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blockSeqs : .
blockSeqCons : ** ATA******** C********** ** CA*** A*** ** ** ** A* C**** GT********* ** ** G***** *** ** CC********* ** GCC******** CTC* ** ** T* **
originalCons : CATGTATTATTCACATT-AT--T--ATAT---A-----TT--CTGAA-GTACGAT-AT--TACATT--GATA----C------TAGCCCC---AG--AAAGAAGTGCATG--CTT--C-ACT-G-TACCTTGGT-GATGA-TAT--A-CATTT-ATTGC-AC-GGCAATGAGGGG-GAT------AT--GAAGATTTA-TTCAGCCTAAAAGAAC--C--ATATTCC-TC--GAGGGCAACGGCT-TTCA--ATTAAAAA-CGT-GC----GTGTTTCCGCTAAACT-----T-----TA-TATTCAGAGCAAAGGCGG-ATCCAGC-GC--TGGCGC-ACCCCCACCCC---C-CCCCGTTTGAGA-G--CCTTTTTTGG-----TATGTTTGTTTT-G-CTTGTTAGTAAA---TCCCAGAC--CA-----CC----G-ATTT--GTC-ACTG------CCTCCCCCCCCTCCT-TCTGAAAT-CTCTGGATACGCCAC----TG-CAGAG--GG--TTGGTTA-GTCAAGAC---TTT-ATCTA--GA-CTATT-TAAATCTC---AT-CA--TAAA----A-TAAGCGC--TGTGTAAA-ATT-ATG-ATAGTT
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2 sequences could not be aligned to this reference sequence:
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Reference ( family-266 ) : CATGTATTATTCACATT-AT--T--ATAT---A-----TT--CTGAA-GTACGAT-AT--TACATT--GATA----C------TAGCCCC---AG--AAAGAAGTGCATG--CTT--C-ACT-G-TACCTTGGT-GATGA-TAT--A-CATTT-ATTGC-AC-GGCAATGAGGGG-GAT------AT--GAAGATTTA-TTCAGCCTAAAAGAAC--C--ATATTCC-TC--GAGGGCAACGGCT-TTCA--ATTAAAAA-CGT-GC----GTGTTTCCGCTA-AACT--G----T---TA-TATTCAGAGCAAAGGCGG-ATCCAGC-GC--TGGCGC-ACCCCCACCCC---C-CCCCGTTTGAGA-G--CCTTTTTTGG-----TATGTTTGTTTT-G-CTTGTTAGTAAA---TCCCAGAC--CA-----CC----G-ATTT--GTC-AC-TGC--------CCCCCCCCTCCT-TCTGAAAT-CTCTGGATACGCCAC----TG-CAGAG--GG--TTGGTTA-GTCAAGAC---TTT-ATCTA--GA-CTATT-TAAATCTC---AT-CA--TAAA----A-TAAGCGC--TGTGTAAA-ATT-ATG-ATAGTT
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gi|4 : ataacatgatgtctttatttaaggttttttgttggtgatgggggatacatatcttcaAGATTTA-TTCAGCCTAAAAGAAC--C--ATATTCC-TC--AAGGGCAGCG-TT-TTCA--ATTAAAAA-CGT-GA----GTGTTTCCGCTA-AACT--G----TATTTA-TATTCAGAGCAAAGGCGG-ACCCAGC-GC--TGGCGC-ACCCCCACCCC---------GTTTGAGA-G--CCTTTTTTGG-----TATGTTTGTTTT-G-CTTGTTAGTAAA---TCCCAGAC--CA-----CC----G-ATTT--GTC-AA-TTC--------CCCCCCCCTCCT--CTGAAAT-TTTTGGATCCGCCTC----TG-CAGAG--GG--TTGGTTA-GTCAAGAC---TTT-ATCTA--GA-CTATG-TAAATCTC---AT-GA--TAAA----A-TAAGCGC--TGTGTAAA-ATT-ATG-AT
gi|5 : AAGATTTA-TTCAGCCTAAAAGAAC--C--ATATTCC-TC--AAGGGCAACG-TT-TTCA--A---AAAA-CGT-GA----GTGTTTCCGCTA-AACT--GATATT---TA-TATTCAGAGCAAAGGCGGGACCCAGC-GC--TGGCGC-ACCCCCACCCC---------GTTTGAGA-G--CCTTTTTTGG-----T-TATTTGTTTT-G-CTTGTTAG-AAA---TCCCAGAC--CA-----CC----G-ATTT--GTC-AA-TTC--------CCCCCCCCC----TCTGAAAT-TTTTGGATCCGCCTC----TG-CAGAG--GG--TTGGTTA-GTCAAGAC----TT-ATCTA--GA-CTATG-TAAATCTCATGAT-GA--TAAA----A-TAGACGC--TGTGTAAATATT-ATG-
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