lowQualScore : 111 111111111111 222222222222 11111 444444 11111111 111111 777777777777777777777777777777777777777777777777777777 111 222222222222 111111 111
lowQualScore : 000 2 444 2 2 5 66 2 88 4 222222222222 2 2 777777777777 44444 77 222222 00000000 2 2 888888 2 6666 2 2 1 666666 444444444444444444444444444444444444444444444444444444 2 999 444444444444 111111 77 6666 5 444
lowQualScore : ... . ... . . . .. . .. . ............ . . ............ ..... .. ...... ........ . . ...... . .... . . . ...... ...................................................... . ... ............ ...... .. .... . ...
lowQualScore : 888 7 777 7 7 0 99 5 44 7 888888888888 5 7 000000000000 00000 55 222222 44444444 9 6 222222 9 9999 9 9 9 111111 222222222222222222222222222222222222222222222222222222 1 111 111111111111 555555 44 6666 7 000
consensus : AATTCCGA---ACAAG-TAAT---AGCTTTC-C-AAAA-AGCTT--GCC-TGAC--TAAAC-AAA------------TTT-C-TTTCA-CTG-N------AATAA---GTAC-TT--TT--AA--------T-AAGTGATATA------TATCAG-ACG---AT-GTA-CTCTGCA------TAAGTCGACT------------------ATTT--------------------T---A-------AATGATC--TTTCCTCAAATTTC---A-------CT------G-TTTTA--GGGGAGGGGTTATT-ATC---AATAACCAA
Reference ( gi|13640 ) : AATTCCAA---ACAAG-TAAT---AGCTTTC-C-AAAA-AGCTT--GCC-TGAC--TAAAC-AAA------------TTT-C-TTTCA-CTG-A------AATAA---GTAC-TT--TTAAAA--------T-AAGTGATATA------TATCAG-ACA---AT-GTA-CTCTACA------TAAGTCGACT------------------ATTT--------------------T---A-------AGTGATC--TTTCCTCAAATTTC---A-------CT------G-TTTTA--GGGGAGGGGTTATT-ATC---AATAACCAA
gi|13639 : AATTCCAA---ACAAG-TAAT---AGCTTTC-CAAAAA-AGCTT--GCC-TGAC--TAAAC-AAA------------TTT-C-TTTCA-TCG-A------AATAA---GTA--TT--TTAAAA--------T-AAGTGATATA------TATCAG-ACA---AT-GTA-CTCTACA------TAAGTCGACT------------------ATTT--------------------T---A-------AGTGATC--TTTCCTCAAATTT----A-------CT------G-TTTTA---GGGAGGGGTTATT-ATC---AATAACCAA
gi|13642 : AATTCCAA---ACAAG-TAAT---AGCTTTCAC-AAAA-AGCTT--GCC-TGAC--TAAAC--AA------------TTT-C--TTCA-CTG-A------AATAA---GTACTTT--TTAAAA--------T-AAGTGATATA------TATCAG-ACA---AT-GTA-CTCTACA------TAGATCGACT------------------ATTT--------------------T---A-------AGTGATC--TTTCCTCAAATTTC---A-------CT------G-TTTTA---GGGCGGGGTTATT-ATC---AATAACCAA
gi|13641 : AATTCCAA---ACAAG-TAAT---AGCTTTC-C-AAAAAAGCTT--GCC-TGAC--T-AAC-AAA------------TTT-C-TTTCATCTG-A------AATAA---GTA--TT--TTAAAA--------TAAAGTGATATA------TATCAG-ACA---AT-GTA-CTCTACA------TAAGTCGACT------------------ATTT--------------------T---A-------AGTGATCT-TTTCCTCAAATTT----A-------CT------G-TTTTA--GGGGAGGGGTTATT-ATC---AATAAC
gi|13643 : AATTCCGATGCGCAAG-TAAT---AGCTTTC-C-AAAAAAGCTT--GCC-TGGC--TAAAC-AAA------------TTT-
gi|13644 : AATTCCGATGCGCAAG-TAATCATAGCTTTC-C-AAAA-AGCTT--GCC-TGGC--TAAAC-
gi|13645 : ATTC------ACAAG-TTAT---AGCTTTC-T-AAAA-CGCTT--GCC-TGAC--TATAC-AAA------------TTT-C-TTTCA-CTG-T------ATAAA---GTAC-TT--T----A--------C-AAATGATATA------TATCAG-ACA---AT-GTA-CTCTACA------TGAGTCGACT-------------------TTT--------------------T---A-------
gi|13646 : AG---ACAAG-TAAC---AGCTTTC-T-AAAA-AGCTT--GCC-TGAC--TAAAC-AAA------------TCT-C-GTCCA-CTG-T------AATCA---CTAC-TTAATT--AA--------T-GATTGATGTT------TATCAG-ATGTACAT-GTA-CCCTGCA------TAGGTTGACT------------------ATTTATAAATAACAAGTTTCCCTAT---A-------AATTATG--TTTCCTCAAATTTC---AAAGGTTTTT------T-TTTTA--GGGGAGGGGTTATC-A
gi|13648 : AA---ACAAG-TAAT---AACTTTC-C-AAAA-AGCTTTAGCC-TGACT-TAAACTAAA------------TTG-C-TTTC-------------AAT-----GTAT-TT------AA--------T-GAG---TATA------TATCAG-ACG---A---TA-C-CTGCAAT----TTAGTCGACT------------------TTTTG-------------------T---AGAGAATTAATAACCG-TTTACTCAAGATTC---A-------CT------G--TTTA--GCGGAGGGGTT
gi|13647 : AA---ACAAG-TAAT---AACTTTC-C-AAAA-AGCTTTAGCC-TGACT-TAAACTAAA------------TTG-C-TTTC-------------AAT-----GTAT-TT------AA--------T-GAG---TATA------TATCAG-ACG---A---TA-C-CTGCAAT----TTAGTCGACT------------------TTTTG-------------------T---AGAGAATTAATAACCG-TTTACTCAAGATTC---A-------CT------G--TTTA--GCGGAGGGGTT
gi|13649 : AA---ACAAG-TAAC---AGCTTTC-C-AAAA-AGCTT--GCC-TGAC--TAAAC-AAA------------TCT-C-TTCCA-TTG-T------AATCA---GTAC-TT------AA--------T----TGATGTT------CATCAT-------AT-GTG-CCCTGCA------TAAGCTGACT------------------
gi|13650 : A---ACAAACTGAA---AGCTTTC-C-AAAA-CGCTT--GCA-TGAC--TAAAC-AAA------------TTT-CTTTTCA-CTGTAAGC---AATAA---GCAC-TT------AA--------C-AGG-GATTTT------TATCAG-AGG---ATAGT--TTCTGCAAAACCGAAAGTCGACTTCTTAGGGGGAAAAACCAATTA--------------------G---A-------AATGATA--TTTTCTCAAATTTCGGGG-------TT------GTTTTTA--GGGGAGTGGTTATC-A
gi|13651 : ---ACAAG-TAAT---AGCTTTC-C-AAAA-AGCTT--GCC-TGAC--TAAAC-ACA------------TTT-C-TTTCA-ATG-T------ATTAC---GTGG-TT------AA--------T-AAGTGATATA------TATCAG-ACG---AT-GTA-CTCTACA------TAAGTCGACT------------------TTTTATAGAGAATTA---------T---A-------AATGATG--TTTCCTCAAATTTC---A-------CT------G-TATTAGGGGGGAGGAGGCATT-ATT---GATAACCAA
gi|13652 : ---ACAAG-TAAC---AGTTTTC-A-AAAA-AGCTT--GCCATGCCCTTAAAT-AAATGTTAACAATTTTTT-T-TTTCA-CTG-GGAAGTTAACAA---GTAC-TT------AA--------T-TGACGATGTT------TATCAGAACA---TT-GCAGATCTGCA------TAAGTCAACC------------------GTTT--------------------TATAA-------ATTGATTAATATTGTAAAATCTT---AATTTT--CTTGAAAAG-TTCTA--G----GGGGTTATTCATCTCGAATAA
gi|13653 : CAAG-TAAT---AGCTTTC-C-AAAA-AGCTT--GTC-CGAC--TAAAC-AAA------------TTT-C-TTTCA-ATG-T------ATTAAGTGGTAC-AT--TT--AA--------T-ACGTGATATATACATGTATCAG-CCG---AT-GTA-CTCTAAA------TAAGTCGACT-------------------TTT--------------------T---A-------
gi|13654 : CAAG-TAAT---AGCTTTC-C-AAAA-TGCTT--GCC-TGAC--TAAAC-AAA------------TTTAT-TTTCA-------------ATA-----TA--TT--TTAAAAGTGGTTAAT-AAGTGATATA------TATTAG-A-------------------------TGAGTCGACT-------------------TTT--------------------T---ATAG----AATGACG--TTTCCTCAAATTTC---A-------CT------G-ATTTA--G
gi|13655 : -AGCTT--GCC-TGAC--TAAAC-AAA------------TTT-C-TTTCT-CTG-T------AATAAGATGTAC-TC--T
gi|13656 : C-AAA------------TTT-C-TTTCA-------------AT-----GTAT-T-------------------AGGTGGT-TA-------ATCAT-ACG---AT-GTA-CTCTACA------TAAGTCGACT------------------gcacttgtaagtcgactttttataagt
Alignments
lowQualScore : 111 111111111111 333333333333333333333333333 11 111111 555555555555555555555555555555555555555555555555555 111 2222222 111111 111
lowQualScore : 2 000 2 444 2 2 4 66 2 77 4 222222222222 2 2 33 5555 666666666666666666666666666 444 00 2 4 777777 2 444 22 2 0 999999 555555555555555555555555555555555555555555555555555 55 666 6666 0000000 000000 55 55 5 111
lowQualScore : . ... . ... . . . .. . .. . ............ . . .. .... ........................... ... .. . . ...... . ... .. . . ...... ................................................... .. ... .... ....... ...... .. .. . ...
lowQualScore : 7 000 5 444 5 4 7 55 4 99 4 111111111111 4 5 99 3333 000000000000000000000000000 444 33 5 2 222222 5 444 77 5 5 444444 999999999999999999999999999999999999999999999999999 00 555 9999 9999999 555555 99 00 0 777
consensus : AATTCCGA---ACAAG-TAAT---AGCTTTC-CAAAA-A-GCTT--GCC-TGAC--TAAAC-AAA------------TTT-C-TTTCA-CT----G------TAAT----AA---GTACTT--TT---AA--TAA-GTGATATA------TATCAG-ACG---AT-GTA-CTCTGCA------TAAGTCGACT------------------ATTT--------------------TA-------AA--TGATC--TTTCCTCAAATTTC---A-------CT------G-TTTTA--GGGGAGGGGTTATT-ATC---AATAACCAA
Reference ( family-898 ) : AATTCCGA---ACAAG-TAAT---AGCTTTC-CAAAA-A-GCTT--GCC-TGAC--TAAAC-AAA------------TTT-C-TTTCA-CT----G------NAAT----AA---GTACTT--TT---AA--TAA-GTGATATA------TATCAG-ACG---AT-GTA-CTCTGCA------TAAGTCGACT------------------ATTT--------------------TA-------AA--TGATC--TTTCCTCAAATTTC---A-------CT------G-TTTTA--GGGGAGGGGTTATT-ATC---AATAACCAA
gi|13639 : AATTCCAA---ACAAG-TAAT---AGCTTTC-CAAAA-AAGCTT--GCC-TGAC--TAAAC-AAA------------TTT-C-TTTCA-TC----G------AAAT----AA---GTA-TT--TT---AAAATAA-GTGATATA------TATCAG-ACA---AT-GTA-CTCTACA------TAAGTCGACT------------------ATTT--------------------TA-------AG--TGATC--TTTCCTCAAATTT----A-------CT------G-TTTTA---GGGAGGGGTTATT-ATC---AATAACCAA
gi|13640 : AATTCCAA---ACAAG-TAAT---AGCTTTC-CAAAA-A-GCTT--GCC-TGAC--TAAAC-AAA------------TTT-C-TTTCA-CT----G------AAAT----AA---GTACTT--TT---AAAATAA-GTGATATA------TATCAG-ACA---AT-GTA-CTCTACA------TAAGTCGACT------------------ATTT--------------------TA-------AG--TGATC--TTTCCTCAAATTTC---A-------CT------G-TTTTA--GGGGAGGGGTTATT-ATC---AATAACCAA
gi|13641 : AATTCCAA---ACAAG-TAAT---AGCTTTC-CAAAA-AAGCTT--GCC-TGAC--TAA-C-AAA------------TTT-C-TTTCATCT----G------AAAT----AA---GTA-TT--TT---AAAATAAAGTGATATA------TATCAG-ACA---AT-GTA-CTCTACA------TAAGTCGACT------------------ATTT--------------------TA-------AG--TGATCT-TTTCCTCAAATTT----A-------CT------G-TTTTA--GGGGAGGGGTTATT-ATC---AATAAC
gi|13642 : AATTCCAA---ACAAG-TAAT---AGCTTTCACAAAA-A-GCTT--GCC-TGAC--TAAAC-AA-------------TTT-C-TT-CA-CT----G------AAAT----AA---GTACTT--TTTAAAA--TAA-GTGATATA------TATCAG-ACA---AT-GTA-CTCTACA------TAGATCGACT------------------ATTT--------------------TA-------AG--TGATC--TTTCCTCAAATTTC---A-------CT------G-TTTTA---GGGCGGGGTTATT-ATC---AATAACCAA
gi|13643 : AATTCCGATGCGCAAG-TAAT---AGCTTTC-CAAAAAA-GCTT--GCC-TGGC--TAAAC-AAA------------TTT-
gi|13644 : AATTCCGATGCGCAAG-TAATCATAGCTTTC-CAAAA-A-GCTT--GCC-TGGC--TAAAC-
gi|13645 : ATTC------ACAAG-TTAT---AGCTTTC-TAAAA-C-GCTT--GCC-TGAC--TATAC-AAA------------TTT-C-TTTCA-CT----G------TATA----AA---GTACTT--T-----A--CAA-ATGATATA------TATCAG-ACA---AT-GTA-CTCTACA------TGAGTCGACT-------------------TTT--------------------TA-------
gi|13646 : ---ACAAG-TAAC---AGCTTTC-TAAAA-A-GCTT--GCC-TGAC--TAAAC-AAA------------TCT-C-GTCCA-CT----G------TAAT----CA---CTACTTAATT---AA--TGA-TTGATGTT------TATCAG-ATGTACAT-GTA-CCCTGCA------TAGGTTGACT------------------ATTTATAAATAACAAGTTTCCCTATA-------AA--TTATG--TTTCCTCAAATTTC---AAAGGTTTTT------T-TTTTA--GGGGAGGGGTTATC-A
gi|13647 : agA---ACAAG-TAAT---AACTTTC-CAAAA-A-GCTTTAGCC-TGACT-TAAACTAAA------------TTG-C-TTTCA-AT----G------TA----------------T--TT---AA--TGA-G---TATA------TATCAG-ACG---A---TA-C-CTGCAAT----TTAGTCGACT------------------TTTTG-------------------TAGAGAATTAA--TAACCG-TTTACTCAAGATTC---A-------CT------G--TTTA--GCGGAGGGGTT
gi|13648 : aA---ACAAG-TAAT---AACTTTC-CAAAA-A-GCTTTAGCC-TGACT-TAAACTAAA------------TTG-C-TTTCA-AT----G------TA----------------T--TT---AA--TGA-G---TATA------TATCAG-ACG---A---TA-C-CTGCAAT----TTAGTCGACT------------------TTTTG-------------------TAGAGAATTAA--TAACCG-TTTACTCAAGATTC---A-------CT------G--TTTA--GCGGAGGGGTT
gi|13649 : aA---ACAAG-TAAC---AGCTTTC-CAAAA-A-GCTT--GCC-TGAC--TAAAC-AAA------------TCT-C-TTCCA-TT----G------TAAT----CA---GTAC----TT---AA--T----TGATGTT------CATCA----T---AT-GTG-CCCTGCA------TAAGCTGACT------------------
gi|13650 : aA---ACAAACTGAA---AGCTTTC-CAAAA-C-GCTT--GCA-TGAC--TAAAC-AAA------------TTT-CTTTTCA-CTGTAAG------CAAT----AA---GCAC----TT---AA--CAG-G-GATTTT------TATCAG-AGG---ATAGT--TTCTGCAAAACCGAAAGTCGACTTCTTAGGGGGAAAAACCAATTA--------------------GA-------AA--TGATA--TTTTCTCAAATTTCGGGG-------TT------GTTTTTA--GGGGAGTGGTTATC-A
gi|13651 : ---ACAAG-TAAT---AGCTTTC-CAAAA-A-GCTT--GCC-TGAC--TAAAC-ACA------------TTT-C-TTTCA-AT----G------TATT----AC---GTG--G--TT---AA--TAA-GTGATATA------TATCAG-ACG---AT-GTA-CTCTACA------TAAGTCGACTTTTTATAGAGA-------ATTA--------------------TA-------AA--TGATG--TTTCCTCAAATTTC---A-------CT------G-TATTAGGGGGGAGGAGGCATT-ATT---GATAACCAA
gi|13652 : ---ACAAG-TAAC---AGTTTTC-AAAAA-A-GCTT--GCCATGCCCTTAAAT-AAATGTTAACAATTTTTT-T-TTTCA-CT----GGGAAGTTAAC----AA---GTAC----TT---AA--TTG-ACGATGTT------TATCAGAACA---TT-GCAGATCTGCA------TAAGTCAACC------------------GTTT--------------------TAT------AAATTGATTAATATTGTAAAATCTT---AATTTT--CTTGAAAAG-TTCTA--G----GGGGTTATTCATCTCGAATAA
gi|13653 : CAAG-TAAT---AGCTTTC-CAAAA-A-GCTT--GTC-CGAC--TAAAC-AAA------------TTT-C-TTTCA-AT----G------TATT----AAGTGGTACAT--TT---AA--TAC-GTGATATATACATGTATCAG-CCG---AT-GTA-CTCTAAA------TAAGTCGACT-------------------TTT--------------------TA-------
gi|13654 : CAAG-TAAT---AGCTTTC-CAAAA-T-GCTT--GCC-TGAC--TAAAC-AAA------------TTTAT-TTTCA-AT----A------TATTTTAAAA---GTGGTT-------AA--TAA-GTGATATA------TATTAG-ATG---A----------------------GTCGACT-------------------TTT--------------------TATAG----AA--TGACG--TTTCCTCAAATTTC---A-------CT------G-ATTTA--G
gi|13655 : -A-GCTT--GCC-TGAC--TAAAC-AAA------------TTT-C-TTTCT-CT----G----------------------------T---AA--TAA-G--------------------------AT-GTA-CTCTGCACTTG--TAAGTCGACT-------------------TTT--------------------TA-------
gi|13656 : C-AAA------------TTT-C-TTTCA-AT----G----------------------------T---AT--TAG-GTGGT-TA-------ATCAT-ACG---AT-GTA-CTCTACA------TAAGTCGACT------------------taagt
Alignments
lowQualScore : 111 111111111111 2222222222222222222222222222222 11 111111 666666666666666666666666666666666666666666666666666 111 2222222 111111 111
lowQualScore : 2 000 2 444 2 2 4 66 2 77 4 222222222222 2 2 33 1111111111111111111111111111111 444 11 2 1 777777 2 444 33 2 1 0 555555 000000000000000000000000000000000000000000000000000 55 666 6666 0000000 000000 55 55 5 111
lowQualScore : . ... . ... . . . .. . .. . ............ . . .. ............................... ... .. . . ...... . ... .. . . . ...... ................................................... .. ... .... ....... ...... .. .. . ...
lowQualScore : 7 000 5 444 5 4 7 55 4 99 4 111111111111 4 5 99 7777777777777777777777777777777 777 00 7 8 777777 7 777 55 7 1 2 000000 333333333333333333333333333333333333333333333333333 00 555 9999 9999999 555555 99 00 0 777
consensus : AATTCCGA---ACAAG-TAAT---AGCTTTC-CAAAA-A-GCTT--GCC-TGAC--TAAAC-AAA------------TTT-C-TTTCA-CTG------T----AAT----AA---GTACTT--TT---AA--TAA-GTGATATA------TATCAG-ACG---AT-GTA-CTCTGCA------TAAGTCGACT------------------ATTT--------------------TA-------AA--TGATC--TTTCCTCAAATTTC---A-------CT------G-TTTTA--GGGGAGGGGTTATT-ATC---AATAACCAA
Reference ( family-898 ) : AATTCCGA---ACAAG-TAAT---AGCTTTC-CAAAA-A-GCTT--GCC-TGAC--TAAAC-AAA------------TTT-C-TTTCA-CTG------T----AAT----AA---GTACTT--TT---AA--TAA-GTGATATA------TATCAG-ACG---AT-GTA-CTCTGCA------TAAGTCGACT------------------ATTT--------------------TA-------AA--TGATC--TTTCCTCAAATTTC---A-------CT------G-TTTTA--GGGGAGGGGTTATT-ATC---AATAACCAA
gi|13639 : AATTCCAA---ACAAG-TAAT---AGCTTTC-CAAAA-AAGCTT--GCC-TGAC--TAAAC-AAA------------TTT-C-TTTCA-TCG------A----AAT----AA---GTA-TT--TT---AAAATAA-GTGATATA------TATCAG-ACA---AT-GTA-CTCTACA------TAAGTCGACT------------------ATTT--------------------TA-------AG--TGATC--TTTCCTCAAATTT----A-------CT------G-TTTTA---GGGAGGGGTTATT-ATC---AATAACCAA
gi|13640 : AATTCCAA---ACAAG-TAAT---AGCTTTC-CAAAA-A-GCTT--GCC-TGAC--TAAAC-AAA------------TTT-C-TTTCA-CTG------A----AAT----AA---GTACTT--TT---AAAATAA-GTGATATA------TATCAG-ACA---AT-GTA-CTCTACA------TAAGTCGACT------------------ATTT--------------------TA-------AG--TGATC--TTTCCTCAAATTTC---A-------CT------G-TTTTA--GGGGAGGGGTTATT-ATC---AATAACCAA
gi|13641 : AATTCCAA---ACAAG-TAAT---AGCTTTC-CAAAA-AAGCTT--GCC-TGAC--TAA-C-AAA------------TTT-C-TTTCATCTG------A----AAT----AA---GTA-TT--TT---AAAATAAAGTGATATA------TATCAG-ACA---AT-GTA-CTCTACA------TAAGTCGACT------------------ATTT--------------------TA-------AG--TGATCT-TTTCCTCAAATTT----A-------CT------G-TTTTA--GGGGAGGGGTTATT-ATC---AATAAC
gi|13642 : AATTCCAA---ACAAG-TAAT---AGCTTTCACAAAA-A-GCTT--GCC-TGAC--TAAAC-AA-------------TTT-C-TT-CA-CTG------A----AAT----AA---GTACTT--TTTAAAA--TAA-GTGATATA------TATCAG-ACA---AT-GTA-CTCTACA------TAGATCGACT------------------ATTT--------------------TA-------AG--TGATC--TTTCCTCAAATTTC---A-------CT------G-TTTTA---GGGCGGGGTTATT-ATC---AATAACCAA
gi|13643 : AATTCCGATGCGCAAG-TAAT---AGCTTTC-CAAAAAA-GCTT--GCC-TGGC--TAAAC-AAA------------TTT-
gi|13644 : AATTCCGATGCGCAAG-TAATCATAGCTTTC-CAAAA-A-GCTT--GCC-TGGC--TAAAC-
gi|13645 : ATTC------ACAAG-TTAT---AGCTTTC-TAAAA-C-GCTT--GCC-TGAC--TATAC-AAA------------TTT-C-TTTCA-CTG------T----ATA----AA---GTACTT--T-----A--CAA-ATGATATA------TATCAG-ACA---AT-GTA-CTCTACA------TGAGTCGACT-------------------TTT--------------------TA-------
gi|13646 : ---ACAAG-TAAC---AGCTTTC-TAAAA-A-GCTT--GCC-TGAC--TAAAC-AAA------------TCT-C-GTCCA-CTG------T----AAT----CA---CTACTTAATT---AA--TGA-TTGATGTT------TATCAG-ATGTACAT-GTA-CCCTGCA------TAGGTTGACT------------------ATTTATAAATAACAAGTTTCCCTATA-------AA--TTATG--TTTCCTCAAATTTC---AAAGGTTTTT------T-TTTTA--GGGGAGGGGTTATC-A
gi|13647 : agA---ACAAG-TAAT---AACTTTC-CAAAA-A-GCTTTAGCC-TGACT-TAAACTAAA------------TTG-C-TTTCA-ATG------T----A----------------T--TT---AA--TGA-G---TATA------TATCAG-ACG---A---TA-C-CTGCAAT----TTAGTCGACT------------------TTTTG-------------------TAGAGAATTAA--TAACCG-TTTACTCAAGATTC---A-------CT------G--TTTA--GCGGAGGGGTT
gi|13648 : aA---ACAAG-TAAT---AACTTTC-CAAAA-A-GCTTTAGCC-TGACT-TAAACTAAA------------TTG-C-TTTCA-ATG------T----A----------------T--TT---AA--TGA-G---TATA------TATCAG-ACG---A---TA-C-CTGCAAT----TTAGTCGACT------------------TTTTG-------------------TAGAGAATTAA--TAACCG-TTTACTCAAGATTC---A-------CT------G--TTTA--GCGGAGGGGTT
gi|13649 : aA---ACAAG-TAAC---AGCTTTC-CAAAA-A-GCTT--GCC-TGAC--TAAAC-AAA------------TCT-C-TTCCA-TTG------T----AAT----CA---GTAC----TT---AA--T----TGATGTT------CATCA----T---AT-GTG-CCCTGCA------TAAGCTGACT------------------
gi|13650 : aA---ACAAACTGAA---AGCTTTC-CAAAA-C-GCTT--GCA-TGAC--TAAAC-AAA------------TTT-CTTTTCA-CTG------TAAGCAAT----AA---GCAC----TT---AA--CAG-G-GATTTT------TATCAG-AGG---ATAGT--TTCTGCAAAACCGAAAGTCGACTTCTTAGGGGGAAAAACCAATTA--------------------GA-------AA--TGATA--TTTTCTCAAATTTCGGGG-------TT------GTTTTTA--GGGGAGTGGTTATC-A
gi|13651 : ---ACAAG-TAAT---AGCTTTC-CAAAA-A-GCTT--GCC-TGAC--TAAAC-ACA------------TTT-C-TTTCA-ATG------T----ATT----AC---GTG--G--TT---AA--TAA-GTGATATA------TATCAG-ACG---AT-GTA-CTCTACA------TAAGTCGACTTTTTATAGAGA-------ATTA--------------------TA-------AA--TGATG--TTTCCTCAAATTTC---A-------CT------G-TATTAGGGGGGAGGAGGCATT-ATT---GATAACCAA
gi|13652 : ---ACAAG-TAAC---AGTTTTC-AAAAA-A-GCTT--GCCATGCCCTTAAAT-AAATGTTAACAATTTTTT-T-TTTCA-CTGGGAAGTT----AAC----AA---GTAC----TT---AA--TTG-ACGATGTT------TATCAGAACA---TT-GCAGATCTGCA------TAAGTCAACC------------------GTTT--------------------TAT------AAATTGATTAATATTGTAAAATCTT---AATTTT--CTTGAAAAG-TTCTA--G----GGGGTTATTCATCTCGAATAA
gi|13653 : CAAG-TAAT---AGCTTTC-CAAAA-A-GCTT--GTC-CGAC--TAAAC-AAA------------TTT-C-TTTCA-ATG------T----ATT----AAGTGGTACAT--TT---AA--TAC-GTGATATATACATGTATCAG-CCG---AT-GTA-CTCTAAA------TAAGTCGACT-------------------TTT--------------------TA-------
gi|13654 : CAAG-TAAT---AGCTTTC-CAAAA-T-GCTT--GCC-TGAC--TAAAC-AAA------------TTTAT-TTTCA-ATA------T----ATTTTAAAA---GTGGTT-------AA--TAA-GTGATATA------TATTAG-ATG---A----------------------GTCGACT-------------------TTT--------------------TATAG----AA--TGACG--TTTCCTCAAATTTC---A-------CT------G-ATTTA--G
gi|13655 : -A-GCTT--GCC-TGAC--TAAAC-AAA------------TTT-C-TTTCT-CTG------T----AAT----AAGATGTACTC--T
gi|13656 : C-AAA------------TTT-C-TTTCA-ATG------T----A--------------------T-------TAG-GTGGT-TA-------ATCAT-ACG---AT-GTA-CTCTACA------TAAGTCGACT------------------gcacttgtaagtcgactttttataagt
Alignments
lowQualScore : 111 111111111111 2222222222222222222222222222222 11 111111 666666666666666666666666666666666666666666666666666 111 2222222 111111 111
lowQualScore : 2 000 2 444 2 2 4 66 2 77 4 222222222222 2 2 33 1111111111111111111111111111111 444 11 2 1 777777 2 444 33 2 1 0 555555 000000000000000000000000000000000000000000000000000 55 666 6666 0000000 000000 55 55 5 111
lowQualScore : . ... . ... . . . .. . .. . ............ . . .. ............................... ... .. . . ...... . ... .. . . . ...... ................................................... .. ... .... ....... ...... .. .. . ...
lowQualScore : 7 000 5 444 5 4 7 55 4 99 4 111111111111 4 5 99 7777777777777777777777777777777 777 00 7 8 777777 7 777 55 7 1 2 000000 333333333333333333333333333333333333333333333333333 00 555 9999 9999999 555555 99 00 0 777
consensus : AATTCCGA---ACAAG-TAAT---AGCTTTC-CAAAA-A-GCTT--GCC-TGAC--TAAAC-AAA------------TTT-C-TTTCA-CTG------T----AAT----AA---GTACTT--TT---AA--TAA-GTGATATA------TATCAG-ACG---AT-GTA-CTCTGCA------TAAGTCGACT------------------ATTT--------------------TA-------AA--TGATC--TTTCCTCAAATTTC---A-------CT------G-TTTTA--GGGGAGGGGTTATT-ATC---AATAACCAA
Reference ( family-898 ) : AATTCCGA---ACAAG-TAAT---AGCTTTC-CAAAA-A-GCTT--GCC-TGAC--TAAAC-AAA------------TTT-C-TTTCA-CTG------T----AAT----AA---GTACTT--TT---AA--TAA-GTGATATA------TATCAG-ACG---AT-GTA-CTCTGCA------TAAGTCGACT------------------ATTT--------------------TA-------AA--TGATC--TTTCCTCAAATTTC---A-------CT------G-TTTTA--GGGGAGGGGTTATT-ATC---AATAACCAA
gi|13639 : AATTCCAA---ACAAG-TAAT---AGCTTTC-CAAAA-AAGCTT--GCC-TGAC--TAAAC-AAA------------TTT-C-TTTCA-TCG------A----AAT----AA---GTA-TT--TT---AAAATAA-GTGATATA------TATCAG-ACA---AT-GTA-CTCTACA------TAAGTCGACT------------------ATTT--------------------TA-------AG--TGATC--TTTCCTCAAATTT----A-------CT------G-TTTTA---GGGAGGGGTTATT-ATC---AATAACCAA
gi|13640 : AATTCCAA---ACAAG-TAAT---AGCTTTC-CAAAA-A-GCTT--GCC-TGAC--TAAAC-AAA------------TTT-C-TTTCA-CTG------A----AAT----AA---GTACTT--TT---AAAATAA-GTGATATA------TATCAG-ACA---AT-GTA-CTCTACA------TAAGTCGACT------------------ATTT--------------------TA-------AG--TGATC--TTTCCTCAAATTTC---A-------CT------G-TTTTA--GGGGAGGGGTTATT-ATC---AATAACCAA
gi|13641 : AATTCCAA---ACAAG-TAAT---AGCTTTC-CAAAA-AAGCTT--GCC-TGAC--TAA-C-AAA------------TTT-C-TTTCATCTG------A----AAT----AA---GTA-TT--TT---AAAATAAAGTGATATA------TATCAG-ACA---AT-GTA-CTCTACA------TAAGTCGACT------------------ATTT--------------------TA-------AG--TGATCT-TTTCCTCAAATTT----A-------CT------G-TTTTA--GGGGAGGGGTTATT-ATC---AATAAC
gi|13642 : AATTCCAA---ACAAG-TAAT---AGCTTTCACAAAA-A-GCTT--GCC-TGAC--TAAAC-AA-------------TTT-C-TT-CA-CTG------A----AAT----AA---GTACTT--TTTAAAA--TAA-GTGATATA------TATCAG-ACA---AT-GTA-CTCTACA------TAGATCGACT------------------ATTT--------------------TA-------AG--TGATC--TTTCCTCAAATTTC---A-------CT------G-TTTTA---GGGCGGGGTTATT-ATC---AATAACCAA
gi|13643 : AATTCCGATGCGCAAG-TAAT---AGCTTTC-CAAAAAA-GCTT--GCC-TGGC--TAAAC-AAA------------TTT-
gi|13644 : AATTCCGATGCGCAAG-TAATCATAGCTTTC-CAAAA-A-GCTT--GCC-TGGC--TAAAC-
gi|13645 : ATTC------ACAAG-TTAT---AGCTTTC-TAAAA-C-GCTT--GCC-TGAC--TATAC-AAA------------TTT-C-TTTCA-CTG------T----ATA----AA---GTACTT--T-----A--CAA-ATGATATA------TATCAG-ACA---AT-GTA-CTCTACA------TGAGTCGACT-------------------TTT--------------------TA-------
gi|13646 : ---ACAAG-TAAC---AGCTTTC-TAAAA-A-GCTT--GCC-TGAC--TAAAC-AAA------------TCT-C-GTCCA-CTG------T----AAT----CA---CTACTTAATT---AA--TGA-TTGATGTT------TATCAG-ATGTACAT-GTA-CCCTGCA------TAGGTTGACT------------------ATTTATAAATAACAAGTTTCCCTATA-------AA--TTATG--TTTCCTCAAATTTC---AAAGGTTTTT------T-TTTTA--GGGGAGGGGTTATC-A
gi|13647 : agA---ACAAG-TAAT---AACTTTC-CAAAA-A-GCTTTAGCC-TGACT-TAAACTAAA------------TTG-C-TTTCA-ATG------T----A----------------T--TT---AA--TGA-G---TATA------TATCAG-ACG---A---TA-C-CTGCAAT----TTAGTCGACT------------------TTTTG-------------------TAGAGAATTAA--TAACCG-TTTACTCAAGATTC---A-------CT------G--TTTA--GCGGAGGGGTT
gi|13648 : aA---ACAAG-TAAT---AACTTTC-CAAAA-A-GCTTTAGCC-TGACT-TAAACTAAA------------TTG-C-TTTCA-ATG------T----A----------------T--TT---AA--TGA-G---TATA------TATCAG-ACG---A---TA-C-CTGCAAT----TTAGTCGACT------------------TTTTG-------------------TAGAGAATTAA--TAACCG-TTTACTCAAGATTC---A-------CT------G--TTTA--GCGGAGGGGTT
gi|13649 : aA---ACAAG-TAAC---AGCTTTC-CAAAA-A-GCTT--GCC-TGAC--TAAAC-AAA------------TCT-C-TTCCA-TTG------T----AAT----CA---GTAC----TT---AA--T----TGATGTT------CATCA----T---AT-GTG-CCCTGCA------TAAGCTGACT------------------
gi|13650 : aA---ACAAACTGAA---AGCTTTC-CAAAA-C-GCTT--GCA-TGAC--TAAAC-AAA------------TTT-CTTTTCA-CTG------TAAGCAAT----AA---GCAC----TT---AA--CAG-G-GATTTT------TATCAG-AGG---ATAGT--TTCTGCAAAACCGAAAGTCGACTTCTTAGGGGGAAAAACCAATTA--------------------GA-------AA--TGATA--TTTTCTCAAATTTCGGGG-------TT------GTTTTTA--GGGGAGTGGTTATC-A
gi|13651 : ---ACAAG-TAAT---AGCTTTC-CAAAA-A-GCTT--GCC-TGAC--TAAAC-ACA------------TTT-C-TTTCA-ATG------T----ATT----AC---GTG--G--TT---AA--TAA-GTGATATA------TATCAG-ACG---AT-GTA-CTCTACA------TAAGTCGACTTTTTATAGAGA-------ATTA--------------------TA-------AA--TGATG--TTTCCTCAAATTTC---A-------CT------G-TATTAGGGGGGAGGAGGCATT-ATT---GATAACCAA
gi|13652 : ---ACAAG-TAAC---AGTTTTC-AAAAA-A-GCTT--GCCATGCCCTTAAAT-AAATGTTAACAATTTTTT-T-TTTCA-CTGGGAAGTT----AAC----AA---GTAC----TT---AA--TTG-ACGATGTT------TATCAGAACA---TT-GCAGATCTGCA------TAAGTCAACC------------------GTTT--------------------TAT------AAATTGATTAATATTGTAAAATCTT---AATTTT--CTTGAAAAG-TTCTA--G----GGGGTTATTCATCTCGAATAA
gi|13653 : CAAG-TAAT---AGCTTTC-CAAAA-A-GCTT--GTC-CGAC--TAAAC-AAA------------TTT-C-TTTCA-ATG------T----ATT----AAGTGGTACAT--TT---AA--TAC-GTGATATATACATGTATCAG-CCG---AT-GTA-CTCTAAA------TAAGTCGACT-------------------TTT--------------------TA-------
gi|13654 : CAAG-TAAT---AGCTTTC-CAAAA-T-GCTT--GCC-TGAC--TAAAC-AAA------------TTTAT-TTTCA-ATA------T----ATTTTAAAA---GTGGTT-------AA--TAA-GTGATATA------TATTAG-ATG---A----------------------GTCGACT-------------------TTT--------------------TATAG----AA--TGACG--TTTCCTCAAATTTC---A-------CT------G-ATTTA--G
gi|13655 : -A-GCTT--GCC-TGAC--TAAAC-AAA------------TTT-C-TTTCT-CTG------T----AAT----AAGATGTACTC--T
gi|13656 : C-AAA------------TTT-C-TTTCA-ATG------T----A--------------------T-------TAG-GTGGT-TA-------ATCAT-ACG---AT-GTA-CTCTACA------TAAGTCGACT------------------gcacttgtaagtcgactttttataagt
blockSeqs : A TGC C CAT A A A TA A CT T TGTTAACAATTT A T TC GGAAGTTAACAAGTAC TAA AA A T TACATG A TAC TA G T AAACCG ATTTATAAATAACAAGTTTCCCTATA AT TAA CGGG AAGGTTT TGAAAA TT GG C TCG
blockSeqs : A TGC . . . . . TA . T T . . . C TATTTTAAAAGTGGTT . AA . T . . . T . T AT TCTTAGGGGGAAAAACCAATTAGA . CT C ATTTT . T . . .
blockSeqs : A . . . . . . . . T . . . . C TATTAAGTGGTACAT . . . T . . . T . T AT TTTTATAGAGAATTATA . CG C . . T . . .
blockSeqs : G . . . . . . . . . . . . . C TAATAAGATGTACTC . . . T . . . T . T . TTTTGTAGAGAATT . CG C . . T . . .
blockSeqs : G . . . . . . . . . . . . . C TAATCACTACTTAA . . . T . . . T . C . TTTTGTAGAGAATT . C C . . T . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . A TAAGCAATAAGCAC . . . T . . . T . C . TTTTATAG . C C . . T . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . A AAATAAGTACTT . . . T . . . T . T . GTTTTAT . G C . . T . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . T AAATAAGTACTT . . . C . . . T . T . ATTTTA . A T . . A .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . C TATAAAGTACTT . . . T . . . T . T . ATTTTA . G C . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . A AAATAAGTATT . . . T . . . T . T . ATTTTA . G . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . C TAATCAGTAC . . . T . . . T . T . TTTTA
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . A TATTACGTGG . . . . . . . . . . . TTTTA
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . A TAT . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . C TAT . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . A TA
blockSeqs : . . . . . . . .
blockSeqs : .
blockSeqCons : TAATAAGTACTT******************* ** C***
originalCons : AATTCCGA---ACAAG-TAAT---AGCTTTC-CAAAA-A-GCTT--GCC-TGAC--TAAAC-AAA------------TTT-C-TTTCA-CTG------T----AAT----AA---GTACTT--TT---AA--TAA-GTGATATA------TATCAG-ACG---AT-GTA-CTCTGCA------TAAGTCGACT------------------ATTT--------------------TA-------AA--TGATC--TTTCCTCAAATTTC---A-------CT------G-TTTTA--GGGGAGGGGTTATT-ATC---AATAACCAA
finalCons : AATTCCGA---ACAAG-TAAT---AGCTTTC-CAAAA-A-GCTT--GCC-TGAC--TAAAC-AAA------------TTT-C-TTTCA-CTGTAATAAGTACTT-------------------TT---AA--TAA-GTGATATA------TATCAG-ACG---AT-GTA-CTCTGCA------TAAGTCGACT------------------ATTT--------------------TA-------AA--TGATC--TTTCCTCAAATTTC---A-------CT------G-TTTTA--GGGGAGGGGTTATT-ATC---AATAACCAA
Alignments
lowQualScore : 111 111111111111 2222222222222222222222222222222 11 111111 666666666666666666666666666666666666666666666666666 111 2222222 111111 111
lowQualScore : 2 000 2 444 2 2 4 66 2 77 4 222222222222 2 2 33 1111111111111111111111111111111 444 11 2 1 777777 2 444 33 2 1 0 555555 000000000000000000000000000000000000000000000000000 55 666 6666 0000000 000000 55 55 5 111
lowQualScore : . ... . ... . . . .. . .. . ............ . . .. ............................... ... .. . . ...... . ... .. . . . ...... ................................................... .. ... .... ....... ...... .. .. . ...
lowQualScore : 7 000 5 444 5 4 7 55 4 99 4 111111111111 4 5 99 7777777777777777777777777777777 777 00 7 8 777777 7 777 55 7 1 2 000000 333333333333333333333333333333333333333333333333333 00 555 9999 9999999 555555 99 00 0 777
consensus : AATTCCGA---ACAAG-TAAT---AGCTTTC-CAAAA-A-GCTT--GCC-TGAC--TAAAC-AAA------------TTT-C-TTTCA-CTG------T----AAT----AA---GTACTT--TT---AA--TAA-GTGATATA------TATCAG-ACG---AT-GTA-CTCTGCA------TAAGTCGACT------------------ATTT--------------------TA-------AA--TGATC--TTTCCTCAAATTTC---A-------CT------G-TTTTA--GGGGAGGGGTTATT-ATC---AATAACCAA
Reference ( family-898 ) : AATTCCGA---ACAAG-TAAT---AGCTTTC-CAAAA-A-GCTT--GCC-TGAC--TAAAC-AAA------------TTT-C-TTTCA-CTG------T----AAT----AA---GTACTT--TT---AA--TAA-GTGATATA------TATCAG-ACG---AT-GTA-CTCTGCA------TAAGTCGACT------------------ATTT--------------------TA-------AA--TGATC--TTTCCTCAAATTTC---A-------CT------G-TTTTA--GGGGAGGGGTTATT-ATC---AATAACCAA
gi|13639 : AATTCCAA---ACAAG-TAAT---AGCTTTC-CAAAA-AAGCTT--GCC-TGAC--TAAAC-AAA------------TTT-C-TTTCA-TCG------A----AAT----AA---GTA-TT--TT---AAAATAA-GTGATATA------TATCAG-ACA---AT-GTA-CTCTACA------TAAGTCGACT------------------ATTT--------------------TA-------AG--TGATC--TTTCCTCAAATTT----A-------CT------G-TTTTA---GGGAGGGGTTATT-ATC---AATAACCAA
gi|13640 : AATTCCAA---ACAAG-TAAT---AGCTTTC-CAAAA-A-GCTT--GCC-TGAC--TAAAC-AAA------------TTT-C-TTTCA-CTG------A----AAT----AA---GTACTT--TT---AAAATAA-GTGATATA------TATCAG-ACA---AT-GTA-CTCTACA------TAAGTCGACT------------------ATTT--------------------TA-------AG--TGATC--TTTCCTCAAATTTC---A-------CT------G-TTTTA--GGGGAGGGGTTATT-ATC---AATAACCAA
gi|13641 : AATTCCAA---ACAAG-TAAT---AGCTTTC-CAAAA-AAGCTT--GCC-TGAC--TAA-C-AAA------------TTT-C-TTTCATCTG------A----AAT----AA---GTA-TT--TT---AAAATAAAGTGATATA------TATCAG-ACA---AT-GTA-CTCTACA------TAAGTCGACT------------------ATTT--------------------TA-------AG--TGATCT-TTTCCTCAAATTT----A-------CT------G-TTTTA--GGGGAGGGGTTATT-ATC---AATAAC
gi|13642 : AATTCCAA---ACAAG-TAAT---AGCTTTCACAAAA-A-GCTT--GCC-TGAC--TAAAC-AA-------------TTT-C-TT-CA-CTG------A----AAT----AA---GTACTT--TTTAAAA--TAA-GTGATATA------TATCAG-ACA---AT-GTA-CTCTACA------TAGATCGACT------------------ATTT--------------------TA-------AG--TGATC--TTTCCTCAAATTTC---A-------CT------G-TTTTA---GGGCGGGGTTATT-ATC---AATAACCAA
gi|13643 : AATTCCGATGCGCAAG-TAAT---AGCTTTC-CAAAAAA-GCTT--GCC-TGGC--TAAAC-AAA------------TTT-
gi|13644 : AATTCCGATGCGCAAG-TAATCATAGCTTTC-CAAAA-A-GCTT--GCC-TGGC--TAAAC-
gi|13645 : ATTC------ACAAG-TTAT---AGCTTTC-TAAAA-C-GCTT--GCC-TGAC--TATAC-AAA------------TTT-C-TTTCA-CTG------T----ATA----AA---GTACTT--T-----A--CAA-ATGATATA------TATCAG-ACA---AT-GTA-CTCTACA------TGAGTCGACT-------------------TTT--------------------TA-------
gi|13646 : ---ACAAG-TAAC---AGCTTTC-TAAAA-A-GCTT--GCC-TGAC--TAAAC-AAA------------TCT-C-GTCCA-CTG------T----AAT----CA---CTACTTAATT---AA--TGA-TTGATGTT------TATCAG-ATGTACAT-GTA-CCCTGCA------TAGGTTGACT------------------ATTTATAAATAACAAGTTTCCCTATA-------AA--TTATG--TTTCCTCAAATTTC---AAAGGTTTTT------T-TTTTA--GGGGAGGGGTTATC-A
gi|13647 : agA---ACAAG-TAAT---AACTTTC-CAAAA-A-GCTTTAGCC-TGACT-TAAACTAAA------------TTG-C-TTTCA-ATG------T----A----------------T--TT---AA--TGA-G---TATA------TATCAG-ACG---A---TA-C-CTGCAAT----TTAGTCGACT------------------TTTTG-------------------TAGAGAATTAA--TAACCG-TTTACTCAAGATTC---A-------CT------G--TTTA--GCGGAGGGGTT
gi|13648 : aA---ACAAG-TAAT---AACTTTC-CAAAA-A-GCTTTAGCC-TGACT-TAAACTAAA------------TTG-C-TTTCA-ATG------T----A----------------T--TT---AA--TGA-G---TATA------TATCAG-ACG---A---TA-C-CTGCAAT----TTAGTCGACT------------------TTTTG-------------------TAGAGAATTAA--TAACCG-TTTACTCAAGATTC---A-------CT------G--TTTA--GCGGAGGGGTT
gi|13649 : aA---ACAAG-TAAC---AGCTTTC-CAAAA-A-GCTT--GCC-TGAC--TAAAC-AAA------------TCT-C-TTCCA-TTG------T----AAT----CA---GTAC----TT---AA--T----TGATGTT------CATCA----T---AT-GTG-CCCTGCA------TAAGCTGACT------------------
gi|13650 : aA---ACAAACTGAA---AGCTTTC-CAAAA-C-GCTT--GCA-TGAC--TAAAC-AAA------------TTT-CTTTTCA-CTG------TAAGCAAT----AA---GCAC----TT---AA--CAG-G-GATTTT------TATCAG-AGG---ATAGT--TTCTGCAAAACCGAAAGTCGACTTCTTAGGGGGAAAAACCAATTA--------------------GA-------AA--TGATA--TTTTCTCAAATTTCGGGG-------TT------GTTTTTA--GGGGAGTGGTTATC-A
gi|13651 : ---ACAAG-TAAT---AGCTTTC-CAAAA-A-GCTT--GCC-TGAC--TAAAC-ACA------------TTT-C-TTTCA-ATG------T----ATT----AC---GTG--G--TT---AA--TAA-GTGATATA------TATCAG-ACG---AT-GTA-CTCTACA------TAAGTCGACTTTTTATAGAGA-------ATTA--------------------TA-------AA--TGATG--TTTCCTCAAATTTC---A-------CT------G-TATTAGGGGGGAGGAGGCATT-ATT---GATAACCAA
gi|13652 : ---ACAAG-TAAC---AGTTTTC-AAAAA-A-GCTT--GCCATGCCCTTAAAT-AAATGTTAACAATTTTTT-T-TTTCA-CTGGGAAGTT----AAC----AA---GTAC----TT---AA--TTG-ACGATGTT------TATCAGAACA---TT-GCAGATCTGCA------TAAGTCAACC------------------GTTT--------------------TAT------AAATTGATTAATATTGTAAAATCTT---AATTTT--CTTGAAAAG-TTCTA--G----GGGGTTATTCATCTCGAATAA
gi|13653 : CAAG-TAAT---AGCTTTC-CAAAA-A-GCTT--GTC-CGAC--TAAAC-AAA------------TTT-C-TTTCA-ATG------T----ATT----AAGTGGTACAT--TT---AA--TAC-GTGATATATACATGTATCAG-CCG---AT-GTA-CTCTAAA------TAAGTCGACT-------------------TTT--------------------TA-------
gi|13654 : CAAG-TAAT---AGCTTTC-CAAAA-T-GCTT--GCC-TGAC--TAAAC-AAA------------TTTAT-TTTCA-ATA------T----ATTTTAAAA---GTGGTT-------AA--TAA-GTGATATA------TATTAG-ATG---A----------------------GTCGACT-------------------TTT--------------------TATAG----AA--TGACG--TTTCCTCAAATTTC---A-------CT------G-ATTTA--G
gi|13655 : -A-GCTT--GCC-TGAC--TAAAC-AAA------------TTT-C-TTTCT-CTG------T----AAT----AAGATGTACTC--T
gi|13656 : C-AAA------------TTT-C-TTTCA-ATG------T----A--------------------T-------TAG-GTGGT-TA-------ATCAT-ACG---AT-GTA-CTCTACA------TAAGTCGACT------------------gcacttgtaagtcgactttttataagt