lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               11111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111                                                     11111111111111111111111111111111111111111111111111                                                                                       1111111111111111111111111111111111111111                                                       111111111111111111111                                    1111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111                                                                                33333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333                                                                                                                                                                                                33333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333                                                                                                                                                                                   
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                         111111   33333333333333333333333          111111             22222222222              222       33333       22      3333                                             33333333                                                                2222222      1111             4444444444444444444                                       22           4444444444444444444444444444444444            55            1111111111111              111      11      2222222222222222222222222222                                   22                    22        111   33333333333               222222222                    1        333       1111   66666666666666666666666666666666666666666666666666666666           44444444444444444         22222   2222     333   111111111111111111       22     222222222222222222222222222           111           333333333333333333333333333333333   22  111111           77777777777777777777777777777777  11111                    333333333         11  44444444444444           22                  1    1111      11        222222222                      2                 1   222222     11              1   444444444   1   2222222     11     666666666666666       1111      6666666    3        3333333333          222     1   11        22         222      111  1      333333333           11   77777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777      1111  11     222    22      1          11      00000000000000000000000000000000000000000000000000          4444444444444444444444444         22222222222222      222    222    2222     1111111111111111111111111111111111111111       44444   1    33333333       4444   22           000000000000000000000          44444444     2            5555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555    111     4          2     2   44444444    11    444444444444444      11      44444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444     1       1           1      1       22              33333            1       111  33    1   1     1         1   2222222    7777777           22222   11    1     222   333         1        11111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111   11           1      111   55555555555555555555555         1   555555        222   33333       777777777777777777777777777777         1           2             2    3333        
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                              7       7  666666   00000000000000000000000     5    111111    6  555   88888888888  33   8888   222 77    88888       33  3   0000   5555555   9 2   5     2 1 5 77  2 2  2    66666666  33    5555        33        6666  33 2     2    5  33    444  2222222  2   4444 555555  2   2222222222222222222      2  77777   2   2 5555      2     44   0    33 7777777777777777777777777777777777     2      00   2  2 444 1111111111111   7 33 55 2  333      77    2 8888888888888888888888888888    2     9999999       333 3      77 0       0  888 1   00  77    111   77777777777 44 3          777777777               4 55 2   777  333       4444   99999999999999999999999999999999999999999999999999999999     4     55555555555555555 1   4   22222   0000  3  333   999999999999999999       11     666666666666666666666666666    55 0 3 888 3   6666  999999999999999999999999999999999   66  111111           77777777777777777777777777777777  22222 5       5  5  5    888888888         33  33333333333333        6  66                5 7 5  2222  5   00     0  333333333  7  3    8    8  22  4     3           1   999999     11       0      0   000000000   0   2222222     77  0  111111111111111 0     7777      2222222    0     0  7777777777 3     7  555 7   3   11     4  33  7      333      777  0      777777777    6   7  33   11111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111   6  4444  33     777    33      0  3       33 3    66666666666666666666666666666666666666666666666666       1  7777777777777777777777777   0     99999999999999      333    222    8888     2222222222222222222222222222222222222222       33333   3    66666666       3333   77           555555555555555555555 3 2      33333333 4   0            5555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555 4  666     0          0     0   00000000    88    444444444444444      88      00000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000     3       3           3      3       00 7    1  6    00000     6  7   3       777  66    3   3     3         7   2222222    2222222       0   11111   33    0     222   333         0        22222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222   33 3    3  2 5    3 777   33333333333333333333333    9    5   111111        333   33333    7  444444444444444444444444444444    6    3 3     4   0             0    7777        
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                              .       .  ......   .......................     .    ......    .  ...   ...........  ..   ....   ... ..    .....       ..  .   ....   .......   . .   .     . . . ..  . .  .    ........  ..    ....        ..        ....  .. .     .    .  ..    ...  .......  .   .... ......  .   ...................      .  .....   .   . ....      .     ..   .    .. ..................................     .      ..   .  . ... .............   . .. .. .  ...      ..    . ............................    .     .......       ... .      .. .       .  ... .   ..  ..    ...   ........... .. .          .........               . .. .   ...  ...       ....   ........................................................     .     ................. .   .   .....   ....  .  ...   ..................       ..     ...........................    .. . . ... .   ....  .................................   ..  ......           ................................  ..... .       .  .  .    .........         ..  ..............        .  ..                . . .  ....  .   ..     .  .........  .  .    .    .  ..  .     .           .   ......     ..       .      .   .........   .   .......     ..  .  ............... .     ....      .......    .     .  .......... .     .  ... .   .   ..     .  ..  .      ...      ...  .      .........    .   .  ..   ................................................................................................................................   .  ....  ..     ...    ..      .  .       .. .    ..................................................       .  .........................   .     ..............      ...    ...    ....     ........................................       .....   .    ........       ....   ..           ..................... . .      ........ .   .            .................................................................................................... .  ...     .          .     .   ........    ..    ...............      ..      ...........................................................................................................................................................................................................     .       .           .      .       .. .    .  .    .....     .  .   .       ...  ..    .   .     .         .   .......    .......       .   .....   ..    .     ...   ...         .        .............................................................................................................................   .. .    .  . .    . ...   .......................    .    .   ......        ...   .....    .  ..............................    .    . .     .   .             .    ....        
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                              3       3  000000   77777777777777777777777     0    111111    9  000   44444444444  77   9999   111 99    33333       88  1   9999   7777777   7 7   3     7 5 7 66  5 5  5    77777777  77    7777        77        1111  99 9     9    7  77    444  6666666  5   7777 999999  4   8888888888888888888      7  66666   7   7 7777      7     00   6    77 0000000000000000000000000000000000     4      44   5  5 444 6666666666666   5 44 99 5  000      77    7 9999999999999999999999999999    9     3333333       777 1      77 8       7  555 0   44  99    111   99999999999 99 6          777777777               0 55 5   000  000       0000   99999999999999999999999999999999999999999999999999999999     0     11111111111111111 9   0   00000   6666  6  000   333333333333333333       55     111111111111111111111111111    00 9 6 666 6   9999  666666666666666666666666666666666   44  555555           22222222222222222222222222222222  00000 0       7  7  7    888888888         66  11111111111111        7  33                7 1 7  1111  7   77     7  555555555  5  5    0    0  22  0     8           4   333333     33       8      5   000000000   0   0000000     22  8  000000000000000 8     0000      5555555    0     8  0000000000 2     3  777 3   3   00     0  00  3      333      555  0      222222222    0   2  88   55555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555   5  8888  88     222    88      0  2       88 2    55555555555555555555555555555555555555555555555555       0  3333333333333333333333333   7     33333333333333      333    000    3333     0000000000000000000000000000000000000000       33333   3    33333333       5555   55           000000000000000000000 0 5      55555555 0   0            0000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 0  555     0          0     0   55555555    00    777777777777777      33      00000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000     3       3           3      3       77 3    0  7    33333     7  3   3       777  77    3   3     3         0   3333333    7777777       7   22222   88    0     222   222         0        55555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555   88 2    2  5 0    2 555   77777777777777777777777    0    5   333333        333   33333    3  333333333333333333333333333333    7    3 7     0   0             0    0000        
consensus                     :                                                                                                                                                                          AAAT-GGCGAAG-TA----A-CAA----A--GT-A--T-A-AA----CGTAATCATA------GTCCCAA---AAA------CAT--AT--ACA----AAA-T-C--GAGT-GTA-GGGCAAC-CAC-GGA----CCT--CC---GACAA-AAG-CGAAG-GCAGGA-TC-A-GG-TGCCA-TGGAGGGA--GTAA----GCATCCTC--TGCTGACC----GG--T-CACAC-CCGC-CG--TGAG---CC-C-N---TA-GTC----G--A---AA-CAA---A--------------GTAAACG-GG-G---TTA-CCC-G----TCGTCA-AATCTAAGTACGAAA--AC--G-CA-GTCTAAACAAAATG-GGTA-AAT---GAAAC-AAATCA--GTC-AA-C---A-----T-------ATG-A--C--T-TA---GTGATAA-TTTG-T---AA-TC--G----C-A-A--C--A--GGTC-ATTAT-------AGCGACC-G-T-AGAATT--TGCGAAATGATG---ACTTT--AA--CGAGAATTCGNT-TTAT----AA-C-CCTGCAACAT--CA-AC--TTTTTGGTTAGTAGT-T--GGCCT---CGCT-TTAAAAA----ATC--N-C--A--TACG-CAT--------G-C-ATG-------------C-CT--T-GCGTATC-GAATCA-AAC------C-----GGGAG-ACATT-A-CACA-C-AT-AA---GCA---G--GGGA--------TAGTGGTAACATTA-------------CTA-ACA-A--AG-AAAG--GAA-AAN-T-GAC---GAT------TGCA-AAG--------TC-AAAGTC--ATCAACG------CTTATCATATA-A---TG---CA-GTT--GT-C-AGT----C-TG--C--C-ATTAGAG-TC-AA-TATT--AAGT---AAAATATCC--AAAT------------ATGAAGCAGATCTGTCAGATTCTGTGGTG-TCC-TT----TA-TTTCGAGTTCGTCGGGATAATATCAAAATGGA-CATA-ATTGTGAAAATTATGATTGTTAATTGAT---AG-ACATC-ATCTATATACCTATATGTA---------AGG-TTG-AA---GGACAC-NGCAAG---------------TTTTTTG----TTTTTAT------CCCGTAACAGTTT-TTTTGAA-ACAAATTCTGCT--TTCAT-ATGNAATATANAA--ATAAGTCTG---CCAATA---AG-GGGGCACAA---T--TAGTGCCCNTA--GGA-AT-AC-CA-AC--A---------GAATTGTTGGAG-AGAC--ATGGTCTCTCC---AAAGACTACAT-AA-AT-A-TT-ATCTAT-A--AGAAA----ACCC-A---------------AGC---A-ATGCTC-T--TA--ATATCCTACTTCA-AGAGTA-CTTGTGTGGG--CAATCA----------------GAGTG----GGTT---------CTNANAAA----AATATGTGTCTT--GTTT-----CCCCAAC-----GACTAGAAA-TTNTTA--TT---TTCGGG---TGCC-G-TTTT----TTGTTT---------AAAANCAATTA--------T--CGAT--CCCGAAAAA-G---CCT-AGAT--TT-T--ATTTTAT-CGTGAGAAGAATCGTTGTGATATTGGGTTAGTAGAGCTCGGNGNAGAAATCNACGNGATNTTGAATGCAGTCAATTGTCTCNGCATTGAAANCAACTCTCGTGATTTAAAGTTGTTTTAGTATAAAGCTGGGCTTTTAGAAGGGGCGTTTTCACCGTTGANATATCCCCAATCTTNGNATNGACACCA-TTCTGGAATAATGTAGGCGGAAACAGTATATCN-TGAAA---TGA--CT--T-TTAACA--GCTGTTC-AG-TAGTT-----T--TTAGTA-GAC-------TAAGGNA----------T-AGA-G---------------G------C------T---GGTAGAG-CAC--TTACTGGAA---CCAGCG-ATA-T-A-----TC-TTCG-TTTGTAAGGA-TTTN---TTA-TGC--GTT--TCG-----GAATCCAGT-A--------AAGGT-ATGGTAA-TTCAAATTGAT-CCTGAT-TCTTCGG-AAATATTGAAAGTAT-TT-CAAACAGAAAGGT-GATTTTG-A-GAA-TTTC-ATC-TTAGT-CAGATTGCTTGGA-GTATA-AAGT----AAGATTCCCAAATGCG---TGA--AGTA-AACCCT-AGTTC-ATTTAAAAGG-ACAAGTATAGTAGT-----GA-CTCTN--TACAAAC--A-----AAG----ACAAA-TGTNA-TC------------ACTNTGCTTTATGCTG-CCT--AACC--TANCAA-AGTTTTCA-TGTG--TC----TAA--CTCATTTACNCACTTCTG---GCT-TN-----TTAA-GACAG-----AAGGATAAATAGTCNCG--ATTTTCCC---CGC-----TAAATGGTT---A---CGG-ATTT----TAA-TAA--TTTCCGAAT-ANTTTTGNCCATTTCAGACAAAGTGTTCAANCCCCTCTCCCT
Reference ( gi|2 )            :                                                                                                                                                                          AAAT-GGCGAAG-TA----A-CAA----A--GT-A--T-A-AA----CGTAATCATA------GTCCAAA---AAA------CA---AT--ACA----AAAAT-C--GAGTTGTAAGGGCAAC-CAC-GGA---ACCT--TC---GACGA-AAG-CGAAG-GCAAGG-TC-A-GG-TGCCAATGGAGAGA--GTAA----GCATCCTC--TGCTGACC----GG--T-CACAC-CCGC-CG--TGAG---CC-T-G---TA-GTC----G--A---AA-CAA---A-------------TGTAAACG-GG-G---TTA-CCC-G----TCGTCA-AATCTAAGTATGAAA--AT--G-CA-GTCTAAACAAAATG-GGTA-AAT---GAAAC-AAATCATGGTC-AA-C---A-----T-------ATG-A--C--T-TA---GTGATAC-TTTG-T---A--TC--G----C-A-A--C--A--GGTC-ATTAT-------AGCGACC-G-T-AGAATTTGTGCGAAATGATG---ACTTT--AA--CGAGAATTCGGT-TTA-----AA-C-CCTGCAACATA-CA-AC--TTTTTGGTTAGTAGT-T--GCCCT---CG---TTAAAAA----ATC--A-C--AT-TACG-CAT--------G-C-ATG-------------C-CT--T-G-GTATC-GAATC--A-C------C-----GAGAG-ACATT-A-CACA-C-AT-AAT--GCA---G--TGGA--------TAGTGGTAACATTA-------------CTA-ACA-A--AA-AAAG--GAA-AAG-T-GAC---AAT------TGGC-AAG--------TC-AAAGTCCCATCAACG------TTTATCATATATA---TG---T--GTT--TTGC-AGT----CCTG--C--C-ATTAGAG-TC-AA-TATT--A--T---AAAATATCC--AA-T------------ATGAAGCACATTGGTCAGATTCTGTGGTG-T-C-TT----TA-TTTCAAGTTCGTCAGGATAATATCAAAATGGA-CATA-ATTGTG-AAATTATGATTGTTAATGGAT---AA-ACATC-GTCTATATACCTATAAGTA---------AGG-TTG-AA---GGACAC-TGCAAG---------------TTTTTTG----TTTTTA-------CCCG-AACAGTTT-TCCTGAA-ACAAATTCTGCT--TTCAT-ATGGAATATATAAAAATAAGTCTG---CCAATA---AG-GGGGCAACA---T--TAGTACCCATA--GGA-A--AC-CA-AC--A---------GAATTGTTGGAGAAGACGGAT-GTCACTCCAAAAAAGACTACAA-TA-AT-A-TTAATCTATAA--AGCAA----ACCC-A---------------AGC---A-ATGCTC-T--TA--ATATCTTTCTTC--AGAGTA-CTTGTGTGGG--CAATCA----------------GAGTG----GGTT---------CTGACAAA----AATATGTATC-T--GTTT-----CCCAAAT-----GACCAGAAACTTGGTA--TT---TTCGGG---TGCC-G-TTTT----TTGTTC---------AAAAGCAATTA--------T--CAATTTCCTGAAAAA-G---CCT-AGAT--TT-T--ATTTTATCCGTGAG--GAATTGTTGTA------------TAAAG--TGGTGGAGAAATTCATATG-TTTTG-ATGCAGTCAATT---TTAG----AAAAA----TCTCGTGATTGAA----GTTTT-CTATAAAGCT----CTTTAGA------GTTTT-----T-GAGA-ATCCACAATC--TGAATGAACACCACTTCTGGAATA-TGTAG-TGGAAACAG--TATCT-TGAAG---TGA--CC--T-TTAACA--GCTGTT--AG-TAGTT-----TTGTTAGTA-G---------TAAGGGA----------T-AGA-G---------------G------C------T---GGTAAGG-CAC--TTACTGGAA---CCAGCGAATG-T-A-----TC-TTTGGTTTGTAAGGA-TTTC---TTA-TGCATATTT-TTG-----GAATCCAGT-A--------AAGGT-ATGGTAA-TTCAAATTGAT-CCTGAT-TCTTCGG-AAATATTAAACGTAT-TC-CAAACAGAAAGGT-GATTTTG-A-GA--TTTC-ATC-TTAGT-CAGATTGCTAGGA-GTATA-AAGTCAGGAAAATTCCCAGATGTG---TGA--AGTA-AACCCTAAGTTCAATTTAAAAAG-ACAAGTATAATAGT-----GA-CTTTA--TACAAAC--A-----AAG----ACAAG-TG----TT------------ACTGTGCTTTATACAG-CCTGGAACCAGTAACAA-AGTTTTCA-TGTA-GTCTATGTAA--CTCATTTACCCCCTTCTG---GCT-TC-----TTAA-GACAG-----AAGGGTAAATAGT-A-G--ATTTTCCC---CGC-----TAAATGGTTATAA---CGGGATTT----TAAATAA--TTTCCGAAT-ACTTTTGATCA-TTCAGACAAAGTG-TCAAGAT-CTCTCCCTCA
gi|3                          :                                                                                                                                                                          AAAT-GGCGAAG-TACA--A-CAA----T--GT-G--TTA-AA----CGTAA-AATA------GTCCCAA---AAA------CATGTAT--ACA----AAA-T-T--GAGT-GTA-GGTCAAC--AC-GGA----CCT--CC---GACAA-AAG-TGAAG-G-AGGA-TC-A-GG-TGCCA-TGG-GTGA--GTAA----GCATCCTC--TGCTGACG----CG--C-CACAC-CCGT-CG--TGAG---CC-C-T---TA-GTC----G--A---AA-CAA---C-------------AGTAAACG-GG-A---TTA-CC--G----TCGTGA-AATCTA-GTACGAAA--AT--G--A---CTGA-CAAA--G-GATA---T---GAAAC-AAATCA--GTC-AA-C---A-----T-------ATG-A--C--C-TG---GTGATAA-TTTG-T---AA-TC--G----C-A-A--AGAA--GGTC-ATTAT-------AGCGACC-G-T-ATAATTTG--CGAAATGAT----ACTTT--AAA-TGAGA-TTCGTT-ATACCGTTAA-C-CCTGCAACAT--CA-----TTTTTGGTTACTAGT-T--GGCCT---AGC--TTTAAAA----ATC--C-CTCATACACA-TAT--------G-CCATGTGTTGGATATAGCC-CT--T-GCGTATC-GAATC--AAC------T-----GAGAG-ACAT--A-CACA-CCAT-AA---GCA---G--GTGA--------TATTGGTA-CATTA-------------CTA--CATA--GA-AAAG--GAA-TGT-T-GAC---GATA-----TGCA-AAG--------TC-AAAGTC--ATCA-CG------TTTATTATATA-A---TG---T--ATG--T--C-AGT----C-TG--CATC-ATTAGAG-TC-AAATATT--AAGT---AAAATAGCC--AAAT------------ATAAAGCAGATATGTCAGATTCTGTGGTG-T-CCTT----TA-TTTCGAGTTCGCCA----AATATATAAATGGA-CATA-ATTGTG-AAATT-TTATTGTTAATTGAT---AAGACATC-GTTTATATACCCATATGTA---------AGG-TTG-AA---GGACAC-GGT------------------TTTTTTG----TTTTTAT------CCTGTAACGTTTT-TTTTAAC-AC-AATTCTAC---TTCAT-ATGA---ATATAAAAATAAGTCTG---CCAATA---AG-AGGACACAA---T--TAGTGTCCTTA--GGA-AT-AC-CA-AC--A---------T-ATTGTTG--GAAGAC--ATGGTTTCT-----AAAGACTACAT-AA-AT-A-TT-GTCCAT-A--AGAAA----ACCC-A---------------AGC-----ATGCTC-T--TA--ATATC-TACTTC--AGAGTA-CTTGTGTGGG--CAATCA----------------GAGT-----GGTT---------CTGAC-AA----AACATGT
gi|8                          :                                                                                                                  ctattaaacctgacacaatacatctgctagtcatctgggactgatgtttatatatcAAAT-GGCGAAG-TA----A-CAA----A--GT-A--TGA-AA----CGTAATCATA------GTCCAAA---AAA------CAC--AT--ACA----AAA-T-C--GAGT-GTA-GGGCAAC--AC-GGA----CCT--TC---GACGA-AAG-CGAAG-GCAGGA-GC-A-GG-TGCCA-TGGAG-GA--GTAA----GCATCCTC--TGCTGACC----GG--T-CACAC-CCGC-CG--TGAG---CC-T-G---TA-GTC----G--A---AA-CAA---A--------------GTAAACG-GG-G---TTA-CCC-G----TCGTCA-AATCT-AGTATGAAA--AT--GACA-GTCT-AAC-AAAT--GGT---AT---GAAAC-AAATCA--GTC-AA-C---A-----T-------ATG-A--C--T-TA---GTGATAC-TTTG-TA--A--TC--G----CAA-A--CA-A--GGTC-ATTAT-------AGCGACC-G-T-AGAATT--TGCGAAATGATG---ACTTTA-AA--CGAG-ATTCG---TTAT----AA-C-CCTGCAACAT--CA-AC--TTTTTGGTTAGTAGT-T--GGCCT---CGCT-TTAAAAA----ATC--ATC--A--TACG-CATG-------G-C-ATGC------------C-CT--T-GCGTATC-GAATCA-A-C------T-----GAGAG-ACA-T-A-CACACC-AT-AA---GCA---G--GTGA--------TAGTGGT-ACATTA-------------CTACAC--A--AA-AAAG--GAA-AGT-T-GAC---AAT------TGCA-AAG--------TC-AAAGT--CATC-ACG------TTTA
gi|4                          :                                                                                                                                                                  ggcatataAAATTGGCGAAG-TA----AACAA----T--GT-G--TTA-AA----CGTAATCGTACATGTAGTCCCTA---AAA------CAT--AT--ATA----CAACTTC--GAGT-GTA-TGGCAAC--AT-GGA----CCT--CC---GACAACAGG-CGAAG-CCAGGA-TC-A-G--TGCCA-TGGAGGGA--GTAG----GCATCCTC--TGCTGACC----GG--T-CAC-C-CCACACG--TGAG---CC-TCG---TA-GTC----G--A---GA-CAA------------------GTAAACA-GG-G---TTT-ACC-G----TCTACT-A--CGAA--ATGAGA--------CA-GTCTAA-CAA---G-GGTA---T---GAAAC-AAATCA--GTC-AG-C---A-----T-------ATG-A--C--T-TA---GTGATAA-TTTGGT---AA-TC--G----C-A-A--C--AA-GGTC-AT-AT-------AGCGACC-G-T-AGAATCC-TGCGAAATGCTGCGGACTTTGAAA--CGAGAACTCG---TTAT----AA-C-CCTGCAA-ACA-TC-AT--TTCTTTTTTTGTAAT-T--GAC-T---CG---CTTTAAA----GTCCTG-C--GT-C-CG-CAT--------GAT-ATA-------------C-CT--TTGCGTATC-GAATC--AAC------T-----GAGAG-ACAT--A-CACA-CCAT-AA---GCA---G--GTGA--------TAGTGG-AACATTA-------------CTA--CA-A--AG-AAAG--GGA-AAG-TTGAC---GAT------TG---------------C-AAAGTC--ATCA-CG------TTTATCATATA-A---TG---TA-GTT--GT-C-AGT----C-TG--C--C-ATTAGAA-TC-AA-TTTT--AAGT---AAAATATCC--AAAT------------ATGAAGCACATCTGTCAGATTCTGTGGTGTT-C-TT----TA-TTTGGAGTTCGTCAGGAT-ATATC-AAATGGA-CATA-ATTATGAAAATTATGATTGTTAATAGATC--AG-ACATC-ACCTATATATCTACA
gi|5                          :                                                                                                                 actatcttatccgaatgacatcaaagattacttgaacgattgtctgtactgcaatatAAATTGGTGAAG-TA----AACAA----T--GT-G--T-T-AAT---CGTAATCATA------GTCCTAA---AAA------CAT--ATTTACA----AAG-T-C--GAGT-GTA-GGGCAAC--AC-GGA----TCT--CC---GACAA-AAG-CGAAG-GCAGGA-TC-A-GG-TGCCA-TAGAG-GA--GTAA----GCATCCTC--TGCTGACC----GG--T-CACAC-CCGC-CA--TGAG---CC-C-T---TA-GTC----G--A---AA-CAA---G--------------GTAAACA-GG-A---TTA-CCC-G----TTGTCA-CATCT-AGTACGAAA--AT--GACA-GTCT-AACAAAA---GGT---AT---GGGAC-AAATCA--GTC-AG-C---A-----T--------TA-A--T--T-T-------ATA-----------A--TC--G----CAA-A--CA-A--GGTC-ATTAT-------ACCGACT-G-T-AGAATT--TGCGACATGGTG---ACTTTA-AA--CGAGAA-TCG---TTAT----AA-T-CCTGCAACAT--CA-AC--TTTTTAGTTAGTAGT-T--GGCCT---CGCT-TTAAAAA----GTCT-T-C--A--TACG-CAT--------GAC-ATGT------------T-CT--T-GCGTATC-TAATC--A-A------CTGCATGGAAA-ACATTCA-CAC--C-AT-AA---GCA---G--GTGATACATTTGTAGTGGT-ACATTA-------------CTA-tatgta
gi|16                         : tatactctatatgataatatatgtcttctgaaaccgcttttacatgtttctgtgttggcgacatcggtattttgggctttttcaaaagtttggcttatatttaaaaagttttcttttcatgaatgcatttttttctgtatttttttttattgtatgtagtaaaagatatAAAT-GGCGAAG-TA----A-CAATTAAA--GT-A--TCA-AA----CGTA-TCATA------GTCCCCA---AAA------CAC--AT--ACA----AAA-T-C--GAGT-GTA--GGCAAT--AC-GGA----CCT--TC---GACAA-AAG-CGAAAAGCAGGAATC-AAGG-TGCCA-TGGAG-GA--GTAA----GCATCCTC--TGCTGACC----GG--TCCACAC-CCGC-CG--TGAG---CC-C-T---TA-GTC----G--A---AA-CAA---A--------------GTAAACG-GG-G---TTA-CCC-G----TCGTCA-AATCTAG--ACGAAA--AT--GACA-GCCTAACTAACAAG-GGTATAA-----AAAC-AAATCA--GTC-A------A-----T-------ATG-A--C--T-GA---GTGATAA-TTTG-TA--A--TC--G----CAA-A--CA-A--GGTC-ATTAT-------AGCGACCGG-T-AGAATT--TGCGAAATGATG---ACTTTAAAA--CGAG-ATTCAGT-TAT-----AA-C-CCTGCAca
gi|14                         :                                                                                                                                                                        taAAA--GGCAAAGATA----A-CGA----ACAGTGA--T-C-AATCT-CGTAA-----------GTCCTAA---ATA------GA---AT--ACA----AAAA--CAAGAGTCG----GGCAAT-CAC-GGA---CCCC--TG---GAC-A-CAC-CAGAA-GTGGGA-TC-A-GG-TGCC--TAGGGGGA--GTAA----GCACCCCC--TGTTGACC----GG--T-CACAC-CCGC-CG--TGAG---CC-C-A---TA-GTCTT--G------AT-CAG------------------GTAAACG-GA-----------C-A----TC-----AGT----GTGTGAAA--A---A-CG-G-CTTAAC--AATG-GCT---AT---GAAAC-ACATCA--GAC-AG-C---A-----T-------TTG-A--C--T-CA---ATGATAG-GTCA-T---A--TT--GGT--A-A-A--CT-A--AATT-GTTAC-------AACGACC-A-T-AGAATT--TACGAAATGCTGC--ATTTA--AA--CGTGA---CTGT-TGA-----AACC-CCTGCAACATACCG-AC--TTTT
gi|24                         :                                                                                                                                                                    ggatgtAAA--GGCAAAGATA----A-CGA----ACAGTGA--T-C-AATCT-CGTAA-----------GTCCTAA---ATA------GA---AT--ACA----AAAA--CAAGAGTTG----GGCAAT-CAC-GGA---CCCC--TG---GAC-A-CAC-CAGAG-GTGGGA-TC-A-GG-TACCTA-GGAG-GA--GTAA----GCATCCCC--TGTTGAataaatcatgcactttcttttcaaagtacatgtatatttgcacatgaaat
gi|39                         :                                                                                                                                               cactgtgataaatggtagtattaatgtAAAT-GGCGAAG-TATTTTA-CAA----T--GT-G--T-TTAA----CATAATCATA------GTCCAAA---AAA------CAT--GT--AC-----AAAAT-C--GAGa
gi|42                         :                                                                                                                                                                 tttgttataAAAT-GGCGAAG-TA----A-CAA----A--GT-A--T-G-AAC---CGTAATCATAC-----GTACACAGATAAA------CC---AT--A
gi|44                         :                                                                                                                                                                          AAAT-GGCGAAG-TA----G-CAA----A--GT-AT-T-C-AA----CATAATCATA------AT
gi|6                          :                                                                                                                                                                 cgcacatttataT-GGCCAAA-TA----AACAA----T--TTGA--T-A-AT----TGTAATCAAA------ACCCCAA---AA-------CA----T--ACAC---AAAGT-C--GAAT-GTAAGG--AAA-CAC-AGA----CCT--CC---GATAA-TAG-CGAAG-GAATAG-TC-A-GT-CG----------------------GCATCCTC--TGCTGACC----GG--T-CACAT-CCGC-CG--TGAG---CC-C-T---TG-GTC----G--A---AA-CAA---A--------------GTAAACG-GG-A---TTA-CCC-G----TCGTCA-AATCTA-GTAGGAAA--AT--GACA-GTCTAA-CAAA--G-GGTA---T---GAAAC-AAATCA--GTC-AA-C---A-----T-------ATG-A--C--T-TA---ATGACAA-CTTG-T---AA-TC--G----C-ATA--C--AA-GGTC-ATT-----------------------------TGCGAAATGGTG---ACT------------------GT---------AG-C-CCTGCAACAT--CA-----TTTTTTGCTAGTAGT-T--GACCT---CGCT-TTAAAAA----GTC--C-T--CG-TACG-CAT--------GAC-ATG-------------CTCT--T-GCGTATC-GAATC--AAC------T-----GGAAG-ACA-----CACA-C-AC-AATAAGCA---G--GTGA--------TAAGGGTA-CATTA-------------CTA--CA-T--GA-AAAG--GAA-AGG-T-GAC---GAT------TGCA-AAG--------TT-AAAGTC--ATCA-CG------CTTATCATATA-A---TG---CA-GTT--AT-C-AG-----CCTA--C--C-TTTAAAG-TC-AA-TATT--AAGT---AAAAAATCC--AAAT------------ATGAAGCAGATATGTCAGATTCTGTGGTG-TCC-TT----TA-ATACTGG--CGTCA----AAGCTCAAAAT
gi|21                         :                                                                                                                                                                                          atagatAA----A--GT-AATT-A--------GTAA-CATA------GTGCCAA---AAA------CATATAT--ACA----AAAA--C--GAGT-GCA-GGGCAAG--AC-GGA----CCT--TC---GACAA-ACG-Ctcttggagcgggaataataaaatatatt
gi|20                         :                                                                                                                                                                                           ctattaA----A--AT-A--T-A-AATAGGCGAAGT--TA------ATCCCAA---AAA------CAT--AT--ACA----AAA-C-C--AAGT-GTA-GGGCAAC--AC-GGA----CCT--CC---GACAA-AAG-CGAAG-GCAGGA-TC-A-GG-TGCCA-TGGA-AGA--GTAA----GCATCCTC--TGCTGATC----GG--T-CACAC-CCGC-CG--TGAG---CC-C-T---TA-GTC----G--A---AA-AAAAGCA-------------TG-AAACG-AA-A---TCA------------GTCT-AA-CTATACATG-----AC--T-TA-GT---GATAATATG-CGT--AATCTGGAAAC-AAGTCATTTGC-GA-A---A-----TG------ATG-A--C--T-Tacaaaataaacagggtagcccgtcgtaaaatcttgtacaaaaataagagtctgacaaagggtacgaaacagatcagtcaacacacgacttcgtgataatttgtagtcgcaaacaaggtcattatagcgacagtagaatttgcgaaaggatgat
gi|27                         :                                                                                                                                                                                                           -A--C-A-AC----CGT--TCATA------ATCCAAA---AAAATG---TAT--AT--ACA----AAAAT-C--GAGTCG--AGAGCAGCGCACTGGACACATCT--TCTGTAATAA-AAGCCGAAtaaattgagtattcgttat
gi|9                          :                                                                                                                                                                                                                                 ggcgactgtaCCAAA---AGAAAACCCCA---AC--ACATTACAAATT-C--G--CTGTAAG--CAAC-C---GGG---ACCT--CC---GACAA-AAG----AG-GTAGGA-TC-A-G--TGCACATGGGAGGA--GTAA----GTTTCCTC--TCCCGAC------G--T-CACAC-CCGCGCA--TGACACCCC-C-AAATTA-GAT----G--ACCAAA-CAA------------------GTAAACG-GG-GA--TTAACCC-GGGTTTCA--A-AAT---AGTACGAAATGAC--A-CA--TCTAA-CAAA--G-GGTA---T---GAAAC-AAATCA--GTC-AAAC---A-----T-------ATG-A--C--T-TGCGGATGATAA-TTTG-T---AA-TC--GGGAAC-A-A--C--A--GGTC-ATTATTTCGATAAGC-ACC-GCT-AGAA-TTGC-CGA-----------------------AGAATTCGTTATTA-----A----CCTACAACATA-CA-AC--TTTTTTGTTAGTAGT-TTGGCTCC---CT---TTAAAAGCC--CTC--C-C--A--CACG-CACGA------G-T-ATG-------------C-TC--T-GCGTATC-GAATCAAA-C------C-----GAGAG-ACATtggtttagtgatagttttattgagagaagaaaatggtaagtccactaaccagtca
gi|37                         :                                                                                                                                                                                                                           cccaccccacccccctctggcggcccA------TA---AT--ACA----GAG-T-C--GA--TGTA--GACAAC--AC-AGA----CCTAGT----AACAA-AAGGCGAGG-GCAGGA-TC-A-GG-TGCCAgagagattgtaagc
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                             cccccaacatacatgt---ACCT--CT---AACAA-AGG-CGAAG-G-AGGG-TC-A-GG-TGCCA--GGAG-GA--GTAA----GCATCCTC--TGCTGACC----GG--T-CACAC-CCAC-CG--TGAG---CC-C-T---TA-GTCG---G--A---AA-TAAG--G-------------TATGAACtg
gi|23                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          caaatA-ACG-CACAG-GCAGGA-TC-A-GG-TGCCA-TGGAG-GA--GTAA----GCATCCTT--TGCTGACC----GG--T-CACAT-CCGC-CG--TGAG---CC-G-G---TA-TTC----G--A---AA-CAA---A--------------ATAAACA-GG-G---TAA-CCC-G----TCGTAA-AATCT-TGTACGAAA--ATAAG--A-GTCT-GACAAA--G-GGT---AT---GAAAC-AGATCA--GTC-AA-C---A-----C-------ACG-A--C--T-TC---GTGATAA-TTTG-T---AG-TC--G----CAA-A--CA-A--GGTC-ATTAT-------AGCGAaaaatcagtcaacatatggacctttagtgataatttgcaacgcaaacaaggtcattataccgaccattagaatttgcgaaaaatgatgatttttaaacgagatttcgttataacctgcaacattcaactttttttgtttagcagttagcctaagctttaaaaaatctttcattacgcggacatgctcttgctatcgaatcaacttgcggagtaaattacacatcataagcaggatggatagtggtgtattactacttctttcgttacttggataattttattgaacattgac
gi|18                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        AG-GCAGGA-TC-A-GGGTGCCA--GGAG-GATCGTAATTGAGCATCCTC--TGCTGACC----GATCT-CACACACCGC-CATCTGAG---CCTT-G---TA-GTT----C--A---AA-CAA---A-------------GCTAAACG-GG-GATTCTA-TCC------TCGTCA-AATCT-AGTACGAAA--AT--G-AA-GGCTAAACACAA-G-GGTT-ATT---GAAAC-AAG-CA-GGTC-AA-C---A-----T-------ATG-A--CT-T-TA---GTGATAA-TTTG-T---A--TC--G----C-A-A--C--A--
gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                 gcaaacataaaatgttatgtagattattatcgggacctccaaaaattatagaggtAG-CCAAG---C-A-GG-TGGC--TAGAAGGA--GTGA----GTATC------GC---CC----GA--T-CACAC-CTGC-CG--TTAG---CC-C-----TG-ATCTT--G------AT-CAG---G-------------T---AACGCAA-G---TAA-TCC-G----TAGTCA-AA-CTCAGTATGCAA--AC--G-GATATC-GAAC--AATC-GGTA-AA-----AAGC-Aaaat
gi|36                         :                                                                                    tttactcagtatacacatgtatatgtctttgaagtcggttatgatgttcaatgcaacgacatcggtatacatgtacttcaaacgaactacacgtttaccgtgacatcaaagtaaatatatgtttagcggactttttttctgcctatatatagttacggcactggatttcttatgaacaagtgaaaattacgaacagtgactaatctcttagatcctaaattaaaagtactagtatacaaacaaagatccctGG-TCGA-GG-T-CCG-TGAATGAA--GTAA----GCATC-TCGTTGCTGATCCGAGGA--T-CACAC-CCAC-CG--TGAG---C---------A-ATCAAGAG--A---AA-CAG---A-------------ttaggcgtttggtccattgtataacttgtatctgtaaataagatcatt
gi|10                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    gatggat--TGAG---CC-T-----TACATC----GTTG---AT-CAG---A-------------T--AAACA-GGTG---CTT-CTT-G------GTAT-AATTTA-GTATGTAA--AG--A-CC-GGCTTAACAA--TT-GG---AAT---GAAAC-GCTTCA--GAC-AA-C---AACCTAC-------ACGTA--C--C-TACAAGTTGTA--TTTG-C---AAAT---G----C-A-AAAT--A--AACC-ATCAT-------AACGACC-A-T-AGAATTTGT---AAAC---------------A--CGAGA-TT--GT-AGA-----AA-CTCCTG-----------------TTTG-TCAGTATCAC--GCCTT---GG---TTTAAGACTTTATC--A-C--AC-TCAG-AATCTGTTTTCG-C-ATT-------------T-CTATT-G-G-ATC--AGTT--A-CATTTTGC-----AGGAG-ACAAA-ATCAC--C-AT-AA---ACAA--G--TGAA---------AATAG-AATATTG-------------CTACATG-A--AT-ACAG--GAA-A-T-T-GAC---GAT------GGAA-AAG--------TT-AAAG--CAATCT-CG------CTTGTCATCAAGA---AG---G--GTTG-TTGT-AAT----T-TG--C--C-TTGAACG-TC-TA-TGTTCAG--T---AAATTATCCA-AA-T------------ATGA
gi|35                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              gaacacgtcccggtaaGAG---CC-T-T---TA-GTC----G--A---AAACAG---GGAGGGGGGGCGGTTACGAGCG-GA-G---TTA-CCCTG----TCGTCAGAATCT-AGTACGGAA--A---G--A-G--TGGACAAA--G-GGTA-
gi|21                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               A-CAA---A--------------ATAAACA-GG-G---TAG-CCC-G----TCGTAA-AATCTT-GTACAAAA--ATAAG--A-GTCTGA-CAAA--G-GGTA---C---GAAAC-AGATCA--GTC-AA-C---A-----C-------ACG-A--C--T-TC---GTGATAA-TTTG-T---AG-TC--G----C-A-AA-C--AA-GGTC-ATTAT-------AGCGACA-G-T-AGAATT--TGCGAAAGGATG---Atg
gi|1                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     ctattaaaagtaattagtaacatagtgccaaaaacatatatacaaaaacgagtgcagggcaagacggaccttcgacaaacgcAAACAGGGTA-TGCA-AA-----AAAC-CAATCA--ATC-AA-T---A-----TCATTTTTATGTAGTC--TCTATT-GTG-TACCTTTG-T---AA-TC--G----C-A-AA-C--AACGGTCCATTAT-------AGCGACC-G-T-AGTATT--TGCGAAATGATG---A-TTT--AA--CGAGAATTCGTT-ATAT----CA-C-CCTGCAACAT--CAGAC--TTTTTGG-TAGTAGT-T--G-CCT---CGCTTTTAAAAA----ATC--ATC--A--TACGACATG-------G-C-ATG-------------CTCT--T-GCGTATCTGAATCA-A-C------T-----GAGAG-ACA-T-A-CACACC-ATGAAC--GCAGCGG--TGGA--------TAGTGGT-ACATTATACATTCTTTGTTCTT-ACT-ATGAA-TAAGTTGAACAAGTT-GACTTGGAT------TGCC-AAGCCTATCCTTC-AAA---TCATCAACGCCCCCCTTTATC-CCTATAACTCGCACC--GCTAGTTGC-AGTGTCGCTTGTTC--CGATTAATG-TCGAA-TATT--T--TGTGGAAATATTTTAAA-TCACTTCATAACAACGAAGCAGATC-GTCAGATTCTGTGGTG-TCC-TT----TACTTTCGAGTT-GTTCGG-TGATTTCAAATGGGACCATACATTATGAAAATCATGATTGTTAATTGATATAAA-ACATCAATCTATATACTTTCAAATATATTTTGTTAGGTTTGCAACTGAGACACGTGCAAGAT-------------TTTTTCGTTGTTTTTTAAAAAATCCCCGTAACAGCCTATTTTGAATCCAAATTC-GCTAGTTGCTAATAGAATTTAGAATCAT-AGTCTG---CCAATATTTAGTGGGGCAACAGACTCATAGTGTCCATAAGGGATA--AT-CACAC--ACTTACCTAGGAATGTTTGGAG-AGAC-AAT-G--GCTACACAATAGACACCAATTACAT-AGTTTATCTATTATTAG--A----ACCCAA---------------AGCATGA-ATA--A-T--TA--ATATC-TTCTTCA-AGAGCACCTTGTATGAGATTAATCAGTTATTGCATTTTGGGGGGTGTTTTGGTTCTTTTCATTCTTATAAACAAAAATATGCATT-TAAATTT-----CCCCAAC-----GACCAGAAACTTGTTACCTTAAGTTCAGGTTTTGCC-G-TTTTGGTGTTGTTCCAAACCCTTGAAACCAATTAATCACTTTT--CAA-TTCTCGAAAAA-GCGCCCT-GGATAATT-TTAATTTCAT-TGTGAGAAGAATTGTTGTAATATTGGGTTAGTAGAGCTCGGGGCAGAAATCAATAAGATATTGAATGCAGTCAATTGTCTCAGCATTGAAAACAACTCTCGTGATTTAAAGTTGTTTTAGTATAAAGCTGGGCTTTTAGAAGGGGCATTTTCACCGT-GAGA-ATT--CAATCTTTGAATTGACACCA-TTCTGGAATA-TGTAG-CGG-AATAGTATATCC-TGATATTCTGACTCT--T-TTAACAGCGCTGTTCAAGCTAGTTTAAGCTTTTTAGTATGACAATCTTTTAAGGTA----------TAAGA-G---------------GGGTCACT------T---GGTATGATCACTATTTCTGGAACCGCCAGCGACTACT-AACTACTT-TTTGTTTTGTAAGGA-TCTCACTTTATTGC--ATTT-CCG-----GAGT-CAGT----------AAGGT-ATGGGAATTTCAAGTTGGTCCCTCGT-CCTTCGG--AATATTGAAAGTAT-TTACAAACAGAAAGTT-GATTTTGAA-GAATTTTC-ATCTTTAGTAAAGGTTGCTTGTA-GTAAT-AAGT----AAGATTCTCCAACCTGTTCTGA--AGTA-AACCT--AGTTC--TTTAAAAGC-ACAAGTATAA-AGTA----AA-CTTTT--AACAAACGGA-----AAGCACCATAGC-TGTAA-TC------------AGTGTACTTT-TGCTC-TCT----TCTGTTAC----GCCTCTACTGTA--------TAA--CTTATTTACCCCCTTCTGTTTGCT-TCTCTCGTT---GACAGAAATTAAGGATAAA-AGTCC-G--CTTTTTTCCAACGC-----TAAATGGTTAATA---TGGAATTTGTTACAAATAAGGTTTT----T-ACTTTt
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     tttcaaactaccataccggaaaaAAATAAGGTA---T---GAACA-AAATCA--GTC-AA-C---A-----T-------ATGGA--CCTT-TA---GTGATAA-TTTG-C---A--AC--G----C-A-AA-C--AA-GGTC-ATTAT-------ACCGACC-A-TTAGAATTTGCGAAAAATGATG---ATTTTTAAA--CGAGATTTCGTT-ATA-----A----CCTGCAACATT-CA-ACTTTTTTTGTTTAGCAGT-T--AGCCTAAGCT---TTAAAAA----ATCTTT-C--AT-TACG-CGG--------A-C-ATG-------------CTCT--T-G-CTATC-GAATCA-A-CTTG---C-----G-GAGTAAATT-A-CACATC-AT-AA---GCA---GGATGGA--------TAGTGGT-GTATTA-------------CTA-
gi|20                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          caaatacctctaacaaaggcgaaggagggtcaggtgccaggaggagtaagcatcctctgctgaccggtcacacccaccgtgagcccttagtcggAT---GAAACGAAATCA--GTCTAA-CTATA-----C-------ATG-A--C--T-TA---GTGATAA-TATG-CGTAA--TCTGG----A-A-A--C--A--AGTC-ATT-----------------------------TGCGAAATGATG---ACTTT--AAATTGAGTATTCGcttctttcgttacttggataattttattgaacattgac
gi|46                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           aaatataaataggcgaagttaatcccaaaaacatatacaaaaccaagtgtagggcaacacggacctccgacaaaagcgaaggcaggatcaggtgccatggaagagtaagcatcctctgctgatcggtcacacccgccgtgagcccttagtcgaaaaaaagcTTTTGGTTAGTAGA-T--GGCCT---CGCT-TTAACAA----ATC--ttat
gi|22                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  TATC-TAATC--AAC------T-----GGGAG-ATAT--G-CATA-CCAT-T-T--GCA---A--GGGA--------TAGTGGTA-TATTA-------------CTA--CA-A--AG-ACAG--GGA-AAGCT-GAT---GAT------TG-C-ATT--------TTTAAAGTC--ACCAA-G------CTTATCATATA-A---TG---TA-GCT--GTA--AGT----C-TG--C--C-ATTAGAG-CC-AA-TATT--AAGT---AAAATATCC--AACT------------AAGAAGCAGATTTGTCAAATTCTGTGGTC-TCC-TT----TA-TTTTGAGTTCGTCGGG
gi|32                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    CATT---CAC--C-AT-AA---GCA---GG-TGGA--------TGGTGGTA-TATTA-------------CT--ACA-T--AG-AAAG--GGA-AAGTT-GAC---GATAGCCGATAGCAAAG--------TT-AAGGT--CATC-ACG------CTTATC
gi|31                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                tatcctTC-A-CAC--C-AT-AA---GTA---GG-TGG---------TAGTGGTA-TATTA--------------TC-ACA-T--TG-AAAG--G-----------C---AA-------------AG--------TT-AAAGTC--ATCT-TG------CTTATCATATA-A---TG---CA-GTT--GT-C-AGT-----GTG--T--C-ATTAG
gi|30                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  cttatACATTG-------------TTA-ACT-A--CATAAAA--GAA-ATT-T-G-C---AA------------AAC--------TC-AA-GTC--ATCA-CG------TTTATCATATA-A---TG---TTAGTT--GTCCAAGT----CCTG-----C-ATTAGAGATT-AA-TATT--A--
gi|47                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       -AAGG--GGA-AAT-T-GAC---AAT------TGCA-AAG--------TC-AAAGTCaaggaagtgttcatggaata
gi|49                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       --AA-T------------ATGAAGCACATCTGTCTGATTCTGTGat
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     aGTCAGATT--GTGTTG-T-C-TT----TA-TAT-GAGTTT-TCGGGATA-T-TCCAAAT------TA-AT---G-CCCTTGTTATTGATAGCAGAT---A---------TCTATAT-CCTATATATA---------AGG-TTG-A-----GACAA-AGCAGGGAGTTTTTTTTTTTTTTTTTTG----TTTTTAT------CCCG-TAAAGTTT-T--TGTA-GCAAATTCTGCT--T-CAT-ATGTAATATTCAG---TAAGTCTGGTGCCAATA---AA-GGGGCA--A---T--TAGTGCCACTA--GGA-ATGACGCA-ACGGA---------GAATTGTTTGAT-CGAC--CT-GTCTCTCC----ACGACTACAT-AA-ATAA-TT--TCTGT-A--AGAAACTCTACTC-ATCATGATGTCATGTTATC---ATTTGTTC-TAATAATATATCCTACTTCAGAGAGTA-CT--TGTGGG--C-ATCA----------------GAGTG----TTTT---------TTAA-ACA----AATATGTGTCTT--GTTTTTCCGCCCCAATCCCCGAACTAGAAA--TATTA--TT---TTCGGG---GGTC-ATTTTT----TTGTTT---------AACCAC-ATT---------T--CGATAATCTGAAAAG------CT-AGAT--TTAT--ATTTT
gi|28                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              taagatataaaacggtcagctactaaggattgtgtggtgtGTCAGTGTCTGTGGTG-T-C-CTGAATTA-TATTAAGTTCTTCGCGATA-TATCAAA-TGGA-TATA-ACTGTGAAAATTATGATTGTTAATTGAT---AGCACATC-taatgtga
gi|41                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     t---AG-ACATC-ATCTATATATCTATATGTA---------ATG-ATG-AA---GGACAC-AGTAAG---------------TTTTTTG----TTTaccgcaagtttttgtttttattccgtaacaggttttgaacaaatt
gi|28                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              CAC-CGCAAG---------------T-TTTTG----TTTTTAT------TCCGTAACAGGTT-T--TG-A-ACAAATT
gi|34                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     tgtcagtgtctgtggtgtcctgaattatattaagttcttcgcgatatatcaaatggatataactgtgaaaattatgattgttaattgatagcacatCAATA---AG-GGGGCACAA---T--TAGTGCCCGTT--GGA-AT-AT-CA-AC------------GGATTGTT--AGTAGAC--ATGGT--CTCC---AAAGACTACAC-AA-AT-A-TT-ATTTATAA--
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      A--AG-AA----ACCC-A---------------AGC-----ATGCTCAT--TA--ATATCTAACTTC--AGAGTA-CTTGTGTGGG--CAATCA----------------GA--G----GGTT---------TTCAACAA----AATATGTGTCTT--GTTT-----CCC-AAC-----GACTAGAAA-TTCGTA--TT---TTCGGG---TGCCGG-TTTT----TTGTTTA--------AAAAGCAATTA--------TTATAAT----TGAAAAAGG---CCTAAGAT--TT-TA-ACTTTAT-CG-GAG--GAATCGTTGTG------------TAAAG--T-GTGGAGAAATCTACGT--TTTTG-ATGCAGTCAATT---TTTG----AAAAT----TCTTGT-ATTgctaa
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          aatcgaccaattgttgctaccatatgttttcctaatgatTAGA------GTTTT-----TTGATATATCCCCA-TC--GGTATGA-CACCA-TTCTGGAATAATGTAGGTGGA--CAG--TATCTCTGAAA---AGA--CTGTT-TTAACA--GCTGTTT-AG-TAGTT-----TAGTT--TA-GAT-------TAAGGAAGAGGCTTGGTT-AGA-GCACTTACTTGAACTAG------CATATATT---GGTAGAG-CAC--TTACTGGAA---C-AGC--ATA-T-A-----TC-TTTG--TTGTAAGGA-ATTG---TTA-T---TGTTAATTC-----GAATCCAGTTA--------AAGGTCATTGTAA-ATCAAATTGAT-CCAGAT-TCTTCGG-AA-TATTGAAAGTAT-TC--AAACAGAA-GGT-GAATTTG-AAGA--ATTCTATC-TTAGT-CAGATTGCTTGGAGGTATATAAGT-----AGATTCCCAGATGCT---CGA--AGTA-CACCCTTAGTC--ATCTTAAAAG-ACAAGTACAG-AGT-----CAGCTCTAGTTACAA
gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               agtgATCA-TGAAG---TGA--CG--TCTTAACA--GCAGTT--A---------------CTAGTA---------------GGA----------T-AGAGG---------------G------C------TGCGGGTAGAG-C-C--TTAGT-GAA---CCAGCG-ATG-TAA-----TCATTCTGTTTG-AAGGAGTTTT---TTA-TGCA------TCGAAAAAAAATCCAAT-ATAAAAAACAAGGT-ATGGTAA-TTTCAATTGAT-CCTGATGTCTTTGGAAAATATGAAGCAAATGTT-TAAACA-AAAGGTGGATTTGA-A-GAAGTATC-ACT-TTAGT-CAGATGTCTTGGA-G--TA-AGATTAGTA----TTCCAAATGAC---TGA--AGTG-AATCCT-AGTTACAGTTAAAAGGCATAAGTAT-GTA-T-----GA-CTATT--TATCAAC--AC----AAG----ACAAA-TGTGAATC------------ACTTGGCTTTAT-CAG-CT--GAACTA-TATCAA-AGTTTTCA-TGTGCGTCT-T-TAA--C-CATTTACACACGTC-----GCTCTG-----TAAA-GACAG-----AAGGCTA
gi|25                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                tccTGTG---TGATAAGTATAACCCTA-GTTCA-TTTATAAAG-ACAAGTATAATATTTTCTGGC-CCCTA---ACAAAA--AAATTCAAG----ACAAATTGAC--TTTGTAACATCTTAACTCTGTTTCA-ACTGTCCTGTAA----TAGCAATAGTTCTC--------TC---GTAAGGCTCATTTTACCACTTCTG---
gi|29                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    --CTCATT-ACAC--TTCTG---GCT-TT-----TTAAAGACA-------AGGATAAATAGT-ACGCCATTTTCCT---CGCGCGCTTAAA--GTTTTAATTACGG-ATTT----TAATTA---CTTCCGAATTAATTTTGATCATTTCAGACAAAGTATTCAACTC-CTCTCCC
gi|38                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      --ATTTTCCC---CGC-----TAAATGG-------------ATTT----TAA-TCA--TTTCCGAAT-ATTTGTATCCA-TTCAGACAAAGTG-TCAAGCTCCTCTCCCT
7 sequences could not be aligned to this particular reference sequence:
Unaligned ( gi|19 ): TTAGATACTGTTGGAGACAATATTGGTTGCTCACCGAAAGAATGAAAAGTGAAGATAACGTAACAGTGATCCATCTCATAAATCCCATAAAGAATATAAAACTAAGGCAAACACGAACCCTTGCATATACCGGAGGTGGGATCAGGTTTTTTTTAAAAGAGGGATAAGCACCCCTTGTTGACCGTCCACTCGCATTATACCCTCTATCTTGATCAGGTAAACTGAGTAATCTGTAGGTCAAGAACGAAATAAATGTTGATGCATT
Unaligned ( gi|26 ): AATTTGCGAAATGATAAGACAGGATTTAAGGCGACAACAATAAAAATTTTTAGAATTTAGTCAGTGGCCTCGACCTGATAAGAAAAAAATATCAAAAAATATACGCACGTGGTATATGACCCTCTGCGCGACGAATCAATCTGATGAGACGATACA
Unaligned ( gi|33 ): GTTTTTGCGTTGGTGACATCAGAATTTTGGATTTTTTCAAAACTTTGGCAGTGACTGGCTTATCATATTTAAAAAGTTTTCTTTTCATGAATGCATTT
Unaligned ( gi|40 ): TTAAAAGTGAAGATAACAAACAGTGATCTATGTCATAATTCCTATAAAAAATTGAAATCTAA
Unaligned ( gi|43 ): GATCTGAGGTCCAGGGGTGATGAATATAGCATACTTCCATGTTGATTGATT
Unaligned ( gi|45 ): TATTAAGTGATGCCATACATAGAGGATCTTGAATGAGT
Unaligned ( gi|48 ): TAGTCGATACTAAAATTCATGCTCATTTGAT






Alignments
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       111111111111                                                                                                                                                                                                                                          11111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                      111111   1111111  22222222222222                                 111111                                22                                                                              111111111111111                                                     1111111111                        111111111111                                            22           3333333333333333333333333333333333                             1111111                                              1   22222                                                               11             22                       11  1111111                                  1111111          3333333333333           444444444444444444444444444                    33333333333            1111   11 1     11111     111  11111111       11     1111111111111   11                      11           111111        11111111             22   111111               22222222222222            11                                                       222222222222                                                                                                          1111111                  222222    111            1111             555555555555555              222222                   2222              222      1  1         22222      111        111             11111                   111     444444444444          1111   11111111        11111   222222                           11111    666666666666666666666666     1111  11            111                11       666666666666666666666666      44444444444444                  11   22222      2222  1        22     11  111       111   111    2222     555555555555      1   6666666666666666666666      222222  1    111  11111    11  11     11          000000000000      333              22222     11           444444444      22                2222     11         2222       222222     5555555    2    111111111    1       1          2     22   22         1      111   3333         33333333333      77777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777  111   1       11         2222     33333333333  1  11 1  11       1   1111    11   4444444444444444444      3333333333     1         1           1    1         11  1   111       111            1       111     111      1     1           1   111    22222                111  11                                       222222222   1    1111      444444444444444444444444444444444444444          7777777777777777777777777777777777777777777777777777   11                   111   1   333333333       22222           333           111  22222    2222      33333       1              1           2             2    222         
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                           6       6  333333   4444444  55555555555555     3    777777 2        2 444  444444  33 33     88      2   2  1    11  2   2 5555   2 444 4    2 6666  4   2 2 2 555  2  2   2  2   2 8888888      333333333333333         2           5555  33 2     2    5  33   2   4444444444     6666 333   2   222 333333333333 333 33    2  2 666  2    2 5555    1 2     11        66 6666666666666666666666666666666666           33  33 2    55555 0000000  2 4 33 55 2 9999999   2    2    2      5555 5 2 66666 88    2     9999999       3 6       2  33  33  2      777 3 0 88  3    55    55   6666   0       3  3 11  8888888     1 555  44   3     0   3      4444444     77   1111111111111 3 3   3   999999999999999999999999999  3 3       3       44444444444 666   3    4444   77 0 3   11111     222  22222222       88     6666666666666   99 3 2 2 3 44 3 44   44 00 6   555   222222 3      22222222        44   22   000000      4 66   4 66666666666666  88      4 22   555  99999 4       5  5  5     0   5        4 777   222222222222        0  1                   2 888   5   5      4   11  99 3  7  3     6   6      3  3  1               8888888      5           888888    111        8 8 4444      77     333333333333333    99        333333 0   8 0        8  3333 8   8     3  999      0  0     44  22222  3   777        444  8      8   33333        1  8    88 222  8  333333333333 3        4444   66666666    5 0 77777   333333       0 0   8       777   77777    222222222222222222222222     4444  11       6    999      8 0       11 0     999999999999999999999999      55555555555555 66           2 3 33   55555   8  1111  0        33 44  33  777       777   444    1111     111111111111   1  0   8888888888888888888888      666666  0    777  22222    33  66 3   11    0     111111111111   0  111  1 1       1 44444 1   44           222222222      33  2          3  4444     88         2222       888888     6666666  1 3    888888888 1  4       3          3     44   22      9  0      777   2222         11111111111      77777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777  777   0    3  33     2   0000   2 66666666666  0  22 0  33 3     0   8888    22 2 6666666666666666666  2   7777777777 3   0         0           0    0         88  0   777       999     55     0       111 3   444      0     0           0   777    44444 0   2       4  444  11    8     8 8  0 8 88         8        444444444   6  1 3333      777777777777777777777777777777777777777   1      2222222222222222222222222222222222222222222222222222   11 0  8  0  8 0    0 444   0 1 222222222    2  55555  0    7   888           777  55555    1111   3  22222       3   7          3 1     11  3             3    999         
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                           .       .  ......   .......  ..............     .    ...... .        . ...  ......  .. ..     ..      .   .  .    ..  .   . ....   . ... .    . ....  .   . . . ...  .  .   .  .   . .......      ...............         .           ....  .. .     .    .  ..   .   ..........     .... ...   .   ... ............ ... ..    .  . ...  .    . ....    . .     ..        .. ..................................           ..  .. .    ..... .......  . . .. .. . .......   .    .    .      .... . . ..... ..    .     .......       . .       .  ..  ..  .      ... . . ..  .    ..    ..   ....   .       .  . ..  .......     . ...  ..   .     .   .      .......     ..   ............. . .   .   ...........................  . .       .       ........... ...   .    ....   .. . .   .....     ...  ........       ..     .............   .. . . . . .. . ..   .. .. .   ...   ...... .      ........        ..   ..   ......      . ..   . ..............  ..      . ..   ...  ..... .       .  .  .     .   .        . ...   ............        .  .                   . ...   .   .      .   ..  .. .  .  .     .   .      .  .  .               .......      .           ......    ...        . . ....      ..     ...............    ..        ...... .   . .        .  .... .   .     .  ...      .  .     ..  .....  .   ...        ...  .      .   .....        .  .    .. ...  .  ............ .        ....   ........    . . .....   ......       . .   .       ...   .....    ........................     ....  ..       .    ...      . .       .. .     ........................      .............. ..           . . ..   .....   .  ....  .        .. ..  ..  ...       ...   ...    ....     ............   .  .   ......................      ......  .    ...  .....    ..  .. .   ..    .     ............   .  ...  . .       . ..... .   ..           .........      ..  .          .  ....     ..         ....       ......     .......  . .    ......... .  .       .          .     ..   ..      .  .      ...   ....         ...........      ................................................................................  ...   .    .  ..     .   ....   . ...........  .  .. .  .. .     .   ....    .. . ...................  .   .......... .   .         .           .    .         ..  .   ...       ...     ..     .       ... .   ...      .     .           .   ...    ..... .   .       .  ...  ..    .     . .  . . ..         .        .........   .  . ....      .......................................   .      ....................................................   .. .  .  .  . .    . ...   . . .........    .  .....  .    .   ...           ...  .....    ....   .  .....       .   .          . .     ..  .             .    ...         
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                           7       7  999999   2222222  55555555555555     2    222222 7        5 444  888888  44 44     44      7   7  7    00  5   4 0000   4 111 7    2 9999  4   4 4 4 333  4  4   1  1   1 2222222      000000000000000         2           0000  22 4     5    0  22   2   2222222222     9999 999   1   555 666666666666 999 11    4  4 555  4    4 0000    8 4     88        55 6666666666666666666666666666666666           22  22 4    99999 0000000  4 7 22 66 4 3333333   5    5    5      3333 0 5 44444 44    7     3333333       1 2       9  99  99  9      999 3 3 88  1    88    88   5555   8       3  3 22  8888888     0 888  66   3     2   3      2222222     99   4444444444444 6 6   6   777777777777777777777777777  6 6       3       22222222222 000   3    9999   33 0 3   77777     555  11111111       33     9999999999999   44 6 6 0 3 66 3 66   66 88 7   888   999999 3      11111111        66   44   555555      4 11   4 11111111111111  99      4 22   222  66666 4       0  0  0     4   0        4 888   888888888888        7  7                   5 888   0   3      3   44  00 5  5  5     7   7      2  2  7               4444444      7           333333    777        0 0 8888      77     333333333333333    22        000000 8   0 8        0  0000 0   0     2  222      0  8     22  22222  2   555        000  0      0   00000        0  0    88 444  0  888888888888 8        6666   44444444    0 8 88888   000000       8 8   0       555   88888    888888888888888888888888     8888  00       0    444      0 8       00 8     888888888888888888888888      00000000000000 66           5 2 88   00000   8  2222  0        22 00  88  555       555   000    2222     888888888888   0  0   5555555555555555555555      222222  0    555  00000    88  55 2   33    7     777777777777   7  000  0 0       0 33333 0   77           000000000      00  5          0  0000     00         5555       000000     7777777  0 7    000000000 0  0       3          7     00   77      2  8      555   2222         00000000000      88888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888  555   0    2  88     5   0000   5 55555555555  0  00 0  22 2     0   5555    55 0 5555555555555555555  5   2222222222 2   0         0           0    0         88  0   555       555     88     0       000 2   888      0     0           0   222    55555 2   5       6  000  00    0     0 0  8 0 88         0        000000000   0  4 4444      888888888888888888888888888888888888888   0      5555555555555555555555555555555555555555555555555555   00 8  0  8  8 6    8 000   0 0 888888888    5  00000  8    3   777           555  00000    2222   2  00000       3   7          3 0     77  7             7    777         
consensus                     :                                                                                                                                                                       AAAT-GGCGAAG-TA----A-CAA----A--GT-A--T-A-AA----CGTAATCATA------G-TCCCAAAA-A---CAT-----AT--A--CAAAA--TCGAGT-GTA-GGGCAAC-CAC-GGA-C----CTC-C---G-ACAA-A----AG-CGA-A-G-G--CAG-GA-TCA-GG-TGC-C-----A-TGGAGGG-----A--------GTAAGCATC-CTCTGCTGACC----GG--T-CACAC-CCGC-CG--TGA-GCC---C-----TTAGTC----G---AAA-CAA-A-G------------T---A--AACG-GG-G---TT-ACCC-G----TCGTCA-AATCTAAGTACGAAA--AC--G-CA-GTCTAAACAAAATG-GGTA-AAT---GAAACAAATCA--GT--C-AACA-----T-------AT-G-A--C--T-T---A---GTG-ATAA-TTTG-TAATCG----CAA-A--CA-A--GGTC-ATTAT-------AGCGACC-G-TAGAATT-TG--CG--AA-ATGATG---ACTTT--AA-CGAGAATTCG-TTTA----TAACCCTGCAA-CA-T--CA-A--C--TTTTTGG---TT--AGT-AGTTGGCCT-CGCTTT-------AAAAA--ATC--T--C-------A-T-ACG-CAT--G-----CATG-------------C-CT-T-GCGTATC-GAATCAA---C------TG-A-GAG-ACAT-TA-CACA-C-A-TAA-----GCAGG--TGA--------TAGTGGTAACATTA-------------CTA-AC-ANAGA-A--A-G--GAA--AGNT-GAC---GAT------T-GCAAAG--------TCAAAGTC--ATCAACGC------TTATCA-T--ATA-A--------------TG-TAGTTGT-C--AGT-C-TG--C--C-ATTAGAG-TC-AA-TATTAAGTA-AAATATCC-A---AAT------------ATGAAGCAGATCTGTCAGATTCTGTGGTGTCCT---TTA-TTTCGAGTTCGTCGGGATAATATCAAAATGGAC-ATA-ATTGTGAAAATTATGATTGTTAATTGAT-A---G-ACATCA-TCTATATACCT------ATAT---GTAAGGTT-G-AA---GGACACG-GCAAG---------------TTTT--TTGTTTTT------ATCCC-GTAACAGTTT-TTTTGAA-ACA-AATTCTGCT--TTCATA-TGGAATATANAA--A--TAAGTC---TGCCAATA---AG-GGGGCA-CAA--T--TAGTGCCCNTA-GGAAT-A-C-CA-AC--A---------GAATTGTTGGANA-GAC--A-TGGTCTCTCCAA-A---GAC------TACATAAATATTA-TCTATAA-G-AAA----ACCCA---------------A-GCAT--ATGCTC-T--TA--ATATCTTACTTCA-AGAGTAC-TTGTGTGGG--CAATCAG----------------AGTG----GGTTCTN-------------ACAAAAATATGTGTCTTG--TTT-----CCCCAA----CG-ACCAGAAACTTGNTA--TT---TTCGGGT---GCC-G-TTTT----TTGTT---------T-AAAANCA-ATTA--------T--CAAT--TC-TGAAAAA-GC---CT-AGAT---TT-T-A-TTTT--ATC-GTGAGAGGAATCGTTGTA-----------GTAAAGT--GGTGGAGAAATCNATATG-TTTTGAATGCAGTCAATTGTCTCAGCATTGGAAACAANTCTCGTGATTNAAAGTTGTTTTNGTATAAAGCTGGGCCTTTAGAAGGGGCGTTTT-----TTGAGA-ATCC-CAATCTC-GAAT-GACACCA-TTCTGGAATA-TGTAG-CGGAA-CAGTATATCNTGAAGT---GAC-T-TTTTAACAGC--TGTTCAG--TAGTTT-------T--TAGT--A-GAC-------TAAGGGA----------TA-GAG---------------GG-----C------TG---GTA-GAGCACT--TACTGGAACC---AGCGA----TG--TA-TC-TTT-G-TTT-GTAAGGA-TTTC---TTAT-GCGT---T---TC-GGAA-----TCCAGT-A--------AAGGT-ATGGTAATT-CAAATTGATCC-TGAT-TCTTCGGAAATAT-TGA---AAGTATTT-CAAACAGAAAGGT-GATTTTG-A-GAATT-T-CATCTT-AGTCA-GATTGCTTGGA-GTATA-AAGT----AAGATTCCCAGATGTGT---GA--AGTA-AACCC-T-AGTT-C-ATTTAAAAAG-ACAAGTATAATA----GTGA-CTCT--TTACAAAC--A-----AAG----ACAAA-------TGTG-NATC---ACTNTGCTTTAT--GCTGTC---T--AACCA-TANCAA-AGTTTTCACGT-G----TC----TAA--CTCA-TTTACNCACTTCTG---GCT-TCT-----TAA-GACAGAA-----GGATAAATAGT-C-CGATTTTCCCC---GC-----TAAA----TGGTTAC----GGATTTT-AATNATTTCCGAAT-ANTTTTGATCA-TTCAGACAAAGTG-TCAAGCTCCTCTCCCT
Reference ( family-568 )      :                                                                                                                                                                       AAAT-GGCGAAG-TA----A-CAA----A--GT-A--T-A-AA----CGTAATCATA------G-TCCCAAAA-A---CAT-----AT--A--CAAAA--TCGAGT-GTA-GGGCAAC-CAC-GGA-C----CTC-C---G-ACAA-A----AG-CGA-A-G-G--CAG-GA-TCA-GG-TGC-C-----A-TGGAGGG-----A--------GTAAGCATC-CTCTGCTGACC----GG--T-CACAC-CCGC-CG--TGA-GCC---C-----NTAGTC----G---AAA-CAA-A-G------------T---A--AACG-GG-G---TT-ACCC-G----TCGTCA-AATCTAAGTACGAAA--AC--G-CA-GTCTAAACAAAATG-GGTA-AAT---GAAACAAATCA--GT--C-AACA-----T-------AT-G-A--C--T-T---A---GTG-ATAA-TTTG-TAATCG----C-A-A--C--A--GGTC-ATTAT-------AGCGACC-G-TAGAATT-TG--CG--AA-ATGATG---ACTTT--AA-CGAGAATTCGNTTTA----TAACCCTGCAA-CA-T--CA-A--C--TTTTTGG---TT--AGT-AGTTGGCCT-CGCTTT-------AAAAA--ATC--N--C-------A-T-ACG-CAT--G-----CATG-------------C-CT-T-GCGTATC-GAATCAA--AC------CG-G-GAG-ACAT-TA-CACA-C-A-TAA-----GCAGG--GGA--------TAGTGGTAACATTA-------------CTA-AC-AAAGA-A--A-G--GAA--AANT-GAC---GAT------T-GCAAAG--------TCAAAGTC--ATCAACGC------TTATCA-T--ATA-A--------------TG-CAGTTGT-C--AGT-C-TG--C--C-ATTAGAG-TC-AA-TATTAAGTA-AAATATCC-A---AAT------------ATGAAGCAGATCTGTCAGATTCTGTGGTGTCCT---TTA-TTTCGAGTTCGTCGGGATAATATCAAAATGGAC-ATA-ATTGTGAAAATTATGATTGTTAATTGAT-A---G-ACATCA-TCTATATACCT------ATAT---GTAAGGTT-G-AA---GGACACN-GCAAG---------------TTTT--TTGTTTTT------ATCCC-GTAACAGTTT-TTTTGAA-ACA-AATTCTGCT--TTCATA-TGNAATATANAA--A--TAAGTC---TGCCAATA---AG-GGGGCA-CAA--T--TAGTGCCCNTA-GGAAT-A-C-CA-AC--A---------GAATTGTTGGAGA-GAC--A-TGGTCTCTCCAA-A---GAC------TACATAAATATTA-TCTATAA-G-AAA----ACCCA---------------A-GCA---ATGCTC-T--TA--ATATCCTACTTCA-AGAGTAC-TTGTGTGGG--CAATCAG----------------AGTG----GGTTCTN-------------ANAAAAATATGTGTCTTG--TTT-----CCCCAA----CG-ACTAGAAA-TTNTTA--TT---TTCGGGT---GCC-G-TTTT----TTGTT---------T-AAAANCA-ATTA--------T--CGAT--CC-CGAAAAA-GC---CT-AGAT---TT-T-A-TTTT--ATC-GTGAGAAGAATCGTTGTGATATTGGGTTAGTAGAGCTCGGNGNAGAAATCNACGNGATNTTGAATGCAGTCAATTGTCTCNGCATTGAAANCAACTCTCGTGATTTAAAGTTGTTTTAGTATAAAGCTGGGCTTTTAGAAGGGGCGTTTTCACCGTTGANATATCCCCAATCTTNGNATNGACACCA-TTCTGGAATAATGTAGGCGGAAACAGTATATCNTGAAAT---GAC-T--TTTAACAGC--TGTTCAG--TAGTTT-------T--TAGT--A-GAC-------TAAGGNA----------TA-GAG---------------G------C------TG---GTA-GAGCACT--TACTGGAACC---AGCGA----TA--TA-TC-TTC-G-TTT-GTAAGGA-TTTN---TTAT-GCGT---T---TC-GGAA-----TCCAGT-A--------AAGGT-ATGGTAATT-CAAATTGATCC-TGAT-TCTTCGGAAATAT-TGA---AAGTATTT-CAAACAGAAAGGT-GATTTTG-A-GAATT-T-CATCTT-AGTCA-GATTGCTTGGA-GTATA-AAGT----AAGATTCCCAAATGCGT---GA--AGTA-AACCC-T-AGTT-C-ATTTAAAAGG-ACAAGTATAGTA----GTGA-CTCT--NTACAAAC--A-----AAG----ACAAA-------TGT--NATC---ACTNTGCTTTAT--GCTGCC---T--AACC--TANCAA-AGTTTTCATGT-G----TC----TAA--CTCA-TTTACNCACTTCTG---GCT-TNT-----TAA-GACAGAA-----GGATAAATAGT-CNCGATTTTCCCC---GC-----TAAA----TGGTTAC----GGATTTT-AATAATTTCCGAAT-ANTTTTGNCCATTTCAGACAAAGTGTTCAANCCCCTCTCCCT
gi|1                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    AAACAGGGTA-TGCA-AA-----AAACCAATCA--AT--C-AATA-----TCATTTTTAT-GTAGTC--TCT---ATT-GTG--TACCTTTG-TAATCG----C-A-AA-C--AACGGTCCATTAT-------AGCGACC-G-TAGTATT-TG--CG--AA-ATGATG---A-TTT--AA-CGAGAATTCGTTATA----TCACCCTGCAA-CA-T--CAGA--C--TTTTTGG---T---AGT-AGTTG-CCT-CGCTTTT------AAAAA--ATC--AT-C-------A-T-ACGACAT--GG----CATG-------------CTCT-T-GCGTATCTGAATCAA---C------TG-A-GAG-ACAT--A-CACA-CCA-TGAACGCAGCGGT--GGA--------TAGTGGTA-CATTATACATTCTTTGTTCTT-AC-TATGA-ATAA-GTTGAACAAGTT-GACTTGGAT------T-GCCAAGCCTATCCTTCAAA-TC--ATCAACGCCCCCCTTTATCCCT--ATA-ACTCGCACCGCTAGTTG-CAGT-GT-C---GC-T-TGTTC--CGATTAATG-TCGAA-TATTTTGTGGAAATATTTTA---AATCACTTCATAACAACGAAGCAGATC-GTCAGATTCTGTGGTGTCCT---TTACTTTCGAGTTGTTCGG--TGATTTCAAATGGGACCATACATTATGAAAATCATGATTGTTAATTGAT-ATAAA-ACATCAATCTATATACTTTCAAATATATTTTGTTAGGTTTGCAACTGAGACACGTGCAAGATT------------TTTTCGTTGTTTTTTAAAAAATCCCCGTAACAGCCTATTTTGAATCCA-AATTC-GCTAGTTGCTAATAGAATTTAGAATCA--TA-GTC---TGCCAATATTTAGTGGGGCAACAGACTCATAGTGTCCATAAGGGAT-AAT-CACAC--ACTTACCTAGGAATGTTTGGAGA-GAC--AATGG-CTACACAATA---GACACCAATTACATAG-T-TTA-TCTATTA-TTAGA----ACCCA---------------AAGCATGAATAAT-----TA--ATATCTT-CTTCA-AGAGCACCTTGTATGAGATTAATCAGTTATTGCATTTTGGGGGGTGTTTTGGTTCTTTTCATTCTTATAAACAAAAATATGCAT-TTAAATTT-----CCCCAA----CG-ACCAGAAACTTGTTACCTTAAGTTCAGGTTTTGCC-G-TTTTGGTGTTGTTCCAAACCCTT-GAAACCA-ATTAATCACTTTT--CAAT--TCTCGAAAAA-GCGCCCT-GGATAATTT-T-AATTTC--ATT-GTGAGAAGAATTGTTGTAATATTGGGTTAGTAGAGCTCGGGGCAGAAATCAATAAGATATTGAATGCAGTCAATTGTCTCAGCATTGAAAACAACTCTCGTGATTTAAAGTTGTTTTAGTATAAAGCTGGGCTTTTAGAAGGGGCATTTTCACCGT-GAGA-ATTC--AATCTTTGAATTGACACCA-TTCTGGAATA-TGTAG-CGGAA-TAGTATATCCTGATATTCTGAC-TCTTTTAACAGCGCTGTTCAAGCTAGTTTAAGCTTTT--TAGT--ATGACAATCTTTTAAGGTA----------TAAGAG---------------GGGTCACT------TG---GTATGATCACTATTTCTGGAACCGCCAGCGACTACTAACTACTT-TTT-G-TTTTGTAAGGA-TCTCACTTTATTGCAT---T---TCCGGAG-----TC-AGT-A--------A-GGT-ATGGGAATTTCAAGTTGGTCCCTCGT-CCTTCGGAA-TAT-TGA---AAGTATTTACAAACAGAAAGTT-GATTTTG-AAGAATT-TTCATCTTTAGTAAAGGTTGCTTGTA-GTAAT-AAGT----AAGATTCTCCAACCTGTTCTGA--AGTA-AACC--T-AGTT-C--TTTAAAAGC-ACAAGTATAA-A----GTAAACTTT--TAACAAACGGA-----AAGCACCATAGC-------TGT--AATC---AGTGTACTTT-T--GCTCTC---T----TC--TGTTAC--GCCTCTAC-T-G----TA----TAA--CTTA-TTTACCCCCTTCTGTTTGCT-TCTCTCGTT---GACAGAAATTAAGGATAAA-AGT-C-CGCTTTTTTCCAACGC-----TAAA----TGGTTA
gi|10                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 tttcaaactaccataccggaaaa--TGA-GCCTTAC-----ATCGTT----G---AT--CAG-A--------------T---A--AACA-GGTG---CT-TCTT-G------GTAT-AATTTA-GTATGTAA--AG--A-CC-GGCTTAACAA--TT-GG---AAT---GAAACGCTTCA--GA--C-AACAACCTAC-------AC-GTA--C--C-T---ACAAGTT-GTA--TTTG-CAAATG----C-A-AAAT--A--AACC-ATCAT-------AACGACC-A-TAGAATT-TG--TA--AACACGA-G---ATTGT--A---GAAACTCCTGTTTG----T-------CAG-TA-T--CA----C--GCCTTGG---TTTAAG--ACTTTATCA-CACTC----------AGA--ATC--TG-T-------T-T-TCG-CAT----------------------------T-T--C-TATT-GGATCAGTTACATTTTGCA-G-GAG-ACAA-AATCAC--C-A-TAA-----ACAAG--TGA--------AAATAG-AATATTG-------------CTACAT-GAATA-C--A-G--GAA--A-TT-GAC---GAT------G-GAAAAG--------TTAAAGCA--ATCT-CGC------TTGTCA-TCAAGA-A--------------GG---GTTGT-TGTAAT-T-TG--C--C-TTGAACG-TC-TA-TGTTCAGTA-AATTATCC-A---AAT------------ATGAatatggaatttgttacaaataaggtttttacttt
gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     gaacacgtcccggtaaCA-GG-TGG-C-------TAGAAGG-----A--------GTGAGTATC-----GC---CC----GA--T-CACAC-CTGC-CG--TTA-GCC---C------TGATC----T---TGA-TCA-G-G------------T------AACGCAA-G---TA-ATCC-G----TAGTCA-AA-CTCAGTATGCAA--AC--G-GATATC-GAAC--AATC-GGTA-AA-----AAGC--ATTA--G------GCG-----T-------TT-G-G--T--C-C---A---TTGTATAA-CTTG-TATCTG----T-A-AATA--A--GATC-ATT
gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             tttactcagtatacacatgtatatgtctttgaagtcggttatgatgttcaatgcaacgacatcggtatacatgtacttcaaacgaactacacgtttaccgtgacatcaaagtaaatatatgtttagcggactttttttctgcctatatatagttacggcactggatttcttatgaacaagtgaaaattacgaacagtgactaatctcttagatcctaaattaaaagtactagtatacaaacaaagatccctagccaagATCATGAAGT---GACGT--CTTAACAGC------------AGTTA-------C--TAGT--A-G--------------GA----------TA-GAG---------------GG-----C------TGCGGGTA-GAGC-CT--TAGTG-AACC---AGCGA----TG--TAATCATTCTG-TTT-G-AAGGAGTTTT---TTAT-GCAT--------C-GAAAAAAAATCCAAT-ATAAAAAACAAGGT-ATGGTAATT-TCAATTGATCC-TGATGTCTTTGGAAA-ATATGAAGCAAATGTTT--AAACA-AAAGGTGGATTTGA-A-GAAGTAT-CACTTT-AGTCA-GATGTCTTGGA-GTA-A-GATT----AGTATT-CCAAATGACT---GA--AGTG-AATCC-T-AGTTAC-AGTTAAAAGGCATAAGTAT-GTA-----TGA-CTAT--TTATCAAC--AC----AAG----ACAAA-------TGTG-AATC---ACTTGGCTTTATCAGCTG--------AACTA-TATCAA-AGTTTTCATGT-GCGTCTT----TAA--C-CA-TTTACACACGTC-----GCTCTGT-----AAA-GACAGAA-----GGCTA
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    tccGTTTT-----TTGATATATCCCCA---TCGGTAT-GACACCA-TTCTGGAATAATGTAGGTGGA--CAGTATCTC-TGAAAA---GAC-TGTTTTAACAGC--TGTTTAG--TAGTTT-----------AGTTTA-GAT-------TAAGGAAGAGGCTTGGTTA-GAGCACTTACTTGAACTAG------CATATATTG---GTA-GAGCACT--TACTGGAAC----AGC-A----TA--TA-TC-TTT-G-TT--GTAAGGA-ATTG---TTAT--TGT---TAATTC-G-AA-----TCCAGTTA--------AAGGTCATTGTAAAT-CAAATTGATCC-AGAT-TCTTCGGAA-TAT-TGA---AAGTATT--CAAACAG-AAGGT-GAATTTGAA-GAATT-C-TATCTT-AGTCA-GATTGCTTGGAGGTATATAAGT-----AGATTCCCAGATGCTC---GA--AGTA-CACCCTT-AG-T-C-ATCTTAAAAG-ACAAGTACAG-A----GTCAGCTCTAGTTACAA
gi|14                         :                                                                                                                                                               agtgtagaAAA--GGCAAAGATA----A-CGA----ACAGTGA--T-C-AATCT-CGTAA-----------G-TCCTAAAT-A---GA------AT--A--CAAAA--ACAAGA-GTC-GGGCAAT-CAC-GGA-C----CCC-T---GGACAC-A----C--CAG-A-A-G--TGG-GA-TCA-GG-TGC-C-------TAGGGGG-----A--------GTAAGCACC-CCCTGTTGACC----GG--T-CACAC-CCGC-CG--TGA-GCC---C-----ATAGTC----T---TGA-TCA-G-G------------T---A--AACG-GA-----------C-A----TC-----AGT----GTGTGAAA--A---A-CG-G-CTTAAC--AATG-GCT---AT---GAAACACATCA--GA--C-AGCA-----T-------TT-G-A--C--T-C---A---ATG-ATAG-GTCA-TATTGG----T-A-AACT--A--AATT-GTTAC-------AACGACC-A-TAGAATT-TA--CG--AA-ATGCTGC--ATTTA--AA-CGTGA---CTGTTGA----AACCCCTGCAA-CA-TACCG-A--C--TTTT
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                              ggatgtA-C----CTC-T---A-ACAA-A----GG-CGA-A-G-G---AG-GG-TCA-GG-TGC-C-----A--GGAGG------A--------GTAAGCATC-CTCTGCTGACC----GG--T-CACAC-CCAC-CG--TGA-GCC---C-----TTAGTCG---G---AAA-TAA-G-G------------T---A--ataaatcatgcactttcttttcaaagtacatgtatatttgcacatgaaat
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    caaatAAATAAGGTA---T---GAACAAAATCA--GT--C-AACA-----T-------ATGG-A--CCTT-T---A---GTG-ATAA-TTTG-CAA-CG----CAA-A--CA-A--GGTC-ATTAT-------ACCGACC-ATTAGAATT-TG--CGAAAA-ATGATG---ATTTTTAAA-CGAGATTTCG--TTA----TAA-CCTGCAA-CATT--CA-A--CTTTTTTTGT---TT--AGC-AGTTAGCCTAAGCTTT-------AAAAA--ATCTTT--C-------ATT-ACG-CGG--A-----CATG-------------CTCT-T-GC-TATC-GAATCAA--CT------TGCG-GAGTAAAT-TA-CACATC-A-TAA-----GCAGGATGGA--------TAGTGGT-GTATTA-------------CTA-tgaacaaaatcagtcaacatatggacctttagtgataatttgcaacgcaaacaaggtcattataccgaccattagaatttgcgaaaaatgatgatttttaaacgagatttcgttataacctgcaacattcaactttttttgtttagcagttagcctaagctttaaaaaatctttcattacgcggacatgctcttgctatcgaatcaacttgcggagtaaattacacatcataagcaggatggatagtggtgtattactacttctttcgttacttggataattttattgaacattgac
gi|16                         :                                                                         caaatacctctaacaaaggcgaaggagggtcaggtgccaggaggagtaagcatcctctgctgaccggtcacacccaccgtgagcccttagtcggAAAT-GGCGAAG-TA----A-CAATTAAA--GT-A--TCA-AA----CGTA-TCATA------G-TCCCCAAA-A---CAC-----AT--A--CAAAA--TCGAGT-GTA-GG-CAAT--AC-GGA-C----CTT-C---G-ACAA-A----AG-CGA-A-AAG--CAG-GAATCAAGG-TGC-C-----A-TGGA-GG-----A--------GTAAGCATC-CTCTGCTGACC----GG--TCCACAC-CCGC-CG--TGA-GCC---C-----TTAGTC----G---AAA-CAA-A-G------------T---A--AACG-GG-G---TT-ACCC-G----TCGTCA-AATCTAG--ACGAAA--AT--GACA-GCCTAACTAACAAG-GGTATAA-----AAACAAATCA--GT--C-A--A-----T-------AT-G-A--C--T-G---A---GTG-ATAA-TTTG-TAATCG----CAA-A--CA-A--GGTC-ATTAT-------AGCGACCGG-TAGAATT-TG--CG--AA-ATGATG---ACTTTAAAA-CGAG-ATTCAG-TTA----TAACCCTGCActtctttcgttacttggataattttattgaacattgac
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         taATAA-G-AAA-----CCCA---------------A-GCA----TGCTCAT--TA--ATATCTAACTTCA--GAGTAC-TTGTGTGGG--CAATCAG----------------AG------GGTTTTC-------------AACAAAATATGTGTCTTG--TTT-----CCC-AA----CG-ACTAGAAA-TTCGTA--TT---TTCGGGT---GCCGG-TTTT----TTGTT---------TAAAAAGCA-ATTA--------TTATAAT-----TGAAAAAGGC---CTAAGAT---TT-TAA-CTTT--ATC-G---GAGGAATCGTTGT------------GTAAAGT---GTGGAGAAATCTACGT--TTTTG-ATGCAGTCAATT
gi|18                         :                                                                                                                                                                                                                                                            aatcgaccaattgttgctaccatatgttttcctaatg-GGA-C----CTC-C---A-A-AA-ATTATAG-AGGTA-G-G--CAG-GA-TCA-GGGTGC-C-----A--GGAGGATCGTAA--------TTGAGCATC-CTCTGCTGACC----GATCT-CACACACCGC-CATCTGA-GCCT--T-----GTAGTT----C---AAA-CAA-A-GC-----------T---A--AACG-GG-GATTCT-ATCC------TCGTCA-AATCT-AGTACGAAA--AT--G-AA-GGCTAAACACAA-G-GGTT-ATT---GAAACAAGCAG--GT--C-AACA-----T-------AT-G-A--CT-T-T---A---GTG-ATAA-TTTG-T-ATCG----C-A-A--C--A--tttgaaaattcttgtatt
gi|19                         :                                                                                                                                                                                           gcaaacataaaatgttatgtagattattatcgTCATA------AATCCCATAA-A---GA------AT--A--TAAAA--C-------TA-AGGCAAA-CAC-GAA-C----CCT-T---G--CAT-AT---AC-CGG-A-G-G--TGG-GA-TCA-GG-TTT-TTTTTAA-AAGAGGG-----A---------TAAGCACC-CCTTGTTGACC-----G--T-C-CAC-TCGC-AT--TAT-ACC---C-----TCTATC----T---TGA-TCA-G-G------------T---A--AACT-GA-G---TA-ATCT-G----T----A-GGTC-AAGAACGAAA--aaat
gi|2                          :                                                                                            ttagatactgttggagacaatattggttgctcaccgaaagaatgaaaagtgaagataacgtaacagtgatccatcAAAT-GGCGAAG-TA----A-CAA----A--GT-A--T-A-AA----CGTAATCATA------G-TCCAAAAA-A---CA------AT--A--CAAAAA-TCGAGTTGTAAGGGCAAC-CAC-GGAAC----CTT-C---G-ACGA-A----AG-CGA-A-G-G--CAA-GG-TCA-GG-TGC-C-----AATGGAGAG-----A--------GTAAGCATC-CTCTGCTGACC----GG--T-CACAC-CCGC-CG--TGA-GCC---T-----GTAGTC----G---AAA-CAA-ATG------------T---A--AACG-GG-G---TT-ACCC-G----TCGTCA-AATCTAAGTATGAAA--AT--G-CA-GTCTAAACAAAATG-GGTA-AAT---GAAACAAATCATGGT--C-AACA-----T-------AT-G-A--C--T-T---A---GTG-ATAC-TTTG-TA-TCG----C-A-A--C--A--GGTC-ATTAT-------AGCGACC-G-TAGAATT-TGTGCG--AA-ATGATG---ACTTT--AA-CGAGAATTCGGTTTA-----AACCCTGCAA-CA-TA-CA-A--C--TTTTTGG---TT--AGT-AGTTGCCCT-CG--TT-------AAAAA--ATC--A--C-------A-TTACG-CAT--G-----CATG-------------C-CT-T-G-GTATC-GAATCA----C------CG-A-GAG-ACAT-TA-CACA-C-A-TAAT----GCAGT--GGA--------TAGTGGTAACATTA-------------CTA-AC-AAAAA-A--A-G--GAA--AAGT-GAC---AAT------T-GGCAAG--------TCAAAGTCCCATCAACGT------TTATCA-T--ATATA--------------TG-T-GTTTTGC--AGT-CCTG--C--C-ATTAGAG-TC-AA-TATTA--TA-AAATATCC-A---A-T------------ATGAAGCACATTGGTCAGATTCTGTGGTGTC-T---TTA-TTTCAAGTTCGTCAGGATAATATCAAAATGGAC-ATA-ATTGTGAAA-TTATGATTGTTAATGGAT-A---A-ACATCG-TCTATATACCT------ATAA---GTAAGGTT-G-AA---GGACACT-GCAAG---------------TTTT--TTGTTTTT------A-CCC-G-AACAGTTT-TCCTGAA-ACA-AATTCTGCT--TTCATA-TGGAATATATAA--AAATAAGTC---TGCCAATA---AG-GGGGCA-ACA--T--TAGTACCCATA-GGAA--A-C-CA-AC--A---------GAATTGTTGGAGAAGACGGA-TG-TCACTCCAA-AAAAGAC------TACAATAATATTAATCTATAAAG-CAA----ACCCA---------------A-GCA---ATGCTC-T--TA--ATATCTTTCTTCA--GAGTAC-TTGTGTGGG--CAATCAG----------------AGTG----GGTTCTG-------------ACAAAAATATGTATCT-G--TTT-----CCCAAA----TG-ACCAGAAACTTGGTA--TT---TTCGGGT---GCC-G-TTTT----TTGTT---------C-AAAAGCA-ATTA--------T--CAATTTCC-TGAAAAA-GC---CT-AGAT---TT-T-A-TTTT--ATCCGTGAG--GAATTGTTGTA------------TAAAGT--GGTGGAGAAATTCATATG-TTTTGA-TGCAGTCAATT---------TTAGAA--AAATCTCGTGATTGAA----GTTTTC-TATAAAGCT----CTTTAGA------GTTTT------TGAGA-ATCCACAATCT--GAATGAACACCACTTCTGGAATA-TGTAG-TGGAAACAGTAT--CTTGAAGT---GAC-C--TTTAACAGC--TGTT-AG--TAGTTT-------TGTTAGT--A-G---------TAAGGGA----------TA-GAG---------------G------C------TG---GTA-AGGCACT--TACTGGAACC---AGCGAA---TG--TA-TC-TTT-GGTTT-GTAAGGA-TTTC---TTAT-GCATATTT---TT-GGAA-----TCCAGT-A--------AAGGT-ATGGTAATT-CAAATTGATCC-TGAT-TCTTCGGAAATAT-TAA---ACGTATTC-CAAACAGAAAGGT-GATTTTG-A-G-ATT-T-CATCTT-AGTCA-GATTGCTAGGA-GTATA-AAGTCAGGAAAATTCCCAGATGTGT---GA--AGTA-AACCC-TAAGTT-CAATTTAAAAAG-ACAAGTATAATA----GTGA-CTTT--ATACAAAC--A-----AAG----ACAAG-------TGT--T------ACTGTGCTTTAT--ACAGCC---TGGAACCAGTAACAA-AGTTTTCATGTAG----TCTATGTAA--CTCA-TTTACCCCCTTCTG---GCT-TCT-----TAA-GACAGAA-----GGGTAAATAGT---AGATTTTCCCC---GC-----TAAA----TGGTTATAACGGGATTTTAAATAATTTCCGAAT-ACTTTTGATCA-TTCAGACAAAGTG-TCAAG-ATCTCTCCCTtaaatgttgatgcatt
gi|20                         :                                                                                                                                                                                              A----A--AT-A--T-A-AATAGGCGAAGT--TA------A-TCCCAAAA-A---CAT-----AT--A--CAAAA--CCAAGT-GTA-GGGCAAC--AC-GGA-C----CTC-C---G-ACAA-A----AG-CGA-A-G-G--CAG-GA-TCA-GG-TGC-C-----A-TGGAAG------A--------GTAAGCATC-CTCTGCTGATC----GG--T-CACAC-CCGC-CG--TGA-GCC---C-----TTAGTC----G---AAA-AAA-A-G------------CATGA--AACG-AA-A---TC-A-----------GTCT-AA-CTA--TAC-ATG--AC--T-TA-GT---GATAATATG-CGT--AATCTGGAAACAAGTCA--TTTGC-GAAA-----TG------AT-G-A--C--T-T---ca
gi|21                         :                                                                                                                                                                                             AA----A--GT-AATT-A--------GTAA-CATA------G-TGCCAAAA-A---CAT-----AT--ATACAAAA--ACGAGT-GCA-GGGCAA--GAC-GGA-C----CTT-C---G-ACAA-A----CG-Ctaaattgagtattcgttat
gi|21                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    ctattaA-CAA-A-A------------T---A--AACA-GG-G---TA-GCCC-G----TCGTAA-AATCTT-GTACAAAA--ATAAG--A-GTCTGA-CAAA--G-GGTA---C---GAAACAGATCA--GT--C-AACA-----C-------AC-G-A--C--T-T---C---GTG-ATAA-TTTG-TAGTCG----CAA-A--CA-A--GGTC-ATTAT-------AGCGACA-G-TAGAATT-TG--CG--AA-AGGATG---Aacaaaataaacagggtagcccgtcgtaaaatcttgtacaaaaataagagtctgacaaagggtacgaaacagatcagtcaacacacgacttcgtgataatttgtagtcgcaaacaaggtcattatagcgacagtagaatttgcgaaaggatgat
gi|22                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   ctattaaaagtaattagtaacatagtgccaaaaacatatatacaaaaacgagtgcagggcaagacggaccttcgacaaacgcTATC-TAATCAA---C------TG-G-GAG-ATATGCA-TAC--C-A-TTT-----GCAAG--GGA--------TAGTGGTA-TATTA-------------CTA--C-AAAGACA--G-G--GAA--AGCT-GAT---GAT------T-GCATTT--------TTAAAGTC--ACCAA-GC------TTATCA-T--ATA-A--------------TG-TAGCTGT-A--AGT-C-TG--C--C-ATTAGAG-CC-AA-TATTAAGTA-AAATATCC-A---ACT------------AAGAAGCAGATTTGTCAAATTCTGTGGTCTCCT---TTA-TTTTGAGTTCGTCGGGt
gi|23                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        A-A----CG-CAC-A-G-G--CAG-GA-TCA-GG-TGC-C-----A-TGGAGG------A--------GTAAGCATC-CTTTGCTGACC----GG--T-CACAT-CCGC-CG--TGA-GCC---G-----GTATTC----G---AAA-CAA-A-A------------T---A--AACA-GG-G---TA-ACCC-G----TCGTAA-AATCT-TGTACGAAA--ATAAG--A-GTCT-GACAAA--G-GGT---AT---GAAACAGATCA--GT--C-AACA-----C-------AC-G-A--C--T-T---C---GTG-ATAA-TTTG-TAGTCG----CAA-A--CA-A--GGTC-ATTAT-------AGCGA
gi|24                         :                                                                                                                                                                       AAA--GGCAAAGATA----A-CGA----ACAGTGA--T-C-AATCT-CGTAA-----------G-TCCTAAAT-A---GA------AT--A--CAAAA--ACAAGA-GTT-GGGCAAT-CAC-GGA-C----CCC-T---GGACAC-A----C--CAG-A-G-G--TGG-GA-TCA-GG-TAC-C-------TAGGAGG-----A--------GTAAGCATC-CCCTGTTGA
gi|25                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          cactgtgataaatggtagtattaatgtTGTGT---GATAAGTATAACCC-T-AGTT-C-ATTTATAAAG-ACAAGTATAATATTTTCTGG-CCCC--TAACAAAA--AAATTCAAG----ACAAATTGACTTTGTAACATCTTAACTCTGTTTCA---ACTGTCCTGT--AA----TAGCAATAGTTCTC----------TCG---TAAGGCTCATTTTAC-CACTTCTG---a
gi|26                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      AATT-TG--CG--AA-ATGATA---A------GA-C-AGGATT-----------TAAGGCGACAA-CA-A--TA-A--AAATTTTTAGAATTT--AGTCAGT-GGCCT-CGACCTGATAAGAAAAAA--ATA--T--CAAAAAATA-T-ACG-CAC--GTGGTATATGAC-----------C-CTCT-GCGCGAC-GAATCAA--TC------TG-ATGAG-ACGA-TA-CA
gi|27                         :                                                                                                                                                                                                        -A--C-A-AC----CGT--TCATA------A-TCCAAAAA-AATGTAT-----AT--A--CAAAAA-TCGAGT-CGA-GAGCAGCGCACTGGA-CACATCTT-CTGTA-ATAA-A----AGCCGA-ATG-GTTTAGTGA-T---AG-TTT-T-----A-TTGAGAG-----AAGAAAATGGTAAG------TCCACTAACC----AG--T-CA
gi|28                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                ggcgactgtaTGTCAGTGTCTGTGGTGTCCTGAATTA-TATTAAGTTCTTCGCGATA-TATCAAA-TGGAT-ATA-ACTGTGAAAATTATGATTGTTAATTGAT-A---GCACATCA-CC
gi|28                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 CACC-GCAAG---------------TTTT---TGTTTTT------ATTCC-GTAACAGGTT-TT---GA-ACA-AATTgcaagtttttgtttttattccgtaacaggttttgaacaaatt
gi|29                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           tgtcagtgtctgtggtgtcctgaattatattaagttcttcgcgatatatcaaatggatataactgtgaaaattatgattgttaattgatagcacat--CTCA-TT---ACACTTCTG---GCT-TTT-----TAAAGACA--A-----GGATAAATAGTACGCCATTTTCCTC---GCGCGCTTAAAGTTTTAATTAC----GGATTTT-AATTACTTCCGAATTAATTTTGATCATTTCAGACAAAGTATTCAA-CTCCTCTCCC
gi|3                          :                                                                                                                                                                       AAAT-GGCGAAG-TACA--A-CAA----T--GT-G--TTA-AA----CGTAA-AATA------G-TCCCAAAA-A---CATGT---AT--A--CAAAA--TTGAGT-GTA-GGTCAAC--AC-GGA-C----CTC-C---G-ACAA-A----AG-TGA-A-G-G---AG-GA-TCA-GG-TGC-C-----A-TGG-GTG-----A--------GTAAGCATC-CTCTGCTGACG----CG--C-CACAC-CCGT-CG--TGA-GCC---C-----TTAGTC----G---AAA-CAACA-G------------T---A--AACG-GG-A---TT-ACC--G----TCGTGA-AATCTA-GTACGAAA--AT--G--A---CTGA-CAAA--G-GATA---T---GAAACAAATCA--GT--C-AACA-----T-------AT-G-A--C--C-T---G---GTG-ATAA-TTTG-TAATCG----C-A-A--AGAA--GGTC-ATTAT-------AGCGACC-G-TATAATT-TG--CG--AA-ATGAT----ACTTT--AAATGAGA-TTCGTTATACCGTTAACCCTGCAA-CA-T--CA-------TTTTTGG---TT--ACT-AGTTGGCCT-AGCTTT-------AAAAAT-CCC--T--C-------A-T-ACA-CAT--ATGC--CATGTGTTGGATATAGCC-CT-T-GCGTATC-GAATCAA---C------TG-A-GAG-ACAT--A-CACA-CCA-TAA-----GCAGG--TGA--------TATTGGTA-CATTA-------------CTA--C-ATAGA-A--AAG--GAA--TGTT-GAC---GATA-----T-GCAAAG--------TCAAAGTC--ATCA-CGT------TTATTA-T--ATA-A--------------TG-TA--TGT-C--AGT-C-TG--CATC-ATTAGAG-TC-AAATATTAAGTA-AAATAGCC-A---AAT------------ATAAAGCAGATATGTCAGATTCTGTGGTGTCCT---TTA-TTTCGAGTTCGCCA----AATATATAAATGGAC-ATA-ATTGTG-AAATT-TTATTGTTAATTGATAA---G-ACATCG-TTTATATACCC------ATAT---GTAAGGTT-G-AA---GGACACG-GT------------------TTTT--TTGTTTTT------ATCCT-GTAACGTTTT-TTTT--A-ACACAATTCTAC---TTCATA-TG-AATATAAAA--A--TAAGTC---TGCCAATA---AG-AGGACA-CAA--T--TAGTGTCCTTA-GGAAT-A-C-CA-AC--A---------T-ATTGTTGGA-A-GAC--A-TGGTTTCT--AA-A---GAC------TACATAAATATTG-TCCATAA-G-AAA----ACCCA---------------A-GC----ATGCTC-T--TA--ATAT-CTACTTC--AGAGTAC-TTGTGTGGG--CAATCAG----------------AGT-----GGTTCTG-------------AC-AAAACATGT
gi|30                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               ctattaaacctgacacaatacatctgctagtcatctgggactgatgtttatatatcACATTG-------------TTA-ACTACATA-A--A-A--GAA--A--T---------T------T-GCAAAA--------CTCAAGTC--ATCA-CGT------TTATCA-T--ATA-A--------------TGTTAGTTGT-CCAAGTCC-TG-----C-ATTAGAGATT-AA-TATTAAAGG-AAGTGTTC-ATGGAAT------------A
gi|31                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       T-CA-CAC--C-A-TAA-----GTAGG--TGG--------TAGTGGT-ATATTA--------------TC-AC-ATTGA-A--A-G-----------------------------GCAAAG--------TTAAAGTC--ATC-TTGC------TTATCA-T--ATA-A--------------TG-CAGTTGT-C--AGT-G-TG--T--C-ATTAG
gi|32                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                cttatCAT-T--CAC--C-A-TAA-----GCAGGT-GGA--------TGGTGGTA-TATTA-------------CTA--C-ATAGA-A--A-G--GGA--AAGTTGAC---GATAGCCGATAGCAAAG--------TTAAGGTC--ATC-ACGC------TTATC
gi|34                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    tatcctCAATA---AG-GGGGCA-CAA--T--TAGTGCCCGTT-GGAAT-A-T-CA-AC------------GGATTGTTAG-TA-GAC--A-TGG--TCTCCAA-A---GAC------TACACAAATATTA-TTTATAA-G-
gi|35                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           GA-GCC---T-----TTAGTC----G---AAAACAG-G-GAGGGGGGGCGGTT---ACGAGCG-GA-G---TT-ACCCTG----TCGTCAGAATCT-AGTACGGAA--A---G--A-G--TGGACAAA--G-GGTA-ctaa
gi|36                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      A-GG-T-C-C-----G-TGAATGA-----A--------GTAAGCATCTCGTTGCTGATCCGAGGA--T-CACAC-CCAC-CG--TGA-GC------------AATCAAGAG---AAA-CAG-A-tg
gi|37                         :                                                                                                                                                                                                                             gatggatggtcgCCCAACATA---CATGTATAAT--A--CAGAG--TCGA-T-GTA-GA-CAAC--AC-AGA-C----CTAGT---A-ACAA-A----AGGCGA-G-G-G--CAG-GA-TCA-GG-TGC-C-----A-TG
gi|38                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             ccATTTTCCCC---GC-----TAAA----TGG----------ATTTT-AATCATTTCCGAAT-ATTTGTATCCA-TTCAGACAAAGTG-TCAAGCTCCTCTCCCT
gi|39                         :                                                                                                                                                                     gcAAAT-GGCGAAG-TATTTTA-CAA----T--GT-G--T-TTAA----CATAATCATA------G-TCCAAAAA-A---CAT-----GT--A--CAAAA--TCGAG
gi|4                          :                                                                                                                                                              tttgttataAAATTGGCGAAG-TA----AACAA----T--GT-G--TTA-AA----CGTAATCGTACATGTAG-TCCCTAAA-A---CAT-----AT--A--TACAACTTCGAGT-GTA-TGGCAAC--AT-GGA-C----CTC-C---G-ACAACA----GG-CGA-A-G-C--CAG-GA-TCA-G--TGC-C-----A-TGGAGGG-----A--------GTAGGCATC-CTCTGCTGACC----GG--T-CAC-C-CCACACG--TGA-GCCT--C-----GTAGTC----G---AGA-CAA---G------------T---A--AACA-GG-G---TT-TACC-G----TC---------TAC-TACGAAATGAG--A-CA-GTCTAA-CAA---G-GGTA---T---GAAACAAATCA--GT--C-AGCA-----T-------AT-G-A--C--T-T---A---GTG-ATAA-TTTGGTAATCG----C-A-A--C--AA-GGTC-AT-AT-------AGCGACC-G-TAGAATCCTG--CG--AA-ATGCTGCGGACTTTGAAA-CGAGAACTCG--TTA----TAACCCTGCAAACA-T--CA-TTTC--TTTTT-----TT---GT-AATTGAC-T-CGCTTT-------AAAG----TC--CTGC-------G-T-CCG-CAT--GA----TATA-------------C-CT-TTGCGTATC-GAATCAA---C------TG-A-GAG-ACAT--A-CACA-CCA-TAA-----GCAGG--TGA--------TAGTGG-AACATTA-------------CTA--C-AAAGA-A--A-G--GGA--AAGTTGAC---GAT------T-GCAAAG--------TCA--------TCA-CGT------TTATCA-T--ATA-A--------------TG-TAGTTGT-C--AGT-C-TG--C--C-ATTAGAA-TC-AA-TTTTAAGTA-AAATATCC-A---AAT------------ATGAAGCACATCTGTCAGATTCTGTGGTGTTCT---TTA-TTTGGAGTTCGTCAGGAT-ATATC-AAATGGAC-ATA-ATTATGAAAATTATGATTGTTAATAGATCA---G-ACATCA-CCTATATATCTAC----ATAT---GTA
gi|41                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               actatcttatccgaatgacatcaaagattacttgaacgattgtctgtactgcaatat-A---G-ACATCA-TCTATATATCT------ATAT---GTAATGAT-G-AA---GGACACA-GTAAG---------------TTTT--TTGTTT
gi|42                         :                                                                                                                                                                       AAAT-GGCGAAG-TA----A-CAA----A--GT-A--T-G-AAC---CGTAATCATA------
gi|44                         :                                                                                                                                                                       AAAT-GGCGAAG-TA----G-CAA----A--GT-AT-T-C-AA----CATAATCATA------A-Tcgtacacagataaaccata
gi|46                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            cgcacatttataTTTTGG---TT--AGT-AGATGGCCT-CGCTTT-------AACAA--ATC--
gi|47                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     A-A--G-G--GGA--AATT-GAC---AAT------T-GCAAAG--------TCAAAGTC--AT
gi|49                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          -A---AAT------------ATGAAGCACATCTGTCTGATTCTGTG
gi|5                          :                                                                                                                                                                       AAATTGGTGAAG-TA----AACAA----T--GT-G--T-T-AAT---CGTAATCATA------G-TCCTAAAA-A---CAT-----ATTTA--CAAAG--TCGAGT-GTA-GGGCAAC--AC-GGA-T----CTC-C---G-ACAA-A----AG-CGA-A-G-G--CAG-GA-TCA-GG-TGC-C-----A-TAGAGG------A--------GTAAGCATC-CTCTGCTGACC----GG--T-CACAC-CCGC-CA--TGA-GCC---C-----TTAGTC----G---AAA-CAA-G-G------------T---A--AACA-GG-A---TT-ACCC-G----TTGTCA-CATCT-AGTACGAAA--AT--GACA-GTCT-AACAAAA---GGT---AT---GGGACAAATCA--GT--C-AGCA-----T---------------------------------TAA-TTTA-TAATCG----CAA-A--CA-A--GGTC-ATTAT-------ACCGACT-G-TAGAATT-TG--CG--AC-ATGGTG---ACTTTA-AA-CGAGAA-TCG--TTA----TAATCCTGCAA-CA-T--CA-A--C--TTTTTAG---TT--AGT-AGTTGGCCT-CGCTTT-------AAAAA--GTCT-T--C-------A-T-ACG-CAT--GA----CATGT------------T-CT-T-GCGTATC-TAATCAACTGCA-----TG-G-AAA-ACAT-T--CACACC-A-TAA-----GCAGG--TGATACATTTGTAGTGGT-ACATTA-------------CTA-
gi|6                          : tatactctatatgataatatatgtcttctgaaaccgcttttacatgtttctgtgttggcgacatcggtattttgggctttttcaaaagtttggcttatatttaaaaagttttcttttcatgaatgcatttttttctgtatttttttttattgtatgtagtaaaagatatT-GGCCAAA-TA----AACAA----T--TTGA--T-A-AT----TGTAATCAAA------A-CCCCAAAA-----CAT-----AC--A--CAAAG--TCGAAT-GTA-AGGAAAC--AC-AGA-C----CTC-C---G-ATAA-T----AG-CGA-A-G-G--AAT-AG-TCA-GT-CG-----------------------------------GCATC-CTCTGCTGACC----GG--T-CACAT-CCGC-CG--TGA-GCC---C-----TTGGTC----G---AAA-CAA-A-G------------T---A--AACG-GG-A---TT-ACCC-G----TCGTCA-AATCTA-GTAGGAAA--AT--GACA-GTCTAA-CAAA--G-GGTA---T---GAAACAAATCA--GT--C-AACA-----T-------AT-G-A--C--T-T---A---ATG-ACAA-CTTG-TAATCG----C-ATA--C--AA-GGTC-ATT---------------------------TG--CG--AA-ATGGTG---ACT---------------------G----TAGCCCTGCAA-CA-T--CA-------TTTTTTG---CT--AGT-AGTTGACCT-CGCTTT-------AAAAA--GTC--CT-C-------G-T-ACG-CAT--GA----CATG-------------CTCT-T-GCGTATC-GAATCAA---C------TG-G-AAG-ACAC--A-CACA-C-AATAA-----GCAGG--TGA--------TAAGGGTA-CATTA-------------CTA--C-ATGAA-A--A-G--GAA--AGGT-GAC---GAT------T-GCAAAG--------TTAAAGTC--ATCA-CGC------TTATCA-T--ATA-A--------------TG-CAGTTAT-C--AGC-C-TA--C--C-TTTAAAG-TC-AA-TATTAAGTA-AAAAATCC-A---AAT------------ATGAAGCAGATATGTCAGATTCTGTGGTGTCCT---TTA-ca
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    atagatTGTCAGATT--GTGTTGTC-T---TTA-TAT-GAGTTT-TCGGGATA-T-TCCAAAT------TA-AT----------GCCCTTGTTA-TTGAT-A---GCAGAT-A-TCTATAT-CCT------ATAT---ATAAGGTT-G-A-----GACAAA-GCAGGGAGTTTTTTTTTTTTTTTT--TTGTTTTT------ATCCC-GTAA-AGTTT-TTGT--A-GCA-AATTCTGC---TTCATA-TGTAATAT-TCA--G--TAAGTCTGGTGCCAATA---AA-GGGG---CAA--T--TAGTGCCACTA-GGAATGA-CGCA-ACGGA---------GAATTGTTTGATC-GAC--C-T-GTCTCTCC-A-C---GAC------TACATAAATAATT-TCTGTAA-G-AAACTCTACTCATCATGATGTCATGTTA-TCAT--TTGTTC-TAATAATATATCCTACTTCAGAGAGTAC-T--TGTGGG--C-ATCAG----------------AGT-----GTTTTTT-------------AAACAAATATGTGTCTTG--TTTTTCCGCCCCAATCCCCGAACTAGAAA--TATTA--TT---TTCGGGG---GTC-ATTTTT----TTGTT---------T---AACCACATT---------T--CGATAATC-TGAAAAG------CT-AGAT---TTAT-A-TTTTTAAT--GTGAatactggcgtcaaagctcaaaattcttggagcgggaataataaaatatatt
gi|8                          :                                                                                                                                taagatataaaacggtcagctactaaggattgtgtggtgAAAT-GGCGAAG-TA----A-CAA----A--GT-A--TGA-AA----CGTAATCATA------G-TCCAAAAA-A---CAC-----AT--A--CAAAA--TCGAGT-GTA-GGGCAAC--AC-GGA-C----CTT-C---G-ACGA-A----AG-CGA-A-G-G--CAG-GA-GCA-GG-TGC-C-----A-TGGAGG------A--------GTAAGCATC-CTCTGCTGACC----GG--T-CACAC-CCGC-CG--TGA-GCC---T-----GTAGTC----G---AAA-CAA-A-G------------T---A--AACG-GG-G---TT-ACCC-G----TCGTCA-AATCT-AGTATGAAA--AT--GACA-GTCT-AAC-AAAT--GGT---AT---GAAACAAATCA--GT--C-AACA-----T-------AT-G-A--C--T-T---A---GTG-ATAC-TTTG-TAATCG----CAA-A--CA-A--GGTC-ATTAT-------AGCGACC-G-TAGAATT-TG--CG--AA-ATGATG---ACTTTA-AA-CGAG-ATTCG--TTA----TAACCCTGCAA-CA-T--CA-A--C--TTTTTGG---TT--AGT-AGTTGGCCT-CGCTTT-------AAAAA--ATCA-T--C-------A-T-ACG-CATG-G-----CATGC------------C-CT-T-GCGTATC-GAATC-A--AC------TG-A-GAG-ACA--TA-CACACC-A-TAA-----GCAGG--TGA--------TAGTGGT-ACATTA-------------CTACAC-AAA-A-A--A-G--GAA--AGTT-GAC---AAT------T-GCAAAG--------TCAAAGTC--ATC-ACGT------TTA
gi|9                          :                                                                                                                                                                                                                                 ggcatataCCCCAAC-A---CAT------T--A--CAAAT--TCGC-T-GTA-AG-CAAC-CG--GGA-C----CTC-C---G-ACAA-A----AG-----A-G-G--TAG-GA-TCA--G-TGCAC-----A-TGGGAGG-----A--------GTAAGTTTC-CTCTCCCGAC------G--T-CACAC-CCGCGCA--TGACACC---CCCAAATTAGAT----GACCAAA-C-A-A-G------------T---A--AACG-GG-GA--TTAACCC-GGGTTTCA--A-AAT---AGTACGAAATGAC--A-CA--TCT-AACAAA--G-GGT---AT---GAAACAAATCA--GT--CAAACA-----T-------AT-G-A--C--T-TGCGG---ATG-ATAA-TTTG-TAATCGGGAAC-A-A--C--A--GGTC-ATTATTTCGATAAGC-ACC-GCTAGAATT-GC--CG--A-----------------------AGAATTCG--TTA----TTAACCTACAA-CA-TA-CA-A--C--TTTTTTG---TT--AGT-AGTTTGGCT-CCCTTT-------AAAAGCCCTC--C--C-------A-C-ACG-CACGAG-----TATG-------------C-TC-T-GCGTATC-GAATCAA--AC------CG-A-GAG-ACAT-
5 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|33 ): GTTTTTGCGTTGGTGACATCAGAATTTTGGATTTTTTCAAAACTTTGGCAGTGACTGGCTTATCATATTTAAAAAGTTTTCTTTTCATGAATGCATTT
Unaligned ( gi|40 ): TTAAAAGTGAAGATAACAAACAGTGATCTATGTCATAATTCCTATAAAAAATTGAAATCTAA
Unaligned ( gi|43 ): GATCTGAGGTCCAGGGGTGATGAATATAGCATACTTCCATGTTGATTGATT
Unaligned ( gi|45 ): TATTAAGTGATGCCATACATAGAGGATCTTGAATGAGT
Unaligned ( gi|48 ): TAGTCGATACTAAAATTCATGCTCATTTGAT






Alignments
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                      111111   1111111  22222222222222                                 111111                                22                                                                              111111111111111                                                                                       111111111111                                            22           3333333333333333333333333333333333                           1111111                                                                                                                   11              1111111111                11  1111111                                  1111111          2222222222222           444444444444444444444444444                          1111              1111   11 1                    11111111       11     1111111111111   22                                    111111        11111111             22   111111                111111111              1111111                                                 222222222222                                                                                                          222  1                  2222   11111             1111      11     444444444444444    1111        222222                   2222              222     1             22222      111        111               111                11        444444444444          1111   11    1        11111   222222                           11111     555555555555555   22222       11  11            111                11      5555555555555555555555555      44444444444444                111    222222     2222  1            1  11  111      111    111    2222    4444444444444      1   444444444444444444444  1      33333   1    11  2222     11  11     11         66666666666666     2222           1     1                  333333333       11               2222     11         2222        222222     2222     1  111     444   1   1     1          1          1         1     111    22        11      444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444  111   1      11         111       111  44444444  11    2          1   1111   1     55555555555555555555555555555555555     1       1           1      1             1   111       111            1       2    1  1     1     1             1   111    22222               111   11                                         2222222         11        444444444444444444444444444444444   111          3333333333333333333    111         55555555555555   11                   111   22222222  111    222222             11111        111   22222    2222      33333       1             1            1                             
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                           6       6  333333   4444444  55555555555555     3    777777 2        2 444  444444  33 33     88      2   2  1    11  2   2 5555   2 444 4    2 6666  4   2 2 2 555  2  2   2  2   2 8888888      333333333333333         2           5555  33 2     2    5  33   2   6666666 2  2   2 666  333 2   222 333333333333 333 33    2  2 666  2    2 5555    1 2     11        66 6666666666666666666666666666666666           33  33 2    444 0000000   4 33 55 2 444444   2    2    2  0       33  33 2   5555 2     9999999       3 6       2  33  33  2      777 3 0 88  3    33   3 7777777777   0       3  3 11  8888888     1 555  44   3     0   3      4444444     77   5555555555555 3 3   3   999999999999999999999999999  3 3       3     3 555 3 7777  8888   3    4444   77 0 3   77    44 3 3 6 22222222       88     6666666666666   00 7 222 6 555 3 44 6  44 66    555   222222 3      22222222        44   22   000000      4 66   4  777777777       8888   6666666  99999 4       5  5  5     0   5        4 777   222222222222        0  1                   2 888   5   5      4   11  99 3  7  3    6    6      3  3  1               111  1     5            3333   66666       8   8 4444      00     888888888888888    4444        333333 88    0        8  3333 8   8     3  999     0  6      44  22222 3    777        444  8     8   8  444        1 8     66  8  8  333333333333 3        3333   99    0    5 0 77777   333333     6   0   8    6   6    77777   8 000000000000000   33333  3  8 11  11     3 6    999     8  0       11 0    9999999999999999999999999      55555555555555  5           2 777    777777     1111  0        6   0  33  777      777    444    1111    2222222222222   1  0   555555555555555555555  0      00000   0    33  4444     33  66 3   11    0    88888888888888     1111           4   4 3      7           777777777       88 1          1  4444     66         2222        888888     8888     3  555     111   3   3     3          3     3    3      9  0     777    00   3    33  3   777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777  777   0    3 33      2  777 2   2 111  66666666  33    0  3 3     0   7777   0 2 2 55555555555555555555555555555555555     0       0           0      0       3 66  0   777       999     55     0       0  3 0  0     0     0             0   777    44444 0   2         444   11    8  3  8 8  0 8 88         8        0 3333333 8888  1 11 1      888888888888888888888888888888888   777   1      3333333333333333333  1 000         88888888888888   11 0  8  0  8 0    0 444   66666666  000    777777    0    7   77777        777   55555    1111   3  22222       3   1         3  1         3                    6        
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                           .       .  ......   .......  ..............     .    ...... .        . ...  ......  .. ..     ..      .   .  .    ..  .   . ....   . ... .    . ....  .   . . . ...  .  .   .  .   . .......      ...............         .           ....  .. .     .    .  ..   .   ....... .  .   . ...  ... .   ... ............ ... ..    .  . ...  .    . ....    . .     ..        .. ..................................           ..  .. .    ... .......   . .. .. . ......   .    .    .  .       ..  .. .   .... .     .......       . .       .  ..  ..  .      ... . . ..  .    ..   . ..........   .       .  . ..  .......     . ...  ..   .     .   .      .......     ..   ............. . .   .   ...........................  . .       .     . ... . ....  ....   .    ....   .. . .   ..    .. . . . ........       ..     .............   .. . ... . ... . .. .  .. ..    ...   ...... .      ........        ..   ..   ......      . ..   .  .........       ....   .......  ..... .       .  .  .     .   .        . ...   ............        .  .                   . ...   .   .      .   ..  .. .  .  .    .    .      .  .  .               ...  .     .            ....   .....       .   . ....      ..     ...............    ....        ...... ..    .        .  .... .   .     .  ...     .  .      ..  ..... .    ...        ...  .     .   .  ...        . .     ..  .  .  ............ .        ....   ..    .    . . .....   ......     .   .   .    .   .    .....   . ...............   .....  .  . ..  ..     . .    ...     .  .       .. .    .........................      ..............  .           . ...    ......     ....  .        .   .  ..  ...      ...    ...    ....    .............   .  .   .....................  .      .....   .    ..  ....     ..  .. .   ..    .    ..............     ....           .   . .      .           .........       .. .          .  ....     ..         ....        ......     ....     .  ...     ...   .   .     .          .     .    .      .  .     ...    ..   .    ..  .   ..........................................................................................  ...   .    . ..      .  ... .   . ...  ........  ..    .  . .     .   ....   . . . ...................................     .       .           .      .       . ..  .   ...       ...     ..     .       .  . .  .     .     .             .   ...    ..... .   .         ...   ..    .  .  . .  . . ..         .        . ....... ....  . .. .      .................................   ...   .      ...................  . ...         ..............   .. .  .  .  . .    . ...   ........  ...    ......    .    .   .....        ...   .....    ....   .  .....       .   .         .  .         .                    .        
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                           7       7  999999   2222222  55555555555555     2    222222 7        5 444  888888  44 44     44      7   7  7    00  5   4 0000   4 111 7    2 9999  4   4 4 4 333  4  4   1  1   1 2222222      000000000000000         2           0000  22 4     5    0  22   2   0000000 1  1   1 666  777 1   555 666666666666 999 11    4  4 555  4    4 0000    8 4     88        55 6666666666666666666666666666666666           22  22 4    111 0000000   7 22 66 4 999999   5    5    5  8       44  44 5   7777 7     3333333       1 2       9  99  99  9      999 3 3 88  1    88   1 5555555555   8       3  3 22  8888888     0 888  66   3     2   3      2222222     99   9999999999999 6 6   6   777777777777777777777777777  6 6       3     3 888 3 5555  5555   3    9999   33 0 3   99    66 3 3 7 11111111       33     9999999999999   88 3 777 7 888 3 66 7  66 44    888   999999 3      11111111        66   44   555555      4 11   4  888888888       9999   3333333  66666 4       0  0  0     4   0        4 888   888888888888        7  7                   5 888   0   3      3   44  00 5  5  5    7    7      2  2  7               444  4     7            3333   77777       0   0 8888      33     333333333333333    2222        000000 88    8        0  0000 0   0     2  222     0  5      22  22222 2    555        000  0     0   0  000        0 0     88  0  0  888888888888 8        4444   00    6    0 8 88888   000000     0   8   0    7   7    88888   0 000000000000000   44444  2  0 00  00     8 0    444     0  8       00 8    8888888888888888888888888      00000000000000  6           5 000    555555     2222  0        5   8  88  555      555    000    2222    8888888888888   0  0   888888888888888888888  0      00000   0    88  8888     88  55 2   00    7    33333333333333     0000           0   7 3      3           000000000       00 0          0  0000     00         5555        777777     3333     3  333     000   3   3     3          3     7    3      2  8     555    88   2    88  2   222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222  555   0    2 88      5  555 5   5 222  22222222  88    0  2 2     0   8888   0 5 0 55555555555555555555555555555555555     0       0           0      0       2 55  0   555       555     88     0       0  2 0  0     0     0             0   222    55555 2   5         000   00    0  2  0 0  8 0 88         0        8 6666666 2222  4 00 4      555555555555555555555555555555555   555   0      8888888888888888888  0 222         00000000000000   00 8  0  8  8 6    8 000   22222222  222    555555    8    3   11111        555   00000    2222   2  00000       3   0         3  0         3                    7        
consensus                     :                                                                                                                                                                       AAAT-GGCGAAG-TA----A-CAA----A--GT-A--T-A-AA----CGTAATCATA------G-TCCCAAAA-A---CAT-----AT--A--CAAAA--TCGAGT-GTA-GGGCAAC-CAC-GGA-C----CTC-C---G-ACAA-A----AG-CGA-A-G-G--CAG-GA-TCA-GG-TGC-C-----A-TGGAGGG-----A--------GTAAGCATC-CTCTGCTGACC----GG--T-CACAC-CCGC-CG--TGA-GCC-C-----T-TA-GTC-G---AA---A-CAA-A-G------------T---A--AACG-GG-G---TT-ACCC-G----TCGTCA-AATCTAAGTACGAAA--AC--G-CA-GTCTAAACAAAATG-GGTA-AAT---GAAACAAATCA--GT--C-AACA---T-------ATG-A--C--T-T---A--GTG-ATAA-TTTG-TAATCGCAAA--CA--A-GGT----C-ATTAT-------AGCGACC-G-TAGAATT-TG--CG--AA-ATGATG---ACTTT--AA-CGAGAATTC-G-TT-TA----TAACCCTGCAA-CA-T--CA-A--C--TTTTTGG---TT--AGT-AGTTGGCCT-CGCTTT-------AAAAA--ATC--T--C-------A-T-ACG-CAT--G-----CATG-------------C-CT-T-GCGTATC-GAATC-A---A-C----TG--A-GAG-ACAT-TA-CACA-C-A-TAA--GCAG--G-T-G-A--------TAGTGGTAACATTA-------------CTA-AC-ANAGA-A---A-G--G-AA--AGTTGAC---GAT------T-GCAAAG--------TCAAAGTC--ATCAACGC------TTATCA-T--ATA-AT-------G-TAGTTGT-C--AGT-----C-TG--C--C-ATTAGAG-TC-AA-TATTAAGTA-AAATATCC-A---AAT------------ATGAAGCAGATCTGTCAGATTCTGTGGTGTCCT---TTA-TTTCGAGTTCGTCGGGATAATATCAAAATGGA-CATA-ATTGTGAAAATTATGATTGTTAATTGAT---AG-ACATC-ATCTATATACCT----ATA-----TGTAAGG-TTG-AA---GGACACG-GCAAG---------------TTTT----TTGTTTTT------AT-CCCGTAACAGTTT-TTTTGAA-ACA-AATTCTGCT--TTCAT-ATGGAATATANAA--A--TAAGTC---TGCCAATA---AG-GGGGC-ACA-AT---TAGTGCCCNT-AGGAAT-AC-CA-AC--A---------GAATTGTTGGANA-GAC--ATGGTCTCTCCAA-A---GAC------TACATAAATATTA-TCTA-TAA-GAAA----ACCC-A---------------AGCAT--ATGCTC-T--TA--ATATCTTACTTCA-AGAGTA-CTTGTGTGGG--CAATCA----------------GAGTG----GGTTCT-------------NACAAAAATATGTGTCTT--GTTT-----CCCCAA----CG-ACCAGAAACTTGTTA--TT---TTCGGG---TGCC-G-TTTT----TTGT---------TT-AAAANCA-ATTA--------T--CAAT--T--CT-GAAAAA-G---CCT-AGAT--TT-T--ATTTT--ATC-GTGAGAGGAATCGTTG-----------TAGTAAAG--TGGTGGAGAAATC-ATACG-TTTTGAATGCAGTCAATTGTCTCAGCATTGGAAACAANTCTCGTGATTNAAAGTTGTTTTNGTATAAAGCTGGGCCTTTAGAGGGGGCGTTTTT----TGAGA-ATCC-CAATC-T-GAA-TGA-CACCA-TTCTGGAATA-TGTAGCGGAA-CAGTATATCNTGAAG---TGACT-TTTTAACA--GCTGTTCAG--TAG-------TTTT--TAGT--A-GAC-------TAAGGGA----------T-AGAG--------------GG-----C------TG---GTA-GAGCAC--TTACTGGAA---CCAGCGA-TGTA--------TC--TTTG-TTTGTAAGGA-TTTC---TTA-TGCGT---T---T-CGGAA-----TCCAGT-A--------AAGGT-ATGGTAA-TTCAAATTGAT-CCTGAT-TCTTCGGAAATAT-TGA---AAGTATTT-CAAACAGAAAGGT-GATTTTGAAGAA-TT-TCATC-TTAGT-CAGATTGCTTGGA-GTATA-AAGT----AAGATTCCCAGATGTG---TGA--AGTA-AACCC-T-AGTT-C-ATTTAAAAAG-ACAAGTATAATA----GT-GA-CTCT--TTACAAAC--A-----AAG----ACAAA-------TGT-GAATC---ACTNTGCTTTAT--GCTGTCT--AACTA-TAACAA-AGTTTTCACGT-G----TN----TAA--CTCA-TTTACNCACTTCTG---GCT-TC-----TTAA-GACAG-----AAGGATAAATAGT-CG--ATTTTCCC---CGC-----TAAA----TGGTTAC----GGATTTT-AATNATTTCCGAA-TANTTTTGATCA-TTCAGACAAAGTGTCAAGCTCCTCTCCCT
Reference ( family-568 )      :                                                                                                                                                                       AAAT-GGCGAAG-TA----A-CAA----A--GT-A--T-A-AA----CGTAATCATA------G-TCCCAAAA-A---CAT-----AT--A--CAAAA--TCGAGT-GTA-GGGCAAC-CAC-GGA-C----CTC-C---G-ACAA-A----AG-CGA-A-G-G--CAG-GA-TCA-GG-TGC-C-----A-TGGAGGG-----A--------GTAAGCATC-CTCTGCTGACC----GG--T-CACAC-CCGC-CG--TGA-GCC-C-----T-TA-GTC-G---AA---A-CAA-A-G------------T---A--AACG-GG-G---TT-ACCC-G----TCGTCA-AATCTAAGTACGAAA--AC--G-CA-GTCTAAACAAAATG-GGTA-AAT---GAAACAAATCA--GT--C-AACA---T-------ATG-A--C--T-T---A--GTG-ATAA-TTTG-TAATCGCAAA--CA--A-GGT----C-ATTAT-------AGCGACC-G-TAGAATT-TG--CG--AA-ATGATG---ACTTT--AA-CGAGAATTC-G-TT-TA----TAACCCTGCAA-CA-T--CA-A--C--TTTTTGG---TT--AGT-AGTTGGCCT-CGCTTT-------AAAAA--ATC--T--C-------A-T-ACG-CAT--G-----CATG-------------C-CT-T-GCGTATC-GAATC-A---A-C----TG--A-GAG-ACAT-TA-CACA-C-A-TAA--GCAG--G-T-G-A--------TAGTGGTAACATTA-------------CTA-AC-ANAGA-A---A-G--G-AA--AGNTGAC---GAT------T-GCAAAG--------TCAAAGTC--ATCAACGC------TTATCA-T--ATA-AT-------G-TAGTTGT-C--AGT-----C-TG--C--C-ATTAGAG-TC-AA-TATTAAGTA-AAATATCC-A---AAT------------ATGAAGCAGATCTGTCAGATTCTGTGGTGTCCT---TTA-TTTCGAGTTCGTCGGGATAATATCAAAATGGA-CATA-ATTGTGAAAATTATGATTGTTAATTGAT---AG-ACATC-ATCTATATACCT----ATA-----TGTAAGG-TTG-AA---GGACACG-GCAAG---------------TTTT----TTGTTTTT------AT-CCCGTAACAGTTT-TTTTGAA-ACA-AATTCTGCT--TTCAT-ATGGAATATANAA--A--TAAGTC---TGCCAATA---AG-GGGGC-ACA-AT---TAGTGCCCNT-AGGAAT-AC-CA-AC--A---------GAATTGTTGGANA-GAC--ATGGTCTCTCCAA-A---GAC------TACATAAATATTA-TCTA-TAA-GAAA----ACCC-A---------------AGCAT--ATGCTC-T--TA--ATATCTTACTTCA-AGAGTA-CTTGTGTGGG--CAATCA----------------GAGTG----GGTTCT-------------NACAAAAATATGTGTCTT--GTTT-----CCCCAA----CG-ACCAGAAACTTGNTA--TT---TTCGGG---TGCC-G-TTTT----TTGT---------TT-AAAANCA-ATTA--------T--CAAT--T--CT-GAAAAA-G---CCT-AGAT--TT-T--ATTTT--ATC-GTGAGAGGAATCGTTG-----------TAGTAAAG--TGGTGGAGAAATCNATATG-TTTTGAATGCAGTCAATTGTCTCAGCATTGGAAACAANTCTCGTGATTNAAAGTTGTTTTNGTATAAAGCTGGGCCTTTAGAAGGGGCGTTTTT----TGAGA-ATCC-CAATC-TCGAA-TGA-CACCA-TTCTGGAATA-TGTAGCGGAA-CAGTATATCNTGAAG---TGACT-TTTTAACA--GCTGTTCAG--TAG-------TTTT--TAGT--A-GAC-------TAAGGGA----------T-AGAG--------------GG-----C------TG---GTA-GAGCAC--TTACTGGAA---CCAGCGA-TGTA--------TC--TTTG-TTTGTAAGGA-TTTC---TTA-TGCGT---T---T-CGGAA-----TCCAGT-A--------AAGGT-ATGGTAA-TTCAAATTGAT-CCTGAT-TCTTCGGAAATAT-TGA---AAGTATTT-CAAACAGAAAGGT-GATTTTG-AGAA-TT-TCATC-TTAGT-CAGATTGCTTGGA-GTATA-AAGT----AAGATTCCCAGATGTG---TGA--AGTA-AACCC-T-AGTT-C-ATTTAAAAAG-ACAAGTATAATA----GT-GA-CTCT--TTACAAAC--A-----AAG----ACAAA-------TGT-GNATC---ACTNTGCTTTAT--GCTGTCT--AACCA-TANCAA-AGTTTTCACGT-G----TC----TAA--CTCA-TTTACNCACTTCTG---GCT-TC-----TTAA-GACAG-----AAGGATAAATAGTCCG--ATTTTCCC---CGC-----TAAA----TGGTTAC----GGATTTT-AATNATTTCCGAA-TANTTTTGATCA-TTCAGACAAAGTGTCAAGCTCCTCTCCCT
gi|1                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    AAACAGGGTA-TGCA-AA-----AAACCAATCA--AT--C-AATA---TCATTTTTATGTAGTC--TCT---ATTGTG--TACCTTTG-TAATCGCAAA--CA--ACGGT----CCATTAT-------AGCGACC-G-TAGTATT-TG--CG--AA-ATGATG---A-TTT--AA-CGAGAATTC-G-TTATA----TCACCCTGCAA-CA-T--CAGA--C--TTTTTGG---T---AGT-AGTTG-CCT-CGCTTTT------AAAAA--ATCA-T--C-------A-T-ACGACAT--GG----CATG-------------CTCT-T-GCGTATCTGAATC-A---A-C----TG--A-GAG-ACAT--A-CACA-CCA-TGAACGCAGCGG-T-GGA--------TAGTGGTA-CATTATACATTCTTTGTTCTT-ACTATGAATA---A-GTTG-AACAAGTTGACTTGGAT------T-GCCAAGCCTATCCTTCAAA-TC--ATCAACGCCCCCCTTTATCCCT--ATA-ACTCGCACCGCTAGTTG--C--AGTGTCGCT-TGTTC--CGATTAATG-TCGAA-TATTTTGTGGAAATATTTTA---AATCACTTCATAACAACGAAGCAGATC-GTCAGATTCTGTGGTGTCCT---TTACTTTCGAGTTGTTCGG--TGATTTCAAATGGGACCATACATTATGAAAATCATGATTGTTAATTGATATAAA-ACATCAATCTATATACTTTCAAATATATTTTGTTAGGTTTGCAACTGAGACACGTGCAAGA--------------TTTTTTCGTTGTTTTTTAAAAAATCCCCGTAACAGCCTATTTTGAATCCA-AATTC-GCTAGTTGCTAATAGAATTTAGAATCA--T-AGTC---TGCCAATATTTAGTGGGGCAACAGACTCATAGTGTCCATAAGGGATAAT-CACAC--ACTTACCTAGGAATGTTTGGAGA-GACA-ATGG-CTACACAATA---GACACCAATTACAT-AGT-TTA-TCTATTAT-TAGA----ACCCAA---------------AGCATGAATA--A-T--TA--ATATCTT-CTTCA-AGAGCACCTTGTATGAGATTAATCAGTTATTGCATTTTGGGGGGTGTTTTGGTTCTTTTCATTCTTATAAACAAAAATATGCAT-TTAAATTT-----CCCCAA----CG-ACCAGAAACTTGTTACCTTAAGTTCAGGTTTTGCC-G-TTTTGGTGTTGTTCCAAACCCTT-GAAACCA-ATTAATCACTTTT--CAAT--T--CTCGAAAAA-GCGCCCT-GGATAATT-TTAATTTC--ATT-GTGAGAAGAATTGTTGTAATATTGGGTTAGTAGAGCTCGGGGCAGAAATCAATAAGATATTGAATGCAGTCAATTGTCTCAGCATTGAAAACAACTCTCGTGATTTAAAGTTGTTTTAGTATAAAGCTGGGCTTTTAGAAGGGGCATTTTCACCGTGAGA-AT-T-CAATCTTTGAATTGA-CACCA-TTCTGGAATA-TGTAGCGGAA-TAGTATATCCTGATATTCTGACTCTTTTAACAGCGCTGTTCAAGCTAGTTTAAGCTTTT--TAGT--ATGACAATCTTTTAAGGTA----------TAAGAG--------------GGGTCACT------TG---GTATGATCACTATTTCTGGAACCGCCAGCGA-C-TACTAACTACTT--TTTGTTTTGTAAGGA-TCTCACTTTATTGCAT---T---TCCGGAG-----T-CAGT----------AAGGT-ATGGGAATTTCAAGTTGGTCCCTCGT-CCTTCGG-AATAT-TGA---AAGTATTTACAAACAGAAAGTT-GATTTTGAAGAATTT-TCATCTTTAGTAAAGGTTGCTTGTA-GTAAT-AAGT----AAGATTCTCCAACCTGTTCTGA--AGTA-AA-CC-T-AGTT-C--TTTAAAAGC-ACAAGTATAA-A----GTAAA-CTTT--TAACAAACGGA-----AAGCACCATAGC-------TGT--AATC---AGTGTACTTT-T--GCTCTCT---TCTG-TTAC----GCCTCTAC-T-G----TA----TAA--CTTA-TTTACCCCCTTCTGTTTGCT-TCTCTCGTT---GACAGAAATTAAGGATAAA-AGTCCG--CTTTTTTCCAACGC-----TAAA----TGGTTA
gi|10                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 tttcaaactaccataccggaaaa--TGA-GCC-------T-TACATC-GTT-GA---T-CAG-A--------------T---A--AACA-GGTG---CT-TCTT-G------GTAT-AATTTA-GTATGTAA--AG--A-CC-GGCTTAACAA--TT-GG---AAT---GAAACGCTTCA--GA--C-AACAACCT-------AC--A--C--G-T---A--CCT-ACAA-GTTG-TATTTGCAAATGCA--A-AATAAACC-ATCAT-------AACGACC-A-TAGAATT-TG--TA--AACACGA-G---ATTGT--A---GAAACTCCTG-TT-TG----T-------CAG-TA-T--CA----C--GCCTTGG---TTTAAG--ACTTTATCA-CACTC----------AGA--ATC--TG-T-------T-T-TCG-CAT----------------------------T-T--C-TATT-GGATC-AGTTA-CATTTTGCAG-GAG-ACAA-AATCAC--C-A-TAA--ACAA--G-T-G-A--------AAATAG-AATATTG-------------CTA--C-AT-GA-ATACA-G--G-AA--A-TTGAC---GAT------G-GAAAAG--------TTAAAGCA--ATCT-CGC------TTGTCA-TCAAGA-AG-------GGTTGTTGT----AAT-----T-TG--C--C-TTGAACG-TC-TA-TGTTCAGTA-AATTATCC-A---AAT------------ATGAatatggaatttgttacaaataaggtttttacttt
gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     gaacacgtcccggtaaCA-GG-TGG-C-------TAGAAGG-----A--------GTGAGTATC-----GC---CC----GA--T-CACAC-CTGC-CG--TTA-GCC-C-----T-GA--TC-T---TG---A-TCA-G-G------------T------AACGCAA-G---TA-ATCC-G----TAGTCA-AA-CTCAGTATGCAA--AC--G-GATATC-GAAC--AATC-GGTA-AA-----AAGC--ATTA--G------GCG---T-------TTG-G--T--C-C---A--TTGTATAA-CTTG-TATCTGTAAA--TA--A-GAT----C-ATT
gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        tttactcagtatacacatgtatatgtctttgaagtcggttatgatgttcaatgcaacgacatcggtatacatgtacttcaaacgaactacacgtttaccgtgacatcaaagtaaatatatgtttagcggactttttttctgcctatatatagttacggcactggatttcttatgaacaagtgaaaattacgaacagtgactaatctcttagatcctaaattaaaagtactagtatacaaacaaagatccctagccaagATCATGAAG---TGACG-TCTTAACA--GC----------AG-------TTAC--TAGT--A-G--------------GA----------T-AGAG--------------GG-----C------TGCGGGTA-GAGC-C--TTAGTG-AA---CCAGCGA-TGTAA-------TCATTCTG-TTTG-AAGGAGTTTT---TTA-TGCAT---------CGAAAAAAAATCCAAT-ATAAAAAACAAGGT-ATGGTAA-TTTCAATTGAT-CCTGATGTCTTTGGAAA-ATATGAAGCAAATGTTT--AAACA-AAAGGTGGATTTGA-AGAA-GTATCACT-TTAGT-CAGATGTCTTGGA-GTA-A-GATT----AGTATT-CCAAATGAC---TGA--AGTG-AATCC-T-AGTTAC-AGTTAAAAGGCATAAGTAT-GTA-----T-GA-CTAT--TTATCAAC--AC----AAG----ACAAA-------TGT-GAATC---ACTTGGCTTTATCAGCTG-----AACTA-TATCAA-AGTTTTCATGT-GCGTCTT----TAA--C-CA-TTTACACACGTC-----GCTCTG-----TAAA-GACAG-----AAGGCTA
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                tccGTTTTT----TGATATATCC-CCATC-G-GTA-TGA-CACCA-TTCTGGAATAATGTAGGTGGA-CAGTATCTC-TGAAA---AGACTGTTTTAACA--GCTGTTTAG--TAG-------TTT----AGTTTA-GAT-------TAAGGAAGAGGCTTGGTT-AGAGCACTTACTTGAACTAG-----CATATATTG---GTA-GAGCAC--TTACTGGAA---C-AGC-A-TATA--------TC--TTTG-TT-GTAAGGA-ATTG---TTA-T-TGT---TAATT-CG-AA-----TCCAGTTA--------AAGGTCATTGTAA-ATCAAATTGAT-CCAGAT-TCTTCGGAA-TAT-TGA---AAGTATT--CAAACAG-AAGGT-GAATTTGAAGAA-TT-CTATC-TTAGT-CAGATTGCTTGGAGGTATATAAGT-----AGATTCCCAGATGCT---CGA--AGTA-CACCCTT-AG-T-C-ATCTTAAAAG-ACAAGTACAG-A----GT-CAGCTCTAGTTACAA
gi|14                         :                                                                                                                                                               agtgtagaAAA--GGCAAAGATA----A-CGA----ACAGTGA--T-C-AATCT-CGTAA-----------G-TCCTAAAT-A---GA------AT--A--CAAAA--ACAAGA-GTC-GGGCAAT-CAC-GGA-C----CCC-T---GGACAC-A----C--CAG-A-A-G--TGG-GA-TCA-GG-TGC-C-------TAGGGGG-----A--------GTAAGCACC-CCCTGTTGACC----GG--T-CACAC-CCGC-CG--TGA-GCC-C-----A-TA-GTC-T---TG---A-TCA-G-G------------T---A--AACG-GA-----------C-A----TC-----AGT----GTGTGAAA--A---A-CG-G-CTTAAC--AATG-GCT---AT---GAAACACATCA--GA--C-AGCA---T-------TTG-A--C--T-C---A--ATG-ATAG-GTCA-TATTGGTAAA--CT--A-AAT----T-GTTAC-------AACGACC-A-TAGAATT-TA--CG--AA-ATGCTGC--ATTTA--AA-CGTGACT---G-TT-GA----AACCCCTGCAA-CA-TACCG-A--C--TTTT
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                              ggatgtA-C----CTC-T---A-ACAA-A----GG-CGA-A-G-G---AG-GG-TCA-GG-TGC-C-----A--GGAGG------A--------GTAAGCATC-CTCTGCTGACC----GG--T-CACAC-CCAC-CG--TGA-GCC-C-----T-TA-GTCGG---AA---A-TAA-G-G------------T---A--ataaatcatgcactttcttttcaaagtacatgtatatttgcacatgaaat
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    caaatAAATAAGGTA---T---GAACAAAATCA--GT--C-AACA---T-------ATGGA--CCTT-T---A--GTG-ATAA-TTTG-CAA-CGCAAA--CA--A-GGT----C-ATTAT-------ACCGACC-ATTAGAATT-TG--CGAAAA-ATGATG---ATTTTTAAA-CGAGATTTC-G--T-TA----TAA-CCTGCAA-CATT--CA-A--CTTTTTTTGT---TT--AGC-AGTTAGCCTAAGCTTT-------AAAAA--ATCTTT--C-------ATT-ACG-CGG--A-----CATG-------------CTCT-T-GC-TATC-GAATC-A---A-CT---TGC-G-GAGTAAAT-TA-CACATC-A-TAA--GCAG--GATGG-A--------TAGTGGT-GTATTA-------------CTA-tgaacaaaatcagtcaacatatggacctttagtgataatttgcaacgcaaacaaggtcattataccgaccattagaatttgcgaaaaatgatgatttttaaacgagatttcgttataacctgcaacattcaactttttttgtttagcagttagcctaagctttaaaaaatctttcattacgcggacatgctcttgctatcgaatcaacttgcggagtaaattacacatcataagcaggatggatagtggtgtattactacttctttcgttacttggataattttattgaacattgac
gi|16                         :                                                                         caaatacctctaacaaaggcgaaggagggtcaggtgccaggaggagtaagcatcctctgctgaccggtcacacccaccgtgagcccttagtcggAAAT-GGCGAAG-TA----A-CAATTAAA--GT-A--TCA-AA----CGTA-TCATA------G-TCCCCAAA-A---CAC-----AT--A--CAAAA--TCGAGT-GTA-GG-CAAT--AC-GGA-C----CTT-C---G-ACAA-A----AG-CGA-A-AAG--CAG-GAATCAAGG-TGC-C-----A-TGGA-GG-----A--------GTAAGCATC-CTCTGCTGACC----GG--TCCACAC-CCGC-CG--TGA-GCC-C-----T-TA-GTC-G---AA---A-CAA-A-G------------T---A--AACG-GG-G---TT-ACCC-G----TCGTCA-AATCTAG--ACGAAA--AT--GACA-GCCTAACTAACAAG-GGTATAA-----AAACAAATCA--GT--C-A--A---T-------ATG-A--C--T-G---A--GTG-ATAA-TTTG-TAATCGCAAA--CA--A-GGT----C-ATTAT-------AGCGACCGG-TAGAATT-TG--CG--AA-ATGATG---ACTTTAAAA-CGAG-ATTC-A-GT-TA----TAACCCTGCActtctttcgttacttggataattttattgaacattgac
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    taA-TAA-GAAA-----CCC-A---------------AGCAT----GCTCAT--TA--ATATCTAACTTCA--GAGTA-CTTGTGTGGG--CAATCA----------------GA--G----GGTTTT-------------CAACAAAATATGTGTCTT--GTTT------CCCAA----CG-ACTAGAAATTCG-TA--TT---TTCGGG---TGCCGG-TTTT----TTGT---------TTAAAAAGCA-ATTA--------TTATAAT------T-GAAAAAGG---CCTAAGAT--TT-TA-ACTTT--ATC-G---GAGGAATCGTTG-----------T-GTAAAG--T-GTGGAGAAATC--TACG-TTTTTGATGCAGTCAATT
gi|18                         :                                                                                                                                                                                                                                                            aatcgaccaattgttgctaccatatgttttcctaatg-GGA-C----CTC-C---A-A-AA-ATTATAG-AGGTA-G-G--CAG-GA-TCA-GGGTGC-C-----A--GGAGGATCGTAA--------TTGAGCATC-CTCTGCTGACC----GATCT-CACACACCGC-CATCTGA-GCC-T-----TGTA-GTT-C---AA---A-CAA-A-GC-----------T---A--AACG-GG-GATTCT-ATCC------TCGTCA-AATCT-AGTACGAAA--AT--G-AA-GGCTAAACACAA-G-GGTT-ATT---GAAACAAGCAG--GT--C-AACA---T-------ATG-A--CT-T-T---A--GTG-ATAA-TTTG-T-ATCGC-AA--CA--A-tttgaaaattcttgtatt
gi|19                         :                                                                                                                                                                                           gcaaacataaaatgttatgtagattattatcgTCATA------AATCCCATAA-A---GA------AT--A--TAAAA--C-------TA-AGGCAAA-CAC-GAA-C----CCT-T---G--CAT-AT---AC-CGG-A-G-G--TGG-GA-TCA-GG-TTT-TTTTTAA-AAGAGGG-----A---------TAAGCACC-CCTTGTTGACC-----G--T-C-CAC-TCGC-AT--TAT-ACC-C-----T-CT-ATC-T---TG---A-TCA-G-G------------T---A--AACT-GA-G---TA-ATCT-G----T----A-GGTC-AAGAACGAAA--aat
gi|2                          :                                                                                            ttagatactgttggagacaatattggttgctcaccgaaagaatgaaaagtgaagataacgtaacagtgatccatcAAAT-GGCGAAG-TA----A-CAA----A--GT-A--T-A-AA----CGTAATCATA------G-TCCAAAAA-A---CA------AT--A--CAAAAA-TCGAGTTGTAAGGGCAAC-CAC-GGAAC----CTT-C---G-ACGA-A----AG-CGA-A-G-G--CAA-GG-TCA-GG-TGC-C-----AATGGAGAG-----A--------GTAAGCATC-CTCTGCTGACC----GG--T-CACAC-CCGC-CG--TGA-GCC-T-----G-TA-GTC-G---AA---A-CAA-ATG------------T---A--AACG-GG-G---TT-ACCC-G----TCGTCA-AATCTAAGTATGAAA--AT--G-CA-GTCTAAACAAAATG-GGTA-AAT---GAAACAAATCATGGT--C-AACA---T-------ATG-A--C--T-T---A--GTG-ATAC-TTTG-TA-TCGCAA---CA----GGT----C-ATTAT-------AGCGACC-G-TAGAATT-TGTGCG--AA-ATGATG---ACTTT--AA-CGAGAATTC-GGTT-TA-----AACCCTGCAA-CA-TA-CA-A--C--TTTTTGG---TT--AGT-AGTTGCCCT-CG--TT-------AAAAA--ATC--A--C-------A-TTACG-CAT--G-----CATG-------------C-CT-T-G-GTATC-GAATC-A-----C----CG--A-GAG-ACAT-TA-CACA-C-A-TAAT-GCAG--T-G-G-A--------TAGTGGTAACATTA-------------CTA-AC-AAAAA-A---A-G--G-AA--AAGTGAC---AAT------T-GGCAAG--------TCAAAGTCCCATCAACGT------TTATCA-T--ATATAT-------G-T-GTTTTGC--AGT-----CCTG--C--C-ATTAGAG-TC-AA-TATTA--TA-AAATATCC-A---A-T------------ATGAAGCACATTGGTCAGATTCTGTGGTGTC-T---TTA-TTTCAAGTTCGTCAGGATAATATCAAAATGGA-CATA-ATTGTGAAA-TTATGATTGTTAATGGAT---AA-ACATC-GTCTATATACCT----ATA-----AGTAAGG-TTG-AA---GGACACT-GCAAG---------------TTTT----TTGTTTTT------A--CCCG-AACAGTTT-TCCTGAA-ACA-AATTCTGCT--TTCAT-ATGGAATATATAA--AAATAAGTC---TGCCAATA---AG-GGGGC-AAC-AT---TAGTACCCAT-AGGAA--AC-CA-AC--A---------GAATTGTTGGAGAAGACGGATG-TCACTCCAA-AAAAGAC------TACAATAATATTAATCTA-TAAAGCAA----ACCC-A---------------AGCA---ATGCTC-T--TA--ATATCTTTCTTCA--GAGTA-CTTGTGTGGG--CAATCA----------------GAGTG----GGTTCT-------------GACAAAAATATGTATCT---GTTT-----CCCAAA----TG-ACCAGAAACTTGGTA--TT---TTCGGG---TGCC-G-TTTT----TTGT---------TC-AAAAGCA-ATTA--------T--CAAT--TTCCT-GAAAAA-G---CCT-AGAT--TT-T--ATTTT--ATCCGTGAG--GAATTGTTG-----------TA-TAAAG--TGGTGGAGAAATTCATATG-TTTTGA-TGCAGTCAATT---------TTAGAAA--AATCTCGTGATTGAA----GTTTTC-TATAAAGCT----CTTTAGAG-------TTTT----TGAGA-ATCCACAATC-T-GAA-TGAACACCACTTCTGGAATA-TGTAGTGGAAACAGTAT--CTTGAAG---TGACC-TTT-AACA--GCTGTT-AG--TAG-------TTTTGTTAGT--A-G---------TAAGGGA----------T-AGAG--------------G------C------TG---GTA-AGGCAC--TTACTGGAA---CCAGCGAATGTA--------TC--TTTGGTTTGTAAGGA-TTTC---TTA-TGCATATTT---T-TGGAA-----TCCAGT-A--------AAGGT-ATGGTAA-TTCAAATTGAT-CCTGAT-TCTTCGGAAATAT-TAA---ACGTATTC-CAAACAGAAAGGT-GATTTTG-AG-A-TT-TCATC-TTAGT-CAGATTGCTAGGA-GTATA-AAGTCAGGAAAATTCCCAGATGTG---TGA--AGTA-AACCC-TAAGTT-CAATTTAAAAAG-ACAAGTATAATA----GT-GA-CTTT--ATACAAAC--A-----AAG----ACAAG-------TG-----TT---ACTGTGCTTTAT--ACAGCCTGGAACCAGTAACAA-AGTTTTCATGTAG----TCTATGTAA--CTCA-TTTACCCCCTTCTG---GCT-TC-----TTAA-GACAG-----AAGGGTAAATAGT-AG--ATTTTCCC---CGC-----TAAA----TGGTTATAACGGGATTTTAAATAATTTCCGAA-TACTTTTGATCA-TTCAGACAAAGTGTCAAGAT-CTCTCCCTtaaatgttgatgcatt
gi|20                         :                                                                                                                                                                                              A----A--AT-A--T-A-AATAGGCGAAGT--TA------A-TCCCAAAA-A---CAT-----AT--A--CAAAA--CCAAGT-GTA-GGGCAAC--AC-GGA-C----CTC-C---G-ACAA-A----AG-CGA-A-G-G--CAG-GA-TCA-GG-TGC-C-----A-TGGAAG------A--------GTAAGCATC-CTCTGCTGATC----GG--T-CACAC-CCGC-CG--TGA-GCC-C-----T-TA-GTC-G---AA---A-AAA-A-G------------CATGA--AACG-AA-A---TC-A-----------GTCT-AA-CTA--TAC-ATG--AC--T-TA-GT---GATAATATG-CGT--AATCTGGAAACAAGTCA--TTTGC-GAAA---TG------ATG-A--C--T-T---ca
gi|21                         :                                                                                                                                                                                             AA----A--GT-AATT-A--------GTAA-CATA------G-TGCCAAAA-A---CAT-----AT--ATACAAAA--ACGAGT-GCA-GGGCAA--GAC-GGA-C----CTT-C---G-ACAA-A----CG-Ctaaattgagtattcgttat
gi|21                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          ctattaC-C-----T-TC-GAC-A---AACGCA-CAA-A-A------------T---A--AACA-GG-G---TA-GCCC-G----TCGTAA-AATCTT-GTACAAAA--ATAAG--A-GTCTGA-CAAA--G-GGTA---C---GAAACAGATCA--GT--C-AACA---C-------ACG-A--C--T-T---C--GTG-ATAA-TTTG-TAGTCGCAAA--CA--A-GGT----C-ATTAT-------AGCGACA-G-TAGAATT-TG--CG--AA-AGGATG---Aacaaaataaacagggtagcccgtcgtaaaatcttgtacaaaaataagagtctgacaaagggtacgaaacagatcagtcaacacacgacttcgtgataatttgtagtcgcaaacaaggtcattatagcgacagtagaatttgcgaaaggatgat
gi|22                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              ctattaaaagtaattagtaacatagtgccaaaaacatatatacaaaaacgagtgcagggcaagacggaTATC-TAATC-A---A-C----TG--G-GAG-ATATGCA-TAC--C-A-TTT--GCAA--G-G-G-A--------TAGTGGTA-TATTA-------------CTA--C-AAAGACA---G-G--G-AA--AGCTGAT---GAT------T-GCATTT--------TTAAAGTC--ACCAA-GC------TTATCA-T--ATA-AT-------G-TAGCTGT-A--AGT-----C-TG--C--C-ATTAGAG-CC-AA-TATTAAGTA-AAATATCC-A---ACT------------AAGAAGCAGATTTGTCAAATTCTGTGGTCTCCT---TTA-TTTTGAGTTCGTCGGGt
gi|23                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        A-A----CG-CAC-A-G-G--CAG-GA-TCA-GG-TGC-C-----A-TGGAGG------A--------GTAAGCATC-CTTTGCTGACC----GG--T-CACAT-CCGC-CG--TGA-GCC-G-----G-TA-TTC-G---AA---A-CAA-A-A------------T---A--AACA-GG-G---TA-ACCC-G----TCGTAA-AATCT-TGTACGAAA--ATAAG--A-GTCT-GACAAA--G-GGT---AT---GAAACAGATCA--GT--C-AACA---C-------ACG-A--C--T-T---C--GTG-ATAA-TTTG-TAGTCGCAAA--CA--A-GGT----C-ATTAT-------AGCGA
gi|24                         :                                                                                                                                                                       AAA--GGCAAAGATA----A-CGA----ACAGTGA--T-C-AATCT-CGTAA-----------G-TCCTAAAT-A---GA------AT--A--CAAAA--ACAAGA-GTT-GGGCAAT-CAC-GGA-C----CCC-T---GGACAC-A----C--CAG-A-G-G--TGG-GA-TCA-GG-TAC-C-------TAGGAGG-----A--------GTAAGCATC-CCCTGTTGA
gi|25                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   cactgtgataaatggtagtattaatgtTGTG---TGATAAGTATAACCC-T-AGTT-C-ATTTATAAAG-ACAAGTATAATATTTTCT-GG-CCCC--TAACAAAA--AAATTCAAG----ACAAATTGACTTTGTAACATCTTAACTCTGTTTCA---ACTGTCC--TGTAA-TAGCAATAGTTCTCTCG-------------TAAGGCTCATTTTAC-CACTTCTG---a
gi|26                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 AATT-TG--CG--AA-ATGATA---A------GA-C-AGGATT-------------TAAGGCGACAA-CA-A--TA-A--AAATTTTTAGAATTT--AGTCAGT-GGCCT-CGACCTGATAAGAAAAAA--ATA--T--CAAAAAATA-T-ACG-CAC--GTGGTATATGAC-----------C-CTCT-GCGCGAC-GAATC-A---ATC----TG--ATGAG-ACGA-TA-CA
gi|27                         :                                                                                                                                                                                                        -A--C-A-AC----CGT--TCATA------A-TCCAAAAA-AATGTAT-----AT--A--CAAAAA-TCGAGT-CGA-GAGCAGCGCACTGGA-CACATCTT-CTGTA-ATAA-A----AGCCGA-ATG-GTTTAGTGA-T---AG-TTT-T-----A-TTGAGAG-----AAGAAAATGGTAAG------TCCACTAACC----AG--T-CA
gi|28                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            ggcgactgtaTGTCAGTGTCTGTGGTGTCCTGAATTA-TATTAAGTTCTTCGCGATA-TATCAAA-TGGA-TATA-ACTGTGAAAATTATGATTGTTAATTGAT---AGCACATC-ACC
gi|28                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            CACC-GCAAG---------------TTTT-----TGTTTTT------AT-TCCGTAACAGGTT-TT---GA-ACA-AATTgcaagtttttgtttttattccgtaacaggttttgaacaaatt
gi|29                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  tgtcagtgtctgtggtgtcctgaattatattaagttcttcgcgatatatcaaatggatataactgtgaaaattatgattgttaattgatagcacat--CTCA-TT---ACACTTCTG---GCT-TT-----TTAAAGACA-------AGGATAAATAGTACGCCATTTTCCT---CGCGCGCTTAAAGTTTTAATTAC----GGATTTT-AATTACTTCCGAATTAATTTTGATCATTTCAGACAAAGTATTCAACTCCTCTCCC
gi|3                          :                                                                                                                                                                       AAAT-GGCGAAG-TACA--A-CAA----T--GT-G--TTA-AA----CGTAA-AATA------G-TCCCAAAA-A---CATGT---AT--A--CAAAA--TTGAGT-GTA-GGTCAAC--AC-GGA-C----CTC-C---G-ACAA-A----AG-TGA-A-G-G---AG-GA-TCA-GG-TGC-C-----A-TGG-GTG-----A--------GTAAGCATC-CTCTGCTGACG----CG--C-CACAC-CCGT-CG--TGA-GCC-C-----T-TA-GTC-G---AA---A-CAACA-G------------T---A--AACG-GG-A---TT-ACC--G----TCGTGA-AATCTA-GTACGAAA--AT--G--A---CTGA-CAAA--G-GATA---T---GAAACAAATCA--GT--C-AACA---T-------ATG-A--C--C-T---G--GTG-ATAA-TTTG-TAATCGCAAA--GA--A-GGT----C-ATTAT-------AGCGACC-G-TATAATT-TG--CG--AA-ATGAT----ACTTT--AAATGAGA-TTC-G-TTATACCGTTAACCCTGCAA-CA-T--CA-------TTTTTGG---TT--ACT-AGTTGGCCT-AGCTTT-------AAAAAT-CCC--T--C-------A-T-ACA-CAT--ATGC--CATGTGTTGGATATAGCC-CT-T-GCGTATC-GAATC-A---A-C----TG--A-GAG-ACAT--A-CACA-CCA-TAA--GCAG--G-T-G-A--------TATTGGTA-CATTA-------------CTA--C-ATAGA-A---AAG--G-AA--TGTTGAC---GATA-----T-GCAAAG--------TCAAAGTC--ATCA-CGT------TTATTA-T--ATA-AT-------G-TA--TGT-C--AGT-----C-TG--CATC-ATTAGAG-TC-AAATATTAAGTA-AAATAGCC-A---AAT------------ATAAAGCAGATATGTCAGATTCTGTGGTGTCCT---TTA-TTTCGAGTTCGCCA----AATATATAAATGGA-CATA-ATTGTG-AAATT-TTATTGTTAATTGATA--AG-ACATC-GTTTATATACCC----ATA-----TGTAAGG-TTG-AA---GGACACG-GT------------------TTTT----TTGTTTTT------AT-CCTGTAACGTTTT-TTTT--A-ACACAATTCTAC---TTCAT-AT-GAATATAAAA--A--TAAGTC---TGCCAATA---AG-AGGAC-ACA-AT---TAGTGTCCTT-AGGAAT-AC-CA-AC--A---------T-ATTGTTGGA-A-GAC--ATGGTTTCT--AA-A---GAC------TACATAAATATTG-TCCA-TAA-GAAA----ACCC-A---------------AGC----ATGCTC-T--TA--ATATC-TACTTC--AGAGTA-CTTGTGTGGG--CAATCA----------------GAGT-----GGTTCT-------------GAC-AAAACATGT
gi|30                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             ctattaaacctgacacaatacatctgctagtcatctgggactgatgtttatatatcACATTG-------------TTA-ACTACATA-A---A-A--G-AA--A--T--------T------T-GCAAAA--------CTCAAGTC--ATCA-CGT------TTATCA-T--ATA-AT-------GTTAGTTGT-CCAAGTC----C-TG-----C-ATTAGAGATT-AA-TATTAAAGG-AAGTGTTC-ATGGAAT------------A
gi|31                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     T-CA-CAC--C-A-TAA--GTAG--G-T-G-G--------TAGTGGT-ATATTA--------------TC-AC-ATTGA-A---A-G-----------------------------GCAAAG--------TTAAAGTC--ATC-TTGC------TTATCA-T--ATA-AT-------G-CAGTTGT-C--AGT-----G-TG--T--C-ATTAG
gi|32                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              cttatCAT-T--CAC--C-A-TAA--GCAG--G-T-GGA--------TGGTGGTA-TATTA-------------CTA--C-ATAGA-A---A-G--GGAA--AGTTGAC---GATAGCCGATAGCAAAG--------TTAAGGTC--ATC-ACGC------TTATC
gi|34                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 tatcctCAATA---AG-GGGGC-ACA-AT---TAGTGCCCGT-TGGAAT-AT-CA-AC------------GGATTGTTAG-TA-GAC--ATGG--TCTCCAA-A---GAC------TACACAAATATTA-TTTA-TAA-G
gi|35                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           GA-GCC-T-----T-TA-GTC-G---AA---AACAG-G-GAGGGGGGGCGGTT---ACGAGCG-GA-G---TT-ACCCTG----TCGTCAGAATCT-AGTACGGAA--A---G--A-G--TGGACAAA--G-GGTA-ctaa
gi|36                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      A-GG-T-C-C-----G-TGAATGA-----A--------GTAAGCATCTCGTTGCTGATCCGAGGA--T-CACAC-CCAC-CG--TGA-GCA-A-----T-CA-AGA-G---AA---A-CAG-A-tg
gi|37                         :                                                                                                                                                                                                                             gatggatggtcgCCCAACATA---CATGTATAAT--A--CAGAG--TCGA-T-GTA-GA-CAAC--AC-AGA-C----CTAGT---A-ACAA-A----AGGCGA-G-G-G--CAG-GA-TCA-GG-TGC-C-----A-TG
gi|38                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  cc--ATTTTCCC---CGC-----TAAA----TGG----------ATTTT-AATCATTTCCGAA-TATTTGTATCCA-TTCAGACAAAGTGTCAAGCTCCTCTCCCT
gi|39                         :                                                                                                                                                                     gcAAAT-GGCGAAG-TATTTTA-CAA----T--GT-G--T-TTAA----CATAATCATA------G-TCCAAAAA-A---CAT-----GT--A--CAAAA--TCGAG
gi|4                          :                                                                                                                                                              tttgttataAAATTGGCGAAG-TA----AACAA----T--GT-G--TTA-AA----CGTAATCGTACATGTAG-TCCCTAAA-A---CAT-----AT--A--TACAACTTCGAGT-GTA-TGGCAAC--AT-GGA-C----CTC-C---G-ACAACA----GG-CGA-A-G-C--CAG-GA-TCA-G--TGC-C-----A-TGGAGGG-----A--------GTAGGCATC-CTCTGCTGACC----GG--T-CAC-C-CCACACG--TGA-GCCTC-----G-TA-GTC-G---AG---A-CAA---G------------T---A--AACA-GG-G---TT-TACC-G----TC---------TAC-TACGAAATGAG--A-CA-GTCTAA-CAA---G-GGTA---T---GAAACAAATCA--GT--C-AGCA---T-------ATG-A--C--T-T---A--GTG-ATAA-TTTGGTAATCGCAA---CA--A-GGT----C-AT-AT-------AGCGACC-G-TAGAATCCTG--CG--AA-ATGCTGCGGACTTTGAAA-CGAGAACTC-G-TT--A----TAACCCTGCAAACA-T--CA-TTTC--TTTTT-----TT---GT-AATTGAC-T-CGCTTT-------AAAG----TC--CTGC-------G-T-CCG-CAT--GA----TATA-------------C-CT-TTGCGTATC-GAATC-A---A-C----TG--A-GAG-ACAT--A-CACA-CCA-TAA--GCAG--G-T-G-A--------TAGTGG-AACATTA-------------CTA--C-AAAGA-A---A-G--GGAA--AGTTGAC---GAT------T-GCAAAG--------TCA--------TCA-CGT------TTATCA-T--ATA-AT-------G-TAGTTGT-C--AGT-----C-TG--C--C-ATTAGAA-TC-AA-TTTTAAGTA-AAATATCC-A---AAT------------ATGAAGCACATCTGTCAGATTCTGTGGTGTTCT---TTA-TTTGGAGTTCGTCAGGAT-ATATC-AAATGGA-CATA-ATTATGAAAATTATGATTGTTAATAGATC--AG-ACATC-ACCTATATATCTAC--ATA-----TGTA
gi|41                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           actatcttatccgaatgacatcaaagattacttgaacgattgtctgtactgcaatat---AG-ACATC-ATCTATATATCT----ATA-----TGTAATG-ATG-AA---GGACACA-GTAAG---------------TTTT----TTGTTT
gi|42                         :                                                                                                                                                                       AAAT-GGCGAAG-TA----A-CAA----A--GT-A--T-G-AAC---CGTAATCATA------
gi|44                         :                                                                                                                                                                       AAAT-GGCGAAG-TA----G-CAA----A--GT-AT-T-C-AA----CATAATCATA------A-Tcgtacacagataaaccata
gi|46                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         cgcacatttataTTTTGG---TT--AGT-AGATGGCCT-CGCTTT-------AACAA--ATC--
gi|47                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   A-A---G-G--G-GA--AATTGAC---AAT------T-GCAAAG--------TCAAAGTC--AT
gi|49                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      -A---AAT------------ATGAAGCACATCTGTCTGATTCTGTG
gi|5                          :                                                                                                                                                                       AAATTGGTGAAG-TA----AACAA----T--GT-G--T-T-AAT---CGTAATCATA------G-TCCTAAAA-A---CAT-----ATTTA--CAAAG--TCGAGT-GTA-GGGCAAC--AC-GGA-T----CTC-C---G-ACAA-A----AG-CGA-A-G-G--CAG-GA-TCA-GG-TGC-C-----A-TAGAGG------A--------GTAAGCATC-CTCTGCTGACC----GG--T-CACAC-CCGC-CA--TGA-GCC-C-----T-TA-GTC-G---AA---A-CAA-G-G------------T---A--AACA-GG-A---TT-ACCC-G----TTGTCA-CATCT-AGTACGAAA--AT--GACA-GTCT-AACAAAA---GGT---AT---GGGACAAATCA--GT--C-AGCA---T-------------------------------TAA-TTTA-TAATCGCAAA--CA--A-GGT----C-ATTAT-------ACCGACT-G-TAGAATT-TG--CG--AC-ATGGTG---ACTTTA-AA-CGAGAA-TC-G--T-TA----TAATCCTGCAA-CA-T--CA-A--C--TTTTTAG---TT--AGT-AGTTGGCCT-CGCTTT-------AAAAA--GTCT-T--C-------A-T-ACG-CAT--GA----CATGT------------T-CT-T-GCGTATC-TAATC-A---A-CTGCATG--G-AAA-ACAT-T--CACACC-A-TAA--GCAG--G-T-G-ATACATTTGTAGTGGT-ACATTA-------------CTA-
gi|6                          : tatactctatatgataatatatgtcttctgaaaccgcttttacatgtttctgtgttggcgacatcggtattttgggctttttcaaaagtttggcttatatttaaaaagttttcttttcatgaatgcatttttttctgtatttttttttattgtatgtagtaaaagatatT-GGCCAAA-TA----AACAA----T--TTGA--T-A-AT----TGTAATCAAA------A-CCCCAAAA-----CAT-----AC--A--CAAAG--TCGAAT-GTA-AGGAAAC--AC-AGA-C----CTC-C---G-ATAA-T----AG-CGA-A-G-G--AAT-AG-TCA-GT-CG-----------------------------------GCATC-CTCTGCTGACC----GG--T-CACAT-CCGC-CG--TGA-GCC-C-----T-TG-GTC-G---AA---A-CAA-A-G------------T---A--AACG-GG-A---TT-ACCC-G----TCGTCA-AATCTA-GTAGGAAA--AT--GACA-GTCTAA-CAAA--G-GGTA---T---GAAACAAATCA--GT--C-AACA---T-------ATG-A--C--T-T---A--ATG-ACAA-CTTG-TAATCGCATA--CA--A-GGT----C-ATT---------------------------TG--CG--AA-ATGGTG---ACT-----------------------G----TAGCCCTGCAA-CA-T--CA-------TTTTTTG---CT--AGT-AGTTGACCT-CGCTTT-------AAAAA--GTCC-T--C-------G-T-ACG-CAT--GA----CATG-------------CTCT-T-GCGTATC-GAATC-A---A-C----TG--G-AAG-ACAC--A-CACA-C-AATAA--GCAG--G-T-G-A--------TAAGGGTA-CATTA-------------CTA--C-ATGAA-A---A-G--G-AA--AGGTGAC---GAT------T-GCAAAG--------TTAAAGTC--ATCA-CGC------TTATCA-T--ATA-AT-------G-CAGTTAT-C--AGC-----C-TA--C--C-TTTAAAG-TC-AA-TATTAAGTA-AAAAATCC-A---AAT------------ATGAAGCAGATATGTCAGATTCTGTGGTGTCCT---TTA-ca
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                atagatTGTCAGATT--GTGTTGTC-T---TTA-TAT-GAGTTT-TCGGGATA-T-TCCAAAT------TA-AT----------GCCCTTGTTA-TTGAT---AGCAGAT--ATCTATAT-CCT----ATA-----TATAAGG-TTG-A-----GACAAA-GCAGGGAGTTTTTTTTTTTTTTTT----TTGTTTTT------AT-CCCGTAA-AGTTT-TTGT--A-GCA-AATTCTGC---TTCAT-ATGTAATAT-TCA--G--TAAGTCTGGTGCCAATA---AA-GGGG---CA-AT---TAGTGCCACT-AGGAATGACGCA-ACGGA---------GAATTGTTTGATC-GAC--CT-GTCTCTCC-A-C---GAC------TACATAAATAATT-TCTG-TAA-GAAACTCTACTC-ATCATGATGTCATGTTATCAT--TTGTTC-TAATAATATATCCTACTTCAGAGAGTA-CT--TGTGGG--C-ATCA----------------GAGT-----GTTTTT-------------TAAACAAATATGTGTCTT--GTTTTTCCGCCCCAATCCCCGAACTAGAAA--TATTA--TT---TTCGGG---GGTC-ATTTTT----TTGT---------TT---AACCACATT---------T--CGATAAT--CT-GAAAAG------CT-AGAT--TTAT--ATTTTTAAT--GTGAatactggcgtcaaagctcaaaattcttggagcgggaataataaaatatatt
gi|8                          :                                                                                                                                taagatataaaacggtcagctactaaggattgtgtggtgAAAT-GGCGAAG-TA----A-CAA----A--GT-A--TGA-AA----CGTAATCATA------G-TCCAAAAA-A---CAC-----AT--A--CAAAA--TCGAGT-GTA-GGGCAAC--AC-GGA-C----CTT-C---G-ACGA-A----AG-CGA-A-G-G--CAG-GA-GCA-GG-TGC-C-----A-TGGAGG------A--------GTAAGCATC-CTCTGCTGACC----GG--T-CACAC-CCGC-CG--TGA-GCC-T-----G-TA-GTC-G---AA---A-CAA-A-G------------T---A--AACG-GG-G---TT-ACCC-G----TCGTCA-AATCTA-GTATGAAA--AT--GACA-GTCTAA-CAAA-TG-G-TA---T---GAAACAAATCA--GT--C-AACA---T-------ATG-A--C--T-T---A--GTG-ATAC-TTTG-TAATCGCAAA--CA--A-GGT----C-ATTAT-------AGCGACC-G-TAGAATT-TG--CG--AA-ATGATG---ACTTTA-AA-CGAG-ATTC-G--T-TA----TAACCCTGCAA-CA-T--CA-A--C--TTTTTGG---TT--AGT-AGTTGGCCT-CGCTTT-------AAAAA--ATCA-T--C-------A-T-ACG-CATG-G-----CATGC------------C-CT-T-GCGTATC-GAATC-A---A-C----TG--A-GAG-ACA--TA-CACACC-A-TAA--GCAG--G-T-G-A--------TAGTGGT-ACATTA-------------CTACAC-AAA-A-A---A-G--G-AA--AGTTGAC---AAT------T-GCAAAG--------TCAAAGTC--ATC-ACGT------TTA
gi|9                          :                                                                                                                                                                                                                                 ggcatataCCCCAAC-A---CAT------T--A--CAAAT--TCGC-T-GTA-AG-CAAC-CG--GGA-C----CTC-C---G-ACAA-A----AG-----A-G-G--TAG-GA-TCA--G-TGCAC-----A-TGGGAGG-----A--------GTAAGTTTC-CTCTCCCGAC------G--T-CACAC-CCGCGCA--TGACACC-CCCAAAT-TA-GAT-GACCAA---A-C-A-A-G------------T---A--AACG-GG-GA--TTAACCC-GGGTTTCA--A-AAT---AGTACGAAATGAC--A-CA--TCT-AACAAA--G-GGT---AT---GAAACAAATCA--GT--CAAACA---T-------ATG-A--C--T-TGCGG--ATG-ATAA-TTTG-TAATCGGGAA--CAACA-GGT----C-ATTATTTCGATAAGC-ACC-GCTAGAATT-GC--CG--A-----------------------AGAATTC-G--T-TA----TTAACCTACAA-CA-TA-CA-A--C--TTTTTTG---TT--AGT-AGTTTGGCT-CCCTTT-------AAAAGCCCTC--C--C-------A-C-ACG-CACGAG-----TATG-------------C-TC-T-GCGTATC-GAATCAA---A-C----CG--A-GAG-ACAT-
5 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|33 ): GTTTTTGCGTTGGTGACATCAGAATTTTGGATTTTTTCAAAACTTTGGCAGTGACTGGCTTATCATATTTAAAAAGTTTTCTTTTCATGAATGCATTT
Unaligned ( gi|40 ): TTAAAAGTGAAGATAACAAACAGTGATCTATGTCATAATTCCTATAAAAAATTGAAATCTAA
Unaligned ( gi|43 ): GATCTGAGGTCCAGGGGTGATGAATATAGCATACTTCCATGTTGATTGATT
Unaligned ( gi|45 ): TATTAAGTGATGCCATACATAGAGGATCTTGAATGAGT
Unaligned ( gi|48 ): TAGTCGATACTAAAATTCATGCTCATTTGAT






Alignments
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                      111111   1111111  22222222222222                                 111111                                22                                                                              111111111111111                                                                                       111111111111                                            22           3333333333333333333333333333333333                           1111111                                                                                                                   11              1111111111                11  1111111                                  1111111          2222222222222           444444444444444444444444444                          1111              1111   11 1                    11111111       11     111111111111111111                                    111111        11111111             22   111111                111111111              1111111                                                 222222222222                                                                                                          222  1                  2222   11111             1111      11     444444444444444    1111        222222                   2222              222     1     11        11       111        111               111                11        444444444444          111    11  1 1      1111      222222                           11111     555555555555555   22222       11  11            111                11      5555555555555555555555555      44444444444444                 11    222222     2222  1               11  111      111    111    2222    4444444444444      1   444444444444444444444  1      33333   1    11  2222     11  222222            66666666666666     2222         1  22    1     1            333333333      11                2222     11         2222        222222     2222     1  111     11    1  1      1          1        1           1     111    22        11      444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444  111   1      11         111     11     44444444  11   1 1          1   1111   1   333333333333333333333      4444444444     1       1           1      1         11       111      111                        1  1     1     1             1   111    22222               111   11                                        22222222         11        444444444444444444444444444444444   111          4444444444444444444444    111         55555555555555   11                   111   22222222  111    222222             22222        111   22222    2222      33333       1             1            1                             
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                           6       6  333333   4444444  55555555555555     3    777777 2        2 444  444444  33 33     88      2   2  1    11  2   2 5555   2 444 4    2 6666  4   2 2 2 555  2  2   2  2   2 8888888      333333333333333         2           5555  33 2     2    5  33   2   6666666 2  2   2 666  333 2   222 333333333333 333 33    2  2 666  2    2 5555    1 2     11        66 6666666666666666666666666666666666           33  33 2    444 0000000   4 33 55 2 444444   2    2    2  0       33  33 2   5555 2     9999999       3 6       2  33  33  2      777 3 0 88  3    33   3 7777777777   0       3  3 11  8888888     1 555  44   3     0   3      4444444     77   5555555555555 3 3   3   999999999999999999999999999  3 3       3     3 555 3 7777  8888   3    4444   77 0 3   77    44 3 6 3 22222222       88     888888888888888888 7 222 6 555 6 44 3  44 33    555   222222 3      22222222        44   22   000000      4 66   4  777777777       8888   6666666  99999 4       5  5  5     0   5        4 777   222222222222        0  1                   2 888   5   5      4   11  99 3  7  3    6    6      3  3  1               111  1     5            3333   66666       8   8 4444      00     888888888888888    4444        333333 88    0        8  3333 8   8     3  999     0  6  33    44  33  3    777        444  8     8   8  444        1 8     66  8  8  333333333333 3        777    99  0 0    5 4444 8    333333     6   0  8     6 6      77777   8 000000000000000   33333  3  8 11  11     3 6    999     8  0       11 0    9999999999999999999999999      55555555555555  5           55 33    777777     1111  0        6   9  33  777      777    444    1111    2222222222222   1  0   555555555555555555555  0      00000   0    33  4444     33  111111       0    88888888888888     1111         3  00  3 3     2            777777777      88  1          1  4444     66         2222        888888     8888     3  555     88    3  3      3          3     3  3     7     0     777    99        33  3   777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777  777   0    3 33      2  777 2   22  6  66666666  33   0 0  3 3     0   7777   0 2 999999999999999999999 2    9999999999     0       0           0      0       3 33   3   777      999     2  3     4     3   0  0     0     0             0   777    44444 0     2       444   11    8  3  8 8  0 8 88         8         77777777 8888  1 11 1      111111111111111111111111111111111   777   1      8888888888888888888888  1 000         33333333333333   11 0  8  0  8 0    0 444   66666666  000    777777    0    7   88888        777   55555    1111   3  22222       3   1         3  1         3                    6        
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                           .       .  ......   .......  ..............     .    ...... .        . ...  ......  .. ..     ..      .   .  .    ..  .   . ....   . ... .    . ....  .   . . . ...  .  .   .  .   . .......      ...............         .           ....  .. .     .    .  ..   .   ....... .  .   . ...  ... .   ... ............ ... ..    .  . ...  .    . ....    . .     ..        .. ..................................           ..  .. .    ... .......   . .. .. . ......   .    .    .  .       ..  .. .   .... .     .......       . .       .  ..  ..  .      ... . . ..  .    ..   . ..........   .       .  . ..  .......     . ...  ..   .     .   .      .......     ..   ............. . .   .   ...........................  . .       .     . ... . ....  ....   .    ....   .. . .   ..    .. . . . ........       ..     .................. . ... . ... . .. .  .. ..    ...   ...... .      ........        ..   ..   ......      . ..   .  .........       ....   .......  ..... .       .  .  .     .   .        . ...   ............        .  .                   . ...   .   .      .   ..  .. .  .  .    .    .      .  .  .               ...  .     .            ....   .....       .   . ....      ..     ...............    ....        ...... ..    .        .  .... .   .     .  ...     .  .  ..    ..  ..  .    ...        ...  .     .   .  ...        . .     ..  .  .  ............ .        ...    ..  . .    . .... .    ......     .   .  .     . .      .....   . ...............   .....  .  . ..  ..     . .    ...     .  .       .. .    .........................      ..............  .           .. ..    ......     ....  .        .   .  ..  ...      ...    ...    ....    .............   .  .   .....................  .      .....   .    ..  ....     ..  ......       .    ..............     ....         .  ..  . .     .            .........      ..  .          .  ....     ..         ....        ......     ....     .  ...     ..    .  .      .          .     .  .     .     .     ...    ..        ..  .   ..........................................................................................  ...   .    . ..      .  ... .   ..  .  ........  ..   . .  . .     .   ....   . . ..................... .    ..........     .       .           .      .       . ..   .   ...      ...     .  .     .     .   .  .     .     .             .   ...    ..... .     .       ...   ..    .  .  . .  . . ..         .         ........ ....  . .. .      .................................   ...   .      ......................  . ...         ..............   .. .  .  .  . .    . ...   ........  ...    ......    .    .   .....        ...   .....    ....   .  .....       .   .         .  .         .                    .        
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                           7       7  999999   2222222  55555555555555     2    222222 7        5 444  888888  44 44     44      7   7  7    00  5   4 0000   4 111 7    2 9999  4   4 4 4 333  4  4   1  1   1 2222222      000000000000000         2           0000  22 4     5    0  22   2   0000000 1  1   1 666  777 1   555 666666666666 999 11    4  4 555  4    4 0000    8 4     88        55 6666666666666666666666666666666666           22  22 4    111 0000000   7 22 66 4 999999   5    5    5  8       44  44 5   7777 7     3333333       1 2       9  99  99  9      999 3 3 88  1    88   1 5555555555   8       3  3 22  8888888     0 888  66   3     2   3      2222222     99   9999999999999 6 6   6   777777777777777777777777777  6 6       3     3 888 3 5555  5555   3    9999   33 0 3   99    66 3 7 3 11111111       66     000000000000000000 3 777 7 888 7 66 3  66 33    888   999999 3      11111111        66   44   555555      4 11   4  888888888       9999   3333333  66666 4       0  0  0     4   0        4 888   888888888888        7  7                   5 888   0   3      3   44  00 5  5  5    7    7      2  2  7               444  4     7            3333   77777       0   0 8888      33     333333333333333    2222        000000 88    8        0  0000 0   0     2  222     0  5  88    22  88  2    555        000  0     0   0  000        0 0     88  0  0  888888888888 8        666    00  0 6    0 8888 0    000000     0   8  0     7 7      88888   0 000000000000000   44444  2  0 00  00     8 0    444     0  8       00 8    8888888888888888888888888      00000000000000  6           88 88    555555     2222  0        5   2  88  555      555    000    2222    8888888888888   0  0   888888888888888888888  0      00000   0    88  8888     88  555555       7    33333333333333     0000         3  77  7 3     3            000000000      00  0          0  0000     00         5555        777777     3333     3  333     33    3  3      3          3     7  3     3     8     555    22        88  2   222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222  555   0    2 88      5  555 5   55  5  22222222  88   0 0  2 2     0   8888   0 5 555555555555555555555 5    5555555555     0       0           0      0       2 22   2   555      555     5  2     0     2   0  0     0     0             0   222    55555 2     5       000   00    0  2  0 0  8 0 88         0         44444444 2222  4 00 4      000000000000000000000000000000000   555   0      0000000000000000000000  2 222         88888888888888   00 8  0  8  8 6    8 000   22222222  222    555555    8    3   88888        555   00000    2222   2  00000       3   0         3  0         3                    7        
consensus                     :                                                                                                                                                                       AAAT-GGCGAAG-TA----A-CAA----A--GT-A--T-A-AA----CGTAATCATA------G-TCCCAAAA-A---CAT-----AT--A--CAAAA--TCGAGT-GTA-GGGCAAC-CAC-GGA-C----CTC-C---G-ACAA-A----AG-CGA-A-G-G--CAG-GA-TCA-GG-TGC-C-----A-TGGAGGG-----A--------GTAAGCATC-CTCTGCTGACC----GG--T-CACAC-CCGC-CG--TGA-GCC-C-----T-TA-GTC-G---AA---A-CAA-A-G------------T---A--AACG-GG-G---TT-ACCC-G----TCGTCA-AATCTAAGTACGAAA--AC--G-CA-GTCTAAACAAAATG-GGTA-AAT---GAAACAAATCA--GT--C-AACA---T-------ATG-A--C--T-T---A--GTG-ATAA-TTTG-TAATCGCAAA--CA--A-GGT----C-ATTAT-------AGCGACC-G-TAGAATT-TG--CG--AA-ATGATG---ACTTT--AA-CGAGAATTC-G-TT-TA----TAACCCTGCAA-CA-T--CA-A--C--TTTTTGG---TT--AGT-AGTTGGCCT-CGCTTT-------AAAAA--ATC--T--C-------A-T-ACG-CAT--G-----CATG-------------C-CT-T-GCGTATC-GAATC-A---A-C----TG--A-GAG-ACAT-TA-CACA-C-A-TAA--GCAG--G-T-G-A--------TAGTGGTAACATTA-------------CTA-AC-ANAGA-A---A-G--G-AA--AGTTGAC---GAT------T-GCAAAG--------TCAAAGTC--ATCAACGC------TTATCA-T--ATA-AT-------G-TAGTTGT-C--AGT-----C-TG--C--C-ATTAGAG-TC-AA-TATTAAGTA-AAATATCC-A---AAT------------ATGAAGCAGATCTGTCAGATTCTGTGGTGTCCT---TTA-TTTCGAGTTCGTCGGGATAATATCAAAATGGA-CATA-ATTGTGAAAATTATGATTGTTAATTGAT---AG-ACATC-ATCTATATACCT----ATA-----TGTAAGG-TTG-AA---GGACACG-GCAAG---------------TTTT----TTGTTTTT------AT-CCCGTAACAGTTT-TTTTGAA-ACA-AATTCTGCT--TTCAT-ATGGA--ATATAAAA--ATAAGTC---TGCCAATA---AG-GGGGC-ACA-AT---TAGTGCCCNT-AGGAAT-AC-CA-AC--A---------GAATTGTTGGA-NAGAC--ATGGTCTCTCC---AA-AGAC------TACATAAATATT-ATCTA-T-AAGAAA----ACCC-A---------------AGCAT--ATGCTC-T--TA--ATATCTTACTTCA-AGAGTA-CTTGTGTGGG--CAATCA----------------GAGTG----GGTTCT-------------NACAAAAATATGTGTCTT--GTTT-----CCCCAA----CG-ACCAGAAACTTGTTA--TT---TTCGGG---TGCC-G-TTTT----TTGT---------TT-AAAANCA-ATTA--------T--CAAT--T--CT-GAAAAA-G---CCT-AGAT--TT-T--ATTTT--AT-CGTGAGAGGAATCGTTG-----------TAGTAAAG--TGGTGGAGAAA-TC-ATACG-TTTTGGATGCAGTCAATTGTCTCAGCATTGGAAACAANTCTCGTGATTNAAAGTTGTTTTNGTATAAAGCTGGGCCTTTAGAGGGGGCGTTTTT----TGAGA-ATCC-CAATC--TGAA-TG-ACACCA-TTCTGGAATA-TGTAGCGG-AACAGTATATCNTGAAG---TGACT-TTTTAACA--GCTGTTCAG--TAG-------TTT--TTAGT--A-GAC-------TAAGGGA----------T-AGAG--------------GG-----C------TG---GTA-GAGCAC--TTACTGGAA---CCAGCG-ATGTA--------TC--TTT-G-TTTGTAAGGA-TTTC---TTA-TGCG---TT---T-CGGAA-----TCCAGT-A--------AAGGT-ATGGTAA-TTCAAATTGAT-CCTGAT-TCTTCGGAAA-TATTGAA---AGTATTT-CAAACAGAAAGGTGANTTTGAAGAA-TT-TCATC-TTAGT-CAGATTGCTTGGA-GTATA-AAGT----AAGATTCCCAGATGTG---TGA--AGTA-AACCC-T-AGTT-C-ATTTAAAAAG-ACAAGTATAATA----GT-GA-CTCT--TTACAAAC--A-----AAG----ACAAA-------TGTGA-ATC---ACTNTGCTTTAT--GCTGTCT--AACT---A-TAACAA-AGTTTTCACG-----TG----TNTAA--CTCA-TTTACNCACTTCTG---GCT-TC-----TTAA-GACAG-----AAGGATAAATAGT-CG--ATTTTCCC---CGC-----TAAA----TGGTTAC----GGATTTT-AATNATTTCCGAA-TANTTTTGATCA-TTCAGACAAAGTGTCAAGCTCCTCTCCCT
Reference ( family-568 )      :                                                                                                                                                                       AAAT-GGCGAAG-TA----A-CAA----A--GT-A--T-A-AA----CGTAATCATA------G-TCCCAAAA-A---CAT-----AT--A--CAAAA--TCGAGT-GTA-GGGCAAC-CAC-GGA-C----CTC-C---G-ACAA-A----AG-CGA-A-G-G--CAG-GA-TCA-GG-TGC-C-----A-TGGAGGG-----A--------GTAAGCATC-CTCTGCTGACC----GG--T-CACAC-CCGC-CG--TGA-GCC-C-----T-TA-GTC-G---AA---A-CAA-A-G------------T---A--AACG-GG-G---TT-ACCC-G----TCGTCA-AATCTAAGTACGAAA--AC--G-CA-GTCTAAACAAAATG-GGTA-AAT---GAAACAAATCA--GT--C-AACA---T-------ATG-A--C--T-T---A--GTG-ATAA-TTTG-TAATCGCAAA--CA--A-GGT----C-ATTAT-------AGCGACC-G-TAGAATT-TG--CG--AA-ATGATG---ACTTT--AA-CGAGAATTC-G-TT-TA----TAACCCTGCAA-CA-T--CA-A--C--TTTTTGG---TT--AGT-AGTTGGCCT-CGCTTT-------AAAAA--ATC--T--C-------A-T-ACG-CAT--G-----CATG-------------C-CT-T-GCGTATC-GAATC-A---A-C----TG--A-GAG-ACAT-TA-CACA-C-A-TAA--GCAG--G-T-G-A--------TAGTGGTAACATTA-------------CTA-AC-ANAGA-A---A-G--G-AA--AGTTGAC---GAT------T-GCAAAG--------TCAAAGTC--ATCAACGC------TTATCA-T--ATA-AT-------G-TAGTTGT-C--AGT-----C-TG--C--C-ATTAGAG-TC-AA-TATTAAGTA-AAATATCC-A---AAT------------ATGAAGCAGATCTGTCAGATTCTGTGGTGTCCT---TTA-TTTCGAGTTCGTCGGGATAATATCAAAATGGA-CATA-ATTGTGAAAATTATGATTGTTAATTGAT---AG-ACATC-ATCTATATACCT----ATA-----TGTAAGG-TTG-AA---GGACACG-GCAAG---------------TTTT----TTGTTTTT------AT-CCCGTAACAGTTT-TTTTGAA-ACA-AATTCTGCT--TTCAT-ATGGA--ATATANAA--ATAAGTC---TGCCAATA---AG-GGGGC-ACA-AT---TAGTGCCCNT-AGGAAT-AC-CA-AC--A---------GAATTGTTGGA-NAGAC--ATGGTCTCTCC---AA-AGAC------TACATAAATATT-ATCTA-T-AAGAAA----ACCC-A---------------AGCAT--ATGCTC-T--TA--ATATCTTACTTCA-AGAGTA-CTTGTGTGGG--CAATCA----------------GAGTG----GGTTCT-------------NACAAAAATATGTGTCTT--GTTT-----CCCCAA----CG-ACCAGAAACTTGTTA--TT---TTCGGG---TGCC-G-TTTT----TTGT---------TT-AAAANCA-ATTA--------T--CAAT--T--CT-GAAAAA-G---CCT-AGAT--TT-T--ATTTT--AT-CGTGAGAGGAATCGTTG-----------TAGTAAAG--TGGTGGAGAAA-TC-ATACG-TTTTGAATGCAGTCAATTGTCTCAGCATTGGAAACAANTCTCGTGATTNAAAGTTGTTTTNGTATAAAGCTGGGCCTTTAGAGGGGGCGTTTTT----TGAGA-ATCC-CAATC--TGAA-TG-ACACCA-TTCTGGAATA-TGTAGCGG-AACAGTATATCNTGAAG---TGACT-TTTTAACA--GCTGTTCAG--TAG-------TTT--TTAGT--A-GAC-------TAAGGGA----------T-AGAG--------------GG-----C------TG---GTA-GAGCAC--TTACTGGAA---CCAGCG-ATGTA--------TC--TTT-G-TTTGTAAGGA-TTTC---TTA-TGCG---TT---T-CGGAA-----TCCAGT-A--------AAGGT-ATGGTAA-TTCAAATTGAT-CCTGAT-TCTTCGGAAA-TATTGAA---AGTATTT-CAAACAGAAAGGTGATTTTGAAGAA-TT-TCATC-TTAGT-CAGATTGCTTGGA-GTATA-AAGT----AAGATTCCCAGATGTG---TGA--AGTA-AACCC-T-AGTT-C-ATTTAAAAAG-ACAAGTATAATA----GT-GA-CTCT--TTACAAAC--A-----AAG----ACAAA-------TGTGA-ATC---ACTNTGCTTTAT--GCTGTCT--AACT---A-TAACAA-AGTTTTCACG-----TG----TNTAA--CTCA-TTTACNCACTTCTG---GCT-TC-----TTAA-GACAG-----AAGGATAAATAGT-CG--ATTTTCCC---CGC-----TAAA----TGGTTAC----GGATTTT-AATNATTTCCGAA-TANTTTTGATCA-TTCAGACAAAGTGTCAAGCTCCTCTCCCT
gi|1                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    AAACAGGGTA-TGCA-AA-----AAACCAATCA--AT--C-AATA---TCATTTTTATGTAGTC--TCT---ATTGTG--TACCTTTG-TAATCGCAAA--CA--ACGGT----CCATTAT-------AGCGACC-G-TAGTATT-TG--CG--AA-ATGATG---A-TTT--AA-CGAGAATTC-G-TTATA----TCACCCTGCAA-CA-T--CAGA--C--TTTTTGG---T---AGT-AGTTG-CCT-CGCTTTT------AAAAA--ATCA-T--C-------A-T-ACGACAT--GG----CATG-------------CTCT-T-GCGTATCTGAATC-A---A-C----TG--A-GAG-ACAT--A-CACA-CCA-TGAACGCAGCGG-T-GGA--------TAGTGGTA-CATTATACATTCTTTGTTCTT-ACTATGAATA---A-GTTG-AACAAGTTGACTTGGAT------T-GCCAAGCCTATCCTTCAAA-TC--ATCAACGCCCCCCTTTATCCCT--ATA-ACTCGCACCGCTAGTTG--C--AGTGTCGCT-TGTTC--CGATTAATG-TCGAA-TATTTTGTGGAAATATTTTA---AATCACTTCATAACAACGAAGCAGATC-GTCAGATTCTGTGGTGTCCT---TTACTTTCGAGTTGTTCGG--TGATTTCAAATGGGACCATACATTATGAAAATCATGATTGTTAATTGATATAAA-ACATCAATCTATATACTTTCAAATATATTTTGTTAGGTTTGCAACTGAGACACGTGCAAGA--------------TTTTTTCGTTGTTTTTTAAAAAATCCCCGTAACAGCCTATTTTGAATCCA-AATTC-GCTAGTTGCTAATAGA--ATTTAGAATCAT-AGTC---TGCCAATATTTAGTGGGGCAACAGACTCATAGTGTCCATAAGGGATAAT-CACAC--ACTTACCTAGGAATGTTTGGA-GAGACA-ATGG-CTACAC---AATAGACACCAATTACAT-AGT-TT-ATCTATT-ATTAGA----ACCCAA---------------AGCATGAATA--A-T--TA--ATATCTT-CTTCA-AGAGCACCTTGTATGAGATTAATCAGTTATTGCATTTTGGGGGGTGTTTTGGTTCTTTTCATTCTTATAAACAAAAATATGCAT-TTAAATTT-----CCCCAA----CG-ACCAGAAACTTGTTACCTTAAGTTCAGGTTTTGCC-G-TTTTGGTGTTGTTCCAAACCCTT-GAAACCA-ATTAATCACTTTT--CAAT--T--CTCGAAAAA-GCGCCCT-GGATAATT-TTAATTTC--AT-TGTGAGAAGAATTGTTGTAATATTGGGTTAGTAGAGCTCGGGGCAGAAA-TCAATAAGATATTGAATGCAGTCAATTGTCTCAGCATTGAAAACAACTCTCGTGATTTAAAGTTGTTTTAGTATAAAGCTGGGCTTTTAGAAGGGGCATTTTCACCGTGAGA-AT-T-CAATCTTTGAATTG-ACACCA-TTCTGGAATA-TGTAGCGG-AATAGTATATCCTGATATTCTGACTCTTTTAACAGCGCTGTTCAAGCTAGTTTAAGCTTT--TTAGT--ATGACAATCTTTTAAGGTA----------TAAGAG--------------GGGTCACT------TG---GTATGATCACTATTTCTGGAACCGCCAGCG-AC-TACTAACTACTT--TTT-GTTTTGTAAGGA-TCTCACTTTATTGCA---TT---TCCGGAG-----T-CAGT----------AAGGT-ATGGGAATTTCAAGTTGGTCCCTCGT-CCTTCGG-AA-TATTGAA---AGTATTTACAAACAGAAAGTTGATTTTGAAGAATTT-TCATCTTTAGTAAAGGTTGCTTGTA-GTAAT-AAGT----AAGATTCTCCAACCTGTTCTGA--AGTA-AA-CC-T-AGTT-C--TTTAAAAGC-ACAAGTATAA-A----GTAAA-CTTT--TAACAAACGGA-----AAGCACCATAGC-------TGT-A-ATC---AGTGTACTTT-T--GCTCTCT---TCT---G-TTAC----GCCTCTAC------TG----TATAA--CTTA-TTTACCCCCTTCTGTTTGCT-TCTCTCGTT---GACAGAAATTAAGGATAAA-AGTCCG--CTTTTTTCCAACGC-----TAAA----TGGTTA
gi|10                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 tttcaaactaccataccggaaaa--TGA-GCC-------T-TACATC-GTT-GA---T-CAG-A--------------T---A--AACA-GGTG---CT-TCTT-G------GTAT-AATTTA-GTATGTAA--AG--A-CC-GGCTTAACAA--TT-GG---AAT---GAAACGCTTCA--GA--C-AACAACCT-------AC--A--C--G-T---A--CCT-ACAA-GTTG-TATTTGCAAATGCA--A-AATAAACC-ATCAT-------AACGACC-A-TAGAATT-TG--TA--AACACGA-G---ATTGT--A---GAAACTCCTG-TT-TG----T-------CAG-TA-T--CA----C--GCCTTGG---TTTAAG--ACTTTATCA-CACTC----------AGA--ATC--TG-T-------T-T-TCG-CAT----------------------------T-T--C-TATT-GGATC-AGTTA-CATTTTGCAG-GAG-ACAA-AATCAC--C-A-TAA--ACAA--G-T-G-A--------AAATAG-AATATTG-------------CTA--C-AT-GA-ATACA-G--G-AA--A-TTGAC---GAT------G-GAAAAG--------TTAAAGCA--ATCT-CGC------TTGTCA-TCAAGA-AG-------GGTTGTTGT----AAT-----T-TG--C--C-TTGAACG-TC-TA-TGTTCAGTA-AATTATCC-A---AAT------------ATGAatatggaatttgttacaaataaggtttttacttt
gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     gaacacgtcccggtaaCA-GG-TGG-C-------TAGAAGG-----A--------GTGAGTATC-----GC---CC----GA--T-CACAC-CTGC-CG--TTA-GCC-C-----T-GA--TC-T---TG---A-TCA-G-G------------T------AACGCAA-G---TA-ATCC-G----TAGTCA-AA-CTCAGTATGCAA--AC--G-GATATC-GAAC--AATC-GGTA-AA-----AAGC--ATTA--G------GCG---T-------TTG-G--T--C-C---A--TTGTATAA-CTTG-TATCTGTAAA--TA--A-GAT----C-ATT
gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         tttactcagtatacacatgtatatgtctttgaagtcggttatgatgttcaatgcaacgacatcggtatacatgtacttcaaacgaactacacgtttaccgtgacatcaaagtaaatatatgtttagcggactttttttctgcctatatatagttacggcactggatttcttatgaacaagtgaaaattacgaacagtgactaatctcttagatcctaaattaaaagtactagtatacaaacaaagatccctagccaagATCATGAAG---TGACG-TCTTAACA--GC----------AG-------TTA--CTAGT--A-G--------------GA----------T-AGAG--------------GG-----C------TGCGGGTA-GAGC-C--TTAGTG-AA---CCAGCG-ATGTAA-------TCATTCT-G-TTTG-AAGGAGTTTT---TTA-TGCA---T------CGAAAAAAAATCCAAT-ATAAAAAACAAGGT-ATGGTAA-TTTCAATTGAT-CCTGATGTCTTTGGAAAATAT-GAAGCAAATGTTT--AAACA-AAAGGTGGATTTGAAGAA-GTATCACT-TTAGT-CAGATGTCTTGGA-GTA-A-GATT----AGTATTCC-AAATGAC---TGA--AGTG-AATCC-T-AGTTAC-AGTTAAAAGGCATAAGTATG-TA-----T-GA-CTAT--TTATCAAC--AC----AAG----ACAAA-------TGTGA-ATC---ACTTGGCTTTATCAGCTG-----AACT---A-TATCAA-AGTTTTCATG-----TGCGTCTTTAA--C-CA-TTTACACACGTC-----GCTCTG-----TAAA-GACAG-----AAGGCTA
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 tccGTTTTT----TGATATATCC-CCATC--GGTA-TG-ACACCA-TTCTGGAATAATGTAGGTG-GACAGTATCTC-TGAAA---AGACTGTTTTAACA--GCTGTTTAG--TAG-------TTT----AGTTTA-GAT-------TAAGGAAGAGGCTTGGTT-AGAGCACTTACTTGAACTAG-----CATATATTG---GTA-GAGCAC--TTACTGGAA---C-AGC--ATATA--------TC--TTT-G-TT-GTAAGGA-ATTG---TTA-T-TG---TTAATT-CG-AA-----TCCAGTTA--------AAGGTCATTGTAA-ATCAAATTGAT-CCAGAT-TCTTCGGAA--TATTGAA---AGTATT--CAAACAGAA-GGTGAATTTGAAGAA-TT-CTATC-TTAGT-CAGATTGCTTGGAGGTATATAAGT-----AGATTCCCAGATGCT---CGA--AGTA-CACCCTT-AG-T-C-ATCTTAAAAG-ACAAGTACAG-A----GT-CAGCTCTAGTTACAA
gi|14                         :                                                                                                                                                               agtgtagaAAA--GGCAAAGATA----A-CGA----ACAGTGA--T-C-AATCT-CGTAA-----------G-TCCTAAAT-A---GA------AT--A--CAAAA--ACAAGA-GTC-GGGCAAT-CAC-GGA-C----CCC-T---GGACAC-A----C--CAG-A-A-G--TGG-GA-TCA-GG-TGC-C-------TAGGGGG-----A--------GTAAGCACC-CCCTGTTGACC----GG--T-CACAC-CCGC-CG--TGA-GCC-C-----A-TA-GTC-T---TG---A-TCA-G-G------------T---A--AACG-GA-----------C-A----TC-----AGT----GTGTGAAA--A---A-CG-G-CTTAAC--AATG-GCT---AT---GAAACACATCA--GA--C-AGCA---T-------TTG-A--C--T-C---A--ATG-ATAG-GTCA-TATTGGTAAA--CT--A-AAT----T-GTTAC-------AACGACC-A-TAGAATT-TA--CG--AA-ATGCTGC--ATTTA--AA-CGTGACT---G-TT-GA----AACCCCTGCAA-CA-TACCG-A--C--TTTT
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                              ggatgtA-C----CTC-T---A-ACAA-A----GG-CGA-A-G-G---AG-GG-TCA-GG-TGC-C-----A--GGAGG------A--------GTAAGCATC-CTCTGCTGACC----GG--T-CACAC-CCAC-CG--TGA-GCC-C-----T-TA-GTCGG---AA---A-TAA-G-G------------T---A--ataaatcatgcactttcttttcaaagtacatgtatatttgcacatgaaat
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    caaatAAATAAGGTA---T---GAACAAAATCA--GT--C-AACA---T-------ATGGA--CCTT-T---A--GTG-ATAA-TTTG-CAA-CGCAAA--CA--A-GGT----C-ATTAT-------ACCGACC-ATTAGAATT-TG--CGAAAA-ATGATG---ATTTTTAAA-CGAGATTTC-G--T-TA----TAA-CCTGCAA-CATT--CA-A--CTTTTTTTGT---TT--AGC-AGTTAGCCTAAGCTTT-------AAAAA--ATCTTT--C-------ATT-ACG-CGG--A-----CATG-------------CTCT-T-GC-TATC-GAATC-A---A-CT---TGC-G-GAGTAAAT-TA-CACATC-A-TAA--GCAG--GATGG-A--------TAGTGGT-GTATTA-------------CTA-tgaacaaaatcagtcaacatatggacctttagtgataatttgcaacgcaaacaaggtcattataccgaccattagaatttgcgaaaaatgatgatttttaaacgagatttcgttataacctgcaacattcaactttttttgtttagcagttagcctaagctttaaaaaatctttcattacgcggacatgctcttgctatcgaatcaacttgcggagtaaattacacatcataagcaggatggatagtggtgtattactacttctttcgttacttggataattttattgaacattgac
gi|16                         :                                                                         caaatacctctaacaaaggcgaaggagggtcaggtgccaggaggagtaagcatcctctgctgaccggtcacacccaccgtgagcccttagtcggAAAT-GGCGAAG-TA----A-CAATTAAA--GT-A--TCA-AA----CGTA-TCATA------G-TCCCCAAA-A---CAC-----AT--A--CAAAA--TCGAGT-GTA-GG-CAAT--AC-GGA-C----CTT-C---G-ACAA-A----AG-CGA-A-AAG--CAG-GAATCAAGG-TGC-C-----A-TGGA-GG-----A--------GTAAGCATC-CTCTGCTGACC----GG--TCCACAC-CCGC-CG--TGA-GCC-C-----T-TA-GTC-G---AA---A-CAA-A-G------------T---A--AACG-GG-G---TT-ACCC-G----TCGTCA-AATCTAG--ACGAAA--AT--GACA-GCCTAACTAACAAG-GGTATAA-----AAACAAATCA--GT--C-A--A---T-------ATG-A--C--T-G---A--GTG-ATAA-TTTG-TAATCGCAAA--CA--A-GGT----C-ATTAT-------AGCGACCGG-TAGAATT-TG--CG--AA-ATGATG---ACTTTAAAA-CGAG-ATTC-A-GT-TA----TAACCCTGCActtctttcgttacttggataattttattgaacattgac
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    taA-T-AAGAAA-----CCC-A---------------AGCAT----GCTCAT--TA--ATATCTAACTTCA--GAGTA-CTTGTGTGGG--CAATCA----------------GA--G----GGTTTT-------------CAACAAAATATGTGTCTT--GTTT------CCCAA----CG-ACTAGAAATTCG-TA--TT---TTCGGG---TGCCGG-TTTT----TTGT---------TTAAAAAGCA-ATTA--------TTATAAT------T-GAAAAAGG---CCTAAGAT--TT-TA-ACTTT--AT-CG---GAGGAATCGTTG-----------T-GTAAAG--T-GTGGAGAAA-TC--TACG-TTTTTGATGCAGTCAATT
gi|18                         :                                                                                                                                                                                                                                                            aatcgaccaattgttgctaccatatgttttcctaatg-GGA-C----CTC-C---A-A-AA-ATTATAG-AGGTA-G-G--CAG-GA-TCA-GGGTGC-C-----A--GGAGGATCGTAA--------TTGAGCATC-CTCTGCTGACC----GATCT-CACACACCGC-CATCTGA-GCC-T-----TGTA-GTT-C---AA---A-CAA-A-GC-----------T---A--AACG-GG-GATTCT-ATCC------TCGTCA-AATCT-AGTACGAAA--AT--G-AA-GGCTAAACACAA-G-GGTT-ATT---GAAACAAGCAG--GT--C-AACA---T-------ATG-A--CT-T-T---A--GTG-ATAA-TTTG-T-ATCGC-AA--CA--A-tttgaaaattcttgtatt
gi|19                         :                                                                                                                                                                                           gcaaacataaaatgttatgtagattattatcgTCATA------AATCCCATAA-A---GA------AT--A--TAAAA--C-------TA-AGGCAAA-CAC-GAA-C----CCT-T---G--CAT-AT---AC-CGG-A-G-G--TGG-GA-TCA-GG-TTT-TTTTTAA-AAGAGGG-----A---------TAAGCACC-CCTTGTTGACC-----G--T-C-CAC-TCGC-AT--TAT-ACC-C-----T-CT-ATC-T---TG---A-TCA-G-G------------T---A--AACT-GA-G---TA-ATCT-G----T----A-GGTC-AAGAACGAAA--aat
gi|2                          :                                                                                            ttagatactgttggagacaatattggttgctcaccgaaagaatgaaaagtgaagataacgtaacagtgatccatcAAAT-GGCGAAG-TA----A-CAA----A--GT-A--T-A-AA----CGTAATCATA------G-TCCAAAAA-A---CA------AT--A--CAAAAA-TCGAGTTGTAAGGGCAAC-CAC-GGAAC----CTT-C---G-ACGA-A----AG-CGA-A-G-G--CAA-GG-TCA-GG-TGC-C-----AATGGAGAG-----A--------GTAAGCATC-CTCTGCTGACC----GG--T-CACAC-CCGC-CG--TGA-GCC-T-----G-TA-GTC-G---AA---A-CAA-ATG------------T---A--AACG-GG-G---TT-ACCC-G----TCGTCA-AATCTAAGTATGAAA--AT--G-CA-GTCTAAACAAAATG-GGTA-AAT---GAAACAAATCATGGT--C-AACA---T-------ATG-A--C--T-T---A--GTG-ATAC-TTTG-TA-TCGCAA---CA----GGT----C-ATTAT-------AGCGACC-G-TAGAATT-TGTGCG--AA-ATGATG---ACTTT--AA-CGAGAATTC-GGTT-TA-----AACCCTGCAA-CA-TA-CA-A--C--TTTTTGG---TT--AGT-AGTTGCCCT-CG--TT-------AAAAA--ATC--A--C-------A-TTACG-CAT--G-----CATG-------------C-CT-T-G-GTATC-GAATC-A-----C----CG--A-GAG-ACAT-TA-CACA-C-A-TAAT-GCAG--T-G-G-A--------TAGTGGTAACATTA-------------CTA-AC-AAAAA-A---A-G--G-AA--AAGTGAC---AAT------T-GGCAAG--------TCAAAGTCCCATCAACGT------TTATCA-T--ATATAT-------G-T-GTTTTGC--AGT-----CCTG--C--C-ATTAGAG-TC-AA-TATTA--TA-AAATATCC-A---A-T------------ATGAAGCACATTGGTCAGATTCTGTGGTGTC-T---TTA-TTTCAAGTTCGTCAGGATAATATCAAAATGGA-CATA-ATTGTGAAA-TTATGATTGTTAATGGAT---AA-ACATC-GTCTATATACCT----ATA-----AGTAAGG-TTG-AA---GGACACT-GCAAG---------------TTTT----TTGTTTTT------A--CCCG-AACAGTTT-TCCTGAA-ACA-AATTCTGCT--TTCAT-ATGGAATATATAAAA--ATAAGTC---TGCCAATA---AG-GGGGC-AAC-AT---TAGTACCCAT-AGGAA--AC-CA-AC--A---------GAATTGTTGGAGAAGACGGAT-GTCACTCCAAAAA-AGAC------TACAATAATATTAATCTA-TAAAGCAA----ACCC-A---------------AGCA---ATGCTC-T--TA--ATATCTTTCTTC--AGAGTA-CTTGTGTGGG--CAATCA----------------GAGTG----GGTTCT-------------GACAAAAATATGTATC-T--GTTT-----CCCAAA----TG-ACCAGAAACTTGGTA--TT---TTCGGG---TGCC-G-TTTT----TTGT---------TC-AAAAGCA-ATTA--------T--CAAT--TTCCT-GAAAAA-G---CCT-AGAT--TT-T--ATTTT--ATCCGT--GAGGAATTGTTG-----------TA-TAAAG--TGGTGGAGAAATTC-ATATG-TTTTG-ATGCAGTCAATT---------TTAGAA--AAATCTCGTGATTGAA----GTTTTC-TATAAAGCT----CTTTAGAG-------TTTT----TGAGA-ATCCACAATC--TGAA-TGAACACCACTTCTGGAATA-TGTAGTGGAAACAG--TATCTTGAAG---TGAC--CTTTAACA--GCTGTT-AG--TAG-------TTTTGTTAGT--A-G---------TAAGGGA----------T-AGA---------------GG-----C------TG---GTA-AGGCAC--TTACTGGAA---CCAGCGAATGTA--------TC--TTTGG-TTTGTAAGGA-TTTC---TTA-TGCATATTT---T-TGGAA-----TCCAGT-A--------AAGGT-ATGGTAA-TTCAAATTGAT-CCTGAT-TCTTCGGAAA-TATTAAA---CGTATTC-CAAACAGAAAGGTGATTTTGA--GA-TT-TCATC-TTAGT-CAGATTGCTAGGA-GTATA-AAGTCAGGAAAATTCCCAGATGTG---TGA--AGTA-AACCC-TAAGTT-CAATTTAAAAAG-ACAAGTATAATA----GT-GA-CTTT--ATACAAAC--A-----AAG----ACAAG-------TG-----TT---ACTGTGCTTTAT--ACAGCCTGGAACC---AGTAACAA-AGTTTTCATGTAGTCTA----TGTAA--CTCA-TTTACCCCCTTCTG---GCT-TC-----TTAA-GACAG-----AAGGGTAAATAGT-AG--ATTTTCCC---CGC-----TAAA----TGGTTATAACGGGATTTTAAATAATTTCCGAA-TACTTTTGATCA-TTCAGACAAAGTGTCAAGAT-CTCTCCCTtaaatgttgatgcatt
gi|20                         :                                                                                                                                                                                              A----A--AT-A--T-A-AATAGGCGAAGT--TA------A-TCCCAAAA-A---CAT-----AT--A--CAAAA--CCAAGT-GTA-GGGCAAC--AC-GGA-C----CTC-C---G-ACAA-A----AG-CGA-A-G-G--CAG-GA-TCA-GG-TGC-C-----A-TGGAAG------A--------GTAAGCATC-CTCTGCTGATC----GG--T-CACAC-CCGC-CG--TGA-GCC-C-----T-TA-GTC-G---AA---A-AAA-A-G------------CATGA--AACG-AA-A---TC-A-----------GTCT-AA-CTA--TAC-ATG--AC--T-TA-GT---GATAATATG-CGT--AATCTGGAAACAAGTCA--TTTGC-GAAA---TG------ATG-A--C--T-T---ca
gi|21                         :                                                                                                                                                                                             AA----A--GT-AATT-A--------GTAA-CATA------G-TGCCAAAA-A---CAT-----AT--ATACAAAA--ACGAGT-GCA-GGGCAA--GAC-GGA-C----CTT-C---G-ACAA-A----CG-Ctaaattgagtattcgttat
gi|21                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          ctattaC-C-----T-TC-GAC-A---AACGCA-CAA-A-A------------T---A--AACA-GG-G---TA-GCCC-G----TCGTAA-AATCTT-GTACAAAA--ATAAG--A-GTCTGA-CAAA--G-GGTA---C---GAAACAGATCA--GT--C-AACA---C-------ACG-A--C--T-T---C--GTG-ATAA-TTTG-TAGTCGCAAA--CA--A-GGT----C-ATTAT-------AGCGACA-G-TAGAATT-TG--CG--AA-AGGATG---Aacaaaataaacagggtagcccgtcgtaaaatcttgtacaaaaataagagtctgacaaagggtacgaaacagatcagtcaacacacgacttcgtgataatttgtagtcgcaaacaaggtcattatagcgacagtagaatttgcgaaaggatgat
gi|22                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              ctattaaaagtaattagtaacatagtgccaaaaacatatatacaaaaacgagtgcagggcaagacggaTATC-TAATC-A---A-C----TG--G-GAG-ATATGCA-TAC--C-A-TTT--GCAA--G-G-G-A--------TAGTGGTA-TATTA-------------CTA--C-AAAGACA---G-G--G-AA--AGCTGAT---GAT------T-GCATTT--------TTAAAGTC--ACCAA-GC------TTATCA-T--ATA-AT-------G-TAGCTGT-A--AGT-----C-TG--C--C-ATTAGAG-CC-AA-TATTAAGTA-AAATATCC-A---ACT------------AAGAAGCAGATTTGTCAAATTCTGTGGTCTCCT---TTA-TTTTGAGTTCGTCGGGt
gi|23                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        A-A----CG-CAC-A-G-G--CAG-GA-TCA-GG-TGC-C-----A-TGGAGG------A--------GTAAGCATC-CTTTGCTGACC----GG--T-CACAT-CCGC-CG--TGA-GCC-G-----G-TA-TTC-G---AA---A-CAA-A-A------------T---A--AACA-GG-G---TA-ACCC-G----TCGTAA-AATCT-TGTACGAAA--ATAAG--A-GTCT-GACAAA--G-GGT---AT---GAAACAGATCA--GT--C-AACA---C-------ACG-A--C--T-T---C--GTG-ATAA-TTTG-TAGTCGCAAA--CA--A-GGT----C-ATTAT-------AGCGA
gi|24                         :                                                                                                                                                                       AAA--GGCAAAGATA----A-CGA----ACAGTGA--T-C-AATCT-CGTAA-----------G-TCCTAAAT-A---GA------AT--A--CAAAA--ACAAGA-GTT-GGGCAAT-CAC-GGA-C----CCC-T---GGACAC-A----C--CAG-A-G-G--TGG-GA-TCA-GG-TAC-C-------TAGGAGG-----A--------GTAAGCATC-CCCTGTTGA
gi|25                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    cactgtgataaatggtagtattaatgtTGTG---TGATAAGTATAACCC-T-AGTT-C-ATTTATAAAG-ACAAGTATAATATTTTCT-GG-CCCC--TAACAAAA--AAATTCAAG----ACAAATTGACTTTGTAACATCTTAACTCTGTTTCA---ACTGTC-----CTGTAA-TAGCAATAGTTCTCTCG-------------TAAGGCTCATTTTAC-CACTTCTG---a
gi|26                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 AATT-TG--CG--AA-ATGATA---A------GA-C-AGGATT-------------TAAGGCGACAA-CA-A--TA-A--AAATTTTTAGAATTT--AGTCAGT-GGCCT-CGACCTGATAAGAAAAAA--ATA--T--CAAAAAATA-T-ACG-CAC--GTGGTATATGAC-----------C-CTCT-GCGCGAC-GAATC-A---ATC----TG--ATGAG-ACGA-TA-CA
gi|27                         :                                                                                                                                                                                                        -A--C-A-AC----CGT--TCATA------A-TCCAAAAA-AATGTAT-----AT--A--CAAAAA-TCGAGT-CGA-GAGCAGCGCACTGGA-CACATCTT-CTGTA-ATAA-A----AGCCGA-ATG-GTTTAGTGA-T---AG-TTT-T-----A-TTGAGAG-----AAGAAAATGGTAAG------TCCACTAACC----AG--T-CA
gi|28                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            ggcgactgtaTGTCAGTGTCTGTGGTGTCCTGAATTA-TATTAAGTTCTTCGCGATA-TATCAAA-TGGA-TATA-ACTGTGAAAATTATGATTGTTAATTGAT---AGCACATC-ACC
gi|28                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            CACC-GCAAG---------------TTTT-----TGTTTTT------AT-TCCGTAACAGGTT-TT---GA-ACA-AATTgcaagtttttgtttttattccgtaacaggttttgaacaaatt
gi|29                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      tgtcagtgtctgtggtgtcctgaattatattaagttcttcgcgatatatcaaatggatataactgtgaaaattatgattgttaattgatagcacat--CTCA-TT---ACACTTCTG---GCT-TT-----TTAAAGACA-------AGGATAAATAGTACGCCATTTTCCT---CGCGCGCTTAAAGTTTTAATTAC----GGATTTT-AATTACTTCCGAATTAATTTTGATCATTTCAGACAAAGTATTCAACTCCTCTCCC
gi|3                          :                                                                                                                                                                       AAAT-GGCGAAG-TACA--A-CAA----T--GT-G--TTA-AA----CGTAA-AATA------G-TCCCAAAA-A---CATGT---AT--A--CAAAA--TTGAGT-GTA-GGTCAAC--AC-GGA-C----CTC-C---G-ACAA-A----AG-TGA-A-G-G---AG-GA-TCA-GG-TGC-C-----A-TGG-GTG-----A--------GTAAGCATC-CTCTGCTGACG----CG--C-CACAC-CCGT-CG--TGA-GCC-C-----T-TA-GTC-G---AA---A-CAACA-G------------T---A--AACG-GG-A---TT-ACC--G----TCGTGA-AATCTA-GTACGAAA--AT--G--A---CTGA-CAAA--G-GATA---T---GAAACAAATCA--GT--C-AACA---T-------ATG-A--C--C-T---G--GTG-ATAA-TTTG-TAATCGCAAA--GA--A-GGT----C-ATTAT-------AGCGACC-G-TATAATT-TG--CG--AA-ATGAT----ACTTT--AAATGAGA-TTC-G-TTATACCGTTAACCCTGCAA-CA-T--CA-------TTTTTGG---TT--ACT-AGTTGGCCT-AGCTTT-------AAAAAT-CCC--T--C-------A-T-ACA-CAT--ATGC--CATGTGTTGGATATAGCC-CT-T-GCGTATC-GAATC-A---A-C----TG--A-GAG-ACAT--A-CACA-CCA-TAA--GCAG--G-T-G-A--------TATTGGTA-CATTA-------------CTA--C-ATAGA-A---AAG--G-AA--TGTTGAC---GATA-----T-GCAAAG--------TCAAAGTC--ATCA-CGT------TTATTA-T--ATA-AT-------G-TA--TGT-C--AGT-----C-TG--CATC-ATTAGAG-TC-AAATATTAAGTA-AAATAGCC-A---AAT------------ATAAAGCAGATATGTCAGATTCTGTGGTGTCCT---TTA-TTTCGAGTTCGCCA----AATATATAAATGGA-CATA-ATTGTG-AAATT-TTATTGTTAATTGATA--AG-ACATC-GTTTATATACCC----ATA-----TGTAAGG-TTG-AA---GGACACG-GT------------------TTTT----TTGTTTTT------AT-CCTGTAACGTTTT-TTTT--A-ACACAATTCTAC---TTCAT-AT-GA--ATATAAAA--ATAAGTC---TGCCAATA---AG-AGGAC-ACA-AT---TAGTGTCCTT-AGGAAT-AC-CA-AC--A---------T-ATTGTTGGA--AGAC--ATGGTTTCT-----AA-AGAC------TACATAAATATT-GTCCA-T-AAGAAA----ACCC-A---------------AGC----ATGCTC-T--TA--ATATC-TACTTC--AGAGTA-CTTGTGTGGG--CAATCA----------------GAGT-----GGTTCT-------------GAC-AAAACATGT
gi|30                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             ctattaaacctgacacaatacatctgctagtcatctgggactgatgtttatatatcACATTG-------------TTA-ACTACATA-A---A-A--G-AA--A--T--------T------T-GCAAAA--------CTCAAGTC--ATCA-CGT------TTATCA-T--ATA-AT-------GTTAGTTGT-CCAAGTC----C-TG-----C-ATTAGAGATT-AA-TATTAAAGG-AAGTGTTC-ATGGAAT------------A
gi|31                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     T-CA-CAC--C-A-TAA--GTAG--G-T-G-G--------TAGTGGT-ATATTA--------------TC-AC-ATTGA-A---A-G-----------------------------GCAAAG--------TTAAAGTC--ATC-TTGC------TTATCA-T--ATA-AT-------G-CAGTTGT-C--AGT-----G-TG--T--C-ATTAG
gi|32                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              cttatCAT-T--CAC--C-A-TAA--GCAG--G-TGG-A--------TGGTGGT-ATATTA-------------CT--AC-ATAGA-A---AGG--G-AA--AGTTGAC---GATAGCCGATAGCAAAG--------TTAAGGTC--ATC-ACGC------TTATC
gi|34                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 tatcctCAATA---AG-GGGGC-ACA-AT---TAGTGCCCGT-TGGAAT-AT-CA-AC------------GGATTGTTAG--TAGAC--ATGG--TCTCC---AA-AGAC------TACACAAATATT-ATTTA-T-AAG
gi|35                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           GA-GCC-T-----T-TA-GTC-G---AA---AACAG-G-GAGGGGGGGCGGTT---ACGAGCG-GA-G---TT-ACCCTG----TCGTCAGAATCT-AGTACGGAA--A---G--A-G--TGGACAAA--G-GGTA-ctaa
gi|36                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      A-GG-T-C-C-----G-TGAATGA-----A--------GTAAGCATCTCGTTGCTGATCCGAGGA--T-CACAC-CCAC-CG--TGA-GCA-A-----T-CA-AGA-G---AA---A-CAG-A-tg
gi|37                         :                                                                                                                                                                                                                             gatggatggtcgCCCAACATA---CATGTATAAT--A--CAGAG--TCGA-T-GTA-GA-CAAC--AC-AGA-C----CTAGT---A-ACAA-A----AGGCGA-G-G-G--CAG-GA-TCA-GG-TGC-C-----A-TG
gi|38                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      cc--ATTTTCCC---CGC-----TAAA----TGG----------ATTTT-AATCATTTCCGAA-TATTTGTATCCA-TTCAGACAAAGTGTCAAGCTCCTCTCCCT
gi|39                         :                                                                                                                                                                     gcAAAT-GGCGAAG-TATTTTA-CAA----T--GT-G--T-TTAA----CATAATCATA------G-TCCAAAAA-A---CAT-----GT--A--CAAAA--TCGAG
gi|4                          :                                                                                                                                                              tttgttataAAATTGGCGAAG-TA----AACAA----T--GT-G--TTA-AA----CGTAATCGTACATGTAG-TCCCTAAA-A---CAT-----AT--A--TACAACTTCGAGT-GTA-TGGCAAC--AT-GGA-C----CTC-C---G-ACAACA----GG-CGA-A-G-C--CAG-GA-TCA-G--TGC-C-----A-TGGAGGG-----A--------GTAGGCATC-CTCTGCTGACC----GG--T-CAC-C-CCACACG--TGA-GCCTC-----G-TA-GTC-G---AG---A-CAA---G------------T---A--AACA-GG-G---TT-TACC-G----TC---------TAC-TACGAAATGAG--A-CA-GTCTAA-CAA---G-GGTA---T---GAAACAAATCA--GT--C-AGCA---T-------ATG-A--C--T-T---A--GTG-ATAA-TTTGGTAATCGCAA---CA--A-GGT----C-AT-AT-------AGCGACC-G-TAGAATCCTG--CG--AA-ATGCTGCGGACTTTGAAA-CGAGAACTC-G-TT--A----TAACCCTGCAAACA-T--CA-TTTC--TTTTT-----TT---GT-AATTGAC-T-CGCTTT-------AAAG----TC--CTGC-------G-T-CCG-CAT--GA----TATA-------------C-CT-TTGCGTATC-GAATC-A---A-C----TG--A-GAG-ACAT--A-CACA-CCA-TAA--GCAG--G-T-G-A--------TAGTGG-AACATTA-------------CTA--C-AAAGA-A---A-G--GGAA--AGTTGAC---GAT------T-GCAAAG--------TCA--------TCA-CGT------TTATCA-T--ATA-AT-------G-TAGTTGT-C--AGT-----C-TG--C--C-ATTAGAA-TC-AA-TTTTAAGTA-AAATATCC-A---AAT------------ATGAAGCACATCTGTCAGATTCTGTGGTGTTCT---TTA-TTTGGAGTTCGTCAGGAT-ATATC-AAATGGA-CATA-ATTATGAAAATTATGATTGTTAATAGATC--AG-ACATC-ACCTATATATCTAC--ATA-----TGTA
gi|41                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           actatcttatccgaatgacatcaaagattacttgaacgattgtctgtactgcaatat---AG-ACATC-ATCTATATATCT----ATA-----TGTAATG-ATG-AA---GGACACA-GTAAG---------------TTTT----TTGTTT
gi|42                         :                                                                                                                                                                       AAAT-GGCGAAG-TA----A-CAA----A--GT-A--T-G-AAC---CGTAATCATA------
gi|44                         :                                                                                                                                                                       AAAT-GGCGAAG-TA----G-CAA----A--GT-AT-T-C-AA----CATAATCATA------A-Tcgtacacagataaaccata
gi|46                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         cgcacatttataTTTTGG---TT--AGT-AGATGGCCT-CGCTTT-------AACAA--ATC--
gi|47                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   A-A---G-G--G-GA--AATTGAC---AAT------T-GCAAAG--------TCAAAGTC--AT
gi|49                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      -A---AAT------------ATGAAGCACATCTGTCTGATTCTGTG
gi|5                          :                                                                                                                                                                       AAATTGGTGAAG-TA----AACAA----T--GT-G--T-T-AAT---CGTAATCATA------G-TCCTAAAA-A---CAT-----ATTTA--CAAAG--TCGAGT-GTA-GGGCAAC--AC-GGA-T----CTC-C---G-ACAA-A----AG-CGA-A-G-G--CAG-GA-TCA-GG-TGC-C-----A-TAGAGG------A--------GTAAGCATC-CTCTGCTGACC----GG--T-CACAC-CCGC-CA--TGA-GCC-C-----T-TA-GTC-G---AA---A-CAA-G-G------------T---A--AACA-GG-A---TT-ACCC-G----TTGTCA-CATCT-AGTACGAAA--AT--GACA-GTCT-AACAAAA---GGT---AT---GGGACAAATCA--GT--C-AGCA---T-------------------------------TAA-TTTA-TAATCGCAAA--CA--A-GGT----C-ATTAT-------ACCGACT-G-TAGAATT-TG--CG--AC-ATGGTG---ACTTTA-AA-CGAGAA-TC-G--T-TA----TAATCCTGCAA-CA-T--CA-A--C--TTTTTAG---TT--AGT-AGTTGGCCT-CGCTTT-------AAAAA--GTCT-T--C-------A-T-ACG-CAT--GA----CATGT------------T-CT-T-GCGTATC-TAATC-A---A-CTGCATG--G-AAA-ACAT-T--CACACC-A-TAA--GCAG--G-T-G-ATACATTTGTAGTGGT-ACATTA-------------CTA-
gi|6                          : tatactctatatgataatatatgtcttctgaaaccgcttttacatgtttctgtgttggcgacatcggtattttgggctttttcaaaagtttggcttatatttaaaaagttttcttttcatgaatgcatttttttctgtatttttttttattgtatgtagtaaaagatatT-GGCCAAA-TA----AACAA----T--TTGA--T-A-AT----TGTAATCAAA------A-CCCCAAAA-----CAT-----AC--A--CAAAG--TCGAAT-GTA-AGGAAAC--AC-AGA-C----CTC-C---G-ATAA-T----AG-CGA-A-G-G--AAT-AG-TCA-GT-CG-----------------------------------GCATC-CTCTGCTGACC----GG--T-CACAT-CCGC-CG--TGA-GCC-C-----T-TG-GTC-G---AA---A-CAA-A-G------------T---A--AACG-GG-A---TT-ACCC-G----TCGTCA-AATCTA-GTAGGAAA--AT--GACA-GTCTAA-CAAA--G-GGTA---T---GAAACAAATCA--GT--C-AACA---T-------ATG-A--C--T-T---A--ATG-ACAA-CTTG-TAATCGCATA--CA--A-GGT----C-ATT---------------------------TG--CG--AA-ATGGTG---ACT-----------------------G----TAGCCCTGCAA-CA-T--CA-------TTTTTTG---CT--AGT-AGTTGACCT-CGCTTT-------AAAAA--GTCC-T--C-------G-T-ACG-CAT--GA----CATG-------------CTCT-T-GCGTATC-GAATC-A---A-C----TG--G-AAG-ACAC--A-CACA-C-AATAA--GCAG--G-T-G-A--------TAAGGGTA-CATTA-------------CTA--C-ATGAA-A---A-G--G-AA--AGGTGAC---GAT------T-GCAAAG--------TTAAAGTC--ATCA-CGC------TTATCA-T--ATA-AT-------G-CAGTTAT-C--AGC-----C-TA--C--C-TTTAAAG-TC-AA-TATTAAGTA-AAAAATCC-A---AAT------------ATGAAGCAGATATGTCAGATTCTGTGGTGTCCT---TTA-ca
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                atagatTGTCAGATT--GTGTTGTC-T---TTA-TAT-GAGTTT-TCGGGATA-T-TCCAAAT------TA-AT----------GCCCTTGTTA-TTGAT---AGCAGAT--ATCTATAT-CCT----ATA-----TATAAGG-TTG-A-----GACAAA-GCAGGGAGTTTTTTTTTTTTTTTT----TTGTTTTT------AT-CCCGTAA-AGTTT-TTGT--A-GCA-AATTCTGC---TTCAT-ATGTA--ATAT-TCA--GTAAGTCTGGTGCCAATA---AA-GGGG---CA-AT---TAGTGCCACT-AGGAATGACGCA-ACGGA---------GAATTGTTTGA-TCGAC--CT-GTCTCTCC----A-CGAC------TACATAAATAAT-TTCTG-T-AAGAAACTCTACTC-ATCATGATGTCATGTTATCAT--TTGTTC-TAATAATATATCCTACTTCAGAGAGTA-CT--TGTGGG--C-ATCA----------------GAGT-----GTTTTT-------------TAAACAAATATGTGTCTT--GTTTTTCCGCCCCAATCCCCGAACTAGAAA--TATTA--TT---TTCGGG---GGTC-ATTTTT----TTGT---------TT---AACCACATT---------T--CGATAAT--CT-GAAAAG------CT-AGAT--TTAT--ATTTTTAAT--GTGAatactggcgtcaaagctcaaaattcttggagcgggaataataaaatatatt
gi|8                          :                                                                                                                                taagatataaaacggtcagctactaaggattgtgtggtgAAAT-GGCGAAG-TA----A-CAA----A--GT-A--TGA-AA----CGTAATCATA------G-TCCAAAAA-A---CAC-----AT--A--CAAAA--TCGAGT-GTA-GGGCAAC--AC-GGA-C----CTT-C---G-ACGA-A----AG-CGA-A-G-G--CAG-GA-GCA-GG-TGC-C-----A-TGGAGG------A--------GTAAGCATC-CTCTGCTGACC----GG--T-CACAC-CCGC-CG--TGA-GCC-T-----G-TA-GTC-G---AA---A-CAA-A-G------------T---A--AACG-GG-G---TT-ACCC-G----TCGTCA-AATCTA-GTATGAAA--AT--GACA-GTCTAA-CAAA-TG-G-TA---T---GAAACAAATCA--GT--C-AACA---T-------ATG-A--C--T-T---A--GTG-ATAC-TTTG-TAATCGCAAA--CA--A-GGT----C-ATTAT-------AGCGACC-G-TAGAATT-TG--CG--AA-ATGATG---ACTTTA-AA-CGAG-ATTC-G--T-TA----TAACCCTGCAA-CA-T--CA-A--C--TTTTTGG---TT--AGT-AGTTGGCCT-CGCTTT-------AAAAA--ATCA-T--C-------A-T-ACG-CATG-G-----CATGC------------C-CT-T-GCGTATC-GAATC-A---A-C----TG--A-GAG-ACA--TA-CACACC-A-TAA--GCAG--G-T-G-A--------TAGTGGT-ACATTA-------------CTACAC-AAA-A-A---A-G--G-AA--AGTTGAC---AAT------T-GCAAAG--------TCAAAGTC--ATC-ACGT------TTA
gi|9                          :                                                                                                                                                                                                                                 ggcatataCCCCAAC-A---CAT------T--A--CAAAT--TCGC-T-GTA-AG-CAAC-CG--GGA-C----CTC-C---G-ACAA-A----AG-----A-G-G--TAG-GA-TCA--G-TGCAC-----A-TGGGAGG-----A--------GTAAGTTTC-CTCTCCCGAC------G--T-CACAC-CCGCGCA--TGACACC-CCCAAAT-TA-GAT-GACCAA---A-C-A-A-G------------T---A--AACG-GG-GA--TTAACCC-GGGTTTCA--A-AAT---AGTACGAAATGAC--A-CA--TCT-AACAAA--G-GGT---AT---GAAACAAATCA--GT--CAAACA---T-------ATG-A--C--T-TGCGG--ATG-ATAA-TTTG-TAATCGGGAA--CAACA-GGT----C-ATTATTTCGATAAGC-ACC-GCTAGAATT-GC--CG--A-----------------------AGAATTC-G--T-TA----TTAACCTACAA-CA-TA-CA-A--C--TTTTTTG---TT--AGT-AGTTTGGCT-CCCTTT-------AAAAGCCCTC--C--C-------A-C-ACG-CACGAG-----TATG-------------C-TC-T-GCGTATC-GAATCAA---A-C----CG--A-GAG-ACAT-
5 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|33 ): GTTTTTGCGTTGGTGACATCAGAATTTTGGATTTTTTCAAAACTTTGGCAGTGACTGGCTTATCATATTTAAAAAGTTTTCTTTTCATGAATGCATTT
Unaligned ( gi|40 ): TTAAAAGTGAAGATAACAAACAGTGATCTATGTCATAATTCCTATAAAAAATTGAAATCTAA
Unaligned ( gi|43 ): GATCTGAGGTCCAGGGGTGATGAATATAGCATACTTCCATGTTGATTGATT
Unaligned ( gi|45 ): TATTAAGTGATGCCATACATAGAGGATCTTGAATGAGT
Unaligned ( gi|48 ): TAGTCGATACTAAAATTCATGCTCATTTGAT






Alignments
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                      111111   1111111  22222222222222                                 111111                                22                                                                              111111111111111                                                                                       111111111111                                            22           3333333333333333333333333333333333                           1111111                                                                                                                   11              1111111111                11  1111111                                  1111111          2222222222222           444444444444444444444444444                          1111              1111   11 1                    11111111       11     111111111111111111                                    111111        11111111             22   111111                111111111              1111111                                                 222222222222                                                                                                          222  1                  2222   11111             1111      11     444444444444444    1111        222222                   2222              222     1     11        11       111        111               111                11        444444444444          111    11  1 1      1111      222222                           11111     555555555555555   22222       11  11            111                11      5555555555555555555555555      44444444444444                 11    222222     2222  1               11  111      111    111    2222    4444444444444      1   444444444444444444444  1      33333   1    11  2222     11  222222            66666666666666     2222         1  22    1    1             333333333      11                2222     11         2222        222222     2222     1  111     11    1  1      1          1        1           1     111    22        11      444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444  111   1      11         111     11     44444444  11   1 1          1   1111   1   333333333333333333333      4444444444     1       1           1      1         11       111      111                        1  1     1     1             1   111    22222               111   11                                        22222222         11        444444444444444444444444444444444   111          4444444444444444444444    111         55555555555555   11                   111   22222222  111    222222             22222        111   22222    2222      33333       1             1            1                             
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                           6       6  333333   4444444  55555555555555     3    777777 2        2 444  444444  33 33     88      2   2  1    11  2   2 5555   2 444 4    2 6666  4   2 2 2 555  2  2   2  2   2 8888888      333333333333333         2           5555  33 2     2    5  33   2   6666666 2  2   2 666  333 2   222 333333333333 333 33    2  2 666  2    2 5555    1 2     11        66 6666666666666666666666666666666666           33  33 2    444 0000000   4 33 55 2 444444   2    2    2  0       33  33 2   5555 2     9999999       3 6       2  33  33  2      777 3 0 88  3    33   3 7777777777   0       3  3 11  8888888     1 555  44   3     0   3      4444444     77   5555555555555 3 3   3   999999999999999999999999999  3 3       3     3 555 3 7777  8888   3    4444   77 0 3   77    44 3 6 3 22222222       88     888888888888888888 7 222 6 555 6 44 3  44 33    555   222222 3      22222222        44   22   000000      4 66   4  777777777       8888   6666666  99999 4       5  5  5     0   5        4 777   222222222222        0  1                   2 888   5   5      4   11  99 3  7  3    6    6      3  3  1               111  1     5            3333   66666       8   8 4444      00     888888888888888    4444        333333 88    0        8  3333 8   8     3  999     0  6  33    44  33  3    777        444  8     8   8  444        1 8     66  8  8  333333333333 3        777    99  0 0    5 4444 8    333333     6   0  8     6 6      77777   8 000000000000000   33333  3  8 11  11     3 6    999     8  0       11 0    9999999999999999999999999      55555555555555  5           55 33    777777     1111  0        6   9  33  777      777    444    1111    2222222222222   1  0   555555555555555555555  0      00000   0    33  4444     33  111111       0    88888888888888     1111         3  00  3 3    5             777777777      88  1          1  4444     66         2222        888888     8888     3  555     88    3  3      3          3     3  3     7     0     777    99        33  3   777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777  777   0    3 33      2  777 2   22  6  66666666  33   0 0  3 3     0   7777   0 2 999999999999999999999 2    9999999999     0       0           0      0       3 33   3   777      999     2  3     1     3   0  0     0     0             0   777    44444 0     2       444   11    8  3  8 8  0 8 88         8         77777777 8888  1 11 1      111111111111111111111111111111111   777   1      8888888888888888888888  1 000         33333333333333   11 0  8  0  8 0    0 444   66666666  000    777777    0    7   88888        777   55555    1111   3  22222       3   1         3  1         3                    6        
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                           .       .  ......   .......  ..............     .    ...... .        . ...  ......  .. ..     ..      .   .  .    ..  .   . ....   . ... .    . ....  .   . . . ...  .  .   .  .   . .......      ...............         .           ....  .. .     .    .  ..   .   ....... .  .   . ...  ... .   ... ............ ... ..    .  . ...  .    . ....    . .     ..        .. ..................................           ..  .. .    ... .......   . .. .. . ......   .    .    .  .       ..  .. .   .... .     .......       . .       .  ..  ..  .      ... . . ..  .    ..   . ..........   .       .  . ..  .......     . ...  ..   .     .   .      .......     ..   ............. . .   .   ...........................  . .       .     . ... . ....  ....   .    ....   .. . .   ..    .. . . . ........       ..     .................. . ... . ... . .. .  .. ..    ...   ...... .      ........        ..   ..   ......      . ..   .  .........       ....   .......  ..... .       .  .  .     .   .        . ...   ............        .  .                   . ...   .   .      .   ..  .. .  .  .    .    .      .  .  .               ...  .     .            ....   .....       .   . ....      ..     ...............    ....        ...... ..    .        .  .... .   .     .  ...     .  .  ..    ..  ..  .    ...        ...  .     .   .  ...        . .     ..  .  .  ............ .        ...    ..  . .    . .... .    ......     .   .  .     . .      .....   . ...............   .....  .  . ..  ..     . .    ...     .  .       .. .    .........................      ..............  .           .. ..    ......     ....  .        .   .  ..  ...      ...    ...    ....    .............   .  .   .....................  .      .....   .    ..  ....     ..  ......       .    ..............     ....         .  ..  . .    .             .........      ..  .          .  ....     ..         ....        ......     ....     .  ...     ..    .  .      .          .     .  .     .     .     ...    ..        ..  .   ..........................................................................................  ...   .    . ..      .  ... .   ..  .  ........  ..   . .  . .     .   ....   . . ..................... .    ..........     .       .           .      .       . ..   .   ...      ...     .  .     .     .   .  .     .     .             .   ...    ..... .     .       ...   ..    .  .  . .  . . ..         .         ........ ....  . .. .      .................................   ...   .      ......................  . ...         ..............   .. .  .  .  . .    . ...   ........  ...    ......    .    .   .....        ...   .....    ....   .  .....       .   .         .  .         .                    .        
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                           7       7  999999   2222222  55555555555555     2    222222 7        5 444  888888  44 44     44      7   7  7    00  5   4 0000   4 111 7    2 9999  4   4 4 4 333  4  4   1  1   1 2222222      000000000000000         2           0000  22 4     5    0  22   2   0000000 1  1   1 666  777 1   555 666666666666 999 11    4  4 555  4    4 0000    8 4     88        55 6666666666666666666666666666666666           22  22 4    111 0000000   7 22 66 4 999999   5    5    5  8       44  44 5   7777 7     3333333       1 2       9  99  99  9      999 3 3 88  1    88   1 5555555555   8       3  3 22  8888888     0 888  66   3     2   3      2222222     99   9999999999999 6 6   6   777777777777777777777777777  6 6       3     3 888 3 5555  5555   3    9999   33 0 3   99    66 3 7 3 11111111       66     000000000000000000 3 777 7 888 7 66 3  66 33    888   999999 3      11111111        66   44   555555      4 11   4  888888888       9999   3333333  66666 4       0  0  0     4   0        4 888   888888888888        7  7                   5 888   0   3      3   44  00 5  5  5    7    7      2  2  7               444  4     7            3333   77777       0   0 8888      33     333333333333333    2222        000000 88    8        0  0000 0   0     2  222     0  5  88    55  88  2    555        000  0     0   0  000        0 0     88  0  0  888888888888 8        666    00  0 6    0 8888 0    000000     0   8  0     7 7      88888   0 000000000000000   44444  2  0 00  00     8 0    444     0  8       00 8    8888888888888888888888888      00000000000000  6           88 88    555555     2222  0        5   2  88  555      555    000    2222    8888888888888   0  0   888888888888888888888  0      00000   0    88  8888     88  555555       7    33333333333333     0000         3  77  7 3    0             000000000      00  0          0  0000     00         5555        777777     3333     3  333     33    3  3      3          3     7  3     3     8     555    22        88  2   222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222  555   0    2 88      5  555 5   55  5  22222222  88   0 0  2 2     0   8888   0 5 555555555555555555555 5    5555555555     0       0           0      0       2 22   2   555      555     5  2     0     2   0  0     0     0             0   222    55555 2     5       000   00    0  2  0 0  8 0 88         0         44444444 2222  4 00 4      000000000000000000000000000000000   555   0      0000000000000000000000  2 222         88888888888888   00 8  0  8  8 6    8 000   22222222  222    555555    8    3   88888        555   00000    2222   2  00000       3   0         3  0         3                    7        
consensus                     :                                                                                                                                                                       AAAT-GGCGAAG-TA----A-CAA----A--GT-A--T-A-AA----CGTAATCATA------G-TCCCAAAA-A---CAT-----AT--A--CAAAA--TCGAGT-GTA-GGGCAAC-CAC-GGA-C----CTC-C---G-ACAA-A----AG-CGA-A-G-G--CAG-GA-TCA-GG-TGC-C-----A-TGGAGGG-----A--------GTAAGCATC-CTCTGCTGACC----GG--T-CACAC-CCGC-CG--TGA-GCC-C-----T-TA-GTC-G---AA---A-CAA-A-G------------T---A--AACG-GG-G---TT-ACCC-G----TCGTCA-AATCTAAGTACGAAA--AC--G-CA-GTCTAAACAAAATG-GGTA-AAT---GAAACAAATCA--GT--C-AACA---T-------ATG-A--C--T-T---A--GTG-ATAA-TTTG-TAATCGCAAA--CA--A-GGT----C-ATTAT-------AGCGACC-G-TAGAATT-TG--CG--AA-ATGATG---ACTTT--AA-CGAGAATTC-G-TT-TA----TAACCCTGCAA-CA-T--CA-A--C--TTTTTGG---TT--AGT-AGTTGGCCT-CGCTTT-------AAAAA--ATC--T--C-------A-T-ACG-CAT--G-----CATG-------------C-CT-T-GCGTATC-GAATC-A---A-C----TG--A-GAG-ACAT-TA-CACA-C-A-TAA--GCAG--G-T-G-A--------TAGTGGTAACATTA-------------CTA-AC-ANAGA-A---A-G--G-AA--AGTTGAC---GAT------T-GCAAAG--------TCAAAGTC--ATCAACGC------TTATCA-T--ATA-AT-------G-TAGTTGT-C--AGT-----C-TG--C--C-ATTAGAG-TC-AA-TATTAAGTA-AAATATCC-A---AAT------------ATGAAGCAGATCTGTCAGATTCTGTGGTGTCCT---TTA-TTTCGAGTTCGTCGGGATAATATCAAAATGGA-CATA-ATTGTGAAAATTATGATTGTTAATTGAT---AG-ACATC-ATCTATATACCT----ATA-----TGTAAGG-TTG-AA---GGACACG-GCAAG---------------TTTT----TTGTTTTT------AT-CCCGTAACAGTTT-TTTTGAA-ACA-AATTCTGCT--TTCAT-ATGGA--ATATAAAA--ATAAGTC---TGCCAATA---AG-GGGGC-ACA-AT---TAGTGCCCNT-AGGAAT-AC-CA-AC--A---------GAATTGTTGGA-NAGAC--ATGGTCTCTCC---AA-AGAC------TACATAAATATT-ATCTA-T-AAGAAA----ACCC-A---------------AGCAT--ATGCTC-T--TA--ATATCTTACTTCA-AGAGTA-CTTGTGTGGG--CAATCA----------------GAGTG----GGTTCT-------------NACAAAAATATGTGTCTT--GTTT-----CCCCAA----CG-ACCAGAAACTTGTTA--TT---TTCGGG---TGCC-G-TTTT----TTGT---------TT-AAAANCA-ATTA--------T--CAAT--T--CT-GAAAAA-G---CCT-AGAT--TT-T--ATTTT--AT-CGTGAGAGGAATCGTTG-----------TAGTAAAG--TGGTGGAGAAA-TC-ATACG-TTTT-GATGCAGTCAATTGTCTCAGCATTGGAAACAANTCTCGTGATTNAAAGTTGTTTTNGTATAAAGCTGGGCCTTTAGAGGGGGCGTTTTT----TGAGA-ATCC-CAATC--TGAA-TG-ACACCA-TTCTGGAATA-TGTAGCGG-AACAGTATATCNTGAAG---TGACT-TTTTAACA--GCTGTTCAG--TAG-------TTT--TTAGT--A-GAC-------TAAGGGA----------T-AGAG--------------GG-----C------TG---GTA-GAGCAC--TTACTGGAA---CCAGCG-ATGTA--------TC--TTT-G-TTTGTAAGGA-TTTC---TTA-TGCG---TT---T-CGGAA-----TCCAGT-A--------AAGGT-ATGGTAA-TTCAAATTGAT-CCTGAT-TCTTCGGAAA-TATTGAA---AGTATTT-CAAACAGAAAGGTGANTTTGAAGAA-TT-TCATC-TTAGT-CAGATTGCTTGGA-GTATA-AAGT----AAGATTCCCAGATGTG---TGA--AGTA-AACCC-T-AGTT-C-ATTTAAAAAG-ACAAGTATAATA----GT-GA-CTCT--TTACAAAC--A-----AAG----ACAAA-------TGTGA-ATC---ACTNTGCTTTAT--GCTGTCT--AACT---A-TAACAA-AGTTTTCACG-----TG----TNTAA--CTCA-TTTACNCACTTCTG---GCT-TC-----TTAA-GACAG-----AAGGATAAATAGT-CG--ATTTTCCC---CGC-----TAAA----TGGTTAC----GGATTTT-AATNATTTCCGAA-TANTTTTGATCA-TTCAGACAAAGTGTCAAGCTCCTCTCCCT
Reference ( family-568 )      :                                                                                                                                                                       AAAT-GGCGAAG-TA----A-CAA----A--GT-A--T-A-AA----CGTAATCATA------G-TCCCAAAA-A---CAT-----AT--A--CAAAA--TCGAGT-GTA-GGGCAAC-CAC-GGA-C----CTC-C---G-ACAA-A----AG-CGA-A-G-G--CAG-GA-TCA-GG-TGC-C-----A-TGGAGGG-----A--------GTAAGCATC-CTCTGCTGACC----GG--T-CACAC-CCGC-CG--TGA-GCC-C-----T-TA-GTC-G---AA---A-CAA-A-G------------T---A--AACG-GG-G---TT-ACCC-G----TCGTCA-AATCTAAGTACGAAA--AC--G-CA-GTCTAAACAAAATG-GGTA-AAT---GAAACAAATCA--GT--C-AACA---T-------ATG-A--C--T-T---A--GTG-ATAA-TTTG-TAATCGCAAA--CA--A-GGT----C-ATTAT-------AGCGACC-G-TAGAATT-TG--CG--AA-ATGATG---ACTTT--AA-CGAGAATTC-G-TT-TA----TAACCCTGCAA-CA-T--CA-A--C--TTTTTGG---TT--AGT-AGTTGGCCT-CGCTTT-------AAAAA--ATC--T--C-------A-T-ACG-CAT--G-----CATG-------------C-CT-T-GCGTATC-GAATC-A---A-C----TG--A-GAG-ACAT-TA-CACA-C-A-TAA--GCAG--G-T-G-A--------TAGTGGTAACATTA-------------CTA-AC-ANAGA-A---A-G--G-AA--AGTTGAC---GAT------T-GCAAAG--------TCAAAGTC--ATCAACGC------TTATCA-T--ATA-AT-------G-TAGTTGT-C--AGT-----C-TG--C--C-ATTAGAG-TC-AA-TATTAAGTA-AAATATCC-A---AAT------------ATGAAGCAGATCTGTCAGATTCTGTGGTGTCCT---TTA-TTTCGAGTTCGTCGGGATAATATCAAAATGGA-CATA-ATTGTGAAAATTATGATTGTTAATTGAT---AG-ACATC-ATCTATATACCT----ATA-----TGTAAGG-TTG-AA---GGACACG-GCAAG---------------TTTT----TTGTTTTT------AT-CCCGTAACAGTTT-TTTTGAA-ACA-AATTCTGCT--TTCAT-ATGGA--ATATAAAA--ATAAGTC---TGCCAATA---AG-GGGGC-ACA-AT---TAGTGCCCNT-AGGAAT-AC-CA-AC--A---------GAATTGTTGGA-NAGAC--ATGGTCTCTCC---AA-AGAC------TACATAAATATT-ATCTA-T-AAGAAA----ACCC-A---------------AGCAT--ATGCTC-T--TA--ATATCTTACTTCA-AGAGTA-CTTGTGTGGG--CAATCA----------------GAGTG----GGTTCT-------------NACAAAAATATGTGTCTT--GTTT-----CCCCAA----CG-ACCAGAAACTTGTTA--TT---TTCGGG---TGCC-G-TTTT----TTGT---------TT-AAAANCA-ATTA--------T--CAAT--T--CT-GAAAAA-G---CCT-AGAT--TT-T--ATTTT--AT-CGTGAGAGGAATCGTTG-----------TAGTAAAG--TGGTGGAGAAA-TC-ATACG-TTTTGGATGCAGTCAATTGTCTCAGCATTGGAAACAANTCTCGTGATTNAAAGTTGTTTTNGTATAAAGCTGGGCCTTTAGAGGGGGCGTTTTT----TGAGA-ATCC-CAATC--TGAA-TG-ACACCA-TTCTGGAATA-TGTAGCGG-AACAGTATATCNTGAAG---TGACT-TTTTAACA--GCTGTTCAG--TAG-------TTT--TTAGT--A-GAC-------TAAGGGA----------T-AGAG--------------GG-----C------TG---GTA-GAGCAC--TTACTGGAA---CCAGCG-ATGTA--------TC--TTT-G-TTTGTAAGGA-TTTC---TTA-TGCG---TT---T-CGGAA-----TCCAGT-A--------AAGGT-ATGGTAA-TTCAAATTGAT-CCTGAT-TCTTCGGAAA-TATTGAA---AGTATTT-CAAACAGAAAGGTGANTTTGAAGAA-TT-TCATC-TTAGT-CAGATTGCTTGGA-GTATA-AAGT----AAGATTCCCAGATGTG---TGA--AGTA-AACCC-T-AGTT-C-ATTTAAAAAG-ACAAGTATAATA----GT-GA-CTCT--TTACAAAC--A-----AAG----ACAAA-------TGTGA-ATC---ACTNTGCTTTAT--GCTGTCT--AACT---A-TAACAA-AGTTTTCACG-----TG----TNTAA--CTCA-TTTACNCACTTCTG---GCT-TC-----TTAA-GACAG-----AAGGATAAATAGT-CG--ATTTTCCC---CGC-----TAAA----TGGTTAC----GGATTTT-AATNATTTCCGAA-TANTTTTGATCA-TTCAGACAAAGTGTCAAGCTCCTCTCCCT
gi|1                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    AAACAGGGTA-TGCA-AA-----AAACCAATCA--AT--C-AATA---TCATTTTTATGTAGTC--TCT---ATTGTG--TACCTTTG-TAATCGCAAA--CA--ACGGT----CCATTAT-------AGCGACC-G-TAGTATT-TG--CG--AA-ATGATG---A-TTT--AA-CGAGAATTC-G-TTATA----TCACCCTGCAA-CA-T--CAGA--C--TTTTTGG---T---AGT-AGTTG-CCT-CGCTTTT------AAAAA--ATCA-T--C-------A-T-ACGACAT--GG----CATG-------------CTCT-T-GCGTATCTGAATC-A---A-C----TG--A-GAG-ACAT--A-CACA-CCA-TGAACGCAGCGG-T-GGA--------TAGTGGTA-CATTATACATTCTTTGTTCTT-ACTATGAATA---A-GTTG-AACAAGTTGACTTGGAT------T-GCCAAGCCTATCCTTCAAA-TC--ATCAACGCCCCCCTTTATCCCT--ATA-ACTCGCACCGCTAGTTG--C--AGTGTCGCT-TGTTC--CGATTAATG-TCGAA-TATTTTGTGGAAATATTTTA---AATCACTTCATAACAACGAAGCAGATC-GTCAGATTCTGTGGTGTCCT---TTACTTTCGAGTTGTTCGG--TGATTTCAAATGGGACCATACATTATGAAAATCATGATTGTTAATTGATATAAA-ACATCAATCTATATACTTTCAAATATATTTTGTTAGGTTTGCAACTGAGACACGTGCAAGA--------------TTTTTTCGTTGTTTTTTAAAAAATCCCCGTAACAGCCTATTTTGAATCCA-AATTC-GCTAGTTGCTAATAGA--ATTTAGAATCAT-AGTC---TGCCAATATTTAGTGGGGCAACAGACTCATAGTGTCCATAAGGGATAAT-CACAC--ACTTACCTAGGAATGTTTGGA-GAGACA-ATGG-CTACAC---AATAGACACCAATTACAT-AGT-TT-ATCTATT-ATTAGA----ACCCAA---------------AGCATGAATA--A-T--TA--ATATCTT-CTTCA-AGAGCACCTTGTATGAGATTAATCAGTTATTGCATTTTGGGGGGTGTTTTGGTTCTTTTCATTCTTATAAACAAAAATATGCAT-TTAAATTT-----CCCCAA----CG-ACCAGAAACTTGTTACCTTAAGTTCAGGTTTTGCC-G-TTTTGGTGTTGTTCCAAACCCTT-GAAACCA-ATTAATCACTTTT--CAAT--T--CTCGAAAAA-GCGCCCT-GGATAATT-TTAATTTC--AT-TGTGAGAAGAATTGTTGTAATATTGGGTTAGTAGAGCTCGGGGCAGAAA-TCAATAAGATATTGAATGCAGTCAATTGTCTCAGCATTGAAAACAACTCTCGTGATTTAAAGTTGTTTTAGTATAAAGCTGGGCTTTTAGAAGGGGCATTTTCACCGTGAGA-AT-T-CAATCTTTGAATTG-ACACCA-TTCTGGAATA-TGTAGCGG-AATAGTATATCCTGATATTCTGACTCTTTTAACAGCGCTGTTCAAGCTAGTTTAAGCTTT--TTAGT--ATGACAATCTTTTAAGGTA----------TAAGAG--------------GGGTCACT------TG---GTATGATCACTATTTCTGGAACCGCCAGCG-AC-TACTAACTACTT--TTT-GTTTTGTAAGGA-TCTCACTTTATTGCA---TT---TCCGGAG-----T-CAGT----------AAGGT-ATGGGAATTTCAAGTTGGTCCCTCGT-CCTTCGG-AA-TATTGAA---AGTATTTACAAACAGAAAGTTGATTTTGAAGAATTT-TCATCTTTAGTAAAGGTTGCTTGTA-GTAAT-AAGT----AAGATTCTCCAACCTGTTCTGA--AGTA-AA-CC-T-AGTT-C--TTTAAAAGC-ACAAGTATAA-A----GTAAA-CTTT--TAACAAACGGA-----AAGCACCATAGC-------TGT-A-ATC---AGTGTACTTT-T--GCTCTCT---TCT---G-TTAC----GCCTCTAC------TG----TATAA--CTTA-TTTACCCCCTTCTGTTTGCT-TCTCTCGTT---GACAGAAATTAAGGATAAA-AGTCCG--CTTTTTTCCAACGC-----TAAA----TGGTTA
gi|10                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 tttcaaactaccataccggaaaa--TGA-GCC-------T-TACATC-GTT-GA---T-CAG-A--------------T---A--AACA-GGTG---CT-TCTT-G------GTAT-AATTTA-GTATGTAA--AG--A-CC-GGCTTAACAA--TT-GG---AAT---GAAACGCTTCA--GA--C-AACAACCT-------AC--A--C--G-T---A--CCT-ACAA-GTTG-TATTTGCAAATGCA--A-AATAAACC-ATCAT-------AACGACC-A-TAGAATT-TG--TA--AACACGA-G---ATTGT--A---GAAACTCCTG-TT-TG----T-------CAG-TA-T--CA----C--GCCTTGG---TTTAAG--ACTTTATCA-CACTC----------AGA--ATC--TG-T-------T-T-TCG-CAT----------------------------T-T--C-TATT-GGATC-AGTTA-CATTTTGCAG-GAG-ACAA-AATCAC--C-A-TAA--ACAA--G-T-G-A--------AAATAG-AATATTG-------------CTA--C-AT-GA-ATACA-G--G-AA--A-TTGAC---GAT------G-GAAAAG--------TTAAAGCA--ATCT-CGC------TTGTCA-TCAAGA-AG-------GGTTGTTGT----AAT-----T-TG--C--C-TTGAACG-TC-TA-TGTTCAGTA-AATTATCC-A---AAT------------ATGAatatggaatttgttacaaataaggtttttacttt
gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     gaacacgtcccggtaaCA-GG-TGG-C-------TAGAAGG-----A--------GTGAGTATC-----GC---CC----GA--T-CACAC-CTGC-CG--TTA-GCC-C-----T-GA--TC-T---TG---A-TCA-G-G------------T------AACGCAA-G---TA-ATCC-G----TAGTCA-AA-CTCAGTATGCAA--AC--G-GATATC-GAAC--AATC-GGTA-AA-----AAGC--ATTA--G------GCG---T-------TTG-G--T--C-C---A--TTGTATAA-CTTG-TATCTGTAAA--TA--A-GAT----C-ATT
gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         tttactcagtatacacatgtatatgtctttgaagtcggttatgatgttcaatgcaacgacatcggtatacatgtacttcaaacgaactacacgtttaccgtgacatcaaagtaaatatatgtttagcggactttttttctgcctatatatagttacggcactggatttcttatgaacaagtgaaaattacgaacagtgactaatctcttagatcctaaattaaaagtactagtatacaaacaaagatccctagccaagATCATGAAG---TGACG-TCTTAACA--GC----------AG-------TTA--CTAGT--A-G--------------GA----------T-AGAG--------------GG-----C------TGCGGGTA-GAGC-C--TTAGTG-AA---CCAGCG-ATGTAA-------TCATTCT-G-TTTG-AAGGAGTTTT---TTA-TGCA---T------CGAAAAAAAATCCAAT-ATAAAAAACAAGGT-ATGGTAA-TTTCAATTGAT-CCTGATGTCTTTGGAAAATAT-GAAGCAAATGTTT--AAACA-AAAGGTGGATTTGAAGAA-GTATCACT-TTAGT-CAGATGTCTTGGA-GTA-A-GATT----AGTATTCC-AAATGAC---TGA--AGTG-AATCC-T-AGTTAC-AGTTAAAAGGCATAAGTATG-TA-----T-GA-CTAT--TTATCAAC--AC----AAG----ACAAA-------TGTGA-ATC---ACTTGGCTTTATCAGCTG-----AACT---A-TATCAA-AGTTTTCATG-----TGCGTCTTTAA--C-CA-TTTACACACGTC-----GCTCTG-----TAAA-GACAG-----AAGGCTA
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 tccGTTTTT----TGATATATCC-CCATC--GGTA-TG-ACACCA-TTCTGGAATAATGTAGGTG-GACAGTATCTC-TGAAA---AGACTGTTTTAACA--GCTGTTTAG--TAG-------TTT----AGTTTA-GAT-------TAAGGAAGAGGCTTGGTT-AGAGCACTTACTTGAACTAG-----CATATATTG---GTA-GAGCAC--TTACTGGAA---C-AGC--ATATA--------TC--TTT-G-TT-GTAAGGA-ATTG---TTA-T-TG---TTAATT-CG-AA-----TCCAGTTA--------AAGGTCATTGTAA-ATCAAATTGAT-CCAGAT-TCTTCGGAA--TATTGAA---AGTATT--CAAACAGAA-GGTGAATTTGAAGAA-TT-CTATC-TTAGT-CAGATTGCTTGGAGGTATATAAGT-----AGATTCCCAGATGCT---CGA--AGTA-CACCCTT-AG-T-C-ATCTTAAAAG-ACAAGTACAG-A----GT-CAGCTCTAGTTACAA
gi|14                         :                                                                                                                                                               agtgtagaAAA--GGCAAAGATA----A-CGA----ACAGTGA--T-C-AATCT-CGTAA-----------G-TCCTAAAT-A---GA------AT--A--CAAAA--ACAAGA-GTC-GGGCAAT-CAC-GGA-C----CCC-T---GGACAC-A----C--CAG-A-A-G--TGG-GA-TCA-GG-TGC-C-------TAGGGGG-----A--------GTAAGCACC-CCCTGTTGACC----GG--T-CACAC-CCGC-CG--TGA-GCC-C-----A-TA-GTC-T---TG---A-TCA-G-G------------T---A--AACG-GA-----------C-A----TC-----AGT----GTGTGAAA--A---A-CG-G-CTTAAC--AATG-GCT---AT---GAAACACATCA--GA--C-AGCA---T-------TTG-A--C--T-C---A--ATG-ATAG-GTCA-TATTGGTAAA--CT--A-AAT----T-GTTAC-------AACGACC-A-TAGAATT-TA--CG--AA-ATGCTGC--ATTTA--AA-CGTGACT---G-TT-GA----AACCCCTGCAA-CA-TACCG-A--C--TTTT
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                              ggatgtA-C----CTC-T---A-ACAA-A----GG-CGA-A-G-G---AG-GG-TCA-GG-TGC-C-----A--GGAGG------A--------GTAAGCATC-CTCTGCTGACC----GG--T-CACAC-CCAC-CG--TGA-GCC-C-----T-TA-GTCGG---AA---A-TAA-G-G------------T---A--ataaatcatgcactttcttttcaaagtacatgtatatttgcacatgaaat
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    caaatAAATAAGGTA---T---GAACAAAATCA--GT--C-AACA---T-------ATGGA--CCTT-T---A--GTG-ATAA-TTTG-CAA-CGCAAA--CA--A-GGT----C-ATTAT-------ACCGACC-ATTAGAATT-TG--CGAAAA-ATGATG---ATTTTTAAA-CGAGATTTC-G--T-TA----TAA-CCTGCAA-CATT--CA-A--CTTTTTTTGT---TT--AGC-AGTTAGCCTAAGCTTT-------AAAAA--ATCTTT--C-------ATT-ACG-CGG--A-----CATG-------------CTCT-T-GC-TATC-GAATC-A---A-CT---TGC-G-GAGTAAAT-TA-CACATC-A-TAA--GCAG--GATGG-A--------TAGTGGT-GTATTA-------------CTA-tgaacaaaatcagtcaacatatggacctttagtgataatttgcaacgcaaacaaggtcattataccgaccattagaatttgcgaaaaatgatgatttttaaacgagatttcgttataacctgcaacattcaactttttttgtttagcagttagcctaagctttaaaaaatctttcattacgcggacatgctcttgctatcgaatcaacttgcggagtaaattacacatcataagcaggatggatagtggtgtattactacttctttcgttacttggataattttattgaacattgac
gi|16                         :                                                                         caaatacctctaacaaaggcgaaggagggtcaggtgccaggaggagtaagcatcctctgctgaccggtcacacccaccgtgagcccttagtcggAAAT-GGCGAAG-TA----A-CAATTAAA--GT-A--TCA-AA----CGTA-TCATA------G-TCCCCAAA-A---CAC-----AT--A--CAAAA--TCGAGT-GTA-GG-CAAT--AC-GGA-C----CTT-C---G-ACAA-A----AG-CGA-A-AAG--CAG-GAATCAAGG-TGC-C-----A-TGGA-GG-----A--------GTAAGCATC-CTCTGCTGACC----GG--TCCACAC-CCGC-CG--TGA-GCC-C-----T-TA-GTC-G---AA---A-CAA-A-G------------T---A--AACG-GG-G---TT-ACCC-G----TCGTCA-AATCTAG--ACGAAA--AT--GACA-GCCTAACTAACAAG-GGTATAA-----AAACAAATCA--GT--C-A--A---T-------ATG-A--C--T-G---A--GTG-ATAA-TTTG-TAATCGCAAA--CA--A-GGT----C-ATTAT-------AGCGACCGG-TAGAATT-TG--CG--AA-ATGATG---ACTTTAAAA-CGAG-ATTC-A-GT-TA----TAACCCTGCActtctttcgttacttggataattttattgaacattgac
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    taA-T-AAGAAA-----CCC-A---------------AGCAT----GCTCAT--TA--ATATCTAACTTCA--GAGTA-CTTGTGTGGG--CAATCA----------------GA--G----GGTTTT-------------CAACAAAATATGTGTCTT--GTTT------CCCAA----CG-ACTAGAAATTCG-TA--TT---TTCGGG---TGCCGG-TTTT----TTGT---------TTAAAAAGCA-ATTA--------TTATAAT------T-GAAAAAGG---CCTAAGAT--TT-TA-ACTTT--AT-CG---GAGGAATCGTTG-----------T-GTAAAG--T-GTGGAGAAA-TC--TACG-TTTTTGATGCAGTCAATT
gi|18                         :                                                                                                                                                                                                                                                            aatcgaccaattgttgctaccatatgttttcctaatg-GGA-C----CTC-C---A-A-AA-ATTATAG-AGGTA-G-G--CAG-GA-TCA-GGGTGC-C-----A--GGAGGATCGTAA--------TTGAGCATC-CTCTGCTGACC----GATCT-CACACACCGC-CATCTGA-GCC-T-----TGTA-GTT-C---AA---A-CAA-A-GC-----------T---A--AACG-GG-GATTCT-ATCC------TCGTCA-AATCT-AGTACGAAA--AT--G-AA-GGCTAAACACAA-G-GGTT-ATT---GAAACAAGCAG--GT--C-AACA---T-------ATG-A--CT-T-T---A--GTG-ATAA-TTTG-T-ATCGC-AA--CA--A-tttgaaaattcttgtatt
gi|19                         :                                                                                                                                                                                           gcaaacataaaatgttatgtagattattatcgTCATA------AATCCCATAA-A---GA------AT--A--TAAAA--C-------TA-AGGCAAA-CAC-GAA-C----CCT-T---G--CAT-AT---AC-CGG-A-G-G--TGG-GA-TCA-GG-TTT-TTTTTAA-AAGAGGG-----A---------TAAGCACC-CCTTGTTGACC-----G--T-C-CAC-TCGC-AT--TAT-ACC-C-----T-CT-ATC-T---TG---A-TCA-G-G------------T---A--AACT-GA-G---TA-ATCT-G----T----A-GGTC-AAGAACGAAA--aat
gi|2                          :                                                                                            ttagatactgttggagacaatattggttgctcaccgaaagaatgaaaagtgaagataacgtaacagtgatccatcAAAT-GGCGAAG-TA----A-CAA----A--GT-A--T-A-AA----CGTAATCATA------G-TCCAAAAA-A---CA------AT--A--CAAAAA-TCGAGTTGTAAGGGCAAC-CAC-GGAAC----CTT-C---G-ACGA-A----AG-CGA-A-G-G--CAA-GG-TCA-GG-TGC-C-----AATGGAGAG-----A--------GTAAGCATC-CTCTGCTGACC----GG--T-CACAC-CCGC-CG--TGA-GCC-T-----G-TA-GTC-G---AA---A-CAA-ATG------------T---A--AACG-GG-G---TT-ACCC-G----TCGTCA-AATCTAAGTATGAAA--AT--G-CA-GTCTAAACAAAATG-GGTA-AAT---GAAACAAATCATGGT--C-AACA---T-------ATG-A--C--T-T---A--GTG-ATAC-TTTG-TA-TCGCAA---CA----GGT----C-ATTAT-------AGCGACC-G-TAGAATT-TGTGCG--AA-ATGATG---ACTTT--AA-CGAGAATTC-GGTT-TA-----AACCCTGCAA-CA-TA-CA-A--C--TTTTTGG---TT--AGT-AGTTGCCCT-CG--TT-------AAAAA--ATC--A--C-------A-TTACG-CAT--G-----CATG-------------C-CT-T-G-GTATC-GAATC-A-----C----CG--A-GAG-ACAT-TA-CACA-C-A-TAAT-GCAG--T-G-G-A--------TAGTGGTAACATTA-------------CTA-AC-AAAAA-A---A-G--G-AA--AAGTGAC---AAT------T-GGCAAG--------TCAAAGTCCCATCAACGT------TTATCA-T--ATATAT-------G-T-GTTTTGC--AGT-----CCTG--C--C-ATTAGAG-TC-AA-TATTA--TA-AAATATCC-A---A-T------------ATGAAGCACATTGGTCAGATTCTGTGGTGTC-T---TTA-TTTCAAGTTCGTCAGGATAATATCAAAATGGA-CATA-ATTGTGAAA-TTATGATTGTTAATGGAT---AA-ACATC-GTCTATATACCT----ATA-----AGTAAGG-TTG-AA---GGACACT-GCAAG---------------TTTT----TTGTTTTT------A--CCCG-AACAGTTT-TCCTGAA-ACA-AATTCTGCT--TTCAT-ATGGAATATATAAAA--ATAAGTC---TGCCAATA---AG-GGGGC-AAC-AT---TAGTACCCAT-AGGAA--AC-CA-AC--A---------GAATTGTTGGAGAAGACGGAT-GTCACTCCAAAAA-AGAC------TACAATAATATTAATCTA-TAAAGCAA----ACCC-A---------------AGCA---ATGCTC-T--TA--ATATCTTTCTTC--AGAGTA-CTTGTGTGGG--CAATCA----------------GAGTG----GGTTCT-------------GACAAAAATATGTATC-T--GTTT-----CCCAAA----TG-ACCAGAAACTTGGTA--TT---TTCGGG---TGCC-G-TTTT----TTGT---------TC-AAAAGCA-ATTA--------T--CAAT--TTCCT-GAAAAA-G---CCT-AGAT--TT-T--ATTTT--ATCCGT--GAGGAATTGTTG-----------TA-TAAAG--TGGTGGAGAAATTC-ATATG-TTTT-GATGCAGTCAATT---------TTAGAA--AAATCTCGTGATTGAA----GTTTTC-TATAAAGCT----CTTTAGAG-------TTTT----TGAGA-ATCCACAATC--TGAA-TGAACACCACTTCTGGAATA-TGTAGTGGAAACAG--TATCTTGAAG---TGAC--CTTTAACA--GCTGTT-AG--TAG-------TTTTGTTAGT--A-G---------TAAGGGA----------T-AGA---------------GG-----C------TG---GTA-AGGCAC--TTACTGGAA---CCAGCGAATGTA--------TC--TTTGG-TTTGTAAGGA-TTTC---TTA-TGCATATTT---T-TGGAA-----TCCAGT-A--------AAGGT-ATGGTAA-TTCAAATTGAT-CCTGAT-TCTTCGGAAA-TATTAAA---CGTATTC-CAAACAGAAAGGTGATTTTGA--GA-TT-TCATC-TTAGT-CAGATTGCTAGGA-GTATA-AAGTCAGGAAAATTCCCAGATGTG---TGA--AGTA-AACCC-TAAGTT-CAATTTAAAAAG-ACAAGTATAATA----GT-GA-CTTT--ATACAAAC--A-----AAG----ACAAG-------TG-----TT---ACTGTGCTTTAT--ACAGCCTGGAACC---AGTAACAA-AGTTTTCATGTAGTCTA----TGTAA--CTCA-TTTACCCCCTTCTG---GCT-TC-----TTAA-GACAG-----AAGGGTAAATAGT-AG--ATTTTCCC---CGC-----TAAA----TGGTTATAACGGGATTTTAAATAATTTCCGAA-TACTTTTGATCA-TTCAGACAAAGTGTCAAGAT-CTCTCCCTtaaatgttgatgcatt
gi|20                         :                                                                                                                                                                                              A----A--AT-A--T-A-AATAGGCGAAGT--TA------A-TCCCAAAA-A---CAT-----AT--A--CAAAA--CCAAGT-GTA-GGGCAAC--AC-GGA-C----CTC-C---G-ACAA-A----AG-CGA-A-G-G--CAG-GA-TCA-GG-TGC-C-----A-TGGAAG------A--------GTAAGCATC-CTCTGCTGATC----GG--T-CACAC-CCGC-CG--TGA-GCC-C-----T-TA-GTC-G---AA---A-AAA-A-G------------CATGA--AACG-AA-A---TC-A-----------GTCT-AA-CTA--TAC-ATG--AC--T-TA-GT---GATAATATG-CGT--AATCTGGAAACAAGTCA--TTTGC-GAAA---TG------ATG-A--C--T-T---ca
gi|21                         :                                                                                                                                                                                             AA----A--GT-AATT-A--------GTAA-CATA------G-TGCCAAAA-A---CAT-----AT--ATACAAAA--ACGAGT-GCA-GGGCAA--GAC-GGA-C----CTT-C---G-ACAA-A----CG-Ctaaattgagtattcgttat
gi|21                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          ctattaC-C-----T-TC-GAC-A---AACGCA-CAA-A-A------------T---A--AACA-GG-G---TA-GCCC-G----TCGTAA-AATCTT-GTACAAAA--ATAAG--A-GTCTGA-CAAA--G-GGTA---C---GAAACAGATCA--GT--C-AACA---C-------ACG-A--C--T-T---C--GTG-ATAA-TTTG-TAGTCGCAAA--CA--A-GGT----C-ATTAT-------AGCGACA-G-TAGAATT-TG--CG--AA-AGGATG---Aacaaaataaacagggtagcccgtcgtaaaatcttgtacaaaaataagagtctgacaaagggtacgaaacagatcagtcaacacacgacttcgtgataatttgtagtcgcaaacaaggtcattatagcgacagtagaatttgcgaaaggatgat
gi|22                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              ctattaaaagtaattagtaacatagtgccaaaaacatatatacaaaaacgagtgcagggcaagacggaTATC-TAATC-A---A-C----TG--G-GAG-ATATGCA-TAC--C-A-TTT--GCAA--G-G-G-A--------TAGTGGTA-TATTA-------------CTA--C-AAAGACA---G-G--G-AA--AGCTGAT---GAT------T-GCATTT--------TTAAAGTC--ACCAA-GC------TTATCA-T--ATA-AT-------G-TAGCTGT-A--AGT-----C-TG--C--C-ATTAGAG-CC-AA-TATTAAGTA-AAATATCC-A---ACT------------AAGAAGCAGATTTGTCAAATTCTGTGGTCTCCT---TTA-TTTTGAGTTCGTCGGGt
gi|23                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        A-A----CG-CAC-A-G-G--CAG-GA-TCA-GG-TGC-C-----A-TGGAGG------A--------GTAAGCATC-CTTTGCTGACC----GG--T-CACAT-CCGC-CG--TGA-GCC-G-----G-TA-TTC-G---AA---A-CAA-A-A------------T---A--AACA-GG-G---TA-ACCC-G----TCGTAA-AATCT-TGTACGAAA--ATAAG--A-GTCT-GACAAA--G-GGT---AT---GAAACAGATCA--GT--C-AACA---C-------ACG-A--C--T-T---C--GTG-ATAA-TTTG-TAGTCGCAAA--CA--A-GGT----C-ATTAT-------AGCGA
gi|24                         :                                                                                                                                                                       AAA--GGCAAAGATA----A-CGA----ACAGTGA--T-C-AATCT-CGTAA-----------G-TCCTAAAT-A---GA------AT--A--CAAAA--ACAAGA-GTT-GGGCAAT-CAC-GGA-C----CCC-T---GGACAC-A----C--CAG-A-G-G--TGG-GA-TCA-GG-TAC-C-------TAGGAGG-----A--------GTAAGCATC-CCCTGTTGA
gi|25                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    cactgtgataaatggtagtattaatgtTGTG---TGATAAGTATAACCC-T-AGTT-C-ATTTATAAAG-ACAAGTATAATATTTTCT-GG-CCCC--TAACAAAA--AAATTCAAG----ACAAATTGACTTTGTAACATCTTAACTCTGTTTCA---ACTGTC-----CTGTAA-TAGCAATAGTTCTCTCG-------------TAAGGCTCATTTTAC-CACTTCTG---a
gi|26                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 AATT-TG--CG--AA-ATGATA---A------GA-C-AGGATT-------------TAAGGCGACAA-CA-A--TA-A--AAATTTTTAGAATTT--AGTCAGT-GGCCT-CGACCTGATAAGAAAAAA--ATA--T--CAAAAAATA-T-ACG-CAC--GTGGTATATGAC-----------C-CTCT-GCGCGAC-GAATC-A---ATC----TG--ATGAG-ACGA-TA-CA
gi|27                         :                                                                                                                                                                                                        -A--C-A-AC----CGT--TCATA------A-TCCAAAAA-AATGTAT-----AT--A--CAAAAA-TCGAGT-CGA-GAGCAGCGCACTGGA-CACATCTT-CTGTA-ATAA-A----AGCCGA-ATG-GTTTAGTGA-T---AG-TTT-T-----A-TTGAGAG-----AAGAAAATGGTAAG------TCCACTAACC----AG--T-CA
gi|28                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            ggcgactgtaTGTCAGTGTCTGTGGTGTCCTGAATTA-TATTAAGTTCTTCGCGATA-TATCAAA-TGGA-TATA-ACTGTGAAAATTATGATTGTTAATTGAT---AGCACATC-ACC
gi|28                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            CACC-GCAAG---------------TTTT-----TGTTTTT------AT-TCCGTAACAGGTT-TT---GA-ACA-AATTgcaagtttttgtttttattccgtaacaggttttgaacaaatt
gi|29                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      tgtcagtgtctgtggtgtcctgaattatattaagttcttcgcgatatatcaaatggatataactgtgaaaattatgattgttaattgatagcacat--CTCA-TT---ACACTTCTG---GCT-TT-----TTAAAGACA-------AGGATAAATAGTACGCCATTTTCCT---CGCGCGCTTAAAGTTTTAATTAC----GGATTTT-AATTACTTCCGAATTAATTTTGATCATTTCAGACAAAGTATTCAACTCCTCTCCC
gi|3                          :                                                                                                                                                                       AAAT-GGCGAAG-TACA--A-CAA----T--GT-G--TTA-AA----CGTAA-AATA------G-TCCCAAAA-A---CATGT---AT--A--CAAAA--TTGAGT-GTA-GGTCAAC--AC-GGA-C----CTC-C---G-ACAA-A----AG-TGA-A-G-G---AG-GA-TCA-GG-TGC-C-----A-TGG-GTG-----A--------GTAAGCATC-CTCTGCTGACG----CG--C-CACAC-CCGT-CG--TGA-GCC-C-----T-TA-GTC-G---AA---A-CAACA-G------------T---A--AACG-GG-A---TT-ACC--G----TCGTGA-AATCTA-GTACGAAA--AT--G--A---CTGA-CAAA--G-GATA---T---GAAACAAATCA--GT--C-AACA---T-------ATG-A--C--C-T---G--GTG-ATAA-TTTG-TAATCGCAAA--GA--A-GGT----C-ATTAT-------AGCGACC-G-TATAATT-TG--CG--AA-ATGAT----ACTTT--AAATGAGA-TTC-G-TTATACCGTTAACCCTGCAA-CA-T--CA-------TTTTTGG---TT--ACT-AGTTGGCCT-AGCTTT-------AAAAAT-CCC--T--C-------A-T-ACA-CAT--ATGC--CATGTGTTGGATATAGCC-CT-T-GCGTATC-GAATC-A---A-C----TG--A-GAG-ACAT--A-CACA-CCA-TAA--GCAG--G-T-G-A--------TATTGGTA-CATTA-------------CTA--C-ATAGA-A---AAG--G-AA--TGTTGAC---GATA-----T-GCAAAG--------TCAAAGTC--ATCA-CGT------TTATTA-T--ATA-AT-------G-TA--TGT-C--AGT-----C-TG--CATC-ATTAGAG-TC-AAATATTAAGTA-AAATAGCC-A---AAT------------ATAAAGCAGATATGTCAGATTCTGTGGTGTCCT---TTA-TTTCGAGTTCGCCA----AATATATAAATGGA-CATA-ATTGTG-AAATT-TTATTGTTAATTGATA--AG-ACATC-GTTTATATACCC----ATA-----TGTAAGG-TTG-AA---GGACACG-GT------------------TTTT----TTGTTTTT------AT-CCTGTAACGTTTT-TTTT--A-ACACAATTCTAC---TTCAT-AT-GA--ATATAAAA--ATAAGTC---TGCCAATA---AG-AGGAC-ACA-AT---TAGTGTCCTT-AGGAAT-AC-CA-AC--A---------T-ATTGTTGGA--AGAC--ATGGTTTCT-----AA-AGAC------TACATAAATATT-GTCCA-T-AAGAAA----ACCC-A---------------AGC----ATGCTC-T--TA--ATATC-TACTTC--AGAGTA-CTTGTGTGGG--CAATCA----------------GAGT-----GGTTCT-------------GAC-AAAACATGT
gi|30                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             ctattaaacctgacacaatacatctgctagtcatctgggactgatgtttatatatcACATTG-------------TTA-ACTACATA-A---A-A--G-AA--A--T--------T------T-GCAAAA--------CTCAAGTC--ATCA-CGT------TTATCA-T--ATA-AT-------GTTAGTTGT-CCAAGTC----C-TG-----C-ATTAGAGATT-AA-TATTAAAGG-AAGTGTTC-ATGGAAT------------A
gi|31                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     T-CA-CAC--C-A-TAA--GTAG--G-T-G-G--------TAGTGGT-ATATTA--------------TC-AC-ATTGA-A---A-G-----------------------------GCAAAG--------TTAAAGTC--ATC-TTGC------TTATCA-T--ATA-AT-------G-CAGTTGT-C--AGT-----G-TG--T--C-ATTAG
gi|32                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              cttatCAT-T--CAC--C-A-TAA--GCAG--G-TGG-A--------TGGTGGT-ATATTA-------------CT--AC-ATAGA-A---AGG--G-AA--AGTTGAC---GATAGCCGATAGCAAAG--------TTAAGGTC--ATC-ACGC------TTATC
gi|34                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 tatcctCAATA---AG-GGGGC-ACA-AT---TAGTGCCCGT-TGGAAT-AT-CA-AC------------GGATTGTTAG--TAGAC--ATGG--TCTCC---AA-AGAC------TACACAAATATT-ATTTA-T-AAG
gi|35                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           GA-GCC-T-----T-TA-GTC-G---AA---AACAG-G-GAGGGGGGGCGGTT---ACGAGCG-GA-G---TT-ACCCTG----TCGTCAGAATCT-AGTACGGAA--A---G--A-G--TGGACAAA--G-GGTA-ctaa
gi|36                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      A-GG-T-C-C-----G-TGAATGA-----A--------GTAAGCATCTCGTTGCTGATCCGAGGA--T-CACAC-CCAC-CG--TGA-GCA-A-----T-CA-AGA-G---AA---A-CAG-A-tg
gi|37                         :                                                                                                                                                                                                                             gatggatggtcgCCCAACATA---CATGTATAAT--A--CAGAG--TCGA-T-GTA-GA-CAAC--AC-AGA-C----CTAGT---A-ACAA-A----AGGCGA-G-G-G--CAG-GA-TCA-GG-TGC-C-----A-TG
gi|38                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      cc--ATTTTCCC---CGC-----TAAA----TGG----------ATTTT-AATCATTTCCGAA-TATTTGTATCCA-TTCAGACAAAGTGTCAAGCTCCTCTCCCT
gi|39                         :                                                                                                                                                                     gcAAAT-GGCGAAG-TATTTTA-CAA----T--GT-G--T-TTAA----CATAATCATA------G-TCCAAAAA-A---CAT-----GT--A--CAAAA--TCGAG
gi|4                          :                                                                                                                                                              tttgttataAAATTGGCGAAG-TA----AACAA----T--GT-G--TTA-AA----CGTAATCGTACATGTAG-TCCCTAAA-A---CAT-----AT--A--TACAACTTCGAGT-GTA-TGGCAAC--AT-GGA-C----CTC-C---G-ACAACA----GG-CGA-A-G-C--CAG-GA-TCA-G--TGC-C-----A-TGGAGGG-----A--------GTAGGCATC-CTCTGCTGACC----GG--T-CAC-C-CCACACG--TGA-GCCTC-----G-TA-GTC-G---AG---A-CAA---G------------T---A--AACA-GG-G---TT-TACC-G----TC---------TAC-TACGAAATGAG--A-CA-GTCTAA-CAA---G-GGTA---T---GAAACAAATCA--GT--C-AGCA---T-------ATG-A--C--T-T---A--GTG-ATAA-TTTGGTAATCGCAA---CA--A-GGT----C-AT-AT-------AGCGACC-G-TAGAATCCTG--CG--AA-ATGCTGCGGACTTTGAAA-CGAGAACTC-G-TT--A----TAACCCTGCAAACA-T--CA-TTTC--TTTTT-----TT---GT-AATTGAC-T-CGCTTT-------AAAG----TC--CTGC-------G-T-CCG-CAT--GA----TATA-------------C-CT-TTGCGTATC-GAATC-A---A-C----TG--A-GAG-ACAT--A-CACA-CCA-TAA--GCAG--G-T-G-A--------TAGTGG-AACATTA-------------CTA--C-AAAGA-A---A-G--GGAA--AGTTGAC---GAT------T-GCAAAG--------TCA--------TCA-CGT------TTATCA-T--ATA-AT-------G-TAGTTGT-C--AGT-----C-TG--C--C-ATTAGAA-TC-AA-TTTTAAGTA-AAATATCC-A---AAT------------ATGAAGCACATCTGTCAGATTCTGTGGTGTTCT---TTA-TTTGGAGTTCGTCAGGAT-ATATC-AAATGGA-CATA-ATTATGAAAATTATGATTGTTAATAGATC--AG-ACATC-ACCTATATATCTAC--ATA-----TGTA
gi|41                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           actatcttatccgaatgacatcaaagattacttgaacgattgtctgtactgcaatat---AG-ACATC-ATCTATATATCT----ATA-----TGTAATG-ATG-AA---GGACACA-GTAAG---------------TTTT----TTGTTT
gi|42                         :                                                                                                                                                                       AAAT-GGCGAAG-TA----A-CAA----A--GT-A--T-G-AAC---CGTAATCATA------
gi|44                         :                                                                                                                                                                       AAAT-GGCGAAG-TA----G-CAA----A--GT-AT-T-C-AA----CATAATCATA------A-Tcgtacacagataaaccata
gi|46                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         cgcacatttataTTTTGG---TT--AGT-AGATGGCCT-CGCTTT-------AACAA--ATC--
gi|47                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   A-A---G-G--G-GA--AATTGAC---AAT------T-GCAAAG--------TCAAAGTC--AT
gi|49                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      -A---AAT------------ATGAAGCACATCTGTCTGATTCTGTG
gi|5                          :                                                                                                                                                                       AAATTGGTGAAG-TA----AACAA----T--GT-G--T-T-AAT---CGTAATCATA------G-TCCTAAAA-A---CAT-----ATTTA--CAAAG--TCGAGT-GTA-GGGCAAC--AC-GGA-T----CTC-C---G-ACAA-A----AG-CGA-A-G-G--CAG-GA-TCA-GG-TGC-C-----A-TAGAGG------A--------GTAAGCATC-CTCTGCTGACC----GG--T-CACAC-CCGC-CA--TGA-GCC-C-----T-TA-GTC-G---AA---A-CAA-G-G------------T---A--AACA-GG-A---TT-ACCC-G----TTGTCA-CATCT-AGTACGAAA--AT--GACA-GTCT-AACAAAA---GGT---AT---GGGACAAATCA--GT--C-AGCA---T-------------------------------TAA-TTTA-TAATCGCAAA--CA--A-GGT----C-ATTAT-------ACCGACT-G-TAGAATT-TG--CG--AC-ATGGTG---ACTTTA-AA-CGAGAA-TC-G--T-TA----TAATCCTGCAA-CA-T--CA-A--C--TTTTTAG---TT--AGT-AGTTGGCCT-CGCTTT-------AAAAA--GTCT-T--C-------A-T-ACG-CAT--GA----CATGT------------T-CT-T-GCGTATC-TAATC-A---A-CTGCATG--G-AAA-ACAT-T--CACACC-A-TAA--GCAG--G-T-G-ATACATTTGTAGTGGT-ACATTA-------------CTA-
gi|6                          : tatactctatatgataatatatgtcttctgaaaccgcttttacatgtttctgtgttggcgacatcggtattttgggctttttcaaaagtttggcttatatttaaaaagttttcttttcatgaatgcatttttttctgtatttttttttattgtatgtagtaaaagatatT-GGCCAAA-TA----AACAA----T--TTGA--T-A-AT----TGTAATCAAA------A-CCCCAAAA-----CAT-----AC--A--CAAAG--TCGAAT-GTA-AGGAAAC--AC-AGA-C----CTC-C---G-ATAA-T----AG-CGA-A-G-G--AAT-AG-TCA-GT-CG-----------------------------------GCATC-CTCTGCTGACC----GG--T-CACAT-CCGC-CG--TGA-GCC-C-----T-TG-GTC-G---AA---A-CAA-A-G------------T---A--AACG-GG-A---TT-ACCC-G----TCGTCA-AATCTA-GTAGGAAA--AT--GACA-GTCTAA-CAAA--G-GGTA---T---GAAACAAATCA--GT--C-AACA---T-------ATG-A--C--T-T---A--ATG-ACAA-CTTG-TAATCGCATA--CA--A-GGT----C-ATT---------------------------TG--CG--AA-ATGGTG---ACT-----------------------G----TAGCCCTGCAA-CA-T--CA-------TTTTTTG---CT--AGT-AGTTGACCT-CGCTTT-------AAAAA--GTCC-T--C-------G-T-ACG-CAT--GA----CATG-------------CTCT-T-GCGTATC-GAATC-A---A-C----TG--G-AAG-ACAC--A-CACA-C-AATAA--GCAG--G-T-G-A--------TAAGGGTA-CATTA-------------CTA--C-ATGAA-A---A-G--G-AA--AGGTGAC---GAT------T-GCAAAG--------TTAAAGTC--ATCA-CGC------TTATCA-T--ATA-AT-------G-CAGTTAT-C--AGC-----C-TA--C--C-TTTAAAG-TC-AA-TATTAAGTA-AAAAATCC-A---AAT------------ATGAAGCAGATATGTCAGATTCTGTGGTGTCCT---TTA-ca
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                atagatTGTCAGATT--GTGTTGTC-T---TTA-TAT-GAGTTT-TCGGGATA-T-TCCAAAT------TA-AT----------GCCCTTGTTA-TTGAT---AGCAGAT--ATCTATAT-CCT----ATA-----TATAAGG-TTG-A-----GACAAA-GCAGGGAGTTTTTTTTTTTTTTTT----TTGTTTTT------AT-CCCGTAA-AGTTT-TTGT--A-GCA-AATTCTGC---TTCAT-ATGTA--ATAT-TCA--GTAAGTCTGGTGCCAATA---AA-GGGG---CA-AT---TAGTGCCACT-AGGAATGACGCA-ACGGA---------GAATTGTTTGA-TCGAC--CT-GTCTCTCC----A-CGAC------TACATAAATAAT-TTCTG-T-AAGAAACTCTACTC-ATCATGATGTCATGTTATCAT--TTGTTC-TAATAATATATCCTACTTCAGAGAGTA-CT--TGTGGG--C-ATCA----------------GAGT-----GTTTTT-------------TAAACAAATATGTGTCTT--GTTTTTCCGCCCCAATCCCCGAACTAGAAA--TATTA--TT---TTCGGG---GGTC-ATTTTT----TTGT---------TT---AACCACATT---------T--CGATAAT--CT-GAAAAG------CT-AGAT--TTAT--ATTTTTAAT--GTGAatactggcgtcaaagctcaaaattcttggagcgggaataataaaatatatt
gi|8                          :                                                                                                                                taagatataaaacggtcagctactaaggattgtgtggtgAAAT-GGCGAAG-TA----A-CAA----A--GT-A--TGA-AA----CGTAATCATA------G-TCCAAAAA-A---CAC-----AT--A--CAAAA--TCGAGT-GTA-GGGCAAC--AC-GGA-C----CTT-C---G-ACGA-A----AG-CGA-A-G-G--CAG-GA-GCA-GG-TGC-C-----A-TGGAGG------A--------GTAAGCATC-CTCTGCTGACC----GG--T-CACAC-CCGC-CG--TGA-GCC-T-----G-TA-GTC-G---AA---A-CAA-A-G------------T---A--AACG-GG-G---TT-ACCC-G----TCGTCA-AATCTA-GTATGAAA--AT--GACA-GTCTAA-CAAA-TG-G-TA---T---GAAACAAATCA--GT--C-AACA---T-------ATG-A--C--T-T---A--GTG-ATAC-TTTG-TAATCGCAAA--CA--A-GGT----C-ATTAT-------AGCGACC-G-TAGAATT-TG--CG--AA-ATGATG---ACTTTA-AA-CGAG-ATTC-G--T-TA----TAACCCTGCAA-CA-T--CA-A--C--TTTTTGG---TT--AGT-AGTTGGCCT-CGCTTT-------AAAAA--ATCA-T--C-------A-T-ACG-CATG-G-----CATGC------------C-CT-T-GCGTATC-GAATC-A---A-C----TG--A-GAG-ACA--TA-CACACC-A-TAA--GCAG--G-T-G-A--------TAGTGGT-ACATTA-------------CTACAC-AAA-A-A---A-G--G-AA--AGTTGAC---AAT------T-GCAAAG--------TCAAAGTC--ATC-ACGT------TTA
gi|9                          :                                                                                                                                                                                                                                 ggcatataCCCCAAC-A---CAT------T--A--CAAAT--TCGC-T-GTA-AG-CAAC-CG--GGA-C----CTC-C---G-ACAA-A----AG-----A-G-G--TAG-GA-TCA--G-TGCAC-----A-TGGGAGG-----A--------GTAAGTTTC-CTCTCCCGAC------G--T-CACAC-CCGCGCA--TGACACC-CCCAAAT-TA-GAT-GACCAA---A-C-A-A-G------------T---A--AACG-GG-GA--TTAACCC-GGGTTTCA--A-AAT---AGTACGAAATGAC--A-CA--TCT-AACAAA--G-GGT---AT---GAAACAAATCA--GT--CAAACA---T-------ATG-A--C--T-TGCGG--ATG-ATAA-TTTG-TAATCGGGAA--CAACA-GGT----C-ATTATTTCGATAAGC-ACC-GCTAGAATT-GC--CG--A-----------------------AGAATTC-G--T-TA----TTAACCTACAA-CA-TA-CA-A--C--TTTTTTG---TT--AGT-AGTTTGGCT-CCCTTT-------AAAAGCCCTC--C--C-------A-C-ACG-CACGAG-----TATG-------------C-TC-T-GCGTATC-GAATCAA---A-C----CG--A-GAG-ACAT-
5 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|33 ): GTTTTTGCGTTGGTGACATCAGAATTTTGGATTTTTTCAAAACTTTGGCAGTGACTGGCTTATCATATTTAAAAAGTTTTCTTTTCATGAATGCATTT
Unaligned ( gi|40 ): TTAAAAGTGAAGATAACAAACAGTGATCTATGTCATAATTCCTATAAAAAATTGAAATCTAA
Unaligned ( gi|43 ): GATCTGAGGTCCAGGGGTGATGAATATAGCATACTTCCATGTTGATTGATT
Unaligned ( gi|45 ): TATTAAGTGATGCCATACATAGAGGATCTTGAATGAGT
Unaligned ( gi|48 ): TAGTCGATACTAAAATTCATGCTCATTTGAT






Alignments
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                      111111   1111111  22222222222222                                 111111                                22                                                                              111111111111111                                                                                       111111111111                                            22           3333333333333333333333333333333333                           1111111                                                                                                                   11              1111111111                11  1111111                                  1111111          2222222222222           444444444444444444444444444                          1111              1111   11 1                    11111111       11     111111111111111111                                    111111        11111111             22   111111                111111111              1111111                                                 222222222222                                                                                                          222  1                  2222   11111             1111      11     444444444444444    1111        222222                   2222              222     1     11        11       111        111               111                11        444444444444          111    11  1 1      1111      222222                           11111     555555555555555   22222       11  11            111                11      5555555555555555555555555      44444444444444                 11    222222     2222  1               11  111      111    111    2222    4444444444444      1   444444444444444444444  1      33333   1    11  2222     11  222222            66666666666666     2222         1  22    2     1            333333333      11                2222     11         2222        222222     2222     1  111     11    1  1      1          1        1           1     111    22        11      444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444  111   1      11         111     11     44444444  11   1 1          1   1111   1   333333333333333333333      4444444444     1       1           1      1             1   111       111                        1  1     1     1             1   111    22222               111   11                                         2222222         11        444444444444444444444444444444444   111          4444444444444444444444    111         55555555555555   11                   111   22222222  111    222222             22222        111   22222    2222      33333       1             1            1                             
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                           6       6  333333   4444444  55555555555555     3    777777 2        2 444  444444  33 33     88      2   2  1    11  2   2 5555   2 444 4    2 6666  4   2 2 2 555  2  2   2  2   2 8888888      333333333333333         2           5555  33 2     2    5  33   2   6666666 2  2   2 666  333 2   222 333333333333 333 33    2  2 666  2    2 5555    1 2     11        66 6666666666666666666666666666666666           33  33 2    444 0000000   4 33 55 2 444444   2    2    2  0       33  33 2   5555 2     9999999       3 6       2  33  33  2      777 3 0 88  3    33   3 7777777777   0       3  3 11  8888888     1 555  44   3     0   3      4444444     77   5555555555555 3 3   3   999999999999999999999999999  3 3       3     3 555 3 7777  8888   3    4444   77 0 3   77    44 3 6 3 22222222       88     888888888888888888 7 222 6 555 6 44 3  44 33    555   222222 3      22222222        44   22   000000      4 66   4  777777777       8888   6666666  99999 4       5  5  5     0   5        4 777   222222222222        0  1                   2 888   5   5      4   11  99 3  7  3    6    6      3  3  1               111  1     5            3333   66666       8   8 4444      00     888888888888888    4444        333333 88    0        8  3333 8   8     3  999     0  6  33    44  33  3    777        444  8     8   8  444        1 8     66  8  8  333333333333 3        777    99  0 0    5 4444 8    333333     6   0  8     6 6      77777   8 000000000000000   33333  3  8 11  11     3 6    999     8  0       11 0    9999999999999999999999999      55555555555555  5           55 33    777777     1111  0        6   9  33  777      777    444    1111    2222222222222   1  0   555555555555555555555  0      00000   0    33  4444     33  111111       0    88888888888888     1111         3  00  3 6     3            777777777      88  1          1  4444     66         2222        888888     8888     3  555     88    3  3      3          3     3  3     7     0     777    99        33  3   777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777  777   0    3 33      2  777 2   22  6  66666666  33   0 0  3 3     0   7777   0 2 999999999999999999999 2    9999999999     0       0           0      0       3 66  0   777       999     2  3     1     3   0  0     0     0             0   777    44444 0   2         444   11    8  3  8 8  0 8 88         8        0 3333333 8888  1 11 1      111111111111111111111111111111111   777   1      8888888888888888888888  1 000         33333333333333   11 0  8  0  8 0    0 444   66666666  000    777777    0    7   88888        777   55555    1111   3  22222       3   1         3  1         3                    6        
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                           .       .  ......   .......  ..............     .    ...... .        . ...  ......  .. ..     ..      .   .  .    ..  .   . ....   . ... .    . ....  .   . . . ...  .  .   .  .   . .......      ...............         .           ....  .. .     .    .  ..   .   ....... .  .   . ...  ... .   ... ............ ... ..    .  . ...  .    . ....    . .     ..        .. ..................................           ..  .. .    ... .......   . .. .. . ......   .    .    .  .       ..  .. .   .... .     .......       . .       .  ..  ..  .      ... . . ..  .    ..   . ..........   .       .  . ..  .......     . ...  ..   .     .   .      .......     ..   ............. . .   .   ...........................  . .       .     . ... . ....  ....   .    ....   .. . .   ..    .. . . . ........       ..     .................. . ... . ... . .. .  .. ..    ...   ...... .      ........        ..   ..   ......      . ..   .  .........       ....   .......  ..... .       .  .  .     .   .        . ...   ............        .  .                   . ...   .   .      .   ..  .. .  .  .    .    .      .  .  .               ...  .     .            ....   .....       .   . ....      ..     ...............    ....        ...... ..    .        .  .... .   .     .  ...     .  .  ..    ..  ..  .    ...        ...  .     .   .  ...        . .     ..  .  .  ............ .        ...    ..  . .    . .... .    ......     .   .  .     . .      .....   . ...............   .....  .  . ..  ..     . .    ...     .  .       .. .    .........................      ..............  .           .. ..    ......     ....  .        .   .  ..  ...      ...    ...    ....    .............   .  .   .....................  .      .....   .    ..  ....     ..  ......       .    ..............     ....         .  ..  . .     .            .........      ..  .          .  ....     ..         ....        ......     ....     .  ...     ..    .  .      .          .     .  .     .     .     ...    ..        ..  .   ..........................................................................................  ...   .    . ..      .  ... .   ..  .  ........  ..   . .  . .     .   ....   . . ..................... .    ..........     .       .           .      .       . ..  .   ...       ...     .  .     .     .   .  .     .     .             .   ...    ..... .   .         ...   ..    .  .  . .  . . ..         .        . ....... ....  . .. .      .................................   ...   .      ......................  . ...         ..............   .. .  .  .  . .    . ...   ........  ...    ......    .    .   .....        ...   .....    ....   .  .....       .   .         .  .         .                    .        
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                           7       7  999999   2222222  55555555555555     2    222222 7        5 444  888888  44 44     44      7   7  7    00  5   4 0000   4 111 7    2 9999  4   4 4 4 333  4  4   1  1   1 2222222      000000000000000         2           0000  22 4     5    0  22   2   0000000 1  1   1 666  777 1   555 666666666666 999 11    4  4 555  4    4 0000    8 4     88        55 6666666666666666666666666666666666           22  22 4    111 0000000   7 22 66 4 999999   5    5    5  8       44  44 5   7777 7     3333333       1 2       9  99  99  9      999 3 3 88  1    88   1 5555555555   8       3  3 22  8888888     0 888  66   3     2   3      2222222     99   9999999999999 6 6   6   777777777777777777777777777  6 6       3     3 888 3 5555  5555   3    9999   33 0 3   99    66 3 7 3 11111111       66     000000000000000000 3 777 7 888 7 66 3  66 33    888   999999 3      11111111        66   44   555555      4 11   4  888888888       9999   3333333  66666 4       0  0  0     4   0        4 888   888888888888        7  7                   5 888   0   3      3   44  00 5  5  5    7    7      2  2  7               444  4     7            3333   77777       0   0 8888      33     333333333333333    2222        000000 88    8        0  0000 0   0     2  222     0  5  88    55  88  2    555        000  0     0   0  000        0 0     88  0  0  888888888888 8        666    00  0 6    0 8888 0    000000     0   8  0     7 7      88888   0 000000000000000   44444  2  0 00  00     8 0    444     0  8       00 8    8888888888888888888888888      00000000000000  6           88 88    555555     2222  0        5   2  88  555      555    000    2222    8888888888888   0  0   888888888888888888888  0      00000   0    88  8888     88  555555       7    33333333333333     0000         3  77  7 7     3            000000000      00  0          0  0000     00         5555        777777     3333     3  333     33    3  3      3          3     7  3     3     8     555    22        88  2   222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222  555   0    2 88      5  555 5   55  5  22222222  88   0 0  2 2     0   8888   0 5 555555555555555555555 5    5555555555     0       0           0      0       2 55  0   555       555     5  2     0     2   0  0     0     0             0   222    55555 2   5         000   00    0  2  0 0  8 0 88         0        8 6666666 2222  4 00 4      000000000000000000000000000000000   555   0      0000000000000000000000  2 222         88888888888888   00 8  0  8  8 6    8 000   22222222  222    555555    8    3   88888        555   00000    2222   2  00000       3   0         3  0         3                    7        
consensus                     :                                                                                                                                                                       AAAT-GGCGAAG-TA----A-CAA----A--GT-A--T-A-AA----CGTAATCATA------G-TCCCAAAA-A---CAT-----AT--A--CAAAA--TCGAGT-GTA-GGGCAAC-CAC-GGA-C----CTC-C---G-ACAA-A----AG-CGA-A-G-G--CAG-GA-TCA-GG-TGC-C-----A-TGGAGGG-----A--------GTAAGCATC-CTCTGCTGACC----GG--T-CACAC-CCGC-CG--TGA-GCC-C-----T-TA-GTC-G---AA---A-CAA-A-G------------T---A--AACG-GG-G---TT-ACCC-G----TCGTCA-AATCTAAGTACGAAA--AC--G-CA-GTCTAAACAAAATG-GGTA-AAT---GAAACAAATCA--GT--C-AACA---T-------ATG-A--C--T-T---A--GTG-ATAA-TTTG-TAATCGCAAA--CA--A-GGT----C-ATTAT-------AGCGACC-G-TAGAATT-TG--CG--AA-ATGATG---ACTTT--AA-CGAGAATTC-G-TT-TA----TAACCCTGCAA-CA-T--CA-A--C--TTTTTGG---TT--AGT-AGTTGGCCT-CGCTTT-------AAAAA--ATC--T--C-------A-T-ACG-CAT--G-----CATG-------------C-CT-T-GCGTATC-GAATC-A---A-C----TG--A-GAG-ACAT-TA-CACA-C-A-TAA--GCAG--G-T-G-A--------TAGTGGTAACATTA-------------CTA-AC-ANAGA-A---A-G--G-AA--AGTTGAC---GAT------T-GCAAAG--------TCAAAGTC--ATCAACGC------TTATCA-T--ATA-AT-------G-TAGTTGT-C--AGT-----C-TG--C--C-ATTAGAG-TC-AA-TATTAAGTA-AAATATCC-A---AAT------------ATGAAGCAGATCTGTCAGATTCTGTGGTGTCCT---TTA-TTTCGAGTTCGTCGGGATAATATCAAAATGGA-CATA-ATTGTGAAAATTATGATTGTTAATTGAT---AG-ACATC-ATCTATATACCT----ATA-----TGTAAGG-TTG-AA---GGACACG-GCAAG---------------TTTT----TTGTTTTT------AT-CCCGTAACAGTTT-TTTTGAA-ACA-AATTCTGCT--TTCAT-ATGGA--ATATAAAA--ATAAGTC---TGCCAATA---AG-GGGGC-ACA-AT---TAGTGCCCNT-AGGAAT-AC-CA-AC--A---------GAATTGTTGGA-NAGAC--ATGGTCTCTCC---AA-AGAC------TACATAAATATT-ATCTA-T-AAGAAA----ACCC-A---------------AGCAT--ATGCTC-T--TA--ATATCTTACTTCA-AGAGTA-CTTGTGTGGG--CAATCA----------------GAGTG----GGTTCT-------------NACAAAAATATGTGTCTT--GTTT-----CCCCAA----CG-ACCAGAAACTTGTTA--TT---TTCGGG---TGCC-G-TTTT----TTGT---------TT-AAAANCA-ATTA--------T--CAAT--T--CT-GAAAAA-G---CCT-AGAT--TT-T--ATTTT--AT-CGTGAGAGGAATCGTTG-----------TAGTAAAG--TGGTGGAGAAA-TC-ATACG-TTTTG-ATGCAGTCAATTGTCTCAGCATTGGAAACAANTCTCGTGATTNAAAGTTGTTTTNGTATAAAGCTGGGCCTTTAGAGGGGGCGTTTTT----TGAGA-ATCC-CAATC--TGAA-TG-ACACCA-TTCTGGAATA-TGTAGCGG-AACAGTATATCNTGAAG---TGACT-TTTTAACA--GCTGTTCAG--TAG-------TTT--TTAGT--A-GAC-------TAAGGGA----------T-AGAG--------------GG-----C------TG---GTA-GAGCAC--TTACTGGAA---CCAGCG-ATGTA--------TC--TTT-G-TTTGTAAGGA-TTTC---TTA-TGCG---TT---T-CGGAA-----TCCAGT-A--------AAGGT-ATGGTAA-TTCAAATTGAT-CCTGAT-TCTTCGGAAATAT-TGA---AAGTATTT-CAAACAGAAAGGTGANTTTGAAGAA-TT-TCATC-TTAGT-CAGATTGCTTGGA-GTATA-AAGT----AAGATTCCCAGATGTG---TGA--AGTA-AACCC-T-AGTT-C-ATTTAAAAAG-ACAAGTATAATA----GT-GA-CTCT--TTACAAAC--A-----AAG----ACAAA-------TGTGA-ATC---ACTNTGCTTTAT--GCTGTCT--AACT---A-TAACAA-AGTTTTCACG-----TG----TNTAA--CTCA-TTTACNCACTTCTG---GCT-TC-----TTAA-GACAG-----AAGGATAAATAGT-CG--ATTTTCCC---CGC-----TAAA----TGGTTAC----GGATTTT-AATNATTTCCGAA-TANTTTTGATCA-TTCAGACAAAGTGTCAAGCTCCTCTCCCT
Reference ( family-568 )      :                                                                                                                                                                       AAAT-GGCGAAG-TA----A-CAA----A--GT-A--T-A-AA----CGTAATCATA------G-TCCCAAAA-A---CAT-----AT--A--CAAAA--TCGAGT-GTA-GGGCAAC-CAC-GGA-C----CTC-C---G-ACAA-A----AG-CGA-A-G-G--CAG-GA-TCA-GG-TGC-C-----A-TGGAGGG-----A--------GTAAGCATC-CTCTGCTGACC----GG--T-CACAC-CCGC-CG--TGA-GCC-C-----T-TA-GTC-G---AA---A-CAA-A-G------------T---A--AACG-GG-G---TT-ACCC-G----TCGTCA-AATCTAAGTACGAAA--AC--G-CA-GTCTAAACAAAATG-GGTA-AAT---GAAACAAATCA--GT--C-AACA---T-------ATG-A--C--T-T---A--GTG-ATAA-TTTG-TAATCGCAAA--CA--A-GGT----C-ATTAT-------AGCGACC-G-TAGAATT-TG--CG--AA-ATGATG---ACTTT--AA-CGAGAATTC-G-TT-TA----TAACCCTGCAA-CA-T--CA-A--C--TTTTTGG---TT--AGT-AGTTGGCCT-CGCTTT-------AAAAA--ATC--T--C-------A-T-ACG-CAT--G-----CATG-------------C-CT-T-GCGTATC-GAATC-A---A-C----TG--A-GAG-ACAT-TA-CACA-C-A-TAA--GCAG--G-T-G-A--------TAGTGGTAACATTA-------------CTA-AC-ANAGA-A---A-G--G-AA--AGTTGAC---GAT------T-GCAAAG--------TCAAAGTC--ATCAACGC------TTATCA-T--ATA-AT-------G-TAGTTGT-C--AGT-----C-TG--C--C-ATTAGAG-TC-AA-TATTAAGTA-AAATATCC-A---AAT------------ATGAAGCAGATCTGTCAGATTCTGTGGTGTCCT---TTA-TTTCGAGTTCGTCGGGATAATATCAAAATGGA-CATA-ATTGTGAAAATTATGATTGTTAATTGAT---AG-ACATC-ATCTATATACCT----ATA-----TGTAAGG-TTG-AA---GGACACG-GCAAG---------------TTTT----TTGTTTTT------AT-CCCGTAACAGTTT-TTTTGAA-ACA-AATTCTGCT--TTCAT-ATGGA--ATATAAAA--ATAAGTC---TGCCAATA---AG-GGGGC-ACA-AT---TAGTGCCCNT-AGGAAT-AC-CA-AC--A---------GAATTGTTGGA-NAGAC--ATGGTCTCTCC---AA-AGAC------TACATAAATATT-ATCTA-T-AAGAAA----ACCC-A---------------AGCAT--ATGCTC-T--TA--ATATCTTACTTCA-AGAGTA-CTTGTGTGGG--CAATCA----------------GAGTG----GGTTCT-------------NACAAAAATATGTGTCTT--GTTT-----CCCCAA----CG-ACCAGAAACTTGTTA--TT---TTCGGG---TGCC-G-TTTT----TTGT---------TT-AAAANCA-ATTA--------T--CAAT--T--CT-GAAAAA-G---CCT-AGAT--TT-T--ATTTT--AT-CGTGAGAGGAATCGTTG-----------TAGTAAAG--TGGTGGAGAAA-TC-ATACG-TTTTG-ATGCAGTCAATTGTCTCAGCATTGGAAACAANTCTCGTGATTNAAAGTTGTTTTNGTATAAAGCTGGGCCTTTAGAGGGGGCGTTTTT----TGAGA-ATCC-CAATC--TGAA-TG-ACACCA-TTCTGGAATA-TGTAGCGG-AACAGTATATCNTGAAG---TGACT-TTTTAACA--GCTGTTCAG--TAG-------TTT--TTAGT--A-GAC-------TAAGGGA----------T-AGAG--------------GG-----C------TG---GTA-GAGCAC--TTACTGGAA---CCAGCG-ATGTA--------TC--TTT-G-TTTGTAAGGA-TTTC---TTA-TGCG---TT---T-CGGAA-----TCCAGT-A--------AAGGT-ATGGTAA-TTCAAATTGAT-CCTGAT-TCTTCGGAAATAT-TGA---AAGTATTT-CAAACAGAAAGGTGANTTTGAAGAA-TT-TCATC-TTAGT-CAGATTGCTTGGA-GTATA-AAGT----AAGATTCCCAGATGTG---TGA--AGTA-AACCC-T-AGTT-C-ATTTAAAAAG-ACAAGTATAATA----GT-GA-CTCT--TTACAAAC--A-----AAG----ACAAA-------TGTGA-ATC---ACTNTGCTTTAT--GCTGTCT--AACT---A-TAACAA-AGTTTTCACG-----TG----TNTAA--CTCA-TTTACNCACTTCTG---GCT-TC-----TTAA-GACAG-----AAGGATAAATAGT-CG--ATTTTCCC---CGC-----TAAA----TGGTTAC----GGATTTT-AATNATTTCCGAA-TANTTTTGATCA-TTCAGACAAAGTGTCAAGCTCCTCTCCCT
gi|1                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    AAACAGGGTA-TGCA-AA-----AAACCAATCA--AT--C-AATA---TCATTTTTATGTAGTC--TCT---ATTGTG--TACCTTTG-TAATCGCAAA--CA--ACGGT----CCATTAT-------AGCGACC-G-TAGTATT-TG--CG--AA-ATGATG---A-TTT--AA-CGAGAATTC-G-TTATA----TCACCCTGCAA-CA-T--CAGA--C--TTTTTGG---T---AGT-AGTTG-CCT-CGCTTTT------AAAAA--ATCA-T--C-------A-T-ACGACAT--GG----CATG-------------CTCT-T-GCGTATCTGAATC-A---A-C----TG--A-GAG-ACAT--A-CACA-CCA-TGAACGCAGCGG-T-GGA--------TAGTGGTA-CATTATACATTCTTTGTTCTT-ACTATGAATA---A-GTTG-AACAAGTTGACTTGGAT------T-GCCAAGCCTATCCTTCAAA-TC--ATCAACGCCCCCCTTTATCCCT--ATA-ACTCGCACCGCTAGTTG--C--AGTGTCGCT-TGTTC--CGATTAATG-TCGAA-TATTTTGTGGAAATATTTTA---AATCACTTCATAACAACGAAGCAGATC-GTCAGATTCTGTGGTGTCCT---TTACTTTCGAGTTGTTCGG--TGATTTCAAATGGGACCATACATTATGAAAATCATGATTGTTAATTGATATAAA-ACATCAATCTATATACTTTCAAATATATTTTGTTAGGTTTGCAACTGAGACACGTGCAAGA--------------TTTTTTCGTTGTTTTTTAAAAAATCCCCGTAACAGCCTATTTTGAATCCA-AATTC-GCTAGTTGCTAATAGA--ATTTAGAATCAT-AGTC---TGCCAATATTTAGTGGGGCAACAGACTCATAGTGTCCATAAGGGATAAT-CACAC--ACTTACCTAGGAATGTTTGGA-GAGACA-ATGG-CTACAC---AATAGACACCAATTACAT-AGT-TT-ATCTATT-ATTAGA----ACCCAA---------------AGCATGAATA--A-T--TA--ATATCTT-CTTCA-AGAGCACCTTGTATGAGATTAATCAGTTATTGCATTTTGGGGGGTGTTTTGGTTCTTTTCATTCTTATAAACAAAAATATGCAT-TTAAATTT-----CCCCAA----CG-ACCAGAAACTTGTTACCTTAAGTTCAGGTTTTGCC-G-TTTTGGTGTTGTTCCAAACCCTT-GAAACCA-ATTAATCACTTTT--CAAT--T--CTCGAAAAA-GCGCCCT-GGATAATT-TTAATTTC--AT-TGTGAGAAGAATTGTTGTAATATTGGGTTAGTAGAGCTCGGGGCAGAAA-TCAATAAGATATTGAATGCAGTCAATTGTCTCAGCATTGAAAACAACTCTCGTGATTTAAAGTTGTTTTAGTATAAAGCTGGGCTTTTAGAAGGGGCATTTTCACCGTGAGA-AT-T-CAATCTTTGAATTG-ACACCA-TTCTGGAATA-TGTAGCGG-AATAGTATATCCTGATATTCTGACTCTTTTAACAGCGCTGTTCAAGCTAGTTTAAGCTTT--TTAGT--ATGACAATCTTTTAAGGTA----------TAAGAG--------------GGGTCACT------TG---GTATGATCACTATTTCTGGAACCGCCAGCG-AC-TACTAACTACTT--TTT-GTTTTGTAAGGA-TCTCACTTTATTGCA---TT---TCCGGAG-----T-CAGT----------AAGGT-ATGGGAATTTCAAGTTGGTCCCTCGT-CCTTCGG-AATAT-TGA---AAGTATTTACAAACAGAAAGTTGATTTTGAAGAATTT-TCATCTTTAGTAAAGGTTGCTTGTA-GTAAT-AAGT----AAGATTCTCCAACCTGTTCTGA--AGTA-AA-CC-T-AGTT-C--TTTAAAAGC-ACAAGTATAA-A----GTAAA-CTTT--TAACAAACGGA-----AAGCACCATAGC-------TGT-A-ATC---AGTGTACTTT-T--GCTCTCT---TCT---G-TTAC----GCCTCTAC------TG----TATAA--CTTA-TTTACCCCCTTCTGTTTGCT-TCTCTCGTT---GACAGAAATTAAGGATAAA-AGTCCG--CTTTTTTCCAACGC-----TAAA----TGGTTA
gi|10                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 tttcaaactaccataccggaaaa--TGA-GCC-------T-TACATC-GTT-GA---T-CAG-A--------------T---A--AACA-GGTG---CT-TCTT-G------GTAT-AATTTA-GTATGTAA--AG--A-CC-GGCTTAACAA--TT-GG---AAT---GAAACGCTTCA--GA--C-AACAACCT-------AC--A--C--G-T---A--CCT-ACAA-GTTG-TATTTGCAAATGCA--A-AATAAACC-ATCAT-------AACGACC-A-TAGAATT-TG--TA--AACACGA-G---ATTGT--A---GAAACTCCTG-TT-TG----T-------CAG-TA-T--CA----C--GCCTTGG---TTTAAG--ACTTTATCA-CACTC----------AGA--ATC--TG-T-------T-T-TCG-CAT----------------------------T-T--C-TATT-GGATC-AGTTA-CATTTTGCAG-GAG-ACAA-AATCAC--C-A-TAA--ACAA--G-T-G-A--------AAATAG-AATATTG-------------CTA--C-AT-GA-ATACA-G--G-AA--A-TTGAC---GAT------G-GAAAAG--------TTAAAGCA--ATCT-CGC------TTGTCA-TCAAGA-AG-------GGTTGTTGT----AAT-----T-TG--C--C-TTGAACG-TC-TA-TGTTCAGTA-AATTATCC-A---AAT------------ATGAatatggaatttgttacaaataaggtttttacttt
gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     gaacacgtcccggtaaCA-GG-TGG-C-------TAGAAGG-----A--------GTGAGTATC-----GC---CC----GA--T-CACAC-CTGC-CG--TTA-GCC-C-----T-GA--TC-T---TG---A-TCA-G-G------------T------AACGCAA-G---TA-ATCC-G----TAGTCA-AA-CTCAGTATGCAA--AC--G-GATATC-GAAC--AATC-GGTA-AA-----AAGC--ATTA--G------GCG---T-------TTG-G--T--C-C---A--TTGTATAA-CTTG-TATCTGTAAA--TA--A-GAT----C-ATT
gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         tttactcagtatacacatgtatatgtctttgaagtcggttatgatgttcaatgcaacgacatcggtatacatgtacttcaaacgaactacacgtttaccgtgacatcaaagtaaatatatgtttagcggactttttttctgcctatatatagttacggcactggatttcttatgaacaagtgaaaattacgaacagtgactaatctcttagatcctaaattaaaagtactagtatacaaacaaagatccctagccaagATCATGAAG---TGACG-TCTTAACA--GC----------AG-------TTA--CTAGT--A-G--------------GA----------T-AGAG--------------GG-----C------TGCGGGTA-GAGC-C--TTAGTG-AA---CCAGCG-ATGTAA-------TCATTCT-G-TTTG-AAGGAGTTTT---TTA-TGCA---T------CGAAAAAAAATCCAAT-ATAAAAAACAAGGT-ATGGTAA-TTTCAATTGAT-CCTGATGTCTTTGGAAA-ATATGAAGCAAATGTTT--AAACA-AAAGGTGGATTTGAAGAA-GTATCACT-TTAGT-CAGATGTCTTGGA-GTA-A-GATT----AGTATT-CCAAATGAC---TGA--AGTG-AATCC-T-AGTTAC-AGTTAAAAGGCATAAGTAT-GTA-----T-GA-CTAT--TTATCAAC--AC----AAG----ACAAA-------TGTGA-ATC---ACTTGGCTTTATCAGCTG-----AACT---A-TATCAA-AGTTTTCATG-----TGCGTCTTTAA--C-CA-TTTACACACGTC-----GCTCTG-----TAAA-GACAG-----AAGGCTA
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 tccGTTTTT----TGATATATCC-CCATC--GGTA-TG-ACACCA-TTCTGGAATAATGTAGGTG-GACAGTATCTC-TGAAA---AGACTGTTTTAACA--GCTGTTTAG--TAG-------TTT----AGTTTA-GAT-------TAAGGAAGAGGCTTGGTT-AGAGCACTTACTTGAACTAG-----CATATATTG---GTA-GAGCAC--TTACTGGAA---C-AGC--ATATA--------TC--TTT-G-TT-GTAAGGA-ATTG---TTA-T-TG---TTAATT-CG-AA-----TCCAGTTA--------AAGGTCATTGTAA-ATCAAATTGAT-CCAGAT-TCTTCGGAA-TAT-TGA---AAGTATT--CAAACAGAA-GGTGAATTTGAAGAA-TT-CTATC-TTAGT-CAGATTGCTTGGAGGTATATAAGT-----AGATTCCCAGATGCT---CGA--AGTA-CACCCTT-AG-T-C-ATCTTAAAAG-ACAAGTACAG-A----GT-CAGCTCTAGTTACAA
gi|14                         :                                                                                                                                                               agtgtagaAAA--GGCAAAGATA----A-CGA----ACAGTGA--T-C-AATCT-CGTAA-----------G-TCCTAAAT-A---GA------AT--A--CAAAA--ACAAGA-GTC-GGGCAAT-CAC-GGA-C----CCC-T---GGACAC-A----C--CAG-A-A-G--TGG-GA-TCA-GG-TGC-C-------TAGGGGG-----A--------GTAAGCACC-CCCTGTTGACC----GG--T-CACAC-CCGC-CG--TGA-GCC-C-----A-TA-GTC-T---TG---A-TCA-G-G------------T---A--AACG-GA-----------C-A----TC-----AGT----GTGTGAAA--A---A-CG-G-CTTAAC--AATG-GCT---AT---GAAACACATCA--GA--C-AGCA---T-------TTG-A--C--T-C---A--ATG-ATAG-GTCA-TATTGGTAAA--CT--A-AAT----T-GTTAC-------AACGACC-A-TAGAATT-TA--CG--AA-ATGCTGC--ATTTA--AA-CGTGACT---G-TT-GA----AACCCCTGCAA-CA-TACCG-A--C--TTTT
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                              ggatgtA-C----CTC-T---A-ACAA-A----GG-CGA-A-G-G---AG-GG-TCA-GG-TGC-C-----A--GGAGG------A--------GTAAGCATC-CTCTGCTGACC----GG--T-CACAC-CCAC-CG--TGA-GCC-C-----T-TA-GTCGG---AA---A-TAA-G-G------------T---A--ataaatcatgcactttcttttcaaagtacatgtatatttgcacatgaaat
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    caaatAAATAAGGTA---T---GAACAAAATCA--GT--C-AACA---T-------ATGGA--CCTT-T---A--GTG-ATAA-TTTG-CAA-CGCAAA--CA--A-GGT----C-ATTAT-------ACCGACC-ATTAGAATT-TG--CGAAAA-ATGATG---ATTTTTAAA-CGAGATTTC-G--T-TA----TAA-CCTGCAA-CATT--CA-A--CTTTTTTTGT---TT--AGC-AGTTAGCCTAAGCTTT-------AAAAA--ATCTTT--C-------ATT-ACG-CGG--A-----CATG-------------CTCT-T-GC-TATC-GAATC-A---A-CT---TGC-G-GAGTAAAT-TA-CACATC-A-TAA--GCAG--GATGG-A--------TAGTGGT-GTATTA-------------CTA-tgaacaaaatcagtcaacatatggacctttagtgataatttgcaacgcaaacaaggtcattataccgaccattagaatttgcgaaaaatgatgatttttaaacgagatttcgttataacctgcaacattcaactttttttgtttagcagttagcctaagctttaaaaaatctttcattacgcggacatgctcttgctatcgaatcaacttgcggagtaaattacacatcataagcaggatggatagtggtgtattactacttctttcgttacttggataattttattgaacattgac
gi|16                         :                                                                         caaatacctctaacaaaggcgaaggagggtcaggtgccaggaggagtaagcatcctctgctgaccggtcacacccaccgtgagcccttagtcggAAAT-GGCGAAG-TA----A-CAATTAAA--GT-A--TCA-AA----CGTA-TCATA------G-TCCCCAAA-A---CAC-----AT--A--CAAAA--TCGAGT-GTA-GG-CAAT--AC-GGA-C----CTT-C---G-ACAA-A----AG-CGA-A-AAG--CAG-GAATCAAGG-TGC-C-----A-TGGA-GG-----A--------GTAAGCATC-CTCTGCTGACC----GG--TCCACAC-CCGC-CG--TGA-GCC-C-----T-TA-GTC-G---AA---A-CAA-A-G------------T---A--AACG-GG-G---TT-ACCC-G----TCGTCA-AATCTAG--ACGAAA--AT--GACA-GCCTAACTAACAAG-GGTATAA-----AAACAAATCA--GT--C-A--A---T-------ATG-A--C--T-G---A--GTG-ATAA-TTTG-TAATCGCAAA--CA--A-GGT----C-ATTAT-------AGCGACCGG-TAGAATT-TG--CG--AA-ATGATG---ACTTTAAAA-CGAG-ATTC-A-GT-TA----TAACCCTGCActtctttcgttacttggataattttattgaacattgac
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    taA-T-AAGAAA-----CCC-A---------------AGCAT----GCTCAT--TA--ATATCTAACTTCA--GAGTA-CTTGTGTGGG--CAATCA----------------GA--G----GGTTTT-------------CAACAAAATATGTGTCTT--GTTT------CCCAA----CG-ACTAGAAATTCG-TA--TT---TTCGGG---TGCCGG-TTTT----TTGT---------TTAAAAAGCA-ATTA--------TTATAAT------T-GAAAAAGG---CCTAAGAT--TT-TA-ACTTT--AT-CG---GAGGAATCGTTG-----------T-GTAAAG--T-GTGGAGAAA-TC--TACGTTTTTG-ATGCAGTCAATT
gi|18                         :                                                                                                                                                                                                                                                            aatcgaccaattgttgctaccatatgttttcctaatg-GGA-C----CTC-C---A-A-AA-ATTATAG-AGGTA-G-G--CAG-GA-TCA-GGGTGC-C-----A--GGAGGATCGTAA--------TTGAGCATC-CTCTGCTGACC----GATCT-CACACACCGC-CATCTGA-GCC-T-----TGTA-GTT-C---AA---A-CAA-A-GC-----------T---A--AACG-GG-GATTCT-ATCC------TCGTCA-AATCT-AGTACGAAA--AT--G-AA-GGCTAAACACAA-G-GGTT-ATT---GAAACAAGCAG--GT--C-AACA---T-------ATG-A--CT-T-T---A--GTG-ATAA-TTTG-T-ATCGC-AA--CA--A-tttgaaaattcttgtatt
gi|19                         :                                                                                                                                                                                           gcaaacataaaatgttatgtagattattatcgTCATA------AATCCCATAA-A---GA------AT--A--TAAAA--C-------TA-AGGCAAA-CAC-GAA-C----CCT-T---G--CAT-AT---AC-CGG-A-G-G--TGG-GA-TCA-GG-TTT-TTTTTAA-AAGAGGG-----A---------TAAGCACC-CCTTGTTGACC-----G--T-C-CAC-TCGC-AT--TAT-ACC-C-----T-CT-ATC-T---TG---A-TCA-G-G------------T---A--AACT-GA-G---TA-ATCT-G----T----A-GGTC-AAGAACGAAA--aat
gi|2                          :                                                                                            ttagatactgttggagacaatattggttgctcaccgaaagaatgaaaagtgaagataacgtaacagtgatccatcAAAT-GGCGAAG-TA----A-CAA----A--GT-A--T-A-AA----CGTAATCATA------G-TCCAAAAA-A---CA------AT--A--CAAAAA-TCGAGTTGTAAGGGCAAC-CAC-GGAAC----CTT-C---G-ACGA-A----AG-CGA-A-G-G--CAA-GG-TCA-GG-TGC-C-----AATGGAGAG-----A--------GTAAGCATC-CTCTGCTGACC----GG--T-CACAC-CCGC-CG--TGA-GCC-T-----G-TA-GTC-G---AA---A-CAA-ATG------------T---A--AACG-GG-G---TT-ACCC-G----TCGTCA-AATCTAAGTATGAAA--AT--G-CA-GTCTAAACAAAATG-GGTA-AAT---GAAACAAATCATGGT--C-AACA---T-------ATG-A--C--T-T---A--GTG-ATAC-TTTG-TA-TCGCAA---CA----GGT----C-ATTAT-------AGCGACC-G-TAGAATT-TGTGCG--AA-ATGATG---ACTTT--AA-CGAGAATTC-GGTT-TA-----AACCCTGCAA-CA-TA-CA-A--C--TTTTTGG---TT--AGT-AGTTGCCCT-CG--TT-------AAAAA--ATC--A--C-------A-TTACG-CAT--G-----CATG-------------C-CT-T-G-GTATC-GAATC-A-----C----CG--A-GAG-ACAT-TA-CACA-C-A-TAAT-GCAG--T-G-G-A--------TAGTGGTAACATTA-------------CTA-AC-AAAAA-A---A-G--G-AA--AAGTGAC---AAT------T-GGCAAG--------TCAAAGTCCCATCAACGT------TTATCA-T--ATATAT-------G-T-GTTTTGC--AGT-----CCTG--C--C-ATTAGAG-TC-AA-TATTA--TA-AAATATCC-A---A-T------------ATGAAGCACATTGGTCAGATTCTGTGGTGTC-T---TTA-TTTCAAGTTCGTCAGGATAATATCAAAATGGA-CATA-ATTGTGAAA-TTATGATTGTTAATGGAT---AA-ACATC-GTCTATATACCT----ATA-----AGTAAGG-TTG-AA---GGACACT-GCAAG---------------TTTT----TTGTTTTT------A--CCCG-AACAGTTT-TCCTGAA-ACA-AATTCTGCT--TTCAT-ATGGAATATATAAAA--ATAAGTC---TGCCAATA---AG-GGGGC-AAC-AT---TAGTACCCAT-AGGAA--AC-CA-AC--A---------GAATTGTTGGAGAAGACGGAT-GTCACTCCAAAAA-AGAC------TACAATAATATTAATCTA-TAAAGCAA----ACCC-A---------------AGCA---ATGCTC-T--TA--ATATCTTTCTTC--AGAGTA-CTTGTGTGGG--CAATCA----------------GAGTG----GGTTCT-------------GACAAAAATATGTATC-T--GTTT-----CCCAAA----TG-ACCAGAAACTTGGTA--TT---TTCGGG---TGCC-G-TTTT----TTGT---------TC-AAAAGCA-ATTA--------T--CAAT--TTCCT-GAAAAA-G---CCT-AGAT--TT-T--ATTTT--ATCCGT--GAGGAATTGTTG-----------TA-TAAAG--TGGTGGAGAAATTC-ATATG-TTTTG-ATGCAGTCAATT---------TTAGAA--AAATCTCGTGATTGAA----GTTTTC-TATAAAGCT----CTTTAGAG-------TTTT----TGAGA-ATCCACAATC--TGAA-TGAACACCACTTCTGGAATA-TGTAGTGGAAACAG--TATCTTGAAG---TGAC--CTTTAACA--GCTGTT-AG--TAG-------TTTTGTTAGT--A-G---------TAAGGGA----------T-AGA---------------GG-----C------TG---GTA-AGGCAC--TTACTGGAA---CCAGCGAATGTA--------TC--TTTGG-TTTGTAAGGA-TTTC---TTA-TGCATATTT---T-TGGAA-----TCCAGT-A--------AAGGT-ATGGTAA-TTCAAATTGAT-CCTGAT-TCTTCGGAAATAT-TAA---ACGTATTC-CAAACAGAAAGGTGATTTTGA--GA-TT-TCATC-TTAGT-CAGATTGCTAGGA-GTATA-AAGTCAGGAAAATTCCCAGATGTG---TGA--AGTA-AACCC-TAAGTT-CAATTTAAAAAG-ACAAGTATAATA----GT-GA-CTTT--ATACAAAC--A-----AAG----ACAAG-------TG-----TT---ACTGTGCTTTAT--ACAGCCTGGAACC---AGTAACAA-AGTTTTCATGTAGTCTA----TGTAA--CTCA-TTTACCCCCTTCTG---GCT-TC-----TTAA-GACAG-----AAGGGTAAATAGT-AG--ATTTTCCC---CGC-----TAAA----TGGTTATAACGGGATTTTAAATAATTTCCGAA-TACTTTTGATCA-TTCAGACAAAGTGTCAAGAT-CTCTCCCTtaaatgttgatgcatt
gi|20                         :                                                                                                                                                                                              A----A--AT-A--T-A-AATAGGCGAAGT--TA------A-TCCCAAAA-A---CAT-----AT--A--CAAAA--CCAAGT-GTA-GGGCAAC--AC-GGA-C----CTC-C---G-ACAA-A----AG-CGA-A-G-G--CAG-GA-TCA-GG-TGC-C-----A-TGGAAG------A--------GTAAGCATC-CTCTGCTGATC----GG--T-CACAC-CCGC-CG--TGA-GCC-C-----T-TA-GTC-G---AA---A-AAA-A-G------------CATGA--AACG-AA-A---TC-A-----------GTCT-AA-CTA--TAC-ATG--AC--T-TA-GT---GATAATATG-CGT--AATCTGGAAACAAGTCA--TTTGC-GAAA---TG------ATG-A--C--T-T---ca
gi|21                         :                                                                                                                                                                                             AA----A--GT-AATT-A--------GTAA-CATA------G-TGCCAAAA-A---CAT-----AT--ATACAAAA--ACGAGT-GCA-GGGCAA--GAC-GGA-C----CTT-C---G-ACAA-A----CG-Ctaaattgagtattcgttat
gi|21                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          ctattaC-C-----T-TC-GAC-A---AACGCA-CAA-A-A------------T---A--AACA-GG-G---TA-GCCC-G----TCGTAA-AATCTT-GTACAAAA--ATAAG--A-GTCTGA-CAAA--G-GGTA---C---GAAACAGATCA--GT--C-AACA---C-------ACG-A--C--T-T---C--GTG-ATAA-TTTG-TAGTCGCAAA--CA--A-GGT----C-ATTAT-------AGCGACA-G-TAGAATT-TG--CG--AA-AGGATG---Aacaaaataaacagggtagcccgtcgtaaaatcttgtacaaaaataagagtctgacaaagggtacgaaacagatcagtcaacacacgacttcgtgataatttgtagtcgcaaacaaggtcattatagcgacagtagaatttgcgaaaggatgat
gi|22                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              ctattaaaagtaattagtaacatagtgccaaaaacatatatacaaaaacgagtgcagggcaagacggaTATC-TAATC-A---A-C----TG--G-GAG-ATATGCA-TAC--C-A-TTT--GCAA--G-G-G-A--------TAGTGGTA-TATTA-------------CTA--C-AAAGACA---G-G--G-AA--AGCTGAT---GAT------T-GCATTT--------TTAAAGTC--ACCAA-GC------TTATCA-T--ATA-AT-------G-TAGCTGT-A--AGT-----C-TG--C--C-ATTAGAG-CC-AA-TATTAAGTA-AAATATCC-A---ACT------------AAGAAGCAGATTTGTCAAATTCTGTGGTCTCCT---TTA-TTTTGAGTTCGTCGGGt
gi|23                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        A-A----CG-CAC-A-G-G--CAG-GA-TCA-GG-TGC-C-----A-TGGAGG------A--------GTAAGCATC-CTTTGCTGACC----GG--T-CACAT-CCGC-CG--TGA-GCC-G-----G-TA-TTC-G---AA---A-CAA-A-A------------T---A--AACA-GG-G---TA-ACCC-G----TCGTAA-AATCT-TGTACGAAA--ATAAG--A-GTCT-GACAAA--G-GGT---AT---GAAACAGATCA--GT--C-AACA---C-------ACG-A--C--T-T---C--GTG-ATAA-TTTG-TAGTCGCAAA--CA--A-GGT----C-ATTAT-------AGCGA
gi|24                         :                                                                                                                                                                       AAA--GGCAAAGATA----A-CGA----ACAGTGA--T-C-AATCT-CGTAA-----------G-TCCTAAAT-A---GA------AT--A--CAAAA--ACAAGA-GTT-GGGCAAT-CAC-GGA-C----CCC-T---GGACAC-A----C--CAG-A-G-G--TGG-GA-TCA-GG-TAC-C-------TAGGAGG-----A--------GTAAGCATC-CCCTGTTGA
gi|25                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    cactgtgataaatggtagtattaatgtTGTG---TGATAAGTATAACCC-T-AGTT-C-ATTTATAAAG-ACAAGTATAATATTTTCT-GG-CCCC--TAACAAAA--AAATTCAAG----ACAAATTGACTTTGTAACATCTTAACTCTGTTTCA---ACTGTC-----CTGTAA-TAGCAATAGTTCTCTCG-------------TAAGGCTCATTTTAC-CACTTCTG---a
gi|26                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 AATT-TG--CG--AA-ATGATA---A------GA-C-AGGATT-------------TAAGGCGACAA-CA-A--TA-A--AAATTTTTAGAATTT--AGTCAGT-GGCCT-CGACCTGATAAGAAAAAA--ATA--T--CAAAAAATA-T-ACG-CAC--GTGGTATATGAC-----------C-CTCT-GCGCGAC-GAATC-A---ATC----TG--ATGAG-ACGA-TA-CA
gi|27                         :                                                                                                                                                                                                        -A--C-A-AC----CGT--TCATA------A-TCCAAAAA-AATGTAT-----AT--A--CAAAAA-TCGAGT-CGA-GAGCAGCGCACTGGA-CACATCTT-CTGTA-ATAA-A----AGCCGA-ATG-GTTTAGTGA-T---AG-TTT-T-----A-TTGAGAG-----AAGAAAATGGTAAG------TCCACTAACC----AG--T-CA
gi|28                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            ggcgactgtaTGTCAGTGTCTGTGGTGTCCTGAATTA-TATTAAGTTCTTCGCGATA-TATCAAA-TGGA-TATA-ACTGTGAAAATTATGATTGTTAATTGAT---AGCACATC-ACC
gi|28                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            CACC-GCAAG---------------TTTT-----TGTTTTT------AT-TCCGTAACAGGTT-TT---GA-ACA-AATTgcaagtttttgtttttattccgtaacaggttttgaacaaatt
gi|29                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      tgtcagtgtctgtggtgtcctgaattatattaagttcttcgcgatatatcaaatggatataactgtgaaaattatgattgttaattgatagcacat--CTCA-TT---ACACTTCTG---GCT-TT-----TTAAAGACA-------AGGATAAATAGTACGCCATTTTCCT---CGCGCGCTTAAAGTTTTAATTAC----GGATTTT-AATTACTTCCGAATTAATTTTGATCATTTCAGACAAAGTATTCAACTCCTCTCCC
gi|3                          :                                                                                                                                                                       AAAT-GGCGAAG-TACA--A-CAA----T--GT-G--TTA-AA----CGTAA-AATA------G-TCCCAAAA-A---CATGT---AT--A--CAAAA--TTGAGT-GTA-GGTCAAC--AC-GGA-C----CTC-C---G-ACAA-A----AG-TGA-A-G-G---AG-GA-TCA-GG-TGC-C-----A-TGG-GTG-----A--------GTAAGCATC-CTCTGCTGACG----CG--C-CACAC-CCGT-CG--TGA-GCC-C-----T-TA-GTC-G---AA---A-CAACA-G------------T---A--AACG-GG-A---TT-ACC--G----TCGTGA-AATCTA-GTACGAAA--AT--G--A---CTGA-CAAA--G-GATA---T---GAAACAAATCA--GT--C-AACA---T-------ATG-A--C--C-T---G--GTG-ATAA-TTTG-TAATCGCAAA--GA--A-GGT----C-ATTAT-------AGCGACC-G-TATAATT-TG--CG--AA-ATGAT----ACTTT--AAATGAGA-TTC-G-TTATACCGTTAACCCTGCAA-CA-T--CA-------TTTTTGG---TT--ACT-AGTTGGCCT-AGCTTT-------AAAAAT-CCC--T--C-------A-T-ACA-CAT--ATGC--CATGTGTTGGATATAGCC-CT-T-GCGTATC-GAATC-A---A-C----TG--A-GAG-ACAT--A-CACA-CCA-TAA--GCAG--G-T-G-A--------TATTGGTA-CATTA-------------CTA--C-ATAGA-A---AAG--G-AA--TGTTGAC---GATA-----T-GCAAAG--------TCAAAGTC--ATCA-CGT------TTATTA-T--ATA-AT-------G-TA--TGT-C--AGT-----C-TG--CATC-ATTAGAG-TC-AAATATTAAGTA-AAATAGCC-A---AAT------------ATAAAGCAGATATGTCAGATTCTGTGGTGTCCT---TTA-TTTCGAGTTCGCCA----AATATATAAATGGA-CATA-ATTGTG-AAATT-TTATTGTTAATTGATA--AG-ACATC-GTTTATATACCC----ATA-----TGTAAGG-TTG-AA---GGACACG-GT------------------TTTT----TTGTTTTT------AT-CCTGTAACGTTTT-TTTT--A-ACACAATTCTAC---TTCAT-AT-GA--ATATAAAA--ATAAGTC---TGCCAATA---AG-AGGAC-ACA-AT---TAGTGTCCTT-AGGAAT-AC-CA-AC--A---------T-ATTGTTGGA--AGAC--ATGGTTTCT-----AA-AGAC------TACATAAATATT-GTCCA-T-AAGAAA----ACCC-A---------------AGC----ATGCTC-T--TA--ATATC-TACTTC--AGAGTA-CTTGTGTGGG--CAATCA----------------GAGT-----GGTTCT-------------GAC-AAAACATGT
gi|30                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             ctattaaacctgacacaatacatctgctagtcatctgggactgatgtttatatatcACATTG-------------TTA-ACTACATA-A---A-A--G-AA--A--T--------T------T-GCAAAA--------CTCAAGTC--ATCA-CGT------TTATCA-T--ATA-AT-------GTTAGTTGT-CCAAGTC----C-TG-----C-ATTAGAGATT-AA-TATTAAAGG-AAGTGTTC-ATGGAAT------------A
gi|31                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     T-CA-CAC--C-A-TAA--GTAG--G-T-G-G--------TAGTGGT-ATATTA--------------TC-AC-ATTGA-A---A-G-----------------------------GCAAAG--------TTAAAGTC--ATC-TTGC------TTATCA-T--ATA-AT-------G-CAGTTGT-C--AGT-----G-TG--T--C-ATTAG
gi|32                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              cttatCAT-T--CAC--C-A-TAA--GCAG--G-TGG-A--------TGGTGGT-ATATTA-------------CT--AC-ATAGA-A---AGG--G-AA--AGTTGAC---GATAGCCGATAGCAAAG--------TTAAGGTC--ATC-ACGC------TTATC
gi|34                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 tatcctCAATA---AG-GGGGC-ACA-AT---TAGTGCCCGT-TGGAAT-AT-CA-AC------------GGATTGTTAG--TAGAC--ATGG--TCTCC---AA-AGAC------TACACAAATATT-ATTTA-T-AAG
gi|35                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           GA-GCC-T-----T-TA-GTC-G---AA---AACAG-G-GAGGGGGGGCGGTT---ACGAGCG-GA-G---TT-ACCCTG----TCGTCAGAATCT-AGTACGGAA--A---G--A-G--TGGACAAA--G-GGTA-ctaa
gi|36                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      A-GG-T-C-C-----G-TGAATGA-----A--------GTAAGCATCTCGTTGCTGATCCGAGGA--T-CACAC-CCAC-CG--TGA-GCA-A-----T-CA-AGA-G---AA---A-CAG-A-tg
gi|37                         :                                                                                                                                                                                                                             gatggatggtcgCCCAACATA---CATGTATAAT--A--CAGAG--TCGA-T-GTA-GA-CAAC--AC-AGA-C----CTAGT---A-ACAA-A----AGGCGA-G-G-G--CAG-GA-TCA-GG-TGC-C-----A-TG
gi|38                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      cc--ATTTTCCC---CGC-----TAAA----TGG----------ATTTT-AATCATTTCCGAA-TATTTGTATCCA-TTCAGACAAAGTGTCAAGCTCCTCTCCCT
gi|39                         :                                                                                                                                                                     gcAAAT-GGCGAAG-TATTTTA-CAA----T--GT-G--T-TTAA----CATAATCATA------G-TCCAAAAA-A---CAT-----GT--A--CAAAA--TCGAG
gi|4                          :                                                                                                                                                              tttgttataAAATTGGCGAAG-TA----AACAA----T--GT-G--TTA-AA----CGTAATCGTACATGTAG-TCCCTAAA-A---CAT-----AT--A--TACAACTTCGAGT-GTA-TGGCAAC--AT-GGA-C----CTC-C---G-ACAACA----GG-CGA-A-G-C--CAG-GA-TCA-G--TGC-C-----A-TGGAGGG-----A--------GTAGGCATC-CTCTGCTGACC----GG--T-CAC-C-CCACACG--TGA-GCCTC-----G-TA-GTC-G---AG---A-CAA---G------------T---A--AACA-GG-G---TT-TACC-G----TC---------TAC-TACGAAATGAG--A-CA-GTCTAA-CAA---G-GGTA---T---GAAACAAATCA--GT--C-AGCA---T-------ATG-A--C--T-T---A--GTG-ATAA-TTTGGTAATCGCAA---CA--A-GGT----C-AT-AT-------AGCGACC-G-TAGAATCCTG--CG--AA-ATGCTGCGGACTTTGAAA-CGAGAACTC-G-TT--A----TAACCCTGCAAACA-T--CA-TTTC--TTTTT-----TT---GT-AATTGAC-T-CGCTTT-------AAAG----TC--CTGC-------G-T-CCG-CAT--GA----TATA-------------C-CT-TTGCGTATC-GAATC-A---A-C----TG--A-GAG-ACAT--A-CACA-CCA-TAA--GCAG--G-T-G-A--------TAGTGG-AACATTA-------------CTA--C-AAAGA-A---A-G--GGAA--AGTTGAC---GAT------T-GCAAAG--------TCA--------TCA-CGT------TTATCA-T--ATA-AT-------G-TAGTTGT-C--AGT-----C-TG--C--C-ATTAGAA-TC-AA-TTTTAAGTA-AAATATCC-A---AAT------------ATGAAGCACATCTGTCAGATTCTGTGGTGTTCT---TTA-TTTGGAGTTCGTCAGGAT-ATATC-AAATGGA-CATA-ATTATGAAAATTATGATTGTTAATAGATC--AG-ACATC-ACCTATATATCTAC--ATA-----TGTA
gi|41                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           actatcttatccgaatgacatcaaagattacttgaacgattgtctgtactgcaatat---AG-ACATC-ATCTATATATCT----ATA-----TGTAATG-ATG-AA---GGACACA-GTAAG---------------TTTT----TTGTTT
gi|42                         :                                                                                                                                                                       AAAT-GGCGAAG-TA----A-CAA----A--GT-A--T-G-AAC---CGTAATCATA------
gi|44                         :                                                                                                                                                                       AAAT-GGCGAAG-TA----G-CAA----A--GT-AT-T-C-AA----CATAATCATA------A-Tcgtacacagataaaccata
gi|46                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         cgcacatttataTTTTGG---TT--AGT-AGATGGCCT-CGCTTT-------AACAA--ATC--
gi|47                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   A-A---G-G--G-GA--AATTGAC---AAT------T-GCAAAG--------TCAAAGTC--AT
gi|49                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      -A---AAT------------ATGAAGCACATCTGTCTGATTCTGTG
gi|5                          :                                                                                                                                                                       AAATTGGTGAAG-TA----AACAA----T--GT-G--T-T-AAT---CGTAATCATA------G-TCCTAAAA-A---CAT-----ATTTA--CAAAG--TCGAGT-GTA-GGGCAAC--AC-GGA-T----CTC-C---G-ACAA-A----AG-CGA-A-G-G--CAG-GA-TCA-GG-TGC-C-----A-TAGAGG------A--------GTAAGCATC-CTCTGCTGACC----GG--T-CACAC-CCGC-CA--TGA-GCC-C-----T-TA-GTC-G---AA---A-CAA-G-G------------T---A--AACA-GG-A---TT-ACCC-G----TTGTCA-CATCT-AGTACGAAA--AT--GACA-GTCT-AACAAAA---GGT---AT---GGGACAAATCA--GT--C-AGCA---T-------------------------------TAA-TTTA-TAATCGCAAA--CA--A-GGT----C-ATTAT-------ACCGACT-G-TAGAATT-TG--CG--AC-ATGGTG---ACTTTA-AA-CGAGAA-TC-G--T-TA----TAATCCTGCAA-CA-T--CA-A--C--TTTTTAG---TT--AGT-AGTTGGCCT-CGCTTT-------AAAAA--GTCT-T--C-------A-T-ACG-CAT--GA----CATGT------------T-CT-T-GCGTATC-TAATC-A---A-CTGCATG--G-AAA-ACAT-T--CACACC-A-TAA--GCAG--G-T-G-ATACATTTGTAGTGGT-ACATTA-------------CTA-
gi|6                          : tatactctatatgataatatatgtcttctgaaaccgcttttacatgtttctgtgttggcgacatcggtattttgggctttttcaaaagtttggcttatatttaaaaagttttcttttcatgaatgcatttttttctgtatttttttttattgtatgtagtaaaagatatT-GGCCAAA-TA----AACAA----T--TTGA--T-A-AT----TGTAATCAAA------A-CCCCAAAA-----CAT-----AC--A--CAAAG--TCGAAT-GTA-AGGAAAC--AC-AGA-C----CTC-C---G-ATAA-T----AG-CGA-A-G-G--AAT-AG-TCA-GT-CG-----------------------------------GCATC-CTCTGCTGACC----GG--T-CACAT-CCGC-CG--TGA-GCC-C-----T-TG-GTC-G---AA---A-CAA-A-G------------T---A--AACG-GG-A---TT-ACCC-G----TCGTCA-AATCTA-GTAGGAAA--AT--GACA-GTCTAA-CAAA--G-GGTA---T---GAAACAAATCA--GT--C-AACA---T-------ATG-A--C--T-T---A--ATG-ACAA-CTTG-TAATCGCATA--CA--A-GGT----C-ATT---------------------------TG--CG--AA-ATGGTG---ACT-----------------------G----TAGCCCTGCAA-CA-T--CA-------TTTTTTG---CT--AGT-AGTTGACCT-CGCTTT-------AAAAA--GTCC-T--C-------G-T-ACG-CAT--GA----CATG-------------CTCT-T-GCGTATC-GAATC-A---A-C----TG--G-AAG-ACAC--A-CACA-C-AATAA--GCAG--G-T-G-A--------TAAGGGTA-CATTA-------------CTA--C-ATGAA-A---A-G--G-AA--AGGTGAC---GAT------T-GCAAAG--------TTAAAGTC--ATCA-CGC------TTATCA-T--ATA-AT-------G-CAGTTAT-C--AGC-----C-TA--C--C-TTTAAAG-TC-AA-TATTAAGTA-AAAAATCC-A---AAT------------ATGAAGCAGATATGTCAGATTCTGTGGTGTCCT---TTA-ca
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                atagatTGTCAGATT--GTGTTGTC-T---TTA-TAT-GAGTTT-TCGGGATA-T-TCCAAAT------TA-AT----------GCCCTTGTTA-TTGAT---AGCAGAT--ATCTATAT-CCT----ATA-----TATAAGG-TTG-A-----GACAAA-GCAGGGAGTTTTTTTTTTTTTTTT----TTGTTTTT------AT-CCCGTAA-AGTTT-TTGT--A-GCA-AATTCTGC---TTCAT-ATGTA--ATAT-TCA--GTAAGTCTGGTGCCAATA---AA-GGGG---CA-AT---TAGTGCCACT-AGGAATGACGCA-ACGGA---------GAATTGTTTGA-TCGAC--CT-GTCTCTCC----A-CGAC------TACATAAATAAT-TTCTG-T-AAGAAACTCTACTC-ATCATGATGTCATGTTATCAT--TTGTTC-TAATAATATATCCTACTTCAGAGAGTA-CT--TGTGGG--C-ATCA----------------GAGT-----GTTTTT-------------TAAACAAATATGTGTCTT--GTTTTTCCGCCCCAATCCCCGAACTAGAAA--TATTA--TT---TTCGGG---GGTC-ATTTTT----TTGT---------TT---AACCACATT---------T--CGATAAT--CT-GAAAAG------CT-AGAT--TTAT--ATTTTTAAT--GTGAatactggcgtcaaagctcaaaattcttggagcgggaataataaaatatatt
gi|8                          :                                                                                                                                taagatataaaacggtcagctactaaggattgtgtggtgAAAT-GGCGAAG-TA----A-CAA----A--GT-A--TGA-AA----CGTAATCATA------G-TCCAAAAA-A---CAC-----AT--A--CAAAA--TCGAGT-GTA-GGGCAAC--AC-GGA-C----CTT-C---G-ACGA-A----AG-CGA-A-G-G--CAG-GA-GCA-GG-TGC-C-----A-TGGAGG------A--------GTAAGCATC-CTCTGCTGACC----GG--T-CACAC-CCGC-CG--TGA-GCC-T-----G-TA-GTC-G---AA---A-CAA-A-G------------T---A--AACG-GG-G---TT-ACCC-G----TCGTCA-AATCTA-GTATGAAA--AT--GACA-GTCTAA-CAAA-TG-G-TA---T---GAAACAAATCA--GT--C-AACA---T-------ATG-A--C--T-T---A--GTG-ATAC-TTTG-TAATCGCAAA--CA--A-GGT----C-ATTAT-------AGCGACC-G-TAGAATT-TG--CG--AA-ATGATG---ACTTTA-AA-CGAG-ATTC-G--T-TA----TAACCCTGCAA-CA-T--CA-A--C--TTTTTGG---TT--AGT-AGTTGGCCT-CGCTTT-------AAAAA--ATCA-T--C-------A-T-ACG-CATG-G-----CATGC------------C-CT-T-GCGTATC-GAATC-A---A-C----TG--A-GAG-ACA--TA-CACACC-A-TAA--GCAG--G-T-G-A--------TAGTGGT-ACATTA-------------CTACAC-AAA-A-A---A-G--G-AA--AGTTGAC---AAT------T-GCAAAG--------TCAAAGTC--ATC-ACGT------TTA
gi|9                          :                                                                                                                                                                                                                                 ggcatataCCCCAAC-A---CAT------T--A--CAAAT--TCGC-T-GTA-AG-CAAC-CG--GGA-C----CTC-C---G-ACAA-A----AG-----A-G-G--TAG-GA-TCA--G-TGCAC-----A-TGGGAGG-----A--------GTAAGTTTC-CTCTCCCGAC------G--T-CACAC-CCGCGCA--TGACACC-CCCAAAT-TA-GAT-GACCAA---A-C-A-A-G------------T---A--AACG-GG-GA--TTAACCC-GGGTTTCA--A-AAT---AGTACGAAATGAC--A-CA--TCT-AACAAA--G-GGT---AT---GAAACAAATCA--GT--CAAACA---T-------ATG-A--C--T-TGCGG--ATG-ATAA-TTTG-TAATCGGGAA--CAACA-GGT----C-ATTATTTCGATAAGC-ACC-GCTAGAATT-GC--CG--A-----------------------AGAATTC-G--T-TA----TTAACCTACAA-CA-TA-CA-A--C--TTTTTTG---TT--AGT-AGTTTGGCT-CCCTTT-------AAAAGCCCTC--C--C-------A-C-ACG-CACGAG-----TATG-------------C-TC-T-GCGTATC-GAATCAA---A-C----CG--A-GAG-ACAT-
5 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|33 ): GTTTTTGCGTTGGTGACATCAGAATTTTGGATTTTTTCAAAACTTTGGCAGTGACTGGCTTATCATATTTAAAAAGTTTTCTTTTCATGAATGCATTT
Unaligned ( gi|40 ): TTAAAAGTGAAGATAACAAACAGTGATCTATGTCATAATTCCTATAAAAAATTGAAATCTAA
Unaligned ( gi|43 ): GATCTGAGGTCCAGGGGTGATGAATATAGCATACTTCCATGTTGATTGATT
Unaligned ( gi|45 ): TATTAAGTGATGCCATACATAGAGGATCTTGAATGAGT
Unaligned ( gi|48 ): TAGTCGATACTAAAATTCATGCTCATTTGAT






Alignments
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                      111111   1111111  22222222222222                                 111111                                22                                                                              111111111111111                                                                                       111111111111                                            22           3333333333333333333333333333333333                           1111111                                                                                                                   11              1111111111                11  1111111                                  1111111          2222222222222           444444444444444444444444444                          1111              1111   11 1                    11111111       11     111111111111111111                                    111111        11111111             22   111111                111111111              1111111                                                 222222222222                                                                                                          222  1                  2222   11111             1111      11     444444444444444    1111        222222                   2222              222     1     11        11       111        111               111                11        444444444444          111    11  1 1      1111      222222                           11111     555555555555555   22222       11  11            111                11      5555555555555555555555555      44444444444444                 11    222222     2222  1               11  111      111    111    2222    4444444444444      1   444444444444444444444  1      33333   1    11  2222     11  222222            66666666666666     2222         1  22    2     1            333333333      11                2222     11         2222        222222     2222     1  111     11    1  1      1          1        1           1     111    22        11      444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444  111   1      11         111     11     44444444  11   1 1          1   1111   1   333333333333333333333      4444444444     1       1           1      1             1   111       111                        1  1     1     1             1   111    22222               111   11                                         2222222         11        444444444444444444444444444444444   111          4444444444444444444444    111         55555555555555   11                   111   22222222  111    222222             22222        111   22222    2222      33333       1             1            1                             
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                           6       6  333333   4444444  55555555555555     3    777777 2        2 444  444444  33 33     88      2   2  1    11  2   2 5555   2 444 4    2 6666  4   2 2 2 555  2  2   2  2   2 8888888      333333333333333         2           5555  33 2     2    5  33   2   6666666 2  2   2 666  333 2   222 333333333333 333 33    2  2 666  2    2 5555    1 2     11        66 6666666666666666666666666666666666           33  33 2    444 0000000   4 33 55 2 444444   2    2    2  0       33  33 2   5555 2     9999999       3 6       2  33  33  2      777 3 0 88  3    33   3 7777777777   0       3  3 11  8888888     1 555  44   3     0   3      4444444     77   5555555555555 3 3   3   999999999999999999999999999  3 3       3     3 555 3 7777  8888   3    4444   77 0 3   77    44 3 6 3 22222222       88     888888888888888888 7 222 6 555 6 44 3  44 33    555   222222 3      22222222        44   22   000000      4 66   4  777777777       8888   6666666  99999 4       5  5  5     0   5        4 777   222222222222        0  1                   2 888   5   5      4   11  99 3  7  3    6    6      3  3  1               111  1     5            3333   66666       8   8 4444      00     888888888888888    4444        333333 88    0        8  3333 8   8     3  999     0  6  33    44  33  3    777        444  8     8   8  444        1 8     66  8  8  333333333333 3        777    99  0 0    5 4444 8    333333     6   0  8     6 6      77777   8 000000000000000   33333  3  8 11  11     3 6    999     8  0       11 0    9999999999999999999999999      55555555555555  5           55 33    777777     1111  0        6   9  33  777      777    444    1111    2222222222222   1  0   555555555555555555555  0      00000   0    33  4444     33  111111       0    88888888888888     1111         3  00  3 6     3            777777777      88  1          1  4444     66         2222        888888     8888     3  555     88    3  3      3          3     3  3     7     0     777    99        33  3   777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777  777   0    3 33      2  777 2   22  6  66666666  33   0 0  3 3     0   7777   0 2 999999999999999999999 2    9999999999     0       0           0      0       3 66  0   777       999     2  3     1     3   0  0     0     0             0   777    44444 0   2         444   11    8  3  8 8  0 8 88         8        0 3333333 8888  1 11 1      111111111111111111111111111111111   777   1      8888888888888888888888  1 000         33333333333333   11 0  8  0  8 0    0 444   66666666  000    777777    0    7   88888        777   55555    1111   3  22222       3   1         3  1         3                    6        
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                           .       .  ......   .......  ..............     .    ...... .        . ...  ......  .. ..     ..      .   .  .    ..  .   . ....   . ... .    . ....  .   . . . ...  .  .   .  .   . .......      ...............         .           ....  .. .     .    .  ..   .   ....... .  .   . ...  ... .   ... ............ ... ..    .  . ...  .    . ....    . .     ..        .. ..................................           ..  .. .    ... .......   . .. .. . ......   .    .    .  .       ..  .. .   .... .     .......       . .       .  ..  ..  .      ... . . ..  .    ..   . ..........   .       .  . ..  .......     . ...  ..   .     .   .      .......     ..   ............. . .   .   ...........................  . .       .     . ... . ....  ....   .    ....   .. . .   ..    .. . . . ........       ..     .................. . ... . ... . .. .  .. ..    ...   ...... .      ........        ..   ..   ......      . ..   .  .........       ....   .......  ..... .       .  .  .     .   .        . ...   ............        .  .                   . ...   .   .      .   ..  .. .  .  .    .    .      .  .  .               ...  .     .            ....   .....       .   . ....      ..     ...............    ....        ...... ..    .        .  .... .   .     .  ...     .  .  ..    ..  ..  .    ...        ...  .     .   .  ...        . .     ..  .  .  ............ .        ...    ..  . .    . .... .    ......     .   .  .     . .      .....   . ...............   .....  .  . ..  ..     . .    ...     .  .       .. .    .........................      ..............  .           .. ..    ......     ....  .        .   .  ..  ...      ...    ...    ....    .............   .  .   .....................  .      .....   .    ..  ....     ..  ......       .    ..............     ....         .  ..  . .     .            .........      ..  .          .  ....     ..         ....        ......     ....     .  ...     ..    .  .      .          .     .  .     .     .     ...    ..        ..  .   ..........................................................................................  ...   .    . ..      .  ... .   ..  .  ........  ..   . .  . .     .   ....   . . ..................... .    ..........     .       .           .      .       . ..  .   ...       ...     .  .     .     .   .  .     .     .             .   ...    ..... .   .         ...   ..    .  .  . .  . . ..         .        . ....... ....  . .. .      .................................   ...   .      ......................  . ...         ..............   .. .  .  .  . .    . ...   ........  ...    ......    .    .   .....        ...   .....    ....   .  .....       .   .         .  .         .                    .        
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                           7       7  999999   2222222  55555555555555     2    222222 7        5 444  888888  44 44     44      7   7  7    00  5   4 0000   4 111 7    2 9999  4   4 4 4 333  4  4   1  1   1 2222222      000000000000000         2           0000  22 4     5    0  22   2   0000000 1  1   1 666  777 1   555 666666666666 999 11    4  4 555  4    4 0000    8 4     88        55 6666666666666666666666666666666666           22  22 4    111 0000000   7 22 66 4 999999   5    5    5  8       44  44 5   7777 7     3333333       1 2       9  99  99  9      999 3 3 88  1    88   1 5555555555   8       3  3 22  8888888     0 888  66   3     2   3      2222222     99   9999999999999 6 6   6   777777777777777777777777777  6 6       3     3 888 3 5555  5555   3    9999   33 0 3   99    66 3 7 3 11111111       66     000000000000000000 3 777 7 888 7 66 3  66 33    888   999999 3      11111111        66   44   555555      4 11   4  888888888       9999   3333333  66666 4       0  0  0     4   0        4 888   888888888888        7  7                   5 888   0   3      3   44  00 5  5  5    7    7      2  2  7               444  4     7            3333   77777       0   0 8888      33     333333333333333    2222        000000 88    8        0  0000 0   0     2  222     0  5  88    55  88  2    555        000  0     0   0  000        0 0     88  0  0  888888888888 8        666    00  0 6    0 8888 0    000000     0   8  0     7 7      88888   0 000000000000000   44444  2  0 00  00     8 0    444     0  8       00 8    8888888888888888888888888      00000000000000  6           88 88    555555     2222  0        5   2  88  555      555    000    2222    8888888888888   0  0   888888888888888888888  0      00000   0    88  8888     88  555555       7    33333333333333     0000         3  77  7 7     3            000000000      00  0          0  0000     00         5555        777777     3333     3  333     33    3  3      3          3     7  3     3     8     555    22        88  2   222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222  555   0    2 88      5  555 5   55  5  22222222  88   0 0  2 2     0   8888   0 5 555555555555555555555 5    5555555555     0       0           0      0       2 55  0   555       555     5  2     0     2   0  0     0     0             0   222    55555 2   5         000   00    0  2  0 0  8 0 88         0        8 6666666 2222  4 00 4      000000000000000000000000000000000   555   0      0000000000000000000000  2 222         88888888888888   00 8  0  8  8 6    8 000   22222222  222    555555    8    3   88888        555   00000    2222   2  00000       3   0         3  0         3                    7        
consensus                     :                                                                                                                                                                       AAAT-GGCGAAG-TA----A-CAA----A--GT-A--T-A-AA----CGTAATCATA------G-TCCCAAAA-A---CAT-----AT--A--CAAAA--TCGAGT-GTA-GGGCAAC-CAC-GGA-C----CTC-C---G-ACAA-A----AG-CGA-A-G-G--CAG-GA-TCA-GG-TGC-C-----A-TGGAGGG-----A--------GTAAGCATC-CTCTGCTGACC----GG--T-CACAC-CCGC-CG--TGA-GCC-C-----T-TA-GTC-G---AA---A-CAA-A-G------------T---A--AACG-GG-G---TT-ACCC-G----TCGTCA-AATCTAAGTACGAAA--AC--G-CA-GTCTAAACAAAATG-GGTA-AAT---GAAACAAATCA--GT--C-AACA---T-------ATG-A--C--T-T---A--GTG-ATAA-TTTG-TAATCGCAAA--CA--A-GGT----C-ATTAT-------AGCGACC-G-TAGAATT-TG--CG--AA-ATGATG---ACTTT--AA-CGAGAATTC-G-TT-TA----TAACCCTGCAA-CA-T--CA-A--C--TTTTTGG---TT--AGT-AGTTGGCCT-CGCTTT-------AAAAA--ATC--T--C-------A-T-ACG-CAT--G-----CATG-------------C-CT-T-GCGTATC-GAATC-A---A-C----TG--A-GAG-ACAT-TA-CACA-C-A-TAA--GCAG--G-T-G-A--------TAGTGGTAACATTA-------------CTA-AC-ANAGA-A---A-G--G-AA--AGTTGAC---GAT------T-GCAAAG--------TCAAAGTC--ATCAACGC------TTATCA-T--ATA-AT-------G-TAGTTGT-C--AGT-----C-TG--C--C-ATTAGAG-TC-AA-TATTAAGTA-AAATATCC-A---AAT------------ATGAAGCAGATCTGTCAGATTCTGTGGTGTCCT---TTA-TTTCGAGTTCGTCGGGATAATATCAAAATGGA-CATA-ATTGTGAAAATTATGATTGTTAATTGAT---AG-ACATC-ATCTATATACCT----ATA-----TGTAAGG-TTG-AA---GGACACG-GCAAG---------------TTTT----TTGTTTTT------AT-CCCGTAACAGTTT-TTTTGAA-ACA-AATTCTGCT--TTCAT-ATGGA--ATATAAAA--ATAAGTC---TGCCAATA---AG-GGGGC-ACA-AT---TAGTGCCCNT-AGGAAT-AC-CA-AC--A---------GAATTGTTGGA-NAGAC--ATGGTCTCTCC---AA-AGAC------TACATAAATATT-ATCTA-T-AAGAAA----ACCC-A---------------AGCAT--ATGCTC-T--TA--ATATCTTACTTCA-AGAGTA-CTTGTGTGGG--CAATCA----------------GAGTG----GGTTCT-------------NACAAAAATATGTGTCTT--GTTT-----CCCCAA----CG-ACCAGAAACTTGTTA--TT---TTCGGG---TGCC-G-TTTT----TTGT---------TT-AAAANCA-ATTA--------T--CAAT--T--CT-GAAAAA-G---CCT-AGAT--TT-T--ATTTT--AT-CGTGAGAGGAATCGTTG-----------TAGTAAAG--TGGTGGAGAAA-TC-ATACG-TTTTG-ATGCAGTCAATTGTCTCAGCATTGGAAACAANTCTCGTGATTNAAAGTTGTTTTNGTATAAAGCTGGGCCTTTAGAGGGGGCGTTTTT----TGAGA-ATCC-CAATC--TGAA-TG-ACACCA-TTCTGGAATA-TGTAGCGG-AACAGTATATCNTGAAG---TGACT-TTTTAACA--GCTGTTCAG--TAG-------TTT--TTAGT--A-GAC-------TAAGGGA----------T-AGAG--------------GG-----C------TG---GTA-GAGCAC--TTACTGGAA---CCAGCG-ATGTA--------TC--TTT-G-TTTGTAAGGA-TTTC---TTA-TGCG---TT---T-CGGAA-----TCCAGT-A--------AAGGT-ATGGTAA-TTCAAATTGAT-CCTGAT-TCTTCGGAAATAT-TGA---AAGTATTT-CAAACAGAAAGGTGANTTTGAAGAA-TT-TCATC-TTAGT-CAGATTGCTTGGA-GTATA-AAGT----AAGATTCCCAGATGTG---TGA--AGTA-AACCC-T-AGTT-C-ATTTAAAAAG-ACAAGTATAATA----GT-GA-CTCT--TTACAAAC--A-----AAG----ACAAA-------TGTGA-ATC---ACTNTGCTTTAT--GCTGTCT--AACT---A-TAACAA-AGTTTTCACG-----TG----TNTAA--CTCA-TTTACNCACTTCTG---GCT-TC-----TTAA-GACAG-----AAGGATAAATAGT-CG--ATTTTCCC---CGC-----TAAA----TGGTTAC----GGATTTT-AATNATTTCCGAA-TANTTTTGATCA-TTCAGACAAAGTGTCAAGCTCCTCTCCCT
Reference ( family-568 )      :                                                                                                                                                                       AAAT-GGCGAAG-TA----A-CAA----A--GT-A--T-A-AA----CGTAATCATA------G-TCCCAAAA-A---CAT-----AT--A--CAAAA--TCGAGT-GTA-GGGCAAC-CAC-GGA-C----CTC-C---G-ACAA-A----AG-CGA-A-G-G--CAG-GA-TCA-GG-TGC-C-----A-TGGAGGG-----A--------GTAAGCATC-CTCTGCTGACC----GG--T-CACAC-CCGC-CG--TGA-GCC-C-----T-TA-GTC-G---AA---A-CAA-A-G------------T---A--AACG-GG-G---TT-ACCC-G----TCGTCA-AATCTAAGTACGAAA--AC--G-CA-GTCTAAACAAAATG-GGTA-AAT---GAAACAAATCA--GT--C-AACA---T-------ATG-A--C--T-T---A--GTG-ATAA-TTTG-TAATCGCAAA--CA--A-GGT----C-ATTAT-------AGCGACC-G-TAGAATT-TG--CG--AA-ATGATG---ACTTT--AA-CGAGAATTC-G-TT-TA----TAACCCTGCAA-CA-T--CA-A--C--TTTTTGG---TT--AGT-AGTTGGCCT-CGCTTT-------AAAAA--ATC--T--C-------A-T-ACG-CAT--G-----CATG-------------C-CT-T-GCGTATC-GAATC-A---A-C----TG--A-GAG-ACAT-TA-CACA-C-A-TAA--GCAG--G-T-G-A--------TAGTGGTAACATTA-------------CTA-AC-ANAGA-A---A-G--G-AA--AGTTGAC---GAT------T-GCAAAG--------TCAAAGTC--ATCAACGC------TTATCA-T--ATA-AT-------G-TAGTTGT-C--AGT-----C-TG--C--C-ATTAGAG-TC-AA-TATTAAGTA-AAATATCC-A---AAT------------ATGAAGCAGATCTGTCAGATTCTGTGGTGTCCT---TTA-TTTCGAGTTCGTCGGGATAATATCAAAATGGA-CATA-ATTGTGAAAATTATGATTGTTAATTGAT---AG-ACATC-ATCTATATACCT----ATA-----TGTAAGG-TTG-AA---GGACACG-GCAAG---------------TTTT----TTGTTTTT------AT-CCCGTAACAGTTT-TTTTGAA-ACA-AATTCTGCT--TTCAT-ATGGA--ATATAAAA--ATAAGTC---TGCCAATA---AG-GGGGC-ACA-AT---TAGTGCCCNT-AGGAAT-AC-CA-AC--A---------GAATTGTTGGA-NAGAC--ATGGTCTCTCC---AA-AGAC------TACATAAATATT-ATCTA-T-AAGAAA----ACCC-A---------------AGCAT--ATGCTC-T--TA--ATATCTTACTTCA-AGAGTA-CTTGTGTGGG--CAATCA----------------GAGTG----GGTTCT-------------NACAAAAATATGTGTCTT--GTTT-----CCCCAA----CG-ACCAGAAACTTGTTA--TT---TTCGGG---TGCC-G-TTTT----TTGT---------TT-AAAANCA-ATTA--------T--CAAT--T--CT-GAAAAA-G---CCT-AGAT--TT-T--ATTTT--AT-CGTGAGAGGAATCGTTG-----------TAGTAAAG--TGGTGGAGAAA-TC-ATACG-TTTTG-ATGCAGTCAATTGTCTCAGCATTGGAAACAANTCTCGTGATTNAAAGTTGTTTTNGTATAAAGCTGGGCCTTTAGAGGGGGCGTTTTT----TGAGA-ATCC-CAATC--TGAA-TG-ACACCA-TTCTGGAATA-TGTAGCGG-AACAGTATATCNTGAAG---TGACT-TTTTAACA--GCTGTTCAG--TAG-------TTT--TTAGT--A-GAC-------TAAGGGA----------T-AGAG--------------GG-----C------TG---GTA-GAGCAC--TTACTGGAA---CCAGCG-ATGTA--------TC--TTT-G-TTTGTAAGGA-TTTC---TTA-TGCG---TT---T-CGGAA-----TCCAGT-A--------AAGGT-ATGGTAA-TTCAAATTGAT-CCTGAT-TCTTCGGAAATAT-TGA---AAGTATTT-CAAACAGAAAGGTGANTTTGAAGAA-TT-TCATC-TTAGT-CAGATTGCTTGGA-GTATA-AAGT----AAGATTCCCAGATGTG---TGA--AGTA-AACCC-T-AGTT-C-ATTTAAAAAG-ACAAGTATAATA----GT-GA-CTCT--TTACAAAC--A-----AAG----ACAAA-------TGTGA-ATC---ACTNTGCTTTAT--GCTGTCT--AACT---A-TAACAA-AGTTTTCACG-----TG----TNTAA--CTCA-TTTACNCACTTCTG---GCT-TC-----TTAA-GACAG-----AAGGATAAATAGT-CG--ATTTTCCC---CGC-----TAAA----TGGTTAC----GGATTTT-AATNATTTCCGAA-TANTTTTGATCA-TTCAGACAAAGTGTCAAGCTCCTCTCCCT
gi|1                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    AAACAGGGTA-TGCA-AA-----AAACCAATCA--AT--C-AATA---TCATTTTTATGTAGTC--TCT---ATTGTG--TACCTTTG-TAATCGCAAA--CA--ACGGT----CCATTAT-------AGCGACC-G-TAGTATT-TG--CG--AA-ATGATG---A-TTT--AA-CGAGAATTC-G-TTATA----TCACCCTGCAA-CA-T--CAGA--C--TTTTTGG---T---AGT-AGTTG-CCT-CGCTTTT------AAAAA--ATCA-T--C-------A-T-ACGACAT--GG----CATG-------------CTCT-T-GCGTATCTGAATC-A---A-C----TG--A-GAG-ACAT--A-CACA-CCA-TGAACGCAGCGG-T-GGA--------TAGTGGTA-CATTATACATTCTTTGTTCTT-ACTATGAATA---A-GTTG-AACAAGTTGACTTGGAT------T-GCCAAGCCTATCCTTCAAA-TC--ATCAACGCCCCCCTTTATCCCT--ATA-ACTCGCACCGCTAGTTG--C--AGTGTCGCT-TGTTC--CGATTAATG-TCGAA-TATTTTGTGGAAATATTTTA---AATCACTTCATAACAACGAAGCAGATC-GTCAGATTCTGTGGTGTCCT---TTACTTTCGAGTTGTTCGG--TGATTTCAAATGGGACCATACATTATGAAAATCATGATTGTTAATTGATATAAA-ACATCAATCTATATACTTTCAAATATATTTTGTTAGGTTTGCAACTGAGACACGTGCAAGA--------------TTTTTTCGTTGTTTTTTAAAAAATCCCCGTAACAGCCTATTTTGAATCCA-AATTC-GCTAGTTGCTAATAGA--ATTTAGAATCAT-AGTC---TGCCAATATTTAGTGGGGCAACAGACTCATAGTGTCCATAAGGGATAAT-CACAC--ACTTACCTAGGAATGTTTGGA-GAGACA-ATGG-CTACAC---AATAGACACCAATTACAT-AGT-TT-ATCTATT-ATTAGA----ACCCAA---------------AGCATGAATA--A-T--TA--ATATCTT-CTTCA-AGAGCACCTTGTATGAGATTAATCAGTTATTGCATTTTGGGGGGTGTTTTGGTTCTTTTCATTCTTATAAACAAAAATATGCAT-TTAAATTT-----CCCCAA----CG-ACCAGAAACTTGTTACCTTAAGTTCAGGTTTTGCC-G-TTTTGGTGTTGTTCCAAACCCTT-GAAACCA-ATTAATCACTTTT--CAAT--T--CTCGAAAAA-GCGCCCT-GGATAATT-TTAATTTC--AT-TGTGAGAAGAATTGTTGTAATATTGGGTTAGTAGAGCTCGGGGCAGAAA-TCAATAAGATATTGAATGCAGTCAATTGTCTCAGCATTGAAAACAACTCTCGTGATTTAAAGTTGTTTTAGTATAAAGCTGGGCTTTTAGAAGGGGCATTTTCACCGTGAGA-AT-T-CAATCTTTGAATTG-ACACCA-TTCTGGAATA-TGTAGCGG-AATAGTATATCCTGATATTCTGACTCTTTTAACAGCGCTGTTCAAGCTAGTTTAAGCTTT--TTAGT--ATGACAATCTTTTAAGGTA----------TAAGAG--------------GGGTCACT------TG---GTATGATCACTATTTCTGGAACCGCCAGCG-AC-TACTAACTACTT--TTT-GTTTTGTAAGGA-TCTCACTTTATTGCA---TT---TCCGGAG-----T-CAGT----------AAGGT-ATGGGAATTTCAAGTTGGTCCCTCGT-CCTTCGG-AATAT-TGA---AAGTATTTACAAACAGAAAGTTGATTTTGAAGAATTT-TCATCTTTAGTAAAGGTTGCTTGTA-GTAAT-AAGT----AAGATTCTCCAACCTGTTCTGA--AGTA-AA-CC-T-AGTT-C--TTTAAAAGC-ACAAGTATAA-A----GTAAA-CTTT--TAACAAACGGA-----AAGCACCATAGC-------TGT-A-ATC---AGTGTACTTT-T--GCTCTCT---TCT---G-TTAC----GCCTCTAC------TG----TATAA--CTTA-TTTACCCCCTTCTGTTTGCT-TCTCTCGTT---GACAGAAATTAAGGATAAA-AGTCCG--CTTTTTTCCAACGC-----TAAA----TGGTTA
gi|10                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 tttcaaactaccataccggaaaa--TGA-GCC-------T-TACATC-GTT-GA---T-CAG-A--------------T---A--AACA-GGTG---CT-TCTT-G------GTAT-AATTTA-GTATGTAA--AG--A-CC-GGCTTAACAA--TT-GG---AAT---GAAACGCTTCA--GA--C-AACAACCT-------AC--A--C--G-T---A--CCT-ACAA-GTTG-TATTTGCAAATGCA--A-AATAAACC-ATCAT-------AACGACC-A-TAGAATT-TG--TA--AACACGA-G---ATTGT--A---GAAACTCCTG-TT-TG----T-------CAG-TA-T--CA----C--GCCTTGG---TTTAAG--ACTTTATCA-CACTC----------AGA--ATC--TG-T-------T-T-TCG-CAT----------------------------T-T--C-TATT-GGATC-AGTTA-CATTTTGCAG-GAG-ACAA-AATCAC--C-A-TAA--ACAA--G-T-G-A--------AAATAG-AATATTG-------------CTA--C-AT-GA-ATACA-G--G-AA--A-TTGAC---GAT------G-GAAAAG--------TTAAAGCA--ATCT-CGC------TTGTCA-TCAAGA-AG-------GGTTGTTGT----AAT-----T-TG--C--C-TTGAACG-TC-TA-TGTTCAGTA-AATTATCC-A---AAT------------ATGAatatggaatttgttacaaataaggtttttacttt
gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     gaacacgtcccggtaaCA-GG-TGG-C-------TAGAAGG-----A--------GTGAGTATC-----GC---CC----GA--T-CACAC-CTGC-CG--TTA-GCC-C-----T-GA--TC-T---TG---A-TCA-G-G------------T------AACGCAA-G---TA-ATCC-G----TAGTCA-AA-CTCAGTATGCAA--AC--G-GATATC-GAAC--AATC-GGTA-AA-----AAGC--ATTA--G------GCG---T-------TTG-G--T--C-C---A--TTGTATAA-CTTG-TATCTGTAAA--TA--A-GAT----C-ATT
gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         tttactcagtatacacatgtatatgtctttgaagtcggttatgatgttcaatgcaacgacatcggtatacatgtacttcaaacgaactacacgtttaccgtgacatcaaagtaaatatatgtttagcggactttttttctgcctatatatagttacggcactggatttcttatgaacaagtgaaaattacgaacagtgactaatctcttagatcctaaattaaaagtactagtatacaaacaaagatccctagccaagATCATGAAG---TGACG-TCTTAACA--GC----------AG-------TTA--CTAGT--A-G--------------GA----------T-AGAG--------------GG-----C------TGCGGGTA-GAGC-C--TTAGTG-AA---CCAGCG-ATGTAA-------TCATTCT-G-TTTG-AAGGAGTTTT---TTA-TGCA---T------CGAAAAAAAATCCAAT-ATAAAAAACAAGGT-ATGGTAA-TTTCAATTGAT-CCTGATGTCTTTGGAAA-ATATGAAGCAAATGTTT--AAACA-AAAGGTGGATTTGAAGAA-GTATCACT-TTAGT-CAGATGTCTTGGA-GTA-A-GATT----AGTATT-CCAAATGAC---TGA--AGTG-AATCC-T-AGTTAC-AGTTAAAAGGCATAAGTAT-GTA-----T-GA-CTAT--TTATCAAC--AC----AAG----ACAAA-------TGTGA-ATC---ACTTGGCTTTATCAGCTG-----AACT---A-TATCAA-AGTTTTCATG-----TGCGTCTTTAA--C-CA-TTTACACACGTC-----GCTCTG-----TAAA-GACAG-----AAGGCTA
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 tccGTTTTT----TGATATATCC-CCATC--GGTA-TG-ACACCA-TTCTGGAATAATGTAGGTG-GACAGTATCTC-TGAAA---AGACTGTTTTAACA--GCTGTTTAG--TAG-------TTT----AGTTTA-GAT-------TAAGGAAGAGGCTTGGTT-AGAGCACTTACTTGAACTAG-----CATATATTG---GTA-GAGCAC--TTACTGGAA---C-AGC--ATATA--------TC--TTT-G-TT-GTAAGGA-ATTG---TTA-T-TG---TTAATT-CG-AA-----TCCAGTTA--------AAGGTCATTGTAA-ATCAAATTGAT-CCAGAT-TCTTCGGAA-TAT-TGA---AAGTATT--CAAACAGAA-GGTGAATTTGAAGAA-TT-CTATC-TTAGT-CAGATTGCTTGGAGGTATATAAGT-----AGATTCCCAGATGCT---CGA--AGTA-CACCCTT-AG-T-C-ATCTTAAAAG-ACAAGTACAG-A----GT-CAGCTCTAGTTACAA
gi|14                         :                                                                                                                                                               agtgtagaAAA--GGCAAAGATA----A-CGA----ACAGTGA--T-C-AATCT-CGTAA-----------G-TCCTAAAT-A---GA------AT--A--CAAAA--ACAAGA-GTC-GGGCAAT-CAC-GGA-C----CCC-T---GGACAC-A----C--CAG-A-A-G--TGG-GA-TCA-GG-TGC-C-------TAGGGGG-----A--------GTAAGCACC-CCCTGTTGACC----GG--T-CACAC-CCGC-CG--TGA-GCC-C-----A-TA-GTC-T---TG---A-TCA-G-G------------T---A--AACG-GA-----------C-A----TC-----AGT----GTGTGAAA--A---A-CG-G-CTTAAC--AATG-GCT---AT---GAAACACATCA--GA--C-AGCA---T-------TTG-A--C--T-C---A--ATG-ATAG-GTCA-TATTGGTAAA--CT--A-AAT----T-GTTAC-------AACGACC-A-TAGAATT-TA--CG--AA-ATGCTGC--ATTTA--AA-CGTGACT---G-TT-GA----AACCCCTGCAA-CA-TACCG-A--C--TTTT
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                              ggatgtA-C----CTC-T---A-ACAA-A----GG-CGA-A-G-G---AG-GG-TCA-GG-TGC-C-----A--GGAGG------A--------GTAAGCATC-CTCTGCTGACC----GG--T-CACAC-CCAC-CG--TGA-GCC-C-----T-TA-GTCGG---AA---A-TAA-G-G------------T---A--ataaatcatgcactttcttttcaaagtacatgtatatttgcacatgaaat
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    caaatAAATAAGGTA---T---GAACAAAATCA--GT--C-AACA---T-------ATGGA--CCTT-T---A--GTG-ATAA-TTTG-CAA-CGCAAA--CA--A-GGT----C-ATTAT-------ACCGACC-ATTAGAATT-TG--CGAAAA-ATGATG---ATTTTTAAA-CGAGATTTC-G--T-TA----TAA-CCTGCAA-CATT--CA-A--CTTTTTTTGT---TT--AGC-AGTTAGCCTAAGCTTT-------AAAAA--ATCTTT--C-------ATT-ACG-CGG--A-----CATG-------------CTCT-T-GC-TATC-GAATC-A---A-CT---TGC-G-GAGTAAAT-TA-CACATC-A-TAA--GCAG--GATGG-A--------TAGTGGT-GTATTA-------------CTA-tgaacaaaatcagtcaacatatggacctttagtgataatttgcaacgcaaacaaggtcattataccgaccattagaatttgcgaaaaatgatgatttttaaacgagatttcgttataacctgcaacattcaactttttttgtttagcagttagcctaagctttaaaaaatctttcattacgcggacatgctcttgctatcgaatcaacttgcggagtaaattacacatcataagcaggatggatagtggtgtattactacttctttcgttacttggataattttattgaacattgac
gi|16                         :                                                                         caaatacctctaacaaaggcgaaggagggtcaggtgccaggaggagtaagcatcctctgctgaccggtcacacccaccgtgagcccttagtcggAAAT-GGCGAAG-TA----A-CAATTAAA--GT-A--TCA-AA----CGTA-TCATA------G-TCCCCAAA-A---CAC-----AT--A--CAAAA--TCGAGT-GTA-GG-CAAT--AC-GGA-C----CTT-C---G-ACAA-A----AG-CGA-A-AAG--CAG-GAATCAAGG-TGC-C-----A-TGGA-GG-----A--------GTAAGCATC-CTCTGCTGACC----GG--TCCACAC-CCGC-CG--TGA-GCC-C-----T-TA-GTC-G---AA---A-CAA-A-G------------T---A--AACG-GG-G---TT-ACCC-G----TCGTCA-AATCTAG--ACGAAA--AT--GACA-GCCTAACTAACAAG-GGTATAA-----AAACAAATCA--GT--C-A--A---T-------ATG-A--C--T-G---A--GTG-ATAA-TTTG-TAATCGCAAA--CA--A-GGT----C-ATTAT-------AGCGACCGG-TAGAATT-TG--CG--AA-ATGATG---ACTTTAAAA-CGAG-ATTC-A-GT-TA----TAACCCTGCActtctttcgttacttggataattttattgaacattgac
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    taA-T-AAGAAA-----CCC-A---------------AGCAT----GCTCAT--TA--ATATCTAACTTCA--GAGTA-CTTGTGTGGG--CAATCA----------------GA--G----GGTTTT-------------CAACAAAATATGTGTCTT--GTTT------CCCAA----CG-ACTAGAAATTCG-TA--TT---TTCGGG---TGCCGG-TTTT----TTGT---------TTAAAAAGCA-ATTA--------TTATAAT------T-GAAAAAGG---CCTAAGAT--TT-TA-ACTTT--AT-CG---GAGGAATCGTTG-----------T-GTAAAG--T-GTGGAGAAA-TC--TACGTTTTTG-ATGCAGTCAATT
gi|18                         :                                                                                                                                                                                                                                                            aatcgaccaattgttgctaccatatgttttcctaatg-GGA-C----CTC-C---A-A-AA-ATTATAG-AGGTA-G-G--CAG-GA-TCA-GGGTGC-C-----A--GGAGGATCGTAA--------TTGAGCATC-CTCTGCTGACC----GATCT-CACACACCGC-CATCTGA-GCC-T-----TGTA-GTT-C---AA---A-CAA-A-GC-----------T---A--AACG-GG-GATTCT-ATCC------TCGTCA-AATCT-AGTACGAAA--AT--G-AA-GGCTAAACACAA-G-GGTT-ATT---GAAACAAGCAG--GT--C-AACA---T-------ATG-A--CT-T-T---A--GTG-ATAA-TTTG-T-ATCGC-AA--CA--A-tttgaaaattcttgtatt
gi|19                         :                                                                                                                                                                                           gcaaacataaaatgttatgtagattattatcgTCATA------AATCCCATAA-A---GA------AT--A--TAAAA--C-------TA-AGGCAAA-CAC-GAA-C----CCT-T---G--CAT-AT---AC-CGG-A-G-G--TGG-GA-TCA-GG-TTT-TTTTTAA-AAGAGGG-----A---------TAAGCACC-CCTTGTTGACC-----G--T-C-CAC-TCGC-AT--TAT-ACC-C-----T-CT-ATC-T---TG---A-TCA-G-G------------T---A--AACT-GA-G---TA-ATCT-G----T----A-GGTC-AAGAACGAAA--aat
gi|2                          :                                                                                            ttagatactgttggagacaatattggttgctcaccgaaagaatgaaaagtgaagataacgtaacagtgatccatcAAAT-GGCGAAG-TA----A-CAA----A--GT-A--T-A-AA----CGTAATCATA------G-TCCAAAAA-A---CA------AT--A--CAAAAA-TCGAGTTGTAAGGGCAAC-CAC-GGAAC----CTT-C---G-ACGA-A----AG-CGA-A-G-G--CAA-GG-TCA-GG-TGC-C-----AATGGAGAG-----A--------GTAAGCATC-CTCTGCTGACC----GG--T-CACAC-CCGC-CG--TGA-GCC-T-----G-TA-GTC-G---AA---A-CAA-ATG------------T---A--AACG-GG-G---TT-ACCC-G----TCGTCA-AATCTAAGTATGAAA--AT--G-CA-GTCTAAACAAAATG-GGTA-AAT---GAAACAAATCATGGT--C-AACA---T-------ATG-A--C--T-T---A--GTG-ATAC-TTTG-TA-TCGCAA---CA----GGT----C-ATTAT-------AGCGACC-G-TAGAATT-TGTGCG--AA-ATGATG---ACTTT--AA-CGAGAATTC-GGTT-TA-----AACCCTGCAA-CA-TA-CA-A--C--TTTTTGG---TT--AGT-AGTTGCCCT-CG--TT-------AAAAA--ATC--A--C-------A-TTACG-CAT--G-----CATG-------------C-CT-T-G-GTATC-GAATC-A-----C----CG--A-GAG-ACAT-TA-CACA-C-A-TAAT-GCAG--T-G-G-A--------TAGTGGTAACATTA-------------CTA-AC-AAAAA-A---A-G--G-AA--AAGTGAC---AAT------T-GGCAAG--------TCAAAGTCCCATCAACGT------TTATCA-T--ATATAT-------G-T-GTTTTGC--AGT-----CCTG--C--C-ATTAGAG-TC-AA-TATTA--TA-AAATATCC-A---A-T------------ATGAAGCACATTGGTCAGATTCTGTGGTGTC-T---TTA-TTTCAAGTTCGTCAGGATAATATCAAAATGGA-CATA-ATTGTGAAA-TTATGATTGTTAATGGAT---AA-ACATC-GTCTATATACCT----ATA-----AGTAAGG-TTG-AA---GGACACT-GCAAG---------------TTTT----TTGTTTTT------A--CCCG-AACAGTTT-TCCTGAA-ACA-AATTCTGCT--TTCAT-ATGGAATATATAAAA--ATAAGTC---TGCCAATA---AG-GGGGC-AAC-AT---TAGTACCCAT-AGGAA--AC-CA-AC--A---------GAATTGTTGGAGAAGACGGAT-GTCACTCCAAAAA-AGAC------TACAATAATATTAATCTA-TAAAGCAA----ACCC-A---------------AGCA---ATGCTC-T--TA--ATATCTTTCTTC--AGAGTA-CTTGTGTGGG--CAATCA----------------GAGTG----GGTTCT-------------GACAAAAATATGTATC-T--GTTT-----CCCAAA----TG-ACCAGAAACTTGGTA--TT---TTCGGG---TGCC-G-TTTT----TTGT---------TC-AAAAGCA-ATTA--------T--CAAT--TTCCT-GAAAAA-G---CCT-AGAT--TT-T--ATTTT--ATCCGT--GAGGAATTGTTG-----------TA-TAAAG--TGGTGGAGAAATTC-ATATG-TTTTG-ATGCAGTCAATT---------TTAGAA--AAATCTCGTGATTGAA----GTTTTC-TATAAAGCT----CTTTAGAG-------TTTT----TGAGA-ATCCACAATC--TGAA-TGAACACCACTTCTGGAATA-TGTAGTGGAAACAG--TATCTTGAAG---TGAC--CTTTAACA--GCTGTT-AG--TAG-------TTTTGTTAGT--A-G---------TAAGGGA----------T-AGA---------------GG-----C------TG---GTA-AGGCAC--TTACTGGAA---CCAGCGAATGTA--------TC--TTTGG-TTTGTAAGGA-TTTC---TTA-TGCATATTT---T-TGGAA-----TCCAGT-A--------AAGGT-ATGGTAA-TTCAAATTGAT-CCTGAT-TCTTCGGAAATAT-TAA---ACGTATTC-CAAACAGAAAGGTGATTTTGA--GA-TT-TCATC-TTAGT-CAGATTGCTAGGA-GTATA-AAGTCAGGAAAATTCCCAGATGTG---TGA--AGTA-AACCC-TAAGTT-CAATTTAAAAAG-ACAAGTATAATA----GT-GA-CTTT--ATACAAAC--A-----AAG----ACAAG-------TG-----TT---ACTGTGCTTTAT--ACAGCCTGGAACC---AGTAACAA-AGTTTTCATGTAGTCTA----TGTAA--CTCA-TTTACCCCCTTCTG---GCT-TC-----TTAA-GACAG-----AAGGGTAAATAGT-AG--ATTTTCCC---CGC-----TAAA----TGGTTATAACGGGATTTTAAATAATTTCCGAA-TACTTTTGATCA-TTCAGACAAAGTGTCAAGAT-CTCTCCCTtaaatgttgatgcatt
gi|20                         :                                                                                                                                                                                              A----A--AT-A--T-A-AATAGGCGAAGT--TA------A-TCCCAAAA-A---CAT-----AT--A--CAAAA--CCAAGT-GTA-GGGCAAC--AC-GGA-C----CTC-C---G-ACAA-A----AG-CGA-A-G-G--CAG-GA-TCA-GG-TGC-C-----A-TGGAAG------A--------GTAAGCATC-CTCTGCTGATC----GG--T-CACAC-CCGC-CG--TGA-GCC-C-----T-TA-GTC-G---AA---A-AAA-A-G------------CATGA--AACG-AA-A---TC-A-----------GTCT-AA-CTA--TAC-ATG--AC--T-TA-GT---GATAATATG-CGT--AATCTGGAAACAAGTCA--TTTGC-GAAA---TG------ATG-A--C--T-T---ca
gi|21                         :                                                                                                                                                                                             AA----A--GT-AATT-A--------GTAA-CATA------G-TGCCAAAA-A---CAT-----AT--ATACAAAA--ACGAGT-GCA-GGGCAA--GAC-GGA-C----CTT-C---G-ACAA-A----CG-Ctaaattgagtattcgttat
gi|21                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          ctattaC-C-----T-TC-GAC-A---AACGCA-CAA-A-A------------T---A--AACA-GG-G---TA-GCCC-G----TCGTAA-AATCTT-GTACAAAA--ATAAG--A-GTCTGA-CAAA--G-GGTA---C---GAAACAGATCA--GT--C-AACA---C-------ACG-A--C--T-T---C--GTG-ATAA-TTTG-TAGTCGCAAA--CA--A-GGT----C-ATTAT-------AGCGACA-G-TAGAATT-TG--CG--AA-AGGATG---Aacaaaataaacagggtagcccgtcgtaaaatcttgtacaaaaataagagtctgacaaagggtacgaaacagatcagtcaacacacgacttcgtgataatttgtagtcgcaaacaaggtcattatagcgacagtagaatttgcgaaaggatgat
gi|22                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              ctattaaaagtaattagtaacatagtgccaaaaacatatatacaaaaacgagtgcagggcaagacggaTATC-TAATC-A---A-C----TG--G-GAG-ATATGCA-TAC--C-A-TTT--GCAA--G-G-G-A--------TAGTGGTA-TATTA-------------CTA--C-AAAGACA---G-G--G-AA--AGCTGAT---GAT------T-GCATTT--------TTAAAGTC--ACCAA-GC------TTATCA-T--ATA-AT-------G-TAGCTGT-A--AGT-----C-TG--C--C-ATTAGAG-CC-AA-TATTAAGTA-AAATATCC-A---ACT------------AAGAAGCAGATTTGTCAAATTCTGTGGTCTCCT---TTA-TTTTGAGTTCGTCGGGt
gi|23                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        A-A----CG-CAC-A-G-G--CAG-GA-TCA-GG-TGC-C-----A-TGGAGG------A--------GTAAGCATC-CTTTGCTGACC----GG--T-CACAT-CCGC-CG--TGA-GCC-G-----G-TA-TTC-G---AA---A-CAA-A-A------------T---A--AACA-GG-G---TA-ACCC-G----TCGTAA-AATCT-TGTACGAAA--ATAAG--A-GTCT-GACAAA--G-GGT---AT---GAAACAGATCA--GT--C-AACA---C-------ACG-A--C--T-T---C--GTG-ATAA-TTTG-TAGTCGCAAA--CA--A-GGT----C-ATTAT-------AGCGA
gi|24                         :                                                                                                                                                                       AAA--GGCAAAGATA----A-CGA----ACAGTGA--T-C-AATCT-CGTAA-----------G-TCCTAAAT-A---GA------AT--A--CAAAA--ACAAGA-GTT-GGGCAAT-CAC-GGA-C----CCC-T---GGACAC-A----C--CAG-A-G-G--TGG-GA-TCA-GG-TAC-C-------TAGGAGG-----A--------GTAAGCATC-CCCTGTTGA
gi|25                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    cactgtgataaatggtagtattaatgtTGTG---TGATAAGTATAACCC-T-AGTT-C-ATTTATAAAG-ACAAGTATAATATTTTCT-GG-CCCC--TAACAAAA--AAATTCAAG----ACAAATTGACTTTGTAACATCTTAACTCTGTTTCA---ACTGTC-----CTGTAA-TAGCAATAGTTCTCTCG-------------TAAGGCTCATTTTAC-CACTTCTG---a
gi|26                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 AATT-TG--CG--AA-ATGATA---A------GA-C-AGGATT-------------TAAGGCGACAA-CA-A--TA-A--AAATTTTTAGAATTT--AGTCAGT-GGCCT-CGACCTGATAAGAAAAAA--ATA--T--CAAAAAATA-T-ACG-CAC--GTGGTATATGAC-----------C-CTCT-GCGCGAC-GAATC-A---ATC----TG--ATGAG-ACGA-TA-CA
gi|27                         :                                                                                                                                                                                                        -A--C-A-AC----CGT--TCATA------A-TCCAAAAA-AATGTAT-----AT--A--CAAAAA-TCGAGT-CGA-GAGCAGCGCACTGGA-CACATCTT-CTGTA-ATAA-A----AGCCGA-ATG-GTTTAGTGA-T---AG-TTT-T-----A-TTGAGAG-----AAGAAAATGGTAAG------TCCACTAACC----AG--T-CA
gi|28                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            ggcgactgtaTGTCAGTGTCTGTGGTGTCCTGAATTA-TATTAAGTTCTTCGCGATA-TATCAAA-TGGA-TATA-ACTGTGAAAATTATGATTGTTAATTGAT---AGCACATC-ACC
gi|28                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            CACC-GCAAG---------------TTTT-----TGTTTTT------AT-TCCGTAACAGGTT-TT---GA-ACA-AATTgcaagtttttgtttttattccgtaacaggttttgaacaaatt
gi|29                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      tgtcagtgtctgtggtgtcctgaattatattaagttcttcgcgatatatcaaatggatataactgtgaaaattatgattgttaattgatagcacat--CTCA-TT---ACACTTCTG---GCT-TT-----TTAAAGACA-------AGGATAAATAGTACGCCATTTTCCT---CGCGCGCTTAAAGTTTTAATTAC----GGATTTT-AATTACTTCCGAATTAATTTTGATCATTTCAGACAAAGTATTCAACTCCTCTCCC
gi|3                          :                                                                                                                                                                       AAAT-GGCGAAG-TACA--A-CAA----T--GT-G--TTA-AA----CGTAA-AATA------G-TCCCAAAA-A---CATGT---AT--A--CAAAA--TTGAGT-GTA-GGTCAAC--AC-GGA-C----CTC-C---G-ACAA-A----AG-TGA-A-G-G---AG-GA-TCA-GG-TGC-C-----A-TGG-GTG-----A--------GTAAGCATC-CTCTGCTGACG----CG--C-CACAC-CCGT-CG--TGA-GCC-C-----T-TA-GTC-G---AA---A-CAACA-G------------T---A--AACG-GG-A---TT-ACC--G----TCGTGA-AATCTA-GTACGAAA--AT--G--A---CTGA-CAAA--G-GATA---T---GAAACAAATCA--GT--C-AACA---T-------ATG-A--C--C-T---G--GTG-ATAA-TTTG-TAATCGCAAA--GA--A-GGT----C-ATTAT-------AGCGACC-G-TATAATT-TG--CG--AA-ATGAT----ACTTT--AAATGAGA-TTC-G-TTATACCGTTAACCCTGCAA-CA-T--CA-------TTTTTGG---TT--ACT-AGTTGGCCT-AGCTTT-------AAAAAT-CCC--T--C-------A-T-ACA-CAT--ATGC--CATGTGTTGGATATAGCC-CT-T-GCGTATC-GAATC-A---A-C----TG--A-GAG-ACAT--A-CACA-CCA-TAA--GCAG--G-T-G-A--------TATTGGTA-CATTA-------------CTA--C-ATAGA-A---AAG--G-AA--TGTTGAC---GATA-----T-GCAAAG--------TCAAAGTC--ATCA-CGT------TTATTA-T--ATA-AT-------G-TA--TGT-C--AGT-----C-TG--CATC-ATTAGAG-TC-AAATATTAAGTA-AAATAGCC-A---AAT------------ATAAAGCAGATATGTCAGATTCTGTGGTGTCCT---TTA-TTTCGAGTTCGCCA----AATATATAAATGGA-CATA-ATTGTG-AAATT-TTATTGTTAATTGATA--AG-ACATC-GTTTATATACCC----ATA-----TGTAAGG-TTG-AA---GGACACG-GT------------------TTTT----TTGTTTTT------AT-CCTGTAACGTTTT-TTTT--A-ACACAATTCTAC---TTCAT-AT-GA--ATATAAAA--ATAAGTC---TGCCAATA---AG-AGGAC-ACA-AT---TAGTGTCCTT-AGGAAT-AC-CA-AC--A---------T-ATTGTTGGA--AGAC--ATGGTTTCT-----AA-AGAC------TACATAAATATT-GTCCA-T-AAGAAA----ACCC-A---------------AGC----ATGCTC-T--TA--ATATC-TACTTC--AGAGTA-CTTGTGTGGG--CAATCA----------------GAGT-----GGTTCT-------------GAC-AAAACATGT
gi|30                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             ctattaaacctgacacaatacatctgctagtcatctgggactgatgtttatatatcACATTG-------------TTA-ACTACATA-A---A-A--G-AA--A--T--------T------T-GCAAAA--------CTCAAGTC--ATCA-CGT------TTATCA-T--ATA-AT-------GTTAGTTGT-CCAAGTC----C-TG-----C-ATTAGAGATT-AA-TATTAAAGG-AAGTGTTC-ATGGAAT------------A
gi|31                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     T-CA-CAC--C-A-TAA--GTAG--G-T-G-G--------TAGTGGT-ATATTA--------------TC-AC-ATTGA-A---A-G-----------------------------GCAAAG--------TTAAAGTC--ATC-TTGC------TTATCA-T--ATA-AT-------G-CAGTTGT-C--AGT-----G-TG--T--C-ATTAG
gi|32                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              cttatCAT-T--CAC--C-A-TAA--GCAG--G-TGG-A--------TGGTGGT-ATATTA-------------CT--AC-ATAGA-A---AGG--G-AA--AGTTGAC---GATAGCCGATAGCAAAG--------TTAAGGTC--ATC-ACGC------TTATC
gi|34                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 tatcctCAATA---AG-GGGGC-ACA-AT---TAGTGCCCGT-TGGAAT-AT-CA-AC------------GGATTGTTAG--TAGAC--ATGG--TCTCC---AA-AGAC------TACACAAATATT-ATTTA-T-AAG
gi|35                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           GA-GCC-T-----T-TA-GTC-G---AA---AACAG-G-GAGGGGGGGCGGTT---ACGAGCG-GA-G---TT-ACCCTG----TCGTCAGAATCT-AGTACGGAA--A---G--A-G--TGGACAAA--G-GGTA-ctaa
gi|36                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      A-GG-T-C-C-----G-TGAATGA-----A--------GTAAGCATCTCGTTGCTGATCCGAGGA--T-CACAC-CCAC-CG--TGA-GCA-A-----T-CA-AGA-G---AA---A-CAG-A-tg
gi|37                         :                                                                                                                                                                                                                             gatggatggtcgCCCAACATA---CATGTATAAT--A--CAGAG--TCGA-T-GTA-GA-CAAC--AC-AGA-C----CTAGT---A-ACAA-A----AGGCGA-G-G-G--CAG-GA-TCA-GG-TGC-C-----A-TG
gi|38                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      cc--ATTTTCCC---CGC-----TAAA----TGG----------ATTTT-AATCATTTCCGAA-TATTTGTATCCA-TTCAGACAAAGTGTCAAGCTCCTCTCCCT
gi|39                         :                                                                                                                                                                     gcAAAT-GGCGAAG-TATTTTA-CAA----T--GT-G--T-TTAA----CATAATCATA------G-TCCAAAAA-A---CAT-----GT--A--CAAAA--TCGAG
gi|4                          :                                                                                                                                                              tttgttataAAATTGGCGAAG-TA----AACAA----T--GT-G--TTA-AA----CGTAATCGTACATGTAG-TCCCTAAA-A---CAT-----AT--A--TACAACTTCGAGT-GTA-TGGCAAC--AT-GGA-C----CTC-C---G-ACAACA----GG-CGA-A-G-C--CAG-GA-TCA-G--TGC-C-----A-TGGAGGG-----A--------GTAGGCATC-CTCTGCTGACC----GG--T-CAC-C-CCACACG--TGA-GCCTC-----G-TA-GTC-G---AG---A-CAA---G------------T---A--AACA-GG-G---TT-TACC-G----TC---------TAC-TACGAAATGAG--A-CA-GTCTAA-CAA---G-GGTA---T---GAAACAAATCA--GT--C-AGCA---T-------ATG-A--C--T-T---A--GTG-ATAA-TTTGGTAATCGCAA---CA--A-GGT----C-AT-AT-------AGCGACC-G-TAGAATCCTG--CG--AA-ATGCTGCGGACTTTGAAA-CGAGAACTC-G-TT--A----TAACCCTGCAAACA-T--CA-TTTC--TTTTT-----TT---GT-AATTGAC-T-CGCTTT-------AAAG----TC--CTGC-------G-T-CCG-CAT--GA----TATA-------------C-CT-TTGCGTATC-GAATC-A---A-C----TG--A-GAG-ACAT--A-CACA-CCA-TAA--GCAG--G-T-G-A--------TAGTGG-AACATTA-------------CTA--C-AAAGA-A---A-G--GGAA--AGTTGAC---GAT------T-GCAAAG--------TCA--------TCA-CGT------TTATCA-T--ATA-AT-------G-TAGTTGT-C--AGT-----C-TG--C--C-ATTAGAA-TC-AA-TTTTAAGTA-AAATATCC-A---AAT------------ATGAAGCACATCTGTCAGATTCTGTGGTGTTCT---TTA-TTTGGAGTTCGTCAGGAT-ATATC-AAATGGA-CATA-ATTATGAAAATTATGATTGTTAATAGATC--AG-ACATC-ACCTATATATCTAC--ATA-----TGTA
gi|41                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           actatcttatccgaatgacatcaaagattacttgaacgattgtctgtactgcaatat---AG-ACATC-ATCTATATATCT----ATA-----TGTAATG-ATG-AA---GGACACA-GTAAG---------------TTTT----TTGTTT
gi|42                         :                                                                                                                                                                       AAAT-GGCGAAG-TA----A-CAA----A--GT-A--T-G-AAC---CGTAATCATA------
gi|44                         :                                                                                                                                                                       AAAT-GGCGAAG-TA----G-CAA----A--GT-AT-T-C-AA----CATAATCATA------A-Tcgtacacagataaaccata
gi|46                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         cgcacatttataTTTTGG---TT--AGT-AGATGGCCT-CGCTTT-------AACAA--ATC--
gi|47                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   A-A---G-G--G-GA--AATTGAC---AAT------T-GCAAAG--------TCAAAGTC--AT
gi|49                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      -A---AAT------------ATGAAGCACATCTGTCTGATTCTGTG
gi|5                          :                                                                                                                                                                       AAATTGGTGAAG-TA----AACAA----T--GT-G--T-T-AAT---CGTAATCATA------G-TCCTAAAA-A---CAT-----ATTTA--CAAAG--TCGAGT-GTA-GGGCAAC--AC-GGA-T----CTC-C---G-ACAA-A----AG-CGA-A-G-G--CAG-GA-TCA-GG-TGC-C-----A-TAGAGG------A--------GTAAGCATC-CTCTGCTGACC----GG--T-CACAC-CCGC-CA--TGA-GCC-C-----T-TA-GTC-G---AA---A-CAA-G-G------------T---A--AACA-GG-A---TT-ACCC-G----TTGTCA-CATCT-AGTACGAAA--AT--GACA-GTCT-AACAAAA---GGT---AT---GGGACAAATCA--GT--C-AGCA---T-------------------------------TAA-TTTA-TAATCGCAAA--CA--A-GGT----C-ATTAT-------ACCGACT-G-TAGAATT-TG--CG--AC-ATGGTG---ACTTTA-AA-CGAGAA-TC-G--T-TA----TAATCCTGCAA-CA-T--CA-A--C--TTTTTAG---TT--AGT-AGTTGGCCT-CGCTTT-------AAAAA--GTCT-T--C-------A-T-ACG-CAT--GA----CATGT------------T-CT-T-GCGTATC-TAATC-A---A-CTGCATG--G-AAA-ACAT-T--CACACC-A-TAA--GCAG--G-T-G-ATACATTTGTAGTGGT-ACATTA-------------CTA-
gi|6                          : tatactctatatgataatatatgtcttctgaaaccgcttttacatgtttctgtgttggcgacatcggtattttgggctttttcaaaagtttggcttatatttaaaaagttttcttttcatgaatgcatttttttctgtatttttttttattgtatgtagtaaaagatatT-GGCCAAA-TA----AACAA----T--TTGA--T-A-AT----TGTAATCAAA------A-CCCCAAAA-----CAT-----AC--A--CAAAG--TCGAAT-GTA-AGGAAAC--AC-AGA-C----CTC-C---G-ATAA-T----AG-CGA-A-G-G--AAT-AG-TCA-GT-CG-----------------------------------GCATC-CTCTGCTGACC----GG--T-CACAT-CCGC-CG--TGA-GCC-C-----T-TG-GTC-G---AA---A-CAA-A-G------------T---A--AACG-GG-A---TT-ACCC-G----TCGTCA-AATCTA-GTAGGAAA--AT--GACA-GTCTAA-CAAA--G-GGTA---T---GAAACAAATCA--GT--C-AACA---T-------ATG-A--C--T-T---A--ATG-ACAA-CTTG-TAATCGCATA--CA--A-GGT----C-ATT---------------------------TG--CG--AA-ATGGTG---ACT-----------------------G----TAGCCCTGCAA-CA-T--CA-------TTTTTTG---CT--AGT-AGTTGACCT-CGCTTT-------AAAAA--GTCC-T--C-------G-T-ACG-CAT--GA----CATG-------------CTCT-T-GCGTATC-GAATC-A---A-C----TG--G-AAG-ACAC--A-CACA-C-AATAA--GCAG--G-T-G-A--------TAAGGGTA-CATTA-------------CTA--C-ATGAA-A---A-G--G-AA--AGGTGAC---GAT------T-GCAAAG--------TTAAAGTC--ATCA-CGC------TTATCA-T--ATA-AT-------G-CAGTTAT-C--AGC-----C-TA--C--C-TTTAAAG-TC-AA-TATTAAGTA-AAAAATCC-A---AAT------------ATGAAGCAGATATGTCAGATTCTGTGGTGTCCT---TTA-ca
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                atagatTGTCAGATT--GTGTTGTC-T---TTA-TAT-GAGTTT-TCGGGATA-T-TCCAAAT------TA-AT----------GCCCTTGTTA-TTGAT---AGCAGAT--ATCTATAT-CCT----ATA-----TATAAGG-TTG-A-----GACAAA-GCAGGGAGTTTTTTTTTTTTTTTT----TTGTTTTT------AT-CCCGTAA-AGTTT-TTGT--A-GCA-AATTCTGC---TTCAT-ATGTA--ATAT-TCA--GTAAGTCTGGTGCCAATA---AA-GGGG---CA-AT---TAGTGCCACT-AGGAATGACGCA-ACGGA---------GAATTGTTTGA-TCGAC--CT-GTCTCTCC----A-CGAC------TACATAAATAAT-TTCTG-T-AAGAAACTCTACTC-ATCATGATGTCATGTTATCAT--TTGTTC-TAATAATATATCCTACTTCAGAGAGTA-CT--TGTGGG--C-ATCA----------------GAGT-----GTTTTT-------------TAAACAAATATGTGTCTT--GTTTTTCCGCCCCAATCCCCGAACTAGAAA--TATTA--TT---TTCGGG---GGTC-ATTTTT----TTGT---------TT---AACCACATT---------T--CGATAAT--CT-GAAAAG------CT-AGAT--TTAT--ATTTTTAAT--GTGAatactggcgtcaaagctcaaaattcttggagcgggaataataaaatatatt
gi|8                          :                                                                                                                                taagatataaaacggtcagctactaaggattgtgtggtgAAAT-GGCGAAG-TA----A-CAA----A--GT-A--TGA-AA----CGTAATCATA------G-TCCAAAAA-A---CAC-----AT--A--CAAAA--TCGAGT-GTA-GGGCAAC--AC-GGA-C----CTT-C---G-ACGA-A----AG-CGA-A-G-G--CAG-GA-GCA-GG-TGC-C-----A-TGGAGG------A--------GTAAGCATC-CTCTGCTGACC----GG--T-CACAC-CCGC-CG--TGA-GCC-T-----G-TA-GTC-G---AA---A-CAA-A-G------------T---A--AACG-GG-G---TT-ACCC-G----TCGTCA-AATCTA-GTATGAAA--AT--GACA-GTCTAA-CAAA-TG-G-TA---T---GAAACAAATCA--GT--C-AACA---T-------ATG-A--C--T-T---A--GTG-ATAC-TTTG-TAATCGCAAA--CA--A-GGT----C-ATTAT-------AGCGACC-G-TAGAATT-TG--CG--AA-ATGATG---ACTTTA-AA-CGAG-ATTC-G--T-TA----TAACCCTGCAA-CA-T--CA-A--C--TTTTTGG---TT--AGT-AGTTGGCCT-CGCTTT-------AAAAA--ATCA-T--C-------A-T-ACG-CATG-G-----CATGC------------C-CT-T-GCGTATC-GAATC-A---A-C----TG--A-GAG-ACA--TA-CACACC-A-TAA--GCAG--G-T-G-A--------TAGTGGT-ACATTA-------------CTACAC-AAA-A-A---A-G--G-AA--AGTTGAC---AAT------T-GCAAAG--------TCAAAGTC--ATC-ACGT------TTA
gi|9                          :                                                                                                                                                                                                                                 ggcatataCCCCAAC-A---CAT------T--A--CAAAT--TCGC-T-GTA-AG-CAAC-CG--GGA-C----CTC-C---G-ACAA-A----AG-----A-G-G--TAG-GA-TCA--G-TGCAC-----A-TGGGAGG-----A--------GTAAGTTTC-CTCTCCCGAC------G--T-CACAC-CCGCGCA--TGACACC-CCCAAAT-TA-GAT-GACCAA---A-C-A-A-G------------T---A--AACG-GG-GA--TTAACCC-GGGTTTCA--A-AAT---AGTACGAAATGAC--A-CA--TCT-AACAAA--G-GGT---AT---GAAACAAATCA--GT--CAAACA---T-------ATG-A--C--T-TGCGG--ATG-ATAA-TTTG-TAATCGGGAA--CAACA-GGT----C-ATTATTTCGATAAGC-ACC-GCTAGAATT-GC--CG--A-----------------------AGAATTC-G--T-TA----TTAACCTACAA-CA-TA-CA-A--C--TTTTTTG---TT--AGT-AGTTTGGCT-CCCTTT-------AAAAGCCCTC--C--C-------A-C-ACG-CACGAG-----TATG-------------C-TC-T-GCGTATC-GAATCAA---A-C----CG--A-GAG-ACAT-


blockSeqs                     :                                                                                                                                                                           T       A  TTTTA    TTAAA    ATAAATAGG          T    CATGTA A        T ATG  TGTATA  TT TA     CT      T   A  G    GC  T   A ACAT   G TGT G    C TTAT  C   T T A TTT  T  A   A  G   A TTTTAA       GAAGAAAATG              T           CGAG  TC C     A    A  TC   C   CCCAAA  G  .   G ACC  CGC A   AT  AGGGGGGGCGGT ATG CG    C  . ATT  A    T GGTT    C G     CA        TG TGACAGCCTAACTAACAAGGGTATAA                   TG  TG A    ACC G         G .  CT . GCGG     T    .    G          TG  AC .   AAAC .     TTCGATA       G T       C  TG  AA  C      CGG T   TA  A    AC   T TTATACCGT            A  T AC  ACTT        G AAT  TA   C         A      GATAAGA     CC   TCAAAAAAT     T T   .   ATGCCATGTGTTGGATATAGCC       C T       .     A GTT T ATTT  CAG    T    AAT    AT C A   T     .  A G . TACATTTG       AA     CTACA              T AAA C TAC A .  G  .  AG    .     AGCCGA A      .               CC   AA   .           . CA   T  GG              CCA    CC       CAT   .       A  .  A         .        . TGG   .                      T                   C GAA   .   C      G   GG  AA A  A  A    .    .      A  A  A               A    C     .            AC     .           .   . A         T      GAGTTTTTTTTTTTT    .           .      T              .  CTGA .   C     T  T       .  G  AT    AA  .   A    TGG        .    .     .   .  .          A .     TG  G  .  GGA          A        AGA    GG  G T    C AAAA .    .          T      A     . A      CTCTA   . TCATGATGTCATGTT   ATT    C  A AA  AT     T A    AGA     .          .       GAGTG                          C               C           CT .     TTCCGC     TCCC  A        T   G  .   .        .      GG     .       TTAA            G  C   ATCAATTTC              .      GG      A    .   TA       TA  CCGT              TG                 TG           T  A   C T     .            .              .   A          G  .        C          .           .          .        T  CCA     .     .  A      C          A     G  A     T     A     .      TG        .   T   TAGTAGTTTAGTTTAGATTAAGGAAGAGGCTTGGTTAGAGCACTTACTTGAACTAGCATATAT                             CGG   .    A .       G  .   C   GA  G  A         AT   G .  T T     G   T      . G ATCGAAAAAAAA          C    ATAAAAAAC      C       .           .      G       A AT  A   AGC       CC      G  A     A     A   .  A     .     .             G   TAT    CAGGA     C         .     TA    T  T  T A    A AA         C          TATTTTC CAG   A AG T      AAATTCAAGACAAATTGACTTTGTAAC         TTA   T      ATACAGCCTGGAACCAG       T AAT         GTAGTCTATG       GG    T     A        .     CTG       AAA    G              T   ACGCC        .     GCGCT    GTTT   T  C           .   T         T  A         T                    C
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                           T       .  CAA      ACA      GATCAATCT          T    .      .        . .    TGT     .  .      A       .   .  G    C   .   . .      . .   .    . T     G   . . . C    .  .   .  .   . AA           ATCGTAA                 .           .     .  .     .    G  .    .   TC      .  .   . .    .   .   CA  C            .   .     .  . A    .    . .       C .     AG        TG TGCAGTCTAAACAAAATGGGTAAAT                    .   .  .    .   .         . .  T  . A        .    .    .          .   .  .   .    .     .             . C       .  .   .   .      C   T   AA  .    AC   . GTTTA                .  . A   AAAA        G .    .    .         .      .           T    TTTC          . .   .   GTGGTATATGACC                . .       .     . .   . TGCA  CG     .    GCA    AC C .   .     .  . G . .              AA     CTAA               . AAG . .   G .  .  .  GC    .     A      .      .               .    AA   .           . .    .  GT              GC     CC       C     .       .  .  .         .        . .     .                      T                   C .     .   T      G   GG  AA A  A  A    .    .      A  A  A               C    C     .            .      .           .   . A         C      .                  .           .      T              .  TT   .   .     T  .       .  G  .     AA  .   A    .          .    .     .   .  .          T .     T   .  .  A            G        AT     .   G T    C A    .    .          A      .     . .      A       . .                 AT     C  . .   .      T T    A       .          .       GAGT                           G               A           CT .     C          .     .        C   T  .   .        .      AT     .       TCA             G  .   ATTATAAT               .      G       .    .   AT       .   GTGA              TA                 T            .  .   T .     .                                                                                        .        .  CC      .     .  .      .          .     T  .     .     T     .      G         .   T   AGTAGTTTTGTTAGTAGTAAGGGATAGAGGC                                                             .     .    A .       G  .   C   G   A  .         .    . .  T T     .   G      . G ATATTTTTGGAA          C    TA             .       .           .      .       A A   .   .         T       G  A     A     A   .  .     .     .             .   TA     A         C         .     .     .  C  . .    . A          .          TAG     GA    C .  T      ACAAGACAAATGTGA                     .     G      ATCAGCTGAACTA           A AA          GTGCGTCTT        .     .     C        .     TC        AA     G              T   AG           .     .        .      T  .           .   C         .  T         .                    C
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                           .       .  AA       A        ATCAAA             T    .      .        . .    C       .  .      A       .   .  G    C   .   . .      . .   .    . .     .   . . . C    .  .   .  .   . A            GA                      .           .     .  .     .    .  .    .   C       .  .   . .    .   .   G   .            .   .     .  . .    .    . .       C .     AA        .  TGAAGGCTAAACACAAGGGTTATT                     .   .  .    .   .         . .  .  . A        .    .    .          .   .  .   .    .     .             . .       .  .   .   .      .   T   GA  .    AT   . TTTG                 .  . A   TTTC        G .    .    .         .      .           .    CTGC          . .   .   GACATGTT                     . .       .     . .   . T     AT     .    TA     AC . .   .     .  . . . .              AA     TTAA               . TAG . .   . .  .  .  GT    .     .      .      .               .    T    .           . .    .  G               A      T        C     .       .  .  .         .        . .     .                      A                   C .     .   T      T   CG  A  A  T  A    .    .      A  A  A               .    .     .            .      .           .   . A         G      .                  .           .      T              .  GT   .   .     T  .       .  .  .     T   .   A    .          .    .     .   .  .          G .     T   .  .  A            A        A      .   . T    C A    .    .          A      .     . .      A       . .                 AA     C  . .   .      C A    A       .          .       GAGT                           G               A           C  .     .          .     .        .   .  .   .        .      G      .       TT              C  .   TCGATAAT               .      .       .    .   T        .   CG                                                                                                                                                                                                                            .     .      .         .   .   AGTTACTAGTAGGATAGAGGGC                                                                      .     .    . .       .  .   .   .   G  .         .    . .  . .     .   C      . . GTTAATTCGAA           C    A              .       .           .      .       A T   .   .         C       .  .     T     .   .  .     .     .             .   A      .         .         .     .     .  C  . .    . A          .          TA      GA    T .  T      AAAGACAAGTG                         .     C      AACTGTCCTGTAA           G AA          G                .     .     A        .     TT        AA     .                               .     .        .      .                                                               
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                           .       .  AA       A        GTTAAA             T    .      .        . .    T       .  .      .       .   .  G    G   .   . .      . .   .    . .     .   . . . T    .  .   .  .   . A            GA                      .           .     .  .     .    .  .    .   C       .  .   . .    .   .   G   .            .   .     .  . .    .    . .       C .     AA        .  CTTAGTGATAATATGCGTAATCTG                     .   .  .    .   .         . .  .  . A        .    .    .          .   .  .   .    .     .             . .       .  .   .   .      .   C   A   .    AA   . TTGA                 .  . .   AC          A .    .    .         .      .           .    TGT           . .   .   GACATGCT                     . .       .     . .   . .     A      .    TA     A  . .   .     .  . . . .              G      CTA                . CAT . .   . .  .  .  GT    .     .      .      .               .    A    .           . .    .  G               C      C        C     .       .  .  .         .        . .     .                      C                   C .     .   C      G   GG  A  A  C  A    .    .      .  .  G               .    .     .            .      .           .   . .         A      .                  .           .      .              .  G    .   .                                                    .    .     .   .  .          C .     .   .  .  .            .        T      .   . .    . .    .    .          A      .     . .      .       . .                 A      T  . .   .      . A    A       .          .       GAG                            T               .                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              .     .     .  C  . .    . A          .          AG      GG    C .  A                                                                                                              .     .     .        .                                                                                                                                            
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                           .       .  AA       A        GTTTAA             T    .      .        . .    T       .  .      .       .   .  G    C   .   . .      . .   .    . .     .   . . . C    .  .   .  .   . A            GA                      .           .     .  .     .    .  .    .   C       .  .   . .    .   .   G   .            .   .     .  . .    .    . .       C .     AC        .  CGGATATCGAACAATCGGTAAA                       .   .  .    .   .         . .  .  . A        .    .    .          .   .  .   .    .     .             . .       .  .   .   .      .   C   A   .    GA   . GTTA                 .  . .   AC          G .    .    .         .      .           .    TTC           . .   .   GGCATGCC                     . .       .     . .   . .     G      .    TA     A  . .   .     .  . . . .              A      CTA                . TTG . .   . .  .  .  GT    .     .      .      .               .    A    .           . .    .  G               C      C        T     .       .  .  .         .        . .     .                      C                   C .     .   G      G   GG  A  .  .  .    .    .      .  .  .               .    .     .            .      .                           A      .                  .                                                                                                                                                                                                                             . .                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                           .       .  A        T        GTTAAA             T    .      .        . .    T       .  .      .       .   .  G    C   .   . .      . .   .    . .     .   . . . C    .  .   .  .   . A            GA                      .           .     .  .     .    .  .    .   C       .  .   . .    .   .   A   .            .   .     .  . .    .    . .       A .     A         .  TAAGAGTCTGACAAAGGGTAC                        .   .  .    .   .         . .  .  . A        .    .    .          .   .  .   .    .     .             . .       .  .   .   .      .   C   .   .    AA   . TTA                  .  . .   AC          G .    .    .         .      .           .    CTC           . .   .   GAGTATGC                     . .       .     . .   . .     A      .    CA     A  . .   .     .  . . . .              A      CTA                . TAG . .   . .  .  .  AT    .     .      .      .               .    T    .           . .    .  G               C      G        C     .       .  .  .         .        . .     .                      A                   . .     .   .      .   .                                                   .    .     .                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                           .       .  A        T        ATGAAC             T    .      .        . .    T       .  .      .       .   .  T    .   .   . .      . .   .    . .     .   . . . C    .  .   .  .   . A            GA                      .           .     .  .     .    .  .    .   T       .  .   . .    .   .   A   .            .   .     .  . .    .    . .       A .     A         .  TAAGAGTCTGACAAAGGGTAT                        .   .  .    .   .         . .  .  . A        .    .    .          .   .  .   .    .     .             . .       .  .   .   .      .   C   .   .    AA   . TTA                  .  . .   AC          A .    .    .         .      .           .    ATC           . .   .   ACATGCT                      . .       .     . .   . .     A      .    TA     A  . .   .     .  . . . .              A      TCA                . AAG . .   . .  .  .  GG    .     .      .      .               .    A    .           . .    .  G               C      C        C     .       .  .  .         .        . .     .                                          . .     .                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                           .       .  A        T        ATTCAA             T    .      .        . .    T       .  .      .       .   .  G    .   .   . .      . .   .    . .     .   . . . T    .  .   .  .   . A            GA                      .           .     .  .     .    .  .    .   C       .  .   . .    .   .   G   .            .   .     .  . .    .    . .       G .     T         .  TGACAGTCTAACAAAAGGTAT                        .   .  .    .   .         . .  .  . A        .    .    .          .   .  .   .    .     .             . .       .  .   .   .      .   C   .   .    AA   . TTA                  .  . .   AC          T .    .    .         .      .           .    AC            . .   .   GATATAC                      . .       .     . .   . .     G      .    A      .  . .   .     .  . . . .              A      CTA                . TGA . .   . .  .  .  GT    .     .      .      .               .    A    .           . .    .  G               .      C        .     .                                . .     .                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                           .       .  A        A        GTTAAT             T    .      .        . .    T       .  .      .       .   .  G    .   .   . .      . .   .    . .     .   . . . C    .  .   .  .   . A            AA                      .           .     .  .     .    .  .    .   T       .  .   . .    .   .   A   .            .   .     .  . .    .    . .       C .     T         .  TGACAGTCTAACAAAGGGTAT                        .   .  .    .   .         . .  .  . C        .    .    .          .   .  .   .    .     .             . .       .  .   .   .      .   C   .   .    A    . TTA                  .  . .   C           G .    .    .         .      .           .    TC            . .   .   GCATGC                       . .       .     . .   . .     G      .    T      .  . .   .     .  . . . .              A      CTA                . TG  . .   . .  .  .  T     .     .      .      .               .    A    .                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                           .       .  G        A        GATAAT             T    .      .        . .    T       .  .      .       .   .  G    .   .   . .      . .   .    . .     .   . . . C    .  .   .  .   . G            GA                      .           .     .  .     .    .  .    .   C       .  .   . .    .   .   A   .            .   .     .  . .    .    . .       C .     A         .  TGACAGTCTAACAAATGGTAT                        .   .  .    .   .         . .  .  . C        .    .    .          .   .  .   .    .     .             . .       .  .   .   .      .   C   .   .    A    . TTA                  .  . .   .           T .    .    .         .      .           .    CC            . .   .   .                            . .       .     . .   . .     A      .    A      .  . .   .     .  . . . .              A      CTA                . AA  . .   . .  .  .  .     .     .      .      .               .    A    .                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                           .       .  A        T        ATGAAA             T    .      .        . .    C       .  .      .       .   .  G    .   .   . .      . .   .    . .     .   . . . C    .  .   .  .   . A            GA                      .           .     .  .     .    .  .    .   C       .  .   . .    .   .   A   .            .   .     .  . .    .    . .       C .     A         .  ACGGCTTAACAATGGCTAT                          .   .  .    .   .         . .  .  . G        .    .    .          .   .  .   .    .     .             . .       .  .   .   .      .   .   .   .    A    . G                    .  . .   .           . .    .    .         .      .           .                                                                   .     . .   . .     A      .    T      .  . .   .     .  . . . .              A                               . .   . .  .  .  .     .     .      .      .               .                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                               T        ATAAA              T    .      .        . .    T       .  .      .       .   .  .    .   .   . .      . .   .    . .     .   . . . A    .  .   .  .   . A            A                       .           .     .  .     .    .  .    .   G       .  .   . .    .   .   G   .            .   .     .  . .    .    . .       C .     A         .  GACAGTCTAACAAGGGTAT                          .   .  .    .   .         . .  .  . A        .    .    .          .   .  .   .    .     .             . .       .  .   .   .      .   .   .   .    .    . .                                                                                                                                                                                      A                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                               A        AATTA              .    .      .        . .    .       .  .      .       .   .  .    .   .   . .      . .   .    . .     .   . . . C    .  .   .  .   . A            A                       .           .     .  .     .    .  .    .   C       .  .   . .    .   .   A   .            .   .     .  . .    .    . .       . .     A         .  CACATCTAACAAAGGGTAT                          .   .  .    .   .         . .  .  . A        .    .    .          .   .  .   .    .     .                       .  .   .   .      .                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                        ACAAC              .    .      .        . .    .       .  .      .       .   .  .    .   .   . .      . .   .    . .     .   . . . T    .  .   .  .   . A            A                       .           .     .  .     .    .  .    .   T       .  .   . .    .   .   G   .            .   .     .  . .    .    . .       . .     A         .  TGACTGACAAAGGATAT                            .   .  .    .   .         . .  .  . A        .    .    .          .   .  .   .    .                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                           .    .               . .    .       .  .      .                       .   . .      . .   .    . .     .   . . . .    .  .   .  .   . A            A                       .           .     .  .     .    .  .    .   A       .  .   . .    .   .   A   .            .   .     .  . .    .    . .       . .     A         .                                               .   .  .    .   .         . .  .  . .        .    .    .          .   .  .                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                     . .      . .   .    . .     .   . . . .    .  .   .  .   . .            A                       .           .     .  .             .    .   C       .  .   . .    .   .   A   .            .   .     .  . .    .    . .       . .     .         .                                               .   .  .    .   .         . .  .  .                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         . .     .                     .  .   . .            .                       .                                       .   C       .  .   . .    .   .   A   .            .   .                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       .  .   . .                                                                                T       .  .   . .    .   .   .                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        


blockSeqCons                  :                                                                                                                                                                                               N******  GTTAAA********                                 T*****                                **                                                                 A******                                                                          C******          ***                                                                                                                                                *******     **      A*****                                                                                                                TTA*******                    AC*****                                  *******                                                                                                         TA**            **    **                             CTA***************               **    **       ***                 ********             A*   ******                G********              C******  C****                                          ************                                                      GG  A*                                              ***                     ****   *****             A***      N*     ***************    ****        ****** T*                NT**                                                          ***               ***                T*        A***********          A**    **                     ******                                                       A****                         A**                **      GAGT*********************      N*************                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 ***                        A*                            GA**                                                                                                                                           ***
originalCons                  :                                                                                                                                                                       AAAT-GGCGAAG-TA----A-CAA----A--GT-A--T-A-AA----CGTAATCATA------G-TCCCAAAA-A---CAT-----AT--A--CAAAA--TCGAGT-GTA-GGGCAAC-CAC-GGA-C----CTC-C---G-ACAA-A----AG-CGA-A-G-G--CAG-GA-TCA-GG-TGC-C-----A-TGGAGGG-----A--------GTAAGCATC-CTCTGCTGACC----GG--T-CACAC-CCGC-CG--TGA-GCC-C-----T-TA-GTC-G---AA---A-CAA-A-G------------T---A--AACG-GG-G---TT-ACCC-G----TCGTCA-AATCTAAGTACGAAA--AC--G-CA-GTCTAAACAAAATG-GGTA-AAT---GAAACAAATCA--GT--C-AACA---T-------ATG-A--C--T-T---A--GTG-ATAA-TTTG-TAATCGCAAA--CA--A-GGT----C-ATTAT-------AGCGACC-G-TAGAATT-TG--CG--AA-ATGATG---ACTTT--AA-CGAGAATTC-G-TT-TA----TAACCCTGCAA-CA-T--CA-A--C--TTTTTGG---TT--AGT-AGTTGGCCT-CGCTTT-------AAAAA--ATC--T--C-------A-T-ACG-CAT--G-----CATG-------------C-CT-T-GCGTATC-GAATC-A---A-C----TG--A-GAG-ACAT-TA-CACA-C-A-TAA--GCAG--G-T-G-A--------TAGTGGTAACATTA-------------CTA-AC-ANAGA-A---A-G--G-AA--AGTTGAC---GAT------T-GCAAAG--------TCAAAGTC--ATCAACGC------TTATCA-T--ATA-AT-------G-TAGTTGT-C--AGT-----C-TG--C--C-ATTAGAG-TC-AA-TATTAAGTA-AAATATCC-A---AAT------------ATGAAGCAGATCTGTCAGATTCTGTGGTGTCCT---TTA-TTTCGAGTTCGTCGGGATAATATCAAAATGGA-CATA-ATTGTGAAAATTATGATTGTTAATTGAT---AG-ACATC-ATCTATATACCT----ATA-----TGTAAGG-TTG-AA---GGACACG-GCAAG---------------TTTT----TTGTTTTT------AT-CCCGTAACAGTTT-TTTTGAA-ACA-AATTCTGCT--TTCAT-ATGGA--ATATAAAA--ATAAGTC---TGCCAATA---AG-GGGGC-ACA-AT---TAGTGCCCNT-AGGAAT-AC-CA-AC--A---------GAATTGTTGGA-NAGAC--ATGGTCTCTCC---AA-AGAC------TACATAAATATT-ATCTA-T-AAGAAA----ACCC-A---------------AGCAT--ATGCTC-T--TA--ATATCTTACTTCA-AGAGTA-CTTGTGTGGG--CAATCA----------------GAGTG----GGTTCT-------------NACAAAAATATGTGTCTT--GTTT-----CCCCAA----CG-ACCAGAAACTTGTTA--TT---TTCGGG---TGCC-G-TTTT----TTGT---------TT-AAAANCA-ATTA--------T--CAAT--T--CT-GAAAAA-G---CCT-AGAT--TT-T--ATTTT--AT-CGTGAGAGGAATCGTTG-----------TAGTAAAG--TGGTGGAGAAA-TC-ATACG-TTTTG-ATGCAGTCAATTGTCTCAGCATTGGAAACAANTCTCGTGATTNAAAGTTGTTTTNGTATAAAGCTGGGCCTTTAGAGGGGGCGTTTTT----TGAGA-ATCC-CAATC--TGAA-TG-ACACCA-TTCTGGAATA-TGTAGCGG-AACAGTATATCNTGAAG---TGACT-TTTTAACA--GCTGTTCAG--TAG-------TTT--TTAGT--A-GAC-------TAAGGGA----------T-AGAG--------------GG-----C------TG---GTA-GAGCAC--TTACTGGAA---CCAGCG-ATGTA--------TC--TTT-G-TTTGTAAGGA-TTTC---TTA-TGCG---TT---T-CGGAA-----TCCAGT-A--------AAGGT-ATGGTAA-TTCAAATTGAT-CCTGAT-TCTTCGGAAATAT-TGA---AAGTATTT-CAAACAGAAAGGTGANTTTGAAGAA-TT-TCATC-TTAGT-CAGATTGCTTGGA-GTATA-AAGT----AAGATTCCCAGATGTG---TGA--AGTA-AACCC-T-AGTT-C-ATTTAAAAAG-ACAAGTATAATA----GT-GA-CTCT--TTACAAAC--A-----AAG----ACAAA-------TGTGA-ATC---ACTNTGCTTTAT--GCTGTCT--AACT---A-TAACAA-AGTTTTCACG-----TG----TNTAA--CTCA-TTTACNCACTTCTG---GCT-TC-----TTAA-GACAG-----AAGGATAAATAGT-CG--ATTTTCCC---CGC-----TAAA----TGGTTAC----GGATTTT-AATNATTTCCGAA-TANTTTTGATCA-TTCAGACAAAGTGTCAAGCTCCTCTCCCT
finalCons                     :                                                                                                                                                                       AAAT-GGCGAAG-TA----A-CAAN------GTGTTAAA--------CGTAATCATA------G-TCCCAAAA-A---CAT-----AT--A--CAAAA--TCGAGT-GTA-GGGCAAC--AC-GGA-C----CTC-C---G-ACAA-A----AG-CGA-A-G-G--CAG-GA-TCA-GG-TGC-CA------TGGAGGG-----A--------GTAAGCATC-CTCTGCTGACC----GG--T-CACAC-CCGC-CG--TGA-GCCC------T-TA-GTC-G---AA---A-CAA-A-G------------T---A--AACG-GG-G---TT-ACCC-G----TCGTCA-AATCTAAGTACGAAA--AC--G-CA-GTCTAAACAAAATG-GGTA-AAT---GAAACAAATCA--GT--C-AACA---T-------ATG-A--C--T-TA-----GTG-ATAA-TTTG-TAATCGCAAA--CA--A-GGT----C-ATTAT-------AGCGACC-G-TAGAATT-TG--CG--AA-ATGATG---ACTTT--AA-CGAGAATTC-GTTA-------TAACCCTGCAA-CA-T--CAAC-----TTTTTGG---TT--AGT-AGTTGGCCT-CGCTTT-------AAAAA--ATC--T--C-------A-T-ACG-CAT--G-----CATG-------------C-CT-T-GCGTATC-GAATC-A---A-C----TG--A-GAG-ACATTA--CACA-C-A-TAA--GCAG--G-T-G-A--------TAGTGGTAACATTACTA---------------C-ANAGA-A---A-G--G-AA--AGTTGAC---GAT------T-GCAAAG--------TCAAAGTC--ATCA-CGC------TTATCA-T--ATA-ATG--------TAGTTGT-C--AGTC------TGC----C-ATTAGAG-TC-AA-TATTAAGTA-AAATATCC-A---AAT------------ATGAAGCAGATCTGTCAGATTCTGTGGTGTCCT---TTA-TTTCGAGTTCGTCGGGATA-TATCAAAATGGA-CATA-ATTGTGAAAATTATGATTGTTAATTGAT---AG-ACATC-ATCTATATACCT----ATA-----TGTAAGG-TTG-AA---GGACACN-GCAAG---------------TTTT----TTGTTTTT------AT-CCCGTAACAGTTT-TTNT--A-ACA-AATTCTGCT--TTCAT-ATGGA--ATATAAAA--ATAAGTC---TGCCAATA---AG-GGGGC-ACA-AT---TAGTGCCCNT-AGGAAT-AC-CA-ACA-----------GAATTGTTGGA--AGAC--ATGGTCTCTCC---AA-AGAC------TACATAAATATT-ATCTA-T-AAGAAA----ACCC-A---------------AGCA----TGCTC-T--TA--ATATCTTACTTCA--GAGTA-CTTGTGTGGG--CAATCAGAGT---------------------GGTTCTN-------------ACAAAAATATGTGTCTT--GTTT-----CCCCAA----CG-ACCAGAAACTTGTTA--TT---TTCGGG---TGCC-G-TTTT----TTGT---------TT-AAAANCA-ATTA--------T--CAAT--T--CT-GAAAAA-G---CCT-AGAT--TT-T--ATTTT--AT-CGTGAGAGGAATCGTTG-----------TAGTAAAG--TGGTGGAGAAA-TC-ATACG-TTTTG-ATGCAGTCAATTGTCTCAGCATTGGAAACAANTCTCGTGATTNAAAGTTGTTTTNGTATAAAGCTGGGCCTTTAGAGGGGGCGTTTTT----TGAGA-ATCC-CAATC--TGAA-TG-ACACCA-TTCTGGAATA-TGTAGCGG-AACAGTATATCNTGAAG---TGACT-TTTTAACA--GCTGTTCAG--TAG-------TTT--TTAGT--A-GAC-------TAAGGGA----------T-AGAG--------------GG-----C------TG---GTA-GAGCAC--TTACTGGAA---CCAGCG-ATGTA--------TC--TTT-G-TTTGTAAGGA-TTTC---TTA-TGCG---TT---T-CGGAA-----TCCAGT-A--------AAGGT-ATGGTAA-TTCAAATTGAT-CCTGAT-TCTTCGGAAATAT-TGA---AAGTATTT-CAAACAGAAAGGTGANTTTGAAGAA-TT-TCATC-TTAGT-CAGATTGCTTGGA-GTATA-AAGT----AAGATTCCCAGATGTG---TGA--AGTA-AACCC-T-AGTT-CA-TTTAAAAAG-ACAAGTATAATA----GTGA--CTCT--TTACAAAC--A-----AAG----ACAAA-------TGTGA-ATC---ACTNTGCTTTAT--GCTGTCT--AACT---A-TAACAA-AGTTTTCACG-----TG----TNTAA--CTCA-TTTACNCACTTCTG---GCT-TC-----TTAA-GACAG-----AAGGATAAATAGT-CG--ATTTTCCC---CGC-----TAAA----TGGTTAC----GGATTTT-AATNATTTCCGAA-TANTTTTGATCA-TTCAGACAAAGTGTCAAGCTCCTCTCCCT
5 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|33 ): GTTTTTGCGTTGGTGACATCAGAATTTTGGATTTTTTCAAAACTTTGGCAGTGACTGGCTTATCATATTTAAAAAGTTTTCTTTTCATGAATGCATTT
Unaligned ( gi|40 ): TTAAAAGTGAAGATAACAAACAGTGATCTATGTCATAATTCCTATAAAAAATTGAAATCTAA
Unaligned ( gi|43 ): GATCTGAGGTCCAGGGGTGATGAATATAGCATACTTCCATGTTGATTGATT
Unaligned ( gi|45 ): TATTAAGTGATGCCATACATAGAGGATCTTGAATGAGT
Unaligned ( gi|48 ): TAGTCGATACTAAAATTCATGCTCATTTGAT






Alignments
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            111111   11111        111                                       111111                                                                                                                  111111111111111                                                                                       111111111111                                            22           3333333333333333333333333333333333                           1111111                                                                                                          2222222222                     111111               11  1111111                                 1111111          222222222222222       44444444444444444444444444444444444                          1111             11111   22                      11111111       22222222222222222222                    111111                   111111        11111111                  111111               11  111111              22222                                                  222222222222                                                                                     1                     222  1                  2222   11111             1111             444444444444444    1111        222222                   111111111           222     1     11        11       111        111               111                11        444444444444         11  1    11  1 1      1111      222222                           11111     555555555555555     11  11     11  11            11                 11         11                         11   222222     2222  1               11  111       111   111    2222     555555555555      1   444444444444444444444  1      222222  1    111  11111    11  222222             7777777777777      222         1  22    1111    1           333333333      11                2222     11         2222        222222     2222     1  111     11    1  1      1          1        1           1     111    22        11      444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444  111   1      11         111     11     44444444  11   1 1          1   1111   1   333333333333333333333      4444444444     1       1           1      1             1   111       111                        1  1     1     1             1   111    22222               111   11                                         2222222         11        444444444444444444444444444444444   111          4444444444444444444444    111         55555555555555   11                   111   22222222  111    222222             22222        111   22222    2222      33333       1             1            1                             
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                6      3 6  222222   66666    0   000     8888888    777777 2        2 444  444444  33 33     88      2   2  1   8 2  444   2 5555   2 444 4    2 6666  4   2 2 2 555  2  2   2  2   2 8888888    1 000000000000000         2           5555  33 2     2    5  33   2   6666666 2  2   2 666  333 2   222 333333333333 333 33    2  2 666  2    2 5555    1 2     11        66 6666666666666666666666666666666666           33  33 2    444 0000000   4 33 55 2 444444   2    2    2  0       33  33 2   5555 2     9999999       3 6       2  33  33        2222222222  3    666666 44     333333 33       3  3 11  6666666     1 555     3         3   3   0000000     999  555555555555555    3  77777777777777777777777777777777777  3 3       3     3 555 3 7777  8888   3   33333   00 6 3   77   44  3 6 3 22222222       44444444444444444444  6666   3   44   3 222222  6 3  33    555   222222 3      22222222 0     44    7    000000    4   66   4 00  777777       8888   00000   99999 4       5  5  5     0  5      5    777   222222222222        0  1                     888   5   5      4  1 5   6  7  7  3    6    6      1     1               111  1     5            3333   66666       8   8 4444      77     888888888888888    4444        333333 88    0        8  444444444  8     3  999     0  6  33    44  33  3    777        444  8     8   8  444        1 8     66  8  8  333333333333 3       11  6    99  0 0    5 4444 8    333333     6   0  8     6 6      77777   8 000000000000000   8 11  11   8 11  11     3 6    99      8  0       11 0       33      1  5           55  33   777777     1111  0        6   9  33  777       777   444    1111     111111111111   1  0   555555555555555555555  0      666666  0    777  22222    33  111111       0     7777777777777      555         3  00  3 7777    3           777777777      88  1          1  4444     66         2222        888888     8888     3  555     88    3  3      3          3     3  3     7     0     777    99        33  3   777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777  777   0    3 33      2  777 2   22  6  66666666  33   0 0  3 3     0   7777   0 2 999999999999999999999 2    9999999999     0       0           0      0       3 66  0   777       999     2  3     1     3   0  0     0     0             0   777    44444 0   2         444   11    8  3  8 8  0 8 88         8        0 3333333 8888  1 11 1      111111111111111111111111111111111   777   1      8888888888888888888888  1 000         33333333333333   11 0  8  0  8 0    0 444   66666666  000    777777    0    7   88888        777   55555    1111   3  22222       3   1         3  1         3                    6        
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                .      . .  ......   .....    .   ...     .......    ...... .        . ...  ......  .. ..     ..      .   .  .   . .  ...   . ....   . ... .    . ....  .   . . . ...  .  .   .  .   . .......    . ...............         .           ....  .. .     .    .  ..   .   ....... .  .   . ...  ... .   ... ............ ... ..    .  . ...  .    . ....    . .     ..        .. ..................................           ..  .. .    ... .......   . .. .. . ......   .    .    .  .       ..  .. .   .... .     .......       . .       .  ..  ..        ..........  .    ...... ..     ...... ..       .  . ..  .......     . ...     .         .   .   .......     ...  ...............    .  ...................................  . .       .     . ... . ....  ....   .   .....   .. . .   ..   ..  . . . ........       ....................  ....   .   ..   . ......  . .  ..    ...   ...... .      ........ .     ..    .    ......    .   ..   . ..  ......       ....   .....   ..... .       .  .  .     .  .      .    ...   ............        .  .                     ...   .   .      .  . .   .  .  .  .    .    .      .     .               ...  .     .            ....   .....       .   . ....      ..     ...............    ....        ...... ..    .        .  .........  .     .  ...     .  .  ..    ..  ..  .    ...        ...  .     .   .  ...        . .     ..  .  .  ............ .       ..  .    ..  . .    . .... .    ......     .   .  .     . .      .....   . ...............   . ..  ..   . ..  ..     . .    ..      .  .       .. .       ..      .  .           ..  ..   ......     ....  .        .   .  ..  ...       ...   ...    ....     ............   .  .   .....................  .      ......  .    ...  .....    ..  ......       .     .............      ...         .  ..  . ....    .           .........      ..  .          .  ....     ..         ....        ......     ....     .  ...     ..    .  .      .          .     .  .     .     .     ...    ..        ..  .   ..........................................................................................  ...   .    . ..      .  ... .   ..  .  ........  ..   . .  . .     .   ....   . . ..................... .    ..........     .       .           .      .       . ..  .   ...       ...     .  .     .     .   .  .     .     .             .   ...    ..... .   .         ...   ..    .  .  . .  . . ..         .        . ....... ....  . .. .      .................................   ...   .      ......................  . ...         ..............   .. .  .  .  . .    . ...   ........  ...    ......    .    .   .....        ...   .....    ....   .  .....       .   .         .  .         .                    .        
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                2      1 2  222222   00000    7   000     5555555    222222 7        5 444  888888  44 44     44      7   7  7   0 7  444   4 0000   4 111 7    2 9999  4   4 4 4 333  4  4   1  1   1 2222222    0 222222222222222         2           0000  22 4     5    0  22   2   0000000 1  1   1 666  777 1   555 666666666666 999 11    4  4 555  4    4 0000    8 4     88        55 6666666666666666666666666666666666           22  22 4    111 0000000   7 22 66 4 999999   5    5    5  8       44  44 5   7777 7     3333333       1 2       9  99  99        4444444444  1    555555 22     111111 99       3  3 22  7777777     0 888     3         3   3   8888888     666  222222222222222    6  88888888888888888888888888888888888  6 6       3     3 888 3 5555  5555   3   99999   77 7 3   99   66  3 7 3 11111111       00000000000000000000  5555   1   33   3 666666  7 3  33    888   999999 3      11111111 1     66    3    555555    0   11   4 66  222222       9999   00000   66666 4       0  0  0     4  0      0    888   888888888888        7  7                     888   0   3      3  7 7   7  3  2  5    7    7      3     7               444  4     7            3333   77777       0   0 8888      77     333333333333333    2222        000000 88    8        0  888888888  0     2  222     0  5  88    55  88  2    555        000  0     0   0  000        0 0     88  0  0  888888888888 8       00  0    00  0 6    0 8888 0    000000     0   8  0     7 7      88888   0 000000000000000   0 00  00   0 00  00     8 0    00      0  8       00 8       22      0  6           88  88   555555     2222  0        5   2  88  555       555   000    2222     888888888888   0  0   888888888888888888888  0      222222  0    555  00000    88  555555       7     3333333333333      000         3  77  7 3333    3           000000000      00  0          0  0000     00         5555        777777     3333     3  333     33    3  3      3          3     7  3     3     8     555    22        88  2   222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222  555   0    2 88      5  555 5   55  5  22222222  88   0 0  2 2     0   8888   0 5 555555555555555555555 5    5555555555     0       0           0      0       2 55  0   555       555     5  2     0     2   0  0     0     0             0   222    55555 2   5         000   00    0  2  0 0  8 0 88         0        8 6666666 2222  4 00 4      000000000000000000000000000000000   555   0      0000000000000000000000  2 222         88888888888888   00 8  0  8  8 6    8 000   22222222  222    555555    8    3   88888        555   00000    2222   2  00000       3   0         3  0         3                    7        
consensus                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            AAAT-GGCGAA-G-TA----A-CAAN----GTGTTAAA---CGTAAT------CATA------G-TCCCAAAA-A---CAT-----AT--A--CAAAA--TCGAGT-GTA-GGGCAA-C-AC---GGA-C----CTC-C---G-ACAA-A----AG-CGA-A-G-G--CAG-GA-TCA-GG-TGC-C-----A-TGGAGGG-----A--------GTAAGCATC-CTCTGCTGACC----GG--T-CACAC-CCGC-CG--TGA-GCC-C-----T-TA-GTC-G---AA---A-CAA-A-G------------T---A--AACG-GG-G---TT-ACCC-G----TCGTCA-AATCTAAGTACGAAA--AC--G-CA-GTCTAAACAAAATG-GGTA-AAT---GAAACAAATCA--GT--C-AACA---T-------ATG-A--C--T-T---A--GTG-ATAA-TTTG-TAATCGCAAA--CA--A-GGT----C-ATTAT-------AGCGACC-G-TAGAATT-TG--CG--AAATGATG---ACTTT--AA-CGAGAATTC-G--TTATA------A-CCCTGCAA-CA-T--CA-A--C--TTTTTGG---TTAGT-AGTTGGCCT-CGC-TTT-------AAAAA--ATC--T--C-------A-TACG-CA-----T--G-----CAT--G-------------C-CT-T-GCGTATC-GAATC-A---A-C----TG--A-GAG-ACAT-TA-CACA-C-A-TAA--GCA--GG-T-G-A--------TAGTGGTA------ACA----------TT----ACT-ACA-NAGA-A---A--GG-A-AAGTTGAC---GAT------T-GCAAAG--------TCAAAGT--CATC-ACGC------TTAT-CAT--ATA-A--TG------TAGTTGT-C--AGT-----CTG--C--C-ATTAGAG-TC-AA-TATTAAGT-AAAATA-TCCA---AAT------------ATGAAGCAGATCTGTCAGATTCTGTGGTGTCCT---TTA-TTTCGAGTTCGTCGG-GAT-ATATCAAAATGGA-CATA-ATTGTGAAAATTATGATTGTTAATTGAT---AG-ACATC-ATCTATATACCT----ATA-----TGTAAGG-TTG-AA---GGACAC-NGCAAG---------------TTTT----TTGTTTTT------AT-CCCGTAACAGTTT-TTNT--AA---CA-AATTCTGCT--TTCAT-ATGGA--ATATAAAA--ATAAGTC---TGCCAATA---AG-GGGGC-ACA-AT---TAGTGCCCNT-AGGAAT-AC-CA-AC--A---------GAATTGTTG--GA-AGAC--ATGGTCTCTCC---AA-AGAC------TACATAAATATT-ATCTA-T-AAGAAA----ACCC-A---------------AGC-A--TG--CTC-T--TA--ATATCTTACTTCA-AGAGTA-CTTGTGTGGG--CAATCAGAGT-GGTTCTNACAAAAATATGTGTCTTG--TTT-----CCCCAA----CG-ACCAGAAACTTGTTA--TT---TTCGGGT---GCC-G-TTTT----TTGTT---------T-AAAANCA-ATTA--------T--CAAT--T--CT-GAAAAA-GC---CT-AGAT---TT-T-A-TTTT--AT-CGTGAGAGGAATCGTTGTA-----------GTAAAGT--GGTGGAGAAA-TCA-TACG-TT-TTGA-TGCAGTCAATTGTCTCAGCATTGGAAACAANTCTCGTGATTNAAAGTTGTTTTNGTATAAAGCTGGGCCTTTAGAGGGGGCGTTTTT----TGAGA-ATCC-CAATC--TGAA-TG-ACACCA-TTCTGGAATA-TGTAGCGG-AACAGTATATCNTGAAG---TGACT-TTTTAACA--GCTGTTCAG--TAG-------TTT--TTAGT--A-GAC-------TAAGGGA----------T-AGAG--------------GG-----C------TG---GTA-GAGCAC--TTACTGGAA---CCAGCG-ATGTA--------TC--TTT-G-TTTGTAAGGA-TTTC---TTA-TGCG---TT---T-CGGAA-----TCCAGT-A--------AAGGT-ATGGTAA-TTCAAATTGAT-CCTGAT-TCTTCGGAAATAT-TGA---AAGTATTT-CAAACAGAAAGGTGANTTTGAAGAA-TT-TCATC-TTAGT-CAGATTGCTTGGA-GTATA-AAGT----AAGATTCCCAGATGTG---TGA--AGTA-AACCC-T-AGTT-C-ATTTAAAAAG-ACAAGTATAATA----GT-GA-CTCT--TTACAAAC--A-----AAG----ACAAA-------TGTGA-ATC---ACTNTGCTTTAT--GCTGTCT--AACT---A-TAACAA-AGTTTTCACG-----TG----TNTAA--CTCA-TTTACNCACTTCTG---GCT-TC-----TTAA-GACAG-----AAGGATAAATAGT-CG--ATTTTCCC---CGC-----TAAA----TGGTTAC----GGATTTT-AATNATTTCCGAA-TANTTTTGATCA-TTCAGACAAAGTGTCAAGCTCCTCTCCCT
Reference ( family-568 )      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            AAAT-GGCGAA-G-TA----A-CAAN----GTGTTAAA---CGTAAT------CATA------G-TCCCAAAA-A---CAT-----AT--A--CAAAA--TCGAGT-GTA-GGGCAA-C-AC---GGA-C----CTC-C---G-ACAA-A----AG-CGA-A-G-G--CAG-GA-TCA-GG-TGC-C-----A-TGGAGGG-----A--------GTAAGCATC-CTCTGCTGACC----GG--T-CACAC-CCGC-CG--TGA-GCC-C-----T-TA-GTC-G---AA---A-CAA-A-G------------T---A--AACG-GG-G---TT-ACCC-G----TCGTCA-AATCTAAGTACGAAA--AC--G-CA-GTCTAAACAAAATG-GGTA-AAT---GAAACAAATCA--GT--C-AACA---T-------ATG-A--C--T-T---A--GTG-ATAA-TTTG-TAATCGCAAA--CA--A-GGT----C-ATTAT-------AGCGACC-G-TAGAATT-TG--CG--AAATGATG---ACTTT--AA-CGAGAATTC-G--TTATA------A-CCCTGCAA-CA-T--CA-A--C--TTTTTGG---TTAGT-AGTTGGCCT-CGC-TTT-------AAAAA--ATC--T--C-------A-TACG-CA-----T--G-----CAT--G-------------C-CT-T-GCGTATC-GAATC-A---A-C----TG--A-GAG-ACAT-TA-CACA-C-A-TAA--GCA--GG-T-G-A--------TAGTGGTA------ACA----------TT----ACT-ACA-NAGA-A---A--GG-A-AAGTTGAC---GAT------T-GCAAAG--------TCAAAGT--CATC-ACGC------TTAT-CAT--ATA-A--TG------TAGTTGT-C--AGT-----CTG--C--C-ATTAGAG-TC-AA-TATTAAGT-AAAATA-TCCA---AAT------------ATGAAGCAGATCTGTCAGATTCTGTGGTGTCCT---TTA-TTTCGAGTTCGTCGG-GAT-ATATCAAAATGGA-CATA-ATTGTGAAAATTATGATTGTTAATTGAT---AG-ACATC-ATCTATATACCT----ATA-----TGTAAGG-TTG-AA---GGACAC-NGCAAG---------------TTTT----TTGTTTTT------AT-CCCGTAACAGTTT-TTNT--AA---CA-AATTCTGCT--TTCAT-ATGGA--ATATAAAA--ATAAGTC---TGCCAATA---AG-GGGGC-ACA-AT---TAGTGCCCNT-AGGAAT-AC-CA-AC--A---------GAATTGTTG--GA-AGAC--ATGGTCTCTCC---AA-AGAC------TACATAAATATT-ATCTA-T-AAGAAA----ACCC-A---------------AGC-A--TG--CTC-T--TA--ATATCTTACTTC--AGAGTA-CTTGTGTGGG--CAATCAGAGT-GGTTCTNACAAAAATATGTGTCTTG--TTT-----CCCCAA----CG-ACCAGAAACTTGTTA--TT---TTCGGGT---GCC-G-TTTT----TTGTT---------T-AAAANCA-ATTA--------T--CAAT--T--CT-GAAAAA-GC---CT-AGAT---TT-T-A-TTTT--AT-CGTGAGAGGAATCGTTGTA-----------GTAAAGT--GGTGGAGAAA-TCA-TACG-TT-TTGA-TGCAGTCAATTGTCTCAGCATTGGAAACAANTCTCGTGATTNAAAGTTGTTTTNGTATAAAGCTGGGCCTTTAGAGGGGGCGTTTTT----TGAGA-ATCC-CAATC--TGAA-TG-ACACCA-TTCTGGAATA-TGTAGCGG-AACAGTATATCNTGAAG---TGACT-TTTTAACA--GCTGTTCAG--TAG-------TTT--TTAGT--A-GAC-------TAAGGGA----------T-AGAG--------------GG-----C------TG---GTA-GAGCAC--TTACTGGAA---CCAGCG-ATGTA--------TC--TTT-G-TTTGTAAGGA-TTTC---TTA-TGCG---TT---T-CGGAA-----TCCAGT-A--------AAGGT-ATGGTAA-TTCAAATTGAT-CCTGAT-TCTTCGGAAATAT-TGA---AAGTATTT-CAAACAGAAAGGTGANTTTGAAGAA-TT-TCATC-TTAGT-CAGATTGCTTGGA-GTATA-AAGT----AAGATTCCCAGATGTG---TGA--AGTA-AACCC-T-AGTT-C-ATTTAAAAAG-ACAAGTATAATA----GT-GA-CTCT--TTACAAAC--A-----AAG----ACAAA-------TGTGA-ATC---ACTNTGCTTTAT--GCTGTCT--AACT---A-TAACAA-AGTTTTCACG-----TG----TNTAA--CTCA-TTTACNCACTTCTG---GCT-TC-----TTAA-GACAG-----AAGGATAAATAGT-CG--ATTTTCCC---CGC-----TAAA----TGGTTAC----GGATTTT-AATNATTTCCGAA-TANTTTTGATCA-TTCAGACAAAGTGTCAAGCTCCTCTCCCT
gi|1                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           AAACAGGGTA-TGCA-AA-----AAACCAATCA--AT--C-AATA---TCATTTTTATGTAGTC--TCT---ATTGTG--TACCTTTG-TAATCGCAAA--CA--ACGGT----CCATTAT-------AGCGACC-G-TAGTATT-TG--CG--AAATGATG---A-TTT--AA-CGAGAATTC-G--TTATATC----A-CCCTGCAA-CA-T--CAGA--C--TTTTTGG----TAGT-AGTT-GCCT-CGCTTTT-------AAAAA--ATCA-T--C-------A-TACGACA-----TG-G-----CAT--G-------------CTCT-T-GCGTATCTGAATC-A---A-C----TG--A-GAG-ACA--TA-CACACC-A-TGAACGCAGCGG-TGG-A--------TAGTGGTACATTATACATTCTTTGTTCTT----ACT-ATG-AATA-A---GTTGA-ACAAGTTGACTTGGAT------T-GCCAAGCCTATCCTTCAAA-T--CATCAACGCCCCCCTTTATCCCT--ATA-ACTCGCACCGCTAGTTG--C--AGTGTCGCTTGTTC--CGATTAATG-TCGAA-TATTTTGTGGAAATATTTTA---AATCACTTCATAACAACGAAGCAGATC-GTCAGATTCTGTGGTGTCCT---TTACTTTCGAGTTGTTCGGTGAT--T-TCAAATGGGACCATACATTATGAAAATCATGATTGTTAATTGATATAAA-ACATCAATCTATATACTTTCAAATATATTTTGTTAGGTTTGCAACTGAGACACGTGCAAGA--------------TTTTTTCGTTGTTTTTTAAAAAATCCCCGTAACAGCCTATTTT--GAATCCA-AATTC-GCTAGTTGCTAATAGA--ATTTAGAATCAT-AGTC---TGCCAATATTTAGTGGGGCAACAGACTCATAGTGTCCATAAGGGATAAT-CACAC--ACTTACCTAGGAATGTTTG--GAGAGACA-ATGG-CTACAC---AATAGACACCAATTACAT-AGT-TT-ATCTATT-ATTAGA----ACCCAA---------------AGC-A--TGAATAA-T--TA--ATATCTT-CTTCA-AGAGCACCTTGTATGAGATTAATCAG
gi|1                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               tttcaaactaccataccggaaaaACAAAAATATGCAT-TTAAATTT-----CCCCAA----CG-ACCAGAAACTTGTTACCTTAAGTTCAGGTTTTGCC-G-TTTTGGTGTTGTTCCAAACCCTT-GAAACCA-ATTAATCACTTTT--CAAT--T--CTCGAAAAA-GCGCCCT-GGATAATTT-T-AATTTC--AT-TGTGAGAAGAATTGTTGTAATATTGGGTTAGTAGAGCTCGGGGCAGAAA-TCAATAAG-ATATTGAATGCAGTCAATTGTCTCAGCATTGAAAACAACTCTCGTGATTTAAAGTTGTTTTAGTATAAAGCTGGGCTTTTAGAAGGGGCATTTTCACCGTGAGA-AT-T-CAATCTTTGAATTG-ACACCA-TTCTGGAATA-TGTAGCGG-AATAGTATATCCTGATATTCTGACTCTTTTAACAGCGCTGTTCAAGCTAGTTTAAGCTTT--TTAGT--ATGACAATCTTTTAAGGTA----------TAAGAG--------------GGGTCACT------TG---GTATGATCACTATTTCTGGAACCGCCAGCG-AC-TACTAACTACTT--TTT-GTTTTGTAAGGA-TCTCACTTTATTGCA---TT---TCCGGAG-----T-CAGT----------AAGGT-ATGGGAATTTCAAGTTGGTCCCTCGT-CCTTCGG-AATAT-TGA---AAGTATTTACAAACAGAAAGTTGATTTTGAAGAATTT-TCATCTTTAGTAAAGGTTGCTTGTA-GTAAT-AAGT----AAGATTCTCCAACCTGTTCTGA--AGTA-AA-CC-T-AGTT-C--TTTAAAAGC-ACAAGTATAA-A----GTAAA-CTTT--TAACAAACGGA-----AAGCACCATAGC-------TGT-A-ATC---AGTGTACTTT-T--GCTCTCT---TCT---G-TTAC----GCCTCTAC------TG----TATAA--CTTA-TTTACCCCCTTCTGTTTGCT-TCTCTCGTT---GACAGAAATTAAGGATAAA-AGTCCG--CTTTTTTCCAACGC-----TAAA----TGGTTAttattgcattttggggggtgttttggttcttttcattcttataaacaaaaatatgcatttaaatttccccaacgaccagaaacttgttaccttaagttcaggttttgccgttttggtgttgttccaaacccttgaaaccaattaatcacttttcaattctcgaaaaagcgccctggataattttaatttcattgtgagaagaattgttgtaatattgggttagtagagctcggggcagaaatcaataagatattgaatgcagtcaattgtctcagcattgaaaacaactctcgtgatttaaagttgttttagtataaagctgggcttttagaaggggcattttcaccgtgagaattcaatctttgaattgacaccattctggaatatgtagcggaatagtatatcctgatattctgactcttttaacagcgctgttcaagctagtttaagctttttagtatgacaatcttttaaggtataagaggggtcacttggtatgatcactatttctggaaccgccagcgactactaactactttttgttttgtaaggatctcactttattgcatttccggagtcagtaaggtatgggaatttcaagttggtccctcgtccttcggaatattgaaagtatttacaaacagaaagttgattttgaagaattttcatctttagtaaaggttgcttgtagtaataagtaagattctccaacctgttctgaagtaaacctagttctttaaaagcacaagtataaagtaaacttttaacaaacggaaagcaccatagctgtaatcagtgtacttttgctctcttctgttacgcctctactgtataacttatttacccccttctgtttgcttctctcgttgacagaaattaaggataaaagtccgcttttttccaacgctaaatggttaatatggaatttgttacaaataaggtttttacttt
gi|10                         : tttcaaactaccataccggaaaaaaacagggtatgcaaaaaaccaatcaatcaatatcatttttatgtagtctctattgtgtacctttgtaatcgcaaacaacggtccattatagcgaccgtagtatttgcgaaatgatgatttaacgagaattcgttatatcaccctgcaacatcagactttttggtagtagttgcctcgcttttaaaaaatcatcatacgacatggcatgctcttgcgtatctgaatcaactgagagacatacacaccatgaacgcagcggtggatagtggtacattatacattctttgttcttactatgaataagttgaacaagttgacttggattgccaagcctatccttcaaatcatcaacgcccccctttatccctataactcgcaccgctagttgcagtgtcgcttgttccgattaatgtcgaatattttgtggaaatattttaaatcacttcataacaacgaagcagatcgtcagattctgtggtgtcctttactttcgagttgttcggtgatttcaaatgggaccatacattatgaaaatcatgattgttaattgatataaaacatcaatctatatactttcaaatatattttgttaggtttgcaactgagacacgtgcaagattttttcgttgttttttaaaaaatccccgtaacagcctattttgaatccaaattcgctagttgctaatagaatttagaatcatagtctgccaatatttagtggggcaacagactcatagtgtccataagggataatcacacacttacctaggaatgtttggagagacaatggctacacaatagacaccaattacatagtttatctattattagaacccaaagcatgaataattaatatcttcttcaagagcaccttgtatgagattaatcagttattgcattttggggggtgttttggttcttttcattcttataa--TGA-GCC-------T-TACATC-GTT-GA---T-CAG-A--------------T---A--AACA-GGTG---CT-TCTT-G------GTAT-AATTTA-GTATGTAA--AG--A-CC-GGCTTAACAA--TT-GG---AAT---GAAACGCTTCA--GA--C-AACAACCT-------AC--A--C--G-T---A--CCT-ACAA-GTTG-TATTTGCAAATGCA--A-AATAAACC-ATCAT-------AACGACC-A-TAGAATT-TG--TA--AA----------C------A-CGAGA--------TTGTA------------GAAA-C--T--C-----C--TGTTTG----TCAGT-ATCACGCCT-TGG-TTT-------AAGAC--TTTA-T--C-------A-CACT-CAGAATCT--G-----TTTTCG-------------C-AT-T-TC-TATT-GGATC-AGTTA-CATTTTGCAG-GAG-ACAA-AATCAC--C-A-TAA--ACA--AG-T-G-A--------AAATAG-A------ATA----------TT----GCT-ACA-T-GA-ATACA--GG-A-AA-TTGAC---GAT------G-GAAAAG--------TTAAAGC--AATC-TCGC------TTGT-CATCAAGA-AG-GG------TTGTTGT----AAT-----TTG--C--C-TTGAACG-TC-TA-TGTTCAGT-AAATTA-TCCA---AAT------------ATGAatatggaatttgttacaaataaggtttttacttt
gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            gaacacgtcccggtaaCA-GG-TGG-C-------TAGAAGG-----A--------GTGAGTATC-----GC---CC----GA--T-CACAC-CTGC-CG--TTA-GCC-C-----T-GA--TC-T---TG---A-TCA-G-G------------T------AACGCAA-G---TA-ATCC-G----TAGTCA-AA-CTCAGTATGCAA--AC--G-GATATC-GAAC--AATC-GGTA-AA-----AAGC--ATTA--G------GCG---T-------TTG-G--T--C-C---A--TTGTATAA-CTTG-TATCTGTAAA--TA--A-GAT----C-ATT
gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               tttactcagtatacacatgtatatgtctttgaagtcggttatgatgttcaatgcaacgacatcggtatacatgtacttcaaacgaactacacgtttaccgtgacatcaaagtaaatatatgtttagcggactttttttctgcctatatatagttacggcactggatttcttatgaacaagtgaaaattacgaacagtgactaatctcttagatcctaaattaaaagtactagtatacaaacaaagatccctagccaagATCATGAAG---TGACG-TCTTAACA--GC----------AG-------TTA--CTAGT--A-G--------------GA----------T-AGAG--------------GG-----C------TGCGGGTA-GAGC-C--TTAGTG-AA---CCAGCG-ATGTAA-------TCATTCT-G-TTTG-AAGGAGTTTT---TTA-TGCA---T------CGAAAAAAAATCCAAT-ATAAAAAACAAGGT-ATGGTAA-TTTCAATTGAT-CCTGATGTCTTTGGAAA-ATATGAAGCAAATGTTT--AAACA-AAAGGTGGATTTGAAGAA-GTATCACT-TTAGT-CAGATGTCTTGGA-GTA-A-GATT----AGTATT-CCAAATGAC---TGA--AGTG-AATCC-T-AGTTAC-AGTTAAAAGGCATAAGTAT-GTA-----T-GA-CTAT--TTATCAAC--AC----AAG----ACAAA-------TGTGA-ATC---ACTTGGCTTTATCAGCTG-----AACT---A-TATCAA-AGTTTTCATG-----TGCGTCTTTAA--C-CA-TTTACACACGTC-----GCTCTG-----TAAA-GACAG-----AAGGCTA
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       tccGTTTTT----TGATATATCC-CCATC--GGTA-TG-ACACCA-TTCTGGAATAATGTAGGTG-GACAGTATCTC-TGAAA---AGACTGTTTTAACA--GCTGTTTAG--TAG-------TTT----AGTTTA-GAT-------TAAGGAAGAGGCTTGGTT-AGAGCACTTACTTGAACTAG-----CATATATTG---GTA-GAGCAC--TTACTGGAA---C-AGC--ATATA--------TC--TTT-G-TT-GTAAGGA-ATTG---TTA-T-TG---TTAATT-CG-AA-----TCCAGTTA--------AAGGTCATTGTAA-ATCAAATTGAT-CCAGAT-TCTTCGGAA-TAT-TGA---AAGTATT--CAAACAGAA-GGTGAATTTGAAGAA-TT-CTATC-TTAGT-CAGATTGCTTGGAGGTATATAAGT-----AGATTCCCAGATGCT---CGA--AGTA-CACCCTT-AG-T-C-ATCTTAAAAG-ACAAGTACAG-A----GT-CAGCTCTAGTTACAA
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    agtgtagaAAA--GGCAAA-GATA----A-CGAACA--GTGATCAATCTCGTAA-----------------G-TCCTAAAT-A---GA------AT--A--CAAAA--ACAAGA-GTC-GGGCAATC-AC---GGA-C----CCC-T---GGACAC-A----C--CAG-A-A-G--TGG-GA-TCA-GG-TGC-C-------TAGGGGG-----A--------GTAAGCACC-CCCTGTTGACC----GG--T-CACAC-CCGC-CG--TGA-GCC-C-----A-TA-GTC-T---TG---A-TCA-G-G------------T---A--AACG-GA-----------C-A----TC-----AGT----GTGTGAAA--A---A-CG-G-CTTAAC--AATG-GCT---AT---GAAACACATCA--GA--C-AGCA---T-------TTG-A--C--T-C---A--ATG-ATAG-GTCA-TATTGGTAAA--CT--A-AAT----T-GTTAC-------AACGACC-A-TAGAATT-TA--CG--AAATGCTGC--ATTTA--AA-CGTGACT---G--TTGAA------ACCCCTGCAA-CA-TACCG-A--C--TTTT
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     ggatgtA-C----CTC-T---A-ACAA-A----GG-CGA-A-G-G---AG-GG-TCA-GG-TGC-C-----A--GGAGG------A--------GTAAGCATC-CTCTGCTGACC----GG--T-CACAC-CCAC-CG--TGA-GCC-C-----T-TA-GTCGG---AA---A-TAA-G-G------------T---A--ataaatcatgcactttcttttcaaagtacatgtatatttgcacatgaaat
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           caaatAAATAAGGTA---T---GAACAAAATCA--GT--C-AACA---T-------ATGGA--CCTT-T---A--GTG-ATAA-TTTG-CAA-CGCAAA--CA--A-GGT----C-ATTAT-------ACCGACC-ATTAGAATT-TG--CGAAAAATGATG---ATTTTTAAA-CGAGATTTC-G--TTATA------A--CCTGCAA-CATT--CA-A--CTTTTTTTGT---TTAGC-AGTTAGCCTAAGC-TTT-------AAAAA--ATCTTT--C-------ATTACG-CG-----G--A-----CAT--G-------------CTCT-T-GC-TATC-GAATC-A---A-CT---TGC-G-GAGTAAAT-TA-CACATC-A-TAA--GCA--GGATGG-A--------TAGTGGT-------GTA----------TT----ACT-ACtgaacaaaatcagtcaacatatggacctttagtgataatttgcaacgcaaacaaggtcattataccgaccattagaatttgcgaaaaatgatgatttttaaacgagatttcgttataacctgcaacattcaactttttttgtttagcagttagcctaagctttaaaaaatctttcattacgcggacatgctcttgctatcgaatcaacttgcggagtaaattacacatcataagcaggatggatagtggtgtattactacttctttcgttacttggataattttattgaacattgac
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              caaatacctctaacaaaggcgaaggagggtcaggtgccaggaggagtaagcatcctctgctgaccggtcacacccaccgtgagcccttagtcggAAAT-GGCGAA-G-TA----A-CAATTAAAGTATCAAA---CGTA-T------CATA------G-TCCCCAAA-A---CAC-----AT--A--CAAAA--TCGAGT-GTA-GG-CAA-T-AC---GGA-C----CTT-C---G-ACAA-A----AG-CGA-A-AAG--CAG-GAATCAAGG-TGC-C-----A-TGGA-GG-----A--------GTAAGCATC-CTCTGCTGACC----GG--TCCACAC-CCGC-CG--TGA-GCC-C-----T-TA-GTC-G---AA---A-CAA-A-G------------T---A--AACG-GG-G---TT-ACCC-G----TCGTCA-AATCTAG--ACGAAA--AT--GACA-GCCTAACTAACAAG-GGTATAA-----AAACAAATCA--GT--C-A--A---T-------ATG-A--C--T-G---A--GTG-ATAA-TTTG-TAATCGCAAA--CA--A-GGT----C-ATTAT-------AGCGACCGG-TAGAATT-TG--CG--AAATGATG---ACTTTAAAA-CGAG-ATTCAG--TTATA------A-CCCTGCAttctttcgttacttggataattttattgaacattgac
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        taA-T-AAGAAA-----CCC-A---------------AGC-A--TG--CTCAT--TA--ATATCTAACTTC--AGAGTA-CTTGTGTGGG--CAATCAGAG--GGTTTTCAACAAAATATGTGTCTTG--TTT------CCCAA----CG-ACTAGAAATTCG-TA--TT---TTCGGGT---GCCGG-TTTT----TTGTT---------TAAAAAGCA-ATTA--------TTATAAT------T-GAAAAAGGC---CTAAGAT---TT-TAA-CTTT--AT-CG---GAGGAATCGTTGT------------GTAAAGT---GTGGAGAAA-TC--TACGTTT-TTGA-TGCAGTCAATT
gi|18                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 aatcgaccaattgttgctaccatatgttttcctaatg---GGA-C----CTC-C---A-A-AA-ATTATAG-AGGTA-G-G--CAG-GA-TCA-GGGTGC-C-----A--GGAGGATCGTAA--------TTGAGCATC-CTCTGCTGACC----GATCT-CACACACCGC-CATCTGA-GCC-T-----TGTA-GTT-C---AA---A-CAA-A-GC-----------T---A--AACG-GG-GATTCT-ATCC------TCGTCA-AATCT-AGTACGAAA--AT--G-AA-GGCTAAACACAA-G-GGTT-ATT---GAAACAAGCAG--GT--C-AACA---T-------ATG-A--CT-T-T---A--GTG-ATAA-TTTG-T-ATCGC-AA--CA--A-tttgaaaattcttgtatt
gi|19                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          gcaaacataaaatgttatgtagattattatcgT------CATA------AATCCCATAA-A---GA------AT--A--TAAAA--C-------TA-AGGCAAAC-AC---GAA-C----CCT-T---G--CAT-AT---AC-CGG-A-G-G--TGG-GA-TCA-GG-TTT-TTTTTAA-AAGAGGG-----A---------TAAGCACC-CCTTGTTGACC-----G--T-C-CAC-TCGC-AT--TAT-ACC-C-----T-CT-ATC-T---TG---A-TCA-G-G------------T---A--AACT-GA-G---TA-ATCT-G----T----A-GGTC-AAGAACGAAA--aat
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 ttagatactgttggagacaatattggttgctcaccgaaagaatgaaaagtgaagataacgtaacagtgatccatcAAAT-GGCGAA-G-TA----A-CAAA----GTAT-AAA---CGTAAT------CATA------G-TCCAAAAA-A---CA------AT--A--CAAAAA-TCGAGTTGTAAGGGCAA-CCAC---GGAAC----CTT-C---G-ACGA-A----AG-CGA-A-G-G--CAA-GG-TCA-GG-TGC-C-----AATGGAGAG-----A--------GTAAGCATC-CTCTGCTGACC----GG--T-CACAC-CCGC-CG--TGA-GCC-T-----G-TA-GTC-G---AA---A-CAA-ATG------------T---A--AACG-GG-G---TT-ACCC-G----TCGTCA-AATCTAAGTATGAAA--AT--G-CA-GTCTAAACAAAATG-GGTA-AAT---GAAACAAATCATGGT--C-AACA---T-------ATG-A--C--T-T---A--GTG-ATAC-TTTG-TA-TCGCAA---CA----GGT----C-ATTAT-------AGCGACC-G-TAGAATT-TGTGCG--AAATGATG---ACTTT--AA-CGAGAATTC-GGTTTA-A------A-CCCTGCAA-CA-TA-CA-A--C--TTTTTGG---TTAGT-AGTTGCCCT-CG---TT-------AAAAA--ATC--A--C-------ATTACG-CA-----T--G-----CAT--G-------------C-CT-T-G-GTATC-GAATC-----A-C----CG--A-GAG-ACAT-TA-CACA-C-A-TAAT-GCA--GT-G-G-A--------TAGTGGTA------ACA----------TT----ACTAACA-AAAA-A---A--GG-A-AAAGTGAC---AAT------T-GGCAAG--------TCAAAGTCCCATCAACGT------TTAT-CAT--ATATA--TG------T-GTTTTGC--AGTC----CTG--C--C-ATTAGAG-TC-AA-TATTA--T-AAAATA-TCC----AAT------------ATGAAGCACATTGGTCAGATTCTGTGGTGT-CT---TTA-TTTCAAGTTCGTCAG-GATAATATCAAAATGGA-CATA-ATTGTG-AAATTATGATTGTTAATGGAT---AA-ACATC-GTCTATATACCT----ATA-----AGTAAGG-TTG-AA---GGACAC-TGCAAG---------------TTTT----TTGTTTTT------A--CCCG-AACAGTTT-TCCTGAAA---CA-AATTCTGCT--TTCAT-ATGGAATATATAAAA--ATAAGTC---TGCCAATA---AG-GGGGC-AAC-AT---TAGTACCCAT-AGGAA--AC-CA-AC--A---------GAATTGTTGGAGA-AGACGGAT-GTCACTCCAAAAA-AGAC------TACAATAATATTAATCTA-TAAAGCAA----ACCC-A---------------AGCAA--TG--CTC-T--TA--ATATCTTTCTTC--AGAGTA-CTTGTGTGGG--CAATCAGAGTGGGTTCTGACAAAAATATGTATC-TG--TTT-----CCCAAA----TG-ACCAGAAACTTGGTA--TT---TTCGGGT---GCC-G-TTTT----TTGTT---------C-AAAAGCA-ATTA--------T--CAAT--TTCCT-GAAAAA-GC---CT-AGAT---TT-T-A-TTTT--ATCCGT--GAGGAATTGTTGTA------------TAAAGT--GGTGGAGAAATTCA-TATG-TT-TTGA-TGCAGTCAATT---------TTAGAA--AAATCTCGTGATTGAA----GTTTTC-TATAAAGCT----CTTTAGAG-------TTTT----TGAGA-ATCCACAATC--TGAA-TGAACACCACTTCTGGAATA-TGTAGTGGAAACAG--TATCTTGAAG---TGAC--CTTTAACA--GCTGTT-AG--TAG-------TTTTGTTAGT--A-G---------TAAGGGA----------T-AGA---------------GG-----C------TG---GTA-AGGCAC--TTACTGGAA---CCAGCGAATGTA--------TC--TTTGG-TTTGTAAGGA-TTTC---TTA-TGCATATTT---T-TGGAA-----TCCAGT-A--------AAGGT-ATGGTAA-TTCAAATTGAT-CCTGAT-TCTTCGGAAATAT-TAA---ACGTATTC-CAAACAGAAAGGTGATTTTGA--GA-TT-TCATC-TTAGT-CAGATTGCTAGGA-GTATA-AAGTCAGGAAAATTCCCAGATGTG---TGA--AGTA-AACCC-TAAGTT-CAATTTAAAAAG-ACAAGTATAATA----GT-GA-CTTT--ATACAAAC--A-----AAG----ACAAG-------TG-----TT---ACTGTGCTTTAT--ACAGCCTGGAACC---AGTAACAA-AGTTTTCATGTAGTCTA----TGTAA--CTCA-TTTACCCCCTTCTG---GCT-TC-----TTAA-GACAG-----AAGGGTAAATAGT-AG--ATTTTCCC---CGC-----TAAA----TGGTTATAACGGGATTTTAAATAATTTCCGAA-TACTTTTGATCA-TTCAGACAAAGTGTCAAGAT-CTCTCCCTtaaatgttgatgcatt
gi|20                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   TA------A-TCCCAAAA-A---CAT-----AT--A--CAAAA--CCAAGT-GTA-GGGCAA-C-AC---GGA-C----CTC-C---G-ACAA-A----AG-CGA-A-G-G--CAG-GA-TCA-GG-TGC-C-----A-TGGA-AG-----A--------GTAAGCATC-CTCTGCTGATC----GG--T-CACAC-CCGC-CG--TGA-GCC-C-----T-TA-GTC-G---AA---A-AAA-A-G------------CATGA--AACG-AA-A---TC-A-----------GTCT-AA-CTA--TAC-ATG--AC--T-TA-GT---GATAATATG-CGT--AATCTGGAAACAAGTCA--TTTGC-GAAA---TG------ATG-A--C--T-T---ca
gi|21                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        aaatataaataggcgaagtTATTAAA---AGTAATTAGTAACATA------G-TGCCAAAA-A---CAT-----AT--ATACAAAA--ACGAGT-GCA-GGGCAA-G-AC---GGA-C----CTT-C---G-ACAA-A----CG-Ctaaattgagtattcgttat
gi|21                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      cC-C-----T-TC-GAC-A---AACGCA-CAA-A-A------------T---A--AACA-GG-G---TA-GCCC-G----TCGTAA-AATCTT-GTACAAAA--ATAAG--A-GTCTGA-CAAA--G-GGTA---C---GAAACAGATCA--GT--C-AACA---C-------ACG-A--C--T-T---C--GTG-ATAA-TTTG-TAGTCGCAAA--CA--A-GGT----C-ATTAT-------AGCGACA-G-TAGAATT-TG--CG--AAAGGATG---Aacaaaataaacagggtagcccgtcgtaaaatcttgtacaaaaataagagtctgacaaagggtacgaaacagatcagtcaacacacgacttcgtgataatttgtagtcgcaaacaaggtcattatagcgacagtagaatttgcgaaaggatgat
gi|22                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           ctattaaaagtaattagtaacatagtgccaaaaacatatatacaaaaacgagtgcagggcaagacggaTATC-TAATC-A---A-C----TG--G-GAG-ATATGCA-TAC--C-A-TTT--GCA--AG-G-G-A--------TAGTGGTA-------TA----------TT----ACT-ACA-AAGACA---G--GG-A-AAGCTGAT---GAT------T-GCATTT--------TTAAAGT--CACC-AAGC------TTAT-CAT--ATA-A--TG------TAGCTGT-A--AGT-----CTG--C--C-ATTAGAG-CC-AA-TATTAAGT-AAAATA-TCCA---ACT------------AAGAAGCAGATTTGTCAAATTCTGTGGTCTCCT---TTA-TTTTGAGTTCGTCGG-Gt
gi|23                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               A-A----CG-CAC-A-G-G--CAG-GA-TCA-GG-TGC-C-----A-TGGAGG------A--------GTAAGCATC-CTTTGCTGACC----GG--T-CACAT-CCGC-CG--TGA-GCC-G-----G-TA-TTC-G---AA---A-CAA-A-A------------T---A--AACA-GG-G---TA-ACCC-G----TCGTAA-AATCT-TGTACGAAA--ATAAG--A-GTCT-GACAAA--G-GGT---AT---GAAACAGATCA--GT--C-AACA---C-------ACG-A--C--T-T---C--GTG-ATAA-TTTG-TAGTCGCAAA--CA--A-GGT----C-ATTAT-------AGCGA
gi|24                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            AAA--GGCAAA-GATA----A-CGAACA--GTGATCAATCTCGTAA-----------------G-TCCTAAAT-A---GA------AT--A--CAAAA--ACAAGA-GTT-GGGCAATC-AC---GGA-C----CCC-T---GGACAC-A----C--CAG-A-G-G--TGG-GA-TCA-GG-TAC-C-------TAGGAGG-----A--------GTAAGCATC-CCCTGTTGA
gi|25                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          cactgtgataaatggtagtattaatgtTGTG---TGATAAGTATAACCC-T-AGTT-C-ATTTATAAAG-ACAAGTATAATATTTTCT-GG-CCCC--TAACAAAA--AAATTCAAG----ACAAATTGACTTTGTAACATCTTAACTCTGTTTCA---ACTGTC-----CTGTAA-TAGCAATAGTTCTCTCG-------------TAAGGCTCATTTTAC-CACTTCTG---a
gi|26                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        AATT-TG--CG--AAATGATA---A------GA-C-AGGATT--------TA------A-GGCGACAA-CA-A--TA-A--AAATTTTTAGAATTTAGTCAGT-GGCCT-CGA-CCTGATAAGAAAAAA--ATA--T--CAAAAAATA-TACG-CA-----C--GTGGTATAT--GAC-----------C-CTCT-GCGCGAC-GAATC-A---ATC----TG--ATGAG-ACGA-TA-CA
gi|27                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                -GGCGACTG-TA----A-CAAC---------------CGT--T------CATA------A-TCCAAAAA-AATGTAT-----AT--A--CAAAAA-TCGAGT-CGA-GAGCAG-C-GCACTGGA-CACATCTT-CTGTA-ATAA-A----AGCCGA-ATG-GTTTAGTGA-T---AG-TTT-T-----A-TTGAGAG-----AAGAAAATGGTAAG------TCCACTAACC----AG--T-CA
gi|28                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      TGTCAGTGTCTGTGGTGTCCTGAATTA-TATTAAGTTCTTCGC-GAT-ATATCAAA-TGGA-TATA-ACTGTGAAAATTATGATTGTTAATTGAT---AGCACATC-ACC
gi|28                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             CAC-CGCAAG---------------TTTT-----TGTTTTT------AT-TCCGTAACAGGTT-TTG---AA---CA-AATTgcaagtttttgtttttattccgtaacaggttttgaacaaatt
gi|29                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            tgtcagtgtctgtggtgtcctgaattatattaagttcttcgcgatatatcaaatggatataactgtgaaaattatgattgttaattgatagcacat--CTCA-TT---ACACTTCTG---GCT-TT-----TTAAAGACA-------AGGATAAATAGTACGCCATTTTCCT---CGCGCGCTTAAAGTTTTAATTAC----GGATTTT-AATTACTTCCGAATTAATTTTGATCATTTCAGACAAAGTATTCAACTCCTCTCCC
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            AAAT-GGCGAA-G-TACA--A-CAAT----GTGTTAAA---CGTAA-------AATA------G-TCCCAAAA-A---CATGT---AT--A--CAAAA--TTGAGT-GTA-GGTCAA-C-AC---GGA-C----CTC-C---G-ACAA-A----AG-TGA-A-G-G---AG-GA-TCA-GG-TGC-C-----A-TGG-GTG-----A--------GTAAGCATC-CTCTGCTGACG----CG--C-CACAC-CCGT-CG--TGA-GCC-C-----T-TA-GTC-G---AA---A-CAACA-G------------T---A--AACG-GG-A---TT-ACC--G----TCGTGA-AATCTA-GTACGAAA--AT--G--A---CTGA-CAAA--G-GATA---T---GAAACAAATCA--GT--C-AACA---T-------ATG-A--C--C-T---G--GTG-ATAA-TTTG-TAATCGCAAA--GA--A-GGT----C-ATTAT-------AGCGACC-G-TATAATT-TG--CG--AAATGAT----ACTTT--AAATGAGA-TTC-G--TTATACCGTTAA-CCCTGCAA-CA-T--CA-------TTTTTGG---TTACT-AGTTGGCCT-AGC-TTT-------AAAAAT-CCC--T--C-------A-TACA-CA-----T--ATGC--CAT--GTGTTGGATATAGCC-CT-T-GCGTATC-GAATC-A---A-C----TG--A-GAG-ACAT--A-CACA-CCA-TAA--GCA--GG-T-G-A--------TATTGGTA-------CA----------TT----ACT-ACA-TAGA-A---AA-GG-A-ATGTTGAC---GATA-----T-GCAAAG--------TCAAAGT--CATC-ACGT------TTAT-TAT--ATA-A--TG------TA--TGT-C--AGT-----CTG--CATC-ATTAGAG-TC-AAATATTAAGT-AAAATA-GCCA---AAT------------ATAAAGCAGATATGTCAGATTCTGTGGTGTCCT---TTA-TTTCGAGTTCGCC-A-AAT-ATAT--AAATGGA-CATA-ATTGTG-AAATT-TTATTGTTAATTGATA--AG-ACATC-GTTTATATACCC----ATA-----TGTAAGG-TTG-AA---GGACAC-GGT------------------TTTT----TTGTTTTT------AT-CCTGTAACGTTTT-TTTT--AA---CACAATTCTAC---TTCAT-AT-GA--ATATAAAA--ATAAGTC---TGCCAATA---AG-AGGAC-ACA-AT---TAGTGTCCTT-AGGAAT-AC-CA-AC--A---------T-ATTGTTG--GA-AGAC--ATGGTTTCT-----AA-AGAC------TACATAAATATT-GTCCA-T-AAGAAA----ACCC-A---------------AGC-A--TG--CTC-T--TA--ATATC-TACTTC--AGAGTA-CTTGTGTGGG--CAATCAGAGT-GGTTCTGAC-AAAACATGT
gi|30                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          ctattaaacctgacacaatacatctgctagtcatctgggactgatgtttatatatc------ACA----------TTGTTAACT-ACA-TAAA-A-------G-A-AA--T--------T------T-GCAAAA--------CTCAAGT--CATC-ACGT------TTAT-CAT--ATA-A--TGT-----TAGTTGT-CCAAGTC----CTG-----C-ATTAGAGATT-AA-TATTAAAG-GAAGTG-TTCATGGAAT------------A
gi|31                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  T-CA-CAC--C-A-TAA--GTA--GG-T-G-G--------TAGTGGT-------ATA----------TT----ATC-ACA-TTGA-A---A--G--------------------------GCAAAG--------TTAAAGT--CATC-TTGC------TTAT-CAT--ATA-A--TG------CAGTTGT-C--AGT-----GTG--T--C-ATTAG
gi|32                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           cttatCAT-T--CAC--C-A-TAA--GCA--GG-T-GGA--------TGGTGGTA-------TA----------TT----ACT-ACA-TAGA-A---A--GGGA-AAGTTGAC---GATAGCCGATAGCAAAG--------TTAAGGT--CATC-ACGC------TTAT-C
gi|34                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    tatcctCAATA---AG-GGGGC-ACA-AT---TAGTGCCCGT-TGGAAT-AT-CA-AC------------GGATTGTTA--GT-AGAC--ATGG--TCTCC---AA-AGAC------TACACAAATATT-ATTTA-T-AAG
gi|35                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  GA-GCC-T-----T-TA-GTC-G---AA---AACAG-G-GAGGGGGGGCGGTT---ACGAGCG-GA-G---TT-ACCCTG----TCGTCAGAATCT-AGTACGGAA--A---G--A-G--TGGACAAA--G-GGTA-ctaa
gi|36                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             A-GG-T-C-C-----G-TGAATGA-----A--------GTAAGCATCTCGTTGCTGATCCGAGGA--T-CACAC-CCAC-CG--TGA-GCA-A-----T-CA-AGA-G---AA---A-CAG-A-tg
gi|37                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  gatggatggtcgCCCAACATA---CATGTATAAT--A--CAGAG--TCGA-T-GTA-GA-CAA-C-AC---AGA-C----CTAGT---A-ACAA-A----AGGCGA-G-G-G--CAG-GA-TCA-GG-TGC-C-----A-TG
gi|38                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            cc--ATTTTCCC---CGC-----TAAA----TGG----------ATTTT-AATCATTTCCGAA-TATTTGTATCCA-TTCAGACAAAGTGTCAAGCTCCTCTCCCT
gi|39                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          gcAAAT-GGCGAA-G-TATTTTA-CAAT----GTGTTTAA---CATAAT------CATA------G-TCCAAAAA-A---CAT-----GT--A--CAAAA--TCGAG
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   tttgttataAAATTGGCGAA-G-TA----AACAAT----GTGTTAAA---CGTAAT------CGTACATGTAG-TCCCTAAA-A---CAT-----AT--A--TACAACTTCGAGT-GTA-TGGCAA-C-AT---GGA-C----CTC-C---G-ACAACA----GG-CGA-A-G-C--CAG-GA-TCA-G--TGC-C-----A-TGGAGGG-----A--------GTAGGCATC-CTCTGCTGACC----GG--T-CAC-C-CCACACG--TGA-GCCTC-----G-TA-GTC-G---AG---A-CAA---G------------T---A--AACA-GG-G---TT-TACC-G----TC---------TAC-TACGAAATGAG--A-CA-GTCTAA-CAA---G-GGTA---T---GAAACAAATCA--GT--C-AGCA---T-------ATG-A--C--T-T---A--GTG-ATAA-TTTGGTAATCGCAA---CA--A-GGT----C-AT-AT-------AGCGACC-G-TAGAATCCTG--CG--AAATGCTGCGGACTTTGAAA-CGAGAACTC-G--TTATA------A-CCCTGCAAACA-T--CA-TTTC--TTTTT-----TT-GT-AATTGAC-T-CGC-TTT-------AAAG----TC--CTGC-------G-TCCG-CA-----T--GA----TAT--A-------------C-CT-TTGCGTATC-GAATC-A---A-C----TG--A-GAG-ACAT--A-CACA-CCA-TAA--GCA--GG-T-G-A--------TAGTGG-A------ACA----------TT----ACT-ACA-AAGA-A---A--GGGA-AAGTTGAC---GAT------T-GCAAA--------------GT--CATC-ACGT------TTAT-CAT--ATA-A--TG------TAGTTGT-C--AGT-----CTG--C--C-ATTAGAA-TC-AA-TTTTAAGT-AAAATA-TCCA---AAT------------ATGAAGCACATCTGTCAGATTCTGTGGTGTTCT---TTA-TTTGGAGTTCGTCAG-GAT-ATATC-AAATGGA-CATA-ATTATGAAAATTATGATTGTTAATAGATC--AG-ACATC-ACCTATATATCTAC--ATA-----TGTA
gi|41                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            actatcttatccgaatgacatcaaagattacttgaacgattgtctgtactgcaatat---AG-ACATC-ATCTATATATCT----ATA-----TGTAATG-ATG-AA---GGACAC-AGTAAG---------------TTTT----TTGTTT
gi|42                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            AAAT-GGCGAA-G-TA----A-CAAA----GTATGAAC---CGTAAT------CATA------
gi|44                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            AAAT-GGCGAA-G-TA----G-CAAA----GTATTCAA---CATAAT------CATA------A-Tcgtacacagataaaccata
gi|46                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 cgcacatttataTTTTGG---TTAGT-AGATGGCCT-CGC-TTT-------AACAA--ATC--
gi|47                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      A-A---G--GG-G-AAATTGAC---AAT------T-GCAAAG--------TCAAAGT--CAT
gi|49                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       A---AAT------------ATGAAGCACATCTGTCTGATTCTGTG
gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            AAATTGGTGAA-G-TA----AACAAT----GTGTTAAT---CGTAAT------CATA------G-TCCTAAAA-A---CAT-----ATTTA--CAAAG--TCGAGT-GTA-GGGCAA-C-AC---GGA-T----CTC-C---G-ACAA-A----AG-CGA-A-G-G--CAG-GA-TCA-GG-TGC-C-----A-TAGAGG------A--------GTAAGCATC-CTCTGCTGACC----GG--T-CACAC-CCGC-CA--TGA-GCC-C-----T-TA-GTC-G---AA---A-CAA-G-G------------T---A--AACA-GG-A---TT-ACCC-G----TTGTCA-CATCT-AGTACGAAA--AT--GACA-GTCT-AACAAAA---GGT---AT---GGGACAAATCA--GT--C-AGCA---T-------------------------------TAA-TTTA-TAATCGCAAA--CA--A-GGT----C-ATTAT-------ACCGACT-G-TAGAATT-TG--CG--ACATGGTG---ACTTTA-AA-CGAGAA-TC-G--TTATA------A-TCCTGCAA-CA-T--CA-A--C--TTTTTAG---TTAGT-AGTTGGCCT-CGC-TTT-------AAAAA--GTCT-T--C-------A-TACG-CA-----T--GA----CAT--GT------------T-CT-T-GCGTATC-TAATC-A---A-CTGCATG--G-AAA-ACAT-T--CACACC-A-TAA--GCA--GG-T-G-ATACATTTGTAGTGGT-------ACA----------TT----ACT-ACA-
gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      tatactctatatgataatatatgtcttctgaaaccgcttttacatgtttctgtgttggcgacatcggtattttgggctttttcaaaagtttggcttatatttaaaaagttttcttttcatgaatgcatttttttctgtatttttttttattgtatgtagtaaaagatatT-GGCCAA-A-TA----AACAAT----TTGATAAT---TGTAAT------CAAA------A-CCCCAAAA-----CAT-----AC--A--CAAAG--TCGAAT-GTA-AGGAAA-C-AC---AGA-C----CTC-C---G-ATAA-T----AG-CGA-A-G-G--AAT-AG-TCA-GT-CG-----------------------------------GCATC-CTCTGCTGACC----GG--T-CACAT-CCGC-CG--TGA-GCC-C-----T-TG-GTC-G---AA---A-CAA-A-G------------T---A--AACG-GG-A---TT-ACCC-G----TCGTCA-AATCTA-GTAGGAAA--AT--GACA-GTCTAA-CAAA--G-GGTA---T---GAAACAAATCA--GT--C-AACA---T-------ATG-A--C--T-T---A--ATG-ACAA-CTTG-TAATCGCATA--CA--A-GGT----C-ATT---------------------------TG--CG--AAATGGTG---ACT----------------------GTA------G-CCCTGCAA-CA-T--CA-------TTTTTTG---CTAGT-AGTTGACCT-CGC-TTT-------AAAAA--GTCC-T--C-------G-TACG-CA-----T--GA----CAT--G-------------CTCT-T-GCGTATC-GAATC-A---A-C----TG--G-AAG-ACAC--A-CACA-C-AATAA--GCA--GG-T-G-A--------TAAGGGTA-------CA----------TT----ACT-ACA-TGAA-A---A--GG-A-AAGGTGAC---GAT------T-GCAAAG--------TTAAAGT--CATC-ACGC------TTAT-CAT--ATA-A--TG------CAGTTAT-C--AGC-----CTA--C--C-TTTAAAG-TC-AA-TATTAAGT-AAAAAA-TCCA---AAT------------ATGAAGCAGATATGTCAGATTCTGTGGTGTCCT---TTA-
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                atagatTGTCAGATT--GTGTTGTC-T---TTA-TAT-GAGTTT-TCGG-GAT-AT-TCCAAAT------TA-AT----------GCCCTTGTTA-TTGAT---AGCAGAT--ATCTATAT-CCT----ATA-----TATAAGG-TTG-A-----GACAA-AGCAGGGAGTTTTTTTTTTTTTTTT----TTGTTTTT------AT-CCCGTAA-AGTTT-TTGT--AG---CA-AATTCTGC---TTCAT-ATGTA--ATAT-TCA--GTAAGTCTGGTGCCAATA---AA-GGGG---CA-AT---TAGTGCCACT-AGGAATGACGCA-ACGGA---------GAATTGTTT--GATCGAC--CT-GTCTCTCC----A-CGAC------TACATAAATAAT-TTCTG-T-AAGAAACTCTACTC-ATCATGATGTCATGTTATC-ATTTG--TTC-TAATAATATATCCTACTTCAGAGAGTA-CT--TGTGGG--C-ATCAGAGT-GTTTTTTAAACAAATATGTGTCTTG--TTTTTCCGCCCCAATCCCCGAACTAGAAA--TATTA--TT---TTCGGGG---GTC-ATTTTT----TTGTT---------T---AACCACATT---------T--CGATAAT--CT-GAAAAG------CT-AGAT---TTAT-A-TTTTTAAT--GTGAatactggcgtcaaagctcaaaattcttggagcgggaataataaaatatatt
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     taagatataaaacggtcagctactaaggattgtgtggtgAAAT-GGCGAA-G-TA----A-CAAA----GTATGAAA---CGTAAT------CATA------G-TCCAAAAA-A---CAC-----AT--A--CAAAA--TCGAGT-GTA-GGGCAA-C-AC---GGA-C----CTT-C---G-ACGA-A----AG-CGA-A-G-G--CAG-GA-GCA-GG-TGC-C-----A-TGGAGG------A--------GTAAGCATC-CTCTGCTGACC----GG--T-CACAC-CCGC-CG--TGA-GCC-T-----G-TA-GTC-G---AA---A-CAA-A-G------------T---A--AACG-GG-G---TT-ACCC-G----TCGTCA-AATCTA-GTATGAAA--AT--GACA-GTCTAA-CAAA-TG-G-TA---T---GAAACAAATCA--GT--C-AACA---T-------ATG-A--C--T-T---A--GTG-ATAC-TTTG-TAATCGCAAA--CA--A-GGT----C-ATTAT-------AGCGACC-G-TAGAATT-TG--CG--AAATGATG---ACTTTA-AA-CGAG-ATTC-G--TTATA------A-CCCTGCAA-CA-T--CA-A--C--TTTTTGG---TTAGT-AGTTGGCCT-CGC-TTT-------AAAAA--ATCA-T--C-------A-TACG-CA-----TG-G-----CAT--GC------------C-CT-T-GCGTATC-GAATC-A---A-C----TG--A-GAG-ACA--TA-CACACC-A-TAA--GCA--GG-T-G-A--------TAGTGGT-------ACA----------TT----ACT-ACACAAAA-A---A--GG-A-AAGTTGAC---AAT------T-GCAAAG--------TCAAAGT--CATC-ACGT------TTA
gi|9                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      ggcatataCCCCAAC-A---CAT------T--A--CAAAT--TCGC-T-GTA-AG-CAA-C-CG---GGA-C----CTC-C---G-ACAA-A----AG-----A-G-G--TAG-GA-TCA--G-TGCAC-----A-TGGGAGG-----A--------GTAAGTTTC-CTCTCCCGAC------G--T-CACAC-CCGCGCA--TGACACC-CCCAAAT-TA-GAT-GACCAA---A-C-A-A-G------------T---A--AACG-GG-GA--TTAACCC-GGGTTTCA--A-AAT---AGTACGAAATGAC--A-CA--TCT-AACAAA--G-GGT---AT---GAAACAAATCA--GT--CAAACA---T-------ATG-A--C--T-TGCGG--ATG-ATAA-TTTG-TAATCGGGAA--CAACA-GGT----C-ATTATTTCGATAAGC-ACC-GCTAGAATT-GC--CG--A----------------------AGAATTC-G--TTATT------A-ACCTACAA-CA-TA-CA-A--C--TTTTTTG---TTAGT-AGTTTGGCT-CCC-TTT-------AAAAGCCCTC--C--C-------A-CACG-CA-----CGAG-----TAT--G-------------C-TC-T-GCGTATC-GAATCAA---A-C----CG--A-GAG-ACAT-
5 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|33 ): GTTTTTGCGTTGGTGACATCAGAATTTTGGATTTTTTCAAAACTTTGGCAGTGACTGGCTTATCATATTTAAAAAGTTTTCTTTTCATGAATGCATTT
Unaligned ( gi|40 ): TTAAAAGTGAAGATAACAAACAGTGATCTATGTCATAATTCCTATAAAAAATTGAAATCTAA
Unaligned ( gi|43 ): GATCTGAGGTCCAGGGGTGATGAATATAGCATACTTCCATGTTGATTGATT
Unaligned ( gi|45 ): TATTAAGTGATGCCATACATAGAGGATCTTGAATGAGT
Unaligned ( gi|48 ): TAGTCGATACTAAAATTCATGCTCATTTGAT