lowQualScore : 111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 11111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111
lowQualScore : 444444444444444444444444444444444444444444444444444444444 11111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 3333333333333333333 22222222222222222222222222222222222222 111
lowQualScore : 1 11 0 5555 222 0 0 0 111 0 22 22 11 5 0 0 333333333333333333333333333333333333333333333333333333333 77777 3 3 3 44 3 3 4 11111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 6666 2 2 2 11 1 33333 33333 1 1 1 1 4444444444444444444 1 22 2 7777 1 44444444444444444444444444444444444444 1 1 111 22 222 6 22 22 2 2 33
lowQualScore : . .. . .... ... . . . ... . .. .. .. . . . ......................................................... ..... . . . .. . . . ............................................................................................... .... . . . .. . ..... ..... . . . . ................... . .. . .... . ...................................... . . ... .. ... . .. .. . . ..
lowQualScore : 0 33 9 4444 444 9 9 9 555 9 00 11 22 5 9 9 444444444444444444444444444444444444444444444444444444444 77777 1 1 1 22 1 1 4 66666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666 3333 7 7 5 88 3 33333 33333 3 3 3 3 7777777777777777777 4 00 9 2222 5 99999999999999999999999999999999999999 5 5 444 11 777 2 22 22 1 1 99
consensus : AACAA-G--A-TAA---GTTT---G-A-TGC-AA---AGCA-TC--AAA--T--CGG-C-CGCTAAAATTTTAAANCCACGNAGAANTNTANNAAAAANNACAANNCATCGN---------GCT-----CGAGA-CG-GGC-TG--TCT-CCGATA-GTTACTCCACGCCCTAGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTTTCTAACAAGT----------C----------A-------TGTT----AAA-GCAC-CAT--C-A-----TGAT-----GA-T-A-T-GC--A----T----G------C-AA--A-TA----T-AA--------T--------T-----A---TT---------T-TGAA-TG--TCA--AA---A-AA--GTGCAGA--AATCAAACA-T-GCA--TCTA
Reference ( gi|7 ) : AACAA-G--A-TAA---GTTT---G-A-TGC-AA---AGCA-TC--AAA--T--CAG-C-CGCTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--GCT-----CGAGA-CG-GGC-TG--TCT-CCGATA-GTCACTCCANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN----------C----------A-------TGTT----AAA-GCAC-CGT--C-A-----TGAT-----GA-T-A-T-GC--A----T----G------C-AA--A-TA----T-AA--------T--------T-----A---TT---------T-TGAA-TG--CCA--AA---A-AA--GTGCAGA--AATCAAACA-T-GCA--TCTA
gi|1 : AACAA-AGCA-TAA---GTTTTGTG-A-TGCTAA---AGCA-TCC-AAA--TTTCGT-C-CGCTAAAATTTTAAATCCACAAAGAAACATACAGAAAACGACCCGACAT------------GCT-----TAAGA-CG-GGCCTGCCTCT-CCGATA-GTTTCTCCA
gi|2 : aacaaagAATAA-G--A-CAA---GTTT---G-A-AGC-AA---AGCA-CT--AAA--T--TGG-C-CGCcgcccgttctacgttgaaatccaaatttcccatgcttccaggcatttccctcttctcctcaagcgatcctctcaagaactgtcttcttctatcactattatttaaatgcacacgtctgatcagtatgcatgcaaataataaatattttgaaatgtcaaaatgttgtgcagaaatcaaacatag
gi|9 : tgtaAACAA-G--A-AAA---GTTT---G-A-TGC-AA---TGCA-TC--AAA--T--CGG-C-CGCaaaaaattaaatatttataagtaagatacataagttggatgtatttccaaataaacgactaatatgcaattttttgaaccannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatgttttaaagagcaccatgatgatgatatacaaatggaaatagttataagattttaaatgtcaaaaaagtgcagaaaattgttatggttaatataata
gi|60 : AACAA-G--A-AAA---GTTT---G-A-TGC-AA---AGCA-TT--AAA--T--CGG-C-CGCaaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnactcttttgaaccannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntgttttaaaaagcaccatgacgataatatgaaaatggaacaaaatagttattagattttgaatgtcaaaaaagtgcagaaaattgttgtggataatgtaaacag
gi|40 : AACAAAG--A-TAA---TTTT---GTA-TGC-AA---AGCA-TCTAAGA--T--CGG-C-CGCTaaa
gi|35 : aAACAA-G--A-AAC---TTTT---G-A-TGC-AA---AGCA-TC--AAA--T--CGG-C-aaaattgtgaagaaatttctattcccataagaaaactacagcaagacgaaatacataagaatgacccaaca
gi|18 : ACAA-G--A-TAA---GTTT---G-A-TGC-AA---AGCA-TC--AAA--T--CGG-C-CGCTAAAATTTTAAATCCAAAGAAACATACAGAAACGACCAACAT----------------GTT-----CAAGA-CA-----TG--T-T-CCGATA-GTTTCTCCACGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTTTCTAACAAGT-------------------------------TT----AAA-GCAC-CGT--C-A-----TGAT-----CA-T-A-TTGC--A----T----G------C-AA--A-CA----T-AA--------T--------T-----A---TT---------T---GA-TG--TCA--AA---A-AA--GTGCAAA--ATTCAAACA-T-Ggcaaatttaaatattttcaaagaacatacagaatcgacaaccaacgtcttcttcgatgaaacctaaatccgccggcaaatttgcagtagagacggcctaaattgcgtttaaaatgttttaaga
gi|5 : cACAA-G--A-TAA---GTTT---G-A-TGC-AA---AGCA-TT--AAA--T--TGG-C-CGCTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--GCT-----C-----CA-GGT-TG--TCA-CTGATA-GTTATTCCANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN----------NNNNNNNNNNAA-------CGTT----AAA-GCAC-CAT--C-A-----TGAT-----GA-T-A-T-GC--A-------------------A--A-TAGGG-C-AA-----------------------A---TT------------GAA-TG--TTA--AA---A--A--GTGCAGA--AATCAAACA-T-GCA--TCTAg
gi|3 : ACAA-A--A-TAA---GTTT---G-AATGC-AA----GCAGTC--AAAA-T--CGG-CGCGCTAAAATTTTGAAAATATTTTGAATTATAGCAGAACGACCAAATCCATGC----------CT-----CGAGA-CGTGGC-TG--TCTGCCG-TA-GTTANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN----------N----------NNNNNCTTTGTT----AAA-GCAC-CG---C-A-----TGA------GA-TGA-T-GC--A----T----G------C-AATAA-TA----T-AA--------T--------T-----A---CT---------TGTGAA-TG--TCA--AA---AAAA--GTGCAGA--TCTCAAACA-T-GCtgta
gi|14 : cACAA-G--A-CAA---GTTC---G-A-TGC-AG---AGCA-TC--AAA--T--CGG-C-CGCTAAAAAATTTAAATATTGTAAGCTGTTTCCAAATAGACCAACAT--------------GCC-----CAAG------GT-TG--CC--CCGATA-GTTATCCCANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN----------NNNNN------A-------TGTT----AAT-TCAC-CAT--C-A-----TGAT-----AA---A-T-AG--A---------G------C-AA--A-TA----T-AA--------T--------T-----A---TTACATT----T-TGAA-TG--TCA--AC---A-AA--GTGCAG---GATCAttaag
gi|8 : ACAA-G--A-AAA---GTTT---G-A-TGC-AA---AGCA-TC--
gi|63 : tacACAA-G--G-TAA----TTT---G-A-TGC-AA---AGCA-TC--AAA--T--CGG-C-CGCnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnttgaggattgatcaaccttaaggcaaattgcagaagagacgctaaattgcgtttaaaatatttttaaaagcaccgtgacgatgatatgcaaatggaacaaatatagttattagattttgaatgtcaacaaaaagtgcagaaaattgttgtggttaatgtaaacag
gi|68 : ACAA-G--A-AAA---TTTT---G-A-TGC-AA---AGCA-TC--AAA--T--CGG-C-CGa
gi|64 : ACAA-G--A-TAA---TTTT---G-A-CAC-AA---AGCA-TC--AAA--T--CGA-C-CGC
gi|66 : ACAA-G--A-TAA---TTTT---G-A-TGC-AA------A-TC--AAA--T--CGG-C-CGCT
gi|52 : ACAA-G--A-AAA---GTT----G-A-TGC-AA---AGCA-TC--AAA--T--CGA-C-TGCaa
gi|54 : tACAA-G--AGTAA----TTT---G-A-TGC-AA---AGAA-TC--AAA--T--CGGCC-CGCTaaaaggtttataaatattttaagcttcttccaaagaaacac
gi|56 : tatgtACAA-G--A-TAA---G-----------GC-AA---AGCA-TC--AAA--T--CGA-C-CGCTacttctaaagaaatacagagacaacc
gi|37 : ACAA-G--A-TAA---TTTT---G-A-TAC-AA---A-CA-TC--ATA--T--CAA-T-AGCTaaaatgaatattctatttccaaagaaacatac
gi|58 : ACCA-A--A-TAA---TTTT---G-A-TGC-AA---AACA-TA--ATC--T--CGA-C-CGCTaaaactttaatcaaaatgttctaagctgatttccaaataaacatacagaaacgaatagtacatacttgtcttttctacagatatattta
gi|6 : tatagCAA-G--A-TAA---GTTT---G-A-TGC-AA---AGCA-TC--AAG--T--CGG-C-CGCTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--NNNNNGGCCGAGA-CA-GGC-TG--TCT-CCGATA-GTTACTCCATGCCCTAGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN----------N----------N-------NNNN----NNN-NNNN-NN---C-A-----TAAT------------T--C--A----T----G------C-AA--A-TA----T-AA--------T--------T-----A---TT---------T-TGAA-TG---TA--AA---A-AA--ATGCAGA--AATCAAACA-T-GCA--TCTAaaaattta
gi|12 : CAA-G--A-TGA---GTTT---G-A-TGC-AA---AGCA-TC--AAA--T--CGG-C-CGCTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGCT-----CGAGA-CG-GGC-TG--TCT-CCGATA-GTTACTCCAagtaaa
gi|4 : CAA-G--A-TGA---TTGT---G-G-TGC-AA---AGCA-TT--AAA--T--CAG-C-CGTTcgcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncatagttcattttaaatgtcaaaaaaagtgcagaaatcaaacatgcatctaag
gi|61 : CAA-G--A-TGA---TTTT---G-A-TGC-AA---AGCA-TC--AAA--T--CGG-C-CGCTaaacattttaaatattttattctatttttaaagaaacataaagagacgacctatttannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntgttaaagcaccattatgatatgcaaatacagtaaatataattattagattttgaatgtaaaaaggtgctgtaacgaaacatgcatc
gi|20 : CAA-G--A-TAA---TTTT---G-A-TGC-AA---AGCA-TC--AAA--T--CGA-C-CGCTaa
gi|26 : CAA-G--A-TCA---TTTT---G-A-TGC-AA---AGCA-TC--AAA--T--CGG-C-CGCTaaaatttttaagtatgctaagctactaatatacagaaatgaccaacatattcttcttccttatcgatattttgtccannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncgtaattaaagcaccagtatgatgactatactttgaatgtcaaaaaattgcagagcattgtggttaatgtca
gi|67 : CAA-G--A-TAA---TTTT---G-A-TGC-AA---ATCA-TC--AAA--T--CGG-C-CGCaaaatttttaatattctatacaaaaacatacgaaaactaccaacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaca
gi|23 : CAA-G--A-TGA---TTTT---G-A-TGC-AA---AGCA-TG--AAA--T--CGG-C-CGCT
gi|62 : AA-G--A-TAA---TTTT---G-A-TGC-AA---AGCA-TC--AAA--T--CGG-C-CGCTaaagttttaagtgttataagctatttccaagaaacatacagcaacgaccaacatatccttgtcccctacattatttcaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnagtaccatcatgatgatatgcaaaggcgcagaaagttttgcgtatgatatatgtaa
gi|47 : AA-G--A-TAT---ATTT---G-A-TGC-AA---AGCA-TC--AAA--T--CTG-C-CGCaa
gi|21 : AA-G--A-TAATATATCT---G-A-TGC-AA---AGCA-TC--AAA--T--CGA-C-CGCTaaaagttttagatattctaaactatttccccccaaaaaacccatagagaaacgaccag
gi|17 : AA-G--A-TAA---TTTT---G-A-TGG-AA---AGCA-TC--AAA--T--aaatttttaagtattatttccaagaaacatacagaatcgactaacatacccttgtcccctacatttttttcccannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnctgttaaagtaccatcattatgatatgcaaaggtgcagaaagtgttgcggttaatg
gi|42 : AA-A--A-TAA---TTTT---T-A-TGC-AA---AG-A-TC--AAA--T--CTG-C-CGCTgggcgtttaaaattttatgtattcttaatctaagctctttccaagaaacatacagaaactattaacataccttgtcccctgcatgtttcccannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngtaatattaaagtaccattatgatgatatgcaaaagtgcagaaagtgttgcagttaa
gi|65 : A-G--A-TAA---TTTT---G-A-TGC-AA---AGCA-TC--AAA--C--CGG-T-CGCaaaacttacaatattctgagcgatttcaaagaaacgaccagcatacccttatctcatatacatttttcc
gi|50 : cac-G--A-TAA---GTTT---G-A-TGC-AA---AGCA-TC--AAA--T--CGG-C-TACT
gi|10 : ac-G--A-TGA---GTTT---G---TTC-AA---AGCT-TC--AAA--T--CGG-C-CTCTaaatatttgaaatatattttcggagctatttccaaagaaccaacatgc
gi|22 : -G--A-TTA---TTTT---G-A-TGC-AA---AGCA-TC--AAA--T--GGG-C-CGCTaaaatttgaaatattctgagatattgccaaagaaatatcaaatcaatctttcaaacagaaactaccgacatgtatcctttaaggtcccctttatcttttccacgcacttcctaaatccgttcatgctttaaggcaaatgctaaatgcagtagcacccttatgatgatatgctaatgaagcaaatacgattattagattagattgcagaaaccaaacatgtctcagaaacgtgttcaa
gi|46 : -G--A-TAA---GTTT---G-A-TGC-AA---A--A-AC--AAA--T--CGG-C-TACTaaaaagccaacgaaacatacagaaatgacctacatacccctgtcccttttatatttcccccannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncgatcacgacgatatgcaaaatggagcaaatttgattgctaaattttaagggtgaaaaagttgtgcataatataaacagag
gi|44 : c-G--A-TAA---GTTTT--G-A-TGC-AT---AGCA-TC--AAaaatatttgaaatatattttcggagctatttccaaagaaccaacatgctcaaggttgtca
gi|13 : --A-TAT---GTTT---G-A-TGC-AA---AGCA-TC--AAAAGT--CGG-C-CGCTAAAATTTAAATATTCTGAATTATTTCATTTAGAAACATACAGAATCGACCAACAT--GCT-----TGAGA-CG-GGT-TG--TCT-CCGATA-GTtcgctacttaaatattttgaaatatactttttcggagcttttccaaaggaaccaacatgctccaaaggttgt
gi|45 : --A-TAA---TTTT---G-A-TGC-AA---AGCA-TC--AAA--T--CGG-C-CGCTtnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncataagtcatgcaatataattattttgaatgtcaaaaagtacagaaatcaacatgcatctaggtaaa
gi|11 : a-TAA---GTTT---G-A-TGC-AA----GCA-TC--AAA--T--CAG-C-CGTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNC-----------CGA-A-CG-GAC-TG--TCT-CC-ATA-GTCG-TCCANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN------------C----------A-------TTTT----AAA-GCAC-CGT--T-------TGAT-----GA-T-AGT-GC-------T----G------C-AA--AATA----T-AA--------TG-------T-----A---TT---------T-TGAA-TG--T----AA---A-AA--GTGCTGA--AATCAAA-A-T-GCA--aaaattggaagatttctattccaaagaaactacacaaacgacattacataaaatgaccaa
gi|69 : tt-TAA---GTTT---G-A-TGT-AA---AGCA-TG--GAA--T--CGG-C-CGgtaagttta
gi|19 : -TAA---GTTT---G-A-TTC-AAATTAGCA-TC--ATA--T--CGA-T-CGCTat
gi|48 : TTT---G-A-TGC-AA---AGCA-TA--AAA--T--CGG-C-CGCTaaaagtttagatattctaaactatttcgaaacagagcatacagaaacgaccaaattatccttgtcccctatattttttcaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatgttacggtaaagcaccattatgatgacttgcaaatggagccaatgtaacgttaa
gi|25 : tTT---G-T-TGC-AA---CGCA-TC--AAA--T--CGG-T-CGaaaattaattttttaaatagatttctttgtccaagaaccatgtgacagaaggactaac
gi|24 : -TGC-AA---AGCA-TC--AAA--T--CGG-C-CGCataaaactttaaatattgtaagctacatgtatttccaaagaaacatgcttgtcttataaatttttccannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncactataatgaggatatctgaatgaggcaaacaagattattagagttgcagaaactatatacgtgcttcaaaaatgtggttaa
gi|15 : tgattacagatT-----CGAGA-CA-GGC-TG--TCT-CCGGTA-aaaaaattaaatatataagcaagatatttccaaagaaacactacagaaacgaccaattaacatactctatagtcttttgaaccannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatgttttaaaaagcaccatgacgatgatatgtaaatg
gi|16 : aaaaattttaaataatctgaattaattccaaagaaacttacaagaaacgccaacattgT-----CGAGAGCG-GGC-TG--GTC-CCGAAAAGCTACTCCACGTCCNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN----------N----------N-------NNNN----NNN-NNNN-NNN--N-N-----NNNT-----CA-T-A---GT--A----TCATGG------C-AA--AATA----T-AA--------T--------T-----A---TT---------T-TGAA-TG--TCA--AA---A-AA--GTGCAGA--AATCAAACA-TGGCA--TCTActtcannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncaataatatgttaaagcaccatcttgatgatatgcaaatataattaatttgaatgtcaaaaaaagcagaaattaacatgcatctaagtaa
gi|29 : aaagttttgattattctgaattatttccatttagtataacatacagaatcgaccaacatgtttT-----CGAGA-CA-GGC-TG--TCT-CCAATA-GTTACTCCANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTAC----------A-------TGTT----AAA-GCAC-CAT--C-A-----TGAT-----GA-T-A----C--A----T----G------C-AA--A-TA----TGAA--------TGCATATAAT-----A---TT---------A-TGAA-AA--TTG--AA---A-AA-----CA-A--AATT--ACA-T-G
gi|31 : agaaactaccaacatggT-----CGAGA-CA-GGC-TG--TCT-CCGGTA-
gi|28 : g----------C----------A-------TGTT----AGA-GCACATGT--T-A-----TGAT-----CA-T-A-T-GC--A----T----G------CAAA--A-TA----T-AA--------T--------T-----A----T---------T-TGAA-TG--TCA--GAAACA-AA--GT-CAGA--A---AAGCATT-GCA--TCTActtcannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncaataatatgttaaagcaccatcttgatgatatgcaaatatattaatttgaatgtcaaaaaaacaggacaattagacatgcatctaagaaa
gi|15 : gctttgagagggactggtctgccgataagctactcannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn----------A-------TGTT----AAA-GCAC-CAT--C-T-----TGAT-----GA-T-A-T-GC---------------------AA--A-TA----T-AA--------T--------T-----A---AT---------T-TGAA-TG--TCA--AA---A-AA--A-GCAGA--AATT-AACA-T-GCA--TCTAtgtaaacagaatg
gi|31 : aaaaattttaaataatctgaattaattccaaagaaacttacaagaaacgccaacattgtcgagacaggctgtctccggtacttcannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncaataat----------A-------TGTT----AAA-GCAC-CAT--C-T-----TGAT-----GA-T---------A----T----G------C-AA--A-TA----T--A--------T--------T-----A---AT---------T-TGAA-TG--TCA--AA---A-AA----ACAGGACAATTAGACA-T-GCA--TCTAagtaa
gi|36 : gtcgagacaggctgtctccggtacttcannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncaataat----------A-------TGTT----TAA-GCAC-CA---C-A-----TGAT-----AA-T-A-T-GC--AAAA-TAGA-G------C-GA--A-TA----T-AACATTGTAAT--------T-----A---TTACTTACAAAT-TGAA-TG--TCA--AA---AAAA--GTGCAGA--AATCAAACA-T-GCT--TCagaaa
gi|2 : atttctaaa----------A-------TGTTTTAAAGA-GCAC-CAT--G-A-----TGAT-----GA-T-A-T-AC--AAA--T----G------G-AA--A-TAGTTAT-AA--------G--------------A---TT---------T-TAAA-TG--TCA--AA---A-AA--GTGCAGA--AAaaattaaaacagaa
gi|17 : tgtaaataagacaagtttgaagcaaagcactaaattggccgcaaaaaattaaatatttataagtaagatacataagttggatgtatttccaaataaacgactaatatgcaattttttgaaccannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn----------A-------TATT----AAA-GTAC-CAT--T-A-----TGAT-----GA-T-A-T-GC--AAAAGT----G------C-AG--A-attgttatggttaatataata
gi|24 : aagataattttgatggaaagcatcaaatgggcgtttaaaattttatgtattcttaatctaagctctttccaagaaacatacagaaactattaacataccttgtcccctgcatgtttcccannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngta----------A-------TGTTTTAAAAA-GCAC-CAT--G-A-----CGAT-----GA-T-A-T-GT--A----aagtgttgcagttaa
gi|27 : tgattacagattgcaaagcatcaaatcggccgcaaaaaattaaatatataagcaagatatttccaaagaaacactacagaaacgaccaattaacatactctatagtcttttgaaccannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn----------A-------TGTT----AAAAGCAC-CAT--CTA-----TGAT-----GA-C-T-T-GC--A----aatg
gi|4 : gataagtttgatcaaattagcatcaatacatccttaagtagatattctaaactatttcgaaaacagagcatacagaaacgaccaaatttcccttgtcccctatattttttcaaacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn-------TGTT----AAA-GCAC------C-A-----TTAT-----GA-T-A-T-GCAAA----TACA-G------T-AA--A-TA----T-AA--------T--------TATTAGA---TT---------T-TGAA-TG---TA--AA---A-AG--GTGCTGT--AACGAAACA-T-GCA--TCa
gi|21 : caagatgattgtggtgcaaagcattaaatcagccgttaaacattttaaatattttattctatttttaaagaaacataaagagacgacctatttannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn-------TGTT----AAA-GTAC-CAT--C-A-----TTAT-----GA-T-A-T-GC--AAAGGT----G------C-AG--A-
gi|1 : aagataatatatctgatgcaaagcatcaaatcgaccgctaaatttttaagtattatttccaagaaacatacagaatcgactaacatacccttgtcccctacatttttttcccannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncTT----AAATGCACACGT--C-------TGAT-----CAGT-A-T-GC--A----T----G------C-AA--A-TAA---T-AA--------A--------T-----A---TT---------T-TGAAATG--TCA--AA---A-TGTTGTGCAGA--AATCAAACA-T-aagtgttgcggttaatg
gi|38 : aacaaagaacaaagcataagttttgtgatgctaaagcatccaaatttcgtccgctaaaattttaaatccacaaagaaacatacagaaaacgacccgacatgcttaagacgggcctgcctctccgatagtttctccacgcccgttctacgttgaaatccaaatttcccatgcttccaggcatttccctcttctcctcaagcgatcctctcaagaactgtcttcttctatcactattatTT----AAA-GCAC-CAT--C-AATTCATGAC-----GA-T-A-T-GA--AAA--T----GGAGTAAC-AA--G-GA----T-TG--------T--------T-----AGATTT---------T-TTAA-TG--TCA--AA---A-TG--GTGCAGA--AATCAAACA-T-GCA--TCag
gi|20 : ttgatttctaatttaagcTT----AAA-GCAC-CAG--T-A-----TGAT-----GA-C----------------------------------------T-A------------------T-----A---CT---------T-TGAA-TG--TCA--AA---A-AA--TTGCAGA--atgaaaacagaa
gi|30 : caagataattttgatgcaaagcatcaaatcgaccgctaaaatttttaagtatgctaagctactaatatacagaaatgaccaacatattcttcttccttatcgatattttgtccannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncgtaaT----AAA-GTTC-CAT--C-A-----TTAT-----GA-T-A-T-GCTAA----TGGA-G------T-AA--A-TA----T-AA--------T--------T-----G---Tgcattgtggttaatgtca
gi|19 : tttaaatatcccaagctatttccaaagaaacatcagaaacaaccatatatactcttgtcccctatatcttttccannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntgT----AAA-GCAC-CAT--T-A-----TGAT-----GA--------C--T----T----G------C-AA--A-Tcaaagcggtgta
gi|8 : taagtttgattcaaattagcatcatatcgatcgctaaaagtttagatattctaaactatttcgaaacagagcatacagaaacgaccaaattatccttgtcccctatattttttcaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatgttacgg----AAA-GCAC-CGT--G-A-----CGAT-----GA-T-A-T-GCAAA----T----GGAA---C-AA--A-TA----T-AG--------T--------TATTAGA---TT---------T-TGAA-TG--TCAACAA---A-AA--GTGCAGA--AAggagccaatgtaacgttaa
gi|9 : tacacaagaaaagtttgatgcaaagcatcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnttgaggattgatcaaccttaaggcaaattgcagaagagacgctaaattgcgtttaaaatattttta----AAA-GCAC-CAT--G-A-----CGAT-----AA-T-A-T-GA--AAA--T----GGAA---C-AA--A--A----T-AG--------T--------T-----A---TTAGATT----T-TGAA-TG--TCA--AA---A-AA--GTGCAGA--AAattgttgtggttaatgtaaacag
gi|43 : aacaagaaaagtttgatgcaatgcatcaaatcggccgcaaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnactcttttgaaccannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntgttttaa----AAA-GCAT-CGTATC-A-----TGAT-----GA-T-A-T-GCAAA----TCA--G------C-GG--A-TA----T-GA--------T--------TATTAGA---TT---------T-TGAA-TAT-CCA--AA---A-Aattgttgtggataatgtaaacag
gi|39 : atattttaa----AAA-GCAC-CAT--G-A-----CGATTGAAGAA-T-A-T-GC--AAA--T----AGAA---C-AA--A-TA----T-AG--------T--------TTTT--AGGTTT---------T-TGAA-TG--CAA--AA---AAAA--GTGCAGA--AAtcgcttgtttaagttgttaatatga
gi|59 : aaAA-GTAC-CAT--C-A-----TGAT-----GA-T-A-T-GC--A----aattgtttgtggtttaaaatgtttacaaacaaaa
gi|23 : A-GTAC-CAT--C-A-----TGAT-----GA-T-A-T-GC--A----aaggtgcggaaagtgttgcaa
gi|10 : caagatgattttgatgcaaagcatgaaatcggccgctaaagttttaagtgttataagctatttccaagaaacatacagcaacgaccaacatatccttgtcccctacattatttcaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnA-GCAC-CCT--T-A-----TGAT-----GA-T-A-T-GCTAA----T----GAAG---C-AA--A-TA----C-GA--------T--------T-----A---TTAGA------T-TAGA-T--------------------TGCAGA--AACCAAACA-T-Gaaggcgcagaaagttttgcgtatgatatatgtaa
gi|13 : gatgagtttgttcaaagcttcaaatcggcctctaaaatttgaaatattctgagatattgccaaagaaatatcaaatcaatctttcaaacagaaactaccgacatgtatcctttaaggtcccctttatcttttccacgcacttcctaaatccgttcatgctttaaggcaaatgctaaatgcagtC--A----T----G------C-AA----TA----T-AA--------T--------T-----A---TT---------T-TGAA-TG--TC---AA---A-AA--GTACAGA--AATC-AACA-T-GCA--TCTAtctcagaaacgtgttcaa
gi|53 : atatgtttgatgcaaagcatcaaaagtcggccgctaaaatttaaatattctgaattatttcatttagaaacatacagaatcgaccaacatgcttgagacgggttgtctccgatagttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncataagtC--A----T----G------C-AA----TA----T-AA--------T--------T-----T---TA---------T-TG-A-TGTTTCA--AA---A-AA---TACAGA--AATCAGAAA-T-GCGATTCTAggtaaa
gi|12 : cattaatA----T-AG--------T--------TC----A---TT---------T-TAAA-TG--TCA--AA---AAAA--GTGCAGA--AATCAAACA-T-GCA--TCTAggtaaac
gi|55 : caagatgagtttgatgcaaagcatcaaatcggccgctnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngctcgagacgggctgtctccgatagttactccacgcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnc----T-AA--------T--------T-----A---TTACTTACAAAT-TGAA-TG--TCA--AA---A-AA--GTGCAGA--AATCAAACA-T-GCT--TCag
7 sequences could not be aligned to this particular reference sequence:
Unaligned ( gi|32 ): AATTANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
Unaligned ( gi|33 ): TNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNATAGGCNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
Unaligned ( gi|34 ): ATTANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
Unaligned ( gi|41 ): AAAATAAATCTGCACAAGCTAATTTTGATTCAAAGTATTCAATCGGCCGCAAAAATTCTAAACATTTCAGATTGCATGTATTTCCAAGGAAACACACAATATGAAACGT
Unaligned ( gi|49 ): CTAACATGTTGAAGTGCCATTATGATGCTAAGCGAATGAAGCAAGTACGATTACTAGATCCAAACATACTTCAGAAACGTGGTTAA
Unaligned ( gi|51 ): AANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGCTCCAGGTTGTCATAGTTATTCCAC
Unaligned ( gi|57 ): TCATATATTATGCAAAGGTGCAGACAGGTGAAGAAAGTTTTGCGGTTAATGTAAACAG
Alignments
lowQualScore : 8888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888 77777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777 3333333333333333333 22222222222222222222222222222222222222
lowQualScore : 1 11 0 5555 222 0 0 0 111 0 11 22 11 0 0 0 4 1 1 1111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 2 66666 2 33 2 2 88888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888 5555 2 2 11 1 33333 33333 1 3333 2 2222222222222222222 1 11 2 7777 1 55555555555555555555555555555555555555 1 1 22 22 222 66 22 22 2 2 33
lowQualScore : . .. . .... ... . . . ... . .. .. .. . . . . . . ................................................................... . ..... . .. . . ......................................................................................... .... . . .. . ..... ..... . .... . ................... . .. . .... . ...................................... . . .. .. ... .. .. .. . . ..
lowQualScore : 0 33 9 3333 333 8 8 8 444 8 99 00 11 8 8 9 1 1 3 0000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 9 55555 9 99 9 9 77777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777 9999 5 5 77 2 11111 11111 2 9999 5 6666666666666666666 4 99 8 0000 4 88888888888888888888888888888888888888 5 5 00 00 666 55 00 11 0 0 77
consensus : AACAA-G--A-TAA---NTTT---G-A-TGC-AAA---GCA-TC--AAA--T--CGG-C-CGC-TAAA-AT-TTTAA-A---TCCATNNAGA-ANCGTACNAGAAACGAC--AANNCANCGT---------GCT------------CGAGA-C---G-GG-CTG--TCT-CCGATA-GTTACTCCACGCCCTAGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTTTCTAAC--AAGT----------C----------A-------TGTT----AAA-GCAC-C--ATC-A-----TGAT-----GA-T----A-TGC--A----T----G------C-AA--A-TA----T-AA--------T--------T-----A---TT---------T-TGAA-TG--TCA--AA---A--AA--GTGCAGA--AATCAAACA-T-GCA--TCTA
Reference ( family-850 ) : AACAA-G--A-TAA---GTTT---G-A-TGC-AAA---GCA-TC--AAA--T--CGG-C-CGC-TAAA-AT-TTTAA-A---NCCACGNAGA-ANTNTANNAAAAANNAC--AANNCATCGN---------GCT------------CGAGA-C---G-GG-CTG--TCT-CCGATA-GTTACTCCACGCCCTAGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTTTCTAAC--AAGT----------C----------A-------TGTT----AAA-GCAC-C--ATC-A-----TGAT-----GA-T----A-TGC--A----T----G------C-AA--A-TA----T-AA--------T--------T-----A---TT---------T-TGAA-TG--TCA--AA---A--AA--GTGCAGA--AATCAAACA-T-GCA--TCTA
gi|1 : AACAA-AGCA-TAA---GTTTTGTG-A-TGCTAAA---GCA-TCC-AAA--TTTCGT-C-CGC-TAAA-AT-TTTAA-A---TCCACAAAGA-AACATACAGAAAACGAC--CCGACAT------------GCT------------TAAGA-C---G-GGCCTGCCTCT-CCGATA-GTTTCTCCACGCCC
gi|1 : aacaaagTT----AAATGCACAC--GTC-------TGAT-----CAGT----A-TGC--A----T----G------C-AA--A-TAA---T-AA--------A--------T-----A---TT---------T-TGAAATG--TCA--AA---A--TGTTGTGCAGA--AATCAAACA-T-gttctacgttgaaatccaaatttcccatgcttccaggcatttccctcttctcctcaagcgatcctctcaagaactgtcttcttctatcactattatttaaatgcacacgtctgatcagtatgcatgcaaataataaatattttgaaatgtcaaaatgttgtgcagaaatcaaacatag
gi|10 : aacaaagaacaaagcataagttttgtgatgctaaagcatccaaatttcgtccgctaaaattttaaatccacaaagaaacatacagaaaacgacccgacatgcttaagacgggcctgcctctccgatagtttctccacgcccgttctacgttgaaatccaaatttcccatgcttccaggcatttccctcttctcctcaagcgatcctctcaagaactgtcttcttctatcactattat-G--A-TGA---GTTT---G---TTC-AAA---GCT-TC--AAA--T--CGG-C-CTC-TAAA-AT-TTGAA-A---TATTCTGAGATATTGCCAAAGAAATATC--AAATCAag
gi|10 : A-GCAC-C--CTT-A-----TGAT-----GA-T----A-TGCTAA----T----GAAG---C-AA--A-TA----C-GA--------T--------T-----A---TTAGA------T-TAGA-T---------------------TGCAGA--AACCAAACA-T-Gatctttcaaacagaaactaccgacatgtatcctttaaggtcccctttatcttttccacgcacttcctaaatccgttcatgctttaaggcaaatgctaaatgcagtagcacccttatgatgatatgctaatgaagcaaatacgattattagattagattgcagaaaccaaacatgtctcagaaacgtgttcaa
gi|11 : gatgagtttgttcaaagcttcaaatcggcctctaaaatttgaaatattctgagatattgccaaagaaatatcaaatcaatctttcaaacagaaactaccgacatgtatcctttaaggtcccctttatcttttccacgcacttcctaaatccgttcatgctttaaggcaaatgctaaatgcagt-TAA---GTTT---G-A-TGC-AA----GCA-TC--AAA--T--CAG-C-CGT-NNNN-NN-NNNNN-N---NNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNN--NNNNNNNNNN---------NNNNNC---------CGA-A-C---G-GA-CTG--TCT-CC-ATA-GTCG-TCCANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--NN------------C----------A-------TTTT----AAA-GCAC-C--GTT-------TGAT-----GA-T----AGTGC-------T----G------C-AA--AATA----T-AA--------TG-------T-----A---TT---------T-TGAA-TG--T----AA---A--AA--GTGCTGA--AATCAAA-A-T-GCA--tctcagaaacgtgttcaa
gi|12 : ttCAA-G--A-TGA---GTTT---G-A-TGC-AAA---GCA-TC--AAA--T--CGG-C-CGC-TNNN-NN-NNNNN-N---NNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNN--NNNNNNNNNNNNNNNNNNNGCT------------CGAGA-C---G-GG-CTG--TCT-CCGATA-GTTACTCCACGCgtaagttta
gi|12 : A----T-AG--------T--------TC----A---TT---------T-TAAA-TG--TCA--AA---AA-AA--GTGCAGA--AATCAAACA-T-GCA--TCTAnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncatagttcattttaaatgtcaaaaaaagtgcagaaatcaaacatgcatctaag
gi|13 : caagatgagtttgatgcaaagcatcaaatcggccgctnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngctcgagacgggctgtctccgatagttactccacgcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnc--A-TAT---GTTT---G-A-TGC-AAA---GCA-TC--AAAAGT--CGG-C-CGC-TAAA-AT-TTAAATA---TTC-TGAATT-ATTTCATTTAGAAACAT--ACAGAATCGACCAACAT--GCT------------TGAGA-C---G-GG-TTG--TCT-CCGATA-GTTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--NNNN----------N----------N-------CAT------AA-G--------TC-A-----TG-C-----AA-T----A-T-----------------------AA--T-TA----T-------------------------------T---------T-TGAA-TG--TC---AA---A--AA--GTACAGA--AATC-AACA-T-GCA--TCTAag
gi|14 : ACAA-G--A-CAA---GTTC---G-A-TGC-AGA---GCA-TC--AAA--T--CGG-C-CGC-TAAA-AAATTTAA-A---TAT-TGTA-A-GCTGTTTCCAAATAGAC------CAACAT---------GCC------------CAAG---------G-TTG--CC--CCGATA-GTTATCCCANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--NNNN----------NNNNN------A-------TGTT----AAT-TCAC-C--ATC-A-----TGAT-----AA------A-TAG--A---------G------C-AA--A-TA----T-AA--------T--------T-----A---TTACATT----T-TGAA-TG--TCA--AC---A--AA--GTGCAG---GATCAggtaaa
gi|15 : TTAA-T---TCCA--AAGA-AACTTACAAGAAACGCC--AA--CATTG------------T------------CGAGA-C---A-GG-CTG--TCT-CCGGTA-CTT
gi|15 : aaaaattttaaataatctgaa----------A-------TGTT----AAA-GCAC-C--ATC-T-----TGAT-----GA-T----A-TGC---------------------AA--A-TA----T-AA--------T--------T-----A---AT---------T-TGAA-TG--TCA--AA---A--AA--A-GCAGA--AATT-AACA-T-GCA--TCTAcannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncaataatatgttaaagcaccatcttgatgatatgcaaatataattaatttgaatgtcaaaaaaagcagaaattaacatgcatctaagtaa
gi|16 : aaaaattttaaataatctgaattaattccaaagaaacttacaagaaacgccaacattgtcgagacaggctgtctccggtacttcannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncaataatT------------CGAGAGC---G-GG-CTG--GTC-CCGAAAAGCTACTCCACGTCCNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--NNNN----------N----------N-------NNNN----NNN-NNNN-N--NNN-N-----NNNT-----CA-T----A--GT--A----TCATGG------C-AA--AATA----T-AA--------T--------T-----A---TT---------T-TGAA-TG--TCA--AA---A--AA--GTGCAGA--AATCAAACA-TGGCA--TCTAagtaa
gi|17 : aaagttttgattattctgaattatttccatttagtataacatacagaatcgaccaacatgtttAA-G--A-TAA---TTTT---G-A-TGG-AAA---GCA-TC--AAA--T--GGG-C-GTT-TAAA-AT-TTTA
gi|17 : GT----------A----------A-------TATT----AAA-GTAC-C--ATT-A-----TGAT-----GA-T----A-TGC--AAAAGT----G------C-AG--A-tgtattcttaatctaagctctttccaagaaacatacagaaactattaacataccttgtcccctgcatgtttcccannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngtaatattaaagtaccattatgatgatatgcaaaagtgcagaaagtgttgcagttaa
gi|18 : aagataattttgatggaaagcatcaaatgggcgtttaaaattttatgtattcttaatctaagctctttccaagaaacatacagaaactattaacataccttgtcccctgcatgtttcccannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnACAA-G--A-TAA---GTTT---G-A-TGC-AAA---GCA-TC--AAA--T--CGG-C-CGC-TAAA-AT-TTTAA-A---TCCA--AAGA-AACATA-CAGAAACGAC------CAACAT---------GTT------------CAAGA-C---A-----TG--T-T-CCGATA-GTTTCTCCACGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTTTCTAAC--AAGT-------------------------------TT----AAA-GCAC-C--GTC-A-----TGAT-----CA-T----ATTGC--A----T----G------C-AA--A-CA----T-AA--------T--------T-----A---TT---------T---GA-TG--TCA--AA---A--AA--GTGCAAA--ATTCAAACA-T-Gaagtgttgcagttaa
gi|19 : c-TAA---GTTT---G-A-TTC-AAATTAGCA-TC--ATA--T--CGA-T-CGC-TAAA-AG-TTTAG-A---g
gi|19 : GT----------T----------A-------CGGT----AAA-GCAC-C--ATT-A-----TGAT-----GA----------C--T----T----G------C-AA--A-Ttattctaaactatttcgaaacagagcatacagaaacgaccaaattatccttgtcccctatattttttcaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatgttacggtaaagcaccattatgatgacttgcaaatggagccaatgtaacgttaa
gi|2 : taagtttgattcaaattagcatcatatcgatcgctaaaagtttagatattctaaactatttcgaaacagagcatacagaaacgaccaaattatccttgtcccctatattttttcaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatAATAA-G--A-CAA---GTTT---G-A-AGC-AAA---GCA-CT--AAA--T--TGG-C-CGC--AAA-AA-ATTAA-A---ggagccaatgtaacgttaa
gi|2 : tgta----------A-------TGTTTTAAAGA-GCAC-C--ATG-A-----TGAT-----GA-T----A-TAC--AAA--T----G------G-AA--A-TAGTTAT-AA--------G--------------A---TT---------T-TAAA-TG--TCA--AA---A--AA--GTGCAGA--AAtatttataagtaagatacataagttggatgtatttccaaataaacgactaatatgcaattttttgaaccannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatgttttaaagagcaccatgatgatgatatacaaatggaaatagttataagattttaaatgtcaaaaaagtgcagaaaattgttatggttaatataata
gi|20 : tgtaaataagacaagtttgaagcaaagcactaaattggccgcaaaaaattaaatatttataagtaagatacataagttggatgtatttccaaataaacgactaatatgcaattttttgaaccannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnCAA-G--A-TAA---TTTT---G-A-TGC-AAA---GCA-TC--AAA--T--CGA-C-CGC-TAAA-AT-TTTTA-A---attgttatggttaatataata
gi|20 : TT----AAA-GCAC-C--AGT-A-----TGAT-----GA-C------------------------------------------T-A------------------T-----A---CT---------T-TGAA-TG--TCA--AA---A--AA--TTGCAGA--gtatgctaagctactaatatacagaaatgaccaacatattcttcttccttatcgatattttgtccannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncgtaattaaagcaccagtatgatgactatactttgaatgtcaaaaaattgcagagcattgtggttaatgtca
gi|21 : caagataattttgatgcaaagcatcaaatcgaccgctaaaatttttaagtatgctaagctactaatatacagaaatgaccaacatattcttcttccttatcgatattttgtccannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncgtaaAA-G--A-TAATATATCT---G-A-TGC-AAA---GCA-TC--AAA--T--CGA-C-CGC-TAAA-TT-TTTAA-gcattgtggttaatgtca
gi|21 : -------TGTT----AAA-GTAC-C--ATC-A-----TTAT-----GA-T----A-TGC--AAAGGT----G------C-AG--A-gtattatttccaagaaacatacagaatcgactaacatacccttgtcccctacatttttttcccannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnctgttaaagtaccatcattatgatatgcaaaggtgcagaaagtgttgcggttaatg
gi|22 : aagataatatatctgatgcaaagcatcaaatcgaccgctaaatttttaagtattatttccaagaaacatacagaatcgactaacatacccttgtcccctacatttttttcccannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnc-G--A-TTA---TTTT---G-A-TGC-AAA---GCA-TC--AAA--T--GGG-C-CGC-TAAA-Aaagtgttgcggttaatg
gi|23 : CAA-G--A-TGA---TTTT---G-A-TGC-AAA---GCA-TG--AAA--T--CGG-C-CGC-TAAA-GT-TTTAA-agccaacgaaacatacagaaatgacctacatacccctgtcccttttatatttcccccannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncgatcacgacgatatgcaaaatggagcaaatttgattgctaaattttaagggtgaaaaagttgtgcataatataaacagag
gi|23 : A-GTAC-C--ATC-A-----TGAT-----GA-T----A-TGC--A----gtgttataagctatttccaagaaacatacagcaacgaccaacatatccttgtcccctacattatttcaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnagtaccatcatgatgatatgcaaaggcgcagaaagttttgcgtatgatatatgtaa
gi|24 : caagatgattttgatgcaaagcatgaaatcggccgctaaagttttaagtgttataagctatttccaagaaacatacagcaacgaccaacatatccttgtcccctacattatttcaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn-TGC-AAA---GCA-TC--AAA--T--CGG-C-CGC--AAA-AA-ATTAA-A---aaggcgcagaaagttttgcgtatgatatatgtaa
gi|24 : tgattacagat----------A-------TGTTTTAAAAA-GCAC-C--ATG-A-----CGAT-----GA-T----A-TGT--A----tatataagcaagatatttccaaagaaacactacagaaacgaccaattaacatactctatagtcttttgaaccannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatgttttaaaaagcaccatgacgatgatatgtaaatg
gi|25 : tgattacagattgcaaagcatcaaatcggccgcaaaaaattaaatatataagcaagatatttccaaagaaacactacagaaacgaccaattaacatactctatagtcttttgaaccannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnTT---G-T-TGC-AAC---GCA-TC--AAA--T--CGG-T-CGA-TAAA-AC-TTTAA-A---aatg
gi|26 : CAA-G--A-TCA---TTTT---G-A-TGC-AAA---GCA-TC--AAA--T--CGG-C-CGC-TAAA-AT-TTTTA-ATATTCTATACAAA-AACATACGAAAAtattgtaagctacatgtatttccaaagaaacatgcttgtcttataaatttttccannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncactataatgaggatatctgaatgaggcaaacaagattattagagttgcagaaactatatacgtgcttcaaaaatgtggttaa
gi|27 : ----------A-------TGTT----AAAAGCAC-C--ATCTA-----TGAT-----GA-C----T-TGC--A----ctaccaacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaca
gi|28 : gataagtttgatcaaattagcatcaatacatccttaagtagatattctaaactatttcgaaaacagagcatacagaaacgaccaaatttcccttgtcccctatattttttcaaacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn----------C----------A-------TGTT----AGA-GCACAT--GTT-A-----TGAT-----CA-T----A-TGC--A----T----G------CAAA--A-TA----T-AA--------T--------T-----A----T---------T-TGAA-TG--TCA--GAAACA--AA--GT-CAGA--A---AAGCATT-GCA--TCTAa
gi|29 : gctttgagagggactggtctgccgataagctactcannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnAGAAACTAC------CAACAT---------GGT------------CGAGA-C---A-GG-CTG--TCT-CCAATA-GTTACTCCANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--NNNNNNNNNNNNTAC----------A-------TGTT----AAA-GCAC-C--ATC-A-----TGAT-----GA-T----A---C--A----T----G------C-AA--A-TA----TGAA--------TGCATATAAT-----A---TT---------A-TGAA-AA--TTG--AA---A--AA-----CA-A--AATT--ACA-T-Gtgtaaacagaatg
gi|3 : ACAA-A--A-TAA---GTTT---G-AATGC-AA----GCAGTC--AAAA-T--CGG-CGCGC-TAAA-AT-TTTGA-A---AATATTTTGA-ATTATAGCAGAA-CGACCAAATCCAT-GC----------CT------------CGAGA-C---GTGG-CTG--TCTGCCG-TA-GTTANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--NNNN----------N----------NNNNNCTTTGTT----AAA-GCAC-C--G-C-A-----TGA------GA-TG---A-TGC--A----T----G------C-AATAA-TA----T-AA--------T--------T-----A---CT---------TGTGAA-TG--TCA--AA---AA-AA--GTGCAGA--TCTCAAACA-T-GC
gi|30 : cT----AAA-GTTC-C--ATC-A-----TTAT-----GA-T----A-TGCTAA----TGGA-G------T-AA--A-TA----T-AA--------T--------T-----G---Tttaag
gi|31 : tttaaatatcccaagctatttccaaagaaacatcagaaacaaccatatatactcttgtcccctatatcttttccannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntgT------------CGAGA-C---A-GG-CTG--TCT-CCGGTA-CTTcaaagcggtgta
gi|31 : g----------A-------TGTT----AAA-GCAC-C--ATC-T-----TGAT-----GA-T-----------A----T----G------C-AA--A-TA----T--A--------T--------T-----A---AT---------T-TGAA-TG--TCA--AA---A--AA----ACAGGACAATTAGACA-T-GCA--TCTAcannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncaataatatgttaaagcaccatcttgatgatatgcaaatatattaatttgaatgtcaaaaaaacaggacaattagacatgcatctaagaaa
gi|35 : gtcgagacaggctgtctccggtacttcannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncaataatAACAA-G--A-AAC---TTTT---G-A-TGC-AAA---GCA-TC--AAA--T--CGG---CGC--AAA----TTTAA-A---agaaa
gi|36 : TTTCTAA----A-----------------------A-------TGTT----TAA-GCAC-C--A-C-A-----TGAT-----AA-T----A-TGC--AAAA-TAGA-G------C-GA--A-TA----T-AACATTGTAAT--------T-----A---TTACTTACAAAT-TGAA-TG--TCA--AA---AA-AA--GTGCAGA--AATCAAACA-T-GCT--TCtattttcaaagaacatacagaatcgacaaccaacgtcttcttcgatgaaacctaaatccgccggcaaatttgcagtagagacggcctaaattgcgtttaaaatgttttaaga
gi|37 : aACAA-G--A-TAA---TTTT---G-A-TAC-AAA----CA-TC--ATA--T--CAA-T-AGC-TAAA-AC-TTTAA-aaattaaaacagaa
gi|38 : TTTCTAATTTAAGC-------------------------------TT----AAA-GCAC-C--ATC-AATTCATGAC-----GA-T----A-TGA--AAA--T----GGAGTAAC-AA--G-GA----T-TG--------T--------T-----AGATTT---------T-TTAA-TG--TCA--AA---A--TG--GTGCAGA--AATCAAACA-T-GCA--TCtcaaaatgttctaagctgatttccaaataaacatacagaaacgaatagtacatacttgtcttttctacagatatattta
gi|39 : ttga----AAA-GCAC-C--ATG-A-----CGATTGAAGAA-T----A-TGC--AAA--T----AGAA---C-AA--A-TA----T-AG--------T--------TTTT--AGGTTT---------T-TGAA-TG---CA--AA---AAAAA--GTGCAGA--AAatgaaaacagaa
gi|4 : aaCAA-G--A-TGA---TTGT---G-G-TGC-AAA---GCA-TT--AAA--T--CAG-C-CGT-TAAACAT-TTTAA-A---aattgtttgtggtttaaaatgtttacaaacaaaa
gi|4 : -------TGTT----AAA-GCAC-C--ATT-A-----TGAT------A-TGCAAA-TAC--A---------G------T-AA--A-TA----T-AA--------T--------TATTAGA---TT---------T-TGAA-TG--T-A--AA---A--AG--GTGCTGT--AACGAAACA-T-GCA--TCtattttattctatttttaaagaaacataaagagacgacctatttannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntgttaaagcaccattatgatatgcaaatacagtaaatataattattagattttgaatgtaaaaaggtgctgtaacgaaacatgcatc
gi|40 : caagatgattgtggtgcaaagcattaaatcagccgttaaacattttaaatattttattctatttttaaagaaacataaagagacgacctatttannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnAACAAAG--A-TAA---TTTT---GTA-TGC-AAA---GCA-TCTAAGA--T--CGG-C-CGC-TAAA-AT-TGTGA-A---
gi|41 : aACAA-G--C-TAA---TTTT---G-A-TTC-AAA---GTA-TT--CAA--T--CGG-C-CGC-AAAA-AT-TCTAA-A---gaaatttctattcccataagaaaactacagcaagacgaaatacataagaatgacccaaca
gi|42 : aaaataaatctgcAA-A--A-TAA---TTTT---T-A-TGC-AAA---G-A-TC--AAA--T--CTG-C-CGC-TAAA-AC-TTcatttcagattgcatgtatttccaaggaaacacacaatatgaaacgt
gi|43 : ----AAA-GCAT-CGTATC-A-----TGAT-----GA-T----A-TGCAAA----TCA--G------C-GG--A-TA----T-GA--------T--------TATTAGA---TT---------T-TGAA-TA--TCC--AA---A--AA--acaatattctgagcgatttcaaagaaacgaccagcatacccttatctcatatacatttttcc
gi|44 : atattttaa-G--A-TAA---GTTTT--G-A-TGC-ATA---GCA-TC---AA--T--C-G-C-TACTTAAATAT-TTTGA-A---tcgcttgtttaagttgttaatatga
gi|45 : --A-TAA---TTTT---G-A-TGC-AAA---GCA-TC--AAA--T--CGG-C-CGC-TAAA-AT-Tatatactttttcggagcttttccaaaggaaccaacatgctccaaaggttgt
gi|46 : a-G--A-TAA---GTTT---G-A-TGC-AAA-----A-AC--AAA--T--CGG-C-TAC-TAAATAT-TTGAA-A---ggaagatttctattccaaagaaactacacaaacgacattacataaaatgaccaa
gi|47 : cAA-G--A-TAT---ATTT---G-A-TGC-AAA---GCA-TC--AAA--T--CTG-C-CGC-AAAA-GT-TTTAG-A---tatattttcggagctatttccaaagaaccaacatgctcaaggttgtca
gi|48 : TTT---G-A-TGC-AAA---GCA-TA--AAA--T--CGG-C-CGC-TAAA-AT-Ttattctaaactatttccccccaaaaaacccatagagaaacgaccag
gi|5 : tACAA-G--A-TAA---GTTT---G-A-TGC-AAA---GCA-TT--AAA--T--TGG-C-CGC-TNNN-NN-NNNNN-N---NNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNN--NNNNNNNNNN---------NNN------------NNNNG-CTCCA-GG-TTG--TCA-CTGATA-GTTATTCCANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--NNNN----------NNNNNNNNNNAA-------CGTT----AAA-GCAC-C--ATC-A-----TGAT-----GA-T----A-TGC--A-------------------A--A-TAGGG-C-AA-----------------------A---TT------------GAA-TG--TTA--AA---A---A--GTGCAGA--AATCAAACA-T-GCA--TCTAaattttttaaatagatttctttgtccaagaaccatgtgacagaaggactaac
gi|50 : -G--A-TAA---GTTT---G-A-TGC-AAA---GCA-TC--AAA--T--CGG-C-TAC-TAAATAT-TTGAA-A---tgta
gi|52 : acACAA-G--A-AAA---GTT----G-A-TGC-AAA---GCA-TC--AAA--T--CGA-C-TGC-AAAA-GG-TTTAtatattttcggagctatttccaaagaaccaacatgc
gi|53 : tC--A----T----G------C-AA----TA----T-AA--------T--------T-----T---TA---------T-TG-A-TGTTTCA--AA---A--AA---TACAGA--AATCAGAAA-T-GCGATTCTAtaaatattttaagcttcttccaaagaaacac
gi|54 : cattaatACAA-G--AGTAA----TTT---G-A-TGC-AAA---GAA-TC--AAA--T--CGGCC-CGC-T--A-CT-TCTAA-A---ggtaaac
gi|55 : tatgt----T-AA--------T--------T-----A---TTACTTACAAAT-TGAA-TG--TCA--AA---A--AA--GTGCAGA--AATCAAACA-T-GCT--TCgaaatacagagacaacc
gi|56 : ACAA-G--A-TAA---G-----------GC-AAA---GCA-TC--AAA--T--CGA-C-CGC-TAAA-AT-aaattaaaca
gi|58 : ACCA-A--A-TAA---TTTT---G-A-TGC-AAA---ACA-TA--ATC--T--CGA-C-CGC-TAAA-AT-TTgaatattctatttccaaagaaacatac
gi|59 : tatagAA-GTAC-C--ATC-A-----TGAT-----GA-T----A-TGC--A----a
gi|6 : CAA-G--A-TAA---GTTT---G-A-TGC-AAA---GCA-TC--AAG--T--CGG-C-CGC-TNNN-NN-NNNNN-N---NNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNN--NNNNNNNNNN---------NNNNNNNNNNNNGGCCGAGA-C---A-GG-CTG--TCT-CCGATA-GTTACTCCATGCCCTAGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--NNNN----------N----------N-------NNNN----NNN-NNNN-N--N-C-A-----TAAT---------------T-C--A----T----G------C-AA--A-TA----T-AA--------T--------T-----A---TT---------T-TGAA-TG--T-A--AA---A--AA--ATGCAGA--AATCAAACA-T-GCA--TCTAaaggtgcggaaagtgttgcaa
gi|60 : AACAA-G--A-AAA---GTTT---G-A-TGC-AAA---GCA-TT--AAA--T--CGG-C-CGC--AAA-agtaaa
gi|61 : CAA-G--A-TGA---TTTT---G-A-TGC-AAA---GCA-TC--AAA--T--CGG-C-CGC-TAA
gi|62 : AA-G--A-TAA---TTTT---G-A-TGC-AAA---GCA-TC--AAA--T--CGG-C-CGC-TAA
gi|63 : ACAA-G--G-TAA----TTT---G-A-TGC-AAA---GCA-TC--AAA--T--CGG-C-CGC-
gi|64 : ACAA-G--A-TAA---TTTT---G-A-CAC-AAA---GCA-TC--AAA--T--CGA-C-CGC-a
gi|65 : A-G--A-TAA---TTTT---G-A-TGC-AAA---GCA-TC--AAA--C--CGG-T-CGC-
gi|66 : cacACAA-G--A-TAA---TTTT---G-A-TGC-AA------A-TC--AAA--T--CGG-C-CGC-TAA
gi|67 : CAA-G--A-TAA---TTTT---G-A-TGC-AAA---TCA-TC--AAA--T--CGG-C-CGC-
gi|68 : ACAA-G--A-AAA---TTTT---G-A-TGC-AAA---GCA-TC--AAA--T--CGG-C-CG
gi|69 : -TAA---GTTT---G-A-TGT-AAA---GCA-TG--GAA--T--CGG-C-CG
gi|7 : AACAA-G--A-TAA---GTTT---G-A-TGC-AAA---GCA-TC--AAA--T--CAG-C-CGC-TNNN-NN-NNNNN-N---NNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNN--NNNNNNNNNNNNNNNNN--GCT------------CGAGA-C---G-GG-CTG--TCT-CCGATA-GTCACTCCANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--NNNN----------C----------A-------TGTT----AAA-GCAC-C--GTC-A-----TGAT-----GA-T----A-TGC--A----T----G------C-AA--A-TA----T-AA--------T--------T-----A---TT---------T-TGAA-TG--CCA--AA---A--AA--GTGCAGA--AATCAAACA-T-GCA--TCTAat
gi|8 : ACAA-G--A-AAA---GTTT---G-A-TGC-AAA---GCA-TC--
gi|8 : tac----AAA-GCAC-C--GTG-A-----CGAT-----GA-T----A-TGCAAA----T----GGAA---C-AA--A-TA----T-AG--------T--------TATTAGA---TT---------T-TGAA-TG--TCAACAA---A--AA--GTGCAGA--AAnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnttgaggattgatcaaccttaaggcaaattgcagaagagacgctaaattgcgtttaaaatatttttaaaagcaccgtgacgatgatatgcaaatggaacaaatatagttattagattttgaatgtcaacaaaaagtgcagaaaattgttgtggttaatgtaaacag
gi|9 : tacacaagaaaagtttgatgcaaagcatcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnttgaggattgatcaaccttaaggcaaattgcagaagagacgctaaattgcgtttaaaatatttttaAACAA-G--A-AAA---GTTT---G-A-TGC-AAT---GCA-TC--AAA--T--CGG-C-CGC--AAA-attgttgtggttaatgtaaacag
gi|9 : ----AAA-GCAC-C--ATG-A-----CGAT-----AA-T----A-TGA--AAA--T----GGAA---C-AA--A--A----T-AG--------T--------T-----A---TTAGATT----T-TGAA-TG--TCA--AA---A--AA--GTGCAGA--AAnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnactcttttgaaccannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntgttttaaaaagcaccatgacgataatatgaaaatggaacaaaatagttattagattttgaatgtcaaaaaagtgcagaaaattgttgtggataatgtaaacag
6 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|32 ): AATTANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
Unaligned ( gi|33 ): TNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNATAGGCNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
Unaligned ( gi|34 ): ATTANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
Unaligned ( gi|49 ): CTAACATGTTGAAGTGCCATTATGATGCTAAGCGAATGAAGCAAGTACGATTACTAGATCCAAACATACTTCAGAAACGTGGTTAA
Unaligned ( gi|51 ): AANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGCTCCAGGTTGTCATAGTTATTCCAC
Unaligned ( gi|57 ): TCATATATTATGCAAAGGTGCAGACAGGTGAAGAAAGTTTTGCGGTTAATGTAAACAG
Alignments
lowQualScore : 66666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666 111111 111111 77777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777 3333333333333333333 22222222222222222222222222222222222222
lowQualScore : 1 11 0 4444 222 0 0 0 111 0 11 22 11 0 0 0 33333333 8888888888888 2 44444444 11 444444444 333 66666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666 3 2 000000 2 2 22 000000 2 0 1 0 99999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999 5555 2 2 11 1 33333 33333 1 3333 2 2222222222222222222 1 11 2 7777 1 55555555555555555555555555555555555555 1 1 22 22 222 66 22 22 2 2 33
lowQualScore : . .. . .... ... . . . ... . .. .. .. . . . ........ ............. . ........ .. ......... ... .................................................................................................................... . . ...... . . .. ...... . . . . ............................................................................................ .... . . .. . ..... ..... . .... . ................... . .. . .... . ...................................... . . .. .. ... .. .. .. . . ..
lowQualScore : 0 33 9 2222 333 8 8 8 444 8 99 00 11 8 8 9 55555555 2222222222222 2 99999999 55 333333333 888 00000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 5 0 222222 0 0 88 555555 0 5 0 2 88888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888 7777 5 5 77 2 11111 11111 2 9999 5 6666666666666666666 4 99 8 0000 4 88888888888888888888888888888888888888 5 5 00 00 666 55 00 11 0 0 77
consensus : AACAA-G--A-TAAN---TTT---G-A-TGC-AAA---GCA-TC--AAA--T--CGG-C-CGC-TAA--------A------A------T-TT--------T--A---------AA---T--------C----TA--------T---------------TN----AG--A-----AACA--TA-C--AGAAACGA-C-AA--CAAC---AT---------GC-T------------CGAGA-C---G-GG-C-TG--TCT------CCGATA-GTTACTCCACGCCCNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTTTCTAAC--AAGT----------C----------A-------TGTT----AAA-GCAC-C--ATC-A-----TGAT-----GA-T----A-TGC--A----T----G------C-AA--A-TA----T-AA--------T--------T-----A---TT---------T-TGAA-TG--TCA--AA---A--AA--GTGCAGA--AATCAAACA-T-GCA--TCTA
Reference ( family-850 ) : AACAA-G--A-TAAN---TTT---G-A-TGC-AAA---GCA-TC--AAA--T--CGG-C-CGC-TAA--------A------A------T-TT--------T--A---------AA---T--------C----CA--------T---------------NN----AG--A-----ANCG--TA-C-NAGAAACGA-C-AANNCANC---GT---------GC-T------------CGAGA-C---G-GG-C-TG--TCT------CCGATA-GTTACTCCACGCCCTAGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTTTCTAAC--AAGT----------C----------A-------TGTT----AAA-GCAC-C--ATC-A-----TGAT-----GA-T----A-TGC--A----T----G------C-AA--A-TA----T-AA--------T--------T-----A---TT---------T-TGAA-TG--TCA--AA---A--AA--GTGCAGA--AATCAAACA-T-GCA--TCTA
gi|1 : AACAA-AGCA-TAAG---TTTTGTG-A-TGCTAAA---GCA-TCC-AAA--TTTCGT-C-CGC-TAA--------A------A------T-TT--------T--A---------AA---T--------C----CA--------C---------------AA----AG--A-----AACA--TA-C-AGAAAACGA-C----CCGAC---AT---------GC-T------------TAAGA-C---G-GGCC-TGCCTCT------CCGATA-GTTTCTCCACGCCC
gi|1 : aacaaagTT----AAATGCACAC--GTC-------TGAT-----CAGT----A-TGC--A----T----G------C-AA--A-TAA---T-AA--------A--------T-----A---TT---------T-TGAAATG--TCA--AA---A--TGTTGTGCAGA--AATCAAACA-T-gttctacgttgaaatccaaatttcccatgcttccaggcatttccctcttctcctcaagcgatcctctcaagaactgtcttcttctatcactattatttaaatgcacacgtctgatcagtatgcatgcaaataataaatattttgaaatgtcaaaatgttgtgcagaaatcaaacatag
gi|10 : aacaaagaacaaagcataagttttgtgatgctaaagcatccaaatttcgtccgctaaaattttaaatccacaaagaaacatacagaaaacgacccgacatgcttaagacgggcctgcctctccgatagtttctccacgcccgttctacgttgaaatccaaatttcccatgcttccaggcatttccctcttctcctcaagcgatcctctcaagaactgtcttcttctatcactattat-G--A-TGAG---TTT---G---TTC-AAA---GCT-TC--AAA--T--CGG-C-CTC-TAA--------A------A------T-TT--------G--A---------AA---T--------ag
gi|10 : A-GCAC-C--CTT-A-----TGAT-----GA-T----A-TGCTAA----T----GAAG---C-AA--A-TA----C-GA--------T--------T-----A---TTAGA------T-TAGA-T---------------------TGCAGA--AACCAAACA-T-Gattctgagatattgccaaagaaatatcaaatcaatctttcaaacagaaactaccgacatgtatcctttaaggtcccctttatcttttccacgcacttcctaaatccgttcatgctttaaggcaaatgctaaatgcagtagcacccttatgatgatatgctaatgaagcaaatacgattattagattagattgcagaaaccaaacatgtctcagaaacgtgttcaa
gi|11 : gatgagtttgttcaaagcttcaaatcggcctctaaaatttgaaatattctgagatattgccaaagaaatatcaaatcaatctttcaaacagaaactaccgacatgtatcctttaaggtcccctttatcttttccacgcacttcctaaatccgttcatgctttaaggcaaatgctaaatgcagt-TAAG---TTT---G-A-TGC-AA----GCA-TC--AAA--T--CAG-C-CGT-NNN--------N------N------N-NN--------N--N---------NN---N--------N----NN--------N---------------NN----NN--N-----NNNN--NN-N-NNNNNNNNN-N-NNNNNNNN---NN---------NN-NNNC---------CGA-A-C---G-GA-C-TG--TCT------CC-ATA-GTCG-TCCANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--NN------------C----------A-------TTTT----AAA-GCAC-C--GTT-------TGAT-----GA-T----AGTGC-------T----G------C-AA--AATA----T-AA--------TG-------T-----A---TT---------T-TGAA-TG--T----AA---A--AA--GTGCTGA--AATCAAA-A-T-GCA--tctcagaaacgtgttcaa
gi|12 : ttCAA-G--A-TGAG---TTT---G-A-TGC-AAA---GCA-TC--AAA--T--CGG-C-CGC-TNN--------N------N------N-NN--------N--N---------NN---N--------N----NN--------N---------------NN----NN--N-----NNNN--NN-N-NNNNNNNNN-N-NNNNNNNN---NNNNNNNNNNNGC-T------------CGAGA-C---G-GG-C-TG--TCT------CCGATA-GTTACTCCACGCgtaagttta
gi|12 : A----T-AG--------T--------TC----A---TT---------T-TAAA-TG--TCA--AA---AA-AA--GTGCAGA--AATCAAACA-T-GCA--TCTAnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncatagttcattttaaatgtcaaaaaaagtgcagaaatcaaacatgcatctaag
gi|13 : caagatgagtttgatgcaaagcatcaaatcggccgctnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngctcgagacgggctgtctccgatagttactccacgcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnc--A-TATG---TTT---G-A-TGC-AAA---GCA-TC--AAAAGT--CGG-C-CGC-TAA--------A------A------T-TTAAATATTCT--G---------AA---T--------TATTTCA--------T---------------TT----AG--A-----AACA--TA-C--AGAATCGA-C-----CAAC---AT---------GC-T------------TGAGA-C---G-GG-T-TG--TCT------CCGATA-GTTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--NNNN----------N----------N-------CAT------AA-G--------TC-A-----TG-C-----AA-T----A-T-----------------------AA--T-TA----T-------------------------------T---------T-TGAA-TG--TC---AA---A--AA--GTACAGA--AATC-AACA-T-GCA--TCTAag
gi|14 : ACAA-G--A-CAAG---TTC---G-A-TGC-AGA---GCA-TC--AAA--T--CGG-C-CGC-TAA--------A------A------AATT--------T--A---------AA---T--------------A--------T---------------TG----TA--A-----GCTG--TTTC-CAAATA-GA-C-----CAAC---AT---------GC-C------------CAAG---------G-T-TG--CC-------CCGATA-GTTATCCCANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--NNNN----------NNNNN------A-------TGTT----AAT-TCAC-C--ATC-A-----TGAT-----AA------A-TAG--A---------G------C-AA--A-TA----T-AA--------T--------T-----A---TTACATT----T-TGAA-TG--TCA--AC---A--AA--GTGCAG---GATCAggtaaa
gi|15 : T--------T--A---------AT---T--------C----CA-------------------------A----AG--A-----AACT--TA-C-AAGAAACGC-C-AA--CATT---GT-------------------------CGAGA-C---A-GG-C-TG--TCT------CCGGTA-CTT
gi|15 : aaaaattttaaataatctgaa----------A-------TGTT----AAA-GCAC-C--ATC-T-----TGAT-----GA-T----A-TGC---------------------AA--A-TA----T-AA--------T--------T-----A---AT---------T-TGAA-TG--TCA--AA---A--AA--A-GCAGA--AATT-AACA-T-GCA--TCTAcannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncaataatatgttaaagcaccatcttgatgatatgcaaatataattaatttgaatgtcaaaaaaagcagaaattaacatgcatctaagtaa
gi|16 : aaaaattttaaataatctgaattaattccaaagaaacttacaagaaacgccaacattgtcgagacaggctgtctccggtacttcannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncaataat---T--------C----CA--------T---------------TT----AGT-AT----AACA--TA-C--AGAATCGA-C-----CAAC---AT---------GT-TTT----------CGAGAGC---G-GG-C-TG--GTC------CCGAAAAGCTACTCCACGTCCNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--NNNN----------N----------N-------NNNN----NNN-NNNN-N--NNN-N-----NNNT-----CA-T----A--GT--A----TCATGG------C-AA--AATA----T-AA--------T--------T-----A---TT---------T-TGAA-TG--TCA--AA---A--AA--GTGCAGA--AATCAAACA-TGGCA--TCTAagtaa
gi|17 : aaagttttgattattctgaattattAA-G--A-TAAT---TTT---G-A-TGG-AAA---GCA-TC--AAA--T--GGG-C-GTT-TAA--------A------A------T-TT--------T--ATGTATTCTTAA---T--------C----TAAGCTCTTTC---------------CA----AG--A-----AACA--TA-C--AGAAACTATT-AACATACC---TT---------GT-C------------C-----C---C-TG-CATG--TTT------CCCA-N-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--NNGT----------A----------A-------TATT----AAA-GTAC-C--ATT-A-----TGAT-----GA-T----A-TGC--AAAAGT----G------C-AG--A-
gi|18 : ACAA-G--A-TAAG---TTT---G-A-TGC-AAA---GCA-TC--AAA--T--CGG-C-CGC-TAA--------A------A------T-TT--------T--A---------AA---T--------C----CA-------------------------A----AG--A-----AACA--TA-C--AGAAACGA-C-----CAAC---AT---------GT-T------------CAAGA-C---A------TG--T-T------CCGATA-GTTTCTCCACGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTTTCTAAC--AAGT-------------------------------TT----AAA-GCAC-C--GTC-A-----TGAT-----CA-T----ATTGC--A----T----G------C-AA--A-CA----T-AA--------T--------T-----A---TT---------T---GA-TG--TCA--AA---A--AA--GTGCAAA--ATTCAAACA-T-Gaagtgttgcagttaa
gi|19 : c-TAAG---TTT---G-A-TTC-AAATTAGCA-TC--ATA--T--CGA-T-CGC-TAA--------A------A------G-TT--------T--A---------GA---TATTCTAAAC----TA--------T---------------TT----CG--AAACAGAGCA--TA-C--AGAAACGACC-AAATTATC---g
gi|19 : GT----------T----------A-------CGGT----AAA-GCAC-C--ATT-A-----TGAT-----GA----------C--T----T----G------C-AA--A-Tcttgtcccctatattttttcaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatgttacggtaaagcaccattatgatgacttgcaaatggagccaatgtaacgttaa
gi|2 : taagtttgattcaaattagcatcatatcgatcgctaaaagtttagatattctaaactatttcgaaacagagcatacagaaacgaccaaattatccttgtcccctatattttttcaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatAATAA-G--A-CAAG---TTT---G-A-AGC-AAA---GCA-CT--AAA--T--TGG-C-CGC--AA--------A------A------A-AT--------T--A---------AA---T--------ggagccaatgtaacgttaa
gi|2 : tgta----------A-------TGTTTTAAAGA-GCAC-C--ATG-A-----TGAT-----GA-T----A-TAC--AAA--T----G------G-AA--A-TAGTTAT-AA--------G--------------A---TT---------T-TAAA-TG--TCA--AA---A--AA--GTGCAGA--AAatttataagtaagatacataagttggatgtatttccaaataaacgactaatatgcaattttttgaaccannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatgttttaaagagcaccatgatgatgatatacaaatggaaatagttataagattttaaatgtcaaaaaagtgcagaaaattgttatggttaatataata
gi|20 : tgtaaataagacaagtttgaagcaaagcactaaattggccgcaaaaaattaaatatttataagtaagatacataagttggatgtatttccaaataaacgactaatatgcaattttttgaaccannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnCAA-G--A-TAAT---TTT---G-A-TGC-AAA---GCA-TC--AAA--T--CGA-C-CGC-TAA--------A------AT-----T-TT--------T--A---------AG---T--------A----TG--------C---------------TA----AGCTACT---AATA--TA-C--AGAAATGA-C-----CAAC---AT---------AT-T------------C-----------TT-C-TT--CCTTA----TCGATA-TTTTGTCCANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNC----GT----------A----------A---------TT----AAA-GCAC-C--AGT-A-----TGAT-----GA-C------------------------------------TA-------------------------T-----A---CT---------T-TGAA-TG--TCA--AA---A--AA--TTGCAGA--attgttatggttaatataata
gi|21 : AA-G--A-TAATATATCT---G-A-TGC-AAA---GCA-TC--AAA--T--CGA-C-CGC-TAA--------A------T------T-TT--------T--A---------AG---TA-------T----TA--------TTTC------------CA----AG--A-----AACA--TA-C--AGAATCGA-CTAACATACCCTTGT---------CC-C------------CTACA-T--------T-TT--TTT------CCCANN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--NNNN----------N----------C-------TGTT----AAA-GTAC-C--ATC-A-----TTAT-----GA-T----A-TGC--AAAGGT----G------C-AG--A-gcattgtggttaatgtca
gi|22 : -G--A-TTAT---TTT---G-A-TGC-AAA---GCA-TC--AAA--T--GGG-C-CGC-TAA-------------------------------------A---------AA---G--------C----CA-------------------------A----CG--A-----AACA--TA-C--AGAAATGA-C-aagtgttgcggttaatg
gi|23 : CAA-G--A-TGAT---TTT---G-A-TGC-AAA---GCA-TG--AAA--T--CGG-C-CGC-TAA--------A------G------T-TT--------T--A---------AG---TGTTATAAGC----TA--------TTTC------------CA----AG--A-----AACA--TA-C--AGCAACGA-C-----CAAC---AT---------AT-C------------C--------------T-TG--TCC------CCTACA--TTATTTCA---ANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--NNNN----------N----------N-------NNNN----NNA-GTAC-C--ATC-A-----TGAT-----GA-T----A-TGC--A----ctacatacccctgtcccttttatatttcccccannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncgatcacgacgatatgcaaaatggagcaaatttgattgctaaattttaagggtgaaaaagttgtgcataatataaacagag
gi|24 : -TGC-AAA---GCA-TC--AAA--T--CGG-C-CGC--AA--------A------A------A-AT--------T--A---------AA---T--------A----TA--------TAAGCAAGATATTTCCAA----AG--A-----AACAC-TA-C--AGAAACGA-C-CAATTAAC---AT---------AC-T------------CTATA-------------G--TCTTTTGAACCANNN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--NNNN----------N----------A-------TGTTTTAAAAA-GCAC-C--ATG-A-----CGAT-----GA-T----A-TGT--A----aaggcgcagaaagttttgcgtatgatatatgtaa
gi|25 : tgattacagatTT---G-T-TGC-AAC---GCA-TC--AAA--T--CGG-T-CGA-TAA--------A------A------C-TT--------T--A---------AA---T--------aatg
gi|26 : CAA-G--A-TCAT---TTT---G-A-TGC-AAA---GCA-TC--AAA--T--CGG-C-CGC-TAA--------A------A------T-TT--------T--T---------AATATT--------C----TA--------T---------------AC----AA--A-----AACA--TA-C-GA-AAACTA-C-attgtaagctacatgtatttccaaagaaacatgcttgtcttataaatttttccannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncactataatgaggatatctgaatgaggcaaacaagattattagagttgcagaaactatatacgtgcttcaaaaatgtggttaa
gi|27 : ----------A-------TGTT----AAAAGCAC-C--ATCTA-----TGAT-----GA-C----T-TGC--A----caacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaca
gi|28 : gataagtttgatcaaattagcatcaatacatccttaagtagatattctaaactatttcgaaaacagagcatacagaaacgaccaaatttcccttgtcccctatattttttcaaacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn----------C----------A-------TGTT----AGA-GCACAT--GTT-A-----TGAT-----CA-T----A-TGC--A----T----G------CAAA--A-TA----T-AA--------T--------T-----A----T---------T-TGAA-TG--TCA--GAAACA--AA--GT-CAGA--A---AAGCATT-GCA--TCTAa
gi|29 : gctttgagagggactggtctgccgataagctactcannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnAGAAACTA-C-----CAAC---AT---------GG-T------------CGAGA-C---A-GG-C-TG--TCT------CCAATA-GTTACTCCANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--NNNNNNNNNNNNTAC----------A-------TGTT----AAA-GCAC-C--ATC-A-----TGAT-----GA-T----A---C--A----T----G------C-AA--A-TA----TGAA--------TGCATATAAT-----A---TT---------A-TGAA-AA--TTG--AA---A--AA-----CA-A--AATT--ACA-T-Gtgtaaacagaatg
gi|3 : ACAA-A--A-TAAG---TTT---G-AATGC-AA----GCAGTC--AAAA-T--CGG-CGCGC-TAA--------A------A------T-TT--------TGAA---------AA---T--------------A--------T---------------TT----TG--A-----ATTA--TA-G-CAGAA-CGA-CCAAATC--C---AT---------GCCT------------CGAGA-C---GTGG-C-TG--TCTG-----CCG-TA-GTTANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--NNNN----------N----------NNNNNCTTTGTT----AAA-GCAC-C--G-C-A-----TGA------GA-TG---A-TGC--A----T----G------C-AATAA-TA----T-AA--------T--------T-----A---CT---------TGTGAA-TG--TCA--AA---AA-AA--GTGCAGA--TCTCAAACA-T-GC
gi|30 : cT----AAA-GTTC-C--ATC-A-----TTAT-----GA-T----A-TGCTAA----TGGA-G------T-AA--A-TA----T-AA--------T--------T-----G---Tttaag
gi|31 : tttaaatatcccaagctatttccaaagaaacatcagaaacaaccatatatactcttgtcccctatatcttttccannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntg-T------------CGAGA-C---A-GG-C-TG--TCT------CCGGTA-CTTcaaagcggtgta
gi|31 : g----------A-------TGTT----AAA-GCAC-C--ATC-T-----TGAT-----GA-T-----------A----T----G------C-AA--A-TA----T--A--------T--------T-----A---AT---------T-TGAA-TG--TCA--AA---A--AA----ACAGGACAATTAGACA-T-GCA--TCTAcannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncaataatatgttaaagcaccatcttgatgatatgcaaatatattaatttgaatgtcaaaaaaacaggacaattagacatgcatctaagaaa
gi|35 : gtcgagacaggctgtctccggtacttcannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncaataatAACAA-G--A-AACT---TTT---G-A-TGC-AAA---GCA-TC--AAA--T--CGG---CGC--AA--------A---------------TT--------T--A---------AA---T--------A----TT--------T---------------TC----AA--AG----AACA--TA-C--AGAATCGA-C-AA-CCAAC---GT---------agaaa
gi|36 : TTTCTAA----A-----------------------A-------TGTT----TAA-GCAC-C--A-C-A-----TGAT-----AA-T----A-TGC--AAAA-TAGA-G------C-GA--A-TA----T-AACATTGTAAT--------T-----A---TTACTTACAAAT-TGAA-TG--TCA--AA---AA-AA--GTGCAGA--AATCAAACA-T-GCT--TCcttcttcgatgaaacctaaatccgccggcaaatttgcagtagagacggcctaaattgcgtttaaaatgttttaaga
gi|37 : aACAA-G--A-TAAT---TTT---G-A-TAC-AAA----CA-TC--ATA--T--CAA-T-AGC-TAA--------A------A------C-TT--------T--A---------Aaaattaaaacagaa
gi|38 : TTTCTAATTTAAGC-------------------------------TT----AAA-GCAC-C--ATC-AATTCATGAC-----GA-T----A-TGA--AAA--T----GGAGTAAC-AA--G-GA----T-TG--------T--------T-----AGATTT---------T-TTAA-TG--TCA--AA---A--TG--GTGCAGA--AATCAAACA-T-GCA--TCtcaaaatgttctaagctgatttccaaataaacatacagaaacgaatagtacatacttgtcttttctacagatatattta
gi|39 : ttga----AAA-GCAC-C--ATG-A-----CGATTGAAGAA-T----A-TGC--AAA--T----AGAA---C-AA--A-TA----T-AG--------T--------TTTT--AGGTTT---------T-TGAA-TG---CA--AA---AAAAA--GTGCAGA--AAatgaaaacagaa
gi|4 : aaCAA-G--A-TGAT---TGT---G-G-TGC-AAA---GCA-TT--AAA--T--CAG-C-CGT-TAAACATTTTAA------A------TATT--------T--T---------AT---T--------C----TA--------T---------------TTTTAAAG--A-----AACA--TA---AAGA---GA-C-GACCTATTTA-NN---------NN-N------------NNNNN-N---N-NN-N-NN--NNN------NNNNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--NNNN----------N----------N-------TGTT----AAA-GCAC-C--ATT-A-----TGAT------A-TGCAAA-TAC--A---------G------T-AA--A-TA----T-AA--------T--------TATTAGA---TT---------T-TGAA-TG--T-A--AA---A--AG--GTGCTGT--AACGAAACA-T-GCA--TCaattgtttgtggtttaaaatgtttacaaacaaaa
gi|40 : AACAAAG--A-TAAT---TTT---GTA-TGC-AAA---GCA-TCTAAGA--T--CGG-C-CGC-TAA--------A------A------T-TG--------T--G---------AA---
gi|41 : aACAA-G--C-TAAT---TTT---G-A-TTC-AAA---GTA-TT--CAA--T--CGG-C-CGC-AAA--------A------A------T-TC--------T--A---------AA---gaaatttctattcccataagaaaactacagcaagacgaaatacataagaatgacccaaca
gi|42 : aaaataaatctgcAA-A--A-TAAT---TTT---T-A-TGC-AAA---G-A-TC--AAA--T--CTG-C-CGC-TAA--------A------A------C-TT--------A--C---------AA---T--------------A--------T---------------TC----TG--------AGCGATTT-CAAAGAAACGA-C-catttcagattgcatgtatttccaaggaaacacacaatatgaaacgt
gi|43 : ----AAA-GCAT-CGTATC-A-----TGAT-----GA-T----A-TGCAAA----TCA--G------C-GG--A-TA----T-GA--------T--------TATTAGA---TT---------T-TGAA-TA--TCC--AA---A--AA--cagcatacccttatctcatatacatttttcc
gi|44 : atattttaa-G--A-TAAG---TTTT--G-A-TGC-ATA---GCA-TC---AA--T--C-G-C-TACTTAA--------AT-----A------T-TT--------T--G---------AA---tcgcttgtttaagttgttaatatga
gi|45 : --A-TAAT---TTT---G-A-TGC-AAA---GCA-TC--AAA--T--CGG-C-CGC-TAA--------A------A------T-TG--------G--A---------AGATTT--------C----TA--------TTCC------------AA----AG--A-----AAC---TA-C--ACAAACGA-C-Aatatactttttcggagcttttccaaaggaaccaacatgctccaaaggttgt
gi|46 : a-G--A-TAAG---TTT---G-A-TGC-AAA-----A-AC--AAA--T--CGG-C-TAC-TAA--------AT-----A------T-TT--------G--A---------AA---T--------ttacataaaatgaccaa
gi|47 : cAA-G--A-TATA---TTT---G-A-TGC-AAA---GCA-TC--AAA--T--CTG-C-CGC-AAA--------A------G------T-TT--------T--A---------GA---T--------atattttcggagctatttccaaagaaccaacatgctcaaggttgtca
gi|48 : ---TTT---G-A-TGC-AAA---GCA-TA--AAA--T--CGG-C-CGC-TAA--------A------ATTAATTT-TT--------T--A---------AA---T--------attctaaactatttccccccaaaaaacccatagagaaacgaccag
gi|5 : tACAA-G--A-TAAG---TTT---G-A-TGC-AAA---GCA-TT--AAA--T--TGG-C-CGC-TNN--------N------N------N-NN--------N--N---------NN---N--------N----NN--------N---------------NN----NN--N-----NNNN--NN-N-NNNNNNNNN-N-NNNNNNNN---NN---------NN-N------------NNNNG-CTCCA-GG-T-TG--TCA------CTGATA-GTTATTCCANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--NNNN----------NNNNNNNNNNAA-------CGTT----AAA-GCAC-C--ATC-A-----TGAT-----GA-T----A-TGC--A-------------------A--A-TAGGG-C-AA-----------------------A---TT------------GAA-TG--TTA--AA---A---A--GTGCAGA--AATCAAACA-T-GCA--TCTAagatttctttgtccaagaaccatgtgacagaaggactaac
gi|50 : -G--A-TAAG---TTT---G-A-TGC-AAA---GCA-TC--AAA--T--CGG-C-TAC-TAA--------AT-----A------T-TT--------G--A---------AA---T--------tgta
gi|52 : acACAA-G--A--AAA---GTT---G-A-TGC-AAA---GCA-TC--AAA--T--CGA-C-TGC--AA--------A------AGG----T-TTA-------T--A---------AA---T--------atattttcggagctatttccaaagaaccaacatgc
gi|53 : tC--A----T----G------C-AA----TA----T-AA--------T--------T-----T---TA---------T-TG-A-TGTTTCA--AA---A--AA---TACAGA--AATCAGAAA-T-GCGATTCTAattttaagcttcttccaaagaaacac
gi|54 : cattaatACAA-G--AGTAA----TTT---G-A-TGC-AAA---GAA-TC--AAA--T--CGGCC-CGC-T----------A------C------T-TC--------T--A---------AA---G--------A----AA--------T---------------AC----AG--A-----GACggtaaac
gi|55 : tatgt----T-AA--------T--------T-----A---TTACTTACAAAT-TGAA-TG--TCA--AA---A--AA--GTGCAGA--AATCAAACA-T-GCT--TCaacc
gi|56 : ACAA-G--A-TAAG--------------GC-AAA---GCA-TC--AAA--T--CGA-C-CGC-TAA--------AATGAATA------T-TC--------T--A---------TT---T--------C----CA-------------------------A----AG--A-----AACA--TA-C-aaattaaaca
gi|58 : ACCA-A--A-TAAT---TTT---G-A-TGC-AAA---ACA-TA--ATC--T--CGA-C-CGC-TAA--------A------A------T-TT--------
gi|59 : tatagAA-GTAC-C--ATC-A-----TGAT-----GA-T----A-TGC--A----a
gi|6 : CAA-G--A-TAAG---TTT---G-A-TGC-AAA---GCA-TC--AAG--T--CGG-C-CGC-TNN--------N------N------N-NN--------N--N---------NN---N--------N----NN--------N---------------NN----NN--N-----NNNN--NN-N-NNNNNNNNN-N-NNNNNNNN---NN---------NN-NNNNNNNNNNGGCCGAGA-C---A-GG-C-TG--TCT------CCGATA-GTTACTCCATGCCCTAGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--NNNN----------N----------N-------NNNN----NNN-NNNN-N--N-C-A-----TAAT---------------T-C--A----T----G------C-AA--A-TA----T-AA--------T--------T-----A---TT---------T-TGAA-TG--T-A--AA---A--AA--ATGCAGA--AATCAAACA-T-GCA--TCTAaaggtgcggaaagtgttgcaa
gi|60 : AACAA-G--A-AAAG---TTT---G-A-TGC-AAA---GCA-TT--AAA--T--CGG-C-CGC--AA--------A------agtaaa
gi|61 : CAA-G--A-TGAT---TTT---G-A-TGC-AAA---GCA-TC--AAA--T--CGG-C-CGC-TAA--------
gi|62 : AA-G--A-TAAT---TTT---G-A-TGC-AAA---GCA-TC--AAA--T--CGG-C-CGC-TAA--------
gi|63 : ACAA-G--G-TAA----TTT---G-A-TGC-AAA---GCA-TC--AAA--T--CGG-C-CGC-
gi|64 : ACAA-G--A-TAAT---TTT---G-A-CAC-AAA---GCA-TC--AAA--T--CGA-C-CGC-a
gi|65 : A-G--A-TAAT---TTT---G-A-TGC-AAA---GCA-TC--AAA--C--CGG-T-CGC-
gi|66 : cacACAA-G--A-TAAT---TTT---G-A-TGC-AA------A-TC--AAA--T--CGG-C-CGC-TAA--------
gi|67 : CAA-G--A-TAAT---TTT---G-A-TGC-AAA---TCA-TC--AAA--T--CGG-C-CGC-
gi|68 : ACAA-G--A-AAAT---TTT---G-A-TGC-AAA---GCA-TC--AAA--T--CGG-C-CG
gi|69 : -TAAG---TTT---G-A-TGT-AAA---GCA-TG--GAA--T--CGG-C-CG
gi|7 : AACAA-G--A-TAAG---TTT---G-A-TGC-AAA---GCA-TC--AAA--T--CAG-C-CGC-TNN--------N------N------N-NN--------N--N---------NN---N--------N----NN--------N---------------NN----NN--N-----NNNN--NN-N-NNNNNNNNN-N-NNNNNNNN---NNNNNNNNN--GC-T------------CGAGA-C---G-GG-C-TG--TCT------CCGATA-GTCACTCCANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--NNNN----------C----------A-------TGTT----AAA-GCAC-C--GTC-A-----TGAT-----GA-T----A-TGC--A----T----G------C-AA--A-TA----T-AA--------T--------T-----A---TT---------T-TGAA-TG--CCA--AA---A--AA--GTGCAGA--AATCAAACA-T-GCA--TCTAat
gi|8 : ACAA-G--A-AAAG---TTT---G-A-TGC-AAA---GCA-TC--
gi|8 : tac----AAA-GCAC-C--GTG-A-----CGAT-----GA-T----A-TGCAAA----T----GGAA---C-AA--A-TA----T-AG--------T--------TATTAGA---TT---------T-TGAA-TG--TCAACAA---A--AA--GTGCAGA--AAnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnttgaggattgatcaaccttaaggcaaattgcagaagagacgctaaattgcgtttaaaatatttttaaaagcaccgtgacgatgatatgcaaatggaacaaatatagttattagattttgaatgtcaacaaaaagtgcagaaaattgttgtggttaatgtaaacag
gi|9 : tacacaagaaaagtttgatgcaaagcatcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnttgaggattgatcaaccttaaggcaaattgcagaagagacgctaaattgcgtttaaaatatttttaAACAA-G--A-AAAG---TTT---G-A-TGC-AAT---GCA-TC--AAA--T--CGG-C-CGC--AA--------A------attgttgtggttaatgtaaacag
gi|9 : ----AAA-GCAC-C--ATG-A-----CGAT-----AA-T----A-TGA--AAA--T----GGAA---C-AA--A--A----T-AG--------T--------T-----A---TTAGATT----T-TGAA-TG--TCA--AA---A--AA--GTGCAGA--AAnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnactcttttgaaccannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntgttttaaaaagcaccatgacgataatatgaaaatggaacaaaatagttattagattttgaatgtcaaaaaagtgcagaaaattgttgtggataatgtaaacag
6 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|32 ): AATTANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
Unaligned ( gi|33 ): TNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNATAGGCNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
Unaligned ( gi|34 ): ATTANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
Unaligned ( gi|49 ): CTAACATGTTGAAGTGCCATTATGATGCTAAGCGAATGAAGCAAGTACGATTACTAGATCCAAACATACTTCAGAAACGTGGTTAA
Unaligned ( gi|51 ): AANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGCTCCAGGTTGTCATAGTTATTCCAC
Unaligned ( gi|57 ): TCATATATTATGCAAAGGTGCAGACAGGTGAAGAAAGTTTTGCGGTTAATGTAAACAG
Alignments
lowQualScore : 666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666 4444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444 111111 88888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888 33333333333333333333 22222222222222222222222222222222222222
lowQualScore : 1 11 0 4444 222 0 0 0 222 0 11 11 11 0 0 0 77777777777777 1 1 444444444 22 777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777 22 33 777777 1 5555 1 1 1 1 1111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 1 1 22 000000 33 1 1 44444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444 5555 2 2 11 1 33333 33333 1 3333 2 55555555555555555555 1 11 2 6666 1 66666666666666666666666666666666666666 1 1 22 1 22 222 44 33 22 1 1 2 33
lowQualScore : . .. . .... ... . . . ... . .. .. .. . . . .............. . . ......... .. ............................................................ .. .. ...... . .... . . . . ............................................................. . . .. ...... .. . . ............................................................................................ .... . . .. . ..... ..... . .... . .................... . .. . .... . ...................................... . . .. . .. ... .. .. .. . . . ..
lowQualScore : 0 22 9 1111 222 8 8 8 888 8 99 99 11 8 8 9 55555555555555 0 1 111111111 44 666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666 55 66 999999 1 4444 1 2 2 2 1111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 8 8 55 555555 11 1 8 99999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999 5555 4 4 77 2 00000 00000 2 8888 4 11111111111111111111 3 88 7 7777 4 88888888888888888888888888888888888888 4 4 00 4 00 555 88 99 00 5 9 0 77
consensus : AACAA-G--A-TAAN---TTT---G-A-TGC-AAA---GCA-TC--AAA--T--CGG-C-CGCT-AAA-----A------T-TT-T-A---------A--A--------T--------C----T----------A-----T-----T---------N----AG--A--AA------CA-T----A-CA-G-AAACGA-C----CA--A---CAT------------G-CT---------------CGAGA------CG-GG-C-TG--TCT------CCGATA-GTTACTCCACGCCCNANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTTTCTAAC--AAGT----------C----------A-------TGTT----AAA-GCAC-C--ATC-A-----TGAT-----GA-T----A-TGC---A----T----G------C-A--AA-TA----T-AA--------T--------T-----A---TT---------T-TGAA-TG--TC-A--AA---A--AA--GTGCAGA--A-ATCAAACA-T-GCA--TCTA
Reference ( family-850 ) : AACAA-G--A-TAAN---TTT---G-A-TGC-AAA---GCA-TC--AAA--T--CGG-C-CGCT-AAA-----A------T-TT-T-A---------A--A--------T--------C----T----------A-----T-----T---------N----AG--A--AA------CA-T----A-CA-G-AAACGA-C-AA-CA--A---CAT------------G-CT---------------CGAGA------CG-GG-C-TG--TCT------CCGATA-GTTACTCCACGCCCNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTTTCTAAC--AAGT----------C----------A-------TGTT----AAA-GCAC-C--ATC-A-----TGAT-----GA-T----A-TGC---A----T----G------C-A--AA-TA----T-AA--------T--------T-----A---TT---------T-TGAA-TG--TC-A--AA---A--AA--GTGCAGA--A-ATCAAACA-T-GCA--TCTA
gi|1 : AACAA-AGCA-TAAG---TTTTGTG-A-TGCTAAA---GCA-TCC-AAA--TTTCGT-C-CGCT-AAA-----A------T-TT-T-A---------A--A--------T--------C----C----------A-----C-----A---------A----AG--A--AA------CA-T----A-CA-GAAAACGA-C--C-CG--A---CAT------------G-CT---------------TAAGA------CG-GGCC-TGCCTCT------CCGATA-GTTTCTCCACGCCC
gi|1 : aacaaagTT----AAATGCACAC--GTC-------TGAT-----CAGT----A-TGC---A----T----G------C-A--AA-TAA---T-AA--------A--------T-----A---TT---------T-TGAAATG--TC-A--AA---A--TGTTGTGCAGA--A-ATCAAACA-T-gttctacgttgaaatccaaatttcccatgcttccaggcatttccctcttctcctcaagcgatcctctcaagaactgtcttcttctatcactattatttaaatgcacacgtctgatcagtatgcatgcaaataataaatattttgaaatgtcaaaatgttgtgcagaaatcaaacatag
gi|10 : aacaaagaacaaagcataagttttgtgatgctaaagcatccaaatttcgtccgctaaaattttaaatccacaaagaaacatacagaaaacgacccgacatgcttaagacgggcctgcctctccgatagtttctccacgcccgttctacgttgaaatccaaatttcccatgcttccaggcatttccctcttctcctcaagcgatcctctcaagaactgtcttcttctatcactattat-G--A-TGAG---TTT---G---TTC-AAA---GCT-TC--AAA--T--CGG-C-CTCT-AAA-----A------T-TT-G-A---------A--A----------------------T----------A-----T-----T---------C----TG--A--GA------TA-T----ag
gi|10 : A-GCAC-C--CTT-A-----TGAT-----GA-T----A-TGCTA-A----T----GAAG---C-A--AA-TA----C-GA--------T--------T-----A---TTAGA------T-TAGA-T----------------------TGCAGA--A-ACCAAACA-T-Gtgccaaagaaatatcaaatcaatctttcaaacagaaactaccgacatgtatcctttaaggtcccctttatcttttccacgcacttcctaaatccgttcatgctttaaggcaaatgctaaatgcagtagcacccttatgatgatatgctaatgaagcaaatacgattattagattagattgcagaaaccaaacatgtctcagaaacgtgttcaa
gi|11 : gatgagtttgttcaaagcttcaaatcggcctctaaaatttgaaatattctgagatattgccaaagaaatatcaaatcaatctttcaaacagaaactaccgacatgtatcctttaaggtcccctttatcttttccacgcacttcctaaatccgttcatgctttaaggcaaatgctaaatgcagt-TAAG---TTT---G-A-TGC-AA----GCA-TC--AAA--T--CAG-C-CGTN-NNN-----N------N-NN-N-N---------N--N--------N--------N----N----------N-----N-----N---------N----NN--N--NN------NN-N----N-NN-N-NNNNNN-N-NN-NN--N---NNN------------N-NNNNNNNC---------CGA-A------CG-GA-C-TG--TCT------CC-ATA-GTCG-TCCANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--NN------------C----------A-------TTTT----AAA-GCAC-C--GTT-------TGAT-----GA-T----AGTGC--------T----G------C-A--AAATA----T-AA--------TG-------T-----A---TT---------T-TGAA-TG--T-----AA---A--AA--GTGCTGA--A-ATCAAA-A-T-GCA--tctcagaaacgtgttcaa
gi|12 : ttCAA-G--A-TGAG---TTT---G-A-TGC-AAA---GCA-TC--AAA--T--CGG-C-CGCT-NNN-----N------N-NN-N-N---------N--N--------N--------N----N----------N-----N-----N---------N----NN--N--NN------NN-N----N-NN-N-NNNNNN-N-NN-NN--N---NNNNNNNNNNNNNNNG-CT---------------CGAGA------CG-GG-C-TG--TCT------CCGATA-GTTACTCCACGCgtaagttta
gi|12 : A----T-AG--------T--------TC----A---TT---------T-TAAA-TG--TC-A--AA---AA-AA--GTGCAGA--A-ATCAAACA-T-GCA--TCTAnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncatagttcattttaaatgtcaaaaaaagtgcagaaatcaaacatgcatctaag
gi|13 : caagatgagtttgatgcaaagcatcaaatcggccgctnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngctcgagacgggctgtctccgatagttactccacgcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnc--A-TATG---TTT---G-A-TGC-AAA---GCA-TC--AAAAGT--CGG-C-CGCT-AAA-----A------T-TT---A---------A--A--------TATT-----C----TGAATTATTTCA-----T-----T---------T----AG--A--AA------CA-T----A-CA-G-AATCGA-C----CA--A---CAT------------G-CT---------------TGAGA------CG-GG-T-TG--TCT------CCGATA-GTTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--NNNN----------N----------N-------CAT------AA-G--------TC-A-----TG-C-----AA-T----A-T------------------------A--AT-TA----T-------------------------------T---------T-TGAA-TG--TC----AA---A--AA--GTACAGA--A-ATC-AACA-T-GCA--TCTAag
gi|14 : ACAA-G--A-CAAG---TTC---G-A-TGC-AGA---GCA-TC--AAA--T--CGG-C-CGCT-AAA-----A------AATT-T-A---------A--A--------T--------A----T----------T-----G-----T---------A----AG--C--TG------TT-T----C-CA-A-ATA-GA-C----CA--A---CAT------------G-CC---------------CAAG-----------G-T-TG--CC-------CCGATA-GTTATCCCANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--NNNN----------NNNNN------A-------TGTT----AAT-TCAC-C--ATC-A-----TGAT-----AA------A-TAG---A---------G------C-A--AA-TA----T-AA--------T--------T-----A---TTACATT----T-TGAA-TG--TC-A--AC---A--AA--GTGCAG---G-ATCAggtaaa
gi|15 : -AAA-----A------T-TT-T-A---------A--A--------TAAT-----C----TGAATTA----A-----T-----T---------CCAA-AG--A--AA------CT-T----A-CAAG-AAACG--C----CA--A---CAT------------T-GT---------------CGAGA------CA-GG-C-TG--TCT------CCGGTA-CTT
gi|15 : a----------A-------TGTT----AAA-GCAC-C--ATC-T-----TGAT-----GA-T----A-TGC----------------------A--AA-TA----T-AA--------T--------T-----A---AT---------T-TGAA-TG--TC-A--AA---A--AA--A-GCAGA--A-ATT-AACA-T-GCA--TCTAcannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncaataatatgttaaagcaccatcttgatgatatgcaaatataattaatttgaatgtcaaaaaaagcagaaattaacatgcatctaagtaa
gi|16 : aaaaattttaaataatctgaattaattccaaagaaacttacaagaaacgccaacattgtcgagacaggctgtctccggtacttcannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncaataat--------T--------C----C----------A-----T-----T---------T----AGT-AT-AA------CA-T----A-CA-G-AATCGA-C----CA--A---CAT------------G-TTTT-------------CGAGAG-----CG-GG-C-TG--GTC------CCGAAAAGCTACTCCACGTCCNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--NNNN----------N----------N-------NNNN----NNN-NNNN-N--NNN-N-----NNNT-----CA-T----A--GT---A----TCATGG------C-A--AAATA----T-AA--------T--------T-----A---TT---------T-TGAA-TG--TC-A--AA---A--AA--GTGCAGA--A-ATCAAACA-TGGCA--TCTAagtaa
gi|17 : aaagttttgattattctgaattattAA-G--A-TAAT---TTT---G-A-TGG-AAA---GCA-TC--AAA--T--GGG-C-GTTT-AAA-----A------T-TT-T-ATGTATTCTTA--A--------T--------C----T----------AAGCTCT-----TTCC------A----AG--A--AA------CA-T----A-CA-G-AAACTA-T----TA--A---CAT------------ACCT---------------TGTCC------CC-TG-CATG--TTT------CCCA-N-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--NNGT----------A----------A-------TATT----AAA-GTAC-C--ATT-A-----TGAT-----GA-T----A-TGC---AAAAGT----G------C-A--GA-
gi|18 : ACAA-G--A-TAAG---TTT---G-A-TGC-AAA---GCA-TC--AAA--T--CGG-C-CGCT-AAA-----A------T-TT-T-A---------A--A--------T--------C----C----------A---------------------A----AG--A--AA------CA-T----A-CA-G-AAACGA-C----CA--A---CAT------------G-TT---------------CAAGA------CA------TG--T-T------CCGATA-GTTTCTCCACGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTTTCTAAC--AAGT-------------------------------TT----AAA-GCAC-C--GTC-A-----TGAT-----CA-T----ATTGC---A----T----G------C-A--AA-CA----T-AA--------T--------T-----A---TT---------T---GA-TG--TC-A--AA---A--AA--GTGCAAA--A-TTCAAACA-T-Gaagtgttgcagttaa
gi|19 : c-TAAG---TTT---G-A-TTC-AAATTAGCA-TC--ATA--T--CGA-T-CGCT-AAA-----A------G-TT-T-A---------G--A--------TATTCTAAAC----T----------A-----T-----T---------T----CG--A--AACAGAG-CA-T----A-CA-G-AAACGA-C-g
gi|19 : GT----------T----------A-------CGGT----AAA-GCAC-C--ATT-A-----TGAT-----GA----------C---T----T----G------C-A--AA-Tcaaattatccttgtcccctatattttttcaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatgttacggtaaagcaccattatgatgacttgcaaatggagccaatgtaacgttaa
gi|2 : taagtttgattcaaattagcatcatatcgatcgctaaaagtttagatattctaaactatttcgaaacagagcatacagaaacgaccaaattatccttgtcccctatattttttcaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatAATAA-G--A-CAAG---TTT---G-A-AGC-AAA---GCA-CT--AAA--T--TGG-C-CGCA-AAA-----A------A-TT-A-A---------AT-A--------T--------T----T----------A-----TAAG--T---------A----AG--A--TA------CA-T----A-ggagccaatgtaacgttaa
gi|2 : tgta----------A-------TGTTTTAAAGA-GCAC-C--ATG-A-----TGAT-----GA-T----A-TAC---AAA--T----G------G-A--AA-TAGTTAT-AA--------G--------------A---TT---------T-TAAA-TG--TC-A--AA---A--AA--GTGCAGA--A-Aagttggatgtatttccaaataaacgactaatatgcaattttttgaaccannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatgttttaaagagcaccatgatgatgatatacaaatggaaatagttataagattttaaatgtcaaaaaagtgcagaaaattgttatggttaatataata
gi|20 : tgtaaataagacaagtttgaagcaaagcactaaattggccgcaaaaaattaaatatttataagtaagatacataagttggatgtatttccaaataaacgactaatatgcaattttttgaaccannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnCAA-G--A-TAAT---TTT---G-A-TGC-AAA---GCA-TC--AAA--T--CGA-C-CGCT-AAA-----AT-----T-TT-T-A---------A--G--------T--------A----T----------G-----C-----T---------A----AGCTACTAA------TA-T----A-CA-G-AAATGA-C----CA--A---CAT------------A-TT---------------C-------------TT-C-TT--CCTTA----TCGATA-TTTTGTCCANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNC----GT----------A----------A---------TT----AAA-GCAC-C--AGT-A-----TGAT-----GA-C-------------------------------------TA-------------------------T-----A---CT---------T-TGAA-TG--TC-A--AA---A--AA--TTGCAGA--attgttatggttaatataata
gi|21 : AA-G--A-TAATATATCT---G-A-TGC-AAA---GCA-TC--AAA--T--CGA-C-CGCT-AAA-----T------T-TT-T-A---------A--G--------TA-------T----T----------A-----T-----TTCC------A----AG--A--AA------CA-T----A-CA-G-AATCGA-C----TA--A---CAT------------A-CC---------------Cgcattgtggttaatgtca
gi|21 : -------TGTT----AAA-GTAC-C--ATC-A-----TTAT-----GA-T----A-TGC---AAAGGT----G------C-A--GA-ttgtcccctacatttttttcccannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnctgttaaagtaccatcattatgatatgcaaaggtgcagaaagtgttgcggttaatg
gi|22 : aagataatatatctgatgcaaagcatcaaatcgaccgctaaatttttaagtattatttccaagaaacatacagaatcgactaacatacccttgtcccctacatttttttcccannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnc-G--A-TTAT---TTT---G-A-TGC-AAA---GCA-TC--AAA--T--GGG-C-CGCT-AAA-----A-----------------------A--G--------C--------C----A----------A-----C---------------------G--A--AA------CA-T----A-CA-G-AAATGA-C----CT--A---CAT------------A-CC---------------C----------------C-TG--TCC------CTTTTA---TATTTC---CCCCANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--NNNN----------N----------N-------NNNN----NNN-NCG-----ATC-A-----CGAC-----GA-T----A-TGCAAAA----TGGA-G------C-A--AA-TT----T-GA--------T--------TGCTAAA---TT---------T-TAAG-GG--TG-A--AA---A--AGTTGTGCATA--ATAT-AAACA-aagtgttgcggttaatg
gi|23 : CAA-G--A-TGAT---TTT---G-A-TGC-AAA---GCA-TG--AAA--T--CGG-C-CGCT-AAA-----G------T-TT-T-A---------A--G--------TGTTATAAGC----T----------A-----T-----TTCC------A----AG--A--AA------CA-T----A-CA-G-CAACGA-C----CA--A---CAT------------A-TC---------------C----------------T-TG--TCC------CCTACA--TTATTTCA---ANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--NNNN----------N----------N-------NNNN----NNA-GTAC-C--ATC-A-----TGAT-----GA-T----A-TGC---A----gag
gi|24 : -TGC-AAA---GCA-TC--AAA--T--CGG-C-CGC--AAA-----A------A-AT-T-A---------A--A--------TATATAAG-CAAGAT----------A-----T-----TTCCA-----A----AG--A--AA------CACT----A-CA-G-AAACGACC-AATTA--A---CAT------------A-CT---------------CTATA---------------G--TCTTTTGAACCANNN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--NNNN----------N----------A-------TGTTTTAAAAA-GCAC-C--ATG-A-----CGAT-----GA-T----A-TGT---A----aaggcgcagaaagttttgcgtatgatatatgtaa
gi|25 : tgattacagatTT---G-T-TGC-AAC---GCA-TC--AAA--T--CGG-T-CGAT-AAA-----A------C-TT-T-A---------A--A--------T--------aatg
gi|26 : CAA-G--A-TCAT---TTT---G-A-TGC-AAA---GCA-TC--AAA--T--CGG-C-CGCT-AAA-----A------T-TT-T-T---------A--ATAT-----T--------C----T----------A-----T-----A---------C----AA--A--AA------CA-T----A-CG-A-AAACTA-C----CA--A---Cattgtaagctacatgtatttccaaagaaacatgcttgtcttataaatttttccannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncactataatgaggatatctgaatgaggcaaacaagattattagagttgcagaaactatatacgtgcttcaaaaatgtggttaa
gi|27 : -G--A-TAAG---TTT---G-A-T-C-AAATTAGCA-TC--AAT--A--CAT-C-C-TT-AAGTAGATA------T-TC-T-A---------A--A-----------------C----T----------A-----T-----T---------T----CG--A--AAACAGAGCA-T----A-CA-G-AAACGA-C-nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaca
gi|27 : ----------A-------TGTT----AAAAGCAC-C--ATCTA-----TGAT-----GA-C----T-TGC---A----caaatttcccttgtcccctatattttttcaaacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatgttaaaagcaccatctatgatgacttgcaa
gi|28 : gataagtttgatcaaattagcatcaatacatccttaagtagatattctaaactatttcgaaaacagagcatacagaaacgaccaaatttcccttgtcccctatattttttcaaacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn----------C----------A-------TGTT----AGA-GCACAT--GTT-A-----TGAT-----CA-T----A-TGC---A----T----G------CAA--AA-TA----T-AA--------T--------T-----A----T---------T-TGAA-TG--TC-A--GAAACA--AA--GT-CAGA--A----AAGCATT-GCA--TCTAa
gi|29 : gctttgagagggactggtctgccgataagctactcannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnA-G-AAACTA-C----CA--A---CAT------------G-GT---------------CGAGA------CA-GG-C-TG--TCT------CCAATA-GTTACTCCANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--NNNNNNNNNNNNTAC----------A-------TGTT----AAA-GCAC-C--ATC-A-----TGAT-----GA-T----A---C---A----T----G------C-A--AA-TA----TGAA--------TGCATATAAT-----A---TT---------A-TGAA-AA--TT-G--AA---A--AA-----CA-A--A-ATT--ACA-T-Gtgtaaacagaatg
gi|3 : ACAA-A--A-TAAG---TTT---G-AATGC-AA----GCAGTC--AAAA-T--CGG-CGCGCT-AAA-----A------T-TT-T-G---------A--A--------A--------A----T----------A-----T-----T---------T----TG--A--AT------TA-T----AGCA-G--AACGA-C----CA--AATCCAT------------GCCT---------------CGAGA------CGTGG-C-TG--TCTG-----CCG-TA-GTTANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--NNNN----------N----------NNNNNCTTTGTT----AAA-GCAC-C--G-C-A-----TGA------GA-TG---A-TGC---A----T----G------C-AATAA-TA----T-AA--------T--------T-----A---CT---------TGTGAA-TG--TCAA--AA---A--AA--GTGCAGA--T-CTCAAACA-T-GC
gi|30 : c---------A--A--------G--------C----T----------A-----T-----T---------TCCAAAG--A--AA------CA-T------CA-G-AAACAA-C----CAT-A---TAT------------A-CT---------------C----------------T-TG--TCC------CCTATA-TCTTTTCCANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--NN-------------------------------TGT-----AAA-GTTC-C--ATC-A-----TTAT-----GA-T----A-TGCTA-A----TGGA-G------T-A--AA-TA----T-AA--------T--------T-----G---Tttaag
gi|31 : tttaaatatcccT---------------CGAGA------CA-GG-C-TG--TCT------CCGGTA-CTTcaaagcggtgta
gi|31 : g----------A-------TGTT----AAA-GCAC-C--ATC-T-----TGAT-----GA-T------------A----T----G------C-A--AA-TA----T--A--------T--------T-----A---AT---------T-TGAA-TG--TC-A--AA---A--AA----ACAGGACA-ATTAGACA-T-GCA--TCTAcannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncaataatatgttaaagcaccatcttgatgatatgcaaatatattaatttgaatgtcaaaaaaacaggacaattagacatgcatctaagaaa
gi|35 : gtcgagacaggctgtctccggtacttcannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncaataatAACAA-G--A-AACT---TTT---G-A-TGC-AAA---GCA-TC--AAA--T--CGG---CGC--AAA--------------TT-T-A---------A--A--------T--------A----T----------T-----T-----T---------C----AA--AG-AA------CA-T----A-CA-G-AATCGA-C-AACCA--A---CGT------------agaaa
gi|36 : TTTCTAA----A-----------------------A-------TGTT----TAA-GCAC-C--A-C-A-----TGAT-----AA-T----A-TGC---AAAA-TAGA-G------C-G--AA-TA----T-AACATTGTAAT--------T-----A---TTACTTACAAAT-TGAA-TG--TC-A--AA---AA-AA--GTGCAGA--A-ATCAAACA-T-GCT--TCcttcttcgatgaaacctaaatccgccggcaaatttgcagtagagacggcctaaattgcgtttaaaatgttttaaga
gi|37 : aACAA-G--A-TAAT---TTT---G-A-TAC-AAA----CA-TC--ATA--T--CAA-T-AGCT-AAA-----A------C-TT-T-A---------ATCAAAATGT--T--------C----TAAGCTG----A-----T-----TTCCA-----A----AT--A--AA------CA-T----A-CA-G-AAACG----AA-TAGTA---CAT------------A-CT---------------TGaaattaaaacagaa
gi|38 : TTTCTAATTTAAGC-------------------------------TT----AAA-GCAC-C--ATC-AATTCATGAC-----GA-T----A-TGA---AAA--T----GGAGTAAC-A--AG-GA----T-TG--------T--------T-----AGATTT---------T-TTAA-TG--TC-A--AA---A--TG--GTGCAGA--A-ATCAAACA-T-GCA--TCtcttttctacagatatattta
gi|39 : ttga----AAA-GCAC-C--ATG-A-----CGATTGAAGAA-T----A-TGC---AAA--T----AGAA---C-A--AA-TA----T-AG--------T--------TTTT--AGGTTT---------T-TGAA-TG---C-A--AA---AAAAA--GTGCAGA--A-Aatgaaaacagaa
gi|4 : aaCAA-G--A-TGAT---TGT---G-G-TGC-AAA---GCA-TT--AAA--T--CAG-C-CGTT-AAAC----A------T-TT-T-A---------A--ATATTTTATT--------C----T----------A-----T-----TTTTA-----A----AG--A--AA------CA-T----A-AA-G-AGACGA-C-aattgtttgtggtttaaaatgtttacaaacaaaa
gi|4 : -------TGTT----AAA-GCAC-C--ATT-A-----TGAT------A-TGCAAA-TAC---A---------G------T-A--AA-TA----T-AA--------T--------TATTAGA---TT---------T-TGAA-TG--T--A--AA---A--AG--GTGCTGT--A-ACGAAACA-T-GCA--TCctatttannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntgttaaagcaccattatgatatgcaaatacagtaaatataattattagattttgaatgtaaaaaggtgctgtaacgaaacatgcatc
gi|40 : caagatgattgtggtgcaaagcattaaatcagccgttaaacattttaaatattttattctatttttaaagaaacataaagagacgacctatttannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnAACAAAG--A-TAAT---TTT---GTA-TGC-AAA---GCA-TCTAAGA--T--CGG-C-CGCT-AAA-----A------T-TG-T-G---------A--AGAAATT--T--------C----T----------A-----TTCCCAT---------A----AG--A--AA------AC-T----A-CA-G-CAA-GA-C-GA-AAT-A---CAT------------
gi|41 : aACAA-G--C-TAAT---TTT---G-A-TTC-AAA---GTA-TT--CAA--T--CGG-C-CGCA-AAA-----A------T-TC-T-A---------A--A--------C--------A----T----------------T-----T---------C----AG--A--aagaatgacccaaca
gi|42 : aaaataaatctgcAA-A--A-TAAT---TTT---T-A-TGC-AAA---G-A-TC--AAA--T--CTG-C-CGCT-AAA-----A------C-TT-A-C---------A--A--------T--------A----T----------T-----C-----T---------G----AG--C--GA------TT-TC---A-AA-G-AAACGA-C----CA--G---CAT------------A-CC---------------Cttgcatgtatttccaaggaaacacacaatatgaaacgt
gi|43 : ----AAA-GCAT-CGTATC-A-----TGAT-----GA-T----A-TGCAA-A----TCA--G------C-G--GA-TA----T-GA--------T--------TATTAGA---TT---------T-TGAA-TA--TC-C--AA---A--AA--ttatctcatatacatttttcc
gi|44 : atattttaa-G--A-TAAG---TTTT--G-A-TGC-ATA---GCA-TC--AA---T--CG--C-TACTTAAAT----A------T-TT-TGA---------A--A--------T--------A----T----------ACTT--T-----T---------T----CG--G--AG------CT-TTTCCA-AA-G-GAAC--------CA--A---CAT------------G-CT---------------CCAAA---------GG-T-TG--Ttcgcttgtttaagttgttaatatga
gi|45 : --A-TAAT---TTT---G-A-TGC-AAA---GCA-TC--AAA--T--CGG-C-CGCT-AAA-----A------T-TG-G-A---------A--GATT-----T--------C----T----------A-----T-----TCCA------A----AG--A--AA------C--T----A-CA-C-AAACGA-C-A
gi|46 : a-G--A-TAAG---TTT---G-A-TGC-AAA-----A-AC--AAA--T--CGG-C-TACT-AAAT----A------T-TT-G-A---------A--A--------T--------A----T----------A-----T-----T---------TTC--GG--A--GC------TA-T----T-TC-C-AAAGAA-C----CA--A---CAT------------G-CT---------------CAA-----------GG-T-TG--TCttacataaaatgaccaa
gi|47 : cAA-G--A-TATA---TTT---G-A-TGC-AAA---GCA-TC--AAA--T--CTG-C-CGCA-AAA-----G------T-TT-T-A---------G--A--------TATTCTAAAC----T----------A-----T-----TTCCCCC---C----AA--A--AAACC---CA-T----A-GA-G-AAACGA-C-a
gi|48 : ---TTT---G-A-TGC-AAA---GCA-TA--AAA--T--CGG-C-CGCT-AAA-----ATTAATTT-TT-T-A---------A--A--------T--------A----G----------A-----T-----TTCTTTGTCCA----AG--A--AC------CA-TGTG-A-CA-G-AAG-GA-CTAA-Ccag
gi|5 : tACAA-G--A-TAAG---TTT---G-A-TGC-AAA---GCA-TT--AAA--T--TGG-C-CGCT-NNN-----N------N-NN-N-N---------N--N--------N--------N----N----------N-----N-----N---------N----NN--N--NN------NN-N----N-NN-N-NNNNNN-N-NN-NN--N---NNN------------N-NN---------------NNNNNNNGCTCCA-GG-T-TG--TCA------CTGATA-GTTATTCCANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--NNNN----------NNNNNNNNNNAA-------CGTT----AAA-GCAC-C--ATC-A-----TGAT-----GA-T----A-TGC---A---------------------AA-TAGGG-C-AA-----------------------A---TT------------GAA-TG--TT-A--AA---A---A--GTGCAGA--A-ATCAAACA-T-GCA--TCTA
gi|50 : -G--A-TAAG---TTT---G-A-TGC-AAA---GCA-TC--AAA--T--CGG-C-TACT-AAAT----A------T-TT-G-A---------A--A--------T--------A----T----------A-----T-----T---------tgta
gi|52 : acACAA-G--A--AAA---GTT---G-A-TGC-AAA---GCA-TC--AAA--T--CGA-C-TGC--AAA-----AGG----T-TTAT-A---------A--A--------T--------A----T----------T-----T-----T---------A----AG--ttcggagctatttccaaagaaccaacatgc
gi|53 : tC---A----T----G------C-A--A--TA----T-AA--------T--------T-----T---TA---------T-TG-A-TGTTTC-A--AA---A--AA---TACAGA--A-ATCAGAAA-T-GCGATTCTActtcttccaaagaaacac
gi|54 : cattaatACAA-G--AGTAA----TTT---G-A-TGC-AAA---GAA-TC--AAA--T--CGGCC-CGCT---A-----C------T-TC-T-A---------A---------------------------------------------------------------AG--A--A--------A-T----A-CA-G-AGACAA-C-ggtaaac
gi|55 : tatgt----T-AA--------T--------T-----A---TTACTTACAAAT-TGAA-TG--TC-A--AA---A--AA--GTGCAGA--A-ATCAAACA-T-GCT--TCc
gi|56 : ACAA-G--A-TAAG--------------GC-AAA---GCA-TC--AAA--T--CGA-C-CGCT-AAA-----A-----------T-G---------A--ATAT-----T--------C----T----------A-----T-----TTCCA-----A----AG--A--AA------CA-T----A-Caaattaaaca
gi|58 : ACCA-A--A-TAAT---TTT---G-A-TGC-AAA---ACA-TA--ATC--T--CGA-C-CGCT-AAA-----A------T-TT-
gi|59 : tatagAA-GTAC-C--ATC-A-----TGAT-----GA-T----A-TGC---A----a
gi|6 : CAA-G--A-TAAG---TTT---G-A-TGC-AAA---GCA-TC--AAG--T--CGG-C-CGCT-NNN-----N------N-NN-N-N---------N--N--------N--------N----N----------N-----N-----N---------N----NN--N--NN------NN-N----N-NN-N-NNNNNN-N-NN-NN--N---NNN------------N-NNNNNNNNNNNNNNGGCCGAGA------CA-GG-C-TG--TCT------CCGATA-GTTACTCCATGCCCTAGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--NNNN----------N----------N-------NNNN----NNN-NNNN-N--N-C-A-----TAAT---------------T-C---A----T----G------C-A--AA-TA----T-AA--------T--------T-----A---TT---------T-TGAA-TG--T--A--AA---A--AA--ATGCAGA--A-ATCAAACA-T-GCA--TCTAaaggtgcggaaagtgttgcaa
gi|60 : AACAA-G--A-AAAG---TTT---G-A-TGC-AAA---GCA-TT--AAA--T--CGG-C-CGC--AAA-----agtaaa
gi|61 : CAA-G--A-TGAT---TTT---G-A-TGC-AAA---GCA-TC--AAA--T--CGG-C-CGCT-AA
gi|62 : AA-G--A-TAAT---TTT---G-A-TGC-AAA---GCA-TC--AAA--T--CGG-C-CGCT-AA
gi|63 : ACAA-G--G-TAA----TTT---G-A-TGC-AAA---GCA-TC--AAA--T--CGG-C-CGC
gi|64 : ACAA-G--A-TAAT---TTT---G-A-CAC-AAA---GCA-TC--AAA--T--CGA-C-CGCa
gi|65 : A-G--A-TAAT---TTT---G-A-TGC-AAA---GCA-TC--AAA--C--CGG-T-CGC
gi|66 : cacACAA-G--A-TAAT---TTT---G-A-TGC-AA------A-TC--AAA--T--CGG-C-CGCT-AA
gi|67 : CAA-G--A-TAAT---TTT---G-A-TGC-AAA---TCA-TC--AAA--T--CGG-C-CGC
gi|68 : ACAA-G--A-AAAT---TTT---G-A-TGC-AAA---GCA-TC--AAA--T--CGG-C-CG
gi|69 : -TAAG---TTT---G-A-TGT-AAA---GCA-TG--GAA--T--CGG-C-CG
gi|7 : AACAA-G--A-TAAG---TTT---G-A-TGC-AAA---GCA-TC--AAA--T--CAG-C-CGCT-NNN-----N------N-NN-N-N---------N--N--------N--------N----N----------N-----N-----N---------N----NN--N--NN------NN-N----N-NN-N-NNNNNN-N-NN-NN--N---NNNNNNNNNNNNN--G-CT---------------CGAGA------CG-GG-C-TG--TCT------CCGATA-GTCACTCCANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--NNNN----------C----------A-------TGTT----AAA-GCAC-C--GTC-A-----TGAT-----GA-T----A-TGC---A----T----G------C-A--AA-TA----T-AA--------T--------T-----A---TT---------T-TGAA-TG--CC-A--AA---A--AA--GTGCAGA--A-ATCAAACA-T-GCA--TCTAat
gi|8 : ACAA-G--A-AAAG---TTT---G-A-TGC-AAA---GCA-TC--
gi|8 : tac----AAA-GCAC-C--GTG-A-----CGAT-----GA-T----A-TGCAA-A----T----GGAA---C-A--AA-TA----T-AG--------T--------TATTAGA---TT---------T-TGAA-TG--TC-AACAA---A--AA--GTGCAGA--A-Annnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnttgaggattgatcaaccttaaggcaaattgcagaagagacgctaaattgcgtttaaaatatttttaaaagcaccgtgacgatgatatgcaaatggaacaaatatagttattagattttgaatgtcaacaaaaagtgcagaaaattgttgtggttaatgtaaacag
gi|9 : tacacaagaaaagtttgatgcaaagcatcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnttgaggattgatcaaccttaaggcaaattgcagaagagacgctaaattgcgtttaaaatatttttaAACAA-G--A-AAAG---TTT---G-A-TGC-AAT---GCA-TC--AAA--T--CGG-C-CGC--AAA-----attgttgtggttaatgtaaacag
gi|9 : ----AAA-GCAC-C--ATG-A-----CGAT-----AA-T----A-TGA---AAA--T----GGAA---C-A--AA--A----T-AG--------T--------T-----A---TTAGATT----T-TGAA-TG--TC-A--AA---A--AA--GTGCAGA--A-Annnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnactcttttgaaccannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntgttttaaaaagcaccatgacgataatatgaaaatggaacaaaatagttattagattttgaatgtcaaaaaagtgcagaaaattgttgtggataatgtaaacag
6 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|32 ): AATTANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
Unaligned ( gi|33 ): TNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNATAGGCNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
Unaligned ( gi|34 ): ATTANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
Unaligned ( gi|49 ): CTAACATGTTGAAGTGCCATTATGATGCTAAGCGAATGAAGCAAGTACGATTACTAGATCCAAACATACTTCAGAAACGTGGTTAA
Unaligned ( gi|51 ): AANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGCTCCAGGTTGTCATAGTTATTCCAC
Unaligned ( gi|57 ): TCATATATTATGCAAAGGTGCAGACAGGTGAAGAAAGTTTTGCGGTTAATGTAAACAG
Alignments
lowQualScore : 666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666 33333333333333333333333333333333333333333333333333333333 111111 88888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888 33333333333333333333 22222222222222222222222222222222222222
lowQualScore : 1 11 0 4444 222 0 0 0 222 0 11 11 11 0 0 3333333 77777777777777 1 444444444 22 888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888 22 33 777777 1 222 1 33333333 3333 6666666 111 1 1 2222 33 222 77777777777777777777777777777777777777777777777777777777 22 000000 33 1 1 66666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666 5555 2 2 11 1 33333 33333 1 3333 2 55555555555555555555 1 11 2 6666 1 66666666666666666666666666666666666666 1 1 22 1 22 222 44 33 22 1 1 2 33
lowQualScore : . .. . .... ... . . . ... . .. .. .. . . ....... .............. . ......... .. ............................................................ .. .. ...... . ... . ........ .... ....... ... . . .... .. ... ........................................................ .. ...... .. . . ............................................................................................ .... . . .. . ..... ..... . .... . .................... . .. . .... . ...................................... . . .. . .. ... .. .. .. . . . ..
lowQualScore : 0 22 9 1111 222 8 8 8 888 8 99 99 11 8 8 0000000 88888888888888 0 111111111 44 111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 44 55 555555 1 999 1 99999999 5555 2222222 999 1 1 5555 00 333 99999999999999999999999999999999999999999999999999999999 55 555555 11 1 8 00000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 5555 4 4 77 2 00000 00000 2 8888 4 11111111111111111111 3 88 7 7777 4 88888888888888888888888888888888888888 4 4 00 4 00 555 88 99 00 5 9 0 77
consensus : AACAA-G--A-TAAN---TTT---G-A-TGC-AAA---GCA-TC--AAA--T--CGG-C-CGCT-------AAA-----A------T-TT-TA---------A--A--------T--------C----T----------A-----T-----T---------N----AG--A--AA------CA-T---A-C--------A----G-------AA---ACG-A-CC----A--A---CAT--------------G-CT--------CGAGA--------CG-GG-C----------TG--TCT------CCGATA-GTTACTCCACGCCCNANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTTTCTAAC--AAGT----------C----------A-------TGTT----AAA-GCAC-C--ATC-A-----TGAT-----GA-T----A-TGC---A----T----G------C-A--AA-TA----T-AA--------T--------T-----A---TT---------T-TGAA-TG--TC-A--AA---A--AA--GTGCAGA--A-ATCAAACA-T-GCA--TCTA
Reference ( family-850 ) : AACAA-G--A-TAAN---TTT---G-A-TGC-AAA---GCA-TC--AAA--T--CGG-C-CGCT-------AAA-----A------T-TT-TA---------A--A--------T--------C----T----------A-----T-----T---------N----AG--A--AA------CA-T---A-C--------A----G-------AA---ACG-A-CC----A--A---CAT--------------G-CT--------CGAGA--------CG-GG-C----------TG--TCT------CCGATA-GTTACTCCACGCCCNANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTTTCTAAC--AAGT----------C----------A-------TGTT----AAA-GCAC-C--ATC-A-----TGAT-----GA-T----A-TGC---A----T----G------C-A--AA-TA----T-AA--------T--------T-----A---TT---------T-TGAA-TG--TC-A--AA---A--AA--GTGCAGA--A-ATCAAACA-T-GCA--TCTA
gi|1 : AACAA-AGCA-TAAG---TTTTGTG-A-TGCTAAA---GCA-TCC-AAA--TTTCGT-C-CGCT-------AAA-----A------T-TT-TA---------A--A--------T--------C----C----------A-----C-----A---------A----AG--A--AA------CA-T---A-C--------A----GA------AA---ACG-ACCC----G--A---CAT--------------G-CT--------TAAGA--------CG-GGCC----------TGCCTCT------CCGATA-GTTTCTCCACGCCC
gi|1 : aacaaagTT----AAATGCACAC--GTC-------TGAT-----CAGT----A-TGC---A----T----G------C-A--AA-TAA---T-AA--------A--------T-----A---TT---------T-TGAAATG--TC-A--AA---A--TGTTGTGCAGA--A-ATCAAACA-T-gttctacgttgaaatccaaatttcccatgcttccaggcatttccctcttctcctcaagcgatcctctcaagaactgtcttcttctatcactattatttaaatgcacacgtctgatcagtatgcatgcaaataataaatattttgaaatgtcaaaatgttgtgcagaaatcaaacatag
gi|10 : aacaaagaacaaagcataagttttgtgatgctaaagcatccaaatttcgtccgctaaaattttaaatccacaaagaaacatacagaaaacgacccgacatgcttaagacgggcctgcctctccgatagtttctccacgcccgttctacgttgaaatccaaatttcccatgcttccaggcatttccctcttctcctcaagcgatcctctcaagaactgtcttcttctatcactattat-G--A-TGAG---TTT---G---TTC-AAA---GCT-TC--AAA--T--CGG-C-CTCT-------AAA-----A------T-TT-GA---------A--A----------------------T----------A-----T-----T---------C----TG--A--GA------TA-T---ag
gi|10 : A-GCAC-C--CTT-A-----TGAT-----GA-T----A-TGCTA-A----T----GAAG---C-A--AA-TA----C-GA--------T--------T-----A---TTAGA------T-TAGA-T----------------------TGCAGA--A-ACCAAACA-T-Gtgccaaagaaatatcaaatcaatctttcaaacagaaactaccgacatgtatcctttaaggtcccctttatcttttccacgcacttcctaaatccgttcatgctttaaggcaaatgctaaatgcagtagcacccttatgatgatatgctaatgaagcaaatacgattattagattagattgcagaaaccaaacatgtctcagaaacgtgttcaa
gi|11 : gatgagtttgttcaaagcttcaaatcggcctctaaaatttgaaatattctgagatattgccaaagaaatatcaaatcaatctttcaaacagaaactaccgacatgtatcctttaaggtcccctttatcttttccacgcacttcctaaatccgttcatgctttaaggcaaatgctaaatgcagt-TAAG---TTT---G-A-TGC-AA----GCA-TC--AAA--T--CAG-C-CGTN-------NNN-----N------N-NN-NN---------N--N--------N--------N----N----------N-----N-----N---------N----NN--N--NN------NN-N---N-N--------N----N-------NN---NNN-N-NN----N--N---NNN--------------N-NNNNNNNNNCCGA-A--------CG-GA-C----------TG--TCT------CC-ATA-GTCG-TCCANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--NN------------C----------A-------TTTT----AAA-GCAC-C--GTT-------TGAT-----GA-T----AGTGC--------T----G------C-A--AAATA----T-AA--------TG-------T-----A---TT---------T-TGAA-TG--T-----AA---A--AA--GTGCTGA--A-ATCAAA-A-T-GCA--tctcagaaacgtgttcaa
gi|12 : ttCAA-G--A-TGAG---TTT---G-A-TGC-AAA---GCA-TC--AAA--T--CGG-C-CGCT-------NNN-----N------N-NN-NN---------N--N--------N--------N----N----------N-----N-----N---------N----NN--N--NN------NN-N---N-N--------N----N-------NN---NNN-N-NN----N--N---NNNNNNNNNNNNNNNNNG-CT--------CGAGA--------CG-GG-C----------TG--TCT------CCGATA-GTTACTCCACGCgtaagttta
gi|12 : A----T-AG--------T--------TC----A---TT---------T-TAAA-TG--TC-A--AA---AA-AA--GTGCAGA--A-ATCAAACA-T-GCA--TCTAnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncatagttcattttaaatgtcaaaaaaagtgcagaaatcaaacatgcatctaag
gi|13 : caagatgagtttgatgcaaagcatcaaatcggccgctnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngctcgagacgggctgtctccgatagttactccacgcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnc--A-TATG---TTT---G-A-TGC-AAA---GCA-TC--AAAAGT--CGG-C-CGCT-------AAA-----A------T-TT--A---------A--A--------TATT-----C----TGAATTATTTCA-----T-----T---------T----AG--A--AA------CA-T---A-C--------A----G-------AA---TCG-A-CC----A--A---CAT--------------G-CT--------TGAGA--------CG-GG-T----------TG--TCT------CCGATA-GTTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--NNNN----------N----------N-------CAT------AA-G--------TC-A-----TG-C-----AA-T----A-T------------------------A--AT-TA----T-------------------------------T---------T-TGAA-TG--TC----AA---A--AA--GTACAGA--A-ATC-AACA-T-GCA--TCTAag
gi|14 : ACAA-G--A-CAAG---TTC---G-A-TGC-AGA---GCA-TC--AAA--T--CGG-C-CGCT-------AAA-----A------AATT-TA---------A--A--------T--------A----T----------T-----G-----T---------A----AG--C--TG------TT-T---C-C--------A----A-------AT---A-G-A-CC----A--A---CAT--------------G-CC--------CAAG-------------G-T----------TG--CC-------CCGATA-GTTATCCCANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--NNNN----------NNNNN------A-------TGTT----AAT-TCAC-C--ATC-A-----TGAT-----AA------A-TAG---A---------G------C-A--AA-TA----T-AA--------T--------T-----A---TTACATT----T-TGAA-TG--TC-A--AC---A--AA--GTGCAG---G-ATCAggtaaa
gi|15 : -------AAA-----A------T-TT-TA---------A--A--------TAAT-----C----TGAATTA----A-----T-----T---------CCAA-AG--A--AA------CT-T---A-C--------AA---G-------AA---ACG---CC----A--A---CAT--------------T-GT--------CGAGA--------CA-GG-C----------TG--TCT------CCGGTA-CTT
gi|15 : a----------A-------TGTT----AAA-GCAC-C--ATC-T-----TGAT-----GA-T----A-TGC----------------------A--AA-TA----T-AA--------T--------T-----A---AT---------T-TGAA-TG--TC-A--AA---A--AA--A-GCAGA--A-ATT-AACA-T-GCA--TCTAcannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncaataatatgttaaagcaccatcttgatgatatgcaaatataattaatttgaatgtcaaaaaaagcagaaattaacatgcatctaagtaa
gi|16 : aaaaattttaaataatctgaattaattccaaagaaacttacaagaaacgccaacattgtcgagacaggctgtctccggtacttcannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncaataat--------T--------C----C----------A-----T-----T---------T----AGT-AT-AA------CA-T---A-C--------A----G-------AA---TCG-A-CC----A--A---CAT--------------G-TTTT------CGAGAG-------CG-GG-C----------TG--GTC------CCGAAAAGCTACTCCACGTCCNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--NNNN----------N----------N-------NNNN----NNN-NNNN-N--NNN-N-----NNNT-----CA-T----A--GT---A----TCATGG------C-A--AAATA----T-AA--------T--------T-----A---TT---------T-TGAA-TG--TC-A--AA---A--AA--GTGCAGA--A-ATCAAACA-TGGCA--TCTAagtaa
gi|17 : aaagttttgattattctgaattattAA-G--A-TAAT---TTT---G-A-TGG-AAA---GCA-TC--AAA--T--GGG-C-GTTT-------AAA-----A------T-TT-TATGTATTCTTA--A--------T--------C----T----------AAGCTCT-----TTCC------A----AG--A--AA------CA-T---A-C--------A----G-------AA---ACT-A-TT----A--A---CAT--------------ACCT--------TGTCC--------CC-TG-CA---------TG--TTT------CCCA-N-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--NNGT----------A----------A-------TATT----AAA-GTAC-C--ATT-A-----TGAT-----GA-T----A-TGC---AAAAGT----G------C-A--GA-
gi|18 : ACAA-G--A-TAAG---TTT---G-A-TGC-AAA---GCA-TC--AAA--T--CGG-C-CGCT-------AAA-----A------T-TT-TA---------A--A--------T--------C----C----------A---------------------A----AG--A--AA------CA-T---A-C--------A----G-------AA---ACG-A-CC----A--A---CAT--------------G-TT--------CAAGA--------CA---------------TG--T-T------CCGATA-GTTTCTCCACGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTTTCTAAC--AAGT-------------------------------TT----AAA-GCAC-C--GTC-A-----TGAT-----CA-T----ATTGC---A----T----G------C-A--AA-CA----T-AA--------T--------T-----A---TT---------T---GA-TG--TC-A--AA---A--AA--GTGCAAA--A-TTCAAACA-T-Gaagtgttgcagttaa
gi|19 : c-TAAG---TTT---G-A-TTC-AAATTAGCA-TC--ATA--T--CGA-T-CGCT-------AAA-----A------G-TT-TA---------G--A--------TATTCTAAAC----T----------A-----T-----T---------T----CG--A--AACAGAG-CA-T---A-C--------A----G-------AA---ACG-A-CC----A--A---g
gi|19 : GT----------T----------A-------CGGT----AAA-GCAC-C--ATT-A-----TGAT-----GA----------C---T----T----G------C-A--AA-Tattatccttgtcccctatattttttcaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatgttacggtaaagcaccattatgatgacttgcaaatggagccaatgtaacgttaa
gi|2 : taagtttgattcaaattagcatcatatcgatcgctaaaagtttagatattctaaactatttcgaaacagagcatacagaaacgaccaaattatccttgtcccctatattttttcaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatAATAA-G--A-CAAG---TTT---G-A-AGC-AAA---GCA-CT--AAA--T--TGG-C-CGCA-------AAA-----A------A-TT-AA---------AT-A--------T--------T----T----------A-----TAAG--T---------A----AG--A--TA------CA-T---A-ggagccaatgtaacgttaa
gi|2 : tgta----------A-------TGTTTTAAAGA-GCAC-C--ATG-A-----TGAT-----GA-T----A-TAC---AAA--T----G------G-A--AA-TAGTTAT-AA--------G--------------A---TT---------T-TAAA-TG--TC-A--AA---A--AA--GTGCAGA--A-Aagttggatgtatttccaaataaacgactaatatgcaattttttgaaccannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatgttttaaagagcaccatgatgatgatatacaaatggaaatagttataagattttaaatgtcaaaaaagtgcagaaaattgttatggttaatataata
gi|20 : tgtaaataagacaagtttgaagcaaagcactaaattggccgcaaaaaattaaatatttataagtaagatacataagttggatgtatttccaaataaacgactaatatgcaattttttgaaccannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnCAA-G--A-TAAT---TTT---G-A-TGC-AAA---GCA-TC--AAA--T--CGA-C-CGCT-------AAA-----AT-----T-TT-TA---------A--G--------T--------A----T----------G-----C-----T---------A----AGCTACTAA------TA-T---A-C--------A----G-------AA---ATG-A-CC----A--A---CAT--------------A-TT--------C---------------TT-C----------TT--CCTTA----TCGATA-TTTTGTCCANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNC----GT----------A----------A---------TT----AAA-GCAC-C--AGT-A-----TGAT-----GA-C-------------------------------------TA-------------------------T-----A---CT---------T-TGAA-TG--TC-A--AA---A--AA--TTGCAGA--attgttatggttaatataata
gi|21 : AA-G--A-TAATATATCT---G-A-TGC-AAA---GCA-TC--AAA--T--CGA-C-CGCT-------AAA-----T------T-TT-TA---------A--G--------TA-------T----T----------A-----T-----TTCC------A----AG--A--AA------CA-T---A-C--------A----G-------AA---TCG-A-CT----A--A---CAT--------------A-CC--------Cgcattgtggttaatgtca
gi|21 : -------TGTT----AAA-GTAC-C--ATC-A-----TTAT-----GA-T----A-TGC---AAAGGT----G------C-A--GA-ttgtcccctacatttttttcccannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnctgttaaagtaccatcattatgatatgcaaaggtgcagaaagtgttgcggttaatg
gi|22 : aagataatatatctgatgcaaagcatcaaatcgaccgctaaatttttaagtattatttccaagaaacatacagaatcgactaacatacccttgtcccctacatttttttcccannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnc-G--A-TTAT---TTT---G-A-TGC-AAA---GCA-TC--AAA--T--GGG-C-CGCT-------AAA-----A----------------------A--G--------C--------C----A----------A-----C---------------------G--A--AA------CA-T---A-C--------A----G-------AA---ATG-A-CC----T--A---CAT--------------A-CC--------C------------------C----------TG--TCC------CTTTTA---TATTTC---CCCCANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--NNNN----------N----------N-------NNNN----NNN-NCG-----ATC-A-----CGAC-----GA-T----A-TGCAAAA----TGGA-G------C-A--AA-TT----T-GA--------T--------TGCTAAA---TT---------T-TAAG-GG--TG-A--AA---A--AGTTGTGCATA--ATAT-AAACA-aagtgttgcggttaatg
gi|23 : CAA-G--A-TGAT---TTT---G-A-TGC-AAA---GCA-TG--AAA--T--CGG-C-CGCT-------AAA-----G------T-TT-TA---------A--G--------TGTTATAAGC----T----------A-----T-----TTCC------A----AG--A--AA------CA-T---A-C--------A----G-------CA---ACG-A-CC----A--A---CAT--------------A-TC--------C------------------T----------TG--TCC------CCTACA--TTATTTCA---ANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--NNNN----------N----------N-------NNNN----NNA-GTAC-C--ATC-A-----TGAT-----GA-T----A-TGC---A----gag
gi|24 : -TGC-AAA---GCA-TC--AAA--T--CGG-C-CGC--------AAA-----A------A-AT-TA---------A--A--------TATATAAG-CAAGAT----------A-----T-----TTCCA-----A----AG--A--AA------CACT---A-C--------A----G-------AA---ACG-A-CCAATTA--A---CAT--------------A-CT--------CTATA--------------------------G--TCTTTTGAACCANNN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--NNNN----------N----------A-------TGTTTTAAAAA-GCAC-C--ATG-A-----CGAT-----GA-T----A-TGT---A----aaggcgcagaaagttttgcgtatgatatatgtaa
gi|25 : tgattacagatTT---G-T-TGC-AAC---GCA-TC--AAA--T--CGG-T-CGAT-------AAA-----A------C-TT-TA---------A--A--------T--------A----T----------T-----G-----T---------A----AG--C--TA------CA-T---G-T--------ATTTCC-------AA---A-G-A-------A--A---CAT--------------G-CT--------TGaatg
gi|26 : CAA-G--A-TCAT---TTT---G-A-TGC-AAA---GCA-TC--AAA--T--CGG-C-CGCT-------AAA-----A------T-TT-TT---------A--ATAT-----T--------C----T----------A-----T-----A---------C----AA--A--AA------CA-T---A-C--------G----A-------AA---ACT-A-CC----A--A---Ctcttataaatttttccannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncactataatgaggatatctgaatgaggcaaacaagattattagagttgcagaaactatatacgtgcttcaaaaatgtggttaa
gi|27 : -G--A-TAAG---TTT---G-A-T-C-AAATTAGCA-TC--AAT--A--CAT-C-C-TT-------AAGTAGATA------T-TC-TA---------A--A-----------------C----T----------A-----T-----T---------T----CG--A--AAACAGAGCA-T---A-C--------A----G-------AA---ACG-A-CC----A--A---nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaca
gi|27 : ----------A-------TGTT----AAAAGCAC-C--ATCTA-----TGAT-----GA-C----T-TGC---A----atttcccttgtcccctatattttttcaaacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatgttaaaagcaccatctatgatgacttgcaa
gi|28 : gataagtttgatcaaattagcatcaatacatccttaagtagatattctaaactatttcgaaaacagagcatacagaaacgaccaaatttcccttgtcccctatattttttcaaacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn----------C----------A-------TGTT----AGA-GCACAT--GTT-A-----TGAT-----CA-T----A-TGC---A----T----G------CAA--AA-TA----T-AA--------T--------T-----A----T---------T-TGAA-TG--TC-A--GAAACA--AA--GT-CAGA--A----AAGCATT-GCA--TCTAa
gi|29 : gctttgagagggactggtctgccgataagctactcannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn--------A----G-------AA---ACT-A-CC----A--A---CAT--------------G-GT--------CGAGA--------CA-GG-C----------TG--TCT------CCAATA-GTTACTCCANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--NNNNNNNNNNNNTAC----------A-------TGTT----AAA-GCAC-C--ATC-A-----TGAT-----GA-T----A---C---A----T----G------C-A--AA-TA----TGAA--------TGCATATAAT-----A---TT---------A-TGAA-AA--TT-G--AA---A--AA-----CA-A--A-ATT--ACA-T-Gtgtaaacagaatg
gi|3 : ACAA-A--A-TAAG---TTT---G-AATGC-AA----GCAGTC--AAAA-T--CGG-CGCGCT-------AAA-----A------T-TT-TG---------A--A--------A--------A----T----------A-----T-----T---------T----TG--A--AT------TA-T---AGC--------A----G--------A---ACG-A-CC----A--AATCCAT--------------GCCT--------CGAGA--------CGTGG-C----------TG--TCTG-----CCG-TA-GTTANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--NNNN----------N----------NNNNNCTTTGTT----AAA-GCAC-C--G-C-A-----TGA------GA-TG---A-TGC---A----T----G------C-AATAA-TA----T-AA--------T--------T-----A---CT---------TGTGAA-TG--TCAA--AA---A--AA--GTGCAGA--T-CTCAAACA-T-GC
gi|30 : c---------A--A--------G--------C----T----------A-----T-----T---------TCCAAAG--A--AA------CA-T-----C--------A----G-------AA---ACA-A-CC----AT-A---TAT--------------A-CT--------C------------------T----------TG--TCC------CCTATA-TCTTTTCCANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--NN-------------------------------TGT-----AAA-GTTC-C--ATC-A-----TTAT-----GA-T----A-TGCTA-A----TGGA-G------T-A--AA-TA----T-AA--------T--------T-----G---Tttaag
gi|31 : tttaaatatcccT--------CGAGA--------CA-GG-C----------TG--TCT------CCGGTA-CTTcaaagcggtgta
gi|31 : g----------A-------TGTT----AAA-GCAC-C--ATC-T-----TGAT-----GA-T------------A----T----G------C-A--AA-TA----T--A--------T--------T-----A---AT---------T-TGAA-TG--TC-A--AA---A--AA----ACAGGACA-ATTAGACA-T-GCA--TCTAcannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncaataatatgttaaagcaccatcttgatgatatgcaaatatattaatttgaatgtcaaaaaaacaggacaattagacatgcatctaagaaa
gi|35 : gtcgagacaggctgtctccggtacttcannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncaataatAACAA-G--A-AACT---TTT---G-A-TGC-AAA---GCA-TC--AAA--T--CGG---CGC--------AAA--------------TT-TA---------A--A--------T--------A----T----------T-----T-----T---------C----AA--AG-AA------CA-T---A-C--------A----G-------AATCGACA-A-CC----A--A---CGT--------------agaaa
gi|36 : TTTCTAA----A-----------------------A-------TGTT----TAA-GCAC-C--A-C-A-----TGAT-----AA-T----A-TGC---AAAA-TAGA-G------C-G--AA-TA----T-AACATTGTAAT--------T-----A---TTACTTACAAAT-TGAA-TG--TC-A--AA---AA-AA--GTGCAGA--A-ATCAAACA-T-GCT--TCcttcttcgatgaaacctaaatccgccggcaaatttgcagtagagacggcctaaattgcgtttaaaatgttttaaga
gi|37 : aACAA-G--A-TAAT---TTT---G-A-TAC-AAA----CA-TC--ATA--T--CAA-T-AGCT-------AAA-----A------C-TT-TA---------ATCAAAATGT--T--------C----TAAGCTG----A-----T-----TTCCA-----A----AT--A--AA------CA-T---A-C--------A----G-------AA---ACG-A-AT----AGTA---CAT--------------A-CT--------TGaaattaaaacagaa
gi|38 : TTTCTAATTTAAGC-------------------------------TT----AAA-GCAC-C--ATC-AATTCATGAC-----GA-T----A-TGA---AAA--T----GGAGTAAC-A--AG-GA----T-TG--------T--------T-----AGATTT---------T-TTAA-TG--TC-A--AA---A--TG--GTGCAGA--A-ATCAAACA-T-GCA--TCtcttttctacagatatattta
gi|39 : ttga----AAA-GCAC-C--ATG-A-----CGATTGAAGAA-T----A-TGC---AAA--T----AGAA---C-A--AA-TA----T-AG--------T--------TTTT--AGGTTT---------T-TGAA-TG---C-A--AA---AAAAA--GTGCAGA--A-Aatgaaaacagaa
gi|4 : aaCAA-G--A-TGAT---TGT---G-G-TGC-AAA---GCA-TT--AAA--T--CAG-C-CGTT-------AAAC----A------T-TT-TA---------A--ATATTTTATT--------C----T----------A-----T-----TTTTA-----A----AG--A--AA------CA-T---A-A--------A----G-------AG---ACG-A-CC----aattgtttgtggtttaaaatgtttacaaacaaaa
gi|4 : -------TGTT----AAA-GCAC-C--ATT-A-----TGAT------A-TGCAAA-TAC---A---------G------T-A--AA-TA----T-AA--------T--------TATTAGA---TT---------T-TGAA-TG--T--A--AA---A--AG--GTGCTGT--A-ACGAAACA-T-GCA--TCtatttannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntgttaaagcaccattatgatatgcaaatacagtaaatataattattagattttgaatgtaaaaaggtgctgtaacgaaacatgcatc
gi|40 : caagatgattgtggtgcaaagcattaaatcagccgttaaacattttaaatattttattctatttttaaagaaacataaagagacgacctatttannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnAACAAAG--A-TAAT---TTT---GTA-TGC-AAA---GCA-TCTAAGA--T--CGG-C-CGCT-------AAA-----A------T-TG-TG---------A--AGAAATT--T--------C----T----------A-----TTCCCAT---------A----AG--A--AA------AC-T---A-C--------A----GCA-----AG---ACG-A-
gi|41 : aACAA-G--C-TAAT---TTT---G-A-TTC-AAA---GTA-TT--CAA--T--CGG-C-CGCA-------AAA-----A------T-TC-TA---------A--A--------C--------A----T----------------T-----T---------C----AG--A--aatacataagaatgacccaaca
gi|42 : aaaataaatctgcAA-A--A-TAAT---TTT---T-A-TGC-AAA---G-A-TC--AAA--T--CTG-C-CGCT-------AAA-----A------C-TT-AC---------A--A--------T--------A----T----------T-----C-----T---------G----AG--C--GA------TT-TC--A-A--------A----G-------AA---ACG-A-CC----A--G---CAT--------------A-CC--------Cttgcatgtatttccaaggaaacacacaatatgaaacgt
gi|43 : ----AAA-GCAT-CGTATC-A-----TGAT-----GA-T----A-TGCAA-A----TCA--G------C-G--GA-TA----T-GA--------T--------TATTAGA---TT---------T-TGAA-TA--TC-C--AA---A--AA--ttatctcatatacatttttcc
gi|44 : atattttaa-G--A-TAAG---TTTT--G-A-TGC-ATA---GCA-TC--AA----------T-CGCT-------A----------------CT-TA---------A--A----------------------T----------A-----T-----T---------T----TG--A--AA------TA-T---A-CTTTTTCGGA----GCTTTTCCAA---AGGAA-CC----A--A---CAT--------------G-CT--------CCAAA-----------GG-T----------TG--Ttcgcttgtttaagttgttaatatga
gi|45 : --A-TAAT---TTT---G-A-TGC-AAA---GCA-TC--AAA--T--CGG-C-CGCT-------AAA-----A------T-TG-GA---------A--GATT-----T--------C----T----------A-----T-----TCCA------A----AG--A--AA------C--T---A-C--------A----C-------AA---ACG-A-C
gi|46 : a-G--A-TAAG---TTT---G-A-TGC-AAA-----A-AC--AAA--T--CGG-C-TACT-------AAAT----A------T-TT-GA---------A--A--------T--------A----T----------ATT---T-----T---------C----GG--A--GC------TA-T---T-T--------C----C-------AA---AGA-A-CC----A--A---CAT--------------G-CT--------CAA-------------GG-T----------TG--TCattacataaaatgaccaa
gi|47 : cAA-G--A-TATA---TTT---G-A-TGC-AAA---GCA-TC--AAA--T--CTG-C-CGCA-------AAA-----G------T-TT-TA---------G--A--------TATTCTAAAC----T----------A-----T-----TTCCCCC---C----AA--A--AAACC---CA-T---A-G--------A----G-------AA---ACG-A-CC----A--a
gi|48 : ---TTT---G-A-TGC-AAA---GCA-TA--AAA--T--CGG-C-CGCT-------AAA-----ATTAATTT-TT-TA---------A--A--------T--------A----G----------A-----T-----TTCTTTGTCCA----AG--A--AC------CA-TGTGA-C--------A----G-------AA---G-G-A-CT----A--A---Cg
gi|5 : tACAA-G--A-TAAG---TTT---G-A-TGC-AAA---GCA-TT--AAA--T--TGG-C-CGCT-------NNN-----N------N-NN-NN---------N--N--------N--------N----N----------N-----N-----N---------N----NN--N--NN------NN-N---N-N--------N----N-------NN---NNN-N-NN----N--N---NNN--------------N-NN--------NNNNNNNNNGCTCCA-GG-T----------TG--TCA------CTGATA-GTTATTCCANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--NNNN----------NNNNNNNNNNAA-------CGTT----AAA-GCAC-C--ATC-A-----TGAT-----GA-T----A-TGC---A---------------------AA-TAGGG-C-AA-----------------------A---TT------------GAA-TG--TT-A--AA---A---A--GTGCAGA--A-ATCAAACA-T-GCA--TCTA
gi|50 : -G--A-TAAG---TTT---G-A-TGC-AAA---GCA-TC--AAA--T--CGG-C-TACT-------AAAT----A------T-TT-GA---------A--A--------T--------A----T----------ATT---T-----T---------C----GG--A--GC------TA-T---T-T--------C----C-------AA---AGA-A-CC----A--A---CAT--------------G-Ctgta
gi|52 : acACAA-G--A--AAA---GTT---G-A-TGC-AAA---GCA-TC--AAA--T--CGA-C-TGC--------AAA-----AGG----T-TTATA---------A--A--------T--------A----T----------T-----T-----T---------A----AG--
gi|53 : tC---A----T----G------C-A--A--TA----T-AA--------T--------T-----T---TA---------T-TG-A-TGTTTC-A--AA---A--AA---TACAGA--A-ATCAGAAA-T-GCGATTCTActtcttccaaagaaacac
gi|54 : cattaatACAA-G--AGTAA----TTT---G-A-TGC-AAA---GAA-TC--AAA--T--CGGCC-CGCT---------A-----C------T-TC-TA---------A---------------------------------------------------------------AG--A--A--------A-T---A-C--------A----G-------AG---ACA-A-CC----ggtaaac
gi|55 : tatgt----T-AA--------T--------T-----A---TTACTTACAAAT-TGAA-TG--TC-A--AA---A--AA--GTGCAGA--A-ATCAAACA-T-GCT--TC
gi|56 : ACAA-G--A-TAAG--------------GC-AAA---GCA-TC--AAA--T--CGA-C-CGCT-------AAA-----A-----------TG---------A--ATAT-----T--------C----T----------A-----T-----TTCCA-----A----AG--A--AA------CA-T---A-C--------aaattaaaca
gi|58 : ACCA-A--A-TAAT---TTT---G-A-TGC-AAA---ACA-TA--ATC--T--CGA-C-CGCT-------AAA-----A------T-TT-
gi|59 : tatagAA-GTAC-C--ATC-A-----TGAT-----GA-T----A-TGC---A----a
gi|6 : CAA-G--A-TAAG---TTT---G-A-TGC-AAA---GCA-TC--AAG--T--CGG-C-CGCTNNNNNNNNNN-----N------N-NN-NN---------N--N--------N--------N----N----------N-----N-----N---------N----NN--N--NN------NN-N---N-N--------N----N-------NN---NNN-N-NN----N--N---NNN--------------N-NN--------NNNNN--------NN-GG-CCGAGACAGGCTG--TCT------CCGATA-GTTACTCCATGCCCTA-GNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--NNNN----------N----------N-------NNNN----NNN-NNNN-N--NNC-A-----TAAT--------T--------C---A----T----G------C-A--AA-TA----T-AA--------T--------T-----A---TT---------T-TGAA-TG--T--A--AA---A--AA--ATGCAGA--A-ATCAAACA-T-GCA--TCTAaaggtgcggaaagtgttgcaa
gi|60 : AACAA-G--A-AAAG---TTT---G-A-TGC-AAA---GCA-TT--AAA--T--CGG-C-CGC--------AAA-----agtaaa
gi|61 : CAA-G--A-TGAT---TTT---G-A-TGC-AAA---GCA-TC--AAA--T--CGG-C-CGCT-------AA
gi|62 : AA-G--A-TAAT---TTT---G-A-TGC-AAA---GCA-TC--AAA--T--CGG-C-CGCT-------AA
gi|63 : ACAA-G--G-TAA----TTT---G-A-TGC-AAA---GCA-TC--AAA--T--CGG-C-CGC
gi|64 : ACAA-G--A-TAAT---TTT---G-A-CAC-AAA---GCA-TC--AAA--T--CGA-C-CGCa
gi|65 : A-G--A-TAAT---TTT---G-A-TGC-AAA---GCA-TC--AAA--C--CGG-T-CGC
gi|66 : cacACAA-G--A-TAAT---TTT---G-A-TGC-AA------A-TC--AAA--T--CGG-C-CGCT-------AA
gi|67 : CAA-G--A-TAAT---TTT---G-A-TGC-AAA---TCA-TC--AAA--T--CGG-C-CGC
gi|68 : ACAA-G--A-AAAT---TTT---G-A-TGC-AAA---GCA-TC--AAA--T--CGG-C-CG
gi|69 : -TAAG---TTT---G-A-TGT-AAA---GCA-TG--GAA--T--CGG-C-CG
gi|7 : AACAA-G--A-TAAG---TTT---G-A-TGC-AAA---GCA-TC--AAA--T--CAG-C-CGCT-------NNN-----N------N-NN-NN---------N--N--------N--------N----N----------N-----N-----N---------N----NN--N--NN------NN-N---N-N--------N----N-------NN---NNN-N-NN----N--N---NNNNNNNNNNNNNNN--G-CT--------CGAGA--------CG-GG-C----------TG--TCT------CCGATA-GTCACTCCANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--NNNN----------C----------A-------TGTT----AAA-GCAC-C--GTC-A-----TGAT-----GA-T----A-TGC---A----T----G------C-A--AA-TA----T-AA--------T--------T-----A---TT---------T-TGAA-TG--CC-A--AA---A--AA--GTGCAGA--A-ATCAAACA-T-GCA--TCTAat
gi|8 : ACAA-G--A-AAAG---TTT---G-A-TGC-AAA---GCA-TC--
gi|8 : tac----AAA-GCAC-C--GTG-A-----CGAT-----GA-T----A-TGCAA-A----T----GGAA---C-A--AA-TA----T-AG--------T--------TATTAGA---TT---------T-TGAA-TG--TC-AACAA---A--AA--GTGCAGA--A-Annnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnttgaggattgatcaaccttaaggcaaattgcagaagagacgctaaattgcgtttaaaatatttttaaaagcaccgtgacgatgatatgcaaatggaacaaatatagttattagattttgaatgtcaacaaaaagtgcagaaaattgttgtggttaatgtaaacag
gi|9 : tacacaagaaaagtttgatgcaaagcatcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnttgaggattgatcaaccttaaggcaaattgcagaagagacgctaaattgcgtttaaaatatttttaAACAA-G--A-AAAG---TTT---G-A-TGC-AAT---GCA-TC--AAA--T--CGG-C-CGC--------AAA-----attgttgtggttaatgtaaacag
gi|9 : ----AAA-GCAC-C--ATG-A-----CGAT-----AA-T----A-TGA---AAA--T----GGAA---C-A--AA--A----T-AG--------T--------T-----A---TTAGATT----T-TGAA-TG--TC-A--AA---A--AA--GTGCAGA--A-Annnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnactcttttgaaccannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntgttttaaaaagcaccatgacgataatatgaaaatggaacaaaatagttattagattttgaatgtcaaaaaagtgcagaaaattgttgtggataatgtaaacag
6 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|32 ): AATTANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
Unaligned ( gi|33 ): TNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNATAGGCNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
Unaligned ( gi|34 ): ATTANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
Unaligned ( gi|49 ): CTAACATGTTGAAGTGCCATTATGATGCTAAGCGAATGAAGCAAGTACGATTACTAGATCCAAACATACTTCAGAAACGTGGTTAA
Unaligned ( gi|51 ): AANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGCTCCAGGTTGTCATAGTTATTCCAC
Unaligned ( gi|57 ): TCATATATTATGCAAAGGTGCAGACAGGTGAAGAAAGTTTTGCGGTTAATGTAAACAG
Alignments
lowQualScore : 666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666 33333333333333333333333333333333333333333333333333333333 111111 88888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888 33333333333333333333 22222222222222222222222222222222222222
lowQualScore : 1 11 0 4444 222 0 0 0 222 0 11 11 11 0 0 3333333 77777777777777 1 444444444 22 888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888 22 33 777777 1 222 1 33333333 3333 6666666 111 1 1 2222 33 222 77777777777777777777777777777777777777777777777777777777 22 000000 33 1 1 66666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666 5555 2 2 11 1 33333 33333 1 3333 2 55555555555555555555 1 11 2 6666 1 66666666666666666666666666666666666666 1 1 22 1 22 222 44 33 22 1 1 2 33
lowQualScore : . .. . .... ... . . . ... . .. .. .. . . ....... .............. . ......... .. ............................................................ .. .. ...... . ... . ........ .... ....... ... . . .... .. ... ........................................................ .. ...... .. . . ............................................................................................ .... . . .. . ..... ..... . .... . .................... . .. . .... . ...................................... . . .. . .. ... .. .. .. . . . ..
lowQualScore : 0 22 9 1111 222 8 8 8 888 8 99 99 11 8 8 0000000 88888888888888 0 111111111 44 111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 44 55 555555 1 999 1 99999999 5555 2222222 999 1 1 5555 00 333 99999999999999999999999999999999999999999999999999999999 55 555555 11 1 8 00000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 5555 4 4 77 2 00000 00000 2 8888 4 11111111111111111111 3 88 7 7777 4 88888888888888888888888888888888888888 4 4 00 4 00 555 88 99 00 5 9 0 77
consensus : AACAA-G--A-TAAN---TTT---G-A-TGC-AAA---GCA-TC--AAA--T--CGG-C-CGCT-------AAA-----A------T-TT-TA---------A--A--------T--------C----T----------A-----T-----T---------N----AG--A--AA------CA-T---A-C--------A----G-------AA---ACG-A-CC----A--A---CAT--------------G-CT--------CGAGA--------CG-GG-C----------TG--TCT------CCGATA-GTTACTCCACGCCCNANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTTTCTAAC--AAGT----------C----------A-------TGTT----AAA-GCAC-C--ATC-A-----TGAT-----GA-T----A-TGC---A----T----G------C-A--AA-TA----T-AA--------T--------T-----A---TT---------T-TGAA-TG--TC-A--AA---A--AA--GTGCAGA--A-ATCAAACA-T-GCA--TCTA
Reference ( family-850 ) : AACAA-G--A-TAAN---TTT---G-A-TGC-AAA---GCA-TC--AAA--T--CGG-C-CGCT-------AAA-----A------T-TT-TA---------A--A--------T--------C----T----------A-----T-----T---------N----AG--A--AA------CA-T---A-C--------A----G-------AA---ACG-A-CC----A--A---CAT--------------G-CT--------CGAGA--------CG-GG-C----------TG--TCT------CCGATA-GTTACTCCACGCCCNANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTTTCTAAC--AAGT----------C----------A-------TGTT----AAA-GCAC-C--ATC-A-----TGAT-----GA-T----A-TGC---A----T----G------C-A--AA-TA----T-AA--------T--------T-----A---TT---------T-TGAA-TG--TC-A--AA---A--AA--GTGCAGA--A-ATCAAACA-T-GCA--TCTA
gi|1 : AACAA-AGCA-TAAG---TTTTGTG-A-TGCTAAA---GCA-TCC-AAA--TTTCGT-C-CGCT-------AAA-----A------T-TT-TA---------A--A--------T--------C----C----------A-----C-----A---------A----AG--A--AA------CA-T---A-C--------A----GA------AA---ACG-ACCC----G--A---CAT--------------G-CT--------TAAGA--------CG-GGCC----------TGCCTCT------CCGATA-GTTTCTCCACGCCC
gi|1 : aacaaagTT----AAATGCACAC--GTC-------TGAT-----CAGT----A-TGC---A----T----G------C-A--AA-TAA---T-AA--------A--------T-----A---TT---------T-TGAAATG--TC-A--AA---A--TGTTGTGCAGA--A-ATCAAACA-T-gttctacgttgaaatccaaatttcccatgcttccaggcatttccctcttctcctcaagcgatcctctcaagaactgtcttcttctatcactattatttaaatgcacacgtctgatcagtatgcatgcaaataataaatattttgaaatgtcaaaatgttgtgcagaaatcaaacatag
gi|10 : aacaaagaacaaagcataagttttgtgatgctaaagcatccaaatttcgtccgctaaaattttaaatccacaaagaaacatacagaaaacgacccgacatgcttaagacgggcctgcctctccgatagtttctccacgcccgttctacgttgaaatccaaatttcccatgcttccaggcatttccctcttctcctcaagcgatcctctcaagaactgtcttcttctatcactattat-G--A-TGAG---TTT---G---TTC-AAA---GCT-TC--AAA--T--CGG-C-CTCT-------AAA-----A------T-TT-GA---------A--A----------------------T----------A-----T-----T---------C----TG--A--GA------TA-T---ag
gi|10 : A-GCAC-C--CTT-A-----TGAT-----GA-T----A-TGCTA-A----T----GAAG---C-A--AA-TA----C-GA--------T--------T-----A---TTAGA------T-TAGA-T----------------------TGCAGA--A-ACCAAACA-T-Gtgccaaagaaatatcaaatcaatctttcaaacagaaactaccgacatgtatcctttaaggtcccctttatcttttccacgcacttcctaaatccgttcatgctttaaggcaaatgctaaatgcagtagcacccttatgatgatatgctaatgaagcaaatacgattattagattagattgcagaaaccaaacatgtctcagaaacgtgttcaa
gi|11 : gatgagtttgttcaaagcttcaaatcggcctctaaaatttgaaatattctgagatattgccaaagaaatatcaaatcaatctttcaaacagaaactaccgacatgtatcctttaaggtcccctttatcttttccacgcacttcctaaatccgttcatgctttaaggcaaatgctaaatgcagt-TAAG---TTT---G-A-TGC-AA----GCA-TC--AAA--T--CAG-C-CGTN-------NNN-----N------N-NN-NN---------N--N--------N--------N----N----------N-----N-----N---------N----NN--N--NN------NN-N---N-N--------N----N-------NN---NNN-N-NN----N--N---NNN--------------N-NNNNNNNNNCCGA-A--------CG-GA-C----------TG--TCT------CC-ATA-GTCG-TCCANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--NN------------C----------A-------TTTT----AAA-GCAC-C--GTT-------TGAT-----GA-T----AGTGC--------T----G------C-A--AAATA----T-AA--------TG-------T-----A---TT---------T-TGAA-TG--T-----AA---A--AA--GTGCTGA--A-ATCAAA-A-T-GCA--tctcagaaacgtgttcaa
gi|12 : ttCAA-G--A-TGAG---TTT---G-A-TGC-AAA---GCA-TC--AAA--T--CGG-C-CGCT-------NNN-----N------N-NN-NN---------N--N--------N--------N----N----------N-----N-----N---------N----NN--N--NN------NN-N---N-N--------N----N-------NN---NNN-N-NN----N--N---NNNNNNNNNNNNNNNNNG-CT--------CGAGA--------CG-GG-C----------TG--TCT------CCGATA-GTTACTCCACGCgtaagttta
gi|12 : A----T-AG--------T--------TC----A---TT---------T-TAAA-TG--TC-A--AA---AA-AA--GTGCAGA--A-ATCAAACA-T-GCA--TCTAnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncatagttcattttaaatgtcaaaaaaagtgcagaaatcaaacatgcatctaag
gi|13 : caagatgagtttgatgcaaagcatcaaatcggccgctnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngctcgagacgggctgtctccgatagttactccacgcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnc--A-TATG---TTT---G-A-TGC-AAA---GCA-TC--AAAAGT--CGG-C-CGCT-------AAA-----A------T-TT--A---------A--A--------TATT-----C----TGAATTATTTCA-----T-----T---------T----AG--A--AA------CA-T---A-C--------A----G-------AA---TCG-A-CC----A--A---CAT--------------G-CT--------TGAGA--------CG-GG-T----------TG--TCT------CCGATA-GTTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--NNNN----------N----------N-------CAT------AA-G--------TC-A-----TG-C-----AA-T----A-T------------------------A--AT-TA----T-------------------------------T---------T-TGAA-TG--TC----AA---A--AA--GTACAGA--A-ATC-AACA-T-GCA--TCTAag
gi|14 : ACAA-G--A-CAAG---TTC---G-A-TGC-AGA---GCA-TC--AAA--T--CGG-C-CGCT-------AAA-----A------AATT-TA---------A--A--------T--------A----T----------T-----G-----T---------A----AG--C--TG------TT-T---C-C--------A----A-------AT---A-G-A-CC----A--A---CAT--------------G-CC--------CAAG-------------G-T----------TG--CC-------CCGATA-GTTATCCCANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--NNNN----------NNNNN------A-------TGTT----AAT-TCAC-C--ATC-A-----TGAT-----AA------A-TAG---A---------G------C-A--AA-TA----T-AA--------T--------T-----A---TTACATT----T-TGAA-TG--TC-A--AC---A--AA--GTGCAG---G-ATCAggtaaa
gi|15 : -------AAA-----A------T-TT-TA---------A--A--------TAAT-----C----TGAATTA----A-----T-----T---------CCAA-AG--A--AA------CT-T---A-C--------AA---G-------AA---ACG---CC----A--A---CAT--------------T-GT--------CGAGA--------CA-GG-C----------TG--TCT------CCGGTA-CTT
gi|15 : a----------A-------TGTT----AAA-GCAC-C--ATC-T-----TGAT-----GA-T----A-TGC----------------------A--AA-TA----T-AA--------T--------T-----A---AT---------T-TGAA-TG--TC-A--AA---A--AA--A-GCAGA--A-ATT-AACA-T-GCA--TCTAcannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncaataatatgttaaagcaccatcttgatgatatgcaaatataattaatttgaatgtcaaaaaaagcagaaattaacatgcatctaagtaa
gi|16 : aaaaattttaaataatctgaattaattccaaagaaacttacaagaaacgccaacattgtcgagacaggctgtctccggtacttcannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncaataat--------T--------C----C----------A-----T-----T---------T----AGT-AT-AA------CA-T---A-C--------A----G-------AA---TCG-A-CC----A--A---CAT--------------G-TTTT------CGAGAG-------CG-GG-C----------TG--GTC------CCGAAAAGCTACTCCACGTCCNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--NNNN----------N----------N-------NNNN----NNN-NNNN-N--NNN-N-----NNNT-----CA-T----A--GT---A----TCATGG------C-A--AAATA----T-AA--------T--------T-----A---TT---------T-TGAA-TG--TC-A--AA---A--AA--GTGCAGA--A-ATCAAACA-TGGCA--TCTAagtaa
gi|17 : aaagttttgattattctgaattattAA-G--A-TAAT---TTT---G-A-TGG-AAA---GCA-TC--AAA--T--GGG-C-GTTT-------AAA-----A------T-TT-TATGTATTCTTA--A--------T--------C----T----------AAGCTCT-----TTCC------A----AG--A--AA------CA-T---A-C--------A----G-------AA---ACT-A-TT----A--A---CAT--------------ACCT--------TGTCC--------CC-TG-CA---------TG--TTT------CCCA-N-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--NNGT----------A----------A-------TATT----AAA-GTAC-C--ATT-A-----TGAT-----GA-T----A-TGC---AAAAGT----G------C-A--GA-
gi|18 : ACAA-G--A-TAAG---TTT---G-A-TGC-AAA---GCA-TC--AAA--T--CGG-C-CGCT-------AAA-----A------T-TT-TA---------A--A--------T--------C----C----------A---------------------A----AG--A--AA------CA-T---A-C--------A----G-------AA---ACG-A-CC----A--A---CAT--------------G-TT--------CAAGA--------CA---------------TG--T-T------CCGATA-GTTTCTCCACGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTTTCTAAC--AAGT-------------------------------TT----AAA-GCAC-C--GTC-A-----TGAT-----CA-T----ATTGC---A----T----G------C-A--AA-CA----T-AA--------T--------T-----A---TT---------T---GA-TG--TC-A--AA---A--AA--GTGCAAA--A-TTCAAACA-T-Gaagtgttgcagttaa
gi|19 : c-TAAG---TTT---G-A-TTC-AAATTAGCA-TC--ATA--T--CGA-T-CGCT-------AAA-----A------G-TT-TA---------G--A--------TATTCTAAAC----T----------A-----T-----T---------T----CG--A--AACAGAG-CA-T---A-C--------A----G-------AA---ACG-A-CC----A--A---g
gi|19 : GT----------T----------A-------CGGT----AAA-GCAC-C--ATT-A-----TGAT-----GA----------C---T----T----G------C-A--AA-Tattatccttgtcccctatattttttcaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatgttacggtaaagcaccattatgatgacttgcaaatggagccaatgtaacgttaa
gi|2 : taagtttgattcaaattagcatcatatcgatcgctaaaagtttagatattctaaactatttcgaaacagagcatacagaaacgaccaaattatccttgtcccctatattttttcaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatAATAA-G--A-CAAG---TTT---G-A-AGC-AAA---GCA-CT--AAA--T--TGG-C-CGCA-------AAA-----A------A-TT-AA---------AT-A--------T--------T----T----------A-----TAAG--T---------A----AG--A--TA------CA-T---A-ggagccaatgtaacgttaa
gi|2 : tgta----------A-------TGTTTTAAAGA-GCAC-C--ATG-A-----TGAT-----GA-T----A-TAC---AAA--T----G------G-A--AA-TAGTTAT-AA--------G--------------A---TT---------T-TAAA-TG--TC-A--AA---A--AA--GTGCAGA--A-Aagttggatgtatttccaaataaacgactaatatgcaattttttgaaccannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatgttttaaagagcaccatgatgatgatatacaaatggaaatagttataagattttaaatgtcaaaaaagtgcagaaaattgttatggttaatataata
gi|20 : tgtaaataagacaagtttgaagcaaagcactaaattggccgcaaaaaattaaatatttataagtaagatacataagttggatgtatttccaaataaacgactaatatgcaattttttgaaccannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnCAA-G--A-TAAT---TTT---G-A-TGC-AAA---GCA-TC--AAA--T--CGA-C-CGCT-------AAA-----AT-----T-TT-TA---------A--G--------T--------A----T----------G-----C-----T---------A----AGCTACTAA------TA-T---A-C--------A----G-------AA---ATG-A-CC----A--A---CAT--------------A-TT--------C---------------TT-C----------TT--CCTTA----TCGATA-TTTTGTCCANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNC----GT----------A----------A---------TT----AAA-GCAC-C--AGT-A-----TGAT-----GA-C-------------------------------------TA-------------------------T-----A---CT---------T-TGAA-TG--TC-A--AA---A--AA--TTGCAGA--attgttatggttaatataata
gi|21 : AA-G--A-TAATATATCT---G-A-TGC-AAA---GCA-TC--AAA--T--CGA-C-CGCT-------AAA-----T------T-TT-TA---------A--G--------TA-------T----T----------A-----T-----TTCC------A----AG--A--AA------CA-T---A-C--------A----G-------AA---TCG-A-CT----A--A---CAT--------------A-CC--------Cgcattgtggttaatgtca
gi|21 : -------TGTT----AAA-GTAC-C--ATC-A-----TTAT-----GA-T----A-TGC---AAAGGT----G------C-A--GA-ttgtcccctacatttttttcccannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnctgttaaagtaccatcattatgatatgcaaaggtgcagaaagtgttgcggttaatg
gi|22 : aagataatatatctgatgcaaagcatcaaatcgaccgctaaatttttaagtattatttccaagaaacatacagaatcgactaacatacccttgtcccctacatttttttcccannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnc-G--A-TTAT---TTT---G-A-TGC-AAA---GCA-TC--AAA--T--GGG-C-CGCT-------AAA-----A----------------------A--G--------C--------C----A----------A-----C---------------------G--A--AA------CA-T---A-C--------A----G-------AA---ATG-A-CC----T--A---CAT--------------A-CC--------C------------------C----------TG--TCC------CTTTTA---TATTTC---CCCCANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--NNNN----------N----------N-------NNNN----NNN-NCG-----ATC-A-----CGAC-----GA-T----A-TGCAAAA----TGGA-G------C-A--AA-TT----T-GA--------T--------TGCTAAA---TT---------T-TAAG-GG--TG-A--AA---A--AGTTGTGCATA--ATAT-AAACA-aagtgttgcggttaatg
gi|23 : CAA-G--A-TGAT---TTT---G-A-TGC-AAA---GCA-TG--AAA--T--CGG-C-CGCT-------AAA-----G------T-TT-TA---------A--G--------TGTTATAAGC----T----------A-----T-----TTCC------A----AG--A--AA------CA-T---A-C--------A----G-------CA---ACG-A-CC----A--A---CAT--------------A-TC--------C------------------T----------TG--TCC------CCTACA--TTATTTCA---ANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--NNNN----------N----------N-------NNNN----NNA-GTAC-C--ATC-A-----TGAT-----GA-T----A-TGC---A----gag
gi|24 : -TGC-AAA---GCA-TC--AAA--T--CGG-C-CGC--------AAA-----A------A-AT-TA---------A--A--------TATATAAG-CAAGAT----------A-----T-----TTCCA-----A----AG--A--AA------CACT---A-C--------A----G-------AA---ACG-A-CCAATTA--A---CAT--------------A-CT--------CTATA--------------------------G--TCTTTTGAACCANNN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--NNNN----------N----------A-------TGTTTTAAAAA-GCAC-C--ATG-A-----CGAT-----GA-T----A-TGT---A----aaggcgcagaaagttttgcgtatgatatatgtaa
gi|25 : tgattacagatTT---G-T-TGC-AAC---GCA-TC--AAA--T--CGG-T-CGAT-------AAA-----A------C-TT-TA---------A--A--------T--------A----T----------T-----G-----T---------A----AG--C--TA------CA-T---G-T--------ATTTCC-------AA---A-G-A-------A--A---CAT--------------G-CT--------TGaatg
gi|26 : CAA-G--A-TCAT---TTT---G-A-TGC-AAA---GCA-TC--AAA--T--CGG-C-CGCT-------AAA-----A------T-TT-TT---------A--ATAT-----T--------C----T----------A-----T-----A---------C----AA--A--AA------CA-T---A-C--------G----A-------AA---ACT-A-CC----A--A---Ctcttataaatttttccannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncactataatgaggatatctgaatgaggcaaacaagattattagagttgcagaaactatatacgtgcttcaaaaatgtggttaa
gi|27 : -G--A-TAAG---TTT---G-A-T-C-AAATTAGCA-TC--AAT--A--CAT-C-C-TT-------AAGTAGATA------T-TC-TA---------A--A-----------------C----T----------A-----T-----T---------T----CG--A--AAACAGAGCA-T---A-C--------A----G-------AA---ACG-A-CC----A--A---nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaca
gi|27 : ----------A-------TGTT----AAAAGCAC-C--ATCTA-----TGAT-----GA-C----T-TGC---A----atttcccttgtcccctatattttttcaaacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatgttaaaagcaccatctatgatgacttgcaa
gi|28 : gataagtttgatcaaattagcatcaatacatccttaagtagatattctaaactatttcgaaaacagagcatacagaaacgaccaaatttcccttgtcccctatattttttcaaacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn----------C----------A-------TGTT----AGA-GCACAT--GTT-A-----TGAT-----CA-T----A-TGC---A----T----G------CAA--AA-TA----T-AA--------T--------T-----A----T---------T-TGAA-TG--TC-A--GAAACA--AA--GT-CAGA--A----AAGCATT-GCA--TCTAa
gi|29 : gctttgagagggactggtctgccgataagctactcannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn--------A----G-------AA---ACT-A-CC----A--A---CAT--------------G-GT--------CGAGA--------CA-GG-C----------TG--TCT------CCAATA-GTTACTCCANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--NNNNNNNNNNNNTAC----------A-------TGTT----AAA-GCAC-C--ATC-A-----TGAT-----GA-T----A---C---A----T----G------C-A--AA-TA----TGAA--------TGCATATAAT-----A---TT---------A-TGAA-AA--TT-G--AA---A--AA-----CA-A--A-ATT--ACA-T-Gtgtaaacagaatg
gi|3 : ACAA-A--A-TAAG---TTT---G-AATGC-AA----GCAGTC--AAAA-T--CGG-CGCGCT-------AAA-----A------T-TT-TG---------A--A--------A--------A----T----------A-----T-----T---------T----TG--A--AT------TA-T---AGC--------A----G--------A---ACG-A-CC----A--AATCCAT--------------GCCT--------CGAGA--------CGTGG-C----------TG--TCTG-----CCG-TA-GTTANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--NNNN----------N----------NNNNNCTTTGTT----AAA-GCAC-C--G-C-A-----TGA------GA-TG---A-TGC---A----T----G------C-AATAA-TA----T-AA--------T--------T-----A---CT---------TGTGAA-TG--TCAA--AA---A--AA--GTGCAGA--T-CTCAAACA-T-GC
gi|30 : c---------A--A--------G--------C----T----------A-----T-----T---------TCCAAAG--A--AA------CA-T-----C--------A----G-------AA---ACA-A-CC----AT-A---TAT--------------A-CT--------C------------------T----------TG--TCC------CCTATA-TCTTTTCCANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--NN-------------------------------TGT-----AAA-GTTC-C--ATC-A-----TTAT-----GA-T----A-TGCTA-A----TGGA-G------T-A--AA-TA----T-AA--------T--------T-----G---Tttaag
gi|31 : tttaaatatcccT--------CGAGA--------CA-GG-C----------TG--TCT------CCGGTA-CTTcaaagcggtgta
gi|31 : g----------A-------TGTT----AAA-GCAC-C--ATC-T-----TGAT-----GA-T------------A----T----G------C-A--AA-TA----T--A--------T--------T-----A---AT---------T-TGAA-TG--TC-A--AA---A--AA----ACAGGACA-ATTAGACA-T-GCA--TCTAcannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncaataatatgttaaagcaccatcttgatgatatgcaaatatattaatttgaatgtcaaaaaaacaggacaattagacatgcatctaagaaa
gi|35 : gtcgagacaggctgtctccggtacttcannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncaataatAACAA-G--A-AACT---TTT---G-A-TGC-AAA---GCA-TC--AAA--T--CGG---CGC--------AAA--------------TT-TA---------A--A--------T--------A----T----------T-----T-----T---------C----AA--AG-AA------CA-T---A-C--------A----G-------AATCGACA-A-CC----A--A---CGT--------------agaaa
gi|36 : TTTCTAA----A-----------------------A-------TGTT----TAA-GCAC-C--A-C-A-----TGAT-----AA-T----A-TGC---AAAA-TAGA-G------C-G--AA-TA----T-AACATTGTAAT--------T-----A---TTACTTACAAAT-TGAA-TG--TC-A--AA---AA-AA--GTGCAGA--A-ATCAAACA-T-GCT--TCcttcttcgatgaaacctaaatccgccggcaaatttgcagtagagacggcctaaattgcgtttaaaatgttttaaga
gi|37 : aACAA-G--A-TAAT---TTT---G-A-TAC-AAA----CA-TC--ATA--T--CAA-T-AGCT-------AAA-----A------C-TT-TA---------ATCAAAATGT--T--------C----TAAGCTG----A-----T-----TTCCA-----A----AT--A--AA------CA-T---A-C--------A----G-------AA---ACG-A-AT----AGTA---CAT--------------A-CT--------TGaaattaaaacagaa
gi|38 : TTTCTAATTTAAGC-------------------------------TT----AAA-GCAC-C--ATC-AATTCATGAC-----GA-T----A-TGA---AAA--T----GGAGTAAC-A--AG-GA----T-TG--------T--------T-----AGATTT---------T-TTAA-TG--TC-A--AA---A--TG--GTGCAGA--A-ATCAAACA-T-GCA--TCtcttttctacagatatattta
gi|39 : ttga----AAA-GCAC-C--ATG-A-----CGATTGAAGAA-T----A-TGC---AAA--T----AGAA---C-A--AA-TA----T-AG--------T--------TTTT--AGGTTT---------T-TGAA-TG---C-A--AA---AAAAA--GTGCAGA--A-Aatgaaaacagaa
gi|4 : aaCAA-G--A-TGAT---TGT---G-G-TGC-AAA---GCA-TT--AAA--T--CAG-C-CGTT-------AAAC----A------T-TT-TA---------A--ATATTTTATT--------C----T----------A-----T-----TTTTA-----A----AG--A--AA------CA-T---A-A--------A----G-------AG---ACG-A-CC----aattgtttgtggtttaaaatgtttacaaacaaaa
gi|4 : -------TGTT----AAA-GCAC-C--ATT-A-----TGAT------A-TGCAAA-TAC---A---------G------T-A--AA-TA----T-AA--------T--------TATTAGA---TT---------T-TGAA-TG--T--A--AA---A--AG--GTGCTGT--A-ACGAAACA-T-GCA--TCtatttannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntgttaaagcaccattatgatatgcaaatacagtaaatataattattagattttgaatgtaaaaaggtgctgtaacgaaacatgcatc
gi|40 : caagatgattgtggtgcaaagcattaaatcagccgttaaacattttaaatattttattctatttttaaagaaacataaagagacgacctatttannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnAACAAAG--A-TAAT---TTT---GTA-TGC-AAA---GCA-TCTAAGA--T--CGG-C-CGCT-------AAA-----A------T-TG-TG---------A--AGAAATT--T--------C----T----------A-----TTCCCAT---------A----AG--A--AA------AC-T---A-C--------A----GCA-----AG---ACG-A-
gi|41 : aACAA-G--C-TAAT---TTT---G-A-TTC-AAA---GTA-TT--CAA--T--CGG-C-CGCA-------AAA-----A------T-TC-TA---------A--A--------C--------A----T----------------T-----T---------C----AG--A--aatacataagaatgacccaaca
gi|42 : aaaataaatctgcAA-A--A-TAAT---TTT---T-A-TGC-AAA---G-A-TC--AAA--T--CTG-C-CGCT-------AAA-----A------C-TT-AC---------A--A--------T--------A----T----------T-----C-----T---------G----AG--C--GA------TT-TC--A-A--------A----G-------AA---ACG-A-CC----A--G---CAT--------------A-CC--------Cttgcatgtatttccaaggaaacacacaatatgaaacgt
gi|43 : ----AAA-GCAT-CGTATC-A-----TGAT-----GA-T----A-TGCAA-A----TCA--G------C-G--GA-TA----T-GA--------T--------TATTAGA---TT---------T-TGAA-TA--TC-C--AA---A--AA--ttatctcatatacatttttcc
gi|44 : atattttaa-G--A-TAAG---TTTT--G-A-TGC-ATA---GCA-TC--AA----------T-CGCT-------A----------------CT-TA---------A--A----------------------T----------A-----T-----T---------T----TG--A--AA------TA-T---A-CTTTTTCGGA----GCTTTTCCAA---AGGAA-CC----A--A---CAT--------------G-CT--------CCAAA-----------GG-T----------TG--Ttcgcttgtttaagttgttaatatga
gi|45 : --A-TAAT---TTT---G-A-TGC-AAA---GCA-TC--AAA--T--CGG-C-CGCT-------AAA-----A------T-TG-GA---------A--GATT-----T--------C----T----------A-----T-----TCCA------A----AG--A--AA------C--T---A-C--------A----C-------AA---ACG-A-C
gi|46 : a-G--A-TAAG---TTT---G-A-TGC-AAA-----A-AC--AAA--T--CGG-C-TACT-------AAAT----A------T-TT-GA---------A--A--------T--------A----T----------ATT---T-----T---------C----GG--A--GC------TA-T---T-T--------C----C-------AA---AGA-A-CC----A--A---CAT--------------G-CT--------CAA-------------GG-T----------TG--TCattacataaaatgaccaa
gi|47 : cAA-G--A-TATA---TTT---G-A-TGC-AAA---GCA-TC--AAA--T--CTG-C-CGCA-------AAA-----G------T-TT-TA---------G--A--------TATTCTAAAC----T----------A-----T-----TTCCCCC---C----AA--A--AAACC---CA-T---A-G--------A----G-------AA---ACG-A-CC----A--a
gi|48 : ---TTT---G-A-TGC-AAA---GCA-TA--AAA--T--CGG-C-CGCT-------AAA-----ATTAATTT-TT-TA---------A--A--------T--------A----G----------A-----T-----TTCTTTGTCCA----AG--A--AC------CA-TGTGA-C--------A----G-------AA---G-G-A-CT----A--A---Cg
gi|5 : tACAA-G--A-TAAG---TTT---G-A-TGC-AAA---GCA-TT--AAA--T--TGG-C-CGCT-------NNN-----N------N-NN-NN---------N--N--------N--------N----N----------N-----N-----N---------N----NN--N--NN------NN-N---N-N--------N----N-------NN---NNN-N-NN----N--N---NNN--------------N-NN--------NNNNNNNNNGCTCCA-GG-T----------TG--TCA------CTGATA-GTTATTCCANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--NNNN----------NNNNNNNNNNAA-------CGTT----AAA-GCAC-C--ATC-A-----TGAT-----GA-T----A-TGC---A---------------------AA-TAGGG-C-AA-----------------------A---TT------------GAA-TG--TT-A--AA---A---A--GTGCAGA--A-ATCAAACA-T-GCA--TCTA
gi|50 : -G--A-TAAG---TTT---G-A-TGC-AAA---GCA-TC--AAA--T--CGG-C-TACT-------AAAT----A------T-TT-GA---------A--A--------T--------A----T----------ATT---T-----T---------C----GG--A--GC------TA-T---T-T--------C----C-------AA---AGA-A-CC----A--A---CAT--------------G-Ctgta
gi|52 : acACAA-G--A--AAA---GTT---G-A-TGC-AAA---GCA-TC--AAA--T--CGA-C-TGC--------AAA-----AGG----T-TTATA---------A--A--------T--------A----T----------T-----T-----T---------A----AG--
gi|53 : tC---A----T----G------C-A--A--TA----T-AA--------T--------T-----T---TA---------T-TG-A-TGTTTC-A--AA---A--AA---TACAGA--A-ATCAGAAA-T-GCGATTCTActtcttccaaagaaacac
gi|54 : cattaatACAA-G--AGTAA----TTT---G-A-TGC-AAA---GAA-TC--AAA--T--CGGCC-CGCT---------A-----C------T-TC-TA---------A---------------------------------------------------------------AG--A--A--------A-T---A-C--------A----G-------AG---ACA-A-CC----ggtaaac
gi|55 : tatgt----T-AA--------T--------T-----A---TTACTTACAAAT-TGAA-TG--TC-A--AA---A--AA--GTGCAGA--A-ATCAAACA-T-GCT--TC
gi|56 : ACAA-G--A-TAAG--------------GC-AAA---GCA-TC--AAA--T--CGA-C-CGCT-------AAA-----A-----------TG---------A--ATAT-----T--------C----T----------A-----T-----TTCCA-----A----AG--A--AA------CA-T---A-C--------aaattaaaca
gi|58 : ACCA-A--A-TAAT---TTT---G-A-TGC-AAA---ACA-TA--ATC--T--CGA-C-CGCT-------AAA-----A------T-TT-
gi|59 : tatagAA-GTAC-C--ATC-A-----TGAT-----GA-T----A-TGC---A----a
gi|6 : CAA-G--A-TAAG---TTT---G-A-TGC-AAA---GCA-TC--AAG--T--CGG-C-CGCTNNNNNNNNNN-----N------N-NN-NN---------N--N--------N--------N----N----------N-----N-----N---------N----NN--N--NN------NN-N---N-N--------N----N-------NN---NNN-N-NN----N--N---NNN--------------N-NN--------NNNNN--------NN-GG-CCGAGACAGGCTG--TCT------CCGATA-GTTACTCCATGCCCTA-GNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--NNNN----------N----------N-------NNNN----NNN-NNNN-N--NNC-A-----TAAT--------T--------C---A----T----G------C-A--AA-TA----T-AA--------T--------T-----A---TT---------T-TGAA-TG--T--A--AA---A--AA--ATGCAGA--A-ATCAAACA-T-GCA--TCTAaaggtgcggaaagtgttgcaa
gi|60 : AACAA-G--A-AAAG---TTT---G-A-TGC-AAA---GCA-TT--AAA--T--CGG-C-CGC--------AAA-----agtaaa
gi|61 : CAA-G--A-TGAT---TTT---G-A-TGC-AAA---GCA-TC--AAA--T--CGG-C-CGCT-------AA
gi|62 : AA-G--A-TAAT---TTT---G-A-TGC-AAA---GCA-TC--AAA--T--CGG-C-CGCT-------AA
gi|63 : ACAA-G--G-TAA----TTT---G-A-TGC-AAA---GCA-TC--AAA--T--CGG-C-CGC
gi|64 : ACAA-G--A-TAAT---TTT---G-A-CAC-AAA---GCA-TC--AAA--T--CGA-C-CGCa
gi|65 : A-G--A-TAAT---TTT---G-A-TGC-AAA---GCA-TC--AAA--C--CGG-T-CGC
gi|66 : cacACAA-G--A-TAAT---TTT---G-A-TGC-AA------A-TC--AAA--T--CGG-C-CGCT-------AA
gi|67 : CAA-G--A-TAAT---TTT---G-A-TGC-AAA---TCA-TC--AAA--T--CGG-C-CGC
gi|68 : ACAA-G--A-AAAT---TTT---G-A-TGC-AAA---GCA-TC--AAA--T--CGG-C-CG
gi|69 : -TAAG---TTT---G-A-TGT-AAA---GCA-TG--GAA--T--CGG-C-CG
gi|7 : AACAA-G--A-TAAG---TTT---G-A-TGC-AAA---GCA-TC--AAA--T--CAG-C-CGCT-------NNN-----N------N-NN-NN---------N--N--------N--------N----N----------N-----N-----N---------N----NN--N--NN------NN-N---N-N--------N----N-------NN---NNN-N-NN----N--N---NNNNNNNNNNNNNNN--G-CT--------CGAGA--------CG-GG-C----------TG--TCT------CCGATA-GTCACTCCANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--NNNN----------C----------A-------TGTT----AAA-GCAC-C--GTC-A-----TGAT-----GA-T----A-TGC---A----T----G------C-A--AA-TA----T-AA--------T--------T-----A---TT---------T-TGAA-TG--CC-A--AA---A--AA--GTGCAGA--A-ATCAAACA-T-GCA--TCTAat
gi|8 : ACAA-G--A-AAAG---TTT---G-A-TGC-AAA---GCA-TC--
gi|8 : tac----AAA-GCAC-C--GTG-A-----CGAT-----GA-T----A-TGCAA-A----T----GGAA---C-A--AA-TA----T-AG--------T--------TATTAGA---TT---------T-TGAA-TG--TC-AACAA---A--AA--GTGCAGA--A-Annnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnttgaggattgatcaaccttaaggcaaattgcagaagagacgctaaattgcgtttaaaatatttttaaaagcaccgtgacgatgatatgcaaatggaacaaatatagttattagattttgaatgtcaacaaaaagtgcagaaaattgttgtggttaatgtaaacag
gi|9 : tacacaagaaaagtttgatgcaaagcatcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnttgaggattgatcaaccttaaggcaaattgcagaagagacgctaaattgcgtttaaaatatttttaAACAA-G--A-AAAG---TTT---G-A-TGC-AAT---GCA-TC--AAA--T--CGG-C-CGC--------AAA-----attgttgtggttaatgtaaacag
gi|9 : ----AAA-GCAC-C--ATG-A-----CGAT-----AA-T----A-TGA---AAA--T----GGAA---C-A--AA--A----T-AG--------T--------T-----A---TTAGATT----T-TGAA-TG--TC-A--AA---A--AA--GTGCAGA--A-Annnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnactcttttgaaccannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntgttttaaaaagcaccatgacgataatatgaaaatggaacaaaatagttattagattttgaatgtcaaaaaagtgcagaaaattgttgtggataatgtaaacag
blockSeqs : . TATA T TTA TA AG . NNNNNNN ATTAATTT A TGTATTCTT TC AAATGTTCTAAGCTGATTTCCAA CT CT ACAGAG C GTG G TTTTTCGG TTTC CTTTTCC TCG A . AATT GT ATC NNNNNNNNNNNNNNGCTCGAGACGGGC . TTTGAA AG C N NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTACA TTAA A A GT T ATTCA TGAAG . GCAA G AAATGGAGTAA A AT A GTTA G CATTGTAATTATTACTTACAAA G . TT A AC AAC AA TT AC T T G AT
blockSeqs : . G . TTA . A . . TAGATAT . . T TATATAAGCAAGATATTTCCAA T T CAGAG . C . . A CA . . . . T . NNNNNNNNNNNNGCTCGAGACGGGC . TA G N C NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAA TTAA . . . . . . . G T AAAATGGAG . . A GGG . TTATTACTTACAAA . . . . . . A . . . . . .
blockSeqs : . G . . . . . . AGGT . . . TATTCTAAACTATTTCCCCCC . G ACC . . . . . . . . . . . . NNNNNNNNNNGGCCGAGACAGGC . G G T N NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCTT . . . . . . . . . . AAAATAGAG . . . . . TGCATATAATATT . . . . . . A . . . . . .
blockSeqs : . G . . . . . . AAA . . . TATTCTGAATTATTTCATTT . . . . . . . . . . . . . . . NNNNNNNNNNNNGCTCCAGGT . . G C N NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNA . . . . . . . . . . TAATGAAG . . . . . TTTTTAGGTTT . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . G . . . . . . ATT . . . TAATCTGAATTAATTCCAA . . . . . . . . . . . . . . . NNNNNNNNNNCCGAACGGAC . . G N C NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN . . . . . . . . . . TAATGGAG . . . . . TTATTACATT . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . G . . . . . . CAT . . . TATTTTATTCTATTTTTAA . . . . . . . . . . . . . . . GTTTTCGAGAGCGGGC . . C C N NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN . . . . . . . . . . AAATAGAA . . . . . TTGCTAAATT . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . T . . . . . . TAT . . . TGTTATAAGCTATTTCCA . . . . . . . . . . . . . . . ACCTTGTCCCCTGCA . . N G C NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGTAA . . . . . . . . . . AAATGGAA . . . . . TTATTAGATT . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . G . . . . . . TAT . . . GAAATTTCTATTCCCATA . . . . . . . . . . . . . . . GCCTCGAGACGTGGC . . G T N CANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN . . . . . . . . . . AAATGGAA . . . . . TTATTAGATT . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . G . . . . . . AT . . . TAGATTTCTTTGTCCA . . . . . . . . . . . . . . . GCTTGAGACGGGT . . T T N NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN . . . . . . . . . . ATCATGG . . . . . TTATTAGATT . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . G . . . . . . NN . . . TCTAAGCTCTTTCCA . . . . . . . . . . . . . . . TGTCGAGACAGGC . . N N N NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNA . . . . . . . . . . AAAAGTG . . . . . TTATTAGATT . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . T . . . . . . NN . . . TATTCTAAACTATTT . . . . . . . . . . . . . . . GGTCGAGACAGGC . . G C N NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCA . . . . . . . . . . AAAGGTG . . . . . TTATTAGA . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . T . . . . . . AT . . . TATTCTATTTCCAA . . . . . . . . . . . . . . . GCTCCAAAGGT . . G N N TAGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN . . . . . . . . . . AAATCAG . . . . . TTAGATTT . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . T . . . . . . AT . . . ATTTCTATTCCAA . . . . . . . . . . . . . . . GTTCAAGACA . . T T N NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTTTCTAACAAGT . . . . . . . . . . AAATG . . . . . TGTATT . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . T . . . . . . AT . . . TATTATTTCCA . . . . . . . . . . . . . . . GCCCAAGGT . . C T T NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCGTAA . . . . . . . . . . ATG . . . . . TTCATT . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . G . . . . . . AT . . . GCTATTTCCAA . . . . . . . . . . . . . . . GCTCAAGGT . . G C N NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN . . . . . . . . . . TTG . . . . . TTAAT . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . G . . . . . . AG . . . TTTATAAGTA . . . . . . . . . . . . . . . ACTCTATA . . G C . . . . . . . . . . . ATG . . . . . TTATT . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . T . . . . . . AA . . . TATTCTATAC . . . . . . . . . . . . . . . ATTCTTC . . G . . . . . . . . . . . . ATG . . . . . TTATT . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . T . . . . . . TT . . . TATATTTTC . . . . . . . . . . . . . . . ACCCC . . . . . . . . . . . . . ATG . . . . . TTACT . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . T . . . . . . GT . . . TATATTTTC . . . . . . . . . . . . . . . ATCCT . . . . . . . . . . . . . ATG . . . . . TTAAT . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . T . . . . . . AA . . . NNNNNNN . . . . . . . . . . . . . . . ACTCT . . . . . . . . . . . ATG . . . . . TTTTA . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . T . . . . . . AC . . . NNNNNNN . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . ATG . . . . . TTATT . . . . . . . . . .
blockSeqs : . T . . . . . . AT . . . TATTGTA . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . ATG . . . . . TTATT . . . . . . . . . .
blockSeqs : . G . . . . . . AT . . . TCCATTT . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . TG . . . . . GATT . . . . . . . . . .
blockSeqs : . T . . . . . . AC . . . TATGCTA . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . AG . . . . . TACT . . . . . . . . . .
blockSeqs : . G . . . . . . AT . . . TATTGTA . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . AG . . . . . TTAT . . . . . . . . . .
blockSeqs : . A . . . . . . AT . . . AATATTT . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . ATT . . . . . . . . .
blockSeqs : . G . . . . . . AC . . . TATTTTC . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . .
blockSeqs : . G . . . . . . AT . . . TATTCTG . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . A . . . . . . GT . . . NNNNNNN . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . G . . . . . . NN . . . TATTTTA . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . T . . . . . . CT . . . NNNNNNN . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . G . . . . . . AT . . . NNNNNNN . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . G . . . . . . NN . . . CTATTT . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . T . . . . . . NN . . . CATTTC . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . T . . . . . . A . . . TATTC . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . T . . . . . . A . . . TCCAA . . . . . . .
blockSeqs : . T . . . . . . . . . . CCAAC . . . . .
blockSeqs : . T . . . . . . . . . . TATTT . .
blockSeqs : . T . . . . . . . .
blockSeqs : . T . . . . . .
blockSeqs : . G . . . . . .
blockSeqs : . G . . . . . .
blockSeqs : . G . . . . . .
blockSeqs : G . . . . .
blockSeqs : . . . . . .
blockSeqs : . . . . . .
blockSeqs : . . . . .
blockSeqs : . . . . .
blockSeqs : . .
blockSeqCons : ** *** ** ** ******* ** **** **
originalCons : AACAA-G--A-TAAN---TTT---G-A-TGC-AAA---GCA-TC--AAA--T--CGG-C-CGCT-------AAA-----A------T-TT-TA---------A--A--------T--------C----T----------A-----T-----T---------N----AG--A--AA------CA-T---A-C--------A----G-------AA---ACG-A-CC----A--A---CAT--------------G-CT--------CGAGA--------CG-GG-C----------TG--TCT------CCGATA-GTTACTCCACGCCCNANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTTTCTAAC--AAGT----------C----------A-------TGTT----AAA-GCAC-C--ATC-A-----TGAT-----GA-T----A-TGC---A----T----G------C-A--AA-TA----T-AA--------T--------T-----A---TT---------T-TGAA-TG--TC-A--AA---A--AA--GTGCAGA--A-ATCAAACA-T-GCA--TCTA
finalCons : AACAA-G--A-TAAN---TTT---G-A-TGC-AAA---GCA-TC--AAA--T--CGG-C-CGCT-------AAA-----A------T-TT-TA---------A--A--------T--------C----T----------A-----T-----T---------N----AG--A--AA------CA-T---A-C--------A----G-------AA---ACG-A-CC----A--A---CAT--------------G-CT--------CGAGA--------CG-GG-C----------TG--TCT------CCGATA-GTTACTCCACGCCCNANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTTTCTAAC--AAGT----------C----------A-------TGTT----AAA-GCAC-C--ATC-A-----TGAT-----GA-T----A-TGC---A----T----G------C-A--AA-TA----T-AA--------T--------T-----A---TT---------T-TGAA-TG--TC-A--AA---A--AA--GTGCAGA--A-ATCAAACA-T-GCA--TCTA
6 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|32 ): AATTANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
Unaligned ( gi|33 ): TNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNATAGGCNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
Unaligned ( gi|34 ): ATTANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
Unaligned ( gi|49 ): CTAACATGTTGAAGTGCCATTATGATGCTAAGCGAATGAAGCAAGTACGATTACTAGATCCAAACATACTTCAGAAACGTGGTTAA
Unaligned ( gi|51 ): AANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGCTCCAGGTTGTCATAGTTATTCCAC
Unaligned ( gi|57 ): TCATATATTATGCAAAGGTGCAGACAGGTGAAGAAAGTTTTGCGGTTAATGTAAACAG
Alignments
lowQualScore : 666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666 33333333333333333333333333333333333333333333333333333333 111111 88888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888 33333333333333333333 22222222222222222222222222222222222222
lowQualScore : 1 11 0 4444 222 0 0 0 222 0 11 11 11 0 0 3333333 77777777777777 1 444444444 22 888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888 22 33 777777 1 222 1 33333333 3333 6666666 111 1 1 2222 33 222 77777777777777777777777777777777777777777777777777777777 22 000000 33 1 1 66666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666 5555 2 2 11 1 33333 33333 1 3333 2 55555555555555555555 1 11 2 6666 1 66666666666666666666666666666666666666 1 1 22 1 22 222 44 33 22 1 1 2 33
lowQualScore : . .. . .... ... . . . ... . .. .. .. . . ....... .............. . ......... .. ............................................................ .. .. ...... . ... . ........ .... ....... ... . . .... .. ... ........................................................ .. ...... .. . . ............................................................................................ .... . . .. . ..... ..... . .... . .................... . .. . .... . ...................................... . . .. . .. ... .. .. .. . . . ..
lowQualScore : 0 22 9 1111 222 8 8 8 888 8 99 99 11 8 8 0000000 88888888888888 0 111111111 44 111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 44 55 555555 1 999 1 99999999 5555 2222222 999 1 1 5555 00 333 99999999999999999999999999999999999999999999999999999999 55 555555 11 1 8 00000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 5555 4 4 77 2 00000 00000 2 8888 4 11111111111111111111 3 88 7 7777 4 88888888888888888888888888888888888888 4 4 00 4 00 555 88 99 00 5 9 0 77
consensus : AACAA-G--A-TAAN---TTT---G-A-TGC-AAA---GCA-TC--AAA--T--CGG-C-CGCT-------AAA-----A------T-TT-TA---------A--A--------T--------C----T----------A-----T-----T---------N----AG--A--AA------CA-T---A-C--------A----G-------AA---ACG-A-CC----A--A---CAT--------------G-CT--------CGAGA--------CG-GG-C----------TG--TCT------CCGATA-GTTACTCCACGCCCNANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTTTCTAAC--AAGT----------C----------A-------TGTT----AAA-GCAC-C--ATC-A-----TGAT-----GA-T----A-TGC---A----T----G------C-A--AA-TA----T-AA--------T--------T-----A---TT---------T-TGAA-TG--TC-A--AA---A--AA--GTGCAGA--A-ATCAAACA-T-GCA--TCTA
Reference ( family-850 ) : AACAA-G--A-TAAN---TTT---G-A-TGC-AAA---GCA-TC--AAA--T--CGG-C-CGCT-------AAA-----A------T-TT-TA---------A--A--------T--------C----T----------A-----T-----T---------N----AG--A--AA------CA-T---A-C--------A----G-------AA---ACG-A-CC----A--A---CAT--------------G-CT--------CGAGA--------CG-GG-C----------TG--TCT------CCGATA-GTTACTCCACGCCCNANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTTTCTAAC--AAGT----------C----------A-------TGTT----AAA-GCAC-C--ATC-A-----TGAT-----GA-T----A-TGC---A----T----G------C-A--AA-TA----T-AA--------T--------T-----A---TT---------T-TGAA-TG--TC-A--AA---A--AA--GTGCAGA--A-ATCAAACA-T-GCA--TCTA
gi|1 : AACAA-AGCA-TAAG---TTTTGTG-A-TGCTAAA---GCA-TCC-AAA--TTTCGT-C-CGCT-------AAA-----A------T-TT-TA---------A--A--------T--------C----C----------A-----C-----A---------A----AG--A--AA------CA-T---A-C--------A----GA------AA---ACG-ACCC----G--A---CAT--------------G-CT--------TAAGA--------CG-GGCC----------TGCCTCT------CCGATA-GTTTCTCCACGCCC
gi|1 : aacaaagTT----AAATGCACAC--GTC-------TGAT-----CAGT----A-TGC---A----T----G------C-A--AA-TAA---T-AA--------A--------T-----A---TT---------T-TGAAATG--TC-A--AA---A--TGTTGTGCAGA--A-ATCAAACA-T-gttctacgttgaaatccaaatttcccatgcttccaggcatttccctcttctcctcaagcgatcctctcaagaactgtcttcttctatcactattatttaaatgcacacgtctgatcagtatgcatgcaaataataaatattttgaaatgtcaaaatgttgtgcagaaatcaaacatag
gi|10 : aacaaagaacaaagcataagttttgtgatgctaaagcatccaaatttcgtccgctaaaattttaaatccacaaagaaacatacagaaaacgacccgacatgcttaagacgggcctgcctctccgatagtttctccacgcccgttctacgttgaaatccaaatttcccatgcttccaggcatttccctcttctcctcaagcgatcctctcaagaactgtcttcttctatcactattat-G--A-TGAG---TTT---G---TTC-AAA---GCT-TC--AAA--T--CGG-C-CTCT-------AAA-----A------T-TT-GA---------A--A----------------------T----------A-----T-----T---------C----TG--A--GA------TA-T---ag
gi|10 : A-GCAC-C--CTT-A-----TGAT-----GA-T----A-TGCTA-A----T----GAAG---C-A--AA-TA----C-GA--------T--------T-----A---TTAGA------T-TAGA-T----------------------TGCAGA--A-ACCAAACA-T-Gtgccaaagaaatatcaaatcaatctttcaaacagaaactaccgacatgtatcctttaaggtcccctttatcttttccacgcacttcctaaatccgttcatgctttaaggcaaatgctaaatgcagtagcacccttatgatgatatgctaatgaagcaaatacgattattagattagattgcagaaaccaaacatgtctcagaaacgtgttcaa
gi|11 : gatgagtttgttcaaagcttcaaatcggcctctaaaatttgaaatattctgagatattgccaaagaaatatcaaatcaatctttcaaacagaaactaccgacatgtatcctttaaggtcccctttatcttttccacgcacttcctaaatccgttcatgctttaaggcaaatgctaaatgcagt-TAAG---TTT---G-A-TGC-AA----GCA-TC--AAA--T--CAG-C-CGTN-------NNN-----N------N-NN-NN---------N--N--------N--------N----N----------N-----N-----N---------N----NN--N--NN------NN-N---N-N--------N----N-------NN---NNN-N-NN----N--N---NNN--------------N-NNNNNNNNNCCGA-A--------CG-GA-C----------TG--TCT------CC-ATA-GTCG-TCCANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--NN------------C----------A-------TTTT----AAA-GCAC-C--GTT-------TGAT-----GA-T----AGTGC--------T----G------C-A--AAATA----T-AA--------TG-------T-----A---TT---------T-TGAA-TG--T-----AA---A--AA--GTGCTGA--A-ATCAAA-A-T-GCA--tctcagaaacgtgttcaa
gi|12 : ttCAA-G--A-TGAG---TTT---G-A-TGC-AAA---GCA-TC--AAA--T--CGG-C-CGCT-------NNN-----N------N-NN-NN---------N--N--------N--------N----N----------N-----N-----N---------N----NN--N--NN------NN-N---N-N--------N----N-------NN---NNN-N-NN----N--N---NNNNNNNNNNNNNNNNNG-CT--------CGAGA--------CG-GG-C----------TG--TCT------CCGATA-GTTACTCCACGCgtaagttta
gi|12 : A----T-AG--------T--------TC----A---TT---------T-TAAA-TG--TC-A--AA---AA-AA--GTGCAGA--A-ATCAAACA-T-GCA--TCTAnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncatagttcattttaaatgtcaaaaaaagtgcagaaatcaaacatgcatctaag
gi|13 : caagatgagtttgatgcaaagcatcaaatcggccgctnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngctcgagacgggctgtctccgatagttactccacgcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnc--A-TATG---TTT---G-A-TGC-AAA---GCA-TC--AAAAGT--CGG-C-CGCT-------AAA-----A------T-TT--A---------A--A--------TATT-----C----TGAATTATTTCA-----T-----T---------T----AG--A--AA------CA-T---A-C--------A----G-------AA---TCG-A-CC----A--A---CAT--------------G-CT--------TGAGA--------CG-GG-T----------TG--TCT------CCGATA-GTTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--NNNN----------N----------N-------CAT------AA-G--------TC-A-----TG-C-----AA-T----A-T------------------------A--AT-TA----T-------------------------------T---------T-TGAA-TG--TC----AA---A--AA--GTACAGA--A-ATC-AACA-T-GCA--TCTAag
gi|14 : ACAA-G--A-CAAG---TTC---G-A-TGC-AGA---GCA-TC--AAA--T--CGG-C-CGCT-------AAA-----A------AATT-TA---------A--A--------T--------A----T----------T-----G-----T---------A----AG--C--TG------TT-T---C-C--------A----A-------AT---A-G-A-CC----A--A---CAT--------------G-CC--------CAAG-------------G-T----------TG--CC-------CCGATA-GTTATCCCANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--NNNN----------NNNNN------A-------TGTT----AAT-TCAC-C--ATC-A-----TGAT-----AA------A-TAG---A---------G------C-A--AA-TA----T-AA--------T--------T-----A---TTACATT----T-TGAA-TG--TC-A--AC---A--AA--GTGCAG---G-ATCAggtaaa
gi|15 : -------AAA-----A------T-TT-TA---------A--A--------TAAT-----C----TGAATTA----A-----T-----T---------CCAA-AG--A--AA------CT-T---A-C--------AA---G-------AA---ACG---CC----A--A---CAT--------------T-GT--------CGAGA--------CA-GG-C----------TG--TCT------CCGGTA-CTT
gi|15 : a----------A-------TGTT----AAA-GCAC-C--ATC-T-----TGAT-----GA-T----A-TGC----------------------A--AA-TA----T-AA--------T--------T-----A---AT---------T-TGAA-TG--TC-A--AA---A--AA--A-GCAGA--A-ATT-AACA-T-GCA--TCTAcannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncaataatatgttaaagcaccatcttgatgatatgcaaatataattaatttgaatgtcaaaaaaagcagaaattaacatgcatctaagtaa
gi|16 : aaaaattttaaataatctgaattaattccaaagaaacttacaagaaacgccaacattgtcgagacaggctgtctccggtacttcannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncaataat--------T--------C----C----------A-----T-----T---------T----AGT-AT-AA------CA-T---A-C--------A----G-------AA---TCG-A-CC----A--A---CAT--------------G-TTTT------CGAGAG-------CG-GG-C----------TG--GTC------CCGAAAAGCTACTCCACGTCCNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--NNNN----------N----------N-------NNNN----NNN-NNNN-N--NNN-N-----NNNT-----CA-T----A--GT---A----TCATGG------C-A--AAATA----T-AA--------T--------T-----A---TT---------T-TGAA-TG--TC-A--AA---A--AA--GTGCAGA--A-ATCAAACA-TGGCA--TCTAagtaa
gi|17 : aaagttttgattattctgaattattAA-G--A-TAAT---TTT---G-A-TGG-AAA---GCA-TC--AAA--T--GGG-C-GTTT-------AAA-----A------T-TT-TATGTATTCTTA--A--------T--------C----T----------AAGCTCT-----TTCC------A----AG--A--AA------CA-T---A-C--------A----G-------AA---ACT-A-TT----A--A---CAT--------------ACCT--------TGTCC--------CC-TG-CA---------TG--TTT------CCCA-N-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--NNGT----------A----------A-------TATT----AAA-GTAC-C--ATT-A-----TGAT-----GA-T----A-TGC---AAAAGT----G------C-A--GA-
gi|18 : ACAA-G--A-TAAG---TTT---G-A-TGC-AAA---GCA-TC--AAA--T--CGG-C-CGCT-------AAA-----A------T-TT-TA---------A--A--------T--------C----C----------A---------------------A----AG--A--AA------CA-T---A-C--------A----G-------AA---ACG-A-CC----A--A---CAT--------------G-TT--------CAAGA--------CA---------------TG--T-T------CCGATA-GTTTCTCCACGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTTTCTAAC--AAGT-------------------------------TT----AAA-GCAC-C--GTC-A-----TGAT-----CA-T----ATTGC---A----T----G------C-A--AA-CA----T-AA--------T--------T-----A---TT---------T---GA-TG--TC-A--AA---A--AA--GTGCAAA--A-TTCAAACA-T-Gaagtgttgcagttaa
gi|19 : c-TAAG---TTT---G-A-TTC-AAATTAGCA-TC--ATA--T--CGA-T-CGCT-------AAA-----A------G-TT-TA---------G--A--------TATTCTAAAC----T----------A-----T-----T---------T----CG--A--AACAGAG-CA-T---A-C--------A----G-------AA---ACG-A-CC----A--A---g
gi|19 : GT----------T----------A-------CGGT----AAA-GCAC-C--ATT-A-----TGAT-----GA----------C---T----T----G------C-A--AA-Tattatccttgtcccctatattttttcaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatgttacggtaaagcaccattatgatgacttgcaaatggagccaatgtaacgttaa
gi|2 : taagtttgattcaaattagcatcatatcgatcgctaaaagtttagatattctaaactatttcgaaacagagcatacagaaacgaccaaattatccttgtcccctatattttttcaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatAATAA-G--A-CAAG---TTT---G-A-AGC-AAA---GCA-CT--AAA--T--TGG-C-CGCA-------AAA-----A------A-TT-AA---------AT-A--------T--------T----T----------A-----TAAG--T---------A----AG--A--TA------CA-T---A-ggagccaatgtaacgttaa
gi|2 : tgta----------A-------TGTTTTAAAGA-GCAC-C--ATG-A-----TGAT-----GA-T----A-TAC---AAA--T----G------G-A--AA-TAGTTAT-AA--------G--------------A---TT---------T-TAAA-TG--TC-A--AA---A--AA--GTGCAGA--A-Aagttggatgtatttccaaataaacgactaatatgcaattttttgaaccannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatgttttaaagagcaccatgatgatgatatacaaatggaaatagttataagattttaaatgtcaaaaaagtgcagaaaattgttatggttaatataata
gi|20 : tgtaaataagacaagtttgaagcaaagcactaaattggccgcaaaaaattaaatatttataagtaagatacataagttggatgtatttccaaataaacgactaatatgcaattttttgaaccannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnCAA-G--A-TAAT---TTT---G-A-TGC-AAA---GCA-TC--AAA--T--CGA-C-CGCT-------AAA-----AT-----T-TT-TA---------A--G--------T--------A----T----------G-----C-----T---------A----AGCTACTAA------TA-T---A-C--------A----G-------AA---ATG-A-CC----A--A---CAT--------------A-TT--------C---------------TT-C----------TT--CCTTA----TCGATA-TTTTGTCCANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNC----GT----------A----------A---------TT----AAA-GCAC-C--AGT-A-----TGAT-----GA-C-------------------------------------TA-------------------------T-----A---CT---------T-TGAA-TG--TC-A--AA---A--AA--TTGCAGA--attgttatggttaatataata
gi|21 : AA-G--A-TAATATATCT---G-A-TGC-AAA---GCA-TC--AAA--T--CGA-C-CGCT-------AAA-----T------T-TT-TA---------A--G--------TA-------T----T----------A-----T-----TTCC------A----AG--A--AA------CA-T---A-C--------A----G-------AA---TCG-A-CT----A--A---CAT--------------A-CC--------Cgcattgtggttaatgtca
gi|21 : -------TGTT----AAA-GTAC-C--ATC-A-----TTAT-----GA-T----A-TGC---AAAGGT----G------C-A--GA-ttgtcccctacatttttttcccannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnctgttaaagtaccatcattatgatatgcaaaggtgcagaaagtgttgcggttaatg
gi|22 : aagataatatatctgatgcaaagcatcaaatcgaccgctaaatttttaagtattatttccaagaaacatacagaatcgactaacatacccttgtcccctacatttttttcccannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnc-G--A-TTAT---TTT---G-A-TGC-AAA---GCA-TC--AAA--T--GGG-C-CGCT-------AAA-----A----------------------A--G--------C--------C----A----------A-----C---------------------G--A--AA------CA-T---A-C--------A----G-------AA---ATG-A-CC----T--A---CAT--------------A-CC--------C------------------C----------TG--TCC------CTTTTA---TATTTC---CCCCANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--NNNN----------N----------N-------NNNN----NNN-NCG-----ATC-A-----CGAC-----GA-T----A-TGCAAAA----TGGA-G------C-A--AA-TT----T-GA--------T--------TGCTAAA---TT---------T-TAAG-GG--TG-A--AA---A--AGTTGTGCATA--ATAT-AAACA-aagtgttgcggttaatg
gi|23 : CAA-G--A-TGAT---TTT---G-A-TGC-AAA---GCA-TG--AAA--T--CGG-C-CGCT-------AAA-----G------T-TT-TA---------A--G--------TGTTATAAGC----T----------A-----T-----TTCC------A----AG--A--AA------CA-T---A-C--------A----G-------CA---ACG-A-CC----A--A---CAT--------------A-TC--------C------------------T----------TG--TCC------CCTACA--TTATTTCA---ANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--NNNN----------N----------N-------NNNN----NNA-GTAC-C--ATC-A-----TGAT-----GA-T----A-TGC---A----gag
gi|24 : -TGC-AAA---GCA-TC--AAA--T--CGG-C-CGC--------AAA-----A------A-AT-TA---------A--A--------TATATAAG-CAAGAT----------A-----T-----TTCCA-----A----AG--A--AA------CACT---A-C--------A----G-------AA---ACG-A-CCAATTA--A---CAT--------------A-CT--------CTATA--------------------------G--TCTTTTGAACCANNN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--NNNN----------N----------A-------TGTTTTAAAAA-GCAC-C--ATG-A-----CGAT-----GA-T----A-TGT---A----aaggcgcagaaagttttgcgtatgatatatgtaa
gi|25 : tgattacagatTT---G-T-TGC-AAC---GCA-TC--AAA--T--CGG-T-CGAT-------AAA-----A------C-TT-TA---------A--A--------T--------A----T----------T-----G-----T---------A----AG--C--TA------CA-T---G-T--------ATTTCC-------AA---A-G-A-------A--A---CAT--------------G-CT--------TGaatg
gi|26 : CAA-G--A-TCAT---TTT---G-A-TGC-AAA---GCA-TC--AAA--T--CGG-C-CGCT-------AAA-----A------T-TT-TT---------A--ATAT-----T--------C----T----------A-----T-----A---------C----AA--A--AA------CA-T---A-C--------G----A-------AA---ACT-A-CC----A--A---Ctcttataaatttttccannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncactataatgaggatatctgaatgaggcaaacaagattattagagttgcagaaactatatacgtgcttcaaaaatgtggttaa
gi|27 : -G--A-TAAG---TTT---G-A-T-C-AAATTAGCA-TC--AAT--A--CAT-C-C-TT-------AAGTAGATA------T-TC-TA---------A--A-----------------C----T----------A-----T-----T---------T----CG--A--AAACAGAGCA-T---A-C--------A----G-------AA---ACG-A-CC----A--A---nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaca
gi|27 : ----------A-------TGTT----AAAAGCAC-C--ATCTA-----TGAT-----GA-C----T-TGC---A----atttcccttgtcccctatattttttcaaacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatgttaaaagcaccatctatgatgacttgcaa
gi|28 : gataagtttgatcaaattagcatcaatacatccttaagtagatattctaaactatttcgaaaacagagcatacagaaacgaccaaatttcccttgtcccctatattttttcaaacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn----------C----------A-------TGTT----AGA-GCACAT--GTT-A-----TGAT-----CA-T----A-TGC---A----T----G------CAA--AA-TA----T-AA--------T--------T-----A----T---------T-TGAA-TG--TC-A--GAAACA--AA--GT-CAGA--A----AAGCATT-GCA--TCTAa
gi|29 : gctttgagagggactggtctgccgataagctactcannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn--------A----G-------AA---ACT-A-CC----A--A---CAT--------------G-GT--------CGAGA--------CA-GG-C----------TG--TCT------CCAATA-GTTACTCCANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--NNNNNNNNNNNNTAC----------A-------TGTT----AAA-GCAC-C--ATC-A-----TGAT-----GA-T----A---C---A----T----G------C-A--AA-TA----TGAA--------TGCATATAAT-----A---TT---------A-TGAA-AA--TT-G--AA---A--AA-----CA-A--A-ATT--ACA-T-Gtgtaaacagaatg
gi|3 : ACAA-A--A-TAAG---TTT---G-AATGC-AA----GCAGTC--AAAA-T--CGG-CGCGCT-------AAA-----A------T-TT-TG---------A--A--------A--------A----T----------A-----T-----T---------T----TG--A--AT------TA-T---AGC--------A----G--------A---ACG-A-CC----A--AATCCAT--------------GCCT--------CGAGA--------CGTGG-C----------TG--TCTG-----CCG-TA-GTTANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--NNNN----------N----------NNNNNCTTTGTT----AAA-GCAC-C--G-C-A-----TGA------GA-TG---A-TGC---A----T----G------C-AATAA-TA----T-AA--------T--------T-----A---CT---------TGTGAA-TG--TCAA--AA---A--AA--GTGCAGA--T-CTCAAACA-T-GC
gi|30 : c---------A--A--------G--------C----T----------A-----T-----T---------TCCAAAG--A--AA------CA-T-----C--------A----G-------AA---ACA-A-CC----AT-A---TAT--------------A-CT--------C------------------T----------TG--TCC------CCTATA-TCTTTTCCANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--NN-------------------------------TGT-----AAA-GTTC-C--ATC-A-----TTAT-----GA-T----A-TGCTA-A----TGGA-G------T-A--AA-TA----T-AA--------T--------T-----G---Tttaag
gi|31 : tttaaatatcccT--------CGAGA--------CA-GG-C----------TG--TCT------CCGGTA-CTTcaaagcggtgta
gi|31 : g----------A-------TGTT----AAA-GCAC-C--ATC-T-----TGAT-----GA-T------------A----T----G------C-A--AA-TA----T--A--------T--------T-----A---AT---------T-TGAA-TG--TC-A--AA---A--AA----ACAGGACA-ATTAGACA-T-GCA--TCTAcannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncaataatatgttaaagcaccatcttgatgatatgcaaatatattaatttgaatgtcaaaaaaacaggacaattagacatgcatctaagaaa
gi|35 : gtcgagacaggctgtctccggtacttcannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncaataatAACAA-G--A-AACT---TTT---G-A-TGC-AAA---GCA-TC--AAA--T--CGG---CGC--------AAA--------------TT-TA---------A--A--------T--------A----T----------T-----T-----T---------C----AA--AG-AA------CA-T---A-C--------A----G-------AATCGACA-A-CC----A--A---CGT--------------agaaa
gi|36 : TTTCTAA----A-----------------------A-------TGTT----TAA-GCAC-C--A-C-A-----TGAT-----AA-T----A-TGC---AAAA-TAGA-G------C-G--AA-TA----T-AACATTGTAAT--------T-----A---TTACTTACAAAT-TGAA-TG--TC-A--AA---AA-AA--GTGCAGA--A-ATCAAACA-T-GCT--TCcttcttcgatgaaacctaaatccgccggcaaatttgcagtagagacggcctaaattgcgtttaaaatgttttaaga
gi|37 : aACAA-G--A-TAAT---TTT---G-A-TAC-AAA----CA-TC--ATA--T--CAA-T-AGCT-------AAA-----A------C-TT-TA---------ATCAAAATGT--T--------C----TAAGCTG----A-----T-----TTCCA-----A----AT--A--AA------CA-T---A-C--------A----G-------AA---ACG-A-AT----AGTA---CAT--------------A-CT--------TGaaattaaaacagaa
gi|38 : TTTCTAATTTAAGC-------------------------------TT----AAA-GCAC-C--ATC-AATTCATGAC-----GA-T----A-TGA---AAA--T----GGAGTAAC-A--AG-GA----T-TG--------T--------T-----AGATTT---------T-TTAA-TG--TC-A--AA---A--TG--GTGCAGA--A-ATCAAACA-T-GCA--TCtcttttctacagatatattta
gi|39 : ttga----AAA-GCAC-C--ATG-A-----CGATTGAAGAA-T----A-TGC---AAA--T----AGAA---C-A--AA-TA----T-AG--------T--------TTTT--AGGTTT---------T-TGAA-TG---C-A--AA---AAAAA--GTGCAGA--A-Aatgaaaacagaa
gi|4 : aaCAA-G--A-TGAT---TGT---G-G-TGC-AAA---GCA-TT--AAA--T--CAG-C-CGTT-------AAAC----A------T-TT-TA---------A--ATATTTTATT--------C----T----------A-----T-----TTTTA-----A----AG--A--AA------CA-T---A-A--------A----G-------AG---ACG-A-CC----aattgtttgtggtttaaaatgtttacaaacaaaa
gi|4 : -------TGTT----AAA-GCAC-C--ATT-A-----TGAT------A-TGCAAA-TAC---A---------G------T-A--AA-TA----T-AA--------T--------TATTAGA---TT---------T-TGAA-TG--T--A--AA---A--AG--GTGCTGT--A-ACGAAACA-T-GCA--TCtatttannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntgttaaagcaccattatgatatgcaaatacagtaaatataattattagattttgaatgtaaaaaggtgctgtaacgaaacatgcatc
gi|40 : caagatgattgtggtgcaaagcattaaatcagccgttaaacattttaaatattttattctatttttaaagaaacataaagagacgacctatttannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnAACAAAG--A-TAAT---TTT---GTA-TGC-AAA---GCA-TCTAAGA--T--CGG-C-CGCT-------AAA-----A------T-TG-TG---------A--AGAAATT--T--------C----T----------A-----TTCCCAT---------A----AG--A--AA------AC-T---A-C--------A----GCA-----AG---ACG-A-
gi|41 : aACAA-G--C-TAAT---TTT---G-A-TTC-AAA---GTA-TT--CAA--T--CGG-C-CGCA-------AAA-----A------T-TC-TA---------A--A--------C--------A----T----------------T-----T---------C----AG--A--aatacataagaatgacccaaca
gi|42 : aaaataaatctgcAA-A--A-TAAT---TTT---T-A-TGC-AAA---G-A-TC--AAA--T--CTG-C-CGCT-------AAA-----A------C-TT-AC---------A--A--------T--------A----T----------T-----C-----T---------G----AG--C--GA------TT-TC--A-A--------A----G-------AA---ACG-A-CC----A--G---CAT--------------A-CC--------Cttgcatgtatttccaaggaaacacacaatatgaaacgt
gi|43 : ----AAA-GCAT-CGTATC-A-----TGAT-----GA-T----A-TGCAA-A----TCA--G------C-G--GA-TA----T-GA--------T--------TATTAGA---TT---------T-TGAA-TA--TC-C--AA---A--AA--ttatctcatatacatttttcc
gi|44 : atattttaa-G--A-TAAG---TTTT--G-A-TGC-ATA---GCA-TC--AA----------T-CGCT-------A----------------CT-TA---------A--A----------------------T----------A-----T-----T---------T----TG--A--AA------TA-T---A-CTTTTTCGGA----GCTTTTCCAA---AGGAA-CC----A--A---CAT--------------G-CT--------CCAAA-----------GG-T----------TG--Ttcgcttgtttaagttgttaatatga
gi|45 : --A-TAAT---TTT---G-A-TGC-AAA---GCA-TC--AAA--T--CGG-C-CGCT-------AAA-----A------T-TG-GA---------A--GATT-----T--------C----T----------A-----T-----TCCA------A----AG--A--AA------C--T---A-C--------A----C-------AA---ACG-A-C
gi|46 : a-G--A-TAAG---TTT---G-A-TGC-AAA-----A-AC--AAA--T--CGG-C-TACT-------AAAT----A------T-TT-GA---------A--A--------T--------A----T----------ATT---T-----T---------C----GG--A--GC------TA-T---T-T--------C----C-------AA---AGA-A-CC----A--A---CAT--------------G-CT--------CAA-------------GG-T----------TG--TCattacataaaatgaccaa
gi|47 : cAA-G--A-TATA---TTT---G-A-TGC-AAA---GCA-TC--AAA--T--CTG-C-CGCA-------AAA-----G------T-TT-TA---------G--A--------TATTCTAAAC----T----------A-----T-----TTCCCCC---C----AA--A--AAACC---CA-T---A-G--------A----G-------AA---ACG-A-CC----A--a
gi|48 : ---TTT---G-A-TGC-AAA---GCA-TA--AAA--T--CGG-C-CGCT-------AAA-----ATTAATTT-TT-TA---------A--A--------T--------A----G----------A-----T-----TTCTTTGTCCA----AG--A--AC------CA-TGTGA-C--------A----G-------AA---G-G-A-CT----A--A---Cg
gi|5 : tACAA-G--A-TAAG---TTT---G-A-TGC-AAA---GCA-TT--AAA--T--TGG-C-CGCT-------NNN-----N------N-NN-NN---------N--N--------N--------N----N----------N-----N-----N---------N----NN--N--NN------NN-N---N-N--------N----N-------NN---NNN-N-NN----N--N---NNN--------------N-NN--------NNNNNNNNNGCTCCA-GG-T----------TG--TCA------CTGATA-GTTATTCCANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--NNNN----------NNNNNNNNNNAA-------CGTT----AAA-GCAC-C--ATC-A-----TGAT-----GA-T----A-TGC---A---------------------AA-TAGGG-C-AA-----------------------A---TT------------GAA-TG--TT-A--AA---A---A--GTGCAGA--A-ATCAAACA-T-GCA--TCTA
gi|50 : -G--A-TAAG---TTT---G-A-TGC-AAA---GCA-TC--AAA--T--CGG-C-TACT-------AAAT----A------T-TT-GA---------A--A--------T--------A----T----------ATT---T-----T---------C----GG--A--GC------TA-T---T-T--------C----C-------AA---AGA-A-CC----A--A---CAT--------------G-Ctgta
gi|52 : acACAA-G--A--AAA---GTT---G-A-TGC-AAA---GCA-TC--AAA--T--CGA-C-TGC--------AAA-----AGG----T-TTATA---------A--A--------T--------A----T----------T-----T-----T---------A----AG--
gi|53 : tC---A----T----G------C-A--A--TA----T-AA--------T--------T-----T---TA---------T-TG-A-TGTTTC-A--AA---A--AA---TACAGA--A-ATCAGAAA-T-GCGATTCTActtcttccaaagaaacac
gi|54 : cattaatACAA-G--AGTAA----TTT---G-A-TGC-AAA---GAA-TC--AAA--T--CGGCC-CGCT---------A-----C------T-TC-TA---------A---------------------------------------------------------------AG--A--A--------A-T---A-C--------A----G-------AG---ACA-A-CC----ggtaaac
gi|55 : tatgt----T-AA--------T--------T-----A---TTACTTACAAAT-TGAA-TG--TC-A--AA---A--AA--GTGCAGA--A-ATCAAACA-T-GCT--TC
gi|56 : ACAA-G--A-TAAG--------------GC-AAA---GCA-TC--AAA--T--CGA-C-CGCT-------AAA-----A-----------TG---------A--ATAT-----T--------C----T----------A-----T-----TTCCA-----A----AG--A--AA------CA-T---A-C--------aaattaaaca
gi|58 : ACCA-A--A-TAAT---TTT---G-A-TGC-AAA---ACA-TA--ATC--T--CGA-C-CGCT-------AAA-----A------T-TT-
gi|59 : tatagAA-GTAC-C--ATC-A-----TGAT-----GA-T----A-TGC---A----a
gi|6 : CAA-G--A-TAAG---TTT---G-A-TGC-AAA---GCA-TC--AAG--T--CGG-C-CGCTNNNNNNNNNN-----N------N-NN-NN---------N--N--------N--------N----N----------N-----N-----N---------N----NN--N--NN------NN-N---N-N--------N----N-------NN---NNN-N-NN----N--N---NNN--------------N-NN--------NNNNN--------NN-GG-CCGAGACAGGCTG--TCT------CCGATA-GTTACTCCATGCCCTA-GNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--NNNN----------N----------N-------NNNN----NNN-NNNN-N--NNC-A-----TAAT--------T--------C---A----T----G------C-A--AA-TA----T-AA--------T--------T-----A---TT---------T-TGAA-TG--T--A--AA---A--AA--ATGCAGA--A-ATCAAACA-T-GCA--TCTAaaggtgcggaaagtgttgcaa
gi|60 : AACAA-G--A-AAAG---TTT---G-A-TGC-AAA---GCA-TT--AAA--T--CGG-C-CGC--------AAA-----agtaaa
gi|61 : CAA-G--A-TGAT---TTT---G-A-TGC-AAA---GCA-TC--AAA--T--CGG-C-CGCT-------AA
gi|62 : AA-G--A-TAAT---TTT---G-A-TGC-AAA---GCA-TC--AAA--T--CGG-C-CGCT-------AA
gi|63 : ACAA-G--G-TAA----TTT---G-A-TGC-AAA---GCA-TC--AAA--T--CGG-C-CGC
gi|64 : ACAA-G--A-TAAT---TTT---G-A-CAC-AAA---GCA-TC--AAA--T--CGA-C-CGCa
gi|65 : A-G--A-TAAT---TTT---G-A-TGC-AAA---GCA-TC--AAA--C--CGG-T-CGC
gi|66 : cacACAA-G--A-TAAT---TTT---G-A-TGC-AA------A-TC--AAA--T--CGG-C-CGCT-------AA
gi|67 : CAA-G--A-TAAT---TTT---G-A-TGC-AAA---TCA-TC--AAA--T--CGG-C-CGC
gi|68 : ACAA-G--A-AAAT---TTT---G-A-TGC-AAA---GCA-TC--AAA--T--CGG-C-CG
gi|69 : -TAAG---TTT---G-A-TGT-AAA---GCA-TG--GAA--T--CGG-C-CG
gi|7 : AACAA-G--A-TAAG---TTT---G-A-TGC-AAA---GCA-TC--AAA--T--CAG-C-CGCT-------NNN-----N------N-NN-NN---------N--N--------N--------N----N----------N-----N-----N---------N----NN--N--NN------NN-N---N-N--------N----N-------NN---NNN-N-NN----N--N---NNNNNNNNNNNNNNN--G-CT--------CGAGA--------CG-GG-C----------TG--TCT------CCGATA-GTCACTCCANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--NNNN----------C----------A-------TGTT----AAA-GCAC-C--GTC-A-----TGAT-----GA-T----A-TGC---A----T----G------C-A--AA-TA----T-AA--------T--------T-----A---TT---------T-TGAA-TG--CC-A--AA---A--AA--GTGCAGA--A-ATCAAACA-T-GCA--TCTAat
gi|8 : ACAA-G--A-AAAG---TTT---G-A-TGC-AAA---GCA-TC--
gi|8 : tac----AAA-GCAC-C--GTG-A-----CGAT-----GA-T----A-TGCAA-A----T----GGAA---C-A--AA-TA----T-AG--------T--------TATTAGA---TT---------T-TGAA-TG--TC-AACAA---A--AA--GTGCAGA--A-Annnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnttgaggattgatcaaccttaaggcaaattgcagaagagacgctaaattgcgtttaaaatatttttaaaagcaccgtgacgatgatatgcaaatggaacaaatatagttattagattttgaatgtcaacaaaaagtgcagaaaattgttgtggttaatgtaaacag
gi|9 : tacacaagaaaagtttgatgcaaagcatcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnttgaggattgatcaaccttaaggcaaattgcagaagagacgctaaattgcgtttaaaatatttttaAACAA-G--A-AAAG---TTT---G-A-TGC-AAT---GCA-TC--AAA--T--CGG-C-CGC--------AAA-----attgttgtggttaatgtaaacag
gi|9 : ----AAA-GCAC-C--ATG-A-----CGAT-----AA-T----A-TGA---AAA--T----GGAA---C-A--AA--A----T-AG--------T--------T-----A---TTAGATT----T-TGAA-TG--TC-A--AA---A--AA--GTGCAGA--A-Annnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnactcttttgaaccannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntgttttaaaaagcaccatgacgataatatgaaaatggaacaaaatagttattagattttgaatgtcaaaaaagtgcagaaaattgttgtggataatgtaaacag
6 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|32 ): AATTANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
Unaligned ( gi|33 ): TNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNATAGGCNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
Unaligned ( gi|34 ): ATTANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
Unaligned ( gi|49 ): CTAACATGTTGAAGTGCCATTATGATGCTAAGCGAATGAAGCAAGTACGATTACTAGATCCAAACATACTTCAGAAACGTGGTTAA
Unaligned ( gi|51 ): AANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGCTCCAGGTTGTCATAGTTATTCCAC
Unaligned ( gi|57 ): TCATATATTATGCAAAGGTGCAGACAGGTGAAGAAAGTTTTGCGGTTAATGTAAACAG