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Reference ( family-1629 ) : NCAT-TTA-TTC-CGTAA-A---TG-TAAAATC-G-CAATTTAG-T-GC--C----TTTT-G-A--A-GGA-AA-T-GCGT-CGG-TA-T-A-TA-CT------C----ATGTT-A-T-T-CGA-C-C----------------CGCATC-TTC-------------TCTCA-ATTT-------TT----T--A-CAGTAT----TT-C---TT--------CCCCCAAAA-ATTTTCC-AAGC-C-CCA----TTTTTCTGTA--T-TT---TA-CCCC-CAA-AGAA--AACC-CTTTTCCGGGGGA-AAACC---TCCCCCT--AT-T-AT-CAG---A--TTTTA-G-----A-A--T----G-T--T-GCC-TCGG-TA--TA-T-A-T--ATAC-T-CA-T-GTTATTCG-ACCC--GCTCTTT
gi|1 : CAT-TTA-TTC-CGTTA-G---TG-TAAAATC-G-CAATTTAG-T-GC--C----TTTT-G-A--A-NNN-NN-N-NNNN-NNN-NN-N-N-NN-NNNNGTCGC----ATTTT-C-C-T-CAA-C-ATTGTAAA---------CGCATTATTCCGTAAGTGTAAAATCGCA-ATTTAGTGCCTTT----TGAA-NNNNNN----NN-N---NN--------NCCCCAAAA-ATTTTCC-AAAC-C-CCA----TTTTTCTGTA--T-TT---TA-CCCC-CAA-AGAA--AACC-CTTTTCCGGGGGA-AAACC---TCCCCCT--G--T-AT-CAG---A--TTTTA-G-----A-A--T----G-T--T-GCC-TCGG-TA--TA-T-A-T--ATAC-T-CA-T-GTTATTCG-ACCC--GCTCTTT
gi|10 : a-TTA-TTC-CGTAA-G---TG-TAAAATC-G-CAATTTAG-T-GC--C----TTTT-G-A--A-GGA-AATT-GCGT-CGG-TA-T-A-TA-CT------C----ATCTT-ATT-T-CGA-C-C----------------CGCATC-T---------------GCTCA---TT-------TT----T--A-CAGTAT----TT-CCTTTT--------CCGCAAAAA-AAATTCCAAAGC-C-CCA----TTTTTCTGTA----TT---TA--CCC-CAA-AGAA--AACC-C-TTTCCGGGGGA-AAACC---TCCCCC----T-T-ATGCAG---A--TTTTA-G-----A-A--T----G-T--G-GCC-TCGG-TA--TA---A-----------CA-T-GTTATTCG-ACCC--GCTCT
gi|11 : gcaCAT-TTA-TTC-CGTAG-----TG--AAAATC-G-CAATTTAG-T-GCGCC----TTTT-G-A--A-GGA-AA-TTGCGT-CGG-TA-T-A-TA-CT------C-----TATT-A-T-TTCGA-C-C----------------CGCATC-TGC-------------TC----ATTT-------TT-------A-CAGTAT----TT-CC--TT--------TTCCCAAAA-AATCTCC-AAGC-C-CCA----TTTTTCTGT-----TT---TA-CCCC--AA-AGAA--AACC--TTTTCCGGGGGA-AAACC---T-CCCCT--GTAT-AT-CAG---A--TTTTA-G-----A-A--T----G-T--TGGCC-TCGG-TA--TA---------------CA-T-GTTATTCG-ACCC--G-TCT
gi|12 : aacgCAT-TTA-TTC--GTAT-A---TG---AAATC-G-CAATTT------C--CGCGATTTT-C-A--A-GGA-AA-T-GCGT-CGG-TA-G-A-TA--T------C----ATGTTTA-T-T-CGA-C-C----------------CGCA-----C-------------TCTCA----T-------TT----T--A-CAGGAT----TT-C---CT--------TCCCCAAAA-ATTT-CC-GAGC-CACCA----TTTTTCTGTA--T-TT------CCCC-AAA-AGAA--AA-C-CTTTTC--GGGGA-ATA-C---TCCCCCT--AT-A-AT-CTG---A--TTTTA-G-----A-A--T----GTT--T-GTC-TCGG-TA--TA---A-T--ATAC-TCCA-T-G-TA-TCG-A-CC--GCTCTT
gi|13 : g---TT--------CCCCCAAAA----TACC-AAGC-C-C-A----TTTA-CTGTA--T-TT---TA-TCCC-TAA-AGAA--AACC-CTTTTCGGGGGGATAAACG---TTCCCCCAAAG-T-A--CAG---A-----AA-G-----A-A--T----G-TACT-TCG-TCGGTTATTTA-T-A-T--ATAC-T-CC-T-GTTATTTG--CAC--GCCCT
gi|14 : tgcaattacgtatgttagaaataatgcattgatcatgtggctttattccgtttaaaagtgctatcttagcttag---TT--------CACCCAAAACATTT--C-ATGCTC-CCA----TTTTT-TGTA--T-TT---GA-CCCC--AA-AGAA--A--C-CCTCTCCGGGGAA-CAATC---CTCCCCT--TT-T-AT-CCA---A--CTTTA-G-----A-ATTT----G-T--C-GCA--CGA-T---TA-T-A-TTCATAC-T-CA-T--TTATTCG-ACCatg
gi|15 : gttggtatattctctgtattatgatttaattccttgtattcattatat---TC--------CCCCCAAAA-ATA--CC-AAAC-C-CCA----TTTTACTGTA--T-TT---TATCCCC-CAA-AGAA--AACC-CTTTTCCGGGGGATAAACT---TTCCCCCAAAG-T-AT--AG---A-----AA-G-----A-A--T----G-A--T-ACT-TCG
gi|16 : cgttgcaattacgtatgttagatcatgtggcttattccgttaaaagtactaatttagctagtCATCTTA-TTC-CGTAA-A---TG--AAAATC-G-CCATTTAC-T-GCT-C----TTTT-CCA--A-GGA-AA-T-GCGT-CGT-AA-T-ATTA-CT------C----ATG-T-A-T-T-CG--C-C----------------CGCATC--TC-------------TC----ATTT------------------CAGTATA---TC-C---TT--------CCCCCAATA-Atcggata
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gi|3 : catttaattgaatgaaaactgcccatttttagcttaaaattgtCAT-TTA-TTC-CGTAA-T---TG-TAAAATC-G-CAATTTAG-T-GC--CT---TTTT-G-A--A-GGA-AA-T-GCGT-CGG-TA-T-A-TA-CT------CATCAATATT-T-T-C-CAA-G-C----------------CCCAT--TTA-------------TCT---------------------------GTAT----TT-T---AC--------CCCCCAAA
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gi|3 : gcatttattccgtaattgtaaaatcgcaatttagtgcctttttgaaggaaatgcgtcggtatatactcatc-TA-T-A-TA-CT------C----ATGTT-A-T-T-CGA-C-C----------------CAC-TC-ATT-------------CCTTACATTT-------CA----T--A-CAGTccttacatttcatacagtnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnccctttatata
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gi|9 : t-TTA-TTT-CGTAA-----TG-TAAAATCCG-CAATT-AG-T-AC-------TTTT-A-A--A-GAA-AA-T-GCGT-CGGGTA-T-A-TA-CT------C----ATGTT-A-T-A-CG----C----------------CGC--T-TTC-------------TCTCA-ATCT-------TT-------A-CCATAT----TT-C---CT--------TCCCCAAAA--TTTTCC-GAGC-C-CCA----TTTTTCTGTA--TCTT---TA-CCCC-CAACAGCA--AACC-CTTTAC---GGGG-AAACC---TCCCCTT--A----AT-CTG---A--TTTTA-G-----A-A--T----G-T--T-GTC-TC-G-TC--TACT-A-T--ATAC-T-CA-TGGTTATCGA-ACCC--GC-CTTg
1 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|18 ): TTGGAGAAATTTAATTCACTGTGTTTGTACATTATTTAAA