lowQualScore : 11111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 11111111111111111111111111111111111111111111111111 1111111111111111111111111111111111111111 111111111111111111111 1111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 33333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333 33333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333
lowQualScore : 111111 33333333333333333333333 111111 22222222222 222 33333 22 3333 33333333 2222222 1111 4444444444444444444 22 4444444444444444444444444444444444 55 1111111111111 111 11 2222222222222222222222222222 22 22 111 33333333333 222222222 1 333 1111 66666666666666666666666666666666666666666666666666666666 44444444444444444 22222 2222 333 111111111111111111 22 222222222222222222222222222 111 333333333333333333333333333333333 22 111111 77777777777777777777777777777777 11111 333333333 11 44444444444444 22 1 1111 11 222222222 2 1 222222 11 1 444444444 1 2222222 11 666666666666666 1111 6666666 3 3333333333 222 1 11 22 222 111 1 333333333 11 77777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777 1111 11 222 22 1 11 00000000000000000000000000000000000000000000000000 4444444444444444444444444 22222222222222 222 222 2222 1111111111111111111111111111111111111111 44444 1 33333333 4444 22 000000000000000000000 44444444 2 5555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555 111 4 2 2 44444444 11 444444444444444 11 44444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444 1 1 1 1 22 33333 1 111 33 1 1 1 1 2222222 7777777 22222 11 1 222 333 1 11111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 11 1 111 55555555555555555555555 1 555555 222 33333 777777777777777777777777777777 1 2 2 3333
lowQualScore : 7 7 666666 00000000000000000000000 5 111111 6 555 88888888888 33 8888 222 77 88888 33 3 0000 5555555 9 2 5 2 1 5 77 2 2 2 66666666 33 5555 33 6666 33 2 2 5 33 444 2222222 2 4444 555555 2 2222222222222222222 2 77777 2 2 5555 2 44 0 33 7777777777777777777777777777777777 2 00 2 2 444 1111111111111 7 33 55 2 333 77 2 8888888888888888888888888888 2 9999999 333 3 77 0 0 888 1 00 77 111 77777777777 44 3 777777777 4 55 2 777 333 4444 99999999999999999999999999999999999999999999999999999999 4 55555555555555555 1 4 22222 0000 3 333 999999999999999999 11 666666666666666666666666666 55 0 3 888 3 6666 999999999999999999999999999999999 66 111111 77777777777777777777777777777777 22222 5 5 5 5 888888888 33 33333333333333 6 66 5 7 5 2222 5 00 0 333333333 7 3 8 8 22 4 3 1 999999 11 0 0 000000000 0 2222222 77 0 111111111111111 0 7777 2222222 0 0 7777777777 3 7 555 7 3 11 4 33 7 333 777 0 777777777 6 7 33 11111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 6 4444 33 777 33 0 3 33 3 66666666666666666666666666666666666666666666666666 1 7777777777777777777777777 0 99999999999999 333 222 8888 2222222222222222222222222222222222222222 33333 3 66666666 3333 77 555555555555555555555 3 2 33333333 4 0 5555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555 4 666 0 0 0 00000000 88 444444444444444 88 00000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 3 3 3 3 00 7 1 6 00000 6 7 3 777 66 3 3 3 7 2222222 2222222 0 11111 33 0 222 333 0 22222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 33 3 3 2 5 3 777 33333333333333333333333 9 5 111111 333 33333 7 444444444444444444444444444444 6 3 3 4 0 0 7777
lowQualScore : . . ...... ....................... . ...... . ... ........... .. .... ... .. ..... .. . .... ....... . . . . . . .. . . . ........ .. .... .. .... .. . . . .. ... ....... . .... ...... . ................... . ..... . . .... . .. . .. .................................. . .. . . ... ............. . .. .. . ... .. . ............................ . ....... ... . .. . . ... . .. .. ... ........... .. . ......... . .. . ... ... .... ........................................................ . ................. . . ..... .... . ... .................. .. ........................... .. . . ... . .... ................................. .. ...... ................................ ..... . . . . ......... .. .............. . .. . . . .... . .. . ......... . . . . .. . . . ...... .. . . ......... . ....... .. . ............... . .... ....... . . .......... . . ... . . .. . .. . ... ... . ......... . . .. ................................................................................................................................ . .... .. ... .. . . .. . .................................................. . ......................... . .............. ... ... .... ........................................ ..... . ........ .... .. ..................... . . ........ . . .................................................................................................... . ... . . . ........ .. ............... .. ........................................................................................................................................................................................................... . . . . .. . . . ..... . . . ... .. . . . . ....... ....... . ..... .. . ... ... . ............................................................................................................................. .. . . . . . ... ....................... . . ...... ... ..... . .............................. . . . . . . ....
lowQualScore : 3 3 000000 77777777777777777777777 0 111111 9 000 44444444444 77 9999 111 99 33333 88 1 9999 7777777 7 7 3 7 5 7 66 5 5 5 77777777 77 7777 77 1111 99 9 9 7 77 444 6666666 5 7777 999999 4 8888888888888888888 7 66666 7 7 7777 7 00 6 77 0000000000000000000000000000000000 4 44 5 5 444 6666666666666 5 44 99 5 000 77 7 9999999999999999999999999999 9 3333333 777 1 77 8 7 555 0 44 99 111 99999999999 99 6 777777777 0 55 5 000 000 0000 99999999999999999999999999999999999999999999999999999999 0 11111111111111111 9 0 00000 6666 6 000 333333333333333333 55 111111111111111111111111111 00 9 6 666 6 9999 666666666666666666666666666666666 44 555555 22222222222222222222222222222222 00000 0 7 7 7 888888888 66 11111111111111 7 33 7 1 7 1111 7 77 7 555555555 5 5 0 0 22 0 8 4 333333 33 8 5 000000000 0 0000000 22 8 000000000000000 8 0000 5555555 0 8 0000000000 2 3 777 3 3 00 0 00 3 333 555 0 222222222 0 2 88 55555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555 5 8888 88 222 88 0 2 88 2 55555555555555555555555555555555555555555555555555 0 3333333333333333333333333 7 33333333333333 333 000 3333 0000000000000000000000000000000000000000 33333 3 33333333 5555 55 000000000000000000000 0 5 55555555 0 0 0000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 0 555 0 0 0 55555555 00 777777777777777 33 00000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 3 3 3 3 77 3 0 7 33333 7 3 3 777 77 3 3 3 0 3333333 7777777 7 22222 88 0 222 222 0 55555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555 88 2 2 5 0 2 555 77777777777777777777777 0 5 333333 333 33333 3 333333333333333333333333333333 7 3 7 0 0 0 0000
consensus : AAAT-GGCGAAG-TA----A-CAA----A--GT-A--T-A-AA----CGTAATCATA------GTCCCAA---AAA------CAT--AT--ACA----AAA-T-C--GAGT-GTA-GGGCAAC-CAC-GGA----CCT--CC---GACAA-AAG-CGAAG-GCAGGA-TC-A-GG-TGCCA-TGGAGGGA--GTAA----GCATCCTC--TGCTGACC----GG--T-CACAC-CCGC-CG--TGAG---CC-C-N---TA-GTC----G--A---AA-CAA---A--------------GTAAACG-GG-G---TTA-CCC-G----TCGTCA-AATCTAAGTACGAAA--AC--G-CA-GTCTAAACAAAATG-GGTA-AAT---GAAAC-AAATCA--GTC-AA-C---A-----T-------ATG-A--C--T-TA---GTGATAA-TTTG-T---AA-TC--G----C-A-A--C--A--GGTC-ATTAT-------AGCGACC-G-T-AGAATT--TGCGAAATGATG---ACTTT--AA--CGAGAATTCGNT-TTAT----AA-C-CCTGCAACAT--CA-AC--TTTTTGGTTAGTAGT-T--GGCCT---CGCT-TTAAAAA----ATC--N-C--A--TACG-CAT--------G-C-ATG-------------C-CT--T-GCGTATC-GAATCA-AAC------C-----GGGAG-ACATT-A-CACA-C-AT-AA---GCA---G--GGGA--------TAGTGGTAACATTA-------------CTA-ACA-A--AG-AAAG--GAA-AAN-T-GAC---GAT------TGCA-AAG--------TC-AAAGTC--ATCAACG------CTTATCATATA-A---TG---CA-GTT--GT-C-AGT----C-TG--C--C-ATTAGAG-TC-AA-TATT--AAGT---AAAATATCC--AAAT------------ATGAAGCAGATCTGTCAGATTCTGTGGTG-TCC-TT----TA-TTTCGAGTTCGTCGGGATAATATCAAAATGGA-CATA-ATTGTGAAAATTATGATTGTTAATTGAT---AG-ACATC-ATCTATATACCTATATGTA---------AGG-TTG-AA---GGACAC-NGCAAG---------------TTTTTTG----TTTTTAT------CCCGTAACAGTTT-TTTTGAA-ACAAATTCTGCT--TTCAT-ATGNAATATANAA--ATAAGTCTG---CCAATA---AG-GGGGCACAA---T--TAGTGCCCNTA--GGA-AT-AC-CA-AC--A---------GAATTGTTGGAG-AGAC--ATGGTCTCTCC---AAAGACTACAT-AA-AT-A-TT-ATCTAT-A--AGAAA----ACCC-A---------------AGC---A-ATGCTC-T--TA--ATATCCTACTTCA-AGAGTA-CTTGTGTGGG--CAATCA----------------GAGTG----GGTT---------CTNANAAA----AATATGTGTCTT--GTTT-----CCCCAAC-----GACTAGAAA-TTNTTA--TT---TTCGGG---TGCC-G-TTTT----TTGTTT---------AAAANCAATTA--------T--CGAT--CCCGAAAAA-G---CCT-AGAT--TT-T--ATTTTAT-CGTGAGAAGAATCGTTGTGATATTGGGTTAGTAGAGCTCGGNGNAGAAATCNACGNGATNTTGAATGCAGTCAATTGTCTCNGCATTGAAANCAACTCTCGTGATTTAAAGTTGTTTTAGTATAAAGCTGGGCTTTTAGAAGGGGCGTTTTCACCGTTGANATATCCCCAATCTTNGNATNGACACCA-TTCTGGAATAATGTAGGCGGAAACAGTATATCN-TGAAA---TGA--CT--T-TTAACA--GCTGTTC-AG-TAGTT-----T--TTAGTA-GAC-------TAAGGNA----------T-AGA-G---------------G------C------T---GGTAGAG-CAC--TTACTGGAA---CCAGCG-ATA-T-A-----TC-TTCG-TTTGTAAGGA-TTTN---TTA-TGC--GTT--TCG-----GAATCCAGT-A--------AAGGT-ATGGTAA-TTCAAATTGAT-CCTGAT-TCTTCGG-AAATATTGAAAGTAT-TT-CAAACAGAAAGGT-GATTTTG-A-GAA-TTTC-ATC-TTAGT-CAGATTGCTTGGA-GTATA-AAGT----AAGATTCCCAAATGCG---TGA--AGTA-AACCCT-AGTTC-ATTTAAAAGG-ACAAGTATAGTAGT-----GA-CTCTN--TACAAAC--A-----AAG----ACAAA-TGTNA-TC------------ACTNTGCTTTATGCTG-CCT--AACC--TANCAA-AGTTTTCA-TGTG--TC----TAA--CTCATTTACNCACTTCTG---GCT-TN-----TTAA-GACAG-----AAGGATAAATAGTCNCG--ATTTTCCC---CGC-----TAAATGGTT---A---CGG-ATTT----TAA-TAA--TTTCCGAAT-ANTTTTGNCCATTTCAGACAAAGTGTTCAANCCCCTCTCCCT
Reference ( gi|2 ) : AAAT-GGCGAAG-TA----A-CAA----A--GT-A--T-A-AA----CGTAATCATA------GTCCAAA---AAA------CA---AT--ACA----AAAAT-C--GAGTTGTAAGGGCAAC-CAC-GGA---ACCT--TC---GACGA-AAG-CGAAG-GCAAGG-TC-A-GG-TGCCAATGGAGAGA--GTAA----GCATCCTC--TGCTGACC----GG--T-CACAC-CCGC-CG--TGAG---CC-T-G---TA-GTC----G--A---AA-CAA---A-------------TGTAAACG-GG-G---TTA-CCC-G----TCGTCA-AATCTAAGTATGAAA--AT--G-CA-GTCTAAACAAAATG-GGTA-AAT---GAAAC-AAATCATGGTC-AA-C---A-----T-------ATG-A--C--T-TA---GTGATAC-TTTG-T---A--TC--G----C-A-A--C--A--GGTC-ATTAT-------AGCGACC-G-T-AGAATTTGTGCGAAATGATG---ACTTT--AA--CGAGAATTCGGT-TTA-----AA-C-CCTGCAACATA-CA-AC--TTTTTGGTTAGTAGT-T--GCCCT---CG---TTAAAAA----ATC--A-C--AT-TACG-CAT--------G-C-ATG-------------C-CT--T-G-GTATC-GAATC--A-C------C-----GAGAG-ACATT-A-CACA-C-AT-AAT--GCA---G--TGGA--------TAGTGGTAACATTA-------------CTA-ACA-A--AA-AAAG--GAA-AAG-T-GAC---AAT------TGGC-AAG--------TC-AAAGTCCCATCAACG------TTTATCATATATA---TG---T--GTT--TTGC-AGT----CCTG--C--C-ATTAGAG-TC-AA-TATT--A--T---AAAATATCC--AA-T------------ATGAAGCACATTGGTCAGATTCTGTGGTG-T-C-TT----TA-TTTCAAGTTCGTCAGGATAATATCAAAATGGA-CATA-ATTGTG-AAATTATGATTGTTAATGGAT---AA-ACATC-GTCTATATACCTATAAGTA---------AGG-TTG-AA---GGACAC-TGCAAG---------------TTTTTTG----TTTTTA-------CCCG-AACAGTTT-TCCTGAA-ACAAATTCTGCT--TTCAT-ATGGAATATATAAAAATAAGTCTG---CCAATA---AG-GGGGCAACA---T--TAGTACCCATA--GGA-A--AC-CA-AC--A---------GAATTGTTGGAGAAGACGGAT-GTCACTCCAAAAAAGACTACAA-TA-AT-A-TTAATCTATAA--AGCAA----ACCC-A---------------AGC---A-ATGCTC-T--TA--ATATCTTTCTTC--AGAGTA-CTTGTGTGGG--CAATCA----------------GAGTG----GGTT---------CTGACAAA----AATATGTATC-T--GTTT-----CCCAAAT-----GACCAGAAACTTGGTA--TT---TTCGGG---TGCC-G-TTTT----TTGTTC---------AAAAGCAATTA--------T--CAATTTCCTGAAAAA-G---CCT-AGAT--TT-T--ATTTTATCCGTGAG--GAATTGTTGTA------------TAAAG--TGGTGGAGAAATTCATATG-TTTTG-ATGCAGTCAATT---TTAG----AAAAA----TCTCGTGATTGAA----GTTTT-CTATAAAGCT----CTTTAGA------GTTTT-----T-GAGA-ATCCACAATC--TGAATGAACACCACTTCTGGAATA-TGTAG-TGGAAACAG--TATCT-TGAAG---TGA--CC--T-TTAACA--GCTGTT--AG-TAGTT-----TTGTTAGTA-G---------TAAGGGA----------T-AGA-G---------------G------C------T---GGTAAGG-CAC--TTACTGGAA---CCAGCGAATG-T-A-----TC-TTTGGTTTGTAAGGA-TTTC---TTA-TGCATATTT-TTG-----GAATCCAGT-A--------AAGGT-ATGGTAA-TTCAAATTGAT-CCTGAT-TCTTCGG-AAATATTAAACGTAT-TC-CAAACAGAAAGGT-GATTTTG-A-GA--TTTC-ATC-TTAGT-CAGATTGCTAGGA-GTATA-AAGTCAGGAAAATTCCCAGATGTG---TGA--AGTA-AACCCTAAGTTCAATTTAAAAAG-ACAAGTATAATAGT-----GA-CTTTA--TACAAAC--A-----AAG----ACAAG-TG----TT------------ACTGTGCTTTATACAG-CCTGGAACCAGTAACAA-AGTTTTCA-TGTA-GTCTATGTAA--CTCATTTACCCCCTTCTG---GCT-TC-----TTAA-GACAG-----AAGGGTAAATAGT-A-G--ATTTTCCC---CGC-----TAAATGGTTATAA---CGGGATTT----TAAATAA--TTTCCGAAT-ACTTTTGATCA-TTCAGACAAAGTG-TCAAGAT-CTCTCCCTCA
gi|3 : AAAT-GGCGAAG-TACA--A-CAA----T--GT-G--TTA-AA----CGTAA-AATA------GTCCCAA---AAA------CATGTAT--ACA----AAA-T-T--GAGT-GTA-GGTCAAC--AC-GGA----CCT--CC---GACAA-AAG-TGAAG-G-AGGA-TC-A-GG-TGCCA-TGG-GTGA--GTAA----GCATCCTC--TGCTGACG----CG--C-CACAC-CCGT-CG--TGAG---CC-C-T---TA-GTC----G--A---AA-CAA---C-------------AGTAAACG-GG-A---TTA-CC--G----TCGTGA-AATCTA-GTACGAAA--AT--G--A---CTGA-CAAA--G-GATA---T---GAAAC-AAATCA--GTC-AA-C---A-----T-------ATG-A--C--C-TG---GTGATAA-TTTG-T---AA-TC--G----C-A-A--AGAA--GGTC-ATTAT-------AGCGACC-G-T-ATAATTTG--CGAAATGAT----ACTTT--AAA-TGAGA-TTCGTT-ATACCGTTAA-C-CCTGCAACAT--CA-----TTTTTGGTTACTAGT-T--GGCCT---AGC--TTTAAAA----ATC--C-CTCATACACA-TAT--------G-CCATGTGTTGGATATAGCC-CT--T-GCGTATC-GAATC--AAC------T-----GAGAG-ACAT--A-CACA-CCAT-AA---GCA---G--GTGA--------TATTGGTA-CATTA-------------CTA--CATA--GA-AAAG--GAA-TGT-T-GAC---GATA-----TGCA-AAG--------TC-AAAGTC--ATCA-CG------TTTATTATATA-A---TG---T--ATG--T--C-AGT----C-TG--CATC-ATTAGAG-TC-AAATATT--AAGT---AAAATAGCC--AAAT------------ATAAAGCAGATATGTCAGATTCTGTGGTG-T-CCTT----TA-TTTCGAGTTCGCCA----AATATATAAATGGA-CATA-ATTGTG-AAATT-TTATTGTTAATTGAT---AAGACATC-GTTTATATACCCATATGTA---------AGG-TTG-AA---GGACAC-GGT------------------TTTTTTG----TTTTTAT------CCTGTAACGTTTT-TTTTAAC-AC-AATTCTAC---TTCAT-ATGA---ATATAAAAATAAGTCTG---CCAATA---AG-AGGACACAA---T--TAGTGTCCTTA--GGA-AT-AC-CA-AC--A---------T-ATTGTTG--GAAGAC--ATGGTTTCT-----AAAGACTACAT-AA-AT-A-TT-GTCCAT-A--AGAAA----ACCC-A---------------AGC-----ATGCTC-T--TA--ATATC-TACTTC--AGAGTA-CTTGTGTGGG--CAATCA----------------GAGT-----GGTT---------CTGAC-AA----AACATGT
gi|8 : ctattaaacctgacacaatacatctgctagtcatctgggactgatgtttatatatcAAAT-GGCGAAG-TA----A-CAA----A--GT-A--TGA-AA----CGTAATCATA------GTCCAAA---AAA------CAC--AT--ACA----AAA-T-C--GAGT-GTA-GGGCAAC--AC-GGA----CCT--TC---GACGA-AAG-CGAAG-GCAGGA-GC-A-GG-TGCCA-TGGAG-GA--GTAA----GCATCCTC--TGCTGACC----GG--T-CACAC-CCGC-CG--TGAG---CC-T-G---TA-GTC----G--A---AA-CAA---A--------------GTAAACG-GG-G---TTA-CCC-G----TCGTCA-AATCT-AGTATGAAA--AT--GACA-GTCT-AAC-AAAT--GGT---AT---GAAAC-AAATCA--GTC-AA-C---A-----T-------ATG-A--C--T-TA---GTGATAC-TTTG-TA--A--TC--G----CAA-A--CA-A--GGTC-ATTAT-------AGCGACC-G-T-AGAATT--TGCGAAATGATG---ACTTTA-AA--CGAG-ATTCG---TTAT----AA-C-CCTGCAACAT--CA-AC--TTTTTGGTTAGTAGT-T--GGCCT---CGCT-TTAAAAA----ATC--ATC--A--TACG-CATG-------G-C-ATGC------------C-CT--T-GCGTATC-GAATCA-A-C------T-----GAGAG-ACA-T-A-CACACC-AT-AA---GCA---G--GTGA--------TAGTGGT-ACATTA-------------CTACAC--A--AA-AAAG--GAA-AGT-T-GAC---AAT------TGCA-AAG--------TC-AAAGT--CATC-ACG------TTTA
gi|4 : ggcatataAAATTGGCGAAG-TA----AACAA----T--GT-G--TTA-AA----CGTAATCGTACATGTAGTCCCTA---AAA------CAT--AT--ATA----CAACTTC--GAGT-GTA-TGGCAAC--AT-GGA----CCT--CC---GACAACAGG-CGAAG-CCAGGA-TC-A-G--TGCCA-TGGAGGGA--GTAG----GCATCCTC--TGCTGACC----GG--T-CAC-C-CCACACG--TGAG---CC-TCG---TA-GTC----G--A---GA-CAA------------------GTAAACA-GG-G---TTT-ACC-G----TCTACT-A--CGAA--ATGAGA--------CA-GTCTAA-CAA---G-GGTA---T---GAAAC-AAATCA--GTC-AG-C---A-----T-------ATG-A--C--T-TA---GTGATAA-TTTGGT---AA-TC--G----C-A-A--C--AA-GGTC-AT-AT-------AGCGACC-G-T-AGAATCC-TGCGAAATGCTGCGGACTTTGAAA--CGAGAACTCG---TTAT----AA-C-CCTGCAA-ACA-TC-AT--TTCTTTTTTTGTAAT-T--GAC-T---CG---CTTTAAA----GTCCTG-C--GT-C-CG-CAT--------GAT-ATA-------------C-CT--TTGCGTATC-GAATC--AAC------T-----GAGAG-ACAT--A-CACA-CCAT-AA---GCA---G--GTGA--------TAGTGG-AACATTA-------------CTA--CA-A--AG-AAAG--GGA-AAG-TTGAC---GAT------TG---------------C-AAAGTC--ATCA-CG------TTTATCATATA-A---TG---TA-GTT--GT-C-AGT----C-TG--C--C-ATTAGAA-TC-AA-TTTT--AAGT---AAAATATCC--AAAT------------ATGAAGCACATCTGTCAGATTCTGTGGTGTT-C-TT----TA-TTTGGAGTTCGTCAGGAT-ATATC-AAATGGA-CATA-ATTATGAAAATTATGATTGTTAATAGATC--AG-ACATC-ACCTATATATCTACA
gi|5 : actatcttatccgaatgacatcaaagattacttgaacgattgtctgtactgcaatatAAATTGGTGAAG-TA----AACAA----T--GT-G--T-T-AAT---CGTAATCATA------GTCCTAA---AAA------CAT--ATTTACA----AAG-T-C--GAGT-GTA-GGGCAAC--AC-GGA----TCT--CC---GACAA-AAG-CGAAG-GCAGGA-TC-A-GG-TGCCA-TAGAG-GA--GTAA----GCATCCTC--TGCTGACC----GG--T-CACAC-CCGC-CA--TGAG---CC-C-T---TA-GTC----G--A---AA-CAA---G--------------GTAAACA-GG-A---TTA-CCC-G----TTGTCA-CATCT-AGTACGAAA--AT--GACA-GTCT-AACAAAA---GGT---AT---GGGAC-AAATCA--GTC-AG-C---A-----T--------TA-A--T--T-T-------ATA-----------A--TC--G----CAA-A--CA-A--GGTC-ATTAT-------ACCGACT-G-T-AGAATT--TGCGACATGGTG---ACTTTA-AA--CGAGAA-TCG---TTAT----AA-T-CCTGCAACAT--CA-AC--TTTTTAGTTAGTAGT-T--GGCCT---CGCT-TTAAAAA----GTCT-T-C--A--TACG-CAT--------GAC-ATGT------------T-CT--T-GCGTATC-TAATC--A-A------CTGCATGGAAA-ACATTCA-CAC--C-AT-AA---GCA---G--GTGATACATTTGTAGTGGT-ACATTA-------------CTA-tatgta
gi|16 : tatactctatatgataatatatgtcttctgaaaccgcttttacatgtttctgtgttggcgacatcggtattttgggctttttcaaaagtttggcttatatttaaaaagttttcttttcatgaatgcatttttttctgtatttttttttattgtatgtagtaaaagatatAAAT-GGCGAAG-TA----A-CAATTAAA--GT-A--TCA-AA----CGTA-TCATA------GTCCCCA---AAA------CAC--AT--ACA----AAA-T-C--GAGT-GTA--GGCAAT--AC-GGA----CCT--TC---GACAA-AAG-CGAAAAGCAGGAATC-AAGG-TGCCA-TGGAG-GA--GTAA----GCATCCTC--TGCTGACC----GG--TCCACAC-CCGC-CG--TGAG---CC-C-T---TA-GTC----G--A---AA-CAA---A--------------GTAAACG-GG-G---TTA-CCC-G----TCGTCA-AATCTAG--ACGAAA--AT--GACA-GCCTAACTAACAAG-GGTATAA-----AAAC-AAATCA--GTC-A------A-----T-------ATG-A--C--T-GA---GTGATAA-TTTG-TA--A--TC--G----CAA-A--CA-A--GGTC-ATTAT-------AGCGACCGG-T-AGAATT--TGCGAAATGATG---ACTTTAAAA--CGAG-ATTCAGT-TAT-----AA-C-CCTGCAca
gi|14 : taAAA--GGCAAAGATA----A-CGA----ACAGTGA--T-C-AATCT-CGTAA-----------GTCCTAA---ATA------GA---AT--ACA----AAAA--CAAGAGTCG----GGCAAT-CAC-GGA---CCCC--TG---GAC-A-CAC-CAGAA-GTGGGA-TC-A-GG-TGCC--TAGGGGGA--GTAA----GCACCCCC--TGTTGACC----GG--T-CACAC-CCGC-CG--TGAG---CC-C-A---TA-GTCTT--G------AT-CAG------------------GTAAACG-GA-----------C-A----TC-----AGT----GTGTGAAA--A---A-CG-G-CTTAAC--AATG-GCT---AT---GAAAC-ACATCA--GAC-AG-C---A-----T-------TTG-A--C--T-CA---ATGATAG-GTCA-T---A--TT--GGT--A-A-A--CT-A--AATT-GTTAC-------AACGACC-A-T-AGAATT--TACGAAATGCTGC--ATTTA--AA--CGTGA---CTGT-TGA-----AACC-CCTGCAACATACCG-AC--TTTT
gi|24 : ggatgtAAA--GGCAAAGATA----A-CGA----ACAGTGA--T-C-AATCT-CGTAA-----------GTCCTAA---ATA------GA---AT--ACA----AAAA--CAAGAGTTG----GGCAAT-CAC-GGA---CCCC--TG---GAC-A-CAC-CAGAG-GTGGGA-TC-A-GG-TACCTA-GGAG-GA--GTAA----GCATCCCC--TGTTGAataaatcatgcactttcttttcaaagtacatgtatatttgcacatgaaat
gi|39 : cactgtgataaatggtagtattaatgtAAAT-GGCGAAG-TATTTTA-CAA----T--GT-G--T-TTAA----CATAATCATA------GTCCAAA---AAA------CAT--GT--AC-----AAAAT-C--GAGa
gi|42 : tttgttataAAAT-GGCGAAG-TA----A-CAA----A--GT-A--T-G-AAC---CGTAATCATAC-----GTACACAGATAAA------CC---AT--A
gi|44 : AAAT-GGCGAAG-TA----G-CAA----A--GT-AT-T-C-AA----CATAATCATA------AT
gi|6 : cgcacatttataT-GGCCAAA-TA----AACAA----T--TTGA--T-A-AT----TGTAATCAAA------ACCCCAA---AA-------CA----T--ACAC---AAAGT-C--GAAT-GTAAGG--AAA-CAC-AGA----CCT--CC---GATAA-TAG-CGAAG-GAATAG-TC-A-GT-CG----------------------GCATCCTC--TGCTGACC----GG--T-CACAT-CCGC-CG--TGAG---CC-C-T---TG-GTC----G--A---AA-CAA---A--------------GTAAACG-GG-A---TTA-CCC-G----TCGTCA-AATCTA-GTAGGAAA--AT--GACA-GTCTAA-CAAA--G-GGTA---T---GAAAC-AAATCA--GTC-AA-C---A-----T-------ATG-A--C--T-TA---ATGACAA-CTTG-T---AA-TC--G----C-ATA--C--AA-GGTC-ATT-----------------------------TGCGAAATGGTG---ACT------------------GT---------AG-C-CCTGCAACAT--CA-----TTTTTTGCTAGTAGT-T--GACCT---CGCT-TTAAAAA----GTC--C-T--CG-TACG-CAT--------GAC-ATG-------------CTCT--T-GCGTATC-GAATC--AAC------T-----GGAAG-ACA-----CACA-C-AC-AATAAGCA---G--GTGA--------TAAGGGTA-CATTA-------------CTA--CA-T--GA-AAAG--GAA-AGG-T-GAC---GAT------TGCA-AAG--------TT-AAAGTC--ATCA-CG------CTTATCATATA-A---TG---CA-GTT--AT-C-AG-----CCTA--C--C-TTTAAAG-TC-AA-TATT--AAGT---AAAAAATCC--AAAT------------ATGAAGCAGATATGTCAGATTCTGTGGTG-TCC-TT----TA-ATACTGG--CGTCA----AAGCTCAAAAT
gi|21 : atagatAA----A--GT-AATT-A--------GTAA-CATA------GTGCCAA---AAA------CATATAT--ACA----AAAA--C--GAGT-GCA-GGGCAAG--AC-GGA----CCT--TC---GACAA-ACG-Ctcttggagcgggaataataaaatatatt
gi|20 : ctattaA----A--AT-A--T-A-AATAGGCGAAGT--TA------ATCCCAA---AAA------CAT--AT--ACA----AAA-C-C--AAGT-GTA-GGGCAAC--AC-GGA----CCT--CC---GACAA-AAG-CGAAG-GCAGGA-TC-A-GG-TGCCA-TGGA-AGA--GTAA----GCATCCTC--TGCTGATC----GG--T-CACAC-CCGC-CG--TGAG---CC-C-T---TA-GTC----G--A---AA-AAAAGCA-------------TG-AAACG-AA-A---TCA------------GTCT-AA-CTATACATG-----AC--T-TA-GT---GATAATATG-CGT--AATCTGGAAAC-AAGTCATTTGC-GA-A---A-----TG------ATG-A--C--T-Tacaaaataaacagggtagcccgtcgtaaaatcttgtacaaaaataagagtctgacaaagggtacgaaacagatcagtcaacacacgacttcgtgataatttgtagtcgcaaacaaggtcattatagcgacagtagaatttgcgaaaggatgat
gi|27 : -A--C-A-AC----CGT--TCATA------ATCCAAA---AAAATG---TAT--AT--ACA----AAAAT-C--GAGTCG--AGAGCAGCGCACTGGACACATCT--TCTGTAATAA-AAGCCGAAtaaattgagtattcgttat
gi|9 : ggcgactgtaCCAAA---AGAAAACCCCA---AC--ACATTACAAATT-C--G--CTGTAAG--CAAC-C---GGG---ACCT--CC---GACAA-AAG----AG-GTAGGA-TC-A-G--TGCACATGGGAGGA--GTAA----GTTTCCTC--TCCCGAC------G--T-CACAC-CCGCGCA--TGACACCCC-C-AAATTA-GAT----G--ACCAAA-CAA------------------GTAAACG-GG-GA--TTAACCC-GGGTTTCA--A-AAT---AGTACGAAATGAC--A-CA--TCTAA-CAAA--G-GGTA---T---GAAAC-AAATCA--GTC-AAAC---A-----T-------ATG-A--C--T-TGCGGATGATAA-TTTG-T---AA-TC--GGGAAC-A-A--C--A--GGTC-ATTATTTCGATAAGC-ACC-GCT-AGAA-TTGC-CGA-----------------------AGAATTCGTTATTA-----A----CCTACAACATA-CA-AC--TTTTTTGTTAGTAGT-TTGGCTCC---CT---TTAAAAGCC--CTC--C-C--A--CACG-CACGA------G-T-ATG-------------C-TC--T-GCGTATC-GAATCAAA-C------C-----GAGAG-ACATtggtttagtgatagttttattgagagaagaaaatggtaagtccactaaccagtca
gi|37 : cccaccccacccccctctggcggcccA------TA---AT--ACA----GAG-T-C--GA--TGTA--GACAAC--AC-AGA----CCTAGT----AACAA-AAGGCGAGG-GCAGGA-TC-A-GG-TGCCAgagagattgtaagc
gi|15 : cccccaacatacatgt---ACCT--CT---AACAA-AGG-CGAAG-G-AGGG-TC-A-GG-TGCCA--GGAG-GA--GTAA----GCATCCTC--TGCTGACC----GG--T-CACAC-CCAC-CG--TGAG---CC-C-T---TA-GTCG---G--A---AA-TAAG--G-------------TATGAACtg
gi|23 : caaatA-ACG-CACAG-GCAGGA-TC-A-GG-TGCCA-TGGAG-GA--GTAA----GCATCCTT--TGCTGACC----GG--T-CACAT-CCGC-CG--TGAG---CC-G-G---TA-TTC----G--A---AA-CAA---A--------------ATAAACA-GG-G---TAA-CCC-G----TCGTAA-AATCT-TGTACGAAA--ATAAG--A-GTCT-GACAAA--G-GGT---AT---GAAAC-AGATCA--GTC-AA-C---A-----C-------ACG-A--C--T-TC---GTGATAA-TTTG-T---AG-TC--G----CAA-A--CA-A--GGTC-ATTAT-------AGCGAaaaatcagtcaacatatggacctttagtgataatttgcaacgcaaacaaggtcattataccgaccattagaatttgcgaaaaatgatgatttttaaacgagatttcgttataacctgcaacattcaactttttttgtttagcagttagcctaagctttaaaaaatctttcattacgcggacatgctcttgctatcgaatcaacttgcggagtaaattacacatcataagcaggatggatagtggtgtattactacttctttcgttacttggataattttattgaacattgac
gi|18 : AG-GCAGGA-TC-A-GGGTGCCA--GGAG-GATCGTAATTGAGCATCCTC--TGCTGACC----GATCT-CACACACCGC-CATCTGAG---CCTT-G---TA-GTT----C--A---AA-CAA---A-------------GCTAAACG-GG-GATTCTA-TCC------TCGTCA-AATCT-AGTACGAAA--AT--G-AA-GGCTAAACACAA-G-GGTT-ATT---GAAAC-AAG-CA-GGTC-AA-C---A-----T-------ATG-A--CT-T-TA---GTGATAA-TTTG-T---A--TC--G----C-A-A--C--A--
gi|11 : gcaaacataaaatgttatgtagattattatcgggacctccaaaaattatagaggtAG-CCAAG---C-A-GG-TGGC--TAGAAGGA--GTGA----GTATC------GC---CC----GA--T-CACAC-CTGC-CG--TTAG---CC-C-----TG-ATCTT--G------AT-CAG---G-------------T---AACGCAA-G---TAA-TCC-G----TAGTCA-AA-CTCAGTATGCAA--AC--G-GATATC-GAAC--AATC-GGTA-AA-----AAGC-Aaaat
gi|36 : tttactcagtatacacatgtatatgtctttgaagtcggttatgatgttcaatgcaacgacatcggtatacatgtacttcaaacgaactacacgtttaccgtgacatcaaagtaaatatatgtttagcggactttttttctgcctatatatagttacggcactggatttcttatgaacaagtgaaaattacgaacagtgactaatctcttagatcctaaattaaaagtactagtatacaaacaaagatccctGG-TCGA-GG-T-CCG-TGAATGAA--GTAA----GCATC-TCGTTGCTGATCCGAGGA--T-CACAC-CCAC-CG--TGAG---C---------A-ATCAAGAG--A---AA-CAG---A-------------ttaggcgtttggtccattgtataacttgtatctgtaaataagatcatt
gi|10 : gatggat--TGAG---CC-T-----TACATC----GTTG---AT-CAG---A-------------T--AAACA-GGTG---CTT-CTT-G------GTAT-AATTTA-GTATGTAA--AG--A-CC-GGCTTAACAA--TT-GG---AAT---GAAAC-GCTTCA--GAC-AA-C---AACCTAC-------ACGTA--C--C-TACAAGTTGTA--TTTG-C---AAAT---G----C-A-AAAT--A--AACC-ATCAT-------AACGACC-A-T-AGAATTTGT---AAAC---------------A--CGAGA-TT--GT-AGA-----AA-CTCCTG-----------------TTTG-TCAGTATCAC--GCCTT---GG---TTTAAGACTTTATC--A-C--AC-TCAG-AATCTGTTTTCG-C-ATT-------------T-CTATT-G-G-ATC--AGTT--A-CATTTTGC-----AGGAG-ACAAA-ATCAC--C-AT-AA---ACAA--G--TGAA---------AATAG-AATATTG-------------CTACATG-A--AT-ACAG--GAA-A-T-T-GAC---GAT------GGAA-AAG--------TT-AAAG--CAATCT-CG------CTTGTCATCAAGA---AG---G--GTTG-TTGT-AAT----T-TG--C--C-TTGAACG-TC-TA-TGTTCAG--T---AAATTATCCA-AA-T------------ATGA
gi|35 : gaacacgtcccggtaaGAG---CC-T-T---TA-GTC----G--A---AAACAG---GGAGGGGGGGCGGTTACGAGCG-GA-G---TTA-CCCTG----TCGTCAGAATCT-AGTACGGAA--A---G--A-G--TGGACAAA--G-GGTA-
gi|21 : A-CAA---A--------------ATAAACA-GG-G---TAG-CCC-G----TCGTAA-AATCTT-GTACAAAA--ATAAG--A-GTCTGA-CAAA--G-GGTA---C---GAAAC-AGATCA--GTC-AA-C---A-----C-------ACG-A--C--T-TC---GTGATAA-TTTG-T---AG-TC--G----C-A-AA-C--AA-GGTC-ATTAT-------AGCGACA-G-T-AGAATT--TGCGAAAGGATG---Atg
gi|1 : ctattaaaagtaattagtaacatagtgccaaaaacatatatacaaaaacgagtgcagggcaagacggaccttcgacaaacgcAAACAGGGTA-TGCA-AA-----AAAC-CAATCA--ATC-AA-T---A-----TCATTTTTATGTAGTC--TCTATT-GTG-TACCTTTG-T---AA-TC--G----C-A-AA-C--AACGGTCCATTAT-------AGCGACC-G-T-AGTATT--TGCGAAATGATG---A-TTT--AA--CGAGAATTCGTT-ATAT----CA-C-CCTGCAACAT--CAGAC--TTTTTGG-TAGTAGT-T--G-CCT---CGCTTTTAAAAA----ATC--ATC--A--TACGACATG-------G-C-ATG-------------CTCT--T-GCGTATCTGAATCA-A-C------T-----GAGAG-ACA-T-A-CACACC-ATGAAC--GCAGCGG--TGGA--------TAGTGGT-ACATTATACATTCTTTGTTCTT-ACT-ATGAA-TAAGTTGAACAAGTT-GACTTGGAT------TGCC-AAGCCTATCCTTC-AAA---TCATCAACGCCCCCCTTTATC-CCTATAACTCGCACC--GCTAGTTGC-AGTGTCGCTTGTTC--CGATTAATG-TCGAA-TATT--T--TGTGGAAATATTTTAAA-TCACTTCATAACAACGAAGCAGATC-GTCAGATTCTGTGGTG-TCC-TT----TACTTTCGAGTT-GTTCGG-TGATTTCAAATGGGACCATACATTATGAAAATCATGATTGTTAATTGATATAAA-ACATCAATCTATATACTTTCAAATATATTTTGTTAGGTTTGCAACTGAGACACGTGCAAGAT-------------TTTTTCGTTGTTTTTTAAAAAATCCCCGTAACAGCCTATTTTGAATCCAAATTC-GCTAGTTGCTAATAGAATTTAGAATCAT-AGTCTG---CCAATATTTAGTGGGGCAACAGACTCATAGTGTCCATAAGGGATA--AT-CACAC--ACTTACCTAGGAATGTTTGGAG-AGAC-AAT-G--GCTACACAATAGACACCAATTACAT-AGTTTATCTATTATTAG--A----ACCCAA---------------AGCATGA-ATA--A-T--TA--ATATC-TTCTTCA-AGAGCACCTTGTATGAGATTAATCAGTTATTGCATTTTGGGGGGTGTTTTGGTTCTTTTCATTCTTATAAACAAAAATATGCATT-TAAATTT-----CCCCAAC-----GACCAGAAACTTGTTACCTTAAGTTCAGGTTTTGCC-G-TTTTGGTGTTGTTCCAAACCCTTGAAACCAATTAATCACTTTT--CAA-TTCTCGAAAAA-GCGCCCT-GGATAATT-TTAATTTCAT-TGTGAGAAGAATTGTTGTAATATTGGGTTAGTAGAGCTCGGGGCAGAAATCAATAAGATATTGAATGCAGTCAATTGTCTCAGCATTGAAAACAACTCTCGTGATTTAAAGTTGTTTTAGTATAAAGCTGGGCTTTTAGAAGGGGCATTTTCACCGT-GAGA-ATT--CAATCTTTGAATTGACACCA-TTCTGGAATA-TGTAG-CGG-AATAGTATATCC-TGATATTCTGACTCT--T-TTAACAGCGCTGTTCAAGCTAGTTTAAGCTTTTTAGTATGACAATCTTTTAAGGTA----------TAAGA-G---------------GGGTCACT------T---GGTATGATCACTATTTCTGGAACCGCCAGCGACTACT-AACTACTT-TTTGTTTTGTAAGGA-TCTCACTTTATTGC--ATTT-CCG-----GAGT-CAGT----------AAGGT-ATGGGAATTTCAAGTTGGTCCCTCGT-CCTTCGG--AATATTGAAAGTAT-TTACAAACAGAAAGTT-GATTTTGAA-GAATTTTC-ATCTTTAGTAAAGGTTGCTTGTA-GTAAT-AAGT----AAGATTCTCCAACCTGTTCTGA--AGTA-AACCT--AGTTC--TTTAAAAGC-ACAAGTATAA-AGTA----AA-CTTTT--AACAAACGGA-----AAGCACCATAGC-TGTAA-TC------------AGTGTACTTT-TGCTC-TCT----TCTGTTAC----GCCTCTACTGTA--------TAA--CTTATTTACCCCCTTCTGTTTGCT-TCTCTCGTT---GACAGAAATTAAGGATAAA-AGTCC-G--CTTTTTTCCAACGC-----TAAATGGTTAATA---TGGAATTTGTTACAAATAAGGTTTT----T-ACTTTt
gi|15 : tttcaaactaccataccggaaaaAAATAAGGTA---T---GAACA-AAATCA--GTC-AA-C---A-----T-------ATGGA--CCTT-TA---GTGATAA-TTTG-C---A--AC--G----C-A-AA-C--AA-GGTC-ATTAT-------ACCGACC-A-TTAGAATTTGCGAAAAATGATG---ATTTTTAAA--CGAGATTTCGTT-ATA-----A----CCTGCAACATT-CA-ACTTTTTTTGTTTAGCAGT-T--AGCCTAAGCT---TTAAAAA----ATCTTT-C--AT-TACG-CGG--------A-C-ATG-------------CTCT--T-G-CTATC-GAATCA-A-CTTG---C-----G-GAGTAAATT-A-CACATC-AT-AA---GCA---GGATGGA--------TAGTGGT-GTATTA-------------CTA-
gi|20 : caaatacctctaacaaaggcgaaggagggtcaggtgccaggaggagtaagcatcctctgctgaccggtcacacccaccgtgagcccttagtcggAT---GAAACGAAATCA--GTCTAA-CTATA-----C-------ATG-A--C--T-TA---GTGATAA-TATG-CGTAA--TCTGG----A-A-A--C--A--AGTC-ATT-----------------------------TGCGAAATGATG---ACTTT--AAATTGAGTATTCGcttctttcgttacttggataattttattgaacattgac
gi|46 : aaatataaataggcgaagttaatcccaaaaacatatacaaaaccaagtgtagggcaacacggacctccgacaaaagcgaaggcaggatcaggtgccatggaagagtaagcatcctctgctgatcggtcacacccgccgtgagcccttagtcgaaaaaaagcTTTTGGTTAGTAGA-T--GGCCT---CGCT-TTAACAA----ATC--ttat
gi|22 : TATC-TAATC--AAC------T-----GGGAG-ATAT--G-CATA-CCAT-T-T--GCA---A--GGGA--------TAGTGGTA-TATTA-------------CTA--CA-A--AG-ACAG--GGA-AAGCT-GAT---GAT------TG-C-ATT--------TTTAAAGTC--ACCAA-G------CTTATCATATA-A---TG---TA-GCT--GTA--AGT----C-TG--C--C-ATTAGAG-CC-AA-TATT--AAGT---AAAATATCC--AACT------------AAGAAGCAGATTTGTCAAATTCTGTGGTC-TCC-TT----TA-TTTTGAGTTCGTCGGG
gi|32 : CATT---CAC--C-AT-AA---GCA---GG-TGGA--------TGGTGGTA-TATTA-------------CT--ACA-T--AG-AAAG--GGA-AAGTT-GAC---GATAGCCGATAGCAAAG--------TT-AAGGT--CATC-ACG------CTTATC
gi|31 : tatcctTC-A-CAC--C-AT-AA---GTA---GG-TGG---------TAGTGGTA-TATTA--------------TC-ACA-T--TG-AAAG--G-----------C---AA-------------AG--------TT-AAAGTC--ATCT-TG------CTTATCATATA-A---TG---CA-GTT--GT-C-AGT-----GTG--T--C-ATTAG
gi|30 : cttatACATTG-------------TTA-ACT-A--CATAAAA--GAA-ATT-T-G-C---AA------------AAC--------TC-AA-GTC--ATCA-CG------TTTATCATATA-A---TG---TTAGTT--GTCCAAGT----CCTG-----C-ATTAGAGATT-AA-TATT--A--
gi|47 : -AAGG--GGA-AAT-T-GAC---AAT------TGCA-AAG--------TC-AAAGTCaaggaagtgttcatggaata
gi|49 : --AA-T------------ATGAAGCACATCTGTCTGATTCTGTGat
gi|7 : aGTCAGATT--GTGTTG-T-C-TT----TA-TAT-GAGTTT-TCGGGATA-T-TCCAAAT------TA-AT---G-CCCTTGTTATTGATAGCAGAT---A---------TCTATAT-CCTATATATA---------AGG-TTG-A-----GACAA-AGCAGGGAGTTTTTTTTTTTTTTTTTTG----TTTTTAT------CCCG-TAAAGTTT-T--TGTA-GCAAATTCTGCT--T-CAT-ATGTAATATTCAG---TAAGTCTGGTGCCAATA---AA-GGGGCA--A---T--TAGTGCCACTA--GGA-ATGACGCA-ACGGA---------GAATTGTTTGAT-CGAC--CT-GTCTCTCC----ACGACTACAT-AA-ATAA-TT--TCTGT-A--AGAAACTCTACTC-ATCATGATGTCATGTTATC---ATTTGTTC-TAATAATATATCCTACTTCAGAGAGTA-CT--TGTGGG--C-ATCA----------------GAGTG----TTTT---------TTAA-ACA----AATATGTGTCTT--GTTTTTCCGCCCCAATCCCCGAACTAGAAA--TATTA--TT---TTCGGG---GGTC-ATTTTT----TTGTTT---------AACCAC-ATT---------T--CGATAATCTGAAAAG------CT-AGAT--TTAT--ATTTT
gi|28 : taagatataaaacggtcagctactaaggattgtgtggtgtGTCAGTGTCTGTGGTG-T-C-CTGAATTA-TATTAAGTTCTTCGCGATA-TATCAAA-TGGA-TATA-ACTGTGAAAATTATGATTGTTAATTGAT---AGCACATC-taatgtga
gi|41 : t---AG-ACATC-ATCTATATATCTATATGTA---------ATG-ATG-AA---GGACAC-AGTAAG---------------TTTTTTG----TTTaccgcaagtttttgtttttattccgtaacaggttttgaacaaatt
gi|28 : CAC-CGCAAG---------------T-TTTTG----TTTTTAT------TCCGTAACAGGTT-T--TG-A-ACAAATT
gi|34 : tgtcagtgtctgtggtgtcctgaattatattaagttcttcgcgatatatcaaatggatataactgtgaaaattatgattgttaattgatagcacatCAATA---AG-GGGGCACAA---T--TAGTGCCCGTT--GGA-AT-AT-CA-AC------------GGATTGTT--AGTAGAC--ATGGT--CTCC---AAAGACTACAC-AA-AT-A-TT-ATTTATAA--
gi|17 : A--AG-AA----ACCC-A---------------AGC-----ATGCTCAT--TA--ATATCTAACTTC--AGAGTA-CTTGTGTGGG--CAATCA----------------GA--G----GGTT---------TTCAACAA----AATATGTGTCTT--GTTT-----CCC-AAC-----GACTAGAAA-TTCGTA--TT---TTCGGG---TGCCGG-TTTT----TTGTTTA--------AAAAGCAATTA--------TTATAAT----TGAAAAAGG---CCTAAGAT--TT-TA-ACTTTAT-CG-GAG--GAATCGTTGTG------------TAAAG--T-GTGGAGAAATCTACGT--TTTTG-ATGCAGTCAATT---TTTG----AAAAT----TCTTGT-ATTgctaa
gi|13 : aatcgaccaattgttgctaccatatgttttcctaatgatTAGA------GTTTT-----TTGATATATCCCCA-TC--GGTATGA-CACCA-TTCTGGAATAATGTAGGTGGA--CAG--TATCTCTGAAA---AGA--CTGTT-TTAACA--GCTGTTT-AG-TAGTT-----TAGTT--TA-GAT-------TAAGGAAGAGGCTTGGTT-AGA-GCACTTACTTGAACTAG------CATATATT---GGTAGAG-CAC--TTACTGGAA---C-AGC--ATA-T-A-----TC-TTTG--TTGTAAGGA-ATTG---TTA-T---TGTTAATTC-----GAATCCAGTTA--------AAGGTCATTGTAA-ATCAAATTGAT-CCAGAT-TCTTCGG-AA-TATTGAAAGTAT-TC--AAACAGAA-GGT-GAATTTG-AAGA--ATTCTATC-TTAGT-CAGATTGCTTGGAGGTATATAAGT-----AGATTCCCAGATGCT---CGA--AGTA-CACCCTTAGTC--ATCTTAAAAG-ACAAGTACAG-AGT-----CAGCTCTAGTTACAA
gi|12 : agtgATCA-TGAAG---TGA--CG--TCTTAACA--GCAGTT--A---------------CTAGTA---------------GGA----------T-AGAGG---------------G------C------TGCGGGTAGAG-C-C--TTAGT-GAA---CCAGCG-ATG-TAA-----TCATTCTGTTTG-AAGGAGTTTT---TTA-TGCA------TCGAAAAAAAATCCAAT-ATAAAAAACAAGGT-ATGGTAA-TTTCAATTGAT-CCTGATGTCTTTGGAAAATATGAAGCAAATGTT-TAAACA-AAAGGTGGATTTGA-A-GAAGTATC-ACT-TTAGT-CAGATGTCTTGGA-G--TA-AGATTAGTA----TTCCAAATGAC---TGA--AGTG-AATCCT-AGTTACAGTTAAAAGGCATAAGTAT-GTA-T-----GA-CTATT--TATCAAC--AC----AAG----ACAAA-TGTGAATC------------ACTTGGCTTTAT-CAG-CT--GAACTA-TATCAA-AGTTTTCA-TGTGCGTCT-T-TAA--C-CATTTACACACGTC-----GCTCTG-----TAAA-GACAG-----AAGGCTA
gi|25 : tccTGTG---TGATAAGTATAACCCTA-GTTCA-TTTATAAAG-ACAAGTATAATATTTTCTGGC-CCCTA---ACAAAA--AAATTCAAG----ACAAATTGAC--TTTGTAACATCTTAACTCTGTTTCA-ACTGTCCTGTAA----TAGCAATAGTTCTC--------TC---GTAAGGCTCATTTTACCACTTCTG---
gi|29 : --CTCATT-ACAC--TTCTG---GCT-TT-----TTAAAGACA-------AGGATAAATAGT-ACGCCATTTTCCT---CGCGCGCTTAAA--GTTTTAATTACGG-ATTT----TAATTA---CTTCCGAATTAATTTTGATCATTTCAGACAAAGTATTCAACTC-CTCTCCC
gi|38 : --ATTTTCCC---CGC-----TAAATGG-------------ATTT----TAA-TCA--TTTCCGAAT-ATTTGTATCCA-TTCAGACAAAGTG-TCAAGCTCCTCTCCCT
7 sequences could not be aligned to this particular reference sequence:
Unaligned ( gi|19 ): TTAGATACTGTTGGAGACAATATTGGTTGCTCACCGAAAGAATGAAAAGTGAAGATAACGTAACAGTGATCCATCTCATAAATCCCATAAAGAATATAAAACTAAGGCAAACACGAACCCTTGCATATACCGGAGGTGGGATCAGGTTTTTTTTAAAAGAGGGATAAGCACCCCTTGTTGACCGTCCACTCGCATTATACCCTCTATCTTGATCAGGTAAACTGAGTAATCTGTAGGTCAAGAACGAAATAAATGTTGATGCATT
Unaligned ( gi|26 ): AATTTGCGAAATGATAAGACAGGATTTAAGGCGACAACAATAAAAATTTTTAGAATTTAGTCAGTGGCCTCGACCTGATAAGAAAAAAATATCAAAAAATATACGCACGTGGTATATGACCCTCTGCGCGACGAATCAATCTGATGAGACGATACA
Unaligned ( gi|33 ): GTTTTTGCGTTGGTGACATCAGAATTTTGGATTTTTTCAAAACTTTGGCAGTGACTGGCTTATCATATTTAAAAAGTTTTCTTTTCATGAATGCATTT
Unaligned ( gi|40 ): TTAAAAGTGAAGATAACAAACAGTGATCTATGTCATAATTCCTATAAAAAATTGAAATCTAA
Unaligned ( gi|43 ): GATCTGAGGTCCAGGGGTGATGAATATAGCATACTTCCATGTTGATTGATT
Unaligned ( gi|45 ): TATTAAGTGATGCCATACATAGAGGATCTTGAATGAGT
Unaligned ( gi|48 ): TAGTCGATACTAAAATTCATGCTCATTTGAT
Alignments
lowQualScore : 111111111111 11111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111
lowQualScore : 111111 1111111 22222222222222 111111 22 111111111111111 1111111111 111111111111 22 3333333333333333333333333333333333 1111111 1 22222 11 22 11 1111111 1111111 3333333333333 444444444444444444444444444 33333333333 1111 11 1 11111 111 11111111 11 1111111111111 11 11 111111 11111111 22 111111 22222222222222 11 222222222222 1111111 222222 111 1111 555555555555555 222222 2222 222 1 1 22222 111 111 11111 111 444444444444 1111 11111111 11111 222222 11111 666666666666666666666666 1111 11 111 11 666666666666666666666666 44444444444444 11 22222 2222 1 22 11 111 111 111 2222 555555555555 1 6666666666666666666666 222222 1 111 11111 11 11 11 000000000000 333 22222 11 444444444 22 2222 11 2222 222222 5555555 2 111111111 1 1 2 22 22 1 111 3333 33333333333 77777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777 111 1 11 2222 33333333333 1 11 1 11 1 1111 11 4444444444444444444 3333333333 1 1 1 1 11 1 111 111 1 111 111 1 1 1 111 22222 111 11 222222222 1 1111 444444444444444444444444444444444444444 7777777777777777777777777777777777777777777777777777 11 111 1 333333333 22222 333 111 22222 2222 33333 1 1 2 2 222
lowQualScore : 6 6 333333 4444444 55555555555555 3 777777 2 2 444 444444 33 33 88 2 2 1 11 2 2 5555 2 444 4 2 6666 4 2 2 2 555 2 2 2 2 2 8888888 333333333333333 2 5555 33 2 2 5 33 2 4444444444 6666 333 2 222 333333333333 333 33 2 2 666 2 2 5555 1 2 11 66 6666666666666666666666666666666666 33 33 2 55555 0000000 2 4 33 55 2 9999999 2 2 2 5555 5 2 66666 88 2 9999999 3 6 2 33 33 2 777 3 0 88 3 55 55 6666 0 3 3 11 8888888 1 555 44 3 0 3 4444444 77 1111111111111 3 3 3 999999999999999999999999999 3 3 3 44444444444 666 3 4444 77 0 3 11111 222 22222222 88 6666666666666 99 3 2 2 3 44 3 44 44 00 6 555 222222 3 22222222 44 22 000000 4 66 4 66666666666666 88 4 22 555 99999 4 5 5 5 0 5 4 777 222222222222 0 1 2 888 5 5 4 11 99 3 7 3 6 6 3 3 1 8888888 5 888888 111 8 8 4444 77 333333333333333 99 333333 0 8 0 8 3333 8 8 3 999 0 0 44 22222 3 777 444 8 8 33333 1 8 88 222 8 333333333333 3 4444 66666666 5 0 77777 333333 0 0 8 777 77777 222222222222222222222222 4444 11 6 999 8 0 11 0 999999999999999999999999 55555555555555 66 2 3 33 55555 8 1111 0 33 44 33 777 777 444 1111 111111111111 1 0 8888888888888888888888 666666 0 777 22222 33 66 3 11 0 111111111111 0 111 1 1 1 44444 1 44 222222222 33 2 3 4444 88 2222 888888 6666666 1 3 888888888 1 4 3 3 44 22 9 0 777 2222 11111111111 77777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777 777 0 3 33 2 0000 2 66666666666 0 22 0 33 3 0 8888 22 2 6666666666666666666 2 7777777777 3 0 0 0 0 88 0 777 999 55 0 111 3 444 0 0 0 777 44444 0 2 4 444 11 8 8 8 0 8 88 8 444444444 6 1 3333 777777777777777777777777777777777777777 1 2222222222222222222222222222222222222222222222222222 11 0 8 0 8 0 0 444 0 1 222222222 2 55555 0 7 888 777 55555 1111 3 22222 3 7 3 1 11 3 3 999
lowQualScore : . . ...... ....... .............. . ...... . . ... ...... .. .. .. . . . .. . . .... . ... . . .... . . . . ... . . . . . ....... ............... . .... .. . . . .. . .......... .... ... . ... ............ ... .. . . ... . . .... . . .. .. .................................. .. .. . ..... ....... . . .. .. . ....... . . . .... . . ..... .. . ....... . . . .. .. . ... . . .. . .. .. .... . . . .. ....... . ... .. . . . ....... .. ............. . . . ........................... . . . ........... ... . .... .. . . ..... ... ........ .. ............. .. . . . . .. . .. .. .. . ... ...... . ........ .. .. ...... . .. . .............. .. . .. ... ..... . . . . . . . ... ............ . . . ... . . . .. .. . . . . . . . . ....... . ...... ... . . .... .. ............... .. ...... . . . . .... . . . ... . . .. ..... . ... ... . . ..... . . .. ... . ............ . .... ........ . . ..... ...... . . . ... ..... ........................ .... .. . ... . . .. . ........................ .............. .. . . .. ..... . .... . .. .. .. ... ... ... .... ............ . . ...................... ...... . ... ..... .. .. . .. . ............ . ... . . . ..... . .. ......... .. . . .... .. .... ...... ....... . . ......... . . . . .. .. . . ... .... ........... ................................................................................ ... . . .. . .... . ........... . .. . .. . . .... .. . ................... . .......... . . . . . .. . ... ... .. . ... . ... . . . ... ..... . . . ... .. . . . . . .. . ......... . . .... ....................................... . .................................................... .. . . . . . . ... . . ......... . ..... . . ... ... ..... .... . ..... . . . . .. . . ...
lowQualScore : 7 7 999999 2222222 55555555555555 2 222222 7 5 444 888888 44 44 44 7 7 7 00 5 4 0000 4 111 7 2 9999 4 4 4 4 333 4 4 1 1 1 2222222 000000000000000 2 0000 22 4 5 0 22 2 2222222222 9999 999 1 555 666666666666 999 11 4 4 555 4 4 0000 8 4 88 55 6666666666666666666666666666666666 22 22 4 99999 0000000 4 7 22 66 4 3333333 5 5 5 3333 0 5 44444 44 7 3333333 1 2 9 99 99 9 999 3 3 88 1 88 88 5555 8 3 3 22 8888888 0 888 66 3 2 3 2222222 99 4444444444444 6 6 6 777777777777777777777777777 6 6 3 22222222222 000 3 9999 33 0 3 77777 555 11111111 33 9999999999999 44 6 6 0 3 66 3 66 66 88 7 888 999999 3 11111111 66 44 555555 4 11 4 11111111111111 99 4 22 222 66666 4 0 0 0 4 0 4 888 888888888888 7 7 5 888 0 3 3 44 00 5 5 5 7 7 2 2 7 4444444 7 333333 777 0 0 8888 77 333333333333333 22 000000 8 0 8 0 0000 0 0 2 222 0 8 22 22222 2 555 000 0 0 00000 0 0 88 444 0 888888888888 8 6666 44444444 0 8 88888 000000 8 8 0 555 88888 888888888888888888888888 8888 00 0 444 0 8 00 8 888888888888888888888888 00000000000000 66 5 2 88 00000 8 2222 0 22 00 88 555 555 000 2222 888888888888 0 0 5555555555555555555555 222222 0 555 00000 88 55 2 33 7 777777777777 7 000 0 0 0 33333 0 77 000000000 00 5 0 0000 00 5555 000000 7777777 0 7 000000000 0 0 3 7 00 77 2 8 555 2222 00000000000 88888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888 555 0 2 88 5 0000 5 55555555555 0 00 0 22 2 0 5555 55 0 5555555555555555555 5 2222222222 2 0 0 0 0 88 0 555 555 88 0 000 2 888 0 0 0 222 55555 2 5 6 000 00 0 0 0 8 0 88 0 000000000 0 4 4444 888888888888888888888888888888888888888 0 5555555555555555555555555555555555555555555555555555 00 8 0 8 8 6 8 000 0 0 888888888 5 00000 8 3 777 555 00000 2222 2 00000 3 7 3 0 77 7 7 777
consensus : AAAT-GGCGAAG-TA----A-CAA----A--GT-A--T-A-AA----CGTAATCATA------G-TCCCAAAA-A---CAT-----AT--A--CAAAA--TCGAGT-GTA-GGGCAAC-CAC-GGA-C----CTC-C---G-ACAA-A----AG-CGA-A-G-G--CAG-GA-TCA-GG-TGC-C-----A-TGGAGGG-----A--------GTAAGCATC-CTCTGCTGACC----GG--T-CACAC-CCGC-CG--TGA-GCC---C-----TTAGTC----G---AAA-CAA-A-G------------T---A--AACG-GG-G---TT-ACCC-G----TCGTCA-AATCTAAGTACGAAA--AC--G-CA-GTCTAAACAAAATG-GGTA-AAT---GAAACAAATCA--GT--C-AACA-----T-------AT-G-A--C--T-T---A---GTG-ATAA-TTTG-TAATCG----CAA-A--CA-A--GGTC-ATTAT-------AGCGACC-G-TAGAATT-TG--CG--AA-ATGATG---ACTTT--AA-CGAGAATTCG-TTTA----TAACCCTGCAA-CA-T--CA-A--C--TTTTTGG---TT--AGT-AGTTGGCCT-CGCTTT-------AAAAA--ATC--T--C-------A-T-ACG-CAT--G-----CATG-------------C-CT-T-GCGTATC-GAATCAA---C------TG-A-GAG-ACAT-TA-CACA-C-A-TAA-----GCAGG--TGA--------TAGTGGTAACATTA-------------CTA-AC-ANAGA-A--A-G--GAA--AGNT-GAC---GAT------T-GCAAAG--------TCAAAGTC--ATCAACGC------TTATCA-T--ATA-A--------------TG-TAGTTGT-C--AGT-C-TG--C--C-ATTAGAG-TC-AA-TATTAAGTA-AAATATCC-A---AAT------------ATGAAGCAGATCTGTCAGATTCTGTGGTGTCCT---TTA-TTTCGAGTTCGTCGGGATAATATCAAAATGGAC-ATA-ATTGTGAAAATTATGATTGTTAATTGAT-A---G-ACATCA-TCTATATACCT------ATAT---GTAAGGTT-G-AA---GGACACG-GCAAG---------------TTTT--TTGTTTTT------ATCCC-GTAACAGTTT-TTTTGAA-ACA-AATTCTGCT--TTCATA-TGGAATATANAA--A--TAAGTC---TGCCAATA---AG-GGGGCA-CAA--T--TAGTGCCCNTA-GGAAT-A-C-CA-AC--A---------GAATTGTTGGANA-GAC--A-TGGTCTCTCCAA-A---GAC------TACATAAATATTA-TCTATAA-G-AAA----ACCCA---------------A-GCAT--ATGCTC-T--TA--ATATCTTACTTCA-AGAGTAC-TTGTGTGGG--CAATCAG----------------AGTG----GGTTCTN-------------ACAAAAATATGTGTCTTG--TTT-----CCCCAA----CG-ACCAGAAACTTGNTA--TT---TTCGGGT---GCC-G-TTTT----TTGTT---------T-AAAANCA-ATTA--------T--CAAT--TC-TGAAAAA-GC---CT-AGAT---TT-T-A-TTTT--ATC-GTGAGAGGAATCGTTGTA-----------GTAAAGT--GGTGGAGAAATCNATATG-TTTTGAATGCAGTCAATTGTCTCAGCATTGGAAACAANTCTCGTGATTNAAAGTTGTTTTNGTATAAAGCTGGGCCTTTAGAAGGGGCGTTTT-----TTGAGA-ATCC-CAATCTC-GAAT-GACACCA-TTCTGGAATA-TGTAG-CGGAA-CAGTATATCNTGAAGT---GAC-T-TTTTAACAGC--TGTTCAG--TAGTTT-------T--TAGT--A-GAC-------TAAGGGA----------TA-GAG---------------GG-----C------TG---GTA-GAGCACT--TACTGGAACC---AGCGA----TG--TA-TC-TTT-G-TTT-GTAAGGA-TTTC---TTAT-GCGT---T---TC-GGAA-----TCCAGT-A--------AAGGT-ATGGTAATT-CAAATTGATCC-TGAT-TCTTCGGAAATAT-TGA---AAGTATTT-CAAACAGAAAGGT-GATTTTG-A-GAATT-T-CATCTT-AGTCA-GATTGCTTGGA-GTATA-AAGT----AAGATTCCCAGATGTGT---GA--AGTA-AACCC-T-AGTT-C-ATTTAAAAAG-ACAAGTATAATA----GTGA-CTCT--TTACAAAC--A-----AAG----ACAAA-------TGTG-NATC---ACTNTGCTTTAT--GCTGTC---T--AACCA-TANCAA-AGTTTTCACGT-G----TC----TAA--CTCA-TTTACNCACTTCTG---GCT-TCT-----TAA-GACAGAA-----GGATAAATAGT-C-CGATTTTCCCC---GC-----TAAA----TGGTTAC----GGATTTT-AATNATTTCCGAAT-ANTTTTGATCA-TTCAGACAAAGTG-TCAAGCTCCTCTCCCT
Reference ( family-568 ) : AAAT-GGCGAAG-TA----A-CAA----A--GT-A--T-A-AA----CGTAATCATA------G-TCCCAAAA-A---CAT-----AT--A--CAAAA--TCGAGT-GTA-GGGCAAC-CAC-GGA-C----CTC-C---G-ACAA-A----AG-CGA-A-G-G--CAG-GA-TCA-GG-TGC-C-----A-TGGAGGG-----A--------GTAAGCATC-CTCTGCTGACC----GG--T-CACAC-CCGC-CG--TGA-GCC---C-----NTAGTC----G---AAA-CAA-A-G------------T---A--AACG-GG-G---TT-ACCC-G----TCGTCA-AATCTAAGTACGAAA--AC--G-CA-GTCTAAACAAAATG-GGTA-AAT---GAAACAAATCA--GT--C-AACA-----T-------AT-G-A--C--T-T---A---GTG-ATAA-TTTG-TAATCG----C-A-A--C--A--GGTC-ATTAT-------AGCGACC-G-TAGAATT-TG--CG--AA-ATGATG---ACTTT--AA-CGAGAATTCGNTTTA----TAACCCTGCAA-CA-T--CA-A--C--TTTTTGG---TT--AGT-AGTTGGCCT-CGCTTT-------AAAAA--ATC--N--C-------A-T-ACG-CAT--G-----CATG-------------C-CT-T-GCGTATC-GAATCAA--AC------CG-G-GAG-ACAT-TA-CACA-C-A-TAA-----GCAGG--GGA--------TAGTGGTAACATTA-------------CTA-AC-AAAGA-A--A-G--GAA--AANT-GAC---GAT------T-GCAAAG--------TCAAAGTC--ATCAACGC------TTATCA-T--ATA-A--------------TG-CAGTTGT-C--AGT-C-TG--C--C-ATTAGAG-TC-AA-TATTAAGTA-AAATATCC-A---AAT------------ATGAAGCAGATCTGTCAGATTCTGTGGTGTCCT---TTA-TTTCGAGTTCGTCGGGATAATATCAAAATGGAC-ATA-ATTGTGAAAATTATGATTGTTAATTGAT-A---G-ACATCA-TCTATATACCT------ATAT---GTAAGGTT-G-AA---GGACACN-GCAAG---------------TTTT--TTGTTTTT------ATCCC-GTAACAGTTT-TTTTGAA-ACA-AATTCTGCT--TTCATA-TGNAATATANAA--A--TAAGTC---TGCCAATA---AG-GGGGCA-CAA--T--TAGTGCCCNTA-GGAAT-A-C-CA-AC--A---------GAATTGTTGGAGA-GAC--A-TGGTCTCTCCAA-A---GAC------TACATAAATATTA-TCTATAA-G-AAA----ACCCA---------------A-GCA---ATGCTC-T--TA--ATATCCTACTTCA-AGAGTAC-TTGTGTGGG--CAATCAG----------------AGTG----GGTTCTN-------------ANAAAAATATGTGTCTTG--TTT-----CCCCAA----CG-ACTAGAAA-TTNTTA--TT---TTCGGGT---GCC-G-TTTT----TTGTT---------T-AAAANCA-ATTA--------T--CGAT--CC-CGAAAAA-GC---CT-AGAT---TT-T-A-TTTT--ATC-GTGAGAAGAATCGTTGTGATATTGGGTTAGTAGAGCTCGGNGNAGAAATCNACGNGATNTTGAATGCAGTCAATTGTCTCNGCATTGAAANCAACTCTCGTGATTTAAAGTTGTTTTAGTATAAAGCTGGGCTTTTAGAAGGGGCGTTTTCACCGTTGANATATCCCCAATCTTNGNATNGACACCA-TTCTGGAATAATGTAGGCGGAAACAGTATATCNTGAAAT---GAC-T--TTTAACAGC--TGTTCAG--TAGTTT-------T--TAGT--A-GAC-------TAAGGNA----------TA-GAG---------------G------C------TG---GTA-GAGCACT--TACTGGAACC---AGCGA----TA--TA-TC-TTC-G-TTT-GTAAGGA-TTTN---TTAT-GCGT---T---TC-GGAA-----TCCAGT-A--------AAGGT-ATGGTAATT-CAAATTGATCC-TGAT-TCTTCGGAAATAT-TGA---AAGTATTT-CAAACAGAAAGGT-GATTTTG-A-GAATT-T-CATCTT-AGTCA-GATTGCTTGGA-GTATA-AAGT----AAGATTCCCAAATGCGT---GA--AGTA-AACCC-T-AGTT-C-ATTTAAAAGG-ACAAGTATAGTA----GTGA-CTCT--NTACAAAC--A-----AAG----ACAAA-------TGT--NATC---ACTNTGCTTTAT--GCTGCC---T--AACC--TANCAA-AGTTTTCATGT-G----TC----TAA--CTCA-TTTACNCACTTCTG---GCT-TNT-----TAA-GACAGAA-----GGATAAATAGT-CNCGATTTTCCCC---GC-----TAAA----TGGTTAC----GGATTTT-AATAATTTCCGAAT-ANTTTTGNCCATTTCAGACAAAGTGTTCAANCCCCTCTCCCT
gi|1 : AAACAGGGTA-TGCA-AA-----AAACCAATCA--AT--C-AATA-----TCATTTTTAT-GTAGTC--TCT---ATT-GTG--TACCTTTG-TAATCG----C-A-AA-C--AACGGTCCATTAT-------AGCGACC-G-TAGTATT-TG--CG--AA-ATGATG---A-TTT--AA-CGAGAATTCGTTATA----TCACCCTGCAA-CA-T--CAGA--C--TTTTTGG---T---AGT-AGTTG-CCT-CGCTTTT------AAAAA--ATC--AT-C-------A-T-ACGACAT--GG----CATG-------------CTCT-T-GCGTATCTGAATCAA---C------TG-A-GAG-ACAT--A-CACA-CCA-TGAACGCAGCGGT--GGA--------TAGTGGTA-CATTATACATTCTTTGTTCTT-AC-TATGA-ATAA-GTTGAACAAGTT-GACTTGGAT------T-GCCAAGCCTATCCTTCAAA-TC--ATCAACGCCCCCCTTTATCCCT--ATA-ACTCGCACCGCTAGTTG-CAGT-GT-C---GC-T-TGTTC--CGATTAATG-TCGAA-TATTTTGTGGAAATATTTTA---AATCACTTCATAACAACGAAGCAGATC-GTCAGATTCTGTGGTGTCCT---TTACTTTCGAGTTGTTCGG--TGATTTCAAATGGGACCATACATTATGAAAATCATGATTGTTAATTGAT-ATAAA-ACATCAATCTATATACTTTCAAATATATTTTGTTAGGTTTGCAACTGAGACACGTGCAAGATT------------TTTTCGTTGTTTTTTAAAAAATCCCCGTAACAGCCTATTTTGAATCCA-AATTC-GCTAGTTGCTAATAGAATTTAGAATCA--TA-GTC---TGCCAATATTTAGTGGGGCAACAGACTCATAGTGTCCATAAGGGAT-AAT-CACAC--ACTTACCTAGGAATGTTTGGAGA-GAC--AATGG-CTACACAATA---GACACCAATTACATAG-T-TTA-TCTATTA-TTAGA----ACCCA---------------AAGCATGAATAAT-----TA--ATATCTT-CTTCA-AGAGCACCTTGTATGAGATTAATCAGTTATTGCATTTTGGGGGGTGTTTTGGTTCTTTTCATTCTTATAAACAAAAATATGCAT-TTAAATTT-----CCCCAA----CG-ACCAGAAACTTGTTACCTTAAGTTCAGGTTTTGCC-G-TTTTGGTGTTGTTCCAAACCCTT-GAAACCA-ATTAATCACTTTT--CAAT--TCTCGAAAAA-GCGCCCT-GGATAATTT-T-AATTTC--ATT-GTGAGAAGAATTGTTGTAATATTGGGTTAGTAGAGCTCGGGGCAGAAATCAATAAGATATTGAATGCAGTCAATTGTCTCAGCATTGAAAACAACTCTCGTGATTTAAAGTTGTTTTAGTATAAAGCTGGGCTTTTAGAAGGGGCATTTTCACCGT-GAGA-ATTC--AATCTTTGAATTGACACCA-TTCTGGAATA-TGTAG-CGGAA-TAGTATATCCTGATATTCTGAC-TCTTTTAACAGCGCTGTTCAAGCTAGTTTAAGCTTTT--TAGT--ATGACAATCTTTTAAGGTA----------TAAGAG---------------GGGTCACT------TG---GTATGATCACTATTTCTGGAACCGCCAGCGACTACTAACTACTT-TTT-G-TTTTGTAAGGA-TCTCACTTTATTGCAT---T---TCCGGAG-----TC-AGT-A--------A-GGT-ATGGGAATTTCAAGTTGGTCCCTCGT-CCTTCGGAA-TAT-TGA---AAGTATTTACAAACAGAAAGTT-GATTTTG-AAGAATT-TTCATCTTTAGTAAAGGTTGCTTGTA-GTAAT-AAGT----AAGATTCTCCAACCTGTTCTGA--AGTA-AACC--T-AGTT-C--TTTAAAAGC-ACAAGTATAA-A----GTAAACTTT--TAACAAACGGA-----AAGCACCATAGC-------TGT--AATC---AGTGTACTTT-T--GCTCTC---T----TC--TGTTAC--GCCTCTAC-T-G----TA----TAA--CTTA-TTTACCCCCTTCTGTTTGCT-TCTCTCGTT---GACAGAAATTAAGGATAAA-AGT-C-CGCTTTTTTCCAACGC-----TAAA----TGGTTA
gi|10 : tttcaaactaccataccggaaaa--TGA-GCCTTAC-----ATCGTT----G---AT--CAG-A--------------T---A--AACA-GGTG---CT-TCTT-G------GTAT-AATTTA-GTATGTAA--AG--A-CC-GGCTTAACAA--TT-GG---AAT---GAAACGCTTCA--GA--C-AACAACCTAC-------AC-GTA--C--C-T---ACAAGTT-GTA--TTTG-CAAATG----C-A-AAAT--A--AACC-ATCAT-------AACGACC-A-TAGAATT-TG--TA--AACACGA-G---ATTGT--A---GAAACTCCTGTTTG----T-------CAG-TA-T--CA----C--GCCTTGG---TTTAAG--ACTTTATCA-CACTC----------AGA--ATC--TG-T-------T-T-TCG-CAT----------------------------T-T--C-TATT-GGATCAGTTACATTTTGCA-G-GAG-ACAA-AATCAC--C-A-TAA-----ACAAG--TGA--------AAATAG-AATATTG-------------CTACAT-GAATA-C--A-G--GAA--A-TT-GAC---GAT------G-GAAAAG--------TTAAAGCA--ATCT-CGC------TTGTCA-TCAAGA-A--------------GG---GTTGT-TGTAAT-T-TG--C--C-TTGAACG-TC-TA-TGTTCAGTA-AATTATCC-A---AAT------------ATGAatatggaatttgttacaaataaggtttttacttt
gi|11 : gaacacgtcccggtaaCA-GG-TGG-C-------TAGAAGG-----A--------GTGAGTATC-----GC---CC----GA--T-CACAC-CTGC-CG--TTA-GCC---C------TGATC----T---TGA-TCA-G-G------------T------AACGCAA-G---TA-ATCC-G----TAGTCA-AA-CTCAGTATGCAA--AC--G-GATATC-GAAC--AATC-GGTA-AA-----AAGC--ATTA--G------GCG-----T-------TT-G-G--T--C-C---A---TTGTATAA-CTTG-TATCTG----T-A-AATA--A--GATC-ATT
gi|12 : tttactcagtatacacatgtatatgtctttgaagtcggttatgatgttcaatgcaacgacatcggtatacatgtacttcaaacgaactacacgtttaccgtgacatcaaagtaaatatatgtttagcggactttttttctgcctatatatagttacggcactggatttcttatgaacaagtgaaaattacgaacagtgactaatctcttagatcctaaattaaaagtactagtatacaaacaaagatccctagccaagATCATGAAGT---GACGT--CTTAACAGC------------AGTTA-------C--TAGT--A-G--------------GA----------TA-GAG---------------GG-----C------TGCGGGTA-GAGC-CT--TAGTG-AACC---AGCGA----TG--TAATCATTCTG-TTT-G-AAGGAGTTTT---TTAT-GCAT--------C-GAAAAAAAATCCAAT-ATAAAAAACAAGGT-ATGGTAATT-TCAATTGATCC-TGATGTCTTTGGAAA-ATATGAAGCAAATGTTT--AAACA-AAAGGTGGATTTGA-A-GAAGTAT-CACTTT-AGTCA-GATGTCTTGGA-GTA-A-GATT----AGTATT-CCAAATGACT---GA--AGTG-AATCC-T-AGTTAC-AGTTAAAAGGCATAAGTAT-GTA-----TGA-CTAT--TTATCAAC--AC----AAG----ACAAA-------TGTG-AATC---ACTTGGCTTTATCAGCTG--------AACTA-TATCAA-AGTTTTCATGT-GCGTCTT----TAA--C-CA-TTTACACACGTC-----GCTCTGT-----AAA-GACAGAA-----GGCTA
gi|13 : tccGTTTT-----TTGATATATCCCCA---TCGGTAT-GACACCA-TTCTGGAATAATGTAGGTGGA--CAGTATCTC-TGAAAA---GAC-TGTTTTAACAGC--TGTTTAG--TAGTTT-----------AGTTTA-GAT-------TAAGGAAGAGGCTTGGTTA-GAGCACTTACTTGAACTAG------CATATATTG---GTA-GAGCACT--TACTGGAAC----AGC-A----TA--TA-TC-TTT-G-TT--GTAAGGA-ATTG---TTAT--TGT---TAATTC-G-AA-----TCCAGTTA--------AAGGTCATTGTAAAT-CAAATTGATCC-AGAT-TCTTCGGAA-TAT-TGA---AAGTATT--CAAACAG-AAGGT-GAATTTGAA-GAATT-C-TATCTT-AGTCA-GATTGCTTGGAGGTATATAAGT-----AGATTCCCAGATGCTC---GA--AGTA-CACCCTT-AG-T-C-ATCTTAAAAG-ACAAGTACAG-A----GTCAGCTCTAGTTACAA
gi|14 : agtgtagaAAA--GGCAAAGATA----A-CGA----ACAGTGA--T-C-AATCT-CGTAA-----------G-TCCTAAAT-A---GA------AT--A--CAAAA--ACAAGA-GTC-GGGCAAT-CAC-GGA-C----CCC-T---GGACAC-A----C--CAG-A-A-G--TGG-GA-TCA-GG-TGC-C-------TAGGGGG-----A--------GTAAGCACC-CCCTGTTGACC----GG--T-CACAC-CCGC-CG--TGA-GCC---C-----ATAGTC----T---TGA-TCA-G-G------------T---A--AACG-GA-----------C-A----TC-----AGT----GTGTGAAA--A---A-CG-G-CTTAAC--AATG-GCT---AT---GAAACACATCA--GA--C-AGCA-----T-------TT-G-A--C--T-C---A---ATG-ATAG-GTCA-TATTGG----T-A-AACT--A--AATT-GTTAC-------AACGACC-A-TAGAATT-TA--CG--AA-ATGCTGC--ATTTA--AA-CGTGA---CTGTTGA----AACCCCTGCAA-CA-TACCG-A--C--TTTT
gi|15 : ggatgtA-C----CTC-T---A-ACAA-A----GG-CGA-A-G-G---AG-GG-TCA-GG-TGC-C-----A--GGAGG------A--------GTAAGCATC-CTCTGCTGACC----GG--T-CACAC-CCAC-CG--TGA-GCC---C-----TTAGTCG---G---AAA-TAA-G-G------------T---A--ataaatcatgcactttcttttcaaagtacatgtatatttgcacatgaaat
gi|15 : caaatAAATAAGGTA---T---GAACAAAATCA--GT--C-AACA-----T-------ATGG-A--CCTT-T---A---GTG-ATAA-TTTG-CAA-CG----CAA-A--CA-A--GGTC-ATTAT-------ACCGACC-ATTAGAATT-TG--CGAAAA-ATGATG---ATTTTTAAA-CGAGATTTCG--TTA----TAA-CCTGCAA-CATT--CA-A--CTTTTTTTGT---TT--AGC-AGTTAGCCTAAGCTTT-------AAAAA--ATCTTT--C-------ATT-ACG-CGG--A-----CATG-------------CTCT-T-GC-TATC-GAATCAA--CT------TGCG-GAGTAAAT-TA-CACATC-A-TAA-----GCAGGATGGA--------TAGTGGT-GTATTA-------------CTA-tgaacaaaatcagtcaacatatggacctttagtgataatttgcaacgcaaacaaggtcattataccgaccattagaatttgcgaaaaatgatgatttttaaacgagatttcgttataacctgcaacattcaactttttttgtttagcagttagcctaagctttaaaaaatctttcattacgcggacatgctcttgctatcgaatcaacttgcggagtaaattacacatcataagcaggatggatagtggtgtattactacttctttcgttacttggataattttattgaacattgac
gi|16 : caaatacctctaacaaaggcgaaggagggtcaggtgccaggaggagtaagcatcctctgctgaccggtcacacccaccgtgagcccttagtcggAAAT-GGCGAAG-TA----A-CAATTAAA--GT-A--TCA-AA----CGTA-TCATA------G-TCCCCAAA-A---CAC-----AT--A--CAAAA--TCGAGT-GTA-GG-CAAT--AC-GGA-C----CTT-C---G-ACAA-A----AG-CGA-A-AAG--CAG-GAATCAAGG-TGC-C-----A-TGGA-GG-----A--------GTAAGCATC-CTCTGCTGACC----GG--TCCACAC-CCGC-CG--TGA-GCC---C-----TTAGTC----G---AAA-CAA-A-G------------T---A--AACG-GG-G---TT-ACCC-G----TCGTCA-AATCTAG--ACGAAA--AT--GACA-GCCTAACTAACAAG-GGTATAA-----AAACAAATCA--GT--C-A--A-----T-------AT-G-A--C--T-G---A---GTG-ATAA-TTTG-TAATCG----CAA-A--CA-A--GGTC-ATTAT-------AGCGACCGG-TAGAATT-TG--CG--AA-ATGATG---ACTTTAAAA-CGAG-ATTCAG-TTA----TAACCCTGCActtctttcgttacttggataattttattgaacattgac
gi|17 : taATAA-G-AAA-----CCCA---------------A-GCA----TGCTCAT--TA--ATATCTAACTTCA--GAGTAC-TTGTGTGGG--CAATCAG----------------AG------GGTTTTC-------------AACAAAATATGTGTCTTG--TTT-----CCC-AA----CG-ACTAGAAA-TTCGTA--TT---TTCGGGT---GCCGG-TTTT----TTGTT---------TAAAAAGCA-ATTA--------TTATAAT-----TGAAAAAGGC---CTAAGAT---TT-TAA-CTTT--ATC-G---GAGGAATCGTTGT------------GTAAAGT---GTGGAGAAATCTACGT--TTTTG-ATGCAGTCAATT
gi|18 : aatcgaccaattgttgctaccatatgttttcctaatg-GGA-C----CTC-C---A-A-AA-ATTATAG-AGGTA-G-G--CAG-GA-TCA-GGGTGC-C-----A--GGAGGATCGTAA--------TTGAGCATC-CTCTGCTGACC----GATCT-CACACACCGC-CATCTGA-GCCT--T-----GTAGTT----C---AAA-CAA-A-GC-----------T---A--AACG-GG-GATTCT-ATCC------TCGTCA-AATCT-AGTACGAAA--AT--G-AA-GGCTAAACACAA-G-GGTT-ATT---GAAACAAGCAG--GT--C-AACA-----T-------AT-G-A--CT-T-T---A---GTG-ATAA-TTTG-T-ATCG----C-A-A--C--A--tttgaaaattcttgtatt
gi|19 : gcaaacataaaatgttatgtagattattatcgTCATA------AATCCCATAA-A---GA------AT--A--TAAAA--C-------TA-AGGCAAA-CAC-GAA-C----CCT-T---G--CAT-AT---AC-CGG-A-G-G--TGG-GA-TCA-GG-TTT-TTTTTAA-AAGAGGG-----A---------TAAGCACC-CCTTGTTGACC-----G--T-C-CAC-TCGC-AT--TAT-ACC---C-----TCTATC----T---TGA-TCA-G-G------------T---A--AACT-GA-G---TA-ATCT-G----T----A-GGTC-AAGAACGAAA--aaat
gi|2 : ttagatactgttggagacaatattggttgctcaccgaaagaatgaaaagtgaagataacgtaacagtgatccatcAAAT-GGCGAAG-TA----A-CAA----A--GT-A--T-A-AA----CGTAATCATA------G-TCCAAAAA-A---CA------AT--A--CAAAAA-TCGAGTTGTAAGGGCAAC-CAC-GGAAC----CTT-C---G-ACGA-A----AG-CGA-A-G-G--CAA-GG-TCA-GG-TGC-C-----AATGGAGAG-----A--------GTAAGCATC-CTCTGCTGACC----GG--T-CACAC-CCGC-CG--TGA-GCC---T-----GTAGTC----G---AAA-CAA-ATG------------T---A--AACG-GG-G---TT-ACCC-G----TCGTCA-AATCTAAGTATGAAA--AT--G-CA-GTCTAAACAAAATG-GGTA-AAT---GAAACAAATCATGGT--C-AACA-----T-------AT-G-A--C--T-T---A---GTG-ATAC-TTTG-TA-TCG----C-A-A--C--A--GGTC-ATTAT-------AGCGACC-G-TAGAATT-TGTGCG--AA-ATGATG---ACTTT--AA-CGAGAATTCGGTTTA-----AACCCTGCAA-CA-TA-CA-A--C--TTTTTGG---TT--AGT-AGTTGCCCT-CG--TT-------AAAAA--ATC--A--C-------A-TTACG-CAT--G-----CATG-------------C-CT-T-G-GTATC-GAATCA----C------CG-A-GAG-ACAT-TA-CACA-C-A-TAAT----GCAGT--GGA--------TAGTGGTAACATTA-------------CTA-AC-AAAAA-A--A-G--GAA--AAGT-GAC---AAT------T-GGCAAG--------TCAAAGTCCCATCAACGT------TTATCA-T--ATATA--------------TG-T-GTTTTGC--AGT-CCTG--C--C-ATTAGAG-TC-AA-TATTA--TA-AAATATCC-A---A-T------------ATGAAGCACATTGGTCAGATTCTGTGGTGTC-T---TTA-TTTCAAGTTCGTCAGGATAATATCAAAATGGAC-ATA-ATTGTGAAA-TTATGATTGTTAATGGAT-A---A-ACATCG-TCTATATACCT------ATAA---GTAAGGTT-G-AA---GGACACT-GCAAG---------------TTTT--TTGTTTTT------A-CCC-G-AACAGTTT-TCCTGAA-ACA-AATTCTGCT--TTCATA-TGGAATATATAA--AAATAAGTC---TGCCAATA---AG-GGGGCA-ACA--T--TAGTACCCATA-GGAA--A-C-CA-AC--A---------GAATTGTTGGAGAAGACGGA-TG-TCACTCCAA-AAAAGAC------TACAATAATATTAATCTATAAAG-CAA----ACCCA---------------A-GCA---ATGCTC-T--TA--ATATCTTTCTTCA--GAGTAC-TTGTGTGGG--CAATCAG----------------AGTG----GGTTCTG-------------ACAAAAATATGTATCT-G--TTT-----CCCAAA----TG-ACCAGAAACTTGGTA--TT---TTCGGGT---GCC-G-TTTT----TTGTT---------C-AAAAGCA-ATTA--------T--CAATTTCC-TGAAAAA-GC---CT-AGAT---TT-T-A-TTTT--ATCCGTGAG--GAATTGTTGTA------------TAAAGT--GGTGGAGAAATTCATATG-TTTTGA-TGCAGTCAATT---------TTAGAA--AAATCTCGTGATTGAA----GTTTTC-TATAAAGCT----CTTTAGA------GTTTT------TGAGA-ATCCACAATCT--GAATGAACACCACTTCTGGAATA-TGTAG-TGGAAACAGTAT--CTTGAAGT---GAC-C--TTTAACAGC--TGTT-AG--TAGTTT-------TGTTAGT--A-G---------TAAGGGA----------TA-GAG---------------G------C------TG---GTA-AGGCACT--TACTGGAACC---AGCGAA---TG--TA-TC-TTT-GGTTT-GTAAGGA-TTTC---TTAT-GCATATTT---TT-GGAA-----TCCAGT-A--------AAGGT-ATGGTAATT-CAAATTGATCC-TGAT-TCTTCGGAAATAT-TAA---ACGTATTC-CAAACAGAAAGGT-GATTTTG-A-G-ATT-T-CATCTT-AGTCA-GATTGCTAGGA-GTATA-AAGTCAGGAAAATTCCCAGATGTGT---GA--AGTA-AACCC-TAAGTT-CAATTTAAAAAG-ACAAGTATAATA----GTGA-CTTT--ATACAAAC--A-----AAG----ACAAG-------TGT--T------ACTGTGCTTTAT--ACAGCC---TGGAACCAGTAACAA-AGTTTTCATGTAG----TCTATGTAA--CTCA-TTTACCCCCTTCTG---GCT-TCT-----TAA-GACAGAA-----GGGTAAATAGT---AGATTTTCCCC---GC-----TAAA----TGGTTATAACGGGATTTTAAATAATTTCCGAAT-ACTTTTGATCA-TTCAGACAAAGTG-TCAAG-ATCTCTCCCTtaaatgttgatgcatt
gi|20 : A----A--AT-A--T-A-AATAGGCGAAGT--TA------A-TCCCAAAA-A---CAT-----AT--A--CAAAA--CCAAGT-GTA-GGGCAAC--AC-GGA-C----CTC-C---G-ACAA-A----AG-CGA-A-G-G--CAG-GA-TCA-GG-TGC-C-----A-TGGAAG------A--------GTAAGCATC-CTCTGCTGATC----GG--T-CACAC-CCGC-CG--TGA-GCC---C-----TTAGTC----G---AAA-AAA-A-G------------CATGA--AACG-AA-A---TC-A-----------GTCT-AA-CTA--TAC-ATG--AC--T-TA-GT---GATAATATG-CGT--AATCTGGAAACAAGTCA--TTTGC-GAAA-----TG------AT-G-A--C--T-T---ca
gi|21 : AA----A--GT-AATT-A--------GTAA-CATA------G-TGCCAAAA-A---CAT-----AT--ATACAAAA--ACGAGT-GCA-GGGCAA--GAC-GGA-C----CTT-C---G-ACAA-A----CG-Ctaaattgagtattcgttat
gi|21 : ctattaA-CAA-A-A------------T---A--AACA-GG-G---TA-GCCC-G----TCGTAA-AATCTT-GTACAAAA--ATAAG--A-GTCTGA-CAAA--G-GGTA---C---GAAACAGATCA--GT--C-AACA-----C-------AC-G-A--C--T-T---C---GTG-ATAA-TTTG-TAGTCG----CAA-A--CA-A--GGTC-ATTAT-------AGCGACA-G-TAGAATT-TG--CG--AA-AGGATG---Aacaaaataaacagggtagcccgtcgtaaaatcttgtacaaaaataagagtctgacaaagggtacgaaacagatcagtcaacacacgacttcgtgataatttgtagtcgcaaacaaggtcattatagcgacagtagaatttgcgaaaggatgat
gi|22 : ctattaaaagtaattagtaacatagtgccaaaaacatatatacaaaaacgagtgcagggcaagacggaccttcgacaaacgcTATC-TAATCAA---C------TG-G-GAG-ATATGCA-TAC--C-A-TTT-----GCAAG--GGA--------TAGTGGTA-TATTA-------------CTA--C-AAAGACA--G-G--GAA--AGCT-GAT---GAT------T-GCATTT--------TTAAAGTC--ACCAA-GC------TTATCA-T--ATA-A--------------TG-TAGCTGT-A--AGT-C-TG--C--C-ATTAGAG-CC-AA-TATTAAGTA-AAATATCC-A---ACT------------AAGAAGCAGATTTGTCAAATTCTGTGGTCTCCT---TTA-TTTTGAGTTCGTCGGGt
gi|23 : A-A----CG-CAC-A-G-G--CAG-GA-TCA-GG-TGC-C-----A-TGGAGG------A--------GTAAGCATC-CTTTGCTGACC----GG--T-CACAT-CCGC-CG--TGA-GCC---G-----GTATTC----G---AAA-CAA-A-A------------T---A--AACA-GG-G---TA-ACCC-G----TCGTAA-AATCT-TGTACGAAA--ATAAG--A-GTCT-GACAAA--G-GGT---AT---GAAACAGATCA--GT--C-AACA-----C-------AC-G-A--C--T-T---C---GTG-ATAA-TTTG-TAGTCG----CAA-A--CA-A--GGTC-ATTAT-------AGCGA
gi|24 : AAA--GGCAAAGATA----A-CGA----ACAGTGA--T-C-AATCT-CGTAA-----------G-TCCTAAAT-A---GA------AT--A--CAAAA--ACAAGA-GTT-GGGCAAT-CAC-GGA-C----CCC-T---GGACAC-A----C--CAG-A-G-G--TGG-GA-TCA-GG-TAC-C-------TAGGAGG-----A--------GTAAGCATC-CCCTGTTGA
gi|25 : cactgtgataaatggtagtattaatgtTGTGT---GATAAGTATAACCC-T-AGTT-C-ATTTATAAAG-ACAAGTATAATATTTTCTGG-CCCC--TAACAAAA--AAATTCAAG----ACAAATTGACTTTGTAACATCTTAACTCTGTTTCA---ACTGTCCTGT--AA----TAGCAATAGTTCTC----------TCG---TAAGGCTCATTTTAC-CACTTCTG---a
gi|26 : AATT-TG--CG--AA-ATGATA---A------GA-C-AGGATT-----------TAAGGCGACAA-CA-A--TA-A--AAATTTTTAGAATTT--AGTCAGT-GGCCT-CGACCTGATAAGAAAAAA--ATA--T--CAAAAAATA-T-ACG-CAC--GTGGTATATGAC-----------C-CTCT-GCGCGAC-GAATCAA--TC------TG-ATGAG-ACGA-TA-CA
gi|27 : -A--C-A-AC----CGT--TCATA------A-TCCAAAAA-AATGTAT-----AT--A--CAAAAA-TCGAGT-CGA-GAGCAGCGCACTGGA-CACATCTT-CTGTA-ATAA-A----AGCCGA-ATG-GTTTAGTGA-T---AG-TTT-T-----A-TTGAGAG-----AAGAAAATGGTAAG------TCCACTAACC----AG--T-CA
gi|28 : ggcgactgtaTGTCAGTGTCTGTGGTGTCCTGAATTA-TATTAAGTTCTTCGCGATA-TATCAAA-TGGAT-ATA-ACTGTGAAAATTATGATTGTTAATTGAT-A---GCACATCA-CC
gi|28 : CACC-GCAAG---------------TTTT---TGTTTTT------ATTCC-GTAACAGGTT-TT---GA-ACA-AATTgcaagtttttgtttttattccgtaacaggttttgaacaaatt
gi|29 : tgtcagtgtctgtggtgtcctgaattatattaagttcttcgcgatatatcaaatggatataactgtgaaaattatgattgttaattgatagcacat--CTCA-TT---ACACTTCTG---GCT-TTT-----TAAAGACA--A-----GGATAAATAGTACGCCATTTTCCTC---GCGCGCTTAAAGTTTTAATTAC----GGATTTT-AATTACTTCCGAATTAATTTTGATCATTTCAGACAAAGTATTCAA-CTCCTCTCCC
gi|3 : AAAT-GGCGAAG-TACA--A-CAA----T--GT-G--TTA-AA----CGTAA-AATA------G-TCCCAAAA-A---CATGT---AT--A--CAAAA--TTGAGT-GTA-GGTCAAC--AC-GGA-C----CTC-C---G-ACAA-A----AG-TGA-A-G-G---AG-GA-TCA-GG-TGC-C-----A-TGG-GTG-----A--------GTAAGCATC-CTCTGCTGACG----CG--C-CACAC-CCGT-CG--TGA-GCC---C-----TTAGTC----G---AAA-CAACA-G------------T---A--AACG-GG-A---TT-ACC--G----TCGTGA-AATCTA-GTACGAAA--AT--G--A---CTGA-CAAA--G-GATA---T---GAAACAAATCA--GT--C-AACA-----T-------AT-G-A--C--C-T---G---GTG-ATAA-TTTG-TAATCG----C-A-A--AGAA--GGTC-ATTAT-------AGCGACC-G-TATAATT-TG--CG--AA-ATGAT----ACTTT--AAATGAGA-TTCGTTATACCGTTAACCCTGCAA-CA-T--CA-------TTTTTGG---TT--ACT-AGTTGGCCT-AGCTTT-------AAAAAT-CCC--T--C-------A-T-ACA-CAT--ATGC--CATGTGTTGGATATAGCC-CT-T-GCGTATC-GAATCAA---C------TG-A-GAG-ACAT--A-CACA-CCA-TAA-----GCAGG--TGA--------TATTGGTA-CATTA-------------CTA--C-ATAGA-A--AAG--GAA--TGTT-GAC---GATA-----T-GCAAAG--------TCAAAGTC--ATCA-CGT------TTATTA-T--ATA-A--------------TG-TA--TGT-C--AGT-C-TG--CATC-ATTAGAG-TC-AAATATTAAGTA-AAATAGCC-A---AAT------------ATAAAGCAGATATGTCAGATTCTGTGGTGTCCT---TTA-TTTCGAGTTCGCCA----AATATATAAATGGAC-ATA-ATTGTG-AAATT-TTATTGTTAATTGATAA---G-ACATCG-TTTATATACCC------ATAT---GTAAGGTT-G-AA---GGACACG-GT------------------TTTT--TTGTTTTT------ATCCT-GTAACGTTTT-TTTT--A-ACACAATTCTAC---TTCATA-TG-AATATAAAA--A--TAAGTC---TGCCAATA---AG-AGGACA-CAA--T--TAGTGTCCTTA-GGAAT-A-C-CA-AC--A---------T-ATTGTTGGA-A-GAC--A-TGGTTTCT--AA-A---GAC------TACATAAATATTG-TCCATAA-G-AAA----ACCCA---------------A-GC----ATGCTC-T--TA--ATAT-CTACTTC--AGAGTAC-TTGTGTGGG--CAATCAG----------------AGT-----GGTTCTG-------------AC-AAAACATGT
gi|30 : ctattaaacctgacacaatacatctgctagtcatctgggactgatgtttatatatcACATTG-------------TTA-ACTACATA-A--A-A--GAA--A--T---------T------T-GCAAAA--------CTCAAGTC--ATCA-CGT------TTATCA-T--ATA-A--------------TGTTAGTTGT-CCAAGTCC-TG-----C-ATTAGAGATT-AA-TATTAAAGG-AAGTGTTC-ATGGAAT------------A
gi|31 : T-CA-CAC--C-A-TAA-----GTAGG--TGG--------TAGTGGT-ATATTA--------------TC-AC-ATTGA-A--A-G-----------------------------GCAAAG--------TTAAAGTC--ATC-TTGC------TTATCA-T--ATA-A--------------TG-CAGTTGT-C--AGT-G-TG--T--C-ATTAG
gi|32 : cttatCAT-T--CAC--C-A-TAA-----GCAGGT-GGA--------TGGTGGTA-TATTA-------------CTA--C-ATAGA-A--A-G--GGA--AAGTTGAC---GATAGCCGATAGCAAAG--------TTAAGGTC--ATC-ACGC------TTATC
gi|34 : tatcctCAATA---AG-GGGGCA-CAA--T--TAGTGCCCGTT-GGAAT-A-T-CA-AC------------GGATTGTTAG-TA-GAC--A-TGG--TCTCCAA-A---GAC------TACACAAATATTA-TTTATAA-G-
gi|35 : GA-GCC---T-----TTAGTC----G---AAAACAG-G-GAGGGGGGGCGGTT---ACGAGCG-GA-G---TT-ACCCTG----TCGTCAGAATCT-AGTACGGAA--A---G--A-G--TGGACAAA--G-GGTA-ctaa
gi|36 : A-GG-T-C-C-----G-TGAATGA-----A--------GTAAGCATCTCGTTGCTGATCCGAGGA--T-CACAC-CCAC-CG--TGA-GC------------AATCAAGAG---AAA-CAG-A-tg
gi|37 : gatggatggtcgCCCAACATA---CATGTATAAT--A--CAGAG--TCGA-T-GTA-GA-CAAC--AC-AGA-C----CTAGT---A-ACAA-A----AGGCGA-G-G-G--CAG-GA-TCA-GG-TGC-C-----A-TG
gi|38 : ccATTTTCCCC---GC-----TAAA----TGG----------ATTTT-AATCATTTCCGAAT-ATTTGTATCCA-TTCAGACAAAGTG-TCAAGCTCCTCTCCCT
gi|39 : gcAAAT-GGCGAAG-TATTTTA-CAA----T--GT-G--T-TTAA----CATAATCATA------G-TCCAAAAA-A---CAT-----GT--A--CAAAA--TCGAG
gi|4 : tttgttataAAATTGGCGAAG-TA----AACAA----T--GT-G--TTA-AA----CGTAATCGTACATGTAG-TCCCTAAA-A---CAT-----AT--A--TACAACTTCGAGT-GTA-TGGCAAC--AT-GGA-C----CTC-C---G-ACAACA----GG-CGA-A-G-C--CAG-GA-TCA-G--TGC-C-----A-TGGAGGG-----A--------GTAGGCATC-CTCTGCTGACC----GG--T-CAC-C-CCACACG--TGA-GCCT--C-----GTAGTC----G---AGA-CAA---G------------T---A--AACA-GG-G---TT-TACC-G----TC---------TAC-TACGAAATGAG--A-CA-GTCTAA-CAA---G-GGTA---T---GAAACAAATCA--GT--C-AGCA-----T-------AT-G-A--C--T-T---A---GTG-ATAA-TTTGGTAATCG----C-A-A--C--AA-GGTC-AT-AT-------AGCGACC-G-TAGAATCCTG--CG--AA-ATGCTGCGGACTTTGAAA-CGAGAACTCG--TTA----TAACCCTGCAAACA-T--CA-TTTC--TTTTT-----TT---GT-AATTGAC-T-CGCTTT-------AAAG----TC--CTGC-------G-T-CCG-CAT--GA----TATA-------------C-CT-TTGCGTATC-GAATCAA---C------TG-A-GAG-ACAT--A-CACA-CCA-TAA-----GCAGG--TGA--------TAGTGG-AACATTA-------------CTA--C-AAAGA-A--A-G--GGA--AAGTTGAC---GAT------T-GCAAAG--------TCA--------TCA-CGT------TTATCA-T--ATA-A--------------TG-TAGTTGT-C--AGT-C-TG--C--C-ATTAGAA-TC-AA-TTTTAAGTA-AAATATCC-A---AAT------------ATGAAGCACATCTGTCAGATTCTGTGGTGTTCT---TTA-TTTGGAGTTCGTCAGGAT-ATATC-AAATGGAC-ATA-ATTATGAAAATTATGATTGTTAATAGATCA---G-ACATCA-CCTATATATCTAC----ATAT---GTA
gi|41 : actatcttatccgaatgacatcaaagattacttgaacgattgtctgtactgcaatat-A---G-ACATCA-TCTATATATCT------ATAT---GTAATGAT-G-AA---GGACACA-GTAAG---------------TTTT--TTGTTT
gi|42 : AAAT-GGCGAAG-TA----A-CAA----A--GT-A--T-G-AAC---CGTAATCATA------
gi|44 : AAAT-GGCGAAG-TA----G-CAA----A--GT-AT-T-C-AA----CATAATCATA------A-Tcgtacacagataaaccata
gi|46 : cgcacatttataTTTTGG---TT--AGT-AGATGGCCT-CGCTTT-------AACAA--ATC--
gi|47 : A-A--G-G--GGA--AATT-GAC---AAT------T-GCAAAG--------TCAAAGTC--AT
gi|49 : -A---AAT------------ATGAAGCACATCTGTCTGATTCTGTG
gi|5 : AAATTGGTGAAG-TA----AACAA----T--GT-G--T-T-AAT---CGTAATCATA------G-TCCTAAAA-A---CAT-----ATTTA--CAAAG--TCGAGT-GTA-GGGCAAC--AC-GGA-T----CTC-C---G-ACAA-A----AG-CGA-A-G-G--CAG-GA-TCA-GG-TGC-C-----A-TAGAGG------A--------GTAAGCATC-CTCTGCTGACC----GG--T-CACAC-CCGC-CA--TGA-GCC---C-----TTAGTC----G---AAA-CAA-G-G------------T---A--AACA-GG-A---TT-ACCC-G----TTGTCA-CATCT-AGTACGAAA--AT--GACA-GTCT-AACAAAA---GGT---AT---GGGACAAATCA--GT--C-AGCA-----T---------------------------------TAA-TTTA-TAATCG----CAA-A--CA-A--GGTC-ATTAT-------ACCGACT-G-TAGAATT-TG--CG--AC-ATGGTG---ACTTTA-AA-CGAGAA-TCG--TTA----TAATCCTGCAA-CA-T--CA-A--C--TTTTTAG---TT--AGT-AGTTGGCCT-CGCTTT-------AAAAA--GTCT-T--C-------A-T-ACG-CAT--GA----CATGT------------T-CT-T-GCGTATC-TAATCAACTGCA-----TG-G-AAA-ACAT-T--CACACC-A-TAA-----GCAGG--TGATACATTTGTAGTGGT-ACATTA-------------CTA-
gi|6 : tatactctatatgataatatatgtcttctgaaaccgcttttacatgtttctgtgttggcgacatcggtattttgggctttttcaaaagtttggcttatatttaaaaagttttcttttcatgaatgcatttttttctgtatttttttttattgtatgtagtaaaagatatT-GGCCAAA-TA----AACAA----T--TTGA--T-A-AT----TGTAATCAAA------A-CCCCAAAA-----CAT-----AC--A--CAAAG--TCGAAT-GTA-AGGAAAC--AC-AGA-C----CTC-C---G-ATAA-T----AG-CGA-A-G-G--AAT-AG-TCA-GT-CG-----------------------------------GCATC-CTCTGCTGACC----GG--T-CACAT-CCGC-CG--TGA-GCC---C-----TTGGTC----G---AAA-CAA-A-G------------T---A--AACG-GG-A---TT-ACCC-G----TCGTCA-AATCTA-GTAGGAAA--AT--GACA-GTCTAA-CAAA--G-GGTA---T---GAAACAAATCA--GT--C-AACA-----T-------AT-G-A--C--T-T---A---ATG-ACAA-CTTG-TAATCG----C-ATA--C--AA-GGTC-ATT---------------------------TG--CG--AA-ATGGTG---ACT---------------------G----TAGCCCTGCAA-CA-T--CA-------TTTTTTG---CT--AGT-AGTTGACCT-CGCTTT-------AAAAA--GTC--CT-C-------G-T-ACG-CAT--GA----CATG-------------CTCT-T-GCGTATC-GAATCAA---C------TG-G-AAG-ACAC--A-CACA-C-AATAA-----GCAGG--TGA--------TAAGGGTA-CATTA-------------CTA--C-ATGAA-A--A-G--GAA--AGGT-GAC---GAT------T-GCAAAG--------TTAAAGTC--ATCA-CGC------TTATCA-T--ATA-A--------------TG-CAGTTAT-C--AGC-C-TA--C--C-TTTAAAG-TC-AA-TATTAAGTA-AAAAATCC-A---AAT------------ATGAAGCAGATATGTCAGATTCTGTGGTGTCCT---TTA-ca
gi|7 : atagatTGTCAGATT--GTGTTGTC-T---TTA-TAT-GAGTTT-TCGGGATA-T-TCCAAAT------TA-AT----------GCCCTTGTTA-TTGAT-A---GCAGAT-A-TCTATAT-CCT------ATAT---ATAAGGTT-G-A-----GACAAA-GCAGGGAGTTTTTTTTTTTTTTTT--TTGTTTTT------ATCCC-GTAA-AGTTT-TTGT--A-GCA-AATTCTGC---TTCATA-TGTAATAT-TCA--G--TAAGTCTGGTGCCAATA---AA-GGGG---CAA--T--TAGTGCCACTA-GGAATGA-CGCA-ACGGA---------GAATTGTTTGATC-GAC--C-T-GTCTCTCC-A-C---GAC------TACATAAATAATT-TCTGTAA-G-AAACTCTACTCATCATGATGTCATGTTA-TCAT--TTGTTC-TAATAATATATCCTACTTCAGAGAGTAC-T--TGTGGG--C-ATCAG----------------AGT-----GTTTTTT-------------AAACAAATATGTGTCTTG--TTTTTCCGCCCCAATCCCCGAACTAGAAA--TATTA--TT---TTCGGGG---GTC-ATTTTT----TTGTT---------T---AACCACATT---------T--CGATAATC-TGAAAAG------CT-AGAT---TTAT-A-TTTTTAAT--GTGAatactggcgtcaaagctcaaaattcttggagcgggaataataaaatatatt
gi|8 : taagatataaaacggtcagctactaaggattgtgtggtgAAAT-GGCGAAG-TA----A-CAA----A--GT-A--TGA-AA----CGTAATCATA------G-TCCAAAAA-A---CAC-----AT--A--CAAAA--TCGAGT-GTA-GGGCAAC--AC-GGA-C----CTT-C---G-ACGA-A----AG-CGA-A-G-G--CAG-GA-GCA-GG-TGC-C-----A-TGGAGG------A--------GTAAGCATC-CTCTGCTGACC----GG--T-CACAC-CCGC-CG--TGA-GCC---T-----GTAGTC----G---AAA-CAA-A-G------------T---A--AACG-GG-G---TT-ACCC-G----TCGTCA-AATCT-AGTATGAAA--AT--GACA-GTCT-AAC-AAAT--GGT---AT---GAAACAAATCA--GT--C-AACA-----T-------AT-G-A--C--T-T---A---GTG-ATAC-TTTG-TAATCG----CAA-A--CA-A--GGTC-ATTAT-------AGCGACC-G-TAGAATT-TG--CG--AA-ATGATG---ACTTTA-AA-CGAG-ATTCG--TTA----TAACCCTGCAA-CA-T--CA-A--C--TTTTTGG---TT--AGT-AGTTGGCCT-CGCTTT-------AAAAA--ATCA-T--C-------A-T-ACG-CATG-G-----CATGC------------C-CT-T-GCGTATC-GAATC-A--AC------TG-A-GAG-ACA--TA-CACACC-A-TAA-----GCAGG--TGA--------TAGTGGT-ACATTA-------------CTACAC-AAA-A-A--A-G--GAA--AGTT-GAC---AAT------T-GCAAAG--------TCAAAGTC--ATC-ACGT------TTA
gi|9 : ggcatataCCCCAAC-A---CAT------T--A--CAAAT--TCGC-T-GTA-AG-CAAC-CG--GGA-C----CTC-C---G-ACAA-A----AG-----A-G-G--TAG-GA-TCA--G-TGCAC-----A-TGGGAGG-----A--------GTAAGTTTC-CTCTCCCGAC------G--T-CACAC-CCGCGCA--TGACACC---CCCAAATTAGAT----GACCAAA-C-A-A-G------------T---A--AACG-GG-GA--TTAACCC-GGGTTTCA--A-AAT---AGTACGAAATGAC--A-CA--TCT-AACAAA--G-GGT---AT---GAAACAAATCA--GT--CAAACA-----T-------AT-G-A--C--T-TGCGG---ATG-ATAA-TTTG-TAATCGGGAAC-A-A--C--A--GGTC-ATTATTTCGATAAGC-ACC-GCTAGAATT-GC--CG--A-----------------------AGAATTCG--TTA----TTAACCTACAA-CA-TA-CA-A--C--TTTTTTG---TT--AGT-AGTTTGGCT-CCCTTT-------AAAAGCCCTC--C--C-------A-C-ACG-CACGAG-----TATG-------------C-TC-T-GCGTATC-GAATCAA--AC------CG-A-GAG-ACAT-
5 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|33 ): GTTTTTGCGTTGGTGACATCAGAATTTTGGATTTTTTCAAAACTTTGGCAGTGACTGGCTTATCATATTTAAAAAGTTTTCTTTTCATGAATGCATTT
Unaligned ( gi|40 ): TTAAAAGTGAAGATAACAAACAGTGATCTATGTCATAATTCCTATAAAAAATTGAAATCTAA
Unaligned ( gi|43 ): GATCTGAGGTCCAGGGGTGATGAATATAGCATACTTCCATGTTGATTGATT
Unaligned ( gi|45 ): TATTAAGTGATGCCATACATAGAGGATCTTGAATGAGT
Unaligned ( gi|48 ): TAGTCGATACTAAAATTCATGCTCATTTGAT
Alignments
lowQualScore : 111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111
lowQualScore : 111111 1111111 22222222222222 111111 22 111111111111111 111111111111 22 3333333333333333333333333333333333 1111111 11 1111111111 11 1111111 1111111 2222222222222 444444444444444444444444444 1111 1111 11 1 11111111 11 1111111111111 22 111111 11111111 22 111111 111111111 1111111 222222222222 222 1 2222 11111 1111 11 444444444444444 1111 222222 2222 222 1 22222 111 111 111 11 444444444444 1111 11 1 11111 222222 11111 555555555555555 22222 11 11 111 11 5555555555555555555555555 44444444444444 111 222222 2222 1 1 11 111 111 111 2222 4444444444444 1 444444444444444444444 1 33333 1 11 2222 11 11 11 66666666666666 2222 1 1 333333333 11 2222 11 2222 222222 2222 1 111 444 1 1 1 1 1 1 111 22 11 444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444 111 1 11 111 111 44444444 11 2 1 1111 1 55555555555555555555555555555555555 1 1 1 1 1 111 111 1 2 1 1 1 1 1 111 22222 111 11 2222222 11 444444444444444444444444444444444 111 3333333333333333333 111 55555555555555 11 111 22222222 111 222222 11111 111 22222 2222 33333 1 1 1
lowQualScore : 6 6 333333 4444444 55555555555555 3 777777 2 2 444 444444 33 33 88 2 2 1 11 2 2 5555 2 444 4 2 6666 4 2 2 2 555 2 2 2 2 2 8888888 333333333333333 2 5555 33 2 2 5 33 2 6666666 2 2 2 666 333 2 222 333333333333 333 33 2 2 666 2 2 5555 1 2 11 66 6666666666666666666666666666666666 33 33 2 444 0000000 4 33 55 2 444444 2 2 2 0 33 33 2 5555 2 9999999 3 6 2 33 33 2 777 3 0 88 3 33 3 7777777777 0 3 3 11 8888888 1 555 44 3 0 3 4444444 77 5555555555555 3 3 3 999999999999999999999999999 3 3 3 3 555 3 7777 8888 3 4444 77 0 3 77 44 3 3 6 22222222 88 6666666666666 00 7 222 6 555 3 44 6 44 66 555 222222 3 22222222 44 22 000000 4 66 4 777777777 8888 6666666 99999 4 5 5 5 0 5 4 777 222222222222 0 1 2 888 5 5 4 11 99 3 7 3 6 6 3 3 1 111 1 5 3333 66666 8 8 4444 00 888888888888888 4444 333333 88 0 8 3333 8 8 3 999 0 6 44 22222 3 777 444 8 8 8 444 1 8 66 8 8 333333333333 3 3333 99 0 5 0 77777 333333 6 0 8 6 6 77777 8 000000000000000 33333 3 8 11 11 3 6 999 8 0 11 0 9999999999999999999999999 55555555555555 5 2 777 777777 1111 0 6 0 33 777 777 444 1111 2222222222222 1 0 555555555555555555555 0 00000 0 33 4444 33 66 3 11 0 88888888888888 1111 4 4 3 7 777777777 88 1 1 4444 66 2222 888888 8888 3 555 111 3 3 3 3 3 3 9 0 777 00 3 33 3 777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777 777 0 3 33 2 777 2 2 111 66666666 33 0 3 3 0 7777 0 2 2 55555555555555555555555555555555555 0 0 0 0 3 66 0 777 999 55 0 0 3 0 0 0 0 0 777 44444 0 2 444 11 8 3 8 8 0 8 88 8 0 3333333 8888 1 11 1 888888888888888888888888888888888 777 1 3333333333333333333 1 000 88888888888888 11 0 8 0 8 0 0 444 66666666 000 777777 0 7 77777 777 55555 1111 3 22222 3 1 3 1 3 6
lowQualScore : . . ...... ....... .............. . ...... . . ... ...... .. .. .. . . . .. . . .... . ... . . .... . . . . ... . . . . . ....... ............... . .... .. . . . .. . ....... . . . ... ... . ... ............ ... .. . . ... . . .... . . .. .. .................................. .. .. . ... ....... . .. .. . ...... . . . . .. .. . .... . ....... . . . .. .. . ... . . .. . .. . .......... . . . .. ....... . ... .. . . . ....... .. ............. . . . ........................... . . . . ... . .... .... . .... .. . . .. .. . . . ........ .. ............. .. . ... . ... . .. . .. .. ... ...... . ........ .. .. ...... . .. . ......... .... ....... ..... . . . . . . . ... ............ . . . ... . . . .. .. . . . . . . . . ... . . .... ..... . . .... .. ............... .... ...... .. . . .... . . . ... . . .. ..... . ... ... . . . ... . . .. . . ............ . .... .. . . . ..... ...... . . . . . ..... . ............... ..... . . .. .. . . ... . . .. . ......................... .............. . . ... ...... .... . . . .. ... ... ... .... ............. . . ..................... . ..... . .. .... .. .. . .. . .............. .... . . . . ......... .. . . .... .. .... ...... .... . ... ... . . . . . . . . ... .. . .. . .......................................................................................... ... . . .. . ... . . ... ........ .. . . . . .... . . . ................................... . . . . . .. . ... ... .. . . . . . . . . ... ..... . . ... .. . . . . . . .. . . ....... .... . .. . ................................. ... . ................... . ... .............. .. . . . . . . ... ........ ... ...... . . ..... ... ..... .... . ..... . . . . . .
lowQualScore : 7 7 999999 2222222 55555555555555 2 222222 7 5 444 888888 44 44 44 7 7 7 00 5 4 0000 4 111 7 2 9999 4 4 4 4 333 4 4 1 1 1 2222222 000000000000000 2 0000 22 4 5 0 22 2 0000000 1 1 1 666 777 1 555 666666666666 999 11 4 4 555 4 4 0000 8 4 88 55 6666666666666666666666666666666666 22 22 4 111 0000000 7 22 66 4 999999 5 5 5 8 44 44 5 7777 7 3333333 1 2 9 99 99 9 999 3 3 88 1 88 1 5555555555 8 3 3 22 8888888 0 888 66 3 2 3 2222222 99 9999999999999 6 6 6 777777777777777777777777777 6 6 3 3 888 3 5555 5555 3 9999 33 0 3 99 66 3 3 7 11111111 33 9999999999999 88 3 777 7 888 3 66 7 66 44 888 999999 3 11111111 66 44 555555 4 11 4 888888888 9999 3333333 66666 4 0 0 0 4 0 4 888 888888888888 7 7 5 888 0 3 3 44 00 5 5 5 7 7 2 2 7 444 4 7 3333 77777 0 0 8888 33 333333333333333 2222 000000 88 8 0 0000 0 0 2 222 0 5 22 22222 2 555 000 0 0 0 000 0 0 88 0 0 888888888888 8 4444 00 6 0 8 88888 000000 0 8 0 7 7 88888 0 000000000000000 44444 2 0 00 00 8 0 444 0 8 00 8 8888888888888888888888888 00000000000000 6 5 000 555555 2222 0 5 8 88 555 555 000 2222 8888888888888 0 0 888888888888888888888 0 00000 0 88 8888 88 55 2 00 7 33333333333333 0000 0 7 3 3 000000000 00 0 0 0000 00 5555 777777 3333 3 333 000 3 3 3 3 7 3 2 8 555 88 2 88 2 222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 555 0 2 88 5 555 5 5 222 22222222 88 0 2 2 0 8888 0 5 0 55555555555555555555555555555555555 0 0 0 0 2 55 0 555 555 88 0 0 2 0 0 0 0 0 222 55555 2 5 000 00 0 2 0 0 8 0 88 0 8 6666666 2222 4 00 4 555555555555555555555555555555555 555 0 8888888888888888888 0 222 00000000000000 00 8 0 8 8 6 8 000 22222222 222 555555 8 3 11111 555 00000 2222 2 00000 3 0 3 0 3 7
consensus : AAAT-GGCGAAG-TA----A-CAA----A--GT-A--T-A-AA----CGTAATCATA------G-TCCCAAAA-A---CAT-----AT--A--CAAAA--TCGAGT-GTA-GGGCAAC-CAC-GGA-C----CTC-C---G-ACAA-A----AG-CGA-A-G-G--CAG-GA-TCA-GG-TGC-C-----A-TGGAGGG-----A--------GTAAGCATC-CTCTGCTGACC----GG--T-CACAC-CCGC-CG--TGA-GCC-C-----T-TA-GTC-G---AA---A-CAA-A-G------------T---A--AACG-GG-G---TT-ACCC-G----TCGTCA-AATCTAAGTACGAAA--AC--G-CA-GTCTAAACAAAATG-GGTA-AAT---GAAACAAATCA--GT--C-AACA---T-------ATG-A--C--T-T---A--GTG-ATAA-TTTG-TAATCGCAAA--CA--A-GGT----C-ATTAT-------AGCGACC-G-TAGAATT-TG--CG--AA-ATGATG---ACTTT--AA-CGAGAATTC-G-TT-TA----TAACCCTGCAA-CA-T--CA-A--C--TTTTTGG---TT--AGT-AGTTGGCCT-CGCTTT-------AAAAA--ATC--T--C-------A-T-ACG-CAT--G-----CATG-------------C-CT-T-GCGTATC-GAATC-A---A-C----TG--A-GAG-ACAT-TA-CACA-C-A-TAA--GCAG--G-T-G-A--------TAGTGGTAACATTA-------------CTA-AC-ANAGA-A---A-G--G-AA--AGTTGAC---GAT------T-GCAAAG--------TCAAAGTC--ATCAACGC------TTATCA-T--ATA-AT-------G-TAGTTGT-C--AGT-----C-TG--C--C-ATTAGAG-TC-AA-TATTAAGTA-AAATATCC-A---AAT------------ATGAAGCAGATCTGTCAGATTCTGTGGTGTCCT---TTA-TTTCGAGTTCGTCGGGATAATATCAAAATGGA-CATA-ATTGTGAAAATTATGATTGTTAATTGAT---AG-ACATC-ATCTATATACCT----ATA-----TGTAAGG-TTG-AA---GGACACG-GCAAG---------------TTTT----TTGTTTTT------AT-CCCGTAACAGTTT-TTTTGAA-ACA-AATTCTGCT--TTCAT-ATGGAATATANAA--A--TAAGTC---TGCCAATA---AG-GGGGC-ACA-AT---TAGTGCCCNT-AGGAAT-AC-CA-AC--A---------GAATTGTTGGANA-GAC--ATGGTCTCTCCAA-A---GAC------TACATAAATATTA-TCTA-TAA-GAAA----ACCC-A---------------AGCAT--ATGCTC-T--TA--ATATCTTACTTCA-AGAGTA-CTTGTGTGGG--CAATCA----------------GAGTG----GGTTCT-------------NACAAAAATATGTGTCTT--GTTT-----CCCCAA----CG-ACCAGAAACTTGTTA--TT---TTCGGG---TGCC-G-TTTT----TTGT---------TT-AAAANCA-ATTA--------T--CAAT--T--CT-GAAAAA-G---CCT-AGAT--TT-T--ATTTT--ATC-GTGAGAGGAATCGTTG-----------TAGTAAAG--TGGTGGAGAAATC-ATACG-TTTTGAATGCAGTCAATTGTCTCAGCATTGGAAACAANTCTCGTGATTNAAAGTTGTTTTNGTATAAAGCTGGGCCTTTAGAGGGGGCGTTTTT----TGAGA-ATCC-CAATC-T-GAA-TGA-CACCA-TTCTGGAATA-TGTAGCGGAA-CAGTATATCNTGAAG---TGACT-TTTTAACA--GCTGTTCAG--TAG-------TTTT--TAGT--A-GAC-------TAAGGGA----------T-AGAG--------------GG-----C------TG---GTA-GAGCAC--TTACTGGAA---CCAGCGA-TGTA--------TC--TTTG-TTTGTAAGGA-TTTC---TTA-TGCGT---T---T-CGGAA-----TCCAGT-A--------AAGGT-ATGGTAA-TTCAAATTGAT-CCTGAT-TCTTCGGAAATAT-TGA---AAGTATTT-CAAACAGAAAGGT-GATTTTGAAGAA-TT-TCATC-TTAGT-CAGATTGCTTGGA-GTATA-AAGT----AAGATTCCCAGATGTG---TGA--AGTA-AACCC-T-AGTT-C-ATTTAAAAAG-ACAAGTATAATA----GT-GA-CTCT--TTACAAAC--A-----AAG----ACAAA-------TGT-GAATC---ACTNTGCTTTAT--GCTGTCT--AACTA-TAACAA-AGTTTTCACGT-G----TN----TAA--CTCA-TTTACNCACTTCTG---GCT-TC-----TTAA-GACAG-----AAGGATAAATAGT-CG--ATTTTCCC---CGC-----TAAA----TGGTTAC----GGATTTT-AATNATTTCCGAA-TANTTTTGATCA-TTCAGACAAAGTGTCAAGCTCCTCTCCCT
Reference ( family-568 ) : AAAT-GGCGAAG-TA----A-CAA----A--GT-A--T-A-AA----CGTAATCATA------G-TCCCAAAA-A---CAT-----AT--A--CAAAA--TCGAGT-GTA-GGGCAAC-CAC-GGA-C----CTC-C---G-ACAA-A----AG-CGA-A-G-G--CAG-GA-TCA-GG-TGC-C-----A-TGGAGGG-----A--------GTAAGCATC-CTCTGCTGACC----GG--T-CACAC-CCGC-CG--TGA-GCC-C-----T-TA-GTC-G---AA---A-CAA-A-G------------T---A--AACG-GG-G---TT-ACCC-G----TCGTCA-AATCTAAGTACGAAA--AC--G-CA-GTCTAAACAAAATG-GGTA-AAT---GAAACAAATCA--GT--C-AACA---T-------ATG-A--C--T-T---A--GTG-ATAA-TTTG-TAATCGCAAA--CA--A-GGT----C-ATTAT-------AGCGACC-G-TAGAATT-TG--CG--AA-ATGATG---ACTTT--AA-CGAGAATTC-G-TT-TA----TAACCCTGCAA-CA-T--CA-A--C--TTTTTGG---TT--AGT-AGTTGGCCT-CGCTTT-------AAAAA--ATC--T--C-------A-T-ACG-CAT--G-----CATG-------------C-CT-T-GCGTATC-GAATC-A---A-C----TG--A-GAG-ACAT-TA-CACA-C-A-TAA--GCAG--G-T-G-A--------TAGTGGTAACATTA-------------CTA-AC-ANAGA-A---A-G--G-AA--AGNTGAC---GAT------T-GCAAAG--------TCAAAGTC--ATCAACGC------TTATCA-T--ATA-AT-------G-TAGTTGT-C--AGT-----C-TG--C--C-ATTAGAG-TC-AA-TATTAAGTA-AAATATCC-A---AAT------------ATGAAGCAGATCTGTCAGATTCTGTGGTGTCCT---TTA-TTTCGAGTTCGTCGGGATAATATCAAAATGGA-CATA-ATTGTGAAAATTATGATTGTTAATTGAT---AG-ACATC-ATCTATATACCT----ATA-----TGTAAGG-TTG-AA---GGACACG-GCAAG---------------TTTT----TTGTTTTT------AT-CCCGTAACAGTTT-TTTTGAA-ACA-AATTCTGCT--TTCAT-ATGGAATATANAA--A--TAAGTC---TGCCAATA---AG-GGGGC-ACA-AT---TAGTGCCCNT-AGGAAT-AC-CA-AC--A---------GAATTGTTGGANA-GAC--ATGGTCTCTCCAA-A---GAC------TACATAAATATTA-TCTA-TAA-GAAA----ACCC-A---------------AGCAT--ATGCTC-T--TA--ATATCTTACTTCA-AGAGTA-CTTGTGTGGG--CAATCA----------------GAGTG----GGTTCT-------------NACAAAAATATGTGTCTT--GTTT-----CCCCAA----CG-ACCAGAAACTTGNTA--TT---TTCGGG---TGCC-G-TTTT----TTGT---------TT-AAAANCA-ATTA--------T--CAAT--T--CT-GAAAAA-G---CCT-AGAT--TT-T--ATTTT--ATC-GTGAGAGGAATCGTTG-----------TAGTAAAG--TGGTGGAGAAATCNATATG-TTTTGAATGCAGTCAATTGTCTCAGCATTGGAAACAANTCTCGTGATTNAAAGTTGTTTTNGTATAAAGCTGGGCCTTTAGAAGGGGCGTTTTT----TGAGA-ATCC-CAATC-TCGAA-TGA-CACCA-TTCTGGAATA-TGTAGCGGAA-CAGTATATCNTGAAG---TGACT-TTTTAACA--GCTGTTCAG--TAG-------TTTT--TAGT--A-GAC-------TAAGGGA----------T-AGAG--------------GG-----C------TG---GTA-GAGCAC--TTACTGGAA---CCAGCGA-TGTA--------TC--TTTG-TTTGTAAGGA-TTTC---TTA-TGCGT---T---T-CGGAA-----TCCAGT-A--------AAGGT-ATGGTAA-TTCAAATTGAT-CCTGAT-TCTTCGGAAATAT-TGA---AAGTATTT-CAAACAGAAAGGT-GATTTTG-AGAA-TT-TCATC-TTAGT-CAGATTGCTTGGA-GTATA-AAGT----AAGATTCCCAGATGTG---TGA--AGTA-AACCC-T-AGTT-C-ATTTAAAAAG-ACAAGTATAATA----GT-GA-CTCT--TTACAAAC--A-----AAG----ACAAA-------TGT-GNATC---ACTNTGCTTTAT--GCTGTCT--AACCA-TANCAA-AGTTTTCACGT-G----TC----TAA--CTCA-TTTACNCACTTCTG---GCT-TC-----TTAA-GACAG-----AAGGATAAATAGTCCG--ATTTTCCC---CGC-----TAAA----TGGTTAC----GGATTTT-AATNATTTCCGAA-TANTTTTGATCA-TTCAGACAAAGTGTCAAGCTCCTCTCCCT
gi|1 : AAACAGGGTA-TGCA-AA-----AAACCAATCA--AT--C-AATA---TCATTTTTATGTAGTC--TCT---ATTGTG--TACCTTTG-TAATCGCAAA--CA--ACGGT----CCATTAT-------AGCGACC-G-TAGTATT-TG--CG--AA-ATGATG---A-TTT--AA-CGAGAATTC-G-TTATA----TCACCCTGCAA-CA-T--CAGA--C--TTTTTGG---T---AGT-AGTTG-CCT-CGCTTTT------AAAAA--ATCA-T--C-------A-T-ACGACAT--GG----CATG-------------CTCT-T-GCGTATCTGAATC-A---A-C----TG--A-GAG-ACAT--A-CACA-CCA-TGAACGCAGCGG-T-GGA--------TAGTGGTA-CATTATACATTCTTTGTTCTT-ACTATGAATA---A-GTTG-AACAAGTTGACTTGGAT------T-GCCAAGCCTATCCTTCAAA-TC--ATCAACGCCCCCCTTTATCCCT--ATA-ACTCGCACCGCTAGTTG--C--AGTGTCGCT-TGTTC--CGATTAATG-TCGAA-TATTTTGTGGAAATATTTTA---AATCACTTCATAACAACGAAGCAGATC-GTCAGATTCTGTGGTGTCCT---TTACTTTCGAGTTGTTCGG--TGATTTCAAATGGGACCATACATTATGAAAATCATGATTGTTAATTGATATAAA-ACATCAATCTATATACTTTCAAATATATTTTGTTAGGTTTGCAACTGAGACACGTGCAAGA--------------TTTTTTCGTTGTTTTTTAAAAAATCCCCGTAACAGCCTATTTTGAATCCA-AATTC-GCTAGTTGCTAATAGAATTTAGAATCA--T-AGTC---TGCCAATATTTAGTGGGGCAACAGACTCATAGTGTCCATAAGGGATAAT-CACAC--ACTTACCTAGGAATGTTTGGAGA-GACA-ATGG-CTACACAATA---GACACCAATTACAT-AGT-TTA-TCTATTAT-TAGA----ACCCAA---------------AGCATGAATA--A-T--TA--ATATCTT-CTTCA-AGAGCACCTTGTATGAGATTAATCAGTTATTGCATTTTGGGGGGTGTTTTGGTTCTTTTCATTCTTATAAACAAAAATATGCAT-TTAAATTT-----CCCCAA----CG-ACCAGAAACTTGTTACCTTAAGTTCAGGTTTTGCC-G-TTTTGGTGTTGTTCCAAACCCTT-GAAACCA-ATTAATCACTTTT--CAAT--T--CTCGAAAAA-GCGCCCT-GGATAATT-TTAATTTC--ATT-GTGAGAAGAATTGTTGTAATATTGGGTTAGTAGAGCTCGGGGCAGAAATCAATAAGATATTGAATGCAGTCAATTGTCTCAGCATTGAAAACAACTCTCGTGATTTAAAGTTGTTTTAGTATAAAGCTGGGCTTTTAGAAGGGGCATTTTCACCGTGAGA-AT-T-CAATCTTTGAATTGA-CACCA-TTCTGGAATA-TGTAGCGGAA-TAGTATATCCTGATATTCTGACTCTTTTAACAGCGCTGTTCAAGCTAGTTTAAGCTTTT--TAGT--ATGACAATCTTTTAAGGTA----------TAAGAG--------------GGGTCACT------TG---GTATGATCACTATTTCTGGAACCGCCAGCGA-C-TACTAACTACTT--TTTGTTTTGTAAGGA-TCTCACTTTATTGCAT---T---TCCGGAG-----T-CAGT----------AAGGT-ATGGGAATTTCAAGTTGGTCCCTCGT-CCTTCGG-AATAT-TGA---AAGTATTTACAAACAGAAAGTT-GATTTTGAAGAATTT-TCATCTTTAGTAAAGGTTGCTTGTA-GTAAT-AAGT----AAGATTCTCCAACCTGTTCTGA--AGTA-AA-CC-T-AGTT-C--TTTAAAAGC-ACAAGTATAA-A----GTAAA-CTTT--TAACAAACGGA-----AAGCACCATAGC-------TGT--AATC---AGTGTACTTT-T--GCTCTCT---TCTG-TTAC----GCCTCTAC-T-G----TA----TAA--CTTA-TTTACCCCCTTCTGTTTGCT-TCTCTCGTT---GACAGAAATTAAGGATAAA-AGTCCG--CTTTTTTCCAACGC-----TAAA----TGGTTA
gi|10 : tttcaaactaccataccggaaaa--TGA-GCC-------T-TACATC-GTT-GA---T-CAG-A--------------T---A--AACA-GGTG---CT-TCTT-G------GTAT-AATTTA-GTATGTAA--AG--A-CC-GGCTTAACAA--TT-GG---AAT---GAAACGCTTCA--GA--C-AACAACCT-------AC--A--C--G-T---A--CCT-ACAA-GTTG-TATTTGCAAATGCA--A-AATAAACC-ATCAT-------AACGACC-A-TAGAATT-TG--TA--AACACGA-G---ATTGT--A---GAAACTCCTG-TT-TG----T-------CAG-TA-T--CA----C--GCCTTGG---TTTAAG--ACTTTATCA-CACTC----------AGA--ATC--TG-T-------T-T-TCG-CAT----------------------------T-T--C-TATT-GGATC-AGTTA-CATTTTGCAG-GAG-ACAA-AATCAC--C-A-TAA--ACAA--G-T-G-A--------AAATAG-AATATTG-------------CTA--C-AT-GA-ATACA-G--G-AA--A-TTGAC---GAT------G-GAAAAG--------TTAAAGCA--ATCT-CGC------TTGTCA-TCAAGA-AG-------GGTTGTTGT----AAT-----T-TG--C--C-TTGAACG-TC-TA-TGTTCAGTA-AATTATCC-A---AAT------------ATGAatatggaatttgttacaaataaggtttttacttt
gi|11 : gaacacgtcccggtaaCA-GG-TGG-C-------TAGAAGG-----A--------GTGAGTATC-----GC---CC----GA--T-CACAC-CTGC-CG--TTA-GCC-C-----T-GA--TC-T---TG---A-TCA-G-G------------T------AACGCAA-G---TA-ATCC-G----TAGTCA-AA-CTCAGTATGCAA--AC--G-GATATC-GAAC--AATC-GGTA-AA-----AAGC--ATTA--G------GCG---T-------TTG-G--T--C-C---A--TTGTATAA-CTTG-TATCTGTAAA--TA--A-GAT----C-ATT
gi|12 : tttactcagtatacacatgtatatgtctttgaagtcggttatgatgttcaatgcaacgacatcggtatacatgtacttcaaacgaactacacgtttaccgtgacatcaaagtaaatatatgtttagcggactttttttctgcctatatatagttacggcactggatttcttatgaacaagtgaaaattacgaacagtgactaatctcttagatcctaaattaaaagtactagtatacaaacaaagatccctagccaagATCATGAAG---TGACG-TCTTAACA--GC----------AG-------TTAC--TAGT--A-G--------------GA----------T-AGAG--------------GG-----C------TGCGGGTA-GAGC-C--TTAGTG-AA---CCAGCGA-TGTAA-------TCATTCTG-TTTG-AAGGAGTTTT---TTA-TGCAT---------CGAAAAAAAATCCAAT-ATAAAAAACAAGGT-ATGGTAA-TTTCAATTGAT-CCTGATGTCTTTGGAAA-ATATGAAGCAAATGTTT--AAACA-AAAGGTGGATTTGA-AGAA-GTATCACT-TTAGT-CAGATGTCTTGGA-GTA-A-GATT----AGTATT-CCAAATGAC---TGA--AGTG-AATCC-T-AGTTAC-AGTTAAAAGGCATAAGTAT-GTA-----T-GA-CTAT--TTATCAAC--AC----AAG----ACAAA-------TGT-GAATC---ACTTGGCTTTATCAGCTG-----AACTA-TATCAA-AGTTTTCATGT-GCGTCTT----TAA--C-CA-TTTACACACGTC-----GCTCTG-----TAAA-GACAG-----AAGGCTA
gi|13 : tccGTTTTT----TGATATATCC-CCATC-G-GTA-TGA-CACCA-TTCTGGAATAATGTAGGTGGA-CAGTATCTC-TGAAA---AGACTGTTTTAACA--GCTGTTTAG--TAG-------TTT----AGTTTA-GAT-------TAAGGAAGAGGCTTGGTT-AGAGCACTTACTTGAACTAG-----CATATATTG---GTA-GAGCAC--TTACTGGAA---C-AGC-A-TATA--------TC--TTTG-TT-GTAAGGA-ATTG---TTA-T-TGT---TAATT-CG-AA-----TCCAGTTA--------AAGGTCATTGTAA-ATCAAATTGAT-CCAGAT-TCTTCGGAA-TAT-TGA---AAGTATT--CAAACAG-AAGGT-GAATTTGAAGAA-TT-CTATC-TTAGT-CAGATTGCTTGGAGGTATATAAGT-----AGATTCCCAGATGCT---CGA--AGTA-CACCCTT-AG-T-C-ATCTTAAAAG-ACAAGTACAG-A----GT-CAGCTCTAGTTACAA
gi|14 : agtgtagaAAA--GGCAAAGATA----A-CGA----ACAGTGA--T-C-AATCT-CGTAA-----------G-TCCTAAAT-A---GA------AT--A--CAAAA--ACAAGA-GTC-GGGCAAT-CAC-GGA-C----CCC-T---GGACAC-A----C--CAG-A-A-G--TGG-GA-TCA-GG-TGC-C-------TAGGGGG-----A--------GTAAGCACC-CCCTGTTGACC----GG--T-CACAC-CCGC-CG--TGA-GCC-C-----A-TA-GTC-T---TG---A-TCA-G-G------------T---A--AACG-GA-----------C-A----TC-----AGT----GTGTGAAA--A---A-CG-G-CTTAAC--AATG-GCT---AT---GAAACACATCA--GA--C-AGCA---T-------TTG-A--C--T-C---A--ATG-ATAG-GTCA-TATTGGTAAA--CT--A-AAT----T-GTTAC-------AACGACC-A-TAGAATT-TA--CG--AA-ATGCTGC--ATTTA--AA-CGTGACT---G-TT-GA----AACCCCTGCAA-CA-TACCG-A--C--TTTT
gi|15 : ggatgtA-C----CTC-T---A-ACAA-A----GG-CGA-A-G-G---AG-GG-TCA-GG-TGC-C-----A--GGAGG------A--------GTAAGCATC-CTCTGCTGACC----GG--T-CACAC-CCAC-CG--TGA-GCC-C-----T-TA-GTCGG---AA---A-TAA-G-G------------T---A--ataaatcatgcactttcttttcaaagtacatgtatatttgcacatgaaat
gi|15 : caaatAAATAAGGTA---T---GAACAAAATCA--GT--C-AACA---T-------ATGGA--CCTT-T---A--GTG-ATAA-TTTG-CAA-CGCAAA--CA--A-GGT----C-ATTAT-------ACCGACC-ATTAGAATT-TG--CGAAAA-ATGATG---ATTTTTAAA-CGAGATTTC-G--T-TA----TAA-CCTGCAA-CATT--CA-A--CTTTTTTTGT---TT--AGC-AGTTAGCCTAAGCTTT-------AAAAA--ATCTTT--C-------ATT-ACG-CGG--A-----CATG-------------CTCT-T-GC-TATC-GAATC-A---A-CT---TGC-G-GAGTAAAT-TA-CACATC-A-TAA--GCAG--GATGG-A--------TAGTGGT-GTATTA-------------CTA-tgaacaaaatcagtcaacatatggacctttagtgataatttgcaacgcaaacaaggtcattataccgaccattagaatttgcgaaaaatgatgatttttaaacgagatttcgttataacctgcaacattcaactttttttgtttagcagttagcctaagctttaaaaaatctttcattacgcggacatgctcttgctatcgaatcaacttgcggagtaaattacacatcataagcaggatggatagtggtgtattactacttctttcgttacttggataattttattgaacattgac
gi|16 : caaatacctctaacaaaggcgaaggagggtcaggtgccaggaggagtaagcatcctctgctgaccggtcacacccaccgtgagcccttagtcggAAAT-GGCGAAG-TA----A-CAATTAAA--GT-A--TCA-AA----CGTA-TCATA------G-TCCCCAAA-A---CAC-----AT--A--CAAAA--TCGAGT-GTA-GG-CAAT--AC-GGA-C----CTT-C---G-ACAA-A----AG-CGA-A-AAG--CAG-GAATCAAGG-TGC-C-----A-TGGA-GG-----A--------GTAAGCATC-CTCTGCTGACC----GG--TCCACAC-CCGC-CG--TGA-GCC-C-----T-TA-GTC-G---AA---A-CAA-A-G------------T---A--AACG-GG-G---TT-ACCC-G----TCGTCA-AATCTAG--ACGAAA--AT--GACA-GCCTAACTAACAAG-GGTATAA-----AAACAAATCA--GT--C-A--A---T-------ATG-A--C--T-G---A--GTG-ATAA-TTTG-TAATCGCAAA--CA--A-GGT----C-ATTAT-------AGCGACCGG-TAGAATT-TG--CG--AA-ATGATG---ACTTTAAAA-CGAG-ATTC-A-GT-TA----TAACCCTGCActtctttcgttacttggataattttattgaacattgac
gi|17 : taA-TAA-GAAA-----CCC-A---------------AGCAT----GCTCAT--TA--ATATCTAACTTCA--GAGTA-CTTGTGTGGG--CAATCA----------------GA--G----GGTTTT-------------CAACAAAATATGTGTCTT--GTTT------CCCAA----CG-ACTAGAAATTCG-TA--TT---TTCGGG---TGCCGG-TTTT----TTGT---------TTAAAAAGCA-ATTA--------TTATAAT------T-GAAAAAGG---CCTAAGAT--TT-TA-ACTTT--ATC-G---GAGGAATCGTTG-----------T-GTAAAG--T-GTGGAGAAATC--TACG-TTTTTGATGCAGTCAATT
gi|18 : aatcgaccaattgttgctaccatatgttttcctaatg-GGA-C----CTC-C---A-A-AA-ATTATAG-AGGTA-G-G--CAG-GA-TCA-GGGTGC-C-----A--GGAGGATCGTAA--------TTGAGCATC-CTCTGCTGACC----GATCT-CACACACCGC-CATCTGA-GCC-T-----TGTA-GTT-C---AA---A-CAA-A-GC-----------T---A--AACG-GG-GATTCT-ATCC------TCGTCA-AATCT-AGTACGAAA--AT--G-AA-GGCTAAACACAA-G-GGTT-ATT---GAAACAAGCAG--GT--C-AACA---T-------ATG-A--CT-T-T---A--GTG-ATAA-TTTG-T-ATCGC-AA--CA--A-tttgaaaattcttgtatt
gi|19 : gcaaacataaaatgttatgtagattattatcgTCATA------AATCCCATAA-A---GA------AT--A--TAAAA--C-------TA-AGGCAAA-CAC-GAA-C----CCT-T---G--CAT-AT---AC-CGG-A-G-G--TGG-GA-TCA-GG-TTT-TTTTTAA-AAGAGGG-----A---------TAAGCACC-CCTTGTTGACC-----G--T-C-CAC-TCGC-AT--TAT-ACC-C-----T-CT-ATC-T---TG---A-TCA-G-G------------T---A--AACT-GA-G---TA-ATCT-G----T----A-GGTC-AAGAACGAAA--aat
gi|2 : ttagatactgttggagacaatattggttgctcaccgaaagaatgaaaagtgaagataacgtaacagtgatccatcAAAT-GGCGAAG-TA----A-CAA----A--GT-A--T-A-AA----CGTAATCATA------G-TCCAAAAA-A---CA------AT--A--CAAAAA-TCGAGTTGTAAGGGCAAC-CAC-GGAAC----CTT-C---G-ACGA-A----AG-CGA-A-G-G--CAA-GG-TCA-GG-TGC-C-----AATGGAGAG-----A--------GTAAGCATC-CTCTGCTGACC----GG--T-CACAC-CCGC-CG--TGA-GCC-T-----G-TA-GTC-G---AA---A-CAA-ATG------------T---A--AACG-GG-G---TT-ACCC-G----TCGTCA-AATCTAAGTATGAAA--AT--G-CA-GTCTAAACAAAATG-GGTA-AAT---GAAACAAATCATGGT--C-AACA---T-------ATG-A--C--T-T---A--GTG-ATAC-TTTG-TA-TCGCAA---CA----GGT----C-ATTAT-------AGCGACC-G-TAGAATT-TGTGCG--AA-ATGATG---ACTTT--AA-CGAGAATTC-GGTT-TA-----AACCCTGCAA-CA-TA-CA-A--C--TTTTTGG---TT--AGT-AGTTGCCCT-CG--TT-------AAAAA--ATC--A--C-------A-TTACG-CAT--G-----CATG-------------C-CT-T-G-GTATC-GAATC-A-----C----CG--A-GAG-ACAT-TA-CACA-C-A-TAAT-GCAG--T-G-G-A--------TAGTGGTAACATTA-------------CTA-AC-AAAAA-A---A-G--G-AA--AAGTGAC---AAT------T-GGCAAG--------TCAAAGTCCCATCAACGT------TTATCA-T--ATATAT-------G-T-GTTTTGC--AGT-----CCTG--C--C-ATTAGAG-TC-AA-TATTA--TA-AAATATCC-A---A-T------------ATGAAGCACATTGGTCAGATTCTGTGGTGTC-T---TTA-TTTCAAGTTCGTCAGGATAATATCAAAATGGA-CATA-ATTGTGAAA-TTATGATTGTTAATGGAT---AA-ACATC-GTCTATATACCT----ATA-----AGTAAGG-TTG-AA---GGACACT-GCAAG---------------TTTT----TTGTTTTT------A--CCCG-AACAGTTT-TCCTGAA-ACA-AATTCTGCT--TTCAT-ATGGAATATATAA--AAATAAGTC---TGCCAATA---AG-GGGGC-AAC-AT---TAGTACCCAT-AGGAA--AC-CA-AC--A---------GAATTGTTGGAGAAGACGGATG-TCACTCCAA-AAAAGAC------TACAATAATATTAATCTA-TAAAGCAA----ACCC-A---------------AGCA---ATGCTC-T--TA--ATATCTTTCTTCA--GAGTA-CTTGTGTGGG--CAATCA----------------GAGTG----GGTTCT-------------GACAAAAATATGTATCT---GTTT-----CCCAAA----TG-ACCAGAAACTTGGTA--TT---TTCGGG---TGCC-G-TTTT----TTGT---------TC-AAAAGCA-ATTA--------T--CAAT--TTCCT-GAAAAA-G---CCT-AGAT--TT-T--ATTTT--ATCCGTGAG--GAATTGTTG-----------TA-TAAAG--TGGTGGAGAAATTCATATG-TTTTGA-TGCAGTCAATT---------TTAGAAA--AATCTCGTGATTGAA----GTTTTC-TATAAAGCT----CTTTAGAG-------TTTT----TGAGA-ATCCACAATC-T-GAA-TGAACACCACTTCTGGAATA-TGTAGTGGAAACAGTAT--CTTGAAG---TGACC-TTT-AACA--GCTGTT-AG--TAG-------TTTTGTTAGT--A-G---------TAAGGGA----------T-AGAG--------------G------C------TG---GTA-AGGCAC--TTACTGGAA---CCAGCGAATGTA--------TC--TTTGGTTTGTAAGGA-TTTC---TTA-TGCATATTT---T-TGGAA-----TCCAGT-A--------AAGGT-ATGGTAA-TTCAAATTGAT-CCTGAT-TCTTCGGAAATAT-TAA---ACGTATTC-CAAACAGAAAGGT-GATTTTG-AG-A-TT-TCATC-TTAGT-CAGATTGCTAGGA-GTATA-AAGTCAGGAAAATTCCCAGATGTG---TGA--AGTA-AACCC-TAAGTT-CAATTTAAAAAG-ACAAGTATAATA----GT-GA-CTTT--ATACAAAC--A-----AAG----ACAAG-------TG-----TT---ACTGTGCTTTAT--ACAGCCTGGAACCAGTAACAA-AGTTTTCATGTAG----TCTATGTAA--CTCA-TTTACCCCCTTCTG---GCT-TC-----TTAA-GACAG-----AAGGGTAAATAGT-AG--ATTTTCCC---CGC-----TAAA----TGGTTATAACGGGATTTTAAATAATTTCCGAA-TACTTTTGATCA-TTCAGACAAAGTGTCAAGAT-CTCTCCCTtaaatgttgatgcatt
gi|20 : A----A--AT-A--T-A-AATAGGCGAAGT--TA------A-TCCCAAAA-A---CAT-----AT--A--CAAAA--CCAAGT-GTA-GGGCAAC--AC-GGA-C----CTC-C---G-ACAA-A----AG-CGA-A-G-G--CAG-GA-TCA-GG-TGC-C-----A-TGGAAG------A--------GTAAGCATC-CTCTGCTGATC----GG--T-CACAC-CCGC-CG--TGA-GCC-C-----T-TA-GTC-G---AA---A-AAA-A-G------------CATGA--AACG-AA-A---TC-A-----------GTCT-AA-CTA--TAC-ATG--AC--T-TA-GT---GATAATATG-CGT--AATCTGGAAACAAGTCA--TTTGC-GAAA---TG------ATG-A--C--T-T---ca
gi|21 : AA----A--GT-AATT-A--------GTAA-CATA------G-TGCCAAAA-A---CAT-----AT--ATACAAAA--ACGAGT-GCA-GGGCAA--GAC-GGA-C----CTT-C---G-ACAA-A----CG-Ctaaattgagtattcgttat
gi|21 : ctattaC-C-----T-TC-GAC-A---AACGCA-CAA-A-A------------T---A--AACA-GG-G---TA-GCCC-G----TCGTAA-AATCTT-GTACAAAA--ATAAG--A-GTCTGA-CAAA--G-GGTA---C---GAAACAGATCA--GT--C-AACA---C-------ACG-A--C--T-T---C--GTG-ATAA-TTTG-TAGTCGCAAA--CA--A-GGT----C-ATTAT-------AGCGACA-G-TAGAATT-TG--CG--AA-AGGATG---Aacaaaataaacagggtagcccgtcgtaaaatcttgtacaaaaataagagtctgacaaagggtacgaaacagatcagtcaacacacgacttcgtgataatttgtagtcgcaaacaaggtcattatagcgacagtagaatttgcgaaaggatgat
gi|22 : ctattaaaagtaattagtaacatagtgccaaaaacatatatacaaaaacgagtgcagggcaagacggaTATC-TAATC-A---A-C----TG--G-GAG-ATATGCA-TAC--C-A-TTT--GCAA--G-G-G-A--------TAGTGGTA-TATTA-------------CTA--C-AAAGACA---G-G--G-AA--AGCTGAT---GAT------T-GCATTT--------TTAAAGTC--ACCAA-GC------TTATCA-T--ATA-AT-------G-TAGCTGT-A--AGT-----C-TG--C--C-ATTAGAG-CC-AA-TATTAAGTA-AAATATCC-A---ACT------------AAGAAGCAGATTTGTCAAATTCTGTGGTCTCCT---TTA-TTTTGAGTTCGTCGGGt
gi|23 : A-A----CG-CAC-A-G-G--CAG-GA-TCA-GG-TGC-C-----A-TGGAGG------A--------GTAAGCATC-CTTTGCTGACC----GG--T-CACAT-CCGC-CG--TGA-GCC-G-----G-TA-TTC-G---AA---A-CAA-A-A------------T---A--AACA-GG-G---TA-ACCC-G----TCGTAA-AATCT-TGTACGAAA--ATAAG--A-GTCT-GACAAA--G-GGT---AT---GAAACAGATCA--GT--C-AACA---C-------ACG-A--C--T-T---C--GTG-ATAA-TTTG-TAGTCGCAAA--CA--A-GGT----C-ATTAT-------AGCGA
gi|24 : AAA--GGCAAAGATA----A-CGA----ACAGTGA--T-C-AATCT-CGTAA-----------G-TCCTAAAT-A---GA------AT--A--CAAAA--ACAAGA-GTT-GGGCAAT-CAC-GGA-C----CCC-T---GGACAC-A----C--CAG-A-G-G--TGG-GA-TCA-GG-TAC-C-------TAGGAGG-----A--------GTAAGCATC-CCCTGTTGA
gi|25 : cactgtgataaatggtagtattaatgtTGTG---TGATAAGTATAACCC-T-AGTT-C-ATTTATAAAG-ACAAGTATAATATTTTCT-GG-CCCC--TAACAAAA--AAATTCAAG----ACAAATTGACTTTGTAACATCTTAACTCTGTTTCA---ACTGTCC--TGTAA-TAGCAATAGTTCTCTCG-------------TAAGGCTCATTTTAC-CACTTCTG---a
gi|26 : AATT-TG--CG--AA-ATGATA---A------GA-C-AGGATT-------------TAAGGCGACAA-CA-A--TA-A--AAATTTTTAGAATTT--AGTCAGT-GGCCT-CGACCTGATAAGAAAAAA--ATA--T--CAAAAAATA-T-ACG-CAC--GTGGTATATGAC-----------C-CTCT-GCGCGAC-GAATC-A---ATC----TG--ATGAG-ACGA-TA-CA
gi|27 : -A--C-A-AC----CGT--TCATA------A-TCCAAAAA-AATGTAT-----AT--A--CAAAAA-TCGAGT-CGA-GAGCAGCGCACTGGA-CACATCTT-CTGTA-ATAA-A----AGCCGA-ATG-GTTTAGTGA-T---AG-TTT-T-----A-TTGAGAG-----AAGAAAATGGTAAG------TCCACTAACC----AG--T-CA
gi|28 : ggcgactgtaTGTCAGTGTCTGTGGTGTCCTGAATTA-TATTAAGTTCTTCGCGATA-TATCAAA-TGGA-TATA-ACTGTGAAAATTATGATTGTTAATTGAT---AGCACATC-ACC
gi|28 : CACC-GCAAG---------------TTTT-----TGTTTTT------AT-TCCGTAACAGGTT-TT---GA-ACA-AATTgcaagtttttgtttttattccgtaacaggttttgaacaaatt
gi|29 : tgtcagtgtctgtggtgtcctgaattatattaagttcttcgcgatatatcaaatggatataactgtgaaaattatgattgttaattgatagcacat--CTCA-TT---ACACTTCTG---GCT-TT-----TTAAAGACA-------AGGATAAATAGTACGCCATTTTCCT---CGCGCGCTTAAAGTTTTAATTAC----GGATTTT-AATTACTTCCGAATTAATTTTGATCATTTCAGACAAAGTATTCAACTCCTCTCCC
gi|3 : AAAT-GGCGAAG-TACA--A-CAA----T--GT-G--TTA-AA----CGTAA-AATA------G-TCCCAAAA-A---CATGT---AT--A--CAAAA--TTGAGT-GTA-GGTCAAC--AC-GGA-C----CTC-C---G-ACAA-A----AG-TGA-A-G-G---AG-GA-TCA-GG-TGC-C-----A-TGG-GTG-----A--------GTAAGCATC-CTCTGCTGACG----CG--C-CACAC-CCGT-CG--TGA-GCC-C-----T-TA-GTC-G---AA---A-CAACA-G------------T---A--AACG-GG-A---TT-ACC--G----TCGTGA-AATCTA-GTACGAAA--AT--G--A---CTGA-CAAA--G-GATA---T---GAAACAAATCA--GT--C-AACA---T-------ATG-A--C--C-T---G--GTG-ATAA-TTTG-TAATCGCAAA--GA--A-GGT----C-ATTAT-------AGCGACC-G-TATAATT-TG--CG--AA-ATGAT----ACTTT--AAATGAGA-TTC-G-TTATACCGTTAACCCTGCAA-CA-T--CA-------TTTTTGG---TT--ACT-AGTTGGCCT-AGCTTT-------AAAAAT-CCC--T--C-------A-T-ACA-CAT--ATGC--CATGTGTTGGATATAGCC-CT-T-GCGTATC-GAATC-A---A-C----TG--A-GAG-ACAT--A-CACA-CCA-TAA--GCAG--G-T-G-A--------TATTGGTA-CATTA-------------CTA--C-ATAGA-A---AAG--G-AA--TGTTGAC---GATA-----T-GCAAAG--------TCAAAGTC--ATCA-CGT------TTATTA-T--ATA-AT-------G-TA--TGT-C--AGT-----C-TG--CATC-ATTAGAG-TC-AAATATTAAGTA-AAATAGCC-A---AAT------------ATAAAGCAGATATGTCAGATTCTGTGGTGTCCT---TTA-TTTCGAGTTCGCCA----AATATATAAATGGA-CATA-ATTGTG-AAATT-TTATTGTTAATTGATA--AG-ACATC-GTTTATATACCC----ATA-----TGTAAGG-TTG-AA---GGACACG-GT------------------TTTT----TTGTTTTT------AT-CCTGTAACGTTTT-TTTT--A-ACACAATTCTAC---TTCAT-AT-GAATATAAAA--A--TAAGTC---TGCCAATA---AG-AGGAC-ACA-AT---TAGTGTCCTT-AGGAAT-AC-CA-AC--A---------T-ATTGTTGGA-A-GAC--ATGGTTTCT--AA-A---GAC------TACATAAATATTG-TCCA-TAA-GAAA----ACCC-A---------------AGC----ATGCTC-T--TA--ATATC-TACTTC--AGAGTA-CTTGTGTGGG--CAATCA----------------GAGT-----GGTTCT-------------GAC-AAAACATGT
gi|30 : ctattaaacctgacacaatacatctgctagtcatctgggactgatgtttatatatcACATTG-------------TTA-ACTACATA-A---A-A--G-AA--A--T--------T------T-GCAAAA--------CTCAAGTC--ATCA-CGT------TTATCA-T--ATA-AT-------GTTAGTTGT-CCAAGTC----C-TG-----C-ATTAGAGATT-AA-TATTAAAGG-AAGTGTTC-ATGGAAT------------A
gi|31 : T-CA-CAC--C-A-TAA--GTAG--G-T-G-G--------TAGTGGT-ATATTA--------------TC-AC-ATTGA-A---A-G-----------------------------GCAAAG--------TTAAAGTC--ATC-TTGC------TTATCA-T--ATA-AT-------G-CAGTTGT-C--AGT-----G-TG--T--C-ATTAG
gi|32 : cttatCAT-T--CAC--C-A-TAA--GCAG--G-T-GGA--------TGGTGGTA-TATTA-------------CTA--C-ATAGA-A---A-G--GGAA--AGTTGAC---GATAGCCGATAGCAAAG--------TTAAGGTC--ATC-ACGC------TTATC
gi|34 : tatcctCAATA---AG-GGGGC-ACA-AT---TAGTGCCCGT-TGGAAT-AT-CA-AC------------GGATTGTTAG-TA-GAC--ATGG--TCTCCAA-A---GAC------TACACAAATATTA-TTTA-TAA-G
gi|35 : GA-GCC-T-----T-TA-GTC-G---AA---AACAG-G-GAGGGGGGGCGGTT---ACGAGCG-GA-G---TT-ACCCTG----TCGTCAGAATCT-AGTACGGAA--A---G--A-G--TGGACAAA--G-GGTA-ctaa
gi|36 : A-GG-T-C-C-----G-TGAATGA-----A--------GTAAGCATCTCGTTGCTGATCCGAGGA--T-CACAC-CCAC-CG--TGA-GCA-A-----T-CA-AGA-G---AA---A-CAG-A-tg
gi|37 : gatggatggtcgCCCAACATA---CATGTATAAT--A--CAGAG--TCGA-T-GTA-GA-CAAC--AC-AGA-C----CTAGT---A-ACAA-A----AGGCGA-G-G-G--CAG-GA-TCA-GG-TGC-C-----A-TG
gi|38 : cc--ATTTTCCC---CGC-----TAAA----TGG----------ATTTT-AATCATTTCCGAA-TATTTGTATCCA-TTCAGACAAAGTGTCAAGCTCCTCTCCCT
gi|39 : gcAAAT-GGCGAAG-TATTTTA-CAA----T--GT-G--T-TTAA----CATAATCATA------G-TCCAAAAA-A---CAT-----GT--A--CAAAA--TCGAG
gi|4 : tttgttataAAATTGGCGAAG-TA----AACAA----T--GT-G--TTA-AA----CGTAATCGTACATGTAG-TCCCTAAA-A---CAT-----AT--A--TACAACTTCGAGT-GTA-TGGCAAC--AT-GGA-C----CTC-C---G-ACAACA----GG-CGA-A-G-C--CAG-GA-TCA-G--TGC-C-----A-TGGAGGG-----A--------GTAGGCATC-CTCTGCTGACC----GG--T-CAC-C-CCACACG--TGA-GCCTC-----G-TA-GTC-G---AG---A-CAA---G------------T---A--AACA-GG-G---TT-TACC-G----TC---------TAC-TACGAAATGAG--A-CA-GTCTAA-CAA---G-GGTA---T---GAAACAAATCA--GT--C-AGCA---T-------ATG-A--C--T-T---A--GTG-ATAA-TTTGGTAATCGCAA---CA--A-GGT----C-AT-AT-------AGCGACC-G-TAGAATCCTG--CG--AA-ATGCTGCGGACTTTGAAA-CGAGAACTC-G-TT--A----TAACCCTGCAAACA-T--CA-TTTC--TTTTT-----TT---GT-AATTGAC-T-CGCTTT-------AAAG----TC--CTGC-------G-T-CCG-CAT--GA----TATA-------------C-CT-TTGCGTATC-GAATC-A---A-C----TG--A-GAG-ACAT--A-CACA-CCA-TAA--GCAG--G-T-G-A--------TAGTGG-AACATTA-------------CTA--C-AAAGA-A---A-G--GGAA--AGTTGAC---GAT------T-GCAAAG--------TCA--------TCA-CGT------TTATCA-T--ATA-AT-------G-TAGTTGT-C--AGT-----C-TG--C--C-ATTAGAA-TC-AA-TTTTAAGTA-AAATATCC-A---AAT------------ATGAAGCACATCTGTCAGATTCTGTGGTGTTCT---TTA-TTTGGAGTTCGTCAGGAT-ATATC-AAATGGA-CATA-ATTATGAAAATTATGATTGTTAATAGATC--AG-ACATC-ACCTATATATCTAC--ATA-----TGTA
gi|41 : actatcttatccgaatgacatcaaagattacttgaacgattgtctgtactgcaatat---AG-ACATC-ATCTATATATCT----ATA-----TGTAATG-ATG-AA---GGACACA-GTAAG---------------TTTT----TTGTTT
gi|42 : AAAT-GGCGAAG-TA----A-CAA----A--GT-A--T-G-AAC---CGTAATCATA------
gi|44 : AAAT-GGCGAAG-TA----G-CAA----A--GT-AT-T-C-AA----CATAATCATA------A-Tcgtacacagataaaccata
gi|46 : cgcacatttataTTTTGG---TT--AGT-AGATGGCCT-CGCTTT-------AACAA--ATC--
gi|47 : A-A---G-G--G-GA--AATTGAC---AAT------T-GCAAAG--------TCAAAGTC--AT
gi|49 : -A---AAT------------ATGAAGCACATCTGTCTGATTCTGTG
gi|5 : AAATTGGTGAAG-TA----AACAA----T--GT-G--T-T-AAT---CGTAATCATA------G-TCCTAAAA-A---CAT-----ATTTA--CAAAG--TCGAGT-GTA-GGGCAAC--AC-GGA-T----CTC-C---G-ACAA-A----AG-CGA-A-G-G--CAG-GA-TCA-GG-TGC-C-----A-TAGAGG------A--------GTAAGCATC-CTCTGCTGACC----GG--T-CACAC-CCGC-CA--TGA-GCC-C-----T-TA-GTC-G---AA---A-CAA-G-G------------T---A--AACA-GG-A---TT-ACCC-G----TTGTCA-CATCT-AGTACGAAA--AT--GACA-GTCT-AACAAAA---GGT---AT---GGGACAAATCA--GT--C-AGCA---T-------------------------------TAA-TTTA-TAATCGCAAA--CA--A-GGT----C-ATTAT-------ACCGACT-G-TAGAATT-TG--CG--AC-ATGGTG---ACTTTA-AA-CGAGAA-TC-G--T-TA----TAATCCTGCAA-CA-T--CA-A--C--TTTTTAG---TT--AGT-AGTTGGCCT-CGCTTT-------AAAAA--GTCT-T--C-------A-T-ACG-CAT--GA----CATGT------------T-CT-T-GCGTATC-TAATC-A---A-CTGCATG--G-AAA-ACAT-T--CACACC-A-TAA--GCAG--G-T-G-ATACATTTGTAGTGGT-ACATTA-------------CTA-
gi|6 : tatactctatatgataatatatgtcttctgaaaccgcttttacatgtttctgtgttggcgacatcggtattttgggctttttcaaaagtttggcttatatttaaaaagttttcttttcatgaatgcatttttttctgtatttttttttattgtatgtagtaaaagatatT-GGCCAAA-TA----AACAA----T--TTGA--T-A-AT----TGTAATCAAA------A-CCCCAAAA-----CAT-----AC--A--CAAAG--TCGAAT-GTA-AGGAAAC--AC-AGA-C----CTC-C---G-ATAA-T----AG-CGA-A-G-G--AAT-AG-TCA-GT-CG-----------------------------------GCATC-CTCTGCTGACC----GG--T-CACAT-CCGC-CG--TGA-GCC-C-----T-TG-GTC-G---AA---A-CAA-A-G------------T---A--AACG-GG-A---TT-ACCC-G----TCGTCA-AATCTA-GTAGGAAA--AT--GACA-GTCTAA-CAAA--G-GGTA---T---GAAACAAATCA--GT--C-AACA---T-------ATG-A--C--T-T---A--ATG-ACAA-CTTG-TAATCGCATA--CA--A-GGT----C-ATT---------------------------TG--CG--AA-ATGGTG---ACT-----------------------G----TAGCCCTGCAA-CA-T--CA-------TTTTTTG---CT--AGT-AGTTGACCT-CGCTTT-------AAAAA--GTCC-T--C-------G-T-ACG-CAT--GA----CATG-------------CTCT-T-GCGTATC-GAATC-A---A-C----TG--G-AAG-ACAC--A-CACA-C-AATAA--GCAG--G-T-G-A--------TAAGGGTA-CATTA-------------CTA--C-ATGAA-A---A-G--G-AA--AGGTGAC---GAT------T-GCAAAG--------TTAAAGTC--ATCA-CGC------TTATCA-T--ATA-AT-------G-CAGTTAT-C--AGC-----C-TA--C--C-TTTAAAG-TC-AA-TATTAAGTA-AAAAATCC-A---AAT------------ATGAAGCAGATATGTCAGATTCTGTGGTGTCCT---TTA-ca
gi|7 : atagatTGTCAGATT--GTGTTGTC-T---TTA-TAT-GAGTTT-TCGGGATA-T-TCCAAAT------TA-AT----------GCCCTTGTTA-TTGAT---AGCAGAT--ATCTATAT-CCT----ATA-----TATAAGG-TTG-A-----GACAAA-GCAGGGAGTTTTTTTTTTTTTTTT----TTGTTTTT------AT-CCCGTAA-AGTTT-TTGT--A-GCA-AATTCTGC---TTCAT-ATGTAATAT-TCA--G--TAAGTCTGGTGCCAATA---AA-GGGG---CA-AT---TAGTGCCACT-AGGAATGACGCA-ACGGA---------GAATTGTTTGATC-GAC--CT-GTCTCTCC-A-C---GAC------TACATAAATAATT-TCTG-TAA-GAAACTCTACTC-ATCATGATGTCATGTTATCAT--TTGTTC-TAATAATATATCCTACTTCAGAGAGTA-CT--TGTGGG--C-ATCA----------------GAGT-----GTTTTT-------------TAAACAAATATGTGTCTT--GTTTTTCCGCCCCAATCCCCGAACTAGAAA--TATTA--TT---TTCGGG---GGTC-ATTTTT----TTGT---------TT---AACCACATT---------T--CGATAAT--CT-GAAAAG------CT-AGAT--TTAT--ATTTTTAAT--GTGAatactggcgtcaaagctcaaaattcttggagcgggaataataaaatatatt
gi|8 : taagatataaaacggtcagctactaaggattgtgtggtgAAAT-GGCGAAG-TA----A-CAA----A--GT-A--TGA-AA----CGTAATCATA------G-TCCAAAAA-A---CAC-----AT--A--CAAAA--TCGAGT-GTA-GGGCAAC--AC-GGA-C----CTT-C---G-ACGA-A----AG-CGA-A-G-G--CAG-GA-GCA-GG-TGC-C-----A-TGGAGG------A--------GTAAGCATC-CTCTGCTGACC----GG--T-CACAC-CCGC-CG--TGA-GCC-T-----G-TA-GTC-G---AA---A-CAA-A-G------------T---A--AACG-GG-G---TT-ACCC-G----TCGTCA-AATCTA-GTATGAAA--AT--GACA-GTCTAA-CAAA-TG-G-TA---T---GAAACAAATCA--GT--C-AACA---T-------ATG-A--C--T-T---A--GTG-ATAC-TTTG-TAATCGCAAA--CA--A-GGT----C-ATTAT-------AGCGACC-G-TAGAATT-TG--CG--AA-ATGATG---ACTTTA-AA-CGAG-ATTC-G--T-TA----TAACCCTGCAA-CA-T--CA-A--C--TTTTTGG---TT--AGT-AGTTGGCCT-CGCTTT-------AAAAA--ATCA-T--C-------A-T-ACG-CATG-G-----CATGC------------C-CT-T-GCGTATC-GAATC-A---A-C----TG--A-GAG-ACA--TA-CACACC-A-TAA--GCAG--G-T-G-A--------TAGTGGT-ACATTA-------------CTACAC-AAA-A-A---A-G--G-AA--AGTTGAC---AAT------T-GCAAAG--------TCAAAGTC--ATC-ACGT------TTA
gi|9 : ggcatataCCCCAAC-A---CAT------T--A--CAAAT--TCGC-T-GTA-AG-CAAC-CG--GGA-C----CTC-C---G-ACAA-A----AG-----A-G-G--TAG-GA-TCA--G-TGCAC-----A-TGGGAGG-----A--------GTAAGTTTC-CTCTCCCGAC------G--T-CACAC-CCGCGCA--TGACACC-CCCAAAT-TA-GAT-GACCAA---A-C-A-A-G------------T---A--AACG-GG-GA--TTAACCC-GGGTTTCA--A-AAT---AGTACGAAATGAC--A-CA--TCT-AACAAA--G-GGT---AT---GAAACAAATCA--GT--CAAACA---T-------ATG-A--C--T-TGCGG--ATG-ATAA-TTTG-TAATCGGGAA--CAACA-GGT----C-ATTATTTCGATAAGC-ACC-GCTAGAATT-GC--CG--A-----------------------AGAATTC-G--T-TA----TTAACCTACAA-CA-TA-CA-A--C--TTTTTTG---TT--AGT-AGTTTGGCT-CCCTTT-------AAAAGCCCTC--C--C-------A-C-ACG-CACGAG-----TATG-------------C-TC-T-GCGTATC-GAATCAA---A-C----CG--A-GAG-ACAT-
5 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|33 ): GTTTTTGCGTTGGTGACATCAGAATTTTGGATTTTTTCAAAACTTTGGCAGTGACTGGCTTATCATATTTAAAAAGTTTTCTTTTCATGAATGCATTT
Unaligned ( gi|40 ): TTAAAAGTGAAGATAACAAACAGTGATCTATGTCATAATTCCTATAAAAAATTGAAATCTAA
Unaligned ( gi|43 ): GATCTGAGGTCCAGGGGTGATGAATATAGCATACTTCCATGTTGATTGATT
Unaligned ( gi|45 ): TATTAAGTGATGCCATACATAGAGGATCTTGAATGAGT
Unaligned ( gi|48 ): TAGTCGATACTAAAATTCATGCTCATTTGAT
Alignments
lowQualScore : 111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111
lowQualScore : 111111 1111111 22222222222222 111111 22 111111111111111 111111111111 22 3333333333333333333333333333333333 1111111 11 1111111111 11 1111111 1111111 2222222222222 444444444444444444444444444 1111 1111 11 1 11111111 11 111111111111111111 111111 11111111 22 111111 111111111 1111111 222222222222 222 1 2222 11111 1111 11 444444444444444 1111 222222 2222 222 1 11 11 111 111 111 11 444444444444 111 11 1 1 1111 222222 11111 555555555555555 22222 11 11 111 11 5555555555555555555555555 44444444444444 11 222222 2222 1 11 111 111 111 2222 4444444444444 1 444444444444444444444 1 33333 1 11 2222 11 222222 66666666666666 2222 1 22 1 1 333333333 11 2222 11 2222 222222 2222 1 111 11 1 1 1 1 1 1 111 22 11 444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444 111 1 11 111 11 44444444 11 1 1 1 1111 1 333333333333333333333 4444444444 1 1 1 1 11 111 111 1 1 1 1 1 111 22222 111 11 22222222 11 444444444444444444444444444444444 111 4444444444444444444444 111 55555555555555 11 111 22222222 111 222222 22222 111 22222 2222 33333 1 1 1
lowQualScore : 6 6 333333 4444444 55555555555555 3 777777 2 2 444 444444 33 33 88 2 2 1 11 2 2 5555 2 444 4 2 6666 4 2 2 2 555 2 2 2 2 2 8888888 333333333333333 2 5555 33 2 2 5 33 2 6666666 2 2 2 666 333 2 222 333333333333 333 33 2 2 666 2 2 5555 1 2 11 66 6666666666666666666666666666666666 33 33 2 444 0000000 4 33 55 2 444444 2 2 2 0 33 33 2 5555 2 9999999 3 6 2 33 33 2 777 3 0 88 3 33 3 7777777777 0 3 3 11 8888888 1 555 44 3 0 3 4444444 77 5555555555555 3 3 3 999999999999999999999999999 3 3 3 3 555 3 7777 8888 3 4444 77 0 3 77 44 3 6 3 22222222 88 888888888888888888 7 222 6 555 6 44 3 44 33 555 222222 3 22222222 44 22 000000 4 66 4 777777777 8888 6666666 99999 4 5 5 5 0 5 4 777 222222222222 0 1 2 888 5 5 4 11 99 3 7 3 6 6 3 3 1 111 1 5 3333 66666 8 8 4444 00 888888888888888 4444 333333 88 0 8 3333 8 8 3 999 0 6 33 44 33 3 777 444 8 8 8 444 1 8 66 8 8 333333333333 3 777 99 0 0 5 4444 8 333333 6 0 8 6 6 77777 8 000000000000000 33333 3 8 11 11 3 6 999 8 0 11 0 9999999999999999999999999 55555555555555 5 55 33 777777 1111 0 6 9 33 777 777 444 1111 2222222222222 1 0 555555555555555555555 0 00000 0 33 4444 33 111111 0 88888888888888 1111 3 00 3 3 2 777777777 88 1 1 4444 66 2222 888888 8888 3 555 88 3 3 3 3 3 3 7 0 777 99 33 3 777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777 777 0 3 33 2 777 2 22 6 66666666 33 0 0 3 3 0 7777 0 2 999999999999999999999 2 9999999999 0 0 0 0 3 33 3 777 999 2 3 4 3 0 0 0 0 0 777 44444 0 2 444 11 8 3 8 8 0 8 88 8 77777777 8888 1 11 1 111111111111111111111111111111111 777 1 8888888888888888888888 1 000 33333333333333 11 0 8 0 8 0 0 444 66666666 000 777777 0 7 88888 777 55555 1111 3 22222 3 1 3 1 3 6
lowQualScore : . . ...... ....... .............. . ...... . . ... ...... .. .. .. . . . .. . . .... . ... . . .... . . . . ... . . . . . ....... ............... . .... .. . . . .. . ....... . . . ... ... . ... ............ ... .. . . ... . . .... . . .. .. .................................. .. .. . ... ....... . .. .. . ...... . . . . .. .. . .... . ....... . . . .. .. . ... . . .. . .. . .......... . . . .. ....... . ... .. . . . ....... .. ............. . . . ........................... . . . . ... . .... .... . .... .. . . .. .. . . . ........ .. .................. . ... . ... . .. . .. .. ... ...... . ........ .. .. ...... . .. . ......... .... ....... ..... . . . . . . . ... ............ . . . ... . . . .. .. . . . . . . . . ... . . .... ..... . . .... .. ............... .... ...... .. . . .... . . . ... . . .. .. .. . ... ... . . . ... . . .. . . ............ . ... .. . . . .... . ...... . . . . . ..... . ............... ..... . . .. .. . . ... . . .. . ......................... .............. . .. .. ...... .... . . . .. ... ... ... .... ............. . . ..................... . ..... . .. .... .. ...... . .............. .... . .. . . . ......... .. . . .... .. .... ...... .... . ... .. . . . . . . . . ... .. .. . .......................................................................................... ... . . .. . ... . .. . ........ .. . . . . . .... . . ..................... . .......... . . . . . .. . ... ... . . . . . . . . . ... ..... . . ... .. . . . . . . .. . ........ .... . .. . ................................. ... . ...................... . ... .............. .. . . . . . . ... ........ ... ...... . . ..... ... ..... .... . ..... . . . . . .
lowQualScore : 7 7 999999 2222222 55555555555555 2 222222 7 5 444 888888 44 44 44 7 7 7 00 5 4 0000 4 111 7 2 9999 4 4 4 4 333 4 4 1 1 1 2222222 000000000000000 2 0000 22 4 5 0 22 2 0000000 1 1 1 666 777 1 555 666666666666 999 11 4 4 555 4 4 0000 8 4 88 55 6666666666666666666666666666666666 22 22 4 111 0000000 7 22 66 4 999999 5 5 5 8 44 44 5 7777 7 3333333 1 2 9 99 99 9 999 3 3 88 1 88 1 5555555555 8 3 3 22 8888888 0 888 66 3 2 3 2222222 99 9999999999999 6 6 6 777777777777777777777777777 6 6 3 3 888 3 5555 5555 3 9999 33 0 3 99 66 3 7 3 11111111 66 000000000000000000 3 777 7 888 7 66 3 66 33 888 999999 3 11111111 66 44 555555 4 11 4 888888888 9999 3333333 66666 4 0 0 0 4 0 4 888 888888888888 7 7 5 888 0 3 3 44 00 5 5 5 7 7 2 2 7 444 4 7 3333 77777 0 0 8888 33 333333333333333 2222 000000 88 8 0 0000 0 0 2 222 0 5 88 22 88 2 555 000 0 0 0 000 0 0 88 0 0 888888888888 8 666 00 0 6 0 8888 0 000000 0 8 0 7 7 88888 0 000000000000000 44444 2 0 00 00 8 0 444 0 8 00 8 8888888888888888888888888 00000000000000 6 88 88 555555 2222 0 5 2 88 555 555 000 2222 8888888888888 0 0 888888888888888888888 0 00000 0 88 8888 88 555555 7 33333333333333 0000 3 77 7 3 3 000000000 00 0 0 0000 00 5555 777777 3333 3 333 33 3 3 3 3 7 3 3 8 555 22 88 2 222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 555 0 2 88 5 555 5 55 5 22222222 88 0 0 2 2 0 8888 0 5 555555555555555555555 5 5555555555 0 0 0 0 2 22 2 555 555 5 2 0 2 0 0 0 0 0 222 55555 2 5 000 00 0 2 0 0 8 0 88 0 44444444 2222 4 00 4 000000000000000000000000000000000 555 0 0000000000000000000000 2 222 88888888888888 00 8 0 8 8 6 8 000 22222222 222 555555 8 3 88888 555 00000 2222 2 00000 3 0 3 0 3 7
consensus : AAAT-GGCGAAG-TA----A-CAA----A--GT-A--T-A-AA----CGTAATCATA------G-TCCCAAAA-A---CAT-----AT--A--CAAAA--TCGAGT-GTA-GGGCAAC-CAC-GGA-C----CTC-C---G-ACAA-A----AG-CGA-A-G-G--CAG-GA-TCA-GG-TGC-C-----A-TGGAGGG-----A--------GTAAGCATC-CTCTGCTGACC----GG--T-CACAC-CCGC-CG--TGA-GCC-C-----T-TA-GTC-G---AA---A-CAA-A-G------------T---A--AACG-GG-G---TT-ACCC-G----TCGTCA-AATCTAAGTACGAAA--AC--G-CA-GTCTAAACAAAATG-GGTA-AAT---GAAACAAATCA--GT--C-AACA---T-------ATG-A--C--T-T---A--GTG-ATAA-TTTG-TAATCGCAAA--CA--A-GGT----C-ATTAT-------AGCGACC-G-TAGAATT-TG--CG--AA-ATGATG---ACTTT--AA-CGAGAATTC-G-TT-TA----TAACCCTGCAA-CA-T--CA-A--C--TTTTTGG---TT--AGT-AGTTGGCCT-CGCTTT-------AAAAA--ATC--T--C-------A-T-ACG-CAT--G-----CATG-------------C-CT-T-GCGTATC-GAATC-A---A-C----TG--A-GAG-ACAT-TA-CACA-C-A-TAA--GCAG--G-T-G-A--------TAGTGGTAACATTA-------------CTA-AC-ANAGA-A---A-G--G-AA--AGTTGAC---GAT------T-GCAAAG--------TCAAAGTC--ATCAACGC------TTATCA-T--ATA-AT-------G-TAGTTGT-C--AGT-----C-TG--C--C-ATTAGAG-TC-AA-TATTAAGTA-AAATATCC-A---AAT------------ATGAAGCAGATCTGTCAGATTCTGTGGTGTCCT---TTA-TTTCGAGTTCGTCGGGATAATATCAAAATGGA-CATA-ATTGTGAAAATTATGATTGTTAATTGAT---AG-ACATC-ATCTATATACCT----ATA-----TGTAAGG-TTG-AA---GGACACG-GCAAG---------------TTTT----TTGTTTTT------AT-CCCGTAACAGTTT-TTTTGAA-ACA-AATTCTGCT--TTCAT-ATGGA--ATATAAAA--ATAAGTC---TGCCAATA---AG-GGGGC-ACA-AT---TAGTGCCCNT-AGGAAT-AC-CA-AC--A---------GAATTGTTGGA-NAGAC--ATGGTCTCTCC---AA-AGAC------TACATAAATATT-ATCTA-T-AAGAAA----ACCC-A---------------AGCAT--ATGCTC-T--TA--ATATCTTACTTCA-AGAGTA-CTTGTGTGGG--CAATCA----------------GAGTG----GGTTCT-------------NACAAAAATATGTGTCTT--GTTT-----CCCCAA----CG-ACCAGAAACTTGTTA--TT---TTCGGG---TGCC-G-TTTT----TTGT---------TT-AAAANCA-ATTA--------T--CAAT--T--CT-GAAAAA-G---CCT-AGAT--TT-T--ATTTT--AT-CGTGAGAGGAATCGTTG-----------TAGTAAAG--TGGTGGAGAAA-TC-ATACG-TTTTGGATGCAGTCAATTGTCTCAGCATTGGAAACAANTCTCGTGATTNAAAGTTGTTTTNGTATAAAGCTGGGCCTTTAGAGGGGGCGTTTTT----TGAGA-ATCC-CAATC--TGAA-TG-ACACCA-TTCTGGAATA-TGTAGCGG-AACAGTATATCNTGAAG---TGACT-TTTTAACA--GCTGTTCAG--TAG-------TTT--TTAGT--A-GAC-------TAAGGGA----------T-AGAG--------------GG-----C------TG---GTA-GAGCAC--TTACTGGAA---CCAGCG-ATGTA--------TC--TTT-G-TTTGTAAGGA-TTTC---TTA-TGCG---TT---T-CGGAA-----TCCAGT-A--------AAGGT-ATGGTAA-TTCAAATTGAT-CCTGAT-TCTTCGGAAA-TATTGAA---AGTATTT-CAAACAGAAAGGTGANTTTGAAGAA-TT-TCATC-TTAGT-CAGATTGCTTGGA-GTATA-AAGT----AAGATTCCCAGATGTG---TGA--AGTA-AACCC-T-AGTT-C-ATTTAAAAAG-ACAAGTATAATA----GT-GA-CTCT--TTACAAAC--A-----AAG----ACAAA-------TGTGA-ATC---ACTNTGCTTTAT--GCTGTCT--AACT---A-TAACAA-AGTTTTCACG-----TG----TNTAA--CTCA-TTTACNCACTTCTG---GCT-TC-----TTAA-GACAG-----AAGGATAAATAGT-CG--ATTTTCCC---CGC-----TAAA----TGGTTAC----GGATTTT-AATNATTTCCGAA-TANTTTTGATCA-TTCAGACAAAGTGTCAAGCTCCTCTCCCT
Reference ( family-568 ) : AAAT-GGCGAAG-TA----A-CAA----A--GT-A--T-A-AA----CGTAATCATA------G-TCCCAAAA-A---CAT-----AT--A--CAAAA--TCGAGT-GTA-GGGCAAC-CAC-GGA-C----CTC-C---G-ACAA-A----AG-CGA-A-G-G--CAG-GA-TCA-GG-TGC-C-----A-TGGAGGG-----A--------GTAAGCATC-CTCTGCTGACC----GG--T-CACAC-CCGC-CG--TGA-GCC-C-----T-TA-GTC-G---AA---A-CAA-A-G------------T---A--AACG-GG-G---TT-ACCC-G----TCGTCA-AATCTAAGTACGAAA--AC--G-CA-GTCTAAACAAAATG-GGTA-AAT---GAAACAAATCA--GT--C-AACA---T-------ATG-A--C--T-T---A--GTG-ATAA-TTTG-TAATCGCAAA--CA--A-GGT----C-ATTAT-------AGCGACC-G-TAGAATT-TG--CG--AA-ATGATG---ACTTT--AA-CGAGAATTC-G-TT-TA----TAACCCTGCAA-CA-T--CA-A--C--TTTTTGG---TT--AGT-AGTTGGCCT-CGCTTT-------AAAAA--ATC--T--C-------A-T-ACG-CAT--G-----CATG-------------C-CT-T-GCGTATC-GAATC-A---A-C----TG--A-GAG-ACAT-TA-CACA-C-A-TAA--GCAG--G-T-G-A--------TAGTGGTAACATTA-------------CTA-AC-ANAGA-A---A-G--G-AA--AGTTGAC---GAT------T-GCAAAG--------TCAAAGTC--ATCAACGC------TTATCA-T--ATA-AT-------G-TAGTTGT-C--AGT-----C-TG--C--C-ATTAGAG-TC-AA-TATTAAGTA-AAATATCC-A---AAT------------ATGAAGCAGATCTGTCAGATTCTGTGGTGTCCT---TTA-TTTCGAGTTCGTCGGGATAATATCAAAATGGA-CATA-ATTGTGAAAATTATGATTGTTAATTGAT---AG-ACATC-ATCTATATACCT----ATA-----TGTAAGG-TTG-AA---GGACACG-GCAAG---------------TTTT----TTGTTTTT------AT-CCCGTAACAGTTT-TTTTGAA-ACA-AATTCTGCT--TTCAT-ATGGA--ATATANAA--ATAAGTC---TGCCAATA---AG-GGGGC-ACA-AT---TAGTGCCCNT-AGGAAT-AC-CA-AC--A---------GAATTGTTGGA-NAGAC--ATGGTCTCTCC---AA-AGAC------TACATAAATATT-ATCTA-T-AAGAAA----ACCC-A---------------AGCAT--ATGCTC-T--TA--ATATCTTACTTCA-AGAGTA-CTTGTGTGGG--CAATCA----------------GAGTG----GGTTCT-------------NACAAAAATATGTGTCTT--GTTT-----CCCCAA----CG-ACCAGAAACTTGTTA--TT---TTCGGG---TGCC-G-TTTT----TTGT---------TT-AAAANCA-ATTA--------T--CAAT--T--CT-GAAAAA-G---CCT-AGAT--TT-T--ATTTT--AT-CGTGAGAGGAATCGTTG-----------TAGTAAAG--TGGTGGAGAAA-TC-ATACG-TTTTGAATGCAGTCAATTGTCTCAGCATTGGAAACAANTCTCGTGATTNAAAGTTGTTTTNGTATAAAGCTGGGCCTTTAGAGGGGGCGTTTTT----TGAGA-ATCC-CAATC--TGAA-TG-ACACCA-TTCTGGAATA-TGTAGCGG-AACAGTATATCNTGAAG---TGACT-TTTTAACA--GCTGTTCAG--TAG-------TTT--TTAGT--A-GAC-------TAAGGGA----------T-AGAG--------------GG-----C------TG---GTA-GAGCAC--TTACTGGAA---CCAGCG-ATGTA--------TC--TTT-G-TTTGTAAGGA-TTTC---TTA-TGCG---TT---T-CGGAA-----TCCAGT-A--------AAGGT-ATGGTAA-TTCAAATTGAT-CCTGAT-TCTTCGGAAA-TATTGAA---AGTATTT-CAAACAGAAAGGTGATTTTGAAGAA-TT-TCATC-TTAGT-CAGATTGCTTGGA-GTATA-AAGT----AAGATTCCCAGATGTG---TGA--AGTA-AACCC-T-AGTT-C-ATTTAAAAAG-ACAAGTATAATA----GT-GA-CTCT--TTACAAAC--A-----AAG----ACAAA-------TGTGA-ATC---ACTNTGCTTTAT--GCTGTCT--AACT---A-TAACAA-AGTTTTCACG-----TG----TNTAA--CTCA-TTTACNCACTTCTG---GCT-TC-----TTAA-GACAG-----AAGGATAAATAGT-CG--ATTTTCCC---CGC-----TAAA----TGGTTAC----GGATTTT-AATNATTTCCGAA-TANTTTTGATCA-TTCAGACAAAGTGTCAAGCTCCTCTCCCT
gi|1 : AAACAGGGTA-TGCA-AA-----AAACCAATCA--AT--C-AATA---TCATTTTTATGTAGTC--TCT---ATTGTG--TACCTTTG-TAATCGCAAA--CA--ACGGT----CCATTAT-------AGCGACC-G-TAGTATT-TG--CG--AA-ATGATG---A-TTT--AA-CGAGAATTC-G-TTATA----TCACCCTGCAA-CA-T--CAGA--C--TTTTTGG---T---AGT-AGTTG-CCT-CGCTTTT------AAAAA--ATCA-T--C-------A-T-ACGACAT--GG----CATG-------------CTCT-T-GCGTATCTGAATC-A---A-C----TG--A-GAG-ACAT--A-CACA-CCA-TGAACGCAGCGG-T-GGA--------TAGTGGTA-CATTATACATTCTTTGTTCTT-ACTATGAATA---A-GTTG-AACAAGTTGACTTGGAT------T-GCCAAGCCTATCCTTCAAA-TC--ATCAACGCCCCCCTTTATCCCT--ATA-ACTCGCACCGCTAGTTG--C--AGTGTCGCT-TGTTC--CGATTAATG-TCGAA-TATTTTGTGGAAATATTTTA---AATCACTTCATAACAACGAAGCAGATC-GTCAGATTCTGTGGTGTCCT---TTACTTTCGAGTTGTTCGG--TGATTTCAAATGGGACCATACATTATGAAAATCATGATTGTTAATTGATATAAA-ACATCAATCTATATACTTTCAAATATATTTTGTTAGGTTTGCAACTGAGACACGTGCAAGA--------------TTTTTTCGTTGTTTTTTAAAAAATCCCCGTAACAGCCTATTTTGAATCCA-AATTC-GCTAGTTGCTAATAGA--ATTTAGAATCAT-AGTC---TGCCAATATTTAGTGGGGCAACAGACTCATAGTGTCCATAAGGGATAAT-CACAC--ACTTACCTAGGAATGTTTGGA-GAGACA-ATGG-CTACAC---AATAGACACCAATTACAT-AGT-TT-ATCTATT-ATTAGA----ACCCAA---------------AGCATGAATA--A-T--TA--ATATCTT-CTTCA-AGAGCACCTTGTATGAGATTAATCAGTTATTGCATTTTGGGGGGTGTTTTGGTTCTTTTCATTCTTATAAACAAAAATATGCAT-TTAAATTT-----CCCCAA----CG-ACCAGAAACTTGTTACCTTAAGTTCAGGTTTTGCC-G-TTTTGGTGTTGTTCCAAACCCTT-GAAACCA-ATTAATCACTTTT--CAAT--T--CTCGAAAAA-GCGCCCT-GGATAATT-TTAATTTC--AT-TGTGAGAAGAATTGTTGTAATATTGGGTTAGTAGAGCTCGGGGCAGAAA-TCAATAAGATATTGAATGCAGTCAATTGTCTCAGCATTGAAAACAACTCTCGTGATTTAAAGTTGTTTTAGTATAAAGCTGGGCTTTTAGAAGGGGCATTTTCACCGTGAGA-AT-T-CAATCTTTGAATTG-ACACCA-TTCTGGAATA-TGTAGCGG-AATAGTATATCCTGATATTCTGACTCTTTTAACAGCGCTGTTCAAGCTAGTTTAAGCTTT--TTAGT--ATGACAATCTTTTAAGGTA----------TAAGAG--------------GGGTCACT------TG---GTATGATCACTATTTCTGGAACCGCCAGCG-AC-TACTAACTACTT--TTT-GTTTTGTAAGGA-TCTCACTTTATTGCA---TT---TCCGGAG-----T-CAGT----------AAGGT-ATGGGAATTTCAAGTTGGTCCCTCGT-CCTTCGG-AA-TATTGAA---AGTATTTACAAACAGAAAGTTGATTTTGAAGAATTT-TCATCTTTAGTAAAGGTTGCTTGTA-GTAAT-AAGT----AAGATTCTCCAACCTGTTCTGA--AGTA-AA-CC-T-AGTT-C--TTTAAAAGC-ACAAGTATAA-A----GTAAA-CTTT--TAACAAACGGA-----AAGCACCATAGC-------TGT-A-ATC---AGTGTACTTT-T--GCTCTCT---TCT---G-TTAC----GCCTCTAC------TG----TATAA--CTTA-TTTACCCCCTTCTGTTTGCT-TCTCTCGTT---GACAGAAATTAAGGATAAA-AGTCCG--CTTTTTTCCAACGC-----TAAA----TGGTTA
gi|10 : tttcaaactaccataccggaaaa--TGA-GCC-------T-TACATC-GTT-GA---T-CAG-A--------------T---A--AACA-GGTG---CT-TCTT-G------GTAT-AATTTA-GTATGTAA--AG--A-CC-GGCTTAACAA--TT-GG---AAT---GAAACGCTTCA--GA--C-AACAACCT-------AC--A--C--G-T---A--CCT-ACAA-GTTG-TATTTGCAAATGCA--A-AATAAACC-ATCAT-------AACGACC-A-TAGAATT-TG--TA--AACACGA-G---ATTGT--A---GAAACTCCTG-TT-TG----T-------CAG-TA-T--CA----C--GCCTTGG---TTTAAG--ACTTTATCA-CACTC----------AGA--ATC--TG-T-------T-T-TCG-CAT----------------------------T-T--C-TATT-GGATC-AGTTA-CATTTTGCAG-GAG-ACAA-AATCAC--C-A-TAA--ACAA--G-T-G-A--------AAATAG-AATATTG-------------CTA--C-AT-GA-ATACA-G--G-AA--A-TTGAC---GAT------G-GAAAAG--------TTAAAGCA--ATCT-CGC------TTGTCA-TCAAGA-AG-------GGTTGTTGT----AAT-----T-TG--C--C-TTGAACG-TC-TA-TGTTCAGTA-AATTATCC-A---AAT------------ATGAatatggaatttgttacaaataaggtttttacttt
gi|11 : gaacacgtcccggtaaCA-GG-TGG-C-------TAGAAGG-----A--------GTGAGTATC-----GC---CC----GA--T-CACAC-CTGC-CG--TTA-GCC-C-----T-GA--TC-T---TG---A-TCA-G-G------------T------AACGCAA-G---TA-ATCC-G----TAGTCA-AA-CTCAGTATGCAA--AC--G-GATATC-GAAC--AATC-GGTA-AA-----AAGC--ATTA--G------GCG---T-------TTG-G--T--C-C---A--TTGTATAA-CTTG-TATCTGTAAA--TA--A-GAT----C-ATT
gi|12 : tttactcagtatacacatgtatatgtctttgaagtcggttatgatgttcaatgcaacgacatcggtatacatgtacttcaaacgaactacacgtttaccgtgacatcaaagtaaatatatgtttagcggactttttttctgcctatatatagttacggcactggatttcttatgaacaagtgaaaattacgaacagtgactaatctcttagatcctaaattaaaagtactagtatacaaacaaagatccctagccaagATCATGAAG---TGACG-TCTTAACA--GC----------AG-------TTA--CTAGT--A-G--------------GA----------T-AGAG--------------GG-----C------TGCGGGTA-GAGC-C--TTAGTG-AA---CCAGCG-ATGTAA-------TCATTCT-G-TTTG-AAGGAGTTTT---TTA-TGCA---T------CGAAAAAAAATCCAAT-ATAAAAAACAAGGT-ATGGTAA-TTTCAATTGAT-CCTGATGTCTTTGGAAAATAT-GAAGCAAATGTTT--AAACA-AAAGGTGGATTTGAAGAA-GTATCACT-TTAGT-CAGATGTCTTGGA-GTA-A-GATT----AGTATTCC-AAATGAC---TGA--AGTG-AATCC-T-AGTTAC-AGTTAAAAGGCATAAGTATG-TA-----T-GA-CTAT--TTATCAAC--AC----AAG----ACAAA-------TGTGA-ATC---ACTTGGCTTTATCAGCTG-----AACT---A-TATCAA-AGTTTTCATG-----TGCGTCTTTAA--C-CA-TTTACACACGTC-----GCTCTG-----TAAA-GACAG-----AAGGCTA
gi|13 : tccGTTTTT----TGATATATCC-CCATC--GGTA-TG-ACACCA-TTCTGGAATAATGTAGGTG-GACAGTATCTC-TGAAA---AGACTGTTTTAACA--GCTGTTTAG--TAG-------TTT----AGTTTA-GAT-------TAAGGAAGAGGCTTGGTT-AGAGCACTTACTTGAACTAG-----CATATATTG---GTA-GAGCAC--TTACTGGAA---C-AGC--ATATA--------TC--TTT-G-TT-GTAAGGA-ATTG---TTA-T-TG---TTAATT-CG-AA-----TCCAGTTA--------AAGGTCATTGTAA-ATCAAATTGAT-CCAGAT-TCTTCGGAA--TATTGAA---AGTATT--CAAACAGAA-GGTGAATTTGAAGAA-TT-CTATC-TTAGT-CAGATTGCTTGGAGGTATATAAGT-----AGATTCCCAGATGCT---CGA--AGTA-CACCCTT-AG-T-C-ATCTTAAAAG-ACAAGTACAG-A----GT-CAGCTCTAGTTACAA
gi|14 : agtgtagaAAA--GGCAAAGATA----A-CGA----ACAGTGA--T-C-AATCT-CGTAA-----------G-TCCTAAAT-A---GA------AT--A--CAAAA--ACAAGA-GTC-GGGCAAT-CAC-GGA-C----CCC-T---GGACAC-A----C--CAG-A-A-G--TGG-GA-TCA-GG-TGC-C-------TAGGGGG-----A--------GTAAGCACC-CCCTGTTGACC----GG--T-CACAC-CCGC-CG--TGA-GCC-C-----A-TA-GTC-T---TG---A-TCA-G-G------------T---A--AACG-GA-----------C-A----TC-----AGT----GTGTGAAA--A---A-CG-G-CTTAAC--AATG-GCT---AT---GAAACACATCA--GA--C-AGCA---T-------TTG-A--C--T-C---A--ATG-ATAG-GTCA-TATTGGTAAA--CT--A-AAT----T-GTTAC-------AACGACC-A-TAGAATT-TA--CG--AA-ATGCTGC--ATTTA--AA-CGTGACT---G-TT-GA----AACCCCTGCAA-CA-TACCG-A--C--TTTT
gi|15 : ggatgtA-C----CTC-T---A-ACAA-A----GG-CGA-A-G-G---AG-GG-TCA-GG-TGC-C-----A--GGAGG------A--------GTAAGCATC-CTCTGCTGACC----GG--T-CACAC-CCAC-CG--TGA-GCC-C-----T-TA-GTCGG---AA---A-TAA-G-G------------T---A--ataaatcatgcactttcttttcaaagtacatgtatatttgcacatgaaat
gi|15 : caaatAAATAAGGTA---T---GAACAAAATCA--GT--C-AACA---T-------ATGGA--CCTT-T---A--GTG-ATAA-TTTG-CAA-CGCAAA--CA--A-GGT----C-ATTAT-------ACCGACC-ATTAGAATT-TG--CGAAAA-ATGATG---ATTTTTAAA-CGAGATTTC-G--T-TA----TAA-CCTGCAA-CATT--CA-A--CTTTTTTTGT---TT--AGC-AGTTAGCCTAAGCTTT-------AAAAA--ATCTTT--C-------ATT-ACG-CGG--A-----CATG-------------CTCT-T-GC-TATC-GAATC-A---A-CT---TGC-G-GAGTAAAT-TA-CACATC-A-TAA--GCAG--GATGG-A--------TAGTGGT-GTATTA-------------CTA-tgaacaaaatcagtcaacatatggacctttagtgataatttgcaacgcaaacaaggtcattataccgaccattagaatttgcgaaaaatgatgatttttaaacgagatttcgttataacctgcaacattcaactttttttgtttagcagttagcctaagctttaaaaaatctttcattacgcggacatgctcttgctatcgaatcaacttgcggagtaaattacacatcataagcaggatggatagtggtgtattactacttctttcgttacttggataattttattgaacattgac
gi|16 : caaatacctctaacaaaggcgaaggagggtcaggtgccaggaggagtaagcatcctctgctgaccggtcacacccaccgtgagcccttagtcggAAAT-GGCGAAG-TA----A-CAATTAAA--GT-A--TCA-AA----CGTA-TCATA------G-TCCCCAAA-A---CAC-----AT--A--CAAAA--TCGAGT-GTA-GG-CAAT--AC-GGA-C----CTT-C---G-ACAA-A----AG-CGA-A-AAG--CAG-GAATCAAGG-TGC-C-----A-TGGA-GG-----A--------GTAAGCATC-CTCTGCTGACC----GG--TCCACAC-CCGC-CG--TGA-GCC-C-----T-TA-GTC-G---AA---A-CAA-A-G------------T---A--AACG-GG-G---TT-ACCC-G----TCGTCA-AATCTAG--ACGAAA--AT--GACA-GCCTAACTAACAAG-GGTATAA-----AAACAAATCA--GT--C-A--A---T-------ATG-A--C--T-G---A--GTG-ATAA-TTTG-TAATCGCAAA--CA--A-GGT----C-ATTAT-------AGCGACCGG-TAGAATT-TG--CG--AA-ATGATG---ACTTTAAAA-CGAG-ATTC-A-GT-TA----TAACCCTGCActtctttcgttacttggataattttattgaacattgac
gi|17 : taA-T-AAGAAA-----CCC-A---------------AGCAT----GCTCAT--TA--ATATCTAACTTCA--GAGTA-CTTGTGTGGG--CAATCA----------------GA--G----GGTTTT-------------CAACAAAATATGTGTCTT--GTTT------CCCAA----CG-ACTAGAAATTCG-TA--TT---TTCGGG---TGCCGG-TTTT----TTGT---------TTAAAAAGCA-ATTA--------TTATAAT------T-GAAAAAGG---CCTAAGAT--TT-TA-ACTTT--AT-CG---GAGGAATCGTTG-----------T-GTAAAG--T-GTGGAGAAA-TC--TACG-TTTTTGATGCAGTCAATT
gi|18 : aatcgaccaattgttgctaccatatgttttcctaatg-GGA-C----CTC-C---A-A-AA-ATTATAG-AGGTA-G-G--CAG-GA-TCA-GGGTGC-C-----A--GGAGGATCGTAA--------TTGAGCATC-CTCTGCTGACC----GATCT-CACACACCGC-CATCTGA-GCC-T-----TGTA-GTT-C---AA---A-CAA-A-GC-----------T---A--AACG-GG-GATTCT-ATCC------TCGTCA-AATCT-AGTACGAAA--AT--G-AA-GGCTAAACACAA-G-GGTT-ATT---GAAACAAGCAG--GT--C-AACA---T-------ATG-A--CT-T-T---A--GTG-ATAA-TTTG-T-ATCGC-AA--CA--A-tttgaaaattcttgtatt
gi|19 : gcaaacataaaatgttatgtagattattatcgTCATA------AATCCCATAA-A---GA------AT--A--TAAAA--C-------TA-AGGCAAA-CAC-GAA-C----CCT-T---G--CAT-AT---AC-CGG-A-G-G--TGG-GA-TCA-GG-TTT-TTTTTAA-AAGAGGG-----A---------TAAGCACC-CCTTGTTGACC-----G--T-C-CAC-TCGC-AT--TAT-ACC-C-----T-CT-ATC-T---TG---A-TCA-G-G------------T---A--AACT-GA-G---TA-ATCT-G----T----A-GGTC-AAGAACGAAA--aat
gi|2 : ttagatactgttggagacaatattggttgctcaccgaaagaatgaaaagtgaagataacgtaacagtgatccatcAAAT-GGCGAAG-TA----A-CAA----A--GT-A--T-A-AA----CGTAATCATA------G-TCCAAAAA-A---CA------AT--A--CAAAAA-TCGAGTTGTAAGGGCAAC-CAC-GGAAC----CTT-C---G-ACGA-A----AG-CGA-A-G-G--CAA-GG-TCA-GG-TGC-C-----AATGGAGAG-----A--------GTAAGCATC-CTCTGCTGACC----GG--T-CACAC-CCGC-CG--TGA-GCC-T-----G-TA-GTC-G---AA---A-CAA-ATG------------T---A--AACG-GG-G---TT-ACCC-G----TCGTCA-AATCTAAGTATGAAA--AT--G-CA-GTCTAAACAAAATG-GGTA-AAT---GAAACAAATCATGGT--C-AACA---T-------ATG-A--C--T-T---A--GTG-ATAC-TTTG-TA-TCGCAA---CA----GGT----C-ATTAT-------AGCGACC-G-TAGAATT-TGTGCG--AA-ATGATG---ACTTT--AA-CGAGAATTC-GGTT-TA-----AACCCTGCAA-CA-TA-CA-A--C--TTTTTGG---TT--AGT-AGTTGCCCT-CG--TT-------AAAAA--ATC--A--C-------A-TTACG-CAT--G-----CATG-------------C-CT-T-G-GTATC-GAATC-A-----C----CG--A-GAG-ACAT-TA-CACA-C-A-TAAT-GCAG--T-G-G-A--------TAGTGGTAACATTA-------------CTA-AC-AAAAA-A---A-G--G-AA--AAGTGAC---AAT------T-GGCAAG--------TCAAAGTCCCATCAACGT------TTATCA-T--ATATAT-------G-T-GTTTTGC--AGT-----CCTG--C--C-ATTAGAG-TC-AA-TATTA--TA-AAATATCC-A---A-T------------ATGAAGCACATTGGTCAGATTCTGTGGTGTC-T---TTA-TTTCAAGTTCGTCAGGATAATATCAAAATGGA-CATA-ATTGTGAAA-TTATGATTGTTAATGGAT---AA-ACATC-GTCTATATACCT----ATA-----AGTAAGG-TTG-AA---GGACACT-GCAAG---------------TTTT----TTGTTTTT------A--CCCG-AACAGTTT-TCCTGAA-ACA-AATTCTGCT--TTCAT-ATGGAATATATAAAA--ATAAGTC---TGCCAATA---AG-GGGGC-AAC-AT---TAGTACCCAT-AGGAA--AC-CA-AC--A---------GAATTGTTGGAGAAGACGGAT-GTCACTCCAAAAA-AGAC------TACAATAATATTAATCTA-TAAAGCAA----ACCC-A---------------AGCA---ATGCTC-T--TA--ATATCTTTCTTC--AGAGTA-CTTGTGTGGG--CAATCA----------------GAGTG----GGTTCT-------------GACAAAAATATGTATC-T--GTTT-----CCCAAA----TG-ACCAGAAACTTGGTA--TT---TTCGGG---TGCC-G-TTTT----TTGT---------TC-AAAAGCA-ATTA--------T--CAAT--TTCCT-GAAAAA-G---CCT-AGAT--TT-T--ATTTT--ATCCGT--GAGGAATTGTTG-----------TA-TAAAG--TGGTGGAGAAATTC-ATATG-TTTTG-ATGCAGTCAATT---------TTAGAA--AAATCTCGTGATTGAA----GTTTTC-TATAAAGCT----CTTTAGAG-------TTTT----TGAGA-ATCCACAATC--TGAA-TGAACACCACTTCTGGAATA-TGTAGTGGAAACAG--TATCTTGAAG---TGAC--CTTTAACA--GCTGTT-AG--TAG-------TTTTGTTAGT--A-G---------TAAGGGA----------T-AGA---------------GG-----C------TG---GTA-AGGCAC--TTACTGGAA---CCAGCGAATGTA--------TC--TTTGG-TTTGTAAGGA-TTTC---TTA-TGCATATTT---T-TGGAA-----TCCAGT-A--------AAGGT-ATGGTAA-TTCAAATTGAT-CCTGAT-TCTTCGGAAA-TATTAAA---CGTATTC-CAAACAGAAAGGTGATTTTGA--GA-TT-TCATC-TTAGT-CAGATTGCTAGGA-GTATA-AAGTCAGGAAAATTCCCAGATGTG---TGA--AGTA-AACCC-TAAGTT-CAATTTAAAAAG-ACAAGTATAATA----GT-GA-CTTT--ATACAAAC--A-----AAG----ACAAG-------TG-----TT---ACTGTGCTTTAT--ACAGCCTGGAACC---AGTAACAA-AGTTTTCATGTAGTCTA----TGTAA--CTCA-TTTACCCCCTTCTG---GCT-TC-----TTAA-GACAG-----AAGGGTAAATAGT-AG--ATTTTCCC---CGC-----TAAA----TGGTTATAACGGGATTTTAAATAATTTCCGAA-TACTTTTGATCA-TTCAGACAAAGTGTCAAGAT-CTCTCCCTtaaatgttgatgcatt
gi|20 : A----A--AT-A--T-A-AATAGGCGAAGT--TA------A-TCCCAAAA-A---CAT-----AT--A--CAAAA--CCAAGT-GTA-GGGCAAC--AC-GGA-C----CTC-C---G-ACAA-A----AG-CGA-A-G-G--CAG-GA-TCA-GG-TGC-C-----A-TGGAAG------A--------GTAAGCATC-CTCTGCTGATC----GG--T-CACAC-CCGC-CG--TGA-GCC-C-----T-TA-GTC-G---AA---A-AAA-A-G------------CATGA--AACG-AA-A---TC-A-----------GTCT-AA-CTA--TAC-ATG--AC--T-TA-GT---GATAATATG-CGT--AATCTGGAAACAAGTCA--TTTGC-GAAA---TG------ATG-A--C--T-T---ca
gi|21 : AA----A--GT-AATT-A--------GTAA-CATA------G-TGCCAAAA-A---CAT-----AT--ATACAAAA--ACGAGT-GCA-GGGCAA--GAC-GGA-C----CTT-C---G-ACAA-A----CG-Ctaaattgagtattcgttat
gi|21 : ctattaC-C-----T-TC-GAC-A---AACGCA-CAA-A-A------------T---A--AACA-GG-G---TA-GCCC-G----TCGTAA-AATCTT-GTACAAAA--ATAAG--A-GTCTGA-CAAA--G-GGTA---C---GAAACAGATCA--GT--C-AACA---C-------ACG-A--C--T-T---C--GTG-ATAA-TTTG-TAGTCGCAAA--CA--A-GGT----C-ATTAT-------AGCGACA-G-TAGAATT-TG--CG--AA-AGGATG---Aacaaaataaacagggtagcccgtcgtaaaatcttgtacaaaaataagagtctgacaaagggtacgaaacagatcagtcaacacacgacttcgtgataatttgtagtcgcaaacaaggtcattatagcgacagtagaatttgcgaaaggatgat
gi|22 : ctattaaaagtaattagtaacatagtgccaaaaacatatatacaaaaacgagtgcagggcaagacggaTATC-TAATC-A---A-C----TG--G-GAG-ATATGCA-TAC--C-A-TTT--GCAA--G-G-G-A--------TAGTGGTA-TATTA-------------CTA--C-AAAGACA---G-G--G-AA--AGCTGAT---GAT------T-GCATTT--------TTAAAGTC--ACCAA-GC------TTATCA-T--ATA-AT-------G-TAGCTGT-A--AGT-----C-TG--C--C-ATTAGAG-CC-AA-TATTAAGTA-AAATATCC-A---ACT------------AAGAAGCAGATTTGTCAAATTCTGTGGTCTCCT---TTA-TTTTGAGTTCGTCGGGt
gi|23 : A-A----CG-CAC-A-G-G--CAG-GA-TCA-GG-TGC-C-----A-TGGAGG------A--------GTAAGCATC-CTTTGCTGACC----GG--T-CACAT-CCGC-CG--TGA-GCC-G-----G-TA-TTC-G---AA---A-CAA-A-A------------T---A--AACA-GG-G---TA-ACCC-G----TCGTAA-AATCT-TGTACGAAA--ATAAG--A-GTCT-GACAAA--G-GGT---AT---GAAACAGATCA--GT--C-AACA---C-------ACG-A--C--T-T---C--GTG-ATAA-TTTG-TAGTCGCAAA--CA--A-GGT----C-ATTAT-------AGCGA
gi|24 : AAA--GGCAAAGATA----A-CGA----ACAGTGA--T-C-AATCT-CGTAA-----------G-TCCTAAAT-A---GA------AT--A--CAAAA--ACAAGA-GTT-GGGCAAT-CAC-GGA-C----CCC-T---GGACAC-A----C--CAG-A-G-G--TGG-GA-TCA-GG-TAC-C-------TAGGAGG-----A--------GTAAGCATC-CCCTGTTGA
gi|25 : cactgtgataaatggtagtattaatgtTGTG---TGATAAGTATAACCC-T-AGTT-C-ATTTATAAAG-ACAAGTATAATATTTTCT-GG-CCCC--TAACAAAA--AAATTCAAG----ACAAATTGACTTTGTAACATCTTAACTCTGTTTCA---ACTGTC-----CTGTAA-TAGCAATAGTTCTCTCG-------------TAAGGCTCATTTTAC-CACTTCTG---a
gi|26 : AATT-TG--CG--AA-ATGATA---A------GA-C-AGGATT-------------TAAGGCGACAA-CA-A--TA-A--AAATTTTTAGAATTT--AGTCAGT-GGCCT-CGACCTGATAAGAAAAAA--ATA--T--CAAAAAATA-T-ACG-CAC--GTGGTATATGAC-----------C-CTCT-GCGCGAC-GAATC-A---ATC----TG--ATGAG-ACGA-TA-CA
gi|27 : -A--C-A-AC----CGT--TCATA------A-TCCAAAAA-AATGTAT-----AT--A--CAAAAA-TCGAGT-CGA-GAGCAGCGCACTGGA-CACATCTT-CTGTA-ATAA-A----AGCCGA-ATG-GTTTAGTGA-T---AG-TTT-T-----A-TTGAGAG-----AAGAAAATGGTAAG------TCCACTAACC----AG--T-CA
gi|28 : ggcgactgtaTGTCAGTGTCTGTGGTGTCCTGAATTA-TATTAAGTTCTTCGCGATA-TATCAAA-TGGA-TATA-ACTGTGAAAATTATGATTGTTAATTGAT---AGCACATC-ACC
gi|28 : CACC-GCAAG---------------TTTT-----TGTTTTT------AT-TCCGTAACAGGTT-TT---GA-ACA-AATTgcaagtttttgtttttattccgtaacaggttttgaacaaatt
gi|29 : tgtcagtgtctgtggtgtcctgaattatattaagttcttcgcgatatatcaaatggatataactgtgaaaattatgattgttaattgatagcacat--CTCA-TT---ACACTTCTG---GCT-TT-----TTAAAGACA-------AGGATAAATAGTACGCCATTTTCCT---CGCGCGCTTAAAGTTTTAATTAC----GGATTTT-AATTACTTCCGAATTAATTTTGATCATTTCAGACAAAGTATTCAACTCCTCTCCC
gi|3 : AAAT-GGCGAAG-TACA--A-CAA----T--GT-G--TTA-AA----CGTAA-AATA------G-TCCCAAAA-A---CATGT---AT--A--CAAAA--TTGAGT-GTA-GGTCAAC--AC-GGA-C----CTC-C---G-ACAA-A----AG-TGA-A-G-G---AG-GA-TCA-GG-TGC-C-----A-TGG-GTG-----A--------GTAAGCATC-CTCTGCTGACG----CG--C-CACAC-CCGT-CG--TGA-GCC-C-----T-TA-GTC-G---AA---A-CAACA-G------------T---A--AACG-GG-A---TT-ACC--G----TCGTGA-AATCTA-GTACGAAA--AT--G--A---CTGA-CAAA--G-GATA---T---GAAACAAATCA--GT--C-AACA---T-------ATG-A--C--C-T---G--GTG-ATAA-TTTG-TAATCGCAAA--GA--A-GGT----C-ATTAT-------AGCGACC-G-TATAATT-TG--CG--AA-ATGAT----ACTTT--AAATGAGA-TTC-G-TTATACCGTTAACCCTGCAA-CA-T--CA-------TTTTTGG---TT--ACT-AGTTGGCCT-AGCTTT-------AAAAAT-CCC--T--C-------A-T-ACA-CAT--ATGC--CATGTGTTGGATATAGCC-CT-T-GCGTATC-GAATC-A---A-C----TG--A-GAG-ACAT--A-CACA-CCA-TAA--GCAG--G-T-G-A--------TATTGGTA-CATTA-------------CTA--C-ATAGA-A---AAG--G-AA--TGTTGAC---GATA-----T-GCAAAG--------TCAAAGTC--ATCA-CGT------TTATTA-T--ATA-AT-------G-TA--TGT-C--AGT-----C-TG--CATC-ATTAGAG-TC-AAATATTAAGTA-AAATAGCC-A---AAT------------ATAAAGCAGATATGTCAGATTCTGTGGTGTCCT---TTA-TTTCGAGTTCGCCA----AATATATAAATGGA-CATA-ATTGTG-AAATT-TTATTGTTAATTGATA--AG-ACATC-GTTTATATACCC----ATA-----TGTAAGG-TTG-AA---GGACACG-GT------------------TTTT----TTGTTTTT------AT-CCTGTAACGTTTT-TTTT--A-ACACAATTCTAC---TTCAT-AT-GA--ATATAAAA--ATAAGTC---TGCCAATA---AG-AGGAC-ACA-AT---TAGTGTCCTT-AGGAAT-AC-CA-AC--A---------T-ATTGTTGGA--AGAC--ATGGTTTCT-----AA-AGAC------TACATAAATATT-GTCCA-T-AAGAAA----ACCC-A---------------AGC----ATGCTC-T--TA--ATATC-TACTTC--AGAGTA-CTTGTGTGGG--CAATCA----------------GAGT-----GGTTCT-------------GAC-AAAACATGT
gi|30 : ctattaaacctgacacaatacatctgctagtcatctgggactgatgtttatatatcACATTG-------------TTA-ACTACATA-A---A-A--G-AA--A--T--------T------T-GCAAAA--------CTCAAGTC--ATCA-CGT------TTATCA-T--ATA-AT-------GTTAGTTGT-CCAAGTC----C-TG-----C-ATTAGAGATT-AA-TATTAAAGG-AAGTGTTC-ATGGAAT------------A
gi|31 : T-CA-CAC--C-A-TAA--GTAG--G-T-G-G--------TAGTGGT-ATATTA--------------TC-AC-ATTGA-A---A-G-----------------------------GCAAAG--------TTAAAGTC--ATC-TTGC------TTATCA-T--ATA-AT-------G-CAGTTGT-C--AGT-----G-TG--T--C-ATTAG
gi|32 : cttatCAT-T--CAC--C-A-TAA--GCAG--G-TGG-A--------TGGTGGT-ATATTA-------------CT--AC-ATAGA-A---AGG--G-AA--AGTTGAC---GATAGCCGATAGCAAAG--------TTAAGGTC--ATC-ACGC------TTATC
gi|34 : tatcctCAATA---AG-GGGGC-ACA-AT---TAGTGCCCGT-TGGAAT-AT-CA-AC------------GGATTGTTAG--TAGAC--ATGG--TCTCC---AA-AGAC------TACACAAATATT-ATTTA-T-AAG
gi|35 : GA-GCC-T-----T-TA-GTC-G---AA---AACAG-G-GAGGGGGGGCGGTT---ACGAGCG-GA-G---TT-ACCCTG----TCGTCAGAATCT-AGTACGGAA--A---G--A-G--TGGACAAA--G-GGTA-ctaa
gi|36 : A-GG-T-C-C-----G-TGAATGA-----A--------GTAAGCATCTCGTTGCTGATCCGAGGA--T-CACAC-CCAC-CG--TGA-GCA-A-----T-CA-AGA-G---AA---A-CAG-A-tg
gi|37 : gatggatggtcgCCCAACATA---CATGTATAAT--A--CAGAG--TCGA-T-GTA-GA-CAAC--AC-AGA-C----CTAGT---A-ACAA-A----AGGCGA-G-G-G--CAG-GA-TCA-GG-TGC-C-----A-TG
gi|38 : cc--ATTTTCCC---CGC-----TAAA----TGG----------ATTTT-AATCATTTCCGAA-TATTTGTATCCA-TTCAGACAAAGTGTCAAGCTCCTCTCCCT
gi|39 : gcAAAT-GGCGAAG-TATTTTA-CAA----T--GT-G--T-TTAA----CATAATCATA------G-TCCAAAAA-A---CAT-----GT--A--CAAAA--TCGAG
gi|4 : tttgttataAAATTGGCGAAG-TA----AACAA----T--GT-G--TTA-AA----CGTAATCGTACATGTAG-TCCCTAAA-A---CAT-----AT--A--TACAACTTCGAGT-GTA-TGGCAAC--AT-GGA-C----CTC-C---G-ACAACA----GG-CGA-A-G-C--CAG-GA-TCA-G--TGC-C-----A-TGGAGGG-----A--------GTAGGCATC-CTCTGCTGACC----GG--T-CAC-C-CCACACG--TGA-GCCTC-----G-TA-GTC-G---AG---A-CAA---G------------T---A--AACA-GG-G---TT-TACC-G----TC---------TAC-TACGAAATGAG--A-CA-GTCTAA-CAA---G-GGTA---T---GAAACAAATCA--GT--C-AGCA---T-------ATG-A--C--T-T---A--GTG-ATAA-TTTGGTAATCGCAA---CA--A-GGT----C-AT-AT-------AGCGACC-G-TAGAATCCTG--CG--AA-ATGCTGCGGACTTTGAAA-CGAGAACTC-G-TT--A----TAACCCTGCAAACA-T--CA-TTTC--TTTTT-----TT---GT-AATTGAC-T-CGCTTT-------AAAG----TC--CTGC-------G-T-CCG-CAT--GA----TATA-------------C-CT-TTGCGTATC-GAATC-A---A-C----TG--A-GAG-ACAT--A-CACA-CCA-TAA--GCAG--G-T-G-A--------TAGTGG-AACATTA-------------CTA--C-AAAGA-A---A-G--GGAA--AGTTGAC---GAT------T-GCAAAG--------TCA--------TCA-CGT------TTATCA-T--ATA-AT-------G-TAGTTGT-C--AGT-----C-TG--C--C-ATTAGAA-TC-AA-TTTTAAGTA-AAATATCC-A---AAT------------ATGAAGCACATCTGTCAGATTCTGTGGTGTTCT---TTA-TTTGGAGTTCGTCAGGAT-ATATC-AAATGGA-CATA-ATTATGAAAATTATGATTGTTAATAGATC--AG-ACATC-ACCTATATATCTAC--ATA-----TGTA
gi|41 : actatcttatccgaatgacatcaaagattacttgaacgattgtctgtactgcaatat---AG-ACATC-ATCTATATATCT----ATA-----TGTAATG-ATG-AA---GGACACA-GTAAG---------------TTTT----TTGTTT
gi|42 : AAAT-GGCGAAG-TA----A-CAA----A--GT-A--T-G-AAC---CGTAATCATA------
gi|44 : AAAT-GGCGAAG-TA----G-CAA----A--GT-AT-T-C-AA----CATAATCATA------A-Tcgtacacagataaaccata
gi|46 : cgcacatttataTTTTGG---TT--AGT-AGATGGCCT-CGCTTT-------AACAA--ATC--
gi|47 : A-A---G-G--G-GA--AATTGAC---AAT------T-GCAAAG--------TCAAAGTC--AT
gi|49 : -A---AAT------------ATGAAGCACATCTGTCTGATTCTGTG
gi|5 : AAATTGGTGAAG-TA----AACAA----T--GT-G--T-T-AAT---CGTAATCATA------G-TCCTAAAA-A---CAT-----ATTTA--CAAAG--TCGAGT-GTA-GGGCAAC--AC-GGA-T----CTC-C---G-ACAA-A----AG-CGA-A-G-G--CAG-GA-TCA-GG-TGC-C-----A-TAGAGG------A--------GTAAGCATC-CTCTGCTGACC----GG--T-CACAC-CCGC-CA--TGA-GCC-C-----T-TA-GTC-G---AA---A-CAA-G-G------------T---A--AACA-GG-A---TT-ACCC-G----TTGTCA-CATCT-AGTACGAAA--AT--GACA-GTCT-AACAAAA---GGT---AT---GGGACAAATCA--GT--C-AGCA---T-------------------------------TAA-TTTA-TAATCGCAAA--CA--A-GGT----C-ATTAT-------ACCGACT-G-TAGAATT-TG--CG--AC-ATGGTG---ACTTTA-AA-CGAGAA-TC-G--T-TA----TAATCCTGCAA-CA-T--CA-A--C--TTTTTAG---TT--AGT-AGTTGGCCT-CGCTTT-------AAAAA--GTCT-T--C-------A-T-ACG-CAT--GA----CATGT------------T-CT-T-GCGTATC-TAATC-A---A-CTGCATG--G-AAA-ACAT-T--CACACC-A-TAA--GCAG--G-T-G-ATACATTTGTAGTGGT-ACATTA-------------CTA-
gi|6 : tatactctatatgataatatatgtcttctgaaaccgcttttacatgtttctgtgttggcgacatcggtattttgggctttttcaaaagtttggcttatatttaaaaagttttcttttcatgaatgcatttttttctgtatttttttttattgtatgtagtaaaagatatT-GGCCAAA-TA----AACAA----T--TTGA--T-A-AT----TGTAATCAAA------A-CCCCAAAA-----CAT-----AC--A--CAAAG--TCGAAT-GTA-AGGAAAC--AC-AGA-C----CTC-C---G-ATAA-T----AG-CGA-A-G-G--AAT-AG-TCA-GT-CG-----------------------------------GCATC-CTCTGCTGACC----GG--T-CACAT-CCGC-CG--TGA-GCC-C-----T-TG-GTC-G---AA---A-CAA-A-G------------T---A--AACG-GG-A---TT-ACCC-G----TCGTCA-AATCTA-GTAGGAAA--AT--GACA-GTCTAA-CAAA--G-GGTA---T---GAAACAAATCA--GT--C-AACA---T-------ATG-A--C--T-T---A--ATG-ACAA-CTTG-TAATCGCATA--CA--A-GGT----C-ATT---------------------------TG--CG--AA-ATGGTG---ACT-----------------------G----TAGCCCTGCAA-CA-T--CA-------TTTTTTG---CT--AGT-AGTTGACCT-CGCTTT-------AAAAA--GTCC-T--C-------G-T-ACG-CAT--GA----CATG-------------CTCT-T-GCGTATC-GAATC-A---A-C----TG--G-AAG-ACAC--A-CACA-C-AATAA--GCAG--G-T-G-A--------TAAGGGTA-CATTA-------------CTA--C-ATGAA-A---A-G--G-AA--AGGTGAC---GAT------T-GCAAAG--------TTAAAGTC--ATCA-CGC------TTATCA-T--ATA-AT-------G-CAGTTAT-C--AGC-----C-TA--C--C-TTTAAAG-TC-AA-TATTAAGTA-AAAAATCC-A---AAT------------ATGAAGCAGATATGTCAGATTCTGTGGTGTCCT---TTA-ca
gi|7 : atagatTGTCAGATT--GTGTTGTC-T---TTA-TAT-GAGTTT-TCGGGATA-T-TCCAAAT------TA-AT----------GCCCTTGTTA-TTGAT---AGCAGAT--ATCTATAT-CCT----ATA-----TATAAGG-TTG-A-----GACAAA-GCAGGGAGTTTTTTTTTTTTTTTT----TTGTTTTT------AT-CCCGTAA-AGTTT-TTGT--A-GCA-AATTCTGC---TTCAT-ATGTA--ATAT-TCA--GTAAGTCTGGTGCCAATA---AA-GGGG---CA-AT---TAGTGCCACT-AGGAATGACGCA-ACGGA---------GAATTGTTTGA-TCGAC--CT-GTCTCTCC----A-CGAC------TACATAAATAAT-TTCTG-T-AAGAAACTCTACTC-ATCATGATGTCATGTTATCAT--TTGTTC-TAATAATATATCCTACTTCAGAGAGTA-CT--TGTGGG--C-ATCA----------------GAGT-----GTTTTT-------------TAAACAAATATGTGTCTT--GTTTTTCCGCCCCAATCCCCGAACTAGAAA--TATTA--TT---TTCGGG---GGTC-ATTTTT----TTGT---------TT---AACCACATT---------T--CGATAAT--CT-GAAAAG------CT-AGAT--TTAT--ATTTTTAAT--GTGAatactggcgtcaaagctcaaaattcttggagcgggaataataaaatatatt
gi|8 : taagatataaaacggtcagctactaaggattgtgtggtgAAAT-GGCGAAG-TA----A-CAA----A--GT-A--TGA-AA----CGTAATCATA------G-TCCAAAAA-A---CAC-----AT--A--CAAAA--TCGAGT-GTA-GGGCAAC--AC-GGA-C----CTT-C---G-ACGA-A----AG-CGA-A-G-G--CAG-GA-GCA-GG-TGC-C-----A-TGGAGG------A--------GTAAGCATC-CTCTGCTGACC----GG--T-CACAC-CCGC-CG--TGA-GCC-T-----G-TA-GTC-G---AA---A-CAA-A-G------------T---A--AACG-GG-G---TT-ACCC-G----TCGTCA-AATCTA-GTATGAAA--AT--GACA-GTCTAA-CAAA-TG-G-TA---T---GAAACAAATCA--GT--C-AACA---T-------ATG-A--C--T-T---A--GTG-ATAC-TTTG-TAATCGCAAA--CA--A-GGT----C-ATTAT-------AGCGACC-G-TAGAATT-TG--CG--AA-ATGATG---ACTTTA-AA-CGAG-ATTC-G--T-TA----TAACCCTGCAA-CA-T--CA-A--C--TTTTTGG---TT--AGT-AGTTGGCCT-CGCTTT-------AAAAA--ATCA-T--C-------A-T-ACG-CATG-G-----CATGC------------C-CT-T-GCGTATC-GAATC-A---A-C----TG--A-GAG-ACA--TA-CACACC-A-TAA--GCAG--G-T-G-A--------TAGTGGT-ACATTA-------------CTACAC-AAA-A-A---A-G--G-AA--AGTTGAC---AAT------T-GCAAAG--------TCAAAGTC--ATC-ACGT------TTA
gi|9 : ggcatataCCCCAAC-A---CAT------T--A--CAAAT--TCGC-T-GTA-AG-CAAC-CG--GGA-C----CTC-C---G-ACAA-A----AG-----A-G-G--TAG-GA-TCA--G-TGCAC-----A-TGGGAGG-----A--------GTAAGTTTC-CTCTCCCGAC------G--T-CACAC-CCGCGCA--TGACACC-CCCAAAT-TA-GAT-GACCAA---A-C-A-A-G------------T---A--AACG-GG-GA--TTAACCC-GGGTTTCA--A-AAT---AGTACGAAATGAC--A-CA--TCT-AACAAA--G-GGT---AT---GAAACAAATCA--GT--CAAACA---T-------ATG-A--C--T-TGCGG--ATG-ATAA-TTTG-TAATCGGGAA--CAACA-GGT----C-ATTATTTCGATAAGC-ACC-GCTAGAATT-GC--CG--A-----------------------AGAATTC-G--T-TA----TTAACCTACAA-CA-TA-CA-A--C--TTTTTTG---TT--AGT-AGTTTGGCT-CCCTTT-------AAAAGCCCTC--C--C-------A-C-ACG-CACGAG-----TATG-------------C-TC-T-GCGTATC-GAATCAA---A-C----CG--A-GAG-ACAT-
5 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|33 ): GTTTTTGCGTTGGTGACATCAGAATTTTGGATTTTTTCAAAACTTTGGCAGTGACTGGCTTATCATATTTAAAAAGTTTTCTTTTCATGAATGCATTT
Unaligned ( gi|40 ): TTAAAAGTGAAGATAACAAACAGTGATCTATGTCATAATTCCTATAAAAAATTGAAATCTAA
Unaligned ( gi|43 ): GATCTGAGGTCCAGGGGTGATGAATATAGCATACTTCCATGTTGATTGATT
Unaligned ( gi|45 ): TATTAAGTGATGCCATACATAGAGGATCTTGAATGAGT
Unaligned ( gi|48 ): TAGTCGATACTAAAATTCATGCTCATTTGAT
Alignments
lowQualScore : 111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111
lowQualScore : 111111 1111111 22222222222222 111111 22 111111111111111 111111111111 22 3333333333333333333333333333333333 1111111 11 1111111111 11 1111111 1111111 2222222222222 444444444444444444444444444 1111 1111 11 1 11111111 11 111111111111111111 111111 11111111 22 111111 111111111 1111111 222222222222 222 1 2222 11111 1111 11 444444444444444 1111 222222 2222 222 1 11 11 111 111 111 11 444444444444 111 11 1 1 1111 222222 11111 555555555555555 22222 11 11 111 11 5555555555555555555555555 44444444444444 11 222222 2222 1 11 111 111 111 2222 4444444444444 1 444444444444444444444 1 33333 1 11 2222 11 222222 66666666666666 2222 1 22 1 1 333333333 11 2222 11 2222 222222 2222 1 111 11 1 1 1 1 1 1 111 22 11 444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444 111 1 11 111 11 44444444 11 1 1 1 1111 1 333333333333333333333 4444444444 1 1 1 1 11 111 111 1 1 1 1 1 111 22222 111 11 22222222 11 444444444444444444444444444444444 111 4444444444444444444444 111 55555555555555 11 111 22222222 111 222222 22222 111 22222 2222 33333 1 1 1
lowQualScore : 6 6 333333 4444444 55555555555555 3 777777 2 2 444 444444 33 33 88 2 2 1 11 2 2 5555 2 444 4 2 6666 4 2 2 2 555 2 2 2 2 2 8888888 333333333333333 2 5555 33 2 2 5 33 2 6666666 2 2 2 666 333 2 222 333333333333 333 33 2 2 666 2 2 5555 1 2 11 66 6666666666666666666666666666666666 33 33 2 444 0000000 4 33 55 2 444444 2 2 2 0 33 33 2 5555 2 9999999 3 6 2 33 33 2 777 3 0 88 3 33 3 7777777777 0 3 3 11 8888888 1 555 44 3 0 3 4444444 77 5555555555555 3 3 3 999999999999999999999999999 3 3 3 3 555 3 7777 8888 3 4444 77 0 3 77 44 3 6 3 22222222 88 888888888888888888 7 222 6 555 6 44 3 44 33 555 222222 3 22222222 44 22 000000 4 66 4 777777777 8888 6666666 99999 4 5 5 5 0 5 4 777 222222222222 0 1 2 888 5 5 4 11 99 3 7 3 6 6 3 3 1 111 1 5 3333 66666 8 8 4444 00 888888888888888 4444 333333 88 0 8 3333 8 8 3 999 0 6 33 44 33 3 777 444 8 8 8 444 1 8 66 8 8 333333333333 3 777 99 0 0 5 4444 8 333333 6 0 8 6 6 77777 8 000000000000000 33333 3 8 11 11 3 6 999 8 0 11 0 9999999999999999999999999 55555555555555 5 55 33 777777 1111 0 6 9 33 777 777 444 1111 2222222222222 1 0 555555555555555555555 0 00000 0 33 4444 33 111111 0 88888888888888 1111 3 00 3 3 5 777777777 88 1 1 4444 66 2222 888888 8888 3 555 88 3 3 3 3 3 3 7 0 777 99 33 3 777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777 777 0 3 33 2 777 2 22 6 66666666 33 0 0 3 3 0 7777 0 2 999999999999999999999 2 9999999999 0 0 0 0 3 33 3 777 999 2 3 1 3 0 0 0 0 0 777 44444 0 2 444 11 8 3 8 8 0 8 88 8 77777777 8888 1 11 1 111111111111111111111111111111111 777 1 8888888888888888888888 1 000 33333333333333 11 0 8 0 8 0 0 444 66666666 000 777777 0 7 88888 777 55555 1111 3 22222 3 1 3 1 3 6
lowQualScore : . . ...... ....... .............. . ...... . . ... ...... .. .. .. . . . .. . . .... . ... . . .... . . . . ... . . . . . ....... ............... . .... .. . . . .. . ....... . . . ... ... . ... ............ ... .. . . ... . . .... . . .. .. .................................. .. .. . ... ....... . .. .. . ...... . . . . .. .. . .... . ....... . . . .. .. . ... . . .. . .. . .......... . . . .. ....... . ... .. . . . ....... .. ............. . . . ........................... . . . . ... . .... .... . .... .. . . .. .. . . . ........ .. .................. . ... . ... . .. . .. .. ... ...... . ........ .. .. ...... . .. . ......... .... ....... ..... . . . . . . . ... ............ . . . ... . . . .. .. . . . . . . . . ... . . .... ..... . . .... .. ............... .... ...... .. . . .... . . . ... . . .. .. .. . ... ... . . . ... . . .. . . ............ . ... .. . . . .... . ...... . . . . . ..... . ............... ..... . . .. .. . . ... . . .. . ......................... .............. . .. .. ...... .... . . . .. ... ... ... .... ............. . . ..................... . ..... . .. .... .. ...... . .............. .... . .. . . . ......... .. . . .... .. .... ...... .... . ... .. . . . . . . . . ... .. .. . .......................................................................................... ... . . .. . ... . .. . ........ .. . . . . . .... . . ..................... . .......... . . . . . .. . ... ... . . . . . . . . . ... ..... . . ... .. . . . . . . .. . ........ .... . .. . ................................. ... . ...................... . ... .............. .. . . . . . . ... ........ ... ...... . . ..... ... ..... .... . ..... . . . . . .
lowQualScore : 7 7 999999 2222222 55555555555555 2 222222 7 5 444 888888 44 44 44 7 7 7 00 5 4 0000 4 111 7 2 9999 4 4 4 4 333 4 4 1 1 1 2222222 000000000000000 2 0000 22 4 5 0 22 2 0000000 1 1 1 666 777 1 555 666666666666 999 11 4 4 555 4 4 0000 8 4 88 55 6666666666666666666666666666666666 22 22 4 111 0000000 7 22 66 4 999999 5 5 5 8 44 44 5 7777 7 3333333 1 2 9 99 99 9 999 3 3 88 1 88 1 5555555555 8 3 3 22 8888888 0 888 66 3 2 3 2222222 99 9999999999999 6 6 6 777777777777777777777777777 6 6 3 3 888 3 5555 5555 3 9999 33 0 3 99 66 3 7 3 11111111 66 000000000000000000 3 777 7 888 7 66 3 66 33 888 999999 3 11111111 66 44 555555 4 11 4 888888888 9999 3333333 66666 4 0 0 0 4 0 4 888 888888888888 7 7 5 888 0 3 3 44 00 5 5 5 7 7 2 2 7 444 4 7 3333 77777 0 0 8888 33 333333333333333 2222 000000 88 8 0 0000 0 0 2 222 0 5 88 55 88 2 555 000 0 0 0 000 0 0 88 0 0 888888888888 8 666 00 0 6 0 8888 0 000000 0 8 0 7 7 88888 0 000000000000000 44444 2 0 00 00 8 0 444 0 8 00 8 8888888888888888888888888 00000000000000 6 88 88 555555 2222 0 5 2 88 555 555 000 2222 8888888888888 0 0 888888888888888888888 0 00000 0 88 8888 88 555555 7 33333333333333 0000 3 77 7 3 0 000000000 00 0 0 0000 00 5555 777777 3333 3 333 33 3 3 3 3 7 3 3 8 555 22 88 2 222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 555 0 2 88 5 555 5 55 5 22222222 88 0 0 2 2 0 8888 0 5 555555555555555555555 5 5555555555 0 0 0 0 2 22 2 555 555 5 2 0 2 0 0 0 0 0 222 55555 2 5 000 00 0 2 0 0 8 0 88 0 44444444 2222 4 00 4 000000000000000000000000000000000 555 0 0000000000000000000000 2 222 88888888888888 00 8 0 8 8 6 8 000 22222222 222 555555 8 3 88888 555 00000 2222 2 00000 3 0 3 0 3 7
consensus : AAAT-GGCGAAG-TA----A-CAA----A--GT-A--T-A-AA----CGTAATCATA------G-TCCCAAAA-A---CAT-----AT--A--CAAAA--TCGAGT-GTA-GGGCAAC-CAC-GGA-C----CTC-C---G-ACAA-A----AG-CGA-A-G-G--CAG-GA-TCA-GG-TGC-C-----A-TGGAGGG-----A--------GTAAGCATC-CTCTGCTGACC----GG--T-CACAC-CCGC-CG--TGA-GCC-C-----T-TA-GTC-G---AA---A-CAA-A-G------------T---A--AACG-GG-G---TT-ACCC-G----TCGTCA-AATCTAAGTACGAAA--AC--G-CA-GTCTAAACAAAATG-GGTA-AAT---GAAACAAATCA--GT--C-AACA---T-------ATG-A--C--T-T---A--GTG-ATAA-TTTG-TAATCGCAAA--CA--A-GGT----C-ATTAT-------AGCGACC-G-TAGAATT-TG--CG--AA-ATGATG---ACTTT--AA-CGAGAATTC-G-TT-TA----TAACCCTGCAA-CA-T--CA-A--C--TTTTTGG---TT--AGT-AGTTGGCCT-CGCTTT-------AAAAA--ATC--T--C-------A-T-ACG-CAT--G-----CATG-------------C-CT-T-GCGTATC-GAATC-A---A-C----TG--A-GAG-ACAT-TA-CACA-C-A-TAA--GCAG--G-T-G-A--------TAGTGGTAACATTA-------------CTA-AC-ANAGA-A---A-G--G-AA--AGTTGAC---GAT------T-GCAAAG--------TCAAAGTC--ATCAACGC------TTATCA-T--ATA-AT-------G-TAGTTGT-C--AGT-----C-TG--C--C-ATTAGAG-TC-AA-TATTAAGTA-AAATATCC-A---AAT------------ATGAAGCAGATCTGTCAGATTCTGTGGTGTCCT---TTA-TTTCGAGTTCGTCGGGATAATATCAAAATGGA-CATA-ATTGTGAAAATTATGATTGTTAATTGAT---AG-ACATC-ATCTATATACCT----ATA-----TGTAAGG-TTG-AA---GGACACG-GCAAG---------------TTTT----TTGTTTTT------AT-CCCGTAACAGTTT-TTTTGAA-ACA-AATTCTGCT--TTCAT-ATGGA--ATATAAAA--ATAAGTC---TGCCAATA---AG-GGGGC-ACA-AT---TAGTGCCCNT-AGGAAT-AC-CA-AC--A---------GAATTGTTGGA-NAGAC--ATGGTCTCTCC---AA-AGAC------TACATAAATATT-ATCTA-T-AAGAAA----ACCC-A---------------AGCAT--ATGCTC-T--TA--ATATCTTACTTCA-AGAGTA-CTTGTGTGGG--CAATCA----------------GAGTG----GGTTCT-------------NACAAAAATATGTGTCTT--GTTT-----CCCCAA----CG-ACCAGAAACTTGTTA--TT---TTCGGG---TGCC-G-TTTT----TTGT---------TT-AAAANCA-ATTA--------T--CAAT--T--CT-GAAAAA-G---CCT-AGAT--TT-T--ATTTT--AT-CGTGAGAGGAATCGTTG-----------TAGTAAAG--TGGTGGAGAAA-TC-ATACG-TTTT-GATGCAGTCAATTGTCTCAGCATTGGAAACAANTCTCGTGATTNAAAGTTGTTTTNGTATAAAGCTGGGCCTTTAGAGGGGGCGTTTTT----TGAGA-ATCC-CAATC--TGAA-TG-ACACCA-TTCTGGAATA-TGTAGCGG-AACAGTATATCNTGAAG---TGACT-TTTTAACA--GCTGTTCAG--TAG-------TTT--TTAGT--A-GAC-------TAAGGGA----------T-AGAG--------------GG-----C------TG---GTA-GAGCAC--TTACTGGAA---CCAGCG-ATGTA--------TC--TTT-G-TTTGTAAGGA-TTTC---TTA-TGCG---TT---T-CGGAA-----TCCAGT-A--------AAGGT-ATGGTAA-TTCAAATTGAT-CCTGAT-TCTTCGGAAA-TATTGAA---AGTATTT-CAAACAGAAAGGTGANTTTGAAGAA-TT-TCATC-TTAGT-CAGATTGCTTGGA-GTATA-AAGT----AAGATTCCCAGATGTG---TGA--AGTA-AACCC-T-AGTT-C-ATTTAAAAAG-ACAAGTATAATA----GT-GA-CTCT--TTACAAAC--A-----AAG----ACAAA-------TGTGA-ATC---ACTNTGCTTTAT--GCTGTCT--AACT---A-TAACAA-AGTTTTCACG-----TG----TNTAA--CTCA-TTTACNCACTTCTG---GCT-TC-----TTAA-GACAG-----AAGGATAAATAGT-CG--ATTTTCCC---CGC-----TAAA----TGGTTAC----GGATTTT-AATNATTTCCGAA-TANTTTTGATCA-TTCAGACAAAGTGTCAAGCTCCTCTCCCT
Reference ( family-568 ) : AAAT-GGCGAAG-TA----A-CAA----A--GT-A--T-A-AA----CGTAATCATA------G-TCCCAAAA-A---CAT-----AT--A--CAAAA--TCGAGT-GTA-GGGCAAC-CAC-GGA-C----CTC-C---G-ACAA-A----AG-CGA-A-G-G--CAG-GA-TCA-GG-TGC-C-----A-TGGAGGG-----A--------GTAAGCATC-CTCTGCTGACC----GG--T-CACAC-CCGC-CG--TGA-GCC-C-----T-TA-GTC-G---AA---A-CAA-A-G------------T---A--AACG-GG-G---TT-ACCC-G----TCGTCA-AATCTAAGTACGAAA--AC--G-CA-GTCTAAACAAAATG-GGTA-AAT---GAAACAAATCA--GT--C-AACA---T-------ATG-A--C--T-T---A--GTG-ATAA-TTTG-TAATCGCAAA--CA--A-GGT----C-ATTAT-------AGCGACC-G-TAGAATT-TG--CG--AA-ATGATG---ACTTT--AA-CGAGAATTC-G-TT-TA----TAACCCTGCAA-CA-T--CA-A--C--TTTTTGG---TT--AGT-AGTTGGCCT-CGCTTT-------AAAAA--ATC--T--C-------A-T-ACG-CAT--G-----CATG-------------C-CT-T-GCGTATC-GAATC-A---A-C----TG--A-GAG-ACAT-TA-CACA-C-A-TAA--GCAG--G-T-G-A--------TAGTGGTAACATTA-------------CTA-AC-ANAGA-A---A-G--G-AA--AGTTGAC---GAT------T-GCAAAG--------TCAAAGTC--ATCAACGC------TTATCA-T--ATA-AT-------G-TAGTTGT-C--AGT-----C-TG--C--C-ATTAGAG-TC-AA-TATTAAGTA-AAATATCC-A---AAT------------ATGAAGCAGATCTGTCAGATTCTGTGGTGTCCT---TTA-TTTCGAGTTCGTCGGGATAATATCAAAATGGA-CATA-ATTGTGAAAATTATGATTGTTAATTGAT---AG-ACATC-ATCTATATACCT----ATA-----TGTAAGG-TTG-AA---GGACACG-GCAAG---------------TTTT----TTGTTTTT------AT-CCCGTAACAGTTT-TTTTGAA-ACA-AATTCTGCT--TTCAT-ATGGA--ATATAAAA--ATAAGTC---TGCCAATA---AG-GGGGC-ACA-AT---TAGTGCCCNT-AGGAAT-AC-CA-AC--A---------GAATTGTTGGA-NAGAC--ATGGTCTCTCC---AA-AGAC------TACATAAATATT-ATCTA-T-AAGAAA----ACCC-A---------------AGCAT--ATGCTC-T--TA--ATATCTTACTTCA-AGAGTA-CTTGTGTGGG--CAATCA----------------GAGTG----GGTTCT-------------NACAAAAATATGTGTCTT--GTTT-----CCCCAA----CG-ACCAGAAACTTGTTA--TT---TTCGGG---TGCC-G-TTTT----TTGT---------TT-AAAANCA-ATTA--------T--CAAT--T--CT-GAAAAA-G---CCT-AGAT--TT-T--ATTTT--AT-CGTGAGAGGAATCGTTG-----------TAGTAAAG--TGGTGGAGAAA-TC-ATACG-TTTTGGATGCAGTCAATTGTCTCAGCATTGGAAACAANTCTCGTGATTNAAAGTTGTTTTNGTATAAAGCTGGGCCTTTAGAGGGGGCGTTTTT----TGAGA-ATCC-CAATC--TGAA-TG-ACACCA-TTCTGGAATA-TGTAGCGG-AACAGTATATCNTGAAG---TGACT-TTTTAACA--GCTGTTCAG--TAG-------TTT--TTAGT--A-GAC-------TAAGGGA----------T-AGAG--------------GG-----C------TG---GTA-GAGCAC--TTACTGGAA---CCAGCG-ATGTA--------TC--TTT-G-TTTGTAAGGA-TTTC---TTA-TGCG---TT---T-CGGAA-----TCCAGT-A--------AAGGT-ATGGTAA-TTCAAATTGAT-CCTGAT-TCTTCGGAAA-TATTGAA---AGTATTT-CAAACAGAAAGGTGANTTTGAAGAA-TT-TCATC-TTAGT-CAGATTGCTTGGA-GTATA-AAGT----AAGATTCCCAGATGTG---TGA--AGTA-AACCC-T-AGTT-C-ATTTAAAAAG-ACAAGTATAATA----GT-GA-CTCT--TTACAAAC--A-----AAG----ACAAA-------TGTGA-ATC---ACTNTGCTTTAT--GCTGTCT--AACT---A-TAACAA-AGTTTTCACG-----TG----TNTAA--CTCA-TTTACNCACTTCTG---GCT-TC-----TTAA-GACAG-----AAGGATAAATAGT-CG--ATTTTCCC---CGC-----TAAA----TGGTTAC----GGATTTT-AATNATTTCCGAA-TANTTTTGATCA-TTCAGACAAAGTGTCAAGCTCCTCTCCCT
gi|1 : AAACAGGGTA-TGCA-AA-----AAACCAATCA--AT--C-AATA---TCATTTTTATGTAGTC--TCT---ATTGTG--TACCTTTG-TAATCGCAAA--CA--ACGGT----CCATTAT-------AGCGACC-G-TAGTATT-TG--CG--AA-ATGATG---A-TTT--AA-CGAGAATTC-G-TTATA----TCACCCTGCAA-CA-T--CAGA--C--TTTTTGG---T---AGT-AGTTG-CCT-CGCTTTT------AAAAA--ATCA-T--C-------A-T-ACGACAT--GG----CATG-------------CTCT-T-GCGTATCTGAATC-A---A-C----TG--A-GAG-ACAT--A-CACA-CCA-TGAACGCAGCGG-T-GGA--------TAGTGGTA-CATTATACATTCTTTGTTCTT-ACTATGAATA---A-GTTG-AACAAGTTGACTTGGAT------T-GCCAAGCCTATCCTTCAAA-TC--ATCAACGCCCCCCTTTATCCCT--ATA-ACTCGCACCGCTAGTTG--C--AGTGTCGCT-TGTTC--CGATTAATG-TCGAA-TATTTTGTGGAAATATTTTA---AATCACTTCATAACAACGAAGCAGATC-GTCAGATTCTGTGGTGTCCT---TTACTTTCGAGTTGTTCGG--TGATTTCAAATGGGACCATACATTATGAAAATCATGATTGTTAATTGATATAAA-ACATCAATCTATATACTTTCAAATATATTTTGTTAGGTTTGCAACTGAGACACGTGCAAGA--------------TTTTTTCGTTGTTTTTTAAAAAATCCCCGTAACAGCCTATTTTGAATCCA-AATTC-GCTAGTTGCTAATAGA--ATTTAGAATCAT-AGTC---TGCCAATATTTAGTGGGGCAACAGACTCATAGTGTCCATAAGGGATAAT-CACAC--ACTTACCTAGGAATGTTTGGA-GAGACA-ATGG-CTACAC---AATAGACACCAATTACAT-AGT-TT-ATCTATT-ATTAGA----ACCCAA---------------AGCATGAATA--A-T--TA--ATATCTT-CTTCA-AGAGCACCTTGTATGAGATTAATCAGTTATTGCATTTTGGGGGGTGTTTTGGTTCTTTTCATTCTTATAAACAAAAATATGCAT-TTAAATTT-----CCCCAA----CG-ACCAGAAACTTGTTACCTTAAGTTCAGGTTTTGCC-G-TTTTGGTGTTGTTCCAAACCCTT-GAAACCA-ATTAATCACTTTT--CAAT--T--CTCGAAAAA-GCGCCCT-GGATAATT-TTAATTTC--AT-TGTGAGAAGAATTGTTGTAATATTGGGTTAGTAGAGCTCGGGGCAGAAA-TCAATAAGATATTGAATGCAGTCAATTGTCTCAGCATTGAAAACAACTCTCGTGATTTAAAGTTGTTTTAGTATAAAGCTGGGCTTTTAGAAGGGGCATTTTCACCGTGAGA-AT-T-CAATCTTTGAATTG-ACACCA-TTCTGGAATA-TGTAGCGG-AATAGTATATCCTGATATTCTGACTCTTTTAACAGCGCTGTTCAAGCTAGTTTAAGCTTT--TTAGT--ATGACAATCTTTTAAGGTA----------TAAGAG--------------GGGTCACT------TG---GTATGATCACTATTTCTGGAACCGCCAGCG-AC-TACTAACTACTT--TTT-GTTTTGTAAGGA-TCTCACTTTATTGCA---TT---TCCGGAG-----T-CAGT----------AAGGT-ATGGGAATTTCAAGTTGGTCCCTCGT-CCTTCGG-AA-TATTGAA---AGTATTTACAAACAGAAAGTTGATTTTGAAGAATTT-TCATCTTTAGTAAAGGTTGCTTGTA-GTAAT-AAGT----AAGATTCTCCAACCTGTTCTGA--AGTA-AA-CC-T-AGTT-C--TTTAAAAGC-ACAAGTATAA-A----GTAAA-CTTT--TAACAAACGGA-----AAGCACCATAGC-------TGT-A-ATC---AGTGTACTTT-T--GCTCTCT---TCT---G-TTAC----GCCTCTAC------TG----TATAA--CTTA-TTTACCCCCTTCTGTTTGCT-TCTCTCGTT---GACAGAAATTAAGGATAAA-AGTCCG--CTTTTTTCCAACGC-----TAAA----TGGTTA
gi|10 : tttcaaactaccataccggaaaa--TGA-GCC-------T-TACATC-GTT-GA---T-CAG-A--------------T---A--AACA-GGTG---CT-TCTT-G------GTAT-AATTTA-GTATGTAA--AG--A-CC-GGCTTAACAA--TT-GG---AAT---GAAACGCTTCA--GA--C-AACAACCT-------AC--A--C--G-T---A--CCT-ACAA-GTTG-TATTTGCAAATGCA--A-AATAAACC-ATCAT-------AACGACC-A-TAGAATT-TG--TA--AACACGA-G---ATTGT--A---GAAACTCCTG-TT-TG----T-------CAG-TA-T--CA----C--GCCTTGG---TTTAAG--ACTTTATCA-CACTC----------AGA--ATC--TG-T-------T-T-TCG-CAT----------------------------T-T--C-TATT-GGATC-AGTTA-CATTTTGCAG-GAG-ACAA-AATCAC--C-A-TAA--ACAA--G-T-G-A--------AAATAG-AATATTG-------------CTA--C-AT-GA-ATACA-G--G-AA--A-TTGAC---GAT------G-GAAAAG--------TTAAAGCA--ATCT-CGC------TTGTCA-TCAAGA-AG-------GGTTGTTGT----AAT-----T-TG--C--C-TTGAACG-TC-TA-TGTTCAGTA-AATTATCC-A---AAT------------ATGAatatggaatttgttacaaataaggtttttacttt
gi|11 : gaacacgtcccggtaaCA-GG-TGG-C-------TAGAAGG-----A--------GTGAGTATC-----GC---CC----GA--T-CACAC-CTGC-CG--TTA-GCC-C-----T-GA--TC-T---TG---A-TCA-G-G------------T------AACGCAA-G---TA-ATCC-G----TAGTCA-AA-CTCAGTATGCAA--AC--G-GATATC-GAAC--AATC-GGTA-AA-----AAGC--ATTA--G------GCG---T-------TTG-G--T--C-C---A--TTGTATAA-CTTG-TATCTGTAAA--TA--A-GAT----C-ATT
gi|12 : tttactcagtatacacatgtatatgtctttgaagtcggttatgatgttcaatgcaacgacatcggtatacatgtacttcaaacgaactacacgtttaccgtgacatcaaagtaaatatatgtttagcggactttttttctgcctatatatagttacggcactggatttcttatgaacaagtgaaaattacgaacagtgactaatctcttagatcctaaattaaaagtactagtatacaaacaaagatccctagccaagATCATGAAG---TGACG-TCTTAACA--GC----------AG-------TTA--CTAGT--A-G--------------GA----------T-AGAG--------------GG-----C------TGCGGGTA-GAGC-C--TTAGTG-AA---CCAGCG-ATGTAA-------TCATTCT-G-TTTG-AAGGAGTTTT---TTA-TGCA---T------CGAAAAAAAATCCAAT-ATAAAAAACAAGGT-ATGGTAA-TTTCAATTGAT-CCTGATGTCTTTGGAAAATAT-GAAGCAAATGTTT--AAACA-AAAGGTGGATTTGAAGAA-GTATCACT-TTAGT-CAGATGTCTTGGA-GTA-A-GATT----AGTATTCC-AAATGAC---TGA--AGTG-AATCC-T-AGTTAC-AGTTAAAAGGCATAAGTATG-TA-----T-GA-CTAT--TTATCAAC--AC----AAG----ACAAA-------TGTGA-ATC---ACTTGGCTTTATCAGCTG-----AACT---A-TATCAA-AGTTTTCATG-----TGCGTCTTTAA--C-CA-TTTACACACGTC-----GCTCTG-----TAAA-GACAG-----AAGGCTA
gi|13 : tccGTTTTT----TGATATATCC-CCATC--GGTA-TG-ACACCA-TTCTGGAATAATGTAGGTG-GACAGTATCTC-TGAAA---AGACTGTTTTAACA--GCTGTTTAG--TAG-------TTT----AGTTTA-GAT-------TAAGGAAGAGGCTTGGTT-AGAGCACTTACTTGAACTAG-----CATATATTG---GTA-GAGCAC--TTACTGGAA---C-AGC--ATATA--------TC--TTT-G-TT-GTAAGGA-ATTG---TTA-T-TG---TTAATT-CG-AA-----TCCAGTTA--------AAGGTCATTGTAA-ATCAAATTGAT-CCAGAT-TCTTCGGAA--TATTGAA---AGTATT--CAAACAGAA-GGTGAATTTGAAGAA-TT-CTATC-TTAGT-CAGATTGCTTGGAGGTATATAAGT-----AGATTCCCAGATGCT---CGA--AGTA-CACCCTT-AG-T-C-ATCTTAAAAG-ACAAGTACAG-A----GT-CAGCTCTAGTTACAA
gi|14 : agtgtagaAAA--GGCAAAGATA----A-CGA----ACAGTGA--T-C-AATCT-CGTAA-----------G-TCCTAAAT-A---GA------AT--A--CAAAA--ACAAGA-GTC-GGGCAAT-CAC-GGA-C----CCC-T---GGACAC-A----C--CAG-A-A-G--TGG-GA-TCA-GG-TGC-C-------TAGGGGG-----A--------GTAAGCACC-CCCTGTTGACC----GG--T-CACAC-CCGC-CG--TGA-GCC-C-----A-TA-GTC-T---TG---A-TCA-G-G------------T---A--AACG-GA-----------C-A----TC-----AGT----GTGTGAAA--A---A-CG-G-CTTAAC--AATG-GCT---AT---GAAACACATCA--GA--C-AGCA---T-------TTG-A--C--T-C---A--ATG-ATAG-GTCA-TATTGGTAAA--CT--A-AAT----T-GTTAC-------AACGACC-A-TAGAATT-TA--CG--AA-ATGCTGC--ATTTA--AA-CGTGACT---G-TT-GA----AACCCCTGCAA-CA-TACCG-A--C--TTTT
gi|15 : ggatgtA-C----CTC-T---A-ACAA-A----GG-CGA-A-G-G---AG-GG-TCA-GG-TGC-C-----A--GGAGG------A--------GTAAGCATC-CTCTGCTGACC----GG--T-CACAC-CCAC-CG--TGA-GCC-C-----T-TA-GTCGG---AA---A-TAA-G-G------------T---A--ataaatcatgcactttcttttcaaagtacatgtatatttgcacatgaaat
gi|15 : caaatAAATAAGGTA---T---GAACAAAATCA--GT--C-AACA---T-------ATGGA--CCTT-T---A--GTG-ATAA-TTTG-CAA-CGCAAA--CA--A-GGT----C-ATTAT-------ACCGACC-ATTAGAATT-TG--CGAAAA-ATGATG---ATTTTTAAA-CGAGATTTC-G--T-TA----TAA-CCTGCAA-CATT--CA-A--CTTTTTTTGT---TT--AGC-AGTTAGCCTAAGCTTT-------AAAAA--ATCTTT--C-------ATT-ACG-CGG--A-----CATG-------------CTCT-T-GC-TATC-GAATC-A---A-CT---TGC-G-GAGTAAAT-TA-CACATC-A-TAA--GCAG--GATGG-A--------TAGTGGT-GTATTA-------------CTA-tgaacaaaatcagtcaacatatggacctttagtgataatttgcaacgcaaacaaggtcattataccgaccattagaatttgcgaaaaatgatgatttttaaacgagatttcgttataacctgcaacattcaactttttttgtttagcagttagcctaagctttaaaaaatctttcattacgcggacatgctcttgctatcgaatcaacttgcggagtaaattacacatcataagcaggatggatagtggtgtattactacttctttcgttacttggataattttattgaacattgac
gi|16 : caaatacctctaacaaaggcgaaggagggtcaggtgccaggaggagtaagcatcctctgctgaccggtcacacccaccgtgagcccttagtcggAAAT-GGCGAAG-TA----A-CAATTAAA--GT-A--TCA-AA----CGTA-TCATA------G-TCCCCAAA-A---CAC-----AT--A--CAAAA--TCGAGT-GTA-GG-CAAT--AC-GGA-C----CTT-C---G-ACAA-A----AG-CGA-A-AAG--CAG-GAATCAAGG-TGC-C-----A-TGGA-GG-----A--------GTAAGCATC-CTCTGCTGACC----GG--TCCACAC-CCGC-CG--TGA-GCC-C-----T-TA-GTC-G---AA---A-CAA-A-G------------T---A--AACG-GG-G---TT-ACCC-G----TCGTCA-AATCTAG--ACGAAA--AT--GACA-GCCTAACTAACAAG-GGTATAA-----AAACAAATCA--GT--C-A--A---T-------ATG-A--C--T-G---A--GTG-ATAA-TTTG-TAATCGCAAA--CA--A-GGT----C-ATTAT-------AGCGACCGG-TAGAATT-TG--CG--AA-ATGATG---ACTTTAAAA-CGAG-ATTC-A-GT-TA----TAACCCTGCActtctttcgttacttggataattttattgaacattgac
gi|17 : taA-T-AAGAAA-----CCC-A---------------AGCAT----GCTCAT--TA--ATATCTAACTTCA--GAGTA-CTTGTGTGGG--CAATCA----------------GA--G----GGTTTT-------------CAACAAAATATGTGTCTT--GTTT------CCCAA----CG-ACTAGAAATTCG-TA--TT---TTCGGG---TGCCGG-TTTT----TTGT---------TTAAAAAGCA-ATTA--------TTATAAT------T-GAAAAAGG---CCTAAGAT--TT-TA-ACTTT--AT-CG---GAGGAATCGTTG-----------T-GTAAAG--T-GTGGAGAAA-TC--TACG-TTTTTGATGCAGTCAATT
gi|18 : aatcgaccaattgttgctaccatatgttttcctaatg-GGA-C----CTC-C---A-A-AA-ATTATAG-AGGTA-G-G--CAG-GA-TCA-GGGTGC-C-----A--GGAGGATCGTAA--------TTGAGCATC-CTCTGCTGACC----GATCT-CACACACCGC-CATCTGA-GCC-T-----TGTA-GTT-C---AA---A-CAA-A-GC-----------T---A--AACG-GG-GATTCT-ATCC------TCGTCA-AATCT-AGTACGAAA--AT--G-AA-GGCTAAACACAA-G-GGTT-ATT---GAAACAAGCAG--GT--C-AACA---T-------ATG-A--CT-T-T---A--GTG-ATAA-TTTG-T-ATCGC-AA--CA--A-tttgaaaattcttgtatt
gi|19 : gcaaacataaaatgttatgtagattattatcgTCATA------AATCCCATAA-A---GA------AT--A--TAAAA--C-------TA-AGGCAAA-CAC-GAA-C----CCT-T---G--CAT-AT---AC-CGG-A-G-G--TGG-GA-TCA-GG-TTT-TTTTTAA-AAGAGGG-----A---------TAAGCACC-CCTTGTTGACC-----G--T-C-CAC-TCGC-AT--TAT-ACC-C-----T-CT-ATC-T---TG---A-TCA-G-G------------T---A--AACT-GA-G---TA-ATCT-G----T----A-GGTC-AAGAACGAAA--aat
gi|2 : ttagatactgttggagacaatattggttgctcaccgaaagaatgaaaagtgaagataacgtaacagtgatccatcAAAT-GGCGAAG-TA----A-CAA----A--GT-A--T-A-AA----CGTAATCATA------G-TCCAAAAA-A---CA------AT--A--CAAAAA-TCGAGTTGTAAGGGCAAC-CAC-GGAAC----CTT-C---G-ACGA-A----AG-CGA-A-G-G--CAA-GG-TCA-GG-TGC-C-----AATGGAGAG-----A--------GTAAGCATC-CTCTGCTGACC----GG--T-CACAC-CCGC-CG--TGA-GCC-T-----G-TA-GTC-G---AA---A-CAA-ATG------------T---A--AACG-GG-G---TT-ACCC-G----TCGTCA-AATCTAAGTATGAAA--AT--G-CA-GTCTAAACAAAATG-GGTA-AAT---GAAACAAATCATGGT--C-AACA---T-------ATG-A--C--T-T---A--GTG-ATAC-TTTG-TA-TCGCAA---CA----GGT----C-ATTAT-------AGCGACC-G-TAGAATT-TGTGCG--AA-ATGATG---ACTTT--AA-CGAGAATTC-GGTT-TA-----AACCCTGCAA-CA-TA-CA-A--C--TTTTTGG---TT--AGT-AGTTGCCCT-CG--TT-------AAAAA--ATC--A--C-------A-TTACG-CAT--G-----CATG-------------C-CT-T-G-GTATC-GAATC-A-----C----CG--A-GAG-ACAT-TA-CACA-C-A-TAAT-GCAG--T-G-G-A--------TAGTGGTAACATTA-------------CTA-AC-AAAAA-A---A-G--G-AA--AAGTGAC---AAT------T-GGCAAG--------TCAAAGTCCCATCAACGT------TTATCA-T--ATATAT-------G-T-GTTTTGC--AGT-----CCTG--C--C-ATTAGAG-TC-AA-TATTA--TA-AAATATCC-A---A-T------------ATGAAGCACATTGGTCAGATTCTGTGGTGTC-T---TTA-TTTCAAGTTCGTCAGGATAATATCAAAATGGA-CATA-ATTGTGAAA-TTATGATTGTTAATGGAT---AA-ACATC-GTCTATATACCT----ATA-----AGTAAGG-TTG-AA---GGACACT-GCAAG---------------TTTT----TTGTTTTT------A--CCCG-AACAGTTT-TCCTGAA-ACA-AATTCTGCT--TTCAT-ATGGAATATATAAAA--ATAAGTC---TGCCAATA---AG-GGGGC-AAC-AT---TAGTACCCAT-AGGAA--AC-CA-AC--A---------GAATTGTTGGAGAAGACGGAT-GTCACTCCAAAAA-AGAC------TACAATAATATTAATCTA-TAAAGCAA----ACCC-A---------------AGCA---ATGCTC-T--TA--ATATCTTTCTTC--AGAGTA-CTTGTGTGGG--CAATCA----------------GAGTG----GGTTCT-------------GACAAAAATATGTATC-T--GTTT-----CCCAAA----TG-ACCAGAAACTTGGTA--TT---TTCGGG---TGCC-G-TTTT----TTGT---------TC-AAAAGCA-ATTA--------T--CAAT--TTCCT-GAAAAA-G---CCT-AGAT--TT-T--ATTTT--ATCCGT--GAGGAATTGTTG-----------TA-TAAAG--TGGTGGAGAAATTC-ATATG-TTTT-GATGCAGTCAATT---------TTAGAA--AAATCTCGTGATTGAA----GTTTTC-TATAAAGCT----CTTTAGAG-------TTTT----TGAGA-ATCCACAATC--TGAA-TGAACACCACTTCTGGAATA-TGTAGTGGAAACAG--TATCTTGAAG---TGAC--CTTTAACA--GCTGTT-AG--TAG-------TTTTGTTAGT--A-G---------TAAGGGA----------T-AGA---------------GG-----C------TG---GTA-AGGCAC--TTACTGGAA---CCAGCGAATGTA--------TC--TTTGG-TTTGTAAGGA-TTTC---TTA-TGCATATTT---T-TGGAA-----TCCAGT-A--------AAGGT-ATGGTAA-TTCAAATTGAT-CCTGAT-TCTTCGGAAA-TATTAAA---CGTATTC-CAAACAGAAAGGTGATTTTGA--GA-TT-TCATC-TTAGT-CAGATTGCTAGGA-GTATA-AAGTCAGGAAAATTCCCAGATGTG---TGA--AGTA-AACCC-TAAGTT-CAATTTAAAAAG-ACAAGTATAATA----GT-GA-CTTT--ATACAAAC--A-----AAG----ACAAG-------TG-----TT---ACTGTGCTTTAT--ACAGCCTGGAACC---AGTAACAA-AGTTTTCATGTAGTCTA----TGTAA--CTCA-TTTACCCCCTTCTG---GCT-TC-----TTAA-GACAG-----AAGGGTAAATAGT-AG--ATTTTCCC---CGC-----TAAA----TGGTTATAACGGGATTTTAAATAATTTCCGAA-TACTTTTGATCA-TTCAGACAAAGTGTCAAGAT-CTCTCCCTtaaatgttgatgcatt
gi|20 : A----A--AT-A--T-A-AATAGGCGAAGT--TA------A-TCCCAAAA-A---CAT-----AT--A--CAAAA--CCAAGT-GTA-GGGCAAC--AC-GGA-C----CTC-C---G-ACAA-A----AG-CGA-A-G-G--CAG-GA-TCA-GG-TGC-C-----A-TGGAAG------A--------GTAAGCATC-CTCTGCTGATC----GG--T-CACAC-CCGC-CG--TGA-GCC-C-----T-TA-GTC-G---AA---A-AAA-A-G------------CATGA--AACG-AA-A---TC-A-----------GTCT-AA-CTA--TAC-ATG--AC--T-TA-GT---GATAATATG-CGT--AATCTGGAAACAAGTCA--TTTGC-GAAA---TG------ATG-A--C--T-T---ca
gi|21 : AA----A--GT-AATT-A--------GTAA-CATA------G-TGCCAAAA-A---CAT-----AT--ATACAAAA--ACGAGT-GCA-GGGCAA--GAC-GGA-C----CTT-C---G-ACAA-A----CG-Ctaaattgagtattcgttat
gi|21 : ctattaC-C-----T-TC-GAC-A---AACGCA-CAA-A-A------------T---A--AACA-GG-G---TA-GCCC-G----TCGTAA-AATCTT-GTACAAAA--ATAAG--A-GTCTGA-CAAA--G-GGTA---C---GAAACAGATCA--GT--C-AACA---C-------ACG-A--C--T-T---C--GTG-ATAA-TTTG-TAGTCGCAAA--CA--A-GGT----C-ATTAT-------AGCGACA-G-TAGAATT-TG--CG--AA-AGGATG---Aacaaaataaacagggtagcccgtcgtaaaatcttgtacaaaaataagagtctgacaaagggtacgaaacagatcagtcaacacacgacttcgtgataatttgtagtcgcaaacaaggtcattatagcgacagtagaatttgcgaaaggatgat
gi|22 : ctattaaaagtaattagtaacatagtgccaaaaacatatatacaaaaacgagtgcagggcaagacggaTATC-TAATC-A---A-C----TG--G-GAG-ATATGCA-TAC--C-A-TTT--GCAA--G-G-G-A--------TAGTGGTA-TATTA-------------CTA--C-AAAGACA---G-G--G-AA--AGCTGAT---GAT------T-GCATTT--------TTAAAGTC--ACCAA-GC------TTATCA-T--ATA-AT-------G-TAGCTGT-A--AGT-----C-TG--C--C-ATTAGAG-CC-AA-TATTAAGTA-AAATATCC-A---ACT------------AAGAAGCAGATTTGTCAAATTCTGTGGTCTCCT---TTA-TTTTGAGTTCGTCGGGt
gi|23 : A-A----CG-CAC-A-G-G--CAG-GA-TCA-GG-TGC-C-----A-TGGAGG------A--------GTAAGCATC-CTTTGCTGACC----GG--T-CACAT-CCGC-CG--TGA-GCC-G-----G-TA-TTC-G---AA---A-CAA-A-A------------T---A--AACA-GG-G---TA-ACCC-G----TCGTAA-AATCT-TGTACGAAA--ATAAG--A-GTCT-GACAAA--G-GGT---AT---GAAACAGATCA--GT--C-AACA---C-------ACG-A--C--T-T---C--GTG-ATAA-TTTG-TAGTCGCAAA--CA--A-GGT----C-ATTAT-------AGCGA
gi|24 : AAA--GGCAAAGATA----A-CGA----ACAGTGA--T-C-AATCT-CGTAA-----------G-TCCTAAAT-A---GA------AT--A--CAAAA--ACAAGA-GTT-GGGCAAT-CAC-GGA-C----CCC-T---GGACAC-A----C--CAG-A-G-G--TGG-GA-TCA-GG-TAC-C-------TAGGAGG-----A--------GTAAGCATC-CCCTGTTGA
gi|25 : cactgtgataaatggtagtattaatgtTGTG---TGATAAGTATAACCC-T-AGTT-C-ATTTATAAAG-ACAAGTATAATATTTTCT-GG-CCCC--TAACAAAA--AAATTCAAG----ACAAATTGACTTTGTAACATCTTAACTCTGTTTCA---ACTGTC-----CTGTAA-TAGCAATAGTTCTCTCG-------------TAAGGCTCATTTTAC-CACTTCTG---a
gi|26 : AATT-TG--CG--AA-ATGATA---A------GA-C-AGGATT-------------TAAGGCGACAA-CA-A--TA-A--AAATTTTTAGAATTT--AGTCAGT-GGCCT-CGACCTGATAAGAAAAAA--ATA--T--CAAAAAATA-T-ACG-CAC--GTGGTATATGAC-----------C-CTCT-GCGCGAC-GAATC-A---ATC----TG--ATGAG-ACGA-TA-CA
gi|27 : -A--C-A-AC----CGT--TCATA------A-TCCAAAAA-AATGTAT-----AT--A--CAAAAA-TCGAGT-CGA-GAGCAGCGCACTGGA-CACATCTT-CTGTA-ATAA-A----AGCCGA-ATG-GTTTAGTGA-T---AG-TTT-T-----A-TTGAGAG-----AAGAAAATGGTAAG------TCCACTAACC----AG--T-CA
gi|28 : ggcgactgtaTGTCAGTGTCTGTGGTGTCCTGAATTA-TATTAAGTTCTTCGCGATA-TATCAAA-TGGA-TATA-ACTGTGAAAATTATGATTGTTAATTGAT---AGCACATC-ACC
gi|28 : CACC-GCAAG---------------TTTT-----TGTTTTT------AT-TCCGTAACAGGTT-TT---GA-ACA-AATTgcaagtttttgtttttattccgtaacaggttttgaacaaatt
gi|29 : tgtcagtgtctgtggtgtcctgaattatattaagttcttcgcgatatatcaaatggatataactgtgaaaattatgattgttaattgatagcacat--CTCA-TT---ACACTTCTG---GCT-TT-----TTAAAGACA-------AGGATAAATAGTACGCCATTTTCCT---CGCGCGCTTAAAGTTTTAATTAC----GGATTTT-AATTACTTCCGAATTAATTTTGATCATTTCAGACAAAGTATTCAACTCCTCTCCC
gi|3 : AAAT-GGCGAAG-TACA--A-CAA----T--GT-G--TTA-AA----CGTAA-AATA------G-TCCCAAAA-A---CATGT---AT--A--CAAAA--TTGAGT-GTA-GGTCAAC--AC-GGA-C----CTC-C---G-ACAA-A----AG-TGA-A-G-G---AG-GA-TCA-GG-TGC-C-----A-TGG-GTG-----A--------GTAAGCATC-CTCTGCTGACG----CG--C-CACAC-CCGT-CG--TGA-GCC-C-----T-TA-GTC-G---AA---A-CAACA-G------------T---A--AACG-GG-A---TT-ACC--G----TCGTGA-AATCTA-GTACGAAA--AT--G--A---CTGA-CAAA--G-GATA---T---GAAACAAATCA--GT--C-AACA---T-------ATG-A--C--C-T---G--GTG-ATAA-TTTG-TAATCGCAAA--GA--A-GGT----C-ATTAT-------AGCGACC-G-TATAATT-TG--CG--AA-ATGAT----ACTTT--AAATGAGA-TTC-G-TTATACCGTTAACCCTGCAA-CA-T--CA-------TTTTTGG---TT--ACT-AGTTGGCCT-AGCTTT-------AAAAAT-CCC--T--C-------A-T-ACA-CAT--ATGC--CATGTGTTGGATATAGCC-CT-T-GCGTATC-GAATC-A---A-C----TG--A-GAG-ACAT--A-CACA-CCA-TAA--GCAG--G-T-G-A--------TATTGGTA-CATTA-------------CTA--C-ATAGA-A---AAG--G-AA--TGTTGAC---GATA-----T-GCAAAG--------TCAAAGTC--ATCA-CGT------TTATTA-T--ATA-AT-------G-TA--TGT-C--AGT-----C-TG--CATC-ATTAGAG-TC-AAATATTAAGTA-AAATAGCC-A---AAT------------ATAAAGCAGATATGTCAGATTCTGTGGTGTCCT---TTA-TTTCGAGTTCGCCA----AATATATAAATGGA-CATA-ATTGTG-AAATT-TTATTGTTAATTGATA--AG-ACATC-GTTTATATACCC----ATA-----TGTAAGG-TTG-AA---GGACACG-GT------------------TTTT----TTGTTTTT------AT-CCTGTAACGTTTT-TTTT--A-ACACAATTCTAC---TTCAT-AT-GA--ATATAAAA--ATAAGTC---TGCCAATA---AG-AGGAC-ACA-AT---TAGTGTCCTT-AGGAAT-AC-CA-AC--A---------T-ATTGTTGGA--AGAC--ATGGTTTCT-----AA-AGAC------TACATAAATATT-GTCCA-T-AAGAAA----ACCC-A---------------AGC----ATGCTC-T--TA--ATATC-TACTTC--AGAGTA-CTTGTGTGGG--CAATCA----------------GAGT-----GGTTCT-------------GAC-AAAACATGT
gi|30 : ctattaaacctgacacaatacatctgctagtcatctgggactgatgtttatatatcACATTG-------------TTA-ACTACATA-A---A-A--G-AA--A--T--------T------T-GCAAAA--------CTCAAGTC--ATCA-CGT------TTATCA-T--ATA-AT-------GTTAGTTGT-CCAAGTC----C-TG-----C-ATTAGAGATT-AA-TATTAAAGG-AAGTGTTC-ATGGAAT------------A
gi|31 : T-CA-CAC--C-A-TAA--GTAG--G-T-G-G--------TAGTGGT-ATATTA--------------TC-AC-ATTGA-A---A-G-----------------------------GCAAAG--------TTAAAGTC--ATC-TTGC------TTATCA-T--ATA-AT-------G-CAGTTGT-C--AGT-----G-TG--T--C-ATTAG
gi|32 : cttatCAT-T--CAC--C-A-TAA--GCAG--G-TGG-A--------TGGTGGT-ATATTA-------------CT--AC-ATAGA-A---AGG--G-AA--AGTTGAC---GATAGCCGATAGCAAAG--------TTAAGGTC--ATC-ACGC------TTATC
gi|34 : tatcctCAATA---AG-GGGGC-ACA-AT---TAGTGCCCGT-TGGAAT-AT-CA-AC------------GGATTGTTAG--TAGAC--ATGG--TCTCC---AA-AGAC------TACACAAATATT-ATTTA-T-AAG
gi|35 : GA-GCC-T-----T-TA-GTC-G---AA---AACAG-G-GAGGGGGGGCGGTT---ACGAGCG-GA-G---TT-ACCCTG----TCGTCAGAATCT-AGTACGGAA--A---G--A-G--TGGACAAA--G-GGTA-ctaa
gi|36 : A-GG-T-C-C-----G-TGAATGA-----A--------GTAAGCATCTCGTTGCTGATCCGAGGA--T-CACAC-CCAC-CG--TGA-GCA-A-----T-CA-AGA-G---AA---A-CAG-A-tg
gi|37 : gatggatggtcgCCCAACATA---CATGTATAAT--A--CAGAG--TCGA-T-GTA-GA-CAAC--AC-AGA-C----CTAGT---A-ACAA-A----AGGCGA-G-G-G--CAG-GA-TCA-GG-TGC-C-----A-TG
gi|38 : cc--ATTTTCCC---CGC-----TAAA----TGG----------ATTTT-AATCATTTCCGAA-TATTTGTATCCA-TTCAGACAAAGTGTCAAGCTCCTCTCCCT
gi|39 : gcAAAT-GGCGAAG-TATTTTA-CAA----T--GT-G--T-TTAA----CATAATCATA------G-TCCAAAAA-A---CAT-----GT--A--CAAAA--TCGAG
gi|4 : tttgttataAAATTGGCGAAG-TA----AACAA----T--GT-G--TTA-AA----CGTAATCGTACATGTAG-TCCCTAAA-A---CAT-----AT--A--TACAACTTCGAGT-GTA-TGGCAAC--AT-GGA-C----CTC-C---G-ACAACA----GG-CGA-A-G-C--CAG-GA-TCA-G--TGC-C-----A-TGGAGGG-----A--------GTAGGCATC-CTCTGCTGACC----GG--T-CAC-C-CCACACG--TGA-GCCTC-----G-TA-GTC-G---AG---A-CAA---G------------T---A--AACA-GG-G---TT-TACC-G----TC---------TAC-TACGAAATGAG--A-CA-GTCTAA-CAA---G-GGTA---T---GAAACAAATCA--GT--C-AGCA---T-------ATG-A--C--T-T---A--GTG-ATAA-TTTGGTAATCGCAA---CA--A-GGT----C-AT-AT-------AGCGACC-G-TAGAATCCTG--CG--AA-ATGCTGCGGACTTTGAAA-CGAGAACTC-G-TT--A----TAACCCTGCAAACA-T--CA-TTTC--TTTTT-----TT---GT-AATTGAC-T-CGCTTT-------AAAG----TC--CTGC-------G-T-CCG-CAT--GA----TATA-------------C-CT-TTGCGTATC-GAATC-A---A-C----TG--A-GAG-ACAT--A-CACA-CCA-TAA--GCAG--G-T-G-A--------TAGTGG-AACATTA-------------CTA--C-AAAGA-A---A-G--GGAA--AGTTGAC---GAT------T-GCAAAG--------TCA--------TCA-CGT------TTATCA-T--ATA-AT-------G-TAGTTGT-C--AGT-----C-TG--C--C-ATTAGAA-TC-AA-TTTTAAGTA-AAATATCC-A---AAT------------ATGAAGCACATCTGTCAGATTCTGTGGTGTTCT---TTA-TTTGGAGTTCGTCAGGAT-ATATC-AAATGGA-CATA-ATTATGAAAATTATGATTGTTAATAGATC--AG-ACATC-ACCTATATATCTAC--ATA-----TGTA
gi|41 : actatcttatccgaatgacatcaaagattacttgaacgattgtctgtactgcaatat---AG-ACATC-ATCTATATATCT----ATA-----TGTAATG-ATG-AA---GGACACA-GTAAG---------------TTTT----TTGTTT
gi|42 : AAAT-GGCGAAG-TA----A-CAA----A--GT-A--T-G-AAC---CGTAATCATA------
gi|44 : AAAT-GGCGAAG-TA----G-CAA----A--GT-AT-T-C-AA----CATAATCATA------A-Tcgtacacagataaaccata
gi|46 : cgcacatttataTTTTGG---TT--AGT-AGATGGCCT-CGCTTT-------AACAA--ATC--
gi|47 : A-A---G-G--G-GA--AATTGAC---AAT------T-GCAAAG--------TCAAAGTC--AT
gi|49 : -A---AAT------------ATGAAGCACATCTGTCTGATTCTGTG
gi|5 : AAATTGGTGAAG-TA----AACAA----T--GT-G--T-T-AAT---CGTAATCATA------G-TCCTAAAA-A---CAT-----ATTTA--CAAAG--TCGAGT-GTA-GGGCAAC--AC-GGA-T----CTC-C---G-ACAA-A----AG-CGA-A-G-G--CAG-GA-TCA-GG-TGC-C-----A-TAGAGG------A--------GTAAGCATC-CTCTGCTGACC----GG--T-CACAC-CCGC-CA--TGA-GCC-C-----T-TA-GTC-G---AA---A-CAA-G-G------------T---A--AACA-GG-A---TT-ACCC-G----TTGTCA-CATCT-AGTACGAAA--AT--GACA-GTCT-AACAAAA---GGT---AT---GGGACAAATCA--GT--C-AGCA---T-------------------------------TAA-TTTA-TAATCGCAAA--CA--A-GGT----C-ATTAT-------ACCGACT-G-TAGAATT-TG--CG--AC-ATGGTG---ACTTTA-AA-CGAGAA-TC-G--T-TA----TAATCCTGCAA-CA-T--CA-A--C--TTTTTAG---TT--AGT-AGTTGGCCT-CGCTTT-------AAAAA--GTCT-T--C-------A-T-ACG-CAT--GA----CATGT------------T-CT-T-GCGTATC-TAATC-A---A-CTGCATG--G-AAA-ACAT-T--CACACC-A-TAA--GCAG--G-T-G-ATACATTTGTAGTGGT-ACATTA-------------CTA-
gi|6 : tatactctatatgataatatatgtcttctgaaaccgcttttacatgtttctgtgttggcgacatcggtattttgggctttttcaaaagtttggcttatatttaaaaagttttcttttcatgaatgcatttttttctgtatttttttttattgtatgtagtaaaagatatT-GGCCAAA-TA----AACAA----T--TTGA--T-A-AT----TGTAATCAAA------A-CCCCAAAA-----CAT-----AC--A--CAAAG--TCGAAT-GTA-AGGAAAC--AC-AGA-C----CTC-C---G-ATAA-T----AG-CGA-A-G-G--AAT-AG-TCA-GT-CG-----------------------------------GCATC-CTCTGCTGACC----GG--T-CACAT-CCGC-CG--TGA-GCC-C-----T-TG-GTC-G---AA---A-CAA-A-G------------T---A--AACG-GG-A---TT-ACCC-G----TCGTCA-AATCTA-GTAGGAAA--AT--GACA-GTCTAA-CAAA--G-GGTA---T---GAAACAAATCA--GT--C-AACA---T-------ATG-A--C--T-T---A--ATG-ACAA-CTTG-TAATCGCATA--CA--A-GGT----C-ATT---------------------------TG--CG--AA-ATGGTG---ACT-----------------------G----TAGCCCTGCAA-CA-T--CA-------TTTTTTG---CT--AGT-AGTTGACCT-CGCTTT-------AAAAA--GTCC-T--C-------G-T-ACG-CAT--GA----CATG-------------CTCT-T-GCGTATC-GAATC-A---A-C----TG--G-AAG-ACAC--A-CACA-C-AATAA--GCAG--G-T-G-A--------TAAGGGTA-CATTA-------------CTA--C-ATGAA-A---A-G--G-AA--AGGTGAC---GAT------T-GCAAAG--------TTAAAGTC--ATCA-CGC------TTATCA-T--ATA-AT-------G-CAGTTAT-C--AGC-----C-TA--C--C-TTTAAAG-TC-AA-TATTAAGTA-AAAAATCC-A---AAT------------ATGAAGCAGATATGTCAGATTCTGTGGTGTCCT---TTA-ca
gi|7 : atagatTGTCAGATT--GTGTTGTC-T---TTA-TAT-GAGTTT-TCGGGATA-T-TCCAAAT------TA-AT----------GCCCTTGTTA-TTGAT---AGCAGAT--ATCTATAT-CCT----ATA-----TATAAGG-TTG-A-----GACAAA-GCAGGGAGTTTTTTTTTTTTTTTT----TTGTTTTT------AT-CCCGTAA-AGTTT-TTGT--A-GCA-AATTCTGC---TTCAT-ATGTA--ATAT-TCA--GTAAGTCTGGTGCCAATA---AA-GGGG---CA-AT---TAGTGCCACT-AGGAATGACGCA-ACGGA---------GAATTGTTTGA-TCGAC--CT-GTCTCTCC----A-CGAC------TACATAAATAAT-TTCTG-T-AAGAAACTCTACTC-ATCATGATGTCATGTTATCAT--TTGTTC-TAATAATATATCCTACTTCAGAGAGTA-CT--TGTGGG--C-ATCA----------------GAGT-----GTTTTT-------------TAAACAAATATGTGTCTT--GTTTTTCCGCCCCAATCCCCGAACTAGAAA--TATTA--TT---TTCGGG---GGTC-ATTTTT----TTGT---------TT---AACCACATT---------T--CGATAAT--CT-GAAAAG------CT-AGAT--TTAT--ATTTTTAAT--GTGAatactggcgtcaaagctcaaaattcttggagcgggaataataaaatatatt
gi|8 : taagatataaaacggtcagctactaaggattgtgtggtgAAAT-GGCGAAG-TA----A-CAA----A--GT-A--TGA-AA----CGTAATCATA------G-TCCAAAAA-A---CAC-----AT--A--CAAAA--TCGAGT-GTA-GGGCAAC--AC-GGA-C----CTT-C---G-ACGA-A----AG-CGA-A-G-G--CAG-GA-GCA-GG-TGC-C-----A-TGGAGG------A--------GTAAGCATC-CTCTGCTGACC----GG--T-CACAC-CCGC-CG--TGA-GCC-T-----G-TA-GTC-G---AA---A-CAA-A-G------------T---A--AACG-GG-G---TT-ACCC-G----TCGTCA-AATCTA-GTATGAAA--AT--GACA-GTCTAA-CAAA-TG-G-TA---T---GAAACAAATCA--GT--C-AACA---T-------ATG-A--C--T-T---A--GTG-ATAC-TTTG-TAATCGCAAA--CA--A-GGT----C-ATTAT-------AGCGACC-G-TAGAATT-TG--CG--AA-ATGATG---ACTTTA-AA-CGAG-ATTC-G--T-TA----TAACCCTGCAA-CA-T--CA-A--C--TTTTTGG---TT--AGT-AGTTGGCCT-CGCTTT-------AAAAA--ATCA-T--C-------A-T-ACG-CATG-G-----CATGC------------C-CT-T-GCGTATC-GAATC-A---A-C----TG--A-GAG-ACA--TA-CACACC-A-TAA--GCAG--G-T-G-A--------TAGTGGT-ACATTA-------------CTACAC-AAA-A-A---A-G--G-AA--AGTTGAC---AAT------T-GCAAAG--------TCAAAGTC--ATC-ACGT------TTA
gi|9 : ggcatataCCCCAAC-A---CAT------T--A--CAAAT--TCGC-T-GTA-AG-CAAC-CG--GGA-C----CTC-C---G-ACAA-A----AG-----A-G-G--TAG-GA-TCA--G-TGCAC-----A-TGGGAGG-----A--------GTAAGTTTC-CTCTCCCGAC------G--T-CACAC-CCGCGCA--TGACACC-CCCAAAT-TA-GAT-GACCAA---A-C-A-A-G------------T---A--AACG-GG-GA--TTAACCC-GGGTTTCA--A-AAT---AGTACGAAATGAC--A-CA--TCT-AACAAA--G-GGT---AT---GAAACAAATCA--GT--CAAACA---T-------ATG-A--C--T-TGCGG--ATG-ATAA-TTTG-TAATCGGGAA--CAACA-GGT----C-ATTATTTCGATAAGC-ACC-GCTAGAATT-GC--CG--A-----------------------AGAATTC-G--T-TA----TTAACCTACAA-CA-TA-CA-A--C--TTTTTTG---TT--AGT-AGTTTGGCT-CCCTTT-------AAAAGCCCTC--C--C-------A-C-ACG-CACGAG-----TATG-------------C-TC-T-GCGTATC-GAATCAA---A-C----CG--A-GAG-ACAT-
5 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|33 ): GTTTTTGCGTTGGTGACATCAGAATTTTGGATTTTTTCAAAACTTTGGCAGTGACTGGCTTATCATATTTAAAAAGTTTTCTTTTCATGAATGCATTT
Unaligned ( gi|40 ): TTAAAAGTGAAGATAACAAACAGTGATCTATGTCATAATTCCTATAAAAAATTGAAATCTAA
Unaligned ( gi|43 ): GATCTGAGGTCCAGGGGTGATGAATATAGCATACTTCCATGTTGATTGATT
Unaligned ( gi|45 ): TATTAAGTGATGCCATACATAGAGGATCTTGAATGAGT
Unaligned ( gi|48 ): TAGTCGATACTAAAATTCATGCTCATTTGAT
Alignments
lowQualScore : 111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111
lowQualScore : 111111 1111111 22222222222222 111111 22 111111111111111 111111111111 22 3333333333333333333333333333333333 1111111 11 1111111111 11 1111111 1111111 2222222222222 444444444444444444444444444 1111 1111 11 1 11111111 11 111111111111111111 111111 11111111 22 111111 111111111 1111111 222222222222 222 1 2222 11111 1111 11 444444444444444 1111 222222 2222 222 1 11 11 111 111 111 11 444444444444 111 11 1 1 1111 222222 11111 555555555555555 22222 11 11 111 11 5555555555555555555555555 44444444444444 11 222222 2222 1 11 111 111 111 2222 4444444444444 1 444444444444444444444 1 33333 1 11 2222 11 222222 66666666666666 2222 1 22 2 1 333333333 11 2222 11 2222 222222 2222 1 111 11 1 1 1 1 1 1 111 22 11 444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444 111 1 11 111 11 44444444 11 1 1 1 1111 1 333333333333333333333 4444444444 1 1 1 1 1 111 111 1 1 1 1 1 111 22222 111 11 2222222 11 444444444444444444444444444444444 111 4444444444444444444444 111 55555555555555 11 111 22222222 111 222222 22222 111 22222 2222 33333 1 1 1
lowQualScore : 6 6 333333 4444444 55555555555555 3 777777 2 2 444 444444 33 33 88 2 2 1 11 2 2 5555 2 444 4 2 6666 4 2 2 2 555 2 2 2 2 2 8888888 333333333333333 2 5555 33 2 2 5 33 2 6666666 2 2 2 666 333 2 222 333333333333 333 33 2 2 666 2 2 5555 1 2 11 66 6666666666666666666666666666666666 33 33 2 444 0000000 4 33 55 2 444444 2 2 2 0 33 33 2 5555 2 9999999 3 6 2 33 33 2 777 3 0 88 3 33 3 7777777777 0 3 3 11 8888888 1 555 44 3 0 3 4444444 77 5555555555555 3 3 3 999999999999999999999999999 3 3 3 3 555 3 7777 8888 3 4444 77 0 3 77 44 3 6 3 22222222 88 888888888888888888 7 222 6 555 6 44 3 44 33 555 222222 3 22222222 44 22 000000 4 66 4 777777777 8888 6666666 99999 4 5 5 5 0 5 4 777 222222222222 0 1 2 888 5 5 4 11 99 3 7 3 6 6 3 3 1 111 1 5 3333 66666 8 8 4444 00 888888888888888 4444 333333 88 0 8 3333 8 8 3 999 0 6 33 44 33 3 777 444 8 8 8 444 1 8 66 8 8 333333333333 3 777 99 0 0 5 4444 8 333333 6 0 8 6 6 77777 8 000000000000000 33333 3 8 11 11 3 6 999 8 0 11 0 9999999999999999999999999 55555555555555 5 55 33 777777 1111 0 6 9 33 777 777 444 1111 2222222222222 1 0 555555555555555555555 0 00000 0 33 4444 33 111111 0 88888888888888 1111 3 00 3 6 3 777777777 88 1 1 4444 66 2222 888888 8888 3 555 88 3 3 3 3 3 3 7 0 777 99 33 3 777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777 777 0 3 33 2 777 2 22 6 66666666 33 0 0 3 3 0 7777 0 2 999999999999999999999 2 9999999999 0 0 0 0 3 66 0 777 999 2 3 1 3 0 0 0 0 0 777 44444 0 2 444 11 8 3 8 8 0 8 88 8 0 3333333 8888 1 11 1 111111111111111111111111111111111 777 1 8888888888888888888888 1 000 33333333333333 11 0 8 0 8 0 0 444 66666666 000 777777 0 7 88888 777 55555 1111 3 22222 3 1 3 1 3 6
lowQualScore : . . ...... ....... .............. . ...... . . ... ...... .. .. .. . . . .. . . .... . ... . . .... . . . . ... . . . . . ....... ............... . .... .. . . . .. . ....... . . . ... ... . ... ............ ... .. . . ... . . .... . . .. .. .................................. .. .. . ... ....... . .. .. . ...... . . . . .. .. . .... . ....... . . . .. .. . ... . . .. . .. . .......... . . . .. ....... . ... .. . . . ....... .. ............. . . . ........................... . . . . ... . .... .... . .... .. . . .. .. . . . ........ .. .................. . ... . ... . .. . .. .. ... ...... . ........ .. .. ...... . .. . ......... .... ....... ..... . . . . . . . ... ............ . . . ... . . . .. .. . . . . . . . . ... . . .... ..... . . .... .. ............... .... ...... .. . . .... . . . ... . . .. .. .. . ... ... . . . ... . . .. . . ............ . ... .. . . . .... . ...... . . . . . ..... . ............... ..... . . .. .. . . ... . . .. . ......................... .............. . .. .. ...... .... . . . .. ... ... ... .... ............. . . ..................... . ..... . .. .... .. ...... . .............. .... . .. . . . ......... .. . . .... .. .... ...... .... . ... .. . . . . . . . . ... .. .. . .......................................................................................... ... . . .. . ... . .. . ........ .. . . . . . .... . . ..................... . .......... . . . . . .. . ... ... . . . . . . . . . ... ..... . . ... .. . . . . . . .. . . ....... .... . .. . ................................. ... . ...................... . ... .............. .. . . . . . . ... ........ ... ...... . . ..... ... ..... .... . ..... . . . . . .
lowQualScore : 7 7 999999 2222222 55555555555555 2 222222 7 5 444 888888 44 44 44 7 7 7 00 5 4 0000 4 111 7 2 9999 4 4 4 4 333 4 4 1 1 1 2222222 000000000000000 2 0000 22 4 5 0 22 2 0000000 1 1 1 666 777 1 555 666666666666 999 11 4 4 555 4 4 0000 8 4 88 55 6666666666666666666666666666666666 22 22 4 111 0000000 7 22 66 4 999999 5 5 5 8 44 44 5 7777 7 3333333 1 2 9 99 99 9 999 3 3 88 1 88 1 5555555555 8 3 3 22 8888888 0 888 66 3 2 3 2222222 99 9999999999999 6 6 6 777777777777777777777777777 6 6 3 3 888 3 5555 5555 3 9999 33 0 3 99 66 3 7 3 11111111 66 000000000000000000 3 777 7 888 7 66 3 66 33 888 999999 3 11111111 66 44 555555 4 11 4 888888888 9999 3333333 66666 4 0 0 0 4 0 4 888 888888888888 7 7 5 888 0 3 3 44 00 5 5 5 7 7 2 2 7 444 4 7 3333 77777 0 0 8888 33 333333333333333 2222 000000 88 8 0 0000 0 0 2 222 0 5 88 55 88 2 555 000 0 0 0 000 0 0 88 0 0 888888888888 8 666 00 0 6 0 8888 0 000000 0 8 0 7 7 88888 0 000000000000000 44444 2 0 00 00 8 0 444 0 8 00 8 8888888888888888888888888 00000000000000 6 88 88 555555 2222 0 5 2 88 555 555 000 2222 8888888888888 0 0 888888888888888888888 0 00000 0 88 8888 88 555555 7 33333333333333 0000 3 77 7 7 3 000000000 00 0 0 0000 00 5555 777777 3333 3 333 33 3 3 3 3 7 3 3 8 555 22 88 2 222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 555 0 2 88 5 555 5 55 5 22222222 88 0 0 2 2 0 8888 0 5 555555555555555555555 5 5555555555 0 0 0 0 2 55 0 555 555 5 2 0 2 0 0 0 0 0 222 55555 2 5 000 00 0 2 0 0 8 0 88 0 8 6666666 2222 4 00 4 000000000000000000000000000000000 555 0 0000000000000000000000 2 222 88888888888888 00 8 0 8 8 6 8 000 22222222 222 555555 8 3 88888 555 00000 2222 2 00000 3 0 3 0 3 7
consensus : AAAT-GGCGAAG-TA----A-CAA----A--GT-A--T-A-AA----CGTAATCATA------G-TCCCAAAA-A---CAT-----AT--A--CAAAA--TCGAGT-GTA-GGGCAAC-CAC-GGA-C----CTC-C---G-ACAA-A----AG-CGA-A-G-G--CAG-GA-TCA-GG-TGC-C-----A-TGGAGGG-----A--------GTAAGCATC-CTCTGCTGACC----GG--T-CACAC-CCGC-CG--TGA-GCC-C-----T-TA-GTC-G---AA---A-CAA-A-G------------T---A--AACG-GG-G---TT-ACCC-G----TCGTCA-AATCTAAGTACGAAA--AC--G-CA-GTCTAAACAAAATG-GGTA-AAT---GAAACAAATCA--GT--C-AACA---T-------ATG-A--C--T-T---A--GTG-ATAA-TTTG-TAATCGCAAA--CA--A-GGT----C-ATTAT-------AGCGACC-G-TAGAATT-TG--CG--AA-ATGATG---ACTTT--AA-CGAGAATTC-G-TT-TA----TAACCCTGCAA-CA-T--CA-A--C--TTTTTGG---TT--AGT-AGTTGGCCT-CGCTTT-------AAAAA--ATC--T--C-------A-T-ACG-CAT--G-----CATG-------------C-CT-T-GCGTATC-GAATC-A---A-C----TG--A-GAG-ACAT-TA-CACA-C-A-TAA--GCAG--G-T-G-A--------TAGTGGTAACATTA-------------CTA-AC-ANAGA-A---A-G--G-AA--AGTTGAC---GAT------T-GCAAAG--------TCAAAGTC--ATCAACGC------TTATCA-T--ATA-AT-------G-TAGTTGT-C--AGT-----C-TG--C--C-ATTAGAG-TC-AA-TATTAAGTA-AAATATCC-A---AAT------------ATGAAGCAGATCTGTCAGATTCTGTGGTGTCCT---TTA-TTTCGAGTTCGTCGGGATAATATCAAAATGGA-CATA-ATTGTGAAAATTATGATTGTTAATTGAT---AG-ACATC-ATCTATATACCT----ATA-----TGTAAGG-TTG-AA---GGACACG-GCAAG---------------TTTT----TTGTTTTT------AT-CCCGTAACAGTTT-TTTTGAA-ACA-AATTCTGCT--TTCAT-ATGGA--ATATAAAA--ATAAGTC---TGCCAATA---AG-GGGGC-ACA-AT---TAGTGCCCNT-AGGAAT-AC-CA-AC--A---------GAATTGTTGGA-NAGAC--ATGGTCTCTCC---AA-AGAC------TACATAAATATT-ATCTA-T-AAGAAA----ACCC-A---------------AGCAT--ATGCTC-T--TA--ATATCTTACTTCA-AGAGTA-CTTGTGTGGG--CAATCA----------------GAGTG----GGTTCT-------------NACAAAAATATGTGTCTT--GTTT-----CCCCAA----CG-ACCAGAAACTTGTTA--TT---TTCGGG---TGCC-G-TTTT----TTGT---------TT-AAAANCA-ATTA--------T--CAAT--T--CT-GAAAAA-G---CCT-AGAT--TT-T--ATTTT--AT-CGTGAGAGGAATCGTTG-----------TAGTAAAG--TGGTGGAGAAA-TC-ATACG-TTTTG-ATGCAGTCAATTGTCTCAGCATTGGAAACAANTCTCGTGATTNAAAGTTGTTTTNGTATAAAGCTGGGCCTTTAGAGGGGGCGTTTTT----TGAGA-ATCC-CAATC--TGAA-TG-ACACCA-TTCTGGAATA-TGTAGCGG-AACAGTATATCNTGAAG---TGACT-TTTTAACA--GCTGTTCAG--TAG-------TTT--TTAGT--A-GAC-------TAAGGGA----------T-AGAG--------------GG-----C------TG---GTA-GAGCAC--TTACTGGAA---CCAGCG-ATGTA--------TC--TTT-G-TTTGTAAGGA-TTTC---TTA-TGCG---TT---T-CGGAA-----TCCAGT-A--------AAGGT-ATGGTAA-TTCAAATTGAT-CCTGAT-TCTTCGGAAATAT-TGA---AAGTATTT-CAAACAGAAAGGTGANTTTGAAGAA-TT-TCATC-TTAGT-CAGATTGCTTGGA-GTATA-AAGT----AAGATTCCCAGATGTG---TGA--AGTA-AACCC-T-AGTT-C-ATTTAAAAAG-ACAAGTATAATA----GT-GA-CTCT--TTACAAAC--A-----AAG----ACAAA-------TGTGA-ATC---ACTNTGCTTTAT--GCTGTCT--AACT---A-TAACAA-AGTTTTCACG-----TG----TNTAA--CTCA-TTTACNCACTTCTG---GCT-TC-----TTAA-GACAG-----AAGGATAAATAGT-CG--ATTTTCCC---CGC-----TAAA----TGGTTAC----GGATTTT-AATNATTTCCGAA-TANTTTTGATCA-TTCAGACAAAGTGTCAAGCTCCTCTCCCT
Reference ( family-568 ) : AAAT-GGCGAAG-TA----A-CAA----A--GT-A--T-A-AA----CGTAATCATA------G-TCCCAAAA-A---CAT-----AT--A--CAAAA--TCGAGT-GTA-GGGCAAC-CAC-GGA-C----CTC-C---G-ACAA-A----AG-CGA-A-G-G--CAG-GA-TCA-GG-TGC-C-----A-TGGAGGG-----A--------GTAAGCATC-CTCTGCTGACC----GG--T-CACAC-CCGC-CG--TGA-GCC-C-----T-TA-GTC-G---AA---A-CAA-A-G------------T---A--AACG-GG-G---TT-ACCC-G----TCGTCA-AATCTAAGTACGAAA--AC--G-CA-GTCTAAACAAAATG-GGTA-AAT---GAAACAAATCA--GT--C-AACA---T-------ATG-A--C--T-T---A--GTG-ATAA-TTTG-TAATCGCAAA--CA--A-GGT----C-ATTAT-------AGCGACC-G-TAGAATT-TG--CG--AA-ATGATG---ACTTT--AA-CGAGAATTC-G-TT-TA----TAACCCTGCAA-CA-T--CA-A--C--TTTTTGG---TT--AGT-AGTTGGCCT-CGCTTT-------AAAAA--ATC--T--C-------A-T-ACG-CAT--G-----CATG-------------C-CT-T-GCGTATC-GAATC-A---A-C----TG--A-GAG-ACAT-TA-CACA-C-A-TAA--GCAG--G-T-G-A--------TAGTGGTAACATTA-------------CTA-AC-ANAGA-A---A-G--G-AA--AGTTGAC---GAT------T-GCAAAG--------TCAAAGTC--ATCAACGC------TTATCA-T--ATA-AT-------G-TAGTTGT-C--AGT-----C-TG--C--C-ATTAGAG-TC-AA-TATTAAGTA-AAATATCC-A---AAT------------ATGAAGCAGATCTGTCAGATTCTGTGGTGTCCT---TTA-TTTCGAGTTCGTCGGGATAATATCAAAATGGA-CATA-ATTGTGAAAATTATGATTGTTAATTGAT---AG-ACATC-ATCTATATACCT----ATA-----TGTAAGG-TTG-AA---GGACACG-GCAAG---------------TTTT----TTGTTTTT------AT-CCCGTAACAGTTT-TTTTGAA-ACA-AATTCTGCT--TTCAT-ATGGA--ATATAAAA--ATAAGTC---TGCCAATA---AG-GGGGC-ACA-AT---TAGTGCCCNT-AGGAAT-AC-CA-AC--A---------GAATTGTTGGA-NAGAC--ATGGTCTCTCC---AA-AGAC------TACATAAATATT-ATCTA-T-AAGAAA----ACCC-A---------------AGCAT--ATGCTC-T--TA--ATATCTTACTTCA-AGAGTA-CTTGTGTGGG--CAATCA----------------GAGTG----GGTTCT-------------NACAAAAATATGTGTCTT--GTTT-----CCCCAA----CG-ACCAGAAACTTGTTA--TT---TTCGGG---TGCC-G-TTTT----TTGT---------TT-AAAANCA-ATTA--------T--CAAT--T--CT-GAAAAA-G---CCT-AGAT--TT-T--ATTTT--AT-CGTGAGAGGAATCGTTG-----------TAGTAAAG--TGGTGGAGAAA-TC-ATACG-TTTTG-ATGCAGTCAATTGTCTCAGCATTGGAAACAANTCTCGTGATTNAAAGTTGTTTTNGTATAAAGCTGGGCCTTTAGAGGGGGCGTTTTT----TGAGA-ATCC-CAATC--TGAA-TG-ACACCA-TTCTGGAATA-TGTAGCGG-AACAGTATATCNTGAAG---TGACT-TTTTAACA--GCTGTTCAG--TAG-------TTT--TTAGT--A-GAC-------TAAGGGA----------T-AGAG--------------GG-----C------TG---GTA-GAGCAC--TTACTGGAA---CCAGCG-ATGTA--------TC--TTT-G-TTTGTAAGGA-TTTC---TTA-TGCG---TT---T-CGGAA-----TCCAGT-A--------AAGGT-ATGGTAA-TTCAAATTGAT-CCTGAT-TCTTCGGAAATAT-TGA---AAGTATTT-CAAACAGAAAGGTGANTTTGAAGAA-TT-TCATC-TTAGT-CAGATTGCTTGGA-GTATA-AAGT----AAGATTCCCAGATGTG---TGA--AGTA-AACCC-T-AGTT-C-ATTTAAAAAG-ACAAGTATAATA----GT-GA-CTCT--TTACAAAC--A-----AAG----ACAAA-------TGTGA-ATC---ACTNTGCTTTAT--GCTGTCT--AACT---A-TAACAA-AGTTTTCACG-----TG----TNTAA--CTCA-TTTACNCACTTCTG---GCT-TC-----TTAA-GACAG-----AAGGATAAATAGT-CG--ATTTTCCC---CGC-----TAAA----TGGTTAC----GGATTTT-AATNATTTCCGAA-TANTTTTGATCA-TTCAGACAAAGTGTCAAGCTCCTCTCCCT
gi|1 : AAACAGGGTA-TGCA-AA-----AAACCAATCA--AT--C-AATA---TCATTTTTATGTAGTC--TCT---ATTGTG--TACCTTTG-TAATCGCAAA--CA--ACGGT----CCATTAT-------AGCGACC-G-TAGTATT-TG--CG--AA-ATGATG---A-TTT--AA-CGAGAATTC-G-TTATA----TCACCCTGCAA-CA-T--CAGA--C--TTTTTGG---T---AGT-AGTTG-CCT-CGCTTTT------AAAAA--ATCA-T--C-------A-T-ACGACAT--GG----CATG-------------CTCT-T-GCGTATCTGAATC-A---A-C----TG--A-GAG-ACAT--A-CACA-CCA-TGAACGCAGCGG-T-GGA--------TAGTGGTA-CATTATACATTCTTTGTTCTT-ACTATGAATA---A-GTTG-AACAAGTTGACTTGGAT------T-GCCAAGCCTATCCTTCAAA-TC--ATCAACGCCCCCCTTTATCCCT--ATA-ACTCGCACCGCTAGTTG--C--AGTGTCGCT-TGTTC--CGATTAATG-TCGAA-TATTTTGTGGAAATATTTTA---AATCACTTCATAACAACGAAGCAGATC-GTCAGATTCTGTGGTGTCCT---TTACTTTCGAGTTGTTCGG--TGATTTCAAATGGGACCATACATTATGAAAATCATGATTGTTAATTGATATAAA-ACATCAATCTATATACTTTCAAATATATTTTGTTAGGTTTGCAACTGAGACACGTGCAAGA--------------TTTTTTCGTTGTTTTTTAAAAAATCCCCGTAACAGCCTATTTTGAATCCA-AATTC-GCTAGTTGCTAATAGA--ATTTAGAATCAT-AGTC---TGCCAATATTTAGTGGGGCAACAGACTCATAGTGTCCATAAGGGATAAT-CACAC--ACTTACCTAGGAATGTTTGGA-GAGACA-ATGG-CTACAC---AATAGACACCAATTACAT-AGT-TT-ATCTATT-ATTAGA----ACCCAA---------------AGCATGAATA--A-T--TA--ATATCTT-CTTCA-AGAGCACCTTGTATGAGATTAATCAGTTATTGCATTTTGGGGGGTGTTTTGGTTCTTTTCATTCTTATAAACAAAAATATGCAT-TTAAATTT-----CCCCAA----CG-ACCAGAAACTTGTTACCTTAAGTTCAGGTTTTGCC-G-TTTTGGTGTTGTTCCAAACCCTT-GAAACCA-ATTAATCACTTTT--CAAT--T--CTCGAAAAA-GCGCCCT-GGATAATT-TTAATTTC--AT-TGTGAGAAGAATTGTTGTAATATTGGGTTAGTAGAGCTCGGGGCAGAAA-TCAATAAGATATTGAATGCAGTCAATTGTCTCAGCATTGAAAACAACTCTCGTGATTTAAAGTTGTTTTAGTATAAAGCTGGGCTTTTAGAAGGGGCATTTTCACCGTGAGA-AT-T-CAATCTTTGAATTG-ACACCA-TTCTGGAATA-TGTAGCGG-AATAGTATATCCTGATATTCTGACTCTTTTAACAGCGCTGTTCAAGCTAGTTTAAGCTTT--TTAGT--ATGACAATCTTTTAAGGTA----------TAAGAG--------------GGGTCACT------TG---GTATGATCACTATTTCTGGAACCGCCAGCG-AC-TACTAACTACTT--TTT-GTTTTGTAAGGA-TCTCACTTTATTGCA---TT---TCCGGAG-----T-CAGT----------AAGGT-ATGGGAATTTCAAGTTGGTCCCTCGT-CCTTCGG-AATAT-TGA---AAGTATTTACAAACAGAAAGTTGATTTTGAAGAATTT-TCATCTTTAGTAAAGGTTGCTTGTA-GTAAT-AAGT----AAGATTCTCCAACCTGTTCTGA--AGTA-AA-CC-T-AGTT-C--TTTAAAAGC-ACAAGTATAA-A----GTAAA-CTTT--TAACAAACGGA-----AAGCACCATAGC-------TGT-A-ATC---AGTGTACTTT-T--GCTCTCT---TCT---G-TTAC----GCCTCTAC------TG----TATAA--CTTA-TTTACCCCCTTCTGTTTGCT-TCTCTCGTT---GACAGAAATTAAGGATAAA-AGTCCG--CTTTTTTCCAACGC-----TAAA----TGGTTA
gi|10 : tttcaaactaccataccggaaaa--TGA-GCC-------T-TACATC-GTT-GA---T-CAG-A--------------T---A--AACA-GGTG---CT-TCTT-G------GTAT-AATTTA-GTATGTAA--AG--A-CC-GGCTTAACAA--TT-GG---AAT---GAAACGCTTCA--GA--C-AACAACCT-------AC--A--C--G-T---A--CCT-ACAA-GTTG-TATTTGCAAATGCA--A-AATAAACC-ATCAT-------AACGACC-A-TAGAATT-TG--TA--AACACGA-G---ATTGT--A---GAAACTCCTG-TT-TG----T-------CAG-TA-T--CA----C--GCCTTGG---TTTAAG--ACTTTATCA-CACTC----------AGA--ATC--TG-T-------T-T-TCG-CAT----------------------------T-T--C-TATT-GGATC-AGTTA-CATTTTGCAG-GAG-ACAA-AATCAC--C-A-TAA--ACAA--G-T-G-A--------AAATAG-AATATTG-------------CTA--C-AT-GA-ATACA-G--G-AA--A-TTGAC---GAT------G-GAAAAG--------TTAAAGCA--ATCT-CGC------TTGTCA-TCAAGA-AG-------GGTTGTTGT----AAT-----T-TG--C--C-TTGAACG-TC-TA-TGTTCAGTA-AATTATCC-A---AAT------------ATGAatatggaatttgttacaaataaggtttttacttt
gi|11 : gaacacgtcccggtaaCA-GG-TGG-C-------TAGAAGG-----A--------GTGAGTATC-----GC---CC----GA--T-CACAC-CTGC-CG--TTA-GCC-C-----T-GA--TC-T---TG---A-TCA-G-G------------T------AACGCAA-G---TA-ATCC-G----TAGTCA-AA-CTCAGTATGCAA--AC--G-GATATC-GAAC--AATC-GGTA-AA-----AAGC--ATTA--G------GCG---T-------TTG-G--T--C-C---A--TTGTATAA-CTTG-TATCTGTAAA--TA--A-GAT----C-ATT
gi|12 : tttactcagtatacacatgtatatgtctttgaagtcggttatgatgttcaatgcaacgacatcggtatacatgtacttcaaacgaactacacgtttaccgtgacatcaaagtaaatatatgtttagcggactttttttctgcctatatatagttacggcactggatttcttatgaacaagtgaaaattacgaacagtgactaatctcttagatcctaaattaaaagtactagtatacaaacaaagatccctagccaagATCATGAAG---TGACG-TCTTAACA--GC----------AG-------TTA--CTAGT--A-G--------------GA----------T-AGAG--------------GG-----C------TGCGGGTA-GAGC-C--TTAGTG-AA---CCAGCG-ATGTAA-------TCATTCT-G-TTTG-AAGGAGTTTT---TTA-TGCA---T------CGAAAAAAAATCCAAT-ATAAAAAACAAGGT-ATGGTAA-TTTCAATTGAT-CCTGATGTCTTTGGAAA-ATATGAAGCAAATGTTT--AAACA-AAAGGTGGATTTGAAGAA-GTATCACT-TTAGT-CAGATGTCTTGGA-GTA-A-GATT----AGTATT-CCAAATGAC---TGA--AGTG-AATCC-T-AGTTAC-AGTTAAAAGGCATAAGTAT-GTA-----T-GA-CTAT--TTATCAAC--AC----AAG----ACAAA-------TGTGA-ATC---ACTTGGCTTTATCAGCTG-----AACT---A-TATCAA-AGTTTTCATG-----TGCGTCTTTAA--C-CA-TTTACACACGTC-----GCTCTG-----TAAA-GACAG-----AAGGCTA
gi|13 : tccGTTTTT----TGATATATCC-CCATC--GGTA-TG-ACACCA-TTCTGGAATAATGTAGGTG-GACAGTATCTC-TGAAA---AGACTGTTTTAACA--GCTGTTTAG--TAG-------TTT----AGTTTA-GAT-------TAAGGAAGAGGCTTGGTT-AGAGCACTTACTTGAACTAG-----CATATATTG---GTA-GAGCAC--TTACTGGAA---C-AGC--ATATA--------TC--TTT-G-TT-GTAAGGA-ATTG---TTA-T-TG---TTAATT-CG-AA-----TCCAGTTA--------AAGGTCATTGTAA-ATCAAATTGAT-CCAGAT-TCTTCGGAA-TAT-TGA---AAGTATT--CAAACAGAA-GGTGAATTTGAAGAA-TT-CTATC-TTAGT-CAGATTGCTTGGAGGTATATAAGT-----AGATTCCCAGATGCT---CGA--AGTA-CACCCTT-AG-T-C-ATCTTAAAAG-ACAAGTACAG-A----GT-CAGCTCTAGTTACAA
gi|14 : agtgtagaAAA--GGCAAAGATA----A-CGA----ACAGTGA--T-C-AATCT-CGTAA-----------G-TCCTAAAT-A---GA------AT--A--CAAAA--ACAAGA-GTC-GGGCAAT-CAC-GGA-C----CCC-T---GGACAC-A----C--CAG-A-A-G--TGG-GA-TCA-GG-TGC-C-------TAGGGGG-----A--------GTAAGCACC-CCCTGTTGACC----GG--T-CACAC-CCGC-CG--TGA-GCC-C-----A-TA-GTC-T---TG---A-TCA-G-G------------T---A--AACG-GA-----------C-A----TC-----AGT----GTGTGAAA--A---A-CG-G-CTTAAC--AATG-GCT---AT---GAAACACATCA--GA--C-AGCA---T-------TTG-A--C--T-C---A--ATG-ATAG-GTCA-TATTGGTAAA--CT--A-AAT----T-GTTAC-------AACGACC-A-TAGAATT-TA--CG--AA-ATGCTGC--ATTTA--AA-CGTGACT---G-TT-GA----AACCCCTGCAA-CA-TACCG-A--C--TTTT
gi|15 : ggatgtA-C----CTC-T---A-ACAA-A----GG-CGA-A-G-G---AG-GG-TCA-GG-TGC-C-----A--GGAGG------A--------GTAAGCATC-CTCTGCTGACC----GG--T-CACAC-CCAC-CG--TGA-GCC-C-----T-TA-GTCGG---AA---A-TAA-G-G------------T---A--ataaatcatgcactttcttttcaaagtacatgtatatttgcacatgaaat
gi|15 : caaatAAATAAGGTA---T---GAACAAAATCA--GT--C-AACA---T-------ATGGA--CCTT-T---A--GTG-ATAA-TTTG-CAA-CGCAAA--CA--A-GGT----C-ATTAT-------ACCGACC-ATTAGAATT-TG--CGAAAA-ATGATG---ATTTTTAAA-CGAGATTTC-G--T-TA----TAA-CCTGCAA-CATT--CA-A--CTTTTTTTGT---TT--AGC-AGTTAGCCTAAGCTTT-------AAAAA--ATCTTT--C-------ATT-ACG-CGG--A-----CATG-------------CTCT-T-GC-TATC-GAATC-A---A-CT---TGC-G-GAGTAAAT-TA-CACATC-A-TAA--GCAG--GATGG-A--------TAGTGGT-GTATTA-------------CTA-tgaacaaaatcagtcaacatatggacctttagtgataatttgcaacgcaaacaaggtcattataccgaccattagaatttgcgaaaaatgatgatttttaaacgagatttcgttataacctgcaacattcaactttttttgtttagcagttagcctaagctttaaaaaatctttcattacgcggacatgctcttgctatcgaatcaacttgcggagtaaattacacatcataagcaggatggatagtggtgtattactacttctttcgttacttggataattttattgaacattgac
gi|16 : caaatacctctaacaaaggcgaaggagggtcaggtgccaggaggagtaagcatcctctgctgaccggtcacacccaccgtgagcccttagtcggAAAT-GGCGAAG-TA----A-CAATTAAA--GT-A--TCA-AA----CGTA-TCATA------G-TCCCCAAA-A---CAC-----AT--A--CAAAA--TCGAGT-GTA-GG-CAAT--AC-GGA-C----CTT-C---G-ACAA-A----AG-CGA-A-AAG--CAG-GAATCAAGG-TGC-C-----A-TGGA-GG-----A--------GTAAGCATC-CTCTGCTGACC----GG--TCCACAC-CCGC-CG--TGA-GCC-C-----T-TA-GTC-G---AA---A-CAA-A-G------------T---A--AACG-GG-G---TT-ACCC-G----TCGTCA-AATCTAG--ACGAAA--AT--GACA-GCCTAACTAACAAG-GGTATAA-----AAACAAATCA--GT--C-A--A---T-------ATG-A--C--T-G---A--GTG-ATAA-TTTG-TAATCGCAAA--CA--A-GGT----C-ATTAT-------AGCGACCGG-TAGAATT-TG--CG--AA-ATGATG---ACTTTAAAA-CGAG-ATTC-A-GT-TA----TAACCCTGCActtctttcgttacttggataattttattgaacattgac
gi|17 : taA-T-AAGAAA-----CCC-A---------------AGCAT----GCTCAT--TA--ATATCTAACTTCA--GAGTA-CTTGTGTGGG--CAATCA----------------GA--G----GGTTTT-------------CAACAAAATATGTGTCTT--GTTT------CCCAA----CG-ACTAGAAATTCG-TA--TT---TTCGGG---TGCCGG-TTTT----TTGT---------TTAAAAAGCA-ATTA--------TTATAAT------T-GAAAAAGG---CCTAAGAT--TT-TA-ACTTT--AT-CG---GAGGAATCGTTG-----------T-GTAAAG--T-GTGGAGAAA-TC--TACGTTTTTG-ATGCAGTCAATT
gi|18 : aatcgaccaattgttgctaccatatgttttcctaatg-GGA-C----CTC-C---A-A-AA-ATTATAG-AGGTA-G-G--CAG-GA-TCA-GGGTGC-C-----A--GGAGGATCGTAA--------TTGAGCATC-CTCTGCTGACC----GATCT-CACACACCGC-CATCTGA-GCC-T-----TGTA-GTT-C---AA---A-CAA-A-GC-----------T---A--AACG-GG-GATTCT-ATCC------TCGTCA-AATCT-AGTACGAAA--AT--G-AA-GGCTAAACACAA-G-GGTT-ATT---GAAACAAGCAG--GT--C-AACA---T-------ATG-A--CT-T-T---A--GTG-ATAA-TTTG-T-ATCGC-AA--CA--A-tttgaaaattcttgtatt
gi|19 : gcaaacataaaatgttatgtagattattatcgTCATA------AATCCCATAA-A---GA------AT--A--TAAAA--C-------TA-AGGCAAA-CAC-GAA-C----CCT-T---G--CAT-AT---AC-CGG-A-G-G--TGG-GA-TCA-GG-TTT-TTTTTAA-AAGAGGG-----A---------TAAGCACC-CCTTGTTGACC-----G--T-C-CAC-TCGC-AT--TAT-ACC-C-----T-CT-ATC-T---TG---A-TCA-G-G------------T---A--AACT-GA-G---TA-ATCT-G----T----A-GGTC-AAGAACGAAA--aat
gi|2 : ttagatactgttggagacaatattggttgctcaccgaaagaatgaaaagtgaagataacgtaacagtgatccatcAAAT-GGCGAAG-TA----A-CAA----A--GT-A--T-A-AA----CGTAATCATA------G-TCCAAAAA-A---CA------AT--A--CAAAAA-TCGAGTTGTAAGGGCAAC-CAC-GGAAC----CTT-C---G-ACGA-A----AG-CGA-A-G-G--CAA-GG-TCA-GG-TGC-C-----AATGGAGAG-----A--------GTAAGCATC-CTCTGCTGACC----GG--T-CACAC-CCGC-CG--TGA-GCC-T-----G-TA-GTC-G---AA---A-CAA-ATG------------T---A--AACG-GG-G---TT-ACCC-G----TCGTCA-AATCTAAGTATGAAA--AT--G-CA-GTCTAAACAAAATG-GGTA-AAT---GAAACAAATCATGGT--C-AACA---T-------ATG-A--C--T-T---A--GTG-ATAC-TTTG-TA-TCGCAA---CA----GGT----C-ATTAT-------AGCGACC-G-TAGAATT-TGTGCG--AA-ATGATG---ACTTT--AA-CGAGAATTC-GGTT-TA-----AACCCTGCAA-CA-TA-CA-A--C--TTTTTGG---TT--AGT-AGTTGCCCT-CG--TT-------AAAAA--ATC--A--C-------A-TTACG-CAT--G-----CATG-------------C-CT-T-G-GTATC-GAATC-A-----C----CG--A-GAG-ACAT-TA-CACA-C-A-TAAT-GCAG--T-G-G-A--------TAGTGGTAACATTA-------------CTA-AC-AAAAA-A---A-G--G-AA--AAGTGAC---AAT------T-GGCAAG--------TCAAAGTCCCATCAACGT------TTATCA-T--ATATAT-------G-T-GTTTTGC--AGT-----CCTG--C--C-ATTAGAG-TC-AA-TATTA--TA-AAATATCC-A---A-T------------ATGAAGCACATTGGTCAGATTCTGTGGTGTC-T---TTA-TTTCAAGTTCGTCAGGATAATATCAAAATGGA-CATA-ATTGTGAAA-TTATGATTGTTAATGGAT---AA-ACATC-GTCTATATACCT----ATA-----AGTAAGG-TTG-AA---GGACACT-GCAAG---------------TTTT----TTGTTTTT------A--CCCG-AACAGTTT-TCCTGAA-ACA-AATTCTGCT--TTCAT-ATGGAATATATAAAA--ATAAGTC---TGCCAATA---AG-GGGGC-AAC-AT---TAGTACCCAT-AGGAA--AC-CA-AC--A---------GAATTGTTGGAGAAGACGGAT-GTCACTCCAAAAA-AGAC------TACAATAATATTAATCTA-TAAAGCAA----ACCC-A---------------AGCA---ATGCTC-T--TA--ATATCTTTCTTC--AGAGTA-CTTGTGTGGG--CAATCA----------------GAGTG----GGTTCT-------------GACAAAAATATGTATC-T--GTTT-----CCCAAA----TG-ACCAGAAACTTGGTA--TT---TTCGGG---TGCC-G-TTTT----TTGT---------TC-AAAAGCA-ATTA--------T--CAAT--TTCCT-GAAAAA-G---CCT-AGAT--TT-T--ATTTT--ATCCGT--GAGGAATTGTTG-----------TA-TAAAG--TGGTGGAGAAATTC-ATATG-TTTTG-ATGCAGTCAATT---------TTAGAA--AAATCTCGTGATTGAA----GTTTTC-TATAAAGCT----CTTTAGAG-------TTTT----TGAGA-ATCCACAATC--TGAA-TGAACACCACTTCTGGAATA-TGTAGTGGAAACAG--TATCTTGAAG---TGAC--CTTTAACA--GCTGTT-AG--TAG-------TTTTGTTAGT--A-G---------TAAGGGA----------T-AGA---------------GG-----C------TG---GTA-AGGCAC--TTACTGGAA---CCAGCGAATGTA--------TC--TTTGG-TTTGTAAGGA-TTTC---TTA-TGCATATTT---T-TGGAA-----TCCAGT-A--------AAGGT-ATGGTAA-TTCAAATTGAT-CCTGAT-TCTTCGGAAATAT-TAA---ACGTATTC-CAAACAGAAAGGTGATTTTGA--GA-TT-TCATC-TTAGT-CAGATTGCTAGGA-GTATA-AAGTCAGGAAAATTCCCAGATGTG---TGA--AGTA-AACCC-TAAGTT-CAATTTAAAAAG-ACAAGTATAATA----GT-GA-CTTT--ATACAAAC--A-----AAG----ACAAG-------TG-----TT---ACTGTGCTTTAT--ACAGCCTGGAACC---AGTAACAA-AGTTTTCATGTAGTCTA----TGTAA--CTCA-TTTACCCCCTTCTG---GCT-TC-----TTAA-GACAG-----AAGGGTAAATAGT-AG--ATTTTCCC---CGC-----TAAA----TGGTTATAACGGGATTTTAAATAATTTCCGAA-TACTTTTGATCA-TTCAGACAAAGTGTCAAGAT-CTCTCCCTtaaatgttgatgcatt
gi|20 : A----A--AT-A--T-A-AATAGGCGAAGT--TA------A-TCCCAAAA-A---CAT-----AT--A--CAAAA--CCAAGT-GTA-GGGCAAC--AC-GGA-C----CTC-C---G-ACAA-A----AG-CGA-A-G-G--CAG-GA-TCA-GG-TGC-C-----A-TGGAAG------A--------GTAAGCATC-CTCTGCTGATC----GG--T-CACAC-CCGC-CG--TGA-GCC-C-----T-TA-GTC-G---AA---A-AAA-A-G------------CATGA--AACG-AA-A---TC-A-----------GTCT-AA-CTA--TAC-ATG--AC--T-TA-GT---GATAATATG-CGT--AATCTGGAAACAAGTCA--TTTGC-GAAA---TG------ATG-A--C--T-T---ca
gi|21 : AA----A--GT-AATT-A--------GTAA-CATA------G-TGCCAAAA-A---CAT-----AT--ATACAAAA--ACGAGT-GCA-GGGCAA--GAC-GGA-C----CTT-C---G-ACAA-A----CG-Ctaaattgagtattcgttat
gi|21 : ctattaC-C-----T-TC-GAC-A---AACGCA-CAA-A-A------------T---A--AACA-GG-G---TA-GCCC-G----TCGTAA-AATCTT-GTACAAAA--ATAAG--A-GTCTGA-CAAA--G-GGTA---C---GAAACAGATCA--GT--C-AACA---C-------ACG-A--C--T-T---C--GTG-ATAA-TTTG-TAGTCGCAAA--CA--A-GGT----C-ATTAT-------AGCGACA-G-TAGAATT-TG--CG--AA-AGGATG---Aacaaaataaacagggtagcccgtcgtaaaatcttgtacaaaaataagagtctgacaaagggtacgaaacagatcagtcaacacacgacttcgtgataatttgtagtcgcaaacaaggtcattatagcgacagtagaatttgcgaaaggatgat
gi|22 : ctattaaaagtaattagtaacatagtgccaaaaacatatatacaaaaacgagtgcagggcaagacggaTATC-TAATC-A---A-C----TG--G-GAG-ATATGCA-TAC--C-A-TTT--GCAA--G-G-G-A--------TAGTGGTA-TATTA-------------CTA--C-AAAGACA---G-G--G-AA--AGCTGAT---GAT------T-GCATTT--------TTAAAGTC--ACCAA-GC------TTATCA-T--ATA-AT-------G-TAGCTGT-A--AGT-----C-TG--C--C-ATTAGAG-CC-AA-TATTAAGTA-AAATATCC-A---ACT------------AAGAAGCAGATTTGTCAAATTCTGTGGTCTCCT---TTA-TTTTGAGTTCGTCGGGt
gi|23 : A-A----CG-CAC-A-G-G--CAG-GA-TCA-GG-TGC-C-----A-TGGAGG------A--------GTAAGCATC-CTTTGCTGACC----GG--T-CACAT-CCGC-CG--TGA-GCC-G-----G-TA-TTC-G---AA---A-CAA-A-A------------T---A--AACA-GG-G---TA-ACCC-G----TCGTAA-AATCT-TGTACGAAA--ATAAG--A-GTCT-GACAAA--G-GGT---AT---GAAACAGATCA--GT--C-AACA---C-------ACG-A--C--T-T---C--GTG-ATAA-TTTG-TAGTCGCAAA--CA--A-GGT----C-ATTAT-------AGCGA
gi|24 : AAA--GGCAAAGATA----A-CGA----ACAGTGA--T-C-AATCT-CGTAA-----------G-TCCTAAAT-A---GA------AT--A--CAAAA--ACAAGA-GTT-GGGCAAT-CAC-GGA-C----CCC-T---GGACAC-A----C--CAG-A-G-G--TGG-GA-TCA-GG-TAC-C-------TAGGAGG-----A--------GTAAGCATC-CCCTGTTGA
gi|25 : cactgtgataaatggtagtattaatgtTGTG---TGATAAGTATAACCC-T-AGTT-C-ATTTATAAAG-ACAAGTATAATATTTTCT-GG-CCCC--TAACAAAA--AAATTCAAG----ACAAATTGACTTTGTAACATCTTAACTCTGTTTCA---ACTGTC-----CTGTAA-TAGCAATAGTTCTCTCG-------------TAAGGCTCATTTTAC-CACTTCTG---a
gi|26 : AATT-TG--CG--AA-ATGATA---A------GA-C-AGGATT-------------TAAGGCGACAA-CA-A--TA-A--AAATTTTTAGAATTT--AGTCAGT-GGCCT-CGACCTGATAAGAAAAAA--ATA--T--CAAAAAATA-T-ACG-CAC--GTGGTATATGAC-----------C-CTCT-GCGCGAC-GAATC-A---ATC----TG--ATGAG-ACGA-TA-CA
gi|27 : -A--C-A-AC----CGT--TCATA------A-TCCAAAAA-AATGTAT-----AT--A--CAAAAA-TCGAGT-CGA-GAGCAGCGCACTGGA-CACATCTT-CTGTA-ATAA-A----AGCCGA-ATG-GTTTAGTGA-T---AG-TTT-T-----A-TTGAGAG-----AAGAAAATGGTAAG------TCCACTAACC----AG--T-CA
gi|28 : ggcgactgtaTGTCAGTGTCTGTGGTGTCCTGAATTA-TATTAAGTTCTTCGCGATA-TATCAAA-TGGA-TATA-ACTGTGAAAATTATGATTGTTAATTGAT---AGCACATC-ACC
gi|28 : CACC-GCAAG---------------TTTT-----TGTTTTT------AT-TCCGTAACAGGTT-TT---GA-ACA-AATTgcaagtttttgtttttattccgtaacaggttttgaacaaatt
gi|29 : tgtcagtgtctgtggtgtcctgaattatattaagttcttcgcgatatatcaaatggatataactgtgaaaattatgattgttaattgatagcacat--CTCA-TT---ACACTTCTG---GCT-TT-----TTAAAGACA-------AGGATAAATAGTACGCCATTTTCCT---CGCGCGCTTAAAGTTTTAATTAC----GGATTTT-AATTACTTCCGAATTAATTTTGATCATTTCAGACAAAGTATTCAACTCCTCTCCC
gi|3 : AAAT-GGCGAAG-TACA--A-CAA----T--GT-G--TTA-AA----CGTAA-AATA------G-TCCCAAAA-A---CATGT---AT--A--CAAAA--TTGAGT-GTA-GGTCAAC--AC-GGA-C----CTC-C---G-ACAA-A----AG-TGA-A-G-G---AG-GA-TCA-GG-TGC-C-----A-TGG-GTG-----A--------GTAAGCATC-CTCTGCTGACG----CG--C-CACAC-CCGT-CG--TGA-GCC-C-----T-TA-GTC-G---AA---A-CAACA-G------------T---A--AACG-GG-A---TT-ACC--G----TCGTGA-AATCTA-GTACGAAA--AT--G--A---CTGA-CAAA--G-GATA---T---GAAACAAATCA--GT--C-AACA---T-------ATG-A--C--C-T---G--GTG-ATAA-TTTG-TAATCGCAAA--GA--A-GGT----C-ATTAT-------AGCGACC-G-TATAATT-TG--CG--AA-ATGAT----ACTTT--AAATGAGA-TTC-G-TTATACCGTTAACCCTGCAA-CA-T--CA-------TTTTTGG---TT--ACT-AGTTGGCCT-AGCTTT-------AAAAAT-CCC--T--C-------A-T-ACA-CAT--ATGC--CATGTGTTGGATATAGCC-CT-T-GCGTATC-GAATC-A---A-C----TG--A-GAG-ACAT--A-CACA-CCA-TAA--GCAG--G-T-G-A--------TATTGGTA-CATTA-------------CTA--C-ATAGA-A---AAG--G-AA--TGTTGAC---GATA-----T-GCAAAG--------TCAAAGTC--ATCA-CGT------TTATTA-T--ATA-AT-------G-TA--TGT-C--AGT-----C-TG--CATC-ATTAGAG-TC-AAATATTAAGTA-AAATAGCC-A---AAT------------ATAAAGCAGATATGTCAGATTCTGTGGTGTCCT---TTA-TTTCGAGTTCGCCA----AATATATAAATGGA-CATA-ATTGTG-AAATT-TTATTGTTAATTGATA--AG-ACATC-GTTTATATACCC----ATA-----TGTAAGG-TTG-AA---GGACACG-GT------------------TTTT----TTGTTTTT------AT-CCTGTAACGTTTT-TTTT--A-ACACAATTCTAC---TTCAT-AT-GA--ATATAAAA--ATAAGTC---TGCCAATA---AG-AGGAC-ACA-AT---TAGTGTCCTT-AGGAAT-AC-CA-AC--A---------T-ATTGTTGGA--AGAC--ATGGTTTCT-----AA-AGAC------TACATAAATATT-GTCCA-T-AAGAAA----ACCC-A---------------AGC----ATGCTC-T--TA--ATATC-TACTTC--AGAGTA-CTTGTGTGGG--CAATCA----------------GAGT-----GGTTCT-------------GAC-AAAACATGT
gi|30 : ctattaaacctgacacaatacatctgctagtcatctgggactgatgtttatatatcACATTG-------------TTA-ACTACATA-A---A-A--G-AA--A--T--------T------T-GCAAAA--------CTCAAGTC--ATCA-CGT------TTATCA-T--ATA-AT-------GTTAGTTGT-CCAAGTC----C-TG-----C-ATTAGAGATT-AA-TATTAAAGG-AAGTGTTC-ATGGAAT------------A
gi|31 : T-CA-CAC--C-A-TAA--GTAG--G-T-G-G--------TAGTGGT-ATATTA--------------TC-AC-ATTGA-A---A-G-----------------------------GCAAAG--------TTAAAGTC--ATC-TTGC------TTATCA-T--ATA-AT-------G-CAGTTGT-C--AGT-----G-TG--T--C-ATTAG
gi|32 : cttatCAT-T--CAC--C-A-TAA--GCAG--G-TGG-A--------TGGTGGT-ATATTA-------------CT--AC-ATAGA-A---AGG--G-AA--AGTTGAC---GATAGCCGATAGCAAAG--------TTAAGGTC--ATC-ACGC------TTATC
gi|34 : tatcctCAATA---AG-GGGGC-ACA-AT---TAGTGCCCGT-TGGAAT-AT-CA-AC------------GGATTGTTAG--TAGAC--ATGG--TCTCC---AA-AGAC------TACACAAATATT-ATTTA-T-AAG
gi|35 : GA-GCC-T-----T-TA-GTC-G---AA---AACAG-G-GAGGGGGGGCGGTT---ACGAGCG-GA-G---TT-ACCCTG----TCGTCAGAATCT-AGTACGGAA--A---G--A-G--TGGACAAA--G-GGTA-ctaa
gi|36 : A-GG-T-C-C-----G-TGAATGA-----A--------GTAAGCATCTCGTTGCTGATCCGAGGA--T-CACAC-CCAC-CG--TGA-GCA-A-----T-CA-AGA-G---AA---A-CAG-A-tg
gi|37 : gatggatggtcgCCCAACATA---CATGTATAAT--A--CAGAG--TCGA-T-GTA-GA-CAAC--AC-AGA-C----CTAGT---A-ACAA-A----AGGCGA-G-G-G--CAG-GA-TCA-GG-TGC-C-----A-TG
gi|38 : cc--ATTTTCCC---CGC-----TAAA----TGG----------ATTTT-AATCATTTCCGAA-TATTTGTATCCA-TTCAGACAAAGTGTCAAGCTCCTCTCCCT
gi|39 : gcAAAT-GGCGAAG-TATTTTA-CAA----T--GT-G--T-TTAA----CATAATCATA------G-TCCAAAAA-A---CAT-----GT--A--CAAAA--TCGAG
gi|4 : tttgttataAAATTGGCGAAG-TA----AACAA----T--GT-G--TTA-AA----CGTAATCGTACATGTAG-TCCCTAAA-A---CAT-----AT--A--TACAACTTCGAGT-GTA-TGGCAAC--AT-GGA-C----CTC-C---G-ACAACA----GG-CGA-A-G-C--CAG-GA-TCA-G--TGC-C-----A-TGGAGGG-----A--------GTAGGCATC-CTCTGCTGACC----GG--T-CAC-C-CCACACG--TGA-GCCTC-----G-TA-GTC-G---AG---A-CAA---G------------T---A--AACA-GG-G---TT-TACC-G----TC---------TAC-TACGAAATGAG--A-CA-GTCTAA-CAA---G-GGTA---T---GAAACAAATCA--GT--C-AGCA---T-------ATG-A--C--T-T---A--GTG-ATAA-TTTGGTAATCGCAA---CA--A-GGT----C-AT-AT-------AGCGACC-G-TAGAATCCTG--CG--AA-ATGCTGCGGACTTTGAAA-CGAGAACTC-G-TT--A----TAACCCTGCAAACA-T--CA-TTTC--TTTTT-----TT---GT-AATTGAC-T-CGCTTT-------AAAG----TC--CTGC-------G-T-CCG-CAT--GA----TATA-------------C-CT-TTGCGTATC-GAATC-A---A-C----TG--A-GAG-ACAT--A-CACA-CCA-TAA--GCAG--G-T-G-A--------TAGTGG-AACATTA-------------CTA--C-AAAGA-A---A-G--GGAA--AGTTGAC---GAT------T-GCAAAG--------TCA--------TCA-CGT------TTATCA-T--ATA-AT-------G-TAGTTGT-C--AGT-----C-TG--C--C-ATTAGAA-TC-AA-TTTTAAGTA-AAATATCC-A---AAT------------ATGAAGCACATCTGTCAGATTCTGTGGTGTTCT---TTA-TTTGGAGTTCGTCAGGAT-ATATC-AAATGGA-CATA-ATTATGAAAATTATGATTGTTAATAGATC--AG-ACATC-ACCTATATATCTAC--ATA-----TGTA
gi|41 : actatcttatccgaatgacatcaaagattacttgaacgattgtctgtactgcaatat---AG-ACATC-ATCTATATATCT----ATA-----TGTAATG-ATG-AA---GGACACA-GTAAG---------------TTTT----TTGTTT
gi|42 : AAAT-GGCGAAG-TA----A-CAA----A--GT-A--T-G-AAC---CGTAATCATA------
gi|44 : AAAT-GGCGAAG-TA----G-CAA----A--GT-AT-T-C-AA----CATAATCATA------A-Tcgtacacagataaaccata
gi|46 : cgcacatttataTTTTGG---TT--AGT-AGATGGCCT-CGCTTT-------AACAA--ATC--
gi|47 : A-A---G-G--G-GA--AATTGAC---AAT------T-GCAAAG--------TCAAAGTC--AT
gi|49 : -A---AAT------------ATGAAGCACATCTGTCTGATTCTGTG
gi|5 : AAATTGGTGAAG-TA----AACAA----T--GT-G--T-T-AAT---CGTAATCATA------G-TCCTAAAA-A---CAT-----ATTTA--CAAAG--TCGAGT-GTA-GGGCAAC--AC-GGA-T----CTC-C---G-ACAA-A----AG-CGA-A-G-G--CAG-GA-TCA-GG-TGC-C-----A-TAGAGG------A--------GTAAGCATC-CTCTGCTGACC----GG--T-CACAC-CCGC-CA--TGA-GCC-C-----T-TA-GTC-G---AA---A-CAA-G-G------------T---A--AACA-GG-A---TT-ACCC-G----TTGTCA-CATCT-AGTACGAAA--AT--GACA-GTCT-AACAAAA---GGT---AT---GGGACAAATCA--GT--C-AGCA---T-------------------------------TAA-TTTA-TAATCGCAAA--CA--A-GGT----C-ATTAT-------ACCGACT-G-TAGAATT-TG--CG--AC-ATGGTG---ACTTTA-AA-CGAGAA-TC-G--T-TA----TAATCCTGCAA-CA-T--CA-A--C--TTTTTAG---TT--AGT-AGTTGGCCT-CGCTTT-------AAAAA--GTCT-T--C-------A-T-ACG-CAT--GA----CATGT------------T-CT-T-GCGTATC-TAATC-A---A-CTGCATG--G-AAA-ACAT-T--CACACC-A-TAA--GCAG--G-T-G-ATACATTTGTAGTGGT-ACATTA-------------CTA-
gi|6 : tatactctatatgataatatatgtcttctgaaaccgcttttacatgtttctgtgttggcgacatcggtattttgggctttttcaaaagtttggcttatatttaaaaagttttcttttcatgaatgcatttttttctgtatttttttttattgtatgtagtaaaagatatT-GGCCAAA-TA----AACAA----T--TTGA--T-A-AT----TGTAATCAAA------A-CCCCAAAA-----CAT-----AC--A--CAAAG--TCGAAT-GTA-AGGAAAC--AC-AGA-C----CTC-C---G-ATAA-T----AG-CGA-A-G-G--AAT-AG-TCA-GT-CG-----------------------------------GCATC-CTCTGCTGACC----GG--T-CACAT-CCGC-CG--TGA-GCC-C-----T-TG-GTC-G---AA---A-CAA-A-G------------T---A--AACG-GG-A---TT-ACCC-G----TCGTCA-AATCTA-GTAGGAAA--AT--GACA-GTCTAA-CAAA--G-GGTA---T---GAAACAAATCA--GT--C-AACA---T-------ATG-A--C--T-T---A--ATG-ACAA-CTTG-TAATCGCATA--CA--A-GGT----C-ATT---------------------------TG--CG--AA-ATGGTG---ACT-----------------------G----TAGCCCTGCAA-CA-T--CA-------TTTTTTG---CT--AGT-AGTTGACCT-CGCTTT-------AAAAA--GTCC-T--C-------G-T-ACG-CAT--GA----CATG-------------CTCT-T-GCGTATC-GAATC-A---A-C----TG--G-AAG-ACAC--A-CACA-C-AATAA--GCAG--G-T-G-A--------TAAGGGTA-CATTA-------------CTA--C-ATGAA-A---A-G--G-AA--AGGTGAC---GAT------T-GCAAAG--------TTAAAGTC--ATCA-CGC------TTATCA-T--ATA-AT-------G-CAGTTAT-C--AGC-----C-TA--C--C-TTTAAAG-TC-AA-TATTAAGTA-AAAAATCC-A---AAT------------ATGAAGCAGATATGTCAGATTCTGTGGTGTCCT---TTA-ca
gi|7 : atagatTGTCAGATT--GTGTTGTC-T---TTA-TAT-GAGTTT-TCGGGATA-T-TCCAAAT------TA-AT----------GCCCTTGTTA-TTGAT---AGCAGAT--ATCTATAT-CCT----ATA-----TATAAGG-TTG-A-----GACAAA-GCAGGGAGTTTTTTTTTTTTTTTT----TTGTTTTT------AT-CCCGTAA-AGTTT-TTGT--A-GCA-AATTCTGC---TTCAT-ATGTA--ATAT-TCA--GTAAGTCTGGTGCCAATA---AA-GGGG---CA-AT---TAGTGCCACT-AGGAATGACGCA-ACGGA---------GAATTGTTTGA-TCGAC--CT-GTCTCTCC----A-CGAC------TACATAAATAAT-TTCTG-T-AAGAAACTCTACTC-ATCATGATGTCATGTTATCAT--TTGTTC-TAATAATATATCCTACTTCAGAGAGTA-CT--TGTGGG--C-ATCA----------------GAGT-----GTTTTT-------------TAAACAAATATGTGTCTT--GTTTTTCCGCCCCAATCCCCGAACTAGAAA--TATTA--TT---TTCGGG---GGTC-ATTTTT----TTGT---------TT---AACCACATT---------T--CGATAAT--CT-GAAAAG------CT-AGAT--TTAT--ATTTTTAAT--GTGAatactggcgtcaaagctcaaaattcttggagcgggaataataaaatatatt
gi|8 : taagatataaaacggtcagctactaaggattgtgtggtgAAAT-GGCGAAG-TA----A-CAA----A--GT-A--TGA-AA----CGTAATCATA------G-TCCAAAAA-A---CAC-----AT--A--CAAAA--TCGAGT-GTA-GGGCAAC--AC-GGA-C----CTT-C---G-ACGA-A----AG-CGA-A-G-G--CAG-GA-GCA-GG-TGC-C-----A-TGGAGG------A--------GTAAGCATC-CTCTGCTGACC----GG--T-CACAC-CCGC-CG--TGA-GCC-T-----G-TA-GTC-G---AA---A-CAA-A-G------------T---A--AACG-GG-G---TT-ACCC-G----TCGTCA-AATCTA-GTATGAAA--AT--GACA-GTCTAA-CAAA-TG-G-TA---T---GAAACAAATCA--GT--C-AACA---T-------ATG-A--C--T-T---A--GTG-ATAC-TTTG-TAATCGCAAA--CA--A-GGT----C-ATTAT-------AGCGACC-G-TAGAATT-TG--CG--AA-ATGATG---ACTTTA-AA-CGAG-ATTC-G--T-TA----TAACCCTGCAA-CA-T--CA-A--C--TTTTTGG---TT--AGT-AGTTGGCCT-CGCTTT-------AAAAA--ATCA-T--C-------A-T-ACG-CATG-G-----CATGC------------C-CT-T-GCGTATC-GAATC-A---A-C----TG--A-GAG-ACA--TA-CACACC-A-TAA--GCAG--G-T-G-A--------TAGTGGT-ACATTA-------------CTACAC-AAA-A-A---A-G--G-AA--AGTTGAC---AAT------T-GCAAAG--------TCAAAGTC--ATC-ACGT------TTA
gi|9 : ggcatataCCCCAAC-A---CAT------T--A--CAAAT--TCGC-T-GTA-AG-CAAC-CG--GGA-C----CTC-C---G-ACAA-A----AG-----A-G-G--TAG-GA-TCA--G-TGCAC-----A-TGGGAGG-----A--------GTAAGTTTC-CTCTCCCGAC------G--T-CACAC-CCGCGCA--TGACACC-CCCAAAT-TA-GAT-GACCAA---A-C-A-A-G------------T---A--AACG-GG-GA--TTAACCC-GGGTTTCA--A-AAT---AGTACGAAATGAC--A-CA--TCT-AACAAA--G-GGT---AT---GAAACAAATCA--GT--CAAACA---T-------ATG-A--C--T-TGCGG--ATG-ATAA-TTTG-TAATCGGGAA--CAACA-GGT----C-ATTATTTCGATAAGC-ACC-GCTAGAATT-GC--CG--A-----------------------AGAATTC-G--T-TA----TTAACCTACAA-CA-TA-CA-A--C--TTTTTTG---TT--AGT-AGTTTGGCT-CCCTTT-------AAAAGCCCTC--C--C-------A-C-ACG-CACGAG-----TATG-------------C-TC-T-GCGTATC-GAATCAA---A-C----CG--A-GAG-ACAT-
5 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|33 ): GTTTTTGCGTTGGTGACATCAGAATTTTGGATTTTTTCAAAACTTTGGCAGTGACTGGCTTATCATATTTAAAAAGTTTTCTTTTCATGAATGCATTT
Unaligned ( gi|40 ): TTAAAAGTGAAGATAACAAACAGTGATCTATGTCATAATTCCTATAAAAAATTGAAATCTAA
Unaligned ( gi|43 ): GATCTGAGGTCCAGGGGTGATGAATATAGCATACTTCCATGTTGATTGATT
Unaligned ( gi|45 ): TATTAAGTGATGCCATACATAGAGGATCTTGAATGAGT
Unaligned ( gi|48 ): TAGTCGATACTAAAATTCATGCTCATTTGAT
Alignments
lowQualScore : 111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111
lowQualScore : 111111 1111111 22222222222222 111111 22 111111111111111 111111111111 22 3333333333333333333333333333333333 1111111 11 1111111111 11 1111111 1111111 2222222222222 444444444444444444444444444 1111 1111 11 1 11111111 11 111111111111111111 111111 11111111 22 111111 111111111 1111111 222222222222 222 1 2222 11111 1111 11 444444444444444 1111 222222 2222 222 1 11 11 111 111 111 11 444444444444 111 11 1 1 1111 222222 11111 555555555555555 22222 11 11 111 11 5555555555555555555555555 44444444444444 11 222222 2222 1 11 111 111 111 2222 4444444444444 1 444444444444444444444 1 33333 1 11 2222 11 222222 66666666666666 2222 1 22 2 1 333333333 11 2222 11 2222 222222 2222 1 111 11 1 1 1 1 1 1 111 22 11 444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444 111 1 11 111 11 44444444 11 1 1 1 1111 1 333333333333333333333 4444444444 1 1 1 1 1 111 111 1 1 1 1 1 111 22222 111 11 2222222 11 444444444444444444444444444444444 111 4444444444444444444444 111 55555555555555 11 111 22222222 111 222222 22222 111 22222 2222 33333 1 1 1
lowQualScore : 6 6 333333 4444444 55555555555555 3 777777 2 2 444 444444 33 33 88 2 2 1 11 2 2 5555 2 444 4 2 6666 4 2 2 2 555 2 2 2 2 2 8888888 333333333333333 2 5555 33 2 2 5 33 2 6666666 2 2 2 666 333 2 222 333333333333 333 33 2 2 666 2 2 5555 1 2 11 66 6666666666666666666666666666666666 33 33 2 444 0000000 4 33 55 2 444444 2 2 2 0 33 33 2 5555 2 9999999 3 6 2 33 33 2 777 3 0 88 3 33 3 7777777777 0 3 3 11 8888888 1 555 44 3 0 3 4444444 77 5555555555555 3 3 3 999999999999999999999999999 3 3 3 3 555 3 7777 8888 3 4444 77 0 3 77 44 3 6 3 22222222 88 888888888888888888 7 222 6 555 6 44 3 44 33 555 222222 3 22222222 44 22 000000 4 66 4 777777777 8888 6666666 99999 4 5 5 5 0 5 4 777 222222222222 0 1 2 888 5 5 4 11 99 3 7 3 6 6 3 3 1 111 1 5 3333 66666 8 8 4444 00 888888888888888 4444 333333 88 0 8 3333 8 8 3 999 0 6 33 44 33 3 777 444 8 8 8 444 1 8 66 8 8 333333333333 3 777 99 0 0 5 4444 8 333333 6 0 8 6 6 77777 8 000000000000000 33333 3 8 11 11 3 6 999 8 0 11 0 9999999999999999999999999 55555555555555 5 55 33 777777 1111 0 6 9 33 777 777 444 1111 2222222222222 1 0 555555555555555555555 0 00000 0 33 4444 33 111111 0 88888888888888 1111 3 00 3 6 3 777777777 88 1 1 4444 66 2222 888888 8888 3 555 88 3 3 3 3 3 3 7 0 777 99 33 3 777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777 777 0 3 33 2 777 2 22 6 66666666 33 0 0 3 3 0 7777 0 2 999999999999999999999 2 9999999999 0 0 0 0 3 66 0 777 999 2 3 1 3 0 0 0 0 0 777 44444 0 2 444 11 8 3 8 8 0 8 88 8 0 3333333 8888 1 11 1 111111111111111111111111111111111 777 1 8888888888888888888888 1 000 33333333333333 11 0 8 0 8 0 0 444 66666666 000 777777 0 7 88888 777 55555 1111 3 22222 3 1 3 1 3 6
lowQualScore : . . ...... ....... .............. . ...... . . ... ...... .. .. .. . . . .. . . .... . ... . . .... . . . . ... . . . . . ....... ............... . .... .. . . . .. . ....... . . . ... ... . ... ............ ... .. . . ... . . .... . . .. .. .................................. .. .. . ... ....... . .. .. . ...... . . . . .. .. . .... . ....... . . . .. .. . ... . . .. . .. . .......... . . . .. ....... . ... .. . . . ....... .. ............. . . . ........................... . . . . ... . .... .... . .... .. . . .. .. . . . ........ .. .................. . ... . ... . .. . .. .. ... ...... . ........ .. .. ...... . .. . ......... .... ....... ..... . . . . . . . ... ............ . . . ... . . . .. .. . . . . . . . . ... . . .... ..... . . .... .. ............... .... ...... .. . . .... . . . ... . . .. .. .. . ... ... . . . ... . . .. . . ............ . ... .. . . . .... . ...... . . . . . ..... . ............... ..... . . .. .. . . ... . . .. . ......................... .............. . .. .. ...... .... . . . .. ... ... ... .... ............. . . ..................... . ..... . .. .... .. ...... . .............. .... . .. . . . ......... .. . . .... .. .... ...... .... . ... .. . . . . . . . . ... .. .. . .......................................................................................... ... . . .. . ... . .. . ........ .. . . . . . .... . . ..................... . .......... . . . . . .. . ... ... . . . . . . . . . ... ..... . . ... .. . . . . . . .. . . ....... .... . .. . ................................. ... . ...................... . ... .............. .. . . . . . . ... ........ ... ...... . . ..... ... ..... .... . ..... . . . . . .
lowQualScore : 7 7 999999 2222222 55555555555555 2 222222 7 5 444 888888 44 44 44 7 7 7 00 5 4 0000 4 111 7 2 9999 4 4 4 4 333 4 4 1 1 1 2222222 000000000000000 2 0000 22 4 5 0 22 2 0000000 1 1 1 666 777 1 555 666666666666 999 11 4 4 555 4 4 0000 8 4 88 55 6666666666666666666666666666666666 22 22 4 111 0000000 7 22 66 4 999999 5 5 5 8 44 44 5 7777 7 3333333 1 2 9 99 99 9 999 3 3 88 1 88 1 5555555555 8 3 3 22 8888888 0 888 66 3 2 3 2222222 99 9999999999999 6 6 6 777777777777777777777777777 6 6 3 3 888 3 5555 5555 3 9999 33 0 3 99 66 3 7 3 11111111 66 000000000000000000 3 777 7 888 7 66 3 66 33 888 999999 3 11111111 66 44 555555 4 11 4 888888888 9999 3333333 66666 4 0 0 0 4 0 4 888 888888888888 7 7 5 888 0 3 3 44 00 5 5 5 7 7 2 2 7 444 4 7 3333 77777 0 0 8888 33 333333333333333 2222 000000 88 8 0 0000 0 0 2 222 0 5 88 55 88 2 555 000 0 0 0 000 0 0 88 0 0 888888888888 8 666 00 0 6 0 8888 0 000000 0 8 0 7 7 88888 0 000000000000000 44444 2 0 00 00 8 0 444 0 8 00 8 8888888888888888888888888 00000000000000 6 88 88 555555 2222 0 5 2 88 555 555 000 2222 8888888888888 0 0 888888888888888888888 0 00000 0 88 8888 88 555555 7 33333333333333 0000 3 77 7 7 3 000000000 00 0 0 0000 00 5555 777777 3333 3 333 33 3 3 3 3 7 3 3 8 555 22 88 2 222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 555 0 2 88 5 555 5 55 5 22222222 88 0 0 2 2 0 8888 0 5 555555555555555555555 5 5555555555 0 0 0 0 2 55 0 555 555 5 2 0 2 0 0 0 0 0 222 55555 2 5 000 00 0 2 0 0 8 0 88 0 8 6666666 2222 4 00 4 000000000000000000000000000000000 555 0 0000000000000000000000 2 222 88888888888888 00 8 0 8 8 6 8 000 22222222 222 555555 8 3 88888 555 00000 2222 2 00000 3 0 3 0 3 7
consensus : AAAT-GGCGAAG-TA----A-CAA----A--GT-A--T-A-AA----CGTAATCATA------G-TCCCAAAA-A---CAT-----AT--A--CAAAA--TCGAGT-GTA-GGGCAAC-CAC-GGA-C----CTC-C---G-ACAA-A----AG-CGA-A-G-G--CAG-GA-TCA-GG-TGC-C-----A-TGGAGGG-----A--------GTAAGCATC-CTCTGCTGACC----GG--T-CACAC-CCGC-CG--TGA-GCC-C-----T-TA-GTC-G---AA---A-CAA-A-G------------T---A--AACG-GG-G---TT-ACCC-G----TCGTCA-AATCTAAGTACGAAA--AC--G-CA-GTCTAAACAAAATG-GGTA-AAT---GAAACAAATCA--GT--C-AACA---T-------ATG-A--C--T-T---A--GTG-ATAA-TTTG-TAATCGCAAA--CA--A-GGT----C-ATTAT-------AGCGACC-G-TAGAATT-TG--CG--AA-ATGATG---ACTTT--AA-CGAGAATTC-G-TT-TA----TAACCCTGCAA-CA-T--CA-A--C--TTTTTGG---TT--AGT-AGTTGGCCT-CGCTTT-------AAAAA--ATC--T--C-------A-T-ACG-CAT--G-----CATG-------------C-CT-T-GCGTATC-GAATC-A---A-C----TG--A-GAG-ACAT-TA-CACA-C-A-TAA--GCAG--G-T-G-A--------TAGTGGTAACATTA-------------CTA-AC-ANAGA-A---A-G--G-AA--AGTTGAC---GAT------T-GCAAAG--------TCAAAGTC--ATCAACGC------TTATCA-T--ATA-AT-------G-TAGTTGT-C--AGT-----C-TG--C--C-ATTAGAG-TC-AA-TATTAAGTA-AAATATCC-A---AAT------------ATGAAGCAGATCTGTCAGATTCTGTGGTGTCCT---TTA-TTTCGAGTTCGTCGGGATAATATCAAAATGGA-CATA-ATTGTGAAAATTATGATTGTTAATTGAT---AG-ACATC-ATCTATATACCT----ATA-----TGTAAGG-TTG-AA---GGACACG-GCAAG---------------TTTT----TTGTTTTT------AT-CCCGTAACAGTTT-TTTTGAA-ACA-AATTCTGCT--TTCAT-ATGGA--ATATAAAA--ATAAGTC---TGCCAATA---AG-GGGGC-ACA-AT---TAGTGCCCNT-AGGAAT-AC-CA-AC--A---------GAATTGTTGGA-NAGAC--ATGGTCTCTCC---AA-AGAC------TACATAAATATT-ATCTA-T-AAGAAA----ACCC-A---------------AGCAT--ATGCTC-T--TA--ATATCTTACTTCA-AGAGTA-CTTGTGTGGG--CAATCA----------------GAGTG----GGTTCT-------------NACAAAAATATGTGTCTT--GTTT-----CCCCAA----CG-ACCAGAAACTTGTTA--TT---TTCGGG---TGCC-G-TTTT----TTGT---------TT-AAAANCA-ATTA--------T--CAAT--T--CT-GAAAAA-G---CCT-AGAT--TT-T--ATTTT--AT-CGTGAGAGGAATCGTTG-----------TAGTAAAG--TGGTGGAGAAA-TC-ATACG-TTTTG-ATGCAGTCAATTGTCTCAGCATTGGAAACAANTCTCGTGATTNAAAGTTGTTTTNGTATAAAGCTGGGCCTTTAGAGGGGGCGTTTTT----TGAGA-ATCC-CAATC--TGAA-TG-ACACCA-TTCTGGAATA-TGTAGCGG-AACAGTATATCNTGAAG---TGACT-TTTTAACA--GCTGTTCAG--TAG-------TTT--TTAGT--A-GAC-------TAAGGGA----------T-AGAG--------------GG-----C------TG---GTA-GAGCAC--TTACTGGAA---CCAGCG-ATGTA--------TC--TTT-G-TTTGTAAGGA-TTTC---TTA-TGCG---TT---T-CGGAA-----TCCAGT-A--------AAGGT-ATGGTAA-TTCAAATTGAT-CCTGAT-TCTTCGGAAATAT-TGA---AAGTATTT-CAAACAGAAAGGTGANTTTGAAGAA-TT-TCATC-TTAGT-CAGATTGCTTGGA-GTATA-AAGT----AAGATTCCCAGATGTG---TGA--AGTA-AACCC-T-AGTT-C-ATTTAAAAAG-ACAAGTATAATA----GT-GA-CTCT--TTACAAAC--A-----AAG----ACAAA-------TGTGA-ATC---ACTNTGCTTTAT--GCTGTCT--AACT---A-TAACAA-AGTTTTCACG-----TG----TNTAA--CTCA-TTTACNCACTTCTG---GCT-TC-----TTAA-GACAG-----AAGGATAAATAGT-CG--ATTTTCCC---CGC-----TAAA----TGGTTAC----GGATTTT-AATNATTTCCGAA-TANTTTTGATCA-TTCAGACAAAGTGTCAAGCTCCTCTCCCT
Reference ( family-568 ) : AAAT-GGCGAAG-TA----A-CAA----A--GT-A--T-A-AA----CGTAATCATA------G-TCCCAAAA-A---CAT-----AT--A--CAAAA--TCGAGT-GTA-GGGCAAC-CAC-GGA-C----CTC-C---G-ACAA-A----AG-CGA-A-G-G--CAG-GA-TCA-GG-TGC-C-----A-TGGAGGG-----A--------GTAAGCATC-CTCTGCTGACC----GG--T-CACAC-CCGC-CG--TGA-GCC-C-----T-TA-GTC-G---AA---A-CAA-A-G------------T---A--AACG-GG-G---TT-ACCC-G----TCGTCA-AATCTAAGTACGAAA--AC--G-CA-GTCTAAACAAAATG-GGTA-AAT---GAAACAAATCA--GT--C-AACA---T-------ATG-A--C--T-T---A--GTG-ATAA-TTTG-TAATCGCAAA--CA--A-GGT----C-ATTAT-------AGCGACC-G-TAGAATT-TG--CG--AA-ATGATG---ACTTT--AA-CGAGAATTC-G-TT-TA----TAACCCTGCAA-CA-T--CA-A--C--TTTTTGG---TT--AGT-AGTTGGCCT-CGCTTT-------AAAAA--ATC--T--C-------A-T-ACG-CAT--G-----CATG-------------C-CT-T-GCGTATC-GAATC-A---A-C----TG--A-GAG-ACAT-TA-CACA-C-A-TAA--GCAG--G-T-G-A--------TAGTGGTAACATTA-------------CTA-AC-ANAGA-A---A-G--G-AA--AGTTGAC---GAT------T-GCAAAG--------TCAAAGTC--ATCAACGC------TTATCA-T--ATA-AT-------G-TAGTTGT-C--AGT-----C-TG--C--C-ATTAGAG-TC-AA-TATTAAGTA-AAATATCC-A---AAT------------ATGAAGCAGATCTGTCAGATTCTGTGGTGTCCT---TTA-TTTCGAGTTCGTCGGGATAATATCAAAATGGA-CATA-ATTGTGAAAATTATGATTGTTAATTGAT---AG-ACATC-ATCTATATACCT----ATA-----TGTAAGG-TTG-AA---GGACACG-GCAAG---------------TTTT----TTGTTTTT------AT-CCCGTAACAGTTT-TTTTGAA-ACA-AATTCTGCT--TTCAT-ATGGA--ATATAAAA--ATAAGTC---TGCCAATA---AG-GGGGC-ACA-AT---TAGTGCCCNT-AGGAAT-AC-CA-AC--A---------GAATTGTTGGA-NAGAC--ATGGTCTCTCC---AA-AGAC------TACATAAATATT-ATCTA-T-AAGAAA----ACCC-A---------------AGCAT--ATGCTC-T--TA--ATATCTTACTTCA-AGAGTA-CTTGTGTGGG--CAATCA----------------GAGTG----GGTTCT-------------NACAAAAATATGTGTCTT--GTTT-----CCCCAA----CG-ACCAGAAACTTGTTA--TT---TTCGGG---TGCC-G-TTTT----TTGT---------TT-AAAANCA-ATTA--------T--CAAT--T--CT-GAAAAA-G---CCT-AGAT--TT-T--ATTTT--AT-CGTGAGAGGAATCGTTG-----------TAGTAAAG--TGGTGGAGAAA-TC-ATACG-TTTTG-ATGCAGTCAATTGTCTCAGCATTGGAAACAANTCTCGTGATTNAAAGTTGTTTTNGTATAAAGCTGGGCCTTTAGAGGGGGCGTTTTT----TGAGA-ATCC-CAATC--TGAA-TG-ACACCA-TTCTGGAATA-TGTAGCGG-AACAGTATATCNTGAAG---TGACT-TTTTAACA--GCTGTTCAG--TAG-------TTT--TTAGT--A-GAC-------TAAGGGA----------T-AGAG--------------GG-----C------TG---GTA-GAGCAC--TTACTGGAA---CCAGCG-ATGTA--------TC--TTT-G-TTTGTAAGGA-TTTC---TTA-TGCG---TT---T-CGGAA-----TCCAGT-A--------AAGGT-ATGGTAA-TTCAAATTGAT-CCTGAT-TCTTCGGAAATAT-TGA---AAGTATTT-CAAACAGAAAGGTGANTTTGAAGAA-TT-TCATC-TTAGT-CAGATTGCTTGGA-GTATA-AAGT----AAGATTCCCAGATGTG---TGA--AGTA-AACCC-T-AGTT-C-ATTTAAAAAG-ACAAGTATAATA----GT-GA-CTCT--TTACAAAC--A-----AAG----ACAAA-------TGTGA-ATC---ACTNTGCTTTAT--GCTGTCT--AACT---A-TAACAA-AGTTTTCACG-----TG----TNTAA--CTCA-TTTACNCACTTCTG---GCT-TC-----TTAA-GACAG-----AAGGATAAATAGT-CG--ATTTTCCC---CGC-----TAAA----TGGTTAC----GGATTTT-AATNATTTCCGAA-TANTTTTGATCA-TTCAGACAAAGTGTCAAGCTCCTCTCCCT
gi|1 : AAACAGGGTA-TGCA-AA-----AAACCAATCA--AT--C-AATA---TCATTTTTATGTAGTC--TCT---ATTGTG--TACCTTTG-TAATCGCAAA--CA--ACGGT----CCATTAT-------AGCGACC-G-TAGTATT-TG--CG--AA-ATGATG---A-TTT--AA-CGAGAATTC-G-TTATA----TCACCCTGCAA-CA-T--CAGA--C--TTTTTGG---T---AGT-AGTTG-CCT-CGCTTTT------AAAAA--ATCA-T--C-------A-T-ACGACAT--GG----CATG-------------CTCT-T-GCGTATCTGAATC-A---A-C----TG--A-GAG-ACAT--A-CACA-CCA-TGAACGCAGCGG-T-GGA--------TAGTGGTA-CATTATACATTCTTTGTTCTT-ACTATGAATA---A-GTTG-AACAAGTTGACTTGGAT------T-GCCAAGCCTATCCTTCAAA-TC--ATCAACGCCCCCCTTTATCCCT--ATA-ACTCGCACCGCTAGTTG--C--AGTGTCGCT-TGTTC--CGATTAATG-TCGAA-TATTTTGTGGAAATATTTTA---AATCACTTCATAACAACGAAGCAGATC-GTCAGATTCTGTGGTGTCCT---TTACTTTCGAGTTGTTCGG--TGATTTCAAATGGGACCATACATTATGAAAATCATGATTGTTAATTGATATAAA-ACATCAATCTATATACTTTCAAATATATTTTGTTAGGTTTGCAACTGAGACACGTGCAAGA--------------TTTTTTCGTTGTTTTTTAAAAAATCCCCGTAACAGCCTATTTTGAATCCA-AATTC-GCTAGTTGCTAATAGA--ATTTAGAATCAT-AGTC---TGCCAATATTTAGTGGGGCAACAGACTCATAGTGTCCATAAGGGATAAT-CACAC--ACTTACCTAGGAATGTTTGGA-GAGACA-ATGG-CTACAC---AATAGACACCAATTACAT-AGT-TT-ATCTATT-ATTAGA----ACCCAA---------------AGCATGAATA--A-T--TA--ATATCTT-CTTCA-AGAGCACCTTGTATGAGATTAATCAGTTATTGCATTTTGGGGGGTGTTTTGGTTCTTTTCATTCTTATAAACAAAAATATGCAT-TTAAATTT-----CCCCAA----CG-ACCAGAAACTTGTTACCTTAAGTTCAGGTTTTGCC-G-TTTTGGTGTTGTTCCAAACCCTT-GAAACCA-ATTAATCACTTTT--CAAT--T--CTCGAAAAA-GCGCCCT-GGATAATT-TTAATTTC--AT-TGTGAGAAGAATTGTTGTAATATTGGGTTAGTAGAGCTCGGGGCAGAAA-TCAATAAGATATTGAATGCAGTCAATTGTCTCAGCATTGAAAACAACTCTCGTGATTTAAAGTTGTTTTAGTATAAAGCTGGGCTTTTAGAAGGGGCATTTTCACCGTGAGA-AT-T-CAATCTTTGAATTG-ACACCA-TTCTGGAATA-TGTAGCGG-AATAGTATATCCTGATATTCTGACTCTTTTAACAGCGCTGTTCAAGCTAGTTTAAGCTTT--TTAGT--ATGACAATCTTTTAAGGTA----------TAAGAG--------------GGGTCACT------TG---GTATGATCACTATTTCTGGAACCGCCAGCG-AC-TACTAACTACTT--TTT-GTTTTGTAAGGA-TCTCACTTTATTGCA---TT---TCCGGAG-----T-CAGT----------AAGGT-ATGGGAATTTCAAGTTGGTCCCTCGT-CCTTCGG-AATAT-TGA---AAGTATTTACAAACAGAAAGTTGATTTTGAAGAATTT-TCATCTTTAGTAAAGGTTGCTTGTA-GTAAT-AAGT----AAGATTCTCCAACCTGTTCTGA--AGTA-AA-CC-T-AGTT-C--TTTAAAAGC-ACAAGTATAA-A----GTAAA-CTTT--TAACAAACGGA-----AAGCACCATAGC-------TGT-A-ATC---AGTGTACTTT-T--GCTCTCT---TCT---G-TTAC----GCCTCTAC------TG----TATAA--CTTA-TTTACCCCCTTCTGTTTGCT-TCTCTCGTT---GACAGAAATTAAGGATAAA-AGTCCG--CTTTTTTCCAACGC-----TAAA----TGGTTA
gi|10 : tttcaaactaccataccggaaaa--TGA-GCC-------T-TACATC-GTT-GA---T-CAG-A--------------T---A--AACA-GGTG---CT-TCTT-G------GTAT-AATTTA-GTATGTAA--AG--A-CC-GGCTTAACAA--TT-GG---AAT---GAAACGCTTCA--GA--C-AACAACCT-------AC--A--C--G-T---A--CCT-ACAA-GTTG-TATTTGCAAATGCA--A-AATAAACC-ATCAT-------AACGACC-A-TAGAATT-TG--TA--AACACGA-G---ATTGT--A---GAAACTCCTG-TT-TG----T-------CAG-TA-T--CA----C--GCCTTGG---TTTAAG--ACTTTATCA-CACTC----------AGA--ATC--TG-T-------T-T-TCG-CAT----------------------------T-T--C-TATT-GGATC-AGTTA-CATTTTGCAG-GAG-ACAA-AATCAC--C-A-TAA--ACAA--G-T-G-A--------AAATAG-AATATTG-------------CTA--C-AT-GA-ATACA-G--G-AA--A-TTGAC---GAT------G-GAAAAG--------TTAAAGCA--ATCT-CGC------TTGTCA-TCAAGA-AG-------GGTTGTTGT----AAT-----T-TG--C--C-TTGAACG-TC-TA-TGTTCAGTA-AATTATCC-A---AAT------------ATGAatatggaatttgttacaaataaggtttttacttt
gi|11 : gaacacgtcccggtaaCA-GG-TGG-C-------TAGAAGG-----A--------GTGAGTATC-----GC---CC----GA--T-CACAC-CTGC-CG--TTA-GCC-C-----T-GA--TC-T---TG---A-TCA-G-G------------T------AACGCAA-G---TA-ATCC-G----TAGTCA-AA-CTCAGTATGCAA--AC--G-GATATC-GAAC--AATC-GGTA-AA-----AAGC--ATTA--G------GCG---T-------TTG-G--T--C-C---A--TTGTATAA-CTTG-TATCTGTAAA--TA--A-GAT----C-ATT
gi|12 : tttactcagtatacacatgtatatgtctttgaagtcggttatgatgttcaatgcaacgacatcggtatacatgtacttcaaacgaactacacgtttaccgtgacatcaaagtaaatatatgtttagcggactttttttctgcctatatatagttacggcactggatttcttatgaacaagtgaaaattacgaacagtgactaatctcttagatcctaaattaaaagtactagtatacaaacaaagatccctagccaagATCATGAAG---TGACG-TCTTAACA--GC----------AG-------TTA--CTAGT--A-G--------------GA----------T-AGAG--------------GG-----C------TGCGGGTA-GAGC-C--TTAGTG-AA---CCAGCG-ATGTAA-------TCATTCT-G-TTTG-AAGGAGTTTT---TTA-TGCA---T------CGAAAAAAAATCCAAT-ATAAAAAACAAGGT-ATGGTAA-TTTCAATTGAT-CCTGATGTCTTTGGAAA-ATATGAAGCAAATGTTT--AAACA-AAAGGTGGATTTGAAGAA-GTATCACT-TTAGT-CAGATGTCTTGGA-GTA-A-GATT----AGTATT-CCAAATGAC---TGA--AGTG-AATCC-T-AGTTAC-AGTTAAAAGGCATAAGTAT-GTA-----T-GA-CTAT--TTATCAAC--AC----AAG----ACAAA-------TGTGA-ATC---ACTTGGCTTTATCAGCTG-----AACT---A-TATCAA-AGTTTTCATG-----TGCGTCTTTAA--C-CA-TTTACACACGTC-----GCTCTG-----TAAA-GACAG-----AAGGCTA
gi|13 : tccGTTTTT----TGATATATCC-CCATC--GGTA-TG-ACACCA-TTCTGGAATAATGTAGGTG-GACAGTATCTC-TGAAA---AGACTGTTTTAACA--GCTGTTTAG--TAG-------TTT----AGTTTA-GAT-------TAAGGAAGAGGCTTGGTT-AGAGCACTTACTTGAACTAG-----CATATATTG---GTA-GAGCAC--TTACTGGAA---C-AGC--ATATA--------TC--TTT-G-TT-GTAAGGA-ATTG---TTA-T-TG---TTAATT-CG-AA-----TCCAGTTA--------AAGGTCATTGTAA-ATCAAATTGAT-CCAGAT-TCTTCGGAA-TAT-TGA---AAGTATT--CAAACAGAA-GGTGAATTTGAAGAA-TT-CTATC-TTAGT-CAGATTGCTTGGAGGTATATAAGT-----AGATTCCCAGATGCT---CGA--AGTA-CACCCTT-AG-T-C-ATCTTAAAAG-ACAAGTACAG-A----GT-CAGCTCTAGTTACAA
gi|14 : agtgtagaAAA--GGCAAAGATA----A-CGA----ACAGTGA--T-C-AATCT-CGTAA-----------G-TCCTAAAT-A---GA------AT--A--CAAAA--ACAAGA-GTC-GGGCAAT-CAC-GGA-C----CCC-T---GGACAC-A----C--CAG-A-A-G--TGG-GA-TCA-GG-TGC-C-------TAGGGGG-----A--------GTAAGCACC-CCCTGTTGACC----GG--T-CACAC-CCGC-CG--TGA-GCC-C-----A-TA-GTC-T---TG---A-TCA-G-G------------T---A--AACG-GA-----------C-A----TC-----AGT----GTGTGAAA--A---A-CG-G-CTTAAC--AATG-GCT---AT---GAAACACATCA--GA--C-AGCA---T-------TTG-A--C--T-C---A--ATG-ATAG-GTCA-TATTGGTAAA--CT--A-AAT----T-GTTAC-------AACGACC-A-TAGAATT-TA--CG--AA-ATGCTGC--ATTTA--AA-CGTGACT---G-TT-GA----AACCCCTGCAA-CA-TACCG-A--C--TTTT
gi|15 : ggatgtA-C----CTC-T---A-ACAA-A----GG-CGA-A-G-G---AG-GG-TCA-GG-TGC-C-----A--GGAGG------A--------GTAAGCATC-CTCTGCTGACC----GG--T-CACAC-CCAC-CG--TGA-GCC-C-----T-TA-GTCGG---AA---A-TAA-G-G------------T---A--ataaatcatgcactttcttttcaaagtacatgtatatttgcacatgaaat
gi|15 : caaatAAATAAGGTA---T---GAACAAAATCA--GT--C-AACA---T-------ATGGA--CCTT-T---A--GTG-ATAA-TTTG-CAA-CGCAAA--CA--A-GGT----C-ATTAT-------ACCGACC-ATTAGAATT-TG--CGAAAA-ATGATG---ATTTTTAAA-CGAGATTTC-G--T-TA----TAA-CCTGCAA-CATT--CA-A--CTTTTTTTGT---TT--AGC-AGTTAGCCTAAGCTTT-------AAAAA--ATCTTT--C-------ATT-ACG-CGG--A-----CATG-------------CTCT-T-GC-TATC-GAATC-A---A-CT---TGC-G-GAGTAAAT-TA-CACATC-A-TAA--GCAG--GATGG-A--------TAGTGGT-GTATTA-------------CTA-tgaacaaaatcagtcaacatatggacctttagtgataatttgcaacgcaaacaaggtcattataccgaccattagaatttgcgaaaaatgatgatttttaaacgagatttcgttataacctgcaacattcaactttttttgtttagcagttagcctaagctttaaaaaatctttcattacgcggacatgctcttgctatcgaatcaacttgcggagtaaattacacatcataagcaggatggatagtggtgtattactacttctttcgttacttggataattttattgaacattgac
gi|16 : caaatacctctaacaaaggcgaaggagggtcaggtgccaggaggagtaagcatcctctgctgaccggtcacacccaccgtgagcccttagtcggAAAT-GGCGAAG-TA----A-CAATTAAA--GT-A--TCA-AA----CGTA-TCATA------G-TCCCCAAA-A---CAC-----AT--A--CAAAA--TCGAGT-GTA-GG-CAAT--AC-GGA-C----CTT-C---G-ACAA-A----AG-CGA-A-AAG--CAG-GAATCAAGG-TGC-C-----A-TGGA-GG-----A--------GTAAGCATC-CTCTGCTGACC----GG--TCCACAC-CCGC-CG--TGA-GCC-C-----T-TA-GTC-G---AA---A-CAA-A-G------------T---A--AACG-GG-G---TT-ACCC-G----TCGTCA-AATCTAG--ACGAAA--AT--GACA-GCCTAACTAACAAG-GGTATAA-----AAACAAATCA--GT--C-A--A---T-------ATG-A--C--T-G---A--GTG-ATAA-TTTG-TAATCGCAAA--CA--A-GGT----C-ATTAT-------AGCGACCGG-TAGAATT-TG--CG--AA-ATGATG---ACTTTAAAA-CGAG-ATTC-A-GT-TA----TAACCCTGCActtctttcgttacttggataattttattgaacattgac
gi|17 : taA-T-AAGAAA-----CCC-A---------------AGCAT----GCTCAT--TA--ATATCTAACTTCA--GAGTA-CTTGTGTGGG--CAATCA----------------GA--G----GGTTTT-------------CAACAAAATATGTGTCTT--GTTT------CCCAA----CG-ACTAGAAATTCG-TA--TT---TTCGGG---TGCCGG-TTTT----TTGT---------TTAAAAAGCA-ATTA--------TTATAAT------T-GAAAAAGG---CCTAAGAT--TT-TA-ACTTT--AT-CG---GAGGAATCGTTG-----------T-GTAAAG--T-GTGGAGAAA-TC--TACGTTTTTG-ATGCAGTCAATT
gi|18 : aatcgaccaattgttgctaccatatgttttcctaatg-GGA-C----CTC-C---A-A-AA-ATTATAG-AGGTA-G-G--CAG-GA-TCA-GGGTGC-C-----A--GGAGGATCGTAA--------TTGAGCATC-CTCTGCTGACC----GATCT-CACACACCGC-CATCTGA-GCC-T-----TGTA-GTT-C---AA---A-CAA-A-GC-----------T---A--AACG-GG-GATTCT-ATCC------TCGTCA-AATCT-AGTACGAAA--AT--G-AA-GGCTAAACACAA-G-GGTT-ATT---GAAACAAGCAG--GT--C-AACA---T-------ATG-A--CT-T-T---A--GTG-ATAA-TTTG-T-ATCGC-AA--CA--A-tttgaaaattcttgtatt
gi|19 : gcaaacataaaatgttatgtagattattatcgTCATA------AATCCCATAA-A---GA------AT--A--TAAAA--C-------TA-AGGCAAA-CAC-GAA-C----CCT-T---G--CAT-AT---AC-CGG-A-G-G--TGG-GA-TCA-GG-TTT-TTTTTAA-AAGAGGG-----A---------TAAGCACC-CCTTGTTGACC-----G--T-C-CAC-TCGC-AT--TAT-ACC-C-----T-CT-ATC-T---TG---A-TCA-G-G------------T---A--AACT-GA-G---TA-ATCT-G----T----A-GGTC-AAGAACGAAA--aat
gi|2 : ttagatactgttggagacaatattggttgctcaccgaaagaatgaaaagtgaagataacgtaacagtgatccatcAAAT-GGCGAAG-TA----A-CAA----A--GT-A--T-A-AA----CGTAATCATA------G-TCCAAAAA-A---CA------AT--A--CAAAAA-TCGAGTTGTAAGGGCAAC-CAC-GGAAC----CTT-C---G-ACGA-A----AG-CGA-A-G-G--CAA-GG-TCA-GG-TGC-C-----AATGGAGAG-----A--------GTAAGCATC-CTCTGCTGACC----GG--T-CACAC-CCGC-CG--TGA-GCC-T-----G-TA-GTC-G---AA---A-CAA-ATG------------T---A--AACG-GG-G---TT-ACCC-G----TCGTCA-AATCTAAGTATGAAA--AT--G-CA-GTCTAAACAAAATG-GGTA-AAT---GAAACAAATCATGGT--C-AACA---T-------ATG-A--C--T-T---A--GTG-ATAC-TTTG-TA-TCGCAA---CA----GGT----C-ATTAT-------AGCGACC-G-TAGAATT-TGTGCG--AA-ATGATG---ACTTT--AA-CGAGAATTC-GGTT-TA-----AACCCTGCAA-CA-TA-CA-A--C--TTTTTGG---TT--AGT-AGTTGCCCT-CG--TT-------AAAAA--ATC--A--C-------A-TTACG-CAT--G-----CATG-------------C-CT-T-G-GTATC-GAATC-A-----C----CG--A-GAG-ACAT-TA-CACA-C-A-TAAT-GCAG--T-G-G-A--------TAGTGGTAACATTA-------------CTA-AC-AAAAA-A---A-G--G-AA--AAGTGAC---AAT------T-GGCAAG--------TCAAAGTCCCATCAACGT------TTATCA-T--ATATAT-------G-T-GTTTTGC--AGT-----CCTG--C--C-ATTAGAG-TC-AA-TATTA--TA-AAATATCC-A---A-T------------ATGAAGCACATTGGTCAGATTCTGTGGTGTC-T---TTA-TTTCAAGTTCGTCAGGATAATATCAAAATGGA-CATA-ATTGTGAAA-TTATGATTGTTAATGGAT---AA-ACATC-GTCTATATACCT----ATA-----AGTAAGG-TTG-AA---GGACACT-GCAAG---------------TTTT----TTGTTTTT------A--CCCG-AACAGTTT-TCCTGAA-ACA-AATTCTGCT--TTCAT-ATGGAATATATAAAA--ATAAGTC---TGCCAATA---AG-GGGGC-AAC-AT---TAGTACCCAT-AGGAA--AC-CA-AC--A---------GAATTGTTGGAGAAGACGGAT-GTCACTCCAAAAA-AGAC------TACAATAATATTAATCTA-TAAAGCAA----ACCC-A---------------AGCA---ATGCTC-T--TA--ATATCTTTCTTC--AGAGTA-CTTGTGTGGG--CAATCA----------------GAGTG----GGTTCT-------------GACAAAAATATGTATC-T--GTTT-----CCCAAA----TG-ACCAGAAACTTGGTA--TT---TTCGGG---TGCC-G-TTTT----TTGT---------TC-AAAAGCA-ATTA--------T--CAAT--TTCCT-GAAAAA-G---CCT-AGAT--TT-T--ATTTT--ATCCGT--GAGGAATTGTTG-----------TA-TAAAG--TGGTGGAGAAATTC-ATATG-TTTTG-ATGCAGTCAATT---------TTAGAA--AAATCTCGTGATTGAA----GTTTTC-TATAAAGCT----CTTTAGAG-------TTTT----TGAGA-ATCCACAATC--TGAA-TGAACACCACTTCTGGAATA-TGTAGTGGAAACAG--TATCTTGAAG---TGAC--CTTTAACA--GCTGTT-AG--TAG-------TTTTGTTAGT--A-G---------TAAGGGA----------T-AGA---------------GG-----C------TG---GTA-AGGCAC--TTACTGGAA---CCAGCGAATGTA--------TC--TTTGG-TTTGTAAGGA-TTTC---TTA-TGCATATTT---T-TGGAA-----TCCAGT-A--------AAGGT-ATGGTAA-TTCAAATTGAT-CCTGAT-TCTTCGGAAATAT-TAA---ACGTATTC-CAAACAGAAAGGTGATTTTGA--GA-TT-TCATC-TTAGT-CAGATTGCTAGGA-GTATA-AAGTCAGGAAAATTCCCAGATGTG---TGA--AGTA-AACCC-TAAGTT-CAATTTAAAAAG-ACAAGTATAATA----GT-GA-CTTT--ATACAAAC--A-----AAG----ACAAG-------TG-----TT---ACTGTGCTTTAT--ACAGCCTGGAACC---AGTAACAA-AGTTTTCATGTAGTCTA----TGTAA--CTCA-TTTACCCCCTTCTG---GCT-TC-----TTAA-GACAG-----AAGGGTAAATAGT-AG--ATTTTCCC---CGC-----TAAA----TGGTTATAACGGGATTTTAAATAATTTCCGAA-TACTTTTGATCA-TTCAGACAAAGTGTCAAGAT-CTCTCCCTtaaatgttgatgcatt
gi|20 : A----A--AT-A--T-A-AATAGGCGAAGT--TA------A-TCCCAAAA-A---CAT-----AT--A--CAAAA--CCAAGT-GTA-GGGCAAC--AC-GGA-C----CTC-C---G-ACAA-A----AG-CGA-A-G-G--CAG-GA-TCA-GG-TGC-C-----A-TGGAAG------A--------GTAAGCATC-CTCTGCTGATC----GG--T-CACAC-CCGC-CG--TGA-GCC-C-----T-TA-GTC-G---AA---A-AAA-A-G------------CATGA--AACG-AA-A---TC-A-----------GTCT-AA-CTA--TAC-ATG--AC--T-TA-GT---GATAATATG-CGT--AATCTGGAAACAAGTCA--TTTGC-GAAA---TG------ATG-A--C--T-T---ca
gi|21 : AA----A--GT-AATT-A--------GTAA-CATA------G-TGCCAAAA-A---CAT-----AT--ATACAAAA--ACGAGT-GCA-GGGCAA--GAC-GGA-C----CTT-C---G-ACAA-A----CG-Ctaaattgagtattcgttat
gi|21 : ctattaC-C-----T-TC-GAC-A---AACGCA-CAA-A-A------------T---A--AACA-GG-G---TA-GCCC-G----TCGTAA-AATCTT-GTACAAAA--ATAAG--A-GTCTGA-CAAA--G-GGTA---C---GAAACAGATCA--GT--C-AACA---C-------ACG-A--C--T-T---C--GTG-ATAA-TTTG-TAGTCGCAAA--CA--A-GGT----C-ATTAT-------AGCGACA-G-TAGAATT-TG--CG--AA-AGGATG---Aacaaaataaacagggtagcccgtcgtaaaatcttgtacaaaaataagagtctgacaaagggtacgaaacagatcagtcaacacacgacttcgtgataatttgtagtcgcaaacaaggtcattatagcgacagtagaatttgcgaaaggatgat
gi|22 : ctattaaaagtaattagtaacatagtgccaaaaacatatatacaaaaacgagtgcagggcaagacggaTATC-TAATC-A---A-C----TG--G-GAG-ATATGCA-TAC--C-A-TTT--GCAA--G-G-G-A--------TAGTGGTA-TATTA-------------CTA--C-AAAGACA---G-G--G-AA--AGCTGAT---GAT------T-GCATTT--------TTAAAGTC--ACCAA-GC------TTATCA-T--ATA-AT-------G-TAGCTGT-A--AGT-----C-TG--C--C-ATTAGAG-CC-AA-TATTAAGTA-AAATATCC-A---ACT------------AAGAAGCAGATTTGTCAAATTCTGTGGTCTCCT---TTA-TTTTGAGTTCGTCGGGt
gi|23 : A-A----CG-CAC-A-G-G--CAG-GA-TCA-GG-TGC-C-----A-TGGAGG------A--------GTAAGCATC-CTTTGCTGACC----GG--T-CACAT-CCGC-CG--TGA-GCC-G-----G-TA-TTC-G---AA---A-CAA-A-A------------T---A--AACA-GG-G---TA-ACCC-G----TCGTAA-AATCT-TGTACGAAA--ATAAG--A-GTCT-GACAAA--G-GGT---AT---GAAACAGATCA--GT--C-AACA---C-------ACG-A--C--T-T---C--GTG-ATAA-TTTG-TAGTCGCAAA--CA--A-GGT----C-ATTAT-------AGCGA
gi|24 : AAA--GGCAAAGATA----A-CGA----ACAGTGA--T-C-AATCT-CGTAA-----------G-TCCTAAAT-A---GA------AT--A--CAAAA--ACAAGA-GTT-GGGCAAT-CAC-GGA-C----CCC-T---GGACAC-A----C--CAG-A-G-G--TGG-GA-TCA-GG-TAC-C-------TAGGAGG-----A--------GTAAGCATC-CCCTGTTGA
gi|25 : cactgtgataaatggtagtattaatgtTGTG---TGATAAGTATAACCC-T-AGTT-C-ATTTATAAAG-ACAAGTATAATATTTTCT-GG-CCCC--TAACAAAA--AAATTCAAG----ACAAATTGACTTTGTAACATCTTAACTCTGTTTCA---ACTGTC-----CTGTAA-TAGCAATAGTTCTCTCG-------------TAAGGCTCATTTTAC-CACTTCTG---a
gi|26 : AATT-TG--CG--AA-ATGATA---A------GA-C-AGGATT-------------TAAGGCGACAA-CA-A--TA-A--AAATTTTTAGAATTT--AGTCAGT-GGCCT-CGACCTGATAAGAAAAAA--ATA--T--CAAAAAATA-T-ACG-CAC--GTGGTATATGAC-----------C-CTCT-GCGCGAC-GAATC-A---ATC----TG--ATGAG-ACGA-TA-CA
gi|27 : -A--C-A-AC----CGT--TCATA------A-TCCAAAAA-AATGTAT-----AT--A--CAAAAA-TCGAGT-CGA-GAGCAGCGCACTGGA-CACATCTT-CTGTA-ATAA-A----AGCCGA-ATG-GTTTAGTGA-T---AG-TTT-T-----A-TTGAGAG-----AAGAAAATGGTAAG------TCCACTAACC----AG--T-CA
gi|28 : ggcgactgtaTGTCAGTGTCTGTGGTGTCCTGAATTA-TATTAAGTTCTTCGCGATA-TATCAAA-TGGA-TATA-ACTGTGAAAATTATGATTGTTAATTGAT---AGCACATC-ACC
gi|28 : CACC-GCAAG---------------TTTT-----TGTTTTT------AT-TCCGTAACAGGTT-TT---GA-ACA-AATTgcaagtttttgtttttattccgtaacaggttttgaacaaatt
gi|29 : tgtcagtgtctgtggtgtcctgaattatattaagttcttcgcgatatatcaaatggatataactgtgaaaattatgattgttaattgatagcacat--CTCA-TT---ACACTTCTG---GCT-TT-----TTAAAGACA-------AGGATAAATAGTACGCCATTTTCCT---CGCGCGCTTAAAGTTTTAATTAC----GGATTTT-AATTACTTCCGAATTAATTTTGATCATTTCAGACAAAGTATTCAACTCCTCTCCC
gi|3 : AAAT-GGCGAAG-TACA--A-CAA----T--GT-G--TTA-AA----CGTAA-AATA------G-TCCCAAAA-A---CATGT---AT--A--CAAAA--TTGAGT-GTA-GGTCAAC--AC-GGA-C----CTC-C---G-ACAA-A----AG-TGA-A-G-G---AG-GA-TCA-GG-TGC-C-----A-TGG-GTG-----A--------GTAAGCATC-CTCTGCTGACG----CG--C-CACAC-CCGT-CG--TGA-GCC-C-----T-TA-GTC-G---AA---A-CAACA-G------------T---A--AACG-GG-A---TT-ACC--G----TCGTGA-AATCTA-GTACGAAA--AT--G--A---CTGA-CAAA--G-GATA---T---GAAACAAATCA--GT--C-AACA---T-------ATG-A--C--C-T---G--GTG-ATAA-TTTG-TAATCGCAAA--GA--A-GGT----C-ATTAT-------AGCGACC-G-TATAATT-TG--CG--AA-ATGAT----ACTTT--AAATGAGA-TTC-G-TTATACCGTTAACCCTGCAA-CA-T--CA-------TTTTTGG---TT--ACT-AGTTGGCCT-AGCTTT-------AAAAAT-CCC--T--C-------A-T-ACA-CAT--ATGC--CATGTGTTGGATATAGCC-CT-T-GCGTATC-GAATC-A---A-C----TG--A-GAG-ACAT--A-CACA-CCA-TAA--GCAG--G-T-G-A--------TATTGGTA-CATTA-------------CTA--C-ATAGA-A---AAG--G-AA--TGTTGAC---GATA-----T-GCAAAG--------TCAAAGTC--ATCA-CGT------TTATTA-T--ATA-AT-------G-TA--TGT-C--AGT-----C-TG--CATC-ATTAGAG-TC-AAATATTAAGTA-AAATAGCC-A---AAT------------ATAAAGCAGATATGTCAGATTCTGTGGTGTCCT---TTA-TTTCGAGTTCGCCA----AATATATAAATGGA-CATA-ATTGTG-AAATT-TTATTGTTAATTGATA--AG-ACATC-GTTTATATACCC----ATA-----TGTAAGG-TTG-AA---GGACACG-GT------------------TTTT----TTGTTTTT------AT-CCTGTAACGTTTT-TTTT--A-ACACAATTCTAC---TTCAT-AT-GA--ATATAAAA--ATAAGTC---TGCCAATA---AG-AGGAC-ACA-AT---TAGTGTCCTT-AGGAAT-AC-CA-AC--A---------T-ATTGTTGGA--AGAC--ATGGTTTCT-----AA-AGAC------TACATAAATATT-GTCCA-T-AAGAAA----ACCC-A---------------AGC----ATGCTC-T--TA--ATATC-TACTTC--AGAGTA-CTTGTGTGGG--CAATCA----------------GAGT-----GGTTCT-------------GAC-AAAACATGT
gi|30 : ctattaaacctgacacaatacatctgctagtcatctgggactgatgtttatatatcACATTG-------------TTA-ACTACATA-A---A-A--G-AA--A--T--------T------T-GCAAAA--------CTCAAGTC--ATCA-CGT------TTATCA-T--ATA-AT-------GTTAGTTGT-CCAAGTC----C-TG-----C-ATTAGAGATT-AA-TATTAAAGG-AAGTGTTC-ATGGAAT------------A
gi|31 : T-CA-CAC--C-A-TAA--GTAG--G-T-G-G--------TAGTGGT-ATATTA--------------TC-AC-ATTGA-A---A-G-----------------------------GCAAAG--------TTAAAGTC--ATC-TTGC------TTATCA-T--ATA-AT-------G-CAGTTGT-C--AGT-----G-TG--T--C-ATTAG
gi|32 : cttatCAT-T--CAC--C-A-TAA--GCAG--G-TGG-A--------TGGTGGT-ATATTA-------------CT--AC-ATAGA-A---AGG--G-AA--AGTTGAC---GATAGCCGATAGCAAAG--------TTAAGGTC--ATC-ACGC------TTATC
gi|34 : tatcctCAATA---AG-GGGGC-ACA-AT---TAGTGCCCGT-TGGAAT-AT-CA-AC------------GGATTGTTAG--TAGAC--ATGG--TCTCC---AA-AGAC------TACACAAATATT-ATTTA-T-AAG
gi|35 : GA-GCC-T-----T-TA-GTC-G---AA---AACAG-G-GAGGGGGGGCGGTT---ACGAGCG-GA-G---TT-ACCCTG----TCGTCAGAATCT-AGTACGGAA--A---G--A-G--TGGACAAA--G-GGTA-ctaa
gi|36 : A-GG-T-C-C-----G-TGAATGA-----A--------GTAAGCATCTCGTTGCTGATCCGAGGA--T-CACAC-CCAC-CG--TGA-GCA-A-----T-CA-AGA-G---AA---A-CAG-A-tg
gi|37 : gatggatggtcgCCCAACATA---CATGTATAAT--A--CAGAG--TCGA-T-GTA-GA-CAAC--AC-AGA-C----CTAGT---A-ACAA-A----AGGCGA-G-G-G--CAG-GA-TCA-GG-TGC-C-----A-TG
gi|38 : cc--ATTTTCCC---CGC-----TAAA----TGG----------ATTTT-AATCATTTCCGAA-TATTTGTATCCA-TTCAGACAAAGTGTCAAGCTCCTCTCCCT
gi|39 : gcAAAT-GGCGAAG-TATTTTA-CAA----T--GT-G--T-TTAA----CATAATCATA------G-TCCAAAAA-A---CAT-----GT--A--CAAAA--TCGAG
gi|4 : tttgttataAAATTGGCGAAG-TA----AACAA----T--GT-G--TTA-AA----CGTAATCGTACATGTAG-TCCCTAAA-A---CAT-----AT--A--TACAACTTCGAGT-GTA-TGGCAAC--AT-GGA-C----CTC-C---G-ACAACA----GG-CGA-A-G-C--CAG-GA-TCA-G--TGC-C-----A-TGGAGGG-----A--------GTAGGCATC-CTCTGCTGACC----GG--T-CAC-C-CCACACG--TGA-GCCTC-----G-TA-GTC-G---AG---A-CAA---G------------T---A--AACA-GG-G---TT-TACC-G----TC---------TAC-TACGAAATGAG--A-CA-GTCTAA-CAA---G-GGTA---T---GAAACAAATCA--GT--C-AGCA---T-------ATG-A--C--T-T---A--GTG-ATAA-TTTGGTAATCGCAA---CA--A-GGT----C-AT-AT-------AGCGACC-G-TAGAATCCTG--CG--AA-ATGCTGCGGACTTTGAAA-CGAGAACTC-G-TT--A----TAACCCTGCAAACA-T--CA-TTTC--TTTTT-----TT---GT-AATTGAC-T-CGCTTT-------AAAG----TC--CTGC-------G-T-CCG-CAT--GA----TATA-------------C-CT-TTGCGTATC-GAATC-A---A-C----TG--A-GAG-ACAT--A-CACA-CCA-TAA--GCAG--G-T-G-A--------TAGTGG-AACATTA-------------CTA--C-AAAGA-A---A-G--GGAA--AGTTGAC---GAT------T-GCAAAG--------TCA--------TCA-CGT------TTATCA-T--ATA-AT-------G-TAGTTGT-C--AGT-----C-TG--C--C-ATTAGAA-TC-AA-TTTTAAGTA-AAATATCC-A---AAT------------ATGAAGCACATCTGTCAGATTCTGTGGTGTTCT---TTA-TTTGGAGTTCGTCAGGAT-ATATC-AAATGGA-CATA-ATTATGAAAATTATGATTGTTAATAGATC--AG-ACATC-ACCTATATATCTAC--ATA-----TGTA
gi|41 : actatcttatccgaatgacatcaaagattacttgaacgattgtctgtactgcaatat---AG-ACATC-ATCTATATATCT----ATA-----TGTAATG-ATG-AA---GGACACA-GTAAG---------------TTTT----TTGTTT
gi|42 : AAAT-GGCGAAG-TA----A-CAA----A--GT-A--T-G-AAC---CGTAATCATA------
gi|44 : AAAT-GGCGAAG-TA----G-CAA----A--GT-AT-T-C-AA----CATAATCATA------A-Tcgtacacagataaaccata
gi|46 : cgcacatttataTTTTGG---TT--AGT-AGATGGCCT-CGCTTT-------AACAA--ATC--
gi|47 : A-A---G-G--G-GA--AATTGAC---AAT------T-GCAAAG--------TCAAAGTC--AT
gi|49 : -A---AAT------------ATGAAGCACATCTGTCTGATTCTGTG
gi|5 : AAATTGGTGAAG-TA----AACAA----T--GT-G--T-T-AAT---CGTAATCATA------G-TCCTAAAA-A---CAT-----ATTTA--CAAAG--TCGAGT-GTA-GGGCAAC--AC-GGA-T----CTC-C---G-ACAA-A----AG-CGA-A-G-G--CAG-GA-TCA-GG-TGC-C-----A-TAGAGG------A--------GTAAGCATC-CTCTGCTGACC----GG--T-CACAC-CCGC-CA--TGA-GCC-C-----T-TA-GTC-G---AA---A-CAA-G-G------------T---A--AACA-GG-A---TT-ACCC-G----TTGTCA-CATCT-AGTACGAAA--AT--GACA-GTCT-AACAAAA---GGT---AT---GGGACAAATCA--GT--C-AGCA---T-------------------------------TAA-TTTA-TAATCGCAAA--CA--A-GGT----C-ATTAT-------ACCGACT-G-TAGAATT-TG--CG--AC-ATGGTG---ACTTTA-AA-CGAGAA-TC-G--T-TA----TAATCCTGCAA-CA-T--CA-A--C--TTTTTAG---TT--AGT-AGTTGGCCT-CGCTTT-------AAAAA--GTCT-T--C-------A-T-ACG-CAT--GA----CATGT------------T-CT-T-GCGTATC-TAATC-A---A-CTGCATG--G-AAA-ACAT-T--CACACC-A-TAA--GCAG--G-T-G-ATACATTTGTAGTGGT-ACATTA-------------CTA-
gi|6 : tatactctatatgataatatatgtcttctgaaaccgcttttacatgtttctgtgttggcgacatcggtattttgggctttttcaaaagtttggcttatatttaaaaagttttcttttcatgaatgcatttttttctgtatttttttttattgtatgtagtaaaagatatT-GGCCAAA-TA----AACAA----T--TTGA--T-A-AT----TGTAATCAAA------A-CCCCAAAA-----CAT-----AC--A--CAAAG--TCGAAT-GTA-AGGAAAC--AC-AGA-C----CTC-C---G-ATAA-T----AG-CGA-A-G-G--AAT-AG-TCA-GT-CG-----------------------------------GCATC-CTCTGCTGACC----GG--T-CACAT-CCGC-CG--TGA-GCC-C-----T-TG-GTC-G---AA---A-CAA-A-G------------T---A--AACG-GG-A---TT-ACCC-G----TCGTCA-AATCTA-GTAGGAAA--AT--GACA-GTCTAA-CAAA--G-GGTA---T---GAAACAAATCA--GT--C-AACA---T-------ATG-A--C--T-T---A--ATG-ACAA-CTTG-TAATCGCATA--CA--A-GGT----C-ATT---------------------------TG--CG--AA-ATGGTG---ACT-----------------------G----TAGCCCTGCAA-CA-T--CA-------TTTTTTG---CT--AGT-AGTTGACCT-CGCTTT-------AAAAA--GTCC-T--C-------G-T-ACG-CAT--GA----CATG-------------CTCT-T-GCGTATC-GAATC-A---A-C----TG--G-AAG-ACAC--A-CACA-C-AATAA--GCAG--G-T-G-A--------TAAGGGTA-CATTA-------------CTA--C-ATGAA-A---A-G--G-AA--AGGTGAC---GAT------T-GCAAAG--------TTAAAGTC--ATCA-CGC------TTATCA-T--ATA-AT-------G-CAGTTAT-C--AGC-----C-TA--C--C-TTTAAAG-TC-AA-TATTAAGTA-AAAAATCC-A---AAT------------ATGAAGCAGATATGTCAGATTCTGTGGTGTCCT---TTA-ca
gi|7 : atagatTGTCAGATT--GTGTTGTC-T---TTA-TAT-GAGTTT-TCGGGATA-T-TCCAAAT------TA-AT----------GCCCTTGTTA-TTGAT---AGCAGAT--ATCTATAT-CCT----ATA-----TATAAGG-TTG-A-----GACAAA-GCAGGGAGTTTTTTTTTTTTTTTT----TTGTTTTT------AT-CCCGTAA-AGTTT-TTGT--A-GCA-AATTCTGC---TTCAT-ATGTA--ATAT-TCA--GTAAGTCTGGTGCCAATA---AA-GGGG---CA-AT---TAGTGCCACT-AGGAATGACGCA-ACGGA---------GAATTGTTTGA-TCGAC--CT-GTCTCTCC----A-CGAC------TACATAAATAAT-TTCTG-T-AAGAAACTCTACTC-ATCATGATGTCATGTTATCAT--TTGTTC-TAATAATATATCCTACTTCAGAGAGTA-CT--TGTGGG--C-ATCA----------------GAGT-----GTTTTT-------------TAAACAAATATGTGTCTT--GTTTTTCCGCCCCAATCCCCGAACTAGAAA--TATTA--TT---TTCGGG---GGTC-ATTTTT----TTGT---------TT---AACCACATT---------T--CGATAAT--CT-GAAAAG------CT-AGAT--TTAT--ATTTTTAAT--GTGAatactggcgtcaaagctcaaaattcttggagcgggaataataaaatatatt
gi|8 : taagatataaaacggtcagctactaaggattgtgtggtgAAAT-GGCGAAG-TA----A-CAA----A--GT-A--TGA-AA----CGTAATCATA------G-TCCAAAAA-A---CAC-----AT--A--CAAAA--TCGAGT-GTA-GGGCAAC--AC-GGA-C----CTT-C---G-ACGA-A----AG-CGA-A-G-G--CAG-GA-GCA-GG-TGC-C-----A-TGGAGG------A--------GTAAGCATC-CTCTGCTGACC----GG--T-CACAC-CCGC-CG--TGA-GCC-T-----G-TA-GTC-G---AA---A-CAA-A-G------------T---A--AACG-GG-G---TT-ACCC-G----TCGTCA-AATCTA-GTATGAAA--AT--GACA-GTCTAA-CAAA-TG-G-TA---T---GAAACAAATCA--GT--C-AACA---T-------ATG-A--C--T-T---A--GTG-ATAC-TTTG-TAATCGCAAA--CA--A-GGT----C-ATTAT-------AGCGACC-G-TAGAATT-TG--CG--AA-ATGATG---ACTTTA-AA-CGAG-ATTC-G--T-TA----TAACCCTGCAA-CA-T--CA-A--C--TTTTTGG---TT--AGT-AGTTGGCCT-CGCTTT-------AAAAA--ATCA-T--C-------A-T-ACG-CATG-G-----CATGC------------C-CT-T-GCGTATC-GAATC-A---A-C----TG--A-GAG-ACA--TA-CACACC-A-TAA--GCAG--G-T-G-A--------TAGTGGT-ACATTA-------------CTACAC-AAA-A-A---A-G--G-AA--AGTTGAC---AAT------T-GCAAAG--------TCAAAGTC--ATC-ACGT------TTA
gi|9 : ggcatataCCCCAAC-A---CAT------T--A--CAAAT--TCGC-T-GTA-AG-CAAC-CG--GGA-C----CTC-C---G-ACAA-A----AG-----A-G-G--TAG-GA-TCA--G-TGCAC-----A-TGGGAGG-----A--------GTAAGTTTC-CTCTCCCGAC------G--T-CACAC-CCGCGCA--TGACACC-CCCAAAT-TA-GAT-GACCAA---A-C-A-A-G------------T---A--AACG-GG-GA--TTAACCC-GGGTTTCA--A-AAT---AGTACGAAATGAC--A-CA--TCT-AACAAA--G-GGT---AT---GAAACAAATCA--GT--CAAACA---T-------ATG-A--C--T-TGCGG--ATG-ATAA-TTTG-TAATCGGGAA--CAACA-GGT----C-ATTATTTCGATAAGC-ACC-GCTAGAATT-GC--CG--A-----------------------AGAATTC-G--T-TA----TTAACCTACAA-CA-TA-CA-A--C--TTTTTTG---TT--AGT-AGTTTGGCT-CCCTTT-------AAAAGCCCTC--C--C-------A-C-ACG-CACGAG-----TATG-------------C-TC-T-GCGTATC-GAATCAA---A-C----CG--A-GAG-ACAT-
blockSeqs : T A TTTTA TTAAA ATAAATAGG T CATGTA A T ATG TGTATA TT TA CT T A G GC T A ACAT G TGT G C TTAT C T T A TTT T A A G A TTTTAA GAAGAAAATG T CGAG TC C A A TC C CCCAAA G . G ACC CGC A AT AGGGGGGGCGGT ATG CG C . ATT A T GGTT C G CA TG TGACAGCCTAACTAACAAGGGTATAA TG TG A ACC G G . CT . GCGG T . G TG AC . AAAC . TTCGATA G T C TG AA C CGG T TA A AC T TTATACCGT A T AC ACTT G AAT TA C A GATAAGA CC TCAAAAAAT T T . ATGCCATGTGTTGGATATAGCC C T . A GTT T ATTT CAG T AAT AT C A T . A G . TACATTTG AA CTACA T AAA C TAC A . G . AG . AGCCGA A . CC AA . . CA T GG CCA CC CAT . A . A . . TGG . T C GAA . C G GG AA A A A . . A A A A C . AC . . . A T GAGTTTTTTTTTTTT . . T . CTGA . C T T . G AT AA . A TGG . . . . . A . TG G . GGA A AGA GG G T C AAAA . . T A . A CTCTA . TCATGATGTCATGTT ATT C A AA AT T A AGA . . GAGTG C C CT . TTCCGC TCCC A T G . . . GG . TTAA G C ATCAATTTC . GG A . TA TA CCGT TG TG T A C T . . . A G . C . . . T CCA . . A C A G A T A . TG . T TAGTAGTTTAGTTTAGATTAAGGAAGAGGCTTGGTTAGAGCACTTACTTGAACTAGCATATAT CGG . A . G . C GA G A AT G . T T G T . G ATCGAAAAAAAA C ATAAAAAAC C . . G A AT A AGC CC G A A A . A . . G TAT CAGGA C . TA T T T A A AA C TATTTTC CAG A AG T AAATTCAAGACAAATTGACTTTGTAAC TTA T ATACAGCCTGGAACCAG T AAT GTAGTCTATG GG T A . CTG AAA G T ACGCC . GCGCT GTTT T C . T T A T C
blockSeqs : T . CAA ACA GATCAATCT T . . . . TGT . . A . . G C . . . . . . . T G . . . C . . . . . AA ATCGTAA . . . . . G . . TC . . . . . . CA C . . . . A . . . C . AG TG TGCAGTCTAAACAAAATGGGTAAAT . . . . . . . T . A . . . . . . . . . . C . . . . C T AA . AC . GTTTA . . A AAAA G . . . . . T TTTC . . . GTGGTATATGACC . . . . . . TGCA CG . GCA AC C . . . . G . . AA CTAA . AAG . . G . . . GC . A . . . AA . . . . GT GC CC C . . . . . . . . T C . . T G GG AA A A A . . A A A C C . . . . . A C . . . T . TT . . T . . G . AA . A . . . . . . T . T . . A G AT . G T C A . . A . . . A . . AT C . . . T T A . . GAGT G A CT . C . . C T . . . AT . TCA G . ATTATAAT . G . . AT . GTGA TA T . . T . . . . CC . . . . . T . . T . G . T AGTAGTTTTGTTAGTAGTAAGGGATAGAGGC . . A . G . C G A . . . . T T . G . G ATATTTTTGGAA C TA . . . . A A . . T G A A A . . . . . TA A C . . . C . . . A . TAG GA C . T ACAAGACAAATGTGA . G ATCAGCTGAACTA A AA GTGCGTCTT . . C . TC AA G T AG . . . T . . C . T . C
blockSeqs : . . AA A ATCAAA T . . . . C . . A . . G C . . . . . . . . . . . . C . . . . . A GA . . . . . . . . C . . . . . . G . . . . . . . . . C . AA . TGAAGGCTAAACACAAGGGTTATT . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . T GA . AT . TTTG . . A TTTC G . . . . . . CTGC . . . GACATGTT . . . . . . T AT . TA AC . . . . . . . . AA TTAA . TAG . . . . . . GT . . . . . T . . . . G A T C . . . . . . . . A C . . T T CG A A T A . . A A A . . . . . . . A G . . . T . GT . . T . . . . T . A . . . . . . G . T . . A A A . . T C A . . A . . . A . . AA C . . . C A A . . GAGT G A C . . . . . . . . . G . TT C . TCGATAAT . . . . T . CG . . . . . AGTTACTAGTAGGATAGAGGGC . . . . . . . . G . . . . . . . C . . GTTAATTCGAA C A . . . . A T . . C . . T . . . . . . A . . . . . C . . . A . TA GA T . T AAAGACAAGTG . C AACTGTCCTGTAA G AA G . . A . TT AA . . . . .
blockSeqs : . . AA A GTTAAA T . . . . T . . . . . G G . . . . . . . . . . . . T . . . . . A GA . . . . . . . . C . . . . . . G . . . . . . . . . C . AA . CTTAGTGATAATATGCGTAATCTG . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . C A . AA . TTGA . . . AC A . . . . . . TGT . . . GACATGCT . . . . . . . A . TA A . . . . . . . . G CTA . CAT . . . . . . GT . . . . . A . . . . G C C C . . . . . . . . C C . . C G GG A A C A . . . . G . . . . . . . . A . . . . . G . . . . . . . C . . . . . . T . . . . . . . A . . . . . . A T . . . . A A . . GAG T . . . . C . . . A . AG GG C . A . . . .
blockSeqs : . . AA A GTTTAA T . . . . T . . . . . G C . . . . . . . . . . . . C . . . . . A GA . . . . . . . . C . . . . . . G . . . . . . . . . C . AC . CGGATATCGAACAATCGGTAAA . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . C A . GA . GTTA . . . AC G . . . . . . TTC . . . GGCATGCC . . . . . . . G . TA A . . . . . . . . A CTA . TTG . . . . . . GT . . . . . A . . . . G C C T . . . . . . . . C C . . G G GG A . . . . . . . . . . . . . A . . . .
blockSeqs : . . A T GTTAAA T . . . . T . . . . . G C . . . . . . . . . . . . C . . . . . A GA . . . . . . . . C . . . . . . A . . . . . . . . . A . A . TAAGAGTCTGACAAAGGGTAC . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . C . . AA . TTA . . . AC G . . . . . . CTC . . . GAGTATGC . . . . . . . A . CA A . . . . . . . . A CTA . TAG . . . . . . AT . . . . . T . . . . G C G C . . . . . . . . A . . . . . . . . .
blockSeqs : . . A T ATGAAC T . . . . T . . . . . T . . . . . . . . . . . . . C . . . . . A GA . . . . . . . . T . . . . . . A . . . . . . . . . A . A . TAAGAGTCTGACAAAGGGTAT . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . C . . AA . TTA . . . AC A . . . . . . ATC . . . ACATGCT . . . . . . . A . TA A . . . . . . . . A TCA . AAG . . . . . . GG . . . . . A . . . . G C C C . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . A T ATTCAA T . . . . T . . . . . G . . . . . . . . . . . . . T . . . . . A GA . . . . . . . . C . . . . . . G . . . . . . . . . G . T . TGACAGTCTAACAAAAGGTAT . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . C . . AA . TTA . . . AC T . . . . . . AC . . . GATATAC . . . . . . . G . A . . . . . . . . . A CTA . TGA . . . . . . GT . . . . . A . . . . G . C . . . . .
blockSeqs : . . A A GTTAAT T . . . . T . . . . . G . . . . . . . . . . . . . C . . . . . A AA . . . . . . . . T . . . . . . A . . . . . . . . . C . T . TGACAGTCTAACAAAGGGTAT . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . . C . . A . TTA . . . C G . . . . . . TC . . . GCATGC . . . . . . . G . T . . . . . . . . . A CTA . TG . . . . . . T . . . . . A .
blockSeqs : . . G A GATAAT T . . . . T . . . . . G . . . . . . . . . . . . . C . . . . . G GA . . . . . . . . C . . . . . . A . . . . . . . . . C . A . TGACAGTCTAACAAATGGTAT . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . . C . . A . TTA . . . . T . . . . . . CC . . . . . . . . . . . A . A . . . . . . . . . A CTA . AA . . . . . . . . . . . . A .
blockSeqs : . . A T ATGAAA T . . . . C . . . . . G . . . . . . . . . . . . . C . . . . . A GA . . . . . . . . C . . . . . . A . . . . . . . . . C . A . ACGGCTTAACAATGGCTAT . . . . . . . . . G . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . G . . . . . . . . . . . . . . . . A . T . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : T ATAAA T . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . A A . . . . . . . . G . . . . . . G . . . . . . . . . C . A . GACAGTCTAACAAGGGTAT . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A
blockSeqs : A AATTA . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . A A . . . . . . . . C . . . . . . A . . . . . . . . . . . A . CACATCTAACAAAGGGTAT . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : ACAAC . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . A A . . . . . . . . T . . . . . . G . . . . . . . . . . . A . TGACTGACAAAGGATAT . . . . . . . . . A . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A A . . . . . . . . A . . . . . . A . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . C . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . C . . . . . . A . . .
blockSeqs : . . . . T . . . . . . .
blockSeqCons : N****** GTTAAA******** T***** ** A****** C****** *** ******* ** A***** TTA******* AC***** ******* TA** ** ** CTA*************** ** ** *** ******** A* ****** G******** C****** C**** ************ GG A* *** **** ***** A*** N* *************** **** ****** T* NT** *** *** T* A*********** A** ** ****** A**** A** ** GAGT********************* N************* *** A* GA** ***
originalCons : AAAT-GGCGAAG-TA----A-CAA----A--GT-A--T-A-AA----CGTAATCATA------G-TCCCAAAA-A---CAT-----AT--A--CAAAA--TCGAGT-GTA-GGGCAAC-CAC-GGA-C----CTC-C---G-ACAA-A----AG-CGA-A-G-G--CAG-GA-TCA-GG-TGC-C-----A-TGGAGGG-----A--------GTAAGCATC-CTCTGCTGACC----GG--T-CACAC-CCGC-CG--TGA-GCC-C-----T-TA-GTC-G---AA---A-CAA-A-G------------T---A--AACG-GG-G---TT-ACCC-G----TCGTCA-AATCTAAGTACGAAA--AC--G-CA-GTCTAAACAAAATG-GGTA-AAT---GAAACAAATCA--GT--C-AACA---T-------ATG-A--C--T-T---A--GTG-ATAA-TTTG-TAATCGCAAA--CA--A-GGT----C-ATTAT-------AGCGACC-G-TAGAATT-TG--CG--AA-ATGATG---ACTTT--AA-CGAGAATTC-G-TT-TA----TAACCCTGCAA-CA-T--CA-A--C--TTTTTGG---TT--AGT-AGTTGGCCT-CGCTTT-------AAAAA--ATC--T--C-------A-T-ACG-CAT--G-----CATG-------------C-CT-T-GCGTATC-GAATC-A---A-C----TG--A-GAG-ACAT-TA-CACA-C-A-TAA--GCAG--G-T-G-A--------TAGTGGTAACATTA-------------CTA-AC-ANAGA-A---A-G--G-AA--AGTTGAC---GAT------T-GCAAAG--------TCAAAGTC--ATCAACGC------TTATCA-T--ATA-AT-------G-TAGTTGT-C--AGT-----C-TG--C--C-ATTAGAG-TC-AA-TATTAAGTA-AAATATCC-A---AAT------------ATGAAGCAGATCTGTCAGATTCTGTGGTGTCCT---TTA-TTTCGAGTTCGTCGGGATAATATCAAAATGGA-CATA-ATTGTGAAAATTATGATTGTTAATTGAT---AG-ACATC-ATCTATATACCT----ATA-----TGTAAGG-TTG-AA---GGACACG-GCAAG---------------TTTT----TTGTTTTT------AT-CCCGTAACAGTTT-TTTTGAA-ACA-AATTCTGCT--TTCAT-ATGGA--ATATAAAA--ATAAGTC---TGCCAATA---AG-GGGGC-ACA-AT---TAGTGCCCNT-AGGAAT-AC-CA-AC--A---------GAATTGTTGGA-NAGAC--ATGGTCTCTCC---AA-AGAC------TACATAAATATT-ATCTA-T-AAGAAA----ACCC-A---------------AGCAT--ATGCTC-T--TA--ATATCTTACTTCA-AGAGTA-CTTGTGTGGG--CAATCA----------------GAGTG----GGTTCT-------------NACAAAAATATGTGTCTT--GTTT-----CCCCAA----CG-ACCAGAAACTTGTTA--TT---TTCGGG---TGCC-G-TTTT----TTGT---------TT-AAAANCA-ATTA--------T--CAAT--T--CT-GAAAAA-G---CCT-AGAT--TT-T--ATTTT--AT-CGTGAGAGGAATCGTTG-----------TAGTAAAG--TGGTGGAGAAA-TC-ATACG-TTTTG-ATGCAGTCAATTGTCTCAGCATTGGAAACAANTCTCGTGATTNAAAGTTGTTTTNGTATAAAGCTGGGCCTTTAGAGGGGGCGTTTTT----TGAGA-ATCC-CAATC--TGAA-TG-ACACCA-TTCTGGAATA-TGTAGCGG-AACAGTATATCNTGAAG---TGACT-TTTTAACA--GCTGTTCAG--TAG-------TTT--TTAGT--A-GAC-------TAAGGGA----------T-AGAG--------------GG-----C------TG---GTA-GAGCAC--TTACTGGAA---CCAGCG-ATGTA--------TC--TTT-G-TTTGTAAGGA-TTTC---TTA-TGCG---TT---T-CGGAA-----TCCAGT-A--------AAGGT-ATGGTAA-TTCAAATTGAT-CCTGAT-TCTTCGGAAATAT-TGA---AAGTATTT-CAAACAGAAAGGTGANTTTGAAGAA-TT-TCATC-TTAGT-CAGATTGCTTGGA-GTATA-AAGT----AAGATTCCCAGATGTG---TGA--AGTA-AACCC-T-AGTT-C-ATTTAAAAAG-ACAAGTATAATA----GT-GA-CTCT--TTACAAAC--A-----AAG----ACAAA-------TGTGA-ATC---ACTNTGCTTTAT--GCTGTCT--AACT---A-TAACAA-AGTTTTCACG-----TG----TNTAA--CTCA-TTTACNCACTTCTG---GCT-TC-----TTAA-GACAG-----AAGGATAAATAGT-CG--ATTTTCCC---CGC-----TAAA----TGGTTAC----GGATTTT-AATNATTTCCGAA-TANTTTTGATCA-TTCAGACAAAGTGTCAAGCTCCTCTCCCT
finalCons : AAAT-GGCGAAG-TA----A-CAAN------GTGTTAAA--------CGTAATCATA------G-TCCCAAAA-A---CAT-----AT--A--CAAAA--TCGAGT-GTA-GGGCAAC--AC-GGA-C----CTC-C---G-ACAA-A----AG-CGA-A-G-G--CAG-GA-TCA-GG-TGC-CA------TGGAGGG-----A--------GTAAGCATC-CTCTGCTGACC----GG--T-CACAC-CCGC-CG--TGA-GCCC------T-TA-GTC-G---AA---A-CAA-A-G------------T---A--AACG-GG-G---TT-ACCC-G----TCGTCA-AATCTAAGTACGAAA--AC--G-CA-GTCTAAACAAAATG-GGTA-AAT---GAAACAAATCA--GT--C-AACA---T-------ATG-A--C--T-TA-----GTG-ATAA-TTTG-TAATCGCAAA--CA--A-GGT----C-ATTAT-------AGCGACC-G-TAGAATT-TG--CG--AA-ATGATG---ACTTT--AA-CGAGAATTC-GTTA-------TAACCCTGCAA-CA-T--CAAC-----TTTTTGG---TT--AGT-AGTTGGCCT-CGCTTT-------AAAAA--ATC--T--C-------A-T-ACG-CAT--G-----CATG-------------C-CT-T-GCGTATC-GAATC-A---A-C----TG--A-GAG-ACATTA--CACA-C-A-TAA--GCAG--G-T-G-A--------TAGTGGTAACATTACTA---------------C-ANAGA-A---A-G--G-AA--AGTTGAC---GAT------T-GCAAAG--------TCAAAGTC--ATCA-CGC------TTATCA-T--ATA-ATG--------TAGTTGT-C--AGTC------TGC----C-ATTAGAG-TC-AA-TATTAAGTA-AAATATCC-A---AAT------------ATGAAGCAGATCTGTCAGATTCTGTGGTGTCCT---TTA-TTTCGAGTTCGTCGGGATA-TATCAAAATGGA-CATA-ATTGTGAAAATTATGATTGTTAATTGAT---AG-ACATC-ATCTATATACCT----ATA-----TGTAAGG-TTG-AA---GGACACN-GCAAG---------------TTTT----TTGTTTTT------AT-CCCGTAACAGTTT-TTNT--A-ACA-AATTCTGCT--TTCAT-ATGGA--ATATAAAA--ATAAGTC---TGCCAATA---AG-GGGGC-ACA-AT---TAGTGCCCNT-AGGAAT-AC-CA-ACA-----------GAATTGTTGGA--AGAC--ATGGTCTCTCC---AA-AGAC------TACATAAATATT-ATCTA-T-AAGAAA----ACCC-A---------------AGCA----TGCTC-T--TA--ATATCTTACTTCA--GAGTA-CTTGTGTGGG--CAATCAGAGT---------------------GGTTCTN-------------ACAAAAATATGTGTCTT--GTTT-----CCCCAA----CG-ACCAGAAACTTGTTA--TT---TTCGGG---TGCC-G-TTTT----TTGT---------TT-AAAANCA-ATTA--------T--CAAT--T--CT-GAAAAA-G---CCT-AGAT--TT-T--ATTTT--AT-CGTGAGAGGAATCGTTG-----------TAGTAAAG--TGGTGGAGAAA-TC-ATACG-TTTTG-ATGCAGTCAATTGTCTCAGCATTGGAAACAANTCTCGTGATTNAAAGTTGTTTTNGTATAAAGCTGGGCCTTTAGAGGGGGCGTTTTT----TGAGA-ATCC-CAATC--TGAA-TG-ACACCA-TTCTGGAATA-TGTAGCGG-AACAGTATATCNTGAAG---TGACT-TTTTAACA--GCTGTTCAG--TAG-------TTT--TTAGT--A-GAC-------TAAGGGA----------T-AGAG--------------GG-----C------TG---GTA-GAGCAC--TTACTGGAA---CCAGCG-ATGTA--------TC--TTT-G-TTTGTAAGGA-TTTC---TTA-TGCG---TT---T-CGGAA-----TCCAGT-A--------AAGGT-ATGGTAA-TTCAAATTGAT-CCTGAT-TCTTCGGAAATAT-TGA---AAGTATTT-CAAACAGAAAGGTGANTTTGAAGAA-TT-TCATC-TTAGT-CAGATTGCTTGGA-GTATA-AAGT----AAGATTCCCAGATGTG---TGA--AGTA-AACCC-T-AGTT-CA-TTTAAAAAG-ACAAGTATAATA----GTGA--CTCT--TTACAAAC--A-----AAG----ACAAA-------TGTGA-ATC---ACTNTGCTTTAT--GCTGTCT--AACT---A-TAACAA-AGTTTTCACG-----TG----TNTAA--CTCA-TTTACNCACTTCTG---GCT-TC-----TTAA-GACAG-----AAGGATAAATAGT-CG--ATTTTCCC---CGC-----TAAA----TGGTTAC----GGATTTT-AATNATTTCCGAA-TANTTTTGATCA-TTCAGACAAAGTGTCAAGCTCCTCTCCCT
5 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|33 ): GTTTTTGCGTTGGTGACATCAGAATTTTGGATTTTTTCAAAACTTTGGCAGTGACTGGCTTATCATATTTAAAAAGTTTTCTTTTCATGAATGCATTT
Unaligned ( gi|40 ): TTAAAAGTGAAGATAACAAACAGTGATCTATGTCATAATTCCTATAAAAAATTGAAATCTAA
Unaligned ( gi|43 ): GATCTGAGGTCCAGGGGTGATGAATATAGCATACTTCCATGTTGATTGATT
Unaligned ( gi|45 ): TATTAAGTGATGCCATACATAGAGGATCTTGAATGAGT
Unaligned ( gi|48 ): TAGTCGATACTAAAATTCATGCTCATTTGAT
Alignments
lowQualScore : 111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111
lowQualScore : 111111 11111 111 111111 111111111111111 111111111111 22 3333333333333333333333333333333333 1111111 2222222222 111111 11 1111111 1111111 222222222222222 44444444444444444444444444444444444 1111 11111 22 11111111 22222222222222222222 111111 111111 11111111 111111 11 111111 22222 222222222222 1 222 1 2222 11111 1111 444444444444444 1111 222222 111111111 222 1 11 11 111 111 111 11 444444444444 11 1 11 1 1 1111 222222 11111 555555555555555 11 11 11 11 11 11 11 11 222222 2222 1 11 111 111 111 2222 555555555555 1 444444444444444444444 1 222222 1 111 11111 11 222222 7777777777777 222 1 22 1111 1 333333333 11 2222 11 2222 222222 2222 1 111 11 1 1 1 1 1 1 111 22 11 444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444 111 1 11 111 11 44444444 11 1 1 1 1111 1 333333333333333333333 4444444444 1 1 1 1 1 111 111 1 1 1 1 1 111 22222 111 11 2222222 11 444444444444444444444444444444444 111 4444444444444444444444 111 55555555555555 11 111 22222222 111 222222 22222 111 22222 2222 33333 1 1 1
lowQualScore : 6 3 6 222222 66666 0 000 8888888 777777 2 2 444 444444 33 33 88 2 2 1 8 2 444 2 5555 2 444 4 2 6666 4 2 2 2 555 2 2 2 2 2 8888888 1 000000000000000 2 5555 33 2 2 5 33 2 6666666 2 2 2 666 333 2 222 333333333333 333 33 2 2 666 2 2 5555 1 2 11 66 6666666666666666666666666666666666 33 33 2 444 0000000 4 33 55 2 444444 2 2 2 0 33 33 2 5555 2 9999999 3 6 2 33 33 2222222222 3 666666 44 333333 33 3 3 11 6666666 1 555 3 3 3 0000000 999 555555555555555 3 77777777777777777777777777777777777 3 3 3 3 555 3 7777 8888 3 33333 00 6 3 77 44 3 6 3 22222222 44444444444444444444 6666 3 44 3 222222 6 3 33 555 222222 3 22222222 0 44 7 000000 4 66 4 00 777777 8888 00000 99999 4 5 5 5 0 5 5 777 222222222222 0 1 888 5 5 4 1 5 6 7 7 3 6 6 1 1 111 1 5 3333 66666 8 8 4444 77 888888888888888 4444 333333 88 0 8 444444444 8 3 999 0 6 33 44 33 3 777 444 8 8 8 444 1 8 66 8 8 333333333333 3 11 6 99 0 0 5 4444 8 333333 6 0 8 6 6 77777 8 000000000000000 8 11 11 8 11 11 3 6 99 8 0 11 0 33 1 5 55 33 777777 1111 0 6 9 33 777 777 444 1111 111111111111 1 0 555555555555555555555 0 666666 0 777 22222 33 111111 0 7777777777777 555 3 00 3 7777 3 777777777 88 1 1 4444 66 2222 888888 8888 3 555 88 3 3 3 3 3 3 7 0 777 99 33 3 777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777 777 0 3 33 2 777 2 22 6 66666666 33 0 0 3 3 0 7777 0 2 999999999999999999999 2 9999999999 0 0 0 0 3 66 0 777 999 2 3 1 3 0 0 0 0 0 777 44444 0 2 444 11 8 3 8 8 0 8 88 8 0 3333333 8888 1 11 1 111111111111111111111111111111111 777 1 8888888888888888888888 1 000 33333333333333 11 0 8 0 8 0 0 444 66666666 000 777777 0 7 88888 777 55555 1111 3 22222 3 1 3 1 3 6
lowQualScore : . . . ...... ..... . ... ....... ...... . . ... ...... .. .. .. . . . . . ... . .... . ... . . .... . . . . ... . . . . . ....... . ............... . .... .. . . . .. . ....... . . . ... ... . ... ............ ... .. . . ... . . .... . . .. .. .................................. .. .. . ... ....... . .. .. . ...... . . . . .. .. . .... . ....... . . . .. .. .......... . ...... .. ...... .. . . .. ....... . ... . . . ....... ... ............... . ................................... . . . . ... . .... .... . ..... .. . . .. .. . . . ........ .................... .... . .. . ...... . . .. ... ...... . ........ . .. . ...... . .. . .. ...... .... ..... ..... . . . . . . . ... ............ . . ... . . . . . . . . . . . . . ... . . .... ..... . . .... .. ............... .... ...... .. . . ......... . . ... . . .. .. .. . ... ... . . . ... . . .. . . ............ . .. . .. . . . .... . ...... . . . . . ..... . ............... . .. .. . .. .. . . .. . . .. . .. . . .. .. ...... .... . . . .. ... ... ... .... ............ . . ..................... . ...... . ... ..... .. ...... . ............. ... . .. . .... . ......... .. . . .... .. .... ...... .... . ... .. . . . . . . . . ... .. .. . .......................................................................................... ... . . .. . ... . .. . ........ .. . . . . . .... . . ..................... . .......... . . . . . .. . ... ... . . . . . . . . . ... ..... . . ... .. . . . . . . .. . . ....... .... . .. . ................................. ... . ...................... . ... .............. .. . . . . . . ... ........ ... ...... . . ..... ... ..... .... . ..... . . . . . .
lowQualScore : 2 1 2 222222 00000 7 000 5555555 222222 7 5 444 888888 44 44 44 7 7 7 0 7 444 4 0000 4 111 7 2 9999 4 4 4 4 333 4 4 1 1 1 2222222 0 222222222222222 2 0000 22 4 5 0 22 2 0000000 1 1 1 666 777 1 555 666666666666 999 11 4 4 555 4 4 0000 8 4 88 55 6666666666666666666666666666666666 22 22 4 111 0000000 7 22 66 4 999999 5 5 5 8 44 44 5 7777 7 3333333 1 2 9 99 99 4444444444 1 555555 22 111111 99 3 3 22 7777777 0 888 3 3 3 8888888 666 222222222222222 6 88888888888888888888888888888888888 6 6 3 3 888 3 5555 5555 3 99999 77 7 3 99 66 3 7 3 11111111 00000000000000000000 5555 1 33 3 666666 7 3 33 888 999999 3 11111111 1 66 3 555555 0 11 4 66 222222 9999 00000 66666 4 0 0 0 4 0 0 888 888888888888 7 7 888 0 3 3 7 7 7 3 2 5 7 7 3 7 444 4 7 3333 77777 0 0 8888 77 333333333333333 2222 000000 88 8 0 888888888 0 2 222 0 5 88 55 88 2 555 000 0 0 0 000 0 0 88 0 0 888888888888 8 00 0 00 0 6 0 8888 0 000000 0 8 0 7 7 88888 0 000000000000000 0 00 00 0 00 00 8 0 00 0 8 00 8 22 0 6 88 88 555555 2222 0 5 2 88 555 555 000 2222 888888888888 0 0 888888888888888888888 0 222222 0 555 00000 88 555555 7 3333333333333 000 3 77 7 3333 3 000000000 00 0 0 0000 00 5555 777777 3333 3 333 33 3 3 3 3 7 3 3 8 555 22 88 2 222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 555 0 2 88 5 555 5 55 5 22222222 88 0 0 2 2 0 8888 0 5 555555555555555555555 5 5555555555 0 0 0 0 2 55 0 555 555 5 2 0 2 0 0 0 0 0 222 55555 2 5 000 00 0 2 0 0 8 0 88 0 8 6666666 2222 4 00 4 000000000000000000000000000000000 555 0 0000000000000000000000 2 222 88888888888888 00 8 0 8 8 6 8 000 22222222 222 555555 8 3 88888 555 00000 2222 2 00000 3 0 3 0 3 7
consensus : AAAT-GGCGAA-G-TA----A-CAAN----GTGTTAAA---CGTAAT------CATA------G-TCCCAAAA-A---CAT-----AT--A--CAAAA--TCGAGT-GTA-GGGCAA-C-AC---GGA-C----CTC-C---G-ACAA-A----AG-CGA-A-G-G--CAG-GA-TCA-GG-TGC-C-----A-TGGAGGG-----A--------GTAAGCATC-CTCTGCTGACC----GG--T-CACAC-CCGC-CG--TGA-GCC-C-----T-TA-GTC-G---AA---A-CAA-A-G------------T---A--AACG-GG-G---TT-ACCC-G----TCGTCA-AATCTAAGTACGAAA--AC--G-CA-GTCTAAACAAAATG-GGTA-AAT---GAAACAAATCA--GT--C-AACA---T-------ATG-A--C--T-T---A--GTG-ATAA-TTTG-TAATCGCAAA--CA--A-GGT----C-ATTAT-------AGCGACC-G-TAGAATT-TG--CG--AAATGATG---ACTTT--AA-CGAGAATTC-G--TTATA------A-CCCTGCAA-CA-T--CA-A--C--TTTTTGG---TTAGT-AGTTGGCCT-CGC-TTT-------AAAAA--ATC--T--C-------A-TACG-CA-----T--G-----CAT--G-------------C-CT-T-GCGTATC-GAATC-A---A-C----TG--A-GAG-ACAT-TA-CACA-C-A-TAA--GCA--GG-T-G-A--------TAGTGGTA------ACA----------TT----ACT-ACA-NAGA-A---A--GG-A-AAGTTGAC---GAT------T-GCAAAG--------TCAAAGT--CATC-ACGC------TTAT-CAT--ATA-A--TG------TAGTTGT-C--AGT-----CTG--C--C-ATTAGAG-TC-AA-TATTAAGT-AAAATA-TCCA---AAT------------ATGAAGCAGATCTGTCAGATTCTGTGGTGTCCT---TTA-TTTCGAGTTCGTCGG-GAT-ATATCAAAATGGA-CATA-ATTGTGAAAATTATGATTGTTAATTGAT---AG-ACATC-ATCTATATACCT----ATA-----TGTAAGG-TTG-AA---GGACAC-NGCAAG---------------TTTT----TTGTTTTT------AT-CCCGTAACAGTTT-TTNT--AA---CA-AATTCTGCT--TTCAT-ATGGA--ATATAAAA--ATAAGTC---TGCCAATA---AG-GGGGC-ACA-AT---TAGTGCCCNT-AGGAAT-AC-CA-AC--A---------GAATTGTTG--GA-AGAC--ATGGTCTCTCC---AA-AGAC------TACATAAATATT-ATCTA-T-AAGAAA----ACCC-A---------------AGC-A--TG--CTC-T--TA--ATATCTTACTTCA-AGAGTA-CTTGTGTGGG--CAATCAGAGT-GGTTCTNACAAAAATATGTGTCTTG--TTT-----CCCCAA----CG-ACCAGAAACTTGTTA--TT---TTCGGGT---GCC-G-TTTT----TTGTT---------T-AAAANCA-ATTA--------T--CAAT--T--CT-GAAAAA-GC---CT-AGAT---TT-T-A-TTTT--AT-CGTGAGAGGAATCGTTGTA-----------GTAAAGT--GGTGGAGAAA-TCA-TACG-TT-TTGA-TGCAGTCAATTGTCTCAGCATTGGAAACAANTCTCGTGATTNAAAGTTGTTTTNGTATAAAGCTGGGCCTTTAGAGGGGGCGTTTTT----TGAGA-ATCC-CAATC--TGAA-TG-ACACCA-TTCTGGAATA-TGTAGCGG-AACAGTATATCNTGAAG---TGACT-TTTTAACA--GCTGTTCAG--TAG-------TTT--TTAGT--A-GAC-------TAAGGGA----------T-AGAG--------------GG-----C------TG---GTA-GAGCAC--TTACTGGAA---CCAGCG-ATGTA--------TC--TTT-G-TTTGTAAGGA-TTTC---TTA-TGCG---TT---T-CGGAA-----TCCAGT-A--------AAGGT-ATGGTAA-TTCAAATTGAT-CCTGAT-TCTTCGGAAATAT-TGA---AAGTATTT-CAAACAGAAAGGTGANTTTGAAGAA-TT-TCATC-TTAGT-CAGATTGCTTGGA-GTATA-AAGT----AAGATTCCCAGATGTG---TGA--AGTA-AACCC-T-AGTT-C-ATTTAAAAAG-ACAAGTATAATA----GT-GA-CTCT--TTACAAAC--A-----AAG----ACAAA-------TGTGA-ATC---ACTNTGCTTTAT--GCTGTCT--AACT---A-TAACAA-AGTTTTCACG-----TG----TNTAA--CTCA-TTTACNCACTTCTG---GCT-TC-----TTAA-GACAG-----AAGGATAAATAGT-CG--ATTTTCCC---CGC-----TAAA----TGGTTAC----GGATTTT-AATNATTTCCGAA-TANTTTTGATCA-TTCAGACAAAGTGTCAAGCTCCTCTCCCT
Reference ( family-568 ) : AAAT-GGCGAA-G-TA----A-CAAN----GTGTTAAA---CGTAAT------CATA------G-TCCCAAAA-A---CAT-----AT--A--CAAAA--TCGAGT-GTA-GGGCAA-C-AC---GGA-C----CTC-C---G-ACAA-A----AG-CGA-A-G-G--CAG-GA-TCA-GG-TGC-C-----A-TGGAGGG-----A--------GTAAGCATC-CTCTGCTGACC----GG--T-CACAC-CCGC-CG--TGA-GCC-C-----T-TA-GTC-G---AA---A-CAA-A-G------------T---A--AACG-GG-G---TT-ACCC-G----TCGTCA-AATCTAAGTACGAAA--AC--G-CA-GTCTAAACAAAATG-GGTA-AAT---GAAACAAATCA--GT--C-AACA---T-------ATG-A--C--T-T---A--GTG-ATAA-TTTG-TAATCGCAAA--CA--A-GGT----C-ATTAT-------AGCGACC-G-TAGAATT-TG--CG--AAATGATG---ACTTT--AA-CGAGAATTC-G--TTATA------A-CCCTGCAA-CA-T--CA-A--C--TTTTTGG---TTAGT-AGTTGGCCT-CGC-TTT-------AAAAA--ATC--T--C-------A-TACG-CA-----T--G-----CAT--G-------------C-CT-T-GCGTATC-GAATC-A---A-C----TG--A-GAG-ACAT-TA-CACA-C-A-TAA--GCA--GG-T-G-A--------TAGTGGTA------ACA----------TT----ACT-ACA-NAGA-A---A--GG-A-AAGTTGAC---GAT------T-GCAAAG--------TCAAAGT--CATC-ACGC------TTAT-CAT--ATA-A--TG------TAGTTGT-C--AGT-----CTG--C--C-ATTAGAG-TC-AA-TATTAAGT-AAAATA-TCCA---AAT------------ATGAAGCAGATCTGTCAGATTCTGTGGTGTCCT---TTA-TTTCGAGTTCGTCGG-GAT-ATATCAAAATGGA-CATA-ATTGTGAAAATTATGATTGTTAATTGAT---AG-ACATC-ATCTATATACCT----ATA-----TGTAAGG-TTG-AA---GGACAC-NGCAAG---------------TTTT----TTGTTTTT------AT-CCCGTAACAGTTT-TTNT--AA---CA-AATTCTGCT--TTCAT-ATGGA--ATATAAAA--ATAAGTC---TGCCAATA---AG-GGGGC-ACA-AT---TAGTGCCCNT-AGGAAT-AC-CA-AC--A---------GAATTGTTG--GA-AGAC--ATGGTCTCTCC---AA-AGAC------TACATAAATATT-ATCTA-T-AAGAAA----ACCC-A---------------AGC-A--TG--CTC-T--TA--ATATCTTACTTC--AGAGTA-CTTGTGTGGG--CAATCAGAGT-GGTTCTNACAAAAATATGTGTCTTG--TTT-----CCCCAA----CG-ACCAGAAACTTGTTA--TT---TTCGGGT---GCC-G-TTTT----TTGTT---------T-AAAANCA-ATTA--------T--CAAT--T--CT-GAAAAA-GC---CT-AGAT---TT-T-A-TTTT--AT-CGTGAGAGGAATCGTTGTA-----------GTAAAGT--GGTGGAGAAA-TCA-TACG-TT-TTGA-TGCAGTCAATTGTCTCAGCATTGGAAACAANTCTCGTGATTNAAAGTTGTTTTNGTATAAAGCTGGGCCTTTAGAGGGGGCGTTTTT----TGAGA-ATCC-CAATC--TGAA-TG-ACACCA-TTCTGGAATA-TGTAGCGG-AACAGTATATCNTGAAG---TGACT-TTTTAACA--GCTGTTCAG--TAG-------TTT--TTAGT--A-GAC-------TAAGGGA----------T-AGAG--------------GG-----C------TG---GTA-GAGCAC--TTACTGGAA---CCAGCG-ATGTA--------TC--TTT-G-TTTGTAAGGA-TTTC---TTA-TGCG---TT---T-CGGAA-----TCCAGT-A--------AAGGT-ATGGTAA-TTCAAATTGAT-CCTGAT-TCTTCGGAAATAT-TGA---AAGTATTT-CAAACAGAAAGGTGANTTTGAAGAA-TT-TCATC-TTAGT-CAGATTGCTTGGA-GTATA-AAGT----AAGATTCCCAGATGTG---TGA--AGTA-AACCC-T-AGTT-C-ATTTAAAAAG-ACAAGTATAATA----GT-GA-CTCT--TTACAAAC--A-----AAG----ACAAA-------TGTGA-ATC---ACTNTGCTTTAT--GCTGTCT--AACT---A-TAACAA-AGTTTTCACG-----TG----TNTAA--CTCA-TTTACNCACTTCTG---GCT-TC-----TTAA-GACAG-----AAGGATAAATAGT-CG--ATTTTCCC---CGC-----TAAA----TGGTTAC----GGATTTT-AATNATTTCCGAA-TANTTTTGATCA-TTCAGACAAAGTGTCAAGCTCCTCTCCCT
gi|1 : AAACAGGGTA-TGCA-AA-----AAACCAATCA--AT--C-AATA---TCATTTTTATGTAGTC--TCT---ATTGTG--TACCTTTG-TAATCGCAAA--CA--ACGGT----CCATTAT-------AGCGACC-G-TAGTATT-TG--CG--AAATGATG---A-TTT--AA-CGAGAATTC-G--TTATATC----A-CCCTGCAA-CA-T--CAGA--C--TTTTTGG----TAGT-AGTT-GCCT-CGCTTTT-------AAAAA--ATCA-T--C-------A-TACGACA-----TG-G-----CAT--G-------------CTCT-T-GCGTATCTGAATC-A---A-C----TG--A-GAG-ACA--TA-CACACC-A-TGAACGCAGCGG-TGG-A--------TAGTGGTACATTATACATTCTTTGTTCTT----ACT-ATG-AATA-A---GTTGA-ACAAGTTGACTTGGAT------T-GCCAAGCCTATCCTTCAAA-T--CATCAACGCCCCCCTTTATCCCT--ATA-ACTCGCACCGCTAGTTG--C--AGTGTCGCTTGTTC--CGATTAATG-TCGAA-TATTTTGTGGAAATATTTTA---AATCACTTCATAACAACGAAGCAGATC-GTCAGATTCTGTGGTGTCCT---TTACTTTCGAGTTGTTCGGTGAT--T-TCAAATGGGACCATACATTATGAAAATCATGATTGTTAATTGATATAAA-ACATCAATCTATATACTTTCAAATATATTTTGTTAGGTTTGCAACTGAGACACGTGCAAGA--------------TTTTTTCGTTGTTTTTTAAAAAATCCCCGTAACAGCCTATTTT--GAATCCA-AATTC-GCTAGTTGCTAATAGA--ATTTAGAATCAT-AGTC---TGCCAATATTTAGTGGGGCAACAGACTCATAGTGTCCATAAGGGATAAT-CACAC--ACTTACCTAGGAATGTTTG--GAGAGACA-ATGG-CTACAC---AATAGACACCAATTACAT-AGT-TT-ATCTATT-ATTAGA----ACCCAA---------------AGC-A--TGAATAA-T--TA--ATATCTT-CTTCA-AGAGCACCTTGTATGAGATTAATCAG
gi|1 : tttcaaactaccataccggaaaaACAAAAATATGCAT-TTAAATTT-----CCCCAA----CG-ACCAGAAACTTGTTACCTTAAGTTCAGGTTTTGCC-G-TTTTGGTGTTGTTCCAAACCCTT-GAAACCA-ATTAATCACTTTT--CAAT--T--CTCGAAAAA-GCGCCCT-GGATAATTT-T-AATTTC--AT-TGTGAGAAGAATTGTTGTAATATTGGGTTAGTAGAGCTCGGGGCAGAAA-TCAATAAG-ATATTGAATGCAGTCAATTGTCTCAGCATTGAAAACAACTCTCGTGATTTAAAGTTGTTTTAGTATAAAGCTGGGCTTTTAGAAGGGGCATTTTCACCGTGAGA-AT-T-CAATCTTTGAATTG-ACACCA-TTCTGGAATA-TGTAGCGG-AATAGTATATCCTGATATTCTGACTCTTTTAACAGCGCTGTTCAAGCTAGTTTAAGCTTT--TTAGT--ATGACAATCTTTTAAGGTA----------TAAGAG--------------GGGTCACT------TG---GTATGATCACTATTTCTGGAACCGCCAGCG-AC-TACTAACTACTT--TTT-GTTTTGTAAGGA-TCTCACTTTATTGCA---TT---TCCGGAG-----T-CAGT----------AAGGT-ATGGGAATTTCAAGTTGGTCCCTCGT-CCTTCGG-AATAT-TGA---AAGTATTTACAAACAGAAAGTTGATTTTGAAGAATTT-TCATCTTTAGTAAAGGTTGCTTGTA-GTAAT-AAGT----AAGATTCTCCAACCTGTTCTGA--AGTA-AA-CC-T-AGTT-C--TTTAAAAGC-ACAAGTATAA-A----GTAAA-CTTT--TAACAAACGGA-----AAGCACCATAGC-------TGT-A-ATC---AGTGTACTTT-T--GCTCTCT---TCT---G-TTAC----GCCTCTAC------TG----TATAA--CTTA-TTTACCCCCTTCTGTTTGCT-TCTCTCGTT---GACAGAAATTAAGGATAAA-AGTCCG--CTTTTTTCCAACGC-----TAAA----TGGTTAttattgcattttggggggtgttttggttcttttcattcttataaacaaaaatatgcatttaaatttccccaacgaccagaaacttgttaccttaagttcaggttttgccgttttggtgttgttccaaacccttgaaaccaattaatcacttttcaattctcgaaaaagcgccctggataattttaatttcattgtgagaagaattgttgtaatattgggttagtagagctcggggcagaaatcaataagatattgaatgcagtcaattgtctcagcattgaaaacaactctcgtgatttaaagttgttttagtataaagctgggcttttagaaggggcattttcaccgtgagaattcaatctttgaattgacaccattctggaatatgtagcggaatagtatatcctgatattctgactcttttaacagcgctgttcaagctagtttaagctttttagtatgacaatcttttaaggtataagaggggtcacttggtatgatcactatttctggaaccgccagcgactactaactactttttgttttgtaaggatctcactttattgcatttccggagtcagtaaggtatgggaatttcaagttggtccctcgtccttcggaatattgaaagtatttacaaacagaaagttgattttgaagaattttcatctttagtaaaggttgcttgtagtaataagtaagattctccaacctgttctgaagtaaacctagttctttaaaagcacaagtataaagtaaacttttaacaaacggaaagcaccatagctgtaatcagtgtacttttgctctcttctgttacgcctctactgtataacttatttacccccttctgtttgcttctctcgttgacagaaattaaggataaaagtccgcttttttccaacgctaaatggttaatatggaatttgttacaaataaggtttttacttt
gi|10 : tttcaaactaccataccggaaaaaaacagggtatgcaaaaaaccaatcaatcaatatcatttttatgtagtctctattgtgtacctttgtaatcgcaaacaacggtccattatagcgaccgtagtatttgcgaaatgatgatttaacgagaattcgttatatcaccctgcaacatcagactttttggtagtagttgcctcgcttttaaaaaatcatcatacgacatggcatgctcttgcgtatctgaatcaactgagagacatacacaccatgaacgcagcggtggatagtggtacattatacattctttgttcttactatgaataagttgaacaagttgacttggattgccaagcctatccttcaaatcatcaacgcccccctttatccctataactcgcaccgctagttgcagtgtcgcttgttccgattaatgtcgaatattttgtggaaatattttaaatcacttcataacaacgaagcagatcgtcagattctgtggtgtcctttactttcgagttgttcggtgatttcaaatgggaccatacattatgaaaatcatgattgttaattgatataaaacatcaatctatatactttcaaatatattttgttaggtttgcaactgagacacgtgcaagattttttcgttgttttttaaaaaatccccgtaacagcctattttgaatccaaattcgctagttgctaatagaatttagaatcatagtctgccaatatttagtggggcaacagactcatagtgtccataagggataatcacacacttacctaggaatgtttggagagacaatggctacacaatagacaccaattacatagtttatctattattagaacccaaagcatgaataattaatatcttcttcaagagcaccttgtatgagattaatcagttattgcattttggggggtgttttggttcttttcattcttataa--TGA-GCC-------T-TACATC-GTT-GA---T-CAG-A--------------T---A--AACA-GGTG---CT-TCTT-G------GTAT-AATTTA-GTATGTAA--AG--A-CC-GGCTTAACAA--TT-GG---AAT---GAAACGCTTCA--GA--C-AACAACCT-------AC--A--C--G-T---A--CCT-ACAA-GTTG-TATTTGCAAATGCA--A-AATAAACC-ATCAT-------AACGACC-A-TAGAATT-TG--TA--AA----------C------A-CGAGA--------TTGTA------------GAAA-C--T--C-----C--TGTTTG----TCAGT-ATCACGCCT-TGG-TTT-------AAGAC--TTTA-T--C-------A-CACT-CAGAATCT--G-----TTTTCG-------------C-AT-T-TC-TATT-GGATC-AGTTA-CATTTTGCAG-GAG-ACAA-AATCAC--C-A-TAA--ACA--AG-T-G-A--------AAATAG-A------ATA----------TT----GCT-ACA-T-GA-ATACA--GG-A-AA-TTGAC---GAT------G-GAAAAG--------TTAAAGC--AATC-TCGC------TTGT-CATCAAGA-AG-GG------TTGTTGT----AAT-----TTG--C--C-TTGAACG-TC-TA-TGTTCAGT-AAATTA-TCCA---AAT------------ATGAatatggaatttgttacaaataaggtttttacttt
gi|11 : gaacacgtcccggtaaCA-GG-TGG-C-------TAGAAGG-----A--------GTGAGTATC-----GC---CC----GA--T-CACAC-CTGC-CG--TTA-GCC-C-----T-GA--TC-T---TG---A-TCA-G-G------------T------AACGCAA-G---TA-ATCC-G----TAGTCA-AA-CTCAGTATGCAA--AC--G-GATATC-GAAC--AATC-GGTA-AA-----AAGC--ATTA--G------GCG---T-------TTG-G--T--C-C---A--TTGTATAA-CTTG-TATCTGTAAA--TA--A-GAT----C-ATT
gi|12 : tttactcagtatacacatgtatatgtctttgaagtcggttatgatgttcaatgcaacgacatcggtatacatgtacttcaaacgaactacacgtttaccgtgacatcaaagtaaatatatgtttagcggactttttttctgcctatatatagttacggcactggatttcttatgaacaagtgaaaattacgaacagtgactaatctcttagatcctaaattaaaagtactagtatacaaacaaagatccctagccaagATCATGAAG---TGACG-TCTTAACA--GC----------AG-------TTA--CTAGT--A-G--------------GA----------T-AGAG--------------GG-----C------TGCGGGTA-GAGC-C--TTAGTG-AA---CCAGCG-ATGTAA-------TCATTCT-G-TTTG-AAGGAGTTTT---TTA-TGCA---T------CGAAAAAAAATCCAAT-ATAAAAAACAAGGT-ATGGTAA-TTTCAATTGAT-CCTGATGTCTTTGGAAA-ATATGAAGCAAATGTTT--AAACA-AAAGGTGGATTTGAAGAA-GTATCACT-TTAGT-CAGATGTCTTGGA-GTA-A-GATT----AGTATT-CCAAATGAC---TGA--AGTG-AATCC-T-AGTTAC-AGTTAAAAGGCATAAGTAT-GTA-----T-GA-CTAT--TTATCAAC--AC----AAG----ACAAA-------TGTGA-ATC---ACTTGGCTTTATCAGCTG-----AACT---A-TATCAA-AGTTTTCATG-----TGCGTCTTTAA--C-CA-TTTACACACGTC-----GCTCTG-----TAAA-GACAG-----AAGGCTA
gi|13 : tccGTTTTT----TGATATATCC-CCATC--GGTA-TG-ACACCA-TTCTGGAATAATGTAGGTG-GACAGTATCTC-TGAAA---AGACTGTTTTAACA--GCTGTTTAG--TAG-------TTT----AGTTTA-GAT-------TAAGGAAGAGGCTTGGTT-AGAGCACTTACTTGAACTAG-----CATATATTG---GTA-GAGCAC--TTACTGGAA---C-AGC--ATATA--------TC--TTT-G-TT-GTAAGGA-ATTG---TTA-T-TG---TTAATT-CG-AA-----TCCAGTTA--------AAGGTCATTGTAA-ATCAAATTGAT-CCAGAT-TCTTCGGAA-TAT-TGA---AAGTATT--CAAACAGAA-GGTGAATTTGAAGAA-TT-CTATC-TTAGT-CAGATTGCTTGGAGGTATATAAGT-----AGATTCCCAGATGCT---CGA--AGTA-CACCCTT-AG-T-C-ATCTTAAAAG-ACAAGTACAG-A----GT-CAGCTCTAGTTACAA
gi|14 : agtgtagaAAA--GGCAAA-GATA----A-CGAACA--GTGATCAATCTCGTAA-----------------G-TCCTAAAT-A---GA------AT--A--CAAAA--ACAAGA-GTC-GGGCAATC-AC---GGA-C----CCC-T---GGACAC-A----C--CAG-A-A-G--TGG-GA-TCA-GG-TGC-C-------TAGGGGG-----A--------GTAAGCACC-CCCTGTTGACC----GG--T-CACAC-CCGC-CG--TGA-GCC-C-----A-TA-GTC-T---TG---A-TCA-G-G------------T---A--AACG-GA-----------C-A----TC-----AGT----GTGTGAAA--A---A-CG-G-CTTAAC--AATG-GCT---AT---GAAACACATCA--GA--C-AGCA---T-------TTG-A--C--T-C---A--ATG-ATAG-GTCA-TATTGGTAAA--CT--A-AAT----T-GTTAC-------AACGACC-A-TAGAATT-TA--CG--AAATGCTGC--ATTTA--AA-CGTGACT---G--TTGAA------ACCCCTGCAA-CA-TACCG-A--C--TTTT
gi|15 : ggatgtA-C----CTC-T---A-ACAA-A----GG-CGA-A-G-G---AG-GG-TCA-GG-TGC-C-----A--GGAGG------A--------GTAAGCATC-CTCTGCTGACC----GG--T-CACAC-CCAC-CG--TGA-GCC-C-----T-TA-GTCGG---AA---A-TAA-G-G------------T---A--ataaatcatgcactttcttttcaaagtacatgtatatttgcacatgaaat
gi|15 : caaatAAATAAGGTA---T---GAACAAAATCA--GT--C-AACA---T-------ATGGA--CCTT-T---A--GTG-ATAA-TTTG-CAA-CGCAAA--CA--A-GGT----C-ATTAT-------ACCGACC-ATTAGAATT-TG--CGAAAAATGATG---ATTTTTAAA-CGAGATTTC-G--TTATA------A--CCTGCAA-CATT--CA-A--CTTTTTTTGT---TTAGC-AGTTAGCCTAAGC-TTT-------AAAAA--ATCTTT--C-------ATTACG-CG-----G--A-----CAT--G-------------CTCT-T-GC-TATC-GAATC-A---A-CT---TGC-G-GAGTAAAT-TA-CACATC-A-TAA--GCA--GGATGG-A--------TAGTGGT-------GTA----------TT----ACT-ACtgaacaaaatcagtcaacatatggacctttagtgataatttgcaacgcaaacaaggtcattataccgaccattagaatttgcgaaaaatgatgatttttaaacgagatttcgttataacctgcaacattcaactttttttgtttagcagttagcctaagctttaaaaaatctttcattacgcggacatgctcttgctatcgaatcaacttgcggagtaaattacacatcataagcaggatggatagtggtgtattactacttctttcgttacttggataattttattgaacattgac
gi|16 : caaatacctctaacaaaggcgaaggagggtcaggtgccaggaggagtaagcatcctctgctgaccggtcacacccaccgtgagcccttagtcggAAAT-GGCGAA-G-TA----A-CAATTAAAGTATCAAA---CGTA-T------CATA------G-TCCCCAAA-A---CAC-----AT--A--CAAAA--TCGAGT-GTA-GG-CAA-T-AC---GGA-C----CTT-C---G-ACAA-A----AG-CGA-A-AAG--CAG-GAATCAAGG-TGC-C-----A-TGGA-GG-----A--------GTAAGCATC-CTCTGCTGACC----GG--TCCACAC-CCGC-CG--TGA-GCC-C-----T-TA-GTC-G---AA---A-CAA-A-G------------T---A--AACG-GG-G---TT-ACCC-G----TCGTCA-AATCTAG--ACGAAA--AT--GACA-GCCTAACTAACAAG-GGTATAA-----AAACAAATCA--GT--C-A--A---T-------ATG-A--C--T-G---A--GTG-ATAA-TTTG-TAATCGCAAA--CA--A-GGT----C-ATTAT-------AGCGACCGG-TAGAATT-TG--CG--AAATGATG---ACTTTAAAA-CGAG-ATTCAG--TTATA------A-CCCTGCAttctttcgttacttggataattttattgaacattgac
gi|17 : taA-T-AAGAAA-----CCC-A---------------AGC-A--TG--CTCAT--TA--ATATCTAACTTC--AGAGTA-CTTGTGTGGG--CAATCAGAG--GGTTTTCAACAAAATATGTGTCTTG--TTT------CCCAA----CG-ACTAGAAATTCG-TA--TT---TTCGGGT---GCCGG-TTTT----TTGTT---------TAAAAAGCA-ATTA--------TTATAAT------T-GAAAAAGGC---CTAAGAT---TT-TAA-CTTT--AT-CG---GAGGAATCGTTGT------------GTAAAGT---GTGGAGAAA-TC--TACGTTT-TTGA-TGCAGTCAATT
gi|18 : aatcgaccaattgttgctaccatatgttttcctaatg---GGA-C----CTC-C---A-A-AA-ATTATAG-AGGTA-G-G--CAG-GA-TCA-GGGTGC-C-----A--GGAGGATCGTAA--------TTGAGCATC-CTCTGCTGACC----GATCT-CACACACCGC-CATCTGA-GCC-T-----TGTA-GTT-C---AA---A-CAA-A-GC-----------T---A--AACG-GG-GATTCT-ATCC------TCGTCA-AATCT-AGTACGAAA--AT--G-AA-GGCTAAACACAA-G-GGTT-ATT---GAAACAAGCAG--GT--C-AACA---T-------ATG-A--CT-T-T---A--GTG-ATAA-TTTG-T-ATCGC-AA--CA--A-tttgaaaattcttgtatt
gi|19 : gcaaacataaaatgttatgtagattattatcgT------CATA------AATCCCATAA-A---GA------AT--A--TAAAA--C-------TA-AGGCAAAC-AC---GAA-C----CCT-T---G--CAT-AT---AC-CGG-A-G-G--TGG-GA-TCA-GG-TTT-TTTTTAA-AAGAGGG-----A---------TAAGCACC-CCTTGTTGACC-----G--T-C-CAC-TCGC-AT--TAT-ACC-C-----T-CT-ATC-T---TG---A-TCA-G-G------------T---A--AACT-GA-G---TA-ATCT-G----T----A-GGTC-AAGAACGAAA--aat
gi|2 : ttagatactgttggagacaatattggttgctcaccgaaagaatgaaaagtgaagataacgtaacagtgatccatcAAAT-GGCGAA-G-TA----A-CAAA----GTAT-AAA---CGTAAT------CATA------G-TCCAAAAA-A---CA------AT--A--CAAAAA-TCGAGTTGTAAGGGCAA-CCAC---GGAAC----CTT-C---G-ACGA-A----AG-CGA-A-G-G--CAA-GG-TCA-GG-TGC-C-----AATGGAGAG-----A--------GTAAGCATC-CTCTGCTGACC----GG--T-CACAC-CCGC-CG--TGA-GCC-T-----G-TA-GTC-G---AA---A-CAA-ATG------------T---A--AACG-GG-G---TT-ACCC-G----TCGTCA-AATCTAAGTATGAAA--AT--G-CA-GTCTAAACAAAATG-GGTA-AAT---GAAACAAATCATGGT--C-AACA---T-------ATG-A--C--T-T---A--GTG-ATAC-TTTG-TA-TCGCAA---CA----GGT----C-ATTAT-------AGCGACC-G-TAGAATT-TGTGCG--AAATGATG---ACTTT--AA-CGAGAATTC-GGTTTA-A------A-CCCTGCAA-CA-TA-CA-A--C--TTTTTGG---TTAGT-AGTTGCCCT-CG---TT-------AAAAA--ATC--A--C-------ATTACG-CA-----T--G-----CAT--G-------------C-CT-T-G-GTATC-GAATC-----A-C----CG--A-GAG-ACAT-TA-CACA-C-A-TAAT-GCA--GT-G-G-A--------TAGTGGTA------ACA----------TT----ACTAACA-AAAA-A---A--GG-A-AAAGTGAC---AAT------T-GGCAAG--------TCAAAGTCCCATCAACGT------TTAT-CAT--ATATA--TG------T-GTTTTGC--AGTC----CTG--C--C-ATTAGAG-TC-AA-TATTA--T-AAAATA-TCC----AAT------------ATGAAGCACATTGGTCAGATTCTGTGGTGT-CT---TTA-TTTCAAGTTCGTCAG-GATAATATCAAAATGGA-CATA-ATTGTG-AAATTATGATTGTTAATGGAT---AA-ACATC-GTCTATATACCT----ATA-----AGTAAGG-TTG-AA---GGACAC-TGCAAG---------------TTTT----TTGTTTTT------A--CCCG-AACAGTTT-TCCTGAAA---CA-AATTCTGCT--TTCAT-ATGGAATATATAAAA--ATAAGTC---TGCCAATA---AG-GGGGC-AAC-AT---TAGTACCCAT-AGGAA--AC-CA-AC--A---------GAATTGTTGGAGA-AGACGGAT-GTCACTCCAAAAA-AGAC------TACAATAATATTAATCTA-TAAAGCAA----ACCC-A---------------AGCAA--TG--CTC-T--TA--ATATCTTTCTTC--AGAGTA-CTTGTGTGGG--CAATCAGAGTGGGTTCTGACAAAAATATGTATC-TG--TTT-----CCCAAA----TG-ACCAGAAACTTGGTA--TT---TTCGGGT---GCC-G-TTTT----TTGTT---------C-AAAAGCA-ATTA--------T--CAAT--TTCCT-GAAAAA-GC---CT-AGAT---TT-T-A-TTTT--ATCCGT--GAGGAATTGTTGTA------------TAAAGT--GGTGGAGAAATTCA-TATG-TT-TTGA-TGCAGTCAATT---------TTAGAA--AAATCTCGTGATTGAA----GTTTTC-TATAAAGCT----CTTTAGAG-------TTTT----TGAGA-ATCCACAATC--TGAA-TGAACACCACTTCTGGAATA-TGTAGTGGAAACAG--TATCTTGAAG---TGAC--CTTTAACA--GCTGTT-AG--TAG-------TTTTGTTAGT--A-G---------TAAGGGA----------T-AGA---------------GG-----C------TG---GTA-AGGCAC--TTACTGGAA---CCAGCGAATGTA--------TC--TTTGG-TTTGTAAGGA-TTTC---TTA-TGCATATTT---T-TGGAA-----TCCAGT-A--------AAGGT-ATGGTAA-TTCAAATTGAT-CCTGAT-TCTTCGGAAATAT-TAA---ACGTATTC-CAAACAGAAAGGTGATTTTGA--GA-TT-TCATC-TTAGT-CAGATTGCTAGGA-GTATA-AAGTCAGGAAAATTCCCAGATGTG---TGA--AGTA-AACCC-TAAGTT-CAATTTAAAAAG-ACAAGTATAATA----GT-GA-CTTT--ATACAAAC--A-----AAG----ACAAG-------TG-----TT---ACTGTGCTTTAT--ACAGCCTGGAACC---AGTAACAA-AGTTTTCATGTAGTCTA----TGTAA--CTCA-TTTACCCCCTTCTG---GCT-TC-----TTAA-GACAG-----AAGGGTAAATAGT-AG--ATTTTCCC---CGC-----TAAA----TGGTTATAACGGGATTTTAAATAATTTCCGAA-TACTTTTGATCA-TTCAGACAAAGTGTCAAGAT-CTCTCCCTtaaatgttgatgcatt
gi|20 : TA------A-TCCCAAAA-A---CAT-----AT--A--CAAAA--CCAAGT-GTA-GGGCAA-C-AC---GGA-C----CTC-C---G-ACAA-A----AG-CGA-A-G-G--CAG-GA-TCA-GG-TGC-C-----A-TGGA-AG-----A--------GTAAGCATC-CTCTGCTGATC----GG--T-CACAC-CCGC-CG--TGA-GCC-C-----T-TA-GTC-G---AA---A-AAA-A-G------------CATGA--AACG-AA-A---TC-A-----------GTCT-AA-CTA--TAC-ATG--AC--T-TA-GT---GATAATATG-CGT--AATCTGGAAACAAGTCA--TTTGC-GAAA---TG------ATG-A--C--T-T---ca
gi|21 : aaatataaataggcgaagtTATTAAA---AGTAATTAGTAACATA------G-TGCCAAAA-A---CAT-----AT--ATACAAAA--ACGAGT-GCA-GGGCAA-G-AC---GGA-C----CTT-C---G-ACAA-A----CG-Ctaaattgagtattcgttat
gi|21 : cC-C-----T-TC-GAC-A---AACGCA-CAA-A-A------------T---A--AACA-GG-G---TA-GCCC-G----TCGTAA-AATCTT-GTACAAAA--ATAAG--A-GTCTGA-CAAA--G-GGTA---C---GAAACAGATCA--GT--C-AACA---C-------ACG-A--C--T-T---C--GTG-ATAA-TTTG-TAGTCGCAAA--CA--A-GGT----C-ATTAT-------AGCGACA-G-TAGAATT-TG--CG--AAAGGATG---Aacaaaataaacagggtagcccgtcgtaaaatcttgtacaaaaataagagtctgacaaagggtacgaaacagatcagtcaacacacgacttcgtgataatttgtagtcgcaaacaaggtcattatagcgacagtagaatttgcgaaaggatgat
gi|22 : ctattaaaagtaattagtaacatagtgccaaaaacatatatacaaaaacgagtgcagggcaagacggaTATC-TAATC-A---A-C----TG--G-GAG-ATATGCA-TAC--C-A-TTT--GCA--AG-G-G-A--------TAGTGGTA-------TA----------TT----ACT-ACA-AAGACA---G--GG-A-AAGCTGAT---GAT------T-GCATTT--------TTAAAGT--CACC-AAGC------TTAT-CAT--ATA-A--TG------TAGCTGT-A--AGT-----CTG--C--C-ATTAGAG-CC-AA-TATTAAGT-AAAATA-TCCA---ACT------------AAGAAGCAGATTTGTCAAATTCTGTGGTCTCCT---TTA-TTTTGAGTTCGTCGG-Gt
gi|23 : A-A----CG-CAC-A-G-G--CAG-GA-TCA-GG-TGC-C-----A-TGGAGG------A--------GTAAGCATC-CTTTGCTGACC----GG--T-CACAT-CCGC-CG--TGA-GCC-G-----G-TA-TTC-G---AA---A-CAA-A-A------------T---A--AACA-GG-G---TA-ACCC-G----TCGTAA-AATCT-TGTACGAAA--ATAAG--A-GTCT-GACAAA--G-GGT---AT---GAAACAGATCA--GT--C-AACA---C-------ACG-A--C--T-T---C--GTG-ATAA-TTTG-TAGTCGCAAA--CA--A-GGT----C-ATTAT-------AGCGA
gi|24 : AAA--GGCAAA-GATA----A-CGAACA--GTGATCAATCTCGTAA-----------------G-TCCTAAAT-A---GA------AT--A--CAAAA--ACAAGA-GTT-GGGCAATC-AC---GGA-C----CCC-T---GGACAC-A----C--CAG-A-G-G--TGG-GA-TCA-GG-TAC-C-------TAGGAGG-----A--------GTAAGCATC-CCCTGTTGA
gi|25 : cactgtgataaatggtagtattaatgtTGTG---TGATAAGTATAACCC-T-AGTT-C-ATTTATAAAG-ACAAGTATAATATTTTCT-GG-CCCC--TAACAAAA--AAATTCAAG----ACAAATTGACTTTGTAACATCTTAACTCTGTTTCA---ACTGTC-----CTGTAA-TAGCAATAGTTCTCTCG-------------TAAGGCTCATTTTAC-CACTTCTG---a
gi|26 : AATT-TG--CG--AAATGATA---A------GA-C-AGGATT--------TA------A-GGCGACAA-CA-A--TA-A--AAATTTTTAGAATTTAGTCAGT-GGCCT-CGA-CCTGATAAGAAAAAA--ATA--T--CAAAAAATA-TACG-CA-----C--GTGGTATAT--GAC-----------C-CTCT-GCGCGAC-GAATC-A---ATC----TG--ATGAG-ACGA-TA-CA
gi|27 : -GGCGACTG-TA----A-CAAC---------------CGT--T------CATA------A-TCCAAAAA-AATGTAT-----AT--A--CAAAAA-TCGAGT-CGA-GAGCAG-C-GCACTGGA-CACATCTT-CTGTA-ATAA-A----AGCCGA-ATG-GTTTAGTGA-T---AG-TTT-T-----A-TTGAGAG-----AAGAAAATGGTAAG------TCCACTAACC----AG--T-CA
gi|28 : TGTCAGTGTCTGTGGTGTCCTGAATTA-TATTAAGTTCTTCGC-GAT-ATATCAAA-TGGA-TATA-ACTGTGAAAATTATGATTGTTAATTGAT---AGCACATC-ACC
gi|28 : CAC-CGCAAG---------------TTTT-----TGTTTTT------AT-TCCGTAACAGGTT-TTG---AA---CA-AATTgcaagtttttgtttttattccgtaacaggttttgaacaaatt
gi|29 : tgtcagtgtctgtggtgtcctgaattatattaagttcttcgcgatatatcaaatggatataactgtgaaaattatgattgttaattgatagcacat--CTCA-TT---ACACTTCTG---GCT-TT-----TTAAAGACA-------AGGATAAATAGTACGCCATTTTCCT---CGCGCGCTTAAAGTTTTAATTAC----GGATTTT-AATTACTTCCGAATTAATTTTGATCATTTCAGACAAAGTATTCAACTCCTCTCCC
gi|3 : AAAT-GGCGAA-G-TACA--A-CAAT----GTGTTAAA---CGTAA-------AATA------G-TCCCAAAA-A---CATGT---AT--A--CAAAA--TTGAGT-GTA-GGTCAA-C-AC---GGA-C----CTC-C---G-ACAA-A----AG-TGA-A-G-G---AG-GA-TCA-GG-TGC-C-----A-TGG-GTG-----A--------GTAAGCATC-CTCTGCTGACG----CG--C-CACAC-CCGT-CG--TGA-GCC-C-----T-TA-GTC-G---AA---A-CAACA-G------------T---A--AACG-GG-A---TT-ACC--G----TCGTGA-AATCTA-GTACGAAA--AT--G--A---CTGA-CAAA--G-GATA---T---GAAACAAATCA--GT--C-AACA---T-------ATG-A--C--C-T---G--GTG-ATAA-TTTG-TAATCGCAAA--GA--A-GGT----C-ATTAT-------AGCGACC-G-TATAATT-TG--CG--AAATGAT----ACTTT--AAATGAGA-TTC-G--TTATACCGTTAA-CCCTGCAA-CA-T--CA-------TTTTTGG---TTACT-AGTTGGCCT-AGC-TTT-------AAAAAT-CCC--T--C-------A-TACA-CA-----T--ATGC--CAT--GTGTTGGATATAGCC-CT-T-GCGTATC-GAATC-A---A-C----TG--A-GAG-ACAT--A-CACA-CCA-TAA--GCA--GG-T-G-A--------TATTGGTA-------CA----------TT----ACT-ACA-TAGA-A---AA-GG-A-ATGTTGAC---GATA-----T-GCAAAG--------TCAAAGT--CATC-ACGT------TTAT-TAT--ATA-A--TG------TA--TGT-C--AGT-----CTG--CATC-ATTAGAG-TC-AAATATTAAGT-AAAATA-GCCA---AAT------------ATAAAGCAGATATGTCAGATTCTGTGGTGTCCT---TTA-TTTCGAGTTCGCC-A-AAT-ATAT--AAATGGA-CATA-ATTGTG-AAATT-TTATTGTTAATTGATA--AG-ACATC-GTTTATATACCC----ATA-----TGTAAGG-TTG-AA---GGACAC-GGT------------------TTTT----TTGTTTTT------AT-CCTGTAACGTTTT-TTTT--AA---CACAATTCTAC---TTCAT-AT-GA--ATATAAAA--ATAAGTC---TGCCAATA---AG-AGGAC-ACA-AT---TAGTGTCCTT-AGGAAT-AC-CA-AC--A---------T-ATTGTTG--GA-AGAC--ATGGTTTCT-----AA-AGAC------TACATAAATATT-GTCCA-T-AAGAAA----ACCC-A---------------AGC-A--TG--CTC-T--TA--ATATC-TACTTC--AGAGTA-CTTGTGTGGG--CAATCAGAGT-GGTTCTGAC-AAAACATGT
gi|30 : ctattaaacctgacacaatacatctgctagtcatctgggactgatgtttatatatc------ACA----------TTGTTAACT-ACA-TAAA-A-------G-A-AA--T--------T------T-GCAAAA--------CTCAAGT--CATC-ACGT------TTAT-CAT--ATA-A--TGT-----TAGTTGT-CCAAGTC----CTG-----C-ATTAGAGATT-AA-TATTAAAG-GAAGTG-TTCATGGAAT------------A
gi|31 : T-CA-CAC--C-A-TAA--GTA--GG-T-G-G--------TAGTGGT-------ATA----------TT----ATC-ACA-TTGA-A---A--G--------------------------GCAAAG--------TTAAAGT--CATC-TTGC------TTAT-CAT--ATA-A--TG------CAGTTGT-C--AGT-----GTG--T--C-ATTAG
gi|32 : cttatCAT-T--CAC--C-A-TAA--GCA--GG-T-GGA--------TGGTGGTA-------TA----------TT----ACT-ACA-TAGA-A---A--GGGA-AAGTTGAC---GATAGCCGATAGCAAAG--------TTAAGGT--CATC-ACGC------TTAT-C
gi|34 : tatcctCAATA---AG-GGGGC-ACA-AT---TAGTGCCCGT-TGGAAT-AT-CA-AC------------GGATTGTTA--GT-AGAC--ATGG--TCTCC---AA-AGAC------TACACAAATATT-ATTTA-T-AAG
gi|35 : GA-GCC-T-----T-TA-GTC-G---AA---AACAG-G-GAGGGGGGGCGGTT---ACGAGCG-GA-G---TT-ACCCTG----TCGTCAGAATCT-AGTACGGAA--A---G--A-G--TGGACAAA--G-GGTA-ctaa
gi|36 : A-GG-T-C-C-----G-TGAATGA-----A--------GTAAGCATCTCGTTGCTGATCCGAGGA--T-CACAC-CCAC-CG--TGA-GCA-A-----T-CA-AGA-G---AA---A-CAG-A-tg
gi|37 : gatggatggtcgCCCAACATA---CATGTATAAT--A--CAGAG--TCGA-T-GTA-GA-CAA-C-AC---AGA-C----CTAGT---A-ACAA-A----AGGCGA-G-G-G--CAG-GA-TCA-GG-TGC-C-----A-TG
gi|38 : cc--ATTTTCCC---CGC-----TAAA----TGG----------ATTTT-AATCATTTCCGAA-TATTTGTATCCA-TTCAGACAAAGTGTCAAGCTCCTCTCCCT
gi|39 : gcAAAT-GGCGAA-G-TATTTTA-CAAT----GTGTTTAA---CATAAT------CATA------G-TCCAAAAA-A---CAT-----GT--A--CAAAA--TCGAG
gi|4 : tttgttataAAATTGGCGAA-G-TA----AACAAT----GTGTTAAA---CGTAAT------CGTACATGTAG-TCCCTAAA-A---CAT-----AT--A--TACAACTTCGAGT-GTA-TGGCAA-C-AT---GGA-C----CTC-C---G-ACAACA----GG-CGA-A-G-C--CAG-GA-TCA-G--TGC-C-----A-TGGAGGG-----A--------GTAGGCATC-CTCTGCTGACC----GG--T-CAC-C-CCACACG--TGA-GCCTC-----G-TA-GTC-G---AG---A-CAA---G------------T---A--AACA-GG-G---TT-TACC-G----TC---------TAC-TACGAAATGAG--A-CA-GTCTAA-CAA---G-GGTA---T---GAAACAAATCA--GT--C-AGCA---T-------ATG-A--C--T-T---A--GTG-ATAA-TTTGGTAATCGCAA---CA--A-GGT----C-AT-AT-------AGCGACC-G-TAGAATCCTG--CG--AAATGCTGCGGACTTTGAAA-CGAGAACTC-G--TTATA------A-CCCTGCAAACA-T--CA-TTTC--TTTTT-----TT-GT-AATTGAC-T-CGC-TTT-------AAAG----TC--CTGC-------G-TCCG-CA-----T--GA----TAT--A-------------C-CT-TTGCGTATC-GAATC-A---A-C----TG--A-GAG-ACAT--A-CACA-CCA-TAA--GCA--GG-T-G-A--------TAGTGG-A------ACA----------TT----ACT-ACA-AAGA-A---A--GGGA-AAGTTGAC---GAT------T-GCAAA--------------GT--CATC-ACGT------TTAT-CAT--ATA-A--TG------TAGTTGT-C--AGT-----CTG--C--C-ATTAGAA-TC-AA-TTTTAAGT-AAAATA-TCCA---AAT------------ATGAAGCACATCTGTCAGATTCTGTGGTGTTCT---TTA-TTTGGAGTTCGTCAG-GAT-ATATC-AAATGGA-CATA-ATTATGAAAATTATGATTGTTAATAGATC--AG-ACATC-ACCTATATATCTAC--ATA-----TGTA
gi|41 : actatcttatccgaatgacatcaaagattacttgaacgattgtctgtactgcaatat---AG-ACATC-ATCTATATATCT----ATA-----TGTAATG-ATG-AA---GGACAC-AGTAAG---------------TTTT----TTGTTT
gi|42 : AAAT-GGCGAA-G-TA----A-CAAA----GTATGAAC---CGTAAT------CATA------
gi|44 : AAAT-GGCGAA-G-TA----G-CAAA----GTATTCAA---CATAAT------CATA------A-Tcgtacacagataaaccata
gi|46 : cgcacatttataTTTTGG---TTAGT-AGATGGCCT-CGC-TTT-------AACAA--ATC--
gi|47 : A-A---G--GG-G-AAATTGAC---AAT------T-GCAAAG--------TCAAAGT--CAT
gi|49 : A---AAT------------ATGAAGCACATCTGTCTGATTCTGTG
gi|5 : AAATTGGTGAA-G-TA----AACAAT----GTGTTAAT---CGTAAT------CATA------G-TCCTAAAA-A---CAT-----ATTTA--CAAAG--TCGAGT-GTA-GGGCAA-C-AC---GGA-T----CTC-C---G-ACAA-A----AG-CGA-A-G-G--CAG-GA-TCA-GG-TGC-C-----A-TAGAGG------A--------GTAAGCATC-CTCTGCTGACC----GG--T-CACAC-CCGC-CA--TGA-GCC-C-----T-TA-GTC-G---AA---A-CAA-G-G------------T---A--AACA-GG-A---TT-ACCC-G----TTGTCA-CATCT-AGTACGAAA--AT--GACA-GTCT-AACAAAA---GGT---AT---GGGACAAATCA--GT--C-AGCA---T-------------------------------TAA-TTTA-TAATCGCAAA--CA--A-GGT----C-ATTAT-------ACCGACT-G-TAGAATT-TG--CG--ACATGGTG---ACTTTA-AA-CGAGAA-TC-G--TTATA------A-TCCTGCAA-CA-T--CA-A--C--TTTTTAG---TTAGT-AGTTGGCCT-CGC-TTT-------AAAAA--GTCT-T--C-------A-TACG-CA-----T--GA----CAT--GT------------T-CT-T-GCGTATC-TAATC-A---A-CTGCATG--G-AAA-ACAT-T--CACACC-A-TAA--GCA--GG-T-G-ATACATTTGTAGTGGT-------ACA----------TT----ACT-ACA-
gi|6 : tatactctatatgataatatatgtcttctgaaaccgcttttacatgtttctgtgttggcgacatcggtattttgggctttttcaaaagtttggcttatatttaaaaagttttcttttcatgaatgcatttttttctgtatttttttttattgtatgtagtaaaagatatT-GGCCAA-A-TA----AACAAT----TTGATAAT---TGTAAT------CAAA------A-CCCCAAAA-----CAT-----AC--A--CAAAG--TCGAAT-GTA-AGGAAA-C-AC---AGA-C----CTC-C---G-ATAA-T----AG-CGA-A-G-G--AAT-AG-TCA-GT-CG-----------------------------------GCATC-CTCTGCTGACC----GG--T-CACAT-CCGC-CG--TGA-GCC-C-----T-TG-GTC-G---AA---A-CAA-A-G------------T---A--AACG-GG-A---TT-ACCC-G----TCGTCA-AATCTA-GTAGGAAA--AT--GACA-GTCTAA-CAAA--G-GGTA---T---GAAACAAATCA--GT--C-AACA---T-------ATG-A--C--T-T---A--ATG-ACAA-CTTG-TAATCGCATA--CA--A-GGT----C-ATT---------------------------TG--CG--AAATGGTG---ACT----------------------GTA------G-CCCTGCAA-CA-T--CA-------TTTTTTG---CTAGT-AGTTGACCT-CGC-TTT-------AAAAA--GTCC-T--C-------G-TACG-CA-----T--GA----CAT--G-------------CTCT-T-GCGTATC-GAATC-A---A-C----TG--G-AAG-ACAC--A-CACA-C-AATAA--GCA--GG-T-G-A--------TAAGGGTA-------CA----------TT----ACT-ACA-TGAA-A---A--GG-A-AAGGTGAC---GAT------T-GCAAAG--------TTAAAGT--CATC-ACGC------TTAT-CAT--ATA-A--TG------CAGTTAT-C--AGC-----CTA--C--C-TTTAAAG-TC-AA-TATTAAGT-AAAAAA-TCCA---AAT------------ATGAAGCAGATATGTCAGATTCTGTGGTGTCCT---TTA-
gi|7 : atagatTGTCAGATT--GTGTTGTC-T---TTA-TAT-GAGTTT-TCGG-GAT-AT-TCCAAAT------TA-AT----------GCCCTTGTTA-TTGAT---AGCAGAT--ATCTATAT-CCT----ATA-----TATAAGG-TTG-A-----GACAA-AGCAGGGAGTTTTTTTTTTTTTTTT----TTGTTTTT------AT-CCCGTAA-AGTTT-TTGT--AG---CA-AATTCTGC---TTCAT-ATGTA--ATAT-TCA--GTAAGTCTGGTGCCAATA---AA-GGGG---CA-AT---TAGTGCCACT-AGGAATGACGCA-ACGGA---------GAATTGTTT--GATCGAC--CT-GTCTCTCC----A-CGAC------TACATAAATAAT-TTCTG-T-AAGAAACTCTACTC-ATCATGATGTCATGTTATC-ATTTG--TTC-TAATAATATATCCTACTTCAGAGAGTA-CT--TGTGGG--C-ATCAGAGT-GTTTTTTAAACAAATATGTGTCTTG--TTTTTCCGCCCCAATCCCCGAACTAGAAA--TATTA--TT---TTCGGGG---GTC-ATTTTT----TTGTT---------T---AACCACATT---------T--CGATAAT--CT-GAAAAG------CT-AGAT---TTAT-A-TTTTTAAT--GTGAatactggcgtcaaagctcaaaattcttggagcgggaataataaaatatatt
gi|8 : taagatataaaacggtcagctactaaggattgtgtggtgAAAT-GGCGAA-G-TA----A-CAAA----GTATGAAA---CGTAAT------CATA------G-TCCAAAAA-A---CAC-----AT--A--CAAAA--TCGAGT-GTA-GGGCAA-C-AC---GGA-C----CTT-C---G-ACGA-A----AG-CGA-A-G-G--CAG-GA-GCA-GG-TGC-C-----A-TGGAGG------A--------GTAAGCATC-CTCTGCTGACC----GG--T-CACAC-CCGC-CG--TGA-GCC-T-----G-TA-GTC-G---AA---A-CAA-A-G------------T---A--AACG-GG-G---TT-ACCC-G----TCGTCA-AATCTA-GTATGAAA--AT--GACA-GTCTAA-CAAA-TG-G-TA---T---GAAACAAATCA--GT--C-AACA---T-------ATG-A--C--T-T---A--GTG-ATAC-TTTG-TAATCGCAAA--CA--A-GGT----C-ATTAT-------AGCGACC-G-TAGAATT-TG--CG--AAATGATG---ACTTTA-AA-CGAG-ATTC-G--TTATA------A-CCCTGCAA-CA-T--CA-A--C--TTTTTGG---TTAGT-AGTTGGCCT-CGC-TTT-------AAAAA--ATCA-T--C-------A-TACG-CA-----TG-G-----CAT--GC------------C-CT-T-GCGTATC-GAATC-A---A-C----TG--A-GAG-ACA--TA-CACACC-A-TAA--GCA--GG-T-G-A--------TAGTGGT-------ACA----------TT----ACT-ACACAAAA-A---A--GG-A-AAGTTGAC---AAT------T-GCAAAG--------TCAAAGT--CATC-ACGT------TTA
gi|9 : ggcatataCCCCAAC-A---CAT------T--A--CAAAT--TCGC-T-GTA-AG-CAA-C-CG---GGA-C----CTC-C---G-ACAA-A----AG-----A-G-G--TAG-GA-TCA--G-TGCAC-----A-TGGGAGG-----A--------GTAAGTTTC-CTCTCCCGAC------G--T-CACAC-CCGCGCA--TGACACC-CCCAAAT-TA-GAT-GACCAA---A-C-A-A-G------------T---A--AACG-GG-GA--TTAACCC-GGGTTTCA--A-AAT---AGTACGAAATGAC--A-CA--TCT-AACAAA--G-GGT---AT---GAAACAAATCA--GT--CAAACA---T-------ATG-A--C--T-TGCGG--ATG-ATAA-TTTG-TAATCGGGAA--CAACA-GGT----C-ATTATTTCGATAAGC-ACC-GCTAGAATT-GC--CG--A----------------------AGAATTC-G--TTATT------A-ACCTACAA-CA-TA-CA-A--C--TTTTTTG---TTAGT-AGTTTGGCT-CCC-TTT-------AAAAGCCCTC--C--C-------A-CACG-CA-----CGAG-----TAT--G-------------C-TC-T-GCGTATC-GAATCAA---A-C----CG--A-GAG-ACAT-
5 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|33 ): GTTTTTGCGTTGGTGACATCAGAATTTTGGATTTTTTCAAAACTTTGGCAGTGACTGGCTTATCATATTTAAAAAGTTTTCTTTTCATGAATGCATTT
Unaligned ( gi|40 ): TTAAAAGTGAAGATAACAAACAGTGATCTATGTCATAATTCCTATAAAAAATTGAAATCTAA
Unaligned ( gi|43 ): GATCTGAGGTCCAGGGGTGATGAATATAGCATACTTCCATGTTGATTGATT
Unaligned ( gi|45 ): TATTAAGTGATGCCATACATAGAGGATCTTGAATGAGT
Unaligned ( gi|48 ): TAGTCGATACTAAAATTCATGCTCATTTGAT