lowQualScore : 1111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 11111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111
lowQualScore : 22 22222222 55555555555555555555555555555555555555555555555555 11111 111 11 1111 11 2222222222222 444444 333333333333 2222222222 11111111 66666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666 11111 11111 11111 222222222 11111 1111111 33333333333333333 11 77777777777777777777777777777777777 111111 11 11 77777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777 33333 111111 1 1111 111111111 1 111 111111111 111 111 111 2222222 1111111 11 1111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 33333 22222222222222 222 111111111 11111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 33333333333333333333 111 11111111 11111111111 555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555 1 111 7777777777777777777 4444444444444 1 111 1 111 1111111111111
lowQualScore : 4 4 55 66 55 3 00 3 3 444 11111111 44444444444444444444444444444444444444444444444444 555 5555 555 3 9999 3 44 66666 3 222 3 3 44 3 3 66 3 3 6 6 44 3 3 555 33 7777 11 2222222222222 777 3 999999 77 3 3 7777 333333333333 66 66 1111111111 11111111 3 99999999 55 88888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888 4 9999 777 55 1 8888 2 00000 55 4 4 4 999999999999999 4 00000 777 11111 555555555 55 11111 4 4444444 9999 4 55555555555555555 4 1 00 4 22 4 00000000000000000000000000000000000 555555 5 22 0 11 5 0 22222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 777 4 55 66 11111 8 3 111111 0 9 2222 6666 4 1 4 444444444 2 1 7 4 4 4 333 7777 55 0 555555555 000 44 2 3 7777 44 3 3 3 33 3 3 777 44 3 3 777 6 0 1111111 8888888 3 55 2 1 3 7777 55 77 9999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999 22222 4 55555555555555 4 4 222 6666 3 3 0 77 55 444444444 55555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555 33333333333333333333 3 3 3 55 111 3 4 4 11111111 7 3 1 77777777777 333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333 7 3 3 3 44 5 3 000 0 3 4 2222222222222222222 1 0 2 9 5 0000000000000 5 1 999999 0 999 3 8 0 0 3 0 3 444 6666666666666 6
lowQualScore : . . .. .. .. . .. . . ... ........ .................................................. ... .... ... . .... . .. ..... . ... . . .. . . .. . . . . .. . . ... .. .... .. ............. ... . ...... .. . . .... ............ .. .. .......... ........ . ........ .. ................................................................. . .... ... .. . .... . ..... .. . . . ............... . ..... ... ..... ......... .. ..... . ....... .... . ................. . . .. . .. . ................................... ...... . .. . .. . . ....................................................................... ... . .. .. ..... . . ...... . . .... .... . . . ......... . . . . . . ... .... .. . ......... ... .. . . .... .. . . . .. . . ... .. . . ... . . ....... ....... . .. . . . .... .. .. .............................................................................................. ..... . .............. . . ... .... . . . .. .. ......... .............................................................. .................... . . . .. ... . . . ........ . . . ........... ............................................................... . . . . .. . . ... . . . ................... . . . . . ............. . . ...... . ... . . . . . . . ... ............. .
lowQualScore : 7 0 55 77 00 6 99 6 6 999 22222222 33333333333333333333333333333333333333333333333333 888 1111 999 3 8888 3 66 88888 3 222 3 3 66 3 3 11 3 3 7 2 22 1 1 444 11 8888 22 5555555555555 000 1 555555 99 3 3 7777 000000000000 99 99 7777777777 44444444 6 33333333 00 77777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777 0 3333 444 55 5 5555 3 00000 55 0 0 0 222222222222222 0 00000 000 11111 222222222 11 11111 4 4444444 4444 4 88888888888888888 4 1 66 4 88 1 11111111111111111111111111111111111 666666 7 11 7 66 7 5 88888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888 111 0 55 33 66666 9 9 222222 1 8 3333 5555 0 5 0 555555555 5 3 8 0 0 0 666 7777 00 5 444444444 999 66 7 3 1111 66 3 3 3 88 3 3 999 66 3 3 000 7 1 7777777 8888888 3 77 6 3 3 1111 33 99 9999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999 88888 4 00000000000000 0 0 444 1111 6 6 5 77 00 555555555 55555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555 99999999999999999999 6 9 6 00 444 6 0 0 77777777 7 6 4 00000000000 777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777 3 6 6 3 66 0 6 222 2 6 0 6666666666666666666 1 7 4 8 1 4444444444444 0 2 888888 8 222 0 0 6 8 2 8 2 555 3333333333333 7
consensus : CCGGGAGGAATTC-CCA--CT-AGCATGG--CA-A-GTGCGA-G-GTA-T-CAG--------CAGA-----------------A-------TCT-C-A-GA----GAGC--T----TCC---GA-A--T-G-C-T--A-GGTTCC-A--C---C-A-TAT--A-A-TCT--GCCAA-C-TT-C-C-TA-TC-GA--AGTGG-GGAG-GGC---AT-AAGGCT--ACGGA-NATG-GT----------GTG--GAC-ACATA--TATC--TTCTGA-GG-CA----A-CATCG-CCCC-AG--CCT--C---------GTCCTGGG---ANT--CC-G--C-----TCTGCC--AA-AA---GT--------C-GTC-NT--AT---CCCCTC-CCC----CC---C---A-C--------GGAGA-G-AA-TGCTA-TG--CCCC----AGGTCT-----AA--T-TT-TGC-CTT-A-CA---TTC---TCG-C-----AG---GAA-----GT---C-----TA-TA-----CCA-AG-------C----AA-CATGGAG--T-C----CTT-C--AAGG-GAGCCACA--TACAGG-TTCAGC----T---A-T--TG---TACN----TTC-----ACCCCCA--CT-TGGATG-GGGAATGGGCCCGCAATA-AATCCAC----T-CA-N-T-C--CC---CA-G--TA--TG--CTNA-------TTTCTG--CC------CT-AG----TAT-C-CAC-C--A-CGGCCTC-TGC-ACGTA-----GGTCCTGAACCCGTAATTGC---ACTGTA--TA-TCTCGT-TG---AGTG--CCTCACCTGGCCAGT-GGTGA-TG-CA---CC----G--ATCGCCTTCCCC-TGG----AATC-TCTATCTC--TGG-G----GCA--T-CCTC-CCCG-AG-C-CCA-CCC-ATCCCTGG--TTTC-T-CGG--G-TCCAC-------TCC-------CTG-GG-CGATCAAGCTCC-A----GCTC-AA--CC--------TN-------C--GGG------CTGC------TA-CCAG-CN----------TACCACGATC--C-G--ATCC-TC-TCT--TCTCTACTGTCCTC--G-GAAAAGGTGGG-----------TGCCTTAA-AA-CGCACGCGC-C--T-GTAC-TTCCTCCGGC-GCCCT--GGTTTC---------ACG-------------------T-------------------G-----------------TC---CTGGGTGTCTG-------------------GT-CTTGG-G--TTG---TATG-ACCAT-CT-GCCT------C-TGCGCCTC-CAGG----------AGACA------AT-CA----CAGTCT--TCC-AA----GA--G---CACGCCA-T-GA----T-----TCT-TGGC-AGC-GAGAAGG-C--TTCTCCTGAC-TAGTGGGCTCCCTGTA-GGTA-TCAAAC-CTATCATTGGCTCCAGACGATGGCATAGAACCACCCTTAAATTCA-AC-TTGGG-CTTTAGAGCGACGCNGGGGCTGGCGGTCGTTCCTAGTAGAAG--NTGCCGTCA-GCTCCTTGTGCGCCTCCTGACTTATGGTNCCAGGGCACTCC--GTACGGAAA--TT---C---CCGG-CTTTGCCGCACCTAAAAC
Reference ( gi|1 ) : CCGAGAGAAATTC-CCA--CT-GGCATGG--CA-A-TTGCGA-G-GTA-T-CAG--------CAGA-----------------A-------CCT-A-A-GA----GAGC--C----TCC---GA-A--T-G-C-T--A-GGTTCC-A--C---T-A-TAC--A-A-TCT--GCCAA-C-TC-C-C-TA-TC-GA--AGTGG-GGAG-GGC---AA-AAGGGT--ACGGA-AATG-TT----------GTG--GAC-ACATAATTATC--TTCTGA-GG-CA----A-TATCA-CTC--AG--CCT--C---------GTCCTGGG---ATT--CC-G--C-----TCTGCC--AA-AC---GT--------C-ATC-AT--AT---CTTCTC-GCC----CC---C---A-T--------GGAGA-G-AG-TGCCA-TG--CTCC----AGGTCT-----AA--T-TT-TGC-CTT-A-CA---TCC---CCG-C-----AG---GAA-----GT---T-----TA-CA-----CCA-AG-------C----AA-CATGGAA--T-A----CGT-C--AAGG-GAGCCACA--TACAGG-TCCAAC----T---A-T--TG---GATT----TTC-----TCCCCCA--TT-TGGATG-GAGAATGGGCCCACAATA-AATCCAC----T-GA-G-T-C--CC---CA-G--TG--TG--GTAA-------TTTCTG--TC------AT-AG----TAT-C-CAC-C--A-CGGTATC-TGC-AGGTA-----GGTCCTGAACCCGTGATTGC---ACTGCA--TA-TCTCGT-TG---AATG--CCTCATCTGACCAGT-GGTGA-TG-CA---CC----G--ATCACCTTCCCT-TGG----AATC-TTTATCTC--TAG-G----GCA--T-CCTC-CCCG-AG-C-CCA-CTT-ATCCCTGG--TTTC-T-CGA--G-TCCAC-------TCC-------CTG-GG-TGATTAAACTTC-A----GCTC-AA--CC--------GG-------C--GGG------CTAC------TA-CCAG-CA----------TAACACGTTC--CCG--ATCC-TC-TCTAGTCTCCACTGTC--C--G-GAAAAGGTGGG-----------TACCTTAA-AA-CGCACAAGC-C--T-GTAC-TTCCTCCGGT-GCCCT--GGTTTC---------ACG-------------------T-------------------G-----------------TT---CTGGGTGTCTA-------------------GT-CTCGG-G--TTG---TATG-ACCAT-CT-GCCT------C-TGCGCTTC-CAGG----------AGACA------AT--A----CAGTTT--T---------AA--G---CATGCC-----A----T-----TCT-TGGC-AGC-GAGAAGG-C--TTCTCCTCAC-TAGTGAGCTCTCTGTA-GGTA-TCAGAC-CTATTATTGGCTCCAGACGATGACACAGAACCACTCTTAAATCCAGAC-TTGGGACTTTAGAGCGACGCTGGGGCTGGTGGTCATTCCTAGTAGAAG--CTGCTGTCA-GCTCCTTGTTTGCCTCCTGACTTATGGTGCCAGGGCACTCC--ATACGGAAA--TT---C---CAAG-CTTTGCTGCACTTAAAAC
gi|21 : CCGGGGGA--TTT-CCA--CA-AGCATGA--CA-A-GTGCGA-G-GTA-T-CAG--------CAGA-----------------A-------TCT-C-A-GA----GAGC--TTAAATCT---GA-A--T-G-C-T--A-GGTTCC-A--C---C-A-TAT--A-A-TCT--GTCAA-T-TT-C-C-T---------AGTGG-GGAG-GAC---AT-AAGACT--ACGGA-AATG-GT----------GTG--GAC-ATA----TATT--TTCTGA-GG-CA----A-
gi|22 : CCGAGAAGAATTC-CAA--CT-AGCATGG--AA-A-GTGCGA-G-GCA-T-CAG--------CAGA-----------------A-------TAT-C-A-GA----GAGT--C----TCC---GA-A--T-G-C-T--A-AATTAT-A--C---C-A-TAC--A-A-TCT--G----------T-C-TG-TC-GA--AGTGG-GGAG-GAC---AC-AAGGCA--ACGGA-AATG-GC----------GCT--GAC-AC----TTATC--TTCTGA-GG-CA----
gi|18 : CCGAGAGGAATTT-CCA--CT-AGCATGA--CA-A-GTGCGG-G-GTA-T-CAGCAGATTCTCAGAGTNNNNNNNNNNNNNNNN-------NNN-N-N-NN----NNNN--N----NNN---NN-N--N-N-N-T--A-GGTTCC-A--C---C-A-TAT--A-A-TCT--GCCAA-C-TT-C-C-TG-TC-GA--AGTGG-GGAG-AAC---AT-AAGGCT--ACGAA-TATG-GT----------GTG--GAC-AC------ATC--TTCTGA-GG-C
gi|2 : CGA-AGGAATTC-CAA--CA-AGCATGG--AA-A-GTGCGA-G-GCA-T-CAGC-------CAGA-----------------AT------CCT-C-A-GA----GAGC--C----TCC---AA-AATT-GCC-T--A-GGTTCC-A--C---TCA-TACCAA-A-TCT--GCCAA-T-TC-CTC-TA-TC-GA--AGTGA-GCAG-GGCAATAA-AAGGCA--ACGGA-AAGA-AC----------GCT--GATAACATAATCATC--T
gi|12 : attCGGGAAGAATTT-CCA--CT-AGCATGA--CA-A-GTGCAA-G-GTG-T-CAG--------CAGA-----------------A-------TCT-C-A-GA----GAGC--T----TCC---GA-A--T-G-C-T--A-GGTTCC-A--C---C-A-TAT--A-A-TCT--GCTAA-C-TT-C-C-TA-TC-AA--AGTGG-AGAG-GGC---AT-AAGGCT--ATGGA-CATG-GT----------GTA--GAC-ATATA----TC--TTCTGA-GA-CA----A-CATCG-CCCC-AG--CCT--C---------GTCCTGGG---AGT--CC-G--C-----TCTGCC--AA-AA---GT--------A-GCC-TT--AT---CCCCCC-CCC----CC---C-----TCCCCTCCCGGAGA-G-AA-TGCTT-TG--CCCC----AGATCT-----AA--T-TT-TGC-CTT-A-CA---TTC---TCG-C-----AT---GAT-----GT---A-----TA-TA-----CCA-AG-------C----AA-CATGGAG--T-C----CTT-C--AAGG-GAGCCACA--TACAGA-TTCAGC----T---A-T--TG---TACA----TTC-----ACCCCCA--CT-TGGATG-GGGAATGGGCCCGCAATA-AATCCTC----T-TA-T-T-C--TC---AA-G--TA--TG--CTTA-------TTTCTG--CC------CT-AG----TAT-A-CAC-C--gaaacgctctgacaaaggtcgtctgtatcttctctcctccacggagagagtgccttgctcaaggtctaattccgccttacatcctcgcaggaagtctacaccaagcaacatttagtccttaaaaccacatgcatgtccactcagatccccagcatgctcatttctgtcccagcatacaccacggtctttgcaggtaggttctgaacccataactgctagatgcatatccatttaatggcctcacctggccagtcgtgatgcacaaatcacctcccccctatgatctgtatatctggggcatcctcctcgggcccacccatccctgatttcttgggtccactcccgaatccctggacgatcaaactccagcttaacctccgggctactaccatgatccatatcctctccactgtcctcgaaaaaggaggatgccttaaaatgcatgcgcctgtacttcctccggcaccctagtatcacgcaggaatgtttcttttccctgttctgggtatctggtcttgaggtgtatgaccatttgcctctgcgcctctaggagacattgcacagttgttcttggtaacgagaagatttctcctgaccagtgggctctctgtaggtatcaaatctatcattggctccagaccagggcacagaatcacctttgaaccttggtactttggagcgacgctggggctggtttcctagtagaagctgctgtcagctctttgttttcccctgacttatggtaccagggcat
gi|5 : GGGAGAA--TT-CCA--CA-AGCATGA--CA-A-GT-CGA-GTGTA-T-CAG--------CAGA-----------------A-------TCC-A---GA----G-GT--TAAA-TCT---GATA--T---C-T--T-G--TCC-ATTC---C-A-TAT--A-A-TCT---CCAA-C-TT-C-C-TA---------GTGG-GGAG-GAC---AT-AAGC-T--ACGGA---TA-TT----------GTA------ACATA---------TCTCG-AG-CA----A-C-TCG-CCC--AG--CTT--C----------TCCTTAG---AGC--CC----------TCTGCC--AATAA---GT--------A-GTC-TT--AT---CCTC-----C----CC---C-----T--------GGAG-------TGC-A-TC--CCTC----AAGTCT-----AG--T-TT-TGC-TTT-A-CG---TTC---TT--C-----TG---GAA-----GT---T-----TAATA-----CCA--G-------C----AA-CATGGAG--C-C----CTT-C--AAGG-GAGCCACA--TACAGG-TTCAGC----T---AGT--TA---CATT-------------ACCCCA--CT---GATGTGGGAATGG-CCCGCAATA-AAACCAC----C--A-G-T-C--CC----A-G--TA--TC---TAA-------TGTCTG--CC------CT-AG----TAT-C-CAC-C--A-AGG---C-TTC-ACGTA-------TCCTGAACCTGTAATTGA---ACTG-A--TA-TCTCAT-TG---AAGG--TCTCACCT--CCAGT-GATGA-TG-CA---CC----G--ATTGCTTCCCCT---G----AATC-TCTATCTC--TAG-G----CGA--T-CATC-CCGT-AC-C-GCA-CTC-ATTCC-GG--TTTC-TGCG---G-TTCAC-------TTC-------TTG-G----ATTAAGCT-C-A----GCTT-AAA-CC--------TC-------T--AAG------CTGC------TA-CCAGTCC----------TACCACATAT--CCG--ATTCATA-TCT--TCTCTACTGTC--CTCG-AAAAATGTG-------------TGCCTTAATAA-CGCACATGT-C--T-GTAC-TTC-TCCG-C-GCCCT--G--TTC---------ACG-------------------T-------------------G-----------------TC---TTGGGTGTCTG-------------------GT-CTTGAAG--TT----TATG-ACCAT-CT-GCCT------C-TGCGC--C-CA-G----------AGACAT-----AC--A----CAATCT--TCCAA-----GA--G---CACGCC-----A----TGTGGATCTGTGGC-AGC-GAGAA-G-C--TTTTCCTGAC-TAATG-GTTCATTGTA--GTA-TC-------------------AGACGATTACATAAAATCACCCTTGAATTCA
gi|3 : gGAGATAT---CCA--CT-AGCATGA--CA-A-GTGGCA-G-GTG---CA---------CAGA-----------------AG------TCC-A-A-GA-----AGC--T----TCC---GA-A--TAG-C-TTAA-GGTTCA-A--C---C-A-TAT--ATA-TCTTGGCTAA-C-TT-C-C-TA-TC-AA--AGTGG-AGAG-GGT---AA---GGAT--GC-----ATGGTT----------ATG---AC-ATATA--TATC--TTCT-A-GA-CA----A-CATCG-CCC--AG--CCT--C----------TGCTGGG---AGT--CC-G--C-----TTTGGC--AA-AA---GT--------A-A-C-TT--AC---CCCCTC-CCC----CC---C-----TCCCTCCC-GGAGA-G-AA-TGCTT-TG--CCCG----AGATCT-----AA--T-TT-TGCGCTT-AACA---TTC---TCG-C-----AT---G--------T---C-----TG-TATAATGCCA-AG-------C----AA-CATGGAG--C-C----TGTTC--AAGG-GAGCCACA--TACAGA-TC-AGCG---T---A-T--TGTACGATT-------------CACCCA--CT---GATG-GCGAATGGGCCCGCAATA-AATCCTC----T-TA-T-T-T--CT---CAAG--TGACTG--CTTA-------TTTCTG--CCTACCT-AC-AAGTA-TAT-C-CAC-C--A-CGGC-TCGTGCTACG-A-----GGTCCTGACCCCGTAATTGC---ACTGTA--TA--CTCGT-TG---GGTGTCCCTGACCTGGCCATT-GGTGA-TG-CAG--GC----G--ATCGCCTTCCCC-TTG----AATC-TCTATTTC--TGG-GAAAAACA--T-CCTC-CCTG-AGCC-CCA-CTC-ATCCCTGG--TTTCTT-CGG--GTTTCAC-------TCC-------TTGTGGTTGATTAAGCTTTAA----GCT--AA--TC---------T-------CTAAAG------CTGC------TATCCAG-CC----------TACCACAATCGTCCAATATCC-TC-TCTA---TCTGTTCCT--C--G-GAAAAGGTGGG-----------TGC--TAA-AA-CGCA-ACGC-C--TGGTAC-TTCCTCCGGC-GCCCT---GTTTC---------ACG-------------------T-------------------G------------------T---CTGGGTGTCT---------------------------G-G--TCG---TATG-GACTT-GT-GCCT----------TGCCTC-CA-G----------CGACA------AT--ACATGCAGTCT--TCCCAAG---GA--G---CAAGCC-----AG---TTGA--TCTGTGAC-AGCGGAGATGG-C--T--TTCTGAC-TAATTGTTTCCCTGTA-GATA-TC-------------------AGACGATGACATAG-ATCACCATTAAATCCAacccatcttgctacacttaatacaaat
gi|6 : AGGACTTC-CCA--CTAGGCATGG--AA-AAGTGCGACG-GT----C-G--------CAGA-----------------A-------TTT-ATA--------AGC--T----TCC---CA-A--A-G-C-T--A-GGTTCC-A--C---C-T-TAC--A-AGTCT--GTCAA-C-TC-C-C-TA-TC-GAAGAGTGACGGAG-GGC---AT-AGAGCTTAATGGA-AATG-GC----------GCGCTGAC-ACA-----ATA--CTCTGATGG-CA----A-CA-AA-CCCCGAG---CT--C---------CTCCTAGG---ATT---C-G--T-----TCAGCC--AA-AG---GT--------C-GTC--T--GTTTGCTTTCC-ACT----CCTT-C---A-A--------TGAGATG-AGTTGTCA-TG--CTCG----AGTCTT-----AA--T-AT-T-C-GTT----A---TCT---CTG-G-----AG---G
gi|8 : aAATTTCTCCA--CT-AACATAGACCA-A-GTGC-A-C-GTA-T-GAT--------CAAA-----------------AAAATCATCAT-A-G-TATATTGAGC--T----TTC---GG----T-G-C-TT-A-GGTTCCGA--CAA-T-A-TAT--A-A-TCT--GCTAA-C-TT-C-CATACTCTGA--CGTGG-GGAGTGGT---TA-A-GGTT--ACGGATCATG-GT----------GTG------ACATTACTATCC-TTCTGA-GA-CA----AACATCG-CCCCCAG--CCTTCC---------GTCCTGGGCACGTC--CCCG--CCCCCTTCTGCCCAAA-GCTTAGT--------CCATT-AG--TC---CTCCTC-CCCACCTCC---C---A-C--------TG-GA-G-AG-TGCTA-TG--CCCCTCGAGGGTCT-----AAAATGCT-CGC-CTTTA-CA---TAT---CTG-C-----AGCTAGAGCACGGGTATGC-----TA-CA-----A-A-AG-------CTCCCAA-CATG--A--T-CTTTTCGT----AAAG-GAGC-ACAA-TACAGG-TTCAGC----TGATA-TAATG-----TTACCATTT-----ACCTCCA--CTGTGGAT------------------TATAATCCAC----T-CA-T-TTC--CC---CA-G--TA--TG--CTGAGA-----TTTCTGCGTC------CT-AG----TATTC-CACTC--A-TGGC-TCATAC-AGATATACGAAGTCCTGACCCCGTAAGTGCC--ACTGTA--TA-T-TCGTGCG---GGTT--CCTCATC-GGCTAGTCGGTGG-TG-CAAAGCG----A--ATCGCCTTTTCC-CGGTGGCAATCATCTAT-TCGGTAG-T-----CAGTT-CCTCGCCCGGAG-C-CCACCTC-AT-CCTGGGTTTTC-T-CGGTTGTTTCAC-------TCC-------TT---G-TGGTAAAGCTTT-A----GCT--AA--CC--------catcctcccgacccaccatccatggtttctcgggtccactccgaatatctggatgatcaaactccagctaattccggggctgcaccaccaagccatatcctctctactgtcctcgaaatggttgaataaaatccattaccttaacatgcagcgcggtgtacttcccgtacctgttccacataggaacgtttcttttcctttctggttactttctggttgaatatgacaatctagcctcgtgccctctaggagacatacaacagtctttcgaagagcacccttgttcttggcaacaagaaagacttctcctgacatagtgggctctctgtaggtatcaaacctaccattgatcagacccagcatagaactaccctacattaaaccttggatttagaggacgcagggctgacggtcgttcctagagatggtttggcgtaaggatcctggtgcgaatctgacttatgggcccagcgactccgagtacggaaaatttcctagactttgccccacctacaa
gi|7 : TC-CCAGTCT-GGCATGG--GACA-GTGCGA-G-GAA-TTCAGGAA-----CAGA-----------------A-------TCTTC-A-GAC---GAGCGGT----TCCTGGGA-A--T-G-C-T--G-CGT-AC-A--CAGAT-AATA---A-A-TCT--GCTAAAC-TCTC-C-TAATCTGT--AAAGG-GTCG-GAA---AG-AGGGGT--AATAA-AATG-TTACTGACTGGTGTG--GAC-ATATA--TACCCCTTCGGA-GATCA----A-G--CA-ATCG-AG--CTT--CCACATGCTAGTCTGGGG---GTTGGCC-GGCC-----TCTGCC--AA-GA---GTAGGTTACCC-ATT-AT---T---CTTCTT-CCT----CCTCTC---G-C--------GGCGA-GGAA-TGCTAATAAACTTA----AAATCTTACATAG--C-TTATGC-TTC-A-AACTGTTCGCACTG-CGAGCAAG---GAA-----GT---A-----TG-TA-----CCA-AGTCTTCACC----AGTCATGGAG--TTA----CCT-TCAAAGG-GAGG-ACAAGTACAGGGTTCAGCCTAGT---A-A--TG---GACA----ATCAGTCATCCCCCAACTT-CGAAAG-GA-AATGGGACGGCATTA-AATCCACGCACT-CA-A-T-T--TCTCGCA-GAATGATTGACGTAAACTAAAGTTTCTG--GCCCTGAAAT-AGGGGCTAT-T-CCC-CTCA-CGGGGCG-CGCCACGTA-----GGTCCCGG----GTAATTGC---GCTGTA--TA-TTTCGT-TG---G-TG--TCT-A-CTGGCCAGT-GGTGA-TGTCA---GC----G--GATGCCTTCCCC-TGG----AATC-TCTATCTC--TAG-G----GCA--T--CTT-CCCG-AG-C-CCA-CTC-ATCCCTGG--TTTC-T-CG---G-TTCAC-------GTC-------CTG-GG-TGAGTAAGCTTC-A----GCTT-AA--CC--------TGAAACCTCT--AAG------CTGC------TA-CCAG-Ctctaagcttgtctacccaggtacctaccactaattccgatc
gi|4 : atccggggaggcaatattcaT-AGCATGA--CA-A---GCGA-G-GTAAT-AAG--------CAGA-----------------A-------T-T-C-A-GA----TAG--------TTC---GG-G--T---C-T----GGTTC--------------A---A-A-TTT---TTAA-C-TT-C-C-TA-TC-GA---GTGG-GAAG---C---ATTAAGGTT--ACGGA-CATG-T-----------GTA--AA--ATAT-----TC--TTCTGA-GA-CAGAGCA-T-TCG-CCC--AGGCTCT--C---------GTCCTGTGC--GTG--CC-G--C-----TCAGCC--AA------GT--------A-ATC-TTTTAT---CCCCCC--CC----CT---C---ACT--------AGAGA-A-----GCTA-TG--CCAC----AG--CT-----A---T-TT-T-C-CTT----------T---TCGAC-----AG---AAA-----GT---TGTACCTA-CA-----CTGTAG-------C----AA-CATGGAG--T-C----CTT-T--AAGGTGAGCCATA--TA-AGT-TC--AC----T---A-T--TG---TACA----TTC--------CCCA--CT-TGGAGG-GA-ACTGGGCCCGCAATA-AATCCAC----TCGATG-TGCGGCC---TATG--TA--TG--CTAA-------TTTCTC--CC-------T-AG----TAT-GACAC-C--ATCGGTCCT-TGT-ACGT-------GTCCTGG-CCCGT-ATTG----ATTATAGATACTCTCGT-TGTTTGGTG--TCT-A-CTGGCCAGT-GGTGAATG-CG---CCTCTTGTTATCGCCTTCCCT--GG----AATC-TCTATCTC--CTC-A----GCA--T-CTTC-CGCG-AG-C-CCA-CCTCATCC-TGG--TTTC-T-CGG--G-TTCAC-------TCC--------TG-GG-TGAGTAG-CTTT-ACTAAGCTCTAA-------------G-------C--G-----------C------TA-CCAG-CC----------TACCACAATC--C-G--ATTC-AT-TCC--TCTCTAATGTT--CTCG-GAA--TGCGGC-----------TGCCTTAA-AAACGCAT--GC-T--T---ACGTTCCTCCGGTCGCCCT--GGTTTT---------------------------------------------------------------------------TGGTTGTC------------------------CTTGG-G--TTGATGTATGGACCATGCT-GC-T------C-TTTGCTTCTCAGGGCTTTTTCCTAGG-A------AC--A----CA---T--T---------AT--G----ATTCC----------T-----TC---GGCGAGC-GAGAAGG-CAGTTTTCCTGA--TATTGTTCACCCTGTACGGTATTCAGAct
gi|23 : aggatttcaG--------CAGA-----------------T-------TCT-C-ACGA----GTGC--T----TCC---GA-A--T-G-CAT--ATGGTTCC-A--C---C-A-TAT--A-A-TCT--GCCAA-CTTT-C-C-TG-TC-GA--AGTGG-GGAG-AAC---AT-AAGGCTAAACGAA-TATG-GT----------GTG--GAC-AC------ATC--TTCTGA-GG-CA----A-Tgatcgacatagaatatttggcccttgaagtgtgcagtgatagctttttttgcttcatttatacaaa
gi|27 : -GA--AGTGG-GTAG-GGC---AT-AAAGCT--ACGGA-TATG-GT----------GTG--GAC-A
gi|26 : tTGA-GG-CA----A-CAAAATCCC--AG--CCT--T---------GTCCTGGG---ATT--CC-G--T-----TCTGCC--AA-A
gi|11 : ---------GTCCTGGG---AGT--CC-G--C-----TCTGCC--AA-AA---GT--------T-ATC-GT--AT---CTTCTC-TCC----CC---CTCCC-T--------GGA-A-G-AA-TGCCA--G--CCCC----AGGTCT-----AA--A-TT-TGC-CTG-A-CA---TTC---TCG-C-----AG---GAA-----GT---C-----TA-TA-----CCA-AG-------C----AA-CATGGAAGGT-C----CTT-C--AAGG-GA-CCACA--TACAGG-TTCAGC----T---A-T---G---TACA----TTC-----ATCTCCA--CT-TGGATG-GGGAATGGGCC-GCAATA---------------A-A-T-C--CA---C--------------------------------TC------AT---------T-C-C-C-C--A---GTAT---GC-ACGCA-----GGCCCTGATCCCGTAATTGC---ACTGAA--TA-TCTCGT-TG---AGTG--TCTCACCTGGCTAGT-GGTGA-TG-CA---CC----G--ATCGCCTTCCCC-TGG----AATA-TCTATCTC--TAG-G----GCA--T-CCTC-CCCG-AG-T-CCA-CTC-ATTCCCAG--TTTC-T-CGG--G-TTTAC-------TCC-------TTG-GG-TGATTAAGCTTC-A----GCTA-AA--CC--------a
gi|19 : G---AGT--CC-G--C-----TCTGCC--AA-AA---GT--------A-GTC-TT--AT---C----CAGCA----C----------T--------GGAGA-G-AA-TGTTA-TG--TCCC----AGGTCT-----AA--T-TT-TGC-CTA-A-CA---TTC---TCG-C-----AG---GAA-----GT---A-----TG-TA-----CCA-AG-------C----AA-CATTGAG--T-C----CTT-C--AAGG-GAGCCACG--TACAGG-TGCAGC----T---A-T--TG---tctactgaaacttgggaagattccacaataggtaccagtaggtactagcttaccacaatccgatc
gi|2 : C-G--C-----TCTGAC--AA-AG---GT--------C-GTCTGT--AT---CTTCTC-TCC----TC---C---A-C--------GGAGA-G-AG-TGCCT-TG--CTCA----AGGTCT-----AA--T-TC-CGC-CTT-A-CA---TCC---TCG-C-----AG---GAA-----GT---C-----TA-CA-----CCA-AG-------C----AA-CATTTAG--T------CCT-T--AA----AACCACA--TGCATG-TCCAtacaccccctggcgacaatacagtcttccta
gi|2 : attcgaaggaattccaacaagcatggaaagtgcgaggcatcagccagaatcctcagagagcctccaaaattgcctaggttccactcataccaaatctgccaattcctctatcgaagtgagcagggcaataaaaggcaacggaaagaacgctgataacataatcatctgaaaTCCAC----T-CA-GAT-C--CC---CA-G--CA--TG--CTCA-------TTTCTG--TC------CC-AG----CAT-A-CAC-C--A-CGGTCTT-TGC-AGGTA-----GGTTCTGAACCCATAACTGCTAGA-TGCA--TA-TC-CAT-TT---AATGG-CCTCACCTGGCCAGT-CGTGA-TG-CA---CA----A--ATCACCTCCCCCCTAT----GATC-TGTATATC--TGG-G----GCA--T-CCTC-CTCG-GG-C-CCA-CCC-ATCCCTGA--TTTC-T-TGG--G-TCCACTCCCGAATCC-------CTG-GA-CGATCAAACTCC-A----GCTT-AA--CC--------TC-------C--GGG------CTAC------TA-C----CA----------TGA-----TC--CAT--ATCC---------TCTCCACTGTCCTC--G-AAAAAGGAGGA-----------TGCCTTAA-AA-TGCATGCGC-C--T-GTAC-TTCCTCCGGC-ACCCT--AGTATC---------ACGCAGGAATGTTTCTTTTCCCT-------------------G-----------------TT---CTGGGTATCTG-------------------GT-CTTGA-G--GTG---TATG-ACCAT-TT-GCCT------C-TGCGCCTC-TAGG----------AGACA------TTGCA----CAGTT--------------------------------G----T-----TCT-TGGT-AAC-GAGAAGA-T--TTCTCCTGAC-CAGTGGGCTCTCTGTA-GGTA-TCAAAT-CTATCATTGGCTCCAGACCAGGGCACAGAATCACCTTTGAAC-----C-TTGGTACTTTGGAGCGACGCTGGGGCTGGT-----TTCCTAGTAGAAG--CTGCTGTCA-GCTCTTTGTTTTCC-CCTGACTTATGGTACCAGGGCActcagatccccagcatgctcatttctgtcccagcatacaccacggtctttgcaggtaggttctgaacccataactgctagatgcatatccatttaatggcctcacctggccagtcgtgatgcacaaatcacctcccccctatgatctgtatatctggggcatcctcctcgggcccacccatccctgatttcttgggtccactcccgaatccctggacgatcaaactccagcttaacctccgggctactaccatgatccatatcctctccactgtcctcgaaaaaggaggatgccttaaaatgcatgcgcctgtacttcctccggcaccctagtatcacgcaggaatgtttcttttccctgttctgggtatctggtcttgaggtgtatgaccatttgcctctgcgcctctaggagacattgcacagttgttcttggtaacgagaagatttctcctgaccagtgggctctctgtaggtatcaaatctatcattggctccagaccagggcacagaatcacctttgaaccttggtactttggagcgacgctggggctggtttcctagtagaagctgctgtcagctctttgttttcccctgacttatggtaccagggcat
gi|9 : attcgaaggaattccaacaagcatggaaagtgcgaggcatcagccagaatcctcagagagcctccaaaattgcctaggttccactcataccaaatctgccaattcctctatcgaagtgagcagggcaataaaaggcaacggaaagaacgctgataacataatcatctgaaacgctctgacaaaggtcgtctgtatcttctctcctccacggagagagtgccttgctcaaggtctaattccgccttacatcctcgcaggaagtctacaccaagcaacatttagtccttaaaaccacatgcatg-C--CC---CA-G--CA--CG--CTCA-------TTTCT---CC------ACCAG----TAT-C-CAC-C--A-CGGTCTC-TGC-AGGTA-----GGTCCTCAACCCA-AATTAT---TCTGCG--TA-TCAGTT-TG---AGAG--ACTCACCTGCGCAGT-GGTGA-TG-CA---CT----G--ATCGCCTTCCCC-TAT----AATC---TATCTC--TGG-G----GCA--C-CCGC-CCCG-AG-CACCC-CCC-CTCCCTGA---TTC-T-CTG--G-TCCACTCGCGATTCC-------CTA-TG-CGATCAAACCCC-A----GTTC-AA--CC--------CC-------C--AGG------CTGC------TA-C-------------------CACGATC--CAT--ATCC-TC-TCTt
gi|10 : aaTCTG--CC------CC-AG----TAT-C-CAC-C--A-TGGCCTA-TGC-AGGTA-----GTTTCTTAACCCGTA----C---GCTGTG--TA-TCCCAT-TG---AGGG--CCTCACCTGGCCAGT-GGTGA-TG-CAC--CC----A--ATCACCTTCCCC-TGG------------------------------------TTC-CTCG-GG-T-CCA-CT---CCCCTG--------------------AT-------TCT-------TTG-GG-CGATCAAACTCC-A----GCCC-AA--CC--------TC-------C--GGG------CTGC------TA-C----TG----------TAATCCGT---------ATCC-TC-CCT-------ACTGTCCTC--G-GAAAAGGTTGG-----------CTCCTTAA-AA-CGCACAAGC-T--T-GCAC-TTCCTCTGGG-GCCCT--GATTTC---------ATGTAGGAACGTTTCTTCCC--T-------------------G-----------------TC---CTGGGTGTCCG-------------------GTCCTTGG-GCTTTG---TTTG-ACCAT-CT-GCCT------C-TGCACCTC-CAGG----------GAACA------ATACA----CAGATTCCT---------AAGGG---AACACCAGTGGA----T-----TAT-TGGC-AGT--AGAAGG-C--TTCTCCTGAC-TAGTGGA--CTCTGTA-GGTA-TCAAACTCTATCACTGGCTCCAGACGATGACATAGAACAACCCTT-----CAACC-TTAGG-CTTTAGA-----ACTAAGGCTGGCGGTCGCTCGTAGTAGAAT--ATACCGTCA-GCTCCTTATACGCCTCCTGACTTCTGTCGCC--GGCACTCT--CTACAGTAA--TG---C---CAAG-CTTTGCCGCATTTTAAACnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnacaggtttctcctgactagtgggctctctgtaagtatcaaacccattattggctccagacgagggcatagaaccatccttcaattcaacctttagagcgacacaggagctggcggtagttccttgtagaaggtgccgtcagctccttgtgtgcctcctgacttatggtgccagggtactccatacggaaatccccggctttgccgcacctaaaacaag
gi|14 : gttcaccGCG--TA-TCCCTT-TG---ATAG--CCTCACCTGGCCAAT-GGTGA-TG-CA---CC----G--TTCACCTCCCCC-TAT----AATC-TGTATCTC--TGG-G----GCA--T-CCTC-CGCA-AG-C-CCA-C-C-ATCCCTGC--TTTT-T-CGG--G-TCGAC-------TCCCGAATCACTG-GA-CGATCAAACTCC-A----GCTT-AA--CC--------TT-------C--GAA------CTGC------TA-C-------------------CACGATT--CAT--ATCC-TT-TCT-------ACTGTCCTC--G-GAAAAGGTGAA-----------TGCCTTAA-AA-TGCACGCGC-G--T-GTAC-TTCTTACAGC-ACCCT--GGTTTTTAAGTAGGAACG-------------------TTTCTTTTCCCC--------G-----------------TT---CTGGGTGTCTG-------------------Gatg
gi|25 : A---CC----G--ATCACCTCCCCC-TAT----AATC-TGTATCT----GG-G----GCA--TGCCTC-CAGG-A--C-CCA-CC--ATCCCTGG--TTTC-T-CGG--G-TCCAC-------TTC-------C
gi|6 : tgcatgcgtttctTC-GTTATCTC--TGGAG----GCA--T-CCTC-CC-G-A--C-CCA-CC--ATCCATGG--TTTC-T-CGG--G-TCCAC-------TCCGAATAT-CTG-GA-TGATCAAACTCC-A----GCT--AATTCC--------GG-----------GG------CTGC-------A-CCAC-CA-----------AGC-CAT---------ATCC-TC-TCTA-------CTGTC--C--TCGAAATGGTTGAATAAAATCCATTACCTTAA-CA-TGCA---GCGCGGT-GTAC-TTCCC---GT-ACCT----GTTCC---------ACA-------------------T-------------------AGGAACGTTTCTTTTCCTTT---CTGG----TTA-------------------CT-TTCTG-G--TTGAA-TATG-ACAAT-CTAGCCT------CGTGC-CCTC-TAGG----------AGACAT-----AC--AA---CAGTCT--TTCGAA----GA--G---CAC-CCTT---G----T-----TCT-TGGC-AAC-AAGAAAGAC--TTCTCCTGACATAGTGGGCTCTCTGTA-GGTA-TCAAAC-CTACCATTGA--TCAGAC-CCAGCATAGAACTAC-CCTACAT-TAAAC-CTTGGA-TTTAGAG-GACGC-AGGGCTGACGGTCGTTCCTAG-AGATGGTTTGGCGTAAGGATCCTGGTGCGAAT-CTGACTTATGGGCCCAGCG-ACTCCGAGTACGGAAAATTT---C---CTAGACTTTGCCCCACCTACAAgaatg
gi|17 : aaggacttcccactaggcatggaaaagtgcgacggtcgcagaatttataagcttcccaaagctaggttccaccttacaagtctgtcaactccctatcgaagagtgacggagggcatagagcttaatggaaatggcgcgctgacacaatactctgatggcaacaaaccccgagctcctcctaggattcgttcagccaaaggtcgtctgtttgctttccactccttcaatgagatgagttgtcatgctcgagtcttaatatC-------CTN-G--TGATTAAGCTTC-A----GCTA-AA--CCTCTACTGAAG-------CTTGGGAAGCTTCCACAATAGGTA-CCAG-TAGGTACTAGCCTACCACAAT---CCG--ATCC-TTATCC--TCTATACTGTCCTC--G-GAAAAGGTGGG-----------TCCCTTAA-AA-CGCACATGC-C--T-GTAC-CTCCTCCGGC-GCCCT--GGTTTA---------ACG-------------------T-------------------G-----------------TCTAATTAGGTGTCTG-------------------GT-CTTGG-G--TTG---TATG-
gi|15 : tG------CTGC------TA-TCAG-CC----------TACCACAATC--C-G--ATCC--C-TATCCTCTCTACTATC--CTCG-GAAAAGGTGGG-----------T----------------------------AC-CTTCTCCGGC-GCCCT--GGTTTC---------ATG-------------------T-------------------G-----------------TC---TTTGGTGTCTG-------------------GT-CTTGG-G--TTG---TATG-AGCAT-CT-GTCT------C-TGCGCCTC-CAGG----------CGACA------ATACA----CAGTCT--TCCTTA----AA--GGAACACGCCATTTGA----T-----TCT-TGGA-AGC-GTGAAGG-C--TTTTCATGAC-TAATGGGTTCCTTGTA-GGT
gi|16 : taagctataagcctctaaTTAC-AA-CGCACACGC-C--T-CGAC-------CGGC-ACCCCTGGGTTTC---------ACG-------------------T-------------------G-----------------TC---CNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCTGGGT-GTCTG-G--TTG---TATG-ACTAT-TT-GCCT------T-TTTGCCTC-CAGG----------CGACA------ATACA----CAGTCT--TCCCAAG---GA--G---CAAGCCAGTTGA----T-----TCT-TGAC-AGC-GAGATGG-C--TTTTCCTGAC-TAATGGGTTCCCTGTA-GATA-TC-------------------AGACGATGACATAGAATCACCATTAAATTCAcgcccttgaattgaacccagctttgctgcacttaataaac
gi|13 : -C--T-GTAC-TTCATCCGGC-ACCCT--AGTTTC---------ACG-------------------TAGGAACGTTTCCTTTCCCTG-----------------TT---CTGGGTGTCTG-------------------GT-CTTGG-A--TTG---TATG-ACCAT-CT-GCCTTTGGTTC-TGCGCCTC-TAGA----------AGACATT----AC--A----CAGTCT--TCCTATTCCTAA--GATGCACACC-----AGTTGT-----TCT-TGGC-AAC-GAGAAGA-T--TTCTCCTGAC-TAGTGGGGTCTCTGTA-GGTA-TCAATC-CTATCATTGGCTCCAGATCAGGGCATAGAACCACCCTTCAATTGA-ACATTGGG-CTTTAGAGCGACGCAGGGACTGACATTCGTTCCTAGTAGAAG--GTGCCGTCA-GCTTCTTGTGCGCTTCCTGACTTATGGTCCCAAGGCACTCC--ATACGGAAA--TG---C---CCGG-GTGTGCTGCCCCTAAAACacccagctttgctgcacttaatacaaatt
gi|24 : -------------------GT-CTTGG-G--TTG---TTTG-ACCAT-CT-ACCA------C-TGCACCTC-TATA----------AGACAGTCTTCAT--A----CG----------------AA--G---CACACCAATTGA----T-----TCT-TGGT-AGC-GAGAAGG-A--TTCTCCTacg
gi|20 : -TACACCCC-CTGG----------CGACA------AT--A----CAGTCT--TCCTAAG---GA--G---TACTCCAGTTGA----T-----TCC-TGGC-AGC-AAGAAGG-C--TTTTCCTGAC-TAATGGGTTCCTTGTA-GGTA-TC-------------------AGACGATGACACAGAATCACCTTTAAATTCA-AC-TTAG--CTTTg
gi|9 : cagctattgAGG-T--TTCTCCTGAC-TAGTGGGCTCTCTGTA-AGTA-TCAAAC-CCATTATTGGCTCCAGACGAGGGCATAGAACCATCCTTCAATTCA-AC-------CTTTAGAGCGACACAGGAGCTGGCGGTAGTTCCTTGTAGAAG--GTGCCGTCA-GCTCCTTGTGTGCCTCCTGACTTATGGTGCCAGGGTACTCC--ATACGGAAA--TC---C---CCGG-CTTTGCCGCACCTAAAACgatgcacttaatacaa
gi|16 : aaccccagcacgctcatttctccaccagtatccaccacggtctctgcaggtaggtcctcaacccaaattattctgcgtatcagtttgagagactcacctgcgcagtggtgatgcactgatcgccttcccctataatctatctctggggcacccgccccgagcaccccccctccctgattctctggtccactcgcgattccctatgcgatcaaaccccagttcaacccccaggctgctaccacgatccatatcctctctnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnacAAA--TT---CAACCCAG-CTTTGCTGCACTTAATACaag
gi|15 : ttacaacgcacacgcctcgaccggcacccctgggtttcacgtgtccnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnctgggtgtctggttgtatgactatttgcctttttgcctccaggcgacaatacacagtcttcccaaggagcaagccagttgattcttgacagcgagatggcttttcctgactaatgggttccctgtagatatcagacgatgacatagaatcaccattAA--TTGAAC---CCAG-CTTTGCTGCACTTAAaaatt
Alignments
lowQualScore : 111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111
lowQualScore : 11111111 111111111 1111 22222222222222222 11 11111 1111111111 1 1111111 1111111111111111 22222222222222222222 11111 11111111111111 111111 11111 2222222 1111 1111111111 11111 222222222222222 11111111111 2222222222222 11111 111 1111111 222222222222222 22222222 11111 11111111111 111111111 333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333 111111 22222 33333333333 333333 4444444444444444444 11111111 111 111 11
lowQualScore : 4 99999 3 0 44 3 44 3 3 3 3 99999 66666666 3 3 6 3 3 333333333 44 1111 555 3 44 3 77777777777777777 8888 3 44 00 44 3 3 6666 44 3 3 3 3 3 6 777 33 33 2 555 2 33 2 2 33 33 77 44 444 99999 3 44 2 33 2 77 7777777777 0 4 55 2 3 3333333 44 88888 3 3 55 9999999999999999 3 55 77 1 666 88888888888888888888 3 4444 0 3 55 7777 1 44444 3 3 4 4 4 444 4 99999999999999 777 333333 4 00000 55 4 4444444 4 55 55 4 777 4 4 4 4 4 1 3333 8888888888 11111 5 88 666 5 2 5 333333333333333 1 8 55 77777777777 777 55 3 55 666 99999999999 7777 3 66 3 55 4 1111111111111 4 2 8 0 00000 3 55 3 0 3 666 0 88 1 3 3 3 222 7777 44 3 99999 3 77 6666 44 3 3 3 3 3 6 0 44 3 44 6 0000000 555555555555555 3 44 3 2 3 44444444 3 444 3 3 1 5 999999 88 44 3 9 88888 7777 4 4 99999999999 3 3 8888 3 3 3 3 44 333333333 000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 77 77 777777 44 3 3 3 000000 3 3 0 2 77777 44 99999999999 1 3 3 333333 3 44 3 3 3 44 3 0 3 4444444444444444444 1 4 4 44444444 3 1 1 000 6 1 1 1 555 8 3 11
lowQualScore : . ..... . . .. . .. . . . . ..... ........ . . . . . ......... .. .... ... . .. . ................. .... . .. .. .. . . .... .. . . . . . . ... .. .. . ... . .. . . .. .. .. .. ... ..... . .. . .. . .. .......... . . .. . . ....... .. ..... . . .. ................ . .. .. . ... .................... . .... . . .. .... . ..... . . . . . ... . .............. ... ...... . ..... .. . ....... . .. .. . ... . . . . . . .... .......... ..... . .. ... . . . ............... . . .. ........... ... .. . .. ... ........... .... . .. . .. . ............. . . . . ..... . .. . . . ... . .. . . . . ... .... .. . ..... . .. .... .. . . . . . . . .. . .. . ....... ............... . .. . . . ........ . ... . . . . ...... .. .. . . ..... .... . . ........... . . .... . . . . .. ......... ................................................................................. .. .. ...... .. . . . ...... . . . . ..... .. ........... . . . ...... . .. . . . .. . . . ................... . . . ........ . . . ... . . . . ... . . ..
lowQualScore : 0 11111 3 4 66 3 66 3 3 3 3 66666 55555555 1 1 2 1 1 555555555 22 9999 444 1 22 1 77777777777777777 3333 1 22 44 22 1 1 5555 22 1 1 1 1 1 2 999 99 99 9 000 9 99 9 9 99 99 99 99 555 66666 1 22 9 99 9 99 8888888888 0 0 55 8 3 5555555 66 33333 3 3 00 4444444444444444 6 00 77 3 444 55555555555555555555 6 4444 9 6 00 7777 2 11111 6 6 0 0 0 444 0 55555555555555 000 222222 0 00000 55 0 5555555 0 55 55 0 000 0 0 0 0 0 3 9999 8888888888 11111 0 22 888 0 5 0 000000000000000 6 0 55 33333333333 333 00 6 00 444 22222222222 7777 6 55 6 00 0 8888888888888 0 3 2 8 11111 0 00 6 5 6 444 1 66 4 6 6 6 555 1111 66 3 66666 3 33 5555 22 1 1 1 1 1 2 2 22 1 22 2 0000000 000000000000000 3 88 3 9 3 11111111 1 444 3 3 5 7 111111 22 22 1 2 00000 2222 0 0 00000000000 6 6 6666 3 3 3 3 66 333333333 666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666 99 99 444444 66 3 6 6 555555 3 3 4 2 99999 66 77777777777 2 3 7 000000 2 66 3 3 1 22 3 8 3 0000000000000000000 2 0 4 22222222 3 0 0 222 7 0 0 0 666 0 6 00
consensus : CCGGGAGG-AAT-----TC-CCA--CTAG-CATGG--CA-A-GTGCGA-G-GTA-T---CAG--------C-AGAA-TC-T-CA-GA-G-------AGC--T----TCC---GA-A--T-GC-----------------T--A-GGTTCC-A--C--CATAT--A-A-T----CT--GCCAA-C-T-TC-C-TA-TC---GA--AGTG--G-G---GAG-GGC--A-T-AA--G--GCT--ACGGA-NATGGTGTG--GACACATA--TAT-C--TTCTGA-GG-C-AA--CA-T-CG-----CCCCAGC-CT--CGTCCTGGG-A---GT--CCG--C-----TCTGCCAA-A-AG--T--------CGTC--T-TA-TC--C-CCTCC---CC----CC---C-------AC-GGAGA-G-AA-TGCTA-TG--CCCC----AGGTCT-----AAT-TT-TGC-C-TTA-CAT-T-CTCG-CA----------G---GAA---GT-----NTA-TA-----C--CA-AG-------CAA-CATGGA--GT--CC-TT---CAA-GG-GAGC-CAC-ATACAGG-TTCAGC----TATTGTA-------CA-TTCA-----CCCCCA-CT-TGGATG-GGGAA-TGGGCCCGCAATA-AATCCACTCA-N-T---C-------CCCA-GTA--TG-----------CT--NA--TTTCTG-C--C---CT-----A-----G----TA-TC-CAC-C--A-CGGC-CTC-------TGC-ACGTAGGTCCTGAACCCGTAATTG-C---ACTGTA--TA-TCTCGT-TG---AGTG--CCTCACCTGGCCAGT-GGTGA-TG-CA---CC----G--ATCGCCTTCCCC-TGG----AATC-TCTATCTCTGG--G----GCA--T-CCTC-CCC-GAG-C-CCACC-CATCCCTGG--TTTC-TCGG--G-TCCAC-------TCC-------C-------TG-GG-CGA-TCAAGCTCC-AGCTC-------AA-CCTCC-GAGC-TG-CTA-CCAG---CCTACCACG-A--T-CCG-ATCC--TN-TCC--TCTCTA-CTG-TCCTCGGAAAAGGTGGG-----------TGCCTT-AA-AACGCA-CGCGCCT-GTAC-TTCCTCCGG-CGC-CCT--GGTTTC---------ACG-------------------T-------------------G-------------TC--------------------------CTGGGTGTCTGGT--CTTG--GG--T---TG--TAT-GACCAT-CT-GCCT------C-TGCGCCTC-CAGGAGACA-ATACA--CAGTCTTC---CT------AGGA-GCACGCCAGTT---GATTC--TTGGC-AGC-GAGAAGG-C--TTCTCCTGAC-TAGTGGGCTCCCTGTA-GGTATCAAAC-CTATCATTGGCTCCAGACGATGACATAGAACCACCCTTAAATTCA-A-C-TTGG-G-CTTTAGAGCGACGCAGGGGCTGGCGGTCGTTCCTAGTAGAAG--NTGCCGTCA-GCTCCTTGTGCGCCTCCTGACTTATGGTGCCAGGGCACTCC--GTACGG-AAATNCCC--GGCTTTGCCGCACCTAAAAC
Reference ( family-1452 ) : CCGGGAGG-AAT-----TC-CCA--CTAG-CATGG--CA-A-GTGCGA-G-GTA-T---CAG--------C-AGAA-TC-T-CA-GA-G-------AGC--T----TCC---GA-A--T-GC-----------------T--A-GGTTCC-A--C--CATAT--A-A-T----CT--GCCAA-C-T-TC-C-TA-TC---GA--AGTG--G-G---GAG-GGC--A-T-AA--G--GCT--ACGGA-NATGGTGTG--GACACATA--TAT-C--TTCTGA-GG-C-AA--CA-T-CG-----CCCCAGC-CT--CGTCCTGGG-A---NT--CCG--C-----TCTGCCAA-A-AG--T--------CGTC--N-TA-TC--C-CCTCC---CC----CC---C-------AC-GGAGA-G-AA-TGCTA-TG--CCCC----AGGTCT-----AAT-TT-TGC-C-TTA-CAT-T-CTCG-CA----------G---GAA---GT-----CTA-TA-----C--CA-AG-------CAA-CATGGA--GT--CC-TT---CAA-GG-GAGC-CAC-ATACAGG-TTCAGC----TATTGTA-------CN-TTCA-----CCCCCA-CT-TGGATG-GGGAA-TGGGCCCGCAATA-AATCCACTCA-N-T---C-------CCCA-GTA--TG-----------CT--NA--TTTCTG-C--C---CT-----A-----G----TA-TC-CAC-C--A-CGGC-CTC-------TGC-ACGTAGGTCCTGAACCCGTAATTG-C---ACTGTA--TA-TCTCGT-TG---AGTG--CCTCACCTGGCCAGT-GGTGA-TG-CA---CC----G--ATCGCCTTCCCC-TGG----AATC-TCTATCTCTGG--G----GCA--T-CCTC-CCC-GAG-C-CCACC-CATCCCTGG--TTTC-TCGG--G-TCCAC-------TCC-------C-------TG-GG-CGA-TCAAGCTCC-AGCTC-------AA-CCTNC-GGGC-TG-CTA-CCAG---CNTACCACG-A--T-CCG-ATCC--TC-TCT--TCTCTA-CTG-TCCTCGGAAAAGGTGGG-----------TGCCTT-AA-AACGCA-CGCGCCT-GTAC-TTCCTCCGG-CGC-CCT--GGTTTC---------ACG-------------------T-------------------G-------------TC--------------------------CTGGGTGTCTGGT--CTTG--GG--T---TG--TAT-GACCAT-CT-GCCT------C-TGCGCCTC-CAGGAGACA-AT-CA--CAGTCTTC---C-------AAGA-GCACGCCA--T---GATTC--TTGGC-AGC-GAGAAGG-C--TTCTCCTGAC-TAGTGGGCTCCCTGTA-GGTATCAAAC-CTATCATTGGCTCCAGACGATGGCATAGAACCACCCTTAAATTCA-A-C-TTGG-G-CTTTAGAGCGACGCNGGGGCTGGCGGTCGTTCCTAGTAGAAG--NTGCCGTCA-GCTCCTTGTGCGCCTCCTGACTTATGGTNCCAGGGCACTCC--GTACGG-AAATTCCC--GGCTTTGCCGCACCTAAAAC
gi|1 : CCGAGAGA-AAT-----TC-CCA--CTGG-CATGG--CA-A-TTGCGA-G-GTA-T---CAG--------C-AGAA-CC-T-AA-GA-G-------AGC--C----TCC---GA-A--T-GC-----------------T--A-GGTTCC-A--C--TATAC--A-A-T----CT--GCCAA-C-T-CC-C-TA-TC---GA--AGTG--G-G---GAG-GGC--A-A-AA--G--GGT--ACGGA-AATGTTGTG--GACACATAATTAT-C--TTCTGA-GG-C-AA--TA-T-CA-----CTC-AGC-CT--CGTCCTGGG-A---TT--CCG--C-----TCTGCCAA-A-CG--T--------CATC--A-TA-TC--T-TCTCG---CC----CC---C-------AT-GGAGA-G-AG-TGCCA-TG--CTCC----AGGTCT-----AAT-TT-TGC-C-TTA-CAT-C-CCCG-CA----------G---GAA---GT-----TTA-CA-----C--CA-AG-------CAA-CATGGA--AT--AC-GT---CAA-GG-GAGC-CAC-ATACAGG-TCCAAC----TATTGGA-------TT-TTCT-----CCCCCA-TT-TGGATG-GAGAA-TGGGCCCACAATA-AATCCACTGA-G-T---C-------CCCA-GTG--TG-----------GT--AA--TTTCTG-T--C---AT-----A-----G----TA-TC-CAC-C--A-CGGT-ATC-------TGC-AGGTAGGTCCTGAACCCGTGATTG-C---ACTGCA--TA-TCTCGT-TG---AATG--CCTCATCTGACCAGT-GGTGA-TG-CA---CC----G--ATCACCTTCCCT-TGG----AATC-TTTATCTCTAG--G----GCA--T-CCTC-CCC-GAG-C-CCACT-TATCCCTGG--TTTC-TCGA--G-TCCAC-------TCC-------C-------TG-GG-TGA-TTAAACTTC-AGCTC-------AA-CCGGC-GGGC-TA-CTA-CCAG---CATAACACG-T--TCCCG-ATCC--TC-TCTAGTCTCCA-CTG-TC--CGGAAAAGGTGGG-----------TACCTT-AA-AACGCA-CAAGCCT-GTAC-TTCCTCCGG-TGC-CCT--GGTTTC---------ACG-------------------T-------------------G-------------TT--------------------------CTGGGTGTCTAGT--CTCG--GG--T---TG--TAT-GACCAT-CT-GCCT------C-TGCGCTTC-CAGGAGACA-AT--A--CAGTTTT--------------AA-GCATGCC--------ATTC--TTGGC-AGC-GAGAAGG-C--TTCTCCTCAC-TAGTGAGCTCTCTGTA-GGTATCAGAC-CTATTATTGGCTCCAGACGATGACACAGAACCACTCTTAAATCCAGA-C-TTGG-GACTTTAGAGCGACGCTGGGGCTGGTGGTCATTCCTAGTAGAAG--CTGCTGTCA-GCTCCTTGTTTGCCTCCTGACTTATGGTGCCAGGGCACTCC--ATACGG-AAATTCCA--AGCTTTGCTGCACTTAAAAC
gi|10 : G-----------TT--CA--CCTCTG-C--C---CC-----A-----G----TA-TC-CAC-C--A-TGGC-CTA-------TGC-AGGTAGTTTCTTAACCCGTA-----C---GCTGTG--TA-TCCCAT-TG---AGGG--CCTCACCTGGCCAGT-GGTGA-TG-CAC--CC----A--ATCACCTTCCCC-TGG-----------------------------------TTC-CTC-GGG-T-CCACT-C--CCCTG-------------------AT-------TCT-------T-------TG-GG-CGA-TCAAACTCC-AGCCC-------AA-CCTCC-GGGC-TG-CTA-C------TGTA------A--T-CCGTATCC----------TCCCTA-CTG-TCCTCGGAAAAGGTTGG-----------CTCCTT-AA-AACGCA-CAAGCTT-GCAC-TTCCTCTGG-GGC-CCT--GATTTC---------ATGTAGGAACGTTTCTTCCC--T-------------------G-------------TC--------------------------CTGGGTGTCCGGTC-CTTG--GGCTT---TG--TTT-GACCAT-CT-GCCT------C-TGCACCTC-CAGGGAACA-ATACA--CAGATTCC---T-------AAGG-GAACACCAG-TG--GATTA--TTGGC-AGT--AGAAGG-C--TTCTCCTGAC-TAGTGGACT--CTGTA-GGTATCAAACTCTATCACTGGCTCCAGACGATGACATAGAACAACCC-----TTCA-ACC-TTAG-G-CTTTAGAACTA-----AGGCTGGCGGTCGCTCGTAGTAGAAT--ATACCGTCA-GCTCCTTATACGCCTCCTGACTTCTGTCGCC--GGCACTCT--CTACAG-TAATGCCA--AGCTTTGCCGCATTTTAAAC
gi|11 : GTCCTGGG-A---GT--CCG--C-----TCTGCCAA-A-AG--T--------TATC--G-TA-TCTTC-TCTCC---CC----CT---C-------CC-TGGAA-G-AA-TGCCA--G--CCCC----AGGTCT-----AAA-TT-TGC-C-TGA-CAT-T-CTCG-CA----------G---GAA---GT-----CTA-TA-----C--CA-AG-------CAA-CATGGAAGGT--CC-TT---CAA-GG-GA-C-CAC-ATACAGG-TTCAGC----TAT-GTA-------CA-TTCA-----TCTCCA-CT-TGGATG-GGGAA-TGGGCC-GCAATA-AATCCACTCA-T-T-------------------------------------------------C--C---CC-----A-----G----TA-T---------------------------GC-ACGCAGGCCCTGATCCCGTAATTG-C---ACTGAA--TA-TCTCGT-TG---AGTG--TCTCACCTGGCTAGT-GGTGA-TG-CA---CC----G--ATCGCCTTCCCC-TGG----AATA-TCTATCTCTAG--G----GCA--T-CCTC-CCC-GAG-T-CCACT-CATTCCCAG--TTTC-TCGG--G-TTTAC-------TCC-------T-------TG-GG-TGA-TTAAGCTTC-AGCTA-------AA-CCTatg
gi|11 : TA-CTAG---CTTACCACA-A--T-CCG-ATCctactgaaacttgggaagattccacaataggtaccagtaggtactagcttaccacaatccgatc
gi|12 : gtcctgggagtccgctctgccaaaagttatcgtatcttctctccccctccctggaagaatgccagccccaggtctaaatttgcctgacattctcgcaggaagtctataccaagcaacatggaaggtccttcaagggaccacatacaggttcagctatgtacattcatctccacttggatggggaatgggccgcaataaatccactcattccccagtatgcacgcaggccctgatcccgtaattgcactgaatatctcgttgagtgtctcacctggctagtggtgatgcaccgatcgccttcccctggaatatctatctctagggcatcctccccgagtccactcattcccagtttctcgggtttactccttgggtgattaagcttcagctaaacctctactgaaacttgggaagattccacaataggtaccagtaggCGGGAAG-AAT-----TT-CCA--CTAG-CATGA--CA-A-GTGCAA-G-GTG-T---CAG--------C-AGAA-TC-T-CA-GA-G-------AGC--T----TCC---GA-A--T-GC-----------------T--A-GGTTCC-A--C--CATAT--A-A-T----CT--GCTAA-C-T-TC-C-TA-TC---AA--AGTG--G-A---GAG-GGC--A-T-AA--G--GCT--ATGGA-CATGGTGTA--GACA--TA--TAT-C--TTCTGA-GA-C-AA--CA-T-CG-----CCCCAGC-CT--CGTCCTGGG-A---GT--CCG--C-----TCTGCCAA-A-AG--T--------AGCC--T-TA-TC--C-CCCCC---CC----CC---CTCCCCTCCC-GGAGA-G-AA-TGCTT-TG--CCCC----AGATCT-----AAT-TT-TGC-C-TTA-CAT-T-CTCG-CA----------T---GAT---GT-----ATA-TA-----C--CA-AG-------CAA-CATGGA--GT--CC-TT---CAA-GG-GAGC-CAC-ATACAGA-TTCAGC----TATTGTA-------CA-TTCA-----CCCCCA-CT-TGGATG-GGGAA-TGGGCCCGCAATA-AATCCTCTTA-T-T---C-------TCAA-GTA--TG-----------CT--TA--TTTCTG-C--C---CT-----A-----G----TA-TA-CAC-C--
gi|13 : CT-GTAC-TTCATCCGG-CAC-CCT--AGTTTC---------ACG-------------------TAGGAACGTTTCCTTTCCCTG-------------TT--------------------------CTGGGTGTCTGGT--CTTG--GA--T---TG--TAT-GACCAT-CT-GCCTTTGGTTC-TGCGCCTC-TAGAAGACA-TTACA--CAGTCTTC---CTATTCCTAAGATGCACACCAGTT---G-TTC--TTGGC-AAC-GAGAAGA-T--TTCTCCTGAC-TAGTGGGGTCTCTGTA-GGTATCAATC-CTATCATTGGCTCCAGATCAGGGCATAGAACCACCCTTCAATTGA-A-CATTGG-G-CTTTAGAGCGACGCAGGGACTGACATTCGTTCCTAGTAGAAG--GTGCCGTCA-GCTTCTTGTGCGCTTCCTGACTTATGGTCCCAAGGCACTCC--ATACGG-AAATGCCC--GGGTGTGCTGCCCCTAAAAC
gi|14 : --TA-TCCCTT-TG---ATAG--CCTCACCTGGCCAAT-GGTGA-TG-CA---CC----G--TTCACCTCCCCC-TAT----AATC-TGTATCTCTGG--G----GCA--T-CCTC-CGC-AAG-C-CCA-C-CATCCCTGC--TTTT-TCGG--G-TCGAC-------TCCCGAATCAC-------TG-GA-CGA-TCAAACTCC-AGCTT-------AA-CCTTC-GAAC-TG-C------------TACCACG-A--T------TCA--TA-TCC--TTTCTA-CTG-TCCTCGGAAAAGGTGAA-----------TGCCTT-AA-AATGCA-CGCGCGT-GTAC-TTCTTACAG-CAC-CCT--GGTTTTTAAGTAGGAACG-------------------TTTCTTTTCCCC--------G-------------TT--------------------------CTGGGTGTCTGGacg
gi|15 : gcg-------AG-CCTCT-AAGC-TG-CTA-TCAG---CCTACCACA-A--T-CCG-ATCCC-TA-TCC--TCTCTA-CTA-TCCTCGGAAAAGGTGGG-----------TACCTT---------------------------CTCCGG-CGC-CCT--GGTTTC---------ATG-------------------T-------------------G-------------TC--------------------------TTTGGTGTCTGGT--CTTG--GG--T---TG--TAT-GAGCAT-CT-GTCT------C-TGCGCCTC-CAGGCGACA-ATACA--CAGTCTTC---CTTAA---AGGA-ACACGCCATTT---GATTC--TTGGA-AGC-GTGAAGG-C--TTTTCATGAC-TAATGGGTTCCTTGTA-GGT
gi|16 : taagctataTT-AC-AACGCA-CACGCCT-CGAC-------CGG-CAC-CCCTGGGTTTC---------ACG-------------------T-------------------G-------------TCCNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCTGGGTGTCTGGT----------------TG--TAT-GACTAT-TT-GCCT------T-TTTGCCTC-CAGGCGACA-ATACA--CAGTCTTC---CCA-----AGGA-GCAAGCCAGTT---GATTC--TTGAC-AGC-GAGATGG-C--TTTTCCTGAC-TAATGGGTTCCCTGTA-GATAT-------------------CAGACGATGACATAGAATCACCATTAAATTCA-A-C-CC-A-G-CTTTcgcccttgaattgaacccagctttgctgcacttaataaac
gi|17 : TA-CTAG---CCTACCACA-A--T-CCG-ATCC--TTATCC--TCTATA-CTG-TCCTCGGAAAAGGTGGG-----------TCCCTT-AA-AACGCA-CATGCCT-GTAC-CTCCTCCGG-CGC-CCT--GGTTTA---------ACG-------------------T-------------------G-------------TCTAA-----------------------TTAGGTGTCTGGT--CTTG--GG--T---TG--TAT-Ggctgcacttaatacaaatt
gi|18 : tcctngtgattaagcttcagctaaacctctactgaagcttgggaagcttccacaataggtaccagtaggCCGAGAGG-AAT-----TT-CCA--CTAG-CATGA--CA-A-GTGCGG-G-GTA-T---CAGCAGATTCTC-AGAG-TN-N-NN-NN-N-------NNN--N----NNN---NN-N--N-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNT--A-GGTTCC-A--C--CATAT--A-A-T----CT--GCCAA-C-T-TC-C-TG-TC---GA--AGTG--G-G---GAG-AAC--A-T-AA--G--GCT--ACGAA-TATGGTGTG--GACAC------AT-C--TTCTGA-GG-C-
gi|19 : G-A---GT--CCG--C-----TCTGCCAA-A-AG--T--------AGTC--T-TA-TC--C-AG-----------------C-------ACTGGAGA-G-AA-TGTTA-TG--TCCC----AGGTCT-----AAT-TT-TGC-C-TAA-CAT-T-CTCG-CA----------G---GAA---GT-----ATG-TA-----C--CA-AG-------CAA-CATTGA--GT--CC-TT---CAA-GG-GAGC-CAC-GTACAGG-TGCAGC----TATTGTA------------CA-----CCCCC
gi|2 : GAAGG-AAT-----TC-CAA--CAAG-CATGG--AA-A-GTGCGA-G-GCA-T---CAG--------CCAGAA-TCCT-CA-GA-G-------AGC--C----TCC---AA-AATT-GCC----------------T--A-GGTTCC-A--CT-CATACCAA-A-T----CT--GCCAA-T-T-CCTC-TA-TC---GA--AGTG--A-G---CAG-GGC--AAT-AAAAG--GCA--ACGGA-AA------G--AACGC---------------TGA----T-AA--CA-T------------AA---T--CATC-TGAA-A--------CG--C-----TCTGACAA-A-GG--T--------CGTC--TGTA-TC--T-TCTCT---CC----TC---C-------AC-GGAGA-G-AG-TGCCT-TG--CTCA----AGGTCT-----AAT-TC-CGC-C-TTA-CAT-C-CTCG-CA----------G---GAA---GT-----CTA-CA-----C--CA-AG-------CAA-CATTTA--GT--CC-TT----AA-----AAC-CAC-ATGCATG-TCCAtggcgacaatacagtcttccta
gi|2 : attcTCCACTCA-GAT---C-------CCCA-GCA--TG-----------CT--CA--TTTCTG-T--C---CC-----A-----G----CA-TA-CAC-C--A-CGGT-CTT-------TGC-AGGTAGGTTCTGAACCCATAACTG-CTAGA-TGCA--TA-TC-CAT-TT---AATGG-CCTCACCTGGCCAGT-CGTGA-TG-CA---CA----A--ATCACCTCCCCCCTAT----GATC-TGTATATCTGG--G----GCA--T-CCTC-CTC-GGG-C-CCACC-CATCCCTGA--TTTC-TTGG--G-TCCAC-------TCC-------CGAATCCCTG-GA-CGA-TCAAACTCC-AGCTT-------AA-CCTCC-GGGC-TA-CTA-CCA-----------TG-A--T-CCATATCC--TC-TCC-------A-CTG-TCCTCGAAAAAGGAGGA-----------TGCCTT-AA-AATGCA-TGCGCCT-GTAC-TTCCTCCGG-CAC-CCT--AGTATC---------ACGCAGGAATGTTTCTTTTCCCT-------------------G-------------TT--------------------------CTGGGTATCTGGT--CTTG--AG--G---TG--TAT-GACCAT-TT-GCCT------C-TGCGCCTC-TAGGAGACA-TTGCA--CAGT------------------------------T---G-TTC--TTGGT-AAC-GAGAAGA-T--TTCTCCTGAC-CAGTGGGCTCTCTGTA-GGTATCAAAT-CTATCATTGGCTCCAGACCAGGGCACAGAATCACCTTTGAAC------C-TTGGTA-CTTTGGAGCGACGCTGGGGCTGGT-----TTCCTAGTAGAAG--CTGCTGTCA-GCTCTTTGTTTTCC-CCTGACTTATGGTACCAGGGCActcagatccccagcatgctcatttctgtcccagcatacaccacggtctttgcaggtaggttctgaacccataactgctagatgcatatccatttaatggcctcacctggccagtcgtgatgcacaaatcacctcccccctatgatctgtatatctggggcatcctcctcgggcccacccatccctgatttcttgggtccactcccgaatccctggacgatcaaactccagcttaacctccgggctactaccatgatccatatcctctccactgtcctcgaaaaaggaggatgccttaaaatgcatgcgcctgtacttcctccggcaccctagtatcacgcaggaatgtttcttttccctgttctgggtatctggtcttgaggtgtatgaccatttgcctctgcgcctctaggagacattgcacagttgttcttggtaacgagaagatttctcctgaccagtgggctctctgtaggtatcaaatctatcattggctccagaccagggcacagaatcacctttgaaccttggtactttggagcgacgctggggctggtttcctagtagaagctgctgtcagctctttgttttcccctgacttatggtaccagggcat
gi|20 : attcgaaggaattccaacaagcatggaaagtgcgaggcatcagccagaatcctcagagagcctccaaaattgcctaggttccactcataccaaatctgccaattcctctatcgaagtgagcagggcaataaaaggcaacggaaagaacgctgataacataatcatctgaaacgctctgacaaaggtcgtctgtatcttctctcctccacggagagagtgccttgctcaaggtctaattccgccttacatcctcgcaggaagtctacaccaagcaacatttagtccttaaaaccacatgcatg-TACACCCC-CTGGCGACA-AT--A--CAGTCTTC---CTA-----AGGA-GTACTCCAGTT---GATTC--CTGGC-AGC-AAGAAGG-C--TTTTCCTGAC-TAATGGGTTCCTTGTA-GGTAT-------------------CAGACGATGACACAGAATCACCTTTAAATTCA-A-C-TT-A-G-CTTTt
gi|21 : cagctattgCCGGGGG---AT-----TT-CCA--CAAG-CATGA--CA-A-GTGCGA-G-GTA-T---CAG--------C-AGAA-TC-T-CA-GA-G-------AGC--TTAAATCT---GA-A--T-GC-----------------T--A-GGTTCC-A--C--CATAT--A-A-T----CT--GTCAA-T-T-TC-C-T-----------AGTG--G-G---GAG-GAC--A-T-AA--G--ACT--ACGGA-AATGGTGTG--G--ACATA--TAT-T--TTCTGA-GG-C-AA--gatgcacttaatacaa
gi|22 : CCGAGAAG-AAT-----TC-CAA--CTAG-CATGG--AA-A-GTGCGA-G-GCA-T---CAG--------C-AGAA-TA-T-CA-GA-G-------AGT--C----TCC---GA-A--T-GC-----------------T--A-AATTAT-A--C--CATAC--A-A-T----CT--G----------T-C-TG-TC---GA--AGTG--G-G---GAG-GAC--A-C-AA--G--GCA--ACGGA-AATGGCGCT--GACAC-T---TAT-C--TTCTGA-GG-C-A
gi|23 : G--------C-AGAT-TC-T-CACGA-G-------TGC--T----TCC---GA-A--T-GCA----------------T--ATGGTTCC-A--C--CATAT--A-A-T----CT--GCCAA-CTT-TC-C-TG-TC---GA--AGTG--G-G---GAG-AAC--A-T-AA--G--GCTAAACGAA-TATGGTGTG--GACAC------AT-C--TTCTGA-GG-C-AA--
gi|24 : GT--CTTG--GG--T---TG--TTT-GACCAT-CT-ACCA------C-TGCACCTC-TATAAG--------A--CAGTCTTCATAC-------GA-A-GCACACCAATT---GATTC--TTGGT-AGC-GAGAAGG-A--TTCTCCTGt
gi|25 : A---CC----G--ATCACCTCCCCC-TAT----AATC-TGTATCT--GG--G----GCA--TGCCTC-CAG-GA--C-CCACC--ATCCCTGG--TTTC-TCGG--G-TCCAC-------TTC-------C-------
gi|26 : tgcatgcgtttctTGA-GG-C-AA--CA-A-AA-----TCCCAGC-CT--TGTCCTGGG-A---TT--CCG--T-----TCTGCCAA-A-Agaatg
gi|27 : ---GA--AGTG--G-G---TAG-GGC--A-T-AA--A--GCT--ACGGA-TATGGTGTG--GACA
gi|3 : t-CCA--CTAG-CATGA--CA-A-GTGGCA-G-GTG-----CA---------C-AGAAGTC-C-AA-GA---------AGC--T----TCC---GA-A--TAGC-----------------TTAA-GGTTCA-A--C--CATAT--ATA-T----CTTGGCTAA-C-T-TC-C-TA-TC---AA--AGTG--G-A---GAG-GG-----T-AA--G--GAT--GC-----ATGGTTAT--GACATATA--TAT-C--TTCT-A-GA-C-AA--CA-T-CG-----CCC-AGC-CT--C-TGCTGGG-A---GT--CCG--C-----TTTGGCAA-A-AG--T--------AA-C--T-TA-CC--C-CCTCC---CC----CC---CTCCCTC-CC-GGAGA-G-AA-TGCTT-TG--CCCG----AGATCT-----AAT-TT-TGCGC-TTAACAT-T-CTCG-CA----------T---G------T-----CTG-TATAATGC--CA-AG-------CAA-CATGGA--GC--CTGTT---CAA-GG-GAGC-CAC-ATACAGA-T-CAGCG---TATTGTA-------CGATTCA-----CCC--A-CT---GATG-GCGAA-TGGGCCCGCAATA-AATCCTCTTA-T-T---T-------CTCAAGTGACTG-----------CT--TA--TTTCTG-C--CTACCT-----ACAAGTA----TA-TC-CAC-C--A-CGGC-TCG-------TGCTACG-AGGTCCTGACCCCGTAATTG-C---ACTGTA--TA--CTCGT-TG---GGTGTCCCTGACCTGGCCATT-GGTGA-TG-CAG--GC----G--ATCGCCTTCCCC-TTG----AATC-TCTATTTCTGG--GAAAAACA--T-CCTC-CCT-GAGCC-CCACT-CATCCCTGG--TTTCTTCGG--GTTTCAC-------TCC-------T-------TGTGGTTGA-TTAAGCTTTAAGCT--------AA-TCTCTAAAGC-TG-CTATCCAG---CCTACCACA-A--T-C---GTCCAATA-TCC--TCTCTATCTGTTCCTCGGAAAAGGTGGG-----------TGC--T-AA-AACGCA--ACGCCTGGTAC-TTCCTCCGG-CGC-CCT---GTTTC---------ACG-------------------T-------------------G-------------T---------------------------CTGGGTGTCTGGT--C--------------G--TAT-GGACTT-GT-GCCT----------TGCCTC-CA-GCGACA-ATACATGCAGTCTTC---CCA-----AGGA-GCAAGCCAGTT---GATCT--GTGAC-AGCGGAGATGG-C--T--TTCTGAC-TAATTGTTTCCCTGTA-GATAT-------------------CAGACGATGACATAG-ATCACCATTAAATCCA-
gi|4 : gagatatAGG-ATT-----TC---A---TAG-CATGA--CA-A-G--CGA-G-GTAAT---AAG--------C-AGAA-T--T-CA-GA-T-------AGT--T------C---GG-G--T--C-----------------T----GGTTC-----------A---A-A-T----TT---TTAA-C-T-TC-C-TA-TC---GA---GTG--G-G---AAG---C--A-TTAA--G--GTT--ACGGA-CATG-TGTA--AA---ATA--T-T-C--TTCTGA-GA-C-AGAGCA-TTCG-----CCCAGGCTCT--CGTCCTGTG-C---GTG-CCG--C-----TCAGCCAA-GTAA--T--------C-TT--T-TA-TC--C-CC-CC---CC----CT---C-------AC-T-AGA-G-AA--GCTA-TG--CCAC----AG--CT-----A-T-TT-T-C-C-TT--------TTCGACA----------G---AAA---GTTGTACCTA-CA-----C--TGTAG-------CAA-CATGGA--GT--CC-TT---TAA-GGTGAGC-CAT-ATA--AG-TTCA-C----TATTGTA-------CA-TTC--------CCCA-CT-TGGA---GGGAACTGGGCCCGCAATA-AATCCACTCG-A-TGTGCGG-----CCTATGTA--TG-----------CT--AA--TTTCT--C--C---CT-----A-----G----TA-TGACAC-C--ATCGGT-CCT-------TGT-ACGT--GTCCTGG-CCCGTA-TTG-----ATTATAGATACTCTCGT-TGTTTGGTG--TCT-AC-TGGCCAGT-GGTGAATG-CG---CCTCTTGTTATCGCCTTCCC--TGG----AATC-TCTATCTCCTC--A----GCA--T-CTTC-CGC-GAG-C-CCACCTCAT-CCTGG--TTTC-TCGG--G-TTCAC-------T-C-------C-------TG-GG-TGAGT--AGCTTT-A-CT--------AA-GCTCT-AAGC--G-CTA-CCAG---CCTACCACA-A--T-CCG-ATTC--AT-TCC--TCTCTA-ATG-TTCTCGG--AATGCGGC-----------TGCCTTAAA-AACGCA-TG---CT--TACGTTCCTCCGGTCGC-CCT--GGTTT----------------------------------------------------------------------------------------------TTGGTTGTC------CTTG--GG--TTGATG--TATGGACCATGCT-G-CT------C-TTTGCTTCTCAG--GGC---T--------TTTTC---CT------AGGA-ACACATTA--T---GATTCCTTCGGCGAGC-GAGAAGG-CAGTTTTCCTGA--TATTGTTCACCCTGTACGGTAT
gi|5 : GGGGAG-AAT-----TC-C-A--CAAG-CATGA--CA-A-GT-CGA-GTGTA-T---CAG--------C-AGAA-TC---CA-GA-G--------GT--TAAA-TCT---GATA--T--C-----------------T--T-G--TCC-ATTC--CATAT--A-A-T----CT---CCAA-C-T-TC-C-TA-----------GTG--G-G---GAG-GAC--A-T-AA--G---CT--ACGGA-TAT--TGTA-----ACATA--TCT-C------GA-G--C-AA--C--T-CG-----CCC-AGC-TT--C-TCCTTAG-A---GC--CC---------TCTGCCAATA-AG--T--------AGTC--T-TA-TC--C---TCC---CC----CT--------------GGAG-------TGC-A-TC--CCTC----AAGTCT-----AGT-TT-TGC-T-TTA-CGT-T-CTT--CT----------G---GAA---GT-----TTAATA-----C--CA--G-------CAA-CATGGA--GC--CC-TT---CAA-GG-GAGC-CAC-ATACAGG-TTCAGC----TAGT-TA-------CA-TT-A-----CCCC-A-CT---GATGTGGGAA-TGG-CCCGCAATA-AAACCAC-CA-G-T---C-------CC-A-GTA--T------------CT--AA--TGTCTG-C--C---CT-----A-----G----TA-TC-CAC-C--A-AGGC-TTC-----------ACGTA--TCCTGAACCTGTAATTG-A---ACTG-A--TA-TCTCAT-TG---AAGG--TCTCACCT--CCAGT-GATGA-TG-CA---CC----G--ATTGC-TTCCCC-TG-----AATC-TCTATCTCTAG--G----CGA--T-CATC-CCG-TAC-C-GCACT-CATTCC-GG--TTTC-TGCG--G-TTCAC-------TTC-------T-------TG-G----A-TTAAGCTC--AGCTT-------AAACCTCT-AAGC-TG-CTA-CCAGT--CCTACCACATA--T-CCG-ATTCA-TA-TCT--TCTCTA-CTG-TCCTCGAAAAATGTG-------------TGCCTT-AATAACGCA-CATGTCT-GTAC-TTC-TCCG--CGC-CCT--G--TTC---------ACG-------------------T-------------------G-------------TC--------------------------TTGGGTGTCTGGT--CTTGA-AG--T---T---TAT-GACCAT-CT-GCCT------C-TGCGC--C-CA-GAGACA-TA-CA--CAATCTTC---C-------AAGA-GCACGCCA--TGTGGATCT--GTGGC-AGC-GAGAA-G-C--TTTTCCTGAC-TAAT-GGTTCATTGTA--GTAT-------------------CAGACGATTACATAAAATCACCCTTGAATTCA-A-C-tcagagatcgacatagaatatttggcccttgaagtgtgcagtgatagctttttttgcttcatttatacaaa
gi|6 : AGG-ACT-----TC-CCA--CTAGGCATGG--AA-AAGTGCGACG-GT------C-G--------C-AGAA-TT-T--A-TA---------AGC--T----TCC---CA-A--A-GC-----------------T--A-GGTTCC-A--C--CTTAC--A-AGT----CT--GTCAA-C-T-CC-C-TA-TC---GAAGAGTG--ACG---GAG-GGC--A-T-AG--A--GCTTAATGGA-AATGGCGCGCTGACACA-A--TA-----CTCTGATGG-C-AA--CA---AA-----CCCCGAG-CT--CCTCCTAGG-A---TT---CG--T-----TCAGCCAA-A-GG--T--------CGTCT-G-TT-TG--C-TTTCCACTCC----TT---C-------AA-TGAGATG-AGTTGTCA-TG--CTCG----AGTCTT-----AAT-AT-Tccatcttgctacacttaatacaaat
gi|6 : aTATCTCTGGA-G----GCA--T-CCTC-CC--GA--C-CCACC--ATCCATGG--TTTC-TCGG--G-TCCAC-------TCCGAATAT-C-------TG-GA-TGA-TCAAACTCC-AGCT--------AA-TTCCG-GGGC-TG-C-A-CCAC---CAAGCCAT-----------ATCC--TC-TCT-------A-CTG-TCCTCG-AAATGGTTGAATAAAATCCATTACCTT-AA-CATGCAGCGCGG-T-GTAC-TTCC------CGTACCT--G-TTCC---------ACA-------------------T-------------------AGGAACGTTTCTTTTC--------------------------CT---T-TCTGGTTACTTTCTGG--T---TGAATAT-GACAAT-CTAGCCT------CGTGC-CCTC-TAGGAGACATAC-AA--CAGTCTTT---CG------AAGA-GCAC-CCT--T---G-TTC--TTGGC-AAC-AAGAAAGAC--TTCTCCTGACATAGTGGGCTCTCTGTA-GGTATCAAAC-CTACCATTGAT--CAGACC-CAGCATAGAACTACCCT-ACATTAA-A-C-CTTG-G-ATTTAGAG-GACGCAGGG-CTGACGGTCGTTCCTAG-AGATGGTTTGGCGTAAGGATCCTGGTGCGAAT-CTGACTTATGGGCCCAGCG-ACTCCGAGTACGGAAAATTTCCTAGACTTTGCCCCACCTACAAcgttatctctggaggcatcctcccgacccaccatccatggtttctcgggtccactccgaatatctggatgatcaaactccagctaattccggggctgcaccaccaagccatatcctctctactgtcctcgaaatggttgaataaaatccattaccttaacatgcagcgcggtgtacttcccgtacctgttccacataggaacgtttcttttcctttctggttactttctggttgaatatgacaatctagcctcgtgccctctaggagacatacaacagtctttcgaagagcacccttgttcttggcaacaagaaagacttctcctgacatagtgggctctctgtaggtatcaaacctaccattgatcagacccagcatagaactaccctacattaaaccttggatttagaggacgcagggctgacggtcgttcctagagatggtttggcgtaaggatcctggtgcgaatctgacttatgggcccagcgactccgagtacggaaaatttcctagactttgccccacctacaa
gi|7 : aaggacttcccactaggcatggaaaagtgcgacggtcgcagaatttataagcttcccaaagctaggttccaccttacaagtctgtcaactccctatcgaagagtgacggagggcatagagcttaatggaaatggcgcgctgacacaatactctgatggcaacaaaccccgagctcctcctaggattcgttcagccaaaggtcgtctgtttgctttccactccttcaatgagatgagttgtcatgctcgagtcttaatattcgtGGGAGGCAATATTCATC-CCAGTCTGG-CATGG--GACA-GTGCGA-G-GAA-TT--CAGGAA-----C-AGAA-TC-TTCA-GACG-------AGCGGT----TCCTGGGA-A--T-GC-----------------T--G-CGT----A--CA-CAGAT--A-A-TAAATCT--GCTAAAC-TCTC-C-TAATCTGTAA--AGGGTCG-GAAAGAG-GGGTAA-T-AA--AATGTT--ACTGA-C-TGGTGTG--GACATATA--TAC-CCCTTCGGA-GATC-AAG-CAAT-CGAGCTTCCACATG-CT--AGTCTGGGG-G---TTGGCCGGCC-----TCTGCCAA-G-AG--TAGGTTACCCATT--A-T--TC--T-TCTTC---CT----CCTCTC-------GC-GGCGA-GGAA-TGCTAATAAACTTA----AAATCTTACATAGC-TTATGC-T-TCA-AAC-TGTTCG-CACTGCGAGCAAG---GAA---GT-----ATG-TA-----C--CA-AGTCTTCACCAGTCATGGA--GTTACC-TT---CAAAGG-GAGGACAA-GTACAGGGTTCAGCCTAGTAATGGA-------CA-ATCAGTCATCCCCCAACT-TCGAAA-GGAAA-TGGGACGGCATTA-AATCCACGCA-C-T---CAATTTCTCGCA-GAA--TGATTGACGTAAACT--AAAGTTTCTGGC--C---CTGAAATA-----GGGGCTA-TT-CCC-CTCA-CGGGGCGC-------GCC-ACGTAGGTCCCGG----GTAATTG-C---GCTGTA--TA-TTTCGT-TG----GTG--TCT-AC-TGGCCAGT-GGTGA-TGTCA---GC----G--GATGCCTTCCCC-TGG----AATC-TCTATCTCTAG--G----GCA--T--CTT-CCC-GAG-C-CCACT-CATCCCTGG--TTTC-TC-G--G-TTCAC-------GTC-------C-------TG-GG-TGA-GTAAGCTTC-AGCTTAACCTGAAA-CCTCT-AAGC-TG-CTA-CCAG---CCT
gi|8 : atccgT-----TCTCCA--CTAA-CATAGACCA-A-GTGC-A-C-GTA-TGATCAA--------A-AAAA-TCAT-CA-TA-GTATATTGAGC--T----TTC---GG----T-GC-----------------TT-A-GGTTCCGA--CAATATAT--A-A-T----CT--GCTAA-C-T-TC-CATACTCT--GA--CGTG--G-G---GAGTGGT----T-AA--G--GTT--ACGGATCATGGTGT---GACAT-TAC-TATCC--TTCTGA-GA-CAAA--CA-T-CGC----CCCCAGC-CTTCCGTCCTGGGCACGTCC--CCG--CCCCCTTCTGCCCA-A-AGCTT--------AGTCCAT-TAGTC--CTCCTCC---CCACCTCC---C-------ACTGGAGA-G----TGCTA-TG--CCCCTCGAGGGTCTAA---AATGCT-CGC-CTTTA-CATAT-CT-G-CA----------GCTAGAGCACGG-----GTA-TG-----CTACA-AAAGCTCC-CAA-CATG----AT--CT-TTTCGTAA-AG-GAG--CACAATACAGG-TTCAGC----TGATATAATGTTACCA-TTTA-----CCTCCA-CTGTGGAT-------------------TATAATCCACTCATT-T---C-------CCCA-GTA--TG-----------CTGAGA--TTTCTG-CGTC---CT-----A-----G----TATTC-CACTC--A-TGG--CTCATACAGATAT-ACG-AAGTCCTGACCCCGTAAGTGCC---ACTGTA--TA-T-TCGTGCG---GGTT--CCTCATC-GGCTAGTCGGTGG-TG-CAAAGCG----A--ATCGCCTTTTCC-CGGTGGCAATCATCTAT-TC-GGTAG----TCAGTT-CCTCGCCCGGAG-C-CCACCTCAT-CCTGGGTTTTC-TCGGTTGTTTCAC-------TCC-------T-------T---G-TGG-TAAAGCTTT-AGCT--------AA-CCTCT-AAGCTTGTCTACCCAGGTACCTACCACT-AATT-CCG-ATC
gi|9 : aat---C-------CCCA-GCA--CG-----------CT--CA--TTTCTC-C--A---CC-----A-----G----TA-TC-CAC-C--A-CGGT-CTC-------TGC-AGGTAGGTCCTCAACCCA-AATTA-T---TCTGCG--TA-TCAGTT-TG---AGAG--ACTCACCTGCGCAGT-GGTGA-TG-CA---CT----G--ATCGCCTTCCCC-TAT----AA---TCTATCTCTGG--G----GCA--C-CCGC-CCC-GAG-CACCCCC-CCTCCCTGA---TTC-TCTG--G-TCCACTCGCGATTCC-------C-------TA-TG-CGA-TCAAACCCC-AGTTC-------AA-CCCCC-AGGC-TG-C------------TACCACG-A--T-CCATATCC--TC-TCT--
gi|9 : aaAGG-T--TTCTCCTGAC-TAGTGGGCTCTCTGTA-AGTATCAAAC-CCATTATTGGCTCCAGACGAGGGCATAGAACCATCCTTCAATTCA-A-C--------CTTTAGAGCGACACAGGAGCTGGCGGTAGTTCCTTGTAGAAG--GTGCCGTCA-GCTCCTTGTGTGCCTCCTGACTTATGGTGCCAGGGTACTCC--ATACGG-AAATCCCC--GGCTTTGCCGCACCTAAAACnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnacaggtttctcctgactagtgggctctctgtaagtatcaaacccattattggctccagacgagggcatagaaccatccttcaattcaacctttagagcgacacaggagctggcggtagttccttgtagaaggtgccgtcagctccttgtgtgcctcctgacttatggtgccagggtactccatacggaaatccccggctttgccgcacctaaaacaag
Alignments
lowQualScore : 111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111
lowQualScore : 11111111 111111111 1111 22222222222222222 11 11111 1111111111 1 111111 1111111111111 111 22222222222222222222 11111 11111111111111 111 2222222 1111 111111111 11111 222222222222222 11111111111 2222222222222 11111 111 1111111 222222222222222 22222222 1111 111111 11111111111 111111111 333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333 111111 1111 22222222222 4444444444444444444 11111111 111 111 11
lowQualScore : 4 99999 3 0 44 3 44 3 3 3 3 99999 66666666 3 3 6 3 3 333333333 44 1111 555 3 44 3 77777777777777777 8888 3 44 00 44 3 3 6666 44 3 3 3 3 3 6 777 33 33 2 555 2 33 2 2 33 33 77 44 444 99999 3 44 2 33 2 77 7777777777 0 4 55 2 3 333333 44 88888 3 3 55 4444444444444 3 55 111 1 666 88888888888888888888 3 4444 0 3 55 7777 1 44444 3 3 4 4 4 444 4 99999999999999 111 4 8 55 777 8888 4444444 4 55 55 4 777 4 4 4 4 4 1 3333 666666666 11111 5 88 666 5 2 5 333333333333333 1 8 55 77777777777 777 55 3 55 666 99999999999 7777 3 66 3 55 4 1111111111111 4 2 8 0 00000 3 55 3 0 3 666 0 88 1 3 3 3 222 7777 44 3 99999 3 77 6666 44 3 3 3 3 3 6 0 44 3 44 6 0000000 555555555555555 3 44 3 2 3 44444444 3 33 3 3 5 0000 88 44 3 666666 44 55 4 4 99999999999 3 3 8888 3 3 3 3 44 333333333 000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 77 77 777777 44 3 3 3 000000 3 3 3 6 2 1111 33333333333 3 3 55 3 44 3 3 3 44 3 0 3 4444444444444444444 0 1 4 4 44444444 66 1 000 6 1 1 1 555 8 1 11
lowQualScore : . ..... . . .. . .. . . . . ..... ........ . . . . . ......... .. .... ... . .. . ................. .... . .. .. .. . . .... .. . . . . . . ... .. .. . ... . .. . . .. .. .. .. ... ..... . .. . .. . .. .......... . . .. . . ...... .. ..... . . .. ............. . .. ... . ... .................... . .... . . .. .... . ..... . . . . . ... . .............. ... . . .. ... .... ....... . .. .. . ... . . . . . . .... ......... ..... . .. ... . . . ............... . . .. ........... ... .. . .. ... ........... .... . .. . .. . ............. . . . . ..... . .. . . . ... . .. . . . . ... .... .. . ..... . .. .... .. . . . . . . . .. . .. . ....... ............... . .. . . . ........ . .. . . . .... .. .. . ...... .. .. . . ........... . . .... . . . . .. ......... ................................................................................. .. .. ...... .. . . . ...... . . . . . .... ........... . . .. . .. . . . .. . . . ................... . . . . ........ .. . ... . . . . ... . . ..
lowQualScore : 0 11111 3 4 66 3 66 3 3 3 3 66666 55555555 1 1 2 1 1 555555555 22 9999 444 1 22 1 77777777777777777 3333 1 22 44 22 1 1 5555 22 1 1 1 1 1 2 999 99 99 9 000 9 99 9 9 99 99 99 99 555 66666 1 22 9 99 9 99 8888888888 0 0 55 8 3 888888 66 33333 3 3 00 2222222222222 6 00 444 3 444 55555555555555555555 6 4444 9 6 00 7777 2 11111 6 6 0 0 0 444 0 55555555555555 000 9 0 55 000 5555 5555555 0 55 55 0 000 0 0 0 0 0 3 9999 222222222 11111 0 22 888 0 5 0 000000000000000 6 0 55 33333333333 333 00 6 00 444 22222222222 7777 6 55 6 00 0 8888888888888 0 3 2 8 11111 0 00 6 5 6 444 1 66 4 6 6 6 555 1111 66 3 66666 3 33 5555 22 1 1 1 1 1 2 2 22 1 22 2 0000000 000000000000000 3 88 3 9 3 11111111 1 44 3 3 7 4444 22 22 1 999999 66 00 0 0 00000000000 6 6 6666 3 3 3 3 66 333333333 666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666 99 99 444444 66 3 6 6 555555 1 1 2 2 2 0000 88888888888 3 7 11 2 66 3 3 1 22 3 8 3 0000000000000000000 8 2 0 4 22222222 22 0 222 7 0 0 0 666 0 0 00
consensus : CCGGGAGG-AAT-----TC-CCA--CTAG-CATGG--CA-A-GTGCGA-G-GTA-T---CAG--------C-AGAA-TC-T-CA-GA-G-------AGC--T----TCC---GA-A--T-GC-----------------T--A-GGTTCC-A--C--CATAT--A-A-T----CT--GCCAA-C-T-TC-C-TA-TC---GA--AGTG--G-G---GAG-GGC--A-T-AA--G--GCT--ACGGA-NATGGTGTG--GACACATA--TAT-C--TTCTGA-GG-C-AA--CA-T-CG-----CCCCAGC-CT--CGTCCTGGG-A-GT---CCG--C-----TCTGCCAA-A-AG--TNG-----TC--T-TA-TC--C-C-CTCC---CC----CC---C-------AC-GGAGA-G-AA-TGCTA-TG--CCCC----AGGTCT-----AAT-TT-TGC-C-TTA-CAT-T-CTCG-CA----------G---GAA---GTNTA-TAC--C---A----AG-------CAA-CATGGA--GT--CC-TT---CAA-GG-GAGC-CAC-ATACAGG-TTCAGC----TATTGTA-------C-ATTCA-----CCCCCA-CT-TGGATG-GGGAA-TGGGCCCGCAATA-AATCCACTCA-N-T---C-------CCCA-GTA--TG-----------CT--NA--TTTCTG-C--C---CT-----A-----G----TA-TC-CAC-C--A-CGGC-CTC-------TGC-ACGTAGGTCCTGAACCCGTAATTG-C---ACTGTA--TA-TCTCGT-TG---AGTG--CCTCACCTGGCCAGT-GGTGA-TG-CA---CC----G--ATCGCCTTCCCC-TGG----AATC-TCTATCTCTGG--G----GCA--T-CCTC-CCC-GAG-C-CCACC-CATCCCTGG--TTTC-TCGG--G-TCCAC-------TCC-------C-------TG-GG-CGA-TCAAGCTCC-AGCTC-------AA-CCTCC-GAGC-TG-CTA-CCAG---CCTACCACG-A--T-CCGATCC--TA-TCC--TCTCTA-CTG-TCCTCGGAAAAGGTGGG-----------TGCCTT-AA-AACGCA-CGCGCCT-GTAC-TTCCTCCGG-CGC-CCT--GGTTTC---------ACG-------------------T-------------------G-------------TC--------------------------CTGGGTGTCTGGT--CTTG--GG--T---TG--TAT-GACCAT-CT-GCCT------C-TGCGCCTC-CAGGNGACAATACA--CAGTCTTCCT---A------GGA-GCACGCCA-GTTGATTC--TTGGC-AGC-GAGAAGG-C--TTCTCCTGAC-TAGTGGGCTCCCTGTA-GGTATCAAAC-CTATCATTGGCTCCAGACGATGACATAGAACCACCCTTAAATTCA-A-C-TTGG-G-CTTTAGAGCGACGCAGGGGCTGGCGGTCGTTCCTAGTAGAAG--NTGCCGTCA-GCTCCTTGTGCGCCTCCTGACTTATGGTGCCAGGGCACTCC--GTACGG-AAATNCCC--GGCTTTGCCGCACCTAAAAC
Reference ( family-1452 ) : CCGGGAGG-AAT-----TC-CCA--CTAG-CATGG--CA-A-GTGCGA-G-GTA-T---CAG--------C-AGAA-TC-T-CA-GA-G-------AGC--T----TCC---GA-A--T-GC-----------------T--A-GGTTCC-A--C--CATAT--A-A-T----CT--GCCAA-C-T-TC-C-TA-TC---GA--AGTG--G-G---GAG-GGC--A-T-AA--G--GCT--ACGGA-NATGGTGTG--GACACATA--TAT-C--TTCTGA-GG-C-AA--CA-T-CG-----CCCCAGC-CT--CGTCCTGGG-A-GT---CCG--C-----TCTGCCAA-A-AG--TCG-----TC--T-TA-TC--C-C-CTCC---CC----CC---C-------AC-GGAGA-G-AA-TGCTA-TG--CCCC----AGGTCT-----AAT-TT-TGC-C-TTA-CAT-T-CTCG-CA----------G---GAA---GTNTA-TAC--C---A----AG-------CAA-CATGGA--GT--CC-TT---CAA-GG-GAGC-CAC-ATACAGG-TTCAGC----TATTGTA-------C-ATTCA-----CCCCCA-CT-TGGATG-GGGAA-TGGGCCCGCAATA-AATCCACTCA-N-T---C-------CCCA-GTA--TG-----------CT--NA--TTTCTG-C--C---CT-----A-----G----TA-TC-CAC-C--A-CGGC-CTC-------TGC-ACGTAGGTCCTGAACCCGTAATTG-C---ACTGTA--TA-TCTCGT-TG---AGTG--CCTCACCTGGCCAGT-GGTGA-TG-CA---CC----G--ATCGCCTTCCCC-TGG----AATC-TCTATCTCTGG--G----GCA--T-CCTC-CCC-GAG-C-CCACC-CATCCCTGG--TTTC-TCGG--G-TCCAC-------TCC-------C-------TG-GG-CGA-TCAAGCTCC-AGCTC-------AA-CCTCC-GAGC-TG-CTA-CCAG---CCTACCACG-A--T-CCGATCC--TN-TCC--TCTCTA-CTG-TCCTCGGAAAAGGTGGG-----------TGCCTT-AA-AACGCA-CGCGCCT-GTAC-TTCCTCCGG-CGC-CCT--GGTTTC---------ACG-------------------T-------------------G-------------TC--------------------------CTGGGTGTCTGGT--CTTG--GG--T---TG--TAT-GACCAT-CT-GCCT------C-TGCGCCTC-CAGGAGACAATACA--CAGTCTTCCT---A------GGA-GCACGCCA-GTTGATTC--TTGGC-AGC-GAGAAGG-C--TTCTCCTGAC-TAGTGGGCTCCCTGTA-GGTATCAAAC-CTATCATTGGCTCCAGACGATGACATAGAACCACCCTTAAATTCA-A-C-TTGG-G-CTTTAGAGCGACGCAGGGGCTGGCGGTCGTTCCTAGTAGAAG--NTGCCGTCA-GCTCCTTGTGCGCCTCCTGACTTATGGTGCCAGGGCACTCC--GTACGG-AAATNCCC--GGCTTTGCCGCACCTAAAAC
gi|1 : CCGAGAGA-AAT-----TC-CCA--CTGG-CATGG--CA-A-TTGCGA-G-GTA-T---CAG--------C-AGAA-CC-T-AA-GA-G-------AGC--C----TCC---GA-A--T-GC-----------------T--A-GGTTCC-A--C--TATAC--A-A-T----CT--GCCAA-C-T-CC-C-TA-TC---GA--AGTG--G-G---GAG-GGC--A-A-AA--G--GGT--ACGGA-AATGTTGTG--GACACATAATTAT-C--TTCTGA-GG-C-AA--TA-T-CA-----CTC-AGC-CT--CGTCCTGGG-A-TT---CCG--C-----TCTGCCAA-A-CG--TCA-----TC--A-TA-TC--T-T-CTCG---CC----CC---C-------AT-GGAGA-G-AG-TGCCA-TG--CTCC----AGGTCT-----AAT-TT-TGC-C-TTA-CAT-C-CCCG-CA----------G---GAA---GTTTA-CAC--C---A----AG-------CAA-CATGGA--AT--AC-GT---CAA-GG-GAGC-CAC-ATACAGG-TCCAAC----TATTGGA-------T-TTTCT-----CCCCCA-TT-TGGATG-GAGAA-TGGGCCCACAATA-AATCCACTGA-G-T---C-------CCCA-GTG--TG-----------GT--AA--TTTCTG-T--C---AT-----A-----G----TA-TC-CAC-C--A-CGGT-ATC-------TGC-AGGTAGGTCCTGAACCCGTGATTG-C---ACTGCA--TA-TCTCGT-TG---AATG--CCTCATCTGACCAGT-GGTGA-TG-CA---CC----G--ATCACCTTCCCT-TGG----AATC-TTTATCTCTAG--G----GCA--T-CCTC-CCC-GAG-C-CCACT-TATCCCTGG--TTTC-TCGA--G-TCCAC-------TCC-------C-------TG-GG-TGA-TTAAACTTC-AGCTC-------AA-CCGGC-GGGC-TA-CTA-CCAG---CATAACACG-T--TCCCGATCC--TC-TCTAGTCTCCA-CTG-TC--CGGAAAAGGTGGG-----------TACCTT-AA-AACGCA-CAAGCCT-GTAC-TTCCTCCGG-TGC-CCT--GGTTTC---------ACG-------------------T-------------------G-------------TT--------------------------CTGGGTGTCTAGT--CTCG--GG--T---TG--TAT-GACCAT-CT-GCCT------C-TGCGCTTC-CAGGAGACAAT--A--CAGTTTT--------------AA-GCATGCC------ATTC--TTGGC-AGC-GAGAAGG-C--TTCTCCTCAC-TAGTGAGCTCTCTGTA-GGTATCAGAC-CTATTATTGGCTCCAGACGATGACACAGAACCACTCTTAAATCCAGA-C-TTGG-GACTTTAGAGCGACGCTGGGGCTGGTGGTCATTCCTAGTAGAAG--CTGCTGTCA-GCTCCTTGTTTGCCTCCTGACTTATGGTGCCAGGGCACTCC--ATACGG-AAATTCCA--AGCTTTGCTGCACTTAAAAC
gi|10 : G-----------TT--CA--CCTCTG-C--C---CC-----A-----G----TA-TC-CAC-C--A-TGGC-CTA-------TGC-AGGTAGTTTCTTAACCCGTA-----C---GCTGTG--TA-TCCCAT-TG---AGGG--CCTCACCTGGCCAGT-GGTGA-TG-CAC--CC----A--ATCACCTTCCCC-TGG-----------------------------------TTC-CTC-GGG-T-CCACT-C--CCCTG-------------------AT-------TCT-------T-------TG-GG-CGA-TCAAACTCC-AGCCC-------AA-CCTCC-GGGC-TG-CTA-CTG------TA------A--T-CCG------TA-TCC--TCCCTA-CTG-TCCTCGGAAAAGGTTGG-----------CTCCTT-AA-AACGCA-CAAGCTT-GCAC-TTCCTCTGG-GGC-CCT--GATTTC---------ATGTAGGAACGTTTCTTCCC--T-------------------G-------------TC--------------------------CTGGGTGTCCGGTC-CTTG--GGCTT---TG--TTT-GACCAT-CT-GCCT------C-TGCACCTC-CAGGGAACAATACA--CAG-ATTCCT---A------AGG-GAACACCA-GTGGATTA--TTGGC-AGT--AGAAGG-C--TTCTCCTGAC-TAGTGGACT--CTGTA-GGTATCAAACTCTATCACTGGCTCCAGACGATGACATAGAACAACCC-----TTCA-ACC-TTAG-G-CTTTAGAACTA-----AGGCTGGCGGTCGCTCGTAGTAGAAT--ATACCGTCA-GCTCCTTATACGCCTCCTGACTTCTGTCGCC--GGCACTCT--CTACAG-TAATGCCA--AGCTTTGCCGCATTTTAAAC
gi|11 : GTCCTGGG-A-GT---CCG--C-----TCTGCCAA-A-AG--TTA-----TC--G-TA-TCTTC-T-CTCC---CC----CT---C-------CC-TGGAA-G-AA-TGCCA--G--CCCC----AGGTCT-----AAA-TT-TGC-C-TGA-CAT-T-CTCG-CA----------G---GAA---GTCTA-TAC--C---A----AG-------CAA-CATGGAAGGT--CC-TT---CAA-GG-GA-C-CAC-ATACAGG-TTCAGC----TAT-GTA-------C-ATTCA-----TCTCCA-CT-TGGATG-GGGAA-TGGGCC-GCAATA-AATCCACTCA-T-T-------------------------------------------------C--C---CC-----A-----G----TA-T---------------------------GC-ACGCAGGCCCTGATCCCGTAATTG-C---ACTGAA--TA-TCTCGT-TG---AGTG--TCTCACCTGGCTAGT-GGTGA-TG-CA---CC----G--ATCGCCTTCCCC-TGG----AATA-TCTATCTCTAG--G----GCA--T-CCTC-CCC-GAG-T-CCACT-CATTCCCAG--TTTC-TCGG--G-TTTAC-------TCC-------T-------TG-GG-TGA-TTAAGCTTC-AGCTA-------AA-CCTCatg
gi|11 : TA-CTAG---CTTACCACA-A--T-CCGATCtactgaaacttgggaagattccacaataggtaccagtaggtactagcttaccacaatccgatc
gi|12 : gtcctgggagtccgctctgccaaaagttatcgtatcttctctccccctccctggaagaatgccagccccaggtctaaatttgcctgacattctcgcaggaagtctataccaagcaacatggaaggtccttcaagggaccacatacaggttcagctatgtacattcatctccacttggatggggaatgggccgcaataaatccactcattccccagtatgcacgcaggccctgatcccgtaattgcactgaatatctcgttgagtgtctcacctggctagtggtgatgcaccgatcgccttcccctggaatatctatctctagggcatcctccccgagtccactcattcccagtttctcgggtttactccttgggtgattaagcttcagctaaacctctactgaaacttgggaagattccacaataggtaccagtaggCGGGAAG-AAT-----TT-CCA--CTAG-CATGA--CA-A-GTGCAA-G-GTG-T---CAG--------C-AGAA-TC-T-CA-GA-G-------AGC--T----TCC---GA-A--T-GC-----------------T--A-GGTTCC-A--C--CATAT--A-A-T----CT--GCTAA-C-T-TC-C-TA-TC---AA--AGTG--G-A---GAG-GGC--A-T-AA--G--GCT--ATGGA-CATGGTGTA--GACA--TA--TAT-C--TTCTGA-GA-C-AA--CA-T-CG-----CCCCAGC-CT--CGTCCTGGG-A-GT---CCG--C-----TCTGCCAA-A-AG--TAG-----CC--T-TA-TC--C-C-CCCC---CC----CC---CTCCCCTCCC-GGAGA-G-AA-TGCTT-TG--CCCC----AGATCT-----AAT-TT-TGC-C-TTA-CAT-T-CTCG-CA----------T---GAT---GTATA-TAC--C---A----AG-------CAA-CATGGA--GT--CC-TT---CAA-GG-GAGC-CAC-ATACAGA-TTCAGC----TATTGTA-------C-ATTCA-----CCCCCA-CT-TGGATG-GGGAA-TGGGCCCGCAATA-AATCCTCTTA-T-T---C-------TCAA-GTA--TG-----------CT--TA--TTTCTG-C--C---CT-----A-----G----TA-TA-CAC-C--
gi|13 : CT-GTAC-TTCATCCGG-CAC-CCT--AGTTTC---------ACG-------------------TAGGAACGTTTCCTTTCCCTG-------------TT--------------------------CTGGGTGTCTGGT--CTTG--GA--T---TG--TAT-GACCAT-CT-GCCTTTGGTTC-TGCGCCTC-TAGAAGACATTACA--CAGTCTTCCT---ATTCCTAAGATGCACACCA-GTTG-TTC--TTGGC-AAC-GAGAAGA-T--TTCTCCTGAC-TAGTGGGGTCTCTGTA-GGTATCAATC-CTATCATTGGCTCCAGATCAGGGCATAGAACCACCCTTCAATTGA-A-CATTGG-G-CTTTAGAGCGACGCAGGGACTGACATTCGTTCCTAGTAGAAG--GTGCCGTCA-GCTTCTTGTGCGCTTCCTGACTTATGGTCCCAAGGCACTCC--ATACGG-AAATGCCC--GGGTGTGCTGCCCCTAAAAC
gi|14 : --TA-TCCCTT-TG---ATAG--CCTCACCTGGCCAAT-GGTGA-TG-CA---CC----G--TTCACCTCCCCC-TAT----AATC-TGTATCTCTGG--G----GCA--T-CCTC-CGC-AAG-C-CCA-C-CATCCCTGC--TTTT-TCGG--G-TCGAC-------TCCCGAATCAC-------TG-GA-CGA-TCAAACTCC-AGCTT-------AA-CCTTC-GAAC-TG-------------CTACCACG-A--T-----TCA--TA-TCC--TTTCTA-CTG-TCCTCGGAAAAGGTGAA-----------TGCCTT-AA-AATGCA-CGCGCGT-GTAC-TTCTTACAG-CAC-CCT--GGTTTTTAAGTAGGAACG-------------------TTTCTTTTCCCC--------G-------------TT--------------------------CTGGGTGTCTGGacg
gi|15 : gcg-------AG-CCTCT-AAGC-TG-CTA-TCAG---CCTACCACA-A--T-CCGATCCC-TA-TCC--TCTCTA-CTA-TCCTCGGAAAAGGTGGG-----------TACCTT---------------------------CTCCGG-CGC-CCT--GGTTTC---------ATG-------------------T-------------------G-------------TC--------------------------TTTGGTGTCTGGT--CTTG--GG--T---TG--TAT-GAGCAT-CT-GTCT------C-TGCGCCTC-CAGGCGACAATACA--CAGTCTTCCTTAAA------GGA-ACACGCCA-TTTGATTC--TTGGA-AGC-GTGAAGG-C--TTTTCATGAC-TAATGGGTTCCTTGTA-GGT
gi|16 : taagctataTT-AC-AACGCA-CACGCCT-CGAC-------CGG-CAC-CCCTGGGTTTC---------ACG-------------------T-------------------G-------------TCCNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCTGGGTGTCTGGT----------------TG--TAT-GACTAT-TT-GCCT------T-TTTGCCTC-CAGGCGACAATACA--CAGTCTTCCC---AA-----GGA-GCAAGCCA-GTTGATTC--TTGAC-AGC-GAGATGG-C--TTTTCCTGAC-TAATGGGTTCCCTGTA-GATAT-------------------CAGACGATGACATAGAATCACCATTAAATTCA-A-C-CC-A-G-CTTTcgcccttgaattgaacccagctttgctgcacttaataaac
gi|17 : TA-CTAG---CCTACCACA-A--T-CCGATCC--TTATCC--TCTATA-CTG-TCCTCGGAAAAGGTGGG-----------TCCCTT-AA-AACGCA-CATGCCT-GTAC-CTCCTCCGG-CGC-CCT--GGTTTA---------ACG-------------------T-------------------G-------------TCTAA-----------------------TTAGGTGTCTGGT--CTTG--GG--T---TG--TAT-Ggctgcacttaatacaaatt
gi|18 : tcctngtgattaagcttcagctaaacctctactgaagcttgggaagcttccacaataggtaccagtaggCCGAGAGG-AAT-----TT-CCA--CTAG-CATGA--CA-A-GTGCGG-G-GTA-T---CAGCAGATTCTC-AGAG-TN-N-NN-NN-N-------NNN--N----NNN---NN-N--N-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNT--A-GGTTCC-A--C--CATAT--A-A-T----CT--GCCAA-C-T-TC-C-TG-TC---GA--AGTG--G-G---GAG-AAC--A-T-AA--G--GCT--ACGAA-TATGGTGTG--GACAC------AT-C--TTCTGA-GG-C-
gi|19 : G-A-GT---CCG--C-----TCTGCCAA-A-AG--TAG-----TC--T-TA-TC--C-A-G-----------------C-------ACTGGAGA-G-AA-TGTTA-TG--TCCC----AGGTCT-----AAT-TT-TGC-C-TAA-CAT-T-CTCG-CA----------G---GAA---GTATG-TAC--C---A----AG-------CAA-CATTGA--GT--CC-TT---CAA-GG-GAGC-CAC-GTACAGG-TGCAGC----TATTGTA------------CA-----CCCCC
gi|19 : -TACACCCC-CTGGCGACAATACA----GTCTTCCT---A------tggcgacaatacagtcttccta
gi|2 : gagtccgctctgccaaaagtagtcttatccagcactggagagaatgttatgtcccaggtctaattttgcctaacattctcgcaggaagtatgtaccaagcaacattgagtccttcaagggagccacgtacaggtgcagctattgGAAGG-AAT-----TC-CAA--CAAG-CATGG--AA-A-GTGCGA-G-GCA-T---CAG--------CCAGAA-TCCT-CA-GA-G-------AGC--C----TCC---AA-AATT-GCC----------------T--A-GGTTCC-A--CT-CATACCAA-A-T----CT--GCCAA-T-T-CCTC-TA-TC---GA--AGTG--A-G---CAG-GGC--AAT-AAAAG--GCA--ACGGA-AA------G--AACGC---------------TGA----T-AA--CA-T------------AA---T--CATC-TGAA-A-------CG--C-----TCTGACAA-A-GG--TCG-----TC--TGTA-TC--T-T-CTCT---CC----TC---C-------AC-GGAGA-G-AG-TGCCT-TG--CTCA----AGGTCT-----AAT-TC-CGC-C-TTA-CAT-C-CTCG-CA----------G---GAA---GTCTA-CAC--C---A----AG-------CAA-CATTTA--GT--CC-TT----AA-----AAC-CAC-ATGCATG-TCCA
gi|2 : attcTCCACTCA-GAT---C-------CCCA-GCA--TG-----------CT--CA--TTTCTG-T--C---CC-----A-----G----CA-TA-CAC-C--A-CGGT-CTT-------TGC-AGGTAGGTTCTGAACCCATAACTG-CTAGA-TGCA--TA-TC-CAT-TT---AATGG-CCTCACCTGGCCAGT-CGTGA-TG-CA---CA----A--ATCACCTCCCCCCTAT----GATC-TGTATATCTGG--G----GCA--T-CCTC-CTC-GGG-C-CCACC-CATCCCTGA--TTTC-TTGG--G-TCCAC-------TCC-------CGAATCCCTG-GA-CGA-TCAAACTCC-AGCTT-------AA-CCTCC-GGGC-TA-CTA-CCA-----------TG-A--T-CCA------TA-TCC--TCTCCA-CTG-TCCTCGAAAAAGGAGGA-----------TGCCTT-AA-AATGCA-TGCGCCT-GTAC-TTCCTCCGG-CAC-CCT--AGTATC---------ACGCAGGAATGTTTCTTTTCCCT-------------------G-------------TT--------------------------CTGGGTATCTGGT--CTTG--AG--G---TG--TAT-GACCAT-TT-GCCT------C-TGCGCCTC-TAGGAGACA------------TT-----------------GCA---CA-GTTG-TTC--TTGGT-AAC-GAGAAGA-T--TTCTCCTGAC-CAGTGGGCTCTCTGTA-GGTATCAAAT-CTATCATTGGCTCCAGACCAGGGCACAGAATCACCTTTGAAC------C-TTGGTA-CTTTGGAGCGACGCTGGGGCTGGT-----TTCCTAGTAGAAG--CTGCTGTCA-GCTCTTTGTTTTCC-CCTGACTTATGGTACCAGGGCActcagatccccagcatgctcatttctgtcccagcatacaccacggtctttgcaggtaggttctgaacccataactgctagatgcatatccatttaatggcctcacctggccagtcgtgatgcacaaatcacctcccccctatgatctgtatatctggggcatcctcctcgggcccacccatccctgatttcttgggtccactcccgaatccctggacgatcaaactccagcttaacctccgggctactaccatgatccatatcctctccactgtcctcgaaaaaggaggatgccttaaaatgcatgcgcctgtacttcctccggcaccctagtatcacgcaggaatgtttcttttccctgttctgggtatctggtcttgaggtgtatgaccatttgcctctgcgcctctaggagacattgcacagttgttcttggtaacgagaagatttctcctgaccagtgggctctctgtaggtatcaaatctatcattggctccagaccagggcacagaatcacctttgaaccttggtactttggagcgacgctggggctggtttcctagtagaagctgctgtcagctctttgttttcccctgacttatggtaccagggcat
gi|20 : attcgaaggaattccaacaagcatggaaagtgcgaggcatcagccagaatcctcagagagcctccaaaattgcctaggttccactcataccaaatctgccaattcctctatcgaagtgagcagggcaataaaaggcaacggaaagaacgctgataacataatcatctgaaacgctctgacaaaggtcgtctgtatcttctctcctccacggagagagtgccttgctcaaggtctaattccgccttacatcctcgcaggaagtctacaccaagcaacatttagtccttaaaaccacatgcatg-TACACCCC-CTGGCGACAATACA----GTCTTCCT---AA-----GGA-GTACTCCA-GTTGATTC--CTGGC-AGC-AAGAAGG-C--TTTTCCTGAC-TAATGGGTTCCTTGTA-GGTAT-------------------CAGACGATGACACAGAATCACCTTTAAATTCA-A-C-TT-A-G-CTTTt
gi|21 : cagctattgCCGGGGG---AT-----TT-CCA--CAAG-CATGA--CA-A-GTGCGA-G-GTA-T---CAG--------C-AGAA-TC-T-CA-GA-G-------AGC--TTAAATCT---GA-A--T-GC-----------------T--A-GGTTCC-A--C--CATAT--A-A-T----CT--GTCAA-T-T-TC-C-T-----------AGTG--G-G---GAG-GAC--A-T-AA--G--ACT--ACGGA-AATGGTGTG--G--ACATA--TAT-T--TTCTGA-GG-C-AA--gatgcacttaatacaa
gi|22 : CCGAGAAG-AAT-----TC-CAA--CTAG-CATGG--AA-A-GTGCGA-G-GCA-T---CAG--------C-AGAA-TA-T-CA-GA-G-------AGT--C----TCC---GA-A--T-GC-----------------T--A-AATTAT-A--C--CATAC--A-A-T----CT--G----------T-C-TG-TC---GA--AGTG--G-G---GAG-GAC--A-C-AA--G--GCA--ACGGA-AATGGCGCT--GACAC-T---TAT-C--TTCTGA-GG-C-A
gi|23 : G--------C-AGAT-TC-T-CACGA-G-------TGC--T----TCC---GA-A--T-GCA----------------T--ATGGTTCC-A--C--CATAT--A-A-T----CT--GCCAA-CTT-TC-C-TG-TC---GA--AGTG--G-G---GAG-AAC--A-T-AA--G--GCTAAACGAA-TATGGTGTG--GACAC------AT-C--TTCTGA-GG-C-AA--
gi|24 : GT--CTTG--GG--T---TG--TTT-GACCAT-CT-ACCA------C-TGCACCTC-TATAAGACA---------GTCTTCAT---AC-----GAA-GCACACCA-ATTGATTC--TTGGT-AGC-GAGAAGG-A--TTCTCCTGt
gi|25 : A---CC----G--ATCACCTCCCCC-TAT----AATC-TGTATCT--GG--G----GCA--TGCCTC-CAG-GA--C-CCACC--ATCCCTGG--TTTC-TCGG--G-TCCAC-------TTC-------C-------
gi|26 : tgcatgcgtttctTGA-GG-C-AA--CA-A-AA-----TCCCAGC-CT--TGTCCTGGG-A-TT---CCG--T-----TCTGCCAA-A-Agaatg
gi|27 : ---GA--AGTG--G-G---TAG-GGC--A-T-AA--A--GCT--ACGGA-TATGGTGTG--GACA
gi|3 : t-CCA--CTAG-CATGA--CA-A-GTGGCA-G-GTG-----CA---------C-AGAAGTC-C-AA-GA---------AGC--T----TCC---GA-A--TAGC-----------------TTAA-GGTTCA-A--C--CATAT--ATA-T----CTTGGCTAA-C-T-TC-C-TA-TC---AA--AGTG--G-A---GAG-GG-----T-AA--G--GAT--GC-----ATGGTTAT--GACATATA--TAT-C--TTCT-A-GA-C-AA--CA-T-CG-----CCC-AGC-CT--C-TGCTGGG-A-GT---CCG--C-----TTTGGCAA-A-AG--TAA------C--T-TA-CC--C-C-CTCC---CC----CC---CTCCCTC-CC-GGAGA-G-AA-TGCTT-TG--CCCG----AGATCT-----AAT-TT-TGCGC-TTAACAT-T-CTCG-CA----------T---GTCT--GTATAATGC--C---A----AG-------CAA-CATGGA--GC--CTGTT---CAA-GG-GAGC-CAC-ATACAGA-T-CAGCG---TATTGTA-------CGATTCA-----CCC--A-CT---GATG-GCGAA-TGGGCCCGCAATA-AATCCTCTTA-T-T---T-------CTCAAGTGACTG-----------CT--TA--TTTCTG-C--CTACCT-----ACAAGTA----TA-TC-CAC-C--A-CGGC-TCG-------TGCTACG-AGGTCCTGACCCCGTAATTG-C---ACTGTA--TA--CTCGT-TG---GGTGTCCCTGACCTGGCCATT-GGTGA-TG-CAG--GC----G--ATCGCCTTCCCC-TTG----AATC-TCTATTTCTGG--GAAAAACA--T-CCTC-CCT-GAGCC-CCACT-CATCCCTGG--TTTCTTCGG--GTTTCAC-------TCC-------T-------TGTGGTTGA-TTAAGCTTTAAGCT--------AA-TCTCTAAAGC-TG-CTATCCAG---CCTACCACA-A--T-C--GTCCAATA-TCC--TCTCTATCTGTTCCTCGGAAAAGGTGGG-----------TGC--T-AA-AACGCA--ACGCCTGGTAC-TTCCTCCGG-CGC-CCT---GTTTC---------ACG-------------------T-------------------G-------------T---------------------------CTGGGTGTCTGGT--C--------------G--TAT-GGACTT-GT-GCCT----------TGCCTC-CA-GCGACAATACATGCAGTCTTCCCA--A------GGA-GCAAGCCA-GTTGATCT--GTGAC-AGCGGAGATGG-C--T--TTCTGAC-TAATTGTTTCCCTGTA-GATAT-------------------CAGACGATGACATAG-ATCACCATTAAATCCA-
gi|4 : gagatatAGG-ATT-----TC---A---TAG-CATGA--CA-A-G--CGA-G-GTAAT---AAG--------C-AGAA-T--T-CA-GA-T-------AGT--T------C---GG-G--T--C-----------------T----GGTTC-----------A---A-A-T----TT---TTAA-C-T-TC-C-TA-TC---GA---GTG--G-G---AAG---C--A-TTAA--G--GTT--ACGGA-CATG-TGTA--AA---ATA--T-T-C--TTCTGA-GA-C-AGAGCA-TTCG-----CCCAGGCTCT--CGTCCTGTG-C-GTG--CCG--C-----TCAGCCAA-GTAA--TC------TT--T-TA-TC--C-C-C-CC---CC----CT---C-------AC-T-AGA-G-AA--GCTA-TG--CCAC----AG--CT-----A-T-TT-T-C-C-TT--------TTCGACA----------G---AAA---GT-TG-TAC--CTACACTGTAG-------CAA-CATGGA--GT--CC-TT---TAA-GGTGAGC-CAT-ATA--AG-TTCA-C----TATTGTA-------C-ATTC--------CCCA-CT-TGGA---GGGAACTGGGCCCGCAATA-AATCCACTCG-A-TGTGCGG-----CCTATGTA--TG-----------CT--AA--TTTCT--C--C---CT-----A-----G----TA-TGACAC-C--ATCGGT-CCT-------TGT-ACGT--GTCCTGG-CCCGTA-TTG-----ATTATAGATACTCTCGT-TGTTTGGTG--TCT-AC-TGGCCAGT-GGTGAATG-CG---CCTCTTGTTATCGCCTTCCC--TGG----AATC-TCTATCTCCTC--A----GCA--T-CTTC-CGC-GAG-C-CCACCTCAT-CCTGG--TTTC-TCGG--G-TTCAC-------T-C-------C-------TG-GG-TGAGT--AGCTTT-A-CT--------AA-GCTCT-AAGC--G-CTA-CCAG---CCTACCACA-A--T-CCGATTC--AT-TCC--TCTCTA-ATG-TTCTCGG--AATGCGGC-----------TGCCTTAAA-AACGCA-TG---CT--TACGTTCCTCCGGTCGC-CCT--GGTTT----------------------------------------------------------------------------------------------TTGGTTGTC------CTTG--GG--TTGATG--TATGGACCATGCT-G-CT------C-TTTGCTTCTCAG--GGC--T--------TTTTCCT---A------GGA-ACACATTA---TGATTCCTTCGGCGAGC-GAGAAGG-CAGTTTTCCTGA--TATTGTTCACCCTGTACGGTAT
gi|5 : GGGGAG-AAT-----TC-C-A--CAAG-CATGA--CA-A-GT-CGA-GTGTA-T---CAG--------C-AGAA-TC---CA-GA-G--------GT--TAAA-TCT---GATA--T--C-----------------T--T-G--TCC-ATTC--CATAT--A-A-T----CT---CCAA-C-T-TC-C-TA-----------GTG--G-G---GAG-GAC--A-T-AA--G---CT--ACGGA-TAT--TGTA-----ACATA--TCT-C------GA-G--C-AA--C--T-CG-----CCC-AGC-TT--C-TCCTTAG-A-GC---CC---------TCTGCCAATA-AG--TAG-----TC--T-TA-TC--C----TCC---CC----CT--------------GGAG-------TGC-A-TC--CCTC----AAGTCT-----AGT-TT-TGC-T-TTA-CGT-T-CTT--CT----------G---GAA---GTTTAATAC--C---A-----G-------CAA-CATGGA--GC--CC-TT---CAA-GG-GAGC-CAC-ATACAGG-TTCAGC----TAGT-TA-------C-ATT-A-----CCCC-A-CT---GATGTGGGAA-TGG-CCCGCAATA-AAACCAC-CA-G-T---C-------CC-A-GTA--T------------CT--AA--TGTCTG-C--C---CT-----A-----G----TA-TC-CAC-C--A-AGGC-TTC-----------ACGTA--TCCTGAACCTGTAATTG-A---ACTG-A--TA-TCTCAT-TG---AAGG--TCTCACCT--CCAGT-GATGA-TG-CA---CC----G--ATTGC-TTCCCC-TG-----AATC-TCTATCTCTAG--G----CGA--T-CATC-CCG-TAC-C-GCACT-CATTCC-GG--TTTC-TGCG--G-TTCAC-------TTC-------T-------TG-G----A-TTAAGCTC--AGCTT-------AAACCTCT-AAGC-TG-CTA-CCAGT--CCTACCACATA--T-CCGATTCA-TA-TCT--TCTCTA-CTG-TCCTCGAAAAATGTG-------------TGCCTT-AATAACGCA-CATGTCT-GTAC-TTC-TCCG--CGC-CCT--G--TTC---------ACG-------------------T-------------------G-------------TC--------------------------TTGGGTGTCTGGT--CTTGA-AG--T---T---TAT-GACCAT-CT-GCCT------C-TGCGC--C-CA-GAGAC-ATACA--CAATCTTCC----A------AGA-GCACGCCATGTGGATCT--GTGGC-AGC-GAGAA-G-C--TTTTCCTGAC-TAAT-GGTTCATTGTA--GTAT-------------------CAGACGATTACATAAAATCACCCTTGAATTCA-A-C-tcagagatcgacatagaatatttggcccttgaagtgtgcagtgatagctttttttgcttcatttatacaaa
gi|6 : AGG-ACT-----TC-CCA--CTAGGCATGG--AA-AAGTGCGACG-GT------C-G--------C-AGAA-TT-T--A-TA---------AGC--T----TCC---CA-A--A-GC-----------------T--A-GGTTCC-A--C--CTTAC--A-AGT----CT--GTCAA-C-T-CC-C-TA-TC---GAAGAGTG--ACG---GAG-GGC--A-T-AG--A--GCTTAATGGA-AATGGCGCGCTGACACA-A--TA-----CTCTGATGG-C-AA--CA---AA-----CCCCGAG-CT--CCTCCTAGG-A--T---TCG--T-----TCAGCCAA-A-GG--TCG-----TC--TGTT-TG--C-T-TTCCACTCC----TT---C-------AA-TGAGATG-AGTTGTCA-TG--CTCG----AGTCTT-----AAT-AT-Tccatcttgctacacttaatacaaat
gi|6 : aTATCTCTGGA-G----GCA--T-CCTC-CC--GA--C-CCACC--ATCCATGG--TTTC-TCGG--G-TCCAC-------TCCGAATAT-C-------TG-GA-TGA-TCAAACTCC-AGCT--------AA-TTCCG-GGGC-TG-C-------------ACCAC--------CAAGCCA-TA-TCC--TCTCTA-CTG-TCCTCG-AAATGGTTGAATAAAATCCATTACCTT-AA-CATGCAGCGCGG-T-GTAC-TTCC------CGTACCT--G-TTCC---------ACA-------------------T-------------------AGGAACGTTTCTTTTC--------------------------CT---T-TCTGGTTACTTTCTGG--T---TGAATAT-GACAAT-CTAGCCT------CGTGC-CCTC-TAGGAGACA-TACAA-CAGTCTTTCG---A------AGA-GCAC-CC---TTG-TTC--TTGGC-AAC-AAGAAAGAC--TTCTCCTGACATAGTGGGCTCTCTGTA-GGTATCAAAC-CTACCATTGA--TCAGAC-CCAGCATAGAACTACCC-TACATTAA-A-C-CTTG-G-ATTTAGAG-GACGCA-GGGCTGACGGTCGTTCCTAG-AGATGGTTTGGCGTAAGGATCCTGGTGCGAAT-CTGACTTATGGGCCCAGCG-ACTCCGAGTACGGAAAATTTCCTAGACTTTGCCCCACCTACAAcgttatctctggaggcatcctcccgacccaccatccatggtttctcgggtccactccgaatatctggatgatcaaactccagctaattccggggctgcaccaccaagccatatcctctctactgtcctcgaaatggttgaataaaatccattaccttaacatgcagcgcggtgtacttcccgtacctgttccacataggaacgtttcttttcctttctggttactttctggttgaatatgacaatctagcctcgtgccctctaggagacatacaacagtctttcgaagagcacccttgttcttggcaacaagaaagacttctcctgacatagtgggctctctgtaggtatcaaacctaccattgatcagacccagcatagaactaccctacattaaaccttggatttagaggacgcagggctgacggtcgttcctagagatggtttggcgtaaggatcctggtgcgaatctgacttatgggcccagcgactccgagtacggaaaatttcctagactttgccccacctacaa
gi|7 : aaggacttcccactaggcatggaaaagtgcgacggtcgcagaatttataagcttcccaaagctaggttccaccttacaagtctgtcaactccctatcgaagagtgacggagggcatagagcttaatggaaatggcgcgctgacacaatactctgatggcaacaaaccccgagctcctcctaggattcgttcagccaaaggtcgtctgtttgctttccactccttcaatgagatgagttgtcatgctcgagtcttaatattcgtGGGAGGCAATATTCATC-CCAGTCTGG-CATGG--GACA-GTGCGA-G-GAA-TT--CAGGAA-----C-AGAA-TC-TTCA-GACG-------AGCGGT----TCCTGGGA-A--T-GC-----------------T--G-CGT----A--CA-CAGAT--A-A-TAAATCT--GCTAAAC-TCTC-C-TAATCTGTAA--AGGGTCG-GAAAGAG-GGGTAA-T-AA--AATGTT--ACTGA-C-TGGTGTG--GACATATA--TAC-CCCTTCGGA-GATC-AAG-CAAT-CGAGCTTCCACATG-CT--AGTC-TGGG-G-GTTGGCCGGCC-----TCTGCCAA-G-AG--TAGGTTACCCA-T-TA-TT--C-TTCTTC---CT----CCTCTC-------GC-GGCGA-GGAA-TGCTAATAAACTTA----AAATCTTACATAGC-TTATGC-T-TCA-AAC-TGTTCG-CACTGCGAGCAAG---GAA---GTATG-TAC--C---A----AGTCTTCACCAGTCATGGA--GTTACC-TT---CAAAGG-GAGGACAA-GTACAGGGTTCAGCCTAGTAATGGA-------C-AATCAGTCATCCCCCAACT-TCGAAA-GGAAA-TGGGACGGCATTA-AATCCACGCA-C-T---CAATTTCTCGCA-GAA--TGATTGACGTAAACT--AAAGTTTCTGGC--C---CTGAAATA-----GGGGCTA-TT-CCC-CTCA-CGGGGCGC-------GCC-ACGTAGGTCCCGG----GTAATTG-C---GCTGTA--TA-TTTCGT-TG----GTG--TCT-AC-TGGCCAGT-GGTGA-TGTCA---GC----G--GATGCCTTCCCC-TGG----AATC-TCTATCTCTAG--G----GCA--T--CTT-CCC-GAG-C-CCACT-CATCCCTGG--TTTC-TC-G--G-TTCAC-------GTC-------C-------TG-GG-TGA-GTAAGCTTC-AGCTTAACCTGAAA-CCTCT-AAGC-TG-CTA-CCAG---CCT
gi|8 : atccgT-----TCTCCA--CTAA-CATAGACCA-A-GTGC-A-C-GTA-TGATCAA--------A-AAAA-TCAT-CA-TA-GTATATTGAGC--T----TTC---GG----T-GC-----------------TT-A-GGTTCCGA--CAATATAT--A-A-T----CT--GCTAA-C-T-TC-CATACTCT--GA--CGTG--G-G---GAGTGGT----T-AA--G--GTT--ACGGATCATGGTGT---GACAT-TAC-TATCC--TTCTGA-GA-CAAA--CA-T-CGC----CCCCAGC-CTTCCGTCCTGGGCACGTCC-CCG--CCCCCTTCTGCCCA-A-AGCTTAG-----TCCAT-TAGTC--CTC-CTCC---CCACCTCC---C-------ACTGGAGA-G----TGCTA-TG--CCCCTCGAGGGTCTAA---AATGCT-CGC-CTTTA-CATAT-CT-G-CA----------GCTAGAGCACGGGTA-TGCTAC---A----AAAGCTCC-CAA-CATG----AT--CT-TTTCGTAA-AG-GAG--CACAATACAGG-TTCAGC----TGATATAATGTTACC-ATTTA-----CCTCCA-CTGTGGAT-------------------TATAATCCACTCATT-T---C-------CCCA-GTA--TG-----------CTGAGA--TTTCTG-CGTC---CT-----A-----G----TATTC-CACTC--A-TGG--CTCATACAGATAT-ACG-AAGTCCTGACCCCGTAAGTGCC---ACTGTA--TA-T-TCGTGCG---GGTT--CCTCATC-GGCTAGTCGGTGG-TG-CAAAGCG----A--ATCGCCTTTTCC-CGGTGGCAATCATCTAT-TC-GGTAG----TCAGTT-CCTCGCCCGGAG-C-CCACCTCAT-CCTGGGTTTTC-TCGGTTGTTTCAC-------TCC-------T-------T---G-TGG-TAAAGCTTT-AGCT--------AA-CCTCT-AAGCTTGTCTACCCAGGTACCTACCACT-AATT-CCGATC
gi|9 : aat---C-------CCCA-GCA--CG-----------CT--CA--TTTCTC-C--A---CC-----A-----G----TA-TC-CAC-C--A-CGGT-CTC-------TGC-AGGTAGGTCCTCAACCCA-AATTA-T---TCTGCG--TA-TCAGTT-TG---AGAG--ACTCACCTGCGCAGT-GGTGA-TG-CA---CT----G--ATCGCCTTCCCC-TAT----AA---TCTATCTCTGG--G----GCA--C-CCGC-CCC-GAG-CACCCCC-CCTCCCTGA---TTC-TCTG--G-TCCACTCGCGATTCC-------C-------TA-TG-CGA-TCAAACCCC-AGTTC-------AA-CCCCC-AGGC-TG-------------CTACCACG-A--T-CCA------TA-TCC--TCTCT
gi|9 : aaAGG-T--TTCTCCTGAC-TAGTGGGCTCTCTGTA-AGTATCAAAC-CCATTATTGGCTCCAGACGAGGGCATAGAACCATCCTTCAATTCA-A-C--------CTTTAGAGCGACACAGGAGCTGGCGGTAGTTCCTTGTAGAAG--GTGCCGTCA-GCTCCTTGTGTGCCTCCTGACTTATGGTGCCAGGGTACTCC--ATACGG-AAATCCCC--GGCTTTGCCGCACCTAAAACnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnacaggtttctcctgactagtgggctctctgtaagtatcaaacccattattggctccagacgagggcatagaaccatccttcaattcaacctttagagcgacacaggagctggcggtagttccttgtagaaggtgccgtcagctccttgtgtgcctcctgacttatggtgccagggtactccatacggaaatccccggctttgccgcacctaaaacaag
Alignments
lowQualScore : 111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111
lowQualScore : 11111111 111111111 1111 22222222222222222 11 11111 1111111111 1 111111 1111 111 22222222222222222222 11111 11111111111111 111 2222222 1111 111111111 11111 222222222222222 11111111111 2222222222222 11111 111 1111111 222222222222222 22222222 1111 111111 11111111111 111111111 333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333 11111111 1111 22222222222 4444444444444444444 11111111 111 111 11
lowQualScore : 4 99999 3 0 44 3 44 3 3 3 3 99999 66666666 3 3 6 3 3 333333333 44 1111 555 3 44 3 77777777777777777 8888 3 44 00 44 3 3 6666 44 3 3 3 3 3 6 777 33 33 2 555 2 33 2 2 33 33 77 44 444 99999 3 44 2 33 2 77 7777777777 0 4 55 2 3 333333 44 88888 3 55 1 99999 1111 55 3 55 111 1 666 88888888888888888888 3 4444 0 3 55 7777 1 44444 3 3 4 4 4 444 4 99999999999999 111 4 8 55 777 8888 4444444 4 55 55 4 777 4 4 4 4 4 1 3333 666666666 11111 5 88 666 5 2 5 333333333333333 1 8 55 77777777777 777 55 3 55 666 99999999999 7777 3 66 3 55 4 1111111111111 4 2 8 0 00000 3 55 3 0 3 666 0 88 1 3 3 3 222 7777 44 3 99999 3 77 6666 44 3 3 3 3 3 6 0 44 3 44 6 0000000 555555555555555 3 44 3 2 3 44444444 3 33 3 3 5 0000 88 44 3 666666 3 55 4 4 99999999999 3 3 8888 3 3 3 3 44 333333333 000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 77 77 777777 44 3 3 3 3 11111111 0 1 6 2 1111 33333333333 3 3 55 3 44 3 3 3 44 3 0 3 4444444444444444444 0 1 4 4 44444444 66 1 000 6 1 1 1 555 8 1 11
lowQualScore : . ..... . . .. . .. . . . . ..... ........ . . . . . ......... .. .... ... . .. . ................. .... . .. .. .. . . .... .. . . . . . . ... .. .. . ... . .. . . .. .. .. .. ... ..... . .. . .. . .. .......... . . .. . . ...... .. ..... . .. . ..... .... .. . .. ... . ... .................... . .... . . .. .... . ..... . . . . . ... . .............. ... . . .. ... .... ....... . .. .. . ... . . . . . . .... ......... ..... . .. ... . . . ............... . . .. ........... ... .. . .. ... ........... .... . .. . .. . ............. . . . . ..... . .. . . . ... . .. . . . . ... .... .. . ..... . .. .... .. . . . . . . . .. . .. . ....... ............... . .. . . . ........ . .. . . . .... .. .. . ...... . .. . . ........... . . .... . . . . .. ......... ................................................................................. .. .. ...... .. . . . . ........ . . . . .... ........... . . .. . .. . . . .. . . . ................... . . . . ........ .. . ... . . . . ... . . ..
lowQualScore : 0 11111 3 4 66 3 66 3 3 3 3 66666 55555555 1 1 2 1 1 555555555 22 9999 444 1 22 1 77777777777777777 3333 1 22 44 22 1 1 5555 22 1 1 1 1 1 2 999 99 99 9 000 9 99 9 9 99 99 99 99 555 66666 1 22 9 99 9 99 8888888888 0 0 55 8 3 888888 66 33333 3 00 0 11111 5555 00 6 00 444 3 444 55555555555555555555 6 4444 9 6 00 7777 2 11111 6 6 0 0 0 444 0 55555555555555 000 9 0 55 000 5555 5555555 0 55 55 0 000 0 0 0 0 0 3 9999 222222222 11111 0 22 888 0 5 0 000000000000000 6 0 55 33333333333 333 00 6 00 444 22222222222 7777 6 55 6 00 0 8888888888888 0 3 2 8 11111 0 00 6 5 6 444 1 66 4 6 6 6 555 1111 66 3 66666 3 33 5555 22 1 1 1 1 1 2 2 22 1 22 2 0000000 000000000000000 3 88 3 9 3 11111111 1 44 3 3 7 4444 22 22 1 999999 6 00 0 0 00000000000 6 6 6666 3 3 3 3 66 333333333 666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666 99 99 444444 66 3 6 6 6 00000000 7 0 2 2 0000 88888888888 3 7 11 2 66 3 3 1 22 3 8 3 0000000000000000000 8 2 0 4 22222222 22 0 222 7 0 0 0 666 0 0 00
consensus : CCGGGAGG-AAT-----TC-CCA--CTAG-CATGG--CA-A-GTGCGA-G-GTA-T---CAG--------C-AGAA-TC-T-CA-GA-G-------AGC--T----TCC---GA-A--T-GC-----------------T--A-GGTTCC-A--C--CATAT--A-A-T----CT--GCCAA-C-T-TC-C-TA-TC---GA--AGTG--G-G---GAG-GGC--A-T-AA--G--GCT--ACGGA-NATGGTGTG--GACACATA--TAT-C--TTCTGA-GG-C-AA--CA-T-CG-----CCCCAGC-CT--CGTCCTGGG-A-GT---CCG--C-----TCTGCCAA-AAG--TAG-----TC--T-T--A-TC--C-C-CTCC---CC----CC---C-------AC-GGAGA-G-AA-TGCTA-TG--CCCC----AGGTCT-----AAT-TT-TGC-C-TTA-CAT-T-CTCG-CA----------G---GAA---GTNTA-TAC--C---A----AG-------CAA-CATGGA--GT--CC-TT---CAA-GG-GAGC-CAC-ATACAGG-TTCAGC----TATTGTA-------C-ATTCA-----CCCCCA-CT-TGGATG-GGGAA-TGGGCCCGCAATA-AATCCACTCA-N-T---C-------CCCA-GTA--TG-----------CT--NA--TTTCTG-C--C---CT-----A-----G----TA-TC-CAC-C--A-CGGC-CTC-------TGC-ACGTAGGTCCTGAACCCGTAATTG-C---ACTGTA--TA-TCTCGT-TG---AGTG--CCTCACCTGGCCAGT-GGTGA-TG-CA---CC----G--ATCGCCTTCCCC-TGG----AATC-TCTATCTCTGG--G----GCA--T-CCTC-CCC-GAG-C-CCACC-CATCCCTGG--TTTC-TCGG--G-TCCAC-------TCC-------C-------TG-GG-CGA-TCAAGCTCC-AGCTC-------AA-CCTCC-GAGC-TG-CTA-CCAG---CCTACCACG-A--T-CCGATCC--T-ATCC--TCTCTA-CTG-TCCTCGGAAAAGGTGGG-----------TGCCTT-AA-AACGCA-CGCGCCT-GTAC-TTCCTCCGG-CGC-CCT--GGTTTC---------ACG-------------------T-------------------G-------------TC--------------------------CTGGGTGTCTGGT--CTTG--GG--T---TG--TAT-GACCAT-CT-GC-CT------C-TGCGCCTCCAGGNGACAATACA--CAGTCTTCCT---A------GGA-GCACGCCA-GTTGATTC--TTGGC-AGC-GAGAAGG-C--TTCTCCTGAC-TAGTGGGCTCCCTGTA-GGTATCAAAC-CTATCATTGGCTCCAGACGATGACATAGAACCACCCTTAAATTCA-A-C-TTGG-G-CTTTAGAGCGACGCAGGGGCTGGCGGTCGTTCCTAGTAGAAG--NTGCCGTCA-GCTCCTTGTGCGCCTCCTGACTTATGGTGCCAGGGCACTCC--GTACGG-AAATNCCC--GGCTTTGCCGCACCTAAAAC
Reference ( family-1452 ) : CCGGGAGG-AAT-----TC-CCA--CTAG-CATGG--CA-A-GTGCGA-G-GTA-T---CAG--------C-AGAA-TC-T-CA-GA-G-------AGC--T----TCC---GA-A--T-GC-----------------T--A-GGTTCC-A--C--CATAT--A-A-T----CT--GCCAA-C-T-TC-C-TA-TC---GA--AGTG--G-G---GAG-GGC--A-T-AA--G--GCT--ACGGA-NATGGTGTG--GACACATA--TAT-C--TTCTGA-GG-C-AA--CA-T-CG-----CCCCAGC-CT--CGTCCTGGG-A-GT---CCG--C-----TCTGCCAA-AAG--TNG-----TC--T-T--A-TC--C-C-CTCC---CC----CC---C-------AC-GGAGA-G-AA-TGCTA-TG--CCCC----AGGTCT-----AAT-TT-TGC-C-TTA-CAT-T-CTCG-CA----------G---GAA---GTNTA-TAC--C---A----AG-------CAA-CATGGA--GT--CC-TT---CAA-GG-GAGC-CAC-ATACAGG-TTCAGC----TATTGTA-------C-ATTCA-----CCCCCA-CT-TGGATG-GGGAA-TGGGCCCGCAATA-AATCCACTCA-N-T---C-------CCCA-GTA--TG-----------CT--NA--TTTCTG-C--C---CT-----A-----G----TA-TC-CAC-C--A-CGGC-CTC-------TGC-ACGTAGGTCCTGAACCCGTAATTG-C---ACTGTA--TA-TCTCGT-TG---AGTG--CCTCACCTGGCCAGT-GGTGA-TG-CA---CC----G--ATCGCCTTCCCC-TGG----AATC-TCTATCTCTGG--G----GCA--T-CCTC-CCC-GAG-C-CCACC-CATCCCTGG--TTTC-TCGG--G-TCCAC-------TCC-------C-------TG-GG-CGA-TCAAGCTCC-AGCTC-------AA-CCTCC-GAGC-TG-CTA-CCAG---CCTACCACG-A--T-CCGATCC--T-ATCC--TCTCTA-CTG-TCCTCGGAAAAGGTGGG-----------TGCCTT-AA-AACGCA-CGCGCCT-GTAC-TTCCTCCGG-CGC-CCT--GGTTTC---------ACG-------------------T-------------------G-------------TC--------------------------CTGGGTGTCTGGT--CTTG--GG--T---TG--TAT-GACCAT-CT-GC-CT------C-TGCGCCTCCAGGNGACAATACA--CAGTCTTCCT---A------GGA-GCACGCCA-GTTGATTC--TTGGC-AGC-GAGAAGG-C--TTCTCCTGAC-TAGTGGGCTCCCTGTA-GGTATCAAAC-CTATCATTGGCTCCAGACGATGACATAGAACCACCCTTAAATTCA-A-C-TTGG-G-CTTTAGAGCGACGCAGGGGCTGGCGGTCGTTCCTAGTAGAAG--NTGCCGTCA-GCTCCTTGTGCGCCTCCTGACTTATGGTGCCAGGGCACTCC--GTACGG-AAATNCCC--GGCTTTGCCGCACCTAAAAC
gi|1 : CCGAGAGA-AAT-----TC-CCA--CTGG-CATGG--CA-A-TTGCGA-G-GTA-T---CAG--------C-AGAA-CC-T-AA-GA-G-------AGC--C----TCC---GA-A--T-GC-----------------T--A-GGTTCC-A--C--TATAC--A-A-T----CT--GCCAA-C-T-CC-C-TA-TC---GA--AGTG--G-G---GAG-GGC--A-A-AA--G--GGT--ACGGA-AATGTTGTG--GACACATAATTAT-C--TTCTGA-GG-C-AA--TA-T-CA-----CTC-AGC-CT--CGTCCTGGG-A-TT---CCG--C-----TCTGCCAA-ACG--TCA-----TC--A-T--A-TC--T-T-CTCG---CC----CC---C-------AT-GGAGA-G-AG-TGCCA-TG--CTCC----AGGTCT-----AAT-TT-TGC-C-TTA-CAT-C-CCCG-CA----------G---GAA---GTTTA-CAC--C---A----AG-------CAA-CATGGA--AT--AC-GT---CAA-GG-GAGC-CAC-ATACAGG-TCCAAC----TATTGGA-------T-TTTCT-----CCCCCA-TT-TGGATG-GAGAA-TGGGCCCACAATA-AATCCACTGA-G-T---C-------CCCA-GTG--TG-----------GT--AA--TTTCTG-T--C---AT-----A-----G----TA-TC-CAC-C--A-CGGT-ATC-------TGC-AGGTAGGTCCTGAACCCGTGATTG-C---ACTGCA--TA-TCTCGT-TG---AATG--CCTCATCTGACCAGT-GGTGA-TG-CA---CC----G--ATCACCTTCCCT-TGG----AATC-TTTATCTCTAG--G----GCA--T-CCTC-CCC-GAG-C-CCACT-TATCCCTGG--TTTC-TCGA--G-TCCAC-------TCC-------C-------TG-GG-TGA-TTAAACTTC-AGCTC-------AA-CCGGC-GGGC-TA-CTA-CCAG---CATAACACG-T--TCCCGATCC--T-CTCTAGTCTCCA-CTG-TC--CGGAAAAGGTGGG-----------TACCTT-AA-AACGCA-CAAGCCT-GTAC-TTCCTCCGG-TGC-CCT--GGTTTC---------ACG-------------------T-------------------G-------------TT--------------------------CTGGGTGTCTAGT--CTCG--GG--T---TG--TAT-GACCAT-CT-GC-CT------C-TGCGCTTCCAGGAGACAAT--A--CAGTTTT--------------AA-GCATGCC------ATTC--TTGGC-AGC-GAGAAGG-C--TTCTCCTCAC-TAGTGAGCTCTCTGTA-GGTATCAGAC-CTATTATTGGCTCCAGACGATGACACAGAACCACTCTTAAATCCAGA-C-TTGG-GACTTTAGAGCGACGCTGGGGCTGGTGGTCATTCCTAGTAGAAG--CTGCTGTCA-GCTCCTTGTTTGCCTCCTGACTTATGGTGCCAGGGCACTCC--ATACGG-AAATTCCA--AGCTTTGCTGCACTTAAAAC
gi|10 : G-----------TT--CA--CCTCTG-C--C---CC-----A-----G----TA-TC-CAC-C--A-TGGC-CTA-------TGC-AGGTAGTTTCTTAACCCGTA-----C---GCTGTG--TA-TCCCAT-TG---AGGG--CCTCACCTGGCCAGT-GGTGA-TG-CAC--CC----A--ATCACCTTCCCC-TGG-----------------------------------TTC-CTC-GGG-T-CCACT-C--CCCTG-------------------AT-------TCT-------T-------TG-GG-CGA-TCAAACTCC-AGCCC-------AA-CCTCC-GGGC-TG-CTA-CTG------TA------A--T-CCG------T-ATCC--TCCCTA-CTG-TCCTCGGAAAAGGTTGG-----------CTCCTT-AA-AACGCA-CAAGCTT-GCAC-TTCCTCTGG-GGC-CCT--GATTTC---------ATGTAGGAACGTTTCTTCCC--T-------------------G-------------TC--------------------------CTGGGTGTCCGGTC-CTTG--GGCTT---TG--TTT-GACCAT-CT-GC-CT------C-TGCACCTCCAGGGAACAATACA--CAG-ATTCCT---A------AGG-GAACACCA-GTGGATTA--TTGGC-AGT--AGAAGG-C--TTCTCCTGAC-TAGTGGACT--CTGTA-GGTATCAAACTCTATCACTGGCTCCAGACGATGACATAGAACAACCC-----TTCA-ACC-TTAG-G-CTTTAGAACTA-----AGGCTGGCGGTCGCTCGTAGTAGAAT--ATACCGTCA-GCTCCTTATACGCCTCCTGACTTCTGTCGCC--GGCACTCT--CTACAG-TAATGCCA--AGCTTTGCCGCATTTTAAAC
gi|11 : GTCCTGGG-A-GT---CCG--C-----TCTGCCAA-AAG--TTA-----TC--G-T--A-TCTTC-T-CTCC---CC----CT---C-------CC-TGGAA-G-AA-TGCCA--G--CCCC----AGGTCT-----AAA-TT-TGC-C-TGA-CAT-T-CTCG-CA----------G---GAA---GTCTA-TAC--C---A----AG-------CAA-CATGGAAGGT--CC-TT---CAA-GG-GA-C-CAC-ATACAGG-TTCAGC----TAT-GTA-------C-ATTCA-----TCTCCA-CT-TGGATG-GGGAA-TGGGCC-GCAATA-AATCCACTCA-T-T-------------------------------------------------C--C---CC-----A-----G----TA-T---------------------------GC-ACGCAGGCCCTGATCCCGTAATTG-C---ACTGAA--TA-TCTCGT-TG---AGTG--TCTCACCTGGCTAGT-GGTGA-TG-CA---CC----G--ATCGCCTTCCCC-TGG----AATA-TCTATCTCTAG--G----GCA--T-CCTC-CCC-GAG-T-CCACT-CATTCCCAG--TTTC-TCGG--G-TTTAC-------TCC-------T-------TG-GG-TGA-TTAAGCTTC-AGCTA-------AA-CCTCatg
gi|11 : TA-CTAG---CTTACCACA-A--T-CCGATCtactgaaacttgggaagattccacaataggtaccagtaggtactagcttaccacaatccgatc
gi|12 : gtcctgggagtccgctctgccaaaagttatcgtatcttctctccccctccctggaagaatgccagccccaggtctaaatttgcctgacattctcgcaggaagtctataccaagcaacatggaaggtccttcaagggaccacatacaggttcagctatgtacattcatctccacttggatggggaatgggccgcaataaatccactcattccccagtatgcacgcaggccctgatcccgtaattgcactgaatatctcgttgagtgtctcacctggctagtggtgatgcaccgatcgccttcccctggaatatctatctctagggcatcctccccgagtccactcattcccagtttctcgggtttactccttgggtgattaagcttcagctaaacctctactgaaacttgggaagattccacaataggtaccagtaggCGGGAAG-AAT-----TT-CCA--CTAG-CATGA--CA-A-GTGCAA-G-GTG-T---CAG--------C-AGAA-TC-T-CA-GA-G-------AGC--T----TCC---GA-A--T-GC-----------------T--A-GGTTCC-A--C--CATAT--A-A-T----CT--GCTAA-C-T-TC-C-TA-TC---AA--AGTG--G-A---GAG-GGC--A-T-AA--G--GCT--ATGGA-CATGGTGTA--GACA--TA--TAT-C--TTCTGA-GA-C-AA--CA-T-CG-----CCCCAGC-CT--CGTCCTGGG-A-GT---CCG--C-----TCTGCCAA-AAG--TAG-----CC--T-T--A-TC--C-C-CCCC---CC----CC---CTCCCCTCCC-GGAGA-G-AA-TGCTT-TG--CCCC----AGATCT-----AAT-TT-TGC-C-TTA-CAT-T-CTCG-CA----------T---GAT---GTATA-TAC--C---A----AG-------CAA-CATGGA--GT--CC-TT---CAA-GG-GAGC-CAC-ATACAGA-TTCAGC----TATTGTA-------C-ATTCA-----CCCCCA-CT-TGGATG-GGGAA-TGGGCCCGCAATA-AATCCTCTTA-T-T---C-------TCAA-GTA--TG-----------CT--TA--TTTCTG-C--C---CT-----A-----G----TA-TA-CAC-C--
gi|13 : CT-GTAC-TTCATCCGG-CAC-CCT--AGTTTC---------ACG-------------------TAGGAACGTTTCCTTTCCCTG-------------TT--------------------------CTGGGTGTCTGGT--CTTG--GA--T---TG--TAT-GACCAT-CT-GC-CTTTGGTTC-TGCGCCTCTAGAAGACATTACA--CAGTCTTCCT---ATTCCTAAGATGCACACCA-GTTG-TTC--TTGGC-AAC-GAGAAGA-T--TTCTCCTGAC-TAGTGGGGTCTCTGTA-GGTATCAATC-CTATCATTGGCTCCAGATCAGGGCATAGAACCACCCTTCAATTGA-A-CATTGG-G-CTTTAGAGCGACGCAGGGACTGACATTCGTTCCTAGTAGAAG--GTGCCGTCA-GCTTCTTGTGCGCTTCCTGACTTATGGTCCCAAGGCACTCC--ATACGG-AAATGCCC--GGGTGTGCTGCCCCTAAAAC
gi|14 : --TA-TCCCTT-TG---ATAG--CCTCACCTGGCCAAT-GGTGA-TG-CA---CC----G--TTCACCTCCCCC-TAT----AATC-TGTATCTCTGG--G----GCA--T-CCTC-CGC-AAG-C-CCA-C-CATCCCTGC--TTTT-TCGG--G-TCGAC-------TCCCGAATCAC-------TG-GA-CGA-TCAAACTCC-AGCTT-------AA-CCTTC-GAAC-TG-------------CTACCACG-A--T-----TCA--T-ATCC--TTTCTA-CTG-TCCTCGGAAAAGGTGAA-----------TGCCTT-AA-AATGCA-CGCGCGT-GTAC-TTCTTACAG-CAC-CCT--GGTTTTTAAGTAGGAACG-------------------TTTCTTTTCCCC--------G-------------TT--------------------------CTGGGTGTCTGGacg
gi|15 : gcg-------AG-CCTCT-AAGC-TG-CTA-TCAG---CCTACCACA-A--T-CCGATCCC-T-ATCC--TCTCTA-CTA-TCCTCGGAAAAGGTGGG-----------TACCTT---------------------------CTCCGG-CGC-CCT--GGTTTC---------ATG-------------------T-------------------G-------------TC--------------------------TTTGGTGTCTGGT--CTTG--GG--T---TG--TAT-GAGCAT-CT-GT-CT------C-TGCGCCTCCAGGCGACAATACA--CAGTCTTCCTTAAA------GGA-ACACGCCA-TTTGATTC--TTGGA-AGC-GTGAAGG-C--TTTTCATGAC-TAATGGGTTCCTTGTA-GGT
gi|16 : taagctataTT-AC-AACGCA-CACGCCT-CGAC-------CGG-CAC-CCCTGGGTTTC---------ACG-------------------T-------------------G-------------TCCNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCTGGGTGTCTGGT----------------TG--TAT-GACTAT-TT-GC-CT------T-TTTGCCTCCAGGCGACAATACA--CAGTCTTCCC---AA-----GGA-GCAAGCCA-GTTGATTC--TTGAC-AGC-GAGATGG-C--TTTTCCTGAC-TAATGGGTTCCCTGTA-GATAT-------------------CAGACGATGACATAGAATCACCATTAAATTCA-A-C-CC-A-G-CTTTcgcccttgaattgaacccagctttgctgcacttaataaac
gi|17 : TA-CTAG---CCTACCACA-A--T-CCGATCC--TTATCC--TCTATA-CTG-TCCTCGGAAAAGGTGGG-----------TCCCTT-AA-AACGCA-CATGCCT-GTAC-CTCCTCCGG-CGC-CCT--GGTTTA---------ACG-------------------T-------------------G-------------TCTAA-----------------------TTAGGTGTCTGGT--CTTG--GG--T---TG--TAT-Ggctgcacttaatacaaatt
gi|18 : tcctngtgattaagcttcagctaaacctctactgaagcttgggaagcttccacaataggtaccagtaggCCGAGAGG-AAT-----TT-CCA--CTAG-CATGA--CA-A-GTGCGG-G-GTA-T---CAGCAGATTCTC-AGAG-TN-N-NN-NN-N-------NNN--N----NNN---NN-N--N-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNT--A-GGTTCC-A--C--CATAT--A-A-T----CT--GCCAA-C-T-TC-C-TG-TC---GA--AGTG--G-G---GAG-AAC--A-T-AA--G--GCT--ACGAA-TATGGTGTG--GACAC------AT-C--TTCTGA-GG-C-
gi|19 : G-A-GT---CCG--C-----TCTGCCAA-AAG--TAG-----TC--T-T--A-TC--C-A-G-----------------C-------ACTGGAGA-G-AA-TGTTA-TG--TCCC----AGGTCT-----AAT-TT-TGC-C-TAA-CAT-T-CTCG-CA----------G---GAA---GTATG-TAC--C---A----AG-------CAA-CATTGA--GT--CC-TT---CAA-GG-GAGC-CAC-GTACAGG-TGCAGC----TATTGTA------------CA-----CCCCC
gi|19 : -TACACCCCCTGGCGACAATACA----GTCTTCCT---A------tggcgacaatacagtcttccta
gi|2 : gagtccgctctgccaaaagtagtcttatccagcactggagagaatgttatgtcccaggtctaattttgcctaacattctcgcaggaagtatgtaccaagcaacattgagtccttcaagggagccacgtacaggtgcagctattgGAAGG-AAT-----TC-CAA--CAAG-CATGG--AA-A-GTGCGA-G-GCA-T---CAG--------CCAGAA-TCCT-CA-GA-G-------AGC--C----TCC---AA-AATT-GCC----------------T--A-GGTTCC-A--CT-CATACCAA-A-T----CT--GCCAA-T-T-CCTC-TA-TC---GA--AGTG--A-G---CAG-GGC--AAT-AAAAG--GCA--ACGGA-AA------G--AACGC---------------TGA----T-AA--CA-T------------AA---T--CATC-TGAA-A-------CG--C-----TCTGACAA-AGG--TCG-----TC--TGT--A-TC--T-T-CTCT---CC----TC---C-------AC-GGAGA-G-AG-TGCCT-TG--CTCA----AGGTCT-----AAT-TC-CGC-C-TTA-CAT-C-CTCG-CA----------G---GAA---GTCTA-CAC--C---A----AG-------CAA-CATTTA--GT--CC-TT----AA-----AAC-CAC-ATGCATG-TCCA
gi|2 : attcTCCACTCA-GAT---C-------CCCA-GCA--TG-----------CT--CA--TTTCTG-T--C---CC-----A-----G----CA-TA-CAC-C--A-CGGT-CTT-------TGC-AGGTAGGTTCTGAACCCATAACTG-CTAGA-TGCA--TA-TC-CAT-TT---AATGG-CCTCACCTGGCCAGT-CGTGA-TG-CA---CA----A--ATCACCTCCCCCCTAT----GATC-TGTATATCTGG--G----GCA--T-CCTC-CTC-GGG-C-CCACC-CATCCCTGA--TTTC-TTGG--G-TCCAC-------TCC-------CGAATCCCTG-GA-CGA-TCAAACTCC-AGCTT-------AA-CCTCC-GGGC-TA-CTA-CCA-----------TG-A--T-CCA------T-ATCC--TCTCCA-CTG-TCCTCGAAAAAGGAGGA-----------TGCCTT-AA-AATGCA-TGCGCCT-GTAC-TTCCTCCGG-CAC-CCT--AGTATC---------ACGCAGGAATGTTTCTTTTCCCT-------------------G-------------TT--------------------------CTGGGTATCTGGT--CTTG--AG--G---TG--TAT-GACCAT-TT-GC-CT------C-TGCGCCTCTAGGAGACA------------TT-----------------GCA---CA-GTTG-TTC--TTGGT-AAC-GAGAAGA-T--TTCTCCTGAC-CAGTGGGCTCTCTGTA-GGTATCAAAT-CTATCATTGGCTCCAGACCAGGGCACAGAATCACCTTTGAAC------C-TTGGTA-CTTTGGAGCGACGCTGGGGCTGGT-----TTCCTAGTAGAAG--CTGCTGTCA-GCTCTTTGTTTTCC-CCTGACTTATGGTACCAGGGCActcagatccccagcatgctcatttctgtcccagcatacaccacggtctttgcaggtaggttctgaacccataactgctagatgcatatccatttaatggcctcacctggccagtcgtgatgcacaaatcacctcccccctatgatctgtatatctggggcatcctcctcgggcccacccatccctgatttcttgggtccactcccgaatccctggacgatcaaactccagcttaacctccgggctactaccatgatccatatcctctccactgtcctcgaaaaaggaggatgccttaaaatgcatgcgcctgtacttcctccggcaccctagtatcacgcaggaatgtttcttttccctgttctgggtatctggtcttgaggtgtatgaccatttgcctctgcgcctctaggagacattgcacagttgttcttggtaacgagaagatttctcctgaccagtgggctctctgtaggtatcaaatctatcattggctccagaccagggcacagaatcacctttgaaccttggtactttggagcgacgctggggctggtttcctagtagaagctgctgtcagctctttgttttcccctgacttatggtaccagggcat
gi|20 : attcgaaggaattccaacaagcatggaaagtgcgaggcatcagccagaatcctcagagagcctccaaaattgcctaggttccactcataccaaatctgccaattcctctatcgaagtgagcagggcaataaaaggcaacggaaagaacgctgataacataatcatctgaaacgctctgacaaaggtcgtctgtatcttctctcctccacggagagagtgccttgctcaaggtctaattccgccttacatcctcgcaggaagtctacaccaagcaacatttagtccttaaaaccacatgcatg-TACACCCCCTGGCGACAATACA----GTCTTCCT---AA-----GGA-GTACTCCA-GTTGATTC--CTGGC-AGC-AAGAAGG-C--TTTTCCTGAC-TAATGGGTTCCTTGTA-GGTAT-------------------CAGACGATGACACAGAATCACCTTTAAATTCA-A-C-TT-A-G-CTTTt
gi|21 : cagctattgCCGGGGG---AT-----TT-CCA--CAAG-CATGA--CA-A-GTGCGA-G-GTA-T---CAG--------C-AGAA-TC-T-CA-GA-G-------AGC--TTAAATCT---GA-A--T-GC-----------------T--A-GGTTCC-A--C--CATAT--A-A-T----CT--GTCAA-T-T-TC-C-T-----------AGTG--G-G---GAG-GAC--A-T-AA--G--ACT--ACGGA-AATGGTGTG--G--ACATA--TAT-T--TTCTGA-GG-C-AA--gatgcacttaatacaa
gi|22 : CCGAGAAG-AAT-----TC-CAA--CTAG-CATGG--AA-A-GTGCGA-G-GCA-T---CAG--------C-AGAA-TA-T-CA-GA-G-------AGT--C----TCC---GA-A--T-GC-----------------T--A-AATTAT-A--C--CATAC--A-A-T----CT--G----------T-C-TG-TC---GA--AGTG--G-G---GAG-GAC--A-C-AA--G--GCA--ACGGA-AATGGCGCT--GACAC-T---TAT-C--TTCTGA-GG-C-A
gi|23 : G--------C-AGAT-TC-T-CACGA-G-------TGC--T----TCC---GA-A--T-GCA----------------T--ATGGTTCC-A--C--CATAT--A-A-T----CT--GCCAA-CTT-TC-C-TG-TC---GA--AGTG--G-G---GAG-AAC--A-T-AA--G--GCTAAACGAA-TATGGTGTG--GACAC------AT-C--TTCTGA-GG-C-AA--
gi|24 : GT--CTTG--GG--T---TG--TTT-GACCAT-CT-AC-CA------C-TGCACCTCTATAAGACA---------GTCTTCAT---AC-----GAA-GCACACCA-ATTGATTC--TTGGT-AGC-GAGAAGG-A--TTCTCCTGt
gi|25 : A---CC----G--ATCACCTCCCCC-TAT----AATC-TGTATCT--GG--G----GCA--TGCCTC-CAG-GA--C-CCACC--ATCCCTGG--TTTC-TCGG--G-TCCAC-------TTC-------C-------
gi|26 : tgcatgcgtttctTGA-GG-C-AA--CA-A-AA-----TCCCAGC-CT--TGTCCTGGG-A-TT---CCG--T-----TCTGCCAA-AAgaatg
gi|27 : ---GA--AGTG--G-G---TAG-GGC--A-T-AA--A--GCT--ACGGA-TATGGTGTG--GACA
gi|3 : t-CCA--CTAG-CATGA--CA-A-GTGGCA-G-GTG-----CA---------C-AGAAGTC-C-AA-GA---------AGC--T----TCC---GA-A--TAGC-----------------TTAA-GGTTCA-A--C--CATAT--ATA-T----CTTGGCTAA-C-T-TC-C-TA-TC---AA--AGTG--G-A---GAG-GG-----T-AA--G--GAT--GC-----ATGGTTAT--GACATATA--TAT-C--TTCT-A-GA-C-AA--CA-T-CG-----CCC-AGC-CT--C-TGCTGGG-A-GT---CCG--C-----TTTGGCAA-AAG--TAA------C--T-T--A-CC--C-C-CTCC---CC----CC---CTCCCTC-CC-GGAGA-G-AA-TGCTT-TG--CCCG----AGATCT-----AAT-TT-TGCGC-TTAACAT-T-CTCG-CA----------T---GTCT--GTATAATGC--C---A----AG-------CAA-CATGGA--GC--CTGTT---CAA-GG-GAGC-CAC-ATACAGA-T-CAGCG---TATTGTA-------CGATTCA-----CCC--A-CT---GATG-GCGAA-TGGGCCCGCAATA-AATCCTCTTA-T-T---T-------CTCAAGTGACTG-----------CT--TA--TTTCTG-C--CTACCT-----ACAAGTA----TA-TC-CAC-C--A-CGGC-TCG-------TGCTACG-AGGTCCTGACCCCGTAATTG-C---ACTGTA--TA--CTCGT-TG---GGTGTCCCTGACCTGGCCATT-GGTGA-TG-CAG--GC----G--ATCGCCTTCCCC-TTG----AATC-TCTATTTCTGG--GAAAAACA--T-CCTC-CCT-GAGCC-CCACT-CATCCCTGG--TTTCTTCGG--GTTTCAC-------TCC-------T-------TGTGGTTGA-TTAAGCTTTAAGCT--------AA-TCTCTAAAGC-TG-CTATCCAG---CCTACCACA-A--T-C--GTCCAAT-ATCC--TCTCTATCTGTTCCTCGGAAAAGGTGGG-----------TGC--T-AA-AACGCA--ACGCCTGGTAC-TTCCTCCGG-CGC-CCT---GTTTC---------ACG-------------------T-------------------G-------------T---------------------------CTGGGTGTCTGGT--C--------------G--TAT-GGACTT-GT-GC-CT----------TGCCTCCA-GCGACAATACATGCAGTCTTCCCA--A------GGA-GCAAGCCA-GTTGATCT--GTGAC-AGCGGAGATGG-C--T--TTCTGAC-TAATTGTTTCCCTGTA-GATAT-------------------CAGACGATGACATAG-ATCACCATTAAATCCA-
gi|4 : gagatatAGG-ATT-----TC---A---TAG-CATGA--CA-A-G--CGA-G-GTAAT---AAG--------C-AGAA-T--T-CA-GA-T-------AGT--T------C---GG-G--T--C-----------------T----GGTTC-----------A---A-A-T----TT---TTAA-C-T-TC-C-TA-TC---GA---GTG--G-G---AAG---C--A-TTAA--G--GTT--ACGGA-CATG-TGTA--AA---ATA--T-T-C--TTCTGA-GA-C-AGAGCA-TTCG-----CCCAGGCTCT--CGTCCTGTG-C-GTG--CCG--C-----TCAGCCAA---G--TAA-----TC--T-TTTA-TC--C-C-C-CC---CC----CT---C-------AC-T-AGA-G-AA--GCTA-TG--CCAC----AG--CT-----A-T-TT-T-C-C-TT--------TTCGACA----------G---AAA---GT-TG-TAC--CTACACTGTAG-------CAA-CATGGA--GT--CC-TT---TAA-GGTGAGC-CAT-ATA--AG-TTCA-C----TATTGTA-------C-ATTC--------CCCA-CT-TGGA---GGGAACTGGGCCCGCAATA-AATCCACTCG-A-TGTGCGG-----CCTATGTA--TG-----------CT--AA--TTTCT--C--C---CT-----A-----G----TA-TGACAC-C--ATCGGT-CCT-------TGT-ACGT--GTCCTGG-CCCGTA-TTG-----ATTATAGATACTCTCGT-TGTTTGGTG--TCT-AC-TGGCCAGT-GGTGAATG-CG---CCTCTTGTTATCGCCTTCCC--TGG----AATC-TCTATCTCCTC--A----GCA--T-CTTC-CGC-GAG-C-CCACCTCAT-CCTGG--TTTC-TCGG--G-TTCAC-------T-C-------C-------TG-GG-TGAGT--AGCTTT-A-CT--------AA-GCTCT-AAGC--G-CTA-CCAG---CCTACCACA-A--T-CCGATTC--A-TTCC--TCTCTA-ATG-TTCTCGG--AATGCGGC-----------TGCCTTAAA-AACGCA-TG---CT--TACGTTCCTCCGGTCGC-CCT--GGTTT----------------------------------------------------------------------------------------------TTGGTTGTC------CTTG--GG--TTGATG--TATGGACCATGCT-GCTCT------T-TGCTTCTCAGGGC-----T--------TTTTCCT---A------GGA-ACACATTA---TGATTCCTTCGGCGAGC-GAGAAGG-CAGTTTTCCTGA--TATTGTTCACCCTGTACGGTAT
gi|5 : GGGGAG-AAT-----TC-C-A--CAAG-CATGA--CA-A-GT-CGA-GTGTA-T---CAG--------C-AGAA-TC---CA-GA-G--------GT--TAAA-TCT---GATA--T--C-----------------T--T-G--TCC-ATTC--CATAT--A-A-T----CT---CCAA-C-T-TC-C-TA-----------GTG--G-G---GAG-GAC--A-T-AA--G---CT--ACGGA-TAT--TGTA-----ACATA--TCT-C------GA-G--C-AA--C--T-CG-----CCC-AGC-TT--C-TCCTTAG-A-GC---CC---------TCTGCCAATAAG--TAG-----TC--T-T--A-TC--C----TCC---CC----CT--------------GGAG-------TGC-A-TC--CCTC----AAGTCT-----AGT-TT-TGC-T-TTA-CGT-T-CTT--CT----------G---GAA---GTTTAATAC--C---A-----G-------CAA-CATGGA--GC--CC-TT---CAA-GG-GAGC-CAC-ATACAGG-TTCAGC----TAGT-TA-------C-ATT-A-----CCCC-A-CT---GATGTGGGAA-TGG-CCCGCAATA-AAACCAC-CA-G-T---C-------CC-A-GTA--T------------CT--AA--TGTCTG-C--C---CT-----A-----G----TA-TC-CAC-C--A-AGGC-TTC-----------ACGTA--TCCTGAACCTGTAATTG-A---ACTG-A--TA-TCTCAT-TG---AAGG--TCTCACCT--CCAGT-GATGA-TG-CA---CC----G--ATTGC-TTCCCC-TG-----AATC-TCTATCTCTAG--G----CGA--T-CATC-CCG-TAC-C-GCACT-CATTCC-GG--TTTC-TGCG--G-TTCAC-------TTC-------T-------TG-G----A-TTAAGCTC--AGCTT-------AAACCTCT-AAGC-TG-CTA-CCAGT--CCTACCACATA--T-CCGATTCA-T-ATCT--TCTCTA-CTG-TCCTCGAAAAATGTG-------------TGCCTT-AATAACGCA-CATGTCT-GTAC-TTC-TCCG--CGC-CCT--G--TTC---------ACG-------------------T-------------------G-------------TC--------------------------TTGGGTGTCTGGT--CTTGA-AG--T---T---TAT-GACCAT-CT-GC-CT------C-TGCGC--CCA-GAGAC-ATACA--CAATCTTCC----A------AGA-GCACGCCATGTGGATCT--GTGGC-AGC-GAGAA-G-C--TTTTCCTGAC-TAAT-GGTTCATTGTA--GTAT-------------------CAGACGATTACATAAAATCACCCTTGAATTCA-A-C-tcagagatcgacatagaatatttggcccttgaagtgtgcagtgatagctttttttgcttcatttatacaaa
gi|6 : AGG-ACT-----TC-CCA--CTAGGCATGG--AA-AAGTGCGACG-GT------C-G--------C-AGAA-TT-T--A-TA---------AGC--T----TCC---CA-A--A-GC-----------------T--A-GGTTCC-A--C--CTTAC--A-AGT----CT--GTCAA-C-T-CC-C-TA-TC---GAAGAGTG--ACG---GAG-GGC--A-T-AG--A--GCTTAATGGA-AATGGCGCGCTGACACA-A--TA-----CTCTGATGG-C-AA--CA---AA-----CCCCGAG-CT--CCTCCTAGG-A--T---TCG--T-----TCAGCCAA-AGG--TCG-----TC--TGT--T-TG--C-T-TTCCACTCC----TT---C-------AA-TGAGATG-AGTTGTCA-TG--CTCG----AGTCTT-----AAT-AT-Tccatcttgctacacttaatacaaat
gi|6 : aTATCTCTGGA-G----GCA--T-CCTC-CC--GA--C-CCACC--ATCCATGG--TTTC-TCGG--G-TCCAC-------TCCGAATAT-C-------TG-GA-TGA-TCAAACTCC-AGCT--------AA-TTCCG-GGGC-TG-C-------------ACCAC--------CAAGCCA-T-ATCC--TCTCTA-CTG-TCCTCG-AAATGGTTGAATAAAATCCATTACCTT-AA-CATGCAGCGCGG-T-GTAC-TTCC------CGTACCT--G-TTCC---------ACA-------------------T-------------------AGGAACGTTTCTTTTC--------------------------CT---T-TCTGGTTACTTTCTGG--T---TGAATAT-GACAAT-CTAGC-CT------CGTGC-CCTCTAGGAGACA-TACAA-CAGTCTTTCG---A------AGA-GCAC-CC---TTG-TTC--TTGGC-AAC-AAGAAAGAC--TTCTCCTGACATAGTGGGCTCTCTGTA-GGTATCAAAC-CTACCATTGA--TCAGAC-CCAGCATAGAACTACCC-TACATTAA-A-C-CTTG-G-ATTTAGAG-GACGCA-GGGCTGACGGTCGTTCCTAG-AGATGGTTTGGCGTAAGGATCCTGGTGCGAAT-CTGACTTATGGGCCCAGCG-ACTCCGAGTACGGAAAATTTCCTAGACTTTGCCCCACCTACAAcgttatctctggaggcatcctcccgacccaccatccatggtttctcgggtccactccgaatatctggatgatcaaactccagctaattccggggctgcaccaccaagccatatcctctctactgtcctcgaaatggttgaataaaatccattaccttaacatgcagcgcggtgtacttcccgtacctgttccacataggaacgtttcttttcctttctggttactttctggttgaatatgacaatctagcctcgtgccctctaggagacatacaacagtctttcgaagagcacccttgttcttggcaacaagaaagacttctcctgacatagtgggctctctgtaggtatcaaacctaccattgatcagacccagcatagaactaccctacattaaaccttggatttagaggacgcagggctgacggtcgttcctagagatggtttggcgtaaggatcctggtgcgaatctgacttatgggcccagcgactccgagtacggaaaatttcctagactttgccccacctacaa
gi|7 : aaggacttcccactaggcatggaaaagtgcgacggtcgcagaatttataagcttcccaaagctaggttccaccttacaagtctgtcaactccctatcgaagagtgacggagggcatagagcttaatggaaatggcgcgctgacacaatactctgatggcaacaaaccccgagctcctcctaggattcgttcagccaaaggtcgtctgtttgctttccactccttcaatgagatgagttgtcatgctcgagtcttaatattcgtGGGAGGCAATATTCATC-CCAGTCTGG-CATGG--GACA-GTGCGA-G-GAA-TT--CAGGAA-----C-AGAA-TC-TTCA-GACG-------AGCGGT----TCCTGGGA-A--T-GC-----------------T--G-CGT----A--CA-CAGAT--A-A-TAAATCT--GCTAAAC-TCTC-C-TAATCTGTAA--AGGGTCG-GAAAGAG-GGGTAA-T-AA--AATGTT--ACTGA-C-TGGTGTG--GACATATA--TAC-CCCTTCGGA-GATC-AAG-CAAT-CGAGCTTCCACATG-CT--AGTC-TGGG-G-GTTGGCCGGCC-----TCTGCCAA-GAG--TAGGTTACCCA-T-T--A-TT--C-TTCTTC---CT----CCTCTC-------GC-GGCGA-GGAA-TGCTAATAAACTTA----AAATCTTACATAGC-TTATGC-T-TCA-AAC-TGTTCG-CACTGCGAGCAAG---GAA---GTATG-TAC--C---A----AGTCTTCACCAGTCATGGA--GTTACC-TT---CAAAGG-GAGGACAA-GTACAGGGTTCAGCCTAGTAATGGA-------C-AATCAGTCATCCCCCAACT-TCGAAA-GGAAA-TGGGACGGCATTA-AATCCACGCA-C-T---CAATTTCTCGCA-GAA--TGATTGACGTAAACT--AAAGTTTCTGGC--C---CTGAAATA-----GGGGCTA-TT-CCC-CTCA-CGGGGCGC-------GCC-ACGTAGGTCCCGG----GTAATTG-C---GCTGTA--TA-TTTCGT-TG----GTG--TCT-AC-TGGCCAGT-GGTGA-TGTCA---GC----G--GATGCCTTCCCC-TGG----AATC-TCTATCTCTAG--G----GCA--T--CTT-CCC-GAG-C-CCACT-CATCCCTGG--TTTC-TC-G--G-TTCAC-------GTC-------C-------TG-GG-TGA-GTAAGCTTC-AGCTTAACCTGAAA-CCTCT-AAGC-TG-CTA-CCAG---CCT
gi|8 : atccgT-----TCTCCA--CTAA-CATAGACCA-A-GTGC-A-C-GTA-TGATCAA--------A-AAAA-TCAT-CA-TA-GTATATTGAGC--T----TTC---GG----T-GC-----------------TT-A-GGTTCCGA--CAATATAT--A-A-T----CT--GCTAA-C-T-TC-CATACTCT--GA--CGTG--G-G---GAGTGGT----T-AA--G--GTT--ACGGATCATGGTGT---GACAT-TAC-TATCC--TTCTGA-GA-CAAA--CA-T-CGC----CCCCAGC-CTTCCGTCCTGGGCACGTCC-CCG--CCCCCTTCTGCCCA-AAGCTTAG-----TCCAT-T--AGTC--CTC-CTCC---CCACCTCC---C-------ACTGGAGA-G----TGCTA-TG--CCCCTCGAGGGTCTAA---AATGCT-CGC-CTTTA-CATAT-CT-G-CA----------GCTAGAGCACGGGTA-TGCTAC---A----AAAGCTCC-CAA-CATG----AT--CT-TTTCGTAA-AG-GAG--CACAATACAGG-TTCAGC----TGATATAATGTTACC-ATTTA-----CCTCCA-CTGTGGAT-------------------TATAATCCACTCATT-T---C-------CCCA-GTA--TG-----------CTGAGA--TTTCTG-CGTC---CT-----A-----G----TATTC-CACTC--A-TGG--CTCATACAGATAT-ACG-AAGTCCTGACCCCGTAAGTGCC---ACTGTA--TA-T-TCGTGCG---GGTT--CCTCATC-GGCTAGTCGGTGG-TG-CAAAGCG----A--ATCGCCTTTTCC-CGGTGGCAATCATCTAT-TC-GGTAG----TCAGTT-CCTCGCCCGGAG-C-CCACCTCAT-CCTGGGTTTTC-TCGGTTGTTTCAC-------TCC-------T-------T---G-TGG-TAAAGCTTT-AGCT--------AA-CCTCT-AAGCTTGTCTACCCAGGTACCTACCACT-AATT-CCGATC
gi|9 : aat---C-------CCCA-GCA--CG-----------CT--CA--TTTCTC-C--A---CC-----A-----G----TA-TC-CAC-C--A-CGGT-CTC-------TGC-AGGTAGGTCCTCAACCCA-AATTA-T---TCTGCG--TA-TCAGTT-TG---AGAG--ACTCACCTGCGCAGT-GGTGA-TG-CA---CT----G--ATCGCCTTCCCC-TAT----AA---TCTATCTCTGG--G----GCA--C-CCGC-CCC-GAG-CACCCCC-CCTCCCTGA---TTC-TCTG--G-TCCACTCGCGATTCC-------C-------TA-TG-CGA-TCAAACCCC-AGTTC-------AA-CCCCC-AGGC-TG-------------CTACCACG-A--T-CCA------T-ATCC--TCTCT
gi|9 : aaAGG-T--TTCTCCTGAC-TAGTGGGCTCTCTGTA-AGTATCAAAC-CCATTATTGGCTCCAGACGAGGGCATAGAACCATCCTTCAATTCA-A-C--------CTTTAGAGCGACACAGGAGCTGGCGGTAGTTCCTTGTAGAAG--GTGCCGTCA-GCTCCTTGTGTGCCTCCTGACTTATGGTGCCAGGGTACTCC--ATACGG-AAATCCCC--GGCTTTGCCGCACCTAAAACnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnacaggtttctcctgactagtgggctctctgtaagtatcaaacccattattggctccagacgagggcatagaaccatccttcaattcaacctttagagcgacacaggagctggcggtagttccttgtagaaggtgccgtcagctccttgtgtgcctcctgacttatggtgccagggtactccatacggaaatccccggctttgccgcacctaaaacaag
Alignments
lowQualScore : 111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111
lowQualScore : 11111111 111111111 1111 22222222222222222 11 11111 1111111111 1 111111 1111 111 22222222222222222222 11111 11111111111111 111 2222222 1111 111111111 11111 222222222222222 11111111111 2222222222222 11111 111 1111111 222222222222222 22222222 1111 111111 11111111111 111111111 333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333 11111111 1111 22222222222 4444444444444444444 11111111 111 111 11
lowQualScore : 4 99999 3 0 44 3 44 3 3 3 3 99999 66666666 3 3 6 3 3 333333333 44 1111 555 3 44 3 77777777777777777 8888 3 44 00 44 3 3 6666 44 3 3 3 3 3 6 777 33 33 2 555 2 33 2 2 33 33 77 44 444 99999 3 44 2 33 2 77 7777777777 0 4 55 2 3 333333 44 88888 3 55 99999 1111 55 3 55 111 1 666 88888888888888888888 3 4444 0 3 55 7777 1 44444 3 3 4 4 4 444 4 99999999999999 111 4 8 55 777 8888 4444444 4 55 55 4 777 4 4 4 4 4 1 3333 666666666 11111 5 88 666 5 2 5 333333333333333 1 8 55 77777777777 777 55 3 55 666 99999999999 7777 3 66 3 55 4 1111111111111 4 2 8 0 00000 3 55 3 0 3 666 0 88 1 3 3 3 222 7777 44 3 99999 3 77 6666 44 3 3 3 3 3 6 0 44 3 44 6 0000000 555555555555555 3 44 3 2 3 44444444 3 33 3 3 5 0000 88 44 3 666666 3 55 4 4 99999999999 3 3 8888 3 3 3 3 44 333333333 000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 77 77 777777 44 3 3 3 3 11111111 0 1 6 2 1111 33333333333 3 3 55 3 44 3 3 3 44 3 0 3 4444444444444444444 0 1 4 4 44444444 66 1 000 6 1 1 1 555 8 1 11
lowQualScore : . ..... . . .. . .. . . . . ..... ........ . . . . . ......... .. .... ... . .. . ................. .... . .. .. .. . . .... .. . . . . . . ... .. .. . ... . .. . . .. .. .. .. ... ..... . .. . .. . .. .......... . . .. . . ...... .. ..... . .. ..... .... .. . .. ... . ... .................... . .... . . .. .... . ..... . . . . . ... . .............. ... . . .. ... .... ....... . .. .. . ... . . . . . . .... ......... ..... . .. ... . . . ............... . . .. ........... ... .. . .. ... ........... .... . .. . .. . ............. . . . . ..... . .. . . . ... . .. . . . . ... .... .. . ..... . .. .... .. . . . . . . . .. . .. . ....... ............... . .. . . . ........ . .. . . . .... .. .. . ...... . .. . . ........... . . .... . . . . .. ......... ................................................................................. .. .. ...... .. . . . . ........ . . . . .... ........... . . .. . .. . . . .. . . . ................... . . . . ........ .. . ... . . . . ... . . ..
lowQualScore : 0 11111 3 4 66 3 66 3 3 3 3 66666 55555555 1 1 2 1 1 555555555 22 9999 444 1 22 1 77777777777777777 3333 1 22 44 22 1 1 5555 22 1 1 1 1 1 2 999 99 99 9 000 9 99 9 9 99 99 99 99 555 66666 1 22 9 99 9 99 8888888888 0 0 55 8 3 888888 66 33333 3 00 11111 5555 00 6 00 444 3 444 55555555555555555555 6 4444 9 6 00 7777 2 11111 6 6 0 0 0 444 0 55555555555555 000 9 0 55 000 5555 5555555 0 55 55 0 000 0 0 0 0 0 3 9999 222222222 11111 0 22 888 0 5 0 000000000000000 6 0 55 33333333333 333 00 6 00 444 22222222222 7777 6 55 6 00 0 8888888888888 0 3 2 8 11111 0 00 6 5 6 444 1 66 4 6 6 6 555 1111 66 3 66666 3 33 5555 22 1 1 1 1 1 2 2 22 1 22 2 0000000 000000000000000 3 88 3 9 3 11111111 1 44 3 3 7 4444 22 22 1 999999 6 00 0 0 00000000000 6 6 6666 3 3 3 3 66 333333333 666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666 99 99 444444 66 3 6 6 6 00000000 7 0 2 2 0000 88888888888 3 7 11 2 66 3 3 1 22 3 8 3 0000000000000000000 8 2 0 4 22222222 22 0 222 7 0 0 0 666 0 0 00
consensus : CCGGGAGG-AAT-----TC-CCA--CTAG-CATGG--CA-A-GTGCGA-G-GTA-T---CAG--------C-AGAA-TC-T-CA-GA-G-------AGC--T----TCC---GA-A--T-GC-----------------T--A-GGTTCC-A--C--CATAT--A-A-T----CT--GCCAA-C-T-TC-C-TA-TC---GA--AGTG--G-G---GAG-GGC--A-T-AA--G--GCT--ACGGA-NATGGTGTG--GACACATA--TAT-C--TTCTGA-GG-C-AA--CA-T-CG-----CCCCAGC-CT--CGTCCTGGG-A-GT---CCG--C-----TCTGCCAA-AAG--TAG-----TC--T-T--A-TC--C-C-CTCC---CC----CC---C-------AC-GGAGA-G-AA-TGCTA-TG--CCCC----AGGTCT-----AAT-TT-TGC-C-TTA-CAT-T-CTCG-CA----------G---GAA---GTNTA-TAC--C---A----AG-------CAA-CATGGA--GT--CC-TT---CAA-GG-GAGC-CAC-ATACAGG-TTCAGC----TATTGTA-------C-ATTCA-----CCCCCA-CT-TGGATG-GGGAA-TGGGCCCGCAATA-AATCCACTCA-N-T---C-------CCCA-GTA--TG-----------CT--NA--TTTCTG-C--C---CT-----A-----G----TA-TC-CAC-C--A-CGGC-CTC-------TGC-ACGTAGGTCCTGAACCCGTAATTG-C---ACTGTA--TA-TCTCGT-TG---AGTG--CCTCACCTGGCCAGT-GGTGA-TG-CA---CC----G--ATCGCCTTCCCC-TGG----AATC-TCTATCTCTGG--G----GCA--T-CCTC-CCC-GAG-C-CCACC-CATCCCTGG--TTTC-TCGG--G-TCCAC-------TCC-------C-------TG-GG-CGA-TCAAGCTCC-AGCTC-------AA-CCTCC-GAGC-TG-CTA-CCAG---CCTACCACG-A--T-CCGATCC--T-ATCC--TCTCTA-CTG-TCCTCGGAAAAGGTGGG-----------TGCCTT-AA-AACGCA-CGCGCCT-GTAC-TTCCTCCGG-CGC-CCT--GGTTTC---------ACG-------------------T-------------------G-------------TC--------------------------CTGGGTGTCTGGT--CTTG--GG--T---TG--TAT-GACCAT-CT-GC-CT------C-TGCGCCTCCAGGNGACAATACA--CAGTCTTCCT---A------GGA-GCACGCCA-GTTGATTC--TTGGC-AGC-GAGAAGG-C--TTCTCCTGAC-TAGTGGGCTCCCTGTA-GGTATCAAAC-CTATCATTGGCTCCAGACGATGACATAGAACCACCCTTAAATTCA-A-C-TTGG-G-CTTTAGAGCGACGCAGGGGCTGGCGGTCGTTCCTAGTAGAAG--NTGCCGTCA-GCTCCTTGTGCGCCTCCTGACTTATGGTGCCAGGGCACTCC--GTACGG-AAATNCCC--GGCTTTGCCGCACCTAAAAC
Reference ( family-1452 ) : CCGGGAGG-AAT-----TC-CCA--CTAG-CATGG--CA-A-GTGCGA-G-GTA-T---CAG--------C-AGAA-TC-T-CA-GA-G-------AGC--T----TCC---GA-A--T-GC-----------------T--A-GGTTCC-A--C--CATAT--A-A-T----CT--GCCAA-C-T-TC-C-TA-TC---GA--AGTG--G-G---GAG-GGC--A-T-AA--G--GCT--ACGGA-NATGGTGTG--GACACATA--TAT-C--TTCTGA-GG-C-AA--CA-T-CG-----CCCCAGC-CT--CGTCCTGGG-A-GT---CCG--C-----TCTGCCAA-AAG--TAG-----TC--T-T--A-TC--C-C-CTCC---CC----CC---C-------AC-GGAGA-G-AA-TGCTA-TG--CCCC----AGGTCT-----AAT-TT-TGC-C-TTA-CAT-T-CTCG-CA----------G---GAA---GTNTA-TAC--C---A----AG-------CAA-CATGGA--GT--CC-TT---CAA-GG-GAGC-CAC-ATACAGG-TTCAGC----TATTGTA-------C-ATTCA-----CCCCCA-CT-TGGATG-GGGAA-TGGGCCCGCAATA-AATCCACTCA-N-T---C-------CCCA-GTA--TG-----------CT--NA--TTTCTG-C--C---CT-----A-----G----TA-TC-CAC-C--A-CGGC-CTC-------TGC-ACGTAGGTCCTGAACCCGTAATTG-C---ACTGTA--TA-TCTCGT-TG---AGTG--CCTCACCTGGCCAGT-GGTGA-TG-CA---CC----G--ATCGCCTTCCCC-TGG----AATC-TCTATCTCTGG--G----GCA--T-CCTC-CCC-GAG-C-CCACC-CATCCCTGG--TTTC-TCGG--G-TCCAC-------TCC-------C-------TG-GG-CGA-TCAAGCTCC-AGCTC-------AA-CCTCC-GAGC-TG-CTA-CCAG---CCTACCACG-A--T-CCGATCC--T-ATCC--TCTCTA-CTG-TCCTCGGAAAAGGTGGG-----------TGCCTT-AA-AACGCA-CGCGCCT-GTAC-TTCCTCCGG-CGC-CCT--GGTTTC---------ACG-------------------T-------------------G-------------TC--------------------------CTGGGTGTCTGGT--CTTG--GG--T---TG--TAT-GACCAT-CT-GC-CT------C-TGCGCCTCCAGGNGACAATACA--CAGTCTTCCT---A------GGA-GCACGCCA-GTTGATTC--TTGGC-AGC-GAGAAGG-C--TTCTCCTGAC-TAGTGGGCTCCCTGTA-GGTATCAAAC-CTATCATTGGCTCCAGACGATGACATAGAACCACCCTTAAATTCA-A-C-TTGG-G-CTTTAGAGCGACGCAGGGGCTGGCGGTCGTTCCTAGTAGAAG--NTGCCGTCA-GCTCCTTGTGCGCCTCCTGACTTATGGTGCCAGGGCACTCC--GTACGG-AAATNCCC--GGCTTTGCCGCACCTAAAAC
gi|1 : CCGAGAGA-AAT-----TC-CCA--CTGG-CATGG--CA-A-TTGCGA-G-GTA-T---CAG--------C-AGAA-CC-T-AA-GA-G-------AGC--C----TCC---GA-A--T-GC-----------------T--A-GGTTCC-A--C--TATAC--A-A-T----CT--GCCAA-C-T-CC-C-TA-TC---GA--AGTG--G-G---GAG-GGC--A-A-AA--G--GGT--ACGGA-AATGTTGTG--GACACATAATTAT-C--TTCTGA-GG-C-AA--TA-T-CA-----CTC-AGC-CT--CGTCCTGGG-A-TT---CCG--C-----TCTGCCAA-ACG--TCA-----TC--A-T--A-TC--T-T-CTCG---CC----CC---C-------AT-GGAGA-G-AG-TGCCA-TG--CTCC----AGGTCT-----AAT-TT-TGC-C-TTA-CAT-C-CCCG-CA----------G---GAA---GTTTA-CAC--C---A----AG-------CAA-CATGGA--AT--AC-GT---CAA-GG-GAGC-CAC-ATACAGG-TCCAAC----TATTGGA-------T-TTTCT-----CCCCCA-TT-TGGATG-GAGAA-TGGGCCCACAATA-AATCCACTGA-G-T---C-------CCCA-GTG--TG-----------GT--AA--TTTCTG-T--C---AT-----A-----G----TA-TC-CAC-C--A-CGGT-ATC-------TGC-AGGTAGGTCCTGAACCCGTGATTG-C---ACTGCA--TA-TCTCGT-TG---AATG--CCTCATCTGACCAGT-GGTGA-TG-CA---CC----G--ATCACCTTCCCT-TGG----AATC-TTTATCTCTAG--G----GCA--T-CCTC-CCC-GAG-C-CCACT-TATCCCTGG--TTTC-TCGA--G-TCCAC-------TCC-------C-------TG-GG-TGA-TTAAACTTC-AGCTC-------AA-CCGGC-GGGC-TA-CTA-CCAG---CATAACACG-T--TCCCGATCC--T-CTCTAGTCTCCA-CTG-TC--CGGAAAAGGTGGG-----------TACCTT-AA-AACGCA-CAAGCCT-GTAC-TTCCTCCGG-TGC-CCT--GGTTTC---------ACG-------------------T-------------------G-------------TT--------------------------CTGGGTGTCTAGT--CTCG--GG--T---TG--TAT-GACCAT-CT-GC-CT------C-TGCGCTTCCAGGAGACAAT--A--CAGTTTT--------------AA-GCATGCC------ATTC--TTGGC-AGC-GAGAAGG-C--TTCTCCTCAC-TAGTGAGCTCTCTGTA-GGTATCAGAC-CTATTATTGGCTCCAGACGATGACACAGAACCACTCTTAAATCCAGA-C-TTGG-GACTTTAGAGCGACGCTGGGGCTGGTGGTCATTCCTAGTAGAAG--CTGCTGTCA-GCTCCTTGTTTGCCTCCTGACTTATGGTGCCAGGGCACTCC--ATACGG-AAATTCCA--AGCTTTGCTGCACTTAAAAC
gi|10 : G-----------TT--CA--CCTCTG-C--C---CC-----A-----G----TA-TC-CAC-C--A-TGGC-CTA-------TGC-AGGTAGTTTCTTAACCCGTA-----C---GCTGTG--TA-TCCCAT-TG---AGGG--CCTCACCTGGCCAGT-GGTGA-TG-CAC--CC----A--ATCACCTTCCCC-TGG-----------------------------------TTC-CTC-GGG-T-CCACT-C--CCCTG-------------------AT-------TCT-------T-------TG-GG-CGA-TCAAACTCC-AGCCC-------AA-CCTCC-GGGC-TG-CTA-CTG------TA------A--T-CCG------T-ATCC--TCCCTA-CTG-TCCTCGGAAAAGGTTGG-----------CTCCTT-AA-AACGCA-CAAGCTT-GCAC-TTCCTCTGG-GGC-CCT--GATTTC---------ATGTAGGAACGTTTCTTCCC--T-------------------G-------------TC--------------------------CTGGGTGTCCGGTC-CTTG--GGCTT---TG--TTT-GACCAT-CT-GC-CT------C-TGCACCTCCAGGGAACAATACA--CAG-ATTCCT---A------AGG-GAACACCA-GTGGATTA--TTGGC-AGT--AGAAGG-C--TTCTCCTGAC-TAGTGGACT--CTGTA-GGTATCAAACTCTATCACTGGCTCCAGACGATGACATAGAACAACCC-----TTCA-ACC-TTAG-G-CTTTAGAACTA-----AGGCTGGCGGTCGCTCGTAGTAGAAT--ATACCGTCA-GCTCCTTATACGCCTCCTGACTTCTGTCGCC--GGCACTCT--CTACAG-TAATGCCA--AGCTTTGCCGCATTTTAAAC
gi|11 : GTCCTGGG-A-GT---CCG--C-----TCTGCCAA-AAG--TTA-----TC--G-T--A-TCTTC-T-CTCC---CC----CT---C-------CC-TGGAA-G-AA-TGCCA--G--CCCC----AGGTCT-----AAA-TT-TGC-C-TGA-CAT-T-CTCG-CA----------G---GAA---GTCTA-TAC--C---A----AG-------CAA-CATGGAAGGT--CC-TT---CAA-GG-GA-C-CAC-ATACAGG-TTCAGC----TAT-GTA-------C-ATTCA-----TCTCCA-CT-TGGATG-GGGAA-TGGGCC-GCAATA-AATCCACTCA-T-T-------------------------------------------------C--C---CC-----A-----G----TA-T---------------------------GC-ACGCAGGCCCTGATCCCGTAATTG-C---ACTGAA--TA-TCTCGT-TG---AGTG--TCTCACCTGGCTAGT-GGTGA-TG-CA---CC----G--ATCGCCTTCCCC-TGG----AATA-TCTATCTCTAG--G----GCA--T-CCTC-CCC-GAG-T-CCACT-CATTCCCAG--TTTC-TCGG--G-TTTAC-------TCC-------T-------TG-GG-TGA-TTAAGCTTC-AGCTA-------AA-CCTCatg
gi|11 : TA-CTAG---CTTACCACA-A--T-CCGATCtactgaaacttgggaagattccacaataggtaccagtaggtactagcttaccacaatccgatc
gi|12 : gtcctgggagtccgctctgccaaaagttatcgtatcttctctccccctccctggaagaatgccagccccaggtctaaatttgcctgacattctcgcaggaagtctataccaagcaacatggaaggtccttcaagggaccacatacaggttcagctatgtacattcatctccacttggatggggaatgggccgcaataaatccactcattccccagtatgcacgcaggccctgatcccgtaattgcactgaatatctcgttgagtgtctcacctggctagtggtgatgcaccgatcgccttcccctggaatatctatctctagggcatcctccccgagtccactcattcccagtttctcgggtttactccttgggtgattaagcttcagctaaacctctactgaaacttgggaagattccacaataggtaccagtaggCGGGAAG-AAT-----TT-CCA--CTAG-CATGA--CA-A-GTGCAA-G-GTG-T---CAG--------C-AGAA-TC-T-CA-GA-G-------AGC--T----TCC---GA-A--T-GC-----------------T--A-GGTTCC-A--C--CATAT--A-A-T----CT--GCTAA-C-T-TC-C-TA-TC---AA--AGTG--G-A---GAG-GGC--A-T-AA--G--GCT--ATGGA-CATGGTGTA--GACA--TA--TAT-C--TTCTGA-GA-C-AA--CA-T-CG-----CCCCAGC-CT--CGTCCTGGG-A-GT---CCG--C-----TCTGCCAA-AAG--TAG-----CC--T-T--A-TC--C-C-CCCC---CC----CC---CTCCCCTCCC-GGAGA-G-AA-TGCTT-TG--CCCC----AGATCT-----AAT-TT-TGC-C-TTA-CAT-T-CTCG-CA----------T---GAT---GTATA-TAC--C---A----AG-------CAA-CATGGA--GT--CC-TT---CAA-GG-GAGC-CAC-ATACAGA-TTCAGC----TATTGTA-------C-ATTCA-----CCCCCA-CT-TGGATG-GGGAA-TGGGCCCGCAATA-AATCCTCTTA-T-T---C-------TCAA-GTA--TG-----------CT--TA--TTTCTG-C--C---CT-----A-----G----TA-TA-CAC-C--
gi|13 : CT-GTAC-TTCATCCGG-CAC-CCT--AGTTTC---------ACG-------------------TAGGAACGTTTCCTTTCCCTG-------------TT--------------------------CTGGGTGTCTGGT--CTTG--GA--T---TG--TAT-GACCAT-CT-GC-CTTTGGTTC-TGCGCCTCTAGAAGACATTACA--CAGTCTTCCT---ATTCCTAAGATGCACACCA-GTTG-TTC--TTGGC-AAC-GAGAAGA-T--TTCTCCTGAC-TAGTGGGGTCTCTGTA-GGTATCAATC-CTATCATTGGCTCCAGATCAGGGCATAGAACCACCCTTCAATTGA-A-CATTGG-G-CTTTAGAGCGACGCAGGGACTGACATTCGTTCCTAGTAGAAG--GTGCCGTCA-GCTTCTTGTGCGCTTCCTGACTTATGGTCCCAAGGCACTCC--ATACGG-AAATGCCC--GGGTGTGCTGCCCCTAAAAC
gi|14 : --TA-TCCCTT-TG---ATAG--CCTCACCTGGCCAAT-GGTGA-TG-CA---CC----G--TTCACCTCCCCC-TAT----AATC-TGTATCTCTGG--G----GCA--T-CCTC-CGC-AAG-C-CCA-C-CATCCCTGC--TTTT-TCGG--G-TCGAC-------TCCCGAATCAC-------TG-GA-CGA-TCAAACTCC-AGCTT-------AA-CCTTC-GAAC-TG-------------CTACCACG-A--T-----TCA--T-ATCC--TTTCTA-CTG-TCCTCGGAAAAGGTGAA-----------TGCCTT-AA-AATGCA-CGCGCGT-GTAC-TTCTTACAG-CAC-CCT--GGTTTTTAAGTAGGAACG-------------------TTTCTTTTCCCC--------G-------------TT--------------------------CTGGGTGTCTGGacg
gi|15 : gcg-------AG-CCTCT-AAGC-TG-CTA-TCAG---CCTACCACA-A--T-CCGATCCC-T-ATCC--TCTCTA-CTA-TCCTCGGAAAAGGTGGG-----------TACCTT---------------------------CTCCGG-CGC-CCT--GGTTTC---------ATG-------------------T-------------------G-------------TC--------------------------TTTGGTGTCTGGT--CTTG--GG--T---TG--TAT-GAGCAT-CT-GT-CT------C-TGCGCCTCCAGGCGACAATACA--CAGTCTTCCTTAAA------GGA-ACACGCCA-TTTGATTC--TTGGA-AGC-GTGAAGG-C--TTTTCATGAC-TAATGGGTTCCTTGTA-GGT
gi|16 : taagctataTT-AC-AACGCA-CACGCCT-CGAC-------CGG-CAC-CCCTGGGTTTC---------ACG-------------------T-------------------G-------------TCCNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCTGGGTGTCTGGT----------------TG--TAT-GACTAT-TT-GC-CT------T-TTTGCCTCCAGGCGACAATACA--CAGTCTTCCC---AA-----GGA-GCAAGCCA-GTTGATTC--TTGAC-AGC-GAGATGG-C--TTTTCCTGAC-TAATGGGTTCCCTGTA-GATAT-------------------CAGACGATGACATAGAATCACCATTAAATTCA-A-C-CC-A-G-CTTTcgcccttgaattgaacccagctttgctgcacttaataaac
gi|17 : TA-CTAG---CCTACCACA-A--T-CCGATCC--TTATCC--TCTATA-CTG-TCCTCGGAAAAGGTGGG-----------TCCCTT-AA-AACGCA-CATGCCT-GTAC-CTCCTCCGG-CGC-CCT--GGTTTA---------ACG-------------------T-------------------G-------------TCTAA-----------------------TTAGGTGTCTGGT--CTTG--GG--T---TG--TAT-Ggctgcacttaatacaaatt
gi|18 : tcctngtgattaagcttcagctaaacctctactgaagcttgggaagcttccacaataggtaccagtaggCCGAGAGG-AAT-----TT-CCA--CTAG-CATGA--CA-A-GTGCGG-G-GTA-T---CAGCAGATTCTC-AGAG-TN-N-NN-NN-N-------NNN--N----NNN---NN-N--N-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNT--A-GGTTCC-A--C--CATAT--A-A-T----CT--GCCAA-C-T-TC-C-TG-TC---GA--AGTG--G-G---GAG-AAC--A-T-AA--G--GCT--ACGAA-TATGGTGTG--GACAC------AT-C--TTCTGA-GG-C-
gi|19 : G-A-GT---CCG--C-----TCTGCCAA-AAG--TAG-----TC--T-T--A-TC--C-A-G-----------------C-------ACTGGAGA-G-AA-TGTTA-TG--TCCC----AGGTCT-----AAT-TT-TGC-C-TAA-CAT-T-CTCG-CA----------G---GAA---GTATG-TAC--C---A----AG-------CAA-CATTGA--GT--CC-TT---CAA-GG-GAGC-CAC-GTACAGG-TGCAGC----TATTGTA------------CA-----CCCCC
gi|19 : -TACACCCCCTGGCGACAATACA----GTCTTCCT---A------tggcgacaatacagtcttccta
gi|2 : gagtccgctctgccaaaagtagtcttatccagcactggagagaatgttatgtcccaggtctaattttgcctaacattctcgcaggaagtatgtaccaagcaacattgagtccttcaagggagccacgtacaggtgcagctattgGAAGG-AAT-----TC-CAA--CAAG-CATGG--AA-A-GTGCGA-G-GCA-T---CAG--------CCAGAA-TCCT-CA-GA-G-------AGC--C----TCC---AA-AATT-GCC----------------T--A-GGTTCC-A--CT-CATACCAA-A-T----CT--GCCAA-T-T-CCTC-TA-TC---GA--AGTG--A-G---CAG-GGC--AAT-AAAAG--GCA--ACGGA-AA------G--AACGC---------------TGA----T-AA--CA-T------------AA---T--CATC-TGAA-A-------CG--C-----TCTGACAA-AGG--TCG-----TC--TGT--A-TC--T-T-CTCT---CC----TC---C-------AC-GGAGA-G-AG-TGCCT-TG--CTCA----AGGTCT-----AAT-TC-CGC-C-TTA-CAT-C-CTCG-CA----------G---GAA---GTCTA-CAC--C---A----AG-------CAA-CATTTA--GT--CC-TT----AA-----AAC-CAC-ATGCATG-TCCA
gi|2 : attcTCCACTCA-GAT---C-------CCCA-GCA--TG-----------CT--CA--TTTCTG-T--C---CC-----A-----G----CA-TA-CAC-C--A-CGGT-CTT-------TGC-AGGTAGGTTCTGAACCCATAACTG-CTAGA-TGCA--TA-TC-CAT-TT---AATGG-CCTCACCTGGCCAGT-CGTGA-TG-CA---CA----A--ATCACCTCCCCCCTAT----GATC-TGTATATCTGG--G----GCA--T-CCTC-CTC-GGG-C-CCACC-CATCCCTGA--TTTC-TTGG--G-TCCAC-------TCC-------CGAATCCCTG-GA-CGA-TCAAACTCC-AGCTT-------AA-CCTCC-GGGC-TA-CTA-CCA-----------TG-A--T-CCA------T-ATCC--TCTCCA-CTG-TCCTCGAAAAAGGAGGA-----------TGCCTT-AA-AATGCA-TGCGCCT-GTAC-TTCCTCCGG-CAC-CCT--AGTATC---------ACGCAGGAATGTTTCTTTTCCCT-------------------G-------------TT--------------------------CTGGGTATCTGGT--CTTG--AG--G---TG--TAT-GACCAT-TT-GC-CT------C-TGCGCCTCTAGGAGACA------------TT-----------------GCA---CA-GTTG-TTC--TTGGT-AAC-GAGAAGA-T--TTCTCCTGAC-CAGTGGGCTCTCTGTA-GGTATCAAAT-CTATCATTGGCTCCAGACCAGGGCACAGAATCACCTTTGAAC------C-TTGGTA-CTTTGGAGCGACGCTGGGGCTGGT-----TTCCTAGTAGAAG--CTGCTGTCA-GCTCTTTGTTTTCC-CCTGACTTATGGTACCAGGGCActcagatccccagcatgctcatttctgtcccagcatacaccacggtctttgcaggtaggttctgaacccataactgctagatgcatatccatttaatggcctcacctggccagtcgtgatgcacaaatcacctcccccctatgatctgtatatctggggcatcctcctcgggcccacccatccctgatttcttgggtccactcccgaatccctggacgatcaaactccagcttaacctccgggctactaccatgatccatatcctctccactgtcctcgaaaaaggaggatgccttaaaatgcatgcgcctgtacttcctccggcaccctagtatcacgcaggaatgtttcttttccctgttctgggtatctggtcttgaggtgtatgaccatttgcctctgcgcctctaggagacattgcacagttgttcttggtaacgagaagatttctcctgaccagtgggctctctgtaggtatcaaatctatcattggctccagaccagggcacagaatcacctttgaaccttggtactttggagcgacgctggggctggtttcctagtagaagctgctgtcagctctttgttttcccctgacttatggtaccagggcat
gi|20 : attcgaaggaattccaacaagcatggaaagtgcgaggcatcagccagaatcctcagagagcctccaaaattgcctaggttccactcataccaaatctgccaattcctctatcgaagtgagcagggcaataaaaggcaacggaaagaacgctgataacataatcatctgaaacgctctgacaaaggtcgtctgtatcttctctcctccacggagagagtgccttgctcaaggtctaattccgccttacatcctcgcaggaagtctacaccaagcaacatttagtccttaaaaccacatgcatg-TACACCCCCTGGCGACAATACA----GTCTTCCT---AA-----GGA-GTACTCCA-GTTGATTC--CTGGC-AGC-AAGAAGG-C--TTTTCCTGAC-TAATGGGTTCCTTGTA-GGTAT-------------------CAGACGATGACACAGAATCACCTTTAAATTCA-A-C-TT-A-G-CTTTt
gi|21 : cagctattgCCGGGGG---AT-----TT-CCA--CAAG-CATGA--CA-A-GTGCGA-G-GTA-T---CAG--------C-AGAA-TC-T-CA-GA-G-------AGC--TTAAATCT---GA-A--T-GC-----------------T--A-GGTTCC-A--C--CATAT--A-A-T----CT--GTCAA-T-T-TC-C-T-----------AGTG--G-G---GAG-GAC--A-T-AA--G--ACT--ACGGA-AATGGTGTG--G--ACATA--TAT-T--TTCTGA-GG-C-AA--gatgcacttaatacaa
gi|22 : CCGAGAAG-AAT-----TC-CAA--CTAG-CATGG--AA-A-GTGCGA-G-GCA-T---CAG--------C-AGAA-TA-T-CA-GA-G-------AGT--C----TCC---GA-A--T-GC-----------------T--A-AATTAT-A--C--CATAC--A-A-T----CT--G----------T-C-TG-TC---GA--AGTG--G-G---GAG-GAC--A-C-AA--G--GCA--ACGGA-AATGGCGCT--GACAC-T---TAT-C--TTCTGA-GG-C-A
gi|23 : G--------C-AGAT-TC-T-CACGA-G-------TGC--T----TCC---GA-A--T-GCA----------------T--ATGGTTCC-A--C--CATAT--A-A-T----CT--GCCAA-CTT-TC-C-TG-TC---GA--AGTG--G-G---GAG-AAC--A-T-AA--G--GCTAAACGAA-TATGGTGTG--GACAC------AT-C--TTCTGA-GG-C-AA--
gi|24 : GT--CTTG--GG--T---TG--TTT-GACCAT-CT-AC-CA------C-TGCACCTCTATAAGACA---------GTCTTCAT---AC-----GAA-GCACACCA-ATTGATTC--TTGGT-AGC-GAGAAGG-A--TTCTCCTGt
gi|25 : A---CC----G--ATCACCTCCCCC-TAT----AATC-TGTATCT--GG--G----GCA--TGCCTC-CAG-GA--C-CCACC--ATCCCTGG--TTTC-TCGG--G-TCCAC-------TTC-------C-------
gi|26 : tgcatgcgtttctTGA-GG-C-AA--CA-A-AA-----TCCCAGC-CT--TGTCCTGGG-A-TT---CCG--T-----TCTGCCAA-AAgaatg
gi|27 : ---GA--AGTG--G-G---TAG-GGC--A-T-AA--A--GCT--ACGGA-TATGGTGTG--GACA
gi|3 : t-CCA--CTAG-CATGA--CA-A-GTGGCA-G-GTG-----CA---------C-AGAAGTC-C-AA-GA---------AGC--T----TCC---GA-A--TAGC-----------------TTAA-GGTTCA-A--C--CATAT--ATA-T----CTTGGCTAA-C-T-TC-C-TA-TC---AA--AGTG--G-A---GAG-GG-----T-AA--G--GAT--GC-----ATGGTTAT--GACATATA--TAT-C--TTCT-A-GA-C-AA--CA-T-CG-----CCC-AGC-CT--C-TGCTGGG-A-GT---CCG--C-----TTTGGCAA-AAG--TAA------C--T-T--A-CC--C-C-CTCC---CC----CC---CTCCCTC-CC-GGAGA-G-AA-TGCTT-TG--CCCG----AGATCT-----AAT-TT-TGCGC-TTAACAT-T-CTCG-CA----------T---GTCT--GTATAATGC--C---A----AG-------CAA-CATGGA--GC--CTGTT---CAA-GG-GAGC-CAC-ATACAGA-T-CAGCG---TATTGTA-------CGATTCA-----CCC--A-CT---GATG-GCGAA-TGGGCCCGCAATA-AATCCTCTTA-T-T---T-------CTCAAGTGACTG-----------CT--TA--TTTCTG-C--CTACCT-----ACAAGTA----TA-TC-CAC-C--A-CGGC-TCG-------TGCTACG-AGGTCCTGACCCCGTAATTG-C---ACTGTA--TA--CTCGT-TG---GGTGTCCCTGACCTGGCCATT-GGTGA-TG-CAG--GC----G--ATCGCCTTCCCC-TTG----AATC-TCTATTTCTGG--GAAAAACA--T-CCTC-CCT-GAGCC-CCACT-CATCCCTGG--TTTCTTCGG--GTTTCAC-------TCC-------T-------TGTGGTTGA-TTAAGCTTTAAGCT--------AA-TCTCTAAAGC-TG-CTATCCAG---CCTACCACA-A--T-C--GTCCAAT-ATCC--TCTCTATCTGTTCCTCGGAAAAGGTGGG-----------TGC--T-AA-AACGCA--ACGCCTGGTAC-TTCCTCCGG-CGC-CCT---GTTTC---------ACG-------------------T-------------------G-------------T---------------------------CTGGGTGTCTGGT--C--------------G--TAT-GGACTT-GT-GC-CT----------TGCCTCCA-GCGACAATACATGCAGTCTTCCCA--A------GGA-GCAAGCCA-GTTGATCT--GTGAC-AGCGGAGATGG-C--T--TTCTGAC-TAATTGTTTCCCTGTA-GATAT-------------------CAGACGATGACATAG-ATCACCATTAAATCCA-
gi|4 : gagatatAGG-ATT-----TC---A---TAG-CATGA--CA-A-G--CGA-G-GTAAT---AAG--------C-AGAA-T--T-CA-GA-T-------AGT--T------C---GG-G--T--C-----------------T----GGTTC-----------A---A-A-T----TT---TTAA-C-T-TC-C-TA-TC---GA---GTG--G-G---AAG---C--A-TTAA--G--GTT--ACGGA-CATG-TGTA--AA---ATA--T-T-C--TTCTGA-GA-C-AGAGCA-TTCG-----CCCAGGCTCT--CGTCCTGTG-C-GTG--CCG--C-----TCAGCCAA---G--TAA-----TC--T-TTTA-TC--C-C-C-CC---CC----CT---C-------AC-T-AGA-G-AA--GCTA-TG--CCAC----AG--CT-----A-T-TT-T-C-C-TT--------TTCGACA----------G---AAA---GT-TG-TAC--CTACACTGTAG-------CAA-CATGGA--GT--CC-TT---TAA-GGTGAGC-CAT-ATA--AG-TTCA-C----TATTGTA-------C-ATTC--------CCCA-CT-TGGA---GGGAACTGGGCCCGCAATA-AATCCACTCG-A-TGTGCGG-----CCTATGTA--TG-----------CT--AA--TTTCT--C--C---CT-----A-----G----TA-TGACAC-C--ATCGGT-CCT-------TGT-ACGT--GTCCTGG-CCCGTA-TTG-----ATTATAGATACTCTCGT-TGTTTGGTG--TCT-AC-TGGCCAGT-GGTGAATG-CG---CCTCTTGTTATCGCCTTCCC--TGG----AATC-TCTATCTCCTC--A----GCA--T-CTTC-CGC-GAG-C-CCACCTCAT-CCTGG--TTTC-TCGG--G-TTCAC-------T-C-------C-------TG-GG-TGAGT--AGCTTT-A-CT--------AA-GCTCT-AAGC--G-CTA-CCAG---CCTACCACA-A--T-CCGATTC--A-TTCC--TCTCTA-ATG-TTCTCGG--AATGCGGC-----------TGCCTTAAA-AACGCA-TG---CT--TACGTTCCTCCGGTCGC-CCT--GGTTT----------------------------------------------------------------------------------------------TTGGTTGTC------CTTG--GG--TTGATG--TATGGACCATGCT-GCTCT------T-TGCTTCTCAGGGC-----T--------TTTTCCT---A------GGA-ACACATTA---TGATTCCTTCGGCGAGC-GAGAAGG-CAGTTTTCCTGA--TATTGTTCACCCTGTACGGTAT
gi|5 : GGGGAG-AAT-----TC-C-A--CAAG-CATGA--CA-A-GT-CGA-GTGTA-T---CAG--------C-AGAA-TC---CA-GA-G--------GT--TAAA-TCT---GATA--T--C-----------------T--T-G--TCC-ATTC--CATAT--A-A-T----CT---CCAA-C-T-TC-C-TA-----------GTG--G-G---GAG-GAC--A-T-AA--G---CT--ACGGA-TAT--TGTA-----ACATA--TCT-C------GA-G--C-AA--C--T-CG-----CCC-AGC-TT--C-TCCTTAG-A-GC---CC---------TCTGCCAATAAG--TAG-----TC--T-T--A-TC--C----TCC---CC----CT--------------GGAG-------TGC-A-TC--CCTC----AAGTCT-----AGT-TT-TGC-T-TTA-CGT-T-CTT--CT----------G---GAA---GTTTAATAC--C---A-----G-------CAA-CATGGA--GC--CC-TT---CAA-GG-GAGC-CAC-ATACAGG-TTCAGC----TAGT-TA-------C-ATT-A-----CCCC-A-CT---GATGTGGGAA-TGG-CCCGCAATA-AAACCAC-CA-G-T---C-------CC-A-GTA--T------------CT--AA--TGTCTG-C--C---CT-----A-----G----TA-TC-CAC-C--A-AGGC-TTC-----------ACGTA--TCCTGAACCTGTAATTG-A---ACTG-A--TA-TCTCAT-TG---AAGG--TCTCACCT--CCAGT-GATGA-TG-CA---CC----G--ATTGC-TTCCCC-TG-----AATC-TCTATCTCTAG--G----CGA--T-CATC-CCG-TAC-C-GCACT-CATTCC-GG--TTTC-TGCG--G-TTCAC-------TTC-------T-------TG-G----A-TTAAGCTC--AGCTT-------AAACCTCT-AAGC-TG-CTA-CCAGT--CCTACCACATA--T-CCGATTCA-T-ATCT--TCTCTA-CTG-TCCTCGAAAAATGTG-------------TGCCTT-AATAACGCA-CATGTCT-GTAC-TTC-TCCG--CGC-CCT--G--TTC---------ACG-------------------T-------------------G-------------TC--------------------------TTGGGTGTCTGGT--CTTGA-AG--T---T---TAT-GACCAT-CT-GC-CT------C-TGCGC--CCA-GAGAC-ATACA--CAATCTTCC----A------AGA-GCACGCCATGTGGATCT--GTGGC-AGC-GAGAA-G-C--TTTTCCTGAC-TAAT-GGTTCATTGTA--GTAT-------------------CAGACGATTACATAAAATCACCCTTGAATTCA-A-C-tcagagatcgacatagaatatttggcccttgaagtgtgcagtgatagctttttttgcttcatttatacaaa
gi|6 : AGG-ACT-----TC-CCA--CTAGGCATGG--AA-AAGTGCGACG-GT------C-G--------C-AGAA-TT-T--A-TA---------AGC--T----TCC---CA-A--A-GC-----------------T--A-GGTTCC-A--C--CTTAC--A-AGT----CT--GTCAA-C-T-CC-C-TA-TC---GAAGAGTG--ACG---GAG-GGC--A-T-AG--A--GCTTAATGGA-AATGGCGCGCTGACACA-A--TA-----CTCTGATGG-C-AA--CA---AA-----CCCCGAG-CT--CCTCCTAGG-A--T---TCG--T-----TCAGCCAA-AGG--TCG-----TC--TGT--T-TG--C-T-TTCCACTCC----TT---C-------AA-TGAGATG-AGTTGTCA-TG--CTCG----AGTCTT-----AAT-AT-Tccatcttgctacacttaatacaaat
gi|6 : aTATCTCTGGA-G----GCA--T-CCTC-CC--GA--C-CCACC--ATCCATGG--TTTC-TCGG--G-TCCAC-------TCCGAATAT-C-------TG-GA-TGA-TCAAACTCC-AGCT--------AA-TTCCG-GGGC-TG-C-------------ACCAC--------CAAGCCA-T-ATCC--TCTCTA-CTG-TCCTCG-AAATGGTTGAATAAAATCCATTACCTT-AA-CATGCAGCGCGG-T-GTAC-TTCC------CGTACCT--G-TTCC---------ACA-------------------T-------------------AGGAACGTTTCTTTTC--------------------------CT---T-TCTGGTTACTTTCTGG--T---TGAATAT-GACAAT-CTAGC-CT------CGTGC-CCTCTAGGAGACA-TACAA-CAGTCTTTCG---A------AGA-GCAC-CC---TTG-TTC--TTGGC-AAC-AAGAAAGAC--TTCTCCTGACATAGTGGGCTCTCTGTA-GGTATCAAAC-CTACCATTGA--TCAGAC-CCAGCATAGAACTACCC-TACATTAA-A-C-CTTG-G-ATTTAGAG-GACGCA-GGGCTGACGGTCGTTCCTAG-AGATGGTTTGGCGTAAGGATCCTGGTGCGAAT-CTGACTTATGGGCCCAGCG-ACTCCGAGTACGGAAAATTTCCTAGACTTTGCCCCACCTACAAcgttatctctggaggcatcctcccgacccaccatccatggtttctcgggtccactccgaatatctggatgatcaaactccagctaattccggggctgcaccaccaagccatatcctctctactgtcctcgaaatggttgaataaaatccattaccttaacatgcagcgcggtgtacttcccgtacctgttccacataggaacgtttcttttcctttctggttactttctggttgaatatgacaatctagcctcgtgccctctaggagacatacaacagtctttcgaagagcacccttgttcttggcaacaagaaagacttctcctgacatagtgggctctctgtaggtatcaaacctaccattgatcagacccagcatagaactaccctacattaaaccttggatttagaggacgcagggctgacggtcgttcctagagatggtttggcgtaaggatcctggtgcgaatctgacttatgggcccagcgactccgagtacggaaaatttcctagactttgccccacctacaa
gi|7 : aaggacttcccactaggcatggaaaagtgcgacggtcgcagaatttataagcttcccaaagctaggttccaccttacaagtctgtcaactccctatcgaagagtgacggagggcatagagcttaatggaaatggcgcgctgacacaatactctgatggcaacaaaccccgagctcctcctaggattcgttcagccaaaggtcgtctgtttgctttccactccttcaatgagatgagttgtcatgctcgagtcttaatattcgtGGGAGGCAATATTCATC-CCAGTCTGG-CATGG--GACA-GTGCGA-G-GAA-TT--CAGGAA-----C-AGAA-TC-TTCA-GACG-------AGCGGT----TCCTGGGA-A--T-GC-----------------T--G-CGT----A--CA-CAGAT--A-A-TAAATCT--GCTAAAC-TCTC-C-TAATCTGTAA--AGGGTCG-GAAAGAG-GGGTAA-T-AA--AATGTT--ACTGA-C-TGGTGTG--GACATATA--TAC-CCCTTCGGA-GATC-AAG-CAAT-CGAGCTTCCACATG-CT--AGTC-TGGG-G-GTTGGCCGGCC-----TCTGCCAA-GAG--TAGGTTACCCA-T-T--A-TT--C-TTCTTC---CT----CCTCTC-------GC-GGCGA-GGAA-TGCTAATAAACTTA----AAATCTTACATAGC-TTATGC-T-TCA-AAC-TGTTCG-CACTGCGAGCAAG---GAA---GTATG-TAC--C---A----AGTCTTCACCAGTCATGGA--GTTACC-TT---CAAAGG-GAGGACAA-GTACAGGGTTCAGCCTAGTAATGGA-------C-AATCAGTCATCCCCCAACT-TCGAAA-GGAAA-TGGGACGGCATTA-AATCCACGCA-C-T---CAATTTCTCGCA-GAA--TGATTGACGTAAACT--AAAGTTTCTGGC--C---CTGAAATA-----GGGGCTA-TT-CCC-CTCA-CGGGGCGC-------GCC-ACGTAGGTCCCGG----GTAATTG-C---GCTGTA--TA-TTTCGT-TG----GTG--TCT-AC-TGGCCAGT-GGTGA-TGTCA---GC----G--GATGCCTTCCCC-TGG----AATC-TCTATCTCTAG--G----GCA--T--CTT-CCC-GAG-C-CCACT-CATCCCTGG--TTTC-TC-G--G-TTCAC-------GTC-------C-------TG-GG-TGA-GTAAGCTTC-AGCTTAACCTGAAA-CCTCT-AAGC-TG-CTA-CCAG---CCT
gi|8 : atccgT-----TCTCCA--CTAA-CATAGACCA-A-GTGC-A-C-GTA-TGATCAA--------A-AAAA-TCAT-CA-TA-GTATATTGAGC--T----TTC---GG----T-GC-----------------TT-A-GGTTCCGA--CAATATAT--A-A-T----CT--GCTAA-C-T-TC-CATACTCT--GA--CGTG--G-G---GAGTGGT----T-AA--G--GTT--ACGGATCATGGTGT---GACAT-TAC-TATCC--TTCTGA-GA-CAAA--CA-T-CGC----CCCCAGC-CTTCCGTCCTGGGCACGTCC-CCG--CCCCCTTCTGCCCA-AAGCTTAG-----TCCAT-T--AGTC--CTC-CTCC---CCACCTCC---C-------ACTGGAGA-G----TGCTA-TG--CCCCTCGAGGGTCTAA---AATGCT-CGC-CTTTA-CATAT-CT-G-CA----------GCTAGAGCACGGGTA-TGCTAC---A----AAAGCTCC-CAA-CATG----AT--CT-TTTCGTAA-AG-GAG--CACAATACAGG-TTCAGC----TGATATAATGTTACC-ATTTA-----CCTCCA-CTGTGGAT-------------------TATAATCCACTCATT-T---C-------CCCA-GTA--TG-----------CTGAGA--TTTCTG-CGTC---CT-----A-----G----TATTC-CACTC--A-TGG--CTCATACAGATAT-ACG-AAGTCCTGACCCCGTAAGTGCC---ACTGTA--TA-T-TCGTGCG---GGTT--CCTCATC-GGCTAGTCGGTGG-TG-CAAAGCG----A--ATCGCCTTTTCC-CGGTGGCAATCATCTAT-TC-GGTAG----TCAGTT-CCTCGCCCGGAG-C-CCACCTCAT-CCTGGGTTTTC-TCGGTTGTTTCAC-------TCC-------T-------T---G-TGG-TAAAGCTTT-AGCT--------AA-CCTCT-AAGCTTGTCTACCCAGGTACCTACCACT-AATT-CCGATC
gi|9 : aat---C-------CCCA-GCA--CG-----------CT--CA--TTTCTC-C--A---CC-----A-----G----TA-TC-CAC-C--A-CGGT-CTC-------TGC-AGGTAGGTCCTCAACCCA-AATTA-T---TCTGCG--TA-TCAGTT-TG---AGAG--ACTCACCTGCGCAGT-GGTGA-TG-CA---CT----G--ATCGCCTTCCCC-TAT----AA---TCTATCTCTGG--G----GCA--C-CCGC-CCC-GAG-CACCCCC-CCTCCCTGA---TTC-TCTG--G-TCCACTCGCGATTCC-------C-------TA-TG-CGA-TCAAACCCC-AGTTC-------AA-CCCCC-AGGC-TG-------------CTACCACG-A--T-CCA------T-ATCC--TCTCT
gi|9 : aaAGG-T--TTCTCCTGAC-TAGTGGGCTCTCTGTA-AGTATCAAAC-CCATTATTGGCTCCAGACGAGGGCATAGAACCATCCTTCAATTCA-A-C--------CTTTAGAGCGACACAGGAGCTGGCGGTAGTTCCTTGTAGAAG--GTGCCGTCA-GCTCCTTGTGTGCCTCCTGACTTATGGTGCCAGGGTACTCC--ATACGG-AAATCCCC--GGCTTTGCCGCACCTAAAACnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnacaggtttctcctgactagtgggctctctgtaagtatcaaacccattattggctccagacgagggcatagaaccatccttcaattcaacctttagagcgacacaggagctggcggtagttccttgtagaaggtgccgtcagctccttgtgtgcctcctgacttatggtgccagggtactccatacggaaatccccggctttgccgcacctaaaacaag
blockSeqs : C ATTCA T GT G AC C A C T TGAT CAGATTCT C G C T C GTATATTG GG TAAA TGG T AT A NNNNNNNNNNNNNNNNN TAA G TT AA CA T G AAAT TG A T C T A A TGT AG TC C AAA T TA A T AA AT AA TC GCT ATA C CC T AT A AG ATCGAGCTT C T TC G C GTTGG GC CCCCT T CT GTTAC CAT TT G TT TT T ACT CCCTCCCCTCCC T AGT A AA TCGA G TACAT G A G T A TG A CTGCGAGCAAG CAC C A TA TAC CTGT TCTTCAC T AG TA G TCG A T A A G T CTAG ATGTTACC GTCAT A GT TGT C C T CTCAATTTCT A A AC ATTGACGTAAA GAG AG G GT TAC ACAAGT GGGC T GA T TC T CTCATACAGAT T T A CTAG T GA C G TTT TC C C A T AAG TCTT TT C GTGGC A TA AAAA GT G G G C A T GT T TT T TCGCGAT CGAATCAC T TT G C A TAACCTGA A TA T T T GGTA AT AT . GTCCAA T . T T ATAAAATCCAT A T GCGC G G T A TG TAAGTAGGA TGTCCNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN TA CT TTGA AA G G A T TTGGTTC G A A TGCA TATTCCTA T A TG A CT G G A AG A C CAAACTCTATCACTGGCTC C . C ATTGGG AG G GTT G A G C GAG A G TA
blockSeqs : . . . . . . . . . . AT GAA . . A . . CG . AAA . . . . C AT . . T . . . . . . . . . . C T . . . . . . . . . . TA C A ATA . . . A . G TTCG C . . G . CGTCC . . . . . TG . . . TC C . CCCTCCCTCCC . GAA . . . A AA . . . . . AT . GCTA T A A . . . AGCTCC . . . . . . . . . . T G CG . . T TG . C . ATGTGCGG C T . . C . . . . GAAATA . . C . . . GGCGCG . C T CC A . . . . G C . . . C . . . G . A . . . . . . . T . . . T . CGAATCCC . C . T . C . C . . C GT A . . ATCCC . . . . . . . CAA . . . . . . TAGGAACGTTTCCTTTCCCTGTT C A CTT . . . . . CG A T A ACA TTAAA . A G A . . . . . . . CAATCCTATCATTGGCTC A . . TTGGTA TG A A . G C C C . G .
blockSeqs : . . . . . . . . . . TT . . . . . . G . . . . . . A TA . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T G ATA . . . G . . TCGC A . . A . GTG . . . . . TG . . . T T . ACCTCCCACT . AA . . . G . . . . . . T . G . A . . . . . . . . . . . . . . . G . C . . T TG . C . GATC C . . . T . . . . A . . A . . . CCTAT . T A C C . . . . . C . . . G . . . G . . . . . . . . . . . . . . . GAATATC . T . C . A . C . . . G G . . ATTCA . . . . . . . CGC . . . . . . CAGGAATGTTTCTTTTCCCTGTT . . T . . . . . C C A A CA CAA . G G A . . . . . . . CAAATCTATCATTGGCTC G . . TTAGG AG G G . T A C A . T .
blockSeqs : . . . . . . . . . . T . . . . . . N . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A G ATA . . . G . . TCG C . . G . GT . . . . . AT . . . C T . CCTCTCGC . AA . . . G . . . . . . T . T . C . . . . . . . . . . . . . . . C . C . . T TG . C . TTTC T . . . C . . . . A . . A . . . TCTTT . T C C T . . . . . C . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . T . C . C . T . T . . . G A . . AGCCA . . . . . . . CAC . . . . . . TAGGAACGTTTCTTCCCTGTC . . T . . . . . C C A A CA TAA . G T A . . . . . . . CAAACCCATTATTGGCTC A . . CTTGG A G C . G C T A . C .
blockSeqs : . . . . . . . . . . T . . . . . . G . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A G ATA . . . G . . AAA C . . G . GT . . . . . G . . . A T . CTCCC . AA . . . A . . . . . . T . G . A . . . . . . . . . . . . . . . T . C . . T AA . G . TTC C . . . T . . . . A . . C . . . CTCGT . T A C T . . . . . G . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . T . C . T . T . C . . . G A . . ATCC . . . . . . . CAT . . . . . . TAGGAACGTTTCTTTTC . . T . . . . . T C A A CA TAC . T G A . . . . . . . CAAACCTACCATTGAT A . . CCAG . . G . G G .
blockSeqs : . . . . . . . . . . T . . . . . . G . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A T TAC . . . G . . TCG C . . C . GT . . . . . T . . . T T . TCCAC . AG . . . G . . . . . . C . G . T . . . . . . . . . . . . . . . T . C . . . T . . . TTT C . . . A . . . . A . . C . . . TCCTT . T C A T . . . . . C . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . C . T . T . T . T . . . G G . . ATTC . . . . . . . TGC . . . . . . TTTCTTTTCCCCGTT . . G . . . . . C A A A CA CAA . A G A . . . . . . . . G . . TTAG
blockSeqs : . . . . . . . . . . T . . . . . . G . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T G TA . . . G . . TCG . . . G . TT . . . . . T . . . C T . CTCAC . AA . . . T . . . . . . T . T . A . . . . . . . . . . . . . . . T . C . . . . . . . GTC C . . . A . . . . A . . T . . . TCTCT . T A C T . . . . . C . . . . . . . G . . . . . . . . . . . . . . . T . T . C . C . T . . . G A . . TCA . . . . . . . CAT . . . . . . TGTCTAA . . T . . . . . C C A A CA TA . G G A . . . . . . . . A . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . T . . . . . . G . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T G AA . . . A . . AA . . . G . GT . . . . . T . . . C T . TTCAA . AA . . . A . . . . . . T . G . G . . . . . . . . . . . . . . . T . . . TT . . . . A . . . . A . . C . . . CTTC . . . T C . . . . . C . . . . . . . G . . . . . . . . . . . . . . . C . T . T . . . G . . . G A . . . . . . . . . . AC . . . . . . TGTC . . T . . . . . T A A A . TA . A A A . . . . . . . . C . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . T . . . . . . T . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . C T T . . . A . . T . . . . . GC . . . . . T . . . T . . CACT . . . . . G . . . . . . . . G . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . A . . C . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . . . . . . . . T . T . A . . . T . . . . T . . . . . . . . . . TG . . . . . . TGTC . . T . . . . . C C . A . TA . G G . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . G . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T A . . . . G . . . . T . . . . . T . . . . . . CT . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . C . C . C . . . T . . . . G . . . . . . . . . . . . . . TGT . . . . . . . . . C . . . GA . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A A . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . A . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . C G . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . A . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqCons : ATA** ATCC** ** TAA******** G* CAACCTATCATTGGCTC** TTGGG***
originalCons : CCGGGAGG-AAT-----TC-CCA--CTAG-CATGG--CA-A-GTGCGA-G-GTA-T---CAG--------C-AGAA-TC-T-CA-GA-G-------AGC--T----TCC---GA-A--T-GC-----------------T--A-GGTTCC-A--C--CATAT--A-A-T----CT--GCCAA-C-T-TC-C-TA-TC---GA--AGTG--G-G---GAG-GGC--A-T-AA--G--GCT--ACGGA-NATGGTGTG--GACACATA--TAT-C--TTCTGA-GG-C-AA--CA-T-CG-----CCCCAGC-CT--CGTCCTGGG-A-GT---CCG--C-----TCTGCCAA-AAG--TAG-----TC--T-T--A-TC--C-C-CTCC---CC----CC---C-------AC-GGAGA-G-AA-TGCTA-TG--CCCC----AGGTCT-----AAT-TT-TGC-C-TTA-CAT-T-CTCG-CA----------G---GAA---GTNTA-TAC--C---A----AG-------CAA-CATGGA--GT--CC-TT---CAA-GG-GAGC-CAC-ATACAGG-TTCAGC----TATTGTA-------C-ATTCA-----CCCCCA-CT-TGGATG-GGGAA-TGGGCCCGCAATA-AATCCACTCA-N-T---C-------CCCA-GTA--TG-----------CT--NA--TTTCTG-C--C---CT-----A-----G----TA-TC-CAC-C--A-CGGC-CTC-------TGC-ACGTAGGTCCTGAACCCGTAATTG-C---ACTGTA--TA-TCTCGT-TG---AGTG--CCTCACCTGGCCAGT-GGTGA-TG-CA---CC----G--ATCGCCTTCCCC-TGG----AATC-TCTATCTCTGG--G----GCA--T-CCTC-CCC-GAG-C-CCACC-CATCCCTGG--TTTC-TCGG--G-TCCAC-------TCC-------C-------TG-GG-CGA-TCAAGCTCC-AGCTC-------AA-CCTCC-GAGC-TG-CTA-CCAG---CCTACCACG-A--T-CCGATCC--T-ATCC--TCTCTA-CTG-TCCTCGGAAAAGGTGGG-----------TGCCTT-AA-AACGCA-CGCGCCT-GTAC-TTCCTCCGG-CGC-CCT--GGTTTC---------ACG-------------------T-------------------G-------------TC--------------------------CTGGGTGTCTGGT--CTTG--GG--T---TG--TAT-GACCAT-CT-GC-CT------C-TGCGCCTCCAGGNGACAATACA--CAGTCTTCCT---A------GGA-GCACGCCA-GTTGATTC--TTGGC-AGC-GAGAAGG-C--TTCTCCTGAC-TAGTGGGCTCCCTGTA-GGTATCAAAC-CTATCATTGGCTCCAGACGATGACATAGAACCACCCTTAAATTCA-A-C-TTGG-G-CTTTAGAGCGACGCAGGGGCTGGCGGTCGTTCCTAGTAGAAG--NTGCCGTCA-GCTCCTTGTGCGCCTCCTGACTTATGGTGCCAGGGCACTCC--GTACGG-AAATNCCC--GGCTTTGCCGCACCTAAAAC
finalCons : CCGGGAGG-AAT-----TC-CCA--CTAG-CATGG--CA-A-GTGCGA-G-GTA-T---CAG--------C-AGAA-TC-T-CA-GA-G-------AGC--T----TCC---GA-A--T-GC-----------------T--A-GGTTCC-A--C--CATAT--A-A-T----CT--GCCAA-C-T-TC-C-TA-TC---GA--AGTG--G-G---GAG-GGC--A-T-AA--G--GCT--ACGGA-NATGGTGTG--GACACATA--TAT-C--TTCTGA-GG-C-AA--CA-T-CG-----CCCCAGC-CT--CGTCCTGGG-A-GT---CCG--C-----TCTGCCAA-AAG--TAG-----TC--T-T--A-TC--C-C-CTCC---CC----CC---C-------AC-GGAGA-G-AA-TGCTA-TG--CCCC----AGGTCT-----AAT-TT-TGC-C-TTA-CAT-T-CTCG-CA----------G---GAA---GTNTA-TAC--C---A----AG-------CAA-CATGGA--GT--CC-TT---CAA-GG-GAGC-CAC-ATACAGG-TTCAGC----TATTGTA-------C-ATTCA-----CCCCCA-CT-TGGATG-GGGAA-TGGGCCCGCAATA-AATCCACTCA-N-T---C-------CCCA-GTA--TG-----------CT--NA--TTTCTG-C--C---CT-----A-----G----TA-TC-CAC-C--A-CGGC-CTC-------TGC-ACGTAGGTCCTGAACCCGTAATTG-C---ACTGTA--TA-TCTCGT-TG---AGTG--CCTCACCTGGCCAGT-GGTGA-TG-CA---CC----G--ATCGCCTTCCCC-TGG----AATC-TCTATCTCTGG--G----GCA--T-CCTC-CCC-GAG-C-CCACC-CATCCCTGG--TTTC-TCGG--G-TCCAC-------TCC-------C-------TG-GG-CGA-TCAAGCTCC-AGCTC-------AA-CCTCC-GAGC-TG-CTA-CCAG---CCTACCACG-A--T-CCGATCC--T-ATCC--TCTCTA-CTG-TCCTCGGAAAAGGTGGG-----------TGCCTT-AA-AACGCA-CGCGCCT-GTAC-TTCCTCCGG-CGC-CCT--GGTTTC---------ACG-------------------T-------------------G-------------TC--------------------------CTGGGTGTCTGGT--CTTG--GG--T---TG--TAT-GACCAT-CT-GC-CT------C-TGCGCCTCCAGGNGACAATACA--CAGTCTTCCTAA--------GGA-GCACGCCAG-TTGATTC--TTGGC-AGC-GAGAAGG-C--TTCTCCTGAC-TAGTGGGCTCCCTGTA-GGTATCAACCTATCATTGGCTC--CAGACGATGACATAGAACCACCCTTAAATTCA-A-CTTGGG---CTTTAGAGCGACGCAGGGGCTGGCGGTCGTTCCTAGTAGAAG--NTGCCGTCA-GCTCCTTGTGCGCCTCCTGACTTATGGTGCCAGGGCACTCC--GTACGG-AAATNCCC--GGCTTTGCCGCACCTAAAAC
Alignments
lowQualScore : 111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111
lowQualScore : 11111111 111111111 1111 22222222222222222 11 11111 1111111111 1 111111 1111 111 22222222222222222222 11111 11111111111111 111 2222222 1111 111111111 11111 222222222222222 11111111111 2222222222222 11111 111 1111111 222222222222222 22222222 1111 111111 11111111111 111111111 333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333 11111111 1111 111111111 666666666666666666666 11111111 111 111 11
lowQualScore : 4 99999 3 0 44 3 44 3 3 3 3 99999 66666666 3 3 6 3 3 333333333 44 1111 555 3 44 3 77777777777777777 8888 3 44 00 44 3 3 6666 44 3 3 3 3 3 6 777 33 33 2 555 2 33 2 2 33 33 77 44 444 99999 3 44 2 33 2 77 7777777777 0 4 55 2 3 333333 44 88888 3 55 99999 1111 55 3 55 111 1 666 88888888888888888888 3 4444 0 3 55 7777 1 44444 3 3 4 4 4 444 4 99999999999999 111 4 8 55 777 8888 4444444 4 55 55 4 777 4 4 4 4 4 1 3333 666666666 11111 5 88 666 5 2 5 333333333333333 1 8 55 77777777777 777 55 3 55 666 99999999999 7777 3 66 3 55 4 1111111111111 4 2 8 0 00000 3 55 3 0 3 666 0 88 1 3 3 3 222 7777 44 3 99999 3 77 6666 44 3 3 3 3 3 6 0 44 3 44 6 0000000 555555555555555 3 44 3 2 3 44444444 3 33 3 3 5 0000 88 44 3 666666 3 55 4 4 99999999999 3 3 8888 3 3 3 3 44 333333333 000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 77 77 777777 44 3 3 3 3 11111111 0 1 6 2 1111 444444444 3 3 55 3 44 3 3 3 44 3 0 3 222222222222222222222 0 1 4 4 44444444 66 1 000 6 1 1 1 555 8 1 11
lowQualScore : . ..... . . .. . .. . . . . ..... ........ . . . . . ......... .. .... ... . .. . ................. .... . .. .. .. . . .... .. . . . . . . ... .. .. . ... . .. . . .. .. .. .. ... ..... . .. . .. . .. .......... . . .. . . ...... .. ..... . .. ..... .... .. . .. ... . ... .................... . .... . . .. .... . ..... . . . . . ... . .............. ... . . .. ... .... ....... . .. .. . ... . . . . . . .... ......... ..... . .. ... . . . ............... . . .. ........... ... .. . .. ... ........... .... . .. . .. . ............. . . . . ..... . .. . . . ... . .. . . . . ... .... .. . ..... . .. .... .. . . . . . . . .. . .. . ....... ............... . .. . . . ........ . .. . . . .... .. .. . ...... . .. . . ........... . . .... . . . . .. ......... ................................................................................. .. .. ...... .. . . . . ........ . . . . .... ......... . . .. . .. . . . .. . . . ..................... . . . . ........ .. . ... . . . . ... . . ..
lowQualScore : 0 11111 3 4 66 3 66 3 3 3 3 66666 55555555 1 1 2 1 1 555555555 22 9999 444 1 22 1 77777777777777777 3333 1 22 44 22 1 1 5555 22 1 1 1 1 1 2 999 99 99 9 000 9 99 9 9 99 99 99 99 555 66666 1 22 9 99 9 99 8888888888 0 0 55 8 3 888888 66 33333 3 00 11111 5555 00 6 00 444 3 444 55555555555555555555 6 4444 9 6 00 7777 2 11111 6 6 0 0 0 444 0 55555555555555 000 9 0 55 000 5555 5555555 0 55 55 0 000 0 0 0 0 0 3 9999 222222222 11111 0 22 888 0 5 0 000000000000000 6 0 55 33333333333 333 00 6 00 444 22222222222 7777 6 55 6 00 0 8888888888888 0 3 2 8 11111 0 00 6 5 6 444 1 66 4 6 6 6 555 1111 66 3 66666 3 33 5555 22 1 1 1 1 1 2 2 22 1 22 2 0000000 000000000000000 3 88 3 9 3 11111111 1 44 3 3 7 4444 22 22 1 999999 6 00 0 0 00000000000 6 6 6666 3 3 3 3 66 333333333 666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666 99 99 444444 66 3 6 6 6 00000000 7 0 2 2 0000 888888888 3 7 11 2 66 3 3 1 22 3 8 3 444444444444444444444 8 2 0 4 22222222 22 0 222 7 0 0 0 666 0 0 00
consensus : CCGGGAGG-AAT-----TC-CCA--CTAG-CATGG--CA-A-GTGCGA-G-GTA-T---CAG--------C-AGAA-TC-T-CA-GA-G-------AGC--T----TCC---GA-A--T-GC-----------------T--A-GGTTCC-A--C--CATAT--A-A-T----CT--GCCAA-C-T-TC-C-TA-TC---GA--AGTG--G-G---GAG-GGC--A-T-AA--G--GCT--ACGGA-NATGGTGTG--GACACATA--TAT-C--TTCTGA-GG-C-AA--CA-T-CG-----CCCCAGC-CT--CGTCCTGGG-A-GT---CCG--C-----TCTGCCAA-AAG--TAG-----TC--T-T--A-TC--C-C-CTCC---CC----CC---C-------AC-GGAGA-G-AA-TGCTA-TG--CCCC----AGGTCT-----AAT-TT-TGC-C-TTA-CAT-T-CTCG-CA----------G---GAA---GTNTA-TAC--C---A----AG-------CAA-CATGGA--GT--CC-TT---CAA-GG-GAGC-CAC-ATACAGG-TTCAGC----TATTGTA-------C-ATTCA-----CCCCCA-CT-TGGATG-GGGAA-TGGGCCCGCAATA-AATCCACTCA-N-T---C-------CCCA-GTA--TG-----------CT--NA--TTTCTG-C--C---CT-----A-----G----TA-TC-CAC-C--A-CGGC-CTC-------TGC-ACGTAGGTCCTGAACCCGTAATTG-C---ACTGTA--TA-TCTCGT-TG---AGTG--CCTCACCTGGCCAGT-GGTGA-TG-CA---CC----G--ATCGCCTTCCCC-TGG----AATC-TCTATCTCTGG--G----GCA--T-CCTC-CCC-GAG-C-CCACC-CATCCCTGG--TTTC-TCGG--G-TCCAC-------TCC-------C-------TG-GG-CGA-TCAAGCTCC-AGCTC-------AA-CCTCC-GAGC-TG-CTA-CCAG---CCTACCACG-A--T-CCGATCC--T-ATCC--TCTCTA-CTG-TCCTCGGAAAAGGTGGG-----------TGCCTT-AA-AACGCA-CGCGCCT-GTAC-TTCCTCCGG-CGC-CCT--GGTTTC---------ACG-------------------T-------------------G-------------TC--------------------------CTGGGTGTCTGGT--CTTG--GG--T---TG--TAT-GACCAT-CT-GC-CT------C-TGCGCCTCCAGGNGACAATACA--CAGTCTTCCT--A-----AGGA-GCACGCCA-GTTGATTC--TTGGC-AGC-GAGAAGG-C--TTCTCCTGAC-TAGTGGGCTCCCTGTA-GGTATC-A-A--CCTATCATTGGCTCCAGACGATGACATAGAACCACCCTTAAATTCA-A-C-TTGG-G-CTTTAGAGCGACGCAGGGGCTGGCGGTCGTTCCTAGTAGAAG--NTGCCGTCA-GCTCCTTGTGCGCCTCCTGACTTATGGTGCCAGGGCACTCC--GTACGG-AAATNCCC--GGCTTTGCCGCACCTAAAAC
Reference ( family-1452 ) : CCGGGAGG-AAT-----TC-CCA--CTAG-CATGG--CA-A-GTGCGA-G-GTA-T---CAG--------C-AGAA-TC-T-CA-GA-G-------AGC--T----TCC---GA-A--T-GC-----------------T--A-GGTTCC-A--C--CATAT--A-A-T----CT--GCCAA-C-T-TC-C-TA-TC---GA--AGTG--G-G---GAG-GGC--A-T-AA--G--GCT--ACGGA-NATGGTGTG--GACACATA--TAT-C--TTCTGA-GG-C-AA--CA-T-CG-----CCCCAGC-CT--CGTCCTGGG-A-GT---CCG--C-----TCTGCCAA-AAG--TAG-----TC--T-T--A-TC--C-C-CTCC---CC----CC---C-------AC-GGAGA-G-AA-TGCTA-TG--CCCC----AGGTCT-----AAT-TT-TGC-C-TTA-CAT-T-CTCG-CA----------G---GAA---GTNTA-TAC--C---A----AG-------CAA-CATGGA--GT--CC-TT---CAA-GG-GAGC-CAC-ATACAGG-TTCAGC----TATTGTA-------C-ATTCA-----CCCCCA-CT-TGGATG-GGGAA-TGGGCCCGCAATA-AATCCACTCA-N-T---C-------CCCA-GTA--TG-----------CT--NA--TTTCTG-C--C---CT-----A-----G----TA-TC-CAC-C--A-CGGC-CTC-------TGC-ACGTAGGTCCTGAACCCGTAATTG-C---ACTGTA--TA-TCTCGT-TG---AGTG--CCTCACCTGGCCAGT-GGTGA-TG-CA---CC----G--ATCGCCTTCCCC-TGG----AATC-TCTATCTCTGG--G----GCA--T-CCTC-CCC-GAG-C-CCACC-CATCCCTGG--TTTC-TCGG--G-TCCAC-------TCC-------C-------TG-GG-CGA-TCAAGCTCC-AGCTC-------AA-CCTCC-GAGC-TG-CTA-CCAG---CCTACCACG-A--T-CCGATCC--T-ATCC--TCTCTA-CTG-TCCTCGGAAAAGGTGGG-----------TGCCTT-AA-AACGCA-CGCGCCT-GTAC-TTCCTCCGG-CGC-CCT--GGTTTC---------ACG-------------------T-------------------G-------------TC--------------------------CTGGGTGTCTGGT--CTTG--GG--T---TG--TAT-GACCAT-CT-GC-CT------C-TGCGCCTCCAGGNGACAATACA--CAGTCTTCCT--A-----AGGA-GCACGCCA-GTTGATTC--TTGGC-AGC-GAGAAGG-C--TTCTCCTGAC-TAGTGGGCTCCCTGTA-GGTATC-A-A--CCTATCATTGGCTCCAGACGATGACATAGAACCACCCTTAAATTCA-A-C-TTGG-G-CTTTAGAGCGACGCAGGGGCTGGCGGTCGTTCCTAGTAGAAG--NTGCCGTCA-GCTCCTTGTGCGCCTCCTGACTTATGGTGCCAGGGCACTCC--GTACGG-AAATNCCC--GGCTTTGCCGCACCTAAAAC
gi|1 : CCGAGAGA-AAT-----TC-CCA--CTGG-CATGG--CA-A-TTGCGA-G-GTA-T---CAG--------C-AGAA-CC-T-AA-GA-G-------AGC--C----TCC---GA-A--T-GC-----------------T--A-GGTTCC-A--C--TATAC--A-A-T----CT--GCCAA-C-T-CC-C-TA-TC---GA--AGTG--G-G---GAG-GGC--A-A-AA--G--GGT--ACGGA-AATGTTGTG--GACACATAATTAT-C--TTCTGA-GG-C-AA--TA-T-CA-----CTC-AGC-CT--CGTCCTGGG-A-TT---CCG--C-----TCTGCCAA-ACG--TCA-----TC--A-T--A-TC--T-T-CTCG---CC----CC---C-------AT-GGAGA-G-AG-TGCCA-TG--CTCC----AGGTCT-----AAT-TT-TGC-C-TTA-CAT-C-CCCG-CA----------G---GAA---GTTTA-CAC--C---A----AG-------CAA-CATGGA--AT--AC-GT---CAA-GG-GAGC-CAC-ATACAGG-TCCAAC----TATTGGA-------T-TTTCT-----CCCCCA-TT-TGGATG-GAGAA-TGGGCCCACAATA-AATCCACTGA-G-T---C-------CCCA-GTG--TG-----------GT--AA--TTTCTG-T--C---AT-----A-----G----TA-TC-CAC-C--A-CGGT-ATC-------TGC-AGGTAGGTCCTGAACCCGTGATTG-C---ACTGCA--TA-TCTCGT-TG---AATG--CCTCATCTGACCAGT-GGTGA-TG-CA---CC----G--ATCACCTTCCCT-TGG----AATC-TTTATCTCTAG--G----GCA--T-CCTC-CCC-GAG-C-CCACT-TATCCCTGG--TTTC-TCGA--G-TCCAC-------TCC-------C-------TG-GG-TGA-TTAAACTTC-AGCTC-------AA-CCGGC-GGGC-TA-CTA-CCAG---CATAACACG-T--TCCCGATCC--T-CTCTAGTCTCCA-CTG-TC--CGGAAAAGGTGGG-----------TACCTT-AA-AACGCA-CAAGCCT-GTAC-TTCCTCCGG-TGC-CCT--GGTTTC---------ACG-------------------T-------------------G-------------TT--------------------------CTGGGTGTCTAGT--CTCG--GG--T---TG--TAT-GACCAT-CT-GC-CT------C-TGCGCTTCCAGGAGACAAT--A--CAGTTTT-------------AA-GCATGCC------ATTC--TTGGC-AGC-GAGAAGG-C--TTCTCCTCAC-TAGTGAGCTCTCTGTA-GGTATC-AGA--CCTATTATTGGCTCCAGACGATGACACAGAACCACTCTTAAATCCAGA-C-TTGG-GACTTTAGAGCGACGCTGGGGCTGGTGGTCATTCCTAGTAGAAG--CTGCTGTCA-GCTCCTTGTTTGCCTCCTGACTTATGGTGCCAGGGCACTCC--ATACGG-AAATTCCA--AGCTTTGCTGCACTTAAAAC
gi|10 : G-----------TT--CA--CCTCTG-C--C---CC-----A-----G----TA-TC-CAC-C--A-TGGC-CTA-------TGC-AGGTAGTTTCTTAACCCGTA-----C---GCTGTG--TA-TCCCAT-TG---AGGG--CCTCACCTGGCCAGT-GGTGA-TG-CAC--CC----A--ATCACCTTCCCC-TGG-----------------------------------TTC-CTC-GGG-T-CCACT-C--CCCTG-------------------AT-------TCT-------T-------TG-GG-CGA-TCAAACTCC-AGCCC-------AA-CCTCC-GGGC-TG-CTA-CTG------TA------A--T-CCG------T-ATCC--TCCCTA-CTG-TCCTCGGAAAAGGTTGG-----------CTCCTT-AA-AACGCA-CAAGCTT-GCAC-TTCCTCTGG-GGC-CCT--GATTTC---------ATGTAGGAACGTTTCTTCCC--T-------------------G-------------TC--------------------------CTGGGTGTCCGGTC-CTTG--GGCTT---TG--TTT-GACCAT-CT-GC-CT------C-TGCACCTCCAGGGAACAATACA--CAG-ATTCCT--A-----AGG--GAACACCA-GTGGATTA--TTGGC-AGT--AGAAGG-C--TTCTCCTGAC-TAGTGGACT--CTGTA-GGTATC-A-AACTCTATCACTGGCTCCAGACGATGACATAGAACAACCC-----TTCA-ACC-TTAG-G-CTTTAGAACTA-----AGGCTGGCGGTCGCTCGTAGTAGAAT--ATACCGTCA-GCTCCTTATACGCCTCCTGACTTCTGTCGCC--GGCACTCT--CTACAG-TAATGCCA--AGCTTTGCCGCATTTTAAAC
gi|11 : GTCCTGGG-A-GT---CCG--C-----TCTGCCAA-AAG--TTA-----TC--G-T--A-TCTTC-T-CTCC---CC----CT---C-------CC-TGGAA-G-AA-TGCCA--G--CCCC----AGGTCT-----AAA-TT-TGC-C-TGA-CAT-T-CTCG-CA----------G---GAA---GTCTA-TAC--C---A----AG-------CAA-CATGGAAGGT--CC-TT---CAA-GG-GA-C-CAC-ATACAGG-TTCAGC----TAT-GTA-------C-ATTCA-----TCTCCA-CT-TGGATG-GGGAA-TGGGCC-GCAATA-AATCCACTCA-T-T-------------------------------------------------C--C---CC-----A-----G----TA-T---------------------------GC-ACGCAGGCCCTGATCCCGTAATTG-C---ACTGAA--TA-TCTCGT-TG---AGTG--TCTCACCTGGCTAGT-GGTGA-TG-CA---CC----G--ATCGCCTTCCCC-TGG----AATA-TCTATCTCTAG--G----GCA--T-CCTC-CCC-GAG-T-CCACT-CATTCCCAG--TTTC-TCGG--G-TTTAC-------TCC-------T-------TG-GG-TGA-TTAAGCTTC-AGCTA-------AA-CCTCatg
gi|11 : TA-CTAG---CTTACCACA-A--T-CCGATCtactgaaacttgggaagattccacaataggtaccagtaggtactagcttaccacaatccgatc
gi|12 : gtcctgggagtccgctctgccaaaagttatcgtatcttctctccccctccctggaagaatgccagccccaggtctaaatttgcctgacattctcgcaggaagtctataccaagcaacatggaaggtccttcaagggaccacatacaggttcagctatgtacattcatctccacttggatggggaatgggccgcaataaatccactcattccccagtatgcacgcaggccctgatcccgtaattgcactgaatatctcgttgagtgtctcacctggctagtggtgatgcaccgatcgccttcccctggaatatctatctctagggcatcctccccgagtccactcattcccagtttctcgggtttactccttgggtgattaagcttcagctaaacctctactgaaacttgggaagattccacaataggtaccagtaggCGGGAAG-AAT-----TT-CCA--CTAG-CATGA--CA-A-GTGCAA-G-GTG-T---CAG--------C-AGAA-TC-T-CA-GA-G-------AGC--T----TCC---GA-A--T-GC-----------------T--A-GGTTCC-A--C--CATAT--A-A-T----CT--GCTAA-C-T-TC-C-TA-TC---AA--AGTG--G-A---GAG-GGC--A-T-AA--G--GCT--ATGGA-CATGGTGTA--GACA--TA--TAT-C--TTCTGA-GA-C-AA--CA-T-CG-----CCCCAGC-CT--CGTCCTGGG-A-GT---CCG--C-----TCTGCCAA-AAG--TAG-----CC--T-T--A-TC--C-C-CCCC---CC----CC---CTCCCCTCCC-GGAGA-G-AA-TGCTT-TG--CCCC----AGATCT-----AAT-TT-TGC-C-TTA-CAT-T-CTCG-CA----------T---GAT---GTATA-TAC--C---A----AG-------CAA-CATGGA--GT--CC-TT---CAA-GG-GAGC-CAC-ATACAGA-TTCAGC----TATTGTA-------C-ATTCA-----CCCCCA-CT-TGGATG-GGGAA-TGGGCCCGCAATA-AATCCTCTTA-T-T---C-------TCAA-GTA--TG-----------CT--TA--TTTCTG-C--C---CT-----A-----G----TA-TA-CAC-C--
gi|13 : CT-GTAC-TTCATCCGG-CAC-CCT--AGTTTC---------ACG-------------------TAGGAACGTTTCCTTTCCCTG-------------TT--------------------------CTGGGTGTCTGGT--CTTG--GA--T---TG--TAT-GACCAT-CT-GC-CTTTGGTTC-TGCGCCTCTAGAAGACATTACA--CAGTCTTCCT--ATTCCTAAGATGCACACCA-GTTG-TTC--TTGGC-AAC-GAGAAGA-T--TTCTCCTGAC-TAGTGGGGTCTCTGTA-GGTATC-A-AT-CCTATCATTGGCTCCAGATCAGGGCATAGAACCACCCTTCAATTGA-A-CATTGG-G-CTTTAGAGCGACGCAGGGACTGACATTCGTTCCTAGTAGAAG--GTGCCGTCA-GCTTCTTGTGCGCTTCCTGACTTATGGTCCCAAGGCACTCC--ATACGG-AAATGCCC--GGGTGTGCTGCCCCTAAAAC
gi|14 : --TA-TCCCTT-TG---ATAG--CCTCACCTGGCCAAT-GGTGA-TG-CA---CC----G--TTCACCTCCCCC-TAT----AATC-TGTATCTCTGG--G----GCA--T-CCTC-CGC-AAG-C-CCA-C-CATCCCTGC--TTTT-TCGG--G-TCGAC-------TCCCGAATCAC-------TG-GA-CGA-TCAAACTCC-AGCTT-------AA-CCTTC-GAAC-TG-------------CTACCACG-A--T-----TCA--T-ATCC--TTTCTA-CTG-TCCTCGGAAAAGGTGAA-----------TGCCTT-AA-AATGCA-CGCGCGT-GTAC-TTCTTACAG-CAC-CCT--GGTTTTTAAGTAGGAACG-------------------TTTCTTTTCCCC--------G-------------TT--------------------------CTGGGTGTCTGGacg
gi|15 : gcg-------AG-CCTCT-AAGC-TG-CTA-TCAG---CCTACCACA-A--T-CCGATCCC-T-ATCC--TCTCTA-CTA-TCCTCGGAAAAGGTGGG-----------TACCTT---------------------------CTCCGG-CGC-CCT--GGTTTC---------ATG-------------------T-------------------G-------------TC--------------------------TTTGGTGTCTGGT--CTTG--GG--T---TG--TAT-GAGCAT-CT-GT-CT------C-TGCGCCTCCAGGCGACAATACA--CAGTCTTCCTTAA-----AGGA-ACACGCCA-TTTGATTC--TTGGA-AGC-GTGAAGG-C--TTTTCATGAC-TAATGGGTTCCTTGTA-GGT
gi|16 : taagctataTT-AC-AACGCA-CACGCCT-CGAC-------CGG-CAC-CCCTGGGTTTC---------ACG-------------------T-------------------G-------------TCCNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCTGGGTGTCTGGT----------------TG--TAT-GACTAT-TT-GC-CT------T-TTTGCCTCCAGGCGACAATACA--CAGTCTTCCC--A-----AGGA-GCAAGCCA-GTTGATTC--TTGAC-AGC-GAGATGG-C--TTTTCCTGAC-TAATGGGTTCCCTGTA-GATAT---------------------CAGACGATGACATAGAATCACCATTAAATTCA-A-C-CC-A-G-CTTTcgcccttgaattgaacccagctttgctgcacttaataaac
gi|17 : TA-CTAG---CCTACCACA-A--T-CCGATCC--TTATCC--TCTATA-CTG-TCCTCGGAAAAGGTGGG-----------TCCCTT-AA-AACGCA-CATGCCT-GTAC-CTCCTCCGG-CGC-CCT--GGTTTA---------ACG-------------------T-------------------G-------------TCTAA-----------------------TTAGGTGTCTGGT--CTTG--GG--T---TG--TAT-Ggctgcacttaatacaaatt
gi|18 : tcctngtgattaagcttcagctaaacctctactgaagcttgggaagcttccacaataggtaccagtaggCCGAGAGG-AAT-----TT-CCA--CTAG-CATGA--CA-A-GTGCGG-G-GTA-T---CAGCAGATTCTC-AGAG-TN-N-NN-NN-N-------NNN--N----NNN---NN-N--N-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNT--A-GGTTCC-A--C--CATAT--A-A-T----CT--GCCAA-C-T-TC-C-TG-TC---GA--AGTG--G-G---GAG-AAC--A-T-AA--G--GCT--ACGAA-TATGGTGTG--GACAC------AT-C--TTCTGA-GG-C-
gi|19 : G-A-GT---CCG--C-----TCTGCCAA-AAG--TAG-----TC--T-T--A-TC--C-A-G-----------------C-------ACTGGAGA-G-AA-TGTTA-TG--TCCC----AGGTCT-----AAT-TT-TGC-C-TAA-CAT-T-CTCG-CA----------G---GAA---GTATG-TAC--C---A----AG-------CAA-CATTGA--GT--CC-TT---CAA-GG-GAGC-CAC-GTACAGG-TGCAGC----TATTGTA------------CA-----CCCCC
gi|19 : -TACACCCCCTGGCGACAATACA----GTCTTCCT--A-----tggcgacaatacagtcttccta
gi|2 : gagtccgctctgccaaaagtagtcttatccagcactggagagaatgttatgtcccaggtctaattttgcctaacattctcgcaggaagtatgtaccaagcaacattgagtccttcaagggagccacgtacaggtgcagctattgGAAGG-AAT-----TC-CAA--CAAG-CATGG--AA-A-GTGCGA-G-GCA-T---CAG--------CCAGAA-TCCT-CA-GA-G-------AGC--C----TCC---AA-AATT-GCC----------------T--A-GGTTCC-A--CT-CATACCAA-A-T----CT--GCCAA-T-T-CCTC-TA-TC---GA--AGTG--A-G---CAG-GGC--AAT-AAAAG--GCA--ACGGA-AA------G--AACGC---------------TGA----T-AA--CA-T------------AA---T--CATC-TGAA-A-------CG--C-----TCTGACAA-AGG--TCG-----TC--TGT--A-TC--T-T-CTCT---CC----TC---C-------AC-GGAGA-G-AG-TGCCT-TG--CTCA----AGGTCT-----AAT-TC-CGC-C-TTA-CAT-C-CTCG-CA----------G---GAA---GTCTA-CAC--C---A----AG-------CAA-CATTTA--GT--CC-TT----AA-----AAC-CAC-ATGCATG-TCCA
gi|2 : attcTCCACTCA-GAT---C-------CCCA-GCA--TG-----------CT--CA--TTTCTG-T--C---CC-----A-----G----CA-TA-CAC-C--A-CGGT-CTT-------TGC-AGGTAGGTTCTGAACCCATAACTG-CTAGA-TGCA--TA-TC-CAT-TT---AATGG-CCTCACCTGGCCAGT-CGTGA-TG-CA---CA----A--ATCACCTCCCCCCTAT----GATC-TGTATATCTGG--G----GCA--T-CCTC-CTC-GGG-C-CCACC-CATCCCTGA--TTTC-TTGG--G-TCCAC-------TCC-------CGAATCCCTG-GA-CGA-TCAAACTCC-AGCTT-------AA-CCTCC-GGGC-TA-CTA-CCA-----------TG-A--T-CCA------T-ATCC--TCTCCA-CTG-TCCTCGAAAAAGGAGGA-----------TGCCTT-AA-AATGCA-TGCGCCT-GTAC-TTCCTCCGG-CAC-CCT--AGTATC---------ACGCAGGAATGTTTCTTTTCCCT-------------------G-------------TT--------------------------CTGGGTATCTGGT--CTTG--AG--G---TG--TAT-GACCAT-TT-GC-CT------C-TGCGCCTCTAGGAGACA------------TT----------------GCA---CA-GTTG-TTC--TTGGT-AAC-GAGAAGA-T--TTCTCCTGAC-CAGTGGGCTCTCTGTA-GGTATCAA-A--TCTATCATTGGCTCCAGACCAGGGCACAGAATCACCTTTGAAC------C-TTGGTA-CTTTGGAGCGACGCTGGGGCTGGT-----TTCCTAGTAGAAG--CTGCTGTCA-GCTCTTTGTTTTCC-CCTGACTTATGGTACCAGGGCActcagatccccagcatgctcatttctgtcccagcatacaccacggtctttgcaggtaggttctgaacccataactgctagatgcatatccatttaatggcctcacctggccagtcgtgatgcacaaatcacctcccccctatgatctgtatatctggggcatcctcctcgggcccacccatccctgatttcttgggtccactcccgaatccctggacgatcaaactccagcttaacctccgggctactaccatgatccatatcctctccactgtcctcgaaaaaggaggatgccttaaaatgcatgcgcctgtacttcctccggcaccctagtatcacgcaggaatgtttcttttccctgttctgggtatctggtcttgaggtgtatgaccatttgcctctgcgcctctaggagacattgcacagttgttcttggtaacgagaagatttctcctgaccagtgggctctctgtaggtatcaaatctatcattggctccagaccagggcacagaatcacctttgaaccttggtactttggagcgacgctggggctggtttcctagtagaagctgctgtcagctctttgttttcccctgacttatggtaccagggcat
gi|20 : attcgaaggaattccaacaagcatggaaagtgcgaggcatcagccagaatcctcagagagcctccaaaattgcctaggttccactcataccaaatctgccaattcctctatcgaagtgagcagggcaataaaaggcaacggaaagaacgctgataacataatcatctgaaacgctctgacaaaggtcgtctgtatcttctctcctccacggagagagtgccttgctcaaggtctaattccgccttacatcctcgcaggaagtctacaccaagcaacatttagtccttaaaaccacatgcatg-TACACCCCCTGGCGACAATACA----GTCTTCCT--A-----AGGA-GTACTCCA-GTTGATTC--CTGGC-AGC-AAGAAGG-C--TTTTCCTGAC-TAATGGGTTCCTTGTA-GGTAT---------------------CAGACGATGACACAGAATCACCTTTAAATTCA-A-C-TT-A-G-CTTTt
gi|21 : cagctattgCCGGGGG---AT-----TT-CCA--CAAG-CATGA--CA-A-GTGCGA-G-GTA-T---CAG--------C-AGAA-TC-T-CA-GA-G-------AGC--TTAAATCT---GA-A--T-GC-----------------T--A-GGTTCC-A--C--CATAT--A-A-T----CT--GTCAA-T-T-TC-C-T-----------AGTG--G-G---GAG-GAC--A-T-AA--G--ACT--ACGGA-AATGGTGTG--G--ACATA--TAT-T--TTCTGA-GG-C-AA--gatgcacttaatacaa
gi|22 : CCGAGAAG-AAT-----TC-CAA--CTAG-CATGG--AA-A-GTGCGA-G-GCA-T---CAG--------C-AGAA-TA-T-CA-GA-G-------AGT--C----TCC---GA-A--T-GC-----------------T--A-AATTAT-A--C--CATAC--A-A-T----CT--G----------T-C-TG-TC---GA--AGTG--G-G---GAG-GAC--A-C-AA--G--GCA--ACGGA-AATGGCGCT--GACAC-T---TAT-C--TTCTGA-GG-C-A
gi|23 : G--------C-AGAT-TC-T-CACGA-G-------TGC--T----TCC---GA-A--T-GCA----------------T--ATGGTTCC-A--C--CATAT--A-A-T----CT--GCCAA-CTT-TC-C-TG-TC---GA--AGTG--G-G---GAG-AAC--A-T-AA--G--GCTAAACGAA-TATGGTGTG--GACAC------AT-C--TTCTGA-GG-C-AA--
gi|24 : GT--CTTG--GG--T---TG--TTT-GACCAT-CT-AC-CA------C-TGCACCTCTATAAGACA---------GTCTTCAT--A-----CGAA-GCACACCA-ATTGATTC--TTGGT-AGC-GAGAAGG-A--TTCTCCTGt
gi|25 : A---CC----G--ATCACCTCCCCC-TAT----AATC-TGTATCT--GG--G----GCA--TGCCTC-CAG-GA--C-CCACC--ATCCCTGG--TTTC-TCGG--G-TCCAC-------TTC-------C-------
gi|26 : tgcatgcgtttctTGA-GG-C-AA--CA-A-AA-----TCCCAGC-CT--TGTCCTGGG-A-TT---CCG--T-----TCTGCCAA-AAgaatg
gi|27 : ---GA--AGTG--G-G---TAG-GGC--A-T-AA--A--GCT--ACGGA-TATGGTGTG--GACA
gi|3 : t-CCA--CTAG-CATGA--CA-A-GTGGCA-G-GTG-----CA---------C-AGAAGTC-C-AA-GA---------AGC--T----TCC---GA-A--TAGC-----------------TTAA-GGTTCA-A--C--CATAT--ATA-T----CTTGGCTAA-C-T-TC-C-TA-TC---AA--AGTG--G-A---GAG-GG-----T-AA--G--GAT--GC-----ATGGTTAT--GACATATA--TAT-C--TTCT-A-GA-C-AA--CA-T-CG-----CCC-AGC-CT--C-TGCTGGG-A-GT---CCG--C-----TTTGGCAA-AAG--TAA------C--T-T--A-CC--C-C-CTCC---CC----CC---CTCCCTC-CC-GGAGA-G-AA-TGCTT-TG--CCCG----AGATCT-----AAT-TT-TGCGC-TTAACAT-T-CTCG-CA----------T---GTCT--GTATAATGC--C---A----AG-------CAA-CATGGA--GC--CTGTT---CAA-GG-GAGC-CAC-ATACAGA-T-CAGCG---TATTGTA-------CGATTCA-----CCC--A-CT---GATG-GCGAA-TGGGCCCGCAATA-AATCCTCTTA-T-T---T-------CTCAAGTGACTG-----------CT--TA--TTTCTG-C--CTACCT-----ACAAGTA----TA-TC-CAC-C--A-CGGC-TCG-------TGCTACG-AGGTCCTGACCCCGTAATTG-C---ACTGTA--TA--CTCGT-TG---GGTGTCCCTGACCTGGCCATT-GGTGA-TG-CAG--GC----G--ATCGCCTTCCCC-TTG----AATC-TCTATTTCTGG--GAAAAACA--T-CCTC-CCT-GAGCC-CCACT-CATCCCTGG--TTTCTTCGG--GTTTCAC-------TCC-------T-------TGTGGTTGA-TTAAGCTTTAAGCT--------AA-TCTCTAAAGC-TG-CTATCCAG---CCTACCACA-A--T-C--GTCCAAT-ATCC--TCTCTATCTGTTCCTCGGAAAAGGTGGG-----------TGC--T-AA-AACGCA--ACGCCTGGTAC-TTCCTCCGG-CGC-CCT---GTTTC---------ACG-------------------T-------------------G-------------T---------------------------CTGGGTGTCTGGT--C--------------G--TAT-GGACTT-GT-GC-CT----------TGCCTCCA-GCGACAATACATGCAGTCTTCCC--A-----AGGA-GCAAGCCA-GTTGATCT--GTGAC-AGCGGAGATGG-C--T--TTCTGAC-TAATTGTTTCCCTGTA-GATAT---------------------CAGACGATGACATAG-ATCACCATTAAATCCA-
gi|4 : gagatatAGG-ATT-----TC---A---TAG-CATGA--CA-A-G--CGA-G-GTAAT---AAG--------C-AGAA-T--T-CA-GA-T-------AGT--T------C---GG-G--T--C-----------------T----GGTTC-----------A---A-A-T----TT---TTAA-C-T-TC-C-TA-TC---GA---GTG--G-G---AAG---C--A-TTAA--G--GTT--ACGGA-CATG-TGTA--AA---ATA--T-T-C--TTCTGA-GA-C-AGAGCA-TTCG-----CCCAGGCTCT--CGTCCTGTG-C-GTG--CCG--C-----TCAGCCAA---G--TAA-----TC--T-TTTA-TC--C-C-C-CC---CC----CT---C-------AC-T-AGA-G-AA--GCTA-TG--CCAC----AG--CT-----A-T-TT-T-C-C-TT--------TTCGACA----------G---AAA---GT-TG-TAC--CTACACTGTAG-------CAA-CATGGA--GT--CC-TT---TAA-GGTGAGC-CAT-ATA--AG-TTCA-C----TATTGTA-------C-ATTC--------CCCA-CT-TGGA---GGGAACTGGGCCCGCAATA-AATCCACTCG-A-TGTGCGG-----CCTATGTA--TG-----------CT--AA--TTTCT--C--C---CT-----A-----G----TA-TGACAC-C--ATCGGT-CCT-------TGT-ACGT--GTCCTGG-CCCGTA-TTG-----ATTATAGATACTCTCGT-TGTTTGGTG--TCT-AC-TGGCCAGT-GGTGAATG-CG---CCTCTTGTTATCGCCTTCCC--TGG----AATC-TCTATCTCCTC--A----GCA--T-CTTC-CGC-GAG-C-CCACCTCAT-CCTGG--TTTC-TCGG--G-TTCAC-------T-C-------C-------TG-GG-TGAGT--AGCTTT-A-CT--------AA-GCTCT-AAGC--G-CTA-CCAG---CCTACCACA-A--T-CCGATTC--A-TTCC--TCTCTA-ATG-TTCTCGG--AATGCGGC-----------TGCCTTAAA-AACGCA-TG---CT--TACGTTCCTCCGGTCGC-CCT--GGTTT----------------------------------------------------------------------------------------------TTGGTTGTC------CTTG--GG--TTGATG--TATGGACCATGCT-GCTCT------T-TGCTTCTCAGGGC-----T--------TTTTCCT--------AGGA-ACACATTA---TGATTCCTTCGGCGAGC-GAGAAGG-CAGTTTTCCTGA--TATTGTTCACCCTGTACGGTAT
gi|5 : GGGGAG-AAT-----TC-C-A--CAAG-CATGA--CA-A-GT-CGA-GTGTA-T---CAG--------C-AGAA-TC---CA-GA-G--------GT--TAAA-TCT---GATA--T--C-----------------T--T-G--TCC-ATTC--CATAT--A-A-T----CT---CCAA-C-T-TC-C-TA-----------GTG--G-G---GAG-GAC--A-T-AA--G---CT--ACGGA-TAT--TGTA-----ACATA--TCT-C------GA-G--C-AA--C--T-CG-----CCC-AGC-TT--C-TCCTTAG-A-GC---CC---------TCTGCCAATAAG--TAG-----TC--T-T--A-TC--C----TCC---CC----CT--------------GGAG-------TGC-A-TC--CCTC----AAGTCT-----AGT-TT-TGC-T-TTA-CGT-T-CTT--CT----------G---GAA---GTTTAATAC--C---A-----G-------CAA-CATGGA--GC--CC-TT---CAA-GG-GAGC-CAC-ATACAGG-TTCAGC----TAGT-TA-------C-ATT-A-----CCCC-A-CT---GATGTGGGAA-TGG-CCCGCAATA-AAACCAC-CA-G-T---C-------CC-A-GTA--T------------CT--AA--TGTCTG-C--C---CT-----A-----G----TA-TC-CAC-C--A-AGGC-TTC-----------ACGTA--TCCTGAACCTGTAATTG-A---ACTG-A--TA-TCTCAT-TG---AAGG--TCTCACCT--CCAGT-GATGA-TG-CA---CC----G--ATTGC-TTCCCC-TG-----AATC-TCTATCTCTAG--G----CGA--T-CATC-CCG-TAC-C-GCACT-CATTCC-GG--TTTC-TGCG--G-TTCAC-------TTC-------T-------TG-G----A-TTAAGCTC--AGCTT-------AAACCTCT-AAGC-TG-CTA-CCAGT--CCTACCACATA--T-CCGATTCA-T-ATCT--TCTCTA-CTG-TCCTCGAAAAATGTG-------------TGCCTT-AATAACGCA-CATGTCT-GTAC-TTC-TCCG--CGC-CCT--G--TTC---------ACG-------------------T-------------------G-------------TC--------------------------TTGGGTGTCTGGT--CTTGA-AG--T---T---TAT-GACCAT-CT-GC-CT------C-TGCGC--CCA-GAGAC-ATACA--CAATCTTCC---------AAGA-GCACGCCATGTGGATCT--GTGGC-AGC-GAGAA-G-C--TTTTCCTGAC-TAAT-GGTTCATTGTA--GTAT---------------------CAGACGATTACATAAAATCACCCTTGAATTCA-A-C-tcagagatcgacatagaatatttggcccttgaagtgtgcagtgatagctttttttgcttcatttatacaaa
gi|6 : AGG-ACT-----TC-CCA--CTAGGCATGG--AA-AAGTGCGACG-GT------C-G--------C-AGAA-TT-T--A-TA---------AGC--T----TCC---CA-A--A-GC-----------------T--A-GGTTCC-A--C--CTTAC--A-AGT----CT--GTCAA-C-T-CC-C-TA-TC---GAAGAGTG--ACG---GAG-GGC--A-T-AG--A--GCTTAATGGA-AATGGCGCGCTGACACA-A--TA-----CTCTGATGG-C-AA--CA---AA-----CCCCGAG-CT--CCTCCTAGG-A--T---TCG--T-----TCAGCCAA-AGG--TCG-----TC--TGT--T-TG--C-T-TTCCACTCC----TT---C-------AA-TGAGATG-AGTTGTCA-TG--CTCG----AGTCTT-----AAT-AT-Tccatcttgctacacttaatacaaat
gi|6 : aTATCTCTGGA-G----GCA--T-CCTC-CC--GA--C-CCACC--ATCCATGG--TTTC-TCGG--G-TCCAC-------TCCGAATAT-C-------TG-GA-TGA-TCAAACTCC-AGCT--------AA-TTCCG-GGGC-TG-C-------------ACCAC--------CAAGCCA-T-ATCC--TCTCTA-CTG-TCCTCG-AAATGGTTGAATAAAATCCATTACCTT-AA-CATGCAGCGCGG-T-GTAC-TTCC------CGTACCT--G-TTCC---------ACA-------------------T-------------------AGGAACGTTTCTTTTC--------------------------CT---T-TCTGGTTACTTTCTGG--T---TGAATAT-GACAAT-CTAGC-CT------CGTGC-CCTCTAGGAGACA-TACAA-CAGTCTTTCG--A-----AG-A-GCAC-CC---TTG-TTC--TTGGC-AAC-AAGAAAGAC--TTCTCCTGACATAGTGGGCTCTCTGTA-GGTATCAA-A--CCTACCATTGA--TCAGAC-CCAGCATAGAACTACCC-TACATTAA-A-C-CTTG-G-ATTTAGAG-GACGCA-GGGCTGACGGTCGTTCCTAG-AGATGGTTTGGCGTAAGGATCCTGGTGCGAAT-CTGACTTATGGGCCCAGCG-ACTCCGAGTACGGAAAATTTCCTAGACTTTGCCCCACCTACAAcgttatctctggaggcatcctcccgacccaccatccatggtttctcgggtccactccgaatatctggatgatcaaactccagctaattccggggctgcaccaccaagccatatcctctctactgtcctcgaaatggttgaataaaatccattaccttaacatgcagcgcggtgtacttcccgtacctgttccacataggaacgtttcttttcctttctggttactttctggttgaatatgacaatctagcctcgtgccctctaggagacatacaacagtctttcgaagagcacccttgttcttggcaacaagaaagacttctcctgacatagtgggctctctgtaggtatcaaacctaccattgatcagacccagcatagaactaccctacattaaaccttggatttagaggacgcagggctgacggtcgttcctagagatggtttggcgtaaggatcctggtgcgaatctgacttatgggcccagcgactccgagtacggaaaatttcctagactttgccccacctacaa
gi|7 : aaggacttcccactaggcatggaaaagtgcgacggtcgcagaatttataagcttcccaaagctaggttccaccttacaagtctgtcaactccctatcgaagagtgacggagggcatagagcttaatggaaatggcgcgctgacacaatactctgatggcaacaaaccccgagctcctcctaggattcgttcagccaaaggtcgtctgtttgctttccactccttcaatgagatgagttgtcatgctcgagtcttaatattcgtGGGAGGCAATATTCATC-CCAGTCTGG-CATGG--GACA-GTGCGA-G-GAA-TT--CAGGAA-----C-AGAA-TC-TTCA-GACG-------AGCGGT----TCCTGGGA-A--T-GC-----------------T--G-CGT----A--CA-CAGAT--A-A-TAAATCT--GCTAAAC-TCTC-C-TAATCTGTAA--AGGGTCG-GAAAGAG-GGGTAA-T-AA--AATGTT--ACTGA-C-TGGTGTG--GACATATA--TAC-CCCTTCGGA-GATC-AAG-CAAT-CGAGCTTCCACATG-CT--AGTC-TGGG-G-GTTGGCCGGCC-----TCTGCCAA-GAG--TAGGTTACCCA-T-T--A-TT--C-TTCTTC---CT----CCTCTC-------GC-GGCGA-GGAA-TGCTAATAAACTTA----AAATCTTACATAGC-TTATGC-T-TCA-AAC-TGTTCG-CACTGCGAGCAAG---GAA---GTATG-TAC--C---A----AGTCTTCACCAGTCATGGA--GTTACC-TT---CAAAGG-GAGGACAA-GTACAGGGTTCAGCCTAGTAATGGA-------C-AATCAGTCATCCCCCAACT-TCGAAA-GGAAA-TGGGACGGCATTA-AATCCACGCA-C-T---CAATTTCTCGCA-GAA--TGATTGACGTAAACT--AAAGTTTCTGGC--C---CTGAAATA-----GGGGCTA-TT-CCC-CTCA-CGGGGCGC-------GCC-ACGTAGGTCCCGG----GTAATTG-C---GCTGTA--TA-TTTCGT-TG----GTG--TCT-AC-TGGCCAGT-GGTGA-TGTCA---GC----G--GATGCCTTCCCC-TGG----AATC-TCTATCTCTAG--G----GCA--T--CTT-CCC-GAG-C-CCACT-CATCCCTGG--TTTC-TC-G--G-TTCAC-------GTC-------C-------TG-GG-TGA-GTAAGCTTC-AGCTTAACCTGAAA-CCTCT-AAGC-TG-CTA-CCAG---CCT
gi|8 : atccgT-----TCTCCA--CTAA-CATAGACCA-A-GTGC-A-C-GTA-TGATCAA--------A-AAAA-TCAT-CA-TA-GTATATTGAGC--T----TTC---GG----T-GC-----------------TT-A-GGTTCCGA--CAATATAT--A-A-T----CT--GCTAA-C-T-TC-CATACTCT--GA--CGTG--G-G---GAGTGGT----T-AA--G--GTT--ACGGATCATGGTGT---GACAT-TAC-TATCC--TTCTGA-GA-CAAA--CA-T-CGC----CCCCAGC-CTTCCGTCCTGGGCACGTCC-CCG--CCCCCTTCTGCCCA-AAGCTTAG-----TCCAT-T--AGTC--CTC-CTCC---CCACCTCC---C-------ACTGGAGA-G----TGCTA-TG--CCCCTCGAGGGTCTAA---AATGCT-CGC-CTTTA-CATAT-CT-G-CA----------GCTAGAGCACGGGTA-TGCTAC---A----AAAGCTCC-CAA-CATG----AT--CT-TTTCGTAA-AG-GAG--CACAATACAGG-TTCAGC----TGATATAATGTTACC-ATTTA-----CCTCCA-CTGTGGAT-------------------TATAATCCACTCATT-T---C-------CCCA-GTA--TG-----------CTGAGA--TTTCTG-CGTC---CT-----A-----G----TATTC-CACTC--A-TGG--CTCATACAGATAT-ACG-AAGTCCTGACCCCGTAAGTGCC---ACTGTA--TA-T-TCGTGCG---GGTT--CCTCATC-GGCTAGTCGGTGG-TG-CAAAGCG----A--ATCGCCTTTTCC-CGGTGGCAATCATCTAT-TC-GGTAG----TCAGTT-CCTCGCCCGGAG-C-CCACCTCAT-CCTGGGTTTTC-TCGGTTGTTTCAC-------TCC-------T-------T---G-TGG-TAAAGCTTT-AGCT--------AA-CCTCT-AAGCTTGTCTACCCAGGTACCTACCACT-AATT-CCGATC
gi|9 : aat---C-------CCCA-GCA--CG-----------CT--CA--TTTCTC-C--A---CC-----A-----G----TA-TC-CAC-C--A-CGGT-CTC-------TGC-AGGTAGGTCCTCAACCCA-AATTA-T---TCTGCG--TA-TCAGTT-TG---AGAG--ACTCACCTGCGCAGT-GGTGA-TG-CA---CT----G--ATCGCCTTCCCC-TAT----AA---TCTATCTCTGG--G----GCA--C-CCGC-CCC-GAG-CACCCCC-CCTCCCTGA---TTC-TCTG--G-TCCACTCGCGATTCC-------C-------TA-TG-CGA-TCAAACCCC-AGTTC-------AA-CCCCC-AGGC-TG-------------CTACCACG-A--T-CCA------T-ATCC--TCTCT
gi|9 : aaAGG-T--TTCTCCTGAC-TAGTGGGCTCTCTGTA-AGTATC-A-AA-CCCATTATTGGCTCCAGACGAGGGCATAGAACCATCCTTCAATTCA-A-C--------CTTTAGAGCGACACAGGAGCTGGCGGTAGTTCCTTGTAGAAG--GTGCCGTCA-GCTCCTTGTGTGCCTCCTGACTTATGGTGCCAGGGTACTCC--ATACGG-AAATCCCC--GGCTTTGCCGCACCTAAAACnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnacaggtttctcctgactagtgggctctctgtaagtatcaaacccattattggctccagacgagggcatagaaccatccttcaattcaacctttagagcgacacaggagctggcggtagttccttgtagaaggtgccgtcagctccttgtgtgcctcctgacttatggtgccagggtactccatacggaaatccccggctttgccgcacctaaaacaag