lowQualScore : 1111
lowQualScore : 3 1111 7777 3 5 3 3 3 3 3 9999999999 3 3 3 3 3 666 44 3 8888888 44 3 3 2 3 3 3 3 7
lowQualScore : . .... .... . . . . . . . .......... . . . . . ... .. . ....... .. . . . . . . . .
lowQualScore : 6 4444 7777 6 9 6 3 1 1 1 0000000000 1 1 3 3 3 888 66 3 4444444 66 3 3 2 3 6 6 6 3
consensus : GGTGGGACT-TTGGTT----TC----GACCT-TTTNAC-AAA-TAA-TTA-GGGAT-A---T------AT-CAA-TCTA-TCA-T-TTGATGGC-AAAAAAG--GA-CTCA-----A-GGT--AG-C-AGCCACTTCT-ATGCTA-T-TGT-GT-TTTGA
Reference ( gi|130326 ) : GGTGGGACT-TTGGTT----TC----GACCT-TTTCAC-AAA-TAA-TTA-GGGAT-A---T------AT-CAA-TCTA-TCA-T-TTGATGAC-AAAAAAG--GA-CTCA-----A-GGT--AG-C-AGCCACTTCT-ATGCTA-T-TGT-GT-TTTGA
gi|130327 : GGTGTGACT-TTGTTT----TC----GACCT-TTTAAC-AAA-TAA-TTA-GGGAC-A---T------GT-CAA-TCTA-TCA-T-TTGATGGT-ATAAAAG--GA-CTCA-----G-GAT--AG-C-AGTCACTTCT-ATGCTA-T-TGT-GT-TTTGA
gi|130328 : GGTGGCACT-TTGGTT----TC----CACCT-TTTAAC-AAA-TAA-TTG-GGGAT-A---T------AT-CAA-TCTA-TCA-T-TTGATGGC-AAAAAAG--GA-CTCG-----A-GGT--AG-C-AATCACTTCT-ATAATA-T-TGT-AT-TGTG
gi|130330 : GGTGGGACT-TTGGTT----TC----GACCAATTTCAC-AAA-TAA-TTA-GGGATTA---T------AT---A-TTAA-TCA-T-TTGATGG---AAAAGG--GA-CTCA-----A-GAT--AG-C-AGCCACTTCT-ATGCTA-T-TGT-GT-TT
gi|130329 : GGTGGGACT-TTG-TT----TC----GACCC-TTTCAC-AAA-TAA-TTA-GGGAT-A---T------AT-CAA-TCTA-TCATT-TTGATGGC-AAAAAAG--GA-CTCAGGGGGG-GGTAAAG-C-A-CCACTTCTAATGCTA-T-TAT-AT-TTT
gi|130331 : GGTGG-ATT-TTGGTT-----C----GAC-T-TTTCACAAAA-TAA-TTA-GCCAT-A----------AT-CAA-TCTA-TCA-T-TTGATGGC-ATAAAAG--GG-CTCA-----A-GGT--A--C-AGCCACTTCT-ATGCTA-T-TGT-GT-TT
gi|130332 : GGTGGGACTATTGGAT----TT----TATCT-TTTAAA-AAA-TGA-GTG-GGGAT-A---T------AT-CAA-TCTA-TCA-T-TTGATGGC-AAAAGAG--GA-CTCA-----A-GGT--AG-C-TATCACTACT-AGGGTA-T-TGT-GC-TTTGA
gi|130334 : GATGGGATT-TTGGTT----TC----GAACG-TTTCAC-AAA-TAA-TTA-GGGAT-A---T------AT-CAA-TC
gi|130333 : GGTGGGACT-TTGGTT----TC----GATCT-TTCAAC-AAG-TAA-TTT-GGGAT-T---T------AT-CAA-TCTA-TAA-T-
gi|130335 : GTGGGACT-TTGGTT----TCCCGGAACCA-TTT-AC-AAAATAAATTAAGGGAT-AAAAT------ATTCAA-TCTAATCA-TATTGATGGC-TAAAA-G--GA-CTCA-----G-GTT--AG-C-TGTCACTTCT-ATGCTA-TGTGT-GTATTTGA
gi|130336 : TGGGACT-T-GGTTC---TC----GACCT-TTTCAC-AAT-TAA-T-A-GGGAT-A---T------AT-CAAATCTA-TCA-T-TTGATGGCAAAAAAAG--GA-CTAA-----AGGGT--AG-CAAGCC-CTTCT-ATGCTATT-TGTCGT-TTT
gi|130337 : TGGGACT-TTGGTTAATTTC----GACCT-TTCAAC-AAA-TAA-TTA-AGAAT-A---T------A
gi|130338 : AA-TAA-TTA-GGGAT-A---T------AT-CAA-TCGA-TCA-T-TTGGTGGT-AAAAAAA------TCA-----A-GGT--AG-C-AGTCACTTCT-ATGCT
gi|130339 : -TCA-GGGAT-A---TGCATGTAT-CAA-TCTA-TCA-T-TTGATGGC-AAAAAAA--GAACTCA-----A-TAT--TT-C-AGCCACTTCT-ATGCTG-T-TGT-GT-TTTGA
gi|130340 : T-CCA-TCTA-TCA-T-TTGATGGC-AAAAAAAATGA-CTC--------CGT--AGCC-AG-CACTTCT-ATGCTA-T-TGT-GTATTTG
gi|130341 : -AAAAAAA--GA-CTCA-----A-GGT--AG-C-AGTCACTTCA-AT--TA-T-TGT-GT-TTTGA
Alignments
lowQualScore : 1111
lowQualScore : 3 0000 555 3 1 6 2 2 2 555 888888 2 2 3 3 3 3 44 3 77777 3 44 3 3 1 3 3 3 3 6
lowQualScore : . .... ... . . . . . . ... ...... . . . . . . .. . ..... . .. . . . . . . . .
lowQualScore : 3 4444 888 3 0 2 9 9 9 000 222222 9 9 1 1 1 1 22 1 77777 1 22 1 1 2 1 3 3 3 7
consensus : GGTGGGACT-TTGGTT----TC---GACCT-TTTCACAAA-TAA-TTA-GGGAT-A---T------AT-CAA-TCTA-TCA-T-TTGATGGC-AAAAAAG--GA-CTCA-----A-GGT--AG-C-AGCCACTTCT-ATGCTA-T-TGT-GT-TTTGA
Reference ( family-961 ) : GGTGGGACT-TTGGTT----TC---GACCT-TTTNACAAA-TAA-TTA-GGGAT-A---T------AT-CAA-TCTA-TCA-T-TTGATGGC-AAAAAAG--GA-CTCA-----A-GGT--AG-C-AGCCACTTCT-ATGCTA-T-TGT-GT-TTTGA
gi|130326 : GGTGGGACT-TTGGTT----TC---GACCT-TTTCACAAA-TAA-TTA-GGGAT-A---T------AT-CAA-TCTA-TCA-T-TTGATGAC-AAAAAAG--GA-CTCA-----A-GGT--AG-C-AGCCACTTCT-ATGCTA-T-TGT-GT-TTTGA
gi|130327 : GGTGTGACT-TTGTTT----TC---GACCT-TTTAACAAA-TAA-TTA-GGGAC-A---T------GT-CAA-TCTA-TCA-T-TTGATGGT-ATAAAAG--GA-CTCA-----G-GAT--AG-C-AGTCACTTCT-ATGCTA-T-TGT-GT-TTTGA
gi|130328 : GGTGGCACT-TTGGTT----TC---CACCT-TTTAACAAA-TAA-TTG-GGGAT-A---T------AT-CAA-TCTA-TCA-T-TTGATGGC-AAAAAAG--GA-CTCG-----A-GGT--AG-C-AATCACTTCT-ATAATA-T-TGT-AT-TGTG
gi|130329 : GGTGGGACT-TTG-TT----TC---GACCC-TTTCACAAA-TAA-TTA-GGGAT-A---T------AT-CAA-TCTA-TCATT-TTGATGGC-AAAAAAG--GA-CTCAGGGGGG-GGTAAAG-C-A-CCACTTCTAATGCTA-T-TAT-AT-TTT
gi|130330 : GGTGGGACT-TTGGTT----TC---GACCAATTTCACAAA-TAA-TTA-GGGATTA---T------AT---A-TTAA-TCA-T-TTGATGG---AAAAGG--GA-CTCA-----A-GAT--AG-C-AGCCACTTCT-ATGCTA-T-TGT-GT-TT
gi|130331 : GGTGG-ATT-TTGGTT-----C---GAC-T-TTTCACAAAATAA-TTA-GCCAT-A----------AT-CAA-TCTA-TCA-T-TTGATGGC-ATAAAAG--GG-CTCA-----A-GGT--A--C-AGCCACTTCT-ATGCTA-T-TGT-GT-TT
gi|130332 : GGTGGGACTATTGGAT----TT---TATCT-TTTAAAAAA-TGA-GTG-GGGAT-A---T------AT-CAA-TCTA-TCA-T-TTGATGGC-AAAAGAG--GA-CTCA-----A-GGT--AG-C-TATCACTACT-AGGGTA-T-TGT-GC-TTTGA
gi|130333 : GGTGGGACT-TTGGTT----TC---GATCT-TTCAACAAG-TAA-TTT-GGGAT-T---T------AT-CAA-TCTA-TAA-T-
gi|130334 : GATGGGATT-TTGGTT----TC---GAACG-TTTCACAAA-TAA-TTA-GGGAT-A---T------AT-CAA-TC
gi|130335 : GTGGGACT-TTGGTT----TCCCGGAACC-ATTTACAAAATAAATTAAGGGAT-AAAAT------ATTCAA-TCTAATCA-TATTGATGGC-TAAAA-G--GA-CTCA-----G-GTT--AG-C-TGTCACTTCT-ATGCTA-TGTGT-GTATTTGA
gi|130336 : TGGGACT-T-GGTTC---TC---GACCT-TTTCACAAT-TAA-T-A-GGGAT-A---T------AT-CAAATCTA-TCA-T-TTGATGGCAAAAAAAG--GA-CTAA-----AGGGT--AG-CAAGCC-CTTCT-ATGCTATT-TGTCGT-TTT
gi|130337 : TGGGACT-TTGGTTAATTTC---GACCT-TTCAACAAA-TAA-TTA-AGAAT-A---T------A
gi|130338 : AA-TAA-TTA-GGGAT-A---T------AT-CAA-TCGA-TCA-T-TTGGTGGT-AAAAAAA------TCA-----A-GGT--AG-C-AGTCACTTCT-ATGCT
gi|130339 : -TCA-GGGAT-A---TGCATGTAT-CAA-TCTA-TCA-T-TTGATGGC-AAAAAAA--GAACTCA-----A-TAT--TT-C-AGCCACTTCT-ATGCTG-T-TGT-GT-TTTGA
gi|130340 : T-CCA-TCTA-TCA-T-TTGATGGC-AAAAAAAATGA-CTC--------CGT--AGCC-AG-CACTTCT-ATGCTA-T-TGT-GTATTTG
gi|130341 : -AAAAAAA--GA-CTCA-----A-GGT--AG-C-AGTCACTTCA-AT--TA-T-TGT-GT-TTTGA
Alignments
lowQualScore : 1111
lowQualScore : 3 0000 7777 3 33 3 2 2 2 555 888888 2 2 3 3 3 3 44 3 77777 3 44 3 3 1 3 3 3 3 6
lowQualScore : . .... .... . .. . . . . ... ...... . . . . . . .. . ..... . .. . . . . . . . .
lowQualScore : 3 4444 1111 3 88 3 9 9 9 000 222222 9 9 1 1 1 1 22 1 77777 1 22 1 1 2 1 3 3 3 7
consensus : GGTGGGACT-TTGGTT----TC----GACCT-TTT-CAC-AAATAA-TTA-GGGAT-A---T------AT-CAA-TCTA-TCA-T-TTGATGGC-AAAAAAG--GA-CTCA-----A-GGT--AG-C-AGCCACTTCT-ATGCTA-T-TGT-GT-TTTGA
Reference ( family-961 ) : GGTGGGACT-TTGGTT----TC----GACCT-TTT-CAC-AAATAA-TTA-GGGAT-A---T------AT-CAA-TCTA-TCA-T-TTGATGGC-AAAAAAG--GA-CTCA-----A-GGT--AG-C-AGCCACTTCT-ATGCTA-T-TGT-GT-TTTGA
gi|130326 : GGTGGGACT-TTGGTT----TC----GACCT-TTT-CAC-AAATAA-TTA-GGGAT-A---T------AT-CAA-TCTA-TCA-T-TTGATGAC-AAAAAAG--GA-CTCA-----A-GGT--AG-C-AGCCACTTCT-ATGCTA-T-TGT-GT-TTTGA
gi|130327 : GGTGTGACT-TTGTTT----TC----GACCT-TTT-AAC-AAATAA-TTA-GGGAC-A---T------GT-CAA-TCTA-TCA-T-TTGATGGT-ATAAAAG--GA-CTCA-----G-GAT--AG-C-AGTCACTTCT-ATGCTA-T-TGT-GT-TTTGA
gi|130328 : GGTGGCACT-TTGGTT----TC----CACCT-TTT-AAC-AAATAA-TTG-GGGAT-A---T------AT-CAA-TCTA-TCA-T-TTGATGGC-AAAAAAG--GA-CTCG-----A-GGT--AG-C-AATCACTTCT-ATAATA-T-TGT-AT-TGTG
gi|130329 : GGTGGGACT-TTG-TT----TC----GACCC-TTT-CAC-AAATAA-TTA-GGGAT-A---T------AT-CAA-TCTA-TCATT-TTGATGGC-AAAAAAG--GA-CTCAGGGGGG-GGTAAAG-C-A-CCACTTCTAATGCTA-T-TAT-AT-TTT
gi|130330 : GGTGGGACT-TTGGTT----TC----GACCAATTT-CAC-AAATAA-TTA-GGGATTA---T------AT---A-TTAA-TCA-T-TTGATGG---AAAAGG--GA-CTCA-----A-GAT--AG-C-AGCCACTTCT-ATGCTA-T-TGT-GT-TT
gi|130331 : GGTGG-ATT-TTGGTT-----C----GAC-T-TTT-CACAAAATAA-TTA-GCCAT-A----------AT-CAA-TCTA-TCA-T-TTGATGGC-ATAAAAG--GG-CTCA-----A-GGT--A--C-AGCCACTTCT-ATGCTA-T-TGT-GT-TT
gi|130332 : GGTGGGACTATTGGAT----TT----TATCT-TTT-AAA-AAATGA-GTG-GGGAT-A---T------AT-CAA-TCTA-TCA-T-TTGATGGC-AAAAGAG--GA-CTCA-----A-GGT--AG-C-TATCACTACT-AGGGTA-T-TGT-GC-TTTGA
gi|130333 : GGTGGGACT-TTGGTT----TC----GATCT-TTC-AAC-AAGTAA-TTT-GGGAT-T---T------AT-CAA-TCTA-TAA-T-
gi|130334 : GATGGGATT-TTGGTT----TC----GAACG-TTT-CAC-AAATAA-TTA-GGGAT-A---T------AT-CAA-TC
gi|130335 : GTGGGACT-TTGGTT----TCCCGGAACCA-TTTACA--AAATAAATTAAGGGAT-AAAAT------ATTCAA-TCTAATCA-TATTGATGGC-TAAAA-G--GA-CTCA-----G-GTT--AG-C-TGTCACTTCT-ATGCTA-TGTGT-GTATTTGA
gi|130336 : TGGGACT-T-GGTTC---TC----GACCT-TTT-CAC-AATTAA-T-A-GGGAT-A---T------AT-CAAATCTA-TCA-T-TTGATGGCAAAAAAAG--GA-CTAA-----AGGGT--AG-CAAGCC-CTTCT-ATGCTATT-TGTCGT-TTT
gi|130337 : TGGGACT-TTGGTTAATTTC----GACCT-TTC-AAC-AAATAA-TTA-AGAAT-A---T------A
gi|130338 : AATAA-TTA-GGGAT-A---T------AT-CAA-TCGA-TCA-T-TTGGTGGT-AAAAAAA------TCA-----A-GGT--AG-C-AGTCACTTCT-ATGCT
gi|130339 : -TCA-GGGAT-A---TGCATGTAT-CAA-TCTA-TCA-T-TTGATGGC-AAAAAAA--GAACTCA-----A-TAT--TT-C-AGCCACTTCT-ATGCTG-T-TGT-GT-TTTGA
gi|130340 : T-CCA-TCTA-TCA-T-TTGATGGC-AAAAAAAATGA-CTC--------CGT--AGCC-AG-CACTTCT-ATGCTA-T-TGT-GTATTTG
gi|130341 : -AAAAAAA--GA-CTCA-----A-GGT--AG-C-AGTCACTTCA-AT--TA-T-TGT-GT-TTTGA
Alignments
lowQualScore : 1111
lowQualScore : 3 0000 7777 3 33 3 2 2 2 555 888888 2 2 3 3 3 3 44 3 77777 3 44 3 3 1 3 3 3 3 6
lowQualScore : . .... .... . .. . . . . ... ...... . . . . . . .. . ..... . .. . . . . . . . .
lowQualScore : 3 4444 1111 3 88 3 9 9 9 000 222222 9 9 1 1 1 1 22 1 77777 1 22 1 1 2 1 3 3 3 7
consensus : GGTGGGACT-TTGGTT----TC----GACCT-TTT-CAC-AAATAA-TTA-GGGAT-A---T------AT-CAA-TCTA-TCA-T-TTGATGGC-AAAAAAG--GA-CTCA-----A-GGT--AG-C-AGCCACTTCT-ATGCTA-T-TGT-GT-TTTGA
Reference ( family-961 ) : GGTGGGACT-TTGGTT----TC----GACCT-TTT-CAC-AAATAA-TTA-GGGAT-A---T------AT-CAA-TCTA-TCA-T-TTGATGGC-AAAAAAG--GA-CTCA-----A-GGT--AG-C-AGCCACTTCT-ATGCTA-T-TGT-GT-TTTGA
gi|130326 : GGTGGGACT-TTGGTT----TC----GACCT-TTT-CAC-AAATAA-TTA-GGGAT-A---T------AT-CAA-TCTA-TCA-T-TTGATGAC-AAAAAAG--GA-CTCA-----A-GGT--AG-C-AGCCACTTCT-ATGCTA-T-TGT-GT-TTTGA
gi|130327 : GGTGTGACT-TTGTTT----TC----GACCT-TTT-AAC-AAATAA-TTA-GGGAC-A---T------GT-CAA-TCTA-TCA-T-TTGATGGT-ATAAAAG--GA-CTCA-----G-GAT--AG-C-AGTCACTTCT-ATGCTA-T-TGT-GT-TTTGA
gi|130328 : GGTGGCACT-TTGGTT----TC----CACCT-TTT-AAC-AAATAA-TTG-GGGAT-A---T------AT-CAA-TCTA-TCA-T-TTGATGGC-AAAAAAG--GA-CTCG-----A-GGT--AG-C-AATCACTTCT-ATAATA-T-TGT-AT-TGTG
gi|130329 : GGTGGGACT-TTG-TT----TC----GACCC-TTT-CAC-AAATAA-TTA-GGGAT-A---T------AT-CAA-TCTA-TCATT-TTGATGGC-AAAAAAG--GA-CTCAGGGGGG-GGTAAAG-C-A-CCACTTCTAATGCTA-T-TAT-AT-TTT
gi|130330 : GGTGGGACT-TTGGTT----TC----GACCAATTT-CAC-AAATAA-TTA-GGGATTA---T------AT---A-TTAA-TCA-T-TTGATGG---AAAAGG--GA-CTCA-----A-GAT--AG-C-AGCCACTTCT-ATGCTA-T-TGT-GT-TT
gi|130331 : GGTGG-ATT-TTGGTT-----C----GAC-T-TTT-CACAAAATAA-TTA-GCCAT-A----------AT-CAA-TCTA-TCA-T-TTGATGGC-ATAAAAG--GG-CTCA-----A-GGT--A--C-AGCCACTTCT-ATGCTA-T-TGT-GT-TT
gi|130332 : GGTGGGACTATTGGAT----TT----TATCT-TTT-AAA-AAATGA-GTG-GGGAT-A---T------AT-CAA-TCTA-TCA-T-TTGATGGC-AAAAGAG--GA-CTCA-----A-GGT--AG-C-TATCACTACT-AGGGTA-T-TGT-GC-TTTGA
gi|130333 : GGTGGGACT-TTGGTT----TC----GATCT-TTC-AAC-AAGTAA-TTT-GGGAT-T---T------AT-CAA-TCTA-TAA-T-
gi|130334 : GATGGGATT-TTGGTT----TC----GAACG-TTT-CAC-AAATAA-TTA-GGGAT-A---T------AT-CAA-TC
gi|130335 : GTGGGACT-TTGGTT----TCCCGGAACCA-TTTACA--AAATAAATTAAGGGAT-AAAAT------ATTCAA-TCTAATCA-TATTGATGGC-TAAAA-G--GA-CTCA-----G-GTT--AG-C-TGTCACTTCT-ATGCTA-TGTGT-GTATTTGA
gi|130336 : TGGGACT-T-GGTTC---TC----GACCT-TTT-CAC-AATTAA-T-A-GGGAT-A---T------AT-CAAATCTA-TCA-T-TTGATGGCAAAAAAAG--GA-CTAA-----AGGGT--AG-CAAGCC-CTTCT-ATGCTATT-TGTCGT-TTT
gi|130337 : TGGGACT-TTGGTTAATTTC----GACCT-TTC-AAC-AAATAA-TTA-AGAAT-A---T------A
gi|130338 : AATAA-TTA-GGGAT-A---T------AT-CAA-TCGA-TCA-T-TTGGTGGT-AAAAAAA------TCA-----A-GGT--AG-C-AGTCACTTCT-ATGCT
gi|130339 : -TCA-GGGAT-A---TGCATGTAT-CAA-TCTA-TCA-T-TTGATGGC-AAAAAAA--GAACTCA-----A-TAT--TT-C-AGCCACTTCT-ATGCTG-T-TGT-GT-TTTGA
gi|130340 : T-CCA-TCTA-TCA-T-TTGATGGC-AAAAAAAATGA-CTC--------CGT--AGCC-AG-CACTTCT-ATGCTA-T-TGT-GTATTTG
gi|130341 : -AAAAAAA--GA-CTCA-----A-GGT--AG-C-AGTCACTTCA-AT--TA-T-TGT-GT-TTTGA
blockSeqs : A AATT CCGG A AC A A A T AAA GCATGT T A A T A A AT A GGGGG G AA C A T A T G C A
blockSeqs : . C . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . A
blockSeqs : . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . .
blockSeqs : . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . .
blockSeqs : . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . .
blockSeqs : . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . .
blockSeqs : . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . .
blockSeqs : . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . .
blockSeqs : . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . .
blockSeqs : . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . .
blockSeqs : . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . .
blockSeqCons :
originalCons : GGTGGGACT-TTGGTT----TC----GACCT-TTT-CAC-AAATAA-TTA-GGGAT-A---T------AT-CAA-TCTA-TCA-T-TTGATGGC-AAAAAAG--GA-CTCA-----A-GGT--AG-C-AGCCACTTCT-ATGCTA-T-TGT-GT-TTTGA
finalCons : GGTGGGACT-TTGGTT----TC----GACCT-TTT-CAC-AAATAA-TTA-GGGAT-A---T------AT-CAA-TCTA-TCA-T-TTGATGGC-AAAAAAG--GA-CTCA-----A-GGT--AG-C-AGCCACTTCT-ATGCTA-T-TGT-GT-TTTGA
Alignments
lowQualScore : 1111
lowQualScore : 3 0000 7777 3 33 3 2 2 2 555 888888 2 2 3 3 3 3 44 3 77777 3 44 3 3 1 3 3 3 3 6
lowQualScore : . .... .... . .. . . . . ... ...... . . . . . . .. . ..... . .. . . . . . . . .
lowQualScore : 3 4444 1111 3 88 3 9 9 9 000 222222 9 9 1 1 1 1 22 1 77777 1 22 1 1 2 1 3 3 3 7
consensus : GGTGGGACT-TTGGTT----TC----GACCT-TTT-CAC-AAATAA-TTA-GGGAT-A---T------AT-CAA-TCTA-TCA-T-TTGATGGC-AAAAAAG--GA-CTCA-----A-GGT--AG-C-AGCCACTTCT-ATGCTA-T-TGT-GT-TTTGA
Reference ( family-961 ) : GGTGGGACT-TTGGTT----TC----GACCT-TTT-CAC-AAATAA-TTA-GGGAT-A---T------AT-CAA-TCTA-TCA-T-TTGATGGC-AAAAAAG--GA-CTCA-----A-GGT--AG-C-AGCCACTTCT-ATGCTA-T-TGT-GT-TTTGA
gi|130326 : GGTGGGACT-TTGGTT----TC----GACCT-TTT-CAC-AAATAA-TTA-GGGAT-A---T------AT-CAA-TCTA-TCA-T-TTGATGAC-AAAAAAG--GA-CTCA-----A-GGT--AG-C-AGCCACTTCT-ATGCTA-T-TGT-GT-TTTGA
gi|130327 : GGTGTGACT-TTGTTT----TC----GACCT-TTT-AAC-AAATAA-TTA-GGGAC-A---T------GT-CAA-TCTA-TCA-T-TTGATGGT-ATAAAAG--GA-CTCA-----G-GAT--AG-C-AGTCACTTCT-ATGCTA-T-TGT-GT-TTTGA
gi|130328 : GGTGGCACT-TTGGTT----TC----CACCT-TTT-AAC-AAATAA-TTG-GGGAT-A---T------AT-CAA-TCTA-TCA-T-TTGATGGC-AAAAAAG--GA-CTCG-----A-GGT--AG-C-AATCACTTCT-ATAATA-T-TGT-AT-TGTG
gi|130329 : GGTGGGACT-TTG-TT----TC----GACCC-TTT-CAC-AAATAA-TTA-GGGAT-A---T------AT-CAA-TCTA-TCATT-TTGATGGC-AAAAAAG--GA-CTCAGGGGGG-GGTAAAG-C-A-CCACTTCTAATGCTA-T-TAT-AT-TTT
gi|130330 : GGTGGGACT-TTGGTT----TC----GACCAATTT-CAC-AAATAA-TTA-GGGATTA---T------AT---A-TTAA-TCA-T-TTGATGG---AAAAGG--GA-CTCA-----A-GAT--AG-C-AGCCACTTCT-ATGCTA-T-TGT-GT-TT
gi|130331 : GGTGG-ATT-TTGGTT-----C----GAC-T-TTT-CACAAAATAA-TTA-GCCAT-A----------AT-CAA-TCTA-TCA-T-TTGATGGC-ATAAAAG--GG-CTCA-----A-GGT--A--C-AGCCACTTCT-ATGCTA-T-TGT-GT-TT
gi|130332 : GGTGGGACTATTGGAT----TT----TATCT-TTT-AAA-AAATGA-GTG-GGGAT-A---T------AT-CAA-TCTA-TCA-T-TTGATGGC-AAAAGAG--GA-CTCA-----A-GGT--AG-C-TATCACTACT-AGGGTA-T-TGT-GC-TTTGA
gi|130333 : GGTGGGACT-TTGGTT----TC----GATCT-TTC-AAC-AAGTAA-TTT-GGGAT-T---T------AT-CAA-TCTA-TAA-T-
gi|130334 : GATGGGATT-TTGGTT----TC----GAACG-TTT-CAC-AAATAA-TTA-GGGAT-A---T------AT-CAA-TC
gi|130335 : GTGGGACT-TTGGTT----TCCCGGAACCA-TTTACA--AAATAAATTAAGGGAT-AAAAT------ATTCAA-TCTAATCA-TATTGATGGC-TAAAA-G--GA-CTCA-----G-GTT--AG-C-TGTCACTTCT-ATGCTA-TGTGT-GTATTTGA
gi|130336 : TGGGACT-T-GGTTC---TC----GACCT-TTT-CAC-AATTAA-T-A-GGGAT-A---T------AT-CAAATCTA-TCA-T-TTGATGGCAAAAAAAG--GA-CTAA-----AGGGT--AG-CAAGCC-CTTCT-ATGCTATT-TGTCGT-TTT
gi|130337 : TGGGACT-TTGGTTAATTTC----GACCT-TTC-AAC-AAATAA-TTA-AGAAT-A---T------A
gi|130338 : AATAA-TTA-GGGAT-A---T------AT-CAA-TCGA-TCA-T-TTGGTGGT-AAAAAAA------TCA-----A-GGT--AG-C-AGTCACTTCT-ATGCT
gi|130339 : -TCA-GGGAT-A---TGCATGTAT-CAA-TCTA-TCA-T-TTGATGGC-AAAAAAA--GAACTCA-----A-TAT--TT-C-AGCCACTTCT-ATGCTG-T-TGT-GT-TTTGA
gi|130340 : T-CCA-TCTA-TCA-T-TTGATGGC-AAAAAAAATGA-CTC--------CGT--AGCC-AG-CACTTCT-ATGCTA-T-TGT-GTATTTG
gi|130341 : -AAAAAAA--GA-CTCA-----A-GGT--AG-C-AGTCACTTCA-AT--TA-T-TGT-GT-TTTGA