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Reference ( gi|6 ) : ATTAGGCCTTTCGTTCCGTAAGGAACATAGGC-CATCAACAACAGTCCT--C--CAGCGAACAT-GGTT-CTGGGCTGCTT----TTGCTGCCTCTTG-C--CAGGTG--------ATG-T-CACGTTC--TCAATTCTGATTCCGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCATCCGCCT-GATTTGC--A-----ATGA-CC-ACTGG--T-CTTGATTTGCTCTCCCCCGCA-GTTCTTCATTT-GTGATCC---T-T--CAGG-CCA-CGGATGTTAAGGA-TGCGCCCGA-GACG--AGT-C--TTGTAAAATG-TT-GGATCTTTTGCAG------GGCTG-T-TT-AGTAGTTCTCCATTTGTCT--GC--T-C-ATAGAGTAA-GATGGATTTTACGTTGG---A-TTG-AA-G-ATTCG-CAGTTTGGTG-GTAA--T----AC-G--AAT--GTC-CTTTGAGGCCCAGAT--GAT-ATTGAGCATG------GTG-AAAGCT---ACT-CTTG-----CCT-----AT--CCT-------A-GTC-------TTG--------------GTCT-GTACCACCC--TGTATGTC-----------------------CA-CTACAC-T------------CCCC-AGGCAAA-T--GAAGGA--ATC--AACT-TCCTTGA-TGG-GCTCTCC--TC-CCGCTGTGA-CTG-GTG-AT-------TGGACAGT----GGTG----TTGATCT--TCA--TCAGTTCTG----T---TT-TCTTCAGGT--T-GATC--TT-GAGACCCG-T--TCC------TG------TTG--TTG----CAAGGTGAGTTGT-C-TTGTCCTGCA-TCTGCCTGT-GGT----TG-T-----GTGACAGGAGAGCCAGG-TCATCGGCGGAGTCGAGATTATCTA----GTT-GCGTTAGGAGT-GTTCACTG-TAT-GCCAT--T---GTT-CCTTC---CTGTCGT-GA-TGGTCGTCATGAT-CC--AAT-CA--ATGACCAG--G-AGGAACAG--AAACTGT--GATAGCA-A-ACATCC------TTGTCGA-----ACT-CCTGTCTTGACCTCAAAACT-TTCTGACA--T--CTGACCAGCATAGCCAACCCTGCA--TGCNCCGACATCTGACCAGCGTGGGCGACCCTGCATGGCATGCCTTGAT-AGGTGTTACATGTACGAATGAGAGAGAC-GA-GCTTCT-CAGGT--ACTCCATAGTGCCTCAGTATATTCCACAG-TATCTCTTGGTCCATG-CTGTC-GAAAGC-TTTCTCATAATCTATAAAATTGNAAGTTGACATATA-------GAGGG-GACTTCCACTCCAATGATTGTT
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gi|13 : tacTTAGGTCTATCGTTCCGTGAGGAACATAGACTTATCAACGGC-GTCC---C--TAGCGAACACAGGTT-T--GGCTGCTT----TTGCTGCTTCTTG-CAAGAGGTG--------GTG-TCCATGTTCTTTCAATTCTGACTCCGtg
gi|21 : atAGGCCTATTGTTTCGT--------------CACCAACGACAGTCCT--C--CAGCGAACAC-GGTT-tggtctcgcatccaggtacttctctaatgacctcctttcttctcttgcgttgcccctagtgggttccgagtcagcctggcgttgtgttagttgttgacttcctcaaagttgtccaaatccagccccacttcctccgccttgattgcggaacctactgctcttaatttcttcctcccatagttcttcatttgtgatccttctggccatcgaatgttaaagattgcgcctgatgaacagtgctgttgtaaaattctg
gi|5 : CATAGGC-CATCCACAACA--CCTCGC--CAGCGCACTC-GGTT-CTGGGCTAATC----TCATTG-CTCCTGTC--CAGTTG--------ACC-C-CGTGTTCTTTCATCTCTG
gi|8 : tcttacttaggcctatagcccttggttgagcataggccatcatgCATAGGA-CAC--ATAACAGTCAA--C--CAGTGATCAC-GGTT-CTAGGCTACTC----TTA------ATTG-C--TAGATA--------GTT-T-CACcctcagtatctcgcctccagctgttgcgaggccgtnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntccgcagaatctgctcagccactggatcctgtcccaatcgctcccacaagtcttgtctggccatctgatgttgtaaatgcgcctaaagcggcagttgttgaaaaatgcttgaatcttgagcagcattaaaattgtctttgtcgtccgccattgtttcgcatccgtagagaaggacggatttgatactggaattaaagatacgcatttttgtcttcctactgatctgtctggaggcacagatgttcttcaacattacgaaagcccctcttgccttgccaatccttgctgtgacgtctcggtctgtgtccccctgcttgtcaaccacacttcccaggtagacaaaagactccacctctctgatggactctccaccgactgtgattggtgttgatcttcgtcagctcggtcttttttttctgttgattttaagccctgtcgtttcaaggcgagtggtcttgtcctgcatctgggagtagctgtgcgataggagtaccaggtcgtccgcaaagtcgatgtcatccaactgtgtccagagccccactgtatactgtttttcctgcctgttgtagtggtcttcaagatccaatcaatgaccaggaggaagaggaacggcgacagtaagcagccctgacgtactccagtcttcacctcgaaactgtctgacaacctgccggcgtgagcgatactgcagctcatttcttggtgagtgcagcgaatgagggagataatcttctggggaactccgtaatgtttcagcagcttccacggcgtctctctatctacactgtcgaatggcttctcgtattctatgaaattggcgtagaggggggggggggttccactttaaacagcgagtgctcaacaatgatgcgtaggctggcatctggcatctggtcggcacaggatctgttcctgcggaagcccgcctgctggt
gi|11 : TCGACAATA--CCT--CGACAGTGCAATT-GGTT-CTGGGCTAATC----TCATTG-CTCCAGTC--CAGTTG--------ATC-C-CCTGTTCTTTCATCTCTGaggtctacatctctacacctcagatgtttctggttcgtnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnctttcatctaatttacacaagtacgtccatcggctcctgtcttgctctctccacatttcttcgttcatgatttattttcagacctttaatatgcgcctgagacaggtggtttaggctatttggatcgtctatggagttgctttagtcgatctccatgtcttcgcttcgtaaaataaaatggacttaacaatgaagtggggatccacacattgacggtcatttgcacgtggatgtcctatattttcttgggcattgtgaacacttttgctgcttgtcgattcttgacttgacgccttgatcactgccactctggctgtttaccacactccccaggtaaacgaagtattgaacttctccgataggctccccaccgacagtgactagtgatccggcggtgagactgatcttcattcattctgttttctttaaattggacttgggacctgattctgctgatgttgttgcaa
gi|19 : GACTGCTT----TTGCTGCTTCTTG-G--CAGACGATACCGGTATA-T-CATGTTCTTTCCATTCTGACTCTGcctcagtgtctcgcttcgagctgttgcaaggccatcctcttttcctctgaccctgcgggttccaggtcagggcttggcgtgtggtgttggcttcaggtttccgaaaagtaccggattagttcgatccagccccacttcctctgcagaatatgttcaaccactagctcctgttttactcgctcccacaaatcttcatttcgtattttgtctggccatctgatgttgtaaatgtgcctcaggcaggtgttgaaaaatgtttggatcttgagcagcattgtctttgtcgtccgccatgtttcgcatccgtaaagaaggatggatttaacgctggaataaaagatgcgcatattaattgtctt
gi|5 : TCCGCAG-AATCTGC---------TCAGCC-ACTGGA-T-CCTGTCCCAATCGCTCCCACA-AGTCTT------GT----C---T------GG-CCATCTGATGTTGTAAA-TGCGCCTAA-AGCGGCAGT-TG-TTGAAAAATGCTT-GAATCTTGAGCAGCATTAAAATTG-TCTT-TGTCGTCCGCCATT-GTTTC-GCATC-C-GTAGAGAAG-GACGGATTTGATACTGG---AATTA-AA-G-ATACG-CATTTTTGTC-TTCC--T----AC-T--GATCTGTC---TGGAGGCACAGAT--GTT-CTTCAACATT------ACG-AAAGCC---CCT-CTTG-----CCTTGCCAAT--CCTTGCTGTGACGTC-------TCG--------------GTCT-GTGTCCCCC--TGCTTGTC-----------------------AA-CCACAC-T------------TCCC-AGGTAGA-C--AAAAGA--CTC--CACC-TCTCTGA-TGG-ACTCTCC--AC-C------GA-CTG--TG-AT-------TGG-----------TG----TTGATCT--TCG--TCAGCTCGG----TCTTTT-TTTTC-TGT--T-GATT--TT-AAG---------CCC------TG------TCG--TTT----CAAGGCGAGTGGT-C-TTGTCCTGCA-TCTGGGAGT-AGC----TG-T-----GCGATAGGAGTACCAGG-TCGTCCGCAAAGTCGATGTCATCCA----ACT-GTGTCCAGAGC--CCCACTG-TAT-ACTGT--T---TTT-CCTGC---CTGTTGT-AG-TGGTCTTCAAGAT-CC--AAT-CA--ATGACCAG--G-AGGAAGAG--GAACGGC--GACAGTA-A-GCAGCC------CTGACGT-----ACT-CCAGTCTTCACCTCGAAA-----CTG-----T--CTGA----------CAACC-------------------TG-CCGGCGTGAGCGATACTGCAGCTCATTTCTTGGT-GAGTG---CA---GCGAATGAGGGAGAT-AA-TCTTCT-GGGGA--ACTCCGTAATGTTTCAGCAGCTTCCACGG-CGTCTCTCTATCTACA-CTGTC-GAATGG-CTTCTCGTATTCTATGAAATTGG-------CGTAGAGGGG---GGGGG-GGGTTCCACTTTAAtgtttcgc
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gi|11 : acttacttaggtctgttccgtgaggaacatagaccatcaacgacagtccttcagcgaacacggttctgggctgctgttgctgtttcttgtcaagtggtatcatgttctttcaattctgactccgttggctcgcctccaagtgtttctaggacgtnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntgaagA-CC-ACTAGC-T-CCTGTTTTACTCGCTCCCACA-AATCTTCATTTCGT-ATTT---TGT--CTGG-CCATCTGATGTTGTAAA-TGTGCCTCA-GGCA--GGT-G--TTGAAAAATGTTT-GGATCTTGAGCAG------CATTG-TCTT-TGTCGTCCGCCATGTTTC---GCATC-C-GTAAAGAAG-GATGGATTTAACGCTGGA--A-TAA-AA-G-ATGCG-CAatgtcacgccttggcaggtgttacgaatgagagagacgagctttcaggtacttcatagtgcctcatatcttcctgtcgaaagcttttctcatagtctatgaaagtttacatatagaggatgatttccactccagtgattgttcgatgatcatcggatgcgtagactggctatttgatcagcatctgatctgtttggactaaaaccatcctgctggtcacggagctttgggtccactgcgccttctctcatcctccgagaaggactgcttcgaggactttgccggggtttactggacaggagcattacttccacgaatagttaattgcagtccctcaattcttccttcgttggcagctttaatgaggatccctctttcttactcttcagggatgttctcttccttccagatcttcttgaaga
gi|1 : tcgacaatacctcgacagtgcaattggttctgggctaatctcattgctccagtccagttgatcccctgttctttcatctctgcctcagtgtctcgcttcgagctgttgcaaggccatcctcttttcctctgaccctgcgggttccaggtcagggcttggcgtgtggtgttggcttcaggtttccgaaaagtaccggattagttcgatccagccccacttcctctgcagaatatgttcaTTAACGTTGG---AATTA-AA-G-ATGCG-CATTTTCGTC-TTTA--T----ACTG--ACT--GT---TTGGAGGCCCAGAT--G-T-CTTCA-CATT------ACGGAAAGC-----CT-CTTA-----CCTTGCA-AT--CCT-------T-GCTGTGACGTTCG--------------GTCT-GTGCT-CCC--TGTTTGTC-----------------------AA-ATCCAC-T------------TCCC-AGGTAGA-C--AAAAGA--CTC--CCTC-TCTCTGAAGGG-GCTCTCC--AC-CGACTGTGA--TG-GTGTGT-------TGGA--GT----GGTG----TTGAACT--TCA--TCAGTTCGG----T---CT-TTTTTCTGT--T-GATC--TT-AAGCCCCG-T--CCC------TG------CTGATTTGTTTCCAAGGTGAGTGGT-CCTTGTCCTGCAATCCGGGAGTAGGC----TG-T-----GTGACAGGAGTGCAAGGGTCGTCG-CAAAGTTGAGGTAATCCA----AC--GTGTTCAAAGT--CCCACTG-TAT-ACCGT--T---TTT-CCTGC---CTGTTGT-AG-TGATCTTCAAGAT-CC--AAT-CA--ATGACCAG--C-AGGAAGAG--GGACTGC--GACAGTA-AGGCAGCC------CTGACG------TCT-CCAGTCTTCACCCCGAAACTGCTCTGACC--A--CTGGCATGCGTGGGTGCTCCTGCA---GCTCtattaattgtctt
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gi|3 : --------------GTCT-GTCGCACCCAGTGT-TGTC-----------------------AA-TCACAC-T------------CCCA-AGTAAGA-T--CAAATA---TC--A--T-TCTCTGA-TGG-G--CTTC--TCACCACTGTGATTTG-GTGTGT-------TTG-CAGT----GGTT----GTATTTT--TCA--TCAAGTCTG----TCTGTT-GTTTCTGGTGAT-CATC--TT-AAGCCCCG-T--CCCGTGAA-TG------TTG--TTT----CA--GAGAGTGGTAC-TTAGTCTGCA-TCCG--GGT-AGTAAGCTGAT-----TTGAAAGGAT-GCCAGG-TCGTCG--AAAGTTGAGG-TACCTACAACGTT----TCAATAGTCCCTCA-TGTTAT-ACCGT--T----TT-TCTCCATGCTGT-GT-AG-TGATTTTCAAGAT-CCTTAATACA--ATGACCAGCTC-AGGAAAGG--GAACT-T--GCGGACA-A-GTA----------GGCCGACTAGTACT-CCAGTCTC-AC--CAAAACT-GT-TGACAACTTGCTG-CTGGCGTGGGCGAATCTGCA--ccattgtcattgatgatgcgtaggtgctatttatcaacaaattaattctgtttcgcctaaaaccaggcctgctggttaacgagctttgagtcatgcttcttcatcctctccagaagatcctgtggatgactttgccgggcacaagagcattattccacgatagttgttacagtccctcatatcttccttctttgggaagcttaatgaggtgaccctctttccattttcatggaatctcttcctccaaatatctcatgaagagttaagcaatatgtctatattgtctctgtggcagcttgatagcttccgcggtattcgtcaggtcctggtgatttaccattcctgtgatttccattcttagtgttgggtaatagattactcctggtctcggatagtgattgttttgcatttattgggaagactgtattcagggctgtattatccggtggagtttctggtgttggtctgtttaagatctccagtgttctatccatttcttgaattcctcttcactggtttgagaggttccattcttgtcatcactgttttcacgctggtaactttgttttgaaagcttcttggtggaccatgtacagctctctaaaatttccatttcccgctcgtccttcatgctttttggccaaagttgttcaatgtggttccgtttctttcctatacatcgcttcatttctttgttgcagcgtgcatagttcctcttagcctttgactttgctgctcttgttcggcttgtgttactgccttttctttcctgtcctcacattcaatttcctcatgtatcggcgagaccactcttgtgtcgatcttccttctgccggggacttcttcacaatgtttcaccacagttcctcgatgtttgcactgcgagtttcaattttcgtctctattgtcccatttgattcttgacagcgtctgagttggaatgctgtcctcatcttttgtttgatggaaactcatgttgacgctgtcccctactttgtttgttgaattcttgagacgtactcttactgacatcatcaaagattgtggtctgatggaagtctgctcctctcactactctgacatctttccccgatc
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Reference ( family-44 ) : ATTAGGCCTATCGTTCCGTGAG--GAACATAGGC-CATCAACGACAGT-CCT--C--CAGCGAACAC-GGTT-CTGGGCTGCTC----TCGCTGCCTCTTG-C--CAGGTGGTN--------T-CATGTTCTTTCAATTCTGACTCCGTGTTCTATATGCCCAGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNC--TCCGCCT-GATTTGC--A---GT--GACC-ACTGG--TCCT-GNC-TTGCTCNCTCC-CACAGTTCTTCATTT-GTGATCCT-T--CNGG-CCATCNGA-TGTTGNAGA-TGC--GCCTGA---GG--CAG-G-TGTTGNAAAATG-TT-GGATCTTNTGCAG------GGTTGTCTTAGTCGTTCTCCATGTGTCT-GCATTCGTAGAGTAA-GATGGATTTNACGTT-GGA-ATTG-AA-G-ATNCG-C---ANTTTGGCGN-TNA--TAC-GAAT--G-TC-CT---TG-GAGGCCC-AG-ATGT--T-CTTGAGCATN------GCG-AA-AGC-T---AC----T-CTTG-------CCT-----ATCCTTG---CT--G--ACG-TC---TCGG--TCT-G--TGCCACCC-------TGTCTGT------------CNA------------C-CACA---C-T------------CCCC-AGGTAAA--C--GAAGGA--ATC--AACT-TCTCTGA-TGGGCTCTCCACCGACTGTGA-CTG-GTG-AT-------T-GGACAGT----GGTG----TTGATCT--TCA--TCAGTTCNG----T---TT-TCTTCAAGT--T-GATC--TT-GAGACCCGT--TCC-----TGCT----TTGTTGC-AAGGCGAGTNGT-C-TTGTCCTGCA-TCCGCCNGT-GGT----TG-T-----GCGACAGGAGAGCCAGG-TCGTCGGCGAAGTCGAGGT-CATCCAGTT-GCGTT--AGGAGTGCC-CACTG-TAT-GCCGT--TG-TTCCTNC---CTGTCGTGGTGGTCNTCANGA-TCC--AAT-CAATGACCAG--GAGGAA-CAGGAAC-TGCGACGGCAA-GCATCCTTGNCGA-----ACTCCNGTCTTGACCTCG-AAACTNTCTGACATCTGACC-GC-TGG-CGACCCTG-A-GCTCCGACATCTGGCCGGCGTGGGCGATCCTGCANGTCATGCCTTGGT-AGGTGTTACA---GC-GAATGAGAGAGAC-GA-GC-TTC-TCAGG-----T--ACTCCA-TAGTGCCTCAGC-ATCTTC-CACAG-CG-TCT-CCCTATCCACG-CTGTC-GAAAGC-TTTCTCATAGT-CTATAA---TGAAAGTTNACGTATA----GGGGGGGGGANTTCCACTC----CAGTGATTGTT
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gi|13 : tcgacaatacctcgacagtgcaattggttctgggctaatctcattgctccagtccagttgatcccctgttctttcatctctgcctcagtgtctcgcttcgagctgttgcaaggccatcctcttttcctctgaccctgcgggttccaggtcagggcttggcgtgtggtgttggcttcaggtttccgaaaagtaccggattagttcgatccagccccacttcctctgcagaatatgttcaTTAGGTCTATCGTTCCGTGAG--GAACATAGACTTATCAACGGC-GT-CC---C--TAGCGAACACAGGTT-T--GGCTGCTT----TTGCTGCTTCTTG-CAAGAGGTGGTG--------TCCATGTTCTTTCAATTCTGACTCCGTGGTCTtattaattgtctt
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Reference ( family-44 ) : ATTAGGCCTATCGTTCCGTGAG--GAACATAGGC-CATCAACGACAGT-CCT--C--CAGCGAACAC-GGTT-CTGGGCTGCTC----TCGCTGCCTCTTG-C--CAGGTGGTG--------T-CATGTTCTTTCAATTCTGACTCCGTGTTCTATATGCCCAGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNC--TCCGCCT-GATTTGC--A---GT--GACC-ACTGG--TCCT-GNC-TCGCTCNCTCC-CACAGTTCTTCATTT-GTGATCC-T-TC-CGG--CCATCNGA-TGT-TGAAGA-TGC--GCCTGA---GG--CAG-G-TGTTGNAAAATG-TT-GGATCTTTTGCAG------GGTTGTCTTAGTNGTTCTCCAT-GTNTCCGCATCCGTAGAGTAA-GATGGATTTNACGTT-GGA-ATTG-AA-G-ATNCG-C---ANTTTGGCGN-TNA--TAC-GAAT--G-TC-CT---TG-GAGGCCC-AG-ATGT--T-CTTGAGCATN------GC-GAA-AGC-T---AC----T-CTTG-------CCT-----ATC---CTTGA--C--T-G--ACG-TC---TTGG--TC-TG--TGCCACCC-------TGTCTGT------------CNA------------C-CACA---C-T------------CCCC-AGGT-AAA--C--GAAGGA--ATC--AACT-TCTCTG-ATGGGCTCTCCACCGACTGTGA-CTG-GTG-AT-------TGGACA----GT----GGTG----TTGATCT--TCA--TCAGTTCTG----T---TT-TCTTCNAG-T--TGATC--TT-GAGACCCGT--TCCTGCTGATGTTG-TTGCAAGGCGAGTTGT-CTTGTCCTGC-ATCCGCCTGT-GGT----TG-T-----GCGACAGGAGAGCCA-GGTCGTCGGCGAAGTCGAGGT-CATCCAG-TTGCGTT--AGGAGTGCC-CACTG-TA-TGCCGT--TG-TTCCTNC---CTGTCGTGGTGGTCGTCANGA-TCC--AAT-CAATGACCAG--GAGG-AACAGGAAC-TGCGACAGCAA-GCATCCTTGNCG--A-----ACTCCNGTCTT-GACCTCG-A-AACTGTCCGACATCTGACC-GC-TGGCGA---CTG-A-GC-CCAA----TG-CCGGCGTGGGCGATCCTGCAGNTCATGCCTTGGT-AGGTGTTACA---GC-GAATGAGAGAGAC-GA-GC-TTC-TCGGG-----T--ACTCCA-TAGTGCCTCAGC-ANCTTC-CACAG-CG-TCT-CTCTATCCACG-CTGTC-GAAAGC-TTTCTCATAGT-CTATA----TGAAAGTTGACATATA-----GGGGGGGGANTTCCACTC----CAGTGATTGTT
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gi|11 : CGACAATACCT--CGACAGTGCAATT-GGTT-CTGGGCTAATC----TCATTG-CTCCAGTC--CAGTTGATC--------C-CCTGTTCTTTCATCTCTGCCTCAGTGTcctcatgatgatacgtaggctggcgatctggtcagcacaggaatctgttctgcggaagcccgtctgctggctcggagcttagggtcactagccccttcatcctcttagcagactgttgagaaccttgcccggcaccaacaggagcataatccctcggtagttgctgcagtccctgaagtcttcctttctttggcgttgatgatgagtttcctctcttccaaactggactggtatctcttccttctcagatcttgctgaaaggctgtgtaggaatggtgacagtggttccgtgtctgctttgaatggcttctgctgatatgtttgtcgccctgccgctttcattcttaagtggttgccatgcccttcctgatctctgctttagatggttgtcacagttgtggtagctctgttctgctggtggtatgtctggtagtgttgggcgggtggttcaacaactcactgaatgttctgccatctcttcagctgttcctccagttgttgtcagtggtgccattcttgtttttaactggcttgtctgtctgctgggaacttgcctccagcttcttggttgtcaggtattaaggtcctttaggtccctgacctgttgcatgttaggcttgctgcccagttcctcaataaatccttcttatccgtttttattttttttttttttttttttttttttttttttttttttttcttgatctcccttcttcacttcctgtcagctgctgtatacatcttcacaccatttgccttagctgccttgttcggctcatgttagccagtgtacttcttcttttttcctatctctattttctggaaagtatcaaagagtcactctttgtgtttgggtcttcttttttcttagaactcttcacatgtgtcagccagagttcctgctgtgttcccattggctcaatgtctgtctactgctatgatcagttcttgtattgggtggacattggaaaaggctgatctgaaagtcttgtgtccttctcctgagcagttcccatgttgaatttgtcgtgcattattgttggtgttgttgtacctctgatcgaagctcactgctgtaaccagaaaggttgtggtctgatagatgtcggcaccttcattgctcgcacatcccgccatgatc
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gi|15 : cttac-------CCG-----ATT---CTTGAGCT--T-G--ACG-CCCTATTGG--AT-CGACTGCCACTCGGAGAACTGGCTGT------------TTA------------CGCACAGCTC-T------------CCCCGAGGT-AAA--CCCGAAAAAGTATTTGAACTATCTCCG-ATAGGCTTTCCCCCGACTGTGA-CTGAGTG-ATCACCATCTGG--A----GTATGAGGTGAGACTGGATCTAATTATTTCTATTCTG----T---TTATCTTTAAA-T--TGGAC--TTAGGGACCCATGATTCTGATGATGTTG-TTGannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntagagtatgtccgatccaacccccacttcctgcgcggaatctgctcagccactggctcctgtc
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gi|17 : cagccccacttcC--TCTGCAG-AATTTGCTCA---GT-----C-ACTGG--ATGT-GGC-CCGCTCGCTCC-CACAAGTCTTCATTT-CATATTT-TGTC-TGG--CCATCTAA-TGT-TGTAAA-TGC--GCTTCA---GG--CAG-G-TGTTGAAAAATG-gagcagca
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gi|21 : AGGCCTATTGTTTCGT----------------CACCAACGACAGT-CCT--C--CAGCGAACAC-GGTT-ccattgtcattgatgatgcgtaggtgctatttatcaacaaattaattctgtttcgcctaaaaccaggcctgctggttaacgagctttgagtcatgcttcttcatcctctccagaagatcctgtggatgactttgccgggcacaagagcattattccacgatagttgttacagtccctcatatcttccttctttgggaagcttaatgaggtgaccctctttccattttcatggaatctcttcctccaaatatctcatgaagagttaagcaatatgtctatattgtctctgtggcagcttgatagcttccgcggtattcgtcaggtcctggtgatttaccattcctgtgatttccattcttagtgttgggtaatagattactcctggtctcggatagtgattgttttgcatttattgggaagactgtattcagggctgtattatccggtggagtttctggtgttggtctgtttaagatctccagtgttctatccatttcttgaattcctcttcactggtttgagaggttccattcttgtcatcactgttttcacgctggtaactttgttttgaaagcttcttggtggaccatgtacagctctctaaaatttccatttcccgctcgtccttcatgctttttggccaaagttgttcaatgtggttccgtttctttcctatacatcgcttcatttctttgttgcagcgtgcatagttcctcttagcctttgactttgctgctcttgttcggcttgtgttactgccttttctttcctgtcctcacattcaatttcctcatgtatcggcgagaccactcttgtgtcgatcttccttctgccggggacttcttcacaatgtttcaccacagttcctcgatgtttgcactgcgagtttcaattttcgtctctattgtcccatttgattcttgacagcgtctgagttggaatgctgtcctcatcttttgtttgatggaaactcatgttgacgctgtcccctactttgtttgttgaattcttgagacgtactcttactgacatcatcaaagattgtggtctgatggaagtctgctcctctcactactctgacatctttccccgatc
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Reference ( family-44 ) : ATTAGGCCTATCGTTCCGTGAG--GAACATAGGC-CATCAACGACAGT-CCT--C--CAGCGAACAC-GGTT-CTGGGCTGCTC----TCGCTGCCTCTTG-C--CAGGTGGTG--------T-CATGTTCTTTCAATTCTGACTCCGTGTTCTATATGCCCAGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNC--TCCGCCT-GATTTGC--A---GT--GACC-ACTGG--TCCT-GNC-TCGCTCNCTCC-CACAGTTCTTCATTT-GTGATCC-T-TC-CGG--CCATCNGA-TGT-TGAAGA-TGC--GCCTGA---GG--CAG-G-TGTTGNAAAATG-TT-GGATCTTTTGCAG------GGTTGTCTTAGTNGTTCTCCAT-GTNTCCGCATCCGTAGAGTAA-GATGGATTTNACGTT-GGA-ATTG-AA-G-ATNCG-C---ANTTTGGCGN-TNA--TAC-GAAT--G-TC-CT---TG-GAGGCCC-AG-ATGT--T-CTTGAGCATN------GCG-AA-AGC-T---AC----T-CTTG-------CCT-----ATC---CTTGA--C--T-G--ACG-TC---TTGG--TC-TG--TGCCACCC-------TGTCTGT------------CNA------------C-CACA---C-T------------CCCC-AGGT-AAA--C--GAAGGA--ATC--AACT-TCTCTGA-TGGGCTCTCCACCGACTGTGACT-G-GTG-AT-------TGG-CA----GT----GGTG----TTGATCT--TCA--TCAGTTCTG----T---TT-TCTTCNAG-T--TGATC--TT-GAGACCCGT--TCC-TGCTGATGTTG-TTGCAAGGCGAGTTGT-CTTGTCCTGC-ATCCGCCTGT-GGT----TG-T-----GCGACAGGAGAGCCA-GGTCGTCGGCGAAGTCGAGGT-CATCCAG-TTGCGTT--AGGAGTGCC-CACTG-T-A-TGCCGT--TG-TTCCTNCCTGTCGTG--GTGGTCGTCANGA-TCC--AAT-CAATGACCAGG--AGG-AACAGGAACT-GCGACAGCAA-GCATCCTTGNCG--A-----ACTCCNGTCTT-NACCTCG-A-AACTTTCCGACATCTGACCG------------CT-GCATG-------------CCGGCGTGGGCGATCCTGCAGNTCATGCCTTGGT-AGGTGTTACA---GC-GAATGAGAGAGAC-GA-GC-TTC-TCGGG-----T--ACTCCA-TAGTGCCTCAGC-ANCTTC-CACAG-CG-TCT-CTCTATCCACG-CTGTC-GAAAGC-TTTCTCATAGT-CTATA----TGAAAGTTGACATATA-----GGGGGGGGANTTCCACTC----CAGTGATTGTT
gi|1 : TTAACGTT-GGA-ATTA-AA-G-ATGCG-C---ATTTTCGTCT-TTA--TACTGACT--G-T---T---TG-GAGGCCC-AG-ATGT----CTTCA-CATT------ACGGAA-AGC------C----T-CTTA-------CCTTGCA-ATC---CTTG---C--T-GTGACG-T----TCGG--TC-TG--TGCT-CCC-------TGTTTGT------------CAA------------A-TCCA---C-T------------TCCC-AGGT-AGA--C--AAAAGA--CTC--CCTC-TCTCTGAAGGGGCTCTCCACCGACTGTGA-T-G-GTGTGT-------TGG--A----GT----GGTG----TTGAACT--TCA--TCAGTTCGG----T---CT-TTTTTCTG-T--TGATC--TT-AAGCCCCGT--CCC-TGCTGAT-TTGTTTCCAAGGTGAGTGGTCCTTGTCCTGCAATCCGGGAGTAGGC----TG-T-----GTGACAGGAGTGCAAGGGTCGTC-GCAAAGTTGAGGT-AATCCAA--CGTGTT--CAAAGT-CC-CACTG-T-A-TACCGT--TT-TTCCTGCCTGTTGTA--GTGATCTTCAAGA-TCC--AAT-CAATGACCAGC--AGG-AAGAGGGACT-GCGACAGTAAGGCAGCCCTGACG--------TCTCCAGTCTT-CACCCCG-A-AACT-----GC-TCTGACCA------------CTGGCAT-----------------GCGTGGGTGCTCCTGCAGCTCATTTCCTGGTAAGGTG---CA---GC-GGATGAAGGAGAT-GG-TC-TTC-T-GGG--------ACTCAA--ACTGTCTCCGC-AGCTT--CACAG-CG-TCT-CTCTATCTACA-TTGTT-GAATGC-ATTGTC-T-GT-CTA-A----TGAAA-TTG--ATTTA-----GAGGGGGGAGTCCCGCTC----TAGTGAATG
gi|11 : CGACAATACCT--CGACAGTGCAATT-GGTT-CTGGGCTAATC----TCATTG-CTCCAGTC--CAGTTGATC--------C-CCTGTTCTTTCATCTCTGCCTCAGTGTcctcatgatgatacgtaggctggcgatctggtcagcacaggaatctgttctgcggaagcccgtctgctggctcggagcttagggtcactagccccttcatcctcttagcagactgttgagaaccttgcccggcaccaacaggagcataatccctcggtagttgctgcagtccctgaagtcttcctttctttggcgttgatgatgagtttcctctcttccaaactggactggtatctcttccttctcagatcttgctgaaaggctgtgtaggaatggtgacagtggttccgtgtctgctttgaatggcttctgctgatatgtttgtcgccctgccgctttcattcttaagtggttgccatgcccttcctgatctctgctttagatggttgtcacagttgtggtagctctgttctgctggtggtatgtctggtagtgttgggcgggtggttcaacaactcactgaatgttctgccatctcttcagctgttcctccagttgttgtcagtggtgccattcttgtttttaactggcttgtctgtctgctgggaacttgcctccagcttcttggttgtcaggtattaaggtcctttaggtccctgacctgttgcatgttaggcttgctgcccagttcctcaataaatccttcttatccgtttttattttttttttttttttttttttttttttttttttttttttcttgatctcccttcttcacttcctgtcagctgctgtatacatcttcacaccatttgccttagctgccttgttcggctcatgttagccagtgtacttcttcttttttcctatctctattttctggaaagtatcaaagagtcactctttgtgtttgggtcttcttttttcttagaactcttcacatgtgtcagccagagttcctgctgtgttcccattggctcaatgtctgtctactgctatgatcagttcttgtattgggtggacattggaaaaggctgatctgaaagtcttgtgtccttctcctgagcagttcccatgttgaatttgtcgtgcattattgttggtgttgttgtacctctgatcgaagctcactgctgtaaccagaaaggttgtggtctgatagatgtcggcaccttcattgctcgcacatcccgccatgatc
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gi|13 : tcgacaatacctcgacagtgcaattggttctgggctaatctcattgctccagtccagttgatcccctgttctttcatctctgcctcagtgtctcgcttcgagctgttgcaaggccatcctcttttcctctgaccctgcgggttccaggtcagggcttggcgtgtggtgttggcttcaggtttccgaaaagtaccggattagttcgatccagccccacttcctctgcagaatatgttcaTTAGGTCTATCGTTCCGTGAG--GAACATAGACTTATCAACGGC-GT-CC---C--TAGCGAACACAGGTT-T--GGCTGCTT----TTGCTGCTTCTTG-CAAGAGGTGGTG--------TCCATGTTCTTTCAATTCTGACTCCGTGGTCTtattaattgtctt
gi|13 : atC--TCCGCCTTGATT-GC--G---G---AACCTACTGC--TCTT-AAT-TT-CTTCCTCC-CATAGTTCTTCATTT-GTGATCC-T-TC-TGG--CCATCGAA-TGT-TAAAGATTGC--GCCTGA---TGAACAGTGCTGTTGTAAAATcgcatccaggtacttctctaatgacctcctttcttctcttgcgttgcccctagtgggttccgagtcagcctggcgttgtgttagttgttgacttcctcaaagttgtccaaatccagccccacttcctccgccttgattgcggaacctactgctcttaatttcttcctcccatagttcttcatttgtgatccttctggccatcgaatgttaaagattgcgcctgatgaacagtgctgttgtaaaattctg
gi|14 : atttaggtctatcgttccgtgaggaacatagacttatcaacggcgtccctagcgaacacaggtttggctgcttttgctgcttcttgcaagaggtggtgtccatgttctttcaattctgactccgtggtctcgcatccaggtacttctctaatgacctcctttcttctcttgcgttgcccctagtgggttccgagtcagcctggcgttgtgttagttgttgacttcctcaaagttgtccaaatccagccccacttcTTAGGCCCATAAC-CCTTG-GTTGAGCATAAGC-CATTGACAACA---CCT--CGCCAGCGCGCTC-AGTT-CTGGGCTAAAC----TCATTG-CTCCTGTC--CAGCTGtctg
gi|15 : cttac-------CCG-----ATT---CTTGAGCT--T-G--ACG-CCCTATTGG--AT-CGACTGCCACTCGGAGAACTGGCTGT------------TTA------------CGCACAGCTC-T------------CCCCGAGGT-AAA--CCCGAAAAAGTATTTGAACTATCTCCGA-TAGGCTTTCCCCCGACTGTGACT-GAGTG-ATCACCATCTGG--A----GTATGAGGTGAGACTGGATCTAATTATTTCTATTCTG----T---TTATCTTTAAA-T--TGGAC--TTAGGGACCCATGATTC-TGATGATGTTG-TTGannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntagagtatgtccgatccaacccccacttcctgcgcggaatctgctcagccactggctcctgtc
gi|16 : cttggattC--TCTGCA--GATTTGC-------T--CATC-ACGGA--TG-T-GGCGCCGCTC-CTCC-CACAAGTCTTCTTTC-AT-AT---T-TT-CGG--CCATCTAAATGTCTGAA-A-TGCAAGCTTCA---GG--CAG-G-TGTTGAAAAATG-CT-TGATCT
gi|17 : cagccccacttcC--TCTGCAG-AATTTGCTCA---GT-----C-ACTGG--ATGT-GGC-CCGCTCGCTCC-CACAAGTCTTCATTT-CATATTT-TGTC-TGG--CCATCTAA-TGT-TGTAAA-TGC--GCTTCA---GG--CAG-G-TGTTGAAAAATG-gagcagca
gi|18 : ccacttcTTAGGCCTGTCGTTCCGTGAG--GAACATAGGC-CATCAACGACAGT-CCT--C--CAGCGAACAC-GGTTAATCGGCGGTTCTGGGTTGCTGTTTCTCG-C--CAGGTGGTG--------T-CATGTTTTCT
gi|19 : tacGACTGCTT----TTGCTGCTTCTTG-G--CAGACGATACCGGTATAT-CATGTTCTTTCCATTCTGACTCTGTGTTg
gi|2 : TG-AA-G-ATTCGAT---AGTTTGGTG--TAA--TCC-GAAT--T-TC-TT---TG--AGGCCG-AG-ATGT--TTCTTGAGCATG------TGG-AA-AAC-T---AC----T-CTTGGCTATTTCCT-----ATT---CTTGA--CTTT-G--ATG-TC---ATGG--TCTTG--TGCCACCC-------T-TCTAT------------C-A------------C-TACA---C-TTTTCTTTCCCTCCCCC-AGGTAAAA--T--GAAGGA--ATC--AATT-TCTTTAA-T-GACGCTCCA-CAATTGTG-CT-G-A-G-ATC------CGGTCATTATTT----GGAT----TTTATCT--TCA--TCAGTTCCG----T--------TTCAAGTT--TGATCAGTT-GA-ACCCGT--TCC-TGCT-ATGTTG-TTGCAATGCGAGTTGT-C-TGTCCTGC-A--CTCCT-T-GGT----TG-T-----GTGACAGCGAAGCCA-GATCATTGGCGAAATCGAGAT-CATCCAGTTTGCGTT--AGGAGTGTC-CACTGAT-ATTGCCAT--TG-TTCCTACCT-T------GTAGTC-TCATGA-T-C--AGT-CAATGACCAGG--AGGAAACAAATAGT-AGGACAGCAA-GCATCCTTGGCGGAA-----ACCTTTGTCTTCTACCTCG-ACAACTTTCCAA-ATCT----G------------CC-GCATG-------------CCGAC---------CATGCAGC-CATGCCTTGGT-ACGTGTTGC--------AATCAGAGGGACAGACGC-TTCTTCATG-----TCAACTCCA-TAGTGCCT-AGC-A--TTC-CACAG-TG-TAT-CCC--TCCACG-CTGTCTAAAAGC-TTTCTCAAAGT-CTAT-------AAAGTTTACATATAAGGGGGGGGGGGGAACTTCACTC----CAtcgc
gi|21 : AGGCCTATTGTTTCGT----------------CACCAACGACAGT-CCT--C--CAGCGAACAC-GGTT-ccattgtcattgatgatgcgtaggtgctatttatcaacaaattaattctgtttcgcctaaaaccaggcctgctggttaacgagctttgagtcatgcttcttcatcctctccagaagatcctgtggatgactttgccgggcacaagagcattattccacgatagttgttacagtccctcatatcttccttctttgggaagcttaatgaggtgaccctctttccattttcatggaatctcttcctccaaatatctcatgaagagttaagcaatatgtctatattgtctctgtggcagcttgatagcttccgcggtattcgtcaggtcctggtgatttaccattcctgtgatttccattcttagtgttgggtaatagattactcctggtctcggatagtgattgttttgcatttattgggaagactgtattcagggctgtattatccggtggagtttctggtgttggtctgtttaagatctccagtgttctatccatttcttgaattcctcttcactggtttgagaggttccattcttgtcatcactgttttcacgctggtaactttgttttgaaagcttcttggtggaccatgtacagctctctaaaatttccatttcccgctcgtccttcatgctttttggccaaagttgttcaatgtggttccgtttctttcctatacatcgcttcatttctttgttgcagcgtgcatagttcctcttagcctttgactttgctgctcttgttcggcttgtgttactgccttttctttcctgtcctcacattcaatttcctcatgtatcggcgagaccactcttgtgtcgatcttccttctgccggggacttcttcacaatgtttcaccacagttcctcgatgtttgcactgcgagtttcaattttcgtctctattgtcccatttgattcttgacagcgtctgagttggaatgctgtcctcatcttttgtttgatggaaactcatgttgacgctgtcccctactttgtttgttgaattcttgagacgtactcttactgacatcatcaaagattgtggtctgatggaagtctgctcctctcactactctgacatctttccccgatc
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lowQualScore : 5 4 2 55 88 0 6 0 55 00 0 0 5555 2 7 0 55 7 444444444 4 1 11111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 333 111111111111 9 44 7 4 0 4 7 3 4 9 88888888888 99 11 9 0 4 4 7 4 11 1 888 11 4 4 0 0 7 5 222222 0 0 7 0 77 5 7 0 0 0 4 4 4 0 4 888 0 222 0 99 0 00000000000000 0 0 0 0000 2 0000000 1 0 0 55555555555 0 888888888888888 888 77777777777 7 4 888 11 4 11 6666666 7 444444444444444444444444444 4 888 4 888888888888 4 4 33333 00 11 11 4 4 7 33 4 11111111111111111111 4444 66666 11 11 9 00000000 4 77 4 11 11 4 8 111 666 4 4 3 4 7 1111 7 1111 7 33333 4 4 7 7 7 000 99 6666 4 7 99 33 0 000 9 4 9 0 7 99 7 99 7 7 7 0 7 0 4 0 99999999 0 77 7 7 9 11 000000000000000000000000000000000000000000 0 33333 666 7 7 777777777 7 7 7 7 00 0 99999999 7 77 7 6 7 0000 7 44 4 11 7 9 66 9 7 44444444 4 1 1 999999 0 1111 0
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Reference ( family-44 ) : ATTAGGCCTATCGTTCCGTGAG--GAACATAGGC-CATCAACGACAGT-CCT--C--CAGCGAACAC-GGTT-CTGGGCTGCTC----TCGCTGCCTCTTG-C--CAGGTGGTG--------T-CATGTTCTTTCAATTCTGACTCCGTGTTCTATATGCCCAGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNC--TCCGCCT-GATTTGC--A---GT--GACC-ACTGG--TCCT-GNC-TCGCTCNCTCC-CACAGTTCTTCATTT-GTGATCC-T-TC-CGG--CCATCNGA-TGT-TGAAGA-TGC--GCCTGA---GG--CAG-G-TGTTGNAAAATG-TT-GGATCTTTTGCAG------GGTTGTCTTAGTNGTTCTCCAT-GTNTCCGCATCCGTAGAGTAA-GATGGATTTNACGTT-GGA-ATTG-AA-G-ATNCG-C---ANTTTGGCGN-TNA--TAC-GAAT--G-TC-CT---TG-GAGGCCC-AG-ATGT--T-CTTGAGCATN------GCG-AA-AGC-T---AC----T-CTTG-------CCT-----ATC---CTTGA--C--T-G--ACG-TC---TTGG--TC-TG--TGCCACCC-------TGTCTGT------------CNA------------C-CACA---C-T------------CCCC-AGGT-AAA--C--GAAGGA--ATC--AACT-TCTCTGA-TGGGCTCTCCACCGACTGTGA-CTG-GTG-AT-------TGG-CA----GT----GGTG----TTGATCT--TCA--TCAGTTCTG----T---TT-TCTTCNAG-T--TGATC--TT-GAGACCCGT--TCCTGCTGATGTTG-TTGCAAGGCGAGTTGT-CTTGTCCTGC-ATCCGCCTGT-GGT----TG-T-----GCGACAGGAGAGCCA-GGTCGTCGGCGAAGTCGAGGT-CATCCAG-TTGCGTT--AGGAGTGCC-CACTG-TA-TGCCGT--TG-TTCCTNC---CTGTCGTGGTGGTCGTCANGA-TCC--AAT-CAATGACCAG--GAGG-AACAGGAAC-TGCGACAGCAA-GCANCCTTGNCG--A-----ACTCCNGTCTT-NACCTCG-A-AACTTTCCGACATCTG-------------ACC-CT-GCATG-------------CCGGCGTGGGCG-A-C-CTGCAGCTCATGCCTTGGT-AGGTGTTACA---GC-GAATGAGAGAGAC-GA-GC-TTC-TCGGG-----T--ACTCCA-TAGTGCCTCAGC-ANCTTC-CACAG-CG-TCT-CTCTATCCACG-CTGTC-GAAAGC-TTTCTCATAGT-CTATA----TGAAAGTTGACATATA-----GGGGGGGGANTTCCACTC----CAGTGATTGTT
gi|1 : TTAACGTT-GGA-ATTA-AA-G-ATGCG-C---ATTTTCGTCT-TTA--TACTGACT--G-T---T---TG-GAGGCCC-AG-ATGT----CTTCA-CATT------ACGGAA-AGC------C----T-CTTA-------CCTTGCA-ATC---CTTG---C--T-GTGACG-T----TCGG--TC-TG--TGCT-CCC-------TGTTTGT------------CAA------------A-TCCA---C-T------------TCCC-AGGT-AGA--C--AAAAGA--CTC--CCTC-TCTCTGAAGGGGCTCTCCACCGACTGTGA--TG-GTGTGT-------TGG--A----GT----GGTG----TTGAACT--TCA--TCAGTTCGG----T---CT-TTTTTCTG-T--TGATC--TT-AAGCCCCGT--CCCTGCTGAT-TTGTTTCCAAGGTGAGTGGTCCTTGTCCTGCAATCCGGGAGTAGGC----TG-T-----GTGACAGGAGTGCAAGGGTCGTC-GCAAAGTTGAGGT-AATCCAA--CGTGTT--CAAAGT-CC-CACTG-TA-TACCGT--TT-TTCCTGC---CTGTTGTAGTGATCTTCAAGA-TCC--AAT-CAATGACCAG--CAGG-AAGAGGGAC-TGCGACAGTAAGGCAGCCCTGACG--------TCTCCAGTCTT-CACCCCG-A-AACT-----GC-TCTG-------------ACCACTGGCAT-----------------GCGTGGGTG-CTC-CTGCAGCTCATTTCCTGGTAAGGTG---CA---GC-GGATGAAGGAGAT-GG-TC-TTC-T-GGG--------ACTCAA--ACTGTCTCCGC-AGCTT--CACAG-CG-TCT-CTCTATCTACA-TTGTT-GAATGC-ATTGTC-T-GT-CTA-A----TGAAA-TTG--ATTTA-----GAGGGGGGAGTCCCGCTC----TAGTGAATG
gi|11 : CGACAATACCT--CGACAGTGCAATT-GGTT-CTGGGCTAATC----TCATTG-CTCCAGTC--CAGTTGATC--------C-CCTGTTCTTTCATCTCTGCCTCAGTGTcctcatgatgatacgtaggctggcgatctggtcagcacaggaatctgttctgcggaagcccgtctgctggctcggagcttagggtcactagccccttcatcctcttagcagactgttgagaaccttgcccggcaccaacaggagcataatccctcggtagttgctgcagtccctgaagtcttcctttctttggcgttgatgatgagtttcctctcttccaaactggactggtatctcttccttctcagatcttgctgaaaggctgtgtaggaatggtgacagtggttccgtgtctgctttgaatggcttctgctgatatgtttgtcgccctgccgctttcattcttaagtggttgccatgcccttcctgatctctgctttagatggttgtcacagttgtggtagctctgttctgctggtggtatgtctggtagtgttgggcgggtggttcaacaactcactgaatgttctgccatctcttcagctgttcctccagttgttgtcagtggtgccattcttgtttttaactggcttgtctgtctgctgggaacttgcctccagcttcttggttgtcaggtattaaggtcctttaggtccctgacctgttgcatgttaggcttgctgcccagttcctcaataaatccttcttatccgtttttattttttttttttttttttttttttttttttttttttttttcttgatctcccttcttcacttcctgtcagctgctgtatacatcttcacaccatttgccttagctgccttgttcggctcatgttagccagtgtacttcttcttttttcctatctctattttctggaaagtatcaaagagtcactctttgtgtttgggtcttcttttttcttagaactcttcacatgtgtcagccagagttcctgctgtgttcccattggctcaatgtctgtctactgctatgatcagttcttgtattgggtggacattggaaaaggctgatctgaaagtcttgtgtccttctcctgagcagttcccatgttgaatttgtcgtgcattattgttggtgttgttgtacctctgatcgaagctcactgctgtaaccagaaaggttgtggtctgatagatgtcggcaccttcattgctcgcacatcccgccatgatc
gi|11 : tACC-ACTAGC-TCCT-GTT-TTACTCGCTCC-CACAAATCTTCATTTCGT-ATTT-TGTC-TGG--CCATCTGA-TGT-TGTAAA-TGT--GCCTCA---GG--CAG-G-TGTTGAAAAATGTTT-GGATCTTGAGCAG------CATTGTCTTTGTCGTCCGCCAT-GTTT-CGCATCCGTAAAGAAG-GATGGATTTAACGCT-GGA-ATAA-AA-G-ATGCG-C---Actcgcttcgagctgttgcaaggccatcctcttttcctctgaccctgcgggttccaggtcagggcttggcgtgtggtgttggcttcaggtttccgaaaagtaccggattagttcgatccagccccacttcctctgcagaatatgttcaaccactagctcctgttttactcgctcccacaaatcttcatttcgtattttgtctggccatctgatgttgtaaatgtgcctcaggcaggtgttgaaaaatgtttggatcttgagcagcattgtctttgtcgtccgccatgtttcgcatccgtaaagaaggatggatttaacgctggaataaaagatgcgcatattaattgtctt
gi|13 : tcgacaatacctcgacagtgcaattggttctgggctaatctcattgctccagtccagttgatcccctgttctttcatctctgcctcagtgtctcgcttcgagctgttgcaaggccatcctcttttcctctgaccctgcgggttccaggtcagggcttggcgtgtggtgttggcttcaggtttccgaaaagtaccggattagttcgatccagccccacttcctctgcagaatatgttcaTTAGGTCTATCGTTCCGTGAG--GAACATAGACTTATCAACGGC-GT-CC---C--TAGCGAACACAGGTT-T--GGCTGCTT----TTGCTGCTTCTTG-CAAGAGGTGGTG--------TCCATGTTCTTTCAATTCTGACTCCGTGGTCTtattaattgtctt
gi|13 : atC--TCCGCCTTGATT-GC--G---G---AACCTACTGC--TCTT-AAT-TT-CTTCCTCC-CATAGTTCTTCATTT-GTGATCC-T-TC-TGG--CCATCGAA-TGT-TAAAGATTGC--GCCTGA---TGAACAGTGCTGTTGTAAAATcgcatccaggtacttctctaatgacctcctttcttctcttgcgttgcccctagtgggttccgagtcagcctggcgttgtgttagttgttgacttcctcaaagttgtccaaatccagccccacttcctccgccttgattgcggaacctactgctcttaatttcttcctcccatagttcttcatttgtgatccttctggccatcgaatgttaaagattgcgcctgatgaacagtgctgttgtaaaattctg
gi|14 : atttaggtctatcgttccgtgaggaacatagacttatcaacggcgtccctagcgaacacaggtttggctgcttttgctgcttcttgcaagaggtggtgtccatgttctttcaattctgactccgtggtctcgcatccaggtacttctctaatgacctcctttcttctcttgcgttgcccctagtgggttccgagtcagcctggcgttgtgttagttgttgacttcctcaaagttgtccaaatccagccccacttcTTAGGCCCATAAC-CCTTG-GTTGAGCATAAGC-CATTGACAACA---CCT--CGCCAGCGCGCTC-AGTT-CTGGGCTAAAC----TCATTG-CTCCTGTC--CAGCTGtctg
gi|15 : cttac-------CCG-----ATT---CTTGAGCT--T-G--ACG-CCCTATTGG--AT-CGACTGCCACTCGGAGAACTGGCTGT------------TTA------------CGCACAGCTC-T------------CCCCGAGGT-AAA--CCCGAAAAAGTATTTGAACTATCTCCGA-TAGGCTTTCCCCCGACTGTGA-CTGAGTG-ATCACCATCTGG--A----GTATGAGGTGAGACTGGATCTAATTATTTCTATTCTG----T---TTATCTTTAAA-T--TGGAC--TTAGGGACCCATGATTCTGATGATGTTG-TTGannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntagagtatgtccgatccaacccccacttcctgcgcggaatctgctcagccactggctcctgtc
gi|16 : cttggattC--TCTGCA--GATTTGC-------T--CATC-ACGGA--TG-T-GGCGCCGCTC-CTCC-CACAAGTCTTCTTTC-AT-AT---T-TT-CGG--CCATCTAAATGTCTGAA-A-TGCAAGCTTCA---GG--CAG-G-TGTTGAAAAATG-CT-TGATCT
gi|17 : cagccccacttcC--TCTGCAG-AATTTGCTCA---GT-----C-ACTGG--ATGT-GGC-CCGCTCGCTCC-CACAAGTCTTCATTT-CATATTT-TGTC-TGG--CCATCTAA-TGT-TGTAAA-TGC--GCTTCA---GG--CAG-G-TGTTGAAAAATG-gagcagca
gi|18 : ccacttcTTAGGCCTGTCGTTCCGTGAG--GAACATAGGC-CATCAACGACAGT-CCT--C--CAGCGAACAC-GGTTAATCGGCGGTTCTGGGTTGCTGTTTCTCG-C--CAGGTGGTG--------T-CATGTTTTCT
gi|19 : tacGACTGCTT----TTGCTGCTTCTTG-G--CAGACGATACCGGTATAT-CATGTTCTTTCCATTCTGACTCTGTGTTg
gi|2 : TG-AA-G-ATTCGAT---AGTTTGGTG--TAA--TCC-GAAT--T-TC-TT---TG--AGGCCG-AG-ATGT--TTCTTGAGCATG------TGG-AA-AAC-T---AC----T-CTTGGCTATTTCCT-----ATT---CTTGA--CTTT-G--ATG-TC---ATGG--TCTTG--TGCCACCC-------T-TCTAT------------C-A------------C-TACA---C-TTTTCTTTCCCTCCCCC-AGGTAAAA--T--GAAGGA--ATC--AATT-TCTTTAA-T-GACGCTCCA-CAATTGTG--CTG-A-G-ATC------CGGTCATTATTT----GGAT----TTTATCT--TCA--TCAGTTCCG----T--------TTCAAGTT--TGATCAGTT-GA-ACCCGT--TCCTGCT-ATGTTG-TTGCAATGCGAGTTGT-C-TGTCCTGC-A--CTCCT-T-GGT----TG-T-----GTGACAGCGAAGCCA-GATCATTGGCGAAATCGAGAT-CATCCAGTTTGCGTT--AGGAGTGTC-CACTGATATTGCCAT--TG-TTCCTAC---CT-T----GTAGTC-TCATGA-T-C--AGT-CAATGACCAG--GAGGAAACAAATAG-TAGGACAGCAA-GCATCCTTGGCGGAA-----ACCTTTGTCTTCTACCTCG-ACAACTTTCCAA-ATCTG-----------------CC-GCATG-------------CCGAC----------C-ATGCAGC-CATGCCTTGGT-ACGTGTTGC--------AATCAGAGGGACAGACGC-TTCTTCATG-----TCAACTCCA-TAGTGCCT-AGC-A--TTC-CACAG-TG-TAT-CCC--TCCACG-CTGTCTAAAAGC-TTTCTCAAAGT-CTAT-------AAAGTTTACATATAAGGGGGGGGGGGGAACTTCACTC----CAtcgc
gi|21 : AGGCCTATTGTTTCGT----------------CACCAACGACAGT-CCT--C--CAGCGAACAC-GGTT-ccattgtcattgatgatgcgtaggtgctatttatcaacaaattaattctgtttcgcctaaaaccaggcctgctggttaacgagctttgagtcatgcttcttcatcctctccagaagatcctgtggatgactttgccgggcacaagagcattattccacgatagttgttacagtccctcatatcttccttctttgggaagcttaatgaggtgaccctctttccattttcatggaatctcttcctccaaatatctcatgaagagttaagcaatatgtctatattgtctctgtggcagcttgatagcttccgcggtattcgtcaggtcctggtgatttaccattcctgtgatttccattcttagtgttgggtaatagattactcctggtctcggatagtgattgttttgcatttattgggaagactgtattcagggctgtattatccggtggagtttctggtgttggtctgtttaagatctccagtgttctatccatttcttgaattcctcttcactggtttgagaggttccattcttgtcatcactgttttcacgctggtaactttgttttgaaagcttcttggtggaccatgtacagctctctaaaatttccatttcccgctcgtccttcatgctttttggccaaagttgttcaatgtggttccgtttctttcctatacatcgcttcatttctttgttgcagcgtgcatagttcctcttagcctttgactttgctgctcttgttcggcttgtgttactgccttttctttcctgtcctcacattcaatttcctcatgtatcggcgagaccactcttgtgtcgatcttccttctgccggggacttcttcacaatgtttcaccacagttcctcgatgtttgcactgcgagtttcaattttcgtctctattgtcccatttgattcttgacagcgtctgagttggaatgctgtcctcatcttttgtttgatggaaactcatgttgacgctgtcccctactttgtttgttgaattcttgagacgtactcttactgacatcatcaaagattgtggtctgatggaagtctgctcctctcactactctgacatctttccccgatc
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lowQualScore : 5 4 2 55 88 0 6 0 55 00 0 0 5555 2 7 0 55 7 444444444 4 1 11111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 333 111111111111 9 44 7 4 0 4 7 3 4 9 88888888888 99 11 9 0 4 4 7 4 11 1 888 11 4 4 0 0 7 5 222222 0 0 7 0 77 5 7 0 0 0 4 4 4 0 4 888 0 222 0 99 0 00000000000000 0 0 0 0000 2 0000000 1 0 0 55555555555 0 888888888888888 888 77777777777 7 4 888 11 4 11 6666666 7 444444444444444444444444444 4 888 4 888888888888 4 4 33333 00 11 11 4 4 7 33 4 11111111111111111111 4444 66666 11 11 9 00000000 4 77 4 11 11 4 8 111 666 4 4 3 4 7 1111 7 1111 7 33333 4 4 7 7 7 000 99 6666 4 7 99 33 0 000 9 4 9 0 7 99 7 99 7 7 7 0 7 0 4 0 99999999 0 77 7 7 9 11 000000000000000000000000000000000000000000 0 33333 666 7 7 777777777 7 7 7 7 00 0 99999999 7 77 7 6 7 0000 7 44 4 11 7 9 66 9 7 44444444 4 1 1 999999 0 1111 0
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Reference ( family-44 ) : ATTAGGCCTATCGTTCCGTGAG--GAACATAGGC-CATCAACGACAGT-CCT--C--CAGCGAACAC-GGTT-CTGGGCTGCTC----TCGCTGCCTCTTG-C--CAGGTGGTG--------T-CATGTTCTTTCAATTCTGACTCCGTGTTCTATATGCCCAGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNC--TCCGCCT-GATTTGC--A---GT--GACC-ACTGG--TCCT-GNC-TCGCTCNCTCC-CACAGTTCTTCATTT-GTGATCC-T-TC-CGG--CCATCNGA-TGT-TGAAGA-TGC--GCCTGA---GG--CAG-G-TGTTGNAAAATG-TT-GGATCTTTTGCAG------GGTTGTCTTAGTNGTTCTCCAT-GTNTCCGCATCCGTAGAGTAA-GATGGATTTNACGTT-GGA-ATTG-AA-G-ATNCG-C---ANTTTGGCGN-TNA--TAC-GAAT--G-TC-CT---TG-GAGGCCC-AG-ATGT--T-CTTGAGCATN------GCG-AA-AGC-T---AC----T-CTTG-------CCT-----ATC---CTTGA--C--T-G--ACG-TC---TTGG--TC-TG--TGCCACCC-------TGTCTGT------------CNA------------C-CACA---C-T------------CCCC-AGGT-AAA--C--GAAGGA--ATC--AACT-TCTCTGA-TGGGCTCTCCACCGACTGTGA-CTG-GTG-AT-------TGG-CA----GT----GGTG----TTGATCT--TCA--TCAGTTCTG----T---TT-TCTTCNAG-T--TGATC--TT-GAGACCCGT--TCCTGCTGATGTTG-TTGCAAGGCGAGTTGT-CTTGTCCTGC-ATCCGCCTGT-GGT----TG-T-----GCGACAGGAGAGCCA-GGTCGTCGGCGAAGTCGAGGT-CATCCAG-TTGCGTT--AGGAGTGCC-CACTG-TA-TGCCGT--TG-TTCCTNC---CTGTCGTGGTGGTCGTCANGA-TCC--AAT-CAATGACCAG--GAGG-AACAGGAAC-TGCGACAGCAA-GCANCCTTGNCG--A-----ACTCCNGTCTT-NACCTCG-A-AACTTTCCGACATCTG-------------ACC-CT-GCATG-------------CCGGCGTGGGCG-A-C-CTGCAGCTCATGCCTTGGT-AGGTGTTACA---GC-GAATGAGAGAGAC-GA-GC-TTC-TCGGG-----T--ACTCCA-TAGTGCCTCAGC-ANCTTC-CACAG-CG-TCT-CTCTATCCACG-CTGTC-GAAAGC-TTTCTCATAGT-CTATA----TGAAAGTTGACATATA-----GGGGGGGGANTTCCACTC----CAGTGATTGTT
gi|1 : TTAACGTT-GGA-ATTA-AA-G-ATGCG-C---ATTTTCGTCT-TTA--TACTGACT--G-T---T---TG-GAGGCCC-AG-ATGT----CTTCA-CATT------ACGGAA-AGC------C----T-CTTA-------CCTTGCA-ATC---CTTG---C--T-GTGACG-T----TCGG--TC-TG--TGCT-CCC-------TGTTTGT------------CAA------------A-TCCA---C-T------------TCCC-AGGT-AGA--C--AAAAGA--CTC--CCTC-TCTCTGAAGGGGCTCTCCACCGACTGTGA--TG-GTGTGT-------TGG--A----GT----GGTG----TTGAACT--TCA--TCAGTTCGG----T---CT-TTTTTCTG-T--TGATC--TT-AAGCCCCGT--CCCTGCTGAT-TTGTTTCCAAGGTGAGTGGTCCTTGTCCTGCAATCCGGGAGTAGGC----TG-T-----GTGACAGGAGTGCAAGGGTCGTC-GCAAAGTTGAGGT-AATCCAA--CGTGTT--CAAAGT-CC-CACTG-TA-TACCGT--TT-TTCCTGC---CTGTTGTAGTGATCTTCAAGA-TCC--AAT-CAATGACCAG--CAGG-AAGAGGGAC-TGCGACAGTAAGGCAGCCCTGACG--------TCTCCAGTCTT-CACCCCG-A-AACT-----GC-TCTG-------------ACCACTGGCAT-----------------GCGTGGGTG-CTC-CTGCAGCTCATTTCCTGGTAAGGTG---CA---GC-GGATGAAGGAGAT-GG-TC-TTC-T-GGG--------ACTCAA--ACTGTCTCCGC-AGCTT--CACAG-CG-TCT-CTCTATCTACA-TTGTT-GAATGC-ATTGTC-T-GT-CTA-A----TGAAA-TTG--ATTTA-----GAGGGGGGAGTCCCGCTC----TAGTGAATG
gi|11 : CGACAATACCT--CGACAGTGCAATT-GGTT-CTGGGCTAATC----TCATTG-CTCCAGTC--CAGTTGATC--------C-CCTGTTCTTTCATCTCTGCCTCAGTGTcctcatgatgatacgtaggctggcgatctggtcagcacaggaatctgttctgcggaagcccgtctgctggctcggagcttagggtcactagccccttcatcctcttagcagactgttgagaaccttgcccggcaccaacaggagcataatccctcggtagttgctgcagtccctgaagtcttcctttctttggcgttgatgatgagtttcctctcttccaaactggactggtatctcttccttctcagatcttgctgaaaggctgtgtaggaatggtgacagtggttccgtgtctgctttgaatggcttctgctgatatgtttgtcgccctgccgctttcattcttaagtggttgccatgcccttcctgatctctgctttagatggttgtcacagttgtggtagctctgttctgctggtggtatgtctggtagtgttgggcgggtggttcaacaactcactgaatgttctgccatctcttcagctgttcctccagttgttgtcagtggtgccattcttgtttttaactggcttgtctgtctgctgggaacttgcctccagcttcttggttgtcaggtattaaggtcctttaggtccctgacctgttgcatgttaggcttgctgcccagttcctcaataaatccttcttatccgtttttattttttttttttttttttttttttttttttttttttttttcttgatctcccttcttcacttcctgtcagctgctgtatacatcttcacaccatttgccttagctgccttgttcggctcatgttagccagtgtacttcttcttttttcctatctctattttctggaaagtatcaaagagtcactctttgtgtttgggtcttcttttttcttagaactcttcacatgtgtcagccagagttcctgctgtgttcccattggctcaatgtctgtctactgctatgatcagttcttgtattgggtggacattggaaaaggctgatctgaaagtcttgtgtccttctcctgagcagttcccatgttgaatttgtcgtgcattattgttggtgttgttgtacctctgatcgaagctcactgctgtaaccagaaaggttgtggtctgatagatgtcggcaccttcattgctcgcacatcccgccatgatc
gi|11 : tACC-ACTAGC-TCCT-GTT-TTACTCGCTCC-CACAAATCTTCATTTCGT-ATTT-TGTC-TGG--CCATCTGA-TGT-TGTAAA-TGT--GCCTCA---GG--CAG-G-TGTTGAAAAATGTTT-GGATCTTGAGCAG------CATTGTCTTTGTCGTCCGCCAT-GTTT-CGCATCCGTAAAGAAG-GATGGATTTAACGCT-GGA-ATAA-AA-G-ATGCG-C---Actcgcttcgagctgttgcaaggccatcctcttttcctctgaccctgcgggttccaggtcagggcttggcgtgtggtgttggcttcaggtttccgaaaagtaccggattagttcgatccagccccacttcctctgcagaatatgttcaaccactagctcctgttttactcgctcccacaaatcttcatttcgtattttgtctggccatctgatgttgtaaatgtgcctcaggcaggtgttgaaaaatgtttggatcttgagcagcattgtctttgtcgtccgccatgtttcgcatccgtaaagaaggatggatttaacgctggaataaaagatgcgcatattaattgtctt
gi|13 : tcgacaatacctcgacagtgcaattggttctgggctaatctcattgctccagtccagttgatcccctgttctttcatctctgcctcagtgtctcgcttcgagctgttgcaaggccatcctcttttcctctgaccctgcgggttccaggtcagggcttggcgtgtggtgttggcttcaggtttccgaaaagtaccggattagttcgatccagccccacttcctctgcagaatatgttcaTTAGGTCTATCGTTCCGTGAG--GAACATAGACTTATCAACGGC-GT-CC---C--TAGCGAACACAGGTT-T--GGCTGCTT----TTGCTGCTTCTTG-CAAGAGGTGGTG--------TCCATGTTCTTTCAATTCTGACTCCGTGGTCTtattaattgtctt
gi|13 : atC--TCCGCCTTGATT-GC--G---G---AACCTACTGC--TCTT-AAT-TT-CTTCCTCC-CATAGTTCTTCATTT-GTGATCC-T-TC-TGG--CCATCGAA-TGT-TAAAGATTGC--GCCTGA---TGAACAGTGCTGTTGTAAAATcgcatccaggtacttctctaatgacctcctttcttctcttgcgttgcccctagtgggttccgagtcagcctggcgttgtgttagttgttgacttcctcaaagttgtccaaatccagccccacttcctccgccttgattgcggaacctactgctcttaatttcttcctcccatagttcttcatttgtgatccttctggccatcgaatgttaaagattgcgcctgatgaacagtgctgttgtaaaattctg
gi|14 : atttaggtctatcgttccgtgaggaacatagacttatcaacggcgtccctagcgaacacaggtttggctgcttttgctgcttcttgcaagaggtggtgtccatgttctttcaattctgactccgtggtctcgcatccaggtacttctctaatgacctcctttcttctcttgcgttgcccctagtgggttccgagtcagcctggcgttgtgttagttgttgacttcctcaaagttgtccaaatccagccccacttcTTAGGCCCATAAC-CCTTG-GTTGAGCATAAGC-CATTGACAACA---CCT--CGCCAGCGCGCTC-AGTT-CTGGGCTAAAC----TCATTG-CTCCTGTC--CAGCTGtctg
gi|15 : cttac-------CCG-----ATT---CTTGAGCT--T-G--ACG-CCCTATTGG--AT-CGACTGCCACTCGGAGAACTGGCTGT------------TTA------------CGCACAGCTC-T------------CCCCGAGGT-AAA--CCCGAAAAAGTATTTGAACTATCTCCGA-TAGGCTTTCCCCCGACTGTGA-CTGAGTG-ATCACCATCTGG--A----GTATGAGGTGAGACTGGATCTAATTATTTCTATTCTG----T---TTATCTTTAAA-T--TGGAC--TTAGGGACCCATGATTCTGATGATGTTG-TTGannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntagagtatgtccgatccaacccccacttcctgcgcggaatctgctcagccactggctcctgtc
gi|16 : cttggattC--TCTGCA--GATTTGC-------T--CATC-ACGGA--TG-T-GGCGCCGCTC-CTCC-CACAAGTCTTCTTTC-AT-AT---T-TT-CGG--CCATCTAAATGTCTGAA-A-TGCAAGCTTCA---GG--CAG-G-TGTTGAAAAATG-CT-TGATCT
gi|17 : cagccccacttcC--TCTGCAG-AATTTGCTCA---GT-----C-ACTGG--ATGT-GGC-CCGCTCGCTCC-CACAAGTCTTCATTT-CATATTT-TGTC-TGG--CCATCTAA-TGT-TGTAAA-TGC--GCTTCA---GG--CAG-G-TGTTGAAAAATG-gagcagca
gi|18 : ccacttcTTAGGCCTGTCGTTCCGTGAG--GAACATAGGC-CATCAACGACAGT-CCT--C--CAGCGAACAC-GGTTAATCGGCGGTTCTGGGTTGCTGTTTCTCG-C--CAGGTGGTG--------T-CATGTTTTCT
gi|19 : tacGACTGCTT----TTGCTGCTTCTTG-G--CAGACGATACCGGTATAT-CATGTTCTTTCCATTCTGACTCTGTGTTg
gi|2 : TG-AA-G-ATTCGAT---AGTTTGGTG--TAA--TCC-GAAT--T-TC-TT---TG--AGGCCG-AG-ATGT--TTCTTGAGCATG------TGG-AA-AAC-T---AC----T-CTTGGCTATTTCCT-----ATT---CTTGA--CTTT-G--ATG-TC---ATGG--TCTTG--TGCCACCC-------T-TCTAT------------C-A------------C-TACA---C-TTTTCTTTCCCTCCCCC-AGGTAAAA--T--GAAGGA--ATC--AATT-TCTTTAA-T-GACGCTCCA-CAATTGTG--CTG-A-G-ATC------CGGTCATTATTT----GGAT----TTTATCT--TCA--TCAGTTCCG----T--------TTCAAGTT--TGATCAGTT-GA-ACCCGT--TCCTGCT-ATGTTG-TTGCAATGCGAGTTGT-C-TGTCCTGC-A--CTCCT-T-GGT----TG-T-----GTGACAGCGAAGCCA-GATCATTGGCGAAATCGAGAT-CATCCAGTTTGCGTT--AGGAGTGTC-CACTGATATTGCCAT--TG-TTCCTAC---CT-T----GTAGTC-TCATGA-T-C--AGT-CAATGACCAG--GAGGAAACAAATAG-TAGGACAGCAA-GCATCCTTGGCGGAA-----ACCTTTGTCTTCTACCTCG-ACAACTTTCCAA-ATCTG-----------------CC-GCATG-------------CCGAC----------C-ATGCAGC-CATGCCTTGGT-ACGTGTTGC--------AATCAGAGGGACAGACGC-TTCTTCATG-----TCAACTCCA-TAGTGCCT-AGC-A--TTC-CACAG-TG-TAT-CCC--TCCACG-CTGTCTAAAAGC-TTTCTCAAAGT-CTAT-------AAAGTTTACATATAAGGGGGGGGGGGGAACTTCACTC----CAtcgc
gi|21 : AGGCCTATTGTTTCGT----------------CACCAACGACAGT-CCT--C--CAGCGAACAC-GGTT-ccattgtcattgatgatgcgtaggtgctatttatcaacaaattaattctgtttcgcctaaaaccaggcctgctggttaacgagctttgagtcatgcttcttcatcctctccagaagatcctgtggatgactttgccgggcacaagagcattattccacgatagttgttacagtccctcatatcttccttctttgggaagcttaatgaggtgaccctctttccattttcatggaatctcttcctccaaatatctcatgaagagttaagcaatatgtctatattgtctctgtggcagcttgatagcttccgcggtattcgtcaggtcctggtgatttaccattcctgtgatttccattcttagtgttgggtaatagattactcctggtctcggatagtgattgttttgcatttattgggaagactgtattcagggctgtattatccggtggagtttctggtgttggtctgtttaagatctccagtgttctatccatttcttgaattcctcttcactggtttgagaggttccattcttgtcatcactgttttcacgctggtaactttgttttgaaagcttcttggtggaccatgtacagctctctaaaatttccatttcccgctcgtccttcatgctttttggccaaagttgttcaatgtggttccgtttctttcctatacatcgcttcatttctttgttgcagcgtgcatagttcctcttagcctttgactttgctgctcttgttcggcttgtgttactgccttttctttcctgtcctcacattcaatttcctcatgtatcggcgagaccactcttgtgtcgatcttccttctgccggggacttcttcacaatgtttcaccacagttcctcgatgtttgcactgcgagtttcaattttcgtctctattgtcccatttgattcttgacagcgtctgagttggaatgctgtcctcatcttttgtttgatggaaactcatgttgacgctgtcccctactttgtttgttgaattcttgagacgtactcttactgacatcatcaaagattgtggtctgatggaagtctgctcctctcactactctgacatctttccccgatc
gi|3 : T-GGA-ATTA-AG-C-ATGCG-CCATATTTCAGC---CTA--TAT-AACT--GATT-CTGTATGTGAGGCC--AGTATGT--TTCTTCAACATATCTC--GCG-GAGAGCCT---TCATCGT-CTTG-------C-T-----ATCTTGCTTG--------G--ACGCTC---TAGGAGTC-TG--TCGCACCCAG-----TGT-TGT------------CAA------------T-CACA---C-T------------CCC--AAGT-AAGATC--AAAT----ATC--A--T-TCTCTGA-TGGGCTTCTCACC-ACTGTGATTTG-GTGTGT-------TTG-CA----GT----GGTT----GTATTTT--TCA--TCAAGTCTG----TCTGTT-GTTTCTGG-TGATCATC--TT-AAGCCCCG---TCCCGTGAATGTTG-TTTCA--GAGAGTGGTACTTAGTCTGC-ATCCG--GGT-AGTAAGCTGAT-----TTGAAAGGAT-GCCA-GGTCGTCG--AAAGTTGAGGTACCTACA----ACGTTTCAATAGTCCCTCA-TGTTA-TACCGT--T--TTTCTCCATGCTGT-GTAGTGATTTTCAAGA-TCCTTAATACAATGACCAGCTCAGG-AAAGGGAACTTGCG--GACAA-GTAG----GCCG--ACTAGTACTCCAGTC-T-CAC--CA-A-AACTGT-TGACAACT-------------------T-GC-TG-------------CTGGCGTGGGCGAA-T-CTGCAGTTCATTTCT--GT-AG----TGCA---GCGGAATGAGCGAGAT-GG-GTATCC-TTGGGGAATCT--ATTCCATTAATGTCTC-GCGAGCTTCGCACAG-CGCTCTACTCTATCTACA--TGTT-T---GC--TTCTCTTAGTGC--TA----TGAAA-TTGAT-TCTA-----AGGGGAGAAGTT-CACTC----TAGTGA
gi|4 : gtaTTAGGTCT---GTTCCGTGAG--GAACATAGAC-CATCAACGACAGT-CCT--T--CAGCGAACAC-GGTT-CTGGGCTGCTG----TTGCTGTTTCTTG-T--CAAGTGGTA--------T-CATGTTCTTTCAATTCTGACTCCGTcctgctcaatgatgcttatacgttggtgctatctggtattcgaagccagatctcatagacattttctgcgtgtgcagccgtctgctggtctcggcttcagggtcactgccccttcatgccctctagcaggacatctgtcgagacttgttgccctggctgagcaacaacaggacgcataatccttcggtagttgctcgcatcctggagtcttcctttcttggcgtttagatgagtagtcctctcttccattgcatggtatctatactatccttctcccagatttgctgaagaggtcgtgagtaggatgtgagtgtttccgtgtctgcttgatgcttcttatctgtcatatgttgtgcgcgcctgcagttatccatttcttatgtttgcccataggccgtttcctgatttgctttagatggtttgtacataagatgtgatgggagctcgtgttgctctcggtggtatgtctctcggtagcttgtctcagggtaggtgtctcaaactcccttacagtttcgtgaccacatcttagatctgttccgtcatgttgtttgtgttgggccatcctgtgtttttttaactggctggtctgtgctggagacttggccctgccagctcttggtattcaggtataggtaccttattattcgctgacctgttgcaatgttaggctagaactggccacttcctccaagataactcgtcttatatctctctctttatgctcttctt
gi|4 : acttacTTGC--A----T--GTCTTACTGG--TTCTTGAT-TTG-TCTCCTC-CATAGTTCTTCATTT--T-ATCC-T-TT-CAG--C-ATCAGA-TGT-TAAGGA-TGC--GCCTGA---GA--CAG-G-TGTTGTAAAATG-CT-GGATCTTTTGCAG------GGT-GTTTTAATATTTCTCCAT-GTCTCCGC-TCCATAGAGTAA-GATGGACTTTACGTTAGGAGATTATAATA-ATTCG-C---AGTTTGGCCC-TAAATTGC-GA-T--T-TCATT---TT-GAGGCCC-AG-ATGT--T-CTTGAGCATACATGTAGTG-AA-TGC-T---AC----T-CTTGTGTTT--CCT-----ATT---CTTGA--C--TTG--ATG-TC---GTGG--TC-TG--GGCCACCC-------TGTCTGTCCTCTACACTTCCCAGGTAAATGACATC-TACA---C-T------------TCCC-AGGT-AAA--T--GAAGGA--ATC--AACT-TCTTTGA-TGGGCTCTCCACCAACTGTGA-TTG-GTA-AC-------TGGACA----GT----GGTG----TTGATCT--TCA--TCAGCTCAA----T---CT-TCTTCAAG-T--TGATC--TT-GAGACCTAT--TCCTGCTAATGTTG-TTGCAAGGCAAGTTCT-CTTGCCTTGC-ATCTGCCTGT-GGT----TG-TACAACGCGACAGAAGAGCCA-GGTCATCGGCGAATTCGAGAT-CGTCCAG-TTACGTT--AGGAGTGTT-CACTG-TA-TGCCAT--TG-TTCCTAC---CTGTCATGATGGTCGTCATGA-TCC--AGT-CAATGACCAG--GAGG-AACATAAAT-GGNNNNNNNNN-NNNNNNT---CG--A-----ACTCCTGTCTT-GACTTCG-A-AACTTTCCAACAT-----------------------------------------CCGGCATG----------------TCACGCCTTGGC-AGGTGTTA------C-GAATGAGAGAGAC-GA-GC-TT--TCAGG-----T--ACTTCA-TAGTGCCTCA-T-ATCTTC--------------------------CTGTC-GAAAGCTTTTCTCATAGT-C--TA----TGAAAGTTTACATATA------GAGGATGATTTCCACTC----CAGTGATTGTTtggctcgcctccaagtgtttctaggacgtnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntgaagttgcatgtcttactggttcttgatttgtctcctccatagttcttcattttatcctttcagcatcagatgttaaggatgcgcctgagacaggtgttgtaaaatgctggatcttttgcagggtgttttaatatttctccatgtctccgctccatagagtaagatggactttacgttaggagattataataattcgcagtttggccctaaattgcgatttcattttgaggcccagatgttcttgagcatacatgtagtgaatgctactcttgtgtttcctattcttgacttgatgtcgtggtctgggccaccctgtctgtcctctacacttcccaggtaaatgacatctacacttcccaggtaaatgaaggaatcaacttctttgatgggctctccaccaactgtgattggtaactggacagtggtgttgatcttcatcagctcaatcttcttcaagttgatcttgagacctattcctgctaatgttgttgcaaggcaagttctcttgccttgcatctgcctgtggttgtacaacgcgacagaagagccaggtcatcggcgaattcgagatcgtccagttacgttaggagtgttcactgtatgccattgttcctacctgtcatgatggtcgtcatgatccagtcaatgaccaggaggaacataaatggnnnnnnnnnnnnnnntcgaactcctgtcttgacttcgaaactttccaacatccggcatgtcacgccttggcaggtgttacgaatgagagagacgagctttcaggtacttcatagtgcctcatatcttcctgtcgaaagcttttctcatagtctatgaaagtttacatatagaggatgatttccactccagtgattgttcgatgatcatcggatgcgtagactggctatttgatcagcatctgatctgtttggactaaaaccatcctgctggtcacggagctttgggtccactgcgccttctctcatcctccgagaaggactgcttcgaggactttgccggggtttactggacaggagcattacttccacgaatagttaattgcagtccctcaattcttccttcgttggcagctttaatgaggatccctctttcttactcttcagggatgttctcttccttccagatcttcttgaaga
gi|5 : acttacttaggtctgttccgtgaggaacatagaccatcaacgacagtccttcagcgaacacggttctgggctgctgttgctgtttcttgtcaagtggtatcatgttctttcaattctgactccgttggctcgcctccaagtgtttctaggacgtnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntgaagTTAGGCCTATAGC-CCTTG-GTTGAGCATAGGC-CATCAcgatgatcatcggatgcgtagactggctatttgatcagcatctgatctgtttggactaaaaccatcctgctggtcacggagctttgggtccactgcgccttctctcatcctccgagaaggactgcttcgaggactttgccggggtttactggacaggagcattacttccacgaatagttaattgcagtccctcaattcttccttcgttggcagctttaatgaggatccctctttcttactcttcagggatgttctcttccttccagatcttcttgaaga
gi|5 : tcttacCATAGGC-CATCCACAACA---CCTCGC--CAGCGCACTC-GGTT-CTGGGCTAATC----TCATTG-CTCCTGTC--CAGTTGACC--------C-CGTGTTCTTTCATCTCTGCCTCAGTATtgcataggccatccacaacacctcgccagcgcactcggttctgggctaatctcattgctcctgtccagttgaccccgtgttctttcatctctgcctcagtatctcgcctccagctgttgcgaggccgtnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntccgcagaatctgctcagccactggatcctgtcccaatcgctcccacaagtcttgtctggccatctgatgttgtaaatgcgcctaaagcggcagttgttgaaaaatgcttgaatcttgagcagcattaaaattgtctttgtcgtccgccattgtttcgcatccgtagagaaggacggatttgatactggaattaaagatacgcatttttgtcttcctactgatctgtctggaggcacagatgttcttcaacattacgaaagcccctcttgccttgccaatccttgctgtgacgtctcggtctgtgtccccctgcttgtcaaccacacttcccaggtagacaaaagactccacctctctgatggactctccaccgactgtgattggtgttgatcttcgtcagctcggtcttttttttctgttgattttaagccctgtcgtttcaaggcgagtggtcttgtcctgcatctgggagtagctgtgcgataggagtaccaggtcgtccgcaaagtcgatgtcatccaactgtgtccagagccccactgtatactgtttttcctgcctgttgtagtggtcttcaagatccaatcaatgaccaggaggaagaggaacggcgacagtaagcagccctgacgtactccagtcttcacctcgaaactgtctgacaacctgccggcgtgagcgatactgcagctcatttcttggtgagtgcagcgaatgagggagataatcttctggggaactccgtaatgtttcagcagcttccacggcgtctctctatctacactgtcgaatggcttctcgtattctatgaaattggcgtagaggggggggggggttccactttaaacagcgagtgctcaacaatgatgcgtaggctggcatctggcatctggtcggcacaggatctgttcctgcggaagcccgcctgctggt
gi|5 : tcttacttaggcctatagcccttggttgagcataggccatcatg--TCCGCAG-AATCTGCTCA---G-----CC-ACTGGA-TCCT-GTC-CCAATCGCTCC-CACAAGTCTT--------G-------TC-TGG--CCATCTGA-TGT-TGTAAA-TGC--GCCTAAAGCGG--CAG-T-TGTTGAAAAATGCTT-GAATCTTGAGCAGCATTAAAATTGTCTTTGTCGTCCGCCATTGTTTC-GCATCCGTAGAGAAG-GACGGATTTGATACT-GGA-ATTA-AA-G-ATACG-C---ATTTTTGTCT-TCC--TAC-TGATCTG-TC------TG-GAGGCAC-AG-ATGT--T-CTTCAACATT------ACG-AA-AGC-C---CC----T-CTTG-------CCTTGCCAATC---CTTG---C--T-GTGACG-TC---TCGG--TC-TG--TGTCCCCC-------TGCTTGT------------CAA------------C-CACA---C-T------------TCCC-AGGT-AGA--C--AAAAGA--CTC--CACC-TCTCTGA-TGGACTCTCCACCGACTGTGA-TTG-GTG----------------------------------TTGATCT--TCG--TCAGCTCGG----TCTTTT-TTTTCT-G-T--TGATT--TT-AAG-CCC-------------TGTCG-TTTCAAGGCGAGTGGT-CTTGTCCTGC-ATCTGGGAGT-AGC----TG-T-----GCGATAGGAGTACCA-GGTCGTCCGCAAAGTCGATGT-CATCCAA-CTGTGTC--CAGAGC-CC-CACTG-TA-TACTGT--TT-TTCCTGC---CTGTTGTAGTGGTCTTCAAGA-TCC--AAT-CAATGACCAG--GAGG-AAGAGGAAC-GGCGACAGTAA-GCAGCCCTGACG--T-----ACTCCAGTCTT-CACCTCG-A-AACTGTCTGACA-----------------ACC-------TG-------------CCGGCGTGAGCG-A-TACTGCAGCTCATTTCTTGGT-GAGTG---CA---GC-GAATGAGGGAGAT-AA-TC-TTC-TGGGG-----A--ACTCCG-TAATGTTTCAGC-AGCTTC-CACGG-CG-TCT-CTCTATCTACA-CTGTC-GAATGG-CTTCTCGTATT-C--TA----TGAAA-TTGGCGTAGAGG---GGGGGGGGGGTTCCACTTTAAACAGCGAGTGCTctcgcctccagctgttgcgaggccgtnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntccgcagaatctgctcagccactggatcctgtcccaatcgctcccacaagtcttgtctggccatctgatgttgtaaatgcgcctaaagcggcagttgttgaaaaatgcttgaatcttgagcagcattaaaattgtctttgtcgtccgccattgtttcgcatccgtagagaaggacggatttgatactggaattaaagatacgcatttttgtcttcctactgatctgtctggaggcacagatgttcttcaacattacgaaagcccctcttgccttgccaatccttgctgtgacgtctcggtctgtgtccccctgcttgtcaaccacacttcccaggtagacaaaagactccacctctctgatggactctccaccgactgtgattggtgttgatcttcgtcagctcggtcttttttttctgttgattttaagccctgtcgtttcaaggcgagtggtcttgtcctgcatctgggagtagctgtgcgataggagtaccaggtcgtccgcaaagtcgatgtcatccaactgtgtccagagccccactgtatactgtttttcctgcctgttgtagtggtcttcaagatccaatcaatgaccaggaggaagaggaacggcgacagtaagcagccctgacgtactccagtcttcacctcgaaactgtctgacaacctgccggcgtgagcgatactgcagctcatttcttggtgagtgcagcgaatgagggagataatcttctggggaactccgtaatgtttcagcagcttccacggcgtctctctatctacactgtcgaatggcttctcgtattctatgaaattggcgtagaggggggggggggttccactttaaacagcgagtgctcaacaatgatgcgtaggctggcatctggcatctggtcggcacaggatctgttcctgcggaagcccgcctgctggt
gi|6 : tcttacttaggcctatagcccttggttgagcataggccatcatgcataggccatccacaacacctcgccagcgcactcggttctgggctaatctcattgctcctgtccagttgaccccgtgttctttcatctctgcctcagtatctcgcctccagctgttgcgaggccgtnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnATTAGGCCTTTCGTTCCGTAAG--GAACATAGGC-CATCAACAACAGT-CCT--C--CAGCGAACAT-GGTT-CTGGGCTGCTT----TTGCTGCCTCTTG-C--CAGGTGATG--------T-CACGTTCT--CAATTCTGATTCCGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCATCCGCCT-GATTTGC--A---AT--GACC-ACTGG--TCTT-GAT-TTGCTCTCCCC-CGCAGTTCTTCATTT-GTGATCC-T-TC-AGG--CCA-CGGA-TGT-TAAGGA-TGC--GCCCGA---GA--CGA-G-TCTTGTAAAATG-TT-GGATCTTTTGCAG------GGCTGT-TTAGTAGTTCTCCAT-TTGTCTGC--TCATAGAGTAA-GATGGATTTTACGTT-GGA--TTG-AA-G-ATTCG-C---AGTTTGGTGG-TAA--TAC-GAAT--G-TC-CT---TT-GAGGCCC-AG-ATGA--T-ATTGAGCATG------GTG-AA-AGC-T---AC----T-CTTG-------CCT-----ATC---CT-------------A-G-TC---TTGG--TC-TG--TACCACCC-------TGTATGT------------CCA------------C-TACA---C-T------------CCCC-AGGC-AAA--T--GAAGGA--ATC--AACT-TCCTTGA-TGGGCTCTCCTCCCGCTGTGA-CTG-GTG-AT-------TGGACA----GT----GGTG----TTGATCT--TCA--TCAGTTCTG----T---TT-TCTTCAGG-T--TGATC--TT-GAGACCCGT--TCCTG------TTG-TTGCAAGGTGAGTTGT-CTTGTCCTGC-ATCTGCCTGT-GGT----TG-T-----GTGACAGGAGAGCCA-GGTCATCGGCGGAGTCGAGAT-TATCTAG-TTGCGTT--AGGAGTGTT-CACTG-TA-TGCCAT--TG-TTCCTTC---CTGTCGTGATGGTCGTCATGA-TCC--AAT-CAATGACCAG--GAGG-AACAGAAAC-TGTGATAGCAA-ACATCCTTGTCG--A-----ACTCCTGTCTT-GACCTCA-A-AACTTTCTGACATCTGACCAGCATAGCCAACC-CT-GCATGCNCCGACATCTGACCAGCGTGGGCG-ACC-CTGCATGGCATGCCTTGAT-AGGTGTTACATGTAC-GAATGAGAGAGAC-GA-GC-TTC-TCAGG-----T--ACTCCA-TAGTGCCTCAGT-ATATTC-CACAG-TA-TCT-CTTGGTCCATG-CTGTC-GAAAGC-TTTCTCATAAT-CTATAAAATTGNAAGTTGACATATA-------GAGGGGACTTCCACTC----CAATGATTGTTcaacaatgatgcgtaggctggcatctggcatctggtcggcacaggatctgttcctgcggaagcccgcctgctggt
gi|7 : ATTAG-CCTTTC-TTCCGTAAG---AACATAAGC-CATCAACAACAGT-CCT--C--CAGCGAACAT-GGTT-CTGGGCTGCTT----TTGCTGCCT--TG-C--CAGGTGATGA-------T-CACGTTCT--CAATTCTGATTCCGTGTTCTATATGCCCAGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNC--TCCGCCT-GAATTGC-------T---ACC-ACTGAGTTCTT-GAT-TTGCTCTCCCCGCAC-GTTCTTCATTT-GTGATCC-T-TTTCAGATCCA-CGGA-TGT-TAAGGA-TGC--GCCCGA---GA--CAG-G-TCTTGTAAAATG-TT-G-ATCTTTTGCAG------GGCTGT-TTAGTAGTTCTCCAT-GTGTCTGCAATCATAGAGTAAAGATGGATTTTACGTT-GGA-GTTG-AA-GCATTCG-C---AGTTTGGTGAGTAAA-TAC-GA-T--G-TC-CT---TG-GGAGGCC-AG-ATATGAT-ATTGAGCATG------GT--AA-AGC-T---AC----T-CTTG-------CCT-----ATC---T--------------A-G-TC---TTGG--TC-TG--TACCACCC-------TGTATGT------------CCA------------C-TACA---CAT------------CCCC-AGGC-AAA--T--GA--GA--ATC--AACT-TCCTTGA-TGGGCTCTCCACCAGCTGTGA-CTG-GTG-AT-------TGGACA----GT----GGTG----TTGATCT--TCA--TCGGTTCTGGGGTT---TT-TTTTCCAG-T--T-ATC--TT-GTGACCCGT--TCCTGCTGATGTTG-TTGCAAGGTGAGTTGT-CTTGTCTCGC-ATCTGCCT-T-GGT----TG-T-----GTGACAGGAGAGCCA-GGTCATCGGCGGAGTCGAGAT-TATCTAG-TTGCGTT--AGGAGTGTT-CACTG-TA-TGCCATGATATTTCCTTC---CTGTCGTGATGGTCGTCATGATTCC--AA--CAATGACCAG--GAGG-AACAGAAAC-T--GATAGCAA-ACATCCTTGTCG--A-----ACTCCTGTCTT-GACCTCGAA-AACTTTCCGACATCTG-------------A------------------------CCAGCGTGGGCG-A-C-CTGCATGGCATGCCTTGAT-AGGTGTTACATGTAC-GAATGAGAGAGAC-GA-GC-TT--TCAGG-----T--ACTCCA-TAGTGCCT-AGT-ATCTTC-CACAGAGG-TCT-CCCGGTCCACGTCTGTC-GAAAGC-TTTCTCATAGT-CTAT-------AAAGTTGACATATA-------GAGGGGACTTCCACTC----CAATGATTGTT
gi|8 : CATAGGA-CAC--ATAACAGT-CAA--C--CAGTGATCAC-GGTT-CTAGGCTACTC----TTA------ATTG-C--TAGATAGTT--------T-CAcaatttttcaacaaccaactaattc
gi|8 : --TTCATCT-AATTTAC--ACAAGTACGTCC-ATCGGC-TCCT-GTC-TTGCTCTCTCC--ACATTTCTTCGTTC-ATGATTTAT-TT---------TCAGA-CCT-TTAATA-TGC--GCCTGA---GA--CAG-G-TGGTTTAGGCTA-TTTGGATCGTCTATGG------AGTTGCTTTAGTCGATCTCCAT-GTCTTCGC-TTCGTAAAATAA-AATGGACTTAACAAT-G-A-AGTG-GG-G-ATCCA-C---ACATTGACGG-TCA--TTT-GCAC--G-T--------G-GATGTCCTAT-ATTT--T-CTTGGGCATT------GTG-AA-CAC-TTTTGC----TGCTTG-------TCG-----ATT---CTTGA--C--TTG--ACG-CC---TTGA--TC-AC--TGCCACTC-------TGGCTGT------------TTA------------C-CACA---C-T------------CCCC-AGGT-AAA--C--GAAGTA--TTG--AACT-TCTCCGA-TAGGCTCCCCACCGACAGTGA-CTA-GTG-ATC------CGG-CG----GT----GAGA----CTGATCT--TCA--TTCATTCTG----T---TT-TCTTTAAA-T--TGGAC--TT-GGGACCTGA--TTCTGCTGATGTTG-TTGCAAcaggtctacatctctacacctcagatgtttctggttcgtnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnctttcatctaatttacacaagtacgtccatcggctcctgtcttgctctctccacatttcttcgttcatgatttattttcagacctttaatatgcgcctgagacaggtggtttaggctatttggatcgtctatggagttgctttagtcgatctccatgtcttcgcttcgtaaaataaaatggacttaacaatgaagtggggatccacacattgacggtcatttgcacgtggatgtcctatattttcttgggcattgtgaacacttttgctgcttgtcgattcttgacttgacgccttgatcactgccactctggctgtttaccacactccccaggtaaacgaagtattgaacttctccgataggctccccaccgacagtgactagtgatccggcggtgagactgatcttcattcattctgttttctttaaattggacttgggacctgattctgctgatgttgttgcaa
blockSeqs : A A T GA TT . G . CG GC A A TGGG T C T AA ACCGGTATA C T NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNC AG ACAAGTACGT T GT T T A G C G T CATATTTTG TC AT T G A C G T AA AGC AA T C T C T T CATTAA T A T C CC A A A A G T T C G A CAT G GAG A AT . CTGATTCTGTA T T T GAT ACATGTA G . G CTTCATCG G GCTATTTCCT TTG AGCTTG C C CTA AG T AC GGAGAAC C CCTCTACACTTCCCAGGTAAATGACAT G GCT A TTTCTTTCCCTC G A CCC AA GT TG A . G TT A ATCACCATCTGGA ATGA GAGAC AA TT GGGTT A AA T GA AG A A TGA ATG . T A . CCTG . AAGC A ACAAC T A . A GTT TC CCCT A T GA AT A ATG C T T T TT A CT A T G . T T G ACTAGT T CT A C T CC TCTGACCAGCATAGCCAACCCTGCATGCNCCGACATCTGA G AAT GTT . TTACATGTA G A C A CT C GAATCT T CA G G G CGC A TA GT T A TT A G TATAAAAT G AGGGGG A TAAA T
blockSeqs : G C T GA TT . G . . . . . . C T T . GA . C AG TCAGT T A G . G . G . G ATGATTTAT T . T T . . A . . . . . . A . . G . C C . T CT A . T . . . . . T . . T CC T A . ATTTCTT . . . TT ATCTC C . . TTTTGC . TGTTTCCT . ACTTTG T . . . . . AG C TTA . . . . . . ATC GG . . . . A C . ATCCGGTCATTAT . T . . TCTG . AA . . . . A T TGA . G . . GGAG . . . . T A . . GT . GTC T . . G C . T G A . . . . . . C . G T C GAA A C . . G CC TCTGCCGCATG A ATA GCT . TTACATGTA . . . . C T TCA . CA . T . AGG . TA G . A T T . TAT G GGG G . G
blockSeqs : A T T AA . . G . . . . . . T C . . G . T CT AATGA . C C . G . T . G GTGATCCT C . T T . . G . . . . . . A . . T . T A . G CT . . G . . . . . G . . G CT A . . TTTCATT . . . TT G T . . TAC . CCTTGCCA . ACTTG C . . . . . . C CAA . . . . . . T GG . . . . A C . TGTTTGCA . T . . TCTT . TG . . . . C T CTA . T . . CCTG . . . . C T . . AC . GTT . . . G A . C T T . . . . . . N . N T A A T G . . T CT ACTTGCTG G ACC TGG . TGCAG . . . . C C T . CA . G . TG . GG A . T C A . TAT G A T . T
blockSeqs : A A T AA . . G . . . . . . T T . . G . T CT ATGT . . C . A . G . T GTGATCCT T . T A . . A . . . . . . T . . T . . A . G TC . . T . . . . . T . . T GG C . . ATCTGTC . . . T T C . . TAC . CCG . CTGTG T . . . . . . T CAA . . . . . . T AG . . . . G T . ACTGGACA . G . . T . AA . . . . A T CTG . G . . CCT . . . . C A . . GT . GTT . . . T G . C G A . . . . . . C . G T T T A C . . G CT ACCTG G AC TGG . TTGC . . . . C G A . A . T . CG . GG A . A T G . TA G . G . T
blockSeqs : T C T G . . G . . . . . . T C . . A . T CT TCAG . . T . T . T . G GTGATCCT C . T T . . G . . . . . . A . . C . . C . C C . . T . . . . . A . . G GG A . . ATGTCCT . . . T G T . . CCC . CCT . ACTTG C . . . . . . A CCA . . . . . . C GG . . . . C T . ATTGGACA . G . . T . AG . . . . A T CTG . T . . CCT . . . . T A . . GT . GTT . . . G T . . G T . . . . . . T . T . T A T G . . T CC TCTGA . C GC . TTA . . . . . C T . C . T . TA . . G . A T A . TA . . C .
blockSeqs : T C . G . . G . . . . . . C C . . C . . A TCA . . T . A . T . T TATCCT T . T G . . G . . . . . . T . . A . . . . . T . . G G A . . TGTCCT . . . T G T . . TAC . CCT . G C . . . . . . A CCA . . . . . . T GT . . . . A C . ATTGGACA . G . . T . CA . . . . A A CT . T . . GG . . . . T . . . . . CC . . . . T . . . T . . . . . . . . T . . A T G . . T T T . . T . CAG . . . . . C T . A . . . . . . . . . . A . TA . . C .
blockSeqs : . . . . . . G . . . . . . T . . . G . . TA . . C . A . T . T ATATT A . . G . . T . . . . . . T . . . . . . T . . C . C . . ACGT . . . T T T . . TAC . TCG . . . . . . . . . C TTA . . . . . . T T . . . . G C . ATCCGGCG . A . . T . AA . . . . A . . .
blockSeqs : . . . . . . . . T . . . T . . . . . T . . . T G . . . A . . . . . . . . . T . . . C . . CT . . . . . . . . . . CA . . . . . . C G . . . . . C . . . . . . T . T . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . T . . .
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4 sequences could not be aligned to this reference sequence:
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gi|11 : CGACAATACCT--CGACAGTGCAATT-GGTT-CTGGGCTAATC----TCATTG-CTCCAGTC--CAGTTGATC--------C-CCTGTTCTTTCATCTCTGCCTCAGTGTcctcatgatgatacgtaggctggcgatctggtcagcacaggaatctgttctgcggaagcccgtctgctggctcggagcttagggtcactagccccttcatcctcttagcagactgttgagaaccttgcccggcaccaacaggagcataatccctcggtagttgctgcagtccctgaagtcttcctttctttggcgttgatgatgagtttcctctcttccaaactggactggtatctcttccttctcagatcttgctgaaaggctgtgtaggaatggtgacagtggttccgtgtctgctttgaatggcttctgctgatatgtttgtcgccctgccgctttcattcttaagtggttgccatgcccttcctgatctctgctttagatggttgtcacagttgtggtagctctgttctgctggtggtatgtctggtagtgttgggcgggtggttcaacaactcactgaatgttctgccatctcttcagctgttcctccagttgttgtcagtggtgccattcttgtttttaactggcttgtctgtctgctgggaacttgcctccagcttcttggttgtcaggtattaaggtcctttaggtccctgacctgttgcatgttaggcttgctgcccagttcctcaataaatccttcttatccgtttttattttttttttttttttttttttttttttttttttttttttcttgatctcccttcttcacttcctgtcagctgctgtatacatcttcacaccatttgccttagctgccttgttcggctcatgttagccagtgtacttcttcttttttcctatctctattttctggaaagtatcaaagagtcactctttgtgtttgggtcttcttttttcttagaactcttcacatgtgtcagccagagttcctgctgtgttcccattggctcaatgtctgtctactgctatgatcagttcttgtattgggtggacattggaaaaggctgatctgaaagtcttgtgtccttctcctgagcagttcccatgttgaatttgtcgtgcattattgttggtgttgttgtacctctgatcgaagctcactgctgtaaccagaaaggttgtggtctgatagatgtcggcaccttcattgctcgcacatcccgccatgatc
gi|11 : tC--TCTGCAG-AATATGTTCA-----A---CCACTAGC-TCCT-GTT-TTACTCGCTCC-CACAAATCTTCATTTCGT-ATTT-TGTC-TGG--CCATCTGA-TGT-TGTAAA-TGT--GCCTCA---GG--CAG-G-TGTTGAAAAATGTTT-GGATCTTGAGCAG------CATTGTCTTTGTCGTCCGCCAT-GTTT-CGCATCCGTAAAGAAG-GATGGATTTAACGCT-GGA-ATAA-AA-G-ATGCG-C---Actcgcttcgagctgttgcaaggccatcctcttttcctctgaccctgcgggttccaggtcagggcttggcgtgtggtgttggcttcaggtttccgaaaagtaccggattagttcgatccagccccacttcctctgcagaatatgttcaaccactagctcctgttttactcgctcccacaaatcttcatttcgtattttgtctggccatctgatgttgtaaatgtgcctcaggcaggtgttgaaaaatgtttggatcttgagcagcattgtctttgtcgtccgccatgtttcgcatccgtaaagaaggatggatttaacgctggaataaaagatgcgcatattaattgtctt
gi|13 : tcgacaatacctcgacagtgcaattggttctgggctaatctcattgctccagtccagttgatcccctgttctttcatctctgcctcagtgtctcgcttcgagctgttgcaaggccatcctcttttcctctgaccctgcgggttccaggtcagggcttggcgtgtggtgttggcttcaggtttccgaaaagtaccggattagttcgatccagccccacttcTTAGGTCTATCGTTCCGTGAG--GAACATAGACTTATCAACGGC-GT-CC---C--TAGCGAACACAGGTT-T--GGCTGCTT----TTGCTGCTTCTTG-CAAGAGGTGGTG--------TCCATGTTCTTTCAATTCTGACTCCGTGGTCTtattaattgtctt
gi|13 : atC--TCCGCCTTGATT-GCGGA-----AC--CTACTGC--TCTT-AAT-TT-CTTCCTCC-CATAGTTCTTCATTT-GTGATCC-T-TC-TGG--CCATCGAA-TGT-TAAAGATTGC--GCCTGA---TGAACAGTGCTGTTGTAAAATcgcatccaggtacttctctaatgacctcctttcttctcttgcgttgcccctagtgggttccgagtcagcctggcgttgtgttagttgttgacttcctcaaagttgtccaaatccagccccacttcctccgccttgattgcggaacctactgctcttaatttcttcctcccatagttcttcatttgtgatccttctggccatcgaatgttaaagattgcgcctgatgaacagtgctgttgtaaaattctg
gi|14 : atttaggtctatcgttccgtgaggaacatagacttatcaacggcgtccctagcgaacacaggtttggctgcttttgctgcttcttgcaagaggtggtgtccatgttctttcaattctgactccgtggtctcgcatccaggtacttctctaatgacctcctttcttctcttgcgttgcccctagtgggttccgagtcagcctggcgttgtgttagttgttgacttcctcaaagttgtccaaatccagccccacttcTTAGGCCCATAAC-CCTTG-GTTGAGCATAAGC-CATTGACAACA---CCT--CGCCAGCGCGCTC-AGTT-CTGGGCTAAAC----TCATTG-CTCCTGTC--CAGCTGtctg
gi|15 : cttac-------CCG-----ATT---CTTGAGCT--T-G--ACG-CCCTATTGG--AT-CGACTGCCACTCGGAGAACTGGCTGT------------TTA------------CGCACAGCTC-T------------CCCCGAGGT-AAA--CCCGAAAAAGTATTTGAACTATCTCCG-ATAGGCTTTCCCCCGACTGTGACT-GAGTG-ATCACCATCTGG--A----GTATGAGGTGAGACTGGATCTAATTATTTCTATTCTG----T---TTATCTTTAAA-T--TGGAC--TTAGGGACCCATGATTC-TGATGATGTTG-TTGannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntagagtatgtccgatccaacccccacttcctgcgcggaatctgctcagccactggctcctgtc
gi|16 : cttggattC--TCTGCA--GATTTGCTCA---------TCACGGA--TG-T-GGCGCCGCTC-CTCC-CACAAGTCTTCTTTC-AT-AT---T-TT-CGG--CCATCTAAATGTCTGAA-A-TGCAAGCTTCA---GG--CAG-G-TGTTGAAAAATG-CT-TGATCT
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4 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|9 ): CTGGTCGGTGCACGATCTGCCCTGCATGTCTGAAACCTGCCTGGTTGTCTCGTAGATGGATGTCAACCGCGTCTCTCATCCTCTCCAGTAAAATCCTGTTGAACACCTTTCCCGGCACTGACAGGAGTGAGATGCCTCTGTAGTTCTCACAATTGCTGAGGTCTCCTTTTTTGGGCGGTTTGATGATATGCCCGTCTTTCCAATCAGTTGGCACTTCTTCCTGGTCCCAGATCCTCTCAAAAAGTGGTAGCAGGATATTGGCTGTAGTCTCTATATCAGCCTTGAGGGCTTCAGCTGGGATTCCGTCTGGGCCAGCTGCCTTGCCATTTTTGAACTTCTTAATGGCACGAATGATCTCTTCTTTCGTTGGTACGTCACATTTGGTCTCTTAAGTCTATCTCAGCCTCTGCAATGTTTGTAGGGTTCTCTGGTGCTGGTCTATTGAGAAGTTCCTCGAAGTGTTCTGCCCATCTTTCTAGTTGTTTTTCAGTATATCTGTGATGTTCTGCCCGTGCTTGTCTTTCACTGGTCGTTCTGGTTTGGTGTACTTTCCAGCGAGTTTCTTGGTCGTGGCAT
Unaligned ( gi|10 ): GTTGAACACCTTTCGGCACTGCAGGAAGTGAGATGTCTGTAGTTCTCAAGTTGCTGAGGTCTCTTTTTTGGGTGGTTTGAATGATATGCTGTCTTTCCCATCAGTTGGACTTCTTCCTGGTCCAGATCCTCTCAAAAAGTGGTAGCAGGATATTGGCGGTAGTCTCTATATCAGCCTTGAGGGTTCAGGGGATCCGTCTGGGCCAATGCTTGCCATTTTTGAACTTCTTAATGGACGAATGAATCTTCTTTTCGTTGGTACGTAATTTGTTTTTAAGTCTAATCTCAGCCTCTGCAATAGTTGGGGTTTTTGGTGCTTGGTCTATTGAGAAGTTCTGAATAGTGTTCTGCCATCTTTTCTAGTTGTTTTTCAGTATATTGTGATGTTGTCGTGATTGTCTTTCACTGTCGTTCTGGTTTTGGGGCTGTACTTTCAGCGATTTCTTGGTCGTTGGATA
Unaligned ( gi|12 ): GTTGTGGTAATGAGGTCTCATTTGATCTCTGATTTTGTTGGCTTTGTCGCAATTGCAATCGGGAGTCTGTATCAGCTGGCCGTATATCCGCGTGGACGTTTCTTGGTGTTGGTCTGTTTAGCAGATCTCCAAAGTGTTCTACCCATCTCTTCAATTGCTTTTCAGTTGTTTGTTCGAGAGGGTTTCCGTTCTTGTCCTTCCACTGGTTTTTTTTCATTTGCAGAACTTGTTTGAGAGCTTCTTTGGTGATCACTACAGGCTCTTCTCAAATTTTCCTTGTCGCACTAGCTTCTTCTGCTATGTGGCCAGCTGTCACATGTGGTCCCGTTTGGTCTTTCCTTAATACTCTCGGATTAACATTTTATGTTTGTGGCCATTTAGCCCTTTTAGCCTTGTTGCCTTTAGCTGCCTTGTCCGGCTTTGTGT
Unaligned ( gi|20 ): ACAGATGATACGAGGCTGCAGCGATCTGCGTCGGCACACGATTCTGTTCCTGCAGGATAGCCCGCCTGCTG