lowQualScore : 222222 11111 1 1111 333333333333333333333333333333 1111 111111 1111 1111111 1 33333 222222 22 44444444444 22222
lowQualScore : 666666 5 22222 9 4 0000 3 333333333333333333333333333333 999 3 0000 3 44 0 3 0 3 3 99999999 4 3 999999 999999 3 999 88888 44 5 3 3 88888 999 0 4444 5 1111111 3 2 3 44 3 55555 6 2 666666 3 44 00 0 6 11 44444444444 22222 3 1 77777 6 7777
lowQualScore : ...... . ..... . . .... . .............................. ... . .... . .. . . . . . ........ . . ...... ...... . ... ..... .. . . . ..... ... . .... . ....... . . . .. . ..... . . ...... . .. .. . . .. ........... ..... . . ..... . ....
lowQualScore : 000000 7 11111 8 8 4444 3 333333333333333333333333333333 888 3 4444 3 66 4 6 9 6 6 33333333 6 6 222222 555555 3 222 33333 66 0 3 3 11111 222 8 1111 5 8888888 6 2 3 66 1 44444 2 8 666666 3 66 99 2 9 88 66666666666 99999 3 0 33333 7 1111
consensus : NATGAATATCTACGG----GTT-T---AATGCCAAGGTAAGGACCT----ACCTT-T---T-ATG-TA------------GGCCC--TAATTTCAA-G-T-GCATT----GT-TTG--CTCTTT-TTC-CAGTCAT-TTT---G----AGTA-T----A-GT------GT-A---ATG-----AAT--ACGCT-A-TAAAG----CA---ATGTACA----CTGTAG------C-TAAGTCAGTGAAATT-GTG--AACAT-GAAATTTTCTTCCGCTA---CGG-TTCAGTGATCAATCTAACGTGT-CAA--TGTGGT-TTCAGNAAGATAT-TACACGATTTTCACGC-GANGA-AGGTGAAATG-ACATTAT-TT----TTGGAACACTCCTCGTAT
Reference ( gi|2 ) : TATGAATATCTACGG----GGT-T---ATTGCCAAAATAAAGACCT----ACCTT-T---T-GTA-TA------------GGCTT--TAATTTCAA-A-T-GCATT----GT-TTG--CTCTTT-TTC-CAGTCAT-TTT---G----AATA-T----A-GT------GT-A---ATG-----AAT--ACGCT-A-TAAAA----CA---ATGTACA----CTATAG------C-TAAGTCAGTGGAATT-GTG--AACAT-GAAATTTTCTTCCGCTA---GTG-TTCAGTACTCATTCTAACGTGT-CAA--TGTGGA-TTCAGTAAGATATTTATACGAGTTTCACGC-GAATA-AGGTGAAATG-ACATTAT-TT----TTGGAACACTCCTCGTATC
gi|4 : ATGAATATCTACAG----GTT-TTAAAT--CCCAAGTAAGGACCT----ACCTT-T---T-ACA-TT------------GGCAC--TAATTTCAG-G-T-GCATT----GT-TTG--CTCTTT-TCC-CAGTCAT-TCT---G----AGTA-T----A-GT------GTTA---ATG-----GAT--ACGCT-A-TAAAG----CA---ATGTACA----CTGTAG------C-TCGGTCAGTGAAATT-GTG--AATAT-GAAATTTTCTTCTGCTA----TGATTCATTAATCAATCTAACGTGT-CAA--TGTAAT-TTCAGAAAGATATTCACACGATTTTCATGC-GACGA-AGGTGAAATG-A---TAT-TT----TTGGAAC
gi|1 : cgATGAATATCTTCAG----GTT-T---AATGCCAAG-TAAAGACCT----ACCTT-T---TTATA-CA------------GGCCA--TAATTTCAA-A-T-GAATTACATGT-TTG--CTCTTT-TTCGCGGTAAT-TTT---A----AGTA-T----T-GT------GT-C---ATG-----AAT--ACACT-A-TAAAA----CA---ATGCACA----CTGTAGCTAGCTC-TAAGTCAGTGAAATA-GTG--AACGT-GAAATTGTCTTCCGCTACGGATG-AACAGTGATGAATCCAATGTGT-CAA--TGTTGT-TTCTGCAAA----------GA---TCACGC-AAAGA-GGGTGAAATG-ACA-TAT-TTATACTTGGGACACTCCTCATAT
gi|13 : cgATAAAGATCTACGG----ATT-T---AATGCCAAG-TAAGGACCG----AACAT-T---C-ATG-TA------------GGCCC--TAATTTCAA-G-T-GCATT----GT-TTG--TTATTT-TTC-AAGTCAT-TTT---G----AGTA-TATCAA-GT------TT-A---ATG-----AAC--ACGCT-A-TAAAG----CA---ATG
gi|3 : cgTGAATTACTAAGG----GGTAT---AATGCCAGG-TAATAACCT----ACCTA-T-----ATG-TT------------GGCAC--TAATTCCTA-G-T-AAACT----GT-TTG--CAGTTT-TCC-CAGTCAT-TTT---A----AGTG-T----A-GT------GT-T---ATG-----AAT--AT-CT-A-TAAAA----CA---GTGTATA----TTATAG------C-TTAGTCAGTGAAATT-GTG--AACAT-GAACTTCACACCCGCTA---CGA-TTTAGTGATCAATC-AACTTGT-CAA--CTTGGT-TTTAATAAGATATGGACACGATGTTCACGC-GA-TGTAGGTGAAATG-GTATTAA-TT----TGGGAACACTCCTCGTAT
gi|15 : TGAACATTTACGGACCCGTT-T---AATGTCAAGTTAG-GAC----------------------TA------------AACCC--TAATTTCAG-G-T-GCATT----GT-TTG--CTCT
gi|7 : AATATCCATGT------T-T---GATGCCAAG-TAAGGACCTTGTTACCTT-T---T-ATA-TA------------GGCCC--TAATTTCAA-G-T-GCATC----GT-TTG--CTCTTT-T-C-CAGTCAT-TTT---C----AGTA-T----A-GT------GT-A---ATG-----AAT--ACACT-A-TAAAG----CT---ATCTACA-------------------AAGTCATTGAAATT-GTG--AACGT-GAAATTTTTTTCCACTA---CGG-TTCAGTGATCAACCTAACGTGT-CCG--TGTGGT-TTCGGGAAGATA----------TTTCATGC-A---A-AGGTGAAATG-ACATTAT-TC----TTGGAACACTCCTCGT
gi|9 : cgacaT-T---AATGCCAAG-TAAGGGTCT----ATCTT-T---T-ATA-TACTTAGTCTAGTAGGCCC--TA-TTTCAA-G-T-GCATT----GT-TTG--CTCTTT-GTC-CAGTCAT-TTT---G----AGTA-T----A-GT------GT-A---ATG-----AAC--ACGCT-A-TAAAG----CA---ATATACA----CTGCAG------C-TA--TCAGTGAAATT-GTG--AACAT-GAAATTTTCTTCCGCTA---CGG-TTCAGTGATTAATCTAACGTGT-CAA--TGTGGT-TTCAGTAAGATAT
gi|6 : at---ATTGT-AAAGTAAAATTCT----ACTTT-T---A-CTG-TA------------GGCCCC-TAATT-CAATA-T-GCATT----GTCTTG--CTA-TT-TTC-CATTTATCTTT---GGAGTAACA-T------GTGGATTGGT-ACACATG-------T--ACACTAA-TAGCG----CAAATATTTAC-----CTGTAG------CTTAAGTCCATTAAATTCGCG--AACAA-TTAATTCTTTCCAGTTA---G-G-TTCA-TA------------TGT-CAAACTGTGGT-TTCTG-AAG---------CAA--CCCACGC-GGGGC-A-GCGAAATGAACA-TATCTT----TTGCGACACTCCactagcgggaaaaatgattctattta
gi|10 : AAAGTAAAATTCT----ACCTT-T---T-ATG-TA------------GGCCC--TAATTTCAA-A-T-GCATT----GT-TTG--CTATTT-TTC-CAGTTAT-TTT---G----AGTA-C----A-GT------GT-G---ATGGGTACAATGTACACT-A-TAGCG----CA---ATATATATAC-CTGTAG------C-TAAGTCAGTTAAATT-GCG--AACAT-TAA---TTCTTCCGTTA---CGG-TTCA----------TA---TGT-CAA--TGTGGT-TTCTGAAAGA-A-----AC------CACGCGGGGGA-AGGCGAAATG-ACATTAT-TT----TTGGAACACTCCTCgtaattcacatg
gi|5 : tAAAGTAAAATTCT----ACTTC-T---T-ATGGTG------------GGCCCGCTAATTTCAATACT-GCATTA---GT-TTG--CTATTT-TTT-C---CAT-TTTTTGG----AGTA-C----ATGTCGGAG-GT-A---ACA-----CAT--GTACA-ACTAATAGCGCCAG--ATATATATTACCTGTA-------C-TAAGTCAGTTAAATT-CTGCTAACAT-TCACATTCCTTC--TCA-----G-TTAAGGCTTCA---TAATG-GTCCAA--TGTGGGTTTCTGAAAGACA-----AC-----CCACGC-GGGGA-A---GCAATA---ATTATCTT----TTGCGACACTCCTCGTA
gi|11 : AAGTAAGGACCT----ACCTTGT---T-AAA-TACCTGT-------GAC-C--TAATTTCAA-A-GAGCATT----G--TCG--CACTTGAACC-CAGTCAT-TTA---G----AGTATT----A-GT------GT-AT--ATT-----AAT--ACCTC-A-TAAAA----TA---ATGTGCA----CTGTA-------C-TAAGCCAG-G-----------------GAAATTTTTGTCCGCTACG-GTA-GTCGATATCAATTCTAACGTGT-CGA-----GG-----AGTG----GTTTGCATAATTTT---GC-GAAGA-AAGTGAAATG-ATAT--T-TT----TTGGAACACTCCTCattcatcat
gi|8 : aatgcAATACGGACCTT---ACCTT-TATAT-ATA-TA------------GAGCC--TAATTTCAA-G-T-GCATT----GT-TTTTCCTCGTT-TCC-CAATCAT-TTT---G----TGTT-T----A-GT------GT-A---ATG-----AAT--ACTCT-C-TAAAG----CA---ATACACA----CTGTAG------C-CAAGTCGGTGAAATT-TT-----CTTCGAAA------TCCGCTA---CGG-TTCAGTGATCACTCTAACGTGT-TAT--TGTGGC-TTCAGCAAGATATCTACAGGATTTTCACGC----TA-AGGTGAAATG-ACATTAT-TT----TTGGAACACTCCTCGa
gi|12 : acggccT-A---ATG-----AAT--ACGCT-A-TGAAG----CA---ATACACA----CTGTAG------C-TAAGTCAGTG------------------AAATTTTCTTCCGCTA---CGG-TTCAGTGATCAATCTAAGGTGT-TAA--TGTGGT-TTCAATAAGATATGTACACGATTTTCACGC-GACGA-GGGTGAAATA-ACTTTAT-TT----TTGGAACACACCTCc
gi|17 : -GTG--AACAT-GAAATTTTCTTCCGCTA----TGATTCATTGATCAATCa
gi|14 : T-GAAATGTTCT-CCGCTA---CGA-TTCAGTTATTAATCTAACTTGT-TAA--TGTGGT-TTTAGTAAAATATTTACACGACTTTCACGT-CAAGG-AAGTAATATG-CCTTTAT-TT----ATGGAACACGCCTC
gi|16 : aacctaagtcag-TTCAGAAAGATATTCACACGATTTTCACAC-GACGA-AGGTGAAATT-A---TAT-TT----TTGG
Alignments
lowQualScore : 1111 1 222222222222222222222222222 111 111111111111111 1111 1111 1111111 22222
lowQualScore : 2222 5 66 4 9999 3 333333333333333333333333333 3 44 7777 9999 3 44 33 3 000 888888888888888 3 88888 3 6 77777 44 3 3 3 3 1111 2222 0000000 3 3 44 2 33 33 555 3 3 44 3 44 44 2 1 4 44444 77 0 3 3 666 6 6666
lowQualScore : .... . .. . .... . ........................... . .. .... .... . .. .. . ... ............... . ..... . . ..... .. . . . . .... .... ....... . . .. . .. .. ... . . .. . .. .. . . . ..... .. . . . ... . ....
lowQualScore : 1111 0 11 3 6666 1 111111111111111111111111111 1 22 2222 6666 1 22 44 3 444 555555555555555 3 33333 1 2 77777 22 8 1 1 1 9999 9999 0000000 3 1 22 9 99 99 000 6 0 44 1 22 22 9 2 8 33333 33 8 2 1 888 2 5555
consensus : NATGAATATCTACGG----GTT-T--AATGCCAAGGTAAGGACCT----ACCTT-T---T-A------T------------G-TAGG-CCC--TAATTTCAA-G--TGCATT----GT-TTG--CTCTTTT-TC-CAGTCATTTT---GAGTA----------T----A-GT-----GT-A-ATG-----AA--TACGCT-A-TAA-AGCA----ATGTACA----CTGTAG------C-TAAGTCAGTGAAATT-GTG--AACAT-GAAATTTTCTTCC--GCTACGGT--T---CAGTGATCAA-TCTAACGTGTC-AA--T--GTGG-TTTCAGNAAGATA-T-T-ACACGATTTTCACGCGANGAAGGTGAAATG-ACATTAT-TT----TTGGAACACTCCTCGTAT
Reference ( family-1119 ) : NATGAATATCTACGG----GTT-T--AATGCCAAGGTAAGGACCT----ACCTT-T---T-A------T------------G-TAGG-CCC--TAATTTCAA-G--TGCATT----GT-TTG--CTCTTTT-TC-CAGTCATTTT---GAGTA----------T----A-GT-----GT-A-ATG-----AA--TACGCT-A-TAA-AGCA----ATGTACA----CTGTAG------C-TAAGTCAGTGAAATT-GTG--AACAT-GAAATTTTCTTCC--GCTACGGT--T---CAGTGATCAA-TCTAACGTGTC-AA--T--GTGG-TTTCAGNAAGATA-T-T-ACACGATTTTCACGCGANGAAGGTGAAATG-ACATTAT-TT----TTGGAACACTCCTCGTAT
gi|1 : ATGAATATCTTCAG----GTT-T--AATGCCAAG-TAAAGACCT----ACCTT-T---TTA------T------------A-CAGG-CCA--TAATTTCAA-A--TGAATTACATGT-TTG--CTCTTTT-TCGCGGTAATTTT---AAGTA----------T----T-GT-----GT-C-ATG-----AA--TACACT-A-TAA-AACA----ATGCACA----CTGTAGCTAGCTC-TAAGTCAGTGAAATA-GTG--AACGT-GAAATTGTCTTCC--GCTACGGA--TGAACAGTGATGAA-TCCAATGTGTC-AA--T--GTTG-TTTCTGCAAA------------GA---TCACGCAAAGAGGGTGAAATG-ACA-TAT-TTATACTTGGGACACTCCTCATAT
gi|10 : cgAAAGTAAAATTCT----ACCTT-T---T-A------T------------G-TAGG-CCC--TAATTTCAA-A--TGCATT----GT-TTG--CTATTTT-TC-CAGTTATTTT---GAGTA----------C----A-GT-----GT-G-ATGGGTACAATGTACACT-A-TAG-CGCA----ATATATATAC-CTGTAG------C-TAAGTCAGTTAAATT-GCG--AACAT-TAA---TTCTTCC--GTTACGGT--T---CA-----------TA---TGTC-AA--T--GTGG-TTTCTGAAAGAAA-C-C-ACGCG----------GGGGAAGGCGAAATG-ACATTAT-TT----TTGGAACACTCCTC
gi|11 : t--AATGC--AAGTAAGGACCT----ACCTTGT---T-AAATACCT------------G-T--G-ACC--TAATTTCAAAG--AGCATT----GT-C-G--CACTTGAACC-CAGTCATTTA---GAGTA----------TT---A-GT-----GT-ATATT-----AA--TACCTC-A-TAA-AATA----ATGTGCA----CTGTA-------C-TAAGCCAG-G-----------------GAAATTTTTGTCC--GCTACGGTAGT---CGAT-ATCAATTCTAACGTGTC-GA--GGAGTGG-T-------------T-T-GCATAATTTT---GCGAAGAAAGTGAAATG-ATAT--T-TT----TTGGAACACTCCTC
gi|12 : T-A-ATG-----AA--TACGCT-A-TGA-AGCA----ATACACA----CTGTAG------C-TAAGTCAGTGAA------------------ATTTTCTTCC--GCTACGGT--T---CAGTGATCAA-TCTAAGGTGTT-AA--T--GTGG-TTTCAATAAGATA-TGT-ACACGATTTTCACGCGACGAGGGTGAAATA-ACTTTAT-TT----TTGGAACACACCTCa
gi|13 : ATAAAGATCTACGG----ATT-T--AATGCCAAG-TAAGGACCG----AACAT-T---C-A------T------------G-TAGG-CCC--TAATTTCAA-G--TGCATT----GT-TTG--TTATTTT-TC-AAGTCATTTT---GAGTA----------TATCAA-GT-----TT-A-ATG-----AA--CACGCT-A-TAA-AGCA----ATGa
gi|14 : cgT-GAAATGTTCT-CC--GCTACGAT--T---CAGTTATTAA-TCTAACTTGTT-AA--T--GTGG-TTTTAGTAAAATATT-T-ACACGACTTTCACGTCAAGGAAGTAATATG-CCTTTAT-TT----ATGGAACACGCCTC
gi|15 : aacctaagtcagTGAACATTTACGGACCCGTT-T--AATGTCAAGTTA-GGAC----------------------------------------TAAA-CCC--TAATTTCAG-G--TGCATT----GT-TTG--CTCT
gi|16 : -TTTCAGAAAGATA-T-TCACACGATTTTCACACGACGAAGGTGAAATT-A---TAT-TT----TTGG
gi|17 : ntaa-GTG--AACAT-GAAATTTTCTTCC--GCTATGAT--T---CATTGATCAA-TC
gi|2 : ATGAATATCTACGG----GGT-T--ATTGCCAAAATAAAGACCT----ACCTT-T---T-G------T------------A-TAGG-CTT--TAATTTCAA-A--TGCATT----GT-TTG--CTCTTTT-TC-CAGTCATTTT---GAATA----------T----A-GT-----GT-A-ATG-----AA--TACGCT-A-TAA-AACA----ATGTACA----CTATAG------C-TAAGTCAGTGGAATT-GTG--AACAT-GAAATTTTCTTCC--GCTAGTGT--T---CAGTACTCAT-TCTAACGTGTC-AA--T--GTGG-ATTCAGTAAGATATT-T-ATACGAGTTTCACGCGAATAAGGTGAAATG-ACATTAT-TT----TTGGAACACTCCTCGTAT
gi|3 : tTGAATTACTAAGG----GGTAT--AATGCCA-GGTAATAACCT----ACCTA-T-----A------T------------G-TTGG-CAC--TAATTCCTA-G--TAAACT----GT-TTG--CAGTTTT-CC-CAGTCATTTT---AAGTG----------T----A-GT-----GT-T-ATG-----AA--TAT-CT-A-TAA-AACA----GTGTATA----TTATAG------C-TTAGTCAGTGAAATT-GTG--AACAT-GAACTTCACACCC--GCTACGAT--T---TAGTGATCAA-TC-AACTTGTC-AA--C--TTGG-TTTTAATAAGATA-TGG-ACACGATGTTCACGCGATGTAGGTGAAATG-GTATTAA-TT----TGGGAACACTCCTCGTATc
gi|4 : ATGAATATCTACAG----GTT-TTAAATCCCAAG-TAAGGACCT----ACCTT-T---T-A------C------------A-TTGG-CAC--TAATTTCAG-G--TGCATT----GT-TTG--CTCTTTT-CC-CAGTCATTCT---GAGTA----------T----A-GT-----GTTA-ATG-----GA--TACGCT-A-TAA-AGCA----ATGTACA----CTGTAG------C-TCGGTCAGTGAAATT-GTG--AATAT-GAAATTTTCTTCT--GCTATGAT--T---CATTAATCAA-TCTAACGTGTC-AA--T--GTAA-TTTCAGAAAGATA-T-TCACACGATTTTCATGCGACGAAGGTGAAATG-A---TAT-TT----TTGGAAC
gi|5 : cgAAAGTAAAATTCT----ACTTC-T---T-A------T------------GGTGGG-CCCGCTAATTTCAA-TACTGCATTA---GT-TTG--CTATTTT-TT-C---CATTTTTTGGAGTA----------C----ATGTCGGAGGT-A-ACA-----CA--TGTACA-ACTAATAGCGCCAGATATATATTACCTGTA-------C-TAAGTCAGTTAAATT-CTGCTAACAT-TCACATTCCTTCTCAGTTAAGGC--T---------TCA----TAATG-GTCCAA--T--GTGGGTTTCTGAAAGACA-------AC-----CCACGCGGGGAAGC---AATA-A--TTATCTT----TTGCGACACTCCTCGTA
gi|6 : AAAGTAAAATTCT----AC-TT-T---T-AC-----T------------G-TAGGCCCC--TAA-TTCAATA--TGCATT----GTCTTG--CTA-TTT-TC-CATTTATCTTTG-GAGTAACATGTGGATT----G-GT-----AC-ACATG---------TACACTAA-TAG-CGCAAAT-ATTTAC-----CTGTAG------CTTAAGTCCATTAAATTCGCG--AACAA-TTAATTCTTTCCA--GTTA-GGT--T---CA-----------TA---TGTC-AAACT--GTGG-TTTCTG-AAG-----------CAA--CCCACGCGGGGCA-GCGAAATGAACA-TATCTT----TTGCGACACTCCattcatcat
gi|7 : attgtAATATCCATG------TT-T--GATGCCAAG-TAAGGACCTTGTTACCTT-T---T-A------T------------A-TAGG-CCC--TAATTTCAA-G--TGCATC----GT-TTG--CTCTTTT--C-CAGTCATTTT---CAGTA----------T----A-GT-----GT-A-ATG-----AA--TACACT-A-TAA-AGCT----ATCTACA-------------------AAGTCATTGAAATT-GTG--AACGT-GAAATTTTTTTCC--ACTACGGT--T---CAGTGATCAA-CCTAACGTGTC-CG--T--GTGG-TTTCGGGAAGATA------------TTTCATGC---AAAGGTGAAATG-ACATTAT-TC----TTGGAACACTCCTCGTgtaattcacatg
gi|8 : cgacaGCCAA--TACGGACCTT---ACCTT-TATAT-A------T------------A-TAGA-GCC--TAATTTCAA-G--TGCATT----GT-TTTTCCTCGTTT-CC-CAATCATTTT---GTGTT----------T----A-GT-----GT-A-ATG-----AA--TACTCT-C-TAA-AGCA----ATACACA----CTGTAG------C-CAAGTCGGTGAAATT-TT-----CTTCGAAA------TCC--GCTACGGT--T---CAGTGATCAC-TCTAACGTGTT-AT--T--GTGG-CTTCAGCAAGATA-TCT-ACAGGATTTTCACGC---TAAGGTGAAATG-ACATTAT-TT----TTGGAACACTCCTCG
gi|9 : acgTT-T--AATGCCAAG-TAAGGGTCT----ATCTT-T---T-A------TATACTTAGTCTAG-TAGG-CCC--TA-TTTCAA-G--TGCATT----GT-TTG--CTCTTTG-TC-CAGTCATTTT---GAGTA----------T----A-GT-----GT-A-ATG-----AA--CACGCT-A-TAA-AGCA----ATATACA----CTGCAG------C-TA--TCAGTGAAATT-GTG--AACAT-GAAATTTTCTTCC--GCTACGGT--T---CAGTGATTAA-TCTAACGTGTC-AA--T--GTGG-TTTCAGTAAGATA-T-c
Alignments
lowQualScore : 1111 1 222222222222222222222222222 111 111111111111111 1111 1111 1111111 22222
lowQualScore : 2222 5 66 4 9999 3 333333333333333333333333333 3 44 7777 9999 3 44 33 3 000 888888888888888 3 88888 3 6 77777 44 3 3 3 3 1111 2222 0000000 3 3 44 2 33 33 555 3 3 44 3 44 44 2 1 4 44444 77 0 3 3 666 6 6666
lowQualScore : .... . .. . .... . ........................... . .. .... .... . .. .. . ... ............... . ..... . . ..... .. . . . . .... .... ....... . . .. . .. .. ... . . .. . .. .. . . . ..... .. . . . ... . ....
lowQualScore : 1111 0 11 3 6666 1 111111111111111111111111111 1 22 2222 6666 1 22 44 3 444 555555555555555 3 33333 1 2 77777 22 8 1 1 1 9999 9999 0000000 3 1 22 9 99 99 000 6 0 44 1 22 22 9 2 8 33333 33 8 2 1 888 2 5555
consensus : NATGAATATCTACGG----GTT-T--AATGCCAAGGTAAGGACCT----ACCTT-T---T-A------T------------G-TAGG-CCC--TAATTTCAA-G--TGCATT----GT-TTG--CTCTTTT-TC-CAGTCATTTT---GAGTA----------T----A-GT-----GT-A-ATG-----AA--TACGCT-A-TAA-AGCA----ATGTACA----CTGTAG------C-TAAGTCAGTGAAATT-GTG--AACAT-GAAATTTTCTTCC--GCTACGGT--T---CAGTGATCAA-TCTAACGTGTC-AA--T--GTGG-TTTCAGNAAGATA-T-T-ACACGATTTTCACGCGANGAAGGTGAAATG-ACATTAT-TT----TTGGAACACTCCTCGTAT
Reference ( family-1119 ) : NATGAATATCTACGG----GTT-T--AATGCCAAGGTAAGGACCT----ACCTT-T---T-A------T------------G-TAGG-CCC--TAATTTCAA-G--TGCATT----GT-TTG--CTCTTTT-TC-CAGTCATTTT---GAGTA----------T----A-GT-----GT-A-ATG-----AA--TACGCT-A-TAA-AGCA----ATGTACA----CTGTAG------C-TAAGTCAGTGAAATT-GTG--AACAT-GAAATTTTCTTCC--GCTACGGT--T---CAGTGATCAA-TCTAACGTGTC-AA--T--GTGG-TTTCAGNAAGATA-T-T-ACACGATTTTCACGCGANGAAGGTGAAATG-ACATTAT-TT----TTGGAACACTCCTCGTAT
gi|1 : ATGAATATCTTCAG----GTT-T--AATGCCAAG-TAAAGACCT----ACCTT-T---TTA------T------------A-CAGG-CCA--TAATTTCAA-A--TGAATTACATGT-TTG--CTCTTTT-TCGCGGTAATTTT---AAGTA----------T----T-GT-----GT-C-ATG-----AA--TACACT-A-TAA-AACA----ATGCACA----CTGTAGCTAGCTC-TAAGTCAGTGAAATA-GTG--AACGT-GAAATTGTCTTCC--GCTACGGA--TGAACAGTGATGAA-TCCAATGTGTC-AA--T--GTTG-TTTCTGCAAA------------GA---TCACGCAAAGAGGGTGAAATG-ACA-TAT-TTATACTTGGGACACTCCTCATAT
gi|10 : cgAAAGTAAAATTCT----ACCTT-T---T-A------T------------G-TAGG-CCC--TAATTTCAA-A--TGCATT----GT-TTG--CTATTTT-TC-CAGTTATTTT---GAGTA----------C----A-GT-----GT-G-ATGGGTACAATGTACACT-A-TAG-CGCA----ATATATATAC-CTGTAG------C-TAAGTCAGTTAAATT-GCG--AACAT-TAA---TTCTTCC--GTTACGGT--T---CA-----------TA---TGTC-AA--T--GTGG-TTTCTGAAAGAAA-C-C-ACGCG----------GGGGAAGGCGAAATG-ACATTAT-TT----TTGGAACACTCCTC
gi|11 : t--AATGC--AAGTAAGGACCT----ACCTTGT---T-AAATACCT------------G-T--G-ACC--TAATTTCAAAG--AGCATT----GT-C-G--CACTTGAACC-CAGTCATTTA---GAGTA----------TT---A-GT-----GT-ATATT-----AA--TACCTC-A-TAA-AATA----ATGTGCA----CTGTA-------C-TAAGCCAG-G-----------------GAAATTTTTGTCC--GCTACGGTAGT---CGAT-ATCAATTCTAACGTGTC-GA--GGAGTGG-T-------------T-T-GCATAATTTT---GCGAAGAAAGTGAAATG-ATAT--T-TT----TTGGAACACTCCTC
gi|12 : T-A-ATG-----AA--TACGCT-A-TGA-AGCA----ATACACA----CTGTAG------C-TAAGTCAGTGAA------------------ATTTTCTTCC--GCTACGGT--T---CAGTGATCAA-TCTAAGGTGTT-AA--T--GTGG-TTTCAATAAGATA-TGT-ACACGATTTTCACGCGACGAGGGTGAAATA-ACTTTAT-TT----TTGGAACACACCTCa
gi|13 : ATAAAGATCTACGG----ATT-T--AATGCCAAG-TAAGGACCG----AACAT-T---C-A------T------------G-TAGG-CCC--TAATTTCAA-G--TGCATT----GT-TTG--TTATTTT-TC-AAGTCATTTT---GAGTA----------TATCAA-GT-----TT-A-ATG-----AA--CACGCT-A-TAA-AGCA----ATGa
gi|14 : cgT-GAAATGTTCT-CC--GCTACGAT--T---CAGTTATTAA-TCTAACTTGTT-AA--T--GTGG-TTTTAGTAAAATATT-T-ACACGACTTTCACGTCAAGGAAGTAATATG-CCTTTAT-TT----ATGGAACACGCCTC
gi|15 : aacctaagtcagTGAACATTTACGGACCCGTT-T--AATGTCAAGTTA-GGAC----------------------------------------TAAA-CCC--TAATTTCAG-G--TGCATT----GT-TTG--CTCT
gi|16 : -TTTCAGAAAGATA-T-TCACACGATTTTCACACGACGAAGGTGAAATT-A---TAT-TT----TTGG
gi|17 : ntaa-GTG--AACAT-GAAATTTTCTTCC--GCTATGAT--T---CATTGATCAA-TC
gi|2 : ATGAATATCTACGG----GGT-T--ATTGCCAAAATAAAGACCT----ACCTT-T---T-G------T------------A-TAGG-CTT--TAATTTCAA-A--TGCATT----GT-TTG--CTCTTTT-TC-CAGTCATTTT---GAATA----------T----A-GT-----GT-A-ATG-----AA--TACGCT-A-TAA-AACA----ATGTACA----CTATAG------C-TAAGTCAGTGGAATT-GTG--AACAT-GAAATTTTCTTCC--GCTAGTGT--T---CAGTACTCAT-TCTAACGTGTC-AA--T--GTGG-ATTCAGTAAGATATT-T-ATACGAGTTTCACGCGAATAAGGTGAAATG-ACATTAT-TT----TTGGAACACTCCTCGTAT
gi|3 : tTGAATTACTAAGG----GGTAT--AATGCCA-GGTAATAACCT----ACCTA-T-----A------T------------G-TTGG-CAC--TAATTCCTA-G--TAAACT----GT-TTG--CAGTTTT-CC-CAGTCATTTT---AAGTG----------T----A-GT-----GT-T-ATG-----AA--TAT-CT-A-TAA-AACA----GTGTATA----TTATAG------C-TTAGTCAGTGAAATT-GTG--AACAT-GAACTTCACACCC--GCTACGAT--T---TAGTGATCAA-TC-AACTTGTC-AA--C--TTGG-TTTTAATAAGATA-TGG-ACACGATGTTCACGCGATGTAGGTGAAATG-GTATTAA-TT----TGGGAACACTCCTCGTATc
gi|4 : ATGAATATCTACAG----GTT-TTAAATCCCAAG-TAAGGACCT----ACCTT-T---T-A------C------------A-TTGG-CAC--TAATTTCAG-G--TGCATT----GT-TTG--CTCTTTT-CC-CAGTCATTCT---GAGTA----------T----A-GT-----GTTA-ATG-----GA--TACGCT-A-TAA-AGCA----ATGTACA----CTGTAG------C-TCGGTCAGTGAAATT-GTG--AATAT-GAAATTTTCTTCT--GCTATGAT--T---CATTAATCAA-TCTAACGTGTC-AA--T--GTAA-TTTCAGAAAGATA-T-TCACACGATTTTCATGCGACGAAGGTGAAATG-A---TAT-TT----TTGGAAC
gi|5 : cgAAAGTAAAATTCT----ACTTC-T---T-A------T------------GGTGGG-CCCGCTAATTTCAA-TACTGCATTA---GT-TTG--CTATTTT-TT-C---CATTTTTTGGAGTA----------C----ATGTCGGAGGT-A-ACA-----CA--TGTACA-ACTAATAGCGCCAGATATATATTACCTGTA-------C-TAAGTCAGTTAAATT-CTGCTAACAT-TCACATTCCTTCTCAGTTAAGGC--T---------TCA----TAATG-GTCCAA--T--GTGGGTTTCTGAAAGACA-------AC-----CCACGCGGGGAAGC---AATA-A--TTATCTT----TTGCGACACTCCTCGTA
gi|6 : AAAGTAAAATTCT----AC-TT-T---T-AC-----T------------G-TAGGCCCC--TAA-TTCAATA--TGCATT----GTCTTG--CTA-TTT-TC-CATTTATCTTTG-GAGTAACATGTGGATT----G-GT-----AC-ACATG---------TACACTAA-TAG-CGCAAAT-ATTTAC-----CTGTAG------CTTAAGTCCATTAAATTCGCG--AACAA-TTAATTCTTTCCA--GTTA-GGT--T---CA-----------TA---TGTC-AAACT--GTGG-TTTCTG-AAG-----------CAA--CCCACGCGGGGCA-GCGAAATGAACA-TATCTT----TTGCGACACTCCattcatcat
gi|7 : attgtAATATCCATG------TT-T--GATGCCAAG-TAAGGACCTTGTTACCTT-T---T-A------T------------A-TAGG-CCC--TAATTTCAA-G--TGCATC----GT-TTG--CTCTTTT--C-CAGTCATTTT---CAGTA----------T----A-GT-----GT-A-ATG-----AA--TACACT-A-TAA-AGCT----ATCTACA-------------------AAGTCATTGAAATT-GTG--AACGT-GAAATTTTTTTCC--ACTACGGT--T---CAGTGATCAA-CCTAACGTGTC-CG--T--GTGG-TTTCGGGAAGATA------------TTTCATGC---AAAGGTGAAATG-ACATTAT-TC----TTGGAACACTCCTCGTgtaattcacatg
gi|8 : cgacaGCCAA--TACGGACCTT---ACCTT-TATAT-A------T------------A-TAGA-GCC--TAATTTCAA-G--TGCATT----GT-TTTTCCTCGTTT-CC-CAATCATTTT---GTGTT----------T----A-GT-----GT-A-ATG-----AA--TACTCT-C-TAA-AGCA----ATACACA----CTGTAG------C-CAAGTCGGTGAAATT-TT-----CTTCGAAA------TCC--GCTACGGT--T---CAGTGATCAC-TCTAACGTGTT-AT--T--GTGG-CTTCAGCAAGATA-TCT-ACAGGATTTTCACGC---TAAGGTGAAATG-ACATTAT-TT----TTGGAACACTCCTCG
gi|9 : acgTT-T--AATGCCAAG-TAAGGGTCT----ATCTT-T---T-A------TATACTTAGTCTAG-TAGG-CCC--TA-TTTCAA-G--TGCATT----GT-TTG--CTCTTTG-TC-CAGTCATTTT---GAGTA----------T----A-GT-----GT-A-ATG-----AA--CACGCT-A-TAA-AGCA----ATATACA----CTGCAG------C-TA--TCAGTGAAATT-GTG--AACAT-GAAATTTTCTTCC--GCTACGGT--T---CAGTGATTAA-TCTAACGTGTC-AA--T--GTGG-TTTCAGTAAGATA-T-c
blockSeqs : ACCC A TA G TGTT G TATATACTTAGTCTAG C GC TAC A C TC AC . TTG ACATGTGGATT T CGGAG T T GGTAC TG A A C T CCAG TTAC G T C CT C CA AG . A G AT C AC GA G T A TGT TT G A CAT C .
blockSeqs : . . . G T . TAAATACCTG . . AG . . . T . TG TATCA . . . C . . C . . . AAT TAC G . . . . . . . G T A . . . . A T TTT TT A . TAT C .
blockSeqs : . . . T . . ATATATA . . TA . . . T . . TT . . . . . . G . . . . . G . . . . . . . G G A . . . . A T TTC CT C . CTT . .
blockSeqs : . . . A . . TATGG . . A . . . T . . C . . . . . . G . . . . . G . . . . . . . T A A . . . . A A TTT TT A . CTT . .
blockSeqs : . . . G . . TACTG . . G . . . C . . T . . . . . . G . . . . . G . . . . . . . G G T . . . . A T TGG GT C . CAT . .
blockSeqs : . . . G . . TATG . . G . . . C . . T . . . . . . G . . . . . G . . . . . . . G A A . . . . A T TTC TG A . TAT . .
blockSeqs : . . G . . CATG . . A . . . T . . T . . . . . . A . . . . . G . . . . . . . T G A . . . . A A TCT TT T . CAT . .
blockSeqs : . . . . TGTA . . G . . . T . . C . . . . . . A . . . . . G . . . . . . . G G A . . . . T A CC TT C . CAT . .
blockSeqs : . . . TACA . . G . . . C . . T . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . G G C . . . . T G TT T G . CA . .
blockSeqs : . . . TATA . . G . . . T . . T . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . G . A . . . . G C . . G . T . .
blockSeqs : . . . ATG . . G . . . . . . T . . . . . . G . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A T . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . G . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . .
blockSeqCons : TATG*********************** **** G****** *** TTT** TT CAT ****
originalCons : NATGAATATCTACGG----GTT-T--AATGCCAAGGTAAGGACCT----ACCTT-T---T-A------T------------G-TAGG-CCC--TAATTTCAA-G--TGCATT----GT-TTG--CTCTTTT-TC-CAGTCATTTT---GAGTA----------T----A-GT-----GT-A-ATG-----AA--TACGCT-A-TAA-AGCA----ATGTACA----CTGTAG------C-TAAGTCAGTGAAATT-GTG--AACAT-GAAATTTTCTTCC--GCTACGGT--T---CAGTGATCAA-TCTAACGTGTC-AA--T--GTGG-TTTCAGNAAGATA-T-T-ACACGATTTTCACGCGANGAAGGTGAAATG-ACATTAT-TT----TTGGAACACTCCTCGTAT
finalCons : NATGAATATCTACGG----GTT-T--AATGCCAAGGTAAGGACCT----ACCTT-TTATG-----------------------TAGG-CCC--TAATTTCAA-G--TGCATT----GT-TTG--CTCTTTT-TC-CAGTCATTTT---GAGTA----------T----A-GT-----GT-A-ATG-----AA--TACGCT-A-TAA-AGCA----ATGTACA----CTGTAG------C-TAAGTCAGTGAAATT-GTG--AACAT-GAAATTTTCTTCC--GCTACGGT--T---CAGTGATCAA-TCTAACGTGTC-AA--T--GTGG-TTTCAGNAAGATATTT--ACACGATTTTCACGCGANGAAGGTGAAATG-ACATTAT-TT----TTGGAACACTCCTCGTAT
Alignments
lowQualScore : 1111 1 222222222222222222222222222 111 111111111111111 1111 1111111 11111111111
lowQualScore : 2222 5 66 4 9999 3 333333333333333333333333333 3 44 7777 9999 3 44 33 3 000 888888888888888 3 88888 3 6 77777 44 3 3 3 3 6666 555 2222 0000000 3 3 44 2 33 33 555 3 3 44 3 44 3 3 0 66666666666 5555 0 33333 6 6666
lowQualScore : .... . .. . .... . ........................... . .. .... .... . .. .. . ... ............... . ..... . . ..... .. . . . . .... ... .... ....... . . .. . .. .. ... . . .. . .. . . . ........... .... . ..... . ....
lowQualScore : 1111 0 11 3 6666 1 111111111111111111111111111 1 22 2222 6666 1 22 44 3 444 555555555555555 3 33333 1 2 77777 22 8 1 1 1 5555 444 9999 0000000 3 1 22 9 99 99 000 6 0 44 1 22 1 8 7 11111111111 2222 2 88888 2 5555
consensus : NATGAATATCTACGG----GTT-T--AATGCCAAGGTAAGGACCT----ACCTT-T---T-A------T------------G-TAGG-CCC--TAATTTCAA-G--TGCATT----GT-TTG--CTCTTTT-TC-CAGTCATTTT---GAGTA----------T----A-GT-----GT-A-ATG-----AA--TACGCT-A-TAA-AGC----A---ATGTACA----CTGTAG------C-TAAGTCAGTGAAATT-GTG--AACAT-GAAATTTTCTTCC--GCTACGGT--T---CAGTGATCAA-TCTAACGTGT-CAA--TGT-GGTTTCAGNAAGATATTTACACGATTTTCACGC-GANGAAGGTGAAATG-ACATTAT-TT----TTGGAACACTCCTCGTAT
Reference ( family-1119 ) : NATGAATATCTACGG----GTT-T--AATGCCAAGGTAAGGACCT----ACCTT-T---T-A------T------------G-TAGG-CCC--TAATTTCAA-G--TGCATT----GT-TTG--CTCTTTT-TC-CAGTCATTTT---GAGTA----------T----A-GT-----GT-A-ATG-----AA--TACGCT-A-TAA-AGC----A---ATGTACA----CTGTAG------C-TAAGTCAGTGAAATT-GTG--AACAT-GAAATTTTCTTCC--GCTACGGT--T---CAGTGATCAA-TCTAACGTGT-CAA--TGT-GGTTTCAGNAAGATATTTACACGATTTTCACGC-GANGAAGGTGAAATG-ACATTAT-TT----TTGGAACACTCCTCGTAT
gi|1 : ATGAATATCTTCAG----GTT-T--AATGCCAAG-TAAAGACCT----ACCTT-T---TTA------T------------A-CAGG-CCA--TAATTTCAA-A--TGAATTACATGT-TTG--CTCTTTT-TCGCGGTAATTTT---AAGTA----------T----T-GT-----GT-C-ATG-----AA--TACACT-A-TAA-AAC----A---ATGCACA----CTGTAGCTAGCTC-TAAGTCAGTGAAATA-GTG--AACGT-GAAATTGTCTTCC--GCTACGGA--TGAACAGTGATGAA-TCCAATGTGT-CAA--TGT-TGTTTCTGCAAA----------GA---TCACGC-AAAGAGGGTGAAATG-ACA-TAT-TTATACTTGGGACACTCCTCATAT
gi|10 : cgAAAGTAAAATTCT----ACCTT-T---T-A------T------------G-TAGG-CCC--TAATTTCAA-A--TGCATT----GT-TTG--CTATTTT-TC-CAGTTATTTT---GAGTA----------C----A-GT-----GT-G-ATGGGTACAATGTACACT-A-TAG-CGC----A---ATATATATAC-CTGTAG------C-TAAGTCAGTTAAATT-GCG--AACAT-TAA---TTCTTCC--GTTACGGT--T---CA-----------TA---TGT-CAA--TGT-GGTTTCTGAAAGA-A---AC--------CACGCGGGGGAAGGCGAAATG-ACATTAT-TT----TTGGAACACTCCTC
gi|11 : t--AATGC--AAGTAAGGACCT----ACCTTGT---T-AAATACCT------------G-T--G-ACC--TAATTTCAAAG--AGCATT----GT-C-G--CACTTGAACC-CAGTCATTTA---GAGTA----------TT---A-GT-----GT-ATATT-----AA--TACCTC-A-TAA-AAT----A---ATGTGCA----CTGTA-------C-TAAGCCAG-G-----------------GAAATTTTTGTCC--GCTACGGTAGT---CGAT-ATCAATTCTAACGTGT-CGA------GG----AGTG----GTTTGCATAATTTT---GC-GAAGAAAGTGAAATG-ATAT--T-TT----TTGGAACACTCCTC
gi|12 : T-A-ATG-----AA--TACGCT-A-TGA-AGC----A---ATACACA----CTGTAG------C-TAAGTCAGTGAA------------------ATTTTCTTCC--GCTACGGT--T---CAGTGATCAA-TCTAAGGTGT-TAA--TGT-GGTTTCAATAAGATATGTACACGATTTTCACGC-GACGAGGGTGAAATA-ACTTTAT-TT----TTGGAACACACCTCa
gi|13 : ATAAAGATCTACGG----ATT-T--AATGCCAAG-TAAGGACCG----AACAT-T---C-A------T------------G-TAGG-CCC--TAATTTCAA-G--TGCATT----GT-TTG--TTATTTT-TC-AAGTCATTTT---GAGTA----------TATCAA-GT-----TT-A-ATG-----AA--CACGCT-A-TAA-AGC----A---ATGa
gi|14 : cgT-GAAATGTTCT-CC--GCTACGAT--T---CAGTTATTAA-TCTAACTTGT-TAA--TGT-GGTTTTAGTAAAATATTTACACGACTTTCACGT-CAAGGAAGTAATATG-CCTTTAT-TT----ATGGAACACGCCTC
gi|15 : aacctaagtcagTGAACATTTACGGACCCGTT-T--AATGTCAAGTTA-GGAC----------------------------------------TAAA-CCC--TAATTTCAG-G--TGCATT----GT-TTG--CTCT
gi|16 : TTTCAGAAAGATATTCACACGATTTTCACAC-GACGAAGGTGAAATT-A---TAT-TT----TTGG
gi|17 : ntaa-GTG--AACAT-GAAATTTTCTTCC--GCTATGAT--T---CATTGATCAA-TC
gi|2 : ATGAATATCTACGG----GGT-T--ATTGCCAAAATAAAGACCT----ACCTT-T---T-G------T------------A-TAGG-CTT--TAATTTCAA-A--TGCATT----GT-TTG--CTCTTTT-TC-CAGTCATTTT---GAATA----------T----A-GT-----GT-A-ATG-----AA--TACGCT-A-TAA-AAC----A---ATGTACA----CTATAG------C-TAAGTCAGTGGAATT-GTG--AACAT-GAAATTTTCTTCC--GCTAGTGT--T---CAGTACTCAT-TCTAACGTGT-CAA--TGT-GGATTCAGTAAGATATTTATACGAGTTTCACGC-GAATAAGGTGAAATG-ACATTAT-TT----TTGGAACACTCCTCGTAT
gi|3 : tTGAATTACTAAGG----GGTAT--AATGCCA-GGTAATAACCT----ACCTA-T-----A------T------------G-TTGG-CAC--TAATTCCTA-G--TAAACT----GT-TTG--CAGTTTT-CC-CAGTCATTTT---AAGTG----------T----A-GT-----GT-T-ATG-----AA--TAT-CT-A-TAA-AAC----A---GTGTATA----TTATAG------C-TTAGTCAGTGAAATT-GTG--AACAT-GAACTTCACACCC--GCTACGAT--T---TAGTGATCAA-TC-AACTTGT-CAA--CTT-GGTTTTAATAAGATATGGACACGATGTTCACGC-GATGTAGGTGAAATG-GTATTAA-TT----TGGGAACACTCCTCGTATc
gi|4 : ATGAATATCTACAG----GTT-TTAAATCCCAAG-TAAGGACCT----ACCTT-T---T-A------C------------A-TTGG-CAC--TAATTTCAG-G--TGCATT----GT-TTG--CTCTTTT-CC-CAGTCATTCT---GAGTA----------T----A-GT-----GTTA-ATG-----GA--TACGCT-A-TAA-AGC----A---ATGTACA----CTGTAG------C-TCGGTCAGTGAAATT-GTG--AATAT-GAAATTTTCTTCT--GCTATGAT--T---CATTAATCAA-TCTAACGTGT-CAA--TGT-AATTTCAGAAAGATATTCACACGATTTTCATGC-GACGAAGGTGAAATG-A---TAT-TT----TTGGAAC
gi|5 : cgAAAGTAAAATTCT----ACTTC-T---T-A------T------------GGTGGG-CCCGCTAATTTCAA-TACTGCATTA---GT-TTG--CTATTTT-TT-C---CATTTTTTGGAGTA----------C----ATGTCGGAGGT-A-ACA-----CA--TGTACA-ACTAATAGCGCCAG---ATATATATTACCTGTA-------C-TAAGTCAGTTAAATT-CTGCTAACAT-TCACATTCCTTCTCAGTTAAGGC--T---------TCA----TAATG-GTCCAA--TGTGGGTTTCTGAAAGACA---AC-------CCACGC-GGGGAA---GCAATA---ATTATCTT----TTGCGACACTCCTCGTA
gi|6 : AAAGTAAAATTCT----AC-TT-T---T-AC-----T------------G-TAGGCCCC--TAA-TTCAATA--TGCATT----GTCTTG--CTA-TTT-TC-CATTTATCTTTG-GAGTAACATGTGGATT----G-GT-----AC-ACATG---------TACACTAA-TAG-CGC----AAATATTTAC-----CTGTAG------CTTAAGTCCATTAAATTCGCG--AACAA-TTAATTCTTTCCA--GTTA-GGT--T---CA-----------TA---TGT-CAAACTGT-GGTTTCTG-AAG---------CAA--CCCACGC-GGGGCA-GCGAAATGAACA-TATCTT----TTGCGACACTCCattcatcat
gi|7 : attgtAATATCCATG------TT-T--GATGCCAAG-TAAGGACCTTGTTACCTT-T---T-A------T------------A-TAGG-CCC--TAATTTCAA-G--TGCATC----GT-TTG--CTCTTTT--C-CAGTCATTTT---CAGTA----------T----A-GT-----GT-A-ATG-----AA--TACACT-A-TAA-AGC----T---ATCTACA-------------------AAGTCATTGAAATT-GTG--AACGT-GAAATTTTTTTCC--ACTACGGT--T---CAGTGATCAA-CCTAACGTGT-CCG--TGT-GGTTTCGGGAAGATA----------TTTCATGC----AAAGGTGAAATG-ACATTAT-TC----TTGGAACACTCCTCGTgtaattcacatg
gi|8 : cgacaGCCAA--TACGGACCTT---ACCTT-TATAT-A------T------------A-TAGA-GCC--TAATTTCAA-G--TGCATT----GT-TTTTCCTCGTTT-CC-CAATCATTTT---GTGTT----------T----A-GT-----GT-A-ATG-----AA--TACTCT-C-TAA-AGC----A---ATACACA----CTGTAG------C-CAAGTCGGTGAAATT-TT-----CTTCGAAA------TCC--GCTACGGT--T---CAGTGATCAC-TCTAACGTGT-TAT--TGT-GGCTTCAGCAAGATATCTACAGGATTTTCACGC----TAAGGTGAAATG-ACATTAT-TT----TTGGAACACTCCTCG
gi|9 : acgTT-T--AATGCCAAG-TAAGGGTCT----ATCTT-T---T-A------TATACTTAGTCTAG-TAGG-CCC--TA-TTTCAA-G--TGCATT----GT-TTG--CTCTTTG-TC-CAGTCATTTT---GAGTA----------T----A-GT-----GT-A-ATG-----AA--CACGCT-A-TAA-AGC----A---ATATACA----CTGCAG------C-TA--TCAGTGAAATT-GTG--AACAT-GAAATTTTCTTCC--GCTACGGT--T---CAGTGATTAA-TCTAACGTGT-CAA--TGT-GGTTTCAGTAAGATATc