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lowQualScore                  :          ... ....... .  ..... ..   ..... . .. . . . . ... . .   . . .. .. . ....... .. . ...  . ..  ...  .........   .  . .    .... . ..... . .  ....   ..  .  . .   ..  ... . . ...  ........................  .. . .... ....   .  ...... .  ..  ..  ......  .  ... ...   ... .     ............................. .   ..  . .  . ... ..... .       . ... .    .    ....  ................. .  .  ..  ..  . . . ...... .      ....     .. .   .......  ...  ..  .... .    ..    ..   . . .  ..  .. ........... .  .    ..    .  
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Reference ( gi|3 )            :    TTGATT-AAT-------T-AT-----T--GTT-----T-T--A-C-G-T-C---CCA-CTCTA-G--A--A-T-A-----T--T-T---CA-C--TC---AT----G-T--GGA-GA-C-GTCA-A--C-A--T--T-G-CC----GGT--GA-AG-G-GCT--GC---A-A-A--TTT-------AC-ACC------T--G-TG--C-T--C-G----GCA-CT-CG--TG-GC--CT--TT--A---AG-CAG--G---GAG---GAATCTT-TA--T-CG-TGCCAC-----ATCGTGCCA-CAC--CT-G-CT-G---T-----G-ACACGGG-G---C-CTCG-GTTT----TT--T-C--G----G--T-C-TC-ATC-CG--AATG-A-C--CG--C-CCCATTC---AGTCG--C-CTC-------TT---AC--GA--C-ACGCAA--GGGGA-TGC-TGG-GG--ACC-TA--T---CC--A-AC-CCGGAACCCCGCG
gi|4                          :    TTGATT---T-------T-AC-----T--GTT-----T-T--A-C-G-T-C---C-A-CTCGA-G--A--A-A-ACGAAAT--T-C---CG-C--TC---AT----A-T--GAA----C-GTCA-C--CTA--T--T-G-CCC---GGT--GA-AG-G-GCT--GC---A-A-A--ATT-------AG-GCC------T--A-TG--CTT--C-GTGGTGCA--T-CA--GG-GC--CC--TTTGG---AG-CAG--G---GAG---GGATCTT-----T-CG-TG----------------CA-CAT--CT-G-CT-G---T-----G-ACACGGG-A---C-CCCG-GTTTTTTATT--T-C--G----T--C-C-TC-AT--CG--AA-G-A-C--CG--C-CCCATTT---A-TCGCTC-CTC-------TT---AC--GA--C-AC-CAA--GGGGA-TGC-TGG-GG--ACC-TAT-T---CT--A-AC-CCGGA--CCCACG
gi|15                         :   aTTGATT-ATT-------T-AC-----T--GTT-----T-T--A-C-G-T-C---CCA-CTCGA-G--A--A-T-A-----T--T-T---CC-C--TC---AT----A-T--GGA-GA-C-GTCA-C--C-A--T--T-G-CC----GAT--GA-AG-G-GCT--GCA--A-A-A--TTT-------AG-GCCTACATGT--A-TG--C-T--C-G----ACA-CT-CG--GG-GC--CT--TT--G---AG-CAG--G---GAG---GGATTTT-TA--T-C----------------GTGCCA-CAC--CT-G-CT-G---T-----G-ACACGGG-G---C-CTCG-GTTT----TT--C-C--
gi|1                          :  ggTTGATT-ATT-------T-AC-----T--GTTGTTAATAT--A-C-G-T-C---CCA-CTCGA-G--A--T-G-A-----T--T-T---CA-CG-TC---ATAATAA-T--GGA-GA-C-GTTGCG--C-A--T--T-G-C------GT--GA-AG-GCGC----C---A-A-A--ATT-------AG-GCCT-----T--A-TG--C-T--G-G----ACT-CC-CC--AG-GG--CT--TT--G---AG-CA---G---GAG-----ATCTTGTT--T-CG-TG-CAC-----A---TACCA-GACTGCT-G-TT-G---T-----G-ACATGGG-GAA-C-GTCG-GTTT----TT--T-C--GC---GGTT-C-TCGATC-CG--AATG-A-T--CT--G-CCCATTT---GTTCT--C-C-A-------TT---ACT-GAATT-ACGCAATGGAGGA-TGCGTGG-GAGTACG-T---T---CT--A-AC-CCG--ACCC
gi|8                          :   aTTGATTGAATGTGTTGAT-AT-----T--GTT-----T-A--A-C-GTT-C---TTG-CTTTG-A--G--A-T-------T--T-T---CA-CTATT---AT----G----GGA-GA-C-G-CA-A--C-A--T--T-G-------GGT--GG-AA-G-GTT--GC-----A-A--TTT-------TC-GGC------T--A-TC--C-T--C-G----GCG-TT-TA--TGCGT--CT--T-------------------GAG------------A--T-CG-GACCACCTG--ATTGTG--A-CAG--CG-G-C--G---TCCTCCG-ATTTGGG-G---A-TT----TTT----TT--T-C--A----G--A-C-TC-ATC-------------------C-CCCATGT---AGTCG----CTC-------TTA--AC--GA----AT-CAA--GCTGAGTAC-T-G-AG--ACA-TAT-T---TC--A-AC-TCAGGATCCacggg
gi|7                          : ttgaTGATT-GAT-------T-ATCTTAAT--GTT-----T-T--A-C-G-T-C---GCA-CTCGA-G--A--A-T-A-----T--T-T---CA-C--TC---AT----A-T--AGA-GAAC-GTCA-C--C-A--T--T-G-CC----GAT--GA-AG-G---T--GC---AGA-A--ATT-------AG-GCC------TT-A-TG--C-T--T-G----GCA-CT-CA---G-GC--CT--TT--G---AG-CAG--G---GAG---AGATCTT-T---T-C---------------CGTGCCA-CAC--CT-G-CT-G---T-----G-ACACGGGCG---C-CTCG-G------------------------T-C-TC-ATC-CG--AATG-A-C--CG--C-ACCTTTC---AGTCG--C-CTC-------TC---AC--GA--C-ACACAA--GGGGA-TGC-CGG-GG--ACC-TAT-T---CT--A-AC-TCGG-ACCCCACGaaca
gi|9                          :     TGATT-ATT-------T-AC-----T--GTT-----T-T--A-C-G-T-C---C-A-CTCGA-G--A--A-T-A-----T--T-T---CGGC--TC---ATT---A-T--GGA-GA-C-GTCA-C--C----T--T-G-CCC---GGT--GACAG-G-GCT--GA---A-ATA--TTT-------AG-GC-------T--A-TG--C-T--C-G----G-A-CG-CA--GG-GC--CT--TT--G---AG-CAG--G---GAG---GA-TCTT-TT--T-TC-TGC-AC-----AT--------------T-G-CT-G---T-----G-AC--GGG-A---C-CTCG-GTTT----TT--T-C--G----G--T-C-TC-AAT-TG---ATG-A-C------C-CCCATTT----GTCG--C-CGT-------T-----C--G---C-ACGCAA---GGGA-TGC-TTG-GG--ACTATG--T---CTA-A-AG-CCGGACCCCCg
gi|35                         :      GAAT-GAT-------TGAT-----T--GTT-----T-T--G-C-G-T-C---C-G-CTCGA-G--A--A-T-T-----T--T-T---CA-C--TC---AT----A-T--cg
gi|16                         :       ATT-AAT-------T-G-----------T-----T-T--A-C-A-TCC---CCA-CCTGG-G--G--A-G-A-----T--C--------C--TC---AT----------GA-AA-C-GTCC-A--C-A-----T-G-CC----GGTACGG-TG-G-AAC--GC---ACA-A--ATT-------AG-GCC---------A-TG--C-T--C-A----GCA-GG-CG--TG-G----G--GG--A---AGACA---G---GAG---GGATCTTCTA--T-Ca
gi|6                          :   attactT-GAT-------T-AT-----T--TGT-----T-T--A-C-G-T-C---CCA-CTCGA-G--A--A-T-A-----T--T-T---CA-C--TC---AT----A-T--GGA-G--C-GTCG-C--C-A--T--T-GCCC----GGT--GA-AG-G-GCT--GCA--A-A-A--TTT-------AG-GCC------T--A-TG--C----C-G----GCG-C--CA---G-GC--A---TT--G---AG-CAG--GTT-AAGGCCGGATCTT-T--------------------TCGTGCAA-CAC--CT-GCCT-G---T-----G-ACACACG-G---TGCTCGAGTTT----TC--C-C--G----G------TC-AT--CGAAAATG-A-C--CG--C-CCCATT----AGTCG--C-CTC-------TT---AC--GA--C-ACGCAAG-GGGGA-TGC-TGATAG--GCC-TA--T---TCTAA-AC-CCGG-ACCACACGagcacagcgaaacagcgacccttacggtcatcgaaaggttcgccccat
gi|11                         :         T-AAT-------T-AT-----T--GTT-----T-T--A-T-A---C---CCG-CTTGAAG--A--A-T-------T--T-T---CA-C--TC---A----------GG-------GTC------------------C----GGT--GA-GG-G-AC---GC---A-A-A--TTTT------AG-GCC------T--C-TG--C-T----G----GCG-CT-CG-----AC--CT--TT--GG--AG-CAATTG---GGG---GATCTTT-TA--G-CG-TGCCAC-----A-------A-CCC--TT-G-CT-G---T-----G-ACACGGG-A---C-TTGG-ATCT----TT--G-C--A----G--T-T-TC-AGC-CG--AG-G-A-C--CGTCC-CTCATTT---AGT-G--C-CTC-------TC---ACA-GA------GCAA--GGGG--TGC-TAG-GG---CT-T--------------C-CCAGATCCCCACG
gi|12                         :      gtaT-GAT-------T-GT-----TTCGTT-----T-T--A-CTG-T-CA--CCAACTCGA-G--A--AAT-T-----T--T-T---CG-T--TCGATAT----AAT--GGA-GA-C-ATCA----C-G--TAAT-G-CCCCAAGAT--GA-AGCG-GCTATGCT--A-A-A--TTTTGGGCCCAA-ATC------T----TG--C-T--C-G----ACAACT-CG--AG-GG--CTA-TT--ATGCCG-CAT--GTGTGAG---GGATCTT--A--T-CG-T------------TG-GCCA-CAC--CT-G-TTAG---T-----GCACACGGA-GGAGC-CTTG-GTTT----TT--A-TAAG----G--TGC-TC-ATC-TG--Ag
gi|5                          :        ta-AGT-------T-AT-----TT-GTT-----T-T--A-C-G-T-CTC-CCA-CGGAG-G--A--A-A-A-----TCAT-T---CA-C--TTCA-AT----A-C--GGA-GA---GTCA-C--C-AGTT--T-G-TCCTCAAGT--GA-AGTGTGCT--GCT--A-G-A--TTG-------AGGACA------T--AATG--C-TATCAG----GCA-CT-CA--GG-GC--CTATTT--G---AG-CAG--G---ATG---GAATCTT-TAATC-CG-T--------------TGCCA-CAC--CTAA-CT-GTGTT-----G-ACAC-GG-A---C-CTCGAGTTT----TTGCT-T--A----G--T-C-TC-ATC-CG--ATTG-A----CG--C-CTCATTC---AGTCG--CTCTCTAGATCTTT---ACGTGA--C-ACG
gi|10                         :         ttaga-------T-GT-----T--GCT-----T-T--A-C-G-T-C---CCT-CTTGA-G--A--A-C-A-----A--T-T---CA-C--TC---AC----A-T--GGA-GA-C-GTCA----------------CC------------AA-G-GCA--TT---A-A-A------------AC-AAT------T--A-----C-TAAC-G----GCA-CT-CG--GG-GC--CT--TT--G---AG-CAG--G---GAG---GGATCCT-T-------------T-----ATCGTGCCA-CAC--CT-G-CT-G---T-----G-ACACGGG-G---C-CTCG-GTTT----TT--G-T--G----G--T-C-TC-ATC-CA--AAGG-A-C--CG--C-CCCATTC---GGTCG--C-CTC-------TT---CC--GA--C-AAGCAA--GGGG--TAC-TGA-GG--ACC-TGT-T---CT--A-AC-CCGGATCCCCACGaacgg
gi|30                         :         tttta-------T-AT-----TC-GTA-----T-T--A-C-G-T-C---CCT-CT-TG-A--A--A-TAA-----T--TGT---TA-C--TC---AT----A-T--GGA-CG-C-GTCA-T--C-A--g
gi|2                          :                   atgtta-----T--GTG-----T-T--AAC-T-T-C---CCA-CTCTA-G--G--A-TCA-----T--C-TTTATA-C--TC---AT----G--------GATC-ACCATA--CTA--T--T-A-CCT---GGA--AA-AA-A-GAT--GTA--A-A-A--TTT-------AG-GTC------T--A-TAATC-T--C-G----GAG-CTATA--TG-GC--CT--GT--G---AG-CAC--G---GAG---GGATCAT-TA--TCCG-TACCACACGTAATCGTG--G-CGC--CA-G--------------G-ACATCGG-G---C-CTT--GTTT----TT--G-T--T----A--T-C-TT-ATT-CG--AAAGTA-C--CA--C-CCCATTTTAAGGTCAT-T-CCC-------TTAGAAC--GA--CGAAGCAA--GTG---TAC-TGA-AG--Aatctagtaaaa
gi|40                         :                       aa-----T--GTT-----T-TTCA-C-G-T-C---CTT-CTTGA-G--A--A-C-A-----T--T-T---CA-C--TC---AT----A-T--Gttgaatattctaacttgtatacttacg
gi|28                         :                                  aT-----T-T--A-C-G-T-TTCACCA-CTC-A-G--ATTA-T-A-----TA-T-T---CC-C--TC---AT----A-T--GGACGA-C-GTCACA--C-A--TA-T-G-CC----G
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gi|33                         :                                                        ggctttaacgA-G--T--A-T-C-----T--T-T---CA-----------------T--GGA-GA-C-GTCA-C--C-A--T--TTG-CCC---GGT--GA-TG-G-GCT--GC---A-A-A--actttaggagaagtaacacaggctttggtct
gi|34                         :                                                                                   aacga-T---CA-C--TC---AA----A-T--TGA-GA-C-GTCA-C--C-A--T--T-G-CT----GGC--GA-AA-G-GCT--GT---A-A-A--TTT-------A
gi|24                         :                                                                                          ---CA-C--TC---AT----A-TATGGA-GA-C-GTCA-C--C-A--T--T-G-CC-------------------------------A--TTT-------AG-GCC------T--G-TG--C-T--C-G----ACG-CT-TAAATATGC--CT--TT--G---AG-CAG--G---GAG---GGATCTC-TA--T-C
gi|13                         :                                                                                                     ---AT----A-T--GGA-GG-C-ATCA-C--C-A--T--T-G-TC----CGT--AA-AG-G-GCT--GC---A-A-AA-TTT-------AG-GCC------A--A-TG--T-T--C-G----GTG-CC-TA--AA-GC--CT--TT--A---AG-CAG--G---GAG---GAATCTT-TA--T-CA-TGCCAC-----AT-------------CT-G-CT-G---T-----G-ACCTAAG-A---C-CTCA-GATT----TT--G-C--G----G--T-C-TC-ATC-CG--AAGA-A-CTGTG--T-TCTGTTT---AGTCA--C-CTC-------TT---AC--AA--C-ACGCAA--GGGTA-T---TGA-GG--TCA-TA--T---CC--ATAC-CCGGA
gi|17                         :                                                                                                  cat---AT----G----GGA-GA-C-GTCA-A--T-A----------C----GGT--GG-AA-G-GAC--AC---A-A-C--TTT-------------------TAGG-CG--C-T--T-G----GCAATT-CA--GG-GC--CT------G---AG-CAG--G---GAG---GGATTTT-TA--T-CG--GCCAC-------TGTGT--------------------T-----G-AAACGGG-G---C----G-GTTT----TT--TTC--G----G--T-T-Ttcaac
gi|21                         :                                                                 attgatttgagtatgactgtgaacgttcctacgaaaattgtctcag-T--GGA-GA-CGGTCT-A--C-C--A--T-G-------AGT--GA-A----ACT--GCAAGA-A-A--TTA-------AG-TCT------T--T-TG--C-T--T-GC---GCG-CT-TA--TG-GCTTTT--TT--G---AG-CA-------GAA---GGATCTT-T---T-CGATGTTAC-----ATCCTGC
gi|18                         :                                                                                                                     a-GA-C--TCA-C--C-A--T--T-G-CC----GAT--GA-AG-G-GCT--GC---A-A-AAGCTT-------CG-GTC------T--G-CG--A-T---------GCA-TTAAG--CG-GC--C----T--G---AG-CA-------GAG---GGATCTT-T---T-CG--GTCAC-----A--------------CT-G-CT-G---T-----G-A-AC-GA-A---C-CTCA-G--T----TT--C-C--G----G--T-C-TC-AAT-CG--At
gi|14                         :                                                                                                 ttttatgttcacacgaaaaatttA-C-G-CA-AACC-A--T--T-G-CC----AGT--GT-AG-G-ACT--GT---A-A-AG-CTT-------AG-GTC------T--A-TG--T-T--C-G----GTG-CT-TA--TG-GC--CT--TT--G---AG-CAG--G---GAG---GGATTTT-TA--T-CG-T---------------GCCA-CAC--CT-G-CT-G---T-----G-ACACGGG-G---C-CTCA-GTTT----TT--T----G------------------CG--GAGG-A-C--CG--C-CCCATTT---AGTCG--C-CTC-------TT---AT--GA--C-AAGCAA--GGGG--TGC-TGA-GG--ACC-TAT-T---CT--A-AC-CTGGATCCCCACGca
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Reference ( family-350 )      :                                                                               TTGATT-A--AT-------T-A-T-----T--GTT-----T-T--A-C-GTC---CC-A-CTC-GA-GA--A-T-A-----T--T-TC---A-C-TC---AT----A-T--GG-A-GA-CG-TC-AC-C-A--T-----TG-CC----GGT--GA-AG-G-GCT--GC-A-A---A--TTT-AGGCC------T-A-----TG--CT---C-G-G-CG-C-T-CGNG---GCCT--TT--GA----GCAG---G---GAG---GGATC-TT-TA--T-CG-TGCCAC-----ATCGTGCCA-CAC--CTG-CT-GT-----G---ACACGGG-G---C-CTC----G-GTTT----TT--T-C--G----G--T-C-TC-ATC-CGA-A---G--A-CC---G------C-CCC--ATTT---AGTCG--C-CTC-------TT---AC--GA--C-ACGCAA--GGGG-A-TGC-TGG-GGACC---T-AT-T--CT-AAC-C-C-GGANCCCCACG
gi|1                          :                                                                               TTGATT-A--TT-------T-A-C-----T--GTTGTTAATAT--A-C-GTC---CC-A-CTC-GA-GA--T-G-A-----T--T-TC---A-CGTC---ATAATAA-T--GG-A-GA-CG-TT-GCGC-A--T-----TG-C------GT--GA-AG-GCGC----C-A-A---A--ATT-AGGCCT-----T-A-----TG--CT---G-G-A-CT-C-C-CCAG---GGCT--TT--GA----GCAG---------G---AGATC-TTGTT--T-CG-TG-CAC-----A---TACCA-GACTGCTG-TT-GT-----G---ACATGGG-GAA-C-GTC----G-GTTT----TT--T-C--GC---GGTT-C-TCGATC-CGA-AT--G--A-TC---T------G-CCC--ATTT---GTTCT--C-C-A-------TT---ACT-GAATT-ACGCAATGGAGG-A-TGCGTGG-GAGTA---C-GT-T--CT-AAC-C-C-GA---CCCACG
gi|10                         :                                                                                          a-------T-G-T-----T--GCT-----T-T--A-C-GTC---CC-T-CTT-GA-GA--A-C-A-----A--T-TC---A-C-TC---AC----A-T--GG-A-GA-CG-TC-AC-C-A--A-----GG-C------AT--TA-AA-A-------C-A-A-------TT-A---C------T-A-----A--------C-G-G-CA-C-T-CGGG---GCCT--TT--GA----GCAG---G---GAG---GGATC-CT-T-------------T-----ATCGTGCCA-CAC--CTG-CT-GT-----G---ACACGGG-G---C-CTC----G-GTTT----TT--G-T--G----G--T-C-TC-ATC-CAA-AG--G--A-CC---G------C-CCC--ATTC---GGTCG--C-CTC-------TT---CC--GA--C-AAGCAA--GGGG---TAC-TGA-GGACC---T-GT-T--CT-AAC-C-C-GGATCCCCACGgg
gi|11                         :                                                                               ttttaT-A--AT-------T-A-T-----T--GTT-----T-T--A-T-A-C---CC-G-CTT-GAAGA--A-T-------T--T-TC---A-C-TC---A----------GG-------G-TC-------------------C----GGT--GA-GG-G-AC---GC-A-A---A--TTTTAGGCC------T-C-----TG--CT-----G-G-CG-C-T-CGA-----CCT--TTG-GA----GCAATT-G---G-G---GGATCTTT-TA--G-CG-TGCCAC-----A-------A-CCC--TTG-CT-GT-----G---ACACGGG-A---C-TTG----G-ATCT----TT--G-C--A----G--T-T-TC-AGC-CGA-G---G--A-CC---GTC----C-CTC--ATTT---AGT-G--C-CTC-------TC---ACA-GA------GCAA--GGGG---TGC-TAG-GG-CT---T------------C-C-C-AGATCCCCACGg
gi|12                         :                                                                                 gtaT-G--AT-------T-G-T-----TTCGTT-----T-T--A-CTGTCA--CC-AACTC-GA-GA--AAT-T-----T--T-TC---G-T-TCGATAT----AAT--GG-A-GA-CA-TC-ACGT-A--A-----TG-CCCCAAGAT--GA-AGCG-GCTATGCTA-A---A--TTTTGGGCC------C-AAATCTTG--CT---C-G-A-CAAC-T-CGAG---GGCT--AT--TATGCCGCAT---GTGTGAG---GGATC-TT--A--T-CG-T------------TG-GCCA-CAC--CTG-TTAGT-----GC--ACACGGA-GGAGC-CTT----G-GTTT----TT--A-TAAG----G--TGC-TC-ATC-TGA-g
gi|13                         :                                                                                                                                                                              ta---AT----A-T--GG-A-GG-CA-TC-AC-C-A--T-----TG-TC----CGT--AA-AG-G-GCT--GC-A-A---AA-TTT-AGGCC------A-A-----TG--TT---C-G-G-TG-C-C-TAAA---GCCT--TT--AA----GCAG---G---GAG---GAATC-TT-TA--T-CA-TGCCAC-----AT-------------CTG-CT-GT-----G---ACCTAAG-A---C-CTC----A-GATT----TT--G-C--G----G--T-C-TC-ATC-CGA-A---G--A-ACTGTG------T-TCT--GTTT---AGTCA--C-CTC-------TT---AC--AA--C-ACGCAA--GGGT-A-T---TGA-GGTCA---T-AT-C--CA-TAC-C-C-GGAT
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                        cat-AC-C-A--T-----TG-CC----AGT--GT-AG-G-ACT--GT-A-A---AG-CTT-AGGTC------T-A-----TG--TT---C-G-G-TG-C-T-TATG---GCCT--TT--GA----GCAG---G---GAG---GGATT-TT-T-------------------ATCGTGCCA-CAC--CTG-CT-GT-----G---ACACGGG-G---C-CTC----A-GTTT----TT--TGC--G-------------------GA-G---G--A-CC---G------C-CCC--ATTT---AGTCG--C-CTC-------TT---AT--GA--C-AAGCAA--GGGG---TGC-TGA-GGACC---T-AT-T--CT-AAC-C-T-GGATCCCCACGaac
gi|15                         :                                                                     tttcacgcaaTTGATT-A--TT-------T-A-C-----T--GTT-----T-T--A-C-GTC---CC-A-CTC-GA-GA--A-T-A-----T--T-TC---C-C-TC---AT----A-T--GG-A-GA-CG-TC-AC-C-A--T-----TG-CC----GAT--GA-AG-G-GCT--GCAA-A---A--TTT-AGGCCTACATGT-A-----TG--CT---C-G-A-CA-C-T-CGGG---GCCT--TT--GA----GCAG---G---GAG---GGATT-TT-T-------------------ATCGTGCCA-CAC--CTG-CT-GT-----G---ACACGGG-G---C-CTC----G-GTTT----TT--C-C--
gi|16                         :                                                                                ggATT-ACTAT-------T-AAT-----T--GTT-----T----A-C-ATC---CCCA-CCT-GG-GG--A-G-A-----T--C--------C-TC---AT----------G-A-AA-CG-TC-CA-C-A--T------G-CC----GGTACGG-TG-G-AAC--GC-ACA---A--ATT-AGGCC--------A-----TG--CT---C-A-G-CA-G-G-CGTG---G---------GG----GAAGACAG---GAG---GGATC-TTCTA--T-C
gi|17                         :                                                                                                                          --A-C-GTT---CCTA-C---GA-AA--A-T-------T--G-TC-------TC---AG----A-T--GGGA-GA-CG-TC-AA-T-A------------C----GGT--GG-AA-G-GAC--AC-A-A---C--TTTTAGGC----------------G--CT---T-G-G-CAAT-T-CAGG---GCCT------GA----GCAG---G---GAG---GGATT-TT-TA--T-CG--GCCAC-------TGTGT----------------T-----G---AAACGGG-G---C--------G-GTTT----TT--TTC--G----G--T-T-Tagcacagcgaaacagcgacccttacggtcatcgaaaggttcgccccat
gi|18                         :                                                                                          attgatttgagtatgactgtgaTT-----T-T--A-T-GTT---C--A-CAC-GA-AA--A---A-----T--T-T-----------------------------GA-C--TC-AC-C-A--T-----TG-CC----GAT--GA-AG-G-GCT--GC-A-A---AAGCTT-CGGTC------T-G-----CG--AT-------G-CA-T-TAAGCG---GCC----T--GA----GCA--------GAG---GGATC-TT-T---T-CG--GTCAC-----A--------------CTG-CT-GT-----G---A-AC-GA-A---C-CTC----A-G--T----TT--C-C--G----G--T-C-TC-AAT-CGA-
gi|19                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                           -T-CTCG---GCC-------GA----GCAG---G---GAG---AGTTC-TT-TC--T-CG-CGCCGC-----ca
gi|2                          : tcattgattcttatgttttggttttaacgtcacaggctgagattttttttaccatgagtgacgtcaccgggttctaaggtgagaagtaacacaaacttttga-----T--GTG-----T-T--AAC-TTC---CC-A-CTC-TA-GG--A-TCA-----T--C-TTTATA-C-TC---AT---------GG-A-------TC-AC-C-A--TACTATTA-CCT---GGA--AA-AA-A-GAT--GT-A-A---AA-TTT-AGGTC------T-A-----TAATCT---C-G-G-AG-C-TATATG---GCCT--GT--GA----GCAC---G---GAG---GGATC-AT-TA--TCCG-TACCACACGTAATCGTG--G-CGC--CAG-----------G---ACATCGG-G---C-CTT------GTTT----TT--G-T--T----A--T-C-TT-ATT-CGA-A---AGTA-CC---A------C-CCC--ATTTTAAGGTCAT-T-CCC-------TTAGAAC--GA--CGAAGCAA--GTG----TAC-TGA-AGATTGAAT-AT-T--CT-AAC-T-T-GTATACTTACG
gi|20                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   aaCAGGGG-G---C-CCCCTCAA-GTTT----T--------G----G--T-C-TA-A-C-CAA-A---G--G-CT---GAAAGGAC-TGCTAATTT---ATTCG--C-TCA-------TT---AC--GA--T-AA--AA--AGAA-G-TAC-TGA-GAACC---T-AT-T--CT-TAG-C-C-G--ATTCCACG
gi|21                         :                                                                                                                                                                                     ----A-T--GG-A-GA-CGGTCTAC-C-A--T------G-------AGT--GA-AA----CT--GC-A-AGAAA--TTA-AGTCT------T-T-----TG--CT---T-GCG-CG-C-T-TATG---GCTT--TTTTGA----GCAG--------AA---GGATC-TT-T---T-CGATGTTAC-----ATCCTGCggtgcca
gi|22                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 G---ACCT--TT--GA----GCAT---G---GAG---GGATC-TT-TA--G-CG-TGCCAC-----ACC-TGCt
gi|23                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    tcgccgaggattgccgaattgtannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnTCGTTTCAACGT--CTG-TC-GT-----G---ACACGGG-G---C-ATC----A-GTAT----TT--T-T--AAAATG--T-C-TC-ATTGCAA-A---G--ACCC---G------CGACC--ACTC---AGTCA--C-CTA-------TT---tg
gi|24                         :                                                                                                                                                                     gC---A-C-TC---AT----A-TATGG-A-GA-CG-TC-AC-C-A--T-----TG-CC-------------------------------A--TTT-AGGCC------T-G-----TG--CT---C-G-A-CG-C-T-TAAATATGCCT--TT--GA----GCAG---G---GAG---GGATC-TC-TA--T-C
gi|25                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  --T-C-TC--TT-CGA-AAT-G--A-AC---T------C-CCC--ATCT---GATT------TC-------TTCA-AC--TG--C-AAGCAA--GGGGTA-TA---GA-AGAGC---T-AC-T--CT--AT-C-C-AGGTTCCCAC
gi|26                         :                                                                                                                        -T--A-C-GTC---CC-A--TA-GG-AA--A-T-T-----T--T-TC---A-C-CT---AT----A-T--AG-T-GA-CG-TC-AT-C-A--agg
gi|27                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           ggctttaacg--T-C--G----G--T-CGTC-ATC---------G--A-CC-------------TC--ATTC---AGTAG--C-CTC-------TT---AA--GA--CAACGCAA--CGGA-A-TGC-C-G-AGACA---TAAT-T--AT-AAA-C-C-G--ATCCCACGactttaggagaagtaacacaggctttggtct
gi|28                         :                                                                                                                 T-----T-T--A-C-GTTTCACC-A-CTC--A-GATTA-T-A-----TA-T-TC---C-C-TC---AT----A-T--GG-ACGA-CG-TC-ACAC-A--TA----TG-CC----Gg
gi|29                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             tgattttgtatctgCC--ATTTT--AGTCG--C-TTT-------TT---AC--AC--C-A-GCCA--GGAG---TAC-TGG-GGGAC---T-AT-T--CTAAAC-T-C-TAATCTCCA
gi|3                          :                                                                     gagggaacggTTGATT-A--AT-------T-A-T-----T--GTT-----T-T--A-C-GTC---CC-A-CTC-TA-GA--A-T-A-----T--T-TC---A-C-TC---AT----G-T--GG-A-GA-CG-TC-AA-C-A--T-----TG-CC----GGT--GA-AG-G-GCT--GC-A-A---A--TTT-ACACC------T-G-----TG--CT---C-G-G-CA-C-T-CGTG---GCCT--TT--AA----GCAG---G---GAG---GAATC-TT-TA--T-CG-TGCCAC-----ATCGTGCCA-CAC--CTG-CT-GT-----G---ACACGGG-G---C-CTC----G-GTTT----TT--T-C--G----G--T-C-TC-ATC-CGA-AT--G--A-CC---G------C-CCC--ATTC---AGTCG--C-CTC-------TT---AC--GA--C-ACGCAA--GGGG-A-TGC-TGG-GGACC---T-A--T--CC-AAC-C-C-GGAACCCCGCG
gi|30                         :                                                                                           -------T-A-T-----TC-GTA-----T-T--A-C-GTC---CC-T-CTT-GA--A--A-T-AA----T--TGTT---A-C-TC---AT----A-T--GG-A-CG-CG-TC-AT-C-A--
gi|32                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  atgttaTCT--C-TTC-------TT---AC--GA--CTAAGTAA--GGGG---TAC-CTG-AGACC---T-AT-TACCC-AACGA-C-GGATCCCCatctagtaaaa
gi|33                         :                                                                                                                                                                                     ----A-T--GG-A-GA-CG-TC-AC-C-AT-T-----TGCCC----GGT--GA-TG-G-GCT--GC-A-A---A--gaggggt
gi|34                         :                                                                                                                                                     aacgaagtatctttc-TC---A-C-TC---AA----A-T--TG-A-GA-CG-TC-AC-C-A--T-----TG-CT----GGC--GA-AA-G-GCT--GT-A-A---A--TTT-A
gi|35                         :                                                                                 GAAT-G--AT-------TGA-T-----T--GTT-----T-T--G-C-GTC---C--G-CTC-GA-GA--A-T-T-----T--T-TC---A-C-TC---AT----A-T--
gi|36                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              -CTT-------TT---AC--GA--G-AAGCAA--GGGG---CAC-TGA-GAACT---T-AC-T--CT-AAC-C-C-a
gi|37                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          GCAT--GGGG---TAC-TGT-GAACC---T-AT-T--CT-AAC-T-C-AGATCCCCATGacggg
gi|38                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        aaGCAA--TGGG---TAC-CGC-GGACC---T-AT-T--CT-AAC-CGC-GGATCTCCAg
gi|39                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  aa--C-AAGCAA--GGAG---TAC-TGG-GGACC---T-AT-T--CT-AAC-T-C-TAATCCTCg
gi|4                          :                                                                               TTGATT-----T-------T-A-C-----T--GTT-----T-T--A-C-GTC---C--A-CTC-GA-GA--A-A-ACGAAAT--T-CC---G-C-TC---AT----A-T--GA-A----CG-TC-AC-CTA--T-----TG-CCC---GGT--GA-AG-G-GCT--GC-A-A---A--ATT-AGGCC------T-A-----TG--CTTCGT-G-G-TG-CAT-CAGG---GCCC--TTTGGA----GCAG---G---GAG---GGATC-TT-----T-CG-TG----------------CA-CAT--CTG-CT-GT-----G---ACACGGG-A---C-CCC----G-GTTTTTTATT--T-C--G----T--C-C-TC-AT--CGA-A---G--A-CC---G------C-CCC--ATTT---A-TCGCTC-CTC-------TT---AC--GA--C-AC-CAA--GGGG-A-TGC-TGG-GGACC---T-AT-T--CT-AAC-C-C-GGA--CCCACG
gi|40                         :                                                                                                      a-----T--GTT-----T-TTCA-C-GTC---CT-T-CTT-GA-GA--A-C-A-----T--T-TC---A-C-TC---AT----A-T--G
gi|41                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            a--ATTT---AGTCG--A-CTC-------TT---AC--GA--C-AAGCAA---GGG-A-TAC-T
gi|5                          :                                                                                     -A--GT-------T-A-T-----TT-GTT-----T-T--A-C-GTCTC-CC-A-CGG-AG-GA--A-A-A-----TCAT-TC---A-C-TTCA-AT----A-C--GG-A-GA--G-TC-AC-C-AGTT-----TG-TCCTCAAGT--GA-AGTGTGCT--GCTA-G---A--TTG-AGGACA-----T-AA----TG--CTAT-CAG-G-CA-C-T-CAGG---GCCTATTT--GA----GCAG---G---ATG---GAATC-TT-TAATC-CG-T--------------TGCCA-CAC--CTAACT-GT-----GTTGACACGGA-----C-CTC----GAGTTT----TTGCT-T--A----G--T-C-TC-ATC-CGATT---G--A--C---G------C-CTC--ATTC---AGTCG--CTCTCTAGATCTTT---ACGTGA--C-ACGaa
gi|6                          :                                                                               ttagaT-G--AT-------T-A-T-----T--TGT-----T-T--A-C-GTC---CC-A-CTC-GA-GA--A-T-A-----T--T-TC---A-C-TC---AT----A-T--GG-A-G--CG-TC-GC-C-A--T-----TGCCC----GGT--GA-AG-G-GCT--GCAA-A---A--TTT-AGGCC------T-A-----TG--C----C-G-G-CG-C-C---AG---GCA---TT--GA----GCAG---GTT-AAGGCCGGATC-TT-T--------------------TCGTGCAA-CAC--CTGCCT-GT-----G---ACACACG-G---TGCTC----GAGTTT----TC--C-C--G----G------TC-AT--CGA-AAATG--A-CC---G------C-CCC--A-TT---AGTCG--C-CTC-------TT---AC--GA--C-ACGCAAG-GGGG-A-TGC-TGATAGGCC---T-AT-T--CTAAAC-C-C-GGA-CCACACGaacgg
gi|7                          :                                                                                TGATT-G--AT-------T-A-TCTTAAT--GTT-----T-T--A-C-GTC---GC-A-CTC-GA-GA--A-T-A-----T--T-TC---A-C-TC---AT----A-T--AG-A-GAACG-TC-AC-C-A--T-----TG-CC----GAT--GA-AG-G---T--GC-AGA---A--ATT-AGGCC------TTA-----TG--CT---T-G-G-CA-C-T-C-AG---GCCT--TT--GA----GCAG---G---GAG---AGATC-TT-T---T-C---------------CGTGCCA-CAC--CTG-CT-GT-----G---ACACGGGCG---C-CTC----G-GT-------------------------C-TC-ATC-CGA-AT--G--A-CC---G------C-ACC--TTTC---AGTCG--C-CTC-------TC---AC--GA--C-ACACAA--GGGG-A-TGC-CGG-GGACC---T-AT-T--CT-AAC-T-C-GGA-CCCCACG
gi|8                          :                                                                               TTGATTGA--ATGTGTTGAT-A-T-----T--GTT-----T-A--A-C-GTT---CTTG-CTTTGA-GA----T-------T--T-TC---A-C-TA---TT----A-T--GGGA-GA-CG--C-AA-C-A--T-----TG-------GGT--GG-AA-G-GTT--GC-A-A---T--TTT-CGGC-------T-A-----TC--CT---C-G-G-CG-T-T-TATGC--GTC---TT--GA----G--------------------------A--T-CG-GACCACCTG--ATTGTG--A-CAG--CGG-C--GTCCTCCG---ATTTGGG-G---A-TT--------TTT----TT--T-C--A----G--A-C-TC-ATC--------------------------C-CCC--ATGT---AGTCG----CTC-------TTA--AC--GA----AT-CAA--GCTG-AGTAC-T-G-AGACA---T-AT-T--TC-AAC-T-CAGGATCCg
gi|9                          :                                                                            ttgaTGATT-A--TT-------T-A-C-----T--GTT-----T-T--A-C-GTC---C--A-CTC-GA-GA--A-T-A-----T--T-TC---GGC-TC---ATT---A-T--GG-A-GA-CG-TC-AC-C----T-----TG-CCC---GGT--GACAG-G-GCT--GA-A-AT--A--TTT-AGGC-------T-A-----TG--CT---C-G-GACG-C----AGG---GCCT--TT--GA----GCAG---G---GA----GGATC-TT-TT--T-TC-TG-CAC-----AT--------------TG-CT-GT-----G-----ACGGG-A---C-CTC----G-GTTT----TT--T-C--G----G--T-C-TC-AAT-TGA-T---G--A-C-----------C-CCC--ATTT----GTCG--C-CGT-------T-----C--G---C-ACGCAA---GGG-A-TGC-TTG-GGA-C---T-ATGT--CTAAAG-C-C-GGACCCCCaaca

Unaligned ( gi|31 ): ATAAAGATTGTTCAAATCGACGACATGTCGACTTCTTTATATCGACATAGAGAACAGGGGATGCT
Unaligned ( gi|42 ): GACAAGCAAGAAGAGAGAGGGCCTATTCTAACCC

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Reference ( family-350 )      :                                                                               TTGATT-A--AT-------T-A-T-----T--GTT-----T-T--A-C-GTC---CC-A-CTC-GA-GA--A-T-A-----T--T-TC---A-C-TC---AT----A-T--GG-A-GA-CG-TC-AC-C-A--T-----TG-CC----GGT--GA-AG-G-GCT--GC-A-A---A--TTT-AGGCC------T-A-----TG--CT---C-G-G-CG-C-T-CGNG---GCCT--TT--GA----GCAG---G---GAG---GGATC-TT-TA--T-CG-TGCCAC-----ATCGTGCCA-CAC--CTG-CT-GT-----G---ACACGGG-G---C-CTC----G-GTTT----TT--T-C--G----G--T-C-TC-ATC-CGA-A---G--A-CC---G------C-CCC--ATTT---AGTCG--C-CTCTT---AC-GA--C-ANGCAA--GGGG-A-TGC-TGG-GGACC---T-AT-T--CT-AAC-C-C-GGATCCCCACG
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gi|20                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   aaCAGGGG-G---C-CCCCTCAA-GTTT----T--------G----G--T-C-TA-A-C-CAA-A---G--G-CT---GAAAGGAC-TGCTAATTT---ATTCG--C-TCATT---AC-GA--T-AA--AA--AGAA-G-TAC-TGA-GAACC---T-AT-T--CT-TAG-C-C--GAT-TCCACG
gi|21                         :                                                                                                                                                                                     ----A-T--GG-A-GA-CGGTCTAC-C-A--T------G-------AGT--GA-AA----CT--GC-A-AGAAA--TTA-AGTCT------T-T-----TG--CT---T-GCG-CG-C-T-TATG---GCTT--TTTTGA----GCAG--------AA---GGATC-TT-T---T-CGATGTTAC-----ATCCTGCggtgcca
gi|22                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 G---ACCT--TT--GA----GCAT---G---GAG---GGATC-TT-TA--G-CG-TGCCAC-----ACC-TGCt
gi|23                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    tcgccgaggattgccgaattgtannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnTCGTTTCAACGT--CTG-TC-GT-----G---ACACGGG-G---C-ATC----A-GTAT----TT--T-T--AAAATG--T-C-TC-ATTGCAA-A---G--ACCC---G------CGACC--ACTC---AGTCA--C-CTATT---tg
gi|24                         :                                                                                                                                                                     gC---A-C-TC---AT----A-TATGG-A-GA-CG-TC-AC-C-A--T-----TG-CC-------------------------------A--TTT-AGGCC------T-G-----TG--CT---C-G-A-CG-C-T-TAAATATGCCT--TT--GA----GCAG---G---GAG---GGATC-TC-TA--T-C
gi|25                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  --T-C-TC--TT-CGA-AAT-G--A-AC---T------C-CCC--ATCT---GATT------TCTTCA-AC-TG--C-AAGCAA--GGGGTA-TA---GA-AGAGC---T-AC-T--CT--AT-C-C-AGGTTCCCAC
gi|26                         :                                                                                                                        -T--A-C-GTC---CC-A--TA-GG-AA--A-T-T-----T--T-TC---A-C-CT---AT----A-T--AG-T-GA-CG-TC-AT-C-A--agg
gi|27                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           ggctttaacg--T-C--G----G--T-CGTC-ATC---------G--A-CC-------------TC--ATTC---AGTAG--C-CTCTT---AA-GA--CAACGCAA--CGGA-A-TGC-C-G-AGACA---TAAT-T--AT-AAA-C-C--GAT-CCCACGactttaggagaagtaacacaggctttggtct
gi|28                         :                                                                                                                 T-----T-T--A-C-GTTTCACC-A-CTC--A-GATTA-T-A-----TA-T-TC---C-C-TC---AT----A-T--GG-ACGA-CG-TC-ACAC-A--TA----TG-CC----Gg
gi|29                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             tgattttgtatctgCC--ATTTT--AGTCG--C-TTTTT---AC--A--C-CAGCCA--GGAG---TAC-TGG-GGGAC---T-AT-T--CTAAAC-T-C-TAATCTCCA
gi|3                          :                                                                     gagggaacggTTGATT-A--AT-------T-A-T-----T--GTT-----T-T--A-C-GTC---CC-A-CTC-TA-GA--A-T-A-----T--T-TC---A-C-TC---AT----G-T--GG-A-GA-CG-TC-AA-C-A--T-----TG-CC----GGT--GA-AG-G-GCT--GC-A-A---A--TTT-ACACC------T-G-----TG--CT---C-G-G-CA-C-T-CGTG---GCCT--TT--AA----GCAG---G---GAG---GAATC-TT-TA--T-CG-TGCCAC-----ATCGTGCCA-CAC--CTG-CT-GT-----G---ACACGGG-G---C-CTC----G-GTTT----TT--T-C--G----G--T-C-TC-ATC-CGA-AT--G--A-CC---G------C-CCC--ATTC---AGTCG--C-CTCTT---AC-GA--C-ACGCAA--GGGG-A-TGC-TGG-GGACC---T-A--T--CC-AAC-C-C-GGAACCCCGCG
gi|30                         :                                                                                           -------T-A-T-----TC-GTA-----T-T--A-C-GTC---CC-T-CTT-GA--A--A-T-AA----T--TGTT---A-C-TC---AT----A-T--GG-A-CG-CG-TC-AT-C-A--
gi|32                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  atgttaTCT--C-TTCTT---AC-GA--CTAAGTAA--GGGG---TAC-CTG-AGACC---T-AT-TACCC-AACGA-C-GGATCCCCatctagtaaaa
gi|33                         :                                                                                                                                                                                     ----A-T--GG-A-GA-CG-TC-AC-C-AT-T-----TGCCC----GGT--GA-TG-G-GCT--GC-A-A---A--gaggggt
gi|34                         :                                                                                                                                                     aacgaagtatctttc-TC---A-C-TC---AA----A-T--TG-A-GA-CG-TC-AC-C-A--T-----TG-CT----GGC--GA-AA-G-GCT--GT-A-A---A--TTT-A
gi|35                         :                                                                                 GAAT-G--AT-------TGA-T-----T--GTT-----T-T--G-C-GTC---C--G-CTC-GA-GA--A-T-T-----T--T-TC---A-C-TC---AT----A-T--
gi|36                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              -CTTTT---AC-GA--G-AAGCAA--GGGG---CAC-TGA-GAACT---T-AC-T--CT-AAC-C-C-a
gi|37                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               -AAGCAT--GGGG---TAC-TGT-GAACC---T-AT-T--CT-AAC-T-C-AGATCCCCATGacggg
gi|38                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               -AAGCAA--TGGG---TAC-CGC-GGACC---T-AT-T--CT-AAC-CGC-GGATCTCCAg
gi|39                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            --C-AAGCAA--GGAG---TAC-TGG-GGACC---T-AT-T--CT-AAC-T-C-TAATCCTCg
gi|4                          :                                                                               TTGATT-----T-------T-A-C-----T--GTT-----T-T--A-C-GTC---C--A-CTC-GA-GA--A-A-ACGAAAT--T-CC---G-C-TC---AT----A-T--GA-A----CG-TC-AC-CTA--T-----TG-CCC---GGT--GA-AG-G-GCT--GC-A-A---A--ATT-AGGCC------T-A-----TG--CTTCGT-G-G-TG-CAT-CAGG---GCCC--TTTGGA----GCAG---G---GAG---GGATC-TT-----T-CG-TG----------------CA-CAT--CTG-CT-GT-----G---ACACGGG-A---C-CCC----G-GTTTTTTATT--T-C--G----T--C-C-TC-AT--CGA-A---G--A-CC---G------C-CCC--ATTT---A-TCGCTC-CTCTT---AC-GA--C-AC-CAA--GGGG-A-TGC-TGG-GGACC---T-AT-T--CT-AAC-C-C-GGA--CCCACG
gi|40                         :                                                                                                      a-----T--GTT-----T-TTCA-C-GTC---CT-T-CTT-GA-GA--A-C-A-----T--T-TC---A-C-TC---AT----A-T--G
gi|41                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            a--ATTT---AGTCG--A-CTCTT---AC-GA--C-AAGCAA---GGG-A-TAC-T
gi|42                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         -GA--C-AAGCAA--GAAG-A-GA---GA-GGGCC---T-AT-T--CT-AAC-C-C-aa
gi|5                          :                                                                                     -A--GT-------T-A-T-----TT-GTT-----T-T--A-C-GTCTC-CC-A-CGG-AG-GA--A-A-A-----TCAT-TC---A-C-TTCA-AT----A-C--GG-A-GA--G-TC-AC-C-AGTT-----TG-TCCTCAAGT--GA-AGTGTGCT--GCTA-G---A--TTG-AGGACA-----T-AA----TG--CTAT-CAG-G-CA-C-T-CAGG---GCCTATTT--GA----GCAG---G---ATG---GAATC-TT-TAATC-CG-T--------------TGCCA-CAC--CTAACT-GT-----GTTGACACGGA-----C-CTC----GAGTTT----TTGCT-T--A----G--T-C-TC-ATC-CGATT---G--A--C---G------C-CTC--ATTC---AGTCG--CTCTCT
gi|6                          :                                                                               ttagaT-G--AT-------T-A-T-----T--TGT-----T-T--A-C-GTC---CC-A-CTC-GA-GA--A-T-A-----T--T-TC---A-C-TC---AT----A-T--GG-A-G--CG-TC-GC-C-A--T-----TGCCC----GGT--GA-AG-G-GCT--GCAA-A---A--TTT-AGGCC------T-A-----TG--C----C-G-G-CG-C-C---AG---GCA---TT--GA----GCAG---GTT-AAGGCCGGATC-TT-T--------------------TCGTGCAA-CAC--CTGCCT-GT-----G---ACACACG-G---TGCTC----GAGTTT----TC--C-C--G----G------TC-AT--CGA-AAATG--A-CC---G------C-CCC--A-TT---AGTCG--C-CTCTT---AC-GA--C-ACGCAAG-GGGG-A-TGC-TGATAGGCC---T-AT-T--CTAAAC-C-C-GGA-CCACACGagatctttacgtgacacgaacgg
gi|7                          :                                                                                TGATT-G--AT-------T-A-TCTTAAT--GTT-----T-T--A-C-GTC---GC-A-CTC-GA-GA--A-T-A-----T--T-TC---A-C-TC---AT----A-T--AG-A-GAACG-TC-AC-C-A--T-----TG-CC----GAT--GA-AG-G---T--GC-AGA---A--ATT-AGGCC------TTA-----TG--CT---T-G-G-CA-C-T-C-AG---GCCT--TT--GA----GCAG---G---GAG---AGATC-TT-T---T-C---------------CGTGCCA-CAC--CTG-CT-GT-----G---ACACGGGCG---C-CTC----G-GT-------------------------C-TC-ATC-CGA-AT--G--A-CC---G------C-ACC--TTTC---AGTCG--C-CTCTC---AC-GA--C-ACACAA--GGGG-A-TGC-CGG-GGACC---T-AT-T--CT-AAC-T-C-GGA-CCCCACG
gi|8                          :                                                                               TTGATTGA--ATGTGTTGAT-A-T-----T--GTT-----T-A--A-C-GTT---CTTG-CTTTGA-GA----T-------T--T-TC---A-C-TA---TT----A-T--GGGA-GA-CG--C-AA-C-A--T-----TG-------GGT--GG-AA-G-GTT--GC-A-A---T--TTT-CGGC-------T-A-----TC--CT---C-G-G-CG-T-T-TATGC--GTC---TT--GA----G--------------------------A--T-CG-GACCACCTG--ATTGTG--A-CAG--CGG-C--GTCCTCCG---ATTTGGG-G---A-TT--------TTT----TT--T-C--A----G--A-C-TC-ATC--------------------------C-CCC--ATGT---AGTCG----CTCTTA--AC-GA----AT-CAA--GCTG-AGTAC-T-G-AGACA---T-AT-T--TC-AAC-T-CAGGATCCg
gi|9                          :                                                                            ttgaTGATT-A--TT-------T-A-C-----T--GTT-----T-T--A-C-GTC---C--A-CTC-GA-GA--A-T-A-----T--T-TC---GGC-TC---ATT---A-T--GG-A-GA-CG-TC-AC-C----T-----TG-CCC---GGT--GACAG-G-GCT--GA-A-AT--A--TTT-AGGC-------T-A-----TG--CT---C-G-GACG-C----AGG---GCCT--TT--GA----GCAG---G---GA----GGATC-TT-TT--T-TC-TG-CAC-----AT--------------TG-CT-GT-----G-----ACGGG-A---C-CTC----G-GTTT----TT--T-C--G----G--T-C-TC-AAT-TGA-T---G--A-C-----------C-CCC--ATTT----GTCG--C-CGTT-----C-G---C-ACGCAA---GGG-A-TGC-TTG-GGA-C---T-ATGT--CTAAAG-C-C-GGACCCCCaaca