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Reference ( gi|3 ) : TAAGTTGTAAGAACGATAGATTTGATGTTAGATGTCTCATATGTCCATTTGATATA-------T--CCTAACGAACTCGAAA-TAAAGGACACCACAGAATCTGACAGATCTGCTTCATATTTGGATATTTTACTTAATATTGACTCTAATGGCAGACTGACAGCTACATTATATGTTAAACGTGA-----TGACTT----T-------GC--AATCGTCAACTTTCCTTTTCTATGTAGTAATGTACCACTATCGC-CTGCTTATGGCGGGTATGGTTCTCAGT-T----GAT-TCGAA-A----CGCAATGGC--A-TGCCATGCGTAT-GAGGA-CTTTTTAAAGC-GAG-GCC-AACTAC-TA-A-CAAAAAAGTT-----------A--G---TTAT-AACG-----AA---TCTC-GTTTAGAGTCATC-A--TTTC-GC-AAA--TTCT-----A-------C-G-GTC-G-CTA--TAT-----------AAT--GA-CCTT--G-T-TTGCG-A-TTACAAATTATC-ACT-AAGTCATA-TG-TT--GG------------CT-GAT--TTGT-T----TCATA-CCCTTTG-TTA------G-ACT--GTCATTT-TC-C---TAC-TA--GATTT----GAC-TACG-GG---TA--A--TCCCG-T-TTAC-TTTA-TTTC-GAC-T--A-AGGGC--TC-A-C-------GG-C-GGG-TGTG--ACCGG-T-CAG----C-AGAGGA-TGCTT-A------CTCCTCC-----------AT------GG-C---AC-----------CTGA------TCCTGC-CTT----CG-CT-T---TT--G-TC-GA-AG-GTC-CG-A-----G---T-TG--CCC-TACAC---TCGATTTT--G----TAT-GT--G---T--TTT-TG-GGGAC-TATGA-TTAC-G-TTTAATA-CA----T-TG-TT---A--CTTC-GC-C---AT----TTT-ATATT-----TGGGTAGAAGTTAAATAAAATCTGTGTGGAAAAGAAAGA
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gi|10 : ttatttggcccagactttatttaattaatcatacgaagcatgaaccgtttgttcaaaacgttcaacatcgtttacggagattaaaaaaaaaaacttgccgtgtttgtcaaccctaatacttattattacatgtagttgtatagacgatctcttatcaattaacaattcataattttcacaatATTCT------A-------CG-G-TC-G-CTA--TA-------------ATGA-CC--TTA-T-TTGC-G-A-TTAAAAAATATCA-CTA-AGTCA-TAT-----------GTT--GACTG-AT--TTGT-TT----CATA-CTCTGTGTT------A-G-A-----CTGTCATTT-TC--TTA-C--TA--GATTT----G--ACGA-C--GTG--TTA--TCCAG-T-TTAC-TTTG-TTTC-GAC--T--A-AGGGC--TC-A-C-------GGC-G-GG-TGTT--ACCGG-T-CGG----C-ATAGGG-TGCTT-A---------CTTC-----------AT------GG-C---AC-----------CTGA------TCCTGC-CTT----TG-CT-T---TT--G-T-C-GGAGTTC-------CA-TG--T-TG--CCC-T-ACAC---TTGACTTT--G--T----AT-AT--A--TG-TT-TTTG--GG-AC-TATGA-TTAC-G-TATAT-CA-C--ATT-GTTT---A--CTTC-GC-C---AA----TTT-ATATAT---G-ATAA--Attcgaattgatcaaaa
gi|11 : -----GGATTTA-A-AA--AATCACATT-AAAGTAGGC-ATTT--CTGC-AAATCTT------A-------TATG-TC----TT--TAA-----------AACGA-TT--CAC-T-TTGC-A-A-T-ACAACCTGTCA-TTG-GATCA-TATTGGATCAAATAG-T--GTCTG-ACA-TTGT-TT----CATA-CCAATT---------A-G---------------------GCA-C--TG--ACTTT----G--ACAA---------TAAACTCCC---------TTTA-------AC--T------GGC--TC-T-T-------GGC-G-GG-TGTG--GCTGA-T-CGT----C-AGGGGA-GGCTT-A------CTCCTCC------------T------AGTC---AC-----------CTGA------TCCCAC-CTC----TA-AT-A---TC--T-T-T-AGGGGTC-------TG-TGGTT-TA--CCC---AAAT---TTCATTTT--G--T----GT-tgagcatacgtgatacatgctaccacattccccatagcatggc
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gi|6 : gaacagtcacgtttaaaggtagcatttcgtaaattctatggtcgttataacaatttagtttaccggtatgacctaccattgagtcgaatgctgtctggtgtttcatagccattgttacagtaagccgtttttcacacactgatttgactactggttgttccgtttaccagatcaagacgggtgtgaccggtcaacaggggatgcttactccttctaggcacctgatcccacctctggtatgtccaggggttcgtgtttgcccaacccttgtttttgtattctatttaggacttacgagattgatcactgttcgttatctttgcctctacattgaacatggatagtaacgggaaaccaacaactcaactttatggcaaacaggatgacttcagctgctccatcgtcaacttcccatatcaatgtagcactactccattaccacatgcaTTGGATATGTTACTTAACATTGACTCTAATGGCAGACTGACAACTACATTATATGATAAGCGTGATGACTTT--AACT-TT-GC--A--ATCGTCAACTTTCCTTTTCTATGTAGTAATATACCACTATCAC-CTGCTTATGGTGTGTATATCTC-CCAGTT----GCT-TCG----ATACGCAAGAGC--AT-GCTCTGCGTATATG--GA-CTTTTTAAAGC-GAGTGCCTAACTACCTATA-CAAAAAC--AT-------TT-GA----T-------GCTGGCC-----AGTTATA-A--G--AATCTCGTTTAAATTAATC-ATTT--CTGCAAAATTCCTTTACAA-------CG-G-TCGG-CTA--TAA-----------TTCGA-CC--TTG-T-TTGCGG-A-TT-CAATTAATCA-TTGAAGTCATAAT-----------GTTACGACTG-AT--TTGTATT----TATA-CAC-TTGTTATATAGA-A-A-----CTGTCATTT-TCCTTCA-C------G--TT----G--ACTA----GGGTATAG--TTC---T-TTAC-TTTA-TTTC-GAC--T--A-AGGG----T-A-A-------GGC-G-GG-TGTGGTACCGG-T-CAG----C-AGAGGA-TGCTTAA------CTC--TC-----------AT------GGTC---A------------CTGA------TCT--A-TTT----CG-CT-T---TT--G-T-C-GGAGGTC-------CT-TG--T-TG----C-TAACAC---TCGATATTGGG--T----AT-GT--GTTT--TT-TTTG--GA-TT-TGTGA-TTAC-G-TTTGA-CATC--AAT-GTTT---AATCTTC-GCGT---AT----TTTGATATTT---GAATGATTAATTTAAG
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gi|9 : atTATGTCCATATGATGTA-------T--CCCGACGAACTC-AAA-TAAAGTACACCACAGAATCTGACATATCTGCTTCATATTTGGATATTTTACTTCATAGT-------------GACTGACAACCACATTATATGATAAACGGGATac
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