatgtaagtccttcagtaagccatttgtataaatatatattttcgtcgacgcgcttttaaccatgacatgagatgtggtattgctgacaatgctctctctccggcattatttgc
gi|8 : catcgtttaaacttttatttttaaagaaaAC---TTCTT----TTATGCCT---------AG--A-------------AT----GTATACAT-----GGATTTTGA---T----A--A-ATA------T---------------------------------------T--T------TG---------TT------TGG---T--TTTA--A----AAGTTTG--AAA-G-C-A-TGACATTT-AAATCT---T------CG-AT---ATTGC---T---TTTTCTCCT-CTC--GGAATTTTGC--GCGC--CATGAT-CTTT-----GACATT-CATATGTC--GT--CCT---TT--tgttgaacattgtgtcattcggtgtgatagctgtcagag
gi|31 : gtt----TTACTTCT---------T------------------T----GTATGCCT-----ATACT--GAGTTT----A--A-ATA------TGTTTTGAATAAAAT--GT---------T-----------T--T------GC---------TTAG----T-----T--TTT--------AAGTCTG--AAA-G-CAA-TGAAATTCGAA-------TCT--TGTG-AT-ATCATAT---T---TG------T-CTC--GGTATAGTAT--ACGTTCCGTGAT-GTGT-----GTCG-T-C--ATAT---GCGATCT---TT--GCAA-------G---A-AACA--A---CT--TGTTAGCCATTTTATAA-AC--A--AACT--TCATTTAATTAATCG-AC--A-A-AAC---A-----G--GCAATTATCACGTT-------AA-CAGCTtacaacaccaaaaaaaaaaaaaacaaaaaaaaaaacaaactgttagccatatcatttcaaaatttccgatttaatggcacatacaagtcaatcatcacgttaacagtttgttagataacactaacgttcaggggtcggttacggatgtaatagctgtcaaataaggactgtaccgtgaacattgtcaacttttacgaaggaaggtgcgaggaaaaagacgagtattttgtcacacaggaccaataccataaaatcaaaacagtcgtttttgctccatgtactgttaaaaaagaaatgatattattagaaataaaggaaaaccaaacacaggtaggcagcgaccaggtttaacttgcgaggtgtttattttagaagcggatattcgcaactacatgcttacagtgttacattgccaagatatgacacaaaattacacacccgtacacactccctaagaatatgtactcagactcgcattctcattcctaccaaatcgcaaatacacaaatatatgaattaaagatttgaattgaagttgtatttacaataataaatatgtaa
gi|26 : acatttcgtgtttgtttaaagcaaaaCT-----AAAAT--GA--CT----A--ACAGA------TGT----------AT---T---------C-----------T--TAAATTATG---------CT------TAG---T--TTTC--A----A-GTTTG--AAA-G-C-AATGAAAATC-AAATCT---G-----GCA-ATATGCATAT---T---TT------T-CTC--GGTATTTTGC--GCGC--CATGGT-GTGT-----GACG-T-CATATAC---G---CCT---TT--G-GAATG----T---A-AACA--A---C---TCTCAGGCCTATTATAA-AT--A--GATT--CGAT----TTAATAG-ACA-A-A-AA----A-----G--GCAATTATTAT--T-------AA-CAGATTC-C--AA--ATAGCATT-ACGTT-CGA-GTG
gi|3 : agttatccatgtttctatactttaagtaatttttatgcaaatatacttctctggtaaTT--GA--AT----A--A-AT---------T----------AT--GT---------T-----------TGCT------TA---------TT------T-----T--C----------AAGTTTG--AA--G-C-AATGAAATTC-AAATCT---T-----GCA-ATATGCATAT---T---TT------T-CTC--GGTATT--CT--GCGC--CATGGT-GTGT-----GACG-TTCATACGCCCAATGAA------T--GTAA-----------A-C--A--A---C---TCTCAGGCATACTATAA-AT--A--GATA--CGAT----TTAATGG-AC--A-A-AA----AA----G--GCAATTATCACGTT-------AA-CAGTTTG-C--AG--ATAACATT-ACGTT-CGG-GTGt
gi|14 : ctcctaatgttttataactttttatttgtcatgccaaaatcacttctttgattgcctaaaatgatacaaatgtattT--GA--TT----A--A-AGGACACATTGC----------AT--GT---------T-----------T--T------C------------------TAAACAT--TTTA--A----A---TTGCTAAA-G-C-A---AAATT--AATTAT---TTG--CGTGCATATGCATAT---T---TTC-----T-CTC--TGTATTTAAC--GC-C--CATTAT-GTGT-----GACG-T-C--ATAT---GCGACCT---TCGAGCGA-------G---G----------------GTTTG--ATTTTTTTC-A---ACGGATT--AAAT----TTAATCG-ACTTA-A-AA----ATAAATG--T-AATCATCAC---------------GCTCG-T--AG--ACAACATT-ACGTT-CGG-ATGttgtgtgtcggttacgggtgtactagatgtcagaattagggtagtagcctaagtttttttttcaactttttcgaaggaaggttcgaggaaattttgtgtcgactcaaggactttaccataaataaaacagtcgattttctctttgtactgctaaaaaaataaaggaaaacataaacagttcgacagcaaccccgattaattgcgcgagaaggtgtttatatagacgctattgacacggattaagtctacaacgtttatttatgtacaggccatttcacgaaatacacgctcgcactcaaactgacctacataatagcacaacaacaaatactcctgaaggttcgtgttcccatttcctaccaaatcgcacatttaaaaaaaaaaaataacattacaataattaaagatcgaacttgtgtaaaaattacaaataagaaaatatgtagttcctcagtaaacatttataattttttcgtggacgcgcttttaaccatgacatgagatgtgtattgctgacaatgctctccggcattaccttgc
gi|10 : aaGTATTTTAT--GCGT--CATGAT-G-GT-----GACA-T-CATGTGT---GT--CCT---TT--GCGA-------T---A-A--A--A---T---GGTTAGCCATATTATAG-G---A--AATT--CGAT----TTATTGG-AC--A-A-AAG---A-----G--ACAATTATCACGTT-------AA-CAGCTCG-C--AG--ATAACATT-ACGTT-CGG-ATGttatagtatcgacacaacgggcgcattagctgtcagaagctttgtgtttgttttagttttttcgaaagaaggtgcgaaggaaaagaccagtaatttttagttggcacagggtctttgtcgtaaaaaatccacacaaatcagtcacgtttgattatgtacctttttagaaaaagaagaaaaaaaaaggggggggggcaaaacggttgcaaagcgactcagtttaactacgagaaattggtcatatg
gi|8 : tca-A--A--A---C---TGTTAGCCATATCATTTCA---A--AATTTCCGAT----TTAATGGCAC--ATA-CA----A-----G--TCAATCATCACGTT-------AA-CAGTTTGTT--AG--ATAACACTAACGTT-CAG-tactagctgccagaataagggtggtagcctaaattttttcagcttttcgaaggaaggtgcgaagaaatgtttgtcgatacaaggaataaataaataaaactgtcgcttttgtccatgtgctgtaaaaacaatacatgtaataaataaaggaaaacaaaaacagttggacaacaacccagcctaattgctagaaggtgtatatataaaagctaaacacggctagactcatagcgtaaattgtgtccaggccatttcatgaaatacacatctgcaccaattgacctacatataacataataggatttaatacttcaaagttaaatcggtttatcaaagcaaaatatcaattattctccgaaaacgtaccagcgtactttccgggtgctaactaactttatagtggggacacttgcttacgtcacgtcacgtcacgcccaccgtgcaagcatccccagcagtgagcgcatagaaattcaaagaggtatgaggtgttgaattctt
gi|40 : gttacttcttttatgcctagaatgtatacatggattttgataaatattttgtttggttttaaaagtttgaaagcatgacatttaaatcttcgatattgctttttctcctctcggaattttgcgcgccatgatctttgacattcatatgtcgtccttttacaacaccaaaaaaaaaaaaaacaaaaaaaaaaacATCACATT-------AA-CAGCTTG-C--AG--ATAACATT-ACTTT-TGG-GTGggtcggttacggatgtaatagctgtcaaataaggactgtaccgtgaacattgtcaacttttacgaaggaaggtgcgaggaaaaagacgagtattttgtcacacaggaccaataccataaaatcaaaacagtcgtttttgctccatgtactgttaaaaaagaaatgatattattagaaataaaggaaaaccaaacacaggtaggcagcgaccaggtttaacttgcgaggtgtttattttagaagcggatattcgcaactacatgcttacagtgttacattgccaagatatgacacaaaattacacacccgtacacactccctaagaatatgtactcagactcgcattctcattcctaccaaatcgcaaatacacaaatatatgaattaaagatttgaattgaagttgtatttacaataataaatatgtaa
23 sequences could not be aligned to this particular reference sequence:
Unaligned ( gi|12 ): AACCAGGATCATATTCCCATGTTTCTAAACTTTACATAATTTTATTCAAACATTACTTCTCTGATATACCTAAAAATTTGACTACAGACTGTTATTTAAATAAATAATTTGTCGCTCTAGGTTTTTCAAGTTGAAACGCAATGAAATCAAATCTGCAATATCATATGATTTTTCTCAGCGCAACGGTATTTTTGCGCGCCATGGGTGTGTTTTTGTTATTTGTGACGTCAAGTATACGCCTTTGGAATGTAAACAACTCTCAAGGCCTTTATCAAATGATCAGATCGTTAATAGACTAAAAAAGGCAAATTTATTATTAATCAGATTCCAACTATAGCACTTATCGATTCGAGTGTTATGTTAATTGCTACGGGTTGTAATTAATGCTGTAACGGAATTAAGGGTTGGCTAGTCCTGATTATTTTGTCAACTTTTTCGAAGGAATGTCTGCGAGGAATTAGTCGACACAAGACTTAACCTATAAACATAACAGTCGCCCTTTAGTCCAGTCGTACTTGTTTTAAAAAAATAATAAAATTAAGGAAAACATAAACTTAGTGATGGGAACAGTGCAACCCGTAGTCTGATAATTGCGATGGGAGGGGTTGTTTATATAGA
Unaligned ( gi|17 ): ATTATTAAGTTTTATAATCATTTTTATTACTTATGTTGCGTAGCCCAATTAGAAACAGATTAAATTCATCAGGAACAGGTCAAGGTATAAATTGTTCATCAGAGATATGTTCACCAACACTGACACACTAGAATTTAGATTGAATGAAACATCCCATTGCACGAATAGCCCTCCTCAGATGACTTTCTTTCATCTACAACCAATAGCTGCCTGTGAAACAAGTATGTATATCTACCCAACCAATGGCTGTCTCTGAAACAAGTATGTCTTCTACACAATCAAGACTAGCACAAACGGAAAATATAACGGACTTTGTTGAAACTGTTGAAGCAGTCTGTGAAACAAGTAAAAACTCAAGATCTGAAAAATGATTTACAGGAGTGTATAAACAAAAATGGAGGTGAAAAACAAAATATCAATGTGATGTTTTTAAGGTAT
Unaligned ( gi|21 ): GCCAGAATAAGGGTGGTAGTCTAAGTTTTTTTCAGTTTTTTTTCCAAGGAAGGTACATACTGAAGGAAATGTTTTTTGACACCAAGGACTTTACCATAATTAAAACAGTCGCTTTTGTCCATGTGTTGTAAGAAAAAAAAATACACGTAATAAAATAATGAAACAACAACAGTTGGACAGCAACCCAGTCTAATAGCTAAAAAGTGTTTATATAGAAGTTAAACACGGCTAGGCCCACAGCGTAAATTGTGTCCAGGCCCAGGATCACCCGCTCAAACTGACCTACAAATAGCATAACAAATATTCAGGTTCGTGTATTAAAAATTTAATTGAATTATAAGATAATTATGCAAT
Unaligned ( gi|22 ): CCAGAATAAGGGTGGTAGTCTAAGTTTTTTCAGTTTTTTTTCCAAGGAAGGTACATACTGAAGGAAATGTTTGTTGACACAAGGACTTTACCATAATTAAAACAGTCGCTTTTGTCCATGTGTTGTAAGAAAAAAAAATACACGTAATAAAATAAATGAAAACAACAACAGTTGGACAGCAACCCAGTCTAATAGCTAAAAAGTGTTTATATAGAAGTTAAACACGGCTAGGCCCACAGCGTAAATTGTGTCCAGGCCCCAGGATCACCCGCTCCAACTGACCTACAAATAGCATAACAAATATTCAGGTTCGTGTATTAAAAATTTAATTGAATTATAAGATAATTATGCAAT
Unaligned ( gi|24 ): GTGTACTAATGTCAATTAGCGTGGTGAGCCCTGAGTTTTTGTCCAAGAAGGAAGGTTCGGAGAATTTGTTAGTCTGTCGCTTCAAGGACTTAACCATAAAAAAACATCGCGTTTTGTCTCTTTGTAACTGTTAAAAAAAAAAGGGGAGAAACATAAACAAGTGGACAGCGTAACCCCGATTATTGCGCGAGAAGTTTTAAAGTATAGAAAGCTATAAGACACGGCAGTTAGGTCTACAACGTTTATTTATGTCAGCCATTTCACGAATACACGCCCGCACTCAACTAGACCTACATAT
Unaligned ( gi|28 ): TATGTTCGGGTGGTGTGTGTCGGTTACGGGTGTACTAGCTGAGTTTTTCAACTTTTACGAAGGAAGGTGCGAGGAAATTTTTGTCGACACAAGGTCATTATTATAAATAAAACAGTCGCCTTTGTCCTTGTACTGTTAAAATATCAAAATAAAATAAAGGAAAACATAAACAGTTGGACAGCAACCCAGTTTAACTTTATATAGAAGCTAAACACAGCTAGGCCCACAGCGTATAGTGTCCAGGCCATTTCACGAAATACACAACAGTACCAACTGACGTACATAACATATAT
Unaligned ( gi|35 ): AATTTAGCTAATCGAAGTTACATCGGTTTATCGAAGCTACACATCAACATATTTCACTAAAACGTGTCATAATGGTAATTTCTGGCTGCTAGCCATTCCCTTTCGGGTATTAGTAAGGTCATTATGTCACGACTACCGTGCAAAATTCCCCAGGAGTTGGCGCACAGAAATTCAAGAGGTAAGGCGGAGT
Unaligned ( gi|37 ): ACAACAACAAATATCTCCTGACAGCTTCTGTGTTTCCATTTTCTCTAAGCCAAATCGCGCATCATTTATAAAAAAATTAATGAATACAATAATTAAAGATATCGAACTTCTTAATAAAAAATTACAAAAATGAAGAAATATGTAGATTTATATAATCTTTTATACTGTGGAACGACAGCGCTTCTTTA
Unaligned ( gi|41 ): CATTGATTGTTTCTAAACGTTATAATTTTTAAAGCAAAACTACTTCTCAGTATGCCTAAAATGGCTTAAAATGTATTTTAAATAACATATTTTACTTAGTTTTCAGATTTCAAATCAATGAAATTCAAACCTTACATTATACATTTTTTTTCTTGATATA
Unaligned ( gi|42 ): AGGACATCTAGGCCTACAACATATGCATTAATATTCTGTTCTGGTCGTCGTCATTTCCCAAGATACATGTATATACTCGCACTTAGGAATTTAAACTAACTCCGTACCACTAACTAACAATTTATCTTGTGTTCCCACTTCCTACCAACAT
Unaligned ( gi|43 ): AAAGGACACATAGCATAGATACTTAAATTAAACTTTTTTAATTTCTTAAGCACAACTCTTTGTGTGCCTAAAATGACACTTTAAATGTGTTTTTGAATAAAGTCTTTCAAAACTTTGAAAAGTGATGGAATTGAAACAATCTTGCAAATAT
Unaligned ( gi|44 ): GGGCACATCGCATGTTTCTAAACATTTTGATTTTTGAAGCAGAATTGCTTCTTTGCATGCCTAAAATAACTCTGAATTGATTTTGAATAAAATATTTTGCTTAGTTTTCTTGCGATGAAATTCAGATATTGCGATACGCATAATTTTC
Unaligned ( gi|45 ): GTTATAATTTGTCATCAGAGATGTGTTCACCAACGTTGACAACACTAGAATTTAGACTGGAATGAAACACCCCATTGAAAATAGCCCTCCTCAGATGACTATTCTTTTCATCTACCCAACCAAT
Unaligned ( gi|46 ): AAAGATTGAACTTGTATTTACAAATAATAAATATGTAATTCCTCAGTAAACATTTCATTGATTTCACGCGGTTTAACCATGTCATCAATATGAGATGTGTATTGCCGTGCTCTCCGACGGCTT
Unaligned ( gi|49 ): GCAACCCAGCCTAGTTGCGAGAAAATGTTTTTATAGAAGCTAAACACGGCTTGGCGCACAGCGTAAATTCTCCAGGTCATTTCACGAAATACACACCCGC
Unaligned ( gi|50 ): AAAATGTCTTCCAATGTCATTTCTGGCTGCCAGTTCCTTCCCTTTTTCTGGTATTAATGAGGTCATCAATTACGTCACGACCACCGTGCAAGACT
Unaligned ( gi|51 ): CTAAGTGAAATAAGTATCAAGTGAAGTATTTTGCTCAATTTTGAATTTGAAAGCAAGGAATTTCTAATTTTGTGATACGTATTAGCATCAGATAG
Unaligned ( gi|52 ): GTATCTAATGCTCTGTTACGTTCGACATCATATGCGTCCTTGAGTGAGAAGGTTTGAAAACATTAGTTTTATAAATGGATTAAATTTAATCAAC
Unaligned ( gi|53 ): CTTGCATGCCTAAATTAACTTTTAATGTGTTTTCTGTGAAATATTTTGCGAAATATTGAATTCACGAAATTCGAATCTTGTGATACGCATTAT
Unaligned ( gi|54 ): TGATCTTCCTCACTTCACGCAATACACACTCGCACTTTGGGAATAAAAGAACATGCACTTGTGCTCCCATTTTCTATCAACTATTAGA
Unaligned ( gi|58 ): TACAATATTAATGGGATTGAACTACTTCAAGGTTAAATCCATTTATCAAAGTAAA
Unaligned ( gi|59 ): GATGTGTATTGCCGTGCTCTCCGCCGGCTTCAGGC
Unaligned ( gi|60 ): AGAGTCATCTTATGTGACGTCACAAATTTTAGG
Alignments
lowQualScore : 1 222222222222222 11 1 7777777777777777777777777777777777777 55555555555555555555555555 111111111111 111111 1 333333333333333333333333333333333333333333333 11111111111111111 11111111111 11111111 333333333333333333333333 1111111 1111111111 11111111111111 11111 222222222222 1111111 5555555555555555555555555555555555555555555555 111111 22 22222 222222222222 7777777777777777777 999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999 222222222 333333333 11111111 11111111111111 5555555555555555555555555555555555555555 1111 11 1111111111
lowQualScore : 6 6 1 1 5 5 1 77 1 6 77 66 5 111111111111111 33 5 2 0 1 1111111111111111111111111111111111111 4 4 5 4 6666 555 1 00000000000000000000000000 2 777777 2 777777 2 33 2 1 2 2 55555 4444 6666 777777777777 3 4444 999999 4444 6666 666 0 4 4444 333 4 999999 22 3333 2 2 3 4444 2 6 2 2 22 2 55555 2 2 444444444444444444444444444444444444444444444 555 44 88888888888888888 6666 2 2 55555 55555 33 1 7777777777 0 1 22 1 1 1 22 3 1 44 333 22 2 3 2 55555 2 11111111111 666 2 1 00000000 22 2 444444444444444444444444 5 333 22 2 7777 2 1 2 666666 33 2 99999999 555 0000000 6 3 6666666 3333333333 4 3 00000000000000 6 777 99 77 4 4 4 66 888 88 00000 4 1 333333333333 66 8 777 4444444 77 1111111111111111111111111111111111111111111111 77 7777 5 888 66 5 66 11 666666 1 888 6 6 3 7 33 1 55555 1 6666 555 2 555 111111111111 1 2 33 0000000000000000000 66 777 4444 2 55555 333 33 777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777 555 666666 8888888 2 2 22 999999 222222222 22 2 77 2 0 555555555 2 333 4 22 2 333 2 33 66 33 33333333 2 77 3 0 66666666666666 2 77777 2 2 33 1111111111111111111111111111111111111111 555 777 0 33 0 2 0 8888 999999 0 5 0000 2 33 2 2 8888888888 1 2 33 1 777777 5 0 2 33 77 2 2 2 2 2 3
lowQualScore : . . . . . . . .. . . .. .. . ............... .. . . . . ..................................... . . . . .... ... . .......................... . ...... . ...... . .. . . . . ..... .... .... ............ . .... ...... .... .... ... . . .... ... . ...... .. .... . . . .... . . . . .. . ..... . . ............................................. ... .. ................. .... . . ..... ..... .. . .......... . . .. . . . .. . . .. ... .. . . . ..... . ........... ... . . ........ .. . ........................ . ... .. . .... . . . ...... .. . ........ ... ....... . . ....... .......... . . .............. . ... .. .. . . . .. ... .. ..... . . ............ .. . ... ....... .. .............................................. .. .... . ... .. . .. .. ...... . ... . . . . .. . ..... . .... ... . ... ............ . . .. ................... .. ... .... . ..... ... .. .............................................................................. ... ...... ....... . . .. ...... ......... .. . .. . . ......... . ... . .. . ... . .. .. .. ........ . .. . . .............. . ..... . . .. ........................................ ... ... . .. . . . .... ...... . . .... . .. . . .......... . . .. . ...... . . . .. .. . . . . . .
lowQualScore : 0 0 0 0 0 0 0 99 7 5 55 00 0 111111111111111 66 7 2 0 4 3333333333333333333333333333333333333 4 4 5 0 5555 444 6 88888888888888888888888888 5 222222 5 222222 5 44 5 6 5 5 55555 9999 2222 222222222222 3 3333 888888 5555 6666 111 4 4 5555 777 2 444444 88 6666 0 0 5 2222 0 0 0 1 99 1 33333 1 1 999999999999999999999999999999999999999999999 555 88 44444444444444444 6666 1 1 33333 66666 66 9 5555555555 4 9 66 9 9 9 66 8 9 55 333 88 1 8 0 00000 1 77777777777 666 1 0 22222222 99 1 444444444444444444444444 6 555 55 2 8888 4 2 4 888888 22 7 88888888 000 6666666 5 1 4444444 2222222222 5 6 22222222222222 2 888 77 66 4 4 4 11 888 00 99999 4 9 000000000000 11 0 888 4444444 99 5555555555555555555555555555555555555555555555 99 0000 0 888 99 0 99 33 444444 6 777 7 7 3 3 22 0 00000 0 1111 000 9 000 000000000000 2 7 77 0000000000000000000 11 888 7777 2 66666 999 11 222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 888 111111 9999999 1 1 99 444444 777777777 22 1 11 1 4 444444444 1 777 2 66 2 999 5 44 33 77 33333333 7 33 8 1 88888888888888 9 11111 9 9 99 4444444444444444444444444444444444444444 000 999 7 99 7 9 1 9999 222222 8 7 0000 9 66 9 9 5555555555 0 9 99 1 777777 3 5 9 99 99 9 9 9 9 9 1
consensus : GAAAGGGCATTTTATCTGAAAAGCGGATACAGAGAAA--CACATGAGGACACATA-CTGGTGAN-AAA-CCT---T---A-T-A--ATGT--G-ATGTCT-GTGGGAAGGCATTCANT-CG--C-ANGN-NNATC-TTA--AAGAGACACATG-AA-GATACAT-ACT----GGT---GATAAACC-----T-A-AA---AT----A----TA-AATGT------G-A------T-G--TC-TGTGG-GAA-GG----CATTC---AGTCG--GANAGGA---T-ACTTA---AAG----ANACACA----TGA----G---GATA-CA----TAC---T-GGTGA----ATAAA--CCTTA---TAA-AAT----GT-G-ATGTCT-GTG-G--GAAG-GCA-----TTCAGT-C-AGA---C---A--GGNA--AC-TT----A--A-A-G-A-CA-----A-CA---T--GA---------------N-GACA----C-AT-AC-----TG-G---TGAN-AAA-C---C---T--TATA-A--A-T-G-T--GA-TGTCT-GTGGGAA--G---G--CATTC-AGT-C-----G-G---GC-ANACGAC---T-TACA---G----AGA--CAC-A--NA------GGAGA-CACAC---ATACTG--GTGAT-AAA-CC---TTAT-AAAT-GTGA------TG--TCTGTGG-GAAGG------CATTC---AG-CGATACGGGANCA-TTACANAG-ACACATG-AGG-A--ANA-TACTG-G-TGA-TAA-AACCTTNA---TA-AATG-T-G-ATGTCT-GTGGG--AAG-ACAT-TCA--G--TGA-GACG-G-G--A--C--TTACAGACACACAT--GAGGATAC---ATAC-------TGGTGATAAACC--TTATA------A---------T-CAA---TAAGA-----C----A------G--GGAA-A--T-TACA---GAGACA--CA-TGA--GGATACATACT------GGTGATAAACCTT-T-T-GAT-TTATATATGTGATTTGTAT-----TGGTAAGCGTTCATGTAAAGGACACGTCGCATG----TTT---CTA-AAC---TTN------T----TTTATTT-TTT--A--GC-AAA----ATT--TTCT--T---T----G-TATGCCT-----AAAA---TGA--C----T----A--A-A---TG------TG-T----------AT-----------G--T---------T-----------T---T------TG-------C-T-T--A---G--TTTT---N-----AA-GTTT-G--AAA-GCAATGAAATTCAAA-TCT---TTTTGC-G---A-TAT-GCA-T---AT-T--TT--T--CT--------CGGTA-T--TTTGCGCGCCATG--------------AT-GTG-----TGACG-T-CA--TATA-C---GTGACCT---TT--GCGA-------T---A-A--AA---C---TGTTA--GCCA-TATTAT----AAA--TA--AATTC-GAT----TTAATGG-AC--A-A-AA----A-----GGC-AA--TTATCACGTT------AA-CAGCTCG-C--AG--ATAACA-TT-A-CG-TT-CGG-GTGC
Reference ( family-1142 ) : GGAAAGGCATTTNATTTGAAAANCGGATACAGAGANA--CACATGAGGACACATA-CTGGTGAN-AAA-CCT---T---A-T-A--ATGT--G-ATGTCT-GTGGGAAGGCATTCCGT-CG--C-ANGN-ANATC-TTA--AAGAGACAC-TG-AA-GACACAT-ACT----GGT---GATAAACC-----T-ATAA---AT----A----TA-AATGT------G-A------T-G--TC-TGTGG-GAA-GG----CATTC---AGTNA--GANAGGA---T-ACNTA---AAG----ACACACA----TGA----G---GATA-CA----TAC---T-GGTGA----ATAAA--CCTTA---TAA-AAT----GT-G-ATGTCT-GTG-G--GAAG-GCA-----TTCAGT-C-AGA---C---A--NGNA--AC-NT----A--A-A-G-A-CA-----A-CA---T--GA---------------N-GACA----C-AT-AC-----TG-G---TGAN-AAA-C---C---T--TATA-A--A-T-G-T--GA-TGTCT-GTGGGAA--G---G--CATTC-AGT-C-----G-G---GC-ANACGAC---T-TANA---G----AGA--CAC-A--NA------GGAGA-CATAC---ATANTG--GTGAT-AAA-CC---TTAT-AAAT-GTGA------TG--TCTGTGG-GAAGG------CATTC---AG-CGANACGGGATCA-TTACNNAG-NCACATG-AGG-A--ANA-TACTG-G-TGA-TAA-AACCTTAA---TA-AATG-T-G-ATGTCT-GTGGG--AAG-GCAT-TCA--G--TGA-GACG-G-G--A--C--TTACAGACACACAT--GAGGACAC---ATAC-------TGGTGATAAACC--TTATA------A---------T-CAA---TAAGA-----C----A------G--AGAA-A--T-TACA---GAGACA--CA-TGA--GANTACATACT------GGTGATAAACCTT-T-T-AAT-TNATATATGTGA-TTGTNT-----TGGNAAGCGTTCATGTAAAGGACACGTCGCATG----TTT---CTA-AAC---TTN------T----TTTATTT-TTT--A--GC-AAA----A------CT--T---T----G-TATGCCT-----AAAA---TGA--C----T----A--A-A---TG------TG-T----------AT-----------G--T---------T-----------T---T------TG-------C-T-T--A---G--TTTT---A-----AA-GTTT-G--AAA-GCAATGAAATTCAAA-TCT---TTTTGC-G---A-TAT-GCA-T---AT-T--TT--T--CT--------CGGTA-T--TTTNCGCGCCATG--------------AT-GTG-----TGACG-T-CA--TATA-C---GTGACCT---TT--GCGA-------T---A-A--AA---C---TGTTA--GCCA-TATTAT----AAA--TA--AATTC-GAT----TTAATGG-AC--A-A-AA----A-----GNC-AA--TTATCACGTT------AA-CAGCTTG-C--AG--ATAACA-TT-A-CG-TT-CGG-GTGC
gi|1 : GAAAGGGCATTTTATTTGAAAAGCGGATGCAGAGAAA--CACTTGAGGACGCATA-CTGGTGAG-AGA-CCT---T---A-T-A--ATGT--G-ACGTCT-GTGGGAAGACATTCCAT-TG--C-ATGT-ATATC-TTA--AAGAACCAC-TG-AA-GATACAT-ACT----GGT---GATAAACC-----TCATAA---ATTCTCA----TA-AATGT------G-A------C-G--TC-TGTGG-GAA-GG----CATTC---AGTGA--GAAAAGA---T-ACGTA---AAG----ACACATA----TGA----A---GATA-CA----TAC---T-GGTGA----ATAAA--CCTTA---TAA-AAT----GT-G-ACATCT-GTG-G--GAAA-GCA-----TTCAAT-C-AGA---C---A--TGTA--AC-GT----A--A-A-G-A-CA-----A-CA---T--GA---------------T-GACA----C-AT-AC-----TG-G---TGAT-AAA-C---C---T--TATA-A--A-T-G-T--GA-TGTCT-GTGGGAA--G---G--CATTC-AGT-C-----G-G---GC-ATACAAT---T-TAGA---G----AGA--CAC-A--AA------GGAGATCATGT---ATAGTA--GT-AT-AAA-CC---TTAT-AATT-GTGA------TG--CCTGCAA-AAATA------CTTTC---AG-CAATATGGGATCA-TTATTTCG-CCACATG-AAG-A--AAA-TACTG-G-TGG-TAA-AACCTTAA---TA-TATA-T-G-ATGTCC-ATGGG--AAA-ACAT-TTA--G--TGA-GACG-GCG--A--C--TCACAGACACATAT--AACGATAC---ATAC-------TGGTGATAAACC--TTATA------A---------T-CAA---TAAGA-----C----A------G--AGAA-A--T-TACA---GAGACA--CA-TGG--GATTACATACT------GGTGATAAACCTT-T-T-GAT-TTATATATGTGA-TTGTAT-----TGGTAAGCGTTCATGTAAAGGACACGTCGAAT-----TTT---TTA-AAC---TTG------T----TTTATTT-TTT--A--G--------------------T---T----G-TATGCCT-----AGAT---TGA--C----T----A--A-A---TG------TG-C----------AT-----------G--T---------T-----------T---T------TG-------T-T-T---------TTTTA--A-----AA-GTTT-G--AAA-GC-ATAAAATTCAAT-TTT---TTTTGT-G---A-T-T-AAA-T---AT-T--TT--T--CT--------TGGTA-T--TTTCTGCGTCATG--------------AT-GTG-----TGACG-T-CA--TATA-T---GTGACCT---TT--GCGA-------T---A-A--AA---C---TGTTA--GCCA-TATTAT----AGA---A--AATTC-GAT----TTAATGG-AC--A-A-AA----A-----GTC-AA--TTATCACGAT------AA-CAGCTCG-C--AG--ATGACA-TT-A-CG-TT-TGG-GTGC
gi|10 : T--------CAGTA-T--TTTATGCGTCATG--------------AT-G-G-----TGACA-T-CA--TGT------GTGTCCT---TT--GCGA-------T---A-A--AA---T---GGTTA--GCCA-TATTAT----AGG---A--AATTC-GAT----TTATTGG-AC--A-A-AAG---A-----GAC-AA--TTATCACGTT------AA-CAGCTCG-C--AG--ATAACA-TT-A-CG-TT-CGG-ATG
gi|11 : ----GGT---GAAAAAC--------AAAA---AT----A----TC-AATGT------G-A------T-G--T--TGTTT-TAA-GG----TATTA---TCTCG--G---GCT---T-ACTTA---AAC----AAACACA----AGC----G---GA-A-CA----TAC---G-GGTGA----G-AAA--CCATA----AA-AAT----GT-G-ATGT-T-GTGTG--GAAG-GCA-----TTCAGT-C-AGT---C---A--GGAT--AT-TT----G--A-A-GTG-C------A-CA---T--GA---------------T-GACA----CTAT-AC------G-G---TGAT-AAA-C---T---T--T-TA-A--ATT-G-T--GA-TGTCT-GTGGAAA--G---G--CATTT-A-T-T-----G-G---AA-AACCGAC---G-CAGA---G----AAA---AC-A--CA------TGAGtactagctgccagaataagggtggtagcctaaattttttcagcttttcgaaggaaggtgcgaagaaatgtttgtcgatacaaggaataaataaataaaactgtcgcttttgtccatgtgctgtaaaaacaatacatgtaataaataaaggaaaacaaaaacagttggacaacaacccagcctaattgctagaaggtgtatatataaaagctaaacacggctagactcatagcgtaaattgtgtccaggccatttcatgaaatacacatctgcaccaattgacctacatataacataataggatttaatacttcaaagttaaatcggtttatcaaagcaaaatatcaattattctccgaaaacgtaccagcgtactttccgggtgctaactaactttatagtggggacacttgcttacgtcacgtcacgtcacgcccaccgtgcaagcatccccagcagtgagcgcatagaaattcaaagaggtatgaggtgttgaattctt
gi|12 : ttattagttttataatcaatttttattacttatgtgtgcagatagcccattagaaacagattaaattcatcagaacaggtcaaggttataatttgtcatcagagatatgttcaccaacactgacaacacgaatttagattgaatgaaacatcccattgcgaatagccctcctcagatgactattcttttcatcaaccaaccaatagctgcctgtgaaacaagtatgtatatctacccaaccaatggctgtctctgaaacaagtatcttctacacaaatcaaagactagcacaaacggaaaatataacggactttgtgaaactgttgaagcagtctgtgaaacaagtaaaaactcaagatctgaaaaatgatttacaggagtgtataaacaaaaatggaTCCCATG----TTT---CTA-AAC---TTTACATAAT----TTTATT-----------C-AAACATTA------CT--TCTCT----GATATACCT-----AAAAATTTGA--C----T----A--C-AGACTG------T--T----------ATTTAAATAAATAA--T---------T-----------TG--T------CG-------C-TCT--A---GGTTTTT---C-----AA-GTT--G--AAACGCAATGAAA-TCAAA-TC-------TGC-A---A-TAT--CA-TATGAT-T--TT--T--CTCAGCGCAACGGTATT--TTTGCGCGCCATGGGTGTGTTTTTGTTAT-TTG-----TGACG-T-CAAGTATA-C---G---CCT---TT--G-GAATG----T---A-AACAA---C---TCTCAAGGCC--T-TTATC---AAA--TG--A--TCAGATCG--TTAATAG-ACTAA-A-AA----A-----GGC-AAATTTATTA--TT------AATCAGATTC-C--AACTATAGCACTT-ATCGATT-CGA-GTG
gi|13 : aaccaggatcatatATA--CACATGA---TACATA-GTGGAGAA-AAA-CTT---T---ACT-T--ATGT--G-ATATTT-GTGGGAAGACATTGTCT-CG--C-AAAACAAATG-CGA--AA-AGACACATG-AG-GAAACAT-ACT----GGT---GATAAACC-----T---------T----A----TA-AATGT------G-T------T-G--TC-TCTGG-AAA-GG----CATTC---AGTGA--GAAAGGA---A-TCTTA---CAG----AAACACA----AGA----G---GATA-CA----TAC---T-GATG------------C-------TAA--------GT-C-AC---------G--GAAG-GCA-----ACCAAC-C-AGA-------A--TG-------AT----A--G-A-GTA-CAGTGACA-CA---T--GA---------------T-TATA----T-AT-AT-----TG-A---TA-------------------ATG-A--A-T-G-T--GA-TGTTT-TCGGAAA--G---G--TATTC-AAT-C-----A-G---ACAACAC-AC---T-TATA---G----AAT--CAC-ATTAA------GG--------C---ACGTT----TGGT-ACA-CC------T-GAA-----A------TA--CCTGTGG-GA-------------C---AG--GAAAC--------TTACAGAA-ACACATG-AGG-AC-ATA-GAATG-G-TGACCAA-AACttatgttaattgctacgggttgtaattaatgctgtaacggaattaagggttggctagtcctgattattttgtcaactttttcgaaggaatgtctgcgaggaattagtcgacacaagacttaacctataaacataacagtcgccctttagtccagtcgtacttgttttaaaaaaataataaaattaaggaaaacataaacttagtgatgggaacagtgcaacccgtagtctgataattgcgatgggaggggttgtttatataga
gi|14 : aaggcatttaactcttcattgacattaacAA---TGA--T----T----A--A-A---GGACACATTG-C----------AT-----------G--T---------T-----------T---T---------------C-T-A--A---ACATTTT---A-----AA---TT-GCTAAA-GCAA---AATT--AA-T-T---ATTTGC-GTGCA-TAT-GCA-T---AT-T--TTC-T--CT--------CTGTA-T--TTAACGC-CCATT--------------AT-GTG-----TGACG-T-CA--TAT------GCGACCT---TCGAGCGA-------G---G--------------GTTT--G--ATTTTTTT----CAA--CG--GATTA-AAT----TTAATCG-ACTTA-A-AA----ATAAATGT--AA--TCATCAC--------------GCTCG-T--AG--ACAACA-TT-A-CG-TT-CGG-ATGgtgtgttcctgcatagccaaactgacctagtattgtttctgcataactccttatcctatatattttgacaagctcagaaaa
gi|15 : C-AGACAAT---T-TACA---G----AGA--CAC-A--AAA-----GGATA-CATGT---ATAGTA--GTAAT-AAA-TC---TTCT-AATTCGT-A------TG--CCTTCGA-GAATG------CATTC---AG-CCAGATGGGATCA-TTATTTCG-ACATA-------A--AGA-TAC-------A-TA-----CTTTA---TA-TATG-T-G-ATGTCC-GTGGG--AAA-ACAT-TTA--G--TGA-GACG-G-G--A--CACTTACAGACACATAC--AAGGATAC---ATAC-------TGGTGATAAACC--TGATA------A---------TTCAA---TAAGA-----C----A------G--GGAA-A--T-TACA---GAGACA--CA-TGA--GGATACATATT------GGTGAGAAACGTTGT-T-GAT-TTATATATGTGATTTGTAT-----GGGTAAGCGTTAATTTAAAAGACATGTAGCATG----TTT---TTA-AACATTTTT------T----TTTA-TT-TTT--A--G--------------------T---T----G-TATGCCT-----AGAA---TGA--C----TAC--A--A-A---TG------TA-A----------AT-----------G--TA--------T-----------T---T------TGAATAAATCAT-T--AT--G--CTTT---GGTGTTAA-GTTT-T--AAA-GCAATCAATTTCAAA-------TTTTAC-G---ATTAA-ATA-T---AT-T--Tttatagtatcgacacaacgggcgcattagctgtcagaagctttgtgtttgttttagttttttcgaaagaaggtgcgaaggaaaagaccagtaatttttagttggcacagggtctttgtcgtaaaaaatccacacaaatcagtcacgtttgattatgtacctttttagaaaaagaagaaaaaaaaaggggggggggcaaaacggttgcaaagcgactcagtttaactacgagaaattggtcatatg
gi|16 : -C-----A-G---GA-AAATGAT---T-TACA---C----GAA--TGT-A--CA------A---A-CACAA---ATGGAG--GTGAA-AAA-CAAAGTTAT-CAGT-GTCA------TC--TTTGTTG-GAAGG------CATTT---A
gi|16 : ttattagtattataattatttttattatttttcttgcagaaatcccattagaaacatattaggttaatcagaaacatgtcaatgttttaaattggcatcacagatgtgttcactatcactgacaacactagaatttagactgtaatgcaacatccaattggaaatagccctcctcgtatggctattcttttcacccaactaaccaatggctgactgtgaaacaagtatgtctatctacccaaccaatggctgcctgtgaaacaagaatgtcttctacacaatcaagggctagcacaaacggaaaatacaacggacttagtgagactgtagaggctgtctgtgaaacaagtaaaactaaagacG-G---TGAA-AAA-C---AAAGT--TATC-A--G-T-G-T--CA-TCTTT-GTTGGAA--G---G--CATTT-ACT-C-----ctc
gi|18 : ttattagtattataattatttttattatttttcttgcagaaatcccattagaaacatattaggttaatcagaaacatgtcaatgttttaaattggcatcacagatgtgttcactatcactgacaacactagaatttagactgtaatgcaacatccaattggaaatagccctcctcgtatggctattcttttcacccaactaaccaatggctgactgtgaaacaagtatgtctatctacccaaccaatggctgcctgtgaaacaagaatgtcttctacacaatcaagggctagcacaaacggaaaatacaacggacttagtgagactgtagaggctgtctgtgaaacaagtaaaactaaagaccaggaaaatgatttacacgaatgtacaaacacaaatgga----GGT---GAAAAAC--------A-AA---AT----A----TC-AATGT------G-A------T-G--TT-TTT----AA-GG----TATTA---TCTCG--GCT-------T-ACTTA---AAC----AAACACA----AGC----G---GATA-CA----TAC---G-GGTGA----GAAAA--CCATA---TAA-A-T----GT-GCATGTTT-GTG-G--GAAG-GCA-----TTCAGT-C-AGT---C---A---GGA--AT-TT----G--A-A-G-G-C------A-CA---T--G----------------T-GACA----C-AT-AC-----TG-G---TGAA-TAA-C---C---T--T-TA-A--A-T-G-T--GA-TGTCT-GTGGAAA--G---G---ATTG-TAT-T-----T-G---AA-AACCGAC---G-CAGA---G----AAA--CAC-A--T-------GAGGA-C---C---ATACTT--GTGAG-AGA-CC-----AT-AAA
gi|19 : agcacaaacggaaaatataacggactttgttgaaactgttgaagcagtctgtgaaacaagtaaaaactcaagatctgaaaaatgatttacaggagtgtataaacaaaaatgga-AATGT------G-T------T-G--TTGTGTGG-GTA-GG----C-TTC---AGCGA--GACAGGAAGAT--TTTA---CAG-----CACACA------A----GTTTGACAACA----TCT---T-GGTGA-----TAAA--CCT-A---TAA-A-T----GT-G-ATGTCT-GCG-G--GAGG---------TTCAGT-C-GTA---T------GGGA--AC-AT----T--A-A-G-G-GG-----A-CA---T--AA---------------G-AGTAT---C-AT--C-----TG-A---TGAT-AAAAC---C---A--TATA-A----T-G-T--AAATGTTT-GTGGGAA--AAAAG--CATTC-AAT-T-----G-G---AG-ACAGAACATTT-TAAA---A----AGA--CAC-A---A------GATGA-TAC-C---ATACTG--GTGTTTAAA-CCC--TTAT-AAAT-GTGA------TG--TGTGTGG-GAAGG------CATTC---CG-TGAGAAAGGA-CA-TTTTAAAA-AGACAAG-ATT-G--ATACTACTG-G-TG--T-A-AACCTTAA---TA-AAT--T-G-ATGTGT-GTGGGGAAAA-GCAT-TCa
gi|2 : ----A----TACAATGT------ATA------T-T--TT-TGTGG-GAATAA----CATAT---AGTTGT-GTAAAGG---T-GCGTT---ATGTG--ATACACA----CGT----GC--GAT--TA----TAC---T-G-TGG----AGA-----CTTC---TGA-CAT----GT-G-ATAGTT-ATG-T--GAAA-TCACTTGATTAAGTTC-AGA---C---A--GGAG--AT-TT----A--AGA-G-A-CA-------CA---G--GA---------------G-GATA----C-AT-A------TG-G---TGAAGAAA-T---C---T--TCCA-ATAA-T-G-TTGGA-TGTCTTGCGAAAA--G---G---ATTC-AGT-------G-C---GT-AAGGGATCA-T-TACA---ATCGAAGA--CAC-A--AACTTCAAGGTGA-TAAAC---ATA-----GAAAT-AA-------CTGT-AAGG-GTGAAATTTATGAGTCTGTCGTGAAGC------GATTTCTTAG-TGCGAAGGGATCA-T-ACAAA--ACATATG-AGG-A--TAA-TACTG-G-TAA-TAA---CCCTTA---TATAATG-TTGTATGTCTTGTGG---AAG-ACAT-TCACTGACTGA-GA-G-G-A--A--C--TTATTAACACACAT--GAGGA-A----ATAC-------TGGTGAAAAACC--TTTTA------AATGTGATTGT-CTG---TGAGAAGCTTC----AGTCATCG--AGGG-ACCT-TACAGAGGAGACA--CA-TGAAGGAAATCATACT------GGTGAGAGACCCT-TAT-AAT-TGA---ATGT
gi|2 : agccttagttcaagatatgtctttacgccactgtatttgattaagaaaacgtgatacagacttcAGAGA--CACAGGAGGATACATA--TGGTGAAGAAA-TCT---TCCAA-T-A--ATGTTGG-ATGTCTTGCGAAAAGG-ATTCAGTGCG--T-AAGG--GATCATTA--CA-----AT-CG-AA-GACACAA-ACTTCAAGGT---GATAAACA-----T-AGAA---AT----AACTGTA-AGGGT------G-AAATTTAT-GAGTC-TGTCGTGAA-GC----GATTTCTTAGTGC--GAAGGGA---T--CATA---CAA----A-ACATA----TGA----G---GATA--A----TAC---T-GGT-A----ATAAC--CCTTA---TAT-AAT----GTTGTATGTCTTGTG-G---AAG-ACA-----TTCACT----GA---CTGAG--AGGA--AC-TT----ATTA-A-C-A-CA-------CA---T--GA---------------G-GA-A------AT-AC-----TG-G---TGAA-AAA-C---C---T--TTTA-A--A-T-G-T--GATTGTCT-GTGAGAA------G--C-TTC-AGT-CATCGAG-G---G----AC--C---T-TACAGAGG----AGA--CAC-A--TG------AAGGA-AAT-C---ATACTG--GTGAG-AGACCC---TTAT-AATT-G-AA------TG--TCTGGGT-AAAAGATGTTTTATTG---A--CAATA-GAAACC---TATAGAGCACACATT-AGACAACACA-TAATGCGTTGA--AA-GACCATTA---TGTAATGTT-G-AT-TTT-GTGGG---AG-ACA--TCA--A--TTATTATA-C-A--A--CCGTAAAAAACTCACATTGAAGGATACCAAAT-C-------TAGTGAC-AGCC--TTATctgggtaaaagatgttttattgacaatagaaacctatagagcacacattagacaacacataatgcgttgaaagaccattatgtaatgttgattttgtgggagacatcaattattatacaaccgtaaaaaactcacattgaaggataccaaatctagtgacagccttatcagtgtgatgcttgttcgaaacattcagtcagtagagaagacttactgtgtcacaaagataagacatcaacagtgaatgtagtgtctgtggaaagtgtacaccgatgggtcgcagacttagaagcaccatgggacacatac
gi|2 : agccttagttcaagatatgtctttacgccactgtatttgattaagaaaacgtgatacagacttcatacaatgtatatttttgtgggaataacatatagttgtgtaaaggtgcgttatgtgatacacacgtgcgattatactgtggagacttctgacatgtgatagttatgtgaaatcacttgattaagttcagacaggagatttaATACA---AAA--CATATGAGGATA-ATA-CTGGTAAT-AAC-CCT---T---A-T-ATAATGTT-GTATGTCTTGTGG-AAGACATTCACT-GA--CTGAGA-GGAAC-TTATTAACACACA--TG-AG-GA-A-AT-ACT----GGT---GAAAAACC-----T-TT----------------TA-AATGT------G-A------TTG--TC-TGTGA-GAA-G-----C-TTC---AGTCATCGAG-GGA---C--CTTACAGAGG----AGACACA----TGAA---G---GAAATCA----TAC---T-GGTGA----GAGAC--CCTTA---T---AAT-----T-GAATGTCT-G-G-GTAAAAG-ATG-----TTTTAT-T--GA---C---AATAGAA--AC-CT----A--T-A-G-AGCAC----A-CA---TTAGA---------------C-AACA----C-AT-AA-----TGCGT--TGAA-AGA-C---CA--T--TATGTA--A-T-GTT--GA-T-TTT-GTGGG-A--G---A--CA-TC-AAT-T-------A---TT-ATACAAC---CGTAAA--------AAACTCAC-A--TT------GAAGG--ATACCAAAT-CTA--GTGAC--AG-CC---TTAT-CAGT-GTGA------TG--CTTGTTC-GAA-A------CATTC---AGTCAGTA-GAGAAGACTTACTGTG-TCACA-------A--A------------GA-TAA-GACATCAACAGTG-AATG-T-A-GTGTCT-GTGGA--AAGTGTACACCG--A--TGG-GTCGCA-G--A--C--TTAGAAGCAC-CAT--G-GGACAC---ATAC-------cagtgtgatgcttgttcgaaacattcagtcagtagagaagacttactgtgtcacaaagataagacatcaacagtgaatgtagtgtctgtggaaagtgtacaccgatgggtcgcagacttagaagcaccatgggacacatac
gi|20 : agccttagttcaagatatgtctttacgccactgtatttgattaagaaaacgtgatacagacttcatacaatgtatatttttgtgggaataacatatagttgtgtaaaggtgcgttatgtgatacacacgtgcgattatactgtggagacttctgacatgtgatagttatgtgaaatcacttgattaagttcagacaggagatttaagagacacaggaggatacatatggtgaagaaatcttccaataatgttggatgtcttgcgaaaaggattcagtgcgtaagggatcattacaatcgaagacacaaacttcaaggtgataaacatagaaataactgtaagggtgaaatttatgagtctgtcgtgaagcgatttcttagtgcgaagggatc-----G-G---GC-A----AC---T-TACA---G----AGA--CAC-A----------GTA----ACAC---ACACTG--GTGAC-AAA-TC---TTAC-CAAT-GTGA------TG--TTTGTTG-GAAGA------CATTC---AG-TTATTCAGGATCA-TTGCAAAA-GCAC----AGA-A--AGA-CAC-------A-TAATAATCCTAA---TG-AATT-T-G-AAATTT-GTCGG--AA---CA------------------------------TTACAGACACACAT--GAGAATAC---ACAC-------TGGTAATAAACCAGATATATGAGATA---------T-TAATGTTAACG-----CATTAA------GCCAGAC-A--T-AACA---GAGACATTCAGTGA--GA
gi|20 : ttatttcgaaTACAGAGACA--CA-GTAA---CACACA-CTGGTGAC-AAA-TCT---T---A-CCA--ATGT--G-ATGTTT-GTTGGAAGACATTCAGT-TATTC-AGGA-TCATT-GCA--AA-AG-CAC-AGAAA-GACACAT-A-------------ATAATCC-----T-A------------A----TG-AATTT------G-A------A-A--TT-TGTCG-GAA-------CAT----------------------T-AC-------AG----ACACACA----TGA----G---AATA-CA----CAC---T-GGT-A----ATAAA--CCAGA---T-A-TAT----GA-G-ATATTA-ATG-T--TAAC-GCA-----TTAAGC-C-AGA---C---A----TA--AC-------A--G-A-G-A-CAT----T-CAG--T--GA-----------------GACGGGATC-AT--------TA------GAA-AAA-C------------------A-T-A-T--GA-AGAC----GCAAAT-G---G--CATTCGACT-C-----G-A---A--AGTCCAC---T-TACA---A----ATA--CAC-A--C--------GATA--ACAC---TCACTG--GTGAT-AAT-AT---TTA--AAAG-GTGA------TA--TATGTGcgggatcattagaaaaacatatgaagacgcaaatggcattcgactcgaaagtccacttacaaatacacacgataacactcactggtgataatatttaaaaggtgatatatgtg
gi|23 : ttatttcgaagggcaact------CT--T---T----G-TGTGCCTCCCCTAAAA---TGA--C----T----ATAA-A---TG-------G-T----------AT-----------T--TGAATTATTAT-----------T---T------TG-------C-T-T--A---G--TTTT---C-----AA-GTTT-GA-AAA-GCAATTAAATTCAAA-TCC---TT---C-A---A-TAT-GCA-G---AT-T--TT--T---T--------CGGTA-T--TTGCTGT-CCATG--------------AT-GAG-----T-ACG-T-CA--TATGCC---GT--CCT---TC--GCGA-------G---A-A--AA---CAATTGTTA--GCCA--ATCAT----GAA--CA--AGATC-GA-----TTAATGG-AA--A-A-AA----AG----GGCAAA--ATATCACATTACCGTAAA-CAGCTTG-C--AGTTATAACA-TT-A-CG-TT-CGG-
gi|25 : catcgtttaaacttttatttttaaagaaaaaacttgctttgtgtgctacttATG----TTT---TCA-AAC---TT-------T----TTTATTT-GTC--AT-GC-AAA----ATCACTTCT--T---T----G-TATGCCT-----AAAA---TGA--C----TAC--A--A-A---TG------TA-TTTTGAATAA-AT-----------T--A---------T-----------T---T------TG-------C-T-T--A---G--TTTT---C-----AA-GTTT-G--AAA-GCAATGAAATTCAAA-TC------TTGC-A---A-TAT-GCA-T---AT-T--TT--T--CT--------CGGTA-T--TCTGCGCGCCATG--------------GT-GTG-----TGACG-T-CA--TACA-C---G---CC---------CGAATGAATGT---A-AACAA---G---TCTCA--GACA-TATTAT----AAA--TA--AATAC-GAT----TTAATGG-ACA-A-A-AA----A-----GGC-AA--TAATCACGTT------AA-CAGAATG-C--AG--ATAACA-TT-A-CG-TT-TGGTGTGtgttgaacattgtgtcattcggtgtgatagctgtcagag
gi|26 : CATG----TTT---CTA-TAC---TTT------A----AGTAATT-TTT--AT-GC-AAATAT-A------CT--TCTCT----G--GTAACT-----AAAA---TGA--C----T----A--ACA---GA------TG-T----------AT--------------T---------C-----------T---TAAATTATG-------C-T-T--A---G--TTTT---C-----AA-GTTT-G--AAA-GCAATGAAAATCAAA-TCT---G---GC-A---A-TAT-GCA-T---AT-T--TT--T--CT--------CGGTA-T--TTTGCGCGCCATG--------------GT-GTG-----TGACG-T-CA--TATA-C---G---CCT---TT--G-GAATG----T---A-AACAA---C---TCTCA--GGCC-TATTAT----AAA--TA--GATTC-GAT----TTAATAG-ACA-A-A-AA----A-----GGC-AA--TTATTA--TT------AA-CAGATTC-C--AA--ATAGCA-TT-A-CG-TT-CGA-GTG
gi|27 : agttatcCACAT-ACT----GGT---AATAAACC-----T---------T----A----TA-AATGT------A-A------T-G--TC-TGTGG-GAC-GG----CATTT---ATCCA--GAATGGA---A-ACTTA---AAA----GCACACA----TGA----G---GACA-CA----TAC---T-GGTG-----ATAAG--CCTTA---T-A-AAT----GT-G-ATGTCT-GTG-G--GAAG-GCA-----TTCAGT-C-AAA---C---A--GGAA--TC-TT----AC-ACA-G-A-C------A-TA---T--GA---------------G-GATA----C-AT-AC-----TG-G---TGAG-AAA-C---C---T--TATA-A--A-T-G-T--GA-GGTCT-GTGGAAA--G---G--TGTTT-AGC-T-----G-G---GC-AGGAGAC---T-TACAT--G---------CAC-A--CA------TGAGA--ACAC---ATACTG--GTAAC-AAA-CC---ATAT-AAAT-GTGA------TA--TATGTGG-GAt
gi|29 : ATCTGAAAAATG-ATTTACAGGAA--TGTATAAACAAAAATG-GAGGTGAA-AAA-CAAAAAT---A-TGA--ATGC--G-ATGTTT-GTTTTAAGGTATTAACT-CG-----GGC-TTA-C-TTG--AGCAGACACATG-AG-GATACAT-ACT----GGT---GAGAAACC--------------GT----A----TA-AATGT------G-A------T-G--TT-TGTGG-GAA-GA----CATTC---AGTCA--GACAGGA---T-ATTTG---AAG----GTACACA----TGA----
gi|29 : aaactcaag----GGT---GAAAAAC--------AAAA---AT----A----TG-AATGC------G-A------T-G--TT-TGTTT-TAA-GG----TATTA---ACTCG--G---GCT---T-ACTTG---AGC----AGACACA----TGA----G---GATA-CA----TAC---T-GGTGA----G-AAA--CCGTA---TAA-A-T----GT-G-ATGTTT-GTG-G--GAAG-ACA-----TTCAGT-C-AGA---C---A--GGAT--AT-TT----G--A-A-G-G-TAC----A-CA---T--GATTNNNNNNNNNNNNNN-NNNN----N-AA-ACAAAAATG-GAGGTGAA-AAA-CAAAA---A--TATG-A--A-T-G-C--GA-TGTTT-GTTTTAA--G---G--TATTA-ACT-C-----G-G---Gttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaaacaaaaatggaggtgaaaaacaaaaatatgaatgcgatgtttgttttaaggtattaactcggg
gi|3 : aaactcaagatctgaaaaatgatttacaggaatgtataaacaaaaatggaATG----TTT----TATAAC---TT------------TTTATTT-GTC--AT-GCCAAA----ATCACTTCT--T---T----G-ATTGCCT-----AAAA---TGA--TA---C----A--A-A---TG------TA-TTTTGA-----AT-----------AAAT---------TATG--------T---T------TG-------C-T-T--A------TTTT---C-----AA-GTTT-G--AA--GCAATGAAATTCAAA-TCT---T---GC-A---A-TAT-GCA-T---AT-T--TT--T--CT--------CGGTA-T--TCT--GCGCCATG--------------GT-GTG-----TGACG-TTCA--TACG-CCCAATGAA------T--GTAA-----------A-C--AA---C---TCTCA--GGCA-TACTAT----AAA--TA--GATAC-GAT----TTAATGG-AC--A-A-AA----AA----GGC-AA--TTATCACGTT------AA-CAGTTTG-C--AG--ATAACA-TT-A-CG-TT-CGG-GTG
gi|30 : ctcctaAGAGACACATG-AACAATACATTACT----GGTTTTGATATATCCTCATT-ATAACTGAT----A----TG-A---T------G-A------T-G--TC-TATGG-GAA-TT----AGTTG---AGTAG--GGCAGGA---T-CATTG---AGG----ATATACAAATCTGATAAAG---GGTA-TACTTTTACACATAGGTGC----ATAAAAGCCTTAATATAGGAAT----GT---ATGTCT-GTT-G--GAAGTGC------CTCAAT-C-ACAAACC---A--CGAATTAC-AC----A--A-------CA-----ATCA---T---A---------------G-GGCA----C-ATTAC-----TGTA---TGAT-AAA-G---C---CAATATA-A--A-T-G-T--AA-TGTGG-TTGGGAA--G---G--AGTTT-AAT-ttgtgtgtcggttacgggtgtactagatgtcagaattagggtagtagcctaagtttttttttcaactttttcgaaggaaggttcgaggaaattttgtgtcgactcaaggactttaccataaataaaacagtcgattttctctttgtactgctaaaaaaataaaggaaaacataaacagttcgacagcaaccccgattaattgcgcgagaaggtgtttatatagacgctattgacacggattaagtctacaacgtttatttatgtacaggccatttcacgaaatacacgctcgcactcaaactgacctacataatagcacaacaacaaatactcctgaaggttcgtgttcccatttcctaccaaatcgcacatttaaaaaaaaaaaataacattacaataattaaagatcgaacttgtgtaaaaattacaaataagaaaatatgtagttcctcagtaaacatttataattttttcgtggacgcgcttttaaccatgacatgagatgtgtattgctgacaatgctctccggcattaccttgc
gi|31 : cTGTTTGTTT--AAAGC-AAA----ATTACTTCT--T---T----G-TATGCCT-----ATAC---TGAGTT----T----A--A-A---TA------TG-TTTTGAATAAAAT-----------G--T---------T-----------T---T-------G-------C-T-T--A---G--TTTT---T-----AA-GTCT-G--AAA-GCAATGAAATTCGAA-TC------TTGT-G---A-TAT--CA-T---AT-T--TG--T--CT--------CGGTA-TAGTATACGTTCCGTG--------------AT-GTG-----TGTCG-T-CA--TAT------GCGATCT---TT--GCAA-------G---A-AACAA---CT--TGTTA--GCCA-TTTTAT----AAA--CA--AACTT-CATTTAATTAATCG-AC--A-A-AAC---A-----GGC-AA--TTATCACGTT------AA-CAGCT
gi|32 : acatttcgAAA--GCTTA---TAA-A-T----GT-G-ATTTTT-GTG-G--GAAA-ACT-----TTGAGT-T-GTA-------A--AGCT--GC-GT----T--A-CTG-A-TAC----A-CA---C--GA---------------G-GATC----C-AT-AC-----TG-G---TGAG-AGA-C---C---T--CATG-A--A-T-G-T--GG-TGTTT-GTGGGAA--G---A--CATTC-AAT-C-----A-G---AC-AGGAGAC---T-TACA---G----AGA--CAC-A----------GGAGG--ATAC---ATACTG--GTGAA-AAA-CC---TTAT-AAAT-GTGA------TG--TCTGTGG-AAAGG------CATTC---AG-TGCGAAGGAAACA-TTACAAAA-ACACGTG-AGG-AT-ACA-TACTG-G-
gi|33 : ACAGACAAATGCACATGAAGACACAAAACTGGTGAT-AAAACC------------A--A-------ATGAAT-GTGGGAAAGCTTT-----------------GAT--------GGAAACA------A-GCTAGAT-ACT----GGT---GATAAACC-----T--------------------------T------G-A------T-A--TC-TTTTG-CAA-GGTGTACATCC---GGTCA--GATCG-A---TGACTTC---TAGTTCTAAACACG----TGA----A---GATA-C-----TGT---TCAGTGATCTTACAAG--TCCTA---TAA-A-T----GT-G-GTGCCT-GT
gi|34 : ga-AAA-C---C---T--TATA-A--A-TAG-T--GT-GGTTT-GTGGGAA--G---taacaag
gi|36 : agtgtaaacagaaaaagtaatgaatgtagtgaacttaggaaacctgtttgtgaaataattcaactaaagatcagaaaaatgatttacagagaacgggtgaaagatattggagtaaaaacatgttttcactgtgatgatagatatgcacaaaaggcgcaaagaacttcaagaCA----TAA----G---GACA-CA----TAT---T-GATGA-----TAAA--CCTT---------------GT-T-ATTTCT-GTG-G--GAAG-GCA---------AT-C-AGA---C---G--CTAG--AC-TT----A------------------------------------------------CA----C-AT-AA-----CA-G---TGAT-AGA-C---C---C--TACA-A--G-T-G-T--A---GTTT-GTAGAAA--G---C--CATTA-GGT-C-----G-GACAGC-ACACCAA---T-TACA---A----AGT--CAC-A--CA------AG-GA-CACAT---AAACTG----GAT-AAA-aacatcaat
gi|38 : ------G--AGAATA--TCTGCG---TATACA--TA-TTA--GAAGACATGCT------GGTGATAAACCTT-T-TAAATGTGATATATGTGtggagatatgtgagagaggaa
gi|38 : ----ATACATA----TTA----G---AAGA-CA----TGC---T-GGTGA-----TAAA--CCTTT---TAA-A-T----GT-G-ATATAT-GTG-G--AAAG-GCA-----TTT-GT-CTTGA-------A--AGTAG-AA-TT----A--A-A-A-G-C------A-CATTTT--G----------------T-GACT----C-AC-AC-----TG-G---TGAA-AAA-C---C---A--TTTC-A--A-T-G-T--GG-TGTCT-GTGGGAA--G---G--TATgaaaggcatttgtcttgaaagtagaattaaaagcacattttgtgactcacactggtgaaaaaccatttcaatgtggtgtctgtgggaaggtatatggtctaaaagttgtgttaaaga
gi|39 : gagaatatctgcgtA----CAC---T-GGTGA-----CAAA--CCAT----TCA-AAT----GC-G-AGATCT-GTG-G--ACGG-GCC-----TTCCGA-C-AAC---C---A--GGCA--AT-TT----G--A-C-G---CG-----T-CA---TC-GA---------------CTGACC----C-AC-AC-----CA-C---AGTC-AAA-C---C---T--TACG-T--C-T-G-C--CC-AACCT-GCAACAA--A---G--CATTC-AAC-C-----G-G---GC-CTCCAAC---T-TACA---C----ACG--CAC-A--atggtctaaaagttgtgttaaaga
gi|4 : ----TTT---C-A-AAC---TT-------T----TTTATTT-GTC--ACTGC-AAA----AATCATTCT--T---T----G-TATGCTA-----AAAA---TGA--C----TTACGA--A-A---TG------TA-TTTTGAATAA-AT-----------T--A---------T-----------T---T------TG-------C-T-T--A---G--TTTT---C-----AA-GTTT-G--AAA-GATATGAAATTCAAA--------TTTGC-A---ATTAG-CCA-T---TTCT--TC--T--CT--------CGGTA-TTGTCTGCGCGCCATG--------------GTGGTG-----TGACG-T-CA--TAT--C---ACGCCCTAG-TT----AA-------T---GTA--CA---C---TTCTA--GCCA-TAT--------AA--TA--A--TT-GAT----TT-ATGG-AC--A-G-AAACAGA-----GAC-AC--TTATCA-GTT------AATCAGCTTG-CAAAG--ATAACA-TT-A-CG-TT-CGtgcgcactcacac
gi|40 : ATCACATT------AA-CAGCTTG-C--AG--ATAACA-TT-A-CT-TT-TGG-GTGccctcttgtgttgtcattagcggatgtactacttgtcagaatagggtggtcctgagtagtcaactttttcgcaggaaggacgaggaaactttttgtgtcgactcaaggactttacgcataaataaaacaagtccgtttggtctttgtctgttaaaaaaaaataaaggaaaaagacagttggacagcaccccagattaatgcgcgaggaaaggttgtttttatatagaagctagacacagattaggtctacaagcgttttatatgtcagcctttcacgaaatacacgctcgcctcaactgacctacatcaatagcataattgttacaacaaatacttcaagttcctgttcccatttcctaccaaatgaaatgataataatacaatagttaaagattgaactgtataaaaatacaaaaagaaatatgtaagtccttcagtaagccatttgtataaatatatattttcgtcgacgcgcttttaaccatgacatgagatgtggtattgctgacaatgctctctctccggcattatttgc
gi|41 : TG----TTT---CTA-AAC-----G------T----TATAATT-TTT--AAAGC-AAA----A------CTACT---TCTCAG-TATGCCT-----AAAA---TGG--C----TTA--A--A-A---TG------TA-TTTTAAATA--AC-----------A--TA--------T-----------T---T------TA-------C-T-T--A---G--TTTT---C-----AG-ATTT-C--AAA-TCAATGAAATTCAAA-CC------TTAC-A---T-TAT-ACATT---TT-T--TT--T--CT--------TGATA-T--ttgtgtgtcggttgatggtgtactagctgtcagaattagggaggtagcccgagtttttcaactttttcgaaggaaggtgcaaggaaaatttgttgatacaagaactttttcataaataaaactgttgcttt
gi|43 : cattgatAAAGGACACATAGCATAGATACTTAAATTA-AAC---TTT------T----TTAATTT-CTT--AA-GC-ACA----A------CTCTT---T----G-TGTGCCT-----AAAA---TGA--CACTTT----A--A-A---TG---------------------T-----------G--T---------T-----------T---T------TG-------A-A-TAAA---G--TCTTTCAA-----AA-CTTT-GA-AAA-GTGATGGAATTGAAA-CAA---TCTTGCAA---A-TAT-a
gi|44 : GGGCACATCGCATG----TTT---CTA-AAC-----A------T----TTTGATT-TTTGAA--GC-AGA----ATTGCTTCT--T---T----G-CATGCCT-----AAAA---TAA--C----TCTG-A--A-T---TGATTT--TG-A----------ATAAA--------A--TA--------T-----------T---T------TG-------C-T-T--A---G--TTTT-------------CTT--------GCGATGAAATTCAGA-TA------TTGC-G---A-TAC-GCA-T---AA-T--TT--T--C
gi|47 : GA-GATG-G-G--G--TCATTACAGAGACACAA--GAGGATAC---ATACATGATACTGGTGATAAACA--TTAT-----------------T-AAA---AAAAA-----T----ATT----G--GGCA-C--T-TAAA---GACACG--CA-AGA--TGATACCTACC------AGTGAAAAA
gi|5 : AA---AT----A-----A-AATGCCCTTTCG-A------C-G--TC-TGTGG-GAA-GG----CATTC---CGTGA--GACAAGT---A-AGGTA---AAG----ACACACA----TGA----G---GATA-CA----TAC---T-GGTGA-----TGAA--CCTCA---TAA-A-T----GT-G-ACGTCT-GTG-G--GAAG-GCA-----TGCAGT-G-ATA---C---A--AGTA--GC-TT----A--A-A-G-A-CAC----A-CA---T--GA---------------G-GATA----C-AC-AC-----TG-G---TGAT-AAA-C---C---T--TATA-A--A-T-G-T--GA-TGTCT-GTGGGAA--G---G--CATTC-AGT-C-----G-G---GC-ATACAAT---T-TAGA---G----AGA--CATAA--AA------GGATA-CATGT---ATAGTA--GTGAT-AAA-CC---TTAT-AATT-GTGA------TG--CCTGCGA-AAATA------CTTTC---AG-CAATATGGGATCA-TTATTTCG-CCTCATGAAGA-A--ACA-TACTG-G-TAA-T-A-AACCTT-A---TA-TATA-T-G-ATGTCT-GTGGG--AAA-ACAT-TTA--G--TGA-GACG-G-GACA--C--TCACAGACACATAT--AAGGATAC---ATAC-------TGGTGATAAACC--TTATA------AT--------T-CAA---TAAGA-----C----A------G--GGAA-A--T-TACA---GAGACA--CA-TAG--GGATACATACT------GGTGATAAACCTT-T-T-GAT-TTATATATGTGATTTGTAT-----TGGTAAGCGTTCATGTAAAGGACACGTCGAATG----TTT---TTA-AAC---TTG------T----TTTATTT-TTT--A--G--------------------T---T----G-TATGCCT-----AGAT---TGA--C----TAC--A--A-A---TG------TG-C----------AT-----------G--TA--------T-----------T---T------TGT------T-T-T--T---T--TTTT---A-----AA-GTTT-G--AAA-GCAATAAAATTCAAA-T-T---TTTTGT-G---A-T-T-AAA-T---AT-T--TT--T--CT--------TGGTA-T--TTTCTGCGTCATG--------------AT-GTG-----TGACG-T-CA--TATA-T---GTGACCT---TT--GCGA-------T---A-A--AA---C---TGTTA--GCCA-TATTAT----AGA---A--AATTC-GAT----TTAATGG-AC--A-A-AA----A-----GTC-AA--TTATCACGAT------AA-CAGCTCG-C--AG--ATGACA-TT-A-CG-TT-TGG-GTGC
gi|51 : ---------T-----------T---T------TG-------C-T-C--A---A--TTTT---G-----AA--TTT-G--AAA-GCAAGGAATTTCTAA-------TTTTGT-G---A-TAC-GTA-T---t
gi|53 : ctaagtgaaataagtatcaagtgaagta--T---T----G-CATGCCT-----AAAT---TAA--CTT--T----T--A-A---TG------TG-T--------------------------T---------T-----------T---C------TG---------T-G--AAATA--TTTTGCGA-----AA-TATT-G--AAT-TC-ACGAAATTCGAA-TC------TTGT-G---A-TAC-GCA-T---tagcatcagatag
gi|55 : cC---T-TACA---G----AGA--CAC-AT-AA------GGACA-CATACT--ATA-TGCAGTGAT-TGA-TC---TTATAAAAT-TTGA------TG--TCTtat
gi|55 : --T-TACA---GAGACA--CA-TAA--GGACACATACTATATGCAGTGATTGATCTT-A-T-AA----A---ATTTGA--TGTCTAGGTATGAAAAGTGTTCaggtatgaaaagtgttc
gi|56 : c-----A-CA---T--GA---------------G-GACA----C-AT-AC-----AG-G---AGAA-CGC-C---C---G--TACA-A--A-T-G-T--AA-CACGT-GCGGGAAACA---GTTCGCTC-AGTAC-----G-G---G--ACAC
gi|57 : cAAAGGACACATCGCATG----TTT---CTA-AAC---TTT------T----TGAATTT-TGC--A--GC-AAA----ATTACTCCT--T---T----G-TATGCCT-----AAAtgta
gi|6 : AAGGACATATTGCATG----TTT---CTA-AA----TTG------TTAGATTTTTTT-TTT--A--AC-AAA----ATTAGGTCT--T---T----G-CATGACT-----AGAA---TGA--CTT--T----A--G-A---TG------TG-TTTTAAATGAAAT-----------A--T---------T-----------TTAAT------TA-------C-G-T--A---G--TTCT---T-----GA-GTTT-G--AAA-G-------GTACAAA-TCTCAGTCTTGC-G---A-TAT-GCA-T---AT-TAATT--TTACTTA------TGATA-T--TTTATGTACGATG--------------AA-GTGTCGTCTGACA-T-CA--TAT------GTGACCTAGAGT--AAGG-------TCTGA-A--AACAGC---TGTTA--GCCA-TTCTAT----AAATTTATTGATTA-GAT----TTAATTG-AC--A-A-AAT---A-----GCC-CA--TAGCTATG-T------A------TTG-T--AG--ATAACT-TT-G-CA-TG-GGG-GTGC
gi|61 : ATGAGGACACATA-CTGGTGAG-AAA-CCA---T---A-T-A--Atgtgcaccatttatgggtgcacatatactaagtgtcaaaagaagtgatgtatagactgaggtttttcaaatttttctaaagaaggtgtgaggaaaaagaagtgggtgatttttttgtcagcacattaaggacttggtcataacccctcccctctacagtcacctttgtccatgttctttttcaaaaaactattggacagagacccatttaactgtgaggaaatagttatgtagaagccaggcacagctaggcctacagtatatggattctgttctggtcgtcatcatttcacaaatactcactcgcaccttggaaataaaaacggacattgtaacagtatatacttgtgttcccagttcctgtaaacttgtagaattataaaaaaaaaaataaattaaagattgaaaataattgaactt
gi|7 : ----CATTC---CCTAA--CACAGGA---A-GCTTA---CAG----GCACACA----TGA----C---AACA-CA----CAC---T-GGTGA----A-AAC--CCTTA---CAA-A-T----GT-G-GTGTCT-GTG-A--AAAA-GCA-----TTCCCT-C-ACA---T---A--AGT----C-CTTTACA--G-A-G-A-CA-------CA---T--AA---------------T-GATA----C-AT-AC-----TG-G---TGAT-AAA-C---C---T--TACA-A--A-T-G-T--GA-TATCT-GTGGAAA--G---G--CGTTC-ACT-T-----ATA---AT-GGA-GAC---T-TGCG---T----AGA--CAC-AC-CA------G--GA-CANNN---NNNNNN--NNNNN-NNN-NN---NNNN-NNNN-NNNN------NN--NNNNNNN-NNNNN------NNNNN---NN-NNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNN-NNNNNNN-NNN-N--NNN-NNNNN-N-NNN-NNN-NNNNNNNN---NN-NNNN-N-N-GTG--T-GTGGG--AGG-GCAT-TCA--G--TGA-GACA-G-G--AGCC--ATGCGGAAGCACAT--GAAGATAC---ATGC-------Ta
gi|7 : GTGT-GTGGGAGGGCATTCAGT-GA--G-ACAG-GAGCC-ATG--CGGAAGCACATG-AA-GATACAT-GCT----NNN---NNNNNNNN-----N-NNNN---NN----N----NN-NNNNN------N-N------N-N--NN-NNNNN-NNN-NN----NNNNN---NNNNN--NNNNNNN---N-NNNNN---NNN----NNNNNNN----NNN----N---NNNN-NN----NNN---N-NNNNN----NNNNN--NNNNN---NNN-NNNNNNNGT-G-ATGTCT-GTG-G--AAAG-GCA-----TTCAGC-C-GTA---C------GGGA--ACATT----A--A-A-G-A-GAC----A-CA---T--GA---------------nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngtgatgtctgtggaaaggcattcagccgtacgggaacattaaagagacacatgacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaaccatatcagtgtgatgtctgtgggaaggctttcaggcattcagtaacattatataagcata
gi|7 : cattccctaacacaggaagcttacaggcacacatgacaacacacactggtgaaaacccttacaaatgtggtgtctgtgaaaaagcattccctcacataagtcctttacagagacacataatgatacatactggtgataaaccttacaaatgtgatatctgtggaaaggcgttcacttataatggagacttgcgtagacacaccaggacannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn-GTGA------TG--TCTGTGG-AAAGG------CATTC---AG-CCGTACGGGAACA-TTAAAGAG-ACACATG-Acnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaaccatatcagtgtgatgtctgtgggaaggctttcaggcattcagtaacattatataagcata
gi|7 : cattccctaacacaggaagcttacaggcacacatgacaacacacactggtgaaaacccttacaaatgtggtgtctgtgaaaaagcattccctcacataagtcctttacagagacacataatgatacatactggtgataaaccttacaaatgtgatatctgtggaaaggcgttcacttataatggagacttgcgtagacacaccaggacannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngtgtgtgggagggcattcagtgagacaggagccatgcggaagcacatgaagatacatgctnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnAA-CC---ATAT-CAGT-GTGA------TG--TCTGTGG-GAAGG------CTTTC---AG-GCATTCAGTAACA-TTATATAA-GCATAcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaaccatatcagtgtgatgtctgtgggaaggctttcaggcattcagtaacattatataagcata
gi|8 : cattccctaacacaggaagcttacaggcacacatgacaacacacactggtgaaaacccttacaaatgtggtgtctgtgaaaaagcattccctcacataagtcctttacagagacacataatgatacatactggtgataaaccttacaaatgtgatatctgtggaaaggcgttcacttataatggagacttgcgtagacacaccaggacannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngtgtgtgggagggcattcagtgagacaggagccatgcggaagcacatgaagatacatgctnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngtgatgtctgtggaaaggcattcagccgtacgggaacattaaagagacacatgacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn------CT--T---T------TATGCCT-----AGAA---TGT--A----T----A--C-A---TGGATTT-TGAT----------AA-----------A--TA--------T-----------T---T------TG-------T-T-T--G---G--TTTT---A-----AAAGTTT-G--AAA-GCA-TGACATTTAAA-TCT---T----C-G---A-TATTGCT-T---TT-T--CTCCT--CT--------CGGAA-T--TTTGCGCGCCATG--------------AT-CTT-----TGACATT-CA--TATGTC---GT--CCT---TT--
gi|8 : gttactt-A--AA---C---TGTTA--GCCA-TATCATTTCAAAA--T-----TTCCGAT----TTAATGGCAC--ATA-CA----A-----GTC-AA--TCATCACGTT------AA-CAGTTTGTT--AG--ATAACA-CTAA-CG-TT-CAG-tacaacaccaaaaaaaaaaaaaacaaaaaaaaaaacaaactgttagccatatcatttcaaaatttccgatttaatggcacatacaagtcaatcatcacgttaacagtttgttagataacactaacgttcaggggtcggttacggatgtaatagctgtcaaataaggactgtaccgtgaacattgtcaacttttacgaaggaaggtgcgaggaaaaagacgagtattttgtcacacaggaccaataccataaaatcaaaacagtcgtttttgctccatgtactgttaaaaaagaaatgatattattagaaataaaggaaaaccaaacacaggtaggcagcgaccaggtttaacttgcgaggtgtttattttagaagcggatattcgcaactacatgcttacagtgttacattgccaagatatgacacaaaattacacacccgtacacactccctaagaatatgtactcagactcgcattctcattcctaccaaatcgcaaatacacaaatatatgaattaaagatttgaattgaagttgtatttacaataataaatatgtaa
gi|9 : gttacttcttttatgcctagaatgtatacatggattttgataaatattttgtttggttttaaaagtttgaaagcatgacatttaaatcttcgatattgctttttctcctctcggaattttgcgcgccatgatctttgacattcatatgtcgtccttttacaacaccaaaaaaaaaaaaaacaaaaaaaaaaacAAGGACATATCCCATG----TTT---CTA-AAC---TT-------T----ATTAATT-TTT--AT-GC-AAA----ATTACTTCT--C---T----G-TATGCTT-----AAAA---TGA--C----T----A--C-A---GA------TA-T----------AT-----------T--T---------TAAATACATTAAT---T------CG-------C-T-T--A---G--TTTT---C-----AA-GTTTTG--AAA-GCAATGAAATTCAAAATCT---G---GC-A---A-TAT-GCA-T---AT-T--TT--T--CT--------CGGTA-T--TCTGCGCGCCATG--------------GT-GTG-----TGACG-T-CA--TATA-C---G---CCT---TT--G-GAATG----T---A-AACAA---C---TCTCA--GGC--TA--AT----AAA--TA--GATTC-GA-----TTAATAG-AC--A-AGAA----A-----GGC-AA--TTAT-ACGTT------AA-CAGATTG-C--AA--AT-GCA-TT-A-CG-TTACGA-GTGggtcggttacggatgtaatagctgtcaaataaggactgtaccgtgaacattgtcaacttttacgaaggaaggtgcgaggaaaaagacgagtattttgtcacacaggaccaataccataaaatcaaaacagtcgtttttgctccatgtactgttaaaaaagaaatgatattattagaaataaaggaaaaccaaacacaggtaggcagcgaccaggtttaacttgcgaggtgtttattttagaagcggatattcgcaactacatgcttacagtgttacattgccaagatatgacacaaaattacacacccgtacacactccctaagaatatgtactcagactcgcattctcattcctaccaaatcgcaaatacacaaatatatgaattaaagatttgaattgaagttgtatttacaataataaatatgtaa
18 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|17 ): ATTATTAAGTTTTATAATCATTTTTATTACTTATGTTGCGTAGCCCAATTAGAAACAGATTAAATTCATCAGGAACAGGTCAAGGTATAAATTGTTCATCAGAGATATGTTCACCAACACTGACACACTAGAATTTAGATTGAATGAAACATCCCATTGCACGAATAGCCCTCCTCAGATGACTTTCTTTCATCTACAACCAATAGCTGCCTGTGAAACAAGTATGTATATCTACCCAACCAATGGCTGTCTCTGAAACAAGTATGTCTTCTACACAATCAAGACTAGCACAAACGGAAAATATAACGGACTTTGTTGAAACTGTTGAAGCAGTCTGTGAAACAAGTAAAAACTCAAGATCTGAAAAATGATTTACAGGAGTGTATAAACAAAAATGGAGGTGAAAAACAAAATATCAATGTGATGTTTTTAAGGTAT
Unaligned ( gi|21 ): GCCAGAATAAGGGTGGTAGTCTAAGTTTTTTTCAGTTTTTTTTCCAAGGAAGGTACATACTGAAGGAAATGTTTTTTGACACCAAGGACTTTACCATAATTAAAACAGTCGCTTTTGTCCATGTGTTGTAAGAAAAAAAAATACACGTAATAAAATAATGAAACAACAACAGTTGGACAGCAACCCAGTCTAATAGCTAAAAAGTGTTTATATAGAAGTTAAACACGGCTAGGCCCACAGCGTAAATTGTGTCCAGGCCCAGGATCACCCGCTCAAACTGACCTACAAATAGCATAACAAATATTCAGGTTCGTGTATTAAAAATTTAATTGAATTATAAGATAATTATGCAAT
Unaligned ( gi|22 ): CCAGAATAAGGGTGGTAGTCTAAGTTTTTTCAGTTTTTTTTCCAAGGAAGGTACATACTGAAGGAAATGTTTGTTGACACAAGGACTTTACCATAATTAAAACAGTCGCTTTTGTCCATGTGTTGTAAGAAAAAAAAATACACGTAATAAAATAAATGAAAACAACAACAGTTGGACAGCAACCCAGTCTAATAGCTAAAAAGTGTTTATATAGAAGTTAAACACGGCTAGGCCCACAGCGTAAATTGTGTCCAGGCCCCAGGATCACCCGCTCCAACTGACCTACAAATAGCATAACAAATATTCAGGTTCGTGTATTAAAAATTTAATTGAATTATAAGATAATTATGCAAT
Unaligned ( gi|24 ): GTGTACTAATGTCAATTAGCGTGGTGAGCCCTGAGTTTTTGTCCAAGAAGGAAGGTTCGGAGAATTTGTTAGTCTGTCGCTTCAAGGACTTAACCATAAAAAAACATCGCGTTTTGTCTCTTTGTAACTGTTAAAAAAAAAAGGGGAGAAACATAAACAAGTGGACAGCGTAACCCCGATTATTGCGCGAGAAGTTTTAAAGTATAGAAAGCTATAAGACACGGCAGTTAGGTCTACAACGTTTATTTATGTCAGCCATTTCACGAATACACGCCCGCACTCAACTAGACCTACATAT
Unaligned ( gi|28 ): TATGTTCGGGTGGTGTGTGTCGGTTACGGGTGTACTAGCTGAGTTTTTCAACTTTTACGAAGGAAGGTGCGAGGAAATTTTTGTCGACACAAGGTCATTATTATAAATAAAACAGTCGCCTTTGTCCTTGTACTGTTAAAATATCAAAATAAAATAAAGGAAAACATAAACAGTTGGACAGCAACCCAGTTTAACTTTATATAGAAGCTAAACACAGCTAGGCCCACAGCGTATAGTGTCCAGGCCATTTCACGAAATACACAACAGTACCAACTGACGTACATAACATATAT
Unaligned ( gi|35 ): AATTTAGCTAATCGAAGTTACATCGGTTTATCGAAGCTACACATCAACATATTTCACTAAAACGTGTCATAATGGTAATTTCTGGCTGCTAGCCATTCCCTTTCGGGTATTAGTAAGGTCATTATGTCACGACTACCGTGCAAAATTCCCCAGGAGTTGGCGCACAGAAATTCAAGAGGTAAGGCGGAGT
Unaligned ( gi|37 ): ACAACAACAAATATCTCCTGACAGCTTCTGTGTTTCCATTTTCTCTAAGCCAAATCGCGCATCATTTATAAAAAAATTAATGAATACAATAATTAAAGATATCGAACTTCTTAATAAAAAATTACAAAAATGAAGAAATATGTAGATTTATATAATCTTTTATACTGTGGAACGACAGCGCTTCTTTA
Unaligned ( gi|42 ): AGGACATCTAGGCCTACAACATATGCATTAATATTCTGTTCTGGTCGTCGTCATTTCCCAAGATACATGTATATACTCGCACTTAGGAATTTAAACTAACTCCGTACCACTAACTAACAATTTATCTTGTGTTCCCACTTCCTACCAACAT
Unaligned ( gi|45 ): GTTATAATTTGTCATCAGAGATGTGTTCACCAACGTTGACAACACTAGAATTTAGACTGGAATGAAACACCCCATTGAAAATAGCCCTCCTCAGATGACTATTCTTTTCATCTACCCAACCAAT
Unaligned ( gi|46 ): AAAGATTGAACTTGTATTTACAAATAATAAATATGTAATTCCTCAGTAAACATTTCATTGATTTCACGCGGTTTAACCATGTCATCAATATGAGATGTGTATTGCCGTGCTCTCCGACGGCTT
Unaligned ( gi|48 ): GTGAGAAACCTCATAAGTGTAACGTATGTGGAAAAGCCTTCAGCCAGTCCTCCAACCTTATCACACACAGTCGGAAACACACCGGATTCAAGCCATTTAAGTGTGA
Unaligned ( gi|49 ): GCAACCCAGCCTAGTTGCGAGAAAATGTTTTTATAGAAGCTAAACACGGCTTGGCGCACAGCGTAAATTCTCCAGGTCATTTCACGAAATACACACCCGC
Unaligned ( gi|50 ): AAAATGTCTTCCAATGTCATTTCTGGCTGCCAGTTCCTTCCCTTTTTCTGGTATTAATGAGGTCATCAATTACGTCACGACCACCGTGCAAGACT
Unaligned ( gi|52 ): GTATCTAATGCTCTGTTACGTTCGACATCATATGCGTCCTTGAGTGAGAAGGTTTGAAAACATTAGTTTTATAAATGGATTAAATTTAATCAAC
Unaligned ( gi|54 ): TGATCTTCCTCACTTCACGCAATACACACTCGCACTTTGGGAATAAAAGAACATGCACTTGTGCTCCCATTTTCTATCAACTATTAGA
Unaligned ( gi|58 ): TACAATATTAATGGGATTGAACTACTTCAAGGTTAAATCCATTTATCAAAGTAAA
Unaligned ( gi|59 ): GATGTGTATTGCCGTGCTCTCCGCCGGCTTCAGGC
Unaligned ( gi|60 ): AGAGTCATCTTATGTGACGTCACAAATTTTAGG
Alignments
lowQualScore : 1111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111
lowQualScore : 1 11 1111 333333333333333 33333333333333333333333 33333333333333333 11111111 1111111111 111111 1 22222222222222222222222222222 1111111111111111111 3333333333333 1111111111111 11111111 1111111 11111 3333333 1111111 8888888888888888888888888888888888888888888 111 11 111 222222222222 555555555555555 0000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 333333333 11111111 11111111111111 5555555555555555555555555555555555555555 1111 11 1111
lowQualScore : 5 0 6 11 1 6 66 777 2222 555 1 888 000000000000000 55 99 4 0 7 0 333 11111111111111111111111 2 4 4 1 3 6666 555 0 2 99999999999999999 2 66666 2 777777 2 999999 2 33 1 2 2 00000000 5555 7777777777 44 2 2 5555 666666 1 4444 6666 2 0 2 1 4444 333 999999 777777 22 22 333 3 1 1 1 5 44444 0 1 2 22 2 77777 0 2 44 2 333 22 88888 333 8888 55 2 2 99999999999999999999999999999 4444 2 2 55555 66666 33 333 2 22 33 2 22 2 2 2 22 2 2 22 2 0 2 3 1111111111111111111 33 2 6666 3333 2222222222222 1 5555 1 2 7777777777777 333 33 777777 2 22222222 555 6666666 1 3 555555 33 4 77777 9999999 55555 0 5 888 99 8 4 4 4 777 7 88888 4 0 444 1111111 55 777 4 777 3333333 5555555555555555555555555555555555555555555 6 111 6 6 00 222 7 6666 555 2 444 000000000000 0 2 33 222222222222222 2 55555 333 33 4444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444 2 6666 22 55 2 2 33 4444 2 2 77 2 0 555555555 2 333 4 22 2 333 2 33 66 33 33333333 2 77 1 66666666666666 2 77777 5 33 1111111111111111111111111111111111111111 555 777 0 33 0 2 0 8888 999999 0 5 0000 2 66 2 8888 4444 2 2 33 1 777777 5 0 1 2 33 77 2 2 2 2 2 3
lowQualScore : . . . .. . . .. ... .... ... . ... ............... .. .. . . . . ... ....................... . . . . . .... ... . . ................. . ..... . ...... . ...... . .. . . . ........ .... .......... .. . . .... ...... . .... .... . . . . .... ... ...... ...... .. .. ... . . . . . ..... . . . .. . ..... . . .. . ... .. ..... ... .... .. . . ............................. .... . . ..... ..... .. ... . .. .. . .. . . . .. . . .. . . . . ................... .. . .... .... ............. . .... . . ............. ... .. ...... . ........ ... ....... . . ...... .. . ..... ....... ..... . . ... .. . . . . ... . ..... . . ... ....... .. ... . ... ....... ........................................... . ... . . .. ... . .... ... . ... ............ . . .. ............... . ..... ... .. ................................................................................................. . .... .. .. . . .. .... . . .. . . ......... . ... . .. . ... . .. .. .. ........ . .. . .............. . ..... . .. ........................................ ... ... . .. . . . .... ...... . . .... . .. . .... .... . . .. . ...... . . . . .. .. . . . . . .
lowQualScore : 5 7 7 00 0 7 11 000 7777 555 6 333 222222222222222 00 55 0 4 3 4 444 88888888888888888888888 2 0 0 5 6 1111 000 9 9 33333333333333333 5 22222 5 222222 5 777777 5 44 6 5 5 22222222 9999 2222222222 44 2 2 0000 000000 0 0000 0000 0 2 0 9 0000 333 333333 888888 55 00 222 2 8 5 8 5 55555 5 8 0 88 0 00000 3 0 88 0 555 88 77777 777 7777 00 1 1 66666666666666666666666666666 7777 2 2 66666 55555 99 777 1 99 55 1 99 1 1 1 99 1 1 99 1 5 4 8 8888888888888888888 22 4 6666 4444 9999999999999 7 7777 3 5 0000000000000 999 77 777777 7 11111111 444 9999999 0 3 888888 11 0 00000 8888888 99999 2 9 888 77 9 4 4 4 888 3 66666 0 7 666 7777777 55 000 0 000 0000000 5555555555555555555555555555555555555555555 7 777 7 7 00 222 3 1111 000 7 777 111111111111 6 5 44 000000000000000 2 66666 999 11 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 1 6666 99 88 1 1 11 1111 1 1 11 1 4 444444444 1 777 2 66 2 999 5 44 33 77 33333333 7 33 7 88888888888888 9 11111 7 99 4444444444444444444444444444444444444444 000 999 7 99 7 9 1 9999 222222 8 7 0000 9 44 9 9999 6666 9 9 99 1 777777 3 5 4 9 99 99 9 9 9 9 9 1
consensus : GGAAGGGCATTTTATCTGAAAAGCGGA--TACAGAGAAA--CACAT---GAG---GACA-C-ATACTGGTGA-A-AAACC---T---T---A-T-A--ATGT--G-ATGTCT-GTGGGAAGGCATTCAGT-CG--C-ANGGNNATC-TTAAGGAGACACAT-GAA-GATACAT-ACT----GGT---GATAAA-CCT-A-AAAT----A----TA-A-----ATG-T------G-A------T-G--TCTGTGG-GAA-G---G----CATTC---AGTCG--GANA--GGAT-AC-TT-A---AA-G----ANACACA----TGA----G-GATA-C-A----TAC---T------GGTGA----ATAAA--CC-TTA---TAA-AATGT-G-ATG-----TCT-GTG-G--GAAG-GCA-----TTCAGT-CA--G-A---CA--GGNAAC-TT---A--A-A--G-A-CA-A-CA-T---GA---------------TGACA----C-AT-AC-----TG-G---TGAN-AAAC---C-T--T-ATA-A--A-T-G-T--GA-TGTCT-GTGGG--AA-GGCATTC-AGTC-----G-G---GC-ANACGAC--T-TACA---GAG-A--CACA---CA-GGAGA-CACACATACT----GGTGATAAA-CC---T---------TATAANT-GTG--AT------GTCTGT-GGGAAGG------CAT---TCAG-CGATACGGGANCA-TTACANAG-ACACATGAGG-A--AN-ATACTG-G-TGA-TAA-AACCTTNA---TG-AATG-TG-ATGTC-TGTG-GGAAG---ACATTCA--G--TGA-GACG-G-GA----C--TTACAGACACACAT--GAG---GATA-C---ATAC-------TGGTGATAAACCTTATAA---------T-CAATAAGA----C-----------A-------GGGAA-ATTACA---GAGACACATG-AGGATA-CATACTGGTGAN-AAACCTT-T-TGATTTATATATGTGATTTGTATTGGTAAGCGTTCATGTAAAGGACACGTCGCATG----TTT---CTA-AAC---TTN------T----TTTATTT-TTT--A--GC-AAA-AT-TACTTCTTTG-TATGCCT-----AAAA---TGA--C----T----A--A-A---TG------TG-T----------AT-----------G--T---------T-----------T---T--------------TG-CT----T--AG--T-TT-T-CAA-G--T-TT-G--AAA-GCAATGAAATTCAAA-TCT---TTTTGC-G---A-TAT-GCA-T---AT-T--TT--T--CT--------CGGTA-T--TTTGCGCGCCATG--------------AT-GTG-----TGACG-TCA--TATA-C---GTGACCT---TT--GCGA-------T---A-A--AA---C---TGTTA--GCCA-TATTAT----AAA--TA--AATTC-GAT----TTAATGG-AC--A-A----AA----A-GGC-AA--TTATCACGTT------AA-CAGCTCG-C--AG--ATAACA-TT-A-CG-TT-CGG-GTGC
Reference ( family-1142 ) : GAAAGGGCATTTTATCTGAAAAGCGGA--TACAGAGAAA--CACAT---GAG---GACA-C-ATACTGGTGA-N-AAACC---T---T---A-T-A--ATGT--G-ATGTCT-GTGGGAAGGCATTCANT-CG--C-ANGNNNATC-TTAAAGAGACACAT-GAA-GATACAT-ACT----GGT---GATAAA-CCT-A-AAAT----A----TA-A-----ATG-T------G-A------T-G--TCTGTGG-GAA-G---G----CATTC---AGTCG--GANA--GGAT-AC-TT-A---AA-G----ANACACA----TGA----G-GATA-C-A----TAC---T------GGTGA----ATAAA--CC-TTA---TAA-AATGT-G-ATG-----TCT-GTG-G--GAAG-GCA-----TTCAGT-CA--G-A---CA--GGNAAC-TT---A--A-A--G-A-CA-A-CA-T---GA---------------NGACA----C-AT-AC-----TG-G---TGAN-AAAC---C-T--T-ATA-A--A-T-G-T--GA-TGTCT-GTGGG--AA-GGCATTC-AGTC-----G-G---GC-ANACGAC--T-TACA---GAG-A--CACA---NA-GGAGA-CACACATACT----GGTGATAAA-CC---T---------TATAAAT-GTG--AT------GTCTGT-GGGAAGG------CAT---TCAG-CGATACGGGANCA-TTACANAG-ACACATGAGG-A--AN-ATACTG-G-TGA-TAA-AACCTTNA---TA-AATG-TG-ATGTC-TGTG-GGAAG---ACATTCA--G--TGA-GACG-G-GA----C--TTACAGACACACAT--GAG---GATA-C---ATAC-------TGGTGATAAACCTTATAA---------T-CAATAAGA----C-----------A-------GGGAA-ATTACA---GAGACACATG-AGGATA-CATACTGGTGAT-AAACCTT-T-TGATTTATATATGTGATTTGTATTGGTAAGCGTTCATGTAAAGGACACGTCGCATG----TTT---CTA-AAC---TTN------T----TTTATTT-TTT--A--GC-AAA-AT-T--TTCTTTG-TATGCCT-----AAAA---TGA--C----T----A--A-A---TG------TG-T----------AT-----------G--T---------T-----------T---T--------------TG-CT----T--AG--T-TT-T-NAA-G--T-TT-G--AAA-GCAATGAAATTCAAA-TCT---TTTTGC-G---A-TAT-GCA-T---AT-T--TT--T--CT--------CGGTA-T--TTTGCGCGCCATG--------------AT-GTG-----TGACG-TCA--TATA-C---GTGACCT---TT--GCGA-------T---A-A--AA---C---TGTTA--GCCA-TATTAT----AAA--TA--AATTC-GAT----TTAATGG-AC--A-A----AA----A-GGC-AA--TTATCACGTT------AA-CAGCTCG-C--AG--ATAACA-TT-A-CG-TT-CGG-GTGC
gi|1 : GAAAGGGCATTTTATTTGAAAAGCGGA--TGCAGAGAAA--CACTT---GAG---GACG-C-ATACTGGTGA-G-AGACC---T---T---A-T-A--ATGT--G-ACGTCT-GTGGGAAGACATTCCAT-TG--C-ATGTATATC-TTAAAGAACCAC-T-GAA-GATACAT-ACT----GGT---GATAAA-CCTCATAAATTCTCA----TA-A-----ATG-T------G-A------C-G--TCTGTGG-GAA-G---G----CATTC---AGTGA--GAAA--AGAT-AC-GT-A---AA-G----ACACATA----TGA----A-GATA-C-A----TAC---T------GGTGA----ATAAA--CC-TTA---TAA-AATGT-G-ACA-----TCT-GTG-G--GAAA-GCA-----TTCAAT-CA--G-A---CA--TGTAAC-GT---A--A-A--G-A-CA-A-CA-T---GA---------------TGACA----C-AT-AC-----TG-G---TGAT-AAAC---C-T--T-ATA-A--A-T-G-T--GA-TGTCT-GTGGG--AA-GGCATTC-AGTC-----G-G---GC-ATACAAT--T-TAGA---GAG-A--CACA---AA-GGAGATCATGTATAGT----AGT-ATAAA-CC---T---------TATAATT-GTG--AT------GCCTGC-AAAAATA------CTT---TCAG-CAATATGGGATCA-TTATTTCG-CCACATGAAG-A--AA-ATACTG-G-TGG-TAA-AACCTTAA---TA-TATA-TG-ATGTC-CATG-GGAAA---ACATTTA--G--TGA-GACG-GCGA----C--TCACAGACACATAT--AAC---GATA-C---ATAC-------TGGTGATAAACCTTATAA---------T-CAATAAGA----C-----------A-------GAGAA-ATTACA---GAGACACATG-GGATTA-CATACTGGTGAT-AAACCTT-T-TGATTTATATATGTGA-TTGTATTGGTAAGCGTTCATGTAAAGGACACGTCGAAT-----TTT---TTA-AAC---TTG------T----TTTATTT-TTT--A--G----------------TTG-TATGCCT-----AGAT---TGA--C----T----A--A-A---TG------TG-C----------AT-----------G--T---------T-----------T---T--------------TG-TT----T------T-TT-TAAAA-G--T-TT-G--AAA-GC-ATAAAATTCAAT-TTT---TTTTGT-G---A-T-T-AAA-T---AT-T--TT--T--CT--------TGGTA-T--TTTCTGCGTCATG--------------AT-GTG-----TGACG-TCA--TATA-T---GTGACCT---TT--GCGA-------T---A-A--AA---C---TGTTA--GCCA-TATTAT----AGA---A--AATTC-GAT----TTAATGG-AC--A-A----AA----A-GTC-AA--TTATCACGAT------AA-CAGCTCG-C--AG--ATGACA-TT-A-CG-TT-TGG-GTGC
gi|10 : T--------CAGTA-T--TTTATGCGTCATG--------------AT-G-G-----TGACA-TCA--TGT------GTGTCCT---TT--GCGA-------T---A-A--AA---T---GGTTA--GCCA-TATTAT----AGG---A--AATTC-GAT----TTATTGG-AC--A-A----AAG---A-GAC-AA--TTATCACGTT------AA-CAGCTCG-C--AG--ATAACA-TT-A-CG-TT-CGG-ATG
gi|11 : ----GGT---GAAAAA-CA--A-AAAT----A----TC-A-----ATG-T------G-A------T-G--T-TGTTT-TAA-G---G----TATTA---TCTCG--G-----GCTT-AC-TT-A---AA-C----AAACACA----AGC----G-GA-A-C-A----TAC---G------GGTGA----G-AAA--CC-ATA----AA-AATGT-G-ATG-----T-T-GTGTG--GAAG-GCA-----TTCAGT-CA--G-T---CA--GGATAT-TT---G--A-A--GTG-C--A-CA-T---GA---------------TGACA----CTAT-AC------G-G---TGAT-AAAC---T-T--T--TA-A--ATT-G-T--GA-TGTCT-GTGGA--AA-GGCATTT-A-TT-----G-G---AA-AACCGAC-----GCA---GAGAA--AACA---CA-TGAGtactagctgccagaataagggtggtagcctaaattttttcagcttttcgaaggaaggtgcgaagaaatgtttgtcgatacaaggaataaataaataaaactgtcgcttttgtccatgtgctgtaaaaacaatacatgtaataaataaaggaaaacaaaaacagttggacaacaacccagcctaattgctagaaggtgtatatataaaagctaaacacggctagactcatagcgtaaattgtgtccaggccatttcatgaaatacacatctgcaccaattgacctacatataacataataggatttaatacttcaaagttaaatcggtttatcaaagcaaaatatcaattattctccgaaaacgtaccagcgtactttccgggtgctaactaactttatagtggggacacttgcttacgtcacgtcacgtcacgcccaccgtgcaagcatccccagcagtgagcgcatagaaattcaaagaggtatgaggtgttgaattctt
gi|12 : ttattagttttataatcaatttttattacttatgtgtgcagatagcccattagaaacagattaaattcatcagaacaggtcaaggttataatttgtcatcagagatatgttcaccaacactgacaacacgaatttagattgaatgaaacatcccattgcgaatagccctcctcagatgactattcttttcatcaaccaaccaatagctgcctgtgaaacaagtatgtatatctacccaaccaatggctgtctctgaaacaagtatcttctacacaaatcaaagactagcacaaacggaaaatataacggactttgtgaaactgttgaagcagtctgtgaaacaagtaaaaactcaagatctgaaaaatgatttacaggagtgtataaacaaaaatggaTCCCATG----TTT---CTA-AAC---TTTACATAAT----TTTATT-----------C-AAACAT-TACTTCTCTGATATACCT-----AAAAATTTGA--C----T----A--C-AGACTG------T--T----------ATTTAAATAAATAA--T---------T-----------TG--T--------------CG-CTC---T--AGGTT-TT-T-CAA-G--T-T--G--AAACGCAATGAAA-TCAAA-TC-------TGC-A---A-TAT--CA-TATGAT-T--TT--T--CTCAGCGCAACGGTATT--TTTGCGCGCCATGGGTGTGTTTTTGTTAT-TTG-----TGACG-TCAAGTATA-C---G---CCT---TT--G-GAATG----T---A-AACAA---C---TCTCAAGGCC--T-TTATC---AAA--TG--A--TCAGATCG--TTAATAG-ACTAA-A----AA----A-GGC-AAATTTATTA--TT------AATCAGATTC-C--AACTATAGCACTT-ATCGATT-CGA-GTG
gi|13 : aaccaggatcatatA--CACAT---GA------TA-C-ATAGTGGAGA-A-AAACT---T---T---ACT-T--ATGT--G-ATATTT-GTGGGAAGACATTGTCT-CG--C-AAAACAAAT-GCGAAAAGACACAT-GAG-GAAACAT-ACT----GGT---GATAAA-CCT------T----A----TA-A-----ATG-T------G-T------T-G--TCTCTGG-AAA-G---G----CATTC---AGTGA--GAAA--GGAA-TC-TT-A---CA-G----AAACACA----AGA----G-GATA-C-A----TAC---T------GATG------------C--------TAA----GT-C-AC--------------G--GAAG-GCA-----ACCAAC-CA--G-A---AT--GATAGA-GT---A--C-AGTG-A-C--A-CA-T---GA---------------TTATA----T-AT-AT-----TG-A---TA-----------------ATG-A--A-T-G-T--GA-TGTTT-TCGGA--AA-GGTATTC-AATC-----A-G---ACAACAC-AC--T-TATA---GAA-T--CACATT-AA-GG------CACGT-TT----GG---TACA-CC---------------TGAA-------AT------ACCTGT-GGGA---------CA---------------GGAAAC--TTACAGAA-ACACATGAGG-AC-AT-AGAATG-G-TGACCAA-AACttatgttaattgctacgggttgtaattaatgctgtaacggaattaagggttggctagtcctgattattttgtcaactttttcgaaggaatgtctgcgaggaattagtcgacacaagacttaacctataaacataacagtcgccctttagtccagtcgtacttgttttaaaaaaataataaaattaaggaaaacataaacttagtgatgggaacagtgcaacccgtagtctgataattgcgatgggaggggttgtttatataga
gi|14 : aaggcatttaactcttcattgacattaacatAA---TGA--T----T----A--A-A---GGACACATTG-C----------AT-----------G--T---------T-----------T---T-----------------CT----A--AACAT-TT-T-AAA------TT-GCTAAA-GCAA---AATT--AA-T-T---ATTTGC-GTGCA-TAT-GCA-T---AT-T--TTC-T--CT--------CTGTA-T--TTAACGC-CCATT--------------AT-GTG-----TGACG-TCA--TAT------GCGACCT---TCGAGCGA-------G---G--------------GTTT--G--ATTTTTTT----CAA--CG--GATTA-AAT----TTAATCG-ACTTA-AAAATAA----A-TGT-AA--TCATCAC--------------GCTCG-T--AG--ACAACA-TT-A-CG-TT-CGG-ATGgtgtgttcctgcatagccaaactgacctagtattgtttctgcataactccttatcctatatattttgacaagctcagaaaa
gi|15 : C-AGACAAT--T-TACA---GAG-A--CACA---AAAGGATA-CATGTATAGT----AGTAATAAA-TC---T---------TCTAATTCGT---AT------GCCTTC-GAGAATG------CAT---TCAG-CCAGATGGGATCA-TTATTTCG-ACATA------A--AG-ATAC-------A-TA-----CTTTA---TA-TATG-TG-ATGTC-CGTG-GGAAA---ACATTTA--G--TGA-GACG-G-GA----CACTTACAGACACATAC--AAG---GATA-C---ATAC-------TGGTGATAAACCTGATAA---------TTCAATAAGA----C-----------A-------GGGAA-ATTACA---GAGACACATG-AGGATA-CATATTGGTGAG-AAACGTTGT-TGATTTATATATGTGATTTGTATGGGTAAGCGTTAATTTAAAAGACATGTAGCATG----TTT---TTA-AACATTTTT------T----TTTA-TT-TTT--A--G----------------TTG-TATGCCT-----AGAA---TGA--C----TAC--A--A-A---TG------TA-A----------AT-----------G--TA--------T-----------T---TTGAATAAATCATTATG-CT----T--TG--G-TG-T-TAA-G--T-TT-T--AAA-GCAATCAATTTCAAA-------TTTTAC-G---ATTAA-ATA-T---AT-T--Tttatagtatcgacacaacgggcgcattagctgtcagaagctttgtgtttgttttagttttttcgaaagaaggtgcgaaggaaaagaccagtaatttttagttggcacagggtctttgtcgtaaaaaatccacacaaatcagtcacgtttgattatgtacctttttagaaaaagaagaaaaaaaaaggggggggggcaaaacggttgcaaagcgactcagtttaactacgagaaattggtcatatg
gi|16 : C-----A-G---GA-AAATGAT--T-TACA---CGA-A--TGTA---CA-A---A-CACAAATGGA----GGTGAAAAA-CAAAGT---------TATCAGT-GTC--AT------CTTTGT-TGGAAGG------CAT---TTA
gi|16 : ttattagtattataattatttttattatttttcttgcagaaatcccattagaaacatattaggttaatcagaaacatgtcaatgttttaaattggcatcacagatgtgttcactatcactgacaacactagaatttagactgtaatgcaacatccaattggaaatagccctcctcgtatggctattcttttcacccaactaaccaatggctgactgtgaaacaagtatgtctatctacccaaccaatggctgcctgtgaaacaagaatgtcttctacacaatcaagggctagcacaaacggaaaatacaacggacttagtgagactgtagaggctgtctgtgaaacaagtaaaactaaagacGGTGA-A-AAACAAAGT---T---A-TCA--GTGT--C-ATCTTT-GTTGGAAGGCATTTACT-Cctc
gi|18 : ttattagtattataattatttttattatttttcttgcagaaatcccattagaaacatattaggttaatcagaaacatgtcaatgttttaaattggcatcacagatgtgttcactatcactgacaacactagaatttagactgtaatgcaacatccaattggaaatagccctcctcgtatggctattcttttcacccaactaaccaatggctgactgtgaaacaagtatgtctatctacccaaccaatggctgcctgtgaaacaagaatgtcttctacacaatcaagggctagcacaaacggaaaatacaacggacttagtgagactgtagaggctgtctgtgaaacaagtaaaactaaagaccaggaaaatgatttacacgaatgtacaaacacaaatgga----GGT---GAAAAA-C---A-AAAT----A----TC-A-----ATG-T------G-A------T-G--TTTTT----AA-G---G----TATTA---TCTCG--GCT------T-AC-TT-A---AA-C----AAACACA----AGC----G-GATA-C-A----TAC---G------GGTGA----GAAAA--CC-ATA---TAA-A-TGT-GCATG-----TTT-GTG-G--GAAG-GCA-----TTCAGT-CA--G-T---CA--GG-AAT-TT---G--A-A--G-G-C--A-CA-T---G----------------TGACA----C-AT-AC-----TG-G---TGAA-TAAC---C-T--T--TA-A--A-T-G-T--GA-TGTCT-GTGGA--AA-GG-ATTG-TATT-----T-G---AA-AACCGAC-----GCA---GAG-A--AACA---CA-TGAGG--AC-CATACT----TGTGAGAGA-CC--------------ATAAA
gi|19 : agcacaaacggaaaatataacggactttgttgaaactgttgaagcagtctgtgaaacaagtaaaaactcaagatctgaaaaatgatttacaggagtgtataaacaaaaatgga-AATG-TG-TTGTTGTGTG-GGTAG---GC-TTCA--G--CGA-GACA-G-GAAGATT--TTACAG-CACACA----AGTTTGACAAC---ATCT-------TGGTGATAAACC-TATAAATGTGATG-T-CTGCGGGAGGTTC-----------AGTCGTATGGGAACATTAAG---GGGACATAAG-AGTAT--CAT-CTGATGATAAAACCAT-A-TAATGTAAATGTTTGa
gi|19 : AG--CACAC---AAGTTTGACAAC-ATCTTGGTGA-T-AAACC---TA--T---A---A--ATGT--G-ATGTCT-GCGGGAGG---TTCAGT-CG--T-ATGGGAACA-TTAAGGGGACATAA-GAG-TAT-CAT--CT----GAT---GATAAAACC------AT----A----TA-A------TG-T------A-AA-----T-G--TTTGTGG-GAA-AAAAG----CATTC---AATTG--GAGACAGAAC-AT-TTTA---AA-A----AGACACA----AGA----T-GATA-CCA----TAC---T------GGTGT----TTAAA--CCCTTA---TAA-A-TGT-G-ATG-----TGT-GTG-G--GAAG-GCA-----TTCCGT-GA--G-A---AA--GGACAT-TTTAAA--A-A--G-A-CA-A-GA-T--------------------TGATA----C--T-AC-----TG-G---TG-T-AAAC---C-T--TAATA-A--A-T---T--GA-TGTGT-GTGGGGAAA-AGCATTC-tgggaaaaaagcattcaattggagacagaacattttaaaaagacacaagatgataccatactggtgtttaaacccttataaatgtgatgtgtgtgggaaggcattccgtgagaaaggacattttaaaaagacaagattgatactactggtgtaaaccttaataaattgatgtgtgtggggaaaagcattc
gi|2 : aatgtgttgttgtgtgggtaggcttcagcgagacaggaagattttac----A----TACA-----ATG-T------ATA------T-T--TTTGTGG-GAATA---A----CATAT---AGTTGT-GTAA--AGGT-GCGTT-A---TGTG----ATACACA----CGT----GCGAT--T-A----TAC---T------G-TGG----AGA-----C-TTC---TGA-CATGT-G-ATA-----GTT-ATG-T--GAAA-TCACTTGATTAAGTTCA--G-A---CA--GGAGAT-TT---A--AGA--G-A-CA---CA-G---GA---------------GGATA----C-AT-A------TG-G---TGAAGAAAT---C-T--T-CCA-ATAA-T-G-TTGGA-TGTCTTGCGAA--AA-GG-ATTC-AGT------G-C---GT-AAGGGATCAT-TACA-------------A---TC-GAAGA-CACA-A-ACTTCAAGGTGATAAA-CA---TAGAAATAACTGTAAGG-GTGAAATTTATGAGTCTGTCGTGAAGC------GATTTCTTAG-TGCGAAGGGATCA--TACAAA--ACATATGAGG-A--TA-ATACTG-G-TAA-T---AACCCTTA---TATAATGTTGTATGTC-T-TGTGGAAG---ACATTCACTGACTGA-GA-G-G-AA----C--TTATTAACACACAT--GAG---GA-A-----ATAC-------TGGTGAAAAACCTTTTAAATGTGATTGT-CTGTGAGAAG--CTTCAGTCATCGA-------GGGAC-CTTACAGAGGAGACACATGAAGGAAATCATACTGGTGAG-AGACCCT-TATAATT
gi|2 : agccttagttcaagatatgtctttacgccactgtatttgattaagaaaacgtgatacagacttcAGAGA--CACAG---GAG---GATA-C-ATA-TGGTGA-AGAAATC---T---TCCAA-T-A--ATGTTGG-ATGTCTTGCGAAAAGG-ATTCAGTGCG--T-AAGGG-ATCATTA------CA-ATCGAA-GACACAA-ACTTCAAGGT---GATAAA-CAT-AGAAAT----AACTGTA-A-----GGG-T------G-AAATTTAT-GAGTCTGTCGTGAA-G---C----GATTTCTTAGTGC--GAAG--GGAT--C-AT-A---CA------AAACATA----TGA----G-GATA---A----TAC---T------GGT-A----ATAAC--CC-TTA---TAT-AATGTTGTATG-----TCTTGTG-G---AAG-ACA-----TTCACT-GACTG-A---GA--GG-AAC-TT---ATTA-A--C-A-CA---CA-T---GA---------------GGA-A------AT-AC-----TG-G---TGAA-AAAC---C-T--T-TTA-A--A-T-G-T--GATTGTCT-GTGAG--AA--GC-TTC-AGTCATCGAG-G---G----AC--C--T-TACAGAGGAG-A--CACATG-AA-GGAAA-T---CATACT----GGTGAGAGACCC---T---------TATAATT-G-A--AT------GTCTGG-GTAAAAGATGTTTTAT---TGA--CAATA--GAAAC--CTATAGAGCACACATTAGACAACAC-ATAATGCGTTGA--AA-GACCATTA---TGTAATGTTG-AT-TT-TGTG-GG-AG---ACA-TCA--A--TTATTATA-C-AA----CCGTAAAAAACTCACATTGAAG---GATA-CCAAAT-C-------TAGTGAC-AGCCTTATgaatgtctgggtaaaagatgttttattgacaatagaaacctatagagcacacattagacaacacataatgcgttgaaagaccattatgtaatgttgattttgtgggagacatcaattattatacaaccgtaaaaaactcacattgaaggataccaaatctagtgacagccttatcagtgtgatgcttgttcgaaacattcagtcagtagagaagacttactgtgtcacaaagataagacatcaacagtgaatgtagtgtctgtggaaagtgtacaccgatgggtcgcagacttagaagcaccatgggacacatac
gi|2 : agccttagttcaagatatgtctttacgccactgtatttgattaagaaaacgtgatacagacttcatacaatgtatatttttgtgggaataacatatagttgtgtaaaggtgcgttatgtgatacacacgtgcgattatactgtggagacttctgacatgtgatagttatgtgaaatcacttgattaagttcagacaggagatttaA--TACA---AAA--CATAT---GAG---GATA---ATACTGGTAA-T-AACCC---T---T---A-T-ATAATGTT-GTATGTCTTGTGG-AAGACATTCACT-GA--CTGAGAGGAAC-TTATTAACACACAT-GAG-GA-A-AT-ACT----GGT---GAAAAA-CCT------T----T----TA-A-----ATG-T------G-A------TTG--TCTGTGA-GAA-G--------C-TTC---AGTCATCGAG---GGAC--C-TT-ACAGAG-G----AGACACA----TGAA---G-GAAATC-A----TAC---T------GGTGA----GAGAC--CC-TTA---T---AAT-T-GAATG-----TCT-G-G-GTAAAAG-ATG-----TTTTAT-T---G-A---CAATAGAAAC-CT---A--T-A--G-AGCACA-CA-TTA-GA---------------CAACA----C-AT-AA-----TGCGT--TGAA-AGAC---CAT--T-ATGTA--A-T-GTT--GA-T-TTT-GTGGG---A-GACA-TC-AATT-------A---TT-ATACAAC--CGTA-A---AAA-ACTCACATTGAA-GGATA-C-CAAAT-CT----AGTGAC-AG-CC---T---------TATCAGT-GTG--AT------GCTTGT-TCGAA-A------CAT---TCAGTCAGTA-GAGAAGACTTACTGTG-TCACA------A--A------------GA-TAA-GACATCAACAGTG-AATG-TA-GTGTC-TGTG-GAAAGTGTACA-CCG--A--TGG-GTCGCA-GA----C--TTAGAAGCAC-CAT--G-G---GACA-C---ATAC-------cagtgtgatgcttgttcgaaacattcagtcagtagagaagacttactgtgtcacaaagataagacatcaacagtgaatgtagtgtctgtggaaagtgtacaccgatgggtcgcagacttagaagcaccatgggacacatac
gi|20 : agccttagttcaagatatgtctttacgccactgtatttgattaagaaaacgtgatacagacttcatacaatgtatatttttgtgggaataacatatagttgtgtaaaggtgcgttatgtgatacacacgtgcgattatactgtggagacttctgacatgtgatagttatgtgaaatcacttgattaagttcagacaggagatttaagagacacaggaggatacatatggtgaagaaatcttccaataatgttggatgtcttgcgaaaaggattcagtgcgtaagggatcattacaatcgaagacacaaacttcaaggtgataaacatagaaataactgtaagggtgaaatttatgagtctgtcgtgaagcgatttcttagtgcgaagggatc-----G-G---GC-A----AC--T-TACA---GAG-A--CACA------GTA----ACACACACT----GGTGACAAA-TC---T---------TACCAAT-GTG--AT------GTTTGT-TGGAAGA------CAT---TCAG-TTATTCAGGATCA-TTGCAAAA-GCAC---AGA-A--AG-ACAC-------A-TAATAATCCTAA---TG-AATT-TG-AAATT-TGTC-GGA-----ACA-----------------------------TTACAGACACACAT--GAG---AATA-C---ACAC-------TGGTAATAAACC
gi|20 : ttatttcgaa--TACAGAGA----CACAG---TA-----ACA-C-ACACTGGTGA-C-AAATC---T---T---A-CCA--ATGT--G-ATGTTT-GTTGGAAGACATTCAGT-TATTC-AGGATCATT-GCAAA-AG-CACAG-AAA-GACACAT-A-------------ATAAT-CCT-A---------A----TG-A-----ATT-T------G-A------A-A--TTTGTCG-GAA----------CAT---------------------T-AC---------A-G----ACACACA----TGA----G-AATA-C-A----CAC---T------GGT-A----ATAAA--CC-AGA---T-A-TATGA-G-ATA-----TTA-ATG-T--TAAC-GCA-----TTAAGC-CA--G-A---CA----TAAC------A--G-A--G-A-CATT-CAGT---GA----------------GACGGGATC-AT--------TA------GAA-AAAC-----------------A-T-A-T--GA-AGAC----GCA--AATGGCATTCGACTC-----G-A---A--AGTCCAC--T-TACA---AAT-A--CACA---C---GATA--ACACTCACT----GGTGATAAT-AT---T---------TA-AAAG-GTG--AT------ATATGT-Gagatatatgagatattaatgttaacgcattaagccagacataacagagacattcagtgagacgggatcattagaaaaacatatgaagacgcaaatggcattcgactcgaaagtccacttacaaatacacacgataacactcactggtgataatatttaaaaggtgatatatgtg
gi|23 : ttatttcgaagggcaactA-AAC---TTG------C----TTTGTGT-GCT--A------------C--TTCTTTG-TGTGCCTCCCCTAAAA---TGA--C----T----ATAA-A---TG-------G-T----------AT-----------T--TGAATTATTAT-----------T---T--------------TG-CT----T--AG--T-TT-T-CAA-G--T-TT-GA-AAA-GCAATTAAATTCAAA-TCC---TT---C-A---A-TAT-GCA-G---AT-T--TT--T---T--------CGGTA----TTTGCTGTCCATG--------------AT-GAG-----T-ACG-TCA--TATGCC---GT--CCT---TC--GCGA-------G---A-A--AA---CAATTGTTA--GCCA--ATCAT----GAA--CA--AGATC-GA-----TTAATGG-AA--A-A----AA----AGGGCAAA--ATATCACATTACCGTAAA-CAGCTTG-C--AGTTATAACA-TT-A-CG-TT-CGG-
gi|25 : catcgtttaaacttttatttttaaagaaaATG----TTT---TCA-AAC---TT-------T----TTTATTT-GTC--AT-GC-AAA-AT-CACTTCTTTG-TATGCCT-----AAAA---TGA--C----TAC--A--A-A---TG------TA-TTTTGAATAA-AT-----------T--A---------T-----------T---T--------------TG-CT----T--AG--T-TT-T-CAA-G--T-TT-G--AAA-GCAATGAAATTCAAA-TC------TTGC-A---A-TAT-GCA-T---AT-T--TT--T--CT--------CGGTA-T--TCTGCGCGCCATG--------------GT-GTG-----TGACG-TCA--TACA-C---G---CC---------CGAATGAATGT---A-AACAA---G---TCTCA--GACA-TATTAT----AAA--TA--AATAC-GAT----TTAATGG-ACA-A-A----AA----A-GGC-AA--TAATCACGTT------AA-CAGAATG-C--AG--ATAACA-TT-A-CG-TT-TGGTGTGtgttgaacattgtgtcattcggtgtgatagctgtcagag
gi|26 : CATG----TTT---CTA-TAC---TTT------A----AGTAATT-TTT--AT-GC-AAATATAC--TTCTCTG--GTAACT-----AAAA---TGA--C----T----A--ACA---GA------TG-T----------AT--------------T---------C-----------T---TAAATTA--------TG-CT----T--AG--T-TT-T-CAA-G--T-TT-G--AAA-GCAATGAAAATCAAA-TCT---G---GC-A---A-TAT-GCA-T---AT-T--TT--T--CT--------CGGTA-T--TTTGCGCGCCATG--------------GT-GTG-----TGACG-TCA--TATA-C---G---CCT---TT--G-GAATG----T---A-AACAA---C---TCTCA--GGCC-TATTAT----AAA--TA--GATTC-GAT----TTAATAG-ACA-A-A----AA----A-GGC-AA--TTATTA--TT------AA-CAGATTC-C--AA--ATAGCA-TT-A-CG-TT-CGA-GTG
gi|27 : agttatcACAT-ACT----GGT---AATAAA-CCT------T----A----TA-A-----ATG-T------A-A------T-G--TCTGTGG-GAC-G---G----CATTT---ATCCA--GAAT--GGAA-AC-TT-A---AA-A----GCACACA----TGA----G-GACA-C-A----TAC---T------GGTGA-----TAAG--CC-TTA---TAA-A-TGT-G-ATG-----TCT-GTG-G--GAAG-GCA-----TTCAGT-CA--A-A---CA--GGAATC-TT---AC-ACA--G-A-CA---TA-T---GA---------------GGATA----C-AT-AC-----TG-G---TGAG-AAAC---C-T--T-ATA-A--A-T-G-T--GA-GGTCT-GTGGA--AA-GGTGTTT-AGCT-----G-G---GC-AGGAGAC--T-TACAT--G------CACA---CA-TGAGA--ACACATACT----GGTAACAAA-CC---A---------TATAAAT-GTG--AT------ATATGT-GGGAt
gi|29 : cATCTGAAAAATG-A--TTTACAGGAA--TGTAT---AAA---CAAA-A-ATGGAGGTGA-A-AAACA---AAAAT---A-TGA--ATGC--G-ATGTTT-GTTTTAAGGTATTAACT-CG-----GGCTTA-C-TTGAGCAGACACAT-GAG-GATACAT-ACT----GGT---GAGAAA-CC------GT----A----TA-A-----ATG-T------G-A------T-G--TTTGTGG-GAA-G---A----CATTC---AGTCA--GACA--GGAT-AT-TT-G---AA-G----GTACACA----TGA----
gi|29 : aaactcaag----GGT---GAAAAA-CA--A-AAAT----A----TG-A-----ATG-C------G-A------T-G--TTTGTTT-TAA-G---G----TATTA---ACTCG--G-----GCTT-AC-TT-G---AG-C----AGACACA----TGA----G-GATA-C-A----TAC---T------GGTGA----G-AAA--CC-GTA---TAA-A-TGT-G-ATG-----TTT-GTG-G--GAAG-ACA-----TTCAGT-CA--G-A---CA--GGATAT-TT---G--A-A--G-G-TACA-CA-T---GATTNNNNNNNNNNNNNNNNNN----N-AA-ACAAAAATG-GAGGTGAA-AAACAAAA-A--T-ATG-A--A-T-G-C--GA-TGTTT-GTTTT--AA-GGTATTA-ACTC-----G-G---Gttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaaacaaaaatggaggtgaaaaacaaaaatatgaatgcgatgtttgttttaaggtattaactcggg
gi|3 : aaactcaagatctgaaaaatgatttacaggaatgtataaacaaaaatggaATG----TTT----TATAAC---TT------------TTTATTT-GTC--AT-GCCAAA-AT-CACTTCTTTG-ATTGCCT-----AAAA---TGA--TA---C----A--A-A---TG------TA-TTTTGA-----AT-----------AAAT---------TATG--------T---T--------------TG-CT----T--A---T-TT-T-CAA-G--T-TT-G--AA--GCAATGAAATTCAAA-TCT---T---GC-A---A-TAT-GCA-T---AT-T--TT--T--CT--------CGGTA-T--TCT--GCGCCATG--------------GT-GTG-----TGACGTTCA--TACG-CCCAATGAA------T--GTAA-----------A-C--AA---C---TCTCA--GGCA-TACTAT----AAA--TA--GATAC-GAT----TTAATGG-ACA-A-A----AA----A-GGC-AA--TTATCACGTT------AA-CAGTTTG-C--AG--ATAACA-TT-A-CG-TT-CGG-GTG
gi|30 : ctcctaAGAGACACAT-GAACAATACATTACT----GGTTTTGATATA-TCC-T-CATT----A----TA-ACTGATATGAT------G-A------T-G--TCTATGG-GAA-T---T----AGTTG---AGTAG--GGCA--GGAT-CA-TT-G---AG-G----ATATACAAATCTGATAAAG-GGTA-T-ACTTTTACACATA-----GGTGC----ATAAAAGCC-TTAATATAGGAATGT---ATG-----TCT-GTT-G--GAAGTGC------CTCAAT-CA--C-AAACCA--CGAA---TT---A--C-AC-A-A-CA-ATCA-T----A---------------GGGCA----C-ATTAC-----TGTA---TGAT-AAAG---C-CAAT-ATA-A--A-T-G-T--AA-TGTGG-TTGGG--AA-GGAGTTT-AATttgtgtgtcggttacgggtgtactagatgtcagaattagggtagtagcctaagtttttttttcaactttttcgaaggaaggttcgaggaaattttgtgtcgactcaaggactttaccataaataaaacagtcgattttctctttgtactgctaaaaaaataaaggaaaacataaacagttcgacagcaaccccgattaattgcgcgagaaggtgtttatatagacgctattgacacggattaagtctacaacgtttatttatgtacaggccatttcacgaaatacacgctcgcactcaaactgacctacataatagcacaacaacaaatactcctgaaggttcgtgttcccatttcctaccaaatcgcacatttaaaaaaaaaaaataacattacaataattaaagatcgaacttgtgtaaaaattacaaataagaaaatatgtagttcctcagtaaacatttataattttttcgtggacgcgcttttaaccatgacatgagatgtgtattgctgacaatgctctccggcattaccttgc
gi|31 : cTGTTTGTTT--AAAGC-AAA-AT-TACTTCTTTG-TATGCCT-----ATAC---TGAGTT----T----A--A-A---TA------TG-TTTTGAATAAAAT-----------G--T---------T-----------T---T---------------G-CT----T--AG--T-TT-T-TAA-G--T-CT-G--AAA-GCAATGAAATTCGAA-TC------TTGT-G---A-TAT--CA-T---AT-T--TG--T--CT--------CGGTA-TAGTATACGTTCCGTG--------------AT-GTG-----TGTCG-TCA--TAT------GCGATCT---TT--GCAA-------G---A-AACAA---CT--TGTTA--GCCA-TTTTAT----AAA--CA--AACTT-CATTTAATTAATCG-AC--A-A----AAC---A-GGC-AA--TTATCACGTT------AA-CAGCT
gi|32 : acatttcgAAA--GC-TTA---TAA-A-TGT-G-ATT-----TTT-GTG-G--GAAA-ACT-----TTGAGT-TG--T-A---AA--GCTGCG-TT---A--C-T--G-A-TACA-CA-C---GA---------------GGATC----C-AT-AC-----TG-G---TGAG-AGAC---C-T--C-ATG-A--A-T-G-T--GG-TGTTT-GTGGG--AA-GACATTC-AATC-----A-G---AC-AGGAGAC--T-TACA---GAG-A--CACA------GGAGG--ATACATACT----GGTGAAAAA-CC---T---------TATAAAT-GTG--AT------GTCTGT-GGAAAGG------CAT---TCAG-TGCGAAGGAAACA-TTACAAAA-ACACGTGAGG-AT-AC-ATACTG-G-
gi|33 : ACAGACAAATGCACAT---GAA---GACA-CAAAACTGGTGATA-AAACC---------------A--A-------ATGAAT-GTGGGAAAGCTTT----------------GAT------GGAAAC------AA-GCTAGAT-ACT----GGT---GATAAA-CCT-----------------------------T------G-A------T-A--TCTTTTG-CAA-G---GTGTACATCC---GGTCA--GAT---CGATGAC-TT-C---TA-GTTCTAAACACG----TGA----A-GATA-C------TGT---TC-----AGTGATCTTACAAG--TC-CTA---T-A-AATGT-G-GTG-----CCT-GT
gi|34 : ga-AAAC---C-T--T-ATA-A--A-TAG-T--GT-GGTTT-GTGGG--AA-Gtaacaag
gi|36 : agtgtaaacagaaaaagtaatgaatgtagtgaacttaggaaacctgtttgtgaaataattcaactaaagatcagaaaaatgatttacagagaacgggtgaaagatattggagtaaaaacatgttttcactgtgatgatagatatgcacaaaaggcgcaaagaacttcaagaCA----TAA----G-GACA-C-A----TAT---T------GATGA-----TAAA--CC-TT-----------GT-T-ATT-----TCT-GTG-G--GAAG-GCA---------AT-CA--G-A---CG-------C-T---------A--G-A-C----------------------------TTACA----C-AT-AA-----CA-G---TGAT-AGAC---C-C--T-ACA-A--G-T-G-T--A---GTTT-GTAGA--AA-GCCATTA-GGTC-----G-GACAGC-ACACCAA--T-TACA---AAG-T--CACA---CA-AG-GA-CACATAAACT----G--GATAAA-aacatcaat
gi|38 : ----ATACATA----TTA----G-AAGA-C-A----TGC---T------GGTGA-----TAAA--CC-TTT---TAA-A-TGT-G-ATA-----TAT-GTG-G--AAAG-GCA-----TTT-GT-CTT-G-A---AA--GTAGAA-TT---A--A-A--A-G-CA---CA-TTTTG----------------TGACT----C-AC-AC-----TG-G---TGAA-AAAC---C-A--T-TTC-A--A-T-G-T--GG-TGTCT-GTGGG--AA-GGTATtggagatatgtgagagaggaa
gi|38 : gagaatatctgcgtGGAAAGGCATTT-GTCTTGAAAGTAGAATTA----AAAG--CACATTTTG-T---GACT-C-ACACTGGTGA-A-AAACCA--T---T---T-C-A--ATGT--G-GTGTCT-GTGGGAAGGTATATGGT-CT--A-AAAGTTGTG-TTAAAGAatggtctaaaagttgtgttaaaga
gi|39 : gagaatatctgcgtatacatattagaagacatgctggtgataaaccttttaaatgtgatatatgt-A----CAC---T------GGTGA-----CAAA--CC-AT----TCA-AATGC-G-AGA-----TCT-GTG-G--ACGG-GCC-----TTCCGA-CA--A-C---CA--GGCAAT-TT---G--A-C--G---CG-T-CA-TC--GAC--------------TGACC----C-AC-AC-----CA-C---AGTC-AAAC---C-T--T-ACG-T--C-T-G-C--CC-AACCT-GCAAC--AA-AGCATTC-AACC-----G-G---GC-CTCCAAC--T-TACA---CAC-G--CACA---
gi|4 : ----TTT---C-A-AAC---TT-------T----TTTATTT-GTC--ACTGC-AAA-AA-TCATTCTTTG-TATGCTA-----AAAA---TGA--C----TTACGA--A-A---TG------TA-TTTTGAATAA-AT-----------T--A---------T-----------T---T--------------TG-CT----T--AG--T-TT-T-CAA-G--T-TT-G--AAA-GATATGAAATTCAAA--------TTTGC-A---ATTAG-CCA-T---TTCT--TC--T--CT--------CGGTA-TTGTCTGCGCGCCATG--------------GTGGTG-----TGACG-TCA--TAT--C---ACGCCCTAG-TT----AA-------T---GTA--CA---C---TTCTA--GCCA-TAT--------AA--TA--A--TT-GAT----TT-ATGG-AC--A-G----AAACAGA-GAC-AC--TTATCA-GTT------AATCAGCTTG-CAAAG--ATAACA-TT-A-CG-TT-CGtgcgcactcacac
gi|40 : ATCACATT------AA-CAGCTTG-C--AG--ATAACA-TT-A-CT-TT-TGG-GTGccctcttgtgttgtcattagcggatgtactacttgtcagaatagggtggtcctgagtagtcaactttttcgcaggaaggacgaggaaactttttgtgtcgactcaaggactttacgcataaataaaacaagtccgtttggtctttgtctgttaaaaaaaaataaaggaaaaagacagttggacagcaccccagattaatgcgcgaggaaaggttgtttttatatagaagctagacacagattaggtctacaagcgttttatatgtcagcctttcacgaaatacacgctcgcctcaactgacctacatcaatagcataattgttacaacaaatacttcaagttcctgttcccatttcctaccaaatgaaatgataataatacaatagttaaagattgaactgtataaaaatacaaaaagaaatatgtaagtccttcagtaagccatttgtataaatatatattttcgtcgacgcgcttttaaccatgacatgagatgtggtattgctgacaatgctctctctccggcattatttgc
gi|41 : TG----TTT---CTA-AAC-----G------T----TATAATT-TTT--AAAGC-AAA-AC-TACTTCTCAG-TATGCCT-----AAAA---TGG--C----TTA--A--A-A---TG------TA-TTTTAAATA--AC-----------A--TA--------T-----------T---T--------------TA-CT----T--AG--T-TT-T-CAG-A--T-TT-C--AAA-TCAATGAAATTCAAA-CC------TTAC-A---T-TAT-ACATT---TT-T--TT--T--CT--------TGATA-T--ttgtgtgtcggttgatggtgtactagctgtcagaattagggaggtagcccgagtttttcaactttttcgaaggaaggtgcaaggaaaatttgttgatacaagaactttttcataaataaaactgttgcttt
gi|43 : cattgatAAAGGACACATAGCATAGATACTTAAATTA-AAC---TTT------T----TTAATTT-CTT--AA-GC-ACA-AC-T----CTTTG-TGTGCCT-----AAAA---TGA--CACTTT----A--A-A---TG---------------------T-----------G--T---------T-----------T---T--------------TG-AA----TAAAG--TCTT-T-CAA-AACT-TT-GA-AAA-GTGATGGAATTGAAA-CAA---TCTTGCAA---A-TAT-a
gi|44 : GGGCACATCGCATG----TTT---CTA-AAC-----A------T----TTTGATT-TTTGAA--GC-AGA-AT-TGCTTCTTTG-CATGCCT-----AAAA---TAA--C----TCTG-A--A-T---TGATTT--TG-A----------ATAAA--------A--TA--------T-----------T---T--------------TG-CT----T--AG--T-TT-T-C------T-T---------GCGATGAAATTCAGA-TA------TTGC-G---A-TAC-GCA-T---AA-T--TT--T--C
gi|47 : GA-GATG-G-GG----TCATTACAGAGACACAA--GAG---GATA-C---ATACATGATACTGGTGATAAACATTAT-----------T-AAAAAAAA----T-----------ATT-----GGGCA-CTTAAA---GACACGCAAG-ATGATA-CCTACCAGTGAA-AAA
gi|5 : -AAAT----A-----A-A-----ATG-CCCTTTCG-A------C-G--TCTGTGG-GAA-G---G----CATTC---CGTGA--GACA--AGTA-AG-GT-A---AA-G----ACACACA----TGA----G-GATA-C-A----TAC---T------GGTGA-----TGAA--CC-TCA---TAA-A-TGT-G-ACG-----TCT-GTG-G--GAAG-GCA-----TGCAGT-GA--T-A---CA--AGTAGC-TT---A--A-A--G-A-CACA-CA-T---GA---------------GGATA----C-AC-AC-----TG-G---TGAT-AAAC---C-T--T-ATA-A--A-T-G-T--GA-TGTCT-GTGGG--AA-GGCATTC-AGTC-----G-G---GC-ATACAAT--T-TAGA---GAG-A--CATA---AAAGGATA-CATGTATAGT----AGTGATAAA-CC---T---------TATAATT-GTG--AT------GCCTGC-GAAAATA------CTT---TCAG-CAATATGGGATCA-TTATTTCG-CCTCATGAAG-A--AACATACTG-G-TAA-TAA-A-CCTT-A---TA-TATA-TG-ATGTC-TGTG-GGAAA---ACATTTA--G--TGA-GACG-G-GA----CACTCACAGACACATAT--AAG---GATA-C---ATAC-------TGGTGATAAACCTTATAA---------TTCAATAAGA----C-----------A-------GGGAA-ATTACA---GAGACACATA-GGGATA-CATACTGGTGAT-AAACCTT-T-TGATTTATATATGTGATTTGTATTGGTAAGCGTTCATGTAAAGGACACGTCGAATG----TTT---TTA-AAC---TTG------T----TTTATTT-TTT--A--G----------------TTG-TATGCCT-----AGAT---TGA--C----TAC--A--A-A---TG------TG-C----------AT-----------G--TA--------T-----------T---T--------------TGTTT----T--TT--T-TT-T-AAA-G--T-TT-G--AAA-GCAATAAAATTCAAA-T-T---TTTTGT-G---A-T-T-AAA-T---AT-T--TT--T--CT--------TGGTA-T--TTTCTGCGTCATG--------------AT-GTG-----TGACG-TCA--TATA-T---GTGACCT---TT--GCGA-------T---A-A--AA---C---TGTTA--GCCA-TATTAT----AGA---A--AATTC-GAT----TTAATGG-AC--A-A----AA----A-GTC-AA--TTATCACGAT------AA-CAGCTCG-C--AG--ATGACA-TT-A-CG-TT-TGG-GTGC
gi|51 : ---------T-----------T---T--------------TG-CT----C--AA--T-TT-T-GAA----T-TT-G--AAA-GCAAGGAATTTCTAA-------TTTTGT-G---A-TAC-GTA-T---t
gi|53 : ctaagtgaaataagtatcaagtgaagtaTTG-CATGCCT-----AAAT---TAA--CTT--T----T--A-A---TG------TG-T--------------------------T---------T-----------T---C--------------TG--TGAAAT--AT--T-TTGC-GAA-A--TATT-G--AAT-TC-ACGAAATTCGAA-TC------TTGT-G---A-TAC-GCA-T---tagcatcagatag
gi|55 : cC-TT-A---CA-G----AGACACA----TAA----G-GACA-C-A----TAC---TATATGCAGTG-----ATTGA--TC-TTA---TAA-AATTT-G-ATG-----TCT-tat
gi|56 : CACA----TGA----G-GACA-C-A----TAC---A------GGAGA----AC-GC--CC-GTA---C-A-AATGT-A-ACA-----CGT-GCG-G--GAA--ACAG----TTCGCT-CA--GTA---CG--GGACAC-Taggtatgaaaagtgttc
gi|57 : AAAGGACACATCGCATG----TTT---CTA-AAC---TTT------T----TGAATTT-TGC--A--GC-AAA-AT-TACTCCTTTG-TATGCCT-----AAAgta
gi|6 : AAGGACATATTGCATG----TTT---CTA-AA----TTG------TTAGATTTTTTT-TTT--A--AC-AAA-AT-TAGGTCTTTG-CATGACT-----AGAA---TGA--CTT--T----A--G-A---TG------TG-TTTTAAATGAAAT-----------A--T---------T-----------TTAAT--------------TA-CG----T--AG--T-TC-T-TGA-G--T-TT-G--AAA-G-------GTACAAA-TCTCAGTCTTGC-G---A-TAT-GCA-T---AT-TAATT--TTACTTA------TGATA-T--TTTATGTACGATG--------------AA-GTGTCGTCTGACA-TCA--TAT------GTGACCTAGAGT--AAGG-------TCTGA-A--AACAGC---TGTTA--GCCA-TTCTAT----AAATTTATTGATTA-GAT----TTAATTG-AC--A-A----AAT---A-GCC-CA--TAGCTATG-T------A------TTG-T--AG--ATAACT-TT-G-CA-TG-GGG-GTGC
gi|61 : AT---GAG---GACA-C-ATACTGGTGA-G-AAACC---A---T---A-T-A--Atgtgcaccatttatgggtgcacatatactaagtgtcaaaagaagtgatgtatagactgaggtttttcaaatttttctaaagaaggtgtgaggaaaaagaagtgggtgatttttttgtcagcacattaaggacttggtcataacccctcccctctacagtcacctttgtccatgttctttttcaaaaaactattggacagagacccatttaactgtgaggaaatagttatgtagaagccaggcacagctaggcctacagtatatggattctgttctggtcgtcatcatttcacaaatactcactcgcaccttggaaataaaaacggacattgtaacagtatatacttgtgttcccagttcctgtaaacttgtagaattataaaaaaaaaaataaattaaagattgaaaataattgaactt
gi|7 : ACA--GGAA-GC-TT-A---CA-G----GCACACA----TGA----C-AACA-C-A----CAC---T------GGTGA----A-AAC--CC-TTA---CAA-A-TGT-G-GTG-----TCT-GTG-A--AAAA-GCA-----TTCCCT-CA--C-A---TA--AGTCCT-TT---A--C-A--G-A-GACA-CA-T---AA---------------TGATA----C-AT-AC-----TG-G---TGAT-AAAC---C-T--T-ACA-A--A-T-G-T--GA-TATCT-GTGGA--AA-GGCGTTC-ACTT-----ATA---AT-GGA-GAC--T-TGCG---TAG-A--CACAC--CA-GG-----ACANNNNNN----NNNNNNNNN-NN---N---------NNNNNNN-NNN--NN------NNNNNN-NNNNNNN------NNN---NNNN-NNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNN-NNNNNNNNNN-N--NN-NNNNNN-N-NNN-NNN-NNNNNNNN---NN-NNNN-NN-NNGTG-TGTG-GGAGG---GCATTCA--G--TGA-GACA-G-GAGC--C--ATGCGGAAGCACAT--GAA---GATA-C---ATGC-------Ta
gi|7 : cattccctaacGTGT-GTGGGAGGGCATTCAGT-GA--G-ACAGGAGCC-ATGCGGAAGCACAT-GAA-GATACAT-GCT----NNN---NNNNNN-NNN-N-NNNN----N----NN-N-----NNN-N------N-N------N-N--NNNNNNN-NNN-N---N----NNNNN---NNNNN--NNNN--NNNN-NN-NN-N---NN-N----NNNNNNN----NNN----N-NNNN-N-N----NNN---N------NNNNN----NNNNN--NN-NNN---NNN-NNNNN-N-NNGTGATGTCT-GTG-G--AAAG-GCA-----TTCAGC-CG--T-A---C---GGGAACATT---A--A-A--G-A-GACA-CA-T---GA---------------nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngtgatgtctgtggaaaggcattcagccgtacgggaacattaaagagacacatgacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaaccatatcagtgtgatgtctgtgggaaggctttcaggcattcagtaacattatataagcata
gi|7 : cattccctaacacaggaagcttacaggcacacatgacaacacacactggtgaaaacccttacaaatgtggtgtctgtgaaaaagcattccctcacataagtcctttacagagacacataatgatacatactggtgataaaccttacaaatgtgatatctgtggaaaggcgttcacttataatggagacttgcgtagacacaccaggacannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn-GTG--AT------GTCTGT-GGAAAGG------CAT---TCAG-CCGTACGGGAACA-TTAAAGAG-ACACATGAcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaaccatatcagtgtgatgtctgtgggaaggctttcaggcattcagtaacattatataagcata
gi|7 : cattccctaacacaggaagcttacaggcacacatgacaacacacactggtgaaaacccttacaaatgtggtgtctgtgaaaaagcattccctcacataagtcctttacagagacacataatgatacatactggtgataaaccttacaaatgtgatatctgtggaaaggcgttcacttataatggagacttgcgtagacacaccaggacannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngtgtgtgggagggcattcagtgagacaggagccatgcggaagcacatgaagatacatgctnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnAA-CC---A---------TATCAGT-GTG--AT------GTCTGT-GGGAAGG------CTT---TCAG-GCATTCAGTAACA-TTATATAA-GCATAcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaaccatatcagtgtgatgtctgtgggaaggctttcaggcattcagtaacattatataagcata
gi|8 : cattccctaacacaggaagcttacaggcacacatgacaacacacactggtgaaaacccttacaaatgtggtgtctgtgaaaaagcattccctcacataagtcctttacagagacacataatgatacatactggtgataaaccttacaaatgtgatatctgtggaaaggcgttcacttataatggagacttgcgtagacacaccaggacannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngtgtgtgggagggcattcagtgagacaggagccatgcggaagcacatgaagatacatgctnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngtgatgtctgtggaaaggcattcagccgtacgggaacattaaagagacacatgacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn--TTCTTT--TATGCCT-----AGAA---TGT--A----T----A--C-A---TGGATTT-TGAT----------AA-----------A--TA--------T-----------T---T--------------TG-TT----T--GG--T-TT-T-AAAAG--T-TT-G--AAA-GCA-TGACATTTAAA-TCT---T----C-G---A-TATTGCT-T---TT-T--CTCCT--CT--------CGGAA-T--TTTGCGCGCCATG--------------AT-CTT-----TGACATTCA--TATGTC---GT--CCT---TT--
gi|8 : gttac-A--AA---C---TGTTA--GCCA-TATCATTTCAAAA--T-----TTCCGAT----TTAATGGCAC--ATA----CA----A-GTC-AA--TCATCACGTT------AA-CAGTTTGTT--AG--ATAACA-CTAA-CG-TT-CAG-tacaacaccaaaaaaaaaaaaaacaaaaaaaaaaacaaactgttagccatatcatttcaaaatttccgatttaatggcacatacaagtcaatcatcacgttaacagtttgttagataacactaacgttcaggggtcggttacggatgtaatagctgtcaaataaggactgtaccgtgaacattgtcaacttttacgaaggaaggtgcgaggaaaaagacgagtattttgtcacacaggaccaataccataaaatcaaaacagtcgtttttgctccatgtactgttaaaaaagaaatgatattattagaaataaaggaaaaccaaacacaggtaggcagcgaccaggtttaacttgcgaggtgtttattttagaagcggatattcgcaactacatgcttacagtgttacattgccaagatatgacacaaaattacacacccgtacacactccctaagaatatgtactcagactcgcattctcattcctaccaaatcgcaaatacacaaatatatgaattaaagatttgaattgaagttgtatttacaataataaatatgtaa
gi|9 : gttacttcttttatgcctagaatgtatacatggattttgataaatattttgtttggttttaaaagtttgaaagcatgacatttaaatcttcgatattgctttttctcctctcggaattttgcgcgccatgatctttgacattcatatgtcgtccttttacaacaccaaaaaaaaaaaaaacaaaaaaaaaaacAAGGACATATCCCATG----TTT---CTA-AAC---TT-------T----ATTAATT-TTT--AT-GC-AAA-AT-TACTTCTCTG-TATGCTT-----AAAA---TGA--C----T----A--C-A---GA------TA-T----------AT-----------T--T---------TAAATACATTAAT---T--------------CG-CT----T--AG--T-TT-T-CAA-G--T-TTTG--AAA-GCAATGAAATTCAAAATCT---G---GC-A---A-TAT-GCA-T---AT-T--TT--T--CT--------CGGTA-T--TCTGCGCGCCATG--------------GT-GTG-----TGACG-TCA--TATA-C---G---CCT---TT--G-GAATG----T---A-AACAA---C---TCTCA--GGC--TA--AT----AAA--TA--GATTC-GA-----TTAATAG-AC--A-AG---AA----A-GGC-AA--TTAT-ACGTT------AA-CAGATTG-C--AA--AT-GCA-TT-A-CG-TTACGA-GTGggtcggttacggatgtaatagctgtcaaataaggactgtaccgtgaacattgtcaacttttacgaaggaaggtgcgaggaaaaagacgagtattttgtcacacaggaccaataccataaaatcaaaacagtcgtttttgctccatgtactgttaaaaaagaaatgatattattagaaataaaggaaaaccaaacacaggtaggcagcgaccaggtttaacttgcgaggtgtttattttagaagcggatattcgcaactacatgcttacagtgttacattgccaagatatgacacaaaattacacacccgtacacactccctaagaatatgtactcagactcgcattctcattcctaccaaatcgcaaatacacaaatatatgaattaaagatttgaattgaagttgtatttacaataataaatatgtaa
18 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|17 ): ATTATTAAGTTTTATAATCATTTTTATTACTTATGTTGCGTAGCCCAATTAGAAACAGATTAAATTCATCAGGAACAGGTCAAGGTATAAATTGTTCATCAGAGATATGTTCACCAACACTGACACACTAGAATTTAGATTGAATGAAACATCCCATTGCACGAATAGCCCTCCTCAGATGACTTTCTTTCATCTACAACCAATAGCTGCCTGTGAAACAAGTATGTATATCTACCCAACCAATGGCTGTCTCTGAAACAAGTATGTCTTCTACACAATCAAGACTAGCACAAACGGAAAATATAACGGACTTTGTTGAAACTGTTGAAGCAGTCTGTGAAACAAGTAAAAACTCAAGATCTGAAAAATGATTTACAGGAGTGTATAAACAAAAATGGAGGTGAAAAACAAAATATCAATGTGATGTTTTTAAGGTAT
Unaligned ( gi|21 ): GCCAGAATAAGGGTGGTAGTCTAAGTTTTTTTCAGTTTTTTTTCCAAGGAAGGTACATACTGAAGGAAATGTTTTTTGACACCAAGGACTTTACCATAATTAAAACAGTCGCTTTTGTCCATGTGTTGTAAGAAAAAAAAATACACGTAATAAAATAATGAAACAACAACAGTTGGACAGCAACCCAGTCTAATAGCTAAAAAGTGTTTATATAGAAGTTAAACACGGCTAGGCCCACAGCGTAAATTGTGTCCAGGCCCAGGATCACCCGCTCAAACTGACCTACAAATAGCATAACAAATATTCAGGTTCGTGTATTAAAAATTTAATTGAATTATAAGATAATTATGCAAT
Unaligned ( gi|22 ): CCAGAATAAGGGTGGTAGTCTAAGTTTTTTCAGTTTTTTTTCCAAGGAAGGTACATACTGAAGGAAATGTTTGTTGACACAAGGACTTTACCATAATTAAAACAGTCGCTTTTGTCCATGTGTTGTAAGAAAAAAAAATACACGTAATAAAATAAATGAAAACAACAACAGTTGGACAGCAACCCAGTCTAATAGCTAAAAAGTGTTTATATAGAAGTTAAACACGGCTAGGCCCACAGCGTAAATTGTGTCCAGGCCCCAGGATCACCCGCTCCAACTGACCTACAAATAGCATAACAAATATTCAGGTTCGTGTATTAAAAATTTAATTGAATTATAAGATAATTATGCAAT
Unaligned ( gi|24 ): GTGTACTAATGTCAATTAGCGTGGTGAGCCCTGAGTTTTTGTCCAAGAAGGAAGGTTCGGAGAATTTGTTAGTCTGTCGCTTCAAGGACTTAACCATAAAAAAACATCGCGTTTTGTCTCTTTGTAACTGTTAAAAAAAAAAGGGGAGAAACATAAACAAGTGGACAGCGTAACCCCGATTATTGCGCGAGAAGTTTTAAAGTATAGAAAGCTATAAGACACGGCAGTTAGGTCTACAACGTTTATTTATGTCAGCCATTTCACGAATACACGCCCGCACTCAACTAGACCTACATAT
Unaligned ( gi|28 ): TATGTTCGGGTGGTGTGTGTCGGTTACGGGTGTACTAGCTGAGTTTTTCAACTTTTACGAAGGAAGGTGCGAGGAAATTTTTGTCGACACAAGGTCATTATTATAAATAAAACAGTCGCCTTTGTCCTTGTACTGTTAAAATATCAAAATAAAATAAAGGAAAACATAAACAGTTGGACAGCAACCCAGTTTAACTTTATATAGAAGCTAAACACAGCTAGGCCCACAGCGTATAGTGTCCAGGCCATTTCACGAAATACACAACAGTACCAACTGACGTACATAACATATAT
Unaligned ( gi|35 ): AATTTAGCTAATCGAAGTTACATCGGTTTATCGAAGCTACACATCAACATATTTCACTAAAACGTGTCATAATGGTAATTTCTGGCTGCTAGCCATTCCCTTTCGGGTATTAGTAAGGTCATTATGTCACGACTACCGTGCAAAATTCCCCAGGAGTTGGCGCACAGAAATTCAAGAGGTAAGGCGGAGT
Unaligned ( gi|37 ): ACAACAACAAATATCTCCTGACAGCTTCTGTGTTTCCATTTTCTCTAAGCCAAATCGCGCATCATTTATAAAAAAATTAATGAATACAATAATTAAAGATATCGAACTTCTTAATAAAAAATTACAAAAATGAAGAAATATGTAGATTTATATAATCTTTTATACTGTGGAACGACAGCGCTTCTTTA
Unaligned ( gi|42 ): AGGACATCTAGGCCTACAACATATGCATTAATATTCTGTTCTGGTCGTCGTCATTTCCCAAGATACATGTATATACTCGCACTTAGGAATTTAAACTAACTCCGTACCACTAACTAACAATTTATCTTGTGTTCCCACTTCCTACCAACAT
Unaligned ( gi|45 ): GTTATAATTTGTCATCAGAGATGTGTTCACCAACGTTGACAACACTAGAATTTAGACTGGAATGAAACACCCCATTGAAAATAGCCCTCCTCAGATGACTATTCTTTTCATCTACCCAACCAAT
Unaligned ( gi|46 ): AAAGATTGAACTTGTATTTACAAATAATAAATATGTAATTCCTCAGTAAACATTTCATTGATTTCACGCGGTTTAACCATGTCATCAATATGAGATGTGTATTGCCGTGCTCTCCGACGGCTT
Unaligned ( gi|48 ): GTGAGAAACCTCATAAGTGTAACGTATGTGGAAAAGCCTTCAGCCAGTCCTCCAACCTTATCACACACAGTCGGAAACACACCGGATTCAAGCCATTTAAGTGTGA
Unaligned ( gi|49 ): GCAACCCAGCCTAGTTGCGAGAAAATGTTTTTATAGAAGCTAAACACGGCTTGGCGCACAGCGTAAATTCTCCAGGTCATTTCACGAAATACACACCCGC
Unaligned ( gi|50 ): AAAATGTCTTCCAATGTCATTTCTGGCTGCCAGTTCCTTCCCTTTTTCTGGTATTAATGAGGTCATCAATTACGTCACGACCACCGTGCAAGACT
Unaligned ( gi|52 ): GTATCTAATGCTCTGTTACGTTCGACATCATATGCGTCCTTGAGTGAGAAGGTTTGAAAACATTAGTTTTATAAATGGATTAAATTTAATCAAC
Unaligned ( gi|54 ): TGATCTTCCTCACTTCACGCAATACACACTCGCACTTTGGGAATAAAAGAACATGCACTTGTGCTCCCATTTTCTATCAACTATTAGA
Unaligned ( gi|58 ): TACAATATTAATGGGATTGAACTACTTCAAGGTTAAATCCATTTATCAAAGTAAA
Unaligned ( gi|59 ): GATGTGTATTGCCGTGCTCTCCGCCGGCTTCAGGC
Unaligned ( gi|60 ): AGAGTCATCTTATGTGACGTCACAAATTTTAGG
Alignments
lowQualScore : 1111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111
lowQualScore : 1 11 1111 1111111111111 3333333333333333333333333 44444444444444444 11111111111111 11111 111111 33333333333333333333333333333333333333333333333333333333333 1111111111111111111111 11111111111111111 1111111111111111111 33333333333333333333333333333 11111111 1111111111 1111111 2222222222222222222 11111 3333333 1111111 77777777777777777777777777777777777777777777777777777 22222222222 222222222222222222222222222222 0000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 333333333 11111111 11111111111111 5555555555555555555555555555555555555555 1111 11 1111
lowQualScore : 5 0 6 11 1 6 66 777 2222 555 1 999 7777777777777 44 3 9999 0 6 3 2 3 9999999999999999999999999 3 3 3 3 0 3 5555 444 4 2 66666666666666666 88888 2 666666 999999 2 33 0 0 2 22222222222222 6666666 5555 22222 444 555555 4444 1 3333 5555 1 1 3333 333 888888 888888 22 22 333 4 3 9 44 5 44444 1 1 1 333 1 1 1 44 1 333 222 11111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 2 4444 2 4444 2 4444444444444444444444 1 55555555555555555 22 2 2 2 2 2 22 2 2 3 4444444444444444444 444 2 2 77777777777 2 2 77777777777777777777777777777 33 2 4444 2 2 2 2 2 2 44444444 7777777777 1 88 0000000 777777 0000000000000000000 4 0 33333 55 4 4 4 777 99 99 0 444 5555555 777 8888 777 8 777 3333333 5 77777777777777777777777777777777777777777777777777777 6 888 1 6 99 6 6 77 1 8 0 0 6 5 3 6666 444 2 444 22222222222 2 000000000000000000000000000000 0 2 55555 333 33 4444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444 6666 22 55 2 2 8888 2 2 77 2 555555555 2 333 4 22 2 333 2 33 66 33 33333333 2 77 1 66666666666666 2 77777 5 33 1111111111111111111111111111111111111111 555 777 0 33 0 2 0 8888 999999 0 5 0000 2 66 2 8888 4444 2 2 33 1 777777 5 0 1 2 33 77 2 2 2 2 2 3
lowQualScore : . . . .. . . .. ... .... ... . ... ............. .. . .... . . . . . ......................... . . . . . . .... ... . . ................. ..... . ...... ...... . .. . . . .............. ....... .... ..... ... ...... .... . .... .... . . .... ... ...... ...... .. .. ... . . . .. . ..... . . . ... . . . .. . ... ... ........................................................... . .... . .... . ...................... . ................. .. . . . . . .. . . . ................... ... . . ........... . . ............................. .. . .... . . . . . . ........ .......... . .. ....... ...... ................... . . ..... .. . . . ... .. .. . ... ....... ... .... ... . ... ....... . ..................................................... . ... . . .. . . .. . . . . . . . .... ... . ... ........... . .............................. . . ..... ... .. ................................................................................................. .... .. .. . . .... . . .. . ......... . ... . .. . ... . .. .. .. ........ . .. . .............. . ..... . .. ........................................ ... ... . .. . . . .... ...... . . .... . .. . .... .... . . .. . ...... . . . . .. .. . . . . . .
lowQualScore : 5 7 7 00 0 7 11 000 7777 555 6 222 8888888888888 66 3 6666 8 7 3 2 1 7777777777777777777777777 7 3 3 3 4 1 3333 444 2 5 22222222222222222 22222 4 888888 111111 4 22 2 9 4 88888888888888 1111111 7777 99999 555 333333 2222 0 9999 7777 9 8 9999 222 999999 444444 55 00 222 8 6 2 11 2 33333 7 7 9 999 9 9 1 55 9 333 888 00000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 1 5555 1 5555 1 2222222222222222222222 7 55555555555555555 55 0 0 0 0 0 88 0 2 5 0000000000000000000 111 4 4 99999999999 4 4 55555555555555555555555555555 77 5 8888 7 0 7 7 7 9 00000000 6666666666 0 99 2222222 222222 2222222222222222222 4 2 00000 22 4 4 4 888 22 55 7 666 7777777 000 4444 000 0 000 0000000 0 22222222222222222222222222222222222222222222222222222 7 333 0 7 22 7 7 77 4 0 8 6 0 0 2 1111 777 7 777 33333333333 5 999999999999999999999999999999 4 2 66666 999 11 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 6666 99 88 1 1 3333 1 1 11 1 444444444 1 777 2 66 2 999 5 44 33 77 33333333 7 33 7 88888888888888 9 11111 7 99 4444444444444444444444444444444444444444 000 999 7 99 7 9 1 9999 222222 8 7 0000 9 44 9 9999 6666 9 9 99 1 777777 3 5 4 9 99 99 9 9 9 9 9 1
consensus : GGAAGGGCATTTTATCTGAAAAGCGGA--TACAGAGAAA--CACAT---GAG---GACA-C-ATACTGGTGA-N-AAACC-T---T---A-T-A--A-TGT--G-ATGTCT-GTGGGAA-GGCATTCAGT--CG--C--ANGGNNACC-TTAAG-GAGACACAT-G-AG-GATACAT-ACT----GGT---GATAAA-CCT-A-AAAT----A----TAA-----ATG-T------GA------T-G--TCTGTGG-GAAG---G----C-----ATTC---AG-TCG--GANA--GGAN-ACTT-A---AAG----ANACACA----TGA----GGATA-C-A----TAC---T------GGTGA----ATAAA--CC-TTA---TAA-AATGT--G-ATG-----TC-T-GTG-G--GAAG-GCA-TTCAGTCA--G-A---CA--GGNAA--C-TT---A--A-A--G-A-C----A-A-CA-T---GA-T---------------G-ACA----C-A----T-AC---------T----G---G---TGANAAAC---C---T---------T-ATA-AA-T-G-TGA-TGTCTGTGGG--AA-GGCATTC-AGTC-----G-G---GC-ANACGA---C-T-TA---C--A---GAG-A-CACA-C-----A---GGAGA-CACGC-------ATACTGGTGAT--AAA-CC---TTATA-ANT-G-TG-ATGTCTGTG-GGAAGG------CATTCAG-CNAT--ACGGGAACA-TTATNNAG-ACACATGAGG-A--AN-ATACTG-G-TGA-TAA-AACCTTNA---TG-AATG-TGA-TGTC-TGTGGGAAG---ACATTCAGTGA--GACG-G-GA----C--TTACA---GACACACAT--G-AG---GATA-C---ATAC-------TGGTGATAAA-CCTTATAA--------T-CAA---------TAA-------------GA----CA-------G-GGAA-A-TTACAGAG-ACACAT--GAGGATACATACTG-G-TGA-NAAACCTT-TTGATTTATATATGTGATTTGTATTGGTAAGCGTTCATGTAAAGGACACGTCGCATG----TTT---CTA-AAC---TTT------T---TTTATTT-TTT--A--GC-AAA-A---------------TTACTTCTTTG-TATGCCT-----AAAA---TGA--C----T----A--A-A---TG------TG-T----------AT-----------G--T---------T-----------T---T--------------TGCT----T--AG--T-TTTC-AA-G--T-TT-G--AAA-GCAATGAAATTCAAA-TCT---TTTTGC-G---A-TAT-GCA-T---AT-T--TT--T--CT--------CGGTA-T--TTTGCGCGCCATG--------------AT-GTG-----TGACG-TCA--TATA-C---GTGACCT---TT--GCGA-------T---A-A--AA---C---TGTTA--GCCA-TATTAT----AAA--TA--AATTC-GAT----TTAATGG-AC--A-A----AA----A-GGC-AA--TTATCACGTT------AA-CAGCTCG-C--AG--ATAACA-TT-A-CG-TT-CGG-GTGC
Reference ( family-1142 ) : GGAAGGGCATTTTATCTGAAAAGCGGA--TACAGAGAAA--CACAT---GAG---GACA-C-ATACTGGTGA-A-AAACC-T---T---A-T-A--A-TGT--G-ATGTCT-GTGGGAA-GGCATTCAGT--CG--C--ANGGNNATC-TTAAG-GAGACACAT-G-AA-GATACAT-ACT----GGT---GATAAA-CCT-A-AAAT----A----TAA-----ATG-T------GA------T-G--TCTGTGG-GAAG---G----C-----ATTC---AG-TCG--GANA--GGAT-ACTT-A---AAG----ANACACA----TGA----GGATA-C-A----TAC---T------GGTGA----ATAAA--CC-TTA---TAA-AATGT--G-ATG-----TC-T-GTG-G--GAAG-GCA-TTCAGTCA--G-A---CA--GGNAA--C-TT---A--A-A--G-A-C----A-A-CA-T---GA-T---------------G-ACA----C-A----T-AC---------T----G---G---TGANAAAC---C---T---------T-ATA-AA-T-G-TGA-TGTCTGTGGG--AA-GGCATTC-AGTC-----G-G---GC-ANACGA---C-T-TA---C--A---GAG-A-CACA-C-----A---GGAGA-CACAC-------ATACTGGTGAT--AAA-CC---TTATA-ANT-G-TG-ATGTCTGTG-GGAAGG------CATTCAG-CGAT--ACGGGANCA-TTACANAG-ACACATGAGG-A--AN-ATACTG-G-TGA-TAA-AACCTTNA---TG-AATG-TGA-TGTC-TGTGGGAAG---ACATTCAGTGA--GACG-G-GA----C--TTACA---GACACACAT--G-AG---GATA-C---ATAC-------TGGTGATAAA-CCTTATAA--------T-CAA---------TAA-------------GA----CA-------G-GGAA-A-TTACAGAG-ACACAT--GAGGATACATACTG-G-TGA-NAAACCTT-TTGATTTATATATGTGATTTGTATTGGTAAGCGTTCATGTAAAGGACACGTCGCATG----TTT---CTA-AAC---TTN------T---TTTATTT-TTT--A--GC-AAA-A---------------TTACTTCTTTG-TATGCCT-----AAAA---TGA--C----T----A--A-A---TG------TG-T----------AT-----------G--T---------T-----------T---T--------------TGCT----T--AG--T-TTTC-AA-G--T-TT-G--AAA-GCAATGAAATTCAAA-TCT---TTTTGC-G---A-TAT-GCA-T---AT-T--TT--T--CT--------CGGTA-T--TTTGCGCGCCATG--------------AT-GTG-----TGACG-TCA--TATA-C---GTGACCT---TT--GCGA-------T---A-A--AA---C---TGTTA--GCCA-TATTAT----AAA--TA--AATTC-GAT----TTAATGG-AC--A-A----AA----A-GGC-AA--TTATCACGTT------AA-CAGCTCG-C--AG--ATAACA-TT-A-CG-TT-CGG-GTGC
gi|1 : GAAAGGGCATTTTATTTGAAAAGCGGA--TGCAGAGAAA--CACTT---GAG---GACG-C-ATACTGGTGA-G-AGACC-T---T---A-T-A--A-TGT--G-ACGTCT-GTGGGAA-GACATTCCAT--TG--C--ATGTATATC-TTAAA-GAACCAC-T-G-AA-GATACAT-ACT----GGT---GATAAA-CCTCATAAATTCTCA----TAA-----ATG-T------GA------C-G--TCTGTGG-GAAG---G----C-----ATTC---AG-TGA--GAAA--AGAT-ACGT-A---AAG----ACACATA----TGA----AGATA-C-A----TAC---T------GGTGA----ATAAA--CC-TTA---TAA-AATGT--G-ACA-----TC-T-GTG-G--GAAA-GCA-TTCAATCA--G-A---CA--TGTAA--C-GT---A--A-A--G-A-C----A-A-CA-T---GA-T---------------G-ACA----C-A----T-AC---------T----G---G---TGATAAAC---C---T---------T-ATA-AA-T-G-TGA-TGTCTGTGGG--AA-GGCATTC-AGTC-----G-G---GC-ATACAA---T-T-TA---G--A---GAG-A-CACA-A-----A---GGAGATCATGT-------ATAGTAGT-AT--AAA-CC---TTATA-ATT-G-TG-ATGCCTGCA-AAAATA------CTTTCAG-CAAT--ATGGGATCA-TTATTTCG-CCACATGAAG-A--AA-ATACTG-G-TGG-TAA-AACCTTAA---TA-TATA-TGA-TGTC-CATGGGAAA---ACATTTAGTGA--GACG-GCGA----C--TCACA---GACACATAT--A-AC---GATA-C---ATAC-------TGGTGATAAA-CCTTATAA--------T-CAA---------TAA-------------GA----CA-------G-AGAA-A-TTACAGAG-ACACAT--GGGATTACATACTG-G-TGA-TAAACCTT-TTGATTTATATATGTGATT-GTATTGGTAAGCGTTCATGTAAAGGACACGTCGAAT-----TTT---TTA-AAC---TTG------T---TTTATTT-TTT--A--G------------------------------TTG-TATGCCT-----AGAT---TGA--C----T----A--A-A---TG------TG-C----------AT-----------G--T---------T-----------T---T--------------TGTT----T------T-TTTA-AAAG--T-TT-G--AAA-GCA-TAAAATTCAAT-TTT---TTTTGT-G---A-T-T-AAA-T---AT-T--TT--T--CT--------TGGTA-T--TTTCTGCGTCATG--------------AT-GTG-----TGACG-TCA--TATA-T---GTGACCT---TT--GCGA-------T---A-A--AA---C---TGTTA--GCCA-TATTAT----AGA---A--AATTC-GAT----TTAATGG-AC--A-A----AA----A-GTC-AA--TTATCACGAT------AA-CAGCTCG-C--AG--ATGACA-TT-A-CG-TT-TGG-GTGC
gi|10 : T--------CAGTA-T--TTTATGCGTCATG--------------AT-G-G-----TGACA-TCA--TGT------GTGTCCT---TT--GCGA-------T---A-A--AA---T---GGTTA--GCCA-TATTAT----AGG---A--AATTC-GAT----TTATTGG-AC--A-A----AAG---A-GAC-AA--TTATCACGTT------AA-CAGCTCG-C--AG--ATAACA-TT-A-CG-TT-CGG-ATG
gi|11 : ----GGT---GAAAAA-CA--A-AAAT----A----TCA-----ATG-T------GA------T-G--T-TGTTT-TAAG---G----T-----ATTA---TC-TCG--G-----GCTT-ACTT-A---AAC----AAACACA----AGC----GGA-A-C-A----TAC---G------GGTGA----G-AAA--CC-ATA----AA-AATGT--G-ATG-----T--T-GTGTG--GAAG-GCA-TTCAGTCA--G-T---CA--GGATA--T-TT---G--A-A--GTG-C------A-CA-T---GA-T---------------G-ACA----CTA----T-AC--------------G---G---TGATAAAC---T---T---------T--TA-AATT-G-TGA-TGTCTGTGGA--AA-GGCATTT-A-TT-----G-G---AA-AACCGA---C----G---C--A---GAGAA-AACA-C-----A---TGAGtactagctgccagaataagggtggtagcctaaattttttcagcttttcgaaggaaggtgcgaagaaatgtttgtcgatacaaggaataaataaataaaactgtcgcttttgtccatgtgctgtaaaaacaatacatgtaataaataaaggaaaacaaaaacagttggacaacaacccagcctaattgctagaaggtgtatatataaaagctaaacacggctagactcatagcgtaaattgtgtccaggccatttcatgaaatacacatctgcaccaattgacctacatataacataataggatttaatacttcaaagttaaatcggtttatcaaagcaaaatatcaattattctccgaaaacgtaccagcgtactttccgggtgctaactaactttatagtggggacacttgcttacgtcacgtcacgtcacgcccaccgtgcaagcatccccagcagtgagcgcatagaaattcaaagaggtatgaggtgttgaattctt
gi|12 : ttattagttttataatcaatttttattacttatgtgtgcagatagcccattagaaacagattaaattcatcagaacaggtcaaggttataatttgtcatcagagatatgttcaccaacactgacaacacgaatttagattgaatgaaacatcccattgcgaatagccctcctcagatgactattcttttcatcaaccaaccaatagctgcctgtgaaacaagtatgtatatctacccaaccaatggctgtctctgaaacaagtatcttctacacaaatcaaagactagcacaaacggaaaatataacggactttgtgaaactgttgaagcagtctgtgaaacaagtaaaaactcaagatctgaaaaatgatttacaggagtgtataaacaaaaatggaTCCCATG----TTT---CTA-AAC---TTTACATAAT---TTTATT-----------C-AAACA---------------TTACTTCTCTGATATACCT-----AAAAATTTGA--C----T----A--C-AGACTG------T--T----------ATTTAAATAAATAA--T---------T-----------TG--T--------------CGCTC---T--AGGTT-TTTC-AA-G----TT-G--AAACGCAATGAAA-TCAAA-TC-------TGC-A---A-TAT--CA-TATGAT-T--TT--T--CTCAGCGCAACGGTATT--TTTGCGCGCCATGGGTGTGTTTTTGTTAT-TTG-----TGACG-TCAAGTATA-C---G---CCT---TT--G-GAATG----T---A-AACAA---C---TCTCAAGGCC--T-TTATC---AAA--TG--A--TCAGATCG--TTAATAG-ACTAA-A----AA----A-GGC-AAATTTATTA--TT------AATCAGATTC-C--AACTATAGCACTT-ATCGATT-CGA-GTG
gi|13 : aaccaggatcatatA--CACAT---GA------TA-C-ATAGTGGAGA-A-AAACT-T---T---ACT-T--A-TGT--G-ATATTT-GTGGGAA-GACATTGTCT--CG--C--AAAACAAAT-GCGAA-AAGACACAT-G-AG-GAAACAT-ACT----GGT---GATAAA-CCT------T----A----TAA-----ATG-T------GT------T-G--TCTCTGG-AAAG---G----C-----ATTC---AG-TGA--GAAA--GGAA-TCTT-A---CAG----AAACACA----AGA----GGATA-C-A----TAC---T------GATG------------C--------TAA----GT--C-AC---------------G--GAAG-GCA-ACCAACCA--G-A---AT--GATAG--A-GT---A--C-AGTG-A-C------A-CA-T---GA-T---------------T-ATA----T-A----T-AT---------T----G---A---TA-------------------------ATG-AA-T-G-TGA-TGTTTTCGGA--AA-GGTATTC-AATC-----A-G---ACAACAC-A---C-T-TA---T--A---GAA-T-CACA-TTA---A---GG------CAC-------GT-TTGG---T--ACA-CC---TGA----------A-ATACCTGTG-GGA---------CA--------------GGAAAC--TTACAGAA-ACACATGAGG-AC-AT-AGAATG-G-TGACCAA-AACttatgttaattgctacgggttgtaattaatgctgtaacggaattaagggttggctagtcctgattattttgtcaactttttcgaaggaatgtctgcgaggaattagtcgacacaagacttaacctataaacataacagtcgccctttagtccagtcgtacttgttttaaaaaaataataaaattaaggaaaacataaacttagtgatgggaacagtgcaacccgtagtctgataattgcgatgggaggggttgtttatataga
gi|14 : aaggcatttaactcttcattgacattaacatAA---TGA--T----T----A--A-A---GGACACATTG-C----------AT-----------G--T---------T-----------T---T----------------CT----A--AACAT-TTTA-AA------TT-GCTAAA-GCAA---AATT--AA-T-T---ATTTGC-GTGCA-TAT-GCA-T---AT-T--TTC-T--CT--------CTGTA-T--TTAACGC-CCATT--------------AT-GTG-----TGACG-TCA--TAT------GCGACCT---TCGAGCGA-------G---G--------------GTTT--G--ATTTTTTT----CAA--CG--GATTA-AAT----TTAATCG-ACTTA-AAAATAA----A-TGT-AA--TCATCAC--------------GCTCG-T--AG--ACAACA-TT-A-CG-TT-CGG-ATGgtgtgttcctgcatagccaaactgacctagtattgtttctgcataactccttatcctatatattttgacaagctcagaaaa
gi|15 : C-AGACAA---T-T-TA---C--A---GAG-A-CACA-A-----AA--GGATA-CATGT-------ATAGTAGTAAT--AAA-TC---TTCTA-ATTCG-T--ATGCCTTCG-AGAATG------CATTCAG-CCAG--ATGGGATCA-TTATTTCG-ACATA------A--AG-ATAC-------A-TA-----CTTTA---TA-TATG-TGA-TGTC-CGTGGGAAA---ACATTTAGTGA--GACG-G-GA----CACTTACA---GACACATAC--A-AG---GATA-C---ATAC-------TGGTGATAAA-CCTGATAA--------TTCAA---------TAA-------------GA----CA-------G-GGAA-A-TTACAGAG-ACACAT--GAGGATACATATTG-G-TGA-GAAACGTTGTTGATTTATATATGTGATTTGTATGGGTAAGCGTTAATTTAAAAGACATGTAGCATG----TTT---TTA-AACATTTTT------T---TTTATTT-TT---A--G------------------------------TTG-TATGCCT-----AGAA---TGA--C----TAC--A--A-A---TG------TA-A----------AT-----------G--TA--------T-----------T---TTGAATAAATCATTATGCT----T--TG--G-TGTT-AA-G--T-TT-T--AAA-GCAATCAATTTCAAA-------TTTTAC-G---ATTAA-ATA-T---AT-T--Tttatagtatcgacacaacgggcgcattagctgtcagaagctttgtgtttgttttagttttttcgaaagaaggtgcgaaggaaaagaccagtaatttttagttggcacagggtctttgtcgtaaaaaatccacacaaatcagtcacgtttgattatgtacctttttagaaaaagaagaaaaaaaaaggggggggggcaaaacggttgcaaagcgactcagtttaactacgagaaattggtcatatg
gi|16 : GT--G-A-G-----AC-T-GTA-G----AG-GCT-GTCTGTGA--A-A---CA--AGTAAAAC-T----A--A-A--G-A-CCAGGA-A-AA-T---GA-T---------------TTACA----C-GAATGT-ACAAACACAAAT----G---GAGGTGAAAAAC---AAAGT---------T-ATC-AG-T-G-TCA-TCTTTGTTGG--AA-GGCATTT-ACTC-----
gi|16 : ttattagtattataattatttttattatttttcttgcagaaatcccattagaaacatattaggttaatcagaaacatgtcaatgttttaaattggcatcacagatgtgttcactatcactgacaacactagaatttagactgtaatgcaacatccaattggaaatagccctcctcgtatggctattcttttcacccaactaaccaatggctgactgtgaaacaagtatgtctatctacccaaccaatggctgcctgtgaaacaagaatgtcttctacacaatcaagggctagcacaaacggaaaatacaacggacttaC-----A-G---GA-AAATGA---T-T-TA---C--A---CGA-A-TGTA-C-----A---A---A-CACAA-------ATGGAGGTGAA--AAA-CAAAGTTATC-AGT-G-TC-ATCTTTGTT-GGAAGG------CATTTA
gi|18 : ttattagtattataattatttttattatttttcttgcagaaatcccattagaaacatattaggttaatcagaaacatgtcaatgttttaaattggcatcacagatgtgttcactatcactgacaacactagaatttagactgtaatgcaacatccaattggaaatagccctcctcgtatggctattcttttcacccaactaaccaatggctgactgtgaaacaagtatgtctatctacccaaccaatggctgcctgtgaaacaagaatgtcttctacacaatcaagggctagcacaaacggaaaatacaacggacttagtgagactgtagaggctgtctgtgaaacaagtaaaactaaagac----GGT---GAAAAA-C---A-AAAT----A----TCA-----ATG-T------GA------T-G--TTTTT----AAG---G----T-----ATTA---TC-TCG--GCT------T-ACTT-A---AAC----AAACACA----AGC----GGATA-C-A----TAC---G------GGTGA----GAAAA--CC-ATA---TAA-A-TGT--GCATG-----TT-T-GTG-G--GAAG-GCA-TTCAGTCA--G-T---CA--GG-AA--T-TT---G--A-A--G-G-C------A-CA-T---G--T---------------G-ACA----C-A----T-AC---------T----G---G---TGAATAAC---C---T---------T--TA-AA-T-G-TGA-TGTCTGTGGA--AA-GG-ATTG-TATT-----T-G---AA-AACCGA---C----G---C--A---GAG-A-AACA-C-----A---TGAGG--AC-C-------ATACTTGTGAG--AGA-CC-----ATA-Actc
gi|19 : agcacaaacggaaaatataacggactttgttgaaactgttgaagcagtctgtgaaacaagtaaaaactcaagatctgaaaaatgatttacaggagtgtataaacaaaaatgga-AATG-TGT-TGTTGTGTGGGTAG---GC-TTCAGCGA--GACA-G-GAAGATT--TTACA---G-CACACA-----AGTTTGACAAC---ATCT-------TGGTGATAAA-CC-TATAAATGTGATGT-CTG---------CGG-------------GAGGTTCAGTCGTATG-GGAACA-TTAAGGGG-ACATAA--GAGTAT-CAT-CTG-A-TGATAAAACCAT-ATAATGTAAATGTTTGaa
gi|19 : AG--CACAC---AAGTTTGACAAC-ATCTTGGTGA-T-AAACC-TA--T---A---A--A-TGT--G-ATGTCT-GCGGGAG-G---TTCAGT--CG--T--ATGGGAACA-TTAAG-GGGACATAA-G-AG-TAT-CAT--CT----GAT---GATAAAACC------AT----A----TAA------TG-T------AAA-----T-G--TTTGTGG-GAAAAAAG----C-----ATTC---AA-TTG--GAGACAGAAC-ATTTTA---AAA----AGACACA----AGA----TGATA-CCA----TAC---T------GGTGT----TTAAA--CCCTTA---TAA-A-TGT--G-ATG-----TG-T-GTG-G--GAAG-GCA-TTCCGTGA--G-A---AA--GGACA--T-TTTAAA--A-A--G-A-C----A-A-GA-T------T---------------G-ATA----C------T-AC---------T----G---G---TG-TAAAC---C---T---------TAATA-AA-T---TGA-TGTGTGTGGGGAAA-AGCATTC-tgggaaaaaagcattcaattggagacagaacattttaaaaagacacaagatgataccatactggtgtttaaacccttataaatgtgatgtgtgtgggaaggcattccgtgagaaaggacattttaaaaagacaagattgatactactggtgtaaaccttaataaattgatgtgtgtggggaaaagcattc
gi|2 : aatgtgttgttgtgtgggtaggcttcagcgagacaggaagattttac---T---A-C-A--A-TGT--ATATTTTT-GTGGGAATAACATATAGTTGTG--T--AAAGGTGCG-TTATGTGATACACAC-GTGC-GAT-TAT-ACT-----GT---GG-AGA-CT-------T----C----TGAC----ATG-T------GA------T-A--GTTATGT-GAAA---T----CACTTGATTA---AGTTCA--GACA--GGAG-ATTT-----AAG----AGACACA----GGA----GGATA-C-A----TA----T------GGTGA----AGAAA--TC-TTC---CAATAATGTTGG-ATG-----TCTT-GCG-A--AAAG-G-A-TTCAGTGC--G-T---AA--GGGAT--CATT-------------A-C----A-A-T--C---GA-A---------------G-ACA----C-A----A-AC---------TTCAAG---G---TGATAAAC---A---TAGAAATAACT-GTA-AG-G-G-TGA-AATTTATGAG----------TC-TGTC-----G-T---G--AAGCGATTTC-T-TAGTGCGAA---GGG-ATCATA-C-----A-----AAA-CATATGAGGATAATACTGGTAAT--AAC-CC---TTATATAAT-GTTGTATGTCT-TGTGGAAGA------CATTCAC-TGACTGAGAGGAAC--TTATTAAC-ACACATGAGG-A--A--ATACTG-G-TGA--AA-AACCTTT----TA-AATG-TGATTGTC-TGTGAGAAG----C-TTCAGTCATCGA-G-G-GAC---C--TTACAGAGGAGACACAT--GAAG---GAAATC---ATAC-------TGGTGAGAGACCCTTATAA--------T-TGAATGTCTGGGTAAAAGATGTTTTATTGA----CA-------ATAGAA-ACCTATAGAGCACACATTAGACAACACATAATGCGTTGA-AAGACCAT-T--ATGTA-ATGT-TGATTT
gi|2 : agccttagttcaagatatgtctttacgccactgtatttgattaagaaaacgtgatacagacttcaAGAGA--CACAG---GAG---GATA-C-ATA-TGGTGA-AGAAATC-T---TCCAA-T-A--A-TGTTGG-ATGTCTTGCGAAAA-GG-ATTCAGTG-CG--T--AAGGG-ATCATTA-------CA-ATCG-AA-GACACAA-ACTTCAAGGT---GATAAA-CAT-AGAAAT----AACTGTAA-----GGG-T------GAAATTTAT-GAGTCTGTCGTGAAG---C----G-----ATTTCTTAG-TGC--GAAG--GGAT--CAT-A---CA-----AAACATA----TGA----GGATA---A----TAC---T------GGT-A----ATAAC--CC-TTA---TAT-AATGTT-GTATG-----TC-TTGTG-G---AAG-ACA-TTCACTGACTG-A---GA--GG-AA--C-TT---ATTA-A--C-A-C----A---CA-T---GA-G---------------G-A-A------A----T-AC---------T----G---G---TGAAAAAC---C---T---------T-TTA-AA-T-G-TGATTGTCTGTGAG--AA--GC-TTC-AGTCATCGAG-G---G----AC-----C-T-TA---C--AGAGGAG-A-CACA-TGA---A---GGAAA-T---C-------ATACTGGTGAG--AGACCC---TTATA-ATT-G--A-ATGTCTGGG-TAAAAGATGTTTTATTGA--CAAT--A--GAAAC--CTATAGAGCACACATTAGACAACAC-ATAATGCGTTGA--AA-GACCATTA---TGTAATGTTGA-T-TT-TGTGGG-AG---ACA-TCAATTAT-TATA-C-AA----CCGTAAAA---AACTCACATTGA-AG---GATA-CCAAAT-C-------TAGTGAC-AG-CCTTATtgtgggagacatcaattattatacaaccgtaaaaaactcacattgaaggataccaaatctagtgacagccttatcagtgtgatgcttgttcgaaacattcagtcagtagagaagacttactgtgtcacaaagataagacatcaacagtgaatgtagtgtctgtggaaagtgtacaccgatgggtcgcagacttagaagcaccatgggacacatac
gi|2 : agccttagttcaagatatgtctttacgccactgtatttgattaagaaaacgtgatacagacttcatacaatgtatatttttgtgggaataacatatagttgtgtaaaggtgcgttatgtgatacacacgtgcgattatactgtggagacttctgacatgtgatagttatgtgaaatcacttgattaagttcagacaggagatttaA--TACA---AAA--CATAT---GAG---GATA---ATACTGGTAA-T-AACCC-T---T---A-T-ATAA-TGTT-GTATGTCTTGTGG-AA-GACATTCACT--GA--CTGAGAGGAA-C-TTATT-AACACACAT-G-AG-GA-A-AT-ACT----GGT---GAAAAA-CCT------T----T----TAA-----ATG-T------GA------TTG--TCTGTGA-GAAG--------C------TTC---AG-TCATCGAG---GGAC--CTT-ACAGAGG----AGACACA----TGAA---GGAAATC-A----TAC---T------GGTGA----GAGAC--CC-TTA---T---AAT-T--GAATG-----TC-T-G-G-GTAAAAG-ATG-TTTTATT---G-A---CAATAGAAA--C-CT---A--T-A--G-AGC----ACA-CA-TTA-GA-C---------------A-ACA----C-A----T-AA---------T----GC--GT--TGAAAGAC---CA--T---------T-ATGTAA-T-GTTGA-T-TTTGTGGG---A-GACA-TC-AATT-------A---TT-ATACAA---C-CGTA------A---AAA-A-CTCA-CATTGAA---GGATA-C-CAA-------AT-CTAGTGAC---AG-CC---TTATC-AGT-G-TG-ATGCTTGTT-CGAA-A------CATTCAGTCAGT--A-GAGAAGACTTACTGTG-TCACA------A--A------------GA-TAA-GACATCAACAGTG-AATG-TAG-TGTC-TGTGGAAAGTGTACA-CCGATGG--GTCGCA-GA----C--TTAGA---AGCAC-CAT--G--G---GACA-C---ATAC-------cagtgtgatgcttgttcgaaacattcagtcagtagagaagacttactgtgtcacaaagataagacatcaacagtgaatgtagtgtctgtggaaagtgtacaccgatgggtcgcagacttagaagcaccatgggacacatac
gi|20 : agccttagttcaagatatgtctttacgccactgtatttgattaagaaaacgtgatacagacttcatacaatgtatatttttgtgggaataacatatagttgtgtaaaggtgcgttatgtgatacacacgtgcgattatactgtggagacttctgacatgtgatagttatgtgaaatcacttgattaagttcagacaggagatttaagagacacaggaggatacatatggtgaagaaatcttccaataatgttggatgtcttgcgaaaaggattcagtgcgtaagggatcattacaatcgaagacacaaacttcaaggtgataaacatagaaataactgtaagggtgaaatttatgagtctgtcgtgaagcgatttcttagtgcgaagggatc-----G-G---GC-A----A---C-T-TA---C--A---GAG-A-CACA-----------GTA----ACAC-------ACACTGGTGAC--AAA-TC---TTACC-AAT-G-TG-ATGTTTGTT-GGAAGA------CATTCAG-TTAT--TCAGGATCA-TTGCAAAA-GCAC---AGA-A--AG-ACAC-------A-TAATAATCCTAA---TG-AATT-TGA-AATT-TGTCGGA-----ACA--------------------------TTACA---GACACACAT--G-AG---AATA-C---ACAC-------TGGTAATAAA-CC
gi|20 : ttatttcgaa--TACAGAGA----CACAG---TA-----ACA-C-ACACTGGTGA-C-AAATC-T---T---A-CCA--A-TGT--G-ATGTTT-GTTGGAA-GACATTCAGT--TATTC--AGGATCATT-GCAA---AAGCACAG-A-AA-GACACAT-A-------------ATAAT-CCT-A---------A----TGA-----ATT-T------GA------A-A--TTTGTCG-GAA---------C-----AT----------------------T-AC--------AG----ACACACA----TGA----GAATA-C-A----CAC---T------GGT-A----ATAAA--CC-AGA---T-A-TATGA--G-ATA-----TT-A-ATG-T--TAAC-GCA-TTAAGCCA--G-A---CA----TAA--C------A--G-A--G-A-C----ATT-CAGT---GA-----------------G-ACGGGATC-A----T------------T----A--------GAAAAAC------------------------A-T-A-TGA-AGAC---GCA--AATGGCATTCGACTC-----G-A---A--AGTCCA---C-T-TA---C--A---AAT-A-CACA-C----------GATA--ACAC-------TCACTGGTGAT--AAT-AT---TTA-A-AAG-G-TG-ATATATGTG-agatatatgagatattaatgttaacgcattaagccagacataacagagacattcagtgagacgggatcattagaaaaacatatgaagacgcaaatggcattcgactcgaaagtccacttacaaatacacacgataacactcactggtgataatatttaaaaggtgatatatgtg
gi|23 : ttatttcgaagggcaactT---TTA-AAC---TT------------TTATTT-TTA--A--AG-AAA-AAACTTGCTTTGTGTGCTACTTCTTTG-TGTGCCTCCCCTAAAA---TGA--C----T----ATAA-A---TG-------G-T----------AT-----------T--TGAATTATTAT-----------T---T--------------TGCT----T--AG--T-TTTC-AA-G--T-TT-GA-AAA-GCAATTAAATTCAAA-TCC---TT---C-A---A-TAT-GCA-G---AT-T--TT--T---T--------CGGTA----TTTGCTGTCCATG--------------AT-GAG-----T-ACG-TCA--TATGCC---GT--CCT---TC--GCGA-------G---A-A--AA---CAATTGTTA--GCCA--ATCAT----GAA--CA--AGATC-GA-----TTAATGG-AA--A-A----AA----AGGGCAAA--ATATCACATTACCGTAAA-CAGCTTG-C--AGTTATAACA-TT-A-CG-TT-CGG-
gi|25 : catcgATG----TTT---TCA-AAC---TT-------T---TTTATTT-GTC--AT-GC-AAA-A---------------TCACTTCTTTG-TATGCCT-----AAAA---TGA--C----TAC--A--A-A---TG------TA-TTTTGAATAA-AT-----------T--A---------T-----------T---T--------------TGCT----T--AG--T-TTTC-AA-G--T-TT-G--AAA-GCAATGAAATTCAAA-TC------TTGC-A---A-TAT-GCA-T---AT-T--TT--T--CT--------CGGTA-T--TCTGCGCGCCATG--------------GT-GTG-----TGACG-TCA--TACA-C---G---CC---------CGAATGAATGT---A-AACAA---G---TCTCA--GACA-TATTAT----AAA--TA--AATAC-GAT----TTAATGG-ACA-A-A----AA----A-GGC-AA--TAATCACGTT------AA-CAGAATG-C--AG--ATAACA-TT-A-CG-TT-TGGTGTGtgttgaacattgtgtcattcggtgtgatagctgtcagag
gi|26 : CATG----TTT---CTA-TAC---TTT------A---AGTAATT-TTT--AT-GC-AAA-T---------------ATACTTCTCTG--GTAACT-----AAAA---TGA--C----T----A--ACA---GA------TG-T----------AT--------------T---------C-----------T---TAAATTA--------TGCT----T--AG--T-TTTC-AA-G--T-TT-G--AAA-GCAATGAAAATCAAA-TCT---G---GC-A---A-TAT-GCA-T---AT-T--TT--T--CT--------CGGTA-T--TTTGCGCGCCATG--------------GT-GTG-----TGACG-TCA--TATA-C---G---CCT---TT--G-GAATG----T---A-AACAA---C---TCTCA--GGCC-TATTAT----AAA--TA--GATTC-GAT----TTAATAG-ACA-A-A----AA----A-GGC-AA--TTATTA--TT------AA-CAGATTC-C--AA--ATAGCA-TT-A-CG-TT-CGA-GTG
gi|27 : agttatcACAT-ACT----GGT---AATAAA-CCT------T----A----TAA-----ATG-T------AA------T-G--TCTGTGG-GACG---G----C-----ATTT---AT-CCA--GAAT--GGAA-ACTT-A---AAA----GCACACA----TGA----GGACA-C-A----TAC---T------GGTGA-----TAAG--CC-TTA---TAA-A-TGT--G-ATG-----TC-T-GTG-G--GAAG-GCA-TTCAGTCA--A-A---CA--GGAAT--C-TT---AC-ACA--G-A-C----A---TA-T---GA-G---------------G-ATA----C-A----T-AC---------T----G---G---TGAGAAAC---C---T---------T-ATA-AA-T-G-TGA-GGTCTGTGGA--AA-GGTGTTT-AGCT-----G-G---GC-AGGAGA---C-T-TA---C--AT--G-----CACA-C-----A---TGAGA--ACAC-------ATACTGGTAAC--AAA-CC---ATATA-AAT-G-TG-ATATATGTG-GGAt
gi|29 : cATCTGAAAAATG-A--TTTACAGGAA--TGTAT---AAA---CAAA-A-ATGGAGGTGA-A-AAACA-AAAAT---A-TGA--A-TGC--G-ATGTTT-GTTTTAA-GGTATTAACT--CG-------GGCTTAC-TTGAG-CAGACACAT-G-AG-GATACAT-ACT----GGT---GAGAAA-CC------GT----A----TAA-----ATG-T------GA------T-G--TTTGTGG-GAAG---A----C-----ATTC---AG-TCA--GACA--GGAT-ATTT-G---AAG----GTACACA----TGA----
gi|29 : aaactcaag----GGT---GAAAAA-CA--A-AAAT----A----TGA-----ATG-C------GA------T-G--TTTGTTT-TAAG---G----T-----ATTA---AC-TCG--G-----GCTT-ACTT-G---AGC----AGACACA----TGA----GGATA-C-A----TAC---T------GGTGA----G-AAA--CC-GTA---TAA-A-TGT--G-ATG-----TT-T-GTG-G--GAAG-ACA-TTCAGTCA--G-A---CA--GGATA--T-TT---G--A-A--G-G-T----ACA-CA-T---GA-TTNNNNNNNNNNNNNNN-NNN----N-A----A-ACAAAAA----T----GGAGG---TGAAAAACAAAA---A---------T-ATG-AA-T-G-CGA-TGTTTGTTTT--AA-GGTATTA-ACTC-----G-G---Gttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaaacaaaaatggaggtgaaaaacaaaaatatgaatgcgatgtttgttttaaggtattaactcggg
gi|3 : aaactcaagatctgaaaaatgatttacaggaatgtataaacaaaaatggaATG----TTT----TATAAC---TT-----------TTTATTT-GTC--AT-GCCAAA-A---------------TCACTTCTTTG-ATTGCCT-----AAAA---TGA--TA---C----A--A-A---TG------TA-TTTTGA-----AT-----------AAAT---------TATG--------T---T--------------TGCT----T--A---T-TTTC-AA-G--T-TT-G--AA--GCAATGAAATTCAAA-TCT---T---GC-A---A-TAT-GCA-T---AT-T--TT--T--CT--------CGGTA-T--TCT--GCGCCATG--------------GT-GTG-----TGACGTTCA--TACG-CCCAATGAA------T--GTAA-----------A-C--AA---C---TCTCA--GGCA-TACTAT----AAA--TA--GATAC-GAT----TTAATGG-ACA-A-A----AA----A-GGC-AA--TTATCACGTT------AA-CAGTTTG-C--AG--ATAACA-TT-A-CG-TT-CGG-GTG
gi|30 : ctccta-GAGACACAT-G-AACAATACATTACT----GGTTTTGATATA-TCC-T-CATT----A----TAACTGATATGAT------GA------T-G--TCTATGG-GAAT---T----A-----GTTG---AG-TAG--GGCA--GGAT-CATT-G---AGG----ATATACAAATCTGATAAAGGGTA-T-ACTTTTACACATA-----GGTGC----ATAAAAGCC-TTAATATAGGAATGT----ATG-----TC-T-GTT-G--GAAGTGC--CTCAATCA--C-AAACCA--CGAA-----TT---A--C-AC-A-A-C----A-ATCA-T----A-G---------------G-GCA----C-A----TTAC---------T----GT--A---TGATAAAG---C---CAA-------T-ATA-AA-T-G-TAA-TGTGGTTGGG--AA-GGAGTTT-AATttgtgtgtcggttacgggtgtactagatgtcagaattagggtagtagcctaagtttttttttcaactttttcgaaggaaggttcgaggaaattttgtgtcgactcaaggactttaccataaataaaacagtcgattttctctttgtactgctaaaaaaataaaggaaaacataaacagttcgacagcaaccccgattaattgcgcgagaaggtgtttatatagacgctattgacacggattaagtctacaacgtttatttatgtacaggccatttcacgaaatacacgctcgcactcaaactgacctacataatagcacaacaacaaatactcctgaaggttcgtgttcccatttcctaccaaatcgcacatttaaaaaaaaaaaataacattacaataattaaagatcgaacttgtgtaaaaattacaaataagaaaatatgtagttcctcagtaaacatttataattttttcgtggacgcgcttttaaccatgacatgagatgtgtattgctgacaatgctctccggcattaccttgc
gi|31 : caTGTTTGTTT--AAAGC-AAA-A---------------TTACTTCTTTG-TATGCCT-----ATAC---TGAGTT----T----A--A-A---TA------TG-TTTTGAATAAAAT-----------G--T---------T-----------T---T---------------GCT----T--AG--T-TTTT-AA-G--T-CT-G--AAA-GCAATGAAATTCGAA-TC------TTGT-G---A-TAT--CA-T---AT-T--TG--T--CT--------CGGTA-TAGTATACGTTCCGTG--------------AT-GTG-----TGTCG-TCA--TAT------GCGATCT---TT--GCAA-------G---A-AACAA---CT--TGTTA--GCCA-TTTTAT----AAA--CA--AACTT-CATTTAATTAATCG-AC--A-A----AAC---A-GGC-AA--TTATCACGTT------AA-CAGCT
gi|32 : acatttcg-AAAGC-T---T---A-T-A--AATGT--G-ATTTTT-GTGGGAA-AACTTTGAGT--TG--T--AAAGCTGCG-TTACT-GATACACAC-G-AG-GATCCAT-ACT----GGT---GAGAGA-CCT------C----A----TGA-----ATG-T------GG------T-G--TTTGTGG-GAAG---A----C-----ATTC---AA-TCA--GACA--GGAG-ACTT-A---CAG----AGACACA----GGA----GGATA-C-A----TAC---T------GGTGA----A-AAA--CC-TTA---T-A-AATGT--G-ATG-----TC-T-GTG-G--AAAG-GCA-TTCAGTGC--G-A----A--GGAAA--CATTAC-A--A-A--A-A-C------A-CG-T---GA-G---------------G-ATA----C-A----T-AC---------T----G---G---
gi|33 : ACAGACAAATGCACAT---GAA---GACA-CAAAACTGGTGATA-AAACC-------------A--A--------ATGAAT-GTGGGAA-AGCTTT------------------GAT------G-GAAAC-------AA-GCTAGAT-ACT----GGT---GATAAA-CCT----------------------------T------GA------T-A--TCTTTTG-CAAG---GTGTAC-----ATCC---GG-TCA--GAT---CGATGACTT-C---TAGTTCTAAACACG----TGA----AGATA-C------TGT---TC-----AGTGATCTTACAAG--TC-CTA---T-A-AATGT--G-GTG-----CC-T-GT
gi|34 : gaAAAC---C---T---------T-ATA-AA-TAG-TGT-GGTTTGTGGG--AA-Gtaacaag
gi|36 : agtgtaaacagaaaaagtaatgaatgtagtgaacttaggaaacctgtttgtgaaataattcaactaaagatcagaaaaatgatttacagagaacgggtgaaagatattggagtaaaaacatgttttcactgtgatgatagatatgcacaaaaggcgcaaagaacttcaagaCA----TAA----GGACA-C-A----TAT---T------GATGA-----TAAA--CC-TT-----------GT--T-ATT-----TC-T-GTG-G--GAAG-GCA-----ATCA--G-A---CG---------C-T---------A--G-A-C------------------T---------------T-ACA----C-A----T-AA---------C----A---G---TGATAGAC---C---C---------T-ACA-AG-T-G-TA---GTTTGTAGA--AA-GCCATTA-GGTC-----G-GACAGC-ACACCA---A-T-TA---C--A---AAG-T-CACA-C-----A---AG-GA-CACAT-------AAACTG--GAT--AAA-aacatcaat
gi|38 : ----ATACATA----TTA----GAAGA-C-A----TGC---T------GGTGA-----TAAA--CC-TTT---TAA-A-TGT--G-ATA-----TA-T-GTG-G--AAAG-GCA-TTT-GTCTT-G-A---AA--GTAGA--A-TT---A--A-A--A-G-C----A---CA-TTTTG--T---------------G-ACT----C-A----C-AC---------T----G---G---TGAAAAAC---C---A---------T-TTC-AA-T-G-TGG-TGTCTGTGGG--AA-GGTATtggagatatgtgagagaggaa
gi|38 : gagaatatctgcgtGGAAAGGCATTT-GTCTTGAAAGTAGAATTA----AAAG--CACATTTTG-T---GACT-C-ACACTGGTGA-A-AAACCAT---T---T-C-A--A-TGT--G-GTGTCT-GTGGGAA-GGTATATGGT--CT--A--AAAGTTGTG-TTAAA-GAatggtctaaaagttgtgttaaaga
gi|39 : gagaatatctgcgtatacatattagaagacatgctggtgataaaccttttaaatgtgatatatgt-A----CAC---T------GGTGA-----CAAA--CC-AT----TCA-AATGC--G-AGA-----TC-T-GTG-G--ACGG-GCC-TTCCGACA--A-C---CA--GGCAA--T-TT---G--A-C--G---C----G-T-CA-TC--GACT---------------G-ACC----C-A----C-AC---------C----A---C---AGTCAAAC---C---T---------T-ACG-TC-T-G-CCC-AACCTGCAAC--AA-AGCATTC-AACC-----G-G---GC-CTCCAA---C-T-TA---C-------AC-A-CGCA-C-----A---TGCG--CACTC-------ACAC
gi|4 : ----TTT---C-A-AAC---TT-------T---TTTATTT-GTC--ACTGC-AAA-A---------------ATCATTCTTTG-TATGCTA-----AAAA---TGA--C----TTACGA--A-A---TG------TA-TTTTGAATAA-AT-----------T--A---------T-----------T---T--------------TGCT----T--AG--T-TTTC-AA-G--T-TT-G--AAA-GATATGAAATTCAAA--------TTTGC-A---ATTAG-CCA-T---TTCT--TC--T--CT--------CGGTA-TTGTCTGCGCGCCATG--------------GTGGTG-----TGACG-TCA--TAT--C---ACGCCCTAG-TT----AA-------T---GTA--CA---C---TTCTA--GCCA-TAT--------AA--TA--A--TT-GAT----TT-ATGG-AC--A-G----AAACAGA-GAC-AC--TTATCA-GTT------AATCAGCTTG-CAAAG--ATAACA-TT-A-CG-TT-CG
gi|40 : ATCACATT------AA-CAGCTTG-C--AG--ATAACA-TT-A-CT-TT-TGG-GTGccctcttgtgttgtcattagcggatgtactacttgtcagaatagggtggtcctgagtagtcaactttttcgcaggaaggacgaggaaactttttgtgtcgactcaaggactttacgcataaataaaacaagtccgtttggtctttgtctgttaaaaaaaaataaaggaaaaagacagttggacagcaccccagattaatgcgcgaggaaaggttgtttttatatagaagctagacacagattaggtctacaagcgttttatatgtcagcctttcacgaaatacacgctcgcctcaactgacctacatcaatagcataattgttacaacaaatacttcaagttcctgttcccatttcctaccaaatgaaatgataataatacaatagttaaagattgaactgtataaaaatacaaaaagaaatatgtaagtccttcagtaagccatttgtataaatatatattttcgtcgacgcgcttttaaccatgacatgagatgtggtattgctgacaatgctctctctccggcattatttgc
gi|41 : TG----TTT---CTA-AAC-----G------T---TATAATT-TTTAAA--GC-AAA-A---------------CTACTTCTCAG-TATGCCT-----AAAA---TGG--C----TTA--A--A-A---TG------TA-TTTTAAATA--AC-----------A--TA--------T-----------T---T--------------TACT----T--AG--T-TTTC-AG-A--T-TT-C--AAA-TCAATGAAATTCAAA-CC------TTAC-A---T-TAT-ACATT---TT-T--TT--T--CT--------TGATA-T--ttgtgtgtcggttgatggtgtactagctgtcagaattagggaggtagcccgagtttttcaactttttcgaaggaaggtgcaaggaaaatttgttgatacaagaactttttcataaataaaactgttgcttt
gi|43 : cattgatAAAGGACACATAGCATAGATACTTAAATTA-AAC---TTT------T---TTAATTT-CTT--AA-GC-ACA-A---------------CT----CTTTG-TGTGCCT-----AAAA---TGA--CACTTT----A--A-A---TG---------------------T-----------G--T---------T-----------T---T--------------TGAA----TAAAG--TCTTTC-AA-AACT-TT-GA-AAA-GTGATGGAATTGAAA-CAA---TCTTGCAA---A-TAT-a
gi|44 : GGGCACATCGCATG----TTT---CTA-AAC-----A------T---TTTGATT-TTTGAA--GC-AGA-A---------------TTGCTTCTTTG-CATGCCT-----AAAA---TAA--C----TCTG-A--A-T---TGATTT--TG-A----------ATAAA--------A--TA--------T-----------T---T--------------TGCT----T--AG--T-TTTC-------T-T---------GCGATGAAATTCAGA-TA------TTGC-G---A-TAC-GCA-T---AA-T--TT--T--C
gi|47 : GA--GATG-G-GG----TCATTACA---GAGACACAA--G-AG---GATA-C---ATACATGATACTGGTGATAAA-CATTAT----------T-AAA---------AAA-------------AA----TATT-----G-GGCA-C-TTAAAGAC-ACGCAA--GATGATACCTACCA-G-TGA-AAAA
gi|48 : ---G---TGAGAAAC---C---T---------C-ATA-AG-T-G-TAA-CGTATGTGGA--AA-AGCCTTC-AGCC-----A-G---TC-CTCCAA---CCT-TAT--C--A---------CACA-C-----AGTCGGAAA-CAC-----------ACCG--GATTCAAG-CC---ATTTA-AGT-G-TG-A
gi|5 : -AAAT----A-----AA-----ATG-CCCTTTCGA------C-G--TCTGTGG-GAAG---G----C-----ATTC---CG-TGA--GACA--AGTA-AGGT-A---AAG----ACACACA----TGA----GGATA-C-A----TAC---T------GGTGA-----TGAA--CC-TCA---TAA-A-TGT--G-ACG-----TC-T-GTG-G--GAAG-GCA-TGCAGTGA--T-A---CA--AGTAG--C-TT---A--A-A--G-A-C----ACA-CA-T---GA-G---------------G-ATA----C-A----C-AC---------T----G---G---TGATAAAC---C---T---------T-ATA-AA-T-G-TGA-TGTCTGTGGG--AA-GGCATTC-AGTC-----G-G---GC-ATACAA---T-T-TA---G--A---GAG-A-CATA-A-----AA--GGATA-CATGT-------ATAGTAGTGAT--AAA-CC---TTATA-ATT-G-TG-ATGCCTGCG-AAAATA------CTTTCAG-CAAT--ATGGGATCA-TTATTTCG-CCTCATGAAG-A--AACATACTG-G-TAA-TAA-A-CCTT-A---TA-TATA-TGA-TGTC-TGTGGGAAA---ACATTTAGTGA--GACG-G-GA----CACTCACA---GACACATAT--A-AG---GATA-C---ATAC-------TGGTGATAAA-CCTTATAA--------TTCAA---------TAA-------------GA----CA-------G-GGAA-A-TTACAGAG-ACACAT--AGGGATACATACTG-G-TGA-TAAACCTT-TTGATTTATATATGTGATTTGTATTGGTAAGCGTTCATGTAAAGGACACGTCGAATG----TTT---TTA-AAC---TTG------T---TTTATTT-TTT--A--G------------------------------TTG-TATGCCT-----AGAT---TGA--C----T----ACAA-A---TG------TG-C----------AT-----------G--TA--------T-----------T---T--------------TGTT----T--TT--T-TTTT-AAAG--T-TT-G--AAA-GCAATAAAATTCAAA-T-T---TTTTGT-G---A-T-T-AAA-T---AT-T--TT--T--CT--------TGGTA-T--TTTCTGCGTCATG--------------AT-GTG-----TGACG-TCA--TATA-T---GTGACCT---TT--GCGA-------T---A-A--AA---C---TGTTA--GCCA-TATTAT----AGA---A--AATTC-GAT----TTAATGG-AC--A-A----AA----A-GTC-AA--TTATCACGAT------AA-CAGCTCG-C--AG--ATGACA-TT-A-CG-TT-TGG-GTGC
gi|51 : ---------T-----------T---T--------------TGCT----C--AA--T-TTTG-AA----T-TT-G--AAA-GCAAGGAATTTCTAA-------TTTTGT-G---A-TAC-GTA-T---t
gi|53 : ctaagtgaaataagtatcaagtgaagtaTTG-CATGCCT-----AAAT---TAA--CTT--T----T--A-A---TG------TG-T--------------------------T---------T-----------T---C--------------TG-TGAAAT--AT--T-TTGCGAA-A--TATT-G--AAT-TC-ACGAAATTCGAA-TC------TTGT-G---A-TAC-GCA-T---tagcatcagatag
gi|55 : cCTT-A---CAG----AGACACA----TAA----GGACA-C-A----TAC---TATATGCAGTG-----ATTGA--TC-TTA---TAA-AATTT--G-ATG-----TC-T-tat
gi|56 : CACA----TGA----GGACA-C-A----TAC---A------GGAGA----AC-GC--CC-GTA---C-A-AATGT--A-ACA-----CG-T-GCG-G--GAA--ACAGTTCGCTCA--GTA---CG--GGACA--C-Taggtatgaaaagtgttc
gi|57 : AAAGGACACATCGCATG----TTT---CTA-AAC---TTT------T---TGAATTT-TGC--A--GC-AAA-A---------------TTACTCCTTTG-TATGCCT-----AAAgta
gi|6 : AAGGACATATTGCATG----TTT---CTA-AAT---TGT------TAGATTTTTTT-TTT--A--AC-AAA-A---------------TTAGGTCTTTG-CATGACT-----AGAA---TGA--CTT--T----A--G-A---TG------TG-TTTTAAATGAAAT-----------A--T---------T-----------TTAAT--------------TACG----T--AG--T-TCTT-GA-G--T-TT-G--AAA-G-------GTACAAA-TCTCAGTCTTGC-G---A-TAT-GCA-T---AT-TAATT--TTACTTA------TGATA-T--TTTATGTACGATG--------------AA-GTGTCGTCTGACA-TCA--TAT------GTGACCTAGAGT--AAGG-------TCTGA-A--AACAGC---TGTTA--GCCA-TTCTAT----AAATTTATTGATTA-GAT----TTAATTG-AC--A-A----AAT---A-GCC-CA--TAGCTATG-T------A------TTG-T--AG--ATAACT-TT-G-CA-TG-GGG-GTGC
gi|61 : AT---GAG---GACA-C-ATACTGGTGA-G-AAACC-A---T---A-T-A--A-tgtgcaccatttatgggtgcacatatactaagtgtcaaaagaagtgatgtatagactgaggtttttcaaatttttctaaagaaggtgtgaggaaaaagaagtgggtgatttttttgtcagcacattaaggacttggtcataacccctcccctctacagtcacctttgtccatgttctttttcaaaaaactattggacagagacccatttaactgtgaggaaatagttatgtagaagccaggcacagctaggcctacagtatatggattctgttctggtcgtcatcatttcacaaatactcactcgcaccttggaaataaaaacggacattgtaacagtatatacttgtgttcccagttcctgtaaacttgtagaattataaaaaaaaaaataaattaaagattgaaaataattgaactt
gi|7 : ACA--GGAA-GCTT-A---CAG----GCACACA----TGA----CAACA-C-A----CAC---T------GGTGA----A-AAC--CC-TTA---CAA-A-TGT--G-GTG-----TC-T-GTG-A--AAAA-GCA-TTCCCTCA--C-A---TA--AGTCC--T-TT---A--C-A--G-A-G----ACA-CA-T---AA-T---------------G-ATA----C-A----T-AC---------T----G---G---TGATAAAC---C---T---------T-ACA-AA-T-G-TGA-TATCTGTGGA--AA-GGCGTTC-ACTT-----ATA---AT-GGA-GA---C-T-TG---C--G---TAG-A-CACACC-----A---GG-----ACAN-------NNNNNNNNNNN--NNN-NN---NNNNN-NNN-N-NN-NNNNNNNNN-NNNNNN------NNNNNNN-NNNN--NNNNNNNNN-NNNNNNNN-NNNNNNNNNN-N--NN-NNNNNN-N-NNN-NNN-NNNNNNNN---NN-NNNN-NNN-NGTG-TGTGGGAGG---GCATTCAGTGA--GACA-G-GAGC--C--ATGCG---GAAGCACAT--G-AA---GATA-C---ATGC-------Ta
gi|7 : cattccctaacGTGT-GTGGGAG-GGCATTCAGT--GA--G--ACAGGAGCC-ATGCG-GAAGCACAT-G-AA-GATACAT-GCT----NNN---NNNNNN-NNN-N-NNNN----N----NNN-----NNN-N------NN------N-N--NNNNNNN-NNNN---N----N-----NNNN---NN-NNN--NNNN--NNNN-NNNN-N---NNN----NNNNNNN----NNN----NNNNN-N-N----NNN---N------NNNNN----NNNNN--NN-NNN---NNN-NNNNN--N-NNGTGATGTC-T-GTG-G--AAAG-GCA-TTCAGCCG--T-A---C---GGGAA--CATT---A--A-A--G-A-G----ACA-CA-T---GA-nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngtgatgtctgtggaaaggcattcagccgtacgggaacattaaagagacacatgacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaaccatatcagtgtgatgtctgtgggaaggctttcaggcattcagtaacattatataagcata
gi|7 : cattccctaacacaggaagcttacaggcacacatgacaacacacactggtgaaaacccttacaaatgtggtgtctgtgaaaaagcattccctcacataagtcctttacagagacacataatgatacatactggtgataaaccttacaaatgtgatatctgtggaaaggcgttcacttataatggagacttgcgtagacacaccaggacannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn-G-TG-ATGTCTGTG-GAAAGG------CATTCAG-CCGT--ACGGGAACA-TTAAAGAG-ACACATGAcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaaccatatcagtgtgatgtctgtgggaaggctttcaggcattcagtaacattatataagcata
gi|7 : cattccctaacacaggaagcttacaggcacacatgacaacacacactggtgaaaacccttacaaatgtggtgtctgtgaaaaagcattccctcacataagtcctttacagagacacataatgatacatactggtgataaaccttacaaatgtgatatctgtggaaaggcgttcacttataatggagacttgcgtagacacaccaggacannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngtgtgtgggagggcattcagtgagacaggagccatgcggaagcacatgaagatacatgctnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnAA-CC---ATATC-AGT-G-TG-ATGTCTGTG-GGAAGG------CTTTCAG-GCAT--TCAGTAACA-TTATATAA-GCATAcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaaccatatcagtgtgatgtctgtgggaaggctttcaggcattcagtaacattatataagcata
gi|8 : cattccctaacacaggaagcttacaggcacacatgacaacacacactggtgaaaacccttacaaatgtggtgtctgtgaaaaagcattccctcacataagtcctttacagagacacataatgatacatactggtgataaaccttacaaatgtgatatctgtggaaaggcgttcacttataatggagacttgcgtagacacaccaggacannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngtgtgtgggagggcattcagtgagacaggagccatgcggaagcacatgaagatacatgctnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngtgatgtctgtggaaaggcattcagccgtacgggaacattaaagagacacatgacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn---------------TTACTTCTTT--TATGCCT-----AGAA---TGT--A----T----A--C-A---TGGATTT-TGAT----------AA-----------A--TA--------T-----------T---T--------------TGTT----T--GG--T-TTTA-AAAG--T-TT-G--AAA-GCA-TGACATTTAAA-TCT---T----C-G---A-TATTGCT-T---TT-T--CTCCT--CT--------CGGAA-T--TTTGCGCGCCATG--------------AT-CTT-----TGACATTCA--TATGTC---GT--CCT---TT--
gi|8 : g-A--AA---C---TGTTA--GCCA-TATCATTTCAAAA--T-----TTCCGAT----TTAATGGCAC--ATA----CA----A-GTC-AA--TCATCACGTT------AA-CAGTTTGTT--AG--ATAACA-CTAA-CG-TT-CAG-tacaacaccaaaaaaaaaaaaaacaaaaaaaaaaacaaactgttagccatatcatttcaaaatttccgatttaatggcacatacaagtcaatcatcacgttaacagtttgttagataacactaacgttcaggggtcggttacggatgtaatagctgtcaaataaggactgtaccgtgaacattgtcaacttttacgaaggaaggtgcgaggaaaaagacgagtattttgtcacacaggaccaataccataaaatcaaaacagtcgtttttgctccatgtactgttaaaaaagaaatgatattattagaaataaaggaaaaccaaacacaggtaggcagcgaccaggtttaacttgcgaggtgtttattttagaagcggatattcgcaactacatgcttacagtgttacattgccaagatatgacacaaaattacacacccgtacacactccctaagaatatgtactcagactcgcattctcattcctaccaaatcgcaaatacacaaatatatgaattaaagatttgaattgaagttgtatttacaataataaatatgtaa
gi|9 : gttacttcttttatgcctagaatgtatacatggattttgataaatattttgtttggttttaaaagtttgaaagcatgacatttaaatcttcgatattgctttttctcctctcggaattttgcgcgccatgatctttgacattcatatgtcgtccttttacaacaccaaaaaaaaaaaaaacaaaaaaaaaaacAAGGACATATCCCATG----TTT---CTA-AAC---TT-------T---ATTAATT-TTT--AT-GC-AAA-A---------------TTACTTCTCTG-TATGCTT-----AAAA---TGA--C----T----A--C-A---GA------TA-T----------AT-----------T--T---------TAAATACATTAAT---T--------------CGCT----T--AG--T-TTTC-AA-G--T-TTTG--AAA-GCAATGAAATTCAAAATCT---G---GC-A---A-TAT-GCA-T---AT-T--TT--T--CT--------CGGTA-T--TCTGCGCGCCATG--------------GT-GTG-----TGACG-TCA--TATA-C---G---CCT---TT--G-GAATG----T---A-AACAA---C---TCTCA--GGC--TA--AT----AAA--TA--GATTC-GA-----TTAATAG-AC--A-AG---AA----A-GGC-AA--TTAT-ACGTT------AA-CAGATTG-C--AA--AT-GCA-TT-A-CG-TTACGA-GTGggtcggttacggatgtaatagctgtcaaataaggactgtaccgtgaacattgtcaacttttacgaaggaaggtgcgaggaaaaagacgagtattttgtcacacaggaccaataccataaaatcaaaacagtcgtttttgctccatgtactgttaaaaaagaaatgatattattagaaataaaggaaaaccaaacacaggtaggcagcgaccaggtttaacttgcgaggtgtttattttagaagcggatattcgcaactacatgcttacagtgttacattgccaagatatgacacaaaattacacacccgtacacactccctaagaatatgtactcagactcgcattctcattcctaccaaatcgcaaatacacaaatatatgaattaaagatttgaattgaagttgtatttacaataataaatatgtaa
17 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|17 ): ATTATTAAGTTTTATAATCATTTTTATTACTTATGTTGCGTAGCCCAATTAGAAACAGATTAAATTCATCAGGAACAGGTCAAGGTATAAATTGTTCATCAGAGATATGTTCACCAACACTGACACACTAGAATTTAGATTGAATGAAACATCCCATTGCACGAATAGCCCTCCTCAGATGACTTTCTTTCATCTACAACCAATAGCTGCCTGTGAAACAAGTATGTATATCTACCCAACCAATGGCTGTCTCTGAAACAAGTATGTCTTCTACACAATCAAGACTAGCACAAACGGAAAATATAACGGACTTTGTTGAAACTGTTGAAGCAGTCTGTGAAACAAGTAAAAACTCAAGATCTGAAAAATGATTTACAGGAGTGTATAAACAAAAATGGAGGTGAAAAACAAAATATCAATGTGATGTTTTTAAGGTAT
Unaligned ( gi|21 ): GCCAGAATAAGGGTGGTAGTCTAAGTTTTTTTCAGTTTTTTTTCCAAGGAAGGTACATACTGAAGGAAATGTTTTTTGACACCAAGGACTTTACCATAATTAAAACAGTCGCTTTTGTCCATGTGTTGTAAGAAAAAAAAATACACGTAATAAAATAATGAAACAACAACAGTTGGACAGCAACCCAGTCTAATAGCTAAAAAGTGTTTATATAGAAGTTAAACACGGCTAGGCCCACAGCGTAAATTGTGTCCAGGCCCAGGATCACCCGCTCAAACTGACCTACAAATAGCATAACAAATATTCAGGTTCGTGTATTAAAAATTTAATTGAATTATAAGATAATTATGCAAT
Unaligned ( gi|22 ): CCAGAATAAGGGTGGTAGTCTAAGTTTTTTCAGTTTTTTTTCCAAGGAAGGTACATACTGAAGGAAATGTTTGTTGACACAAGGACTTTACCATAATTAAAACAGTCGCTTTTGTCCATGTGTTGTAAGAAAAAAAAATACACGTAATAAAATAAATGAAAACAACAACAGTTGGACAGCAACCCAGTCTAATAGCTAAAAAGTGTTTATATAGAAGTTAAACACGGCTAGGCCCACAGCGTAAATTGTGTCCAGGCCCCAGGATCACCCGCTCCAACTGACCTACAAATAGCATAACAAATATTCAGGTTCGTGTATTAAAAATTTAATTGAATTATAAGATAATTATGCAAT
Unaligned ( gi|24 ): GTGTACTAATGTCAATTAGCGTGGTGAGCCCTGAGTTTTTGTCCAAGAAGGAAGGTTCGGAGAATTTGTTAGTCTGTCGCTTCAAGGACTTAACCATAAAAAAACATCGCGTTTTGTCTCTTTGTAACTGTTAAAAAAAAAAGGGGAGAAACATAAACAAGTGGACAGCGTAACCCCGATTATTGCGCGAGAAGTTTTAAAGTATAGAAAGCTATAAGACACGGCAGTTAGGTCTACAACGTTTATTTATGTCAGCCATTTCACGAATACACGCCCGCACTCAACTAGACCTACATAT
Unaligned ( gi|28 ): TATGTTCGGGTGGTGTGTGTCGGTTACGGGTGTACTAGCTGAGTTTTTCAACTTTTACGAAGGAAGGTGCGAGGAAATTTTTGTCGACACAAGGTCATTATTATAAATAAAACAGTCGCCTTTGTCCTTGTACTGTTAAAATATCAAAATAAAATAAAGGAAAACATAAACAGTTGGACAGCAACCCAGTTTAACTTTATATAGAAGCTAAACACAGCTAGGCCCACAGCGTATAGTGTCCAGGCCATTTCACGAAATACACAACAGTACCAACTGACGTACATAACATATAT
Unaligned ( gi|35 ): AATTTAGCTAATCGAAGTTACATCGGTTTATCGAAGCTACACATCAACATATTTCACTAAAACGTGTCATAATGGTAATTTCTGGCTGCTAGCCATTCCCTTTCGGGTATTAGTAAGGTCATTATGTCACGACTACCGTGCAAAATTCCCCAGGAGTTGGCGCACAGAAATTCAAGAGGTAAGGCGGAGT
Unaligned ( gi|37 ): ACAACAACAAATATCTCCTGACAGCTTCTGTGTTTCCATTTTCTCTAAGCCAAATCGCGCATCATTTATAAAAAAATTAATGAATACAATAATTAAAGATATCGAACTTCTTAATAAAAAATTACAAAAATGAAGAAATATGTAGATTTATATAATCTTTTATACTGTGGAACGACAGCGCTTCTTTA
Unaligned ( gi|42 ): AGGACATCTAGGCCTACAACATATGCATTAATATTCTGTTCTGGTCGTCGTCATTTCCCAAGATACATGTATATACTCGCACTTAGGAATTTAAACTAACTCCGTACCACTAACTAACAATTTATCTTGTGTTCCCACTTCCTACCAACAT
Unaligned ( gi|45 ): GTTATAATTTGTCATCAGAGATGTGTTCACCAACGTTGACAACACTAGAATTTAGACTGGAATGAAACACCCCATTGAAAATAGCCCTCCTCAGATGACTATTCTTTTCATCTACCCAACCAAT
Unaligned ( gi|46 ): AAAGATTGAACTTGTATTTACAAATAATAAATATGTAATTCCTCAGTAAACATTTCATTGATTTCACGCGGTTTAACCATGTCATCAATATGAGATGTGTATTGCCGTGCTCTCCGACGGCTT
Unaligned ( gi|49 ): GCAACCCAGCCTAGTTGCGAGAAAATGTTTTTATAGAAGCTAAACACGGCTTGGCGCACAGCGTAAATTCTCCAGGTCATTTCACGAAATACACACCCGC
Unaligned ( gi|50 ): AAAATGTCTTCCAATGTCATTTCTGGCTGCCAGTTCCTTCCCTTTTTCTGGTATTAATGAGGTCATCAATTACGTCACGACCACCGTGCAAGACT
Unaligned ( gi|52 ): GTATCTAATGCTCTGTTACGTTCGACATCATATGCGTCCTTGAGTGAGAAGGTTTGAAAACATTAGTTTTATAAATGGATTAAATTTAATCAAC
Unaligned ( gi|54 ): TGATCTTCCTCACTTCACGCAATACACACTCGCACTTTGGGAATAAAAGAACATGCACTTGTGCTCCCATTTTCTATCAACTATTAGA
Unaligned ( gi|58 ): TACAATATTAATGGGATTGAACTACTTCAAGGTTAAATCCATTTATCAAAGTAAA
Unaligned ( gi|59 ): GATGTGTATTGCCGTGCTCTCCGCCGGCTTCAGGC
Unaligned ( gi|60 ): AGAGTCATCTTATGTGACGTCACAAATTTTAGG
Alignments
lowQualScore : 1111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111
lowQualScore : 1 11 1111 1111111111111111 22222222222222222222222 444444444444444444 11111 111111 33333333333333333333333333333333333333333333333333333333333 111111111111111111 11111111111111111 11111111111 2222222222222222222222222 11111111 1111 2222222222222222222 11111 3333333 1111111 77777777777777777777777777777777777777777777777777777 1111111111111 222222222222222222222222222222 0000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 1111 33333333 11111111 11111111111111 5555555555555555555555555555555555555555 1111 11 1111
lowQualScore : 5 0 6 11 1 6 66 777 2222 555 1 888 9999999999999999 3 9999 0 6 3 2 3 99999999999999999999999 4 3 6 0 3 5555 444 4 2 666666666666666666 0 77777 2 666666 888888 2 33 0 1 2 99999999 55555 6666 0 444 00000 22 2 4444 4444 1 3333 5555 1 1 3333 333 888888 888888 22 22 333 4 999 44 3 1 44444 3 1 333 1 1 1 44 1 333 222 11111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 2 4444 2 4444 2 333333333333333333 333 2 1 77777777777777777 33 2 2 2 2 2 22 2 2 4 66666 2 66666666666 444 2 8888888888 2 2 5555555555555555555555555 1 2 0 2 0 3 2 3 3 3 3 77777777 4444 2222 1 88 555555 777777 0000000000000000000 4 0 33333 55 4 4 4 777 99 99 0 444 5555555 777 8888 777 8 777 3333333 5 77777777777777777777777777777777777777777777777777777 6 888 1 6 99 6 6 77 1 8 0 0 6 5 3 6666 444 2 444 0000000000000 2 222222222222222222222222222222 0 2 55555 333 33 4444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444 6666 22 55 2 2 0000 2 77 2 2 44444444 2 333 4 22 2 333 2 33 66 33 33333333 2 77 1 66666666666666 2 77777 5 33 1111111111111111111111111111111111111111 555 777 0 33 0 2 0 8888 999999 0 5 0000 2 66 2 8888 4444 2 2 33 1 777777 5 0 1 2 33 77 2 2 2 2 2 3
lowQualScore : . . . .. . . .. ... .... ... . ... ................ . .... . . . . . ....................... . . . . . .... ... . . .................. . ..... . ...... ...... . .. . . . ........ ..... .... . ... ..... .. . .... .... . .... .... . . .... ... ...... ...... .. .. ... . ... .. . . ..... . . ... . . . .. . ... ... ........................................................... . .... . .... . .................. ... . . ................. .. . . . . . .. . . . ..... . ........... ... . .......... . . ......................... . . . . . . . . . . . ........ .... .... . .. ...... ...... ................... . . ..... .. . . . ... .. .. . ... ....... ... .... ... . ... ....... . ..................................................... . ... . . .. . . .. . . . . . . . .... ... . ... ............. . .............................. . . ..... ... .. ................................................................................................. .... .. .. . . .... . .. . . ........ . ... . .. . ... . .. .. .. ........ . .. . .............. . ..... . .. ........................................ ... ... . .. . . . .... ...... . . .... . .. . .... .... . . .. . ...... . . . . .. .. . . . . . .
lowQualScore : 5 7 7 00 0 7 11 000 7777 555 6 000 1111111111111111 3 6666 8 7 3 2 1 66666666666666666666666 4 3 7 4 1 0000 111 9 4 222222222222222222 2 88888 2 444444 666666 2 11 5 7 2 33333333 66666 9999 7 111 11111 66 1 2222 2222 0 9999 7777 9 8 9999 222 999999 444444 55 00 222 8 999 11 5 7 33333 5 9 999 9 9 1 55 9 333 888 00000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 1 5555 1 5555 1 777777777777777777 777 2 8 44444444444444444 11 1 1 1 1 1 99 1 4 4 22222 7 00000000000 777 7 7777777777 7 7 9999999999999999999999999 0 9 3 9 5 1 2 1 1 1 1 11111111 5555 8888 4 99 555555 222222 2222222222222222222 4 2 00000 22 4 4 4 888 22 55 7 666 7777777 000 4444 000 0 000 0000000 0 22222222222222222222222222222222222222222222222222222 7 333 0 7 22 7 7 77 4 0 8 6 0 0 2 1111 777 7 444 6666666666666 5 222222222222222222222222222222 4 2 66666 999 11 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 6666 99 88 1 1 4444 1 11 1 1 66666666 1 777 2 66 2 999 5 44 33 77 33333333 7 33 7 88888888888888 9 11111 7 99 4444444444444444444444444444444444444444 000 999 7 99 7 9 1 9999 222222 8 7 0000 9 44 9 9999 6666 9 9 99 1 777777 3 5 4 9 99 99 9 9 9 9 9 1
consensus : GGAAGGGCATTTTATCTGAAAAGCGGA--TACAGAGAAA--CACAT---GAG---GACA-C-ATACTGGTGA-N-AAACC-T---T---A-T-A--A-TGT--G-ATGTCT-GTGGGAA-GGCATTCAGT-CG--C--ANGGNNACGTTACG-GAGACACAT-GAG-GATACAT-ACT----GGT---GANAAA-CCT-A-AAAT----A----TAA-----ATG-T------GA------T-G--TCTGTGG-GAAG---G----CA-----TTC---AGT-CGGANA--GGANACTT-A---AAG----ANACACA----TGA----GGATA-C-A----TAC---T------GGTGA----ATAAA--CC-TTA---TAA-AATGT--G-A-TG-----TCT-GTG-G--GAAG-GCA-TTCAGTCA--G-A---CAG--GNAA--C-TT---A--A-A--G-A-C----A-A-CA-T---GA-T---------------G-ACA----C-A----T-AC---------T----G---G---T-GANAAAC---C---T---------T-ATA-AA-T-GT-GA-TGTCTGTGGG--AA-GGCATTC-AGTC-----G-G---GC-ANACGA---CT-TA---C--A---GAG-A-CACA-C--A--GGA-G-A-CACGC-----ATA-CTGGTGATAAA-CCTTATA-ANT-G-TG-ATGTCTGCG-GGAAGG------CATTCAG-CNAT--ACGGGAACA-TTATNNAG-ACACATGAGG-A--AN-ATACTG-G-TGA-TAA-AACCTTNA---TG-AATG-TGA-TGTC-TGTGGGAAG---ACATTCAGTGA--GACG-G-GA----C--TTACA---GACACACAT--G-AG---GATA-C---ATAC-------TGGTGATAAA-CCTTATAA--------T-CAA---------TAA-------------GA----CA-------G-GGAA-A-TTACAGAG-ACACAT--GAGGATACATACTG-G-TGA-NAAACCTT-TTGATTTATATATGTGATTTGTATTGGTAAGCGTTCATGTAAAGGACACGTCGCATG----TTT---CTA-AAC---TTT------T---TTTATTT-TTT--A--GC-AAA-A---------------TTACTTCTTTG-TATGCCT-----AAAA---TGA--C----T----A--A-A---TG------TG-T----------AT-----------G--T---------T-----------T---T--------------TGCT----T--AG--T-TTTC-AA-G--T-TTG--AAA-GCAATGAAATTC-AAATCT---TTTTGC-G---A-TAT-GCA-T---AT-T--TT--T--CT--------CGGTA-T--TTTGCGCGCCATG--------------AT-GTG-----TGACG-TCA--TATA-C---GTGACCT---TT--GCGA-------T---A-A--AA---C---TGTTA--GCCA-TATTAT----AAA--TA--AATTC-GAT----TTAATGG-AC--A-A----AA----A-GGC-AA--TTATCACGTT------AA-CAGCTCG-C--AG--ATAACA-TT-A-CG-TT-CGG-GTGC
Reference ( family-1142 ) : GGAAGGGCATTTTATCTGAAAAGCGGA--TACAGAGAAA--CACAT---GAG---GACA-C-ATACTGGTGA-N-AAACC-T---T---A-T-A--A-TGT--G-ATGTCT-GTGGGAA-GGCATTCAGT-CG--C--ANGGNNACCTTAAG-GAGACACAT-GAG-GATACAT-ACT----GGT---GATAAA-CCT-A-AAAT----A----TAA-----ATG-T------GA------T-G--TCTGTGG-GAAG---G----CA-----TTC---AGT-CGGANA--GGANACTT-A---AAG----ANACACA----TGA----GGATA-C-A----TAC---T------GGTGA----ATAAA--CC-TTA---TAA-AATGT--G-A-TG-----TCT-GTG-G--GAAG-GCA-TTCAGTCA--G-A---CAG--GNAA--C-TT---A--A-A--G-A-C----A-A-CA-T---GA-T---------------G-ACA----C-A----T-AC---------T----G---G---T-GANAAAC---C---T---------T-ATA-AA-T-GT-GA-TGTCTGTGGG--AA-GGCATTC-AGTC-----G-G---GC-ANACGA---CT-TA---C--A---GAG-A-CACA-C--A--GGA-G-A-CACGC-----ATA-CTGGTGATAAA-CCTTATA-ANT-G-TG-ATGTCTGTG-GGAAGG------CATTCAG-CNAT--ACGGGAACA-TTATNNAG-ACACATGAGG-A--AN-ATACTG-G-TGA-TAA-AACCTTNA---TG-AATG-TGA-TGTC-TGTGGGAAG---ACATTCAGTGA--GACG-G-GA----C--TTACA---GACACACAT--G-AG---GATA-C---ATAC-------TGGTGATAAA-CCTTATAA--------T-CAA---------TAA-------------GA----CA-------G-GGAA-A-TTACAGAG-ACACAT--GAGGATACATACTG-G-TGA-NAAACCTT-TTGATTTATATATGTGATTTGTATTGGTAAGCGTTCATGTAAAGGACACGTCGCATG----TTT---CTA-AAC---TTT------T---TTTATTT-TTT--A--GC-AAA-A---------------TTACTTCTTTG-TATGCCT-----AAAA---TGA--C----T----A--A-A---TG------TG-T----------AT-----------G--T---------T-----------T---T--------------TGCT----T--AG--T-TTTC-AA-G--T-TTG--AAA-GCAATGAAATTC-AAATCT---TTTTGC-G---A-TAT-GCA-T---AT-T--TT--T--CT--------CGGTA-T--TTTGCGCGCCATG--------------AT-GTG-----TGACG-TCA--TATA-C---GTGACCT---TT--GCGA-------T---A-A--AA---C---TGTTA--GCCA-TATTAT----AAA--TA--AATTC-GAT----TTAATGG-AC--A-A----AA----A-GGC-AA--TTATCACGTT------AA-CAGCTCG-C--AG--ATAACA-TT-A-CG-TT-CGG-GTGC
gi|1 : GAAAGGGCATTTTATTTGAAAAGCGGA--TGCAGAGAAA--CACTT---GAG---GACG-C-ATACTGGTGA-G-AGACC-T---T---A-T-A--A-TGT--G-ACGTCT-GTGGGAA-GACATTCCAT-TG--C--ATGTATATCTTAAA-GAACCAC-T-GAA-GATACAT-ACT----GGT---GATAAA-CCTCATAAATTCTCA----TAA-----ATG-T------GA------C-G--TCTGTGG-GAAG---G----CA-----TTC---AGT-GAGAAA--AGATACGT-A---AAG----ACACATA----TGA----AGATA-C-A----TAC---T------GGTGA----ATAAA--CC-TTA---TAA-AATGT--G-A-CA-----TCT-GTG-G--GAAA-GCA-TTCAATCA--G-A---CAT--GTAA--C-GT---A--A-A--G-A-C----A-A-CA-T---GA-T---------------G-ACA----C-A----T-AC---------T----G---G---T-GATAAAC---C---T---------T-ATA-AA-T-GT-GA-TGTCTGTGGG--AA-GGCATTC-AGTC-----G-G---GC-ATACAA---TT-TA---G--A---GAG-A-CACA-A--A--GGA-G-ATCATGT-----ATA-GTAGT-ATAAA-CCTTATA-ATT-G-TG-ATGCCTGCA-AAAATA------CTTTCAG-CAAT--ATGGGATCA-TTATTTCG-CCACATGAAG-A--AA-ATACTG-G-TGG-TAA-AACCTTAA---TA-TATA-TGA-TGTC-CATGGGAAA---ACATTTAGTGA--GACG-GCGA----C--TCACA---GACACATAT--A-AC---GATA-C---ATAC-------TGGTGATAAA-CCTTATAA--------T-CAA---------TAA-------------GA----CA-------G-AGAA-A-TTACAGAG-ACACAT--GGGATTACATACTG-G-TGA-TAAACCTT-TTGATTTATATATGTGATT-GTATTGGTAAGCGTTCATGTAAAGGACACGTCGAAT-----TTT---TTA-AAC---TTG------T---TTTATTT-TTT--A--G------------------------------TTG-TATGCCT-----AGAT---TGA--C----T----A--A-A---TG------TG-C----------AT-----------G--T---------T-----------T---T--------------TGTT----T------T-TTTA-AAAG--T-TTG--AAA-GCA-TAAAATTC-AATTTT---TTTTGT-G---A-T-T-AAA-T---AT-T--TT--T--CT--------TGGTA-T--TTTCTGCGTCATG--------------AT-GTG-----TGACG-TCA--TATA-T---GTGACCT---TT--GCGA-------T---A-A--AA---C---TGTTA--GCCA-TATTAT----AGA---A--AATTC-GAT----TTAATGG-AC--A-A----AA----A-GTC-AA--TTATCACGAT------AA-CAGCTCG-C--AG--ATGACA-TT-A-CG-TT-TGG-GTGC
gi|10 : T--------CAGTA-T--TTTATGCGTCATG--------------AT-G-G-----TGACA-TCA--TGT------GTGTCCT---TT--GCGA-------T---A-A--AA---T---GGTTA--GCCA-TATTAT----AGG---A--AATTC-GAT----TTATTGG-AC--A-A----AAG---A-GAC-AA--TTATCACGTT------AA-CAGCTCG-C--AG--ATAACA-TT-A-CG-TT-CGG-ATG
gi|11 : ----GGT---GAAAAA-CA--A-AAAT----A----TCA-----ATG-T------GA------T-G--T-TGTTT-TAAG---G----TA-----TTA---TCT-CGG-----GCTTACTT-A---AAC----AAACACA----AGC----GGA-A-C-A----TAC---G------GGTGA----G-AAA--CC-ATA----AA-AATGT--G-A-TG-----T-T-GTGTG--GAAG-GCA-TTCAGTCA--G-T---CAG--GATA--T-TT---G--A-A--GTG-C------A-CA-T---GA-T---------------G-ACA----CTA----T-AC--------------G---G---T-GATAAAC---T---T---------T--TA-AATT-GT-GA-TGTCTGTGGA--AA-GGCATTT-A-TT-----G-G---AA-AACCGA---C---G---C--A---GAGAA-AACA-C--A--TGA-G-tactagctgccagaataagggtggtagcctaaattttttcagcttttcgaaggaaggtgcgaagaaatgtttgtcgatacaaggaataaataaataaaactgtcgcttttgtccatgtgctgtaaaaacaatacatgtaataaataaaggaaaacaaaaacagttggacaacaacccagcctaattgctagaaggtgtatatataaaagctaaacacggctagactcatagcgtaaattgtgtccaggccatttcatgaaatacacatctgcaccaattgacctacatataacataataggatttaatacttcaaagttaaatcggtttatcaaagcaaaatatcaattattctccgaaaacgtaccagcgtactttccgggtgctaactaactttatagtggggacacttgcttacgtcacgtcacgtcacgcccaccgtgcaagcatccccagcagtgagcgcatagaaattcaaagaggtatgaggtgttgaattctt
gi|12 : ttattagttttataatcaatttttattacttatgtgtgcagatagcccattagaaacagattaaattcatcagaacaggtcaaggttataatttgtcatcagagatatgttcaccaacactgacaacacgaatttagattgaatgaaacatcccattgcgaatagccctcctcagatgactattcttttcatcaaccaaccaatagctgcctgtgaaacaagtatgtatatctacccaaccaatggctgtctctgaaacaagtatcttctacacaaatcaaagactagcacaaacggaaaatataacggactttgtgaaactgttgaagcagtctgtgaaacaagtaaaaactcaagatctgaaaaatgatttacaggagtgtataaacaaaaatggaTCCCATG----TTT---CTA-AAC---TTTACATAAT---TTTATT-----------C-AAACA---------------TTACTTCTCTGATATACCT-----AAAAATTTGA--C----T----A--C-AGACTG------T--T----------ATTTAAATAAATAA--T---------T-----------TG--T--------------CGCTC---T--AGGTT-TTTC-AA-G----TTG--AAACGCAATGAAA-TC-AAATC-------TGC-A---A-TAT--CA-TATGAT-T--TT--T--CTCAGCGCAACGGTATT--TTTGCGCGCCATGGGTGTGTTTTTGTTAT-TTG-----TGACG-TCAAGTATA-C---G---CCT---TT--G-GAATG----T---A-AACAA---C---TCTCAAGGCC--T-TTATC---AAA--TG--A--TCAGATCG--TTAATAG-ACTAA-A----AA----A-GGC-AAATTTATTA--TT------AATCAGATTC-C--AACTATAGCACTT-ATCGATT-CGA-GTG
gi|13 : aaccaggatcatatA--CACAT---GA------TA-C-ATAGTGGAGA-A-AAACT-T---T---ACT-T--A-TGT--G-ATATTT-GTGGGAA-GACATTGTCT-CG--C--AAAACAAATGCGAA-AAGACACAT-GAG-GAAACAT-ACT----GGT---GATAAA-CCT------T----A----TAA-----ATG-T------GT------T-G--TCTCTGG-AAAG---G----CA-----TTC---AGT-GAGAAA--GGAATCTT-A---CAG----AAACACA----AGA----GGATA-C-A----TAC---T------GATG------------C--------TAA----GT--C-A-C--------------G--GAAG-GCA-ACCAACCA--G-A---ATG--ATAG--A-GT---A--C-AGTG-A-C------A-CA-T---GA-T---------------T-ATA----T-A----T-AT---------T----G---A---T-A-------------------------ATG-AA-T-GT-GA-TGTTTTCGGA--AA-GGTATTC-AATC-----A-G---ACAACAC-A---CT-TA---T--A---GAA-T-CACA-T-----TAA-G-G-CACGT---------TTGG---TACA-CCTGA----------A-ATACCTGTG-GGA---------CA--------------GGAAAC--TTACAGAA-ACACATGAGG-AC-AT-AGAATG-G-TGACCAA-AACttatgttaattgctacgggttgtaattaatgctgtaacggaattaagggttggctagtcctgattattttgtcaactttttcgaaggaatgtctgcgaggaattagtcgacacaagacttaacctataaacataacagtcgccctttagtccagtcgtacttgttttaaaaaaataataaaattaaggaaaacataaacttagtgatgggaacagtgcaacccgtagtctgataattgcgatgggaggggttgtttatataga
gi|14 : aaggcatttaactcttcattgacattaacatAA---TGA--T----T----A--A-A---GGACACATTG-C----------AT-----------G--T---------T-----------T---T----------------CT----A--AACAT-TTTA-AA------TTGCTAAA-GCAA---AATT---AAT-T---ATTTGC-GTGCA-TAT-GCA-T---AT-T--TTC-T--CT--------CTGTA-T--TTAACGC-CCATT--------------AT-GTG-----TGACG-TCA--TAT------GCGACCT---TCGAGCGA-------G---G--------------GTTT--G--ATTTTTTT----CAA--CG--GATTA-AAT----TTAATCG-ACTTA-AAAATAA----A-TGT-AA--TCATCAC--------------GCTCG-T--AG--ACAACA-TT-A-CG-TT-CGG-ATGgtgtgttcctgcatagccaaactgacctagtattgtttctgcataactccttatcctatatattttgacaagctcagaaaa
gi|15 : C-AGACAA---TT-TA---C--A---GAG-A-CACA-A--AA-GGA-T-A-CATGT-----ATA-GTAGTAATAAA-TCTTCTA-ATTCG-T--ATGCCTTCG-AGAATG------CATTCAG-CCAG--ATGGGATCA-TTATTTCG-ACATA------A--AG-ATAC-------A-TA-----CTTTA---TA-TATG-TGA-TGTC-CGTGGGAAA---ACATTTAGTGA--GACG-G-GA----CACTTACA---GACACATAC--A-AG---GATA-C---ATAC-------TGGTGATAAA-CCTGATAA--------TTCAA---------TAA-------------GA----CA-------G-GGAA-A-TTACAGAG-ACACAT--GAGGATACATATTG-G-TGA-GAAACGTTGTTGATTTATATATGTGATTTGTATGGGTAAGCGTTAATTTAAAAGACATGTAGCATG----TTT---TTA-AACATTTTT------T---TTTATTT-TT---A--G------------------------------TTG-TATGCCT-----AGAA---TGA--C----TAC--A--A-A---TG------TA-A----------AT-----------G--TA--------T-----------T---TTGAATAAATCATTATGCT----T--TG--G-TGTT-AA-G--T-TTT--AAA-GCAATCAATTTC-AAA------TTTTAC-G---ATTAA-ATA-T---AT-T--Tttatagtatcgacacaacgggcgcattagctgtcagaagctttgtgtttgttttagttttttcgaaagaaggtgcgaaggaaaagaccagtaatttttagttggcacagggtctttgtcgtaaaaaatccacacaaatcagtcacgtttgattatgtacctttttagaaaaagaagaaaaaaaaaggggggggggcaaaacggttgcaaagcgactcagtttaactacgagaaattggtcatatg
gi|16 : GT--G-A--G-----ACT-GTA-G----AG-GCT-GTCTGTGA--A-A---CAA--GTAAAAC-T----A--A-A--G-A-CCAGGA-A-AA-T---GA-T---------------TTACA----C-GAATGT-ACAAACACAAAT----G---GAGGT-GAAAAAC---AAAGT---------T-ATC-AG-T-GT-CA-TCTTTGTTGG--AA-GGCATTT-ACTC-----
gi|16 : ttattagtattataattatttttattatttttcttgcagaaatcccattagaaacatattaggttaatcagaaacatgtcaatgttttaaattggcatcacagatgtgttcactatcactgacaacactagaatttagactgtaatgcaacatccaattggaaatagccctcctcgtatggctattcttttcacccaactaaccaatggctgactgtgaaacaagtatgtctatctacccaaccaatggctgcctgtgaaacaagaatgtcttctacacaatcaagggctagcacaaacggaaaatacaacggactta----GGT---GAAAAA-C---A-AAGTT---A----TCA-----GTG-T------CA------T-C--TTTGTTG-GAAG---G----CA-----TTT---ACT-C
gi|18 : ttattagtattataattatttttattatttttcttgcagaaatcccattagaaacatattaggttaatcagaaacatgtcaatgttttaaattggcatcacagatgtgttcactatcactgacaacactagaatttagactgtaatgcaacatccaattggaaatagccctcctcgtatggctattcttttcacccaactaaccaatggctgactgtgaaacaagtatgtctatctacccaaccaatggctgcctgtgaaacaagaatgtcttctacacaatcaagggctagcacaaacggaaaatacaacggacttagtgagactgtagaggctgtctgtgaaacaagtaaaactaaagaccaggaaaatgatttacacgaatgtacaaacacaaatgga----GGT---GAAAAA-C---A-AAAT----A----TCA-----ATG-T------GA------T-G--TTTTT----AAG---G----TA-----TTA---TCT-CGGCT------TACTT-A---AAC----AAACACA----AGC----GGATA-C-A----TAC---G------GGTGA----GAAAA--CC-ATA---T-A-AATGT--GCA-TG-----TTT-GTG-G--GAAG-GCA-TTCAGTCA--G-T---CAG--G-AA--T-TT---G--A-A--G-G-C------A-CA-T---G--T---------------G-ACA----C-A----T-AC---------T----G---G---T-GAATAAC---C---T---------T--TA-AA-T-GT-GA-TGTCTGTGGA--AA-GG-ATTG-TATT-----T-G---AA-AACCGA---C---G---C--A---GAG-A-AACA-C--A--TGA-G-G--AC-C-----ATA-CTTGTGAGAGA-CC--ATA-A
gi|19 : agcacaaacggaaaatataacggactttgttgaaactgttgaagcagtctgtgaaacaagtaaaaactcaagatctgaaaaatgatttacaggagtgtataaacaaaaatgga-AATG-TGT-TGTTGTGTGGGTAG---GC-TTCAGCGA--GACA-G-GAAGATT--TTACA---G-CACACA-----AGTTTGACAAC---ATCT-------TGGTGATAAA-CC-TATAAATGTGATGT-CTG---------CGG-------------GAGGTTCAGTCGTATG-GGAACA-TTAAGGGG-ACATAA--GAGTAT-CAT-CTG-A-TGATAAAACCAT-ATAATGTAAATGTTTGaa
gi|19 : AG--CACAC---AAGTTTGACAAC-ATCTTGGTGA-T-AAACC-TA--T---A---A--A-TGT--G-ATGTCT-GCGGGAG-G---TTCAGT-CG--T--ATGGGAACATTAAG-GGGACATAA-GAG-TAT-CAT--CT----GAT---GATAAAACC------AT----A----TAA------TG-T------AAA-----T-G--TTTGTGG-GAAAAAAG----CA-----TTC---AAT-TGGAGACAGAACATTTTA---AAA----AGACACA----AGA----TGATA-CCA----TAC---T------GGTGT----TTAAA--CCCTTA---TAA-A-TGT--G-A-TG-----TGT-GTG-G--GAAG-GCA-TTCCGTGA--G-A---AAG--GACA--T-TTTAAA--A-A--G-A-C----A-A-GA-T------T---------------G-ATA----C------T-AC---------T----G---G---T-G-TAAAC---C---T---------TAATA-AA-T--T-GA-TGTGTGTGGGGAAA-AGCATTC-tgggaaaaaagcattcaattggagacagaacattttaaaaagacacaagatgataccatactggtgtttaaacccttataaatgtgatgtgtgtgggaaggcattccgtgagaaaggacattttaaaaagacaagattgatactactggtgtaaaccttaataaattgatgtgtgtggggaaaagcattc
gi|2 : aatgtgttgttgtgtgggtaggcttcagcgagacaggaagattttacA-C-AGACT-T---C---A-T-ACAA-TGT--ATATTTTT-GTGGGAATAACATATAGT-TG--TGTAAAGGTGCGTTATGTGATACACAC-GTGCGAT-TAT-ACT----G-T---GG-AGA-CTT-C--------------TGAC----ATG-T------GA------T-A--GTTATGT-GAAA---T----CACTTGATTA---AGTTCAGACA--GGAGATTT-A---A-G----AGACACA----GGA----GGATA-C-A----TA----T------GGTGA----AGAAA--TC-TTC---CAATAATGTTGG-A-TG-----TCTTGCG-A--AAAG-G-A-TTCAGTGC--G-T---AAG--GGAT--CATT---A-----------C----A-A-T--C---GA-A---------------G-ACA----C-A----A-AC---------TTCAAG---G---T-GATAAAC---A---TAGAAATAACT-GTA-AG-G-GT-GA-AATTTATGAG----------TC-TGTC-----G-T---G--AAGCGATTTCT-TAGTGCGAA---GGG-ATCATA-C--A--AAA-C-A-TATGAGGATAATA-CTGGTAATAAC-CCTTATATAAT-GTTGTATGTCT-TGTGGAAGA------CATTCAC-TGACTGAGAGGAAC--TTATTAAC-ACACATGAGG-A--A--ATACTG-G-TGA--AA-AACCTTT----TA-AATG-TGATTGTC-TGTGAGAAG----C-TTCAGTCATCGA-G-G-GAC---C--TTACAGAGGAGACACAT--GAAG---GAAATC---ATAC-------TGGTGAGAGACCCTTATAA--------T-TGAATGTCTGGGTAAAAGATGTTTTATTGA----CA-------ATAGAA-ACCTATAGAGCACACATTAGACAACACATAATGCGTTGA-AAGACCAT-T--ATGTA-ATGT-TGATTT
gi|2 : agccttagttcaagatatgtctttacgccactgtatttgattaagaaaacgtgatAGAGA--CACAG---GAG---GATA-C-ATA-TGGTGA-AGAAATC-T---TCCAA-T-A--A-TGTTGG-ATGTCTTGCGAAAA-GG-ATTCAGTGCG--T--AAGGGATCATTA-------CA-ATCGAA-GACACAA-ACTTCAAGGT---GATAAA-CAT-AGAAAT----AACTGTAA-----GGG-T------GAAATTTAT-GAGTCTGTCGTGAAG---C----GA-----TTTCTTAGT-GCGAAG--GGAT-CAT-A---CA-----AAACATA----TGA----GGATA---A----TAC---T------GGT-A----ATAAC--CC-TTA---TAT-AATGTT-GTA-TG-----TCTTGTG-G---AAG-ACA-TTCACTGACTG-A---GAG--G-AA--C-TT---ATTA-A--C-A-C----A---CA-T---GA-G---------------G-A-A------A----T-AC---------T----G---G---T-GAAAAAC---C---T---------T-TTA-AA-T-GT-GATTGTCTGTGAG--AA--GC-TTC-AGTCATCGAG-G---G----AC-----CT-TA---C--AGAGGAG-A-CACA-TGAA--GGA-A-A-T---C-----ATA-CTGGTGAGAGACCCTTATA-ATT-G--A-ATGTCTGGG-TAAAAGATGTTTTATTGA--CAAT--A--GAAAC--CTATAGAGCACACATTAGACAACAC-ATAATGCGTTGA--AA-GACCATTA---TGTAATGTTGA-T-TT-TGTGGG-AG---ACA-TCAATTAT-TATA-C-AA----CCGTAAAA---AACTCACATTGA-AG---GATA-CCAAAT-C-------TAGTGAC-AG-CCTTATtgtgggagacatcaattattatacaaccgtaaaaaactcacattgaaggataccaaatctagtgacagccttatcagtgtgatgcttgttcgaaacattcagtcagtagagaagacttactgtgtcacaaagataagacatcaacagtgaatgtagtgtctgtggaaagtgtacaccgatgggtcgcagacttagaagcaccatgggacacatac
gi|2 : agccttagttcaagatatgtctttacgccactgtatttgattaagaaaacgtgatacagacttcatacaatgtatatttttgtgggaataacatatagttgtgtaaaggtgcgttatgtgatacacacgtgcgattatactgtggagacttctgacatgtgatagttatgtgaaatcacttgattaagttcagacaggagatttaA--TACA---AAA--CATAT---GAG---GATA---ATACTGGTAA-T-AACCC-T---T---A-T-ATAA-TGTT-GTATGTCTTGTGG-AA-GACATTCACT-GA--CTGAGAGGAAC-TTATT-AACACACAT-GAG-GA-A-AT-ACT----GGT---GAAAAA-CCT------T----T----TAA-----ATG-T------GA------TTG--TCTGTGA-GAAG--------C------TTC---AGT-CATCGA--GGGACCTT-ACAGAGG----AGACACA----TGAA---GGAAATC-A----TAC---T------GGTGA----GAGAC--CC-TTA---TAA---T-T--G-AATG-----TCT-G-G-GTAAAAG-ATG-TTTTATT---G-A---CAATAGAAA--C-CT---A--T-A--G-AGC----ACA-CA-TTA-GA-C---------------A-ACA----C-A----T-AA---------T----GC--G---TTGAAAGAC---CA--T---------T-ATGTAA-T-GTTGA-T-TTTGTGGG--A--GACAT-C-AATT-----A-T----T-ATACAA---CCGTA------A---AAA-A-CTCA-C--ATTGAA-GGA-TAC-C-----AAATCTAGTGACAG--CCTTATC-AGT-G-TG-ATGCTTGTT-CGAA-A------CATTCAGTCAGT--A-GAGAAGACTTACTGTG-TCACA------A--A------------GA-TAA-GACATCAACAGTG-AATG-TAG-TGTC-TGTGGAAAGTGTACA-CCGATGG--GTCGCA-GA----C--TTAGA---AGCAC-CAT--G--G---GACA-C---ATAC-------cagtgtgatgcttgttcgaaacattcagtcagtagagaagacttactgtgtcacaaagataagacatcaacagtgaatgtagtgtctgtggaaagtgtacaccgatgggtcgcagacttagaagcaccatgggacacatac
gi|20 : agccttagttcaagatatgtctttacgccactgtatttgattaagaaaacgtgatacagacttcatacaatgtatatttttgtgggaataacatatagttgtgtaaaggtgcgttatgtgatacacacgtgcgattatactgtggagacttctgacatgtgatagttatgtgaaatcacttgattaagttcagacaggagatttaagagacacaggaggatacatatggtgaagaaatcttccaataatgttggatgtcttgcgaaaaggattcagtgcgtaagggatcattacaatcgaagacacaaacttcaaggtgataaacatagaaataactgtaagggtgaaatttatgagtctgtcgtgaagcgatttcttagtgcgaagggatc-----G-G---GC-A----A---CT-TA---C--A---GAG-A-CACA-------GTA------ACAC-----ACA-CTGGTGACAAA-TCTTACC-AAT-G-TG-ATGTTTGTT-GGAAGA------CATTCAG-TTAT--TCAGGATCA-TTGCAAAA-GCAC---AGA-A--AG-ACAC-------A-TAATAATCCTAA---TG-AATT-TGA-AATT-TGTCGGA-----ACA--------------------------TTACA---GACACACAT--G-AG---AATA-C---ACAC-------TGGTAATAAA-CC
gi|20 : ttatttcgaa--TACAGAGA----CACAG---TA-----ACA-C-ACACTGGTGA-C-AAATC-T---T---A-CCA--A-TGT--G-ATGTTT-GTTGGAA-GACATTCAGT-TATTC--AGGATCA--TTGCA-AAAGCACAG-AAA-GACACAT-A-------------ATAAT-CCT-A---------A----TGA-----ATT-T------GA------A-A--TTTGTCG-GAA---------CA-----TT--------------------AC--------AG----ACACACA----TGA----GAATA-C-A----CAC---T------GGT-A----ATAAA--CC-AGA---T-A-TATGA--G-A-TA-----TTA-ATG-T--TAAC-GCA-TTAAGCCA--G-A---CA----TAA--C------A--G-A--G-A-C----ATT-CAGT---GA-----------------G-ACGGGATC-A----T------------T----A---------GAAAAAC------------------------A-T-AT-GA-AGAC---GCA--AATGGCATTCGACTC-----G-A---A--AGTCCA---CT-TA---C--A---AAT-A-CACA-C------GATA-A-CACTC-------A-CTGGTGATAAT-ATTTA-A-AAG-G-TG-ATATATGTG-agatatatgagatattaatgttaacgcattaagccagacataacagagacattcagtgagacgggatcattagaaaaacatatgaagacgcaaatggcattcgactcgaaagtccacttacaaatacacacgataacactcactggtgataatatttaaaaggtgatatatgtg
gi|23 : ttatttcgaagggcaactT---TTA-AAC---TTT------T------ATTT-TTA--A--AG-AAA-AAACTTGCTTTGTGTGCTACTTCTTTG-TGTGCCTCCCCTAAAA---TGA--C----T----ATAA-A---TG-------G-T----------AT-----------T--TGAATTATTAT-----------T---T--------------TGCT----T--AG--T-TTTC-AA-G--T-TTGA-AAA-GCAATTAAATTC-AAATCC---TT---C-A---A-TAT-GCA-G---AT-T--TT--T---T--------CGGTA----TTTGCTGTCCATG--------------AT-GAG-----T-ACG-TCA--TATGCC---GT--CCT---TC--GCGA-------G---A-A--AA---CAATTGTTA--GCCA--ATCAT----GAA--CA--AGATC-GA-----TTAATGG-AA--A-A----AA----AGGGCAAA--ATATCACATTACCGTAAA-CAGCTTG-C--AGTTATAACA-TT-A-CG-TT-CGG-
gi|25 : catcgATG----TTT---TCA-AAC---TTT------T---TT-ATTT-GTC--AT-GC-AAA-A---------------TCACTTCTTTG-TATGCCT-----AAAA---TGA--C----TAC--A--A-A---TG------TA-TTTTGAATAA-AT-----------T--A---------T-----------T---T--------------TGCT----T--AG--T-TTTC-AA-G--T-TTG--AAA-GCAATGAAATTC-AAATC------TTGC-A---A-TAT-GCA-T---AT-T--TT--T--CT--------CGGTA-T--TCTGCGCGCCATG--------------GT-GTG-----TGACG-TCA--TACA-C---G---CC---------CGAATGAATGT---A-AACAA---G---TCTCA--GACA-TATTAT----AAA--TA--AATAC-GAT----TTAATGG-ACA-A-A----AA----A-GGC-AA--TAATCACGTT------AA-CAGAATG-C--AG--ATAACA-TT-A-CG-TT-TGGTGTGtgttgaacattgtgtcattcggtgtgatagctgtcagag
gi|26 : CATG----TTT---CTA-TAC---TTT------A---AGTAATT-TTT--AT-GC-AAA-T---------------ATACTTCTCTG--GTAACT-----AAAA---TGA--C----T----A--ACA---GA------TG-T----------AT--------------T---------C-----------T---TAAATTA--------TGCT----T--AG--T-TTTC-AA-G--T-TTG--AAA-GCAATGAAAATC-AAATCT---G---GC-A---A-TAT-GCA-T---AT-T--TT--T--CT--------CGGTA-T--TTTGCGCGCCATG--------------GT-GTG-----TGACG-TCA--TATA-C---G---CCT---TT--G-GAATG----T---A-AACAA---C---TCTCA--GGCC-TATTAT----AAA--TA--GATTC-GAT----TTAATAG-ACA-A-A----AA----A-GGC-AA--TTATTA--TT------AA-CAGATTC-C--AA--ATAGCA-TT-A-CG-TT-CGA-GTG
gi|27 : agttatcACAT-ACT----GGT---AATAAA-CCT------T----A----TAA-----ATG-T------AA------T-G--TCTGTGG-GACG---G----CA-----TTT---ATC-CAGAAT--GGAAACTT-A---AAA----GCACACA----TGA----GGACA-C-A----TAC---T------GGTGA-----TAAG--CC-TTA---TAA-A-TGT--G-A-TG-----TCT-GTG-G--GAAG-GCA-TTCAGTCA--A-A---CAG--GAAT--C-TT---AC-ACA--G-A-C----A---TA-T---GA-G---------------G-ATA----C-A----T-AC---------T----G---G---T-GAGAAAC---C---T---------T-ATA-AA-T-GT-GA-GGTCTGTGGA--AA-GGTGTTT-AGCT-----G-G---GC-AGGAGA---CT-TA---C--AT--G-----CACA-C--A--TGA-G-A--ACAC-----ATA-CTGGTAACAAA-CCATATA-AAT-G-TG-ATATATGTG-GGAt
gi|29 : cATCTGAAAAATG-A--TTTACAGGAA--TGTAT---AAA---CAAA-A-ATGGAGGTGA-A-AAACA-AAAAT---A-TGA--A-TGC--G-ATGTTT-GTTTTAA-GGTATTAACT-CG-------GGCTTACTTGAG-CAGACACAT-GAG-GATACAT-ACT----GGT---GAGAAA-CC------GT----A----TAA-----ATG-T------GA------T-G--TTTGTGG-GAAG---A----CA-----TTC---AGT-CAGACA--GGATATTT-G---AAG----GTACACA----TGA----
gi|29 : aaactcaag----GGT---GAAAAA-CA--A-AAAT----A----TGA-----ATG-C------GA------T-G--TTTGTTT-TAAG---G----TA-----TTA---ACT-CGG-----GCTTACTT-G---AGC----AGACACA----TGA----GGATA-C-A----TAC---T------GGTGA----G-AAA--CC-GTA---TAA-A-TGT--G-A-TG-----TTT-GTG-G--GAAG-ACA-TTCAGTCA--G-A---CAG--GATA--T-TT---G--A-A--G-G-T----ACA-CA-T---GA-TTNNNNNNNNNNNNNNN-NNN----N-A----A-ACAAAAA----T----GGAGG---T-GAAAAACAAAA---A---------T-ATG-AA-T-GC-GA-TGTTTGTTTT--AA-GGTATTA-ACTC-----G-G---Gttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaaacaaaaatggaggtgaaaaacaaaaatatgaatgcgatgtttgttttaaggtattaactcggg
gi|3 : aaactcaagatctgaaaaatgatttacaggaatgtataaacaaaaatggaATG----TTT----TATAAC---TTT------T---T--ATTT-GTC--AT-GCCAAA-A---------------TCACTTCTTTG-ATTGCCT-----AAAA---TGA--TA---C----A--A-A---TG------TA-TTTTGA-----AT-----------AAAT---------TATG--------T---T--------------TGCT----T--A---T-TTTC-AA-G--T-TTG--AA--GCAATGAAATTC-AAATCT---T---GC-A---A-TAT-GCA-T---AT-T--TT--T--CT--------CGGTA-T--TCT--GCGCCATG--------------GT-GTG-----TGACGTTCA--TACG-CCCAATGAA------T--GTAA-----------A-C--AA---C---TCTCA--GGCA-TACTAT----AAA--TA--GATAC-GAT----TTAATGG-ACA-A-A----AA----A-GGC-AA--TTATCACGTT------AA-CAGTTTG-C--AG--ATAACA-TT-A-CG-TT-CGG-GTG
gi|30 : ctccta-GAGACACAT-GAACAATACATTACT----GGTTTTGATATA-TCC-T-CATT----A----TAACTGATATGAT------GA------T-G--TCTATGG-GAAT---T----AG-----TTG---AGT-AGGGCA--GGATCATT-G---AGG----ATATACAAATCTGATAAAGGGTA-T-ACTTTTACACATA-----GGTGC----ATAAAAGCC-TTAATATAGGAATGT----A-TG-----TCT-GTT-G--GAAGTGC--CTCAATCA--C-AAACCAC--GAA-----TT---A--C-AC-A-A-C----A-ATCA-T----A-G---------------G-GCA----C-A----TTAC---------T----GT--A---T-GATAAAG---C---CAA-------T-ATA-AA-T-GT-AA-TGTGGTTGGG--AA-GGAGTTT-AATttgtgtgtcggttacgggtgtactagatgtcagaattagggtagtagcctaagtttttttttcaactttttcgaaggaaggttcgaggaaattttgtgtcgactcaaggactttaccataaataaaacagtcgattttctctttgtactgctaaaaaaataaaggaaaacataaacagttcgacagcaaccccgattaattgcgcgagaaggtgtttatatagacgctattgacacggattaagtctacaacgtttatttatgtacaggccatttcacgaaatacacgctcgcactcaaactgacctacataatagcacaacaacaaatactcctgaaggttcgtgttcccatttcctaccaaatcgcacatttaaaaaaaaaaaataacattacaataattaaagatcgaacttgtgtaaaaattacaaataagaaaatatgtagttcctcagtaaacatttataattttttcgtggacgcgcttttaaccatgacatgagatgtgtattgctgacaatgctctccggcattaccttgc
gi|31 : caAC---ATT------T---CGTGTTTGTTT--AAAGC-AAA-A---------------TTACTTCTTTG-TATGCCT-----ATAC---TGAGTT----T----A--A-A---TA------TG-TTTTGAATAAAAT-----------G--T---------T-----------T---T---------------GCT----T--AG--T-TTTT-AA-G--T-CTG--AAA-GCAATGAAATTC-GAATC------TTGT-G---A-TAT--CA-T---AT-T--TG--T--CT--------CGGTA-TAGTATACGTTCCGTG--------------AT-GTG-----TGTCG-TCA--TAT------GCGATCT---TT--GCAA-------G---A-AACAA---CT--TGTTA--GCCA-TTTTAT----AAA--CA--AACTT-CATTTAATTAATCG-AC--A-A----AAC---A-GGC-AA--TTATCACGTT------AA-CAGCT
gi|32 : -AAAGC-T---T---A-T-A--AATGT--G-ATTTTT-GTGGGAA-AACTTTGAGT-TG--T--AAAGCTGCGTTACT-GATACACAC-GAG-GATCCAT-ACT----GGT---GAGAGA-CCT------C----A----TGA-----ATG-T------GG------T-G--TTTGTGG-GAAG---A----CA-----TTC---AAT-CAGACA--GGAGACTT-A---CAG----AGACACA----GGA----GGATA-C-A----TAC---T------GGTGA----A-AAA--CC-TTA---T-A-AATGT--G-A-TG-----TCT-GTG-G--AAAG-GCA-TTCAGTGC--G-A----AG--GAAA--CATTAC-A--A-A--A-A-C------A-CG-T---GA-G---------------G-ATA----C-A----T-AC---------T----G---G---
gi|33 : ACAGACAAATGCACAT---GAA---GACA-CAAAACTGGTGATA-AAACC-------------A--A--------ATGAAT-GTGGGAA-AGCTTT--G---------ATGGAAAC------------------AA-GCTAGAT-ACT----GGT---GATAAA-CCT----------------------------T------GA------T-A--TCTTTTG-CAAG---GTGTACA-----TCC---GGT-CAGATC--GATGACTT-C---TAGTTCTAAACACG----TGA----AGATA-C------TGT---TC-----AGTGATCTTACAAG--TC-CTA---T-A-AATGT--G-G-TG-----CCT-GT
gi|34 : gaAAAC---C---T---------T-ATA-AA-TAGT-GT-GGTTTGTGGG--AA-Gtaacaag
gi|36 : agtgtaaacagaaaaagtaatgaatgtagtgaacttaggaaacctgtttgtgaaataattcaactaaagatcagaaaaatgatttacagagaacgggtgaaagatattggagtaaaaacatgttttcactgtgatgatagatatgcacaaaaggcgcaaagaacttcaagaCA----TAA----GGACA-C-A----TAT---T------GATGA-----TAAA--CC-TT-----------GT--T-A-TT-----TCT-GTG-G--GAAG-GCA-----ATCA--G-A---CG---------C-T---------A--G-A-C------------------T---------------T-ACA----C-A----T-AA---------C----A---G---T-GATAGAC---C---C---------T-ACA-AG-T-GT-A---GTTTGTAGA--AA-GCCATTA-GGTC-----G-GACAGC-ACACCA---AT-TA---C--A---AAG-T-CACA-C--A--AG--G-A-CACAT-----AAA-CTG--GATAAA-aacatcaat
gi|38 : ----ATACATA----TTA----GAAGA-C-A----TGC---T------GGTGA-----TAAA--CC-TTT---TAA-A-TGT--G-A-TA-----TAT-GTG-G--AAAG-GCA-TTT-GTCTT-G-A---AAG--TAGA--A-TT---A--A-A--A-G-C----A---CA-TTTTG--T---------------G-ACT----C-A----C-AC---------T----G---G---T-GAAAAAC---C---A---------T-TTC-AA-T-GT-GG-TGTCTGTGGG--AA-GGTATtggagatatgtgagagaggaa
gi|38 : gagaatatctgcgtGGAAAGGCATTT-GTCTTGAAAGTAGAATTA----AAAG--CACATTTTG-T---GACT-C-ACACTGGTGA-A-AAACCAT---T---T-C-A--A-TGT--G-GTGTCT-GTGGGAA-GGTATATGGT-CT--A--AAAGTTGTGTTAAA-GAatggtctaaaagttgtgttaaaga
gi|39 : gagaatatctgcgtatacatattagaagacatgctggtgataaaccttttaaatgtgatatatgt-A----CAC---T------GGTGA-----CAAA--CC-AT----TCA-AATGC--G-A-GA-----TCT-GTG-G--ACGG-GCC-TTCCGACA--A-C---CAG--GCAA--T-TT---G--A-C--G---C----G-T-CA-TC--GACT---------------G-ACC----C-A----C-AC---------C----A---C---A-GTCAAAC---C---T---------T-ACG-TC-T-GC-CC-AACCTGCAAC--AA-AGCATTC-AACC-----G-G---GC-CTCCAA---CT-TA---C-------AC-A-CGCA-C--A--TGC-G---CACTC-----ACA-C
gi|4 : ----TTT---C-A-AAC---TTT------T---TT-ATTT-GTC--ACTGC-AAA-A---------------ATCATTCTTTG-TATGCTA-----AAAA---TGA--C----TTACGA--A-A---TG------TA-TTTTGAATAA-AT-----------T--A---------T-----------T---T--------------TGCT----T--AG--T-TTTC-AA-G--T-TTG--AAA-GATATGAAATTC-AAA-------TTTGC-A---ATTAG-CCA-T---TTCT--TC--T--CT--------CGGTA-TTGTCTGCGCGCCATG--------------GTGGTG-----TGACG-TCA--TAT--C---ACGCCCTAG-TT----AA-------T---GTA--CA---C---TTCTA--GCCA-TAT--------AA--TA--A--TT-GAT----TT-ATGG-AC--A-G----AAACAGA-GAC-AC--TTATCA-GTT------AATCAGCTTG-CAAAG--ATAACA-TT-A-CG-TT-CG
gi|40 : ATCACATT------AA-CAGCTTG-C--AG--ATAACA-TT-A-CT-TT-TGG-GTGccctcttgtgttgtcattagcggatgtactacttgtcagaatagggtggtcctgagtagtcaactttttcgcaggaaggacgaggaaactttttgtgtcgactcaaggactttacgcataaataaaacaagtccgtttggtctttgtctgttaaaaaaaaataaaggaaaaagacagttggacagcaccccagattaatgcgcgaggaaaggttgtttttatatagaagctagacacagattaggtctacaagcgttttatatgtcagcctttcacgaaatacacgctcgcctcaactgacctacatcaatagcataattgttacaacaaatacttcaagttcctgttcccatttcctaccaaatgaaatgataataatacaatagttaaagattgaactgtataaaaatacaaaaagaaatatgtaagtccttcagtaagccatttgtataaatatatattttcgtcgacgcgcttttaaccatgacatgagatgtggtattgctgacaatgctctctctccggcattatttgc
gi|41 : TG----TTT---CTA-AAC-----G------T---TATAATT-TTTAAA--GC-AAA-A---------------CTACTTCTCAG-TATGCCT-----AAAA---TGG--C----TTA--A--A-A---TG------TA-TTTTAAATA--AC-----------A--TA--------T-----------T---T--------------TACT----T--AG--T-TTTC-AG-A--T-TTC--AAA-TCAATGAAATTC-AAACC------TTAC-A---T-TAT-ACATT---TT-T--TT--T--CT--------TGATA-T--ttgtgtgtcggttgatggtgtactagctgtcagaattagggaggtagcccgagtttttcaactttttcgaaggaaggtgcaaggaaaatttgttgatacaagaactttttcataaataaaactgttgcttt
gi|43 : cattgatAAAGGACACATAGCATAGATACTTAAATTA-AAC---TTT------T---TTAATTT-CTT--AA-GC-ACA-A---------------CT----CTTTG-TGTGCCT-----AAAA---TGA--CACTTT----A--A-A---TG---------------------T-----------G--T---------T-----------T---T--------------TGAA----TAAAG--TCTTTC-AA-AACT-TTGA-AAA-GTGATGGAATTG-AAACAA---TCTTGCAA---A-TAT-a
gi|44 : GGGCACATCGCATG----TTT---CTA-AAC----AT------T---TTGATTT-TTGA-A--GC-AGA-A---------------TTGCTTCTTTG-CATGCCT-----AAAA---TAA--C----TCTG-A--A-T---TGATTT--TG-A----------ATAAA--------A--TA--------T-----------T---T--------------TGCT----T--AG--T-TTTC-------T-T--------GCGATGAAATTC-AGATA------TTGC-G---A-TAC-GCA-T---AA-T--TT--T--C
gi|47 : GA--GATG-G-GG----TCATTACA---GAGACACAA--G-AG---GATA-C---ATACATGATACTGGTGATAAA-CATTAT----------T-AAA---------AAA-------------AA----TATT-----G-GGCA-C-TTAAAGAC-ACGCAA--GATGATACCTACCA-G-TGA-AAAA
gi|5 : -AAAT----A-----AA-----ATG-CCCTTTCGA------C-G--TCTGTGG-GAAG---G----CA-----TTC---CGT-GAGACA--AGTAAGGT-A---AAG----ACACACA----TGA----GGATA-C-A----TAC---T------GGTGA-----TGAA--CC-TCA---TAA-A-TGT--G-A-CG-----TCT-GTG-G--GAAG-GCA-TGCAGTGA--T-A---CAA--GTAG--C-TT---A--A-A--G-A-C----ACA-CA-T---GA-G---------------G-ATA----C-A----C-AC---------T----G---G---T-GATAAAC---C---T---------T-ATA-AA-T-GT-GA-TGTCTGTGGG--AA-GGCATTC-AGTC-----G-G---GC-ATACAA---TT-TA---G--A---GAG-A-CATA-A--AA-GGA-T-A-CATGT-----ATA-GTAGTGATAAA-CCTTATA-ATT-G-TG-ATGCCTGCG-AAAATA------CTTTCAG-CAAT--ATGGGATCA-TTATTTCG-CCTCATGAAG-A--AACATACTG-G-TAA-TAA-A-CCTT-A---TA-TATA-TGA-TGTC-TGTGGGAAA---ACATTTAGTGA--GACG-G-GA----CACTCACA---GACACATAT--A-AG---GATA-C---ATAC-------TGGTGATAAA-CCTTATAA--------TTCAA---------TAA-------------GA----CA-------G-GGAA-A-TTACAGAG-ACACAT--AGGGATACATACTG-G-TGA-TAAACCTT-TTGATTTATATATGTGATTTGTATTGGTAAGCGTTCATGTAAAGGACACGTCGAATG----TTT---TTA-AAC---TTG------T---TTTATTT-TTT--A--G------------------------------TTG-TATGCCT-----AGAT---TGA--C----T----ACAA-A---TG------TG-C----------AT-----------G--TA--------T-----------T---T--------------TGTT----T--TT--T-TTTT-AAAG--T-TTG--AAA-GCAATAAAATTC-AAAT-T---TTTTGT-G---A-T-T-AAA-T---AT-T--TT--T--CT--------TGGTA-T--TTTCTGCGTCATG--------------AT-GTG-----TGACG-TCA--TATA-T---GTGACCT---TT--GCGA-------T---A-A--AA---C---TGTTA--GCCA-TATTAT----AGA---A--AATTC-GAT----TTAATGG-AC--A-A----AA----A-GTC-AA--TTATCACGAT------AA-CAGCTCG-C--AG--ATGACA-TT-A-CG-TT-TGG-GTGC
gi|51 : ---------T-----------T---T--------------TGCT----C--AA--T-TTTG-AA----T-TTG--AAA-GCAAGGAATTTC-TAA------TTTTGT-G---A-TAC-GTA-T---t
gi|53 : ctaagtgaaataagtatcaagtgaagtaTTG-CATGCCT-----AAAT---TAA--CTT--T----T--A-A---TG------TG-T--------------------------T---------T-----------T---C--------------TG-TGAAAT--AT--T-TTGCGAA-A--TATTG--AAT-TC-ACGAAATTC-GAATC------TTGT-G---A-TAC-GCA-T---tagcatcagatag
gi|55 : cCTT-A---CAG----AGACACA----TAA----GGACA-C-A----TAC---TATATGCAGTG-----ATTGA--TC-TTA---TAA-AATTT--G-A-TG-----TCT-tat
gi|56 : CACA----TGA----GGACA-C-A----TAC---A------GGAGA----AC-GC--CC-GTA---C-A-AATGT--A-A-CA-----CGT-GCG-G--GAA--ACAGTTCGCTCA--GTA---CGG--GACA--C-Taggtatgaaaagtgttc
gi|57 : AAAGGACACATCGCATG----TTT---CTA-AAC---TTT------T---TGAATTT-TGC--A--GC-AAA-A---------------TTACTCCTTTG-TATGCCT-----AAAgta
gi|6 : AAGGACATATTGCATG----TTT---CTA-AAT---TGT------TAGATTTTTTT-TTT--A--AC-AAA-A---------------TTAGGTCTTTG-CATGACT-----AGAA---TGA--CTT--T----A--G-A---TG------TG-TTTTAAATGAAAT-----------A--T---------T-----------TTAAT--------------TACG----T--AG--T-TCTT-GA-G--T-TTG--AAA-G-------GTAC-AAATCTCAGTCTTGC-G---A-TAT-GCA-T---AT-TAATT--TTACTTA------TGATA-T--TTTATGTACGATG--------------AA-GTGTCGTCTGACA-TCA--TAT------GTGACCTAGAGT--AAGG-------TCTGA-A--AACAGC---TGTTA--GCCA-TTCTAT----AAATTTATTGATTA-GAT----TTAATTG-AC--A-A----AAT---A-GCC-CA--TAGCTATG-T------A------TTG-T--AG--ATAACT-TT-G-CA-TG-GGG-GTGC
gi|61 : AT---GAG---GACA-C-ATACTGGTGA-G-AAACC-A---T---A-T-A--A-tgtgcaccatttatgggtgcacatatactaagtgtcaaaagaagtgatgtatagactgaggtttttcaaatttttctaaagaaggtgtgaggaaaaagaagtgggtgatttttttgtcagcacattaaggacttggtcataacccctcccctctacagtcacctttgtccatgttctttttcaaaaaactattggacagagacccatttaactgtgaggaaatagttatgtagaagccaggcacagctaggcctacagtatatggattctgttctggtcgtcatcatttcacaaatactcactcgcaccttggaaataaaaacggacattgtaacagtatatacttgtgttcccagttcctgtaaacttgtagaattataaaaaaaaaaataaattaaagattgaaaataattgaactt
gi|7 : ACA--GGAAGCTT-A---CAG----GCACACA----TGA----CAACA-C-A----CAC---T------GGTGA----A-AAC--CC-TTA---CAA-A-TGT--G-G-TG-----TCT-GTG-A--AAAA-GCA-TTCCCTCA--C-A---TAA--GTCC--T-TT---A--C-A--G-A-G----ACA-CA-T---AA-T---------------G-ATA----C-A----T-AC---------T----G---G---T-GATAAAC---C---T---------T-ACA-AA-T-GT-GA-TATCTGTGGA--AA-GGCGTTC-ACTT-----ATA---AT-GGA-GA---CT-TG---C--G---TAG-A-CACACC--A--G---G-A-CANNN-----NNN-NNNNNNNNNNN-NNNNNNN-NNN-N-NN-NNNNNNNNN-NNNNNN------NNNNNNN-NNNN--NNNNNNNNN-NNNNNNNN-NNNNNNNNNN-N--NN-NNNNNN-N-NNN-NNN-NNNNNNNN---NN-NNNN-NNG-TG---TGTGGGAGG---GCATTCAGTGA--GACA-G-GAGC--C--ATGCG---GAAGCACAT--G-AA---GATA-C---ATGC-------Ta
gi|7 : cattccctaacGTGT-GTGGGAG-GGCATTCAGT-GA--G--ACAGGAGCCATGCG-GAAGCACAT-GAA-GATACAT-GCT----NNN---NNNNNN-NNN-N-NNNN----N----NNN-----NNN-N------NN------N-N--NNNNNNN-NNNN---N----NN-----NNN---NNN-NNNNNN--NNNNNNNN-N---NNN----NNNNNNN----NNN----NNNNN-N-N----NNN---N------NNNNN----NNNNN--NN-NNN---NNN-NNNNN--N-N-NGTGATGTCT-GTG-G--AAAG-GCA-TTCAGCCG--T-A---C-G--GGAA--CATT---A--A-A--G-A-G----ACA-CA-T---GA-nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngtgatgtctgtggaaaggcattcagccgtacgggaacattaaagagacacatgacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaaccatatcagtgtgatgtctgtgggaaggctttcaggcattcagtaacattatataagcata
gi|7 : cattccctaacacaggaagcttacaggcacacatgacaacacacactggtgaaaacccttacaaatgtggtgtctgtgaaaaagcattccctcacataagtcctttacagagacacataatgatacatactggtgataaaccttacaaatgtgatatctgtggaaaggcgttcacttataatggagacttgcgtagacacaccaggacannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn-G-TG-ATGTCTGTG-GAAAGG------CATTCAG-CCGT--ACGGGAACA-TTAAAGAG-ACACATGAcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaaccatatcagtgtgatgtctgtgggaaggctttcaggcattcagtaacattatataagcata
gi|7 : cattccctaacacaggaagcttacaggcacacatgacaacacacactggtgaaaacccttacaaatgtggtgtctgtgaaaaagcattccctcacataagtcctttacagagacacataatgatacatactggtgataaaccttacaaatgtgatatctgtggaaaggcgttcacttataatggagacttgcgtagacacaccaggacannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngtgtgtgggagggcattcagtgagacaggagccatgcggaagcacatgaagatacatgctnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnAA-CCATATC-AGT-G-TG-ATGTCTGTG-GGAAGG------CTTTCAG-GCAT--TCAGTAACA-TTATATAA-GCATAcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaaccatatcagtgtgatgtctgtgggaaggctttcaggcattcagtaacattatataagcata
gi|8 : cattccctaacacaggaagcttacaggcacacatgacaacacacactggtgaaaacccttacaaatgtggtgtctgtgaaaaagcattccctcacataagtcctttacagagacacataatgatacatactggtgataaaccttacaaatgtgatatctgtggaaaggcgttcacttataatggagacttgcgtagacacaccaggacannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngtgtgtgggagggcattcagtgagacaggagccatgcggaagcacatgaagatacatgctnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngtgatgtctgtggaaaggcattcagccgtacgggaacattaaagagacacatgacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn---------------TTACTTCTTT--TATGCCT-----AGAA---TGT--A----T----A--C-A---TGGATTT-TGAT----------AA-----------A--TA--------T-----------T---T--------------TGTT----T--GG--T-TTTA-AAAG--T-TTG--AAA-GCA-TGACATTT-AAATCT---T----C-G---A-TATTGCT-T---TT-T--CTCCT--CT--------CGGAA-T--TTTGCGCGCCATG--------------AT-CTT-----TGACATTCA--TATGTC---GT--CCT---TT--
gi|8 : g-A--AA---C---TGTTA--GCCA-TATCATTTCAAAA--T-----TTCCGAT----TTAATGGCAC--ATA----CA----A-GTC-AA--TCATCACGTT------AA-CAGTTTGTT--AG--ATAACA-CTAA-CG-TT-CAG-tacaacaccaaaaaaaaaaaaaacaaaaaaaaaaacaaactgttagccatatcatttcaaaatttccgatttaatggcacatacaagtcaatcatcacgttaacagtttgttagataacactaacgttcaggggtcggttacggatgtaatagctgtcaaataaggactgtaccgtgaacattgtcaacttttacgaaggaaggtgcgaggaaaaagacgagtattttgtcacacaggaccaataccataaaatcaaaacagtcgtttttgctccatgtactgttaaaaaagaaatgatattattagaaataaaggaaaaccaaacacaggtaggcagcgaccaggtttaacttgcgaggtgtttattttagaagcggatattcgcaactacatgcttacagtgttacattgccaagatatgacacaaaattacacacccgtacacactccctaagaatatgtactcagactcgcattctcattcctaccaaatcgcaaatacacaaatatatgaattaaagatttgaattgaagttgtatttacaataataaatatgtaa
gi|9 : gttacttcttttatgcctagaatgtatacatggattttgataaatattttgtttggttttaaaagtttgaaagcatgacatttaaatcttcgatattgctttttctcctctcggaattttgcgcgccatgatctttgacattcatatgtcgtccttttacaacaccaaaaaaaaaaaaaacaaaaaaaaaaacAAGGACATATCCCATG----TTT---CTA-AAC---TTT------A---TTAATTT-TTA--T--GC-AAA-A---------------TTACTTCTCTG-TATGCTT-----AAAA---TGA--C----T----A--C-A---GA------TA-T----------AT-----------T--T---------TAAATACATTAAT---T--------------CGCT----T--AG--T-TTTC-AA-GT-T-TTG--AAA-GCAATGAAATTCAAAATC------TGGC-A---A-TAT-GCA-T---AT-T--TT--T--CT--------CGGTA-T--TCTGCGCGCCATG--------------GT-GTG-----TGACG-TCA--TATA-C---G---CCT---TT--G-GAATG----T---A-AACAA---C---TCTCA--GGC--TA--AT----AAA--TA--GATTC-GA-----TTAATAG-AC--A-AG---AA----A-GGC-AA--TTAT-ACGTT------AA-CAGATTG-C--AA--AT-GCA-TT-A-CG-TTACGA-GTGggtcggttacggatgtaatagctgtcaaataaggactgtaccgtgaacattgtcaacttttacgaaggaaggtgcgaggaaaaagacgagtattttgtcacacaggaccaataccataaaatcaaaacagtcgtttttgctccatgtactgttaaaaaagaaatgatattattagaaataaaggaaaaccaaacacaggtaggcagcgaccaggtttaacttgcgaggtgtttattttagaagcggatattcgcaactacatgcttacagtgttacattgccaagatatgacacaaaattacacacccgtacacactccctaagaatatgtactcagactcgcattctcattcctaccaaatcgcaaatacacaaatatatgaattaaagatttgaattgaagttgtatttacaataataaatatgtaa
18 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|17 ): ATTATTAAGTTTTATAATCATTTTTATTACTTATGTTGCGTAGCCCAATTAGAAACAGATTAAATTCATCAGGAACAGGTCAAGGTATAAATTGTTCATCAGAGATATGTTCACCAACACTGACACACTAGAATTTAGATTGAATGAAACATCCCATTGCACGAATAGCCCTCCTCAGATGACTTTCTTTCATCTACAACCAATAGCTGCCTGTGAAACAAGTATGTATATCTACCCAACCAATGGCTGTCTCTGAAACAAGTATGTCTTCTACACAATCAAGACTAGCACAAACGGAAAATATAACGGACTTTGTTGAAACTGTTGAAGCAGTCTGTGAAACAAGTAAAAACTCAAGATCTGAAAAATGATTTACAGGAGTGTATAAACAAAAATGGAGGTGAAAAACAAAATATCAATGTGATGTTTTTAAGGTAT
Unaligned ( gi|21 ): GCCAGAATAAGGGTGGTAGTCTAAGTTTTTTTCAGTTTTTTTTCCAAGGAAGGTACATACTGAAGGAAATGTTTTTTGACACCAAGGACTTTACCATAATTAAAACAGTCGCTTTTGTCCATGTGTTGTAAGAAAAAAAAATACACGTAATAAAATAATGAAACAACAACAGTTGGACAGCAACCCAGTCTAATAGCTAAAAAGTGTTTATATAGAAGTTAAACACGGCTAGGCCCACAGCGTAAATTGTGTCCAGGCCCAGGATCACCCGCTCAAACTGACCTACAAATAGCATAACAAATATTCAGGTTCGTGTATTAAAAATTTAATTGAATTATAAGATAATTATGCAAT
Unaligned ( gi|22 ): CCAGAATAAGGGTGGTAGTCTAAGTTTTTTCAGTTTTTTTTCCAAGGAAGGTACATACTGAAGGAAATGTTTGTTGACACAAGGACTTTACCATAATTAAAACAGTCGCTTTTGTCCATGTGTTGTAAGAAAAAAAAATACACGTAATAAAATAAATGAAAACAACAACAGTTGGACAGCAACCCAGTCTAATAGCTAAAAAGTGTTTATATAGAAGTTAAACACGGCTAGGCCCACAGCGTAAATTGTGTCCAGGCCCCAGGATCACCCGCTCCAACTGACCTACAAATAGCATAACAAATATTCAGGTTCGTGTATTAAAAATTTAATTGAATTATAAGATAATTATGCAAT
Unaligned ( gi|24 ): GTGTACTAATGTCAATTAGCGTGGTGAGCCCTGAGTTTTTGTCCAAGAAGGAAGGTTCGGAGAATTTGTTAGTCTGTCGCTTCAAGGACTTAACCATAAAAAAACATCGCGTTTTGTCTCTTTGTAACTGTTAAAAAAAAAAGGGGAGAAACATAAACAAGTGGACAGCGTAACCCCGATTATTGCGCGAGAAGTTTTAAAGTATAGAAAGCTATAAGACACGGCAGTTAGGTCTACAACGTTTATTTATGTCAGCCATTTCACGAATACACGCCCGCACTCAACTAGACCTACATAT
Unaligned ( gi|28 ): TATGTTCGGGTGGTGTGTGTCGGTTACGGGTGTACTAGCTGAGTTTTTCAACTTTTACGAAGGAAGGTGCGAGGAAATTTTTGTCGACACAAGGTCATTATTATAAATAAAACAGTCGCCTTTGTCCTTGTACTGTTAAAATATCAAAATAAAATAAAGGAAAACATAAACAGTTGGACAGCAACCCAGTTTAACTTTATATAGAAGCTAAACACAGCTAGGCCCACAGCGTATAGTGTCCAGGCCATTTCACGAAATACACAACAGTACCAACTGACGTACATAACATATAT
Unaligned ( gi|35 ): AATTTAGCTAATCGAAGTTACATCGGTTTATCGAAGCTACACATCAACATATTTCACTAAAACGTGTCATAATGGTAATTTCTGGCTGCTAGCCATTCCCTTTCGGGTATTAGTAAGGTCATTATGTCACGACTACCGTGCAAAATTCCCCAGGAGTTGGCGCACAGAAATTCAAGAGGTAAGGCGGAGT
Unaligned ( gi|37 ): ACAACAACAAATATCTCCTGACAGCTTCTGTGTTTCCATTTTCTCTAAGCCAAATCGCGCATCATTTATAAAAAAATTAATGAATACAATAATTAAAGATATCGAACTTCTTAATAAAAAATTACAAAAATGAAGAAATATGTAGATTTATATAATCTTTTATACTGTGGAACGACAGCGCTTCTTTA
Unaligned ( gi|42 ): AGGACATCTAGGCCTACAACATATGCATTAATATTCTGTTCTGGTCGTCGTCATTTCCCAAGATACATGTATATACTCGCACTTAGGAATTTAAACTAACTCCGTACCACTAACTAACAATTTATCTTGTGTTCCCACTTCCTACCAACAT
Unaligned ( gi|45 ): GTTATAATTTGTCATCAGAGATGTGTTCACCAACGTTGACAACACTAGAATTTAGACTGGAATGAAACACCCCATTGAAAATAGCCCTCCTCAGATGACTATTCTTTTCATCTACCCAACCAAT
Unaligned ( gi|46 ): AAAGATTGAACTTGTATTTACAAATAATAAATATGTAATTCCTCAGTAAACATTTCATTGATTTCACGCGGTTTAACCATGTCATCAATATGAGATGTGTATTGCCGTGCTCTCCGACGGCTT
Unaligned ( gi|48 ): GTGAGAAACCTCATAAGTGTAACGTATGTGGAAAAGCCTTCAGCCAGTCCTCCAACCTTATCACACACAGTCGGAAACACACCGGATTCAAGCCATTTAAGTGTGA
Unaligned ( gi|49 ): GCAACCCAGCCTAGTTGCGAGAAAATGTTTTTATAGAAGCTAAACACGGCTTGGCGCACAGCGTAAATTCTCCAGGTCATTTCACGAAATACACACCCGC
Unaligned ( gi|50 ): AAAATGTCTTCCAATGTCATTTCTGGCTGCCAGTTCCTTCCCTTTTTCTGGTATTAATGAGGTCATCAATTACGTCACGACCACCGTGCAAGACT
Unaligned ( gi|52 ): GTATCTAATGCTCTGTTACGTTCGACATCATATGCGTCCTTGAGTGAGAAGGTTTGAAAACATTAGTTTTATAAATGGATTAAATTTAATCAAC
Unaligned ( gi|54 ): TGATCTTCCTCACTTCACGCAATACACACTCGCACTTTGGGAATAAAAGAACATGCACTTGTGCTCCCATTTTCTATCAACTATTAGA
Unaligned ( gi|58 ): TACAATATTAATGGGATTGAACTACTTCAAGGTTAAATCCATTTATCAAAGTAAA
Unaligned ( gi|59 ): GATGTGTATTGCCGTGCTCTCCGCCGGCTTCAGGC
Unaligned ( gi|60 ): AGAGTCATCTTATGTGACGTCACAAATTTTAGG
Alignments
lowQualScore : 1111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111
lowQualScore : 1 1111 111111111111 444444444444444444 4444444444444 111111 11111 111111 33333333333333333333333333333333333333333333333333333333333 1111111111111111111111 11111111111111111 1111111111111111111 1111111111 222222222222222222222222222 11111111 1111 2222222222222222222 11111 3333333 1111111 77777777777777777777777777777777777777777777777777777 1111111111111 222222222222222222222222222222 0000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 1111 33333333 11111111 11111111111111 5555555555555555555555555555555555555555 1111 11 1111
lowQualScore : 6 5 5 0 66 2222 777 2 888 999999999999 55 3 4 55 8 1 3 3 3 3 2 0 000000000000000000 0 33 888 3 6 0 3 4444 333 1 2 1111111111111 4444 1 77777 2 666666 000000 22 0 333 77777777777777 7777777 2 00000 22 555555 4444 1 3333 1 3333 1 1 3333 333 888888 888888 22 22 333 99999 44 5 44444 1 1 1 333 1 1 1 44 1 333 222 11111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 2 4444 2 4444 2 4444444444444444444444 1 55555555555555555 22 2 2 2 2 2 22 2 2 3 6666666666666666666 666 2 2222222222 2 2 888888888888888888888888888 2 33 2 0 2 2 2 2 2 3 77777777 4444 2222 1 88 555555 777777 0000000000000000000 4 0 33333 55 4 4 4 777 99 99 0 444 5555555 777 8888 777 8 777 3333333 5 77777777777777777777777777777777777777777777777777777 6 888 1 6 99 6 6 77 1 8 0 0 6 5 3 6666 444 2 444 0000000000000 2 222222222222222222222222222222 0 2 55555 333 33 4444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444 6666 22 55 2 2 0000 2 77 2 2 44444444 2 333 4 22 2 333 2 33 66 33 33333333 2 77 1 66666666666666 2 77777 5 33 1111111111111111111111111111111111111111 555 777 0 33 0 2 0 8888 999999 0 5 0000 2 66 2 8888 4444 2 2 33 1 777777 5 0 1 2 33 77 2 2 2 2 2 3
lowQualScore : . . . . .. .... ... . ... ............ .. . . .. . . . . . . . . .................. . .. ... . . . . .... ... . . ............. .... . ..... . ...... ...... .. . ... .............. ....... . ..... .. ...... .... . .... . .... . . .... ... ...... ...... .. .. ... ..... .. . ..... . . . ... . . . .. . ... ... ........................................................... . .... . .... . ...................... . ................. .. . . . . . .. . . . ................... ... . .......... . . ........................... . .. . . . . . . . . ........ .... .... . .. ...... ...... ................... . . ..... .. . . . ... .. .. . ... ....... ... .... ... . ... ....... . ..................................................... . ... . . .. . . .. . . . . . . . .... ... . ... ............. . .............................. . . ..... ... .. ................................................................................................. .... .. .. . . .... . .. . . ........ . ... . .. . ... . .. .. .. ........ . .. . .............. . ..... . .. ........................................ ... ... . .. . . . .... ...... . . .... . .. . .... .... . . .. . ...... . . . . .. .. . . . . . .
lowQualScore : 0 0 0 1 99 4444 222 9 666 222222222222 00 6 0 55 0 8 6 6 6 3 8 5 111111111111111111 2 66 222 3 7 4 1 7777 999 0 2 9999999999999 5555 0 44444 1 111111 333333 99 8 888 55555555555555 8888888 1 11111 66 333333 2222 0 9999 8 9999 9 8 9999 222 999999 444444 55 00 222 11111 11 2 33333 7 7 9 999 9 9 1 55 9 333 888 00000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 1 5555 1 5555 1 2222222222222222222222 7 55555555555555555 55 0 0 0 0 0 88 0 2 5 1111111111111111111 999 5 5555555555 5 5 999999999999999999999999999 7 99 7 8 9 1 9 9 9 3 11111111 5555 8888 4 99 555555 222222 2222222222222222222 4 2 00000 22 4 4 4 888 22 55 7 666 7777777 000 4444 000 0 000 0000000 0 22222222222222222222222222222222222222222222222222222 7 333 0 7 22 7 7 77 4 0 8 6 0 0 2 1111 777 7 444 6666666666666 5 222222222222222222222222222222 4 2 66666 999 11 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 6666 99 88 1 1 4444 1 11 1 1 66666666 1 777 2 66 2 999 5 44 33 77 33333333 7 33 7 88888888888888 9 11111 7 99 4444444444444444444444444444444444444444 000 999 7 99 7 9 1 9999 222222 8 7 0000 9 44 9 9999 6666 9 9 99 1 777777 3 5 4 9 99 99 9 9 9 9 9 1
consensus : GAAAGGGCATTTTATCTGAAAAGCGGATACAGAGAAA--CACATGAG---GACA-C-ATACTGGTGA-N-AAACCT---T---A-T-A--A-TG-T--G-ATGTCT-GTG-GGAA-GACATTCAGT--CG--C--ANGGGNAC-TTACG-GA--GACACAT-GAG-GATACAT-ACT----GGT---GANAAA-CCT-A-AAAT----A----TAA-----ATG-T------GA------TG--TCTGTGG-GAAG---G----C-----ATTC---AG-TCGGANA--GGANACTT-A---AAG----ANACACA----TG-A----GGATA-C-A----TAC---T------GGTGA----ATAAA--CC-TTA---TAA-AATGT--G-ATG-----TC-T-GTG-G--GAAG-GCA-TTCAGTCA--G-A---CA--GGNAA--C-TT---A--A-A--G-A-C----A-A-CA-T---GA-T---------------G-ACA----C-A----T-AC---------T----G---G---TGANAAAC---C---T---------T-ATA-AA-T-G-TGA-TGTCTGTGGG--AA-GGCATTC-AGTC-----G-G---GC-ANACGA---CT-TA---C--A---GAG-A-CACA-C--A---GGA-GA-CACG-----CATA-CTGGTGAT--AAA-CCTTATA-ANT-G-TG-ATGTCTGCGGGAAGG------CATTCAG-CNAT--ACGGGAACA-TTATNNAG-ACACATGAGG-A--AN-ATACTG-G-TGA-TAA-AACCTTNA---TG-AATG-TGA-TGTC-TGTGGGAAG---ACATTCAGTGA--GACG-G-GA----C--TTACA---GACACACAT--G-AG---GATA-C---ATAC-------TGGTGATAAA-CCTTATAA--------T-CAA---------TAA-------------GA----CA-------G-GGAA-A-TTACAGAG-ACACAT--GAGGATACATACTG-G-TGA-NAAACCTT-TTGATTTATATATGTGATTTGTATTGGTAAGCGTTCATGTAAAGGACACGTCGCATG----TTT---CTA-AAC---TTT------T---TTTATTT-TTT--A--GC-AAA-A---------------TTACTTCTTTG-TATGCCT-----AAAA---TGA--C----T----A--A-A---TG------TG-T----------AT-----------G--T---------T-----------T---T--------------TGCT----T--AG--T-TTTC-AA-G--T-TTG--AAA-GCAATGAAATTC-AAATCT---TTTTGC-G---A-TAT-GCA-T---AT-T--TT--T--CT--------CGGTA-T--TTTGCGCGCCATG--------------AT-GTG-----TGACG-TCA--TATA-C---GTGACCT---TT--GCGA-------T---A-A--AA---C---TGTTA--GCCA-TATTAT----AAA--TA--AATTC-GAT----TTAATGG-AC--A-A----AA----A-GGC-AA--TTATCACGTT------AA-CAGCTCG-C--AG--ATAACA-TT-A-CG-TT-CGG-GTGC
Reference ( family-1142 ) : GGAAGGGCATTTTATCTGAAAAGCGGATACAGAGAAA--CACATGAG---GACA-C-ATACTGGTGA-N-AAACCT---T---A-T-A--A-TG-T--G-ATGTCT-GTG-GGAA-GGCATTCAGT--CG--C--ANGGNNACGTTACG-GA--GACACAT-GAG-GATACAT-ACT----GGT---GANAAA-CCT-A-AAAT----A----TAA-----ATG-T------GA------TG--TCTGTGG-GAAG---G----C-----ATTC---AG-TCGGANA--GGANACTT-A---AAG----ANACACA----TG-A----GGATA-C-A----TAC---T------GGTGA----ATAAA--CC-TTA---TAA-AATGT--G-ATG-----TC-T-GTG-G--GAAG-GCA-TTCAGTCA--G-A---CA--GGNAA--C-TT---A--A-A--G-A-C----A-A-CA-T---GA-T---------------G-ACA----C-A----T-AC---------T----G---G---TGANAAAC---C---T---------T-ATA-AA-T-G-TGA-TGTCTGTGGG--AA-GGCATTC-AGTC-----G-G---GC-ANACGA---CT-TA---C--A---GAG-A-CACA-C--A---GGA-GA-CACG-----CATA-CTGGTGAT--AAA-CCTTATA-ANT-G-TG-ATGTCTGCGGGAAGG------CATTCAG-CNAT--ACGGGAACA-TTATNNAG-ACACATGAGG-A--AN-ATACTG-G-TGA-TAA-AACCTTNA---TG-AATG-TGA-TGTC-TGTGGGAAG---ACATTCAGTGA--GACG-G-GA----C--TTACA---GACACACAT--G-AG---GATA-C---ATAC-------TGGTGATAAA-CCTTATAA--------T-CAA---------TAA-------------GA----CA-------G-GGAA-A-TTACAGAG-ACACAT--GAGGATACATACTG-G-TGA-NAAACCTT-TTGATTTATATATGTGATTTGTATTGGTAAGCGTTCATGTAAAGGACACGTCGCATG----TTT---CTA-AAC---TTT------T---TTTATTT-TTT--A--GC-AAA-A---------------TTACTTCTTTG-TATGCCT-----AAAA---TGA--C----T----A--A-A---TG------TG-T----------AT-----------G--T---------T-----------T---T--------------TGCT----T--AG--T-TTTC-AA-G--T-TTG--AAA-GCAATGAAATTC-AAATCT---TTTTGC-G---A-TAT-GCA-T---AT-T--TT--T--CT--------CGGTA-T--TTTGCGCGCCATG--------------AT-GTG-----TGACG-TCA--TATA-C---GTGACCT---TT--GCGA-------T---A-A--AA---C---TGTTA--GCCA-TATTAT----AAA--TA--AATTC-GAT----TTAATGG-AC--A-A----AA----A-GGC-AA--TTATCACGTT------AA-CAGCTCG-C--AG--ATAACA-TT-A-CG-TT-CGG-GTGC
gi|1 : GAAAGGGCATTTTATTTGAAAAGCGGATGCAGAGAAA--CACTTGAG---GACG-C-ATACTGGTGA-G-AGACCT---T---A-T-A--A-TG-T--G-ACGTCT-GTG-GGAA-GACATTCCAT--TG--C--ATGTATATCTTAAA-GA--ACCAC-T-GAA-GATACAT-ACT----GGT---GATAAA-CCTCATAAATTCTCA----TAA-----ATG-T------GA------CG--TCTGTGG-GAAG---G----C-----ATTC---AG-TGAGAAA--AGATACGT-A---AAG----ACACATA----TG-A----AGATA-C-A----TAC---T------GGTGA----ATAAA--CC-TTA---TAA-AATGT--G-ACA-----TC-T-GTG-G--GAAA-GCA-TTCAATCA--G-A---CA--TGTAA--C-GT---A--A-A--G-A-C----A-A-CA-T---GA-T---------------G-ACA----C-A----T-AC---------T----G---G---TGATAAAC---C---T---------T-ATA-AA-T-G-TGA-TGTCTGTGGG--AA-GGCATTC-AGTC-----G-G---GC-ATACAA---TT-TA---G--A---GAG-A-CACA-A--A---GGA-GATCATG-----TATA-GTAGT-AT--AAA-CCTTATA-ATT-G-TG-ATGCCTGCAAAAATA------CTTTCAG-CAAT--ATGGGATCA-TTATTTCG-CCACATGAAG-A--AA-ATACTG-G-TGG-TAA-AACCTTAA---TA-TATA-TGA-TGTC-CATGGGAAA---ACATTTAGTGA--GACG-GCGA----C--TCACA---GACACATAT--A-AC---GATA-C---ATAC-------TGGTGATAAA-CCTTATAA--------T-CAA---------TAA-------------GA----CA-------G-AGAA-A-TTACAGAG-ACACAT--GGGATTACATACTG-G-TGA-TAAACCTT-TTGATTTATATATGTGATT-GTATTGGTAAGCGTTCATGTAAAGGACACGTCGAAT-----TTT---TTA-AAC---TTG------T---TTTATTT-TTT--A--G------------------------------TTG-TATGCCT-----AGAT---TGA--C----T----A--A-A---TG------TG-C----------AT-----------G--T---------T-----------T---T--------------TGTT----T------T-TTTA-AAAG--T-TTG--AAA-GCA-TAAAATTC-AATTTT---TTTTGT-G---A-T-T-AAA-T---AT-T--TT--T--CT--------TGGTA-T--TTTCTGCGTCATG--------------AT-GTG-----TGACG-TCA--TATA-T---GTGACCT---TT--GCGA-------T---A-A--AA---C---TGTTA--GCCA-TATTAT----AGA---A--AATTC-GAT----TTAATGG-AC--A-A----AA----A-GTC-AA--TTATCACGAT------AA-CAGCTCG-C--AG--ATGACA-TT-A-CG-TT-TGG-GTGC
gi|10 : T--------CAGTA-T--TTTATGCGTCATG--------------AT-G-G-----TGACA-TCA--TGT------GTGTCCT---TT--GCGA-------T---A-A--AA---T---GGTTA--GCCA-TATTAT----AGG---A--AATTC-GAT----TTATTGG-AC--A-A----AAG---A-GAC-AA--TTATCACGTT------AA-CAGCTCG-C--AG--ATAACA-TT-A-CG-TT-CGG-ATG
gi|11 : ----GGT---GAAAAA-CA--A-AAAT----A----TCA-----ATG-T------GA------TG--T-TGTTT-TAAG---G----T-----ATTA---TC-TCGG-----GCTTACTT-A---AAC----AAACACA----AG-C----GGA-A-C-A----TAC---G------GGTGA----G-AAA--CC-ATA----AA-AATGT--G-ATG-----T--T-GTGTG--GAAG-GCA-TTCAGTCA--G-T---CA--GGATA--T-TT---G--A-A--GTG-C------A-CA-T---GA-T---------------G-ACA----CTA----T-AC--------------G---G---TGATAAAC---T---T---------T--TA-AATT-G-TGA-TGTCTGTGGA--AA-GGCATTT-A-TT-----G-G---AA-AACCGA---C---G---C--A---GAGAA-AACA-C--A---TGA-Gtactagctgccagaataagggtggtagcctaaattttttcagcttttcgaaggaaggtgcgaagaaatgtttgtcgatacaaggaataaataaataaaactgtcgcttttgtccatgtgctgtaaaaacaatacatgtaataaataaaggaaaacaaaaacagttggacaacaacccagcctaattgctagaaggtgtatatataaaagctaaacacggctagactcatagcgtaaattgtgtccaggccatttcatgaaatacacatctgcaccaattgacctacatataacataataggatttaatacttcaaagttaaatcggtttatcaaagcaaaatatcaattattctccgaaaacgtaccagcgtactttccgggtgctaactaactttatagtggggacacttgcttacgtcacgtcacgtcacgcccaccgtgcaagcatccccagcagtgagcgcatagaaattcaaagaggtatgaggtgttgaattctt
gi|12 : ttattagttttataatcaatttttattacttatgtgtgcagatagcccattagaaacagattaaattcatcagaacaggtcaaggttataatttgtcatcagagatatgttcaccaacactgacaacacgaatttagattgaatgaaacatcccattgcgaatagccctcctcagatgactattcttttcatcaaccaaccaatagctgcctgtgaaacaagtatgtatatctacccaaccaatggctgtctctgaaacaagtatcttctacacaaatcaaagactagcacaaacggaaaatataacggactttgtgaaactgttgaagcagtctgtgaaacaagtaaaaactcaagatctgaaaaatgatttacaggagtgtataaacaaaaatggaTCCCATG----TTT---CTA-AAC---TTTACATAAT---TTTATT-----------C-AAACA---------------TTACTTCTCTGATATACCT-----AAAAATTTGA--C----T----A--C-AGACTG------T--T----------ATTTAAATAAATAA--T---------T-----------TG--T--------------CGCTC---T--AGGTT-TTTC-AA-G----TTG--AAACGCAATGAAA-TC-AAATC-------TGC-A---A-TAT--CA-TATGAT-T--TT--T--CTCAGCGCAACGGTATT--TTTGCGCGCCATGGGTGTGTTTTTGTTAT-TTG-----TGACG-TCAAGTATA-C---G---CCT---TT--G-GAATG----T---A-AACAA---C---TCTCAAGGCC--T-TTATC---AAA--TG--A--TCAGATCG--TTAATAG-ACTAA-A----AA----A-GGC-AAATTTATTA--TT------AATCAGATTC-C--AACTATAGCACTT-ATCGATT-CGA-GTG
gi|13 : aaccaggatcatatA--CACATGA------TA-C-ATAGTGGAGA-A-AAACTT---T---ACT-T--A-TG-T--G-ATATTT-GTG-GGAA-GACATTGTCT--CG--C--AAAACAAA--TGCG-AAAAGACACAT-GAG-GAAACAT-ACT----GGT---GATAAA-CCT------T----A----TAA-----ATG-T------GT------TG--TCTCTGG-AAAG---G----C-----ATTC---AG-TGAGAAA--GGAATCTT-A---CAG----AAACACA----AG-A----GGATA-C-A----TAC---T------GATG------------C--------TAA----GT--C-AC---------------G--GAAG-GCA-ACCAACCA--G-A---AT--GATAG--A-GT---A--C-AGTG-A-C------A-CA-T---GA-T---------------T-ATA----T-A----T-AT---------T----G---A---TA-------------------------ATG-AA-T-G-TGA-TGTTTTCGGA--AA-GGTATTC-AATC-----A-G---ACAACAC-A---CT-TA---T--A---GAA-T-CACA-T------TAA-GG-CACG-----T----TTGG---T--ACA-CCTGA----------A-ATACCTGTGGGA---------CA--------------GGAAAC--TTACAGAA-ACACATGAGG-AC-AT-AGAATG-G-TGACCAA-AACttatgttaattgctacgggttgtaattaatgctgtaacggaattaagggttggctagtcctgattattttgtcaactttttcgaaggaatgtctgcgaggaattagtcgacacaagacttaacctataaacataacagtcgccctttagtccagtcgtacttgttttaaaaaaataataaaattaaggaaaacataaacttagtgatgggaacagtgcaacccgtagtctgataattgcgatgggaggggttgtttatataga
gi|14 : aaggcatttaactcttcattgacattaacatAA---TGA--T----T----A--A-A---GGACACATTG-C----------AT-----------G--T---------T-----------T---T----------------CT----A--AACAT-TTTA-AA------TTGCTAAA-GCAA---AATT---AAT-T---ATTTGC-GTGCA-TAT-GCA-T---AT-T--TTC-T--CT--------CTGTA-T--TTAACGC-CCATT--------------AT-GTG-----TGACG-TCA--TAT------GCGACCT---TCGAGCGA-------G---G--------------GTTT--G--ATTTTTTT----CAA--CG--GATTA-AAT----TTAATCG-ACTTA-AAAATAA----A-TGT-AA--TCATCAC--------------GCTCG-T--AG--ACAACA-TT-A-CG-TT-CGG-ATGgtgtgttcctgcatagccaaactgacctagtattgtttctgcataactccttatcctatatattttgacaagctcagaaaa
gi|15 : C-AGACAA---TT-TA---C--A---GAG-A-CACA-A--AA--GGA-TA-CATG-----TATA-GTAGTAAT--AAA-TCTTCTA-ATTCG-T--ATGCCTTCGAGAATG------CATTCAG-CCAG--ATGGGATCA-TTATTTCG-ACATA------A--AG-ATAC-------A-TA-----CTTTA---TA-TATG-TGA-TGTC-CGTGGGAAA---ACATTTAGTGA--GACG-G-GA----CACTTACA---GACACATAC--A-AG---GATA-C---ATAC-------TGGTGATAAA-CCTGATAA--------TTCAA---------TAA-------------GA----CA-------G-GGAA-A-TTACAGAG-ACACAT--GAGGATACATATTG-G-TGA-GAAACGTTGTTGATTTATATATGTGATTTGTATGGGTAAGCGTTAATTTAAAAGACATGTAGCATG----TTT---TTA-AACATTTTT------T---TTTATTT-TT---A--G------------------------------TTG-TATGCCT-----AGAA---TGA--C----TAC--A--A-A---TG------TA-A----------AT-----------G--TA--------T-----------T---TTGAATAAATCATTATGCT----T--TG--G-TGTT-AA-G--T-TTT--AAA-GCAATCAATTTC-AAA------TTTTAC-G---ATTAA-ATA-T---AT-T--Tttatagtatcgacacaacgggcgcattagctgtcagaagctttgtgtttgttttagttttttcgaaagaaggtgcgaaggaaaagaccagtaatttttagttggcacagggtctttgtcgtaaaaaatccacacaaatcagtcacgtttgattatgtacctttttagaaaaagaagaaaaaaaaaggggggggggcaaaacggttgcaaagcgactcagtttaactacgagaaattggtcatatg
gi|16 : GT--G-A-G-----AC-T-GTA-G----AG-GCT-GTCTGTGA--A-A---CA--AGTAAAAC-T----A--A-A--G-A-CCAGGA-A-AA-T---GA-T---------------TTACA----C-GAATGT-ACAAACACAAAT----G---GAGGTGAAAAAC---AAAGT---------T-ATC-AG-T-G-TCA-TCTTTGTTGG--AA-GGCATTT-ACTC-----
gi|16 : ttattagtattataattatttttattatttttcttgcagaaatcccattagaaacatattaggttaatcagaaacatgtcaatgttttaaattggcatcacagatgtgttcactatcactgacaacactagaatttagactgtaatgcaacatccaattggaaatagccctcctcgtatggctattcttttcacccaactaaccaatggctgactgtgaaacaagtatgtctatctacccaaccaatggctgcctgtgaaacaagaatgtcttctacacaatcaagggctagcacaaacggaaaatacaacggactta----GGT---GAAAAA-C---A-AAGTT---A----TCA-----GTG-T------CA------TC--TTTGTTG-GAAG---G----C-----ATTT---AC-TC
gi|17 : ttattagtattataattatttttattatttttcttgcagaaatcccattagaaacatattaggttaatcagaaacatgtcaatgttttaaattggcatcacagatgtgttcactatcactgacaacactagaatttagactgtaatgcaacatccaattggaaatagccctcctcgtatggctattcttttcacccaactaaccaatggctgactgtgaaacaagtatgtctatctacccaaccaatggctgcctgtgaaacaagaatgtcttctacacaatcaagggctagcacaaacggaaaatacaacggacttagtgagactgtagaggctgtctgtgaaacaagtaaaactaaagaccaggaaaatgatttacacgaatgtacaaacacaaatgga----GGT---GAAAAA-C---A-AAAT----A----TCA-----ATG-T------GA------TG--TTTTT----AAG---G----T-----AT
gi|18 : attattaagttttataatcatttttattacttatgttgcgtagcccaattagaaacagattaaattcatcaggaacaggtcaaggtataaattgttcatcagagatatgttcaccaacactgacacactagaatttagattgaatgaaacatcccattgcacgaatagccctcctcagatgactttctttcatctacaaccaatagctgcctgtgaaacaagtatgtatatctacccaaccaatggctgtctctgaaacaagtatgtcttctacacaatcaagactagcacaaacggaaaatataacggactttgttgaaactgttgaagcagtctgtgaaacaagtaaaaactcaagatctgaaaaatgatttacaggagtgtataaacaaaaatgga----GGT---GAAAAA-C---A-AAAT----A----TCA-----ATG-T------GA------TG--TTTTT----AAG---G----T-----ATTA---TC-TCGGCT------TACTT-A---AAC----AAACACA----AG-C----GGATA-C-A----TAC---G------GGTGA----GAAAA--CC-ATA---T-A-AATGT--GCATG-----TT-T-GTG-G--GAAG-GCA-TTCAGTCA--G-T---CA--GG-AA--T-TT---G--A-A--G-G-C------A-CA-T---G--T---------------G-ACA----C-A----T-AC---------T----G---G---TGAATAAC---C---T---------T--TA-AA-T-G-TGA-TGTCTGTGGA--AA-GG-ATTG-TATT-----T-G---AA-AACCGA---C---G---C--A---GAG-A-AACA-C--A---TGA-GG--AC------CATA-CTTGTGAG--AGA-CC--ATA-A
gi|19 : agcacaaacggaaaatataacggactttgttgaaactgttgaagcagtctgtgaaacaagtaaaaactcaagatctgaaaaatgatttacaggagtgtataaacaaaaatgga-AATG-TGT-TGTTGTGTGGGTAG---GC-TTCAGCGA--GACA-G-GAAGATT--TTACA---G-CACACA-----AGTTTGACAAC---ATCT-------TGGTGATAAA-CC-TATAAATGTGATGT-CTG---------CGG-------------GAGGTTCAGTCGTATG-GGAACA-TTAAGGGG-ACATAA--GAGTAT-CAT-CTG-A-TGATAAAACCAT-ATAATGTAAATGTTTGaa
gi|19 : AG--CACACAAGTTTGACAAC-ATCTTGGTGA-T-AAACCTA--T---A---A--A-TG-T--G-ATGTCT-GCG-GGAG-G---TTCAGT--CG--T--ATGGGAACATTAAG-GG--GACATAA-GAG-TAT-CAT--CT----GAT---GATAAAACC------AT----A----TAA------TG-T------AAA-----TG--TTTGTGG-GAAAAAAG----C-----ATTC---AA-TTGGAGACAGAACATTTTA---AAA----AGACACA----AG-A----TGATA-CCA----TAC---T------GGTGT----TTAAA--CCCTTA---TAA-A-TGT--G-ATG-----TG-T-GTG-G--GAAG-GCA-TTCCGTGA--G-A---AA--GGACA--T-TTTAAA--A-A--G-A-C----A-A-GA-T------T---------------G-ATA----C------T-AC---------T----G---G---TG-TAAAC---C---T---------TAATA-AA-T---TGA-TGTGTGTGGGGAAA-AGCATTC-tgggaaaaaagcattcaattggagacagaacattttaaaaagacacaagatgataccatactggtgtttaaacccttataaatgtgatgtgtgtgggaaggcattccgtgagaaaggacattttaaaaagacaagattgatactactggtgtaaaccttaataaattgatgtgtgtggggaaaagcattc
gi|2 : aatgtgttgttgtgtgggtaggcttcagcgagacaggaagattttacA-C-AGACTT---C---A-T-ACAA-TG-T--ATATTTTT-GTG-GGAATAACATATAGTTGTG--T--AAAGGTGCGTTATGTGA--TACACAC-GTGCGAT-TAT-ACT----GTG---GAGA----CT------T----C----TGAC----ATG-T------GA------TA--GTTATGT-GAAA---T----CACTTGATTA---AGTTCAGACA--GGAGATTT-----AAG----AGACACA----GG-A----GGATA-C-A----TA----T------GGTGA----AGAAA--TC-TTC---CAATAATGTTGG-ATG-----TCTT-GCG-A--AAAG-G-A-TTCAGTGC--G-T---AA--GGGAT--CATT-------------A-C----A-A-T--C---GA-A---------------G-ACA----C-A----A-AC---------TTCAAG---G---TGATAAAC---A---TAGAAATAACT-GTA-AG-G-G-TGA-AATTTATGAG----------TC-TGTC-----G-T---G--AAGCGATTTCT-TAGTGCGAA---GGG-ATCATA-C--A---AAA-CA-TATGAGGATAATA-CTGGTAAT--AAC-CCTTATATAAT-GTTGTATGTCTTGTGGAAGA------CATTCAC-TGACTGAGAGGAAC--TTATTAAC-ACACATGAGG-A--A--ATACTG-G-TGA--AA-AACCTTT----TA-AATG-TGATTGTC-TGTGAGAAG----C-TTCAGTCATCGA-G-G-GAC---C--TTACAGAGGAGACACAT--GAAG---GAAATC---ATAC-------TGGTGAGAGACCCTTATAA--------T-TGAATGTCTGGGTAAAAGATGTTTTATTGA----CA-------ATAGAA-ACCTATAGAGCACACATTAGACAACACATAATGCGTTGA-AAGACCAT-T--ATGTA-ATGT-TGATTT
gi|2 : agccttagttcaagatatgtctttacgccactgtatttgattaagaaaacgtgatAGAGA--CACAGGAG---GATA-C-ATA-TGGTGA-AGAAATCT---TCCAA-T-A--A-TG-TTGG-ATGTCTTGCG-AAAA-GG-ATTCAGTG-CG--T--AAGGGATCATTACA----------ATCGAA-GACACAA-ACTTCAAGGT---GATAAA-CAT-AGAAAT----AACTGTAA-----GGG-T------GAAATTTATGAGTCTGTCGTGAAG---C----G-----ATTTCTTAG-TGCGAAG--GGAT-CAT-A---CA-----AAACATA----TG-A----GGATA---A----TAC---T------GGT-A----ATAAC--CC-TTA---TAT-AATGTT-GTATG-----TC-TTGTG-G---AAG-ACA-TTCACTGACTG-A---GA--GG-AA--C-TT---ATTA-A--C-A-C----A---CA-T---GA-G---------------G-A-A------A----T-AC---------T----G---G---TGAAAAAC---C---T---------T-TTA-AA-T-G-TGATTGTCTGTGAG--AA--GC-TTC-AGTCATCGAG-G---G----AC-----CT-TA---C--AGAGGAG-A-CACA-TGAA---GGA-AA-T--------CATA-CTGGTGAG--AGACCCTTATA-ATT-G--A-ATGTCTGGGTAAAAGATGTTTTATTGA--CAAT--A--GAAAC--CTATAGAGCACACATTAGACAACAC-ATAATGCGTTGA--AA-GACCATTA---TGTAATGTTGA-T-TT-TGTGGG-AG---ACA-TCAATTAT-TATA-C-AA----CCGTAAAA---AACTCACATTGA-AG---GATA-CCAAAT-C-------TAGTGAC-AG-CCTTATtgtgggagacatcaattattatacaaccgtaaaaaactcacattgaaggataccaaatctagtgacagccttatcagtgtgatgcttgttcgaaacattcagtcagtagagaagacttactgtgtcacaaagataagacatcaacagtgaatgtagtgtctgtggaaagtgtacaccgatgggtcgcagacttagaagcaccatgggacacatac
gi|2 : agccttagttcaagatatgtctttacgccactgtatttgattaagaaaacgtgatacagacttcatacaatgtatatttttgtgggaataacatatagttgtgtaaaggtgcgttatgtgatacacacgtgcgattatactgtggagacttctgacatgtgatagttatgtgaaatcacttgattaagttcagacaggagatttaATACA---AAA--CATATGAG---GATA---ATACTGGTAA-T-AACCCTTA-T---A-T-A--A-TGTT--GTATGTCT--TGTGGAA-GACATTCACT--GA--CTGAGAGGAAC-TTATT-AA--CACACAT-GAG-GA-A-AT-ACT----GGT---GAAAAA-CCT------T----T----TAA-----ATG-T------GAT-----TG--TCTGTGA-GAA----G----C------TTC---AG-TCATCGA--GGGACCTT-ACAGAGG----AGACACA----TGAA----GGAAATC-A----TAC---T------GGTGA----GAGAC--CC-TTA---T---AAT-T--GAATG-----TC-T-G-G-GTAAAAG-ATG-TTTTATT---G-A---CAATAGAAA--C-CT---A--T-A--G-AGC----ACA-CA-TTA-GA-C---------------A-ACA----C-A----T-AA---------T----GC--GT--TGAAAGAC---CA--T---------T-ATGTAA-T-GTTGA-T-TTTGTGGG---A-GACA-TC-AATT-------A---TT-ATACAA---CCGTA------A---AAA-A-CTCA-C--ATT-GAAGGA-TAC------CAAATCTAGTGAC---AG-CCTTATC-AGT-G-TG-ATGCTTGTTCGAA-A------CATTCAGTCAGT--A-GAGAAGACTTACTGTG-TCACA------A--A------------GA-TAA-GACATCAACAGTG-AATG-TAG-TGTC-TGTGGAAAGTGTACA-CCGATGG--GTCGCA-GA----C--TTAGA---AGCAC-CAT--G--G---GACA-C---ATAC-------cagtgtgatgcttgttcgaaacattcagtcagtagagaagacttactgtgtcacaaagataagacatcaacagtgaatgtagtgtctgtggaaagtgtacaccgatgggtcgcagacttagaagcaccatgggacacatac
gi|20 : agccttagttcaagatatgtctttacgccactgtatttgattaagaaaacgtgatacagacttcatacaatgtatatttttgtgggaataacatatagttgtgtaaaggtgcgttatgtgatacacacgtgcgattatactgtggagacttctgacatgtgatagttatgtgaaatcacttgattaagttcagacaggagatttaagagacacaggaggatacatatggtgaagaaatcttccaataatgttggatgtcttgcgaaaaggattcagtgcgtaagggatcattacaatcgaagacacaaacttcaaggtgataaacatagaaataactgtaagggtgaaatttatgagtctgtcgtgaagcgatttcttagtgcgaagggatc-----G-G---GC-A----A---CT-TA---C--A---GAG-A-CACA--------GTA-----ACA-----CACA-CTGGTGAC--AAA-TCTTACC-AAT-G-TG-ATGTTTGTTGGAAGA------CATTCAG-TTAT--TCAGGATCA-TTGCAAAA-GCAC---AGA-A--AG-ACAC-------A-TAATAATCCTAA---TG-AATT-TGA-AATT-TGTCGGA-----ACA--------------------------TTACA---GACACACAT--G-AG---AATA-C---ACAC-------TGGTAATAAA-CC
gi|20 : ttatttcgaaTACAGAGA----CACAGTA-----ACA-C-ACACTGGTGA-C-AAATCT---T---A-CCA--A-TG-T--G-ATGTTT-GTT-GGAA-GACATTCAGT--TATTC--AGGATCA--TTGCA-AA--AGCACAG-AAA-GACACAT-A-------------ATAAT-CCT-A---------A----TGA-----ATT-T------GA------AA--TTTGTCG-GAA---------C-----ATT--------------------AC--------AG----ACACACA----TG-A----GAATA-C-A----CAC---T------GGT-A----ATAAA--CC-AGA---T-A-TATGA--G-ATA-----TT-A-ATG-T--TAAC-GCA-TTAAGCCA--G-A---CA----TAA--C------A--G-A--G-A-C----ATT-CAGT---GA-----------------G-ACGGGATC-A----T------------T----A--------GAAAAAC------------------------A-T-A-TGA-AGAC---GCA--AATGGCATTCGACTC-----G-A---A--AGTCCA---CT-TA---C--A---AAT-A-CACA-C-------GATAA-CACT-----C--A-CTGGTGAT--AAT-ATTTA-A-AAG-G-TG-ATATATGTGagatatatgagatattaatgttaacgcattaagccagacataacagagacattcagtgagacgggatcattagaaaaacatatgaagacgcaaatggcattcgactcgaaagtccacttacaaatacacacgataacactcactggtgataatatttaaaaggtgatatatgtg
gi|23 : ttatttcgaagggcaactT---TTA-AAC---TTT------T------ATTT-TTA--A--AG-AAA-AAACTTGCTTTGTGTGCTACTTCTTTG-TGTGCCTCCCCTAAAA---TGA--C----T----ATAA-A---TG-------G-T----------AT-----------T--TGAATTATTAT-----------T---T--------------TGCT----T--AG--T-TTTC-AA-G--T-TTGA-AAA-GCAATTAAATTC-AAATCC---TT---C-A---A-TAT-GCA-G---AT-T--TT--T---T--------CGGTA----TTTGCTGTCCATG--------------AT-GAG-----T-ACG-TCA--TATGCC---GT--CCT---TC--GCGA-------G---A-A--AA---CAATTGTTA--GCCA--ATCAT----GAA--CA--AGATC-GA-----TTAATGG-AA--A-A----AA----AGGGCAAA--ATATCACATTACCGTAAA-CAGCTTG-C--AGTTATAACA-TT-A-CG-TT-CGG-
gi|25 : catcgATG----TTT---TCA-AAC---TTT------T---TT-ATTT-GTC--AT-GC-AAA-A---------------TCACTTCTTTG-TATGCCT-----AAAA---TGA--C----TAC--A--A-A---TG------TA-TTTTGAATAA-AT-----------T--A---------T-----------T---T--------------TGCT----T--AG--T-TTTC-AA-G--T-TTG--AAA-GCAATGAAATTC-AAATC------TTGC-A---A-TAT-GCA-T---AT-T--TT--T--CT--------CGGTA-T--TCTGCGCGCCATG--------------GT-GTG-----TGACG-TCA--TACA-C---G---CC---------CGAATGAATGT---A-AACAA---G---TCTCA--GACA-TATTAT----AAA--TA--AATAC-GAT----TTAATGG-ACA-A-A----AA----A-GGC-AA--TAATCACGTT------AA-CAGAATG-C--AG--ATAACA-TT-A-CG-TT-TGGTGTGtgttgaacattgtgtcattcggtgtgatagctgtcagag
gi|26 : CATG----TTT---CTA-TAC---TTT------A---AGTAATT-TTT--AT-GC-AAA-T---------------ATACTTCTCTG--GTAACT-----AAAA---TGA--C----T----A--ACA---GA------TG-T----------AT--------------T---------C-----------T---TAAATTA--------TGCT----T--AG--T-TTTC-AA-G--T-TTG--AAA-GCAATGAAAATC-AAATCT---G---GC-A---A-TAT-GCA-T---AT-T--TT--T--CT--------CGGTA-T--TTTGCGCGCCATG--------------GT-GTG-----TGACG-TCA--TATA-C---G---CCT---TT--G-GAATG----T---A-AACAA---C---TCTCA--GGCC-TATTAT----AAA--TA--GATTC-GAT----TTAATAG-ACA-A-A----AA----A-GGC-AA--TTATTA--TT------AA-CAGATTC-C--AA--ATAGCA-TT-A-CG-TT-CGA-GTG
gi|27 : agttatcACAT-ACT----GGT---AATAAA-CCT------T----A----TAA-----ATG-T------AA------TG--TCTGTGG-GACG---G----C-----ATTT---AT-CCAGAAT--GGAAACTT-A---AAA----GCACACA----TG-A----GGACA-C-A----TAC---T------GGTGA-----TAAG--CC-TTA---TAA-A-TGT--G-ATG-----TC-T-GTG-G--GAAG-GCA-TTCAGTCA--A-A---CA--GGAAT--C-TT---AC-ACA--G-A-C----A---TA-T---GA-G---------------G-ATA----C-A----T-AC---------T----G---G---TGAGAAAC---C---T---------T-ATA-AA-T-G-TGA-GGTCTGTGGA--AA-GGTGTTT-AGCT-----G-G---GC-AGGAGA---CT-TA---C--AT--G-----CACA-C--A---TGA-GA--ACA-----CATA-CTGGTAAC--AAA-CCATATA-AAT-G-TG-ATATATGTGGGAt
gi|29 : cATCTGAAAAATG-ATTTACAGGAA--TGTATAAA---CAAA-A-ATGGAGGTGA-A-AAACAAAAAT---A-TGA--A-TG-C--G-ATGTTT-GTT-TTAA-GGTATTAACT--CG------GGCTTAC-TTGAG-CA--GACACAT-GAG-GATACAT-ACT----GGT---GAGAAA-CC------GT----A----TAA-----ATG-T------GA------TG--TTTGTGG-GAAG---A----C-----ATTC---AG-TCAGACA--GGATATTT-G---AAG----GTACACA----TG-A----
gi|29 : aaactcaag----GGT---GAAAAA-CA--A-AAAT----A----TGA-----ATG-C------GA------TG--TTTGTTT-TAAG---G----T-----ATTA---AC-TCGG-----GCTTACTT-G---AGC----AGACACA----TG-A----GGATA-C-A----TAC---T------GGTGA----G-AAA--CC-GTA---TAA-A-TGT--G-ATG-----TT-T-GTG-G--GAAG-ACA-TTCAGTCA--G-A---CA--GGATA--T-TT---G--A-A--G-G-T----ACA-CA-T---GA-TTNNNNNNNNNNNNNNN-NNN----N-A----A-ACAAAAA----T----GGAGG---TGAAAAACAAAA---A---------T-ATG-AA-T-G-CGA-TGTTTGTTTT--AA-GGTATTA-ACTC-----G-G---Gttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaaacaaaaatggaggtgaaaaacaaaaatatgaatgcgatgtttgttttaaggtattaactcggg
gi|3 : aaactcaagatctgaaaaatgatttacaggaatgtataaacaaaaatggaATG----TTT----TATAAC---TTT------T---T--ATTT-GTC--AT-GCCAAA-A---------------TCACTTCTTTG-ATTGCCT-----AAAA---TGA--TA---C----A--A-A---TG------TA-TTTTGA-----AT-----------AAAT---------TATG--------T---T--------------TGCT----T--A---T-TTTC-AA-G--T-TTG--AA--GCAATGAAATTC-AAATCT---T---GC-A---A-TAT-GCA-T---AT-T--TT--T--CT--------CGGTA-T--TCT--GCGCCATG--------------GT-GTG-----TGACGTTCA--TACG-CCCAATGAA------T--GTAA-----------A-C--AA---C---TCTCA--GGCA-TACTAT----AAA--TA--GATAC-GAT----TTAATGG-ACA-A-A----AA----A-GGC-AA--TTATCACGTT------AA-CAGTTTG-C--AG--ATAACA-TT-A-CG-TT-CGG-GTG
gi|30 : ctcctaCA-GA--GACACAT-GAACAATACATTACT----GGTTTTGATATA-TCC-T-CATT----A----TAACTGATATGAT------GA------TG--TCTATGG-GAAT---T----A-----GTTG---AG-TAGGGCA--GGATCATT-G---AGG----ATATACAAATCTG-ATAAAGGGTA-T-ACTTTTACACATA-----GGTGC----ATAAAAGCC-TTAATATAGGAATGT----ATG-----TC-T-GTT-G--GAAGTGC--CTCAATCA--C-AAACCA--CGAA-----TT---A--C-AC-A-A-C----A-ATCA-T----A-G---------------G-GCA----C-A----TTAC---------T----GT--A---TGATAAAG---C---CAA-------T-ATA-AA-T-G-TAA-TGTGGTTGGG--AA-GGAGTTT-AATttgtgtgtcggttacgggtgtactagatgtcagaattagggtagtagcctaagtttttttttcaactttttcgaaggaaggttcgaggaaattttgtgtcgactcaaggactttaccataaataaaacagtcgattttctctttgtactgctaaaaaaataaaggaaaacataaacagttcgacagcaaccccgattaattgcgcgagaaggtgtttatatagacgctattgacacggattaagtctacaacgtttatttatgtacaggccatttcacgaaatacacgctcgcactcaaactgacctacataatagcacaacaacaaatactcctgaaggttcgtgttcccatttcctaccaaatcgcacatttaaaaaaaaaaaataacattacaataattaaagatcgaacttgtgtaaaaattacaaataagaaaatatgtagttcctcagtaaacatttataattttttcgtggacgcgcttttaaccatgacatgagatgtgtattgctgacaatgctctccggcattaccttgc
gi|31 : AC---ATT------T---CGTGTTTGTTT--AAAGC-AAA-A---------------TTACTTCTTTG-TATGCCT-----ATAC---TGAGTT----T----A--A-A---TA------TG-TTTTGAATAAAAT-----------G--T---------T-----------T---T---------------GCT----T--AG--T-TTTT-AA-G--T-CTG--AAA-GCAATGAAATTC-GAATC------TTGT-G---A-TAT--CA-T---AT-T--TG--T--CT--------CGGTA-TAGTATACGTTCCGTG--------------AT-GTG-----TGTCG-TCA--TAT------GCGATCT---TT--GCAA-------G---A-AACAA---CT--TGTTA--GCCA-TTTTAT----AAA--CA--AACTT-CATTTAATTAATCG-AC--A-A----AAC---A-GGC-AA--TTATCACGTT------AA-CAGCT
gi|32 : -AAAGCT---T---A-T-A--AATG-T--G-ATTTTT-GTG-GGAA-AACTTTGAGT--TG--T--AAAGCTGCGTTACT-GA--TACACAC-GAG-GATCCAT-ACT----GGT---GAGAGA-CCT------C----A----TGA-----ATG-T------GG------TG--TTTGTGG-GAAG---A----C-----ATTC---AA-TCAGACA--GGAGACTT-A---CAG----AGACACA----GG-A----GGATA-C-A----TAC---T------GGTGA----A-AAA--CC-TTA---T-A-AATGT--G-ATG-----TC-T-GTG-G--AAAG-GCA-TTCAGTGC--G-A----A--GGAAA--CATTAC-A--A-A--A-A-C------A-CG-T---GA-G---------------G-ATA----C-A----T-AC---------T----G---G---
gi|33 : ACAGACAAATGCACATGAA---GACA-CAAAACTGGTGATA-AAACC------------A--A---------ATGAAT-GTG-GGAA-AGC-TT----------------------TGATG-GA--AAC------AA-GCTAGAT-ACT----GGT---GATAAA-CCT----------------------------T------GA------TA--TCTTTTG-CAAG---GTGTAC-----ATCC---GG-TCAGATC--GATGACTT-C---TAGTTCTAAACACG----TG-A----AGATA-C------TGT---TC-----AGTGATCTTACAAG--TC-CTA---T-A-AATGT--G-GTG-----CC-T-GT
gi|34 : gaAAAC---C---T---------T-ATA-AA-TAG-TGT-GGTTTGTGGG--AA-Gtaacaag
gi|36 : agtgtaaacagaaaaagtaatgaatgtagtgaacttaggaaacctgtttgtgaaataattcaactaaagatcagaaaaatgatttacagagaacgggtgaaagatattggagtaaaaacatgttttcactgtgatgatagatatgcacaaaaggcgcaaagaacttcaagaCA----TA-A----GGACA-C-A----TAT---T------GATGA-----TAAA--CC-TT-----------GT--T-ATT-----TC-T-GTG-G--GAAG-GCA-----ATCA--G-A---CG---------C-T---------A--G-A-C------------------T---------------T-ACA----C-A----T-AA---------C----A---G---TGATAGAC---C---C---------T-ACA-AG-T-G-TA---GTTTGTAGA--AA-GCCATTA-GGTC-----G-GACAGC-ACACCA---AT-TA---C--A---AAG-T-CACA-C--A---AG--GA-CACA-----TAAA-CTG--GAT--AAA-aacatcaat
gi|38 : ----ATACATA----TT-A----GAAGA-C-A----TGC---T------GGTGA-----TAAA--CC-TTT---TAA-A-TGT--G-ATA-----TA-T-GTG-G--AAAG-GCA-TTT-GTCTT-G-A---AA--GTAGA--A-TT---A--A-A--A-G-C----A---CA-TTTTG--T---------------G-ACT----C-A----C-AC---------T----G---G---TGAAAAAC---C---A---------T-TTC-AA-T-G-TGG-TGTCTGTGGG--AA-GGTATtggagatatgtgagagaggaa
gi|39 : gagaatatctgcgt-A----CAC---T------GGTGA-----CAAA--CC-AT----TCA-AATGC--G-AGA-----TC-T-GTG-G--ACGG-GCC-TTCCGACA--A-C---CA--GGCAA--T-TT---G--A-C--G---C----G-T-CA-TC--GACT---------------G-ACC----C-A----C-AC---------C----A---C---AGTCAAAC---C---T---------T-ACG-TC-T-G-CCC-AACCTGCAAC--AA-AGCATTC-AACC-----G-G---GC-CTCCAA---CT-TA---C-------AC-A-CGCA-C--A---TGC-G--CACT-----CACA-Catggtctaaaagttgtgttaaaga
gi|4 : ----TTT---C-A-AAC---TTT------T---TT-ATTT-GTC--ACTGC-AAA-A---------------ATCATTCTTTG-TATGCTA-----AAAA---TGA--C----TTACGA--A-A---TG------TA-TTTTGAATAA-AT-----------T--A---------T-----------T---T--------------TGCT----T--AG--T-TTTC-AA-G--T-TTG--AAA-GATATGAAATTC-AAA-------TTTGC-A---ATTAG-CCA-T---TTCT--TC--T--CT--------CGGTA-TTGTCTGCGCGCCATG--------------GTGGTG-----TGACG-TCA--TAT--C---ACGCCCTAG-TT----AA-------T---GTA--CA---C---TTCTA--GCCA-TAT--------AA--TA--A--TT-GAT----TT-ATGG-AC--A-G----AAACAGA-GAC-AC--TTATCA-GTT------AATCAGCTTG-CAAAG--ATAACA-TT-A-CG-TT-CG
gi|40 : ATCACATT------AA-CAGCTTG-C--AG--ATAACA-TT-A-CT-TT-TGG-GTGccctcttgtgttgtcattagcggatgtactacttgtcagaatagggtggtcctgagtagtcaactttttcgcaggaaggacgaggaaactttttgtgtcgactcaaggactttacgcataaataaaacaagtccgtttggtctttgtctgttaaaaaaaaataaaggaaaaagacagttggacagcaccccagattaatgcgcgaggaaaggttgtttttatatagaagctagacacagattaggtctacaagcgttttatatgtcagcctttcacgaaatacacgctcgcctcaactgacctacatcaatagcataattgttacaacaaatacttcaagttcctgttcccatttcctaccaaatgaaatgataataatacaatagttaaagattgaactgtataaaaatacaaaaagaaatatgtaagtccttcagtaagccatttgtataaatatatattttcgtcgacgcgcttttaaccatgacatgagatgtggtattgctgacaatgctctctctccggcattatttgc
gi|41 : TG----TTT---CTA-AAC-----G------T---TATAATT-TTTAAA--GC-AAA-A---------------CTACTTCTCAG-TATGCCT-----AAAA---TGG--C----TTA--A--A-A---TG------TA-TTTTAAATA--AC-----------A--TA--------T-----------T---T--------------TACT----T--AG--T-TTTC-AG-A--T-TTC--AAA-TCAATGAAATTC-AAACC------TTAC-A---T-TAT-ACATT---TT-T--TT--T--CT--------TGATA-T--ttgtgtgtcggttgatggtgtactagctgtcagaattagggaggtagcccgagtttttcaactttttcgaaggaaggtgcaaggaaaatttgttgatacaagaactttttcataaataaaactgttgcttt
gi|43 : cattgatAAAGGACACATAGCATAGATACTTAAATTA-AAC---TTT------T---TTAATTT-CTT--AA-GC-ACA-A---------------CT----CTTTG-TGTGCCT-----AAAA---TGA--CACTTT----A--A-A---TG---------------------T-----------G--T---------T-----------T---T--------------TGAA----TAAAG--TCTTTC-AA-AACT-TTGA-AAA-GTGATGGAATTG-AAACAA---TCTTGCAA---A-TAT-a
gi|44 : GGGCACATCGCATG----TTT---CTA-AAC----AT------T---TTGATTT-TTGA-A--GC-AGA-A---------------TTGCTTCTTTG-CATGCCT-----AAAA---TAA--C----TCTG-A--A-T---TGATTT--TG-A----------ATAAA--------A--TA--------T-----------T---T--------------TGCT----T--AG--T-TTTC-------T-T--------GCGATGAAATTC-AGATA------TTGC-G---A-TAC-GCA-T---AA-T--TT--T--C
gi|47 : GA--GATG-G-GG----TCATTACA---GAGACACAA--G-AG---GATA-C---ATACATGATACTGGTGATAAA-CATTAT----------T-AAA---------AAA-------------AA----TATT-----G-GGCA-C-TTAAAGAC-ACGCAA--GATGATACCTACCA-G-TGA-AAAA
gi|48 : ---G---TGAGAAAC---C---T---------C-ATA-AG-T-G-TAA-CGTATGTGGA--AA-AGCCTTC-AGCC-----A-G---TC-CTCCAAC--CT-TAT--C----------A-CACA-C--AGTCGGA-AA-CAC---------A-CCG--GATTCAAG-CCATTTA-AGT-G-TG-A
gi|5 : -AAAT----A-----AA-----ATG-CCCTTTCGA------CG--TCTGTGG-GAAG---G----C-----ATTC---CG-TGAGACA--AGTAAGGT-A---AAG----ACACACA----TG-A----GGATA-C-A----TAC---T------GGTGA-----TGAA--CC-TCA---TAA-A-TGT--G-ACG-----TC-T-GTG-G--GAAG-GCA-TGCAGTGA--T-A---CA--AGTAG--C-TT---A--A-A--G-A-C----ACA-CA-T---GA-G---------------G-ATA----C-A----C-AC---------T----G---G---TGATAAAC---C---T---------T-ATA-AA-T-G-TGA-TGTCTGTGGG--AA-GGCATTC-AGTC-----G-G---GC-ATACAA---TT-TA---G--A---GAG-A-CATA-A--AA--GGA-TA-CATG-----TATA-GTAGTGAT--AAA-CCTTATA-ATT-G-TG-ATGCCTGCGAAAATA------CTTTCAG-CAAT--ATGGGATCA-TTATTTCG-CCTCATGAAG-A--AACATACTG-G-TAA-TAA-A-CCTT-A---TA-TATA-TGA-TGTC-TGTGGGAAA---ACATTTAGTGA--GACG-G-GA----CACTCACA---GACACATAT--A-AG---GATA-C---ATAC-------TGGTGATAAA-CCTTATAA--------TTCAA---------TAA-------------GA----CA-------G-GGAA-A-TTACAGAG-ACACAT--AGGGATACATACTG-G-TGA-TAAACCTT-TTGATTTATATATGTGATTTGTATTGGTAAGCGTTCATGTAAAGGACACGTCGAATG----TTT---TTA-AAC---TTG------T---TTTATTT-TTT--A--G------------------------------TTG-TATGCCT-----AGAT---TGA--C----T----ACAA-A---TG------TG-C----------AT-----------G--TA--------T-----------T---T--------------TGTT----T--TT--T-TTTT-AAAG--T-TTG--AAA-GCAATAAAATTC-AAAT-T---TTTTGT-G---A-T-T-AAA-T---AT-T--TT--T--CT--------TGGTA-T--TTTCTGCGTCATG--------------AT-GTG-----TGACG-TCA--TATA-T---GTGACCT---TT--GCGA-------T---A-A--AA---C---TGTTA--GCCA-TATTAT----AGA---A--AATTC-GAT----TTAATGG-AC--A-A----AA----A-GTC-AA--TTATCACGAT------AA-CAGCTCG-C--AG--ATGACA-TT-A-CG-TT-TGG-GTGC
gi|51 : ---------T-----------T---T--------------TGCT----C--AA--T-TTTG-AA----T-TTG--AAA-GCAAGGAATTTC-TAA------TTTTGT-G---A-TAC-GTA-T---t
gi|53 : ctaagtgaaataagtatcaagtgaagtaTTG-CATGCCT-----AAAT---TAA--CTT--T----T--A-A---TG------TG-T--------------------------T---------T-----------T---C--------------TG-TGAAAT--AT--T-TTGCGAA-A--TATTG--AAT-TC-ACGAAATTC-GAATC------TTGT-G---A-TAC-GCA-T---tagcatcagatag
gi|55 : cCTT-A---CAG----AGACACA----TA-A----GGACA-C-A----TAC---TATATGCAGTG-----ATTGA--TC-TTA---TAA-AATTT--G-ATG-----TC-T-tat
gi|56 : CACA----TG-A----GGACA-C-A----TAC---A------GGAGA----AC-GC--CC-GTA---C-A-AATGT--A-ACA-----CG-T-GCG-G--GAA--ACAGTTCGCTCA--GTA---CG--GGACA--C-Taggtatgaaaagtgttc
gi|57 : AAAGGACACATCGCATG----TTT---CTA-AAC---TTT------T---TGAATTT-TGC--A--GC-AAA-A---------------TTACTCCTTTG-TATGCCT-----AAAgta
gi|6 : AAGGACATATTGCATG----TTT---CTA-AAT---TGT------TAGATTTTTTT-TTT--A--AC-AAA-A---------------TTAGGTCTTTG-CATGACT-----AGAA---TGA--CTT--T----A--G-A---TG------TG-TTTTAAATGAAAT-----------A--T---------T-----------TTAAT--------------TACG----T--AG--T-TCTT-GA-G--T-TTG--AAA-G-------GTAC-AAATCTCAGTCTTGC-G---A-TAT-GCA-T---AT-TAATT--TTACTTA------TGATA-T--TTTATGTACGATG--------------AA-GTGTCGTCTGACA-TCA--TAT------GTGACCTAGAGT--AAGG-------TCTGA-A--AACAGC---TGTTA--GCCA-TTCTAT----AAATTTATTGATTA-GAT----TTAATTG-AC--A-A----AAT---A-GCC-CA--TAGCTATG-T------A------TTG-T--AG--ATAACT-TT-G-CA-TG-GGG-GTGC
gi|61 : ATGAG---GACA-C-ATACTGGTGA-G-AAACCA---T---A-T-A--A-tgtgcaccatttatgggtgcacatatactaagtgtcaaaagaagtgatgtatagactgaggtttttcaaatttttctaaagaaggtgtgaggaaaaagaagtgggtgatttttttgtcagcacattaaggacttggtcataacccctcccctctacagtcacctttgtccatgttctttttcaaaaaactattggacagagacccatttaactgtgaggaaatagttatgtagaagccaggcacagctaggcctacagtatatggattctgttctggtcgtcatcatttcacaaatactcactcgcaccttggaaataaaaacggacattgtaacagtatatacttgtgttcccagttcctgtaaacttgtagaattataaaaaaaaaaataaattaaagattgaaaataattgaactt
gi|7 : ACA--GGAAGCTT-A---CAG----GCACACA----TG-A----CAACA-C-A----CAC---T------GGTGA----A-AAC--CC-TTA---CAA-A-TGT--G-GTG-----TC-T-GTG-A--AAAA-GCA-TTCCCTCA--C-A---TA--AGTCC--T-TT---A--C-A--G-A-G----ACA-CA-T---AA-T---------------G-ATA----C-A----T-AC---------T----G---G---TGATAAAC---C---T---------T-ACA-AA-T-G-TGA-TATCTGTGGA--AA-GGCGTTC-ACTT-----ATA---AT-GGA-GA---CT-TG---C--G---TAG-A-CACACC--A---G---GA-CANN-----NNNN-NNNNNNNN--NNN-NNNNNNN-NNN-N-NN-NNNNNNNNNNNNNNN------NNNNNNN-NNNN--NNNNNNNNN-NNNNNNNN-NNNNNNNNNN-N--NN-NNNNNN-N-NNN-NNN-NNNNNNNN---NN-NNNN-NNG-TG---TGTGGGAGG---GCATTCAGTGA--GACA-G-GAGC--C--ATGCG---GAAGCACAT--G-AA---GATA-C---ATGC-------Ta
gi|7 : cattccctaacGTGT-GTG-GGAG-GGCATTCAGT--GA--G--ACAGGAGCCATGCG-GA--AGCACAT-GAA-GATACAT-GCT----NNN---NNNNNN-NNN-N-NNNN----N----NNN-----NNN-N------NN------NN--NNNNNNN-NNNN---N----N-----NNNN---NN-NNNNNNN--NNNNNNNN-N---NNN----NNNNNNN----NN-N----NNNNN-N-N----NNN---N------NNNNN----NNNNN--NN-NNN---NNN-NNNNN--N-NNGTGATGTC-T-GTG-G--AAAG-GCA-TTCAGCCG--T-A---C---GGGAA--CATT---A--A-A--G-A-G----ACA-CA-T---GA-nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngtgatgtctgtggaaaggcattcagccgtacgggaacattaaagagacacatgacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaaccatatcagtgtgatgtctgtgggaaggctttcaggcattcagtaacattatataagcata
gi|7 : cattccctaacacaggaagcttacaggcacacatgacaacacacactggtgaaaacccttacaaatgtggtgtctgtgaaaaagcattccctcacataagtcctttacagagacacataatgatacatactggtgataaaccttacaaatgtgatatctgtggaaaggcgttcacttataatggagacttgcgtagacacaccaggacannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn-G-TG-ATGTCTGTGGAAAGG------CATTCAG-CCGT--ACGGGAACA-TTAAAGAG-ACACATGAcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaaccatatcagtgtgatgtctgtgggaaggctttcaggcattcagtaacattatataagcata
gi|7 : cattccctaacacaggaagcttacaggcacacatgacaacacacactggtgaaaacccttacaaatgtggtgtctgtgaaaaagcattccctcacataagtcctttacagagacacataatgatacatactggtgataaaccttacaaatgtgatatctgtggaaaggcgttcacttataatggagacttgcgtagacacaccaggacannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngtgtgtgggagggcattcagtgagacaggagccatgcggaagcacatgaagatacatgctnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnAA-CCATATC-AGT-G-TG-ATGTCTGTGGGAAGG------CTTTCAG-GCAT--TCAGTAACA-TTATATAA-GCATAcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaaccatatcagtgtgatgtctgtgggaaggctttcaggcattcagtaacattatataagcata
gi|8 : cattccctaacacaggaagcttacaggcacacatgacaacacacactggtgaaaacccttacaaatgtggtgtctgtgaaaaagcattccctcacataagtcctttacagagacacataatgatacatactggtgataaaccttacaaatgtgatatctgtggaaaggcgttcacttataatggagacttgcgtagacacaccaggacannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngtgtgtgggagggcattcagtgagacaggagccatgcggaagcacatgaagatacatgctnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngtgatgtctgtggaaaggcattcagccgtacgggaacattaaagagacacatgacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn---------------TTACTTCTTT--TATGCCT-----AGAA---TGT--A----T----A--C-A---TGGATTT-TGAT----------AA-----------A--TA--------T-----------T---T--------------TGTT----T--GG--T-TTTA-AAAG--T-TTG--AAA-GCA-TGACATTT-AAATCT---T----C-G---A-TATTGCT-T---TT-T--CTCCT--CT--------CGGAA-T--TTTGCGCGCCATG--------------AT-CTT-----TGACATTCA--TATGTC---GT--CCT---TT--
gi|8 : g-A--AA---C---TGTTA--GCCA-TATCATTTCAAAA--T-----TTCCGAT----TTAATGGCAC--ATA----CA----A-GTC-AA--TCATCACGTT------AA-CAGTTTGTT--AG--ATAACA-CTAA-CG-TT-CAG-tacaacaccaaaaaaaaaaaaaacaaaaaaaaaaacaaactgttagccatatcatttcaaaatttccgatttaatggcacatacaagtcaatcatcacgttaacagtttgttagataacactaacgttcaggggtcggttacggatgtaatagctgtcaaataaggactgtaccgtgaacattgtcaacttttacgaaggaaggtgcgaggaaaaagacgagtattttgtcacacaggaccaataccataaaatcaaaacagtcgtttttgctccatgtactgttaaaaaagaaatgatattattagaaataaaggaaaaccaaacacaggtaggcagcgaccaggtttaacttgcgaggtgtttattttagaagcggatattcgcaactacatgcttacagtgttacattgccaagatatgacacaaaattacacacccgtacacactccctaagaatatgtactcagactcgcattctcattcctaccaaatcgcaaatacacaaatatatgaattaaagatttgaattgaagttgtatttacaataataaatatgtaa
gi|9 : gttacttcttttatgcctagaatgtatacatggattttgataaatattttgtttggttttaaaagtttgaaagcatgacatttaaatcttcgatattgctttttctcctctcggaattttgcgcgccatgatctttgacattcatatgtcgtccttttacaacaccaaaaaaaaaaaaaacaaaaaaaaaaacAAGGACATATCCCATG----TTT---CTA-AAC---TTT------A---TTAATTT-TTA--T--GC-AAA-A---------------TTACTTCTCTG-TATGCTT-----AAAA---TGA--C----T----A--C-A---GA------TA-T----------AT-----------T--T---------TAAATACATTAAT---T--------------CGCT----T--AG--T-TTTC-AA-GT-T-TTG--AAA-GCAATGAAATTCAAAATC------TGGC-A---A-TAT-GCA-T---AT-T--TT--T--CT--------CGGTA-T--TCTGCGCGCCATG--------------GT-GTG-----TGACG-TCA--TATA-C---G---CCT---TT--G-GAATG----T---A-AACAA---C---TCTCA--GGC--TA--AT----AAA--TA--GATTC-GA-----TTAATAG-AC--A-AG---AA----A-GGC-AA--TTAT-ACGTT------AA-CAGATTG-C--AA--AT-GCA-TT-A-CG-TTACGA-GTGggtcggttacggatgtaatagctgtcaaataaggactgtaccgtgaacattgtcaacttttacgaaggaaggtgcgaggaaaaagacgagtattttgtcacacaggaccaataccataaaatcaaaacagtcgtttttgctccatgtactgttaaaaaagaaatgatattattagaaataaaggaaaaccaaacacaggtaggcagcgaccaggtttaacttgcgaggtgtttattttagaagcggatattcgcaactacatgcttacagtgttacattgccaagatatgacacaaaattacacacccgtacacactccctaagaatatgtactcagactcgcattctcattcctaccaaatcgcaaatacacaaatatatgaattaaagatttgaattgaagttgtatttacaataataaatatgtaa
16 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|21 ): GCCAGAATAAGGGTGGTAGTCTAAGTTTTTTTCAGTTTTTTTTCCAAGGAAGGTACATACTGAAGGAAATGTTTTTTGACACCAAGGACTTTACCATAATTAAAACAGTCGCTTTTGTCCATGTGTTGTAAGAAAAAAAAATACACGTAATAAAATAATGAAACAACAACAGTTGGACAGCAACCCAGTCTAATAGCTAAAAAGTGTTTATATAGAAGTTAAACACGGCTAGGCCCACAGCGTAAATTGTGTCCAGGCCCAGGATCACCCGCTCAAACTGACCTACAAATAGCATAACAAATATTCAGGTTCGTGTATTAAAAATTTAATTGAATTATAAGATAATTATGCAAT
Unaligned ( gi|22 ): CCAGAATAAGGGTGGTAGTCTAAGTTTTTTCAGTTTTTTTTCCAAGGAAGGTACATACTGAAGGAAATGTTTGTTGACACAAGGACTTTACCATAATTAAAACAGTCGCTTTTGTCCATGTGTTGTAAGAAAAAAAAATACACGTAATAAAATAAATGAAAACAACAACAGTTGGACAGCAACCCAGTCTAATAGCTAAAAAGTGTTTATATAGAAGTTAAACACGGCTAGGCCCACAGCGTAAATTGTGTCCAGGCCCCAGGATCACCCGCTCCAACTGACCTACAAATAGCATAACAAATATTCAGGTTCGTGTATTAAAAATTTAATTGAATTATAAGATAATTATGCAAT
Unaligned ( gi|24 ): GTGTACTAATGTCAATTAGCGTGGTGAGCCCTGAGTTTTTGTCCAAGAAGGAAGGTTCGGAGAATTTGTTAGTCTGTCGCTTCAAGGACTTAACCATAAAAAAACATCGCGTTTTGTCTCTTTGTAACTGTTAAAAAAAAAAGGGGAGAAACATAAACAAGTGGACAGCGTAACCCCGATTATTGCGCGAGAAGTTTTAAAGTATAGAAAGCTATAAGACACGGCAGTTAGGTCTACAACGTTTATTTATGTCAGCCATTTCACGAATACACGCCCGCACTCAACTAGACCTACATAT
Unaligned ( gi|28 ): TATGTTCGGGTGGTGTGTGTCGGTTACGGGTGTACTAGCTGAGTTTTTCAACTTTTACGAAGGAAGGTGCGAGGAAATTTTTGTCGACACAAGGTCATTATTATAAATAAAACAGTCGCCTTTGTCCTTGTACTGTTAAAATATCAAAATAAAATAAAGGAAAACATAAACAGTTGGACAGCAACCCAGTTTAACTTTATATAGAAGCTAAACACAGCTAGGCCCACAGCGTATAGTGTCCAGGCCATTTCACGAAATACACAACAGTACCAACTGACGTACATAACATATAT
Unaligned ( gi|35 ): AATTTAGCTAATCGAAGTTACATCGGTTTATCGAAGCTACACATCAACATATTTCACTAAAACGTGTCATAATGGTAATTTCTGGCTGCTAGCCATTCCCTTTCGGGTATTAGTAAGGTCATTATGTCACGACTACCGTGCAAAATTCCCCAGGAGTTGGCGCACAGAAATTCAAGAGGTAAGGCGGAGT
Unaligned ( gi|37 ): ACAACAACAAATATCTCCTGACAGCTTCTGTGTTTCCATTTTCTCTAAGCCAAATCGCGCATCATTTATAAAAAAATTAATGAATACAATAATTAAAGATATCGAACTTCTTAATAAAAAATTACAAAAATGAAGAAATATGTAGATTTATATAATCTTTTATACTGTGGAACGACAGCGCTTCTTTA
Unaligned ( gi|42 ): AGGACATCTAGGCCTACAACATATGCATTAATATTCTGTTCTGGTCGTCGTCATTTCCCAAGATACATGTATATACTCGCACTTAGGAATTTAAACTAACTCCGTACCACTAACTAACAATTTATCTTGTGTTCCCACTTCCTACCAACAT
Unaligned ( gi|45 ): GTTATAATTTGTCATCAGAGATGTGTTCACCAACGTTGACAACACTAGAATTTAGACTGGAATGAAACACCCCATTGAAAATAGCCCTCCTCAGATGACTATTCTTTTCATCTACCCAACCAAT
Unaligned ( gi|46 ): AAAGATTGAACTTGTATTTACAAATAATAAATATGTAATTCCTCAGTAAACATTTCATTGATTTCACGCGGTTTAACCATGTCATCAATATGAGATGTGTATTGCCGTGCTCTCCGACGGCTT
Unaligned ( gi|49 ): GCAACCCAGCCTAGTTGCGAGAAAATGTTTTTATAGAAGCTAAACACGGCTTGGCGCACAGCGTAAATTCTCCAGGTCATTTCACGAAATACACACCCGC
Unaligned ( gi|50 ): AAAATGTCTTCCAATGTCATTTCTGGCTGCCAGTTCCTTCCCTTTTTCTGGTATTAATGAGGTCATCAATTACGTCACGACCACCGTGCAAGACT
Unaligned ( gi|52 ): GTATCTAATGCTCTGTTACGTTCGACATCATATGCGTCCTTGAGTGAGAAGGTTTGAAAACATTAGTTTTATAAATGGATTAAATTTAATCAAC
Unaligned ( gi|54 ): TGATCTTCCTCACTTCACGCAATACACACTCGCACTTTGGGAATAAAAGAACATGCACTTGTGCTCCCATTTTCTATCAACTATTAGA
Unaligned ( gi|58 ): TACAATATTAATGGGATTGAACTACTTCAAGGTTAAATCCATTTATCAAAGTAAA
Unaligned ( gi|59 ): GATGTGTATTGCCGTGCTCTCCGCCGGCTTCAGGC
Unaligned ( gi|60 ): AGAGTCATCTTATGTGACGTCACAAATTTTAGG
Alignments
lowQualScore : 1111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111
lowQualScore : 1 1111 111111111111111 1111 4444444444444444444444 4444444444444 111111 11111 111111 33333333333333333333333333333333333333333333333333333333333 1111111111111111111111 11111111111111111 1111111111111111111 1111111111 222222222222222222222222222 11111111 1111 2222222222222222222 11111 3333333 1111111 77777777777777777777777777777777777777777777777777777 1111111111111 222222222222222222222222222222 0000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 1111 33333333 11111111 11111111111111 5555555555555555555555555555555555555555 1111 11 1111
lowQualScore : 5 5 0 66 0000 555 1 888 888888888888888 3 1111 2 6 3 0 3 111 2222222222222222222222 3 0 888 3 3 6 0 3 4444 333 1 2 1111111111111 4444 1 77777 2 666666 000000 22 0 333 55555555 55555 6666 0 444 00000 22 2 4444 4444 1 4444 1 4444 2 1 4444 333 999999 999999 22 1 333 88888 44 5 44444 3 2 444 2 0 44 333 333 11111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 2 4444 2 4444 2 4444444444444444444444 1 55555555555555555 22 2 2 2 2 2 22 2 2 3 6666666666666666666 666 2 2222222222 2 2 888888888888888888888888888 2 33 2 0 2 2 2 2 2 3 77777777 4444 2222 1 88 555555 777777 0000000000000000000 4 0 33333 55 4 4 4 777 99 99 0 444 5555555 777 8888 777 8 777 3333333 5 77777777777777777777777777777777777777777777777777777 6 888 1 6 99 6 6 77 1 8 0 0 6 5 3 6666 444 2 444 0000000000000 2 222222222222222222222222222222 0 2 55555 333 33 4444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444 6666 22 55 2 2 0000 2 77 2 2 44444444 2 333 4 22 2 333 2 33 66 33 33333333 2 77 1 66666666666666 2 77777 5 33 1111111111111111111111111111111111111111 555 777 0 33 0 2 0 8888 999999 0 5 0000 2 66 2 8888 4444 2 2 33 1 777777 5 0 1 2 33 77 2 2 2 2 2 3
lowQualScore : . . . .. .... ... . ... ............... . .... . . . . . ... ...................... . . ... . . . . . .... ... . . ............. .... . ..... . ...... ...... .. . ... ........ ..... .... . ... ..... .. . .... .... . .... . .... . . .... ... ...... ...... .. . ... ..... .. . ..... . . ... . . .. ... ... ........................................................... . .... . .... . ...................... . ................. .. . . . . . .. . . . ................... ... . .......... . . ........................... . .. . . . . . . . . ........ .... .... . .. ...... ...... ................... . . ..... .. . . . ... .. .. . ... ....... ... .... ... . ... ....... . ..................................................... . ... . . .. . . .. . . . . . . . .... ... . ... ............. . .............................. . . ..... ... .. ................................................................................................. .... .. .. . . .... . .. . . ........ . ... . .. . ... . .. .. .. ........ . .. . .............. . ..... . .. ........................................ ... ... . .. . . . .... ...... . . .... . .. . .... .... . . .. . ...... . . . . .. .. . . . . . .
lowQualScore : 0 0 1 11 2222 555 6 000 999999999999999 3 1111 9 7 3 1 3 999 7777777777777777777777 3 2 222 7 3 7 4 1 7777 999 0 2 9999999999999 5555 0 44444 1 111111 333333 99 8 888 77777777 33333 9999 7 111 11111 66 1 2222 2222 0 0000 9 0000 0 9 0000 333 333333 444444 66 9 333 99999 33 5 55555 6 0 666 0 9 88 555 555 99999999999999999999999999999999999999999999999999999999999 1 5555 1 5555 1 2222222222222222222222 7 55555555555555555 55 0 0 0 0 0 88 0 2 5 1111111111111111111 999 5 5555555555 5 5 999999999999999999999999999 7 99 7 8 9 1 9 9 9 3 11111111 5555 8888 4 99 555555 222222 2222222222222222222 4 2 00000 22 4 4 4 888 22 55 7 666 7777777 000 4444 000 0 000 0000000 0 22222222222222222222222222222222222222222222222222222 7 333 0 7 22 7 7 77 4 0 8 6 0 0 2 1111 777 7 444 6666666666666 5 222222222222222222222222222222 4 2 66666 999 11 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 6666 99 88 1 1 4444 1 11 1 1 66666666 1 777 2 66 2 999 5 44 33 77 33333333 7 33 7 88888888888888 9 11111 7 99 4444444444444444444444444444444444444444 000 999 7 99 7 9 1 9999 222222 8 7 0000 9 44 9 9999 6666 9 9 99 1 777777 3 5 4 9 99 99 9 9 9 9 9 1
consensus : GAAAGGGCATTTTATCTGAAAAGCGGATACAGAGAAA--CACATGAG---GACA-C-ATACTGGTGA-N-AAACCT---T---A-T-A--A-TGT--G-ATGTCT-GTGGGAA-GACA-TTCAGT-C-G--C--ANGGG-N--A-C-T-TACG--GAGACACAT-GAG-GATACAT-ACT----GGT---GANAAA-CCT-A-AAAT----A----TAA-----ATG-T------GA------TG--TCTGTGG-GAAG---G----CA-----TTC---AGT-CGGANA--GGANACTT-A---AAG----ANACACA----TG-A----GGATA-C-A----TAC---T------GGTGA----ATAAA--CC-TTA---TAA-AATGT--G-ATG-----TCT-GTG-G--GAAG-GCATTCAGTCA--GA---CA--GGNAA--C-TT---A--A-A--G-A-C----A-A-CA-T---GA-T---------------G-ACA----C-A----T-AC---------T----G---G---TGANAAAC---C---T---------T-ATA-AA-T-G-TGA-TGTCTGTGGG--AA-GGCATTC-AGTC-----G-G---GC-ANACGA---CT-TA---C--A---GAG-A-CACA-C--A---GGA-GA-CACGC-----ATA-CTGGTGAT--AAA-CCTTATA-ANT-GT-G-ATGTCTGCGGGAAGG------CATTCAG-CNAT--ACGGGAACA-TTATNNAG-ACACATGAGG-A--AN-ATACTG-G-TGA-TAA-AACCTTNA---TG-AATG-TGA-TGTC-TGTGGGAAG---ACATTCAGTGA--GACG-G-GA----C--TTACA---GACACACAT--G-AG---GATA-C---ATAC-------TGGTGATAAA-CCTTATAA--------T-CAA---------TAA-------------GA----CA-------G-GGAA-A-TTACAGAG-ACACAT--GAGGATACATACTG-G-TGA-NAAACCTT-TTGATTTATATATGTGATTTGTATTGGTAAGCGTTCATGTAAAGGACACGTCGCATG----TTT---CTA-AAC---TTT------T---TTTATTT-TTT--A--GC-AAA-A---------------TTACTTCTTTG-TATGCCT-----AAAA---TGA--C----T----A--A-A---TG------TG-T----------AT-----------G--T---------T-----------T---T--------------TGCT----T--AG--T-TTTC-AA-G--T-TTG--AAA-GCAATGAAATTC-AAATCT---TTTTGC-G---A-TAT-GCA-T---AT-T--TT--T--CT--------CGGTA-T--TTTGCGCGCCATG--------------AT-GTG-----TGACG-TCA--TATA-C---GTGACCT---TT--GCGA-------T---A-A--AA---C---TGTTA--GCCA-TATTAT----AAA--TA--AATTC-GAT----TTAATGG-AC--A-A----AA----A-GGC-AA--TTATCACGTT------AA-CAGCTCG-C--AG--ATAACA-TT-A-CG-TT-CGG-GTGC
Reference ( family-1142 ) : GAAAGGGCATTTTATCTGAAAAGCGGATACAGAGAAA--CACATGAG---GACA-C-ATACTGGTGA-N-AAACCT---T---A-T-A--A-TGT--G-ATGTCT-GTGGGAA-GACA-TTCAGT-C-G--C--ANGGG-N--A-C-T-TACG--GAGACACAT-GAG-GATACAT-ACT----GGT---GANAAA-CCT-A-AAAT----A----TAA-----ATG-T------GA------TG--TCTGTGG-GAAG---G----CA-----TTC---AGT-CGGANA--GGANACTT-A---AAG----ANACACA----TG-A----GGATA-C-A----TAC---T------GGTGA----ATAAA--CC-TTA---TAA-AATGT--G-ATG-----TCT-GTG-G--GAAG-GCATTCAGTCA--GA---CA--GGNAA--C-TT---A--A-A--G-A-C----A-A-CA-T---GA-T---------------G-ACA----C-A----T-AC---------T----G---G---TGANAAAC---C---T---------T-ATA-AA-T-G-TGA-TGTCTGTGGG--AA-GGCATTC-AGTC-----G-G---GC-ANACGA---CT-TA---C--A---GAG-A-CACA-C--A---GGA-GA-CACGC-----ATA-CTGGTGAT--AAA-CCTTATA-ANT-GT-G-ATGTCTGCGGGAAGG------CATTCAG-CNAT--ACGGGAACA-TTATNNAG-ACACATGAGG-A--AN-ATACTG-G-TGA-TAA-AACCTTNA---TG-AATG-TGA-TGTC-TGTGGGAAG---ACATTCAGTGA--GACG-G-GA----C--TTACA---GACACACAT--G-AG---GATA-C---ATAC-------TGGTGATAAA-CCTTATAA--------T-CAA---------TAA-------------GA----CA-------G-GGAA-A-TTACAGAG-ACACAT--GAGGATACATACTG-G-TGA-NAAACCTT-TTGATTTATATATGTGATTTGTATTGGTAAGCGTTCATGTAAAGGACACGTCGCATG----TTT---CTA-AAC---TTT------T---TTTATTT-TTT--A--GC-AAA-A---------------TTACTTCTTTG-TATGCCT-----AAAA---TGA--C----T----A--A-A---TG------TG-T----------AT-----------G--T---------T-----------T---T--------------TGCT----T--AG--T-TTTC-AA-G--T-TTG--AAA-GCAATGAAATTC-AAATCT---TTTTGC-G---A-TAT-GCA-T---AT-T--TT--T--CT--------CGGTA-T--TTTGCGCGCCATG--------------AT-GTG-----TGACG-TCA--TATA-C---GTGACCT---TT--GCGA-------T---A-A--AA---C---TGTTA--GCCA-TATTAT----AAA--TA--AATTC-GAT----TTAATGG-AC--A-A----AA----A-GGC-AA--TTATCACGTT------AA-CAGCTCG-C--AG--ATAACA-TT-A-CG-TT-CGG-GTGC
gi|1 : GAAAGGGCATTTTATTTGAAAAGCGGATGCAGAGAAA--CACTTGAG---GACG-C-ATACTGGTGA-G-AGACCT---T---A-T-A--A-TGT--G-ACGTCT-GTGGGAA-GACA-TTCCAT-T-G--C--ATGTA-T--ATC-T-TAAA--GAACCAC-T-GAA-GATACAT-ACT----GGT---GATAAA-CCTCATAAATTCTCA----TAA-----ATG-T------GA------CG--TCTGTGG-GAAG---G----CA-----TTC---AGT-GAGAAA--AGATACGT-A---AAG----ACACATA----TG-A----AGATA-C-A----TAC---T------GGTGA----ATAAA--CC-TTA---TAA-AATGT--G-ACA-----TCT-GTG-G--GAAA-GCATTCAATCA--GA---CA--TGTAA--C-GT---A--A-A--G-A-C----A-A-CA-T---GA-T---------------G-ACA----C-A----T-AC---------T----G---G---TGATAAAC---C---T---------T-ATA-AA-T-G-TGA-TGTCTGTGGG--AA-GGCATTC-AGTC-----G-G---GC-ATACAA---TT-TA---G--A---GAG-A-CACA-A--A---GGA-GATCATGT-----ATA-GTAGT-AT--AAA-CCTTATA-ATT-GT-G-ATGCCTGCAAAAATA------CTTTCAG-CAAT--ATGGGATCA-TTATTTCG-CCACATGAAG-A--AA-ATACTG-G-TGG-TAA-AACCTTAA---TA-TATA-TGA-TGTC-CATGGGAAA---ACATTTAGTGA--GACG-GCGA----C--TCACA---GACACATAT--A-AC---GATA-C---ATAC-------TGGTGATAAA-CCTTATAA--------T-CAA---------TAA-------------GA----CA-------G-AGAA-A-TTACAGAG-ACACAT--GGGATTACATACTG-G-TGA-TAAACCTT-TTGATTTATATATGTGATT-GTATTGGTAAGCGTTCATGTAAAGGACACGTCGAAT-----TTT---TTA-AAC---TTG------T---TTTATTT-TTT--A--G------------------------------TTG-TATGCCT-----AGAT---TGA--C----T----A--A-A---TG------TG-C----------AT-----------G--T---------T-----------T---T--------------TGTT----T------T-TTTA-AAAG--T-TTG--AAA-GCA-TAAAATTC-AATTTT---TTTTGT-G---A-T-T-AAA-T---AT-T--TT--T--CT--------TGGTA-T--TTTCTGCGTCATG--------------AT-GTG-----TGACG-TCA--TATA-T---GTGACCT---TT--GCGA-------T---A-A--AA---C---TGTTA--GCCA-TATTAT----AGA---A--AATTC-GAT----TTAATGG-AC--A-A----AA----A-GTC-AA--TTATCACGAT------AA-CAGCTCG-C--AG--ATGACA-TT-A-CG-TT-TGG-GTGC
gi|10 : T--------CAGTA-T--TTTATGCGTCATG--------------AT-G-G-----TGACA-TCA--TGT------GTGTCCT---TT--GCGA-------T---A-A--AA---T---GGTTA--GCCA-TATTAT----AGG---A--AATTC-GAT----TTATTGG-AC--A-A----AAG---A-GAC-AA--TTATCACGTT------AA-CAGCTCG-C--AG--ATAACA-TT-A-CG-TT-CGG-ATG
gi|11 : ----GGT---GAAAAA-CA--A-AAAT----A----TCA-----ATG-T------GA------TG--T-TGTTT-TAAG---G----TA-----TTA---TCT-CGG-----GCTTACTT-A---AAC----AAACACA----AG-C----GGA-A-C-A----TAC---G------GGTGA----G-AAA--CC-ATA----AA-AATGT--G-ATG-----T-T-GTGTG--GAAG-GCATTCAGTCA--GT---CA--GGATA--T-TT---G--A-A--GTG-C------A-CA-T---GA-T---------------G-ACA----CTA----T-AC--------------G---G---TGATAAAC---T---T---------T--TA-AATT-G-TGA-TGTCTGTGGA--AA-GGCATTT-A-TT-----G-G---AA-AACCGA---C---G---C--A---GAGAA-AACA-C--A---TGA-Gtactagctgccagaataagggtggtagcctaaattttttcagcttttcgaaggaaggtgcgaagaaatgtttgtcgatacaaggaataaataaataaaactgtcgcttttgtccatgtgctgtaaaaacaatacatgtaataaataaaggaaaacaaaaacagttggacaacaacccagcctaattgctagaaggtgtatatataaaagctaaacacggctagactcatagcgtaaattgtgtccaggccatttcatgaaatacacatctgcaccaattgacctacatataacataataggatttaatacttcaaagttaaatcggtttatcaaagcaaaatatcaattattctccgaaaacgtaccagcgtactttccgggtgctaactaactttatagtggggacacttgcttacgtcacgtcacgtcacgcccaccgtgcaagcatccccagcagtgagcgcatagaaattcaaagaggtatgaggtgttgaattctt
gi|12 : ttattagttttataatcaatttttattacttatgtgtgcagatagcccattagaaacagattaaattcatcagaacaggtcaaggttataatttgtcatcagagatatgttcaccaacactgacaacacgaatttagattgaatgaaacatcccattgcgaatagccctcctcagatgactattcttttcatcaaccaaccaatagctgcctgtgaaacaagtatgtatatctacccaaccaatggctgtctctgaaacaagtatcttctacacaaatcaaagactagcacaaacggaaaatataacggactttgtgaaactgttgaagcagtctgtgaaacaagtaaaaactcaagatctgaaaaatgatttacaggagtgtataaacaaaaatggaTCCCATG----TTT---CTA-AAC---TTTACATAAT---TTTATT-----------C-AAACA---------------TTACTTCTCTGATATACCT-----AAAAATTTGA--C----T----A--C-AGACTG------T--T----------ATTTAAATAAATAA--T---------T-----------TG--T--------------CGCTC---T--AGGTT-TTTC-AA-G----TTG--AAACGCAATGAAA-TC-AAATC-------TGC-A---A-TAT--CA-TATGAT-T--TT--T--CTCAGCGCAACGGTATT--TTTGCGCGCCATGGGTGTGTTTTTGTTAT-TTG-----TGACG-TCAAGTATA-C---G---CCT---TT--G-GAATG----T---A-AACAA---C---TCTCAAGGCC--T-TTATC---AAA--TG--A--TCAGATCG--TTAATAG-ACTAA-A----AA----A-GGC-AAATTTATTA--TT------AATCAGATTC-C--AACTATAGCACTT-ATCGATT-CGA-GTG
gi|13 : aaccaggatcatatA--CACATGA------TA-C-ATAGTGGAGA-A-AAACTT---T---ACT-T--A-TGT--G-ATATTT-GTGGGAA-GACA-TTGTCT-C-G--C--AAAAC-A--A-A---TGCGAAAAGACACAT-GAG-GAAACAT-ACT----GGT---GATAAA-CCT------T----A----TAA-----ATG-T------GT------TG--TCTCTGG-AAAG---G----CA-----TTC---AGT-GAGAAA--GGAATCTT-A---CAG----AAACACA----AG-A----GGATA-C-A----TAC---T------GATG------------C--------TAA----GT--C-AC--------------G--GAAG-GCAACCAACCA--GA---AT--GATAG--A-GT---A--C-AGTG-A-C------A-CA-T---GA-T---------------T-ATA----T-A----T-AT---------T----G---A---TA-------------------------ATG-AA-T-G-TGA-TGTTTTCGGA--AA-GGTATTC-AATC-----A-G---ACAACAC-A---CT-TA---T--A---GAA-T-CACA-T------TAA-GG-CACGT---------TTGG---T--ACA-CCTGA----------A-ATACCTGTGGGA---------CA--------------GGAAAC--TTACAGAA-ACACATGAGG-AC-AT-AGAATG-G-TGACCAA-AACttatgttaattgctacgggttgtaattaatgctgtaacggaattaagggttggctagtcctgattattttgtcaactttttcgaaggaatgtctgcgaggaattagtcgacacaagacttaacctataaacataacagtcgccctttagtccagtcgtacttgttttaaaaaaataataaaattaaggaaaacataaacttagtgatgggaacagtgcaacccgtagtctgataattgcgatgggaggggttgtttatataga
gi|14 : aaggcatttaactcttcattgacattaacatAA---TGA--T----T----A--A-A---GGACACATTG-C----------AT-----------G--T---------T-----------T---T----------------CT----A--AACAT-TTTA-AA------TTGCTAAA-GCAA---AATT---AAT-T---ATTTGC-GTGCA-TAT-GCA-T---AT-T--TTC-T--CT--------CTGTA-T--TTAACGC-CCATT--------------AT-GTG-----TGACG-TCA--TAT------GCGACCT---TCGAGCGA-------G---G--------------GTTT--G--ATTTTTTT----CAA--CG--GATTA-AAT----TTAATCG-ACTTA-AAAATAA----A-TGT-AA--TCATCAC--------------GCTCG-T--AG--ACAACA-TT-A-CG-TT-CGG-ATGgtgtgttcctgcatagccaaactgacctagtattgtttctgcataactccttatcctatatattttgacaagctcagaaaa
gi|15 : C-AGACAA---TT-TA---C--A---GAG-A-CACA-A--AA--GGA-TA-CATGT-----ATA-GTAGTAAT--AAA-TCTTCTA-ATTCGT---ATGCCTTCGAGAATG------CATTCAG-CCAG--ATGGGATCA-TTATTTCG-ACATA------A--AG-ATAC-------A-TA-----CTTTA---TA-TATG-TGA-TGTC-CGTGGGAAA---ACATTTAGTGA--GACG-G-GA----CACTTACA---GACACATAC--A-AG---GATA-C---ATAC-------TGGTGATAAA-CCTGATAA--------TTCAA---------TAA-------------GA----CA-------G-GGAA-A-TTACAGAG-ACACAT--GAGGATACATATTG-G-TGA-GAAACGTTGTTGATTTATATATGTGATTTGTATGGGTAAGCGTTAATTTAAAAGACATGTAGCATG----TTT---TTA-AACATTTTT------T---TTTATTT-TT---A--G------------------------------TTG-TATGCCT-----AGAA---TGA--C----TAC--A--A-A---TG------TA-A----------AT-----------G--TA--------T-----------T---TTGAATAAATCATTATGCT----T--TG--G-TGTT-AA-G--T-TTT--AAA-GCAATCAATTTC-AAA------TTTTAC-G---ATTAA-ATA-T---AT-T--Tttatagtatcgacacaacgggcgcattagctgtcagaagctttgtgtttgttttagttttttcgaaagaaggtgcgaaggaaaagaccagtaatttttagttggcacagggtctttgtcgtaaaaaatccacacaaatcagtcacgtttgattatgtacctttttagaaaaagaagaaaaaaaaaggggggggggcaaaacggttgcaaagcgactcagtttaactacgagaaattggtcatatg
gi|16 : GT--G-A-G-----ACT-GTA-G----AG-GCTGTCTGTGA--AA---CA--AGTAAAAC-T----A--A-A--G-A-CCAGGA-A-AA-T---GA-T---------------TTACA----C-GAATGT-ACAAACACAAAT----G---GAGGTGAAAAAC---AAAGT---------T-ATC-AG-T-G-TCA-TCTTTGTTGG--AA-GGCATTT-ACTC-----
gi|16 : ttattagtattataattatttttattatttttcttgcagaaatcccattagaaacatattaggttaatcagaaacatgtcaatgttttaaattggcatcacagatgtgttcactatcactgacaacactagaatttagactgtaatgcaacatccaattggaaatagccctcctcgtatggctattcttttcacccaactaaccaatggctgactgtgaaacaagtatgtctatctacccaaccaatggctgcctgtgaaacaagaatgtcttctacacaatcaagggctagcacaaacggaaaatacaacggactta----GGT---GAAAAA-C---A-AAGTT---A----TCA-----GTG-T------CA------TC--TTTGTTG-GAAG---G----CA-----TTT---ACT-C
gi|17 : ttattagtattataattatttttattatttttcttgcagaaatcccattagaaacatattaggttaatcagaaacatgtcaatgttttaaattggcatcacagatgtgttcactatcactgacaacactagaatttagactgtaatgcaacatccaattggaaatagccctcctcgtatggctattcttttcacccaactaaccaatggctgactgtgaaacaagtatgtctatctacccaaccaatggctgcctgtgaaacaagaatgtcttctacacaatcaagggctagcacaaacggaaaatacaacggacttagtgagactgtagaggctgtctgtgaaacaagtaaaactaaagaccaggaaaatgatttacacgaatgtacaaacacaaatgga----GGT---GAAAAA-C---A-AAAT----A----TCA-----ATG-T------GA------TG--TTTTT----AAG---G----TA-----T
gi|18 : attattaagttttataatcatttttattacttatgttgcgtagcccaattagaaacagattaaattcatcaggaacaggtcaaggtataaattgttcatcagagatatgttcaccaacactgacacactagaatttagattgaatgaaacatcccattgcacgaatagccctcctcagatgactttctttcatctacaaccaatagctgcctgtgaaacaagtatgtatatctacccaaccaatggctgtctctgaaacaagtatgtcttctacacaatcaagactagcacaaacggaaaatataacggactttgttgaaactgttgaagcagtctgtgaaacaagtaaaaactcaagatctgaaaaatgatttacaggagtgtataaacaaaaatgga----GGT---GAAAAA-C---A-AAAT----A----TCA-----ATG-T------GA------TG--TTTTT----AAG---G----TA-----TTA---TCT-CGGCT------TACTT-A---AAC----AAACACA----AG-C----GGATA-C-A----TAC---G------GGTGA----GAAAA--CC-ATA---T-A-AATGT--GCATG-----TTT-GTG-G--GAAG-GCATTCAGTCA--GT---CA--GG-AA--T-TT---G--A-A--G-G-C------A-CA-T---G--T---------------G-ACA----C-A----T-AC---------T----G---G---TGAATAAC---C---T---------T--TA-AA-T-G-TGA-TGTCTGTGGA--AA-GG-ATTG-TATT-----T-G---AA-AACCGA---C---G---C--A---GAG-A-AACA-C--A---TGA-GG--AC-C-----ATA-CTTGTGAG--AGA-CC--ATA-A
gi|19 : agcacaaacggaaaatataacggactttgttgaaactgttgaagcagtctgtgaaacaagtaaaaactcaagatctgaaaaatgatttacaggagtgtataaacaaaaatgga-AATG-TGT-TGTTGTGTGGGTAG---GC-TTCAGCGA--GACA-G-GAAGATT--TTACA---G-CACACA-----AGTTTGACAAC---ATCT-------TGGTGATAAA-CC-TATAAATGTGATGT-CTG---------CGG-------------GAGGTTCAGTCGTATG-GGAACA-TTAAGGGG-ACATAA--GAGTAT-CAT-CTG-A-TGATAAAACCAT-ATAATGTAAATGTTTGaa
gi|19 : AG--CACACAAGTTTGACAAC-ATCTTGGTGA-T-AAACCTA--T---A---A--A-TGT--G-ATGTCT-GCGGGAG-G----TTCAGT-C-G--T--ATGGG-A--A-CAT-TAAG--GGGACATAA-GAG-TAT-CAT--CT----GAT---GATAAAACC------AT----A----TAA------TG-T------AAA-----TG--TTTGTGG-GAAAAAAG----CA-----TTC---AAT-TGGAGACAGAACATTTTA---AAA----AGACACA----AG-A----TGATA-CCA----TAC---T------GGTGT----TTAAA--CCCTTA---TAA-A-TGT--G-ATG-----TGT-GTG-G--GAAG-GCATTCCGTGA--GA---AA--GGACA--T-TTTAAA--A-A--G-A-C----A-A-GA-T------T---------------G-ATA----C------T-AC---------T----G---G---TG-TAAAC---C---T---------TAATA-AA-T---TGA-TGTGTGTGGGGAAA-AGCATTC-tgggaaaaaagcattcaattggagacagaacattttaaaaagacacaagatgataccatactggtgtttaaacccttataaatgtgatgtgtgtgggaaggcattccgtgagaaaggacattttaaaaagacaagattgatactactggtgtaaaccttaataaattgatgtgtgtggggaaaagcattc
gi|2 : aatgtgttgttgtgtgggtaggcttcagcgagacaggaagattttacA-C-AGACTT---C---A-T-ACAA-TGT--ATATTTTT-GTGGGAATAACA-TATAGT-T-G--TGTAAAGG-T--G-CGT-TATGT-GATACACAC-GTGCGAT-TAT-ACT----GTG---GAGA----CT------T----C----TGAC----ATG-T------GA------TA--GTTATGT-GAAA---T----CACTTGATTA---AGTTCAGACA--GGAGATTT-A---A-G----AGACACA----GG-A----GGATA-C-A----TA----T------GGTGA----AGAAA--TC-TTC---CAATAATGTTGG-ATG-----TCTTGCG-A--AAAG-G-ATTCAGTGC--GT---AA--GGGAT--CATT---A-----------C----A-A-T--C---GA-A---------------G-ACA----C-A----A-AC---------TTCAAG---G---TGATAAAC---A---TAGAAATAACT-GTA-AG-G-G-TGA-AATTTATGAG----------TC-TGTC-----G-T---G--AAGCGATTTCT-TAGTGCGAA---GGG-ATCATA-C--A---AAA-CA-TATGAGGATAATA-CTGGTAAT--AAC-CCTTATATAAT-GTTGTATGTCTTGTGGAAGA------CATTCAC-TGACTGAGAGGAAC--TTATTAAC-ACACATGAGG-A--A--ATACTG-G-TGA--AA-AACCTTT----TA-AATG-TGATTGTC-TGTGAGAAG----C-TTCAGTCATCGA-G-G-GAC---C--TTACAGAGGAGACACAT--GAAG---GAAATC---ATAC-------TGGTGAGAGACCCTTATAA--------T-TGAATGTCTGGGTAAAAGATGTTTTATTGA----CA-------ATAGAA-ACCTATAGAGCACACATTAGACAACACATAATGCGTTGA-AAGACCAT-T--ATGTA-ATGT-TGATTT
gi|2 : agccttagttcaagatatgtctttacgccactgtatttgattaagaaaacgtgatAGAGA--CACAGGAG---GATA-C-ATA-TGGTGA-AGAAATCT---TCCAA-T-A--A-TGTTGG-ATGTCTTGCGAAAA-GG-A-TTCAGTGC-G--T--AAGGG-A--T-CAT-TACA---------ATCGAA-GACACAA-ACTTCAAGGT---GATAAA-CAT-AGAAAT----AACTGTAA-----GGG-T------GAAATTTATGAGTCTGTCGTGAAG---C----GA-----TTTCTTAGT-GCGAAG--GGAT-CAT-A---CA-----AAACATA----TG-A----GGATA---A----TAC---T------GGT-A----ATAAC--CC-TTA---TAT-AATGTT-GTATG-----TCTTGTG-G---AAG-ACATTCACTGACTGA---GA--GG-AA--C-TT---ATTA-A--C-A-C----A---CA-T---GA-G---------------G-A-A------A----T-AC---------T----G---G---TGAAAAAC---C---T---------T-TTA-AA-T-G-TGATTGTCTGTGAG--AA--GC-TTC-AGTCATCGAG-G---G----AC-----CT-TA---C--AGAGGAG-A-CACA-TGAA---GGA-AA-T---C-----ATA-CTGGTGAG--AGACCCTTATA-ATT-G--A-ATGTCTGGGTAAAAGATGTTTTATTGA--CAAT--A--GAAAC--CTATAGAGCACACATTAGACAACAC-ATAATGCGTTGA--AA-GACCATTA---TGTAATGTTGA-T-TT-TGTGGG-AG---ACA-TCAATTAT-TATA-C-AA----CCGTAAAA---AACTCACATTGA-AG---GATA-CCAAAT-C-------TAGTGAC-AG-CCTTATtgtgggagacatcaattattatacaaccgtaaaaaactcacattgaaggataccaaatctagtgacagccttatcagtgtgatgcttgttcgaaacattcagtcagtagagaagacttactgtgtcacaaagataagacatcaacagtgaatgtagtgtctgtggaaagtgtacaccgatgggtcgcagacttagaagcaccatgggacacatac
gi|2 : agccttagttcaagatatgtctttacgccactgtatttgattaagaaaacgtgatacagacttcatacaatgtatatttttgtgggaataacatatagttgtgtaaaggtgcgttatgtgatacacacgtgcgattatactgtggagacttctgacatgtgatagttatgtgaaatcacttgattaagttcagacaggagatttaATACA---AAA--CATATGAG---GATA---ATACTGGTAA-T-AACCCT---T---A-T-ATAA-TGTT-GTATGTCTTGTGG-AA-GACA-TTCACT-G-A--CTGAGAGG-A--A-C-T-TATT--AACACACAT-GAG-GA-A-AT-ACT----GGT---GAAAAA-CCT------T----T----TAA-----ATG-T------GAT-----TG--TCTGTGA-GAA----G----C------TTC---AGT-CATCGA--GGGACCTT-ACAGAGG----AGACACA----TGAA----GGAAATC-A----TAC---T------GGTGA----GAGAC--CC-TTA---T---AAT-T--GAATG-----TCT-G-G-GTAAAAG-ATGTTTTATT---GA---CAATAGAAA--C-CT---A--T-A--G-AGC----ACA-CA-TTA-GA-C---------------A-ACA----C-A----T-AA---------T----GC--GT--TGAAAGAC---CA--T---------T-ATGTAA-T-GTTGA-T-TTTGTGGG---A-GACA-TC-AATT-------A---TT-ATACAA---CCGTA------A---AAA-A-CTCA-C--ATT-GAAGGA-TAC-C-----AAATCTAGTGAC---AG-CCTTATC-AGT-GT-G-ATGCTTGTTCGAA-A------CATTCAGTCAGT--A-GAGAAGACTTACTGTG-TCACA------A--A------------GA-TAA-GACATCAACAGTG-AATG-TAG-TGTC-TGTGGAAAGTGTACA-CCGATGG--GTCGCA-GA----C--TTAGA---AGCAC-CAT--G--G---GACA-C---ATAC-------cagtgtgatgcttgttcgaaacattcagtcagtagagaagacttactgtgtcacaaagataagacatcaacagtgaatgtagtgtctgtggaaagtgtacaccgatgggtcgcagacttagaagcaccatgggacacatac
gi|20 : agccttagttcaagatatgtctttacgccactgtatttgattaagaaaacgtgatacagacttcatacaatgtatatttttgtgggaataacatatagttgtgtaaaggtgcgttatgtgatacacacgtgcgattatactgtggagacttctgacatgtgatagttatgtgaaatcacttgattaagttcagacaggagatttaagagacacaggaggatacatatggtgaagaaatcttccaataatgttggatgtcttgcgaaaaggattcagtgcgtaagggatcattacaatcgaagacacaaacttcaaggtgataaacatagaaataactgtaagggtgaaatttatgagtctgtcgtgaagcgatttcttagtgcgaagggatc-----G-G---GC-A----A---CT-TA---C--A---GAG-A-CACA--------GTA-----ACAC-----ACA-CTGGTGAC--AAA-TCTTACC-AAT-GT-G-ATGTTTGTTGGAAGA------CATTCAG-TTAT--TCAGGATCA-TTGCAAAA-GCAC---AGA-A--AG-ACAC-------A-TAATAATCCTAA---TG-AATT-TGA-AATT-TGTCGGA-----ACA--------------------------TTACA---GACACACAT--G-AG---AATA-C---ACAC-------TGGTAATAAA-CC
gi|20 : ttatttcgaaTACAGAGA----CACAGTA-----ACA-C-ACACTGGTGA-C-AAATCT---T---A-CCA--A-TGT--G-ATGTTT-GTTGGAA-GACA-TTCAGT-T-ATTC--AGGAT-C--A---T-TGCA--AAAGCACAG-AAA-GACACAT-A-------------ATAAT-CCT-A---------A----TGA-----ATT-T------GA------AA--TTTGTCG-GAA---------CA-----TT--------------------AC--------AG----ACACACA----TG-A----GAATA-C-A----CAC---T------GGT-A----ATAAA--CC-AGA---T-A-TATGA--G-ATA-----TTA-ATG-T--TAAC-GCATTAAGCCA--GA---CA----TAA--C------A--G-A--G-A-C----ATT-CAGT---GA-----------------G-ACGGGATC-A----T------------T----A--------GAAAAAC------------------------A-T-A-TGA-AGAC---GCA--AATGGCATTCGACTC-----G-A---A--AGTCCA---CT-TA---C--A---AAT-A-CACA-C-------GATAA-CACTC-------A-CTGGTGAT--AAT-ATTTA-A-AAG-GT-G-ATATATGTGagatatatgagatattaatgttaacgcattaagccagacataacagagacattcagtgagacgggatcattagaaaaacatatgaagacgcaaatggcattcgactcgaaagtccacttacaaatacacacgataacactcactggtgataatatttaaaaggtgatatatgtg
gi|23 : ttatttcgaagggcaactT---TTA-AAC---TTT------T------ATTT-TTA--A--AG-AAA-AAACTTGCTTTGTGTGCTACTTCTTTG-TGTGCCTCCCCTAAAA---TGA--C----T----ATAA-A---TG-------G-T----------AT-----------T--TGAATTATTAT-----------T---T--------------TGCT----T--AG--T-TTTC-AA-G--T-TTGA-AAA-GCAATTAAATTC-AAATCC---TT---C-A---A-TAT-GCA-G---AT-T--TT--T---T--------CGGTA----TTTGCTGTCCATG--------------AT-GAG-----T-ACG-TCA--TATGCC---GT--CCT---TC--GCGA-------G---A-A--AA---CAATTGTTA--GCCA--ATCAT----GAA--CA--AGATC-GA-----TTAATGG-AA--A-A----AA----AGGGCAAA--ATATCACATTACCGTAAA-CAGCTTG-C--AGTTATAACA-TT-A-CG-TT-CGG-
gi|25 : catcgATG----TTT---TCA-AAC---TTT------T---TT-ATTT-GTC--AT-GC-AAA-A---------------TCACTTCTTTG-TATGCCT-----AAAA---TGA--C----TAC--A--A-A---TG------TA-TTTTGAATAA-AT-----------T--A---------T-----------T---T--------------TGCT----T--AG--T-TTTC-AA-G--T-TTG--AAA-GCAATGAAATTC-AAATC------TTGC-A---A-TAT-GCA-T---AT-T--TT--T--CT--------CGGTA-T--TCTGCGCGCCATG--------------GT-GTG-----TGACG-TCA--TACA-C---G---CC---------CGAATGAATGT---A-AACAA---G---TCTCA--GACA-TATTAT----AAA--TA--AATAC-GAT----TTAATGG-ACA-A-A----AA----A-GGC-AA--TAATCACGTT------AA-CAGAATG-C--AG--ATAACA-TT-A-CG-TT-TGGTGTGtgttgaacattgtgtcattcggtgtgatagctgtcagag
gi|26 : CATG----TTT---CTA-TAC---TTT------A---AGTAATT-TTT--AT-GC-AAA-T---------------ATACTTCTCTG--GTAACT-----AAAA---TGA--C----T----A--ACA---GA------TG-T----------AT--------------T---------C-----------T---TAAATTA--------TGCT----T--AG--T-TTTC-AA-G--T-TTG--AAA-GCAATGAAAATC-AAATCT---G---GC-A---A-TAT-GCA-T---AT-T--TT--T--CT--------CGGTA-T--TTTGCGCGCCATG--------------GT-GTG-----TGACG-TCA--TATA-C---G---CCT---TT--G-GAATG----T---A-AACAA---C---TCTCA--GGCC-TATTAT----AAA--TA--GATTC-GAT----TTAATAG-ACA-A-A----AA----A-GGC-AA--TTATTA--TT------AA-CAGATTC-C--AA--ATAGCA-TT-A-CG-TT-CGA-GTG
gi|27 : agttatcACAT-ACT----GGT---AATAAA-CCT------T----A----TAA-----ATG-T------AA------TG--TCTGTGG-GACG---G----CA-----TTT---ATC-CAGAAT--GGAAACTT-A---AAA----GCACACA----TG-A----GGACA-C-A----TAC---T------GGTGA-----TAAG--CC-TTA---TAA-A-TGT--G-ATG-----TCT-GTG-G--GAAG-GCATTCAGTCA--AA---CA--GGAAT--C-TT---AC-ACA--G-A-C----A---TA-T---GA-G---------------G-ATA----C-A----T-AC---------T----G---G---TGAGAAAC---C---T---------T-ATA-AA-T-G-TGA-GGTCTGTGGA--AA-GGTGTTT-AGCT-----G-G---GC-AGGAGA---CT-TA---C--AT--G-----CACA-C--A---TGA-GA--ACAC-----ATA-CTGGTAAC--AAA-CCATATA-AAT-GT-G-ATATATGTGGGAt
gi|29 : cATCTGAAAAATG-ATTTACAGGAA--TGTATAAA---CAAA-A-ATGGAGGTGA-A-AAACAAAAAT---A-TGA--A-TGC--G-ATGTTT-GTTTTAA-GGTA-TTAACT-C-G--------GG-CTTA-C-T-TGAG--CAGACACAT-GAG-GATACAT-ACT----GGT---GAGAAA-CC------GT----A----TAA-----ATG-T------GA------TG--TTTGTGG-GAAG---A----CA-----TTC---AGT-CAGACA--GGATATTT-G---AAG----GTACACA----TG-A----
gi|29 : aaactcaag----GGT---GAAAAA-CA--A-AAAT----A----TGA-----ATG-C------GA------TG--TTTGTTT-TAAG---G----TA-----TTA---ACT-CGG-----GCTTACTT-G---AGC----AGACACA----TG-A----GGATA-C-A----TAC---T------GGTGA----G-AAA--CC-GTA---TAA-A-TGT--G-ATG-----TTT-GTG-G--GAAG-ACATTCAGTCA--GA---CA--GGATA--T-TT---G--A-A--G-G-T----ACA-CA-T---GA-TTNNNNNNNNNNNNNNN-NNN----N-A----A-ACAAAAA----T----GGAGG---TGAAAAACAAAA---A---------T-ATG-AA-T-G-CGA-TGTTTGTTTT--AA-GGTATTA-ACTC-----G-G---Gttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaaacaaaaatggaggtgaaaaacaaaaatatgaatgcgatgtttgttttaaggtattaactcggg
gi|3 : aaactcaagatctgaaaaatgatttacaggaatgtataaacaaaaatggaATG----TTT----TATAAC---TTT------T---T--ATTT-GTC--AT-GCCAAA-A---------------TCACTTCTTTG-ATTGCCT-----AAAA---TGA--TA---C----A--A-A---TG------TA-TTTTGA-----AT-----------AAAT---------TATG--------T---T--------------TGCT----T--A---T-TTTC-AA-G--T-TTG--AA--GCAATGAAATTC-AAATCT---T---GC-A---A-TAT-GCA-T---AT-T--TT--T--CT--------CGGTA-T--TCT--GCGCCATG--------------GT-GTG-----TGACGTTCA--TACG-CCCAATGAA------T--GTAA-----------A-C--AA---C---TCTCA--GGCA-TACTAT----AAA--TA--GATAC-GAT----TTAATGG-ACA-A-A----AA----A-GGC-AA--TTATCACGTT------AA-CAGTTTG-C--AG--ATAACA-TT-A-CG-TT-CGG-GTG
gi|30 : ctcctaCA--GAGACACAT-GAACAATACATTACT----GGTTTTGATATA-TCC-T-CATT----A----TAACTGATATGAT------GA------TG--TCTATGG-GAAT---T----AG-----TTG---AGT-AGGGCA--GGATCATT-G---AGG----ATATACAAATCTG-ATAAAGGGTA-T-ACTTTTACACATA-----GGTGC----ATAAAAGCC-TTAATATAGGAATGT----ATG-----TCT-GTT-G--GAAGTGC-CTCAATCA--CAAACCA--CGAA-----TT---A--C-AC-A-A-C----A-ATCA-T----A-G---------------G-GCA----C-A----TTAC---------T----GT--A---TGATAAAG---C---CAA-------T-ATA-AA-T-G-TAA-TGTGGTTGGG--AA-GGAGTTT-AATttgtgtgtcggttacgggtgtactagatgtcagaattagggtagtagcctaagtttttttttcaactttttcgaaggaaggttcgaggaaattttgtgtcgactcaaggactttaccataaataaaacagtcgattttctctttgtactgctaaaaaaataaaggaaaacataaacagttcgacagcaaccccgattaattgcgcgagaaggtgtttatatagacgctattgacacggattaagtctacaacgtttatttatgtacaggccatttcacgaaatacacgctcgcactcaaactgacctacataatagcacaacaacaaatactcctgaaggttcgtgttcccatttcctaccaaatcgcacatttaaaaaaaaaaaataacattacaataattaaagatcgaacttgtgtaaaaattacaaataagaaaatatgtagttcctcagtaaacatttataattttttcgtggacgcgcttttaaccatgacatgagatgtgtattgctgacaatgctctccggcattaccttgc
gi|31 : AC---ATT------T---CGTGTTTGTTT--AAAGC-AAA-A---------------TTACTTCTTTG-TATGCCT-----ATAC---TGAGTT----T----A--A-A---TA------TG-TTTTGAATAAAAT-----------G--T---------T-----------T---T---------------GCT----T--AG--T-TTTT-AA-G--T-CTG--AAA-GCAATGAAATTC-GAATC------TTGT-G---A-TAT--CA-T---AT-T--TG--T--CT--------CGGTA-TAGTATACGTTCCGTG--------------AT-GTG-----TGTCG-TCA--TAT------GCGATCT---TT--GCAA-------G---A-AACAA---CT--TGTTA--GCCA-TTTTAT----AAA--CA--AACTT-CATTTAATTAATCG-AC--A-A----AAC---A-GGC-AA--TTATCACGTT------AA-CAGCT
gi|32 : -AAAGCT---T---A-T-A--AATGT--G-ATTTTT-GTGGGAA-AACT-TTGAGT-T-G--T--AAAGC-T--G-CGT-TACT--GATACACAC-GAG-GATCCAT-ACT----GGT---GAGAGA-CCT------C----A----TGA-----ATG-T------GG------TG--TTTGTGG-GAAG---A----CA-----TTC---AAT-CAGACA--GGAGACTT-A---CAG----AGACACA----GG-A----GGATA-C-A----TAC---T------GGTGA----A-AAA--CC-TTA---T-A-AATGT--G-ATG-----TCT-GTG-G--AAAG-GCATTCAGTGC--GA----A--GGAAA--CATTAC-A--A-A--A-A-C------A-CG-T---GA-G---------------G-ATA----C-A----T-AC---------T----G---G---
gi|33 : ACAGACAAATGCACATGAA---GACA-CAAAACTGGTGATA-AAACC------------A--A--------ATGAAT-GTGGGAA-AGC--TT--------------------------T-GATG--GAAAC------AA-GCTAGAT-ACT----GGT---GATAAA-CCT----------------------------T------GA------TA--TCTTTTG-CAAG---GTGTACA-----TCC---GGT-CAGATC--GATGACTT-C---TAGTTCTAAACACG----TG-A----AGATA-C------TGT---TC-----AGTGATCTTACAAG--TC-CTA---T-A-AATGT--G-GTG-----CCT-GT
gi|34 : gaAAAC---C---T---------T-ATA-AA-TAG-TGT-GGTTTGTGGG--AA-Gtaacaag
gi|36 : agtgtaaacagaaaaagtaatgaatgtagtgaacttaggaaacctgtttgtgaaataattcaactaaagatcagaaaaatgatttacagagaacgggtgaaagatattggagtaaaaacatgttttcactgtgatgatagatatgcacaaaaggcgcaaagaacttcaagaCA----TA-A----GGACA-C-A----TAT---T------GATGA-----TAAA--CC-TT-----------GT--T-ATT-----TCT-GTG-G--GAAG-GCA----ATCA--GA---CG---------C-T---------A--G-A-C------------------T---------------T-ACA----C-A----T-AA---------C----A---G---TGATAGAC---C---C---------T-ACA-AG-T-G-TA---GTTTGTAGA--AA-GCCATTA-GGTC-----G-GACAGC-ACACCA---AT-TA---C--A---AAG-T-CACA-C--A---AG--GA-CACAT-----AAA-CTG--GAT--AAA-aacatcaat
gi|38 : ----ATACATA----TT-A----GAAGA-C-A----TGC---T------GGTGA-----TAAA--CC-TTT---TAA-A-TGT--G-ATA-----TAT-GTG-G--AAAG-GCATTT-GTCTT-GA---AA--GTAGA--A-TT---A--A-A--A-G-C----A---CA-TTTTG--T---------------G-ACT----C-A----C-AC---------T----G---G---TGAAAAAC---C---A---------T-TTC-AA-T-G-TGG-TGTCTGTGGG--AA-GGTATtggagatatgtgagagaggaa
gi|39 : gagaatatctgcgt-A----CAC---T------GGTGA-----CAAA--CC-AT----TCA-AATGC--G-AGA-----TCT-GTG-G--ACGG-GCCTTCCGACA--AC---CA--GGCAA--T-TT---G--A-C--G---C----G-T-CA-TC--GACT---------------G-ACC----C-A----C-AC---------C----A---C---AGTCAAAC---C---T---------T-ACG-TC-T-G-CCC-AACCTGCAAC--AA-AGCATTC-AACC-----G-G---GC-CTCCAA---CT-TA---C-------AC-A-CGCA-C--A---TGC-G--CACTC-----ACA-Catggtctaaaagttgtgttaaaga
gi|4 : ----TTT---C-A-AAC---TTT------T---TT-ATTT-GTC--ACTGC-AAA-A---------------ATCATTCTTTG-TATGCTA-----AAAA---TGA--C----TTACGA--A-A---TG------TA-TTTTGAATAA-AT-----------T--A---------T-----------T---T--------------TGCT----T--AG--T-TTTC-AA-G--T-TTG--AAA-GATATGAAATTC-AAA-------TTTGC-A---ATTAG-CCA-T---TTCT--TC--T--CT--------CGGTA-TTGTCTGCGCGCCATG--------------GTGGTG-----TGACG-TCA--TAT--C---ACGCCCTAG-TT----AA-------T---GTA--CA---C---TTCTA--GCCA-TAT--------AA--TA--A--TT-GAT----TT-ATGG-AC--A-G----AAACAGA-GAC-AC--TTATCA-GTT------AATCAGCTTG-CAAAG--ATAACA-TT-A-CG-TT-CG
gi|40 : ATCACATT------AA-CAGCTTG-C--AG--ATAACA-TT-A-CT-TT-TGG-GTGccctcttgtgttgtcattagcggatgtactacttgtcagaatagggtggtcctgagtagtcaactttttcgcaggaaggacgaggaaactttttgtgtcgactcaaggactttacgcataaataaaacaagtccgtttggtctttgtctgttaaaaaaaaataaaggaaaaagacagttggacagcaccccagattaatgcgcgaggaaaggttgtttttatatagaagctagacacagattaggtctacaagcgttttatatgtcagcctttcacgaaatacacgctcgcctcaactgacctacatcaatagcataattgttacaacaaatacttcaagttcctgttcccatttcctaccaaatgaaatgataataatacaatagttaaagattgaactgtataaaaatacaaaaagaaatatgtaagtccttcagtaagccatttgtataaatatatattttcgtcgacgcgcttttaaccatgacatgagatgtggtattgctgacaatgctctctctccggcattatttgc
gi|41 : TG----TTT---CTA-AAC-----G------T---TATAATT-TTTAAA--GC-AAA-A---------------CTACTTCTCAG-TATGCCT-----AAAA---TGG--C----TTA--A--A-A---TG------TA-TTTTAAATA--AC-----------A--TA--------T-----------T---T--------------TACT----T--AG--T-TTTC-AG-A--T-TTC--AAA-TCAATGAAATTC-AAACC------TTAC-A---T-TAT-ACATT---TT-T--TT--T--CT--------TGATA-T--ttgtgtgtcggttgatggtgtactagctgtcagaattagggaggtagcccgagtttttcaactttttcgaaggaaggtgcaaggaaaatttgttgatacaagaactttttcataaataaaactgttgcttt
gi|43 : cattgatAAAGGACACATAGCATAGATACTTAAATTA-AAC---TTT------T---TTAATTT-CTT--AA-GC-ACA-A---------------CT----CTTTG-TGTGCCT-----AAAA---TGA--CACTTT----A--A-A---TG---------------------T-----------G--T---------T-----------T---T--------------TGAA----TAAAG--TCTTTC-AA-AACT-TTGA-AAA-GTGATGGAATTG-AAACAA---TCTTGCAA---A-TAT-a
gi|44 : GGGCACATCGCATG----TTT---CTA-AAC----AT------T---TTGATTT-TTGA-A--GC-AGA-A---------------TTGCTTCTTTG-CATGCCT-----AAAA---TAA--C----TCTG-A--A-T---TGATTT--TG-A----------ATAAA--------A--TA--------T-----------T---T--------------TGCT----T--AG--T-TTTC-------T-T--------GCGATGAAATTC-AGATA------TTGC-G---A-TAC-GCA-T---AA-T--TT--T--C
gi|47 : GA--GATG-G-GG----TCATTACA---GAGACACAA--G-AG---GATA-C---ATACATGATACTGGTGATAAA-CATTAT----------T-AAA---------AAA-------------AA----TATT-----G-GGCA-C-TTAAAGAC-ACGCAA--GATGATACCTACCA-G-TGA-AAAA
gi|48 : ---G---TGAGAAAC---C---T---------C-ATA-AG-T-G-TAA-CGTATGTGGA--AA-AGCCTTC-AGCC-----A-G---TC-CTCCAAC--CT-TAT--C----------A-CACA-C--AGTCGGA-AA-CAC---------A-CCG--GATTCAAG-CCATTTA-AGT-GT-G-A
gi|5 : -AAAT----A-----AA-----ATG-CCCTTTCGA------CG--TCTGTGG-GAAG---G----CA-----TTC---CGT-GAGACA--AGTAAGGT-A---AAG----ACACACA----TG-A----GGATA-C-A----TAC---T------GGTGA-----TGAA--CC-TCA---TAA-A-TGT--G-ACG-----TCT-GTG-G--GAAG-GCATGCAGTGA--TA---CA--AGTAG--C-TT---A--A-A--G-A-C----ACA-CA-T---GA-G---------------G-ATA----C-A----C-AC---------T----G---G---TGATAAAC---C---T---------T-ATA-AA-T-G-TGA-TGTCTGTGGG--AA-GGCATTC-AGTC-----G-G---GC-ATACAA---TT-TA---G--A---GAG-A-CATA-A--AA--GGA-TA-CATGT-----ATA-GTAGTGAT--AAA-CCTTATA-ATT-GT-G-ATGCCTGCGAAAATA------CTTTCAG-CAAT--ATGGGATCA-TTATTTCG-CCTCATGAAG-A--AACATACTG-G-TAA-TAA-A-CCTT-A---TA-TATA-TGA-TGTC-TGTGGGAAA---ACATTTAGTGA--GACG-G-GA----CACTCACA---GACACATAT--A-AG---GATA-C---ATAC-------TGGTGATAAA-CCTTATAA--------TTCAA---------TAA-------------GA----CA-------G-GGAA-A-TTACAGAG-ACACAT--AGGGATACATACTG-G-TGA-TAAACCTT-TTGATTTATATATGTGATTTGTATTGGTAAGCGTTCATGTAAAGGACACGTCGAATG----TTT---TTA-AAC---TTG------T---TTTATTT-TTT--A--G------------------------------TTG-TATGCCT-----AGAT---TGA--C----T----ACAA-A---TG------TG-C----------AT-----------G--TA--------T-----------T---T--------------TGTT----T--TT--T-TTTT-AAAG--T-TTG--AAA-GCAATAAAATTC-AAAT-T---TTTTGT-G---A-T-T-AAA-T---AT-T--TT--T--CT--------TGGTA-T--TTTCTGCGTCATG--------------AT-GTG-----TGACG-TCA--TATA-T---GTGACCT---TT--GCGA-------T---A-A--AA---C---TGTTA--GCCA-TATTAT----AGA---A--AATTC-GAT----TTAATGG-AC--A-A----AA----A-GTC-AA--TTATCACGAT------AA-CAGCTCG-C--AG--ATGACA-TT-A-CG-TT-TGG-GTGC
gi|51 : ---------T-----------T---T--------------TGCT----C--AA--T-TTTG-AA----T-TTG--AAA-GCAAGGAATTTC-TAA------TTTTGT-G---A-TAC-GTA-T---t
gi|53 : ctaagtgaaataagtatcaagtgaagtaTTG-CATGCCT-----AAAT---TAA--CTT--T----T--A-A---TG------TG-T--------------------------T---------T-----------T---C--------------TG-TGAAAT--AT--T-TTGCGAA-A--TATTG--AAT-TC-ACGAAATTC-GAATC------TTGT-G---A-TAC-GCA-T---tagcatcagatag
gi|55 : cCTT-A---CAG----AGACACA----TA-A----GGACA-C-A----TAC---TATATGCAGTG-----ATTGA--TC-TTA---TAA-AATTT--G-ATG-----TCT-tat
gi|56 : --CACATGAG---GACA-C-ATACAGGAGA-A-CGCCCG---T---A-CAA--A-TGT--A-ACACGT-GCGGGAA--ACAGTTCGCT-CAG--T--ACGGGAC--A-C-T-aggtatgaaaagtgttc
gi|57 : AAAGGACACATCGCATG----TTT---CTA-AAC---TTT------T---TGAATTT-TGC--A--GC-AAA-A---------------TTACTCCTTTG-TATGCCT-----AAAgta
gi|6 : AAGGACATATTGCATG----TTT---CTA-AAT---TGT------TAGATTTTTTT-TTT--A--AC-AAA-A---------------TTAGGTCTTTG-CATGACT-----AGAA---TGA--CTT--T----A--G-A---TG------TG-TTTTAAATGAAAT-----------A--T---------T-----------TTAAT--------------TACG----T--AG--T-TCTT-GA-G--T-TTG--AAA-G-------GTAC-AAATCTCAGTCTTGC-G---A-TAT-GCA-T---AT-TAATT--TTACTTA------TGATA-T--TTTATGTACGATG--------------AA-GTGTCGTCTGACA-TCA--TAT------GTGACCTAGAGT--AAGG-------TCTGA-A--AACAGC---TGTTA--GCCA-TTCTAT----AAATTTATTGATTA-GAT----TTAATTG-AC--A-A----AAT---A-GCC-CA--TAGCTATG-T------A------TTG-T--AG--ATAACT-TT-G-CA-TG-GGG-GTGC
gi|61 : ATGAG---GACA-C-ATACTGGTGA-G-AAACCA---T---A-T-A--A-tgtgcaccatttatgggtgcacatatactaagtgtcaaaagaagtgatgtatagactgaggtttttcaaatttttctaaagaaggtgtgaggaaaaagaagtgggtgatttttttgtcagcacattaaggacttggtcataacccctcccctctacagtcacctttgtccatgttctttttcaaaaaactattggacagagacccatttaactgtgaggaaatagttatgtagaagccaggcacagctaggcctacagtatatggattctgttctggtcgtcatcatttcacaaatactcactcgcaccttggaaataaaaacggacattgtaacagtatatacttgtgttcccagttcctgtaaacttgtagaattataaaaaaaaaaataaattaaagattgaaaataattgaactt
gi|7 : ACA--GGAAGCTT-A---CAG----GCACACA----TG-A----CAACA-C-A----CAC---T------GGTGA----A-AAC--CC-TTA---CAA-A-TGT--G-GTG-----TCT-GTG-A--AAAA-GCATTCCCTCA--CA---TA--AGTCC--T-TT---A--C-A--G-A-G----ACA-CA-T---AA-T---------------G-ATA----C-A----T-AC---------T----G---G---TGATAAAC---C---T---------T-ACA-AA-T-G-TGA-TATCTGTGGA--AA-GGCGTTC-ACTT-----ATA---AT-GGA-GA---CT-TG---C--G---TAG-A-CACACC--A---G---GA-CANNN-----NNN-NNNNNNNN--NNN-NNNNNNN-NNN-NN-N-NNNNNNNNNNNNNNN------NNNNNNN-NNNN--NNNNNNNNN-NNNNNNNN-NNNNNNNNNN-N--NN-NNNNNN-N-NNN-NNN-NNNNNNNN---NN-NNNN-NNG-TG---TGTGGGAGG---GCATTCAGTGA--GACA-G-GAGC--C--ATGCG---GAAGCACAT--G-AA---GATA-C---ATGC-------Ta
gi|7 : cattccctaacGTGT-GTGGGAG-GGCA-TTCAGT-G-A--G--ACAGG-A--G-C-CATGCG--GAAGCACAT-GAA-GATACAT-GCT----NNN---NNNNNN-NNN-N-NNNN----N----NNN-----NNN-N------NN------NN--NNNNNNN-NNNN---N----NN-----NNN---NNN-NNNNNN--NNNNNNNN-N---NNN----NNNNNNN----NN-N----NNNNN-N-N----NNN---N------NNNNN----NNNNN--NN-NNN---NNN-NNNNN--N-NNGTGATGTCT-GTG-G--AAAG-GCATTCAGCCG--TA---C---GGGAA--CATT---A--A-A--G-A-G----ACA-CA-T---GA-nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngtgatgtctgtggaaaggcattcagccgtacgggaacattaaagagacacatgacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaaccatatcagtgtgatgtctgtgggaaggctttcaggcattcagtaacattatataagcata
gi|7 : cattccctaacacaggaagcttacaggcacacatgacaacacacactggtgaaaacccttacaaatgtggtgtctgtgaaaaagcattccctcacataagtcctttacagagacacataatgatacatactggtgataaaccttacaaatgtgatatctgtggaaaggcgttcacttataatggagacttgcgtagacacaccaggacannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn-GT-G-ATGTCTGTGGAAAGG------CATTCAG-CCGT--ACGGGAACA-TTAAAGAG-ACACATGAcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaaccatatcagtgtgatgtctgtgggaaggctttcaggcattcagtaacattatataagcata
gi|7 : cattccctaacacaggaagcttacaggcacacatgacaacacacactggtgaaaacccttacaaatgtggtgtctgtgaaaaagcattccctcacataagtcctttacagagacacataatgatacatactggtgataaaccttacaaatgtgatatctgtggaaaggcgttcacttataatggagacttgcgtagacacaccaggacannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngtgtgtgggagggcattcagtgagacaggagccatgcggaagcacatgaagatacatgctnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnAA-CCATATC-AGT-GT-G-ATGTCTGTGGGAAGG------CTTTCAG-GCAT--TCAGTAACA-TTATATAA-GCATAcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaaccatatcagtgtgatgtctgtgggaaggctttcaggcattcagtaacattatataagcata
gi|8 : cattccctaacacaggaagcttacaggcacacatgacaacacacactggtgaaaacccttacaaatgtggtgtctgtgaaaaagcattccctcacataagtcctttacagagacacataatgatacatactggtgataaaccttacaaatgtgatatctgtggaaaggcgttcacttataatggagacttgcgtagacacaccaggacannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngtgtgtgggagggcattcagtgagacaggagccatgcggaagcacatgaagatacatgctnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngtgatgtctgtggaaaggcattcagccgtacgggaacattaaagagacacatgacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn---------------TTACTTCTTT--TATGCCT-----AGAA---TGT--A----T----A--C-A---TGGATTT-TGAT----------AA-----------A--TA--------T-----------T---T--------------TGTT----T--GG--T-TTTA-AAAG--T-TTG--AAA-GCA-TGACATTT-AAATCT---T----C-G---A-TATTGCT-T---TT-T--CTCCT--CT--------CGGAA-T--TTTGCGCGCCATG--------------AT-CTT-----TGACATTCA--TATGTC---GT--CCT---TT--
gi|8 : g-A--AA---C---TGTTA--GCCA-TATCATTTCAAAA--T-----TTCCGAT----TTAATGGCAC--ATA----CA----A-GTC-AA--TCATCACGTT------AA-CAGTTTGTT--AG--ATAACA-CTAA-CG-TT-CAG-tacaacaccaaaaaaaaaaaaaacaaaaaaaaaaacaaactgttagccatatcatttcaaaatttccgatttaatggcacatacaagtcaatcatcacgttaacagtttgttagataacactaacgttcaggggtcggttacggatgtaatagctgtcaaataaggactgtaccgtgaacattgtcaacttttacgaaggaaggtgcgaggaaaaagacgagtattttgtcacacaggaccaataccataaaatcaaaacagtcgtttttgctccatgtactgttaaaaaagaaatgatattattagaaataaaggaaaaccaaacacaggtaggcagcgaccaggtttaacttgcgaggtgtttattttagaagcggatattcgcaactacatgcttacagtgttacattgccaagatatgacacaaaattacacacccgtacacactccctaagaatatgtactcagactcgcattctcattcctaccaaatcgcaaatacacaaatatatgaattaaagatttgaattgaagttgtatttacaataataaatatgtaa
gi|9 : gttacttcttttatgcctagaatgtatacatggattttgataaatattttgtttggttttaaaagtttgaaagcatgacatttaaatcttcgatattgctttttctcctctcggaattttgcgcgccatgatctttgacattcatatgtcgtccttttacaacaccaaaaaaaaaaaaaacaaaaaaaaaaacAAGGACATATCCCATG----TTT---CTA-AAC---TTT------A---TTAATTT-TTA--T--GC-AAA-A---------------TTACTTCTCTG-TATGCTT-----AAAA---TGA--C----T----A--C-A---GA------TA-T----------AT-----------T--T---------TAAATACATTAAT---T--------------CGCT----T--AG--T-TTTC-AA-GT-T-TTG--AAA-GCAATGAAATTCAAAATC------TGGC-A---A-TAT-GCA-T---AT-T--TT--T--CT--------CGGTA-T--TCTGCGCGCCATG--------------GT-GTG-----TGACG-TCA--TATA-C---G---CCT---TT--G-GAATG----T---A-AACAA---C---TCTCA--GGC--TA--AT----AAA--TA--GATTC-GA-----TTAATAG-AC--A-AG---AA----A-GGC-AA--TTAT-ACGTT------AA-CAGATTG-C--AA--AT-GCA-TT-A-CG-TTACGA-GTGggtcggttacggatgtaatagctgtcaaataaggactgtaccgtgaacattgtcaacttttacgaaggaaggtgcgaggaaaaagacgagtattttgtcacacaggaccaataccataaaatcaaaacagtcgtttttgctccatgtactgttaaaaaagaaatgatattattagaaataaaggaaaaccaaacacaggtaggcagcgaccaggtttaacttgcgaggtgtttattttagaagcggatattcgcaactacatgcttacagtgttacattgccaagatatgacacaaaattacacacccgtacacactccctaagaatatgtactcagactcgcattctcattcctaccaaatcgcaaatacacaaatatatgaattaaagatttgaattgaagttgtatttacaataataaatatgtaa
16 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|21 ): GCCAGAATAAGGGTGGTAGTCTAAGTTTTTTTCAGTTTTTTTTCCAAGGAAGGTACATACTGAAGGAAATGTTTTTTGACACCAAGGACTTTACCATAATTAAAACAGTCGCTTTTGTCCATGTGTTGTAAGAAAAAAAAATACACGTAATAAAATAATGAAACAACAACAGTTGGACAGCAACCCAGTCTAATAGCTAAAAAGTGTTTATATAGAAGTTAAACACGGCTAGGCCCACAGCGTAAATTGTGTCCAGGCCCAGGATCACCCGCTCAAACTGACCTACAAATAGCATAACAAATATTCAGGTTCGTGTATTAAAAATTTAATTGAATTATAAGATAATTATGCAAT
Unaligned ( gi|22 ): CCAGAATAAGGGTGGTAGTCTAAGTTTTTTCAGTTTTTTTTCCAAGGAAGGTACATACTGAAGGAAATGTTTGTTGACACAAGGACTTTACCATAATTAAAACAGTCGCTTTTGTCCATGTGTTGTAAGAAAAAAAAATACACGTAATAAAATAAATGAAAACAACAACAGTTGGACAGCAACCCAGTCTAATAGCTAAAAAGTGTTTATATAGAAGTTAAACACGGCTAGGCCCACAGCGTAAATTGTGTCCAGGCCCCAGGATCACCCGCTCCAACTGACCTACAAATAGCATAACAAATATTCAGGTTCGTGTATTAAAAATTTAATTGAATTATAAGATAATTATGCAAT
Unaligned ( gi|24 ): GTGTACTAATGTCAATTAGCGTGGTGAGCCCTGAGTTTTTGTCCAAGAAGGAAGGTTCGGAGAATTTGTTAGTCTGTCGCTTCAAGGACTTAACCATAAAAAAACATCGCGTTTTGTCTCTTTGTAACTGTTAAAAAAAAAAGGGGAGAAACATAAACAAGTGGACAGCGTAACCCCGATTATTGCGCGAGAAGTTTTAAAGTATAGAAAGCTATAAGACACGGCAGTTAGGTCTACAACGTTTATTTATGTCAGCCATTTCACGAATACACGCCCGCACTCAACTAGACCTACATAT
Unaligned ( gi|28 ): TATGTTCGGGTGGTGTGTGTCGGTTACGGGTGTACTAGCTGAGTTTTTCAACTTTTACGAAGGAAGGTGCGAGGAAATTTTTGTCGACACAAGGTCATTATTATAAATAAAACAGTCGCCTTTGTCCTTGTACTGTTAAAATATCAAAATAAAATAAAGGAAAACATAAACAGTTGGACAGCAACCCAGTTTAACTTTATATAGAAGCTAAACACAGCTAGGCCCACAGCGTATAGTGTCCAGGCCATTTCACGAAATACACAACAGTACCAACTGACGTACATAACATATAT
Unaligned ( gi|35 ): AATTTAGCTAATCGAAGTTACATCGGTTTATCGAAGCTACACATCAACATATTTCACTAAAACGTGTCATAATGGTAATTTCTGGCTGCTAGCCATTCCCTTTCGGGTATTAGTAAGGTCATTATGTCACGACTACCGTGCAAAATTCCCCAGGAGTTGGCGCACAGAAATTCAAGAGGTAAGGCGGAGT
Unaligned ( gi|37 ): ACAACAACAAATATCTCCTGACAGCTTCTGTGTTTCCATTTTCTCTAAGCCAAATCGCGCATCATTTATAAAAAAATTAATGAATACAATAATTAAAGATATCGAACTTCTTAATAAAAAATTACAAAAATGAAGAAATATGTAGATTTATATAATCTTTTATACTGTGGAACGACAGCGCTTCTTTA
Unaligned ( gi|42 ): AGGACATCTAGGCCTACAACATATGCATTAATATTCTGTTCTGGTCGTCGTCATTTCCCAAGATACATGTATATACTCGCACTTAGGAATTTAAACTAACTCCGTACCACTAACTAACAATTTATCTTGTGTTCCCACTTCCTACCAACAT
Unaligned ( gi|45 ): GTTATAATTTGTCATCAGAGATGTGTTCACCAACGTTGACAACACTAGAATTTAGACTGGAATGAAACACCCCATTGAAAATAGCCCTCCTCAGATGACTATTCTTTTCATCTACCCAACCAAT
Unaligned ( gi|46 ): AAAGATTGAACTTGTATTTACAAATAATAAATATGTAATTCCTCAGTAAACATTTCATTGATTTCACGCGGTTTAACCATGTCATCAATATGAGATGTGTATTGCCGTGCTCTCCGACGGCTT
Unaligned ( gi|49 ): GCAACCCAGCCTAGTTGCGAGAAAATGTTTTTATAGAAGCTAAACACGGCTTGGCGCACAGCGTAAATTCTCCAGGTCATTTCACGAAATACACACCCGC
Unaligned ( gi|50 ): AAAATGTCTTCCAATGTCATTTCTGGCTGCCAGTTCCTTCCCTTTTTCTGGTATTAATGAGGTCATCAATTACGTCACGACCACCGTGCAAGACT
Unaligned ( gi|52 ): GTATCTAATGCTCTGTTACGTTCGACATCATATGCGTCCTTGAGTGAGAAGGTTTGAAAACATTAGTTTTATAAATGGATTAAATTTAATCAAC
Unaligned ( gi|54 ): TGATCTTCCTCACTTCACGCAATACACACTCGCACTTTGGGAATAAAAGAACATGCACTTGTGCTCCCATTTTCTATCAACTATTAGA
Unaligned ( gi|58 ): TACAATATTAATGGGATTGAACTACTTCAAGGTTAAATCCATTTATCAAAGTAAA
Unaligned ( gi|59 ): GATGTGTATTGCCGTGCTCTCCGCCGGCTTCAGGC
Unaligned ( gi|60 ): AGAGTCATCTTATGTGACGTCACAAATTTTAGG
Alignments
lowQualScore : 1111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111
lowQualScore : 1 1111 111111111111111 1111 4444444444444444444444 4444444444444 111111 11111 111111 33333333333333333333333333333333333333333333333333333333333 1111111111111111111111 11111111111111111 1111111111111111111 1111111111 222222222222222222222222222 11111111 1111 2222222222222222222 11111 3333333 1111111 77777777777777777777777777777777777777777777777777777 1111111111111 222222222222222222222222222222 0000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 1111 33333333 11111111 11111111111111 5555555555555555555555555555555555555555 1111 11 1111
lowQualScore : 5 5 0 66 0000 555 1 888 888888888888888 3 1111 2 6 3 0 3 111 2222222222222222222222 3 0 888 3 3 6 0 3 4444 333 1 2 1111111111111 4444 1 77777 2 666666 000000 22 0 333 55555555 55555 6666 0 444 00000 22 2 4444 4444 1 4444 1 4444 2 1 4444 333 999999 999999 22 1 333 88888 44 5 44444 3 2 444 2 0 44 333 333 11111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 2 4444 2 4444 2 4444444444444444444444 1 55555555555555555 22 2 2 2 2 2 22 2 2 3 6666666666666666666 666 2 2222222222 2 2 888888888888888888888888888 2 33 2 0 2 2 2 2 2 3 77777777 4444 2222 1 88 555555 777777 0000000000000000000 4 0 33333 55 4 4 4 777 99 99 0 444 5555555 777 8888 777 8 777 3333333 5 77777777777777777777777777777777777777777777777777777 6 888 1 6 99 6 6 77 1 8 0 0 6 5 3 6666 444 2 444 0000000000000 2 222222222222222222222222222222 0 2 55555 333 33 4444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444 6666 22 55 2 2 0000 2 77 2 2 44444444 2 333 4 22 2 333 2 33 66 33 33333333 2 77 1 66666666666666 2 77777 5 33 1111111111111111111111111111111111111111 555 777 0 33 0 2 0 8888 999999 0 5 0000 2 66 2 8888 4444 2 2 33 1 777777 5 0 1 2 33 77 2 2 2 2 2 3
lowQualScore : . . . .. .... ... . ... ............... . .... . . . . . ... ...................... . . ... . . . . . .... ... . . ............. .... . ..... . ...... ...... .. . ... ........ ..... .... . ... ..... .. . .... .... . .... . .... . . .... ... ...... ...... .. . ... ..... .. . ..... . . ... . . .. ... ... ........................................................... . .... . .... . ...................... . ................. .. . . . . . .. . . . ................... ... . .......... . . ........................... . .. . . . . . . . . ........ .... .... . .. ...... ...... ................... . . ..... .. . . . ... .. .. . ... ....... ... .... ... . ... ....... . ..................................................... . ... . . .. . . .. . . . . . . . .... ... . ... ............. . .............................. . . ..... ... .. ................................................................................................. .... .. .. . . .... . .. . . ........ . ... . .. . ... . .. .. .. ........ . .. . .............. . ..... . .. ........................................ ... ... . .. . . . .... ...... . . .... . .. . .... .... . . .. . ...... . . . . .. .. . . . . . .
lowQualScore : 0 0 1 11 2222 555 6 000 999999999999999 3 1111 9 7 3 1 3 999 7777777777777777777777 3 2 222 7 3 7 4 1 7777 999 0 2 9999999999999 5555 0 44444 1 111111 333333 99 8 888 77777777 33333 9999 7 111 11111 66 1 2222 2222 0 0000 9 0000 0 9 0000 333 333333 444444 66 9 333 99999 33 5 55555 6 0 666 0 9 88 555 555 99999999999999999999999999999999999999999999999999999999999 1 5555 1 5555 1 2222222222222222222222 7 55555555555555555 55 0 0 0 0 0 88 0 2 5 1111111111111111111 999 5 5555555555 5 5 999999999999999999999999999 7 99 7 8 9 1 9 9 9 3 11111111 5555 8888 4 99 555555 222222 2222222222222222222 4 2 00000 22 4 4 4 888 22 55 7 666 7777777 000 4444 000 0 000 0000000 0 22222222222222222222222222222222222222222222222222222 7 333 0 7 22 7 7 77 4 0 8 6 0 0 2 1111 777 7 444 6666666666666 5 222222222222222222222222222222 4 2 66666 999 11 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 6666 99 88 1 1 4444 1 11 1 1 66666666 1 777 2 66 2 999 5 44 33 77 33333333 7 33 7 88888888888888 9 11111 7 99 4444444444444444444444444444444444444444 000 999 7 99 7 9 1 9999 222222 8 7 0000 9 44 9 9999 6666 9 9 99 1 777777 3 5 4 9 99 99 9 9 9 9 9 1
consensus : GAAAGGGCATTTTATCTGAAAAGCGGATACAGAGAAA--CACATGAG---GACA-C-ATACTGGTGA-N-AAACCT---T---A-T-A--A-TGT--G-ATGTCT-GTGGGAA-GACA-TTCAGT-C-G--C--ANGGG-N--A-C-T-TACG--GAGACACAT-GAG-GATACAT-ACT----GGT---GANAAA-CCT-A-AAAT----A----TAA-----ATG-T------GA------TG--TCTGTGG-GAAG---G----CA-----TTC---AGT-CGGANA--GGANACTT-A---AAG----ANACACA----TG-A----GGATA-C-A----TAC---T------GGTGA----ATAAA--CC-TTA---TAA-AATGT--G-ATG-----TCT-GTG-G--GAAG-GCATTCAGTCA--GA---CA--GGNAA--C-TT---A--A-A--G-A-C----A-A-CA-T---GA-T---------------G-ACA----C-A----T-AC---------T----G---G---TGANAAAC---C---T---------T-ATA-AA-T-G-TGA-TGTCTGTGGG--AA-GGCATTC-AGTC-----G-G---GC-ANACGA---CT-TA---C--A---GAG-A-CACA-C--A---GGA-GA-CACGC-----ATA-CTGGTGAT--AAA-CCTTATA-ANT-GT-G-ATGTCTGCGGGAAGG------CATTCAG-CNAT--ACGGGAACA-TTATNNAG-ACACATGAGG-A--AN-ATACTG-G-TGA-TAA-AACCTTNA---TG-AATG-TGA-TGTC-TGTGGGAAG---ACATTCAGTGA--GACG-G-GA----C--TTACA---GACACACAT--G-AG---GATA-C---ATAC-------TGGTGATAAA-CCTTATAA--------T-CAA---------TAA-------------GA----CA-------G-GGAA-A-TTACAGAG-ACACAT--GAGGATACATACTG-G-TGA-NAAACCTT-TTGATTTATATATGTGATTTGTATTGGTAAGCGTTCATGTAAAGGACACGTCGCATG----TTT---CTA-AAC---TTT------T---TTTATTT-TTT--A--GC-AAA-A---------------TTACTTCTTTG-TATGCCT-----AAAA---TGA--C----T----A--A-A---TG------TG-T----------AT-----------G--T---------T-----------T---T--------------TGCT----T--AG--T-TTTC-AA-G--T-TTG--AAA-GCAATGAAATTC-AAATCT---TTTTGC-G---A-TAT-GCA-T---AT-T--TT--T--CT--------CGGTA-T--TTTGCGCGCCATG--------------AT-GTG-----TGACG-TCA--TATA-C---GTGACCT---TT--GCGA-------T---A-A--AA---C---TGTTA--GCCA-TATTAT----AAA--TA--AATTC-GAT----TTAATGG-AC--A-A----AA----A-GGC-AA--TTATCACGTT------AA-CAGCTCG-C--AG--ATAACA-TT-A-CG-TT-CGG-GTGC
Reference ( family-1142 ) : GAAAGGGCATTTTATCTGAAAAGCGGATACAGAGAAA--CACATGAG---GACA-C-ATACTGGTGA-N-AAACCT---T---A-T-A--A-TGT--G-ATGTCT-GTGGGAA-GACA-TTCAGT-C-G--C--ANGGG-N--A-C-T-TACG--GAGACACAT-GAG-GATACAT-ACT----GGT---GANAAA-CCT-A-AAAT----A----TAA-----ATG-T------GA------TG--TCTGTGG-GAAG---G----CA-----TTC---AGT-CGGANA--GGANACTT-A---AAG----ANACACA----TG-A----GGATA-C-A----TAC---T------GGTGA----ATAAA--CC-TTA---TAA-AATGT--G-ATG-----TCT-GTG-G--GAAG-GCATTCAGTCA--GA---CA--GGNAA--C-TT---A--A-A--G-A-C----A-A-CA-T---GA-T---------------G-ACA----C-A----T-AC---------T----G---G---TGANAAAC---C---T---------T-ATA-AA-T-G-TGA-TGTCTGTGGG--AA-GGCATTC-AGTC-----G-G---GC-ANACGA---CT-TA---C--A---GAG-A-CACA-C--A---GGA-GA-CACGC-----ATA-CTGGTGAT--AAA-CCTTATA-ANT-GT-G-ATGTCTGCGGGAAGG------CATTCAG-CNAT--ACGGGAACA-TTATNNAG-ACACATGAGG-A--AN-ATACTG-G-TGA-TAA-AACCTTNA---TG-AATG-TGA-TGTC-TGTGGGAAG---ACATTCAGTGA--GACG-G-GA----C--TTACA---GACACACAT--G-AG---GATA-C---ATAC-------TGGTGATAAA-CCTTATAA--------T-CAA---------TAA-------------GA----CA-------G-GGAA-A-TTACAGAG-ACACAT--GAGGATACATACTG-G-TGA-NAAACCTT-TTGATTTATATATGTGATTTGTATTGGTAAGCGTTCATGTAAAGGACACGTCGCATG----TTT---CTA-AAC---TTT------T---TTTATTT-TTT--A--GC-AAA-A---------------TTACTTCTTTG-TATGCCT-----AAAA---TGA--C----T----A--A-A---TG------TG-T----------AT-----------G--T---------T-----------T---T--------------TGCT----T--AG--T-TTTC-AA-G--T-TTG--AAA-GCAATGAAATTC-AAATCT---TTTTGC-G---A-TAT-GCA-T---AT-T--TT--T--CT--------CGGTA-T--TTTGCGCGCCATG--------------AT-GTG-----TGACG-TCA--TATA-C---GTGACCT---TT--GCGA-------T---A-A--AA---C---TGTTA--GCCA-TATTAT----AAA--TA--AATTC-GAT----TTAATGG-AC--A-A----AA----A-GGC-AA--TTATCACGTT------AA-CAGCTCG-C--AG--ATAACA-TT-A-CG-TT-CGG-GTGC
gi|1 : GAAAGGGCATTTTATTTGAAAAGCGGATGCAGAGAAA--CACTTGAG---GACG-C-ATACTGGTGA-G-AGACCT---T---A-T-A--A-TGT--G-ACGTCT-GTGGGAA-GACA-TTCCAT-T-G--C--ATGTA-T--ATC-T-TAAA--GAACCAC-T-GAA-GATACAT-ACT----GGT---GATAAA-CCTCATAAATTCTCA----TAA-----ATG-T------GA------CG--TCTGTGG-GAAG---G----CA-----TTC---AGT-GAGAAA--AGATACGT-A---AAG----ACACATA----TG-A----AGATA-C-A----TAC---T------GGTGA----ATAAA--CC-TTA---TAA-AATGT--G-ACA-----TCT-GTG-G--GAAA-GCATTCAATCA--GA---CA--TGTAA--C-GT---A--A-A--G-A-C----A-A-CA-T---GA-T---------------G-ACA----C-A----T-AC---------T----G---G---TGATAAAC---C---T---------T-ATA-AA-T-G-TGA-TGTCTGTGGG--AA-GGCATTC-AGTC-----G-G---GC-ATACAA---TT-TA---G--A---GAG-A-CACA-A--A---GGA-GATCATGT-----ATA-GTAGT-AT--AAA-CCTTATA-ATT-GT-G-ATGCCTGCAAAAATA------CTTTCAG-CAAT--ATGGGATCA-TTATTTCG-CCACATGAAG-A--AA-ATACTG-G-TGG-TAA-AACCTTAA---TA-TATA-TGA-TGTC-CATGGGAAA---ACATTTAGTGA--GACG-GCGA----C--TCACA---GACACATAT--A-AC---GATA-C---ATAC-------TGGTGATAAA-CCTTATAA--------T-CAA---------TAA-------------GA----CA-------G-AGAA-A-TTACAGAG-ACACAT--GGGATTACATACTG-G-TGA-TAAACCTT-TTGATTTATATATGTGATT-GTATTGGTAAGCGTTCATGTAAAGGACACGTCGAAT-----TTT---TTA-AAC---TTG------T---TTTATTT-TTT--A--G------------------------------TTG-TATGCCT-----AGAT---TGA--C----T----A--A-A---TG------TG-C----------AT-----------G--T---------T-----------T---T--------------TGTT----T------T-TTTA-AAAG--T-TTG--AAA-GCA-TAAAATTC-AATTTT---TTTTGT-G---A-T-T-AAA-T---AT-T--TT--T--CT--------TGGTA-T--TTTCTGCGTCATG--------------AT-GTG-----TGACG-TCA--TATA-T---GTGACCT---TT--GCGA-------T---A-A--AA---C---TGTTA--GCCA-TATTAT----AGA---A--AATTC-GAT----TTAATGG-AC--A-A----AA----A-GTC-AA--TTATCACGAT------AA-CAGCTCG-C--AG--ATGACA-TT-A-CG-TT-TGG-GTGC
gi|10 : T--------CAGTA-T--TTTATGCGTCATG--------------AT-G-G-----TGACA-TCA--TGT------GTGTCCT---TT--GCGA-------T---A-A--AA---T---GGTTA--GCCA-TATTAT----AGG---A--AATTC-GAT----TTATTGG-AC--A-A----AAG---A-GAC-AA--TTATCACGTT------AA-CAGCTCG-C--AG--ATAACA-TT-A-CG-TT-CGG-ATG
gi|11 : ----GGT---GAAAAA-CA--A-AAAT----A----TCA-----ATG-T------GA------TG--T-TGTTT-TAAG---G----TA-----TTA---TCT-CGG-----GCTTACTT-A---AAC----AAACACA----AG-C----GGA-A-C-A----TAC---G------GGTGA----G-AAA--CC-ATA----AA-AATGT--G-ATG-----T-T-GTGTG--GAAG-GCATTCAGTCA--GT---CA--GGATA--T-TT---G--A-A--GTG-C------A-CA-T---GA-T---------------G-ACA----CTA----T-AC--------------G---G---TGATAAAC---T---T---------T--TA-AATT-G-TGA-TGTCTGTGGA--AA-GGCATTT-A-TT-----G-G---AA-AACCGA---C---G---C--A---GAGAA-AACA-C--A---TGA-Gtactagctgccagaataagggtggtagcctaaattttttcagcttttcgaaggaaggtgcgaagaaatgtttgtcgatacaaggaataaataaataaaactgtcgcttttgtccatgtgctgtaaaaacaatacatgtaataaataaaggaaaacaaaaacagttggacaacaacccagcctaattgctagaaggtgtatatataaaagctaaacacggctagactcatagcgtaaattgtgtccaggccatttcatgaaatacacatctgcaccaattgacctacatataacataataggatttaatacttcaaagttaaatcggtttatcaaagcaaaatatcaattattctccgaaaacgtaccagcgtactttccgggtgctaactaactttatagtggggacacttgcttacgtcacgtcacgtcacgcccaccgtgcaagcatccccagcagtgagcgcatagaaattcaaagaggtatgaggtgttgaattctt
gi|12 : ttattagttttataatcaatttttattacttatgtgtgcagatagcccattagaaacagattaaattcatcagaacaggtcaaggttataatttgtcatcagagatatgttcaccaacactgacaacacgaatttagattgaatgaaacatcccattgcgaatagccctcctcagatgactattcttttcatcaaccaaccaatagctgcctgtgaaacaagtatgtatatctacccaaccaatggctgtctctgaaacaagtatcttctacacaaatcaaagactagcacaaacggaaaatataacggactttgtgaaactgttgaagcagtctgtgaaacaagtaaaaactcaagatctgaaaaatgatttacaggagtgtataaacaaaaatggaTCCCATG----TTT---CTA-AAC---TTTACATAAT---TTTATT-----------C-AAACA---------------TTACTTCTCTGATATACCT-----AAAAATTTGA--C----T----A--C-AGACTG------T--T----------ATTTAAATAAATAA--T---------T-----------TG--T--------------CGCTC---T--AGGTT-TTTC-AA-G----TTG--AAACGCAATGAAA-TC-AAATC-------TGC-A---A-TAT--CA-TATGAT-T--TT--T--CTCAGCGCAACGGTATT--TTTGCGCGCCATGGGTGTGTTTTTGTTAT-TTG-----TGACG-TCAAGTATA-C---G---CCT---TT--G-GAATG----T---A-AACAA---C---TCTCAAGGCC--T-TTATC---AAA--TG--A--TCAGATCG--TTAATAG-ACTAA-A----AA----A-GGC-AAATTTATTA--TT------AATCAGATTC-C--AACTATAGCACTT-ATCGATT-CGA-GTG
gi|13 : aaccaggatcatatA--CACATGA------TA-C-ATAGTGGAGA-A-AAACTT---T---ACT-T--A-TGT--G-ATATTT-GTGGGAA-GACA-TTGTCT-C-G--C--AAAAC-A--A-A---TGCGAAAAGACACAT-GAG-GAAACAT-ACT----GGT---GATAAA-CCT------T----A----TAA-----ATG-T------GT------TG--TCTCTGG-AAAG---G----CA-----TTC---AGT-GAGAAA--GGAATCTT-A---CAG----AAACACA----AG-A----GGATA-C-A----TAC---T------GATG------------C--------TAA----GT--C-AC--------------G--GAAG-GCAACCAACCA--GA---AT--GATAG--A-GT---A--C-AGTG-A-C------A-CA-T---GA-T---------------T-ATA----T-A----T-AT---------T----G---A---TA-------------------------ATG-AA-T-G-TGA-TGTTTTCGGA--AA-GGTATTC-AATC-----A-G---ACAACAC-A---CT-TA---T--A---GAA-T-CACA-T------TAA-GG-CACGT---------TTGG---T--ACA-CCTGA----------A-ATACCTGTGGGA---------CA--------------GGAAAC--TTACAGAA-ACACATGAGG-AC-AT-AGAATG-G-TGACCAA-AACttatgttaattgctacgggttgtaattaatgctgtaacggaattaagggttggctagtcctgattattttgtcaactttttcgaaggaatgtctgcgaggaattagtcgacacaagacttaacctataaacataacagtcgccctttagtccagtcgtacttgttttaaaaaaataataaaattaaggaaaacataaacttagtgatgggaacagtgcaacccgtagtctgataattgcgatgggaggggttgtttatataga
gi|14 : aaggcatttaactcttcattgacattaacatAA---TGA--T----T----A--A-A---GGACACATTG-C----------AT-----------G--T---------T-----------T---T----------------CT----A--AACAT-TTTA-AA------TTGCTAAA-GCAA---AATT---AAT-T---ATTTGC-GTGCA-TAT-GCA-T---AT-T--TTC-T--CT--------CTGTA-T--TTAACGC-CCATT--------------AT-GTG-----TGACG-TCA--TAT------GCGACCT---TCGAGCGA-------G---G--------------GTTT--G--ATTTTTTT----CAA--CG--GATTA-AAT----TTAATCG-ACTTA-AAAATAA----A-TGT-AA--TCATCAC--------------GCTCG-T--AG--ACAACA-TT-A-CG-TT-CGG-ATGgtgtgttcctgcatagccaaactgacctagtattgtttctgcataactccttatcctatatattttgacaagctcagaaaa
gi|15 : C-AGACAA---TT-TA---C--A---GAG-A-CACA-A--AA--GGA-TA-CATGT-----ATA-GTAGTAAT--AAA-TCTTCTA-ATTCGT---ATGCCTTCGAGAATG------CATTCAG-CCAG--ATGGGATCA-TTATTTCG-ACATA------A--AG-ATAC-------A-TA-----CTTTA---TA-TATG-TGA-TGTC-CGTGGGAAA---ACATTTAGTGA--GACG-G-GA----CACTTACA---GACACATAC--A-AG---GATA-C---ATAC-------TGGTGATAAA-CCTGATAA--------TTCAA---------TAA-------------GA----CA-------G-GGAA-A-TTACAGAG-ACACAT--GAGGATACATATTG-G-TGA-GAAACGTTGTTGATTTATATATGTGATTTGTATGGGTAAGCGTTAATTTAAAAGACATGTAGCATG----TTT---TTA-AACATTTTT------T---TTTATTT-TT---A--G------------------------------TTG-TATGCCT-----AGAA---TGA--C----TAC--A--A-A---TG------TA-A----------AT-----------G--TA--------T-----------T---TTGAATAAATCATTATGCT----T--TG--G-TGTT-AA-G--T-TTT--AAA-GCAATCAATTTC-AAA------TTTTAC-G---ATTAA-ATA-T---AT-T--Tttatagtatcgacacaacgggcgcattagctgtcagaagctttgtgtttgttttagttttttcgaaagaaggtgcgaaggaaaagaccagtaatttttagttggcacagggtctttgtcgtaaaaaatccacacaaatcagtcacgtttgattatgtacctttttagaaaaagaagaaaaaaaaaggggggggggcaaaacggttgcaaagcgactcagtttaactacgagaaattggtcatatg
gi|16 : GT--G-A-G-----ACT-GTA-G----AG-GCTGTCTGTGA--AA---CA--AGTAAAAC-T----A--A-A--G-A-CCAGGA-A-AA-T---GA-T---------------TTACA----C-GAATGT-ACAAACACAAAT----G---GAGGTGAAAAAC---AAAGT---------T-ATC-AG-T-G-TCA-TCTTTGTTGG--AA-GGCATTT-ACTC-----
gi|16 : ttattagtattataattatttttattatttttcttgcagaaatcccattagaaacatattaggttaatcagaaacatgtcaatgttttaaattggcatcacagatgtgttcactatcactgacaacactagaatttagactgtaatgcaacatccaattggaaatagccctcctcgtatggctattcttttcacccaactaaccaatggctgactgtgaaacaagtatgtctatctacccaaccaatggctgcctgtgaaacaagaatgtcttctacacaatcaagggctagcacaaacggaaaatacaacggactta----GGT---GAAAAA-C---A-AAGTT---A----TCA-----GTG-T------CA------TC--TTTGTTG-GAAG---G----CA-----TTT---ACT-C
gi|17 : ttattagtattataattatttttattatttttcttgcagaaatcccattagaaacatattaggttaatcagaaacatgtcaatgttttaaattggcatcacagatgtgttcactatcactgacaacactagaatttagactgtaatgcaacatccaattggaaatagccctcctcgtatggctattcttttcacccaactaaccaatggctgactgtgaaacaagtatgtctatctacccaaccaatggctgcctgtgaaacaagaatgtcttctacacaatcaagggctagcacaaacggaaaatacaacggacttagtgagactgtagaggctgtctgtgaaacaagtaaaactaaagaccaggaaaatgatttacacgaatgtacaaacacaaatgga----GGT---GAAAAA-C---A-AAAT----A----TCA-----ATG-T------GA------TG--TTTTT----AAG---G----TA-----T
gi|18 : attattaagttttataatcatttttattacttatgttgcgtagcccaattagaaacagattaaattcatcaggaacaggtcaaggtataaattgttcatcagagatatgttcaccaacactgacacactagaatttagattgaatgaaacatcccattgcacgaatagccctcctcagatgactttctttcatctacaaccaatagctgcctgtgaaacaagtatgtatatctacccaaccaatggctgtctctgaaacaagtatgtcttctacacaatcaagactagcacaaacggaaaatataacggactttgttgaaactgttgaagcagtctgtgaaacaagtaaaaactcaagatctgaaaaatgatttacaggagtgtataaacaaaaatgga----GGT---GAAAAA-C---A-AAAT----A----TCA-----ATG-T------GA------TG--TTTTT----AAG---G----TA-----TTA---TCT-CGGCT------TACTT-A---AAC----AAACACA----AG-C----GGATA-C-A----TAC---G------GGTGA----GAAAA--CC-ATA---T-A-AATGT--GCATG-----TTT-GTG-G--GAAG-GCATTCAGTCA--GT---CA--GG-AA--T-TT---G--A-A--G-G-C------A-CA-T---G--T---------------G-ACA----C-A----T-AC---------T----G---G---TGAATAAC---C---T---------T--TA-AA-T-G-TGA-TGTCTGTGGA--AA-GG-ATTG-TATT-----T-G---AA-AACCGA---C---G---C--A---GAG-A-AACA-C--A---TGA-GG--AC-C-----ATA-CTTGTGAG--AGA-CC--ATA-A
gi|19 : agcacaaacggaaaatataacggactttgttgaaactgttgaagcagtctgtgaaacaagtaaaaactcaagatctgaaaaatgatttacaggagtgtataaacaaaaatgga-AATG-TGT-TGTTGTGTGGGTAG---GC-TTCAGCGA--GACA-G-GAAGATT--TTACA---G-CACACA-----AGTTTGACAAC---ATCT-------TGGTGATAAA-CC-TATAAATGTGATGT-CTG---------CGG-------------GAGGTTCAGTCGTATG-GGAACA-TTAAGGGG-ACATAA--GAGTAT-CAT-CTG-A-TGATAAAACCAT-ATAATGTAAATGTTTGaa
gi|19 : AG--CACACAAGTTTGACAAC-ATCTTGGTGA-T-AAACCTA--T---A---A--A-TGT--G-ATGTCT-GCGGGAG-G----TTCAGT-C-G--T--ATGGG-A--A-CAT-TAAG--GGGACATAA-GAG-TAT-CAT--CT----GAT---GATAAAACC------AT----A----TAA------TG-T------AAA-----TG--TTTGTGG-GAAAAAAG----CA-----TTC---AAT-TGGAGACAGAACATTTTA---AAA----AGACACA----AG-A----TGATA-CCA----TAC---T------GGTGT----TTAAA--CCCTTA---TAA-A-TGT--G-ATG-----TGT-GTG-G--GAAG-GCATTCCGTGA--GA---AA--GGACA--T-TTTAAA--A-A--G-A-C----A-A-GA-T------T---------------G-ATA----C------T-AC---------T----G---G---TG-TAAAC---C---T---------TAATA-AA-T---TGA-TGTGTGTGGGGAAA-AGCATTC-tgggaaaaaagcattcaattggagacagaacattttaaaaagacacaagatgataccatactggtgtttaaacccttataaatgtgatgtgtgtgggaaggcattccgtgagaaaggacattttaaaaagacaagattgatactactggtgtaaaccttaataaattgatgtgtgtggggaaaagcattc
gi|2 : aatgtgttgttgtgtgggtaggcttcagcgagacaggaagattttacA-C-AGACTT---C---A-T-ACAA-TGT--ATATTTTT-GTGGGAATAACA-TATAGT-T-G--TGTAAAGG-T--G-CGT-TATGT-GATACACAC-GTGCGAT-TAT-ACT----GTG---GAGA----CT------T----C----TGAC----ATG-T------GA------TA--GTTATGT-GAAA---T----CACTTGATTA---AGTTCAGACA--GGAGATTT-A---A-G----AGACACA----GG-A----GGATA-C-A----TA----T------GGTGA----AGAAA--TC-TTC---CAATAATGTTGG-ATG-----TCTTGCG-A--AAAG-G-ATTCAGTGC--GT---AA--GGGAT--CATT---A-----------C----A-A-T--C---GA-A---------------G-ACA----C-A----A-AC---------TTCAAG---G---TGATAAAC---A---TAGAAATAACT-GTA-AG-G-G-TGA-AATTTATGAG----------TC-TGTC-----G-T---G--AAGCGATTTCT-TAGTGCGAA---GGG-ATCATA-C--A---AAA-CA-TATGAGGATAATA-CTGGTAAT--AAC-CCTTATATAAT-GTTGTATGTCTTGTGGAAGA------CATTCAC-TGACTGAGAGGAAC--TTATTAAC-ACACATGAGG-A--A--ATACTG-G-TGA--AA-AACCTTT----TA-AATG-TGATTGTC-TGTGAGAAG----C-TTCAGTCATCGA-G-G-GAC---C--TTACAGAGGAGACACAT--GAAG---GAAATC---ATAC-------TGGTGAGAGACCCTTATAA--------T-TGAATGTCTGGGTAAAAGATGTTTTATTGA----CA-------ATAGAA-ACCTATAGAGCACACATTAGACAACACATAATGCGTTGA-AAGACCAT-T--ATGTA-ATGT-TGATTT
gi|2 : agccttagttcaagatatgtctttacgccactgtatttgattaagaaaacgtgatAGAGA--CACAGGAG---GATA-C-ATA-TGGTGA-AGAAATCT---TCCAA-T-A--A-TGTTGG-ATGTCTTGCGAAAA-GG-A-TTCAGTGC-G--T--AAGGG-A--T-CAT-TACA---------ATCGAA-GACACAA-ACTTCAAGGT---GATAAA-CAT-AGAAAT----AACTGTAA-----GGG-T------GAAATTTATGAGTCTGTCGTGAAG---C----GA-----TTTCTTAGT-GCGAAG--GGAT-CAT-A---CA-----AAACATA----TG-A----GGATA---A----TAC---T------GGT-A----ATAAC--CC-TTA---TAT-AATGTT-GTATG-----TCTTGTG-G---AAG-ACATTCACTGACTGA---GA--GG-AA--C-TT---ATTA-A--C-A-C----A---CA-T---GA-G---------------G-A-A------A----T-AC---------T----G---G---TGAAAAAC---C---T---------T-TTA-AA-T-G-TGATTGTCTGTGAG--AA--GC-TTC-AGTCATCGAG-G---G----AC-----CT-TA---C--AGAGGAG-A-CACA-TGAA---GGA-AA-T---C-----ATA-CTGGTGAG--AGACCCTTATA-ATT-G--A-ATGTCTGGGTAAAAGATGTTTTATTGA--CAAT--A--GAAAC--CTATAGAGCACACATTAGACAACAC-ATAATGCGTTGA--AA-GACCATTA---TGTAATGTTGA-T-TT-TGTGGG-AG---ACA-TCAATTAT-TATA-C-AA----CCGTAAAA---AACTCACATTGA-AG---GATA-CCAAAT-C-------TAGTGAC-AG-CCTTATtgtgggagacatcaattattatacaaccgtaaaaaactcacattgaaggataccaaatctagtgacagccttatcagtgtgatgcttgttcgaaacattcagtcagtagagaagacttactgtgtcacaaagataagacatcaacagtgaatgtagtgtctgtggaaagtgtacaccgatgggtcgcagacttagaagcaccatgggacacatac
gi|2 : agccttagttcaagatatgtctttacgccactgtatttgattaagaaaacgtgatacagacttcatacaatgtatatttttgtgggaataacatatagttgtgtaaaggtgcgttatgtgatacacacgtgcgattatactgtggagacttctgacatgtgatagttatgtgaaatcacttgattaagttcagacaggagatttaATACA---AAA--CATATGAG---GATA---ATACTGGTAA-T-AACCCT---T---A-T-ATAA-TGTT-GTATGTCTTGTGG-AA-GACA-TTCACT-G-A--CTGAGAGG-A--A-C-T-TATT--AACACACAT-GAG-GA-A-AT-ACT----GGT---GAAAAA-CCT------T----T----TAA-----ATG-T------GAT-----TG--TCTGTGA-GAA----G----C------TTC---AGT-CATCGA--GGGACCTT-ACAGAGG----AGACACA----TGAA----GGAAATC-A----TAC---T------GGTGA----GAGAC--CC-TTA---T---AAT-T--GAATG-----TCT-G-G-GTAAAAG-ATGTTTTATT---GA---CAATAGAAA--C-CT---A--T-A--G-AGC----ACA-CA-TTA-GA-C---------------A-ACA----C-A----T-AA---------T----GC--GT--TGAAAGAC---CA--T---------T-ATGTAA-T-GTTGA-T-TTTGTGGG---A-GACA-TC-AATT-------A---TT-ATACAA---CCGTA------A---AAA-A-CTCA-C--ATT-GAAGGA-TAC-C-----AAATCTAGTGAC---AG-CCTTATC-AGT-GT-G-ATGCTTGTTCGAA-A------CATTCAGTCAGT--A-GAGAAGACTTACTGTG-TCACA------A--A------------GA-TAA-GACATCAACAGTG-AATG-TAG-TGTC-TGTGGAAAGTGTACA-CCGATGG--GTCGCA-GA----C--TTAGA---AGCAC-CAT--G--G---GACA-C---ATAC-------cagtgtgatgcttgttcgaaacattcagtcagtagagaagacttactgtgtcacaaagataagacatcaacagtgaatgtagtgtctgtggaaagtgtacaccgatgggtcgcagacttagaagcaccatgggacacatac
gi|20 : agccttagttcaagatatgtctttacgccactgtatttgattaagaaaacgtgatacagacttcatacaatgtatatttttgtgggaataacatatagttgtgtaaaggtgcgttatgtgatacacacgtgcgattatactgtggagacttctgacatgtgatagttatgtgaaatcacttgattaagttcagacaggagatttaagagacacaggaggatacatatggtgaagaaatcttccaataatgttggatgtcttgcgaaaaggattcagtgcgtaagggatcattacaatcgaagacacaaacttcaaggtgataaacatagaaataactgtaagggtgaaatttatgagtctgtcgtgaagcgatttcttagtgcgaagggatc-----G-G---GC-A----A---CT-TA---C--A---GAG-A-CACA--------GTA-----ACAC-----ACA-CTGGTGAC--AAA-TCTTACC-AAT-GT-G-ATGTTTGTTGGAAGA------CATTCAG-TTAT--TCAGGATCA-TTGCAAAA-GCAC---AGA-A--AG-ACAC-------A-TAATAATCCTAA---TG-AATT-TGA-AATT-TGTCGGA-----ACA--------------------------TTACA---GACACACAT--G-AG---AATA-C---ACAC-------TGGTAATAAA-CC
gi|20 : ttatttcgaaTACAGAGA----CACAGTA-----ACA-C-ACACTGGTGA-C-AAATCT---T---A-CCA--A-TGT--G-ATGTTT-GTTGGAA-GACA-TTCAGT-T-ATTC--AGGAT-C--A---T-TGCA--AAAGCACAG-AAA-GACACAT-A-------------ATAAT-CCT-A---------A----TGA-----ATT-T------GA------AA--TTTGTCG-GAA---------CA-----TT--------------------AC--------AG----ACACACA----TG-A----GAATA-C-A----CAC---T------GGT-A----ATAAA--CC-AGA---T-A-TATGA--G-ATA-----TTA-ATG-T--TAAC-GCATTAAGCCA--GA---CA----TAA--C------A--G-A--G-A-C----ATT-CAGT---GA-----------------G-ACGGGATC-A----T------------T----A--------GAAAAAC------------------------A-T-A-TGA-AGAC---GCA--AATGGCATTCGACTC-----G-A---A--AGTCCA---CT-TA---C--A---AAT-A-CACA-C-------GATAA-CACTC-------A-CTGGTGAT--AAT-ATTTA-A-AAG-GT-G-ATATATGTGagatatatgagatattaatgttaacgcattaagccagacataacagagacattcagtgagacgggatcattagaaaaacatatgaagacgcaaatggcattcgactcgaaagtccacttacaaatacacacgataacactcactggtgataatatttaaaaggtgatatatgtg
gi|23 : ttatttcgaagggcaactT---TTA-AAC---TTT------T------ATTT-TTA--A--AG-AAA-AAACTTGCTTTGTGTGCTACTTCTTTG-TGTGCCTCCCCTAAAA---TGA--C----T----ATAA-A---TG-------G-T----------AT-----------T--TGAATTATTAT-----------T---T--------------TGCT----T--AG--T-TTTC-AA-G--T-TTGA-AAA-GCAATTAAATTC-AAATCC---TT---C-A---A-TAT-GCA-G---AT-T--TT--T---T--------CGGTA----TTTGCTGTCCATG--------------AT-GAG-----T-ACG-TCA--TATGCC---GT--CCT---TC--GCGA-------G---A-A--AA---CAATTGTTA--GCCA--ATCAT----GAA--CA--AGATC-GA-----TTAATGG-AA--A-A----AA----AGGGCAAA--ATATCACATTACCGTAAA-CAGCTTG-C--AGTTATAACA-TT-A-CG-TT-CGG-
gi|25 : catcgATG----TTT---TCA-AAC---TTT------T---TT-ATTT-GTC--AT-GC-AAA-A---------------TCACTTCTTTG-TATGCCT-----AAAA---TGA--C----TAC--A--A-A---TG------TA-TTTTGAATAA-AT-----------T--A---------T-----------T---T--------------TGCT----T--AG--T-TTTC-AA-G--T-TTG--AAA-GCAATGAAATTC-AAATC------TTGC-A---A-TAT-GCA-T---AT-T--TT--T--CT--------CGGTA-T--TCTGCGCGCCATG--------------GT-GTG-----TGACG-TCA--TACA-C---G---CC---------CGAATGAATGT---A-AACAA---G---TCTCA--GACA-TATTAT----AAA--TA--AATAC-GAT----TTAATGG-ACA-A-A----AA----A-GGC-AA--TAATCACGTT------AA-CAGAATG-C--AG--ATAACA-TT-A-CG-TT-TGGTGTGtgttgaacattgtgtcattcggtgtgatagctgtcagag
gi|26 : CATG----TTT---CTA-TAC---TTT------A---AGTAATT-TTT--AT-GC-AAA-T---------------ATACTTCTCTG--GTAACT-----AAAA---TGA--C----T----A--ACA---GA------TG-T----------AT--------------T---------C-----------T---TAAATTA--------TGCT----T--AG--T-TTTC-AA-G--T-TTG--AAA-GCAATGAAAATC-AAATCT---G---GC-A---A-TAT-GCA-T---AT-T--TT--T--CT--------CGGTA-T--TTTGCGCGCCATG--------------GT-GTG-----TGACG-TCA--TATA-C---G---CCT---TT--G-GAATG----T---A-AACAA---C---TCTCA--GGCC-TATTAT----AAA--TA--GATTC-GAT----TTAATAG-ACA-A-A----AA----A-GGC-AA--TTATTA--TT------AA-CAGATTC-C--AA--ATAGCA-TT-A-CG-TT-CGA-GTG
gi|27 : agttatcACAT-ACT----GGT---AATAAA-CCT------T----A----TAA-----ATG-T------AA------TG--TCTGTGG-GACG---G----CA-----TTT---ATC-CAGAAT--GGAAACTT-A---AAA----GCACACA----TG-A----GGACA-C-A----TAC---T------GGTGA-----TAAG--CC-TTA---TAA-A-TGT--G-ATG-----TCT-GTG-G--GAAG-GCATTCAGTCA--AA---CA--GGAAT--C-TT---AC-ACA--G-A-C----A---TA-T---GA-G---------------G-ATA----C-A----T-AC---------T----G---G---TGAGAAAC---C---T---------T-ATA-AA-T-G-TGA-GGTCTGTGGA--AA-GGTGTTT-AGCT-----G-G---GC-AGGAGA---CT-TA---C--AT--G-----CACA-C--A---TGA-GA--ACAC-----ATA-CTGGTAAC--AAA-CCATATA-AAT-GT-G-ATATATGTGGGAt
gi|29 : cATCTGAAAAATG-ATTTACAGGAA--TGTATAAA---CAAA-A-ATGGAGGTGA-A-AAACAAAAAT---A-TGA--A-TGC--G-ATGTTT-GTTTTAA-GGTA-TTAACT-C-G--------GG-CTTA-C-T-TGAG--CAGACACAT-GAG-GATACAT-ACT----GGT---GAGAAA-CC------GT----A----TAA-----ATG-T------GA------TG--TTTGTGG-GAAG---A----CA-----TTC---AGT-CAGACA--GGATATTT-G---AAG----GTACACA----TG-A----
gi|29 : aaactcaag----GGT---GAAAAA-CA--A-AAAT----A----TGA-----ATG-C------GA------TG--TTTGTTT-TAAG---G----TA-----TTA---ACT-CGG-----GCTTACTT-G---AGC----AGACACA----TG-A----GGATA-C-A----TAC---T------GGTGA----G-AAA--CC-GTA---TAA-A-TGT--G-ATG-----TTT-GTG-G--GAAG-ACATTCAGTCA--GA---CA--GGATA--T-TT---G--A-A--G-G-T----ACA-CA-T---GA-TTNNNNNNNNNNNNNNN-NNN----N-A----A-ACAAAAA----T----GGAGG---TGAAAAACAAAA---A---------T-ATG-AA-T-G-CGA-TGTTTGTTTT--AA-GGTATTA-ACTC-----G-G---Gttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaaacaaaaatggaggtgaaaaacaaaaatatgaatgcgatgtttgttttaaggtattaactcggg
gi|3 : aaactcaagatctgaaaaatgatttacaggaatgtataaacaaaaatggaATG----TTT----TATAAC---TTT------T---T--ATTT-GTC--AT-GCCAAA-A---------------TCACTTCTTTG-ATTGCCT-----AAAA---TGA--TA---C----A--A-A---TG------TA-TTTTGA-----AT-----------AAAT---------TATG--------T---T--------------TGCT----T--A---T-TTTC-AA-G--T-TTG--AA--GCAATGAAATTC-AAATCT---T---GC-A---A-TAT-GCA-T---AT-T--TT--T--CT--------CGGTA-T--TCT--GCGCCATG--------------GT-GTG-----TGACGTTCA--TACG-CCCAATGAA------T--GTAA-----------A-C--AA---C---TCTCA--GGCA-TACTAT----AAA--TA--GATAC-GAT----TTAATGG-ACA-A-A----AA----A-GGC-AA--TTATCACGTT------AA-CAGTTTG-C--AG--ATAACA-TT-A-CG-TT-CGG-GTG
gi|30 : ctcctaCA--GAGACACAT-GAACAATACATTACT----GGTTTTGATATA-TCC-T-CATT----A----TAACTGATATGAT------GA------TG--TCTATGG-GAAT---T----AG-----TTG---AGT-AGGGCA--GGATCATT-G---AGG----ATATACAAATCTG-ATAAAGGGTA-T-ACTTTTACACATA-----GGTGC----ATAAAAGCC-TTAATATAGGAATGT----ATG-----TCT-GTT-G--GAAGTGC-CTCAATCA--CAAACCA--CGAA-----TT---A--C-AC-A-A-C----A-ATCA-T----A-G---------------G-GCA----C-A----TTAC---------T----GT--A---TGATAAAG---C---CAA-------T-ATA-AA-T-G-TAA-TGTGGTTGGG--AA-GGAGTTT-AATttgtgtgtcggttacgggtgtactagatgtcagaattagggtagtagcctaagtttttttttcaactttttcgaaggaaggttcgaggaaattttgtgtcgactcaaggactttaccataaataaaacagtcgattttctctttgtactgctaaaaaaataaaggaaaacataaacagttcgacagcaaccccgattaattgcgcgagaaggtgtttatatagacgctattgacacggattaagtctacaacgtttatttatgtacaggccatttcacgaaatacacgctcgcactcaaactgacctacataatagcacaacaacaaatactcctgaaggttcgtgttcccatttcctaccaaatcgcacatttaaaaaaaaaaaataacattacaataattaaagatcgaacttgtgtaaaaattacaaataagaaaatatgtagttcctcagtaaacatttataattttttcgtggacgcgcttttaaccatgacatgagatgtgtattgctgacaatgctctccggcattaccttgc
gi|31 : AC---ATT------T---CGTGTTTGTTT--AAAGC-AAA-A---------------TTACTTCTTTG-TATGCCT-----ATAC---TGAGTT----T----A--A-A---TA------TG-TTTTGAATAAAAT-----------G--T---------T-----------T---T---------------GCT----T--AG--T-TTTT-AA-G--T-CTG--AAA-GCAATGAAATTC-GAATC------TTGT-G---A-TAT--CA-T---AT-T--TG--T--CT--------CGGTA-TAGTATACGTTCCGTG--------------AT-GTG-----TGTCG-TCA--TAT------GCGATCT---TT--GCAA-------G---A-AACAA---CT--TGTTA--GCCA-TTTTAT----AAA--CA--AACTT-CATTTAATTAATCG-AC--A-A----AAC---A-GGC-AA--TTATCACGTT------AA-CAGCT
gi|32 : -AAAGCT---T---A-T-A--AATGT--G-ATTTTT-GTGGGAA-AACT-TTGAGT-T-G--T--AAAGC-T--G-CGT-TACT--GATACACAC-GAG-GATCCAT-ACT----GGT---GAGAGA-CCT------C----A----TGA-----ATG-T------GG------TG--TTTGTGG-GAAG---A----CA-----TTC---AAT-CAGACA--GGAGACTT-A---CAG----AGACACA----GG-A----GGATA-C-A----TAC---T------GGTGA----A-AAA--CC-TTA---T-A-AATGT--G-ATG-----TCT-GTG-G--AAAG-GCATTCAGTGC--GA----A--GGAAA--CATTAC-A--A-A--A-A-C------A-CG-T---GA-G---------------G-ATA----C-A----T-AC---------T----G---G---
gi|33 : ACAGACAAATGCACATGAA---GACA-CAAAACTGGTGATA-AAACC------------A--A--------ATGAAT-GTGGGAA-AGC--TT--------------------------T-GATG--GAAAC------AA-GCTAGAT-ACT----GGT---GATAAA-CCT----------------------------T------GA------TA--TCTTTTG-CAAG---GTGTACA-----TCC---GGT-CAGATC--GATGACTT-C---TAGTTCTAAACACG----TG-A----AGATA-C------TGT---TC-----AGTGATCTTACAAG--TC-CTA---T-A-AATGT--G-GTG-----CCT-GT
gi|34 : gaAAAC---C---T---------T-ATA-AA-TAG-TGT-GGTTTGTGGG--AA-Gtaacaag
gi|36 : agtgtaaacagaaaaagtaatgaatgtagtgaacttaggaaacctgtttgtgaaataattcaactaaagatcagaaaaatgatttacagagaacgggtgaaagatattggagtaaaaacatgttttcactgtgatgatagatatgcacaaaaggcgcaaagaacttcaagaCA----TA-A----GGACA-C-A----TAT---T------GATGA-----TAAA--CC-TT-----------GT--T-ATT-----TCT-GTG-G--GAAG-GCA----ATCA--GA---CG---------C-T---------A--G-A-C------------------T---------------T-ACA----C-A----T-AA---------C----A---G---TGATAGAC---C---C---------T-ACA-AG-T-G-TA---GTTTGTAGA--AA-GCCATTA-GGTC-----G-GACAGC-ACACCA---AT-TA---C--A---AAG-T-CACA-C--A---AG--GA-CACAT-----AAA-CTG--GAT--AAA-aacatcaat
gi|38 : ----ATACATA----TT-A----GAAGA-C-A----TGC---T------GGTGA-----TAAA--CC-TTT---TAA-A-TGT--G-ATA-----TAT-GTG-G--AAAG-GCATTT-GTCTT-GA---AA--GTAGA--A-TT---A--A-A--A-G-C----A---CA-TTTTG--T---------------G-ACT----C-A----C-AC---------T----G---G---TGAAAAAC---C---A---------T-TTC-AA-T-G-TGG-TGTCTGTGGG--AA-GGTATtggagatatgtgagagaggaa
gi|39 : gagaatatctgcgt-A----CAC---T------GGTGA-----CAAA--CC-AT----TCA-AATGC--G-AGA-----TCT-GTG-G--ACGG-GCCTTCCGACA--AC---CA--GGCAA--T-TT---G--A-C--G---C----G-T-CA-TC--GACT---------------G-ACC----C-A----C-AC---------C----A---C---AGTCAAAC---C---T---------T-ACG-TC-T-G-CCC-AACCTGCAAC--AA-AGCATTC-AACC-----G-G---GC-CTCCAA---CT-TA---C-------AC-A-CGCA-C--A---TGC-G--CACTC-----ACA-Catggtctaaaagttgtgttaaaga
gi|4 : ----TTT---C-A-AAC---TTT------T---TT-ATTT-GTC--ACTGC-AAA-A---------------ATCATTCTTTG-TATGCTA-----AAAA---TGA--C----TTACGA--A-A---TG------TA-TTTTGAATAA-AT-----------T--A---------T-----------T---T--------------TGCT----T--AG--T-TTTC-AA-G--T-TTG--AAA-GATATGAAATTC-AAA-------TTTGC-A---ATTAG-CCA-T---TTCT--TC--T--CT--------CGGTA-TTGTCTGCGCGCCATG--------------GTGGTG-----TGACG-TCA--TAT--C---ACGCCCTAG-TT----AA-------T---GTA--CA---C---TTCTA--GCCA-TAT--------AA--TA--A--TT-GAT----TT-ATGG-AC--A-G----AAACAGA-GAC-AC--TTATCA-GTT------AATCAGCTTG-CAAAG--ATAACA-TT-A-CG-TT-CG
gi|40 : ATCACATT------AA-CAGCTTG-C--AG--ATAACA-TT-A-CT-TT-TGG-GTGccctcttgtgttgtcattagcggatgtactacttgtcagaatagggtggtcctgagtagtcaactttttcgcaggaaggacgaggaaactttttgtgtcgactcaaggactttacgcataaataaaacaagtccgtttggtctttgtctgttaaaaaaaaataaaggaaaaagacagttggacagcaccccagattaatgcgcgaggaaaggttgtttttatatagaagctagacacagattaggtctacaagcgttttatatgtcagcctttcacgaaatacacgctcgcctcaactgacctacatcaatagcataattgttacaacaaatacttcaagttcctgttcccatttcctaccaaatgaaatgataataatacaatagttaaagattgaactgtataaaaatacaaaaagaaatatgtaagtccttcagtaagccatttgtataaatatatattttcgtcgacgcgcttttaaccatgacatgagatgtggtattgctgacaatgctctctctccggcattatttgc
gi|41 : TG----TTT---CTA-AAC-----G------T---TATAATT-TTTAAA--GC-AAA-A---------------CTACTTCTCAG-TATGCCT-----AAAA---TGG--C----TTA--A--A-A---TG------TA-TTTTAAATA--AC-----------A--TA--------T-----------T---T--------------TACT----T--AG--T-TTTC-AG-A--T-TTC--AAA-TCAATGAAATTC-AAACC------TTAC-A---T-TAT-ACATT---TT-T--TT--T--CT--------TGATA-T--ttgtgtgtcggttgatggtgtactagctgtcagaattagggaggtagcccgagtttttcaactttttcgaaggaaggtgcaaggaaaatttgttgatacaagaactttttcataaataaaactgttgcttt
gi|43 : cattgatAAAGGACACATAGCATAGATACTTAAATTA-AAC---TTT------T---TTAATTT-CTT--AA-GC-ACA-A---------------CT----CTTTG-TGTGCCT-----AAAA---TGA--CACTTT----A--A-A---TG---------------------T-----------G--T---------T-----------T---T--------------TGAA----TAAAG--TCTTTC-AA-AACT-TTGA-AAA-GTGATGGAATTG-AAACAA---TCTTGCAA---A-TAT-a
gi|44 : GGGCACATCGCATG----TTT---CTA-AAC----AT------T---TTGATTT-TTGA-A--GC-AGA-A---------------TTGCTTCTTTG-CATGCCT-----AAAA---TAA--C----TCTG-A--A-T---TGATTT--TG-A----------ATAAA--------A--TA--------T-----------T---T--------------TGCT----T--AG--T-TTTC-------T-T--------GCGATGAAATTC-AGATA------TTGC-G---A-TAC-GCA-T---AA-T--TT--T--C
gi|47 : GA--GATG-G-GG----TCATTACA---GAGACACAA--G-AG---GATA-C---ATACATGATACTGGTGATAAA-CATTAT----------T-AAA---------AAA-------------AA----TATT-----G-GGCA-C-TTAAAGAC-ACGCAA--GATGATACCTACCA-G-TGA-AAAA
gi|48 : ---G---TGAGAAAC---C---T---------C-ATA-AG-T-G-TAA-CGTATGTGGA--AA-AGCCTTC-AGCC-----A-G---TC-CTCCAAC--CT-TAT--C----------A-CACA-C--AGTCGGA-AA-CAC---------A-CCG--GATTCAAG-CCATTTA-AGT-GT-G-A
gi|5 : -AAAT----A-----AA-----ATG-CCCTTTCGA------CG--TCTGTGG-GAAG---G----CA-----TTC---CGT-GAGACA--AGTAAGGT-A---AAG----ACACACA----TG-A----GGATA-C-A----TAC---T------GGTGA-----TGAA--CC-TCA---TAA-A-TGT--G-ACG-----TCT-GTG-G--GAAG-GCATGCAGTGA--TA---CA--AGTAG--C-TT---A--A-A--G-A-C----ACA-CA-T---GA-G---------------G-ATA----C-A----C-AC---------T----G---G---TGATAAAC---C---T---------T-ATA-AA-T-G-TGA-TGTCTGTGGG--AA-GGCATTC-AGTC-----G-G---GC-ATACAA---TT-TA---G--A---GAG-A-CATA-A--AA--GGA-TA-CATGT-----ATA-GTAGTGAT--AAA-CCTTATA-ATT-GT-G-ATGCCTGCGAAAATA------CTTTCAG-CAAT--ATGGGATCA-TTATTTCG-CCTCATGAAG-A--AACATACTG-G-TAA-TAA-A-CCTT-A---TA-TATA-TGA-TGTC-TGTGGGAAA---ACATTTAGTGA--GACG-G-GA----CACTCACA---GACACATAT--A-AG---GATA-C---ATAC-------TGGTGATAAA-CCTTATAA--------TTCAA---------TAA-------------GA----CA-------G-GGAA-A-TTACAGAG-ACACAT--AGGGATACATACTG-G-TGA-TAAACCTT-TTGATTTATATATGTGATTTGTATTGGTAAGCGTTCATGTAAAGGACACGTCGAATG----TTT---TTA-AAC---TTG------T---TTTATTT-TTT--A--G------------------------------TTG-TATGCCT-----AGAT---TGA--C----T----ACAA-A---TG------TG-C----------AT-----------G--TA--------T-----------T---T--------------TGTT----T--TT--T-TTTT-AAAG--T-TTG--AAA-GCAATAAAATTC-AAAT-T---TTTTGT-G---A-T-T-AAA-T---AT-T--TT--T--CT--------TGGTA-T--TTTCTGCGTCATG--------------AT-GTG-----TGACG-TCA--TATA-T---GTGACCT---TT--GCGA-------T---A-A--AA---C---TGTTA--GCCA-TATTAT----AGA---A--AATTC-GAT----TTAATGG-AC--A-A----AA----A-GTC-AA--TTATCACGAT------AA-CAGCTCG-C--AG--ATGACA-TT-A-CG-TT-TGG-GTGC
gi|51 : ---------T-----------T---T--------------TGCT----C--AA--T-TTTG-AA----T-TTG--AAA-GCAAGGAATTTC-TAA------TTTTGT-G---A-TAC-GTA-T---t
gi|53 : ctaagtgaaataagtatcaagtgaagtaTTG-CATGCCT-----AAAT---TAA--CTT--T----T--A-A---TG------TG-T--------------------------T---------T-----------T---C--------------TG-TGAAAT--AT--T-TTGCGAA-A--TATTG--AAT-TC-ACGAAATTC-GAATC------TTGT-G---A-TAC-GCA-T---tagcatcagatag
gi|55 : cCTT-A---CAG----AGACACA----TA-A----GGACA-C-A----TAC---TATATGCAGTG-----ATTGA--TC-TTA---TAA-AATTT--G-ATG-----TCT-tat
gi|56 : --CACATGAG---GACA-C-ATACAGGAGA-A-CGCCCG---T---A-CAA--A-TGT--A-ACACGT-GCGGGAA--ACAGTTCGCT-CAG--T--ACGGGAC--A-C-T-aggtatgaaaagtgttc
gi|57 : AAAGGACACATCGCATG----TTT---CTA-AAC---TTT------T---TGAATTT-TGC--A--GC-AAA-A---------------TTACTCCTTTG-TATGCCT-----AAAgta
gi|6 : AAGGACATATTGCATG----TTT---CTA-AAT---TGT------TAGATTTTTTT-TTT--A--AC-AAA-A---------------TTAGGTCTTTG-CATGACT-----AGAA---TGA--CTT--T----A--G-A---TG------TG-TTTTAAATGAAAT-----------A--T---------T-----------TTAAT--------------TACG----T--AG--T-TCTT-GA-G--T-TTG--AAA-G-------GTAC-AAATCTCAGTCTTGC-G---A-TAT-GCA-T---AT-TAATT--TTACTTA------TGATA-T--TTTATGTACGATG--------------AA-GTGTCGTCTGACA-TCA--TAT------GTGACCTAGAGT--AAGG-------TCTGA-A--AACAGC---TGTTA--GCCA-TTCTAT----AAATTTATTGATTA-GAT----TTAATTG-AC--A-A----AAT---A-GCC-CA--TAGCTATG-T------A------TTG-T--AG--ATAACT-TT-G-CA-TG-GGG-GTGC
gi|61 : ATGAG---GACA-C-ATACTGGTGA-G-AAACCA---T---A-T-A--A-tgtgcaccatttatgggtgcacatatactaagtgtcaaaagaagtgatgtatagactgaggtttttcaaatttttctaaagaaggtgtgaggaaaaagaagtgggtgatttttttgtcagcacattaaggacttggtcataacccctcccctctacagtcacctttgtccatgttctttttcaaaaaactattggacagagacccatttaactgtgaggaaatagttatgtagaagccaggcacagctaggcctacagtatatggattctgttctggtcgtcatcatttcacaaatactcactcgcaccttggaaataaaaacggacattgtaacagtatatacttgtgttcccagttcctgtaaacttgtagaattataaaaaaaaaaataaattaaagattgaaaataattgaactt
gi|7 : ACA--GGAAGCTT-A---CAG----GCACACA----TG-A----CAACA-C-A----CAC---T------GGTGA----A-AAC--CC-TTA---CAA-A-TGT--G-GTG-----TCT-GTG-A--AAAA-GCATTCCCTCA--CA---TA--AGTCC--T-TT---A--C-A--G-A-G----ACA-CA-T---AA-T---------------G-ATA----C-A----T-AC---------T----G---G---TGATAAAC---C---T---------T-ACA-AA-T-G-TGA-TATCTGTGGA--AA-GGCGTTC-ACTT-----ATA---AT-GGA-GA---CT-TG---C--G---TAG-A-CACACC--A---G---GA-CANNN-----NNN-NNNNNNNN--NNN-NNNNNNN-NNN-NN-N-NNNNNNNNNNNNNNN------NNNNNNN-NNNN--NNNNNNNNN-NNNNNNNN-NNNNNNNNNN-N--NN-NNNNNN-N-NNN-NNN-NNNNNNNN---NN-NNNN-NNG-TG---TGTGGGAGG---GCATTCAGTGA--GACA-G-GAGC--C--ATGCG---GAAGCACAT--G-AA---GATA-C---ATGC-------Ta
gi|7 : cattccctaacGTGT-GTGGGAG-GGCA-TTCAGT-G-A--G--ACAGG-A--G-C-CATGCG--GAAGCACAT-GAA-GATACAT-GCT----NNN---NNNNNN-NNN-N-NNNN----N----NNN-----NNN-N------NN------NN--NNNNNNN-NNNN---N----NN-----NNN---NNN-NNNNNN--NNNNNNNN-N---NNN----NNNNNNN----NN-N----NNNNN-N-N----NNN---N------NNNNN----NNNNN--NN-NNN---NNN-NNNNN--N-NNGTGATGTCT-GTG-G--AAAG-GCATTCAGCCG--TA---C---GGGAA--CATT---A--A-A--G-A-G----ACA-CA-T---GA-nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngtgatgtctgtggaaaggcattcagccgtacgggaacattaaagagacacatgacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaaccatatcagtgtgatgtctgtgggaaggctttcaggcattcagtaacattatataagcata
gi|7 : cattccctaacacaggaagcttacaggcacacatgacaacacacactggtgaaaacccttacaaatgtggtgtctgtgaaaaagcattccctcacataagtcctttacagagacacataatgatacatactggtgataaaccttacaaatgtgatatctgtggaaaggcgttcacttataatggagacttgcgtagacacaccaggacannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn-GT-G-ATGTCTGTGGAAAGG------CATTCAG-CCGT--ACGGGAACA-TTAAAGAG-ACACATGAcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaaccatatcagtgtgatgtctgtgggaaggctttcaggcattcagtaacattatataagcata
gi|7 : cattccctaacacaggaagcttacaggcacacatgacaacacacactggtgaaaacccttacaaatgtggtgtctgtgaaaaagcattccctcacataagtcctttacagagacacataatgatacatactggtgataaaccttacaaatgtgatatctgtggaaaggcgttcacttataatggagacttgcgtagacacaccaggacannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngtgtgtgggagggcattcagtgagacaggagccatgcggaagcacatgaagatacatgctnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnAA-CCATATC-AGT-GT-G-ATGTCTGTGGGAAGG------CTTTCAG-GCAT--TCAGTAACA-TTATATAA-GCATAcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaaccatatcagtgtgatgtctgtgggaaggctttcaggcattcagtaacattatataagcata
gi|8 : cattccctaacacaggaagcttacaggcacacatgacaacacacactggtgaaaacccttacaaatgtggtgtctgtgaaaaagcattccctcacataagtcctttacagagacacataatgatacatactggtgataaaccttacaaatgtgatatctgtggaaaggcgttcacttataatggagacttgcgtagacacaccaggacannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngtgtgtgggagggcattcagtgagacaggagccatgcggaagcacatgaagatacatgctnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngtgatgtctgtggaaaggcattcagccgtacgggaacattaaagagacacatgacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn---------------TTACTTCTTT--TATGCCT-----AGAA---TGT--A----T----A--C-A---TGGATTT-TGAT----------AA-----------A--TA--------T-----------T---T--------------TGTT----T--GG--T-TTTA-AAAG--T-TTG--AAA-GCA-TGACATTT-AAATCT---T----C-G---A-TATTGCT-T---TT-T--CTCCT--CT--------CGGAA-T--TTTGCGCGCCATG--------------AT-CTT-----TGACATTCA--TATGTC---GT--CCT---TT--
gi|8 : g-A--AA---C---TGTTA--GCCA-TATCATTTCAAAA--T-----TTCCGAT----TTAATGGCAC--ATA----CA----A-GTC-AA--TCATCACGTT------AA-CAGTTTGTT--AG--ATAACA-CTAA-CG-TT-CAG-tacaacaccaaaaaaaaaaaaaacaaaaaaaaaaacaaactgttagccatatcatttcaaaatttccgatttaatggcacatacaagtcaatcatcacgttaacagtttgttagataacactaacgttcaggggtcggttacggatgtaatagctgtcaaataaggactgtaccgtgaacattgtcaacttttacgaaggaaggtgcgaggaaaaagacgagtattttgtcacacaggaccaataccataaaatcaaaacagtcgtttttgctccatgtactgttaaaaaagaaatgatattattagaaataaaggaaaaccaaacacaggtaggcagcgaccaggtttaacttgcgaggtgtttattttagaagcggatattcgcaactacatgcttacagtgttacattgccaagatatgacacaaaattacacacccgtacacactccctaagaatatgtactcagactcgcattctcattcctaccaaatcgcaaatacacaaatatatgaattaaagatttgaattgaagttgtatttacaataataaatatgtaa
gi|9 : gttacttcttttatgcctagaatgtatacatggattttgataaatattttgtttggttttaaaagtttgaaagcatgacatttaaatcttcgatattgctttttctcctctcggaattttgcgcgccatgatctttgacattcatatgtcgtccttttacaacaccaaaaaaaaaaaaaacaaaaaaaaaaacAAGGACATATCCCATG----TTT---CTA-AAC---TTT------A---TTAATTT-TTA--T--GC-AAA-A---------------TTACTTCTCTG-TATGCTT-----AAAA---TGA--C----T----A--C-A---GA------TA-T----------AT-----------T--T---------TAAATACATTAAT---T--------------CGCT----T--AG--T-TTTC-AA-GT-T-TTG--AAA-GCAATGAAATTCAAAATC------TGGC-A---A-TAT-GCA-T---AT-T--TT--T--CT--------CGGTA-T--TCTGCGCGCCATG--------------GT-GTG-----TGACG-TCA--TATA-C---G---CCT---TT--G-GAATG----T---A-AACAA---C---TCTCA--GGC--TA--AT----AAA--TA--GATTC-GA-----TTAATAG-AC--A-AG---AA----A-GGC-AA--TTAT-ACGTT------AA-CAGATTG-C--AA--AT-GCA-TT-A-CG-TTACGA-GTGggtcggttacggatgtaatagctgtcaaataaggactgtaccgtgaacattgtcaacttttacgaaggaaggtgcgaggaaaaagacgagtattttgtcacacaggaccaataccataaaatcaaaacagtcgtttttgctccatgtactgttaaaaaagaaatgatattattagaaataaaggaaaaccaaacacaggtaggcagcgaccaggtttaacttgcgaggtgtttattttagaagcggatattcgcaactacatgcttacagtgttacattgccaagatatgacacaaaattacacacccgtacacactccctaagaatatgtactcagactcgcattctcattcctaccaaatcgcaaatacacaaatatatgaattaaagatttgaattgaagttgtatttacaataataaatatgtaa
blockSeqs : . G TG GTTT AC G AG AAAATATGA A TGG T T T G GTC TGTGTAAAGGTGCG A AAA G C C T TCAA TTT A A ATAGAAAT ACTG C CTGAT A CCTTTC AATTTA AG CGT GTGTA CTTGA TCTT TCA AGACA TT T CAGA TTCT A AATC A TAAA T C CTTT ACA ATATGC TCTTAC AG C ATA AATAA TG C TGATG T T TAA T CT AAC ATA ATATTTGAAGGTACACATGATTNNNNNNNNNNNNNN T GGAT T AATG T AAACACAAATGGAGG T ATAGAAATAAC AA T T A T T GA T G A GGACAGCACACC TTT G GTGCGAA A T CAAAACATATGAGGATAAT T TC C T T C T T T AGATGTTT GTCA TGAG A AC AGAGCA TTAGAC ACACATAATGCGTTGA T AACAG TA T T G TGT AT TC CA AGATT GAG TGA TTT A CAA ATGATAC C TTGAATGTCTGGGTAAAAGATGTTTTATTGACA T CA C C TA C T TA T G T G T GATA AAA T ATT ACATAATTTT G AAAGAAAAAACTTGCTTTGTGTGC A CCCCT ATT GT TACAAATGTAAATGTATTTTGAATAAATCATTA GAAA AA GT C G AAC A CT C A TCTCAGTC A TGC T TG T ATG C AA CC TA CAGCGCAA T AG A GGTGTGTTTTTGTT G TCGTC T AG GTGACCTAGAGTAAGGTCTGAA CAG AAT AG T TTCA TTTATT A TTAA C TA T AAAT ACAG G A AT C ACCGTA T C T AA CT C A T A A T
blockSeqs : C . G CA T TA TTCCAATA . TGT C T . . CAG GCGTAAGGGATCA . TG G . C . . . T . CCTCATT . A C . . A . TT AAAG . A CG AAA AA . A . A . . . . . . . A GA . . . AGGAA T T . T . G . T . G TAAAACTAAAGACCAGGAAAATGAT . . . . . AAAAATGGAGG A AAAGT A . . . . . . . . C ATCGAGGGAC C . CAGAG . . CATTGAAGGATACCAA . . . . A . . . C TG GCC AT T A AGAAA TGAGG CATAGAATGGTGACC . TA T . . . . AT T G CAC . GA . T . . . ATGTGATGTCTGCGGGAGGTTCAGTCGTAT . AC A . . . . G A . A T T . . . . TAGATTT . CATGCCAAAAT . . . . TTTAGATGTGTTTTAAATGAAATATTTTAAT C . CA . . AG . A . . TCCTT . . T G . . . . C . TA . TG G . . . T . ACGCCCGAATGAATGTAAAC . T . . C TG C CG . TT . G G . . . C . T T . . TT . . . . . .
blockSeqs : G . G C C A TCATACA . AT T . . . TAG GACTGAGAGGAAC . G T . . . . . A . NNNNNNN . C . . . T . GG G . C GA ACA AC . C . A . . . . . . . C TT . . . AAAA . A . . . G . . . G AAACCTATAGAGCACACATTAGAC . . . . . TTCAAGG A AAAAA A . . . . . . . . A GGAAAACCG . . CAT . . AAAGGATACATGTAT . . . . T . . . G GA CTG TC A A TTCGA TGAGG AACATACTGGTAAT . TA A . . . . AT . G CCG . A . . . . . TAAAAAAAATATT . A T . . . . A A . T G T . . . . TTTT . TAAAGCAAAAT . . . . TACAGACTGTTATTTAAATAAATAATTTGT . . . . . AG . A . . CAATC . . . A . . . . . . . . . A . . . . . ACGCCTTTGGAATGTAAAC . . . . . CG . . . A . . C . . . C . . C . . . . . . . . .
blockSeqs : . . A C C T TTATATA . G C . . . CAG CAGTACGGGACAC . A C . . . . . A . AAAAAT . C . . . . . TG G . T CG AAG AG . A . G . . . . . . . . AG . . . ATAA . . . . . G . . . A AAACATTACAAAAACACGTGAG . . . . . TGCGT T CCAA G . . . . . . . . G AGACAACAC . . CA . . AAAGGATACATGTAT . . . . G . . . G GA GTT AT A A TAACA TGAAG NNNNNNNNNNNNN . AA A . . . . T . G TCA . G . . . . . TTCAATAAGACA . C A . . . . A T . . . . . . . AAGT . CACTGCAAAAA . . . . TTACGAAATGTATTTTGAATAAATTATTT . . . . . GT . . . . TTAT . . . G . . . . . . . . . G . . . . . ACGCCTTTGGAATGTAAAC . . . . . CA . . . A . . T . . . C . . T . . . . . . . . .
blockSeqs : . A C G C TTACTT . G C . . . CAC CGTATGGGAACA . A A . . . . . A . AAAGTT . C . . . . . GG G . A TG CGA AT . A . G . . . . . . . . AT . . . CAAA . . . . . G . . . G TAGAGTACAGTGACACATGAT . . . . . TGTA T CAT T . . . . . . . . G TGAAAACCG . . TA . . TGAAGGAAATCAT . . . . A . . . T TA GCA NN A N TGTGT NNNNN AATACTGGTGA . NN A . . . . T . C CAC . G . . . . . TTCAATAAGACA . A C . . . . T . . . . TCGT . TAAAGCAAAAC . . . . TACAAATGTATTTTGAATAAATTATTT . . . . . G . . . . TCTG . . . G . . . . . . . . . G . . . . . ACGCCTTTGGAATGTAAAC . . . . . TA . . . A . . . . . . C . . T . . . . . . . . .
blockSeqs : . G A C T TTACCA . G T . . . CAG TATTCAGGATCA . C G . . . . . T . AAAAAT . A . . . . . GT G . C GC AAT GA . A . A . . . . . . . . GA . . . AAAA . . . . . A . . . G ACATTTTAAAAAGACAAGATT . . . . . TGA A TT A . . . . . . . . A GGGCAGGAG . . CA . . CATGAGAACACAT . . . . A . . . T NN NNN AC T A AAAAG AGA AGATACAT . T A . . . . A . G GCC . G . . . . . . . . . TTAT . CATGCAAAAT . . . . ACAAATGTATTTTGAATAAATTATGTT . . . . . G . . . . TCTT . . . G . . . . . . . . . G . . . . . GCGATCTTTGCAAGAAAC . . . . . TA . . . . . . . . . . C . . T . . . . . . . . .
blockSeqs : . G C C C GTACAA . G T . . . AAC TGTAAAGCTGCG . G G . . . . . G . AAAAT . G . . . . . GA G . A CA ACA AA . C . G . . . . . . . . AT . . . NNNN . . . . . T . . . G AATCTTACACAGACATATGAG . . . . . TGG A CT A . . . . . . . . C GGGCCTCCA . . CA . . CAAGGACACATAA . . . . A . . . T GG GCC TC T A TTCGC . AGACACAT . A T . . . . A . G CC . A . . . . . . . . . TTTA . TATGCAAATA . . . . TTAAAATGTATTTTAAATAACATATTT . . . . . G . . . . TTTT . . . G . . . . . . . . . A . . . . . CACGCCCTAGTTAATGTA . . . . . TA . . . . . . . . . . C . . T . . . . . . . . .
blockSeqs : . . C C A TATAA . G T . . . GAG CGCAAAACAAA . G T . . . . . T . AAAAT . A . . . . . CG T . C CA GCA AT . A . C . . . . . . . . AT . . . AAA . . . . . G . . . G AGAATTAAAAGCACATTTTGT . . . . . TGG A CT A . . . . . . . . G AGTCCTCCA . . CA . . CATGCGCACTCAC . . . . G . . . T GG GGC A N . NNNNN . AGAT . N . . . . A . G C . G . . . . . . . . TTTG . TAAGCACAAC . . . . TCTGAATTGATTTTGAATAAAATATTT . . . . . G . . . . TCTT . . . C . . . . . . . . . G . . . . . ATGTGACCTTTGCGATAA . . . . . CA . . . . . . . . . . C . . T . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . A TTATA . A A . . . CGC GAGACAGGAGC . G A . . . . . A . CTT . A . . . . . GG C . T CA ACA TT . A . C . . . . . . . . AT . . . AAA . . . . . G . . . G CAATTTGACGCGTCATCGACT . . . . . TGG G CT A . . . . . . . . C GGGCATACA . . CA . . CAGTCGGAAACAC . . . . T . . . C A CA A A . AGAGA . . . . . . . . . . . . . TTTT . GAAGCAGAAT . . . . TACAGATATATTTTAAATACATTAATT . . . . . G . . . . TC . . . A . . . . . . . . . C . . . . . GCGACCTTCGAGCGAGG . . . . . TA . . . . . . . . . . T . . T . . . . . . . . .
blockSeqs : G ATATA . . G . . . CAG CGGGCTTAC . G A . . . . . T . CAT . G . . . . . GG G . C CG ATC AT . A . T . . . . . . . . NN . . . ATA . . . . . G . . . G TAGCTTAAAGACACACATGAG . . . . . TGG A CT A . . . . . . . . A ATAATGGAG . . CA . . CCAGGACANNNNN . . . . N . . . N . . . A . ATAAG . . . . TTGA . CAGCAAAAT . . . . TATAAATGGTATTTGAATTATTATTT . . . . . G . . . . TT . . . G . . . . . . . . . A . . . . . GCCGTCCTTCGCGAGAA . . . . . TA . . . . . . . . . . C . . C . . . . . . . . .
blockSeqs : A . G . . . . . . . . . . . . . T . CTT . A . . . . . TT G . A AG ACA AG . A . G . . . . . . . . G . . . AAA . . . . . A . . . C TCCTTTACAGAGACACATAAT . . . . . TGG T CT A . . . . . . . . G GTGAAGCG . . TC . . CATGAGGACCAT . . . . G . . . T . . . . ATTA . TAACAAAAT . . . . TAAATATGTTTTGAATAAAATGTTTT . . . . . G . . . . TC . . . A . . . . . . . . . G . . . . . GCCCAATGAATGTAAAC . . . . . A . . . . . . . . . . C . . T . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . G . CTT . A . . . . . GG A . G CA ACA TG . C . T . . . . . . . . T . . . AAA . . . . . G . . . G ATATTTGAAGTGCACATGAT . . . . . CAG T CC T . . . . . . . . A ATTATACA . . GA . . TTAAGGCACGT . . . . . . . . T . . . . TTT . ATGCAAAAT . . . . TACATGGATTTTGATAAATATTT . . . . . G . . . . TC . . . G . . . . . . . . . G . . . . . GTGTCCTTTGCGATAA . . . . . A . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . .
blockSeqs : . . A . CTA . G . . . . . GG G . C CA NNN TA . T . G . . . . . . . . G . . . AAA . . . . . A . . . G AACTTATTAACACACATGAG . . . . . TGG A CA A . . . . . . . . G GAAAGTCC . . CG . . CGATAACACTC . . . . . . . . . . . TTT . CAAACAT . . . . TAAAGGACACATTGCATGTTTT . . . . . A . . . . CC . . . G . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . .
blockSeqs : . . T . CTT . A . . . . . TG T . C GA CT AA . A . A . . . . . . . . A . . . AAA . . . . . A . . . G TAACAGAGACATTCAGTGA . . . . . CAC C CT A . . . . . . . . G GGGCA . . A . . GTAACACAC . . . . . TT . TAG . . . . TAACAGATGTATTCTTAAATTA . . . . . A . . . . TA . . . G . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . G . CGT . G . . . . . GG A . C NN . NN . C . T . . . . . . . . T . . . AAA . . . . . G . . . A AATTACACAACAATCATAG . . . . . TGG G CT A . . . . . . . . C . . C . . . T . AG . . . . TACAAATGTGCATGTATTT . . . . . G . . . . TT . . . G . . . .
blockSeqs : . . T . CTC . A . . . . . NN G . N . . T . C . C . . . . . . . . T . . . AAA . . . . . A . . . A AATTTGAAGGCACATGT . . . . . TGG T CT A . . . . . . . . . . . . . ACTTTAAATGTGTTTT . . . . . . . . . . TC . . . . . .
blockSeqs : . . N . CT . N . . . . . . N . . . . . N . G . . . . . . . . C . . . AAA . . . . . A . . . G GATCATTACAATCGAA . . . . . GG T CT . . . . . . . . . . . . . TTTTAATGTGTTTTC . . . . . . . . . . TC . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . . T . . . AA . . . . . . . . . . CTAGACT . . . . . TA . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . .
blockSeqs : . N . . . . . . . . A . . . AA . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . .
blockSeqCons : CGTACGGGAGC*********** CNT********** AT**** AAA** CATGAGGACACAT************** AGATACTGGTGAT****** A* G** CCC**** CAAGCAAAAT******************** G*** TC****** GCGCCTTTGNAATGTAAAC********************* TA****
originalCons : GAAAGGGCATTTTATCTGAAAAGCGGATACAGAGAAA--CACATGAG---GACA-C-ATACTGGTGA-N-AAACCT---T---A-T-A--A-TGT--G-ATGTCT-GTGGGAA-GACA-TTCAGT-C-G--C--ANGGG-N--A-C-T-TACG--GAGACACAT-GAG-GATACAT-ACT----GGT---GANAAA-CCT-A-AAAT----A----TAA-----ATG-T------GA------TG--TCTGTGG-GAAG---G----CA-----TTC---AGT-CGGANA--GGANACTT-A---AAG----ANACACA----TG-A----GGATA-C-A----TAC---T------GGTGA----ATAAA--CC-TTA---TAA-AATGT--G-ATG-----TCT-GTG-G--GAAG-GCATTCAGTCA--GA---CA--GGNAA--C-TT---A--A-A--G-A-C----A-A-CA-T---GA-T---------------G-ACA----C-A----T-AC---------T----G---G---TGANAAAC---C---T---------T-ATA-AA-T-G-TGA-TGTCTGTGGG--AA-GGCATTC-AGTC-----G-G---GC-ANACGA---CT-TA---C--A---GAG-A-CACA-C--A---GGA-GA-CACGC-----ATA-CTGGTGAT--AAA-CCTTATA-ANT-GT-G-ATGTCTGCGGGAAGG------CATTCAG-CNAT--ACGGGAACA-TTATNNAG-ACACATGAGG-A--AN-ATACTG-G-TGA-TAA-AACCTTNA---TG-AATG-TGA-TGTC-TGTGGGAAG---ACATTCAGTGA--GACG-G-GA----C--TTACA---GACACACAT--G-AG---GATA-C---ATAC-------TGGTGATAAA-CCTTATAA--------T-CAA---------TAA-------------GA----CA-------G-GGAA-A-TTACAGAG-ACACAT--GAGGATACATACTG-G-TGA-NAAACCTT-TTGATTTATATATGTGATTTGTATTGGTAAGCGTTCATGTAAAGGACACGTCGCATG----TTT---CTA-AAC---TTT------T---TTTATTT-TTT--A--GC-AAA-A---------------TTACTTCTTTG-TATGCCT-----AAAA---TGA--C----T----A--A-A---TG------TG-T----------AT-----------G--T---------T-----------T---T--------------TGCT----T--AG--T-TTTC-AA-G--T-TTG--AAA-GCAATGAAATTC-AAATCT---TTTTGC-G---A-TAT-GCA-T---AT-T--TT--T--CT--------CGGTA-T--TTTGCGCGCCATG--------------AT-GTG-----TGACG-TCA--TATA-C---GTGACCT---TT--GCGA-------T---A-A--AA---C---TGTTA--GCCA-TATTAT----AAA--TA--AATTC-GAT----TTAATGG-AC--A-A----AA----A-GGC-AA--TTATCACGTT------AA-CAGCTCG-C--AG--ATAACA-TT-A-CG-TT-CGG-GTGC
finalCons : GAAAGGGCATTTTATCTGAAAAGCGGATACAGAGAAA--CACATGAG---GACA-C-ATACTGGTGA-N-AAACCT---T---A-T-A--A-TGT--G-ATGTCT-GTGGGAA-GACA-TTCAGTCGTACGGGAGC-----------T-TACG--GAGACACAT-GAG-GATACAT-ACT----GGT---GANAAA-CCNT----------A----TAA-----ATG-T------GA------TG--TCTGTGG-GAAG---G----CA-----TTC---AGT-CGGANA--GGANACTT-A---AAG----ANACACA----TG-A----GGATA-C-A----TAC---T------GGTGAAT----AAA--CC-TTA---TAAA--TGT--G-ATG-----TCT-GTG-G--GAAG-GCATTCAGTCA--GA---CA--GGNAA--C-TT---A--A-A--G-A-C----A-A-CA-T---GA-T---------------G-ACA----C-A----T-AC---------T----G---G---TGANAAAC---C---T---------T-ATA-AA-T-G-TGA-TGTCTGTGGG--AA-GGCATTC-AGTC-----G-G---GC-ANACGA---CT-TA---C--A---GAG-A-CACACATGAGGACACAT--------------A-CTGGTGAT--AAA-CCTTATA-ANT-GT-G-ATGTCTGCGGGAAGG------CATTCAG-CNAT--ACGGGAACA-TTATNNAG-ACACATGAGG-AAGATACTGGTGAT------AA-AACCTTNA---TG-AATG-TGA-TGTC-TGTGGGAAG---ACA-TCAGTGA--GACGG--GACCC----TTACA---GACACACAT--G-AG---GATA-C---ATAC-------TGGTGATAAA-CCTTATAA--------T-CAA---------TAA-------------GA----CA-------G-GGAA-A-TTACAGAG-ACACAT--GAGGATACATACTG-G-TGA-NAAACCTT-TTGATTTATATATGTGATTTGTATTGGTAAGCGTTCATGTAAAGGACACGTCGCATG----TTT---CTA-AAC---TTT------T---TTTATTT-TTCAAGCAAAAT--------------------TACTTCTTTG-TATGCCT-----AAAA---TGA--C----T----A--A-A---TG------TG-T----------AT-----------G--T---------T-----------T---T--------------TGCT----T--AG--T-TTTC-AAG---T-TTG--AAA-GCAATGAAATTC-AAATC------TTGC-G---A-TAT-GCA-T---AT-T--TT--T--CT--------CGGTA-T--TTTGCGCGCCATG--------------AT-GTG-----TGACG-TCA--TATGCGCCTTTGNAATGTAAAC---------------------AA---C---TGTTA--GCCA-TATTAT----AAATA----AATTC-GAT----TTAATGG-AC--A-A----AA----A-GGC-AA--TTATCACGTT------AA-CAGCTCG-C--AG--ATAACA-TT-A-CG-TT-CGG-GTGC
16 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|21 ): GCCAGAATAAGGGTGGTAGTCTAAGTTTTTTTCAGTTTTTTTTCCAAGGAAGGTACATACTGAAGGAAATGTTTTTTGACACCAAGGACTTTACCATAATTAAAACAGTCGCTTTTGTCCATGTGTTGTAAGAAAAAAAAATACACGTAATAAAATAATGAAACAACAACAGTTGGACAGCAACCCAGTCTAATAGCTAAAAAGTGTTTATATAGAAGTTAAACACGGCTAGGCCCACAGCGTAAATTGTGTCCAGGCCCAGGATCACCCGCTCAAACTGACCTACAAATAGCATAACAAATATTCAGGTTCGTGTATTAAAAATTTAATTGAATTATAAGATAATTATGCAAT
Unaligned ( gi|22 ): CCAGAATAAGGGTGGTAGTCTAAGTTTTTTCAGTTTTTTTTCCAAGGAAGGTACATACTGAAGGAAATGTTTGTTGACACAAGGACTTTACCATAATTAAAACAGTCGCTTTTGTCCATGTGTTGTAAGAAAAAAAAATACACGTAATAAAATAAATGAAAACAACAACAGTTGGACAGCAACCCAGTCTAATAGCTAAAAAGTGTTTATATAGAAGTTAAACACGGCTAGGCCCACAGCGTAAATTGTGTCCAGGCCCCAGGATCACCCGCTCCAACTGACCTACAAATAGCATAACAAATATTCAGGTTCGTGTATTAAAAATTTAATTGAATTATAAGATAATTATGCAAT
Unaligned ( gi|24 ): GTGTACTAATGTCAATTAGCGTGGTGAGCCCTGAGTTTTTGTCCAAGAAGGAAGGTTCGGAGAATTTGTTAGTCTGTCGCTTCAAGGACTTAACCATAAAAAAACATCGCGTTTTGTCTCTTTGTAACTGTTAAAAAAAAAAGGGGAGAAACATAAACAAGTGGACAGCGTAACCCCGATTATTGCGCGAGAAGTTTTAAAGTATAGAAAGCTATAAGACACGGCAGTTAGGTCTACAACGTTTATTTATGTCAGCCATTTCACGAATACACGCCCGCACTCAACTAGACCTACATAT
Unaligned ( gi|28 ): TATGTTCGGGTGGTGTGTGTCGGTTACGGGTGTACTAGCTGAGTTTTTCAACTTTTACGAAGGAAGGTGCGAGGAAATTTTTGTCGACACAAGGTCATTATTATAAATAAAACAGTCGCCTTTGTCCTTGTACTGTTAAAATATCAAAATAAAATAAAGGAAAACATAAACAGTTGGACAGCAACCCAGTTTAACTTTATATAGAAGCTAAACACAGCTAGGCCCACAGCGTATAGTGTCCAGGCCATTTCACGAAATACACAACAGTACCAACTGACGTACATAACATATAT
Unaligned ( gi|35 ): AATTTAGCTAATCGAAGTTACATCGGTTTATCGAAGCTACACATCAACATATTTCACTAAAACGTGTCATAATGGTAATTTCTGGCTGCTAGCCATTCCCTTTCGGGTATTAGTAAGGTCATTATGTCACGACTACCGTGCAAAATTCCCCAGGAGTTGGCGCACAGAAATTCAAGAGGTAAGGCGGAGT
Unaligned ( gi|37 ): ACAACAACAAATATCTCCTGACAGCTTCTGTGTTTCCATTTTCTCTAAGCCAAATCGCGCATCATTTATAAAAAAATTAATGAATACAATAATTAAAGATATCGAACTTCTTAATAAAAAATTACAAAAATGAAGAAATATGTAGATTTATATAATCTTTTATACTGTGGAACGACAGCGCTTCTTTA
Unaligned ( gi|42 ): AGGACATCTAGGCCTACAACATATGCATTAATATTCTGTTCTGGTCGTCGTCATTTCCCAAGATACATGTATATACTCGCACTTAGGAATTTAAACTAACTCCGTACCACTAACTAACAATTTATCTTGTGTTCCCACTTCCTACCAACAT
Unaligned ( gi|45 ): GTTATAATTTGTCATCAGAGATGTGTTCACCAACGTTGACAACACTAGAATTTAGACTGGAATGAAACACCCCATTGAAAATAGCCCTCCTCAGATGACTATTCTTTTCATCTACCCAACCAAT
Unaligned ( gi|46 ): AAAGATTGAACTTGTATTTACAAATAATAAATATGTAATTCCTCAGTAAACATTTCATTGATTTCACGCGGTTTAACCATGTCATCAATATGAGATGTGTATTGCCGTGCTCTCCGACGGCTT
Unaligned ( gi|49 ): GCAACCCAGCCTAGTTGCGAGAAAATGTTTTTATAGAAGCTAAACACGGCTTGGCGCACAGCGTAAATTCTCCAGGTCATTTCACGAAATACACACCCGC
Unaligned ( gi|50 ): AAAATGTCTTCCAATGTCATTTCTGGCTGCCAGTTCCTTCCCTTTTTCTGGTATTAATGAGGTCATCAATTACGTCACGACCACCGTGCAAGACT
Unaligned ( gi|52 ): GTATCTAATGCTCTGTTACGTTCGACATCATATGCGTCCTTGAGTGAGAAGGTTTGAAAACATTAGTTTTATAAATGGATTAAATTTAATCAAC
Unaligned ( gi|54 ): TGATCTTCCTCACTTCACGCAATACACACTCGCACTTTGGGAATAAAAGAACATGCACTTGTGCTCCCATTTTCTATCAACTATTAGA
Unaligned ( gi|58 ): TACAATATTAATGGGATTGAACTACTTCAAGGTTAAATCCATTTATCAAAGTAAA
Unaligned ( gi|59 ): GATGTGTATTGCCGTGCTCTCCGCCGGCTTCAGGC
Unaligned ( gi|60 ): AGAGTCATCTTATGTGACGTCACAAATTTTAGG
Alignments
lowQualScore : 1111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111
lowQualScore : 1 1111 22222222222222 1111 55555555555555555555555555555555555555555 11111111111111 11111111111111111111 11111 222222 33333333333333333333333333333333333333333333333333333333333 1111111111111111111111 11111111111111111 1111111111111111111 11111 1111 11111111 1111111111 11 2222 11 11111 111 11 1111 11111 1111111 77777777777777777777777777777777777777777777777777777 1111111111111 111111111111111 0000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 11111111111111 222 44444444444444444444444 1111111111111 111111 11 1111
lowQualScore : 5 5 0 66 2222 777 2 888 22222222222222 3 1111 2 6 555555 1 22222222222222222222222222222222222222222 444 777777 6 44 444 2 333 1 2 2 88888888888888 1 11111111111111111111 2 4 0 1 2 66666666 55555 6666 0 444 00000 22 2 333 4444 1 4444 2 4444 2 2 4444 333 4 111111 22 2 333 44 22 2 44 3 3 2 444 2 0 44 333 333 11111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 2 4444 2 4444 2 4444444444444444444444 1 77777777777777777 33 2 2 2 888888 22 4444 2 2 5 3333333333333333333 333 2 33 666 77777 2 888 5555 888888 33 2 0 2 2 2 2 2 2 3 99999999 4444444444 00 555555 3 1 5 6666 22 777 11 0 77777 666 4 4 4 4 222 8 8 00 4 4 6666 777 11111 777 8 777 0 4444444 5 77777777777777777777777777777777777777777777777777777 6 888 1 6 99 6 6 77 1 8 0 0 6 5 3 6666 444 2 444 9999999999999 7 44444 1 444444444444444 0 2 55555 333 33 4444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444 555 22 55 2 444 4444 2 2 55 4 333 333 55 22 2 333 4 22 2 666 33 66 33 33 99999999 66 44 55555555555555 2 66666 5 33 555 333 77 11111111111111111111111 4444444444444 2 1 33 3 33 1 2 222222 33 33 2 9999 2 66 2 8888 4444 2 2 33 1 777777 5 0 1 2 33 77 2 2 2 2 2 3
lowQualScore : . . . .. .... ... . ... .............. . .... . . ...... . ......................................... ... ...... . .. ... . ... . . . .............. . .................... . . . . . ........ ..... .... . ... ..... .. . ... .... . .... . .... . . .... ... . ...... .. . ... .. .. . .. . . . ... . . .. ... ... ........................................................... . .... . .... . ...................... . ................. .. . . . ...... .. .... . . . ................... ... . .. ... ..... . ... .... ...... .. . . . . . . . . . ........ .......... .. ...... . . . .... .. ... .. . ..... ... . . . . ... . . .. . . .... ... ..... ... . ... . ....... . ..................................................... . ... . . .. . . .. . . . . . . . .... ... . ... ............. . ..... . ............... . . ..... ... .. ................................................................................................. ... .. .. . ... .... . . .. . ... ... .. .. . ... . .. . ... .. .. .. .. ........ .. .. .............. . ..... . .. ... ... .. ....................... ............. . . .. . .. . . ...... .. .. . .... . .. . .... .... . . .. . ...... . . . . .. .. . . . . . .
lowQualScore : 0 0 1 11 4444 222 9 666 44444444444444 6 1111 9 7 333333 8 44444444444444444444444444444444444444444 888 888888 2 22 444 9 999 0 2 2 22222222222222 1 44444444444444444444 4 4 5 7 2 66666666 66666 9999 7 111 11111 66 2 999 5555 0 2222 0 2222 1 0 2222 555 0 333333 88 0 555 88 88 0 55 8 8 0 666 0 9 88 555 555 99999999999999999999999999999999999999999999999999999999999 1 5555 1 5555 1 2222222222222222222222 7 44444444444444444 11 1 1 1 222222 99 4444 1 2 0 0000000000000000000 111 5 33 444 11111 7 333 0000 222222 99 7 8 9 9 1 9 9 9 1 22222222 3333333333 77 555555 0 6 0 8888 11 666 44 2 99999 666 4 4 4 4 222 9 9 66 4 4 4444 888 44444 888 9 888 8 4444444 7 22222222222222222222222222222222222222222222222222222 7 333 0 7 22 7 7 77 4 0 8 6 0 0 2 1111 777 7 777 4444444444444 5 11111 0 888888888888888 4 2 66666 999 11 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 888 99 88 1 999 1111 1 1 00 2 777 777 00 99 1 777 2 66 2 999 44 33 77 77 77777777 99 77 77777777777777 7 77777 3 77 555 777 33 88888888888888888888888 7777777777777 7 7 77 3 44 2 7 111111 77 77 7 3333 9 44 9 9999 6666 9 9 99 1 777777 3 5 4 9 99 99 9 9 9 9 9 1
consensus : GAAAGGGCATTTTATCTGAAAAGCGGATACAGAGAAA--CACATGAG---GACA-C-ATACTGGTGA-N-AAACCT---T---A-T-A--A-TGT--G-ATGTCT-GTGGGAA-GACA-TTCAGT-----------C-GT--ACGGG-AGC-T--T--AC----G-GA--GACACA-----CGAG-G--ATA--CAT-ACTGGT---GANA-AA-CCN---T----A----TAA-----A---T----------G-TGA-TGTCTGTGG-GAAG---G----CA-----TTC---AGT-CGGANA--GGANACTT-A---AAG----ANACACA----TG-A----GGATA-C-A----TAC---T-GGTGA----ATAAA--CC-TTA---TA--A--A-TGT--G-ATGTCT-GTG-G--GAAG-GCATTCAGTCA--GA---CA--GGNAA--C-TT---A--A-A--G-A-C----A-A-CA-T---GA-T---------------G-ACA----C-A----T-AC---------T----G---G---TGANAAAC---C---T---------T-ATA-AA-TG-TGA------TG--TCTGTGG-G--AA-GGCATTC-AGTC-----G-G---GC-ANACGAC-T-TA-CA-GA-G-ACACACAT--G-AGGACA-C---AT----ACT------GGTGAT--AAA-CCTTAT-A-ANT-G-TG-ATGTCTGCGGGAANG------CATTCAG-CNAT--ACGGGAACA-TTATNNNG-ACACATGAGGA-AA---ATACTG-G-TGA-TAAAACCTTTA---TA-AAT-G-TGA-TGTC-TGTGGGAAG---ACA-TC-AGTGA--GACG-G-GAC--CCTTACA---GACACACAT--G-AG---GATA-C---ATAC-------TGGTGATAAA-CCTTATAA--------T-CAA---------TAA-------------GA----CA-------G-GGAA-A-TTACAGAG-ACACAT--GAGGATACATACTG-G-TGA-NAAACCTT-TTGATTTATATATGTGATTTGTATTGGTAAGCGTTCATGTAAAGGACACGTCGCATG----TTT---CTA-AAC---TTT------T---TTTATTTTTNAA-GC-AAAA--------------TTACTTCTTTG-TATGCCT-----AAAA---TGA--C----T----A--A-A---TG------TG-T----------AT-----------G--T---------T-----------T---T--------------TGCT---T--AG--T-TTT-C-AA-G--T-TT-G--AAA-GCAATGAAATTCA---A---A--TC--TTGC-G---A-TAT-GCA-TAT---T--TT--T--CT--C--------GGTAT--TTT-GCGCGCCATG--------------AT-GTG-----TGACG-TCA--TAT-G-CG---CCTT--TG-----CAATGT------------AAACA-------------AC-TGTTA--GCCA-TATTAT-AAA--T---A--AATT--C-GAT----TTAATGG-AC--A-A----AA----A-GGC-AA--TTATCACGTT------AA-CAGCTCG-C--AG--ATAACA-TT-A-CG-TT-CGG-GTGC
Reference ( family-1142 ) : GAAAGGGCATTTTATCTGAAAAGCGGATACAGAGAAA--CACATGAG---GACA-C-ATACTGGTGA-N-AAACCT---T---A-T-A--A-TGT--G-ATGTCT-GTGGGAA-GACA-TTCAGT-----------C-GT--ACGGG-AGC-T--T--AC----G-GA--GACACA-----TGAG-G--ATA--CAT-ACTGGT---GANA-AA-CCN---T----A----TAA-----A---T----------G-TGA-TGTCTGTGG-GAAG---G----CA-----TTC---AGT-CGGANA--GGANACTT-A---AAG----ANACACA----TG-A----GGATA-C-A----TAC---T-GGTGA----ATAAA--CC-TTA---TA--A--A-TGT--G-ATGTCT-GTG-G--GAAG-GCATTCAGTCA--GA---CA--GGNAA--C-TT---A--A-A--G-A-C----A-A-CA-T---GA-T---------------G-ACA----C-A----T-AC---------T----G---G---TGANAAAC---C---T---------T-ATA-AA-TG-TGA------TG--TCTGTGG-G--AA-GGCATTC-AGTC-----G-G---GC-ANACGAC-T-TA-CA-GA-G-ACACACAT--G-AGGACA-C---AT----ACT------GGTGAT--AAA-CCTTAT-A-ANT-G-TG-ATGTCTGCGGGAAGG------CATTCAG-CNAT--ACGGGAACA-TTATNNAG-ACACATGAGGA-AG---ATACTG-G-TGA-TAAAACCTTNA---TG-AAT-G-TGA-TGTC-TGTGGGAAG---ACA-TC-AGTGA--GACG-G-GAC--CCTTACA---GACACACAT--G-AG---GATA-C---ATAC-------TGGTGATAAA-CCTTATAA--------T-CAA---------TAA-------------GA----CA-------G-GGAA-A-TTACAGAG-ACACAT--GAGGATACATACTG-G-TGA-NAAACCTT-TTGATTTATATATGTGATTTGTATTGGTAAGCGTTCATGTAAAGGACACGTCGCATG----TTT---CTA-AAC---TTT------T---TTTATTTTTCAA-GC-AAAA--------------TTACTTCTTTG-TATGCCT-----AAAA---TGA--C----T----A--A-A---TG------TG-T----------AT-----------G--T---------T-----------T---T--------------TGCT---T--AG--T-TTT-C-AA-G--T-TT-G--AAA-GCAATGAAATTCA---A---A--TC--TTGC-G---A-TAT-GCA-TAT---T--TT--T--CT--C--------GGTAT--TTT-GCGCGCCATG--------------AT-GTG-----TGACG-TCA--TAT-G-CG---CCTT--TG-----NAATGT------------AAACA-------------AC-TGTTA--GCCA-TATTAT-AAA--T---A--AATT--C-GAT----TTAATGG-AC--A-A----AA----A-GGC-AA--TTATCACGTT------AA-CAGCTCG-C--AG--ATAACA-TT-A-CG-TT-CGG-GTGC
gi|1 : GAAAGGGCATTTTATTTGAAAAGCGGATGCAGAGAAA--CACTTGAG---GACG-C-ATACTGGTGA-G-AGACCT---T---A-T-A--A-TGT--G-ACGTCT-GTGGGAA-GACA-TTCCAT-----------T-GC--ATGTATATC-T--T--AA----A-GA--ACCAC------TGAA-G--ATA--CAT-ACTGGT---GATA-AA-CCT---C----A----TAA-----A---TTCTCATAAATG-TGA-CGTCTGTGG-GAAG---G----CA-----TTC---AGT-GAGAAA--AGATACGT-A---AAG----ACACATA----TG-A----AGATA-C-A----TAC---T-GGTGA----ATAAA--CC-TTA---TA--A--AATGT--G-ACATCT-GTG-G--GAAA-GCATTCAATCA--GA---CA--TGTAA--C-GT---A--A-A--G-A-C----A-A-CA-T---GA-T---------------G-ACA----C-A----T-AC---------T----G---G---TGATAAAC---C---T---------T-ATA-AA-TG-TGA------TG--TCTGTGG-G--AA-GGCATTC-AGTC-----G-G---GC-ATACAAT-T-TA-GA-GA-G-ACACAAAG--G-AGATCA-TGT-AT----AGT------AGT-AT--AAA-CCTTAT-A-ATT-G-TG-ATGCCTGCAAAAATA------CTTTCAG-CAAT--ATGGGATCA-TTATTTCG-CCACATGAAGA-AA---ATACTG-G-TGG-TAAAACCTTAA---TA-TAT-A-TGA-TGTC-CATGGGAAA---ACATTT-AGTGA--GACG-GCGAC--TC--ACA---GACACATAT--A-AC---GATA-C---ATAC-------TGGTGATAAA-CCTTATAA--------T-CAA---------TAA-------------GA----CA-------G-AGAA-A-TTACAGAG-ACACAT--GGGATTACATACTG-G-TGA-TAAACCTT-TTGATTTATATATGTGA-TTGTATTGGTAAGCGTTCATGTAAAGGACACGTCGAAT-----TTT---TTA-AAC---TTG------T---TTTATTTTTTAG------------------------------TTG-TATGCCT-----AGAT---TGA--C----T----A--A-A---TG------TG-C----------AT-----------G--T---------T-----------T---T--------------TGTT---T------T-TTTAA-AA-G--T-TT-G--AAA-GC-ATAAAATTCA---ATTTT--TT--TTGT-G---A-T-T-AAA-TAT---T--TT--T--CT--T--------GGTAT--TTT-CTGCGTCATG--------------AT-GTG-----TGACG-TCA--TAT-A-TGTGACCTT--TG-----CGA--T------------AA--A-------------AC-TGTTA--GCCA-TATTAT-AGA------A--AATT--C-GAT----TTAATGG-AC--A-A----AA----A-GTC-AA--TTATCACGAT------AA-CAGCTCG-C--AG--ATGACA-TT-A-CG-TT-TGG-GTGC
gi|10 : T--C--------AGTAT--TTT-ATGCGTCATG--------------AT-G-G-----TGACA-TCA--TGT-G-TGT--CCTT--TG-----CGAT---------------AA-A-------------AT-GGTTA--GCCA-TATTAT-AGG------A--AATT--C-GAT----TTATTGG-AC--A-A----AAG---A-GAC-AA--TTATCACGTT------AA-CAGCTCG-C--AG--ATAACA-TT-A-CG-TT-CGG-ATG
gi|11 : GGT---GAAA-AA-CAAAAAT----A----TCA-----A---T----------G-TGA-TGT-TGTTT-TAAG---G----TA-----TTA---TCT-CGG-----GCTTACTT-A---AAC----AAACACA----AG-C----GGA-A-C-A----TAC---G-GGTGA----G-AAA--CC-ATA---AA--A--A-TGT--G-ATGT-T-GTGTG--GAAG-GCATTCAGTCA--GT---CA--GGATA--T-TT---G--A-A--GTG-C------A-CA-T---GA-T---------------G-ACA----CTA----T-AC--------------G---G---TGATAAAC---T---T---------T--TA-AATTG-TGA------TG--TCTGTGG-A--AA-GGCATTT-A-TT-----G-G---AA-AACCGAC----G-CA-GA-GAAAACACAT--G-AGtactagctgccagaataagggtggtagcctaaattttttcagcttttcgaaggaaggtgcgaagaaatgtttgtcgatacaaggaataaataaataaaactgtcgcttttgtccatgtgctgtaaaaacaatacatgtaataaataaaggaaaacaaaaacagttggacaacaacccagcctaattgctagaaggtgtatatataaaagctaaacacggctagactcatagcgtaaattgtgtccaggccatttcatgaaatacacatctgcaccaattgacctacatataacataataggatttaatacttcaaagttaaatcggtttatcaaagcaaaatatcaattattctccgaaaacgtaccagcgtactttccgggtgctaactaactttatagtggggacacttgcttacgtcacgtcacgtcacgcccaccgtgcaagcatccccagcagtgagcgcatagaaattcaaagaggtatgaggtgttgaattctt
gi|12 : ttattagttttataatcaatttttattacttatgtgtgcagatagcccattagaaacagattaaattcatcagaacaggtcaaggttataatttgtcatcagagatatgttcaccaacactgacaacacgaatttagattgaatgaaacatcccattgcgaatagccctcctcagatgactattcttttcatcaaccaaccaatagctgcctgtgaaacaagtatgtatatctacccaaccaatggctgtctctgaaacaagtatcttctacacaaatcaaagactagcacaaacggaaaatataacggactttgtgaaactgttgaagcagtctgtgaaacaagtaaaaactcaagatctgaaaaatgatttacaggagtgtataaacaaaaatggaTCCCATG----TTT---CTA-AAC---TTTACATAAT---TTTATT---CAA-AC-A-----------------TTACTTCTCTGATATACCT-----AAAAATTTGA--C----T----A--C-AGACTG------T--T----------ATTTAAATAAATAA--T---------T-----------TG--T--------------CGCTC--T--AGGTT-TTT-C-AA-G--T-T--G--AAACGCAATGAAAT-CA---A---A--TC--T-GC-A---A-TAT--CA-TATGATT--TT--T--CT--CAGCGCAACGGTAT--TTTTGCGCGCCATGGGTGTGTTTTTGTTAT-TTG-----TGACG-TCAAGTAT-A-CG---CCTT--TG-----GAATGT------------AAACA-------------AC-TCTCAAGGCC--T-TTATCAAA--T---G--A--T--CAGATCG--TTAATAG-ACTAA-A----AA----A-GGC-AAATTTATTA--TT------AATCAGATTC-C--AACTATAGCACTT-ATCGATT-CGA-GTG
gi|13 : aaccaggatcatatA--CACATGA------TA-C-ATAGTGGAGA-A-AAACTT---T---ACT-T--A-TGT--G-ATATTT-GTGGGAA-GACA-TT--GT-----------C-TC--GCAAA-A-C-AAAT--GC----G-AAAAGACACA-----TGAG-G--AAA--CAT-ACTGGT---GATA-AA-CCT---T----A----TAA-----A---T----------G-TGT-TGTCTCTGG-AAAG---G----CA-----TTC---AGT-GAGAAA--GGAATCTT-A---CAG----AAACACA----AG-A----GGATA-C-A----TAC---T-GATG------------C--------TA--A-----GT--C-AC---------G--GAAG-GCAACCAACCA--GA---AT--GATAG--A-GT---A--C-AGTG-A-C------A-CA-T---GA-T---------------T-ATA----T-A----T-AT---------T----G---A---TA-------------------------ATG-AA-TG-TGA------TG--TTTTCGG-A--AA-GGTATTC-AATC-----A-G---ACAACAC-AC-T-TA-TA-GA---AT-CACAT--T-AAGGCA-C---GT-----TT------GG---T--ACA-CCTGA-----------A-ATACCTGTGGGA---------CA--------------GGAAAC--TTACAGAA-ACACATGAGGACAT---AGAATG-G-TGACCAAAACttatgttaattgctacgggttgtaattaatgctgtaacggaattaagggttggctagtcctgattattttgtcaactttttcgaaggaatgtctgcgaggaattagtcgacacaagacttaacctataaacataacagtcgccctttagtccagtcgtacttgttttaaaaaaataataaaattaaggaaaacataaacttagtgatgggaacagtgcaacccgtagtctgataattgcgatgggaggggttgtttatataga
gi|14 : aaggcatttaactcttcattgacattaacatAA---TGA--T----T----A--A-A---GGACACATTG-C----------AT-----------G--T---------T-----------T---T----------------CT---A--AACAT-TTT-A-AA------TT-GCTAAA-GCAA---AATT-----A---A--TTATTTGC-GTGCA-TAT-GCA-TAT---T--TTC-T--CT--C--------TGTAT--TTA-ACGC-CCATT--------------AT-GTG-----TGACG-TCA--TAT-G-CGA--CCTT--CG------------------------AGCG-------------AG-GGTTT--G--ATTTTTTT-CAA--C---G--GATT--A-AAT----TTAATCG-ACTTA-AAAATAA----A-TGT-AA--TCATCAC--------------GCTCG-T--AG--ACAACA-TT-A-CG-TT-CGG-ATGgtgtgttcctgcatagccaaactgacctagtattgtttctgcataactccttatcctatatattttgacaagctcagaaaa
gi|15 : C-AGACAAT-T-TA-CA-GA-G-ACACAAA-----AGGATA-C---ATGTATAGT------AGTAAT--AAA-TCTTCT-A-ATTCG-T--ATGCCTTCGAGAATG------CATTCAG-CCAG--ATGGGATCA-TTATTTCG-ACATA-----A-AG---ATAC-------A-TA----CTTTA---TA-TAT-G-TGA-TGTC-CGTGGGAAA---ACA-TTTAGTGA--GACG-G-GAC--ACTTACA---GACACATAC--A-AG---GATA-C---ATAC-------TGGTGATAAA-CCTGATAA--------TTCAA---------TAA-------------GA----CA-------G-GGAA-A-TTACAGAG-ACACAT--GAGGATACATATTG-G-TGA-GAAACGTTGTTGATTTATATATGTGATTTGTATGGGTAAGCGTTAATTTAAAAGACATGTAGCATG----TTT---TTA-AACATTTTT------T---TTTATTTTT--A-G----------------------------TTG-TATGCCT-----AGAA---TGA--C----TAC--A--A-A---TG------TA-A----------AT-----------G--TA--------T-----------T---TTGAATAAATCATTATGCT---T--TG--G-TGT-T-AA-G--T-TT-T--AAA-GCAATCAATTTCA---A---A--TT--TTAC-G---ATTAA-ATA-TAT---T--Tttatagtatcgacacaacgggcgcattagctgtcagaagctttgtgtttgttttagttttttcgaaagaaggtgcgaaggaaaagaccagtaatttttagttggcacagggtctttgtcgtaaaaaatccacacaaatcagtcacgtttgattatgtacctttttagaaaaagaagaaaaaaaaaggggggggggcaaaacggttgcaaagcgactcagtttaactacgagaaattggtcatatg
gi|16 : GT--G-A-GACT-GTA-G----AG-GCTGTCTGTGA--AA---CA--AGTAAAAC-T----A--A-A--G-A-CCAGGA-A-AA-T---GA-T---------------TTACA----C-GAATGT-ACAAACACAAAT----G---GAGGTGAAAAAC---AAAGT---------T-ATC-AG-TG-TCA------TC--TTTGTTG-G--AA-GGCATTT-ACTC-----
gi|16 : ttattagtattataattatttttattatttttcttgcagaaatcccattagaaacatattaggttaatcagaaacatgtcaatgttttaaattggcatcacagatgtgttcactatcactgacaacactagaatttagactgtaatgcaacatccaattggaaatagccctcctcgtatggctattcttttcacccaactaaccaatggctgactgtgaaacaagtatgtctatctacccaaccaatggctgcctgtgaaacaagaatgtcttctacacaatcaagggctagcacaaacggaaaatacaacggacttaGGT---GAAA-AA-CAAAGTT----A----TCA-----G---T----------G-TCA-TCTTTGTTG-GAAG---G----CA-----TTT---ACT-C
gi|18 : ttattagtattataattatttttattatttttcttgcagaaatcccattagaaacatattaggttaatcagaaacatgtcaatgttttaaattggcatcacagatgtgttcactatcactgacaacactagaatttagactgtaatgcaacatccaattggaaatagccctcctcgtatggctattcttttcacccaactaaccaatggctgactgtgaaacaagtatgtctatctacccaaccaatggctgcctgtgaaacaagaatgtcttctacacaatcaagggctagcacaaacggaaaatacaacggacttagtgagactgtagaggctgtctgtgaaacaagtaaaactaaagaccaggaaaatgatttacacgaatgtacaaacacaaatggaGGT---GAAA-AA-CAAAA-T----A----TCA-----A---T----------G-TGA-TGTTTTT----AAG---G----TA-----TTA---TCT-CGGCT------TACTT-A---AAC----AAACACA----AG-C----GGATA-C-A----TAC---G-GGTGA----GAAAA--CC-ATA---TA--A--A-TGT--GCATGTTT-GTG-G--GAAG-GCATTCAGTCA--GT---CA--GG-AA--T-TT---G--A-A--G-G-C------A-CA-T---G--T---------------G-ACA----C-A----T-AC---------T----G---G---TGAATAAC---C---T---------T--TA-AA-TG-TGA------TG--TCTGTGG-A--AA-GG-ATTG-TATT-----T-G---AA-AACCGAC----G-CA-GA-G-AAACACAT--G-AGGAC--C---AT----ACT------TGTGAG--AGA-CC--AT-A-A
gi|19 : agcacaaacggaaaatataacggactttgttgaaactgttgaagcagtctgtgaaacaagtaaaaactcaagatctgaaaaatgatttacaggagtgtataaacaaaaatgga-AAT-G-TGT-TGTTGTGTGGGTAG---GCT-TC-AGCGA--GACA-G-GAAGATTTTACA---G-CACACA-----AGTTTGACAAC---ATCT-------TGGTGATAAA-CC-TATAAATGTGATGT-CTG---------CGG-------------GAGGTTCAGTCGTATG-GGAACA-TTAAGGGG-ACATAA--GAGTAT-CAT-CTG-A-TGATAAAACCAT-ATAATGTAAATGTTTGaa
gi|19 : AG--CACACAAGTTTGACAAC-ATCTTGGTGA-T-AAACCTA--T---A---A--A-TGT--G-ATGTCT-GCGGGAG-G----TTCAGT-----------C-GT--ATGGG-AACAT--T--AA----G-GG--GACATA-----AGAG-T--AT---CAT--CTGAT---GATA-AAACCA---T----A----TAA---------T----------G-TAAATGTTTGTGG-GAAAAAAG----CA-----TTC---AAT-TGGAGACAGAACATTTTA---AAA----AGACACA----AG-A----TGATA-CCA----TAC---T-GGTGT----TTAAA--CCCTTA---TA--A--A-TGT--G-ATGTGT-GTG-G--GAAG-GCATTCCGTGA--GA---AA--GGACA--T-TTTAAA--A-A--G-A-C----A-A-GA-T------T---------------G-ATA----C------T-AC---------T----G---G---TG-TAAAC---C---T---------TAATA-AA-T--TGA------TG--TGTGTGG-GGAAA-AGCATTC-tgggaaaaaagcattcaattggagacagaacattttaaaaagacacaagatgataccatactggtgtttaaacccttataaatgtgatgtgtgtgggaaggcattccgtgagaaaggacattttaaaaagacaagattgatactactggtgtaaaccttaataaattgatgtgtgtggggaaaagcattc
gi|2 : aatgtgttgttgtgtgggtaggcttcagcgagacaggaagattttacA-C-AGACTT---C---A-T-ACAA-TGT--ATATTTTT-GTGGGAATAACA-TATAGT-----------T-GTGTAAAGG-TGCGT--T--AT----GTGA--TACACA-----CGTGCG--AT---TAT-ACTGTG---GAGA-----CT---T----C----TGAC----A---T----------G-TGA-TAGTTATGT-GAAA---T----CACTTGATTA---AGTTCAGACA--GGAGATTT-A---A-G----AGACACA----GG-A----GGATA-C-A----TA----T-GGTGA----AGAAA--TC-TTC---CA--ATAA-TGTTGG-ATGTCTTGCG-A--AAAG-G-ATTCAGTGC--GT---AA--GGGAT--CATT---A-----------C----A-A-T--C---GA-A---------------G-ACA----C-A----A-AC---------TTCAAG---G---TGATAAAC---A---TAGAAATAACT-GTA-AG-GG-TGAAATTTATGAGTCTGTCGTG--AA-GCGATTT-CTTA-----G-T---GC-GAAGGGA-T-CA-TA-CA-A-A-ACATAT--G-AGGATA-----AT----ACT------GGTAAT--AAC-CCTTAT-ATAAT-GTTGTATGTCTTGTGGAAGA------CATTCAC-TGACTGAGAGGAAC--TTATTAAC-ACACATGAGGA-A----ATACTG-G-TGA--AAAACCTTT----TA-AAT-G-TGATTGTC-TGTGAGAAG----CT-TC-AGTCATCGA-G-G-GA---CCTTACAGAGGAGACACAT--GAAG---GAAATC---ATAC-------TGGTGAGAGACCCTTATAA--------T-TGAATGTCTGGGTAAAAGATGTTTTATTGA----CA-------ATAGAA-ACCTATAGAGCACACATTAGACAACACATAATGCGTTGA-AAGACCAT-T--ATGTA-ATGT-TGATTT
gi|2 : agccttagttcaagatatgtctttacgccactgtatttgattaagaaaacgtgatAGAGA--CACAGGAG---GATA-C-ATA-TGGTGA-AGAAATCT---TCCAA-T-A--A-TGTTGG-ATGTCTTGCGAAAA-GG-A-TTCAGTG----------C-GT--AAGGG-ATCAT--T--ACAATCG-AA--GACACAAACTTCAAG-GTGATAAACAT-A--------GAAATAA-CTG---T----AAGGGTGA-----AATTT----------A-TGA--GTCTGTCGTGAAG---C----GA-----TTTCTTAGT-GCGAAG--GGAT-CAT-A---CA-----AAACATA----TG-A----GGATA---A----TAC---T-GGT-A----ATAAC--CC-TTA---TAT-A--A-TGTT-GTATGTCTTGTG-G---AAG-ACATTCACTGACTGA---GA--GG-AA--C-TT---ATTA-A--C-A-C----A---CA-T---GA-G---------------G-A-A------A----T-AC---------T----G---G---TGAAAAAC---C---T---------T-TTA-AA-TG-TGAT-----TG--TCTGTGA-G--AA--GC-TTC-AGTCATCGAG-G---G----AC--C-T-TA-CA-GAGG-AGACACAT--GAAGGAAATC---AT----ACT------GGTGAG--AGACCCTTAT-A-ATT-G--A-ATGTCTGGGTAAAAGATGTTTTATTGA--CAAT--A--GAAAC--CTATAGAGCACACATTAGAC-AACACATAATGCGTTGA--AAGACCATTA---TGTAAT-GTTGA-T-TT-TGTGGG-AG---ACA-TC-AATTAT-TATA-C-AAC--CGTAAAA---AACTCACATTGA-AG---GATA-CCAAAT-C-------TAGTGAC-AG-CCTTATtgtgggagacatcaattattatacaaccgtaaaaaactcacattgaaggataccaaatctagtgacagccttatcagtgtgatgcttgttcgaaacattcagtcagtagagaagacttactgtgtcacaaagataagacatcaacagtgaatgtagtgtctgtggaaagtgtacaccgatgggtcgcagacttagaagcaccatgggacacatac
gi|2 : agccttagttcaagatatgtctttacgccactgtatttgattaagaaaacgtgatacagacttcatacaatgtatatttttgtgggaataacatatagttgtgtaaaggtgcgttatgtgatacacacgtgcgattatactgtggagacttctgacatgtgatagttatgtgaaatcacttgattaagttcagacaggagatttaATACA---AAA--CATATGAG---GATA---ATACTGGTAA-T-AACCCT---T---A-T-ATAA-TGTT-GTATGTCTTGTGG-AA-GACA-TTCACTGA---------C-TG--AGAGG-AAC-T--T--AT----T-AA--CACACA-----TGAG-G--A-A---AT-ACTGGT---GAAA-AA-CCT---T----T----TAA-----A---T----------G-TGATTGTCTGTGA-GAA----G----C------TTC---AGT-CATCGA--GGGACCTT-ACAGAGG----AGACACA----TGAA----GGAAATC-A----TAC---T-GGTGA----GAGAC--CC-TTA---TA--A--T-TG---A-ATGTCT-G-G-GTAAAAG-ATGTTTTATT---GA---CAATAGAAA--C-CT---A--T-A--G-AGC----ACA-CA-TTA-GA-C---------------A-ACA----C-A----T-AA---------T----GC--GT--TGAAAGAC---CA--T---------T-ATGTAA-TGTTGA------T---TTTGTGG-G---A-GACA-TC-AATT-------A---TT-ATACAAC-CGTA--A-AA-A-ACTCACATTGA-AGGATA-CCAAAT-----CT------AGTGAC---AG-CCTTAT-C-AGT-G-TG-ATGCTTGTTCGAA-A------CATTCAGTCAGT--A-GAGAAGACTTACTGTG-TCACA-----A-A--------------GA-TAAGACATCAACAGTG-AAT-G-TAG-TGTC-TGTGGAAAGTGTACA-CC-GATGG--GTCGCA-GA----CTTAGA---AGCAC-CAT--G--G---GACA-C---ATAC-------cagtgtgatgcttgttcgaaacattcagtcagtagagaagacttactgtgtcacaaagataagacatcaacagtgaatgtagtgtctgtggaaagtgtacaccgatgggtcgcagacttagaagcaccatgggacacatac
gi|20 : agccttagttcaagatatgtctttacgccactgtatttgattaagaaaacgtgatacagacttcatacaatgtatatttttgtgggaataacatatagttgtgtaaaggtgcgttatgtgatacacacgtgcgattatactgtggagacttctgacatgtgatagttatgtgaaatcacttgattaagttcagacaggagatttaagagacacaggaggatacatatggtgaagaaatcttccaataatgttggatgtcttgcgaaaaggattcagtgcgtaagggatcattacaatcgaagacacaaacttcaaggtgataaacatagaaataactgtaagggtgaaatttatgagtctgtcgtgaagcgatttcttagtgcgaagggatcTACAGAGA----CACAGTA-----ACA-C-ACACTGGTGA-C-AAATCT---T---A-CCA--A-TGT--G-ATGTTT-GTTGGAA-GACA-TTCAGT-----------T-AT--TCAGG-ATCAT--T--GC----A-AA--AGCACA-----GAAA-G--ACA--CAT-A---------ATA-AT-CCT---A----A----TGA-----A---T----------T-TGA-AATTTGTCG-GAA---------CA-----TT--------------------AC--------AG----ACACACA----TG-A----GAATA-C-A----CAC---T-GGT-A----ATAAA--CC-AGA---TA--T--A-TGA--G-ATATTA-ATG-T--TAAC-GCATTAAGCCA--GA---CA----TAA--C------A--G-A--G-A-C----ATT-CAGT---GA-----------------G-ACGGGATC-A----T------------T----A--------GAAAAAC------------------------A-TA-TGA------AG--AC---GC-A--AATGGCATTCGACTC-----G-A---A--AGTCCAC-T-TA-CA-AA-T-ACACAC----G-ATAACA-C---TC----ACT------GGTGAT--AAT-ATTTA--A-AAG-G-TG-ATATATGTG
gi|23 : ttatttcgaagggcaactT---TTA-AAC---TTT------T------ATTTTTAAA-GA-AAAAACTTGCTTTGTGTGCTACTTCTTTG-TGTGCCTCCCCTAAAA---TGA--C----T----ATAA-A---TG-------G-T----------AT-----------T--TGAATTATTAT-----------T---T--------------TGCT---T--AG--T-TTT-C-AA-G--T-TT-G--AAAAGCAATTAAATTCA---A---A--TC--CTTC-A---A-TAT-GCA-GAT---T--TT--T---T--C--------GGTA---TTT-GCTGTCCATG--------------AT-GAG-----T-ACG-TCA--TAT-GCCGT--CCTT--CG-----CGA-GA------------AAACA-------------AT-TGTTA--GCCA--ATCAT-GAA--C---A--AGAT--C-GA-----TTAATGG-AA--A-A----AA----AGGGCAAA--ATATCACATTACCGTAAA-CAGCTTG-C--AGTTATAACA-TT-A-CG-TT-CGG-
gi|25 : catcgATG----TTT---TCA-AAC---TTT------T---TT-ATTTGTCAT-GC-AAAA--------------TCACTTCTTTG-TATGCCT-----AAAA---TGA--C----TAC--A--A-A---TG------TA-TTTTGAATAA-AT-----------T--A---------T-----------T---T--------------TGCT---T--AG--T-TTT-C-AA-G--T-TT-G--AAA-GCAATGAAATTCA---A---A--TC--TTGC-A---A-TAT-GCA-TAT---T--TT--T--CT--C--------GGTAT--TCT-GCGCGCCATG--------------GT-GTG-----TGACG-TCA--TAC-A-CG---CCCGAATG------AATGT------------AAACA-------------AG-TCTCA--GACA-TATTAT-AAA--T---A--AATA--C-GAT----TTAATGG-ACA-A-A----AA----A-GGC-AA--TAATCACGTT------AA-CAGAATG-C--AG--ATAACA-TT-A-CG-TT-TGGTGTGtgttgaacattgtgtcattcggtgtgatagctgtcagag
gi|26 : CATG----TTT---CTA-TAC---TTT------A---AGTAATTTTTAT-GC-AAAT--------------ATACTTCTCTG--GTAACT-----AAAA---TGA--C----T----A--ACA---GA------TG-T----------AT--------------T---------C-----------T---TAAATTA--------TGCT---T--AG--T-TTT-C-AA-G--T-TT-G--AAA-GCAATGAAAATCA---A---A--TC--TGGC-A---A-TAT-GCA-TAT---T--TT--T--CT--C--------GGTAT--TTT-GCGCGCCATG--------------GT-GTG-----TGACG-TCA--TAT-A-CG---CCTT--TG-----GAATGT------------AAACA-------------AC-TCTCA--GGCC-TATTAT-AAA--T---A--GATT--C-GAT----TTAATAG-ACA-A-A----AA----A-GGC-AA--TTATTA--TT------AA-CAGATTC-C--AA--ATAGCA-TT-A-CG-TT-CGA-GTG
gi|27 : agttatcA--CAT-ACTGGT---AATA-AA-CCT---T----A----TAA-----A---T----------G-TAA-TGTCTGTGG-GACG---G----CA-----TTT---ATC-CAGAAT--GGAAACTT-A---AAA----GCACACA----TG-A----GGACA-C-A----TAC---T-GGTGA-----TAAG--CC-TTA---TA--A--A-TGT--G-ATGTCT-GTG-G--GAAG-GCATTCAGTCA--AA---CA--GGAAT--C-TT---AC-ACA--G-A-C----A---TA-T---GA-G---------------G-ATA----C-A----T-AC---------T----G---G---TGAGAAAC---C---T---------T-ATA-AA-TG-TGA------GG--TCTGTGG-A--AA-GGTGTTT-AGCT-----G-G---GC-AGGAGAC-T-TA-CATG-----CACACAT--G-AGAACA-C---AT----ACT------GGTAAC--AAA-CCATAT-A-AAT-G-TG-ATATATGTGGGAt
gi|29 : cATCTGAAAAATG-ATTTACAGGAA--TGTATAAA---CAAA-A-ATGGAGGTGA-A-AAACAAAAAT---A-TGA--A-TGC--G-ATGTTT-GTTTTAA-GGTA-TTAACT-----------C-G---------GGC-T--T--ACTTGAG-CA--GACACA-----TGAG-G--ATA--CAT-ACTGGT---GAGA-AA-CCG---T----A----TAA-----A---T----------G-TGA-TGTTTGTGG-GAAG---A----CA-----TTC---AGT-CAGACA--GGATATTT-G---AAG----GTACACA----TG-A----
gi|29 : aaactcaagGGT---GAAA-AA-CAAAAAT----A----TGA-----A---T----------G-CGA-TGTTTGTTT-TAAG---G----TA-----TTA---ACT-CGG-----GCTTACTT-G---AGC----AGACACA----TG-A----GGATA-C-A----TAC---T-GGTGA----G-AAA--CC-GTA---TA--A--A-TGT--G-ATGTTT-GTG-G--GAAG-ACATTCAGTCA--GA---CA--GGATA--T-TT---G--A-A--G-G-T----ACA-CA-T---GA-TTNNNNNNNNNNNNNNN-NNN----N-A----A-ACAAAAA----T----GGAGG---TGAAAAACAAAA---A---------T-ATG-AA-TG-CGA------TG--TTTGTTT-T--AA-GGTATTA-ACTC-----G-G---Gttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaaacaaaaatggaggtgaaaaacaaaaatatgaatgcgatgtttgttttaaggtattaactcggg
gi|3 : aaactcaagatctgaaaaatgatttacaggaatgtataaacaaaaatggaATG----TTT----TATAAC---TTT------T---T--ATTTGTCAT-GCCAAAA--------------TCACTTCTTTG-ATTGCCT-----AAAA---TGA--TA---C----A--A-A---TG------TA-TTTTGA-----AT-----------AAAT---------TATG--------T---T--------------TGCT---T--A---T-TTT-C-AA-G--T-TT-G--AA--GCAATGAAATTCA---A---A--TC--TTGC-A---A-TAT-GCA-TAT---T--TT--T--CT--C--------GGTAT--TCT---GCGCCATG--------------GT-GTG-----TGACGTTCA--TAC-G-C----CCAA--TG------AATGT------------AAACA-------------AC-TCTCA--GGCA-TACTAT-AAA--T---A--GATA--C-GAT----TTAATGG-ACA-A-A----AA----A-GGC-AA--TTATCACGTT------AA-CAGTTTG-C--AG--ATAACA-TT-A-CG-TT-CGG-GTG
gi|30 : ctcctaC----A-GA--GACACA-----TGAACA--ATA--CATTACTGGTTTTGATA-TA-TCC---TCATTA----TAACTGATA---T----------GATGA-TGTCTATGG-GAAT---T----AG-----TTG---AGT-AGGGCA--GGATCATT-G---AGG----ATATACAAATCTG-ATAAAGGGTA-T-ACTTTTACACATAGGTGC----ATAAAAGCC-TTAATATAGGA--A-TGT----ATGTCT-GTT-G--GAAGTGC-CTCAATCA--CAAACCA--CGAA-----TT---A--C-AC-A-A-C----A-ATCA-T----A-G---------------G-GCA----C-A----TTAC---------T----GT--A---TGATAAAG---C---CAA-------T-ATA-AA-TG-TAA------TG--TGGTTGG-G--AA-GGAGTTT-AATttgtgtgtcggttacgggtgtactagatgtcagaattagggtagtagcctaagtttttttttcaactttttcgaaggaaggttcgaggaaattttgtgtcgactcaaggactttaccataaataaaacagtcgattttctctttgtactgctaaaaaaataaaggaaaacataaacagttcgacagcaaccccgattaattgcgcgagaaggtgtttatatagacgctattgacacggattaagtctacaacgtttatttatgtacaggccatttcacgaaatacacgctcgcactcaaactgacctacataatagcacaacaacaaatactcctgaaggttcgtgttcccatttcctaccaaatcgcacatttaaaaaaaaaaaataacattacaataattaaagatcgaacttgtgtaaaaattacaaataagaaaatatgtagttcctcagtaaacatttataattttttcgtggacgcgcttttaaccatgacatgagatgtgtattgctgacaatgctctccggcattaccttgc
gi|31 : TTTAAA-GC-AAAA--------------TTACTTCTTTG-TATGCCT-----ATAC---TGAGTT----T----A--A-A---TA------TG-TTTTGAATAAAAT-----------G--T---------T-----------T---T---------------GCT---T--AG--T-TTT-T-AA-G--T-CT-G--AAA-GCAATGAAATTCG---A---A--TC--TTGT-G---A-TAT--CA-TAT---T--TG--T--CT--C--------GGTATAGTAT-ACGTTCCGTG--------------AT-GTG-----TGTCG-TCA--TAT-G-CGA--TCTT--TG-----CAA-G-------------AAACA-------------ACTTGTTA--GCCA-TTTTAT-AAA--C---A--AACT--T-CATTTAATTAATCG-AC--A-A----AAC---A-GGC-AA--TTATCACGTT------AA-CAGCT
gi|32 : acatttcgtgtttg-AAAGCT---T---A-T-A--AATGT--G-ATTTTT-GTGGGAA-AACT-TTGAGT-----------T-GT--AAAGC-TGCGT--T--AC----T-GA--TACACA-----CGAG-G--ATC--CAT-ACTGGT---GAGA-GA-CCT---C----A----TGA-----A---T----------G-TGG-TGTTTGTGG-GAAG---A----CA-----TTC---AAT-CAGACA--GGAGACTT-A---CAG----AGACACA----GG-A----GGATA-C-A----TAC---T-GGTGA----A-AAA--CC-TTA---TA--A--A-TGT--G-ATGTCT-GTG-G--AAAG-GCATTCAGTGC--GA----A--GGAAA--CATTAC-A--A-A--A-A-C------A-CG-T---GA-G---------------G-ATA----C-A----T-AC---------T----G---G---
gi|33 : ACAGACAAATGCACATGAA---GACA-CAAAACTGGTGATA-AAACC------------A--A--------ATGAAT-GTGGGAA-----------------------------------AGC-T--TTGAT----G-GA--AAC----------AA-G--CTA--GAT-ACTGGT---GATA-AA-CCT--------------------------------------TGA-TATCTTTTG-CAAG---GTGTACA-----TCC---GGT-CAGATC--GATGACTT-C---TAGTTCTAAACACG----TG-A----AGATA-C------TGT---TCAGTGATCTTACAAG--TC-CTA---TA--A--A-TGT--G-GTGCCT-GT
gi|34 : gaAAAACCTT-A---TA-AATAG-TGT-GGTT-TGTGGGAAGA--ACA-TC-AATtaacaag
gi|36 : agtgtaaacagaaaaagtaatgaatgtagtgaacttaggaaacctgtttgtgaaataattcaactaaagatcagaaaaatgatttacagagaacgggtgaaagatattggagtaaaaacatgttttcactgtgatgatagatatgcacaaaaggcgcaaagaacttcaagCA----TA-A----GGACA-C-A----TAT---T-GATGA-----TAAA--CC-TT--------------GT--T-ATTTCT-GTG-G--GAAG-GCA----ATCA--GA---CG---------C-T---------A--G-A-C------------------T---------------T-ACA----C-A----T-AA---------C----A---G---TGATAGAC---C---C---------T-ACA-AG-TG-TA--------G--TTTGTAG-A--AA-GCCATTA-GGTC-----G-GACAGC-ACACCAA-T-TA-CA-AA-G-TCACACA-----AGGACA-C---ATAA--ACT------G--GAT--AAA-
gi|38 : ----ATACATA----TT-A----GAAGA-C-A----TGC---T-GGTGA-----TAAA--CC-TTT---TA--A--A-TGT--G-ATATAT-GTG-G--AAAG-GCATTT-GTCTT-GA---AA--GTAGA--A-TT---A--A-A--A-G-C----A---CA-TTTTG--T---------------G-ACT----C-A----C-AC---------T----G---G---TGAAAAAC---C---A---------T-TTC-AA-TG-TGG------TG--TCTGTGG-G--AA-GGTATtggagatatgtgagagaggaa
gi|39 : gagaatatctgcgt-A----CAC---T-GGTGA-----CAAA--CC-ATT---CA--A--A-TGC--G-AGATCT-GTG-G--ACGG-GCCTTCCGACA--AC---CA--GGCAA--T-TT---G--A-C--G---C----G-T-CA-TC--GACT---------------G-ACC----C-A----C-AC---------C----A---C---AGTCAAAC---C---T---------T-ACG-TC-TG-CCC------AA--CCTGCAA-C--AA-AGCATTC-AACC-----G-G---GC-CTCCAAC-T-TA-C---A-C-ACGCACAT--G-CGCACT-C---AC----ACatggtctaaaagttgtgttaaaga
gi|4 : ----TTT---C-A-AAC---TTT------T---TT-ATTTGTCACTGC-AAAA--------------ATCATTCTTTG-TATGCTA-----AAAA---TGA--C----TTACGA--A-A---TG------TA-TTTTGAATAA-AT-----------T--A---------T-----------T---T--------------TGCT---T--AG--T-TTT-C-AA-G--T-TT-G--AAA-GATATGAAATTCA---A---A--T---TTGC-A---ATTAG-CCA-TTTC--T--TC--T--CT--C--------GGTATTGTCT-GCGCGCCATG--------------GTGGTG-----TGACG-TCA--TATCA-CG---CCCT--AGT----TAATGT--------------AC--------------AC-TTCTA--GCCA-TAT-----AA--T---A--A--T--T-GAT----TT-ATGG-AC--A-G----AAACAGA-GAC-AC--TTATCA-GTT------AATCAGCTTG-CAAAG--ATAACA-TT-A-CG-TT-CG
gi|40 : ATCACATT------AA-CAGCTTG-C--AG--ATAACA-TT-A-CT-TT-TGG-GTGccctcttgtgttgtcattagcggatgtactacttgtcagaatagggtggtcctgagtagtcaactttttcgcaggaaggacgaggaaactttttgtgtcgactcaaggactttacgcataaataaaacaagtccgtttggtctttgtctgttaaaaaaaaataaaggaaaaagacagttggacagcaccccagattaatgcgcgaggaaaggttgtttttatatagaagctagacacagattaggtctacaagcgttttatatgtcagcctttcacgaaatacacgctcgcctcaactgacctacatcaatagcataattgttacaacaaatacttcaagttcctgttcccatttcctaccaaatgaaatgataataatacaatagttaaagattgaactgtataaaaatacaaaaagaaatatgtaagtccttcagtaagccatttgtataaatatatattttcgtcgacgcgcttttaaccatgacatgagatgtggtattgctgacaatgctctctctccggcattatttgc
gi|41 : TG----TTT---CTA-AAC---GTT------A---TA-ATTTTTAAA-GC-AAAA--------------CTACTTCTCAG-TATGCCT-----AAAA---TGG--C----TTA--A--A-A---TG------TA-TTTTAAATA--AC-----------A--TA--------T-----------T---T--------------TACT---T--AG--T-TTT-C-AG-A--T-TT-C--AAA-TCAATGAAATTCA---A---A--CC--TTAC-A---T-TAT-ACATTTT---T--TT--T--CT--T--------GATAT--ttgtgtgtcggttgatggtgtactagctgtcagaattagggaggtagcccgagtttttcaactttttcgaaggaaggtgcaaggaaaatttgttgatacaagaactttttcataaataaaactgttgcttt
gi|43 : cattgatAAAGGACACATAGCATAGATACTTAAATTA-AAC---TTT------T---TTAATTTCTTAA-GC-ACAA--------------CT----CTTTG-TGTGCCT-----AAAA---TGA--CACTTT----A--A-A---TG---------------------T-----------G--T---------T-----------T---T--------------TGAA---TAAAG--TCTTT-C-AA-AACT-TT-GA-AAA-GTGATGGAATTGAAACA---A--TC--TTGCAA---A-TAT-a
gi|44 : GGGCACATCGCATG----TTT---CTA-AAC---ATT------T---TG-ATTTTTGAA-GC-AGAA--------------TTGCTTCTTTG-CATGCCT-----AAAA---TAA--C----TCTG-A--A-T---TGATTT--TG-A----------ATAAA--------A--TA--------T-----------T---T--------------TGCT---T--AG--T-TTT-C-------T-T---------GCGATGAAATTCA---G---A--TA--TTGC-G---A-TAC-GCA-TAA---T--TT--T--C
gi|47 : GA--GATG-G-GGT--CATTACA---GAGACACAA--G-AG---GATA-C---ATACATGATACTGGTGATAAA-CATTAT----------T-AAA---------AAA-------------AA----TATT-----G-GGCA-C-TTAAAGAC-ACGCAA--GATGATACCTACCA-G-TGA-AAAA
gi|48 : ---G---TGAGAAAC---C---T---------C-ATA-AG-TG-TAA------CG--TATGTGG-A--AA-AGCCTTC-AGCC-----A-G---TC-CTCCAACCT-TATCA-------CACACAG--T-CGGAAA-C---AC----ACC------G--GATTCAAG-CCATTT-A-AGT-G-TG-A
gi|5 : GA-CGTCTGTGG-GAAG---G----CA-----TTC---CGT-GAGACA--AGTAAGGT-A---AAG----ACACACA----TG-A----GGATA-C-A----TAC---T-GGTGA-----TGAA--CC-TCA---TA--A--A-TGT--G-ACGTCT-GTG-G--GAAG-GCATGCAGTGA--TA---CA--AGTAG--C-TT---A--A-A--G-A-C----ACA-CA-T---GA-G---------------G-ATA----C-A----C-AC---------T----G---G---TGATAAAC---C---T---------T-ATA-AA-TG-TGA------TG--TCTGTGG-G--AA-GGCATTC-AGTC-----G-G---GC-ATACAAT-T-TA-GA-GA-G-ACATAAA-----AGGATA-C---ATGTATAGT------AGTGAT--AAA-CCTTAT-A-ATT-G-TG-ATGCCTGCGAAAATA------CTTTCAG-CAAT--ATGGGATCA-TTATTTCG-CCTCATGAAGA-AAC--ATACTG-G-TAA-TAAA-CCTT-A---TA-TAT-A-TGA-TGTC-TGTGGGAAA---ACA-TTTAGTGA--GACG-G-GAC--ACTCACA---GACACATAT--A-AG---GATA-C---ATAC-------TGGTGATAAA-CCTTATAA--------TTCAA---------TAA-------------GA----CA-------G-GGAA-A-TTACAGAG-ACACAT--AGGGATACATACTG-G-TGA-TAAACCTT-TTGATTTATATATGTGATTTGTATTGGTAAGCGTTCATGTAAAGGACACGTCGAATG----TTT---TTA-AAC---TTG------T---TTTATTTTTTAG------------------------------TTG-TATGCCT-----AGAT---TGA--C----TAC--A--A-A---TG------TG-C----------AT-----------G--TA--------T-----------T---T--------------TGTT---T--TT--T-TTT-TAAA-G--T-TT-G--AAA-GCAATAAAATTCA---A---ATTTT--TTGT-G---A-T-T-AAA-TAT---T--TT--T--CT--T--------GGTAT--TTT-CTGCGTCATG--------------AT-GTG-----TGACG-TCA--TAT-A-TGTGACCTT--TG-----CGA--T------------AA--A-------------AC-TGTTA--GCCA-TATTAT-AGA------A--AATT--C-GAT----TTAATGG-AC--A-A----AA----A-GTC-AA--TTATCACGAT------AA-CAGCTCG-C--AG--ATGACA-TT-A-CG-TT-TGG-GTGC
gi|51 : aaataaaatgccctttc---------T-----------T---T--------------TGCT---C--AA--T-TTT-G-AA----T-TT-G--AAA-GCAAGGAATTTCT---A---A--TT--TTGT-G---A-TAC-GTA-Tt
gi|52 : ctaagtgaaataagtatcaagtgaagtaGTAT--CTA-ATGCTCTGTT--------------AC-GTT-----CGACA-TCA--TAT-G-CG---TCCT--TGAGTGAGAAGGTTTGA--------AAACA------------------TTA--G----TTTTAT-AAA--T---G--GATT--A-AAT----TTAATtagcatcagatag
gi|53 : TTG-CATGCCT-----AAAT---TAA--C----T----TTTA-A---TG------TG-T--------------------------T---------T-----------T---C--------------TGTGAAAT--AT--T-TTG-CGAA-A--TATT-G--AAT-TCA-CGAAATTCG---A---A--TC--TTGT-G---A-TAC-GCA-Tcaac
gi|55 : cC-T-TA-CA-GA-G-ACACATA-----AGGACA-C---AT----ACTATATGCAGTGAT--TGA-TCTTATAA-AAT-T-TG-ATGTCTtat
gi|56 : --CACATGAG---GACA-C-ATACAGGAGA-A-CGCCCG---T---A-CAA--A-TGT--A-ACACGT-GCGGGAA--ACAGTTCGCT-----------CAGT--ACGGG-Aaggtatgaaaagtgttc
gi|57 : AAAGGACACATCGCATG----TTT---CTA-AAC---TTT------T---TGAATTTTGC-A-GC-AAAA--------------TTACTCCTTTG-TATGCCT-----AAAcactgta
gi|6 : AAGGACATATTGCATG----TTT---CTA-AAT---TGT------TAGATTTTTTTTTTAA--C-AAAA--------------TTAGGTCTTTG-CATGACT-----AGAA---TGA--CTT--T----A--G-A---TG------TG-TTTTAAATGAAAT-----------A--T---------T-----------TTAAT--------------TACG---T--AG--T-TCT-T-GA-G--T-TT-G--AAA-GGTAC-AAATCTC---A---G--TC--TTGC-G---A-TAT-GCA-TAT---TAATT--TTACTTAT--------GATAT--TTT-ATGTACGATG--------------AA-GTGTCGTCTGACA-TCA--TAT-G-TG---ACCTAGAG-----TAAGGTCTGA--------AAACA-------------GC-TGTTA--GCCA-TTCTAT-AAATTT---ATTGATT--A-GAT----TTAATTG-AC--A-A----AAT---A-GCC-CA--TAGCTATG-T------A------TTG-T--AG--ATAACT-TT-G-CA-TG-GGG-GTGC
gi|61 : A-----TGAG-G--ACA--CAT-ACTGGT---GAGA-AA-CCA---T----A----TAA-----A---tgtgcaccatttatgggtgcacatatactaagtgtcaaaagaagtgatgtatagactgaggtttttcaaatttttctaaagaaggtgtgaggaaaaagaagtgggtgatttttttgtcagcacattaaggacttggtcataacccctcccctctacagtcacctttgtccatgttctttttcaaaaaactattggacagagacccatttaactgtgaggaaatagttatgtagaagccaggcacagctaggcctacagtatatggattctgttctggtcgtcatcatttcacaaatactcactcgcaccttggaaataaaaacggacattgtaacagtatatacttgtgttcccagttcctgtaaacttgtagaattataaaaaaaaaaataaattaaagattgaaaataattgaactt
gi|7 : ACA--GGAAGCTT-A---CAG----GCACACA----TG-A----CAACA-C-A----CAC---T-GGTGA----A-AAC--CC-TTA---CA--A--A-TGT--G-GTGTCT-GTG-A--AAAA-GCATTCCCTCA--CA---TA--AGTCC--T-TT---A--C-A--G-A-G----ACA-CA-T---AA-T---------------G-ATA----C-A----T-AC---------T----G---G---TGATAAAC---C---T---------T-ACA-AA-TG-TGA------TA--TCTGTGG-A--AA-GGCGTTC-ACTT-----ATA---AT-GGA-GAC-T-TG-CG-TA-G-ACACAC----C-AGGACA-N---NN----NNN------NNNNNN--NNN-NNNNNN-N-NNN-N-NN-NNNNNNNNNNNNNNN------NNNNNNN-NNNN--NNNNNNNNN-NNNNNNNN-NNNNNNNNNNN-NN---NNNNNN-N-NNN-NNNNNNNNNNN---NN-NNN-N-NNN-NGTG-TGTGGGAGG---GCATTC-AGTGA--GACA-G-GAG--CCATGCG---GAAGCACAT--G-AA---GATA-C---ATGC-------T
gi|7 : cattccctaacGTGT-GTGGGAG-GGCA-TTCAGTGAGACAGGAGCC-AT--GCGGA-AGC-A--C--AT----G-AA--GATACA-----TGCT-N--NNN--NNN-NNNNNN---NNNN-NN-NNN---N----N----NNN-----N---N----------N-NNN-NNNNNNNNN-NNNN---N----NN-----NNN---NNN-NNNNNN--NNNNNNNN-N---NNN----NNNNNNN----NN-N----NNNNN-N-N----NNN---N-NNNNN----NNNNN--NN-NNN---NN--N--N-NGT--G-ATGTCT-GTG-G--AAAG-GCATTCAGCCG--TA---C---GGGAA--CATT---A--A-A--G-A-G----ACA-CA-T---GA-nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngtgatgtctgtggaaaggcattcagccgtacgggaacattaaagagacacatgacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaaccatatcagtgtgatgtctgtgggaaggctttcaggcattcagtaacattatataagcata
gi|7 : cattccctaacacaggaagcttacaggcacacatgacaacacacactggtgaaaacccttacaaatgtggtgtctgtgaaaaagcattccctcacataagtcctttacagagacacataatgatacatactggtgataaaccttacaaatgtgatatctgtggaaaggcgttcacttataatggagacttgcgtagacacaccaggacannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn-G-TG-ATGTCTGTGGAAAGG------CATTCAG-CCGT--ACGGGAACA-TTAAAGAG-ACACATGAcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaaccatatcagtgtgatgtctgtgggaaggctttcaggcattcagtaacattatataagcata
gi|7 : cattccctaacacaggaagcttacaggcacacatgacaacacacactggtgaaaacccttacaaatgtggtgtctgtgaaaaagcattccctcacataagtcctttacagagacacataatgatacatactggtgataaaccttacaaatgtgatatctgtggaaaggcgttcacttataatggagacttgcgtagacacaccaggacannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngtgtgtgggagggcattcagtgagacaggagccatgcggaagcacatgaagatacatgctnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnAA-CCATAT-C-AGT-G-TG-ATGTCTGTGGGAAGG------CTTTCAG-GCAT--TCAGTAACA-TTATATAA-GCATAcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaaccatatcagtgtgatgtctgtgggaaggctttcaggcattcagtaacattatataagcata
gi|8 : cattccctaacacaggaagcttacaggcacacatgacaacacacactggtgaaaacccttacaaatgtggtgtctgtgaaaaagcattccctcacataagtcctttacagagacacataatgatacatactggtgataaaccttacaaatgtgatatctgtggaaaggcgttcacttataatggagacttgcgtagacacaccaggacannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngtgtgtgggagggcattcagtgagacaggagccatgcggaagcacatgaagatacatgctnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngtgatgtctgtggaaaggcattcagccgtacgggaacattaaagagacacatgacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn--------------TTACTTCTTT--TATGCCT-----AGAA---TGT--A----T----A--C-A---TGGATTT-TGAT----------AA-----------A--TA--------T-----------T---T--------------TGTT---T--GG--T-TTT-A-AAAG--T-TT-G--AAA-GCA-TGACATTTA---A---A--TC--TT-C-G---A-TATTGCT-TTT---T--CTCCT--CT--C--------GGAAT--TTT-GCGCGCCATG--------------AT-CTT-----TGACATTCA--TAT-GTCGTC-CTTT--TA-----CAACACCAAAAAAAAAAAAAACAAAAAAAAAAACAAAC-TGTTA--GCCA-TATCAT------TTCAA--AATTTCC-GAT----TTAATGGCAC--ATA----CA----A-GTC-AA--TCATCACGTT------AA-CAGTTTGTT--AG--ATAACA-CTAA-CG-TT-CAG-
gi|9 : gAAGGACATATCCCATG----TTT---CTA-AAC---TTT------A---TTAATTTTT-AT-GC-AAAA--------------TTACTTCTCTG-TATGCTT-----AAAA---TGA--C----T----A--C-A---GA------TA-T----------AT-----------T--T---------TAAATACATTAAT---T--------------CGCT---T--AG--T-TTT-C-AA-G--T-TTTG--AAA-GCAATGAAATTCA---A---AA-TC--TGGC-A---A-TAT-GCA-TAT---T--TT--T--CT--C--------GGTAT--TCT-GCGCGCCATG--------------GT-GTG-----TGACG-TCA--TAT-A-CG---CCTT--TG-----GAATGT------------AAACA-------------AC-TCTCA--GGC--TA--AT-AAA--T---A--GATT--C-GA-----TTAATAG-AC--A-AG---AA----A-GGC-AA--TTAT-ACGTT------AA-CAGATTG-C--AA--AT-GCA-TT-A-CG-TTACGA-GTGggtcggttacggatgtaatagctgtcaaataaggactgtaccgtgaacattgtcaacttttacgaaggaaggtgcgaggaaaaagacgagtattttgtcacacaggaccaataccataaaatcaaaacagtcgtttttgctccatgtactgttaaaaaagaaatgatattattagaaataaaggaaaaccaaacacaggtaggcagcgaccaggtttaacttgcgaggtgtttattttagaagcggatattcgcaactacatgcttacagtgttacattgccaagatatgacacaaaattacacacccgtacacactccctaagaatatgtactcagactcgcattctcattcctaccaaatcgcaaatacacaaatatatgaattaaagatttgaattgaagttgtatttacaataataaatatgtaa
16 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|17 ): ATTATTAAGTTTTATAATCATTTTTATTACTTATGTTGCGTAGCCCAATTAGAAACAGATTAAATTCATCAGGAACAGGTCAAGGTATAAATTGTTCATCAGAGATATGTTCACCAACACTGACACACTAGAATTTAGATTGAATGAAACATCCCATTGCACGAATAGCCCTCCTCAGATGACTTTCTTTCATCTACAACCAATAGCTGCCTGTGAAACAAGTATGTATATCTACCCAACCAATGGCTGTCTCTGAAACAAGTATGTCTTCTACACAATCAAGACTAGCACAAACGGAAAATATAACGGACTTTGTTGAAACTGTTGAAGCAGTCTGTGAAACAAGTAAAAACTCAAGATCTGAAAAATGATTTACAGGAGTGTATAAACAAAAATGGAGGTGAAAAACAAAATATCAATGTGATGTTTTTAAGGTAT
Unaligned ( gi|21 ): GCCAGAATAAGGGTGGTAGTCTAAGTTTTTTTCAGTTTTTTTTCCAAGGAAGGTACATACTGAAGGAAATGTTTTTTGACACCAAGGACTTTACCATAATTAAAACAGTCGCTTTTGTCCATGTGTTGTAAGAAAAAAAAATACACGTAATAAAATAATGAAACAACAACAGTTGGACAGCAACCCAGTCTAATAGCTAAAAAGTGTTTATATAGAAGTTAAACACGGCTAGGCCCACAGCGTAAATTGTGTCCAGGCCCAGGATCACCCGCTCAAACTGACCTACAAATAGCATAACAAATATTCAGGTTCGTGTATTAAAAATTTAATTGAATTATAAGATAATTATGCAAT
Unaligned ( gi|22 ): CCAGAATAAGGGTGGTAGTCTAAGTTTTTTCAGTTTTTTTTCCAAGGAAGGTACATACTGAAGGAAATGTTTGTTGACACAAGGACTTTACCATAATTAAAACAGTCGCTTTTGTCCATGTGTTGTAAGAAAAAAAAATACACGTAATAAAATAAATGAAAACAACAACAGTTGGACAGCAACCCAGTCTAATAGCTAAAAAGTGTTTATATAGAAGTTAAACACGGCTAGGCCCACAGCGTAAATTGTGTCCAGGCCCCAGGATCACCCGCTCCAACTGACCTACAAATAGCATAACAAATATTCAGGTTCGTGTATTAAAAATTTAATTGAATTATAAGATAATTATGCAAT
Unaligned ( gi|24 ): GTGTACTAATGTCAATTAGCGTGGTGAGCCCTGAGTTTTTGTCCAAGAAGGAAGGTTCGGAGAATTTGTTAGTCTGTCGCTTCAAGGACTTAACCATAAAAAAACATCGCGTTTTGTCTCTTTGTAACTGTTAAAAAAAAAAGGGGAGAAACATAAACAAGTGGACAGCGTAACCCCGATTATTGCGCGAGAAGTTTTAAAGTATAGAAAGCTATAAGACACGGCAGTTAGGTCTACAACGTTTATTTATGTCAGCCATTTCACGAATACACGCCCGCACTCAACTAGACCTACATAT
Unaligned ( gi|28 ): TATGTTCGGGTGGTGTGTGTCGGTTACGGGTGTACTAGCTGAGTTTTTCAACTTTTACGAAGGAAGGTGCGAGGAAATTTTTGTCGACACAAGGTCATTATTATAAATAAAACAGTCGCCTTTGTCCTTGTACTGTTAAAATATCAAAATAAAATAAAGGAAAACATAAACAGTTGGACAGCAACCCAGTTTAACTTTATATAGAAGCTAAACACAGCTAGGCCCACAGCGTATAGTGTCCAGGCCATTTCACGAAATACACAACAGTACCAACTGACGTACATAACATATAT
Unaligned ( gi|35 ): AATTTAGCTAATCGAAGTTACATCGGTTTATCGAAGCTACACATCAACATATTTCACTAAAACGTGTCATAATGGTAATTTCTGGCTGCTAGCCATTCCCTTTCGGGTATTAGTAAGGTCATTATGTCACGACTACCGTGCAAAATTCCCCAGGAGTTGGCGCACAGAAATTCAAGAGGTAAGGCGGAGT
Unaligned ( gi|37 ): ACAACAACAAATATCTCCTGACAGCTTCTGTGTTTCCATTTTCTCTAAGCCAAATCGCGCATCATTTATAAAAAAATTAATGAATACAATAATTAAAGATATCGAACTTCTTAATAAAAAATTACAAAAATGAAGAAATATGTAGATTTATATAATCTTTTATACTGTGGAACGACAGCGCTTCTTTA
Unaligned ( gi|42 ): AGGACATCTAGGCCTACAACATATGCATTAATATTCTGTTCTGGTCGTCGTCATTTCCCAAGATACATGTATATACTCGCACTTAGGAATTTAAACTAACTCCGTACCACTAACTAACAATTTATCTTGTGTTCCCACTTCCTACCAACAT
Unaligned ( gi|45 ): GTTATAATTTGTCATCAGAGATGTGTTCACCAACGTTGACAACACTAGAATTTAGACTGGAATGAAACACCCCATTGAAAATAGCCCTCCTCAGATGACTATTCTTTTCATCTACCCAACCAAT
Unaligned ( gi|46 ): AAAGATTGAACTTGTATTTACAAATAATAAATATGTAATTCCTCAGTAAACATTTCATTGATTTCACGCGGTTTAACCATGTCATCAATATGAGATGTGTATTGCCGTGCTCTCCGACGGCTT
Unaligned ( gi|49 ): GCAACCCAGCCTAGTTGCGAGAAAATGTTTTTATAGAAGCTAAACACGGCTTGGCGCACAGCGTAAATTCTCCAGGTCATTTCACGAAATACACACCCGC
Unaligned ( gi|50 ): AAAATGTCTTCCAATGTCATTTCTGGCTGCCAGTTCCTTCCCTTTTTCTGGTATTAATGAGGTCATCAATTACGTCACGACCACCGTGCAAGACT
Unaligned ( gi|54 ): TGATCTTCCTCACTTCACGCAATACACACTCGCACTTTGGGAATAAAAGAACATGCACTTGTGCTCCCATTTTCTATCAACTATTAGA
Unaligned ( gi|58 ): TACAATATTAATGGGATTGAACTACTTCAAGGTTAAATCCATTTATCAAAGTAAA
Unaligned ( gi|59 ): GATGTGTATTGCCGTGCTCTCCGCCGGCTTCAGGC
Unaligned ( gi|60 ): AGAGTCATCTTATGTGACGTCACAAATTTTAGG