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Reference ( gi|5 )            :                      TTAAAAGGGGACTAATTCATGACTTCCCCCAAAATT--TTGATAATCAAAATCT---ACTG---T-ATA-----A-T-AT--GTGT--T------TTAAAG-GTT---T-C---A--C----A--A-A-AA-AATTGAGG--TTATA--C----A-TCAC-GACAG-----AA-GC----T---CAT--T-------G-T--AT---------A--G----TTT--A---T-C-ATTT-GTTG--TGT--AAAC-AAA-G-ATTTAAGGT--A---A------T-ATGCT-ATT-G-TT---A-AA--A--G---TTACGAAAAG-GT-ATGGT--T----ATCGACCTATGTTT-ATGATATATATA----------TATACCGT--ACATATCA--CATTTCA--AG-----C---------ATTC-TGTAG----GTA-------------A-AA----------------------T---G-TG----CC--------------------T----------------T--------------------T---G-----G------------------G------C--AAAATT----AGGA--T---GCTTTAAA---T--T-A-CAAAA-C-TA-ACATTTCACT-G---GTTT-TTTG
gi|10                         :                         AAAGGCGACTGATTCACGATTTTCTC--AAACT--TTGA------------------G---T-TT--------C-AC--GTGT--T------TAAAAA-GTT---T-CGTAA--A----A--A-A-AA-AAATAAGG--T-GT---C----A-TCATTGAAAG-----AA-AC----T---CAC--T-------A-C--GA---------A--G----ATT--A---TTC-ATTT-GTTA--TGT--AAAC-AAA-G-ATTTCAGTT--AC--A------TGATATC-ATT-G-T-----------------TTACAAAAA
gi|4                          :               ttcatcaatattaacattCTCATTCACGATTTCCCCCTAAATT--T-GAT--TT----TTC---ATT----T-GTA-----A-TGATCAAT-T--T------TTGAAA-ATT---T-C---A--CCAAAA--A-A-AA-AATCAAGG--TTATA--C----A-TTAT-GACAG-----AA-GC----T---CGT--T-------G-T--ATATAG-----A--G----ATT--A---T-C-ATTT-GTCG--TGT--AAAC-AAAGG-A--TGAG--------A------T-ACGTA-ATT-G-TT---C-AC--A--GATATTTC-AAAAT-AT-ATGGT--T----ATCGATTTAAGT----GGAT-TA-ATG----------CATGCCG-------------CATTCCA--AG-----T---------ATTC-TTTAT----GTA-------------A-AATATGTTATTTTCGAGTTAAATTT---G-TG----AC--------------------T----------------T--------------------T----------------------------G------T--AAAATA----AAGA--TAACGCATTATA---T--T-T-CAAAC-T-TA-AAATTTAACT-G---GTTT-GTTataacttaaaaaattatcaaaatctgtgatgaatatttaatcggaaatatttgtaggttcaatatgccatttaaaatgata
gi|7                          :                                  TAACTCA-GATTCCCCTCAATTTTATTTAATTATCAATGTTT---ACTCATTT-ATA-----CCT-TT--CTAG--T------TTATAG-GTT---TTC---ATCC----A--A-T-GATCATTGAAAAATTCTA--C----A-TCAT-GTCAG-----AA-GC----T---CAA--T-------G-TAGAG---------A--G----TTT--A---T-T-CTTT-GTTG--T-TAAAAAC-AAA-G-G-TTGAG--------A------T-GTTTT-ATT-GCTT---ACAA--A--G---TT--TAAAAA-AC-ATGGTA-T----TTTGGGTAAAGTTT-ATCGTATATACA----------TGTA--GT--GAA----------TTCA--AG-----T---------ATTC-TTTAG----GTA-------------A-AA----------------------T---G-TG----tttaaa
gi|8                          :                                   tATTCATGGTATTCCCCAAAATT--TTGacgtcatggcagttttcgttacattgtatcgaactattactaaacatt
gi|30                         :               ctgtatcaaagggatatcgactctgaagATTTCCCCCAGAATT--T-GTTTTTCA---TCTTTAAATG---T-CTA-----A-T-----GTGT--T------TGAAAG-GTT---C-T---A--C----A--A-A-AA-A-TAAAGG--TTATG--C----A-TTAT-GAAAA-----AA-GC----T---CAT--T-------G-T--AG---------AGGG----TTT--A---T-tttttcacattaaattttaatgatcaaaagtcagatattatggtagagagtttattatttgttgtgtaaacaaagtttgaggcatgctattgtttacatagttttcaaaatgtaattgttaatcttcctaagtttataatagtcaaaaaatcatgtttcaagcattatctaggtaaactgtacttatttaaatttgtgttaaaactttaaatgcttaaaatttcactgggttgtttg
gi|3                          :                                                        TT--CTG-TAATTAAAATTT---ATTC---TCAT-----------T--GTGA--T------TGAAAAAGCTCCGT-C---A--C----A--A-A-AA----TAAGG--TC-TA--C----T-TTTT-GACAG-----GATGC----T---CATAAC-------G-G--AG---------A--G----TTT------T-T-AATC-GTCA--TGT--AAAC-AAA-GCATTCACGGT--A---tct
gi|24                         : tgctattaatgggctctgttcatatgattttcttaaaacttgaactttttcactttT--TTAATCATTAAA---------TG---T-ATACAAACA-T-ATT-GTGT--TGGAAAGCGAAAG-GTT---T-C---A--C----A--A-A-AA-ATTAAAAG--TTGTA--CATCGA-TCAC-GACAG-----AA-GCTAATT---AAT--T-------G-T--GTAATAGATAGA--G----TTT--ATATT-C--TTT-GTTG--TGT--AAAC-AAA-G-G-TTGAGGT------A------T-ATttgtttttttttacaaaatatgtttttttttaaactaatctaaaaatctgtgagtgaatatagaacctgaaaggtattatatacgttacaatatttgaaatatgctatattataacttgatatgattttatgactgttcatatgatagttcaaattacagattttt
gi|9                          :                                                                TGATTGAAATGT---ACTG---T-CTA-----T-T-GT--GTTTAAT------TAAAAG-GTTCCGT-C---A--C----A--A-A-AA----TAAGG--CTGTA--G----A-TTAT-GACAG-----AA-GA----T---CAT--TAG-----G-G--AG---------A--G----TTT--A---T-TTATTT-GTTA--TGT--AAAC-AAA-G-ATTCAAGTT------T------T-TTTCT-ATT-G-TTTACA-AA--A--T---ATAAAAAAAA-CT-ATGGT----------GA---ATATCTAATGATA-------------------------------------ATTTTA--AG-----T---------ATTC-TTTAG----GTT-------------G-AA----------------------T---C-TG----CTA-------------------T----------------TTAAAATAATAATTTTATGACT---G-----G------------------T------C--AACATT----ATGA--C---GTTTTATA---T--T-A-CAGA
gi|27                         :                                                                TGATTGAAATGC---ATTG---T-CTA-------T--T--GTGT--T------TACAAA-GTTCCGT-C---A--C----A--A-A-AA-GA-----G--TTGTG--C----A-TTAT-GACAA-----AA-GC----T---TAT--TAC-----G-G--AA---------A--G----TTTT-A---T-T-AATT-GT-GATTGT--AAAC-AAA-ttt
gi|6                          :                                                                  tacaattttcttcaaaccttgattttcactttctcT--GTGT--T------TGTACG-ATT---T-C---A--C----ACAA-ATAA-AATCAAAG--TTCTA--C----A-TTAT-GATAAGTA--AA-GC----T---TAT--T-------C-T--AG---------A--GAA--TAT--A---T-T-CTTT-GTTG--TGT--AAAC-AAACG---TTAATG--------------T-ATGTT-ATT-G-T-----------------TTAC---AAC-GT--TTCC--T----ATCAATCTAAGTTT-AT-------------------------CAT--GCATAGCG--CATTTGA--AG-----TAAATGTGTAATTT-TAAAG----GTA-------------ATTT----------------------T---G-TG----AC--------------------T------------------------------------------------------------------G------C--AAAATT----AAGA--T---GCCTTAAA---T--C-A-CAAAT-G-TA-ACGTTTCACT-G---TCTTATTTG
gi|18                         :                                            aagggtttgattcattttatctctccaaaatgttgttcctttcttttaatggtctgtT--GTGT--T------TAAAAA-GTCCCAT-C---A--C----A--C-A-AA-ACTCG--------TA--C----A-TTAT-GACAG-----AA-GC----T---CAT--TACGGCGAG-T----------------G----TTT--A---T-T-ATTT-GTTA--AGT--AAAC-AAA-G-ATTCA------G---A------T-GTGTT-ATT-G-TT---t
gi|11                         :                                                                                                      ttctaattgaaagtattgtctgtTT---T-C---A--C----C--CCA-AA-AATCAAGG--TTATA--T----A-CTAT-GACAG-----AG-GC----TAAATAT--A-------GAT--AT---------A--GAGA-GTTAAA---T-C-ATTT-GTCG--TGT--GAACTAAA-G-ATTGA--GT--A---ACTGAGGT-ATCTT-ATTGG-TTCACA-AA--A--C---CT-TGAAATG-TT-A---T--T----ATCGG-----ATCT-AAGACATGTAT------------------T--ACATCTCA---ATT-----------------------TTC-TTTGG----GC--------------A-AA----------------------T---A-TG----CCA-------------------T----------------T--------------------TAA-A-----G------------------T------T--AAAATT----GGGA--T---GC-TTAAA---T--T-A-C-AAA-T-TAGGCATTTCACT-A---ATTTGTTTGtagcacatatttcaaaaactatctaaaaatttgatgaatatataatctgaagtattttttgggttaaatatg
gi|12                         :                                                                                                                              T---T-C---A--C----A--A-A-AA-CATTAAGG--TACTA--C----C-TAAA-GACAG-----AG-----------CAT--T-------G-T--AG---------A--GAG--TTT--A---T-T-CTGT-GTTG--TGA--AAGC-AAA-G-GTT--A-----A---A------TCATGTT-ATT-G-TTT--ACAA--A--G---T-ATCAAAAC-GT-ATGGT--T----ACCAATCTAGGTTT-ATCATGTATA------------------G---------CG--CATTTAA--AT-----A---------ATTC-TTTAG----GTA-------------A-AA----------------------T---A-TA----CTA-------------------T----------------T--------------------T---A-----GAGGTAATTTTGTGACTGTG------C--AAAATA----ACAT--T---GTCTGATA---T--T-T-CAAAA-T-TA-AAAATTCACT-G---GCTT-GTTtaaa
gi|13                         :                                                                                                                                     ---A--C----A--C-A-AA-AATCAGAG--TTCTA--C----A-TAAT-GACAA-----TC-GC----T---CAT--T-------G-TAAAG---------A--G----TTTA-A---T-C--TTT-TTTG--TGT--AAAC-AAA-G-G-TTGAGTT--A---T------C-AAGAT-ATTCT-TT---ACAA--A--G---TTTC-AAGAC-AT-ATAGTACT-----TTGAGTAACGTTT-AT--TATATATA----------------G---------CA--CATTTCA--AG-----T---------ATTC-TTTGG----GTA-------------A-AA----------------------T---G-TG----CC--------------------A----------------T--------------------T---t
gi|1                          :                                                                                                                                     ---A--C----A--A-A-AA----TAAGG--TCCTT--C----T-TTTT-GATAG-----AA-GC----T---CAT--TAC-----G-G--AG---------A--A----TTT--T---T-T-ATTC-GTTA--TGT--AAAC-AAG-------CAGG--------------T-ATGTT-ATT-G-T-----------------TTACAAAA----T-ATTTT--TTAAAAACTATCTAAATCT-GTGATGAATATAGAACCTGAAGTATTCTAT--ACATTAAA--TATTTGAATAA-----T---------ATGC-TAT-------TT-------------A-AA----------------------T---GATG----AT--------------------T----------------T--------------------T---A-----T------------------GAATGTTC--AAAATT----ATGA--T---GTTTCAAA---T--T-A-CAGActaaaggtttttttgtgacagtgcaaatttaagatggcttaaacattcactgattggtgtgtaaa
gi|16                         :                                                                                                                                            ----A--A-A-GA-AATTAAGG--TTATC--T----A-TTAT-GACAG-----TA-GC----T---CAT--T-------G-TAGAG---------A--G----TAT--A---T-T-ATTT-GTTG--TGT--ATGC-------ATTT--GTT--G---ATG----T-ATGTT-ATT-G-TT---T-AC--A--A---TTTTCAAAAT-GT-AC-GT--T----ATCGATCTAAGTTT-AT------TATG----------TGTATCGC--A----------ATTT-G--AG-----T---------ATTCATAT-G----GTA-------------A-AA----------------------T---G-TG----CCANNNNNNNNNNNN-------N----------------N--------------------N---N-----N------------------N------N--NNNNNN----NNNN--N---NNNNNNNN---N--N-N-NNNNN-N-NA-ACATTTCACT-G---GCTT-GTTtttttctaaatttggtcagcctttatttacgtaaaattactttacataacacaaatttagggtaagaatactgggtatataaatcctagcaatcagaaagtttcaacttcaaataagttatatttcctattttgtccaaaaatcgtgaatcag
gi|15                         :                                                                                                                                                 --A-A-AA-AATCAAGG--TTATATAC----A-TGAT-GACAG-----AG-GC----TAAATAT--A-------GAT--AT---------A--GAGAGTTA--A---T-C-ATTT-GTCG--TGT--GAAC-TAA-G-ATTGAAG-T--A---ACTGAGGT-ATCTT-ATT-G-TTC--ACAA--A--G---CCTTGAAAAATGT-ATGTT--T----ATCGATCTAAGTC--ATG--------------------------------TATTA--CATCTCA--AT-----T---------ATTC-TTTGG----GCA-------------A-A-----------------------T---A-TG----CCA-------------------T----------------T--------------------T---A-----A------------------A------TTTAAAATT----GGGA--T---GCTTTAAA---T--T-A-CAAAA-T-TA-GCATTTCACT-A---ATTTGTTTGag
gi|17                         :                                                                                                                                                  cc-A-AA-AATCAAGG--TTATA--C----A-TTAT-GACAG-----AA-GG----T---CAT--T--------------------------------------------ATTT-GTCA--TGC--AAAC-AAA-G-------GGTGGG---G------T-GTGAA-ATT-G-TTTACA-AA--T--C---TTTCAAAATG-CC-A-GGT--A----ATCGATCTAAGTTT-A--ATATATTTA----------------AT--ACATTTCAAGTATTTAA--AACGCGCC---------ATTT-T-CAA----GTT-------------A-AA----------------------T---T-TG----TA--------------------G----------------C--------------------T---G-----T------------------G------C--AAACTTTTAAAAGA--T---GCTTACAA---T--T-A-CAAAA-T-TA-AAAACTCACT-G---CTTT-
gi|19                         :                                                                                                                                                   tac-AA-AAT-AAGG--GTGTA--C----A-TTAT-GACAGAATTTAA-GA----T---CAT--T-------A-C--GT---------A--GA---CAT--A---A-T-ACTTAATTA--CTT--AAAC-AAA-G-ATTCATG---------------T-ATGTT-ATT-G-TTTACA-AAATA--T---TTA-GAAAAgattgtca
gi|14                         :                                                                                                                                                      tgA-AATCAAAG--CGATA--C----AATTAT-GACAG-----AA-GC----T---TAT--T-------G-T--AG---------C--GCA--TAT--A---T-T-TTTT-GTTA--CGT--AAAC-AAA-G-G-TTAAGGT----------------TTCTCATT-G-TT---T-AA--ACTG---TTTTCAAAGC-AT-ATGGT--T----ATCAATCTAAGTTT-AT------TATG----------TATTCTG-------------GATTTCA--AT-----T---------ATTC-TCCAG----ATA-------------A-AA----------------------T---G-TG----CCATTTTAAAGTTAAGTGTCTGT----------------C--------------------T---G-----A------------------G------C--AAACTT----AAGATGT---GCTTTGAA---T--T-A-C--AA-T-TA-ACATTTTACT-GCCTGTTT-tatctaaatctgttatgaatattcttcagattaaatatgccatttaaaatgatatgtttatgccggttcaaaaattacagatttaacat
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                  ---------A--G----TTT--A---T-T-ATTT-GTTG--TGT--AAAC-AAA-G--TTTGAGG--------------C-ATGCT-ATT-GTTT---A-CAT-A--G---TTTTCAAAAT-GTAATTGT--TA---ATCTTCCTAAGTTT-ATAATA----------------------GTCAAAAAATCA--TGTTTCA--AG-----C---------ATTA-TCTAG----GTA-------------A-AC----------------------T---G-TA----CTTA------------------T----------------T--------------------T---------------------------------------AAATT----------T---GTGTTAAAACTT--T-A--AATG-CTTA-AAATTTCACTGG---GTTG-TTTG
gi|21                         :                                                                                                                                                            ctgtatcaaagggatatcgactctgaagattcatggtattccccaaaattttgtttttcacattaaattttaatgatcaaaagtcagatattatggtagagTTT-ATTG--TGT--AAAC-AAATG---TTGGGG--------------T-ACGTT-ATT-GTTT---ACAA--A--G---TTTC-AAAAT-GT-ATGGTA-T----TTTGGGTAAAGTTT-ATCATGTAT------------------TGC--GCATA---------TCA--AG-----T---------ATTC-TGTAG----GTA-------------A-AA----------------------T---G-TACTATCC--------------------TAAAGGCTAATCTGTGAC--------------------T---G-----T------------------G------C--ATAATT----AAAA--T---GCCTTAAA---T--G-C-CAAAATT-TA-AAATTTCACT-G---GATT-GTT
gi|25                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                     cAA-G-ATT-GAGGT--ACTAG------T-ATGTT-ATT-G-TTT--ATAA--A--G---TTTTGAAAAT-GT-ATAGT--T----ATCGAACTAAGTTT-GTGATATA---------------------------TATCA--TATTTCA--AA-----T---------ATTC-TTTAT----GTA-------------A-AT----------------------T---G-TG----CCA-------------------T----------------T--------------------T---A-----T-----------------------------AAGTT----AGA----------TTAAA---T--T-A--AAAT-A-TA-TCATTTTACT-A---G
gi|29                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   ATGTTT-ATTGTCTAAGTT----------TATG--GT--ATCCATTA--TATTTCA--AG-----T---------ATTC-TTTAGTATAGTGCCATTTGAAAATTA-AA----------------------T---T-TG----CG--------------------T----------------C--------------------T---A-----A------------------G------C--AAAATT----AGGA--T---GTTTCCAA---T--T-A-CAAAA-T-TA-ACATTTTAC
gi|23                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  TATCAT--TTATAGCA--CATTTCA--AG-----T---------ATTC-ATCAA----GTA-------------A-AA----------------------T---G-GG----CCATTTTAAAGGTAAA------T----------------T--------------------T---GTGACTGT-----------------G------T--AAAGTC----AAGA--T---GCCATAAA---T--T-A-CAAAA-A-TA-GCAATTCTCT-G---ACTTGTTTGaagt
gi|28                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        gtgtgttattgtttacaaagtttcataactcgtggtattttggagtaaagttATATCT--AATCTGA--AG-----T---------ATTC-TTTAG----CTT-------------A-AA----------------------T---A-TG----CCA-------------------T----------------T--------------------T---G-----ATGATGATTTTATGACT--GTT----C--AAAATT----ATGA--T---GTTTTAAA---T--T-A-CAGAT-T-TA-ACATTTCATT-A---GTCT-Tt
gi|32                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       ttcaattaatctccatgtaaatctgtgatgaTTTCA--AG-----T---------ATTC-TTTAA----ATG-------------A-AA----------------------T---G-TG----CCAT------------------T----------------T--------------------TAAAG-----GTAAATTTATGATT-----G------C--AAAATT----AAGA--T----CCCCAAA---G--T-A-CAAAA-T-TA-ACTTTTCACg
gi|31                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     ---------ATTC-TAAAA----GTT-------------A-CA----------------------TTTGG-TG----AC--------------------T----------------G--------------------T---G----------------------------------AAACTT----AAGA--T---GCTTTAAA---T--T-AGCTAGA-T-TA-ACATTTCATT-G---GCTT-
gi|26                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      attaggtcaaatatgtca----GTG-------------A-AT----------------------T---G-TG----CT--------------------T----------------T--------------------T---G-------------------------------C--ACAATT----AAGA--T---GCCTTCAA---T--A-G-TAAAA-T-TA-ACATTTCACT-A---ACTT-GTTgctagtaa
gi|33                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         atgtaattatcagtcttattttatcgtgtccaactcatttaaaatcttctttaggtataatgtaccatcttgaaaataaactt------C--AAAATT----AAGA--T---GTTTTAAA---TAATGA-CAAAG-T-TG-ATATTTCATC-A---GTCT-

Unaligned ( gi|2 ): TGAAAATAAGGGTGTACATTATGACAGAATTTAAGATCATTACGTAGACATAATACCTTAATTACTTAAACAAAGATTCATGTATGTTATTGTTTACAAAAATATTTAGAAAATATCTAAATCTGTTATGAATATTCTTCAGATTAAATATTGCCATTTAAAATGATATGTTAATGCCGGTTCAAAAATTACAGATTTAACATTTCATCAGTGTTTTGTTCATATAACACAGATTTGGGGTTAGATTATTACATGTATCCTTGTACCATGTAGTAAGAAATTCTAAATTTTGGTTTGCAACTTCAAATGAACTATATTTATTTAAAATGAAACATTTTGTCGAAAAATTGGTGAAT
Unaligned ( gi|20 ): ACAGAACCTCATTACGGGGAGTTTGTTATTCAAACAAAGATTAATTCAGGTTTGTTATCGTTTACAAAATATTCAAAAACTATCTAAATTTTGACTATCTAATCTGAAATATTTGTTAAATATGCCATTTAAAATGATAATTTTATGACTGTTCGTTTTAAATTACAGATTTAAAGTTTCATCTGTCTTTGTTTTCATA
Unaligned ( gi|22 ): AAGATTCAGGAATGTTATTGTTTCAAAATTCACTAATTGTAATGAGTATTTAATCCTGAAGTATCTTTAGGTTTAAATATGCCATTTAAAATTGATAATTATTAATGACTGTTTCAAAATTAAGATGTTTAAATTACAGATTTTAACTTTTTCAATCAAGTCTTTGTTTACATAAAAC
Unaligned ( gi|34 ): ATNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNATT
Unaligned ( gi|35 ): TTCAACATAAAAAAGTTATATTTCTTTTGTCCAAAATTCTTGAATCAGTCCT
Unaligned ( gi|36 ): TATATTACTTTCAATTACATTTTTCACCAAATAAAGTAAATTATGATGTT
Unaligned ( gi|37 ): TTTGAAAAATCTGTCTATAGTAATGTTCTAAAGCCAAAGAAAGGTTTC
Unaligned ( gi|38 ): CCCCCGCAATTTAAAATGATCAATAATCTTCTGTCGGATGTATTT

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gi|19                         :                                                                                                                                                                                            ttc-AAAAT-A-----AGGGTGTA--C----A-TTAT-GACAGAATTTAA-GATCAT--TAC-----------G----T--------A--GA-----------CA--TA-AT-A--CTTAATTA--CTTAAA--C-AAA-G----ATTCA-TG-------------T--ATGT-TATTG--TTTAC-A-AA-AT--A---T---TT--AGAAAA-T-----------------ATCTAA-ATCT-GT----T--ATG----------------A-AT-----------------------------ATT--CTTCAGATTA-AATATGCC-------A------------T-------------------T-------------------T-----------------------------------------------------------------------AAAA-TGAT----AT----------------------GTTTA-----T---GCCGGTTCAAAA-AT--T-A-CAGAT-T-TA-ACAT
gi|2                          :                                                                                                                                                                                             tg-AAAAT-A-----AGGGTGTA--C----A-TTAT-GACAGAATTTAA-GATCAT--TAC-----------G----T--------A--GA-----------CA--TA-AT-ACCTTA-ATTA--CTTAAA--C-AAA-G----ATTCA-TG-------------T--ATGT-TATTG--TTTAC-A-AA-AAT-A---T---TT--AGAAAA---T-AT--C--T-A---AATCTG----TT-ATG-A------ATA----T------TCT-----T----CAGATT----AAAT---------ATTGCCATT---TAA-AATG-----------A------------T-------------------A-------------------T-------------------G--------------------------------------------------------T--T----A---------------------------A-----T---GCCGGTTCAAAA-AT--T-A-CAGAT-T-TA-ACATTTCA-TCAGTGT-TTTG
gi|20                         :                                                                                                                                                                                                                                 tgACAG-----AA-CCTCAT--TAC-----------G----G--------G--GA--------G--TT--TG-TT-A--TTC----------AAA--C-AAA-GATTAATTC--AGGT-----------T---TGT-TATCG--TTTAC-A-AA-A---T---A---TT--CAAAAA-C-T---------------ATCTAA-ATTT--TG-ACT--ATCTA---------------------------ATCTG--AAAT---------ATT--TGTT-----A-AATATGCC-------A------------T-------------------T-------------------T-----------------------------------------------------------------------AAAA-TGAT----AATTTTAT----------------G---ACTGTTC---GTT--TT---AA-AT--T-A-CAGAT-T-TA-AAGTTTCATCTGTCTT-ttcatataacacagatttggggttagattattacatgtatccttgtaccatgtagtaagaaattctaaattttggtttgcaacttcaaatgaactatatttatttaaaatgaaacattttgtcgaaaaattggtgaat
gi|21                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                              --TTT-ATTG--TGTAAA--C-AAA-T----GTT-G-GGGTA--------------CGT-TATTG--TTT---ACAA-A---G---T---TT--C-AAAA-TGT-ATGGTA-T-TTT-GGGTAAA-GTTT-AT----C--ATGTA----T------TG-----------CGCATATC--AAGT---------ATT--CTGTAGGTAA-AATGTACT-------A------------TCCTAAAGGCTAATCTGTGAC-------------------T-------------------G-----------------T----------------G-------------C--ATAA-T--T----AA----------------------A---A-----T---GCC--TT---AA-AT--G-C-CAAAATT-TA-AAATTTCA-CTGGATT-GTTgttttcata
gi|23                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           c------T--GTGT-TATTG--TTT---ACAA-A---G---T---TT--C-ATAA-CTC-GTGGTATT-TTG-GAGTAAA-GTTT-ATC-A-T-----------T------T----ATAG----CACATTTC--AAGT---------ATT--CATCAAGTAA-AATGGGCC-------A------------T-------------------T-------------------TTAAAGGTAAATTTGTGACTG-----------------T----------------G-------------T--AAAG-T--C----AA----------------------G---A-----T---GCC--AT---AA-AT--T-A-CAAAA-A-TA-GCAATTCT-CTGACTTGTTTG
gi|24                         :                                                                              gT--T-----TAA-------T-----CATTAAA------T-GTATA-CAAACATATTG-----T-----GTTGGAAAGCG-A----AAGGTT---TC----AC----A--A-A-AAATTAA-----AAGTTGTA--CATCGA-TCAC-GACAG-----AA-GCTAAT--TAATTGTGTAATAGA----T--------A--GA--------G--TTTATA-TT-C--TTT-GTTG--TGTAAA--C-AAA-G----GTT-G-AGGT----A------T--ATt
gi|25                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     AA-G----ATT-G-AGGTACTAG------T--ATGT-TATTG--TTT---ATAA-A---G---T---TT--TGAAAA-TGT-ATAGT--T-ATC-GAACTAA-GTTT-GTG-A-T--AT-------------------ATAT----CATATTTC--AAAT---------ATT--CTTTATGTAA-ATTGTGCC-------A------------T-------------------T-------------------T-------------------A-----------------T----------------------------------AAG-T--T-----A----------------------G---A--------------TT---AA-AT--T----AAAA-TATA-TCATTTTA-CTAG
gi|26                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         CATTTA--AAAT---------CTT--CTTTAGGTAT-AATGTACC-------A------------TCTTGAAAATAAAC------T-------------------T-------------------G-----------------T----------------GAATTGTGCTTTTGC--ACAA-T--T----AA----------------------G---A-----T---GCC--TT---CA-AT--A-G-TAAAA-T-TA-ACATTTCA-CTAACTT-GTT
gi|27                         :                   atgtaattatcagtcttattttatcgtgtccaactACAATTT---TCTTCAAACCTTGATT--T-----TCACTTTCTCT-----GATTGAAATGCATT-GTCTA-T--------TG-----T-----GTT------TA-C----AAAGTTCCGTC----AC----A--A-A-AAGA----------GTTGTG--C----A-TTAT-GACAA-----AA-GCTTAT--TAC-----------G----G--------A--AA--------GT-TT--TA-TT-A--ATT-G-TGATTGTAAA--C-AAA-
gi|28                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                tTC-CATGTAA-ATCT-GTG-A-T--G------------------A-ATAT----CTAATCTG--AAGT---------ATT--CTTTAGCTTA-AATATGCC-------A------------T-------------------T-------------------T-------------------G-----------------ATGATGATTTTATGACTGTT-----------C--AAAA-T--T----AT----------------------G---A-----T---GTT--TT---AA-AT--T-A-CAGAT-T-TA-ACATTTCA-TTAGTCT-TT
gi|29                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           ttcaattaatc-ATGTT--T-ATT-G-TCTAA-GTTT-ATG-G-T--ATCCA----T------TATA-------------TTTC--AAGT---------ATT--CTTTA-GTAT-A--GTGCC-------A------------T-------------------T-------------------T-------------------G---------------------------------------------------AAAA-T--T----AAATTTGCGTCTAAGCAAAATTAGG---A-----T---GTT--TC---CA-AT--T-A-CAAAA-T-TA-ACATTTTA-Cg
gi|3                          :                                                                              TT--C-----TG--------T-----AATTAAAATTTATT-CTC-A-T--------TG-----T-----GAT------TGAA----AAAGCTCCGTC----AC----A--A-A-AA---TA-----AGG-TCTA--C----T-TTTT-GACAG-----GATGCTCATAAC-------------G----G--------A--GA--------G--TT--T--TT-A--ATC-GTCA--TGTAAA--C-AAA-GC---ATTCA-CGGTA---T------T--GTTT-T-TTT--TT----ACAA-A---A---T---aagt
gi|30                         : tgctattaatgggctctgttcatatgattttcttaaaacttgaactttttcactttATTT---CCCCCAGA-----ATT--TGTTTTTCA-------T-----CTTTAAA------T-GTCTA--A-------TG-----T-----GTT------TG-A----AAGGTT---CT----AC----A--A-A-AAA-TAA-----AGGTTATG--C----A-TTAT-GAAAA-----AA-GCTCAT--T-------------G----T--------A--GAGG------G--TT--TA-TT-atgtttttttttaaactaatctaaaaatctgtgagtgaatatagaacctgaaaggtattatatacgttacaatatttgaaatatgctatattataacttgatatgattttatgactgttcatatgatagttcaaattacagattttt
gi|31                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          TAA-AA-GTTAC-------A------------T-------------------T-------------------T-------------------G-----------------GTGACT-----------G-------------T--GAAACT--T----AA----------------------G---A-----T---GCT--TT---AA-AT--T-AGCTAGA-T-TA-ACATTTCA-TTGGCTT-ct
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Reference ( family-9 )        :                                                        NNNAAAGG-----CGACTN-----ATTCACGATTT---CCCCCAAA-----ATT--T-----TGA-------T-----NATTAAAATTTAT--T-G-TCTA-TA-------TGT-----GTT------TG-A----AAGGTT---TC----AC----A--A-A-AAAATCA-----AGGTTNTA--C----A-TTAT-GACAG-----AA-GCTCAT--T-------------G----T--------A--GA--------G--TT--TA-TT-A--TTT-GTTG--TGTAAA--C-AAA-G----ATTCG-AGGTA---A------T--ATGT-TATT-GTTTA-CAAA---G-----T-TT--CGAAAA-CGT-ATGGT--T-ATC-GATCTAA-GTTT-ATGATATATAT------TGA----------AT--CACATTTCAAGT---------ATTCT-----TTAGGTA----A--AATG-TGCC-------A------------T-------------------T-------------------T-------------------G-----------------T---------------G--C--------AAAA-T--T----AA------G---A-----T---GCT--TT---AA-AT--T-A-CAAAA-T-TA-ACATTTCA-CTGGCTT-TTTG
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gi|10                         :                                                         acAAAGG-----CGACTG-----ATTCACGATTT---TCTC--AA-----ACT--T-----TGA------------------------------G-TTT--CA-------CGT-----GTT------TA-A----AAAGTT---TCGTAAAA----A--A-A-AAAAT-A-----AGGT-GT---C----A-TCATTGAAAG-----AA-ACTCAC--T-------------A----C--------G--AA--------G--AT--TA-TTCA--TTT-GTTA--TGTAAA--C-AAA-G----ATTTC-AGTTAC--A------TG-ATAT-CATT-GTTTA-CAAA---AAATAAC-TT--AAAAAA---------T--T-ATC-AA----A-ATCT-GTGATGAATAT------TTA----------AT--CGGA-----AAT---------ATT-T-----GTAGGTT----C--AATA-TGCC-------A------------T-------------------T-------------------T-----------------------------------------------------------------AAAA-T--ttctaaatttggtcagcctttatttacgtaaaattactttacataacacaaatttagggtaagaatactgggtatataaatcctagcaatcagaaagtttcaacttcaaataagttatatttcctattttgtccaaaaatcgtgaatcag
gi|11                         :                                                                                                                                                                                  ttcatcaatattaacattTT---TC----AC----C--CCA-AAAATCA-----AGGTTATA--T----A-CTAT-GACAG-----AG-GCTAAA--T-------------A----TAGATATAGA--GA--------G--TTA-AA-TC-A--TTT-GTCG--TGTGAA--CTAAA-G----ATT-G-A-GTA---ACTGAGGT--ATCT-TATTGGTTCA-CAAA---A-----C-CT--TGAAA----T-GTTAT--T-ATCGGATCTAA--------GACATGTAT------T-----------------ACATCTCAATT----------TTCT-----TTGGGC-----A--AATA-TGCC-------A------------T-------------------T-------------------TAAA----------------G-----------------T------------------T--------AAAA-T--T----GG------G---A-----T---GC---TT---AA-AT--T-A-C-AAA-T-TAGGCATTTCA-CTAATTTGTTTGgata
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gi|24                         :                                                                                                            gT--T-----TAA-------T-----CATTAAA--------T-G-TATA-CAAACATATTGT-----GTTGGAAAGCG-A----AAGGTT---TC----AC----A--A-A-AAATTAA-----AAGTTGTA--CATCGA-TCAC-GACAG-----AA-GCTAAT--TAATTGTGTAATAGA----T--------A--GA--------G--TTTATA-TT-C--TTT-GTTG--TGTAAA--C-AAA-G----GTT-G-AGGT----A------T--ATt
gi|25                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 AA-G----ATT-G-AGGTACTAG------T--ATGT-TATT-GTTTA-TAAA---G-----T-TT--TGAAAA-TGT-ATAGT--T-ATC-GAACTAA-GTTT-GTGATATAT---------------------AT--CATATTTCAAAT---------ATTCT-----TTATGTA----A--ATTG-TGCC-------A------------T-------------------T-------------------T-------------------A-----------------T----------------------------AAG-T--T-----A------G---A--------------TT---AA-AT--T----AAAA-TATA-TCATTTTA-CTAG
gi|26                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   T--T-ATC-AGTCTTA-TTTT-AT----CGTGT------CCA----------A---CTCATTTAAAAT---------CTTCT-----TTAGGTA----T--AATG-TACC-------A------------T-------------------
gi|26                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        atgtaaGTG----A--ATTG-TGC---------------------T-------------------T-------------------T-------------------------------------T---------------G--C--------ACAA-T--T----AA------G---A-----T---GCC--TT---CA-AT--A-G-TAAAA-T-TA-ACATTTCA-CTAACTT-GTTcttgaaaataaacttgtgaattgtgcttttgcacaattaagatgccttcaatagtaaaattaacatttcactaacttgtt
gi|27                         : atgtaattatcagtcttattttatcgtgtccaactcatttaaaatcttctttaggtataatgtaccatcttgaaaataaacttACAATTT---TCTTCAAACCTTGATT--T-----TCACTTTCTCT-----GATTGAAATGCAT--T-G-TCTA-T--------TGT-----GTT------TA-C----AAAGTTCCGTC----AC----A--A-A-AAGA----------GTTGTG--C----A-TTAT-GACAA-----AA-GCTTAT--TAC-----------G----G--------A--AA--------GT-TT--TA-TT-A--ATT-G-TGATTGTAAA--C-AAA-
gi|28                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        tTC-CATGTAA-ATCT-GTGATGAATAT------CTA----------AT--C-----TGAAGT---------ATTCT-----TTAGCTT----A--AATA-TGCC-------A------------T-------------------T-------------------T-------------------GATGATGATTTTATGAC-T---------------GTTC--------AAAA-T--T----AT------G---A-----T---GTT--TT---AA-AT--T-A-CAGAT-T-TA-ACATTTCA-TTAGTCT-TT
gi|29                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   ttcaattaatc-ATGTT--T-ATT-G-TCTAA-GTTT-ATGGTATCCAT------T-----------------ATATTTCAAGT---------ATTCT-----TTA-GTA----T--A--G-TGCC-------A------------T-------------------T-------------------T-------------------GAAAATTAAATT------T---------------G--CGTCTAAGCAAAA-T--T----AG------G---A-----T---GTT--TC---CA-AT--T-A-CAAAA-T-TA-ACATTTTA-Cg
gi|3                          :                                                                                                            TT--C-----TG--------T-----AATTAAAATTTAT--T-C-TC-A-T--------TGT-----GAT------TGAA----AAAGCTCCGTC----AC----A--A-A-AA---TA-----AGG-TCTA--C----T-TTTT-GACAG-----GATGCTCATAAC-------------G----G--------A--GA--------G--TT--T--TT-A--ATC-GTCA--TGTAAA--C-AAA-GC---ATTCA-CGGT----A------T---TGT-TTTT-TTTTA-CAAA---A-----T-aagt
gi|30                         :                               tgctattaatgggctctgttcatatgattttcttaaaacttgaactttttcactttATTT---CCCCCAGA-----ATT--TGTTTTTCA-------T-----CTTTAAA--------T-G-TCTA--A-------TGT-----GTT------TG-A----AAGGTT---CT----AC----A--A-A-AAA-TAA-----AGGTTATG--C----A-TTAT-GAAAA-----AA-GCTCAT--T-------------G----T--------A--GAGG------G--TT--TA-TT-atgtttttttttaaactaatctaaaaatctgtgagtgaatatagaacctgaaaggtattatatacgttacaatatttgaaatatgctatattataacttgatatgattttatgactgttcatatgatagttcaaattacagattttt
gi|31                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               TA----A--AA-G-TTAC-------A------------T-------------------T-------------------T-------------------GGTGAC------------T---------------G--T--------GAAACT--T----AA------G---A-----T---GCT--TT---AA-AT--T-AGCTAGA-T-TA-ACATTTCA-TTGGCTT-ct
gi|32                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         attaggtcaaatatgtcaattcTTTCAAGT---------ATTCT-----TTAAATG----A--AATG-TGCC-------A------------T-------------------T-------------------TTAAA---------------GGTAAATTTATGAT----T---------------G--C--------AAAA-T--T----AA------G---A-----T----CC--CC---AA-AG--T-A-CAAAA-T-TA-ACTTTTCA-Cgctagtaa
gi|33                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          -------------------T-------------------G-----------------T---------------T--C--------AAAA-T--T----AA------G---A-----T---GTT--TT---AA-ATAATGA-CAAAG-T-TG-ATATTTCA-
gi|4                          :                                      ttaaatatgtcatttgaaatgataattttattacCTC-----ATTCACGATTT---CCCCCTAA-----ATT--T------GA-------T-----TTTTCA--TTTGTAAT-GATCAA-T----------T------TT------TG-A----AAA-TT---TC----ACCAAAA--A-A-AAAATCA-----AGGTTATA--C----A-TTAT-GACAG-----AA-GCTCGT--T-------------GTATAT--------A--GA--------G--AT--TA-TC-A--TTT-GTCG--TGTAAA--C-AAAGG----AT--G-AG------A------T--ACGT-AATT-GTTCA-CAGAT--A-----T-TT--C-AAAA-TAT-ATGGT--T-ATC-GATTTAA-GT----GGAT---TAA------TGC----------ATGCCGCATTCCAAGT---------ATTCT-----TTATGTA----A--AATA-TGTT-------A------------T-------------------T-------------------TTC-----------------GAGTTAAATTTGTGACTTT---------------G--T--------AAAA-T--A----AA------G---A-----TAACGCA--TT---AT-AT--T-T-CAAAC-T-TA-AAATTTAA-CTGGTTT-GTTtcagtct
gi|5                          :                                                           AAAGG-----GGACTA-----ATTCATGACTT---CCCCCAAA-----ATT--T-----TGA-------T-----AATCAAAATCTAC--T-G-TATAATA-------TGT-----GTT------TT-A----AAGGTT---TC----AC----A--A-A-AAAATTG-----AGGTTATA--C----A-TCAC-GACAG-----AA-GCTCAT--T-------------G----T--------A--TA--------G--TT--TA-TC-A--TTT-GTTG--TGTAAA--C-AAA-G----ATTTA-AGGTA---A------T--ATGC-TATT-G-TTA--AAA---G-----T-TA--CGAAAA-GGT-ATGGT--T-ATC-GACCTAT-GTTT-ATGATATATAT------ATATACCGTACATAT--CACATTTCAAGC---------ATTCT-----GTAGGTA----A--AATG-TGCC--------------------T-------------------T-------------------T-------------------G-----------------G---------------G--C--------AAAA-T--T----AG------G---A-----T---GCT--TT---AA-AT--T-A-CAAAA-C-TA-ACATTTCA-CTGGTTT-TTTGtttaaa
gi|6                          :                                                                      ttaTG-----ATTCAT--TTTATCTCTCCAAA-----ATG--T-----TGT-------T-----CCTTTCTTTTAAT--G-G-TCTG-T--------TGT-----GTT------TG-T----ACGATT---TC----AC----ACAA-ATAAAATCA-----AAGTTCTA--C----A-TTAT-GATAAGTA--AA-GCTTAT--T-------------C----T--------A--GA--------GAATA--TA-TT-C--TTT-GTTG--TGTAAA--C-AAA-C----GTT-------A---A------TGTATGT-TATT-GTTTA-CAAC---G-----T-TT--C--------------C--T-ATC-AATCTAA-GTTT-ATCATGCATA--------G---------------CGCATTTGAAGTAAATGTGTAATTTT-----AAAGGTA----AT-TTTG-TGAC--------------------------------------------------------------------------------------------------T---------------G--C--------AAAA-T--T----AA------G---A-----T---GCC--TT---AA-AT--C-A-CAAAT-G-TA-ACGTTTCA-CTGTCTTATTTG
gi|7                          :                                                                  aagggttTA-----ACTCA-GATTC---CCCTCAAT-----TTTATT-----TAA-------T-----TATCAATGTTTAC--TCA-TTTA-TA-------CCTTTCTAGTT------TA-T----AGGTTT---TC----AT----C--C-A-ATGATCATTGAAAAATTCTA--C----A-TCAT-GTCAG-----AA-GCTCAA--T-------------G----T--------A--GA--------GAGTT--TA-TT-C--TTT-GTTG--T-TAAAAAC-AAA-G----GTT-G-AG------A------T--GTTT-TATT-GCTTA-CAAA---G-----T-TT--AAAAAA-C---ATGGTA-T-TTT-GGGTAAA-GTTT-ATCGTATATACATGTAGTGA----------AT--------TCAAGT---------ATTCT-----TTAGGTA----A--AATG-TGt
gi|8                          :                                                          tAAAGGGATATCGACTCTGAAGATTCATGGTAT---TCCCCAAA-----ATT--T-----TGT-------TTTTCACATTAAATTTTA----------A---------------------------TG-A-------------TC---------------A-AAAGTCA-----G------A--T----A-TTAT-GGTAG-----A-----------------------------------------GA--------G--TT--TA-TT-A--TTT-GTTG--TGTAAA--C-AAA-G-----TTTG-AGG------------C--ATGC-TATT-GTTTA-CATA---G-----T-TT--TCAAAA-TGTAATTGT--TAATC-TTCCTAA-GTTT-ATAATAGTCAA------AAA----------AT--CATGTTTCAAGC---------ATTAT-----CTAGGTA----A--ACTG-TACTTATTTAAA------------T-------------------T-------------------T-------------------G-----------------T---------------G----------------T--T----AA------A---A----------CT--TT---AA-A---T-G-C-----T-TA-AAATTTCA-CTGGGTTGTTTGacgtcatggcagttttcgttacattgtatcgaactattactaaacatt
gi|9                          :                                                                                                                  ctgtatc-------T-----GATTGAAATGTAC--T-G-TCTA-T--------TGT-----GTT------TA-ATTAAAAGGTTCCGTC----AC----A--A-A-AA---TA-----AGGCTGTA--G----A-TTAT-GACAG-----AA-GATCAT--TAG-----------G----G--------A--GA--------G--TT--TATTT-A--TTT-GTTA--TGTAAA--C-AAA-G----ATTCA-AGTT-----------T--TTTTCTATT-GTTTA-CAAA---A-----T-ATAAAAAAAA-C-T-ATGGT--GAAT---ATCTA-------ATGATA-------------------------------ATTTTAAGT---------ATTCT-----TTAGGTT----G--AATC-TGCT-------A------------T-------------------T-------------------T-----------------------------------------------------------------AAAA-T--

Unaligned ( gi|22 ): AAGATTCAGGAATGTTATTGTTTCAAAATTCACTAATTGTAATGAGTATTTAATCCTGAAGTATCTTTAGGTTTAAATATGCCATTTAAAATTGATAATTATTAATGACTGTTTCAAAATTAAGATGTTTAAATTACAGATTTTAACTTTTTCAATCAAGTCTTTGTTTACATAAAAC
Unaligned ( gi|34 ): ATNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNATT
Unaligned ( gi|35 ): TTCAACATAAAAAAGTTATATTTCTTTTGTCCAAAATTCTTGAATCAGTCCT
Unaligned ( gi|36 ): TATATTACTTTCAATTACATTTTTCACCAAATAAAGTAAATTATGATGTT
Unaligned ( gi|37 ): TTTGAAAAATCTGTCTATAGTAATGTTCTAAAGCCAAAGAAAGGTTTC
Unaligned ( gi|38 ): CCCCCGCAATTTAAAATGATCAATAATCTTCTGTCGGATGTATTT

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gi|18                         :                                                                                                                      tac-------T-----AATTGAAAGT-AT--T-G-TCTG-T--------TGT-----GTT------TA-A----AAAGTCCCATC----AC----A--C-A-AAACTC-----------GTA--C----A-TTAT-GACAG-----AA-GCTCAT--T-------------A----CGGCG----A--GT--------G--TT--TA-TT-A--TTT-GTTA--AGTAAA--C-AAA-G----ATTC--AG------A------T--GTGT-TATT-GTTTAGCACAT--A-----T-TT--CAAAAA-C----------T-ATC---TAAAA-ATTTGATGA-ATATAT---A----------AT--C-----TGAAGT---------ATTTT-----TTGGGTT----A--AATA-TGgattgtca
gi|19                         :                                                                                                                                                                                                                        ttc-AAAAT-A-----AGGGTGTA--C----A-TTAT-GACAGAATTTAA-GATCAT--TAC-----------G----T--------A--GA-----------CA--TA-AT-A--CTTAATTA--CTTAAA--C-AAA-G----ATTCA-TG-------------T--ATGT-TATT-GTTTA-CAAAAT-A-----T-TT--AGAAAA-T-----------------ATCTAA-ATCT-GT--TA------TGA----------A--------------T---------ATTCT-----TCAGATT----A--AATA-TGCC-------A------------T-------------------T-------------------T-----------------------------------------------------------------AAAA-TGAT----AT------GTTTA-----T---GCCGGTTCAAAA-AT--T-A-CAGAT-T-TA-ACAT
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                         tg-AAAAT-A-----AGGGTGTA--C----A-TTAT-GACAGAATTTAA-GATCAT--TAC-----------G----T--------A--GA-----------CA--TA-AT-ACCTTA-ATTA--CTTAAA--C-AAA-G----ATTCA-TG-------------T--ATGT-TATT-GTTTA-CAAAAATA-----T-TT--AGAAAA-T-----------------ATCTAA-ATCT-GT--TA------TGA----------A--------------T---------ATTCT-----TCAGATT----A--AATATTGCC-------A------------T-------------------T-------------------T-----------------------------------------------------------------AAAA-TGAT----AT------GTTAA-----T---GCCGGTTCAAAA-AT--T-A-CAGAT-T-TA-ACATTTCA-TCAGTGT-TTTG
gi|20                         :                                                                                                                                                                                                                                                             tgACAG-----AA-CCTCAT--TAC-----------G----G--------G--GA--------G--TT--TG-TT-A--TTC----------AAA--C-AAA-GATTAATTC--AGGT-----------T---TGT-TATC-GTTTA-CAAA---A-----TATT--CAAAAA-C-T---------------ATCTAA-ATTT--TGAC---TAT-CTA----------AT--C-----TGAAAT---------ATTTG-----TT---------A--AATA-TGCC-------A------------T-------------------T-------------------T-----------------------------------------------------------------AAAA-TGAT----AATTTTATG---ACTGTTC---GTT--TT---AA-AT--T-A-CAGAT-T-TA-AAGTTTCATCTGTCTT-ttcatataacacagatttggggttagattattacatgtatccttgtaccatgtagtaagaaattctaaattttggtttgcaacttcaaatgaactatatttatttaaaatgaaacattttgtcgaaaaattggtgaat
gi|21                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          --TTT-ATTG--TGTAAA--C-AAA-T----GTT-G-GGGTA--------------CGT-TATT-GTTTA-CAAA---G-----T-TT--C-AAAA-TGT-ATGGTA-T-TTT-GGGTAAA-GTTT-AT--CATGTAT-TG---------------CGCATATCAAGT---------ATTCT-----GTAGGTA----A--AATG-TACT-------A------------TCCTAAAGGCTAATCTGTGAC-------------------T-------------------G-----------------T---------------G--C--------ATAA-T--T----AA------A---A-----T---GCC--TT---AA-AT--G-C-CAAAATT-TA-AAATTTCA-CTGGATT-GTTgttttcata
gi|23                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       c------T--GTGT-TATT-GTTTA-CAAA---G-----T-TT--C-ATAA-CTC-GTGGTATT-TTG-GAGTAAA-GTTT-ATCATTTATA---G---------------CACATTTCAAGT---------ATTCA-----TCAAGTA----A--AATG-GGCC-------A------------T-------------------TTTAAAGGTAAATTTGTGACT-------------------G-----------------T---------------G--T--------AAAG-T--C----AA------G---A-----T---GCC--AT---AA-AT--T-A-CAAAA-A-TA-GCAATTCT-CTGACTTGTTTG
gi|24                         :                                                                                                            gT--T-----TAA-------T-----CATTAAA--------T-G-TATA-CAAACATATTGT-----GTTGGAAAGCG-A----AAGGTT---TC----AC----A--A-A-AAATTAA-----AAGTTGTA--CATCGA-TCAC-GACAG-----AA-GCTAAT--TAATTGTGTAATAGA----T--------A--GA--------G--TTTATA-TT-C--TTT-GTTG--TGTAAA--C-AAA-G----GTT-G-AGGT----A------T--ATt
gi|25                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 AA-G----ATT-G-AGGTACTAG------T--ATGT-TATT-GTTTA-TAAA---G-----T-TT--TGAAAA-TGT-ATAGT--T-ATC-GAACTAA-GTTT-GTGATATAT----------------AT--CATATTTCAAAT---------ATTCT-----TTATGTA----A--ATTG-TGCC-------A------------T-------------------T-------------------T-------------------A-----------------T----------------------------AAG-T--T-----A------G---A--------------TT---AA-AT--T----AAAA-TATA-TCATTTTA-CTAG
gi|26                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   T--T-ATC-AGTCTTA-TTTT-AT----CGTGT-CCA----------A---CTCATTTAAAAT---------CTTCT-----TTAGGTA----T--AATG-TACC-------A------------T-------------------
gi|26                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   atgtaaGTG----A--ATTG-TGC---------------------T-------------------T-------------------T-------------------------------------T---------------G--C--------ACAA-T--T----AA------G---A-----T---GCC--TT---CA-AT--A-G-TAAAA-T-TA-ACATTTCA-CTAACTT-GTTcttgaaaataaacttgtgaattgtgcttttgcacaattaagatgccttcaatagtaaaattaacatttcactaacttgtt
gi|27                         : atgtaattatcagtcttattttatcgtgtccaactcatttaaaatcttctttaggtataatgtaccatcttgaaaataaacttACAATTT---TCTTCAAACCTTGATT--T-----TCACTTTCTCT-----GATTGAAATGCAT--T-G-TCTA-T--------TGT-----GTT------TA-C----AAAGTTCCGTC----AC----A--A-A-AAGA----------GTTGTG--C----A-TTAT-GACAA-----AA-GCTTAT--TAC-----------G----G--------A--AA--------GT-TT--TA-TT-A--ATT-G-TGATTGTAAA--C-AAA-
gi|28                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        tTC-CATGTAA-ATCT-GTGATGAATAT-CTA----------AT--C-----TGAAGT---------ATTCT-----TTAGCTT----A--AATA-TGCC-------A------------T-------------------T-------------------T-------------------GATGATGATTTTATGAC-T---------------GTTC--------AAAA-T--T----AT------G---A-----T---GTT--TT---AA-AT--T-A-CAGAT-T-TA-ACATTTCA-TTAGTCT-TT
gi|29                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   ttcaattaatc-ATGTT--T-ATT-G-TCTAA-GTTT-ATGGTATCCAT-T------------AT-----ATTTCAAGT---------ATTCT-----TTA-GTA----T--A--G-TGCC-------A------------T-------------------T-------------------T-------------------GAAAATTAAATT------T---------------G--CGTCTAAGCAAAA-T--T----AG------G---A-----T---GTT--TC---CA-AT--T-A-CAAAA-T-TA-ACATTTTA-Cg
gi|3                          :                                                                                                            TT--C-----TG--------T-----AATTAAAATTTAT--T-C-TC-A-T--------TGT-----GAT------TGAA----AAAGCTCCGTC----AC----A--A-A-AA---TA-----AGG-TCTA--C----T-TTTT-GACAG-----GATGCTCATAAC-------------G----G--------A--GA--------G--TT--T--TT-A--ATC-GTCA--TGTAAA--C-AAA-GC---ATTCA-CGGT----A------T---TGT-TTTT-TTTTA-CAAA---A-----T-aagt
gi|30                         :                               tgctattaatgggctctgttcatatgattttcttaaaacttgaactttttcactttATTT---CCCCCAGA-----ATT--TGTTTTTCA-------T-----CTTTAAA--------T-G-TCTA--A-------TGT-----GTT------TG-A----AAGGTT---CT----AC----A--A-A-AAA-TAA-----AGGTTATG--C----A-TTAT-GAAAA-----AA-GCTCAT--T-------------G----T--------A--GAGG------G--TT--TA-TT-atgtttttttttaaactaatctaaaaatctgtgagtgaatatagaacctgaaaggtattatatacgttacaatatttgaaatatgctatattataacttgatatgattttatgactgttcatatgatagttcaaattacagattttt
gi|31                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          TA----A--AA-G-TTAC-------A------------T-------------------T-------------------T-------------------GGTGAC------------T---------------G--T--------GAAACT--T----AA------G---A-----T---GCT--TT---AA-AT--T-AGCTAGA-T-TA-ACATTTCA-TTGGCTT-ct
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gi|6                          :                                                                      ttaTG-----ATTCAT--TTTATCTCTCCAAA-----ATG--T-----TGT-------T-----CCTTTCTTTTAAT--G-G-TCTG-T--------TGT-----GTT------TG-T----ACGATT---TC----AC----ACAA-ATAAAATCA-----AAGTTCTA--C----A-TTAT-GATAAGTA--AA-GCTTAT--T-------------C----T--------A--GA--------GAATA--TA-TT-C--TTT-GTTG--TGTAAA--C-AAA-C----GTT-------A---A------TGTATGT-TATT-GTTTA-CAAC---G-----T-TT--C--------------C--T-ATC-AATCTAA-GTTT-ATCATGCATA---G---------------CGCATTTGAAGTAAATGTGTAATTTT-----AAAGGTA----AT-TTTG-TGAC--------------------------------------------------------------------------------------------------T---------------G--C--------AAAA-T--T----AA------G---A-----T---GCC--TT---AA-AT--C-A-CAAAT-G-TA-ACGTTTCA-CTGTCTTATTTG
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Reference ( family-9 )        :                                                        NNNAAAGG-----CGACTN-----ATTCACGATTT---CCCCCAAA-----ATT--T-----TGA-------T-----NATTAAAATTTAT--T-G-TCTA-TA-------TGT-----GTT------TG-A----AAGGTT---TC----AC----A--A-A-AAAATCA-----AGGTTNTA--C----A-TTAT-GACAG-----AA-GCTCAT--T-------------G----T--------A--GA--------G--TT--TA-TT-A--TTT-GTTG--TGTAAA--C-AAA-G----ATTCG-AGGTA---A------T--ATGT-TATT-GTTTA-CAAA---G-----T-TT--CGAAAA-CGT-ATGGT--T-ATC-GATCTAA-GTTT-ATGATATATAT-TGA----------AT--CGCATTTCAAGT---------ATTCT-----TTAGGTA----A--AATG-TGCC-------A------------T-------------------T-------------------T-------------------G-----------------T---------------G--C--------AAAA-T--T----AA------G---A-----T---GCT--TT---AA-AT--T-A-CAAAA-T-TA-ACATTTCA-CTGGCTT-TTTG
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gi|21                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          --TTT-ATTG--TGTAAA--C-AAA-T----GTT-G-GGGTA--------------CGT-TATT-GTTTA-CAAA---G-----T-TT--C-AAAA-TGT-ATGGTA-T-TTT-GGGTAAA-GTTT-AT--CATGTAT-TG---------------CGCATATCAAGT---------ATTCT-----GTAGGTA----A--AATG-TACT-------A------------TCCTAAAGGCTAATCTGTGAC-------------------T-------------------G-----------------T---------------G--C--------ATAA-T--T----AA------A---A-----T---GCC--TT---AA-AT--G-C-CAAAATT-TA-AAATTTCA-CTGGATT-GTTgttttcata
gi|23                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       c------T--GTGT-TATT-GTTTA-CAAA---G-----T-TT--C-ATAA-CTC-GTGGTATT-TTG-GAGTAAA-GTTT-ATCATTTATA---G---------------CACATTTCAAGT---------ATTCA-----TCAAGTA----A--AATG-GGCC-------A------------T-------------------TTTAAAGGTAAATTTGTGACT-------------------G-----------------T---------------G--T--------AAAG-T--C----AA------G---A-----T---GCC--AT---AA-AT--T-A-CAAAA-A-TA-GCAATTCT-CTGACTTGTTTG
gi|24                         :                                                                                                            gT--T-----TAA-------T-----CATTAAA--------T-G-TATA-CAAACATATTGT-----GTTGGAAAGCG-A----AAGGTT---TC----AC----A--A-A-AAATTAA-----AAGTTGTA--CATCGA-TCAC-GACAG-----AA-GCTAAT--TAATTGTGTAATAGA----T--------A--GA--------G--TTTATA-TT-C--TTT-GTTG--TGTAAA--C-AAA-G----GTT-G-AGGT----A------T--ATt
gi|25                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 AA-G----ATT-G-AGGTACTAG------T--ATGT-TATT-GTTTA-TAAA---G-----T-TT--TGAAAA-TGT-ATAGT--T-ATC-GAACTAA-GTTT-GTGATATAT----------------AT--CATATTTCAAAT---------ATTCT-----TTATGTA----A--ATTG-TGCC-------A------------T-------------------T-------------------T-------------------A-----------------T----------------------------AAG-T--T-----A------G---A--------------TT---AA-AT--T----AAAA-TATA-TCATTTTA-CTAG
gi|26                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   T--T-ATC-AGTCTTA-TTTT-AT----CGTGT-CCA----------A---CTCATTTAAAAT---------CTTCT-----TTAGGTA----T--AATG-TACC-------A------------T-------------------
gi|26                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   atgtaaGTG----A--ATTG-TGC---------------------T-------------------T-------------------T-------------------------------------T---------------G--C--------ACAA-T--T----AA------G---A-----T---GCC--TT---CA-AT--A-G-TAAAA-T-TA-ACATTTCA-CTAACTT-GTTcttgaaaataaacttgtgaattgtgcttttgcacaattaagatgccttcaatagtaaaattaacatttcactaacttgtt
gi|27                         : atgtaattatcagtcttattttatcgtgtccaactcatttaaaatcttctttaggtataatgtaccatcttgaaaataaacttACAATTT---TCTTCAAACCTTGATT--T-----TCACTTTCTCT-----GATTGAAATGCAT--T-G-TCTA-T--------TGT-----GTT------TA-C----AAAGTTCCGTC----AC----A--A-A-AAGA----------GTTGTG--C----A-TTAT-GACAA-----AA-GCTTAT--TAC-----------G----G--------A--AA--------GT-TT--TA-TT-A--ATT-G-TGATTGTAAA--C-AAA-
gi|28                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        tTC-CATGTAA-ATCT-GTGATGAATAT-CTA----------AT--C-----TGAAGT---------ATTCT-----TTAGCTT----A--AATA-TGCC-------A------------T-------------------T-------------------T-------------------GATGATGATTTTATGAC-T---------------GTTC--------AAAA-T--T----AT------G---A-----T---GTT--TT---AA-AT--T-A-CAGAT-T-TA-ACATTTCA-TTAGTCT-TT
gi|29                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   ttcaattaatc-ATGTT--T-ATT-G-TCTAA-GTTT-ATGGTATCCAT-T------------AT-----ATTTCAAGT---------ATTCT-----TTA-GTA----T--A--G-TGCC-------A------------T-------------------T-------------------T-------------------GAAAATTAAATT------T---------------G--CGTCTAAGCAAAA-T--T----AG------G---A-----T---GTT--TC---CA-AT--T-A-CAAAA-T-TA-ACATTTTA-Cg
gi|3                          :                                                                                                            TT--C-----TG--------T-----AATTAAAATTTAT--T-C-TC-A-T--------TGT-----GAT------TGAA----AAAGCTCCGTC----AC----A--A-A-AA---TA-----AGG-TCTA--C----T-TTTT-GACAG-----GATGCTCATAAC-------------G----G--------A--GA--------G--TT--T--TT-A--ATC-GTCA--TGTAAA--C-AAA-GC---ATTCA-CGGT----A------T---TGT-TTTT-TTTTA-CAAA---A-----T-aagt
gi|30                         :                               tgctattaatgggctctgttcatatgattttcttaaaacttgaactttttcactttATTT---CCCCCAGA-----ATT--TGTTTTTCA-------T-----CTTTAAA--------T-G-TCTA--A-------TGT-----GTT------TG-A----AAGGTT---CT----AC----A--A-A-AAA-TAA-----AGGTTATG--C----A-TTAT-GAAAA-----AA-GCTCAT--T-------------G----T--------A--GAGG------G--TT--TA-TT-atgtttttttttaaactaatctaaaaatctgtgagtgaatatagaacctgaaaggtattatatacgttacaatatttgaaatatgctatattataacttgatatgattttatgactgttcatatgatagttcaaattacagattttt
gi|31                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          TA----A--AA-G-TTAC-------A------------T-------------------T-------------------T-------------------GGTGAC------------T---------------G--T--------GAAACT--T----AA------G---A-----T---GCT--TT---AA-AT--T-AGCTAGA-T-TA-ACATTTCA-TTGGCTT-ct
gi|32                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    attaggtcaaatatgtcaattcTTTCAAGT---------ATTCT-----TTAAATG----A--AATG-TGCC-------A------------T-------------------T-------------------TTAAA---------------GGTAAATTTATGAT----T---------------G--C--------AAAA-T--T----AA------G---A-----T----CC--CC---AA-AG--T-A-CAAAA-T-TA-ACTTTTCA-Cgctagtaa
gi|33                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     -------------------T-------------------G-----------------T---------------T--C--------AAAA-T--T----AA------G---A-----T---GTT--TT---AA-ATAATGA-CAAAG-T-TG-ATATTTCA-
gi|4                          :                                      ttaaatatgtcatttgaaatgataattttattacCTC-----ATTCACGATTT---CCCCCTAA-----ATT--T------GA-------T-----TTTTCA--TTTGTAAT-GATCAA-T----------T------TT------TG-A----AAA-TT---TC----ACCAAAA--A-A-AAAATCA-----AGGTTATA--C----A-TTAT-GACAG-----AA-GCTCGT--T-------------GTATAT--------A--GA--------G--AT--TA-TC-A--TTT-GTCG--TGTAAA--C-AAAGG----AT--G-AG------A------T--ACGT-AATT-GTTCA-CAGAT--A-----T-TT--C-AAAA-TAT-ATGGT--T-ATC-GATTTAA-GT----GGAT---TAA-TGC----------ATGCCGCATTCCAAGT---------ATTCT-----TTATGTA----A--AATA-TGTT-------A------------T-------------------T-------------------TTC-----------------GAGTTAAATTTGTGACTTT---------------G--T--------AAAA-T--A----AA------G---A-----TAACGCA--TT---AT-AT--T-T-CAAAC-T-TA-AAATTTAA-CTGGTTT-GTTtcagtct
gi|5                          :                                                           AAAGG-----GGACTA-----ATTCATGACTT---CCCCCAAA-----ATT--T-----TGA-------T-----AATCAAAATCTAC--T-G-TATAATA-------TGT-----GTT------TT-A----AAGGTT---TC----AC----A--A-A-AAAATTG-----AGGTTATA--C----A-TCAC-GACAG-----AA-GCTCAT--T-------------G----T--------A--TA--------G--TT--TA-TC-A--TTT-GTTG--TGTAAA--C-AAA-G----ATTTA-AGGTA---A------T--ATGC-TATT-G-TTA--AAA---G-----T-TA--CGAAAA-GGT-ATGGT--T-ATC-GACCTAT-GTTT-ATGATATATAT-ATATACCGTACATAT--CACATTTCAAGC---------ATTCT-----GTAGGTA----A--AATG-TGCC--------------------T-------------------T-------------------T-------------------G-----------------G---------------G--C--------AAAA-T--T----AG------G---A-----T---GCT--TT---AA-AT--T-A-CAAAA-C-TA-ACATTTCA-CTGGTTT-TTTGtttaaa
gi|6                          :                                                                      ttaTG-----ATTCAT--TTTATCTCTCCAAA-----ATG--T-----TGT-------T-----CCTTTCTTTTAAT--G-G-TCTG-T--------TGT-----GTT------TG-T----ACGATT---TC----AC----ACAA-ATAAAATCA-----AAGTTCTA--C----A-TTAT-GATAAGTA--AA-GCTTAT--T-------------C----T--------A--GA--------GAATA--TA-TT-C--TTT-GTTG--TGTAAA--C-AAA-C----GTT-------A---A------TGTATGT-TATT-GTTTA-CAAC---G-----T-TT--C--------------C--T-ATC-AATCTAA-GTTT-ATCATGCATA---G---------------CGCATTTGAAGTAAATGTGTAATTTT-----AAAGGTA----AT-TTTG-TGAC--------------------------------------------------------------------------------------------------T---------------G--C--------AAAA-T--T----AA------G---A-----T---GCC--TT---AA-AT--C-A-CAAAT-G-TA-ACGTTTCA-CTGTCTTATTTG
gi|7                          :                                                                  aagggttTA-----ACTCA-GATTC---CCCTCAAT-----TTTATT-----TAA-------T-----TATCAATGTTTAC--TCA-TTTA-TA-------CCTTTCTAGTT------TA-T----AGGTTT---TC----AT----C--C-A-ATGATCATTGAAAAATTCTA--C----A-TCAT-GTCAG-----AA-GCTCAA--T-------------G----T--------A--GA--------GAGTT--TA-TT-C--TTT-GTTG--T-TAAAAAC-AAA-G----GTT-G-AG------A------T--GTTT-TATT-GCTTA-CAAA---G-----T-TT--AAAAAA-C---ATGGTA-T-TTT-GGGTAAA-GTTT-ATCGTATATACATGT----------AG--TGAATT-CAAGT---------ATTCT-----TTAGGTA----A--AATG-TGt
gi|8                          :                                                          tAAAGGGATATCGACTCTGAAGATTCATGGTAT---TCCCCAAA-----ATT--T-----TGT-------TTTTCACATTAAATTTTA----------A---------------------------TG-A-------------TC---------------A-AAAGTCA-----G------A--T----A-TTAT-GGTAG-----A-----------------------------------------GA--------G--TT--TA-TT-A--TTT-GTTG--TGTAAA--C-AAA-G-----TTTG-AGG------------C--ATGC-TATT-GTTTA-CATA---G-----T-TT--TCAAAA-TGTAATTGT--TAATC-TTCCTAA-GTTT-ATAATAGTCAA-AAA----------AT--CATGTTTCAAGC---------ATTAT-----CTAGGTA----A--ACTG-TACTTATTTAAA------------T-------------------T-------------------T-------------------G-----------------T---------------G----------------T--T----AA------A---A----------CT--TT---AA-A---T-G-C-----T-TA-AAATTTCA-CTGGGTTGTTTGacgtcatggcagttttcgttacattgtatcgaactattactaaacatt
gi|9                          :                                                                                                                  ctgtatc-------T-----GATTGAAATGTAC--T-G-TCTA-T--------TGT-----GTT------TA-ATTAAAAGGTTCCGTC----AC----A--A-A-AA---TA-----AGGCTGTA--G----A-TTAT-GACAG-----AA-GATCAT--TAG-----------G----G--------A--GA--------G--TT--TATTT-A--TTT-GTTA--TGTAAA--C-AAA-G----ATTCA-AGTT-----------T--TTTTCTATT-GTTTA-CAAA---A-----T-ATAAAAAAAA-C-T-ATGGT--GAAT---ATCTA-------ATGATA--------------------------ATTTTAAGT---------ATTCT-----TTAGGTT----G--AATC-TGCT-------A------------T-------------------T-------------------T-----------------------------------------------------------------AAAA-T--


blockSeqs                     :                                                                GATAT     CTGAAG     C     ATC        CCTTG   AT TCACTTTCTCTGATTGAAATGCATTGTCTAT                          TTCTA   GGAAAG  ATTAA       CCA  .     CAAA CAA  T     C TTGAA     G  TA ATCG A    T     AATTT  T      AA AATTGTGTAATAGATAGAG                          TA  T  C CC   A    AT      AA T   G ATTA   GAAGTAACTGAGGTA          C    G     G    AAATAA    A  AAAA    CTCGTGGTATTT     GG      C    G  GATATATATATATACCGTACATATCAC            AAATGTGTA     .          T     T     T    ATTCTAAAGGTTTTTTTGTGACAGTGC                                                                                                       C GA TTAA  TTTTAT TTT CTGTT AAC  CGG  CAA  T  AA G G    AT A  .        T       G
blockSeqs                     :                                                                .         C          C     .          .       .  TAATCATTAAATGTATACAAACATAT                               .       .       AA          CCG  .     .    CC   .     T .         A  .  .    .    .     AATTT  .      .  ATAGATATAGAGAG                               A   .  . .    .    .       .  .   . C      GAGTAACTGAGGTA           .    .     .    AATA      .  AA      TGTAATTGTTAA     A       .    .  CGTATATACATGTAGTGA                     .             .          A     .     .    ATTTTAAAGTTAAGTGTCTGTCTGAGC                                                                                                       . GA .     .      TTA TG    .    CGG  CAA  .  .  . .    A  .  .        .       G
blockSeqs                     :                                                                          A          T     .          .       .  TGATAATCAAAATCTACTGTATAATA                               .       .       A           CCG  .     .    A    .     C .         C  .  .    .    .     GTA    .      .  ATAGATATAGAGAG                               .   .  . .    .    .       .  .   . .      TCAGTTACATGA             .    .     .    ATA       .  TG      CATATAGTACT      A       .    .  GATGAATATTTAATCGG                      .             .          A     .     .    ATTTTCAAGTTAAATTTGTAGCTGTGC                                                                                                       . GA .     .      .   .     .    T    .    .  .  . .    A  .  .        .       A
blockSeqs                     :                                                                          G          T     .          .       .  TAATTATCAATGTTTACTCATTTATA                               .       .       A           CCG  .     .    C    .     C .         C  .  .    .    .     .      .      .  ACGGCGAGTG                                   .   .  . .    .    .       .  .   . .      GAGGTACTAGTA             .    .     .    TA        .  TC      ATGTATGTTTA      G       .    .  AATAGTCAAAAAATCAT                      .             .          A     .     .    ATCCTAAAGGCTAATCTGTGACTGTGC                                                                                                       . .  .     .      .   .     .    C    .    .  .  . .    A  .  .        .       G
blockSeqs                     :                                                                          A          T     .          .       .  GATTTTTCATTTGTAATGATCAAT                                 .       .       C           .    .     .    A    .     C .         A  .  .    .    .     .      .      .  GTATATAGAG                                   .   .  . .    .    .       .  .   . .      TGTTGATGTA               .    .     .    TA        .  TG      TGTATGGTATT      A       .    .  GATTAATGCATGCCGC                       .             .          A     .     .    ATTTTAAAGGTAAATTTGTGACTGTGT                                                                                                       . .  .     .      .   .     .    T    .    .  .  . .    A  .  .        .       .
blockSeqs                     :                                                                                     .     .          .       .  TGTTCCTTTCTTTTAATGGTCTGT                                 .       .       A           .    .     .    A    .     T .         A  .  .    .    .     .      .      .  ACGGAAAGT                                    .   .  . .    .    .       .  .   . .      TAAGGTAATA               .    .     .    A         .  TC      CGTATGGTTA       G       .    .  GATGAATATCTAATC                        .             .          A     .     .    ATTTGAAAATTAAATTTGCGTCTAAGC                                                                                                       . .  .     .      .   .     .    T    .    .  .  . .    N  .  .        .       .
blockSeqs                     :                                                                                           .          .       .  GTTTTTCATCTTTAAATGTCTAA                                  .       .       A           .    .     .    C    .     C .         A  .  .    .    .     .      .      .  GTAGAGAG                                     .   .  . .    .    .       .  .   . .      GAGTTATCA                .    .     .    G         .  TC      CATATGGTTA       G       .    .  ATATATTTAATAC                          .             .          A     .     .    ATTTTCGAGTTAAATTTGTGACTTTGT                                                                                                       . .  .     .      .   .     .    N    .    .  .  . .    A  .  .        .       .
blockSeqs                     :                                                                                                              .  TGTAATTAAAATTTATTCTCAT                                   .       .       A           .    .     .    A    .     C .         A  .  .    .    .     .      .      .  GTAAAGAG                                     .   .  . .    .    .       .  .   . .      GAGGTATA                 .    .     .    G         .  CA      TGCCAGGTAA       G       .    .  GACATGTATTAC                           .             .          T     .     .    ATTTAGAGGTAATTTTGTGACTGTGC                                                                                                        . .  .     .      .   .     .    T    .    .  .  . .    T  .  .        .       .
blockSeqs                     :                                                                                                              .  TGTTTTTCACATTAAATTTTAA                                   .       .       T           .    .     .    A    .     A .         G  .  .    .    .     .      .      .  GTAGCGCA                                     .   .  . .    .    .       .  .   . .      CACGGTAT                 .    .     .    G         .  AG      TGTATAGTTA       G       .    .  CATGTATAGCGC                           .             .          T     .     .    ATTTGATGATGATTTTATGACTGTTC                                                                                                        . .  .     .      .   .     .    T    .    .  .  . .    T  .  .        .       .
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                          .       .       T           .    .     .    A    .     T .         G  .  .    .    .     .      .      .  GTAGAGAG                                     .   .  . .    .    .       .  .   . .      CAAGTTTT                 .    .     .    G         .  AG      TATATGGTTA       G       .    .  TATATATAGCAC                           .             .          T     .     .    ATTTTAAAGGTAAATTTATGATTGC                                                                                                         . .  .     .      .   .     .    C    .    .  .  . .    T  .  .        .       .
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                          .       .       A           .    .     .    A    .     A .         G  .  .    .    .     .      .      .  ACGGGGAG                                     .   .  . .    .    .       .  .   . .      TGAGGCA                  .    .     .    T         .  CA      GGTATGGTTA       G       .    .  TATGTATTCTGG                           .             .          A     .     .    ANNNNNNNNNNNNNNNNNNN                                                                                                              . .  .     .      .   .     .    C    .    .  .  . .    A  .  .        .       .
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                      .    .     .    A    .     C .         G  .  .    .    .     .      .      .  GTAGAGGG                                     .   .  . .    .    .       .  .   . .      AAATCA                   .    .     .    A         .  TG      CTATGGTGAA       A       .    .  TATGTGTATCGC                           .             .          A     .     .    TATTTAAATTTGTG                                                                                                                    . .  .     .      .   .     .    C    .    .  .  . .    A  .  .        .       .
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                      .    .     .    A    .     T .         G  .  .    .    .     .      .      .  CTAGAGAA                                     .   .  . .    .    .       .  .   . .      AAGGTT                   .    .     .    G         .  CG      TGTACGTTA        C       .    .  GAATATATAATC                           .             .          A     .     .    ATTTGGTGACTGT                                                                                                                     . .  .     .      .   .     .    T    .    .  .  . .    A  .  .        .       .
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                           .     .    C    .     C .         C  .  .    .    .     .      .      .  GTAGAGAG                                     .   .  . .    .    .       .  .   . .      GGGGTG                   .    .     .    G         .  AA      CATGGTATT        G       .    .  GACTATCTAATC                           .             .          A     .     .    ATTTAAAGTT                                                                                                                        . .  .     .      .   .     .    T    .    .  .  . .    T  .  .        .       .
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                 .    A    .     C .         A  .  .    .    .     .      .      .  AGGGAGAG                                     .   .  . .    .    .       .  .   . .      CAGATG                   .    .     .    G         .  TC      TGTTATTA         G       .    .  CATGTATTGCGC                           .             .          G     .     .    ATTTAAATTT                                                                                                                        . .  .     .      .   .     .    T    .    .  .  . .    A  .  .        .       .
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                      .    .     C .         A  .  .    .    .     .      .      .  ACGTAGA                                      .   .  . .    .    .       .  .   . .      CATGTA                   .    .     .    A         .  C       TTA              G       .    .  CATTTATAGCAC                           .             .          T     .     .    TTTGGGC                                                                                                                           . .  .     .      .   .     .    C    .    .  .  . .    A  .  .        .       .
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                           .     T .         A  .  .    .    .     .      .      .  ACGTAGA                                      .   .  . .    .    .       .  .   . .      CATGTA                   .    .     .    G         .  C       CTA              A       .    .  GATATATATCAT                           .             .          A     .     .    ATTTAT                                                                                                                            . .  .     .      .   .     .    T    .    .  .  . .    A  .  .        .        
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                           .     . .         C  .  .    .    .     .      .      .  ACGAAG                                       .   .  . .    .    .       .  .   . .      CAGGTT                   .    .     .    G         .  C       CTA              G       .    .  CGTGTCCAACTC                           .             .          A     .     .    TTTTGC                                                                                                                            . .  .     .      .   .     .    A    .    .  .  . .    G  .  .        .        
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                           .     . .         C  .  .    .    .     .      .      .  GGAGAG                                       .   .  . .    .    .       .  .   . .      GGGGTA                   .    .     .    G         .  C       CT               T       .    .  GGTATCCATTAT                           .             .          G     .     .    ATTT                                                                                                                              . .  .     .      .   .     .    T    .    .  .  . .    C  .  .        .        
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                           .     . .         G  .  .    .    .     .      .      .  GTATAG                                       .   .  . .    .    .       .  .   . .      GAGATA                   .    .     .    G         .  C       T                .       .    .  CATGCATAGCGC                           .             .          A     .     .    ATTT                                                                                                                              . .  .     .      .   .     .    C    .    .  .  . .    A  .  .        .        
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                 . .         .  .  .    .    .     .      .      .  GAG                                          .   .  . .    .    .       .  .   . .      AATGTA                   .    .     .    A         .  C       T                .       .    .  ATGTATTAC                              .             .          A     .     .    ATTT                                                                                                                              . .  .     .      .   .     .    T    .    .  .  . .    T  .  .                 
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                   .      .      .  .                                            .   .  . .    .    .       .  .   . .      GAGATG                   .    .     .    .         .                           .       .    .  TATGAA                                 .             .          A     .     .    ATTT                                                                                                                              . .  .     .      .   .     .    .    .    .  .  . .    .  .                    
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   .                                                                                       .       .    .  TATGAA                                 .             .          A     .     .    ATTT                                                                                                                              . .  .     .      .   .     .    .    .    .                                    
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           .       .    .  GATA                                   .             .          A     .     .    TGC                                                                                                                               . .                                                                             
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  .             .          T     .     .                                                                                                                                      . .                                                                             
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           .     .     .                                                                                                                                                                                                                      
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