lowQualScore : 66 5 2 2 2 55 2 33 2 2 33 2 2 2 2 2 2 3
lowQualScore : .. . . . . .. . .. . . .. . . . . . . .
lowQualScore : 99 0 5 5 5 99 5 44 5 7 77 7 7 7 7 9 9 1
consensus : GTATGGTC--ATGACCTA-CAT-AC-C-AT--CA-GATG--CTCCCTG-ACA-C--AA-G-GAA-TAA-G-AA-TA-TATAT
Reference ( gi|9778 ) : GTATGGTC--ATGACCTA-CAT-AC-C-AT--CA-GATG--CTCCCTG-ACA-C--AA-G-GAA-TAA-G-AA-TA-TATAT
gi|9781 : GTATGGTC--ATGACCTT-CAT-AC-C-AT--CA-GATG--CTCCCTG-ACA-C--AA-G-GAA-TAA-G-AA-TA-CATAT
gi|9779 : GTATGGTC--ATGACTTA-CAT-AC-C-AT--CA-GATG--CTCGCTG-ACA-C--AA-G-GAA-TAA-G-AA-TG-TATAT
gi|9780 : GTATGGTC--ATGACCTA-CAT-AC-C-AT--TA-GATA--CTCCTGA-ACA-C--AA-G-GAA-TAA-G-AA-TA-TATAT
gi|9782 : GTATGGTC--ATGACCTA-CAT-AC-C-AT--CA-GATG--CTTCCTG-ACA-C--AA-G-AAA-CAA-G-AG-TA-AGTAT
gi|9783 : GCATCGTC--ATGATCTA-CAT----------CA-GATG--CTCCCTT-ACA-C--AA-G-GAA-TAG-A-AA-TT-TATAT
gi|9784 : GTATGGTCCCATGATCTAGCAT-ACGC-AT--CA-GATGGCTTCCCTG-ACA-C--AAGG-GAA-TCA-GAAA-TATTATAT
gi|9785 : GTACGGTTCGATGACTAA-CAT-AC-CCAT--CA-GATG--CTCCCTGCACA-C--AA-G-GAT-TAATG-AA-T--TATA
gi|9786 : GTATGGTC--ATGACCTA-CGTAAC-C-TT--CA-GATG--CTCCCTG-AC
gi|9787 : TACGGTC--ATGACCTA-CAT-AC-C-AA--CA-GATG--CTCCCTG-ACACC--AA-G-GAA-TAA-G-AA-TA-TATAT
gi|9788 : TATG-TC--ATGACCTA-CAT-AT-C-AT--CG-ATTG--CTCCTCG-ATA-CCAAA-A-GAA-T-A-G-AA-T
gi|9789 : ATGGTC--ATAAGCGG-GAT-AC-C-AT--CA-GATG--CTCCTTG-ACA-C--AA-G-GAA-TAA-G-AA-TA-TATAT
gi|9790 : ATGGTC--ATGACCTA-CAT-AC-A-AAA-CA-GATG--CTTCCTG-ACA-C--AA-G-AAT-TAA-G--A-TA-TATAT
gi|9791 : ACGGTC--ATGACCTA-CAT-A--C-ATGGCAGGATG--C-GCCTG-ACA-C--AA-GTGAATTCA-G-AA-TA-TATAT
gi|9792 : GGTC--A-GACCTAACAT-AC-C-AA--CA-GAT---CTCCCTG-ACA-C--AA-G-GAA--AA-G-AAGTA-TATAT
gi|9794 : GCC--GTGACCCA-CAT-AC-C-AT--CC-GATG--TTCCTTG-ACA-C--AA-C-AAA-CAA-G-AA-TA-AGTAT
gi|9793 : GTC--ATGACCTA-CAT-AC-T-AT--CA-TATA--CCCCATG-ACA-C--AT-A-GAA-TAA-
Alignments
lowQualScore : 66 4 2 2 2 55 2 33 2 2 33 2 2 2 2 2 2 2
lowQualScore : .. . . . . .. . .. . . .. . . . . . . .
lowQualScore : 55 7 4 4 4 66 4 22 4 5 44 5 5 5 5 7 7 9
consensus : GTATGGTC--ATGACCTA-CAT-AC-C-AT--CA-GATG--CTCCCTG-ACA-C--AA-G-GAA-TAA-G-AA-TA-TATAT
Reference ( family-935 ) : GTATGGTC--ATGACCTA-CAT-AC-C-AT--CA-GATG--CTCCCTG-ACA-C--AA-G-GAA-TAA-G-AA-TA-TATAT
gi|9778 : GTATGGTC--ATGACCTA-CAT-AC-C-AT--CA-GATG--CTCCCTG-ACA-C--AA-G-GAA-TAA-G-AA-TA-TATAT
gi|9779 : GTATGGTC--ATGACTTA-CAT-AC-C-AT--CA-GATG--CTCGCTG-ACA-C--AA-G-GAA-TAA-G-AA-TG-TATAT
gi|9780 : GTATGGTC--ATGACCTA-CAT-AC-C-AT--TA-GATA--CTCCTGA-ACA-C--AA-G-GAA-TAA-G-AA-TA-TATAT
gi|9781 : GTATGGTC--ATGACCTT-CAT-AC-C-AT--CA-GATG--CTCCCTG-ACA-C--AA-G-GAA-TAA-G-AA-TA-CATAT
gi|9782 : GTATGGTC--ATGACCTA-CAT-AC-C-AT--CA-GATG--CTTCCTG-ACA-C--AA-G-AAA-CAA-G-AG-TA-AGTAT
gi|9783 : GCATCGTC--ATGATCTA-CAT----------CA-GATG--CTCCCTT-ACA-C--AA-G-GAA-TAG-A-AA-TT-TATAT
gi|9784 : GTATGGTCCCATGATCTAGCAT-ACGC-AT--CA-GATGGCTTCCCTG-ACA-C--AAGG-GAA-TCA-GAAA-TATTATAT
gi|9785 : GTACGGTTCGATGACTAA-CAT-AC-CCAT--CA-GATG--CTCCCTGCACA-C--AA-G-GAT-TAATG-AA-T--TATA
gi|9786 : GTATGGTC--ATGACCTA-CGTAAC-C-TT--CA-GATG--CTCCCTG-AC
gi|9787 : TACGGTC--ATGACCTA-CAT-AC-C-AA--CA-GATG--CTCCCTG-ACACC--AA-G-GAA-TAA-G-AA-TA-TATAT
gi|9788 : TATG-TC--ATGACCTA-CAT-AT-C-AT--CG-ATTG--CTCCTCG-ATA-CCAAA-A-GAA-T-A-G-AA-T
gi|9789 : ATGGTC--ATAAGCGG-GAT-AC-C-AT--CA-GATG--CTCCTTG-ACA-C--AA-G-GAA-TAA-G-AA-TA-TATAT
gi|9790 : ATGGTC--ATGACCTA-CAT-AC-A-AAA-CA-GATG--CTTCCTG-ACA-C--AA-G-AAT-TAA-G--A-TA-TATAT
gi|9791 : ACGGTC--ATGACCTA-CAT-A--C-ATGGCAGGATG--C-GCCTG-ACA-C--AA-GTGAATTCA-G-AA-TA-TATAT
gi|9792 : GGTC--A-GACCTAACAT-AC-C-AA--CA-GAT---CTCCCTG-ACA-C--AA-G-GAA--AA-G-AAGTA-TATAT
gi|9793 : GTC--ATGACCTA-CAT-AC-T-AT--CA-TATA--CCCCATG-ACA-C--AT-A-GAA-TAA-
gi|9794 : GCC--GTGACCCA-CAT-AC-C-AT--CC-GATG--TTCCTTG-ACA-C--AA-C-AAA-CAA-G-AA-TA-AGTAT
Alignments
lowQualScore : 66 4 2 2 2 55 2 33 2 2 33 2 2 2 2 2 2 2
lowQualScore : .. . . . . .. . .. . . .. . . . . . . .
lowQualScore : 55 7 4 4 4 66 4 22 4 5 44 5 5 5 5 7 7 9
consensus : GTATGGTC--ATGACCTA-CAT-AC-C-AT--CA-GATG--CTCCCTG-ACA-C--AA-G-GAA-TAA-G-AA-TA-TATAT
Reference ( family-935 ) : GTATGGTC--ATGACCTA-CAT-AC-C-AT--CA-GATG--CTCCCTG-ACA-C--AA-G-GAA-TAA-G-AA-TA-TATAT
gi|9778 : GTATGGTC--ATGACCTA-CAT-AC-C-AT--CA-GATG--CTCCCTG-ACA-C--AA-G-GAA-TAA-G-AA-TA-TATAT
gi|9779 : GTATGGTC--ATGACTTA-CAT-AC-C-AT--CA-GATG--CTCGCTG-ACA-C--AA-G-GAA-TAA-G-AA-TG-TATAT
gi|9780 : GTATGGTC--ATGACCTA-CAT-AC-C-AT--TA-GATA--CTCCTGA-ACA-C--AA-G-GAA-TAA-G-AA-TA-TATAT
gi|9781 : GTATGGTC--ATGACCTT-CAT-AC-C-AT--CA-GATG--CTCCCTG-ACA-C--AA-G-GAA-TAA-G-AA-TA-CATAT
gi|9782 : GTATGGTC--ATGACCTA-CAT-AC-C-AT--CA-GATG--CTTCCTG-ACA-C--AA-G-AAA-CAA-G-AG-TA-AGTAT
gi|9783 : GCATCGTC--ATGATCTA-CAT----------CA-GATG--CTCCCTT-ACA-C--AA-G-GAA-TAG-A-AA-TT-TATAT
gi|9784 : GTATGGTCCCATGATCTAGCAT-ACGC-AT--CA-GATGGCTTCCCTG-ACA-C--AAGG-GAA-TCA-GAAA-TATTATAT
gi|9785 : GTACGGTTCGATGACTAA-CAT-AC-CCAT--CA-GATG--CTCCCTGCACA-C--AA-G-GAT-TAATG-AA-T--TATA
gi|9786 : GTATGGTC--ATGACCTA-CGTAAC-C-TT--CA-GATG--CTCCCTG-AC
gi|9787 : TACGGTC--ATGACCTA-CAT-AC-C-AA--CA-GATG--CTCCCTG-ACACC--AA-G-GAA-TAA-G-AA-TA-TATAT
gi|9788 : TATG-TC--ATGACCTA-CAT-AT-C-AT--CG-ATTG--CTCCTCG-ATA-CCAAA-A-GAA-T-A-G-AA-T
gi|9789 : ATGGTC--ATAAGCGG-GAT-AC-C-AT--CA-GATG--CTCCTTG-ACA-C--AA-G-GAA-TAA-G-AA-TA-TATAT
gi|9790 : ATGGTC--ATGACCTA-CAT-AC-A-AAA-CA-GATG--CTTCCTG-ACA-C--AA-G-AAT-TAA-G--A-TA-TATAT
gi|9791 : ACGGTC--ATGACCTA-CAT-A--C-ATGGCAGGATG--C-GCCTG-ACA-C--AA-GTGAATTCA-G-AA-TA-TATAT
gi|9792 : GGTC--A-GACCTAACAT-AC-C-AA--CA-GAT---CTCCCTG-ACA-C--AA-G-GAA--AA-G-AAGTA-TATAT
gi|9793 : GTC--ATGACCTA-CAT-AC-T-AT--CA-TATA--CCCCATG-ACA-C--AT-A-GAA-TAA-
gi|9794 : GCC--GTGACCCA-CAT-AC-C-AT--CC-GATG--TTCCTTG-ACA-C--AA-C-AAA-CAA-G-AA-TA-AGTAT
blockSeqs : CC G A G C GG G GC C C CA G T T T A G T
blockSeqs : CG A . . . A . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . .
blockSeqCons :
originalCons : GTATGGTC--ATGACCTA-CAT-AC-C-AT--CA-GATG--CTCCCTG-ACA-C--AA-G-GAA-TAA-G-AA-TA-TATAT
finalCons : GTATGGTC--ATGACCTA-CAT-AC-C-AT--CA-GATG--CTCCCTG-ACA-C--AA-G-GAA-TAA-G-AA-TA-TATAT
Alignments
lowQualScore : 66 4 2 2 2 55 2 33 2 2 33 2 2 2 2 2 2 2
lowQualScore : .. . . . . .. . .. . . .. . . . . . . .
lowQualScore : 55 7 4 4 4 66 4 22 4 5 44 5 5 5 5 7 7 9
consensus : GTATGGTC--ATGACCTA-CAT-AC-C-AT--CA-GATG--CTCCCTG-ACA-C--AA-G-GAA-TAA-G-AA-TA-TATAT
Reference ( family-935 ) : GTATGGTC--ATGACCTA-CAT-AC-C-AT--CA-GATG--CTCCCTG-ACA-C--AA-G-GAA-TAA-G-AA-TA-TATAT
gi|9778 : GTATGGTC--ATGACCTA-CAT-AC-C-AT--CA-GATG--CTCCCTG-ACA-C--AA-G-GAA-TAA-G-AA-TA-TATAT
gi|9779 : GTATGGTC--ATGACTTA-CAT-AC-C-AT--CA-GATG--CTCGCTG-ACA-C--AA-G-GAA-TAA-G-AA-TG-TATAT
gi|9780 : GTATGGTC--ATGACCTA-CAT-AC-C-AT--TA-GATA--CTCCTGA-ACA-C--AA-G-GAA-TAA-G-AA-TA-TATAT
gi|9781 : GTATGGTC--ATGACCTT-CAT-AC-C-AT--CA-GATG--CTCCCTG-ACA-C--AA-G-GAA-TAA-G-AA-TA-CATAT
gi|9782 : GTATGGTC--ATGACCTA-CAT-AC-C-AT--CA-GATG--CTTCCTG-ACA-C--AA-G-AAA-CAA-G-AG-TA-AGTAT
gi|9783 : GCATCGTC--ATGATCTA-CAT----------CA-GATG--CTCCCTT-ACA-C--AA-G-GAA-TAG-A-AA-TT-TATAT
gi|9784 : GTATGGTCCCATGATCTAGCAT-ACGC-AT--CA-GATGGCTTCCCTG-ACA-C--AAGG-GAA-TCA-GAAA-TATTATAT
gi|9785 : GTACGGTTCGATGACTAA-CAT-AC-CCAT--CA-GATG--CTCCCTGCACA-C--AA-G-GAT-TAATG-AA-T--TATA
gi|9786 : GTATGGTC--ATGACCTA-CGTAAC-C-TT--CA-GATG--CTCCCTG-AC
gi|9787 : TACGGTC--ATGACCTA-CAT-AC-C-AA--CA-GATG--CTCCCTG-ACACC--AA-G-GAA-TAA-G-AA-TA-TATAT
gi|9788 : TATG-TC--ATGACCTA-CAT-AT-C-AT--CG-ATTG--CTCCTCG-ATA-CCAAA-A-GAA-T-A-G-AA-T
gi|9789 : ATGGTC--ATAAGCGG-GAT-AC-C-AT--CA-GATG--CTCCTTG-ACA-C--AA-G-GAA-TAA-G-AA-TA-TATAT
gi|9790 : ATGGTC--ATGACCTA-CAT-AC-A-AAA-CA-GATG--CTTCCTG-ACA-C--AA-G-AAT-TAA-G--A-TA-TATAT
gi|9791 : ACGGTC--ATGACCTA-CAT-A--C-ATGGCAGGATG--C-GCCTG-ACA-C--AA-GTGAATTCA-G-AA-TA-TATAT
gi|9792 : GGTC--A-GACCTAACAT-AC-C-AA--CA-GAT---CTCCCTG-ACA-C--AA-G-GAA--AA-G-AAGTA-TATAT
gi|9793 : GTC--ATGACCTA-CAT-AC-T-AT--CA-TATA--CCCCATG-ACA-C--AT-A-GAA-TAA-
gi|9794 : GCC--GTGACCCA-CAT-AC-C-AT--CC-GATG--TTCCTTG-ACA-C--AA-C-AAA-CAA-G-AA-TA-AGTAT