lowQualScore : 1 1111111 3333333333333333
lowQualScore : 1 44 66 5 5555 2 2 5 1 1 0 3333333 0000000000000000 444 2 2 444 8888 2 3 5 6 2
lowQualScore : . .. .. . .... . . . . . . ....... ................ ... . . ... .... . . . . .
lowQualScore : 7 22 55 9 3333 5 5 0 4 4 2 4444444 3333333333333333 444 5 5 444 9999 5 0 5 8 7
consensus : TGTTTTGGCCT--CCCAACTTTCCTTTTTCCTTG----TG-G-GTTCCAAT-CCAGGGCCTGTCTTG-------TGGCGTT-G-TCGG-C--T---G-G-T---TT---CCT-CAGTGTGTGNCCNATCCAGCCCCAC-TTTCGCTTC
Reference ( gi|123398 ) : TGTTATGGCCT--CCCAACTTTCCTTTTTCCTTG----TG-G-GTTCCAAT-CCAGAGCTTGTCTTG-------TGCCATT-A-TCGG-C--T---G-G-T---TC---CCT-CAGTGTGTGGCCTATCCAGCCCCAC-TTTCGTTTC
gi|123399 : TGTTTTGGCCT--CCCAACTTTTCTTTTTCCTTG----TG-G-GTTTCAAT-CCAGAGCTTGTATTG-------TGACGTT-T-TCGG-C--T---G-G-T---TT---CCT-CAGTGTGTGACCTATCCAGCCCCAC-TTTCGCTTC
gi|123401 : TGTTTTGGCCT--CCCAACTTTCTTTTTTCCTTG----TG-G-ATTCCAAT-TCAGAGCTTGTCTTG-------TGACATT-A-TCAG-C--T---G-G-T---TT---CCT-CAGTGTGTGGCCTATCCAGCCCC
gi|123400 : TGTTTTGGTCT--CCCAACTTTCCTTTTTTCTTG----TG-G-GTTCCAAT-CCAGAACTTGTCTTG-------TAGCATT-A-TCTG-C--T---G-A-T---TT---CCT-TAATGTGTGGCCTATCCAGCCCCAC-TTTCACTTC
gi|123402 : TGTTTTGGCCT--CCCAACCTTCCTTTTTCCTT-----TG-G-GTTCCAGT-CCAAAGCTTGTCTTG-------TGACGTT-T-TCGG-C--T---G-G-T---TT---CCT-CAGTGTGTGACCTATCCAG-CCCAC-GTTCGCTTC
gi|123403 : TGTTTTGGCCT--CCCAACCTTCCTTTC-CCTTG----TG-G-GTTCCAAT-CCAGAGCTTGTCTTG-------TGACGTT-T-TC-G-T--T---G-GTT---TC---CTT-TAGTGTGTTGACTATCCAGCCCCACTTTTCGCTT
gi|123404 : TGTTGCGGCCT--TC-AACCTTCCTTTTCCTATG----TG-GTGTTCCAATGCCA-AG-TTGTCTTG-------TGACGTT-T-TCGGGT--T---GCG-T---TT---CCTGCAGTGTGTGACA-ATCCAGCCCCAC-TTTCGCTT
gi|123405 : TATGACGT--CCTCTCTGTCCCTTG-CCTTG----TG-G-GTTCCAAG-TCAGGGCCTGTCATG-------TGGTGTTGG-TTGG----T---G-G-C---TT---CCT-CAAAGTGTGTCCAATCCAACCCCAC-TT
gi|123407 : tgtttcTGGTCTACCCCATCTT--CTTTTGCCTTG----CG-G-ATTCCAGT-CTAACGCGT-TCTTGGTGGTGTTGCTGTT---TTGG-C--------G-T---------CT-TAGTATATGGCCTATCCATTTCCAT-TTACGTTT
gi|123408 : gttgtGGTCG--TCCACCTTTTCTTTTTCCTTG----AG-G-GTTCCAGT-TGAGTGTATGT-TTGGCGA---TGCC----A-TCGG-C--T---G-G-T---CT---TTG-CAGTGTATGCCCAATCCAATTCCAT-TTACGTTTC
gi|123406 : tcGGTCG--TCCACGTTTTCTATTCCCCTG----TG-G-ATTCCATC-TTAGTGCATGTCTTG-------TTATATT---TC---C--T---G-G-A---TCCTTCCT-CCGTTGGTGCCTTATCCAGGTCCAC-TTTCTTTTC
gi|123411 : tgtctaCCT--CTC----TTTCTCTTGCCCTG----TG-G-GTTCCAAG-TTAGGACCTGTCGTG-------TG---GT-G-TTGG-T--T---G-G-TGTCTT---CCT-CAAAGTGTGTCCAATCCAACCCCAC-
gi|123410 : CCT--CTCA----TTCTCTTGCCCTG----TG-G-GTCTCGAG-TCAGAGCCTGGCGTG-------TGGTGGTGA-TTGG----T---G-G-C---TT---CCT-CAAAGTGTGTCAAATCCAGCCCCAC-TTCCGCCTCccctccgcct
gi|123409 : CCT--CTC----TTCCTCTTGCCCTG----CG-G-GTTCCAGG-TCAGGGTTTGGCGTG-------TGGTGCT-G-CATG-T--TTAAG-G-T---TT---CCG-AAGAGTATGTCCGATTCAGCCCCAC-CTCC
gi|123412 : TCCTCTTCCCTTGCCTGTGTG-GTTCCAAGATCAGGGCCTGTCGTG-------TGATGTT-GGTTGG----T---G-G-C---TT---CCT-CAA-ATGTGTCCAATCCA-CCCCAC-TT
gi|123413 : CTCTTTTCCTG----CG-G-GTTCCAGT-C-GGGGTCTGTCATG-------TG------G-T--G-C--T---G-G-C---TT---CCT-TAAGGTGTGTCCAATTCAGCCCCAT-TT
gi|123414 : TTTCCCTG----GG-G-GTTCCACT-CAAGGGACTGCGTGG-------TGGTGTT-G---GA-CTTT---G-G-C---TT---TCG-CAACGTGTGGCCGATCCATCCCCAT-TTCCTTTTC
Alignments
lowQualScore : 11111111111
lowQualScore : 777 44 4 5555 2 2 5 0 1 0 1 33333333333 444 2 5555555 2 2 3 1 1 2 444
lowQualScore : ... .. . .... . . . . . . . ........... ... . ....... . . . . . . ...
lowQualScore : 000 55 4 3333 5 5 0 1 1 2 1 00000000000 444 5 4444444 5 5 0 0 0 7 777
consensus : TGTTT---TGGCCTCCCAACTTTCCTTTTTCCTTG----TG-G-GTTCCAAT-CCAGGGCCTGTCTTGTGGCGTT-G-TC-GGC--T---G-G---T---TTCC-T-CAGTGTGTGNCCNATCCAGCCCCAC-T---TTCGCTTC
Reference ( family-944 ) : TGTTT---TGGCCTCCCAACTTTCCTTTTTCCTTG----TG-G-GTTCCAAT-CCAGGGCCTGTCTTGTGGCGTT-G-TC-GGC--T---G-G---T---TTCC-T-CAGTGTGTGNCCNATCCAGCCCCAC-T---TTCGCTTC
gi|123398 : TGTTA---TGGCCTCCCAACTTTCCTTTTTCCTTG----TG-G-GTTCCAAT-CCAGAGCTTGTCTTGTGCCATT-A-TC-GGC--T---G-G---T---TCCC-T-CAGTGTGTGGCCTATCCAGCCCCAC-T---TTCGTTTC
gi|123399 : TGTTT---TGGCCTCCCAACTTTTCTTTTTCCTTG----TG-G-GTTTCAAT-CCAGAGCTTGTATTGTGACGTT-T-TC-GGC--T---G-G---T---TTCC-T-CAGTGTGTGACCTATCCAGCCCCAC-T---TTCGCTTC
gi|123400 : TGTTT---TGGTCTCCCAACTTTCCTTTTTTCTTG----TG-G-GTTCCAAT-CCAGAACTTGTCTTGTAGCATT-A-TC-TGC--T---G-A---T---TTCC-T-TAATGTGTGGCCTATCCAGCCCCAC-T---TTCACTTC
gi|123401 : TGTTT---TGGCCTCCCAACTTTCTTTTTTCCTTG----TG-G-ATTCCAAT-TCAGAGCTTGTCTTGTGACATT-A-TC-AGC--T---G-G---T---TTCC-T-CAGTGTGTGGCCTATCCAGCCCC
gi|123402 : TGTTT---TGGCCTCCCAACCTTCCTTTTTCCTT-----TG-G-GTTCCAGT-CCAAAGCTTGTCTTGTGACGTT-T-TC-GGC--T---G-G---T---TTCC-T-CAGTGTGTGACCTATCCAG-CCCAC-G---TTCGCTTC
gi|123403 : TGTTT---TGGCCTCCCAACCTTCCTTTC-CCTTG----TG-G-GTTCCAAT-CCAGAGCTTGTCTTGTGACGTT-T-TC--GT--T---G-G---T---TTCCTT-TAGTGTGTTGACTATCCAGCCCCACTT---TTCGCTT
gi|123404 : TGTTG---CGGCCTTC-AACCTTCCTTTTCCTATG----TG-GTGTTCCAATGCCAAG--TTGTCTTGTGACGTT-T-TCGGGT--T---GCG---T---TTCC-TGCAGTGTGTGA-CAATCCAGCCCCAC-T---TTCGCTT
gi|123405 : TGTTTCTATGACGTCCTCTCTGTCCCTTG-CCTTG----TG-G-GTTCCAAG-TCAGGGCCTGTCATGTGGTGTTGG-TT-GG---T---G-G---C---TTCC-T-CAAAGTGTGTCCAATCCAACCCCAC-T---
gi|123406 : TGTCT---AGGTCGTCCACGTTTTCTATTCCCCTG----TG-G-ATTCCATC-TTAGTGCATGTCTTGTTATATT---TC---C--T---G-GATCC---TTCC-T-CCGTTGGTGCCTTATCCAGGTCCAC-T---TTCTTTTC
gi|123408 : T---CGGTCGTCCACCTTTTCTTTTTCCTTG----AG-G-GTTCCAGT-TGAGTGTATGTTTGGCGATGCC-A-TC-GGC--T---G-G---T---CTTT-G-CAGTGTATGCCCAATCCAATTCCAT-T---TACGTTTC
gi|123409 : CCTCTC----TTCCTCTTGCCCTG----CG-G-GTTCCAGG-TCAGGGTTTGGCGTGTGGTGCT-G-CA-TGT--TTAAG-G---T---TTCC-G-AAGAGTATGTCCGATTCAGCCCCAC-C---TCC
gi|123410 : CCTCTCA----TTCTCTTGCCCTG----TG-G-GTCTCGAG-TCAGAGCCTGGCGTGTGGTGGT-GATT-GG---T---G-G---C---TTCC-T-CAAAGTGTGTCAAATCCAGCCCCAC-T---TCCGCCTC
gi|123411 : CCTCTC----TTTCTCTTGCCCTG----TG-G-GTTCCAAG-TTAGGACCTGTCGTGTGG---T-G-TT-GGT--T---G-G---TGTCTTCC-T-CAAAGTGTGTCCAATCCAACCCCAC-TCCCTCCGCCT
gi|123412 : TCCTCTTCCCTTGCCTGTGTG-GTTCCAAGATCAGGGCCTGTCGTGTGATGTTGG-TT-GG---T---G-G---C---TTCC-T-CAA-ATGTGTCCAATCCA-CCCCAC-T---
gi|123413 : CTCTTTTCCTG----CG-G-GTTCCAGT-C-GGGGTCTGTCATGTGGTG----------C--T---G-G---C---TTCC-T-TAAGGTGTGTCCAATTCAGCCCCAT-T---
gi|123414 : TTTCCCTG----GG-G-GTTCCACT-CAAGGGACTGCGTGGTGGTGTT-G----GACTTT---G-G---C---TTTC-G-CAACGTGTGGCCGATCCATCCCCAT-T---TCCTTTTC
1 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|123407 ): GTTGTTGGTCTACCCCATCTTCTTTTGCCTTGCGGATTCCAGTCTAACGCGTTCTTGGTGGTGTTGCTGTTTTGGCGTCTTAGTATATGGCCTATCCATTTCCATTTACGTTT
Alignments
lowQualScore : 11111111111
lowQualScore : 777 44 4 5555 2 2 5 0 1 0 1 33333333333 444 2 5555555 2 2 3 1 1 2 444
lowQualScore : ... .. . .... . . . . . . . ........... ... . ....... . . . . . . ...
lowQualScore : 000 55 4 3333 5 5 0 1 1 2 1 00000000000 444 5 4444444 5 5 0 0 0 7 777
consensus : TGTTT---TGGCCTCCCAACTTTCCTTTTTCCTTG----TG-G-GTTCCAAT-CCAGGGCCTGTCTTGTGGCGTT-G-TC-GGC--T---G-G---T---TTCC-T-CAGTGTGTGNCCNATCCAGCCCCAC-T---TTCGCTTC
Reference ( family-944 ) : TGTTT---TGGCCTCCCAACTTTCCTTTTTCCTTG----TG-G-GTTCCAAT-CCAGGGCCTGTCTTGTGGCGTT-G-TC-GGC--T---G-G---T---TTCC-T-CAGTGTGTGNCCNATCCAGCCCCAC-T---TTCGCTTC
gi|123398 : TGTTA---TGGCCTCCCAACTTTCCTTTTTCCTTG----TG-G-GTTCCAAT-CCAGAGCTTGTCTTGTGCCATT-A-TC-GGC--T---G-G---T---TCCC-T-CAGTGTGTGGCCTATCCAGCCCCAC-T---TTCGTTTC
gi|123399 : TGTTT---TGGCCTCCCAACTTTTCTTTTTCCTTG----TG-G-GTTTCAAT-CCAGAGCTTGTATTGTGACGTT-T-TC-GGC--T---G-G---T---TTCC-T-CAGTGTGTGACCTATCCAGCCCCAC-T---TTCGCTTC
gi|123400 : TGTTT---TGGTCTCCCAACTTTCCTTTTTTCTTG----TG-G-GTTCCAAT-CCAGAACTTGTCTTGTAGCATT-A-TC-TGC--T---G-A---T---TTCC-T-TAATGTGTGGCCTATCCAGCCCCAC-T---TTCACTTC
gi|123401 : TGTTT---TGGCCTCCCAACTTTCTTTTTTCCTTG----TG-G-ATTCCAAT-TCAGAGCTTGTCTTGTGACATT-A-TC-AGC--T---G-G---T---TTCC-T-CAGTGTGTGGCCTATCCAGCCCC
gi|123402 : TGTTT---TGGCCTCCCAACCTTCCTTTTTCCTT-----TG-G-GTTCCAGT-CCAAAGCTTGTCTTGTGACGTT-T-TC-GGC--T---G-G---T---TTCC-T-CAGTGTGTGACCTATCCAG-CCCAC-G---TTCGCTTC
gi|123403 : TGTTT---TGGCCTCCCAACCTTCCTTTC-CCTTG----TG-G-GTTCCAAT-CCAGAGCTTGTCTTGTGACGTT-T-TC--GT--T---G-G---T---TTCCTT-TAGTGTGTTGACTATCCAGCCCCACTT---TTCGCTT
gi|123404 : TGTTG---CGGCCTTC-AACCTTCCTTTTCCTATG----TG-GTGTTCCAATGCCAAG--TTGTCTTGTGACGTT-T-TCGGGT--T---GCG---T---TTCC-TGCAGTGTGTGA-CAATCCAGCCCCAC-T---TTCGCTT
gi|123405 : TGTTTCTATGACGTCCTCTCTGTCCCTTG-CCTTG----TG-G-GTTCCAAG-TCAGGGCCTGTCATGTGGTGTTGG-TT-GG---T---G-G---C---TTCC-T-CAAAGTGTGTCCAATCCAACCCCAC-T---
gi|123406 : TGTCT---AGGTCGTCCACGTTTTCTATTCCCCTG----TG-G-ATTCCATC-TTAGTGCATGTCTTGTTATATT---TC---C--T---G-GATCC---TTCC-T-CCGTTGGTGCCTTATCCAGGTCCAC-T---TTCTTTTC
gi|123408 : T---CGGTCGTCCACCTTTTCTTTTTCCTTG----AG-G-GTTCCAGT-TGAGTGTATGTTTGGCGATGCC-A-TC-GGC--T---G-G---T---CTTT-G-CAGTGTATGCCCAATCCAATTCCAT-T---TACGTTTC
gi|123409 : CCTCTC----TTCCTCTTGCCCTG----CG-G-GTTCCAGG-TCAGGGTTTGGCGTGTGGTGCT-G-CA-TGT--TTAAG-G---T---TTCC-G-AAGAGTATGTCCGATTCAGCCCCAC-C---TCC
gi|123410 : CCTCTCA----TTCTCTTGCCCTG----TG-G-GTCTCGAG-TCAGAGCCTGGCGTGTGGTGGT-GATT-GG---T---G-G---C---TTCC-T-CAAAGTGTGTCAAATCCAGCCCCAC-T---TCCGCCTC
gi|123411 : CCTCTC----TTTCTCTTGCCCTG----TG-G-GTTCCAAG-TTAGGACCTGTCGTGTGG---T-G-TT-GGT--T---G-G---TGTCTTCC-T-CAAAGTGTGTCCAATCCAACCCCAC-TCCCTCCGCCT
gi|123412 : TCCTCTTCCCTTGCCTGTGTG-GTTCCAAGATCAGGGCCTGTCGTGTGATGTTGG-TT-GG---T---G-G---C---TTCC-T-CAA-ATGTGTCCAATCCA-CCCCAC-T---
gi|123413 : CTCTTTTCCTG----CG-G-GTTCCAGT-C-GGGGTCTGTCATGTGGTG----------C--T---G-G---C---TTCC-T-TAAGGTGTGTCCAATTCAGCCCCAT-T---
gi|123414 : TTTCCCTG----GG-G-GTTCCACT-CAAGGGACTGCGTGGTGGTGTT-G----GACTTT---G-G---C---TTTC-G-CAACGTGTGGCCGATCCATCCCCAT-T---TCCTTTTC
blockSeqs : CTA AA T CCTG T T G T C TTCGGGT TAA C ATCC T G T A T T CCC
blockSeqs : . AA T . . . A T C TTCGGC . . TGTC . . T G T . .
blockSeqs : . AA T . . . . T C ATCTGC . . T . . T G T . .
blockSeqs : . AA T . . . . T C ATCAGC . . T . . T A T . .
blockSeqs : . AA C . . . . T C TTCGGC . . T . . T G T . .
blockSeqs : . AA C . . . . T C GGTTGG . . T . . T A A . .
blockSeqs : . CT T . . . . C T ATCGGC . . T . . A T A . .
blockSeqs : . AC G . . . . A T GCATGT . . T . . T C T . .
blockSeqs : . AC G . . . . A T GATTGG . . C . . T C A . .
blockSeqs : A G . . . . T T GTTGGT . . T . . A T G . .
blockSeqs : . C . . . . C T GGTTGG . . T . . A T A . .
blockSeqs : . T . . . . C T GGACTT . . C . . A T A . .
blockSeqs : T . . . . C T TTCGT . . C . . G T A . .
blockSeqs : . . . . . C T TCC . . C . . C T A . .
blockSeqs : . . . . . C . C . . C . . . G G
blockSeqCons :
originalCons : TGTTT---TGGCCTCCCAACTTTCCTTTTTCCTTG----TG-G-GTTCCAAT-CCAGGGCCTGTCTTGTGGCGTT-G-TC-GGC--T---G-G---T---TTCC-T-CAGTGTGTGNCCNATCCAGCCCCAC-T---TTCGCTTC
finalCons : TGTTT---TGGCCTCCCAACTTTCCTTTTTCCTTG----TG-G-GTTCCAAT-CCAGGGCCTGTCTTGTGGCGTT-G-TC-GGC--T---G-G---T---TTCC-T-CAGTGTGTGNCCNATCCAGCCCCAC-T---TTCGCTTC
1 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|123407 ): GTTGTTGGTCTACCCCATCTTCTTTTGCCTTGCGGATTCCAGTCTAACGCGTTCTTGGTGGTGTTGCTGTTTTGGCGTCTTAGTATATGGCCTATCCATTTCCATTTACGTTT
Alignments
lowQualScore : 11111111111
lowQualScore : 777 44 4 5555 2 2 5 0 1 0 1 33333333333 444 2 5555555 2 2 3 1 1 2 444
lowQualScore : ... .. . .... . . . . . . . ........... ... . ....... . . . . . . ...
lowQualScore : 000 55 4 3333 5 5 0 1 1 2 1 00000000000 444 5 4444444 5 5 0 0 0 7 777
consensus : TGTTT---TGGCCTCCCAACTTTCCTTTTTCCTTG----TG-G-GTTCCAAT-CCAGGGCCTGTCTTGTGGCGTT-G-TC-GGC--T---G-G---T---TTCC-T-CAGTGTGTGNCCNATCCAGCCCCAC-T---TTCGCTTC
Reference ( family-944 ) : TGTTT---TGGCCTCCCAACTTTCCTTTTTCCTTG----TG-G-GTTCCAAT-CCAGGGCCTGTCTTGTGGCGTT-G-TC-GGC--T---G-G---T---TTCC-T-CAGTGTGTGNCCNATCCAGCCCCAC-T---TTCGCTTC
gi|123398 : TGTTA---TGGCCTCCCAACTTTCCTTTTTCCTTG----TG-G-GTTCCAAT-CCAGAGCTTGTCTTGTGCCATT-A-TC-GGC--T---G-G---T---TCCC-T-CAGTGTGTGGCCTATCCAGCCCCAC-T---TTCGTTTC
gi|123399 : TGTTT---TGGCCTCCCAACTTTTCTTTTTCCTTG----TG-G-GTTTCAAT-CCAGAGCTTGTATTGTGACGTT-T-TC-GGC--T---G-G---T---TTCC-T-CAGTGTGTGACCTATCCAGCCCCAC-T---TTCGCTTC
gi|123400 : TGTTT---TGGTCTCCCAACTTTCCTTTTTTCTTG----TG-G-GTTCCAAT-CCAGAACTTGTCTTGTAGCATT-A-TC-TGC--T---G-A---T---TTCC-T-TAATGTGTGGCCTATCCAGCCCCAC-T---TTCACTTC
gi|123401 : TGTTT---TGGCCTCCCAACTTTCTTTTTTCCTTG----TG-G-ATTCCAAT-TCAGAGCTTGTCTTGTGACATT-A-TC-AGC--T---G-G---T---TTCC-T-CAGTGTGTGGCCTATCCAGCCCC
gi|123402 : TGTTT---TGGCCTCCCAACCTTCCTTTTTCCTT-----TG-G-GTTCCAGT-CCAAAGCTTGTCTTGTGACGTT-T-TC-GGC--T---G-G---T---TTCC-T-CAGTGTGTGACCTATCCAG-CCCAC-G---TTCGCTTC
gi|123403 : TGTTT---TGGCCTCCCAACCTTCCTTTC-CCTTG----TG-G-GTTCCAAT-CCAGAGCTTGTCTTGTGACGTT-T-TC--GT--T---G-G---T---TTCCTT-TAGTGTGTTGACTATCCAGCCCCACTT---TTCGCTT
gi|123404 : TGTTG---CGGCCTTC-AACCTTCCTTTTCCTATG----TG-GTGTTCCAATGCCAAG--TTGTCTTGTGACGTT-T-TCGGGT--T---GCG---T---TTCC-TGCAGTGTGTGA-CAATCCAGCCCCAC-T---TTCGCTT
gi|123405 : TGTTTCTATGACGTCCTCTCTGTCCCTTG-CCTTG----TG-G-GTTCCAAG-TCAGGGCCTGTCATGTGGTGTTGG-TT-GG---T---G-G---C---TTCC-T-CAAAGTGTGTCCAATCCAACCCCAC-T---
gi|123406 : TGTCT---AGGTCGTCCACGTTTTCTATTCCCCTG----TG-G-ATTCCATC-TTAGTGCATGTCTTGTTATATT---TC---C--T---G-GATCC---TTCC-T-CCGTTGGTGCCTTATCCAGGTCCAC-T---TTCTTTTC
gi|123408 : T---CGGTCGTCCACCTTTTCTTTTTCCTTG----AG-G-GTTCCAGT-TGAGTGTATGTTTGGCGATGCC-A-TC-GGC--T---G-G---T---CTTT-G-CAGTGTATGCCCAATCCAATTCCAT-T---TACGTTTC
gi|123409 : CCTCTC----TTCCTCTTGCCCTG----CG-G-GTTCCAGG-TCAGGGTTTGGCGTGTGGTGCT-G-CA-TGT--TTAAG-G---T---TTCC-G-AAGAGTATGTCCGATTCAGCCCCAC-C---TCC
gi|123410 : CCTCTCA----TTCTCTTGCCCTG----TG-G-GTCTCGAG-TCAGAGCCTGGCGTGTGGTGGT-GATT-GG---T---G-G---C---TTCC-T-CAAAGTGTGTCAAATCCAGCCCCAC-T---TCCGCCTC
gi|123411 : CCTCTC----TTTCTCTTGCCCTG----TG-G-GTTCCAAG-TTAGGACCTGTCGTGTGG---T-G-TT-GGT--T---G-G---TGTCTTCC-T-CAAAGTGTGTCCAATCCAACCCCAC-TCCCTCCGCCT
gi|123412 : TCCTCTTCCCTTGCCTGTGTG-GTTCCAAGATCAGGGCCTGTCGTGTGATGTTGG-TT-GG---T---G-G---C---TTCC-T-CAA-ATGTGTCCAATCCA-CCCCAC-T---
gi|123413 : CTCTTTTCCTG----CG-G-GTTCCAGT-C-GGGGTCTGTCATGTGGTG----------C--T---G-G---C---TTCC-T-TAAGGTGTGTCCAATTCAGCCCCAT-T---
gi|123414 : TTTCCCTG----GG-G-GTTCCACT-CAAGGGACTGCGTGGTGGTGTT-G----GACTTT---G-G---C---TTTC-G-CAACGTGTGGCCGATCCATCCCCAT-T---TCCTTTTC
1 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|123407 ): GTTGTTGGTCTACCCCATCTTCTTTTGCCTTGCGGATTCCAGTCTAACGCGTTCTTGGTGGTGTTGCTGTTTTGGCGTCTTAGTATATGGCCTATCCATTTCCATTTACGTTT