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Reference ( gi|9 )            :                                                                                   TATACTT--ACT-AT---TCCCGTA-G-T--G-T-AG----A--T--T-T-AGT-GT-T-----T----AG----------TT-T--CA---TT-G---TT--------C-T------------TT-T----CA-----TT--T-TT-----CA-T-----G-----T--AT-----T-TCT------T-A-T---A-A------TC-A--T-AC--C-CC---G---T---C-C-TG-A-AG-A---A-GGG-AC-A------G-G-TCA--TC-CCG--AA-AAT-T-T-G-A-CA-AT--TTC-GT-ATT--C-TT-C--G-T--GTC--GTT--GG-----T-A-A--TT-T----T---AG-T-GCT---TTT------TAT-A---TCCTTACTC--A-TTTAACGTA--GTA-TC-----TACCATT-AATATAGATCCGACACTTTGGA-T-G--TTGAGT
gi|4                          :                                                                                   TATACTCCCATC-GT---TTCCGTA-G-T--A-T-AG----A--T--T-T-AGT-GT-T-----T----AGATTT------TTGT--TG---TT-G---TT--------T-T------------TT-T----TA-----TC--T-CT-----CA-T-----G-----T--AT-----T-TCT------T-G-T---A-A------CC-A--T-GA--T-TC---G---T---C-C-TG-A-AA-G---A-GGG-AC-A------G-G-TCG--T--CCG--AA-AAT-T-T-G-A-C---T--TT------TTAAC-TTAT--G-T--GTC--GTT--GT-----C-A-----T-T----T---AG-T-GCT---TTA------TATAA---TCTTT--TG--ATTTTGACCTT--GCA-TC-----TTTCATT-AATCCAAACCTGGC------GA-T-GT-TTGAGT
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gi|5                          :                                                   gtttcacattgtaatatgtaggacagtatactactaatcccatT-AC---TTTCATA-GAT--A-T-AC----A--T--G-T-AGT----T-----T----AG----------CT-----G---TT-G---TG--------C-TAG----------TT-T----TA-----TT--TATTACATACA-T-----G-----T--AT-----T-TCTATCTTAT-G-T---A-AACCTCTTC-A--T-------TT---G---T---C-C-TA-A-AG-A---A-GGG-A---------------G--TC-TCA--AA-AAT-T-T-T-A-CA-AT------GTAATT--G-TT-T--G-T--GTA--GTT--GG-------A-A--TT-
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gi|17                         :                                                           cgttttgatcatgttaaaaatgttagacagtaaatatatccctttcaattagtcgttg-AG----A--T--T-T-AAC-GT-T-----T----AA----------CT-T--AG---TG-A---TT--------T-T------------TTGT----AA-----TT--T-TT-----GA-C-----A--------AT--------CT------T-A-TGTAA-A------TC-G--C-TC--T-GC---G---TTGCC-C-TG-A-AC-A---A-AAC-AC-A------T-G-TCG--TC-CC---AA-AAT-TGT-G-A-CA-AT--T---G---------TT-T--G-T--GTC--GTT--TG-----T-A-A--TA-T----T---AG-T-GTT---T
gi|13                         :                                                                                                                       G----G--T--T-T-AGT-GT-T-----A----AG----------TT-G--CAGTTTT-A---TT--------T-TGC----------TT-T----CA-----TT--T-CT------G-T-----G-----TGAAT-----T-TTC------T-A-T---------------------------C---G---T---C-C-TG-A-AG-----------------------G-TCG--TC-CTA--GA-AAT-T-T-G-A-CA-ATAATTCTAT-ATT--G-T-------T--GTT--GTT--AT-----T-C-A--TT-T----T---AT-T-GCG---TTT------TAT-A---TCCTTagtacatatatattccccatggcatgaccagtattgaatacataatgttccatagtttgcat
gi|33                         :                                                                                                               gattagttcagtgttgatgcgcgaccagaacatacttttcaattcccccgtattttcattt---TT-A---TT--------T-T------------TT-T-----G-----TT--T-CT-----CA-T-----G-----TT-AA-----T-TCT------T-T-T---A--------TC-T--T-AC--C-CC---GTCAT---C-C-TG-A-AG-AACCA-GGG-AC-A--------A-TTA--GC-CCG--AA-AA--A-C-G-ACCA-AT--TTT-TT-TAT--G-TT-T--G-T--GCC---TT--GG-----T-ttttgtgacctcgtatccgct
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gi|37                         :                                                                                                                                                                                                                                      -----CA-T-----G-----T--AT-----T-TCG------T-A-T---A-A------TC-A--T-AC--C-CC---G---T---C-C-TG-C-AG-A---A-GGG-GC-A------G-G-TTG--TC-CCG--AA-ATT-T-G-G-A-CA-AA--TTT-A--ATT--G-TA-C--G-T--GTC--GTT--GG-----T-C-T--TT-T----T---GG-ct
gi|46                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                  -A--T-AC--C-CC---G---T---C-C-TG-A-AG-A---A-GGG-AC-A------G-G-TTGATTC-TCG--TA-AAT-T-T-
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gi|40                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                   tataattatcttattta---T---C-T-TG-A-AG-A---A-GGG-AC-A------G-G-TCA--TC-TCT--AA-GAT-T-T--------AT------GT-GGT--CGCT-C--A-T--ATC--G-T--GGCCCATT-A-AATTT-T----T---AG-T-GCT---GTG------TGT-G---TCacagttctgttgaaccaacaatgacgggtatagtatgttgtt
gi|39                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   -A------G-A-TTG--TT-CCA--AA-AAT-T-T-G-A-AA-GT--TTA----ATT--C-TC-C--G-T--GTC--GTT--GG-----T-C-A--TT-C----T---A------T---TTT------TGT-A---CCC---CTT--A-T-----GTA--GTA-TT-----TA
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gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              -TCG--TC-CCG--AA-AAT-T-T-G-A-CT-AT--TCT-AT-A-T--G-TT-T--G-T--GTC--G-C--GG-----A-C-C--TT-T----T---AG-T-GCT---TTG------TAT-A---atatata
gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                           attagctcaactcagtcttgacgctcaaccagaacatacgttttcgattacctcttattacaatcgagaatttcactatgtagacgttttgtttttaaaaatttttgttttttctattccgtttttatttctatctatatattttaA-AAT-C-T-G-A-AG-AT--TTC-GT-ATT--G-TT-C--G-T--GTT--ATT--CG-----T-CTA--TT-T----T---AG-T-GCT---TTTA-----TAT-A---T----------A-TTTGACCTT--GTA-TC-----TA-TATT-----CAGTCCCAACGCTTTGGA-T-GGTTTGAGTatcaatctgtttgaacttgtatc
gi|47                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            taacagtcaactcttttttttctccttaaactacatgttgcttagttttagtgctagtttgcatttcatcttattagtttatttacatttttatgtaaatattttctattattttACCATT-A-----GATCCGACACTTCGGA-T-G--TTGAGTtt

Unaligned ( gi|14 ): GATGTGTCCTAATTCGGTCTATTAGTAAAGCATTGAATACCAAACACTTTAAAAATGTTATTTACAGTTTTAGTTTAGTGGTAGTTTAGTTCATTCCATATTTACATGTATCTTTATCTATGTTATGTAAACATTTCCATTTGTATTGAGGACGAAACCTGAATATTTGACGACCACATTGTTCATGTCATTTGTCAATT
Unaligned ( gi|16 ): CACATCCTAATTCGCTTCCAGGAAAACTTTGATAATCCAGCCCAAAACAATACACAGGTGACTTGCAGTGTAACTCAGTTTGTAGCTTTAGTATAGCCTTAGTTCTAGTGGTTTGTGTTTGTTATTATTTATATGGAAACCTTTATGTTTTTCTTGAGGCTATCTTGAAAAATTGACAATTTAATTATTGTGTAATTG
Unaligned ( gi|20 ): GTCCTTTGGAAGAATAGGACGTGTCCAAATGAACTCCCATGAAAAAGAATTGATTAAGAAGCCAAAACAATAAACATGTGATTTACAGTGTAAATTAATACGTTTGTAGATTTAGTTTTAGTTTCGTTATAGGCCTAGTGCTAGTTTTGTTTATTCGGTGTATATCTCAGTGTAAACCTTTTCGTTTATCT
Unaligned ( gi|23 ): ACAGCTCATTGGAAAATAGAACGTGTTATAATTCGCCTACTCGTCGATATACTGAATAGCAAGCTAAAAACAATAAATATGTGAATTTGAAACTTTATTAGCTTTTTGTACAAACTATATTTAGCTATCTTATGAAAAACATTTTCATTTGGCCAGAGGAAAAGA
Unaligned ( gi|27 ): CAACCCTTTGAGGAAATAGGACGAGCTAAATGTATGCTCATTGAATAGCAAGTCAAAAACAATAAACATGTGACTTGCAGTGTAAATGCGTAACTTTGTATACTCAGTTTAGTTGTACAATGCTAGTTTTATTCATTCCGTATATAT
Unaligned ( gi|28 ): TTGGACGAATAGGACTTGTCTTAATTTGCTCAGCATGTAAAAATGATTAACAAGCAAAGACGATGAATATGTGATTTGTTTGTAGATTGAATATACTTTTAGTGCTTGTTTGTTTTGTGAATATTTTAACCATCTTATGTAAACC
Unaligned ( gi|31 ): CCATTGACAGAATAACACGTGTCGTAATTCACTCATTAGGAAACCTACTGAATAACACGCCCATAACAATCGGTGGACATGTAATTTGCAATGTCAAAATACTTGTAGCTACATATAGCATGTTGGTTTTA
Unaligned ( gi|35 ): AACCCATAGAAGGAATAGTGTGTATCTTGATTAATTCCCCAAAATACATTGATTAGCAAACCAAAACCATAATCATGCAATTTGCAGAGTATATACTTTTTTAGAT
Unaligned ( gi|36 ): GACAAATAGGACATGTCCTAATTCGCTCATTAGAAAACATTGATTTACAAGCCAAAAATAACAATCGTGATTTGCAGTTTACCGTAAATATGTTTGTAG
Unaligned ( gi|42 ): TTTATCCTAAGAAAGGGACGAGTCGTTCCTAGGATCTATCGAATTGTCAGTTTCGTTAATGAACAC
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Unaligned ( gi|44 ): GTAACTGTTTCACATTGTAATATGTAAACAATATATACTCCCATCGTTTCCGTAG

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Reference ( family-7 )        :                                                                                   TATACTC----ACCGT-TT-CC-GTA-G-T--G-T-AG----A--T--T-TA-GT-GT-T---T---AGA---------T-TT--C----G---T--T-G--------T----T-T--T--TT-T---------------CA-----T--T-TC-T-C-A-----T-G-----T--AT----T-TCT------T-GT-A-A------TC-A--T-A-C--C-C---C---G---T---C-C-TG-AAG-A---A-GGG-AC-AG-G-T-CG-----TC-CCG--AA-AA-T-T-TG-A-C---A-ATTTNATATTGTTC--G-TG--TC--GTT--GGT-C-A------TT-T------TA---------G----TGCT-TTT------TAT-ATCC-TTACTTA--TT-TGACCTCGT---AT-CTAC--CATT--AT-CAGATCCGACACTTCG-GA-T-G--TTGAGT
gi|1                          :                                                                                   TATCCCT----ATCGT-TT-CC-GTA-GGT--G-T-AG----A--T--T-TAAGT-GT-T-------AGA---------T-TT-------G---T--T-G--------T----G-T--T--TT-T---------------CA-----T--C-TC-T-C-A-----T-GATATTT--AT----T-CTT------T-GT-A-A------CC-T--T-AAT--T-T---C---G---T---C-C-TG-AAGCA---G-GGG-AC-AG-G-TTCG-----TCACCG--TA-AT-G-T-TG-A-C---A-ATTT-ATATTGTTC--G-TGGGTC----T--GGTTC-A------TT-C------TA---------GATAGTGCC-TTT-------AT-ATGAATTTCATA--TTCTGAT-TCGTTGCATTCTAA--AATTCAAT-CAGATCCGACACTTTG-AG-TCA--TTGAGT
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gi|26                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                     tataattatcttattta---G---T---C-C-TG-AAG-A---T-GGG-AC-GG-A-T-CG-----TC-CCG--AC-AA-T-T-TG-A-C---A-ATTCCATAGTGTTCCGG-TG--TC--ATT--GGA-C-A------TT-T------TAACAGTGGCTG----TGCT-TTA------TA--ATTC-GTAC--------------CGT---AT-TT-T--TATT--TT-CAGATCCGACACCTGG-GACT-G--acagttctgttgaaccaacaatgacgggtatagtatgttgtt
gi|29                         :                                                                  ccagcattgattttctttATAC-C----ATCAG-TT-TC-GTA-G-T--G-T-AG----A--T--T-TA-GT-AT-T---T---AG----------T-TT--C----A---T--T-G--------G----G-T--T--TC-TGCCCCCCCCCCCCCCCA-----T--T-TC-T-C-A-----T-G-----T--AT----T-TCT------T-AT-T-A------TC-A--T-A-C--C-C---C---G---T---C-C-TG-gtgtgtg
gi|3                          :                                          catgtaactgttttaacactgttatatgtagactgtatataTATACTCCCCCATCGT-T--CC-GTATG-CTGG-T-AG----A--A--T-TA-GT-GT-T---T---AGA---------T-TT--TTT--G---T--T-G--------T----T-T--T--TC-A---------------CA-----T--C-CT-T-C-A-----T-G-----T--AT----T-GCT------T-G--A-A------CCTA--T-A-A--T-T---C---G---T---C-C-TG-AAG-A---A--GT-AC-AG-G-T-CG-----TC-CCG--AA-AA-T-T-TGAA-C---A-ATAGTA-ATTGCTC--G-TG--TC--G-T--GCT-C-A------TT-CCTTAGATA---------G----TGATATTA------TAT-ATA---TATATA--TT-TGCCCCACC---AT-TT-C--CATT--GT-
gi|30                         :                                                               ttcgtcaatatgttagacagtaTACCC----ATCGT-TG-CC-GTA-G-T--G-T-AAGTA-A--T--TATA-GT-GTAT---T---AGA---------T-TT--TTT--G---T--T-G--------T----T-T--T--TT-----------------CA-----T--T-CT-T-C-A-----T-G-----T--AT----T-TCT------T-GT-AGA------CC-A--T-A-TGAA-T---C---G---T---T-C--G-A---A---A-GGG-ACTAG-G-T-CG-----TC-CCaaagcatatctactgtagattgca
gi|32                         :                                                                       tgcaaatatgtagacagtatcattatcT-TT-CCTGTA-G-T--C-T-AGTGCTG--T--TGTA-AT-AT-T---T---AGA---------TCTT--A----G---T--G-G--------T----T---------------------------A-----------C-C-C-A-------G-----TTAAT----A-TGT------T-GT-T-A------TT-T--T-T-C--CTC---C---G---T---C-C-TG-ATG-A---A-GGG-GC-AG---T-CG-----TC-CCG--AA-AA-T-T-TG-A-C---
gi|33                         :                                                                                                                                                                  ttatatgtagac---T--T-A--------T----T-T--T--TT-T----------------G-----T--T-TC-T-C-A-----T-GT----T--AA----T-TCT------T-TT---A------TC-T--T-A-C--C-C---C---GTCAT---C-C-TG-AAG-AACCA-GGG-AC-AA-T-T-AG------C-CCG--AA-AA---A-CG-ACC---A-ATTTTTTTATGTTT--G-TG--CC---TT--GGT-C-
gi|34                         :                                                                                                                                                                                                             T-C---------------CA-----T--T-TT-T-C-T-----T-G-----T--AT----T-TCT------T-AT-A-A------TC-A--TAA-C--C-C---C---G---T---C-G-TG-AAC-A---A-CAA-GC-AG-G-T-CG-----TC-CCA--AA------------------------ATATT------------TC--GTT--TTT-C-A------TT-T------TA---------A----TGC---TT------TAT-ATGC-TTACATA--TT-
gi|37                         :                                                                                                                                                                                                                                               -C-A-----T-G-----T--AT----T-TCG------T-AT-A-A------TC-A--T-A-C--C-C---C---G---T---C-C-TG-CAG-A---A-GGG-GC-AG-G-T-TG-----TC-CCG--AA-AT-T-T-GG-A-C---A-AATTTA-ATTGTAC--G-TG--TC--GTT--GGT-C-T------TT-T------TG---------G----ct
gi|38                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        -AG-A-T-TG-----TT-CCA--AA-AA-T-T-TG-A-A---A-GTTTAAT--TCTCC--G-TG--TC--GTT--GGT-C-A------TT-C------TA-----------------T-TTT------TGT-ACCC----CTTA--T
gi|39                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        -AG-A-T-TG-----TT-CCA--AA-AA-T-T-TG-A-A---A-GTTTAAT--TCTCC--G-TG--TC--GTT--GGT-C-A------TT-C------TA-----------------T-TTT------TGT-ACCC----CTTA--Tgtagtatttataaaataaa
gi|4                          :                                                                                   TATACTCCC--ATCGT-TT-CC-GTA-G-T--A-T-AG----A--T--T-TA-GT-GT-T---T---AGA---------T-TT--TTGTTG---T--T-G--------T----T-T--T--TT-T---------------TA-----T--C-TC-T-C-A-----T-G-----T--AT----T-TCT------T-GT-A-A------CC-A--T-G-A--T-T---C---G---T---C-C-TG-AAA-G---A-GGG-AC-AG-G-T-CG-----T--CCG--AA-AA-T-T-TG-A-C---T-TTTTAAC-TTAT----G-TG--TC--GTT---GT-C-A-------T-T------TA---------G----TGCT-TTA------TAT-AATC-TT--TTGATTT-TGACCTTGC---AT-CTTT--CATT--A-----ATCCAA-ACCTGGCGA-T-GT-TTGAGTgtagtatttataaaataaa
gi|40                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                   cacattgtaatatgtaaacaata---T---C-T-TG-AAG-A---A-GGG-AC-AG-G-T-CA-----TC-TCT--AA-GA-T-T-T----------ATGTG--GTCGCTC--A-TA--TC--GTG--GCC-C-ATTAAATTT-T------TA---------G----TGCT-GTG------TGT-GTCgtt
gi|41                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          G-G-T-CG-----TC-CCG--AA-AA-T-T-TG-A-C---A-ATTTA--ATTGCTC--G-TG--TC--GTT--GGT-C-A------TT-CTAGA--TA---------G----TGAT-TTA------TAT-AT
gi|42                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          ---T---C-C-TA-AGA-A---A-GGG-AC-GA-G-T-CG-----TT-CCT--AG-GA-T-C-TA-T-C---G-A------ATTGTCA--G-TT--TC--GTT--atatata
gi|45                         :                                                                                                                                                                                                 ttta-T--T--TT-T----------------------T--T-TC-T-C-A-----T-G-----T--AA----T-TCT------T-TT-A-A------TC-T--T-A-C--C-CCGTC---G---T---C-C-TG-AAG-A---A-GGG-aatgaacac
gi|46                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                  ta-A--T-A-C--C-C---C---G---T---C-C-TG-AAG-A---A-GGG-AC-AG-G-T-TGAT---TC-TCG--TA-AA-T-T-T
gi|47                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              AC--CATT--A----GATCCGACACTTCG-GA-T-G--TTGAGT
gi|5                          :                                                                                                   -TT-TC-ATA-GAT--A-T-AC----A--T--G-TA-GT----T---T---AGC---------T-GT--T----G---TGCTAG--------T----T-T--T--AT-T---------------TA-----T--T-ACATAC-A-----T-G-----T--AT----T-TCTATCTTAT-GT-A-AACCTCTTC-A--T--------T---T---G---T---C-C-TA-AAG-A---A-GGG-A----------G-----TC-TCA--AA-AA-T-T-TT-A-C---A-ATGTA--ATTGTTT--G-TG--TA--GTT--GGggtgttggtct
gi|6                          :            agtcctttggacaaataagatgtgtcctaattcactctgttaaataagcattgaattgcaagccaaaaacaatatatatgtgatttacagtgtgtatac-T--G-T-AG----ACGT--T-TT-GT-TT-T---T---AAAAA-------T-TT-----------T--T-G--------T----T-T--T--TT-C---------------TA-----T--T-CC-G-T-T-----T-T-----T--AT----T-TCT-------------A------TCTA--T-A-T------------A---T---T-T-TA-----------------------T-CG-----TC-CCG--AA-AA-T-T-TG-A-C---T-ATTCTATA-TGTTT--G-TG--TC--G-C--GGA-C-C------TT-T------TA---------G----TGCT-TTG------TATAATCA---ATCTG--TT-TGAACTTGT---AT-Caatt
gi|7                          :                             attagctcaactcagtcttgacgctcaaccagaacatacgttttcgattacctcttattacaatcgagaatttcactaTG-G-C--A-T-AA----A--T--T-TA-GT-GT-TGACC---AGC---------T-TT--T----A---G--T-A--------C----T-T--T--TT-TGCTA-----------TA-----T--T-T------A-----T-A-----T--A------------------GC-A-A------TC-G--T--------T---T---G---T---C-C-TT-AGG-A---A-GGG-AT-AT-G-T-TA-----TT-CCG--AA-AA-T-T-TG-G-C------TATCAAATTGTTC--G-TG--TT--CTT--GGG-T-A------TT-T------T
gi|8                          : tcagcccattgggtgaataaggcgggtcttaattcgccccctagaaaacatattaaacaataaacatacaatttacaatgagaatacgtttgtatatt-TT-CC-GTA-G-T--G-T-AG----A--T--T-TA-GT-GT-T---T---A-A---------T-TT--G----A---T--T-GGTT-----T----T-T--T--TT-T---------------CA-----T--T-TC-T-C-G-----T-G-----T--AT----T-TCT------T-GT-A-A------GC-A--T-A-C--A-C---C---G---T---C-C-TG-AAG-A---A-GGG-GC-AT-G-T-CG-----TC-CAG--AA-AA-T-T-TG-A-C---A-ATTTTATATTGTTC--G-TG--TC--GTT--GTT-C-A------TT-T------TA---------G----TGGT-TTTTATTCGTAT-ATCC-TTATTTA--TT-TGACCTCGT---AT-CTAC--CATT------AGATCTGACACTTCA-GA-T-G--TTGAGT
gi|9                          :                                                                                ctaTATACTT----ACTAT-TC-CC-GTA-G-T--G-T-AG----A--T--T-TA-GT-GT-T---T---AG----------T-TT--C----A---T--T-G--------T----T-C--T--TT-T---------------CA-----T--T-TT-T-C-A-----T-G-----T--AT----T-TCT------T-AT-A-A------TC-A--T-A-C--C-C---C---G---T---C-C-TG-AAG-A---A-GGG-AC-AG-G-T-CA-----TC-CCG--AA-AA-T-T-TG-A-C---A-ATTTCGTATTCTTC--G-TG--TC--GTT--GGT-A-A------TT-T------TA---------G----TGCT-TTT------TAT-ATCC-TTACTCA--TT-TAACGTAGT---AT-CTAC--CATTA-ATATAGATCCGACACTTTG-GA-T-G--TTGAGTgttgtt

Unaligned ( gi|14 ): GATGTGTCCTAATTCGGTCTATTAGTAAAGCATTGAATACCAAACACTTTAAAAATGTTATTTACAGTTTTAGTTTAGTGGTAGTTTAGTTCATTCCATATTTACATGTATCTTTATCTATGTTATGTAAACATTTCCATTTGTATTGAGGACGAAACCTGAATATTTGACGACCACATTGTTCATGTCATTTGTCAATT
Unaligned ( gi|16 ): CACATCCTAATTCGCTTCCAGGAAAACTTTGATAATCCAGCCCAAAACAATACACAGGTGACTTGCAGTGTAACTCAGTTTGTAGCTTTAGTATAGCCTTAGTTCTAGTGGTTTGTGTTTGTTATTATTTATATGGAAACCTTTATGTTTTTCTTGAGGCTATCTTGAAAAATTGACAATTTAATTATTGTGTAATTG
Unaligned ( gi|20 ): GTCCTTTGGAAGAATAGGACGTGTCCAAATGAACTCCCATGAAAAAGAATTGATTAAGAAGCCAAAACAATAAACATGTGATTTACAGTGTAAATTAATACGTTTGTAGATTTAGTTTTAGTTTCGTTATAGGCCTAGTGCTAGTTTTGTTTATTCGGTGTATATCTCAGTGTAAACCTTTTCGTTTATCT
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Unaligned ( gi|27 ): CAACCCTTTGAGGAAATAGGACGAGCTAAATGTATGCTCATTGAATAGCAAGTCAAAAACAATAAACATGTGACTTGCAGTGTAAATGCGTAACTTTGTATACTCAGTTTAGTTGTACAATGCTAGTTTTATTCATTCCGTATATAT
Unaligned ( gi|28 ): TTGGACGAATAGGACTTGTCTTAATTTGCTCAGCATGTAAAAATGATTAACAAGCAAAGACGATGAATATGTGATTTGTTTGTAGATTGAATATACTTTTAGTGCTTGTTTGTTTTGTGAATATTTTAACCATCTTATGTAAACC
Unaligned ( gi|31 ): CCATTGACAGAATAACACGTGTCGTAATTCACTCATTAGGAAACCTACTGAATAACACGCCCATAACAATCGGTGGACATGTAATTTGCAATGTCAAAATACTTGTAGCTACATATAGCATGTTGGTTTTA
Unaligned ( gi|35 ): AACCCATAGAAGGAATAGTGTGTATCTTGATTAATTCCCCAAAATACATTGATTAGCAAACCAAAACCATAATCATGCAATTTGCAGAGTATATACTTTTTTAGAT
Unaligned ( gi|36 ): GACAAATAGGACATGTCCTAATTCGCTCATTAGAAAACATTGATTTACAAGCCAAAAATAACAATCGTGATTTGCAGTTTACCGTAAATATGTTTGTAG
Unaligned ( gi|43 ): ACTTTCCCGTAGACATTAACAANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNACATTACA
Unaligned ( gi|44 ): GTAACTGTTTCACATTGTAATATGTAAACAATATATACTCCCATCGTTTCCGTAG

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Reference ( family-7 )        :                                                                                  TATACTCCC--ATC-GTTT-CC-GTA-G-T--G-T-A-G----A--T--T-T-AGT-GT-T---T---AG--A---------T-TT---C----G---T--T-G--------T----T-T--T--TT-T---------------CA-----T--T-TC-T-C-A-----T-G-----T--AT----T-TCT------T-GT-A-A------TC-A--T-AC--C-C---C---G---T---C-C-TG-AAG-A---A-GGG-AC-AG-G-TCG-----TC-CCG--AA-AA-T-T-TG-A-C---A-ATTTNATATTGTTC--G-T--GTC--GTT--GG-TC-A------TT-T------TA---------G-TGCT-TTT------TAT-AT-CCTTACTTA--TT-TGA--CCTCGTA-TCTAC--CATT--AT-CAGATCCGACACTTCG-GA-T-G--TTGAGT
gi|1                          :                                                                                  TATATCCCT--ATC-GTTT-CC-GTAGG-T--G-T-A-G----A--T--T-TAAGT-G--T---T---AG--A---------T-TT--------G---T--T-G--------T----G-T--T--TT-T---------------CA-----T--C-TC-T-C-A-----T-GATATTT--AT----T-CTT------T-GT-A-A------CC-T--TAAT--T-T---C---G---T---C-C-TG-AAGCA---G-GGG-AC-AG-GTTCG-----TCACCG--TA-AT-G-T-TG-A-C---A-ATTT-ATATTGTTC--G-TGGGTC----T--GGTTC-A------TT-CTAGA--TA---------G-TGC--CTT------TAT-ATGAATTTCATA--TTCTGATTCGTTGCATTCTAA--AATTCAAT-CAGATCCGACACTTTG-AG-TCA--TTGAGT
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gi|11                         :                                                gtttcacattgtaatatgtaggacagtatactacTATACTCCC--ATC-GTTT-CC-CTA-G-T--G-T-ATT----A--T--T-T-AGT-TT-T---T---AGAAA---------T-TTTAGC----G---T--T-G--------T----T-T--T--TC-TTA-------------CA-----TACT-TC-G-T-A-----T-GGC---T--A-----T-TCT------T-GT-A-A------CC-A--T-ATAAT-T---C---G---TA--CAC-TG-AAG-A---A-GGG-AC-AG-GTTCG-----TC-CCT--AA-AA-T-T-TG-A-C---T-TTTTAAC-TTAT----G-T--GTCCGGTTGAGG-TC-A------TC-T------TA---------G-TGCT-
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gi|24                         :                                                                                   ATA-TCCC--ATC-GTTTTCC-G-A-G-T--G-TTA-G----A--A--T-T-AGTTGT-T---TTATGA--A---------T-TT---T----G---T--T-G--------T----T-T--T--TT-T---------------CA-----T--C-CT-T-C-A-----T-G-----A--AT----T-GCT------T-GTAA-A------CC-A--T-AA--T-T---C-----------T-C-TG-AAG-A---A-GGG-AC-AG-G-atcatacctgattttcgaaatctacgcatctt
gi|25                         :                                                                                                                                                                                                                                                                       actgtctacatatttgcaatcaatttatatatatttaagttaagacagtgata---T---C-C-CG-AGG-A---A-GGA-AC-GG-G-TCG-----TC-CCG--AA-AA-T-T-TA-A-C---A-ATTCTA-ATTGTTT--G-T--GTC--GTT--GA-TC-A------CT-T------TT---------G-TGCT-TTG------TATAAT-TCTT--TTG--TT-TGA--CCTTGTA-
gi|26                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                       tataattatcttattta---G---T---C-C-TG-AAG-A---T-GGG-AC-GG-A-TCG-----TC-CCG--AC-AA-T-T-TG-A-C---A-ATTCCATAGTGTTCCGG-T--GTC--ATT--GG-AC-A------TT-T------TAACAGTGGCTG-TGCT-TTA------TA--AT-TCGTAC----------------CGTA-TTT-T--TATT--TT-CAGATCCGACACCTGG-GACT-G--acagttctgttgaaccaacaatgacgggtatagtatgttgtt
gi|29                         :                                                                ccagcattgattttctttTATAATACC--ATC-AGTT-TC-GTA-G-T--G-T-A-G----A--T--T-T-AGT-AT-T---T---AG------------T-TT---C----A---T--T-G--------G----G-T--T--TC-TGCCCCCCCCCCCCCCCA-----T--T-TC-T-C-A-----T-G-----T--AT----T-TCT------T-AT-T-A------TC-A--T-AC--C-C---C---G---T---C-C-TG-gtgtgtg
gi|3                          :                                             catgtaactgttttaacactgttatatgtagactgtaTATACTCCCCCATC-GTT--CC-GTATG-CTGG-T-A-G----A--A--T-T-AGT-GT-T---T---AG--A---------T-TT---TTT--G---T--T-G--------T----T-T--T--TC-A---------------CA-----T--C-CT-T-C-A-----T-G-----T--AT----T-GCT------T-G--A-A------CCTA--T-AA--T-T---C---G---T---C-C-TG-AAG-A---A--GT-AC-AG-G-TCG-----TC-CCG--AA-AA-T-T-TGAA-C---A-ATAGTA-ATTGCTC--G-T--GTC--G-T--GC-TC-A------TT-CCTTAGATA---------G-TGATATTA------TAT-AT-A--TATATA--TT-TGC--CCCACCA-TTT-C--CATT--GT-
gi|30                         :                                                                  ttcgtcaatatgttagacagtaCCC--ATC-GTTG-CC-GTA-G-T--G-T-A-AGTA-A--T--TAT-AGT-GTAT---T---AG--A---------T-TT---TTT--G---T--T-G--------T----T-T--T--TT-----------------CA-----T--T-CT-T-C-A-----T-G-----T--AT----T-TCT------T-GT-AGA------CC-A--T-ATGAA-T---C---G---T---T-C--G-A---A---A-GGG-ACTAG-G-TCG-----TC-CCaaagcatatctactgtagattgca
gi|32                         :                                                                     tgcaaatatgtagacagtatcattatctaTTT-CCTGTA-G-T--C-T-A-GTGCTG--T--TGT-AAT-AT-T---T---AG--A---------TCTT---A----G---T--G-G--------T----T---------------------------A-----------C-C-C-A-------G-----TTAAT----A-TGT------T-GT-T-A------TT-T--T-TC--CTC---C---G---T---C-C-TG-ATG-A---A-GGG-GC-AG---TCG-----TC-CCG--AA-AA-T-T-TG-A-C---
gi|33                         :                                                                                                                                                                     ttatatgtagac---T--T-A--------T----T-T--T--TT-T----------------G-----T--T-TC-T-C-A-----T-GT----T--AA----T-TCT------T-TT---A------TC-T--T-AC--C-C---C---GTCAT---C-C-TG-AAG-AACCA-GGG-AC-AA-T-TAG------C-CCG--AA-AA---A-CG-ACC---A-ATTTTTTTATGTTT--G-T--GCC---TT--GG-TC-
gi|34                         :                                                                                                                                                                                                                T-C---------------CA-----T--T-TT-T-C-T-----T-G-----T--AT----T-TCT------T-AT-A-A------TC-A--TAAC--C-C---C---G---T---C-G-TG-AAC-A---A-CAA-GC-AG-G-TCG-----TC-CCA--AA------------------------ATATT------------TC--GTT--TT-TC-A------TT-T------TA---------A-TGC---TT------TAT-AT-GCTTACATA--TT-
gi|37                         :                                                                                                                                                                                                                                                  -C-A-----T-G-----T--AT----T-TCG------T-AT-A-A------TC-A--T-AC--C-C---C---G---T---C-C-TG-CAG-A---A-GGG-GC-AG-G-TTG-----TC-CCG--AA-AT-T-T-GG-A-C---A-AATTTA-ATTGTAC--G-T--GTC--GTT--GG-TC-T------TT-T------TG---------G-ct
gi|38                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          -AG-A-TTG-----TT-CCA--AA-AA-T-T-TG-A-A---A-GTTTAAT--TCTCC--G-T--GTC--GTT--GG-TC-A------TT-C------TA--------------T-TTT------TGT-AC-CC---CTTA--T
gi|39                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          -AG-A-TTG-----TT-CCA--AA-AA-T-T-TG-A-A---A-GTTTAAT--TCTCC--G-T--GTC--GTT--GG-TC-A------TT-C------TA--------------T-TTT------TGT-AC-CC---CTTA--Tgtagtatttataaaataaa
gi|4                          :                                                                                  TATACTCCC--ATC-GTTT-CC-GTA-G-T--A-T-A-G----A--T--T-T-AGT-GT-T---T---AG--A---------T-TT---TTGTTG---T--T-G--------T----T-T--T--TT-T---------------TA-----T--C-TC-T-C-A-----T-G-----T--AT----T-TCT------T-GT-A-A------CC-A--T-GA--T-T---C---G---T---C-C-TG-AAA-G---A-GGG-AC-AG-G-TCG-----T--CCG--AA-AA-T-T-TG-A-C---T-TTTTAAC-TTAT----G-T--GTC--GTT---G-TC-A-------T-T------TA---------G-TGCT-TTA------TAT-AA-TCTT--TTGATTT-TGA--CCTTGCA-TCTTT--CATT--A-----ATCCAA-ACCTGGCGA-T-GT-TTGAGTgtagtatttataaaataaa
gi|40                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                     cacattgtaatatgtaaacaata---T---C-T-TG-AAG-A---A-GGG-AC-AG-G-TCA-----TC-TCT--AA-GA-T-T-T----------ATGTG--GTCGCTC--A-T--ATC--GTG--GC-CC-ATTAAATTT-T------TA---------G-TGCT-GTG------TGT-GT-Cgtt
gi|41                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            G-G-TCG-----TC-CCG--AA-AA-T-T-TG-A-C---A-ATTTA--ATTGCTC--G-T--GTC--GTT--GG-TC-A------TT-CTAGA--TA---------G-TGAT-TTA------TAT-AT-
gi|42                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            ---T---C-C-TA-AGA-A---A-GGG-AC-GA-G-TCG-----TT-CCT--AG-GA-T-C-TA-T-C---G-A------ATTGTCA--G-T--TTC--GTT--atatata
gi|44                         :                                                                              tttaTATACTCCC--ATC-GTTT-CC-GTA-G-aatgaacac
gi|45                         :                                                                                                                                                                       gtaactgtttcacattgtaatatgtaaacaata-T--T--TT-T----------------------T--T-TC-T-C-A-----T-G-----T--AA----T-TCT------T-TT-A-A------TC-T--T-AC--C-CCGTC---G---T---C-C-TG-AAG-A---A-GGG-
gi|46                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                     ta-A--T-AC--C-C---C---G---T---C-C-TG-AAG-A---A-GGG-AC-AG-G-TTGAT---TC-TCG--TA-AA-T-T-T
gi|47                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           AC--CATT--A----GATCCGACACTTCG-GA-T-G--TTGAGT
gi|5                          :                                                                                                   TT-TC-ATA-GAT--A-T-A-C----A--T--G-T-AGT----T---T---AG--C---------T-GT---T----G---TGCTAG--------T----T-T--T--AT-T---------------TA-----T--T-ACATAC-A-----T-G-----T--AT----T-TCTATCTTAT-GT-A-AACCTCTTC-A--T-------T---T---G---T---C-C-TA-AAG-A---A-GGG-A---------G-----TC-TCA--AA-AA-T-T-TT-A-C---A-ATGTA--ATTGTTT--G-T--GTA--GTT--GG-ggtgttggtct
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