lowQualScore : 11111 2222222222222222 111 11111 111111111 11111111 1111111111111111
lowQualScore : 2 2 00000 2 2 2 999 666666 2 2 2 33 33 666 2 4 2222222222222222 666 5555 2 555 33 2 33 33 5555555 2 2 2 00000 33 66666 666 33 2 33 2 2 5 33 66666 2 2 6 33 2 55 33 8 2 5 5 2 2 33 111111111 2 2 2 5 2 88888 2 444 2 55 5 2 11111111 0000000000000000 5 8888 55 5 33 2
lowQualScore : . . ..... . . . ... ...... . . . .. .. ... . . ................ ... .... . ... .. . .. .. ....... . . . ..... .. ..... ... .. . .. . . . .. ..... . . . .. . .. .. . . . . . . .. ......... . . . . . ..... . ... . .. . . ........ ................ . .... .. . .. .
lowQualScore : 5 5 11111 4 4 4 111 888888 4 4 4 22 22 555 4 7 8888888888888888 999 3333 5 222 44 5 44 44 9999999 5 5 5 44444 44 22222 999 44 5 44 5 5 0 44 22222 5 5 1 44 5 99 77 0 7 3 3 7 5 44 111111111 5 5 5 0 5 88888 5 444 5 99 0 5 66666666 6666666666666666 0 1111 99 0 44 5
consensus : AAAGAAG-GT-GTTGCA-T---G-TA-TCA-T-GGTG------A-TT-TC-CCTAAAG--G--TG---T-T-GC-------------G--TG---A----AA-GATCG-A-T--AA-A--A--T--A----A-AGTTAT-T-CA--TATA--T-----A---T--AG-TAAAA--CC-A-G-TGGA--ACTT-----TTT-GTCT-TGA--T-T--CCA--AAA-T-A-T-A-AG-AA--AATAA-G--T----C-T-A-AAAGGTGTG-T-A-----TT-G---A-C--AAG-A-A--------TT--A-----G--T----CAAA-AT-A--A--ATTG-AG--TTG-AAATCA
Reference ( gi|126801 ) : AAAGAAG-GT-GTTGCA-T---G-TA-TCA-T-GGTG------A-TT-TC-CCTAAAG--G--TG---T-T-GC-------------A--TG---A----AA-GATCG-G-T--AA-A--A--T--A----A-AGTTAT-T-CA--TAGA--T-----A---T--AG-TAAAA--CC-A-G-TGGA--ACTT-----TTT-GTCT-TTA--T-T--CCA--AAA-T-A-T-A-AG-AA--AATAA-G--T----C-T-A-AAAGGTGTG-T-A-----TT-G---A-C--AAG-A-A--------TT--A-----G--T----CAAA-AT-A--A--ATTG-AG--TTG-AAATCA
gi|126802 : AAAGAAG-GT-GTTGCA-T---A-TA-ACA-T-GGTG------A-TT-TC-CCTAAAG--G--TG---T-T-GC-------------G--TG---A----AA-GATCG-A-T--AA-A--A--T--A----A-AGTTAT-T-CA--TATA--T-----A---T--AG-AAAAA--CC-A-G-TAGA--ACTT-----TTT-GTCT-TGA--T-T--CCA--AAA-T-ATT-A-AG-AA--AATAA-G--T----C-T-A-AAAGGTGTG-T-A-----TT-G---A-C--AAG-A-A--------TT--A-----GC-T----CAAA-AT-A--A--ATTA-AG--TTG-AAATCA
gi|126803 : AAAGAAG-GT-GTTGCA-T---G-TA-TAA-T-G-T-------A-TT-TC-CCTAAAG--G--TG---T-T-GC-------------A--TG---A----AA-GATCG-G-T--AA-A--A--TAAA----A-AGTTA--T-CA--TAGA--T-----AT--T--AG-TAAAA--CC-A-G-TGGA--ACTT-----TTT-GTCT-TTA--T-T--CC---AAT-T-A-T-A-AGAAA--AATAA-G--T----CTT-T-AAAGGTGTG-T-A-----TT-G---A-C--AAGAA-A--------TT--A-----G--T----CAAA-AT-A--A--ATTG-AG--TTG-AAATCA
gi|126806 : AAAGAAG-GT-GTTGCAAT---G-TA-TCA-T-G-TG------A-TT-TC-CCTAAAG--G--TG---T-T-GC-------------A--TGG--A----AA-GATCG-GGT--AA-A--AATT--A----A-AATTAT-TTCA--TAGAATT-----A---T--AA-TAA----CC-A-G-TGGA--ACTT-----TTT-GTCT-TTA--T-T--CCA--AAAAT-A-T-A-AG-AA--AATAA-T--C----C-T-A-AAAGGTGTG-T-A-----TT-G---A-C--AAG-A-A--------TT--A-----GGTT----CAAA-AT-AGTA--ATTGAAG--TTG-AAATCA
gi|126805 : AAAGAAG-GT-GTTGCA-T---G-TA-TCA-T-GGTG------A-TT-T--CCTAAAG--G--TG---T-TAGC-------------A--TG---A----AA-AGTCG-G-T--AA-A--A--T--A----A-CGTTAT-T-CA--TAGA--T-----A---T--AGTTAAAA--CC-A-G-TGGAAGACTT-----TTT-GTC--TTA--T-T--CCA--AAAGT-A-T-A-AG-AA--AATAACG--T----C-T-ATATAGGT-TG-T-A-----TT-G---A----AAG-A-A--------TT--A-----G--T----CAAA-ATAA--A--ATTG-AG--CTGCAAATCA
gi|126808 : AAAGAAG-GT-GT-GCA-T---A-AA---A-TTGGTG------A-T---C-CCTAAAG--G--TG---T---GC-------------G--TG---A----AA-G-TCA-A-T--AA-A-----T--A----A-AGTTAT-A-CA---ATA--T-----A---T--AG-TAAA---CC-A-G-TAGA--ACTT-----TTT-GTCT-TGA--T-T--CCA--AAA-T-A-T-A-AG-AA--AATAA-A--T----C-T-A-TAA-GTGTG-T-A-----TT-G---A-C--AAG-A-A--------TT--------T--T----CAAACAT----A--ATTA-AG--TTA-AA
gi|126807 : AAAGAAG--T-GTTG-A-T---G-TA-TCA-TTGGTG------A-TT-TC-CCTAAAG--T--TG---T-T-GC-------------A--AG---A----A--GATCG---T--AA-A--A--T--A----A-A-TTAT---CA--TA-A--T-----A---T--AG-TAAAA--CC-A-GTTGGA--A-TT-----TTT-GTCG-TTA--T-T--CCA--AAA---A-T-A-AG-AA--A--AA-G-------C-T-A-AAA---GTG-T-A------T-G---A-C--AAG-A-A---------T--A-----G--T----CAAA-A--A--A--ATTGCAG--TTG-AA
gi|126809 : AAAGAAG-GT-GTTGTA-TCC-G-TA-TCA-TTGGTG------A-TT-CC----AAAG--GAGTG---T-TTGC-------------AAATG---A----AA-GATCG---T--AA-A--A--T-------A-AGTTAT-T-CA--TAG---T-----AGCCC--AG-TAAAA---C-A-G-TGGA--ACCT-----TTT-GTC--TTA--T-TG-CCATCAAA-T-ATT-A-AG-AAATAATAA-AT-T----C-T-A-AAAGGTGTG-T-AAATATTT-GGAAA-CAAAAG-A-AATGTAGATTT--ACGATGG--TACCACAAA-AT-AC-A--ATTG-AG--TTG-AAATCA
gi|126810 : AAAGAAG-GT-GTTGCAAC---G-TC-TCA-T-TTTA------T-TT-TC-TCAAAAG--G--TG---T-T-GC-------------G--TG---A----AA-GATCG-A-T--AA-C--A--T--A----A-AGTTAA-T-CA--AATA--T-----G---T--AA-TGAAA--TCGA-T-TGGA--AC-T-----TGT-GTCT-TGA--C-T--CAA--ACT-T-C-T-T-TG-AA--AATCA-C--T----T-T-T-AAAAACCTC-T-A-----TT-G---A-C--AAT-A-A--------TT--------G--T----C-TA-AT-A--A--TTTG-AG--TTT-AAATCA
gi|126804 : AAAGAAG-GT-GTTGCA-T---G-TA-TAA-T--GT-------A-TT-TC-CCTAAA---G--TG---T-T-
gi|126811 : AAGAAG-GT-GTTGCA-T---G-TATTCA-T-GGTG------A-TT-T--CCTAAAG--G--TG---T-T-GC-------------G--TGTCAA----GA-TATCGAA-T--AACA--A--T--A----A-AGTTATAT-CAATTGTT--T-----A---T--AG-T-AAA--CC-A-GTTGGA--ACTT-----TTT-GTCTATTC--A-T--CCA--AAA-T-A-T-A----GA--AATAA-AGTT----C-T-A-AAAGGTGTGTT-A-----TTAG---A-C--AAG-ACA--------TT--A-----G--T----CAAA-AT-A--ATGTTTA-AG--TTG-AAATCA
gi|126812 : AAGAAG--T-GTT-CA-TTAAG-CA-TTG-T-G-TG------A-TT-TC-C-TAAAGTTG--TG---TAT-GCG------------A--TG---A----AA-GATCG-A-T--AA-A--A--T--A----AGAGTTAT-T-CA---ATA--T-----A---T--AG-AAAAAACCC-A-A-TAGA--ACTT-----TTTTGTCT-TGA--T-T--CCA--AAA-T-A-TTA-AG-AA--AATAA-G--T----C-T-A-AAAGGTGTGTT-A-----TT-G---A-C--AAG-A-CT-------TT--A-----G--TC---CAAACAT-A--A--AATA-AGTATTG-AAATCA
gi|126813 : AGAAGTGTTGTTGCA-----G-TA-TCA-T-GGTG------A-TTGTT-CCTAAAG--G--CGGATT-T-GTCTTTCTTTCCAATA--TG---ACTAAAA-GA-CGTG-T--AA-ATCA--T--ACGTTA-AATTA----CA--AGAA--T-----A---TCTAG-TAAAA--CT-A-G-TGGA--ACTTCTTTCTTT-GTCT-TTAATT-T--CC
gi|126814 : GAAG-GT--TTGCA-T---G-TA-TCA-T-G-TG------A-CT-TC-CCTAAAG--G--TGT--T-T-GCT------------G--TG---A----AA-GATCG-GAT--AA-A--A--T-------A-AGTTAT-T-CA--T-TA--T-----A---T--AA-T-AAA--CC-A-G-TGAA--ACTT-----TTT-G-CT-TGA--T-TTCCCA--AAATT-A-T-G-AG-AA--AATAG---------C-TAA-AAAGGTGTG-TGA-----TT-G---A-C--AAGAA-A--------TT--A-----G--T----C--A-AT----A--ATTA-AG--TTG--AATCA
gi|126815 : AAG-GT-GCGCCA-C---G-TC-TCG-T-GGTACATGCAA-TT-TC-CCTAAAT--G--TT---T-T-GC-------------G--CG---G----AG-GATCG-A-T--AA-A--A--T--A----A-ATTTAT-T-C----AAA--T-----A---T--A--TAAAA--CC-ATT-TGGA--ACTT-----ATG-GT-T-TGA--T-T--AGA--ATA-T-G-T-A-TG-AA--AATAA-T--T----T-T-A-ATAGAATTG-T-A-----TT-G---A-C--AAT-A-A--------TTCGA-----G--C----CTAA-AT-A--AT-TTTG-AG--TTT-AA
gi|126816 : AAG-AT-GTTGCA-T---G-TC-CCA-T-GTTA------A-TT-TC-CCTAGAG--G--TG---T-T-GC-------------A--TA---A----AA-GATCG-A-T--AA-A--T--T--A----A-A
gi|126817 : -GT-GTTGCAAT---ACTA-ACAAT-GGTG------AATT-TCGCCTAAAG--G--T------T-GC----------------TG---A----AA-G-TCG-A-T--AA-A--A--T--A----A-AGTTAT-T-CA--TATA--T-----A---T--AG-TAAAA--CC-A-G-TAGA--ACTT-----TTT-GTCT-TGA--T-T--CCA--AAA-TAA-T-A-AG-AA--AAT-A-G--T----C-T-A-AAGGGTGTG-T-AG----TT-G---A-CA-AAG-A-A--------TT--A-----G--T----CAAA-AT-A--A--ATTA-AA--TTG-AAATCAcattgctgaaaatatgtataaaagacgtgtattgtcaggaattagccgaaataattagaatttaaatca
gi|126818 : A-T---G-CA-TCG-T-G-TG-----------TC-CCTAAAG-----TG---T-T-GC-------------G--TG---A----AAAGATCG-A-TGAAA-A--A--T--A----A-AGTTAT-T-T---TATA--T-----A---T--AT-GAGAA--CC-A-G-TGGA--ACTT-----TTT-GTCT-G-A--TCT--GCA--AAA-T-C-TTACAG-AA--AATAA-G--T----C-T-T-AAAGGTGTG-T-A-----TT-G---A-C--AAG---A--------TT--A-----G--C----CAAA-ATAA--A--ATTA-AG--CTG-AAATCA
gi|126819 : TAT-T-CA--TATA--TTATATA---T--AG-TACAA-----A-G-TG----ACTT-----TTT-GTCT-TGA--T-T--CCA--AAT-T-A-T-A-AG-----AATAA-G--TCTTAC-T-A-AAAGGTGTG-C-A-----TT-G---ATC--AAG-A-T--------TT--A--------------AAG-AT-A--G--ATGA-AG--TTT-AA
gi|126816 : G-AA--AATAT-G--T----A-T-A-AAAGACGTG-T-A-----TT-G---T-C--AGG-A-A--------TT--A-----G--C----CGAA-AT-A--A--TTAG-AA--TTT-AAATCA
Alignments
lowQualScore : 11111111111111 111111111 11111111
lowQualScore : 2 2 99999 2 4 2 4 6 666666 2 2 2 33 999999 2 55555555555555 4 8888 666 2 2 888 33 2 33 33 33 5555 2 2 2 666 666 1 33 55555 666 2 33 2 2 4 33 55555 2 66 33 666 88 33 7 4 4 4 2 2 33 000000000 2 2 2 5 2 88888 2 444 2 55 5 2 11111111 9999999999999999 5 8888 55 5 33 2
lowQualScore : . . ..... . . . . . ...... . . . .. ...... . .............. . .... ... . . ... .. . .. .. .. .... . . . ... ... . .. ..... ... . .. . . . .. ..... . .. .. ... .. .. . . . . . . .. ......... . . . . . ..... . ... . .. . . ........ ................ . .... .. . .. .
lowQualScore : 4 4 00000 2 4 2 4 7 444444 2 2 2 11 444444 2 33333333333333 4 9999 555 4 4 222 22 4 22 22 22 0000 4 4 2 111 999 8 11 66666 111 2 11 2 2 4 11 66666 2 11 11 111 33 22 1 7 7 7 4 4 22 222222222 4 5 5 0 5 88888 5 444 5 99 0 5 66666666 6666666666666666 0 1111 99 0 44 5
consensus : AAAGAAG-GT-GTTGCA-T---G-TA-TCA-T-GGTG------A-TT-TC-CCTAAAG--G------TG-T--------------T-GC-G--TG---AAA-GATC-G-A-T--AA-A--A--T--A----A-A-GTTAT-T---CA--TATA--T-----A---TAG-TAAAA--CC-A-G-TGGA--ACTT-----TTT-GTCTTG-A--T---T--CCA--AAA-T-A-T-A-AG-AAA--ATAA-G--T----C-T-A-AAAGGTGTG-T-A-----TT-G---A-C--AAG-A-A--------TT--A-----G--T----CAAA-AT-A--A--ATTG-AG--TTG-AAATCA
Reference ( family-865 ) : AAAGAAG-GT-GTTGCA-T---G-TA-TCA-T-GGTG------A-TT-TC-CCTAAAG--G------TG-T--------------T-GC-G--TG---AAA-GATC-G-A-T--AA-A--A--T--A----A-A-GTTAT-T---CA--TATA--T-----A---TAG-TAAAA--CC-A-G-TGGA--ACTT-----TTT-GTCTTG-A--T---T--CCA--AAA-T-A-T-A-AG-AAA--ATAA-G--T----C-T-A-AAAGGTGTG-T-A-----TT-G---A-C--AAG-A-A--------TT--A-----G--T----CAAA-AT-A--A--ATTG-AG--TTG-AAATCA
gi|126801 : AAAGAAG-GT-GTTGCA-T---G-TA-TCA-T-GGTG------A-TT-TC-CCTAAAG--G------TG-T--------------T-GC-A--TG---AAA-GATC-G-G-T--AA-A--A--T--A----A-A-GTTAT-T---CA--TAGA--T-----A---TAG-TAAAA--CC-A-G-TGGA--ACTT-----TTT-GTCTTT-A--T---T--CCA--AAA-T-A-T-A-AG-AAA--ATAA-G--T----C-T-A-AAAGGTGTG-T-A-----TT-G---A-C--AAG-A-A--------TT--A-----G--T----CAAA-AT-A--A--ATTG-AG--TTG-AAATCA
gi|126802 : AAAGAAG-GT-GTTGCA-T---A-TA-ACA-T-GGTG------A-TT-TC-CCTAAAG--G------TG-T--------------T-GC-G--TG---AAA-GATC-G-A-T--AA-A--A--T--A----A-A-GTTAT-T---CA--TATA--T-----A---TAG-AAAAA--CC-A-G-TAGA--ACTT-----TTT-GTCTTG-A--T---T--CCA--AAA-T-ATT-A-AG-AAA--ATAA-G--T----C-T-A-AAAGGTGTG-T-A-----TT-G---A-C--AAG-A-A--------TT--A-----GC-T----CAAA-AT-A--A--ATTA-AG--TTG-AAATCA
gi|126803 : AAAGAAG-GT-GTTGCA-T---G-TA-TAA-T-G-T-------A-TT-TC-CCTAAAG--G------TG-T--------------T-GC-A--TG---AAA-GATC-G-G-T--AA-A--A--TAAA----A-A-GTTA--T---CA--TAGA--T-----AT--TAG-TAAAA--CC-A-G-TGGA--ACTT-----TTT-GTCTTT-A--T---T--CC---AAT-T-A-T-A-AGAAAA--ATAA-G--T----CTT-T-AAAGGTGTG-T-A-----TT-G---A-C--AAGAA-A--------TT--A-----G--T----CAAA-AT-A--A--ATTG-AG--TTG-AAATCA
gi|126804 : AAAGAAG-GT-GTTGCA-T---G-TA-TAA-T--GT-------A-TT-TC-CCTAAA---G------TG-T--------------T-
gi|126805 : AAAGAAG-GT-GTTGCA-T---G-TA-TCA-T-GGTG------A-TT-T--CCTAAAG--G------TG-T--------------TAGC-A--TG---AAA-AGTC-G-G-T--AA-A--A--T--A----A-C-GTTAT-T---CA--TAGA--T-----A---TAGTTAAAA--CC-A-G-TGGAAGACTT-----TTT-GTCTT--A--T---T--CCA--AAAGT-A-T-A-AG-AAA--ATAACG--T----C-T-ATATAGGT-TG-T-A-----TT-G---A----AAG-A-A--------TT--A-----G--T----CAAA-ATAA--A--ATTG-AG--CTGCAAATCA
gi|126806 : AAAGAAG-GT-GTTGCAAT---G-TA-TCA-T-G-TG------A-TT-TC-CCTAAAG--G------TG-T--------------T-GC-A--TGG--AAA-GATC-G-GGT--AA-A--AATT--A----A-A-ATTAT-TT--CA--TAGAATT-----A---TAA-TAA----CC-A-G-TGGA--ACTT-----TTT-GTCTTT-A--T---T--CCA--AAAAT-A-T-A-AG-AAA--ATAA-T--C----C-T-A-AAAGGTGTG-T-A-----TT-G---A-C--AAG-A-A--------TT--A-----GGTT----CAAA-AT-AGTA--ATTGAAG--TTG-AAATCA
gi|126807 : AAAGAAG--T-GTTG-A-T---G-TA-TCA-TTGGTG------A-TT-TC-CCTAAAG--T------TG-T--------------T-GC-A--AG---AA--GATC-G---T--AA-A--A--T--A----A-A--TTAT-----CA--TA-A--T-----A---TAG-TAAAA--CC-A-GTTGGA--A-TT-----TTT-GTCGTT-A--T---T--CCA--AAA---A-T-A-AG-AAA----AA-G-------C-T-A-AAA---GTG-T-A------T-G---A-C--AAG-A-A---------T--A-----G--T----CAAA-A--A--A--ATTGCAG--TTG-AA
gi|126808 : AAAGAAG-GT-GT-GCA-T---A-AAAT---T-GGTG------A-T---C-CCTAAAG--G------TG-T----------------GC-G--TG---AAA-G-TC-A-A-T--AA-A-----T--A----A-A-GTTAT-A---CA---ATA--T-----A---TAG-TAAA---CC-A-G-TAGA--ACTT-----TTT-GTCTTG-A--T---T--CCA--AAA-T-A-T-A-AG-AAA--ATAA-A--T----C-T-A-TAA-GTGTG-T-A-----TT-G---A-C--AAG-A-A--------TT--------T--T----CAAACAT----A--ATTA-AG--TTA-AA
gi|126809 : AAAGAAG-GT-GTTGTA-TCC-G-TA-TCA-TTGGTG------A-TT-CC----AAAG--GAG----TG-T--------------TTGC-AAATG---AAA-GATC-G---T--AA-A--A--T--A----A---GTTAT-T---CA--TA-G--T-----AGCCCAG-TAAAA--C--A-G-TGGA--ACCT-----TTT-GTCTT--A--T---TG-CCATCAAA-T-A-TTA-AG-AAATAATAA-A--TT---C-T-A-AAAGGTGTG-T-AAATATTT-GGAAA-CAAAAG-A-AATGTAGATTT--ACGATGG--TACCACAAA-AT-AC-A--ATTG-AG--TTG-AAATCA
gi|126810 : AAAGAAG-GT-GTTGCAAC---G-TC-TCA-T-TTTA------T-TT-TC-TCAAAAG--G------TG-T--------------T-GC-G--TG---AAA-GATC-G-A-T--AA-C--A--T--A----A-A-GTTAA-T---CA--AATA--T-----G---TAA-TGAAA--TCGA-T-TGGA--AC-T-----TGT-GTCTTG-A--C---T--CAA--ACT-T-C-T-T-TG-AAA--ATCA-C--T----T-T-T-AAAAACCTC-T-A-----TT-G---A-C--AAT-A-A--------TT--------G--T----C-TA-AT-A--A--TTTG-AG--TTT-AAATCA
gi|126811 : AAGAAG-GT-GTTGCA-T---G-TATTCA-T-GGTG------A-TT-T--CCTAAAG--G------TG-T--------------T-GC-G--TGTCAAGA-TATC-GAA-T--AACA--A--T--A----A-A-GTTATAT---CAATTGTT--T-----A---TAG-T-AAA--CC-A-GTTGGA--ACTT-----TTT-GTCT---A--TTCAT--CCA--AAA-T-A-T-A----GAA--ATAA-AGTT----C-T-A-AAAGGTGTGTT-A-----TTAG---A-C--AAG-ACA--------TT--A-----G--T----CAAA-AT-A--ATGTTTA-AG--TTG-AAATCA
gi|126812 : AAGAAG--T-GTT-CA-TTAAG-CA-TTG-T-G-TG------A-TT-TC-C-TAAAGTTG------TG-TA-------------T-GC-GA-TG---AAA-GATC-G-A-T--AA-A--A--T--A----AGA-GTTAT-T---CA---ATA--T-----A---TAG-AAAAAACCC-A-A-TAGA--ACTT-----TTTTGTCTTG-A--T---T--CCA--AAA-T-A-TTA-AG-AAA--ATAA-G--T----C-T-A-AAAGGTGTGTT-A-----TT-G---A-C--AAG-A-CT-------TT--A-----G--TC---CAAACAT-A--A--AATA-AGTATTG-AAATCA
gi|126813 : AGAAGTGTTGTTGCA-----G-TA-TCA-T-GGTG------A-TTGTT-CCTAAAG--GCGGATTTG-TCTTTCTTTCCAATAT-GA-C--TA---AAA-GA-C-GTG-T--AA-ATCA--T--ACGTTA-A-ATTA------CAAGAATA--T-----C---TAG-TAAAA--CT-A-G-TGGA--ACTTCTTTCTTT-GTCTTT-AATT---T--CC
gi|126814 : GAAG-GT--TTGCA-T---G-TA-TCA-T-G-TG------A-CT-TC-CCTAAAG--G------TGTT--------------T-GCTG--TG---AAA-GATCGG-A-T--AA-A--A--T-------A-A-GTTAT-T---CA--T-TA--T-----A---TAA-T-AAA--CC-A-G-TGAA--ACTT-----TTT-G-CTTG-A--T---TTCCCA--AAATT-A-T-G-AG-AAA--ATAG---------C-TAA-AAAGGTGTG-TGA-----TT-G---A-C--AAGAA-A--------TT--A-----G--T----C--A-AT----A--ATTA-AG--TTG--AATCA
gi|126815 : AAG-GT-GCGCCA-C---G-TC-TCG-T-GGTACATGCAA-TT-TC-CCTAAAT--G------TT-T--------------T-GC-G--CG---GAG-GATC-G-A-T--AA-A--A--T--A----A-A-TTTAT-T---CA--AATA--T-----A-------TAAAA--CC-ATT-TGGA--ACTT-----ATG-GT-TTG-A--T---T--AGA--ATA-T-G-T-A-TG-AAA--ATAA-T--T----T-T-A-ATAGAATTG-T-A-----TT-G---A-C--AAT-A-A--------TTCGA-----G--C----CTAA-AT-A--AT-TTTG-AG--TTT-AA
gi|126816 : AAG-AT-GTTGCA-T---G-TC-CCA-T-GTTA------A-TT-TC-CCTAGAG--G------TG-T--------------T-GC-A--TA---AAA-GATC-G-A-T--AA-A--T--T--A----A-ACATTGC-TGAAAA--TATG--T-----A---TAA--AAGA--C----G-TGTA------------TT-GTCAGGAA--T---TAGCCG--AAA-TAA-T-T-AG-AAT--TTAA-A--T----C-
gi|126817 : -GT-GTTGCAAT---ACTA-ACAAT-GGTG------AATT-TCGCCTAAAG--G------T-----------------T-GC----TG---AAA-G-TC-G-A-T--AA-A--A--T--A----A-A-GTTAT-T---CA--TATA--T-----A---TAG-TAAAA--CC-A-G-TAGA--ACTT-----TTT-GTCTTG-A--T---T--CCA--AAA-TAA-T-A-AG-AAA--AT-A-G--T----C-T-A-AAGGGTGTG-T-AG----TT-G---A-CA-AAG-A-A--------TT--A-----G--T----CAAA-AT-A--A--ATTA-AA--TTG-AAATCAa
gi|126818 : A-T---G-CA-TCG-T-G-TG-----------TC-CCTAAAG---------TG-T--------------T-GC-G--TG---AAAAGATC-G-A-TGAAA-A--A--T--A----A-A-GTTAT-T---T---TATA--T-----A---TAT-GAGAA--CC-A-G-TGGA--ACTT-----TTT-GTC-TG-A--TC--T--GCA--AAA-T-CTT-ACAG-AAA--ATAA-G--T----C-T-T-AAAGGTGTG-T-A-----TT-G---A-C--AAG---A--------TT--A-----G--C----CAAA-ATAA--A--ATTA-AG--CTG-AAATCA
gi|126819 : TAT-T---CA--TATA--TTATATA---TAG-TACAA-----A-G-TG----ACTT-----TTT-GTCTTG-A--T---T--CCA--AAT-T-A-T-A-AG---A--ATAA-G--TCTTAC-T-A-AAAGGTGTG-C-A-----TT-G---ATC--AAG-A-T--------TT--A--------------AAG-AT-A--G--ATGA-AG--TTT-AA
Alignments
lowQualScore : 11111111111111 111111111 11111111
lowQualScore : 2 2 99999 2 4 2 4 6 666666 2 2 2 33 999999 2 55555555555555 4 8888 666 2 2 888 33 2 33 33 33 5555 2 2 2 666 666 1 33 55555 666 2 33 2 2 4 33 55555 2 66 33 666 88 33 7 4 4 4 2 2 33 000000000 2 2 2 5 2 88888 2 444 2 55 5 2 11111111 9999999999999999 5 8888 55 5 33 2
lowQualScore : . . ..... . . . . . ...... . . . .. ...... . .............. . .... ... . . ... .. . .. .. .. .... . . . ... ... . .. ..... ... . .. . . . .. ..... . .. .. ... .. .. . . . . . . .. ......... . . . . . ..... . ... . .. . . ........ ................ . .... .. . .. .
lowQualScore : 4 4 00000 2 4 2 4 7 444444 2 2 2 11 444444 2 33333333333333 4 9999 555 4 4 222 22 4 22 22 22 0000 4 4 2 111 999 8 11 66666 111 2 11 2 2 4 11 66666 2 11 11 111 33 22 1 7 7 7 4 4 22 222222222 4 5 5 0 5 88888 5 444 5 99 0 5 66666666 6666666666666666 0 1111 99 0 44 5
consensus : AAAGAAG-GT-GTTGCA-T---G-TA-TCA-T-GGTG------A-TT-TC-CCTAAAG--G------TG-T--------------T-GC-G--TG---AAA-GATC-G-A-T--AA-A--A--T--A----A-A-GTTAT-T---CA--TATA--T-----A---TAG-TAAAA--CC-A-G-TGGA--ACTT-----TTT-GTCTTG-A--T---T--CCA--AAA-T-A-T-A-AG-AAA--ATAA-G--T----C-T-A-AAAGGTGTG-T-A-----TT-G---A-C--AAG-A-A--------TT--A-----G--T----CAAA-AT-A--A--ATTG-AG--TTG-AAATCA
Reference ( family-865 ) : AAAGAAG-GT-GTTGCA-T---G-TA-TCA-T-GGTG------A-TT-TC-CCTAAAG--G------TG-T--------------T-GC-G--TG---AAA-GATC-G-A-T--AA-A--A--T--A----A-A-GTTAT-T---CA--TATA--T-----A---TAG-TAAAA--CC-A-G-TGGA--ACTT-----TTT-GTCTTG-A--T---T--CCA--AAA-T-A-T-A-AG-AAA--ATAA-G--T----C-T-A-AAAGGTGTG-T-A-----TT-G---A-C--AAG-A-A--------TT--A-----G--T----CAAA-AT-A--A--ATTG-AG--TTG-AAATCA
gi|126801 : AAAGAAG-GT-GTTGCA-T---G-TA-TCA-T-GGTG------A-TT-TC-CCTAAAG--G------TG-T--------------T-GC-A--TG---AAA-GATC-G-G-T--AA-A--A--T--A----A-A-GTTAT-T---CA--TAGA--T-----A---TAG-TAAAA--CC-A-G-TGGA--ACTT-----TTT-GTCTTT-A--T---T--CCA--AAA-T-A-T-A-AG-AAA--ATAA-G--T----C-T-A-AAAGGTGTG-T-A-----TT-G---A-C--AAG-A-A--------TT--A-----G--T----CAAA-AT-A--A--ATTG-AG--TTG-AAATCA
gi|126802 : AAAGAAG-GT-GTTGCA-T---A-TA-ACA-T-GGTG------A-TT-TC-CCTAAAG--G------TG-T--------------T-GC-G--TG---AAA-GATC-G-A-T--AA-A--A--T--A----A-A-GTTAT-T---CA--TATA--T-----A---TAG-AAAAA--CC-A-G-TAGA--ACTT-----TTT-GTCTTG-A--T---T--CCA--AAA-T-ATT-A-AG-AAA--ATAA-G--T----C-T-A-AAAGGTGTG-T-A-----TT-G---A-C--AAG-A-A--------TT--A-----GC-T----CAAA-AT-A--A--ATTA-AG--TTG-AAATCA
gi|126803 : AAAGAAG-GT-GTTGCA-T---G-TA-TAA-T-G-T-------A-TT-TC-CCTAAAG--G------TG-T--------------T-GC-A--TG---AAA-GATC-G-G-T--AA-A--A--TAAA----A-A-GTTA--T---CA--TAGA--T-----AT--TAG-TAAAA--CC-A-G-TGGA--ACTT-----TTT-GTCTTT-A--T---T--CC---AAT-T-A-T-A-AGAAAA--ATAA-G--T----CTT-T-AAAGGTGTG-T-A-----TT-G---A-C--AAGAA-A--------TT--A-----G--T----CAAA-AT-A--A--ATTG-AG--TTG-AAATCA
gi|126804 : AAAGAAG-GT-GTTGCA-T---G-TA-TAA-T--GT-------A-TT-TC-CCTAAA---G------TG-T--------------T-
gi|126805 : AAAGAAG-GT-GTTGCA-T---G-TA-TCA-T-GGTG------A-TT-T--CCTAAAG--G------TG-T--------------TAGC-A--TG---AAA-AGTC-G-G-T--AA-A--A--T--A----A-C-GTTAT-T---CA--TAGA--T-----A---TAGTTAAAA--CC-A-G-TGGAAGACTT-----TTT-GTCTT--A--T---T--CCA--AAAGT-A-T-A-AG-AAA--ATAACG--T----C-T-ATATAGGT-TG-T-A-----TT-G---A----AAG-A-A--------TT--A-----G--T----CAAA-ATAA--A--ATTG-AG--CTGCAAATCA
gi|126806 : AAAGAAG-GT-GTTGCAAT---G-TA-TCA-T-G-TG------A-TT-TC-CCTAAAG--G------TG-T--------------T-GC-A--TGG--AAA-GATC-G-GGT--AA-A--AATT--A----A-A-ATTAT-TT--CA--TAGAATT-----A---TAA-TAA----CC-A-G-TGGA--ACTT-----TTT-GTCTTT-A--T---T--CCA--AAAAT-A-T-A-AG-AAA--ATAA-T--C----C-T-A-AAAGGTGTG-T-A-----TT-G---A-C--AAG-A-A--------TT--A-----GGTT----CAAA-AT-AGTA--ATTGAAG--TTG-AAATCA
gi|126807 : AAAGAAG--T-GTTG-A-T---G-TA-TCA-TTGGTG------A-TT-TC-CCTAAAG--T------TG-T--------------T-GC-A--AG---AA--GATC-G---T--AA-A--A--T--A----A-A--TTAT-----CA--TA-A--T-----A---TAG-TAAAA--CC-A-GTTGGA--A-TT-----TTT-GTCGTT-A--T---T--CCA--AAA---A-T-A-AG-AAA----AA-G-------C-T-A-AAA---GTG-T-A------T-G---A-C--AAG-A-A---------T--A-----G--T----CAAA-A--A--A--ATTGCAG--TTG-AA
gi|126808 : AAAGAAG-GT-GT-GCA-T---A-AAAT---T-GGTG------A-T---C-CCTAAAG--G------TG-T----------------GC-G--TG---AAA-G-TC-A-A-T--AA-A-----T--A----A-A-GTTAT-A---CA---ATA--T-----A---TAG-TAAA---CC-A-G-TAGA--ACTT-----TTT-GTCTTG-A--T---T--CCA--AAA-T-A-T-A-AG-AAA--ATAA-A--T----C-T-A-TAA-GTGTG-T-A-----TT-G---A-C--AAG-A-A--------TT--------T--T----CAAACAT----A--ATTA-AG--TTA-AA
gi|126809 : AAAGAAG-GT-GTTGTA-TCC-G-TA-TCA-TTGGTG------A-TT-CC----AAAG--GAG----TG-T--------------TTGC-AAATG---AAA-GATC-G---T--AA-A--A--T--A----A---GTTAT-T---CA--TA-G--T-----AGCCCAG-TAAAA--C--A-G-TGGA--ACCT-----TTT-GTCTT--A--T---TG-CCATCAAA-T-A-TTA-AG-AAATAATAA-A--TT---C-T-A-AAAGGTGTG-T-AAATATTT-GGAAA-CAAAAG-A-AATGTAGATTT--ACGATGG--TACCACAAA-AT-AC-A--ATTG-AG--TTG-AAATCA
gi|126810 : AAAGAAG-GT-GTTGCAAC---G-TC-TCA-T-TTTA------T-TT-TC-TCAAAAG--G------TG-T--------------T-GC-G--TG---AAA-GATC-G-A-T--AA-C--A--T--A----A-A-GTTAA-T---CA--AATA--T-----G---TAA-TGAAA--TCGA-T-TGGA--AC-T-----TGT-GTCTTG-A--C---T--CAA--ACT-T-C-T-T-TG-AAA--ATCA-C--T----T-T-T-AAAAACCTC-T-A-----TT-G---A-C--AAT-A-A--------TT--------G--T----C-TA-AT-A--A--TTTG-AG--TTT-AAATCA
gi|126811 : AAGAAG-GT-GTTGCA-T---G-TATTCA-T-GGTG------A-TT-T--CCTAAAG--G------TG-T--------------T-GC-G--TGTCAAGA-TATC-GAA-T--AACA--A--T--A----A-A-GTTATAT---CAATTGTT--T-----A---TAG-T-AAA--CC-A-GTTGGA--ACTT-----TTT-GTCT---A--TTCAT--CCA--AAA-T-A-T-A----GAA--ATAA-AGTT----C-T-A-AAAGGTGTGTT-A-----TTAG---A-C--AAG-ACA--------TT--A-----G--T----CAAA-AT-A--ATGTTTA-AG--TTG-AAATCA
gi|126812 : AAGAAG--T-GTT-CA-TTAAG-CA-TTG-T-G-TG------A-TT-TC-C-TAAAGTTG------TG-TA-------------T-GC-GA-TG---AAA-GATC-G-A-T--AA-A--A--T--A----AGA-GTTAT-T---CA---ATA--T-----A---TAG-AAAAAACCC-A-A-TAGA--ACTT-----TTTTGTCTTG-A--T---T--CCA--AAA-T-A-TTA-AG-AAA--ATAA-G--T----C-T-A-AAAGGTGTGTT-A-----TT-G---A-C--AAG-A-CT-------TT--A-----G--TC---CAAACAT-A--A--AATA-AGTATTG-AAATCA
gi|126813 : AGAAGTGTTGTTGCA-----G-TA-TCA-T-GGTG------A-TTGTT-CCTAAAG--GCGGATTTG-TCTTTCTTTCCAATAT-GA-C--TA---AAA-GA-C-GTG-T--AA-ATCA--T--ACGTTA-A-ATTA------CAAGAATA--T-----C---TAG-TAAAA--CT-A-G-TGGA--ACTTCTTTCTTT-GTCTTT-AATT---T--CC
gi|126814 : GAAG-GT--TTGCA-T---G-TA-TCA-T-G-TG------A-CT-TC-CCTAAAG--G------TGTT--------------T-GCTG--TG---AAA-GATCGG-A-T--AA-A--A--T-------A-A-GTTAT-T---CA--T-TA--T-----A---TAA-T-AAA--CC-A-G-TGAA--ACTT-----TTT-G-CTTG-A--T---TTCCCA--AAATT-A-T-G-AG-AAA--ATAG---------C-TAA-AAAGGTGTG-TGA-----TT-G---A-C--AAGAA-A--------TT--A-----G--T----C--A-AT----A--ATTA-AG--TTG--AATCA
gi|126815 : AAG-GT-GCGCCA-C---G-TC-TCG-T-GGTACATGCAA-TT-TC-CCTAAAT--G------TT-T--------------T-GC-G--CG---GAG-GATC-G-A-T--AA-A--A--T--A----A-A-TTTAT-T---CA--AATA--T-----A-------TAAAA--CC-ATT-TGGA--ACTT-----ATG-GT-TTG-A--T---T--AGA--ATA-T-G-T-A-TG-AAA--ATAA-T--T----T-T-A-ATAGAATTG-T-A-----TT-G---A-C--AAT-A-A--------TTCGA-----G--C----CTAA-AT-A--AT-TTTG-AG--TTT-AA
gi|126816 : AAG-AT-GTTGCA-T---G-TC-CCA-T-GTTA------A-TT-TC-CCTAGAG--G------TG-T--------------T-GC-A--TA---AAA-GATC-G-A-T--AA-A--T--T--A----A-ACATTGC-TGAAAA--TATG--T-----A---TAA--AAGA--C----G-TGTA------------TT-GTCAGGAA--T---TAGCCG--AAA-TAA-T-T-AG-AAT--TTAA-A--T----C-
gi|126817 : -GT-GTTGCAAT---ACTA-ACAAT-GGTG------AATT-TCGCCTAAAG--G------T-----------------T-GC----TG---AAA-G-TC-G-A-T--AA-A--A--T--A----A-A-GTTAT-T---CA--TATA--T-----A---TAG-TAAAA--CC-A-G-TAGA--ACTT-----TTT-GTCTTG-A--T---T--CCA--AAA-TAA-T-A-AG-AAA--AT-A-G--T----C-T-A-AAGGGTGTG-T-AG----TT-G---A-CA-AAG-A-A--------TT--A-----G--T----CAAA-AT-A--A--ATTA-AA--TTG-AAATCAa
gi|126818 : A-T---G-CA-TCG-T-G-TG-----------TC-CCTAAAG---------TG-T--------------T-GC-G--TG---AAAAGATC-G-A-TGAAA-A--A--T--A----A-A-GTTAT-T---T---TATA--T-----A---TAT-GAGAA--CC-A-G-TGGA--ACTT-----TTT-GTC-TG-A--TC--T--GCA--AAA-T-CTT-ACAG-AAA--ATAA-G--T----C-T-T-AAAGGTGTG-T-A-----TT-G---A-C--AAG---A--------TT--A-----G--C----CAAA-ATAA--A--ATTA-AG--CTG-AAATCA
gi|126819 : TAT-T---CA--TATA--TTATATA---TAG-TACAA-----A-G-TG----ACTT-----TTT-GTCTTG-A--T---T--CCA--AAT-T-A-T-A-AG---A--ATAA-G--TCTTAC-T-A-AAAGGTGTG-C-A-----TT-G---ATC--AAG-A-T--------TT--A--------------AAG-AT-A--G--ATGA-AG--TTT-AA
blockSeqs : T T TTAA C A A T G CATGCA A G G TT CGGATT T CTTTCTTTCCAATA A AAA TCA A G GG GA C TC AT AA CGTT G C A GAA ATT T AT TATAT GCC T AC G T T AG CTTTC T GA AT TCA TC TC G A T T C A TA GTCTTA T A T T G AATAT A GAA T AA A C ATGTAGAT ACGATGGTACCA C AGT TG A TA C
blockSeqs : . . TCC . T . T G . . . . . AG . A T GA G . . AA . . . . . . . . . T AGA G . . T . . . . T . . . G . C AG . A A T T . . . AGTT . . . T . G . . . A A . T AGGTT C AA T C . .
blockSeqs : . . AT . . . . G . . . . . . . . . TG . . . TG . . . . . . . . . . T G . . . . . . . . . . . T . . G . T . . . . . . CGT . . . . . . . . . . . . . CGAGC . AC . . . .
blockSeqs : . . AC . . . . G . . . . . . . . . G . . . A . . . . . . . . . . T G . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . ATT . . . . . . . . . . . . . AGCT . AA . . . .
blockSeqs : . . AT . . . . G . . . . . . . . . A . . . G . . . . . . . . . . T T . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . GT . . . . . . . . . . . . . AGTC . A . . . .
blockSeqs : . . T . . . . G . . . . . . . . . A . . . G . . . . . . . . . . T T . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . . . . GT . . . . . . . . . . . . . AGT . A . . . .
blockSeqs : . . T . . . . T . . . . . . . . . A . . . A . . . . . . . . . . T T . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . . . . TC . . . . . . . . . . . . . AGT . A . . . .
blockSeqs : . . T . . . . G . . . . . . . . . A . . . A . . . . . . . . . . T T . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . . . . AT . . . . . . . . . . . . . AGT . A . . . .
blockSeqs : . . T . . . . G . . . . . . . . . G . . . A . . . . . . . . . . A T . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . CT . . . . . . . . . . . . . AGT . A . . . .
blockSeqs : . . T . . . . G . . . . . . . . . G . . . A . . . . . . . . . . T T . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . . . . GT . . . . . . . . . . . . . AGT . A . . . .
blockSeqs : . . T . . . . T . . . . . . . . . G . . . A . . . . . . . . . . A T . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . . . . TT . . . . . . . . . . . . . AGT . A . . . .
blockSeqs : . . T . . . . G . . . . . . . . . C . . . A . . . . . . . . . . T T . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . . . . AT . . . . . . . . . . . . . AGC . A . . . .
blockSeqs : . . T . . . . . . . . . . . . . . G . . . A . . . . . . . . . . T T . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . . . . GT . . . . . . . . . . . . . TT . A . . . .
blockSeqs : . . C . . . . . . . . . . . . . . A . . . A . . . . . . . . . . T T . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . . . . GT . . . . . . . . . . . . . GT . . . . . .
blockSeqs : . . T . . . . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . . . . . . . T T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . . . . . . A . . . . . .
blockSeqs : . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqCons :
originalCons : AAAGAAG-GT-GTTGCA-T---G-TA-TCA-T-GGTG------A-TT-TC-CCTAAAG--G------TG-T--------------T-GC-G--TG---AAA-GATC-G-A-T--AA-A--A--T--A----A-A-GTTAT-T---CA--TATA--T-----A---TAG-TAAAA--CC-A-G-TGGA--ACTT-----TTT-GTCTTG-A--T---T--CCA--AAA-T-A-T-A-AG-AAA--ATAA-G--T----C-T-A-AAAGGTGTG-T-A-----TT-G---A-C--AAG-A-A--------TT--A-----G--T----CAAA-AT-A--A--ATTG-AG--TTG-AAATCA
finalCons : AAAGAAG-GT-GTTGCA-T---G-TA-TCA-T-GGTG------A-TT-TC-CCTAAAG--G------TG-T--------------T-GC-G--TG---AAA-GATC-G-A-T--AA-A--A--T--A----A-A-GTTAT-T---CA--TATA--T-----A---TAG-TAAAA--CC-A-G-TGGA--ACTT-----TTT-GTCTTG-A--T---T--CCA--AAA-T-A-T-A-AG-AAA--ATAA-G--T----C-T-A-AAAGGTGTG-T-A-----TT-G---A-C--AAG-A-A--------TT--A-----G--T----CAAA-AT-A--A--ATTG-AG--TTG-AAATCA
Alignments
lowQualScore : 11111111111111 111111111 11111111
lowQualScore : 2 2 99999 2 4 2 4 6 666666 2 2 2 33 999999 2 55555555555555 4 8888 666 2 2 888 33 2 33 33 33 5555 2 2 2 666 666 1 33 55555 666 2 33 2 2 4 33 55555 2 66 33 666 88 33 7 4 4 4 2 2 33 000000000 2 2 2 5 2 88888 2 444 2 55 5 2 11111111 9999999999999999 5 8888 55 5 33 2
lowQualScore : . . ..... . . . . . ...... . . . .. ...... . .............. . .... ... . . ... .. . .. .. .. .... . . . ... ... . .. ..... ... . .. . . . .. ..... . .. .. ... .. .. . . . . . . .. ......... . . . . . ..... . ... . .. . . ........ ................ . .... .. . .. .
lowQualScore : 4 4 00000 2 4 2 4 7 444444 2 2 2 11 444444 2 33333333333333 4 9999 555 4 4 222 22 4 22 22 22 0000 4 4 2 111 999 8 11 66666 111 2 11 2 2 4 11 66666 2 11 11 111 33 22 1 7 7 7 4 4 22 222222222 4 5 5 0 5 88888 5 444 5 99 0 5 66666666 6666666666666666 0 1111 99 0 44 5
consensus : AAAGAAG-GT-GTTGCA-T---G-TA-TCA-T-GGTG------A-TT-TC-CCTAAAG--G------TG-T--------------T-GC-G--TG---AAA-GATC-G-A-T--AA-A--A--T--A----A-A-GTTAT-T---CA--TATA--T-----A---TAG-TAAAA--CC-A-G-TGGA--ACTT-----TTT-GTCTTG-A--T---T--CCA--AAA-T-A-T-A-AG-AAA--ATAA-G--T----C-T-A-AAAGGTGTG-T-A-----TT-G---A-C--AAG-A-A--------TT--A-----G--T----CAAA-AT-A--A--ATTG-AG--TTG-AAATCA
Reference ( family-865 ) : AAAGAAG-GT-GTTGCA-T---G-TA-TCA-T-GGTG------A-TT-TC-CCTAAAG--G------TG-T--------------T-GC-G--TG---AAA-GATC-G-A-T--AA-A--A--T--A----A-A-GTTAT-T---CA--TATA--T-----A---TAG-TAAAA--CC-A-G-TGGA--ACTT-----TTT-GTCTTG-A--T---T--CCA--AAA-T-A-T-A-AG-AAA--ATAA-G--T----C-T-A-AAAGGTGTG-T-A-----TT-G---A-C--AAG-A-A--------TT--A-----G--T----CAAA-AT-A--A--ATTG-AG--TTG-AAATCA
gi|126801 : AAAGAAG-GT-GTTGCA-T---G-TA-TCA-T-GGTG------A-TT-TC-CCTAAAG--G------TG-T--------------T-GC-A--TG---AAA-GATC-G-G-T--AA-A--A--T--A----A-A-GTTAT-T---CA--TAGA--T-----A---TAG-TAAAA--CC-A-G-TGGA--ACTT-----TTT-GTCTTT-A--T---T--CCA--AAA-T-A-T-A-AG-AAA--ATAA-G--T----C-T-A-AAAGGTGTG-T-A-----TT-G---A-C--AAG-A-A--------TT--A-----G--T----CAAA-AT-A--A--ATTG-AG--TTG-AAATCA
gi|126802 : AAAGAAG-GT-GTTGCA-T---A-TA-ACA-T-GGTG------A-TT-TC-CCTAAAG--G------TG-T--------------T-GC-G--TG---AAA-GATC-G-A-T--AA-A--A--T--A----A-A-GTTAT-T---CA--TATA--T-----A---TAG-AAAAA--CC-A-G-TAGA--ACTT-----TTT-GTCTTG-A--T---T--CCA--AAA-T-ATT-A-AG-AAA--ATAA-G--T----C-T-A-AAAGGTGTG-T-A-----TT-G---A-C--AAG-A-A--------TT--A-----GC-T----CAAA-AT-A--A--ATTA-AG--TTG-AAATCA
gi|126803 : AAAGAAG-GT-GTTGCA-T---G-TA-TAA-T-G-T-------A-TT-TC-CCTAAAG--G------TG-T--------------T-GC-A--TG---AAA-GATC-G-G-T--AA-A--A--TAAA----A-A-GTTA--T---CA--TAGA--T-----AT--TAG-TAAAA--CC-A-G-TGGA--ACTT-----TTT-GTCTTT-A--T---T--CC---AAT-T-A-T-A-AGAAAA--ATAA-G--T----CTT-T-AAAGGTGTG-T-A-----TT-G---A-C--AAGAA-A--------TT--A-----G--T----CAAA-AT-A--A--ATTG-AG--TTG-AAATCA
gi|126804 : AAAGAAG-GT-GTTGCA-T---G-TA-TAA-T--GT-------A-TT-TC-CCTAAA---G------TG-T--------------T-
gi|126805 : AAAGAAG-GT-GTTGCA-T---G-TA-TCA-T-GGTG------A-TT-T--CCTAAAG--G------TG-T--------------TAGC-A--TG---AAA-AGTC-G-G-T--AA-A--A--T--A----A-C-GTTAT-T---CA--TAGA--T-----A---TAGTTAAAA--CC-A-G-TGGAAGACTT-----TTT-GTCTT--A--T---T--CCA--AAAGT-A-T-A-AG-AAA--ATAACG--T----C-T-ATATAGGT-TG-T-A-----TT-G---A----AAG-A-A--------TT--A-----G--T----CAAA-ATAA--A--ATTG-AG--CTGCAAATCA
gi|126806 : AAAGAAG-GT-GTTGCAAT---G-TA-TCA-T-G-TG------A-TT-TC-CCTAAAG--G------TG-T--------------T-GC-A--TGG--AAA-GATC-G-GGT--AA-A--AATT--A----A-A-ATTAT-TT--CA--TAGAATT-----A---TAA-TAA----CC-A-G-TGGA--ACTT-----TTT-GTCTTT-A--T---T--CCA--AAAAT-A-T-A-AG-AAA--ATAA-T--C----C-T-A-AAAGGTGTG-T-A-----TT-G---A-C--AAG-A-A--------TT--A-----GGTT----CAAA-AT-AGTA--ATTGAAG--TTG-AAATCA
gi|126807 : AAAGAAG--T-GTTG-A-T---G-TA-TCA-TTGGTG------A-TT-TC-CCTAAAG--T------TG-T--------------T-GC-A--AG---AA--GATC-G---T--AA-A--A--T--A----A-A--TTAT-----CA--TA-A--T-----A---TAG-TAAAA--CC-A-GTTGGA--A-TT-----TTT-GTCGTT-A--T---T--CCA--AAA---A-T-A-AG-AAA----AA-G-------C-T-A-AAA---GTG-T-A------T-G---A-C--AAG-A-A---------T--A-----G--T----CAAA-A--A--A--ATTGCAG--TTG-AA
gi|126808 : AAAGAAG-GT-GT-GCA-T---A-AAAT---T-GGTG------A-T---C-CCTAAAG--G------TG-T----------------GC-G--TG---AAA-G-TC-A-A-T--AA-A-----T--A----A-A-GTTAT-A---CA---ATA--T-----A---TAG-TAAA---CC-A-G-TAGA--ACTT-----TTT-GTCTTG-A--T---T--CCA--AAA-T-A-T-A-AG-AAA--ATAA-A--T----C-T-A-TAA-GTGTG-T-A-----TT-G---A-C--AAG-A-A--------TT--------T--T----CAAACAT----A--ATTA-AG--TTA-AA
gi|126809 : AAAGAAG-GT-GTTGTA-TCC-G-TA-TCA-TTGGTG------A-TT-CC----AAAG--GAG----TG-T--------------TTGC-AAATG---AAA-GATC-G---T--AA-A--A--T--A----A---GTTAT-T---CA--TA-G--T-----AGCCCAG-TAAAA--C--A-G-TGGA--ACCT-----TTT-GTCTT--A--T---TG-CCATCAAA-T-A-TTA-AG-AAATAATAA-A--TT---C-T-A-AAAGGTGTG-T-AAATATTT-GGAAA-CAAAAG-A-AATGTAGATTT--ACGATGG--TACCACAAA-AT-AC-A--ATTG-AG--TTG-AAATCA
gi|126810 : AAAGAAG-GT-GTTGCAAC---G-TC-TCA-T-TTTA------T-TT-TC-TCAAAAG--G------TG-T--------------T-GC-G--TG---AAA-GATC-G-A-T--AA-C--A--T--A----A-A-GTTAA-T---CA--AATA--T-----G---TAA-TGAAA--TCGA-T-TGGA--AC-T-----TGT-GTCTTG-A--C---T--CAA--ACT-T-C-T-T-TG-AAA--ATCA-C--T----T-T-T-AAAAACCTC-T-A-----TT-G---A-C--AAT-A-A--------TT--------G--T----C-TA-AT-A--A--TTTG-AG--TTT-AAATCA
gi|126811 : AAGAAG-GT-GTTGCA-T---G-TATTCA-T-GGTG------A-TT-T--CCTAAAG--G------TG-T--------------T-GC-G--TGTCAAGA-TATC-GAA-T--AACA--A--T--A----A-A-GTTATAT---CAATTGTT--T-----A---TAG-T-AAA--CC-A-GTTGGA--ACTT-----TTT-GTCT---A--TTCAT--CCA--AAA-T-A-T-A----GAA--ATAA-AGTT----C-T-A-AAAGGTGTGTT-A-----TTAG---A-C--AAG-ACA--------TT--A-----G--T----CAAA-AT-A--ATGTTTA-AG--TTG-AAATCA
gi|126812 : AAGAAG--T-GTT-CA-TTAAG-CA-TTG-T-G-TG------A-TT-TC-C-TAAAGTTG------TG-TA-------------T-GC-GA-TG---AAA-GATC-G-A-T--AA-A--A--T--A----AGA-GTTAT-T---CA---ATA--T-----A---TAG-AAAAAACCC-A-A-TAGA--ACTT-----TTTTGTCTTG-A--T---T--CCA--AAA-T-A-TTA-AG-AAA--ATAA-G--T----C-T-A-AAAGGTGTGTT-A-----TT-G---A-C--AAG-A-CT-------TT--A-----G--TC---CAAACAT-A--A--AATA-AGTATTG-AAATCA
gi|126813 : AGAAGTGTTGTTGCA-----G-TA-TCA-T-GGTG------A-TTGTT-CCTAAAG--GCGGATTTG-TCTTTCTTTCCAATAT-GA-C--TA---AAA-GA-C-GTG-T--AA-ATCA--T--ACGTTA-A-ATTA------CAAGAATA--T-----C---TAG-TAAAA--CT-A-G-TGGA--ACTTCTTTCTTT-GTCTTT-AATT---T--CC
gi|126814 : GAAG-GT--TTGCA-T---G-TA-TCA-T-G-TG------A-CT-TC-CCTAAAG--G------TGTT--------------T-GCTG--TG---AAA-GATCGG-A-T--AA-A--A--T-------A-A-GTTAT-T---CA--T-TA--T-----A---TAA-T-AAA--CC-A-G-TGAA--ACTT-----TTT-G-CTTG-A--T---TTCCCA--AAATT-A-T-G-AG-AAA--ATAG---------C-TAA-AAAGGTGTG-TGA-----TT-G---A-C--AAGAA-A--------TT--A-----G--T----C--A-AT----A--ATTA-AG--TTG--AATCA
gi|126815 : AAG-GT-GCGCCA-C---G-TC-TCG-T-GGTACATGCAA-TT-TC-CCTAAAT--G------TT-T--------------T-GC-G--CG---GAG-GATC-G-A-T--AA-A--A--T--A----A-A-TTTAT-T---CA--AATA--T-----A-------TAAAA--CC-ATT-TGGA--ACTT-----ATG-GT-TTG-A--T---T--AGA--ATA-T-G-T-A-TG-AAA--ATAA-T--T----T-T-A-ATAGAATTG-T-A-----TT-G---A-C--AAT-A-A--------TTCGA-----G--C----CTAA-AT-A--AT-TTTG-AG--TTT-AA
gi|126816 : AAG-AT-GTTGCA-T---G-TC-CCA-T-GTTA------A-TT-TC-CCTAGAG--G------TG-T--------------T-GC-A--TA---AAA-GATC-G-A-T--AA-A--T--T--A----A-ACATTGC-TGAAAA--TATG--T-----A---TAA--AAGA--C----G-TGTA------------TT-GTCAGGAA--T---TAGCCG--AAA-TAA-T-T-AG-AAT--TTAA-A--T----C-
gi|126817 : -GT-GTTGCAAT---ACTA-ACAAT-GGTG------AATT-TCGCCTAAAG--G------T-----------------T-GC----TG---AAA-G-TC-G-A-T--AA-A--A--T--A----A-A-GTTAT-T---CA--TATA--T-----A---TAG-TAAAA--CC-A-G-TAGA--ACTT-----TTT-GTCTTG-A--T---T--CCA--AAA-TAA-T-A-AG-AAA--AT-A-G--T----C-T-A-AAGGGTGTG-T-AG----TT-G---A-CA-AAG-A-A--------TT--A-----G--T----CAAA-AT-A--A--ATTA-AA--TTG-AAATCAa
gi|126818 : A-T---G-CA-TCG-T-G-TG-----------TC-CCTAAAG---------TG-T--------------T-GC-G--TG---AAAAGATC-G-A-TGAAA-A--A--T--A----A-A-GTTAT-T---T---TATA--T-----A---TAT-GAGAA--CC-A-G-TGGA--ACTT-----TTT-GTC-TG-A--TC--T--GCA--AAA-T-CTT-ACAG-AAA--ATAA-G--T----C-T-T-AAAGGTGTG-T-A-----TT-G---A-C--AAG---A--------TT--A-----G--C----CAAA-ATAA--A--ATTA-AG--CTG-AAATCA
gi|126819 : TAT-T---CA--TATA--TTATATA---TAG-TACAA-----A-G-TG----ACTT-----TTT-GTCTTG-A--T---T--CCA--AAT-T-A-T-A-AG---A--ATAA-G--TCTTAC-T-A-AAAGGTGTG-C-A-----TT-G---ATC--AAG-A-T--------TT--A--------------AAG-AT-A--G--ATGA-AG--TTT-AA