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Reference ( gi|40151 )        : TTGA-CATT-TG-------A-------CCT-------T-GA-----AAA-A------------AC--A-A-TA-GG-CAT-C-TT-CCT-C---T--CA-------T---C-A-TG---G--TG---A-T-C-AA--T---T---G-T--A-C-C--AA-GT-T-G-TA---AG-A-TCC--T-GG-A-GC-T-T-AC-G-G----T-T-CGG-TC-T-G-----T-A-T-----C----C---TG-CC---T-AC--A--AC-G--T-T--TT-C-G-TA-C--------T---AA-GT-G-A--C-AC--T----AC-G--A-TC-TT-G--AC-CTT
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gi|40162                      : TTAA-CCTT-TG-------A-------CCT-------T-CA-----AAA--------------AC--A-A-TA-GG-TGT-C-TT-ACT-T---T--CA-------T---C-A-TG---G--TG---A-T-C-AA--T---T---G-T--A-C-C--AA-GT-T-G-TA---AG-A-TCC--T-GG-A-GC-T-T-AC-G-G----T-T-CTG-TC-T-G-----T-A-T-----C----C---TG-CC---A-AC--A--A
gi|40204                      : TTGA-ACCT-CG-------A-------CCT-------T-GA-----AAA--------------AC--A-A-TA-GG-TGT-C-TT-CCT-T---T--CA-------T---C-A-TG---G--TG---A-T-CAAA--G---T---GCT--A-C-C--AA-GT-T-G-TA---TG-A---C--C-GG-A-GCAT-T-AC-G-GT---T-T-CAG-TC-TGG-----T-A-T-----C----C---CG-CC---T-AC--A--GC-GT-T-T--TT-C-C-TA-C--------T---AT-GT-A-A--C-AC--T----AC-G--G-AC-TT-G--AC-CTT
gi|40188                      : TTGA-ACTC-TG-------A-------CCT-------T-CA-----AGA-A-------------C--A-A-TA-GA-CAT-C-TT-CCT-C---T--TA-------T---C-A-TG---G--TG---A-T-T-AA--T---T---G-T--A-C-A--AA-GT-T-G-CA---AG-A-TCC--T-GG-A-GT-T-T-GC-G-G----T-T-CGG-TC-T-G-----T-A-T-----C----C---TG-CC---T-AC--A--Aggacct
gi|40212                      : TTGA-CCAC-TG-------A-------ACT-------T--------AAA-A------------AC--A-A-TA-GG-CAA-C-TT-CCT-T---T--CA-------T---C-G-TG---G--TG---A-T-T-AA--T---T---G-T--A-C-C--AA-GT-T-G-TA---AG-A-TCC--T-GG-A-GC-T-T-AC-G-G----T-T-TGG-TC-T-A-----C-A-T-----C----C---TG-CC---T-AC--A--A
gi|40182                      : TTGA-CCTC-CG-------A-------CCT-------T-CA-----AAA--------------AC--A-A-TA-GG-CGT-C-TT-CCT-T---T--CA-------C---C-A-TG---G--TG---A-T-C-AA--T---T---G-T--A-T-C--AA-GA-T-G-TA---AA-C-TCC--T-GG-A-GC-T-T-AC-G-G----T-T-CGG-TC-T-G-----T-A-T-----C----C---TG-CC---T-AT--A--
gi|40235                      : TTGA-CTTT-TG-------A-------CCT-------T-GA-----ACA-A-------------C--A-A-TA-GG-CAT-C-TT-TCA-C---T--CA-------T---A-A-TG---A--TG---A-T-A-AA--T---T---T-T--A-C-A--AA-GT-C-A-TA---AC-A-TCC--T-GG-A-GC-T-T-AT-G-G----C-T-CAG-TC-T-G-----T-A-T-----C----C---TG-CT---C-AC-----AT-T--T-T--TT-C-ATTA-C--------T---AA-GT-G-A--T-AC--T----TT-G--T-CT-TT-G--AC-CTT
gi|40201                      : TTGA-CCTT-TG-------A-------CCTCCGACC-T-GG-----AAA-A-----------------------------------CCT-T---T--CA-------T---C-A-TG---G--TG---A-T-C-AA--T---T---G-T--AGC-C--AA--T-T-G-TA---TG-A-TCC--T-GG-G-GC-T-T-AC-G-G----T-T-CGG-TC-T-G-----T-A-T-----C----C---CG-CC-----A---A--AC-G--T-T--TTCC-C-TA-C--------T---GACGT-G-A--C-AC--T----AC-G--A-CC-TT-G--AC-CTT
gi|40200                      : TTGAACACTCTG-------A-------CCT-------T-GA-----AAA-A------------A----------GG-TGT-C-T--CCT-----T--CA-------T---C---TT---G--TG---A-TTC-AA--T---T---G-T--A-C-C--AAAGT-T-G-TA---TG-A-TCC--T-GG-A-GC-T-T-ACGG-G----T-T-CGG--C-T-G-----T-A-T-----C----C---CG-CC---T-AC--A--AC----T-T--TT-C-C-TA-C--------TA--AA-GT-G-AACC-AC--TA---AC-G--A-CC-TT-G--AC-CTTtgacct
gi|40191                      : TTGG-CCTT-TG-------A-------CCT-------T-GT-----AAA-A-------------T--A-A-TA-GG-CAT-C-TT-C-------T--CA-------T---C-A-TG---G--TG---A-T-A-AA--A---C---A-T--A-A-C--AA-GT-T-G-TA---AG-A-TCC--T-GG-A-GC-T-T-AT-G-G----T-T-CTG-TC-T-G-----T-A-T-----C----T---T--CC---T-AC-----------T-T--T-------------------------GT-G-A--T-AC--T----AC-G--A-TC-TT-G--AC-CTTtgacct
gi|40211                      : TTGA-CTTT-TT-------T-------CCT-------T-GA-----AAA-A-------------C--A---TG-GG-CAT-C-TT-CCT-C---T--CT-------T---C-A-CG---G--TG---A-T-C-AA--C---T---G-C--A-C-C--AA-GT-T-G-TG---AG-A-GGT--T-GG-G-TA-T-T-GT-G-G----T-T-CAA-TC-T-G-----T-A-T-----C----C---TG-AC---T-AT--A--AC-G--T-T--TT-C-C-TA-C--------T---AA-GT-G-A--C-AC--T----Atgacct
gi|40226                      : TTGA-CCCTACG-------A-------CCT-------T-GA-----AAA-A-------------C--A-A-TA-GG-CAT-C-T--CCT-C---T--CA-------T---C-A-TG---G--AG---A-T-C-GA--TAACT---G-C--A-C-C--AA-GT-T-G-TA---AG-A-TCC--T-GG-A-GC-T-T-AT-ACG----T-T--AG-TC-T-G-----T-A-T-----CGCTGC---TG-CCTTTT-AC--ATCAC-A----T--TT-C-G-TATC--------T---AAGGT-G-A--C-AC--T----AC-G--T-GC-TT-C--AC-CTatacattgatcgtgaacct
gi|40242                      : TTGA-CCTC-CG-------A-------CCT-------T-GA-----AAA-A------------G---A-A-TA-CG-TAT-C-TT-CCT-C---T--CA-------T---C-A-TG---G--TG---A-T-T-AA--A---T---G-T--A-C-A--AA-GT-T-T-TA---AA-A-TCC--T-GG-A-GC-T-T-AC-A-G----T-T-TGG-TC-T-G-----T-A-T-----C----C---TG-CC---T-GC--A--Aatg
gi|40217                      : TTGA-CCAC-TG-------A-------CCT-------T-GA-----AAA-G-------------C--A-A-TA-CA-CAT-C-TT-CCT-T---T--CA-------T---C-A-TG---G--TG---A-T-C-AA--A---T---G-T--A-C-C--AA-GT-T-G-TA---AA-A-T-C--T-GG-A-AC-T-T-A--G-G----T-T-CAG-TA-T-G-----T-A-TGA---C----C---TG-CC---A-AT--A--AG-G--T-T--TT-C-C-TA-C--------T---TG-GT-G-A--A-AC--T----TT-G--A-CA-TG-G--AC-CT
gi|40243                      : TTGA-CCTT-TG-------A-------CTT-------T---------AA-A------------AC--A-G-TA-GG-CAT-C-GT-CCT-C---T--CA-------T---C-A-AG---G--TG---A-T-C-AA--A---T---G-A--A------AA-G----G-CA---AG-A-TCC--T-GC-A-GC-T-C-AC-A-G----T-T-TGG-TC-A-G-----T-A-T-----C----A---TG-CC---T-AC--A--AG-G--T-T--TT-C-C-TA-C--------T---AA-GT-G-A--T-GC--T----AG-A--A-CC-TT-A--Actgacct
gi|40225                      : TTGA-CCTC-CA-------A-------CCT-------T-GA-----AAA-A-------------T--A-A-TA-GG-CGT-C-TT-CCT-C---T--CA-------TA--C-A-TG---GTTTGC--ATT-C-AA--C---T-----T--A-C-C--AA-GT-T-GACA---TG-A-TCCTTT-GGCA-GC-T-T-AC-G-G----T-T-CAGTTC-T-G-----T-A-T-----C----C---CA-CC---TAAC--A--AT-G--T-T--TT-C-C-TA-C--------T---AA-GT-G-A--C-AC--T----A--G--A--C-CT-G--AC-CCT
gi|40214                      : TTGA-CCTT-TG-------A-------CCC-------C-GACCTTGAAA-A------------AC--A-A-CT-GG--AT-C-TT-CCT-G---T--CA-------A---C-A-TG---G--TG---A-T-C-AA--T---T-----T--A-C-C--AA-GTCT-G-TA---TG-A-TCC----GG-A-GC-T-T-AC-G-G----T-T-T-G-CC-T-------T-A-TTCTGCT----C---TG-CC---T-AC--A--AC-G--T-T--TT-C-C-TA----------T---AG-AG-G-A--C-AC--T----AC-G--ACTC-TT-G--AC-CTTttgactt
gi|40230                      : TTGA-GCTT-TG-------T-------CCT-------T-GA-----AAA-A-------------C--A-A-GA-GG-CAT-C-TT-CCT-C---T--CA-------T---A-A-GG---G--TG---A-T-C-AA----------A-T--A-T-C----------G-TA---AG-A-TCC--T-GG-A-GC-T-T-AC-A-G----T-T-CGG-TC-T-C-----T-A-T-----C------------------------------------TT-C-C-TA-C--------T---AT-GT-G-A--T-AC--T----AT-G--A-CC-TT-G--AC-CTTtatcct
gi|40155                      : TTGAACCTC-CG-------A-------CCT-------T-CA-----AAA--------------AC--A-A-TA-GG-CAT-C-TT-CCT-C---T--CA-------T---C-A-TG---G--TG---A-T-C-AA--T---T---G-T--A-C-G--AA-GT-T-G-T-------A-TCC--T-G--------------------------------------------------------------CC---T-AA--A--AC-G--T-T--TT-C-C-TC-C--------T---AC-GT-G-A--C-AA--T----AC-G--A-CC-TT-G--AC-CTTtgacct
gi|40297                      :  TGA-CCTT-TG-------A-------CCT-------T-GC-----AAA-A------------AC--A-A-TA-GG-TAT-C-TT-CCT-C---T--TA-------T---C-A-TG---G--TA---A-T-T-AA--C---T---G-T--A-C-C--AA-GT-T-G-TA---AT-A-TCC--T-GG-G-TC-T-T-GC-G-G----T-T-TGG-TC-T-G-----T-A-T-----C----C---TG-CC---T-AT--A--CC-A--T-T--TT-C-C-TA-C--------T---GA-TT-G-C--A-AA--T----AC-G--A-CC-TT-A--AC-TTTtgacct
gi|40301                      :  TGA-CCTT-TG-------A-------CCT-------T-GG-----AAA-A-------------C--A-A-TA-GG-CAT-C-TT-CCT-C---T--GA-------T---C-A-TG---G--TG---A-T-C-AA--T---T---G-T--A-T-C--AA-GT-T-T-TA---AT-A-TCC--T-GG-A-GC-T-T-AC-A-G----T-T-TAG-TC-T-G-----C-A-T-----C----T---TG-CC---T-AC--G--A-------T--TT-C-C-TA-CTATTAAATT---AA-GT-G-A--T-AT--T----AC-G--A-CT-TT-G--AC-CTTgatct
gi|40312                      :   GA-CCTC-TG-------A-------CCT-------T-CA-----AAA--------------AC--A-A-TA-GG-CAT-C-TT-ACT-C---T--CA-------T---C-A-TG---G--TA---A-T-C-AA--A---A---G-T--A-C-C--AA-GC-T-A-TA---AT-T-TCC--T-GG-A-AC-T-T-AC-A-G----T-T-CAG-TT-T-G-----C-A-T-----C----T---TG-CC---T-AC--A--AC-G--T-T--TT-C------C--------A---AA-GT-G-A--T-ATTAT----AT-G--A-CC-TT-G--AC-CTT
gi|40315                      :   GA-CCTT-GG-------AA------CCT-------T-TG-----AAA-A------------AC--A-A-TA-GG-CAT-C-TT-CCTTC---T--CAA------C---C-A-TG---G--T----A-T-C-AA--T---T---G-TCAA-C-C--AA-GTGT-T-TA---CG-A-TTC--TTGG-A-GC-T-T-TT-G-G----T-T-CGG-TC-T-G-----T-A-T-----C----C---CG-CC---T-AC--A--AC-G--T-T--TT-T-C-TA-C--------T---AC-GT-T-A--C-AC--T----AT-G--A-CC-TT-G--Atgatct
gi|40314                      :  gGA-CCTC-TG-------A-------CCT-------T-GG-----AAA-A-------------C--A-T-TA-GG-CAT-C-TT-TAT-C---T--CA-------T---C-A-TG---A--TG---A-T-C-AA--A---T---A-T--A-C-C--AA-GT-T-G-TA---TG-A-TCC--T-GG-A-GC-T-T-TC-A-G----T-T-TGG-TC-T-G-----C-A-T-----C----C---TG-CC---T-AC--A--A
gi|40361                      :        TT-TG-------A-------CCT-------T-GA-----AAA-A--------------------CA-GG-CAT-C-TT-TCT-C---T--CA-------T---C-A-TG---G--TG---A-T-C-AA--T---T---G-T--A-C-C--AA-GT-T-G-TA---AG-A-TCC--T-GG-A-GC-T-T-AC-A-G----T-T-CAG-TC-T-G-----T-A-T-----C----C---CG-CC---T-AC--A--AC-G--G-T--TT-C-C-TA-C--------T---AA-GT-G-A--C-AC--T----AC-G--A-CC-TT-G--AC-CTT
gi|40325                      :       cTT-TG-------A-------CCT-------T-GA-----AAA---------------T--A-A-TA-GG-CAT-C-TT-CCT-C---T--CA-------T---C-A-TG---A--TG---A-T-C-AA--T---T---G-T--A-C-C--AA-GT-T-G-TA---AG-A-TTC--T-GG-A-GC-T-T-AC-G-G----T-T-CAG-TC-T-T-----T-A-T-----C----C---TG-CC---T-AC--A--GT-G--T-T--TT-C-C-TA-C--------T---AA-GT-G-A--C-AC--T----AC-G--G-CC-TT-G--AC-CTTtaacct
gi|40334                      :      acTT-TG-------A-------CCT-------T-GA-----AAA-A-------------T--A-A-TA-GG-CAA-C-TT-CCT-C---T--CA-------C---C-A-TG---G--TG---A-T-C-AA--T---T---G-T--A-C-C--AA-GT-T-G-TA---AG-A-TCC--T-GG-A-GC-T-T-AC-G-G----T-T-CAG-TG-T-G-----T-A-T-----C----C---TG-CC---T-AC--A------------------------------------AA-GT-G-A--C-AC--T----AC-G--A-TC-TT-G--AC-CTTtgacct
gi|40337                      :      acTT-TG-------A-------CCT-------T-GA-----AAA---------------C--A-A-TA-GG-CAT-C-TT-CCT-T---T--CA-------T---T-A-TG---G--TA---AAT-C-AA--T---T---G-T--A-C-C--AA-GT-T-G-T-----G-A-TCT--T-G--A-GC-T-A-AT-G-A----T-T-CGG-TC-T-G-----T-A-T-----C----C---TG-CC---C-AC--A--AC-G--T-T--TTAC-G--A-C--------T---AA-GT-G-A--C-AC--T----AC-G--A-CC-TT-G--AC-CTTttacct
gi|40319                      :      acTT-TG-------A-------TCT-------T-CA-----AAA--------------AC--A-A-TA-GG-CAT-C-TT-CCT-C---T--CA-------T---C-A-TG---G--TG---A-T-C-AA--C---T---G-T--A-T-C--AA-GT-T-G-TA---AA-A-TTC--T-TG-A-GC-T-A-AT-G-G----T-T-CAG-TC-T-G-----T-A-T-----C----C---TG-CC---T-AC--A--AC-A--T-T--TT-C-C-TA-C--------T---TA-AT-G-A--T-AC--T----AT-G--A-CC-TT-G--AC-ATTcgacct
gi|40338                      :     aacTT-TG-------A-------CCT-------T-GA-----AAA-A-------------C--A-AGTT-GG-TGT-C-TT-CCT-T---T--CA-------T---C-A-TT---G--T----A-T-C-AA--T---T---G-T--A-C-C--AA-GT-T-G-TA---TG-A-TTC--C-TG-A-GC-T-T-AC-G-G----T-T-CGG-TC-T-G-----T-A-T-----C----C---CG-CC---T-AC--A--GC-G--T-T--TT-C-C-TA-C--------T---AA-GT-G-A--C-AC--T----AC-G--A--C-TT-G--AC-TT
gi|40346                      :      acTT-TG-------A-------CCT-------T-CA-----AAA--------------AC--A-A-TA-GG-CAT-C-TT-CCT-C---T--CA-------T---C-A-TG---G--TG---A-T-C-AA--C---T---G-T--A-C-C--AA-GT-T-G-CA---AG-A-TTC--T-GA-A-GC-T-T-AC-T-G----T-T-CGG-TC-T-G-----T-A-T-----C----C---TG-GC---T-AC--A--Aga
gi|40344                      :      acTT-TG-------A-------CCT-------T-GA-----AAA-A------------CC--A-C-TA-GA-AAT-C-CT-CCT-T---T--TA-------T--------A---G--TG---A-T-C-AA--A---T---G-T--A-C-C--AT-AT-T-G-TA---AG-A-TGA--T-GG-A-GC-T-T-AC-G-G----T-T-TGG-TC-T-G-----T-A-T-----C----C---TG-CC---T-AC--A--AG-G--T-T--TT-T-C-TA-C--------C---AA-GT-A-A--T-AT--T----AC-A--A-CA-TT-G--AC-CTT
gi|40350                      :      acTT-TG-------G-------CCT-------T-GA-----AAA---------------C--G-A-TAAGG-TGT-C-TT-CCT-T---T--CA-------T---T-AATG---G--T----A-T-C-AA--T---T---G-T--A-C-C--AA-GT-T-GTTA---CGCA-TCC--T-GA-A-GC-T-T-AC-A-G------T-CGG-TC-T-G-----T-A-T-----C----C---CGTTC---T-AC--A--ACGG--TGT--TT-C-C-TA-C--------T---AA-CT-G-A--C-AC--TTA--AT-G--A-CC-TT-G--AC-GTTtgacct
gi|40370                      :      acTT-TG-------A-------C-T-------T-GA-----AAA-A------------ACCCA-A--A-GG-CGT-C-TT-CAT-C------CA-------T---C-A-TG------TG---A-TTC-AA--T---TCATG-T--A-C-T--AA-GT-TAG-TA---AG-A-TCC--T-GG-A-GC-T-T-ACAG-A----T-T-CGGTTC-T-G-----T-A-T----------C---TG-CC---T--------AC-G--T-T--TT-C-C-TA-T--------T---AA-GT-G-A--CTAC--T----AC-G--A-CC-TT-tgccc
gi|40327                      :        cT-TG-------A-------CAT-------T-GA-----AAA--------------AC--A-A-TA-GG-CGT-C-TT-CTT-T---T--CA-------T---C-A-TG---G--TG---A-T-C-AA--T---T---G-T--G-C-C--AA-GT-T-G-TA---AG-A-TCC--T-GG-A-GC-T-T-AC-G-G----T-T-CGG-TC-T-A-----T-G-T-----C----C---TG-CC---T-TC--A--AC-G--T-T--TT-T-C-TA-C--------T---AA-GT-G-A--C-AC--T----AT-G--A-CA-TT-G--AC-CTTcgtttttagcct
gi|40330                      :      accT-TG-------A-------CCT-------T-GA-----AAA-A------------AA--C-A-TA-GG-TGT-C-TT-TCT-C---T--CA-------T---C-A-TG---G--TG---A-T-C-AA--T---T---G-T--A-C-C--AA-GT-T-G-TA---AG-A-TCC--C-GG-A-GA-G-T-AC-G-G----T-T-CGG-TC-T-A-----T-A-T-----C----C---TG-CC---T-AC--A--AC-G--T-T--TT-C-C-TT-C--------T---AA-GT-G-A--C-TC--T----AC-G--A-AC-TT-G--AC-CTtgatct
gi|40333                      :      accT-TG-------A-------CCT-------T-GA-----AAA-A------------AC--A-A-TA-AG-CAT-C-TT-CCT-C---T--AA-------C---C-A-TG---G--TA---A-T-C-AA--C---T---G-T--A-C-C--AA-GA-A-A-TA---AT-A-TCC--T-GT-A-GC-T-T-AC-G-G----T-T-AAG-TC-T-G-----T-A-T-----C----C---TA-CC---T-AC--A--AC-A--T-T--TT-C-C-TA-C--------T---AA-GT-G-A--C-AC--T----AC-G--A-CT-TT-G--AC-CTTctgacct
gi|40335                      :      accT-TG-------A-------CCT-------T-GA-----AAA--------------AC--A-A-TA-GG-CGT-C-TT-CCT-T---T--CA-------T---C-A-TG---G--GG---A-T-T-AA--T---T---G-T--A-C-C--AA-GT-T-T-TA---AG-A-TCC--T-GG-A-GC-T-T-AC-A-----------GG-TC-T-G-----T-A-T-----C----C---TG-CC---T-AT--A--AC-G--T-T--TC-C-C-TA-C--------T---AA-GT-G-A--T-AC--T----AC-G--A-CC-TT-G--Aaaatgacc
gi|40386                      :      accT-TG-------A-------CCT-------T-GA-----AAAAA------------AC--A-A-TA-GG-CAT-C-TT-CCT-C---T--CA-------T-------TG---G--TG---A-T-C-AAATT---T---G-T--A-C-CA-AA-GT-T-G-TA---AG-A-TCC--T-GG-A-GC-T-A-AT---G----T-T-CGG-TC-T-G-----T-A-T-----C----C----G-CC---T-AC--A--------T-T--TT-C---CA-C--------T----A-GT-G-A--C-AC--T----AC-G--A-CC-TT-G--AC-CTT
gi|40341                      :         T-TG-------AT------CCT-------T-GA-----AAAAA------------AC--A-A-TA-GG-TAT-C-TT-CCT-C---T--TA-------T---C-A-TG---A--TG---A-T-C-AA--A---T---G-T--A-C-T--AA-GC-T-G-CA---AG-A-TCA--T-GG-A-GC-T-T-AT-G-G----T-T-CGA-TC-T-G-----T-A-T-----T----G---TG-CC---C-AC--A--------T-T--TT-T-C-TA-C--------T---AA-GC-G-A--T-AC--T----AT-G--A-CC-TT-G--AC-CTTtaactt
gi|40339                      :      accT-TG-------A-------CCT-------T-CA-----AAA-A-------------C--G-A-TA-GG-CGT-C-GT-GAT-CAATT--CAAAAACGATAGGC-G-TC---G--TG---A-T-C-AA--T---T---G-C--A-T-G--AA-GT-T-G-TA---AG-A-TCC--T-GG-A-GC-T-T-AC-G-G----T-T-TGG-TC-T-G-----T-A-T-----C----C---TG-CC---T-AC--A--AC-G--T-T--TT-C-C-TA-C--------T---AA-GT-G-A--C-AC--T----AC-G--A-CC-TT-G--AA-CTT
gi|40328                      :      accT-TG-------A-------CCT-------TTGA-----AAA---------------C--A-A-TA-GG-CGC-C-TT-CCT-C---T--CA-------T---C-A-TG---G--TG---A-T-C-AA--T---T---G-T--A-C-C--AA-GT-T-G-TA---AA-C-TCC--T-GG-A-GC-T-T-AC-G-G----T-T-CAG-TC-T-G-----T-A-T-----C----A---TG-CC---T-AC--A--Atgacct
gi|40384                      :      accT-TG-------A-------CCT-------T-GA-----AAA-T-------------C--A-A-TA-AG-CAT-C-TT-CCT-A---T--CA-------T---C-A-TG---G--TG---A-T-C-AA--C---T---G-T--A-C-C--AA-GT-T-G-TA---TA-A-ACC--T-GG-A-CC-T-T-AC-G-G----T-T-CAG-TC-T-G-----T-A-T-----C----T---TG-CC---T-AC--A--AC-G--T-T--TT-G-C-TA-T--------T---NG-GT-
gi|40391                      :         T-TG-------A-------CCT----------A-----AAA-A------------GC--A-A-T--GG-CAT-C-T--CCT-C---T--CA-------T---C-A-TG---G--TG---A-T-C-AA------T---G-A--A-C-C--AA-AT-T-G-TA---AG-A--CC--T--G-A-GC-T-A-AT-G-G----T-T-C-G-TC-T-G-----T-A-T-----C----C---TGACC---T-AC--A--AC-G--C-T--TC-C---T--C--------T---AA-GT-G-A--C-AC--T----AC-G--A-GC-AT-G--AC-CTtcagtctgtatcctgcctacaacgttttgctattagtgactacgaccttgacctttgacct
gi|40385                      :         T-TG-------A-------C-T-------T-GA-----AAA--------------AC--A-A-TA-GG-CGT-T-CT-CCT-T---T--CA-------T---C-T-TG---G--TG---A-T-C-AA--T---T---G-T--A-C-C--AA-GT-T-G-TA---CG-A-TCC--T-GG-A-G--T-T-A--G-G----T-T-CGT-TC-T-G-----T-A-T-----C----C---CG-CC---T-AC--A-----G--C-T--TT-C-C-TA-C--------T---AG-CG-G-A--C-AC--T----AT-C--A-CG-CT-G--AC-CTTacaacct
gi|40340                      :         T-TG-------A-------CCT-------T-AAG----AAA-A------------AC--A-A-TG-AG-CAT-C-T--CCT-C---T--CA-------T---A-A-TG---G--TG---A-T-C-AA--A---T---G-T--A-A-G--AA-GT-A-G-TA---AG-A-TCC--T-GG-A-GC-T-T-AT-G-A----T-T-CGG-TC-T-G-----T-A-T-----C----C---TG-TC---T-A---A-----G--T-C--CT-C-C-TA-C--------TACCAA-GT-G-A--T-AT--T----AC-A--A-CC-TT-G--A
gi|40329                      :      accT-TG-------A-------C-T-------T-GA-----AAA-A------------AC----A-TA-GG-CAT-C-TT-TCT-CT--T--CA-------T---C-A-TG---G--TA---A-T-T-AA--C---T---G-T--A-C-C--AA-GT-T-G-TA---A--A-TCC--T-GG-G-TC-T-T-GC-G-G----T-T-CAG-TC-T-G-----T-G-G-----C----C---CA-CC---T-AC--A--AT-G--T-T--TC-C---T--C--------T---AA-GT-G-A--C-A---T----AC-A--A-CC-T-----AC-CT
gi|40326                      :      accT-TG-------A-------CCT-------T-CA-----ATA-A-------------C--A-A-TA-GG-CAT-C-TT-CCT-C---T--TG-------T---C-A-TG---G--TG---A-T---GA--T---T---G-T--A-C-C--AA-GT-G-T-TA---AG-A-TCT--T-GG-A-GC-T-T-AC-G-G----T-T-CGG-TC-T-G-----T-A-T-----C----C---TG-TC---T-AC--A--Aattgacc
gi|40399                      :       acc-TG-------A-------TCT-------T-GA-----CAA-A------------AC--A-A-TA-GG-CAT-C-TT-CCT-C---T--CA-------T-----A-TA---A--TG---A------A--C---T---G-T--A-T-C--AA-GT-T-G-TA---AG-A-CCC--T-GG-G-TG-T-T-GT-G-G----T-T-CGG-TC-T-G-----C-A-T-----C----C---TG-CC---T-AT--A--AC-G--T-T--TT-C-C-TA-C--------T---AA-GT-G-A--C-AC--T----AC-G--A-CC-TT-G--AC-CTT
gi|40398                      :          -TG-------A-------CCT-------T-GA-----AAA---------------C--A-A-TA-GG-TGTGC-TT-CCT-T---T--C--------T---C-A-TG---G--TG---A-T-C-AA--T---T---G-T--A-C-C--AA-GT-T-G-TA---TG-A--CC--T-GG-A-GC-T-T-AC-G-G----T-T-CGG-TC-T-G-----T-A-T-----C----C------CC---T-AC--A--GC-G--T-T--TT-CTC-TA-C--------T---AC-GT-G-A--C-AC--T----AC-G--A--C-TT-G--AC-CTT
gi|40369                      :          -TG-------A-------CCT-------T-GA-----AAA-G-------------C--A-A-TA-GG-CAT-C-TT-CCT-C---T--CC-------A---A-A-TG---G--TG---A-T-C-AA--A---T---G-T--A-C-T--AA-AT-T-G-TG---CG-A-TCC--T-GG-A-GC-T-T-AT-G-G----T-T-TTG-TC-T-G-----T-A-T-----T----G---TG-CC---C-A---A--AT-G--T-T--TT-C-T-GA-C--------T---AA-AT-G-A--------T----AC-G--A-CC-TT-G--AC-CTTtgacct
gi|40332                      :         ctaG-------A-------CCT-------T--A-----AAA-A------------AT--T-A-TA-GG-CCT-C-TT-CCG-T---T--CA-------T---C-A-TG---G--TG---A-T-C-AA--T---T---G-T--A-C-C--AA-GT-T-G-TA---AA-A-TCC--T-GG-A-GC-T-T-AC-G-G----T-T-TGG-TG-T-G-----T-A-T-----C----C---TG-CC---T-AC--A--AT-G--G-T--TT-C-C-TA-C--------T---AA-GT-G-A--C-AC--T----AC-G--A-CC-TT-G--AC-CTT
gi|40366                      :       accccG-------A-------CCT-------T-CG-----AAA-A------------AC--A-A-TA-CG-TGT-C-TT-CCC-T---T--CA-------T---C-A-TATGAG--TG---A-T-C-AA--T---T---G-T--AAC-C--AA-GT-T-G-TA---TG-A-TCC--T-GG-A-GC-T-T-AC-G-G----T-T-CGG-GCGTAG-----T-A-T-----C----C---CG-CC---T-AC-----AC-G--T-T--TT-CTT-TA-C--------T---AC-GT-G-A--C-AC--T----AC-G--A-CC-TTAG--AC-CTTtgccct
gi|40405                      :        ctccG-------A-------CCT-------T-CA-----AAA-A------------CT--A-A-AA-GG-C-----TT-CAT-C---T--CA-------T---C-A-TG---G--TG---A-T-C-GA--T---T---G-T--A-C-C--AA-GT-T-G-CA---AG-A-TCC--T-GG-A-GC-T-T-AT-G-G----T-T-CAG-TC-T-G-----T-A-T-----C----C---TG-CC---T-AT--A--------T-T--TT-C-C-TA-C--------G---GA-GT-G-A--C-AG--T----AT-G--A-CC-TT-G--GC-ATTtga
gi|40404                      :            G-------A-------CCT-------C-GGC----AAA-A------------AC--G---TA-GG-CAT-C-TC-C-------T--CA-------T---C-A-TG---G--TG---A-T-C-AA--T---T---G-T--A-C-A--AA-GT---G-TA---AG-A-TCC--T-GG---GC-T-T-AC-T-G----T-T-CGG-GC---G-----T-A-T-----C----C---TGGCC---T-AC--A--AT-G--T-T--TC-C-C-TA-C--------T---AA-GT-G-A--C-AC--T----AC-GCAA-CC-TT-G--AC-CTTtgacc
gi|40210                      :             -------A-------CCT-------T-CA-----AAA-A-------------C--A-A-TA-TG-CAT-C-TT-CCT-C---T--CA-------T---T-A-TG---G--TG---A-T-C-AA--T---C---G-T--A-T-C--AA-GT-T-G-TT---AA-A-TCC--T-GA-C-GC-T-T-AG-G-G----T-T-CGG-TC-T-G-----T-A-T-----T----C---TA-CC---A-GC--A--AC-G--T-T--TC-C---TA-C--------T---AA-AT-G-C--C-AC--T----AC-G--A-TC-TT-G--AC-ATTtgacct
gi|40409                      :   ttgatcgtga-------A-------CCT-------T-GA-----AAA--------------AC--A-A-TA-GG-CAT-C-TT-CCT-T---T--AA-------T---C-C-TG---G--TG---A-T-C-AA--T---T---G-T--A-C-T--AA-GT-T-G-TA---AA-A-TCC--T-GG-A-GC-T-T-AA-G-------------------G-----C-A-T-----T----C---TG-CC---T-AC--A--AT-G--T-T--TT-C-C-TA-T--------T---AA-GT-G-A--C-AC--TAC--AC-G--A-CC-TT-G--AC-CTTtgccct
gi|40306                      :             -------A-------CCT-------T-GA-----AAA-A------------AC--A-A-TA-GG-CCT-CATT-CCT-C---T--CA-------T---C-ATTG---G--TGTTTATT-C-AA--T---T---G-T--A-C-C--AA-GT-T-G-TA---A--A-TCC--T-GG-A-GC-T-T-AC-A-GAAAATAT-CGG-TC-T-GT----T-A-T----------C---TG-CC---T-AC--A--AC-G--T-TTATC-C-C-TA-C--------TGA-AA-GT-GCAC-C-AC--T----AC-G--A-CC-TT-G--AC-CTTtcacct
gi|40418                      :             tggactcc-------CCT-------T-GA-----AAA--------------AC--A-A-TA-GG-CAT-C-TT-CCT-C---T--CA-------T---C-A-TG---A--TG---A-T-C-AA--T---T---G-T--A-T-C--AA-GT-T-G-TA---TG-A-TCC--T-GG-A-GC-T-T-AC-G-G----T-T-CGG-TC-T-G-----T-A-T-----C----C---TA-CC---T-AC--A--AT-G--T-T--TC-C---TA-T--------T---AA-GT-G-A--C-AC--T----AT-G--A-CC-TT-GTCAC-CTTt
gi|40419                      :                     -------CCC-------T-GA-----AAA-A-------------C--A-A-TA-CT-CTC-C-TT-CCT-C---T--CC-------G---C-A-TG---G--TG---A-T-C-AA--T---T---G-T--A-C-C--AA-GT-T-G-TA---TA-A-TCC--T-GA-A-AC-T-T-GC-A-G----T-T-CAG-TC-T-G-----T-A-T-----C----C---CG-CC---T-AC--A--AT-G--T-T--TT-C-C-TA-C--------T---AA-GT-G-A--C-AC--T----AC-G--A-CC-TT-G--AC-CTTtgacct
gi|40421                      :                     -------CCT-------T-GA-----AAG-A------------AC--A-A-TA-GG-CAT-C-TT-CCT-C---T--CA-------A---C-A-TG---G--TG---A-T-C-AA--T---T---G-T--A-C-A--AA-TG-T-G-TA---AG-A-TCC--C-TG-A-GC-T-T-AC-G--------T-TAG-TC-TCT-----T-A-T-----C----T---GG-CC---T-AC--A--AC-G--T-T--CT-----TA-C--------TC--AA-GT-A-A--C-AC--T----AC----A-CC-TT-G--AC-CTTtgacct
gi|40303                      :                     -------CCT-------T-GA-----AAA-AG-----------AC--A-A-TA-G--TGT-C-TTTCCT-T---T--CA-------T---C-T-TG---G--TG---A-T-C-AA--T---T---G-T--A-C-C--TA-GT-T-G-TGTATGA-A-TCC--T-GG-A-GC-T-T-AC-G-G----T-T-CCG-TC-T-G-----C-A-T-----C----C----G-CC---T-ATCAA--AC-G--T-T--TC-C---TA-C--------TA--AA-GT-G-A--C-AC--T----AC----A-CC-TT-G--AC-CTTtgatct
gi|40218                      :          tgaaccttaac-------CTT-------T-GG-----AAA-A------------AC--A-A-TA-GG-CGT-C-TC-CTT-T---T--AA-------T---C-C-TG---G--TGA--A-T-C-AA--T---T---G-T--A-C-CAAAA-GT-T-A-TA---AG-A-TGC--T-GA-ACGC-T-T-AC-G-GT---T-T-TGG-TC-TGG-----T-ATT-----C----C---TG-CC---T--------AC-G--T-T--TT-C-C-TA-T--------T---AA-GTGG-A--CAAC--TCAGAAC-G--A-CC-TT-G--AC-CCTtga
gi|40411                      :                 ttggaccacaacCC-------T-GG-----AAA-A------------AC--A-A-TA-GA-CAT-C-TT-CCT-C---T--CG-------C---C-A-TG---G--TG---A-T-C-AA--T---T---G-T--A-C-C--AA-GT-T-G-TA---AG-A-TCC--T-T----GC-T-C-----------T-T-CGG-TC-T-G-----T-A-T-----C----CTAGTG-CC---T-AC--A--AT-C--T-T--TT-C-C-TA-C--------T---AA-GT-G-G--C-AC--T----ttgatc
gi|40437                      :                             aT-------T-GA-----AAA-A-------------C--T-A-TA-G--CAT-C-AT-CTT-C---T--TA-------T---C-A-TG---G--TG---A-T-CTAA--T---T---G-T--A-C-C--AA--T-T--------AA-A-TCC--T-GG-A-GC-T-T-AC-G-T----T-TATAG-TC-T-G-----TAA-T-----C----T---TGCCC---T-AC--A--AC-G--TGT--TT-C-T-TA-C--------T---AA-GT-C-A--C-AC--T----AC-G--A-CC-TT-G--AC-CTTttgtcctttgatttccgacct
gi|40422                      :                                          -----AAA-A------------AC--A-A-TG-GG-CAT-C-CT-CCT-C---T--CA-------T---C-A-TG---G--TG---A-T-C-AA--T---T---G-T--A-C-C--AA-GT-T-G-TG---AG-A-TCC--T-GG-A-GC-T-T-AC-G-G----C-T-TGG-TC-T-G-----T-A-T-----C----C---TG-CC---T-AC--A--AC-G--T-T--TT-A-C-TA-C--------T---AA-GT-G-A--C-AC--T----AC-A--A-CC-TT-G--AC-CTTtga
gi|40451                      :                                      cttc-----AAT-A------------AC--A-A-TA-GGGTAT-C-TT-TTT-T---T--CA-------T---C-AATG---G--TG---A-T-C-AA--T---T---G-T--A-C-C--AA-GT---G-TT---AG---TCC--T-GG-A-GC-T-T-AC-G-G----T-T-CGG-TC-T-G-----T-A-T-----C----C---CG-CC---T-----A--AC-G--CGT--GT-C-C-TA-C--------T---AA-GT-G-A--C-CC--T----AC-G--A-CC-TT-G--AC-CTTtaacct
gi|40420                      :                                          -----AAA-A------------AC--A-A-TA-GA-CAT-C-TT-CCT-C---T--CA-------T---C-A-TG---A--TG---A-T-C-GA--T---T---G-T--A-C-C--AA-GT-T-G-TA---AG-A-TCC--T-GG-A-GC-T-T-AT-G-T----T-T-CAG-TT-T-G-----T-A-C-----C----C---TG-CC---T-AC--A--At
gi|40452                      :                                     ccttc-----AAA-A------------AT--A-A-CA-GG-CAT-T-TT-TCT-C---T--CA-------T---C-A-CG---G--TG---A-T-C-AA--A---T---G-T--A-C-C--AA-AT-T-A-TA---AG-A-TCC--T-GG-A-GT-T-T-AC-G-G----T-T-CTG-TC-T-G-----T-A-T-----C----C---TG-CC---C-AC--A--------T-T--TT-C------C--------TTGAAG-GT-G-A--------T----AC-A--A-CC-TC-G--AC-CTT
gi|40241                      :                                          -----AAA-A------------AC--G-A-TG-GG-CAT-A-TT-CCT-C---T--CA-------T---C-A-TA---G--TG---A-T-C-AA--T---T---G----A-C-C--AA-GG-T-A-CA---AG-G-TCC--T-GG-A-GC-T-T-AC-A-A----T-T-CAG-TC-T-G-----T-A-C-----C----C----------------------------T--TT-C-C-TA-C--------T---AA-GT-G-A--C-TC--T----AC-A--A-CC-TT-G--ACTCTT
gi|40456                      :                                    ttgacctcccactctc------------AC--A-A-TA-GG-CAT-C-TT-CCT-C---C--CA-------T---C-A-TG---G--TG---A-T-A-AA--T---T---G-T--A-C-C--AA-TT-T-G-TA---TG-A-TCC--T-GG-A-AC-T-T-AG-G-G----T-T-CAG-TC-T-G-----T-A-T-----C----C---CA-CC---T-AC--A--AC-G--T-T--TT-C-C-TA-C--------T---AA-GT-G-A--C-AC--T----AC-G--A-CC-TT-G--AC-CTTgacct
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Reference ( family-87 )       :                                                                                                             TTGA-CCTT-TG-------A-------C-C-T-------TGA-----AAA-A------------AC--A-A-TA-GG-CGT-C-TT-CCT-C---T--C-------A-T---CA-TG---GT--G---A-T-C-AA--T---T---G-T--A-C-C--AA-GT-T-G-TA---AG-A-TCCT--GG-A-GC-T-T-AC-G-G----T-T-CGG-T-C-T-G-----TA-T-----C----C---TG-CC---TA-C--A--AC-G--T-T--TT-C-CTA-C--------T---AA-GT-G-A--C-AC--T----AC-G--AC-C-TT-G--AC-CTT
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gi|40211                      :                                                                                                             TTGA-CTTT-TT-------T-------C-C-T-------TGA-----AAA-A-------------C--A---TG-GG-CAT-C-TT-CCT-C---T--C-------T-T---CA-CG---GT--G---A-T-C-AA--C---T---G-C--A-C-C--AA-GT-T-G-TG---AG-A-GGTT--GG-G-TA-T-T-GT-G-G----T-T-CAA-T-C-T-G-----TA-T-----C----C---TG-AC---TA-T--A--AC-G--T-T--TT-C-CTA-C--------T---AA-GT-G-A--C-AC--T----AA-T--AC-A-TT-G--AT-Ctgccct
gi|40212                      :                                                                                                             TTGA-CCAC-TG-------A-------A-C-T-------T-------AAA-A------------AC--A-A-TA-GG-CAA-C-TT-CCT-T---T--C-------A-T---CG-TG---GT--G---A-T-T-AA--T---T---G-T--A-C-C--AA-GT-T-G-TA---AG-A-TCCT--GG-A-GC-T-T-AC-G-G----T-T-TGG-T-C-T-A-----CA-T-----C----C---TG-CC---TA-C--A--Agtgaacct
gi|40214                      :                                                                                                             TTGA-CCTT-TG-------A-------C-C-C-------CGACCTTGAAA-A------------AC--A-A-CT-GG--AT-C-TT-CCT-G---T--C-------A-A---CA-TG---GT--G---A-T-C-AA--T---T-----T--A-C-C--AA-GTCT-G-TA---TG-A-TCC---GG-A-GC-T-T-AC-G-G----T-T-T-G-C-C-T-------TA-TTCTGCT----C---TG-CC---TA-C--A--AC-G--T-T--TT-C-CTA----------T---AG-AG-G-A--C-AC--T----AC-G--ACTC-TT-G--AC-CTT
gi|40217                      :                                                                                                             TTGA-CCAC-TG-------A-------C-C-T-------TGA-----AAA-G-------------C--A-A-TA-CA-CAT-C-TT-CCT-T---T--C-------A-T---CA-TG---GT--G---A-T-C-AA--A---T---G-T--A-C-C--AA-GT-T-G-TA---AA-A-T-CT--GG-A-AC-T-T-A--G-G----T-T-CAG-T-A-T-G-----TA-TGA---C----C---TG-CC---AA-T--A--AG-G--T-T--TT-C-CTA-C--------T---TG-GT-G-A--A-AC--T----TT-G--AC-A-TG-G--AC-CTtatcct
gi|40218                      :                                                                                                                                 -------C-T-T-------TGG-----AAA-A------------AC--A-A-TA-GG-CGT-C-TC-CTT-T---T--A-------A-T---CC-TG---GT--GA--A-T-C-AA--T---T---G-T--A-C-CAAAA-GT-T-A-TA---AG-A-TGCT--GA-ACGC-T-T-AC-G-GT---T-T-TGG-T-C-TGG-----TATT-----C----C---TG-CC---T--------AC-G--T-T--TT-C-CTA-T--------T---AA-GTGG-A--CAAC--TCAGAAC-G--AC-C-TT-G--AC-CCTctgacct
gi|40225                      :                                                                                                 ttggaccacaacTTGA-CCTC-CA-------A-------C-C-T-------TGA-----AAA-A-------------T--A-A-TA-GG-CGT-C-TT-CCT-C---T--C-------A-TA--CA-TG---GTTTGC--A-TTC-AA--C---T-----T--A-C-C--AA-GT-T-GACA---TG-A-TCCTTTGGCA-GC-T-T-AC-G-G----T-T-CAG-TTC-T-G-----TA-T-----C----C---CA-CC---TAAC--A--AT-G--T-T--TT-C-CTA-C--------T---AA-GT-G-A--C-AC--T----A--G--AC-C--T-G--AC-CCTttgatc
gi|40226                      :                                                                                                             TTGA-CCCTACG-------A-------C-C-T-------TGA-----AAA-A-------------C--A-A-TA-GG-CAT-C-T--CCT-C---T--C-------A-T---CA-TG---GA--G---A-T-C-GA--TAACT---G-C--A-C-C--AA-GT-T-G-TA---AG-A-TCCT--GG-A-GC-T-T-AT-ACG----T-T--AG-T-C-T-G-----TA-T-----CGCTGC---TG-CCTTTTA-C--ATCAC-A----T--TT-C-GTATC--------T---AAGGT-G-A--C-AC--T----AC-G--TG-C-TT-C--AC-CTttgactt
gi|40230                      :                                                                                                             TTGA-GCTT-TG-------T-------C-C-T-------TGA-----AAA-A-------------C--A-A-GA-GG-CAT-C-TT-CCT-C---T--C-------A-T---AA-GG---GT--G---A-T-C-AA----------A-T--A-T-C----------G-TA---AG-A-TCCT--GG-A-GC-T-T-AC-A-G----T-T-CGG-T-C-T-C-----TA-T-----C------------------------------------TT-C-CTA-C--------T---AT-GT-G-A--T-AC--T----AT-G--AC-C-TT-G--AC-CTTatg
gi|40235                      :                                                                                                             TTGA-CTTT-TG-------A-------C-C-T-------TGA-----ACA-A-------------C--A-A-TA-GG-CAT-C-TT-TCA-C---T--C-------A-T---AA-TG---AT--G---A-T-A-AA--T---T---T-T--A-C-A--AA-GT-C-A-TA---AC-A-TCCT--GG-A-GC-T-T-AT-G-G----C-T-CAG-T-C-T-G-----TA-T-----C----C---TG-CT---CA-C-----AT-T--T-T--TT-CATTA-C--------T---AA-GT-G-A--T-AC--T----TT-G--TC-T-TT-G--AC-CTTtgacct
gi|40241                      :                                                                                                             TTGA-CCTC-CC-------A-------CTC-T-------C-------AAA-A------------AC--G-A-TG-GG-CAT-A-TT-CCT-C---T--C-------A-T---CA-TA---GT--G---A-T-C-AA--T---T---G----A-C-C--AA-GG-T-A-CA---AG-G-TCCT--GG-A-GC-T-T-AC-A-A----T-T-CAG-T-C-T-G-----TA-C-----C----C----------------------------T--TT-C-CTA-C--------T---AA-GT-G-A--C-TC--T----AC-A--AC-C-TT-G--ACTCTT
gi|40242                      :                                                                                                             TTGA-CCTC-CG-------A-------C-C-T-------TGA-----AAA-A------------G---A-A-TA-CG-TAT-C-TT-CCT-C---T--C-------A-T---CA-TG---GT--G---A-T-T-AA--A---T---G-T--A-C-A--AA-GT-T-T-TA---AA-A-TCCT--GG-A-GC-T-T-AC-A-G----T-T-TGG-T-C-T-G-----TA-T-----C----C---TG-CC---TG-C--A--Agacct
gi|40243                      :                                                                                                             TTGA-CCTT-TG-------A-------C-T-T-------T--------AA-A------------AC--A-G-TA-GG-CAT-C-GT-CCT-C---T--C-------A-T---CA-AG---GT--G---A-T-C-AA--A---T---G-A--A------AA-G----G-CA---AG-A-TCCT--GC-A-GC-T-C-AC-A-G----T-T-TGG-T-C-A-G-----TA-T-----C----A---TG-CC---TA-C--A--AG-G--T-T--TT-C-CTA-C--------T---AA-GT-G-A--T-GC--T----AG-A--AC-C-TT-A--
gi|40297                      :                                                                                                              TGA-CCTT-TG-------A-------C-C-T-------TGC-----AAA-A------------AC--A-A-TA-GG-TAT-C-TT-CCT-C---T--T-------A-T---CA-TG---GT--A---A-T-T-AA--C---T---G-T--A-C-C--AA-GT-T-G-TA---AT-A-TCCT--GG-G-TC-T-T-GC-G-G----T-T-TGG-T-C-T-G-----TA-T-----C----C---TG-CC---TA-T--A--CC-A--T-T--TT-C-CTA-C--------T---GA-TT-G-C--A-AA--T----AC-G--AC-C-TT-A--AC-TTT
gi|40301                      :                                                                                                              TGA-CCTT-TG-------A-------C-C-T-------TGG-----AAA-A-------------C--A-A-TA-GG-CAT-C-TT-CCT-C---T--G-------A-T---CA-TG---GT--G---A-T-C-AA--T---T---G-T--A-T-C--AA-GT-T-T-TA---AT-A-TCCT--GG-A-GC-T-T-AC-A-G----T-T-TAG-T-C-T-G-----CA-T-----C----T---TG-CC---TA-C--G--A-------T--TT-C-CTA-CTATTAAATT---AA-GT-G-A--T-AT--T----AC-G--AC-T-TT-G--AC-CTTgatct
gi|40303                      :                                                                                                              TGA-ACCT-TA-------A-------C-CCT-------TGA-----AAA-AG-----------AC--A-A-TA-G--TGT-C-TTTCCT-T---T--C-------A-T---CT-TG---GT--G---A-T-C-AA--T---T---G-T--A-C-C--TA-GT-T-G-TGTATGA-A-TCCT--GG-A-GC-T-T-AC-G-G----T-T-CCG-T-C-T-G-----CA-T-----C----C----G-CC---TA-TCAA--AC-G----T--TT-C-CTA-C--------TA--AA-GT-G-A--C-AC--T----AC----AC-C-TT-G--AC-CTT
gi|40306                      :                                                                                                                         -------A-------C-C-T-------TGA-----AAA-A------------AC--A-A-TA-GG-CCT-CATT-CCT-C---T--C-------A-T---CATTG---GT--GTTTATT-C-AA--T---T---G-T--A-C-C--AA-GT-T-G-TA---A--A-TCCT--GG-A-GC-T-T-AC-A-GAAAATAT-CGG-T-C-T-GT----TA-T----------C---TG-CC---TA-C--A--AC-G--T-TTATC-C-CTA-C--------TGA-AA-GT-GCAC-C-AC--T----AC-G--AC-C-TT-G--AC-CTTtga
gi|40312                      :                                                                                                       tggactccGA-CCTC-TG-------A-------C-C-T-------TCA-----AAA--------------AC--A-A-TA-GG-CAT-C-TT-ACT-C---T--C-------A-T---CA-TG---GT--A---A-T-C-AA--A---A---G-T--A-C-C--AA-GC-T-A-TA---AT-T-TCCT--GG-A-AC-T-T-AC-A-G----T-T-CAG-T-T-T-G-----CA-T-----C----T---TG-CC---TA-C--A--AC-G--T-T--TT-C-C-A--------------AA-GT-G-A--T-ATTAT----AT-G--AC-C-TT-G--AC-CTTt
gi|40314                      :                                                                                                               GA-CCTC-TG-------A-------C-C-T-------TGG-----AAA-A-------------C--A-T-TA-GG-CAT-C-TT-TAT-C---T--C-------A-T---CA-TG---AT--G---A-T-C-AA--A---T---A-T--A-C-C--AA-GT-T-G-TA---TG-A-TCCT--GG-A-GC-T-T-TC-A-G----T-T-TGG-T-C-T-G-----CA-T-----C----C---TG-CC---TA-C--A--Atgatct
gi|40315                      :                                                                                                               GA-CCTT-GG-------AA------C-C-T-------TTG-----AAA-A------------AC--A-A-TA-GG-CAT-C-TT-CCTTC---T--C-------AAC---CA-TG---GT------A-T-C-AA--T---T---G-TCAA-C-C--AA-GTGT-T-TA---CG-A-TTCTT-GG-A-GC-T-T-TT-G-G----T-T-CGG-T-C-T-G-----TA-T-----C----C---CG-CC---TA-C--A--AC-G--T-T--TT-T-CTA-C--------T---AC-GT-T-A--C-AC--T----AT-G--AC-C-TT-G--
gi|40319                      :                                                                                                                  gCTT-TG-------A-------T-C-T-------TCA-----AAA--------------AC--A-A-TA-GG-CAT-C-TT-CCT-C---T--C-------A-T---CA-TG---GT--G---A-T-C-AA--C---T---G-T--A-T-C--AA-GT-T-G-TA---AA-A-TTCT--TG-A-GC-T-A-AT-G-G----T-T-CAG-T-C-T-G-----TA-T-----C----C---TG-CC---TA-C--A--AC-A--T-T--TT-C-CTA-C--------T---TA-AT-G-A--T-AC--T----AT-G--AC-C-TT-G--AC-ATT
gi|40325                      :                                                                                                                 aaCTT-TG-------A-------C-C-T-------TGA-----AAA---------------T--A-A-TA-GG-CAT-C-TT-CCT-C---T--C-------A-T---CA-TG---AT--G---A-T-C-AA--T---T---G-T--A-C-C--AA-GT-T-G-TA---AG-A-TTCT--GG-A-GC-T-T-AC-G-G----T-T-CAG-T-C-T-T-----TA-T-----C----C---TG-CC---TA-C--A--GT-G--T-T--TT-C-CTA-C--------T---AA-GT-G-A--C-AC--T----AC-G--GC-C-TT-G--AC-CTT
gi|40326                      :                                                                                                                  aCCT-TG-------A-------C-C-T-------TCA-----ATA-A-------------C--A-A-TA-GG-CAT-C-TT-CCT-C---T--T-------G-T---CA-TG---GT--G---A-T---GA--T---T---G-T--A-C-C--AA-GT-G-T-TA---AG-A-TCTT--GG-A-GC-T-T-AC-G-G----T-T-CGG-T-C-T-G-----TA-T-----C----C---TG-TC---TA-C--A--Atgacct
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Reference ( family-87 )       :                                                                                                             TTGA-CCTT-TG-------A-------C-C-T-------TGA-----AAA-A------------AC--A-A-TA-GG-CGT-C-TT-CCT-C---T--C-------A-T---CA-TG---GT--G---A-T-C-AA--T---T---G-T--A-C-C--AA-GT-T-G-TA---AG-A-TCCT--GG-A-GC-T-T-AC-G-G----T-T-CGG-T-C-T-G-----TA-T-----C----C---TG-CC---TA-C--A--AC-G--T-T--TT-C-CTA-C--------T---AA-GT-G-A--C-AC--T----AC-G--AC-C-TT-G--AC-CTT
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gi|40187                      :                                                                                                             TTGA-CCTC-CG-------A-------C-C-T-------TCA-----AAA-ACAATTATTGTCAAT--ATA-TA-TG-CGT-C-TT-CCT-C---T--T-------A-T---CA-TG-----------A-T-C-AA--T---T---G-T--A-T-C--AA-CT-T-G-TA---AG-A-TCCT--GG-A-GC-T-T-AC-G-G----T-T-CAG-T-C-T-G-----TA-T-----C----C---TG-CC---TA-C--A--AT-G--T-T--TT-C-CTT-C--------C---AA-GT-G-A--C-AC--T----AT-G--AC-T-TT-G--AA-CTccgacct
gi|40188                      :                                                                                                             TTGA-ACTC-TG-------A-------C-C-T-------TCA-----AGA-A-------------C--A-A-TA-GA-CAT-C-TT-CCT-C---T--T-------A-T---CA-TG---GT--G---A-T-T-AA--T---T---G-T--A-C-A--AA-GT-T-G-CA---AG-A-TCCT--GG-A-GT-T-T-GC-G-G----T-T-CGG-T-C-T-G-----TA-T-----C----C---TG-CC---TA-C--A--Actgacct
gi|40189                      :                                                                                                             TTGA-CCTT-TG-------A-------T-C-T-------AGA-----AAA--------------AC--A-A-TA-GG-CAT-C-GT-TCT-C---T--C-------A-T---CA-TG---AT--A---G-T-C-AA--A---T---G-T--A-T-C--AA-GT-C-G-TA---AG-A-TACT--GG-A-GC-T-T-AT-G-G----T-T-CGG-T-C-T-A-----TA-T-----C----G---TG-CC---CA-C--A--AC-A--T-T--TT-C-CCA-C--------T---AA-GT-G-A--T-AC--T----GC-G--AC-C-TT-G--GC-CTT
gi|40190                      :                                                                                                             TTGA-CCTT-TG-------A-------C-C-T-------TGA-----AAA-----------------------------------T-CCT-C---T--C-------A-T---CA-TG---GT--G---A-T-C-AA--T---T---G-T--A-C-C--AA-GT-T-G-TA---AG-A-TCCT--GG-A-GC-T-T-AC-G-G----T-T-CGA-T-C-T-G-----TA-T-----C----C---TG-CC---TA-C--G--AT-G--T-T--TT-C-CTA-C--------T---CG-GT-G-A--T-TC--T----AC-G--AC-C-TT-A--AC-ATTtgacct
gi|40191                      :                                                                                                             TTGG-CCTT-TG-------A-------C-C-T-------TGT-----AAA-A-------------T--A-A-TA-GG-CAT-C-TT-C-------T--C-------A-T---CA-TG---GT--G---A-T-A-AA--A---C---A-T--A-A-C--AA-GT-T-G-TA---AG-A-TCCT--GG-A-GC-T-T-AT-G-G----T-T-CTG-T-C-T-G-----TA-T-----C------------------------------------TT-C-CTA-C--------T---TT-GT-G-A--T-AC--T----AC-G--AT-C-TT-G--AC-CTTt
gi|40192                      :                                                                                                             TTGA-CCTT-CG-------A-------C-C-T-------T-A-----AAA-A------------AC--A-A-CA-GG-CGT-C-TT-CCT-T---T--C-------A-----------------------------------------T--A-T-C--AA-GT-T-G-TA---AG-A-TCCT--GG-A-GC-T-T-TC-G-G----T-T-CGG-T-C-T-G-----TA-T-----C----C---TG-CC---CA-C--A--AC-G--T-T--TT-C-CTA-C--------T---TA-GT-G-A--C-AC--T----AC-A--AC-C-TT-G--tgacct
gi|40193                      :                                                                                                             TTGA-CCTT-TA-------A-------C-C-T-------TGA-----AAA-A-------------C--A-A-TA-GG-CAT---TT-CCA-T---T--C-------A-A---TA-TG---GT--G---A-T-C-AA--T---T---G-T--A-C-C--AA-GT-T-G-TA---TG-A-TCCT--GG-A-GC-T-T-AC-G-G----T-T-CGG-T-C-T-G-----TA-T-----C----C----G--C---TA-C--A--AT-G--T-T--TT-C-ATA-C--------T---AA-GT-G-A--C-AC--T----A--G--AC-T-TT-
gi|40195                      :                                                                                                             TTGA-TCTC-TG-------A-------C-C-T-------TGA-----AAA--------------AC--A-A-TA-GG-CAT-C-TT-CCT-C---T--C-------A-T---TA-TG---GT--G---A-T-C-AA--T---T---A-T--A-C-C--GA-GA-T-G-TA---AG-A-TCCT--GG-A-TC-C-T-AT-A-C----T-T-AAG-T-C-T-GT----TT-T-----C----C---TG-CC---TA-C--A--A--GATT-T--TT-C-CTA-C--------T---AA-GT-G-A--C-AC--T----AC-T--AC-C-CT-G--AC-CTTacactttgacct
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gi|40201                      :                                                                                                      ttgaacaTTGA-CCTT-TG-------A-------C-C-TCCGACC-TGG-----AAA-A-----------------------------------CCT-T---T--C-------A-T---CA-TG---GT--G---A-T-C-AA--T---T---G-T--AGC-C--AA--T-T-G-TA---TG-A-TCCT--GG-G-GC-T-T-AC-G-G----T-T-CGG-T-C-T-G-----TA-T-----C----C---CG-CC----A----A--AC-G--T-T--TTCC-CTA-C--------T---GACGT-G-A--C-AC--T----AC-G--AC-C-TT-G--AC-CTTtgacct
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gi|40225                      :                                                                                                 ttggaccacaacTTGA-CCTC-CA-------A-------C-C-T-------TGA-----AAA-A-------------T--A-A-TA-GG-CGT-C-TT-CCT-C---T--C-------A-TA--CA-TG---GTTTGC--A-TTC-AA--C---T-----T--A-C-C--AA-GT-T-GACA---TG-A-TCCTTTGGCA-GC-T-T-AC-G-G----T-T-CAG-TTC-T-G-----TA-T-----C----C---CA-CC---TAAC--A--AT-G--T-T--TT-C-CTA-C--------T---AA-GT-G-A--C-AC--T----A--G--AC-C--T-G--AC-CCTttgatc
gi|40226                      :                                                                                                             TTGA-CCCTACG-------A-------C-C-T-------TGA-----AAA-A-------------C--A-A-TA-GG-CAT-C-T--CCT-C---T--C-------A-T---CA-TG---GA--G---A-T-C-GA--TAACT---G-C--A-C-C--AA-GT-T-G-TA---AG-A-TCCT--GG-A-GC-T-T-AT-ACG----T-T--AG-T-C-T-G-----TA-T-----CGCTGC---TG-CCTTTTA-C--ATCAC-A----T--TT-C-GTATC--------T---AAGGT-G-A--C-AC--T----AC-G--TG-C-TT-C--AC-CTttgactt
gi|40230                      :                                                                                                             TTGA-GCTT-TG-------T-------C-C-T-------TGA-----AAA-A-------------C--A-A-GA-GG-CAT-C-TT-CCT-C---T--C-------A-T---AA-GG---GT--G---A-T-C-AA----------A-T--A-T-C----------G-TA---AG-A-TCCT--GG-A-GC-T-T-AC-A-G----T-T-CGG-T-C-T-C-----TA-T-----C------------------------------------TT-C-CTA-C--------T---AT-GT-G-A--T-AC--T----AT-G--AC-C-TT-G--AC-CTTatg
gi|40235                      :                                                                                                             TTGA-CTTT-TG-------A-------C-C-T-------TGA-----ACA-A-------------C--A-A-TA-GG-CAT-C-TT-TCA-C---T--C-------A-T---AA-TG---AT--G---A-T-A-AA--T---T---T-T--A-C-A--AA-GT-C-A-TA---AC-A-TCCT--GG-A-GC-T-T-AT-G-G----C-T-CAG-T-C-T-G-----TA-T-----C----C---TG-CT---CA-C-----AT-T--T-T--TT-CATTA-C--------T---AA-GT-G-A--T-AC--T----TT-G--TC-T-TT-G--AC-CTTtgacct
gi|40241                      :                                                                                                             TTGA-CCTC-CC-------A-------CTC-T-------C-------AAA-A------------AC--G-A-TG-GG-CAT-A-TT-CCT-C---T--C-------A-T---CA-TA---GT--G---A-T-C-AA--T---T---G----A-C-C--AA-GG-T-A-CA---AG-G-TCCT--GG-A-GC-T-T-AC-A-A----T-T-CAG-T-C-T-G-----TA-C-----C----C----------------------------T--TT-C-CTA-C--------T---AA-GT-G-A--C-TC--T----AC-A--AC-C-TT-G--ACTCTT
gi|40242                      :                                                                                                             TTGA-CCTC-CG-------A-------C-C-T-------TGA-----AAA-A------------G---A-A-TA-CG-TAT-C-TT-CCT-C---T--C-------A-T---CA-TG---GT--G---A-T-T-AA--A---T---G-T--A-C-A--AA-GT-T-T-TA---AA-A-TCCT--GG-A-GC-T-T-AC-A-G----T-T-TGG-T-C-T-G-----TA-T-----C----C---TG-CC---TG-C--A--Agacct
gi|40243                      :                                                                                                             TTGA-CCTT-TG-------A-------C-T-T-------T--------AA-A------------AC--A-G-TA-GG-CAT-C-GT-CCT-C---T--C-------A-T---CA-AG---GT--G---A-T-C-AA--A---T---G-A--A------AA-G----G-CA---AG-A-TCCT--GC-A-GC-T-C-AC-A-G----T-T-TGG-T-C-A-G-----TA-T-----C----A---TG-CC---TA-C--A--AG-G--T-T--TT-C-CTA-C--------T---AA-GT-G-A--T-GC--T----AG-A--AC-C-TT-A--
gi|40297                      :                                                                                                              TGA-CCTT-TG-------A-------C-C-T-------TGC-----AAA-A------------AC--A-A-TA-GG-TAT-C-TT-CCT-C---T--T-------A-T---CA-TG---GT--A---A-T-T-AA--C---T---G-T--A-C-C--AA-GT-T-G-TA---AT-A-TCCT--GG-G-TC-T-T-GC-G-G----T-T-TGG-T-C-T-G-----TA-T-----C----C---TG-CC---TA-T--A--CC-A--T-T--TT-C-CTA-C--------T---GA-TT-G-C--A-AA--T----AC-G--AC-C-TT-A--AC-TTT
gi|40301                      :                                                                                                              TGA-CCTT-TG-------A-------C-C-T-------TGG-----AAA-A-------------C--A-A-TA-GG-CAT-C-TT-CCT-C---T--G-------A-T---CA-TG---GT--G---A-T-C-AA--T---T---G-T--A-T-C--AA-GT-T-T-TA---AT-A-TCCT--GG-A-GC-T-T-AC-A-G----T-T-TAG-T-C-T-G-----CA-T-----C----T---TG-CC---TA-C--G--A-------T--TT-C-CTA-CTATTAAATT---AA-GT-G-A--T-AT--T----AC-G--AC-T-TT-G--AC-CTTgatct
gi|40303                      :                                                                                                              TGA-ACCT-TA-------A-------C-CCT-------TGA-----AAA-AG-----------AC--A-A-TA-G--TGT-C-TTTCCT-T---T--C-------A-T---CT-TG---GT--G---A-T-C-AA--T---T---G-T--A-C-C--TA-GT-T-G-TGTATGA-A-TCCT--GG-A-GC-T-T-AC-G-G----T-T-CCG-T-C-T-G-----CA-T-----C----C----G-CC---TA-TCAA--AC-G----T--TT-C-CTA-C--------TA--AA-GT-G-A--C-AC--T----AC----AC-C-TT-G--AC-CTT
gi|40306                      :                                                                                                                         -------A-------C-C-T-------TGA-----AAA-A------------AC--A-A-TA-GG-CCT-CATT-CCT-C---T--C-------A-T---CATTG---GT--GTTTATT-C-AA--T---T---G-T--A-C-C--AA-GT-T-G-TA---A--A-TCCT--GG-A-GC-T-T-AC-A-GAAAATAT-CGG-T-C-T-GT----TA-T----------C---TG-CC---TA-C--A--AC-G--T-TTATC-C-CTA-C--------TGA-AA-GT-GCAC-C-AC--T----AC-G--AC-C-TT-G--AC-CTTtga
gi|40312                      :                                                                                                       tggactccGA-CCTC-TG-------A-------C-C-T-------TCA-----AAA--------------AC--A-A-TA-GG-CAT-C-TT-ACT-C---T--C-------A-T---CA-TG---GT--A---A-T-C-AA--A---A---G-T--A-C-C--AA-GC-T-A-TA---AT-T-TCCT--GG-A-AC-T-T-AC-A-G----T-T-CAG-T-T-T-G-----CA-T-----C----T---TG-CC---TA-C--A--AC-G--T-T--TT-C-C-A--------------AA-GT-G-A--T-ATTAT----AT-G--AC-C-TT-G--AC-CTTt
gi|40314                      :                                                                                                               GA-CCTC-TG-------A-------C-C-T-------TGG-----AAA-A-------------C--A-T-TA-GG-CAT-C-TT-TAT-C---T--C-------A-T---CA-TG---AT--G---A-T-C-AA--A---T---A-T--A-C-C--AA-GT-T-G-TA---TG-A-TCCT--GG-A-GC-T-T-TC-A-G----T-T-TGG-T-C-T-G-----CA-T-----C----C---TG-CC---TA-C--A--Atgatct
gi|40315                      :                                                                                                               GA-CCTT-GG-------AA------C-C-T-------TTG-----AAA-A------------AC--A-A-TA-GG-CAT-C-TT-CCTTC---T--C-------AAC---CA-TG---GT------A-T-C-AA--T---T---G-TCAA-C-C--AA-GTGT-T-TA---CG-A-TTCTT-GG-A-GC-T-T-TT-G-G----T-T-CGG-T-C-T-G-----TA-T-----C----C---CG-CC---TA-C--A--AC-G--T-T--TT-T-CTA-C--------T---AC-GT-T-A--C-AC--T----AT-G--AC-C-TT-G--
gi|40319                      :                                                                                                                  gCTT-TG-------A-------T-C-T-------TCA-----AAA--------------AC--A-A-TA-GG-CAT-C-TT-CCT-C---T--C-------A-T---CA-TG---GT--G---A-T-C-AA--C---T---G-T--A-T-C--AA-GT-T-G-TA---AA-A-TTCT--TG-A-GC-T-A-AT-G-G----T-T-CAG-T-C-T-G-----TA-T-----C----C---TG-CC---TA-C--A--AC-A--T-T--TT-C-CTA-C--------T---TA-AT-G-A--T-AC--T----AT-G--AC-C-TT-G--AC-ATT
gi|40325                      :                                                                                                                 aaCTT-TG-------A-------C-C-T-------TGA-----AAA---------------T--A-A-TA-GG-CAT-C-TT-CCT-C---T--C-------A-T---CA-TG---AT--G---A-T-C-AA--T---T---G-T--A-C-C--AA-GT-T-G-TA---AG-A-TTCT--GG-A-GC-T-T-AC-G-G----T-T-CAG-T-C-T-T-----TA-T-----C----C---TG-CC---TA-C--A--GT-G--T-T--TT-C-CTA-C--------T---AA-GT-G-A--C-AC--T----AC-G--GC-C-TT-G--AC-CTT
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gi|40329                      :                                                                                                                accCCT-TG-------A-------C---T-------TGA-----AAA-A------------AC----A-TA-GG-CAT-C-TT-TCT-CT--T--C-------A-T---CA-TG---GT--A---A-T-T-AA--C---T---G-T--A-C-C--AA-GT-T-G-TA---A--A-TCCT--GG-G-TC-T-T-GC-G-G----T-T-CAG-T-C-T-G-----TG-G-----C----C---CA-CC---TA-C--A--AT-G----T--TT-C-CT--C--------T---AA-GT-G-A--C-A---T----AC-A--AC-C-T-----AC-CT
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gi|40332                      :                                                                                                                       aG-------A-------C-C-T-------T-A-----AAA-A------------AT--T-A-TA-GG-CCT-C-TT-CCG-T---T--C-------A-T---CA-TG---GT--G---A-T-C-AA--T---T---G-T--A-C-C--AA-GT-T-G-TA---AA-A-TCCT--GG-A-GC-T-T-AC-G-G----T-T-TGG-T-G-T-G-----TA-T-----C----C---TG-CC---TA-C--A--AT-G--G-T--TT-C-CTA-C--------T---AA-GT-G-A--C-AC--T----AC-G--AC-C-TT-G--AC-CTTctgacct
gi|40333                      :                                                                                                              accccCCT-TG-------A-------C-C-T-------TGA-----AAA-A------------AC--A-A-TA-AG-CAT-C-TT-CCT-C---T--A-------A-C---CA-TG---GT--A---A-T-C-AA--C---T---G-T--A-C-C--AA-GA-A-A-TA---AT-A-TCCT--GT-A-GC-T-T-AC-G-G----T-T-AAG-T-C-T-G-----TA-T-----C----C---TA-CC---TA-C--A--AC-A--T-T--TT-C-CTA-C--------T---AA-GT-G-A--C-AC--T----AC-G--AC-T-TT-G--AC-CTTtgccct
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gi|40420                      :                                                                                                                                                       -----AAA-A------------AC--A-A-TA-GA-CAT-C-TT-CCT-C---T--C-------A-T---CA-TG---AT--G---A-T-C-GA--T---T---G-T--A-C-C--AA-GT-T-G-TA---AG-A-TCCT--GG-A-GC-T-T-AT-G-T----T-T-CAG-T-T-T-G-----TA-C-----C----C---TG-CC---TA-C--A--Atgacct
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gi|40422                      :                                                                                                                                                       -----AAA-A------------AC--A-A-TG-GG-CAT-C-CT-CCT-C---T--C-------A-T---CA-TG---GT--G---A-T-C-AA--T---T---G-T--A-C-C--AA-GT-T-G-TG---AG-A-TCCT--GG-A-GC-T-T-AC-G-G----C-T-TGG-T-C-T-G-----TA-T-----C----C---TG-CC---TA-C--A--AC-G--T-T--TT-A-CTA-C--------T---AA-GT-G-A--C-AC--T----AC-A--AC-C-TT-G--AC-CTTtgatct
gi|40437                      :                                                                                                                                       cttc-T-------TGA-----AAA-A-------------C--T-A-TA-G--CAT-C-AT-CTT-C---T--T-------A-T---CA-TG---GT--G---A-T-CTAA--T---T---G-T--A-C-C--AA--T-T--------AA-A-TCCT--GG-A-GC-T-T-AC-G-T----T-TATAG-T-C-T-G-----TAAT-----C----T---TG-CCC--TA-C--A--AC-G--TGT--TT-C-TTA-C--------T---AA-GT-C-A--C-AC--T----AC-G--AC-C-TT-G--AC-CTTtaacct
gi|40451                      :                                                                                                                                                       -----AAT-A------------AC--A-A-TA-GGGTAT-C-TT-TTT-T---T--C-------A-T---CAATG---GT--G---A-T-C-AA--T---T---G-T--A-C-C--AA-GT---G-TT---AG---TCCT--GG-A-GC-T-T-AC-G-G----T-T-CGG-T-C-T-G-----TA-T-----C----C---CG-CC---T-----A--AC-G--CGT--GT-C-CTA-C--------T---AA-GT-G-A--C-CC--T----AC-G--AC-C-TT-G--AC-CTTtga
gi|40452                      :                                                                                                                                                       -----AAA-A------------AT--A-A-CA-GG-CAT-T-TT-TCT-C---T--C-------A-T---CA-CG---GT--G---A-T-C-AA--A---T---G-T--A-C-C--AA-AT-T-A-TA---AG-A-TCCT--GG-A-GT-T-T-AC-G-G----T-T-CTG-T-C-T-G-----TA-T-----C----C---TG-CC---CA-C--A--------T-T--TT-C-CTT-G--------A---AG-GT-G-A--------T----AC-A--AC-C-TC-G--AC-CTTt
gi|40456                      :                                                                                                                                                                 ------------AC--A-A-TA-GG-CAT-C-TT-CCT-C---C--C-------A-T---CA-TG---GT--G---A-T-A-AA--T---T---G-T--A-C-C--AA-TT-T-G-TA---TG-A-TCCT--GG-A-AC-T-T-AG-G-G----T-T-CAG-T-C-T-G-----TA-T-----C----C---CA-CC---TA-C--A--AC-G--T-T--TT-C-CTA-C--------T---AA-GT-G-A--C-AC--T----AC-G--AC-C-TT-G--AC-CTT
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blockSeqs                     :                                                                                                                         .       .           .         .       AA                           A            .   .  .         .    .          .     .           .        .                             .                   .                . .        .               .  .               .  .       .     .        .           .        .                  . 
blockSeqs                     :                                                                                                                         .       .           .         .       AA                           G            .   .  .         .    .          .     .           .        .                             .                   .                . .        .               .  .               .  .       .     .        .           .        .                  . 
blockSeqs                     :                                                                                                                         .       .           .         .       AA                           A            .   .  .         .    .          .     .           .        .                             .                   .                . .        .               .  .               .  .       .     .        .           .        .                  . 
blockSeqs                     :                                                                                                                         .       .           .         .       AG                           A            .   .  .         .    .          .     .           .        .                             .                   .                . .        .               .  .               .  .       .     .        .           .        .                  . 
blockSeqs                     :                                                                                                                         .       .           .         .       AA                           T            .   .  .         .    .          .     .           .        .                             .                   .                . .        .               .  .               .  .       .     .        .           .        .                  . 
blockSeqs                     :                                                                                                                         .       .           .         .       AA                           A            .   .  .         .    .          .     .           .        .                             .                   .                . .        .               .  .               .  .       .     .        .           .        .                  . 
blockSeqs                     :                                                                                                                         .       .           .         .       AA                           A            .   .  .         .    .          .     .           .        .                             .                   .                . .        .               .  .               .  .       .     .        .           .        .                  . 
blockSeqs                     :                                                                                                                         .       .           .         .       AA                           A            .   .  .         .    .          .     .           .        .                             .                   .                . .        .               .  .               .  .       .     .        .           .        .                  . 
blockSeqs                     :                                                                                                                         .       .           .         .       AA                           A            .   .  .         .    .          .     .           .        .                             .                   .                . .        .               .  .               .  .       .     .        .           .        .                  . 
blockSeqs                     :                                                                                                                         .       .           .         .       AG                           A            .   .  .         .    .          .     .           .        .                             .                   .                . .        .               .  .               .  .       .     .        .           .        .                  . 
blockSeqs                     :                                                                                                                         .       .           .         .       AA                           G            .   .  .         .    .          .     .           .        .                             .                   .                . .        .               .  .               .  .       .     .        .           .        .                  . 
blockSeqs                     :                                                                                                                         .       .           .         .       AA                           G            .   .  .         .    .          .     .           .        .                             .                   .                . .        .               .  .               .  .       .     .        .           .        .                  . 
blockSeqs                     :                                                                                                                         .       .           .         .       AA                           A            .   .  .         .    .          .     .           .        .                             .                   .                . .        .               .  .               .  .       .     .        .           .        .                  . 
blockSeqs                     :                                                                                                                         .       .           .         .       AA                           A            .   .  .         .    .          .     .           .        .                             .                   .                . .        .               .  .               .  .       .     .        .           .        .                  . 
blockSeqs                     :                                                                                                                         .       .           .         .       AA                           G            .   .  .         .    .          .     .           .        .                             .                   .                . .        .               .  .               .  .       .     .        .           .        .                  . 
blockSeqs                     :                                                                                                                         .       .           .         .       AA                           A            .   .  .         .    .          .     .           .        .                             .                   .                . .        .               .  .               .  .       .     .        .           .        .                  . 
blockSeqs                     :                                                                                                                         .       .           .         .       AA                           A            .   .  .         .    .          .     .           .        .                             .                   .                . .        .               .  .               .  .       .     .        .           .        .                  . 
blockSeqs                     :                                                                                                                         .       .           .         .       AA                           A            .   .  .         .    .          .     .           .        .                             .                   .                . .        .               .  .               .  .       .     .        .           .        .                  . 
blockSeqs                     :                                                                                                                         .       .           .         .       AA                           G            .   .  .         .    .          .     .           .        .                             .                   .                . .        .               .  .               .  .       .     .        .           .        .                  . 
blockSeqs                     :                                                                                                                         .       .           .         .       AA                           A            .   .  .         .    .          .     .           .        .                             .                   .                . .        .               .  .               .  .       .     .        .           .        .                  . 
blockSeqs                     :                                                                                                                         .       .           .         .       AC                           A            .   .  .         .    .          .     .           .        .                             .                   .                . .        .               .  .               .  .       .     .        .           .        .                  . 
blockSeqs                     :                                                                                                                         .       .           .         .       AA                           G            .   .  .         .    .          .     .           .        .                             .                   .                . .        .               .  .               .  .       .     .        .           .        .                  . 
blockSeqs                     :                                                                                                                         .       .           .         .       AA                           A            .   .  .         .    .          .     .           .        .                             .                   .                . .        .               .  .               .  .       .     .        .           .        .                  . 
blockSeqs                     :                                                                                                                         .       .           .         .       AG                           G            .   .  .         .    .          .     .           .        .                             .                   .                . .        .               .  .               .  .       .     .        .           .        .                  . 
blockSeqs                     :                                                                                                                         .       .           .         .       AA                           G            .   .  .         .    .          .     .           .        .                             .                   .                . .        .               .  .               .  .       .     .        .           .        .                  . 
blockSeqs                     :                                                                                                                         .       .           .         .       AA                           G            .   .  .         .    .          .     .           .        .                             .                   .                . .        .               .  .               .  .       .     .        .           .        .                  . 
blockSeqs                     :                                                                                                                         .       .           .         .       AC                           A            .   .  .         .    .          .     .           .        .                             .                   .                . .        .               .  .               .  .       .     .        .           .        .                  . 
blockSeqs                     :                                                                                                                         .       .           .         .       AA                           A            .   .  .         .    .          .     .           .        .                             .                   .                . .        .               .  .               .  .       .     .        .           .        .                  . 
blockSeqs                     :                                                                                                                         .       .           .         .       AA                           A            .   .  .         .    .          .     .           .        .                             .                   .                . .        .               .  .               .  .       .     .        .           .        .                  . 
blockSeqs                     :                                                                                                                         .       .           .         .       AA                           A            .   .  .         .    .          .     .           .        .                             .                   .                . .        .               .  .               .  .       .     .        .           .        .                  . 
blockSeqs                     :                                                                                                                         .       .           .         .       AA                           A            .   .  .         .    .          .     .           .        .                             .                   .                . .        .               .  .               .  .       .     .        .           .        .                  . 
blockSeqs                     :                                                                                                                         .       .           .         .       AA                           A            .   .  .         .    .          .     .           .        .                             .                   .                . .        .               .  .               .  .       .     .        .           .        .                  . 
blockSeqs                     :                                                                                                                         .       .           .         .       AA                           G            .   .  .         .    .          .     .           .        .                             .                   .                . .        .               .  .               .  .       .     .        .           .        .                  . 
blockSeqs                     :                                                                                                                         .       .           .         .       A                            G            .   .  .         .    .          .     .           .        .                             .                   .                . .        .               .  .               .  .       .     .        .           .        .                  . 
blockSeqs                     :                                                                                                                         .       .           .         .       A                            A            .   .  .         .    .          .     .           .        .                             .                   .                . .        .               .  .               .  .       .     .        .           .        .                  . 
blockSeqs                     :                                                                                                                         .       .           .         .       A                            A            .   .  .         .    .          .     .           .        .                             .                   .                . .        .               .  .               .  .       .     .        .           .        .                  . 
blockSeqs                     :                                                                                                                         .       .           .         .       A                            A            .   .  .         .    .          .     .           .        .                             .                   .                . .        .               .  .               .  .       .     .        .           .        .                  . 
blockSeqs                     :                                                                                                                         .       .           .         .       A                            A            .   .  .         .    .          .     .           .        .                             .                   .                . .        .               .  .               .  .       .     .        .           .        .                  . 
blockSeqs                     :                                                                                                                         .       .           .         .       A                            A            .   .  .         .    .          .     .           .        .                             .                   .                . .        .               .  .               .  .       .     .        .           .        .                  . 
blockSeqs                     :                                                                                                                         .       .           .         .       A                            A            .   .  .         .    .          .     .           .        .                             .                   .                . .        .               .  .               .  .       .     .        .           .        .                  . 
blockSeqs                     :                                                                                                                         .       .           .         .       A                            A            .   .  .         .    .          .     .           .        .                             .                   .                . .        .               .  .               .  .       .     .        .           .        .                  . 
blockSeqs                     :                                                                                                                         .       .           .         .       A                            A            .   .  .         .    .          .     .           .        .                             .                   .                . .        .               .  .               .  .       .     .        .           .        .                  . 
blockSeqs                     :                                                                                                                         .       .           .         .       A                            G            .   .  .         .    .          .     .           .        .                             .                   .                . .        .               .  .               .  .       .     .        .           .        .                  . 
blockSeqs                     :                                                                                                                         .       .           .         .       A                            C            .   .  .         .    .          .     .           .        .                             .                   .                . .        .               .  .               .  .       .     .        .           .        .                  . 
blockSeqs                     :                                                                                                                         .       .           .         .       A                            A            .   .  .         .    .          .     .           .        .                             .                   .                . .        .               .  .               .  .       .     .        .           .        .                  . 
blockSeqs                     :                                                                                                                         .       .           .         .       A                            A            .   .  .         .    .          .     .           .        .                             .                   .                . .        .               .  .               .  .       .     .        .           .        .                  . 
blockSeqs                     :                                                                                                                         .       .           .         .       A                            A            .   .  .         .    .          .     .           .        .                             .                   .                . .        .               .  .               .  .       .     .        .           .        .                  . 
blockSeqs                     :                                                                                                                         .       .           .         .       A                            A            .   .  .         .    .          .     .           .        .                             .                   .                . .        .               .  .               .  .       .     .        .           .        .                  . 
blockSeqs                     :                                                                                                                         .       .           .         .       A                            A            .   .  .         .    .          .     .           .        .                             .                   .                . .        .               .  .               .  .       .     .        .           .        .                  . 
blockSeqs                     :                                                                                                                         .       .           .         .       A                            A            .   .  .         .    .          .     .           .        .                             .                   .                . .        .               .  .               .  .       .     .        .           .        .                  . 
blockSeqs                     :                                                                                                                         .       .           .         .       A                            G            .   .  .         .    .          .     .           .        .                             .                   .                . .        .               .  .               .  .       .     .        .           .        .                  . 
blockSeqs                     :                                                                                                                         .       .           .         .       A                            G            .   .  .         .    .          .     .           .        .                             .                   .                . .        .               .  .               .  .       .     .        .           .        .                  . 
blockSeqs                     :                                                                                                                         .       .           .         .       A                            A            .   .  .         .    .          .     .           .        .                             .                   .                . .        .               .  .               .  .       .     .        .           .        .                  . 
blockSeqs                     :                                                                                                                         .       .           .         .       A                            G            .   .  .         .    .          .     .           .        .                             .                   .                . .        .               .  .               .  .       .     .        .           .        .                  . 
blockSeqs                     :                                                                                                                         .       .           .         .       A                            C            .   .  .         .    .          .     .           .        .                             .                   .                . .        .               .  .               .  .       .     .        .           .        .                  . 
blockSeqs                     :                                                                                                                         .       .           .         .       A                            A            .   .  .         .    .          .     .           .        .                             .                   .                . .        .               .  .               .  .       .     .        .           .        .                  . 
blockSeqs                     :                                                                                                                         .       .           .         .       A                            A            .   .  .         .    .          .     .           .        .                             .                   .                . .        .               .  .               .  .       .     .        .           .        .                  . 
blockSeqs                     :                                                                                                                         .       .           .         .       A                            G            .   .  .         .    .          .     .           .        .                             .                   .                . .        .               .  .               .  .       .     .        .           .        .                  . 
blockSeqs                     :                                                                                                                         .       .           .         .       A                            A            .   .  .         .    .          .     .           .        .                             .                   .                . .        .               .  .               .  .       .     .        .           .        .                  . 
blockSeqs                     :                                                                                                                         .       .           .         .       A                            G            .   .  .         .    .          .     .           .        .                             .                   .                . .        .               .  .               .  .       .     .        .           .        .                  . 
blockSeqs                     :                                                                                                                         .       .           .         .       A                            G            .   .  .         .    .          .     .           .        .                             .                   .                . .        .               .  .               .  .       .     .        .           .        .                  . 
blockSeqs                     :                                                                                                                         .       .           .         .       G                            A            .   .  .         .    .          .     .           .        .                             .                   .                . .        .               .  .               .  .       .     .        .           .        .                  . 
blockSeqs                     :                                                                                                                         .       .           .         .       A                            A            .   .  .         .    .          .     .           .        .                             .                   .                . .        .               .  .               .  .       .     .        .           .        .                  . 
blockSeqs                     :                                                                                                                         .       .           .         .       A                            A            .   .  .         .    .          .     .           .        .                             .                   .                . .        .               .  .               .  .       .     .        .           .        .                  . 
blockSeqs                     :                                                                                                                         .       .           .         .       A                            A            .   .  .         .    .          .     .           .        .                             .                   .                . .        .               .  .               .  .       .     .        .           .        .                  . 
blockSeqs                     :                                                                                                                         .       .           .         .       A                            G            .   .  .         .    .          .     .           .        .                             .                   .                . .        .               .  .               .  .       .     .        .           .        .                  . 
blockSeqs                     :                                                                                                                         .       .           .         .       A                            A            .   .  .         .    .          .     .           .        .                             .                   .                . .        .               .  .               .  .       .     .        .           .        .                  . 
blockSeqs                     :                                                                                                                         .       .           .         .       A                            G            .   .  .         .    .          .     .           .        .                             .                   .                . .        .               .  .               .  .       .     .        .           .        .                  . 
blockSeqs                     :                                                                                                                         .       .           .         .       A                            A            .   .  .         .    .          .     .           .        .                             .                   .                . .        .               .  .               .  .       .     .        .           .        .                  . 
blockSeqs                     :                                                                                                                         .       .           .         .       A                            G            .   .  .         .    .          .     .           .        .                             .                   .                . .        .               .  .               .  .       .     .        .           .        .                  . 
blockSeqs                     :                                                                                                                         .       .           .         .       A                            A            .   .  .         .    .          .     .           .        .                             .                   .                . .        .               .  .               .  .       .     .        .           .        .                  . 
blockSeqs                     :                                                                                                                         .       .           .         .       A                            G            .   .  .         .    .          .     .           .        .                             .                   .                . .        .               .  .               .  .       .     .        .           .        .                  . 
blockSeqs                     :                                                                                                                         .       .           .         .       A                            A            .   .  .         .    .          .     .           .        .                             .                   .                . .        .               .  .               .  .       .     .        .           .        .                  . 
blockSeqs                     :                                                                                                                         .       .           .         .       A                            A            .   .  .         .    .          .     .           .        .                             .                   .                . .        .               .  .               .  .       .     .        .           .        .                  . 
blockSeqs                     :                                                                                                                         .       .           .         .       A                            G            .   .  .         .    .          .     .           .        .                             .                   .                . .        .               .  .               .  .       .     .        .           .        .                  . 
blockSeqs                     :                                                                                                                         .       .           .         .       A                            A            .   .  .         .    .          .     .           .        .                             .                   .                . .        .               .  .               .  .       .     .        .           .        .                  . 
blockSeqs                     :                                                                                                                         .       .           .         .       A                            A            .   .  .         .    .          .     .           .        .                             .                   .                . .        .               .  .               .  .       .     .        .           .        .                  . 
blockSeqs                     :                                                                                                                         .       .           .         .       A                            A            .   .  .         .    .          .     .           .        .                             .                   .                . .        .               .  .               .  .       .     .        .           .        .                  . 
blockSeqs                     :                                                                                                                         .       .           .         .       G                            A            .   .  .         .    .          .     .           .        .                             .                   .                . .        .               .  .               .  .       .     .        .           .        .                  . 
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blockSeqs                     :                                                                                                                                 .           .         .       A                            T            .   .  .         .    .          .     .           .        .                             .                   .                . .        .               .  .               .  .       .     .        .           .        .                    
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Reference ( family-87 )       :                                                                                                             TTGA-CCTT-TG-------A-------CC------T------T--G--A-AA-A--A---C-A-A-T--------------A-GG-CGT-C-TT-CCT-C---T--C-------A-T---C-A-T-G---G--TG---A-T-C-AA--T---T---G-T--A-C-C--AA-GT-T-G-TA---AG-AT-CC--T-GG-A-GC-T-T-AC-G-G----T-T-CGG-TC-T-G-----T-A-T-----C----C---TG-CC---T-AC--A--AC-G--T-T--TT-C-CTA-C--------T---AA-GT-G-A--C-AC--T----AC-G--AC-C-TT-G--AC-CTT
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gi|40184                      :                                                                                                             TTGA-CCTG-CG-------A-------CT------T------T--G--A-AA-A--A---C-G-A-T--------------A-GG-CAT-C-TT-TCA-T---T--C-------A-T---C-A-T-G---G--TG---A-T-C-AA--T---T---G-T--T-C-C--AT-GT-T-G-TA---AG-AT-CT--T-GG-A-AC-T-T-TT-G-G----T-T-CAG-TC-T-G-----T-A-T-----T----C---TG-CC---C-AT--A--AC-G--T-T--TA-C-CTA-T--------T---AA-GT-G-A--C-AC--C----TT-G--AC-CTTT-G--AC-CT
gi|40186                      :                                                                                                             TTGA-TCGT-TG-------A-------CA------T------T--G--A-AA-A--A---T-A-A-C--------------A-GG-CAT-C-TT-CCT-C---T--C-------A-T---C-A-T-G---G--TG---A-T-C-AA--A---T---G-T--A-C-C--AA-GT-T-G-TA---AG-AT-CA--T-GG-A-GC-T-T-AC-G-G----T-T-CGG-TC-T-G-----T-A-T-----C----C---TG-CC---C--------AT-G--T-T--TT-C-CTA-T--------T---TA-GT-G-A--C-AC--T----AC-A--GT-C-TT-G--AC-CT
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gi|40214                      :                                                                                                             TTGA-CCTT-TG-------A-------CCCCGACCT------T--G--A-AA-A--A---C-A-A-C--------------T-GG--AT-C-TT-CCT-G---T--C-------A-A---C-A-T-G---G--TG---A-T-C-AA--T---T-----T--A-C-C--AA-GTCT-G-TA---TG-AT-CC----GG-A-GC-T-T-AC-G-G----T-T-T-G-CC-T-------T-A-TTCTGCT----C---TG-CC---T-AC--A--AC-G--T-T--TT-C-CTA----------T---AG-AG-G-A--C-AC--T----AC-G--ACTC-TT-G--AC-CTT
gi|40217                      :                                                                                                             TTGA-CCAC-TG-------A-------CC------T------T--G--A-AA-A--G---C-A-A-T--------------A-CA-CAT-C-TT-CCT-T---T--C-------A-T---C-A-T-G---G--TG---A-T-C-AA--A---T---G-T--A-C-C--AA-GT-T-G-TA---AA-AT--C--T-GG-A-AC-T-T-A--G-G----T-T-CAG-TA-T-G-----T-A-TGA---C----C---TG-CC---A-AT--A--AG-G--T-T--TT-C-CTA-C--------T---TG-GT-G-A--A-AC--T----TT-G--AC-A-TG-G--AC-CTtatcct
gi|40218                      :                                                                                                                A-CCTT-TG---------------------------------G--A-AA-A--A---C-A-A-T--------------A-GG-CGT-C-TC-CTT-T---T--A-------A-T---C-C-T-G---G--TGA--A-T-C-AA--T---T---G-T--A-C-CAAAA-GT-T-A-TA---AG-AT-GC--T-GA-ACGC-T-T-AC-G-GT---T-T-TGG-TC-TGG-----T-ATT-----C----C---TG-CC---T--------AC-G--T-T--TT-C-CTA-T--------T---AA-GTGG-A--CAAC--TCAGAAC-G--AC-C-TT-G--AC-CCTctgacct
gi|40225                      :                                                                                                   ttggaccacaTTGA-CCTC-CA-------A-------CC------T------T--G--A-AA-A--A---T-A-A-T--------------A-GG-CGT-C-TT-CCT-C---T--C-------A-TA--C-A-T-G---GTTTGC--ATT-C-AA--C---T-----T--A-C-C--AA-GT-T-GACA---TG-AT-CCTTT-GGCA-GC-T-T-AC-G-G----T-T-CAGTTC-T-G-----T-A-T-----C----C---CA-CC---TAAC--A--AT-G--T-T--TT-C-CTA-C--------T---AA-GT-G-A--C-AC--T----A--G--AC-C--T-G--AC-CCTttgatc
gi|40226                      :                                                                                                             TTGA-CCCTACG-------A-------CC------T------T--G--A-AA-A--A---C-A-A-T--------------A-GG-CAT-C-T--CCT-C---T--C-------A-T---C-A-T-G---G--AG---A-T-C-GA--TAACT---G-C--A-C-C--AA-GT-T-G-TA---AG-AT-CC--T-GG-A-GC-T-T-AT-ACG----T-T--AG-TC-T-G-----T-A-T-----CGCTGC---TG-CCTTTT-AC--ATCAC-A----T--TT-C-GTATC--------T---AAGGT-G-A--C-AC--T----AC-G--TG-C-TT-C--AC-CTttgactt
gi|40230                      :                                                                                                             TTGA-GCTT-TG-------T-------CC------T------T--G--A-AA-A--A---C-A-A-G--------------A-GG-CAT-C-TT-CCT-C---T--C-------A-T---A-A-G-G---G--TG---A-T-C-AA----------A-T--A-T-C----------G-TA---AG-AT-CC--T-GG-A-GC-T-T-AC-A-G----T-T-CGG-TC-T-C-----T-A-T-----C------------------------------------TT-C-CTA-C--------T---AT-GT-G-A--T-AC--T----AT-G--AC-C-TT-G--AC-CTTatg
gi|40235                      :                                                                                                             TTGA-CTTT-TG-------A-------CC------T------T--G--A-AC-A--A---C-A-A-T--------------A-GG-CAT-C-TT-TCA-C---T--C-------A-T---A-A-T-G---A--TG---A-T-A-AA--T---T---T-T--A-C-A--AA-GT-C-A-TA---AC-AT-CC--T-GG-A-GC-T-T-AT-G-G----C-T-CAG-TC-T-G-----T-A-T-----C----C---TG-CT---C-AC-----AT-T--T-T--TT-CATTA-C--------T---AA-GT-G-A--T-AC--T----TT-G--TC-T-TT-G--AC-CTTtgacct
gi|40241                      :                                                                                                             TTGA-CCTC-CC-------A-------CT------C------T--C--A-AA-A--A---C-G-A-T--------------G-GG-CAT-A-TT-CCT-C---T--C-------A-T---C-A-T-A---G--TG---A-T-C-AA--T---T---G----A-C-C--AA-GG-T-A-CA---AG-GT-CC--T-GG-A-GC-T-T-AC-A-A----T-T-CAG-TC-T-G-----T-A-C-----C----C----------------------------T--TT-C-CTA-C--------T---AA-GT-G-A--C-TC--T----AC-A--AC-C-TT-G--ACTCTT
gi|40242                      :                                                                                                             TTGA-CCTC-CG-------A-------CC------T------T--G--A-AA-A--A---G-A-A-T--------------A-CG-TAT-C-TT-CCT-C---T--C-------A-T---C-A-T-G---G--TG---A-T-T-AA--A---T---G-T--A-C-A--AA-GT-T-T-TA---AA-AT-CC--T-GG-A-GC-T-T-AC-A-G----T-T-TGG-TC-T-G-----T-A-T-----C----C---TG-CC---T-GC--A--Agacct
gi|40243                      :                                                                                                             TTGA-CCTT-TG-------A-------CT------T------T-------AA-A--A---C-A-G-T--------------A-GG-CAT-C-GT-CCT-C---T--C-------A-T---C-A-A-G---G--TG---A-T-C-AA--A---T---G-A--A------AA-G----G-CA---AG-AT-CC--T-GC-A-GC-T-C-AC-A-G----T-T-TGG-TC-A-G-----T-A-T-----C----A---TG-CC---T-AC--A--AG-G--T-T--TT-C-CTA-C--------T---AA-GT-G-A--T-GC--T----AG-A--AC-C-TT-A--
gi|40297                      :                                                                                                              TGA-CCTT-TG-------A-------CC------T------T--GC-A-AA-A--A---C-A-A-T--------------A-GG-TAT-C-TT-CCT-C---T--T-------A-T---C-A-T-G---G--TA---A-T-T-AA--C---T---G-T--A-C-C--AA-GT-T-G-TA---AT-AT-CC--T-GG-G-TC-T-T-GC-G-G----T-T-TGG-TC-T-G-----T-A-T-----C----C---TG-CC---T-AT--A--CC-A--T-T--TT-C-CTA-C--------T---GA-TT-G-C--A-AA--T----AC-G--AC-C-TT-A--AC-TTT
gi|40301                      :                                                                                                              TGA-CCTT-TG-------A-------CC------T------T--G--G-AA-A--A---C-A-A-T--------------A-GG-CAT-C-TT-CCT-C---T--G-------A-T---C-A-T-G---G--TG---A-T-C-AA--T---T---G-T--A-T-C--AA-GT-T-T-TA---AT-AT-CC--T-GG-A-GC-T-T-AC-A-G----T-T-TAG-TC-T-G-----C-A-T-----C----T---TG-CC---T-AC--G--A-------T--TT-C-CTA-CTATTAAATT---AA-GT-G-A--T-AT--T----AC-G--AC-T-TT-G--AC-CTTgatct
gi|40303                      :                                                                                                              TGA-ACCT-TA-------A-------CCC-----T------T--G--A-AA-A--AGA-C-A-A-T--------------A-G--TGT-C-TTTCCT-T---T--C-------A-T---C-T-T-G---G--TG---A-T-C-AA--T---T---G-T--A-C-C--TA-GT-T-G-TGTATGA-AT-CC--T-GG-A-GC-T-T-AC-G-G----T-T-CCG-TC-T-G-----C-A-T-----C----C----G-CC---T-ATCAA--AC-G----T--TT-C-CTA-C--------TA--AA-GT-G-A--C-AC--T----AC----AC-C-TT-G--AC-CTT
gi|40306                      :                                                                                                                         -------A-------CC------T------T--G--A-AA-A--AA--C-A-A-T--------------A-GG-CCT-CATT-CCT-C---T--C-------A-T---C-A-TTG---G--TGTTTA-TTC-AA--T---T---G-T--A-C-C--AA-GT-T-G-TA---A--AT-CC--T-GG-A-GC-T-T-AC-A-GAAAATAT-CGG-TC-T-G-----TTA-T-----C--------TG-CC---T-AC--A--AC-G--T-TTATC-C-CTA-C--------TGA-AA-GT-GCAC-C-AC--T----AC-G--AC-C-TT-G--AC-CTTtga
gi|40312                      :                                                                                                       tggactccGA-CCTC-TG-------A-------CC------T------T--C--A-AA-A--A---C-A-A-T--------------A-GG-CAT-C-TT-ACT-C---T--C-------A-T---C-A-T-G---G--TA---A-T-C-AA--A---A---G-T--A-C-C--AA-GC-T-A-TA---AT-TT-CC--T-GG-A-AC-T-T-AC-A-G----T-T-CAG-TT-T-G-----C-A-T-----C----T---TG-CC---T-AC--A--AC-G--T-T--TT-C-C-A--------------AA-GT-G-A--T-ATTAT----AT-G--AC-C-TT-G--AC-CTTt
gi|40314                      :                                                                                                               GA-CCTC-TG-------A-------CC------T------T--G--G-AA-A--A---C-A-T-T--------------A-GG-CAT-C-TT-TAT-C---T--C-------A-T---C-A-T-G---A--TG---A-T-C-AA--A---T---A-T--A-C-C--AA-GT-T-G-TA---TG-AT-CC--T-GG-A-GC-T-T-TC-A-G----T-T-TGG-TC-T-G-----C-A-T-----C----C---TG-CC---T-AC--A--Atgatct
gi|40315                      :                                                                                                               GA-CCTT-GG-------AAC-----CT------T------T--G--A-AA-A--A---C-A-A-T--------------A-GG-CAT-C-TT-CCTTC---T--C-------AAC---C-A-T-G---G--T----A-T-C-AA--T---T---G-TCAA-C-C--AA-GTGT-T-TA---CG-AT-TC--TTGG-A-GC-T-T-TT-G-G----T-T-CGG-TC-T-G-----T-A-T-----C----C---CG-CC---T-AC--A--AC-G--T-T--TT-T-CTA-C--------T---AC-GT-T-A--C-AC--T----AT-G--AC-C-TT-G--
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gi|40330                      :                                                                                                                  aCCT-TG-------A-------CC------T------T--G--A-AA-A--A---A-ACA-T--------------A-GG-TGT-C-TT-TCT-C---T--C-------A-T---C-A-T-G---G--TG---A-T-C-AA--T---T---G-T--A-C-C--AA-GT-T-G-TA---AG-AT-CC--C-GG-A-GA-G-T-AC-G-G----T-T-CGG-TC-T-A-----T-A-T-----C----C---TG-CC---T-AC--A--AC-G--T-T--TT-C-CTT-C--------T---AA-GT-G-A--C-TC--T----AC-G--AA-C-TT-G--AC-CTattgacc
gi|40332                      :                                                                                                                       aG-------A-------CC------T------T--A--A-AA-A--A---T-T-A-T--------------A-GG-CCT-C-TT-CCG-T---T--C-------A-T---C-A-T-G---G--TG---A-T-C-AA--T---T---G-T--A-C-C--AA-GT-T-G-TA---AA-AT-CC--T-GG-A-GC-T-T-AC-G-G----T-T-TGG-TG-T-G-----T-A-T-----C----C---TG-CC---T-AC--A--AT-G--G-T--TT-C-CTA-C--------T---AA-GT-G-A--C-AC--T----AC-G--AC-C-TT-G--AC-CTTctgacct
gi|40333                      :                                                                                                              accccCCT-TG-------A-------CC------T------T--G--A-AA-A--AA--C-A-A-T--------------A-AG-CAT-C-TT-CCT-C---T--A-------A-C---C-A-T-G---G--TA---A-T-C-AA--C---T---G-T--A-C-C--AA-GA-A-A-TA---AT-AT-CC--T-GT-A-GC-T-T-AC-G-G----T-T-AAG-TC-T-G-----T-A-T-----C----C---TA-CC---T-AC--A--AC-A--T-T--TT-C-CTA-C--------T---AA-GT-G-A--C-AC--T----AC-G--AC-T-TT-G--AC-CTTtgccct
gi|40334                      :                                                                                                                  aCTT-TG-------A-------CC------T------T--G--A-AA-A--A---T-A-A-T--------------A-GG-CAA-C-TT-CCT-C---T--C-------A-C---C-A-T-G---G--TG---A-T-C-AA--T---T---G-T--A-C-C--AA-GT-T-G-TA---AG-AT-CC--T-GG-A-GC-T-T-AC-G-G----T-T-CAG-TG-T-G-----T-A-T-----C----C---TG-CC---T-AC--A-----------------------------------AA-GT-G-A--C-AC--T----AC-G--AT-C-TT-G--AC-CTTaaatgacc
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gi|40391                      :                                                                                                                     T-TG-------A-------CC------T---------A--A-AA-A--G---C-A-A-T----------------GG-CAT-C-T--CCT-C---T--C-------A-T---C-A-T-G---G--TG---A-T-C-AA------T---G-A--A-C-C--AA-AT-T-G-TA---AG-A--CC--T--G-A-GC-T-A-AT-G-G----T-T-C-G-TC-T-G-----T-A-T-----C----C---TGACC---T-AC--A--AC-G----C--TT-C-CT--C--------T---AA-GT-G-A--C-AC--T----AC-G--AG-C-AT-G--AC-CTtaactt
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gi|40405                      :                                                                                                                        G-------A-------CC------T------T--C--A-AA-A--A---CTA-A-A--------------A-GG-C-----TT-CAT-C---T--C-------A-T---C-A-T-G---G--TG---A-T-C-GA--T---T---G-T--A-C-C--AA-GT-T-G-CA---AG-AT-CC--T-GG-A-GC-T-T-AT-G-G----T-T-CAG-TC-T-G-----T-A-T-----C----C---TG-CC---T-AT--A--------T-T--TT-C-CTA-C--------G---GA-GT-G-A--C-AG--T----AT-G--AC-C-TT-G--GC-ATTtgacct
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