lowQualScore : 111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111
lowQualScore : 11111 1111 1111 333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333 1 111 11111 2222222 1111 111111111 222222222 3333333333333333 111 4444444444444 1111111111 4444444444444444444 111111 777777777777777777777777777777777777777777777 11 33333333333 1 33333333333 111 11 11111 11111111111 11 1111111111111 22222 111 222222222222222222 44 222
lowQualScore : 6 5 88 44444 5 5 5 5 5 3 7777 5 5 5 2 66 9 0000 5 2 5 5 5 333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333 7 111 88888 6 6 3333333 6 6 6 6 6 888 99 6 0000 5 77 555555555 5 555555555 888 1 4 8888888888888888 888 4 4 777 4 0000000000000 4 1 8888888888 4 4 66 4 66 4 2222222222222222222 8 4 4 999999 4 4 4 3 444444444444444444444444444444444444444444444 1 5 44 99999999999 0 4 4 00000000000 4 222 44 55 00000 55555555555 4 4 99 33 4 4 777 1111111111111 4 88888 999999 555 4 777 777 777777777777777777 55 44 44 4 4 00 666 6 6
lowQualScore : . . .. ..... . . . . . . .... . . . . .. . .... . . . . . ................................................................................................................................. . ... ..... . . ....... . . . . . ... .. . .... . .. ......... . ......... ... . . ................ ... . . ... . ............. . . .......... . . .. . .. . ................... . . . ...... . . . . ............................................. . . .. ........... . . . ........... . ... .. .. ..... ........... . . .. .. . . ... ............. . ..... ...... ... . ... ... .................. .. .. .. . . .. ... . .
lowQualScore : 0 7 77 33333 0 7 0 0 0 8 9999 0 0 0 5 99 4 6666 0 5 0 0 7 555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555 0 777 00000 7 7 5555555 7 7 7 7 7 777 22 0 6666 0 44 666666666 0 111111111 888 1 4 8888888888888888 111 4 4 888 4 9999999999999 4 1 0000000000 0 0 11 4 33 4 6666666666666666666 9 4 4 333333 4 4 4 9 222222222222222222222222222222222222222222222 1 0 55 44444444444 0 4 4 77777777777 4 444 44 55 00000 44444444444 0 0 55 44 0 0 000 7777777777777 0 44444 333333 666 0 000 000 555555555555555555 55 77 77 0 0 66 000 7 7
consensus : NAAGGGGAAT-CCCCG-AATTT-----AAGAAAAA-CTGC-CTG-CTTGAAACAAAAT-AANTTN-G-TACA-A-AA-ATGTTCTTTGAGATTTT--CACTAAAAAAT----TGTC-GCTTT-GAAA-TTTTGTTTCAC-GCATGCANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAAAACGTCCAAC---TG--TTTTT-TTT-TAA----A--CGACC-G-A-G-TTCGAA-TCTTTCACGG-A-TAC--ATTTTTTCCNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCGCTTCT----GTGATA-TGGTTTTT--C-AG---C-ACA--G-C---AA---GGCATCAAG-GC---TAT-TAAG--CC-GAAGGAA-GATAA-A-A---T-A--TA--T-----CCCTTGTT-AATGGA-------CG-CAG-C-ACA--G-GACT-AAA-CTG----T---A--A-A---A-AT-TG-AA-CA-AT---GT-AT-A-TCTA-A---AAA-C-GA--A-ATGATA-TAT-T--------CCA-G---TTGCA-AATT-GCAATTGTAA-T----ATT-CAATATTT-TCAG-G---T----GC-ATGGA-CATA-T-ATTTTGAAC--TCTA-----TTGAAC-C---T-----TAA-TAA-T--GC-C-A-TTA---AAC---T-A---A---C-AAA--TG-TG-AA--TCTG-TCT-TA---TTT---TTCGATTT--C--AAA-TA-ATA---A--GTG-TGGAC-AAAAAT-G-AATTGA-AACATAAATAT-TTTTA-CG-CTTGCCC
Reference ( gi|2 ) : CAAGGAGAAT-CCCCG-AATTT-----AAGAAAAA-CTGC-CTG-CTTGAAACAAAAT-AATTTT-G-TACA-A-AA-ATGTTCTTTGAGATTTT--CACTAAAAAAT----TGTC-GCTTT-GAAA-TTTTGTTTCAC-GCATGCANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAAACGACCAAC---TG--TTATT-TTT-TAA----A--CGACC-G-A-G-TTCGAA-TCTTTCACGG-A-TAC--ATTTTTTTCNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCGCTTCT----GTGATA-TGGTTTTT--T-AG---C-AC---G-C---AA---GGCATCAAG-GC---TAT-TAAG--CC-GAAGGAG-GATAA-A-A---T-A--TC--T-----CCCTTGTT-AATGGA-------CG-CAG-C-ACA--G-GACT-AAA-CTG----T---A--A-A---A-AT-TG-AA-CA-AT---GT-AT-A-TCTACATGTAAA-C-AA--A-ATGCTA-TAT-T--------CCA-T---TTGCA-AATT-ACAATAGT---T----ATT-CAATATTT-TCAG-G---A----GT-ATGGA-CATA-T-ATTTTGGAC--TCTA-----TTGAAC-T---T-----TAA-TAA-T--GT-C-A-TTA---AAC---T-A---A---C-AAA--T--TG-AA--TCTG-TAT-TA---TTT---TTCGATTT--T--AAA-TA-ATG---A--GTG-TGGAC-AAAAAT-G-AATTGACAACATAAATAT-TTTTA-CG-CTTGTCC
gi|16 : AAGGGGAATACCCCG-AATTTTAAAGAAAAAAAA-CTGC-CTG-CTTGAAACGAAAT-AATTTA-A-TACA-A-AA-ATGTTC-TTGAGATGTTCCCATAAAAAAAT----TGTCTGCTTT-GAAA-TTTTGTTTCA
gi|1 : caAGGGGAAT-CCCCGAAATTT-----AAG-AAAA-CTGC-ATG-CTTGAAACAAAATAAATTTA-G-TACA-A-AA-ATGTTCTTCGAGATGTT--CACT-AAAAAT----TGTC-GCTTT-GAAA---TTGTTTCAC-GCATGgc
gi|6 : acAGGGGAAT-CCCCG-AATTT-----AAGAAAAA-CTAC-CTG-CTTGAAACAAAAT-AAATTT-AATACA-A-AA-ATGTTCTTTGAGATTTT--CACTAAAAAAT----TGTC-GCTTT-GAAA-TTTTGTTTCAC-GCATGCANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAA-ATGTCCAAC---TG--GTTTTATTT-TAA----A--CGACCTG-A-G-TTCGAA-TCTTTCACGG-A-TAC--ATTTTgcannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntctaactggttttttttttaaacgaccgagtgcgaatctttcacggatacaatttttccctgtannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntctatttcgcttctgtgatatggtttttagcagcacggcaaggcatcaaggctataaggcccgaaggaagataaaatatataatatcccttgttaatggacacagccacaggactaaactgtataaatattggaacaatgtatgatctacatgtaaaacgaaatgatatattttcagttaccatgtacaaattgcaattgtaatatttcaatattttcaggtgccatggacatattattttaactctattaaagcttaataatgccaattaaactaacaaaatgtgaatttgtcttatttttcgatttcaaatgataagaactgaaacataaatatttaccg
gi|17 : acAGGGGAAT-CC----GATTT-----AAGAAAA--CTGC-CTG-CTTGAA-CAAA-T-AATTT--G-TTCA-A-AAGATGTT-TTTGAGATTTT--CAAT-AAAAGT----TGTC-G-TTT-GAAA-TTTTG-TTCAC-GCATG
gi|3 : acGGGAAT-CCCC--AATTA-----AAGAAAAAACTGC-CTG-CTT-AAACAAAAG-AATTTA-A-TACA-A-AA-AT-TTCCTTGA-ATTTT--CACTAAAAAAT----TGTC-GCTTT-GAAA-TTTTGTTTCAC-GCATGCA
gi|9 : acaGGGAAT-CCCCG-AATTT-----A-GAAGAA-CTGC--TG-CTTGAAACAAAAA-AAGTTT-G-TACA-A-AA-ATG-TCTTTGAGATTTT--CACT-AAAAAT----TGTC-GCTTTCGAAATTTTTGTTTC-C-GCATGCAnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaaagtacaactgtttttttttaaagacgaccgagttcgaatctttcacgcataccaattttttgccnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncttctgtgatatttttagcacacgcaaggcaaaaaaatatataaaaaaatatataatatcctgttgatgacacagcacaggactaaactgtattaaatatgaacaagtatatctaaagaaatgatataattgcaattgtatattcaatattttcaagtgcatggacataatttttaactctattgaaccttaataatgccattacactaacaatgtgaacgtttatttttcgttcaaagtacatgtaagtgtgacaaaaatgaattgaaaacataaaagtttacgcttg
gi|4 : acaAAT-CCCCA-GATTT-----A-GAAAAA-CTGCTCTGTCTTGAAACAAAAT-AAATTTAG-TACATACAA-AT-TTCTT--AGAATTT--CACTATAATATGAAATGTT-A--TT-GAAA-TTTTATTTCACGGCATGCAnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntataacgtccaactgtatttgtataaaacgaccgaggttcgaattcttgcaccaagtacacttttt
gi|11 : -CTG-CTTGAAACAAAAT-AAATTTAG-TACA-A-AA-GTGTTCTTTGAGATTTT--CACTAAAACAT----TGTC-GCTTT-GAAA-TGTTGTTTCAC-GCATGCANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAA-ACGTCTAACTATTG--TTGCT-TTT-TAA----A--CGACC-G-A-G-TTCGAA-TCTTTCACGG-T-TAC--ATTTTTTatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaaacgtccacgtattttttttaacaacgcgaccgcagattcgaatctttcacgatatagattttcccnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaatgtccttcttgatattggtttttagcacattgcaatgtgacatcaaggctgataagcgaaggaaataataatatctcccttgttaatgacgcagtcacagtgactaaaactgttaaagattaacaattgcgcatatctaaaaacgaaatg
gi|4 : AAACGTCCACG---TA--TT-TT-TTT-TAACAACG--CGACC-GCA-GATTCGAA-TCTTTCACGATA-TAG--ATTTT
gi|9 : aatccccagatttagaaaaactgctctgtcttgaaacaaaataaatttagtacatacaaatttcttagaatttcactataatatgaaatgttattgaaattttatttcacggcatgcaatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnAACGTCCAAC---TG--T-ATT-TGTATAA----AA-CGACC-G-AGG-TTCGAATTCTTGCACCA-AGTAC--ACTTTTTcccnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaatgtccttcttgatattggtttttagcacattgcaatgtgacatcaaggctgataagcgaaggaaataataatatctcccttgttaatgacgcagtcacagtgactaaaactgttaaagattaacaattgcgcatatctaaaaacgaaatg
gi|1 : acagggaatccccgaatttagaagaactgctgcttgaaacaaaaaaagtttgtacaaaaatgtctttgagattttcactaaaaattgtcgctttcgaaatttttgtttccgcatgcannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntatCTAAC---TGGTTTTTT-TTT-TAA----A--CGACC-G-A-G-TGCGAA-TCTTTCACGG-A-TAC--AATTTTTCC
gi|3 : acaggggaatccccgaaatttaagaaaactgcatgcttgaaacaaaataaatttagtacaaaaatgttcttcgagatgttcactaaaaattgtcgctttgaaattgtttcacgcatggcannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntCAAC---TG--TTTTT-TTT-TAA----AGACGACC-G-A-G-TTCGAA-TCTTTCACGC-A-TACCAATTTTTTctgtannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntctatttcgcttctgtgatatggtttttagcagcacggcaaggcatcaaggctataaggcccgaaggaagataaaatatataatatcccttgttaatggacacagccacaggactaaactgtataaatattggaacaatgtatgatctacatgtaaaacgaaatgatatattttcagttaccatgtacaaattgcaattgtaatatttcaatattttcaggtgccatggacatattattttaactctattaaagcttaataatgccaattaaactaacaaaatgtgaatttgtcttatttttcgatttcaaatgataagaactgaaacataaatatttaccg
gi|1 : acagggaatccccaattaaagaaaaaactgcctgcttaaacaaaagaatttaatacaaaaatttccttgaattttcactaaaaaattgtcgctttgaaattttgtttcacgcatgcannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaaagtaCGCTTCT----GTGATA-TGGTTTTTAGC-AG---C-AC---GGC---AA---GGCATCAAG-GC---TAT--AAGGCCC-GAAGGAA-GATAA-A-A---T-A--TA--TAATATCCCTTGTT-AATGGA-------CA-CAG-CCACA--G-GACT-AAA-CTG----T---AT-A-A---ATAT-TGGAA-CA-AT---GT-ATGA-TCTACATGTAAAAC-GA--A-ATGATA-TAT-TTTCAGTTACCA-T---GTACA-AATT-GCAATTGTAA-T----ATTTCAATATTT-TCAG-G---T----GCCATGGA-CATA-TTATTTTA-AC--TCTA-----TTAAAG-C---T-----TAA-TAA-T--GC-C-AATTA---AAC---T-A---A---C-AAAA-TG-TG-AA--TTTG-TCT-TA---TTT---TTCGATTT--C--AAA-TG-ATA---A-------------------G-AACTGA-AACATAAATAT-TTgccnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncttctgtgatatttttagcacacgcaaggcaaaaaaatatataaaaaaatatataatatcctgttgatgacacagcacaggactaaactgtattaaatatgaacaagtatatctaaagaaatgatataattgcaattgtatattcaatattttcaagtgcatggacataatttttaactctattgaaccttaataatgccattacactaacaatgtgaacgtttatttttcgttcaaagtacatgtaagtgtgacaaaaatgaattgaaaacataaaagtttacgcttg
gi|10 : acaggggaatccccgaaatttaagaaaactgcatgcttgaaacaaaataaatttagtacaaaaatgttcttcgagatgttcactaaaaattgtcgctttgaaattgtttcacgcatggcannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntctaactggttttttttttaaacgaccgagtgcgaatctttcacggatacaatttttccctgtannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntctatttCGCTTCTCCTGGGGATA-TGGTTTTT--TTAG---C-AC---A-CGCTAA---GGCATCAAG-GC----AT--AAG--CC-GAAGGAA-GATAA-A-AATAT-AAATA--T-----CCCTTGTT-AATGGA-------CAACAG-C-ACA--G-GACT-AAA-CTG----T---ATAA-G---A-ATATG-AATCA-AT---GT-AT-A-T-TA-----AAA-C-GA--AGATGATA-AAT-T--------CCA-G---TTACA-ATTG-GCAATTGTAAAT----ATT-CAATATTT-TCAG-G---T----GC-ATGGA-CATA-T-ATTTTGAAC--CGTA-----TTGAAT-C---T-----TAA-TAA-T--GC-CTA-TTA---AAC---------A---C-AAA--TTGTG-AA--TCTG-TCT-TA---TTT---TTCGATTaccg
gi|7 : GCTTCT----GTGATA-TGGTTTTT----AG---CCAC---G-CG--AA---GGC-TCAAG-CT---TA------------AAGGAA-TATAA-A-A---TTA--TA--T-----CCCTTGTT-AATG---------CGACAG-C-ACA--G-GACT-AAAACTG----TTATA--A-A---T-AT-TG-AA-CA-AT---GT-AT-A-TCTA-----AAA-C-GA--A-ATGATA-TAT-T--------CCA-G---TTACA-AATT--CAAT-GT---A----TTT-CAATATTT-TCAG-G---T----GC-ATGGA-CATA-T-ATTTT-AAC--TCTA-----TTGAAC-C---T-----TAA-TAATT--GC-C-A-TTA---AAC---T-A---A---C-AAA--TG-TG-AA--TCTG-TCT-TA---TTT---TTCGATTT--C---AA-T--ATA---A--GTG-TGGAC-AAAAAT-G-AATTCA-AACAT--ATA---TTTA-CG-CT
gi|3 : CTTCT----GTGATA-T----TTT--T-AG---C-ACAC-G-C---AA---GGCA-AAAA-AA---TATATAA--------AAAAA-TATAT-A-A---T-A--TC--C---------TGTT-GATG-A-------CA-CAG-C-ACA--G-GACT-AAA-CTG----T---A--TTA---A-ATATG-AA-CA-A----GT-AT-A-TCTA------AA---GA--A-ATG--A-TAT------------------------AATT-GCAATTGTA--T----ATT-CAATATTT-TCAA-G---T----GC-ATGGA-CATA---ATTTTTAAC--TCTA-----TTGAAC-C---T-----TAA-TAA-T--GC-C-A-TTA---CAC---T-A---A---C-AAT--G--TG-AA----CG-T-T-TA---TTT---TTCG--TT--C--AAAGTACATGTA-A--GTG-T-GAC-AAAAAT-G-AATTGAAAACATAAAAG---TTTA-CG-CTTG
gi|5 : acagggaatccccaattaaagaaaaaactgcctgcttaaacaaaagaatttaatacaaaaatttccttgaattttcactaaaaaattgtcgctttgaaattttgtttcacgcatgcannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaaagtacaactgtttttttttaaagacgaccgagttcgaatctttcacgcataccaattttttgccnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnCTTCT----GTGATAATGCGTTTT--C-AGA--C-AC---G-C---AA---GGCATAAAA-AAAAATATATAAT--------------ATAA-ATA---T-AAGTA--T-----TCCTTGTT-AATGGATCACCAGCG-CA--C-ATG--G-GACT-AAA-ATGGTATT---A--A-ATTAATAT-TG-AA-TATATTG-AT-AT-A-TCTACATACGAG----A--A-GTGA-A-TATGT--------CCA-G---TTACAGAATTGACAATTGTAA-T----ATTTCAATATTT-TCGC-G---T----GC-ATGAA-CAAA-G-TTTTTTGACAATCTACTTAGTTGAACAC---T-----TAA-TAT-TA-GC-C-A-TTACACAAC---T-ATCTACTCC-AAATGT--TG-AA--TCTGATCT-TA---TTT---TTCGATTT--C--AG---A-ATGCGAA--GTA-GGGAC-AAAAATGG-AATTG--AACATAA
gi|4 : CTTCT-----TGATA-TTGGTTTT--T-AG---C-ACATTG-C---AATGTGACATCAAG-GC---TGA-TAAG--C--GAAGGAA--ATAATA-A---T-A--TC--T-----CCCTTGTT-AAT-GA-------CG-CAGTC-ACA--GTGACTAAAA-CTGT---T---A--A-A---G-AT-T--AA-CA-ATTGCGC-AT-A-TCTA-A---AAA-C-GA--A-ATGc
gi|12 : aatccccagatttagaaaaactgctctgtcttgaaacaaaataaatttagtacatacaaatttcttagaatttcactataatatgaaatgttattgaaattttatttcacggcatgcaatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaaacgtccacgtattttttttaacaacgcgaccgcagattcgaatctttcacgatatagattttcccnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaatgtcCT----GTGATA-AGGCTTTT--C-A----C-ACAATG-C---A----GGCAT-AAG-GC---TAT---AG--CCAGAAGGAA-GATAA-T-A---T-A--T------------------AATGGA-------C--CAG-G-ACA--G-GAT---AA-CTG----T---A--T-A------T-TG-AA-CA-AT---GT-AT-A-T--------AAA-C-A------------TAT----------CCG-G---TTG-A-AATT-GCAATTGA---T----ATT-CAGTATTT-T-AG-G---T----GC-AAAAAACATA-T-ATTTTGAA----ATA-----TTGACT-T---T-----TAA-TAT-T--GC-C-A-TT----AAC---T-A---A---C-AAA--TG-TG-AATTTCT--TAT-TA---TTC---ATCGATTTACA--AAA-TA-ATA---AAGGCG-TGGAC-CAACAT-A-AA
gi|19 : taT----GTGATA-TG--TTTT--T-AGCAAC-AC---G-C---AA---G--ATCAAG-GC---T-T-TAA
gi|8 : TCAAGAGC---TTA-TAAG--CC-GAAAAAAAGATAA-A-A---T-AA-TCCGT-----CCCTTGTTTAGTGGAA------CG-TGG-C-ACACAG-GACT-AAA-ACG----T---A--A-A---T-AT-TG-AA-CA-A----GTAAT-AGTCTA-----AAA-CTGA--A-AT--TATTAT-T--------CCAGT---TTGCA-AATT-GC--TATT---TGTAGATT-CAATATTT---AG-GTGCG----GC-ATGGC-AATACT-TTTTTGAAC---CTA-----TTGAAA-TTAAT-----TTA-TAA-T--GC-C-A-TTA---AACCTAT-A---A---C-AAA--TG-TG--A--TCTG--ATCTA----TT---TTCTATTC--A--AAA-TA-ATA---A--GTGTTGGAC-AAAAAT-G-AATTG--AACATACATAT-TTATATCG-CTagt
gi|20 : AGGAA-TATAA-A-G---T-A--TA--TAATATCCCTTGTT-AATGGA-------CA-CAG-C-g
gi|13 : -------CA-CAG-G-ACA--G-AAC----A-CTGGA--T---A--A-ATACA-AC-TG-AA-CA-------T-AC-A-TGTATATATAAA-C-GATTA-AT--TA-TAT-T--------C-A-TGGGTGGCA-ATTG-CCAATTGG---T----AAT-CTATTTTTCTCGGTG---ATTCCAT-ATG-A-CATA-TTATTTTG--C--TCTA-----TT-AAC-T---T-----TAAACAA-TATGC-C-A-TTA-----C---T-C---AT--C-TGA--T--GG------CTG-CCT-TA---TTT---TTCGATTC------AA-GA-ATA---A--ATG--AGAC--AAAAT-G-CATTG--AACATAAc
gi|14 : TT-TCAG-G---T----GC-ATGGA-CA-A-T-ATTT-AAAC--TC-A-----TTGAAC-T----------AA-TAA-T--GCAC-A-TTA---AAC---T-A---A---CCAAA--T--GG-A-----TG-CCT-TA---TTTCCATTCCATTC--C--AA--TA-ATATAAA--AT--TGGAC-AAAAAT-G-AATTA--AACATAAATA---TTTA-CG-CTTGca
gi|15 : ccagtgagcaaattgcaTTTGAAC--TCTA-----TTTAAC-T---TTCACATAA--AA-T--G--C-A-TTA---AAC---TAA---A---C-AAA--TG-TGAAA--TCCG-TCT-TAAATTTT---TTCGATTA--TCAAAA-TA-AT-------GTG-TGGACAAAAAAT-GCAAGTGA-AA-ATAAATATCTTTTA-CGTCTTGCCC
gi|18 : ---A--GTG-TGGAC-AAAAAT-G-AATTGG-AACATACATA--TTTTA-CG-CTTGTC
Alignments
lowQualScore : 11111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111
lowQualScore : 11111 33333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333 1111 1111111 222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 1111 333 22222222222 22222222222 1111111 333333333333333333 11111111 111111111 1111111 11111 111 1111111111111 111 22
lowQualScore : 5 66 22222 3 5 4 4 4 5 99 4 4 4 4 1 66 7 9999 4 1 4 4 5 55555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555 3333 5 8888 3333333 5 5 5 5 5 0 5 77 0 666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666 9999 888 11 8888 4 8 444 8 777 4 44444444444 99 4 4 777 4 66666666666 4 5555555 99 3 3 55 4 44 4 333333333333333333 8 4 4 55555555 4 4 4 666666666 66 55 4 55 4 4 66 4 4444444 4 4 8 00000 8 777 8888 4 4 4 111 2 3 99999 66 7777 3 7777 3 88 3 3 3 666 2222222222222 7 3 3 3 3 666 3 666 55 3 4 888 888888 666 88 3 3 3 3 555 00 5 5 0
lowQualScore : . .. ..... . . . . . . .. . . . . . .. . .... . . . . . ................................................................................................................................ .... . .... ....... . . . . . . . .. . .............................................................................................................................. .... ... .. .... . . ... . ... . ........... .. . . ... . ........... . ....... .. . . .. . .. . .................. . . . ........ . . . ......... .. .. . .. . . .. . ....... . . . ..... . ... .... . . . ... . . ..... .. .... . .... . .. . . . ... ............. . . . . . ... . ... .. . . ... ...... ... .. . . . . ... .. . . .
lowQualScore : 0 44 55555 2 0 4 4 4 3 99 4 4 4 4 1 11 3 4444 4 1 4 4 0 88888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888 7777 7 0000 1111111 7 7 7 7 7 7 7 99 3 000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 4444 222 88 8888 4 9 666 9 888 0 44444444444 00 0 0 000 0 11111111111 0 5555555 11 6 6 55 0 88 0 888888888888888888 0 0 0 33333333 0 0 0 888888888 55 55 0 55 4 4 11 4 4444444 4 4 9 77777 9 000 5555 0 0 0 999 8 6 11111 33 7777 6 7777 6 66 6 6 6 444 6666666666666 3 6 6 6 6 444 6 444 00 6 0 888 222222 444 66 6 6 6 6 222 55 7 7 7
consensus : NAAGGGGAAT-CCCCG-AATTT-----AAGAAAAA-CTGC-CTG-CTTGAAACAAAAT-AANTTT-G-TACA-A-AA-ATGTTCTTTGAGATTTT--CACTAAAAAAT----TGTC-GCTTT-GAAA-TTTTGTTTCAC-GCATGCANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAAAACGTCCAACTG--T-T-TT--T-TTTTAA----A--CGACC-G-A-G-TTCGAA-TCTTTCACGGA-TAC--ATTTTTTCCNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCGCTTCT----GTGATA-T-GGTTTTT--C-AG-C-ACAC-GC-AA---GGCATCAAG-GCTAT-TAAG--CC-GAAGGAA-GATAA-A-A---T-A---TAT-----CCCTTGTT-AATGGA-------CG-CAG-C-ACA--G-GACT-AAA-CTG----T---A--AA---A-AT-TG-AA-CA---AT---GT-AT-A-TCTA-----A---AAACGA--A-A--TGATATAT-TC-C--AG-TTGC-------A-AATTG-C-AATTG-TAA-TATT-CAATATTTTCAGGT---G----C-ATG-GA-CATA-T-ATTTTGA-ACTCTA-----TTGAAC-CTTA----A-T----AA-T--GC-C-A-TTA---AAC---T-A---A---CAAA-TG-TG-A-ATCTG-TCTTA---TT-T---T--TCGATT-T-C-A-AA-TA---AT---AA--GTG-TGGAC-AAAAAT-G-AATTG-A-AACATAAATAT-TTTTA-CG-CTTGTCC
Reference ( family-2544 ) : NAAGGGGAAT-CCCCG-AATTT-----AAGAAAAA-CTGC-CTG-CTTGAAACAAAAT-AANTTN-G-TACA-A-AA-ATGTTCTTTGAGATTTT--CACTAAAAAAT----TGTC-GCTTT-GAAA-TTTTGTTTCAC-GCATGCANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAAAACGTCCAACTG--T-T-TT--T-TTTTAA----A--CGACC-G-A-G-TTCGAA-TCTTTCACGGA-TAC--ATTTTTTCCNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCGCTTCT----GTGATA-T-GGTTTTT--C-AG-C-ACA--GC-AA---GGCATCAAG-GCTAT-TAAG--CC-GAAGGAA-GATAA-A-A---T-A---TAT-----CCCTTGTT-AATGGA-------CG-CAG-C-ACA--G-GACT-AAA-CTG----T---A--AA---A-AT-TG-AA-CA---AT---GT-AT-A-TCTA-----A---AAACGA--A-A--TGATATAT-TC-C--AG-TTGC-------A-AATTG-C-AATTG-TAA-TATT-CAATATTTTCAGGT---G----C-ATG-GA-CATA-T-ATTTTGA-ACTCTA-----TTGAAC-CTTA----A-T----AA-T--GC-C-A-TTA---AAC---T-A---A---CAAA-TG-TG-A-ATCTG-TCTTA---TT-T---T--TCGATT-T-C-A-AA-TA---AT---AA--GTG-TGGAC-AAAAAT-G-AATTG-A-AACATAAATAT-TTTTA-CG-CTTGCCC
gi|1 : AGGGGAAT-CCCCGAAATTT-----AAG-AAAA-CTGC-ATG-CTTGAAACAAAATAAATTTA-G-TACA-A-AA-ATGTTCTTCGAGATGTT--CACT-AAAAAT----TGTC-GCTTT-GAAA---TTGTTTCAC-GCATG
gi|1 : acTCTAACTGGTT-T-TT--T-TTTTAA----A--CGACC-G-A-G-TGCGAA-TCTTTCACGGA-TAC--AATTTTTCCgcannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntctaactggttttttttttaaacgaccgagtgcgaatctttcacggatacaatttttccctgtannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntctatttcgcttctgtgatatggtttttagcagcacggcaaggcatcaaggctataaggcccgaaggaagataaaatatataatatcccttgttaatggacacagccacaggactaaactgtataaatattggaacaatgtatgatctacatgtaaaacgaaatgatatattttcagttaccatgtacaaattgcaattgtaatatttcaatattttcaggtgccatggacatattattttaactctattaaagcttaataatgccaattaaactaacaaaatgtgaatttgtcttatttttcgatttcaaatgataagaactgaaacataaatatttaccg
gi|1 : acaggggaatccccgaaatttaagaaaactgcatgcttgaaacaaaataaatttagtacaaaaatgttcttcgagatgttcactaaaaattgtcgctttgaaattgtttcacgcatggcannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnCGCTTCT----GTGATA-T-GGTTTTTAGC-AG-C-ACG--GC-AA---GGCATCAAG-GCTAT--AAGGCCC-GAAGGAA-GATAA-A-A---T-A---TATAATATCCCTTGTT-AATGGA-------CA-CAG-CCACA--G-GACT-AAA-CTG----T---AT-AA---ATAT-TGGAA-CA---AT---GT-ATGA-TCTACATGTA---AAACGA--A-A--TGATATAT-TTTC--AG-TTACCATGTACA-AATTG-C-AATTG-TAA-TATTTCAATATTTTCAGGT---G----CCATG-GA-CATA-TTATTTT-A-ACTCTA-----TTAAAG-CTTA----A-T----AA-T--GC-C-AATTA---AAC---T-A---A---CAAAATG-TG-A-ATTTG-TCTTA---TT-T---T--TCGATT-T-C-A-AA-TG---AT---AA-------------------G-AACTG-A-AACATAAATAT-TTctgtannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntctatttcgcttctgtgatatggtttttagcagcacggcaaggcatcaaggctataaggcccgaaggaagataaaatatataatatcccttgttaatggacacagccacaggactaaactgtataaatattggaacaatgtatgatctacatgtaaaacgaaatgatatattttcagttaccatgtacaaattgcaattgtaatatttcaatattttcaggtgccatggacatattattttaactctattaaagcttaataatgccaattaaactaacaaaatgtgaatttgtcttatttttcgatttcaaatgataagaactgaaacataaatatttaccg
gi|10 : acaggggaatccccgaaatttaagaaaactgcatgcttgaaacaaaataaatttagtacaaaaatgttcttcgagatgttcactaaaaattgtcgctttgaaattgtttcacgcatggcannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntctaactggttttttttttaaacgaccgagtgcgaatctttcacggatacaatttttccctgtannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntctatttCGCTTCTCCTGGGGATA-T-GGTTTTT--TTAG-C-ACAC-GCTAA---GGCATCAAG-GC-AT--AAG--CC-GAAGGAA-GATAA-A-AATAT-AAA-TAT-----CCCTTGTT-AATGGA-------CAACAG-C-ACA--G-GACT-AAA-CTG----T---ATAAG---A-ATATG-AATCA---AT---GT-AT-A-TT-------A---AAACGA--AGA--TGATAAAT-TC-C--AG-TTAC-------A-ATTGG-C-AATTG-TAAATATT-CAATATTTTCAGGT---G----C-ATG-GA-CATA-T-ATTTTGA-ACCGTA-----TTGAAT-CTTA----A-T----AA-T--GC-CTA-TTA---AAC---------A---CAAATTG-TG-A-ATCTG-TCTTA---TT-T---T--TCGATT-accg
gi|11 : -CTG-CTTGAAACAAAAT-AAATTTAG-TACA-A-AA-GTGTTCTTTGAGATTTT--CACTAAAACAT----TGTC-GCTTT-GAAA-TGTTGTTTCAC-GCATGCANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNA-AACGTCTAACTA--T-TGTTGCT-TTTTAA----A--CGACC-G-A-G-TTCGAA-TCTTTCACGGT-TAC--ATTTTTT
gi|12 : CT----GTGATA-A-GGCTTTT--C-A--C-ACAATGC-A----GGCAT-AAG-GCTAT---AG--CCAGAAGGAA-GATAA-------T-A---TAT--------------AATGGA-------C--CAG-G-ACA--G-GAT---AA-CTG----T---A--TA------T-TG-AA-CA---AT---GT-AT-A-T------------AAAC-------------ATAT--C-C--GG-TTG--------A-AATTG-C-AATTG---A-TATT-CAGTATTTT-AGGT---G----C-AAA-AAACATA-T-ATTTTGA-AAT--A-----TTGACT-TTTA----A-T----AT-T--GC-C-A-TTA---A-C---T-A---A---CAAA-TG-TG-A-ATT---TCTTA---TTAT---TCATCGATT-TACAA-AA-TA---AT---AAAGGCG-TGGAC-CAACAT-A-AA
gi|13 : ta-------CA-CAG-G-ACA--G-AAC----A-CTGGA--T---A--AATACA-AC-TG-AA-CATACAT---GT-AT-A-TATA-----A---A--CGATTA-A--T--TATAT-TC-ATGGG-TGGC-------A-A-TTG-CCAATTGGTAA-TCT----ATTTTTCTCGGT---GATTCC-ATATGA-CATA-TTATTTTG---CTCTA-----TT-AAC-TTTA----AAC----AA-TATGC-C-A-TTA-----C---T---------CA---TC-TG-ATGGCTG-CCTTA---TT-T---T--TCGA-T-T-C-A-AG--A---AT---AA--ATG--AGAC--AAAAT-G-CATTG---AACATAA
gi|14 : TTTCAGGT---G----C-ATG-GA-CA-A-T-A-TTTAA-ACTC-A-----TTGAAC---TA----A-T----AA-T--GCAC-A-TTA---AAC---T-A---AC--CAAA-TG--G-A----TG-CCTTA---TT-TCCAT--TCCATT-C-C---AA-TA---ATATAAA--AT--TGGAC-AAAAAT-G-AATT--A-AACATAAATA---TTTA-CG-CTTGca
gi|15 : ccagtgagcaaattgcaTTTGA-ACTCTA-----TTTAAC-TTTC----A-CATAAAA-T--G--C-A-TTA---AAC---TAA---A---CAAA-TG-TGAA-ATCCG-TCTTAAATTT-T---T--TCGATTAT-C-A-A---A---AT---AAT-GTG-TGGACAAAAAAT-GCAAGTG-A-AA-ATAAATATCTTTTA-CGTCTTGCCC
gi|16 : AAGGGGAATACCCCG-AATTTTAAAGAAAAAAAA-CTGC-CTG-CTTGAAACGAAAT-AATTTA-A-TACA-A-AA-ATGTTC-TTGAGATGTTCCCATAAAAAAAT----TGTCTGCTTT-GAAA-TTTTGTTTCA
gi|17 : caAGGGGAAT-CC----GATTT-----AAGAAAA--CTGC-CTG-CTTG-AAC-AAAT-AA-TTT-G-TTCA-A-AAGATGTT-TTTGAGATTTT--CAAT-AAAAGT----TGTC-G-TTT-GAAA-TTTTG-TTCAC-GCATGgc
gi|18 : ac---AA--GTG-TGGAC-AAAAAT-G-AATTG-G-AACATACATA--TTTTA-CG-CTTGTC
gi|19 : T----GTGATA-T-G--TTTT--T-AG-CAACAC-GC-AA---G--ATCAAG-GCT-T-TAA
gi|2 : AAGGAGAAT-CCCCG-AATTT-----AAGAAAAA-CTGC-CTG-CTTGAAACAAAAT-AATTTT-G-TACA-A-AA-ATGTTCTTTGAGATTTT--CACTAAAAAAT----TGTC-GCTTT-GAAA-TTTTGTTTCAC-GCATGCANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAAACGACCAACTG--T-T-AT--T-TTTTAA----A--CGACC-G-A-G-TTCGAA-TCTTTCACGGA-TAC--ATTTTTTTCNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCGCTTCT----GTGATA-T-GGTTTTT--T-AG-C-AC---GC-AA---GGCATCAAG-GCTAT-TAAG--CC-GAAGGAG-GATAA-A-A---T-A---TCT-----CCCTTGTT-AATGGA-------CG-CAG-C-ACA--G-GACT-AAA-CTG----T---A--AA---A-AT-TG-AA-CA---AT---GT-AT-A-TCTAC----ATGTAAACAA--A-A--TGCTATAT-TC-C--AT-TTGC-------A-AATTA-C-AATAG-T---TATT-CAATATTTTCAGGA---G----T-ATG-GA-CATA-T-ATTTTGG-ACTCTA-----TTGAAC-TTTA----A-T----AA-T--GT-C-A-TTA---AAC---T-A---A---CAAA-T--TG-A-ATCTG-TATTA---TT-T---T--TCGATT-T-T-A-AA-TA---AT---GA--GTG-TGGAC-AAAAAT-G-AATTG-ACAACATAAATAT-TTTTA-CG-CTTGTCCagt
gi|20 : cAGGAA-TATAA-A-G---T-A---TATAATATCCCTTGTT-AATGGA-------CA-CAG-C-
gi|3 : GGGAAT-CCCC--AATTA-----AAGAAAAAACTGC-CTG-CTT-AAACAAAAG-AATTTA-A-TACA-A-AA-AT-TTCCTTGA-ATTTT--CACTAAAAAAT----TGTC-GCTTT-GAAA-TTTTGTTTCAC-GCATGCAc
gi|3 : acaAAAGTACAACTG--T-T-TT--T-TTTTAA----AGACGACC-G-A-G-TTCGAA-TCTTTCACGCA-TACCAATTTTTTnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaaagtacaactgtttttttttaaagacgaccgagttcgaatctttcacgcataccaattttttgccnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncttctgtgatatttttagcacacgcaaggcaaaaaaatatataaaaaaatatataatatcctgttgatgacacagcacaggactaaactgtattaaatatgaacaagtatatctaaagaaatgatataattgcaattgtatattcaatattttcaagtgcatggacataatttttaactctattgaaccttaataatgccattacactaacaatgtgaacgtttatttttcgttcaaagtacatgtaagtgtgacaaaaatgaattgaaaacataaaagtttacgcttg
gi|3 : acagggaatccccaattaaagaaaaaactgcctgcttaaacaaaagaatttaatacaaaaatttccttgaattttcactaaaaaattgtcgctttgaaattttgtttcacgcatgcannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnCTTCT----GTGATA------TTTT--T-AG-C-ACAC-GC-AA---GGCA-AAAA-AATATATA--------AAAAAA-TATAT-A-A---T-A---T---------CCTGTT-GAT-GA-------CA-CAG-C-ACA--G-GACT-AAA-CTG----T---AT-TA---A-ATATG-AA-CA---A----GT-AT-A-TCTA-----A---A---GA--A-A--TGATAT-------------------------AATTG-C-AATTG-T-A-TATT-CAATATTTTCAAGT---G----C-ATG-GA-CATA---ATTTTTA-ACTCTA-----TTGAAC-CTTA----A-T----AA-T--GC-C-A-TTA---CAC---T-A---A---C-AA-TG-TG-A-A--CG-T-TTA---TT-T---T--TCG--T-T-C-A-AAGTACATGT---AA--GTG-T-GAC-AAAAAT-G-AATTGAA-AACATAAAAG---TTTA-CG-CTTGgccnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncttctgtgatatttttagcacacgcaaggcaaaaaaatatataaaaaaatatataatatcctgttgatgacacagcacaggactaaactgtattaaatatgaacaagtatatctaaagaaatgatataattgcaattgtatattcaatattttcaagtgcatggacataatttttaactctattgaaccttaataatgccattacactaacaatgtgaacgtttatttttcgttcaaagtacatgtaagtgtgacaaaaatgaattgaaaacataaaagtttacgcttg
gi|4 : acagggaatccccaattaaagaaaaaactgcctgcttaaacaaaagaatttaatacaaaaatttccttgaattttcactaaaaaattgtcgctttgaaattttgtttcacgcatgcannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaaagtacaactgtttttttttaaagacgaccgagttcgaatctttcacgcataccaattttttgccnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnAAT-CCCCA-GATTT-----A-GAAAAA-CTGCTCTGTCTTGAAACAAAAT-AAATTTAG-TACATACAA-AT-TTCTT--AGAATTT--CACTATAATATGAAATGTT-A--TT-GAAA-TTTTATTTCACGGCATGCA
gi|4 : AAACGTCCA--CG--TAT-TT--T-TTTTAACAACG--CGACC-GCA-GATTCGAA-TCTTTCAC-GA-TAT--AGATTTTCCatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaaacgtccacgtattttttttaacaacgcgaccgcagattcgaatctttcacgatatagattttcccnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaatgtccttcttgatattggtttttagcacattgcaatgtgacatcaaggctgataagcgaaggaaataataatatctcccttgttaatgacgcagtcacagtgactaaaactgttaaagattaacaattgcgcatatctaaaaacgaaatg
gi|4 : aatccccagatttagaaaaactgctctgtcttgaaacaaaataaatttagtacatacaaatttcttagaatttcactataatatgaaatgttattgaaattttatttcacggcatgcaatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnCTTCT-----TGATA-TTGGTTTTT----AG-C-ACATTGC-AATGTGACATCAAG-GCTGA-TAAG--C--GAAGGAA--ATAATA-A---T-A---TCT-----CCCTTGTT-AAT-GA-------CG-CAGTC-ACA--GTGACTAAAA-CTGT---T---A--AA---G-AT-T--AA-CA---ATTGCGC-AT-A-TCTA-----A---AAACGA--A-A--TGcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaatgtccttcttgatattggtttttagcacattgcaatgtgacatcaaggctgataagcgaaggaaataataatatctcccttgttaatgacgcagtcacagtgactaaaactgttaaagattaacaattgcgcatatctaaaaacgaaatg
gi|5 : aatccccagatttagaaaaactgctctgtcttgaaacaaaataaatttagtacatacaaatttcttagaatttcactataatatgaaatgttattgaaattttatttcacggcatgcaatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaaacgtccacgtattttttttaacaacgcgaccgcagattcgaatctttcacgatatagattttcccnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaatgtcCTTCT----GTGATAAT-GCGTTTT--C-AGAC-AC---GC-AA---GGCATAAAA-AAAAA-TATA--T-------AA-TATAA-ATA---T-AAG-TAT-----TCCTTGTT-AATGGATCACCAGCG-CA--C-ATG--G-GACT-AAA-ATGGTATT---A--AATTAATAT-TG-AA-TAT--ATTG-AT-AT-A-TCTA-----C---ATACGA--G-AAGTGA-ATATGTC-C--AG-TTAC-------AGAATTGAC-AATTG-TAA-TATTTCAATATTTTCGCGT---G----C-ATG-AA-CAAAGT-TTTTTGACAATCTACTTAGTTGAACACTTA----A-T----AT-TA-GC-C-A-TTACACAAC---T-ATCTACTCCAAA-TGTTG-A-ATCTGATCTTA---TT-T---T--TCGATT-T-C-AGAA-TG---CG---AA--GTA-GGGAC-AAAAATGG-AATTG---AACATAA
gi|6 : AGGGGAAT-CCCCG-AATTT-----AAGAAAAA-CTAC-CTG-CTTGAAACAAAAT-AAATTT-AATACA-A-AA-ATGTTCTTTGAGATTTT--CACTAAAAAAT----TGTC-GCTTT-GAAA-TTTTGTTTCAC-GCATGCANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNA-AATGTCCAACTG--G-T-TT--TATTTTAA----A--CGACCTG-A-G-TTCGAA-TCTTTCACGGA-TAC--ATTTTc
gi|7 : acGCTTCT----GTGATA-T-GGTTTTT----AG-CCAC---GCGAA---GGC-TCAAG-CTTA------------AAGGAA-TATAA-A-A---TTA---TAT-----CCCTTGTT-AATG---------CGACAG-C-ACA--G-GACT-AAAACTG----TTATA--AA---T-AT-TG-AA-CA---AT---GT-AT-A-TCTA-----A---AA-CGA--A-A--TGATATAT-TC-C--AG-TTAC-------A-AATT--C-AAT-G-TA--T-TT-CAATATTTTCAGGT---G----C-ATG-GA-CATA-T-ATTTT-A-ACTCTA-----TTGAAC-CTTA----A-T----AATT--GC-C-A-TTA---AAC---T-A---A---CAAA-TG-TG-A-ATCTG-TCTTA---TT-T---T--TCGATT-T-C---AA-T----AT---AA--GTG-TGGAC-AAAAAT-G-AATTC-A-AACAT--ATA---TTTA-CG-CT
gi|8 : TCAAGAGCTTA-TAAG--CC-GAAAAAAAGATAA-A-A---T-AATCCGT-----CCCTTGTTTAGTGGAA------CG-TGG-C-ACACAG-GACT-AAA-ACG----T---A--AA---T-AT-TG-AA-CA---A----GTAAT-AGTCTA-----A---AACTGA--A-A--TTAT-TAT-TC-C--AGTTTGC-------A-AATTG-CTATTTG-TAG--ATT-CAATATTT--AGGTGCGG----C-ATG-GC-AATACT-TTTTTGA-AC-CTA-----TTGAA--ATTAATTTA-T----AA-T--GC-C-A-TTA---AACCTAT-A---A---CAAA-TG-TG---ATCTG-ATCTA----T-T---T--TCTATT-C-A-A-AA-TA---AT---AA--GTGTTGGAC-AAAAAT-G-AATTG---AACATACATAT-TTATATCG-CT
gi|9 : GGGAAT-CCCCG-AATTT-----A-GAAGAA-CTGC--TG-CTTGAAACAAAAA-AAGTTT-G-TACA-A-AA-ATG-TCTTTGAGATTTT--CACT-AAAAAT----TGTC-GCTTTCGAAATTTTTGTTTC-C-GCATGCAg
gi|9 : acaAACGTCCAACTG--TAT-TT--G-TATAAA----A--CGACC-G-AGG-TTCGAATTCTTGCACCAAGTAC--ACTTTTTnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntataacgtccaactgtatttgtataaaacgaccgaggttcgaattcttgcaccaagtacacttttt
Alignments
lowQualScore : 11111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111
lowQualScore : 11111 1 33333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333 1111 1111111 222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 1111 111 22222222222 22222222222 1111111 333333333333333333 11111111 111111111 1111111 11111 111 1111111111111 111 22
lowQualScore : 5 66 22222 3 5 4 4 5 3 4 4 4 4 1 66 7 9999 4 1 4 4 5 55555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555 3333 5 8888 3333333 5 5 5 5 5 0 5 77 0 666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666 9999 4 4 11 8888 4 000 8 777 4 44444444444 99 4 4 777 4 66666666666 4 5555555 99 3 3 55 4 44 4 333333333333333333 8 4 4 55555555 4 4 4 666666666 66 55 4 55 4 4 66 4 4444444 4 4 8 00000 8 777 8888 4 4 4 111 2 3 99999 66 7777 3 7777 3 88 3 3 3 666 2222222222222 7 3 3 3 3 666 3 666 55 3 4 888 888888 666 88 3 3 3 3 555 00 5 5
lowQualScore : . .. ..... . . . . . . . . . . . .. . .... . . . . . ................................................................................................................................ .... . .... ....... . . . . . . . .. . .............................................................................................................................. .... . . .. .... . ... . ... . ........... .. . . ... . ........... . ....... .. . . .. . .. . .................. . . . ........ . . . ......... .. .. . .. . . .. . ....... . . . ..... . ... .... . . . ... . . ..... .. .... . .... . .. . . . ... ............. . . . . . ... . ... .. . . ... ...... ... .. . . . . ... .. . .
lowQualScore : 0 44 55555 2 0 4 4 3 3 4 4 4 4 1 11 3 4444 4 1 4 4 0 88888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888 7777 7 0000 1111111 7 7 7 7 7 7 7 99 3 000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 4444 4 4 88 8888 4 888 9 888 0 44444444444 00 0 0 000 0 11111111111 0 5555555 11 6 6 55 0 88 0 888888888888888888 0 0 0 33333333 0 0 0 888888888 55 55 0 55 4 4 11 4 4444444 4 4 9 77777 9 000 5555 0 0 0 999 8 6 11111 33 7777 6 7777 6 66 6 6 6 444 6666666666666 3 6 6 6 6 444 6 444 00 6 0 888 222222 444 66 6 6 6 6 222 55 7 7
consensus : NAAGGGGAAT-CCCCG-AATTT-----AAGAAAAA-CTGC-CTG-CTTGAAACAAAATAANTTT-G-TACA-A-AA-ATGTTCTTTGAGATTTT--CACTAAAAAAT----TGTC-GCTTT-GAAA-TTTTGTTTCAC-GCATGCANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAAAACGTCCAACTG--T-T-TT--T-TTTTAA----A--CGACC-G-A-G-TTCGAA-TCTTTCACGGA-TAC--ATTTTTTCCNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCGCTTCT----GTGATA-T-GGTTTTT--C-AGC-ACA-C-GC-AA---GGCATCAAG-GCTAT-TAAG--CC-GAAGGAA-GATAA-A-A---T-A---TAT-----CCCTTGTT-AATGGA-------CG-CAG-C-ACA--G-GACT-AAA-CTG----T---A--AA---A-AT-TG-AA-CA---AT---GT-AT-A-TCTA-----A---AAACGA--A-A--TGATATAT-TC-C--AG-TTGC-------A-AATTG-C-AATTG-TAA-TATT-CAATATTTTCAGGT---G----C-ATG-GA-CATA-T-ATTTTGA-ACTCTA-----TTGAAC-CTTA----A-T----AA-T--GC-C-A-TTA---AAC---T-A---A---CAAA-TG-TG-A-ATCTG-TCTTA---TT-T---T--TCGATT-T-C-A-AA-TA---AT---AA--GTG-TGGAC-AAAAAT-G-AATTG-A-AACATAAATAT-TTTTA-CG-CTTGTCC
Reference ( family-2544 ) : NAAGGGGAAT-CCCCG-AATTT-----AAGAAAAA-CTGC-CTG-CTTGAAACAAAATAANTTT-G-TACA-A-AA-ATGTTCTTTGAGATTTT--CACTAAAAAAT----TGTC-GCTTT-GAAA-TTTTGTTTCAC-GCATGCANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAAAACGTCCAACTG--T-T-TT--T-TTTTAA----A--CGACC-G-A-G-TTCGAA-TCTTTCACGGA-TAC--ATTTTTTCCNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCGCTTCT----GTGATA-T-GGTTTTT--C-AGC-ACA-C-GC-AA---GGCATCAAG-GCTAT-TAAG--CC-GAAGGAA-GATAA-A-A---T-A---TAT-----CCCTTGTT-AATGGA-------CG-CAG-C-ACA--G-GACT-AAA-CTG----T---A--AA---A-AT-TG-AA-CA---AT---GT-AT-A-TCTA-----A---AAACGA--A-A--TGATATAT-TC-C--AG-TTGC-------A-AATTG-C-AATTG-TAA-TATT-CAATATTTTCAGGT---G----C-ATG-GA-CATA-T-ATTTTGA-ACTCTA-----TTGAAC-CTTA----A-T----AA-T--GC-C-A-TTA---AAC---T-A---A---CAAA-TG-TG-A-ATCTG-TCTTA---TT-T---T--TCGATT-T-C-A-AA-TA---AT---AA--GTG-TGGAC-AAAAAT-G-AATTG-A-AACATAAATAT-TTTTA-CG-CTTGTCC
gi|1 : AGGGGAAT-CCCCGAAATTT-----AAG-AAAA-CTGC-ATG-CTTGAAACAAAATAAATTTAG-TACA-A-AA-ATGTTCTTCGAGATGTT--CACT-AAAAAT----TGTC-GCTTT-GAAA---TTGTTTCAC-GCATG
gi|1 : acTCTAACTGGTT-T-TT--T-TTTTAA----A--CGACC-G-A-G-TGCGAA-TCTTTCACGGA-TAC--AATTTTTCCgcannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntctaactggttttttttttaaacgaccgagtgcgaatctttcacggatacaatttttccctgtannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntctatttcgcttctgtgatatggtttttagcagcacggcaaggcatcaaggctataaggcccgaaggaagataaaatatataatatcccttgttaatggacacagccacaggactaaactgtataaatattggaacaatgtatgatctacatgtaaaacgaaatgatatattttcagttaccatgtacaaattgcaattgtaatatttcaatattttcaggtgccatggacatattattttaactctattaaagcttaataatgccaattaaactaacaaaatgtgaatttgtcttatttttcgatttcaaatgataagaactgaaacataaatatttaccg
gi|1 : acaggggaatccccgaaatttaagaaaactgcatgcttgaaacaaaataaatttagtacaaaaatgttcttcgagatgttcactaaaaattgtcgctttgaaattgtttcacgcatggcannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnCGCTTCT----GTGATA-T-GGTTTTTAGC-AGC-ACG---GC-AA---GGCATCAAG-GCTAT--AAGGCCC-GAAGGAA-GATAA-A-A---T-A---TATAATATCCCTTGTT-AATGGA-------CA-CAG-CCACA--G-GACT-AAA-CTG----T---AT-AA---ATAT-TGGAA-CA---AT---GT-ATGA-TCTACATGTA---AAACGA--A-A--TGATATAT-TTTC--AG-TTACCATGTACA-AATTG-C-AATTG-TAA-TATTTCAATATTTTCAGGT---G----CCATG-GA-CATA-TTATTTT-A-ACTCTA-----TTAAAG-CTTA----A-T----AA-T--GC-C-AATTA---AAC---T-A---A---CAAAATG-TG-A-ATTTG-TCTTA---TT-T---T--TCGATT-T-C-A-AA-TG---AT---AA-------------------G-AACTG-A-AACATAAATAT-TTctgtannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntctatttcgcttctgtgatatggtttttagcagcacggcaaggcatcaaggctataaggcccgaaggaagataaaatatataatatcccttgttaatggacacagccacaggactaaactgtataaatattggaacaatgtatgatctacatgtaaaacgaaatgatatattttcagttaccatgtacaaattgcaattgtaatatttcaatattttcaggtgccatggacatattattttaactctattaaagcttaataatgccaattaaactaacaaaatgtgaatttgtcttatttttcgatttcaaatgataagaactgaaacataaatatttaccg
gi|10 : acaggggaatccccgaaatttaagaaaactgcatgcttgaaacaaaataaatttagtacaaaaatgttcttcgagatgttcactaaaaattgtcgctttgaaattgtttcacgcatggcannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntctaactggttttttttttaaacgaccgagtgcgaatctttcacggatacaatttttccctgtannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntctatttCGCTTCTCCTGGGGATA-T-GGTTTTT--TTAGC-ACA-C-GCTAA---GGCATCAAG-GC-AT--AAG--CC-GAAGGAA-GATAA-A-AATAT-AAA-TAT-----CCCTTGTT-AATGGA-------CAACAG-C-ACA--G-GACT-AAA-CTG----T---ATAAG---A-ATATG-AATCA---AT---GT-AT-A-TT-------A---AAACGA--AGA--TGATAAAT-TC-C--AG-TTAC-------A-ATTGG-C-AATTG-TAAATATT-CAATATTTTCAGGT---G----C-ATG-GA-CATA-T-ATTTTGA-ACCGTA-----TTGAAT-CTTA----A-T----AA-T--GC-CTA-TTA---AAC---------A---CAAATTG-TG-A-ATCTG-TCTTA---TT-T---T--TCGATT-accg
gi|11 : -CTG-CTTGAAACAAAATAAATTTAG-TACA-A-AA-GTGTTCTTTGAGATTTT--CACTAAAACAT----TGTC-GCTTT-GAAA-TGTTGTTTCAC-GCATGCANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNA-AACGTCTAACTA--T-TGTTGCT-TTTTAA----A--CGACC-G-A-G-TTCGAA-TCTTTCACGGT-TAC--ATTTTTT
gi|12 : CT----GTGATA-A-GGCTTTT--C-A-C-ACAAT-GC-A----GGCAT-AAG-GCTAT---AG--CCAGAAGGAA-GATAA-------T-A---TAT--------------AATGGA-------C--CAG-G-ACA--G-GAT---AA-CTG----T---A--TA------T-TG-AA-CA---AT---GT-AT-A-T------------AAAC-------------ATAT--C-C--GG-TTG--------A-AATTG-C-AATTG---A-TATT-CAGTATTTT-AGGT---G----C-AAA-AAACATA-T-ATTTTGA-AAT--A-----TTGACT-TTTA----A-T----AT-T--GC-C-A-TTA---A-C---T-A---A---CAAA-TG-TG-A-ATT---TCTTA---TTAT---TCATCGATT-TACAA-AA-TA---AT---AAAGGCG-TGGAC-CAACAT-A-AA
gi|13 : ta-------CA-CAG-G-ACA--G-AAC----A-CTGGA--T---A--AATACA-AC-TG-AA-CATACAT---GT-AT-A-TATA-----A---A--CGATTA-A--T--TATAT-TC-ATGGG-TGGC-------A-A-TTG-CCAATTGGTAA-TCT----ATTTTTCTCGGT---GATTCC-ATATGA-CATA-TTATTTTG---CTCTA-----TT-AAC-TTTA----AAC----AA-TATGC-C-A-TTA-----C---T---------CA---TC-TG-ATGGCTG-CCTTA---TT-T---T--TCGA-T-T-C-A-AG--A---AT---AA--ATG--AGAC--AAAAT-G-CATTG---AACATAA
gi|14 : TTTCAGGT---G----C-ATG-GA-CA-A-T-A-TTTAA-ACTC-A-----TTGAAC---TA----A-T----AA-T--GCAC-A-TTA---AAC---T-A---AC--CAAA-TG--G-A----TG-CCTTA---TT-TCCAT--TCCATT-C-C---AA-TA---ATATAAA--AT--TGGAC-AAAAAT-G-AATT--A-AACATAAATA---TTTA-CG-CTTGca
gi|15 : ccagtgagcaaattgcaTTTGA-ACTCTA-----TTTAAC-TTTC----A-CATAAAA-T--G--C-A-TTA---AAC---TAA---A---CAAA-TG-TGAA-ATCCG-TCTTAAATTT-T---T--TCGATTAT-C-A-A---A---AT---AAT-GTG-TGGACAAAAAAT-GCAAGTG-A-AA-ATAAATATCTTTTA-CGTCTTGCCC
gi|16 : AAGGGGAATACCCCG-AATTTTAAAGAAAAAAAA-CTGC-CTG-CTTGAAACGAAATAATTTA-A-TACA-A-AA-ATGTTC-TTGAGATGTTCCCATAAAAAAAT----TGTCTGCTTT-GAAA-TTTTGTTTCA
gi|17 : caAGGGGAAT-CC----GATTT-----AAGAAAA--CTGC-CTG-CTTGAA-CAAA-TAA-TTT-G-TTCA-A-AAGATGTT-TTTGAGATTTT--CAAT-AAAAGT----TGTC-G-TTT-GAAA-TTTTG-TTCAC-GCATGgc
gi|18 : ac---AA--GTG-TGGAC-AAAAAT-G-AATTG-G-AACATACATA--TTTTA-CG-CTTGTC
gi|19 : T----GTGATA-T-G--TTTT--T-AGCAACA-C-GC-AA---G--ATCAAG-GCT-T-TAA
gi|2 : AAGGAGAAT-CCCCG-AATTT-----AAGAAAAA-CTGC-CTG-CTTGAAACAAAATAATTTT-G-TACA-A-AA-ATGTTCTTTGAGATTTT--CACTAAAAAAT----TGTC-GCTTT-GAAA-TTTTGTTTCAC-GCATGCANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAAACGACCAACTG--T-T-AT--T-TTTTAA----A--CGACC-G-A-G-TTCGAA-TCTTTCACGGA-TAC--ATTTTTTTCNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCGCTTCT----GTGATA-T-GGTTTTT--T-AGC-AC----GC-AA---GGCATCAAG-GCTAT-TAAG--CC-GAAGGAG-GATAA-A-A---T-A---TCT-----CCCTTGTT-AATGGA-------CG-CAG-C-ACA--G-GACT-AAA-CTG----T---A--AA---A-AT-TG-AA-CA---AT---GT-AT-A-TCTAC----ATGTAAACAA--A-A--TGCTATAT-TC-C--AT-TTGC-------A-AATTA-C-AATAG-T---TATT-CAATATTTTCAGGA---G----T-ATG-GA-CATA-T-ATTTTGG-ACTCTA-----TTGAAC-TTTA----A-T----AA-T--GT-C-A-TTA---AAC---T-A---A---CAAA-T--TG-A-ATCTG-TATTA---TT-T---T--TCGATT-T-T-A-AA-TA---AT---GA--GTG-TGGAC-AAAAAT-G-AATTG-ACAACATAAATAT-TTTTA-CG-CTTGTCCagt
gi|20 : cAGGAA-TATAA-A-G---T-A---TATAATATCCCTTGTT-AATGGA-------CA-CAG-C-
gi|3 : GGGAAT-CCCC--AATTA-----AAGAAAAAACTGC-CTG-CTT-AAACAAAAGAATTTA-A-TACA-A-AA-AT-TTCCTTGA-ATTTT--CACTAAAAAAT----TGTC-GCTTT-GAAA-TTTTGTTTCAC-GCATGCAc
gi|3 : acaAAAGTACAACTG--T-T-TT--T-TTTTAA----AGACGACC-G-A-G-TTCGAA-TCTTTCACGCA-TACCAATTTTTTnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaaagtacaactgtttttttttaaagacgaccgagttcgaatctttcacgcataccaattttttgccnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncttctgtgatatttttagcacacgcaaggcaaaaaaatatataaaaaaatatataatatcctgttgatgacacagcacaggactaaactgtattaaatatgaacaagtatatctaaagaaatgatataattgcaattgtatattcaatattttcaagtgcatggacataatttttaactctattgaaccttaataatgccattacactaacaatgtgaacgtttatttttcgttcaaagtacatgtaagtgtgacaaaaatgaattgaaaacataaaagtttacgcttg
gi|3 : acagggaatccccaattaaagaaaaaactgcctgcttaaacaaaagaatttaatacaaaaatttccttgaattttcactaaaaaattgtcgctttgaaattttgtttcacgcatgcannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnCTTCT----GTGATA-T-----TTT--T-AGC-ACA-C-GC-AA---GGCA-AAAA-AATATATA--------AAAAAA-TATAT-A-A---T-A---T---------CCTGTT-GAT-GA-------CA-CAG-C-ACA--G-GACT-AAA-CTG----T---AT-TA---A-ATATG-AA-CA---A----GT-AT-A-TCTA-----A---A---GA--A-A--TGATAT-------------------------AATTG-C-AATTG-T-A-TATT-CAATATTTTCAAGT---G----C-ATG-GA-CATA---ATTTTTA-ACTCTA-----TTGAAC-CTTA----A-T----AA-T--GC-C-A-TTA---CAC---T-A---A---C-AA-TG-TG-A-A--CG-T-TTA---TT-T---T--TCG--T-T-C-A-AAGTACATGT---AA--GTG-T-GAC-AAAAAT-G-AATTGAA-AACATAAAAG---TTTA-CG-CTTGgccnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncttctgtgatatttttagcacacgcaaggcaaaaaaatatataaaaaaatatataatatcctgttgatgacacagcacaggactaaactgtattaaatatgaacaagtatatctaaagaaatgatataattgcaattgtatattcaatattttcaagtgcatggacataatttttaactctattgaaccttaataatgccattacactaacaatgtgaacgtttatttttcgttcaaagtacatgtaagtgtgacaaaaatgaattgaaaacataaaagtttacgcttg
gi|4 : acagggaatccccaattaaagaaaaaactgcctgcttaaacaaaagaatttaatacaaaaatttccttgaattttcactaaaaaattgtcgctttgaaattttgtttcacgcatgcannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaaagtacaactgtttttttttaaagacgaccgagttcgaatctttcacgcataccaattttttgccnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnAAT-CCCCA-GATTT-----A-GAAAAA-CTGCTCTGTCTTGAAACAAAATAAATTTAG-TACATACAA-AT-TTCTT--AGAATTT--CACTATAATATGAAATGTT-A--TT-GAAA-TTTTATTTCACGGCATGCA
gi|4 : AAACGTCCA--CG--TAT-TT--T-TTTTAACAACG--CGACC-GCA-GATTCGAA-TCTTTCAC-GA-TAT--AGATTTTCCatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaaacgtccacgtattttttttaacaacgcgaccgcagattcgaatctttcacgatatagattttcccnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaatgtccttcttgatattggtttttagcacattgcaatgtgacatcaaggctgataagcgaaggaaataataatatctcccttgttaatgacgcagtcacagtgactaaaactgttaaagattaacaattgcgcatatctaaaaacgaaatg
gi|4 : aatccccagatttagaaaaactgctctgtcttgaaacaaaataaatttagtacatacaaatttcttagaatttcactataatatgaaatgttattgaaattttatttcacggcatgcaatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnCTTCT-----TGATA-TTGGTTTTT----AGC-ACA-TTGC-AATGTGACATCAAG-GCTGA-TAAG--C--GAAGGAA--ATAATA-A---T-A---TCT-----CCCTTGTT-AAT-GA-------CG-CAGTC-ACA--GTGACTAAAA-CTGT---T---A--AA---G-AT-T--AA-CA---ATTGCGC-AT-A-TCTA-----A---AAACGA--A-A--TGcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaatgtccttcttgatattggtttttagcacattgcaatgtgacatcaaggctgataagcgaaggaaataataatatctcccttgttaatgacgcagtcacagtgactaaaactgttaaagattaacaattgcgcatatctaaaaacgaaatg
gi|5 : aatccccagatttagaaaaactgctctgtcttgaaacaaaataaatttagtacatacaaatttcttagaatttcactataatatgaaatgttattgaaattttatttcacggcatgcaatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaaacgtccacgtattttttttaacaacgcgaccgcagattcgaatctttcacgatatagattttcccnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaatgtcCTTCT----GTGATAAT-GCGTTTT--C-AG--ACA-C-GC-AA---GGCATAAAA-AAAAA-TATA--T-------AA-TATAA-ATA---T-AAG-TAT-----TCCTTGTT-AATGGATCACCAGCG-CA--C-ATG--G-GACT-AAA-ATGGTATT---A--AATTAATAT-TG-AA-TAT--ATTG-AT-AT-A-TCTA-----C---ATACGA--G-AAGTGA-ATATGTC-C--AG-TTAC-------AGAATTGAC-AATTG-TAA-TATTTCAATATTTTCGCGT---G----C-ATG-AA-CAAAGT-TTTTTGACAATCTACTTAGTTGAACACTTA----A-T----AT-TA-GC-C-A-TTACACAAC---T-ATCTACTCCAAA-TGTTG-A-ATCTGATCTTA---TT-T---T--TCGATT-T-C-AGAA-TG---CG---AA--GTA-GGGAC-AAAAATGG-AATTG---AACATAA
gi|6 : AGGGGAAT-CCCCG-AATTT-----AAGAAAAA-CTAC-CTG-CTTGAAACAAAATAAATTT-AATACA-A-AA-ATGTTCTTTGAGATTTT--CACTAAAAAAT----TGTC-GCTTT-GAAA-TTTTGTTTCAC-GCATGCANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNA-AATGTCCAACTG--G-T-TT--TATTTTAA----A--CGACCTG-A-G-TTCGAA-TCTTTCACGGA-TAC--ATTTTc
gi|7 : acGCTTCT----GTGATA-T-GGTTTTT----AGC--CA-C-GCGAA---GGC-TCAAG-CTTA------------AAGGAA-TATAA-A-A---TTA---TAT-----CCCTTGTT-AATG---------CGACAG-C-ACA--G-GACT-AAAACTG----TTATA--AA---T-AT-TG-AA-CA---AT---GT-AT-A-TCTA-----A---AA-CGA--A-A--TGATATAT-TC-C--AG-TTAC-------A-AATT--C-AAT-G-TA--T-TT-CAATATTTTCAGGT---G----C-ATG-GA-CATA-T-ATTTT-A-ACTCTA-----TTGAAC-CTTA----A-T----AATT--GC-C-A-TTA---AAC---T-A---A---CAAA-TG-TG-A-ATCTG-TCTTA---TT-T---T--TCGATT-T-C---AA-T----AT---AA--GTG-TGGAC-AAAAAT-G-AATTC-A-AACAT--ATA---TTTA-CG-CT
gi|8 : TCAAGAGCTTA-TAAG--CC-GAAAAAAAGATAA-A-A---T-AATCCGT-----CCCTTGTTTAGTGGAA------CG-TGG-C-ACACAG-GACT-AAA-ACG----T---A--AA---T-AT-TG-AA-CA---A----GTAAT-AGTCTA-----A---AACTGA--A-A--TTAT-TAT-TC-C--AGTTTGC-------A-AATTG-CTATTTG-TAG--ATT-CAATATTT--AGGTGCGG----C-ATG-GC-AATACT-TTTTTGA-AC-CTA-----TTGAA--ATTAATTTA-T----AA-T--GC-C-A-TTA---AACCTAT-A---A---CAAA-TG-TG---ATCTG-ATCTA----T-T---T--TCTATT-C-A-A-AA-TA---AT---AA--GTGTTGGAC-AAAAAT-G-AATTG---AACATACATAT-TTATATCG-CT
gi|9 : GGGAAT-CCCCG-AATTT-----A-GAAGAA-CTGC--TG-CTTGAAACAAAAAAAGTTT-G-TACA-A-AA-ATG-TCTTTGAGATTTT--CACT-AAAAAT----TGTC-GCTTTCGAAATTTTTGTTTC-C-GCATGCAg
gi|9 : acaAACGTCCAACTG--TAT-TT--G-TATAAA----A--CGACC-G-AGG-TTCGAATTCTTGCACCAAGTAC--ACTTTTTnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntataacgtccaactgtatttgtataaaacgaccgaggttcgaattcttgcaccaagtacacttttt
Alignments
lowQualScore : 11111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111
lowQualScore : 11111 1 33333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333 1111 1111111 222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 1111 111 22222222222 22222222222 1111111 333333333333333333 11111111 111111111 1111111 11111 111 1111111111111 111 22
lowQualScore : 5 66 22222 3 5 4 4 5 3 4 4 4 4 1 66 7 9999 4 1 4 4 5 55555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555 3333 5 8888 3333333 5 5 5 5 5 0 5 77 0 666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666 9999 4 4 11 8888 4 000 8 777 4 44444444444 99 4 4 777 4 66666666666 4 5555555 99 3 3 55 4 44 4 333333333333333333 8 4 4 55555555 4 4 4 666666666 66 55 4 55 4 4 66 4 4444444 4 4 8 00000 8 777 8888 4 4 4 111 2 3 99999 66 7777 3 7777 3 88 3 3 3 666 2222222222222 7 3 3 3 3 666 3 666 55 3 4 888 888888 666 88 3 3 3 3 555 00 5 5
lowQualScore : . .. ..... . . . . . . . . . . . .. . .... . . . . . ................................................................................................................................ .... . .... ....... . . . . . . . .. . .............................................................................................................................. .... . . .. .... . ... . ... . ........... .. . . ... . ........... . ....... .. . . .. . .. . .................. . . . ........ . . . ......... .. .. . .. . . .. . ....... . . . ..... . ... .... . . . ... . . ..... .. .... . .... . .. . . . ... ............. . . . . . ... . ... .. . . ... ...... ... .. . . . . ... .. . .
lowQualScore : 0 44 55555 2 0 4 4 3 3 4 4 4 4 1 11 3 4444 4 1 4 4 0 88888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888 7777 7 0000 1111111 7 7 7 7 7 7 7 99 3 000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 4444 4 4 88 8888 4 888 9 888 0 44444444444 00 0 0 000 0 11111111111 0 5555555 11 6 6 55 0 88 0 888888888888888888 0 0 0 33333333 0 0 0 888888888 55 55 0 55 4 4 11 4 4444444 4 4 9 77777 9 000 5555 0 0 0 999 8 6 11111 33 7777 6 7777 6 66 6 6 6 444 6666666666666 3 6 6 6 6 444 6 444 00 6 0 888 222222 444 66 6 6 6 6 222 55 7 7
consensus : NAAGGGGAAT-CCCCG-AATTT-----AAGAAAAA-CTGC-CTG-CTTGAAACAAAATAANTTT-G-TACA-A-AA-ATGTTCTTTGAGATTTT--CACTAAAAAAT----TGTC-GCTTT-GAAA-TTTTGTTTCAC-GCATGCANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAAAACGTCCAACTG--T-T-TT--T-TTTTAA----A--CGACC-G-A-G-TTCGAA-TCTTTCACGGA-TAC--ATTTTTTCCNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCGCTTCT----GTGATA-T-GGTTTTT--C-AGC-ACA-C-GC-AA---GGCATCAAG-GCTAT-TAAG--CC-GAAGGAA-GATAA-A-A---T-A---TAT-----CCCTTGTT-AATGGA-------CG-CAG-C-ACA--G-GACT-AAA-CTG----T---A--AA---A-AT-TG-AA-CA---AT---GT-AT-A-TCTA-----A---AAACGA--A-A--TGATATAT-TC-C--AG-TTGC-------A-AATTG-C-AATTG-TAA-TATT-CAATATTTTCAGGT---G----C-ATG-GA-CATA-T-ATTTTGA-ACTCTA-----TTGAAC-CTTA----A-T----AA-T--GC-C-A-TTA---AAC---T-A---A---CAAA-TG-TG-A-ATCTG-TCTTA---TT-T---T--TCGATT-T-C-A-AA-TA---AT---AA--GTG-TGGAC-AAAAAT-G-AATTG-A-AACATAAATAT-TTTTA-CG-CTTGTCC
Reference ( family-2544 ) : NAAGGGGAAT-CCCCG-AATTT-----AAGAAAAA-CTGC-CTG-CTTGAAACAAAATAANTTT-G-TACA-A-AA-ATGTTCTTTGAGATTTT--CACTAAAAAAT----TGTC-GCTTT-GAAA-TTTTGTTTCAC-GCATGCANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAAAACGTCCAACTG--T-T-TT--T-TTTTAA----A--CGACC-G-A-G-TTCGAA-TCTTTCACGGA-TAC--ATTTTTTCCNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCGCTTCT----GTGATA-T-GGTTTTT--C-AGC-ACA-C-GC-AA---GGCATCAAG-GCTAT-TAAG--CC-GAAGGAA-GATAA-A-A---T-A---TAT-----CCCTTGTT-AATGGA-------CG-CAG-C-ACA--G-GACT-AAA-CTG----T---A--AA---A-AT-TG-AA-CA---AT---GT-AT-A-TCTA-----A---AAACGA--A-A--TGATATAT-TC-C--AG-TTGC-------A-AATTG-C-AATTG-TAA-TATT-CAATATTTTCAGGT---G----C-ATG-GA-CATA-T-ATTTTGA-ACTCTA-----TTGAAC-CTTA----A-T----AA-T--GC-C-A-TTA---AAC---T-A---A---CAAA-TG-TG-A-ATCTG-TCTTA---TT-T---T--TCGATT-T-C-A-AA-TA---AT---AA--GTG-TGGAC-AAAAAT-G-AATTG-A-AACATAAATAT-TTTTA-CG-CTTGTCC
gi|1 : AGGGGAAT-CCCCGAAATTT-----AAG-AAAA-CTGC-ATG-CTTGAAACAAAATAAATTTAG-TACA-A-AA-ATGTTCTTCGAGATGTT--CACT-AAAAAT----TGTC-GCTTT-GAAA---TTGTTTCAC-GCATG
gi|1 : acTCTAACTGGTT-T-TT--T-TTTTAA----A--CGACC-G-A-G-TGCGAA-TCTTTCACGGA-TAC--AATTTTTCCgcannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntctaactggttttttttttaaacgaccgagtgcgaatctttcacggatacaatttttccctgtannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntctatttcgcttctgtgatatggtttttagcagcacggcaaggcatcaaggctataaggcccgaaggaagataaaatatataatatcccttgttaatggacacagccacaggactaaactgtataaatattggaacaatgtatgatctacatgtaaaacgaaatgatatattttcagttaccatgtacaaattgcaattgtaatatttcaatattttcaggtgccatggacatattattttaactctattaaagcttaataatgccaattaaactaacaaaatgtgaatttgtcttatttttcgatttcaaatgataagaactgaaacataaatatttaccg
gi|1 : acaggggaatccccgaaatttaagaaaactgcatgcttgaaacaaaataaatttagtacaaaaatgttcttcgagatgttcactaaaaattgtcgctttgaaattgtttcacgcatggcannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnCGCTTCT----GTGATA-T-GGTTTTTAGC-AGC-ACG---GC-AA---GGCATCAAG-GCTAT--AAGGCCC-GAAGGAA-GATAA-A-A---T-A---TATAATATCCCTTGTT-AATGGA-------CA-CAG-CCACA--G-GACT-AAA-CTG----T---AT-AA---ATAT-TGGAA-CA---AT---GT-ATGA-TCTACATGTA---AAACGA--A-A--TGATATAT-TTTC--AG-TTACCATGTACA-AATTG-C-AATTG-TAA-TATTTCAATATTTTCAGGT---G----CCATG-GA-CATA-TTATTTT-A-ACTCTA-----TTAAAG-CTTA----A-T----AA-T--GC-C-AATTA---AAC---T-A---A---CAAAATG-TG-A-ATTTG-TCTTA---TT-T---T--TCGATT-T-C-A-AA-TG---AT---AA-------------------G-AACTG-A-AACATAAATAT-TTctgtannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntctatttcgcttctgtgatatggtttttagcagcacggcaaggcatcaaggctataaggcccgaaggaagataaaatatataatatcccttgttaatggacacagccacaggactaaactgtataaatattggaacaatgtatgatctacatgtaaaacgaaatgatatattttcagttaccatgtacaaattgcaattgtaatatttcaatattttcaggtgccatggacatattattttaactctattaaagcttaataatgccaattaaactaacaaaatgtgaatttgtcttatttttcgatttcaaatgataagaactgaaacataaatatttaccg
gi|10 : acaggggaatccccgaaatttaagaaaactgcatgcttgaaacaaaataaatttagtacaaaaatgttcttcgagatgttcactaaaaattgtcgctttgaaattgtttcacgcatggcannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntctaactggttttttttttaaacgaccgagtgcgaatctttcacggatacaatttttccctgtannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntctatttCGCTTCTCCTGGGGATA-T-GGTTTTT--TTAGC-ACA-C-GCTAA---GGCATCAAG-GC-AT--AAG--CC-GAAGGAA-GATAA-A-AATAT-AAA-TAT-----CCCTTGTT-AATGGA-------CAACAG-C-ACA--G-GACT-AAA-CTG----T---ATAAG---A-ATATG-AATCA---AT---GT-AT-A-TT-------A---AAACGA--AGA--TGATAAAT-TC-C--AG-TTAC-------A-ATTGG-C-AATTG-TAAATATT-CAATATTTTCAGGT---G----C-ATG-GA-CATA-T-ATTTTGA-ACCGTA-----TTGAAT-CTTA----A-T----AA-T--GC-CTA-TTA---AAC---------A---CAAATTG-TG-A-ATCTG-TCTTA---TT-T---T--TCGATT-accg
gi|11 : -CTG-CTTGAAACAAAATAAATTTAG-TACA-A-AA-GTGTTCTTTGAGATTTT--CACTAAAACAT----TGTC-GCTTT-GAAA-TGTTGTTTCAC-GCATGCANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNA-AACGTCTAACTA--T-TGTTGCT-TTTTAA----A--CGACC-G-A-G-TTCGAA-TCTTTCACGGT-TAC--ATTTTTT
gi|12 : CT----GTGATA-A-GGCTTTT--C-A-C-ACAAT-GC-A----GGCAT-AAG-GCTAT---AG--CCAGAAGGAA-GATAA-------T-A---TAT--------------AATGGA-------C--CAG-G-ACA--G-GAT---AA-CTG----T---A--TA------T-TG-AA-CA---AT---GT-AT-A-T------------AAAC-------------ATAT--C-C--GG-TTG--------A-AATTG-C-AATTG---A-TATT-CAGTATTTT-AGGT---G----C-AAA-AAACATA-T-ATTTTGA-AAT--A-----TTGACT-TTTA----A-T----AT-T--GC-C-A-TTA---A-C---T-A---A---CAAA-TG-TG-A-ATT---TCTTA---TTAT---TCATCGATT-TACAA-AA-TA---AT---AAAGGCG-TGGAC-CAACAT-A-AA
gi|13 : ta-------CA-CAG-G-ACA--G-AAC----A-CTGGA--T---A--AATACA-AC-TG-AA-CATACAT---GT-AT-A-TATA-----A---A--CGATTA-A--T--TATAT-TC-ATGGG-TGGC-------A-A-TTG-CCAATTGGTAA-TCT----ATTTTTCTCGGT---GATTCC-ATATGA-CATA-TTATTTTG---CTCTA-----TT-AAC-TTTA----AAC----AA-TATGC-C-A-TTA-----C---T---------CA---TC-TG-ATGGCTG-CCTTA---TT-T---T--TCGA-T-T-C-A-AG--A---AT---AA--ATG--AGAC--AAAAT-G-CATTG---AACATAA
gi|14 : TTTCAGGT---G----C-ATG-GA-CA-A-T-A-TTTAA-ACTC-A-----TTGAAC---TA----A-T----AA-T--GCAC-A-TTA---AAC---T-A---AC--CAAA-TG--G-A----TG-CCTTA---TT-TCCAT--TCCATT-C-C---AA-TA---ATATAAA--AT--TGGAC-AAAAAT-G-AATT--A-AACATAAATA---TTTA-CG-CTTGca
gi|15 : ccagtgagcaaattgcaTTTGA-ACTCTA-----TTTAAC-TTTC----A-CATAAAA-T--G--C-A-TTA---AAC---TAA---A---CAAA-TG-TGAA-ATCCG-TCTTAAATTT-T---T--TCGATTAT-C-A-A---A---AT---AAT-GTG-TGGACAAAAAAT-GCAAGTG-A-AA-ATAAATATCTTTTA-CGTCTTGCCC
gi|16 : AAGGGGAATACCCCG-AATTTTAAAGAAAAAAAA-CTGC-CTG-CTTGAAACGAAATAATTTA-A-TACA-A-AA-ATGTTC-TTGAGATGTTCCCATAAAAAAAT----TGTCTGCTTT-GAAA-TTTTGTTTCA
gi|17 : caAGGGGAAT-CC----GATTT-----AAGAAAA--CTGC-CTG-CTTGAA-CAAA-TAA-TTT-G-TTCA-A-AAGATGTT-TTTGAGATTTT--CAAT-AAAAGT----TGTC-G-TTT-GAAA-TTTTG-TTCAC-GCATGgc
gi|18 : ac---AA--GTG-TGGAC-AAAAAT-G-AATTG-G-AACATACATA--TTTTA-CG-CTTGTC
gi|19 : T----GTGATA-T-G--TTTT--T-AGCAACA-C-GC-AA---G--ATCAAG-GCT-T-TAA
gi|2 : AAGGAGAAT-CCCCG-AATTT-----AAGAAAAA-CTGC-CTG-CTTGAAACAAAATAATTTT-G-TACA-A-AA-ATGTTCTTTGAGATTTT--CACTAAAAAAT----TGTC-GCTTT-GAAA-TTTTGTTTCAC-GCATGCANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAAACGACCAACTG--T-T-AT--T-TTTTAA----A--CGACC-G-A-G-TTCGAA-TCTTTCACGGA-TAC--ATTTTTTTCNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCGCTTCT----GTGATA-T-GGTTTTT--T-AGC-AC----GC-AA---GGCATCAAG-GCTAT-TAAG--CC-GAAGGAG-GATAA-A-A---T-A---TCT-----CCCTTGTT-AATGGA-------CG-CAG-C-ACA--G-GACT-AAA-CTG----T---A--AA---A-AT-TG-AA-CA---AT---GT-AT-A-TCTAC----ATGTAAACAA--A-A--TGCTATAT-TC-C--AT-TTGC-------A-AATTA-C-AATAG-T---TATT-CAATATTTTCAGGA---G----T-ATG-GA-CATA-T-ATTTTGG-ACTCTA-----TTGAAC-TTTA----A-T----AA-T--GT-C-A-TTA---AAC---T-A---A---CAAA-T--TG-A-ATCTG-TATTA---TT-T---T--TCGATT-T-T-A-AA-TA---AT---GA--GTG-TGGAC-AAAAAT-G-AATTG-ACAACATAAATAT-TTTTA-CG-CTTGTCCagt
gi|20 : cAGGAA-TATAA-A-G---T-A---TATAATATCCCTTGTT-AATGGA-------CA-CAG-C-
gi|3 : GGGAAT-CCCC--AATTA-----AAGAAAAAACTGC-CTG-CTT-AAACAAAAGAATTTA-A-TACA-A-AA-AT-TTCCTTGA-ATTTT--CACTAAAAAAT----TGTC-GCTTT-GAAA-TTTTGTTTCAC-GCATGCAc
gi|3 : acaAAAGTACAACTG--T-T-TT--T-TTTTAA----AGACGACC-G-A-G-TTCGAA-TCTTTCACGCA-TACCAATTTTTTnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaaagtacaactgtttttttttaaagacgaccgagttcgaatctttcacgcataccaattttttgccnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncttctgtgatatttttagcacacgcaaggcaaaaaaatatataaaaaaatatataatatcctgttgatgacacagcacaggactaaactgtattaaatatgaacaagtatatctaaagaaatgatataattgcaattgtatattcaatattttcaagtgcatggacataatttttaactctattgaaccttaataatgccattacactaacaatgtgaacgtttatttttcgttcaaagtacatgtaagtgtgacaaaaatgaattgaaaacataaaagtttacgcttg
gi|3 : acagggaatccccaattaaagaaaaaactgcctgcttaaacaaaagaatttaatacaaaaatttccttgaattttcactaaaaaattgtcgctttgaaattttgtttcacgcatgcannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnCTTCT----GTGATA-T-----TTT--T-AGC-ACA-C-GC-AA---GGCA-AAAA-AATATATA--------AAAAAA-TATAT-A-A---T-A---T---------CCTGTT-GAT-GA-------CA-CAG-C-ACA--G-GACT-AAA-CTG----T---AT-TA---A-ATATG-AA-CA---A----GT-AT-A-TCTA-----A---A---GA--A-A--TGATAT-------------------------AATTG-C-AATTG-T-A-TATT-CAATATTTTCAAGT---G----C-ATG-GA-CATA---ATTTTTA-ACTCTA-----TTGAAC-CTTA----A-T----AA-T--GC-C-A-TTA---CAC---T-A---A---C-AA-TG-TG-A-A--CG-T-TTA---TT-T---T--TCG--T-T-C-A-AAGTACATGT---AA--GTG-T-GAC-AAAAAT-G-AATTGAA-AACATAAAAG---TTTA-CG-CTTGgccnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncttctgtgatatttttagcacacgcaaggcaaaaaaatatataaaaaaatatataatatcctgttgatgacacagcacaggactaaactgtattaaatatgaacaagtatatctaaagaaatgatataattgcaattgtatattcaatattttcaagtgcatggacataatttttaactctattgaaccttaataatgccattacactaacaatgtgaacgtttatttttcgttcaaagtacatgtaagtgtgacaaaaatgaattgaaaacataaaagtttacgcttg
gi|4 : acagggaatccccaattaaagaaaaaactgcctgcttaaacaaaagaatttaatacaaaaatttccttgaattttcactaaaaaattgtcgctttgaaattttgtttcacgcatgcannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaaagtacaactgtttttttttaaagacgaccgagttcgaatctttcacgcataccaattttttgccnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnAAT-CCCCA-GATTT-----A-GAAAAA-CTGCTCTGTCTTGAAACAAAATAAATTTAG-TACATACAA-AT-TTCTT--AGAATTT--CACTATAATATGAAATGTT-A--TT-GAAA-TTTTATTTCACGGCATGCA
gi|4 : AAACGTCCA--CG--TAT-TT--T-TTTTAACAACG--CGACC-GCA-GATTCGAA-TCTTTCAC-GA-TAT--AGATTTTCCatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaaacgtccacgtattttttttaacaacgcgaccgcagattcgaatctttcacgatatagattttcccnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaatgtccttcttgatattggtttttagcacattgcaatgtgacatcaaggctgataagcgaaggaaataataatatctcccttgttaatgacgcagtcacagtgactaaaactgttaaagattaacaattgcgcatatctaaaaacgaaatg
gi|4 : aatccccagatttagaaaaactgctctgtcttgaaacaaaataaatttagtacatacaaatttcttagaatttcactataatatgaaatgttattgaaattttatttcacggcatgcaatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnCTTCT-----TGATA-TTGGTTTTT----AGC-ACA-TTGC-AATGTGACATCAAG-GCTGA-TAAG--C--GAAGGAA--ATAATA-A---T-A---TCT-----CCCTTGTT-AAT-GA-------CG-CAGTC-ACA--GTGACTAAAA-CTGT---T---A--AA---G-AT-T--AA-CA---ATTGCGC-AT-A-TCTA-----A---AAACGA--A-A--TGcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaatgtccttcttgatattggtttttagcacattgcaatgtgacatcaaggctgataagcgaaggaaataataatatctcccttgttaatgacgcagtcacagtgactaaaactgttaaagattaacaattgcgcatatctaaaaacgaaatg
gi|5 : aatccccagatttagaaaaactgctctgtcttgaaacaaaataaatttagtacatacaaatttcttagaatttcactataatatgaaatgttattgaaattttatttcacggcatgcaatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaaacgtccacgtattttttttaacaacgcgaccgcagattcgaatctttcacgatatagattttcccnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaatgtcCTTCT----GTGATAAT-GCGTTTT--C-AG--ACA-C-GC-AA---GGCATAAAA-AAAAA-TATA--T-------AA-TATAA-ATA---T-AAG-TAT-----TCCTTGTT-AATGGATCACCAGCG-CA--C-ATG--G-GACT-AAA-ATGGTATT---A--AATTAATAT-TG-AA-TAT--ATTG-AT-AT-A-TCTA-----C---ATACGA--G-AAGTGA-ATATGTC-C--AG-TTAC-------AGAATTGAC-AATTG-TAA-TATTTCAATATTTTCGCGT---G----C-ATG-AA-CAAAGT-TTTTTGACAATCTACTTAGTTGAACACTTA----A-T----AT-TA-GC-C-A-TTACACAAC---T-ATCTACTCCAAA-TGTTG-A-ATCTGATCTTA---TT-T---T--TCGATT-T-C-AGAA-TG---CG---AA--GTA-GGGAC-AAAAATGG-AATTG---AACATAA
gi|6 : AGGGGAAT-CCCCG-AATTT-----AAGAAAAA-CTAC-CTG-CTTGAAACAAAATAAATTT-AATACA-A-AA-ATGTTCTTTGAGATTTT--CACTAAAAAAT----TGTC-GCTTT-GAAA-TTTTGTTTCAC-GCATGCANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNA-AATGTCCAACTG--G-T-TT--TATTTTAA----A--CGACCTG-A-G-TTCGAA-TCTTTCACGGA-TAC--ATTTTc
gi|7 : acGCTTCT----GTGATA-T-GGTTTTT----AGC--CA-C-GCGAA---GGC-TCAAG-CTTA------------AAGGAA-TATAA-A-A---TTA---TAT-----CCCTTGTT-AATG---------CGACAG-C-ACA--G-GACT-AAAACTG----TTATA--AA---T-AT-TG-AA-CA---AT---GT-AT-A-TCTA-----A---AA-CGA--A-A--TGATATAT-TC-C--AG-TTAC-------A-AATT--C-AAT-G-TA--T-TT-CAATATTTTCAGGT---G----C-ATG-GA-CATA-T-ATTTT-A-ACTCTA-----TTGAAC-CTTA----A-T----AATT--GC-C-A-TTA---AAC---T-A---A---CAAA-TG-TG-A-ATCTG-TCTTA---TT-T---T--TCGATT-T-C---AA-T----AT---AA--GTG-TGGAC-AAAAAT-G-AATTC-A-AACAT--ATA---TTTA-CG-CT
gi|8 : TCAAGAGCTTA-TAAG--CC-GAAAAAAAGATAA-A-A---T-AATCCGT-----CCCTTGTTTAGTGGAA------CG-TGG-C-ACACAG-GACT-AAA-ACG----T---A--AA---T-AT-TG-AA-CA---A----GTAAT-AGTCTA-----A---AACTGA--A-A--TTAT-TAT-TC-C--AGTTTGC-------A-AATTG-CTATTTG-TAG--ATT-CAATATTT--AGGTGCGG----C-ATG-GC-AATACT-TTTTTGA-AC-CTA-----TTGAA--ATTAATTTA-T----AA-T--GC-C-A-TTA---AACCTAT-A---A---CAAA-TG-TG---ATCTG-ATCTA----T-T---T--TCTATT-C-A-A-AA-TA---AT---AA--GTGTTGGAC-AAAAAT-G-AATTG---AACATACATAT-TTATATCG-CT
gi|9 : GGGAAT-CCCCG-AATTT-----A-GAAGAA-CTGC--TG-CTTGAAACAAAAAAAGTTT-G-TACA-A-AA-ATG-TCTTTGAGATTTT--CACT-AAAAAT----TGTC-GCTTTCGAAATTTTTGTTTC-C-GCATGCAg
gi|9 : acaAACGTCCAACTG--TAT-TT--G-TATAAA----A--CGACC-G-AGG-TTCGAATTCTTGCACCAAGTAC--ACTTTTTnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntataacgtccaactgtatttgtataaaacgaccgaggttcgaattcttgcaccaagtacacttttt
blockSeqs : A G TAAAG A A T T A A A T C G G CC A GAAA T C C T G NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNA TA G GCT CAACG T C G A T G CA CCTG A T GT TT A AT T TGT A TTAAGCC AG T T ATA T TATAATAT T TCACCAG AA T . CA T TA A GTATTAAATTAAT A . T TACAT A . G CATGT AA TT G AG G . TG T . G A C TAAA T GCG ATTC . T A TT G C CTTAG AC ATTT A ATAA T AT A T . CAC TATCTACTC T T A T A AAT A CCA CA A A AA GTACAT ATA AG T A G C AC TC T T
blockSeqs : . G . A . . . T A . . . . G . A . . C . . . NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNA TA . TA AGA . . . . . . . . . . GC C . TT G . . ATAAGCC G . . . . ATCCGT . A GA . . . . T . GATAAATACA A . . ATTGC . . . A AA . . . . . . . . . . T GTAA . . . . . . GT G . . C . . . . A . . . . CTATAA . . . . . . . . . . . AG TA . T . . . . AA T . .
blockSeqs : . A . A . . . T . . . . . G . A . . C . . . T . T A . . . . . . . . . . GT T . C . . . TAAGCC G . . . . AATAT . . A . . . . T . TTATAAAT . . . TATTG . . . A AA . . . . . . . . . . . TAA . . . . . . CT G . . T . . . . . . . . . TAAC . . . . . . . . . . . A TA . . . . . . A T . .
blockSeqs : . G . A . . . T . . . . . G . A . . C . . . T . T A . . . . . . . . . . GT T . C . . . TAGCCA G . . . . AGTAT . . G . . . . T . TATAAGA . . . AT . . . A AA . . . . . . . . . . . TAG . . . . . . T A . . T . . . . . . . . . TAAA . . . . . . . . . . . A TA . . . . . . A . . .
blockSeqs : . G . A . . . A . . . . . G . A . . C . . . T . T A . . . . . . . . . . CG T . C . . . ATAAGC T . . . . TAT . . A . . . . T . TATTAA . . . AT . . . A TA . . . . . . . . . . . TA . . . . . . T G . . T . . . . . . . . . TAA . . . . . . . . . . . A TG . . . . . . G . . .
blockSeqs : . . . . . . . A . . . . . G . A . . C . . . G . G A . . . . . . . . . . GT C . C . . . ATATAT T . . . . TCT . . A . . . . T . TTAAAG . . . AT . . . C AC . . . . . . . . . . . TA . . . . . . T G . . T . . . . . . . . . TAA . . . . . . . . . . . A TA . . . . . . A . . .
blockSeqs : . . . . . . . G . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . TATA T . . . . TCT . . G . . . . T . TAAAA . . . AT . . . A A . . . . . . . . . . . A . . . . . . T T . . C . . . . . . . . . TAA . . . . . . . . . . . A A . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . TAT . . G . . . . . . TAAAT . . . A . . . A . . . . . . . . . . . . T . . . . . . T G . . C . . . . . . . . . TAA . . . . . . . . . . . . A . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . T . . G . . . . . . TATA . . . A . . . . . . . . . . . . . . G . . A . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . T . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqCons : G* T*** T*** C** ATAAGCC**** ATAT******* TAAAA************* A******** ******* TAA** T** **
originalCons : NAAGGGGAAT-CCCCG-AATTT-----AAGAAAAA-CTGC-CTG-CTTGAAACAAAATAANTTT-G-TACA-A-AA-ATGTTCTTTGAGATTTT--CACTAAAAAAT----TGTC-GCTTT-GAAA-TTTTGTTTCAC-GCATGCANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAAAACGTCCAACTG--T-T-TT--T-TTTTAA----A--CGACC-G-A-G-TTCGAA-TCTTTCACGGA-TAC--ATTTTTTCCNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCGCTTCT----GTGATA-T-GGTTTTT--C-AGC-ACA-C-GC-AA---GGCATCAAG-GCTAT-TAAG--CC-GAAGGAA-GATAA-A-A---T-A---TAT-----CCCTTGTT-AATGGA-------CG-CAG-C-ACA--G-GACT-AAA-CTG----T---A--AA---A-AT-TG-AA-CA---AT---GT-AT-A-TCTA-----A---AAACGA--A-A--TGATATAT-TC-C--AG-TTGC-------A-AATTG-C-AATTG-TAA-TATT-CAATATTTTCAGGT---G----C-ATG-GA-CATA-T-ATTTTGA-ACTCTA-----TTGAAC-CTTA----A-T----AA-T--GC-C-A-TTA---AAC---T-A---A---CAAA-TG-TG-A-ATCTG-TCTTA---TT-T---T--TCGATT-T-C-A-AA-TA---AT---AA--GTG-TGGAC-AAAAAT-G-AATTG-A-AACATAAATAT-TTTTA-CG-CTTGTCC
finalCons : NAAGGGGAAT-CCCCG-AATTT-----AAGAAAAA-CTGC-CTG-CTTGAAACAAAATAANTTT-G-TACA-A-AA-ATGTTCTTTGAGATTTT--CACTAAAAAAT----TGTC-GCTTT-GAAA-TTTTGTTTCAC-GCATGCANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAAAACGTCCAACTGT---T-TT--T-TTTTAA----A--CGACC-G-A-G-TTCGAA-TCTTTCACGGA-TAC--ATTTTTTCCNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCGCTTCT----GTGATA-T-GGTTTTTT---AGC-ACAC--GC-AA---GGCATCAAG-GCTAATAAGCC----GAAGGAA-GATAA-A-A---T-AATAT-------CCCTTGTT-AATGGA-------CG-CAG-C-ACA--G-GACT-AAA-CTGTAAAA-------------AT-TG-AA-CA---AT---GT-AT-A-TCTAA--------AAACGA--A-A--TGATATAT-TC-C--AG-TTGC-------A-AATTG-C-AATTGTAA--TATT-CAATATTTTCAGGT---G----C-ATG-GA-CATAT--ATTTTGA-ACTCTA-----TTGAAC-CTTA----A-T----AA-T--GC-C-A-TTA---AAC---T-A---A---CAAA-TG-TG-A-ATCTG-TCTTA---TT-T---T--TCGATT-T-C-A-AA-TA---AT---AA--GTG-TGGAC-AAAAAT-G-AATTG-A-AACATAAATA--TTTTA-CG-CTTGTCC
Alignments
lowQualScore : 11111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111
lowQualScore : 11111 1 33333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333 1111 1111111 222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 1111111 11111111111111111 1111111 3333333333333333333 11111111 111111111 1111111 11 111 1111111111111 111 111
lowQualScore : 5 66 22222 3 5 4 4 5 3 4 4 4 4 1 66 7 9999 4 1 4 4 5 55555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555 3333 5 8888 3333333 5 5 5 5 5 0 5 77 0 666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666 9999 4 44 99 555 555 4 8 777 4 99 6666666 99 88888888888888888 55 55 4 5 5555555 99 3 3 55 4 0 8 3333333333333333333 8 4 4 55555555 4 4 4 666666666 66 55 4 55 4 4 66 4 4444444 4 4 8 4 00 8 777 8888 4 4 4 111 2 3 99999 66 7777 3 7777 3 88 3 3 3 666 2222222222222 7 3 3 3 3 666 3 666 55 3 4 888 888888 666 88 3 3 3 3 555 888 5 5 5
lowQualScore : . .. ..... . . . . . . . . . . . .. . .... . . . . . ................................................................................................................................ .... . .... ....... . . . . . . . .. . .............................................................................................................................. .... . .. .. ... ... . . ... . .. ....... .. ................. .. .. . . ....... .. . . .. . . . ................... . . . ........ . . . ......... .. .. . .. . . .. . ....... . . . . .. . ... .... . . . ... . . ..... .. .... . .... . .. . . . ... ............. . . . . . ... . ... .. . . ... ...... ... .. . . . . ... ... . . .
lowQualScore : 0 44 55555 2 0 4 4 3 3 4 4 4 4 1 11 3 4444 4 1 4 4 0 88888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888 7777 7 0000 1111111 7 7 7 7 7 7 7 99 3 000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 4444 4 44 77 333 222 4 9 888 0 22 7777777 00 11111111111111111 55 55 0 0 5555555 11 6 6 55 0 8 0 8888888888888888888 0 0 0 33333333 0 0 0 888888888 55 55 0 55 4 4 11 4 4444444 4 4 9 4 77 9 000 5555 0 0 0 999 8 6 11111 33 7777 6 7777 6 66 6 6 6 444 6666666666666 3 6 6 6 6 444 6 444 00 6 0 888 222222 444 66 6 6 6 6 222 111 0 7 7
consensus : NAAGGGGAAT-CCCCG-AATTT-----AAGAAAAA-CTGC-CTG-CTTGAAACAAAATAANTTT-G-TACA-A-AA-ATGTTCTTTGAGATTTT--CACTAAAAAAT----TGTC-GCTTT-GAAA-TTTTGTTTCAC-GCATGCANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAAAACGTCCAACTG--T-T-TT--T-TTTTAA----A--CGACC-G-A-G-TTCGAA-TCTTTCACGGA-TAC--ATTTTTTCCNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCGCTTCT----GTGATA-TGGTTTTTT-AGC-A-CA-C-G-C-AA---GGCATCAAG-GCTA-ATAAG--CC-GAAGGAA-GATAAA----A---TA----A-T--ATC--CCTTGTT-AATGGA-------CG-CAG-C-ACA--G-GACTAAA-CTG----T---A--A-A---A-AT-TG-AA-CA---AT---GT-AT-A-TCTA-----A---AAACGA--A-A--TGATATAT-TC-C--AG-TTGC-------A-AATTG-C-AATTG-TAA-TATT-CAATATTTTCAGGT---G----C-ATG-GA-CATA-T-ATTTTGA-ACTCTA-----TTGAAC-CTTA----A-T----AA-T--GC-C-A-TTA---AAC---T-A---A---CAAA-TG-TG-A-ATCTG-TCTTA---TT-T---T--TCGATT-T-C-A-AA-TA---AT---AA--GTG-TGGAC-AAAAAT-G-AATTG-A-AACATAAATA--TTT-TA-CG-CTTGTCC
Reference ( family-2544 ) : NAAGGGGAAT-CCCCG-AATTT-----AAGAAAAA-CTGC-CTG-CTTGAAACAAAATAANTTT-G-TACA-A-AA-ATGTTCTTTGAGATTTT--CACTAAAAAAT----TGTC-GCTTT-GAAA-TTTTGTTTCAC-GCATGCANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAAAACGTCCAACTG--T-T-TT--T-TTTTAA----A--CGACC-G-A-G-TTCGAA-TCTTTCACGGA-TAC--ATTTTTTCCNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCGCTTCT----GTGATA-TGGTTTTTT-AGC-A-CA-C-G-C-AA---GGCATCAAG-GCTA-ATAAG--CC-GAAGGAA-GATAAA----A---TA----A-T--ATC--CCTTGTT-AATGGA-------CG-CAG-C-ACA--G-GACTAAA-CTG----T---A--A-A---A-AT-TG-AA-CA---AT---GT-AT-A-TCTA-----A---AAACGA--A-A--TGATATAT-TC-C--AG-TTGC-------A-AATTG-C-AATTG-TAA-TATT-CAATATTTTCAGGT---G----C-ATG-GA-CATA-T-ATTTTGA-ACTCTA-----TTGAAC-CTTA----A-T----AA-T--GC-C-A-TTA---AAC---T-A---A---CAAA-TG-TG-A-ATCTG-TCTTA---TT-T---T--TCGATT-T-C-A-AA-TA---AT---AA--GTG-TGGAC-AAAAAT-G-AATTG-A-AACATAAATA--TTT-TA-CG-CTTGTCC
gi|1 : AGGGGAAT-CCCCGAAATTT-----AAG-AAAA-CTGC-ATG-CTTGAAACAAAATAAATTTAG-TACA-A-AA-ATGTTCTTCGAGATGTT--CACT-AAAAAT----TGTC-GCTTT-GAAA---TTGTTTCAC-GCATG
gi|1 : acTCTAACTGGTT-T-TT--T-TTTTAA----A--CGACC-G-A-G-TGCGAA-TCTTTCACGGA-TAC--AATTTTTCCgcannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntctaactggttttttttttaaacgaccgagtgcgaatctttcacggatacaatttttccctgtannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntctatttcgcttctgtgatatggtttttagcagcacggcaaggcatcaaggctataaggcccgaaggaagataaaatatataatatcccttgttaatggacacagccacaggactaaactgtataaatattggaacaatgtatgatctacatgtaaaacgaaatgatatattttcagttaccatgtacaaattgcaattgtaatatttcaatattttcaggtgccatggacatattattttaactctattaaagcttaataatgccaattaaactaacaaaatgtgaatttgtcttatttttcgatttcaaatgataagaactgaaacataaatatttaccg
gi|1 : acaggggaatccccgaaatttaagaaaactgcatgcttgaaacaaaataaatttagtacaaaaatgttcttcgagatgttcactaaaaattgtcgctttgaaattgtttcacgcatggcannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnCGCTTCT----GTGATA-TGGTTTTT--AGC-AGCA-C-GGC-AA---GGCATCAAG-GCTA--TAAGGCCC-GAAGGAA-GATAAA----A---TATATAA-T--ATC--CCTTGTT-AATGGA-------CA-CAG-CCACA--G-GACTAAA-CTG----T---AT-A-A---ATAT-TGGAA-CA---AT---GT-ATGA-TCTACATGTA---AAACGA--A-A--TGATATAT-TTTC--AG-TTACCATGTACA-AATTG-C-AATTG-TAA-TATTTCAATATTTTCAGGT---G----CCATG-GA-CATA-TTATTTT-A-ACTCTA-----TTAAAG-CTTA----A-T----AA-T--GC-C-AATTA---AAC---T-A---A---CAAAATG-TG-A-ATTTG-TCTTA---TT-T---T--TCGATT-T-C-A-AA-TG---AT---AA-------------------G-AACTG-A-AACATAAATA--TTT-ctgtannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntctatttcgcttctgtgatatggtttttagcagcacggcaaggcatcaaggctataaggcccgaaggaagataaaatatataatatcccttgttaatggacacagccacaggactaaactgtataaatattggaacaatgtatgatctacatgtaaaacgaaatgatatattttcagttaccatgtacaaattgcaattgtaatatttcaatattttcaggtgccatggacatattattttaactctattaaagcttaataatgccaattaaactaacaaaatgtgaatttgtcttatttttcgatttcaaatgataagaactgaaacataaatatttaccg
gi|10 : acaggggaatccccgaaatttaagaaaactgcatgcttgaaacaaaataaatttagtacaaaaatgttcttcgagatgttcactaaaaattgtcgctttgaaattgtttcacgcatggcannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntctaactggttttttttttaaacgaccgagtgcgaatctttcacggatacaatttttccctgtannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntctatttCGCTTCTCCTGGGGATA-TGGTTTTTTTAGC-A-CA-C-G-CTAA---GGCATCAAG-GC---ATAAG--CC-GAAGGAA-GATAAA----AATATA----AAT--ATC--CCTTGTT-AATGGA-------CAACAG-C-ACA--G-GACTAAA-CTG----T---ATAA-G---A-ATATG-AATCA---AT---GT-AT-A-TT-------A---AAACGA--AGA--TGATAAAT-TC-C--AG-TTAC-------A-ATTGG-C-AATTG-TAAATATT-CAATATTTTCAGGT---G----C-ATG-GA-CATA-T-ATTTTGA-ACCGTA-----TTGAAT-CTTA----A-T----AA-T--GC-CTA-TTA---AAC---------A---CAAATTG-TG-A-ATCTG-TCTTA---TT-T---T--TCGATT-accg
gi|11 : -CTG-CTTGAAACAAAATAAATTTAG-TACA-A-AA-GTGTTCTTTGAGATTTT--CACTAAAACAT----TGTC-GCTTT-GAAA-TGTTGTTTCAC-GCATGCANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNA-AACGTCTAACTA--T-TGTTGCT-TTTTAA----A--CGACC-G-A-G-TTCGAA-TCTTTCACGGT-TAC--ATTTTTT
gi|12 : CT----GTGATA-AGGCTTTTC-A-C-A-CAAT-G-C-A----GGCAT-AAG-GCTA--TA-G--CCAGAAGGAA-GATAAT----A---TA--------------------T-AATGGA-------C--CAG-G-ACA--G-GAT--AA-CTG----T---A--T-A------T-TG-AA-CA---AT---GT-AT-A-T------------AAAC-------------ATAT--C-C--GG-TTG--------A-AATTG-C-AATTG---A-TATT-CAGTATTTT-AGGT---G----C-AAA-AAACATA-T-ATTTTGA-AAT--A-----TTGACT-TTTA----A-T----AT-T--GC-C-A-TTA---A-C---T-A---A---CAAA-TG-TG-A-ATT---TCTTA---TTAT---TCATCGATT-TACAA-AA-TA---AT---AAAGGCG-TGGAC-CAACAT-A-AA
gi|13 : ta-------CA-CAG-G-ACA--G-AAC---A-CTGGA--T---A--A-ATACA-AC-TG-AA-CATACAT---GT-AT-A-TATA-----A---A--CGATTA-A--T--TATAT-TC-ATGGG-TGGC-------A-A-TTG-CCAATTGGTAA-TCT----ATTTTTCTCGGT---GATTCC-ATATGA-CATA-TTATTTTG---CTCTA-----TT-AAC-TTTA----AAC----AA-TATGC-C-A-TTA-----C---T---------CA---TC-TG-ATGGCTG-CCTTA---TT-T---T--TCGA-T-T-C-A-AG--A---AT---AA--ATG--AGAC--AAAAT-G-CATTG---AACATAA
gi|14 : TTTCAGGT---G----C-ATG-GA-CA-A-T-A-TTTAA-ACTC-A-----TTGAAC---TA----A-T----AA-T--GCAC-A-TTA---AAC---T-A---AC--CAAA-TG--G-A----TG-CCTTA---TT-TCCAT--TCCATT-C-C---AA-TA---ATATAAA--AT--TGGAC-AAAAAT-G-AATT--A-AACATAAATA---TT-TA-CG-CTTGca
gi|15 : ccagtgagcaaattgcaTTTGA-ACTCTA-----TTTAAC-TTTC----A-CATAAAA-T--G--C-A-TTA---AAC---TAA---A---CAAA-TG-TGAA-ATCCG-TCTTAAATTT-T---T--TCGATTAT-C-A-A---A---AT---AAT-GTG-TGGACAAAAAAT-GCAAGTG-A-AA-ATAAATATCTTT-TA-CGTCTTGCCC
gi|16 : AAGGGGAATACCCCG-AATTTTAAAGAAAAAAAA-CTGC-CTG-CTTGAAACGAAATAATTTA-A-TACA-A-AA-ATGTTC-TTGAGATGTTCCCATAAAAAAAT----TGTCTGCTTT-GAAA-TTTTGTTTCA
gi|17 : caAGGGGAAT-CC----GATTT-----AAGAAAA--CTGC-CTG-CTTGAA-CAAA-TAA-TTT-G-TTCA-A-AAGATGTT-TTTGAGATTTT--CAAT-AAAAGT----TGTC-G-TTT-GAAA-TTTTG-TTCAC-GCATGgc
gi|18 : ac---AA--GTG-TGGAC-AAAAAT-G-AATTG-G-AACATACATA--TTT-TA-CG-CTTGTC
gi|19 : T----GTGATA-TG--TTTTT-AGCAA-CA-C-G-C-AA---G--ATCAAG-GCT
gi|2 : AAGGAGAAT-CCCCG-AATTT-----AAGAAAAA-CTGC-CTG-CTTGAAACAAAATAATTTT-G-TACA-A-AA-ATGTTCTTTGAGATTTT--CACTAAAAAAT----TGTC-GCTTT-GAAA-TTTTGTTTCAC-GCATGCANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAAACGACCAACTG--T-T-AT--T-TTTTAA----A--CGACC-G-A-G-TTCGAA-TCTTTCACGGA-TAC--ATTTTTTTCNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCGCTTCT----GTGATA-TGGTTTTTT-AGC-A-C----G-C-AA---GGCATCAAG-GCTA-TTAAG--CC-GAAGGAG-GATAAA----A---TA------T--CTC--CCTTGTT-AATGGA-------CG-CAG-C-ACA--G-GACTAAA-CTG----T---A--A-A---A-AT-TG-AA-CA---AT---GT-AT-A-TCTAC----ATGTAAACAA--A-A--TGCTATAT-TC-C--AT-TTGC-------A-AATTA-C-AATAG-T---TATT-CAATATTTTCAGGA---G----T-ATG-GA-CATA-T-ATTTTGG-ACTCTA-----TTGAAC-TTTA----A-T----AA-T--GT-C-A-TTA---AAC---T-A---A---CAAA-T--TG-A-ATCTG-TATTA---TT-T---T--TCGATT-T-T-A-AA-TA---AT---GA--GTG-TGGAC-AAAAAT-G-AATTG-ACAACATAAATAT-TTT-TA-CG-CTTGTCCttaaagt
gi|20 : cAGGAA-TATAAAGTATA---TA----A-T--ATC--CCTTGTT-AATGGA-------CA-CAG-C-
gi|3 : GGGAAT-CCCC--AATTA-----AAGAAAAAACTGC-CTG-CTT-AAACAAAAGAATTTA-A-TACA-A-AA-AT-TTCCTTGA-ATTTT--CACTAAAAAAT----TGTC-GCTTT-GAAA-TTTTGTTTCAC-GCATGCAc
gi|3 : acaAAAGTACAACTG--T-T-TT--T-TTTTAA----AGACGACC-G-A-G-TTCGAA-TCTTTCACGCA-TACCAATTTTTTnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaaagtacaactgtttttttttaaagacgaccgagttcgaatctttcacgcataccaattttttgccnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncttctgtgatatttttagcacacgcaaggcaaaaaaatatataaaaaaatatataatatcctgttgatgacacagcacaggactaaactgtattaaatatgaacaagtatatctaaagaaatgatataattgcaattgtatattcaatattttcaagtgcatggacataatttttaactctattgaaccttaataatgccattacactaacaatgtgaacgtttatttttcgttcaaagtacatgtaagtgtgacaaaaatgaattgaaaacataaaagtttacgcttg
gi|3 : acagggaatccccaattaaagaaaaaactgcctgcttaaacaaaagaatttaatacaaaaatttccttgaattttcactaaaaaattgtcgctttgaaattttgtttcacgcatgcannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnCTTCT----GTGATA-T----TTTT-AGC-A-CA-C-G-C-AA---GGCA-AAAA-AATATATAA--------AAAAA-TATA----------TA----A-T--ATC--C--TGTT-GATG-A-------CA-CAG-C-ACA--G-GACTAAA-CTG----T---A--TTA---A-ATATG-AA-CA---A----GT-AT-A-TCTA-----A---A---GA--A-A--TGATATA-------------------------ATTG-C-AATTG-TA--TATT-CAATATTTTCAAGT---G----C-ATG-GA-CATA---ATTTTTA-ACTCTA-----TTGAAC-CTTA----A-T----AA-T--GC-C-A-TTA---CAC---T-A---A---C-AA-TG-TG-A-A--CG-T-TTA---TT-T---T--TCG--T-T-C-A-AAGTACATGT---AA--GTG-T-GAC-AAAAAT-G-AATTGAA-AACATAAA-A--GTT-TA-CG-CTTGgccnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncttctgtgatatttttagcacacgcaaggcaaaaaaatatataaaaaaatatataatatcctgttgatgacacagcacaggactaaactgtattaaatatgaacaagtatatctaaagaaatgatataattgcaattgtatattcaatattttcaagtgcatggacataatttttaactctattgaaccttaataatgccattacactaacaatgtgaacgtttatttttcgttcaaagtacatgtaagtgtgacaaaaatgaattgaaaacataaaagtttacgcttg
gi|4 : acagggaatccccaattaaagaaaaaactgcctgcttaaacaaaagaatttaatacaaaaatttccttgaattttcactaaaaaattgtcgctttgaaattttgtttcacgcatgcannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaaagtacaactgtttttttttaaagacgaccgagttcgaatctttcacgcataccaattttttgccnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnAAT-CCCCA-GATTT-----A-GAAAAA-CTGCTCTGTCTTGAAACAAAATAAATTTAG-TACATACAA-AT-TTCTT--AGAATTT--CACTATAATATGAAATGTT-A--TT-GAAA-TTTTATTTCACGGCATGCA
gi|4 : AAACGTCCA--CG--TAT-TT--T-TTTTAACAACG--CGACC-GCA-GATTCGAA-TCTTTCAC-GA-TAT--AGATTTTCCatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaaacgtccacgtattttttttaacaacgcgaccgcagattcgaatctttcacgatatagattttcccnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaatgtccttcttgatattggtttttagcacattgcaatgtgacatcaaggctgataagcgaaggaaataataatatctcccttgttaatgacgcagtcacagtgactaaaactgttaaagattaacaattgcgcatatctaaaaacgaaatg
gi|4 : aatccccagatttagaaaaactgctctgtcttgaaacaaaataaatttagtacatacaaatttcttagaatttcactataatatgaaatgttattgaaattttatttcacggcatgcaatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnCTTCT-----TGATA-TTGGTTTTT-AGC-A-CA-TTG-C-AATGTGACATCAAG-GCTG-ATAAG--C--GAAGGAA--ATAA---------TA----A-T--ATCTCCCTTGTT-AATG-A-------CG-CAGTC-ACA--GTGACTAAAACTG----TT--A--A-A---G-AT-T--AA-CA---ATTGCGC-AT-A-TCTA-----A---AAACGA--A-A--TGcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaatgtccttcttgatattggtttttagcacattgcaatgtgacatcaaggctgataagcgaaggaaataataatatctcccttgttaatgacgcagtcacagtgactaaaactgttaaagattaacaattgcgcatatctaaaaacgaaatg
gi|5 : aatccccagatttagaaaaactgctctgtcttgaaacaaaataaatttagtacatacaaatttcttagaatttcactataatatgaaatgttattgaaattttatttcacggcatgcaatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaaacgtccacgtattttttttaacaacgcgaccgcagattcgaatctttcacgatatagattttcccnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaatgtcCTTCT----GTGATAATGCGTTTTC-AG--A-CA-C-G-C-AA---GGCATAAAA-AAAA-ATATA--T-------AA-TATAAAT---A---TA----AGT--ATT--CCTTGTT-AATGGATCACCAGCG-CA--C-ATG--G-GACTAAA-ATGGTATT---A--A-ATTAATAT-TG-AA-TAT--ATTG-AT-AT-A-TCTA-----C---ATACGA--G-AAGTGA-ATATGTC-C--AG-TTAC-------AGAATTGAC-AATTG-TAA-TATTTCAATATTTTCGCGT---G----C-ATG-AA-CAAAGT-TTTTTGACAATCTACTTAGTTGAACACTTA----A-T----AT-TA-GC-C-A-TTACACAAC---T-ATCTACTCCAAA-TGTTG-A-ATCTGATCTTA---TT-T---T--TCGATT-T-C-AGAA-TG---CG---AA--GTA-GGGAC-AAAAATGG-AATTG---AACATAA
gi|6 : AGGGGAAT-CCCCG-AATTT-----AAGAAAAA-CTAC-CTG-CTTGAAACAAAATAAATTT-AATACA-A-AA-ATGTTCTTTGAGATTTT--CACTAAAAAAT----TGTC-GCTTT-GAAA-TTTTGTTTCAC-GCATGCANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNA-AATGTCCAACTG--G-T-TT--TATTTTAA----A--CGACCTG-A-G-TTCGAA-TCTTTCACGGA-TAC--ATTTTc
gi|7 : acGCTTCT----GTGATA-TGGTTTTT--AGC---CA-C-G-CGAA---GGC-TCAAG-CTTA-A-----------AGGAA-TATAAA----A---TT----A-T--ATC--CCTTGTT-AATG---------CGACAG-C-ACA--G-GACTAAAACTG----TTATA--A-A---T-AT-TG-AA-CA---AT---GT-AT-A-TCTA-----A---AA-CGA--A-A--TGATATAT-TC-C--AG-TTAC-------A-AATT--C-AAT-G-TA--T-TT-CAATATTTTCAGGT---G----C-ATG-GA-CATA-T-ATTTT-A-ACTCTA-----TTGAAC-CTTA----A-T----AATT--GC-C-A-TTA---AAC---T-A---A---CAAA-TG-TG-A-ATCTG-TCTTA---TT-T---T--TCGATT-T-C---AA-T----AT---AA--GTG-TGGAC-AAAAAT-G-AATTC-A-AACAT--ATA---TT-TA-CG-CT
gi|8 : TCAAGAGCTT-ATAAG--CC-GAAAAAAAGATAAA----A---TA----A-TCCGTC--CCTTGTTTAGTGGAA------CG-TGG-C-ACACAG-GACTAAA-ACG----T---A--A-A---T-AT-TG-AA-CA---A----GTAAT-AGTCTA-----A---AACTGA--A-A--TTAT-TAT-TC-C--AGTTTGC-------A-AATTG-CTATTTG-TAG--ATT-CAATATTT--AGGTGCGG----C-ATG-GC-AATACT-TTTTTGA-AC-CTA-----TTGAA--ATTAATTTA-T----AA-T--GC-C-A-TTA---AACCTAT-A---A---CAAA-TG-TG---ATCTG-ATCTA----T-T---T--TCTATT-C-A-A-AA-TA---AT---AA--GTGTTGGAC-AAAAAT-G-AATTG---AACATACATA--TTTATATCG-CT
gi|9 : GGGAAT-CCCCG-AATTT-----A-GAAGAA-CTGC--TG-CTTGAAACAAAAAAAGTTT-G-TACA-A-AA-ATG-TCTTTGAGATTTT--CACT-AAAAAT----TGTC-GCTTTCGAAATTTTTGTTTC-C-GCATGCAg
gi|9 : acaAACGTCCAACTG--TAT-TT--G-TATAAA----A--CGACC-G-AGG-TTCGAATTCTTGCACCAAGTAC--ACTTTTTnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntataacgtccaactgtatttgtataaaacgaccgaggttcgaattcttgcaccaagtacacttttt