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Reference ( gi|4 )            :                                                       GGAGCAGA-T-ATT--A----CGAT-GTAGTCAT--GT-A--A-CACAGTTAGTA-T-CT-G---G-T-AT-TACA--TGCC--A-CGT-G-CG-AGTA-A-T--ACC-TG-TAC-C-TGT--CTTG-TC--AAAACA-AAGG---------------ATA-------------------T---TCT-----------------AATCA-C-TGCT----C-AA--TT--TAGA--TTAATGTC-----T-GC-T-CT-G--TC--C-AAAA--C-TA-T----CG-AA--G-TT-TG-ACA--A-C-TTATCA-G---A--AAGG-T--A-T--AG-T-CTG-T---GCTC---T----------T-CAT--TGAA--TT--TTC---A-A--CTATAC---------ATT-TT-GA-----A-ATG-C-GAT-TGTGGAATGAG-AT--G-AT--GGACAC---A---G---CTT-CGA---ACTA--AA----C-----T-G-AATT-G-GA-T-GCG-TTT-T----AT----------CAT---T-C-T-T-G-----T-A-CA-C-A-CA-TACATG-------CAT-CGA----------A--G-------TT----A-G-CT--GC-A-TG-AT-TTCCT-CAAATATC--AACTG-A-CACAGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTCGTC-TTAAATCTG----G-TATCTA--GCCC-GACT-C--A---TA-T-A--T-TT--CACA--TTTT---TTCCTT-TTGCTA--G-CGTCCA--AGCT-T----------A-G--G---AA-CTCT-----AGG-G---ACT----CTAG-ATAATTC-CTT-T-GTTG----CGAAA------A--------A-CC----CT-T-CG-A-----T-T-----T--GC-A--TGGATT---A-----------AACAA-TG------TT-CTC---T-TT-TT--AAACAC-------C---G-C--A---------CCGAT--C---T-A------A-TATA---TTT--A-----TC-------TA-----GA--A------TTA------GC-GGAC--ACAA-A--C---TTCCA-A-TT-TGC--GTG-G-ATT-TT-ACAA--A-T------------GA-A-TT-T--A-A-G-AA-----AAGT------------TG--ATGAA----TG--A-A---AATGGTT--T-TT--TA------T-----TT-------TGA-GAAAAAAA-AAAA--AT--------------ATAACG-A--C----AC-G-C-ACATGT--CT--A---T-A-G-C-T-AC-TAT---C-AT---TTG---GAAA---AA---AT---TAA--TTT-AC-T---ATCGT--TCA--ATGGA--A---ATAA-A-------------T-------------AA--AAT--A-TAT-T-----A--T----A----T-T------ACGT-------------GG-TAAA-CA-T-A-AA---A--T-ATT-TT-C--AG-T-T-G---------G--T-ACA-AA-TTTACAAGTATTGG-G-T-CGGT-CGGC-A-CAT-C-T-CGG---AAAA-C-------C-A--T------AT--------------C----------TT--CAA--TA---------------GT-GA-C-------------AT-A-ATTT-TA-AT-A-AT--TTCCGAAGA-G-GTATTGAT-ATAT----ATACTTGAAC---TATC-------GCACAA-C--A--TT--AAC-ACGCAC-TG-TTCC--TTTGTG-A-T------CCCAACA--TA-CAGGT-ATA-CAT--ATATT-A--ATATT-T-TGTGCTTATACTA--AACG--CTA--GT-AG-AAAC-ATTT-AT-GA-ATTATTG-TA-GCA--TTGC-TGCATA--AC-ATGTG--TGT-AT----AT-ATT-AA-TAGC-ATATT-T--T-GTG---A-GAATT-TC-GC-ATT--AATGAATA-ATCGTAAC-A----CT-TGC----G-AA-C-AAC-G--T-CGCGA--T-TATG-C--ATGCC-T-CT-CCT-TCC-GTTTT-A--CC-TGCTCTCTCCTTCCGTTTTATCTG-------CTACA-GTCTT-GA-TTTTTTTCATTTGAT
gi|1                          :                                                       GGAGCGGA-T-ATT--TTT--CGAT-GTA--CAT--GTTAT-A-CACA---AGTA-C-TT-A---G-TTAT-TACA--TGCC--A-CATTG-CG-AGTA-A-T--ATC-TGCTAC---TGT--CTTT-TTCGAAAAAA-AAGG---------------ATA-------------------T----CT-----------------AATCAACATGCT----C-AA--TT--T-GA--TTA-TGTC-----TAGC-T-CA-G--TCATT-ATA-----TA-T----AG-AA--G-TT-TGGACATTA-C-TTATAATG---G--AAGG-T--AGT--AG-TTCTG-C----CTCGGGTAA--------T-CAT--GCGT--TT--TTC---A-A--CTATAC---------ATT-TT-GA-----T-A-G-A-AAT-TGGGGAATGAT-AT--T-A-----ACAC---G---A---CTT-CGAGATAC-A--AA----CACATATAG-AATT-GAGA-T-GCG-TTT-T----AT----------CAG---T-C-T-TTG-----T-A-CA-C-A-CA-TACATG-------CAT-CGA----------A--G-------TT----A-GCCT--GC-A-TG-ATATTCTA-CAAAT-TCATAACTG-A-CACAG
gi|2                          :          aaacaacaatcaggtcttgtgttttcttcaagaagaatttaagacGGAGCGGA-TTATTTAAT---CGATTGTA--CAT--GT-ATTA-CACA--CAGTA-T-CT-G-----T-AT--ACA--TGCC--A-CGT-G-CGTAGTATA-T--ACC-TG-TAC-T-CGT--CTTG-TC--AAAACA-AAGA---------------TTA-------------------TCTATCT-----------------AATC----TGCT----C-GAATTT--TAGA--TTA-TGTC-----T-GC-T-CT-G--TC--C-AAAA----TA-T----CG-AAACG-TT-TG-ACAT-A-C-TGATCG-G---A--AAGGTT--A-T--AGTT-CTGCT---GCTA---A----------G-CA---TGGT--TT--TCC---ATA--CT-TAC---------ATT-TT-GA-----T-ATG-C-GAT---TGGAA-GAG--------T--ATACAC---A---AGACTTT-CGA---ACTAAGAA----C-----T-G-AATT-G-GAGT-GCGTTTT-T----AT----------CAT---T-C-T-T-G-----TAA-CATC-A-CATTACATG-------CAT-CGG----------AACG-------TT----A-G-CT--GCAA-TG-AT-TTCCT--AAATATCT-ATCTG-AGCACAnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntcgtccttaaatctgggtatcacgccttgacttcatagtgattcacactttggatcctttttgctagaatccaagcttggaaacctagggttcactgtaatgttttgttgcgaaaaaccctttcgaatttgcatggattaaacaatgttctctttttaaacaccgcccgatctgagtatatttttactccagaattagcgggcacaaaaccttccaagttgcacgtgggattttacaattgtgaattaagaaaaagttgtatatgagaaatggtttgttacattttgagtaagaaaaatttataaaacgacacgcacatgtctatcagactactataccatttggaaaaataattaattttactatcgtctcatggaaataaattaatatatatatatacgtggtaaacatataaattttgcatttgcgccggggcgcctacaaatttacagtattggcgctcggtcggccacatctcggaaaaaccaatcttcaatagtgacatgatttatatttaatgttctgaagagatattgggtataaactaactatcgcacaacattaacatgcactatttccttttgtgcattccaacatacaattatacatatttattatattgtgtgtgcttatactaagcgctagtagaaagattttatgaattattgagcaattgcctgcaacatgcgtgtattacattaaatagtttatttgctgagaatttcgcattaataatagtcgtaacaacttgcgaacaacgacgcgattatgcatgccttctcctcctttttatctgattttccaagcagtcttgattttttttcat
gi|6                          :         acaactaacaatacgggtctttagtgttttctcaagacaaatagacGGAGCGGA-T-ATTTTA----CGAT-GTA--CATTAGT-A--ATCACA---AGTA-T-AT-G---G-T-AT-TACA--TGCC--A-CGT-G-CG-AGTA-A-T--ACC-TG-TAC-C-TGT--CTTG-TC--AAAACA-AAGG---------------ATA-----------------------TCT-----------------AATCA-C-TGCT----C-AA--TT--TAGA--TT-ATGTC-----T-GC-T-CT-G--TC--C-AAAA--C-TA-T----CG-AA--G-TT-TG-ACA--A-C-TTATCG-G---A--AAGG-T--A-T--AG-T-----T---GCTCTAAT----------T-CA---TGAG--GT--TTCTCAA-A--CTATAC---------ATT-TT-GA-----T-ATGCC-GAT-TG-GGAAT--G-AT-----T----ACAC---A---GA--CTT-TGA---AC-A--A-----------T-G-AATT-G-GA-T-GCG-TAT-T----ATACTGAAATTGCATGCGT-C-T-T-G-----T-ATCA-C-ATCA-TACATGTGCTACACAT-CGATACATGTTACA--GCTCGAATTT----A-G-CT--GC-A-TG-AT-TTCCT-CAAATATC--AACTGCA-CACAGtgtcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngtccttcaaaatctgcgtatctatcgcccgactcaataatatttaccacaccttttttttgctagacgtccaagctgtaggaaactctagggaatctaaattcttttgttccgaaaaacccttcgaattctgcatggattaaacaatgttctcttttaaatcactgcgccgatcctatgatatattttacctagaacttagcgacacaaacttgcgggagcggagggacaatgaatttaaagaaaaagtaatgaatgcaaaatggttgtttttataaaattttgaagaaaaaaaaaaatataacgacacgcgacatgttatagctactattcatttgtgaaaaatatgtaattactatcgtctcatggaataaataaatatatatatattacgtggtaaacataaaaaatatttttcagtttggtaacagtatgggtcggtcgtcacatcttcggaaaaaccaatcttcagagtagtgacacggattttatataatgctgaagaaggtatttattatactgaactatcgcataacgcactaacacgcacctgttcctttgtgattccaacatacaggtatcataaatatttattattgtgcttatactaaacgctaacgtagaaaacatatgatattatgtagcattactgcattacatgttgtcatatactaaatagcatatttgtgaaatttcggcaattaatgaataatcgtaacacccccttgcgaactaacgtcgcgatttatgcaataccctccttccgatttattcctgcttccaacaggcgtttaaaattttttcagtttgata
gi|15                         :           aaacaacaatacgggtccttgtgttttctcaagaagaattagacGGAGCGGAAT-ATTTAG----CGAT-GTA--CAT--GT-AT-A-CACA--TAGTA-T-CT-G---G-T-AT-TACA--TGCC--A-CGT-G-CG-AGTA-A-T--ACC-TG-TAC-C-TGT--CTTG-TC---AAACATTAGG---------------ATA-------------------T-----T-----------------AATCA-C-TGCT----TGAA--TTTGTAGA--TTATGGTC-----T-GC-T-CT-G--TT--C-AAAA--CTTATT----CG-AA--G-TT-TG-ACA--A-CTTTATCG-G---A--AAGG-T--A-T--TG-T--TG-T---GCTT---C----------T-AATCATGGT--TT--TTC---A-A--CTATAC---------ATT-TT-GA-----T-AGG-C-G-T-TG-GGAATGAT-AT----------ACAC---A---GA--CTTACGA---ACTA--AA----C-----T-G-AATT-G-GA-T-GCG-TTT-T----nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntcgtcttaaatctggtatctcgccgactcaataattttcacacctttttgctagacgtcaagctttaggaaactctagggaatctaattcttttgttgcgaaaaaacttcgaatttgcatggattaaacaatgttctctcatttctaaaccccgcctgccgacttatatataggttttattccttcttgattattacgcgggacgagcaaactcgttccatattctgcgtgtattttgagcgatgaattttagagaaaagttagacgtgtgcgtggtgaattattgctaaaatgtttttttacatgttttgag
gi|12                         :                                   ttcctcaagaagaattagacGGAGCAGA-T-ATTT-A----CGAT-GCA--CAT--G-------CATAG---GTA-T-CTTG---G-A-AT-CACA--TGCC--G-CGT-G-CG-AGTA-A-T--ACC-T---AC-C-TGT--CTTG-TC--AAAATA-AAG----------------------------------------------------------------TCA-C-TACT----C-AA--TT--TAGA--TTA-TGTC-----T-GT-T-CT-G--CT--C-AAAA--C-TA-T----CG-AA--G-TT-GA-ACA--A-T-TTATCG-G---AT-AATG----A-T--A--T-TTG-T---TCCT---A----------T-CA---TGAA--TA--CTC---A-A--CT-------------ATT-TG-GA-----T-ATG-C-GAT-TG-GAAATAAC-AT--GCAC--GGACA--------------T-CGA---ACAA--AA----C-----T-A-AATT-G-GA-T-GCG-TTT-T----CT----------CCG---C-C-A-T-G-----T-A-CA-C-G-CA-T-------------AT-CGA----------A--G-------TA----G-G-CC--GT-G-TG-AT-TTCCT-CAAATATC--A
gi|34                         :                   tattttctcaaggacaagtccttggaatcaattaggGGGGCGGA-T-ATTT-A----CGAT-GTA--CAT--------A-CACA--T-GTA-T-CT-G---G-T-TT-CACA--TGCC--A-CGT-G-CG-AGT--A-T--ACT-TG-TAC-C-TGT--CTTT-TT--AAAACA-AAcac
gi|33                         :                                    tcttagaaatcaattaggtGGGGCGGA-T-ATTT-A----CGAT-GTA--CAT--------A-CACA--T-GTA-TGCT-G---G-T-TT-CACA--TGCCCAA-CGT-GGCG-AGTA-AAT--AC--TG-TAC-C-TGTCGCTTT-TT--AAAACA-AAGG---------------
gi|30                         :                                    tcttagaaatcaattaggtGGGGCGGA-T-ATTT-A----CGAT-GTA--CAT--------A-CACA-TTG--A-T-CT-G---G-T--T-CACA--TGCC--AACGT-G-CG-AGTA-------TC-T--TGC-C-TGT--CTTT-TTTTAAAACA-AAGG---------------AT
gi|3                          : aagcaaccgggtcgttaatgtattttttaccagcaattcttagaatcaattagtgGAGCGGA-T-ATT--A----CGAT-GTA--CAT--GT-AT-A-CACGA--AGTACT-CT-G---GCT-AT-TACA--C-CC--A-CGT-G-CG-AGTA-A-T--ACC-T--TACGC-TGT--CTTG-TC--AAACCA-AAGG---------------ATA-------------------T----CT-----------------AGACA-C--GC-----C-AA--TT--TAG---TT--TGTC-----T-G--T-CT-G--TC--C-AAAA--CCTA-T----CG-AA--G-TT-TG-ACA--A-C-TTATC--G---A--AAGGCT--A----AG-T--TC-T---GCTC---TAAAT------C-CAT--TGAAGTTT--TTC---A-A---TATAC---------ATT-TTTGA-----A-A------AC-TGCGAATTGAG-----G-AT--GTATAC---ACAAA---CTT-CGA----CTA--AA----C-----T-G-AA---G-GA-T-GCG-TTTCT----AT----------CAT---T-CGTAT-G-----T-A-CA-C-A-CA-TACATG-------CAT-CGA----------A--G-------TT----A-G-CT--GC-A-TG-AT-TTC-T-CAAATATC--AACTG-A-CACAGTCTCCTTCCTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-------C-TTAAATCTG----T-T-TCTC--GCCC-GACT-C--AAACTA-T-A--T-TT--CACA--CCTT---TT-----TTGCTA--GACGTCCA--AGCT-T----------A-G--G---AA-ACTT-----AGG-G---ACT----CTAG-ATAATTCGTTT-T-GTTG----CGAAA------A--------A-CC----CT-T-CG-AA----T-T-----T--GC-A--TGG-TT---A-----------AACAA-TG------T--CTC---T-TT-TT--AAACAC-------C---G-C--A---------CCGAT--C---T-A------A-TATA---TTTT-A-----CCG------TA-----GA--A------TTA------GC-GGAC--ACAA-A--CC--TTCCA-A-TT-TGC--GTG-G-ATT-TT-ACAA----T------------GA-A-TT----A-A-G-AA-----AAGT------------TG--ATGAA----TG--A-A---A-TGGTT--T-TT--TA------C-----AT-------TGACGAAAAAAA-AA-----T--------------ATAACG-A--C----ACTGTC-ACATGT--CT--A---T-AAG-C-TTAC-TAT-----AT---TTG---GAAA---AAT--AT---T----TAT-AA-C---ATCGTC-TCA--TTGGA--A---ATAA-A-------------T-------------AA--AAT--AGTA--T-----A--T----A----T-T------ACGT-------------GG-T-AA-CATT-A-AA---A--T-ATT-TT-C--AG-T-T-G---------G--T-ACA-AATTTTAC-AGTATTGG-T-C-CGGT-CGGC-A--ATAC-T-CAG---AAAA-C-------C-A---------AT--------------C-----------T--CAA--TA---------------GT-GA-C-------------ATGA-ATTT-TATAT-A-AGAATTCTGAAGA---GT-TTGAT-ATA-----ATACTTGAACT--TATC-------GCACAA-CA-A--TT--AAC-ACGCAC-TG-TTCC--TTTGTG-A-T------CCCAACA--TA-CAGGTAATA-CAC--ATATC-T--ATA-T-T-TGTGCTTATACTA--AACGTTCTA--GTAAG-AAAC-ATTT-AT-GA-ATTATTGTTATGCA--TTGC-TGCAT---AC-ATTTG--TG--------AT-TTT-AA-T-GCAATATTAT--T-GTGTGAA-GAATT-TC-GC-ATT--AAATAATACATCGT-AC-A----CT-TGC----GAAA-C-AAC-G--T-CGCGA--TGTATGCC--ATGCC-T-CTGCCT-TCC-GTTTTGA--CCTTGCCTTCTCCTTCTCTTTTACTTG-------CTACA-GTCTTGGA-TTTTTTTCATTTGAt
gi|8                          :          aacgaacagccatatacgggtcttggttttctcaagaataattagcGAGCGGA-T-ATTT-A----CGAT-GTA--CAT--AT-AT-A-CACA---AGTA-T-CT-G---G-T-AT-TACA--TGCC--A-CGT-G-CG-AGTA-A-T--ACC-TG-TAC-CATGT--CTTGTTC--AAAACA-AGGG---------------ATA-----------------------TCT-----------------AA-CA-C-TGCTC---C-AA--TT--TAGA--TTTATGTC-----TGGC-T-CT----TC--C---AA--C-TA-T----C--AA--G-TT-TG-ACA--A-C-TTATCG-G---A--AAGGTT--A-T--AG-T-TTC-T---GCTCTAAT----------T-CA---TGAG--TT--TTC---A-ACTCTATAC---------ATT-TT-GA-----T-ATG-C-GAT-TG-GGAAT----------AT--ATACAC---A---GA--CTT-CGA---ACTA--AA----C-----T-G-AATTGG-GA-T-ACG-TTT-TA---AT----------CAT---T-C-T-T-G-----T-A-CA-C-A-CA-TACATG-------CAT-CAA----------A--G-------TT----A-G-CT--GC-ATTG-AT-TTCCTACAAATATC--AACTG-A-CAGAG
gi|1                          :                                                         AGCAGA-T-ATT--ACTCGCAAT-GTGG-CAT--GT-A--A-TA-ACTAAGTA-C-TT-GT--G-T-AT-AACA--TG-T--A-CAT---CG-AAAA-A-T--ATC-CG-CTC-C--GT--CTTnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntcgtctcgcccatcttcaatacattcacatctttttttgctagacgtccaagcttagagaaactcaggggactctaattctttttgttgcgaaaaaacccttcaattttgacaaggatcctaaaacaatgttctctatttttaaaacaccgcagaacacagcccataactgaatatatatatatacccacgaacaaatcctagcggacacagccttccaatctgcctggatttac
gi|17                         :                      aaacaacaatcaggtcttgtgttttcttcaagaagaatttA-T-ATTT-A----CGAT-CTA--CAT--G--G--A-CAT-----GTA-T-CT-G---A-T-AT-CACAATTTCC--A--------G-AA-A-A-T--ACC-AG-T-C-C-TGT--CTTG-TC--AAAGCA-AAGG---------------ATATGCTTTCGAATATACATGTT---TTT-----------------AATCA-C-TTAT----C-AG--TT--TAAG--TTA---TC-----T-GT-T-CT-G--TC--actgtctttttcgaaaaaaaaggatatctaatcaacatgctcaatttgattatgtctagctcagtcattatatatagaagtttggacattacttataatggaaggtagtagttctgcctcgggtaatcatgcgtttttcaactatacattttgatagaaattggggaatgatattaacacgacttcgagatacaaacacatatagaattgagatgcgttttatcagtctttgtacacacatacatgcatcgaagttagcctgcatgatattctacaaattcataactgacacagnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntcgtccttaaatctgggtatcacgccttgacttcatagtgattcacactttggatcctttttgctagaatccaagcttggaaacctagggttcactgtaatgttttgttgcgaaaaaccctttcgaatttgcatggattaaacaatgttctctttttaaacaccgcccgatctgagtatatttttactccagaattagcgggcacaaaaccttccaagttgcacgtgggattttacaattgtgaattaagaaaaagttgtatatgagaaatggtttgttacattttgagtaagaaaaatttataaaacgacacgcacatgtctatcagactactataccatttggaaaaataattaattttactatcgtctcatggaaataaattaatatatatatatacgtggtaaacatataaattttgcatttgcgccggggcgcctacaaatttacagtattggcgctcggtcggccacatctcggaaaaaccaatcttcaatagtgacatgatttatatttaatgttctgaagagatattgggtataaactaactatcgcacaacattaacatgcactatttccttttgtgcattccaacatacaattatacatatttattatattgtgtgtgcttatactaagcgctagtagaaagattttatgaattattgagcaattgcctgcaacatgcgtgtattacattaaatagtttatttgctgagaatttcgcattaataatagtcgtaacaacttgcgaacaacgacgcgattatgcatgccttctcctcctttttatctgattttccaagcagtcttgattttttttcat
gi|6                          :                                                                    tcttgaaatcatttaggtagtacga-A--A-GACAG---GTA---CA-G---G-T-AT-TACT--CGC---A-CGT-GGCA-TGTA-A-T--ACCATA-TAC-T-TGT--atgcgtttatattgaataaactcaactattttgatatgtgattaaaattatttggtaccttatctacgtacaaaactgatttggatgcttttctcattatcgaattgatttcctcaattaccacttg
gi|22                         :                  aaacaacaatacgggtccttgtgttttctcaagaagaattagacggagcggatattttacgatgtacattagtaatc--A-CACA---AGTA-T-CT-GCAGG-A-ATACACA--TGC------GT-G-AG-AGTA-G-CTAATC-TGATAC-C-TGT--CTTG-TC--AAAACA-AAGGGATTTGCTTTCAATTATA-------------------A---TCT-----------------AATCA-C-TACT----C-AA--TTCATAGG--T---TGTC-----T-GC-C-TTGG--TC--CGAAAA--C-TG-T----TGAAA--G-TTATT-ACA--A-C-TTAT----------ACGG----A-T---T-T-CT-------CTT---C----------T-CA---TGAG--TT--CTC-----A--CTACACTGATATATAATTATT-GA-----A-A---C-GAT-TG-GGAATgtcaaaacaaaggatatctaatcactgctcaatttagattatgtctgctctgtccaaaactatcgaagtttgacaacttatcggaaaggtatagttgctctaattcatgaggtttctcaaactatacattttgatatgccgattgggaatgattacacagactttgaacaatgaattggatgcgtattatactgaaattgcatgcgtcttgtatcacatcatacatgtgctacacatcgatacatgttacagctcgaatttagctgcatgatttcctcaaatatcaactgcacacagnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntcgtcttaaatctggtatctcgccgactcaataattttcacacctttttgctagacgtcaagctttaggaaactctagggaatctaattcttttgttgcgaaaaaacttcgaatttgcatggattaaacaatgttctctcatttctaaaccccgcctgccgacttatatataggttttattccttcttgattattacgcgggacgagcaaactcgttccatattctgcgtgtattttgagcgatgaattttagagaaaagttagacgtgtgcgtggtgaattattgctaaaatgtttttttacatgttttgag
gi|18                         :                                                                                                      AATTGGTA-T-CT-G---A-T-AT-CACA-----A--A-TGT-A-TA---TATA-T--ACC-AG-TTC-C-TGT--CTTG-TC--AAA-CT-CAGG---------------ATT-------------------T---GCTTTTTTAATATAATATAAAATCA-C-TACT----C-AA--TT--TAGA--TTAG-GCCTTTATT-GA-T--T-G--TC--C-TAAA--C-TA-T----CG-GA--G-TT-GG-ATA--A-
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                 tgattaactgcacaagtcaagggttattgattgacgtgcgaggtacatgttgcaaatcaataaccctggCA-C-TGCTACAAT-AA--TTAATAGAG-TTTATGTC-----T-GCATACT-GGGTC--C-AAAA--A-CA-TATGCTG-AA--GGTT-TGGACA--AGC-TTATCG-GG--A--AAGG-TGAA-T--AA-T-AAG-T---TCCC---TAGCATCATAAT-CAT--TGGAG-TT--TTC---A----CTA-AC---------ATT-TT-GG-----ATATG-CTGAT-T-TGGGATGAC--T--T-AT----ACAC---A---GAC-TTT-CGA---ACTA--CAGAGTC-----T-GGAATT-G-GA-TTGCG-TTT-TTAGAATT---------CAT---TTC-TAT-GAGTAAT-A-CA-C-AACA-TA-ATG--------ATACGA----------T--G-------TTCGATA-G-GTTAGC-G-AG-AT-TTCCT-CAAATATC--AACTG-A-CACAatgtttcaagaacgaaaatgtctactatcgtttggaaaaacaatcgtttagcaaatgtgtttacggaaaga
gi|23                         :                                                                                                                                                                                                                                            gtcaaaacagtgacatggacgtagtatcaatatca----C-AG--TT--TAGA--TTA-TGTC-----T-GT-T-CT-G--TC--C-AAAA----TA-T----CG-AA--G-TT-----CA--A-C-TTA-CA-G---G----GA-T--A-C--AG-G-ATG-TT--GTTC---TAA--------T-CAT---GAT--TT--CTC---A-A-----TA----------ATT-GT-GATAATTATATG-C-GAT-TG-AGTATAGT-AT--C-AA--GGAC--------------TT-CAA---ACAA--AA----C-----T-G-AATT-G-G--T-GTG-TTT-T----CT----------CAG---T-C-T-T-G-----T-G-CA-C-A-CA--ATATGA------TAT-CGA----------A--G-------TA----G-G-CC--GT-T-TG-AG-CTCCT-CAAATACC---ACTG-A-
gi|25                         :                                                                                                                                                                                                                                                                               ----C-AA--TT--TAGG--TTG--GTC-----T-TG-T-TT-G--TC--C-AAAAAAC-T--T----TG-AA--G-TT-TG-AGA--AAC-TTAT------------GG----A-T---T-T-CT--C---ATTC---T------------CAT---GAG--TT--CTC---A-A--CTACA----------ATG-TT----------ATA-T-AAT-TCT---ATGAT-ATACG-ATTTGGACAT------------TT-CCA---ACAA--AAA---C-----T-G-AACC-T-GA-G-AC------T-----T----------CAG---T-C-T-T-G-----C-A-CA-C-A-CA-AA------------AT-CGA----------A--G-------TTC---G-G-CC--GT-ACTGTAT-TTCTT-CAAATATC--At
gi|21                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                 tgactc--TT--TAGAAATTA-TGTC-----T-GT-T-CT-G--TC--C-AAAA----TA-T----CG-AA--G-TT-----CA--A-C-TTAACA-GGATA--AAGG----------A-T-TTG-T---TCTA---T----------A-CA---TGA----T--CTC---A-A---TA------------ATT-GT-GAT----A-AT------TATATGCGATGAGTAT--GTAT--GATCAT---AG--G---CTT-CAA---AACA--AA----A-----C-G-AA-T-G-GG-T-GTG-TTT-T----CT----------CTA---T-C-T-T-G-----T-G-CA-CAA-CA--ATATGA------TAT-CGA----------A--A-------GT----AGG-CC--GT-T-TGAAG-CTCCT-CAATTA
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   tatggtctagataaccctaccagt-TT-TA-ATC--A-C-TTATCA-G---TTTAAGT-T--A-TCTGT-T-CTG-TCATGCGT---T----------TATAT--TGAA--TAAACTC---A-A--CTAT-------------T-TT-GA-----T-ATG-T-GAT-TA--AAATTAT-TT--G-GT------ACCTTA---T---CTA-CGT---ACAA--AA----C-----T-G-ATTT-G-GA-T-GC--TTT-T----CT----------CAT---T-c
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 tcttgaaatcatttaggtagtacgaatatttacgatctacatggacatgtatctgatatcacaatttccagaaaataccagtcctgtcttgtcaaagcaaaggatatgctttcgaatatacatgtt--AA----C-----T-G-AATT-T-GA-T-GCG-TTT-T----AT----------CAA---T-C-T-T-G-----T-A-CA-C-A-CA-T-------------AT-CGA----------A--G-------TT----G-G-Catcgaattgatttcctcaattaccacttg
gi|1                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 TCGTCCTTAAATCTG----GGTATCAC--GCCTTGACTTC--A---TAGT-G--A-TT--CACA--CTTTGGATCCTTT-TTGCTA--G-AATCCA--AGCT-T----------G-G--A---AA-C-CT-----AGG-GTTCACT----GTA--ATG-----TTT-T-GTTG----CGAAA------A--------A-CC----CT-TTCG-AA----T-T-----T--GC-A--TGGATT---A-----------AACAA-TG------TT-CTC---T-TT-TT--AAACAC-------C---G-C------------CCGAT--C---T-G------AGTATA---TTTTTAC----TC-------CA-----GA--A------TTA------GC-GGGC--ACAA-AACC---TTCCA-A-GT-TGCACGTG-GGATT-TT-ACAATTG-T------------GA-A-TT-A--A-G-A-AA-----AAGT------------TGT-AT--A----TG--AGA---AATGGTT--T-GT--TACA----T-----TT-------TGA-GTAAGAAA-AATTT-AT--------------AAAACG-A--C----AC-G-C-ACATGT--CT--A---TCA-GAC-T-AC-TATAC-C-AT---TTG---GAAA---AATA-AT---TAA--TTTTAC-T---ATCGT--CTC--ATGGA--A---ATAA-A-------------T-------------TA--A-T--A-TAT-------A--T----A----TAT------ACGT-------------GG-TAAA-CA-T-ATAA---A--T--TT-TG-C--AT-T-T-GCGCCGGGGCGCCT-ACA-AA-TTTACA-GTATTGGCGCT-CGGT-CGGCCA-CAT-C-T-CGG---AAAAAC-------C-A---------AT--------------C----------TT--CAA--TA---------------GT-GA-C-------------AT-G-ATTTATA-TTTA-ATG-TTCTGAAGA-G-ATATTGG--GTAT----AAACT--AAC---TATC-------GCACAA-C--A--TT--AAC-ATGCAC-TA-TTTCCTTTTGTGCA-T------TCCAACA--TA-CAATT-ATA-CAT--AT-TT-ATTATATTGTGTGTGCTTATACTA--AGCG--CTA--GT-AG-AAAG-ATTTTAT-GA-ATTATTG--A-GCAA-TTGCCTGCA----AC-ATGCG--TGT-ATT---AC-ATT-AAATAGT-TTATT-T--G-CTG---A-GAATT-TC-GC-ATT--AAT-AATA-GTCGTAACAA----CT-TGC----G-AA-C-AAC-G--A-CGCGA--T-TATG-C--ATGCCTT-CT-CC--TCC-TTTTT-A--TC-TGAT-----TTTCCA----A-------------GCA-GTCTT-GATTTTTTTTCATcatattnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaccttttttgctagacgtccaagcttatgaatcgcagggactctagttcttttgttgcaaaaaacatttgaatttgcatggattacacaatgctctttcttaaacaccgtgccgatctaatatattttacccagaattagcgggcacaacccttcgaatttgcgtgaattttacaaagttcttttatttaagaatttaaagaaagttgatgaagtaaaatgtttctttatattttgaaaaaaatatatataatggcacgcacatgtctactatcattatatttggaaaaatttactatcgtctcatggaaataaataatatatatattacgtggtaaacataaaatattttcaggtacgaatttgatgggtcggtcggcacatctcggaaaacgaattttcaatggaaaaactttcaatagtgacatgattttatagagttttgaagaggtatcaaaatacctgaactatcgcacaacattaacacgtactgttcctttgcaattccaac
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gi|26                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        TTATATTA--A-CG--CTA--GT-AG-AAAC-ATGT-AT-CA-ATTATTG-TA-GCA--TTAC-TGAATA---C-ATGTG--TGT-AT----AT-ATT-AA-TAGC-ATATT-T--T-GTG---A-GAATC-TC-AC-ATT--AAT-AATA-ATCGTAAC-A----CT-TGC----A-AA-C-AGC-G--T-CGCGA--T-TATG-C--ATGTC-T-CT-CCT-TCC-TTTTT-A--CC-TGCT------TTCCA------------------ACA-GTCTT-AA-TTTCTGTCATT
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gi|35                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 ctaaaatctggtattcgcccgactcaatatcatttcacaccttttttgtgctagacttccagcttaggaaactctaggactctaattcttttgttgcgaaaaacccttcgtggcatggattaaacaatgtttctctttttaaacacctctgcgcgatctaatatattttacccttagaattagcggacgacaaaccttccaatttgcgtgcgattgttacaatgaattctagagaaaagttaatgaatgataatggttttttaacttttgagaaacaaaaaatataacgaccaacgcacatgtctatagctactatcaattggaaaaatattaatttactatcgtctcatggaataataatatatatattatagtacgtggtaaaccataaaaatattttcagtctggtaacatcattttcgtattgggtccggtcggccatctcggaaaaccaatcttcaatagtggacatgatttatataattctgaagaggcattgataataaatacttgagcttatgcacaacattaacacgcactgtttcctttgtgatttccagcccatcaattacaggtataattgattcgggcagtattgtcttgcgtactggagagactgatgcgtagtctgcggtgttatatatatataagagctcgtcacggagaAATA-ATTGTAAT-A----CT-TGCGTGTG-AA-C-AAA-G--T-TGCGA--T-TTTG-A--ATGCC-T-TT-GCT-TCCTGTTTT-A--AC-TG-----------CATTCAA-------------ATA-GTCTT-AT-TTTTCTTCATTTAAT
2 sequences could not be aligned to this particular reference sequence:
Unaligned ( gi|32 ): AAACAAAATACGCTGATCTTGTTGTTTTCTCAACGAAGAATTTGGAGGGAGAAGCTCGCCAGGAAATATCTTTACGGGCAAGATATGTAAGCTGATGTATACACAGAGTTACTAATGGTGAATTATCAATGCCAC
Unaligned ( gi|36 ): TTCGTCCATTAGGTAACTCTGGTGTATCTCGCCCCGCGACGCAATATTATTTCACCACCTTTCTGTGTTAGACATCTA






Alignments
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Reference ( family-217 )      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           GGAGCGGA-T-ATTT-A--CGAT-GTA--CAT--GT-A--A-CAC-A---AGTA-T-CT-G---G-T-AT-CACA--TGCC--ACGT-GCG-AGT-A-AT--ACCTG-TAC-C-TGT--C--TTG-TC--AAAACA-AAGG---------------ATAT---TCT-----------------AATCA-C-TGCT----C-AA--TT--TAGA--TTA-T-GTC-----T-GC-T-CT--G--TC--C-AAAA--C-T-A-T----CG-AA--G-TT-TG-ACA--A-C-TTAT--CGG---A-AAGG-T--A-TAG-T-CTG-T---GCTC---T----------T-CAT--T-G-AN--TT--CTC-A-A--CTATAC---------ATT-TT-G------ATA------TG-C-GA-TTG-GG-AATGA-NAT--GAT---G-ACACA-G---CTT-C-GA---ACNA--A-A----C---T-G-AATT-G-GA-T-GCG-TTT-T----AT----------CA---NT-C-T-T-G-----T-A-CA-C-A-CA-TACATG-------CAT-CGA----------A--G-------TT----A-GCC--GC-G-TG-AT-TTCCT-CAAATATC--AACTG-A-CACA-GTCTCCTTCCTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN---TCGTC-TTAAATCTG----G-T--ATCT--CGCC---C-GA---CT-C--A---TA-T-A--TT--T--C--A-C---A-CCTT---T-T--------CCTTTTGCTA-GACGTC----CAAG-----CT-T-------A-G--G---AA-CTCT-----AGG-G---ACT-CTAG-T--AA----T-TC-TTTT-GTTG----CG-AAA------A--------ACC----CT-T-CGAA----T-T-----TG-CA--TGGATT---A-----------AACAA-TG------TT-CTC---T-TT-TT--AAACAC-------C---GC--------G---CCGAT--C---T-A------A-TATA--T---TT------T-A-----C-C--TA-GA--A------TTA------GC-GGAC--ACAAA-CC--TTCCA-A-TT-TGC--G----TG-G-ATT-TT-ACAA--A-T------------GA-A-TT-T--A-A-G-AA-----AAGT------------TG--ATGAA----TG--A-A---AATGGTT--T-TT--TA------T-----TT-------TGA-GAAAAA---AAAAA------------A-T-ATAA--CG-A--C----AC-G-C-ACATGT--CT--A---T-AG-C-TAC-TAT---C-AT---TTG---GAAAAA--T--A-T-TAA--TTT-AC-TATCGTC-CNA-T--GGA--A---ATAA-A-------------T-------------AA--A-AT--A-TAT-T-----A--T----A----TT------ACGT-------------GG-TAAA-CA-T-A-AA---A--T-ATT-TT-C--AG-T-T-G---------G--TACGA--A-TTTACA-GTA---TTGG-G-T-CGG----T-CGGC-A-CAT-C-T-CGG---AAAA-C-------C-A--T------AT--------------C----------TT--CAA--TA---------------GT-GA-C-------------ATG-ATTT-T-ATAT---AA--TTCTGAAGA-G-GTATTGAT-ATAT----ATACTTGAAC---TATC-------GCACAA-C--A--TT--AAC-ACGCAC-TG-TT--CCTTTGTG-A-TT------CCAACA--TA-CAGGT-ATA-CAT--ATATT-A--ATATT-T-TGTGCTTATACTA--AACG--CTA--GT-AG-AAAC-A-TTT-AT-GA-ATTATTG-TA-GC-A--T-TG-CTGCA-T-AC----ATGTG--TGT-A-T----AT-ATT-AATAGC-ATATT-T--T-GTG---A-GAATT-TC-GC-ATT--AAT-A-ATA-ATCGTAAC-A----CT-TGC----G-AA-C-AAC-G--T-CGCGA--T-TATG-C--ATG-CC-T-CT-CCT-TCC-GTTTT-ACC-TGCTCTCTCCTTCCGTTTTA--C--GC-ACAGTCTT-GA-TTTTTTTCA-TTTGAT
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gi|21                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      --TT--TAGAAATTA-T-GTC-----T-GT-T-CT--G--TC--C-AAAA----T-A-T----CG-AA--G-TT-----CA--A-C-TTAA--CAGGATA-AAGG--------A-T-TTG-T---TCTA---T----------A-CA---T-G-A----T--CTC-A-A---TA------------ATT-GT-GATAATTATA------TG-C-GA--TG-AG-TATG--TAT--GAT------CATAGG---CTT-CAAA---ACAA--A-A----C-----G-AA-T-G-GG-T-GTG-TTT-T----CT----------CT---AT-C-T-T-G-----T-G-CA-CAA-CA--ATATGA------TAT-CGA----------A--A-------GT----AGGCC--GT-T-TGAAG-CTCCT-CAATTA
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gi|23                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              ----C-AG--TT--TAGA--TTA-T-GTC-----T-GT-T-CT--G--TC--C-AAAA----T-A-T----CG-AA--G-TT-----CA--A-C-TTAC--AGG-------GA-T--A-CAG-G-ATG-TT--GTTC---TAA--------T-CAT----G-AT--TT--CTC-A-A-----TA----------ATT-GT-G------ATAATTATATG-C-GA-TTG-AG-TATAG-TAT-----------CAAG-GA--CTT-C-AA---ACAA--A-A----C---T-G-AATT-G-G--T-GTG-TTT-T----CT----------CA---GT-C-T-T-G-----T-G-CA-C-A-CA--ATATGA------TAT-CGA----------A--G-------TA----G-GCC--GT-T-TG-AG-CTCCT-CAAATACC---ACTG-A-
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gi|31                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           aagcaaccgggtcgttaatgtattttttaccagcaattcttagaatcaattagtg-ACGTAC-TC-TT--CCTTCGTG-A-TT------CCAACG--CA-GAGGC-ATG-CAT--ATGTT-A---TATT-G-TGTGCTTATACTA--AACG--CTA--GT-AG-AAAT-A-TTT-AT-GA-ATTATTT-TA-GC-A--T-TG-ATGCA-T-AC-----T-------------------------TAGC-ATATT-T--T-GTG---A-TAATT-TC-AC-ATT--AAT-ATATA-t
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gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    aaacaacaatacgggtccttgtgttttctcaagaagaattagac---TCGTC-TTAAATCTG----G-T--ATCT--CGCC-----GA---CT-C--A----A-T-AATTT--T--C--A-C---A-CCTT---T-T-------------TGCTA-GACGTC-----AAG-----CT-TT------A-G--G---AAACTCT-----AGG-G---AAT-CTA------A----T-TC-TTTT-GTTG----CG-AAA------A--------AAC-----T-T-CGAA----T-T-----TG-CA--TGGATT---A-----------AACAA-TG------TT-CTCTCAT-TT-CT--AAACCC-------C---GCCT------G---CCGAC--T---T-AT-----A-TATAGGT---TT------T-ATTCCTT-C--TT-GATTA------TTAC-----GCGGGACGAGCAAA-CTCGTTCCATA-TTCTGC--G----TG-T-ATT-TTGAGCG--A-T------------GA-A-TT-TTAG-A-G-AA-----AAGTTAGACGTGTGCGTG--GTGAATTATTGCTA-A---AATGTTT--T-TT--TACATG--T-----TT-------TGA-Gnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntcgtcttaaatctggtatctcgccgactcaataattttcacacctttttgctagacgtcaagctttaggaaactctagggaatctaattcttttgttgcgaaaaaacttcgaatttgcatggattaaacaatgttctctcatttctaaaccccgcctgccgacttatatataggttttattccttcttgattattacgcgggacgagcaaactcgttccatattctgcgtgtattttgagcgatgaattttagagaaaagttagacgtgtgcgtggtgaattattgctaaaatgtttttttacatgttttgag
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1 sequences could not be aligned to this reference sequence:
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Reference ( family-217 )      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           GGAGCGGA-T-ATTT-A--CGAT-GTA--CAT--GT-AT-ACAC-A---AGTA-T-CT-G---G-T-AT-CACA--TGCC--ACGT-GCG-AGT-A-AT--ACCTG-TAC-C-TGT--C--TTG-TC--AAAACA-----AA-GG--A-----T----------------AT-CTAA--T----CA-C-TGCT----C-AA--TT--TAGA--TTA-T-GTC-----T-GC-T-CT--G--TC--C-AAAA--C-T-A-T----CG-AA--G-TT-TG-ACA--A-C-TTAT--CGG---A-AAGG-T--A-TAG-T-CTG-T---GCTC---T----------T-CAT--T-G-AN--TT--CTC-A-A--CTATAC---------ATT-TT-G------ATA------TG-C-GA-TTG-GG-AATGATATGAT--ACAC-A-----GAC--TT-C-GA---ACNA--A-A----C---T-G-AATT-G-GA-T-GCG-TTT-T----AT----------CA---NT-C-T-T-G-----T-A-CA-C-A-CA-TACATG-------CAT-CGA----------A--G-------TT----A-GCC--GC-G-TG-AT-TTCCT-CAAATATC--AACTG-A-CACA-GTCTCCTTCCTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN---TCGTC-TTAAATCTG----G-T--ATCT--CGCC--------C---GA-C---T-C--A-------TA-T-A--TT---T--CA-CA-CCTT-----T-T--TTTTGCTA-GACGTC----CAAG-----CT-T-------A-G--G---AA-CTCT-----AGG-G---ACT-CT----AG-T--AA-T-TC-TTTT-GTTG----CG-AAA------A--------ACC----CT-T-CGAA----T-T-----TG-CA--TGGATT---A-----------AACAA-TG------TT-CTC---T-TT-TT--AAACAC-------C---GC--------G---CCGAT--C---T-A------A-TATA--T---TT------T-A-----C-C--TA-GA--A------TTA------GC-GGAC--ACAAA-CC--TTCCA-A-TT-TGC--G----TG-G-ATT-TT-ACAA--A-T------------GA-A-TT-T--A-A-G-AA-----AAGT------------TG--ATGAA----TG--A-A---AATGGTT--T-TT--TA------T-----TT-------TGA-GAAAAA---AAAAA------------A-T-ATAA--CG-A--C----AC-G-C-ACATGT--CT--A---T-AG-C-TAC-TAT---C-AT---TTG---GAAAAA--TA--T-TAA--TTT-AC-TATCGTC-TCA-T--GGA--A---ATAA-A-------------T-------------AA--A-AT--A-TAT-T-----A--T----A----TT------ACGT-------------GG-TAAA-CA-T--A-AA---AT-A-TT-TTC--AG-T-TG---------G--TACGA--A-TTTACA-GTA---TTGG-G-T-CGG----T-CGGC-A-CAT-C-TCGG---AAAA-C-------C-A--T------AT--------------C----------TT--C--AA-TA---------------GT-GA-C-------------AT-G-ATTT-T-ATAT---AA--TTCTGAAG-AG-GTATTGAT-ATAT----ATACTTGAAC---TATC-------GCACAA--C-A--TT--AAC-ACGCA-CTG-TT--CCTTTGTG-A-TT------CCAACA--TA-CAGGT-ATA-CAT--ATATT-A--ATATT-T-TGTGCTTATACTA--AACG--CTA--GT-AG-AAAC-A-TTT-AT-GA-ATTATTG-TA-GC-A--T-TG-CTGCA-T-AC----ATGTG--TGT-A-T----AT-ATT-AATAGC-ATATT-T--T-GTG---A-GAATT-TC-GC-ATT--AAT-A-ATA-ATCGTAAC-A----CT-TGC----G-AA-C-AAC-G--T-CGCGA--T-TATG-C--ATG-CC-T-CT-CCT-TCC-GTTTT-ACC-TGCTCTCTCCTTCCGTTTTA----C--G--A-CAGTCTT-GA-TTTTTTTCA-TTTGAT
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gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   tattttctcaaggacaagtccttggaatcaattaggT-TTC--AG-T-T-------------TTCGA--A-TTGACA--TA---T--G-G-T-CG-----T-CGCC-A-CAT-C-TCGA---AAAA-C-------C-A--T------AT--------------T----------TTTTC--AA-TG---------------G---A-A-------------AT-A-ACTT-TCATAT---AA--C-------------ATAGAT--TAT----ATAATCGAAAGAGTATT-------AAATAA--T-ACCTTGAAAA-AC-CA-CT---T--CCTTTGT------------TCAA-A--TA-C---T-AT----T--TCAT--A--AGATT-T-T----TTA-ATTT--AACG--CTA---T-A----AC-A-GTC-AA-TA-TTTAT-G-T---C-A--TATG-----A-T-A-------------GG-A-T----A------AATAGC-A-ATT-T----GT----A-GAAAT-TC-AC-ATT--ACT-A-ATA-ATC-CAAC-A----CT-T-C------AA-C-AGC-GCTT-CGC-A--T-TAT--C--A-G-TC-TGCT-CCT-TCC---TTT-ACC-T--TCTTTCCAACCATCTTA------------------T-AA-TTTCTGTCA-TTcac
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gi|23                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            ----C-AG--TT--TAGA--TTA-T-GTC-----T-GT-T-CT--G--TC--C-AAAA----T-A-T----CG-AA--G-TT-----CA--A-C-TTAC--AGG-------GA-T--A-CAG-G-ATG-TT--GTTC---TAA--------T-CAT----G-AT--TT--CTC-A-A-----TA----------ATT-GT-G------ATAATTATATG-C-GA-TTG-AG-TATAGTAT------CAA-G-----GAC--TT-C-AA---ACAA--A-A----C---T-G-AATT-G-G--T-GTG-TTT-T----CT----------CA---GT-C-T-T-G-----T-G-CA-C-A-CA--ATATGA------TAT-CGA----------A--G-------TA----G-GCC--GT-T-TG-AG-CTCCT-CAAATACC---ACTG-A-
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gi|33                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           GGGGCGGA-T-ATTT-A--CGAT-GTA--C-------AT-ACAC-A---TGTA-TGCT-G---G-T-TT-CACA--TGCCCAACGTGGCG-AGTAA-AT--A-CTG-TAC-C-TGTCGC--TTT-TT--AAAACA-----AA-GG--
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1 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|32 ): AAACAAAATACGCTGATCTTGTTGTTTTCTCAACGAAGAATTTGGAGGGAGAAGCTCGCCAGGAAATATCTTTACGGGCAAGATATGTAAGCTGATGTATACACAGAGTTACTAATGGTGAATTATCAATGCCAC






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Reference ( family-217 )      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           GGAGCGGA-T-ATTT-A--CGAT-GTA--CAT--GT-AT-ACAC-A---AGTA-T-CT-G---G-T-AT-CACA--TGCC--ACGT-GCG-AGT-A-AT--ACCTG-TAC-C-TGT--C--TTG-TC--AAAACA-----AA-GG--A-----T----------------AT-CTAA--T----CA-C-TGCT----C-AA--TT--TAGA--TTA-T-GTC-----T-GC-T-CT--G--TC--C-AAAA--C-T-A-T----CG-AA--G-TT-TG-ACA--A-C-TTAT--CGG---A-AAGG-T--A-TAG-T-CTG-T---GCTC---T----------T-CAT--T-G-AN--TT--CTC-A-A--CTATAC---------ATT-TT-G------ATA------TG-C-GA-TTG-GG-AATGATATGAT--ACAC-G-----GAC--TT-C-GA---ACNA--A-A----C---T-G-AATT-G-GA-T-GCG-TTT-T----AT----------CA---NT-C-T-T-G-----T-A-CA-C-A-CA-TACATG-------CAT-CGA----------A--G-------TT----A-GCC--GC-G-TG-AT-TTCCT-CAAATATC--AACTG-A-CACA-GTCTCCTTCCTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN---TCGTC-TTAAATCTG----G-T--ATCT--CGCC--------C---GA-C---T-C-AA--T--------A-T-ATT-T--CA-CA-CCTT-----T-T--TTTTGCTA-GACGTC----CAAG-----CT-T-------A-G--G---AA-CTCT-----AGG-G---ACT-CT----AG-T--AA-T-TC-TTTT-GTTG----CG-AAA------A--------ACC----CT-T-CGAA----T-T-----TG-CA--TGGATT---A-----------AACAA-TG------TT-CTC---T-TT-TT--AAACAC-------C---GC--------G---CCGAT--C---T-A------A-TATA--T---TT------T-A-----C-C--TA-GA--A------TTA------GC-GGAC--ACAAA-CC--TTCCA-A-TT-TGC--G----TG-G-ATT-TT-ACAA--A-T------------GA-A-TT-T--A-A-G-AA-----AAGT------------TG--ATGAA----TG--A-A---AATGGTT--T-TT--TA------T-----TT-------TGA-GAAAAA---AAAAA------------A-T-ATAA--CG-A--C----AC-G-C-ACATGT--CT--A---T-AG-C-TAC-TAT---C-AT---TTG---GAAAAA--TA--T-TAA--TTT-AC-TATCGTC-TCA-T--GGA--A---ATAA-A-------------T-------------AA--A-AT--A-TAT-T-----A--T----A----TT------ACGT-------------GG-TAAA-CA-T-A-AA---A--T-ATT-TT-C--AG-T-T-G---------G--TACGA--A-TTTACA-GTA---TTGG-G-T-CGG----T-CGGC-A-CAT-C-T-CGG---AAAA-C-------C-A--T------AT--------------C----------TT--CAA--TA---------------GT-GA-C-------------ATG-ATTT-T-ATAT---AA--TTCTGAAGA-G-GTATTGAT-ATAT----ATACTTGAAC---TATC-------GCACAA-C--A--TT--AAC-ACGCAC-TG-TT--CCTTTGTG-A-TT------CCAACA--TA-CAGGT-ATA-CAT--ATATT-A--ATATT-T-TGTGCTTATACTA--AACG--CTA--GT-AG-AAAC-A-TTT-AT-GA-ATTATTG-TA-GC-A--T-TG-CTGCA-T-AC----ATGTG--TGT-A-T----AT-ATT-AATAGC-ATATT-T--T-GTG---A-GAATT-TC-GC-ATT--AAT-A-ATA-ATCGTAAC-A----CT-TGCG----AA-C-AAC-G--T-CGCGA--T-TATG-C--ATG-CC-T-CT-CCT-TCC-GTTTT-ACC-TG-CTTTCTCCTTC-CGTT-----TA----CAACA---GTCT--T-GA-TTTTTTTCA-TTTGAT
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gi|21                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    --TT--TAGAAATTA-T-GTC-----T-GT-T-CT--G--TC--C-AAAA----T-A-T----CG-AA--G-TT-----CA--A-C-TTAA--CAGGATA-AAGG--------A-T-TTG-T---TCTA---T----------A-CA---T-G-A----T--CTC-A-A---TA------------ATT-GT-GATAATTATA------TG-C-GA--TG-AG-TATG-TATGAT---CAT-A-----GGC--TT-CAAA---ACAA--A-A----C-----G-AA-T-G-GG-T-GTG-TTT-T----CT----------CT---AT-C-T-T-G-----T-G-CA-CAA-CA--ATATGA------TAT-CGA----------A--A-------GT----AGGCC--GT-T-TGAAG-CTCCT-CAATTA
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gi|23                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            ----C-AG--TT--TAGA--TTA-T-GTC-----T-GT-T-CT--G--TC--C-AAAA----T-A-T----CG-AA--G-TT-----CA--A-C-TTAC--AGG-------GA-T--A-CAG-G-ATG-TT--GTTC---TAA--------T-CAT----G-AT--TT--CTC-A-A-----TA----------ATT-GT-G------ATAATTATATG-C-GA-TTG-AG-TATAGTAT------CAA-G-----GAC--TT-C-AA---ACAA--A-A----C---T-G-AATT-G-G--T-GTG-TTT-T----CT----------CA---GT-C-T-T-G-----T-G-CA-C-A-CA--ATATGA------TAT-CGA----------A--G-------TA----G-GCC--GT-T-TG-AG-CTCCT-CAAATACC---ACTG-A-
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gi|33                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           GGGGCGGA-T-ATTT-A--CGAT-GTA--C-------AT-ACAC-A---TGTA-TGCT-G---G-T-TT-CACA--TGCCCAACGTGGCG-AGTAA-AT--A-CTG-TAC-C-TGTCGC--TTT-TT--AAAACA-----AA-GG--
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1 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|32 ): AAACAAAATACGCTGATCTTGTTGTTTTCTCAACGAAGAATTTGGAGGGAGAAGCTCGCCAGGAAATATCTTTACGGGCAAGATATGTAAGCTGATGTATACACAGAGTTACTAATGGTGAATTATCAATGCCAC






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Reference ( family-217 )      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           GGAGCGGA-T-ATTT-A--CGAT-GTA--CAT--GT-AT-ACAC-A---AGTA-T-CT-G---G-T-AT-CACA--TGCC--ACGT-GCG-AGT-A-AT--ACCTG-TAC-C-TGT--C--TTG-TC--AAAACA-----AA-GG--A-----T----------------AT-CTAA--T----CA-C-TGCT----C-AA--TT--TAGA--TTA-T-GTC-----T-GC-T-CT--GTC--C-AAAA--C-T-A-T----CG-AA--GTT-T-G-ACA--A-C-TTAT--C-GG---A-AAGG-T--A-TAG-T-CTG-T---GCTC---T----------T-CAT--T-GAN--TT--CTC-A-A--CTATAC---------ATT-TT-G------ATA------TG-C-GA-TTG-GG-AATGATATGAT--ACAC-G-----GAC--TT-C-GA---ACNA--A-A----C---T-GAATT-G-GA-TGCG-TTT-T-A----T----------CA---NTC-T-T-G-----T-A-CA-C-A-CA-TACATG-------CAT-CGA----------A--G-------T----T-A-G--CC-GC-G-TG-AT-TTCCT-CAAATATC--AACTG-A-CACA-GTCTCCTTCCTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN---TCGTC-TTAAATCTG----G-T--ATCT--CGCC--------C---GA-C---T-C-AA--T--------A-T-ATT-T--CA-CA-CCTT-----T-T--TTTTGCTA-GACGTC----CAAG-----CT-T-------A-G--G---AA-CTCT-----AGG-G---ACT-CT----AG-T--AA-T-TC-TTTT-GTTG----CG-AAA------A--------ACC----CT-T-CGAA----T-T-----TG-CA--TGGATT---A-----------AACAA-TG------TT-CTC---T-TT-TT--AAACAC-------C---GC--------G---CCGAT--C---T-A------A-TATA--T---TT------T-A-----C-C--TA-GA--A------TTA------GC-GGAC--ACAAA-CC--TTCCA-A-TT-TGC--G----TG-G-ATT-TT-ACAA--A-T------------GA-A-TT-T--A-A-G-AA-----AAGT------------TG--ATGAA----TG--A-A---AATGGTT--T-TT--TA------T-----TT-------TGA-GAAAAA---AAAAA------------A-T-ATAA--CG-A--C----AC-G-C-ACATGT--CT--A---T-A-G-C-T-AC-TAT---C-AT---TTG---GAAAAA--TA--T-TAA--TTT-AC-TATCGTC-TCAT--GGA--A---ATAA-A-------------T-------------AA--A-AT--A-TAT-T-----A--T----A----TT------ACGT-------------GG-TAAA-CAT-A-AA---A--T-ATT-TT-C--AG-T-T-G---------G--TACGA--ATTT-ACA-GTA---TTGG-G-T-CGG----T-CGGC-A-CAT-C-T-CGG---AAAA-C-------C-A--T------AT--------------C----------TT--CAA--TA---------------GT-GA-C-------------ATG-A-TTT-T-ATATAA---TT-CTGAAGA-G-GTATTGAT-ATAT----ATACTTGAAC---T-ATC-------GCACAA-C--A--TT--AAC-ACGCAC-TG-TT--CCTTTGTG-A-TT------CCAACA--TA-CAGGTA-TA-CAT--ATATT-A--ATATT-T-TGTGCTTATACTA--AACG--CTA--GTA-G-AAAC-A-TTT-AT-GA-ATTATTGT-A-GC-A--T-TG-CTGCA-TA-C----ATGTG--TGT-A-T----AT-ATT-AATAGCA-TATT-T--T-GTG---A-GAATT-TC-GC-ATT--AA-T-A-ATA-ATCGTAAC-A----CT-TGC----GAA-C-AAC-G--T-CGCGA--T-TATGC--ATG-CC-T-CT-CCT-TCC-GTTTT-A--CCT-G--CTTTC--CTTCC---------A---------CAACA---GTCT--TG-A-TTTTTTTCA-TTTGAT
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gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            ttcctcaagaagaattagac-----AAGT------------TG--ATGAA----TT--A-A---AACAGTT--C-TT--TA------AA----TT-------TGG------A---AAAAA------------A-T-ATAA--CG-G--C----GC-T-C-GCATGT--CT--A--------------C-TAT---T-AT---TTG---GAAAAA--TA--T-TAA--TTT-AA-TTTCGTT-T------GA--A---ATAA-A-------------T-------------------------TGT-T-----ACTT----G----TT------ACAT--------------G-TAAA-CAT-A-AA---A--A-AAA-TT----AG-T-C-T---------G--CGCGA--ATTT-A-A--------TGG-G-T-CGG----T-CAGC-A-TAT-C-T-CGG---AAAA-C-------C-A---------AT--------------T----------TT--CAA--TGGAAAAAAAATCAATTGT-GA-CTGTCACATGTCCCATG-A-TTT-T-ATATAA---TT-CTGAAGA-A-GTATTAA----------ATACCTGAAC---T-ATC-------ACACAA-C--A--AT--AAC-AC
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gi|21                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    --TT--TAGAAATTA-T-GTC-----T-GT-T-CT--GTC--C-AAAA----T-A-T----CG-AA--GTT------CA--A-C-TTAA--C-AGGATA-AAGG--------A-T-TTG-T---TCTA---T----------A-CA---T-GA----T--CTC-A-A---TA------------ATT-GT-GATAATTATA------TG-C-GA--TG-AG-TATG-TATGAT---CAT-A-----GGC--TT-CAAA---ACAA--A-A----C-----GAA-T-G-GG-TGTG-TTT-T-C----T----------CT---ATC-T-T-G-----T-G-CA-CAA-CA--ATATGA------TAT-CGA----------A--A-------G----T-AGG--CC-GT-T-TGAAG-CTCCT-CAATTA
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gi|23                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            ----C-AG--TT--TAGA--TTA-T-GTC-----T-GT-T-CT--GTC--C-AAAA----T-A-T----CG-AA--GTT------CA--A-C-TTAC--A-GG-------GA-T--A-CAG-G-ATG-TT--GTTC---TAA--------T-CAT----GAT--TT--CTC-A-A-----TA----------ATT-GT-G------ATAATTATATG-C-GA-TTG-AG-TATAGTAT------CAA-G-----GAC--TT-C-AA---ACAA--A-A----C---T-GAATT-G-G--TGTG-TTT-T-C----T----------CA---GTC-T-T-G-----T-G-CA-C-A-CA--ATATGA------TAT-CGA----------A--G-------T----A-G-G--CC-GT-T-TG-AG-CTCCT-CAAATACC---ACTG-A-
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gi|33                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           GGGGCGGA-T-ATTT-A--CGAT-GTA--C-------AT-ACAC-A---TGTA-TGCT-G---G-T-TT-CACA--TGCCCAACGTGGCG-AGTAA-AT--A-CTG-TAC-C-TGTCGC--TTT-TT--AAAACA-----AA-GG--
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gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               aaacaacaatacgggtccttgtgttttctcaagaagaattagac---TCGTC-TTAAATCTG----G-T--ATCT--CGCC------------GA-C---T-C-AA--T--------A-A-TTT-T--CA-CA-CCTT-----T-T--T---GCTA-GACGTC-----AAG-----CT-TT------A-G--G---AAACTCT-----AGG-G---AAT-CT----A------A-T-TC-TTTT-GTTG----CG-AAA------A--------AAC-----T-T-CGAA----T-T-----TG-CA--TGGATT---A-----------AACAA-TG------TT-CTCTCAT-TT-CT--AAACCC-------C---GCCT------G---CCGAC--T---T-AT-----A-TATAGGT---TT------T-ATTCCTT-C--TT-GATTA------TTAC-----GCGGGACGAGCAAA-CTCGTTCCATA-TTCTGC--G----TG-T-ATT-TTGAGCG--A-T------------GA-A-TT-TTAG-A-G-AA-----AAGTTAGACGTGTGCGTG--GTGAATTATTGCTA-A---AATGTTT--T-TT--TACATG--T-----TT-------TGA-Gnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntcgtcttaaatctggtatctcgccgactcaataattttcacacctttttgctagacgtcaagctttaggaaactctagggaatctaattcttttgttgcgaaaaaacttcgaatttgcatggattaaacaatgttctctcatttctaaaccccgcctgccgacttatatataggttttattccttcttgattattacgcgggacgagcaaactcgttccatattctgcgtgtattttgagcgatgaattttagagaaaagttagacgtgtgcgtggtgaattattgctaaaatgtttttttacatgttttgag
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Reference ( family-217 )      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           GGAGCGGA-T-ATTT-A--CGAT-GTA--CAT--GT-AT-ACAC-A---AGTA-T-CT-G---G-T-AT-CACA--TGCC--ACGT-GCG-AGT-A-AT--ACCTG-TAC-C-TGT--C--TTG-TC--AAAACA-----AA-GG--A-----T----------------AT-CTAA--T----CA-C-TGCT----C-AA--TT--TAGA--TTA-T-GTC-----T-GC-T-CT--G--TC--C-AAAA--C-T-A-T----CG-AA--G-TT-TG-ACA--A-C-TTAT--CGG---A-AAGG-T--A-TAG-T-CTG-T---GCTC---T----------T-CAT--T-G-AN--TT--CTC-A-A--CTATAC---------ATT-TT-G------ATA------TG-C-GA-TTG-GG-AATGATATGAT--ACAC-G-----GAC--TT-C-GA---ACNA--A-A----C---T-G-AATT-G-GA-T-GCG-TTT-T----AT----------CA---NT-C-T-T-G-----T-A-CA-C-A-CA-TACATG-------CAT-CGA----------A--G-------TT----A-GCC--GC-G-TG-AT-TTCCT-CAAATATC--AACTG-A-CACA-GTCTCCTTCCTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN---TCGTC-TTAAATCTG----G-T--ATCT--CGCC--------C---GA-C---T-C-AA--T--------A-T-ATT-T--CA-CA-CCTT-----T-T--TTTTGCTA-GACGTC----CAAG-----CT-T-------A-G--G---AA-CTCT-----AGG-G---ACT-CT----AG-T--AA-T-TC-TTTT-GTTG----CG-AAA------A--------ACC----CT-T-CGAA----T-T-----TG-CA--TGGATT---A-----------AACAA-TG------TT-CTC---T-TT-TT--AAACAC-------C---GC--------G---CCGAT--C---T-A------A-TATA--T---TT------T-A-----C-C--TA-GA--A------TTA------GC-GGAC--ACAAA-CC--TTCCA-A-TT-TGC--G----TG-G-ATT-TT-ACAA--A-T------------GA-A-TT-T--A-A-G-AA-----AAGT------------TG--ATGAA----TG--A-A---AATGGTT--T-TT--TA------T-----TT-------TGA-GAAAAA---AAAAA------------A-T-ATAA--CG-A--C----AC-G-C-ACATGT--CT--A---T-A-G-C-T-AC-TAT---C-AT---TTG---GAAAAA--TA--T-TAA--TTT-AC-TATCGTC-TCAT--GGA--A---ATAA-A-------------T-------------AA--A-AT--A-TAT-T-----A--T----A----TT------ACGT-------------GG-TAAA-CAT-A-AA---A--T-ATT-TT-C--AG-T-T-G---------G--TACGA--ATTT-ACA-GTA---TTGG-G-T-CGG----T-CGGC-A-CAT-C-T-CGG---AAAA-C-------C-A--T------AT--------------C----------TT--CAA--TA---------------GT-GA-C-------------ATG-A-TTT-T-ATATAA---TTCTGAAGA-G-GTATTGAT-ATAT----ATACTTGAAC---T-ATC-------GCACAA-C--A--TT--AAC-ACGCAC-TG-TT--CCTTTGTG-ATT------CCAACA--TA-CAGGTA-TA-CAT--ATATT-A--ATATT-T-TGTGCTTATACTA--AACG--CTA--GTA-G-AAAC-A-TTT-ATGA-ATTATTGT-A-GC-A--T-TG-CTGCA-T-AC----ATGTGT--GT-A-T----AT-ATT-AATAGCA-TATT-TT--GTG---AGA-ATTTC-GC-ATT--AA-T-A-ATA-ATCGTAAC-A----CT-TGC----GAA-C-AACG--T-CGCGA--T-TATGC--ATG-CC-T-CT-CCT-TCC-GTTTT-A--CCT-G-CT------TTC-----C------TCC-------GCAACA---GTCT--TG-A-TTTTTTTCA-TTTGAT
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gi|21                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    --TT--TAGAAATTA-T-GTC-----T-GT-T-CT--G--TC--C-AAAA----T-A-T----CG-AA--G-TT-----CA--A-C-TTAA--CAGGATA-AAGG--------A-T-TTG-T---TCTA---T----------A-CA---T-G-A----T--CTC-A-A---TA------------ATT-GT-GATAATTATA------TG-C-GA--TG-AG-TATG-TATGAT---CAT-A-----GGC--TT-CAAA---ACAA--A-A----C-----G-AA-T-G-GG-T-GTG-TTT-T----CT----------CT---AT-C-T-T-G-----T-G-CA-CAA-CA--ATATGA------TAT-CGA----------A--A-------GT----AGGCC--GT-T-TGAAG-CTCCT-CAATTA
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gi|23                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            ----C-AG--TT--TAGA--TTA-T-GTC-----T-GT-T-CT--G--TC--C-AAAA----T-A-T----CG-AA--G-TT-----CA--A-C-TTAC--AGG-------GA-T--A-CAG-G-ATG-TT--GTTC---TAA--------T-CAT----G-AT--TT--CTC-A-A-----TA----------ATT-GT-G------ATAATTATATG-C-GA-TTG-AG-TATAGTAT------CAA-G-----GAC--TT-C-AA---ACAA--A-A----C---T-G-AATT-G-G--T-GTG-TTT-T----CT----------CA---GT-C-T-T-G-----T-G-CA-C-A-CA--ATATGA------TAT-CGA----------A--G-------TA----G-GCC--GT-T-TG-AG-CTCCT-CAAATACC---ACTG-A-
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gi|31                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         aagcaaccgggtcgttaatgtattttttaccagcaattcttagaatcaattagtg-ACGTAC-TC-TT--CCTTCGTG-ATT------CCAACG--CA-GAGGCA-TG-CAT--ATGTT-A---TATT-G-TGTGCTTATACTA--AACG--CTA--GTA-G-AAAT-A-TTT-ATGA-ATTATTTT-A-GC-A--T-TG-ATGCA-T-AC-----T-------------------------TAGCA-TATT-TT--GTG---ATA-ATTTC-AC-ATT--AA-T-ATATA-t
gi|33                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           GGGGCGGA-T-ATTT-A--CGAT-GTA--C-------AT-ACAC-A---TGTA-TGCT-G---G-T-TT-CACA--TGCCCAACGTGGCG-AGTAA-AT--A-CTG-TAC-C-TGTCGC--TTT-TT--AAAACA-----AA-GG--
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1 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|32 ): AAACAAAATACGCTGATCTTGTTGTTTTCTCAACGAAGAATTTGGAGGGAGAAGCTCGCCAGGAAATATCTTTACGGGCAAGATATGTAAGCTGATGTATACACAGAGTTACTAATGGTGAATTATCAATGCCAC






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Reference ( family-217 )      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           GGAGCGGA-T-ATTT-A--CGAT-GTA--CAT--GT-AT-ACAC-A---AGTA-T-CT-G---G-T-AT-CACA--TGCC--ACGT-GCG-AGT-A-AT--ACCTG-TAC-C-TGT--C--TTG-TC--AAAACA-----AA-GG--A-----T----------------AT-CTAA--T----CA-C-TGCT----C-AA--TT--TAGA--TTA-T-GTC-----T-GC-T-CT--G--TC--C-AAAA--C-T-A-T----CG-AA--G-TT-TG-ACA--A-C-TTAT--CGG---A-AAGG-T--A-TAG-T-CTG-T---GCTC---T----------T-CAT--T-G-AN--TT--CTC-A-A--CTATAC---------ATT-TT-G------ATA------TG-C-GA-TTG-GG-AATGATATGAT--ACAC-G-----GAC--TT-C-GA---ACNA--A-A----C---T-G-AATT-G-GA-T-GCG-TTT-T----AT----------CA---NT-C-T-T-G-----T-A-CA-C-A-CA-TACATG-------CAT-CGA----------A--G-------TT----A-GCC--GC-G-TG-AT-TTCCT-CAAATATC--AACTG-A-CACA-GTCTCCTTCCTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN---TCGTC-TTAAATCTG----G-T--ATCT--CGCC--------C---GA-C---T-C-AA--T--------A-T-ATT-T--CA-CA-CCTT-----T-T--TTTTGCTA-GACGTC----CAAG-----CT-T-------A-G--G---AA-CTCT-----AGG-G---ACT-CT----AG-T--AA-T-TC-TTTT-GTTG----CG-AAA------A--------ACC----CT-T-CGAA----T-T-----TG-CA--TGGATT---A-----------AACAA-TG------TT-CTC---T-TT-TT--AAACAC-------C---GC--------G---CCGAT--C---T-A------A-TATA--T---TT------T-A-----C-C--TA-GA--A------TTA------GC-GGAC--ACAAA-CC--TTCCA-A-TT-TGC--G----TG-G-ATT-TT-ACAA--A-T------------GA-A-TT-T--A-A-G-AA-----AAGT------------TG--ATGAA----TG--A-A---AATGGTT--T-TT--TA------T-----TT-------TGA-GAAAAA---AAAAA------------A-T-ATAA--CG-A--C----AC-G-C-ACATGT--CT--A---T-A-G-C-T-AC-TAT---C-AT---TTG---GAAAAA--TA--T-TAA--TTT-AC-TATCGTC-TCAT--GGA--A---ATAA-A-------------T-------------AA--A-AT--A-TAT-T-----A--T----A----TT------ACGT-------------GG-TAAA-CAT-A-AA---A--T-ATT-TT-C--AG-T-T-G---------G--TACGA--ATTT-ACA-GTA---TTGG-G-T-CGG----T-CGGC-A-CAT-C-T-CGG---AAAA-C-------C-A--T------AT--------------C----------TT--CAA--TA---------------GT-GA-C-------------ATG-A-TTT-T-ATATAA---TT-CTGAAGA-G-GTATTGAT-ATAT----ATACTTGAAC---T-ATC-------GCACAA-C--A--TT--AAC-ACGCAC-TG-TT--CCTTTGTG-A-TT------CCAACA--TA-CAGGTA-TA-CAT--ATATT-A--ATATT-T-TGTGCTTATACTA--AACG--CTA--GTA-G-AAAC-A-TTT-AT-GA-ATTATTGT-A-GC-A--T-TG-CTGCA-TA-C----ATGTG--TGT-A-T----AT-ATT-AATAGCA-TATT-T--T-GTG---A-GAATT-TC-GC-ATT--AA-T-A-ATA-ATCGTAAC-A----CT-TGC----GAA-C-AAC-G--T-CGCGA--T-TATGC--ATG-CC----------------------T-CT-CCT-TCC-GTTTT-A--CCT-G-CTTTCC-CC-------------GCAACA---GTCT--TG-A-TTTTTTTCA-TTTGAT
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gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              ttcctcaagaagaattagac-----AAGT------------TG--ATGAA----TT--A-A---AACAGTT--C-TT--TA------AA----TT-------TGG------A---AAAAA------------A-T-ATAA--CG-G--C----GC-T-C-GCATGT--CT--A--------------C-TAT---T-AT---TTG---GAAAAA--TA--T-TAA--TTT-AA-TTTCGTT-T------GA--A---ATAA-A-------------T-------------------------TGT-T-----ACTT----G----TT------ACAT--------------G-TAAA-CAT-A-AA---A--A-AAA-TT----AG-T-C-T---------G--CGCGA--ATTT-A-A--------TGG-G-T-CGG----T-CAGC-A-TAT-C-T-CGG---AAAA-C-------C-A---------AT--------------T----------TT--CAA--TGGAAAAAAAATCAATTGT-GA-CTGTCACATGTCCCATG-A-TTT-T-ATATAA---TT-CTGAAGA-A-GTATTAA----------ATACCTGAAC---T-ATC-------ACACAA-C--A--AT--AAC-AC
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gi|23                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            ----C-AG--TT--TAGA--TTA-T-GTC-----T-GT-T-CT--G--TC--C-AAAA----T-A-T----CG-AA--G-TT-----CA--A-C-TTAC--AGG-------GA-T--A-CAG-G-ATG-TT--GTTC---TAA--------T-CAT----G-AT--TT--CTC-A-A-----TA----------ATT-GT-G------ATAATTATATG-C-GA-TTG-AG-TATAGTAT------CAA-G-----GAC--TT-C-AA---ACAA--A-A----C---T-G-AATT-G-G--T-GTG-TTT-T----CT----------CA---GT-C-T-T-G-----T-G-CA-C-A-CA--ATATGA------TAT-CGA----------A--G-------TA----G-GCC--GT-T-TG-AG-CTCCT-CAAATACC---ACTG-A-
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gi|31                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          aagcaaccgggtcgttaatgtattttttaccagcaattcttagaatcaattagtg-ACGTAC-TC-TT--CCTTCGTG-A-TT------CCAACG--CA-GAGGCA-TG-CAT--ATGTT-A---TATT-G-TGTGCTTATACTA--AACG--CTA--GTA-G-AAAT-A-TTT-AT-GA-ATTATTTT-A-GC-A--T-TG-ATGCA-TA-C-----T-------------------------TAGCA-TATT-T--T-GTG---A-TAATT-TC-AC-ATT--AA-T-ATATA-t
gi|33                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           GGGGCGGA-T-ATTT-A--CGAT-GTA--C-------AT-ACAC-A---TGTA-TGCT-G---G-T-TT-CACA--TGCCCAACGTGGCG-AGTAA-AT--A-CTG-TAC-C-TGTCGC--TTT-TT--AAAACA-----AA-GG--
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gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 aaacaacaatacgggtccttgtgttttctcaagaagaattagac---TCGTC-TTAAATCTG----G-T--ATCT--CGCC------------GA-C---T-C-AA--T--------A-A-TTT-T--CA-CA-CCTT-----T-T--T---GCTA-GACGTC-----AAG-----CT-TT------A-G--G---AAACTCT-----AGG-G---AAT-CT----A------A-T-TC-TTTT-GTTG----CG-AAA------A--------AAC-----T-T-CGAA----T-T-----TG-CA--TGGATT---A-----------AACAA-TG------TT-CTCTCAT-TT-CT--AAACCC-------C---GCCT------G---CCGAC--T---T-AT-----A-TATAGGT---TT------T-ATTCCTT-C--TT-GATTA------TTAC-----GCGGGACGAGCAAA-CTCGTTCCATA-TTCTGC--G----TG-T-ATT-TTGAGCG--A-T------------GA-A-TT-TTAG-A-G-AA-----AAGTTAGACGTGTGCGTG--GTGAATTATTGCTA-A---AATGTTT--T-TT--TACATG--T-----TT-------TGA-Gnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntcgtcttaaatctggtatctcgccgactcaataattttcacacctttttgctagacgtcaagctttaggaaactctagggaatctaattcttttgttgcgaaaaaacttcgaatttgcatggattaaacaatgttctctcatttctaaaccccgcctgccgacttatatataggttttattccttcttgattattacgcgggacgagcaaactcgttccatattctgcgtgtattttgagcgatgaattttagagaaaagttagacgtgtgcgtggtgaattattgctaaaatgtttttttacatgttttgag
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1 sequences could not be aligned to this reference sequence:
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Reference ( family-217 )      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           GGAGCGGA-T-ATTT-A--CGAT-GTA--CAT--GT-AT-ACAC-A---AGTA-T-CT-G---G-T-AT-CACA--TGCC--ACGT-GCG-AGT-A-AT--ACCTG-TAC-C-TGT--C--TTG-TC--AAAACA-----AA-GG--A-----T----------------AT-CTAA--T----CA-C-TGCT----C-AA--TT--TAGA--TTA-T-GTC-----T-GC-T-CT--GTC--C-AAAA--C-T-A-T----CG-AA--GTT-T-G-ACA--A-C-TTAT--C-GG---A-AAGG-T--A-TAG-T-CTG-T---GCTC---T----------T-CAT--T-GAN--TT--CTC-A-A--CTATAC---------ATT-TT-G------ATA------TG-C-GA-TTG-GG-AATGATATGAT--ACAC-G-----GAC--TT-C-GA---ACNA--A-A----C---T-GAATT-G-GA-TGCG-TTT-T-A----T----------CA---NTC-T-T-G-----T-A-CA-C-A-CA-TACATG-------CAT-CGA----------A--G-------T----T-A-G--CC-GC-G-TG-AT-TTCCT-CAAATATC--AACTG-A-CACA-GTCTCCTTCCTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN---TCGTC-TTAAATCTG----G-T--ATCT--CGCC--------C---GA-C---T-C-AA--T--------A-T-ATT-T--CA-CA-CCTT-----T-T--TTTTGCTA-GACGTC----CAAG-----CT-T-------A-G--G---AA-CTCT-----AGG-G---ACT-CT----AG-T--AA-T-TC-TTTT-GTTG----CG-AAA------A--------ACC----CT-T-CGAA----T-T-----TG-CA--TGGATT---A-----------AACAA-TG------TT-CTC---T-TT-TT--AAACAC-------C---GC--------G---CCGAT--C---T-A------A-TATA--T---TT------T-A-----C-C--TA-GA--A------TTA------GC-GGAC--ACAAA-CC--TTCCA-A-TT-TGC--G----TG-G-ATT-TT-ACAA--A-T------------GA-A-TT-T--A-A-G-AA-----AAGT------------TG--ATGAA----TG--A-A---AATGGTT--T-TT--TA------T-----TT-------TGA-GAAAAA---AAAAA------------A-T-ATAA--CG-A--C----AC-G-C-ACATGT--CT--A---T-AG-C-TAC-TAT---C-AT---TTG---GAAAAA--TA--T-TAA--TTT-AC-TATCGTC-TCA-T--GGA--A---ATAA-A-------------T-------------AA--A-AT--A-TAT-T-----A--T----A----TT------ACGT-------------GG-TAAA-CA-T-A-AA---A--T-ATT-TT-C--AG-T-T-G---------G--TACGA--A-TTTACA-GTA---TTGG-G-T-CGG----T-CGGC-A-CAT-C-T-CGG---AAAA-C-------C-A--T------AT--------------C----------TT--CAA--TA---------------GT-GA-C-------------ATG-ATTT-T-ATAT---AA-T--TCTGAAGA-G-GTATTGAT-ATAT----ATACTTGAAC---TATC-------GCACAA-C--A--TT--AAC-ACGCAC-TG-TTCC--TTTGTG-A-TT------CCAACA--TA-CAGGT-ATA-CAT--AT--ATT-AATATT-T-TGTGCTTATACTA--AACG--CTA--GT-AG-AAAC-ATTT-AT-GA-ATTATTG-TA-GCA--T-TGC-TGCA-T-AC----ATGTG--TGT-AT----AT-ATT-AA-TAGC-ATATT-T--T-GTG---A-GAATT-TC-GC-ATT--AAT-A-ATA-ATCGTAAC-A----CT-TGC----G-AA-C-AAC-G--T-CGCGA--T-TATG-C--ATG-CC-T-CT-CCT-TCC-GTTTT-A--CC-TG-CTTTCC--C-C---------A------ACA---GTCT--T-GA-TTTTTTTCA-TTTGAT
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gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            ttcctcaagaagaattagac-----AAGT------------TG--ATGAA----TT--A-A---AACAGTT--C-TT--TA------AA----TT-------TGG------A---AAAAA------------A-T-ATAA--CG-G--C----GC-T-C-GCATGT--CT--A------------C-TAT---T-AT---TTG---GAAAAA--TA--T-TAA--TTT-AA-TTTCGTT-T-------GA--A---ATAA-A-------------T-------------------------TGT-T-----ACTT----G----TT------ACAT--------------G-TAAA-CA-T-A-AA---A--A-AAA-TT----AG-T-C-T---------G--CGCGA--A-TTTA-A--------TGG-G-T-CGG----T-CAGC-A-TAT-C-T-CGG---AAAA-C-------C-A---------AT--------------T----------TT--CAA--TGGAAAAAAAATCAATTGT-GA-CTGTCACATGTCCCATG-ATTT-T-ATAT---AA-T--TCTGAAGA-A-GTATTAA----------ATACCTGAAC---TATC-------ACACAA-C--A--AT--AAC-AC
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gi|21                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    --TT--TAGAAATTA-T-GTC-----T-GT-T-CT--GTC--C-AAAA----T-A-T----CG-AA--GTT------CA--A-C-TTAA--C-AGGATA-AAGG--------A-T-TTG-T---TCTA---T----------A-CA---T-GA----T--CTC-A-A---TA------------ATT-GT-GATAATTATA------TG-C-GA--TG-AG-TATG-TATGAT---CAT-A-----GGC--TT-CAAA---ACAA--A-A----C-----GAA-T-G-GG-TGTG-TTT-T-C----T----------CT---ATC-T-T-G-----T-G-CA-CAA-CA--ATATGA------TAT-CGA----------A--A-------G----T-AGG--CC-GT-T-TGAAG-CTCCT-CAATTA
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gi|23                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            ----C-AG--TT--TAGA--TTA-T-GTC-----T-GT-T-CT--GTC--C-AAAA----T-A-T----CG-AA--GTT------CA--A-C-TTAC--A-GG-------GA-T--A-CAG-G-ATG-TT--GTTC---TAA--------T-CAT----GAT--TT--CTC-A-A-----TA----------ATT-GT-G------ATAATTATATG-C-GA-TTG-AG-TATAGTAT------CAA-G-----GAC--TT-C-AA---ACAA--A-A----C---T-GAATT-G-G--TGTG-TTT-T-C----T----------CA---GTC-T-T-G-----T-G-CA-C-A-CA--ATATGA------TAT-CGA----------A--G-------T----A-G-G--CC-GT-T-TG-AG-CTCCT-CAAATACC---ACTG-A-
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gi|33                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           GGGGCGGA-T-ATTT-A--CGAT-GTA--C-------AT-ACAC-A---TGTA-TGCT-G---G-T-TT-CACA--TGCCCAACGTGGCG-AGTAA-AT--A-CTG-TAC-C-TGTCGC--TTT-TT--AAAACA-----AA-GG--
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gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               aaacaacaatacgggtccttgtgttttctcaagaagaattagac---TCGTC-TTAAATCTG----G-T--ATCT--CGCC------------GA-C---T-C-AA--T--------A-A-TTT-T--CA-CA-CCTT-----T-T--T---GCTA-GACGTC-----AAG-----CT-TT------A-G--G---AAACTCT-----AGG-G---AAT-CT----A------A-T-TC-TTTT-GTTG----CG-AAA------A--------AAC-----T-T-CGAA----T-T-----TG-CA--TGGATT---A-----------AACAA-TG------TT-CTCTCAT-TT-CT--AAACCC-------C---GCCT------G---CCGAC--T---T-AT-----A-TATAGGT---TT------T-ATTCCTT-C--TT-GATTA------TTAC-----GCGGGACGAGCAAA-CTCGTTCCATA-TTCTGC--G----TG-T-ATT-TTGAGCG--A-T------------GA-A-TT-TTAG-A-G-AA-----AAGTTAGACGTGTGCGTG--GTGAATTATTGCTA-A---AATGTTT--T-TT--TACATG--T-----TT-------TGA-Gnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntcgtcttaaatctggtatctcgccgactcaataattttcacacctttttgctagacgtcaagctttaggaaactctagggaatctaattcttttgttgcgaaaaaacttcgaatttgcatggattaaacaatgttctctcatttctaaaccccgcctgccgacttatatataggttttattccttcttgattattacgcgggacgagcaaactcgttccatattctgcgtgtattttgagcgatgaattttagagaaaagttagacgtgtgcgtggtgaattattgctaaaatgtttttttacatgttttgag
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         aaacaacaatacgggtccttgtgttttctcaagaagaattagacggagcggatattttacgatgtacattagtaatcacaagtatatggtattacatgccacgtgcgagtaatacctgtacctgtcttgtcaaaacaaaggatatctaatcactgctcaatttagattatgtctgctctgtccaaaactatcgaagtttgacaacttatcggaaaggtatagttgctctaattcatgaggtttctcaaactatacattttgatatgccgattgggaatgattacacagactttgaacaatgaattggatgcgtattatactgaaattgcatgcgtcttgtatcacatcatacatgtgctacacatcgatacatgttacagctcgaatttagctgcatgatttcctcaaatatcaactgcacacagnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn--A-A----C---T-GAATT-T-GA-TGCG-TTT-T-A----T----------CA---ATC-T-T-G-----T-A-CA-C-A-CA-T-------------AT-CGA----------A--G-------T----T-G-G--CC-
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Reference ( family-217 )      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           GGAGCGGA-T-ATTT-A--CGAT-GTA--CAT--GT-AT-ACAC-A---AGTA-T-CT-G---G-T-AT-CACA--TGCC--ACGT-GCG-AGT-A-AT--ACCTG-TAC-C-TGT--C--TTG-TC--AAAACA-----AA-GG--A-----T----------------AT-CTAA--T----CA-C-TGCT----C-AA--TT--TAGA--TTA-T-GTC-----T-GC-T-CT--GTC--C-AAAA--C-T-A-T----CG-AA--GTT-T-G-ACA--A-C-TTAT--C-GG---A-AAGG-T--A-TAG-T-CTG-T---GCTC---T----------T-CAT--T-GAN--TT--CTC-A-A--CTATAC---------ATT-TT-G------ATA------TG-C-GA-TTG-GG-AATGATATGAT--ACAC-G-----GAC--TT-C-GA---ACNA--A-A----C---T-GAATT-G-GA-TGCG-TTT-T-A----T----------CA---NTC-T-T-G-----T-A-CA-C-A-CA-TACATG-------CAT-CGA----------A--G-------T----T-A-G--CC-GC-G-TG-AT-TTCCT-CAAATATC--AACTG-A-CACA-GTCTCCTTCCTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN---TCGTC-TTAAATCTG----G-T--ATCT--CGCC--------C---GA-C---T-C-AA--T--------A-T-ATT-T--CA-CA-CCTT-----T-T--TTTTGCTA-GACGTC----CAAG-----CT-T-------A-G--G---AA-CTCT-----AGG-G---ACT-CT----AG-T--AA-T-TC-TTTT-GTTG----CG-AAA------A--------ACC----CT-T-CGAA----T-T-----TG-CA--TGGATT---A-----------AACAA-TG------TT-CTC---T-TT-TT--AAACAC-------C---GC--------G---CCGAT--C---T-A------A-TATA--T---TT------T-A-----C-C--TA-GA--A------TTA------GC-GGAC--ACAAA-CC--TTCCA-A-TT-TGC--G----TG-G-ATT-TT-ACAA--A-T------------GA-A-TT-T--A-A-G-AA-----AAGT------------TG--ATGAA----TG--A-A---AATGGTT--T-TT--TA------T-----TT-------TGA-GAAAAA---AAAAA------------A-T-ATAA--CG-A--C----AC-G-C-ACATGT--CT--A---T-AG-C-TAC-TAT---C-AT---TTG---GAAAAA--TA--T-TAA--TTT-AC-TATCGTC-TCA-T--GGA--A---ATAA-A-------------T-------------AA--A-AT--A-TAT-T-----A--T----A----TT------ACGT-------------GG-TAAA-CA-T-A-AA---A--T-ATT-TT-C--AG-T-T-G---------G--TACGA--A-TTTACA-GTA---TTGG-G-T-CGG----T-CGGC-A-CAT-C-T-CGG---AAAA-C-------C-A--T------AT--------------C----------TT--CAA--TA---------------GT-GA-C-------------ATG-ATTT-T-ATAT---AA-T--TCTGAAGA-G-GTATTGAT-ATAT----ATACTTGAAC---TATC-------GCACAA-C--A--TT--AAC-ACGCAC-TG-TTCC--TTTGTG-A-TT------CCAACA--TA-CAGGT-ATA-CAT--AT--ATT-AATATT-T-TGTGCTTATACTA--AACG--CTA--GT-AG-AAAC-ATTT-AT-GA-ATTATTG-TA-GCA--T-TGC-TGCA-T-AC----ATGTG--TGT-AT----AT-ATT-AA-TAGC-ATATT-T--T-GTG---A-GAATT-TC-GC-ATT--AAT-A-ATA-ATCGTAAC-A----CT-TGC----G-AA-C-AAC-G--T-CGCGA--T-TATG-C--ATG-CC-T-CT-CCT-TCC-GTTTT-A--CC-TG-CTTTCC--C-C---------A------ACA---GTCT--T-GA-TTTTTTTCA-TTTGAT
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gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            ttcctcaagaagaattagac-----AAGT------------TG--ATGAA----TT--A-A---AACAGTT--C-TT--TA------AA----TT-------TGG------A---AAAAA------------A-T-ATAA--CG-G--C----GC-T-C-GCATGT--CT--A------------C-TAT---T-AT---TTG---GAAAAA--TA--T-TAA--TTT-AA-TTTCGTT-T-------GA--A---ATAA-A-------------T-------------------------TGT-T-----ACTT----G----TT------ACAT--------------G-TAAA-CA-T-A-AA---A--A-AAA-TT----AG-T-C-T---------G--CGCGA--A-TTTA-A--------TGG-G-T-CGG----T-CAGC-A-TAT-C-T-CGG---AAAA-C-------C-A---------AT--------------T----------TT--CAA--TGGAAAAAAAATCAATTGT-GA-CTGTCACATGTCCCATG-ATTT-T-ATAT---AA-T--TCTGAAGA-A-GTATTAA----------ATACCTGAAC---TATC-------ACACAA-C--A--AT--AAC-AC
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gi|21                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    --TT--TAGAAATTA-T-GTC-----T-GT-T-CT--GTC--C-AAAA----T-A-T----CG-AA--GTT------CA--A-C-TTAA--C-AGGATA-AAGG--------A-T-TTG-T---TCTA---T----------A-CA---T-GA----T--CTC-A-A---TA------------ATT-GT-GATAATTATA------TG-C-GA--TG-AG-TATG-TATGAT---CAT-A-----GGC--TT-CAAA---ACAA--A-A----C-----GAA-T-G-GG-TGTG-TTT-T-C----T----------CT---ATC-T-T-G-----T-G-CA-CAA-CA--ATATGA------TAT-CGA----------A--A-------G----T-AGG--CC-GT-T-TGAAG-CTCCT-CAATTA
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gi|23                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            ----C-AG--TT--TAGA--TTA-T-GTC-----T-GT-T-CT--GTC--C-AAAA----T-A-T----CG-AA--GTT------CA--A-C-TTAC--A-GG-------GA-T--A-CAG-G-ATG-TT--GTTC---TAA--------T-CAT----GAT--TT--CTC-A-A-----TA----------ATT-GT-G------ATAATTATATG-C-GA-TTG-AG-TATAGTAT------CAA-G-----GAC--TT-C-AA---ACAA--A-A----C---T-GAATT-G-G--TGTG-TTT-T-C----T----------CA---GTC-T-T-G-----T-G-CA-C-A-CA--ATATGA------TAT-CGA----------A--G-------T----A-G-G--CC-GT-T-TG-AG-CTCCT-CAAATACC---ACTG-A-
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gi|33                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           GGGGCGGA-T-ATTT-A--CGAT-GTA--C-------AT-ACAC-A---TGTA-TGCT-G---G-T-TT-CACA--TGCCCAACGTGGCG-AGTAA-AT--A-CTG-TAC-C-TGTCGC--TTT-TT--AAAACA-----AA-GG--
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gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               aaacaacaatacgggtccttgtgttttctcaagaagaattagac---TCGTC-TTAAATCTG----G-T--ATCT--CGCC------------GA-C---T-C-AA--T--------A-A-TTT-T--CA-CA-CCTT-----T-T--T---GCTA-GACGTC-----AAG-----CT-TT------A-G--G---AAACTCT-----AGG-G---AAT-CT----A------A-T-TC-TTTT-GTTG----CG-AAA------A--------AAC-----T-T-CGAA----T-T-----TG-CA--TGGATT---A-----------AACAA-TG------TT-CTCTCAT-TT-CT--AAACCC-------C---GCCT------G---CCGAC--T---T-AT-----A-TATAGGT---TT------T-ATTCCTT-C--TT-GATTA------TTAC-----GCGGGACGAGCAAA-CTCGTTCCATA-TTCTGC--G----TG-T-ATT-TTGAGCG--A-T------------GA-A-TT-TTAG-A-G-AA-----AAGTTAGACGTGTGCGTG--GTGAATTATTGCTA-A---AATGTTT--T-TT--TACATG--T-----TT-------TGA-Gnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntcgtcttaaatctggtatctcgccgactcaataattttcacacctttttgctagacgtcaagctttaggaaactctagggaatctaattcttttgttgcgaaaaaacttcgaatttgcatggattaaacaatgttctctcatttctaaaccccgcctgccgacttatatataggttttattccttcttgattattacgcgggacgagcaaactcgttccatattctgcgtgtattttgagcgatgaattttagagaaaagttagacgtgtgcgtggtgaattattgctaaaatgtttttttacatgttttgag
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         aaacaacaatacgggtccttgtgttttctcaagaagaattagacggagcggatattttacgatgtacattagtaatcacaagtatatggtattacatgccacgtgcgagtaatacctgtacctgtcttgtcaaaacaaaggatatctaatcactgctcaatttagattatgtctgctctgtccaaaactatcgaagtttgacaacttatcggaaaggtatagttgctctaattcatgaggtttctcaaactatacattttgatatgccgattgggaatgattacacagactttgaacaatgaattggatgcgtattatactgaaattgcatgcgtcttgtatcacatcatacatgtgctacacatcgatacatgttacagctcgaatttagctgcatgatttcctcaaatatcaactgcacacagnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn--A-A----C---T-GAATT-T-GA-TGCG-TTT-T-A----T----------CA---ATC-T-T-G-----T-A-CA-C-A-CA-T-------------AT-CGA----------A--G-------T----T-G-G--CC-
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1 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|32 ): AAACAAAATACGCTGATCTTGTTGTTTTCTCAACGAAGAATTTGGAGGGAGAAGCTCGCCAGGAAATATCTTTACGGGCAAGATATGTAAGCTGATGTATACACAGAGTTACTAATGGTGAATTATCAATGCCAC






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Reference ( family-217 )      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           GGAGCGGA-T-ATTT-A--CGAT-GTA--CAT--GT-AT-ACAC-A---AGTA-T-CT-G---G-T-AT-CACA--TGCC--ACGT-GCG-AGT-A-AT--ACCTG-TAC-C-TGT--C--TTG-TC--AAAACA-----AA-GG--A-----T----------------AT-CTAA--T----CA-C-TGCT----C-AA--TT--TAGA--TTA-T-GTC-----T-GC-T-CT--G--TC--C-AAAA--C-T-A-T----CG-AA--G-TT-TG-ACA--A-C-TTAT--CGG---A-AAGG-T--A-TAG-T-CTG-T---GCTC---T----------T-CAT--T-G-AN--TT--CTC-A-A--CTATAC---------ATT-TT-G------ATA------TG-C-GA-TTG-GG-AATGA--T---AT-----A--CA---C-GGAC--TT-C-GA---ACNA--A-A----C---T-GAATT-G-GA-TGCG-TTT-T-A----T----------CA---NTC-T-T-G-----T-A-CA-C-A-CA-TACATG-------CAT-CGA----------A--G-------T----T-A-G--CC-GC-G-TG-AT-TTCCT-CAAATATC--AACTG-A-CACA-GTCTCCTTCCTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN---TCGTC-TTAAATCTG----G-T--ATCT--CGCC--------C---GA-C---T-C-AA--T--------A-T-ATT-T--CA-CA-CCTT-----T-T--TTTTGCTA-GACGTC----CAAG-----CT-T-------A-G--G---AA-CTCT-----AGG-G---ACT-CT----AG-T--AA-T-TC-TTTT-GTTG----CG-AAA------A--------ACC----CT-T-CGAA----T-T-----TG-CA--TGGATT---A-----------AACAA-TG------TT-CTC---T-TT-TT--AAACAC-------C---GC--------G---CCGAT--C---T-A------ATATA--T---TT------TA-----C-C--TA-GA--A------TTA------GC-GGAC--AC-AAACC--TTCCA-A-TT-TG--CG----T-G-GATT-TT-ACAA--A-T------------GA-A-TT-T--A-A-G-AA-----AAGT------------TG--ATGAA----TG--A-A---AATGGTT--T-TT--T--A------T-----TT-------TGA-GAAAAA---AAAA--A------------A-T-ATAA-CG-A--C----AC-G-C-ACATGT--CT--A---T-AG-C-TAC-TAT---C-AT---TTG---GAAAAA--C-A--T-TAA--TTTAC-TATCGTC-TCA-T--GGA--A---ATAA-A-------------T-------------AA--A-AT--A-TAT-T-----A--T----A----T-T------ACGT-------------GG-TAAA-CA-T-A-AA---A--T-ATT-TT-C--A-----G-T-C-GG------TACGA--A-TTTACA-GTA----T-GGG---T--CGG----T-CGG-CA-CAT-C-T-CGG---AAAA-C-------CA-AT----------------CTT--CAA--T-------------A---------------GT-GA-C-------------ATG-ATTT-T-ATAT---AA--TTCTGAAGA-G-GTATTGAT-ATAT----ATACTTGAAC---TATC-------GCACAA-C--A--TT--AAC-ACGCAC-TG-TT--CCTTTGTG-A-TT------CCAACA--TA-CAGGT-ATA-CAT--A--TAT-T--ATATT-T-TGTGCTTATACTA--AACG--CTA--GT-AG-AAAC-A-TTT-AT-GA-ATTATTG-TA-GC-A--T-TG-CTGCA-T-AC----ATGTG--TGT-A-T----AT-ATT-AATAGC-ATATT-T--T-GTG---A-GAATT-TC-GC-ATT--AAT-A-ATA-ATCGTAAC-A----CT-TGCG----AA-C-AAC-G--T-CGCGA--T-TATG-C--ATG-CC-T-CT-CCT-TCC-GTTTT-A--CC-TG-CT------TT-C-----------------CA-----------A-C-A---GTCT--T-GA-TTTTTTTCA-TTTGAT
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gi|23                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            ----C-AG--TT--TAGA--TTA-T-GTC-----T-GT-T-CT--G--TC--C-AAAA----T-A-T----CG-AA--G-TT-----CA--A-C-TTAC--AGG-------GA-T--A-CAG-G-ATG-TT--GTTC---TAA--------T-CAT----G-AT--TT--CTC-A-A-----TA----------ATT-GT-G------ATAATTATATG-C-GA-TTG-AG-TATAG--T---AT--------CA---A-GGAC--TT-C-AA---ACAA--A-A----C---T-GAATT-G-G--TGTG-TTT-T-C----T----------CA---GTC-T-T-G-----T-G-CA-C-A-CA--ATATGA------TAT-CGA----------A--G-------T----A-G-G--CC-GT-T-TG-AG-CTCCT-CAAATACC---ACTG-A-
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gi|33                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           GGGGCGGA-T-ATTT-A--CGAT-GTA--C-------AT-ACAC-A---TGTA-TGCT-G---G-T-TT-CACA--TGCCCAACGTGGCG-AGTAA-AT--A-CTG-TAC-C-TGTCGC--TTT-TT--AAAACA-----AA-GG--
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gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      aaacaacaatacgggtccttgtgttttctcaagaagaattagac---TCGTC-TTAAATCTG----G-T--ATCT--CGCC------------GA-C---T-C-AA--T--------A-A-TTT-T--CA-CA-CCTT-----T-T--T---GCTA-GACGTC-----AAG-----CT-TT------A-G--G---AAACTCT-----AGG-G---AAT-CT----A------A-T-TC-TTTT-GTTG----CG-AAA------A--------AAC-----T-T-CGAA----T-T-----TG-CA--TGGATT---A-----------AACAA-TG------TT-CTCTCAT-TT-CT--AAACCC-------C---GCCT------G---CCGAC--T---T-AT-----ATATAGGT---TT------TATTCCTT-C--TT-GATTA------TTAC-----GCGGGACGAGC-AAACTCGTTCCATA-TTCTG--CG----T-G-TATT-TTGAGCG--A-T------------GA-A-TT-TTAG-A-G-AA-----AAGTTAGACGTGTGCGTG--GTGAATTATTGCTA-A---AATGTTT--T-TT--T--ACATG--T-----TT-------TGA-Gnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntcgtcttaaatctggtatctcgccgactcaataattttcacacctttttgctagacgtcaagctttaggaaactctagggaatctaattcttttgttgcgaaaaaacttcgaatttgcatggattaaacaatgttctctcatttctaaaccccgcctgccgacttatatataggttttattccttcttgattattacgcgggacgagcaaactcgttccatattctgcgtgtattttgagcgatgaattttagagaaaagttagacgtgtgcgtggtgaattattgctaaaatgtttttttacatgttttgag
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1 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|32 ): AAACAAAATACGCTGATCTTGTTGTTTTCTCAACGAAGAATTTGGAGGGAGAAGCTCGCCAGGAAATATCTTTACGGGCAAGATATGTAAGCTGATGTATACACAGAGTTACTAATGGTGAATTATCAATGCCAC