lowQualScore                  :            444                                      11         111                          22222222222                                 111111        2222222222                              
lowQualScore                  :         8  333        1    3      0       33  6666  66  2    3 111 2          2    444 2  2 00000000000    2 77          2   33  33 3   333333   1 3  7777777777    55   3     3   4  4 55    
lowQualScore                  :         .  ...        .    .      .       ..  ....  ..  .    . ... .          .    ... .  . ...........    . ..          .   ..  .. .   ......   . .  ..........    ..   .     .   .  . ..    
lowQualScore                  :         0  222        1    1      2       99  1111  88  7    3 111 7          7    777 7  7 33333333333    9 99          7   99  99 1   000000   2 7  2222222222    00   6     6   9  0 55    
consensus                     :  AAAAGAA-AAAC-GCAATGATCAAAC-CAATGACAACTCAA--CA----CTA-CA-TCTGCA-CTA-TAGATGCGGT-GAGA---G-TA-T---A-------AAAA-A--TTACATTATG-CAA--TG--T-TAC----ANCGACTCAG-C-TA--G--AAAG--TAC-AACCG-ATCGAC-T--CAAT
Reference ( gi|110856 )       :  AAAAGAA-AACCCACAATGATCAAAC-CAATGACAACTCAA--CA----CTT-CA-TCTGCA-CTA-TAGATGCGGT-GAGA---G-TA-T---A-------AAAA-A--TTACATTATG-CAA--TG--T-TAC----AGCGACTTAG-A-TA--T--AAAG--TAC-AACCG-ATCAAC-T--CAAT
gi|110858                     :  AAAAGAA-AAAC-ACAATGATCAAAC-CAATGACAACCCAA--CA----CTA-CA-TCTGCA-CTA-CAGATGCGGT-GAGA---G-CA-T---AT------AAAA-C--CTACATTATG-CAA--TG--T-TAC----AACGACTCAG-C-AA--G--AAAA--TAC-AACCG-ATCGAC-T--GAAT
gi|110857                     :  AAAAGAATAAC--GCAATGATCAAAC-CAATGACAACTCAA--TA----CTA-CA-TCCGCA-CTA-TAAATGCGAT-GAGA---T-TA-TAA-A-------AAAA-A--TTACATTATG-CAA--TG--T-TAC----ATCAA-TTAA-ACTA--T--AAAA--TAC-AACCG-ATCAAC-T--CAAT
gi|110860                     :  AAAAGAA-AAAT-ACAACGATCAAAC-CAATGACAACTCAA--CA----CTA-CA-TCTGCA-CTA-CAGCTGCGGT-AGAA---G-TA-T---A-------TAAA-A--TTACATTATG-CAA--TG--T-TAC----AAGGATTCAG-A-AA--A--GAAG--TAC-ATCCG-A
gi|110861                     :  AAAATAA-AAAACGTAATGATCAAAC-CAATGACAACTCAC--AA----CTA-CA-TCTG-A---A-TAGATGCGGT-TAGG---G-TA-T-----------GAAC-A--TTACATTATG-CAA--TG--T-TAC----GTCGACTCAG-C-TA--T--
gi|110862                     :  AAAATAA-AAAC-GTAATGATCAAAC-CAATGACAACTCAA--CA----CTA-CA-TCTG-A---A-TAGATGCGGT-AGTA---G-TA-T---A-------A
gi|110859                     :                 AATGAT-AAAC-CAATGACAACTCAA--CA----CTTACA-T-TG-A---A-TAGATGCGGT-GAGA---G-TG-T---A-------AACA-G--TTACAT-ATG-CAA--TG--T-TAC----GTCGACTCAG-C-TA--C--AAAG--TAC-AACCG-AGCAAC-T--CAAT
gi|110863                     : aaaatagtttaaacgtAATGATGAAAC-CAATGACAACTCAA--CA----CTA-CA-----CAATTA-TAGATGCGGT-GAGA---G-TA-T---A-------AACA-A--TTACATTATG-CAA--TT--T-TAC----GTCAACTCAG-C-TA--T--AAAA--TAC-AACTG-ACTAGCAT--CAA
gi|110864                     :  aaataatttaaacgtAATGAGCAAAC-CAATGA-AACTCAA--CA----CTA-CAGGCTGCA-A-A-TAGATGCGGT-GAGA---G-TA-T---A-------AAAACAGTTTACATTATGCCAATCTG--T-TACGACTATCGGC-TAG-C-TAACA--AAAG--TGC-AACCG-AGC-AC-T--CAAT
gi|110865                     :                 AATGA-AAAACACAATGA-AACTAAA--CA----CTA-AA-TCTACA-CTA-CAGATGTGAT-GAGA---G-TA-C---ATGTATATACAA-G--CTACATTTTG-CAG--TG--
gi|110866                     :                        AAAC-CAATGACAACTCAA--CA----CTA-CA-TCTACA-CTA-CAGATGCGGT-GAAA---G-TA-TATAA-------AAAA-G--CTATATTATG-CAA--TG--T-TTT----AACGATTCA--A-CAG-G--AAAG--TTC-AATCG-ATCGAC-G--CAAT
gi|110867                     :                        AAAC-CAATGACAACTCAA--CA----CTTACA-TCTACA-CTA-CAGATGCGGT-GAAAAGTG-TATT---A-------AAAA-AGCGTATATTATG-CAA--TGTTT-TA-----AACGATTCA--A-CAG-G--AAAGCTTTC-AATCG-ATCGAC-CGGCAAT
gi|110868                     :                         AAC-CAATGATAACTCAA--CATGCACTA-CA-TCTGCA-CTA-TAGATGCAGT-AAGA---G-TA-T---A-------TAAA-A--TTACATTATA-CA
gi|110869                     :                            -CAATGATAACTCAATGCA----CTA-CA-TCTGCA-CTAATAGATGCAGTTAAGA---GGTA-T---AT------AAAC-A--TTACATTATG-CAA--TG--TATAC----AAC-ATTCAGCG-TA--G--GAAG--TACAAACCGTATCGAC-T--TAATttatatttgatactcacagcta
gi|110870                     :                                    AACTAAA--CA----CTT-AA-TCCACA-ATA-AAGATTTGAT-TTGA---G-TA-T---AT------ACGA-G--CTACATT-TG-CAA--TG--T-TAG----AACAGTTCAG---TA--GGAAAAG--CAC-AACCG-ATCGAT-T--CAAT
gi|110871                     :                                                      -CA-TCTG-A---A-TAGATGCGGT-TAGA---G-TA-T---G-------AACA-A--TTACATTATG-CAA--TG--T-TAC----GTCGACTCAG-C-TA--T--A
gi|110872                     :                                                                                                                      TATG-CAA--TG--T-AAC----ATTGATTCAG-C-AA--G--AAAG--TAC-AACCG-ATCGAC-T--CAAT





Alignments
lowQualScore                  :                                                                                                      11111111111                                                                                         
lowQualScore                  :               6       5             2              33  5555  5   2    2 999 2          2    444 2  2 88888888888    2 77          2  33 33  33 2   5555 1     33    2  99999    44   3     3       55    
lowQualScore                  :               .       .             .              ..  ....  .   .    . ... .          .    ... .  . ...........    . ..          .  .. ..  .. .   .... .     ..    .  .....    ..   .     .       ..    
lowQualScore                  :               7       0             9              77  7777  3   5    5 222 5          5    444 5  5 44444444444    7 33          5  44 44  44 7   7777 0     77    7  22222    66   3     3       55    
consensus                     :           AAAA-GAAAAAC-GCAATGATCAAAC-CAATGACAACTCAA--CA----CT-ACA-TCTGCA-CTA-TAGATGCGGT-GAGA---G-TA-T---A-------AAAA-A--TTACATTATG-CA--A--TG--T-TAC----ANCGACT--CAGC-TA--G--AAAG--TAC-AACCG-ATCGACT--CAAT
Reference ( family-925 )      :           AAAA-GAAAAAC-GCAATGATCAAAC-CAATGACAACTCAA--CA----CT-ACA-TCTGCA-CTA-TAGATGCGGT-GAGA---G-TA-T---A-------AAAA-A--TTACATTATG-CA--A--TG--T-TAC----ANCGACT--CAGC-TA--G--AAAG--TAC-AACCG-ATCGACT--CAAT
gi|110856                     :           AAAA-GAAAACCCACAATGATCAAAC-CAATGACAACTCAA--CA----CT-TCA-TCTGCA-CTA-TAGATGCGGT-GAGA---G-TA-T---A-------AAAA-A--TTACATTATG-CA--A--TG--T-TAC----AGCGACT--TAGA-TA--T--AAAG--TAC-AACCG-ATCAACT--CAAT
gi|110857                     :           AAAA-GAATAAC-GCAATGATCAAAC-CAATGACAACTCAA--TA----CT-ACA-TCCGCA-CTA-TAAATGCGAT-GAGA---T-TA-TAA-A-------AAAA-A--TTACATTATG-CA--A--TG--T-TAC----ATCAATT--AAAC-TA--T--AAAA--TAC-AACCG-ATCAACT--CAAT
gi|110858                     :           AAAA-GAAAAAC-ACAATGATCAAAC-CAATGACAACCCAA--CA----CT-ACA-TCTGCA-CTA-CAGATGCGGT-GAGA---G-CA-T---AT------AAAA-C--CTACATTATG-CA--A--TG--T-TAC----AACGACT--CAGC-AA--G--AAAA--TAC-AACCG-ATCGACT--GAAT
gi|110859                     :                   AAAC-GTAATGAT-AAAC-CAATGACAACTCAA--CA----CTTACA-T-TG-A---A-TAGATGCGGT-GAGA---G-TG-T---A-------AACA-G--TTACAT-ATG-CA--A--TG--T-TAC----GTCGACT--CAGC-TA--C--AAAG--TAC-AACCG-AGCAACT--CAAT
gi|110860                     : aaaatagtttAAAA-GAAAAAT-ACAACGATCAAAC-CAATGACAACTCAA--CA----CT-ACA-TCTGCA-CTA-CAGCTGCGGT-AGAA---G-TA-T---A-------TAAA-A--TTACATTATG-CA--A--TG--T-TAC----AAGGATT--CAGA-AA--A--GAAG--TAC-ATCCG-A
gi|110861                     :           AAAATAAAAAAC-GTAATGATCAAAC-CAATGACAACTCAC--AA----CT-ACA-TCTG-A---A-TAGATGCGGT-TAGG---G-TA-T-----------GAAC-A--TTACATTATG-CA--A--TG--T-TAC----GTCGACT--CAGC-TA--
gi|110862                     :           AAAA-TAAAAAC-GTAATGATCAAAC-CAATGACAACTCAA--CA----CT-ACA-TCTG-A---A-TAGATGCGGT-AGTA---G-TA-T---A-------At
gi|110863                     :                   AAAC-GTAATGATGAAAC-CAATGACAACTCAA--CA----CT-ACA-----CAATTA-TAGATGCGGT-GAGA---G-TA-T---A-------AACA-A--TTACATTATG-CA--A--TT--T-TAC----GTCAACT--CAGC-TA--T--AAAA--TAC-AACTG-A
gi|110864                     :                 aaataatttAATGAGCAAAC-CAATGA-AACTCAA--CA----CT-ACAGGCTGCA-A-A-TAGATGCGGT-GAGA---G-TA-T---A-------AAAACAGTTTACATTATGCCA--ATCTG--T-TACGACTATCGGCT---AGC-TAACA--AAAG--TGC-AACCG-AGC-ACT--CAATctagcatcaa
gi|110865                     :                          AATGA-AAAACACAATGA-AACTAAA--CA----CT-AAA-TCTACA-CTA-CAGATGTGAT-GAGA---G-TA-C---ATGTATATACAA-G--CTACATTTTG-CA--G--TG--
gi|110866                     :                                 AAAC-CAATGACAACTCAA--CA----CT-ACA-TCTACA-CTA-CAGATGCGGT-GAAA---G-TA-TATAA-------AAAA-G--CTATATTATG-CA--A--TG--T-TTT----AACGATT--CAAC-AG--G--AAAG--TTC-AATCG-ATCGACG--CAAT
gi|110867                     :                                 AAAC-CAATGACAACTCAA--CA----CTTACA-TCTACA-CTA-CAGATGCGGT-GAAAAGTG-TATT---A-------AAAA-AGCGTATATTATG-CA--A--TGTTT-TA-----AACGATT--CAAC-AG--G--AAAGCTTTC-AATCG-ATCGACCGGCAAT
gi|110868                     :                                  AAC-CAATGATAACTCAA--CATGCACT-ACA-TCTGCA-CTA-TAGATGCAGT-AAGA---G-TA-T---A-------TAAA-A--TTACATTATA-CATTA--TA--T-TTG----AT--ACTCACAGC-TA--
gi|110869                     :                                     -CAATGATAACTCAATGCA----CT-ACA-TCTGCA-CTAATAGATGCAGTTAAGA---GGTA-T---AT------AAAC-A--TTACATTATG-CA--A--TG--TATAC----AAC-ATT--CAGCGTA--G--GAAG--TACAAACCGTATCGACT--TAAT
gi|110870                     :                                             AACTAAA--CA----CT-TAA-TCCACA-ATA-AAGATTTGAT-TTGA---G-TA-T---AT------ACGA-G--CTACATT-TG-CA--A--TG--T-TAG----AACAGTT--CAG--TA--GGAAAAG--CAC-AACCG-ATCGATT--CAAT
gi|110871                     :                                                                CA-TCTG-A---A-TAGATGCGGT-TAGA---G-TA-T---G-------AACA-A--TTACATTATG-CA--A--TG--T-TAC----GTCGACT--CAGC-TA--
gi|110872                     :                                                                                                                               TATG-CA--A--TG--T-AAC----ATTGATT--CAGC-AA--G--AAAG--TAC-AACCG-ATCGACT--CAATta





Alignments
lowQualScore                  :                                                                                                      11111111111                                                                                         
lowQualScore                  :               6       5             2              33  5555  5   2    2 999 2          2    444 2  2 88888888888    2 77          2  33 33  33 2   5555 1     33    2  99999    44   3     3       55    
lowQualScore                  :               .       .             .              ..  ....  .   .    . ... .          .    ... .  . ...........    . ..          .  .. ..  .. .   .... .     ..    .  .....    ..   .     .       ..    
lowQualScore                  :               7       0             9              77  7777  3   5    5 222 5          5    444 5  5 44444444444    7 33          5  44 44  44 7   7777 0     77    7  22222    66   3     3       55    
consensus                     :           AAAA-GAAAAAC-GCAATGATCAAAC-CAATGACAACTCAA--CA----CT-ACA-TCTGCA-CTA-TAGATGCGGT-GAGA---G-TA-T---A-------AAAA-A--TTACATTATG-CA--A--TG--T-TAC----ANCGACT--CAGC-TA--G--AAAG--TAC-AACCG-ATCGACT--CAAT
Reference ( family-925 )      :           AAAA-GAAAAAC-GCAATGATCAAAC-CAATGACAACTCAA--CA----CT-ACA-TCTGCA-CTA-TAGATGCGGT-GAGA---G-TA-T---A-------AAAA-A--TTACATTATG-CA--A--TG--T-TAC----ANCGACT--CAGC-TA--G--AAAG--TAC-AACCG-ATCGACT--CAAT
gi|110856                     :           AAAA-GAAAACCCACAATGATCAAAC-CAATGACAACTCAA--CA----CT-TCA-TCTGCA-CTA-TAGATGCGGT-GAGA---G-TA-T---A-------AAAA-A--TTACATTATG-CA--A--TG--T-TAC----AGCGACT--TAGA-TA--T--AAAG--TAC-AACCG-ATCAACT--CAAT
gi|110857                     :           AAAA-GAATAAC-GCAATGATCAAAC-CAATGACAACTCAA--TA----CT-ACA-TCCGCA-CTA-TAAATGCGAT-GAGA---T-TA-TAA-A-------AAAA-A--TTACATTATG-CA--A--TG--T-TAC----ATCAATT--AAAC-TA--T--AAAA--TAC-AACCG-ATCAACT--CAAT
gi|110858                     :           AAAA-GAAAAAC-ACAATGATCAAAC-CAATGACAACCCAA--CA----CT-ACA-TCTGCA-CTA-CAGATGCGGT-GAGA---G-CA-T---AT------AAAA-C--CTACATTATG-CA--A--TG--T-TAC----AACGACT--CAGC-AA--G--AAAA--TAC-AACCG-ATCGACT--GAAT
gi|110859                     :                   AAAC-GTAATGAT-AAAC-CAATGACAACTCAA--CA----CTTACA-T-TG-A---A-TAGATGCGGT-GAGA---G-TG-T---A-------AACA-G--TTACAT-ATG-CA--A--TG--T-TAC----GTCGACT--CAGC-TA--C--AAAG--TAC-AACCG-AGCAACT--CAAT
gi|110860                     : aaaatagtttAAAA-GAAAAAT-ACAACGATCAAAC-CAATGACAACTCAA--CA----CT-ACA-TCTGCA-CTA-CAGCTGCGGT-AGAA---G-TA-T---A-------TAAA-A--TTACATTATG-CA--A--TG--T-TAC----AAGGATT--CAGA-AA--A--GAAG--TAC-ATCCG-A
gi|110861                     :           AAAATAAAAAAC-GTAATGATCAAAC-CAATGACAACTCAC--AA----CT-ACA-TCTG-A---A-TAGATGCGGT-TAGG---G-TA-T-----------GAAC-A--TTACATTATG-CA--A--TG--T-TAC----GTCGACT--CAGC-TA--
gi|110862                     :           AAAA-TAAAAAC-GTAATGATCAAAC-CAATGACAACTCAA--CA----CT-ACA-TCTG-A---A-TAGATGCGGT-AGTA---G-TA-T---A-------At
gi|110863                     :                   AAAC-GTAATGATGAAAC-CAATGACAACTCAA--CA----CT-ACA-----CAATTA-TAGATGCGGT-GAGA---G-TA-T---A-------AACA-A--TTACATTATG-CA--A--TT--T-TAC----GTCAACT--CAGC-TA--T--AAAA--TAC-AACTG-A
gi|110864                     :                 aaataatttAATGAGCAAAC-CAATGA-AACTCAA--CA----CT-ACAGGCTGCA-A-A-TAGATGCGGT-GAGA---G-TA-T---A-------AAAACAGTTTACATTATGCCA--ATCTG--T-TACGACTATCGGCT---AGC-TAACA--AAAG--TGC-AACCG-AGC-ACT--CAATctagcatcaa
gi|110865                     :                          AATGA-AAAACACAATGA-AACTAAA--CA----CT-AAA-TCTACA-CTA-CAGATGTGAT-GAGA---G-TA-C---ATGTATATACAA-G--CTACATTTTG-CA--G--TG--
gi|110866                     :                                 AAAC-CAATGACAACTCAA--CA----CT-ACA-TCTACA-CTA-CAGATGCGGT-GAAA---G-TA-TATAA-------AAAA-G--CTATATTATG-CA--A--TG--T-TTT----AACGATT--CAAC-AG--G--AAAG--TTC-AATCG-ATCGACG--CAAT
gi|110867                     :                                 AAAC-CAATGACAACTCAA--CA----CTTACA-TCTACA-CTA-CAGATGCGGT-GAAAAGTG-TATT---A-------AAAA-AGCGTATATTATG-CA--A--TGTTT-TA-----AACGATT--CAAC-AG--G--AAAGCTTTC-AATCG-ATCGACCGGCAAT
gi|110868                     :                                  AAC-CAATGATAACTCAA--CATGCACT-ACA-TCTGCA-CTA-TAGATGCAGT-AAGA---G-TA-T---A-------TAAA-A--TTACATTATA-CATTA--TA--T-TTG----AT--ACTCACAGC-TA--
gi|110869                     :                                     -CAATGATAACTCAATGCA----CT-ACA-TCTGCA-CTAATAGATGCAGTTAAGA---GGTA-T---AT------AAAC-A--TTACATTATG-CA--A--TG--TATAC----AAC-ATT--CAGCGTA--G--GAAG--TACAAACCGTATCGACT--TAAT
gi|110870                     :                                             AACTAAA--CA----CT-TAA-TCCACA-ATA-AAGATTTGAT-TTGA---G-TA-T---AT------ACGA-G--CTACATT-TG-CA--A--TG--T-TAG----AACAGTT--CAG--TA--GGAAAAG--CAC-AACCG-ATCGATT--CAAT
gi|110871                     :                                                                CA-TCTG-A---A-TAGATGCGGT-TAGA---G-TA-T---G-------AACA-A--TTACATTATG-CA--A--TG--T-TAC----GTCGACT--CAGC-TA--
gi|110872                     :                                                                                                                               TATG-CA--A--TG--T-AAC----ATTGATT--CAGC-AA--G--AAAG--TAC-AACCG-ATCGACT--CAATta


blockSeqs                     :               T       .             A              TG  TGCA  T   G    C ATT A          T    AGT G  T ATGTATAT       C GT          C  TT TC  TT A   GACT T     CA    G  ACA      CT   A     T       GG
blockSeqs                     :               .       .             .              .   .     T   .    C CT  .          .    .   .  . ATAA           . GC          .  .  .   .  .   .    A     .     .  GGA      .    .     .       . 
blockSeqs                     :               .       .             .              .   .     .   .    C CT  .          .    .   .  . AAA            . .           .  .  .   .  .   .    T     .     .  T        .    .     .       . 
blockSeqs                     :               .       .             .              .   .     .   .    C CT  .          .    .   .  . AT             . .           .  .  .   .  .   .    A     .     .  G        .    .     .       . 
blockSeqs                     :               .       .             .              .   .     .   .    C CT  .          .    .   .  . AT             . .           .  .  .   .  .   .    T     .     .  C        .    .     .       . 
blockSeqs                     :                       .             .              .   .     .   .    C CT  .          .    .   .  . AT             . .           .  .  .   .  .   .    T     .     .  A        .    .     .       . 
blockSeqs                     :                       .             .              .   .     .   .    C CT  .          .    .   .  . A              . .           .  .  .   .  .   .    T     .     .  T        .    .     .       . 
blockSeqs                     :                                     .              .   .     .   .    C CT  .          .    .   .  . A              . .           .  .  .   .  .   .    A     .     .  G        .    .     .       . 
blockSeqs                     :                                     .              .   .     .   .    C CT  .          .    .   .  . A              . .           .  .  .   .  .   .    A     .     .  G        .    .     .       . 
blockSeqs                     :                                     .              .   .     .   .    C AT  .          .    .   .  . A              . .           .  .  .   .  .   .    T     .     .  G        .    .     .         
blockSeqs                     :                                     .              .   .     .   .    C A   .          .    .   .  . A              . .           .  .  .   .  .   .    A     .     .  G        .    .     .         
blockSeqs                     :                                     .              .   .     .   .    . .   .          .    .   .  . A              . .           .  .  .   .  .   .    A     .     .                                
blockSeqs                     :                                     .              .   .     .   .    . .   .          .    .   .  . A              . .           .  .  .   .  .   .    T     .     .                                
blockSeqs                     :                                                    .   .     .   .    . .   .          .    .   .  . G              . .           .  .  .   .  .   .    T     .     .                                
blockSeqs                     :                                                                  .    . .   .          .    .   .  . .                            .  .  .   .                                                        


blockSeqCons                  :           
originalCons                  :           AAAA-GAAAAAC-GCAATGATCAAAC-CAATGACAACTCAA--CA----CT-ACA-TCTGCA-CTA-TAGATGCGGT-GAGA---G-TA-T---A-------AAAA-A--TTACATTATG-CA--A--TG--T-TAC----ANCGACT--CAGC-TA--G--AAAG--TAC-AACCG-ATCGACT--CAAT
finalCons                     :           AAAA-GAAAAAC-GCAATGATCAAAC-CAATGACAACTCAA--CA----CT-ACA-TCTGCA-CTA-TAGATGCGGT-GAGA---G-TA-T---A-------AAAA-A--TTACATTATG-CA--A--TG--T-TAC----ANCGACT--CAGC-TA--G--AAAG--TAC-AACCG-ATCGACT--CAAT





Alignments
lowQualScore                  :                                                                                                      11111111111                                                                                         
lowQualScore                  :               6       5             2              33  5555  5   2    2 999 2          2    444 2  2 88888888888    2 77          2  33 33  33 2   5555 1     33    2  99999    44   3     3       55    
lowQualScore                  :               .       .             .              ..  ....  .   .    . ... .          .    ... .  . ...........    . ..          .  .. ..  .. .   .... .     ..    .  .....    ..   .     .       ..    
lowQualScore                  :               7       0             9              77  7777  3   5    5 222 5          5    444 5  5 44444444444    7 33          5  44 44  44 7   7777 0     77    7  22222    66   3     3       55    
consensus                     :           AAAA-GAAAAAC-GCAATGATCAAAC-CAATGACAACTCAA--CA----CT-ACA-TCTGCA-CTA-TAGATGCGGT-GAGA---G-TA-T---A-------AAAA-A--TTACATTATG-CA--A--TG--T-TAC----ANCGACT--CAGC-TA--G--AAAG--TAC-AACCG-ATCGACT--CAAT
Reference ( family-925 )      :           AAAA-GAAAAAC-GCAATGATCAAAC-CAATGACAACTCAA--CA----CT-ACA-TCTGCA-CTA-TAGATGCGGT-GAGA---G-TA-T---A-------AAAA-A--TTACATTATG-CA--A--TG--T-TAC----ANCGACT--CAGC-TA--G--AAAG--TAC-AACCG-ATCGACT--CAAT
gi|110856                     :           AAAA-GAAAACCCACAATGATCAAAC-CAATGACAACTCAA--CA----CT-TCA-TCTGCA-CTA-TAGATGCGGT-GAGA---G-TA-T---A-------AAAA-A--TTACATTATG-CA--A--TG--T-TAC----AGCGACT--TAGA-TA--T--AAAG--TAC-AACCG-ATCAACT--CAAT
gi|110857                     :           AAAA-GAATAAC-GCAATGATCAAAC-CAATGACAACTCAA--TA----CT-ACA-TCCGCA-CTA-TAAATGCGAT-GAGA---T-TA-TAA-A-------AAAA-A--TTACATTATG-CA--A--TG--T-TAC----ATCAATT--AAAC-TA--T--AAAA--TAC-AACCG-ATCAACT--CAAT
gi|110858                     :           AAAA-GAAAAAC-ACAATGATCAAAC-CAATGACAACCCAA--CA----CT-ACA-TCTGCA-CTA-CAGATGCGGT-GAGA---G-CA-T---AT------AAAA-C--CTACATTATG-CA--A--TG--T-TAC----AACGACT--CAGC-AA--G--AAAA--TAC-AACCG-ATCGACT--GAAT
gi|110859                     :                   AAAC-GTAATGAT-AAAC-CAATGACAACTCAA--CA----CTTACA-T-TG-A---A-TAGATGCGGT-GAGA---G-TG-T---A-------AACA-G--TTACAT-ATG-CA--A--TG--T-TAC----GTCGACT--CAGC-TA--C--AAAG--TAC-AACCG-AGCAACT--CAAT
gi|110860                     : aaaatagtttAAAA-GAAAAAT-ACAACGATCAAAC-CAATGACAACTCAA--CA----CT-ACA-TCTGCA-CTA-CAGCTGCGGT-AGAA---G-TA-T---A-------TAAA-A--TTACATTATG-CA--A--TG--T-TAC----AAGGATT--CAGA-AA--A--GAAG--TAC-ATCCG-A
gi|110861                     :           AAAATAAAAAAC-GTAATGATCAAAC-CAATGACAACTCAC--AA----CT-ACA-TCTG-A---A-TAGATGCGGT-TAGG---G-TA-T-----------GAAC-A--TTACATTATG-CA--A--TG--T-TAC----GTCGACT--CAGC-TA--
gi|110862                     :           AAAA-TAAAAAC-GTAATGATCAAAC-CAATGACAACTCAA--CA----CT-ACA-TCTG-A---A-TAGATGCGGT-AGTA---G-TA-T---A-------At
gi|110863                     :                   AAAC-GTAATGATGAAAC-CAATGACAACTCAA--CA----CT-ACA-----CAATTA-TAGATGCGGT-GAGA---G-TA-T---A-------AACA-A--TTACATTATG-CA--A--TT--T-TAC----GTCAACT--CAGC-TA--T--AAAA--TAC-AACTG-A
gi|110864                     :                 aaataatttAATGAGCAAAC-CAATGA-AACTCAA--CA----CT-ACAGGCTGCA-A-A-TAGATGCGGT-GAGA---G-TA-T---A-------AAAACAGTTTACATTATGCCA--ATCTG--T-TACGACTATCGGCT---AGC-TAACA--AAAG--TGC-AACCG-AGC-ACT--CAATctagcatcaa
gi|110865                     :                          AATGA-AAAACACAATGA-AACTAAA--CA----CT-AAA-TCTACA-CTA-CAGATGTGAT-GAGA---G-TA-C---ATGTATATACAA-G--CTACATTTTG-CA--G--TG--
gi|110866                     :                                 AAAC-CAATGACAACTCAA--CA----CT-ACA-TCTACA-CTA-CAGATGCGGT-GAAA---G-TA-TATAA-------AAAA-G--CTATATTATG-CA--A--TG--T-TTT----AACGATT--CAAC-AG--G--AAAG--TTC-AATCG-ATCGACG--CAAT
gi|110867                     :                                 AAAC-CAATGACAACTCAA--CA----CTTACA-TCTACA-CTA-CAGATGCGGT-GAAAAGTG-TATT---A-------AAAA-AGCGTATATTATG-CA--A--TGTTT-TA-----AACGATT--CAAC-AG--G--AAAGCTTTC-AATCG-ATCGACCGGCAAT
gi|110868                     :                                  AAC-CAATGATAACTCAA--CATGCACT-ACA-TCTGCA-CTA-TAGATGCAGT-AAGA---G-TA-T---A-------TAAA-A--TTACATTATA-CATTA--TA--T-TTG----AT--ACTCACAGC-TA--
gi|110869                     :                                     -CAATGATAACTCAATGCA----CT-ACA-TCTGCA-CTAATAGATGCAGTTAAGA---GGTA-T---AT------AAAC-A--TTACATTATG-CA--A--TG--TATAC----AAC-ATT--CAGCGTA--G--GAAG--TACAAACCGTATCGACT--TAAT
gi|110870                     :                                             AACTAAA--CA----CT-TAA-TCCACA-ATA-AAGATTTGAT-TTGA---G-TA-T---AT------ACGA-G--CTACATT-TG-CA--A--TG--T-TAG----AACAGTT--CAG--TA--GGAAAAG--CAC-AACCG-ATCGATT--CAAT
gi|110871                     :                                                                CA-TCTG-A---A-TAGATGCGGT-TAGA---G-TA-T---G-------AACA-A--TTACATTATG-CA--A--TG--T-TAC----GTCGACT--CAGC-TA--
gi|110872                     :                                                                                                                               TATG-CA--A--TG--T-AAC----ATTGATT--CAGC-AA--G--AAAG--TAC-AACCG-ATCGACT--CAATta