lowQualScore : 111111111111111111111111111111111111111111111111111 11111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 1111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 111111111111111111111111 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 11111111111111111111111111111 111111111111111111111111111111111111111 11111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111
lowQualScore : 2222222222 11111111 111 111111111111 111111111 111111111 11111111111 111 1111 22222222222 1111111111 33333333333333333333 11111 1 5555555555555555555555555555555555555555555 11111111 1111 2222222222222222222222222 2222 222 22 111 111111111111111111111111111111111111111111111111111 1111 1 333333333 111 3333333333 3333333333333333 22222222 11 1111111 111111 2222 111 1111 11 11 111 3333333333 111 11 11111 3333333333333333 111111 11 1111111 11111 444444444 333 111 1111 222222222 1 22 1 111111111 22222222 11 1 1 11111 11 111 22 55555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555 2222222 1 1111111 1111 1 1 2222 1 5555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555 222222 1111111 44444444444444 2222 111 1 8888888888888888888888888888888888888 2 1 1 1 333333333333333333 1 666666666666666 1 22 11 3333 3333333 11 11 11 11111 222 3333333333 44444444 55555555555555555 222 1 2222 1 22 99999999999 1 1 333333333333333333333333 222 777777777777777 3333333 2222222 88888888888888888888 111111 11 1111 11111111111 1 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 1 1 2222 11 2222 00000000000000000000000000000 6666666666 222 44444444 1111 11 1 3333 22 1 555555 11111111 1111 111 1111 111 333333333333333333333333333333333333333 33 2222 111111 22222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 22222 66666666666666666666666666 33333 7777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777 222222222222222222222 11111 111 1 11 1111 11 1111 333333333333 1 444444444444444444444444444444444 11111 11111 111 111 22 1111
lowQualScore : 4 5555555555 8888 55 3 3 55 22222222 7777 3 88 3 000 4 666666666666 4 55 888 4 99 55 4 4 55 4 333333333 4 99999 4 5 333333333 44444444444 888 000 5 4444 66 5 888 88888888888 777 5555555555 55 99999999999999999999 888 44444 5 2 66 2222222222222222222222222222222222222222222 77 66666666 7777 77 5 5555555555555555555555555 7777 333 6 55 99 4 6 444 111111111111111111111111111111111111111111111111111 4444 8888 77 5 77 0 1 5 5 1 5 111111111 000 8888888888 5 77 5555555555555555 5 5 77 66666666 22 5 6 6 7777777 999999 3333 111 6 6 4444 44 1 6 77 6 00 6 444 9999999999 5 5 222 5 33 33333 5 77 8888888888888888 6 555555 99 44 6 3 6666666 66666 6 6 99 6 333333333 3 888 111 3 6 4444 111111111 6 0 66 5 888888888 88 33333333 99 0 6 99999 99 99 333 77 11111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 5555555 3 8888888 3 4444 0 5 1111 0 9999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999 6 111111 7 9999999 77777777777777 0000 666 0 2222222222222222222222222222222222222 3 7 3 3 3 777777777777777777 3 1 888888888888888 3 22 33 0000 8888888 8 8 8 3 99 3 77 11 77777 777 9 0 8 5555555555 8 11111111 66666666666666666 555 3 8888 6 6 7 7 3 00 3 77777777777 3 7 2 666666666666666666666666 888 55 444444444444444 2 2222222 2222222 2 5 3 33333333333333333333 888888 11 88 2222 2 2 44444444444 0 8 6666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666 3 0 0 4444 22 66 7 5555 3 88888888888888888888888888888 6 8888888888 555 55555555 7 9999 99 3 0 3333 22 9 0 3 0 5 111111 1 88888 88888888 0000 6 1 000 99 4 5 6 4444 3 111 3 777777777777777777777777777777777777777 1 6 6 1 6 55 77 88 0000 999999 00000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 00000 6 11111111111111111111111111 6 6 6 55555 3 7777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777 0 000000000000000000000 999999 5 666 88888 1 999 0 5 66 88 66 0000 777 66 2 33 66 0000 66 888888888888 0 444444444444444444444444444444444 5 33333 5 55555 5 000 5 888 4 1 4 8 99 8 55 4 33 4 55 5555
lowQualScore : . .......... .... .. . . .. ........ .... . .. . ... . ............ . .. ... . .. .. . . .. . ......... . ..... . . ......... ........... ... ... . .... .. . ... ........... ... .......... .. .................... ... ..... . . .. ........................................... .. ........ .... .. . ......................... .... ... . .. .. . . ... ................................................... .... .... .. . .. . . . . . . ......... ... .......... . .. ................ . . .. ........ .. . . . ....... ...... .... ... . . .... .. . . .. . .. . ... .......... . . ... . .. ..... . .. ................ . ...... .. .. . . ....... ..... . . .. . ......... . ... ... . . .... ......... . . .. . ......... .. ........ .. . . ..... .. .. ... .. ....................................................................................................................................................................................................................................................................... ....... . ....... . .... . . .... . ..................................................................................... . ...... . ....... .............. .... ... . ..................................... . . . . . .................. . . ............... . .. .. .... ....... . . . . .. . .. .. ..... ... . . . .......... . ........ ................. ... . .... . . . . . .. . ........... . . . ........................ ... .. ............... . ....... ....... . . . .................... ...... .. .. .... . . ........... . . ................................................................................................................................................................................................................................................. . . . .... .. .. . .... . ............................. . .......... ... ........ . .... .. . . .... .. . . . . . ...... . ..... ........ .... . . ... .. . . . .... . ... . ....................................... . . . . . .. .. .. .... ...... ....................................................................................................................... ..... . .......................... . . . ..... . ...................................................................... . ..................... ...... . ... ..... . ... . . .. .. .. .... ... .. . .. .. .... .. ............ . ................................. . ..... . ..... . ... . ... . . . . .. . .. . .. . .. ....
lowQualScore : 4 7777777777 5555 00 6 6 77 44444444 7777 6 66 6 000 0 000000000000 0 55 777 0 00 55 0 0 55 0 555555555 0 22222 4 0 999999999 11111111111 888 000 0 4444 99 0 888 88888888888 000 2222222222 11 66666666666666666666 888 11111 0 0 99 5555555555555555555555555555555555555555555 99 33333333 9999 99 7 4444444444444444444444444 5555 333 7 33 22 2 7 000 777777777777777777777777777777777777777777777777777 2222 5555 99 7 99 1 4 7 7 7 7 666666666 000 7777777777 7 99 6666666666666666 7 7 99 00000000 99 7 7 7 8888888 222222 3333 777 7 7 2222 88 0 7 77 7 22 7 000 8888888888 7 7 999 7 66 77777 0 99 9999999999999999 7 888888 22 55 7 2 8888888 77777 7 7 22 7 333333333 2 777 777 5 7 2222 000000000 7 0 22 5 000000000 88 66666666 00 6 0 88888 55 00 888 55 99999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999 8888888 3 3333333 7 2222 0 0 2222 0 5555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555 7 000000 0 5555555 00000000000000 8888 888 0 2222222222222222222222222222222222222 2 8 3 3 3 000000000000000000 3 0 777777777777777 3 33 88 5555 4444444 0 0 0 2 22 2 88 00 88888 000 6 8 0 0000000000 0 88888888 00000000000000000 000 3 3333 7 7 3 3 3 00 2 00000000000 3 3 0 000000000000000000000000 000 55 222222222222222 5 0000000 5555555 5 0 2 77777777777777777777 222222 00 88 8888 5 5 55555555555 0 0 6666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666 5 0 0 8888 55 22 0 8888 2 22222222222222222222222222222 5 2222222222 222 22222222 0 5555 88 2 0 5555 22 2 0 2 8 6 888888 0 22222 22222222 0000 0 7 888 22 2 7 7 0000 2 333 2 111111111111111111111111111111111111111 0 7 7 7 7 00 77 33 8888 222222 44444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444 22222 7 33333333333333333333333333 7 7 7 22222 8 4444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444 8 333333333333333333333 666666 7 333 66666 7 555 0 0 99 88 99 6666 111 99 5 99 99 2222 99 444444444444 0 111111111111111111111111111111111 0 99999 0 11111 7 000 7 777 3 4 0 0 55 0 55 0 00 0 55 2222
consensus : CTAAATTA-AA----A--TTTTGT----T--T-GT-TT-GCGG-------T----TTC-CC--G-A---CCG-ACC----T-A-----GTAAA-T--TCGTTNC-GA-CT-GAA--A-AT-CT--T-T-T-------A-TTT--G--TAT-TT-A----C---CAGG--T--GATAT-TTT---TTTTTAT---TCATTT-CT--G-TT--GCG-AC---CGA-----------CCGA--AAAT-CT-----TATTT-CTGC----A-TT-----T--A---CCG---CTC--A--AAACA-TTTT--T-----------AT-----C--G-AA-AATT-C--TGA--TT--TTTT--TTT----CC--CGAT----AA--GGACT-A-------AGTAC-TCCTAGT-----TTTCTAC---CTTGTCC-GCA-CGCAAGC--TCGGAG-CTGAGA-CACTTCCGAAT---------------AC--C------AT--------------ATA------TACCA----AT-CG-TCAG--CGA-CT--ATAA-A-A-ACGTG-CTTA--TCAT-GCATCAAAA---GT-AT----C--A-T--TTTA-------AT-AT----AA-AATGCATAG-T--TT-CAN-A-AAGT-AA-ATGA-A-TTGAA---T--TTGCA------TTTA----GG---T-A-CGAAAT----TGTAGCGATAAGGGG-GAGGA-GG-TTGA-AG-GA-A-ATCG-TTAA----AGA-TA-TG-G-A-AA--GTTTCATA--T--ATCT--TT----------A--CG-GG-ACAAA----A-AACCA--TGGATTCAGACCCAA-CACAACT-T-----GTC-----CG-A-T--ACAG-AGAT---------TGAGAATCGGT--ATGAA---TTAAAACCAGATCAA-GT----CGCT---GC----A-CTTCGT-GCAATTTGAAGATGC--A---T--TATACA-TGTAT-GCCTAN-TACCAA--CTGGTTATAGAAATAA-NATACGCAGAATAAATATTNTGCTCCAGCAAAACGCNATCGCCATG-GC-GG-TAATG-A---TCA----AACGTTCAG-------------TG-----------TTA-TTGCACATA-ATN-AT-G--TTTAT---TT-----TTCA--TTTTTAT---A-TTC------------G----T------------TT-TGTAGT-A--A---AC-T-A--------------TGTG---GA-----T--ATTCAG------A-T-------TTGT-----------------GG-----ACGAT--A-CT-AA-TTTCCC----CCCCAAAC----GATAG-TGGACATGCGC----GA-GCCG-T-TATA------CATTTCGTTAAAAGAACCTAAAAGAACCATTTTTAAGAGAGAGAGGGAGAAAGAGCACTTAATAACGTTTGTCATTAAATA-TG---TTCGAG---GAA-ACCCC-----CA-------CACACA---CTGTGAN-AGA-GAAGAA-GA---AAAC-G---CAATGATT-CATTT-----CAGTTTTGTT-GGT-AGA-CAAAA-TACC-GAGTA-ATCGT-AA-TCGT-TCACAGACCCAGT-----------CCG-TGC-TATCT-AATCACAACGATGGCCCT--GCTT-CCATGAC----CAAC-TT-GATT-GTTGAA-NATGGTCGAATGAACACA--CTGAA----TCGGT--CCGAACGTAGGGATATGC-A----------ACCG-AAA-TATATTTTTTTTAACTCCC-----------------AAAG---TTCAA-CAA----GCGTGCACTTTGCTTGCAA-CTGTAAAATACAAGC-ACGTGGAAAGTGTTCATGTTAATATTGAA-TAAACACCGGGATGATCA---------CACATCA----GCCATAGTAAATACC-GTANGTAA--------------TACCGAAA------TAA-G--T--TTCTCCATCGAAATAAGT-GCATGACAAAA--CTGCAGAGGCAAACACTA--ATCTATTT--TTA-CC-TTGCCTNT-AAG-TATA--C-TTTA-TATTAT-ACCCAACA------------------T----------------------T----------------------ACCGC-TTG-----TTTTAAAG------------------AAAATTTCTAT-TTACC-GCTTATTCA--GTNAAGTGGG-AAA-TATA-CGATAAAA-AACTA-----A--ATAATACAATA------------A----------------TTT--------------CCGGACTGAATG-TAC-CC-A-CCGAC-TTTTTTTTAATATGG-GT-ACTAGT------A-----G----------T--T--ATGGGCCGAC--A-TG---NTTAGATGCATATG----AACAGACAAG--GCAA-TTGACACGAAG-AAAATACA-CTTT-TTCTTCAAAGA-ATAATATTTTTT-TA-TGTTACACATGTTCNATTGATTT----GCAC-G-TACTAGTAATTACAT--TTAC-TATATATGTA-GCAT--ACAACTG-CCGTGATA---ATTT--AC----GA--GT-G----NTGT--------TGCGACGTCAAAAA-CGGT-CATTG-GTG-ACTT-GAA-CTTGGA--C-CAGA------AAA---------A----------TTAAGTT----TTAT--GG-TTGTGCG------------TA-------------CCC-----CCCCCCCCCTC--------------------------CACTTC-TAG-G-TTTGAATT--------------G-CTC-------AC-AAAA-CACGATAAT-CGTACGATATA--A-TT--GC-AAA--TT---T--A--AAGATACA--AAA-A--AAAG-TACAT-A-AATGTA-TATN--ATATA-TA-CATGCATATGCACCTA-CAAAAGCA-G-T--A-CAGAC-AAA--CTAATATCAT-ATTATCAAAT-AAA-TAAAA--TA--TTTTAT--CG----ACC--TA--CCTACCCAGAG-AA--AAATAAG-GGC--CTACT-----TGAAGTTATTT-TTTG-------GCTTA------------------GAAAA-AAT----AAAATATTTTA---C-CTAC-CTA---CCGA-CC-TTACGTCCGTAAAT-C-G--G-TC--G-G--AAA-GG--GCAAACAAACAAT--TTTTTAATTTA
Reference ( gi|1 ) : CTAAATTA-AA----A--TTGTGT----T--T-GT-TT-GCGG-------T----TTC-CC--G-A---CCG-ACC----T-A-----GTAAA-T--TCGTTGC-GA-CG-GAA--A-AT-CT--T-T-T-------A-TTT--G--TAT-TT-A----C---CAGG--T--GATAT-TTT---TTTTTAT---TCATTT-CT--G-TT--GCG-AC---CGA-----------CCGA--AAAT-CT-----TATTT-CTGC----A-TT-----T--A---CCG---CTC--A--AAACA-TATT--T-----------AT-----C--G-AA-AATT-C--TGA------TTTT--TTT----CC--CGAT----AA--GGACT-A-------AGTAC-TCCTAGT-----TTTCTA----CTTGT-C-GCA-CGCAAGC--TCAGAG-CTGAGG-CACTTCCGAAT---------------A---C------AT--------------ATA------TACCA----AT-CG-TCAG--CGA-CT--ATAA-A-A-ACGTG-CTTA--TCAT-GCATCAAAA---GTAAT----C--A-T--TTTA-------A--AT----AA-AATGCATAG-T--TC-TAA-A-AAGT-AA-ATGA-A-TTGAG---T--TTGCA------TTTA----GG---T-A-CGAAAT----TGTAGCAATAAAGGG-GAGGA-GG-TTGA-AG-GA-G-ATCGGTTAA----AGA-TA-TG-G-A-AA--GTTTCATA--T--ATCT--TT----------A--C--GG-ACAAA----A-AACCA--TGGATTCAGAACCAA-CACAACT-T-----GTC-----CG-A-T--ACAG-AGAT---------TGAGAATCGGTAAATGAA---TTAAAACCAGATCAA-GT----CGCT---GC----A-CTTCGT-GCAAATTTAAGATGC--A---T--TATACA-TGTAT-GCCCAA-TACCAA--CTGGTTATAG-AATAA-GATACACAGAATAGATATTTTGCTCCA--AAAACGCAATCTCCATGTGT-GG-TAATG-A---TCA----AACGTTCAG-------------T------------TTA-TTGCACATA-ATG-AT-G--TTTAT---TT-----TTCA--TTTTTAT---A-TTC------------G----T------------TT-TGTAGTTA--A---AC-T-A--------------TGTG---GA-----T--ATTCAG------A-T-------TTGT-----------------GG-----ACGAT--A-CT-AA-TTTCCC----CCCCAAAC----GATAG-TGGACATGCGC----GA-GCCG-TGTATAATGAACCATTTTTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCATTACATA-TG---TTTGAG---GAA-ACCCC-----TA-------CACACA---CTGTGAA-AGA-GAAAAATGA---AAAC-G---CAATGATTTCATTT-----CAGTTTTGTTTGGT-AGA-CAAAA-TACC-GAGTACATCGTAAAATCGT-TCATAGACCCAGT-----------CCG-TGC-TATCTCAATCACAACGATGGCCTT--GCTTTCCATGAC----CAAC-TT-GATT-GTTGAA-TATGGTCGAATGGACACA--CTGAA----TCGGT--CCGAACGTAAGGGTATGC-A----------ACCG-AAA-TATATTTTTTTTAACTCCC-----------------AAAG---TTCAA-CAA----GCCTGCACTTTGCTTGCAA-CTGTAAAATACAAGC-ACGTGGAAAGTGTTCAA--TAAT-TTGAA-TAAACACCGGGATGATCA--ATGCATGCATATCA----GCCATAGTAAATACCCGTAAGTAA--------------TACCGAAA------TAA-G--T--TTCTTTATCGAAATAAGT-GCATGACAAAATTCTGCAGAGGCAAACACTA--ATCTATTT--TTA-CC-TTGCCTGT-AAG-TATA--C-TTTA-TATTAT-A-C-AACA------------------T----------------------T----------------------ACCGC-TTG-----TTTTAAAG------------------AAATTTTCTAT-TTACC-GTTTATTCA--GTAAAGTGGG-AAA-TATA-CGATACA-----TA-----A--ATAATACAATA------------A----------------TTT--------------CCTGACTGAATG-TAC-C--A-CCGAC-TTTTTTTTAATATGG-GT-ACTAGT------A-----G----------T--T--ATGGGCCGAC----T----TTTAGATAAATATG----AACAGACAAG--GCAA-TTGACACGAAG-AAAAT-CA-CTTTGTTCTTCAAAGA-ATAATATTTTTTATACTGTTACACATGTTCCATTGATTT----GCAC-G-TACTAGTGATTACAT--TTAC-TATATATGTA-GCAT--ACAACTG-CCGTGATA---A-----AC----GA--GT-G----TTGC--------TGCGACGTCAAAAA-CGGT-CATTG-GTGAACTT-AAA-CTTGGA--C-CAGA------AAA---------A----------TTAAGTT----TTAT--GG-TTGTGCG------------TA-------------CCC-----CCCCCCCCCTC--------------------------CACTTT-TAA-G-TTTGAATT--------------G-CTC-------AC-AAAA-CACAATAAT-TATACGATATA--A-TT--GC-AAG--TT---T--A--AAGATACA--AAA-A--AAAGTTACAT-A-AATGTA-TATT--ATATA-TA-CATGTATATGCACCTA-CAAAAGCA-G-T--A-CAGGC-AAA--CTAATATCAT-ATTATCAAAT-AAA-TAAAA--TA--TTTTAT--CG----ACC--TA--CCTACCCAGAG-AA--AAATAAG-GGC--CTACT-----TGAAAATATTT-TTTG-------GCTTA------------------GAAAA-AAT----AAAATATTTTA---C-CTAC-CTA---CCGA-CC-TAACGTCCGTAAAT-C-G--G-TC--G-G--AAA-GG--GCAAACAAACAAT--TTTTTAATTTA
gi|2 : CTAAATTA-AA----A--TT-TGT----T--T-GT-TT-GCGG-------T----CTC-CC--G-AA--CCG-ACC----C-A-----GTAAA-T--TCGTT-C-GA-CT-GAA--A--T-CT--T-T-T-------A-CTT--G--TATATT-A----C---CAGG--T--GATAT-TTT---TTTT-AT---TCATTT-CT----TT--GCG-AC---CGA-----------CCGA--AAAT-CT-----TATTT-CTGC----ATTT-----T--A---CCG---CTC-----AAACATTTTT--T-----------AT-----C--G--A-AATT-C--TGATATT--TTTT--TTT----TC--CGAT----TT--AGACT-ACAGCTGTAATAC-TCGT-GT-----TTTCTA----CTTGTCC-GCA-CGCAGCC--TCGGAG-CTGAGA-CACTTCCGAAT---------------ACCGC------ATGTACACTGTACATAATA------TACCA----AT-CG-TCAG--CGA-CT--ATGA-A-A-ACGTGCCTTA--T-----CATCGAAA---GT-AT----C--A-T--TTTA-------ATTAT----AAGAATGCATAG-T--TT-CAATA-AAGT-GA-ATT--A-TTGAA---T--TTGCA------TTTA----GG---T-A-CGAAAT----TGTAGC-ATACGGGG-GAGGA-GG-TTGA-A--GA-A-ATCG--TAA----AGA-TA-TGCG-A-AA--ATTTCATA--T--ATCT--TT----------AGGC--GGAACAAA----A-AACCA--T-GATTCAGACCCAA-CAC--CT-T-----GTC-----CGCA-T--ACAG---------------------------ATGAA---TTAAAA-CAGAT-AA-GT----CGCT---GC----A-CTTTAT-GCAATTTGAAGATGC--A---T--CATACA-T-TAT-G--CAA-TACCAAC-CTGG-TATAGAAATAA-GATACGCAGAATAAATA-TTTGCTCCA--AAAACGCATTCATCATG-GC-GGCTAATG-A---TCA----AACGTTCAG-------------TGAAAGTGTGTAATTA-TTGCACATA-ATG-AG-A----TA-----------TTCA--TTTT--T---A-TTC------------G----T------------TT-TGTAGT----A---AC-T-A--------------T-TG---GA-----T--ATTCAG------A-T-------GTG------------------GG-----ACAAT--A-CT-AATTTTCCC----CTCCAAAC----GATAG-TGGACAT-CGC----GA-GCCG-T-TATA
gi|18 : CTAAATTA-GA----AATTTTTGT----T--T-GT-T--GCGG-------T----TTC-CC--G-A---C-G-ACCCCATT-G-----TTGAC-T--TCGTTACCGA-CGTGAATCA-ATACT--T-TCT-------A-TTTTGA--TGT-TTGA----CGTACAGG--TTGAATATATCT---TTTTTATATTTCGTTT-CTCTG-TT---TA-AC---CGATACCTGTGGAGCCGATTAAAT--T-----TATTTTCTGTGACAA-TT-----C--ATACCCGAAACAC--A--AAACA-TTTTCCT-----------AT-----TATG-AACAATT-C--TGA------TTTT--TTT----TC--AGCTA---AA--GGACT-A-------AGTATATCCTGAT-----TTtttctatttaaccgagagacgagaaattaaataatgttgagaaccctacacactgtgaagagaagatttcatttcagtttgttggtagacaaaataccgaacatcgtaaattcatatatagacccagtcctgcctatctcaatcacaacgatggccttttgcttcaatgaccacttgattgttgaaatatgatcgaataaacacactgaatcggtacgaacgtgagggtatgcaaccgcaaatattttttaaatcccaaagttcaacaagcctgcactttgctgcaattgtaaaataaaagacgtggaaagtgttcatgttaatattgaaataaacaccggtgatcatgatgccatatcactcagccatagtaaatacccgtaagtataccaaaataagttcttatcgaaataaggcatgacataaatctgcagaggcaaacactaatctatttttaccttgcctgtaagataactttatattataccaacatttcatgttaatataaagttaccgcttgttttaaagaaatttctatttatcgcttattcagtaaagtgaaaatacgatacatacatggaataacaaataaatttattatctatttcttgactgaatgataccaccgactttttttttaatatggcgtactagtaattagtagagtttatggaccgaccaattagatgcatatacagcaagcaagacacgaagaaaaatacactttttcttcaagaataatatttattacacatgttcaattgattgcacgctactagtaattacatttacatattatgtagcctacaactgcgtgataatttacatgagttgcgacgtcaaaaacggtcatggtgacttaaaacttggacagaaaaataacttttatggttgtgcgcttgcgaccctccgcccccccccccctcccccccctccacgcccccccccccctcactttaagtttgaattgctcacaaaacacaataatattacgatatatttgcgcaagtttaagatacaaaacaacagtacataaatgtttattataatatctgtatatgcatcacaaagcatacagacaaaactatatcattatcaaataagatattttatcgtaaaatttatcacaaatgaaaattcttctataaacaaaaaaatttatttcttataaaaaatggtaaaaata
gi|6 : TAAATTTTAA----A--TTTTGT----T--T-GC----GCGG-------T----TTC-CC--G-GGACCCG-ACC----TCA-----GTAAA-T--TCGTTTC-GA-CT-GAA--A-AT-CT--T-CCT-------A-TTT-----TAT-TT-A----C----AGG--T--G-TAT-TGT---TTTTTAT---TCATTTTCT--G-TT--GCGGAC---CGA-----------C-------AT-CTCCCTCTCTCT-CT-C----A-ATGACAAT--AATCCTG---ACC--T--AAACA-TATA--T-----------ATATATTC--ATAA-AATT-C--TGA------TTTT--TTTTTTACC--CAAT----AA--GGACT-A--------GTGG-TCCTAGT-----TTTCTA------TGT-CCGCATCGCA-GC--TCGGAGACTGAGA-CACTTCCAAAT---------------A---CCGC---AT--------------GTACATTATTACTACTCCAT-CG-TCAG--CGATCT--ATAA-ACA-ACGTT-CTTA--TCATCGCCT----A---GTTACGTGGC--G-TGCTTTACCTATATG--AG----AA-GATGCATAG-T--TT-CAT-TTAAGT-AA-ATGAGA-TTGAA---TGATTGCA------TTTAAA--GG---TTA-CGAAATGTCTCGTAG-GATAAGGGGAGAAGA-GG-TTTA-AG-GA-ATATCG--TACCCCCGGA-TA--G-G-A-AAAAGTTTCATA--T--ATCTTCTT----------A--CCAGG-ACAAA----ACAAACA--TGCATTCAG-ACCAA-CACAACTAT-----GTCGGGTGCG-A-T--ACAG-AGATAATGA----TGAG-ATCGGTTTATGAA---ATTAAACCAGATCAACGT----CGCT---GC----AGCTTTGT-GCATTTTAAAGATTC--A---TAGTATAC--TGTATGGCCTAATTACCAAGGCTGGTTATAG-A
gi|14 : TAAATTA-AA----A--AATTGT----T--T-GT-TT-GCCC-------T----TTT-CC--G-A---CC
gi|24 : gatttcgccctccccccccccccccttccactttcgacgtttgaattgctcacaaaaacacaatatccgatatatttgcaaagttttagtaagacacacaaaaaccaaagttacattataatgtagtataatatatatcgtgtatatgcatctaacaaaagcaggtaacagacaaaaactaatatcattatcaaataaataaaaaatattttattccgacccgtatccctacgcagaggataaagtaatcggcctactgaagttattttttgtttggcttaagaaaataaaatattctgaggcgctacctggagcagaccctagcgttcgtaaatcgTAAATTA-AA----A--AT-TGT----T--T-GT-TT-GCCC-------T----TTT-CC--GAA---CCGCATT----T-ACGGACGTAGG-G--TCGGTAG-GA-TT-AAA--T-AT--T--T-T-T-------ATTTT--G--TA
gi|8 : aaaaaaaaaaaataatctttatcgacctacctacccagagaaaataaacctactgaagttattttttggctAAATTA-AA----A--TTTTGTATACT--TAGT-TTAGCGAGTCAGATT----TTCTCC--G-A---CCG-ACC----C-A-----GTAAA-T--TCCTTTCCGA-CT-GAA--AGAT-CT--TGT-T-------A-TAT--GGGTAT-TT-AGACGC---CAGGGGTA-GATCTATTTACATTTTTAT---TCATTT-CT--GCTT--GCG-AC---CGA-----------CCGA--AATT-TT-----TATTT-CTGC----AGTT-----T--A----CG---CTC--A--AAAC--TATT--TTATGTCCATAAAT-----C--ACAA-AGTTCC--TGAATTTTTTTTT--TTT----TCAGCTAT----AATCGGACTAA-------AGCA--TTCTAGTTATTATTTCCATTACCTTCC-C-GCA-CGT-AGC--TC-GAG-CTGAGATTACTTCCAAATGTGGAACGCAATGTAA---C------AT--------------ATA------T-CCC----AT-CATTCAGTCTGA-CTCAAT-A-A-A-CCGTG-CTTAATTCAT---ATCAAAAAAGGTAG-----C--ATT--TTTA-------A--ATATGAAA-AATGCATAG-TTATCATAA-T-AAGT-AATATGA-ATTTGAATATT--TTGCAGAACGTTTCAAATTGGGGTT-ATCGAAA-----TGT-GC-ATAAGAGG-GAGGATGGTTTGA-AGAGG-A-ATCGTTTAA----GAG-TAGTG-G-ACAA--G-TTCATAAGTAAATCT--TT----------A--CG-GG-AC-AA----C-AACCT--GGGGTTCAGTCCCAAGCAGCACT-CATAAGGCC-----CG-A-TAAACAG-AGATAAATGAATGTGAGAATCGGT---TGAATATTTAAAACAAGATCAA-GT----C
gi|26 : gcctaAAAT---AA----C--TTGTGT----TATT-GTGTT-GCGG-------TATATTTC-CCACG-A---CCG-ACCC---T-A-----GTAAA-TTATC-TTGC-GA-CG---A--A-AT-AT--A-T-C-------A--TT--A--TAT-TT-T----T------G--T--GGTAT-TTT---Tcc
gi|4 : AATTA-AATTTCA--TTGT---------T-GT-TT-GCG--------T----TTC-CG--A-A---CCG-ACC----C-A-----GTAAACT--TCGTTCC-GAACT-ACA--A-AT-CT--T-T-T-------A-TTT--G--TAT-TT-A----C---CAG----------T-TAT---TTTTTAT---TCATTT-CT--G-TTTGGCG-ACAAACGA-----------CCGA--AA-T-CT------ATT--CTGC----AATT-----T--A---CCG---CT---A--AAACA-TGTT--TTT---------AT-----C--G-AA---TT-CACTGA------TTTTATCTT----TC--CGATTATTAA--GGACT-A-------------------T-----TGTCTA----CTTGC-CCGAA-CGCA-GCAATGA-AG---GAGA-CACTTCCAAAT---------------A---CTGCATGAC--------------ATAA-----TACCA----AT------------------ATAACA-A-ACGAG-ACTA----AT--CATCAAAA---GTA-T----C--A-T--TTTA-------A---T----AT-AATGC-TAG-T--TT-CAT-A-AAGT-AA--TGA-A-TTGAA---T--TTGCA------TTTA----GG---T-A-CGAA-T----TGCAGTCATAAGGGG-CAGGA-GG-TTGACAG-GATA-ATCG-TCAA----AGAACA-TG-G-A-AAA-GTATCATA-----ATTT--TCGGGACCAAAAA--C--AA-ACAAACATAA-AACCA--CGGATTC-GACCCAG-AACAACT-T-----GTC-----CG-ACT--ACAG-AGAT---------CGAGAATCGGTTA-TGAA---TTAAAGCCAGATCA--GTTTTTCTCTAGCGCCAAAA-CTTCGT-GCA--TTGAAGATTCCAA---T--TATACA-TGCAT-GTCTAC-TCCAAA--CTG-TCATGG-AA-------ACA-AAAATACAGAT--------G--AATACGT----TCCA---AT-G---AAAG-A---TT-------TGT--AG-------------C------------T-G-TTGCACATA-ATC-AT-------AT---TT-----TTGA--TTTGAA----A-C------------------------------------ATAGT-A--A---AC-T-A--------------TG-G---GA-----T--ATTCAG------ATT-------TTGTCTATTTATAAATTGTTGGG-----ACAAT--A----AA-TTT--T----TCCCAAAC----GATagaacatcctgaccacaaatatcttctttatttttcatttctg
gi|33 : AATTA-AA----------TGT----T--T-GT-TT-GCAG-------T----TTC-CC--G-A---CCG-ACC----C-A-----GTAAA-T--TCGTTTC-GA-CT-GAA--A-AT-ATAAT-T-TAATTCACA-TTT--G--TAT-T
gi|11 : ----T--T-GT-T--GCGG-------T----TTC-CC--G-A---CCG-ACC----T-A-----GTAAT-T--TCGTTGC-GA-CG-GAA--A-AT-CT--T-T-T-------A-TTT--G--TAT-TT-A----C---CAGG--T--GATA--TTT---TTTTTAT---TCATTT-CT----TT--GCG-AC---CGA-----------CCGA--AAGTGCT-----TATTT-CTGC----ATTT-----T--A---CCG---CTC--AACAAACA-T-TT--T-----------AT-----C--G--A-ATTT-C--TGGACTT--TTTT--TTT----CG--CGAT----AA--GGA-T-A-------AGTAC-TCC-AGT-----TTTCTAC---CTTGTCC-GCA-CGC-AGC--TCAGAG-CTGA-G-CACTTCCGAAT---------------AC--C------AT--------------AT-------TACCA----AT-CG-TCAG--CGA-CT--ATAACA-A-ACGTG-CTT---TCAT-GCATCAAAA---GT-AT----CA-A-T--TTTA-------A--AT----AA-AATGCATAG-T--TT-CTA-A-AAGT--A-ATGA-A-TTGAA---T--TTGCA------TTTA----GG---T-A-CGAAAT----TGTAGCATAAAAGGA-GAGGA--G-TTG--AG-GA-G-ATC-GT--A----AGA-TA-TG-GAA-AA--GTTTCATA--T--A--C--TT----------A--CG-GG-ACAAA----A-AACCA--TGGATTCAGACCCAA-CACAACT-T-----GTC-----CG-A-T--ACAG-AAGA---------TGAGAATCGGT-AATGAA---TTAAAACCAGATCAA-GT----CGCT---GC----A-CT
gi|10 : --T-GT-TT-GCGG-------T----TTC-CCC-G-A---CCG-ACC----T-A-----GTAAA-T--TCGTTGC-GA-CG-GAA--A-AT-CT--T-T-T-------A-TTT--G--TAT-TT-A----C---CAGG--T--GATA---TT---TTTTTAT---TCATTT-CT--G-TT--GCG-AC---CGAC----------CCG----AAT-CT-----TATTT-CTGC----A-TT-----TTAA---CCG---CTCAAA--AAACA-TTTT--T-----------AT-----C--G----AATTCC--TGACTT---TTTT--TTT----CG--CGAT----AA--GGACT-A-------AGTAC-TCC-AGT-----TTTCTAC---CTTGTCC-GCA-CGC-AGC--TCAGAG-CTGA-G-CACTTCCGAAT---------------AC--C------AT--------------ATA------TACCA----ATCCG-TCAG--CGA-CT--ATAC-A-A-ACG-G-CTT---TCAT-GCATCAAAA---GT-AT----CAAA-T--TTTA-------AT-AT----AA-AATGCATAGTT--TC-T---A-AAGT--A-ATGA-A-TTGAA---T--TTGCA------TTTA-----G---T-A-CGAAAT----TGTAGCATAAAAGGA-GAAGG-AG-TTGT-AG-GA-G-ATC-GT--------GA-TA-TG-GAA-AA--GTTTCATA--T--A-CT--GT----------A--CG-GG-ACAAA----A-AACCAATTGGATTCA-ACCCAA-CACAACT-T-----GTC-----CG-A-T--ACAGAAGAT---------TGAGAATCGGT--ATGAA---TT-AAACCAGATCAA-GT----CGCT----C----A-CTT
gi|35 : ATTG-CT--G-TT--GCG-AC---CAA-----------CCGA--AA----------TAT-----------------------A---CCA---CTC--A--AAACA-TTTT--T-----------AT-----C--G--A-AATT-C--T
gi|34 : --CGA-CT--ATAA-A-GGACGTG-CTT---TCA----GTCAAAA---GT-AT----C--A-T--TTTA-------AT-AT----AA-AATACAT-G-T--TT-CAT-A-AAGTCAA-AT
gi|2 : TAA----AGA-TA-TATG-A-AA--TTTTCGCA--T--ATCT--TT----------A--C--G
gi|7 : ctaaattaaaatttgtttgtttgcggtctcccgaaccgacccagtaaattcgttcgactgaaatcttttacttgtatattaccaggtgatattttttttattcatttctttgcgaccgaccgaaaatcttatttctgcattttaccgctcaaacattttttatcgaaattctgatattttttttttccgatttagactacagctgtaatactcgtgttttctacttgtccgcacgcagcctcggagctgagacacttccgaataccgcatgtacactgtacataatataccaatcgtcagcgactatgaaaacgtgccttatcatcgaaagtatcattttaattataagaatgcatagtttcaataaagtgaattattgaatttgcatttaggtacgaaattgtagcatacgggggaggaggttgaagaaat-CTTCGTAGCAATTTGGAGATGC--AAATT--CATACA-TGTAT-AC-----TGTCGT--ATGG----AA-AATAATAATACGAGAAATGAATATTCTGCTCCAGCAAAACGCCATCGACATG-GC-GG-TAATG-AACGTCAGTGAAAAGATTTG-------------TA-----------TTA-TTGCACATA-ATC-ATTA--TTTAT---TT-----T-CG--TTTA-AT---A-TTC------------G----T------------CTGTGTAGGTA--A------C-A--------------TGTG---TA-----T--ATTCAG------A-A-------TTGT-----------------GGGA---ACGATT-A-C--AA-TTTTTC----C---AAAC----GATAG-TGGACATGTGC----GA-GCCG-T---TA------CATTTCGTTAAAAGAACCTAAAAGAACCATTTTTAAGAGAGAGAGGGAGAAAGAGCACTTAATAACGTTTGTCAATTCGTG-T----TTCGAG---GAA-ACCTA-----CA-------CATACA---CTGTGAC-AGA-AGA----GA---AAACCG---CAATAATTACATTTTGAAGCAGTTTTGTT-GGTCAGA-CAAAA-TA----AATA-AT-----AATCGT-TCACAGACCCAGT-----------CCGTTGC-TGTC----CCACAACGAAAGGCCT--GC--TCCATGAC----C-AC-TT--ATT-GTTAGA-AATGGTTG-ATGA--ACA--CTGAA----TCAGTCCCCGAACATAGGGACATGC-A----------ACCA-AAA-T-CA-TTTTTTTAACTCCA-----------------AAGG---Tggcggaacaaaaaaccatgattcagacccaacaccttgtccgcatacagatgaattaaaacagataagtcgctgcactttatgcaatttgaagatgcatcatacattatgcaataccaacctggtatagaaataagatacgcagaataaatatttgctccaaaaacgcattcatcatggcggctaatgatcaaacgttcagtgaaagtgtgtaattattgcacataatgagatattcatttttattcgttttgtagtaactattggatattcagatgtgggacaatactaattttcccctccaaacgatagtggacatcgcgagccgttatatttctatttaaccgagagacgagaaattaaataatgttgagaaccctacacactgtgaagagaagatttcatttcagtttgttggtagacaaaataccgaacatcgtaaattcatatatagacccagtcctgcctatctcaatcacaacgatggccttttgcttcaatgaccacttgattgttgaaatatgatcgaataaacacactgaatcggtacgaacgtgagggtatgcaaccgcaaatattttttaaatcccaaagttcaacaagcctgcactttgctgcaattgtaaaataaaagacgtggaaagtgttcatgttaatattgaaataaacaccggtgatcatgatgccatatcactcagccatagtaaatacccgtaagtataccaaaataagttcttatcgaaataaggcatgacataaatctgcagaggcaaacactaatctatttttaccttgcctgtaagataactttatattataccaacatttcatgttaatataaagttaccgcttgttttaaagaaatttctatttatcgcttattcagtaaagtgaaaatacgatacatacatggaataacaaataaatttattatctatttcttgactgaatgataccaccgactttttttttaatatggcgtactagtaattagtagagtttatggaccgaccaattagatgcatatacagcaagcaagacacgaagaaaaatacactttttcttcaagaataatatttattacacatgttcaattgattgcacgctactagtaattacatttacatattatgtagcctacaactgcgtgataatttacatgagttgcgacgtcaaaaacggtcatggtgacttaaaacttggacagaaaaataacttttatggttgtgcgcttgcgaccctccgcccccccccccctcccccccctccacgcccccccccccctcactttaagtttgaattgctcacaaaacacaataatattacgatatatttgcgcaagtttaagatacaaaacaacagtacataaatgtttattataatatctgtatatgcatcacaaagcatacagacaaaactatatcattatcaaataagatattttatcgtaaaatttatcacaaatgaaaattcttctataaacaaaaaaatttatttcttataaaaaatggtaaaaata
gi|5 : ATGC--A---T--TATACAATGTAT-GCCTAT-AACCAA--CTGGTTATAGAAATCA-TATAC-CAGATTCAATATTATGCTCCAGCAAAACGCTATCACCATGGGCAGG-TAATGAA---TCA----AACGTTCAGTGACAGATTTGTAT------------TTATTTGCAC-TA-ATC-AT-GTATTTATTTATT-----TTCACTCTCTTAC---ACTTC------------GTCATT------------TT-CGTAGTAA--AGTGAC-T-AACTGAATCGAATGTTGTGTGCGG-----TGAATCGAGGGGGT-A-A-------TTGT-----------------GGGAAATATGAT--ACCT-AATTTTCCC----CCCCAAAC----GATAG-TGGACATGCGC----GAGGCCG-T-TATattaaactggttccataagcaatattatgtaaagatttcagcaacgctgcatgcacttgcttgcaactgtgaaatacaagcaatgtgggaa
gi|27 : TA-TT--ACATACATGTAT-G--TTTA-------------CA--TTTTTATTCGG-TTT------------T----T------------TT-TTTAGT----A---AC-TTA--------------TGAG---GA-----T--ATTTAG------A-T-------TTtttcgttcaaaaacatgaacattttaacgagagagagagagagagagagcgcattaaatatgaagtttgaggaataccccaggtacacacacactgtgaacagagaggaaggagaaaaacgaatgtttgttggtagaacaaaaataccagagtaatcgtcagtcgtatcacaaacccagttacaactgcacctgtactacctaatcacaacgatggccttgcttcatgacaccccatcgttagatttgttgaaaatggtcgaatgaacacaccctgaataatttggtcgaatgtagggatatgcaaaccgaaattattttttttttactccccaatagtgtagtttgttaaagtattccaaccaagcgtgctttgcttggaacctgtaaaatacaagcacgggaaagtgttc
gi|16 : gatgggaatttaaggacagcgctcattgaaaattttgTG-AT-G--TTTAT---TTATTTGTTCATTTTTTTAT---A-TTTTTGATAGATTAAG----TTTCTTACTTCCGTT-TATGGTTAGTA---ACTT-A--------------T-TG---GAGTTAGT--ATCC----------T-------TTGTG----------------GG-----ACGATACA-CTAAA-TTTCCCCCCACCCCATACCGAAGAGAGATGGACGT-CGCTCCTGA-GCCGTTGTAcctctttccgtaaacacatttgctaaacgat
gi|19 : aggtaatttcggattctaaacgttcatttgtaaagactttgttatttgcatttggtcacattattttaatt-AT-G--CTTGC---TT-----T-CA--TTTTTAT------TC------------A----T------------TT-TGTAGT-A--G---AA-T-A--------------TGAG---GA-----T--ATTCAG------A-T-------Tgtattttcggattttctttgtcggagaacatgaaccatttaaggtaagatagagtaagatgagag
gi|32 : tttgcatcagaaaacatatctttttgatgaggtttatgagaacggtcattgaaattttgtattcatttgtattcactTCTTAT---T-TTC------------G----T------------TT-T-TG--TA--A---AC-T-A--------------TGTG---GA-----T--ATTCAATTTGTTA-TCTATAAATTGT-----------------GG-----ACGAT--A-AT-AA-TTT-TT----CTCCAAAC----GACAagctccgtaaatacatttataaacggtgagacaaaactaattttattcgtattgttgagtagacaagcgtgacccattatatttttttcaacatttgataaagaacaaatttaat
gi|5 : CATTAAATA-TGAAGTTTGAG---GAATACCCCAGGTACA-------CACACA---CTGTGAACAGA-GAGGAAGGAGAAAAAC-G----AATG------------------TTTGTT-GGT-AGAACAAAAATACCAGAGTA-ATCGTCAG-TCGTATCACAAACCCAGTTACAACTGCACCTG-TAC-TACCT-AATCACAACGATGGCCTT--GCTT--CATGACACCCCATCGTTAGATTTGTTGAA-AATGGTCGAATGAACACACCCTGAATAATTTGGT---CGAATGTAGGGATATGCAA----------ACCG-AAATTAT-TTTTTTTTTACTCCCCAATAGTGTAGTTTGTTAAAGTATTCCAACCAA----GCGTG--CTTTGCTTGGAACCTGTAAAATACAAGC-ACG-GGAAAGTGTTCt
gi|2 : atgcattatacaatgtatgcctataaccaactggttatagaaatcatataccagattcaatattatgctccagcaaaacgctatcaccatgggcaggtaatgaatcaaacgttcagtgacagatttgtatttatttgcactaatcatgtatttatttattttcactctcttacacttcgtcattttcgtagtaaagtgactaactgaatcgaatgttgtgtgcggtgaatcgagggggtaattgtgggaaatatgatacctaattttcccccccaaacgatagtggacatgcgcgaggccgttattttcgttcaaaaacatgaacattttaacgagagagagagagagagagagcgATTAAATAATG---TT-GAG---AA----CCC-----TA-------CACAC-----TGTGAA--GA-GAA----------------------GATTTCATTT-----CAGTTT-GTT-GGT-AGA-CAAAA-TACC-GA--ACATCGTAAATTCAT-ATATAGACCCAGT-----------CC--TGCCTATCTCAATCACAACGATGGCCTTTTGCTT-CAATGAC----CA-C-TT-GATT-GTTGAAATATGATCGAATAAACACA--CTGAA----TCGGT--ACGAACGTGAGGGTATGC-A----------ACCGCAAA-TAT----TTTTTAAATCCC-----------------AAAG---TTCAA-CAA----GCCTGCACTTTGCT-GCAA-TTGTAAAATAAAAG--ACGTGGAAAGTGTTCATGTTAATATTGAAATAAACACCGG--TGATCATGATGC---CATATCACTCAGCCATAGTAAATACCCGTAAGTA---------------TACCAAAA------TAA-G--T--TC--TTATCGAAATAAG--GCATGACATAAATCTGCAGAGGCAAACACTA--ATCTATTT--TTA-CC-TTGCCTGT-AAGATA-A--C-TTTA-TATTAT-ACC-AACATTTCATGTTAATATAAAGT----------------------T----------------------ACCGC-TTG-----TTTTAAAG------------------AAA-TTTCTAT-TTATC-GCTTATTCA--GTAAAGT--G-AAA--ATA-CGATACA-----TACATGGA--ATAACA-AATAAATTTATTATCTA----------------TTT--------------CTTGACTGAATGATAC-C--A-CCGACTTTTTTTTTAATATGGCGT-ACTAGT------A-----ATTAGTAGAGTT--T--ATGGACCGAC----CA---ATTAGATGCATAT------ACAG-CAA---GCAA---GACACGAAGAAAAATACA-CTTT-TTCTTC-AAGA-ATAATATT--------TATTACACATGTTCAATTGA-TT----GCAC-GCTACTAGTAATTACAT--TTACATAT-TATGTA-GCCT--ACAACTG--CGTGATA---ATTTACAT----GA--GT------------------TGCGACGTCAAAAA-CGGT-CA-TG-GTG-ACTTAAAA-CTTGGA----CAGA------AAA---------A-----------TAACTT----TTAT--GG-TTGTGCGCTTGCGACCCTCCG-------------CCC-----CCCCCCCCCTCCCCCCCCTCCACGCCCCCCCCCCCCTCACT-T-TAA-G-TTTGAATT--------------G-CTC-------AC-AAAA-CACAATAAT-ATTACGATATA--T-TTGCGC-AAG--TT---T-----AAGATACA--AAACA--ACAG-TACAT-A-AATGTT-TATT--ATA-A-TA-TCTGTATATGCATC-A-C-AAAGCA---T--A-CAGACAAAA--CT-ATATC---ATTATC-----AAA-TAAGA--TA--TTTTAT--CGTAAAATT--TA--TC-A--CAAAT-GA--AAAT------T--CTTCTATAAACAAAAAAATTTATTT---------CTTA------------------TAAAA-AATGGTAAAAATA
gi|31 : ctaaattaaaatttgtttgtttgcggtctcccgaaccgacccagtaaattcgttcgactgaaatcttttacttgtatattaccaggtgatattttttttattcatttctttgcgaccgaccgaaaatcttatttctgcattttaccgctcaaacattttttatcgaaattctgatattttttttttccgatttagactacagctgtaatactcgtgttttctacttgtccgcacgcagcctcggagctgagacacttccgaataccgcatgtacactgtacataatataccaatcgtcagcgactatgaaaacgtgccttatcatcgaaagtatcattttaattataagaatgcatagtttcaataaagtgaattattgaatttgcatttaggtacgaaattgtagcatacgggggaggaggttgaagaaatcgtaaagatatgcgaaaatttcatatatctttaggcggaacaaaaaaccatgattcagacccaacaccttgtccgcatacagatgaattaaaacagataagtcgctgcactttatgcaatttgaagatgcatcatacattatgcaataccaacctggtatagaaataagatacgcagaataaatatttgctccaaaaacgcattcatcatggcggctaatgatcaaacgttcagtgaaagtgtgtaattattgcacataatgagatattcatttttattcgttttgtagtaactattggatattcagatgtgggacaatactaattttcccctccaaacgatagtggacatcgcgagccgttatatttctatttaaccgagagacgagaaATA-TG---ATTGAGAGAGGA-ACCCC-----TAAAACTACCATACATTTCTGTGAT-ATATGAAAAATGA---ATAC-GGGGCGATGATT-CATTT-----CAGTTTTGCTT
gi|23 : ACGATGGCCCT--GCTT--CACGAC------AC-TG-GCTT-ATC----TATGGTC
gi|30 : ATGAC----CA-C-TC-GATT-CGTGAA--ATGGTAGAATG-ACACA--CTGAA----TCAGT--CAGAACATAGGGAAATGC-A----------ACCG-AAA-AAAA-----ATTGACTCCC-----------------AAAG---tgattagttttgaacatggtcatcgattgagagataaaccccatgtccaaaactctatcctgatcggtatccgaacgtaaggtagcacaaaaaatataccgaaatattttatttttac
gi|23 : --CTGA-----TCGGTATCCGAACGTAAGG-TA-GC-ACAAAAAATATACCG-AAA-TATTTTATTTTTAgaa
gi|7 : acgatggccctgcttcacgacactggcttatctatggtctgattagttttgaacatggtcatcgattgagagataaaccccatgtccaaaactctatc-----------------AAAGAT-TTCAG-CAACGCTGCATGCACTT-GCTTGCAA-CTGTGAAATACAAGCAATGTGGGAAc
gi|3 : cttcgtagcaatttggagatgcaaattcatacatgtatactgtcgtatggaaaataataatacgagaaatgaatattctgctccagcaaaacgccatcgacatggcggtaatgaacgtcagtgaaaagatttgtattattgcacataatcattatttattttcgtttaatattcgtctgtgtaggtaacatgtgtatattcagaattgtgggaacgattacaatttttccaaacgatagtggacatgtgcgagccgttacatttcgttaaaagaacctaaaagaaccatttttaagagagagagggagaaagagcacttaataacgtttgtcaattcgtgtttcgaggaaacctacacatacactgtgacagaagagaaaaccgcaataattacattttgaagcagttttgttggtcagacaaaataaataataatcgttcacagacccagtccgttgctgtcccacaacgaaaggcctgctccatgaccacttattgttagaaatggttgatgaacactgaatcagtccccgaacatagggacatgcaaccaaaatcatttttttaactccaaaggtattaaactggttccataagcaatattatgtGTGGAAAGTGTTC-----------GAA-TAAAC-CCGGAATG-------------CACATCA----GCCATAGTACATGT---TAAGTAACCTAGTTTGGTAGTTAC-GAAA------TAAAG--T--TTCTCCATCGAAATAA--------------------AGTGACAAACA-TA--ATCTTTTT--TTA-CC-GTTCCTTT-AAA-AATA--C-TTTAATATTAT-A-CCGACA------------------T----------------------T----------------------TTCATGTTGAATATTTTTAAAGTTCCGCTGTTTTCAATTAAGAATTTCTATCTTACC-GCTTATTCA--GTCAAGTAGG-AAAATACATCGATAAA-----TA-----A--ATGATACAATA------------AACTCTATTTATCTATTTTT--------------CCTGACTAAATG-TAC-CCCA-CCGAC-TATTTTC--ACATGG--T-ACTAGTTAGTAAA-----G----------T--TTCATGG-CCGAC----TGAGTTTTAGATACATATGCCATAA-GGGCA-G--GCAAATTGCAACGAAG-AAAGTACA-CTTTATTCTTCAAAAA-AT----TTTTTT----T-TTATACATGTTTAATTT-TTT----GCAC-G-TACTAGTAATTATAT--TCA----TGTATGCA-GCA---ACAAC-G-C-GTGATA---ATTT--AC----AT--GC-A----GCGT--------TGAGACGTCCAAAA-CGGT-CATTG-GTG-ACTT-GAACCTTGAA--CACAGA------AAA---------AAGCGATACT-CTAGTTT----TTAT--GG-TTGTGTG------------TAAACAACAGAACACCCC-----CCCCCCCCCCC--------------------------CCCTTC-CAG-GTTTTGAATTCCTGGGAGGAAAACG-TTC-------AC-AAAA-CAAGATAA--CATACGG-GTA--ATTT--GC-AAG--TT---TACA--AAGAGATA--AAA-A--------ACA--A-AATATA-------ATATC-TG-CATACA------------AAAAGCA-G-T--A-CAAAC-AAA--
gi|29 : AA-TAAACACCGGGATGATCA--------------------GCCATAGTAAATACC-ATACGTA---------------TACCGAAAAAAAAATAA-AGATAATTCTTATTCGA--TAAGTTGCATGATTAAA------ACAGGTGAAT-------TCTATTT--TCA-Catttat
gi|17 : aTAAGTACT-GTAC-TAA--------------GGCCGAA-------TAA-G--T--TTCTCCATTGAAATAAGT-G----ACAAAAC---GAAGAGGCAAACACTA--ATCTATTTAATT--TC-T--CCTTTAAAG-TATA--CATTTA-TATTTC-ACC-AACA------------------TTTTCATGTCGACATATCAAGTCT----------------------ACCG---TG-----TTTTCAAT------------------AAAT----CAT-T------TCTATTCA--GCTAAGTGGGAAAA-TA-A-CG-TAGAAGAACTA-----A--ACAA---AATA------------A----------------TT
gi|9 : CTGCAGAGGCAAACAC-ACTATCTATTT--TTAACCATTGC-TGT-C-G-TATGAGC-TTTA-TATTATTA-CCAACA------------------T----------------------TTTCATGGTTGATTAATTAAGCTACCGT-TTG-----TTTTAAAG------------------AAAATT---ATATTA-----TTAT-CATCGCAA-GTGGG-AAA-TATA-TGATAAAATAACTA-----ATAGTAATACAATA------------A----------------TTTATTTATCTATTTTACCAGACTGACTG-TAC-CC-A-CCGAC-TTTTTTTTCATATGG-GTTACTAGT------ATTGGAG----------TCTT--ATGGGCCGACAGA-T----GTTAGA---ATAT-----AACATACAAG--GCAA-TTGACACGAAG-AAAATACAATTTTTTTCTTCAAGAAGATAATATCTTTT-TA-----AAACATGATCCATTGATTT----GCAC-G-TACTAGTAATTACA---TTAC-TATATATGTAGGCAT--ACAACTG-CCGTAATACTGAC----AC----GA--ATAG----TTG----------GCGACAT--AAAA-CGGTCCATTG-GTG-CCTT-AAG-CTTGGA--C-C--G------AAA---------A----------TTAAGTT----TTAT--GGTTTGTGCG------------TA-------------CCCTCCCTCCCCCCCCTTC--------------------------CACTTTCTAC-G-TTTG-ATT--------------GCCTCA------AC-AAAA-CACAAaatatttatataatatatagaagatatctatctctccatccgatcctttttttttttttatcgtttcacatatgggtcaaaaatagtat
gi|15 : A-TATTAT-G-C----------------------------------------------T----------------------ACCGC-TGG-----TTTTAAAG------------------AAA--TTCTA--TTACCGGTTTATTCA---T-AAGTGGA-AAA--ATA-CGCTA-A-----TA-----A--ATAATACAATA-------------------------------T--------------CTGGGCTGAATG-TACTC--ATCCGA---TTTTTTTAA---------ATT-GT------A-----A----------T------TGGGCCGACCCATT----TTTAGAT-AATCTG----A--AGACAAGCAGTAA-ATGACACGA---AAAAT--A-CTT-----TTCCAAGA-ATAATA-TGTTTATAC-GTAACA----TTTCAATGATTTGGCAGTACAG-TACTAGTAA-TACAT--TTAC-TAGAGA-G-A-GCATTCACGCCTG-TTGTG
gi|12 : tctgtctatacttacctgtatattccaacatattcatggtggaTTTTTTTTATCGTTTCACAT-----ATGGGT-------CAA-A--AATAGTATCTATATAATTAC-TATGTATGTG-GC-T--ACAA--G-CCG-GATA---ATTT--AC----AATAGT-G----AT----------TGCGACGTCAAAAAACGGT-C-TTG-GTGA-CTT-GA--CTTGGAA-C-CAGATTGAGAAAA---------A----------AAAAACTGCGATTCT--GT-TTGTGCG------------TA-----------------------------------------------------------ACTTC-TA--G-TTTGAATT----------------CTTGGAGGAAATGAAAA-CAAGATAA--TATACGTCAAA--A-TT--GCTAAA--TTCTAT--A--GAGATACA--AAA-C--AAA-------------GTG-TATT--ATATACTA--AT-CAT---CA-CTA-CAAAA-CATG-C--A--AGAC-AAA--CTTCTATAATCATTATCAAATAAAA-TAAAA--TAT-TTTTAT--CT----ACC--T---CCTA-CCAGA--AA--AAATAAG-GGC--CTACT-------GAATTATTTGTTTG-------GCT--------------------GAGAA-AAT------AACATTTTA---C-CCATACTA---CCGC-CC-T-AC-TTCGT-AAT-C-GC-G-TC--G-G--AAA-AGGCGCAATCAAACA----TTTTTAAT
gi|21 : ATTTCAC--TT---TATATATAGA-GCAC--ACAACTGGCTGGGGTA---A-----ACCTCTGA---T-GAAATTTACATGGGAGTTGCAACATTAAAAA-TGGT-CATTG-GTG-ACCT-GAA-CTTACACCC-CAAA------AAAGGGTGATTCA----------TTTAGTCCA--TTATTGGA-TCATGTA------------TA-------------CCC-----CC
gi|13 : GT--------TACAGCACCAAAAA-CAGT-TACTATGTGA-CCT-GAA-CTTGAA--C-CAGA------AAA---------GGGGCGATACTTTTAGTC----ATAT--GGATTACGC-------------TA-------------CAC-----CCATCCAAC-----------------------------ACTTCCTGG-G-TTAGAATT--------------T-CT-----------AAAA-CA-AACAATGCGCACAATACACGA-T-------AA--TT---T--A--TGG-------------------TACAT------GTA-TATGCAAAATA--A-CATAGATAT------A-CAAATACA-G-T--A-CAGAC-AAA-----A-GCCGC-ATTATCAAAT------AAAA--TA--TTTTAC--CA----ACT--TA--TCTACAAAATG-CA--TAAAAAA-GGCTTCTGTT-----T-----TGTTT-TTTGTTTTTTTGTTTGTTTTTTTTTTTTTTGGCTGAGAAAAAT----AAAATATTTTG---C-CTAC-CTA---TTTACCC-T--CTTTCG------G-G--G-TC--GTT--AAA-GG--GCAAAAAAAAAATCATTTTTTATTTAaactttctggattagaattccagggaaaaatttgcacacaat
gi|14 : ctctgatgtttacatga-------------CCC-----CCCCCCCCTTC--------------------------CACTTT-CGACG-TTTGAATT--------------G-CTC-------AC-AAAAACACAATA-----TCCGATATA--T-TT--GC-AAAGTTT---T--AGTAAGACACACAAAA-ACCAAAGTTACATTATAATGTAGTATA--ATATA-TATCGTGTATATGCATCTAACAAAAGCA-GGT--AACAGAC-AAAAACTAATATCAT---TATCAAAT-AAA-TAAAAAATA--TTTTATTCCG----ACCCGTATCCCTACGCAGAG-GATAAAGTAATCGGC--CTACT------GAAGTTATTT-TTTGTTTG---GCTTA-------------------AGAA-AAT----AAAATATTCTGAGGCGCTAC-CTGGAGCAGA-CCCTAGCGTTCGTAAAT-C-G--GGTC--G-G--AAAAGG--GCAAACAAACAAT--TTTTTAATTTAggcc
gi|20 : gatttcgccctcccGCACCTA-CAAAAGCA-G-TTTA-CAGAT-AAAA-CTAATATCAT-GG-ATCAAAT-AAA-TAAAA--TA--TTTTAT--CG----ACC--TA--CCTACCCAGAGAAA--AAATAAG-TTC--CTACT-----AGAAGTTATTT-TTT--------GCTTA------------------G-AAA-AAT-----AAATA-TTTA---C-CTAC-CTA---CCGA-CC-TAACGTCCGTAAAT-C-GGCG-TC--G-GAAAAA-GG--GCAAACAAACAAT--TTTTTCATTT
gi|22 : GCACCTA-CAAAAGCA-G-T--A-CAGAT-AAA--ATAATATCAT---TATCAAATAAAA-TAAAA---A--TTTTAT--CG----ACC--TA--CCTACCCAGAGAAA--AAATAAG-GTC--CTAC------TGAAGTTA-TT-TTTG-------GCTTA------------------G-AAA-AAT----AAAATA-TTTA-----CTAC-CTA---CCGA-CC-ATACGTCCGTAAAT-CGG--G-TC--G-GA-AAA-GG--GCAAA-AAACAAT--TTTTTCATTTAta
gi|24 : AAAA-AAA-AAAAA--TAATCTTTAT--CG----ACC--TA--CCTACCCAGAG--A--AAATAA---AC--CTAC------TGAAGTTATTT-TTTG-------GCTTA------------------CAAAA-TA-----AAAATATTTAA---T----C-CTA---CCGA-CC-CTACGTCCGTAAATGC-G--GTTC--G-GA-AAA-GG--GCAAACAAACAA---TTTTTAATTTA
gi|25 : AAT-AAAATAAAA--TACTTTTTAT--CT----AC---TA--CCTACC-AGAG-AA--AAATAAG-GGC--CTACT------GAAGTAATTT-TTTG-------GCTGA------------------GAAAA-A-T----AA--T-TTTTA---C-CTAC-CTA---CCGA-CC-TTACTTTCGTAAAT-CGG--G-TC--G-GGAAAA-GG--GCAAACAA
gi|2 : T-C-G--G-TTCGG-G--AGA-CC--GCAAACAAACAA---ATTTTAATTTAtttt
gi|33 : cT-C-G--G-TC--G-GG-AAA-CT--GCAAACAAACA------TTTAATTcccagtaaattcgttcgactgaaatcttttacttgtatattaccaggtgatattttttttattcatttctttgcgaccgaccgaaaatcttatttctgcattttaccgctcaaacattttttatcgaaattctgatattttttttttccgatttagactacagctgtaatactcgtgttttctacttgtccgcacgcagcctcggagctgagacacttccgaataccgcatgtacactgtacataatataccaatcgtcagcgactatgaaaacgtgccttatcatcgaaagtatcattttaattataagaatgcatagtttcaataaagtgaattattgaatttgcatttaggtacgaaattgtagcatacgggggaggaggttgaagaaatcgtaaagatatgcgaaaatttcatatatctttaggcggaacaaaaaaccatgattcagacccaacaccttgtccgcatacagatgaattaaaacagataagtcgctgcactttatgcaatttgaagatgcatcatacattatgcaataccaacctggtatagaaataagatacgcagaataaatatttgctccaaaaacgcattcatcatggcggctaatgatcaaacgttcagtgaaagtgtgtaattattgcacataatgagatattcatttttattcgttttgtagtaactattggatattcagatgtgggacaatactaattttcccctccaaacgatagtggacatcgcgagccgttatatttctatttaaccgagagacgagaaattaaataatgttgagaaccctacacactgtgaagagaagatttcatttcagtttgttggtagacaaaataccgaacatcgtaaattcatatatagacccagtcctgcctatctcaatcacaacgatggccttttgcttcaatgaccacttgattgttgaaatatgatcgaataaacacactgaatcggtacgaacgtgagggtatgcaaccgcaaatattttttaaatcccaaagttcaacaagcctgcactttgctgcaattgtaaaataaaagacgtggaaagtgttcatgttaatattgaaataaacaccggtgatcatgatgccatatcactcagccatagtaaatacccgtaagtataccaaaataagttcttatcgaaataaggcatgacataaatctgcagaggcaaacactaatctatttttaccttgcctgtaagataactttatattataccaacatttcatgttaatataaagttaccgcttgttttaaagaaatttctatttatcgcttattcagtaaagtgaaaatacgatacatacatggaataacaaataaatttattatctatttcttgactgaatgataccaccgactttttttttaatatggcgtactagtaattagtagagtttatggaccgaccaattagatgcatatacagcaagcaagacacgaagaaaaatacactttttcttcaagaataatatttattacacatgttcaattgattgcacgctactagtaattacatttacatattatgtagcctacaactgcgtgataatttacatgagttgcgacgtcaaaaacggtcatggtgacttaaaacttggacagaaaaataacttttatggttgtgcgcttgcgaccctccgcccccccccccctcccccccctccacgcccccccccccctcactttaagtttgaattgctcacaaaacacaataatattacgatatatttgcgcaagtttaagatacaaaacaacagtacataaatgtttattataatatctgtatatgcatcacaaagcatacagacaaaactatatcattatcaaataagatattttatcgtaaaatttatcacaaatgaaaattcttctataaacaaaaaaatttatttcttataaaaaatggtaaaaata
gi|36 : T-C-G--G-GT--G-G--CAA-CA--GCAAACAAACAAT--TCTTTATTTTAcccagtaaattcgtttcgactgaaaatataatttaattcacatttgtatt
1 sequences could not be aligned to this particular reference sequence:
Unaligned ( gi|28 ): TAGTTTACATGCAGGTTCAGCGCTGTCAAACGGTCATTCTGGGAGCATGTCCCTTTGATAGATAGTATATTATTAATTTATTTGTACAGACACCCCCCCCCCCCCCTTCCCCCGGGCCTTGTAAT
Alignments
lowQualScore : 11111111111111111111111111111111111111111111111111 1111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111
lowQualScore : 111 1111111 111 111111 111 1111111 11111111 222222222222222222 11111 11 22222222222 11111 222222222222222222222222 2222222222222222222222 2222 1111 11111111 11111 111 1 11 11 11111 66666666666666666666666666 222222222222 1 22222222 11 111 111111 11 111 111111 2222 111 1111 2 11 11 3333333333 1 11111 11 33333333333333 11111 11111 333333333 1111111 111 1111 111111 111111111 111111 11 1 11 1 111 1 222 2222 8888888888888 11111 22222 1111111 11111111111 1111 3333333333333333 11111 66666666666666666666666666666666666666666666 1111 1 11 1111 1111 1 1111 00000000000000000000000000000000000000000000000000 111 55555555555555555555555555555555555 111 444444444444444 111 3333333333333333 11111 22222 1 1 1 1 11 1 22 1 44444444444 11 1 22 11 4444444444444444444444444444 111 222222222 33333333333333 1111 1111 222 2222222222 33333 44444444444444444 222 1 2222 1 11 444444444 1 888888888888888 3333333333 11111 222222 11 11 333333333333333333333 111 1111 5555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555 11 11111 444444444444444444 1 111111111 22 6666666666666666 111 77777777777777777777777777777777777 1 1111 77777777777777777777777777777 555555555555 111 22222222 1111 11 1 11 1 22222222 1111 22222222222 33333333 1111 11 1111 111111 666666666666666666666 1111 11111 3333333333333333333333333333 11111 1111 444444444444444444 555555555555555555555555555555555 222 1111 2222222222 333333333333333333333 111 111 111 11 11 11 1111 1111 444444444444444444444 11111 11 22
lowQualScore : 5 000 66 9999 55 4 4 77 3333333 8888 4 99 111 333333 4 55 88 4 4 77 55 111 4 4 55 4 8 3333333 77777777 4 999999999999999999 777 55555 00 777 66 777 55 4 4 66 4 777 55555555555 66 6 44 11111 4 000000000000000000000000 777 66 66 4 66 2222222222222222222222 444 8 66 2222 66 9999999 5555 66 5 99999999 99 88 22222 000 5 5 99 77 4 5 22 44444 66666666666666666666666666 0 999999999999 5 5 66 5 66 0 5 5 0 5 11111111 888 888 5 11 66 66 888 88 555 5 5 222222 00 5 5 5 000 77 666666 0000 000 5 5 2222 4 33 5 00 5 77 5 888 1111111111 5 5 5 5 7 5 77 33333 5 77 33 5 33333333333333 5 77 0 5 1 5 44444 44444 5 5 77 5 777777777 1 9999999 000 1 5 2222 6 999999 5 8 77 222222222 6 222222 1 55 2 3 88 1 88 6 0 1 0 1 66 1 44 0 444 0 777 1111 2222222222222 8 0 1 88888 0 44444 5 66 1111111 11111111111 55 0000 3333333333333333 22 5 22222 66 00000000000000000000000000000000000000000000 5 5555 1 22 1 2222 2222 8 0 7777 8 8 99999999999999999999999999999999999999999999999999 444 77 8 2 33333333333333333333333333333333333 444 8 888888888888888 444 8 99 8 0 3333333333333333 66666 00000 5 8 0 0 0 2 0 33 3 0 77 0 77777777777 22 0 33 11 88 5 6666666666666666666666666666 6 111 6 7 666666666 6 55555555555555 99 4444 4444 000 4 6 9999999999 6 00000 66666666666666666 000 0 1111 6 2 3 3 0 22 0 888888888 0 3 6 3 333333333333333 6666666666 3 88888 44 333333 0 99 11 99 0 000000000000000000000 111 3 99 6 8 0 1 8 0 6 3333 8 6 5555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555 00 66666 999999999999999999 1 3 444444444 99 999 1 22 6 6 3 0000000000000000 99 111 88888888888888888888888888888888888 8 8 0 8 8 8 11 3 6666 0 99999999999999999999999999999 3 555555555555 555 88888888 3 1111 44 0 8 0 11 6 0 5 8 0 88888888 5 6 3 1 4444 6 6 0 888 22 5 3 5 9999 1 666 33333333333 66 2 5 66666666 5 66 5 5 888 5 0000 5 888 5 00 5555 444444 333333333333333333333 4 7777 11111 9999999999999999999999999999 11111 2222 3 5 5 5 333333333333333333 444444444444444444444444444444444 5 5 55 222 1 5555 99 6 99 1111111111 1 99 888888888888888888888 6 222 6 99 55 444 6 3 5 77 66 5 5 5 222 5 0 444 8 4 66 66 66 66 66 22 66 66 66 55 0000 5 0000 0 444444444444444444444 3 3 22222 5 888 1 5 2 0 4 8 00 8 4 11 4 66 777 0
lowQualScore : . ... .. .... .. . . .. ....... .... . .. ... ...... . .. .. . . .. .. ... . . .. . . ....... ........ . .................. ... ..... .. ... .. ... .. . . .. . ... ........... .. . .. ..... . ........................ ... .. .. . .. ...................... ... . .. .... .. ....... .... .. . ........ .. .. ..... ... . . .. .. . . .. ..... .......................... . ............ . . .. . .. . . . . . ........ ... ... . .. .. .. ... .. ... . . ...... .. . . . ... .. ...... .... ... . . .... . .. . .. . .. . ... .......... . . . . . . .. ..... . .. .. . .............. . .. . . . . ..... ..... . . .. . ......... . ....... ... . . .... . ...... . . .. ......... . ...... . .. . . .. . .. . . . . . .. . .. . ... . ... .... ............. . . . ..... . ..... . .. ....... ........... .. .... ................ .. . ..... .. ............................................ . .... . .. . .... .... . . .... . . .................................................. ... .. . . ................................... ... . ............... ... . .. . . ................ ..... ..... . . . . . . . .. . . .. . ........... .. . .. .. .. . ............................ . ... . . ......... . .............. .. .... .... ... . . .......... . ..... ................. ... . .... . . . . . .. . ......... . . . . ............... .......... . ..... .. ...... . .. .. .. . ..................... ... . .. . . . . . . . .... . . ...................................................................... .. ..... .................. . . ......... .. ... . .. . . . ................ .. ... ................................... . . . . . . .. . .... . ............................. . ............ ... ........ . .... .. . . . .. . . . . . ........ . . . . .... . . . ... .. . . . .... . ... ........... .. . . ........ . .. . . ... . .... . ... . .. .... ...... ..................... . .... ..... ............................ ..... .... . . . . .................. ................................. . . .. ... . .... .. . .. .......... . .. ..................... . ... . .. .. ... . . . .. .. . . . ... . . ... . . .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .... . .... . ..................... . . ..... . ... . . . . . . .. . . .. . .. ... .
lowQualScore : 0 222 99 4444 55 0 0 22 0000000 5555 0 55 000 555555 0 55 99 0 0 11 55 000 0 0 55 0 0 0000000 66666666 0 333333333333333333 888 88888 88 888 11 888 55 0 0 11 4 888 66666666666 11 4 66 11111 4 333333333333333333333333 888 11 11 4 11 9999999999999999999999 666 9 11 5555 99 2222222 6666 99 0 55555555 55 22 55555 000 0 7 11 99 0 7 99 33333 33333333333333333333333333 1 333333333333 7 7 99 0 99 0 0 0 4 0 99999999 888 888 0 99 99 99 888 22 666 0 0 555555 11 0 7 7 000 99 444444 0000 000 7 7 1111 4 66 7 00 7 44 7 999 6666666666 7 7 7 7 1 7 99 77777 0 99 66 7 66666666666666 7 99 7 7 4 7 33333 33333 7 7 99 7 111111111 4 6666666 000 7 7 1111 7 222222 7 0 00 000000000 7 555555 0 88 5 2 88 0 88 4 8 8 8 6 44 0 55 0 000 0 555 2222 2222222222222 0 8 0 99999 1 33333 0 11 0000000 55555555555 44 6666 1111111111111111 99 0 55555 99 55555555555555555555555555555555555555555555 7 7777 4 33 7 1111 1111 0 0 0000 0 0 44444444444444444444444444444444444444444444444444 000 66 0 2 66666666666666666666666666666666666 000 0 222222222222222 000 0 66 0 8 4444444444444444 44444 00000 6 0 0 0 0 5 0 22 2 0 55 0 55555555555 55 0 22 00 88 0 8888888888888888888888888888 7 777 7 5 777777777 7 77777777777777 22 2222 2222 888 2 7 2222222222 7 77777 77777777777777777 888 0 2222 5 5 2 2 0 55 8 333333333 0 2 5 2 222222222222222 0000000000 2 00000 66 000000 8 00 00 66 8 222222222222222222222 777 2 22 7 0 8 0 0 8 0 0000 0 7 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 33 77777 222222222222222222 7 2 888888888 22 222 0 22 7 7 2 8888888888888888 22 777 00000000000000000000000000000000000 2 0 0 0 0 0 44 8 8888 8 22222222222222222222222222222 2 666666666666 444 66666666 8 8888 00 8 0 6 00 0 8 6 0 8 00000000 2 7 3 7 2222 7 7 1 000 11 7 6 7 4444 4 999 88888888888 99 0 0 66666666 0 99 0 0 888 0 6666 0 888 0 11 1111 444444 999999999999999999999 5 5555 44444 1111111111111111111111111111 11111 6666 1 0 0 0 777777777777777777 444444444444444444444444444444444 7 7 77 333 7 5555 22 7 22 8888888888 0 22 222222222222222222222 7 555 7 22 88 777 5 1 0 55 99 0 0 0 666 1 1 111 9 4 11 77 11 99 99 00 99 44 99 99 6666 0 6666 1 555555555555555555555 2 2 00000 0 888 8 0 5 1 4 9 66 9 4 11 4 11 000 2
consensus : CTAAATTA-AAA--TT--TTGT----T--T-GT-TT-GCGG-------T----TTC-CC--GA---CCGACC----T-AGTAAA-T--TCGTT-NC-GA-C-TGAA--A---AT-C-T--T-T-T-------ATTT-----G--TAT-TT-------------A----C---CAGG--T--GATAT-TTT---TTT--TTA---TTCATT--T-CTG-TT--GCG-AC---CGA-----------CCGA--AAAT-CT-----TA-TTTCT-----GC----A-TT--T--A---CCG---CTC--A--AAAC-AT--TTT--T--------AT-----CG-AA-AATT-C--TGA----T--TTTTTTTT--CC--CGAT----AA--GGACT-A-------AGTAC-TCCTAGT-----TTTC---TACCTTGTCCGCA-CGCAAGC--TCGGAG-CTGAGA-CACTTCCGAAT-----AC---------CAT--------------ATATAC------------CAAT-CG-TCAG--CGA-CT--ATAA-A-A-ACGTG-CTTA--TCATGCATCAA---AA---GTA-TC--AT--TTT--A---A-TAT---AA-AATGCATAGTT-TC-ATA--AAGT-AA-ATGA-A-TTGAA---T--TTGCA------TTTA----GG---T-A-CGAAAT----TGTAGC-AT--AAGGGG-GAGGA-GG-TTGA-AG-GA-G-ATCG-TTAA-----AG-A-TA-TG-GAA-AA--GTTTCATA--T--ATCT--TTA--CGGGA-CAA--------------AA-AACCA--TGGATTCAGACCCAA-CACAACT-T-----GTC-----CG-A-T--ACAG-AGAT---------TGAGAATCGG--T-A--TGAA---TTAAAACCAGATCAA-G----TCGCT-GC------A-CTTCGT-GCAATTTGAAGATGC--A---T--TATACA-TGTAT-GCCT-ANTACCAA--CTGGTTATAGAAA-TAANA-TACGCAGAATGAATATT-TGCTCCAGCAAAACGCNATCGCCATG-G-C-GG-TAATGAA--TCA----AACGTTCAGTGA-AG--T---A-TTATT-GCACATAATNAT-GT--TTATTT-----TTCATT--TT--TATA-TTCGT----TT-TG--TAGT-AA----ACTA----------------TGTG-GA-----T--ATTCAG------A-T-------TTGT-----------------GGG----ACGAT-AC--TAA-TTT-CCCCCC----CAAAC----GATAG-TGGACATGCGC----GAG-CCGT-TATA------CA-TTTCG--------TTA--AAAGAACATGAA-GAACCATTTTTAAG---AGAGAGAGNGAGA-GAGAGCACTT-AATAACGTTTGTCATTACGTATG---TTTGAG---GAA-ACCCC-----CA-------CACACA---CTGTG-ACAGA-GAAGAATG----AAAACG---CAATGATT-CATTT-----CAGTTTTGTT-GGT-AG-AC-AAAATACC-GAGTA-ATCGT-AAA-TCGT-TCACAGACCCAGT-----------CCG-TG-CTATCTCAATCACAACGATGGCC--TTGC-TTCCATGA----CCAAC-T---------------T-GA-TTG---TTG-AANATGGTC---------GA-ATGAAC------------ACA--CTG----AA----TCGGT--CCGAACGTAGGGATATGC-A----------ACCG-AAATATA-TTTTTTTTAACTCCC-----------------AAAG---TTCAA-CAA----GCNTGCACTTTGCTTGCAA-CTGTAAAATACAAGC-ACGTGGAAAGTGTTCA---TAAT-TTG-AATAAACACCGGGATGATCA--GCGC-CATA----TCAGCCATAGTAAAT--------ACCCGTAN----GTAATACCG------AAATAAA-GT--TTCTCCATCGAAATAAG-TGCATGA-CA-AAA--CTGCAGAGGCAAACAC--TAATCTATTT--TTA-CC-TTGCCTGT-AAGTAT-A--C-TTTA-TATTATACC-------------CGACA------------------T--------T----------------------ACCGC-TTG-----TTTTAAAG------------------AAAATTTCTAT-TTACCG-CTTAT--TCAGTNAAGTGGGAAA-TAT-A-CGATA---------AA--AACTAA--ATAA---TACAATA-A----------------TTT--------------CCTGACTGAATG-TACCC-A-CCGAC-TTTTTTTTAATATGG-GT-ACTAGT------A-----G----------T--T--ATGGGCCGA--CA--TGA---TTAGATACATATG----AACAGACAAG--GCAA-TTGACACGAAG-AAAATACA--CTTT-TTCTTCAA-AGAATAATATTTTTT-TA-T-GTTACACATGTTCAATTGATTT----GCAC-G-TACTAGTAATTACAT--TTACTATA-TATGTA-GCAT--ACAACTG-CCG-----------TGAT--AATT-TACGNGC-GGTG-TT--GCGACGTCAAAAA-CGGT-CATT---G-G----TG-AC---TT-GAA-CTTGGA--C-CAGA------AAA---------A----------TTAAGTT----TTAT--GG-TTGTGCG------------TA-------------CCC-----CCCCCCCCCT---CCAC-TT-C-TANG----------------TTTGAAT------T--------------G-CTC-------AC-AAAA-CACAATAAT-CATACGATATA--A-TT--GC-AAG--TT---T--A--AAGATACA--AAA-A--AAAG-T-ACAT-A-AATGTA-TATN--ATATATA-C--ATGTATATGCACCTA-CAAAAGCAG-T--A-C-AGAC-AAA--CTAATATCAT-ATTATCAAAT-AAA-TAAAA--TA--TTTTAT--CGACC--TA--CCTACCCAGAG-AA--AAATAAG-GGC--CTACTTGAAG----TTATTT-TTTG----GCTTA------------------GA-AAAAATAAAATATTTTA---C-CTAC-CTA---CCGACCCTA-CGTCCGTAAAT-C-G--G-TCG-G--AAA-GG--GCAAACAAACAAT--TTTTTAATTTA
Reference ( family-458 ) : CTAAATTA-AAA--TT--TTGT----T--T-GT-TT-GCGG-------T----TTC-CC--GA---CCGACC----T-AGTAAA-T--TCGTT-NC-GA-C-TGAA--A---AT-C-T--T-T-T-------ATTT-----G--TAT-TT-------------A----C---CAGG--T--GATAT-TTT---TTT--TTA---TTCATT--T-CTG-TT--GCG-AC---CGA-----------CCGA--AAAT-CT-----TA-TTTCT-----GC----A-TT--T--A---CCG---CTC--A--AAAC-AT--TTT--T--------AT-----CG-AA-AATT-C--TGA----T--TTTTTTTT--CC--CGAT----AA--GGACT-A-------AGTAC-TCCTAGT-----TTTC---TACCTTGTCCGCA-CGCAAGC--TCGGAG-CTGAGA-CACTTCCGAAT-----AC---------CAT--------------ATATAC------------CAAT-CG-TCAG--CGA-CT--ATAA-A-A-ACGTG-CTTA--TCATGCATCAA---AA---GTA-TC--AT--TTT--A---A-TAT---AA-AATGCATAGTT-TC-ANA--AAGT-AA-ATGA-A-TTGAA---T--TTGCA------TTTA----GG---T-A-CGAAAT----TGTAGCGAT--AAGGGG-GAGGA-GG-TTGA-AG-GA-A-ATCG-TTAA-----AG-A-TA-TG-G-A-AA--GTTTCATA--T--ATCT--TTA--CGGGA-CAA--------------AA-AACCA--TGGATTCAGACCCAA-CACAACT-T-----GTC-----CG-A-T--ACAG-AGAT---------TGAGAATCGG--T-A--TGAA---TTAAAACCAGATCAA-G----TCGCT-GC------A-CTTCGT-GCAATTTGAAGATGC--A---T--TATACA-TGTAT-GCCT-ANTACCAA--CTGGTTATAGAAA-TAANA-TACGCAGAATAAATATTNTGCTCCAGCAAAACGCNATCGCCATG-G-C-GG-TAATGA---TCA----AACGTTCAGTG------------TTATT-GCACATAATNAT-GT--TTATTT-----TTCATT--TT--TATA-TTCGT----TT-TG--TAGT-AA----ACTA----------------TGTG-GA-----T--ATTCAG------A-T-------TTGT-----------------GG-----ACGAT-AC--TAA-TTT-CCCCCC----CAAAC----GATAG-TGGACATGCGC----GAG-CCGT-TATA------CA-TTTCG--------TTA--AAAGAACCTAAAAGAACCATTTTTAAG---AGAGAGAGGGAGA-AAGAGCACTT-AATAACGTTTGTCATTAAATATG---TTCGAG---GAA-ACCCC-----CA-------CACACA---CTGTG-ANAGA-GAAGAA-G----AAAACG---CAATGATT-CATTT-----CAGTTTTGTT-GGT-AG-AC-AAAATACC-GAGTA-ATCGT-AA--TCGT-TCACAGACCCAGT-----------CCG-TG-CTATCT-AATCACAACGATGGCC--CTGC-TTCCATGA----CCAAC-T---------------T-GA-TTG---TTG-AANATGGTC---------GA-ATGAAC------------ACA--CTG----AA----TCGGT--CCGAACGTAGGGATATGC-A----------ACCG-AAATATA-TTTTTTTTAACTCCC-----------------AAAG---TTCAA-CAA----GCGTGCACTTTGCTTGCAA-CTGTAAAATACAAGC-ACGTGGAAAGTGTTCATGTTAATATTG-AATAAACACCGGGATGATCA-------CACA----TCAGCCATAGTAAAT--------A-CCGTAN----GTAATACCG------AAATAA--GT--TTCTCCATCGAAATAAG-TGCATGA-CA-AAA--CTGCAGAGGCAAACAC--TAATCTATTT--TTA-CC-TTGCCTNT-AAGTAT-A--C-TTTA-TATTATACC-------------CAACA------------------T--------T----------------------ACCGC-TTG-----TTTTAAAG------------------AAAATTTCTAT-TTACCG-CTTAT--TCAGTNAAGTGGGAAA-TAT-A-CGATA---------AAA-AACTAA--ATAA---TACAATA-A----------------TTT--------------CCGGACTGAATG-TACCC-A-CCGAC-TTTTTTTTAATATGG-GT-ACTAGT------A-----G----------T--T--ATGGGCCGA--CA--TGN---TTAGATGCATATG----AACAGACAAG--GCAA-TTGACACGAAG-AAAATACA--CTTT-TTCTTCAA-AGAATAATATTTTTT-TA-T-GTTACACATGTTCNATTGATTT----GCAC-G-TACTAGTAATTACAT--TTACTATA-TATGTA-GCAT--ACAACTG-CCG-----------TGAT--AATT-TACGAGT-GNTG-TT--GCGACGTCAAAAA-CGGT-CATT---G-G----TG-AC---TT-GAA-CTTGGA--C-CAGA------AAA---------A----------TTAAGTT----TTAT--GG-TTGTGCG------------TA-------------CCC-----CCCCCCCCCT---CCAC-TT-C-TAGG----------------TTTGAAT------T--------------G-CTC-------AC-AAAA-CACGATAAT-CGTACGATATA--A-TT--GC-AAA--TT---T--A--AAGATACA--AAA-A--AAAG-T-ACAT-A-AATGTA-TATN--ATATATA-C--ATGCATATGCACCTA-CAAAAGCAG-T--A-C-AGAC-AAA--CTAATATCAT-ATTATCAAAT-AAA-TAAAA--TA--TTTTAT--CGACC--TA--CCTACCCAGAG-AA--AAATAAG-GGC--CTACTTGAAG----TTATTT-TTTG----GCTTA------------------GA-AAAAATAAAATATTTTA---C-CTAC-CTA---CCGACCTTA-CGTCCGTAAAT-C-G--G-TCG-G--AAA-GG--GCAAACAAACAAT--TTTTTAATTTA
gi|1 : CTAAATTA-AAA--TT--GTGT----T--T-GT-TT-GCGG-------T----TTC-CC--GA---CCGACC----T-AGTAAA-T--TCGTT-GC-GA-C-GGAA--A---AT-C-T--T-T-T-------ATTT-----G--TAT-TT-------------A----C---CAGG--T--GATAT-TTT---TTT--TTA---TTCATT--T-CTG-TT--GCG-AC---CGA-----------CCGA--AAAT-CT-----TA-TTTCT-----GC----A-TT--T--A---CCG---CTC--A--AAAC-AT--ATT--T--------AT-----CG-AA-AATT-C--TGA----T--TTTTTT----CC--CGAT----AA--GGACT-A-------AGTAC-TCCTAGT-----TTTC---TAC-TTGTC-GCA-CGCAAGC--TCAGAG-CTGAGG-CACTTCCGAAT-----AC----------AT--------------ATATAC------------CAAT-CG-TCAG--CGA-CT--ATAA-A-A-ACGTG-CTTA--TCATGCATCAA---AA---GTAATC--AT--TTT--A---A--AT---AA-AATGCATAGTT-CT-AAA--AAGT-AA-ATGA-A-TTGAG---T--TTGCA------TTTA----GG---T-A-CGAAAT----TGTAGCAAT--AAAGGG-GAGGA-GG-TTGA-AG-GA-G-ATCGGTTAA-----AG-A-TA-TG-G-A-AA--GTTTCATA--T--ATCT--TTA--CGG-A-CAA--------------AA-AACCA--TGGATTCAGAACCAA-CACAACT-T-----GTC-----CG-A-T--ACAG-AGAT---------TGAGAATCGG--T-AAATGAA---TTAAAACCAGATCAA-G----TCGCT-GC------A-CTTCGT-GCAAATTTAAGATGC--A---T--TATACA-TGTAT-GCCC-AATACCAA--CTGGTTATAGAA--TAAGA-TACACAGAATAGATATTTTGCTCCA--AAAACGCAATCTCCATGTG-T-GG-TAATGA---TCA----AACGTTCAGT-------------TTATT-GCACATAATGAT-GT--TTATTT-----TTCATT--TT--TATA-TTCGT----TT-TG--TAGTTAA----ACTA----------------TGTG-GA-----T--ATTCAG------A-T-------TTGT-----------------GG-----ACGAT-AC--TAA-TTT-CCCCCC----CAAAC----GATAG-TGGACATGCGC----GAG-CCGTGTATAATGAACCA-TTTTT--------NNN--NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN---NNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNCATTACATATG---TTTGAG---GAA-ACCCC-----TA-------CACACA---CTGTG-AAAGA-GAAAAATG----AAAACG---CAATGATTTCATTT-----CAGTTTTGTTTGGT-AG-AC-AAAATACC-GAGTACATCGT-AAAATCGT-TCATAGACCCAGT-----------CCG-TG-CTATCTCAATCACAACGATGGCC--TTGCTTTCCATGA----CCAAC-T---------------T-GA-TTG---TTG-AATATGGTC---------GA-ATGGAC------------ACA--CTG----AA----TCGGT--CCGAACGTAAGGGTATGC-A----------ACCG-AAATATA-TTTTTTTTAACTCCC-----------------AAAG---TTCAA-CAA----GCCTGCACTTTGCTTGCAA-CTGTAAAATACAAGC-ACGTGGAAAGTGTTCA--ATAAT-TTG-AATAAACACCGGGATGATCAATGCATGCATA----TCAGCCATAGTAAAT--------ACCCGTAA----GTAATACCG------AAATAA--GT--TTCTTTATCGAAATAAG-TGCATGA-CA-AAATTCTGCAGAGGCAAACAC--TAATCTATTT--TTA-CC-TTGCCTGT-AAGTAT-A--C-TTTA-TATTATA---------------CAACA------------------T--------T----------------------ACCGC-TTG-----TTTTAAAG------------------AAATTTTCTAT-TTACCG-TTTAT--TCAGTAAAGTGGGAAA-TAT-A-CGATA---------CA-----TAA--ATAA---TACAATA-A----------------TTT--------------CCTGACTGAATG-TA-CC-A-CCGAC-TTTTTTTTAATATGG-GT-ACTAGT------A-----G----------T--T--ATGGGCCGA--CT--T-----TTAGATAAATATG----AACAGACAAG--GCAA-TTGACACGAAG-AAAAT-CA--CTTTGTTCTTCAA-AGAATAATATTTTTTATACT-GTTACACATGTTCCATTGATTT----GCAC-G-TACTAGTGATTACAT--TTACTATA-TATGTA-GCAT--ACAACTG-CCG-----------TGAT--AA----ACGAGT-GTTG-CT--GCGACGTCAAAAA-CGGT-CATT---G-G----TGAAC---TT-AAA-CTTGGA--C-CAGA------AAA---------A----------TTAAGTT----TTAT--GG-TTGTGCG------------TA-------------CCC-----CCCCCCCCCT---CCAC-TT-T-TAAG----------------TTTGAAT------T--------------G-CTC-------AC-AAAA-CACAATAAT-TATACGATATA--A-TT--GC-AAG--TT---T--A--AAGATACA--AAA-A--AAAGTT-ACAT-A-AATGTA-TATT--ATATATA-C--ATGTATATGCACCTA-CAAAAGCAG-T--A-C-AGGC-AAA--CTAATATCAT-ATTATCAAAT-AAA-TAAAA--TA--TTTTAT--CGACC--TA--CCTACCCAGAG-AA--AAATAAG-GGC--CTACTTGAAA----ATATTT-TTTG----GCTTA------------------GA-AAAAATAAAATATTTTA---C-CTAC-CTA---CCGACCTAA-CGTCCGTAAAT-C-G--G-TCG-G--AAA-GG--GCAAACAAACAAT--TTTTTAATTTA
gi|10 : --T-GT-TT-GCGG-------T----TTC-CCC-GA---CCGACC----T-AGTAAA-T--TCGTT-GC-GA-C-GGAA--A---AT-C-T--T-T-T-------ATTT-----G--TAT-TT-------------A----C---CAGG--T--GATA---TT---TTT--TTA---TTCATT--T-CTG-TT--GCG-AC---CGAC----------CCG----AAT-CT-----TA-TTTCT-----GC----A-TT--TTAA---CCG---CTCAAA--AAAC-AT--TTT--T--------AT-----CG----AATTCC--TGAC---T--TTTTTTTT--CG--CGAT----AA--GGACT-A-------AGTAC-TCC-AGT-----TTTC---TACCTTGTCCGCA-CGC-AGC--TCAGAG-CTGAG--CACTTCCGAAT-----AC---------CAT--------------ATATAC------------CAATCCG-TCAG--CGA-CT--ATAC-A-A-ACG-G-CTT---TCATGCATCAA---AA---GTA-TCAAAT--TTT--A---A-TAT---AA-AATGCATAGTT-TC--TA--AAGT--A-ATGA-A-TTGAA---T--TTGCA------TTTA-----G---T-A-CGAAAT----TGTAGC-ATAAAAGGAG-AAGGA--G-TTGT-AG-GA-G-ATCG-T---------G-A-TA-TG-GAA-AA--GTTTCATA--T--A-CT--GTA--CGGGA-CAA--------------AA-AACCAATTGGATTCA-ACCCAA-CACAACT-T-----GTC-----CG-A-T--ACAGAAGAT---------TGAGAATCGG--T-A--TGAA---TT-AAACCAGATCAA-G----TCGCT--C------A-CTT
gi|11 : ----T--T-GT-T--GCGG-------T----TTC-CC--GA---CCGACC----T-AGTAAT-T--TCGTT-GC-GA-C-GGAA--A---AT-C-T--T-T-T-------ATTT-----G--TAT-TT-------------A----C---CAGG--T--GATA--TTT---TTT--TTA---TTCATT--T-CT--TT--GCG-AC---CGA-----------CCGA--AAGTGCT-----TA-TTTCT-----GC----ATTT--T--A---CCG---CTC--AACAAAC-A---TTT--T--------AT-----CG--A-ATTT-C--TGGAC--T--TTTTTTTT--CG--CGAT----AA--GGA-T-A-------AGTAC-TCC-AGT-----TTTC---TACCTTGTCCGCA-CGC-AGC--TCAGAG-CTGAG--CACTTCCGAAT-----AC---------CAT--------------AT-TAC------------CAAT-CG-TCAG--CGA-CT--ATAACA-A-ACGTG-CTT---TCATGCATCAA---AA---GTA-TCA-AT--TTT--A---A--AT---AA-AATGCATAGTT-TC-TAA--AAGT--A-ATGA-A-TTGAA---T--TTGCA------TTTA----GG---T-A-CGAAAT----TGTAGC-ATA-AAAGGA-GAGGA--G-TTG--AG-GA-G-ATCG-T--A-----AG-A-TA-TG-GAA-AA--GTTTCATA--T--A--C--TTA--CGGGA-CAA--------------AA-AACCA--TGGATTCAGACCCAA-CACAACT-T-----GTC-----CG-A-T--ACAG-AAGA---------TGAGAATCGG--TAA--TGAA---TTAAAACCAGATCAA-G----TCGCT-GC------A-CT
gi|12 : TTTTTT-TA-TCGTTTCACAT-----ATGGGT-------CAA-A--AATAGTATCTATATAATTACTATG-TATGTG-GC-T--ACAA--G-CCG------------GAT--AATT-TACAA-T-AGTGATT--GCGACGTCAAAAAACGGT-C-TT---G-G----TG-AC---TT-GA--CTTGGAA-C-CAGATTGAGAAAA---------A----------AAAAACTGCGATTCT--GT-TTGTGCG------------TA------------------------------------AC-TT-C-TAG-----------------TTTGAAT------T----------------CTTGGAGGAAATGAAAA-CAAGATAAT--ATACGTCAAA--A-TT--GCTAAA--TTCTAT--A--GAGATACA--AAA-C--AAAG------------TGTA-T------TATATA-CTAAT-CAT---CA-CTA-CAAAA-CA--T--G-CAAGAC-AAA--CTTCTATAATCATTATCAAATAAAA-TAAAA--TAT-TTTTAT--CTACC--T---CCTA-CCAGA--AA--AAATAAG-GGC--CTAC-TGAA-----TTATTTGTTTG----GCT--------------------GA-GAAAAT--AACATTTTA---C-CCATACTA---CCG-CCCTA-C-TTCGT-AAT-C-GC-G-TCG-G--AAA-AGGCGCAATCAAACA----TTTTTAAT
gi|13 : t-----------TGAT--G-TT-TACA--T-GA-G-TT--ACAGCACCAAAAA-CAGT-TACT---ATG----TG-AC---CT-GAA-CTTGAA--C-CAGA------AAA---------GGGGCGATACTTTTAGTC----ATAT--GGATTACGC-------------TA-------------CAC-----CCATCCAAC------AC-TT-CCTGGG----------------TTAGAAT------T--------------T-CT-----------AAAA-CA-AACAATGCGCACAATACACGA-T-------AA--TT---T--A------TG--------------G-T-ACAT------GTA-TATGCAAAATA-A-C--ATAGATAT------A-CAAATACAG-T--A-C-AGAC-AAA-----A-GCCGC-ATTATCAAAT------AAAA--TA--TTTTAC--CAACT--TA--TCTACAAAATG-CA--TAAAAAA-GGCTTCTGTTTT--GTTTTTTGTTT-TTTT----GTTTGTTTTTTTTTTTTTTGGCTGAGAAAAATAAAATATTTTG---C-CTAC-CTA---TTTACCCT--CTTTCG------G-G--G-TCGTT--AAA-GG--GCAAAAAAAAAATCATTTTTTATTTA
gi|14 : ctc-------------CCC-----CCCCCCCCTT---CCAC-TTTC-GACG----------------TTTGAAT------T--------------G-CTC-------AC-AAAAACACAATA-T-C---CGATATA--T-TT--GC-AAAGTTT---T--AGTAAGACACACAAAA-ACCAAAG-TTACATTATAATGTAGTATA--ATATATATC--GTGTATATGCATCTAACAAAAGCAGGT--AAC-AGAC-AAAAACTAATATCAT---TATCAAAT-AAA-TAAAAAATA--TTTTATTCCGACCCGTATCCCTACGCAGAG-GATAAAGTAATCGGC--CTACT-GAAG----TTATTT-TTTGTTTGGCTTA-------------------A-GAAAATAAAATATTCTGAGGCGCTAC-CTGGAGCAGACCCTAGCGTTCGTAAAT-C-G--GGTCG-G--AAAAGG--GCAAACAAACAAT--TTTTTAATTTAggcc
gi|15 : gatttcgccctcccA-TATTATGC----------------------------------------------T----------------------ACCGC-TGG-----TTTTAAAG------------------AAA--TTCTAT-T-ACCGGTTTAT--TCA--TAAGTGGAAAA--AT-A-CGCTA---------A------TAA--ATAA---TACAATA--------------------T--------------CTGGGCTGAATG-TACTC-ATCCGA---TTTTTTTAA---------ATT-GT------A-----A----------T------TGGGCCGACCCA--TTT---TTAGATA-ATCTG----A--AGACAAGCAGTAA-ATGACACGA---AAAAT--A--CTTT-TCC----A-AGAATAATATGTTTA-TA-C-G-TA-ACAT-TTCAA-TGATTTGGCAGTACAG-TACTAGTAA-TACAT--TTACTAGA-GA-G-A-GCATTCACGCCTG-TTG-----------TG
gi|16 : tctgtctatacttacctgtatattccaacatattcatggtggaTGAT-GT--TTATTTATTTGTTCATTTTTT--TATA-TT
gi|16 : aggtaatttcggattctaaacgttcatttgtaaagactttgttatttgcatttggtcacattattttaattTT--CT--TACT-TCCGT----TTATGGTTAGT-AA----CTTA----------------T-TG-GAGTTAGT--ATCC----------T-------TTGT-----------------GGG----ACGAT-ACACTAAATTT-CCCCCCACCCCATACCGAAGAGAGATGGACGT-CGCTCCTGAG-CCGT-TGTAG-----TATTTTCGGATTTTCTTTGTCGGAGAACAT----GAACCA--TTTAAGGTAAGATAGAGTAAGATGAGAGtttgatagattaagtttcttacttccgtttatggttagtaacttattggagttagtatcctttgtgggacgatacactaaatttccccccaccccataccgaagagagatggacgtcgctcctgagccgttgtagtattttcggattttctttgtcggagaacatgaaccatttaaggtaagatagagtaagatgagag
gi|17 : aggtaatttcggattctaaacgttcatttgtaaagactttgttatttgcatttggtcacattattttaatttgatgtttatttatttgttcatttttttatatttttgatagattaagtTAAGT--------A-CTGTAC-----TAAGGCCG------AA-TAA--GT--TTCTCCATTGAAATAAG-----TGA-CA-AAA--C-GAAGAGGCAAACAC--TAATCTATTTAATT--TC-T--CCTTTAAAGTAT-A--CATTTA-TATTTCACCAACATTTTCATGTCGACA------------------TATCAAGTCT----------------------ACCG---TG-----TTTTCAAT------------------AAA---TC-AT-TT------CTAT--TCAGCTAAGTGGGAAA--ATAA-CG-TAG--------AAG-AACTAA--ACAA------AATA-A----------------TT
gi|18 : CTAAATTA-GAAATTT--TTGT----T--T-GT-T--GCGG-------T----TTC-CC--GA----CGACCCCATT-GTTGAC-T--TCGTTACC-GA-CGTGAATCA---ATAC-T--T-TCT-------ATTTTG---A--TGT-TTG------------A----CGTACAGG--TTGAATATATCT---TTT--TTATATTTCGTTTCT-CTG-TT---TA-AC---CGATACCTGTGGAGCCGATTAAAT--T-----TATTTTCT-----GTGACAA-TT--C--ATACCCGAAACAC--A--AAAC-AT--TTTCCT--------ATTA---TG-AACAATT-C--TGA----T--TTTTTTT----C--AGCTA---AA--GGACT-A-------AGTATATCCTGAT-----TTaatatttatataatatatagaagatatctatctctccatccgatcctttttttttttttatcgtttcacatatgggtcaaaaatagtat
gi|19 : ACTAT-GC--TTGCTT-----T-CATT--TT--TAT---TCAT----TT-TG--TAGT-AG----AATA----------------TGAG-GA-----T--ATTCAG------A-T-------T
gi|2 : tttgcatcagaaaacatatctttttgatgaggtttatgagaacggtcattgaaattttgtattcatttgtattcCTAAATTA-AAA--TT--T-GT----T--T-GT-TT-GCGG-------T----CTC-CC--GAA--CCGACC----C-AGTAAA-T--TCGTT--C-GA-C-TGAA--A----T-C-T--T-T-T-------ACTT-----G--TATATT-------------A----C---CAGG--T--GATAT-TTT---TTT--T-A---TTCATT--T-CT--TT--GCG-AC---CGA-----------CCGA--AAAT-CT-----TA-TTTCT-----GC----A-TT--TT-A---CCG---CTC--A--AA-C-AT--TTT--TT-------AT-----CG-AA-A-TT-C--TGA----TATTTTTTTTT--TC--CGAT----TT--AGACT-ACAGCTGTAATAC-TCGT-GT-----TTTC---TAC-TTGTCCGCA-CGCAGCC--TCGGAG-CTGAGA-CACTTCCGAAT-----ACCG-------CATGTACACTGTACATAATATAC------------CAAT-CG-TCAG--CGA-CT--ATGA-A-A-ACGTGCCTTA--T----CATCGA---AA---GTA-TC--AT--TTT--A---ATTAT---AAGAATGCATAGTT-TCAATA--AAGT-GA-ATT--A-TTGAA---T--TTGCA------TTTA----GG---T-A-CGAAAT----TGTAGC-AT--ACGGGG-GAGGA-GG-TTGA-A--GA-A-ATCG--TAA-----AG-A-TA-TGCG-A-AA--ATTTCATA--T--ATCT--TTAGGCGGAA-CAA--------------AA-AACCA--T-GATTCAGACCCAA-CAC--CT-T-----GTC-----CGCA-T--ACAG----------------------------A--TGAA---TTAAAA-CAGAT-AA-G----TCGCT-GC------A-CTTTAT-GCAATTTGAAGATGC--A---T--CATACA-T-TAT-GC---AATACCAAC-CTGG-TATAGAAA-TAAGA-TACGCAGAATAAATATT-TGCTCCA--AAAACGCATTCATCATG-G-C-GGCTAATGA---TCA----AACGTTCAGTGAAAGTGTGTAA-TTATT-GCACATAATGAG-A----TA--------TTCATT--TT----TA-TTCGT----TT-TG--TAGT--A----ACTA----------------T-TG-GA-----T--ATTCAG------A-T-------GTG------------------GG-----ACAAT-AC--TAATTTT-CCCCTC----CAAAC----GATAG-TGGACAT-CGC----GAG-CCGT-TAT--------A-TTTC----------TA-----------------------TTTAAC---CGAGAGA-CGAGA-AA------TTAAATAATGTT--------------------GAG-----A-ACCC---------------TACACA---CTGTG-A-AGA-GAAG-------------------AT--TT-CATTT-----CAG-TTTGTT-GGT-AG-AC-AAAATACC-GAAC--ATCGT-AAATTCAT-ATATAGACCCAGT-----------CC--TGCCTATCTCAATCACAACGATGGCCTTTTGC-TTCAATGA----CC-AC-T---------------T-GA-TTG---TTGAAATATGATC---------GA-ATAAAC------------ACA--CTG----AA----TCGGT--ACGAACGTGAGGGTATGC-A----------ACCGCAAATA-----TTTTTTAAATCCC-----------------AAAG---TTCAA-CAA----GCCTGCACTTTGC-TGCAA-TTGTAAAATAAAAG--ACGTGGAAAGTGTTCATGTTAATATTGAAATAAACACCGG--TGATCATGATGC-CATATCACTCAGCCATAGTAAAT--------ACCCGTAA----GT-ATACCA------AAATAA--GT--TCTT--ATCGAAATAAG--GCATGA-CATAAAT-CTGCAGAGGCAAACAC--TAATCTATTT--TTA-CC-TTGCCTGT-AAG-ATAA--C-TTTA-TATTATA-C-------------CAACATTTCATGTTAATATAAAGT--------T----------------------ACCGC-TTG-----TTTTAAAG-------------------AAATTTCTAT-TTATCG-CTTAT--TCAGTAAAGT--GAAA--AT-A-CGATACATACATGGAAT-AAC-AA--ATAAATTTATTATCTA----------------TTT--------------CTTGACTGAATGATA-CC-A-CCGACTTTTTTTTTAATATGGCGT-ACTAGT------A-----ATTAGTAGAGTT--T--ATGGACCGA--C---CAA---TTAGATGCATAT------ACAG-CAA---GCAA---GACACGAAGAAAAATACA--CTTT-TTCTTC-A-AGAATAATATT--------T-ATTACACATGTTCAATTGA-TT----GCAC-GCTACTAGTAATTACAT--TTAC-ATATTATGTA-GCCT--ACAACTG--CG-----------TGAT--AATT-TAC--AT-GA-G-TT--GCGACGTCAAAAA-CGGT-CA-T---G-G----TG-AC---TTAAAA-CTTGGA----CAGA------AAA---------A-----------TAACTT----TTAT--GG-TTGTGCGCTTGCGACCCTCCG-------------CCC-----CCCCCCCCCTCCCCCCC-CT-C-CACGCCCCCCCCCCCCTCACTTTAAGTTTGAATT--------------G-CTC-------AC-AAAA-CACAATAAT-ATTACGATATA--T-TTGCGC-AAG--TT---T-----AAGATACA--AAACA--ACAG-T-ACAT-A-AATGTT-TATT--ATA-ATA-T--CTGTATATGCATC-A-C-AAAGCA--T--A-C-AGACAAAA--CT-ATATC---ATTATC-----AAA-TAAGA--TA--TTTTAT--CGagctccgtaaatacatttataaacggtgagacaaaactaattttattcgtattgttgagtagacaagcgtgacccattatatttttttcaacatttgataaagaacaaatttaat
gi|20 : GCACCTA-CAAAAGCAG-TTTA-C-AGAT-AAAA-CTAATATCAT-GG-ATCAAAT-AAA-TAAAA--TA--TTTTAT--CGACC--TA--CCTACCCAGAGAAA--AAATAAG-TTC--CTACTAGAAG----TTATTT-TTT-----GCTTA------------------G--AAAAAT-AAATA-TTTA---C-CTAC-CTA---CCGACCTAA-CGTCCGTAAAT-C-GGCG-TCG-GAAAAA-GG--GCAAACAAACAAT--TTTTTCATTTtaaaatttatcacaaatgaaaattcttctataaacaaaaaaatttatttcttataaaaaatggtaaaaata
gi|21 : ATTTCAC--TT--TATA-TATAGA-GCAC--ACAACTGGCTGGGGTAAACCTCTGATGAAATT-TACATGG-GA-G-TT--GCAACATTAAAAA-TGGT-CATT---G-G----TG-AC---CT-GAA-CTTACACCC-CAAA------AAAGGGTGATTCA----------TTTAGTCCA--TTATTGGA-TCATGTA------------TA-------------CCC-----CCta
gi|22 : GCACCTA-CAAAAGCAG-T--A-C-AGAT-AAA--ATAATATCAT---TATCAAATAAAA-TAAAA---A--TTTTAT--CGACC--TA--CCTACCCAGAGAAA--AAATAAG-GTC--CTAC-TGAAG----TTA-TT-TTTG----GCTTA------------------G--AAAAATAAAATA-TTTA-----CTAC-CTA---CCGACCATA-CGTCCGTAAAT-CGG--G-TCG-GA-AAA-GG--GCAAA-AAACAAT--TTTTTCATTTAaactttctggattagaattccagggaaaaatttgcacacaat
gi|23 : ACGATGGCC--CTGC-TTC-ACGA----C--AC-TGGCTTATCTATGGTCT-GA-TTAGTTTTG-AACATGGTCATCGATTGAGAGATAAACCCCATGTCCAAAACT--CTATCCTGA----TCGGTATCCGAACGTAAGG-TA-GC-ACAAAAAATATACCG-AAATATT-TTATTTTTA
gi|24 : AAAA-AAA-AAAAA--TAATCTTTAT--CGACC--TA--CCTACCCAGAG--A--AAATAA---AC--CTAC-TGAAG----TTATTT-TTTG----GCTTA------------------CA-AAATA-AAAATATTTAA---T----C-CTA---CCGACCCTA-CGTCCGTAAATGC-G--GTTCG-GA-AAA-GG--GCAAACAAACAA---TTTTTAATTTAc
gi|25 : AAT-AAAATAAAA--TACTTTTTAT--CTAC---TA--CCTACC-AGAG-AA--AAATAAG-GGC--CTACT-GAAG----TAATTT-TTTG----GCTGA------------------GA-AAAA-TAA--T-TTTTA---C-CTAC-CTA---CCGACCTTA-CTTTCGTAAAT-CGG--G-TCG-GGAAAA-GG--GCAAACAA
gi|26 : AAAT---AAC--TT--GTGT----TATT-GTGTT-GCGG-------TATATTTC-CCACGA---CCGACCC---T-AGTAAA-TTATC-TT-GC-GA-C--GAA--ATATAT-CAT--T-A-T-------ATTTTTGTGG--TAT-TTTTAGAACATCCTGA----C---CACA-----AATAT-CTT---CTTTATTT---TTCATT--T-CTG-tttt
gi|28 : T--AGTT-TACATGC-AG-G-TTCAGCGCTGTCAAA---CGGT-CATTCTGG-GAGCATG-TCCCTTT-GA----TAGA--T--AGT------ATATT-------A----------TTAA--T----TTAT-----TTGTACA------------GA-------------CAC-----CCCCCCCCCC---CC-C-TT-C-
gi|29 : -AATAAACACCGGGATGATCA------------------GCCATAGTAAAT--------A-CCATAC----GTA-TACCGAAAAAAAAATAAAGATAATTCTTATTCG--ATAAGTTGCATGATTA-AAA--C-----AGGTGAAT-------TCTATTT--TCA-Cccccgggccttgtaat
gi|3 : aGTGGAAAGTGTTC-----------G-AATAAAC-CCGGAATG-----------CACA----TCAGCCATAGTACATGTTAAGTAA-CC-TAGTTTGGTAGTTACG------AAATAAA-GT--TTCTCCATCGAAATAA----------------------AGTGACAAACA---TAATCTTTTT--TTA-CC-GTTCCTTT-AAAAAT-A--C-TTTAATATTATACC--------------GACA------------------T--------T----------------------TTCATGTTGAATATTTTTAAAGTTCCGCTGTTTTCAATTAAGAATTTCTATCTTACCG-CTTAT--TCAGTCAAGTAGGAAAATAC-ATCGATA---------AA-----TAA--ATGA---TACAATA-AACTCTATTTATCTATTTTT--------------CCTGACTAAATG-TACCCCA-CCGAC-TATTTTC--ACATGG--T-ACTAGTTAGTAAA-----G----------T--TTCATGG-CCGA--C---TGAGTTTTAGATACATATGCCATAA-GGGCA-G--GCAAATTGCAACGAAG-AAAGTACA--CTTTATTCTTCAA-AAAAT----TTTTTT-T-----TTATACATGTTTAATTT-TTT----GCAC-G-TACTAGTAATTATAT--TCA---TG-TATGCA-GCA---ACAAC-G-C-G-----------TGAT--AATT-TACATGC-AGCG-TT--GAGACGTCCAAAA-CGGT-CATT---G-G----TG-AC---TT-GAACCTTGAA--CACAGA------AAA---------AAGCGATACT-CTAGTTT----TTAT--GG-TTGTGTG------------TAAACAACAGAACACCCC-----CCCCCCCCCC---CCCC-TT-C-CAGGT---------------TTTGAAT------TCCTGGGAGGAAAACG-TTC-------AC-AAAA-CAAGATAA--CATACGG-GTA--ATTT--GC-AAG--TT---TACA--AAGAGATA--AAA-A-----------AC-A-AA---A-TATA--ATATCTG-C--ATACA------------AAAAGCAG-T--A-C-AAAC-AAA--
gi|30 : ATGA----CCA-C-T---------------C-GA-TTC---GTG-AA-ATGGTA---------GA-ATGA-C------------ACA--CTG----AA----TCAGT--CAGAACATAGGGAAATGC-A----------ACCG-AAAAAAA------ATTGACTCCC-----------------AAAG---atttat
gi|31 : ATATG---ATTGAGAGAGGA-ACCCC-----TAAAACTACCATACATTTCTGTG-ATATATGAAAAATG----AATACGGGGCGATGATT-CATTT-----CAGTTTTGCT-gaa
gi|32 : T--CT--TATT-TTCGT----TT-T---T-GT-AA----ACTA----------------TGTG-GA-----T--ATTCAATTTGTTA-TCTATAAATTGT-----------------GG-----ACGAT-AA--TAA-TTT--TTCTC----CAAAC----GACAt
gi|33 : AATTA-AA--------TGT----T--T-GT-TT-GCAG-------T----TTC-CC--GA---CCGACC----C-AGTAAA-T--TCGTT-TC-GA-C-TGAA--A---AT-A-TAAT-T-TAATTCACATTT-----G--TAT-Tt
gi|34 : --CGA-CT--ATAA-A-GGACGTG-CTT---TCA---GTCAA---AA---GTA-TC--AT--TTT--A---A-TAT---AA-AATACAT-GTT-TC-ATA--AAGTCAA-AT
gi|35 : ATT--G-CTG-TT--GCG-AC---CAA-----------CCGA--AA----------TA-T------------------------A---CCA---CTC--A--AAAC-AT--TTT--T--------AT-----CG--A-AATT-C--T
gi|36 : T-C-G--G-GTG-G--CAA-CA--GCAAACAAACAAT--TCTTTATTTTA
gi|4 : tcgggAATTA-AAT--TTCATTGT----T----GT-TT-GCG--------T----TTC-CG--AA---CCGACC----C-AGTAAACT--TCGTT-CC-GAAC-TACA--A---AT-C-T--T-T-T-------ATTT-----G--TAT-TT-------------A----C---CAG----------T-TAT---TTT--TTA---TTCATT--T-CTG-TTTGGCG-ACAAACGA-----------CCGA--AA-T-CT------A-TT-CT-----GC----AATT--T--A---CCG---CT---A--AAAC-ATGTTTT--T--------AT-----CG-AA---TT-CACTGA----T--TTTATCTT--TC--CGATTATTAA--GGACT-A-------------------T-----TGTC---TAC-TTGCCCGAA-CGCA-GCAAT-GAAG---GAGA-CACTTCCAAAT-----ACTGCATGA--CAT--------------A-ATAC------------CAAT------------------ATAACA-A-ACGAG-ACTA----AT-CATCAA---AA---GTA-TC--AT--TTT--A---A-TAT---AA---TGC-TAGTT-TC-ATA--AAGT-AA--TGA-A-TTGAA---T--TTGCA------TTTA----GG---T-A-CG-AAT----TGCAGTCAT--AAGGGG-CAGGA-GG-TTGACAG-GATA-ATCG-TCAA-----AGAA-CA-TG-GAA-AA--GTATCATA-----ATTT--T----CGGGACCAAAAACAAACAAACATAA-AACCA--CGGATTC-GACCCAG-AACAACT-T-----GTC-----CG-ACT--ACAG-AGAT---------CGAGAATCGGT-T-A--TGAA---TTAAAGCCAGATC-A-GTTTTTCTCTAGCGCCAAAA-CTTCGT-GCA--TTGAAGATTCCAA---T--TATACA-TGCAT-GTCT-ACTCCAAA--CT-GTCATGGAAA-CAAAA--ATACAG-ATGAATA---CGTTCCAATGAAAgg
gi|4 : G------------CTGTT-GCACATAATCAT-------ATTT-----TTGATT--TG--AA-A-C------------A--TAGT-AA----ACTA----------------TG-G-GA-----T--ATTCAG------ATT-------TTGTCTATTTATAAATTGTTGGG-----ACAAT-A----AA-TTT---TTCC----CAAAC----GATgatttgtagctgttgcacataatcatatttttgatttgaaacatagtaaactatgggatattcagattttgtctatttataaattgttgggacaataaatttttcccaaacgat
gi|5 : aattaaatttcattgttgtttgcgtttccgaaccgacccagtaaacttcgttccgaactacaaatcttttatttgtatttaccagttattttttattcatttctgtttggcgacaaacgaccgaaatctattctgcaatttaccgctaaaacatgtttttatcgaattcactgattttatctttccgattattaaggactattgtctacttgcccgaacgcagcaatgaaggagacacttccaaatactgcatgacataataccaatataacaaacgagactaatcatcaaaagtatcattttaatataatgctagtttcataaagtaatgaattgaatttgcatttaggtacgaattgcagtcataaggggcaggaggttgacaggataatcgtcaaagaacatggaaaagtatcataattttcgggaccaaaaacaaacaaacataaaaccacggattcgacccagaacaacttgtccgactacagagatcgagaatcggttatgaattaaagccagatcagtttttctctagcgccaaaacttcgtgcattgaagattccaattatacatgcatgtctactccaaactgtcatggaaacaaaaatacagatgaatacgttccaatgaaagatttgtaATGC--A---T--TATACAATGTAT-GCCT-ATAACCAA--CTGGTTATAGAAA-TCATA-TAC-CAGATTCAATATTATGCTCCAGCAAAACGCTATCACCATG-GGCAGG-TAATGAA--TCA----AACGTTCAGTGACAGATTTGTATTTATTTGCAC-TAATCAT-GTATTTATTTATT--TTCACT--CTCTTACACTTCGTCATTTT-CG--TAGT-AAAGTGACTAACTGAATCGAATGTTGTGTGCGG-----TGAATCGAGGGGGT-A-A-------TTGT-----------------GGGAAATATGAT-ACC-TAA-TTTTCCCCCC----CAAAC----GATAG-TGGACATGCGC----GAGGCCGT-TAT----------TTTCG--------TTC--AAA-AACATGAA-----CATTTTAACG---AGAGAGAGAGAGA-GAGAG---------AGCG-----CATTAAATATGAAGTTTGAG---GAATACCCCAGGTACA-------CACACA---CTGTGAACAGA-GAGGAA-GGAGAAAAACG----AATG------------------TTTGTT-GGT-AGAACAAAAATACCAGAGTA-ATCGTCAG--TCGTATCACAAACCCAGTTACAACTGCACCTG-TA-CTACCT-AATCACAACGATGGCC--TTGC-TT-CATGACACCCCATCGT---------------TAGATTTG---TTG-AAAATGGTC---------GA-ATGAAC------------ACACCCTG----AATAATTTGGT---CGAATGTAGGGATATGCAA----------ACCG-AAAT-TATTTTTTTTTTACTCCCCAATAGTGTAGTTTGTTAAAGTATTCCAACCAA----GCGTG--CTTTGCTTGGAACCTGTAAAATACAAGC-ACG-GGAAAGTGTTC
gi|6 : TAAATTTTAAA--TT--TTGT----T--T-GC----GCGG-------T----TTC-CC--GGGACCCGACC----TCAGTAAA-T--TCGTT-TC-GA-C-TGAA--A---AT-C-T--T-CCT-------ATTT--------TAT-TT-------------A----C----AGG--T--G-TAT-TGT---TTT--TTA---TTCATT--TTCTG-TT--GCGGAC---CGA-----------C-------AT-CTCCCTCTC-TCTCTCAATGAC----A-ATAAT--C---CTG---ACC--T--AAAC-AT--ATA--T--------ATATATTCATAA-AATT-C--TGA----T--TTTTTTTTTACC--CAAT----AA--GGACT-A--------GTGG-TCCTAGT-----TTTC---TA---TGTCCGCATCGCA-GC--TCGGAGACTGAGA-CACTTCCAAAT-----AC---------CGC--------------ATGTACATTATTACTACTCCAT-CG-TCAG--CGATCT--ATAA-ACA-ACGTT-CTTA--TCAT-CGCCTAGTTAC---GTG-GC--GTGCTTT--ACCTA-TATGAGAA-GATGCATAGTT-TC-ATTT-AAGT-AA-ATGAGA-TTGAA---TGATTGCA------TTTAAA--GG---TTA-CGAAATGTCTCGTAG-GAT--AAGGGGAGAAGA-GG-TTTA-AG-GA-ATATCG-T--ACCCCCGG-A-TA--G-G-A-AAAAGTTTCATA--T--ATCTTCTTAC-CAGGA-CAA--------------AACAAACA--TGCATTCAGA-CCAA-CACAACTAT-----GTCGGGTGCG-A-T--ACAG-AGATAATGA----TGAG-ATCGGTTT-A--TGAA---ATTAAACCAGATCAACG----TCGCT-GC------AGCTTTGT-GCATTTTAAAGATTC--A---TAGTATAC--TGTATGGCCTAATTACCAAGGCTGGTTATAGA
gi|7 : -CTTCGTAGCAATTTGGAGATGC--AAATT--CATACA-TGTAT------ACTGTCG--------TATGGAAAATAATAATACGAGAAATGAATATTCTGCTCCAGCAAAACGCCATCGACATG-G-C-GG-TAATGAACGTCAGTGAAAAGATTTGTA------------TTATT-GCACATAATCATTAT--TTATTT-----T-CGTT--TA---ATA-TTCGT----CTGTG--TAGG-TA----AC-A----------------TGTG-TA-----T--ATTCAG------A-A-------TTGT-----------------GGGA---ACGATTAC---AA-TTT-TTCC-------AAAC----GATAG-TGGACATGTGC----GAG-CCGT-TA--------CA-TTTCG--------TTA--AAAGAACCTAAAAGAACCATTTTTAAG---AGAGAGAGGGAGA-AAGAGCACTT-AATAACGTTTGTCAATTCGTGT----TTCGAG---GAA-ACCTA-----CA-------CATACA---CTGTG-AC--A-GAAGAG-A----AAACCG---CAATAATTACATTTTGAAGCAGTTTTGTT-GGTCAG-AC-AAAATA----AATA-A---T-AA--TCGT-TCACAGACCCAGT-----------CCGTTG-CTGTC----CCACAACGAAAGGC--CTGC--TCCATGA----CC-AC-T---------------T--A-TTG---TTA-GAAATGGTT---------G--ATGA--------------ACA--CTG----AA----TCAGTCCCCGAACATAGGGACATGC-A----------ACCA-AAAT-CA--TTTTTTTAACTCCA-----------------AAGG---T
gi|7 : -----------------AAAGAT-TTCAG-CAACGCTGCATGCACTT-GCTTGCAA-CTGTGAAATACAAGCAATGTGGGAAattaaactggttccataagcaatattatgtaaagatttcagcaacgctgcatgcacttgcttgcaactgtgaaatacaagcaatgtgggaa
gi|8 : cttcgtagcaatttggagatgcaaattcatacatgtatactgtcgtatggaaaataataatacgagaaatgaatattctgctccagcaaaacgccatcgacatggcggtaatgaacgtcagtgaaaagatttgtattattgcacataatcattatttattttcgtttaatattcgtctgtgtaggtaacatgtgtatattcagaattgtgggaacgattacaatttttccaaacgatagtggacatgtgcgagccgttacatttcgttaaaagaacctaaaagaaccatttttaagagagagagggagaaagagcacttaataacgtttgtcaattcgtgtttcgaggaaacctacacatacactgtgacagaagagaaaaccgcaataattacattttgaagcagttttgttggtcagacaaaataaataataatcgttcacagacccagtccgttgctgtcccacaacgaaaggcctgctccatgaccacttattgttagaaatggttgatgaacactgaatcagtccccgaacatagggacatgcaaccaaaatcatttttttaactccaaaggtattaaactggttccataagcaatattatgtAAATTA-AAA--TT--TTGTATACT--TAGT-TTAGCGAGTCAGATT----TTCTCC--GA---CCGACC----C-AGTAAA-T--TCCTT-TCCGA-C-TGAA--AG--AT-C-T--TGT-T-------ATAT-----GGGTAT-TT-------------AGACGC---CAGGGGTA-GATCTATTTACATTT--TTA---TTCATT--T-CTGCTT--GCG-AC---CGA-----------CCGA--AATT-TT-----TA-TTTCT-----GC----AGTT--T--A----CG---CTC--A--AAACTAT--TTTA-TGTCCATAAAT-----CACAA-AGTTCC--TGAATTTT--TTTTTTTT--TCAGCTAT----AATCGGACTAA-------AGCA--TTCTAGTTATTATTTCCATTACCTT-CCCGCA-CGT-AGC--TC-GAG-CTGAGATTACTTCCAAATGTGGAACGCAATGTAACAT--------------ATAT-C------------CCAT-CATTCAGTCTGA-CTCAAT-A-A-A-CCGTG-CTTAATTCAT--ATCAA---AAAAGGTA-GC--AT--TTTTAA---A-TATGA-AA-AATGCATAGTTATC-ATAATAAGT-AATATGA-ATTTGAATATT--TTGCAGAACGTTTCAAATTGGGGTT-ATCGAAA-----TGT-GC-AT--AAGAGG-GAGGATGGTTTGA-AGAGG-A-ATCG-TTTA-----AG-AGTAGTG-G-ACAA--G-TTCATAAGTAAATCT--TTA--CGGGA-C-A--------------AC-AACCT--GGGGTTCAGTCCCAAGCAGCACT-CATAAGGCC-----CG-A-TAAACAG-AGATAAATGAATGTGAGAATCGG--T----TGAATATTTAAAACAAGATCAA-G----TC
gi|9 : gccta--CTGCAGAGGCAAACACACTA-TCTATTT--TTAACCATTGC-TGT-C-GTAT-GAGC-TTTA-TATTATTAC-------------CAACA------------------T--------TTTCATGGTTGATTAATTAAGCTACCGT-TTG-----TTTTAAAG------------------AAAATT---ATATTA-----TTATCATCG--CAAGTGGGAAA-TAT-A-TGATA---------AAATAACTAATAGTAA---TACAATA-A----------------TTTATTTATCTATTTTACCAGACTGACTG-TACCC-A-CCGAC-TTTTTTTTCATATGG-GTTACTAGT------ATTGGAG----------TCTT--ATGGGCCGA--CAGATG----TTAGA---ATAT-----AACATACAAG--GCAA-TTGACACGAAG-AAAATACAATTTTT-TTCTTCAAGAAGATAATATCTTTT-TA------AAACATGATCCATTGATTT----GCAC-G-TACTAGTAATTACA---TTACTATA-TATGTAGGCAT--ACAACTG-CCG-----------TAAT--ACTGACACGAATAGTTG-----GCGACAT--AAAA-CGGTCCATT---G-G----TG-CC---TT-AAG-CTTGGA--C-C--G------AAA---------A----------TTAAGTT----TTAT--GGTTTGTGCG------------TA-------------CCCTCCCTCCCCCCCCTT---CCACTTT-C-TACG----------------TTTG-AT------T--------------GCCTCA------AC-AAAA-CACAAcc
1 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|27 ): GATGGGAATTTAAGGACAGCGCTCATTGAAAATTTTGTATTACATACATGTATGTTTACATTTTTATTCGGTTTTTTTTTTAGTAACTTATGAGGATATTTAGATTTCCTCTTTCCGTAAACACATTTGCTAAACGAT
Alignments
lowQualScore : 111111111111111111111111111111111111111111111111111 1111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 1111111111111111111111111111111111111111111111
lowQualScore : 111 1111111 111 111111 111 1111111 11111111 222222222222222222 11111 11 22222222222 11111 222222222222222222222222 2222222222222222222222 2222 1111 11111111 11111 111 1 11 11 11111 7777777777777777777777777 222222222222 1 111 1 11 111 11 11 111 111111 2222 111 1111 11 11 111 33333333 11111 11 33333333333333 11111 11111 333333333 2222222 111 1111 111111 111111111 111111 1111 111 11 1 111 1111111111 77777777777777777777777777777777777777 111111 111 11111 2222222 1111111111 11111 2222222222222222 11111 11111111 6666666666666666 1111 1111111 11111111 1111 1 1111 111111111111111111111111111111111111111111111111111 111 555555555555555555555555555555555 111 444444444444444 111 2222222222222222222222222 22222 1 1 1 1 11 2 1 44444444444 11 1 11 11 111 4444444444444444444444444444 111 222222222 33333333333333 1111 1111 222 2222222222 33333 44444444444444444 222 1 2222 1 11 555555555 1 888888888888888888888 2222222 11111111 222222 222222 333333333333333333333 111 1111 5555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555 11 11111 444444444444444444 1 111111111 22 3333333 0000000000000000000000000000000000000000000000 1111 77777777777777777777777777777 555555555555 1 22222222 1111 11 1 11 1 22222222 111 1111 22222222222 222222222 1111 11 1111 111111 666666666666666666666 1111 11111 3333333333333333333333333333 11111 1111 5555555555555555555555 44444444444444444444444444 111 1111 2222222222 22222222222222222222 111 111 111 11 11 11 1111 1111 444444444444444444444 11111 11 22
lowQualScore : 5 000 66 9999 55 4 4 77 3333333 8888 4 99 111 333333 4 55 88 4 4 77 55 111 4 4 55 4 8 3333333 77777777 4 999999999999999999 777 55555 00 777 66 777 55 4 4 66 4 777 55555555555 66 6 44 11111 4 000000000000000000000000 777 66 66 4 66 2222222222222222222222 444 8 66 2222 66 9999999 5555 66 5 99999999 99 88 22222 000 5 5 99 77 4 5 22 44444 4444444444444444444444444 5 0 999999999999 5 5 66 5 66 0 5 5 0 5 666 8 888 888 5 11 66 66 888 88 555 5 5 55 11 00 5 999 000 77 666666 0000 000 5 5 2222 5 5 33 5 00 5 77 5 555 5 44444444 5 5 5 33333 5 77 33 5 33333333333333 5 77 0 0 5 1 5 44444 44444 5 5 77 5 777777777 1 3333333 000 1 0 5 2222 6 999999 5 8 77 222222222 6 222222 1 0000 2 1 88 1 88 6 0 1 0 888 66 1 44 0 222 8 5555555555 5 888 5 66666666666666666666666666666666666666 5 888 3 444444 5 222 44444 5 1111111 66 4444444444 9999 00000 4 9999 9999999999999999 33 4 11111 66 11111111 7777777777777777 5 7777 8888888 5 77777777 1 2222 8 0 7777 8 8 000000000000000000000000000000000000000000000000000 444 33 8 2 888888888888888888888888888888888 444 8 888888888888888 444 8 8 8 5555555555555555555555555 00000 5 8 0 0 0 2 0 33 2 3 0 0 77777777777 22 0 22 11 0 333 6666666666666666666666666666 6 111 6 7 666666666 6 55555555555555 99 4444 4444 000 4 6 9999999999 6 00000 66666666666666666 000 0 1111 1 2 3 3 0 22 0 333333333 0 3 6 777777777777777777777 6666666 5 3 99999999 333333 0 888888 77 0 000000000000000000000 111 3 99 6 8 0 8 0 6 3333 8 6 7777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777 00 66666 999999999999999999 1 3 444444444 99 999 1 22 6 6 6 8888888 6 99 1 2 5555555555555555555555555555555555555555555555 1 8 8 8 8 11 3 6666 0 99999999999999999999999999999 3 444444444444 0 0 88888888 3 1111 44 0 8 0 11 6 0 5 8 0 88888888 5 1 111 7 66 4444 777 0 888 22 5 3 5 9999 1 666 33333333333 66 2 5 999999999 66 5 5 888 5 0000 5 888 5 00 5555 444444 333333333333333333333 4 7777 11111 9999999999999999999999999999 11111 2222 3 5 5 5 6 6666666666666666666666 77777777777777777777777777 5 5 4 777 1 5555 99 6 99 1111111111 1 99 77777777777777777777 6 000 99999 55 3333 6 3 5 77 66 5 5 5 222 5 0 444 8 4 66 66 66 66 66 22 66 66 66 55 0000 5 0000 0 444444444444444444444 3 3 22222 5 888 5 2 0 4 8 00 8 4 11 4 66 777 0
lowQualScore : . ... .. .... .. . . .. ....... .... . .. ... ...... . .. .. . . .. .. ... . . .. . . ....... ........ . .................. ... ..... .. ... .. ... .. . . .. . ... ........... .. . .. ..... . ........................ ... .. .. . .. ...................... ... . .. .... .. ....... .... .. . ........ .. .. ..... ... . . .. .. . . .. ..... ......................... . . ............ . . .. . .. . . . . . ... . ... ... . .. .. .. ... .. ... . . .. .. .. . ... ... .. ...... .... ... . . .... . . .. . .. . .. . ... . ........ . . . ..... . .. .. . .............. . .. . . . . . ..... ..... . . .. . ......... . ....... ... . . . .... . ...... . . .. ......... . ...... . .... . . .. . .. . . . . ... .. . .. . ... . .......... . ... . ...................................... . ... . ...... . ... ..... . ....... .. .......... .... ..... . .... ................ .. . ..... .. ........ ................ . .... ....... . ........ . .... . . .... . . ................................................... ... .. . . ................................. ... . ............... ... . . . ......................... ..... . . . . . . . .. . . . . ........... .. . .. .. . ... ............................ . ... . . ......... . .............. .. .... .... ... . . .......... . ..... ................. ... . .... . . . . . .. . ......... . . . ..................... ....... . . ........ ...... . ...... .. . ..................... ... . .. . . . . . . .... . . ...................................................................... .. ..... .................. . . ......... .. ... . .. . . . ....... . .. . . .............................................. . . . . . .. . .... . ............................. . ............ . . ........ . .... .. . . . .. . . . . . ........ . . ... . .. .... ... . ... .. . . . .... . ... ........... .. . . ......... .. . . ... . .... . ... . .. .... ...... ..................... . .... ..... ............................ ..... .... . . . . . ...................... .......................... . . . ... . .... .. . .. .......... . .. .................... . ... ..... .. .... . . . .. .. . . . ... . . ... . . .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .... . .... . ..................... . . ..... . ... . . . . . .. . . .. . .. ... .
lowQualScore : 0 222 99 4444 55 0 0 22 0000000 5555 0 55 000 555555 0 55 99 0 0 11 55 000 0 0 55 0 0 0000000 66666666 0 333333333333333333 888 88888 88 888 11 888 55 0 0 11 4 888 66666666666 11 4 66 11111 4 333333333333333333333333 888 11 11 4 11 9999999999999999999999 666 9 11 5555 99 2222222 6666 99 0 55555555 55 22 55555 000 0 7 11 99 0 7 99 33333 3333333333333333333333333 7 1 333333333333 7 7 99 0 99 0 0 0 4 0 222 1 888 888 0 99 99 99 888 22 666 0 0 44 99 11 0 444 000 99 444444 0000 000 7 7 1111 7 7 66 7 00 7 44 7 444 7 99999999 7 7 7 77777 0 99 66 7 66666666666666 7 99 7 7 7 4 7 33333 33333 7 7 99 7 111111111 4 0000000 000 7 7 7 1111 7 222222 7 0 00 000000000 7 555555 0 0000 5 7 88 0 88 4 8 4 8 000 44 0 55 0 000 0 2222222222 0 888 0 99999999999999999999999999999999999999 0 888 2 444444 0 999 11111 1 5555555 11 8888888888 4444 44444 4 4444 4444444444444444 33 4 11111 11 44444444 1111111111111111 7 9999 1111111 7 11111111 7 1111 0 0 0000 0 0 444444444444444444444444444444444444444444444444444 000 22 0 2 222222222222222222222222222222222 000 0 222222222222222 000 0 2 0 2222222222222222222222222 00000 6 0 0 0 0 5 0 22 5 0 0 0 55555555555 55 0 00 00 8 000 8888888888888888888888888888 7 777 7 5 777777777 7 77777777777777 22 2222 2222 888 2 7 2222222222 7 77777 77777777777777777 888 0 2222 0 5 2 2 0 55 8 333333333 0 2 5 555555555555555555555 0000000 0 2 66666666 000000 8 444444 88 8 222222222222222222222 777 2 22 7 0 8 0 8 0 0000 0 7 3333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333 33 77777 222222222222222222 7 2 888888888 22 222 0 22 7 7 7 7777777 7 22 7 5 5555555555555555555555555555555555555555555555 0 0 0 0 0 44 8 8888 8 22222222222222222222222222222 2 888888888888 8 0 66666666 8 8888 00 8 0 6 00 0 8 6 0 8 00000000 2 0 777 3 33 2222 555 1 000 11 7 6 7 4444 4 999 88888888888 99 0 0 111111111 99 0 0 888 0 6666 0 888 0 11 1111 444444 999999999999999999999 5 5555 44444 1111111111111111111111111111 11111 6666 1 0 0 0 6 4444444444444444444444 00000000000000000000000000 7 7 3 888 7 5555 22 7 22 8888888888 0 22 22222222222222222222 7 222 88888 22 7777 5 1 0 55 99 0 0 0 666 1 1 111 9 4 11 77 11 99 99 00 99 44 99 99 6666 0 6666 1 555555555555555555555 2 2 00000 0 888 0 5 1 4 9 66 9 4 11 4 11 000 2
consensus : CTAAATTA-AAA--TT--TTGT----T--T-GT-TT-GCGG-------T----TTC-CC--GA---CCGACC----T-AGTAAA-T--TCGTT-NC-GA-C-TGAA--A---AT-C-T--T-T-T-------ATTT-----G--TAT-TT-------------A----C---CAGG--T--GATAT-TTT---TTT--TTA---TTCATT--T-CTG-TT--GCG-AC---CGA-----------CCGA--AAAT-CT-----TA-TTTCT-----GC----A-TT--T--A---CCG---CTC--A--AAAC-AT--TTT--T--------AT-----CG-AA-AATT-C--TGA----T--TTTTTTTT--CC--CGAT----AA--GGACT-A-------AGTAC-TCCTAGT-----TTTC---TACCTTGTCCGCA-CGCAAGC--TCGGAG-CTGAGA-CACTTCCGAAT-----AC---------C---------------ATA-TATAC------------CAAT-CG-TCAG--CGA-CT--ATAA-A-A-ACGTGC-TTA--TCATGCATCAA---AA---GTA-TC--AT--TTT--A---AT-AT---AA-AATGCATAGTT-TCA-TA--AAGT-AA-ATGA-A-TTGAA---T--TTGCA------TTTA----GG---T-A-CGAAAT----TGTAG-CA-T--AAGGGG-GAGGA-GG-TTGA-AG-GA-G-ATCG-T-AA-----AG-A-TA-TGGAAAAGTTTCATA--T--ATCT--TTA--CGGGA-CAA--------------AA-AACCA--TGGATTCAGACCCAA-CACAACT-T-----GTC-----CG-A-T--ACAG-AGAT---------TGAGAATCGG--T-A--TGAA---TTAAAACCAGATCAA-G----TCGCT-GC------A-CTTCGT-GCAATTTGAAGATGC--A---T--TATACA-TGTAT-GCCT-ANTACCAA--C-TGGTTATAGAAA-TAANA-TACGCAGAATGAATATT-T-GCTCCAGCAAAACGCNATCGCCATG-G-C-GG-TAAT----GAATC-AAACGTTC-A---GTG-A---A----T--G----T-----A-TT-ATTT-------G-CA---CAT------A-ATN--AT-GT--TTATTT-----TTCA--TTTT--TAT---A-TTCGT----TT-TG--TAGT-AA----ACTA----------------TGTG-GA-----T--ATTCAG-----A-TTTG----------------TG-GGA----CGAT--AC-T-AA-TTT-CCC----CCCCAAAC----GATAG-TGGACATGCGC----GAG-CCGT-TATA------CA-TTTC-G--------TTA--AAAGAACATGAA-GAACCATTTTTAAG---AGAGAGAGNGAGA-GAGAGCACTT-AATAACGTTTGTCATTACGTATG---TTTGAG---GAA-ACCCC-----CA-------CACACA---CTGTG-ACAGA-GAAGAATG---AAAACG---CAATGATT-CATTT-----CAGTTTTGTT-GGT-AG-AC-AAAATACC-GAGTA-ATCGTAAA-TCGT-TCACAGACCCAGT-----------CCG-TG-CTATCTCAATCACAACGATGGCC--TTGCTT-CCATGA----CCAAC-T---------------T-GA-TTG---TTG-AANATGGTC---------GA-ATGAAC------------ACA--CTG----AA----TCGGT--CCGAACGTAGGGATATGC-A----------ACCG-AAATATA-TTTTTTTTAACTCCC-----------------AAAG---TTCAA-CAA----GCNTGCACTTTGCTTGCAA-CTGTAAAATACAAGC-ACGTGGAAAGTGTTCA---TAAT-TTG-AATAAACACCGGGATGATCA--ATGC---CATA----TCAGCCATAGTA-------AATACCCGTAN----GTAATACCG------AAATAAAG-T--TTCTCCATCGAAATAAG-TGCATGA-CA-AAA--CTGCAGAGGCAAACAC--TAATCTATTT--TTA-CC-TTGCCTGT-AAGTAT-A--C-TTTA-TATTATACC-------------CGACA------------------T--------T----------------------ACCGC-TTG-----TTTTAAAG------------------AAAATTTCTAT-TTACCG-CTTAT--TCAGTNAAGTGGGAAA-TAT-A-CG-ATAAA---AC-T-AA--ATAATACAATA------------A----------------TTT--------------CCTGACTGAATG-TACCC-A-CCGAC-TTTTTTTTAATATGG-GT-ACTAGT------A-----G----------T--T--ATGGGCCGA--CA--TGA---TTAGATACATATG----AACAGACAAG--GCAA-TTGACACGAAG-AAAATACA--CTTT-TTCTTCAA-AGAATAATATTTTTT-TA-T-GTTACACATGT---TCAATTGATTT----GCAC-G-TACTAGTAATTACAT--TTACTATA-TATGTA-GCAT--ACAACTG-CCG-----------TGAT--AATT-TACATGCGGTG-TT--GCGACGTCAAAAA-CGGT-CATT---G-G----TGA-C---TT-GAA-CTTGGA--C-CAGA------AAA---------A----------TTAAGTT----TTAT--GG-TTGTGCG------------TA-------------CCC-----CCCCCCCCCT---CCAC-TT-C-TANG----------------------TTTGAATT--------------G-CTC-------AC-AAAA-CACAATAAT-CATACGATATA--A-TT--GC-AAG--TT---T--A--AAGATACA--AAA-A--AAAGT-ACAT-A-AATGTA-TATN--ATATATA-CATGTATATGCACCTA-CAAAAGCAG-T--A-C-AGAC-AAA--CTAATATCAT-ATTATCAAAT-AAA-TAAAA--TA--TTTTAT--CGACC--TA--CCTACCCAGAG-AA--AAATAAG-GGC--CTACTTGAAG----TTATTT-TTTG----GCTTA------------------GA-AAAAATAAAATATTTTA---C-CTAC-CTA---CCGACCCTA-CGTCCGTAAAT-C-G--G-TCG-G--AAA-GG--GCAAACAAACAAT--TTTTTAATTTA
Reference ( family-458 ) : CTAAATTA-AAA--TT--TTGT----T--T-GT-TT-GCGG-------T----TTC-CC--GA---CCGACC----T-AGTAAA-T--TCGTT-NC-GA-C-TGAA--A---AT-C-T--T-T-T-------ATTT-----G--TAT-TT-------------A----C---CAGG--T--GATAT-TTT---TTT--TTA---TTCATT--T-CTG-TT--GCG-AC---CGA-----------CCGA--AAAT-CT-----TA-TTTCT-----GC----A-TT--T--A---CCG---CTC--A--AAAC-AT--TTT--T--------AT-----CG-AA-AATT-C--TGA----T--TTTTTTTT--CC--CGAT----AA--GGACT-A-------AGTAC-TCCTAGT-----TTTC---TACCTTGTCCGCA-CGCAAGC--TCGGAG-CTGAGA-CACTTCCGAAT-----AC---------C---------------ATA-TATAC------------CAAT-CG-TCAG--CGA-CT--ATAA-A-A-ACGTGC-TTA--TCATGCATCAA---AA---GTA-TC--AT--TTT--A---AT-AT---AA-AATGCATAGTT-TCA-TA--AAGT-AA-ATGA-A-TTGAA---T--TTGCA------TTTA----GG---T-A-CGAAAT----TGTAG-CA-T--AAGGGG-GAGGA-GG-TTGA-AG-GA-G-ATCG-TTAA-----AG-A-TA-TGGAAAAGTTTCATA--T--ATCT--TTA--CGGGA-CAA--------------AA-AACCA--TGGATTCAGACCCAA-CACAACT-T-----GTC-----CG-A-T--ACAG-AGAT---------TGAGAATCGG--T-A--TGAA---TTAAAACCAGATCAA-G----TCGCT-GC------A-CTTCGT-GCAATTTGAAGATGC--A---T--TATACA-TGTAT-GCCT-ANTACCAA--C-TGGTTATAGAAA-TAANA-TACGCAGAATGAATATT-T-GCTCCAGCAAAACGCNATCGCCATG-G-C-GG-TAAT----GAATC-AAACGTTC-A---GTG-A---A-------G----T-----A-TT-ATT--------G-CA---CAT------A-ATN--AT-GT--TTATTT-----TTCA--TTTT--TAT---A-TTCGT----TT-TG--TAGT-AA----ACTA----------------TGTG-GA-----T--ATTCAG-----A-TTTG----------------TG-GGA----CGAT--AC-T-AA-TTT-CCC----CCCCAAAC----GATAG-TGGACATGCGC----GAG-CCGT-TATA------CA-TTTC-G--------TTA--AAAGAACATGAA-GAACCATTTTTAAG---AGAGAGAGNGAGA-GAGAGCACTT-AATAACGTTTGTCATTACGTATG---TTTGAG---GAA-ACCCC-----CA-------CACACA---CTGTG-ACAGA-GAAGAATG---AAAACG---CAATGATT-CATTT-----CAGTTTTGTT-GGT-AG-AC-AAAATACC-GAGTA-ATCGTAAA-TCGT-TCACAGACCCAGT-----------CCG-TG-CTATCTCAATCACAACGATGGCC--TTGCTT-CCATGA----CCAAC-T---------------T-GA-TTG---TTG-AANATGGTC---------GA-ATGAAC------------ACA--CTG----AA----TCGGT--CCGAACGTAGGGATATGC-A----------ACCG-AAATATA-TTTTTTTTAACTCCC-----------------AAAG---TTCAA-CAA----GCNTGCACTTTGCTTGCAA-CTGTAAAATACAAGC-ACGTGGAAAGTGTTCA---TAAT-TTG-AATAAACACCGGGATGATCA--GCGC---CATA----TCAGCCATAGTA-------AATACCCGTAN----GTAATACCG------AAATAAAG-T--TTCTCCATCGAAATAAG-TGCATGA-CA-AAA--CTGCAGAGGCAAACAC--TAATCTATTT--TTA-CC-TTGCCTGT-AAGTAT-A--C-TTTA-TATTATACC-------------CGACA------------------T--------T----------------------ACCGC-TTG-----TTTTAAAG------------------AAAATTTCTAT-TTACCG-CTTAT--TCAGTNAAGTGGGAAA-TAT-A-CG-ATAAAA--AC-T-AA--ATAATACAATA------------A----------------TTT--------------CCTGACTGAATG-TACCC-A-CCGAC-TTTTTTTTAATATGG-GT-ACTAGT------A-----G----------T--T--ATGGGCCGA--CA--TGA---TTAGATACATATG----AACAGACAAG--GCAA-TTGACACGAAG-AAAATACA--CTTT-TTCTTCAA-AGAATAATATTTTTT-TA-T-GTTACACATGT---TCAATTGATTT----GCAC-G-TACTAGTAATTACAT--TTACTATA-TATGTA-GCAT--ACAACTG-CCG-----------TGAT--AATT-TACGNGCGGTG-TT--GCGACGTCAAAAA-CGGT-CATT---G-G----TGA-C---TT-GAA-CTTGGA--C-CAGA------AAA---------A----------TTAAGTT----TTAT--GG-TTGTGCG------------TA-------------CCC-----CCCCCCCCCT---CCAC-TT-C-TANG----------------------TTTGAATT--------------G-CTC-------AC-AAAA-CACAATAAT-CATACGATATA--A-TT--GC-AAG--TT---T--A--AAGATACA--AAA-A--AAAGT-ACAT-A-AATGTA-TATN--ATATATA-CATGTATATGCACCTA-CAAAAGCAG-T--A-C-AGAC-AAA--CTAATATCAT-ATTATCAAAT-AAA-TAAAA--TA--TTTTAT--CGACC--TA--CCTACCCAGAG-AA--AAATAAG-GGC--CTACTTGAAG----TTATTT-TTTG----GCTTA------------------GA-AAAAATAAAATATTTTA---C-CTAC-CTA---CCGACCCTA-CGTCCGTAAAT-C-G--G-TCG-G--AAA-GG--GCAAACAAACAAT--TTTTTAATTTA
gi|1 : CTAAATTA-AAA--TT--GTGT----T--T-GT-TT-GCGG-------T----TTC-CC--GA---CCGACC----T-AGTAAA-T--TCGTT-GC-GA-C-GGAA--A---AT-C-T--T-T-T-------ATTT-----G--TAT-TT-------------A----C---CAGG--T--GATAT-TTT---TTT--TTA---TTCATT--T-CTG-TT--GCG-AC---CGA-----------CCGA--AAAT-CT-----TA-TTTCT-----GC----A-TT--T--A---CCG---CTC--A--AAAC-AT--ATT--T--------AT-----CG-AA-AATT-C--TGA----T--TTTTTT----CC--CGAT----AA--GGACT-A-------AGTAC-TCCTAGT-----TTTC---TAC-TTGTC-GCA-CGCAAGC--TCAGAG-CTGAGG-CACTTCCGAAT-----AC-------------------------ATA-TATAC------------CAAT-CG-TCAG--CGA-CT--ATAA-A-A-ACGTGC-TTA--TCATGCATCAA---AA---GTAATC--AT--TTT--A---A--AT---AA-AATGCATAGTT-CTA-AA--AAGT-AA-ATGA-A-TTGAG---T--TTGCA------TTTA----GG---T-A-CGAAAT----TGTAG-CAAT--AAAGGG-GAGGA-GG-TTGA-AG-GA-G-ATCGGTTAA-----AG-A-TA-TGGAAA-GTTTCATA--T--ATCT--TTA--CGG-A-CAA--------------AA-AACCA--TGGATTCAGAACCAA-CACAACT-T-----GTC-----CG-A-T--ACAG-AGAT---------TGAGAATCGG--T-AAATGAA---TTAAAACCAGATCAA-G----TCGCT-GC------A-CTTCGT-GCAAATTTAAGATGC--A---T--TATACA-TGTAT-GCCC-AATACCAA--C-TGGTTATAGAA--TAAGA-TACACAGAATAGATATT-TTGCTCCA--AAAACGCAATCTCCATGTG-T-GG-TAAT----GA-TC-AAACGTTC-A---GT---------------------------TT-ATT--------G-CA---CAT------A-ATG--AT-GT--TTATTT-----TTCA--TTTT--TAT---A-TTCGT----TT-TG--TAGTTAA----ACTA----------------TGTG-GA-----T--ATTCAG-----A-TTTG----------------TG-G-A----CGAT--AC-T-AA-TTT-CCC----CCCCAAAC----GATAG-TGGACATGCGC----GAG-CCGTGTATAATGAACCA-TTTTTN--------NNN--NNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNNN---NNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNCATTACATATG---TTTGAG---GAA-ACCCC-----TA-------CACACA---CTGTG-AAAGA-GAAAAATG---AAAACG---CAATGATTTCATTT-----CAGTTTTGTTTGGT-AG-AC-AAAATACC-GAGTACATCGTAAAATCGT-TCATAGACCCAGT-----------CCG-TG-CTATCTCAATCACAACGATGGCC--TTGCTTTCCATGA----CCAAC-T---------------T-GA-TTG---TTG-AATATGGTC---------GA-ATGGAC------------ACA--CTG----AA----TCGGT--CCGAACGTAAGGGTATGC-A----------ACCG-AAATATA-TTTTTTTTAACTCCC-----------------AAAG---TTCAA-CAA----GCCTGCACTTTGCTTGCAA-CTGTAAAATACAAGC-ACGTGGAAAGTGTTCAA--TAAT-TTG-AATAAACACCGGGATGATCA--ATGCATGCATA----TCAGCCATAGTA-------AATACCCGTAA----GTAATACCG------AAATAA-G-T--TTCTTTATCGAAATAAG-TGCATGA-CA-AAATTCTGCAGAGGCAAACAC--TAATCTATTT--TTA-CC-TTGCCTGT-AAGTAT-A--C-TTTA-TATTATAC---------------AACA------------------T--------T----------------------ACCGC-TTG-----TTTTAAAG------------------AAATTTTCTAT-TTACCG-TTTAT--TCAGTAAAGTGGGAAA-TAT-A-CG-ATACA------T-AA--ATAATACAATA------------A----------------TTT--------------CCTGACTGAATG-TACC--A-CCGAC-TTTTTTTTAATATGG-GT-ACTAGT------A-----G----------T--T--ATGGGCCGA--CT--T-----TTAGATAAATATG----AACAGACAAG--GCAA-TTGACACGAAG-AAAAT-CA--CTTTGTTCTTCAA-AGAATAATATTTTTTATACT-GTTACACATGT---TCCATTGATTT----GCAC-G-TACTAGTGATTACAT--TTACTATA-TATGTA-GCAT--ACAACTG-CCG-----------TGAT--AA----ACGAGTGTTG-CT--GCGACGTCAAAAA-CGGT-CATT---G-G----TGAAC---TT-AAA-CTTGGA--C-CAGA------AAA---------A----------TTAAGTT----TTAT--GG-TTGTGCG------------TA-------------CCC-----CCCCCCCCCT---CCAC-TT-T-TAAG----------------------TTTGAATT--------------G-CTC-------AC-AAAA-CACAATAAT-TATACGATATA--A-TT--GC-AAG--TT---T--A--AAGATACA--AAA-A--AAAGTTACAT-A-AATGTA-TATT--ATATATA-CATGTATATGCACCTA-CAAAAGCAG-T--A-C-AGGC-AAA--CTAATATCAT-ATTATCAAAT-AAA-TAAAA--TA--TTTTAT--CGACC--TA--CCTACCCAGAG-AA--AAATAAG-GGC--CTACTTGAAA----ATATTT-TTTG----GCTTA------------------GA-AAAAATAAAATATTTTA---C-CTAC-CTA---CCGACCTAA-CGTCCGTAAAT-C-G--G-TCG-G--AAA-GG--GCAAACAAACAAT--TTTTTAATTTA
gi|10 : --T-GT-TT-GCGG-------T----TTC-CCC-GA---CCGACC----T-AGTAAA-T--TCGTT-GC-GA-C-GGAA--A---AT-C-T--T-T-T-------ATTT-----G--TAT-TT-------------A----C---CAGG--T--GATA---TT---TTT--TTA---TTCATT--T-CTG-TT--GCG-AC---CGAC----------CCG----AAT-CT-----TA-TTTCT-----GC----A-TT--TTAA---CCG---CTCAAA--AAAC-AT--TTT--T--------AT-----CG----AATTCC--TGAC---T--TTTTTTTT--CG--CGAT----AA--GGACT-A-------AGTAC-TCC-AGT-----TTTC---TACCTTGTCCGCA-CGC-AGC--TCAGAG-CTGAG--CACTTCCGAAT-----AC---------C---------------ATA-TATAC------------CAATCCG-TCAG--CGA-CT--ATAC-A-A-ACG-GC-TT---TCATGCATCAA---AA---GTA-TCAAAT--TTT--A---AT-AT---AA-AATGCATAGTT-TC--TA--AAGT--A-ATGA-A-TTGAA---T--TTGCA------TTTA-----G---T-A-CGAAAT----TGTAG-CA-TAAAAGGAG-AAGGA--G-TTGT-AG-GA-G-ATCG-T---------G-A-TA-TGGAAAAGTTTCATA--T--A-CT--GTA--CGGGA-CAA--------------AA-AACCAATTGGATTCA-ACCCAA-CACAACT-T-----GTC-----CG-A-T--ACAGAAGAT---------TGAGAATCGG--T-A--TGAA---TT-AAACCAGATCAA-G----TCGCT--C------A-CTT
gi|11 : ----T--T-GT-T--GCGG-------T----TTC-CC--GA---CCGACC----T-AGTAAT-T--TCGTT-GC-GA-C-GGAA--A---AT-C-T--T-T-T-------ATTT-----G--TAT-TT-------------A----C---CAGG--T--GATA--TTT---TTT--TTA---TTCATT--T-CT--TT--GCG-AC---CGA-----------CCGA--AAGTGCT-----TA-TTTCT-----GC----ATTT--T--A---CCG---CTC--AACAAAC-A---TTT--T--------AT-----CG--A-ATTT-C--TGGAC--T--TTTTTTTT--CG--CGAT----AA--GGA-T-A-------AGTAC-TCC-AGT-----TTTC---TACCTTGTCCGCA-CGC-AGC--TCAGAG-CTGAG--CACTTCCGAAT-----AC---------C---------------ATA-T-TAC------------CAAT-CG-TCAG--CGA-CT--ATAACA-A-ACGTGC-TT---TCATGCATCAA---AA---GTA-TCA-AT--TTT--A---A--AT---AA-AATGCATAGTT-TCT-AA--AAGT--A-ATGA-A-TTGAA---T--TTGCA------TTTA----GG---T-A-CGAAAT----TGTAG-CA-TA-AAAGGA-GAGGA--G-TTG--AG-GA-G-ATCG-T--A-----AG-A-TA-TGGAAAAGTTTCATA--T--A--C--TTA--CGGGA-CAA--------------AA-AACCA--TGGATTCAGACCCAA-CACAACT-T-----GTC-----CG-A-T--ACAG-AAGA---------TGAGAATCGG--TAA--TGAA---TTAAAACCAGATCAA-G----TCGCT-GC------A-CT
gi|12 : TTTTTT-TA-TCGTTTCACATATGGGTCAA-------------A-----AATAGTATCTATATAATTACTATG-TATGTG-GC-T--ACAA--G-CCG------------GAT--AATT-TACAA-TAGTGATT--GCGACGTCAAAAAACGGT-C-TT---G-G----TGA-C---TT-GA--CTTGGAA-C-CAGATTGAGAAAA---------A----------AAAAACTGCGATTCT--GT-TTGTGCG------------TA------------------------------------AC-TT-C-TA-G----------------------TTTGAATT----------------CTTGGAGGAAATGAAAA-CAAGATAAT--ATACGTCAAA--A-TT--GCTAAA--TTCTAT--A--GAGATACA--AAA-C--AAAGT-GTAT-------TA-TATA--CTA-AT--CAT-------CA-CTA-CAAAA-CA--T--G-CAAGAC-AAA--CTTCTATAATCATTATCAAATAAAA-TAAAA--TAT-TTTTAT--CTACC--T---CCTA-CCAGA--AA--AAATAAG-GGC--CTAC-TGAA-----TTATTTGTTTG----GCT--------------------GA-GAAAAT--AACATTTTA---C-CCATACTA---CCG-CCCTA-C-TTCGT-AAT-C-GC-G-TCG-G--AAA-AGGCGCAATCAAACA----TTTTTAAT
gi|13 : t-----------TGAT--G-TT-TACATGAG----TT--ACAGCACCAAAAA-CAGT-TACT---ATG----TGA-C---CT-GAA-CTTGAA--C-CAGA------AAA---------GGGGCGATACTTTTAGTC----ATAT--GGATTACGC-------------TA-------------CAC-----CCATCCAAC------AC-TT-CCTGGG----------------------TTAGAATT--------------T-CT-----------AAAA-CA-AACAATGCGCACAATACACGA-T-------AA--TT---T--A------TG--------------GT-ACAT------GTA-TATGCAAAATA-A-CATAGATAT------A-CAAATACAG-T--A-C-AGAC-AAA-----A-GCCGC-ATTATCAAAT------AAAA--TA--TTTTAC--CAACT--TA--TCTACAAAATG-CA--TAAAAAA-GGCTTCTGTTTT--GTTTTTTGTTT-TTTT----GTTTGTTTTTTTTTTTTTTGGCTGAGAAAAATAAAATATTTTG---C-CTAC-CTA---TTTACCCT--CTTTCG------G-G--G-TCGTT--AAA-GG--GCAAAAAAAAAATCATTTTTTATTTA
gi|14 : ctc-------------CCC-----CCCCCCCCTT---CCAC-TTTC-GACG----------------------TTTGAATT--------------G-CTC-------AC-AAAAACACAATA-T-C---CGATATA--T-TT--GC-AAAGTTT---T--AGTAAGACACACAAAA-ACCAAAGTTACATTATAATGTAGTATA--ATATATATCGTGTATATGCATCTAACAAAAGCAGGT--AAC-AGAC-AAAAACTAATATCAT---TATCAAAT-AAA-TAAAAAATA--TTTTATTCCGACCCGTATCCCTACGCAGAG-GATAAAGTAATCGGC--CTACT-GAAG----TTATTT-TTTGTTTGGCTTA-------------------A-GAAAATAAAATATTCTGAGGCGCTAC-CTGGAGCAGACCCTAGCGTTCGTAAAT-C-G--GGTCG-G--AAAAGG--GCAAACAAACAAT--TTTTTAATTTAggcc
gi|15 : gatttcgccctcccA-TATTATGC----------------------------------------------T----------------------ACCGC-TGG-----TTTTAAAG------------------AAA--TTCTAT-T-ACCGGTTTAT--TCA--TAAGTGGAAAA--AT-A-CG-CTAA-------T-AA--ATAATACAATA-------------------------------T--------------CTGGGCTGAATG-TACTC-ATCCGA---TTTTTTTAA---------ATT-GT------A-----A----------T------TGGGCCGACCCA--TTT---TTAGATA-ATCTG----A--AGACAAGCAGTAA-ATGACACGA---AAAAT--A--CTTT-TCC----A-AGAATAATATGTTTA-TA-C-G-TA-ACAT-T---TCAA-TGATTTGGCAGTACAG-TACTAGTAA-TACAT--TTACTAGA-GA-G-A-GCATTCACGCCTG-TTG-----------TG
gi|16 : tctgtctatacttacctgtatattccaacatattcatggtgga-GG-TAATTTCGGATTCTAAACGTTC-ATTTGTA-A---A-------GACTTT-----G-TT-ATTTGCATTTGGTCA---CATTATTTTA-ATTTGAT-GT--TTATTTATTTGTTCATTTTTT--TAT---A-TT
gi|16 : a--TTCT--TAC---T-TCCGT----TTATGGTTAGT-AA----CTTA----------------T-TG-GAGTTAGT--ATCC---------TTTG----------------TG-GGA----CGATACAC-TAAA-TTT-CCCCCCACCCCATACCGAAGAGAGATGGACGT-CGCTCCTGAG-CCGT-TGTAG-----TATTTTC-GGATTTTCTTTGTCGGAGAACAT----GAACCA--TTTAAGGTAAGATAGAGTAAGATGAGAGtttgatagattaagtttcttacttccgtttatggttagtaacttattggagttagtatcctttgtgggacgatacactaaatttccccccaccccataccgaagagagatggacgtcgctcctgagccgttgtagtattttcggattttctttgtcggagaacatgaaccatttaaggtaagatagagtaagatgagag
gi|17 : aggtaatttcggattctaaacgttcatttgtaaagactttgttatttgcatttggtcacattattttaatttgatgtttatttatttgttcatttttttatatttttgatagattaagtTA-------AGTACT-GTAC-----TAAGGCCG------AA-TAA-G-T--TTCTCCATTGAAATAAG-TG----A-CA-AAA--C-GAAGAGGCAAACAC--TAATCTATTTAATT--TC-T--CCTTTAAAGTAT-A--CATTTA-TATTTCACCAACATTTTCATGTCGACA------------------TATCAAGTCT----------------------ACCG---TG-----TTTTCAAT------------------AAA---TC-AT-TT------CTAT--TCAGCTAAGTGGGAAA--ATAA-CGTAGAAGA--AC-T-AA--ACAA---AATA------------A----------------TT
gi|18 : CTAAATTA-GAAATTT--TTGT----T--T-GT-T--GCGG-------T----TTC-CC--GA----CGACCCCATT-GTTGAC-T--TCGTTACC-GA-CGTGAATCA---ATAC-T--T-TCT-------ATTTTG---A--TGT-TTG------------A----CGTACAGG--TTGAATATATCT---TTT--TTATATTTCGTTTCT-CTG-TT---TA-AC---CGATACCTGTGGAGCCGATTAAAT--T-----TATTTTCT-----GTGACAA-TT--C--ATACCCGAAACAC--A--AAAC-AT--TTTCCT--------ATTA---TG-AACAATT-C--TGA----T--TTTTTTT----C--AGCTA---AA--GGACT-A-------AGTATATCCTGAT-----TTaatatttatataatatatagaagatatctatctctccatccgatcctttttttttttttatcgtttcacatatgggtcaaaaatagtat
gi|19 : AACGGTC-A---TTG-A---AATTTT--G----T-----A-TTCATTT-------G-TA---T-T------C-ACT--AT-GC--TTGCTT-----T-CA--TTTT--TAT------TCAT----TT-TG--TAGT-AG----AATA----------------TGAG-GA-----T--ATTCAG-----A-TT
gi|2 : tttgcatcagaaaacatatctttttgatgaggtttatgagCTAAATTA-AAA--TT--T-GT----T--T-GT-TT-GCGG-------T----CTC-CC--GAA--CCGACC----C-AGTAAA-T--TCGTT--C-GA-C-TGAA--A----T-C-T--T-T-T-------ACTT-----G--TATATT-------------A----C---CAGG--T--GATAT-TTT---TTT--T-A---TTCATT--T-CT--TT--GCG-AC---CGA-----------CCGA--AAAT-CT-----TA-TTTCT-----GC----A-TT--TT-A---CCG---CTC--A--AA-C-AT--TTT--TT-------AT-----CG-AA-A-TT-C--TGA----TATTTTTTTTT--TC--CGAT----TT--AGACT-ACAGCTGTAATAC-TCGT-GT-----TTTC---TAC-TTGTCCGCA-CGCAGCC--TCGGAG-CTGAGA-CACTTCCGAAT-----AC---------CGCATGTACACTGTACATAATATAC------------CAAT-CG-TCAG--CGA-CT--ATGA-A-A-ACGTGCCTTA--TCAT----CGA---AA---GTA-TC--AT--TTT--A---ATTAT---AAGAATGCATAGTT-TCAATA--AAGT-GA-ATTA---TTGAA---T--TTGCA------TTTA----GG---T-A-CGAAAT----TGTAG-CA-T--ACGGGG-GAGGA-GG-TTGA-AG-AA---ATCG-T-AA-----AG-A-TA-TGCGAAAATTTCATA--T--ATCT--TTAGGCGGAA-CAA--------------AA-AACCA--TG-ATTCAGACCCAA-CAC--CT-T-----GTC-----CGCA-T--ACAG-A-----------------------------TGAA---TTAAAAC-AGAT-AA-G----TCGCT-GC------A-CTTTAT-GCAATTTGAAGATGC--A---T--CATACA-T-TAT-GC---AATACCAA--CCTGGT-ATAGAAA-TAAGA-TACGCAGAATAAATATT-T-GCTCCA--AAAACGCATTCATCATG-G-C-GGCTAAT----G-ATC-AAACGTTC-A---GTGAA---A-------G----TGTGTAA-TT-ATT--------G-CA---CAT------A-ATG--AG-A----TA--------TTCA--TTTT----T---A-TTCGT----TT-TG--TAGT--A----ACTA----------------T-TG-GA-----T--ATTCAG-----A---TG----------------TG-GGA----CAAT--AC-T-AATTTT-CCC----CTCCAAAC----GATAG-TGGACAT-CGC----GAG-CCGT-TAT--------A-TTTC-----------TA-----------------------TTTAAC---CGAGAGA-CGAGA-AA------TTAAATAATGT--------------------TGAG-----A-ACCC---------------TACACA---CTGTG-A-AGA-GAAG-AT-------------------TT-CATTT-----CAG-TTTGTT-GGT-AG-AC-AAAATACC-GAAC--ATCGTAAATTCAT-ATATAGACCCAGT-----------CC--TGCCTATCTCAATCACAACGATGGCCTTTTGCTT-CAATGA----CC-AC-T---------------T-GA-TTG---TTGAAATATGATC---------GA-ATAAAC------------ACA--CTG----AA----TCGGT--ACGAACGTGAGGGTATGC-A----------ACCGCAAATA-----TTTTTTAAATCCC-----------------AAAG---TTCAA-CAA----GCCTGCACTTTGC-TGCAA-TTGTAAAATAAAAG--ACGTGGAAAGTGTTCATGTTAATATTGAAATAAACACCGG--TGATCATGATGC---CATATCACTCAGCCATAGTA-------AATACCCGTAA----GT-ATACCA------AAATAAG-----TTCT-TATCGAAATAAG--GCATGA-CATAAAT-CTGCAGAGGCAAACAC--TAATCTATTT--TTA-CC-TTGCCTGT-AAG-ATAA--C-TTTA-TATTATA-C-------------CAACATTTCATGTTAATATAAAGT--------T----------------------ACCGC-TTG-----TTTTAAAG-------------------AAATTTCTAT-TTATCG-CTTAT--TCAGTAAAGT--GAAA--AT-A-CG-ATACAT--ACATGGA--ATAACA-AATAAATTTATTATCTA----------------TTT--------------CTTGACTGAATGATA-CC-A-CCGACTTTTTTTTTAATATGGCGT-ACTAGT------A-----ATTAGTAGAGTT--T--ATGGACCGA--C---CAA---TTAGATGCATAT------ACAG-CAA---GCAA---GACACGAAGAAAAATACA--CTTT-TTCTTC-A-AGAATAATATT--------T-ATTACACATGT---TCAATTGA-TT----GCAC-GCTACTAGTAATTACAT--TTAC-ATATTATGTA-GCCT--ACAACTG--CG-----------TGAT--AATT-TACATGA---G-TT--GCGACGTCAAAAA-CGGT-CA-T---G-G----TGA-C---TTAAAA-CTTGGA----CAGA------AAA---------A-----------TAACTT----TTAT--GG-TTGTGCGCTTGCGACCCTCCG-------------CCC-----CCCCCCCCCTCCCCCCC-CT-C-CACGCCCCCCCCCCCCTCACTTTAAGTTTGAATT--------------G-CTC-------AC-AAAA-CACAATAAT-ATTACGATATA--T-TTGCGC-AAG--TT---T-----AAGATACA--AAACA--ACAGT-ACAT-A-AATGTT-TATT--ATA-ATA-TCTGTATATGCATC-A-C-AAAGCA--T--A-C-AGACAAAA--CT-ATATC---ATTATC-----AAA-TAAGA--TA--TTTTAT--CGagctccgtaaatacatttataaacggtgagacaaaactaattttattcgtattgttgagtagacaagcgtgacccattatatttttttcaacatttgataaagaacaaatttaat
gi|20 : GCACCTA-CAAAAGCAG-TTTA-C-AGAT-AAAA-CTAATATCAT-GG-ATCAAAT-AAA-TAAAA--TA--TTTTAT--CGACC--TA--CCTACCCAGAGAAA--AAATAAG-TTC--CTACTAGAAG----TTATTT-TTT-----GCTTA------------------G--AAAAAT-AAATA-TTTA---C-CTAC-CTA---CCGACCTAA-CGTCCGTAAAT-C-GGCG-TCG-GAAAAA-GG--GCAAACAAACAAT--TTTTTCATTTtaaaatttatcacaaatgaaaattcttctataaacaaaaaaatttatttcttataaaaaatggtaaaaata
gi|21 : ATTTCAC--TT--TATA-TATAGA-GCAC--ACAACTGGCTGGGGTAAACCTCTGATGAAATT-TACATG-GGAG-TT--GCAACATTAAAAA-TGGT-CATT---G-G----TGA-C---CT-GAA-CTTACACCC-CAAA------AAAGGGTGATTCA----------TTTAGTCCA--TTATTGGA-TCATGTA------------TA-------------CCC-----CCta
gi|22 : GCACCTA-CAAAAGCAG-T--A-C-AGAT-AAA--ATAATATCAT---TATCAAATAAAA-TAAAA---A--TTTTAT--CGACC--TA--CCTACCCAGAGAAA--AAATAAG-GTC--CTAC-TGAAG----TTA-TT-TTTG----GCTTA------------------G--AAAAATAAAATA-TTTA-----CTAC-CTA---CCGACCATA-CGTCCGTAAAT-CGG--G-TCG-GA-AAA-GG--GCAAA-AAACAAT--TTTTTCATTTAaactttctggattagaattccagggaaaaatttgcacacaat
gi|23 : ACGATGGCC--CTGCTT-C-ACGA----C--AC-TGGCTTATCTATGGTCT-GA-TTAGTTTTG-AACATGGTCATCGATTGAGAGATAAACCCCATGTCCAAAACT--CTATCCTGA----TCGGTATCCGAACGTAAGG-TA-GC-ACAAAAAATATACCG-AAATATT-TTATTTTTA
gi|24 : AAAA-AAA-AAAAA--TAATCTTTAT--CGACC--TA--CCTACCCAGAG--A--AAATAA---AC--CTAC-TGAAG----TTATTT-TTTG----GCTTA------------------CA-AAATA-AAAATATTTAA---T----C-CTA---CCGACCCTA-CGTCCGTAAATGC-G--GTTCG-GA-AAA-GG--GCAAACAAACAA---TTTTTAATTTAc
gi|25 : AAT-AAAATAAAA--TACTTTTTAT--CTAC---TA--CCTACC-AGAG-AA--AAATAAG-GGC--CTACT-GAAG----TAATTT-TTTG----GCTGA------------------GA-AAAA-TAA--T-TTTTA---C-CTAC-CTA---CCGACCTTA-CTTTCGTAAAT-CGG--G-TCG-GGAAAA-GG--GCAAACAA
gi|26 : AAAT---AAC--TT--GTGT----TATT-GTGTT-GCGG-------TATATTTC-CCACGA---CCGACCC---T-AGTAAA-TTATC-TT-GC-GA-C--GAA--ATATAT-CAT--T-A-T-------ATTTTTGTGG--TAT-TTTTAGAACATCCTGA----C---CACA-----AATAT-CTT---CTTTATTT---TTCATT--T-CTG-tttt
gi|27 : AGCGCTC-A---TTG-A---A-------A----------A-TT--TT--------G-TATTACAT------ACATGT-AT-GT--TTA----------CA--TTTT--TATTCGG-TTTTT----TT-TT--TAGT-AA----CTTA----------------TGAG-GA-----T--ATTTAG-----A-TTT
gi|28 : gatgggaatttaaggacT--AGTT-TACATGCAG-G-TTCAGCGCTGTCAAA---CGGT-CATTCTGG-GAGCATGT-CCCTTT-GA----TAGA--T--AGT------ATATT-------A----------TTAA--T----TTAT-----TTGTACA------------GA-------------CAC-----CCCCCCCCCC---CC-C-TT-C-cctctttccgtaaacacatttgctaaacgat
gi|29 : -AATAAACACCGGGATG----------------A----TCAGCCATAGTA-------AATA-CCATAC----GT-ATACCGAAAAAAAAATAAAGATAATTCTTATTCG--ATAAGTTGCATGATTA-AAA--C-----AGGTGAAT-------TCTATTT--TCA-Cccccgggccttgtaat
gi|3 : aGTGGAAAGTGTTC-----------G-AATAAAC-CCGGAATG-------------CACA----TCAGCCATAGTACATGTTAAGTAACC-TAGTTTGGTAGTTACG------AAATAAAG-T--TTCTCCATCGAAATAA----------------------AGTGACAAACA---TAATCTTTTT--TTA-CC-GTTCCTTT-AAAAAT-A--C-TTTAATATTATACC--------------GACA------------------T--------T----------------------TTCATGTTGAATATTTTTAAAGTTCCGCTGTTTTCAATTAAGAATTTCTATCTTACCG-CTTAT--TCAGTCAAGTAGGAAAATAC-ATCG-ATAAA------T-AA--ATGATACAATA------------AACTCTATTTATCTATTTTT--------------CCTGACTAAATG-TACCCCA-CCGAC-TATTTTC--ACATGG--T-ACTAGTTAGTAAA-----G----------T--TTCATGG-CCGA--C---TGAGTTTTAGATACATATGCCATAA-GGGCA-G--GCAAATTGCAACGAAG-AAAGTACA--CTTTATTCTTCAA-AAAAT----TTTTTT-T-----TTATACATGT---TTAATTT-TTT----GCAC-G-TACTAGTAATTATAT--TCA---TG-TATGCA-GCA---ACAAC-G-C-G-----------TGAT--AATT-TACATGCAGCG-TT--GAGACGTCCAAAA-CGGT-CATT---G-G----TGA-C---TT-GAACCTTGAA--CACAGA------AAA---------AAGCGATACT-CTAGTTT----TTAT--GG-TTGTGTG------------TAAACAACAGAACACCCC-----CCCCCCCCCC---CCCC-TT-C-CAGGT---------------------TTTGAATTCCTGGGAGGAAAACG-TTC-------AC-AAAA-CAAGATAA--CATACGG-GTA--ATTT--GC-AAG--TT---TACA--AAGAGATA--AAA-A----------AC-A-AA---A-TATA--ATATCTG-CATACA------------AAAAGCAG-T--A-C-AAAC-AAA--
gi|30 : ATGA----CCA-C-T---------------C-GA-TTC---GTG-AA-ATGGTA---------GA-ATGA-C------------ACA--CTG----AA----TCAGT--CAGAACATAGGGAAATGC-A----------ACCG-AAAAAAA------ATTGACTCCC-----------------AAAG---atttat
gi|31 : TATG---ATTGAGAGAGGA-ACCCC-----TAAAACTACCATACATTTCTGTG-ATATATGAAAAATG---AATACGGGGCGATGATT-CATTT-----CAGTTTTGCT-gaa
gi|32 : aTCT--TAT---T-TTCGT----TT-T---T-GT-AA----ACTA----------------TGTG-GA-----T--ATTCA------A-TTTGTTATCTATAAAT----TGTGGA----CGAT--AA-T-AA-TTT--TT----CTCCAAAC----GACAt
gi|33 : AATTA-AA--------TGT----T--T-GT-TT-GCAG-------T----TTC-CC--GA---CCGACC----C-AGTAAA-T--TCGTT-TC-GA-C-TGAA--A---AT-A-TAAT-T-TAATTCACATTT-----G--TAT-Tt
gi|34 : --CGA-CT--ATAA-A-GGACGTGC-TT---TCA---GTCAA---AA---GTA-TC--AT--TTT--A---AT-AT---AA-AATACAT-GTT-TCA-TA--AAGTCAA-AT
gi|35 : ATT--G-CTG-TT--GCG-AC---CAA-----------CCGA--AA----------TA-T------------------------A---CCA---CTC--A--AAAC-AT--TTT--T--------AT-----CG--A-AATT-C--T
gi|36 : T-C-G--G-GTG-G--CAA-CA--GCAAACAAACAAT--TCTTTATTTTA
gi|4 : tcgggAATTA-AAT--TTCATTGT----T----GT-TT-GCG--------T----TTC-CG--AA---CCGACC----C-AGTAAACT--TCGTT-CC-GAAC-TACA--A---AT-C-T--T-T-T-------ATTT-----G--TAT-TT-------------A----C---CAG----------T-TAT---TTT--TTA---TTCATT--T-CTG-TTTGGCG-ACAAACGA-----------CCGA--AA-T-CT------A-TT-CT-----GC----AATT--T--A---CCG---CT---A--AAAC-ATGTTTT--T--------AT-----CG-AA---TT-CACTGA----T--TTTATCTT--TC--CGATTATTAA--GGACT-A-------------------T-----TGTC---TAC-TTGCCCGAA-CGCA-GCAAT-GAAG---GAGA-CACTTCCAAAT-----ACTGCATGA--C---------------ATA--ATAC------------CAAT------------------ATAACA-A-ACGAGA-CTA----AT-CATCAA---AA---GTA-TC--AT--TTT--A---AT-AT---AA---TGC-TAGTT-TCA-TA--AAGT-AA--TGA-A-TTGAA---T--TTGCA------TTTA----GG---T-A-CG-AAT----TGCAGTCA-T--AAGGGG-CAGGA-GG-TTGACAG-GATA-ATCG-TCAA-----AGAA-CA-TGGAAAAGTATCATA-----ATTT--T----CGGGACCAAAAACAAACAAACATAA-AACCA--CGGATTC-GACCCAG-AACAACT-T-----GTC-----CG-ACT--ACAG-AGAT---------CGAGAATCGGT-T-A--TGAA---TTAAAGCCAGATC-A-GTTTTTCTCTAGCGCCAAAA-CTTCGT-GCA--TTGAAGATTCCAA---T--TATACA-TGCAT-GTCT-ACTCCAAA--C-T-GTCATGGAAA-CAAAA--ATACAG-ATGAATA---C-GTTCCAATGAAAgg
gi|4 : AT----GAAT----ACGTTCCA---ATG-A---AAGATTT-G----T-----AGCT-GTT--------G-CA---CAT------A-ATC--AT-------ATTT-----TTGA--TTTG--AA----A-C------------A--TAGT-AA----ACTA----------------TG-G-GA-----T--ATTCAG-----ATTTTGTCTATTTATAAATTGTTG-GGA----CAAT--A----AA-TTT---T----TCCCAAAC----GATgatttgtagctgttgcacataatcatatttttgatttgaaacatagtaaactatgggatattcagattttgtctatttataaattgttgggacaataaatttttcccaaacgat
gi|5 : aattaaatttcattgttgtttgcgtttccgaaccgacccagtaaacttcgttccgaactacaaatcttttatttgtatttaccagttattttttattcatttctgtttggcgacaaacgaccgaaatctattctgcaatttaccgctaaaacatgtttttatcgaattcactgattttatctttccgattattaaggactattgtctacttgcccgaacgcagcaatgaaggagacacttccaaatactgcatgacataataccaatataacaaacgagactaatcatcaaaagtatcattttaatataatgctagtttcataaagtaatgaattgaatttgcatttaggtacgaattgcagtcataaggggcaggaggttgacaggataatcgtcaaagaacatggaaaagtatcataattttcgggaccaaaaacaaacaaacataaaaccacggattcgacccagaacaacttgtccgactacagagatcgagaatcggttatgaattaaagccagatcagtttttctctagcgccaaaacttcgtgcattgaagattccaattatacatgcatgtctactccaaactgtcatggaaacaaaaatacagATGC--A---T--TATACAATGTAT-GCCT-ATAACCAA--C-TGGTTATAGAAA-TCATA-TAC-CAGATTCAATATTAT-GCTCCAGCAAAACGCTATCACCATG-GGCAGG-TAAT----GAATC-AAACGTTC-A---GTG-ACAGATTT----G----T-----A-TTTATTT-------G-CA---C-T------A-ATC--AT-GTATTTATTTATT--TTCA--CTCTCTTAC---ACTTCGTCATTTT-CG--TAGT-AAAGTGACTAACTGAATCGAATGTTGTGTGCGG-----TGAATCGAGGGGGTA-ATTG----------------TG-GGAAATATGAT--ACCT-AA-TTTTCCC----CCCCAAAC----GATAG-TGGACATGCGC----GAGGCCGT-TAT----------TTTC-G--------TTC--AAA-AACATGAA-----CATTTTAACG---AGAGAGAGAGAGA-GAGAG---------AGCG-----CATTAAATATGAAGTTTGAG---GAATACCCCAGGTACA-------CACACA---CTGTGAACAGA-GAGGAAGGAGAAAAACG----AATG------------------TTTGTT-GGT-AGAACAAAAATACCAGAGTA-ATCGTCAG-TCGTATCACAAACCCAGTTACAACTGCACCTG-TA-CTACCT-AATCACAACGATGGCC--TTGCTT--CATGACACCCCATCGT---------------TAGATTTG---TTG-AAAATGGTC---------GA-ATGAAC------------ACACCCTG----AATAATTTGGT---CGAATGTAGGGATATGCAA----------ACCG-AAAT-TATTTTTTTTTTACTCCCCAATAGTGTAGTTTGTTAAAGTATTCCAACCAA----GCGTG--CTTTGCTTGGAACCTGTAAAATACAAGC-ACG-GGAAAGTGTTC
gi|6 : TAAATTTTAAA--TT--TTGT----T--T-GC----GCGG-------T----TTC-CC--GGGACCCGACC----TCAGTAAA-T--TCGTT-TC-GA-C-TGAA--A---AT-C-T--T-CCT-------ATTT--------TAT-TT-------------A----C----AGG--T--G-TAT-TGT---TTT--TTA---TTCATT--TTCTG-TT--GCGGAC---CGA-----------C-------AT-CTCCCTCTC-TCTCTCAATGAC----A-ATAAT--C---CTG---ACC--T--AAAC-AT--ATA--T--------ATATATTCATAA-AATT-C--TGA----T--TTTTTTTTTACC--CAAT----AA--GGACT-A--------GTGG-TCCTAGT-----TTTC---TA---TGTCCGCATCGCA-GC--TCGGAGACTGAGA-CACTTCCAAAT-----AC---------C---------------GCA-TGTACATTATTACTACTCCAT-CG-TCAG--CGATCT--ATAA-ACA-ACGTTC-TTA--TCAT-CGCCTAGTTAC---GTG-GC--GTGCTTT--ACCTAT-ATGAGAA-GATGCATAGTT-TCA-TTT-AAGT-AA-ATGAGA-TTGAA---TGATTGCA------TTTAAA--GG---TTA-CGAAATGTCTCGTAG-GA-T--AAGGGGAGAAGA-GG-TTTA-AG-GA-ATATCG-T--ACCCCCGG-A-TA-GGAAAAAGTTTCATA--T--ATCTTCTTAC-CAGGA-CAA--------------AACAAACA--TGCATTCAGA-CCAA-CACAACTAT-----GTCGGGTGCG-A-T--ACAG-AGATAATGA----TGAG-ATCGGTTT-A--TGAA---ATTAAACCAGATCAACG----TCGCT-GC------AGCTTTGT-GCATTTTAAAGATTC--A---TAGTATAC--TGTATGGCCTAATTACCAAGGC-TGGTTATAGA
gi|7 : -CTTCGTAGCAATTTGGAGATGC--AAATT--CATACA-TGTAT------ACTGTCG---------TATGGAAAATAATAATACGAGAAATGAATATTCT-GCTCCAGCAAAACGCCATCGACATG-G-C-GG-TAAT----GAA------CGT-C-A---GTG-A---AAAGATTTG----T-----A-TT-ATT--------G-CA---CAT------A-ATC--ATTAT--TTATTT-----T-CG--TTTA---AT---A-TTCGT----CTGTG--TAGG-TA----AC-A----------------TGTG-TA-----T--ATTCAG-----A-ATTG----------------TG-GGAA---CGATT-AC---AA-TTT-TTC----C---AAAC----GATAG-TGGACATGTGC----GAG-CCGT-TA--------CA-TTTC-G--------TTA--AAAGAACCTAAAAGAACCATTTTTAAG---AGAGAGAGGGAGA-AAGAGCACTT-AATAACGTTTGTCAATTCGTGT----TTCGAG---GAA-ACCTA-----CA-------CATACA---CTGTG-ACAGA-AGAGA------AAACCG---CAATAATTACATTTTGAAGCAGTTTTGTT-GGTCAG-AC-AAAATA----AATA-AT----AA-TCGT-TCACAGACCCAGT-----------CCGTTG-CTGTC----CCACAACGAAAGGC--CTGC-T-CCATGA----CC-AC-T---------------T--A-TTG---TTA-GAAATGGTT---------G--ATGA--------------ACA--CTG----AA----TCAGTCCCCGAACATAGGGACATGC-A----------ACCA-AAAT-CA--TTTTTTTAACTCCA-----------------AAGG---T
gi|7 : -----------------AAAGAT-TTCAG-CAACGCTGCATGCACTT-GCTTGCAA-CTGTGAAATACAAGCAATGTGGGAAattaaactggttccataagcaatattatgtaaagatttcagcaacgctgcatgcacttgcttgcaactgtgaaatacaagcaatgtgggaa
gi|8 : cttcgtagcaatttggagatgcaaattcatacatgtatactgtcgtatggaaaataataatacgagaaatgaatattctgctccagcaaaacgccatcgacatggcggtaatgaacgtcagtgaaaagatttgtattattgcacataatcattatttattttcgtttaatattcgtctgtgtaggtaacatgtgtatattcagaattgtgggaacgattacaatttttccaaacgatagtggacatgtgcgagccgttacatttcgttaaaagaacctaaaagaaccatttttaagagagagagggagaaagagcacttaataacgtttgtcaattcgtgtttcgaggaaacctacacatacactgtgacagaagagaaaaccgcaataattacattttgaagcagttttgttggtcagacaaaataaataataatcgttcacagacccagtccgttgctgtcccacaacgaaaggcctgctccatgaccacttattgttagaaatggttgatgaacactgaatcagtccccgaacatagggacatgcaaccaaaatcatttttttaactccaaaggtattaaactggttccataagcaatattatgtAAATTA-AAA--TT--TTGTATACT--TAGT-TTAGCGAGTCAGATT----TTCTCC--GA---CCGACC----C-AGTAAA-T--TCCTT-TCCGA-C-TGAA--AG--AT-C-T--TGT-T-------ATAT-----GGGTAT-TT-------------AGACGC---CAGGGGTA-GATCTATTTACATTT--TTA---TTCATT--T-CTGCTT--GCG-AC---CGA-----------CCGA--AATT-TT-----TA-TTTCT-----GC----AGTT--T--A----CG---CTC--A--AAACTAT--TTTA-TGTCCATAAAT-----CACAA-AGTTCC--TGAATTTT--TTTTTTTT--TCAGCTAT----AATCGGACTAA-------AGCA--TTCTAGTTATTATTTCCATTACCTT-CCCGCA-CGT-AGC--TC-GAG-CTGAGATTACTTCCAAATGTGGAACGCAATGTAAC---------------ATA-TAT-C------------CCAT-CATTCAGTCTGA-CTCAAT-A-A-A-CCGTGC-TTAATTCAT--ATCAA---AAAAGGTA-GC--AT--TTTTAA---AT-ATGA-AA-AATGCATAGTTATCA-TAATAAGT-AATATGA-ATTTGAATATT--TTGCAGAACGTTTCAAATTGGGGTT-ATCGAAA-----TGT-G-CA-T--AAGAGG-GAGGATGGTTTGA-AGAGG-A-ATCG-TTTA-----AG-AGTAGTGGACAAG-TTCATAAGTAAATCT--TTA--CGGGA-C-A--------------AC-AACCT--GGGGTTCAGTCCCAAGCAGCACT-CATAAGGCC-----CG-A-TAAACAG-AGATAAATGAATGTGAGAATCGG--T----TGAATATTTAAAACAAGATCAA-G----TC
gi|9 : gccta--CTGCAGAGGCAAACACACTA-TCTATTT--TTAACCATTGC-TGT-C-GTAT-GAGC-TTTA-TATTATTAC-------------CAACA------------------T--------TTTCATGGTTGATTAATTAAGCTACCGT-TTG-----TTTTAAAG------------------AAAATT---ATATTA-----TTATCATCG--CAAGTGGGAAA-TAT-A-TG-ATAAAATAAC-T-AATAGTAATACAATA------------A----------------TTTATTTATCTATTTTACCAGACTGACTG-TACCC-A-CCGAC-TTTTTTTTCATATGG-GTTACTAGT------ATTGGAG----------TCTT--ATGGGCCGA--CAGATG----TTAGA---ATAT-----AACATACAAG--GCAA-TTGACACGAAG-AAAATACAATTTTT-TTCTTCAAGAAGATAATATCTTTT-TA------AAACATGA---TCCATTGATTT----GCAC-G-TACTAGTAATTACA---TTACTATA-TATGTAGGCAT--ACAACTG-CCG-----------TAAT--ACTGACACGAATAGT--TG--GCGACAT--AAAA-CGGTCCATT---G-G----TGC-C---TT-AAG-CTTGGA--C-C--G------AAA---------A----------TTAAGTT----TTAT--GGTTTGTGCG------------TA-------------CCCTCCCTCCCCCCCCTT---CCACTTT-C-TACG----------------------TTTG-ATT--------------GCCTCA------AC-AAAA-CACAAcc
Alignments
lowQualScore : 111111111111111111111111111111111111111111111111111 1111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 1111111111111111111111111111111111111111111111
lowQualScore : 111 1111111 111 111111 111 1111111 11111111 222222222222222222 11111 11 22222222222 11111 222222222222222222222222 2222222222222222222222 2222 1111 11111111 11111 111 1 11 11 11111 66666666666666666666666666 222222222222 1 22222222 11 111 11 11 111 111111 2222 111 1111 11 11 111 2222222222 11111 11 33333333333333 11111 11111 333333333 1111111 111 1111 111111 111111111 111111 11 111 11 1 111 1111111111 77777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777 11111 2222222222222222 11111 11111111 6666666666666666 1111 1111111 11111111 1111 1 1111 111111111111111111111111111111111111111111111111111 111 555555555555555555555555555555555 111 444444444444444 111 2222222222222222222222222 22222 1 1 1 1 11 2 1 44444444444 11 1 11 11 4444444444444444444444444444 111 222222222 33333333333333 1111 1111 222 2222222222 33333 44444444444444444 222 1 2222 1 11 5555555555 1 777777777777777777777 2222222 11111111 222222 111111 333333333333333333333 111 1111 5555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555 11 11111 444444444444444444 1 111111111 22 44444444444 0000000000000000000000000000000000000000000000 1 1111 77777777777777777777777777777 555555555555 1 22222222 1111 11 1 11 1 22222222 111 1111 22222222222 3333 11 11111 11 1111 111111 666666666666666666666 1111 11111 3333333333333333333333333333 11111 1111 5555555555555555555555 44444444444444444444444444 111 1111 2222222222 222222222222222222222 111 111 111 11 11 11 1111 1111 444444444444444444444 11111 11 22
lowQualScore : 5 000 66 9999 55 4 4 77 3333333 8888 4 99 111 333333 4 55 88 4 4 77 55 111 4 4 55 4 8 3333333 77777777 4 999999999999999999 777 55555 00 777 66 777 55 4 4 66 4 777 55555555555 66 6 44 11111 4 000000000000000000000000 777 66 66 4 66 2222222222222222222222 444 8 66 2222 66 9999999 5555 66 5 99999999 99 88 22222 000 5 5 99 77 4 5 22 44444 66666666666666666666666666 0 999999999999 5 5 66 5 66 0 5 5 0 5 11111111 888 888 5 11 66 66 888 88 555 5 5 55 11 00 5 5 5 000 77 666666 0000 000 5 5 2222 5 5 33 5 00 5 77 5 000 7777777777 5 5 33333 5 77 33 5 33333333333333 5 77 0 5 1 5 44444 44444 5 5 77 5 777777777 1 9999999 000 1 5 2222 6 999999 5 8 77 222222222 6 222222 1 55 2 3 88 1 88 6 0 1 0 888 66 1 44 0 222 8 5555555555 5 888 66666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666 9999 00000 4 9999 9999999999999999 33 4 11111 66 11111111 7777777777777777 5 7777 8888888 5 77777777 1 2222 8 0 7777 8 8 000000000000000000000000000000000000000000000000000 444 33 8 2 888888888888888888888888888888888 444 8 888888888888888 444 8 8 8 5555555555555555555555555 00000 5 8 0 0 0 2 0 33 2 3 0 0 77777777777 22 0 22 11 88 5 6666666666666666666666666666 6 111 6 7 666666666 6 55555555555555 99 4444 4444 000 4 6 9999999999 6 00000 66666666666666666 000 0 1111 1 2 3 3 0 22 0 0000000000 0 3 6 222222222222222222222 6666666 5 3 99999999 333333 0 0 888888 77 0 000000000000000000000 111 3 99 6 8 0 8 0 6 3333 8 6 7777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777 00 66666 999999999999999999 1 3 444444444 99 999 1 22 6 6 6 44444444444 99 1 2 5555555555555555555555555555555555555555555555 1 8 0 8 8 8 11 3 6666 0 99999999999999999999999999999 3 444444444444 0 0 88888888 3 1111 44 0 8 0 11 6 0 5 8 0 88888888 5 1 111 7 66 4444 777 0 888 22 5 3 5 9999 1 666 33333333333 66 2 1111 5 11 5 5 66 5 22222 5 888 5 00 9999 444444 333333333333333333333 4 7777 11111 9999999999999999999999999999 11111 2222 3 5 5 5 6 6666666666666666666666 77777777777777777777777777 5 5 4 777 1 5555 99 6 99 1111111111 1 99 777777777777777777777 6 000 99999 55 3333 6 3 5 77 66 5 5 5 222 5 0 444 8 4 66 66 66 66 66 22 66 66 66 55 0000 5 0000 0 444444444444444444444 3 3 22222 5 888 5 2 0 4 8 00 8 4 11 4 66 777 0
lowQualScore : . ... .. .... .. . . .. ....... .... . .. ... ...... . .. .. . . .. .. ... . . .. . . ....... ........ . .................. ... ..... .. ... .. ... .. . . .. . ... ........... .. . .. ..... . ........................ ... .. .. . .. ...................... ... . .. .... .. ....... .... .. . ........ .. .. ..... ... . . .. .. . . .. ..... .......................... . ............ . . .. . .. . . . . . ........ ... ... . .. .. .. ... .. ... . . .. .. .. . . . ... .. ...... .... ... . . .... . . .. . .. . .. . ... .......... . . ..... . .. .. . .............. . .. . . . . ..... ..... . . .. . ......... . ....... ... . . .... . ...... . . .. ......... . ...... . .. . . .. . .. . . . . ... .. . .. . ... . .......... . ... ................................................................................................................. .... ..... . .... ................ .. . ..... .. ........ ................ . .... ....... . ........ . .... . . .... . . ................................................... ... .. . . ................................. ... . ............... ... . . . ......................... ..... . . . . . . . .. . . . . ........... .. . .. .. .. . ............................ . ... . . ......... . .............. .. .... .... ... . . .......... . ..... ................. ... . .... . . . . . .. . .......... . . . ..................... ....... . . ........ ...... . . ...... .. . ..................... ... . .. . . . . . . .... . . ...................................................................... .. ..... .................. . . ......... .. ... . .. . . . ........... .. . . .............................................. . . . . . . .. . .... . ............................. . ............ . . ........ . .... .. . . . .. . . . . . ........ . . ... . .. .... ... . ... .. . . . .... . ... ........... .. . .... . .. . . .. . ..... . ... . .. .... ...... ..................... . .... ..... ............................ ..... .... . . . . . ...................... .......................... . . . ... . .... .. . .. .......... . .. ..................... . ... ..... .. .... . . . .. .. . . . ... . . ... . . .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .... . .... . ..................... . . ..... . ... . . . . . .. . . .. . .. ... .
lowQualScore : 0 222 99 4444 55 0 0 22 0000000 5555 0 55 000 555555 0 55 99 0 0 11 55 000 0 0 55 0 0 0000000 66666666 0 333333333333333333 888 88888 88 888 11 888 55 0 0 11 4 888 66666666666 11 4 66 11111 4 333333333333333333333333 888 11 11 4 11 9999999999999999999999 666 9 11 5555 99 2222222 6666 99 0 55555555 55 22 55555 000 0 7 11 99 0 7 99 33333 33333333333333333333333333 1 333333333333 7 7 99 0 99 0 0 0 4 0 99999999 888 888 0 99 99 99 888 22 666 0 0 44 99 11 0 7 7 000 99 444444 0000 000 7 7 1111 7 7 66 7 00 7 44 7 666 4444444444 7 7 77777 0 99 66 7 66666666666666 7 99 7 7 4 7 33333 33333 7 7 99 7 111111111 4 6666666 000 7 7 1111 7 222222 7 0 00 000000000 7 555555 0 88 5 2 88 0 88 4 8 4 8 000 44 0 55 0 000 0 2222222222 0 888 66666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666 4444 44444 4 4444 4444444444444444 33 4 11111 11 44444444 1111111111111111 7 9999 1111111 7 11111111 7 1111 0 0 0000 0 0 444444444444444444444444444444444444444444444444444 000 22 0 2 222222222222222222222222222222222 000 0 222222222222222 000 0 2 0 2222222222222222222222222 00000 6 0 0 0 0 5 0 22 5 0 0 0 55555555555 55 0 00 00 88 0 8888888888888888888888888888 7 777 7 5 777777777 7 77777777777777 22 2222 2222 888 2 7 2222222222 7 77777 77777777777777777 888 0 2222 0 5 2 2 0 55 8 0000000000 0 2 5 555555555555555555555 0000000 0 2 66666666 000000 8 8 666666 88 8 222222222222222222222 777 2 22 7 0 8 0 8 0 0000 0 7 3333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333 33 77777 222222222222222222 7 2 888888888 22 222 0 22 7 7 7 77777777777 22 7 5 5555555555555555555555555555555555555555555555 0 0 0 0 0 0 44 8 8888 8 22222222222222222222222222222 2 888888888888 8 0 66666666 8 8888 00 8 0 6 00 0 8 6 0 8 00000000 2 0 777 3 33 2222 555 1 000 11 7 6 7 4444 4 999 88888888888 99 2 0000 0 99 0 0 99 0 55555 0 888 0 11 4444 444444 999999999999999999999 5 5555 44444 1111111111111111111111111111 11111 6666 1 0 0 0 6 4444444444444444444444 00000000000000000000000000 7 7 3 888 7 5555 22 7 22 8888888888 0 22 222222222222222222222 7 222 88888 22 7777 5 1 0 55 99 0 0 0 666 1 1 111 9 4 11 77 11 99 99 00 99 44 99 99 6666 0 6666 1 555555555555555555555 2 2 00000 0 888 0 5 1 4 9 66 9 4 11 4 11 000 2
consensus : CTAAATTA-AAA--TT--TTGT----T--T-GT-TT-GCGG-------T----TTC-CC--GA---CCGACC----T-AGTAAA-T--TCGTT-NC-GA-C-TGAA--A---AT-C-T--T-T-T-------ATTT-----G--TAT-TT-------------A----C---CAGG--T--GATAT-TTT---TTT--TTA---TTCATT--T-CTG-TT--GCG-AC---CGA-----------CCGA--AAAT-CT-----TA-TTTCT-----GC----A-TT--T--A---CCG---CTC--A--AAAC-AT--TTT--T--------AT-----CG-AA-AATT-C--TGA----T--TTTTTTTT--CC--CGAT----AA--GGACT-A-------AGTAC-TCCTAGT-----TTTC---TACCTTGTCCGCA-CGCAAGC--TCGGAG-CTGAGA-CACTTCCGAAT-----AC---------CAT--------------ATATAC------------CAAT-CG-TCAG--CGA-CT--ATAA-A-A-ACGTG-CTTA--TCATGCATCAA---AA---GTA-TC--AT--TTT--A---A-TAT---AA-AATGCATAGTT-TC-ATA--AAGT-AA-ATGA-A-TTGAA---T--TTGCA------TTTA----GG---T-A-CGAAAT----TGTAG-CA-T--AAGGGG-GAGGA-GG-TTGA-AG-GA-G-ATCG--T-AA----AG-ATA-TGGAAAAGTTTCATA--T--ATCT--TTA--CGGGA-CAA--------------AA-AACCA--TGGATTCAGACCCAA-CACAACT-T-----GTC-----CG-A-T--ACAG-AGAT---------TGAGAATCGG--T-A--TGAA---TTAAAACCAGATCAA-G----TCGCT-GC------A-CTTCGT-GCAATTTGAAGATGC--A---T--TATACA-TGTAT-GCCT-ANTACCAA--CTGGTTATAGAAA-TAANA-TACGCAGAATGAATATT-T-GCTCCAGCAAAACGCNATCGCCATG-G-C-GG-TAAT----GAATC-AAACGTTC-A---GTGA---AAA-TT-T--GT---ATT---ATTTG--CACAT------AATC--AT-GT--TTATTT-----TTCA--TTTT--TAT---A-TT-------------------------CGT----TT-TG--TAGT-AA----ACTA----------------TGTG-GA-----T--ATTCAG-----A-TTTG----------------TG-GGA----CGAT--AC-T-AA-TTT-CCC----CCCCAAAC----GATAG-TGGACATGCGC----GAG-CCGT-TATA------CA-TTTC-G--------TTA--AAAGAACATGAA-GAACCATTTTTAAG---AGAGAGAGNGAGA-GAGAGCACTT-AATAACGTTTGTCATTACGTATG---TTTGAG---GAA-ACCCC-----CA-------CACACA---CTGTG-ACAGA-GAAGAATG---AAAACG---CAATGATT-CATTT-----CAGTTTTGTT-GGT-AG-AC-AAAATACC-GAGTA-ATCGTAAA-TCGT-TCACAGACCCAGT-----------CCG-TG-CTATCTCAATCACAACGATGGCC--TTGC-TTCCATGA----CCAAC-T---------------T-GA-TTG---TTG-AANATGGTC---------GA-ATGAAC------------ACA--CTG----AA----TCGGT--CCGAACGTAGGGATATGC-A----------ACCG-AAATATA-TTTTTTTTAACTCCC-----------------AAAG---TTCAA-CAA----GCNTGCACTTTGCTTGCAA-CTGTAAAATACAAGC-ACGTGGAAAGTGTTC-A---TAAT-TTG-AATAAACACCGGGATGATCA--ATGC---CATA----TCAGCCATAGTA-------AATACCCGTAN----GTAATACCG------AAATAAAG-T--TTCTCCATCGAAATAAG-TGCATGA-CA-AAA--CTGCAGAGGCAAACAC--TAATCTATTT--TTA-CC-TTGCCTGT-AAGTAT-A--C-TTTA-TATTATACC-------------CGACA------------------T--------T----------------------ACCGC-TTG-----TTTTAAAG------------------AAAATTTCTAT-TTACCG-CTTAT--TCAGTNAAGTGGGAAA-TAT-A-CG-ATA---A-AA---CTAA--ATAATACAATA------------A----------------TTT--------------CCTGACTGAATG-TACCC-A-CCGAC-TTTTTTTTAATATGG-GT-ACTAGT------A-----G----------T--T--ATGGGCCGA--CA--TGA---TTAGATACATATG----AACAGACAAG--GCAA-TTGACACGAAG-AAAATACA--CTTT-TTCTTCAA-AGAATAATATTTTTT-TA-T-GTTACACATGT---TCAATTGATTT----GCAC-G-TACTAGTAATTACAT--TTACTATA-TATGTA-GCAT--ACAACTG-CCG-----------TGAT--AATTTACATGCGG-G-TT--GCGACGTCAAAAA-CGGT-CAT--TG-G-----TG-AC---TT-GAA-CTTGGA--C-CAGA------AAA---------A----------TTAAGTT----TTAT--GG-TTGTGCG------------TA-------------CCC-----CCCCCCCCCT---CCAC-TT-C-TANG----------------------TTTGAATT--------------G-CTC-------AC-AAAA-CACAATAAT-CATACGATATA--A-TT--GC-AAG--TT---T--A--AAGATACA--AAA-A--AAAG-T-ACAT-A-AATGTA-TATN--ATATATA-CATGTATATGCACCTA-CAAAAGCAG-T--A-C-AGAC-AAA--CTAATATCAT-ATTATCAAAT-AAA-TAAAA--TA--TTTTAT--CGACC--TA--CCTACCCAGAG-AA--AAATAAG-GGC--CTACTTGAAG----TTATTT-TTTG----GCTTA------------------GA-AAAAATAAAATATTTTA---C-CTAC-CTA---CCGACCCTA-CGTCCGTAAAT-C-G--G-TCG-G--AAA-GG--GCAAACAAACAAT--TTTTTAATTTA
Reference ( family-458 ) : CTAAATTA-AAA--TT--TTGT----T--T-GT-TT-GCGG-------T----TTC-CC--GA---CCGACC----T-AGTAAA-T--TCGTT-NC-GA-C-TGAA--A---AT-C-T--T-T-T-------ATTT-----G--TAT-TT-------------A----C---CAGG--T--GATAT-TTT---TTT--TTA---TTCATT--T-CTG-TT--GCG-AC---CGA-----------CCGA--AAAT-CT-----TA-TTTCT-----GC----A-TT--T--A---CCG---CTC--A--AAAC-AT--TTT--T--------AT-----CG-AA-AATT-C--TGA----T--TTTTTTTT--CC--CGAT----AA--GGACT-A-------AGTAC-TCCTAGT-----TTTC---TACCTTGTCCGCA-CGCAAGC--TCGGAG-CTGAGA-CACTTCCGAAT-----AC---------CAT--------------ATATAC------------CAAT-CG-TCAG--CGA-CT--ATAA-A-A-ACGTG-CTTA--TCATGCATCAA---AA---GTA-TC--AT--TTT--A---A-TAT---AA-AATGCATAGTT-TC-ATA--AAGT-AA-ATGA-A-TTGAA---T--TTGCA------TTTA----GG---T-A-CGAAAT----TGTAG-CA-T--AAGGGG-GAGGA-GG-TTGA-AG-GA-G-ATCG--T-AA----AG-ATA-TGGAAAAGTTTCATA--T--ATCT--TTA--CGGGA-CAA--------------AA-AACCA--TGGATTCAGACCCAA-CACAACT-T-----GTC-----CG-A-T--ACAG-AGAT---------TGAGAATCGG--T-A--TGAA---TTAAAACCAGATCAA-G----TCGCT-GC------A-CTTCGT-GCAATTTGAAGATGC--A---T--TATACA-TGTAT-GCCT-ANTACCAA--CTGGTTATAGAAA-TAANA-TACGCAGAATGAATATT-T-GCTCCAGCAAAACGCNATCGCCATG-G-C-GG-TAAT----GAATC-AAACGTTC-A---GTGA---A------T--GT---ATT---ATTTG--CACAT------AATN--AT-GT--TTATTT-----TTCA--TTTT--TAT---A-TT-------------------------CGT----TT-TG--TAGT-AA----ACTA----------------TGTG-GA-----T--ATTCAG-----A-TTTG----------------TG-GGA----CGAT--AC-T-AA-TTT-CCC----CCCCAAAC----GATAG-TGGACATGCGC----GAG-CCGT-TATA------CA-TTTC-G--------TTA--AAAGAACATGAA-GAACCATTTTTAAG---AGAGAGAGNGAGA-GAGAGCACTT-AATAACGTTTGTCATTACGTATG---TTTGAG---GAA-ACCCC-----CA-------CACACA---CTGTG-ACAGA-GAAGAATG---AAAACG---CAATGATT-CATTT-----CAGTTTTGTT-GGT-AG-AC-AAAATACC-GAGTA-ATCGTAAA-TCGT-TCACAGACCCAGT-----------CCG-TG-CTATCTCAATCACAACGATGGCC--TTGC-TTCCATGA----CCAAC-T---------------T-GA-TTG---TTG-AANATGGTC---------GA-ATGAAC------------ACA--CTG----AA----TCGGT--CCGAACGTAGGGATATGC-A----------ACCG-AAATATA-TTTTTTTTAACTCCC-----------------AAAG---TTCAA-CAA----GCNTGCACTTTGCTTGCAA-CTGTAAAATACAAGC-ACGTGGAAAGTGTTC-A---TAAT-TTG-AATAAACACCGGGATGATCA--ATGC---CATA----TCAGCCATAGTA-------AATACCCGTAN----GTAATACCG------AAATAAAG-T--TTCTCCATCGAAATAAG-TGCATGA-CA-AAA--CTGCAGAGGCAAACAC--TAATCTATTT--TTA-CC-TTGCCTGT-AAGTAT-A--C-TTTA-TATTATACC-------------CGACA------------------T--------T----------------------ACCGC-TTG-----TTTTAAAG------------------AAAATTTCTAT-TTACCG-CTTAT--TCAGTNAAGTGGGAAA-TAT-A-CG-ATA---A-AA---CTAA--ATAATACAATA------------A----------------TTT--------------CCTGACTGAATG-TACCC-A-CCGAC-TTTTTTTTAATATGG-GT-ACTAGT------A-----G----------T--T--ATGGGCCGA--CA--TGA---TTAGATACATATG----AACAGACAAG--GCAA-TTGACACGAAG-AAAATACA--CTTT-TTCTTCAA-AGAATAATATTTTTT-TA-T-GTTACACATGT---TCAATTGATTT----GCAC-G-TACTAGTAATTACAT--TTACTATA-TATGTA-GCAT--ACAACTG-CCG-----------TGAT--AATTTACATGCGGTG-TT--GCGACGTCAAAAA-CGGT-CAT--TG-G-----TG-AC---TT-GAA-CTTGGA--C-CAGA------AAA---------A----------TTAAGTT----TTAT--GG-TTGTGCG------------TA-------------CCC-----CCCCCCCCCT---CCAC-TT-C-TANG----------------------TTTGAATT--------------G-CTC-------AC-AAAA-CACAATAAT-CATACGATATA--A-TT--GC-AAG--TT---T--A--AAGATACA--AAA-A--AAAG-T-ACAT-A-AATGTA-TATN--ATATATA-CATGTATATGCACCTA-CAAAAGCAG-T--A-C-AGAC-AAA--CTAATATCAT-ATTATCAAAT-AAA-TAAAA--TA--TTTTAT--CGACC--TA--CCTACCCAGAG-AA--AAATAAG-GGC--CTACTTGAAG----TTATTT-TTTG----GCTTA------------------GA-AAAAATAAAATATTTTA---C-CTAC-CTA---CCGACCCTA-CGTCCGTAAAT-C-G--G-TCG-G--AAA-GG--GCAAACAAACAAT--TTTTTAATTTA
gi|1 : CTAAATTA-AAA--TT--GTGT----T--T-GT-TT-GCGG-------T----TTC-CC--GA---CCGACC----T-AGTAAA-T--TCGTT-GC-GA-C-GGAA--A---AT-C-T--T-T-T-------ATTT-----G--TAT-TT-------------A----C---CAGG--T--GATAT-TTT---TTT--TTA---TTCATT--T-CTG-TT--GCG-AC---CGA-----------CCGA--AAAT-CT-----TA-TTTCT-----GC----A-TT--T--A---CCG---CTC--A--AAAC-AT--ATT--T--------AT-----CG-AA-AATT-C--TGA----T--TTTTTT----CC--CGAT----AA--GGACT-A-------AGTAC-TCCTAGT-----TTTC---TAC-TTGTC-GCA-CGCAAGC--TCAGAG-CTGAGG-CACTTCCGAAT-----AC----------AT--------------ATATAC------------CAAT-CG-TCAG--CGA-CT--ATAA-A-A-ACGTG-CTTA--TCATGCATCAA---AA---GTAATC--AT--TTT--A---A--AT---AA-AATGCATAGTT-CT-AAA--AAGT-AA-ATGA-A-TTGAG---T--TTGCA------TTTA----GG---T-A-CGAAAT----TGTAG-CAAT--AAAGGG-GAGGA-GG-TTGA-AG-GA-G-ATCGGTT-AA----AG-ATA-TGGAAA-GTTTCATA--T--ATCT--TTA--CGG-A-CAA--------------AA-AACCA--TGGATTCAGAACCAA-CACAACT-T-----GTC-----CG-A-T--ACAG-AGAT---------TGAGAATCGG--T-AAATGAA---TTAAAACCAGATCAA-G----TCGCT-GC------A-CTTCGT-GCAAATTTAAGATGC--A---T--TATACA-TGTAT-GCCC-AATACCAA--CTGGTTATAGAA--TAAGA-TACACAGAATAGATATT-TTGCTCCA--AAAACGCAATCTCCATGTG-T-GG-TAAT----GA-TC-AAACGTTC-A---GT---------------------TT---ATT-G--CACAT------AATG--AT-GT--TTATTT-----TTCA--TTTT--TAT---A-TT-------------------------CGT----TT-TG--TAGTTAA----ACTA----------------TGTG-GA-----T--ATTCAG-----A-TTTG----------------TG-G-A----CGAT--AC-T-AA-TTT-CCC----CCCCAAAC----GATAG-TGGACATGCGC----GAG-CCGTGTATAATGAACCA-TTTTTN--------NNN--NNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNNN---NNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNCATTACATATG---TTTGAG---GAA-ACCCC-----TA-------CACACA---CTGTG-AAAGA-GAAAAATG---AAAACG---CAATGATTTCATTT-----CAGTTTTGTTTGGT-AG-AC-AAAATACC-GAGTACATCGTAAAATCGT-TCATAGACCCAGT-----------CCG-TG-CTATCTCAATCACAACGATGGCC--TTGCTTTCCATGA----CCAAC-T---------------T-GA-TTG---TTG-AATATGGTC---------GA-ATGGAC------------ACA--CTG----AA----TCGGT--CCGAACGTAAGGGTATGC-A----------ACCG-AAATATA-TTTTTTTTAACTCCC-----------------AAAG---TTCAA-CAA----GCCTGCACTTTGCTTGCAA-CTGTAAAATACAAGC-ACGTGGAAAGTGTTCAA---TAAT-TTG-AATAAACACCGGGATGATCA--ATGCATGCATA----TCAGCCATAGTA-------AATACCCGTAA----GTAATACCG------AAAT-AAG-T--TTCTTTATCGAAATAAG-TGCATGA-CA-AAATTCTGCAGAGGCAAACAC--TAATCTATTT--TTA-CC-TTGCCTGT-AAGTAT-A--C-TTTA-TATTATA---------------CAACA------------------T--------T----------------------ACCGC-TTG-----TTTTAAAG------------------AAATTTTCTAT-TTACCG-TTTAT--TCAGTAAAGTGGGAAA-TAT-A-CG-ATA---C-A-----TAA--ATAATACAATA------------A----------------TTT--------------CCTGACTGAATG-TA-CC-A-CCGAC-TTTTTTTTAATATGG-GT-ACTAGT------A-----G----------T--T--ATGGGCCGA--CT--T-----TTAGATAAATATG----AACAGACAAG--GCAA-TTGACACGAAG-AAAAT-CA--CTTTGTTCTTCAA-AGAATAATATTTTTTATACT-GTTACACATGT---TCCATTGATTT----GCAC-G-TACTAGTGATTACAT--TTACTATA-TATGTA-GCAT--ACAACTG-CCG-----------TGAT--AA---ACGAGTGTTG-CT--GCGACGTCAAAAA-CGGT-CAT--TG-G-----TGAAC---TT-AAA-CTTGGA--C-CAGA------AAA---------A----------TTAAGTT----TTAT--GG-TTGTGCG------------TA-------------CCC-----CCCCCCCCCT---CCAC-TT-T-TAAG----------------------TTTGAATT--------------G-CTC-------AC-AAAA-CACAATAAT-TATACGATATA--A-TT--GC-AAG--TT---T--A--AAGATACA--AAA-A--AAAGTT-ACAT-A-AATGTA-TATT--ATATATA-CATGTATATGCACCTA-CAAAAGCAG-T--A-C-AGGC-AAA--CTAATATCAT-ATTATCAAAT-AAA-TAAAA--TA--TTTTAT--CGACC--TA--CCTACCCAGAG-AA--AAATAAG-GGC--CTACTTGAAA----ATATTT-TTTG----GCTTA------------------GA-AAAAATAAAATATTTTA---C-CTAC-CTA---CCGACCTAA-CGTCCGTAAAT-C-G--G-TCG-G--AAA-GG--GCAAACAAACAAT--TTTTTAATTTA
gi|10 : --T-GT-TT-GCGG-------T----TTC-CCC-GA---CCGACC----T-AGTAAA-T--TCGTT-GC-GA-C-GGAA--A---AT-C-T--T-T-T-------ATTT-----G--TAT-TT-------------A----C---CAGG--T--GATA---TT---TTT--TTA---TTCATT--T-CTG-TT--GCG-AC---CGAC----------CCG----AAT-CT-----TA-TTTCT-----GC----A-TT--TTAA---CCG---CTCAAA--AAAC-AT--TTT--T--------AT-----CG----AATTCC--TGAC---T--TTTTTTTT--CG--CGAT----AA--GGACT-A-------AGTAC-TCC-AGT-----TTTC---TACCTTGTCCGCA-CGC-AGC--TCAGAG-CTGAG--CACTTCCGAAT-----AC---------CAT--------------ATATAC------------CAATCCG-TCAG--CGA-CT--ATAC-A-A-ACG-G-CTT---TCATGCATCAA---AA---GTA-TCAAAT--TTT--A---A-TAT---AA-AATGCATAGTT-TC--TA--AAGT--A-ATGA-A-TTGAA---T--TTGCA------TTTA-----G---T-A-CGAAAT----TGTAG-CA-TAAAAGGAG-AAGGA--G-TTGT-AG-GA-G-ATCG--T--------G-ATA-TGGAAAAGTTTCATA--T--A-CT--GTA--CGGGA-CAA--------------AA-AACCAATTGGATTCA-ACCCAA-CACAACT-T-----GTC-----CG-A-T--ACAGAAGAT---------TGAGAATCGG--T-A--TGAA---TT-AAACCAGATCAA-G----TCGCT--C------A-CTT
gi|11 : ----T--T-GT-T--GCGG-------T----TTC-CC--GA---CCGACC----T-AGTAAT-T--TCGTT-GC-GA-C-GGAA--A---AT-C-T--T-T-T-------ATTT-----G--TAT-TT-------------A----C---CAGG--T--GATA--TTT---TTT--TTA---TTCATT--T-CT--TT--GCG-AC---CGA-----------CCGA--AAGTGCT-----TA-TTTCT-----GC----ATTT--T--A---CCG---CTC--AACAAAC-A---TTT--T--------AT-----CG--A-ATTT-C--TGGAC--T--TTTTTTTT--CG--CGAT----AA--GGA-T-A-------AGTAC-TCC-AGT-----TTTC---TACCTTGTCCGCA-CGC-AGC--TCAGAG-CTGAG--CACTTCCGAAT-----AC---------CAT--------------AT-TAC------------CAAT-CG-TCAG--CGA-CT--ATAACA-A-ACGTG-CTT---TCATGCATCAA---AA---GTA-TCA-AT--TTT--A---A--AT---AA-AATGCATAGTT-TC-TAA--AAGT--A-ATGA-A-TTGAA---T--TTGCA------TTTA----GG---T-A-CGAAAT----TGTAG-CA-TA-AAAGGA-GAGGA--G-TTG--AG-GA-G-ATCG--T--A----AG-ATA-TGGAAAAGTTTCATA--T--A--C--TTA--CGGGA-CAA--------------AA-AACCA--TGGATTCAGACCCAA-CACAACT-T-----GTC-----CG-A-T--ACAG-AAGA---------TGAGAATCGG--TAA--TGAA---TTAAAACCAGATCAA-G----TCGCT-GC------A-CT
gi|12 : TTTTTT-TA-TCGTTTCACATATGGGTCAA-------------A-----AATAGTATCTATATAATTACTATG-TATGTG-GC-T--ACAA--G-CCG------------GAT--AATTTACA-ATAGTGATT--GCGACGTCAAAAAACGGT-C-T--TG-G-----TG-AC---TT-GA--CTTGGAA-C-CAGATTGAGAAAA---------A----------AAAAACTGCGATTCT--GT-TTGTGCG------------TA------------------------------------AC-TT-C-TA-G----------------------TTTGAATT----------------CTTGGAGGAAATGAAAA-CAAGATAAT--ATACGTCAAA--A-TT--GCTAAA--TTCTAT--A--GAGATACA--AAA-C--AAAG-T-GTAT-------TA-TATA--CTA-AT--CAT-------CA-CTA-CAAAA-CA--T--G-CAAGAC-AAA--CTTCTATAATCATTATCAAATAAAA-TAAAA--TAT-TTTTAT--CTACC--T---CCTA-CCAGA--AA--AAATAAG-GGC--CTAC-TGAA-----TTATTTGTTTG----GCT--------------------GA-GAAAAT--AACATTTTA---C-CCATACTA---CCG-CCCTA-C-TTCGT-AAT-C-GC-G-TCG-G--AAA-AGGCGCAATCAAACA----TTTTTAAT
gi|13 : t-----------TGAT--G-TTTACATGAG----TT--ACAGCACCAAAAA-CAGT-TAC--TATG-----TG-AC---CT-GAA-CTTGAA--C-CAGA------AAA---------GGGGCGATACTTTTAGTC----ATAT--GGATTACGC-------------TA-------------CAC-----CCATCCAAC------AC-TT-CCTGGG----------------------TTAGAATT--------------T-CT-----------AAAA-CA-AACAATGCGCACAATACACGA-T-------AA--TT---T--A------TG--------------G-T-ACAT------GTA-TATGCAAAATA-A-CATAGATAT------A-CAAATACAG-T--A-C-AGAC-AAA-----A-GCCGC-ATTATCAAAT------AAAA--TA--TTTTAC--CAACT--TA--TCTACAAAATG-CA--TAAAAAA-GGCTTCTGTTTT--GTTTTTTGTTT-TTTT----GTTTGTTTTTTTTTTTTTTGGCTGAGAAAAATAAAATATTTTG---C-CTAC-CTA---TTTACCCT--CTTTCG------G-G--G-TCGTT--AAA-GG--GCAAAAAAAAAATCATTTTTTATTTA
gi|14 : ctc-------------CCC-----CCCCCCCCTT---CCAC-TTTC-GACG----------------------TTTGAATT--------------G-CTC-------AC-AAAAACACAATA-T-C---CGATATA--T-TT--GC-AAAGTTT---T--AGTAAGACACACAAAA-ACCAAAG-TTACATTATAATGTAGTATA--ATATATATCGTGTATATGCATCTAACAAAAGCAGGT--AAC-AGAC-AAAAACTAATATCAT---TATCAAAT-AAA-TAAAAAATA--TTTTATTCCGACCCGTATCCCTACGCAGAG-GATAAAGTAATCGGC--CTACT-GAAG----TTATTT-TTTGTTTGGCTTA-------------------A-GAAAATAAAATATTCTGAGGCGCTAC-CTGGAGCAGACCCTAGCGTTCGTAAAT-C-G--GGTCG-G--AAAAGG--GCAAACAAACAAT--TTTTTAATTTAggcc
gi|15 : gatttcgccctcccA-TATTATGC----------------------------------------------T----------------------ACCGC-TGG-----TTTTAAAG------------------AAA--TTCTAT-T-ACCGGTTTAT--TCA--TAAGTGGAAAA--AT-A-CG-CTA---A-------TAA--ATAATACAATA-------------------------------T--------------CTGGGCTGAATG-TACTC-ATCCGA---TTTTTTTAA---------ATT-GT------A-----A----------T------TGGGCCGACCCA--TTT---TTAGATA-ATCTG----A--AGACAAGCAGTAA-ATGACACGA---AAAAT--A--CTTT-TCC----A-AGAATAATATGTTTA-TA-C-G-TA-ACAT-T---TCAA-TGATTTGGCAGTACAG-TACTAGTAA-TACAT--TTACTAGA-GA-G-A-GCATTCACGCCTG-TTG-----------TG
gi|16 : tctgtctatacttacctgtatattccaacatattcatggtgga-GG-TAATTTCGGATTCTAAACGTTC-ATTTGTAA---AGACTT-T--GTT--ATTTGCATTTGGTCACATTATTTTAATTTGAT-GT--TTATTTATTTGTTCATTTTTT--TAT---A-TTTTTGATAGATTAAGTTTCTTACTTCCGT----TTATGGTTAGT-AA----CTTA----------------T-TG-GAGTTAGT--ATCC---------TTTG----------------TG-GGA----CGATACAC-TAAA-TTT-CCCCCCACCCCATACCGAAGAGAGATGGACGT-CGCTCCTGAG-CCGT-TGTAG-----TATTTTC-GGATTTTCTTTGTCGGAGAACAT----GAACCA--TTTAAGGTAAGATAGAGTAAGATGAGAG
gi|17 : aTA-------AGTACT-GTAC-----TAAGGCCG------AA-TAA-G-T--TTCTCCATTGAAATAAG-TG----A-CA-AAA--C-GAAGAGGCAAACAC--TAATCTATTTAATT--TC-T--CCTTTAAAGTAT-A--CATTTA-TATTTCACCAACATTTTCATGTCGACA------------------TATCAAGTCT----------------------ACCG---TG-----TTTTCAAT------------------AAA---TC-AT-TT------CTAT--TCAGCTAAGTGGGAAA--ATAA-CGTAGA---AGAA---CTAA--ACAA---AATA------------A----------------TT
gi|18 : CTAAATTA-GAAATTT--TTGT----T--T-GT-T--GCGG-------T----TTC-CC--GA----CGACCCCATT-GTTGAC-T--TCGTTACC-GA-CGTGAATCA---ATAC-T--T-TCT-------ATTTTG---A--TGT-TTG------------A----CGTACAGG--TTGAATATATCT---TTT--TTATATTTCGTTTCT-CTG-TT---TA-AC---CGATACCTGTGGAGCCGATTAAAT--T-----TATTTTCT-----GTGACAA-TT--C--ATACCCGAAACAC--A--AAAC-AT--TTTCCT--------ATTA---TG-AACAATT-C--TGA----T--TTTTTTT----C--AGCTA---AA--GGACT-A-------AGTATATCCTGAT-----TTaatatttatataatatatagaagatatctatctctccatccgatcctttttttttttttatcgtttcacatatgggtcaaaaatagtat
gi|19 : AACGGTC-A---TTGA---AATTT--T--GT---ATTC--ATTTG--TAT-T------CACT--AT-GC--TTGCTT-----T-CA--TTTT--TAT------T-------------------------CAT----TT-TG--TAGT-AG----AATA----------------TGAG-GA-----T--ATTCAG-----A-TT
gi|2 : tttgcatcagaaaacatatctttttgatgaggtttatgagCTAAATTA-AAA--TT--T-GT----T--T-GT-TT-GCGG-------T----CTC-CC--GAA--CCGACC----C-AGTAAA-T--TCGTT--C-GA-C-TGAA--A----T-C-T--T-T-T-------ACTT-----G--TATATT-------------A----C---CAGG--T--GATAT-TTT---TTT--T-A---TTCATT--T-CT--TT--GCG-AC---CGA-----------CCGA--AAAT-CT-----TA-TTTCT-----GC----A-TT--TT-A---CCG---CTC--A--AA-C-AT--TTT--TT-------AT-----CG-AA-A-TT-C--TGA----TATTTTTTTTT--TC--CGAT----TT--AGACT-ACAGCTGTAATAC-TCGT-GT-----TTTC---TAC-TTGTCCGCA-CGCAGCC--TCGGAG-CTGAGA-CACTTCCGAAT-----ACCG-------CATGTACACTGTACATAATATAC------------CAAT-CG-TCAG--CGA-CT--ATGA-A-A-ACGTGCCTTA--T----CATCGA---AA---GTA-TC--AT--TTT--A---ATTAT---AAGAATGCATAGTT-TCAATA--AAGT-GA-ATT--A-TTGAA---T--TTGCA------TTTA----GG---T-A-CGAAAT----TGTAG-CA-T--ACGGGG-GAGGA-GG-TTGA-A--GA-A-ATCG--T-AA----AG-ATA-TGCGAAAATTTCATA--T--ATCT--TTAGGCGGAA-CAA--------------AA-AACCA--T-GATTCAGACCCAA-CAC--CT-T-----GTC-----CGCA-T--ACAG----------------------------A--TGAA---TTAAAA-CAGAT-AA-G----TCGCT-GC------A-CTTTAT-GCAATTTGAAGATGC--A---T--CATACA-T-TAT-GC---AATACCAAC-CTGG-TATAGAAA-TAAGA-TACGCAGAATAAATATT-T-GCTCCA--AAAACGCATTCATCATG-G-C-GGCTAAT----G-ATC-AAACGTTC-A---GTGA---AAG----T--GTGTAATT---A-TTG--CACAT------AATG--AG-A----TA--------TTCA--TTTT----T---A-TT-------------------------CGT----TT-TG--TAGT--A----ACTA----------------T-TG-GA-----T--ATTCAG-----A---TG----------------TG-GGA----CAAT--AC-T-AATTTT-CCC----CTCCAAAC----GATAG-TGGACAT-CGC----GAG-CCGT-TAT--------A-TTTC-----------TA-----------------------TTTAAC---CGAGAGA-CGAGA-AA------TTAAATAATGT--------------------TGAG-----A-ACCC---------------TACACA---CTGTG-A-AGA-GAAG-AT-------------------TT-CATTT-----CAG-TTTGTT-GGT-AG-AC-AAAATACC-GAAC--ATCGTAAATTCAT-ATATAGACCCAGT-----------CC--TGCCTATCTCAATCACAACGATGGCCTTTTGC-TTCAATGA----CC-AC-T---------------T-GA-TTG---TTGAAATATGATC---------GA-ATAAAC------------ACA--CTG----AA----TCGGT--ACGAACGTGAGGGTATGC-A----------ACCGCAAATA-----TTTTTTAAATCCC-----------------AAAG---TTCAA-CAA----GCCTGCACTTTGC-TGCAA-TTGTAAAATAAAAG--ACGTGGAAAGTGTTC-ATGTTAATATTGAAATAAACACCGG--TGATCATGATGC---CATATCACTCAGCCATAGTA-------AATACCCGTAA----GT-ATACCA------AAATAAG-----TTCT-TATCGAAATAAG--GCATGA-CATAAAT-CTGCAGAGGCAAACAC--TAATCTATTT--TTA-CC-TTGCCTGT-AAG-ATAA--C-TTTA-TATTATA-C-------------CAACATTTCATGTTAATATAAAGT--------T----------------------ACCGC-TTG-----TTTTAAAG-------------------AAATTTCTAT-TTATCG-CTTAT--TCAGTAAAGT--GAAA--AT-A-CG-ATACATA-CA---TGGA--ATAACA-AATAAATTTATTATCTA----------------TTT--------------CTTGACTGAATGATA-CC-A-CCGACTTTTTTTTTAATATGGCGT-ACTAGT------A-----ATTAGTAGAGTT--T--ATGGACCGA--C---CAA---TTAGATGCATAT------ACAG-CAA---GCAA---GACACGAAGAAAAATACA--CTTT-TTCTTC-A-AGAATAATATT--------T-ATTACACATGT---TCAATTGA-TT----GCAC-GCTACTAGTAATTACAT--TTAC-ATATTATGTA-GCCT--ACAACTG--CG-----------TGAT--AATTTACATGA---G-TT--GCGACGTCAAAAA-CGGT-CA---TG-G-----TG-AC---TTAAAA-CTTGGA----CAGA------AAA---------A-----------TAACTT----TTAT--GG-TTGTGCGCTTGCGACCCTCCG-------------CCC-----CCCCCCCCCTCCCCCCC-CT-C-CACGCCCCCCCCCCCCTCACTTTAAGTTTGAATT--------------G-CTC-------AC-AAAA-CACAATAAT-ATTACGATATA--T-TTGCGC-AAG--TT---T-----AAGATACA--AAACA--ACAG-T-ACAT-A-AATGTT-TATT--ATA-ATA-TCTGTATATGCATC-A-C-AAAGCA--T--A-C-AGACAAAA--CT-ATATC---ATTATC-----AAA-TAAGA--TA--TTTTAT--CGagctccgtaaatacatttataaacggtgagacaaaactaattttattcgtattgttgagtagacaagcgtgacccattatatttttttcaacatttgataaagaacaaatttaat
gi|20 : GCACCTA-CAAAAGCAG-TTTA-C-AGAT-AAAA-CTAATATCAT-GG-ATCAAAT-AAA-TAAAA--TA--TTTTAT--CGACC--TA--CCTACCCAGAGAAA--AAATAAG-TTC--CTACTAGAAG----TTATTT-TTT-----GCTTA------------------G--AAAAAT-AAATA-TTTA---C-CTAC-CTA---CCGACCTAA-CGTCCGTAAAT-C-GGCG-TCG-GAAAAA-GG--GCAAACAAACAAT--TTTTTCATTTtaaaatttatcacaaatgaaaattcttctataaacaaaaaaatttatttcttataaaaaatggtaaaaata
gi|21 : ATTTCAC--TT--TATA-TATAGA-GCAC--ACAACTGGCTGGGGTAAACCTCTGATGAAATTTACATG-GGAG-TT--GCAACATTAAAAA-TGGT-CAT--TG-G-----TG-AC---CT-GAA-CTTACACCC-CAAA------AAAGGGTGATTCA----------TTTAGTCCA--TTATTGGA-TCATGTA------------TA-------------CCC-----CCta
gi|22 : GCACCTA-CAAAAGCAG-T--A-C-AGAT-AAA--ATAATATCAT---TATCAAATAAAA-TAAAA---A--TTTTAT--CGACC--TA--CCTACCCAGAGAAA--AAATAAG-GTC--CTAC-TGAAG----TTA-TT-TTTG----GCTTA------------------G--AAAAATAAAATA-TTTA-----CTAC-CTA---CCGACCATA-CGTCCGTAAAT-CGG--G-TCG-GA-AAA-GG--GCAAA-AAACAAT--TTTTTCATTTAaactttctggattagaattccagggaaaaatttgcacacaat
gi|23 : ACGATGGCC--CTGC-TTC-ACGA----C--AC-TGGCTTATCTATGGTCT-GA-TTAGTTTTG-AACATGGTCATCGATTGAGAGATAAACCCCATGTCCAAAACT--CTATCCTGA----TCGGTATCCGAACGTAAGG-TA-GC-ACAAAAAATATACCG-AAATATT-TTATTTTTA
gi|24 : AAAA-AAA-AAAAA--TAATCTTTAT--CGACC--TA--CCTACCCAGAG--A--AAATAA---AC--CTAC-TGAAG----TTATTT-TTTG----GCTTA------------------CA-AAATA-AAAATATTTAA---T----C-CTA---CCGACCCTA-CGTCCGTAAATGC-G--GTTCG-GA-AAA-GG--GCAAACAAACAA---TTTTTAATTTAc
gi|25 : AAT-AAAATAAAA--TACTTTTTAT--CTAC---TA--CCTACC-AGAG-AA--AAATAAG-GGC--CTACT-GAAG----TAATTT-TTTG----GCTGA------------------GA-AAAA-TAA--T-TTTTA---C-CTAC-CTA---CCGACCTTA-CTTTCGTAAAT-CGG--G-TCG-GGAAAA-GG--GCAAACAA
gi|26 : AAAT---AAC--TT--GTGT----TATT-GTGTT-GCGG-------TATATTTC-CCACGA---CCGACCC---T-AGTAAA-TTATC-TT-GC-GA-C--GAA--ATATAT-CAT--T-A-T-------ATTTTTGTGG--TAT-TTTTAGAACATCCTGA----C---CACA-----AATAT-CTT---CTTTATTT---TTCATT--T-CTG-tttt
gi|27 : AGCGCTC-A---TTGA---AAATTT-T--GT---ATT---ACATA--CATGT------A------T-GT--TTA----------CA--TTTT--TATTCGG-TT-------------------------TTT----TT-TT--TAGT-AA----CTTA----------------TGAG-GA-----T--ATTTAG-----A-TTT
gi|28 : gatgggaatttaaggacT--AGTTTACATGCAG-G-TTCAGCGCTGTCAAA---CGGT-CATTCTG-GGAGCATG-TCCCTTT-GA----TAGA----TAGT------ATATT-------A----------TTAA--T----TTAT-----TTGTACA------------GA-------------CAC-----CCCCCCCCCC---CC-C-TT-C-cctctttccgtaaacacatttgctaaacgat
gi|29 : -AATAAACACCGGGATG----------------A----TCAGCCATAGTA-------AATA-CCATAC----GT-ATACCGAAAAAAAAATAAAGATAATTCTTATTCG--ATAAGTTGCATGATTA-AAA--C-----AGGTGAAT-------TCTATTT--TCA-Cccccgggccttgtaat
gi|3 : aGTGGAAAGTGTTC------------G-AATAAAC-CCGGAATG-------------CACA----TCAGCCATAGTACATGTTAAGTAACC-TAGTTTGGTAGTTACG------AAATAAAG-T--TTCTCCATCGAAATAA----------------------AGTGACAAACA---TAATCTTTTT--TTA-CC-GTTCCTTT-AAAAAT-A--C-TTTAATATTATACC--------------GACA------------------T--------T----------------------TTCATGTTGAATATTTTTAAAGTTCCGCTGTTTTCAATTAAGAATTTCTATCTTACCG-CTTAT--TCAGTCAAGTAGGAAAATAC-ATCG-ATA---A-A-----TAA--ATGATACAATA------------AACTCTATTTATCTATTTTT--------------CCTGACTAAATG-TACCCCA-CCGAC-TATTTTC--ACATGG--T-ACTAGTTAGTAAA-----G----------T--TTCATGG-CCGA--C---TGAGTTTTAGATACATATGCCATAA-GGGCA-G--GCAAATTGCAACGAAG-AAAGTACA--CTTTATTCTTCAA-AAAAT----TTTTTT-T-----TTATACATGT---TTAATTT-TTT----GCAC-G-TACTAGTAATTATAT--TCA---TG-TATGCA-GCA---ACAAC-G-C-G-----------TGAT--AATTTACATGCAGCG-TT--GAGACGTCCAAAA-CGGT-CAT--TG-G-----TG-AC---TT-GAACCTTGAA--CACAGA------AAA---------AAGCGATACT-CTAGTTT----TTAT--GG-TTGTGTG------------TAAACAACAGAACACCCC-----CCCCCCCCCC---CCCC-TT-C-CAGGT---------------------TTTGAATTCCTGGGAGGAAAACG-TTC-------AC-AAAA-CAAGATAA--CATACGG-GTA--ATTT--GC-AAG--TT---TACA--AAGAGATA--AAA-A-----------AC-A-AA---A-TATA--ATATCTG-CATACA------------AAAAGCAG-T--A-C-AAAC-AAA--
gi|30 : ATGA----CCA-C-T---------------C-GA-TTC---GTG-AA-ATGGTA---------GA-ATGA-C------------ACA--CTG----AA----TCAGT--CAGAACATAGGGAAATGC-A----------ACCG-AAAAAAA------ATTGACTCCC-----------------AAAG---atttat
gi|31 : TATG---ATTGAGAGAGGA-ACCCC-----TAAAACTACCATACATTTCTGTG-ATATATGAAAAATG---AATACGGGGCGATGATT-CATTT-----CAGTTTTGCT-gaa
gi|32 : aTCT--TAT---T-TT-------------------------CGT----TT-T---T-GT-AA----ACTA----------------TGTG-GA-----T--ATTCA------A-TTTGTTATCTATAAAT----TGTGGA----CGAT--AA-T-AA-TTT--TT----CTCCAAAC----GACAt
gi|33 : AATTA-AA--------TGT----T--T-GT-TT-GCAG-------T----TTC-CC--GA---CCGACC----C-AGTAAA-T--TCGTT-TC-GA-C-TGAA--A---AT-A-TAAT-T-TAATTCACATTT-----G--TAT-Tt
gi|34 : --CGA-CT--ATAA-A-GGACGTG-CTT---TCA---GTCAA---AA---GTA-TC--AT--TTT--A---A-TAT---AA-AATACAT-GTT-TC-ATA--AAGTCAA-AT
gi|35 : ATT--G-CTG-TT--GCG-AC---CAA-----------CCGA--AA----------TA-T------------------------A---CCA---CTC--A--AAAC-AT--TTT--T--------AT-----CG--A-AATT-C--T
gi|36 : T-C-G--G-GTG-G--CAA-CA--GCAAACAAACAAT--TCTTTATTTTA
gi|4 : tcgggAATTA-AAT--TTCATTGT----T----GT-TT-GCG--------T----TTC-CG--AA---CCGACC----C-AGTAAACT--TCGTT-CC-GAAC-TACA--A---AT-C-T--T-T-T-------ATTT-----G--TAT-TT-------------A----C---CAG----------T-TAT---TTT--TTA---TTCATT--T-CTG-TTTGGCG-ACAAACGA-----------CCGA--AA-T-CT------A-TT-CT-----GC----AATT--T--A---CCG---CT---A--AAAC-ATGTTTT--T--------AT-----CG-AA---TT-CACTGA----T--TTTATCTT--TC--CGATTATTAA--GGACT-A-------------------T-----TGTC---TAC-TTGCCCGAA-CGCA-GCAAT-GAAG---GAGA-CACTTCCAAAT-----ACTGCATGA--CAT--------------A-ATAC------------CAAT------------------ATAACA-A-ACGAG-ACTA----AT-CATCAA---AA---GTA-TC--AT--TTT--A---A-TAT---AA---TGC-TAGTT-TC-ATA--AAGT-AA--TGA-A-TTGAA---T--TTGCA------TTTA----GG---T-A-CG-AAT----TGCAGTCA-T--AAGGGG-CAGGA-GG-TTGACAG-GATA-ATCG--TCAA----AGAACA-TGGAAAAGTATCATA-----ATTT--T----CGGGACCAAAAACAAACAAACATAA-AACCA--CGGATTC-GACCCAG-AACAACT-T-----GTC-----CG-ACT--ACAG-AGAT---------CGAGAATCGGT-T-A--TGAA---TTAAAGCCAGATC-A-GTTTTTCTCTAGCGCCAAAA-CTTCGT-GCA--TTGAAGATTCCAA---T--TATACA-TGCAT-GTCT-ACTCCAAA--CT-GTCATGGAAA-CAAAA--ATACAG-ATGAATA---C-GTTCCAATGAAAgg
gi|4 : AT----GAAT----ACGTTCCA---ATGA---AAGATT-T--GT---AGC---TGTTG--CACAT------AATC--AT-------ATTT-----TTGA--TTTG--AA----A-C-------------------------------------A--TAGT-AA----ACTA----------------TG-G-GA-----T--ATTCAG-----ATTTTGTCTATTTATAAATTGTTG-GGA----CAAT--A----AA-TTT---T----TCCCAAAC----GATgatttgtagctgttgcacataatcatatttttgatttgaaacatagtaaactatgggatattcagattttgtctatttataaattgttgggacaataaatttttcccaaacgat
gi|5 : aattaaatttcattgttgtttgcgtttccgaaccgacccagtaaacttcgttccgaactacaaatcttttatttgtatttaccagttattttttattcatttctgtttggcgacaaacgaccgaaatctattctgcaatttaccgctaaaacatgtttttatcgaattcactgattttatctttccgattattaaggactattgtctacttgcccgaacgcagcaatgaaggagacacttccaaatactgcatgacataataccaatataacaaacgagactaatcatcaaaagtatcattttaatataatgctagtttcataaagtaatgaattgaatttgcatttaggtacgaattgcagtcataaggggcaggaggttgacaggataatcgtcaaagaacatggaaaagtatcataattttcgggaccaaaaacaaacaaacataaaaccacggattcgacccagaacaacttgtccgactacagagatcgagaatcggttatgaattaaagccagatcagtttttctctagcgccaaaacttcgtgcattgaagattccaattatacatgcatgtctactccaaactgtcatggaaacaaaaatacagATGC--A---T--TATACAATGTAT-GCCT-ATAACCAA--CTGGTTATAGAAA-TCATA-TAC-CAGATTCAATATTAT-GCTCCAGCAAAACGCTATCACCATG-GGCAGG-TAAT----GAATC-AAACGTTC-A---GTGACAGA------TTTGT---ATTT--ATTTG--CAC-T------AATC--AT-GTATTTATTTATT--TTCA--CTCTCTTAC---ACTT-------------------------CGTCATTTT-CG--TAGT-AAAGTGACTAACTGAATCGAATGTTGTGTGCGG-----TGAATCGAGGGGGTA-ATTG----------------TG-GGAAATATGAT--ACCT-AA-TTTTCCC----CCCCAAAC----GATAG-TGGACATGCGC----GAGGCCGT-TAT----------TTTC-G--------TTC--AAA-AACATGAA-----CATTTTAACG---AGAGAGAGAGAGA-GAGAG---------AGCG-----CATTAAATATGAAGTTTGAG---GAATACCCCAGGTACA-------CACACA---CTGTGAACAGA-GAGGAAGGAGAAAAACG----AATG------------------TTTGTT-GGT-AGAACAAAAATACCAGAGTA-ATCGTCAG-TCGTATCACAAACCCAGTTACAACTGCACCTG-TA-CTACCT-AATCACAACGATGGCC--TTGC-TT-CATGACACCCCATCGT---------------TAGATTTG---TTG-AAAATGGTC---------GA-ATGAAC------------ACACCCTG----AATAATTTGGT---CGAATGTAGGGATATGCAA----------ACCG-AAAT-TATTTTTTTTTTACTCCCCAATAGTGTAGTTTGTTAAAGTATTCCAACCAA----GCGTG--CTTTGCTTGGAACCTGTAAAATACAAGC-ACG-GGAAAGTGTTC-
gi|6 : TAAATTTTAAA--TT--TTGT----T--T-GC----GCGG-------T----TTC-CC--GGGACCCGACC----TCAGTAAA-T--TCGTT-TC-GA-C-TGAA--A---AT-C-T--T-CCT-------ATTT--------TAT-TT-------------A----C----AGG--T--G-TAT-TGT---TTT--TTA---TTCATT--TTCTG-TT--GCGGAC---CGA-----------C-------AT-CTCCCTCTC-TCTCTCAATGAC----A-ATAAT--C---CTG---ACC--T--AAAC-AT--ATA--T--------ATATATTCATAA-AATT-C--TGA----T--TTTTTTTTTACC--CAAT----AA--GGACT-A--------GTGG-TCCTAGT-----TTTC---TA---TGTCCGCATCGCA-GC--TCGGAGACTGAGA-CACTTCCAAAT-----AC---------CGC--------------ATGTACATTATTACTACTCCAT-CG-TCAG--CGATCT--ATAA-ACA-ACGTT-CTTA--TCAT-CGCCTAGTTAC---GTG-GC--GTGCTTT--ACCTA-TATGAGAA-GATGCATAGTT-TC-ATTT-AAGT-AA-ATGAGA-TTGAA---TGATTGCA------TTTAAA--GG---TTA-CGAAATGTCTCGTAG-GA-T--AAGGGGAGAAGA-GG-TTTA-AG-GA-ATATCG--T-ACCCCCGG-ATA-GGAAAAAGTTTCATA--T--ATCTTCTTAC-CAGGA-CAA--------------AACAAACA--TGCATTCAGA-CCAA-CACAACTAT-----GTCGGGTGCG-A-T--ACAG-AGATAATGA----TGAG-ATCGGTTT-A--TGAA---ATTAAACCAGATCAACG----TCGCT-GC------AGCTTTGT-GCATTTTAAAGATTC--A---TAGTATAC--TGTATGGCCTAATTACCAAGGCTGGTTATAGA
gi|7 : -CTTCGTAGCAATTTGGAGATGC--AAATT--CATACA-TGTAT------ACTGTCG--------TATGGAAAATAATAATACGAGAAATGAATATTCT-GCTCCAGCAAAACGCCATCGACATG-G-C-GG-TAAT----GAA------CGT-C-A---GTGA---AAAGATTT--GT---ATT---ATT-G--CACAT------AATC--ATTAT--TTATTT-----T-CG--TTTA---AT---A-TT-------------------------CGT----CTGTG--TAGG-TA----AC-A----------------TGTG-TA-----T--ATTCAG-----A-ATTG----------------TG-GGAA---CGATT-AC---AA-TTT-TTC----C---AAAC----GATAG-TGGACATGTGC----GAG-CCGT-TA--------CA-TTTC-G--------TTA--AAAGAACCTAAAAGAACCATTTTTAAG---AGAGAGAGGGAGA-AAGAGCACTT-AATAACGTTTGTCAATTCGTGT----TTCGAG---GAA-ACCTA-----CA-------CATACA---CTGTG-ACAGA-AGAGA------AAACCG---CAATAATTACATTTTGAAGCAGTTTTGTT-GGTCAG-AC-AAAATA----AATA-AT----AA-TCGT-TCACAGACCCAGT-----------CCGTTG-CTGTC----CCACAACGAAAGGC--CTGC--TCCATGA----CC-AC-T---------------T--A-TTG---TTA-GAAATGGTT---------G--ATGA--------------ACA--CTG----AA----TCAGTCCCCGAACATAGGGACATGC-A----------ACCA-AAAT-CA--TTTTTTTAACTCCA-----------------AAGG---T
gi|7 : -----------------AAAGAT-TTCAG-CAACGCTGCATGCACTT-GCTTGCAA-CTGTGAAATACAAGCAATGTGGGAAattaaactggttccataagcaatattatgtaaagatttcagcaacgctgcatgcacttgcttgcaactgtgaaatacaagcaatgtgggaa
gi|8 : cttcgtagcaatttggagatgcaaattcatacatgtatactgtcgtatggaaaataataatacgagaaatgaatattctgctccagcaaaacgccatcgacatggcggtaatgaacgtcagtgaaaagatttgtattattgcacataatcattatttattttcgtttaatattcgtctgtgtaggtaacatgtgtatattcagaattgtgggaacgattacaatttttccaaacgatagtggacatgtgcgagccgttacatttcgttaaaagaacctaaaagaaccatttttaagagagagagggagaaagagcacttaataacgtttgtcaattcgtgtttcgaggaaacctacacatacactgtgacagaagagaaaaccgcaataattacattttgaagcagttttgttggtcagacaaaataaataataatcgttcacagacccagtccgttgctgtcccacaacgaaaggcctgctccatgaccacttattgttagaaatggttgatgaacactgaatcagtccccgaacatagggacatgcaaccaaaatcatttttttaactccaaaggtattaaactggttccataagcaatattatgtAAATTA-AAA--TT--TTGTATACT--TAGT-TTAGCGAGTCAGATT----TTCTCC--GA---CCGACC----C-AGTAAA-T--TCCTT-TCCGA-C-TGAA--AG--AT-C-T--TGT-T-------ATAT-----GGGTAT-TT-------------AGACGC---CAGGGGTA-GATCTATTTACATTT--TTA---TTCATT--T-CTGCTT--GCG-AC---CGA-----------CCGA--AATT-TT-----TA-TTTCT-----GC----AGTT--T--A----CG---CTC--A--AAACTAT--TTTA-TGTCCATAAAT-----CACAA-AGTTCC--TGAATTTT--TTTTTTTT--TCAGCTAT----AATCGGACTAA-------AGCA--TTCTAGTTATTATTTCCATTACCTT-CCCGCA-CGT-AGC--TC-GAG-CTGAGATTACTTCCAAATGTGGAACGCAATGTAACAT--------------ATAT-C------------CCAT-CATTCAGTCTGA-CTCAAT-A-A-A-CCGTG-CTTAATTCAT--ATCAA---AAAAGGTA-GC--AT--TTTTAA---A-TATGA-AA-AATGCATAGTTATC-ATAATAAGT-AATATGA-ATTTGAATATT--TTGCAGAACGTTTCAAATTGGGGTT-ATCGAAA-----TGT-G-CA-T--AAGAGG-GAGGATGGTTTGA-AGAGG-A-ATCGTTT-AA----GA-GTAGTGGACAAG-TTCATAAGTAAATCT--TTA--CGGGA-C-A--------------AC-AACCT--GGGGTTCAGTCCCAAGCAGCACT-CATAAGGCC-----CG-A-TAAACAG-AGATAAATGAATGTGAGAATCGG--T----TGAATATTTAAAACAAGATCAA-G----TC
gi|9 : gccta--CTGCAGAGGCAAACACACTA-TCTATTT--TTAACCATTGC-TGT-C-GTAT-GAGC-TTTA-TATTATTAC-------------CAACA------------------T--------TTTCATGGTTGATTAATTAAGCTACCGT-TTG-----TTTTAAAG------------------AAAATT---ATATTA-----TTATCATCG--CAAGTGGGAAA-TAT-A-TG-ATA---A-AATAACTAATAGTAATACAATA------------A----------------TTTATTTATCTATTTTACCAGACTGACTG-TACCC-A-CCGAC-TTTTTTTTCATATGG-GTTACTAGT------ATTGGAG----------TCTT--ATGGGCCGA--CAGATG----TTAGA---ATAT-----AACATACAAG--GCAA-TTGACACGAAG-AAAATACAATTTTT-TTCTTCAAGAAGATAATATCTTTT-TA------AAACATGA---TCCATTGATTT----GCAC-G-TACTAGTAATTACA---TTACTATA-TATGTAGGCAT--ACAACTG-CCG-----------TAAT---ACTGACACGAATAG-TTG-GCGACAT--AAAA-CGGTCCAT--TG-G-----TG-CC---TT-AAG-CTTGGA--C-C--G------AAA---------A----------TTAAGTT----TTAT--GGTTTGTGCG------------TA-------------CCCTCCCTCCCCCCCCTT---CCACTTT-C-TACG----------------------TTTG-ATT--------------GCCTCA------AC-AAAA-CACAAcc
Alignments
lowQualScore : 111111111111111111111111111111111111111111111111111 1111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 1111111111111111111111111111111111111111111111
lowQualScore : 111 1111111 111 111111 111 1111111 11111111 222222222222222222 11111 11 22222222222 11111 222222222222222222222222 2222222222222222222222 2222 1111 11111111 11111 111 1 11 11 11111 7777777777777777777777777 222222222222 1 111 1 11 111 11 11 111 111111 2222 111 1111 11 11 111 2222222222 11111 11 33333333333333 11111 11111 333333333 2222222 111 1111 111111 111111111 111111 1111 111 11 1 111 1111111111 1111 1 1111111 111111 1111111 55555555555555555555555555555555555555555555555555 2222222222222222 11111 11111111 6666666666666666 1111 1111111 11111111 1111 1 1111 111111111111111111111111111111111111111111111111111 111 555555555555555555555555555555555 111 444444444444444 111 2222222222222222222222222 22222 1 1 1 1 11 2 1 44444444444 11 1 11 11 111 4444444444444444444444444444 111 222222222 33333333333333 1111 1111 222 2222222222 33333 44444444444444444 222 1 2222 1 11 5555555555 1 777777777777777777777 2222222 11111111 222222 111111 333333333333333333333 111 1111 5555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555 11 11111 444444444444444444 1 111111111 22 44444444444 0000000000000000000000000000000000000000000000 1 1111 77777777777777777777777777777 555555555555 1 22222222 1111 11 1 11 1 22222222 111 1111 22222222222 22222 11 11111 11 1111 111111 666666666666666666666 1111 11111 3333333333333333333333333333 11111 1111 5555555555555555555555 44444444444444444444444444 111 1111 2222222222 222222222222222222222 111 111 111 11 11 11 1111 1111 444444444444444444444 11111 11 22
lowQualScore : 5 000 66 9999 55 4 4 77 3333333 8888 4 99 111 333333 4 55 88 4 4 77 55 111 4 4 55 4 8 3333333 77777777 4 999999999999999999 777 55555 00 777 66 777 55 4 4 66 4 777 55555555555 66 6 44 11111 4 000000000000000000000000 777 66 66 4 66 2222222222222222222222 444 8 66 2222 66 9999999 5555 66 5 99999999 99 88 22222 000 5 5 99 77 4 5 22 44444 4444444444444444444444444 5 0 999999999999 5 5 66 5 66 0 5 5 0 5 666 8 888 888 5 11 66 66 888 88 555 5 5 55 11 00 5 999 000 77 666666 0000 000 5 5 2222 5 5 33 5 00 5 77 5 555 7777777777 5 5 33333 5 77 33 5 33333333333333 5 77 0 0 5 1 5 44444 44444 5 5 77 5 777777777 1 3333333 000 1 0 5 2222 6 999999 5 8 77 222222222 6 222222 1 0000 2 1 88 1 88 6 0 1 0 888 66 1 44 0 222 8 5555555555 5 888 5 6666 5 0 9999999 66 3 444444 777 4444444 11111111111111111111111111111111111111111111111111 9999 99999 4 9999 9999999999999999 33 4 11111 66 11111111 7777777777777777 5 7777 8888888 5 77777777 1 2222 8 0 7777 8 8 000000000000000000000000000000000000000000000000000 444 33 8 2 888888888888888888888888888888888 444 8 888888888888888 444 8 8 8 5555555555555555555555555 00000 5 8 0 0 0 2 0 33 2 3 0 0 77777777777 22 0 22 11 0 333 6666666666666666666666666666 6 111 6 7 666666666 6 55555555555555 99 4444 4444 000 4 6 9999999999 6 00000 66666666666666666 000 0 1111 1 2 3 3 0 22 0 0000000000 0 3 6 222222222222222222222 6666666 5 3 99999999 333333 0 0 888888 77 0 000000000000000000000 111 3 99 6 8 0 8 0 6 3333 8 6 7777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777 00 66666 999999999999999999 1 3 444444444 99 999 1 22 6 6 6 44444444444 99 1 2 5555555555555555555555555555555555555555555555 1 8 0 8 8 8 11 3 6666 0 99999999999999999999999999999 3 444444444444 0 0 88888888 3 1111 44 0 8 0 11 6 0 5 8 0 88888888 5 1 111 7 66 4444 777 0 888 22 5 3 5 9999 1 666 33333333333 66 5 99999 11 5 5 66 5 22222 5 888 5 00 9999 444444 333333333333333333333 4 7777 11111 9999999999999999999999999999 11111 2222 3 5 5 5 6 6666666666666666666666 77777777777777777777777777 5 5 4 777 1 5555 99 6 99 1111111111 1 99 777777777777777777777 6 000 99999 55 3333 6 3 5 77 66 5 5 5 222 5 0 444 8 4 66 66 66 66 66 22 66 66 66 55 0000 5 0000 0 444444444444444444444 3 3 22222 5 888 5 2 0 4 8 00 8 4 11 4 66 777 0
lowQualScore : . ... .. .... .. . . .. ....... .... . .. ... ...... . .. .. . . .. .. ... . . .. . . ....... ........ . .................. ... ..... .. ... .. ... .. . . .. . ... ........... .. . .. ..... . ........................ ... .. .. . .. ...................... ... . .. .... .. ....... .... .. . ........ .. .. ..... ... . . .. .. . . .. ..... ......................... . . ............ . . .. . .. . . . . . ... . ... ... . .. .. .. ... .. ... . . .. .. .. . ... ... .. ...... .... ... . . .... . . .. . .. . .. . ... .......... . . ..... . .. .. . .............. . .. . . . . . ..... ..... . . .. . ......... . ....... ... . . . .... . ...... . . .. ......... . ...... . .... . . .. . .. . . . . ... .. . .. . ... . .......... . ... . .... . . ....... .. . ...... ... ....... .................................................. .... ..... . .... ................ .. . ..... .. ........ ................ . .... ....... . ........ . .... . . .... . . ................................................... ... .. . . ................................. ... . ............... ... . . . ......................... ..... . . . . . . . .. . . . . ........... .. . .. .. . ... ............................ . ... . . ......... . .............. .. .... .... ... . . .......... . ..... ................. ... . .... . . . . . .. . .......... . . . ..................... ....... . . ........ ...... . . ...... .. . ..................... ... . .. . . . . . . .... . . ...................................................................... .. ..... .................. . . ......... .. ... . .. . . . ........... .. . . .............................................. . . . . . . .. . .... . ............................. . ............ . . ........ . .... .. . . . .. . . . . . ........ . . ... . .. .... ... . ... .. . . . .... . ... ........... .. . ..... .. . . .. . ..... . ... . .. .... ...... ..................... . .... ..... ............................ ..... .... . . . . . ...................... .......................... . . . ... . .... .. . .. .......... . .. ..................... . ... ..... .. .... . . . .. .. . . . ... . . ... . . .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .... . .... . ..................... . . ..... . ... . . . . . .. . . .. . .. ... .
lowQualScore : 0 222 99 4444 55 0 0 22 0000000 5555 0 55 000 555555 0 55 99 0 0 11 55 000 0 0 55 0 0 0000000 66666666 0 333333333333333333 888 88888 88 888 11 888 55 0 0 11 4 888 66666666666 11 4 66 11111 4 333333333333333333333333 888 11 11 4 11 9999999999999999999999 666 9 11 5555 99 2222222 6666 99 0 55555555 55 22 55555 000 0 7 11 99 0 7 99 33333 3333333333333333333333333 7 1 333333333333 7 7 99 0 99 0 0 0 4 0 222 1 888 888 0 99 99 99 888 22 666 0 0 44 99 11 0 444 000 99 444444 0000 000 7 7 1111 7 7 66 7 00 7 44 7 444 4444444444 7 7 77777 0 99 66 7 66666666666666 7 99 7 7 7 4 7 33333 33333 7 7 99 7 111111111 4 0000000 000 7 7 7 1111 7 222222 7 0 00 000000000 7 555555 0 0000 5 7 88 0 88 4 8 4 8 000 44 0 55 0 000 0 2222222222 0 888 0 0000 0 0 5555555 99 2 444444 111 2222222 22222222222222222222222222222222222222222222222222 4444 44444 4 4444 4444444444444444 33 4 11111 11 44444444 1111111111111111 7 9999 1111111 7 11111111 7 1111 0 0 0000 0 0 444444444444444444444444444444444444444444444444444 000 22 0 2 222222222222222222222222222222222 000 0 222222222222222 000 0 2 0 2222222222222222222222222 00000 6 0 0 0 0 5 0 22 5 0 0 0 55555555555 55 0 00 00 8 000 8888888888888888888888888888 7 777 7 5 777777777 7 77777777777777 22 2222 2222 888 2 7 2222222222 7 77777 77777777777777777 888 0 2222 0 5 2 2 0 55 8 0000000000 0 2 5 555555555555555555555 0000000 0 2 66666666 000000 8 8 666666 88 8 222222222222222222222 777 2 22 7 0 8 0 8 0 0000 0 7 3333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333 33 77777 222222222222222222 7 2 888888888 22 222 0 22 7 7 7 77777777777 22 7 5 5555555555555555555555555555555555555555555555 0 0 0 0 0 0 44 8 8888 8 22222222222222222222222222222 2 888888888888 8 0 66666666 8 8888 00 8 0 6 00 0 8 6 0 8 00000000 2 0 777 3 33 2222 555 1 000 11 7 6 7 4444 4 999 88888888888 99 0 11111 99 0 0 99 0 55555 0 888 0 11 4444 444444 999999999999999999999 5 5555 44444 1111111111111111111111111111 11111 6666 1 0 0 0 6 4444444444444444444444 00000000000000000000000000 7 7 3 888 7 5555 22 7 22 8888888888 0 22 222222222222222222222 7 222 88888 22 7777 5 1 0 55 99 0 0 0 666 1 1 111 9 4 11 77 11 99 99 00 99 44 99 99 6666 0 6666 1 555555555555555555555 2 2 00000 0 888 0 5 1 4 9 66 9 4 11 4 11 000 2
consensus : CTAAATTA-AAA--TT--TTGT----T--T-GT-TT-GCGG-------T----TTC-CC--GA---CCGACC----T-AGTAAA-T--TCGTT-NC-GA-C-TGAA--A---AT-C-T--T-T-T-------ATTT-----G--TAT-TT-------------A----C---CAGG--T--GATAT-TTT---TTT--TTA---TTCATT--T-CTG-TT--GCG-AC---CGA-----------CCGA--AAAT-CT-----TA-TTTCT-----GC----A-TT--T--A---CCG---CTC--A--AAAC-AT--TTT--T--------AT-----CG-AA-AATT-C--TGA----T--TTTTTTTT--CC--CGAT----AA--GGACT-A-------AGTAC-TCCTAGT-----TTTC---TACCTTGTCCGCA-CGCAAGC--TCGGAG-CTGAGA-CACTTCCGAAT-----AC---------C---------------ATA-TATAC------------CAAT-CG-TCAG--CGA-CT--ATAA-A-A-ACGTGC-TTA--TCATGCATCAA---AA---GTA-TC--AT--TTT--A---AT-AT---AA-AATGCATAGTT-TCA-TA--AAGT-AA-ATGA-A-TTGAA---T--TTGCA------TTTA----GG---T-A-CGAAAT----TGTAG-CA-T--AAGGGG-GAGGA-GG-TTGA-AG-GA-G-ATCG--T-AA----AG-ATA-TGGAAAAGTTTCATA--T--ATCT--TTA--CGGGA-CAA--------------AA-AACCA--TGGATTCAGACCCAA-CACAACT-T-----GTC-----CG-A-T--ACAG-AGAT---------TGAGAATCGG--T-A--TGAA---TTAAAACCAGATCAA-G----TCGCT-GC------A-CTTCGT-GCAATTTGAAGATGC--A---T--TATACA-TGTAT-GCCT-ANTACCAA--C-TGGTTATAGAAA-TAANA-TACGCAGAATGAATATT-T-GCTCCAGCAAAACGCNATCGCCATG-G-C-GG-TAAT----GAATC-AAACGTTC-A---GTGA-AA-A--TTT-GT-ATT---ATTTG--CACAT------AATC--AT-GT--TTATTT-----TT-CAT----------TTT--T-AT---A----------------TTCGT----TT-TG--TAGT-AA----ACTA----------------TGTG-GA-----T--ATTCAG-----A-TTTG----------------TG-GGA----CGAT--AC-T-AA-TTT-CCC----CCCCAAAC----GATAG-TGGACATGCGC----GAG-CCGT-TATA------CA-TTTC-G--------TTA--AAAGAACATGAA-GAACCATTTTTAAG---AGAGAGAGNGAGA-GAGAGCACTT-AATAACGTTTGTCATTACGTATG---TTTGAG---GAA-ACCCC-----CA-------CACACA---CTGTG-ACAGA-GAAGAATG---AAAACG---CAATGATT-CATTT-----CAGTTTTGTT-GGT-AG-AC-AAAATACC-GAGTA-ATCGTAAA-TCGT-TCACAGACCCAGT-----------CCG-TG-CTATCTCAATCACAACGATGGCC--TTGCTT-CCATGA----CCAAC-T---------------T-GA-TTG---TTG-AANATGGTC---------GA-ATGAAC------------ACA--CTG----AA----TCGGT--CCGAACGTAGGGATATGC-A----------ACCG-AAATATA-TTTTTTTTAACTCCC-----------------AAAG---TTCAA-CAA----GCNTGCACTTTGCTTGCAA-CTGTAAAATACAAGC-ACGTGGAAAGTGTTC-A---TAAT-TTG-AATAAACACCGGGATGATCA--ATGC---CATA----TCAGCCATAGTA-------AATACCCGTAN----GTAATACCG------AAATAAAG-T--TTCTCCATCGAAATAAG-TGCATGA-CA-AAA--CTGCAGAGGCAAACAC--TAATCTATTT--TTA-CC-TTGCCTGT-AAGTAT-A--C-TTTA-TATTATACC-------------CGACA------------------T--------T----------------------ACCGC-TTG-----TTTTAAAG------------------AAAATTTCTAT-TTACCG-CTTAT--TCAGTNAAGTGGGAAA-TAT-A-CG-ATA---A-AA---CTAA--ATAATACAATA------------A----------------TTT--------------CCTGACTGAATG-TACCC-A-CCGAC-TTTTTTTTAATATGG-GT-ACTAGT------A-----G----------T--T--ATGGGCCGA--CA--TGA---TTAGATACATATG----AACAGACAAG--GCAA-TTGACACGAAG-AAAATACA--CTTT-TTCTTCAA-AGAATAATATTTTTT-TA-T-GTTACACATGT---TCAATTGATTT----GCAC-G-TACTAGTAATTACAT--TTACTATA-TATGTA-GCAT--ACAACTG-CCG-----------TGAT--AATTTACA-TGCG-G-GTT--GCGACGTCAAAAA-CGGT-CAT--TG-G-----TG-AC---TT-GAA-CTTGGA--C-CAGA------AAA---------A----------TTAAGTT----TTAT--GG-TTGTGCG------------TA-------------CCC-----CCCCCCCCCT---CCAC-TT-C-TANG----------------------TTTGAATT--------------G-CTC-------AC-AAAA-CACAATAAT-CATACGATATA--A-TT--GC-AAG--TT---T--A--AAGATACA--AAA-A--AAAG-T-ACAT-A-AATGTA-TATN--ATATATA-CATGTATATGCACCTA-CAAAAGCAG-T--A-C-AGAC-AAA--CTAATATCAT-ATTATCAAAT-AAA-TAAAA--TA--TTTTAT--CGACC--TA--CCTACCCAGAG-AA--AAATAAG-GGC--CTACTTGAAG----TTATTT-TTTG----GCTTA------------------GA-AAAAATAAAATATTTTA---C-CTAC-CTA---CCGACCCTA-CGTCCGTAAAT-C-G--G-TCG-G--AAA-GG--GCAAACAAACAAT--TTTTTAATTTA
Reference ( family-458 ) : CTAAATTA-AAA--TT--TTGT----T--T-GT-TT-GCGG-------T----TTC-CC--GA---CCGACC----T-AGTAAA-T--TCGTT-NC-GA-C-TGAA--A---AT-C-T--T-T-T-------ATTT-----G--TAT-TT-------------A----C---CAGG--T--GATAT-TTT---TTT--TTA---TTCATT--T-CTG-TT--GCG-AC---CGA-----------CCGA--AAAT-CT-----TA-TTTCT-----GC----A-TT--T--A---CCG---CTC--A--AAAC-AT--TTT--T--------AT-----CG-AA-AATT-C--TGA----T--TTTTTTTT--CC--CGAT----AA--GGACT-A-------AGTAC-TCCTAGT-----TTTC---TACCTTGTCCGCA-CGCAAGC--TCGGAG-CTGAGA-CACTTCCGAAT-----AC---------C---------------ATA-TATAC------------CAAT-CG-TCAG--CGA-CT--ATAA-A-A-ACGTGC-TTA--TCATGCATCAA---AA---GTA-TC--AT--TTT--A---AT-AT---AA-AATGCATAGTT-TCA-TA--AAGT-AA-ATGA-A-TTGAA---T--TTGCA------TTTA----GG---T-A-CGAAAT----TGTAG-CA-T--AAGGGG-GAGGA-GG-TTGA-AG-GA-G-ATCG--T-AA----AG-ATA-TGGAAAAGTTTCATA--T--ATCT--TTA--CGGGA-CAA--------------AA-AACCA--TGGATTCAGACCCAA-CACAACT-T-----GTC-----CG-A-T--ACAG-AGAT---------TGAGAATCGG--T-A--TGAA---TTAAAACCAGATCAA-G----TCGCT-GC------A-CTTCGT-GCAATTTGAAGATGC--A---T--TATACA-TGTAT-GCCT-ANTACCAA--C-TGGTTATAGAAA-TAANA-TACGCAGAATGAATATT-T-GCTCCAGCAAAACGCNATCGCCATG-G-C-GG-TAAT----GAATC-AAACGTTC-A---GTGA-AA-A--TTT-GT-ATT---ATTTG--CACAT------AATC--AT-GT--TTATTT-----TT-CAT----------TTT--T-AT---A----------------TTCGT----TT-TG--TAGT-AA----ACTA----------------TGTG-GA-----T--ATTCAG-----A-TTTG----------------TG-GGA----CGAT--AC-T-AA-TTT-CCC----CCCCAAAC----GATAG-TGGACATGCGC----GAG-CCGT-TATA------CA-TTTC-G--------TTA--AAAGAACATGAA-GAACCATTTTTAAG---AGAGAGAGNGAGA-GAGAGCACTT-AATAACGTTTGTCATTACGTATG---TTTGAG---GAA-ACCCC-----CA-------CACACA---CTGTG-ACAGA-GAAGAATG---AAAACG---CAATGATT-CATTT-----CAGTTTTGTT-GGT-AG-AC-AAAATACC-GAGTA-ATCGTAAA-TCGT-TCACAGACCCAGT-----------CCG-TG-CTATCTCAATCACAACGATGGCC--TTGCTT-CCATGA----CCAAC-T---------------T-GA-TTG---TTG-AANATGGTC---------GA-ATGAAC------------ACA--CTG----AA----TCGGT--CCGAACGTAGGGATATGC-A----------ACCG-AAATATA-TTTTTTTTAACTCCC-----------------AAAG---TTCAA-CAA----GCNTGCACTTTGCTTGCAA-CTGTAAAATACAAGC-ACGTGGAAAGTGTTC-A---TAAT-TTG-AATAAACACCGGGATGATCA--ATGC---CATA----TCAGCCATAGTA-------AATACCCGTAN----GTAATACCG------AAATAAAG-T--TTCTCCATCGAAATAAG-TGCATGA-CA-AAA--CTGCAGAGGCAAACAC--TAATCTATTT--TTA-CC-TTGCCTGT-AAGTAT-A--C-TTTA-TATTATACC-------------CGACA------------------T--------T----------------------ACCGC-TTG-----TTTTAAAG------------------AAAATTTCTAT-TTACCG-CTTAT--TCAGTNAAGTGGGAAA-TAT-A-CG-ATA---A-AA---CTAA--ATAATACAATA------------A----------------TTT--------------CCTGACTGAATG-TACCC-A-CCGAC-TTTTTTTTAATATGG-GT-ACTAGT------A-----G----------T--T--ATGGGCCGA--CA--TGA---TTAGATACATATG----AACAGACAAG--GCAA-TTGACACGAAG-AAAATACA--CTTT-TTCTTCAA-AGAATAATATTTTTT-TA-T-GTTACACATGT---TCAATTGATTT----GCAC-G-TACTAGTAATTACAT--TTACTATA-TATGTA-GCAT--ACAACTG-CCG-----------TGAT--AATTTACA-TGCG-G-GTT--GCGACGTCAAAAA-CGGT-CAT--TG-G-----TG-AC---TT-GAA-CTTGGA--C-CAGA------AAA---------A----------TTAAGTT----TTAT--GG-TTGTGCG------------TA-------------CCC-----CCCCCCCCCT---CCAC-TT-C-TANG----------------------TTTGAATT--------------G-CTC-------AC-AAAA-CACAATAAT-CATACGATATA--A-TT--GC-AAG--TT---T--A--AAGATACA--AAA-A--AAAG-T-ACAT-A-AATGTA-TATN--ATATATA-CATGTATATGCACCTA-CAAAAGCAG-T--A-C-AGAC-AAA--CTAATATCAT-ATTATCAAAT-AAA-TAAAA--TA--TTTTAT--CGACC--TA--CCTACCCAGAG-AA--AAATAAG-GGC--CTACTTGAAG----TTATTT-TTTG----GCTTA------------------GA-AAAAATAAAATATTTTA---C-CTAC-CTA---CCGACCCTA-CGTCCGTAAAT-C-G--G-TCG-G--AAA-GG--GCAAACAAACAAT--TTTTTAATTTA
gi|1 : CTAAATTA-AAA--TT--GTGT----T--T-GT-TT-GCGG-------T----TTC-CC--GA---CCGACC----T-AGTAAA-T--TCGTT-GC-GA-C-GGAA--A---AT-C-T--T-T-T-------ATTT-----G--TAT-TT-------------A----C---CAGG--T--GATAT-TTT---TTT--TTA---TTCATT--T-CTG-TT--GCG-AC---CGA-----------CCGA--AAAT-CT-----TA-TTTCT-----GC----A-TT--T--A---CCG---CTC--A--AAAC-AT--ATT--T--------AT-----CG-AA-AATT-C--TGA----T--TTTTTT----CC--CGAT----AA--GGACT-A-------AGTAC-TCCTAGT-----TTTC---TAC-TTGTC-GCA-CGCAAGC--TCAGAG-CTGAGG-CACTTCCGAAT-----AC-------------------------ATA-TATAC------------CAAT-CG-TCAG--CGA-CT--ATAA-A-A-ACGTGC-TTA--TCATGCATCAA---AA---GTAATC--AT--TTT--A---A--AT---AA-AATGCATAGTT-CTA-AA--AAGT-AA-ATGA-A-TTGAG---T--TTGCA------TTTA----GG---T-A-CGAAAT----TGTAG-CAAT--AAAGGG-GAGGA-GG-TTGA-AG-GA-G-ATCGGTT-AA----AG-ATA-TGGAAA-GTTTCATA--T--ATCT--TTA--CGG-A-CAA--------------AA-AACCA--TGGATTCAGAACCAA-CACAACT-T-----GTC-----CG-A-T--ACAG-AGAT---------TGAGAATCGG--T-AAATGAA---TTAAAACCAGATCAA-G----TCGCT-GC------A-CTTCGT-GCAAATTTAAGATGC--A---T--TATACA-TGTAT-GCCC-AATACCAA--C-TGGTTATAGAA--TAAGA-TACACAGAATAGATATT-TTGCTCCA--AAAACGCAATCTCCATGTG-T-GG-TAAT----GA-TC-AAACGTTC-A---GT-----------------TT---ATT-G--CACAT------AATG--AT-GT--TTATTT-----TT-CAT----------TTT--T-AT---A----------------TTCGT----TT-TG--TAGTTAA----ACTA----------------TGTG-GA-----T--ATTCAG-----A-TTTG----------------TG-G-A----CGAT--AC-T-AA-TTT-CCC----CCCCAAAC----GATAG-TGGACATGCGC----GAG-CCGTGTATAATGAACCA-TTTTTN--------NNN--NNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNNN---NNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNCATTACATATG---TTTGAG---GAA-ACCCC-----TA-------CACACA---CTGTG-AAAGA-GAAAAATG---AAAACG---CAATGATTTCATTT-----CAGTTTTGTTTGGT-AG-AC-AAAATACC-GAGTACATCGTAAAATCGT-TCATAGACCCAGT-----------CCG-TG-CTATCTCAATCACAACGATGGCC--TTGCTTTCCATGA----CCAAC-T---------------T-GA-TTG---TTG-AATATGGTC---------GA-ATGGAC------------ACA--CTG----AA----TCGGT--CCGAACGTAAGGGTATGC-A----------ACCG-AAATATA-TTTTTTTTAACTCCC-----------------AAAG---TTCAA-CAA----GCCTGCACTTTGCTTGCAA-CTGTAAAATACAAGC-ACGTGGAAAGTGTTCAA---TAAT-TTG-AATAAACACCGGGATGATCA--ATGCATGCATA----TCAGCCATAGTA-------AATACCCGTAA----GTAATACCG------AAAT-AAG-T--TTCTTTATCGAAATAAG-TGCATGA-CA-AAATTCTGCAGAGGCAAACAC--TAATCTATTT--TTA-CC-TTGCCTGT-AAGTAT-A--C-TTTA-TATTATA---------------CAACA------------------T--------T----------------------ACCGC-TTG-----TTTTAAAG------------------AAATTTTCTAT-TTACCG-TTTAT--TCAGTAAAGTGGGAAA-TAT-A-CG-ATA---C-A-----TAA--ATAATACAATA------------A----------------TTT--------------CCTGACTGAATG-TA-CC-A-CCGAC-TTTTTTTTAATATGG-GT-ACTAGT------A-----G----------T--T--ATGGGCCGA--CT--T-----TTAGATAAATATG----AACAGACAAG--GCAA-TTGACACGAAG-AAAAT-CA--CTTTGTTCTTCAA-AGAATAATATTTTTTATACT-GTTACACATGT---TCCATTGATTT----GCAC-G-TACTAGTGATTACAT--TTACTATA-TATGTA-GCAT--ACAACTG-CCG-----------TGAT--AA---ACG-AGTGTT-GCT--GCGACGTCAAAAA-CGGT-CAT--TG-G-----TGAAC---TT-AAA-CTTGGA--C-CAGA------AAA---------A----------TTAAGTT----TTAT--GG-TTGTGCG------------TA-------------CCC-----CCCCCCCCCT---CCAC-TT-T-TAAG----------------------TTTGAATT--------------G-CTC-------AC-AAAA-CACAATAAT-TATACGATATA--A-TT--GC-AAG--TT---T--A--AAGATACA--AAA-A--AAAGTT-ACAT-A-AATGTA-TATT--ATATATA-CATGTATATGCACCTA-CAAAAGCAG-T--A-C-AGGC-AAA--CTAATATCAT-ATTATCAAAT-AAA-TAAAA--TA--TTTTAT--CGACC--TA--CCTACCCAGAG-AA--AAATAAG-GGC--CTACTTGAAA----ATATTT-TTTG----GCTTA------------------GA-AAAAATAAAATATTTTA---C-CTAC-CTA---CCGACCTAA-CGTCCGTAAAT-C-G--G-TCG-G--AAA-GG--GCAAACAAACAAT--TTTTTAATTTA
gi|10 : --T-GT-TT-GCGG-------T----TTC-CCC-GA---CCGACC----T-AGTAAA-T--TCGTT-GC-GA-C-GGAA--A---AT-C-T--T-T-T-------ATTT-----G--TAT-TT-------------A----C---CAGG--T--GATA---TT---TTT--TTA---TTCATT--T-CTG-TT--GCG-AC---CGAC----------CCG----AAT-CT-----TA-TTTCT-----GC----A-TT--TTAA---CCG---CTCAAA--AAAC-AT--TTT--T--------AT-----CG----AATTCC--TGAC---T--TTTTTTTT--CG--CGAT----AA--GGACT-A-------AGTAC-TCC-AGT-----TTTC---TACCTTGTCCGCA-CGC-AGC--TCAGAG-CTGAG--CACTTCCGAAT-----AC---------C---------------ATA-TATAC------------CAATCCG-TCAG--CGA-CT--ATAC-A-A-ACG-GC-TT---TCATGCATCAA---AA---GTA-TCAAAT--TTT--A---AT-AT---AA-AATGCATAGTT-TC--TA--AAGT--A-ATGA-A-TTGAA---T--TTGCA------TTTA-----G---T-A-CGAAAT----TGTAG-CA-TAAAAGGAG-AAGGA--G-TTGT-AG-GA-G-ATCG--T--------G-ATA-TGGAAAAGTTTCATA--T--A-CT--GTA--CGGGA-CAA--------------AA-AACCAATTGGATTCA-ACCCAA-CACAACT-T-----GTC-----CG-A-T--ACAGAAGAT---------TGAGAATCGG--T-A--TGAA---TT-AAACCAGATCAA-G----TCGCT--C------A-CTT
gi|11 : ----T--T-GT-T--GCGG-------T----TTC-CC--GA---CCGACC----T-AGTAAT-T--TCGTT-GC-GA-C-GGAA--A---AT-C-T--T-T-T-------ATTT-----G--TAT-TT-------------A----C---CAGG--T--GATA--TTT---TTT--TTA---TTCATT--T-CT--TT--GCG-AC---CGA-----------CCGA--AAGTGCT-----TA-TTTCT-----GC----ATTT--T--A---CCG---CTC--AACAAAC-A---TTT--T--------AT-----CG--A-ATTT-C--TGGAC--T--TTTTTTTT--CG--CGAT----AA--GGA-T-A-------AGTAC-TCC-AGT-----TTTC---TACCTTGTCCGCA-CGC-AGC--TCAGAG-CTGAG--CACTTCCGAAT-----AC---------C---------------ATA-T-TAC------------CAAT-CG-TCAG--CGA-CT--ATAACA-A-ACGTGC-TT---TCATGCATCAA---AA---GTA-TCA-AT--TTT--A---A--AT---AA-AATGCATAGTT-TCT-AA--AAGT--A-ATGA-A-TTGAA---T--TTGCA------TTTA----GG---T-A-CGAAAT----TGTAG-CA-TA-AAAGGA-GAGGA--G-TTG--AG-GA-G-ATCG--T--A----AG-ATA-TGGAAAAGTTTCATA--T--A--C--TTA--CGGGA-CAA--------------AA-AACCA--TGGATTCAGACCCAA-CACAACT-T-----GTC-----CG-A-T--ACAG-AAGA---------TGAGAATCGG--TAA--TGAA---TTAAAACCAGATCAA-G----TCGCT-GC------A-CT
gi|12 : TTTTTT-TA-TCGTTTCACATATGGGTCAA-------------A-----AATAGTATCTATATAATTACTATG-TATGTG-GC-T--ACAA--G-CCG------------GAT--AATTTACAATAGT-G-ATT--GCGACGTCAAAAAACGGT-C-T--TG-G-----TG-AC---TT-GA--CTTGGAA-C-CAGATTGAGAAAA---------A----------AAAAACTGCGATTCT--GT-TTGTGCG------------TA------------------------------------AC-TT-C-TA-G----------------------TTTGAATT----------------CTTGGAGGAAATGAAAA-CAAGATAAT--ATACGTCAAA--A-TT--GCTAAA--TTCTAT--A--GAGATACA--AAA-C--AAAG-T-GTAT-------TA-TATA--CTA-AT--CAT-------CA-CTA-CAAAA-CA--T--G-CAAGAC-AAA--CTTCTATAATCATTATCAAATAAAA-TAAAA--TAT-TTTTAT--CTACC--T---CCTA-CCAGA--AA--AAATAAG-GGC--CTAC-TGAA-----TTATTTGTTTG----GCT--------------------GA-GAAAAT--AACATTTTA---C-CCATACTA---CCG-CCCTA-C-TTCGT-AAT-C-GC-G-TCG-G--AAA-AGGCGCAATCAAACA----TTTTTAAT
gi|13 : t-----------TGAT--G-TTTACA-TG---A-GTT--ACAGCACCAAAAA-CAGT-TAC--TATG-----TG-AC---CT-GAA-CTTGAA--C-CAGA------AAA---------GGGGCGATACTTTTAGTC----ATAT--GGATTACGC-------------TA-------------CAC-----CCATCCAAC------AC-TT-CCTGGG----------------------TTAGAATT--------------T-CT-----------AAAA-CA-AACAATGCGCACAATACACGA-T-------AA--TT---T--A------TG--------------G-T-ACAT------GTA-TATGCAAAATA-A-CATAGATAT------A-CAAATACAG-T--A-C-AGAC-AAA-----A-GCCGC-ATTATCAAAT------AAAA--TA--TTTTAC--CAACT--TA--TCTACAAAATG-CA--TAAAAAA-GGCTTCTGTTTT--GTTTTTTGTTT-TTTT----GTTTGTTTTTTTTTTTTTTGGCTGAGAAAAATAAAATATTTTG---C-CTAC-CTA---TTTACCCT--CTTTCG------G-G--G-TCGTT--AAA-GG--GCAAAAAAAAAATCATTTTTTATTTA
gi|14 : ctc-------------CCC-----CCCCCCCCTT---CCAC-TTTC-GACG----------------------TTTGAATT--------------G-CTC-------AC-AAAAACACAATA-T-C---CGATATA--T-TT--GC-AAAGTTT---T--AGTAAGACACACAAAA-ACCAAAG-TTACATTATAATGTAGTATA--ATATATATCGTGTATATGCATCTAACAAAAGCAGGT--AAC-AGAC-AAAAACTAATATCAT---TATCAAAT-AAA-TAAAAAATA--TTTTATTCCGACCCGTATCCCTACGCAGAG-GATAAAGTAATCGGC--CTACT-GAAG----TTATTT-TTTGTTTGGCTTA-------------------A-GAAAATAAAATATTCTGAGGCGCTAC-CTGGAGCAGACCCTAGCGTTCGTAAAT-C-G--GGTCG-G--AAAAGG--GCAAACAAACAAT--TTTTTAATTTAggcc
gi|15 : gatttcgccctcccA-TATTATGC----------------------------------------------T----------------------ACCGC-TGG-----TTTTAAAG------------------AAA--TTCTAT-T-ACCGGTTTAT--TCA--TAAGTGGAAAA--AT-A-CG-CTA---A-------TAA--ATAATACAATA-------------------------------T--------------CTGGGCTGAATG-TACTC-ATCCGA---TTTTTTTAA---------ATT-GT------A-----A----------T------TGGGCCGACCCA--TTT---TTAGATA-ATCTG----A--AGACAAGCAGTAA-ATGACACGA---AAAAT--A--CTTT-TCC----A-AGAATAATATGTTTA-TA-C-G-TA-ACAT-T---TCAA-TGATTTGGCAGTACAG-TACTAGTAA-TACAT--TTACTAGA-GA-G-A-GCATTCACGCCTG-TTG-----------TG
gi|16 : tctgtctatacttacctgtatattccaacatattcatggtgga-GG-TAATTTCGGATTCTAAACGTTC-ATTTGTAA-AG-AC-TTT-GTTATTTGCATTTGGTCACATTATTTTAATTTGAT-GT--TTATTTATTTGTT-CATTTTTTTATATTTT--TGAT---AGATTAAGTTTCTTACTTCCGT----TTATGGTTAGT-AA----CTTA----------------T-TG-GAGTTAGT--ATCC---------TTTG----------------TG-GGA----CGATACAC-TAAA-TTT-CCCCCCACCCCATACCGAAGAGAGATGGACGT-CGCTCCTGAG-CCGT-TGTAG-----TATTTTC-GGATTTTCTTTGTCGGAGAACAT----GAACCA--TTTAAGGTAAGATAGAGTAAGATGAGAG
gi|17 : aTA-------AGTACT-GTAC-----TAAGGCCG------AA-TAA-G-T--TTCTCCATTGAAATAAG-TG----A-CA-AAA--C-GAAGAGGCAAACAC--TAATCTATTTAATT--TC-T--CCTTTAAAGTAT-A--CATTTA-TATTTCACCAACATTTTCATGTCGACA------------------TATCAAGTCT----------------------ACCG---TG-----TTTTCAAT------------------AAA---TC-AT-TT------CTAT--TCAGCTAAGTGGGAAA--ATAA-CGTAGA---AGAA---CTAA--ACAA---AATA------------A----------------TT
gi|18 : CTAAATTA-GAAATTT--TTGT----T--T-GT-T--GCGG-------T----TTC-CC--GA----CGACCCCATT-GTTGAC-T--TCGTTACC-GA-CGTGAATCA---ATAC-T--T-TCT-------ATTTTG---A--TGT-TTG------------A----CGTACAGG--TTGAATATATCT---TTT--TTATATTTCGTTTCT-CTG-TT---TA-AC---CGATACCTGTGGAGCCGATTAAAT--T-----TATTTTCT-----GTGACAA-TT--C--ATACCCGAAACAC--A--AAAC-AT--TTTCCT--------ATTA---TG-AACAATT-C--TGA----T--TTTTTTT----C--AGCTA---AA--GGACT-A-------AGTATATCCTGAT-----TTaatatttatataatatatagaagatatctatctctccatccgatcctttttttttttttatcgtttcacatatgggtcaaaaatagtat
gi|19 : AACGGTC-A---TTGA-AA-T--TTT-GT-ATTC--ATTTG--TAT-T------CACT--AT-GC--TTGCTT-----T--CAT----------TTT--T-AT---------------------TCAT----TT-TG--TAGT-AG----AATA----------------TGAG-GA-----T--ATTCAG-----A-TT
gi|2 : tttgcatcagaaaacatatctttttgatgaggtttatgagCTAAATTA-AAA--TT--T-GT----T--T-GT-TT-GCGG-------T----CTC-CC--GAA--CCGACC----C-AGTAAA-T--TCGTT--C-GA-C-TGAA--A----T-C-T--T-T-T-------ACTT-----G--TATATT-------------A----C---CAGG--T--GATAT-TTT---TTT--T-A---TTCATT--T-CT--TT--GCG-AC---CGA-----------CCGA--AAAT-CT-----TA-TTTCT-----GC----A-TT--TT-A---CCG---CTC--A--AA-C-AT--TTT--TT-------AT-----CG-AA-A-TT-C--TGA----TATTTTTTTTT--TC--CGAT----TT--AGACT-ACAGCTGTAATAC-TCGT-GT-----TTTC---TAC-TTGTCCGCA-CGCAGCC--TCGGAG-CTGAGA-CACTTCCGAAT-----AC---------CGCATGTACACTGTACATAATATAC------------CAAT-CG-TCAG--CGA-CT--ATGA-A-A-ACGTGCCTTA--TCAT----CGA---AA---GTA-TC--AT--TTT--A---ATTAT---AAGAATGCATAGTT-TCAATA--AAGT-GA-ATTA---TTGAA---T--TTGCA------TTTA----GG---T-A-CGAAAT----TGTAG-CA-T--ACGGGG-GAGGA-GG-TTGA-AG-AA---ATCG--T-AA----AG-ATA-TGCGAAAATTTCATA--T--ATCT--TTAGGCGGAA-CAA--------------AA-AACCA--TG-ATTCAGACCCAA-CAC--CT-T-----GTC-----CGCA-T--ACAG-A-----------------------------TGAA---TTAAAAC-AGAT-AA-G----TCGCT-GC------A-CTTTAT-GCAATTTGAAGATGC--A---T--CATACA-T-TAT-GC---AATACCAA--CCTGGT-ATAGAAA-TAAGA-TACGCAGAATAAATATT-T-GCTCCA--AAAACGCATTCATCATG-G-C-GGCTAAT----G-ATC-AAACGTTC-A---GTGA-AA-G--TGT-GTAATT---A-TTG--CACAT------AATG--AG-A----TA--------TT-CAT----------TTT-----T---A----------------TTCGT----TT-TG--TAGT--A----ACTA----------------T-TG-GA-----T--ATTCAG-----A---TG----------------TG-GGA----CAAT--AC-T-AATTTT-CCC----CTCCAAAC----GATAG-TGGACAT-CGC----GAG-CCGT-TAT--------A-TTTC-----------TA-----------------------TTTAAC---CGAGAGA-CGAGA-AA------TTAAATAATGT--------------------TGAG-----A-ACCC---------------TACACA---CTGTG-A-AGA-GAAG-AT-------------------TT-CATTT-----CAG-TTTGTT-GGT-AG-AC-AAAATACC-GAAC--ATCGTAAATTCAT-ATATAGACCCAGT-----------CC--TGCCTATCTCAATCACAACGATGGCCTTTTGCTT-CAATGA----CC-AC-T---------------T-GA-TTG---TTGAAATATGATC---------GA-ATAAAC------------ACA--CTG----AA----TCGGT--ACGAACGTGAGGGTATGC-A----------ACCGCAAATA-----TTTTTTAAATCCC-----------------AAAG---TTCAA-CAA----GCCTGCACTTTGC-TGCAA-TTGTAAAATAAAAG--ACGTGGAAAGTGTTC-ATGTTAATATTGAAATAAACACCGG--TGATCATGATGC---CATATCACTCAGCCATAGTA-------AATACCCGTAA----GT-ATACCA------AAATAAG-----TTCT-TATCGAAATAAG--GCATGA-CATAAAT-CTGCAGAGGCAAACAC--TAATCTATTT--TTA-CC-TTGCCTGT-AAG-ATAA--C-TTTA-TATTATA-C-------------CAACATTTCATGTTAATATAAAGT--------T----------------------ACCGC-TTG-----TTTTAAAG-------------------AAATTTCTAT-TTATCG-CTTAT--TCAGTAAAGT--GAAA--AT-A-CG-ATACATA-CA---TGGA--ATAACA-AATAAATTTATTATCTA----------------TTT--------------CTTGACTGAATGATA-CC-A-CCGACTTTTTTTTTAATATGGCGT-ACTAGT------A-----ATTAGTAGAGTT--T--ATGGACCGA--C---CAA---TTAGATGCATAT------ACAG-CAA---GCAA---GACACGAAGAAAAATACA--CTTT-TTCTTC-A-AGAATAATATT--------T-ATTACACATGT---TCAATTGA-TT----GCAC-GCTACTAGTAATTACAT--TTAC-ATATTATGTA-GCCT--ACAACTG--CG-----------TGAT--AATTTACA-T--G-A-GTT--GCGACGTCAAAAA-CGGT-CA---TG-G-----TG-AC---TTAAAA-CTTGGA----CAGA------AAA---------A-----------TAACTT----TTAT--GG-TTGTGCGCTTGCGACCCTCCG-------------CCC-----CCCCCCCCCTCCCCCCC-CT-C-CACGCCCCCCCCCCCCTCACTTTAAGTTTGAATT--------------G-CTC-------AC-AAAA-CACAATAAT-ATTACGATATA--T-TTGCGC-AAG--TT---T-----AAGATACA--AAACA--ACAG-T-ACAT-A-AATGTT-TATT--ATA-ATA-TCTGTATATGCATC-A-C-AAAGCA--T--A-C-AGACAAAA--CT-ATATC---ATTATC-----AAA-TAAGA--TA--TTTTAT--CGagctccgtaaatacatttataaacggtgagacaaaactaattttattcgtattgttgagtagacaagcgtgacccattatatttttttcaacatttgataaagaacaaatttaat
gi|20 : GCACCTA-CAAAAGCAG-TTTA-C-AGAT-AAAA-CTAATATCAT-GG-ATCAAAT-AAA-TAAAA--TA--TTTTAT--CGACC--TA--CCTACCCAGAGAAA--AAATAAG-TTC--CTACTAGAAG----TTATTT-TTT-----GCTTA------------------G--AAAAAT-AAATA-TTTA---C-CTAC-CTA---CCGACCTAA-CGTCCGTAAAT-C-GGCG-TCG-GAAAAA-GG--GCAAACAAACAAT--TTTTTCATTTtaaaatttatcacaaatgaaaattcttctataaacaaaaaaatttatttcttataaaaaatggtaaaaata
gi|21 : ATTTCAC--TT--TATA-TATAGA-GCAC--ACAACTGGCTGGGGTAAACCTCTGATGAAATTTACA-TGGG-A-GTT--GCAACATTAAAAA-TGGT-CAT--TG-G-----TG-AC---CT-GAA-CTTACACCC-CAAA------AAAGGGTGATTCA----------TTTAGTCCA--TTATTGGA-TCATGTA------------TA-------------CCC-----CCta
gi|22 : GCACCTA-CAAAAGCAG-T--A-C-AGAT-AAA--ATAATATCAT---TATCAAATAAAA-TAAAA---A--TTTTAT--CGACC--TA--CCTACCCAGAGAAA--AAATAAG-GTC--CTAC-TGAAG----TTA-TT-TTTG----GCTTA------------------G--AAAAATAAAATA-TTTA-----CTAC-CTA---CCGACCATA-CGTCCGTAAAT-CGG--G-TCG-GA-AAA-GG--GCAAA-AAACAAT--TTTTTCATTTAaactttctggattagaattccagggaaaaatttgcacacaat
gi|23 : ACGATGGCC--CTGCTT-C-ACGA----C--AC-TGGCTTATCTATGGTCT-GA-TTAGTTTTG-AACATGGTCATCGATTGAGAGATAAACCCCATGTCCAAAACT--CTATCCTGA----TCGGTATCCGAACGTAAGG-TA-GC-ACAAAAAATATACCG-AAATATT-TTATTTTTA
gi|24 : AAAA-AAA-AAAAA--TAATCTTTAT--CGACC--TA--CCTACCCAGAG--A--AAATAA---AC--CTAC-TGAAG----TTATTT-TTTG----GCTTA------------------CA-AAATA-AAAATATTTAA---T----C-CTA---CCGACCCTA-CGTCCGTAAATGC-G--GTTCG-GA-AAA-GG--GCAAACAAACAA---TTTTTAATTTAc
gi|25 : AAT-AAAATAAAA--TACTTTTTAT--CTAC---TA--CCTACC-AGAG-AA--AAATAAG-GGC--CTACT-GAAG----TAATTT-TTTG----GCTGA------------------GA-AAAA-TAA--T-TTTTA---C-CTAC-CTA---CCGACCTTA-CTTTCGTAAAT-CGG--G-TCG-GGAAAA-GG--GCAAACAA
gi|26 : AAAT---AAC--TT--GTGT----TATT-GTGTT-GCGG-------TATATTTC-CCACGA---CCGACCC---T-AGTAAA-TTATC-TT-GC-GA-C--GAA--ATATAT-CAT--T-A-T-------ATTTTTGTGG--TAT-TTTTAGAACATCCTGA----C---CACA-----AATAT-CTT---CTTTATTT---TTCATT--T-CTG-tttt
gi|27 : AGCGCTC-A---TTGA-AA-A--TTTTGT-ATT---A--------CAT------A--C--AT-GT----ATGT-----TTACAT----------TTT--T-ATTCGG----------------TTTTT----TT-TT--TAGT-AA----CTTA----------------TGAG-GA-----T--ATTTAG-----A-TTT
gi|28 : gatgggaatttaaggacT--AGTTTACA-TGCA-G-GTTCAGCGCTGTCAAA---CGGT-CATTCTG-GGAGCATG-TCCCTTT-GA----TAGA----TAGT------ATATT-------A----------TTAA--T----TTAT-----TTGTACA------------GA-------------CAC-----CCCCCCCCCC---CC-C-TT-C-cctctttccgtaaacacatttgctaaacgat
gi|29 : -AATAAACACCGGGATG----------------A----TCAGCCATAGTA-------AATA-CCATAC----GT-ATACCGAAAAAAAAATAAAGATAATTCTTATTCG--ATAAGTTGCATGATTA-AAA--C-----AGGTGAAT-------TCTATTT--TCA-Cccccgggccttgtaat
gi|3 : aGTGGAAAGTGTTC------------G-AATAAAC-CCGGAATG-------------CACA----TCAGCCATAGTACATGTTAAGTAACC-TAGTTTGGTAGTTACG------AAATAAAG-T--TTCTCCATCGAAATAA----------------------AGTGACAAACA---TAATCTTTTT--TTA-CC-GTTCCTTT-AAAAAT-A--C-TTTAATATTATACC--------------GACA------------------T--------T----------------------TTCATGTTGAATATTTTTAAAGTTCCGCTGTTTTCAATTAAGAATTTCTATCTTACCG-CTTAT--TCAGTCAAGTAGGAAAATAC-ATCG-ATA---A-A-----TAA--ATGATACAATA------------AACTCTATTTATCTATTTTT--------------CCTGACTAAATG-TACCCCA-CCGAC-TATTTTC--ACATGG--T-ACTAGTTAGTAAA-----G----------T--TTCATGG-CCGA--C---TGAGTTTTAGATACATATGCCATAA-GGGCA-G--GCAAATTGCAACGAAG-AAAGTACA--CTTTATTCTTCAA-AAAAT----TTTTTT-T-----TTATACATGT---TTAATTT-TTT----GCAC-G-TACTAGTAATTATAT--TCA---TG-TATGCA-GCA---ACAAC-G-C-G-----------TGAT--AATTTACA-TGCA-GCGTT--GAGACGTCCAAAA-CGGT-CAT--TG-G-----TG-AC---TT-GAACCTTGAA--CACAGA------AAA---------AAGCGATACT-CTAGTTT----TTAT--GG-TTGTGTG------------TAAACAACAGAACACCCC-----CCCCCCCCCC---CCCC-TT-C-CAGGT---------------------TTTGAATTCCTGGGAGGAAAACG-TTC-------AC-AAAA-CAAGATAA--CATACGG-GTA--ATTT--GC-AAG--TT---TACA--AAGAGATA--AAA-A-----------AC-A-AA---A-TATA--ATATCTG-CATACA------------AAAAGCAG-T--A-C-AAAC-AAA--
gi|30 : ATGA----CCA-C-T---------------C-GA-TTC---GTG-AA-ATGGTA---------GA-ATGA-C------------ACA--CTG----AA----TCAGT--CAGAACATAGGGAAATGC-A----------ACCG-AAAAAAA------ATTGACTCCC-----------------AAAG---atttat
gi|31 : TATG---ATTGAGAGAGGA-ACCCC-----TAAAACTACCATACATTTCTGTG-ATATATGAAAAATG---AATACGGGGCGATGATT-CATTT-----CAGTTTTGCT-gaa
gi|32 : a----------TCT--T-AT---T----------------TTCGT----TT-T---T-GT-AA----ACTA----------------TGTG-GA-----T--ATTCA------A-TTTGTTATCTATAAAT----TGTGGA----CGAT--AA-T-AA-TTT--TT----CTCCAAAC----GACAt
gi|33 : AATTA-AA--------TGT----T--T-GT-TT-GCAG-------T----TTC-CC--GA---CCGACC----C-AGTAAA-T--TCGTT-TC-GA-C-TGAA--A---AT-A-TAAT-T-TAATTCACATTT-----G--TAT-Tt
gi|34 : --CGA-CT--ATAA-A-GGACGTGC-TT---TCA---GTCAA---AA---GTA-TC--AT--TTT--A---AT-AT---AA-AATACAT-GTT-TCA-TA--AAGTCAA-AT
gi|35 : ATT--G-CTG-TT--GCG-AC---CAA-----------CCGA--AA----------TA-T------------------------A---CCA---CTC--A--AAAC-AT--TTT--T--------AT-----CG--A-AATT-C--T
gi|36 : T-C-G--G-GTG-G--CAA-CA--GCAAACAAACAAT--TCTTTATTTTA
gi|4 : tcgggAATTA-AAT--TTCATTGT----T----GT-TT-GCG--------T----TTC-CG--AA---CCGACC----C-AGTAAACT--TCGTT-CC-GAAC-TACA--A---AT-C-T--T-T-T-------ATTT-----G--TAT-TT-------------A----C---CAG----------T-TAT---TTT--TTA---TTCATT--T-CTG-TTTGGCG-ACAAACGA-----------CCGA--AA-T-CT------A-TT-CT-----GC----AATT--T--A---CCG---CT---A--AAAC-ATGTTTT--T--------AT-----CG-AA---TT-CACTGA----T--TTTATCTT--TC--CGATTATTAA--GGACT-A-------------------T-----TGTC---TAC-TTGCCCGAA-CGCA-GCAAT-GAAG---GAGA-CACTTCCAAAT-----ACTGCATGA--C---------------ATA--ATAC------------CAAT------------------ATAACA-A-ACGAGA-CTA----AT-CATCAA---AA---GTA-TC--AT--TTT--A---AT-AT---AA---TGC-TAGTT-TCA-TA--AAGT-AA--TGA-A-TTGAA---T--TTGCA------TTTA----GG---T-A-CG-AAT----TGCAGTCA-T--AAGGGG-CAGGA-GG-TTGACAG-GATA-ATCG--TCAA----AGAACA-TGGAAAAGTATCATA-----ATTT--T----CGGGACCAAAAACAAACAAACATAA-AACCA--CGGATTC-GACCCAG-AACAACT-T-----GTC-----CG-ACT--ACAG-AGAT---------CGAGAATCGGT-T-A--TGAA---TTAAAGCCAGATC-A-GTTTTTCTCTAGCGCCAAAA-CTTCGT-GCA--TTGAAGATTCCAA---T--TATACA-TGCAT-GTCT-ACTCCAAA--C-T-GTCATGGAAA-CAAAA--ATACAG-ATGAATA---C-GTTCCAATGAAAgg
gi|4 : AT----GAAT----ACGTTCCA---ATGA-AAGA--TTT-GT-AGC---TGTTG--CACAT------AATC--A-------TATTT-----TT-GA-----------TTT--G-AA---A----------------------------CA--TAGT-AA----ACTA----------------TG-G-GA-----T--ATTCAG-----ATTTTGTCTATTTATAAATTGTTG-GGA----CAAT--A----AA-TTT---T----TCCCAAAC----GATgatttgtagctgttgcacataatcatatttttgatttgaaacatagtaaactatgggatattcagattttgtctatttataaattgttgggacaataaatttttcccaaacgat
gi|5 : aattaaatttcattgttgtttgcgtttccgaaccgacccagtaaacttcgttccgaactacaaatcttttatttgtatttaccagttattttttattcatttctgtttggcgacaaacgaccgaaatctattctgcaatttaccgctaaaacatgtttttatcgaattcactgattttatctttccgattattaaggactattgtctacttgcccgaacgcagcaatgaaggagacacttccaaatactgcatgacataataccaatataacaaacgagactaatcatcaaaagtatcattttaatataatgctagtttcataaagtaatgaattgaatttgcatttaggtacgaattgcagtcataaggggcaggaggttgacaggataatcgtcaaagaacatggaaaagtatcataattttcgggaccaaaaacaaacaaacataaaaccacggattcgacccagaacaacttgtccgactacagagatcgagaatcggttatgaattaaagccagatcagtttttctctagcgccaaaacttcgtgcattgaagattccaattatacatgcatgtctactccaaactgtcatggaaacaaaaatacagATGC--A---T--TATACAATGTAT-GCCT-ATAACCAA--C-TGGTTATAGAAA-TCATA-TAC-CAGATTCAATATTAT-GCTCCAGCAAAACGCTATCACCATG-GGCAGG-TAAT----GAATC-AAACGTTC-A---GTGACAG-A--TTT-GT-ATTT--ATTTG--CAC-T------AATC--AT-GTATTTATTTATT--TT-CAC----------TCTCTT-AC---AC---------------TTCGTCATTTT-CG--TAGT-AAAGTGACTAACTGAATCGAATGTTGTGTGCGG-----TGAATCGAGGGGGTA-ATTG----------------TG-GGAAATATGAT--ACCT-AA-TTTTCCC----CCCCAAAC----GATAG-TGGACATGCGC----GAGGCCGT-TAT----------TTTC-G--------TTC--AAA-AACATGAA-----CATTTTAACG---AGAGAGAGAGAGA-GAGAG---------AGCG-----CATTAAATATGAAGTTTGAG---GAATACCCCAGGTACA-------CACACA---CTGTGAACAGA-GAGGAAGGAGAAAAACG----AATG------------------TTTGTT-GGT-AGAACAAAAATACCAGAGTA-ATCGTCAG-TCGTATCACAAACCCAGTTACAACTGCACCTG-TA-CTACCT-AATCACAACGATGGCC--TTGCTT--CATGACACCCCATCGT---------------TAGATTTG---TTG-AAAATGGTC---------GA-ATGAAC------------ACACCCTG----AATAATTTGGT---CGAATGTAGGGATATGCAA----------ACCG-AAAT-TATTTTTTTTTTACTCCCCAATAGTGTAGTTTGTTAAAGTATTCCAACCAA----GCGTG--CTTTGCTTGGAACCTGTAAAATACAAGC-ACG-GGAAAGTGTTC-
gi|6 : TAAATTTTAAA--TT--TTGT----T--T-GC----GCGG-------T----TTC-CC--GGGACCCGACC----TCAGTAAA-T--TCGTT-TC-GA-C-TGAA--A---AT-C-T--T-CCT-------ATTT--------TAT-TT-------------A----C----AGG--T--G-TAT-TGT---TTT--TTA---TTCATT--TTCTG-TT--GCGGAC---CGA-----------C-------AT-CTCCCTCTC-TCTCTCAATGAC----A-ATAAT--C---CTG---ACC--T--AAAC-AT--ATA--T--------ATATATTCATAA-AATT-C--TGA----T--TTTTTTTTTACC--CAAT----AA--GGACT-A--------GTGG-TCCTAGT-----TTTC---TA---TGTCCGCATCGCA-GC--TCGGAGACTGAGA-CACTTCCAAAT-----AC---------C---------------GCA-TGTACATTATTACTACTCCAT-CG-TCAG--CGATCT--ATAA-ACA-ACGTTC-TTA--TCAT-CGCCTAGTTAC---GTG-GC--GTGCTTT--ACCTAT-ATGAGAA-GATGCATAGTT-TCA-TTT-AAGT-AA-ATGAGA-TTGAA---TGATTGCA------TTTAAA--GG---TTA-CGAAATGTCTCGTAG-GA-T--AAGGGGAGAAGA-GG-TTTA-AG-GA-ATATCG--T-ACCCCCGG-ATA-GGAAAAAGTTTCATA--T--ATCTTCTTAC-CAGGA-CAA--------------AACAAACA--TGCATTCAGA-CCAA-CACAACTAT-----GTCGGGTGCG-A-T--ACAG-AGATAATGA----TGAG-ATCGGTTT-A--TGAA---ATTAAACCAGATCAACG----TCGCT-GC------AGCTTTGT-GCATTTTAAAGATTC--A---TAGTATAC--TGTATGGCCTAATTACCAAGGC-TGGTTATAGA
gi|7 : -CTTCGTAGCAATTTGGAGATGC--AAATT--CATACA-TGTAT------ACTGTCG---------TATGGAAAATAATAATACGAGAAATGAATATTCT-GCTCCAGCAAAACGCCATCGACATG-G-C-GG-TAAT----GAA------CGT-C-A---GTGA-AA-AGATTT-GT-ATT---ATT-G--CACAT------AATC--ATTAT--TTATTT-----T--CGT----------TTA----AT---A----------------TTCGT----CTGTG--TAGG-TA----AC-A----------------TGTG-TA-----T--ATTCAG-----A-ATTG----------------TG-GGAA---CGATT-AC---AA-TTT-TTC----C---AAAC----GATAG-TGGACATGTGC----GAG-CCGT-TA--------CA-TTTC-G--------TTA--AAAGAACCTAAAAGAACCATTTTTAAG---AGAGAGAGGGAGA-AAGAGCACTT-AATAACGTTTGTCAATTCGTGT----TTCGAG---GAA-ACCTA-----CA-------CATACA---CTGTG-ACAGA-AGAGA------AAACCG---CAATAATTACATTTTGAAGCAGTTTTGTT-GGTCAG-AC-AAAATA----AATA-AT----AA-TCGT-TCACAGACCCAGT-----------CCGTTG-CTGTC----CCACAACGAAAGGC--CTGC-T-CCATGA----CC-AC-T---------------T--A-TTG---TTA-GAAATGGTT---------G--ATGA--------------ACA--CTG----AA----TCAGTCCCCGAACATAGGGACATGC-A----------ACCA-AAAT-CA--TTTTTTTAACTCCA-----------------AAGG---T
gi|7 : -----------------AAAGAT-TTCAG-CAACGCTGCATGCACTT-GCTTGCAA-CTGTGAAATACAAGCAATGTGGGAAattaaactggttccataagcaatattatgtaaagatttcagcaacgctgcatgcacttgcttgcaactgtgaaatacaagcaatgtgggaa
gi|8 : cttcgtagcaatttggagatgcaaattcatacatgtatactgtcgtatggaaaataataatacgagaaatgaatattctgctccagcaaaacgccatcgacatggcggtaatgaacgtcagtgaaaagatttgtattattgcacataatcattatttattttcgtttaatattcgtctgtgtaggtaacatgtgtatattcagaattgtgggaacgattacaatttttccaaacgatagtggacatgtgcgagccgttacatttcgttaaaagaacctaaaagaaccatttttaagagagagagggagaaagagcacttaataacgtttgtcaattcgtgtttcgaggaaacctacacatacactgtgacagaagagaaaaccgcaataattacattttgaagcagttttgttggtcagacaaaataaataataatcgttcacagacccagtccgttgctgtcccacaacgaaaggcctgctccatgaccacttattgttagaaatggttgatgaacactgaatcagtccccgaacatagggacatgcaaccaaaatcatttttttaactccaaaggtattaaactggttccataagcaatattatgtAAATTA-AAA--TT--TTGTATACT--TAGT-TTAGCGAGTCAGATT----TTCTCC--GA---CCGACC----C-AGTAAA-T--TCCTT-TCCGA-C-TGAA--AG--AT-C-T--TGT-T-------ATAT-----GGGTAT-TT-------------AGACGC---CAGGGGTA-GATCTATTTACATTT--TTA---TTCATT--T-CTGCTT--GCG-AC---CGA-----------CCGA--AATT-TT-----TA-TTTCT-----GC----AGTT--T--A----CG---CTC--A--AAACTAT--TTTA-TGTCCATAAAT-----CACAA-AGTTCC--TGAATTTT--TTTTTTTT--TCAGCTAT----AATCGGACTAA-------AGCA--TTCTAGTTATTATTTCCATTACCTT-CCCGCA-CGT-AGC--TC-GAG-CTGAGATTACTTCCAAATGTGGAACGCAATGTAAC---------------ATA-TAT-C------------CCAT-CATTCAGTCTGA-CTCAAT-A-A-A-CCGTGC-TTAATTCAT--ATCAA---AAAAGGTA-GC--AT--TTTTAA---AT-ATGA-AA-AATGCATAGTTATCA-TAATAAGT-AATATGA-ATTTGAATATT--TTGCAGAACGTTTCAAATTGGGGTT-ATCGAAA-----TGT-G-CA-T--AAGAGG-GAGGATGGTTTGA-AGAGG-A-ATCGTTT-AA----GA-GTAGTGGACAAG-TTCATAAGTAAATCT--TTA--CGGGA-C-A--------------AC-AACCT--GGGGTTCAGTCCCAAGCAGCACT-CATAAGGCC-----CG-A-TAAACAG-AGATAAATGAATGTGAGAATCGG--T----TGAATATTTAAAACAAGATCAA-G----TC
gi|9 : gccta--CTGCAGAGGCAAACACACTA-TCTATTT--TTAACCATTGC-TGT-C-GTAT-GAGC-TTTA-TATTATTAC-------------CAACA------------------T--------TTTCATGGTTGATTAATTAAGCTACCGT-TTG-----TTTTAAAG------------------AAAATT---ATATTA-----TTATCATCG--CAAGTGGGAAA-TAT-A-TG-ATA---A-AATAACTAATAGTAATACAATA------------A----------------TTTATTTATCTATTTTACCAGACTGACTG-TACCC-A-CCGAC-TTTTTTTTCATATGG-GTTACTAGT------ATTGGAG----------TCTT--ATGGGCCGA--CAGATG----TTAGA---ATAT-----AACATACAAG--GCAA-TTGACACGAAG-AAAATACAATTTTT-TTCTTCAAGAAGATAATATCTTTT-TA------AAACATGA---TCCATTGATTT----GCAC-G-TACTAGTAATTACA---TTACTATA-TATGTAGGCAT--ACAACTG-CCG-----------TAAT---ACTGACA-CGAATA-GTTG-GCGACAT--AAAA-CGGTCCAT--TG-G-----TG-CC---TT-AAG-CTTGGA--C-C--G------AAA---------A----------TTAAGTT----TTAT--GGTTTGTGCG------------TA-------------CCCTCCCTCCCCCCCCTT---CCACTTT-C-TACG----------------------TTTG-ATT--------------GCCTCA------AC-AAAA-CACAAcc
Alignments
lowQualScore : 111111111111111111111111111111111111111111111111111 1111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 1111111111111111111111111111111111111111111111
lowQualScore : 111 1111111 111 111111 111 1111111 11111111 222222222222222222 11111 11 22222222222 11111 222222222222222222222222 2222222222222222222222 2222 1111 11111111 11111 111 1 11 11 11111 7777777777777777777777777 222222222222 1 111 1 11 111 11 11 111 111111 2222 111 1111 11 11 111 2222222222 11111 11 33333333333333 11111 11111 333333333 2222222 111 1111 111111 111111111 111111 1111 111 11 1 111 1111111111 1111 1 1111111 111111 1111111 55555555555555555555555555555555555555555555555555 2222222222222222 11111 11111111 6666666666666666 1111 1111111 11111111 1111 1 1111 111111111111111111111111111111111111111111111111111 111 555555555555555555555555555555555 111 444444444444444 111 2222222222222222222222222 22222 1 1 1 1 11 2 1 44444444444 11 1 11 11 111 4444444444444444444444444444 111 222222222 33333333333333 1111 1111 222 2222222222 33333 44444444444444444 222 1 2222 1 11 5555555555 1 777777777777777777777 2222222 11111111 222222 111111 333333333333333333333 111 1111 5555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555 11 11111 444444444444444444 1 111111111 22 44444444444 0000000000000000000000000000000000000000000000 1 1111 77777777777777777777777777777 555555555555 1 22222222 1111 11 1 11 1 22222222 111 1111 22222222222 22222 11 11111 11 1111 111111 666666666666666666666 1111 11111 3333333333333333333333333333 11111 1111 5555555555555555555555 44444444444444444444444444 111 1111 2222222222 222222222222222222222 111 111 111 11 11 11 1111 1111 444444444444444444444 11111 11 22
lowQualScore : 5 000 66 9999 55 4 4 77 3333333 8888 4 99 111 333333 4 55 88 4 4 77 55 111 4 4 55 4 8 3333333 77777777 4 999999999999999999 777 55555 00 777 66 777 55 4 4 66 4 777 55555555555 66 6 44 11111 4 000000000000000000000000 777 66 66 4 66 2222222222222222222222 444 8 66 2222 66 9999999 5555 66 5 99999999 99 88 22222 000 5 5 99 77 4 5 22 44444 4444444444444444444444444 5 0 999999999999 5 5 66 5 66 0 5 5 0 5 666 8 888 888 5 11 66 66 888 88 555 5 5 55 11 00 5 999 000 77 666666 0000 000 5 5 2222 5 5 33 5 00 5 77 5 555 7777777777 5 5 33333 5 77 33 5 33333333333333 5 77 0 0 5 1 5 44444 44444 5 5 77 5 777777777 1 3333333 000 1 0 5 2222 6 999999 5 8 77 222222222 6 222222 1 0000 2 1 88 1 88 6 0 1 0 888 66 1 44 0 222 8 5555555555 5 888 5 6666 5 0 9999999 66 3 444444 777 4444444 11111111111111111111111111111111111111111111111111 9999 99999 4 9999 9999999999999999 33 4 11111 66 11111111 7777777777777777 5 7777 8888888 5 77777777 1 2222 8 0 7777 8 8 000000000000000000000000000000000000000000000000000 444 33 8 2 888888888888888888888888888888888 444 8 888888888888888 444 8 8 8 5555555555555555555555555 00000 5 8 0 0 0 2 0 33 2 3 0 0 77777777777 22 0 22 11 0 333 6666666666666666666666666666 6 111 6 7 666666666 6 55555555555555 99 4444 4444 000 4 6 9999999999 6 00000 66666666666666666 000 0 1111 1 2 3 3 0 22 0 0000000000 0 3 6 222222222222222222222 6666666 5 3 99999999 333333 0 0 888888 77 0 000000000000000000000 111 3 99 6 8 0 8 0 6 3333 8 6 7777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777 00 66666 999999999999999999 1 3 444444444 99 999 1 22 6 6 6 44444444444 99 1 2 5555555555555555555555555555555555555555555555 1 8 0 8 8 8 11 3 6666 0 99999999999999999999999999999 3 444444444444 0 0 88888888 3 1111 44 0 8 0 11 6 0 5 8 0 88888888 5 1 111 7 66 4444 777 0 888 22 5 3 5 9999 1 666 33333333333 66 5 99999 11 5 5 66 5 22222 5 888 5 00 9999 444444 333333333333333333333 4 7777 11111 9999999999999999999999999999 11111 2222 3 5 5 5 6 6666666666666666666666 77777777777777777777777777 5 5 4 777 1 5555 99 6 99 1111111111 1 99 777777777777777777777 6 000 99999 55 3333 6 3 5 77 66 5 5 5 222 5 0 444 8 4 66 66 66 66 66 22 66 66 66 55 0000 5 0000 0 444444444444444444444 3 3 22222 5 888 5 2 0 4 8 00 8 4 11 4 66 777 0
lowQualScore : . ... .. .... .. . . .. ....... .... . .. ... ...... . .. .. . . .. .. ... . . .. . . ....... ........ . .................. ... ..... .. ... .. ... .. . . .. . ... ........... .. . .. ..... . ........................ ... .. .. . .. ...................... ... . .. .... .. ....... .... .. . ........ .. .. ..... ... . . .. .. . . .. ..... ......................... . . ............ . . .. . .. . . . . . ... . ... ... . .. .. .. ... .. ... . . .. .. .. . ... ... .. ...... .... ... . . .... . . .. . .. . .. . ... .......... . . ..... . .. .. . .............. . .. . . . . . ..... ..... . . .. . ......... . ....... ... . . . .... . ...... . . .. ......... . ...... . .... . . .. . .. . . . . ... .. . .. . ... . .......... . ... . .... . . ....... .. . ...... ... ....... .................................................. .... ..... . .... ................ .. . ..... .. ........ ................ . .... ....... . ........ . .... . . .... . . ................................................... ... .. . . ................................. ... . ............... ... . . . ......................... ..... . . . . . . . .. . . . . ........... .. . .. .. . ... ............................ . ... . . ......... . .............. .. .... .... ... . . .......... . ..... ................. ... . .... . . . . . .. . .......... . . . ..................... ....... . . ........ ...... . . ...... .. . ..................... ... . .. . . . . . . .... . . ...................................................................... .. ..... .................. . . ......... .. ... . .. . . . ........... .. . . .............................................. . . . . . . .. . .... . ............................. . ............ . . ........ . .... .. . . . .. . . . . . ........ . . ... . .. .... ... . ... .. . . . .... . ... ........... .. . ..... .. . . .. . ..... . ... . .. .... ...... ..................... . .... ..... ............................ ..... .... . . . . . ...................... .......................... . . . ... . .... .. . .. .......... . .. ..................... . ... ..... .. .... . . . .. .. . . . ... . . ... . . .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. .... . .... . ..................... . . ..... . ... . . . . . .. . . .. . .. ... .
lowQualScore : 0 222 99 4444 55 0 0 22 0000000 5555 0 55 000 555555 0 55 99 0 0 11 55 000 0 0 55 0 0 0000000 66666666 0 333333333333333333 888 88888 88 888 11 888 55 0 0 11 4 888 66666666666 11 4 66 11111 4 333333333333333333333333 888 11 11 4 11 9999999999999999999999 666 9 11 5555 99 2222222 6666 99 0 55555555 55 22 55555 000 0 7 11 99 0 7 99 33333 3333333333333333333333333 7 1 333333333333 7 7 99 0 99 0 0 0 4 0 222 1 888 888 0 99 99 99 888 22 666 0 0 44 99 11 0 444 000 99 444444 0000 000 7 7 1111 7 7 66 7 00 7 44 7 444 4444444444 7 7 77777 0 99 66 7 66666666666666 7 99 7 7 7 4 7 33333 33333 7 7 99 7 111111111 4 0000000 000 7 7 7 1111 7 222222 7 0 00 000000000 7 555555 0 0000 5 7 88 0 88 4 8 4 8 000 44 0 55 0 000 0 2222222222 0 888 0 0000 0 0 5555555 99 2 444444 111 2222222 22222222222222222222222222222222222222222222222222 4444 44444 4 4444 4444444444444444 33 4 11111 11 44444444 1111111111111111 7 9999 1111111 7 11111111 7 1111 0 0 0000 0 0 444444444444444444444444444444444444444444444444444 000 22 0 2 222222222222222222222222222222222 000 0 222222222222222 000 0 2 0 2222222222222222222222222 00000 6 0 0 0 0 5 0 22 5 0 0 0 55555555555 55 0 00 00 8 000 8888888888888888888888888888 7 777 7 5 777777777 7 77777777777777 22 2222 2222 888 2 7 2222222222 7 77777 77777777777777777 888 0 2222 0 5 2 2 0 55 8 0000000000 0 2 5 555555555555555555555 0000000 0 2 66666666 000000 8 8 666666 88 8 222222222222222222222 777 2 22 7 0 8 0 8 0 0000 0 7 3333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333 33 77777 222222222222222222 7 2 888888888 22 222 0 22 7 7 7 77777777777 22 7 5 5555555555555555555555555555555555555555555555 0 0 0 0 0 0 44 8 8888 8 22222222222222222222222222222 2 888888888888 8 0 66666666 8 8888 00 8 0 6 00 0 8 6 0 8 00000000 2 0 777 3 33 2222 555 1 000 11 7 6 7 4444 4 999 88888888888 99 0 11111 99 0 0 99 0 55555 0 888 0 11 4444 444444 999999999999999999999 5 5555 44444 1111111111111111111111111111 11111 6666 1 0 0 0 6 4444444444444444444444 00000000000000000000000000 7 7 3 888 7 5555 22 7 22 8888888888 0 22 222222222222222222222 7 222 88888 22 7777 5 1 0 55 99 0 0 0 666 1 1 111 9 4 11 77 11 99 99 00 99 44 99 99 6666 0 6666 1 555555555555555555555 2 2 00000 0 888 0 5 1 4 9 66 9 4 11 4 11 000 2
consensus : CTAAATTA-AAA--TT--TTGT----T--T-GT-TT-GCGG-------T----TTC-CC--GA---CCGACC----T-AGTAAA-T--TCGTT-NC-GA-C-TGAA--A---AT-C-T--T-T-T-------ATTT-----G--TAT-TT-------------A----C---CAGG--T--GATAT-TTT---TTT--TTA---TTCATT--T-CTG-TT--GCG-AC---CGA-----------CCGA--AAAT-CT-----TA-TTTCT-----GC----A-TT--T--A---CCG---CTC--A--AAAC-AT--TTT--T--------AT-----CG-AA-AATT-C--TGA----T--TTTTTTTT--CC--CGAT----AA--GGACT-A-------AGTAC-TCCTAGT-----TTTC---TACCTTGTCCGCA-CGCAAGC--TCGGAG-CTGAGA-CACTTCCGAAT-----AC---------C---------------ATA-TATAC------------CAAT-CG-TCAG--CGA-CT--ATAA-A-A-ACGTGC-TTA--TCATGCATCAA---AA---GTA-TC--AT--TTT--A---AT-AT---AA-AATGCATAGTT-TCA-TA--AAGT-AA-ATGA-A-TTGAA---T--TTGCA------TTTA----GG---T-A-CGAAAT----TGTAG-CA-T--AAGGGG-GAGGA-GG-TTGA-AG-GA-G-ATCG--T-AA----AG-ATA-TGGAAAAGTTTCATA--T--ATCT--TTA--CGGGA-CAA--------------AA-AACCA--TGGATTCAGACCCAA-CACAACT-T-----GTC-----CG-A-T--ACAG-AGAT---------TGAGAATCGG--T-A--TGAA---TTAAAACCAGATCAA-G----TCGCT-GC------A-CTTCGT-GCAATTTGAAGATGC--A---T--TATACA-TGTAT-GCCT-ANTACCAA--C-TGGTTATAGAAA-TAANA-TACGCAGAATGAATATT-T-GCTCCAGCAAAACGCNATCGCCATG-G-C-GG-TAAT----GAATC-AAACGTTC-A---GTGA-AA-A--TTT-GT-ATT---ATTTG--CACAT------AATC--AT-GT--TTATTT-----TT-CAT----------TTT--T-AT---A----------------TTCGT----TT-TG--TAGT-AA----ACTA----------------TGTG-GA-----T--ATTCAG-----A-TTTG----------------TG-GGA----CGAT--AC-T-AA-TTT-CCC----CCCCAAAC----GATAG-TGGACATGCGC----GAG-CCGT-TATA------CA-TTTC-G--------TTA--AAAGAACATGAA-GAACCATTTTTAAG---AGAGAGAGNGAGA-GAGAGCACTT-AATAACGTTTGTCATTACGTATG---TTTGAG---GAA-ACCCC-----CA-------CACACA---CTGTG-ACAGA-GAAGAATG---AAAACG---CAATGATT-CATTT-----CAGTTTTGTT-GGT-AG-AC-AAAATACC-GAGTA-ATCGTAAA-TCGT-TCACAGACCCAGT-----------CCG-TG-CTATCTCAATCACAACGATGGCC--TTGCTT-CCATGA----CCAAC-T---------------T-GA-TTG---TTG-AANATGGTC---------GA-ATGAAC------------ACA--CTG----AA----TCGGT--CCGAACGTAGGGATATGC-A----------ACCG-AAATATA-TTTTTTTTAACTCCC-----------------AAAG---TTCAA-CAA----GCNTGCACTTTGCTTGCAA-CTGTAAAATACAAGC-ACGTGGAAAGTGTTC-A---TAAT-TTG-AATAAACACCGGGATGATCA--ATGC---CATA----TCAGCCATAGTA-------AATACCCGTAN----GTAATACCG------AAATAAAG-T--TTCTCCATCGAAATAAG-TGCATGA-CA-AAA--CTGCAGAGGCAAACAC--TAATCTATTT--TTA-CC-TTGCCTGT-AAGTAT-A--C-TTTA-TATTATACC-------------CGACA------------------T--------T----------------------ACCGC-TTG-----TTTTAAAG------------------AAAATTTCTAT-TTACCG-CTTAT--TCAGTNAAGTGGGAAA-TAT-A-CG-ATA---A-AA---CTAA--ATAATACAATA------------A----------------TTT--------------CCTGACTGAATG-TACCC-A-CCGAC-TTTTTTTTAATATGG-GT-ACTAGT------A-----G----------T--T--ATGGGCCGA--CA--TGA---TTAGATACATATG----AACAGACAAG--GCAA-TTGACACGAAG-AAAATACA--CTTT-TTCTTCAA-AGAATAATATTTTTT-TA-T-GTTACACATGT---TCAATTGATTT----GCAC-G-TACTAGTAATTACAT--TTACTATA-TATGTA-GCAT--ACAACTG-CCG-----------TGAT--AATTTACA-TGCG-G-GTT--GCGACGTCAAAAA-CGGT-CAT--TG-G-----TG-AC---TT-GAA-CTTGGA--C-CAGA------AAA---------A----------TTAAGTT----TTAT--GG-TTGTGCG------------TA-------------CCC-----CCCCCCCCCT---CCAC-TT-C-TANG----------------------TTTGAATT--------------G-CTC-------AC-AAAA-CACAATAAT-CATACGATATA--A-TT--GC-AAG--TT---T--A--AAGATACA--AAA-A--AAAG-T-ACAT-A-AATGTA-TATN--ATATATA-CATGTATATGCACCTA-CAAAAGCAG-T--A-C-AGAC-AAA--CTAATATCAT-ATTATCAAAT-AAA-TAAAA--TA--TTTTAT--CGACC--TA--CCTACCCAGAG-AA--AAATAAG-GGC--CTACTTGAAG----TTATTT-TTTG----GCTTA------------------GA-AAAAATAAAATATTTTA---C-CTAC-CTA---CCGACCCTA-CGTCCGTAAAT-C-G--G-TCG-G--AAA-GG--GCAAACAAACAAT--TTTTTAATTTA
Reference ( family-458 ) : CTAAATTA-AAA--TT--TTGT----T--T-GT-TT-GCGG-------T----TTC-CC--GA---CCGACC----T-AGTAAA-T--TCGTT-NC-GA-C-TGAA--A---AT-C-T--T-T-T-------ATTT-----G--TAT-TT-------------A----C---CAGG--T--GATAT-TTT---TTT--TTA---TTCATT--T-CTG-TT--GCG-AC---CGA-----------CCGA--AAAT-CT-----TA-TTTCT-----GC----A-TT--T--A---CCG---CTC--A--AAAC-AT--TTT--T--------AT-----CG-AA-AATT-C--TGA----T--TTTTTTTT--CC--CGAT----AA--GGACT-A-------AGTAC-TCCTAGT-----TTTC---TACCTTGTCCGCA-CGCAAGC--TCGGAG-CTGAGA-CACTTCCGAAT-----AC---------C---------------ATA-TATAC------------CAAT-CG-TCAG--CGA-CT--ATAA-A-A-ACGTGC-TTA--TCATGCATCAA---AA---GTA-TC--AT--TTT--A---AT-AT---AA-AATGCATAGTT-TCA-TA--AAGT-AA-ATGA-A-TTGAA---T--TTGCA------TTTA----GG---T-A-CGAAAT----TGTAG-CA-T--AAGGGG-GAGGA-GG-TTGA-AG-GA-G-ATCG--T-AA----AG-ATA-TGGAAAAGTTTCATA--T--ATCT--TTA--CGGGA-CAA--------------AA-AACCA--TGGATTCAGACCCAA-CACAACT-T-----GTC-----CG-A-T--ACAG-AGAT---------TGAGAATCGG--T-A--TGAA---TTAAAACCAGATCAA-G----TCGCT-GC------A-CTTCGT-GCAATTTGAAGATGC--A---T--TATACA-TGTAT-GCCT-ANTACCAA--C-TGGTTATAGAAA-TAANA-TACGCAGAATGAATATT-T-GCTCCAGCAAAACGCNATCGCCATG-G-C-GG-TAAT----GAATC-AAACGTTC-A---GTGA-AA-A--TTT-GT-ATT---ATTTG--CACAT------AATC--AT-GT--TTATTT-----TT-CAT----------TTT--T-AT---A----------------TTCGT----TT-TG--TAGT-AA----ACTA----------------TGTG-GA-----T--ATTCAG-----A-TTTG----------------TG-GGA----CGAT--AC-T-AA-TTT-CCC----CCCCAAAC----GATAG-TGGACATGCGC----GAG-CCGT-TATA------CA-TTTC-G--------TTA--AAAGAACATGAA-GAACCATTTTTAAG---AGAGAGAGNGAGA-GAGAGCACTT-AATAACGTTTGTCATTACGTATG---TTTGAG---GAA-ACCCC-----CA-------CACACA---CTGTG-ACAGA-GAAGAATG---AAAACG---CAATGATT-CATTT-----CAGTTTTGTT-GGT-AG-AC-AAAATACC-GAGTA-ATCGTAAA-TCGT-TCACAGACCCAGT-----------CCG-TG-CTATCTCAATCACAACGATGGCC--TTGCTT-CCATGA----CCAAC-T---------------T-GA-TTG---TTG-AANATGGTC---------GA-ATGAAC------------ACA--CTG----AA----TCGGT--CCGAACGTAGGGATATGC-A----------ACCG-AAATATA-TTTTTTTTAACTCCC-----------------AAAG---TTCAA-CAA----GCNTGCACTTTGCTTGCAA-CTGTAAAATACAAGC-ACGTGGAAAGTGTTC-A---TAAT-TTG-AATAAACACCGGGATGATCA--ATGC---CATA----TCAGCCATAGTA-------AATACCCGTAN----GTAATACCG------AAATAAAG-T--TTCTCCATCGAAATAAG-TGCATGA-CA-AAA--CTGCAGAGGCAAACAC--TAATCTATTT--TTA-CC-TTGCCTGT-AAGTAT-A--C-TTTA-TATTATACC-------------CGACA------------------T--------T----------------------ACCGC-TTG-----TTTTAAAG------------------AAAATTTCTAT-TTACCG-CTTAT--TCAGTNAAGTGGGAAA-TAT-A-CG-ATA---A-AA---CTAA--ATAATACAATA------------A----------------TTT--------------CCTGACTGAATG-TACCC-A-CCGAC-TTTTTTTTAATATGG-GT-ACTAGT------A-----G----------T--T--ATGGGCCGA--CA--TGA---TTAGATACATATG----AACAGACAAG--GCAA-TTGACACGAAG-AAAATACA--CTTT-TTCTTCAA-AGAATAATATTTTTT-TA-T-GTTACACATGT---TCAATTGATTT----GCAC-G-TACTAGTAATTACAT--TTACTATA-TATGTA-GCAT--ACAACTG-CCG-----------TGAT--AATTTACA-TGCG-G-GTT--GCGACGTCAAAAA-CGGT-CAT--TG-G-----TG-AC---TT-GAA-CTTGGA--C-CAGA------AAA---------A----------TTAAGTT----TTAT--GG-TTGTGCG------------TA-------------CCC-----CCCCCCCCCT---CCAC-TT-C-TANG----------------------TTTGAATT--------------G-CTC-------AC-AAAA-CACAATAAT-CATACGATATA--A-TT--GC-AAG--TT---T--A--AAGATACA--AAA-A--AAAG-T-ACAT-A-AATGTA-TATN--ATATATA-CATGTATATGCACCTA-CAAAAGCAG-T--A-C-AGAC-AAA--CTAATATCAT-ATTATCAAAT-AAA-TAAAA--TA--TTTTAT--CGACC--TA--CCTACCCAGAG-AA--AAATAAG-GGC--CTACTTGAAG----TTATTT-TTTG----GCTTA------------------GA-AAAAATAAAATATTTTA---C-CTAC-CTA---CCGACCCTA-CGTCCGTAAAT-C-G--G-TCG-G--AAA-GG--GCAAACAAACAAT--TTTTTAATTTA
gi|1 : CTAAATTA-AAA--TT--GTGT----T--T-GT-TT-GCGG-------T----TTC-CC--GA---CCGACC----T-AGTAAA-T--TCGTT-GC-GA-C-GGAA--A---AT-C-T--T-T-T-------ATTT-----G--TAT-TT-------------A----C---CAGG--T--GATAT-TTT---TTT--TTA---TTCATT--T-CTG-TT--GCG-AC---CGA-----------CCGA--AAAT-CT-----TA-TTTCT-----GC----A-TT--T--A---CCG---CTC--A--AAAC-AT--ATT--T--------AT-----CG-AA-AATT-C--TGA----T--TTTTTT----CC--CGAT----AA--GGACT-A-------AGTAC-TCCTAGT-----TTTC---TAC-TTGTC-GCA-CGCAAGC--TCAGAG-CTGAGG-CACTTCCGAAT-----AC-------------------------ATA-TATAC------------CAAT-CG-TCAG--CGA-CT--ATAA-A-A-ACGTGC-TTA--TCATGCATCAA---AA---GTAATC--AT--TTT--A---A--AT---AA-AATGCATAGTT-CTA-AA--AAGT-AA-ATGA-A-TTGAG---T--TTGCA------TTTA----GG---T-A-CGAAAT----TGTAG-CAAT--AAAGGG-GAGGA-GG-TTGA-AG-GA-G-ATCGGTT-AA----AG-ATA-TGGAAA-GTTTCATA--T--ATCT--TTA--CGG-A-CAA--------------AA-AACCA--TGGATTCAGAACCAA-CACAACT-T-----GTC-----CG-A-T--ACAG-AGAT---------TGAGAATCGG--T-AAATGAA---TTAAAACCAGATCAA-G----TCGCT-GC------A-CTTCGT-GCAAATTTAAGATGC--A---T--TATACA-TGTAT-GCCC-AATACCAA--C-TGGTTATAGAA--TAAGA-TACACAGAATAGATATT-TTGCTCCA--AAAACGCAATCTCCATGTG-T-GG-TAAT----GA-TC-AAACGTTC-A---GT-----------------TT---ATT-G--CACAT------AATG--AT-GT--TTATTT-----TT-CAT----------TTT--T-AT---A----------------TTCGT----TT-TG--TAGTTAA----ACTA----------------TGTG-GA-----T--ATTCAG-----A-TTTG----------------TG-G-A----CGAT--AC-T-AA-TTT-CCC----CCCCAAAC----GATAG-TGGACATGCGC----GAG-CCGTGTATAATGAACCA-TTTTTN--------NNN--NNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNNN---NNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNCATTACATATG---TTTGAG---GAA-ACCCC-----TA-------CACACA---CTGTG-AAAGA-GAAAAATG---AAAACG---CAATGATTTCATTT-----CAGTTTTGTTTGGT-AG-AC-AAAATACC-GAGTACATCGTAAAATCGT-TCATAGACCCAGT-----------CCG-TG-CTATCTCAATCACAACGATGGCC--TTGCTTTCCATGA----CCAAC-T---------------T-GA-TTG---TTG-AATATGGTC---------GA-ATGGAC------------ACA--CTG----AA----TCGGT--CCGAACGTAAGGGTATGC-A----------ACCG-AAATATA-TTTTTTTTAACTCCC-----------------AAAG---TTCAA-CAA----GCCTGCACTTTGCTTGCAA-CTGTAAAATACAAGC-ACGTGGAAAGTGTTCAA---TAAT-TTG-AATAAACACCGGGATGATCA--ATGCATGCATA----TCAGCCATAGTA-------AATACCCGTAA----GTAATACCG------AAAT-AAG-T--TTCTTTATCGAAATAAG-TGCATGA-CA-AAATTCTGCAGAGGCAAACAC--TAATCTATTT--TTA-CC-TTGCCTGT-AAGTAT-A--C-TTTA-TATTATA---------------CAACA------------------T--------T----------------------ACCGC-TTG-----TTTTAAAG------------------AAATTTTCTAT-TTACCG-TTTAT--TCAGTAAAGTGGGAAA-TAT-A-CG-ATA---C-A-----TAA--ATAATACAATA------------A----------------TTT--------------CCTGACTGAATG-TA-CC-A-CCGAC-TTTTTTTTAATATGG-GT-ACTAGT------A-----G----------T--T--ATGGGCCGA--CT--T-----TTAGATAAATATG----AACAGACAAG--GCAA-TTGACACGAAG-AAAAT-CA--CTTTGTTCTTCAA-AGAATAATATTTTTTATACT-GTTACACATGT---TCCATTGATTT----GCAC-G-TACTAGTGATTACAT--TTACTATA-TATGTA-GCAT--ACAACTG-CCG-----------TGAT--AA---ACG-AGTGTT-GCT--GCGACGTCAAAAA-CGGT-CAT--TG-G-----TGAAC---TT-AAA-CTTGGA--C-CAGA------AAA---------A----------TTAAGTT----TTAT--GG-TTGTGCG------------TA-------------CCC-----CCCCCCCCCT---CCAC-TT-T-TAAG----------------------TTTGAATT--------------G-CTC-------AC-AAAA-CACAATAAT-TATACGATATA--A-TT--GC-AAG--TT---T--A--AAGATACA--AAA-A--AAAGTT-ACAT-A-AATGTA-TATT--ATATATA-CATGTATATGCACCTA-CAAAAGCAG-T--A-C-AGGC-AAA--CTAATATCAT-ATTATCAAAT-AAA-TAAAA--TA--TTTTAT--CGACC--TA--CCTACCCAGAG-AA--AAATAAG-GGC--CTACTTGAAA----ATATTT-TTTG----GCTTA------------------GA-AAAAATAAAATATTTTA---C-CTAC-CTA---CCGACCTAA-CGTCCGTAAAT-C-G--G-TCG-G--AAA-GG--GCAAACAAACAAT--TTTTTAATTTA
gi|10 : --T-GT-TT-GCGG-------T----TTC-CCC-GA---CCGACC----T-AGTAAA-T--TCGTT-GC-GA-C-GGAA--A---AT-C-T--T-T-T-------ATTT-----G--TAT-TT-------------A----C---CAGG--T--GATA---TT---TTT--TTA---TTCATT--T-CTG-TT--GCG-AC---CGAC----------CCG----AAT-CT-----TA-TTTCT-----GC----A-TT--TTAA---CCG---CTCAAA--AAAC-AT--TTT--T--------AT-----CG----AATTCC--TGAC---T--TTTTTTTT--CG--CGAT----AA--GGACT-A-------AGTAC-TCC-AGT-----TTTC---TACCTTGTCCGCA-CGC-AGC--TCAGAG-CTGAG--CACTTCCGAAT-----AC---------C---------------ATA-TATAC------------CAATCCG-TCAG--CGA-CT--ATAC-A-A-ACG-GC-TT---TCATGCATCAA---AA---GTA-TCAAAT--TTT--A---AT-AT---AA-AATGCATAGTT-TC--TA--AAGT--A-ATGA-A-TTGAA---T--TTGCA------TTTA-----G---T-A-CGAAAT----TGTAG-CA-TAAAAGGAG-AAGGA--G-TTGT-AG-GA-G-ATCG--T--------G-ATA-TGGAAAAGTTTCATA--T--A-CT--GTA--CGGGA-CAA--------------AA-AACCAATTGGATTCA-ACCCAA-CACAACT-T-----GTC-----CG-A-T--ACAGAAGAT---------TGAGAATCGG--T-A--TGAA---TT-AAACCAGATCAA-G----TCGCT--C------A-CTT
gi|11 : ----T--T-GT-T--GCGG-------T----TTC-CC--GA---CCGACC----T-AGTAAT-T--TCGTT-GC-GA-C-GGAA--A---AT-C-T--T-T-T-------ATTT-----G--TAT-TT-------------A----C---CAGG--T--GATA--TTT---TTT--TTA---TTCATT--T-CT--TT--GCG-AC---CGA-----------CCGA--AAGTGCT-----TA-TTTCT-----GC----ATTT--T--A---CCG---CTC--AACAAAC-A---TTT--T--------AT-----CG--A-ATTT-C--TGGAC--T--TTTTTTTT--CG--CGAT----AA--GGA-T-A-------AGTAC-TCC-AGT-----TTTC---TACCTTGTCCGCA-CGC-AGC--TCAGAG-CTGAG--CACTTCCGAAT-----AC---------C---------------ATA-T-TAC------------CAAT-CG-TCAG--CGA-CT--ATAACA-A-ACGTGC-TT---TCATGCATCAA---AA---GTA-TCA-AT--TTT--A---A--AT---AA-AATGCATAGTT-TCT-AA--AAGT--A-ATGA-A-TTGAA---T--TTGCA------TTTA----GG---T-A-CGAAAT----TGTAG-CA-TA-AAAGGA-GAGGA--G-TTG--AG-GA-G-ATCG--T--A----AG-ATA-TGGAAAAGTTTCATA--T--A--C--TTA--CGGGA-CAA--------------AA-AACCA--TGGATTCAGACCCAA-CACAACT-T-----GTC-----CG-A-T--ACAG-AAGA---------TGAGAATCGG--TAA--TGAA---TTAAAACCAGATCAA-G----TCGCT-GC------A-CT
gi|12 : TTTTTT-TA-TCGTTTCACATATGGGTCAA-------------A-----AATAGTATCTATATAATTACTATG-TATGTG-GC-T--ACAA--G-CCG------------GAT--AATTTACAATAGT-G-ATT--GCGACGTCAAAAAACGGT-C-T--TG-G-----TG-AC---TT-GA--CTTGGAA-C-CAGATTGAGAAAA---------A----------AAAAACTGCGATTCT--GT-TTGTGCG------------TA------------------------------------AC-TT-C-TA-G----------------------TTTGAATT----------------CTTGGAGGAAATGAAAA-CAAGATAAT--ATACGTCAAA--A-TT--GCTAAA--TTCTAT--A--GAGATACA--AAA-C--AAAG-T-GTAT-------TA-TATA--CTA-AT--CAT-------CA-CTA-CAAAA-CA--T--G-CAAGAC-AAA--CTTCTATAATCATTATCAAATAAAA-TAAAA--TAT-TTTTAT--CTACC--T---CCTA-CCAGA--AA--AAATAAG-GGC--CTAC-TGAA-----TTATTTGTTTG----GCT--------------------GA-GAAAAT--AACATTTTA---C-CCATACTA---CCG-CCCTA-C-TTCGT-AAT-C-GC-G-TCG-G--AAA-AGGCGCAATCAAACA----TTTTTAAT
gi|13 : t-----------TGAT--G-TTTACA-TG---A-GTT--ACAGCACCAAAAA-CAGT-TAC--TATG-----TG-AC---CT-GAA-CTTGAA--C-CAGA------AAA---------GGGGCGATACTTTTAGTC----ATAT--GGATTACGC-------------TA-------------CAC-----CCATCCAAC------AC-TT-CCTGGG----------------------TTAGAATT--------------T-CT-----------AAAA-CA-AACAATGCGCACAATACACGA-T-------AA--TT---T--A------TG--------------G-T-ACAT------GTA-TATGCAAAATA-A-CATAGATAT------A-CAAATACAG-T--A-C-AGAC-AAA-----A-GCCGC-ATTATCAAAT------AAAA--TA--TTTTAC--CAACT--TA--TCTACAAAATG-CA--TAAAAAA-GGCTTCTGTTTT--GTTTTTTGTTT-TTTT----GTTTGTTTTTTTTTTTTTTGGCTGAGAAAAATAAAATATTTTG---C-CTAC-CTA---TTTACCCT--CTTTCG------G-G--G-TCGTT--AAA-GG--GCAAAAAAAAAATCATTTTTTATTTA
gi|14 : ctc-------------CCC-----CCCCCCCCTT---CCAC-TTTC-GACG----------------------TTTGAATT--------------G-CTC-------AC-AAAAACACAATA-T-C---CGATATA--T-TT--GC-AAAGTTT---T--AGTAAGACACACAAAA-ACCAAAG-TTACATTATAATGTAGTATA--ATATATATCGTGTATATGCATCTAACAAAAGCAGGT--AAC-AGAC-AAAAACTAATATCAT---TATCAAAT-AAA-TAAAAAATA--TTTTATTCCGACCCGTATCCCTACGCAGAG-GATAAAGTAATCGGC--CTACT-GAAG----TTATTT-TTTGTTTGGCTTA-------------------A-GAAAATAAAATATTCTGAGGCGCTAC-CTGGAGCAGACCCTAGCGTTCGTAAAT-C-G--GGTCG-G--AAAAGG--GCAAACAAACAAT--TTTTTAATTTAggcc
gi|15 : gatttcgccctcccA-TATTATGC----------------------------------------------T----------------------ACCGC-TGG-----TTTTAAAG------------------AAA--TTCTAT-T-ACCGGTTTAT--TCA--TAAGTGGAAAA--AT-A-CG-CTA---A-------TAA--ATAATACAATA-------------------------------T--------------CTGGGCTGAATG-TACTC-ATCCGA---TTTTTTTAA---------ATT-GT------A-----A----------T------TGGGCCGACCCA--TTT---TTAGATA-ATCTG----A--AGACAAGCAGTAA-ATGACACGA---AAAAT--A--CTTT-TCC----A-AGAATAATATGTTTA-TA-C-G-TA-ACAT-T---TCAA-TGATTTGGCAGTACAG-TACTAGTAA-TACAT--TTACTAGA-GA-G-A-GCATTCACGCCTG-TTG-----------TG
gi|16 : tctgtctatacttacctgtatattccaacatattcatggtgga-GG-TAATTTCGGATTCTAAACGTTC-ATTTGTAA-AG-AC-TTT-GTTATTTGCATTTGGTCACATTATTTTAATTTGAT-GT--TTATTTATTTGTT-CATTTTTTTATATTTT--TGAT---AGATTAAGTTTCTTACTTCCGT----TTATGGTTAGT-AA----CTTA----------------T-TG-GAGTTAGT--ATCC---------TTTG----------------TG-GGA----CGATACAC-TAAA-TTT-CCCCCCACCCCATACCGAAGAGAGATGGACGT-CGCTCCTGAG-CCGT-TGTAG-----TATTTTC-GGATTTTCTTTGTCGGAGAACAT----GAACCA--TTTAAGGTAAGATAGAGTAAGATGAGAG
gi|17 : aTA-------AGTACT-GTAC-----TAAGGCCG------AA-TAA-G-T--TTCTCCATTGAAATAAG-TG----A-CA-AAA--C-GAAGAGGCAAACAC--TAATCTATTTAATT--TC-T--CCTTTAAAGTAT-A--CATTTA-TATTTCACCAACATTTTCATGTCGACA------------------TATCAAGTCT----------------------ACCG---TG-----TTTTCAAT------------------AAA---TC-AT-TT------CTAT--TCAGCTAAGTGGGAAA--ATAA-CGTAGA---AGAA---CTAA--ACAA---AATA------------A----------------TT
gi|18 : CTAAATTA-GAAATTT--TTGT----T--T-GT-T--GCGG-------T----TTC-CC--GA----CGACCCCATT-GTTGAC-T--TCGTTACC-GA-CGTGAATCA---ATAC-T--T-TCT-------ATTTTG---A--TGT-TTG------------A----CGTACAGG--TTGAATATATCT---TTT--TTATATTTCGTTTCT-CTG-TT---TA-AC---CGATACCTGTGGAGCCGATTAAAT--T-----TATTTTCT-----GTGACAA-TT--C--ATACCCGAAACAC--A--AAAC-AT--TTTCCT--------ATTA---TG-AACAATT-C--TGA----T--TTTTTTT----C--AGCTA---AA--GGACT-A-------AGTATATCCTGAT-----TTaatatttatataatatatagaagatatctatctctccatccgatcctttttttttttttatcgtttcacatatgggtcaaaaatagtat
gi|19 : AACGGTC-A---TTGA-AA-T--TTT-GT-ATTC--ATTTG--TAT-T------CACT--AT-GC--TTGCTT-----T--CAT----------TTT--T-AT---------------------TCAT----TT-TG--TAGT-AG----AATA----------------TGAG-GA-----T--ATTCAG-----A-TT
gi|2 : tttgcatcagaaaacatatctttttgatgaggtttatgagCTAAATTA-AAA--TT--T-GT----T--T-GT-TT-GCGG-------T----CTC-CC--GAA--CCGACC----C-AGTAAA-T--TCGTT--C-GA-C-TGAA--A----T-C-T--T-T-T-------ACTT-----G--TATATT-------------A----C---CAGG--T--GATAT-TTT---TTT--T-A---TTCATT--T-CT--TT--GCG-AC---CGA-----------CCGA--AAAT-CT-----TA-TTTCT-----GC----A-TT--TT-A---CCG---CTC--A--AA-C-AT--TTT--TT-------AT-----CG-AA-A-TT-C--TGA----TATTTTTTTTT--TC--CGAT----TT--AGACT-ACAGCTGTAATAC-TCGT-GT-----TTTC---TAC-TTGTCCGCA-CGCAGCC--TCGGAG-CTGAGA-CACTTCCGAAT-----AC---------CGCATGTACACTGTACATAATATAC------------CAAT-CG-TCAG--CGA-CT--ATGA-A-A-ACGTGCCTTA--TCAT----CGA---AA---GTA-TC--AT--TTT--A---ATTAT---AAGAATGCATAGTT-TCAATA--AAGT-GA-ATTA---TTGAA---T--TTGCA------TTTA----GG---T-A-CGAAAT----TGTAG-CA-T--ACGGGG-GAGGA-GG-TTGA-AG-AA---ATCG--T-AA----AG-ATA-TGCGAAAATTTCATA--T--ATCT--TTAGGCGGAA-CAA--------------AA-AACCA--TG-ATTCAGACCCAA-CAC--CT-T-----GTC-----CGCA-T--ACAG-A-----------------------------TGAA---TTAAAAC-AGAT-AA-G----TCGCT-GC------A-CTTTAT-GCAATTTGAAGATGC--A---T--CATACA-T-TAT-GC---AATACCAA--CCTGGT-ATAGAAA-TAAGA-TACGCAGAATAAATATT-T-GCTCCA--AAAACGCATTCATCATG-G-C-GGCTAAT----G-ATC-AAACGTTC-A---GTGA-AA-G--TGT-GTAATT---A-TTG--CACAT------AATG--AG-A----TA--------TT-CAT----------TTT-----T---A----------------TTCGT----TT-TG--TAGT--A----ACTA----------------T-TG-GA-----T--ATTCAG-----A---TG----------------TG-GGA----CAAT--AC-T-AATTTT-CCC----CTCCAAAC----GATAG-TGGACAT-CGC----GAG-CCGT-TAT--------A-TTTC-----------TA-----------------------TTTAAC---CGAGAGA-CGAGA-AA------TTAAATAATGT--------------------TGAG-----A-ACCC---------------TACACA---CTGTG-A-AGA-GAAG-AT-------------------TT-CATTT-----CAG-TTTGTT-GGT-AG-AC-AAAATACC-GAAC--ATCGTAAATTCAT-ATATAGACCCAGT-----------CC--TGCCTATCTCAATCACAACGATGGCCTTTTGCTT-CAATGA----CC-AC-T---------------T-GA-TTG---TTGAAATATGATC---------GA-ATAAAC------------ACA--CTG----AA----TCGGT--ACGAACGTGAGGGTATGC-A----------ACCGCAAATA-----TTTTTTAAATCCC-----------------AAAG---TTCAA-CAA----GCCTGCACTTTGC-TGCAA-TTGTAAAATAAAAG--ACGTGGAAAGTGTTC-ATGTTAATATTGAAATAAACACCGG--TGATCATGATGC---CATATCACTCAGCCATAGTA-------AATACCCGTAA----GT-ATACCA------AAATAAG-----TTCT-TATCGAAATAAG--GCATGA-CATAAAT-CTGCAGAGGCAAACAC--TAATCTATTT--TTA-CC-TTGCCTGT-AAG-ATAA--C-TTTA-TATTATA-C-------------CAACATTTCATGTTAATATAAAGT--------T----------------------ACCGC-TTG-----TTTTAAAG-------------------AAATTTCTAT-TTATCG-CTTAT--TCAGTAAAGT--GAAA--AT-A-CG-ATACATA-CA---TGGA--ATAACA-AATAAATTTATTATCTA----------------TTT--------------CTTGACTGAATGATA-CC-A-CCGACTTTTTTTTTAATATGGCGT-ACTAGT------A-----ATTAGTAGAGTT--T--ATGGACCGA--C---CAA---TTAGATGCATAT------ACAG-CAA---GCAA---GACACGAAGAAAAATACA--CTTT-TTCTTC-A-AGAATAATATT--------T-ATTACACATGT---TCAATTGA-TT----GCAC-GCTACTAGTAATTACAT--TTAC-ATATTATGTA-GCCT--ACAACTG--CG-----------TGAT--AATTTACA-T--G-A-GTT--GCGACGTCAAAAA-CGGT-CA---TG-G-----TG-AC---TTAAAA-CTTGGA----CAGA------AAA---------A-----------TAACTT----TTAT--GG-TTGTGCGCTTGCGACCCTCCG-------------CCC-----CCCCCCCCCTCCCCCCC-CT-C-CACGCCCCCCCCCCCCTCACTTTAAGTTTGAATT--------------G-CTC-------AC-AAAA-CACAATAAT-ATTACGATATA--T-TTGCGC-AAG--TT---T-----AAGATACA--AAACA--ACAG-T-ACAT-A-AATGTT-TATT--ATA-ATA-TCTGTATATGCATC-A-C-AAAGCA--T--A-C-AGACAAAA--CT-ATATC---ATTATC-----AAA-TAAGA--TA--TTTTAT--CGagctccgtaaatacatttataaacggtgagacaaaactaattttattcgtattgttgagtagacaagcgtgacccattatatttttttcaacatttgataaagaacaaatttaat
gi|20 : GCACCTA-CAAAAGCAG-TTTA-C-AGAT-AAAA-CTAATATCAT-GG-ATCAAAT-AAA-TAAAA--TA--TTTTAT--CGACC--TA--CCTACCCAGAGAAA--AAATAAG-TTC--CTACTAGAAG----TTATTT-TTT-----GCTTA------------------G--AAAAAT-AAATA-TTTA---C-CTAC-CTA---CCGACCTAA-CGTCCGTAAAT-C-GGCG-TCG-GAAAAA-GG--GCAAACAAACAAT--TTTTTCATTTtaaaatttatcacaaatgaaaattcttctataaacaaaaaaatttatttcttataaaaaatggtaaaaata
gi|21 : ATTTCAC--TT--TATA-TATAGA-GCAC--ACAACTGGCTGGGGTAAACCTCTGATGAAATTTACA-TGGG-A-GTT--GCAACATTAAAAA-TGGT-CAT--TG-G-----TG-AC---CT-GAA-CTTACACCC-CAAA------AAAGGGTGATTCA----------TTTAGTCCA--TTATTGGA-TCATGTA------------TA-------------CCC-----CCta
gi|22 : GCACCTA-CAAAAGCAG-T--A-C-AGAT-AAA--ATAATATCAT---TATCAAATAAAA-TAAAA---A--TTTTAT--CGACC--TA--CCTACCCAGAGAAA--AAATAAG-GTC--CTAC-TGAAG----TTA-TT-TTTG----GCTTA------------------G--AAAAATAAAATA-TTTA-----CTAC-CTA---CCGACCATA-CGTCCGTAAAT-CGG--G-TCG-GA-AAA-GG--GCAAA-AAACAAT--TTTTTCATTTAaactttctggattagaattccagggaaaaatttgcacacaat
gi|23 : ACGATGGCC--CTGCTT-C-ACGA----C--AC-TGGCTTATCTATGGTCT-GA-TTAGTTTTG-AACATGGTCATCGATTGAGAGATAAACCCCATGTCCAAAACT--CTATCCTGA----TCGGTATCCGAACGTAAGG-TA-GC-ACAAAAAATATACCG-AAATATT-TTATTTTTA
gi|24 : AAAA-AAA-AAAAA--TAATCTTTAT--CGACC--TA--CCTACCCAGAG--A--AAATAA---AC--CTAC-TGAAG----TTATTT-TTTG----GCTTA------------------CA-AAATA-AAAATATTTAA---T----C-CTA---CCGACCCTA-CGTCCGTAAATGC-G--GTTCG-GA-AAA-GG--GCAAACAAACAA---TTTTTAATTTAc
gi|25 : AAT-AAAATAAAA--TACTTTTTAT--CTAC---TA--CCTACC-AGAG-AA--AAATAAG-GGC--CTACT-GAAG----TAATTT-TTTG----GCTGA------------------GA-AAAA-TAA--T-TTTTA---C-CTAC-CTA---CCGACCTTA-CTTTCGTAAAT-CGG--G-TCG-GGAAAA-GG--GCAAACAA
gi|26 : AAAT---AAC--TT--GTGT----TATT-GTGTT-GCGG-------TATATTTC-CCACGA---CCGACCC---T-AGTAAA-TTATC-TT-GC-GA-C--GAA--ATATAT-CAT--T-A-T-------ATTTTTGTGG--TAT-TTTTAGAACATCCTGA----C---CACA-----AATAT-CTT---CTTTATTT---TTCATT--T-CTG-tttt
gi|27 : AGCGCTC-A---TTGA-AA-A--TTTTGT-ATT---A--------CAT------A--C--AT-GT----ATGT-----TTACAT----------TTT--T-ATTCGG----------------TTTTT----TT-TT--TAGT-AA----CTTA----------------TGAG-GA-----T--ATTTAG-----A-TTT
gi|28 : gatgggaatttaaggacT--AGTTTACA-TGCA-G-GTTCAGCGCTGTCAAA---CGGT-CATTCTG-GGAGCATG-TCCCTTT-GA----TAGA----TAGT------ATATT-------A----------TTAA--T----TTAT-----TTGTACA------------GA-------------CAC-----CCCCCCCCCC---CC-C-TT-C-cctctttccgtaaacacatttgctaaacgat
gi|29 : -AATAAACACCGGGATG----------------A----TCAGCCATAGTA-------AATA-CCATAC----GT-ATACCGAAAAAAAAATAAAGATAATTCTTATTCG--ATAAGTTGCATGATTA-AAA--C-----AGGTGAAT-------TCTATTT--TCA-Cccccgggccttgtaat
gi|3 : aGTGGAAAGTGTTC------------G-AATAAAC-CCGGAATG-------------CACA----TCAGCCATAGTACATGTTAAGTAACC-TAGTTTGGTAGTTACG------AAATAAAG-T--TTCTCCATCGAAATAA----------------------AGTGACAAACA---TAATCTTTTT--TTA-CC-GTTCCTTT-AAAAAT-A--C-TTTAATATTATACC--------------GACA------------------T--------T----------------------TTCATGTTGAATATTTTTAAAGTTCCGCTGTTTTCAATTAAGAATTTCTATCTTACCG-CTTAT--TCAGTCAAGTAGGAAAATAC-ATCG-ATA---A-A-----TAA--ATGATACAATA------------AACTCTATTTATCTATTTTT--------------CCTGACTAAATG-TACCCCA-CCGAC-TATTTTC--ACATGG--T-ACTAGTTAGTAAA-----G----------T--TTCATGG-CCGA--C---TGAGTTTTAGATACATATGCCATAA-GGGCA-G--GCAAATTGCAACGAAG-AAAGTACA--CTTTATTCTTCAA-AAAAT----TTTTTT-T-----TTATACATGT---TTAATTT-TTT----GCAC-G-TACTAGTAATTATAT--TCA---TG-TATGCA-GCA---ACAAC-G-C-G-----------TGAT--AATTTACA-TGCA-GCGTT--GAGACGTCCAAAA-CGGT-CAT--TG-G-----TG-AC---TT-GAACCTTGAA--CACAGA------AAA---------AAGCGATACT-CTAGTTT----TTAT--GG-TTGTGTG------------TAAACAACAGAACACCCC-----CCCCCCCCCC---CCCC-TT-C-CAGGT---------------------TTTGAATTCCTGGGAGGAAAACG-TTC-------AC-AAAA-CAAGATAA--CATACGG-GTA--ATTT--GC-AAG--TT---TACA--AAGAGATA--AAA-A-----------AC-A-AA---A-TATA--ATATCTG-CATACA------------AAAAGCAG-T--A-C-AAAC-AAA--
gi|30 : ATGA----CCA-C-T---------------C-GA-TTC---GTG-AA-ATGGTA---------GA-ATGA-C------------ACA--CTG----AA----TCAGT--CAGAACATAGGGAAATGC-A----------ACCG-AAAAAAA------ATTGACTCCC-----------------AAAG---atttat
gi|31 : TATG---ATTGAGAGAGGA-ACCCC-----TAAAACTACCATACATTTCTGTG-ATATATGAAAAATG---AATACGGGGCGATGATT-CATTT-----CAGTTTTGCT-gaa
gi|32 : a----------TCT--T-AT---T----------------TTCGT----TT-T---T-GT-AA----ACTA----------------TGTG-GA-----T--ATTCA------A-TTTGTTATCTATAAAT----TGTGGA----CGAT--AA-T-AA-TTT--TT----CTCCAAAC----GACAt
gi|33 : AATTA-AA--------TGT----T--T-GT-TT-GCAG-------T----TTC-CC--GA---CCGACC----C-AGTAAA-T--TCGTT-TC-GA-C-TGAA--A---AT-A-TAAT-T-TAATTCACATTT-----G--TAT-Tt
gi|34 : --CGA-CT--ATAA-A-GGACGTGC-TT---TCA---GTCAA---AA---GTA-TC--AT--TTT--A---AT-AT---AA-AATACAT-GTT-TCA-TA--AAGTCAA-AT
gi|35 : ATT--G-CTG-TT--GCG-AC---CAA-----------CCGA--AA----------TA-T------------------------A---CCA---CTC--A--AAAC-AT--TTT--T--------AT-----CG--A-AATT-C--T
gi|36 : T-C-G--G-GTG-G--CAA-CA--GCAAACAAACAAT--TCTTTATTTTA
gi|4 : tcgggAATTA-AAT--TTCATTGT----T----GT-TT-GCG--------T----TTC-CG--AA---CCGACC----C-AGTAAACT--TCGTT-CC-GAAC-TACA--A---AT-C-T--T-T-T-------ATTT-----G--TAT-TT-------------A----C---CAG----------T-TAT---TTT--TTA---TTCATT--T-CTG-TTTGGCG-ACAAACGA-----------CCGA--AA-T-CT------A-TT-CT-----GC----AATT--T--A---CCG---CT---A--AAAC-ATGTTTT--T--------AT-----CG-AA---TT-CACTGA----T--TTTATCTT--TC--CGATTATTAA--GGACT-A-------------------T-----TGTC---TAC-TTGCCCGAA-CGCA-GCAAT-GAAG---GAGA-CACTTCCAAAT-----ACTGCATGA--C---------------ATA--ATAC------------CAAT------------------ATAACA-A-ACGAGA-CTA----AT-CATCAA---AA---GTA-TC--AT--TTT--A---AT-AT---AA---TGC-TAGTT-TCA-TA--AAGT-AA--TGA-A-TTGAA---T--TTGCA------TTTA----GG---T-A-CG-AAT----TGCAGTCA-T--AAGGGG-CAGGA-GG-TTGACAG-GATA-ATCG--TCAA----AGAACA-TGGAAAAGTATCATA-----ATTT--T----CGGGACCAAAAACAAACAAACATAA-AACCA--CGGATTC-GACCCAG-AACAACT-T-----GTC-----CG-ACT--ACAG-AGAT---------CGAGAATCGGT-T-A--TGAA---TTAAAGCCAGATC-A-GTTTTTCTCTAGCGCCAAAA-CTTCGT-GCA--TTGAAGATTCCAA---T--TATACA-TGCAT-GTCT-ACTCCAAA--C-T-GTCATGGAAA-CAAAA--ATACAG-ATGAATA---C-GTTCCAATGAAAgg
gi|4 : AT----GAAT----ACGTTCCA---ATGA-AAGA--TTT-GT-AGC---TGTTG--CACAT------AATC--A-------TATTT-----TT-GA-----------TTT--G-AA---A----------------------------CA--TAGT-AA----ACTA----------------TG-G-GA-----T--ATTCAG-----ATTTTGTCTATTTATAAATTGTTG-GGA----CAAT--A----AA-TTT---T----TCCCAAAC----GATgatttgtagctgttgcacataatcatatttttgatttgaaacatagtaaactatgggatattcagattttgtctatttataaattgttgggacaataaatttttcccaaacgat
gi|5 : aattaaatttcattgttgtttgcgtttccgaaccgacccagtaaacttcgttccgaactacaaatcttttatttgtatttaccagttattttttattcatttctgtttggcgacaaacgaccgaaatctattctgcaatttaccgctaaaacatgtttttatcgaattcactgattttatctttccgattattaaggactattgtctacttgcccgaacgcagcaatgaaggagacacttccaaatactgcatgacataataccaatataacaaacgagactaatcatcaaaagtatcattttaatataatgctagtttcataaagtaatgaattgaatttgcatttaggtacgaattgcagtcataaggggcaggaggttgacaggataatcgtcaaagaacatggaaaagtatcataattttcgggaccaaaaacaaacaaacataaaaccacggattcgacccagaacaacttgtccgactacagagatcgagaatcggttatgaattaaagccagatcagtttttctctagcgccaaaacttcgtgcattgaagattccaattatacatgcatgtctactccaaactgtcatggaaacaaaaatacagATGC--A---T--TATACAATGTAT-GCCT-ATAACCAA--C-TGGTTATAGAAA-TCATA-TAC-CAGATTCAATATTAT-GCTCCAGCAAAACGCTATCACCATG-GGCAGG-TAAT----GAATC-AAACGTTC-A---GTGACAG-A--TTT-GT-ATTT--ATTTG--CAC-T------AATC--AT-GTATTTATTTATT--TT-CAC----------TCTCTT-AC---AC---------------TTCGTCATTTT-CG--TAGT-AAAGTGACTAACTGAATCGAATGTTGTGTGCGG-----TGAATCGAGGGGGTA-ATTG----------------TG-GGAAATATGAT--ACCT-AA-TTTTCCC----CCCCAAAC----GATAG-TGGACATGCGC----GAGGCCGT-TAT----------TTTC-G--------TTC--AAA-AACATGAA-----CATTTTAACG---AGAGAGAGAGAGA-GAGAG---------AGCG-----CATTAAATATGAAGTTTGAG---GAATACCCCAGGTACA-------CACACA---CTGTGAACAGA-GAGGAAGGAGAAAAACG----AATG------------------TTTGTT-GGT-AGAACAAAAATACCAGAGTA-ATCGTCAG-TCGTATCACAAACCCAGTTACAACTGCACCTG-TA-CTACCT-AATCACAACGATGGCC--TTGCTT--CATGACACCCCATCGT---------------TAGATTTG---TTG-AAAATGGTC---------GA-ATGAAC------------ACACCCTG----AATAATTTGGT---CGAATGTAGGGATATGCAA----------ACCG-AAAT-TATTTTTTTTTTACTCCCCAATAGTGTAGTTTGTTAAAGTATTCCAACCAA----GCGTG--CTTTGCTTGGAACCTGTAAAATACAAGC-ACG-GGAAAGTGTTC-
gi|6 : TAAATTTTAAA--TT--TTGT----T--T-GC----GCGG-------T----TTC-CC--GGGACCCGACC----TCAGTAAA-T--TCGTT-TC-GA-C-TGAA--A---AT-C-T--T-CCT-------ATTT--------TAT-TT-------------A----C----AGG--T--G-TAT-TGT---TTT--TTA---TTCATT--TTCTG-TT--GCGGAC---CGA-----------C-------AT-CTCCCTCTC-TCTCTCAATGAC----A-ATAAT--C---CTG---ACC--T--AAAC-AT--ATA--T--------ATATATTCATAA-AATT-C--TGA----T--TTTTTTTTTACC--CAAT----AA--GGACT-A--------GTGG-TCCTAGT-----TTTC---TA---TGTCCGCATCGCA-GC--TCGGAGACTGAGA-CACTTCCAAAT-----AC---------C---------------GCA-TGTACATTATTACTACTCCAT-CG-TCAG--CGATCT--ATAA-ACA-ACGTTC-TTA--TCAT-CGCCTAGTTAC---GTG-GC--GTGCTTT--ACCTAT-ATGAGAA-GATGCATAGTT-TCA-TTT-AAGT-AA-ATGAGA-TTGAA---TGATTGCA------TTTAAA--GG---TTA-CGAAATGTCTCGTAG-GA-T--AAGGGGAGAAGA-GG-TTTA-AG-GA-ATATCG--T-ACCCCCGG-ATA-GGAAAAAGTTTCATA--T--ATCTTCTTAC-CAGGA-CAA--------------AACAAACA--TGCATTCAGA-CCAA-CACAACTAT-----GTCGGGTGCG-A-T--ACAG-AGATAATGA----TGAG-ATCGGTTT-A--TGAA---ATTAAACCAGATCAACG----TCGCT-GC------AGCTTTGT-GCATTTTAAAGATTC--A---TAGTATAC--TGTATGGCCTAATTACCAAGGC-TGGTTATAGA
gi|7 : -CTTCGTAGCAATTTGGAGATGC--AAATT--CATACA-TGTAT------ACTGTCG---------TATGGAAAATAATAATACGAGAAATGAATATTCT-GCTCCAGCAAAACGCCATCGACATG-G-C-GG-TAAT----GAA------CGT-C-A---GTGA-AA-AGATTT-GT-ATT---ATT-G--CACAT------AATC--ATTAT--TTATTT-----T--CGT----------TTA----AT---A----------------TTCGT----CTGTG--TAGG-TA----AC-A----------------TGTG-TA-----T--ATTCAG-----A-ATTG----------------TG-GGAA---CGATT-AC---AA-TTT-TTC----C---AAAC----GATAG-TGGACATGTGC----GAG-CCGT-TA--------CA-TTTC-G--------TTA--AAAGAACCTAAAAGAACCATTTTTAAG---AGAGAGAGGGAGA-AAGAGCACTT-AATAACGTTTGTCAATTCGTGT----TTCGAG---GAA-ACCTA-----CA-------CATACA---CTGTG-ACAGA-AGAGA------AAACCG---CAATAATTACATTTTGAAGCAGTTTTGTT-GGTCAG-AC-AAAATA----AATA-AT----AA-TCGT-TCACAGACCCAGT-----------CCGTTG-CTGTC----CCACAACGAAAGGC--CTGC-T-CCATGA----CC-AC-T---------------T--A-TTG---TTA-GAAATGGTT---------G--ATGA--------------ACA--CTG----AA----TCAGTCCCCGAACATAGGGACATGC-A----------ACCA-AAAT-CA--TTTTTTTAACTCCA-----------------AAGG---T
gi|7 : -----------------AAAGAT-TTCAG-CAACGCTGCATGCACTT-GCTTGCAA-CTGTGAAATACAAGCAATGTGGGAAattaaactggttccataagcaatattatgtaaagatttcagcaacgctgcatgcacttgcttgcaactgtgaaatacaagcaatgtgggaa
gi|8 : cttcgtagcaatttggagatgcaaattcatacatgtatactgtcgtatggaaaataataatacgagaaatgaatattctgctccagcaaaacgccatcgacatggcggtaatgaacgtcagtgaaaagatttgtattattgcacataatcattatttattttcgtttaatattcgtctgtgtaggtaacatgtgtatattcagaattgtgggaacgattacaatttttccaaacgatagtggacatgtgcgagccgttacatttcgttaaaagaacctaaaagaaccatttttaagagagagagggagaaagagcacttaataacgtttgtcaattcgtgtttcgaggaaacctacacatacactgtgacagaagagaaaaccgcaataattacattttgaagcagttttgttggtcagacaaaataaataataatcgttcacagacccagtccgttgctgtcccacaacgaaaggcctgctccatgaccacttattgttagaaatggttgatgaacactgaatcagtccccgaacatagggacatgcaaccaaaatcatttttttaactccaaaggtattaaactggttccataagcaatattatgtAAATTA-AAA--TT--TTGTATACT--TAGT-TTAGCGAGTCAGATT----TTCTCC--GA---CCGACC----C-AGTAAA-T--TCCTT-TCCGA-C-TGAA--AG--AT-C-T--TGT-T-------ATAT-----GGGTAT-TT-------------AGACGC---CAGGGGTA-GATCTATTTACATTT--TTA---TTCATT--T-CTGCTT--GCG-AC---CGA-----------CCGA--AATT-TT-----TA-TTTCT-----GC----AGTT--T--A----CG---CTC--A--AAACTAT--TTTA-TGTCCATAAAT-----CACAA-AGTTCC--TGAATTTT--TTTTTTTT--TCAGCTAT----AATCGGACTAA-------AGCA--TTCTAGTTATTATTTCCATTACCTT-CCCGCA-CGT-AGC--TC-GAG-CTGAGATTACTTCCAAATGTGGAACGCAATGTAAC---------------ATA-TAT-C------------CCAT-CATTCAGTCTGA-CTCAAT-A-A-A-CCGTGC-TTAATTCAT--ATCAA---AAAAGGTA-GC--AT--TTTTAA---AT-ATGA-AA-AATGCATAGTTATCA-TAATAAGT-AATATGA-ATTTGAATATT--TTGCAGAACGTTTCAAATTGGGGTT-ATCGAAA-----TGT-G-CA-T--AAGAGG-GAGGATGGTTTGA-AGAGG-A-ATCGTTT-AA----GA-GTAGTGGACAAG-TTCATAAGTAAATCT--TTA--CGGGA-C-A--------------AC-AACCT--GGGGTTCAGTCCCAAGCAGCACT-CATAAGGCC-----CG-A-TAAACAG-AGATAAATGAATGTGAGAATCGG--T----TGAATATTTAAAACAAGATCAA-G----TC
gi|9 : gccta--CTGCAGAGGCAAACACACTA-TCTATTT--TTAACCATTGC-TGT-C-GTAT-GAGC-TTTA-TATTATTAC-------------CAACA------------------T--------TTTCATGGTTGATTAATTAAGCTACCGT-TTG-----TTTTAAAG------------------AAAATT---ATATTA-----TTATCATCG--CAAGTGGGAAA-TAT-A-TG-ATA---A-AATAACTAATAGTAATACAATA------------A----------------TTTATTTATCTATTTTACCAGACTGACTG-TACCC-A-CCGAC-TTTTTTTTCATATGG-GTTACTAGT------ATTGGAG----------TCTT--ATGGGCCGA--CAGATG----TTAGA---ATAT-----AACATACAAG--GCAA-TTGACACGAAG-AAAATACAATTTTT-TTCTTCAAGAAGATAATATCTTTT-TA------AAACATGA---TCCATTGATTT----GCAC-G-TACTAGTAATTACA---TTACTATA-TATGTAGGCAT--ACAACTG-CCG-----------TAAT---ACTGACA-CGAATA-GTTG-GCGACAT--AAAA-CGGTCCAT--TG-G-----TG-CC---TT-AAG-CTTGGA--C-C--G------AAA---------A----------TTAAGTT----TTAT--GGTTTGTGCG------------TA-------------CCCTCCCTCCCCCCCCTT---CCACTTT-C-TACG----------------------TTTG-ATT--------------GCCTCA------AC-AAAA-CACAAcc
blockSeqs : T AAT CA ATAC AT A G TA GTCAGAT ATAT T AC GAC CCATT C TA AC C A GT TC TAT A A AA G C AATTCAC TTGTGG A TTAGAACATCCTGA GTA GGTA TA ACA TA TAT TC T C TG G AAA TACCTGTGGAG TT A GC CCCTC T GTGACAATTCATAC AAA AA AC T GT ATGTCCATAAATCACA CAA C AC ATTT AT TTACC TATT TC A CAGCTGTA TA TG TATTA CAT C T AG AA A A AT GTGGA CGCATGTACACTGTAC A ATTATTACTACT C T TC T CA C C G C AAT G GTT AAG . AA GC TA CCT TT GAG G A AA AT CA T GA TAT GA GAACGT AATT GGT T T GTCT T . AA A TG T AC A TA TACCCCC A G AGTAA T TC GG C AAACAAACAAACAT C AT G A A ATAAG GGGTG C C AA A AAATGAATG A TTTA TAT A C TTTT A GCCAAA G A AT AAATT A GGCCTA A GGC G C AA G AT G A AT AT A AT . GCA C TTCGGATTCT C TTT C AGA T T TGCATTT GT A TATTTT TTG TGTATT ATTTGTTCATTTTTTTATATTTTTGATAGATTAAGTTTCTTACT CATT ATGGT . AGTG ACTGAATCGAATGTTG GA C GTTAG GA GGGGTAA TCTATTTATAAATTGT T AATA ACACTA T CCCCCCA C CGAA A G TCCT G . TAGTATTTTCGGATTTTCTTTGTCGGAGAACATGAACCA GTA GT T G CACTTAATAACGTTTGTCAATTCGTGTT AGA T CTAAAACTAC TTT A T T AATGAATACGGGGCGATGATT TGAAG T . C A A C A A C A T A TACAACTGCAC GT C TC TT CA CACTGGCTTATCTATGGTCT T GTT A T ATCGATTGA G ACCCCATGTCCAAA CC TCCT TAAT ATC G A CAAAAAATAT C ATTT CAATAGTGTAGTTTGTT TAT C CGCT C C T T C CA ATGTTAATA A A G ATCATGATGCCATATCAC CATGTTA C G GTTTGGTA AAAAAA AGATAA CC GCATGACATAAATCTGC CAC A AA A A A T GAG A A ACCAACATTTTCATGGTTGATTAATTAAGCT TG AATAT TTCCGCTGTTTTCAATTA A T CTTACCGC CA GCT G AT A T T CATACAT TA T C AACTCTATTTATCTATTTTT G A C C T T TA T CGT AATTAGTAGAGTTT G CCCATTT C GCCATAA A AGCA AT A A AT A A G TATCGT C A GGG T AT GGCA AG TAA CT T T G ATTC T GCT GGGTAAACCTC GA A CAGC CA A C TC T GAGCA . CCT A AC CCC TTGAGA GGGGCGATACTT A GCGA TGGA GTAAACAACAGAACAC TCCCT TCCC A T T C G CCCCCCCCCCCCTCACTTTAAG CCTGGGAGGAAAACGTTC G A A GCG C CGA GC T GT CTATAG C CA ACCAAAGTTACATTATAAT G GCA TATAT AG TATG T T A GG TT A A A AAC T CAT A A AA AT TC CG TC AA TA TC TT TT TTTT G TTTG TTTTTTTTTTTTTTGGCTGAG A T AGGCG A GAG G T G G GC G T AA A GC TCA
blockSeqs : . A . . . . . T . . . C A CT . . G . . G . G . . . . C . TGA . AGACG . TTG TA . . . . . . . . . C . G C . . CAATGACAATAATC . . . . . TATATATTCATA AA C . AC . TTCAG A . . A C TA . . C . A . A . A . GCAATGTAAC . . . . . . . C . . . A G . . . A . . . T GA . . T T G . AT . . . AA . . . . . . A . G . T . AT TTTAA . . T T . C . . . . . A . . . . . . . AATGA A TAA . A . . . . . . TT CAAT . GTCT C CC G T A A T A G CT GC T AC . C . GAATC . . . AC . A CATTT . A . T TTATT ATTTTCACTCTCTTACAC . GTG . . . GA . . . ATT TTATCTATAAAT . A ACCT . TCCC T . . G . . . CATTTCGTTAAAAGAACCTAAAAGAACCATT . GA . G AGCGCATTAAATATGAAGT . . CAGGTACA . . C . AAGGAGAAAAACGAATG . T . . . . C . A C C . . . G . T . CC CACCCCATCGTTA . . . C . . AC . . . CCC A . . . TATT . AT . . G C T T . C . . A A CACA . C G CTA . AGT TA TTGCATGATTAAAAC C A . . . . A AA . . CCAACATTTTCATGTCGACATATCAAGTCT C . . A T TACCGGT . GTA G T . . . AAATAAC . C C ATTTATTTATCTATTTTA T . C . . . TA C GTT TAGTAAAGTTTC A CTGAGTT C AAC G AG A . A . . A . TACG C G . T AT . GC T CT . T . CT T CC . . . AATA G . . . . . . . . A AC . GGGTGATTCAT G CA GGA GCTTGCGACCCTCCG . T A . . . C T CTTGGAGGAA . . C AT T AT . . . TAGTA C . CAACAGTACATAAAT . A TCTG GT TATG T T . G . . . . AC A AT A . . CT . . . AA . G . TA . . . GA A T C . . . G . G C T . GA . . T
blockSeqs : . C . . . . . T . . . . . TC . . G . . G . . . . . . . . GGG . GA . T T . . . . . . . . . . . A C . . GCATTTTAA . . . . . CCTATTATGA AT . . C . TCG . . . A C TA . . C . A . G . A . TGCATGAC . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . T . . . A . A . A . . . . . . . . . . . . G . A . G TCAA . . T T . . . . . . . A . . . . . . . . A TTA . A . . . . . . AT ATAG . GCCT T C G T A T T G C T GC C GA . C . GATC . . . GA . . TATTT . A . G TGTT TTACATTTTTATTCGG . TG . . . GT . . . AT . . . ACT . CCC T . . . . . . TTTTCGTTCAAAAACATGAACATT . GG . G TTAAATAATGT . . ACA . . C . AAAACCGCAATAATTA . . . . . . . . . . . . . . . . . . C CCACTT . . . A . . AC . . . A A . . . AAA . . . . A . . . . . . . . A . A A AGT . GT CC TGACAAAACGA C A . . . . T A . . CCAACATTTCATGTTAATATAAAGTT C . . A T TTATCGC . GTC A . . . . AGAAC . T C AATTTATTATCTATTT T . C . . . TC T T ATTGGAGTCTT G CAGATG . GA A A T . A . . . . TAT T G . T A . G T CT . G . AC T TT . . . GTG . . . . . . . . . A CA . AAGCGATACTC C . GGT GTA . C A . . . C . GCCTCA . . C CA T A . . . TACAA C . CAAAGTGTAT . A TAA GT TAT C T . G . . . . C A AT . . . T . . . A . A . T . . . CA A T C . . . G . . . . . A . . T
blockSeqs : . T . . . . . T . . . . . T . . G . . T . . . . . . . . G . A . T T . . . . . . . . . . . A C . . GCATTTTA . . . . . TTATCGA AA . . . . TCG . . . A C A . . . . A . G . A . C . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . T . . . A . A . A . . . . . . . . . . . . G . A . G TAA . . T T . . . . . . . A . . . . . . . . A TA . T . . . . . . . AT . GC T C . T A T . . G C . . GAAT . . . T . . TGTT . A . C TGCT TTGATTTGAAA . TG . . . GT . . . AT . . . AAT . TTC C . . . . . . TATTTCTA . C . . . . . . . . . ATTT . . . . C CCACTC . . . A . . C . . . C A . . . CA . . . . . CGT . G T . . . . . . . . A . . CCGACATT T . . . . ATTA . T G . . . . AA . T . T A . . . . . . . . AAT . CCAA . AC . G . . . . . . . TT A G . . T . G C C . C . AT T CC . . . GGA . . . . . . . . . A C . TTAT G . GT ATA . C C . . . G . GCTC . . A A T T . . . TA T . GTACAT . T ATA AC . C T . G . . . . C A GG . . . . . . . C . G . T . . . GA A T C . . . G . . . . . A . . T
blockSeqs : . A . . . . . T . . . . . T . . T . . T . . . . . . . . G . A . T T . . . . . . . . . . . A C . . GCATTTTA . . . . . TATCGA AA . . . . TTC . . . A G A . . . . A . G . . . C . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . A . A . A . . . . . . . . . . . . . . A . A TA . . T . . . . . . . . C . . . . . . . . . T . A . . . . . AT . . C . . . GAA . . . G . . ATT . A . C TGT TCATTTTTAT . TT . . . GT . . . AT . . . TAC . TT C . CCACTT . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . CT . . . . . TT . C . . . . . A . . . TA . . . . . . . T T . T . T . C . . . CAG . . . . . . . . . G C . AA T . GG AGA . T C . . . C . GCTC . . C C . T . . . TA . . AACAAA . A AT . . . . . G . . . . A . . . . . . . . . G . G . T . . . A A T T . . . G . . . . . . . . T
blockSeqs : . A . . . . . T . . . . . C . . C . . T . . . . . . . . G . A . T T . . . . . . . . . . . T T . . GCAATTTA . . . . . TATCG AG . . . . TTC . . . . . T . . . . A . . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . ATT . . . C GA TTCATTTTTA . CA . . . T . . . AA . . . A . T . . . . . . . A . C . . . GA . . . . . . . . . . . . AT G . GG GTA . . A . . . . . TCT . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . G . T . . . G . . C . . . T . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . C . . T . . T . . . . . . . . G . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . GCAGTTTA . . . . . TATCG A . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . A . . . C . TCGTTTAATA . CG . . . T . . . T . . . A . . . . . . . . . . . . A . . . TA . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . G . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . C . . T . . T . . . . . . . . G . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . TATCG . . . . T . . . G . . . A . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqCons : GCANTTTA**************** TATCGA**************** TCG**** TA A* GCATAC******************* A** T* TAA******* TA***** AT******* A* T** GC A*** TTCATTTTTAC*************************************** AC************* AAGAAGACGATT************* C** CCACTT********************** CC* CGT***** GACAAAGC************* C** ** AAAC******* AATCTATTATCTATTTT***************************** T*** ATGGAGTTT******************** CCGAT******* GC****** AG** TAT***** G** GA*** C*** AT******************* A** TAA******* CAAAGTACAAAT********* TATA* T*
originalCons : CTAAATTA-AAA--TT--TTGT----T--T-GT-TT-GCGG-------T----TTC-CC--GA---CCGACC----T-AGTAAA-T--TCGTT-NC-GA-C-TGAA--A---AT-C-T--T-T-T-------ATTT-----G--TAT-TT-------------A----C---CAGG--T--GATAT-TTT---TTT--TTA---TTCATT--T-CTG-TT--GCG-AC---CGA-----------CCGA--AAAT-CT-----TA-TTTCT-----GC----A-TT--T--A---CCG---CTC--A--AAAC-AT--TTT--T--------AT-----CG-AA-AATT-C--TGA----T--TTTTTTTT--CC--CGAT----AA--GGACT-A-------AGTAC-TCCTAGT-----TTTC---TACCTTGTCCGCA-CGCAAGC--TCGGAG-CTGAGA-CACTTCCGAAT-----AC---------C---------------ATA-TATAC------------CAAT-CG-TCAG--CGA-CT--ATAA-A-A-ACGTGC-TTA--TCATGCATCAA---AA---GTA-TC--AT--TTT--A---AT-AT---AA-AATGCATAGTT-TCA-TA--AAGT-AA-ATGA-A-TTGAA---T--TTGCA------TTTA----GG---T-A-CGAAAT----TGTAG-CA-T--AAGGGG-GAGGA-GG-TTGA-AG-GA-G-ATCG--T-AA----AG-ATA-TGGAAAAGTTTCATA--T--ATCT--TTA--CGGGA-CAA--------------AA-AACCA--TGGATTCAGACCCAA-CACAACT-T-----GTC-----CG-A-T--ACAG-AGAT---------TGAGAATCGG--T-A--TGAA---TTAAAACCAGATCAA-G----TCGCT-GC------A-CTTCGT-GCAATTTGAAGATGC--A---T--TATACA-TGTAT-GCCT-ANTACCAA--C-TGGTTATAGAAA-TAANA-TACGCAGAATGAATATT-T-GCTCCAGCAAAACGCNATCGCCATG-G-C-GG-TAAT----GAATC-AAACGTTC-A---GTGA-AA-A--TTT-GT-ATT---ATTTG--CACAT------AATC--AT-GT--TTATTT-----TT-CAT----------TTT--T-AT---A----------------TTCGT----TT-TG--TAGT-AA----ACTA----------------TGTG-GA-----T--ATTCAG-----A-TTTG----------------TG-GGA----CGAT--AC-T-AA-TTT-CCC----CCCCAAAC----GATAG-TGGACATGCGC----GAG-CCGT-TATA------CA-TTTC-G--------TTA--AAAGAACATGAA-GAACCATTTTTAAG---AGAGAGAGNGAGA-GAGAGCACTT-AATAACGTTTGTCATTACGTATG---TTTGAG---GAA-ACCCC-----CA-------CACACA---CTGTG-ACAGA-GAAGAATG---AAAACG---CAATGATT-CATTT-----CAGTTTTGTT-GGT-AG-AC-AAAATACC-GAGTA-ATCGTAAA-TCGT-TCACAGACCCAGT-----------CCG-TG-CTATCTCAATCACAACGATGGCC--TTGCTT-CCATGA----CCAAC-T---------------T-GA-TTG---TTG-AANATGGTC---------GA-ATGAAC------------ACA--CTG----AA----TCGGT--CCGAACGTAGGGATATGC-A----------ACCG-AAATATA-TTTTTTTTAACTCCC-----------------AAAG---TTCAA-CAA----GCNTGCACTTTGCTTGCAA-CTGTAAAATACAAGC-ACGTGGAAAGTGTTC-A---TAAT-TTG-AATAAACACCGGGATGATCA--ATGC---CATA----TCAGCCATAGTA-------AATACCCGTAN----GTAATACCG------AAATAAAG-T--TTCTCCATCGAAATAAG-TGCATGA-CA-AAA--CTGCAGAGGCAAACAC--TAATCTATTT--TTA-CC-TTGCCTGT-AAGTAT-A--C-TTTA-TATTATACC-------------CGACA------------------T--------T----------------------ACCGC-TTG-----TTTTAAAG------------------AAAATTTCTAT-TTACCG-CTTAT--TCAGTNAAGTGGGAAA-TAT-A-CG-ATA---A-AA---CTAA--ATAATACAATA------------A----------------TTT--------------CCTGACTGAATG-TACCC-A-CCGAC-TTTTTTTTAATATGG-GT-ACTAGT------A-----G----------T--T--ATGGGCCGA--CA--TGA---TTAGATACATATG----AACAGACAAG--GCAA-TTGACACGAAG-AAAATACA--CTTT-TTCTTCAA-AGAATAATATTTTTT-TA-T-GTTACACATGT---TCAATTGATTT----GCAC-G-TACTAGTAATTACAT--TTACTATA-TATGTA-GCAT--ACAACTG-CCG-----------TGAT--AATTTACA-TGCG-G-GTT--GCGACGTCAAAAA-CGGT-CAT--TG-G-----TG-AC---TT-GAA-CTTGGA--C-CAGA------AAA---------A----------TTAAGTT----TTAT--GG-TTGTGCG------------TA-------------CCC-----CCCCCCCCCT---CCAC-TT-C-TANG----------------------TTTGAATT--------------G-CTC-------AC-AAAA-CACAATAAT-CATACGATATA--A-TT--GC-AAG--TT---T--A--AAGATACA--AAA-A--AAAG-T-ACAT-A-AATGTA-TATN--ATATATA-CATGTATATGCACCTA-CAAAAGCAG-T--A-C-AGAC-AAA--CTAATATCAT-ATTATCAAAT-AAA-TAAAA--TA--TTTTAT--CGACC--TA--CCTACCCAGAG-AA--AAATAAG-GGC--CTACTTGAAG----TTATTT-TTTG----GCTTA------------------GA-AAAAATAAAATATTTTA---C-CTAC-CTA---CCGACCCTA-CGTCCGTAAAT-C-G--G-TCG-G--AAA-GG--GCAAACAAACAAT--TTTTTAATTTA
finalCons : CTAAATTA-AAA--TT--TTGT----T--T-GT-TT-GCGG-------T----TTC-CC--GA---CCGACC----T-AGTAAA-T--TCGTT-NC-GA-C-TGAA--A---AT-C-T--T-T-T-------ATTT-----G--TAT-TT-------------A----C---CAGG--T--GATAT-TTT---TTT--TTA---TTCATT--T-CTG-TT--GCG-AC---CGA-----------CCGA--AAAT-CT-----TA-TTTCTGCANTTTA----------------CCG---CTC--A--AAAC-AT--TTTTATCGA----------------A-AATT-C--TGA----T--TTTTTTTTCG----CGAT----AA--GGACT-A-------AGTAC-TCCTAGT-----TTTC---TACCTTGTCCGCA-CGCA-GC--TCGGAG-CTGAGA-CACTTCCGAAT-----ACGCATAC-------------------ATA-TATAC------------CAAT-CG-TCAG--CGA-CT--ATAA-A-A-ACGTGC-TTA--TCATGCATCAA---AA---GTA-TC--AT--TTT--A---AT-AT---AA-AATGCATAGTT-TCA-TA--AAGT-AA-ATGA-A-TTGAA---T--TTGCA------TTTA----GG---T-A-CGAAAT----TGTAG-CA-T--AAGGGG-GAGGA-GG-TTGA-AG-GA-G-ATCGTAA-------AG-ATA-TGGAAAAGTTTCATA--T--ATCT--TTA--CGGGA-CAA--------------AA-AACCA--TGGATTCAGACCCAA-CACAACT-T-----GTC-----CG-A-T--ACAG-AGAT---------TGAGAATCGGTA-----TGAA---TTAAAACCAGATCAA-G----TCGCT-GC------A-CTTCGT-GCAATTTGAAGATGCAT-------TATACA-TGTAT-GCCT-ANTACCAA--C-TGGTTATAGAAA-TAANA-TACGCAGAATGAATATTT--GCTCCAGCAAAACGCNATCGCCATG-G-C-GG-TAAT----GAATC-AAACGTTC-A---GTGA-AAA---TTT-GT-ATT---ATTTG--CACAT------AATC--AT-GT--TTATTTTTCATTTTTAC---------------------------------------TTCGT----TT-TG--TAGT-AA----ACTA----------------TGTG-GA-----T--ATTCAG-----A-TTTG----------------TG-GGA----CGAT--AC-T-AA-TTT-CCC----CCCCAAAC----GATAG-TGGACATGCGC----GAG-CCGT-TATA------CA-TTTC-G--------TTA--AAAGAACATGAA-GAACCATTTTTAAG---AGAGAGAGNGAGA-GAGAGCACTT-AATAACGTTTGTCATTACGTATG---TTTGAG---GAA-ACCCAC-------------CACACA---CTGTG-ACAGA-GAAGAAGAAGACGATT-------------CATTT-----CAGTTTTGTT-GGT-AG-AC-AAAATACC-GAGTA-ATCGTAAA-TCGT-TCACAGACCCAGT-----------CCG-TG-CTATCTCAATCACAACGATGGCC--TTGCTTC--ATGACCACTT----------------------GA-TTG---TTG-AANATGGTC---------GA-ATGAAC------------ACA--CTG----AA----TCGGTCC-CGAACGTAGGGATATGC-A----------ACCG-AAATATA-TTTTTTTTAACTCCC-----------------AAAG---TTCAA-CAA----GCNTGCACTTTGCTTGCAA-CTGTAAAATACAAGC-ACGTGGAAAGTGTTC-A---TAAT-TTG-AATAAACACCGGGATGATCA--ATGC---CATA----TCAGCCATAGTA-------AATACCCGTACGT-----ATACCG------AAATAAAG-T--TTCTCCATCGAAATAAGGACAAAGC-------------AGAGGCAAACAC--TAATCTATTT--TTA-CC-TTGCCTGT-AAGTAT-A--C-TTTA-TATTATACC-------------CGACA------------------T--------T----------------------ACCGC-TTG-----TTTTAAAG------------------AAAATTTCTAT-TTACCG-CTTAT--TCAGTNAAGTGGGAAA--AT-A-CG-ATAAAAC-------TAA--ATAATACAATAAATCTATTATCTATTTT-----------------------------CCTGACTGAATG-TACCC-A-CCGAC-TTTTTTTTAATATGGT---ACTAGTATGGAGTTT--------------------ATGGGCCGACCGAT-------TTAGATACATATGC------AGACAAG--GCAA-TTGACACGAAG-AAAATACA--CTTT-TTCTTCAA-AGAATAATATTTTTTTAT-----TACACATGT---TCAATTGATTT----GCACG--TACTAGTAATTACAT--TTACTATA-TATGTA-GCAT--ACAACTG-CCG-----------TGAT--AATTTACA-TGGA---GTT--GCGACGTCAAAAA-CGGT-CAT--TG-G-----TG-AC---TT-GAA-CTTGGAC---CAGA------AAAAT-------------------TAAGTT----TTAT--GG-TTGTGCG------------TA-------------CCC-----CCCCCCCCCT---CCAC-TT-C-TANG----------------------TTTGAATT--------------G-CTC-------AC-AAAA-CACAATAATA--TACGATATA--A-TT--GC-AAG--TTTAA-------AGATACA--AAACAAAGTACAAAT---------GTA-TATN--ATATATA-CATGTATATGCACCTA-CAAAAGCAG-T--A-C-AGAC-AAA--CTAATATCAT-ATTATCAAAT-AAA-TAAAA--TA--TTTTAT--CGACC--TA--CCTACCCAGAG-AA--AAATAAG-GGC--CTACT-GAAG----TTATTT-TTTG----GCTTA------------------GA-AAAAATAAAATATTTTA---C-CTAC-CTA---CCGACCCTA-CGTCCGTAAAT-C-G--G-TCG-G--AAA-GG--GCAAACAAACAAT--TTTTTAATTTA
Alignments
lowQualScore : 11111111111111111111111111111111111111111111111111 1111111111111111111111111111111111 1111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111
lowQualScore : 111 1111111 111 111111 111 1111111 11111111 222222222222222222 11111 11 22222222222 11111 1111111111 2222222222222222222222 333333333 11 1111 11111111 11111 111 11 11 11 7777777777777777777777 1111 1 111 1 11 111 11 11 111 111111 2222 111 1111 11 11 111 2222222222 11111 11 33333333333333 11111 11111 333333333 22222 111 1111 111111 111111111 111111 11 2222 11 1 111 1 1 1111 111 2222222 3333333333333333333333 1111111111 11111 2222222222222222 11111 11111111 6666666666666666 1111 1111111 11111111 1111 1 1111 11111111111111111111111111111111111111111111111111 111 7777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777 111 11 0000000000000000000000000000000000 22222 1 1 1 1 11 11 1 1 44444444444 11 1 11 11 11 1111 44444444444444444444 111 222222222 33333333333333 1111 1111 333 2222222222 33333 44444444444444444 222 1 2222 1 11 5555555555 1 777777777777777777777 333333333333333333 1 888888888888888888888888888 11 11 1111 5555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555 11 11111 444444444444444444 1 111111111 1 111 44444444444 4444444444444444444 1 1111111 5555555555555555 2222222 11 2222222 11 11 111 1 22222222 1111 22222222222 22222222222222222222 1111 11 1111 111111 666666666666666666666 1111 11111 3333333333333333333333333333 11111 1111 5555555555555555555555 44444444444444444444444444 111111 11 222222222222 111 555555555555555 111 111 111 11 1 2222222 33333333333333333333 11111 1111 22
lowQualScore : 5 000 66 9999 55 4 4 77 3333333 8888 4 99 111 333333 4 55 88 4 4 77 55 111 4 4 55 4 8 3333333 77777777 4 999999999999999999 777 55555 00 777 66 777 55 4 4 66 4 777 55555555555 66 6 44 11111 4 777 6 5555555555 777 66 66 4 66 2222222222222222222222 444 8 66 000000000 5 66 33 0000 66 5 99999999 99 88 22222 000 22 5 5 33 4 5 22 5555555555555555555555 5 888 2222 5 5 66 5 66 0 5 5 0 5 666 8 888 888 5 11 66 66 888 88 555 5 5 55 11 00 5 5 5 000 77 666666 0000 000 5 5 2222 5 5 33 5 00 5 77 5 000 7777777777 5 5 0 33333 5 77 33 5 33333333333333 5 77 0 5 1 5 44444 44444 5 5 77 5 777777777 1 11111 000 1 5 2222 6 999999 5 8 77 222222222 6 222222 1 55 2 3 8 1 88 6 0 1 0000 66 1 44 0 444 0 0 666 5 5 2222 5 55 666 0 3 00 0 0000000 888 88 4444444444444444444444 4 4444444444 00000 4 9999 9999999999999999 33 4 11111 66 11111111 7777777777777777 5 7777 8888888 5 77777777 1 2222 8 0 7777 8 8 00000000000000000000000000000000000000000000000000 444 33 8 2 6666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666 444 66 8 0000000000000000000000000000000000 0 00000 0 0 8 0 0 0 2 0 33 2 33 0 0 77777777777 22 0 22 11 11 6 4444 6 22222222222222222222 6 111 6 7 666666666 6 55555555555555 99 4444 4444 333 4 6 9999999999 6 00000 66666666666666666 000 0 1111 1 2 3 3 0 22 0 0000000000 0 3 6 222222222222222222222 999999999999999999 0 88 0 0 66 6 888888888888888888888888888 11 0 11 88 8 0 8 0 6 3333 8 6 7777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777 00 66666 999999999999999999 1 3 444444444 99 999 1 3 6 111 6 44444444444 99 1 6666666666666666666 1 8 0 8 8 8 11 3 5555555 7777777777777777 8 3 5555555 11 0 8 0 3333333 3 11 44 8 0 111 6 0 5 8 0 44 33333333 8 0 0 11 7777 8 8 0 77 0 22 5 3 5 9999 1 666 33333333333 66 66666666666666666666 5 5 888 5 0000 5 888 5 00 5555 444444 333333333333333333333 4 7777 11111 9999999999999999999999999999 11111 2222 3 5 5 5 6 6666666666666666666666 77777777777777777777777777 5 77 999999 6 6 1 3 00 99 6 99 999999999999 2 111 6 6 444444444444444 6 222 6 5 7 5 999 3 5 77 66 5 5 5 222 5 0 444 8 4 66 66 66 66 66 0 66 5 5 5 1 5 6666666 0 99999999999999999999 5 3 3 22222 5 888 5 2 0 4 4 3333 4 11 4 66 3 66 0
lowQualScore : . ... .. .... .. . . .. ....... .... . .. ... ...... . .. .. . . .. .. ... . . .. . . ....... ........ . .................. ... ..... .. ... .. ... .. . . .. . ... ........... .. . .. ..... . ... . .......... ... .. .. . .. ...................... ... . .. ......... . .. .. .... .. . ........ .. .. ..... ... .. . . .. . . .. ...................... . ... .... . . .. . .. . . . . . ... . ... ... . .. .. .. ... .. ... . . .. .. .. . . . ... .. ...... .... ... . . .... . . .. . .. . .. . ... .......... . . . ..... . .. .. . .............. . .. . . . . ..... ..... . . .. . ......... . ..... ... . . .... . ...... . . .. ......... . ...... . .. . . . . .. . . . .... .. . .. . ... . . ... . . .... . .. ... . . .. . ....... ... .. ...................... . .......... ..... . .... ................ .. . ..... .. ........ ................ . .... ....... . ........ . .... . . .... . . .................................................. ... .. . . ............................................................. ... .. . .................................. . ..... . . . . . . . . .. . .. . . ........... .. . .. .. .. . .... . .................... . ... . . ......... . .............. .. .... .... ... . . .......... . ..... ................. ... . .... . . . . . .. . .......... . . . ..................... .................. . .. . . .. . ........................... .. . .. .. . . . . . .... . . ...................................................................... .. ..... .................. . . ......... .. ... . . . ... . ........... .. . ................... . . . . . . .. . ....... ................ . . ....... .. . . . ....... . .. .. . . ... . . . . . .. ........ . . . .. .... . . . .. . .. . . . .... . ... ........... .. .................... . . ... . .... . ... . .. .... ...... ..................... . .... ..... ............................ ..... .... . . . . . ...................... .......................... . .. ...... . . . . .. .. . .. ............ . ... . . ............... . ... . . . . ... . . .. .. . . . ... . . ... . . .. .. .. .. .. . .. . . . . . ....... . .................... . . . ..... . ... . . . . . .... . .. . .. . .. .
lowQualScore : 0 222 99 4444 55 0 0 22 0000000 5555 0 55 000 555555 0 55 99 0 0 11 55 000 0 0 55 0 0 0000000 66666666 0 333333333333333333 888 88888 88 888 11 888 55 0 0 11 4 888 66666666666 11 4 66 11111 4 888 9 8888888888 888 11 11 4 11 9999999999999999999999 666 9 11 222222222 0 99 88 6666 99 0 55555555 55 22 55555 000 11 7 7 66 0 7 99 9999999999999999999999 7 777 1111 7 7 99 0 99 0 0 0 4 0 222 1 888 888 0 99 99 99 888 22 666 0 0 44 99 11 0 7 7 000 99 444444 0000 000 7 7 1111 7 7 66 7 00 7 44 7 666 4444444444 7 7 1 77777 0 99 66 7 66666666666666 7 99 7 7 4 7 33333 33333 7 7 99 7 111111111 4 66666 000 7 7 1111 7 222222 7 0 00 000000000 7 555555 0 88 5 2 0 0 88 4 8 4 6666 44 0 55 0 000 0 6 444 7 7 9999 0 11 666 1 2 22 2 6666666 888 22 1111111111111111111111 4 2222222222 44444 4 4444 4444444444444444 33 4 11111 11 44444444 1111111111111111 7 9999 1111111 7 11111111 7 1111 0 0 0000 0 0 44444444444444444444444444444444444444444444444444 000 22 0 2 6666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666 000 22 0 0000000000000000000000000000000000 8 00000 8 8 0 0 0 0 5 0 22 5 00 0 0 55555555555 55 0 00 00 00 7 2222 7 00000000000000000000 7 777 7 5 777777777 7 77777777777777 22 2222 2222 555 2 7 2222222222 7 77777 77777777777777777 888 0 2222 0 5 2 2 0 55 8 0000000000 0 2 5 555555555555555555555 444444444444444444 0 88 8 8 33 5 999999999999999999999999999 00 8 00 88 0 8 0 8 0 0000 0 7 3333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333 33 77777 222222222222222222 7 2 888888888 22 222 0 3 7 777 7 77777777777 22 0 0000000000000000000 0 0 0 0 0 0 44 8 0000000 6666666666666666 0 2 2222222 00 8 2 8 0000000 8 00 00 0 8 888 0 8 6 0 8 44 66666666 2 6 8 66 0000 0 0 1 99 1 11 7 6 7 4444 4 999 88888888888 99 00000000000000000000 0 0 888 0 6666 0 888 0 11 1111 444444 999999999999999999999 5 5555 44444 1111111111111111111111111111 11111 6666 1 0 0 0 6 4444444444444444444444 00000000000000000000000000 7 99 222222 7 7 7 5 33 22 7 22 333333333333 5 777 7 7 000000000000000 7 555 7 7 3 6 111 1 0 55 99 0 0 0 666 1 1 111 9 4 11 77 11 99 99 0 99 0 0 0 4 0 9999999 1 55555555555555555555 0 2 2 00000 0 888 0 5 1 4 4 9999 4 11 4 11 9 11 2
consensus : CTAAATTA-AAA--TT--TTGT----T--T-GT-TT-GCGG-------T----TTC-CC--GA---CCGACC----T-AGTAAA-T--TCGTT-NC-GA-C-TGAA--A---AT-C-T--T-T-T-------ATTT-----G--TAT-TT-------------A----C---CAGG--T--GATAT-TTT---TTT--TTA---TTCATT--T-CTG-TT--GCG-AC---CGA-----------CCGA--AAAT-CT-----TA-TTTCTG---CANTT----T-A---CCG---CTC--A--AAAC-AT--TTT--T--------AT-----CG-AA-AATT-C--TGA-----T---TTT-TTTTT--C-GCGAT----AA--GGACT-A-------AGTAC-TCCTAGT-----TTTC---TACCTTGTCCGCA-CGC-AGC--TCGGAG-CTGAGA-CACTTCCGAAT-----AC-GC-ATGT-------ACAT-A-TATACCA----AT-CG-TCAG--CGA-CT--ATAA-A-A-ACGTGC-TTA--TCATGCATCAA---AA---GT-ATC--AT--TTT--A---AT-AT---AA-AATGCATAGTT-TC-ATA--AAGT-AA-ATGA-A-TTGAA---T--TTGCA------TTTA----GG---T-A-CGAAAT----TGTAG-C-AT--AAGGGG-GAGGA-GG-TTGA-AG-GA-G-ATCG--T-AA----AG-ATA-TGGAAAAGTTTCATA--T--ATCT--TTA--CGGGA-CAA--------------AA-AACCA--TGGATTCAGACCCAA-CACAACT-T-----GTC-----CG-A-T--ACAG-AGAT---------TGAGAATCGG--T--ATGAA---TTAAAACCAGATCAA-G----TCGCT-GC------A-CTTCGT-GCAATTTGAAGATGC--A---T--TATACA-TGTAT-GCCT-ANTACCAA--CTGGTTATAGAAA-TAANA-TACGCAGAATGAATA-TT-TGCTCCAGCAAAACGCNATCGCCATG-G-C-GG-TAATGAATCAAACGTTC-AGTGA-AA-A--TTT-GT-ATT-ATTTGCACATAATCAT-GT--TTATTT---TT-CAT----------TTT-T----AC-TTC-G-----T----TT-TG--TAG-TAA----ACTA----------------TGTG-GA-----T--ATTCAG-----A-TTTG----------------TG-GGA----CGAT--AC-T-AA-TTT-CCC----CCCCAAAC----GATAG-TGGACATGCGC----GAG-CCGT-TATA------CATTTTCG--------TTA--AAAGAACATGAA-GAACCATTTTTAAG---AGAGAGAGNGAGA-GAGAGCACTT-AATAACGTTTGTCATTACGTATG---TTTGAG---GAA-ACCCC-------ACA-CACACA---CTGTGA-CAGA-GAAGAATGA---A--------GA----CG-A-----TT-CATTT-----CAGTTTTG-TTGGT-AGA-CAAAA-TACC-GAGTA-ATCGT-AAA-TCGT-TCACAGACCCAGT-----------CCG-TG-CTATCTCAATCACAACGATGGCC--TTGCTT--C-ATGA----CC-AC--T---------------T-GA-TTG---TTG-AANATGGTC---------GA-ATGAAC------------ACA--CTG----AA----TCGGT-CCCGAACGTAGGGATATGC-A----------ACCG-AAATATA-TTTTTTTTAACTCCC-----------------AAAG---TTCAA-CAA----GCNTGCACTTTGCTTGCAA-CTGTAAAATACAAGC-ACGTGGAAAGTGTTC-A---TAAT-TTG-AATAAACACCGGGATGATCA--ATGC---CATA----TCAGCCATAGTAAAT--------ACCC------GTANGT-ATACCGAAATAAAGTTTCTCCATCGAAATAAGT----G------ACAAA--T--GC--AGAGGCAAACAC--TAATCTATTT--TTA-CC-TTGCCTGT-AAGTAT-A--C-TTTA-TATTATACC-------------CGACA------------------T--------T----------------------ACCGC-TTG-----TTTTAAAG------------------AAAATTTCTAT-TTACCG-CTTAT--TCAGTNAAGTGGGAAA-AT-AC---G-ATA---A-AA---CTAA--ATAATACAATAAA-T-TATT-ATCTATTTT-CCTGACTGAATG-TACCC-A-CCGAC-TTTTTTTTAATAT-G--G--TACTAGT--A-----T-GGAGT-TT-ATGGGCCGACCGA--T-TT--AGATACATATG--C----AGACAAG--GCAA-TTGACACGAAG-AAAATACA--CTTT-TTCTTCAAAGA-ATAATATTTTTT----TAT-TACACATGTTCAATTGATTT----GCAC-G-TACTAGTAATTACAT--TTACTATA-TATGTAG-CAT--ACAACTG-CCG-----------TGAT--AATTTACA-TG--G--AG-T-----T--GCGACGTCAAAAA-CGGT-CATT---G-G----TG-AC---TT-GAA-CTTGGA--C-CAGA------AAA---------A----------TTAAGTT----TTAT--GG-TTGTGCG------------TA-------------CCC-----CCCCCCCCCT---CCAC-TT-C-TANG----------------------TTTGAATT--------------G-CTC-------AC-AAAACA--CGAT------AA-TA-TACGATATAA-TT--GC-AAG--TT---T----A--AAGATACA---AAAC-AA-AGT---AC--A----AATGTA-TATN--ATATATA-CGTGTATATGCAC--CTA-CAAAAGCAG-T--A-C-AGAC-AAA--CTAATATCAT-ATTATCAAAT-AAA-TAAAA--TA--TTTTAT--CGACC--TA--CCTACCCAGAG-AA--AAATAAG-GGCCTAC-T-GAAGTTATTT-TTTG-------GCTTA------------------GAAAA-AATAAAATATTTTA---C-CTAC-CTA---CCGACCCTA-CGTCCGTAAAT-C-G--G-TCG-G--AAA-GG--GCAAACAAACAAT--TTTTTAATTTA
Reference ( family-458 ) : CTAAATTA-AAA--TT--TTGT----T--T-GT-TT-GCGG-------T----TTC-CC--GA---CCGACC----T-AGTAAA-T--TCGTT-NC-GA-C-TGAA--A---AT-C-T--T-T-T-------ATTT-----G--TAT-TT-------------A----C---CAGG--T--GATAT-TTT---TTT--TTA---TTCATT--T-CTG-TT--GCG-AC---CGA-----------CCGA--AAAT-CT-----TA-TTTCTG---CANTT----T-A---CCG---CTC--A--AAAC-AT--TTT--T--------AT-----CG-AA-AATT-C--TGA-----T---TTT-TTTTT--C-GCGAT----AA--GGACT-A-------AGTAC-TCCTAGT-----TTTC---TACCTTGTCCGCA-CGC-AGC--TCGGAG-CTGAGA-CACTTCCGAAT-----AC-GC-AT---------ACAT-A-TATACCA----AT-CG-TCAG--CGA-CT--ATAA-A-A-ACGTGC-TTA--TCATGCATCAA---AA---GT-ATC--AT--TTT--A---AT-AT---AA-AATGCATAGTT-TC-ATA--AAGT-AA-ATGA-A-TTGAA---T--TTGCA------TTTA----GG---T-A-CGAAAT----TGTAG-C-AT--AAGGGG-GAGGA-GG-TTGA-AG-GA-G-ATCG--T-AA----AG-ATA-TGGAAAAGTTTCATA--T--ATCT--TTA--CGGGA-CAA--------------AA-AACCA--TGGATTCAGACCCAA-CACAACT-T-----GTC-----CG-A-T--ACAG-AGAT---------TGAGAATCGG--T--ATGAA---TTAAAACCAGATCAA-G----TCGCT-GC------A-CTTCGT-GCAATTTGAAGATGC--A---T--TATACA-TGTAT-GCCT-ANTACCAA--CTGGTTATAGAAA-TAANA-TACGCAGAATGAATA-TT-TGCTCCAGCAAAACGCNATCGCCATG-G-C-GG-TAATGAATCAAACGTTC-AGTGA-AA-A--TTT-GT-ATT-ATTTGCACATAATCAT-GT--TTATTT---TT-CAT----------TTT-T----AC-TTC-G-----T----TT-TG--TAG-TAA----ACTA----------------TGTG-GA-----T--ATTCAG-----A-TTTG----------------TG-GGA----CGAT--AC-T-AA-TTT-CCC----CCCCAAAC----GATAG-TGGACATGCGC----GAG-CCGT-TATA------CA-TTTCG--------TTA--AAAGAACATGAA-GAACCATTTTTAAG---AGAGAGAGNGAGA-GAGAGCACTT-AATAACGTTTGTCATTACGTATG---TTTGAG---GAA-ACCC--------AC--CACACA---CTGTGA-CAGA-GAAGAA-GA---A--------GA----CG-A-----TT-CATTT-----CAGTTTTG-TTGGT-AGA-CAAAA-TACC-GAGTA-ATCGT-AAA-TCGT-TCACAGACCCAGT-----------CCG-TG-CTATCTCAATCACAACGATGGCC--TTGCTT--C-ATGA----CC-AC--T---------------T-GA-TTG---TTG-AANATGGTC---------GA-ATGAAC------------ACA--CTG----AA----TCGGT-CCCGAACGTAGGGATATGC-A----------ACCG-AAATATA-TTTTTTTTAACTCCC-----------------AAAG---TTCAA-CAA----GCNTGCACTTTGCTTGCAA-CTGTAAAATACAAGC-ACGTGGAAAGTGTTC-A---TAAT-TTG-AATAAACACCGGGATGATCA--ATGC---CATA----TCAGCCATAGTAAAT--------ACCC------GTACGT-ATACCGAAATAAAGTTTCTCCATCGAAATAAG-----G------ACAAA-----GC--AGAGGCAAACAC--TAATCTATTT--TTA-CC-TTGCCTGT-AAGTAT-A--C-TTTA-TATTATACC-------------CGACA------------------T--------T----------------------ACCGC-TTG-----TTTTAAAG------------------AAAATTTCTAT-TTACCG-CTTAT--TCAGTNAAGTGGGAAA-AT-AC---G-ATA---A-AA---CTAA--ATAATACAATAAA-TCTATT-ATCTATTTT-CCTGACTGAATG-TACCC-A-CCGAC-TTTTTTTTAATAT-G--G--TACTAGT--A-----T-GGAGT-TT-ATGGGCCGACCGA--T-TT--AGATACATATG--C----AGACAAG--GCAA-TTGACACGAAG-AAAATACA--CTTT-TTCTTCAAAGA-ATAATATTTTTT----TAT-TACACATGTTCAATTGATTT----GCAC-G-TACTAGTAATTACAT--TTACTATA-TATGTAG-CAT--ACAACTG-CCG-----------TGAT--AATTTACA-TG--G--AG-T-----T--GCGACGTCAAAAA-CGGT-CATT---G-G----TG-AC---TT-GAA-CTTGGA--C-CAGA------AAA---------A----------TTAAGTT----TTAT--GG-TTGTGCG------------TA-------------CCC-----CCCCCCCCCT---CCAC-TT-C-TANG----------------------TTTGAATT--------------G-CTC-------AC-AAAACA--CAAT------AA-TA-TACGATATAA-TT--GC-AAG--TT---T----A--AAGATACA---AAAC-AA-AGT---AC--A----AATGTA-TATN--ATATATA-CATGTATATGCAC--CTA-CAAAAGCAG-T--A-C-AGAC-AAA--CTAATATCAT-ATTATCAAAT-AAA-TAAAA--TA--TTTTAT--CGACC--TA--CCTACCCAGAG-AA--AAATAAG-GGCCTAC-T-GAAGTTATTT-TTTG-------GCTTA------------------GAAAA-AATAAAATATTTTA---C-CTAC-CTA---CCGACCCTA-CGTCCGTAAAT-C-G--G-TCG-G--AAA-GG--GCAAACAAACAAT--TTTTTAATTTA
gi|1 : CTAAATTA-AAA--TT--GTGT----T--T-GT-TT-GCGG-------T----TTC-CC--GA---CCGACC----T-AGTAAA-T--TCGTT-GC-GA-C-GGAA--A---AT-C-T--T-T-T-------ATTT-----G--TAT-TT-------------A----C---CAGG--T--GATAT-TTT---TTT--TTA---TTCATT--T-CTG-TT--GCG-AC---CGA-----------CCGA--AAAT-CT-----TA-TTTCTG---CA-TT----T-A---CCG---CTC--A--AAAC-AT--ATT--T--------AT-----CG-AA-AATT-C--TGA----------TT-TTTTT--C-CCGAT----AA--GGACT-A-------AGTAC-TCCTAGT-----TTTC---TA-CTTGT-CGCA-CGCAAGC--TCAGAG-CTGAGG-CACTTCCGA-------------AT---------ACAT-A-TATACCA----AT-CG-TCAG--CGA-CT--ATAA-A-A-ACGTGC-TTA--TCATGCATCAA---AA---GTAATC--AT--TTT--A---A--AT---AA-AATGCATAGTT-CT-AAA--AAGT-AA-ATGA-A-TTGAG---T--TTGCA------TTTA----GG---T-A-CGAAAT----TGTAG-CAAT--AAAGGG-GAGGA-GG-TTGA-AG-GA-G-ATCGGTT-AA----AG-ATA-TGG-AAAGTTTCATA--T--ATCT--TTA--C-GGA-CAA--------------AA-AACCA--TGGATTCAGAACCAA-CACAACT-T-----GTC-----CG-A-T--ACAG-AGAT---------TGAGAATCGG--TAAATGAA---TTAAAACCAGATCAA-G----TCGCT-GC------A-CTTCGT-GCAAATTTAAGATGC--A---T--TATACA-TGTAT-GCCC-AATACCAA--CTGGTTATAG-AA-TAAGA-TACACAGAATAGATATTT-TGCTCCA--AAAACGCAATCTCCATGTG-T-GG-TAATG-ATCAAACGTTC-AGT-----------------TT-A-TTGCACATAATGAT-GT--TTATTT---TT-CAT----------TTT-T----ATATTC-G-----T----TT-TG--TAGTTAA----ACTA----------------TGTG-GA-----T--ATTCAG-----A-TTTG----------------T--GGA----CGAT--AC-T-AA-TTT-CCC----CCCCAAAC----GATAG-TGGACATGCGC----GAG-CCGTGTATAATGAACCATTTTTN--------NNN--NNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNNN---NNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNCATTACATATG---TTTGAG---GAA-ACCC---------CTACACACA---CTGTGA-AAGA-GAAAAATGA---A--------AA----CGCAATGATTT-CATTT-----CAGTTTTGTTTGGT-AGA-CAAAA-TACC-GAGTACATCGTAAAA-TCGT-TCATAGACCCAGT-----------CCG-TG-CTATCTCAATCACAACGATGGCC--TTGCTTTCC-ATGA----CCAAC--T---------------T-GA-TTG---TTG-AATATGGTC---------GA-ATGGAC------------ACA--CTG----AA----TCGGT--CCGAACGTAAGGGTATGC-A----------ACCG-AAATATA-TTTTTTTTAACTCCC-----------------AAAG---TTCAA-CAA----GCCTGCACTTTGCTTGCAA-CTGTAAAATACAAGC-ACGTGGAAAGTGTTCAA---TAAT-TTG-AATAAACACCGGGATGATCA--ATGCATGCATA----TCAGCCATAGTAAAT--------ACCC------GTAAGTAATACCGAAAT-AAGTTTCTTTATCGAAATAAGTGCATG------ACAAAATTCTGC--AGAGGCAAACAC--TAATCTATTT--TTA-CC-TTGCCTGT-AAGTAT-A--C-TTTA-TATTATA---------------CAACA------------------T--------T----------------------ACCGC-TTG-----TTTTAAAG------------------AAATTTTCTAT-TTACCG-TTTAT--TCAGTAAAGTGGGAAATAT-AC---G-ATA---C-A-----TAA--ATAATACAATAA---------------TTT-CCTGACTGAATG-TA-CC-A-CCGAC-TTTTTTTTAATATGG--G--TACTAGT--A-------G-----TT-ATGGGCCGACT----T-TT--AGATAAATATGAAC----AGACAAG--GCAA-TTGACACGAAG-AAAAT-CA--CTTTGTTCTTCAAAGA-ATAATATTTTTTATACTGT-TACACATGTTCCATTGATTT----GCAC-G-TACTAGTGATTACAT--TTACTATA-TATGTAG-CAT--ACAACTG-CCG-----------TGAT--AA---AC------G--AG-TGTTGCT--GCGACGTCAAAAA-CGGT-CATT---G-G----TGAAC---TT-AAA-CTTGGA--C-CAGA------AAA---------A----------TTAAGTT----TTAT--GG-TTGTGCG------------TA-------------CCC-----CCCCCCCCCT---CCAC-TT-T-TAAG----------------------TTTGAATT--------------G-CTC-------AC-AAAACA--CAAT------AATTA-TACGATATAA-TT--GC-AAG--TT---T----A--AAGATACA---AAAA-AA-AGTTACAT--A----AATGTA-TATT--ATATATA-CATGTATATGCAC--CTA-CAAAAGCAG-T--A-C-AGGC-AAA--CTAATATCAT-ATTATCAAAT-AAA-TAAAA--TA--TTTTAT--CGACC--TA--CCTACCCAGAG-AA--AAATAAG-GGCCTACTT-GAAAATATTT-TTTG-------GCTTA------------------GAAAA-AATAAAATATTTTA---C-CTAC-CTA---CCGACCTAA-CGTCCGTAAAT-C-G--G-TCG-G--AAA-GG--GCAAACAAACAAT--TTTTTAATTTA
gi|10 : --T-GT-TT-GCGG-------T----TTC-CCC-GA---CCGACC----T-AGTAAA-T--TCGTT-GC-GA-C-GGAA--A---AT-C-T--T-T-T-------ATTT-----G--TAT-TT-------------A----C---CAGG--T--GATA---TT---TTT--TTA---TTCATT--T-CTG-TT--GCG-AC---CGAC----------CCG----AAT-CT-----TA-TTTCTG---CATTT----TAA---CCG---CTCAAA--AAAC-AT--TTT--T--------AT-----CG----AATTCC--TGAC----T---TTT-TTTTT--C-GCGAT----AA--GGACT-A-------AGTAC-TCC-AGT-----TTTC---TACCTTGTCCGCA-CGC-AGC--TCAGAG-CTGAG--CACTTCCGAAT-----AC----------------CAT-A-TATACCA----ATCCG-TCAG--CGA-CT--ATAC-A-A-ACG-GC-TT---TCATGCATCAA---AA---GT-ATCAAAT--TTT--A---AT-AT---AA-AATGCATAGTT-TC--TA--AAGT--A-ATGA-A-TTGAA---T--TTGCA------TTTA-----G---T-A-CGAAAT----TGTAG-C-ATAAAAGGAG-AAGGA--G-TTGT-AG-GA-G-ATCG--T--------G-ATA-TGGAAAAGTTTCATA--T--A-CT--GTA--CGGGA-CAA--------------AA-AACCAATTGGATTCA-ACCCAA-CACAACT-T-----GTC-----CG-A-T--ACAGAAGAT---------TGAGAATCGG--T--ATGAA---TT-AAACCAGATCAA-G----TCGCT--C------A-CTT
gi|11 : ----T--T-GT-T--GCGG-------T----TTC-CC--GA---CCGACC----T-AGTAAT-T--TCGTT-GC-GA-C-GGAA--A---AT-C-T--T-T-T-------ATTT-----G--TAT-TT-------------A----C---CAGG--T--GATA--TTT---TTT--TTA---TTCATT--T-CT--TT--GCG-AC---CGA-----------CCGA--AAGTGCT-----TA-TTTCTG---CATTT----T-A---CCG---CTC--AACAAAC-A---TTT--T--------AT-----CG--A-ATTT-C--TGGAC---T---TTT-TTTTT--C-GCGAT----AA--GGA-T-A-------AGTAC-TCC-AGT-----TTTC---TACCTTGTCCGCA-CGC-AGC--TCAGAG-CTGAG--CACTTCCGAAT-----AC----------------CAT-A-T-TACCA----AT-CG-TCAG--CGA-CT--ATAACA-A-ACGTGC-TT---TCATGCATCAA---AA---GT-ATCA-AT--TTT--A---A--AT---AA-AATGCATAGTT-TC-TAA--AAGT--A-ATGA-A-TTGAA---T--TTGCA------TTTA----GG---T-A-CGAAAT----TGTAG-C-ATA-AAAGGA-GAGGA--G-TTG--AG-GA-G-ATCG--T--A----AG-ATA-TGGAAAAGTTTCATA--T--A--C--TTA--CGGGA-CAA--------------AA-AACCA--TGGATTCAGACCCAA-CACAACT-T-----GTC-----CG-A-T--ACAG-AAGA---------TGAGAATCGG--TA-ATGAA---TTAAAACCAGATCAA-G----TCGCT-GC------A-CT
gi|12 : TAGTATCTATATAATTACTATG-TATGTGG-C-T--ACAA--G-CCG------------GAT--AATTTACAATA--G--TGAT-----T--GCGACGTCAAAAAACGGT-C-TT---G-G----TG-AC---TT-GA--CTTGGAA-C-CAGATTGAGAAAA---------A----------AAAAACTGCGATTCT--GT-TTGTGCG------------TA------------------------------------AC-TT-C-TA-G----------------------TTTGAATT----------------CTTGGAGGAAATGAAAACA--AGAT------AA-TA-TACGTCAAAA-TT--GCTAAA--TTCTAT----A--GAGATACA---AAAC-AA-AG---------------TGTA-T------TATATA-C---TA-AT-CATCACTA-CAAAA-CA--T--G-CAAGAC-AAA--CTTCTATAATCATTATCAAATAAAA-TAAAA--TAT-TTTTAT--CTACC--T---CCTA-CCAGA--AA--AAATAAG-GGCCTAC-T-GAA-TTATTTGTTTG-------GCT--------------------GAGAA-AAT--AACATTTTA---C-CCATACTA---CCG-CCCTA-C-TTCGT-AAT-C-GC-G-TCG-G--AAA-AGGCGCAATCAAACA----TTTTTAAT
gi|13 : ttttttttatcgtttcacatatgggtcaaaaa-----------TGAT--G-TTTACA-TG-----AG-T-----T--ACAGCACCAAAAA-CAGT-TACT---ATG----TG-AC---CT-GAA-CTTGAA--C-CAGA------AAA---------GGGGCGATACTTTTAGTC----ATAT--GGATTACGC-------------TA-------------CAC-----CCATCCAAC------AC-TT-CCTGGG----------------------TTAGAATT--------------T-CT-----------AAAACAAACAATGCGCACAA-TA-CACGATA-------------A--TT---T----A------TG--------------GT---AC--A------TGTA-TATGCAAAATA-A-CATAGATAT--------A-CAAATACAG-T--A-C-AGAC-AAA-----A-GCCGC-ATTATCAAAT------AAAA--TA--TTTTAC--CAACT--TA--TCTACAAAATG-CA--TAAAAAA-GGCTT-C-T-G-TTTTGTTT-TTTGTTTTTTTGTTTGTTTTTTTTTTTTTTGGCTGAGAAAAATAAAATATTTTG---C-CTAC-CTA---TTTACCCT--CTTTCG------G-G--G-TCGTT--AAA-GG--GCAAAAAAAAAATCATTTTTTATTTA
gi|14 : ctc-------------CCC-----CCCCCCCCTT---CCAC-TTTC-GACG----------------------TTTGAATT--------------G-CTC-------AC-AAAA-A--CA-C------AA-TA-TCCGATATAT-TT--GC-AAAGTTT---T----AGTAAGACACACAAAAACCAA-AGTT--AC--ATTATAATGTAGTATA--ATATATATCGTGTATATGCAT--CTAACAAAAGCAGGT--AAC-AGAC-AAAAACTAATATCAT---TATCAAAT-AAA-TAAAAAATA--TTTTATTCCGACCCGTATCCCTACGCAGAG-GATAAAGTAATCGGCCTAC-T-GAAGTTATTT-TTTGTTTG---GCTTA-------------------AGAA-AATAAAATATTCTGAGGCGCTAC-CTGGAGCAGACCCTAGCGTTCGTAAAT-C-G--GGTCG-G--AAAAGG--GCAAACAAACAAT--TTTTTAATTTAggcc
gi|15 : gatttcgccctcccA-TATTATGC----------------------------------------------T----------------------ACCGC-TGG-----TTTTAAAG------------------AAA--TTCTAT-T-ACCGGTTTAT--TCA--TAAGTGGAAAA-AT-AC---G-CTA---A-------TAA--ATAATACAATA-----------TCTG--------GGCTGAATG-TACTC-ATCCGA---TTTTTTTAA-AT-T--G--TA-------A-----T-----------TGGGCCGACCCA--T-TTTTAGATA-ATCTG--A----AGACAAGCAGTAA-ATGACACGAA---AAATAC-----TT-TTCC---AAGA-ATAATATGTTTA----TACGTA-ACAT-TTCAA-TGATTTGGCAGTACAG-TACTAGTAA-TACAT--TTACTAGA-GA-G-AG-CATTCACGCCTG-TTG-----------TG
gi|16 : tctgtctatacttacctgtatattccaacatattcatggtgga--TTT-AT--TT-ATTTGTTCAT--TTTT-TT--ATATTT---TT-GATAGATTAAGTTTCT-T----AC-TTCCG-----T----TTATGGTTAG-TAA----CTTA----------------T-TG-GAGTTAGT--ATCC---------TTTG----------------TG-GGA----CGATACAC-TAAA-TTT-CCCCCCACCCCATACCGAAGAGAGATGGACGT-CGCTCCTGAG-CCGT-TGTAG-----TATTTTCGGATTTTCTTTGTCGGAGAACAT----GAACCA--TTTAAGGTAAGATAGAGTAAGATGAGAG
gi|17 : aggtaatttcggattctaaacgttcatttgtaaagactttgttatttgcatttggtcacattattttaatttgatgTAAGT--------ACT-------GTACTA-AGGCCGAA-TAA-GTTTCTCCATTGAAATAAGT----G------ACAAA-----ACGAAGAGGCAAACAC--TAATCTATTTAATT--TC-T--CCTTTAAAGTAT-A--CATTTA-TATTTCACCAACATTTTCATGTCGACA------------------TATCAAGTCT----------------------ACCG---TG-----TTTTCAAT------------------AAA---TC-AT-TT------CTAT--TCAGCTAAGTGGGAAA-ATAAC---GTAGA---AGAA---CTAA--ACAAAATAATTAA-TAT-TT-ATATA
gi|18 : CTAAATTA-GAAATTT--TTGT----T--T-GT-T--GCGG-------T----TTC-CC--GA----CGACCCCATT-GTTGAC-T--TCGTTACC-GA-CGTGAATCA---ATAC-T--T-TCT-------ATTTTG---A--TGT-TTG------------A----CGTACAGG--TTGAATATATCT---TTT--TTATATTTCGTTTCT-CTG-TT---TA-AC---CGATACCTGTGGAGCCGATTAAAT--T-----TATTTTCTGTGACAATT----C-ATACCCGAAACAC--A--AAAC-AT--TTTCCT--------ATTA---TG-AACAATT-C--TGA-----T---TTT-TTTTC--A-GCTA-----AA--GGACT-A-------AGTATATCCTGAT-----TTatatatagaagatatctatctctccatccgatcctttttttttttttatcgtttcacatatgggtcaaaaatagtat
gi|19 : AACGGTC-ATTGA-AA-T--TTT-GT-ATTCATTTGTAT-TCACTAT-GC--TTGCTT---T--CAT----------TTT-T----A--TTC-A-----T----TT-TG--TAG-TAG----AATA----------------TGAG-GA-----T--ATTCAG-----A-TT
gi|2 : tttgcatcagaaaacatatctttttgatgaggtttatgagCTAAATTA-AAA--TT--T-GT----T--T-GT-TT-GCGG-------T----CTC-CC--GAA--CCGACC----C-AGTAAA-T--TCGTT--C-GA-C-TGAA--A----T-C-T--T-T-T-------ACTT-----G--TATATT-------------A----C---CAGG--T--GATAT-TTT---TTT--T-A---TTCATT--T-CT--TT--GCG-AC---CGA-----------CCGA--AAAT-CT-----TA-TTTCTG---CATTT----T-A---CCG---CTC--A--AA-C-AT--TTT--TT-------AT-----CG-AA-A-TT-C--TGA-----TATTTTT-TTTTT--C--CGAT----TT--AGACT-ACAGCTGTAATAC-TCGT-GT-----TTTC---TAC-TTGTCCGCA-CGC-AGCC-TCGGAG-CTGAGA-CACTTCCGAAT-----ACCGC-ATGTACACTGTACAT-AATATACCA----AT-CG-TCAG--CGA-CT--ATGA-A-A-ACGTGCCTTA--TCAT----CGA---AA---GT-ATC--AT--TTT--A---ATTAT---AAGAATGCATAGTT-TCAATA--AAGT-GA-ATT--A-TTGAA---T--TTGCA------TTTA----GG---T-A-CGAAAT----TGTAG-C-AT--ACGGGG-GAGGA-GG-TTGA-A--GA-A-ATCG--T-AA----AG-ATA-TGCGAAAATTTCATA--T--ATCT--TTAGGCGGAA-CAA--------------AA-AACCA--T-GATTCAGACCCAA-CAC--CT-T-----GTC-----CGCA-T--ACAG-----------------------------ATGAA---TTAAAA-CAGAT-AA-G----TCGCT-GC------A-CTTTAT-GCAATTTGAAGATGC--A---T--CATACA-T-TAT-GC---AATACCAAC-CTGG-TATAGAAA-TAAGA-TACGCAGAATAAATA-TT-TGCTCCA--AAAACGCATTCATCATG-G-C-GGCTAATG-ATCAAACGTTC-AGTGA-AA-G--TGT-GTAATT-A-TTGCACATAATGAG-A----TA------TT-CAT----------TTT-T----A--TTC-G-----T----TT-TG--TAG-T-A----ACTA----------------T-TG-GA-----T--ATTCAG-----A---TG----------------TG-GGA----CAAT--AC-T-AATTTT-CCC----CTCCAAAC----GATAG-TGGACAT-CGC----GAG-CCGT-TAT--------A-TTTC----------TA-----------------------TTTAAC---CGAGAGA-CGAGA-AA------TTAAATAATGT--------------------TGAG-----A-ACC----------C--TACACA---CTGTGA--AGA-GAAGA-------------------------T-----TT-CATTT-----CAG-TTTG-TTGGT-AGA-CAAAA-TACC-GAAC--ATCGT-AAATTCAT-ATATAGACCCAGT-----------CC--TGCCTATCTCAATCACAACGATGGCCTTTTGCTT--CAATGA----CC-AC--T---------------T-GA-TTG---TTGAAATATGATC---------GA-ATAAAC------------ACA--CTG----AA----TCGGT--ACGAACGTGAGGGTATGC-A----------ACCGCAAATA-----TTTTTTAAATCCC-----------------AAAG---TTCAA-CAA----GCCTGCACTTTGC-TGCAA-TTGTAAAATAAAAG--ACGTGGAAAGTGTTC-ATGTTAATATTGAAATAAACACCGG--TGATCATGATGC---CATATCACTCAGCCATAGTAAAT--------ACCC------GTAAGT-ATACCAAAATAAG--TTCT-TATCGAAATAAG-----GCATGACATAAATCT--GC--AGAGGCAAACAC--TAATCTATTT--TTA-CC-TTGCCTGT-AAG-ATAA--C-TTTA-TATTATA-C-------------CAACATTTCATGTTAATATAAAGT--------T----------------------ACCGC-TTG-----TTTTAAAG-------------------AAATTTCTAT-TTATCG-CTTAT--TCAGTAAAGT--GAAA-AT-AC---G-ATACATA-CA---TGGA--ATAACA-AATAAA-TTTATT-ATCTA-TTT-CTTGACTGAATGATA-CC-A-CCGACTTTTTTTTTAATAT-GGCG--TACTAGT--AATTAGT-AGAGT-TT-ATGGACCGACCAA----TT--AGATGCATATA--C----AG-CAA---GCAA---GACACGAAGAAAAATACA--CTTT-TTCTTC-AAGA-ATAATA----TT----TAT-TACACATGTTCAATTGA-TT----GCAC-GCTACTAGTAATTACAT--TTAC-ATATTATGTAG-CCT--ACAACTG--CG-----------TGAT--AATTTACA-T---G--AG-T-----T--GCGACGTCAAAAA-CGGT-CA-T---G-G----TG-AC---TTAAAA-CTTGGA----CAGA------AAA---------A-----------TAACTT----TTAT--GG-TTGTGCGCTTGCGACCCTCCG-------------CCC-----CCCCCCCCCTCCCCCCC-CT-C-CACGCCCCCCCCCCCCTCACTTTAAGTTTGAATT--------------G-CTC-------AC-AAAACA--CAAT------AA-TATTACGATATAT-TTGCGC-AAG--TT---T-------AAGATACA---AAAC-AACAGT---ACATA----AATGTT-TATT--ATA-ATA-TCTGTATATGCAT--C-A-C-AAAGCA--T--A-C-AGACAAAA--CT-ATATC---ATTATC-----AAA-TAAGA--TA--TTTTAT--CGagctccgtaaatacatttataaacggtgagacaaaactaattttattcgtattgttgagtagacaagcgtgacccattatatttttttcaacatttgataaagaacaaatttaat
gi|20 : GCAC--CTA-CAAAAGCAG-TTTA-C-AGAT-AAAA-CTAATATCAT-GG-ATCAAAT-AAA-TAAAA--TA--TTTTAT--CGACC--TA--CCTACCCAGAGAAA--AAATAAG-TTCCTAC-TAGAAGTTATTT-TTT--------GCTTA------------------G-AAA-AAT-AAATA-TTTA---C-CTAC-CTA---CCGACCTAA-CGTCCGTAAAT-C-GGCG-TCG-GAAAAA-GG--GCAAACAAACAAT--TTTTTCATTTtaaaatttatcacaaatgaaaattcttctataaacaaaaaaatttatttcttataaaaaatggtaaaaata
gi|21 : ATTTCAC--TT--TATA-TATAGAG-CAC--ACAACTGGCTGGGGTAAACCTCTGATGAAATTTACA-TG--GG-AG-T-----T--GCAACATTAAAAA-TGGT-CATT---G-G----TG-AC---CT-GAA-CTTACACCC-CAAA------AAAGGGTGATTCA----------TTTAGTCCA--TTATTGGA-TCATGTA------------TA-------------CCC-----CCta
gi|22 : GCAC--CTA-CAAAAGCAG-T--A-C-AGAT-AAA--ATAATATCAT---TATCAAATAAAA-TAAAA---A--TTTTAT--CGACC--TA--CCTACCCAGAGAAA--AAATAAG-GTCCTAC-T-GAAGTTA-TT-TTTG-------GCTTA------------------G-AAA-AATAAAATA-TTTA-----CTAC-CTA---CCGACCATA-CGTCCGTAAAT-CGG--G-TCG-GA-AAA-GG--GCAAA-AAACAAT--TTTTTCATTTAaactttctggattagaattccagggaaaaatttgcacacaat
gi|23 : ACGATGGCC--CTGCTT--C-ACGA----C--AC--TGGCTTATCTATGGTCT-GA-TTAGTTTTG-AACATGGTCATCGATTGAGAGATAAACCCCATGTCCAAAACT--CTATCCTGA----TCGGTATCCGAACGTAAGG-TA-GC-ACAAAAAATATACCG-AAATATT-TTATTTTTA
gi|24 : AAAA-AAA-AAAAA--TAATCTTTAT--CGACC--TA--CCTACCCAGAG-AA--AA-TAAA---CCTAC-T-GAAGTTATTT-TTTG-------GCTTA------------------CAAAA-TA-AAAATATTTAA---T----C-CTA---CCGACCCTA-CGTCCGTAAATGC-G--GTTCG-GA-AAA-GG--GCAAACAAACAA---TTTTTAATTTAc
gi|25 : AAT-AAAATAAAA--TACTTTTTAT--CTAC---TA--CCTACC-AGAG-AA--AAATAAG-GGCCTAC-T-GAAGTAATTT-TTTG-------GCTGA------------------GAAAA-A-TAA--T-TTTTA---C-CTAC-CTA---CCGACCTTA-CTTTCGTAAAT-C-G--GGTCG-GGAAAA-GG--GCAAA----CAAT--TTT
gi|26 : AAAT---AAC--TT--GTGT----TATT-GTGTT-GCGG-------TATATTTC-CCACGA---CCGACCC---T-AGTAAA-TTATC-TT-GC-GA-C--GAA--ATATAT-CAT--T-A-T-------ATTTTTGTGG--TAT-TTTTAGAACATCCTGA----C---CACA-----AATAT-CTT---CTTTATTT---TTCATT--T-CTG-
gi|27 : AGCGCTC-ATTGA-AA-A--TTTTGT-ATT-A------CATA--CAT-GT----ATGT---TTACAT----------TTT-T----A--TTC-GGTTTTT----TT-TT--TAG-TAA----CTTA----------------TGAG-GA-----T--ATTTAG-----A-TTT
gi|28 : gatgggaatttaaggacT--AGTTTACA-TG--C--AGGT-----TCAGCGCTGTCAAA---CGGT-CATTCTGG-GAGCATG-TCCCTTT-GA----TAGA--T--AGT------ATATT-------A----------TTAA--T----TTAT-----TTGTACA------------GA-------------CAC-----CCCCCCCCCC---CC-C-TT-C-cctctttccgtaaacacatttgctaaacgat
gi|29 : -AATAAACACCGGGATG----------------A----TCAGCCATAGTAAAT--------A-CC------ATACGT-ATACCGAAAAAAAccccgggccttgtaat
gi|3 : aGTGGAAAGTGTTC------------G-AATAAAC-CCGGAATG-------------CACA----TCAGCCATAGTACATGTTAAGTAACCTAGTTTGGTA-GT--TAC-GAAATAAAGTTTCTCCATCGAAATAA---------------------------AGTGACAAACA---TAATCTTTTT--TTA-CC-GTTCCTTT-AAAAAT-A--C-TTTAATATTATACC--------------GACA------------------T--------T----------------------TTCATGTTGAATATTTTTAAAGTTCCGCTGTTTTCAATTAAGAATTTCTATCTTACCG-CTTAT--TCAGTCAAGTAGGAAA-AT-ACATCG-ATA---A-A-----TAA--ATGATACAATAAACTCTATTTATCTATTTTTCCTGACTAAATG-TACCCCA-CCGAC-TATTTTC--ACAT-G--G--TACTAGTTAG-----T-AAAGT-TTCATGG-CCGACTGAGTT-TT--AGATACATATG--CCATAAGGGCAG--GCAAATTGCAACGAAG-AAAGTACA--CTTTATTCTTCAAAAA-AT----TTTTTT----T-T-TATACATGTTTAATTT-TTT----GCAC-G-TACTAGTAATTATAT--TCA---TG-TATGCAG-CA---ACAAC-G-C-G-----------TGAT--AATTTACA-TGCAG--CG-T-----T--GAGACGTCCAAAA-CGGT-CATT---G-G----TG-AC---TT-GAACCTTGAA--CACAGA------AAA---------AAGCGATACT-CTAGTTT----TTAT--GG-TTGTGTG------------TAAACAACAGAACACCCC-----CCCCCCCCCC---CCCC-TT-C-CAGGT---------------------TTTGAATTCCTGGGAGGAAAACG-TTC-------AC-AAAACA--AGAT------AA-CA-TACGG-GTAATTT--GC-AAG--TT---TACAAA--GAGATAAA---AAAC-AA-A-------------------A-TATA--ATATCTG-CATACA--------------AAAAGCAG-T--A-C-AAAC-AAA--aataaagataattcttattcgataagttgcatgattaaaacaggtgaattctattttcac
gi|30 : -ATGA----CC-AC--T---------------C-GA-TTC---GTG-AA-ATGGTA---------GA-ATGA-C------------ACA--CTG----AA----TCAGT-CA-GAACATAGGGAAATGC-A----------ACCG-AAAAAAA------ATTGACTCCC-----------------AAAG---atttat
gi|31 : TATG---ATTGAGAGAGGA-ACCCCTAAAACTAC--CATACATTTCTGTGA-TATATGAAAAATGA---ATACGGGGCGA----TG-A-----TT-CATTT-----CAGTTTTG-CTgaa
gi|32 : a-TTC-G-----T----TT-T---T-G-TAA----ACTA----------------TGTG-GA-----T--ATTCA------A-TTTGTTATCTATAAAT----TGTGGA----CGAT--AA-T-AA-TTT--TT----CTCCAAAC----GACAt
gi|33 : tcttattAATTA-AA--------TGT----T--T-GT-TT-GCAG-------T----TTC-CC--GA---CCGACC----C-AGTAAA-T--TCGTT-TC-GA-C-TGAA--A---AT-A-TAAT-T-TAATTCACATTT-----G--TAT-Tt
gi|34 : --CGA-CT--ATAA-A-GGACGTGC-TT---TCA---GTCAA---AA---GT-ATC--AT--TTT--A---AT-AT---AA-AATACAT-GTT-TC-ATA--AAGTCAA-AT
gi|35 : ATT--G-CTG-TT--GCG-AC---CAA-----------CCGA--AA----------TA-T-------------------A---CCA---CTC--A--AAAC-AT--TTT--T--------AT-----CG--A-AATT-C--T
gi|36 : T-C-G--G-GTG-G--CAA-CA--GCAAACAAACAAT--TCTTTATTTTA
gi|4 : tcgggAATTA-AAT--TTCATTGT----T----GT-TT-GCG--------T----TTC-CG--AA---CCGACC----C-AGTAAACT--TCGTT-CC-GAAC-TACA--A---AT-C-T--T-T-T-------ATTT-----G--TAT-TT-------------A----C---CAG----------T-TAT---TTT--TTA---TTCATT--T-CTG-TTTGGCG-ACAAACGA-----------CCGA--AA-T-CT------A-TT-CTG---CAATT----T-A---CCG---CT---A--AAAC-ATGTTTT--T--------AT-----CG-AA---TT-CACTGA-----T---TTTATCTTT--C--CGATTATTAA--GGACT-A-------------------T-----TGTC---TAC-TTGCCCGAA-CGC-AGCAAT-GAAG---GAGA-CACTTCCAAAT-----ACTGC-ATG--------ACAT-A--ATACCA----AT------------------ATAACA-A-ACGAGA-CTA----AT-CATCAA---AA---GT-ATC--AT--TTT--A---AT-AT---AA---TGC-TAGTT-TC-ATA--AAGT-AA--TGA-A-TTGAA---T--TTGCA------TTTA----GG---T-A-CG-AAT----TGCAGTC-AT--AAGGGG-CAGGA-GG-TTGACAG-GATA-ATCG--TCAA----AGAACA-TGGAAAAGTATCATA-----ATTT--T----CGGGACCAAAAACAAACAAACATAA-AACCA--CGGATTC-GACCCAG-AACAACT-T-----GTC-----CG-ACT--ACAG-AGAT---------CGAGAATCGGT-T--ATGAA---TTAAAGCCAGATC-A-GTTTTTCTCTAGCGCCAAAA-CTTCGT-GCA--TTGAAGATTCCAA---T--TATACA-TGCAT-GTCT-ACTCCAAA--CT-GTCATGGAAA-CAAAA--ATACAG-ATGAATA----CGTTCCAATGAAAgg
gi|4 : ATGAAT---ACGTTCCAATGA-AAGA--TTT-GT-AGC-TGTTGCACATAATCA-------TATTT---TT-GAT----------TTGAA----AC--------------------A--TAG-TAA----ACTA----------------TG-G-GA-----T--ATTCAG-----ATTTTGTCTATTTATAAATTGTTG-GGA----CAAT--A----AA-TTT---T----TCCCAAAC----GATgatttgtagctgttgcacataatcatatttttgatttgaaacatagtaaactatgggatattcagattttgtctatttataaattgttgggacaataaatttttcccaaacgat
gi|5 : aattaaatttcattgttgtttgcgtttccgaaccgacccagtaaacttcgttccgaactacaaatcttttatttgtatttaccagttattttttattcatttctgtttggcgacaaacgaccgaaatctattctgcaatttaccgctaaaacatgtttttatcgaattcactgattttatctttccgattattaaggactattgtctacttgcccgaacgcagcaatgaaggagacacttccaaatactgcatgacataataccaatataacaaacgagactaatcatcaaaagtatcattttaatataatgctagtttcataaagtaatgaattgaatttgcatttaggtacgaattgcagtcataaggggcaggaggttgacaggataatcgtcaaagaacatggaaaagtatcataattttcgggaccaaaaacaaacaaacataaaaccacggattcgacccagaacaacttgtccgactacagagatcgagaatcggttatgaattaaagccagatcagtttttctctagcgccaaaacttcgtgcattgaagattccaattatacatgcatgtctactccaaactgtcatggaaacaaaaatacagATGC--A---T--TATACAATGTAT-GCCT-ATAACCAA--CTGGTTATAGAAA-TCATA-TAC-CAGATTCAATA-TTATGCTCCAGCAAAACGCTATCACCATG-GGCAGG-TAATGAATCAAACGTTC-AGTGACAG-A--TTT-GT-ATTTATTTGCAC-TAATCAT-GTATTTATTTATTTT-CAC----------TCT-CTTACAC-TTC-G-----TCATTTT-CG--TAG-TAAAGTGACTAACTGAATCGAATGTTGTGTGCGG-----TGAATCGAGGGGGTA-ATTG----------------TG-GGAAATATGAT--ACCT-AA-TTTTCCC----CCCCAAAC----GATAG-TGGACATGCGC----GAGGCCGT-TAT----------TTTCG--------TTC--AAA-AACATGAA-----CATTTTAACG---AGAGAGAGAGAGA-GAGAG---------AGCG-----CATTAAATATGAAGTTTGAG---GAATACCCCAGGT---ACA-CACACA---CTGTGAACAGA-GAGGAA-GG---A--------GAAAAACG-A---------AT---------GTTT-G-TTGGT-AGAACAAAAATACCAGAGTA-ATCGT-CAG-TCGTATCACAAACCCAGTTACAACTGCACCTG-TA-CTACCT-AATCACAACGATGGCC--TTGCTT--C-ATGACACCCC-ATCGT---------------TAGATTTG---TTG-AAAATGGTC---------GA-ATGAAC------------ACACCCTG----AATAATTTGGT---CGAATGTAGGGATATGCAA----------ACCG-AAAT-TATTTTTTTTTTACTCCCCAATAGTGTAGTTTGTTAAAGTATTCCAACCAA----GCGTG--CTTTGCTTGGAACCTGTAAAATACAAGC-ACG-GGAAAGTGTTC-
gi|6 : TAAATTTTAAA--TT--TTGT----T--T-GC----GCGG-------T----TTC-CC--GGGACCCGACC----TCAGTAAA-T--TCGTT-TC-GA-C-TGAA--A---AT-C-T--T-CCT-------ATTT--------TAT-TT-------------A----C----AGG--T--G-TAT-TGT---TTT--TTA---TTCATT--TTCTG-TT--GCGGAC---CGA-----------C-------AT-CTCCCTCTC-TCTCT----CAATGACAAT-AATCCTG---ACC--T--AAAC-AT--ATA--T--------ATATATTCATAA-AATT-C--TGA-----T---TTT-TTTTTTAC-CCAAT----AA--GGACT-A--------GTGG-TCCTAGT-----TTTC---TA---TGTCCGCATCGC-AGC--TCGGAGACTGAGA-CACTTCCAAAT-----ACCGC-ATGT-------ACATTA-T-TACTACTCCAT-CG-TCAG--CGATCT--ATAA-ACA-ACGTTC-TTA--TCAT-CGCCTAGTTAC---GT-GGC--GTGCTTT--ACCTAT-ATGAGAA-GATGCATAGTT-TC-ATTT-AAGT-AA-ATGAGA-TTGAA---TGATTGCA------TTTAAA--GG---TTA-CGAAATGTCTCGTAG-G-AT--AAGGGGAGAAGA-GG-TTTA-AG-GA-ATATCG--T-ACCCCCGG-ATA-GGAAAAAGTTTCATA--T--ATCTTCTTAC-CAGGA-CAA--------------AACAAACA--TGCATTCAGA-CCAA-CACAACTAT-----GTCGGGTGCG-A-T--ACAG-AGATAATGA----TGAG-ATCGGTTT--ATGAA---ATTAAACCAGATCAACG----TCGCT-GC------AGCTTTGT-GCATTTTAAAGATTC--A---TAGTATAC--TGTATGGCCTAATTACCAAGGCTGGTTATAGA
gi|7 : -CTTCGTAGCAATTTGGAGATGC--AAATT--CATACA-TGTAT------ACTGTCG--------TATGGAAAATAATAATACGAGAAATGAATA-TTCTGCTCCAGCAAAACGCCATCGACATG-G-C-GG-TAATGAA-----CGT-C-AGTGA-AA-AGATTT-GT-ATT-ATT-GCACATAATCATTAT--TTATTT---T--CGT----------TTAAT----A--TTC-G-----T----CTGTG--TAG-GTA----AC-A----------------TGTG-TA-----T--ATTCAG-----A-ATTG----------------TG-GGAA---CGATT-AC---AA-TTT-TTC----C---AAAC----GATAG-TGGACATGTGC----GAG-CCGT-TA--------CA-TTTCG--------TTA--AAAGAACCTAAAAGAACCATTTTTAAG---AGAGAGAGGGAGA-AAGAGCACTT-AATAACGTTTGTCAATTCGTGT----TTCGAG---GAA-ACCT--------ACA-CATACA---CTGTGA-CAGA-AGAGAA-AACCGC--------AA----TA-A-----TTACATTTTGAAGCAGTTTTG-TTGGTCAGA-CAAAA-TA----AATA-AT-----AA-TCGT-TCACAGACCCAGT-----------CCGTTG-CTGTC----CCACAACGAAAGGC--CTGCTC--C-ATGA----CC-AC--T---------------T--A-TTG---TTA-GAAATGGTT---------G--ATGA--------------ACA--CTG----AA----TCAGTCCCCGAACATAGGGACATGC-A----------ACCA-AAAT-CA--TTTTTTTAACTCCA-----------------AAGG---T
gi|7 : -----------------AAAGAT-TTCAG-CAACGCTGCATGCACTT-GCTTGCAA-CTGTGAAATACAAGCAATGTGGGAAattaaactggttccataagcaatattatgtaaagatttcagcaacgctgcatgcacttgcttgcaactgtgaaatacaagcaatgtgggaa
gi|8 : cttcgtagcaatttggagatgcaaattcatacatgtatactgtcgtatggaaaataataatacgagaaatgaatattctgctccagcaaaacgccatcgacatggcggtaatgaacgtcagtgaaaagatttgtattattgcacataatcattatttattttcgtttaatattcgtctgtgtaggtaacatgtgtatattcagaattgtgggaacgattacaatttttccaaacgatagtggacatgtgcgagccgttacatttcgttaaaagaacctaaaagaaccatttttaagagagagagggagaaagagcacttaataacgtttgtcaattcgtgtttcgaggaaacctacacatacactgtgacagaagagaaaaccgcaataattacattttgaagcagttttgttggtcagacaaaataaataataatcgttcacagacccagtccgttgctgtcccacaacgaaaggcctgctccatgaccacttattgttagaaatggttgatgaacactgaatcagtccccgaacatagggacatgcaaccaaaatcatttttttaactccaaaggtattaaactggttccataagcaatattatgtAAATTA-AAA--TT--TTGTATACT--TAGT-TTAGCGAGTCAGATT----TTCTCC--GA---CCGACC----C-AGTAAA-T--TCCTT-TCCGA-C-TGAA--AG--AT-C-T--TGT-T-------ATAT-----GGGTAT-TT-------------AGACGC---CAGGGGTA-GATCTATTTACATTT--TTA---TTCATT--T-CTGCTT--GCG-AC---CGA-----------CCGA--AATT-TT-----TA-TTTCTG---CAGTT----T-A----CG---CTC--A--AAACTAT--TTTA-TGTCCATAAAT-----CACAA-AGTTCC--TGAATTTTT---TTT-TTTTT--CAGCTAT----AATCGGACTAA-------AGCA--TTCTAGTTATTATTTCCATTACCTT-CCCGCA-CGT-AGC--TC-GAG-CTGAGATTACTTCCAAATGTGGAAC-GCAATGTA------ACAT-A-TAT-CCC----AT-CATTCAGTCTGA-CTCAAT-A-A-A-CCGTGC-TTAATTCAT--ATCAA---AAAAGGT-AGC--AT--TTTTAA---AT-ATGA-AA-AATGCATAGTTATC-ATAATAAGT-AATATGA-ATTTGAATATT--TTGCAGAACGTTTCAAATTGGGGTT-ATCGAAA-----TGT-G-C-AT--AAGAGG-GAGGATGGTTTGA-AGAGG-A-ATCGTTT-AA----GA-GTAGTGGACAAG-TTCATAAGTAAATCT--TTA--CGGGA-C-A--------------AC-AACCT--GGGGTTCAGTCCCAAGCAGCACT-CATAAGGCC-----CG-A-TAAACAG-AGATAAATGAATGTGAGAATCGG--T---TGAATATTTAAAACAAGATCAA-G----TC
gi|9 : gccta-----GC--AGAGGCAAACACACTA-TCTATTT--TTAACCATTGC-TGT-C-GTAT-GAGC-TTTA-TATTATTAC-------------CAACA------------------T--------TTTCATGGTTGATTAATTAAGCTACCGT-TTG-----TTTTAAAG------------------AAAATT---ATATTA-----TTATCATCG--CAAGTGGGAAATAT-AT---G-ATA---A-AATAACTAATAGTAATACAATAA--TTTATTTATCTATTTTACCAGACTGACTG-TACCC-A-CCGAC-TTTTTTTTCATAT-G--GGTTACTAGT--A-----TTGGAGTCTT-ATGGGCCGACAGA--TGTT--AGA-ATATA-A--C----ATACAAG--GCAA-TTGACACGAAG-AAAATACAATTTTT-TTCTTCAAGAAGATAATATCTTTT----TA---AAACATGATCCATTGATTT----GCAC-G-TACTAGTAATTACAT--T-ACTATA-TATGTAGGCAT--ACAACTG-CCG-----------TAAT---ACTGACA-CG--AATAG-T-----TG-GCGACAT--AAAA-CGGTCCATT---G-G----TG-CC---TT-AAG-CTTGGA--C-C--G------AAA---------A----------TTAAGTT----TTAT--GGTTTGTGCG------------TA-------------CCCTCCCTCCCCCCCCTT---CCACTTT-C-TACG----------------------TTTG-ATT--------------GCCTCA------AC-AAAACA--CAAcc