lowQualScore : 111111111 1111111111 1111111 55555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555 111 9999999999999999999999999999999999999999999999999 111111111 2222222222 222222 111
lowQualScore : 2 2 33 2 5 2 66 111111111 6666666666 6 3 3 3 3 3 3 3 6666 6 7777777 2 9999999 2 00000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 888888 6666 2 1 66 2 2 66 33 33 777 0 888 444 2 33 2 111 33 777 6666666666666666666666666666666666666666666666666 2 2 000000000 4 2 2 5 2 2 99 2 44 1 1111111111 8 2 2 33 33 33 2 111111 111 3 6
lowQualScore : . . .. . . . .. ......... .......... . . . . . . . . .... . ....... . ....... . ................................................................. ...... .... . . .. . . .. .. .. ... . ... ... . .. . ... .. ... ................................................. . . ......... . . . . . . .. . .. . .......... . . . .. .. .. . ...... ... . .
lowQualScore : 9 9 99 9 7 9 88 444444444 5555555555 2 1 1 1 1 1 1 1 5555 2 1111111 9 3333333 9 55555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555 222222 1111 9 1 88 9 9 00 99 99 999 1 999 000 7 77 7 111 77 333 9999999999999999999999999999999999999999999999999 7 7 777777777 9 7 7 3 7 9 66 9 44 4 1111111111 4 7 7 77 77 77 7 666666 555 1 2
consensus : TAACACT-AG-AGA--GT-TCCAC-TA-CA--ACA---------AT----------A-T-GTC-G-TCT-CG-AAA-C-G----G-TATT-------T-A-------CG-A--------G-----------T-T-----A-CG----------------A--G-------------AGG------A----TAT-CGCTGCGCTTGT--C-GAC-T-NT--A--A---AGATAG---TAG--AAAC-AAA--C-AAAA--NG--TTGT---GA----------AAGTG----------G-------C------G--------T-TTTGGAGA-C---------TAT-T-T-AGTG-GAAAGA-TA--TG-G-AAAAACT-A-TA-----ATATTGAGG-A-A--AT--AGAGAAAT--TACTTTC-AAT-GG-AGA-TCGGTCGATGTG-TTCT-AAATTGAA
Reference ( gi|36111 ) : TAACACT-AG-AGA--GT-TCCAC-TA-CA--ACA---------AT----------A-T-GTC-G-TCT-CG-AAA-C-G----G-TATT-------T-A-------CG-A--------G-----------T-T-----A-CG----------------A--G-------------AGG------A----TAT-CGCTGCGCTTGT--C-GAC-T-AT--A--A---AGATAG---TAG--AAAC-AAA--C-AAAA--TG--TTGT---AA----------AA-TG----------G-------T------G--------T-TTTGGAGA-C---------TGT-T-T-AGTG-GAAAGA-TA--TG-G-AAAAACT-A-TA-----ATATCGAGG-A-A--AT--AGAGAAAT--TACTTTC-AAT-AG-CGA-TCGGTCGATGTG-TTCT-AAATTGAA
gi|36113 : TAACACT-AG-AGA--GT-TCCAC-TA-CA--ACA---------AT----------A-T-GTC-G-TCT-CG-AAA-C-G----G-TATT-------T-A-------CG-A--------G-----------T-T-----A-CG----------------A--A-------------GGG------A----TAT-CGCTGCGC-TGT--C-GAC-T-AT--A--A---AGATAG---TAG--AAAC-AAA--C-AAAA--TGTTTTGT---AA----------AAGTG----------G-------C------T--------T-TTTGGAGA-C---------TAT-T-T-A-TT-GAAAGA-TA--TG-GAAAAAACT-A-TA-----ACATTGAGG-A-A--AT--AGAGAAAT--TACTTTC-AAT-GG-AGA-TCGGTCGATGTG-TTCT-AAATTTAA
gi|36112 : TAACACT-AG-AGA--GT-TCCCA-TA-CA--ACA---------AT----------A-T-GTC-G-TCT-CG-AAA-C-A----C-TATT-------T-A-------CG-A--------G-----------T-T-----A-CG----------------A--G-------------AGG------A----TAT-CGCTGCGCTTTT--TTGAC-T-AT--A--A---AGATAG---TAG--AAAC-AAA--C-AAAA--TG--TTGT---AA----------AAATG----------G-------C------T--------T-TTTGGAGA-C---------TAT-T-TTAGTG-GAAAGA-TA--TG-G-AAAAATT-A-TA-----ATATTGAGG-A-A--AT--AGAGAAAT--TACTTTC-AAT-GG-AGA-TCGGTCGATGTG-TTCT-ACATTGAA
gi|36114 : TAACACT-AG-AGA--GT-TCCAC-TA-CA--A------------T----------A-T-GT--G-TCT-CG-AAA-C-G----G-TATT-------T-A-------CG-A--------G-----------T-T-----A-CA----------------A--G-------------AGG------A----TAT-CGCTGCGCTTGT--C-GAC-TAAT--A--A---A-ATAG---TAG--AAAC-AAA--C-AAAA--TG--TTGT---AA----------AG-TG----------G-------C------A--------T-TTTGGTGA-C---------TAA-T-T-AGTG-GAAAGA-TA--TG-G--AAAACTAA-TA-----ATATT-AGG-A-A--AT--AGAGAAAT--TACTTTC-AAT-GG-AGA-TCGGTCAATGTG-TTCT-AAATTGAA
gi|36115 : TAACGCT-AGGAGA--GT-TCCAC-TA-CATAACA---------AC----------AAT-GTCCG-TCT-CG-AA--C-G----G-TATT-------T-A-------CG-AA-------G-----------T-T-----A-CG----------------AA-G-------------AGG------A----TAT-CGCTGCGGTTGT--C-GAC-T-AT--ACCA---AGATAACGCTAA--TAAC-AAAAGC-AAAA--TG--TTAT---GA----------AA-------------G-------T------GCT------T-TTTGGAGA-----------TGA-C-T-AGTG-GAAAGA-TG--TG-G-AAAA--C-A-TA-----AAATTGAGG-A-A--AT--AGAG-AAT--TACTTTCAAAT-GG-AGATTCGGT-GATGAGCTTCTAAAATTGAA
gi|36116 : TAACGCT-AG-AGA--GT-TCCAC-TA-CA--ACA---------AC----------AGT-GTG-T-TCT-CG-AAA-C-G----GGTATT-----------------CG-A--------------------T-T-----A-CG----------------A--G-------------AGG------A----TAT-CGCT-CGGT-GT--C-GAC---AT--T--A---A-ATAG---TA---AAAC-AAA--C-AAAA--TG--T-------A----------AA-------------G-------T------C--------T-TTTTGAGA-C---------TATCT-T-AGTGAGAAAGA-TG--TG-G-AAA--CT-A-TA-----ATATTGAGG-A-A--AT--AGA-AAAT--TA-TTTC-AA--GG-AGA--CGGTCGA--TG-ATCTAAAATTGAA
gi|36117 : TAACACTTAG-A-A--GT-TCCACATA-CA--ACATTAATAATGGT----------A-T-TTC-G-TCCACGGAAA-C-G----G-TATTC------T-A-------CGCA--------G-----------T-T-----A-CA-----------------------------------G------A----TAT-CGCTG-GCTTGTT-C-GAC-T-AT--A--ATTAATATAG---TAG--AAAC-AAA--CAAAAA--TG--TTGT---AAAGGG------AA-TG----------G-------C------T--------T-TTTGGAGAGCCACTATCTATAT-T-T-AGTG-CAAAGA-TAAGTGTG-AAAAACT-ATTAC----ATATTGAGGAA-A--ATAAAGAGAAAT--CACTTTC-AATGAGACG--TC-GTTGATGTG-TT-T-AAATTAA
gi|36128 : TAACACT-AG-AGA--GT-TCCAC-TA-CA--ACA---------
gi|36118 : AACAAC-GG-GGA--GT-TCCAC-TA-AT--ACA---------AT----------A-T-GTC-G-TCC-CA-AAA-T-A----G-TATCTATGTGAT-A-------CG-A--------G-----------T-C-----A-TG----------------A--A-------------ACGAAAAATA----TAT-TACTGTAATTGT--C-ACC-T-CT--A--A---AGATAA---TAG--AAGG-AAA--C-AAAA--AG--TTGTG--AA----------AG-TGACAACACT--G-------C------A--------T-TTTAGAGA-C---------TAC-T-T-AGTG-GATAGA-TA--TG-G-AAAAACT----------GTATTGGGG-A-A--AC--GGAAAAAT--TACTTT--AA--AG-AGA-T--ATCGATGTG-TTTT-AAATTAAAgannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatatcgaggaaatagagaaattactttcaatagcgatcggtcgatgtgttctaaattgaa
gi|36119 : AACACT-AG-AGA---T-TCCACATAACA--ACA---------AT----------A-T-GTC-G-GTC-CG-AA--C-G----GATATT-------TTA-------CG-A--------GATACCGAGTCTT-T-----AACG----------------AC-G-------------AGG------A----TAT-CGC-GTGCTTGTTTC-GAC-T-CT--A--A---AGATAG---TAG--AAG--AAG--C-AAAA--AG--TTGT---GA----------AG-TGCACTACAATTGT------T------T--------T-TTTGGAGA-C----------AT-TAT-AG-G-GAAGGATTAT-TG-G-AAAAAGA-A-TA-----AT---GAGG-ATA--AC--AGAGAAAT--TACTTTC-AA
gi|36120 : AACACT-AG-AGGAGGTATCCAC-TA-CA--ACC---------AT----------A-TTGTC-GGTCT-CG-AAAAC-G----G-TATT-------T-A-------CG-A--------GA----------G-T-----A-CGTAGTCCTTTTAAAGGGAC-G-------------AGG------A----TAG-C-CTGGTGTTGT--C-GAC-T-CT--A--AC--AGA-AG---TAG--ATGA-AAA--G-AAAA--AG--TTGTGTAAAGTGACTAC--AA-TG----------T-------T------T--------T-TTTGGAGA-C---------TAT-C-T-TATA-GGAAG--T---TG-G-TAAAAG-----A-----ATATTGAGG-A-A--A----GAGAAATCTTACTTTC-AAC-GG--GA----GCTGATGTG-TCTT-TAATTGAAcgggaggatcatggtgttttgtatt
gi|36121 : AACACT-AG-AGA--GT-CCCAC-TT-CA--ACA---------ATGCGATCATGTA-T-GTC-G-TTT-CG-AGA-C-A----G-TATT-------T-A-------CG-A--------GATACA------TGT-----A-CG----------------A--GTCGTTAAACAACGAGG------A----TAC-AGCTGAGCCTGT--C-GAT-T-CT--A--G---AGACAT---TAT--GAAC-AAA--C-AAAA--AG--TTGT---GAAAGTGGCTACAA-CG----------G-------T---------------T-TTTGGAGA-C---------TAT-A-T-AGTA-G
gi|36122 : AACACT-GA-AGA--GT-TTCAC-TA-CA--ACA---------ATT---------A-T-GTC-G-TCT-GG-AAG-C-GAGCAG-TACGAGG----T-A-------CG-A--------G-----------T-CGTTAAA-CG----------------ACGG-------------ACG------A----TAT-TGCGGCA-TTGT--G-GGA-T-TTCCA--A---AGATAG---CA---AAAC-ACT--C-AGAA--AG--TAGT---GA----------GAGTA----------G-------C------GACTAAACTC-CTTGGAGA-T---------TAT-T-T-GTTG-AGAAAA-TAT-TG-G-AGA----------------------G-A-A--AT--GGAGAAA----AC-CAC-AAC-GG-AGA-TTGGTC
gi|36123 : ACACC-GG--GA--GT-TTCTC-TA-TA---CA---------AT----------A-T-GTC-G-TCT-C--AAA-T-A----G-TATC-------T-ATCAGATACA-A--------G-----------T-C-----A-TG----------------A--A-------------ACG------AAAAATATATACTGCACTTGT--C-ACCCT-CT--A--A---AGATAA---TAG--AAAGGAAA--C-AAAA---G--TTGT---GA----------AAGTGACTACAAT--G-------C------A--------T-TTTA-AGA-C---------TAC-T-T-AGTG-GATAGA-TA--TG----AAAACT-A-T---------TTGGGG-A-A--AC--GGAACAAT--TACTTTT-AA--AG-AGA-T--ATCGATCTG-TTTT-AAATTAAA
gi|36124 : T-AA-AAA--AT-TCTAC-TA-TGT-ACA---------AT----------A-T-GAC-G-TCT-CG-AAA-CAA----G-AATT-------T-A-------CG-AAATATGATA-----------T-TAA---A-CG----------------AC-G-------------AGG------A----TAT-CACTGCGTTTGT--C-GAT-T-CT--G--A---AGATAG---TAG--AAAC-AAA--C-AAAT--AG--TTGG---AA----------AAGTG----------GCTACAATT------C--------TATTTGGAGA-A---------TAT-T-T-AGTG-TAAATA-TA--TA-G---AAACT---TACT---ATATTGATG-A-A--AT--GGAGAACT--TACTTT--AA--AG--GA---GATCGATATG-TTCT-AAATCAAA
gi|36125 : -------T-A-------CG-A--------G-----------T-T-----A-CG----------------A--G-------------AGG------A----TAT-CGATGCGCTTG
gi|36126 : CTTGT--T-GA----AG--G--A---AATTAGCG-TAGCTAACC-AAA--C-AAAA--AG--TTGT---GA----------AAGTG----------G-------TTACATTGAT------T-TTTGGAGA-C---------TAT-T-T-AGTG-GGGAAA-TA--TA-G-AGAAACT----------ATATTGAGG-A-A--AT--GGAGAAAC--TACTTTC---T-A--CGA--AGATCGATGTG-TTTT-AAATTAAA
gi|36127 : -AAA--C-AAAAATCG--TTGT---AA----------AG-AG----------T-------T------GGGCT----T-TTTGGAGA-C---------TAT-T-TTAGTG-GA-----TA--TG-G-AAAA-CT-A-TAGATGAATGT-GAGG-A-AGGAT--AGAGAAAT--CATTGTC-AAT--G-AGA-TCGCTCGATGTT-TGCT-AAATTGAA
gi|36128 : -----ATATCGAGG-A-A--AT--AGAGAAAT--TACTTTC-AAT-AG-CGA-TCGGTCGATGTG-TTCT-AAATTGAA
Alignments
lowQualScore : 111111111 1111111111 1111111 44444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444 111111 1111111111 5555555555555555555555555555555555 1111111111 111111
lowQualScore : 2 2 33 2 5 2 66 000000000 5555555555 5 2 2 2 2 2 2 2 6666 5 777 2 7777777 2 22222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 333333 2 1 66 2 2 33 33 33 777 444 33 2 33 999 33 55 0000000000 2 444 3333333333333333333333333333333333 5555 444 99999999 55 2 5 2 2 99 2 33 6666666666 33 2 2 33 2 33 33 2 7 33 555555 2 2 5
lowQualScore : . . .. . . . .. ......... .......... . . . . . . . . .... . ... . ....... . ................................................................. ...... . . .. . . .. .. .. ... ... .. . .. ... .. .. .......... . ... .................................. .... ... ........ .. . . . . .. . .. .......... .. . . .. . .. .. . . .. ...... . . .
lowQualScore : 7 7 77 7 3 7 33 777777777 4444444444 7 9 9 9 9 9 9 9 1111 7 333 7 3333333 7 11111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 333333 7 1 88 9 9 99 99 99 999 777 77 5 44 444 44 33 9999999999 5 444 7777777777777777777777777777777777 3333 444 11111111 99 5 0 5 7 00 7 55 0000000000 44 5 5 44 5 44 44 5 0 44 111111 7 7 3
consensus : TAACACT-AG-AGA--GT-TCCAC-TA-CA--ACA---------AT----------A-T-GTC-G-TCT-CG-AAA-C-G----G-TATT---T-A-------CG-A--------G-----------T-T-----A-CG----------------A--G-------------AGGA------TAT-CGCTGCGCTTGT--C-GAC-T-NT--A--A---AGATAG---TAG--AAAC-AAA--CAAAAA--GTT--GTG-A----------A-AG---T--G--------G------C------G--------T----TTT---GGAGA--------CTAT--T-T-AGTG-GAAAGA-TA--TG-G-AAAAACT-AT-A--AT--AT-TGAGGA-A--A-TA--GAGAAA--TTACTTTC-AACGG--AGA-TCG--GTCGAT-GTG-TTCT-AAATTGAA
Reference ( family-905 ) : TAACACT-AG-AGA--GT-TCCAC-TA-CA--ACA---------AT----------A-T-GTC-G-TCT-CG-AAA-C-G----G-TATT---T-A-------CG-A--------G-----------T-T-----A-CG----------------A--G-------------AGGA------TAT-CGCTGCGCTTGT--C-GAC-T-NT--A--A---AGATAG---TAG--AAAC-AAA--CAAAAN--GTT--GTG-A----------A-AG---T--G--------G------C------G--------T----TTT---GGAGA--------CTAT--T-T-AGTG-GAAAGA-TA--TG-G-AAAAACT-AT-A--AT--AT-TGAGGA-A--A-TA--GAGAAA--TTACTTTC-AATGG--AGA-TCG--GTCGAT-GTG-TTCT-AAATTGAA
gi|36111 : TAACACT-AG-AGA--GT-TCCAC-TA-CA--ACA---------AT----------A-T-GTC-G-TCT-CG-AAA-C-G----G-TATT---T-A-------CG-A--------G-----------T-T-----A-CG----------------A--G-------------AGGA------TAT-CGCTGCGCTTGT--C-GAC-T-AT--A--A---AGATAG---TAG--AAAC-AAA--CAAAAT--GTT--GT--A----------A-AA---T--G--------G------T------G--------T----TTT---GGAGA--------CTGT--T-T-AGTG-GAAAGA-TA--TG-G-AAAAACT-AT-A--AT--AT-CGAGGA-A--A-TA--GAGAAA--TTACTTTC-AATAG--CGA-TCG--GTCGAT-GTG-TTCT-AAATTGAA
gi|36112 : TAACACT-AG-AGA--GT-TCCCA-TA-CA--ACA---------AT----------A-T-GTC-G-TCT-CG-AAA-C-A----C-TATT---T-A-------CG-A--------G-----------T-T-----A-CG----------------A--G-------------AGGA------TAT-CGCTGCGCTTTT--TTGAC-T-AT--A--A---AGATAG---TAG--AAAC-AAA--CAAAAT--GTT--GTA-A----------A-AA---T--G--------G------C------T--------T----TTT---GGAGA--------CTAT--T-TTAGTG-GAAAGA-TA--TG-G-AAAAATT-AT-A--AT--AT-TGAGGA-A--A-TA--GAGAAA--TTACTTTC-AATGG--AGA-TCG--GTCGAT-GTG-TTCT-ACATTGAA
gi|36113 : TAACACT-AG-AGA--GT-TCCAC-TA-CA--ACA---------AT----------A-T-GTC-G-TCT-CG-AAA-C-G----G-TATT---T-A-------CG-A--------G-----------T-T-----A-CG----------------A--A-------------GGGA------TAT-CGCTGCGCT-GT--C-GAC-T-AT--A--A---AGATAG---TAG--AAAC-AAA--CAAAAT--GTTTTGTA-A----------A-AG---T--G--------G------C------T--------T----TTT---GGAGA--------CTAT--T-T-A-TT-GAAAGA-TA--TG-GAAAAAACT-AT-A--AC--AT-TGAGGA-A--A-TA--GAGAAA--TTACTTTC-AATGG--AGA-TCG--GTCGAT-GTG-TTCT-AAATTTAA
gi|36114 : TAACACT-AG-AGA--GT-TCCAC-TA-CA--A------------T----------A-T-GT--G-TCT-CG-AAA-C-G----G-TATT---T-A-------CG-A--------G-----------T-T-----A-CA----------------A--G-------------AGGA------TAT-CGCTGCGCTTGT--C-GAC-TAAT--A--A---A-ATAG---TAG--AAAC-AAA--CAAAAT--GTT--GT--A----------A-AG---T--G--------G------C------A--------T----TTT---GGTGA--------CTAA--T-T-AGTG-GAAAGA-TA--TG-G--AAAACTAAT-A--AT--AT-T-AGGA-A--A-TA--GAGAAA--TTACTTTC-AATGG--AGA-TCG--GTCAAT-GTG-TTCT-AAATTGAA
gi|36115 : TAACGCT-AGGAGA--GT-TCCAC-TA-CATAACA---------AC----------AAT-GTCCG-TCT-CG-AA--C-G----G-TATT---T-A-------CG-AA-------G-----------T-T-----A-CG----------------AA-G-------------AGGA------TAT-CGCTGCGGTTGT--C-GAC-T-AT--ACCA---AGATAACGCTAA--TAAC-AAAAGCAAAAT--GTT--ATG-A----------A-AG---T-----------G------C------T--------T----TTT---GGAGA--------TGA---C-T-AGTG-GAAAGA-TG--TG-G-AAAA--C-AT-A--AA--AT-TGAGGA-A--A-TA--GAG-AA--TTACTTTCAAATGG--AGATTCG--GT-GAT-GAGCTTCTAAAATTGAA
gi|36116 : TAACGCT-AG-AGA--GT-TCCAC-TA-CA--ACA---------AC----------AGT-GTG-T-TCT-CG-AAA-C-G----GGTATT-------------CG-A--------------------T-T-----A-CG----------------A--G-------------AGGA------TAT-CGCT-CGGT-GT--C-GAC-A-TT--A--A---A--TAG---TA---AAAC-AAA--CAAAAT--GT-------A----------A-AG---T------------------C------T--------T----TTT---G-AGA--------CTATC-T-T-AGTGAGAAAGA-TG--TG-G-AAA--CT-AT-A--AT--AT-TGAGGA-A--A-TA--GA-AAA--TTA-TTTC-AA-GG--AGA--CG--GTCGA---TG-ATCTAAAATTGAA
gi|36117 : TAACACTTAG-A-A--GT-TCCACATA-CA--ACATTAATAATGGT----------A-T-TTC-G-TCCACGGAAA-C-G----G-TATTC--T-A-------CGCA--------G-----------T-T-----A-CA-----------------------------------GA------TAT-CGCTG-GCTTGTT-C-GAC-T-AT--A--ATTAATATAG---TAG--AAAC-AAA--CAAAAAT-GTT--GTA-A----------A-GGGAAT--G--------G------C------T--------T----TTT---GGAGAGCCACTATCTATATT-T-AGTG-CAAAGA-TAAGTGTG-AAAAACT-ATTAC-AT--AT-TGAGGA-A--AATAAAGAGAAA--TCACTTTC-AAT-G--AGA--CGTCGTTGAT-GTG-TT-T-AAATTAA
gi|36118 : AACAAC-GG-GGA--GT-TCCAC-TA-AT--ACA---------AT----------A-T-GTC-G-TCC-CA-AAA-T-A----G-TATC---T-ATGTGATACG-A--------G-----------T-C-----A-TG----------------A--A-------------ACGAAAAATATAT-TACTGTAATTGT--C-ACC-T-CT--A--A---AGATAA---TAG--AAGG-AAA--CAAAAA--GTT--GTG-A----------A-AG---T--GACAACACTG------C------A--------T----TTT---AGAGA--------CTAC--T-T-AGTG-GATAGA-TA--TG-G-AAAAACT-------GT--AT-TGGGGA-A--A-CG--GAAAAA--TTACTTTA-AA--G--AGA-T----ATCGAT-GTG-TTTT-AAATTAAA
gi|36119 : AACACT-AG-AGA---T-TCCACATAACA--ACA---------AT----------A-T-GTC-G-GTC-CG-AA--C-G----GATATT---TTA-------CG-A--------GATACCGAGTCTT-T-----AACG----------------AC-G-------------AGGA------TAT-CGC-GTGCTTGTTTC-GAC-T-CT--A--A---AGATAG---TAG--AAG--AAG--CAAAAA--GTT--GTG-AAGTGCACTACA-AT---T--G--------T------T------T--------T----TTT---GGAGA--------C-AT--TAT-AG-G-GAAGGATTAT-TG-G-AAAA----AG-A--AT--AA-TGAGGATA--A-CA--GAGAAA--TTACTTTC-AACGGGAGGA-TC-------ATGGTG-TTTT-GTATT
gi|36120 : AACACT-AG-AGGAGGTATCCAC-TA-CA--ACC---------AT----------A-TTGTC-GGTCT-CG-AAAAC-G----G-TATT---T-A-------CG-A--------GA----------G-T-----A-CGTAGTCCTTTTAAAGGGAC-G-------------AGGA------TAG-C-CTGGTGTTGT--C-GAC-T-CT--A--AC--AGA-AG---TAG--ATGA-AAA--GAAAAA--GTT--GTGTA----------A-AG---T--G--------A------CTACAATG--------T----TTTTTTGGAGA--------CTAT--C-T-TATA-GGAAG--T---TG-G-TAAAAG-----A--AT--AT-TGAGGA-A-----A--GAGAAATCTTACTTTC-AACGG---GA------GCTGAT-GTG-TCTT-TAATTGAA
gi|36121 : AACACT-AG-AGA--GT-CCCAC-TT-CA--ACA---------ATGCGATCATGTA-T-GTC-G-TTT-CG-AGA-C-A----G-TATT---T-A-------CG-A--------GATACA------TGT-----A-CG----------------A--GTCGTTAAACAACGAGGA------TAC-AGCTGAGCCTGT--C-GAT-T-CT--A--G---AGACAT---TAT--GAAC-AAA--CAAAAA--GTT--GTG-A----------A-AG---T--G--------GCTACAAC------GGT------T----TTT---GGAGA--------CTAT--A-T-AGTA-G
gi|36122 : AACACT-GA-AGA--GT-TTCAC-TA-CA--ACA---------ATT---------A-T-GTC-G-TCT-GG-AAG-C-GAGCAG-TACGAGGT-A-------CG-A--------G-----------T-CGTTAAA-CG----------------ACGG-------------ACGA------TAT-TGCGGCA-TTGT--G-GGA-T-TTCCA--A---AGATAG---CA---AAAC-ACT--CAGAAA--GTA--GTG-A----------G-AG---T--A--------G------C------GACTAAACTC----CTT---GGAGA--------TTAT--T-T-GTTG-AGAAAA-TAT-TG-G-AGA----------------------GA-A--A-TG--GAGAAA----AC-CAC-AACGG--AGA-TTG--GTC
gi|36123 : ACACC-GG--GA--GT-TTCTC-TA-TA---CA---------AT----------A-T-GTC-G-TCT-C--AAA-T-A----G-TATC---T-ATCAGATACA-A--------G-----------T-C-----A-TG----------------A--A-------------ACGAAAAA--TATATACTGCACTTGT--C-ACCCT-CT--A--A---AGATAA---TAG--AAAGGAAA--CAAAA---GTT--GTG-A----------A-AG---T--GACTACAATG------C------A--------T----TTT----AAGA--------CTAC--T-T-AGTG-GATAGA-TA--TG----AAAACT-AT---------T-TGGGGA-A--A-CG--GAACAA--TTACTTTT-AA-AG--AGA-T----ATCGAT-CTG-TTTT-AAATTAAA
gi|36124 : T-AA-AAA--AT-TCTAC-TA-TGT-ACA---------AT----------A-T-GAC-G-TCT-CG-AAA-CAA----G-AATT---T-A-------CG-AAATATGATA-----------T-TAA---A-CG----------------AC-G-------------AGGA------TAT-CACTGCGTTTGT--C-GAT-T-CT--G--A---AGATAG---TAG--AAAC-AAA--CAAATA--GTT--GGA-A----------A-AG---T--G--------G------CTACA--A--------TTCTATTT---GGAGA--------ATAT--T-T-AGTG-TAAATA-TA--TA-G---AAACT--T-ACTAT--AT-TGATGA-A--A-TG--GAGAAC--TTACTTTA-AA-GG--AGA-------TCGAT-ATG-TTCT-AAATCAAA
gi|36125 : ---T-A-------CG-A--------G-----------T-T-----A-CG----------------A--G-------------AGGA------TAT-CGATGCGCTTG
gi|36126 : G---TAGCTAACC-AAA--CAAAAA--GTT--GTG-A----------A-AG---T--G--------G------TTACATTGAT------T----TTT---GGAGA--------CTAT--T-T-AGTG-GGGAAA-TA--TA-G-AGAAACT-------AT--AT-TGAGGA-A--A-TG--GAGAAA--CTACTTTC-TACGA--AGA-------TCGAT-GTG-TTTT-AAATTAAA
gi|36127 : cttgttgaaggaaattagc-AAA--CAAAAATCGTT--GTA-A----------AGAG---TTGG--------G------C------T--------T----TTT---GGAGA--------CTAT--T-TTAGTG-GA-----TA--TG-G-AAAA-CT-AT-AG-ATGAATGTGAGGA-AGGA-TA--GAGAAA--TCATTGTC-AATG---AGA-TCG--CTCGAT-GTT-TGCT-AAATTGAA
gi|36128 : TAACACT-AG-AGA--GT-TCCAC-TA-CA--ACA---------
gi|36128 : --AT--AT-CGAGGA-A--A-TA--GAGAAA--TTACTTTC-AATAG--CGA-TCG--GTCGAT-GTG-TTCT-AAATTGAAgannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatatcgaggaaatagagaaattactttcaatagcgatcggtcgatgtgttctaaattgaa
Alignments
lowQualScore : 111111111 1111111111 1111111 44444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444 111111 111 1111111111 5555555555555555555555555555555555 111111111 111111
lowQualScore : 2 2 33 2 5 2 66 000000000 5555555555 5 2 2 2 2 2 2 2 6666 5 777 2 7777777 2 22222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 333333 2 1 66 2 2 33 33 33 777 444 33 2 33 111 33 66 0000000000 2 444 3333333333333333333333333333333333 5555 444 2 000000000 2 2 5 2 2 99 2 33 9999999999 33 2 2 2 33 33 33 2 8 33 555555 2 2 5
lowQualScore : . . .. . . . .. ......... .......... . . . . . . . . .... . ... . ....... . ................................................................. ...... . . .. . . .. .. .. ... ... .. . .. ... .. .. .......... . ... .................................. .... ... . ......... . . . . . .. . .. .......... .. . . . .. .. .. . . .. ...... . . .
lowQualScore : 7 7 77 7 3 7 33 777777777 4444444444 7 9 9 9 9 9 9 9 1111 7 333 7 3333333 7 11111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 333333 7 1 88 9 9 99 99 99 999 777 77 5 44 222 44 99 9999999999 5 444 7777777777777777777777777777777777 3333 444 5 000000000 5 5 0 5 7 00 7 55 6666666666 44 5 5 5 44 44 44 5 9 44 111111 7 7 3
consensus : TAACACT-AG-AGA--GT-TCCAC-TA-CA--ACA---------AT----------A-T-GTC-G-TCT-CG-AAA-C-G----G-TATT---T-A-------CG-A--------G-----------T-T-----A-CG----------------A--G-------------AGGA------TAT-CGCTGCGCTTGT--C-GAC-T-NT--A--A---AGATAG---TAG--AAAC-AAA--CAAAAA--GTT--GTG-A----------A-AG---T--G--------G------C------G--------T----TTT---GGAGA-C---------TAT-T-T-AGTG-GAAAGA-TA--TG-G-AAAAACT-A-TA--AT--AT-TGAGG-A-A--AT--AGAGAAA--TTACTTTC-AACGG--AGA-TCG--GTCGAT-GTG-TTCT-AAATTGAA
Reference ( family-905 ) : TAACACT-AG-AGA--GT-TCCAC-TA-CA--ACA---------AT----------A-T-GTC-G-TCT-CG-AAA-C-G----G-TATT---T-A-------CG-A--------G-----------T-T-----A-CG----------------A--G-------------AGGA------TAT-CGCTGCGCTTGT--C-GAC-T-NT--A--A---AGATAG---TAG--AAAC-AAA--CAAAAA--GTT--GTG-A----------A-AG---T--G--------G------C------G--------T----TTT---GGAGA-C---------TAT-T-T-AGTG-GAAAGA-TA--TG-G-AAAAACT-A-TA--AT--AT-TGAGG-A-A--AT--AGAGAAA--TTACTTTC-AACGG--AGA-TCG--GTCGAT-GTG-TTCT-AAATTGAA
gi|36111 : TAACACT-AG-AGA--GT-TCCAC-TA-CA--ACA---------AT----------A-T-GTC-G-TCT-CG-AAA-C-G----G-TATT---T-A-------CG-A--------G-----------T-T-----A-CG----------------A--G-------------AGGA------TAT-CGCTGCGCTTGT--C-GAC-T-AT--A--A---AGATAG---TAG--AAAC-AAA--CAAAAT--GTT--GT--A----------A-AA---T--G--------G------T------G--------T----TTT---GGAGA-C---------TGT-T-T-AGTG-GAAAGA-TA--TG-G-AAAAACT-A-TA--AT--AT-CGAGG-A-A--AT--AGAGAAA--TTACTTTC-AATAG--CGA-TCG--GTCGAT-GTG-TTCT-AAATTGAA
gi|36112 : TAACACT-AG-AGA--GT-TCCCA-TA-CA--ACA---------AT----------A-T-GTC-G-TCT-CG-AAA-C-A----C-TATT---T-A-------CG-A--------G-----------T-T-----A-CG----------------A--G-------------AGGA------TAT-CGCTGCGCTTTT--TTGAC-T-AT--A--A---AGATAG---TAG--AAAC-AAA--CAAAAT--GTT--GTA-A----------A-AA---T--G--------G------C------T--------T----TTT---GGAGA-C---------TAT-T-TTAGTG-GAAAGA-TA--TG-G-AAAAATT-A-TA--AT--AT-TGAGG-A-A--AT--AGAGAAA--TTACTTTC-AATGG--AGA-TCG--GTCGAT-GTG-TTCT-ACATTGAA
gi|36113 : TAACACT-AG-AGA--GT-TCCAC-TA-CA--ACA---------AT----------A-T-GTC-G-TCT-CG-AAA-C-G----G-TATT---T-A-------CG-A--------G-----------T-T-----A-CG----------------A--A-------------GGGA------TAT-CGCTGCGCT-GT--C-GAC-T-AT--A--A---AGATAG---TAG--AAAC-AAA--CAAAAT--GTTTTGTA-A----------A-AG---T--G--------G------C------T--------T----TTT---GGAGA-C---------TAT-T-T-A-TT-GAAAGA-TA--TG-GAAAAAACT-A-TA--AC--AT-TGAGG-A-A--AT--AGAGAAA--TTACTTTC-AATGG--AGA-TCG--GTCGAT-GTG-TTCT-AAATTTAA
gi|36114 : TAACACT-AG-AGA--GT-TCCAC-TA-CA--A------------T----------A-T-GT--G-TCT-CG-AAA-C-G----G-TATT---T-A-------CG-A--------G-----------T-T-----A-CA----------------A--G-------------AGGA------TAT-CGCTGCGCTTGT--C-GAC-TAAT--A--A---A-ATAG---TAG--AAAC-AAA--CAAAAT--GTT--GT--A----------A-AG---T--G--------G------C------A--------T----TTT---GGTGA-C---------TAA-T-T-AGTG-GAAAGA-TA--TG-G--AAAACTAA-TA--AT--AT-T-AGG-A-A--AT--AGAGAAA--TTACTTTC-AATGG--AGA-TCG--GTCAAT-GTG-TTCT-AAATTGAA
gi|36115 : TAACGCT-AGGAGA--GT-TCCAC-TA-CATAACA---------AC----------AAT-GTCCG-TCT-CG-AA--C-G----G-TATT---T-A-------CG-AA-------G-----------T-T-----A-CG----------------AA-G-------------AGGA------TAT-CGCTGCGGTTGT--C-GAC-T-AT--ACCA---AGATAACGCTAA--TAAC-AAAAGCAAAAT--GTT--ATG-A----------A-AG---T-----------G------C------T--------T----TTT---GGAGA-T---------GA--C-T-AGTG-GAAAGA-TG--TG-G-AAAA--C-A-TA--AA--AT-TGAGG-A-A--AT--AGAG-AA--TTACTTTCAAATGG--AGATTCG--GT-GAT-GAGCTTCTAAAATTGAA
gi|36116 : TAACGCT-AG-AGA--GT-TCCAC-TA-CA--ACA---------AC----------AGT-GTG-T-TCT-CG-AAA-C-G----GGTATT-------------CG-A--------------------T-T-----A-CG----------------A--G-------------AGGA------TAT-CGCT-CGGT-GT--C-GAC-A-TT--A--A---A--TAG---TA---AAAC-AAA--CAAAA-----T--GT--A----------A-AG---T------------------C------T--------T----TTT---G-AGA-C---------TATCT-T-AGTGAGAAAGA-TG--TG-G-AAA--CT-A-TA--AT--AT-TGAGG-A-A--AT--AGA-AAA--TTA-TTTC-AA-GG--AGA--CG--GTCGA---TG-ATCTAAAATTGAA
gi|36117 : TAACACTTAG-A-A--GT-TCCACATA-CA--ACATTAATAATGGT----------A-T-TTC-G-TCCACGGAAA-C-G----G-TATTC--T-A-------CGCA--------G-----------T-T-----A-CA-----------------------------------GA------TAT-CGCTG-GCTTGTT-C-GAC-T-AT--A--ATTAATATAG---TAG--AAAC-AAA--CAAAAAT-GTT--GTA-A----------A-GGGAAT--G--------G------C------T--------T----TTT---GGAGAGCCACTATCTATAT-T-T-AGTG-CAAAGA-TAAGTGTG-AAAAACT-ATTAC-AT--AT-TGAGGAA-A--ATAAAGAGAAA--TCACTTTC-AAT-G--AGA--CGTCGTTGAT-GTG-TT-T-AAATTAA
gi|36118 : AACAAC-GG-GGA--GT-TCCAC-TA-AT--ACA---------AT----------A-T-GTC-G-TCC-CA-AAA-T-A----G-TATC---T-ATGTGATACG-A--------G-----------T-C-----A-TG----------------A--A-------------ACGAAAAATATAT-TACTGTAATTGT--C-ACC-T-CT--A--A---AGATAA---TAG--AAGG-AAA--CAAAAA--GTT--GTG-A----------A-AG---T--GACAACACTG------C------A--------T----TTT---AGAGA-C---------TAC-T-T-AGTG-GATAGA-TA--TG-G-AAAAACT-------GT--AT-TGGGG-A-A--AC--GGAAAAA--TTACTTTA-AA--G--AGA-T----ATCGAT-GTG-TTTT-AAATTAAA
gi|36119 : AACACT-AG-AGA---T-TCCACATAACA--ACA---------AT----------A-T-GTC-G-GTC-CG-AA--C-G----GATATT---TTA-------CG-A--------GATACCGAGTCTT-T-----AACG----------------AC-G-------------AGGA------TAT-CGC-GTGCTTGTTTC-GAC-T-CT--A--A---AGATAG---TAG--AAG--AAG--CAAAAA--GTT--GTG-AAGTGCACTACA-AT---T--G--------T------T------T--------T----TTT---GGAGA-C----------AT-TAT-AG-G-GAAGGATTAT-TG-G-AAAA----A-GA--AT--AA-TGAGG-ATA--AC--AGAGAAA--TTACTTTC-AACGGGAGGA-TC-------ATGGTG-TTTT-GTATT
gi|36120 : AACACT-AG-AGGAGGTATCCAC-TA-CA--ACC---------AT----------A-TTGTC-GGTCT-CG-AAAAC-G----G-TATT---T-A-------CG-A--------GA----------G-T-----A-CGTAGTCCTTTTAAAGGGAC-G-------------AGGA------TAG-C-CTGGTGTTGT--C-GAC-T-CT--A--AC--AGA-AG---TAG--ATGA-AAA--GAAAAA--GTT--GTGTA----------A-AG---T--G--------A------CTACAATG--------T----TTTTTTGGAGA-C---------TAT-C-T-TATA-GGAAG--T---TG-G-TAAAAG-----A--AT--AT-TGAGG-A-A------AGAGAAATCTTACTTTC-AACGG---GA------GCTGAT-GTG-TCTT-TAATTGAA
gi|36121 : AACACT-AG-AGA--GT-CCCAC-TT-CA--ACA---------ATGCGATCATGTA-T-GTC-G-TTT-CG-AGA-C-A----G-TATT---T-A-------CG-A--------GATACA------TGT-----A-CG----------------A--GTCGTTAAACAACGAGGA------TAC-AGCTGAGCCTGT--C-GAT-T-CT--A--G---AGACAT---TAT--GAAC-AAA--CAAAAA--GTT--GTG-A----------A-AG---T--G--------GCTACAAC------GGT------T----TTT---GGAGA-C---------TAT-A-T-AGTA-G
gi|36122 : AACACT-GA-AGA--GT-TTCAC-TA-CA--ACA---------ATT---------A-T-GTC-G-TCT-GG-AAG-C-GAGCAG-TACGAGGT-A-------CG-A--------G-----------T-CGTTAAA-CG----------------ACGG-------------ACGA------TAT-TGCGGCA-TTGT--G-GGA-T-TTCCA--A---AGATAG---CA---AAAC-ACT--CAGAAA--GTA--GTG-A----------G-AG---T--A--------G------C------GACTAAACTC----CTT---GGAGA-T---------TAT-T-T-GTTG-AGAAAA-TAT-TG-G-AGA----------------------G-A-A--AT--GGAGAAA----AC-CAC-AACGG--AGA-TTG--GTC
gi|36123 : ACACC-GG--GA--GT-TTCTC-TA-TA---CA---------AT----------A-T-GTC-G-TCT-C--AAA-T-A----G-TATC---T-ATCAGATACA-A--------G-----------T-C-----A-TG----------------A--A-------------ACGAAAAA--TATATACTGCACTTGT--C-ACCCT-CT--A--A---AGATAA---TAG--AAAGGAAA--CAAAA---GTT--GTG-A----------A-AG---T--GACTACAATG------C------A--------T----TTT----AAGA-C---------TAC-T-T-AGTG-GATAGA-TA--TG----AAAACT-A-T--------T-TGGGG-A-A--AC--GGAACAA--TTACTTTT-AA-AG--AGA-T----ATCGAT-CTG-TTTT-AAATTAAA
gi|36124 : T-AA-AAA--AT-TCTAC-TA-TGT-ACA---------AT----------A-T-GAC-G-TCT-CG-AAA-CAA----G-AATT---T-A-------CG-AAATATGATA-----------T-TAA---A-CG----------------AC-G-------------AGGA------TAT-CACTGCGTTTGT--C-GAT-T-CT--G--A---AGATAG---TAG--AAAC-AAA--CAAATA--GTT--GGA-A----------A-AG---T--G--------G------CTACA--A--------TTCTATTT---GGAGA-A---------TAT-T-T-AGTG-TAAATA-TA--TA-G---AAACT---TACTAT--AT-TGATG-A-A--AT--GGAGAAC--TTACTTT--AAAGG--AGA-------TCGAT-ATG-TTCT-AAATCAAA
gi|36125 : ---T-A-------CG-A--------G-----------T-T-----A-CG----------------A--G-------------AGGA------TAT-CGATGCGCTTG
gi|36126 : G---TAGCTAACC-AAA--CAAAAA--GTT--GTG-A----------A-AG---T--G--------G------TTACATTGAT------T----TTT---GGAGA-C---------TAT-T-T-AGTG-GGGAAA-TA--TA-G-AGAAACT-A-TA-------T-TGAGG-A-A--AT--GGAGAAA--CTACTTTC-TACGA--AGA-------TCGAT-GTG-TTTT-AAATTAAA
gi|36127 : cttgttgaaggaaattagc-AAA--CAAAAATCGTT--GTA-A----------AGAG---TTGG--------G------C------T--------T----TTT---GGAGA-C---------TAT-T-TTAGTG-GA-----TA--TG-G-AAAA-CT-A-TAG-ATGAATGTGAGG-A-AGGAT--AGAGAAA--TCATTGTC-AATG---AGA-TCG--CTCGAT-GTT-TGCT-AAATTGAA
gi|36128 : TAACACT-AG-AGA--GT-TCCAC-TA-CA--ACA---------
gi|36128 : --AT--AT-CGAGG-A-A--AT--AGAGAAA--TTACTTTC-AATAG--CGA-TCG--GTCGAT-GTG-TTCT-AAATTGAAgannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatatcgaggaaatagagaaattactttcaatagcgatcggtcgatgtgttctaaattgaa
Alignments
lowQualScore : 111111111 1111111111 1111111 44444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444 111111 111 1111111111 5555555555555555555555555555555555 111111111 111111
lowQualScore : 2 2 33 2 5 2 66 000000000 5555555555 5 2 2 2 2 2 2 2 6666 5 777 2 7777777 2 22222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 333333 2 1 66 2 2 33 33 33 777 444 33 2 33 111 33 66 0000000000 2 444 3333333333333333333333333333333333 5555 444 2 000000000 2 2 5 2 2 99 2 33 9999999999 33 2 2 2 33 33 33 2 8 33 555555 2 2 5
lowQualScore : . . .. . . . .. ......... .......... . . . . . . . . .... . ... . ....... . ................................................................. ...... . . .. . . .. .. .. ... ... .. . .. ... .. .. .......... . ... .................................. .... ... . ......... . . . . . .. . .. .......... .. . . . .. .. .. . . .. ...... . . .
lowQualScore : 7 7 77 7 3 7 33 777777777 4444444444 7 9 9 9 9 9 9 9 1111 7 333 7 3333333 7 11111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 333333 7 1 88 9 9 99 99 99 999 777 77 5 44 222 44 99 9999999999 5 444 7777777777777777777777777777777777 3333 444 5 000000000 5 5 0 5 7 00 7 55 6666666666 44 5 5 5 44 44 44 5 9 44 111111 7 7 3
consensus : TAACACT-AG-AGA--GT-TCCAC-TA-CA--ACA---------AT----------A-T-GTC-G-TCT-CG-AAA-C-G----G-TATT---T-A-------CG-A--------G-----------T-T-----A-CG----------------A--G-------------AGGA------TAT-CGCTGCGCTTGT--C-GAC-T-NT--A--A---AGATAG---TAG--AAAC-AAA--CAAAAA--GTT--GTG-A----------A-AG---T--G--------G------C------G--------T----TTT---GGAGA-C---------TAT-T-T-AGTG-GAAAGA-TA--TG-G-AAAAACT-A-TA--AT--AT-TGAGG-A-A--AT--AGAGAAA--TTACTTTC-AACGG--AGA-TCG--GTCGAT-GTG-TTCT-AAATTGAA
Reference ( family-905 ) : TAACACT-AG-AGA--GT-TCCAC-TA-CA--ACA---------AT----------A-T-GTC-G-TCT-CG-AAA-C-G----G-TATT---T-A-------CG-A--------G-----------T-T-----A-CG----------------A--G-------------AGGA------TAT-CGCTGCGCTTGT--C-GAC-T-NT--A--A---AGATAG---TAG--AAAC-AAA--CAAAAA--GTT--GTG-A----------A-AG---T--G--------G------C------G--------T----TTT---GGAGA-C---------TAT-T-T-AGTG-GAAAGA-TA--TG-G-AAAAACT-A-TA--AT--AT-TGAGG-A-A--AT--AGAGAAA--TTACTTTC-AACGG--AGA-TCG--GTCGAT-GTG-TTCT-AAATTGAA
gi|36111 : TAACACT-AG-AGA--GT-TCCAC-TA-CA--ACA---------AT----------A-T-GTC-G-TCT-CG-AAA-C-G----G-TATT---T-A-------CG-A--------G-----------T-T-----A-CG----------------A--G-------------AGGA------TAT-CGCTGCGCTTGT--C-GAC-T-AT--A--A---AGATAG---TAG--AAAC-AAA--CAAAAT--GTT--GT--A----------A-AA---T--G--------G------T------G--------T----TTT---GGAGA-C---------TGT-T-T-AGTG-GAAAGA-TA--TG-G-AAAAACT-A-TA--AT--AT-CGAGG-A-A--AT--AGAGAAA--TTACTTTC-AATAG--CGA-TCG--GTCGAT-GTG-TTCT-AAATTGAA
gi|36112 : TAACACT-AG-AGA--GT-TCCCA-TA-CA--ACA---------AT----------A-T-GTC-G-TCT-CG-AAA-C-A----C-TATT---T-A-------CG-A--------G-----------T-T-----A-CG----------------A--G-------------AGGA------TAT-CGCTGCGCTTTT--TTGAC-T-AT--A--A---AGATAG---TAG--AAAC-AAA--CAAAAT--GTT--GTA-A----------A-AA---T--G--------G------C------T--------T----TTT---GGAGA-C---------TAT-T-TTAGTG-GAAAGA-TA--TG-G-AAAAATT-A-TA--AT--AT-TGAGG-A-A--AT--AGAGAAA--TTACTTTC-AATGG--AGA-TCG--GTCGAT-GTG-TTCT-ACATTGAA
gi|36113 : TAACACT-AG-AGA--GT-TCCAC-TA-CA--ACA---------AT----------A-T-GTC-G-TCT-CG-AAA-C-G----G-TATT---T-A-------CG-A--------G-----------T-T-----A-CG----------------A--A-------------GGGA------TAT-CGCTGCGCT-GT--C-GAC-T-AT--A--A---AGATAG---TAG--AAAC-AAA--CAAAAT--GTTTTGTA-A----------A-AG---T--G--------G------C------T--------T----TTT---GGAGA-C---------TAT-T-T-A-TT-GAAAGA-TA--TG-GAAAAAACT-A-TA--AC--AT-TGAGG-A-A--AT--AGAGAAA--TTACTTTC-AATGG--AGA-TCG--GTCGAT-GTG-TTCT-AAATTTAA
gi|36114 : TAACACT-AG-AGA--GT-TCCAC-TA-CA--A------------T----------A-T-GT--G-TCT-CG-AAA-C-G----G-TATT---T-A-------CG-A--------G-----------T-T-----A-CA----------------A--G-------------AGGA------TAT-CGCTGCGCTTGT--C-GAC-TAAT--A--A---A-ATAG---TAG--AAAC-AAA--CAAAAT--GTT--GT--A----------A-AG---T--G--------G------C------A--------T----TTT---GGTGA-C---------TAA-T-T-AGTG-GAAAGA-TA--TG-G--AAAACTAA-TA--AT--AT-T-AGG-A-A--AT--AGAGAAA--TTACTTTC-AATGG--AGA-TCG--GTCAAT-GTG-TTCT-AAATTGAA
gi|36115 : TAACGCT-AGGAGA--GT-TCCAC-TA-CATAACA---------AC----------AAT-GTCCG-TCT-CG-AA--C-G----G-TATT---T-A-------CG-AA-------G-----------T-T-----A-CG----------------AA-G-------------AGGA------TAT-CGCTGCGGTTGT--C-GAC-T-AT--ACCA---AGATAACGCTAA--TAAC-AAAAGCAAAAT--GTT--ATG-A----------A-AG---T-----------G------C------T--------T----TTT---GGAGA-T---------GA--C-T-AGTG-GAAAGA-TG--TG-G-AAAA--C-A-TA--AA--AT-TGAGG-A-A--AT--AGAG-AA--TTACTTTCAAATGG--AGATTCG--GT-GAT-GAGCTTCTAAAATTGAA
gi|36116 : TAACGCT-AG-AGA--GT-TCCAC-TA-CA--ACA---------AC----------AGT-GTG-T-TCT-CG-AAA-C-G----GGTATT-------------CG-A--------------------T-T-----A-CG----------------A--G-------------AGGA------TAT-CGCT-CGGT-GT--C-GAC-A-TT--A--A---A--TAG---TA---AAAC-AAA--CAAAA-----T--GT--A----------A-AG---T------------------C------T--------T----TTT---G-AGA-C---------TATCT-T-AGTGAGAAAGA-TG--TG-G-AAA--CT-A-TA--AT--AT-TGAGG-A-A--AT--AGA-AAA--TTA-TTTC-AA-GG--AGA--CG--GTCGA---TG-ATCTAAAATTGAA
gi|36117 : TAACACTTAG-A-A--GT-TCCACATA-CA--ACATTAATAATGGT----------A-T-TTC-G-TCCACGGAAA-C-G----G-TATTC--T-A-------CGCA--------G-----------T-T-----A-CA-----------------------------------GA------TAT-CGCTG-GCTTGTT-C-GAC-T-AT--A--ATTAATATAG---TAG--AAAC-AAA--CAAAAAT-GTT--GTA-A----------A-GGGAAT--G--------G------C------T--------T----TTT---GGAGAGCCACTATCTATAT-T-T-AGTG-CAAAGA-TAAGTGTG-AAAAACT-ATTAC-AT--AT-TGAGGAA-A--ATAAAGAGAAA--TCACTTTC-AAT-G--AGA--CGTCGTTGAT-GTG-TT-T-AAATTAA
gi|36118 : AACAAC-GG-GGA--GT-TCCAC-TA-AT--ACA---------AT----------A-T-GTC-G-TCC-CA-AAA-T-A----G-TATC---T-ATGTGATACG-A--------G-----------T-C-----A-TG----------------A--A-------------ACGAAAAATATAT-TACTGTAATTGT--C-ACC-T-CT--A--A---AGATAA---TAG--AAGG-AAA--CAAAAA--GTT--GTG-A----------A-AG---T--GACAACACTG------C------A--------T----TTT---AGAGA-C---------TAC-T-T-AGTG-GATAGA-TA--TG-G-AAAAACT-------GT--AT-TGGGG-A-A--AC--GGAAAAA--TTACTTTA-AA--G--AGA-T----ATCGAT-GTG-TTTT-AAATTAAA
gi|36119 : AACACT-AG-AGA---T-TCCACATAACA--ACA---------AT----------A-T-GTC-G-GTC-CG-AA--C-G----GATATT---TTA-------CG-A--------GATACCGAGTCTT-T-----AACG----------------AC-G-------------AGGA------TAT-CGC-GTGCTTGTTTC-GAC-T-CT--A--A---AGATAG---TAG--AAG--AAG--CAAAAA--GTT--GTG-AAGTGCACTACA-AT---T--G--------T------T------T--------T----TTT---GGAGA-C----------AT-TAT-AG-G-GAAGGATTAT-TG-G-AAAA----A-GA--AT--AA-TGAGG-ATA--AC--AGAGAAA--TTACTTTC-AACGGGAGGA-TC-------ATGGTG-TTTT-GTATT
gi|36120 : AACACT-AG-AGGAGGTATCCAC-TA-CA--ACC---------AT----------A-TTGTC-GGTCT-CG-AAAAC-G----G-TATT---T-A-------CG-A--------GA----------G-T-----A-CGTAGTCCTTTTAAAGGGAC-G-------------AGGA------TAG-C-CTGGTGTTGT--C-GAC-T-CT--A--AC--AGA-AG---TAG--ATGA-AAA--GAAAAA--GTT--GTGTA----------A-AG---T--G--------A------CTACAATG--------T----TTTTTTGGAGA-C---------TAT-C-T-TATA-GGAAG--T---TG-G-TAAAAG-----A--AT--AT-TGAGG-A-A------AGAGAAATCTTACTTTC-AACGG---GA------GCTGAT-GTG-TCTT-TAATTGAA
gi|36121 : AACACT-AG-AGA--GT-CCCAC-TT-CA--ACA---------ATGCGATCATGTA-T-GTC-G-TTT-CG-AGA-C-A----G-TATT---T-A-------CG-A--------GATACA------TGT-----A-CG----------------A--GTCGTTAAACAACGAGGA------TAC-AGCTGAGCCTGT--C-GAT-T-CT--A--G---AGACAT---TAT--GAAC-AAA--CAAAAA--GTT--GTG-A----------A-AG---T--G--------GCTACAAC------GGT------T----TTT---GGAGA-C---------TAT-A-T-AGTA-G
gi|36122 : AACACT-GA-AGA--GT-TTCAC-TA-CA--ACA---------ATT---------A-T-GTC-G-TCT-GG-AAG-C-GAGCAG-TACGAGGT-A-------CG-A--------G-----------T-CGTTAAA-CG----------------ACGG-------------ACGA------TAT-TGCGGCA-TTGT--G-GGA-T-TTCCA--A---AGATAG---CA---AAAC-ACT--CAGAAA--GTA--GTG-A----------G-AG---T--A--------G------C------GACTAAACTC----CTT---GGAGA-T---------TAT-T-T-GTTG-AGAAAA-TAT-TG-G-AGA----------------------G-A-A--AT--GGAGAAA----AC-CAC-AACGG--AGA-TTG--GTC
gi|36123 : ACACC-GG--GA--GT-TTCTC-TA-TA---CA---------AT----------A-T-GTC-G-TCT-C--AAA-T-A----G-TATC---T-ATCAGATACA-A--------G-----------T-C-----A-TG----------------A--A-------------ACGAAAAA--TATATACTGCACTTGT--C-ACCCT-CT--A--A---AGATAA---TAG--AAAGGAAA--CAAAA---GTT--GTG-A----------A-AG---T--GACTACAATG------C------A--------T----TTT----AAGA-C---------TAC-T-T-AGTG-GATAGA-TA--TG----AAAACT-A-T--------T-TGGGG-A-A--AC--GGAACAA--TTACTTTT-AA-AG--AGA-T----ATCGAT-CTG-TTTT-AAATTAAA
gi|36124 : T-AA-AAA--AT-TCTAC-TA-TGT-ACA---------AT----------A-T-GAC-G-TCT-CG-AAA-CAA----G-AATT---T-A-------CG-AAATATGATA-----------T-TAA---A-CG----------------AC-G-------------AGGA------TAT-CACTGCGTTTGT--C-GAT-T-CT--G--A---AGATAG---TAG--AAAC-AAA--CAAATA--GTT--GGA-A----------A-AG---T--G--------G------CTACA--A--------TTCTATTT---GGAGA-A---------TAT-T-T-AGTG-TAAATA-TA--TA-G---AAACT---TACTAT--AT-TGATG-A-A--AT--GGAGAAC--TTACTTT--AAAGG--AGA-------TCGAT-ATG-TTCT-AAATCAAA
gi|36125 : ---T-A-------CG-A--------G-----------T-T-----A-CG----------------A--G-------------AGGA------TAT-CGATGCGCTTG
gi|36126 : G---TAGCTAACC-AAA--CAAAAA--GTT--GTG-A----------A-AG---T--G--------G------TTACATTGAT------T----TTT---GGAGA-C---------TAT-T-T-AGTG-GGGAAA-TA--TA-G-AGAAACT-A-TA-------T-TGAGG-A-A--AT--GGAGAAA--CTACTTTC-TACGA--AGA-------TCGAT-GTG-TTTT-AAATTAAA
gi|36127 : cttgttgaaggaaattagc-AAA--CAAAAATCGTT--GTA-A----------AGAG---TTGG--------G------C------T--------T----TTT---GGAGA-C---------TAT-T-TTAGTG-GA-----TA--TG-G-AAAA-CT-A-TAG-ATGAATGTGAGG-A-AGGAT--AGAGAAA--TCATTGTC-AATG---AGA-TCG--CTCGAT-GTT-TGCT-AAATTGAA
gi|36128 : TAACACT-AG-AGA--GT-TCCAC-TA-CA--ACA---------
gi|36128 : --AT--AT-CGAGG-A-A--AT--AGAGAAA--TTACTTTC-AATAG--CGA-TCG--GTCGAT-GTG-TTCT-AAATTGAAgannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatatcgaggaaatagagaaattactttcaatagcgatcggtcgatgtgttctaaattgaa
blockSeqs : T G AG A A A TA TTAATAATG GCGATCATGT A T C G A G A A AGCA G AGG T TGTGATA C GATACATGTACGAGTCGTTAAACAACG AAAATA A C TT T C AA CC CC TTA CGC CT G AG ATC TT GT AGTGCACTAC G GAA GACAACACTGCA TCTA TTT G CACTATCTA C A T A T AG T AA ACTATTAC GA G A T GG AA TC A T GA TTCG G C A
blockSeqs : . . . . A . T . T G . . . . . . . . A C . TCAGATA . GAGTACGTAGTCCTTTTAAAGGGACG AAAA . C T . . A . . C . . . . AT . A . . . GGCTACAACGGT . . . . . . T . . T . A ACTAATA . . . . . . . . T . CGTC . . A
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . GATACCGAGTCTTTAACGACG . . C . . . A . . . . . . . T . A . . . AGCGACTAAACT . . . . . . . . . T . A ACTTACT . . . . . . . . T . TCG . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . AATATGATATTAAACGACG . . G . . . A . . . . . . . T . G . . . GACTACAATGCA . . . . . . . . . . . A ATTATA . . . . . . . . T . TCG . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . GTCGTTAAACGACGG . . G . . . T . . . . . . . T . A . . . GGTTACATTGAT . . . . . . . . . . . A ACTATA . . . . . . . . T . TCG . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . AGTTACGAAG . . C . . . A . . . . . . . T . G . . . GACTACAATG . . . . . . . . . . . A ACTATA . . . . . . . . C . TTG . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . GTTACGAG . . A . . . C . . . . . . . A . G . . . GGCTACAA . . . . . . . . . . . A CTATAG . . . . . . . . C . TCG . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . GTTACGAA . . C . . . C . . . . . . . A . G . . . TGGGCT . . . . . . . . . . . T CTATA . . . . . . . . C . TCG . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . GTTACAAG . . G . . . C . . . . . . . A . G . . . GGCT . . . . . . . . . . . A ACTAT . . . . . . . . A . CG . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . GTCATGAA . . C . . . C . . . . . . . A . G . . . GGCT . . . . . . . . . . . A CATA . . . . . . . . C . TC . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . GTCATGAA . . C . . . T . . . . . . . A . A . . . GGCA . . . . . . . . . . . A ACT . . . . . . . . T . T . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . GTTACGAG . . T . . . C . . . . . . . A . G . . . GGCT . . . . . . . . . . . . AGA . . . . . . . . T . T . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . TTACGAG . . C . . . C . . . . . . . A . A . . . GTTT . . . . . . . . . . . . AGA . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . GTTACA . . . . . . . . . . . . . GCT . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . CT . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqCons : G* GGCTACAA**************************
originalCons : TAACACT-AG-AGA--GT-TCCAC-TA-CA--ACA---------AT----------A-T-GTC-G-TCT-CG-AAA-C-G----G-TATT---T-A-------CG-A--------G-----------T-T-----A-CG----------------A--G-------------AGGA------TAT-CGCTGCGCTTGT--C-GAC-T-NT--A--A---AGATAG---TAG--AAAC-AAA--CAAAAA--GTT--GTG-A----------A-AG---T--G--------G------C------G--------T----TTT---GGAGA-C---------TAT-T-T-AGTG-GAAAGA-TA--TG-G-AAAAACT-A-TA--AT--AT-TGAGG-A-A--AT--AGAGAAA--TTACTTTC-AACGG--AGA-TCG--GTCGAT-GTG-TTCT-AAATTGAA
finalCons : TAACACT-AG-AGA--GT-TCCAC-TA-CA--ACA---------AT----------A-T-GTC-G-TCT-CG-AAA-C-G----G-TATT---T-A-------CG-A--------G-----------T-T-----A-CG----------------A--G-------------AGGA------TAT-CGCTGCGCTTGT--C-GAC-T-NT--A--A---AGATAG---TAG--AAAC-AAA--CAAAAA--GTT--GTG-A----------A-AG---TGGCTACAA--------------------------T----TTT---GGAGA-C---------TAT-T-T-AGTG-GAAAGA-TA--TG-G-AAAAACT-A-TA--AT--AT-TGAGG-A-A--AT--AGAGAAA--TTACTTTC-AACGG--AGA-TCG--GTCGAT-GTG-TTCT-AAATTGAA
Alignments
lowQualScore : 111111111 1111111111 1111111 44444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444 111111 111 4444444444444444444444444444 111111111 111111
lowQualScore : 2 2 33 2 5 2 66 000000000 5555555555 5 2 2 2 2 2 2 2 6666 5 777 2 7777777 2 22222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 333333 2 1 66 2 2 33 33 33 777 444 33 2 33 111 33 66 2 444 33 2 7777777777777777777777777777 2 2 000000000 2 2 5 2 2 66 2 2 33 0 666 88 33 2 2 2 33 33 33 2 8 33 555555 2 2 5
lowQualScore : . . .. . . . .. ......... .......... . . . . . . . . .... . ... . ....... . ................................................................. ...... . . .. . . .. .. .. ... ... .. . .. ... .. .. . ... .. . ............................ . . ......... . . . . . .. . . .. . ... .. .. . . . .. .. .. . . .. ...... . . .
lowQualScore : 7 7 77 7 3 7 33 777777777 4444444444 7 9 9 9 9 9 9 9 1111 7 333 7 3333333 7 11111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 333333 7 1 88 9 9 99 99 99 999 777 77 5 44 222 44 99 5 444 44 5 0000000000000000000000000000 5 5 000000000 5 5 0 5 7 33 7 7 55 7 111 44 44 5 5 5 44 44 44 5 9 44 111111 7 7 3
consensus : TAACACT-AG-AGA--GT-TCCAC-TA-CA--ACA---------AT----------A-T-GTC-G-TCT-CG-AAA-C-G----G-TATT---T-A-------CG-A--------G-----------T-T-----A-CG----------------A--G-------------AGGA------TAT-CGCTGCGCTTGT--C-GAC-T-NT--A--A---AGATAG---TAG--AAAC-AAA--CAAAAA--G--TTGTG-AA-AG---T--G-GCTAC--A----A----T-----T------TT-GGAGA-C---------TAT-T-T-AGTG-GAAAGAT-A--T-G-G-AAAAACT-A-TA--AT--AT-TGAGG-A-A--AT--AGAGAAA--TTACTTTC-AACGG--AGA-TCG--GTCGAT-GTG-TTCT-AAATTGAA
Reference ( family-905 ) : TAACACT-AG-AGA--GT-TCCAC-TA-CA--ACA---------AT----------A-T-GTC-G-TCT-CG-AAA-C-G----G-TATT---T-A-------CG-A--------G-----------T-T-----A-CG----------------A--G-------------AGGA------TAT-CGCTGCGCTTGT--C-GAC-T-NT--A--A---AGATAG---TAG--AAAC-AAA--CAAAAA--G--TTGTG-AA-AG---T--G-GCTAC--A----A----T-----T------TT-GGAGA-C---------TAT-T-T-AGTG-GAAAGAT-A--T-G-G-AAAAACT-A-TA--AT--AT-TGAGG-A-A--AT--AGAGAAA--TTACTTTC-AACGG--AGA-TCG--GTCGAT-GTG-TTCT-AAATTGAA
gi|36111 : TAACACT-AG-AGA--GT-TCCAC-TA-CA--ACA---------AT----------A-T-GTC-G-TCT-CG-AAA-C-G----G-TATT---T-A-------CG-A--------G-----------T-T-----A-CG----------------A--G-------------AGGA------TAT-CGCTGCGCTTGT--C-GAC-T-AT--A--A---AGATAG---TAG--AAAC-AAA--CAAAAT--G--TTGT--AA-AA---T--G-GT----------G----T-----T------TT-GGAGA-C---------TGT-T-T-AGTG-GAAAGAT-A--T-G-G-AAAAACT-A-TA--AT--AT-CGAGG-A-A--AT--AGAGAAA--TTACTTTC-AATAG--CGA-TCG--GTCGAT-GTG-TTCT-AAATTGAA
gi|36112 : TAACACT-AG-AGA--GT-TCCCA-TA-CA--ACA---------AT----------A-T-GTC-G-TCT-CG-AAA-C-A----C-TATT---T-A-------CG-A--------G-----------T-T-----A-CG----------------A--G-------------AGGA------TAT-CGCTGCGCTTTT--TTGAC-T-AT--A--A---AGATAG---TAG--AAAC-AAA--CAAAAT--G--TTGTA-AA-AA---T--G-GCT--------------T-----T------TT-GGAGA-C---------TAT-T-TTAGTG-GAAAGAT-A--T-G-G-AAAAATT-A-TA--AT--AT-TGAGG-A-A--AT--AGAGAAA--TTACTTTC-AATGG--AGA-TCG--GTCGAT-GTG-TTCT-ACATTGAA
gi|36113 : TAACACT-AG-AGA--GT-TCCAC-TA-CA--ACA---------AT----------A-T-GTC-G-TCT-CG-AAA-C-G----G-TATT---T-A-------CG-A--------G-----------T-T-----A-CG----------------A--A-------------GGGA------TAT-CGCTGCGC-TGT--C-GAC-T-AT--A--A---AGATAG---TAG--AAAC-AAA--CAAAAT--GTTTTGTA-AA-AG---T--G-GCT--------------T-----T------TT-GGAGA-C---------TAT-T-T-A-TT-GAAAGAT-A--T-G-GAAAAAACT-A-TA--AC--AT-TGAGG-A-A--AT--AGAGAAA--TTACTTTC-AATGG--AGA-TCG--GTCGAT-GTG-TTCT-AAATTTAA
gi|36114 : TAACACT-AG-AGA--GT-TCCAC-TA-CA--A------------T----------A-T-GT--G-TCT-CG-AAA-C-G----G-TATT---T-A-------CG-A--------G-----------T-T-----A-CA----------------A--G-------------AGGA------TAT-CGCTGCGCTTGT--C-GAC-TAAT--A--A---A-ATAG---TAG--AAAC-AAA--CAAAAT--G--TTGT--AA-AG---T--G-GC----------A----T-----T------TT-GGTGA-C---------TAA-T-T-AGTG-GAAAGAT-A--T-G-G--AAAACTAA-TA--AT--AT-T-AGG-A-A--AT--AGAGAAA--TTACTTTC-AATGG--AGA-TCG--GTCAAT-GTG-TTCT-AAATTGAA
gi|36115 : TAACGCT-AGGAGA--GT-TCCAC-TA-CATAACA---------AC----------AAT-GTCCG-TCT-CG-AA--C-G----G-TATT---T-A-------CG-AA-------G-----------T-T-----A-CG----------------AA-G-------------AGGA------TAT-CGCTGCGGTTGT--C-GAC-T-AT--ACCA---AGATAACGCTAA--TAAC-AAAAGCAAAAT--G--TTATG-AA-AG---T----GCT--------------T-----T------TT-GGAGA-T---------GA--C-T-AGTG-GAAAGAT-G--T-G-G-AAAA--C-A-TA--AA--AT-TGAGG-A-A--AT--AGAG-AA--TTACTTTCAAATGG--AGATTCG--GT-GAT-GAGCTTCTAAAATTGAA
gi|36116 : TAACGCT-AG-AGA--GT-TCCAC-TA-CA--ACA---------AC----------AGT-GTG-T-TCT-CG-AAA-C-G----GGTATT-------------CG-A--------------------T-T-----A-CG----------------A--G-------------AGGA------TAT-CGCT-CGGT-GT--C-GAC-A-TT--A--A---A--TAG---TA---AAAC-AAA--CAAAA-------TGT--AA-AG---T-----CT--------------T-----T------TT-G-AGA-C---------TATCT-T-AGTGAGAAAGAT-G--T-G-G-AAA--CT-A-TA--AT--AT-TGAGG-A-A--AT--AGA-AAA--TTA-TTTC-AA-GG--AGA--CG--GTCGA---TG-ATCTAAAATTGAA
gi|36117 : TAACACTTAG-A-A--GT-TCCACATA-CA--ACATTAATAATGGT----------A-T-TTC-G-TCCACGGAAA-C-G----G-TATTC--T-A-------CGCA--------G-----------T-T-----A-CA-----------------------------------GA------TAT-CGCTG-GCTTGTT-C-GAC-T-AT--A--ATTAATATAG---TAG--AAAC-AAA--CAAAAAT-G--TTGTA-AA-GGGAAT--G-GCT--------------T-----T------TT-GGAGAGCCACTATCTATAT-T-T-AGTG-CAAAGAT-AAGT-GTG-AAAAACT-ATTAC-AT--AT-TGAGGAA-A--ATAAAGAGAAA--TCACTTTC-AAT-G--AGA--CGTCGTTGAT-GTG-TT-T-AAATTAA
gi|36118 : AACAAC-GG-GGA--GT-TCCAC-TA-AT--ACA---------AT----------A-T-GTC-G-TCC-CA-AAA-T-A----G-TATC---T-ATGTGATACG-A--------G-----------T-C-----A-TG----------------A--A-------------ACGAAAAATATAT-TACTGTAATTGT--C-ACC-T-CT--A--A---AGATAA---TAG--AAGG-AAA--CAAAAA--G--TTGTG-AA-AG---T--G-ACAAC--ACTGCA----T-----T------TT-AGAGA-C---------TAC-T-T-AGTG-GATAGAT-A--T-G-G-AAAAACT-------GT--AT-TGGGG-A-A--AC--GGAAAAA--TTACTTTA-AA--G--AGA-T----ATCGAT-GTG-TTTT-AAATTAAA
gi|36119 : AACACT-AG-AGA---T-TCCACATAACA--ACA---------AT----------A-T-GTC-G-GTC-CG-AA--C-G----GATATT---TTA-------CG-A--------GATACCGAGTCTT-T-----AACG----------------AC-G-------------AGGA------TAT-CGC-GTGCTTGTTTC-GAC-T-CT--A--A---AGATAG---TAG--AAG--AAG--CAAAAA--G--TTGTG-AA--G---T--GCACTAC--A----A----T-----TGTTTTTTT-GGAGA-C----------AT-TAT-AG-G-GAAGGATTA--TTG-G-AAAAAGA-A-TA--AT------GAGG-ATA--AC--AGAGAAA--TTACTTTC-AACGGGAGGA-TC-------ATGGTG-TTTT-GTATT
gi|36120 : AACACT-AG-AGGAGGTATCCAC-TA-CA--ACC---------AT----------A-TTGTC-GGTCT-CG-AAAAC-G----G-TATT---T-A-------CG-A--------GA----------G-T-----A-CGTAGTCCTTTTAAAGGGAC-G-------------AGGA------TAG-C-CTGGTGTTGT--C-GAC-T-CT--A--AC--AGA-AG---TAG--ATGA-AAA--GAAAAA--G--TTGTGTAA-AG---T--G-ACTAC--A----A----TGTTTTT------TT-GGAGA-C---------TAT-C-T-TATA-GGAAG-T----T-G-G-TAAAAG-----A--AT--AT-TGAGG-A-A------AGAGAAATCTTACTTTC-AACGG---GA------GCTGAT-GTG-TCTT-TAATTGAA
gi|36121 : AACACT-AG-AGA--GT-CCCAC-TT-CA--ACA---------ATGCGATCATGTA-T-GTC-G-TTT-CG-AGA-C-A----G-TATT---T-A-------CG-A--------GATACA------TGT-----A-CG----------------A--GTCGTTAAACAACGAGGA------TAC-AGCTGAGCCTGT--C-GAT-T-CT--A--G---AGACAT---TAT--GAAC-AAA--CAAAAA--G--TTGTG-AA-AG---T--G-GCTAC--A----ACGGTT-----T------TT-GGAGA-C---------TAT-A-T-AGTA-G
gi|36122 : AACACT-GA-AGA--GT-TTCAC-TA-CA--ACA---------ATT---------A-T-GTC-G-TCT-GG-AAG-C-GAGCAG-TACGAGGT-A-------CG-A--------G-----------T-CGTTAAA-CG----------------ACGG-------------ACGA------TAT-TGCGGCA-TTGT--G-GGA-T-TTCCA--A---AGATAG---CA---AAAC-ACT--CAGAAA--G--TAGTG-AG-AG---T--A-GCGACTAA----A----C-----TCC----TT-GGAGA-T---------TAT-T-T-GTTG-AGAAAAT-AT-T-G-G-AGA----------------------G-A-A--AT--GGAGAAA----AC-CAC-AACGG--AGA-TTG--GTC
gi|36123 : ACACC-GG--GA--GT-TTCTC-TA-TA---CA---------AT----------A-T-GTC-G-TCT-C--AAA-T-A----G-TATC---T-ATCAGATACA-A--------G-----------T-C-----A-TG----------------A--A-------------ACGAAAAA--TATATACTGCACTTGT--C-ACCCT-CT--A--A---AGATAA---TAG--AAAGGAAA--CAAAA---G--TTGTG-AA-AG---T--G-ACTAC--A----A----TGCA--T------TT-TAAGA-C---------TAC-T-T-AGTG-GATAGAT-A--T-G----AAAACT-A-T--------T-TGGGG-A-A--AC--GGAACAA--TTACTTTT-AA-AG--AGA-T----ATCGAT-CTG-TTTT-AAATTAAA
gi|36124 : T-AA-AAA--AT-TCTAC-TA-TGT-ACA---------AT----------A-T-GAC-G-TCT-CG-AAA-CAA----G-AATT---T-A-------CG-AAATATGATA-----------T-TAA---A-CG----------------AC-G-------------AGGA------TAT-CACTGCGTTTGT--C-GAT-T-CT--G--A---AGATAG---TAG--AAAC-AAA--CAAATA--G--TTGGA-AA-AG---T--G-GCTAC--A----A----TTCTA-T------TT-GGAGA-A---------TAT-T-T-AGTG-TAAATAT-A--T-A-G---AAACT---TACTAT--AT-TGATG-A-A--AT--GGAGAAC--TTACTTT--AAAGG--AGA-------TCGAT-ATG-TTCT-AAATCAAA
gi|36125 : ---T-A-------CG-A--------G-----------T-T-----A-CG----------------A--G-------------AGGA------TAT-CGATGCGCTTG
gi|36126 : G---TAGCTAACC-AAA--CAAAAA--G--TTGTG-AA-AG---T--G-GTTAC--ATTG-A----T-----T------TTTGGAGA-C---------TAT-T-T-AGTG-GGGAAAT-A--T-A-G-AGAAACT-A-TA-------T-TGAGG-A-A--AT--GGAGAAA--CTACTTTC-TACGA--AGA-------TCGAT-GTG-TTTT-AAATTAAA
gi|36127 : cttgttgaaggaaattagc-AAA--CAAAAATCG--TTGTA-AAGAG---TTGG-GCT--------------T-----T------TT-GGAGA-C---------TAT-T-TTAGTG-GA----T-A--T-G-G-AAAA-CT-A-TAG-ATGAATGTGAGG-A-AGGAT--AGAGAAA--TCATTGTC-AATG---AGA-TCG--CTCGAT-GTT-TGCT-AAATTGAA
gi|36128 : TAACACT-AG-AGA--GT-TCCAC-TA-CA--ACA---------
gi|36128 : --AT--AT-CGAGG-A-A--AT--AGAGAAA--TTACTTTC-AATAG--CGA-TCG--GTCGAT-GTG-TTCT-AAATTGAAgannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatatcgaggaaatagagaaattactttcaatagcgatcggtcgatgtgttctaaattgaa