lowQualScore : 222222222 1111
lowQualScore : 444 2 2 88888 33 2 4 777777 2 4444 2 4444 2 2 33 2 33 2 888888888 2 777 2 33 2 55 3333 2 2 5
lowQualScore : ... . . ..... .. . . ...... . .... . .... . . .. . .. . ......... . ... . .. . .. .... . . .
lowQualScore : 111 4 4 22222 22 4 7 999999 4 7777 2 5555 2 2 11 2 11 2 888888888 4 888 5 44 5 77 5555 9 9 7
consensus : AAATTGAA---A-CTC-CCCAGA-----AAACA--GAAA-A-TTTA-----AA-T----TCT-AGTTA---CA-AC-AATCA--AT-CCAT--AG-TGTTCA-------TNAAA-A---GCTT-T--TCTTG-TGTGCT-CAAGT--AAAA-G-GAACA-TTGAAAAAA
Reference ( gi|124226 ) : AAATTGAA---A-CTC-CCCAGA-----AAACA--GAAA-A-TTTA-----AA-T----TCT-AGTTA---CA-AC-AATCA--AT-CCAT--AG-TGTTCA-------TTAAA-A---GCTT-T--TCTTG-TGTGCT-TAAGT--ATAA-G-GAACA-TTGAAAAAA
gi|124227 : AAATTGAA---A-CTC-CCCAGA-----AAACA--GAAA-A-TTTA-----AA-T----TCT-AGTTA---CA-AC-AATCA--AT-CCAT--AG-TGTCCA-------TTAAA-A---GCTT-T--TCTTG-TGTGCT-TAAGT--ATAA-G-GAACA-TTGGGAA
gi|124228 : AAATTGAA---A-CTC-CCCAGA-----AAACA--GAAA-A-TTTA-----AA-T----TCT-AGTTA---CA-AC-AATCA--AT-CCAT--AG-TCCTCA-------TCAAA-A---GCTT-T--TCTTG-CGTGCT-CAAGC--AAAA-G-GAACA-TTGAAAAAA
gi|124229 : AAATTGAA---A-CTC-CCCAGA-----AAACA--GGAA-A-TTTA-----TA-T----TCT-AGTTA---CA-AA-AATCA--AT-CCAT--AG-TCTTCA-------TTAAA-A---GCTT-T--TCTTG-TGTGCT-CAAGT--AAAA-G-GAACA-TTGAAAAAA
gi|124230 : AAATTGAA---A-CTC-TCCAGA-----AAACG--GAAA-A-TTTA-----GA-T----TCT-AGTTA---CA-AC-AATCA--AT-CCAT--AG-TGTTAA-------AAAAA-A---GCTT-T--TCTTG-TGTGCT-CAAGT--AAAA-G-GAACA-TTTAAAAAA
gi|124231 : AAATTGAA---A-CTC-CCCAGA-----AAACA--GAAA-G-TTTT-----AA-T----TCT-AGTTA---CA-AC-AATCA--AT-CCAT--AA--GTTCA--------TAAA-A---GCTT-T--TCTTG-TTTGCT-CAAGT--AAAA-G-GAACA-TCGAAAAAA
gi|124232 : AAATTGAA---AACTCTCCCAGA-----AAACA--GAAA-A-TTTA-----AG-T----TCT-ACTTA---CA-A--AATCA--AT-CCAT--AGTTGTTCA-------TTAAA-G---CTTT-T--TCTTG-CGTGCTGCAAGT--AAAA-G-GAACA-TTGAAAAAA
gi|124233 : AAATTAAA---A-AAT-TCCAGA-----AAACG--GAAA-A-TTTA-----TA-T----TCT-AGTTA---CA-AG-AATCA--AT-CCAT--AG-TGTTCA-------AAAAA-A---GCTT-T--TCTTG-TGTACT-CAAGT--AAAA-G-GAACA-TTGAAACAA
gi|124234 : AAAATGGA---A-CTC-CCCTGA-----AAACA--GAAA-A-TTTA-----AA-T----TCT-AGTTA---AC-AC-AATCA--GA-CCAT--AG-TGTTC----------AAA-ATATACTT-T--TCTTG-TGTGCA-CAAGT--AAAA-G-GAACA-TTGAAAAAA
gi|124235 : AAATTGAA---A-CTC-CCCAGA-----AAACG--GAAA-A-TT-A-----AA-T----TCT-AATTA---CA-AC-AATCA--AT-CCAT--AG-TGTTCA-------TTAAA-
gi|124236 : AAATTGAA---A--TC-CCCAG------AAACA--GAAA-ATTTTA-----AATT----TCT-AGTTA---AC-AC-AATTA--GA-CCAT--TA-TGTTCC-------AAAAA-A---AC-T-T--TCTTG-TGTGCG-CAAGTA-AGAA-G-AAACATTTGAAAAAA
gi|124237 : AAATTGAA---C-CTT-TCCAGA-----AAACG--GAAA-A-TTTA-----CA-T----TCT-AGTTA---AA-TC-AATTA--AT-TCAT--AG-TGTTAA--------AAAA-A---ACTT------GTA-TGTGCT-CCAGT--A
gi|124240 : AAATTAAA---A-CTC-TCCAGA------AACA--AGAA-A-TTGATTCTTAA-C----CCT-AGTTG---AA-AC-AAACC--AT-TCAT--AG-TTTTC----------AAA-A---GCTT-T----TTGTTGTGC--TAAAT--TGAA-G-TAACT-TTGAAAAaa
gi|124239 : AAATTGAA---A-CTC-TTCATA-----AAGGA--AAAA-A-ATTG-----CA-T----TCT-AGCTA---TA-AC-AATCT--AT-CCAT--AG-TTTTCA--------GAAA-G---GCTC-T--TTAGA-TGT-TT-TCAGTTAAT-A-G-AAACT-TTGGAAAAA
gi|124238 : AAATTAAA---A-CTC-C--AGA-----AAA------AA-A-TGCG--------T----TCT-AGTTG---AA-AC-AACCA--AT-CCAT--AG-TTTTCATAACTTTTCAAA-AAT-GCTT-T--TTGGG-TGTGCT-CATTT--AATA-G-GAACT-TTGAAAAAA
gi|124241 : AAATTAAA---A-CTC-TCCAGA-----AAA-A--GAAA-A----A-----AA-TGCATTCT-AGTTG---AA-TC-AACCA--AT-GTAT--AG-TTTTCA---------AAACA---GCTT-T----TTG-GGTG
gi|124242 : AAATTGAATAAA-CTT-CC-AGATTCCAAGACATTGAAATACTTTA-----AA-T----TCTTAGTTATTACAGACTAATCACAATACCATTAAG-TGTTTACATG---TTAAA-T---GCTTATAATCTTG-TGTGCC-CAAG---AAAA-T-GACTATTTGAAAAAA
gi|124243 : ATTGAC---A-CTC-TTCAAAT----AAGGA--AACA-A-ATTG-----CA-T----TGT-AGTCA---AA-AC-AACCA--AT-CCAT--AG-TTTTCA--------AAAA-A---GTTT-T--TCAC--TGTACT-C-AGT---TAATGCGAACT-TTGACAAA
gi|124244 : ----TCC-AGTTA---CA-AC-AATCA--AT-CCAT--AG-TGTTCA-------TT
Alignments
lowQualScore : 111111
lowQualScore : 333 2 2 77777 33 2 4 777777 2 4444 2 3333 2 2 22 2 22 2 666666 666666 444 2 33 2 2 2 5
lowQualScore : ... . . ..... .. . . ...... . .... . .... . . .. . .. . ...... ...... ... . .. . . . .
lowQualScore : 999 2 2 88888 11 2 4 000000 2 5555 1 7777 1 1 99 1 99 1 555555 444444 111 4 22 4 5 5 3
consensus : AAATTGAA---A-CTC-CCCAGA-----AAACA--GAAA-A-TTTA-----AA-T----TCT-AGTTA---CA-AC-AATCA--AT-CCAT--AG-TGTTCA----TNA------AAA---GCTT-T--TCTTG-TGTGCT-CAAGTAA-AAGGAACA-TTGAAAAAA
Reference ( family-873 ) : AAATTGAA---A-CTC-CCCAGA-----AAACA--GAAA-A-TTTA-----AA-T----TCT-AGTTA---CA-AC-AATCA--AT-CCAT--AG-TGTTCA----TNA------AAA---GCTT-T--TCTTG-TGTGCT-CAAGTAA-AAGGAACA-TTGAAAAAA
gi|124226 : AAATTGAA---A-CTC-CCCAGA-----AAACA--GAAA-A-TTTA-----AA-T----TCT-AGTTA---CA-AC-AATCA--AT-CCAT--AG-TGTTCA----TTA------AAA---GCTT-T--TCTTG-TGTGCT-TAAGTAT-AAGGAACA-TTGAAAAAA
gi|124227 : AAATTGAA---A-CTC-CCCAGA-----AAACA--GAAA-A-TTTA-----AA-T----TCT-AGTTA---CA-AC-AATCA--AT-CCAT--AG-TGTCCA----TTA------AAA---GCTT-T--TCTTG-TGTGCT-TAAGTAT-AAGGAACA-TTGGGAA
gi|124228 : AAATTGAA---A-CTC-CCCAGA-----AAACA--GAAA-A-TTTA-----AA-T----TCT-AGTTA---CA-AC-AATCA--AT-CCAT--AG-TCCTCA----TCA------AAA---GCTT-T--TCTTG-CGTGCT-CAAGCAA-AAGGAACA-TTGAAAAAA
gi|124229 : AAATTGAA---A-CTC-CCCAGA-----AAACA--GGAA-A-TTTA-----TA-T----TCT-AGTTA---CA-AA-AATCA--AT-CCAT--AG-TCTTCA----TTA------AAA---GCTT-T--TCTTG-TGTGCT-CAAGTAA-AAGGAACA-TTGAAAAAA
gi|124230 : AAATTGAA---A-CTC-TCCAGA-----AAACG--GAAA-A-TTTA-----GA-T----TCT-AGTTA---CA-AC-AATCA--AT-CCAT--AG-TGTTAA----AAA------AAA---GCTT-T--TCTTG-TGTGCT-CAAGTAA-AAGGAACA-TTTAAAAAA
gi|124231 : AAATTGAA---A-CTC-CCCAGA-----AAACA--GAAA-G-TTTT-----AA-T----TCT-AGTTA---CA-AC-AATCA--AT-CCAT--AA--GTTCA----T-A------AAA---GCTT-T--TCTTG-TTTGCT-CAAGTAA-AAGGAACA-TCGAAAAAA
gi|124232 : AAATTGAA---AACTCTCCCAGA-----AAACA--GAAA-A-TTTA-----AG-T----TCT-ACTTA---CA-A--AATCA--AT-CCAT--AGTTGTTCA----TTA------AAG---CTTT-T--TCTTG-CGTGCTGCAAGTAA-AAGGAACA-TTGAAAAAA
gi|124233 : AAATTAAA---A-AAT-TCCAGA-----AAACG--GAAA-A-TTTA-----TA-T----TCT-AGTTA---CA-AG-AATCA--AT-CCAT--AG-TGTTCA----AAA------AAA---GCTT-T--TCTTG-TGTACT-CAAGTAA-AAGGAACA-TTGAAACAA
gi|124234 : AAAATGGA---A-CTC-CCCTGA-----AAACA--GAAA-A-TTTA-----AA-T----TCT-AGTTA---AC-AC-AATCA--GA-CCAT--AG-TGTTCA----AAA------TAT---ACTT-T--TCTTG-TGTGCA-CAAGTAA-AAGGAACA-TTGAAAAAA
gi|124235 : AAATTGAA---A-CTC-CCCAGA-----AAACG--GAAA-A-TT-A-----AA-T----TCT-AATTA---CA-AC-AATCA--AT-CCAT--AG-TGTTCA----TTA------AA
gi|124236 : AAATTGAA---A--TC-CCCAG------AAACA--GAAA-ATTTTA-----AATT----TCT-AGTTA---AC-AC-AATTA--GA-CCAT--TA-TGTTCC----AAA------AAA---AC-T-T--TCTTG-TGTGCG-CAAGTAAGAAGAAACATTTGAAAAAA
gi|124237 : AAATTGAA---C-CTT-TCCAGA-----AAACG--GAAA-A-TTTA-----CA-T----TCT-AGTTA---AA-TC-AATTA--AT-TCAT--AG-TGTTAA-----AA------AAA---ACTT------GTA-TGTGCT-CCAGTAA-A
gi|124238 : AAATTAAA---A-CTC-C--AGA-----AAA------AA-A-TGCG--------T----TCT-AGTTG---AA-AC-AACCA--AT-CCAT--AG-TTTTCA----TAACTTTTCAAAAATGCTT-T--TTGGG-TGTGCT-CATTTAA-TAGGAACT-TTGAAAAAA
gi|124239 : AAATTGAA---A-CTC-TTCATA-----AAGGA--AAAA-A-ATTG-----CA-T----TCT-AGCTA---TA-AC-AATCT--AT-CCAT--AG-TTTTCA-----GA------AAG---GCTC-T--TTAGA-TGTTTT-CAGTTAA-TAGAAACT-TTGGAAAAA
gi|124240 : AAATTAAA---A-CTC-TCCAGA------AACA--AGAA-A-TTGATTCTTAA-C----CCT-AGTTG---AA-AC-AAACC--AT-TCAT--AG-TTTTC-------A------AAA---GCTT-T----TTGTTGTGCT--AAATTG-AAGTAACT-TTGAAAA
gi|124241 : AAATTAAA---A-CTC-TCCAGA-----AAA-A--GAAA-A----A-----AA-TGCATTCT-AGTTG---AA-TC-AACCA--AT-GTAT--AG-TTTTCA-----AA------ACA---GCTT-T----TTG-GGTG
gi|124242 : AAATTGAATAAA-CTT-CC-AGATTCCAAGACATTGAAATACTTTA-----AA-T----TCTTAGTTATTACAGACTAATCACAATACCATTAAG-TGTTTACATGTTA------AAT---GCTTATAATCTTG-TGTGCC-CAAG-AA-AATGACTATTTGAAAAAA
gi|124243 : ATTGAC---A-CTC-TTCAAAT----AAGGA--AACA-A-ATTG-----CA-T----TGT-AGTCA---AA-AC-AACCA--AT-CCAT--AG-TTTTCA-----AA------AAA---GTTT-T--TCAC--TGTACT-CAGTTAA-TGCGAACT-TTGACAAA
gi|124244 : ----TCC-AGTTA---CA-AC-AATCA--AT-CCAT--AG-TGTTCA----T
Alignments
lowQualScore : 111111
lowQualScore : 333 2 2 77777 33 2 4 777777 2 4444 2 3333 2 2 22 2 22 2 666666 666666 444 2 33 2 2 2 5
lowQualScore : ... . . ..... .. . . ...... . .... . .... . . .. . .. . ...... ...... ... . .. . . . .
lowQualScore : 999 2 2 88888 11 2 4 000000 2 5555 1 7777 1 1 99 1 99 1 555555 444444 111 4 22 4 5 5 3
consensus : AAATTGAA---A-CTC-CCCAGA-----AAACA--GAAA-A-TTTA-----AA-T----TCT-AGTTA---CA-AC-AATCA--AT-CCAT--AG-TGTTCA----TNA------AAA---GCTT-T--TCTTG-TGTGCT-CAAGTAA-AAGGAACA-TTGAAAAAA
Reference ( family-873 ) : AAATTGAA---A-CTC-CCCAGA-----AAACA--GAAA-A-TTTA-----AA-T----TCT-AGTTA---CA-AC-AATCA--AT-CCAT--AG-TGTTCA----TNA------AAA---GCTT-T--TCTTG-TGTGCT-CAAGTAA-AAGGAACA-TTGAAAAAA
gi|124226 : AAATTGAA---A-CTC-CCCAGA-----AAACA--GAAA-A-TTTA-----AA-T----TCT-AGTTA---CA-AC-AATCA--AT-CCAT--AG-TGTTCA----TTA------AAA---GCTT-T--TCTTG-TGTGCT-TAAGTAT-AAGGAACA-TTGAAAAAA
gi|124227 : AAATTGAA---A-CTC-CCCAGA-----AAACA--GAAA-A-TTTA-----AA-T----TCT-AGTTA---CA-AC-AATCA--AT-CCAT--AG-TGTCCA----TTA------AAA---GCTT-T--TCTTG-TGTGCT-TAAGTAT-AAGGAACA-TTGGGAA
gi|124228 : AAATTGAA---A-CTC-CCCAGA-----AAACA--GAAA-A-TTTA-----AA-T----TCT-AGTTA---CA-AC-AATCA--AT-CCAT--AG-TCCTCA----TCA------AAA---GCTT-T--TCTTG-CGTGCT-CAAGCAA-AAGGAACA-TTGAAAAAA
gi|124229 : AAATTGAA---A-CTC-CCCAGA-----AAACA--GGAA-A-TTTA-----TA-T----TCT-AGTTA---CA-AA-AATCA--AT-CCAT--AG-TCTTCA----TTA------AAA---GCTT-T--TCTTG-TGTGCT-CAAGTAA-AAGGAACA-TTGAAAAAA
gi|124230 : AAATTGAA---A-CTC-TCCAGA-----AAACG--GAAA-A-TTTA-----GA-T----TCT-AGTTA---CA-AC-AATCA--AT-CCAT--AG-TGTTAA----AAA------AAA---GCTT-T--TCTTG-TGTGCT-CAAGTAA-AAGGAACA-TTTAAAAAA
gi|124231 : AAATTGAA---A-CTC-CCCAGA-----AAACA--GAAA-G-TTTT-----AA-T----TCT-AGTTA---CA-AC-AATCA--AT-CCAT--AA--GTTCA----T-A------AAA---GCTT-T--TCTTG-TTTGCT-CAAGTAA-AAGGAACA-TCGAAAAAA
gi|124232 : AAATTGAA---AACTCTCCCAGA-----AAACA--GAAA-A-TTTA-----AG-T----TCT-ACTTA---CA-A--AATCA--AT-CCAT--AGTTGTTCA----TTA------AAG---CTTT-T--TCTTG-CGTGCTGCAAGTAA-AAGGAACA-TTGAAAAAA
gi|124233 : AAATTAAA---A-AAT-TCCAGA-----AAACG--GAAA-A-TTTA-----TA-T----TCT-AGTTA---CA-AG-AATCA--AT-CCAT--AG-TGTTCA----AAA------AAA---GCTT-T--TCTTG-TGTACT-CAAGTAA-AAGGAACA-TTGAAACAA
gi|124234 : AAAATGGA---A-CTC-CCCTGA-----AAACA--GAAA-A-TTTA-----AA-T----TCT-AGTTA---AC-AC-AATCA--GA-CCAT--AG-TGTTCA----AAA------TAT---ACTT-T--TCTTG-TGTGCA-CAAGTAA-AAGGAACA-TTGAAAAAA
gi|124235 : AAATTGAA---A-CTC-CCCAGA-----AAACG--GAAA-A-TT-A-----AA-T----TCT-AATTA---CA-AC-AATCA--AT-CCAT--AG-TGTTCA----TTA------AA
gi|124236 : AAATTGAA---A--TC-CCCAG------AAACA--GAAA-ATTTTA-----AATT----TCT-AGTTA---AC-AC-AATTA--GA-CCAT--TA-TGTTCC----AAA------AAA---AC-T-T--TCTTG-TGTGCG-CAAGTAAGAAGAAACATTTGAAAAAA
gi|124237 : AAATTGAA---C-CTT-TCCAGA-----AAACG--GAAA-A-TTTA-----CA-T----TCT-AGTTA---AA-TC-AATTA--AT-TCAT--AG-TGTTAA-----AA------AAA---ACTT------GTA-TGTGCT-CCAGTAA-A
gi|124238 : AAATTAAA---A-CTC-C--AGA-----AAA------AA-A-TGCG--------T----TCT-AGTTG---AA-AC-AACCA--AT-CCAT--AG-TTTTCA----TAACTTTTCAAAAATGCTT-T--TTGGG-TGTGCT-CATTTAA-TAGGAACT-TTGAAAAAA
gi|124239 : AAATTGAA---A-CTC-TTCATA-----AAGGA--AAAA-A-ATTG-----CA-T----TCT-AGCTA---TA-AC-AATCT--AT-CCAT--AG-TTTTCA-----GA------AAG---GCTC-T--TTAGA-TGTTTT-CAGTTAA-TAGAAACT-TTGGAAAAA
gi|124240 : AAATTAAA---A-CTC-TCCAGA------AACA--AGAA-A-TTGATTCTTAA-C----CCT-AGTTG---AA-AC-AAACC--AT-TCAT--AG-TTTTC-------A------AAA---GCTT-T----TTGTTGTGCT--AAATTG-AAGTAACT-TTGAAAA
gi|124241 : AAATTAAA---A-CTC-TCCAGA-----AAA-A--GAAA-A----A-----AA-TGCATTCT-AGTTG---AA-TC-AACCA--AT-GTAT--AG-TTTTCA-----AA------ACA---GCTT-T----TTG-GGTG
gi|124242 : AAATTGAATAAA-CTT-CC-AGATTCCAAGACATTGAAATACTTTA-----AA-T----TCTTAGTTATTACAGACTAATCACAATACCATTAAG-TGTTTACATGTTA------AAT---GCTTATAATCTTG-TGTGCC-CAAG-AA-AATGACTATTTGAAAAAA
gi|124243 : ATTGAC---A-CTC-TTCAAAT----AAGGA--AACA-A-ATTG-----CA-T----TGT-AGTCA---AA-AC-AACCA--AT-CCAT--AG-TTTTCA-----AA------AAA---GTTT-T--TCAC--TGTACT-CAGTTAA-TGCGAACT-TTGACAAA
gi|124244 : ----TCC-AGTTA---CA-AC-AATCA--AT-CCAT--AG-TGTTCA----T
blockSeqs : TAA A T TTCCA TT T T TTCTTA T GCAT T TTAC G T CA A TA T CATGTT CTTTTC AAT A AA T G G T
blockSeqs : . . . T . . C A . . . C . . . . . . TT . . . . . . . T
blockSeqs : . . . . . . . A . . . C . . . . . . TC . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . T . . . C . . . . . . TT . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . G . . . C . . . . . . AA . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . A . . . C . . . . . . TT . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . A . . . C . . . . . . AA . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . T . . . C . . . . . . AA . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . A . . . A . . . . . . TT . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . A . . . C . . . . . . AA . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . A . . . A . . . . . . TA . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . C . . . A . . . . . . T . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . C . . . A . . . . . . A . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . A . . . T . . . . . . G . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . A . . . A . . . . . . A . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . C . . . A . . . . . . A . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . A . . . . . . . .
blockSeqs : . . C . . . . . .
blockSeqCons :
originalCons : AAATTGAA---A-CTC-CCCAGA-----AAACA--GAAA-A-TTTA-----AA-T----TCT-AGTTA---CA-AC-AATCA--AT-CCAT--AG-TGTTCA----TNA------AAA---GCTT-T--TCTTG-TGTGCT-CAAGTAA-AAGGAACA-TTGAAAAAA
finalCons : AAATTGAA---A-CTC-CCCAGA-----AAACA--GAAA-A-TTTA-----AA-T----TCT-AGTTA---CA-AC-AATCA--AT-CCAT--AG-TGTTCA----TNA------AAA---GCTT-T--TCTTG-TGTGCT-CAAGTAA-AAGGAACA-TTGAAAAAA
Alignments
lowQualScore : 111111
lowQualScore : 333 2 2 77777 33 2 4 777777 2 4444 2 3333 2 2 22 2 22 2 666666 666666 444 2 33 2 2 2 5
lowQualScore : ... . . ..... .. . . ...... . .... . .... . . .. . .. . ...... ...... ... . .. . . . .
lowQualScore : 999 2 2 88888 11 2 4 000000 2 5555 1 7777 1 1 99 1 99 1 555555 444444 111 4 22 4 5 5 3
consensus : AAATTGAA---A-CTC-CCCAGA-----AAACA--GAAA-A-TTTA-----AA-T----TCT-AGTTA---CA-AC-AATCA--AT-CCAT--AG-TGTTCA----TNA------AAA---GCTT-T--TCTTG-TGTGCT-CAAGTAA-AAGGAACA-TTGAAAAAA
Reference ( family-873 ) : AAATTGAA---A-CTC-CCCAGA-----AAACA--GAAA-A-TTTA-----AA-T----TCT-AGTTA---CA-AC-AATCA--AT-CCAT--AG-TGTTCA----TNA------AAA---GCTT-T--TCTTG-TGTGCT-CAAGTAA-AAGGAACA-TTGAAAAAA
gi|124226 : AAATTGAA---A-CTC-CCCAGA-----AAACA--GAAA-A-TTTA-----AA-T----TCT-AGTTA---CA-AC-AATCA--AT-CCAT--AG-TGTTCA----TTA------AAA---GCTT-T--TCTTG-TGTGCT-TAAGTAT-AAGGAACA-TTGAAAAAA
gi|124227 : AAATTGAA---A-CTC-CCCAGA-----AAACA--GAAA-A-TTTA-----AA-T----TCT-AGTTA---CA-AC-AATCA--AT-CCAT--AG-TGTCCA----TTA------AAA---GCTT-T--TCTTG-TGTGCT-TAAGTAT-AAGGAACA-TTGGGAA
gi|124228 : AAATTGAA---A-CTC-CCCAGA-----AAACA--GAAA-A-TTTA-----AA-T----TCT-AGTTA---CA-AC-AATCA--AT-CCAT--AG-TCCTCA----TCA------AAA---GCTT-T--TCTTG-CGTGCT-CAAGCAA-AAGGAACA-TTGAAAAAA
gi|124229 : AAATTGAA---A-CTC-CCCAGA-----AAACA--GGAA-A-TTTA-----TA-T----TCT-AGTTA---CA-AA-AATCA--AT-CCAT--AG-TCTTCA----TTA------AAA---GCTT-T--TCTTG-TGTGCT-CAAGTAA-AAGGAACA-TTGAAAAAA
gi|124230 : AAATTGAA---A-CTC-TCCAGA-----AAACG--GAAA-A-TTTA-----GA-T----TCT-AGTTA---CA-AC-AATCA--AT-CCAT--AG-TGTTAA----AAA------AAA---GCTT-T--TCTTG-TGTGCT-CAAGTAA-AAGGAACA-TTTAAAAAA
gi|124231 : AAATTGAA---A-CTC-CCCAGA-----AAACA--GAAA-G-TTTT-----AA-T----TCT-AGTTA---CA-AC-AATCA--AT-CCAT--AA--GTTCA----T-A------AAA---GCTT-T--TCTTG-TTTGCT-CAAGTAA-AAGGAACA-TCGAAAAAA
gi|124232 : AAATTGAA---AACTCTCCCAGA-----AAACA--GAAA-A-TTTA-----AG-T----TCT-ACTTA---CA-A--AATCA--AT-CCAT--AGTTGTTCA----TTA------AAG---CTTT-T--TCTTG-CGTGCTGCAAGTAA-AAGGAACA-TTGAAAAAA
gi|124233 : AAATTAAA---A-AAT-TCCAGA-----AAACG--GAAA-A-TTTA-----TA-T----TCT-AGTTA---CA-AG-AATCA--AT-CCAT--AG-TGTTCA----AAA------AAA---GCTT-T--TCTTG-TGTACT-CAAGTAA-AAGGAACA-TTGAAACAA
gi|124234 : AAAATGGA---A-CTC-CCCTGA-----AAACA--GAAA-A-TTTA-----AA-T----TCT-AGTTA---AC-AC-AATCA--GA-CCAT--AG-TGTTCA----AAA------TAT---ACTT-T--TCTTG-TGTGCA-CAAGTAA-AAGGAACA-TTGAAAAAA
gi|124235 : AAATTGAA---A-CTC-CCCAGA-----AAACG--GAAA-A-TT-A-----AA-T----TCT-AATTA---CA-AC-AATCA--AT-CCAT--AG-TGTTCA----TTA------AA
gi|124236 : AAATTGAA---A--TC-CCCAG------AAACA--GAAA-ATTTTA-----AATT----TCT-AGTTA---AC-AC-AATTA--GA-CCAT--TA-TGTTCC----AAA------AAA---AC-T-T--TCTTG-TGTGCG-CAAGTAAGAAGAAACATTTGAAAAAA
gi|124237 : AAATTGAA---C-CTT-TCCAGA-----AAACG--GAAA-A-TTTA-----CA-T----TCT-AGTTA---AA-TC-AATTA--AT-TCAT--AG-TGTTAA-----AA------AAA---ACTT------GTA-TGTGCT-CCAGTAA-A
gi|124238 : AAATTAAA---A-CTC-C--AGA-----AAA------AA-A-TGCG--------T----TCT-AGTTG---AA-AC-AACCA--AT-CCAT--AG-TTTTCA----TAACTTTTCAAAAATGCTT-T--TTGGG-TGTGCT-CATTTAA-TAGGAACT-TTGAAAAAA
gi|124239 : AAATTGAA---A-CTC-TTCATA-----AAGGA--AAAA-A-ATTG-----CA-T----TCT-AGCTA---TA-AC-AATCT--AT-CCAT--AG-TTTTCA-----GA------AAG---GCTC-T--TTAGA-TGTTTT-CAGTTAA-TAGAAACT-TTGGAAAAA
gi|124240 : AAATTAAA---A-CTC-TCCAGA------AACA--AGAA-A-TTGATTCTTAA-C----CCT-AGTTG---AA-AC-AAACC--AT-TCAT--AG-TTTTC-------A------AAA---GCTT-T----TTGTTGTGCT--AAATTG-AAGTAACT-TTGAAAA
gi|124241 : AAATTAAA---A-CTC-TCCAGA-----AAA-A--GAAA-A----A-----AA-TGCATTCT-AGTTG---AA-TC-AACCA--AT-GTAT--AG-TTTTCA-----AA------ACA---GCTT-T----TTG-GGTG
gi|124242 : AAATTGAATAAA-CTT-CC-AGATTCCAAGACATTGAAATACTTTA-----AA-T----TCTTAGTTATTACAGACTAATCACAATACCATTAAG-TGTTTACATGTTA------AAT---GCTTATAATCTTG-TGTGCC-CAAG-AA-AATGACTATTTGAAAAAA
gi|124243 : ATTGAC---A-CTC-TTCAAAT----AAGGA--AACA-A-ATTG-----CA-T----TGT-AGTCA---AA-AC-AACCA--AT-CCAT--AG-TTTTCA-----AA------AAA---GTTT-T--TCAC--TGTACT-CAGTTAA-TGCGAACT-TTGACAAA
gi|124244 : ----TCC-AGTTA---CA-AC-AATCA--AT-CCAT--AG-TGTTCA----T