lowQualScore : 1 33 11 111 11 111111 11 11 1111111111111111111 1 33333 11 2222 111111 3333333333333 1 222222 11111 22222 222 111 3333333333 111111111111 1 4444444444444444444444444 11 2222 11 111 111 22 111111 77777777777777777777777777777777777777777777777777 2222222222222222222 22222222222222 22222222222 1 11111 333333333333333 222 1
lowQualScore : 5 00 22 444 3 33 888888 0 00 2 88888 33 444 2 2 2 2 4 2 2 2 55 3333333333333333333 2 2 9 2 2 2 2 22 2 55 44444 55 2 2 33 11 0000 33333 33 33 88888888 333333 2 888 2 4 33 2 2 7777 8888 55 8888888888888 5 888 33 2 2 3 1 3 999999 2 2 22222 99999 2 5 2 2 2 777 8888 555 2 2 2 2 333 2 555 5555555555 77777 777777777777 2 2 2 5 1 9999999999999999999999999 6 66 9999 44 44 444 111 55 3 6 44 99 444444 44 3 3 88 55555555555555555555555555555555555555555555555555 3 2222222222222222222 3 3 11111111111111 44444444444 3 99 44 6 0 3 33333 222222222222222 3 444 6 0 5 6
lowQualScore : . .. .. ... . .. ...... . .. . ..... .. ... . . . . . . . . .. ................... . . . . . . . .. . .. ..... .. . . .. .. .... ..... .. .. ........ ...... . ... . . .. . . .... .... .. ............. . ... .. . . . . . ...... . . ..... ..... . . . . . ... .... ... . . . . ... . ... .......... ..... ............ . . . . . ......................... . .. .... .. .. ... ... .. . . .. .. ...... .. . . .. .................................................. . ................... . . .............. ........... . .. .. . . . ..... ............... . ... . . . .
lowQualScore : 0 00 00 000 0 00 666666 8 00 5 88888 44 111 4 4 2 1 2 1 1 1 00 5555555555555555555 1 1 8 1 7 1 1 99 1 00 55555 88 1 2 11 11 7777 99999 11 11 99999999 444444 4 888 4 7 22 4 5 8888 8888 99 6666666666666 3 111 77 7 9 9 0 1 666666 9 9 99999 55555 9 7 9 9 9 111 9999 000 9 9 9 9 999 9 000 4444444444 11111 666666666666 9 9 9 7 4 5555555555555555555555555 2 77 1111 22 77 666 555 00 1 2 22 22 555555 33 1 1 55 33333333333333333333333333333333333333333333333333 1 8888888888888888888 1 1 99999999999999 33333333333 3 22 66 7 0 3 55555 888888888888888 6 777 3 6 0 0
consensus : ATCAAAATTAAGAAATG---TACGAAAGCCC-AG---AA-GGCTCATTCGTA--AAAG-C-----C--AG---AAGG-C-T-CATTCG-A-C-A-T-T--C---NA---A----------A-T-TC-A-AAAT-CC-GA--A-A--TTC----GA--A-ATT-C--AAG-AT--T-C---G-AA--AT--CC-AAG--A-TTC--G--AGATTC-AA---T-A-TC--C-AA-A----T----CAG--CCA----ATC--A---AAATC-AAG--AA--TTC-ATA-CTTCAAATTTCCTCTGTAGTTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTATGAGG-AA--G-G-CGATT-C-C-----GTT----GTA-T-TT-TA-T-GG--AA--T-TA---C-TCCC-C-CTT-AAGAAA---T-TT---T----T--GA-TT-----ATG--TA-----A-AATA-AA-TA-C-A-TTTA---TCTT----TC-T----GT---AAG-ATAT-TTTCTGTA--NTTTTG--CCATGC---AA---GAAT-T-T-A--TAN-AATN-----CA-TAT-T-TA--TAT-A-AA--TC-TC-A-GG-AT-A--AAC-ATT---G-AC-A-G-C-A----T-AGGACAT----C-G---T----AG-T-ATT--T-ATAA-TG---ACT---A-------T-AA--AT--G-T-GTAA-CAAC-TT--TTTTATTTT----T-AT--TGA-AAG-TTTTT--NTTAATTAGGTCATGT
Reference ( gi|7 ) : ATCAACATGCAGGGATG---TATGAAAGCCG-AG---AA-GGCTCATTCGTA--AAAG-C-----C--AG---AAGG-C-T-CATTCG-A-C-A-T-T--C---TA---A----------A-T-TCAA-AAAT-CC-AA--A-A--TT-----GA--A-ATT-C--AAT-AT--G-C---G-AA--AT--CC-AAG--A-TTC--A--AGATTC-AA---T-A-TC--C-AA-A----T----CAG--CCA----A----A---AAATC-AAG--AA--TTC-ATA-CTTCACATTTCCTTTGTAGTTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTATGAGG-AA--G-T-CGATT-C-C-----GTT----ATA-T-TT-TA-T-G---AA--T-TA---C-TTCC-C-CTT-AAGAAA---T-TT---T----T--G--TT-----ATA--TA-----A-AATA-AA-TA-C-A-TTTA---TCTT----TC-T----G----AAG-ATAT-TTTCTGTA--AATTTG--CCAAGC---AA---GAA--T-T-A--TAA-AATT-----CA-TAT-T-TA--TAT---AA--T--TC---GG-GT-A--AAC-ATT---G-A--A-T-C-A----T-AGGATAC----C-G---T----AG-T-ATT--T-AT-A-TG---ACT---A-------T-AA--AT--G-T-GTAA-CAAC-TT--TTTTATTTT----T-AT--TG--AAG-TTTTT--GTTGATTAGGTAATAT
gi|6 : ATCAAAATTAAGAAATAAGATATGAAAG--G-AG---------TTA--CGTACGAAAG-C-----CC-AG---ATGG-C-T-CATTCGGA-C-A-T-TT-C---TA---A----------A-T-TTCA-AAAT-CCCAA--A-A--TTC----GA--A-ATT-C--AAT-AT--T-C---G-AA--AT--CC----------C--A--AGATTC-AA---TGA-TC--C-AATT----T----CAG--CCA----ATC--T---AAATC-AAAGCAA--TTC--TACCTTCAAAT
gi|3 : ATG---TACGAAACCCC-AGTACAA-GGCTCATTCGgtnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnagtagtatgattaaggaaagcgattccgttgttatgttttggaagtactccccttaaagaaattttctgatgctgtaataaatacaggtgttttcttggtaagatatttctgtattttgtcatgcaaaaatttattatatttactattctatataaaattctaggatataaacattgaaagcattaggaaaccgtagtatttaaatgactaatacatgtaaataagttaacaactttatttatattgaaagtttttaat
gi|5 : aatattcacttcggaatccggattgctttttctgaacatcttgattatgaaaaatacactaG---TACGAAAGCCC-AG---AAGGGCTCATTCGacacttcctaaatatcaacaaatccaaattcgaaattcaagattccaagaagtcctaattcgttaattcgaatatcaaatcgcacaatcaaaaaatccggaattccgactgatatcattgcgcaaaatctnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngtaattggtatagggaagcgatttcctgttgttctattttatggaattactctaagattttattcttgaataaaaaataacttcattatctgtcttatcaaagatatttcctttactaattaccatgcaaagagatatctaaaatcatacattatattaaattataggacaaacgattgatacccaagactagcacatgcgacgtagctactatatactataatctagtcaagacattttatttctaaatatatgatttcatgttcattcgct
gi|9 : c---TACGAAAGCCGCAG---AA-GGCTCATacatctcgaaattcaaaatcccaaagattcccgcgagtaattcaagctgattcgtggatttcaatttagtttcctaaatatttcagtctaacaaaatcaagtatatttctatttatctctaatagtannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncggacccattcccacccggagtgtctatgagataagcgattcctgcttggcgtattttacgtagaatgtactcccccttaagaaattttctgattatgcctagcaataaatacgatttactcgggctaaaatatttctgtatcttttgccagcaaagaatttatataatacatatttaatcagaatcaaagataaaatatagacagcataggacatggtagtattgatataatgacttcttaagcatgtggtaacaattttttacttctataatgaaagttttgaaatgatctgtc
gi|18 : ---TACGAAAGCTC-AG---AA-GGCTCATT--TA--AGAT-T-----C--AA---A---------ATCCG-A-G-A-T-C--C---GA---A----------A-T-CC-A-AGAC-CT-GA--A-A--TTC----GA--T-ATT-C--AAT-AT--C-C---A-AATCAT--CC-A----A-TTC--A--Acgacattctacatgattccaaaattcagttacttcgagaaattcgcaagatttcaaaatcccaagatgtgattcaataatccagatatcagccagatcaaatgagaacattcatacttcaaagtttannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatgagggatagcgattctgtgtatgtttatagaatactcccccttaagaaatgctttctgattatgtaaaataaatacattttaaactgtttcggtaaaatattcttgttacttttccttgcaatgaattttatataatacacatttatatcaaattctatagataaaaatttagaaatgcagtaggactggtaagtatttttatatttacttttaatgtgtaacaactttcttttatttttatattgaagtttt
gi|5 : gattagcttttcagactgataacgttaagcCGTACGAAAG-C-----CC-AG---AAGGGC-T-CATTCG-A-C-A-TCT--C---GA---A----------A-T-TCAA-AATC-CC-AA--AGA--TTCCCGCGAGTA-ATT-C--AA------G-C---T-GA--TT--CG-TGG--ATTTC--A----ATTT-AG---T-T-TC--CTAA-ATATTT----CAGT-CTA----AC---A---AAATC-AAG--------T-ATA-TTTC-TATTTtcgtatgaaacagcgtctattacaatccaagatttcgta
gi|2 : A--AAAG-C-----C--AG---AAGG-C-T-CATTCG-A-C-ATT-T--C---TA---A----------A-T-TC---AAGT-CC-AA--A-A--TTC----GA--A-ATT-C--AAG-ATTCT-C---A-AA--AC--C---AG--A-TT---G--TGATTC-AAT--T-A-TC--C-AA-A----T----CAG--CCAACTCA----A---AGATG-AAG---A--TTC-ATA-CTatctctaatagtannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncggacccattcccacccggagtgtctatgagataagcgattcctgcttggcgtattttacgtagaatgtactcccccttaagaaattttctgattatgcctagcaataaatacgatttactcgggctaaaatatttctgtatcttttgccagcaaagaatttatataatacatatttaatcagaatcaaagataaaatatagacagcataggacatggtagtattgatataatgacttcttaagcatgtggtaacaattttttacttctataatgaaagttttgaaatgatctgtc
gi|16 : attgtaatatcagacatattacttcttgagatgaattggcgaaatcagcattacatatctacgA--AAAA-C-----C--AG---AAGG-C-T-CATTCG-A-C-G-T-T--C---GA---A----------A-T-TC-A-AAAC-CC-GA--A-A--TTC----GA--A-ACC-C--AAG-AT--T-C---G-AA--AT--GC-GAG--A-TTC--G--TGATTC-AA---T----------A-A----T----C----------------A---AAATA-AGG--AA--TTC-ATA-CTTCAAATTTCCCCTGTActaaagttttannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntgaggaaagcgattccgtttgtattttatggaattacttccccttgagaaatttttttgacttatgtaaaatatgtacactttctcggtaaaatatttctgtctctttgccatgcagaatttataatattaaatataaataaacaagacggcataggaccaagttagtattccataatgactataaatgtgtaagcaacttttttattcatattgaaagtttttaaattattcggtcattataacctgtgccggcgccttaaacagaagcgtaatgtgcgaatggaatcctatacagaaaaccggaactggaagaggcggcagaacatctgtata
gi|12 : aagaatcatttctcaccggtcatgcagatttctgtcgtcaaacacatgcaagggtctgtacaaggtttaaagctcatgtgaaaatttgaaaaatagctgtaca--AAAG-C-----CC-AG---AAGG-C-T-CATTCG-A-C-A-T-T--C---TA---A----------A-T-TC-A-AAAT-CC-AA--A-A--TTC----GA--A-ATTCC--AAT-AT--T-C---GAAA--AT--CC-AAA-----TC--A--AGATTC-AA---T-A-TC--C-AA-AT---T----CAG--CCA----ATC--A---AAATC-AAG--AA--TTC-ATA-CTTCAATTTTCCTTTGTAGTT
gi|15 : cg--AAAGTC-----C--AG---AAGG-C-TTCATTCG-A-C-A-T-T--C---TA---A----------A-T-TC-A-AAAT-CC-AA--A-AATTC-----GA--A-ATT-C--AAT-AT----T---G-AA--AT--CC-AAGATA-TTC--A--AGATTC--A---T-A-T---C-AA-A----T----CAG--CCA----ATC--A---AAATC-AAG--AA--TTC-ATA-CTTCAaatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatgaggaagtcgattccgttgtattttatggaattacttccctttaaagaaatttttgattatataaaataatacatttat
gi|9 : aactacagaggaaatttgaagtattttgattggctgatttagatattgaatctcgaatattgtattttgaatcttggatttcgaatttcggattttgaacttttgaatgttcgaatgtttacg--AAAG-C-----CGCAG---AAGG-C-T-CAT-CG-A-C-A-T-T--C---TACATG----------A-T-TCCA-AAAT-TC-AGTTA-C--TTCGA--GA--A-ATT-CGCAAG-AT--TTC---A-AA--AT--CCCAAG--A-TGT------GATTC-AA---T-AATC--C-AG-A----TAT--CAG--CCA----G----ATC-AAAT--GAG--AACATTC-ATA-CTTCA
gi|23 : tacg--AAAG-C-----C--AG---AAGG-CCT-CATTCG-A-C-A-T-T--T---CT---A----------A-T-TC-A-AATT-CC-AA--A-A--TTC----GA--A-ATT-C--AAG-AT--T-C---G--A--AT--TC-AAG--AGTTT--G--TGATTC-AAG--T-A-TT--C-aagtttannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatgagggatagcgattctgtgtatgtttatagaatactcccccttaagaaatgctttctgattatgtaaaataaatacattttaaactgtttcggtaaaatattcttgttacttttccttgcaatgaattttatataatacacatttatatcaaattctatagataaaaatttagaaatgcagtaggactggtaagtatttttatatttacttttaatgtgtaacaactttcttttatttttatattgaagtttt
gi|18 : cg--AAAG-CT----C--AG---AAGG-C-T-CATTTA-A-G-A-T-T--C--------------------------A-AAAT-CC-GA--G-A--TCC----GA--A-ATC-C--AAG-AC--C-T---G-AA--AT--TC---G--A-T---------ATTC-AA---T-A-TC--C-AA-A----T----CAT--CCA----A----catgagtc
gi|19 : gattagcttttcagactgataacgttaagctacg--AAAG-CGCGCAC--AG---AAGG-C-T-CATT-G-A-CTA-T-T--CCGACG---A----------A-T-TCCC-AACTCCC-AA--A-A--CTTCGG-GAACA-ATT-C--AA--AT--T-C---G-AG--G------AGA--A-TTC--G--TGATTC-AACCCT-A-TCCAC-AA-A----T----CAGGCCCA----ATCAGG---AAATCAAAG--AA--TTCAATA-CTTttcaatcgtatgaaacagcgtctattacaatccaagatttcgta
gi|4 : tacgAAG-C-----CC-AG---AAGG-C-T-CNNNNN-N-N-N-N-N--N---NN---N----------N-N-NNNN-NNNN-NN-NN--N-N--NN-----NN--N-NNN-N--NNN-NN--N-N---N-NN--NN--NN-NNN--N-NNN--N--NNNNNN-NN---N-N-NC--C-AA-A----T----CAG--CCA----ATC--A---AAATC-AAG--AA--TTC-ATA-CTTCAAATTTCCTTTGTAGTTgcaaagttt
gi|8 : aaagaattctttcttcgattaagttgctgtgaattgtacatcagcaactcatcgggtgcactatttgtttatttcagaacttgaagaggttagggtacgg-C-----C--AG---AATG-T-T-CAGTAG-G-C-A-T-T--C---GA---A----------A-T-TCAT-AA-T-CC-GA--A-A--TTC----GA--A-ATT-C--AAG-AT---------------T--CC-AAG----TCC--G--AGAATC-AA---T-A-TC--C-AA-A----T----CAG--CCA----ATC--A---AAATA-AAG--AA--TTC-ATA-CTTCAAATTTCCTCTGTAnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntgaggaagtcgattccgttgtattttatggaattacttccccttaaggatttttgattatatgaaataaatgtatttatctttctttaagaatatttctgtaaatttgccaagctagaatttataaaatacatatttatattcaatctagggtaaacattgaaagcataggacatggtagtatttataatgactataaatgtgtaacaacttttcaatttttatattgaagttttttcttgatta
gi|3 : tgattgtttcaaagaacaggaaactgggtttattacggatgc-C-----C--AGTACAAGG-C-T-CATTCG-A-C-A-C-TTCC---TA---A----------A-TATCAACAAAT-CC-AA--A-T--TC-----GA--A-ATT-C--AAG-AT--T-CCAAG-AA--GT--CC-TA---A-TTC--GTTA-ATTCGAA---T-A-T---C-AA-A----TCGCACAA--TCA----A----A---AAATC-CGG--AA--TTC-nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntgaggaaagcgattgcgttgtattgtatggaattactacccctgaagtaattttctgattaagtaaaataaatacatttttctttctttaagaatatttctgtactgttgtcatgcaagaattcatagaatacacatttatatcaaatcttgcgtaaacattgaaagcatgacatatggtagtttttataatgactataaatgtgtaaaaacattttatattatattaatttttttaataaggtcattcaaagatttgtaaaaaa
gi|22 : aatattcacttcggaatccggattgctttttctgaacatcttgattatgaaaaatacactaatgtacgaaacc-C-----C--AG---ATGG-C-T-CATTCA-A-C-A-T-T--C---AG---G----------A-T-TC---------------------------GA--A-ATT-C--AAT-AT--cgactgatatcattgcgcaaaatctnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngtaattggtatagggaagcgatttcctgttgttctattttatggaattactctaagattttattcttgaataaaaaataacttcattatctgtcttatcaaagatatttcctttactaattaccatgcaaagagatatctaaaatcatacattatattaaattataggacaaacgattgatacccaagactagcacatgcgacgtagctactatatactataatctagtcaagacattttatttctaaatatatgatttcatgttcattcgct
gi|24 : tacgacagc-C-----C--AG---AAGG-C-T-CATTCG-A-C-A-T-T--C---GA---A----------A-T-TC-G-AAAT-CC-AA--G-AC-TC-----GA--A-ATccatatcatcgaatccaaataaaggattcatatttcgaatttcctctgtagt
gi|1 : cggaatctgtaaatgtatacttgcgattagt---AAGG-C-T-CATTCG-ATC-A-T-T--C---TA---ACATCAACACAA-T-CCAA-AAAT-CC-AA--A-A--AT-----AA--AGATT-C--A---------C---G-AA--ATTGCA-AAG--A-TTCTCG--TGATTT-CA---T-AATC--C-AA-A----T----CAG--CCA----ATCA-A---AAATCCAAG--AA--TTC-ATA-CTTCAgcgagcttca
gi|15 : tacgataacaagcagatc-CATTCG-AAC-A-T-T--C---AA---A----------AGT-TCAA-AA-T-CC-GA--A-A--TTC----GA--A-ATC-C--AAG-AT--T-C---A-AA--AT--AC-AAT--A-TTC--G--AGATTC-AA---T-A-TC--T-AA-A----T----CAG--CC---------------AATC-AAA----------ATA-CTTCAAATTTCCTCTGTAGTTagttcttannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntgaggaaaatgcgattccgttgtaattttatggacattaccttcccgcctaaggaatttatctcgattatgtgctaacaaataaagtacatctttctttctggtataaaatatttctgtacttttcacccatgctcaaggaagtttatatgtacatgtgtgtattaaaatctaggataaacatagacggcttaggacattgttacgagtattactaatacactataaatgctgtaacaactttttttattttcaatatgacaagttctttaattattccaggtcattatttactggccgggagttttaagcacaacgcgtatatgcgaaagagaagtaattaggttcaccggaacattggaaaaggcggagaacatctgcaata
gi|10 : G-A-C-A-T-T--CC--TA---A----------A-T-TC-A-AAAT-CC-AA--C-A--TTC----GA--A-CTT-C--AATGAT--T-C---G--A--AT--CC-AAG--A-TTC--A--AGA-TC-AA---T-A-TC--C--A-A----T----CAG--CCAAATCA----A---AAATC-AAGA-AA--TTC-ATA-CTtttacgaaagtccagaaggcttcattcgacattctaaattcaaaatccaaaaattcgaaattcaatattgaaatccaagatattcaagattcatatcaaatcagccaatcaaaatcaagaattcatacttca
gi|22 : -AT--T-C---A-AC--AT--TC-AGG--A-TTC--G--AAATTC-AA---T-A-TC--C-AT-A----T----CA---TCG----A----ATCCAAATA-AAG--GA--TTC-ATA-TTTCGAATTTCCTCTGTAGTcaaaattnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngtgaggaaagcgattccgttgtattttatggaattacttccttaagaaatattctgattctgtaaataaatacagttttctttgggtaagatatttctgtatttttgtcatgcaagaatttatatattttaacgcattttatataaaatcataggcataaaattgaagcaatagcacaccgtagtatttataatgactatagatgaagtacaactttttttttttttatatgaaaagtttttaatttatt
gi|5 : tacgacagcccagatggctcTATGAGATAA--G---CGATT-C-CT----GCTTGGCGTA-T-TT-TA-C-GTAGAA--TGTA---C-TCCC-C-CTT-AAGAAA---T-TT---TC---T--GA-TT-----ATGCCTA-----GCAATA-AA-TA-CGA-TTTAC--TCGG----GC-T---------AAA-ATA--TTTCTGTAT-CTTTTG--CC-AGCA--AA---GAAT-T-T-A--TAT-AATA-----CA-TAT-T-TAATCAG---AA-----TCAA-AG-ATAA--AAT-ATA---G-AC-A-G-C-A----T-AGGACAT----G-G---T----AG-T-ATTGAT-ATAA-TG---ACTTC-T-------T-AAGCAT--G-TGGTAA-CAA--TT--TTTTACTTC----T-ATAATG--AAA-GTTTT--G
gi|3 : cgtacgaaagcccagaagggctcattcgacatctcgaaattcaaaatcccaaagattcccgcgagtaattcaagctgattcgtggatttcaatttagtttcctaaatatttcagtctaacaaaatcaagtatatttctatttatctctaatagtannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncggacccattcccacccggagtgtcTATAGGG-AA--G---CGATT-T-CCTGTTGTT----CTA-T-TT-TA-T-GG--AA--T-TA---C-TC-------T-AAGA-------TT---T----T--A--TTCTTGAATA--AA-----A-AATA-AC-TT-C-A-TT-A---TCTG----TC-TTATCA----AAG-ATAT-TTCCTTTACTAA-TTA--CCATGCA--AA---GAG--A-T-ATCTAA-AA-T-----CA-TACAT-TA--TATTA-AA--TTATA---GG-AC-A--AACGATT---G-AT-ACC-C-AAGACT-AGCACATGCGAC-G---T----AGCT-A-C--T-AT-A-T----ACT---A-------T--A--AT--C-TAGTCA-AGAC--A--TTTTATTTC----T-Aaaatgatctgtc
gi|12 : aatattcacttcggaatccggattgctttttctgaacatcttgattatgaaaaatacactaatgtacgaaaccccagtacaaggctcattcgacacttcctaaatatcaacaaatccaaattcgaaattcaagattccaagaagtcctaattcgttaattcgaatatcaaatcgcacaatcaaaaaatccggaattccgactgatatcattgcgcaaaatctnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngtaattggATGAGG-AA--G-T-CGATT-C-C-----GTT----GTA-T-TT-TA-TGG---AA--T-TA---C-TTCC-C-TTTAAAGAAA---T-TT---T----T--GA-TT-----ATA--TA-----A-AAT--AA-TA-C-A-TTTA---Taatatatgatttcatgttcattcgct
gi|9 : cgaaagcccagaaggctcattcgacattctaaattcaaaatccaaaattcgaaattccaatattcgaaaatccaaatcaagattcaatatccaaattcagccaatcaaaatcaagaattcatacttcaattttcctttgtagttaatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnATGAGG-GATAG---CGATT-C-T-----GT-----GTA-TGTT-TA-T-A---GA--A-TA---C-TCCC-C-CTT-AAGAAATGCT-TT---C----T--GA-TT-----ATG--TA-----A-AATA-AA-TA-C-ATTTTAAACTGTT----TC-G----GT---AAA-ATAT-TCT-TGTT--ACTTTT--CCTTGC---AAT--GAATTT-T-A--TAT-AATA-----CA-CAT-T-TA--TATCA-AA--T--TCTATAG-AT-A--AAA-ATTTAGA-A--A-TGC-AG---T-AGG--AC----TGG---TA---AG-T-ATT--T-TT-A-TATTTACT---T-------T-TA--AT--G-T-GTAA-CAAC-TTTCTTTTATTTTTA--T-AT--TG--AAG-TTTT
gi|4 : tacgaaagccgcagaaggctcatcgacattctacatgattccaaaattcagttacttcgagaaattcgcaagatttcaaaatcccaagatgtgattcaataatccagatatcagccagatcaaatgagaacattcatacttcaaagtttannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnTGAGG-AA--G-T-CGATT-C-C-----GTT----GTA-T-TT-TA-T-GG--AA--T-TA---C-TTCC-C-CTT-AAG-GA---T-TT---T----T--GA-TT-----ATA--TG-----A-AATA-AA-TG-T-A-TTTA---TCTT----TCTT----T----AAGAATA--TTTCTGTA--AATTTG--CCAAGC---TA---GAAT-T-T-A--TAA-AATA-----CA-TAT-T-TA--TATTC-AA--TC-TA---GG-GT-A--AAC-ATT---GAA--A-G-C-A----T-AGGACAT----G-G---T----AG-T-ATT--T-ATAA-TG---ACT---A-------T-AA--AT--G-T-GTAA-CAAC-TT--TTCAATTTTTA--T-AT--TG--AAGTTTTTT--CTTGATTA
gi|8 : aaagaattctttcttcgattaagttgctgtgaattgtacatcagcaactcatcgggtgcactatttgtttatttcagaacttgaagaggttagggtacggaagcccagaaggctcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnccaaatcagccaatcaaaatcaagaattcatacttcaaatttcctttgtagttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnTGAGG-AA--A-G-CGATT-G-C-----GTT----GTA-T-TG-TA-T-GG--AA--T-TA---C-TACC-C-CTG-AAGTAA---T-TT---TC---T--GA-TT-----AAG--TA-----A-AATA-AA-TA-C-A-TTTT---TCTT----TC-T----TT---AAG-A-ATATTTCTGTA--CTGTTG--TCATGC---AA---GAA--T-TCA--TAG-AATA-----CA-CAT-T-TA--TATCA-AA--TC-TT---GC-GT-A--AAC-ATT---G-A--AAG-C-A----T-GACATAT----G-G---T----AG-T-TTT--T-AT-AATG---ACT---A-------T-AA--AT--G-T-GTAA-AAACATT--TTATA-TTA----T-AT--T----AA-TTTTT---TTAATAAGGTCAT
gi|10 : tgattgtttcaaagaacaggaaactgggtttattacggatgcccagaatgttcagtaggcattcgaaattcataatccgaaattcgaaattcaagattccaagtccgagaatcaatatccaaatcagccaatcaaaataaagaattcatacttcaaatttcctctgtannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnTGAGG-AA--A-G-CGATT-C-C-----GTT----GTA-T-TT-TA-T-GG--AA--T-TA---C-TTCC----TT-AAGAAA---TATT---C----T--GA-TT-----CTG--TA-----A-A-TA-AA-TA-C-A-GTTT---TCTT----TG-G----GT---AAG-ATA--TTTCTGTA--TTTTTG--TCATGC---AA---GAAT-T-T-A--TAT-ATTTTAACGCA-T-T-T-TA--TATAA-AA--TCATA---GGCAT-A--AA--ATT---G-A--A-G-CAA----T-AGCACAC----C-G---T----AG-T-ATT--T-ATAA-TG---ACT---A-------T-AG--AT--GAA-GT-A-CAACTTT--TTTTTTTTT----T-ATA-TGAAAAG-TTTTT--tcaaagatttgtaaaaaa
gi|2 : gacattcctaaattcaaaatccaacattcgaacttcaatgattcgaatccaagattcaagatcaatatccaatcagccaaatcaaaaatcaagaaattcatactcaaaattnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngTGAGG-AA--A-G-CGATT-C-C-----GTTT---GTA-T-TT-TA-T-GG--AA--T-TA---C-TTCC-C-CTT-GAGAAATT-T-TT---T----T--GACTT-----ATG--TA-----A-AATA-TG-TA-C-A-CTT------TC----TC-G----GT---AAA-ATA--TTTCTGTC--TCTTTG--CCATGC---AG---AAT--T-T-A--TAA-TATT-----AA--------A--TAT---AA-------------AT-A--AAC-A-A---G-AC-G-G-C-A----T-AGG--AC----C-AAGTT----AG-T-ATTC-C-ATAA-TG---ACT---A-------T-AA--AT--G-T-GTAAGCAAC-TT--TTTTATTCA----T-AT--TGA-AAG-TTTTTAAATT-ATTCGGTCATaatttatt
gi|6 : attgtaatatcagacatattacttcttgagatgaattggcgaaatcagcattacatatctacgaaaagccagaaggctcattcgacatttctaaattcaagtccaaaattcgaaattcaagattctcaaaaccagattgtgattcaattatccaaatcagccaactcaaagatgaagattcatactctaaagttttannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnTAAGG-AA--A-G-CGATT-C-C-----GTTGTT-ATG-T-TT-TG---G---AA--G-TA---C-TCCC-C-TTA-AAGAAA---T-TT---TCTGAT--G--CT-----GTA------------ATA-AA-TA-C-A-GGTG---TTTT----CT-T----GGT--AAG-ATAT-TT-CTGTA--T-TTTG--TCATGC---AA---AAA--T-TTA--TTA-TATT-----TACTAT-TCTA--TAT---AAAAT--TCTA-GG-AT-ATAAAC-ATT---G-A--AAG-C-A----TTAGGAAAC----C-G---T----AG-T-ATT--T-AA-A-TG---ACT---AATACATGT-AA--ATAAG-T--TAA-CAAC------TTTATTTA----T-AT--TGA-AAG-TTTTT--tataacctgtgccggcgccttaaacagaagcgtaatgtgcgaatggaatcctatacagaaaaccggaactggaagaggcggcagaacatctgtata
gi|1 : atcaaaattaagaaataagatatgaaaggagttacgtacgaaagcccagatggctcattcggacatttctaaatttcaaaatcccaaaattcgaaattcaatattcgaaatcccaagattcaatgatccaatttcagccaatctaaatcaaagcaattctaccttcaaatgtnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnagtagtatgatTGAGG-AA--AATGCGATT-C-C-----GTT----GTAAT-TT-TA-T-G---GACAT-TA---CCTTCC-CGCCT-AAGGAA---T-TTATCT----C--GA-TT-----ATG--TGCTAACA-AATA-AAGTA-C-A-TCTT---TCTT----TC-T----GGTATAAA-ATAT-TT-CTGTA--CTTTTCACCCATGCTCAAG---GAAGTT-T-A--TAT-G-TA-----CA-TGT-G-TG--TATTAAAA--TC-TA---GG-AT-A--AAC-ATA---G-AC-G-G-C-T----T-AGGACAT----T-G---TTACGAG-T-ATTACT-A--A-TAC--ACT---A-------T-AA--AT--GCT-GTAA-CAACTTT--TTTTATTTT----CAATA-TGACAAG-TTCT----TTAATTAaat
gi|11 : tacgataacaagcagatcaaggctcattcgatcattctaacatcaacacaatccaaaaatccaaaaataaagattcacgaaattgcaaagattctcgtgatttcataatccaaatcagccaatcaaaaatccaagaattcatacttcaagttcttannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnGAGG-AACAG-G-CGATTGCGC-----GTTTG--GTA-T-TTGTA-T-GG--AA--TGTAAAAC-TTCCGC-CTT-AGGAGA---T-TT---T----CTGG--TT-----ATCGTTA-----GTAATA-AG-TAAC-AATCTA---TTCTCGGGTC-T----GGAT-AAA-ATAT-TTTCTGGT--AATTTG--CATGGC---AAAGAGAG--T-T-T--TAATGATT-----TA-GAT-C-TG---------A----------GG-AT-AG-AAC-ATA---G-ACGG-G-C-AG---T-AGGACAT----T-G---TT---AG-TCATT--CCAT-AATGG--ACTTTTA-------TCAA--AT--G-T-GTAA-CAAC-TT--TTTTATTTTGCACT-A---TGAAAAG-TTTTTAAATCAATTCGGTCATGttccaggtcattatttactggccgggagttttaagcacaacgcgtatatgcgaaagagaagtaattaggttcaccggaacattggaaaaggcggagaacatctgcaata
gi|14 : -AA--G---CGATT-C-CT----GCTTGGCGTA-T-TT-TA-C-GTAGAA--TGTA---C-TCCC-C-CTT-AAGAAA---T-TT---TC---T--GA-TT-----ATGCCTA-----GCAATA-AA-TA-CGA-TTTAC--TCGG----GC-T---------AAA-ATA--TTTCTGTAT-CTTTTG--CC-AGCA--AA---GAAT-T-T-A--TAT-AATA-----CA-TAT-T-TAATCAG---AA-----TCAA-AG-ATAA--AAT-ATA---G-AC-A-G-C-A----T-AGGACAT----G-G---T----AG-T-ATTGAT-ATAA-TG---ACTTC-T-------T-AAGCAT--G-TGGTAA-CAA--TT--TTTTACTTC----T-ATAATGA-AAG-TTTatacttgggccggagttttgaaacataatgcgtatatgcgaacagggaatattaaaggtatccgggaacatggaagagggccggttgaacatctgtag
gi|20 : gat-AA--G---CGATT-C-C-----GTT----GTA-T-TC-TATT-T---AA--T-TA---C-CTCC-A-ATT-AAATAA---T-TT---TC---T--G--TA-----AAA--TA-----C-AATGTAC-TA-C-ATTTTA------T----TC-T----GT---AAGAATA--TGTCTGTA--TTTTTG--CCATGC---AA---GAA--TCT-A--TGT-AATG-----CA-CAT-T-TA--TAT---
gi|13 : -CGATT-C-T-----GT-----GTA-TGTT-TA-T-A---GA--A-TA---C-TCCC-C-CTT-AAGAAATGCT-TT---C----T--GA-TT-----ATG--TA-----A-AATA-AA-TA-C-ATTTTAAACTGTT----TC-G----GT---AAA-ATAT-TCT-TGTT--ACTTTT--CCTTGC---AAT--GAATTT-T-A--TAT-AATA-----CA-CAT-T-TA--TATCA-AA--T--TCTATAG-AT-A--AAA-ATTTAGA-A--A-TGC-AG---T-AGG--AC----TGG---TA---AG-T-ATT--T-TT-A-TATTTACT---T-------T-TA--AT--G-T-GTAA-CAAC-TTTCTTTTATTTTTA--T-AT--TG--AAG-TTTTT--CTTGtaa
gi|26 : atag---GG-GT-A--AAC-ATT---G-A--A-AAC-A----T-AGGACAT----G-A---T----AG-T-ATT--T-AT-A-TG---ATT---
3 sequences could not be aligned to this particular reference sequence:
Unaligned ( gi|17 ): AACATAAGGGATTCGTACTCCAAATTTTCTCTATAGTTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCG
Unaligned ( gi|21 ): GAAAGCATAGGAACATTGGTAGTATTTATAATGATACTAGATGTGGCTAAGAATCTTTTTTTTCTTTTTATAATTAAAAGTTATATTGAAGTTTTTCTTGGTTGTGTA
Unaligned ( gi|25 ): CGGCATGTGCGAAGGAAATATTTAAGGTACCAGAAAATGGAAGAGGCGGAGAACATC
Alignments
lowQualScore : 1111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111
lowQualScore : 222 22222222 111111111111111111111111111 11 3333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333 11111 1111 111 1 111111111111 11111111 111 111111 3333333333333 111 1111 11111111111111 11 11111 1111111 111111111 2222 11 111 222222222
lowQualScore : 333 1 44444444 777 66 3 666666666666666666666666666 2 2 2 4 2 2 2 44 66666 333 2 2 4 2 666 2 00 22 22 44 22 4444 9999 2 22 555 22 2 88888888888888888888888 22 3333 2 777 2 4 222 2 2 6666 33 33 55 2 2 4 55 22 2 33 333 55 33 2 2 2 4 9999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999 00000 2 2 99 7777 777 2 5 2 77 2 8 444 33 1 2 2 444 33 222 444 3 2 2 77 66666 99 2 2 2 5 8 2 555555555555 99999999 33 2 77 6 8 99 2 444 1 2 777 666 2 8 000000 4 2 2 5 1 5 3333333333333 66 2 888 777 111 2 2 6666 2 0 44444444444444 2 2 77 22 2 5 66666 2 77 5 8 3333333 2 111111111 2 2222 777 11 55 333 111111111
lowQualScore : ... . ........ ... .. . ........................... . . . . . . . .. ..... ... . . . . ... . .. .. .. .. .. .... .... . .. ... .. . ....................... .. .... . ... . . ... . . .... .. .. .. . . . .. .. . .. ... .. .. . . . . ........................................................................................................................................... ..... . . .. .... ... . . . .. . . ... .. . . . ... .. ... ... . . . .. ..... .. . . . . . . ............ ........ .. . .. . . .. . ... . . ... ... . . ...... . . . . . . ............. .. . ... ... ... . . .... . . .............. . . .. .. . . ..... . .. . . ....... . ......... . .... ... .. .. ... .........
lowQualScore : 000 7 33333333 888 11 6 666666666666666666666666666 1 1 0 0 0 0 0 88 55555 555 0 0 0 0 222 0 11 88 88 88 88 2222 8888 0 88 555 88 0 00000000000000000000000 99 3333 1 999 1 2 999 1 2 9999 11 11 33 2 2 4 00 99 2 11 777 33 11 2 4 5 4 0000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 77777 7 7 00 7777 333 7 3 7 33 7 0 777 77 4 7 7 777 77 000 777 3 7 7 33 77777 00 7 7 7 3 0 7 555555555555 66666666 99 9 22 1 6 55 9 000 7 9 999 444 9 6 999999 8 9 9 7 5 7 9999999999999 88 9 000 666 444 7 7 3333 7 8 77777777777777 7 7 33 77 7 3 00000 9 99 7 6 2222222 9 999999999 9 9999 999 55 44 333 000000000
consensus : ATCAAAATTT-NAGAAAT----G---TACGAA---AGCC--CAGAAGGCTCATTCGTA--AAAG-C-----C--AGAAGGC-T-CATTCG-A-C-A-T-T--C---N-A---AA-T-T-C-AA---AA-TCC-GA--A--A--T--T----CGA----AATT-C--AA---GAT--T-C---G-AA--AT--CC-AAG--A-TTC--G--AGATTC-AA---T-A-TC--C-AA-A----T--CAG--C--C-A-A-TC--A--AA-A--T-C-AAG--AA--TTC-ATA-CTT-CAAATTTCCTCT-GTAGTTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTATGAGGAA--A--GCGATT-C-C--GTT----GT---A-T-TT-TATG--GA-AT-TA---C--TCCC-CCTT-AAGA---AA--T---TT---T-TGA-TTAT-G--TA-----A--AATA-AA-TA-C-A-TT-TA---TCTT----TC-T--G---T--AAGA-TAT-TTTCTG-TAC-T-TTTG--CCATG-C---AA---GA-A-TTTATA-----TAATACA-TAT-T-TATA-TC-AAA--TCT-A-GG--ATA-AA-C-ATT--GANA-G-C-A----TAGGA-CAT----NG---T----AG-T-A--TT--T-ATAATG-ACT---A-T-AA--ATG-T-G-------TAA-CAA---C-TT--TTTTAT-TTT----T---AT--TGA-AAGTTTTT--NTTAATT-----A---GGTCATGT
Reference ( family-33 ) : ATCAAAATT--AAGAAAT----G---TACGAA---AGCC--CAGAAGGCTCATTCGTA--AAAG-C-----C--AGAAGGC-T-CATTCG-A-C-A-T-T--C---N-A---AA-T-T-C-AA---AA-TCC-GA--A--A--T--T----CGA----AATT-C--AA---GAT--T-C---G-AA--AT--CC-AAG--A-TTC--G--AGATTC-AA---T-A-TC--C-AA-A----T--CAG--C--C-A-A-TC--A--AA-A--T-C-AAG--AA--TTC-ATA-CTT-CAAATTTCCTCT-GTAGTTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTATGAGGAA--G--GCGATT-C-C--GTT----GT---A-T-TT-TATG--GA-AT-TA---C--TCCC-CCTT-AAGA---AA--T---TT---T-TGA-TTAT-G--TA-----A--AATA-AA-TA-C-A-TT-TA---TCTT----TC-T--G---T--AAGA-TAT-TTTCTG-TAN-T-TTTG--CCATG-C---AA---GA-A-TTTATA-----NAATNCA-TAT-T-TATA-T--AAA--TCTCA-GG--ATA-AA-C-ATT--GACA-G-C-A----TAGGA-CAT----CG---T----AG-T-A--TT--T-ATAATG-ACT---A-T-AA--ATG-T-G-------TAA-CAA---C-TT--TTTTAT-TTT----T---AT--TGA-AAGTTTTT--NTTAATT-----A---GGTCATGT
gi|1 : AAGGC-T-CATTCG-ATC-A-T-T--C---T-A---AC-A-T-C-AACACAA-TCC-AA--A--AA-T--C----CAA----AAAT-A--AA---GAT--T-CAC-G-AA--ATTGCA-AAG--A-TTCTCG--TGATTT-CA---T-AATC--C-AA-A----T--CAG--C--C-A-A-TC--A--AA-AATC-C-AAG--AA--TTC-ATA-CTT-CAAGTT
gi|1 : tacgataacaagcagatcTGAGGAA--AATGCGATT-C-C--GTT----GT---AAT-TT-TATG--GACAT-TA---CCTTCCC-GCCT-AAGG---AA--T---TTATCT-CGA-TTAT-G--TGCTAACA--AATA-AAGTA-C-A-TC-TT---TCTT----TC-T--GGTAT--AAAA-TAT-TT-CTG-TAC-T-TTTCACCCATG-CTCAAG---GA-AGTTTATA-----TG-TACA-TGT-G-TGTA-TTAAAA--TCT-A-GG--ATA-AA-C-ATA--GACG-G-C-T----TAGGA-CAT----TG---TTACGAG-T-A--TT--A-CTAATACACT---A-T-AA--ATGCT-G-------TAA-CAA---CTTT--TTTTAT-TTT----CA--ATA-TGACAAGTTCT----TTAATTATTCCA---GGTCATcttannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntgaggaaaatgcgattccgttgtaattttatggacattaccttcccgcctaaggaatttatctcgattatgtgctaacaaataaagtacatctttctttctggtataaaatatttctgtacttttcacccatgctcaaggaagtttatatgtacatgtgtgtattaaaatctaggataaacatagacggcttaggacattgttacgagtattactaatacactataaatgctgtaacaactttttttattttcaatatgacaagttctttaattattccaggtcattatttactggccgggagttttaagcacaacgcgtatatgcgaaagagaagtaattaggttcaccggaacattggaaaaggcggagaacatctgcaata
gi|10 : tacgataacaagcagatcaaggctcattcgatcattctaacatcaacacaatccaaaaatccaaaaataaagattcacgaaattgcaaagattctcgtgatttcataatccaaatcagccaatcaaaaatccaagaattcatacttcaagttcttannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnG-A-C-A-T-T--C---CTA---AA-T-T-C-AA---AA-TCC-AA--C--A--T--T----CGA----ACTT-C--AAT--GAT--T-C---G--A--AT--CC-AAG--A-TTC--A--AGA-TC-AA---T-A-TC--C--A-A----T--CAG--C--CAA-A-TCA-A--AA-A--T-C-AAGA-AA--TTC-ATA-CTC-AAAATTtatttactggccgggagttttaagcacaacgcgtatatgcgaaagagaagtaattaggttcaccggaacattggaaaaggcggagaacatctgcaata
gi|10 : TGAGGAA--A--GCGATT-C-C--GTT----GT---A-T-TT-TATG--GA-AT-TA---C--T--T-CCTT-AAGA---AA--TA--TT---C-TGA-TTCT-G--T------A--AATA-AA-TA-C-A-GT-TT---TCTT----TG-G--G---T--AAGA-TA--TTTCTG-TAT-T-TTTG--TCATG-C---AA---GA-A-TTTATATATTTTAACGCA-T-T-T-TATA-TA-AAA--TCATA-GGC-ATA-AA---ATT--GA-A-G-CAA----TAGCA-CAC----CG---T----AG-T-A--TT--T-ATAATG-ACT---A-T-AG--ATGAA-G-------T-A-CAA---C-TT--TTTTTT-TTTTTA-T---AT--GAA-AAGTTTTTA-ATTTATT-----nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngtgaggaaagcgattccgttgtattttatggaattacttccttaagaaatattctgattctgtaaataaatacagttttctttgggtaagatatttctgtatttttgtcatgcaagaatttatatattttaacgcattttatataaaatcataggcataaaattgaagcaatagcacaccgtagtatttataatgactatagatgaagtacaactttttttttttttatatgaaaagtttttaatttatt
gi|11 : gacattcctaaattcaaaatccaacattcgaacttcaatgattcgaatccaagattcaagatcaatatccaatcagccaaatcaaaaatcaagaaattcatactcaaaattnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngGAGGAACAG--GCGATTGCGC--GTTTG--GT---A-T-TTGTATG--GA-ATGTAAAAC--TTCCGCCTT-AGGA---GA--T---TT---TCTGG-TTATCG--TT-----AGTAATA-AG-TAAC-AATC-TA---TTCTCGGGTC-T--GGA-T--AAAA-TAT-TTTCTGGTAA-T-TT-G--C-ATGGC---AAAGAGA-G-TTT--------TAATG----AT-T-TA-------GA--TCTGA-GG--ATAGAA-C-ATA--GACG-GGC-AG---TAGGA-CAT----TG---TT---AG-TCA--TT--CCATAATGGACTTTTA-TCAA--ATG-T-G-------TAA-CAA---C-TT--TTTTAT-TTTGCACT---AT--GAA-AAGTTTTTAAATCAATT-----C---GGTCATGT
gi|12 : --AAAG-C-----CC-AGAAGGC-T-CATTCG-A-C-A-T-T--C---T-A---AA-T-T-C-AA---AA-TCC-AA--A--A--T--T----CGA----AATTCC--AA---TAT--T-C---GAAA--AT--CC-AAA-----TC--A--AGATTC-AA---T-A-TC--C-AA-AT---T--CAG--C--C-A-A-TC--A--AA-A--T-C-AAG--AA--TTC-ATA-CTT-CAATTTTCCTTT-GTAGTTatacttgggccggagttttgaaacataatgcgtatatgcgaacagggaatattaaaggtatccgggaacatggaagagggccggttgaacatctgtag
gi|12 : cgATGAGGAA--G--TCGATT-C-C--GTT----GT---A-T-TT-TATG--GA-AT-TA---C--TTCC-CTTTAAAGA---AA--T---TT---T-TGA-TTAT-A--TA-----A--AAT--AA-TA-C-A-TT-TA---Taatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatgaggaagtcgattccgttgtattttatggaattacttccctttaaagaaatttttgattatataaaataatacatttat
gi|13 : cgaaagcccagaaggctcattcgacattctaaattcaaaatccaaaattcgaaattccaatattcgaaaatccaaatcaagattcaatatccaaattcagccaatcaaaatcaagaattcatacttcaattttcctttgtagttaatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn--GCGATT-C-T--GT-----GT---A-TGTT-TATA--GA-AT--A---C--TCCC-CCTT-AAGA---AA--TGCTTT---C-TGA-TTAT-G--TA-----A--AATA-AA-TA-C-ATTT-TAAACTGTT----TC-G--G---T--AAAA-TAT-TCT-TGTTAC-T-TTT---CCTTG-C---AAT--GA-ATTTTATA-----TAATACA-CAT-T-TATA-TC-AAA--TTCTATAG--ATA-AA-A-ATTTAGAAATG-C-AG---TAGGA-C-T----GG---TA---AG-T-ATTTT--T-ATATTT-ACT---T-T-TA--ATG-T-G-------TAA-CAA---C-TTTCTTTTAT-TTTTA--T---AT--TG--AAGTTTTT--CTT
gi|14 : ataA--A--GCGATT-C-CT-GCTTGGCGT---A-T-TT-TACGTAGA-ATGTA---C--TCCC-CCTT-AAGA---AA--T---TT---TCTGA-TTAT-GCCTA-----GC-AATA-AA-TA-CGA-TT-TA---C-------TC-G--GGC-T--AAAA-TAT-TT-CTG-TATCT-TTTG--CCA-G-C---AAA--GA-A-TTTATA-----TAATACA-TAT-T-TA-A-TCAGAA--TC-AA-AG--ATA-AAAT-ATA--GACA-G-C-A----TAGGA-CAT----GG---T----AG-T-A--TTGAT-ATAATG-ACTTC-T-T-AAGCATG-TGG-------TAA-CAA-----TT--TTTTAC-TTC----T---ATAATGA-AAGTTTg
gi|15 : gatAATT--TAGAA-T----G---T-CGAATGAAGCCTTCTG--GACT--TTCGTA--AA----------------------CATTCG-AAC-A-T-T--C---A-A---AAGT-T-C-AA---AA-TCC-GA--A--A--T--T----CGA----AATC-C--AA---GAT--T-C---A-AA--AT--AC-AAT--A-TTC--G--AGATTC-AA---T-A-TC--T-AA-A----T--CAG--C--C-A-A-TC--A--AA---------------------ATA-CTT-CAAATTTCCTCT-GTAGTT
gi|15 : --AAAGTC-----C--AGAAGGC-TTCATTCG-A-C-A-T-T--C---T-A---AA-T-T-C-AA---AA-TCCAAA--A--A--T--T----CGA----AATT-C--AA---TAT--T-----G-AA--AT--CC-AAGATA-TTC--A--AGATTC--A---T-A-T---C-AA-A----T--CAG--C--C-A-A-TC--A--AA-A--T-C-AAG--AA--TTC-ATA-CTT-CAcaaaatccaaaaattcgaaattcaatattgaaatccaagatattcaagattcatatcaaatcagccaatcaaaatcaagaattcatacttca
gi|16 : aactacagaggaaatttgaagtattttgattggctgatttagatattgaatctcgaatattgtattttgaatcttggatttcgaatttcggattttgaacttttgaatgttcgaatgtttacgAAAATTT-GAAAAATAGCTG---TACAAA---AAAC--CAGAAGGCTCATTCG
gi|16 : aagaatcatttctcaccggtcatgcagatttctgtcgtcaaacacatgcaagggtctgtacaaggtttaaagctcatgtgA--AAAA-C-----C--AGAAGGC-T-CATTCG-A-C-G-T-T--C---G-A---AA-T-T-C-AA---AA-CCC-GA--A--A--T--T----CGA----AACC-C--AA---GAT--T-C---G-AA--AT--GC-GAG--A-TTC--G--TGATTC-AA---T------------------------------A-A-TC--A--AA-A--T-A-AGG--AA--TTC-ATA-CTT-CAAATTTCCCCT-GTAacgttcgaaattcaaaacccgaaattcgaaacccaagattcgaaatgcgagattcgtgattcaataatcaaaataaggaattcatacttcaaatttcccctgta
gi|17 : aagaatcatttctcaccggtcatgcagatttctgtcgtcaaacacatgcaagggtctgtacaaggtttaaagctcatgtgaaaatttgaaaaatagctgtaca--A--AC-A--T-A-AGG--GA--TTC-GTA-CTC-CAAATTTTCTCT-ATAGTT
gi|18 : ---TACGAA---AGCT--CAGAAGGCTCATT--TA--AGAT-T-----C--AAA--------ATCCG-A-G-A-T-C--C---G-A---AA-T-C-C-AA---GA-CCT-GA--A--A--T--T----CGA----TATT-C--AA---TAT--C-C---A-AATCAT--CC-A----A-TTC--A--A---TC--G---T-A-T-----GA-A----A--CAG--CGTC-T-A-TT--A--CA-A--TCC-AAG--AT--TTC-GTA-nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncg
gi|18 : gattagcttttcagactgataacgttaagc--AAAG-CT----C--AGAAGGC-T-CATTT-----------------A-A---GA-T-T-C-AA---AA-TCC-GA--G--A--T--C----CGA----AATC-C--AA---GAC--C-T---G-AA--------------A-TTC--G--ATATTC-AA---T-A-TC--C-AA-A----T--CAT--C--C-A-ATTC--A--A
gi|19 : gattagcttttcagactgataacgttaagctacg--AAAG-CGCGCAC--AGAAGGC-T-CATT-G-A-CTA-T-T--CCGAC-G---AA-T-TCC-CA---AC-TCC-CA--A--AACT--T----CGGGAACAATT-C--AA----AT--T-C---G-AG--G------AGA--A-TTC--G--TGATTC-AACCCT-A-TCCAC-AA-A----T--CAGGCC--C-A-A-TC--AGGAA-A--T-CAAAG--AA--TTCAATA-CTTGCAAAGTTtcgtatgaaacagcgtctattacaatccaagatttcgta
gi|2 : tacgA--AAAG-C-----C--AGAAGGC-T-CATTCG-A-C-ATT-T--C---T-A---AA-T-T-C--A---AG-TCC-AA--A--A--T--T----CGA----AATT-C--AA---GATTCT-C---A-AA--AC--C---AG--A-TT---G--TGATTC-AAT--T-A-TC--C-AA-A----T--CAG--C--C-A-ACTC--A--AAGA--T-G-AAG---A--TTC-ATA-CTC-TAAAGTTt
gi|2 : attgtaatatcagacatattacttcttgagatgaattggcgaaatcagcattacatatctacgTGAGGAA--A--GCGATT-C-C--GTTT---GT---A-T-TT-TATG--GA-AT-TA---C--TTCC-CCTT-GAGA---AATTT---TT---T-TGACTTAT-G--TA-----A--AATA-TG-TA-C-A-CT-T------TC----TC-G--G---T--AAAA-TA--TTTCTG-TCT-C-TTTG--CCATG-C----A---GA-A-TTTATA-----------A-TAT-TAAATA-T--AA-------------ATA-AA-C-A-A--GACG-G-C-A----TAGGA-C------CAAGTT----AG-T-A--TTC-C-ATAATG-ACT---A-T-AA--ATG-T-G-------TAAGCAA---C-TT--TTTTAT-TCA----T---AT--TGA-AAGTTTTT--A--AATT-----ATTCGGTCATttannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntgaggaaagcgattccgtttgtattttatggaattacttccccttgagaaatttttttgacttatgtaaaatatgtacactttctcggtaaaatatttctgtctctttgccatgcagaatttataatattaaatataaataaacaagacggcataggaccaagttagtattccataatgactataaatgtgtaagcaacttttttattcatattgaaagtttttaaattattcggtcattataacctgtgccggcgccttaaacagaagcgtaatgtgcgaatggaatcctatacagaaaaccggaactggaagaggcggcagaacatctgtata
gi|20 : attgtaatatcagacatattacttcttgagatgaattggcgaaatcagcattacatatctacgaaaagccagaaggctcattcgacatttctaaattcaagtccaaaattcgaaattcaagattctcaaaaccagattgtgattcaattatccaaatcagccaactcaaagatgaagattcatactctaaagttttannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnA--A--GCGATT-C-C--GTT----GT---A-T-TC-TATT--TA-AT-TA---C--CTCC-AATT-AAAT---AA--T---TT---T-C------T-G--TA-----A--AATACAA-TG-T-A-CTACA---TTTTAT--TC-T--G---T--AAGAATAT-GT-CTG-TAT-T-TTTG--CCATG-C---AA---GA-A-TCTATG-----TAATGCA-CAT-T-TATA-T--TAA--tataacctgtgccggcgccttaaacagaagcgtaatgtgcgaatggaatcctatacagaaaaccggaactggaagaggcggcagaacatctgtata
gi|21 : --GAAA-G-C-A----TAGGAACAT----TGG--T----AG-T-A--TT--T-ATAATG-A-T---ACT-AG--ATG-T-GGC-----TAA-GAATCTT-TT--TTTTCT-TTT----TATAAT--TAA-AAGTT
gi|22 : ---TACGAC---AGCC--CAGATGGCTCATTC--A--A-----------------------CATTCA-G-G-A-T-T--C---G-A---AA-T-T-C-AA---TA-TCC--A--T--A--TCAT----CG-----AATC-C--AA---atattgaagtttttcttggttgtgta
gi|22 : AT--T-C---A-AC--AT--TC-AGG--A-TTC--G--AAATTC-AA---T-A-TC--C-AT-A----T--CAT--C--G-A-A-TC--C--AA-A--T-A-AAG--GA--TTC-ATA-TTT-CGAATTTCCTCT-GTAGTataaaggattcatatttcgaatttcctctgtagt
gi|23 : tacgacagcccagatggctc--AAAG-C-----C--AGAAGGCCT-CATTCG-A-C-A-T-T--T---C-T---AA-T-T-C-AA---AT-TCC-AA--A--A--T--T----CGA----AATT-C--AA---GAT--T-C---G--A--AT--TC-AAG--AGTTT--G--TGATTC-AAG--T-A-TT--C-
gi|24 : cg-C-----C--AGAAGGC-T-CATTCG-A-C-A-T-T--C---G-A---AA-T-T-C-GA---AA-TCC-AA--G--A--C--T----CGA----AATG-C--GA---GCT--T-C---catgagtc
gi|26 : cggaatctgtaaatgtatacttgcgattagtA-GG--GTA-AA-C-ATT--GAAA-A-C-A----TAGGA-CAT----GA---T----AG-T-A--TT--T-AT-ATG-ATT---a
gi|3 : ctAAT----G---TACGAA---ACCC--CAG---------------------------T--ACAAGGC-T-CATTCG-A-C-A-C-TTCC---T-A---AA-TAT-C-AACA-AA-TCC--A--A--A--T--T----CGA----AATT-C--AA---GAT--T-CCAAG-AA--GT--CC-TA---A-TTC--GTTA-ATTCGAA---T-A-T---C-AA-A----T--C-G--CA-C-A-A-TCAAA--AA-A--T-C-CGG--AA--TTC-
gi|3 : aatattcacttcggaatccggattgctttttctgaacatcttgattatgaaaaatacactTATAGGGAA--G---CGATT-T-CCTGTT----GTTCTA-T-TT-TATG--GA-AT-TA---C--TC------T-AAGATTTTA--T---TC---T-TGA---AT-A--AA-----A--AATA-AC-TT-C-A--T-TA---TCTG----TCTT--A---TCAAAGA-TAT-TTCCTT-TAC-TAATTA--CCATG-CA--AA---GAGA-TATCTA-----AAAT-CA-TACAT-TATATT--AAA--TTATA-GG--ACA-AA-CGATT--GATACC-C-AAGACTAGCA-CATGCGACG---T----AGCT-A--CTA-T-AT-----ACT---A-T--A--ATC-TAG-------TCA-AGA---C--A--TTTTAT-TTC----T---Acgactgatatcattgcgcaaaatctnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngtaattggtatagggaagcgatttcctgttgttctattttatggaattactctaagattttattcttgaataaaaaataacttcattatctgtcttatcaaagatatttcctttactaattaccatgcaaagagatatctaaaatcatacattatattaaattataggacaaacgattgatacccaagactagcacatgcgacgtagctactatatactataatctagtcaagacattttatttctaaatatatgatttcatgttcattcgct
gi|4 : aatattcacttcggaatccggattgctttttctgaacatcttgattatgaaaaatacactaatgtacgaaaccccagtacaaggctcattcgacacttcctaaatatcaacaaatccaaattcgaaattcaagattccaagaagtcctaattcgttaattcgaatatcaaatcgcacaatcaaaaaatccggaattccgactgatatcattgcgcaaaatctnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngtaattggTCAGAACTTGAAGAGGTTAGGG---TACGGA---AGCC--CAGAAGGCTCaatatatgatttcatgttcattcgct
gi|4 : aaagaattctttcttcgattaagttgctgtgaattgtacatcagcaactcatcgggtgcactatttgtttattAAG-C-----CC-AGAAGGC-T-CNNNNN-N-N-N-N-N--N---N-N---NN-N-N-N-NN---NN-NNN-NN--N--N--N--N----NNN----NNNN-N--NN---NNN--N-N---N-NN--NN--NN-NNN--N-NNN--N--NNNNNN-NN---N-N-NC--C-AA-A----T--CAG--C--C-A-A-TC--A--AA-A--T-C-AAG--AA--TTC-ATA-CTT-CAAATTTCCTTT-GTAGTTnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnccaaatcagccaatcaaaatcaagaattcatacttcaaatttcctttgtagttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntgaggaagtcgattccgttgtattttatggaattacttccccttaaggatttttgattatatgaaataaatgtatttatctttctttaagaatatttctgtaaatttgccaagctagaatttataaaatacatatttatattcaatctagggtaaacattgaaagcataggacatggtagtatttataatgactataaatgtgtaacaacttttcaatttttatattgaagttttttcttgatta
gi|4 : aaagaattctttcttcgattaagttgctgtgaattgtacatcagcaactcatcgggtgcactatttgtttatttcagaacttgaagaggttagggtacggTGAGGAA--G--TCGATT-C-C--GTT----GT---A-T-TT-TATG--GA-AT-TA---C--TTCC-CCTT-AAGG---A---T---TT---T-TGA-TTAT-A--TG-----A--AATA-AA-TG-T-A-TT-TA---TCTT----TC-T--T---T--AAGA--ATATTTCTG-TAA-A-TTTG--CCAAG-C---TA---GA-A-TTTATA-----AAATACA-TAT-T-TATATT--CAA--TCT-A-GG--GTA-AA-C-ATT--GAAA-G-C-A----TAGGA-CAT----GG---T----AG-T-A--TT--T-ATAATG-ACT---A-T-AA--ATG-T-G-------TAA-CAA---C-TT--TTCAAT-TTTTA--T---AT--TGA-AGTTTTTT--CTTGATT-----A---nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntgaggaagtcgattccgttgtattttatggaattacttccccttaaggatttttgattatatgaaataaatgtatttatctttctttaagaatatttctgtaaatttgccaagctagaatttataaaatacatatttatattcaatctagggtaaacattgaaagcataggacatggtagtatttataatgactataaatgtgtaacaacttttcaatttttatattgaagttttttcttgatta
gi|5 : aaagaattctttcttcgattaagttgctgtgaattgtacatcagcaactcatcgggtgcactatttgtttatttcagaacttgaagaggttagggtacggaagcccagaaggctcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnccaaatcagccaatcaaaatcaagaattcatacttcaaatttcctttgtagttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn----G---TACGAA---AGCC--CAGAAG-------------------------------GGC-T-CATTCG-A-C-A-TCT--C---G-A---AA-T-T-C-AA---AA-TCC-CA--AAGA--T--TCCCGCGAGT--AATT-C--AAGCTGAT--T-C---G------T------GG--A-TTT--C--A-ATTT-AG---T-T-TC--CTAA-ATATTT--CAG--T--C-T-A-AC--A--AA-A--T-C-AAG--------T-ATA-TTT-CTATTTATCTCTAATAGT
gi|5 : cTATGAGATA--A--GCGATT-C-CT-GCTTGGCGT---A-T-TT-TACGTAGA-ATGTA---C--TCCC-CCTT-AAGA---AA--T---TT---TCTGA-TTAT-GCCTA-----GC-AATA-AA-TA-CGA-TT-TA---C-------TC-G--GGC-T--AAAA-TAT-TT-CTG-TATCT-TTTG--CCA-G-C---AAA--GA-A-TTTATA-----TAATACA-TAT-T-TA-A-TCAGAA--TC-AA-AG--ATA-AAAT-ATA--GACA-G-C-A----TAGGA-CAT----GG---T----AG-T-A--TTGAT-ATAATG-ACTTC-T-T-AAGCATG-TGG-------TAA-CAA-----TT--TTTTAC-TTC----T---ATAATGA-AAGTTTTannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncggacccattcccacccggagtgtctatgagataagcgattcctgcttggcgtattttacgtagaatgtactcccccttaagaaattttctgattatgcctagcaataaatacgatttactcgggctaaaatatttctgtatcttttgccagcaaagaatttatataatacatatttaatcagaatcaaagataaaatatagacagcataggacatggtagtattgatataatgacttcttaagcatgtggtaacaattttttacttctataatgaaagttttgaaatgatctgtc
gi|6 : cgtacgaaagcccagaagggctcattcgacatctcgaaattcaaaatcccaaagattcccgcgagtaattcaagctgattcgtggatttcaatttagtttcctaaatatttcagtctaacaaaatcaagtatatttctatttatctctaatagtannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncggacccattcccacccggagtgtcATCAAAATT--AAGAAAT----AAGATATGAA---AG-------GAG--TTA--CGTACGAAAG-C-----CC-AGATGGC-T-CATTCGGA-C-A-T-TT-C---T-A---AA-T-TTC-AA---AA-TCCCAA--A--A--T--T----CGA----AATT-C--AA---TAT--T-C---G-AA--AT--CC----------C--A--AGATTC-AA---TGA-TC--C-AATT----T--CAG--C--C-A-A-TC--T--AA-A--T-C-AAAGCAA--TTC--TACCTT-CAAATgaaatgatctgtc
gi|6 : TAAGGAA--A--GCGATT-C-C--GTT----GTT--A-T-GT-TTTG--GA-AG-TA---C--TCCC-CTTA-AAGA---AA--T---TT---TCTGA-TGCT-G--TA-----A----TA-AA-TA-C-A-GG-TG---T-TT----TC-TTGG---T--AAGA-TA--TTTCTG-TA--T-TTTG--TCATG-C---AA---AA-A-TTTATT-----ATATTTACTAT-TCTATA-T--AAAATTCT-A-GGATATA-AA-C-ATT--GAAA-G-C-AT---TAGGA-AAC----CG---T----AG-T-A--TT--T-A-AATG-ACTA--A-T-AC--ATG-T-AAATAAGTTAA-CAA---C------TTTAT-TTA----T---AT--TGA-AAGTTTTT--gtnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnagtagtatgattaaggaaagcgattccgttgttatgttttggaagtactccccttaaagaaattttctgatgctgtaataaatacaggtgttttcttggtaagatatttctgtattttgtcatgcaaaaatttattatatttactattctatataaaattctaggatataaacattgaaagcattaggaaaccgtagtatttaaatgactaatacatgtaaataagttaacaactttatttatattgaaagtttttaat
gi|7 : atcaaaattaagaaataagatatgaaaggagttacgtacgaaagcccagatggctcattcggacatttctaaatttcaaaatcccaaaattcgaaattcaatattcgaaatcccaagattcaatgatccaatttcagccaatctaaatcaaagcaattctaccttcaaatgtnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnagtagtatgatATCAACATG--CAGGGAT----G---TATGAA---AGCC--GAGAAGGCTCATTCGTA--AAAG-C-----C--AGAAGGC-T-CATTCG-A-C-A-T-T--C---T-A---AA-T-T-C-AA---AAATCC-AA--A--A--T--T-----GA----AATT-C--AA---TAT--G-C---G-AA--AT--CC-AAG--A-TTC--A--AGATTC-AA---T-A-TC--C-AA-A----T--CAG--C--C-A-A-----A--AA-A--T-C-AAG--AA--TTC-ATA-CTT-CACATTTCCTTT-GTAGTTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTATGAGGAA--G--TCGATT-C-C--GTT----AT---A-T-TT-TATG---A-AT-TA---C--TTCC-CCTT-AAGA---AA--T---TT---T-TG--TTAT-A--TA-----A--AATA-AA-TA-C-A-TT-TA---TCTT----TC-T--G------AAGA-TAT-TTTCTG-TAA-A-TTTG--CCAAG-C---AA---GA-A-TT-ATA-----AAATTCA-TAT-T-TATA-T--AAT--TC----GG--GTA-AA-C-ATT--GA-A-T-C-A----TAGGA-TAC----CG---T----AG-T-A--TT--T-ATA-TG-ACT---A-T-AA--ATG-T-G-------TAA-CAA---C-TT--TTTTAT-TTT----T---AT--TG--AAGTTTTT--GTTGATT-----A---GGTAATATaat
gi|8 : -C-----C--AGAATGT-T-CAGTAG-G-C-A-T-T--C---G-A---AA-T-T-C-AT---AA-TCC-GA--A--A--T--T----CGA----AATT-C--AA---GAT--T-C--------------C-AAG----TCC--G--AGAATC-AA---T-A-TC--C-AA-A----T--CAG--C--C-A-A-TC--A--AA-A--T-A-AAG--AA--TTC-ATA-CTT-CAAATTTCCTCT-GTA
gi|8 : tgattgtttcaaagaacaggaaactgggtttattacggatgcTGAGGAA--A--GCGATT-G-C--GTT----GT---A-T-TG-TATG--GA-AT-TA---C--TACC-CCTG-AAGT---AA--T---TT---TCTGA-TTAA-G--TA-----A--AATA-AA-TA-C-A-TT-TT---TCTT----TC-T--T---T--AAGA--ATATTTCTG-TAC-T-GTTG--TCATG-C---AA---GA-A-TTCATA-----GAATACA-CAT-T-TATA-TC-AAA--TCTT--GC--GTA-AA-C-ATT--GAAA-G-C-A----TGACA-TAT----GG---T----AG-T-T--TT--T-ATAATG-ACT---A-T-AA--ATG-T-G-------TAA-AAA---C--A--TTTTATATTA----T---AT--TAA-----TTTT--TTTAATA-----A---GGTCATnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntgaggaaagcgattgcgttgtattgtatggaattactacccctgaagtaattttctgattaagtaaaataaatacatttttctttctttaagaatatttctgtactgttgtcatgcaagaattcatagaatacacatttatatcaaatcttgcgtaaacattgaaagcatgacatatggtagtttttataatgactataaatgtgtaaaaacattttatattatattaatttttttaataaggtcattcaaagatttgtaaaaaa
gi|9 : tgattgtttcaaagaacaggaaactgggtttattacggatgcccagaatgttcagtaggcattcgaaattcataatccgaaattcgaaattcaagattccaagtccgagaatcaatatccaaatcagccaatcaaaataaagaattcatacttcaaatttcctctgtannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn--AAAG-C-----CGCAGAAGGC-T-CAT-CG-A-C-A-T-T--C---T-ACATGA-T-T-CCAA---AA-TTC-AGTTA--C--T--T----CGAGA--AATT-CGCAA---GAT--TTC---A-AA--AT--CCCAAG--A-T----G--TGATTC-AA---T-AATC--C-AG-A----TATCAG--C--C-AGA-TC--A--AA------T-GAG--AACATTC-ATA-CTT-CAAAGTTtcaaagatttgtaaaaaa
gi|9 : tacgATGAGGGAT-A--GCGATT-C-T--GT-----GT---A-TGTT-TATA--GA-AT--A---C--TCCC-CCTT-AAGA---AA--TGCTTT---C-TGA-TTAT-G--TA-----A--AATA-AA-TA-C-ATTT-TAAACTGTT----TC-G--G---T--AAAA-TAT-TCT-TGTTAC-T-TTT---CCTTG-C---AAT--GA-ATTTTATA-----TAATACA-CAT-T-TATA-TC-AAA--TTCTATAG--ATA-AA-A-ATTTAGAAATG-C-AG---TAGGA-C-T----GG---TA---AG-T-ATTTT--T-ATATTT-ACT---T-T-TA--ATG-T-G-------TAA-CAA---C-TTTCTTTTAT-TTTTA--T---AT--TG--AAGTTTTtannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatgagggatagcgattctgtgtatgtttatagaatactcccccttaagaaatgctttctgattatgtaaaataaatacattttaaactgtttcggtaaaatattcttgttacttttccttgcaatgaattttatataatacacatttatatcaaattctatagataaaaatttagaaatgcagtaggactggtaagtatttttatatttacttttaatgtgtaacaactttcttttatttttatattgaagtttt
1 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|25 ): CGGCATGTGCGAAGGAAATATTTAAGGTACCAGAAAATGGAAGAGGCGGAGAACATC
Alignments
lowQualScore : 1111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111
lowQualScore : 2222 11111111 333333333333333333333333333 11 3333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333 1111 111 111 1 111111111111 11111111 11 111 1111 1111 11 11111 1111111 111111111 2222 11 111 222222222
lowQualScore : 7777 3 55555555 888 66 55 000000000000000000000000000 2 2 2 4 2 2 2 44 66666 333 2 2 4 2 666 2 00 22 22 44 22 4444 9999 2 22 555 22 2 88888888888888888888888 22 3333 2 777 2 4 222 2 2 6666 33 33 55 2 2 4 55 22 2 33 333 55 33 2 2 2 4 9999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999 66 33 2 2 99 7777 000 5 2 77 2 8 444 33 1 2 2 444 33 222 444 3 2 2 77 66666 99 2 2 2 5 8 2 555555555555 99999999 33 2 00 2 8 88 2 444 1 66 666 33 5 2 77777 2 2 2 2 1 9999 9 5 2 5 66 5 2 2 777 888 2 2 6666 2 66666 5 3333 2 2 77 22 2 5 66666 2 77 5 8 3333333 2 111111111 2 2222 777 11 55 333 111111111
lowQualScore : .... . ........ ... .. .. ........................... . . . . . . . .. ..... ... . . . . ... . .. .. .. .. .. .... .... . .. ... .. . ....................... .. .... . ... . . ... . . .... .. .. .. . . . .. .. . .. ... .. .. . . . . ........................................................................................................................................... .. .. . . .. .... ... . . .. . . ... .. . . . ... .. ... ... . . . .. ..... .. . . . . . . ............ ........ .. . .. . . .. . ... . .. ... .. . . ..... . . . . . .... . . . . .. . . . ... ... . . .... . ..... . .... . . .. .. . . ..... . .. . . ....... . ......... . .... ... .. .. ... .........
lowQualScore : 2222 8 66666666 888 99 44 222222222222222222222222222 1 1 0 0 0 0 0 88 55555 555 0 0 0 0 222 0 11 88 88 88 88 2222 8888 0 88 555 88 0 00000000000000000000000 99 3333 1 999 1 2 999 1 2 9999 11 11 33 2 2 4 00 99 2 11 777 33 11 2 4 5 4 0000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 33 77 7 7 00 7777 000 3 7 33 7 0 777 77 4 7 7 777 77 000 777 3 7 7 33 77777 00 7 7 7 3 0 7 555555555555 66666666 99 9 77 6 6 11 9 000 7 88 444 99 7 9 11111 9 9 9 9 5 4444 2 7 9 7 88 7 9 9 666 222 7 7 3333 7 77777 3 7777 7 7 33 77 7 3 00000 9 99 7 6 2222222 9 999999999 9 9999 999 55 44 333 000000000
consensus : ATCAAAATTTNA-GAAAT----G---TACGAA---AGCC--CAGAAGGCTCATTCGTA--AAAG-C-----C--AGAAGGC-T-CATTCG-A-C-A-T-T--C---N-A---AA-T-T-C-AA---AA-TCC-GA--A--A--T--T----CGA----AATT-C--AA---GAT--T-C---G-AA--AT--CC-AAG--A-TTC--G--AGATTC-AA---T-A-TC--C-AA-A----T--CAG--C--C-A-A-TC--A--AA-A--T-C-AAG--AA--TTC-ATA-CTT-CAAATTTCCTCT-GTAGTTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTATGAGGAA--A--GCGATT-C-C--GTT----GT---AT-TT-TATG--GA-AT-TA---C--TCCC-CCTT-AAGA---AA--T---TT---T-TGA-TTAT-G--TA-----A--AATA-AA-TA-C-A-TT-TA---TCTT----TC-T--G---T--AAGA-TAT-TTTCTG-TA-CT-TTT--GCCATG--CAA---G--AA-TTTA-TA-----TA-ATA-CATAT-T-TATATC-A-AA-TC-T-A-GG--AT-A-AAC-ATT--GANA-G-C-A----TAGGA-CAT----NG-T----AG-T-A--TT--T-ATAATG-ACT---A-T-AA--ATG-T-G-------TAA-CAA---C-TT--TTTTAT-TTT----T---AT--TGA-AAGTTTTT--NTTAATT-----A---GGTCATGT
Reference ( family-33 ) : ATCAAAATTTNA-GAAAT----G---TACGAA---AGCC--CAGAAGGCTCATTCGTA--AAAG-C-----C--AGAAGGC-T-CATTCG-A-C-A-T-T--C---N-A---AA-T-T-C-AA---AA-TCC-GA--A--A--T--T----CGA----AATT-C--AA---GAT--T-C---G-AA--AT--CC-AAG--A-TTC--G--AGATTC-AA---T-A-TC--C-AA-A----T--CAG--C--C-A-A-TC--A--AA-A--T-C-AAG--AA--TTC-ATA-CTT-CAAATTTCCTCT-GTAGTTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTATGAGGAA--A--GCGATT-C-C--GTT----GT---AT-TT-TATG--GA-AT-TA---C--TCCC-CCTT-AAGA---AA--T---TT---T-TGA-TTAT-G--TA-----A--AATA-AA-TA-C-A-TT-TA---TCTT----TC-T--G---T--AAGA-TAT-TTTCTG-TA-CT-TTT--GCCATG--CAA---G--AA-TTTA-TA-----TA-ATA-CATAT-T-TATATC-A-AA-TC-T-A-GG--AT-A-AAC-ATT--GANA-G-C-A----TAGGA-CAT----NG-T----AG-T-A--TT--T-ATAATG-ACT---A-T-AA--ATG-T-G-------TAA-CAA---C-TT--TTTTAT-TTT----T---AT--TGA-AAGTTTTT--NTTAATT-----A---GGTCATGT
gi|1 : AAGGC-T-CATTCG-ATC-A-T-T--C---T-A---AC-A-T-C-AACACAA-TCC-AA--A--AA-T--C----CAA----AAAT-A--AA---GAT--T-CAC-G-AA--ATTGCA-AAG--A-TTCTCG--TGATTT-CA---T-AATC--C-AA-A----T--CAG--C--C-A-A-TC--A--AA-AATC-C-AAG--AA--TTC-ATA-CTT-CAAGTT
gi|1 : tacgataacaagcagatcTGAGGAA--AATGCGATT-C-C--GTT----GTA--AT-TT-TATG--GACAT-TA---CCTTCCC-GCCT-AAGG---AA--T---TTATCT-CGA-TTAT-G--TGCTAACA--AATA-AAGTA-C-A-TC-TT---TCTT----TC-T--GGTAT--AAAA-TA--TTTCTG-TA-CT-TTTCACCCATGCTCAA---GGAAG-TTTA-TA-----T--GTA-CATGT-G-TGTATTAA-AA-TC-T-A-GG--AT-A-AAC-ATA--GACG-G-C-T----TAGGA-CAT----TG-TTACGAG-T-A--TT--A-CTAATACACT---A-T-AA--ATGCT-G-------TAA-CAA---CTTT--TTTTAT-TTT----CA--ATA-TGACAAGTTCT----TTAATTATTCCA---GGTCATcttannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntgaggaaaatgcgattccgttgtaattttatggacattaccttcccgcctaaggaatttatctcgattatgtgctaacaaataaagtacatctttctttctggtataaaatatttctgtacttttcacccatgctcaaggaagtttatatgtacatgtgtgtattaaaatctaggataaacatagacggcttaggacattgttacgagtattactaatacactataaatgctgtaacaactttttttattttcaatatgacaagttctttaattattccaggtcattatttactggccgggagttttaagcacaacgcgtatatgcgaaagagaagtaattaggttcaccggaacattggaaaaggcggagaacatctgcaata
gi|10 : tacgataacaagcagatcaaggctcattcgatcattctaacatcaacacaatccaaaaatccaaaaataaagattcacgaaattgcaaagattctcgtgatttcataatccaaatcagccaatcaaaaatccaagaattcatacttcaagttcttannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnG-A-C-A-T-T--C---CTA---AA-T-T-C-AA---AA-TCC-AA--C--A--T--T----CGA----ACTT-C--AAT--GAT--T-C---G--A--AT--CC-AAG--A-TTC--A--AGA-TC-AA---T-A-TC--C--A-A----T--CAG--C--CAA-A-TCA-A--AA-A--T-C-AAGA-AA--TTC-ATA-CTC-AAAATTtatttactggccgggagttttaagcacaacgcgtatatgcgaaagagaagtaattaggttcaccggaacattggaaaaggcggagaacatctgcaata
gi|10 : TGAGGAA--A--GCGATT-C-C--GTT----GT---AT-TT-TATG--GA-AT-TA---C--T--T-CCTT-AAGA---AA--TA--TT---C-TGA-TTCT-G--T------A--AATA-AA-TA-C-A-GT-TT---TCTT----TG-G--G---T--AAGA-TA--TTTCTG-TA-TT-TTT--GTCATG--CAA---G--AA-TTTA-TATATTTTA-ACG-CAT-T-T-TATATA-A-AA-TCAT-A-GGC-AT-A-AA--ATT--GA-A-G-CAA----TAGCA-CAC----CG-T----AG-T-A--TT--T-ATAATG-ACT---A-T-AG--ATGAA-G-------T-A-CAA---C-TT--TTTTTT-TTTTTA-T---AT--GAA-AAGTTTTTA-ATTTATT-----nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngtgaggaaagcgattccgttgtattttatggaattacttccttaagaaatattctgattctgtaaataaatacagttttctttgggtaagatatttctgtatttttgtcatgcaagaatttatatattttaacgcattttatataaaatcataggcataaaattgaagcaatagcacaccgtagtatttataatgactatagatgaagtacaactttttttttttttatatgaaaagtttttaatttatt
gi|11 : gacattcctaaattcaaaatccaacattcgaacttcaatgattcgaatccaagattcaagatcaatatccaatcagccaaatcaaaaatcaagaaattcatactcaaaattnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngGAGGAACAG--GCGATTGCGC--GTTTG--GT---AT-TTGTATG--GA-ATGTAAAAC--TTCCGCCTT-AGGA---GA--T---TT---TCTGG-TTATCG--TT-----AGTAATA-AG-TAAC-AATC-TA---TTCTCGGGTC-T--GGA-T--AAAA-TAT-TTTCTGGTA-AT-TT---GC-ATGG-CAAAGAG--AG-TTT---------TA-ATG----AT-T-TA-------GA-TC-TGA-GG--AT-AGAAC-ATA--GACG-GGC-AG---TAGGA-CAT----TG-TT---AG-TCA--TT--CCATAATGGACTTTTA-TCAA--ATG-T-G-------TAA-CAA---C-TT--TTTTAT-TTTGCACT---AT--GAA-AAGTTTTTAAATCAATT-----C---GGTCATGT
gi|12 : --AAAG-C-----CC-AGAAGGC-T-CATTCG-A-C-A-T-T--C---T-A---AA-T-T-C-AA---AA-TCC-AA--A--A--T--T----CGA----AATTCC--AA---TAT--T-C---GAAA--AT--CC-AAA-----TC--A--AGATTC-AA---T-A-TC--C-AA-AT---T--CAG--C--C-A-A-TC--A--AA-A--T-C-AAG--AA--TTC-ATA-CTT-CAATTTTCCTTT-GTAGTTatacttgggccggagttttgaaacataatgcgtatatgcgaacagggaatattaaaggtatccgggaacatggaagagggccggttgaacatctgtag
gi|12 : cgATGAGGAA--G--TCGATT-C-C--GTT----GT---AT-TT-TATG--GA-AT-TA---C--TTCC-CTTTAAAGA---AA--T---TT---T-TGA-TTAT-A--TA-----A--AAT--AA-TA-C-A-TT-TA---Taatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatgaggaagtcgattccgttgtattttatggaattacttccctttaaagaaatttttgattatataaaataatacatttat
gi|13 : cgaaagcccagaaggctcattcgacattctaaattcaaaatccaaaattcgaaattccaatattcgaaaatccaaatcaagattcaatatccaaattcagccaatcaaaatcaagaattcatacttcaattttcctttgtagttaatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn--A--GCGATT-C-T--GT-----GT---ATGTT-TATA--GA-AT--A---C--TCCC-CCTT-AAGA---AA--TGCTTT---C-TGA-TTAT-G--TA-----A--AATA-AA-TA-C-ATTT-TAAACTGTT----TC-G--G---T--AAAA-TAT-TCT-TGTTA-CT-TTT---CCTTG--CAAT--G--AATTTTA-TA-----TA-ATA-CACAT-T-TATATC-A-AATTC-T-ATAG--AT-A-AAA-ATTTAGAAATG-C-AG---TAGGA-C-T----GG-TA---AG-T-ATTTT--T-ATATTT-ACT---T-T-TA--ATG-T-G-------TAA-CAA---C-TTTCTTTTAT-TTTTA--T---AT--TG--AAGTTTTT--CTT
gi|14 : atA--A--GCGATT-C-CT-GCTTGGCGT---AT-TT-TACGTAGA-ATGTA---C--TCCC-CCTT-AAGA---AA--T---TT---TCTGA-TTAT-GCCTA-----GC-AATA-AA-TA-CGA-TT-TA---C-------TC-G--GGC-T--AAAA-TAT-TT-CTG-TATCT-TTT--GCCA-G--CAAA--G--AA-TTTA-TA-----TA-ATA-CATAT-T-TA-ATC-AGAA-TC-A-A-AG--ATAA-AAT-ATA--GACA-G-C-A----TAGGA-CAT----GG-T----AG-T-A--TTGAT-ATAATG-ACTTC-T-T-AAGCATG-TGG-------TAA-CAA-----TT--TTTTAC-TTC----T---ATAATGA-AAGTTTg
gi|15 : gatAATTT-A-GAA-T----G---T-CGAATGAAGCCTTCTG--GACT--TTCGTA--AA----------------------CATTCG-AAC-A-T-T--C---A-A---AAGT-T-C-AA---AA-TCC-GA--A--A--T--T----CGA----AATC-C--AA---GAT--T-C---A-AA--AT--AC-AAT--A-TTC--G--AGATTC-AA---T-A-TC--T-AA-A----T--CAG--C--C-A-A-TC--A--AA---------------------ATA-CTT-CAAATTTCCTCT-GTAGTT
gi|15 : --AAAGTC-----C--AGAAGGC-TTCATTCG-A-C-A-T-T--C---T-A---AA-T-T-C-AA---AA-TCCAAA--A--A--T--T----CGA----AATT-C--AA---TAT--T-----G-AA--AT--CC-AAGATA-TTC--A--AGATTC--A---T-A-T---C-AA-A----T--CAG--C--C-A-A-TC--A--AA-A--T-C-AAG--AA--TTC-ATA-CTT-CAcaaaatccaaaaattcgaaattcaatattgaaatccaagatattcaagattcatatcaaatcagccaatcaaaatcaagaattcatacttca
gi|16 : aactacagaggaaatttgaagtattttgattggctgatttagatattgaatctcgaatattgtattttgaatcttggatttcgaatttcggattttgaacttttgaatgttcgaatgtttacgA--AAAA-C-----C--AGAAGGC-T-CATTCG-A-C-G-T-T--C---G-A---AA-T-T-C-AA---AA-CCC-GA--A--A--T--T----CGA----AACC-C--AA---GAT--T-C---G-AA--AT--GC-GAG--A-TTC--G--TGATTC-AA---T------------------------------A-A-TC--A--AA-A--T-A-AGG--AA--TTC-ATA-CTT-CAAATTTCCCCT-GTA
gi|17 : aagaatcatttctcaccggtcatgcagatttctgtcgtcaaacacatgcaagggtctgtacaaggtttaaagctcatgtgaaaatttgaaaaatagctgtaca--A--AC-A--T-A-AGG--GA--TTC-GTA-CTC-CAAATTTTCTCT-ATAGTT
gi|18 : ---TACGAA---AGCT--CAGAAGGCTCATT--TA--AGAT-T-----C--AAA--------ATCCG-A-G-A-T-C--C---G-A---AA-T-C-C-AA---GA-CCT-GA--A--A--T--T----CGA----TATT-C--AA---TAT--C-C---A-AATCAT--CC-A----A-TTC--A--A---TC--G---T-A-T-----GA-A----A--CAG--CGTC-T-A-TT--A--CA-A--TCC-AAG--AT--TTC-GTA-nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncg
gi|18 : gattagcttttcagactgataacgttaagc--AAAG-CT----C--AGAAGGC-T-CATTT-----------------A-A---GA-T-T-C-AA---AA-TCC-GA--G--A--T--C----CGA----AATC-C--AA---GAC--C-T---G-AA--------------A-TTC--G--ATATTC-AA---T-A-TC--C-AA-A----T--CAT--C--C-A-ATTC--A--A
gi|19 : gattagcttttcagactgataacgttaagctacg--AAAG-CGCGCAC--AGAAGGC-T-CATT-G-A-CTA-T-T--CCGAC-G---AA-T-TCC-CA---AC-TCC-CA--A--AACT--T----CGGGAACAATT-C--AA----AT--T-C---G-AG--G------AGA--A-TTC--G--TGATTC-AACCCT-A-TCCAC-AA-A----T--CAGGCC--C-A-A-TC--AGGAA-A--T-CAAAG--AA--TTCAATA-CTTGCAAAGTTtcgtatgaaacagcgtctattacaatccaagatttcgta
gi|2 : tacgA--AAAG-C-----C--AGAAGGC-T-CATTCG-A-C-ATT-T--C---T-A---AA-T-T-C--A---AG-TCC-AA--A--A--T--T----CGA----AATT-C--AA---GATTCT-C---A-AA--AC--C---AG--A-TT---G--TGATTC-AAT--T-A-TC--C-AA-A----T--CAG--C--C-A-ACTC--A--AAGA--T-G-AAG---A--TTC-ATA-CTC-TAAAGTTt
gi|2 : attgtaatatcagacatattacttcttgagatgaattggcgaaatcagcattacatatctacgTGAGGAA--A--GCGATT-C-C--GTTT---GT---AT-TT-TATG--GA-AT-TA---C--TTCC-CCTT-GAGA---AATTT---TT---T-TGACTTAT-G--TA-----A--AATA-TG-TA-C-A-CT-T------TC----TC-G--G---T--AAAA-TA--TTTCTG-TC-TC-TTT--GCCATG--C-A---G--AA-TTTA-TA---------------------ATATT-A-AA-TA-T-A--A--AT-A-AAC-A-A--GACG-G-C-A----TAGGA-CCA----AGTT----AG-T-A--TTC-C-ATAATG-ACT---A-T-AA--ATG-T-G-------TAAGCAA---C-TT--TTTTAT-TCA----T---AT--TGA-AAGTTTTT--A--AATT-----ATTCGGTCATttannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntgaggaaagcgattccgtttgtattttatggaattacttccccttgagaaatttttttgacttatgtaaaatatgtacactttctcggtaaaatatttctgtctctttgccatgcagaatttataatattaaatataaataaacaagacggcataggaccaagttagtattccataatgactataaatgtgtaagcaacttttttattcatattgaaagtttttaaattattcggtcattataacctgtgccggcgccttaaacagaagcgtaatgtgcgaatggaatcctatacagaaaaccggaactggaagaggcggcagaacatctgtata
gi|20 : attgtaatatcagacatattacttcttgagatgaattggcgaaatcagcattacatatctacgaaaagccagaaggctcattcgacatttctaaattcaagtccaaaattcgaaattcaagattctcaaaaccagattgtgattcaattatccaaatcagccaactcaaagatgaagattcatactctaaagttttannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnA--A--GCGATT-C-C--GTT----GT---AT-TC-TATT--TA-AT-TA---C--CTCC-AATT-AAAT---AA--T---TT---T-C------T-G--TA-----A--AATACAA-TG-T-A-CTACA---TTTTAT--TC-T--G---T--AAGAATAT-GT-CTG-TA-TT-TTT--GCCATG--CAA---G--AA-TCTA-TG-----TA-ATG-CACAT-T-TATATT-A-Atataacctgtgccggcgccttaaacagaagcgtaatgtgcgaatggaatcctatacagaaaaccggaactggaagaggcggcagaacatctgtata
gi|21 : --GAAA-G-C-A----TAGGAACAT----TGGT----AG-T-A--TT--T-ATAATG-A-T---ACT-AG--ATG-T-GGC-----TAA-GAATCTT-TT--TTTTCT-TTT----TATAAT--TAA-AAGTT
gi|22 : ---TACGAC---AGCC--CAGATGGCTCATTC--A--A-----------------------CATTCA-G-G-A-T-T--C---G-A---AA-T-T-C-AA---TA-TCC--A--T--A--TCAT----CG-----AATC-C--AA---atattgaagtttttcttggttgtgta
gi|22 : AT--T-C---A-AC--AT--TC-AGG--A-TTC--G--AAATTC-AA---T-A-TC--C-AT-A----T--CAT--C--G-A-A-TC--C--AA-A--T-A-AAG--GA--TTC-ATA-TTT-CGAATTTCCTCT-GTAGTataaaggattcatatttcgaatttcctctgtagt
gi|23 : tacgacagcccagatggctc--AAAG-C-----C--AGAAGGCCT-CATTCG-A-C-A-T-T--T---C-T---AA-T-T-C-AA---AT-TCC-AA--A--A--T--T----CGA----AATT-C--AA---GAT--T-C---G--A--AT--TC-AAG--AGTTT--G--TGATTC-AAG--T-A-TT--C-
gi|24 : cg-C-----C--AGAAGGC-T-CATTCG-A-C-A-T-T--C---G-A---AA-T-T-C-GA---AA-TCC-AA--G--A--C--T----CGA----AATG-C--GA---GCT--T-C---catgagtc
gi|26 : cggaatctgtaaatgtatacttgcgattagtC-T-A-GG--GT-A-AAC-ATT--GAAA-A-C-A----TAGGA-CAT----GA-T----AG-T-A--TT--T-AT-ATG-ATT---a
gi|3 : AAT----G---TACGAA---ACCC--CAG---------------------------T--ACAAGGC-T-CATTCG-A-C-A-C-TTCC---T-A---AA-TAT-C-AACA-AA-TCC--A--A--A--T--T----CGA----AATT-C--AA---GAT--T-CCAAG-AA--GT--CC-TA---A-TTC--GTTA-ATTCGAA---T-A-T---C-AA-A----T--C-G--CA-C-A-A-TCAAA--AA-A--T-C-CGG--AA--TTC-
gi|3 : aatattcacttcggaatccggattgctttttctgaacatcttgattatgaaaaatacactTAT-AGGGA--A--GCGATT-T-CCTGTT----GTTCTAT-TT-TATG--GA-AT-TA---C--TC------T-AAGATTTTA--T---TC---T-TGA---AT-A--AA-----A--AATA-AC-TT-C-A--T-TA---TCTG----TCTT--A---TCAAAGA-TAT-TTCCTT-TA-CTAATT--ACCATG--CAA---A--GA-GATA-TC-----TA-AAATCATACAT-TATATT-A-AA-TTAT-A-GG--AC-A-AACGATT--GATACC-C-AAGACTAGCA-CATGCGACG-T----AGCT-A--CTA-T-AT-----ACT---A-T--A--ATC-TAG-------TCA-AGA---C--A--TTTTAT-TTC----T---Acgactgatatcattgcgcaaaatctnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngtaattggtatagggaagcgatttcctgttgttctattttatggaattactctaagattttattcttgaataaaaaataacttcattatctgtcttatcaaagatatttcctttactaattaccatgcaaagagatatctaaaatcatacattatattaaattataggacaaacgattgatacccaagactagcacatgcgacgtagctactatatactataatctagtcaagacattttatttctaaatatatgatttcatgttcattcgct
gi|4 : aatattcacttcggaatccggattgctttttctgaacatcttgattatgaaaaatacactaatgtacgaaaccccagtacaaggctcattcgacacttcctaaatatcaacaaatccaaattcgaaattcaagattccaagaagtcctaattcgttaattcgaatatcaaatcgcacaatcaaaaaatccggaattccgactgatatcattgcgcaaaatctnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngtaattggTCAGAACTTGAAGAGGTTAGGG---TACGGA---AGCC--CAGAAGGCTCaatatatgatttcatgttcattcgct
gi|4 : aaagaattctttcttcgattaagttgctgtgaattgtacatcagcaactcatcgggtgcactatttgtttattAAG-C-----CC-AGAAGGC-T-CNNNNN-N-N-N-N-N--N---N-N---NN-N-N-N-NN---NN-NNN-NN--N--N--N--N----NNN----NNNN-N--NN---NNN--N-N---N-NN--NN--NN-NNN--N-NNN--N--NNNNNN-NN---N-N-NC--C-AA-A----T--CAG--C--C-A-A-TC--A--AA-A--T-C-AAG--AA--TTC-ATA-CTT-CAAATTTCCTTT-GTAGTTnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnccaaatcagccaatcaaaatcaagaattcatacttcaaatttcctttgtagttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntgaggaagtcgattccgttgtattttatggaattacttccccttaaggatttttgattatatgaaataaatgtatttatctttctttaagaatatttctgtaaatttgccaagctagaatttataaaatacatatttatattcaatctagggtaaacattgaaagcataggacatggtagtatttataatgactataaatgtgtaacaacttttcaatttttatattgaagttttttcttgatta
gi|4 : aaagaattctttcttcgattaagttgctgtgaattgtacatcagcaactcatcgggtgcactatttgtttatttcagaacttgaagaggttagggtacggTGAGGAA--G--TCGATT-C-C--GTT----GT---AT-TT-TATG--GA-AT-TA---C--TTCC-CCTT-AAGG---A---T---TT---T-TGA-TTAT-A--TG-----A--AATA-AA-TG-T-A-TT-TA---TCTT----TC-T--T---T--AAGA--ATATTTCTG-TA-AA-TTT--GCCAAG--CTA---G--AA-TTTA-TA-----AA-ATA-CATAT-T-TATATT-C-AA-TC-T-A-GG--GT-A-AAC-ATT--GAAA-G-C-A----TAGGA-CAT----GG-T----AG-T-A--TT--T-ATAATG-ACT---A-T-AA--ATG-T-G-------TAA-CAA---C-TT--TTCAAT-TTTTA--T---AT--TGA-AGTTTTTT--CTTGATT-----A---nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntgaggaagtcgattccgttgtattttatggaattacttccccttaaggatttttgattatatgaaataaatgtatttatctttctttaagaatatttctgtaaatttgccaagctagaatttataaaatacatatttatattcaatctagggtaaacattgaaagcataggacatggtagtatttataatgactataaatgtgtaacaacttttcaatttttatattgaagttttttcttgatta
gi|5 : aaagaattctttcttcgattaagttgctgtgaattgtacatcagcaactcatcgggtgcactatttgtttatttcagaacttgaagaggttagggtacggaagcccagaaggctcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnccaaatcagccaatcaaaatcaagaattcatacttcaaatttcctttgtagttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn----G---TACGAA---AGCC--CAGAAG-------------------------------GGC-T-CATTCG-A-C-A-TCT--C---G-A---AA-T-T-C-AA---AA-TCC-CA--AAGA--T--TCCCGCGAGT--AATT-C--AAGCTGAT--T-C---G------T------GG--A-TTT--C--A-ATTT-AG---T-T-TC--CTAA-ATATTT--CAG--T--C-T-A-AC--A--AA-A--T-C-AAG--------T-ATA-TTT-CTATTTATCTCTAATAGT
gi|5 : cTATGAGATA--A--GCGATT-C-CT-GCTTGGCGT---AT-TT-TACGTAGA-ATGTA---C--TCCC-CCTT-AAGA---AA--T---TT---TCTGA-TTAT-GCCTA-----GC-AATA-AA-TA-CGA-TT-TA---C-------TC-G--GGC-T--AAAA-TAT-TT-CTG-TATCT-TTT--GCCA-G--CAAA--G--AA-TTTA-TA-----TA-ATA-CATAT-T-TA-ATC-AGAA-TC-A-A-AG--ATAA-AAT-ATA--GACA-G-C-A----TAGGA-CAT----GG-T----AG-T-A--TTGAT-ATAATG-ACTTC-T-T-AAGCATG-TGG-------TAA-CAA-----TT--TTTTAC-TTC----T---ATAATGA-AAGTTTTannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncggacccattcccacccggagtgtctatgagataagcgattcctgcttggcgtattttacgtagaatgtactcccccttaagaaattttctgattatgcctagcaataaatacgatttactcgggctaaaatatttctgtatcttttgccagcaaagaatttatataatacatatttaatcagaatcaaagataaaatatagacagcataggacatggtagtattgatataatgacttcttaagcatgtggtaacaattttttacttctataatgaaagttttgaaatgatctgtc
gi|6 : cgtacgaaagcccagaagggctcattcgacatctcgaaattcaaaatcccaaagattcccgcgagtaattcaagctgattcgtggatttcaatttagtttcctaaatatttcagtctaacaaaatcaagtatatttctatttatctctaatagtannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncggacccattcccacccggagtgtcATCAAAATT-AA-GAAAT----AAGATATGAA---AG-------GAG--TTA--CGTACGAAAG-C-----CC-AGATGGC-T-CATTCGGA-C-A-T-TT-C---T-A---AA-T-TTC-AA---AA-TCCCAA--A--A--T--T----CGA----AATT-C--AA---TAT--T-C---G-AA--AT--CC----------C--A--AGATTC-AA---TGA-TC--C-AATT----T--CAG--C--C-A-A-TC--T--AA-A--T-C-AAAGCAA--TTC--TACCTT-CAAATgaaatgatctgtc
gi|6 : TAAGGAA--A--GCGATT-C-C--GTT----GTT--AT-GT-TTTG--GA-AG-TA---C--TCCC-CTTA-AAGA---AA--T---TT---TCTGA-TGCT-G--TA-----A----TA-AA-TA-C-A-GG-TG---T-TT----TC-TTGG---T--AAGA-TA--TTTCTG-TA--T-TTT--GTCATG--CAA---A--AA-TTTATTA-----TATTTA-C-TAT-TCTATATA-A-AATTC-T-A-GGATAT-A-AAC-ATT--GAAA-G-C-AT---TAGGA-AAC----CG-T----AG-T-A--TT--T-A-AATG-ACTA--A-T-AC--ATG-T-AAATAAGTTAA-CAA---C------TTTAT-TTA----T---AT--TGA-AAGTTTTT--gtnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnagtagtatgattaaggaaagcgattccgttgttatgttttggaagtactccccttaaagaaattttctgatgctgtaataaatacaggtgttttcttggtaagatatttctgtattttgtcatgcaaaaatttattatatttactattctatataaaattctaggatataaacattgaaagcattaggaaaccgtagtatttaaatgactaatacatgtaaataagttaacaactttatttatattgaaagtttttaat
gi|7 : atcaaaattaagaaataagatatgaaaggagttacgtacgaaagcccagatggctcattcggacatttctaaatttcaaaatcccaaaattcgaaattcaatattcgaaatcccaagattcaatgatccaatttcagccaatctaaatcaaagcaattctaccttcaaatgtnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnagtagtatgatATCAACATG-CA-GGGAT----G---TATGAA---AGCC--GAGAAGGCTCATTCGTA--AAAG-C-----C--AGAAGGC-T-CATTCG-A-C-A-T-T--C---T-A---AA-T-T-C-AA---AAATCC-AA--A--A--T--T-----GA----AATT-C--AA---TAT--G-C---G-AA--AT--CC-AAG--A-TTC--A--AGATTC-AA---T-A-TC--C-AA-A----T--CAG--C--C-A-A-----A--AA-A--T-C-AAG--AA--TTC-ATA-CTT-CACATTTCCTTT-GTAGTTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTATGAGGAA--G--TCGATT-C-C--GTT----AT---AT-TT-TATG---A-AT-TA---C--TTCC-CCTT-AAGA---AA--T---TT---T-TG--TTAT-A--TA-----A--AATA-AA-TA-C-A-TT-TA---TCTT----TC-T--G------AAGA-TAT-TTTCTG-TA-AA-TTT--GCCAAG--CAA---G--AA-TT-A-TA-----AA-ATT-CATAT-T-TATAT----AA-T--T-C-GG--GT-A-AAC-ATT--GA-A-T-C-A----TAGGA-TAC----CG-T----AG-T-A--TT--T-ATA-TG-ACT---A-T-AA--ATG-T-G-------TAA-CAA---C-TT--TTTTAT-TTT----T---AT--TG--AAGTTTTT--GTTGATT-----A---GGTAATATaat
gi|8 : -C-----C--AGAATGT-T-CAGTAG-G-C-A-T-T--C---G-A---AA-T-T-C-AT---AA-TCC-GA--A--A--T--T----CGA----AATT-C--AA---GAT--T-C--------------C-AAG----TCC--G--AGAATC-AA---T-A-TC--C-AA-A----T--CAG--C--C-A-A-TC--A--AA-A--T-A-AAG--AA--TTC-ATA-CTT-CAAATTTCCTCT-GTA
gi|8 : tgattgtttcaaagaacaggaaactgggtttattacggatgcTGAGGAA--A--GCGATT-G-C--GTT----GT---AT-TG-TATG--GA-AT-TA---C--TACC-CCTG-AAGT---AA--T---TT---TCTGA-TTAA-G--TA-----A--AATA-AA-TA-C-A-TT-TT---TCTT----TC-T--T---T--AAGA--ATATTTCTG-TA-CT-GTT--GTCATG--CAA---G--AA-TTCA-TA-----GA-ATA-CACAT-T-TATATC-A-AA-TC-T-T-GC--GT-A-AAC-ATT--GAAA-G-C-A----TGACA-TAT----GG-T----AG-T-T--TT--T-ATAATG-ACT---A-T-AA--ATG-T-G-------TAA-AAA---C--A--TTTTATATTA----T---AT--TAA-----TTTT--TTTAATA-----A---GGTCATnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntgaggaaagcgattgcgttgtattgtatggaattactacccctgaagtaattttctgattaagtaaaataaatacatttttctttctttaagaatatttctgtactgttgtcatgcaagaattcatagaatacacatttatatcaaatcttgcgtaaacattgaaagcatgacatatggtagtttttataatgactataaatgtgtaaaaacattttatattatattaatttttttaataaggtcattcaaagatttgtaaaaaa
gi|9 : tgattgtttcaaagaacaggaaactgggtttattacggatgcccagaatgttcagtaggcattcgaaattcataatccgaaattcgaaattcaagattccaagtccgagaatcaatatccaaatcagccaatcaaaataaagaattcatacttcaaatttcctctgtannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn--AAAG-C-----CGCAGAAGGC-T-CAT-CG-A-C-A-T-T--C---T-ACATGA-T-T-CCAA---AA-TTC-AGTTA--C--T--T----CGAGA--AATT-CGCAA---GAT--TTC---A-AA--AT--CCCAAG--A-T----G--TGATTC-AA---T-AATC--C-AG-A----TATCAG--C--C-AGA-TC--A--AA------T-GAG--AACATTC-ATA-CTT-CAAAGTTtcaaagatttgtaaaaaa
gi|9 : tacgATGAGGGAT-A--GCGATT-C-T--GT-----GT---ATGTT-TATA--GA-AT--A---C--TCCC-CCTT-AAGA---AA--TGCTTT---C-TGA-TTAT-G--TA-----A--AATA-AA-TA-C-ATTT-TAAACTGTT----TC-G--G---T--AAAA-TAT-TCT-TGTTA-CT-TTT---CCTTG--CAAT--G--AATTTTA-TA-----TA-ATA-CACAT-T-TATATC-A-AATTC-T-ATAG--AT-A-AAA-ATTTAGAAATG-C-AG---TAGGA-C-T----GG-TA---AG-T-ATTTT--T-ATATTT-ACT---T-T-TA--ATG-T-G-------TAA-CAA---C-TTTCTTTTAT-TTTTA--T---AT--TG--AAGTTTTtannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatgagggatagcgattctgtgtatgtttatagaatactcccccttaagaaatgctttctgattatgtaaaataaatacattttaaactgtttcggtaaaatattcttgttacttttccttgcaatgaattttatataatacacatttatatcaaattctatagataaaaatttagaaatgcagtaggactggtaagtatttttatatttacttttaatgtgtaacaactttcttttatttttatattgaagtttt
1 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|25 ): CGGCATGTGCGAAGGAAATATTTAAGGTACCAGAAAATGGAAGAGGCGGAGAACATC
Alignments
lowQualScore : 1111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111
lowQualScore : 2222 11111111 333333333333333333333333333 11 3333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333 1111 111 111 1 111111111111 11111111 11 111 1111 1111 11 11111 1111111 111111111 2222 11 111 222222222
lowQualScore : 7777 3 55555555 888 66 55 000000000000000000000000000 2 2 2 4 2 2 2 44 66666 333 2 2 4 2 666 2 00 22 22 44 22 4444 9999 2 22 555 22 2 88888888888888888888888 22 3333 2 777 2 4 222 2 2 6666 33 33 55 2 2 4 55 22 2 33 333 55 33 2 2 2 4 9999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999 66 33 2 2 99 7777 000 5 2 77 2 8 444 33 1 2 2 444 33 222 444 3 2 2 77 66666 99 2 2 2 5 8 2 555555555555 99999999 33 2 00 2 8 88 2 444 1 66 666 33 5 2 77777 2 2 2 2 1 9999 9 5 2 5 66 5 2 2 777 888 2 2 6666 2 66666 5 3333 2 2 77 22 2 5 66666 2 77 5 8 3333333 2 111111111 2 2222 777 11 55 333 111111111
lowQualScore : .... . ........ ... .. .. ........................... . . . . . . . .. ..... ... . . . . ... . .. .. .. .. .. .... .... . .. ... .. . ....................... .. .... . ... . . ... . . .... .. .. .. . . . .. .. . .. ... .. .. . . . . ........................................................................................................................................... .. .. . . .. .... ... . . .. . . ... .. . . . ... .. ... ... . . . .. ..... .. . . . . . . ............ ........ .. . .. . . .. . ... . .. ... .. . . ..... . . . . . .... . . . . .. . . . ... ... . . .... . ..... . .... . . .. .. . . ..... . .. . . ....... . ......... . .... ... .. .. ... .........
lowQualScore : 2222 8 66666666 888 99 44 222222222222222222222222222 1 1 0 0 0 0 0 88 55555 555 0 0 0 0 222 0 11 88 88 88 88 2222 8888 0 88 555 88 0 00000000000000000000000 99 3333 1 999 1 2 999 1 2 9999 11 11 33 2 2 4 00 99 2 11 777 33 11 2 4 5 4 0000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 33 77 7 7 00 7777 000 3 7 33 7 0 777 77 4 7 7 777 77 000 777 3 7 7 33 77777 00 7 7 7 3 0 7 555555555555 66666666 99 9 77 6 6 11 9 000 7 88 444 99 7 9 11111 9 9 9 9 5 4444 2 7 9 7 88 7 9 9 666 222 7 7 3333 7 77777 3 7777 7 7 33 77 7 3 00000 9 99 7 6 2222222 9 999999999 9 9999 999 55 44 333 000000000
consensus : ATCAAAATTTNA-GAAAT----G---TACGAA---AGCC--CAGAAGGCTCATTCGTA--AAAG-C-----C--AGAAGGC-T-CATTCG-A-C-A-T-T--C---N-A---AA-T-T-C-AA---AA-TCC-GA--A--A--T--T----CGA----AATT-C--AA---GAT--T-C---G-AA--AT--CC-AAG--A-TTC--G--AGATTC-AA---T-A-TC--C-AA-A----T--CAG--C--C-A-A-TC--A--AA-A--T-C-AAG--AA--TTC-ATA-CTT-CAAATTTCCTCT-GTAGTTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTATGAGGAA--A--GCGATT-C-C--GTT----GT---AT-TT-TATG--GA-AT-TA---C--TCCC-CCTT-AAGA---AA--T---TT---T-TGA-TTAT-G--TA-----A--AATA-AA-TA-C-A-TT-TA---TCTT----TC-T--G---T--AAGA-TAT-TTTCTG-TA-CT-TTT--GCCATG--CAA---G--AA-TTTA-TA-----TA-ATA-CATAT-T-TATATC-A-AA-TC-T-A-GG--AT-A-AAC-ATT--GANA-G-C-A----TAGGA-CAT----NG-T----AG-T-A--TT--T-ATAATG-ACT---A-T-AA--ATG-T-G-------TAA-CAA---C-TT--TTTTAT-TTT----T---AT--TGA-AAGTTTTT--NTTAATT-----A---GGTCATGT
Reference ( family-33 ) : ATCAAAATTTNA-GAAAT----G---TACGAA---AGCC--CAGAAGGCTCATTCGTA--AAAG-C-----C--AGAAGGC-T-CATTCG-A-C-A-T-T--C---N-A---AA-T-T-C-AA---AA-TCC-GA--A--A--T--T----CGA----AATT-C--AA---GAT--T-C---G-AA--AT--CC-AAG--A-TTC--G--AGATTC-AA---T-A-TC--C-AA-A----T--CAG--C--C-A-A-TC--A--AA-A--T-C-AAG--AA--TTC-ATA-CTT-CAAATTTCCTCT-GTAGTTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTATGAGGAA--A--GCGATT-C-C--GTT----GT---AT-TT-TATG--GA-AT-TA---C--TCCC-CCTT-AAGA---AA--T---TT---T-TGA-TTAT-G--TA-----A--AATA-AA-TA-C-A-TT-TA---TCTT----TC-T--G---T--AAGA-TAT-TTTCTG-TA-CT-TTT--GCCATG--CAA---G--AA-TTTA-TA-----TA-ATA-CATAT-T-TATATC-A-AA-TC-T-A-GG--AT-A-AAC-ATT--GANA-G-C-A----TAGGA-CAT----NG-T----AG-T-A--TT--T-ATAATG-ACT---A-T-AA--ATG-T-G-------TAA-CAA---C-TT--TTTTAT-TTT----T---AT--TGA-AAGTTTTT--NTTAATT-----A---GGTCATGT
gi|1 : AAGGC-T-CATTCG-ATC-A-T-T--C---T-A---AC-A-T-C-AACACAA-TCC-AA--A--AA-T--C----CAA----AAAT-A--AA---GAT--T-CAC-G-AA--ATTGCA-AAG--A-TTCTCG--TGATTT-CA---T-AATC--C-AA-A----T--CAG--C--C-A-A-TC--A--AA-AATC-C-AAG--AA--TTC-ATA-CTT-CAAGTT
gi|1 : tacgataacaagcagatcTGAGGAA--AATGCGATT-C-C--GTT----GTA--AT-TT-TATG--GACAT-TA---CCTTCCC-GCCT-AAGG---AA--T---TTATCT-CGA-TTAT-G--TGCTAACA--AATA-AAGTA-C-A-TC-TT---TCTT----TC-T--GGTAT--AAAA-TA--TTTCTG-TA-CT-TTTCACCCATGCTCAA---GGAAG-TTTA-TA-----T--GTA-CATGT-G-TGTATTAA-AA-TC-T-A-GG--AT-A-AAC-ATA--GACG-G-C-T----TAGGA-CAT----TG-TTACGAG-T-A--TT--A-CTAATACACT---A-T-AA--ATGCT-G-------TAA-CAA---CTTT--TTTTAT-TTT----CA--ATA-TGACAAGTTCT----TTAATTATTCCA---GGTCATcttannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntgaggaaaatgcgattccgttgtaattttatggacattaccttcccgcctaaggaatttatctcgattatgtgctaacaaataaagtacatctttctttctggtataaaatatttctgtacttttcacccatgctcaaggaagtttatatgtacatgtgtgtattaaaatctaggataaacatagacggcttaggacattgttacgagtattactaatacactataaatgctgtaacaactttttttattttcaatatgacaagttctttaattattccaggtcattatttactggccgggagttttaagcacaacgcgtatatgcgaaagagaagtaattaggttcaccggaacattggaaaaggcggagaacatctgcaata
gi|10 : tacgataacaagcagatcaaggctcattcgatcattctaacatcaacacaatccaaaaatccaaaaataaagattcacgaaattgcaaagattctcgtgatttcataatccaaatcagccaatcaaaaatccaagaattcatacttcaagttcttannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnG-A-C-A-T-T--C---CTA---AA-T-T-C-AA---AA-TCC-AA--C--A--T--T----CGA----ACTT-C--AAT--GAT--T-C---G--A--AT--CC-AAG--A-TTC--A--AGA-TC-AA---T-A-TC--C--A-A----T--CAG--C--CAA-A-TCA-A--AA-A--T-C-AAGA-AA--TTC-ATA-CTC-AAAATTtatttactggccgggagttttaagcacaacgcgtatatgcgaaagagaagtaattaggttcaccggaacattggaaaaggcggagaacatctgcaata
gi|10 : TGAGGAA--A--GCGATT-C-C--GTT----GT---AT-TT-TATG--GA-AT-TA---C--T--T-CCTT-AAGA---AA--TA--TT---C-TGA-TTCT-G--T------A--AATA-AA-TA-C-A-GT-TT---TCTT----TG-G--G---T--AAGA-TA--TTTCTG-TA-TT-TTT--GTCATG--CAA---G--AA-TTTA-TATATTTTA-ACG-CAT-T-T-TATATA-A-AA-TCAT-A-GGC-AT-A-AA--ATT--GA-A-G-CAA----TAGCA-CAC----CG-T----AG-T-A--TT--T-ATAATG-ACT---A-T-AG--ATGAA-G-------T-A-CAA---C-TT--TTTTTT-TTTTTA-T---AT--GAA-AAGTTTTTA-ATTTATT-----nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngtgaggaaagcgattccgttgtattttatggaattacttccttaagaaatattctgattctgtaaataaatacagttttctttgggtaagatatttctgtatttttgtcatgcaagaatttatatattttaacgcattttatataaaatcataggcataaaattgaagcaatagcacaccgtagtatttataatgactatagatgaagtacaactttttttttttttatatgaaaagtttttaatttatt
gi|11 : gacattcctaaattcaaaatccaacattcgaacttcaatgattcgaatccaagattcaagatcaatatccaatcagccaaatcaaaaatcaagaaattcatactcaaaattnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngGAGGAACAG--GCGATTGCGC--GTTTG--GT---AT-TTGTATG--GA-ATGTAAAAC--TTCCGCCTT-AGGA---GA--T---TT---TCTGG-TTATCG--TT-----AGTAATA-AG-TAAC-AATC-TA---TTCTCGGGTC-T--GGA-T--AAAA-TAT-TTTCTGGTA-AT-TT---GC-ATGG-CAAAGAG--AG-TTT---------TA-ATG----AT-T-TA-------GA-TC-TGA-GG--AT-AGAAC-ATA--GACG-GGC-AG---TAGGA-CAT----TG-TT---AG-TCA--TT--CCATAATGGACTTTTA-TCAA--ATG-T-G-------TAA-CAA---C-TT--TTTTAT-TTTGCACT---AT--GAA-AAGTTTTTAAATCAATT-----C---GGTCATGT
gi|12 : --AAAG-C-----CC-AGAAGGC-T-CATTCG-A-C-A-T-T--C---T-A---AA-T-T-C-AA---AA-TCC-AA--A--A--T--T----CGA----AATTCC--AA---TAT--T-C---GAAA--AT--CC-AAA-----TC--A--AGATTC-AA---T-A-TC--C-AA-AT---T--CAG--C--C-A-A-TC--A--AA-A--T-C-AAG--AA--TTC-ATA-CTT-CAATTTTCCTTT-GTAGTTatacttgggccggagttttgaaacataatgcgtatatgcgaacagggaatattaaaggtatccgggaacatggaagagggccggttgaacatctgtag
gi|12 : cgATGAGGAA--G--TCGATT-C-C--GTT----GT---AT-TT-TATG--GA-AT-TA---C--TTCC-CTTTAAAGA---AA--T---TT---T-TGA-TTAT-A--TA-----A--AAT--AA-TA-C-A-TT-TA---Taatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatgaggaagtcgattccgttgtattttatggaattacttccctttaaagaaatttttgattatataaaataatacatttat
gi|13 : cgaaagcccagaaggctcattcgacattctaaattcaaaatccaaaattcgaaattccaatattcgaaaatccaaatcaagattcaatatccaaattcagccaatcaaaatcaagaattcatacttcaattttcctttgtagttaatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn--A--GCGATT-C-T--GT-----GT---ATGTT-TATA--GA-AT--A---C--TCCC-CCTT-AAGA---AA--TGCTTT---C-TGA-TTAT-G--TA-----A--AATA-AA-TA-C-ATTT-TAAACTGTT----TC-G--G---T--AAAA-TAT-TCT-TGTTA-CT-TTT---CCTTG--CAAT--G--AATTTTA-TA-----TA-ATA-CACAT-T-TATATC-A-AATTC-T-ATAG--AT-A-AAA-ATTTAGAAATG-C-AG---TAGGA-C-T----GG-TA---AG-T-ATTTT--T-ATATTT-ACT---T-T-TA--ATG-T-G-------TAA-CAA---C-TTTCTTTTAT-TTTTA--T---AT--TG--AAGTTTTT--CTT
gi|14 : atA--A--GCGATT-C-CT-GCTTGGCGT---AT-TT-TACGTAGA-ATGTA---C--TCCC-CCTT-AAGA---AA--T---TT---TCTGA-TTAT-GCCTA-----GC-AATA-AA-TA-CGA-TT-TA---C-------TC-G--GGC-T--AAAA-TAT-TT-CTG-TATCT-TTT--GCCA-G--CAAA--G--AA-TTTA-TA-----TA-ATA-CATAT-T-TA-ATC-AGAA-TC-A-A-AG--ATAA-AAT-ATA--GACA-G-C-A----TAGGA-CAT----GG-T----AG-T-A--TTGAT-ATAATG-ACTTC-T-T-AAGCATG-TGG-------TAA-CAA-----TT--TTTTAC-TTC----T---ATAATGA-AAGTTTg
gi|15 : gatAATTT-A-GAA-T----G---T-CGAATGAAGCCTTCTG--GACT--TTCGTA--AA----------------------CATTCG-AAC-A-T-T--C---A-A---AAGT-T-C-AA---AA-TCC-GA--A--A--T--T----CGA----AATC-C--AA---GAT--T-C---A-AA--AT--AC-AAT--A-TTC--G--AGATTC-AA---T-A-TC--T-AA-A----T--CAG--C--C-A-A-TC--A--AA---------------------ATA-CTT-CAAATTTCCTCT-GTAGTT
gi|15 : --AAAGTC-----C--AGAAGGC-TTCATTCG-A-C-A-T-T--C---T-A---AA-T-T-C-AA---AA-TCCAAA--A--A--T--T----CGA----AATT-C--AA---TAT--T-----G-AA--AT--CC-AAGATA-TTC--A--AGATTC--A---T-A-T---C-AA-A----T--CAG--C--C-A-A-TC--A--AA-A--T-C-AAG--AA--TTC-ATA-CTT-CAcaaaatccaaaaattcgaaattcaatattgaaatccaagatattcaagattcatatcaaatcagccaatcaaaatcaagaattcatacttca
gi|16 : aactacagaggaaatttgaagtattttgattggctgatttagatattgaatctcgaatattgtattttgaatcttggatttcgaatttcggattttgaacttttgaatgttcgaatgtttacgA--AAAA-C-----C--AGAAGGC-T-CATTCG-A-C-G-T-T--C---G-A---AA-T-T-C-AA---AA-CCC-GA--A--A--T--T----CGA----AACC-C--AA---GAT--T-C---G-AA--AT--GC-GAG--A-TTC--G--TGATTC-AA---T------------------------------A-A-TC--A--AA-A--T-A-AGG--AA--TTC-ATA-CTT-CAAATTTCCCCT-GTA
gi|17 : aagaatcatttctcaccggtcatgcagatttctgtcgtcaaacacatgcaagggtctgtacaaggtttaaagctcatgtgaaaatttgaaaaatagctgtaca--A--AC-A--T-A-AGG--GA--TTC-GTA-CTC-CAAATTTTCTCT-ATAGTT
gi|18 : ---TACGAA---AGCT--CAGAAGGCTCATT--TA--AGAT-T-----C--AAA--------ATCCG-A-G-A-T-C--C---G-A---AA-T-C-C-AA---GA-CCT-GA--A--A--T--T----CGA----TATT-C--AA---TAT--C-C---A-AATCAT--CC-A----A-TTC--A--A---TC--G---T-A-T-----GA-A----A--CAG--CGTC-T-A-TT--A--CA-A--TCC-AAG--AT--TTC-GTA-nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncg
gi|18 : gattagcttttcagactgataacgttaagc--AAAG-CT----C--AGAAGGC-T-CATTT-----------------A-A---GA-T-T-C-AA---AA-TCC-GA--G--A--T--C----CGA----AATC-C--AA---GAC--C-T---G-AA--------------A-TTC--G--ATATTC-AA---T-A-TC--C-AA-A----T--CAT--C--C-A-ATTC--A--A
gi|19 : gattagcttttcagactgataacgttaagctacg--AAAG-CGCGCAC--AGAAGGC-T-CATT-G-A-CTA-T-T--CCGAC-G---AA-T-TCC-CA---AC-TCC-CA--A--AACT--T----CGGGAACAATT-C--AA----AT--T-C---G-AG--G------AGA--A-TTC--G--TGATTC-AACCCT-A-TCCAC-AA-A----T--CAGGCC--C-A-A-TC--AGGAA-A--T-CAAAG--AA--TTCAATA-CTTGCAAAGTTtcgtatgaaacagcgtctattacaatccaagatttcgta
gi|2 : tacgA--AAAG-C-----C--AGAAGGC-T-CATTCG-A-C-ATT-T--C---T-A---AA-T-T-C--A---AG-TCC-AA--A--A--T--T----CGA----AATT-C--AA---GATTCT-C---A-AA--AC--C---AG--A-TT---G--TGATTC-AAT--T-A-TC--C-AA-A----T--CAG--C--C-A-ACTC--A--AAGA--T-G-AAG---A--TTC-ATA-CTC-TAAAGTTt
gi|2 : attgtaatatcagacatattacttcttgagatgaattggcgaaatcagcattacatatctacgTGAGGAA--A--GCGATT-C-C--GTTT---GT---AT-TT-TATG--GA-AT-TA---C--TTCC-CCTT-GAGA---AATTT---TT---T-TGACTTAT-G--TA-----A--AATA-TG-TA-C-A-CT-T------TC----TC-G--G---T--AAAA-TA--TTTCTG-TC-TC-TTT--GCCATG--C-A---G--AA-TTTA-TA---------------------ATATT-A-AA-TA-T-A--A--AT-A-AAC-A-A--GACG-G-C-A----TAGGA-CCA----AGTT----AG-T-A--TTC-C-ATAATG-ACT---A-T-AA--ATG-T-G-------TAAGCAA---C-TT--TTTTAT-TCA----T---AT--TGA-AAGTTTTT--A--AATT-----ATTCGGTCATttannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntgaggaaagcgattccgtttgtattttatggaattacttccccttgagaaatttttttgacttatgtaaaatatgtacactttctcggtaaaatatttctgtctctttgccatgcagaatttataatattaaatataaataaacaagacggcataggaccaagttagtattccataatgactataaatgtgtaagcaacttttttattcatattgaaagtttttaaattattcggtcattataacctgtgccggcgccttaaacagaagcgtaatgtgcgaatggaatcctatacagaaaaccggaactggaagaggcggcagaacatctgtata
gi|20 : attgtaatatcagacatattacttcttgagatgaattggcgaaatcagcattacatatctacgaaaagccagaaggctcattcgacatttctaaattcaagtccaaaattcgaaattcaagattctcaaaaccagattgtgattcaattatccaaatcagccaactcaaagatgaagattcatactctaaagttttannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnA--A--GCGATT-C-C--GTT----GT---AT-TC-TATT--TA-AT-TA---C--CTCC-AATT-AAAT---AA--T---TT---T-C------T-G--TA-----A--AATACAA-TG-T-A-CTACA---TTTTAT--TC-T--G---T--AAGAATAT-GT-CTG-TA-TT-TTT--GCCATG--CAA---G--AA-TCTA-TG-----TA-ATG-CACAT-T-TATATT-A-Atataacctgtgccggcgccttaaacagaagcgtaatgtgcgaatggaatcctatacagaaaaccggaactggaagaggcggcagaacatctgtata
gi|21 : --GAAA-G-C-A----TAGGAACAT----TGGT----AG-T-A--TT--T-ATAATG-A-T---ACT-AG--ATG-T-GGC-----TAA-GAATCTT-TT--TTTTCT-TTT----TATAAT--TAA-AAGTT
gi|22 : ---TACGAC---AGCC--CAGATGGCTCATTC--A--A-----------------------CATTCA-G-G-A-T-T--C---G-A---AA-T-T-C-AA---TA-TCC--A--T--A--TCAT----CG-----AATC-C--AA---atattgaagtttttcttggttgtgta
gi|22 : AT--T-C---A-AC--AT--TC-AGG--A-TTC--G--AAATTC-AA---T-A-TC--C-AT-A----T--CAT--C--G-A-A-TC--C--AA-A--T-A-AAG--GA--TTC-ATA-TTT-CGAATTTCCTCT-GTAGTataaaggattcatatttcgaatttcctctgtagt
gi|23 : tacgacagcccagatggctc--AAAG-C-----C--AGAAGGCCT-CATTCG-A-C-A-T-T--T---C-T---AA-T-T-C-AA---AT-TCC-AA--A--A--T--T----CGA----AATT-C--AA---GAT--T-C---G--A--AT--TC-AAG--AGTTT--G--TGATTC-AAG--T-A-TT--C-
gi|24 : cg-C-----C--AGAAGGC-T-CATTCG-A-C-A-T-T--C---G-A---AA-T-T-C-GA---AA-TCC-AA--G--A--C--T----CGA----AATG-C--GA---GCT--T-C---catgagtc
gi|26 : cggaatctgtaaatgtatacttgcgattagtC-T-A-GG--GT-A-AAC-ATT--GAAA-A-C-A----TAGGA-CAT----GA-T----AG-T-A--TT--T-AT-ATG-ATT---a
gi|3 : AAT----G---TACGAA---ACCC--CAG---------------------------T--ACAAGGC-T-CATTCG-A-C-A-C-TTCC---T-A---AA-TAT-C-AACA-AA-TCC--A--A--A--T--T----CGA----AATT-C--AA---GAT--T-CCAAG-AA--GT--CC-TA---A-TTC--GTTA-ATTCGAA---T-A-T---C-AA-A----T--C-G--CA-C-A-A-TCAAA--AA-A--T-C-CGG--AA--TTC-
gi|3 : aatattcacttcggaatccggattgctttttctgaacatcttgattatgaaaaatacactTAT-AGGGA--A--GCGATT-T-CCTGTT----GTTCTAT-TT-TATG--GA-AT-TA---C--TC------T-AAGATTTTA--T---TC---T-TGA---AT-A--AA-----A--AATA-AC-TT-C-A--T-TA---TCTG----TCTT--A---TCAAAGA-TAT-TTCCTT-TA-CTAATT--ACCATG--CAA---A--GA-GATA-TC-----TA-AAATCATACAT-TATATT-A-AA-TTAT-A-GG--AC-A-AACGATT--GATACC-C-AAGACTAGCA-CATGCGACG-T----AGCT-A--CTA-T-AT-----ACT---A-T--A--ATC-TAG-------TCA-AGA---C--A--TTTTAT-TTC----T---Acgactgatatcattgcgcaaaatctnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngtaattggtatagggaagcgatttcctgttgttctattttatggaattactctaagattttattcttgaataaaaaataacttcattatctgtcttatcaaagatatttcctttactaattaccatgcaaagagatatctaaaatcatacattatattaaattataggacaaacgattgatacccaagactagcacatgcgacgtagctactatatactataatctagtcaagacattttatttctaaatatatgatttcatgttcattcgct
gi|4 : aatattcacttcggaatccggattgctttttctgaacatcttgattatgaaaaatacactaatgtacgaaaccccagtacaaggctcattcgacacttcctaaatatcaacaaatccaaattcgaaattcaagattccaagaagtcctaattcgttaattcgaatatcaaatcgcacaatcaaaaaatccggaattccgactgatatcattgcgcaaaatctnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngtaattggTCAGAACTTGAAGAGGTTAGGG---TACGGA---AGCC--CAGAAGGCTCaatatatgatttcatgttcattcgct
gi|4 : aaagaattctttcttcgattaagttgctgtgaattgtacatcagcaactcatcgggtgcactatttgtttattAAG-C-----CC-AGAAGGC-T-CNNNNN-N-N-N-N-N--N---N-N---NN-N-N-N-NN---NN-NNN-NN--N--N--N--N----NNN----NNNN-N--NN---NNN--N-N---N-NN--NN--NN-NNN--N-NNN--N--NNNNNN-NN---N-N-NC--C-AA-A----T--CAG--C--C-A-A-TC--A--AA-A--T-C-AAG--AA--TTC-ATA-CTT-CAAATTTCCTTT-GTAGTTnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnccaaatcagccaatcaaaatcaagaattcatacttcaaatttcctttgtagttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntgaggaagtcgattccgttgtattttatggaattacttccccttaaggatttttgattatatgaaataaatgtatttatctttctttaagaatatttctgtaaatttgccaagctagaatttataaaatacatatttatattcaatctagggtaaacattgaaagcataggacatggtagtatttataatgactataaatgtgtaacaacttttcaatttttatattgaagttttttcttgatta
gi|4 : aaagaattctttcttcgattaagttgctgtgaattgtacatcagcaactcatcgggtgcactatttgtttatttcagaacttgaagaggttagggtacggTGAGGAA--G--TCGATT-C-C--GTT----GT---AT-TT-TATG--GA-AT-TA---C--TTCC-CCTT-AAGG---A---T---TT---T-TGA-TTAT-A--TG-----A--AATA-AA-TG-T-A-TT-TA---TCTT----TC-T--T---T--AAGA--ATATTTCTG-TA-AA-TTT--GCCAAG--CTA---G--AA-TTTA-TA-----AA-ATA-CATAT-T-TATATT-C-AA-TC-T-A-GG--GT-A-AAC-ATT--GAAA-G-C-A----TAGGA-CAT----GG-T----AG-T-A--TT--T-ATAATG-ACT---A-T-AA--ATG-T-G-------TAA-CAA---C-TT--TTCAAT-TTTTA--T---AT--TGA-AGTTTTTT--CTTGATT-----A---nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntgaggaagtcgattccgttgtattttatggaattacttccccttaaggatttttgattatatgaaataaatgtatttatctttctttaagaatatttctgtaaatttgccaagctagaatttataaaatacatatttatattcaatctagggtaaacattgaaagcataggacatggtagtatttataatgactataaatgtgtaacaacttttcaatttttatattgaagttttttcttgatta
gi|5 : aaagaattctttcttcgattaagttgctgtgaattgtacatcagcaactcatcgggtgcactatttgtttatttcagaacttgaagaggttagggtacggaagcccagaaggctcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnccaaatcagccaatcaaaatcaagaattcatacttcaaatttcctttgtagttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn----G---TACGAA---AGCC--CAGAAG-------------------------------GGC-T-CATTCG-A-C-A-TCT--C---G-A---AA-T-T-C-AA---AA-TCC-CA--AAGA--T--TCCCGCGAGT--AATT-C--AAGCTGAT--T-C---G------T------GG--A-TTT--C--A-ATTT-AG---T-T-TC--CTAA-ATATTT--CAG--T--C-T-A-AC--A--AA-A--T-C-AAG--------T-ATA-TTT-CTATTTATCTCTAATAGT
gi|5 : cTATGAGATA--A--GCGATT-C-CT-GCTTGGCGT---AT-TT-TACGTAGA-ATGTA---C--TCCC-CCTT-AAGA---AA--T---TT---TCTGA-TTAT-GCCTA-----GC-AATA-AA-TA-CGA-TT-TA---C-------TC-G--GGC-T--AAAA-TAT-TT-CTG-TATCT-TTT--GCCA-G--CAAA--G--AA-TTTA-TA-----TA-ATA-CATAT-T-TA-ATC-AGAA-TC-A-A-AG--ATAA-AAT-ATA--GACA-G-C-A----TAGGA-CAT----GG-T----AG-T-A--TTGAT-ATAATG-ACTTC-T-T-AAGCATG-TGG-------TAA-CAA-----TT--TTTTAC-TTC----T---ATAATGA-AAGTTTTannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncggacccattcccacccggagtgtctatgagataagcgattcctgcttggcgtattttacgtagaatgtactcccccttaagaaattttctgattatgcctagcaataaatacgatttactcgggctaaaatatttctgtatcttttgccagcaaagaatttatataatacatatttaatcagaatcaaagataaaatatagacagcataggacatggtagtattgatataatgacttcttaagcatgtggtaacaattttttacttctataatgaaagttttgaaatgatctgtc
gi|6 : cgtacgaaagcccagaagggctcattcgacatctcgaaattcaaaatcccaaagattcccgcgagtaattcaagctgattcgtggatttcaatttagtttcctaaatatttcagtctaacaaaatcaagtatatttctatttatctctaatagtannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncggacccattcccacccggagtgtcATCAAAATT-AA-GAAAT----AAGATATGAA---AG-------GAG--TTA--CGTACGAAAG-C-----CC-AGATGGC-T-CATTCGGA-C-A-T-TT-C---T-A---AA-T-TTC-AA---AA-TCCCAA--A--A--T--T----CGA----AATT-C--AA---TAT--T-C---G-AA--AT--CC----------C--A--AGATTC-AA---TGA-TC--C-AATT----T--CAG--C--C-A-A-TC--T--AA-A--T-C-AAAGCAA--TTC--TACCTT-CAAATgaaatgatctgtc
gi|6 : TAAGGAA--A--GCGATT-C-C--GTT----GTT--AT-GT-TTTG--GA-AG-TA---C--TCCC-CTTA-AAGA---AA--T---TT---TCTGA-TGCT-G--TA-----A----TA-AA-TA-C-A-GG-TG---T-TT----TC-TTGG---T--AAGA-TA--TTTCTG-TA--T-TTT--GTCATG--CAA---A--AA-TTTATTA-----TATTTA-C-TAT-TCTATATA-A-AATTC-T-A-GGATAT-A-AAC-ATT--GAAA-G-C-AT---TAGGA-AAC----CG-T----AG-T-A--TT--T-A-AATG-ACTA--A-T-AC--ATG-T-AAATAAGTTAA-CAA---C------TTTAT-TTA----T---AT--TGA-AAGTTTTT--gtnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnagtagtatgattaaggaaagcgattccgttgttatgttttggaagtactccccttaaagaaattttctgatgctgtaataaatacaggtgttttcttggtaagatatttctgtattttgtcatgcaaaaatttattatatttactattctatataaaattctaggatataaacattgaaagcattaggaaaccgtagtatttaaatgactaatacatgtaaataagttaacaactttatttatattgaaagtttttaat
gi|7 : atcaaaattaagaaataagatatgaaaggagttacgtacgaaagcccagatggctcattcggacatttctaaatttcaaaatcccaaaattcgaaattcaatattcgaaatcccaagattcaatgatccaatttcagccaatctaaatcaaagcaattctaccttcaaatgtnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnagtagtatgatATCAACATG-CA-GGGAT----G---TATGAA---AGCC--GAGAAGGCTCATTCGTA--AAAG-C-----C--AGAAGGC-T-CATTCG-A-C-A-T-T--C---T-A---AA-T-T-C-AA---AAATCC-AA--A--A--T--T-----GA----AATT-C--AA---TAT--G-C---G-AA--AT--CC-AAG--A-TTC--A--AGATTC-AA---T-A-TC--C-AA-A----T--CAG--C--C-A-A-----A--AA-A--T-C-AAG--AA--TTC-ATA-CTT-CACATTTCCTTT-GTAGTTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTATGAGGAA--G--TCGATT-C-C--GTT----AT---AT-TT-TATG---A-AT-TA---C--TTCC-CCTT-AAGA---AA--T---TT---T-TG--TTAT-A--TA-----A--AATA-AA-TA-C-A-TT-TA---TCTT----TC-T--G------AAGA-TAT-TTTCTG-TA-AA-TTT--GCCAAG--CAA---G--AA-TT-A-TA-----AA-ATT-CATAT-T-TATAT----AA-T--T-C-GG--GT-A-AAC-ATT--GA-A-T-C-A----TAGGA-TAC----CG-T----AG-T-A--TT--T-ATA-TG-ACT---A-T-AA--ATG-T-G-------TAA-CAA---C-TT--TTTTAT-TTT----T---AT--TG--AAGTTTTT--GTTGATT-----A---GGTAATATaat
gi|8 : -C-----C--AGAATGT-T-CAGTAG-G-C-A-T-T--C---G-A---AA-T-T-C-AT---AA-TCC-GA--A--A--T--T----CGA----AATT-C--AA---GAT--T-C--------------C-AAG----TCC--G--AGAATC-AA---T-A-TC--C-AA-A----T--CAG--C--C-A-A-TC--A--AA-A--T-A-AAG--AA--TTC-ATA-CTT-CAAATTTCCTCT-GTA
gi|8 : tgattgtttcaaagaacaggaaactgggtttattacggatgcTGAGGAA--A--GCGATT-G-C--GTT----GT---AT-TG-TATG--GA-AT-TA---C--TACC-CCTG-AAGT---AA--T---TT---TCTGA-TTAA-G--TA-----A--AATA-AA-TA-C-A-TT-TT---TCTT----TC-T--T---T--AAGA--ATATTTCTG-TA-CT-GTT--GTCATG--CAA---G--AA-TTCA-TA-----GA-ATA-CACAT-T-TATATC-A-AA-TC-T-T-GC--GT-A-AAC-ATT--GAAA-G-C-A----TGACA-TAT----GG-T----AG-T-T--TT--T-ATAATG-ACT---A-T-AA--ATG-T-G-------TAA-AAA---C--A--TTTTATATTA----T---AT--TAA-----TTTT--TTTAATA-----A---GGTCATnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntgaggaaagcgattgcgttgtattgtatggaattactacccctgaagtaattttctgattaagtaaaataaatacatttttctttctttaagaatatttctgtactgttgtcatgcaagaattcatagaatacacatttatatcaaatcttgcgtaaacattgaaagcatgacatatggtagtttttataatgactataaatgtgtaaaaacattttatattatattaatttttttaataaggtcattcaaagatttgtaaaaaa
gi|9 : tgattgtttcaaagaacaggaaactgggtttattacggatgcccagaatgttcagtaggcattcgaaattcataatccgaaattcgaaattcaagattccaagtccgagaatcaatatccaaatcagccaatcaaaataaagaattcatacttcaaatttcctctgtannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn--AAAG-C-----CGCAGAAGGC-T-CAT-CG-A-C-A-T-T--C---T-ACATGA-T-T-CCAA---AA-TTC-AGTTA--C--T--T----CGAGA--AATT-CGCAA---GAT--TTC---A-AA--AT--CCCAAG--A-T----G--TGATTC-AA---T-AATC--C-AG-A----TATCAG--C--C-AGA-TC--A--AA------T-GAG--AACATTC-ATA-CTT-CAAAGTTtcaaagatttgtaaaaaa
gi|9 : tacgATGAGGGAT-A--GCGATT-C-T--GT-----GT---ATGTT-TATA--GA-AT--A---C--TCCC-CCTT-AAGA---AA--TGCTTT---C-TGA-TTAT-G--TA-----A--AATA-AA-TA-C-ATTT-TAAACTGTT----TC-G--G---T--AAAA-TAT-TCT-TGTTA-CT-TTT---CCTTG--CAAT--G--AATTTTA-TA-----TA-ATA-CACAT-T-TATATC-A-AATTC-T-ATAG--AT-A-AAA-ATTTAGAAATG-C-AG---TAGGA-C-T----GG-TA---AG-T-ATTTT--T-ATATTT-ACT---T-T-TA--ATG-T-G-------TAA-CAA---C-TTTCTTTTAT-TTTTA--T---AT--TG--AAGTTTTtannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatgagggatagcgattctgtgtatgtttatagaatactcccccttaagaaatgctttctgattatgtaaaataaatacattttaaactgtttcggtaaaatattcttgttacttttccttgcaatgaattttatataatacacatttatatcaaattctatagataaaaatttagaaatgcagtaggactggtaagtatttttatatttacttttaatgtgtaacaactttcttttatttttatattgaagtttt
blockSeqs : TGAA A TAGGG . . AA GCTCATTCGTAAAAGCC C T G A T T C TC CGAC CAT G A C C CA A AA TT AG AC CA CCCG GAAC C GC GCT TC T GAAATCCAAGATA . TTA G CCC G A CCA T T TATT AT GC GT A G T AA GG G . CC GC CA A C G A CA . G G CT TGGC TCT G G TA . G AAA . T G A TTT TT GCT . C C C CC . GT C . A G A A ATTCTCGGG TGGA CA A TA T G TC A G T G AGA . T T TATTT T T A C T CAG T A G T AT A G G TTA AAT G A AGAC A GCGAC T T C C TT GA C G TTTA C GC A G AATAAGT G TCTTTT A GCAC ATA AA A AAA ATTC
blockSeqs : AA G AAGA . . AT TTACGTACGAAAGCCC . . . . . . . T CT . . . T . . . CA . . . . . GT . . T . . CAAGAAGTCCTAA . AG . T . . C . . T . . A . . C A . . . CA A . . . . . T . . . T TGGC T G . TA . G . . T . . . . GCT . C . . CC . C . . . G T . AAACTGTT GGGC . . TA T T TC . G T . T . T . . . . . . T CAG T A . T C A . . TTA TAC . . G . C G A . . TT GA . . TCT . GC . A GC . CTTTC . TTA . AA A AA C
blockSeqs : CA A G . . AA GCTCATTTAAGATTC . . . . . . . . T . . . . . . . A . . . . . GA . . . . . AAAATCCCAAGA . AG . G . . C . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . T TG . . . . . G . . C . . . . A . C . . . . C . . . . T . AAACTGTT GGGC . . T T T T . G T . A . . . . . . . . T AA T . . . . . . . T AAT . . G . T . A . . . C . . TCT . . . G . . CTTTC . TA . . A C A
blockSeqs : A G . . AA GCTCATTCAA . . . . . . . . A . . . . . . . A . . . . . . . . . . . GAAAATCCAAA . AG . . . . C . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . C . . . . . . C . . . . . . . . . . . ATTTTAT TTGG . . T T . A . G T . A . . . . . . . . T CA . . . . . . . . A CG . . T . G . . . . . A . . AC . . . . . . CTT . TA . . A A A
blockSeqs : G . . GA T . . . . . . . . T . . . . . . . G . . . . . . . . . . . AAAATACAATA . AG . . . . C . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . C . . . . . . . . . . . TTCTT TTA . . T C . C . G T . T . . . . . . . . T TA . . . . . . . . A CA . . G . G . . . . . . . . AA . . . . . . CTT . TA . . A C A
blockSeqs : . . AA . . . . . . . . . G . . . . . . . G . . . . . . . . . . . GAAATGCGAGA . TG . . . . C . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . ATCTG GG . . T T . T . A T . . . . . . . . . . T TA . . . . . . . . A CG . . . . A . . . . . . . . A . . . . . . CTT . . . . A G
blockSeqs : . . . . . . . . . . . G . . . . . . . G . . . . . . . . . . . AAATCATCCAA . AT . . . . C . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . . . . ATCTT GG . . T T . T . G A . . . . . . . . . . T TA . . . . . . . . T AA . . . . T . . . . . . . . T . . . . . . CTT . . . . A T
blockSeqs : . . . . . . . . A . . . . . . . G . . . . . . . . . . . AACATTCAGGA . TG . . . . T . . . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . ATCTT GG . . T T . C . G T . . . . . . . . . . T TC . . . . . . . . T AA . . . . G . . . . . . . . A . . . . . . CTT . . . . A
blockSeqs : . . . . . . . . T . . . . . . . C . . . . . . . . . . . GAATTCAAGAG . TG . . . . C . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . . . . TTCTT TG . . T T . A . G A . . . . . . . . . . T AA . . . . . . . . T AA . . . . G . . . . . . . . A . . . . . . TT . . . . A
blockSeqs : . . . . . . . . G . . . . . . . A . . . . . . . . . . . NNNNNNNNNNN . AA . . . . C . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . . . . GTTT TT . . T T . A . G T . . . . . . . . . . T CA . . . . . . . . A CA . . . . G . . . . . . . . A . . . . . . CA . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . C . . . . . . . A . . . . . . . . . . . GAAATCCAAGA . TG . . . . C . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . AC TG . . . . . C . G T . . . . . . . . . . . CA . . . . . . . . T AA . . . . C . . . . . . . . A . . . . . . TT . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . G . . . . . . . A . . . . . . . . . . . GAATCCAAGA . NN . . . . C . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . TC TT . . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T AA . . . . C . . . . . . . . A . . . . . . CA . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . T . . . . . . . N . . . . . . . . . . . AAAACCAGA . AG . . . . C . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . . . . AC GG . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T A . . . . G . . . . . . . . T . . . . . . C . . .
blockSeqs : . . . . . . . . N . . . . . . . C . . . . . . . . . . . GAGGAGAA . AG . . . . C . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . G . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . G . . . . . . . A . . . . . . . . . . . GAAATCC . AG . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . T . . . . . . . G . . . . . . . . . . . GTGGA . TG . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . T . . . . . . . A . . . . . . . . . . . GAAA . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . G . . . . . . . . . . . . . . . . . . . CAAG . A . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqCons : *** ** AA GCTCATTCTAAAAC************* *** ** GAAATCCAAGA************ ** ** ** *** ** *** ***** NG****** T* G** ** ** CA** **** CTT****** *** ** A* N** A********
originalCons : ATCAAAATTTNA-GAAAT----G---TACGAA---AGCC--CAGAAGGCTCATTCGTA--AAAG-C-----C--AGAAGGC-T-CATTCG-A-C-A-T-T--C---N-A---AA-T-T-C-AA---AA-TCC-GA--A--A--T--T----CGA----AATT-C--AA---GAT--T-C---G-AA--AT--CC-AAG--A-TTC--G--AGATTC-AA---T-A-TC--C-AA-A----T--CAG--C--C-A-A-TC--A--AA-A--T-C-AAG--AA--TTC-ATA-CTT-CAAATTTCCTCT-GTAGTTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTATGAGGAA--A--GCGATT-C-C--GTT----GT---AT-TT-TATG--GA-AT-TA---C--TCCC-CCTT-AAGA---AA--T---TT---T-TGA-TTAT-G--TA-----A--AATA-AA-TA-C-A-TT-TA---TCTT----TC-T--G---T--AAGA-TAT-TTTCTG-TA-CT-TTT--GCCATG--CAA---G--AA-TTTA-TA-----TA-ATA-CATAT-T-TATATC-A-AA-TC-T-A-GG--AT-A-AAC-ATT--GANA-G-C-A----TAGGA-CAT----NG-T----AG-T-A--TT--T-ATAATG-ACT---A-T-AA--ATG-T-G-------TAA-CAA---C-TT--TTTTAT-TTT----T---AT--TGA-AAGTTTTT--NTTAATT-----A---GGTCATGT
finalCons : ATCAAAATTTNA-GAAAT----G---TACGAA---AGCC--CAGAAGGCTCATTCTAAAAC-------------AGAAGGC-T-CATTCG-A-C-A-T-T--C---N-A---AA-T-T-C-AA---AA-TCC-GA--A--A--T--T----CGA----AATT-C--AA---GAT--T-CGAAATCCAAGA------------TTC--G--AGATTC-AA---T-A-TC--C-AA-A----T--CAG--C--C-A-A-TC--A--AA-A--T-C-AAG--AA--TTC-ATA-CTT-CAAATTTCCTCT-GTAGTTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTATGAGGAA--A--GCGATT-C-C--GTT----GT---AT-TT-TATG--GA-AT-TA---C--TCCC-CCTT-AAGA---AA--T---TT---T-TGA-TTAT-G--TA-----A--AATA-AA-TA-C-A-TT-TA---TCTT----TCNG------T--AAGA-TAT-TTTCTG-TA-CT-TTTG--CCATG--CAA---G--AA-TTTA-TA-----TA-ATA-CATAT-T-TATATCA--AA-TC-T-A-GG--AT-A-AAC-ATT--GANA-G-C-A----TAGGA-CAT----NG-T----AG-T-A--TT--T-ATAATG-ACT---A-T-AA--ATG-T-G-------TAA-CAACTT------TTTTAT-TTT----T---AT--TGA-AAGTTTTTN--TTAATTA--------GGTCATGT
1 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|25 ): CGGCATGTGCGAAGGAAATATTTAAGGTACCAGAAAATGGAAGAGGCGGAGAACATC
Alignments
lowQualScore : 1111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111
lowQualScore : 2222 1111 44444444444444 11 1111 3333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333 1111 111 111 1 111111111111 111 11 111 1111 1111 11 11111 1111111 111111111 2222 11 111 222222222
lowQualScore : 9999 4444 777 55 99999 0 77777777777777 33 444 2 2 4 2 2 2 55 66666 333 2 2 4 2 666 2 11 22 22 55 22 4444 0000 2 22 555 22 2 666666 666666 3333 33 333 2 888 2 4 33 2 2 7777 33 33 2 2 2 4 55 33 2 33 2 55 33 2 2 2 4 9999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999 66 33 2 2 99 7777 000 5 2 77 2 8 444 33 1 2 2 444 33 222 444 3 2 2 77 66666 99 2 2 2 5 8 777 888888888888 1 666 2 00 2 8 88 2 444 1 66 666 33 5 2 77777 2 2 2 2 1 9999 9 5 2 5 66 5 2 2 777 888 2 2 6666 2 66666 5 3333 2 2 77 22 2 5 66666 2 77 5 8 3333333 2 111111111 2 2222 777 11 55 333 111111111
lowQualScore : .... .... ... .. ..... . .............. .. ... . . . . . . .. ..... ... . . . . ... . .. .. .. .. .. .... .... . .. ... .. . ...... ...... .... .. ... . ... . . .. . . .... .. .. . . . . .. .. . .. . .. .. . . . . ........................................................................................................................................... .. .. . . .. .... ... . . .. . . ... .. . . . ... .. ... ... . . . .. ..... .. . . . . . ... ............ . ... . .. . . .. . ... . .. ... .. . . ..... . . . . . .... . . . . .. . . . ... ... . . .... . ..... . .... . . .. .. . . ..... . .. . . ....... . ......... . .... ... .. .. ... .........
lowQualScore : 0000 2222 000 55 11111 9 22222222222222 22 111 4 1 2 1 1 1 00 88888 777 1 1 2 1 666 1 11 99 99 00 99 5555 3333 1 99 888 99 1 888888 999999 6666 11 333 2 333 2 4 11 2 4 4444 22 22 4 4 4 7 33 11 4 22 4 66 22 4 5 5 4 0000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 33 77 7 7 00 7777 000 3 7 33 7 0 777 77 4 7 7 777 77 000 777 3 7 7 33 77777 00 7 7 7 3 0 333 000000000000 0 888 9 77 6 6 11 9 000 7 88 444 99 7 9 11111 9 9 9 9 5 4444 2 7 9 7 88 7 9 9 666 222 7 7 3333 7 77777 3 7777 7 7 33 77 7 3 00000 9 99 7 6 2222222 9 999999999 9 9999 999 55 44 333 000000000
consensus : ATCAAAATT-NA-GAAAT----G---T--ACGAAAGC---C-CAGAAGGCT-CATTC--AAA---C--AGA---AGGC-TCATTCG-A-C-A-T-T--C---N-A---AA-T-T-C-AA---AA-TCC-GA--A--A--T--T----CGA----AATT-C--AA---GAT--T-C---G-AAAT--CC-AAG--A-TTC--G--AGATTC-AA---T-A-TC--C-AA-A----T--CAG--C-C-A-A-TC--A--AA-A--TC-AAG--AA--TTC-ATA-CTT-CAAATTTCCTCT-GTAGTTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTATGAGGAA--A--GCGATT-C-C--GTT----GT---AT-TT-TATG--GA-AT-TA---C--TCCC-CCTT-AAGA---AA--T---TT---T-TGA-TTAT-G--TA-----A--AATA-AA-TA-C-A-TT---TA---TCTT----TCGG---TAAGA-TAT-TTTCTG-TA-CT-TTT--GCCATG--CAA---G--AA-TTTA-TA-----TA-ATA-CATAT-T-TATATC-A-AA-TC-T-A-GG--AT-A-AAC-ATT--GANA-G-C-A----TAGGA-CAT----NG-T----AG-T-A--TT--T-ATAATG-ACT---A-T-AA--ATG-T-G-------TAA-CAA---C-TT--TTTTAT-TTT----T---AT--TGA-AAGTTTTT--NTTAATT-----A---GGTCATGT
Reference ( family-33 ) : ATCAAAATTTNA-GAAAT----G---T--ACGAAAGC---C-CAGAAGGCT-CATTC-TAAAA--C--AGA---AGGC-TCATTCG-A-C-A-T-T--C---N-A---AA-T-T-C-AA---AA-TCC-GA--A--A--T--T----CGA----AATT-C--AA---GAT--T-C---G-AAAT--CC-AAG--A-TTC--G--AGATTC-AA---T-A-TC--C-AA-A----T--CAG--C-C-A-A-TC--A--AA-A--TC-AAG--AA--TTC-ATA-CTT-CAAATTTCCTCT-GTAGTTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTATGAGGAA--A--GCGATT-C-C--GTT----GT---AT-TT-TATG--GA-AT-TA---C--TCCC-CCTT-AAGA---AA--T---TT---T-TGA-TTAT-G--TA-----A--AATA-AA-TA-C-A-TT---TA---TCTT----TCNG---TAAGA-TAT-TTTCTG-TA-CT-TTT--GCCATG--CAA---G--AA-TTTA-TA-----TA-ATA-CATAT-T-TATATC-A-AA-TC-T-A-GG--AT-A-AAC-ATT--GANA-G-C-A----TAGGA-CAT----NG-T----AG-T-A--TT--T-ATAATG-ACT---A-T-AA--ATG-T-G-------TAA-CAA---C-TT--TTTTAT-TTT----T---AT--TGA-AAGTTTTT--NTTAATT-----A---GGTCATGT
gi|1 : AAG--C--AGATCAAGGC-TCATTCG-ATC-A-T-T--C---T-A---AC-A-T-C-AACACAA-TCC-AA--A--AA-T--C----CAA----AAAT-A--AA---GAT--T-CAC-G-AAATTGCA-AAG--A-TTCTCG--TGATTT-CA---T-AATC--C-AA-A----T--CAG--C-C-A-A-TC--A--AA-AATCC-AAG--AA--TTC-ATA-CTT-CAAGTT
gi|1 : tacgataacTGAGGAA--AATGCGATT-C-C--GTT----GTA--AT-TT-TATG--GACAT-TA---CCTTCCC-GCCT-AAGG---AA--T---TTATCT-CGA-TTAT-G--TGCTAACA--AATA-AAGTA-C-A-TC---TT---TCTT----TCTGGTATAAAA-TA--TTTCTG-TA-CT-TTTCACCCATGCTCAA---GGAAG-TTTA-TA-----T--GTA-CATGT-G-TGTATTAA-AA-TC-T-A-GG--AT-A-AAC-ATA--GACG-G-C-T----TAGGA-CAT----TG-TTACGAG-T-A--TT--A-CTAATACACT---A-T-AA--ATGCT-G-------TAA-CAA---CTTT--TTTTAT-TTT----CA--ATA-TGACAAGTTCT----TTAATTATTCCA---GGTCATcttannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntgaggaaaatgcgattccgttgtaattttatggacattaccttcccgcctaaggaatttatctcgattatgtgctaacaaataaagtacatctttctttctggtataaaatatttctgtacttttcacccatgctcaaggaagtttatatgtacatgtgtgtattaaaatctaggataaacatagacggcttaggacattgttacgagtattactaatacactataaatgctgtaacaactttttttattttcaatatgacaagttctttaattattccaggtcattatttactggccgggagttttaagcacaacgcgtatatgcgaaagagaagtaattaggttcaccggaacattggaaaaggcggagaacatctgcaata
gi|10 : tacgataacaagcagatcaaggctcattcgatcattctaacatcaacacaatccaaaaatccaaaaataaagattcacgaaattgcaaagattctcgtgatttcataatccaaatcagccaatcaaaaatccaagaattcatacttcaagttcttannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnG-A-C-A-T-T--C---CTA---AA-T-T-C-AA---AA-TCC-AA--C--A--T--T----CGA----ACTT-C--AAT--GAT--T-C---G--AAT--CC-AAG--A-TTC--A--AGA-TC-AA---T-A-TC--C--A-A----T--CAG--C-CAA-A-TCA-A--AA-A--TC-AAGA-AA--TTC-ATA-CTC-AAAATTtatttactggccgggagttttaagcacaacgcgtatatgcgaaagagaagtaattaggttcaccggaacattggaaaaggcggagaacatctgcaata
gi|10 : TGAGGAA--A--GCGATT-C-C--GTT----GT---AT-TT-TATG--GA-AT-TA---C--T--T-CCTT-AAGA---AA--TA--TT---C-TGA-TTCT-G--T------A--AATA-AA-TA-C-A-GT---TT---TCTT----TGGG---TAAGA-TA--TTTCTG-TA-TT-TTT--GTCATG--CAA---G--AA-TTTA-TATATTTTA-ACG-CAT-T-T-TATATA-A-AA-TCAT-A-GGC-AT-A-AA--ATT--GA-A-G-CAA----TAGCA-CAC----CG-T----AG-T-A--TT--T-ATAATG-ACT---A-T-AG--ATGAA-G-------T-A-CAA---C-TT--TTTTTT-TTTTTA-T---AT--GAA-AAGTTTTTA-ATTTATT-----nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngtgaggaaagcgattccgttgtattttatggaattacttccttaagaaatattctgattctgtaaataaatacagttttctttgggtaagatatttctgtatttttgtcatgcaagaatttatatattttaacgcattttatataaaatcataggcataaaattgaagcaatagcacaccgtagtatttataatgactatagatgaagtacaactttttttttttttatatgaaaagtttttaatttatt
gi|11 : gacattcctaaattcaaaatccaacattcgaacttcaatgattcgaatccaagattcaagatcaatatccaatcagccaaatcaaaaatcaagaaattcatactcaaaattnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngGAGGAACAG--GCGATTGCGC--GTTTG--GT---AT-TTGTATG--GA-ATGTAAAAC--TTCCGCCTT-AGGA---GA--T---TT---TCTGG-TTATCG--TT-----AGTAATA-AG-TAAC-AATC---TA---TTCTCGGGTCTGGA-TAAAA-TAT-TTTCTGGTA-AT-TT---GC-ATGG-CAAAGAG--AG-TTT---------TA-ATG----AT-T-TA-------GA-TC-TGA-GG--AT-AGAAC-ATA--GACG-GGC-AG---TAGGA-CAT----TG-TT---AG-TCA--TT--CCATAATGGACTTTTA-TCAA--ATG-T-G-------TAA-CAA---C-TT--TTTTAT-TTTGCACT---AT--GAA-AAGTTTTTAAATCAATT-----C---GGTCATGT
gi|12 : --C--AGA---AGGC-TCATTCG-A-C-A-T-T--C---T-A---AA-T-T-C-AA---AA-TCC-AA--A--A--T--T----CGA----AATTCC--AA---TAT--T-C---GAAAAT--CC-AAA-----TC--A--AGATTC-AA---T-A-TC--C-AA-AT---T--CAG--C-C-A-A-TC--A--AA-A--TC-AAG--AA--TTC-ATA-CTT-CAATTTTCCTTT-GTAGTTatacttgggccggagttttgaaacataatgcgtatatgcgaacagggaatattaaaggtatccgggaacatggaagagggccggttgaacatctgtag
gi|12 : cgaaagccATGAGGAA--G--TCGATT-C-C--GTT----GT---AT-TT-TATG--GA-AT-TA---C--TTCC-CTTTAAAGA---AA--T---TT---T-TGA-TTAT-A--TA-----A--AAT--AA-TA-C-A-TT---TA---Taatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatgaggaagtcgattccgttgtattttatggaattacttccctttaaagaaatttttgattatataaaataatacatttat
gi|13 : cgaaagcccagaaggctcattcgacattctaaattcaaaatccaaaattcgaaattccaatattcgaaaatccaaatcaagattcaatatccaaattcagccaatcaaaatcaagaattcatacttcaattttcctttgtagttaatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn--A--GCGATT-C-T--GT-----GT---ATGTT-TATA--GA-AT--A---C--TCCC-CCTT-AAGA---AA--TGCTTT---C-TGA-TTAT-G--TA-----A--AATA-AA-TA-C-ATTT---TAAACTGTT----TCGG---TAAAA-TAT-TCT-TGTTA-CT-TTT---CCTTG--CAAT--G--AATTTTA-TA-----TA-ATA-CACAT-T-TATATC-A-AATTC-T-ATAG--AT-A-AAA-ATTTAGAAATG-C-AG---TAGGA-C-T----GG-TA---AG-T-ATTTT--T-ATATTT-ACT---T-T-TA--ATG-T-G-------TAA-CAA---C-TTTCTTTTAT-TTTTA--T---AT--TG--AAGTTTTT--CTT
gi|14 : atA--A--GCGATT-C-CT-GCTTGGCGT---AT-TT-TACGTAGA-ATGTA---C--TCCC-CCTT-AAGA---AA--T---TT---TCTGA-TTAT-GCCTA-----GC-AATA-AA-TA-CGA-TT---TA---C-------TCGGGC-TAAAA-TAT-TT-CTG-TATCT-TTT--GCCA-G--CAAA--G--AA-TTTA-TA-----TA-ATA-CATAT-T-TA-ATC-AGAA-TC-A-A-AG--ATAA-AAT-ATA--GACA-G-C-A----TAGGA-CAT----GG-T----AG-T-A--TTGAT-ATAATG-ACTTC-T-T-AAGCATG-TGG-------TAA-CAA-----TT--TTTTAC-TTC----T---ATAATGA-AAGTTTg
gi|15 : gatCATTCG-AAC-A-T-T--C---A-A---AAGT-T-C-AA---AA-TCC-GA--A--A--T--T----CGA----AATC-C--AA---GAT--T-C---A-AAAT--AC-AAT--A-TTC--G--AGATTC-AA---T-A-TC--T-AA-A----T--CAG--C-C-A-A-TC--A--AA--------------------ATA-CTT-CAAATTTCCTCT-GTAGTT
gi|15 : AAT----G---TTTACGAAAGT---C-CAGAAGGCT----------------------------TCATTCG-A-C-A-T-T--C---T-A---AA-T-T-C-AA---AA-TCCAAA--A--A--T--T----CGA----AATT-C--AA---TAT--T-----G-AAAT--CC-AAGATA-TTC--A--AGATTC--A---T-A-T---C-AA-A----T--CAG--C-C-A-A-TC--A--AA-A--TC-AAG--AA--TTC-ATA-CTT-CAtttacgaaagtccagaaggcttcattcgacattctaaattcaaaatccaaaaattcgaaattcaatattgaaatccaagatattcaagattcatatcaaatcagccaatcaaaatcaagaattcatacttca
gi|16 : aactacagaggaaatttgaagtattttgattggctgatttagatattgaatctcgaatattgtattttgaatcttggatttcgaatttcggattttgaacttttgaatgttcgAAAC--C--AGA---AGGC-TCATTCG-A-C-G-T-T--C---G-A---AA-T-T-C-AA---AA-CCC-GA--A--A--T--T----CGA----AACC-C--AA---GAT--T-C---G-AAAT--GC-GAG--A-TTC--G--TGATTC-AA---T-----------------------------A-A-TC--A--AA-A--TA-AGG--AA--TTC-ATA-CTT-CAAATTTCCCCT-GTA
gi|17 : aagaatcatttctcaccggtcatgcagatttctgtcgtcaaacacatgcaagggtctgtacaaggtttaaagctcatgtgaaaatttgaaaaatagctgtacaaa--A--AC-A--TA-AGG--GA--TTC-GTA-CTC-CAAATTTTCTCT-ATAGTT
gi|18 : ---T--ACGAAAGC---T-CAGAAGGCT-CATTnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncg
gi|18 : gattagcttttcagactgataacgttaagc--C--AGA---AGGC-TCATTT-----------------A-A---GA-T-T-C-AA---AA-TCC-GA--G--A--T--C----CGA----AATC-C--AA---GAC--C-T---G-AA------------A-TTC--G--ATATTC-AA---T-A-TC--C-AA-A----T--CAT--C-C-A-ATTC--A--Ataagattcaaaatccgagatccgaaatccaagacctgaaattcgatattcaatatccaaatcatccaattcaatcgtatgaaacagcgtctattacaatccaagatttcgta
gi|19 : gattagcttttcagactgataacgttaagctacgaaagct---T--ACGAAAGCGCGCACAGAAGGCT-CATTtcgtatgaaacagcgtctattacaatccaagatttcgta
gi|19 : A--C--AGA---AGGC-TCATT-G-A-CTA-T-T--CCGAC-G---AA-T-TCC-CA---AC-TCC-CA--A--AACT--T----CGGGAACAATT-C--AA----AT--T-C---G-AGG------AGA--A-TTC--G--TGATTC-AACCCT-A-TCCAC-AA-A----T--CAGGCC-C-A-A-TC--AGGAA-A--TCAAAG--AA--TTCAATA-CTTGCAAAGTTgactattccgacgaattcccaactcccaaaacttcgggaacaattcaaattcgaggagaattcgtgattcaaccctatccacaaatcaggcccaatcaggaaatcaaagaattcaatacttgcaaagttt
gi|2 : tacgaaagcgcgcAAAAGCC--AGA---AGGC-TCATTCG-A-C-ATT-T--C---T-A---AA-T-T-C--A---AG-TCC-AA--A--A--T--T----CGA----AATT-C--AA---GATTCT-C---A-AAAC--C---AG--A-TT---G--TGATTC-AAT--T-A-TC--C-AA-A----T--CAG--C-C-A-ACTC--A--AAGA--TG-AAG---A--TTC-ATA-CTC-TAAAGTTt
gi|2 : attgtaatatcagacatattacttcttgagatgaattggcgaaatcagcattacatatctacgTGAGGAA--A--GCGATT-C-C--GTTT---GT---AT-TT-TATG--GA-AT-TA---C--TTCC-CCTT-GAGA---AATTT---TT---T-TGACTTAT-G--TA-----A--AATA-TG-TA-C-A-CT---T------TC----TCGG---TAAAA-TA--TTTCTG-TC-TC-TTT--GCCATG--C-A---G--AA-TTTA-TA---------------------ATATT-A-AA-TA-T-A--A--AT-A-AAC-A-A--GACG-G-C-A----TAGGA-CCA----AGTT----AG-T-A--TTC-C-ATAATG-ACT---A-T-AA--ATG-T-G-------TAAGCAA---C-TT--TTTTAT-TCA----T---AT--TGA-AAGTTTTT--A--AATT-----ATTCGGTCATttannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntgaggaaagcgattccgtttgtattttatggaattacttccccttgagaaatttttttgacttatgtaaaatatgtacactttctcggtaaaatatttctgtctctttgccatgcagaatttataatattaaatataaataaacaagacggcataggaccaagttagtattccataatgactataaatgtgtaagcaacttttttattcatattgaaagtttttaaattattcggtcattataacctgtgccggcgccttaaacagaagcgtaatgtgcgaatggaatcctatacagaaaaccggaactggaagaggcggcagaacatctgtata
gi|20 : attgtaatatcagacatattacttcttgagatgaattggcgaaatcagcattacatatctacgaaaagccagaaggctcattcgacatttctaaattcaagtccaaaattcgaaattcaagattctcaaaaccagattgtgattcaattatccaaatcagccaactcaaagatgaagattcatactctaaagttttannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnA--A--GCGATT-C-C--GTT----GT---AT-TC-TATT--TA-AT-TA---C--CTCC-AATT-AAAT---AA--T---TT---T-C------T-G--TA-----A--AATACAA-TG-T-A-CTA--CA---TTTTAT--TCTG---TAAGAATAT-GT-CTG-TA-TT-TTT--GCCATG--CAA---G--AA-TCTA-TG-----TA-ATG-CACAT-T-TATATT-A-Atataacctgtgccggcgccttaaacagaagcgtaatgtgcgaatggaatcctatacagaaaaccggaactggaagaggcggcagaacatctgtata
gi|21 : --GAAA-G-C-A----TAGGAACAT----TGGT----AG-T-A--TT--T-ATAATG-A-T---ACT-AG--ATG-T-GGC-----TAA-GAATCTT-TT--TTTTCT-TTT----TATAAT--TAA-AAGTT
gi|22 : ---T--ACGACAGC---C-CAGATGGCT-CATTC--AA-------------------CATTCA-G-G-A-T-T--C---G-A---AA-T-T-C-AA---TA-TCC--A--T--A--TCAT----CG-----AATC-C--AA---atattgaagtttttcttggttgtgta
gi|22 : AT--T-C---A-ACAT--TC-AGG--A-TTC--G--AAATTC-AA---T-A-TC--C-AT-A----T--CAT--C-G-A-A-TC--C--AA-A--TA-AAG--GA--TTC-ATA-TTT-CGAATTTCCTCT-GTAGTataaaggattcatatttcgaatttcctctgtagt
gi|23 : tacgacagcccagatggctc--C--AGA---AGGCCTCATTCG-A-C-A-T-T--T---C-T---AA-T-T-C-AA---AT-TCC-AA--A--A--T--T----CGA----AATT-C--AA---GAT--T-C---G--AAT--TC-AAG--AGTTT--G--TGATTC-AAG--T-A-TT--C-
gi|24 : cgaaagc--C--AGA---AGGC-TCATTCG-A-C-A-T-T--C---G-A---AA-T-T-C-GA---AA-TCC-AA--G--A--C--T----CGA----AATG-C--GA---GCT--T-C---catgagtc
gi|26 : cggaatctgtaaatgtatacttgcgattagtcC-T-A-GG--GT-A-AAC-ATT--GAAA-A-C-A----TAGGA-CAT----GA-T----AG-T-A--TT--T-AT-ATG-ATT---a
gi|3 : AAT----G---T--ACGAAACC---C-CAG--------------------T--ACA---AGGC-TCATTCG-A-C-A-C-TTCC---T-A---AA-TAT-C-AACA-AA-TCC--A--A--A--T--T----CGA----AATT-C--AA---GAT--T-CCAAG-AAGT--CC-TA---A-TTC--GTTA-ATTCGAA---T-A-T---C-AA-A----T--C-G--CAC-A-A-TCAAA--AA-A--TC-CGG--AA--TTC-
gi|3 : aatattcacttcggaatccggattgctttttctgaacatcttgattatgaaaaatacactTAT-AGGGA--A--GCGATT-T-CCTGTT----GTTCTAT-TT-TATG--GA-AT-TA---C--TC------T-AAGATTTTA--T---TC---T-TGA---AT-A--AA-----A--AATA-AC-TT-C-A-TTATCTG---TCTTA---TCA-----AAGA-TAT-TTCCTT-TA-CTAATT--ACCATG--CAA---A--GA-GATA-TC-----TA-AAATCATACAT-TATATT-A-AA-TTAT-A-GG--AC-A-AACGATT--GATACC-C-AAGACTAGCA-CATGCGACG-T----AGCT-A--CTA-T-AT-----ACT---A-T--A--ATC-TAG-------TCA-AGA---C--A--TTTTAT-TTC----T---Acgactgatatcattgcgcaaaatctnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngtaattggtatagggaagcgatttcctgttgttctattttatggaattactctaagattttattcttgaataaaaaataacttcattatctgtcttatcaaagatatttcctttactaattaccatgcaaagagatatctaaaatcatacattatattaaattataggacaaacgattgatacccaagactagcacatgcgacgtagctactatatactataatctagtcaagacattttatttctaaatatatgatttcatgttcattcgct
gi|4 : aatattcacttcggaatccggattgctttttctgaacatcttgattatgaaaaatacactaatgtacgaaaccccagtacaaggctcattcgacacttcctaaatatcaacaaatccaaattcgaaattcaagattccaagaagtcctaattcgttaattcgaatatcaaatcgcacaatcaaaaaatccggaattccgactgatatcattgcgcaaaatctnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngtaattggTCAGAACTTGAAGAGGTTAGGG---T--ACGGAAGC---C-CAGAAGGCT-Caatatatgatttcatgttcattcgct
gi|4 : aaagaattctttcttcgattaagttgctgtgaattgtacatcagcaactcatcgggtgcactatttgtttatt--C--AGA---AGGC-TCNNNNN-N-N-N-N-N--N---N-N---NN-N-N-N-NN---NN-NNN-NN--N--N--N--N----NNN----NNNN-N--NN---NNN--N-N---N-NNNN--NN-NNN--N-NNN--N--NNNNNN-NN---N-N-NC--C-AA-A----T--CAG--C-C-A-A-TC--A--AA-A--TC-AAG--AA--TTC-ATA-CTT-CAAATTTCCTTT-GTAGTTnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnccaaatcagccaatcaaaatcaagaattcatacttcaaatttcctttgtagttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntgaggaagtcgattccgttgtattttatggaattacttccccttaaggatttttgattatatgaaataaatgtatttatctttctttaagaatatttctgtaaatttgccaagctagaatttataaaatacatatttatattcaatctagggtaaacattgaaagcataggacatggtagtatttataatgactataaatgtgtaacaacttttcaatttttatattgaagttttttcttgatta
gi|4 : aaagaattctttcttcgattaagttgctgtgaattgtacatcagcaactcatcgggtgcactatttgtttatttcagaacttgaagaggttagggtacggaagccTGAGGAA--G--TCGATT-C-C--GTT----GT---AT-TT-TATG--GA-AT-TA---C--TTCC-CCTT-AAGG---A---T---TT---T-TGA-TTAT-A--TG-----A--AATA-AA-TG-T-A-TT---TA---TCTT----TCTT---TAAGA--ATATTTCTG-TA-AA-TTT--GCCAAG--CTA---G--AA-TTTA-TA-----AA-ATA-CATAT-T-TATATT-C-AA-TC-T-A-GG--GT-A-AAC-ATT--GAAA-G-C-A----TAGGA-CAT----GG-T----AG-T-A--TT--T-ATAATG-ACT---A-T-AA--ATG-T-G-------TAA-CAA---C-TT--TTCAAT-TTTTA--T---AT--TGA-AGTTTTTT--CTTGATT-----A---nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntgaggaagtcgattccgttgtattttatggaattacttccccttaaggatttttgattatatgaaataaatgtatttatctttctttaagaatatttctgtaaatttgccaagctagaatttataaaatacatatttatattcaatctagggtaaacattgaaagcataggacatggtagtatttataatgactataaatgtgtaacaacttttcaatttttatattgaagttttttcttgatta
gi|5 : aaagaattctttcttcgattaagttgctgtgaattgtacatcagcaactcatcgggtgcactatttgtttatttcagaacttgaagaggttagggtacggaagcccagaaggctcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnccaaatcagccaatcaaaatcaagaattcatacttcaaatttcctttgtagttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn----G---T--ACGAAAGC---C-CAGAAG---------------------------GGC-TCATTCG-A-C-A-TCT--C---G-A---AA-T-T-C-AA---AA-TCC-CA--AAGA--T--TCCCGCGAGT--AATT-C--AAGCTGAT--T-C---G----T------GG--A-TTT--C--A-ATTT-AG---T-T-TC--CTAA-ATATTT--CAG--T-C-T-A-AC--A--AA-A--TC-AAG--------T-ATA-TTT-CTATTTATCTCTAATAGT
gi|5 : cTATGAGATA--A--GCGATT-C-CT-GCTTGGCGT---AT-TT-TACGTAGA-ATGTA---C--TCCC-CCTT-AAGA---AA--T---TT---TCTGA-TTAT-GCCTA-----GC-AATA-AA-TA-CGA-TT---TA---C-------TCGGGC-TAAAA-TAT-TT-CTG-TATCT-TTT--GCCA-G--CAAA--G--AA-TTTA-TA-----TA-ATA-CATAT-T-TA-ATC-AGAA-TC-A-A-AG--ATAA-AAT-ATA--GACA-G-C-A----TAGGA-CAT----GG-T----AG-T-A--TTGAT-ATAATG-ACTTC-T-T-AAGCATG-TGG-------TAA-CAA-----TT--TTTTAC-TTC----T---ATAATGA-AAGTTTTannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncggacccattcccacccggagtgtctatgagataagcgattcctgcttggcgtattttacgtagaatgtactcccccttaagaaattttctgattatgcctagcaataaatacgatttactcgggctaaaatatttctgtatcttttgccagcaaagaatttatataatacatatttaatcagaatcaaagataaaatatagacagcataggacatggtagtattgatataatgacttcttaagcatgtggtaacaattttttacttctataatgaaagttttgaaatgatctgtc
gi|6 : cgtacgaaagcccagaagggctcattcgacatctcgaaattcaaaatcccaaagattcccgcgagtaattcaagctgattcgtggatttcaatttagtttcctaaatatttcagtctaacaaaatcaagtatatttctatttatctctaatagtannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncggacccattcccacccggagtgtcATCAAAATT-AA-GAAAT----AAGAT--ATGAAAG--------GA--GTTACGTAC-GAAAG--CCCAGA---TGGC-TCATTCGGA-C-A-T-TT-C---T-A---AA-T-TTC-AA---AA-TCCCAA--A--A--T--T----CGA----AATT-C--AA---TAT--T-C---G-AAAT--CC----------C--A--AGATTC-AA---TGA-TC--C-AATT----T--CAG--C-C-A-A-TC--T--AA-A--TC-AAAGCAA--TTC--TACCTT-CAAATgaaatgatctgtc
gi|6 : TAAGGAA--A--GCGATT-C-C--GTT----GTT--AT-GT-TTTG--GA-AG-TA---C--TCCC-CTTA-AAGA---AA--T---TT---TCTGA-TGCT-G--TA-----A----TA-AA-TA-C-A-GG---TG---TTTTC---TTGG---TAAGA-TA--TTTCTG-TA--T-TTT--GTCATG--CAA---A--AA-TTTATTA-----TATTTA-C-TAT-TCTATATA-A-AATTC-T-A-GGATAT-A-AAC-ATT--GAAA-G-C-AT---TAGGA-AAC----CG-T----AG-T-A--TT--T-A-AATG-ACTA--A-T-AC--ATG-T-AAATAAGTTAA-CAA---C------TTTAT-TTA----T---AT--TGA-AAGTTTTT--gtnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnagtagtatgattaaggaaagcgattccgttgttatgttttggaagtactccccttaaagaaattttctgatgctgtaataaatacaggtgttttcttggtaagatatttctgtattttgtcatgcaaaaatttattatatttactattctatataaaattctaggatataaacattgaaagcattaggaaaccgtagtatttaaatgactaatacatgtaaataagttaacaactttatttatattgaaagtttttaat
gi|7 : atcaaaattaagaaataagatatgaaaggagttacgtacgaaagcccagatggctcattcggacatttctaaatttcaaaatcccaaaattcgaaattcaatattcgaaatcccaagattcaatgatccaatttcagccaatctaaatcaaagcaattctaccttcaaatgtnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnagtagtatgatATCAACATG-CA-GGGAT----G---T--ATGAAAGC---C-GAGAAGGCT-CATTCGTAAAAGCC--AGA---AGGC-TCATTCG-A-C-A-T-T--C---T-A---AA-T-T-C-AA---AAATCC-AA--A--A--T--T-----GA----AATT-C--AA---TAT--G-C---G-AAAT--CC-AAG--A-TTC--A--AGATTC-AA---T-A-TC--C-AA-A----T--CAG--C-C-A-A-----A--AA-A--TC-AAG--AA--TTC-ATA-CTT-CACATTTCCTTT-GTAGTTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTATGAGGAA--G--TCGATT-C-C--GTT----AT---AT-TT-TATG---A-AT-TA---C--TTCC-CCTT-AAGA---AA--T---TT---T-TG--TTAT-A--TA-----A--AATA-AA-TA-C-A-TT---TA---TCTT----TCTG----AAGA-TAT-TTTCTG-TA-AA-TTT--GCCAAG--CAA---G--AA-TT-A-TA-----AA-ATT-CATAT-T-TATAT----AA-T--T-C-GG--GT-A-AAC-ATT--GA-A-T-C-A----TAGGA-TAC----CG-T----AG-T-A--TT--T-ATA-TG-ACT---A-T-AA--ATG-T-G-------TAA-CAA---C-TT--TTTTAT-TTT----T---AT--TG--AAGTTTTT--GTTGATT-----A---GGTAATATaat
gi|8 : --C--AGA---ATGT-TCAGTAG-G-C-A-T-T--C---G-A---AA-T-T-C-AT---AA-TCC-GA--A--A--T--T----CGA----AATT-C--AA---GAT--T-C------------C-AAG----TCC--G--AGAATC-AA---T-A-TC--C-AA-A----T--CAG--C-C-A-A-TC--A--AA-A--TA-AAG--AA--TTC-ATA-CTT-CAAATTTCCTCT-GTA
gi|8 : tgattgtttcaaagaacaggaaactgggtttattacggatgccTGAGGAA--A--GCGATT-G-C--GTT----GT---AT-TG-TATG--GA-AT-TA---C--TACC-CCTG-AAGT---AA--T---TT---TCTGA-TTAA-G--TA-----A--AATA-AA-TA-C-A-TT---TT---TCTT----TCTT---TAAGA--ATATTTCTG-TA-CT-GTT--GTCATG--CAA---G--AA-TTCA-TA-----GA-ATA-CACAT-T-TATATC-A-AA-TC-T-T-GC--GT-A-AAC-ATT--GAAA-G-C-A----TGACA-TAT----GG-T----AG-T-T--TT--T-ATAATG-ACT---A-T-AA--ATG-T-G-------TAA-AAA---C--A--TTTTATATTA----T---AT--TAA-----TTTT--TTTAATA-----A---GGTCATnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntgaggaaagcgattgcgttgtattgtatggaattactacccctgaagtaattttctgattaagtaaaataaatacatttttctttctttaagaatatttctgtactgttgtcatgcaagaattcatagaatacacatttatatcaaatcttgcgtaaacattgaaagcatgacatatggtagtttttataatgactataaatgtgtaaaaacattttatattatattaatttttttaataaggtcattcaaagatttgtaaaaaa
gi|9 : tgattgtttcaaagaacaggaaactgggtttattacggatgcccagaatgttcagtaggcattcgaaattcataatccgaaattcgaaattcaagattccaagtccgagaatcaatatccaaatcagccaatcaaaataaagaattcatacttcaaatttcctctgtannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn---T--ACGAAAGC---CGCAGAAGGCT-CATtcaaagatttgtaaaaaa
gi|9 : --C--AGA---AGGC-TCAT-CG-A-C-A-T-T--C---T-ACATGA-T-T-CCAA---AA-TTC-AGTTA--C--T--T----CGAGA--AATT-CGCAA---GAT--TTC---A-AAAT--CCCAAG--A-T----G--TGATTC-AA---T-AATC--C-AG-A----TATCAG--C-C-AGA-TC--A--AA-----T-GAG--AACATTC-ATA-CTT-CAAAGTTcgacattctacatgattccaaaattcagttacttcgagaaattcgcaagatttcaaaatcccaagatgtgattcaataatccagatatcagccagatcaaatgagaacattcatacttcaaagtttannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatgagggatagcgattctgtgtatgtttatagaatactcccccttaagaaatgctttctgattatgtaaaataaatacattttaaactgtttcggtaaaatattcttgttacttttccttgcaatgaattttatataatacacatttatatcaaattctatagataaaaatttagaaatgcagtaggactggtaagtatttttatatttacttttaatgtgtaacaactttcttttatttttatattgaagtttt
gi|9 : tacgaaagccgATGAGGGAT-A--GCGATT-C-T--GT-----GT---ATGTT-TATA--GA-AT--A---C--TCCC-CCTT-AAGA---AA--TGCTTT---C-TGA-TTAT-G--TA-----A--AATA-AA-TA-C-ATTT---TAAACTGTT----TCGG---TAAAA-TAT-TCT-TGTTA-CT-TTT---CCTTG--CAAT--G--AATTTTA-TA-----TA-ATA-CACAT-T-TATATC-A-AATTC-T-ATAG--AT-A-AAA-ATTTAGAAATG-C-AG---TAGGA-C-T----GG-TA---AG-T-ATTTT--T-ATATTT-ACT---T-T-TA--ATG-T-G-------TAA-CAA---C-TTTCTTTTAT-TTTTA--T---AT--TG--AAGTTTTtannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatgagggatagcgattctgtgtatgtttatagaatactcccccttaagaaatgctttctgattatgtaaaataaatacattttaaactgtttcggtaaaatattcttgttacttttccttgcaatgaattttatataatacacatttatatcaaattctatagataaaaatttagaaatgcagtaggactggtaagtatttttatatttacttttaatgtgtaacaactttcttttatttttatattgaagtttt
1 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|25 ): CGGCATGTGCGAAGGAAATATTTAAGGTACCAGAAAATGGAAGAGGCGGAGAACATC