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gi|92560                      : cACTGACCAGTGGA-TGTGAC-AC-A-AAACA---T---CCTGGATTTT-C-TCATGGGAT-ATA---------------------T-CAAA---AA-AAAAGTCTACT--CCCTGCGA-GGT---AATTCAGGGAT--A-A-TCT-AT------A---A-GCCAAT---A--CATC-GA-GGGC-TATACGC--G---TGA-G-GCGAGA-AT-T-AACTG-ATC--AGA---CA--AGTC-A-A-AGACAAG-----TG-T---G----A--AAA---AGATCTC--GCT----CATG--T-----AA-AGTT----G-T--A--T-----A-ACCATG-AG-ATAG--CGG------GA--AC-T----A-C-T--GACAT--ATGTTTA-AGG-CACACGATATT-GTAT-TGGAGCCGA-AA------TGCAAA-AAAG-CATC---CTGA----GAA-TA-T-----GC-T--TACC-A--AACT-T-AG--TG-ATCT-GCC-TT-A-T--GCA------TG-C-ATG-G-T-A------AC-A----G-C--GA----CA-C-AC-----TAC-C-AA---CTCTC--TT-CACTA-TGCGCA-GACC--A--G-GC-AA--ACCAA--TCT--TG-T-AAGC---CC-TTCATCT-ACC-A-TCCGTCC-AA-CG--CAC-A-T-GGCG--ATGCGCGGAAGGTT---G--G--ATAG-TG-G-TTGTT
gi|92558                      :  ACTGAC----AGGGTGTGACCACCG-A--CA---T---CTT--AATT--C-T--TGG--T-ATAAGCCCGTAGAAAATGGCCTCTT-CAAATATAATAA---TCT--TTTCCCTGCGA-G-TTATATTCTAGTGAT--A-A-T-T-ATTATCACA---A-GA---CATAA--C-TT-GACGGGCTT-TA-G---G---TGAGG-G--AGA-AT-TAAACTGAATCT-AGACATCA--A-TT-A-A-AG---AG-----TGAT-----------ATA---G---TTT--A-TTGTAC-CG--TGTAAAAA-G--T----A-T--A--TGTATAA-ACCATTGAA-A-AG--C-G------AG--ACGT----ACC-T--G---T--ACG-GCA-AGA-GAT---GTA-T-GA-T-TGG----GC-AATATCATT-C-AACAAAG-T--CTCACTGGATATGAA-TA-TAAAAAGC-C--T--C-A--A--C-T-AG--TG-A--T-GCC-TT-A-T--GCAAATTGTTA-C-AT--GTT-A------A--ATGCTA-C--GA-G--CA-C-ACTCTGATAC-C-AAAGAC---T--TT-GAGTA-TG-G-ATGA-C--A--G-GT-CA--AC--A--T-TTCTG-T-AAGC---CC-TT-AT-A-ACCAA-TCGGTGCCAA-CT--GAC-A-T-GG-G--AT----GAAG-TTT---G--G--ATGGATG-GTTTGTT
gi|92555                      :    cGAC----AGGGTGGGAC-AC-A-A--CA---T---CTT--ATTT--C-T-ATG---T-ATA---------------------T-CAAA---AA-AAAT-TCT--T--CCCTGCGA-G-T---ATTC--AGGAT--A-A-T-T-AT------A---A--C---T---A--C-TC-GA-GGGC-T-TA-G---G---TGAGG-G--AGA-AT-T--ACTG-ATC--AGA---C---A-TCAA-A-AG---AGT----TG-TTTGA----A--AAA---G---TTTG-G-T----C-TG--T-----AA-GT-T----G-T--A--T-----A-ACCA---AG-A-AAGCCGG------AG--AC-TCTAGA-T-T--G------ACG-GTA-AGG-AAT---GTATT-GT-TATGG----GA-AA------T-C--A-AAAG-C--C---CTGA----GAA-TA-T-----AG-CAGC-CC-A--A----T-AG--TG-A--T-GCC-TT-A-TTGGCA------TG-C-AT--G-T--------A--A----G-C--GAGG--CACC-AC-----TAC-G-AA--GC---C--TT-GA-TA-T--G-A-GA-C--A--G-G--AA--AC--A--T-T--TG-T-AAGC---CC-TT-AT-T-ACC-A-T--GTCC-AA-CT--G-C-ATT-GG-G--AT----GGAA-GTTGACG--A--ATGG--G-G-TTGTT
gi|92561                      :       cactggGA-TGTGAC-AC-A-G--CA---T---CTC--A-TTT-C-T-GTAG--T-ATA---------------------T-GAAA---AA-TA---TTT--T--C----AGG-G-T---GTT-CAGCGAT--A-A-C-T-AT------A---A-AG---T------C-CC-GA-GAG
gi|92562                      :                  TGAC-AC-T-A--TA---TATTCTT--ATTT--C-T-ATTT--T-ATA---------------------T-CAAA---AA-AAA--TCT--T--CCCTGCGATG-T---ATTC--AGGATTAA-A-T-T-AT------A---A-GC---T---A--C-TC-GA-GGGC-T-TA-----G---TGA-G-G--AGA-ATAT-AACTG-ATC--AGA---CA--A-TC-ATA-AG---AGTTTTTTT-T---G-------AAA---G---TTT--G-T----C-TG--T-----AT-C--T----G-TTCA--TAA---A-ACCA------A-AG--CG--------A--AC-T----A-C-T--GA--T--AC--GTA-AG----T----TATT-AT-C-TTT----GA-AA------T-C-AA-AAAG-C--C---CTGA-----AA-TATT-----GC-C--T-CC-A--A--T----------A--T-ATA-T----T--GCA------TG-C-AT--G-T--------A--A----G-CTTGA-G--CA-C-AC-----TAC-C--A--GC---C--TT--A-TA-T----A-TA-C--AG-G-GCAAA--ACA-A--T-T--TG-T-AATCTCGCT-TT-AT-T-ACCTA-T--G-CCAAT-AT--GAC-A-T-GG-G--AT-----GAA-GT----------GTGT-TG-G-TTGT
gi|92563                      :                    AC-AC-AGA--CAGTCT---CTT--ATTT--C-T-A--G--T-ATA---------------------T-CAAA---AA-A----TCT--T--CCC-GCGA-G-----ATCTCAGGAAT--A-A-T-T-AT------A---ATGC---TTC-AGCC-TC-G--GGGC-T-TA-GTGAG---TGA-G-G--AG---T-T-AACTG-ATC--AGA---CACAA-TC-A-A-AG---TG-----TG-TT--G----ATAAGA---G---TTTATG-T----C-TG--T-----AA-G--TT---G-T--ACAT-----A-ACCA---AG-A-CG--CG-------AGCAAC-T----AAC-TTAGATTT--ACG-GTCTAAG-ATT---GTATTTGT-T-TGG----GA-A-------T-C-AA-AA-G-C--A---CTGA----GAA-TACT-----GCTC--T-CCCA--A--C-T-AG--TG-A--T--CC-TT-ATT--GCA------TG-C-ATTCG-T-A------A--A----ATC--GA-G--CA-CAAC-----TAC----A--GC---C--TT--A-TA-TGAG-A-GA-C--A--G-GC-AA--A---A----T--TG-T-AAGC---CC--T-AT-TAACC-AGTA-GTCC-AA-CTTGGAC-A-T-GG-G--AT----GG-A-GCT---GT-G--ATGG-T--G-TTGTT
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consensus                     :       ACTGAC-AG--GGTGTGAC-AC-A-A--CA---T---CTTA---TTT--CT-ATGG--T-A-TA---------------------T-CAAA---AA-AA---TCT--T--CCCTGCGA-G-T---A-T-TC-AGGGAT--A-A-T-T-AT------A---A-GC---T--A---C-TC-GA-GGGC-T-T-A-G---G---TGA-G-G--AGA-AT-TAA-CTGA-TC--AG--ACA---A-TCA-A-A-G---AG-----T-G-T---G----AAAA---G---TT--TG-T----C-TG--T-----A--A-GT---T--G---T--A--TA-A-CCA---AG-A-AG--CG-G------AGAC-T-AC-T--G--A--T--ACG-GTA-A-GG-AAT---G-TA-TTGT-T-TGG----GA-AA-T------C-AA-AAAG-C--C---CTGA----G--AAT-A-T-----GC-C--T-CCA--A--C-T-AGT--G-A--T-GCC-TT-A-T--GCA------TG-CA-T--GT-A------A--A----G-C--GA-GCA-C-AC--T-----AC-C-AA-G--C---C--TT-GA-TA-TG-G-A-GA-C--A-G--GC-AA--AC--A--T-TT--G-T-AAGC---CC-TT-AT-T-ACC-A-----T--GTCC-AA--C-T--GAC-A-T-GG-G--AT----GGAA-GTT---G--G--ATGG-TG-G-TTGTT
Reference ( family-849 )      :       ACTGAC-AG--GGTGTGAC-AC-A-A--CA---T---CTTA---TTT--CT-ATGG--T-A-TA---------------------T-CAAA---AA-AA---TCT--T--CCCTGCGA-G-T---A-T-TC-AGGGAT--A-A-T-T-AT------A---A-GC---T--A---C-TC-GA-GGGC-T-T-A-G---G---TGA-G-G--AGA-AT-TAA-CTGA-TC--AG--ACA---A-TCA-A-A-G---AG-----T-G-T---G----AAAA---G---TT--TG-T----C-TG--T-----A--A-GT---T--G---T--A--TA-A-CCA---AG-A-AG--CG-G------AGAC-T-AC-T--G--A--T--ACG-GTA-A-GG-AAT---G-TA-TTGT-T-TGG----GA-AA-T------C-AA-AAAG-C--C---CTGA----G--AAT-A-T-----GC-C--T-CCA--A--C-T-AGT--G-A--T-GCC-TT-A-T--GCA------TG-CA-T--GT-A------A--A----G-C--GA-GCA-C-AC--T-----AC-C-AA-G--C---C--TT-GA-TA-TG-G-A-GA-C--A-G--GC-AA--AC--A--T-TT--G-T-AAGC---CC-TT-AT-T-ACC-A-----T--GTCC-AA--C-T--GAC-A-T-GG-G--AT----GGAA-GTT---G--G--ATGG-TG-G-TTGTT
gi|92547                      :       ACTGAC-AG--GGTGTGAC-AC-A-A--CA---T---CTT-----TT--CT-ATAG--T-A-TA---------------------T-CAAA---AA-AA---TCT--T--CCCTGCGA-G-T---A-T-TC-AGGGAT--A-A-TAT-AT------A---A-GC---T--A---C-TC-GA-GGGC-T-T-A-G---G---TTA-G-G--AGA-AT-TAA-CTGA-TC--AG--ACA---A-TCA-A-A-G---AG-----T-G-T---G-----AAA---G---TT--TG-T----C-TG--T-----A--A-GT---T--G---T--A--TA-A-CCA---AG-A-AG--CG-G------AGAC-T-AC-T--G--A--T--ACG-GTA-A--G-AAT---G-TA-TTGT-T-TGG----GA-AA-T------C-AA-AAAG-C--C---CTGA----G--AAT-A-T-----GC-C--T-CCACCA--C-T-AGT--G-A--T-GCC-TT-A-T--GCA------TG-CA-T--GT-A------A--A----G-C--GA-GCA-C-AC--T-----AC-C-AA-G--C---C--TT-GATTA-TG-G-A-GA-C--A-G--GC-AA--AC--A--T-TT--G-T-AAGC---CCTTT-AT-T-ACC-A-----T--GTCC-AA--C-T--GAC-A-TGGG-G--AT----GGGA-GTT---G--G--AT-G-TG-G-TTGTT
gi|92548                      :      cACTGAC-AG--GGTGTGAC-AC-A-A--CA---T---CTTA---TTT--CT-ATGG--T-A-TA---------------------T-CAAA---A--AA---TCT--T--CCCTGCGA-G-T---A-T-TC-AGGGAT--A-A-T-T-AT------A---A-GC---T--A---C-TC--A-GGGC-T-T-A-G---G---TGAGG-G--AGA-AT-TAA-CTGA-TC--AG--ACA---A-TCA-A-A-G---AG-----T-G-T---G----AAAA---G---TT--TG-T----C-TG--T-----A--A-GT---T--G---T--A--TA-A-CCA---AG---AG--CG-G------AGAC-T-AC-T--G--A-----ACG-GTA-A-GG-AAT---G-TA-TTGT-T-TGG----GA-AA-T------C-AA-AAAG-C--C---CTGA----G--AAT-A-T-----GC-T--C-CCA--A--C-T-AGT--G-A--T-GCC-TT-A-T--GCA------TG-CA-T--GT-A------A--A------C--GA-GCA-C-AC--T-----AC-C-AA-G--C---C--TT-GA-TA-TG-G-A-GA-C--A-G--GC-AA--AC--A--T-TT--GTT-AAGC---CC-TT-AT-T-ACCAA-----T--GTCCAAA--C-T--GAC-A-T-GG-G--AT----GGAA-GTT---GGCG--ATGG-TG-G-TTGTT
gi|92549                      :      cACTGAC-AG--G-TGTGAC-AC-A-A--CA---T---CTTA---TTT--CT-ATGG--T-A-TA---------------------TTCAAA---AA-AA---TCT--T--CCCTACGA-G-T---A-T-TC-AGGGATT-A-A-T-TTAT------A---A-GC---TTAA---C-TC-GA-GGGC-T-T-A-G---G---TGA-G-GG-AGA-AT-TAA-CTGA-TC--AG--ACA---A-TCA-A-A-G---AG-----T-G-T---G----AAAA---G---TT--TG-T----C-TG--T-----A--A-GT---G--T---T--A--TA-A-CCA---AG-A-AG--CG-G------AGAC-T-AC-T--G--A--T--ACG---A-A-GGAAAT---G-TA-TTGT-T-TGG----GA-AA-T------C-AA-AAAG----C---CTGAG---G--AAT-A-T-----G--C--T-CCA--A--C-T-AGT--G-AT-T-GCC-TT-A-T--GCA------TG-CA-T--GT-A------A--A----G-C--GA-GCA-C-AC--T-----A--C-AA-G--C---C--TT-GA-TA-TG-G-A-GA-C--A-G--GC-AA--AC--A--T-TT--G-T-AAG----CC-TT-AT-T-ACC-A-----T--GTCC-AA--C-T--GAC-A-T--G-G--AT----GGAACGTT---G--G--ATGG-TT-G-TT
gi|92550                      :      cACTGAC--G--GGTGTGAC-AC-A-A--CA---T---CTTA---TTT--CT-ATGG--T-A-TA---------------------T-CAAA---A--AA---TCT--T--CCCTGCGA-G-T---A-T-TC-AGGGAT--A-ATT-T-AT------A---A-GC---T--A---C-TC-G--GGGC-T-T-A-GT--G---TG--G-G--AGAGAT-TAA-CTGA-TC---G--ACA---A-TCA-A-A-G---AG-----T-G-T---G----AAAA---G---TT--TG-T----C-TG--T-----A--A-GT---T--G---T-----TATA-CCA---AG-A-AG--C--G------AGAC-TAAC-T--G--A--T---C--GTA-A-GG-AAT---G-TA-TTGT-T-TGG----GA-AA-T------CAAA-AAAG-C--C---CTGA----G--AAT-A-T-----GC-C--T-CCA--A--C-T-AGT--G-A--T-G-C-TT-A-T--GCA------TG-CA-T--GT--------A--A----G-C--GA-GCA-C-AC--T-----A--C-AA-G--C---C--TT-GA-TA-TG-G---GA-C--A-G--GC--A--AC--A--T-TT--G-T-A--C---CC-TT-AT-T-ACC-A-----T--GTCC-AA--C-T--GAC-A-T-GG-G--AT----GGAA-GTT---G--A--GT-G-TG-G-TTGTT
gi|92551                      :      cACTGACCAG--GGTGTGAC-AC-A-A--CA---T---CTTA---TTTGGTT-ATGG--TTA-TA---------------------T--AAA---AA-AA---TTC--T--TCCTGCGA-G-T---A-T-TC-ATG-AT--A-A-T-T-AT------A---A-GC---T--A---C-TC-GA-GGGC-T-T-A-G---G---TGA-G-GG-AGA-AT-TAA-CTGA-TC--AG--ACA---A-TCA-A-A-G---AG-----T-G-T---G----AAAG--------T--TG-T----CCTG--T-----A--A-GT---T--G---T--A--TA-A-CCA---AG-A-AG--CG--------AGAC-TTAC-TT-G--A--T--ACG-GTA-A-GG-AAT---GGTA-TTGT-T-TGG----GA-AA-T------C-AA-AAAG-C--C---CTGA----GGGAAT-A-T-----GC-C--T-CCA--A--C-T-AGTTTG-A--T-GCC-TT-A-T--GCA------TG-CAAT--GTTA------A--A----G-C--GA-GCA-C-ACACT-----AC-C-AA-G--C---C--TT-GA-TA-TG-G-A-GA-C--A-GTGGC-AA--AC--A--T-TT--G-T-AAGC---CCTTT-AT-T-ACC-A-----T--GT-C-AA--C-T--GAC-A-T-GG-G--AT----GGAA-GTT---G--G--ATGG-TG-G-TTGTT
gi|92552                      :      cACTGAC-AG--G-TGTGA--AC-A-A--CAA--T---CTTA---TTT--CT-ATGG--T-A-TA---------------------T-CAAA---AA-AA---TCT--T--CCCT-CGA-G-T---A-T-TC-AGG-AT--A-A-T-T-AT------A---A-GC---T--A---C-TC-GA-GG-C-T-T-A-G-------TGA-G-GG-AGA-AT-TAAACTGA-TC--AG--ACA---A-TCA-A-A-G---AG-----T-G-T---G----AAA----G---TT--TG-T----C-TG--T-----A--A-GT---T--G---T--A--TA-A-C-A---AG-A-AG--CG-G------A--C-T-AC-T--G--A--T--ACG-GTA-A-GG-AAT---G-TA-TTGT-G-TGG-----A-AA-T------C-AA-AAAG-C--C---CTGA-------AAT-A-T-----GC-C--T-CCA-----C-T---C--T-A--T--CC-TT-A-T--GCA------TG-CA-T--GT-A------A--A----G-C--GA-GCA-C-A---T-----AC-C-AA-G--C---C--TT-GA-TA-TG-G-A-GA-C--A-G--GCAAA--AC--A--T-TT--G-T-AAGC---CC-TT-AT-T-ACC-A-----T--GTCC-AA--C-T--GAC-A-T-GG-G--AT-----GAA-GTT---G--G--ATGG-TG-G-TTGTT
gi|92553                      :      cACTGAC-AG--GGTGTGAC-AC-A-A--CA---T---CTTA---TTT--CT-ATG---T-A-TA---------------------T--AAA---AA-AT---TCT--T--CCCTGCGA-G-T---A-T-TC-AGGGAT--ATA-T-T-AT------ATAAG-GT---T--A---C-TC-GA-GGGC-T-T-A-G---G---TGA-G-GG-AGA-AT-TAA-CTGA-TC--AG--ACA---A-TCA-AGA-T---AG-----T-G-T---GG---AAAA---G---TT--TG-T----CCTG--T-----A--A-GT---T--G---T--A--TAGA-CCA---AGTA-AG--CG-G------AGAC-T-AC-T--G--A--T--ACG-GTA-A-GG-AAT---G-TA-TTGT-T-TGG----GA-AA-T------C--A-AAAG-C--C---GTGA----A--GAT-A-T-----GC-C--T-CCA--A--C-T-AGT--G-A--T-GCC-TA-A-T--GCA------TGCCA-T--GT-A------A--A----GCC--GA-GCA-C-AC--T-----ACGC-AA-G--C---C--TTGGA-TA-TGAG-A-G--C--A-GC-GC-AATTAC--A--T-TT--G-T-AA-C---CC-TT-AT-T-ACC-A-----T--GTCC-AA--C-T--GAC-A-T-GG-G--AT----GGAA-GTT---G--G--ATGG-TGAG-TTGTT
gi|92554                      :      cACTGAC-AG--G-TGC-AC-CC-A-A--CA---T---CTTA---TTTTCCT-ATGG--T-A-TA---------------------TTCAAA---AA-AA---TCT--TT-CCCTGCGA-G-T---A-T-TC-AAGGATT-A-A-T-TTAT------A---A-GC---T--A---C-TCCGA-GGGCCT-T-A-G---G---TGA-G-G--AGA-AT-TAA-CTGA-TC--AG--ACA---A-TCA-A-A-G---AG-----T---T---GATCAAAAA---G---TT--TG-T----C-TGTTT-----A--A-GT---T------T--A--TA-A-CCA---AA-G-AG--CG-GCGGGAAAGAC-T-AC-T--G--AT-T--ACG-GTA-A-GA-ATT---G-TA-TTGT-T-TTG----GG-AA-T------C-AA-AAAGCC--C---CTGA----A--ATT-A-T-----GC-C--T-CCA--A--C-TAAGT--G-A--TGGCC-TTGA-T--GCAG-----TG-CA-T--GT-G------AACA----G-C--GA-GCA-C-AC--T-----AC-C-AA-G--C---TCGTT-GA-TACTG-G-A-GA-C--ACG--GCAAA--AC--A--T-TT--G-TAAAGC---CC-TT--T-T-ACC-A-----T--GTCC-AAACC-T--GAC-A-T-GG-G--AT----GGAA-GTT------G--ATGGTTG-G-TTGT
gi|92555                      :         cGAC-AG--GGTGGGAC-AC-A-A--CA---T---CTTA---TTT--CT-ATG---T-A-TA---------------------T-CAAA---AA-AAAT-TCT--T--CCCTGCGA-G-T---A-T-TC-AGG-AT--A-A-T-T-AT------A---A--C---T--A---C-TC-GA-GGGC-T-T-A-G---G---TGA-G-GG-AGA-AT-TA--CTGA-TC--AG--ACA-----TCA-A-AAG---AG-----TTG-TTTGA----AAAA---G---TT--TGGT----C-TG--T-----A--A-GT---T--G---T--A--TA-A-CCA---AG-A-AAGCCG-G------AGAC-T--C-TA-G--A--TTGACG-GTA-A-GG-AAT---G-TA-TTGT-TATGG----GA-AA-T------C--A-AAAG-C--C---CTGA----G--AAT-A-T-----AG-CAGC-CCA--A----T-AGT--G-A--T-GCC-TT-A-TTGGCA------TG-CA-T--GT--------A--A----G-C--GAGGCACC-AC--T-----AC-G-AA-G--C---C--TT-GA-TA-T--G-A-GA-C--A-G--G--AA--AC--A--T-TT--G-T-AAGC---CC-TT-AT-T-ACC-A-----T--GTCC-AA--C-T--G-C-ATT-GG-G--AT----GGAA-GTTGACG--A--ATGG--G-G-TTGTT
gi|92556                      : cactggACTGAC-AG--GGTGTGAC-AC-A-A-------T---TTTA---TTT--CT-ATGG--T-A-TA---------------------T-CAAA---AA-------TT--T--CCCTG-GA-G-----A-T-TC-AGTGAT--A-A-T-T-AT------A-----GCG--T--A---C-TT-GA-GGGC-T-T-A-G---G---TG--G-G--AGA-AT-TAA-CTGA-TC--AG--ACA-----TCA-A-A-G---AG-----T-G-T---GG---AAAA---G---TT--TG-T----C-TG--T-----A--A-AT------G---T--A--TA---CCA----G-A-AG--CG--------AGAC-T-AC-T--G--A--T--ACG-GTA---GG-AAT---G-TA-TTGT-T-TGG----GA-AAAT------C-AA-AAG---------CTGA----G--AAT-A-T-----GGAC--T-CCA--A----T-AGT--G-A--T-GCC-TT-A-T--GC-------TG--A-T--GTTA------A--A----G-C--GA-GCA-C-AC--T-----AC---GA-G--C---C--TT-GA-TA-TG-G-A-GA-C--A-G--GC-AA--AC--A--T-TT--G-T-AAGC---C--TT-AT-T-ACA-A-----T--GTCC-AA--C-T--GAC-A-T-GT-G--AT----GGAA-TTT---G--G--ATGG-TG-G-TTGTT
gi|92557                      :      cACTGAC-AG--GGTGTGAC-AC-A-A--CA---T---CTTAC--TTT--CT-AT----T-ATTA---------------------G-CAAA---AA-AA---T-T--T--CCCTGC---T-T---A-T-TC-A-GGAT--A-A-T-T-AT------A---A-GC---T--A---C-TC-AG-AGGC-T-T-A-----G---TGA-G-G---GA-AT-TAA-CTGA-TCAAAG--ACA---A-TCA-A-A-G---AG-----T-GTT---GTT--AAAA---G----T--TG-T----C-TG--T-----A--A-GT---T--G---T--A---A-A-CCA---AG---AG--CA-G------AGAC-T-ACTT--G--AT-T--ACG-TGA-A-GG-AA----G-TA--TGT-T-T-G----GA-AA-T------C-AA-AAAT-C--C---CTGA----G--AAA-G-T-----G--C--T-CCA--A--C-T-A-T--G-AT-T-GCC-TT-A-T---CA------TG-CA-T--GT-A------A--A------C--GA-GCA-C-AC--T-----AC-C-AA-G--C---CT-TT-GA-TA-TT-G-A-GA-C--A-G--GC-AA--AC--A--T-TT--G-T-AAAC---CC-TT--T-T-ACC-A-----T--GTCC-AA--C-----ACAA-T-GGTG--A-----GGAA-GTT---G--G--AT-G-TG-G--TGTT
gi|92558                      :      cACTGAC-AG--GGTGTGACCACCG-A--CA---T---CTTA---ATT--CT--TGG--T-A-TAAGCCCGTAGAAAATGGCCTCTT-CAAATATAATAA---TCT--TTTCCCTGCGA-G-TTATA-T-TCTAGTGAT--A-A-T-T-ATTATCACA---A-GA---C--ATAAC-TT-GACGGGC-T-TTA-G---G---TGA-G-GG-AGA-AT-TAAACTGAATCT-AG--ACATCAA-TTA-A-A-G---AG-----T-GAT---------ATA---G---TT--TA-TTGTAC-CG--TGTAAAA--A-GTATAT--G---T--A--TA-AACCATTGAA-A-AG--CG--------AGACGT-AC-C--T--G--T--ACG-GCA-A-GA-GAT---G-TA-T-GA-T-TGG----GC-AA-TATCATTC-AACAAAG-T--CTCACTGGATATG--AAT-A-TAAAAAGC-C--T-C-A--A--C-T-AGT--G-A--T-GCC-TT-A-T--GCAAATTGTTA-CA-T--GTTA------A--ATGCTA-C--GA-GCA-C-AC--TCTGATAC-C-AA-AGAC---T--TT-GAGTA-TG-G-ATGA-C--A-G--GT-CA--AC--A--T-TTCTG-T-AAGC---CC-TT-AT-A-ACC-AATCGGT--G-CC-AA--C-T--GAC-A-T-GG-G--AT----GAAG-TTT---G--G--ATGGATG-GTTTGTT
gi|92559                      :      cACTGAC-AG--G-TGTGAC-AC-A-A--CA---T---CTTA---TTTT-CT-ATGG--T-A-TA---------------------T-CAAA---AA-AA---TCT--T--CCCTGCGA-G-T---A-T-TCCAGGGAT--A-A-T-T-AT------A---A-GC---T--A---C-TC-GA-GGGC-T-T-A-G---G---TGA-G-G--AGA-AT-TAA-CTGA-TC--AG--ACA---A-TCA-A-A-G---AG-----T-G-T---G----AAAA---G---TT--TG-T----C-TG--T-----A--A-GT------G---T--A--TA-A-CCA---AG-A-AG--CG-G------AGAC-T-AC-T--G-----T--ACG-GTA-A-GG-AAT---G-TA-TTGT-T-TGG----GA-AA-T------C-AA-AAAG-C--C---CTGA----G--AAT-A-T-----GC-C--T-CCA--A--C-T-AGT--G-A--T-GCC-TT-A-T--GCA------TG-CA-T--GT-A------A--A----G-C--GA-GCA-C-AC--T-----AC-C-AA-G--C---C--TT-GA-TA-TG-G-A-GA-C--A-G--GC-AA--AC--A--T-TT--G-T-AAGC---CC-TT-AT-T-ACC-A-----T--GTCCAAA--C-T--GAC-A-T-GG-G--AT----GGAA-GTT---G--G--ATGG-TG-G-TTGTT
gi|92560                      :       ACTGACCAGTGGATGTGAC-AC-A-AAACA---T---CCTGGATTTT--CTCATGGGAT-A-TA---------------------T-CAAA---AA-AAAAGTCTACT--CCCTGCGA-GGT---AAT-TC-AGGGAT--A-A-TCT-AT------A---A-GCCAAT--A---CATC-GA-GGGC-TAT-ACGC--G---TGA-G-GCGAGA-AT-TAA-CTGA-TC--AG--ACA---AGTCA-A-A-GACAAG-----T-G-T---G----AAAA---AGATCT--CGCT----CATG--TA----A--A-GT---T--G---T--A--TA-A-CCATG-AG-ATAG--CG-G------GAAC-T-AC-T--GACA--T--ATGTTTA-A-GG-CACACGA-TA-TTGTAT-TGGAGCCGA-AA-TG-----CAAA-AAAG-CATC---CTGA----G--AAT-A-T-----GC-T--TACCA--AACT-T-AGT--G-ATCT-GCC-TT-A-T--GCA------TG-CA-TG-GT-A------AC-A----G-C--GA--CA-C-AC--T-----AC-C-AA----CTCTC--TT-CACTA-TGCGCA-GACC--A-G--GC-AA--ACCAA--TCTT--G-T-AAGC---CC-TTCATCT-ACC-A-----TCCGTCC-AA--C-G--CAC-A-T-GGCG--ATGCGCGGAAGGTT---G--G--ATAG-TG-G-TTGTT
gi|92561                      :                --GATGTGAC-AC-A-G--CA---T---CTCA---TTT--CT-GTAG--T-A-TA---------------------T-GAAA---AA-TA---TTT--T--C----AGG-G-T---G-T-TC-AGCGAT--A-A-C-T-AT------A---A-AG---T------C-CC-GA-GAG
gi|92562                      :                      TGAC-AC-T-A--TA---TATTCTTA---TTT--CT-ATTT--T-A-TA---------------------T-CAAA---AA-AAA--TCT--T--CCCTGCGATG-T---A-T-TC-AGG-ATTAA-A-T-T-AT------A---A-GC---T--A---C-TC-GA-GGGC-T-T-A-----G---TGA-G-G--AGA-ATATAA-CTGA-TC--AG--ACA---A-TCATA-A-G---AGTTTTTT-T-T---G-----AAA---G---TT--TG-T----C-TG--T-----ATCT-GT---TC-A---T--A--AA-A-CCA------A-AG--CG---------AAC-T-AC-T--G--A--T--AC--GTA-A-G----T-----TA-TTAT-C-TTT----GA-AA-T------C-AA-AAAG-C--C---CTGA-------AAT-ATT-----GC-C--T-CCA--A--T----------A--T-A----T-ATT--GCA------TG-CA-T--GT--------A--A----G-CTTGA-GCA-C-AC--T-----AC-C--A-G--C---C--TT--A-TA-T----A-TA-C--AGG--GCAAA--ACA-A--T-TT--G-T-AATCTCGCT-TT-AT-T-ACCTA-----T--G-CC-AA--TAT--GAC-A-T-GG-G--AT-----GAA-GT----------GTGT-TG-G-TTGT
gi|92563                      :                        AC-AC-AGA--CAGTCT---CTTA---TTT--CT-A--G--T-A-TA---------------------T-CAAA---AA-A----TCT--T--CCC-GCGA-G-----A-TCTC-AGGAAT--A-A-T-T-AT------A---ATGC---TTCAGC-C-TC-G--GGGC-T-T-A-GTGAG---TGA-G-G--AG---T-TAA-CTGA-TC--AGACACA---A-TCA-A-A-G---TG-----T-GTT---GAT--AAGA---G---TTTATG-T----C-TG--T-----A--A-GT---T--G---TACA--TA-A-CCA---AG-A-CG--CGAG------CAAC-TAAC-TTAG--ATTT--ACG-GTCTA-AG-ATT---G-TATTTGT-T-TGG----G--AA-T------C--A-AAAG-C--A---CTGA----G--AAT-ACT-----GCTC--TCCCA--A--C-T-AGT--G-A--T--CC-TT-ATT--GCA------TG-CA-TTCGT-A------A--A----ATC--GA-GCA-CAAC--T-----AC----A-G--C---C--TT--A-TA-TGAG-A-GA-C--A-G--GC-AA--A---A----TT--G-T-AAGC---CC--T-AT-TAACC-AG----TA-GTCC-AA--C-TTGGAC-A-T-GG-G--AT----GG-A-GCT---GT-G--ATGG-T--G-TTGTT
gi|92564                      :                                                                                                                                                                                        C-GA-GGGCCT-T-A-G---GGGCTGA-GCG--AGA-AT-TAA-CT-A-TC--AG--ACC---A-TCA-A---G---AG-----T-G-T---G----AAAAAGGG---TT--TG-TA---C-GG--T-----A--ACGT---T--GGGGT--AATCA-A-CCA---AG-A-AG--CG--------AGAC-T-AC-T--G--A--TGGACG-GTA-A-GG-AAT---G--A-TTGT-T-TGG----GA-AA-T------C-AA-AA-G-C--C---CTGA----G--AATTA-T-----GC-C--T-CCA--A--C-T-AGTT-G-A--T-GCCATT-A-T--GCA------TG-CA-T--GT-A------A--A------C--GA-GCA-C-AC--T-----AC-C-AAGG--C---C--TT-GA-TA-TG-----GA-C--A----GC-AA--AC--AATT-TT--G-T-AAGC---CC--T-AT-T-ACC-AG----T--GTCC-AA--C-T--GAC-A-T-GG-GGAAT----GGAA-GCTTGAG--G--ATG
gi|92565                      :                                                                                                                                                                                                                                                                -G---AG-----T-T-A---G----AATA---GGT-TT--TG-T----C-TG--T-----A--A-GT---TATG---T--A--TA-A-CCA---AG-A-AG--CG-G------A-AC-T-AC-T--G--A--T--ACG-GTA-AGGG-AAT---G-TA-TTGT-T-TGG----GA-AA-T------C-CA-AAAA-C--C---CTGA----G--AAT-A-T-----GC-G--T-CAA--A--CGT-AGT--GAA--T-G-C-TT-A-T--GCA------TG-CA-T--GT-A------A--A----G-C--GA-GCA-C-AC--T-----AC-CAAA-G--C---C--TT-GATTA-TG-G-A-GA-CAAA-G--GC--A--AC--AT-T-TT--G-T-AAG----CC-TT-AT-T-ACC-A-----T--GTCC-AA--C-T--GAC-A-T-GG-G--AT----GGAA-GTT---G--GGAATGG-TG-G-TTGTT
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lowQualScore                  :             .  .. .      .  . . ..  ... ...    ...   ..  .    .. . .  ..................... .    ...  .  ...   .. ..        . . ... . .  .   .  .. . . . .  ...... ... .  ... ...... .  .  .    . . . . ... ...   . . ..   .  .   .    .  ..  ..   ... .   . . . ...  ..... . . ... ....    ... ...  ..  . .... .  .. ..... .. .  ...... ... .. ..  . .   ...  . .  ..  ........    . .  . .. .. .. ..   .   . .  .   ... .  .    . .   ....  .  . ...... .  .    . .. ...    .... ..   . . .....  . .. .   .. .. . .   .. . .. .   .  . . ..   ......  .  . ..  ........ .. ...... ..  .   . .  .. .....  . .  . .. ... ..  .  .  .  . . .  . .. . ..  .  ..  .. .. .  .. . .    ...  .  .  . .   . ..... ..    .  .. . ..   . . .  . ..  ....    .   ... .. ..    .  . .     
lowQualScore                  :             7  77 5      4  4 4 22  555 111    555   88  4    22 4 4  000000000000000000000 7    111  4  777   22 66        4 4 111 4 4  7   7  99 4 4 7 7  888888 111 4  555 777777 4  2  2    7 4 4 4 888 111   4 4 44   4  4   7    4  66  22   111 4   4 4 2 999  66666 2 7 999 3333    999 999  11  4 9999 7  11 88888 11 2  999999 999 11 11  4 2   999  2 2  11  55555555    2 7  2 55 11 55 11   2   2 2  2   999 2  2    1 1   6666  1  1 222222 2  1    1 99 777    6666 99   1 2 33333  2 99 2   99 99 1 1   00 1 11 1   1  1 2 99   222222  1  1 00  99999999 00 333333 99  1   1 1  99 33333  1 1  1 99 777 00  1  4  1  3 1 1  1 99 2 00  3  99  00 33 2  11 2 2    999  4  2  2 2   4 00000 33    4  11 2 11   2 2 2  4 11  7777    4   888 33 11    7  4 4     
consensus                     :       ACTGAC-AG--GGTGTGAC-AC-A-A--CA---T---CTTA---TTT--CT-ATGG--T-A-TA---------------------T-CAAA---AA-AA---TCT--T--CCCTGCGA-G-T---A-T-TC-AGGGAT--A-A-T-T-AT------A---A-GC---T--A---C-TC-GA-GGGC-T-T-A-G---G---TGA-G-G--AGA-AT-TAA-CTGA-TC--AG--ACA---A-TCA-A-A-G---AG-----T-G-T---G----AAAA---G---TT--TG-T----C-TG--T-----A--A-GT---T--G---T--A--TA-A-CCA---AG-A-AG--CG-G------AGAC-T-AC-T--G--A--T--ACG-GTA-A-GG-AAT---G-TA-TTGT-T-TGG----GA-AA-T------C-AA-AAAG-C--C---CTGA----G--AAT-A-T-----GC-C--T-CCA--A--C-T-AGT--G-A--T-GCC-TT-A-T--GCA------TG-CA-T--GT-A------A--A----G-C--GA-GCA-C-AC--T-----AC-C-AA-G--C---C--TT-GA-TA-TG-G-A-GA-C--A-G--GC-AA--AC--A--T-TT--G-T-AAGC---CC-TT-AT-T-ACC-A-----T--GTCC-AA--C-T--GAC-A-T-GG-G--AT----GGAA-GTT---G--G--ATGG-TG-G-TTGTT
Reference ( family-849 )      :       ACTGAC-AG--GGTGTGAC-AC-A-A--CA---T---CTTA---TTT--CT-ATGG--T-A-TA---------------------T-CAAA---AA-AA---TCT--T--CCCTGCGA-G-T---A-T-TC-AGGGAT--A-A-T-T-AT------A---A-GC---T--A---C-TC-GA-GGGC-T-T-A-G---G---TGA-G-G--AGA-AT-TAA-CTGA-TC--AG--ACA---A-TCA-A-A-G---AG-----T-G-T---G----AAAA---G---TT--TG-T----C-TG--T-----A--A-GT---T--G---T--A--TA-A-CCA---AG-A-AG--CG-G------AGAC-T-AC-T--G--A--T--ACG-GTA-A-GG-AAT---G-TA-TTGT-T-TGG----GA-AA-T------C-AA-AAAG-C--C---CTGA----G--AAT-A-T-----GC-C--T-CCA--A--C-T-AGT--G-A--T-GCC-TT-A-T--GCA------TG-CA-T--GT-A------A--A----G-C--GA-GCA-C-AC--T-----AC-C-AA-G--C---C--TT-GA-TA-TG-G-A-GA-C--A-G--GC-AA--AC--A--T-TT--G-T-AAGC---CC-TT-AT-T-ACC-A-----T--GTCC-AA--C-T--GAC-A-T-GG-G--AT----GGAA-GTT---G--G--ATGG-TG-G-TTGTT
gi|92547                      :       ACTGAC-AG--GGTGTGAC-AC-A-A--CA---T---CTT-----TT--CT-ATAG--T-A-TA---------------------T-CAAA---AA-AA---TCT--T--CCCTGCGA-G-T---A-T-TC-AGGGAT--A-A-TAT-AT------A---A-GC---T--A---C-TC-GA-GGGC-T-T-A-G---G---TTA-G-G--AGA-AT-TAA-CTGA-TC--AG--ACA---A-TCA-A-A-G---AG-----T-G-T---G-----AAA---G---TT--TG-T----C-TG--T-----A--A-GT---T--G---T--A--TA-A-CCA---AG-A-AG--CG-G------AGAC-T-AC-T--G--A--T--ACG-GTA-A--G-AAT---G-TA-TTGT-T-TGG----GA-AA-T------C-AA-AAAG-C--C---CTGA----G--AAT-A-T-----GC-C--T-CCACCA--C-T-AGT--G-A--T-GCC-TT-A-T--GCA------TG-CA-T--GT-A------A--A----G-C--GA-GCA-C-AC--T-----AC-C-AA-G--C---C--TT-GATTA-TG-G-A-GA-C--A-G--GC-AA--AC--A--T-TT--G-T-AAGC---CCTTT-AT-T-ACC-A-----T--GTCC-AA--C-T--GAC-A-TGGG-G--AT----GGGA-GTT---G--G--AT-G-TG-G-TTGTT
gi|92548                      :      cACTGAC-AG--GGTGTGAC-AC-A-A--CA---T---CTTA---TTT--CT-ATGG--T-A-TA---------------------T-CAAA---A--AA---TCT--T--CCCTGCGA-G-T---A-T-TC-AGGGAT--A-A-T-T-AT------A---A-GC---T--A---C-TC--A-GGGC-T-T-A-G---G---TGAGG-G--AGA-AT-TAA-CTGA-TC--AG--ACA---A-TCA-A-A-G---AG-----T-G-T---G----AAAA---G---TT--TG-T----C-TG--T-----A--A-GT---T--G---T--A--TA-A-CCA---AG---AG--CG-G------AGAC-T-AC-T--G--A-----ACG-GTA-A-GG-AAT---G-TA-TTGT-T-TGG----GA-AA-T------C-AA-AAAG-C--C---CTGA----G--AAT-A-T-----GC-T--C-CCA--A--C-T-AGT--G-A--T-GCC-TT-A-T--GCA------TG-CA-T--GT-A------A--A------C--GA-GCA-C-AC--T-----AC-C-AA-G--C---C--TT-GA-TA-TG-G-A-GA-C--A-G--GC-AA--AC--A--T-TT--GTT-AAGC---CC-TT-AT-T-ACCAA-----T--GTCCAAA--C-T--GAC-A-T-GG-G--AT----GGAA-GTT---GGCG--ATGG-TG-G-TTGTT
gi|92549                      :      cACTGAC-AG--G-TGTGAC-AC-A-A--CA---T---CTTA---TTT--CT-ATGG--T-A-TA---------------------TTCAAA---AA-AA---TCT--T--CCCTACGA-G-T---A-T-TC-AGGGATT-A-A-T-TTAT------A---A-GC---TTAA---C-TC-GA-GGGC-T-T-A-G---G---TGA-G-GG-AGA-AT-TAA-CTGA-TC--AG--ACA---A-TCA-A-A-G---AG-----T-G-T---G----AAAA---G---TT--TG-T----C-TG--T-----A--A-GT---G--T---T--A--TA-A-CCA---AG-A-AG--CG-G------AGAC-T-AC-T--G--A--T--ACG---A-A-GGAAAT---G-TA-TTGT-T-TGG----GA-AA-T------C-AA-AAAG----C---CTGAG---G--AAT-A-T-----G--C--T-CCA--A--C-T-AGT--G-AT-T-GCC-TT-A-T--GCA------TG-CA-T--GT-A------A--A----G-C--GA-GCA-C-AC--T-----A--C-AA-G--C---C--TT-GA-TA-TG-G-A-GA-C--A-G--GC-AA--AC--A--T-TT--G-T-AAG----CC-TT-AT-T-ACC-A-----T--GTCC-AA--C-T--GAC-A-T--G-G--AT----GGAACGTT---G--G--ATGG-TT-G-TT
gi|92550                      :      cACTGAC--G--GGTGTGAC-AC-A-A--CA---T---CTTA---TTT--CT-ATGG--T-A-TA---------------------T-CAAA---A--AA---TCT--T--CCCTGCGA-G-T---A-T-TC-AGGGAT--A-ATT-T-AT------A---A-GC---T--A---C-TC-G--GGGC-T-T-A-GT--G---TG--G-G--AGAGAT-TAA-CTGA-TC---G--ACA---A-TCA-A-A-G---AG-----T-G-T---G----AAAA---G---TT--TG-T----C-TG--T-----A--A-GT---T--G---T-----TATA-CCA---AG-A-AG--C--G------AGAC-TAAC-T--G--A--T---C--GTA-A-GG-AAT---G-TA-TTGT-T-TGG----GA-AA-T------CAAA-AAAG-C--C---CTGA----G--AAT-A-T-----GC-C--T-CCA--A--C-T-AGT--G-A--T-G-C-TT-A-T--GCA------TG-CA-T--GT--------A--A----G-C--GA-GCA-C-AC--T-----A--C-AA-G--C---C--TT-GA-TA-TG-G---GA-C--A-G--GC--A--AC--A--T-TT--G-T-A--C---CC-TT-AT-T-ACC-A-----T--GTCC-AA--C-T--GAC-A-T-GG-G--AT----GGAA-GTT---G--A--GT-G-TG-G-TTGTT
gi|92551                      :      cACTGACCAG--GGTGTGAC-AC-A-A--CA---T---CTTA---TTTGGTT-ATGG--TTA-TA---------------------T--AAA---AA-AA---TTC--T--TCCTGCGA-G-T---A-T-TC-ATG-AT--A-A-T-T-AT------A---A-GC---T--A---C-TC-GA-GGGC-T-T-A-G---G---TGA-G-GG-AGA-AT-TAA-CTGA-TC--AG--ACA---A-TCA-A-A-G---AG-----T-G-T---G----AAAG--------T--TG-T----CCTG--T-----A--A-GT---T--G---T--A--TA-A-CCA---AG-A-AG--CG--------AGAC-TTAC-TT-G--A--T--ACG-GTA-A-GG-AAT---GGTA-TTGT-T-TGG----GA-AA-T------C-AA-AAAG-C--C---CTGA----GGGAAT-A-T-----GC-C--T-CCA--A--C-T-AGTTTG-A--T-GCC-TT-A-T--GCA------TG-CAAT--GTTA------A--A----G-C--GA-GCA-C-ACACT-----AC-C-AA-G--C---C--TT-GA-TA-TG-G-A-GA-C--A-GTGGC-AA--AC--A--T-TT--G-T-AAGC---CCTTT-AT-T-ACC-A-----T--GT-C-AA--C-T--GAC-A-T-GG-G--AT----GGAA-GTT---G--G--ATGG-TG-G-TTGTT
gi|92552                      :      cACTGAC-AG--G-TGTGA--AC-A-A--CAA--T---CTTA---TTT--CT-ATGG--T-A-TA---------------------T-CAAA---AA-AA---TCT--T--CCCT-CGA-G-T---A-T-TC-AGG-AT--A-A-T-T-AT------A---A-GC---T--A---C-TC-GA-GG-C-T-T-A-G-------TGA-G-GG-AGA-AT-TAAACTGA-TC--AG--ACA---A-TCA-A-A-G---AG-----T-G-T---G----AAA----G---TT--TG-T----C-TG--T-----A--A-GT---T--G---T--A--TA-A-C-A---AG-A-AG--CG-G------A--C-T-AC-T--G--A--T--ACG-GTA-A-GG-AAT---G-TA-TTGT-G-TGG-----A-AA-T------C-AA-AAAG-C--C---CTGA-------AAT-A-T-----GC-C--T-CCA-----C-T---C--T-A--T--CC-TT-A-T--GCA------TG-CA-T--GT-A------A--A----G-C--GA-GCA-C-A---T-----AC-C-AA-G--C---C--TT-GA-TA-TG-G-A-GA-C--A-G--GCAAA--AC--A--T-TT--G-T-AAGC---CC-TT-AT-T-ACC-A-----T--GTCC-AA--C-T--GAC-A-T-GG-G--AT-----GAA-GTT---G--G--ATGG-TG-G-TTGTT
gi|92553                      :      cACTGAC-AG--GGTGTGAC-AC-A-A--CA---T---CTTA---TTT--CT-ATG---T-A-TA---------------------T--AAA---AA-AT---TCT--T--CCCTGCGA-G-T---A-T-TC-AGGGAT--ATA-T-T-AT------ATAAG-GT---T--A---C-TC-GA-GGGC-T-T-A-G---G---TGA-G-GG-AGA-AT-TAA-CTGA-TC--AG--ACA---A-TCA-AGA-T---AG-----T-G-T---GG---AAAA---G---TT--TG-T----CCTG--T-----A--A-GT---T--G---T--A--TAGA-CCA---AGTA-AG--CG-G------AGAC-T-AC-T--G--A--T--ACG-GTA-A-GG-AAT---G-TA-TTGT-T-TGG----GA-AA-T------C--A-AAAG-C--C---GTGA----A--GAT-A-T-----GC-C--T-CCA--A--C-T-AGT--G-A--T-GCC-TA-A-T--GCA------TGCCA-T--GT-A------A--A----GCC--GA-GCA-C-AC--T-----ACGC-AA-G--C---C--TTGGA-TA-TGAG-A-G--C--A-GC-GC-AATTAC--A--T-TT--G-T-AA-C---CC-TT-AT-T-ACC-A-----T--GTCC-AA--C-T--GAC-A-T-GG-G--AT----GGAA-GTT---G--G--ATGG-TGAG-TTGTT
gi|92554                      :      cACTGAC-AG--G-TGC-AC-CC-A-A--CA---T---CTTA---TTTTCCT-ATGG--T-A-TA---------------------TTCAAA---AA-AA---TCT--TT-CCCTGCGA-G-T---A-T-TC-AAGGATT-A-A-T-TTAT------A---A-GC---T--A---C-TCCGA-GGGCCT-T-A-G---G---TGA-G-G--AGA-AT-TAA-CTGA-TC--AG--ACA---A-TCA-A-A-G---AG-----T---T---GATCAAAAA---G---TT--TG-T----C-TGTTT-----A--A-GT---T------T--A--TA-A-CCA---AA-G-AG--CG-GCGGGAAAGAC-T-AC-T--G--AT-T--ACG-GTA-A-GA-ATT---G-TA-TTGT-T-TTG----GG-AA-T------C-AA-AAAGCC--C---CTGA----A--ATT-A-T-----GC-C--T-CCA--A--C-TAAGT--G-A--TGGCC-TTGA-T--GCAG-----TG-CA-T--GT-G------AACA----G-C--GA-GCA-C-AC--T-----AC-C-AA-G--C---TCGTT-GA-TACTG-G-A-GA-C--ACG--GCAAA--AC--A--T-TT--G-TAAAGC---CC-TT--T-T-ACC-A-----T--GTCC-AAACC-T--GAC-A-T-GG-G--AT----GGAA-GTT------G--ATGGTTG-G-TTGT
gi|92555                      :         cGAC-AG--GGTGGGAC-AC-A-A--CA---T---CTTA---TTT--CT-ATG---T-A-TA---------------------T-CAAA---AA-AAAT-TCT--T--CCCTGCGA-G-T---A-T-TC-AGG-AT--A-A-T-T-AT------A---A--C---T--A---C-TC-GA-GGGC-T-T-A-G---G---TGA-G-GG-AGA-AT-TA--CTGA-TC--AG--ACA-----TCA-A-AAG---AG-----TTG-TTTGA----AAAA---G---TT--TGGT----C-TG--T-----A--A-GT---T--G---T--A--TA-A-CCA---AG-A-AAGCCG-G------AGAC-T--C-TA-G--A--TTGACG-GTA-A-GG-AAT---G-TA-TTGT-TATGG----GA-AA-T------C--A-AAAG-C--C---CTGA----G--AAT-A-T-----AG-CAGC-CCA--A----T-AGT--G-A--T-GCC-TT-A-TTGGCA------TG-CA-T--GT--------A--A----G-C--GAGGCACC-AC--T-----AC-G-AA-G--C---C--TT-GA-TA-T--G-A-GA-C--A-G--G--AA--AC--A--T-TT--G-T-AAGC---CC-TT-AT-T-ACC-A-----T--GTCC-AA--C-T--G-C-ATT-GG-G--AT----GGAA-GTTGACG--A--ATGG--G-G-TTGTT
gi|92556                      : cactggACTGAC-AG--GGTGTGAC-AC-A-A-------T---TTTA---TTT--CT-ATGG--T-A-TA---------------------T-CAAA---AA-------TT--T--CCCTG-GA-G-----A-T-TC-AGTGAT--A-A-T-T-AT------A-----GCG--T--A---C-TT-GA-GGGC-T-T-A-G---G---TG--G-G--AGA-AT-TAA-CTGA-TC--AG--ACA-----TCA-A-A-G---AG-----T-G-T---GG---AAAA---G---TT--TG-T----C-TG--T-----A--A-AT------G---T--A--TA---CCA----G-A-AG--CG--------AGAC-T-AC-T--G--A--T--ACG-GTA---GG-AAT---G-TA-TTGT-T-TGG----GA-AAAT------C-AA-AAG---------CTGA----G--AAT-A-T-----GGAC--T-CCA--A----T-AGT--G-A--T-GCC-TT-A-T--GC-------TG--A-T--GTTA------A--A----G-C--GA-GCA-C-AC--T-----AC---GA-G--C---C--TT-GA-TA-TG-G-A-GA-C--A-G--GC-AA--AC--A--T-TT--G-T-AAGC---C--TT-AT-T-ACA-A-----T--GTCC-AA--C-T--GAC-A-T-GT-G--AT----GGAA-TTT---G--G--ATGG-TG-G-TTGTT
gi|92557                      :      cACTGAC-AG--GGTGTGAC-AC-A-A--CA---T---CTTAC--TTT--CT-AT----T-ATTA---------------------G-CAAA---AA-AA---T-T--T--CCCTGC---T-T---A-T-TC-A-GGAT--A-A-T-T-AT------A---A-GC---T--A---C-TC-AG-AGGC-T-T-A-----G---TGA-G-G---GA-AT-TAA-CTGA-TCAAAG--ACA---A-TCA-A-A-G---AG-----T-GTT---GTT--AAAA---G----T--TG-T----C-TG--T-----A--A-GT---T--G---T--A---A-A-CCA---AG---AG--CA-G------AGAC-T-ACTT--G--AT-T--ACG-TGA-A-GG-AA----G-TA--TGT-T-T-G----GA-AA-T------C-AA-AAAT-C--C---CTGA----G--AAA-G-T-----G--C--T-CCA--A--C-T-A-T--G-AT-T-GCC-TT-A-T---CA------TG-CA-T--GT-A------A--A------C--GA-GCA-C-AC--T-----AC-C-AA-G--C---CT-TT-GA-TA-TT-G-A-GA-C--A-G--GC-AA--AC--A--T-TT--G-T-AAAC---CC-TT--T-T-ACC-A-----T--GTCC-AA--C-----ACAA-T-GGTG--A-----GGAA-GTT---G--G--AT-G-TG-G--TGTT
gi|92558                      :      cACTGAC-AG--GGTGTGACCACCG-A--CA---T---CTTA---ATT--CT--TGG--T-A-TAAGCCCGTAGAAAATGGCCTCTT-CAAATATAATAA---TCT--TTTCCCTGCGA-G-TTATA-T-TCTAGTGAT--A-A-T-T-ATTATCACA---A-GA---C--ATAAC-TT-GACGGGC-T-TTA-G---G---TGA-G-GG-AGA-AT-TAAACTGAATCT-AG--ACATCAA-TTA-A-A-G---AG-----T-GAT---------ATA---G---TT--TA-TTGTAC-CG--TGTAAAA--A-GTATAT--G---T--A--TA-AACCATTGAA-A-AG--CG--------AGACGT-AC-C--T--G--T--ACG-GCA-A-GA-GAT---G-TA-T-GA-T-TGG----GC-AA-TATCATTC-AACAAAG-T--CTCACTGGATATG--AAT-A-TAAAAAGC-C--T-C-A--A--C-T-AGT--G-A--T-GCC-TT-A-T--GCAAATTGTTA-CA-T--GTTA------A--ATGCTA-C--GA-GCA-C-AC--TCTGATAC-C-AA-AGAC---T--TT-GAGTA-TG-G-ATGA-C--A-G--GT-CA--AC--A--T-TTCTG-T-AAGC---CC-TT-AT-A-ACC-AATCGGT--G-CC-AA--C-T--GAC-A-T-GG-G--AT----GAAG-TTT---G--G--ATGGATG-GTTTGTT
gi|92559                      :      cACTGAC-AG--G-TGTGAC-AC-A-A--CA---T---CTTA---TTTT-CT-ATGG--T-A-TA---------------------T-CAAA---AA-AA---TCT--T--CCCTGCGA-G-T---A-T-TCCAGGGAT--A-A-T-T-AT------A---A-GC---T--A---C-TC-GA-GGGC-T-T-A-G---G---TGA-G-G--AGA-AT-TAA-CTGA-TC--AG--ACA---A-TCA-A-A-G---AG-----T-G-T---G----AAAA---G---TT--TG-T----C-TG--T-----A--A-GT------G---T--A--TA-A-CCA---AG-A-AG--CG-G------AGAC-T-AC-T--G-----T--ACG-GTA-A-GG-AAT---G-TA-TTGT-T-TGG----GA-AA-T------C-AA-AAAG-C--C---CTGA----G--AAT-A-T-----GC-C--T-CCA--A--C-T-AGT--G-A--T-GCC-TT-A-T--GCA------TG-CA-T--GT-A------A--A----G-C--GA-GCA-C-AC--T-----AC-C-AA-G--C---C--TT-GA-TA-TG-G-A-GA-C--A-G--GC-AA--AC--A--T-TT--G-T-AAGC---CC-TT-AT-T-ACC-A-----T--GTCCAAA--C-T--GAC-A-T-GG-G--AT----GGAA-GTT---G--G--ATGG-TG-G-TTGTT
gi|92560                      :       ACTGACCAGTGGATGTGAC-AC-A-AAACA---T---CCTGGATTTT--CTCATGGGAT-A-TA---------------------T-CAAA---AA-AAAAGTCTACT--CCCTGCGA-GGT---AAT-TC-AGGGAT--A-A-TCT-AT------A---A-GCCAAT--A---CATC-GA-GGGC-TAT-ACGC--G---TGA-G-GCGAGA-AT-TAA-CTGA-TC--AG--ACA---AGTCA-A-A-GACAAG-----T-G-T---G----AAAA---AGATCT--CGCT----CATG--TA----A--A-GT---T--G---T--A--TA-A-CCATG-AG-ATAG--CG-G------GAAC-T-AC-T--GACA--T--ATGTTTA-A-GG-CACACGA-TA-TTGTAT-TGGAGCCGA-AA-TG-----CAAA-AAAG-CATC---CTGA----G--AAT-A-T-----GC-T--TACCA--AACT-T-AGT--G-ATCT-GCC-TT-A-T--GCA------TG-CA-TG-GT-A------AC-A----G-C--GA--CA-C-AC--T-----AC-C-AA----CTCTC--TT-CACTA-TGCGCA-GACC--A-G--GC-AA--ACCAA--TCTT--G-T-AAGC---CC-TTCATCT-ACC-A-----TCCGTCC-AA--C-G--CAC-A-T-GGCG--ATGCGCGGAAGGTT---G--G--ATAG-TG-G-TTGTT
gi|92561                      :                --GATGTGAC-AC-A-G--CA---T---CTCA---TTT--CT-GTAG--T-A-TA---------------------T-GAAA---AA-TA---TTT--T--C----AGG-G-T---G-T-TC-AGCGAT--A-A-C-T-AT------A---A-AG---T------C-CC-GA-GAG
gi|92562                      :                      TGAC-AC-T-A--TA---TATTCTTA---TTT--CT-ATTT--T-A-TA---------------------T-CAAA---AA-AAA--TCT--T--CCCTGCGATG-T---A-T-TC-AGG-ATTAA-A-T-T-AT------A---A-GC---T--A---C-TC-GA-GGGC-T-T-A-----G---TGA-G-G--AGA-ATATAA-CTGA-TC--AG--ACA---A-TCATA-A-G---AGTTTTTT-T-T---G-----AAA---G---TT--TG-T----C-TG--T-----ATCT-GT---TC-A---T--A--AA-A-CCA------A-AG--CG---------AAC-T-AC-T--G--A--T--AC--GTA-A-G----T-----TA-TTAT-C-TTT----GA-AA-T------C-AA-AAAG-C--C---CTGA-------AAT-ATT-----GC-C--T-CCA--A--T----------A--T-A----T-ATT--GCA------TG-CA-T--GT--------A--A----G-CTTGA-GCA-C-AC--T-----AC-C--A-G--C---C--TT--A-TA-T----A-TA-C--AGG--GCAAA--ACA-A--T-TT--G-T-AATCTCGCT-TT-AT-T-ACCTA-----T--G-CC-AA--TAT--GAC-A-T-GG-G--AT-----GAA-GT----------GTGT-TG-G-TTGT
gi|92563                      :                        AC-AC-AGA--CAGTCT---CTTA---TTT--CT-A--G--T-A-TA---------------------T-CAAA---AA-A----TCT--T--CCC-GCGA-G-----A-TCTC-AGGAAT--A-A-T-T-AT------A---ATGC---TTCAGC-C-TC-G--GGGC-T-T-A-GTGAG---TGA-G-G--AG---T-TAA-CTGA-TC--AGACACA---A-TCA-A-A-G---TG-----T-GTT---GAT--AAGA---G---TTTATG-T----C-TG--T-----A--A-GT---T--G---TACA--TA-A-CCA---AG-A-CG--CGAG------CAAC-TAAC-TTAG--ATTT--ACG-GTCTA-AG-ATT---G-TATTTGT-T-TGG----G--AA-T------C--A-AAAG-C--A---CTGA----G--AAT-ACT-----GCTC--TCCCA--A--C-T-AGT--G-A--T--CC-TT-ATT--GCA------TG-CA-TTCGT-A------A--A----ATC--GA-GCA-CAAC--T-----AC----A-G--C---C--TT--A-TA-TGAG-A-GA-C--A-G--GC-AA--A---A----TT--G-T-AAGC---CC--T-AT-TAACC-AG----TA-GTCC-AA--C-TTGGAC-A-T-GG-G--AT----GG-A-GCT---GT-G--ATGG-T--G-TTGTT
gi|92564                      :                                                                                                                                                                                        C-GA-GGGCCT-T-A-G---GGGCTGA-GCG--AGA-AT-TAA-CT-A-TC--AG--ACC---A-TCA-A---G---AG-----T-G-T---G----AAAAAGGG---TT--TG-TA---C-GG--T-----A--ACGT---T--GGGGT--AATCA-A-CCA---AG-A-AG--CG--------AGAC-T-AC-T--G--A--TGGACG-GTA-A-GG-AAT---G--A-TTGT-T-TGG----GA-AA-T------C-AA-AA-G-C--C---CTGA----G--AATTA-T-----GC-C--T-CCA--A--C-T-AGTT-G-A--T-GCCATT-A-T--GCA------TG-CA-T--GT-A------A--A------C--GA-GCA-C-AC--T-----AC-C-AAGG--C---C--TT-GA-TA-TG-----GA-C--A----GC-AA--AC--AATT-TT--G-T-AAGC---CC--T-AT-T-ACC-AG----T--GTCC-AA--C-T--GAC-A-T-GG-GGAAT----GGAA-GCTTGAG--G--ATG
gi|92565                      :                                                                                                                                                                                                                                                                -G---AG-----T-T-A---G----AATA---GGT-TT--TG-T----C-TG--T-----A--A-GT---TATG---T--A--TA-A-CCA---AG-A-AG--CG-G------A-AC-T-AC-T--G--A--T--ACG-GTA-AGGG-AAT---G-TA-TTGT-T-TGG----GA-AA-T------C-CA-AAAA-C--C---CTGA----G--AAT-A-T-----GC-G--T-CAA--A--CGT-AGT--GAA--T-G-C-TT-A-T--GCA------TG-CA-T--GT-A------A--A----G-C--GA-GCA-C-AC--T-----AC-CAAA-G--C---C--TT-GATTA-TG-G-A-GA-CAAA-G--GC--A--AC--AT-T-TT--G-T-AAG----CC-TT-AT-T-ACC-A-----T--GTCC-AA--C-T--GAC-A-T-GG-G--AT----GGAA-GTT---G--GGAATGG-TG-G-TTGTT
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blockSeqs                     :             C  .  G      .  . . .   A   .      C     TC  .    .  . .  .                     T    .    .  AT    .  T         . . .   . .  C   G  T  . . . T  .      .   .  G   ATAA   .  .  .    C . . . T   .     . . G    .  .   A    .  T   .    .   .   . . . .    .     . A .   TT      .   GT   .   C A    C  .  A     .  .  TAT    .   .  .   G .   TG   . .  .   AG          . T  . T  .  T  GG   .   . .  .   .   .  .    . .   C     .  . G      A  .    . .  .      G    .    . C .      T .  C   .  .  . .   T  . T  .   .  . T .    G       .  . G   TA       C  GC     .   .   . .  .  .      . .  . .  .   T   .  C  .  C . .  . .  G C   A  .   A  T  .  .  . .    .    .  .  . .   T G     A     A  .  . .    . . .  C .   .       G   TGA T  .     A  . .
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