lowQualScore : 111 11111
lowQualScore : 2 33 2 2 2 2 22 2 555555 2 000 2 2 88888 2 2 22 2 2 333 2 2 333 55 55 2 4 6 2 2 2 2 66666 7777 2 3
lowQualScore : . .. . . . . .. . ...... . ... . . ..... . . .. . . ... . . ... .. .. . . . . . . . ..... .... . .
lowQualScore : 4 22 2 2 2 2 33 2 666666 2 999 2 2 99999 1 1 99 1 1 777 1 1 777 00 33 2 4 7 2 4 4 4 11111 8888 5 1
consensus : TGACG-T--AACACCA-ATG-ACG-TTGGCCT-AC-AT-CCTTG----A-AAA-A-AAG-T-TTTCG---T-TGC-G-A--GT-T-T---T-T-G---AA--ATC--AC-CTCA-A-C-G-ATC-AAGG-ACAG-T---GG----AT-CGTGG-ACTAA
Reference ( gi|123018 ) : TGACG-T--AACACCA-ATG-ACG-TTGGCCT-AC-AT-CTTTG----A-AAA-A-AAG-T-TTTCG---T-TGC-G-A--GT-T-T---T-T-G---AA--ATC--AC-CTCA-A-C-G-ATC-AAGG-ACAG-C---GG----AT-CGTGG-ACTAA
gi|123016 : TGACG-T--AACACCA-ATG-ACG-TTGGCCT-AG-AT-CCTTG----A-GAA-A-A-G-T-TTTCG---T-TGC-G-A--GT-T-T---T-T-G---AA--ATC--AC-CTCA-A-C-G-ATC-AAGG-ACAG-T---GG----AT-CGTGG-AATAA
gi|123019 : TGACG-T--AACAGCA-ATG-ACG-TTGACCT-AG-AT-CTTTG----A-AAA---AAG-T-TTTCG---T-TGC-G-A--GT-T-T---T-T-G---AA--ATC--AC-CTCA-A-T-G-ATC-AAGG-ACAG-T---GG----AT-TGTGG-ACTAA
gi|123021 : TGACG-TTAAATACCA-ATG-ACG-TTGGCCT-AC-AT-ACTTC----A-AAA-A-AAG-T-TTTCG---T-TGC-T-A--GT-T-T---T-T-G---AA--ATC--AC-CTCA-A-C-G-ATC-AAGG-ACAG-T---GG----AT-CGTGG-AGTAA
gi|123023 : TGACG-T--ATTACCA-ATT-ACG-TTGGCCT-AC-AT-CTTTG----A-AAAAA-AAG-T-TTTCG---T-TGC-G-A--GT-T-T---T-T-A---AA--ATC--AC-CTCA-A-T-G-ATC-AAGG-ACAG-T---GG----AT-CGTTG-GCT
gi|123020 : TGACG-T--AACACCA-ATG-ACG-TTGACCT-A--AT-CTTTC----A-AAA-A-ATG-T-TT-CG---T-TGC-G-A--GT-T-T---T-T-G---AA--ATC--AC-CTCA-A-C-G-ATC-AAGG---AG-T---GG-----T-CGTGG-ACTAA
gi|123022 : TGACG-A--AACACCA-ATG-ACG-TTAGCCT-AG-AT-CCTTG----A-AAA-C-C-G-T-TTTCA---T-TGC-G-A--GA-T-T---T-T-G---AA--ATC--AC-CTCA-A-C-G-ATC-AAGG-ACAG-T---GG----AT-CGTGG-
gi|123025 : TGACG-T--AACACC--ATGAACGTTTGACCT-AC-A--CTTTG----A-AAA-A-AAG-T-TTTCG---T-TGC-G-A--GT-T-T---T-T-T---AA--ATCAGAC-CTCA-A-C-G-ATC-AAGG---AG-----GG----AT-CGTGG-ACT
gi|123024 : TGACG-T--AACACCA-TTG-ACG-TTGGCCT-AG-AT-ACTTG----A-TAA-A-A-G-T-TTTCG---G-TGT-G-A--GT-T-T---T-G-G---AA--ATC--AC-CTCA-A-C-G-ATT-GAGG-ACAG-T---GG----AT-TGTGG-GCTAA
gi|123026 : TGACT-T--AACACCA-ATG-ACG-TTGGCCG-AC-AT-ACTTG------AAA-A-AAG-T-TTTCG---T-TGT-G-A--GT-T-T---T-T-G---AAAGATC--AC-CTCA-A-C-
gi|123028 : TGACG-T--A---CCA-ATG-ACG-TTGGCCT-AT-AT-CTTTG----ATAAA-A-GAG---TTTCA-----TGC-G-A--GTCT-T---T-T-G---AA--ATC--AG-TTCA-ACC-G-AT--AAGG-CAAG-TGTGGG----AT-CGTGG-AGTA
gi|123029 : TGACG-T--AACACCA------------------C-AT-TCTTGTGAAA-AAA-A-AAG-T-TTTCG---T-TGC-G-A--AG-T-T---T-T-G----A--ATC--AC-CTCATACC-G-ATC-AAGG-ACAG-----GG----ATCCGTGGAACTA
gi|123027 : TGACG-T--A---CCA-ATG-ACG-TGGCCCTCAC-ATACTTCG----A-AAA-A---G-TCTTTCAGA-TATGT-GCA--GT-T-T---TGT-G---AAC-ATC--AG-TTCA-A-C-G-ATC-AAGG-ACA
gi|123030 : TGACG-T--AACAGCA-ATG-ACG-TT-GCCT--C---------------------AAG-T-TTT-----------------------------G---AA--ATC--AC-CTCA-A-C-G-TTC-AAGG-ACAG-T---TG----AT-C
gi|123017 : TGACGGT--AACACCA-ATG-AC--TTGGCCT-ATGAT-GCTTG----ATAGA-ATAAGTT-TTTCGTTAT-TGCTG-A--GT-T-TTGCT-T-G---AA--A
gi|123031 : GACG-T--AACACCACATG--TG-T--------C-A--CTTTG----A-AAA-A-A-G-T-TTTCG---T---C-G-A--GT-T-T---T-T-G---AA--AGC--ACGCTC--A-C-G--TT-AA-C-ACAG-T---GG----AT-CGT
gi|123032 : CG-T--AACACCA-ATG-ACG-TTGACCT-AC-AT-CTTTG----C-AAA-A-AAG-T-TTTCG---T-TGC-G-AAGAT-TAT---G-T-G---AA--ATCA-AG-CTCA-GTC-GAAT---AGG-A-AG-T---GGGAATAT-CGTGA-GCTA
gi|123033 : -T--AACACCA-ATG-A-G-TTGGCCT-AC-AT-CTTTG----A-AAA-A-----T-TTTCG---G-T-C-G-A--GT-T-T---T-T-GTTTGA--ATC--AC-CTCATA-CTG-ATCGAAGG-ACAG-T----G----AT-TGTGG-ACT
gi|123034 : ACCA-ATG-ACG-TTGGC-T-AC-AT-ACTTG----A-AAA-A---G-T-TTTCG---TATGT-G-A--GT-T-T---T-TTG---AA--ATC--AG-TTCA-A-C-G-ATC-AAGGCACAGTC---GGA---AT-CGTGG-
gi|123035 : -TGC-G-A--GT-T-T---T-T-G---AA--ATC--AC-CTCA-A-C-G-GTC-AAAG-ACAG-T---GG----AT-C
Alignments
lowQualScore : 2 33 2 2 2 2 33 555555 77777 2 77777 2 2 22 2 2 333 2 2 333 44 55 2 4 6 2 2 2 2 777 5555 2 2
lowQualScore : . .. . . . . .. ...... ..... . ..... . . .. . . ... . . ... .. .. . . . . . . . ... .... . .
lowQualScore : 2 11 1 1 1 1 00 666666 11111 1 99999 0 0 88 0 0 555 0 0 555 88 00 1 2 3 1 2 2 2 444 0000 4 9
consensus : TGACG-T--AACACCA-ATG-ACG-TTGGCCT-AC-ATCCTTG----A-AAA-A-AAG-TTTTCG---T-TGC-G-A--GT-T-T---T-T-G---AA--ATC--AC-CTCA-A-C-GATC-A-AGG-ACAGT---GG----AT-CGTGG-ACTAA
Reference ( family-840 ) : TGACG-T--AACACCA-ATG-ACG-TTGGCCT-AC-ATCCTTG----A-AAA-A-AAG-TTTTCG---T-TGC-G-A--GT-T-T---T-T-G---AA--ATC--AC-CTCA-A-C-GATC-A-AGG-ACAGT---GG----AT-CGTGG-ACTAA
gi|123016 : TGACG-T--AACACCA-ATG-ACG-TTGGCCT-AG-ATCCTTG----A-GAA-A-A-G-TTTTCG---T-TGC-G-A--GT-T-T---T-T-G---AA--ATC--AC-CTCA-A-C-GATC-A-AGG-ACAGT---GG----AT-CGTGG-AATAA
gi|123017 : TGACGGT--AACACCA-ATG-AC--TTGGCCT-ATGATGCTTG----ATAGA-ATAAGTTTTTCGTTAT-TGCTG-A--GT-T-TTGCT-T-G---AA--A
gi|123018 : TGACG-T--AACACCA-ATG-ACG-TTGGCCT-AC-ATCTTTG----A-AAA-A-AAG-TTTTCG---T-TGC-G-A--GT-T-T---T-T-G---AA--ATC--AC-CTCA-A-C-GATC-A-AGG-ACAGC---GG----AT-CGTGG-ACTAA
gi|123019 : TGACG-T--AACAGCA-ATG-ACG-TTGACCT-AG-ATCTTTG----A-AAA---AAG-TTTTCG---T-TGC-G-A--GT-T-T---T-T-G---AA--ATC--AC-CTCA-A-T-GATC-A-AGG-ACAGT---GG----AT-TGTGG-ACTAA
gi|123020 : TGACG-T--AACACCA-ATG-ACG-TTGACCT-A--ATCTTTC----A-AAA-A-ATG-TTT-CG---T-TGC-G-A--GT-T-T---T-T-G---AA--ATC--AC-CTCA-A-C-GATC-A-AGG---AGT---GG-----T-CGTGG-ACTAA
gi|123021 : TGACG-TTAAATACCA-ATG-ACG-TTGGCCT-AC-ATACTTC----A-AAA-A-AAG-TTTTCG---T-TGC-T-A--GT-T-T---T-T-G---AA--ATC--AC-CTCA-A-C-GATC-A-AGG-ACAGT---GG----AT-CGTGG-AGTAA
gi|123022 : TGACG-A--AACACCA-ATG-ACG-TTAGCCT-AG-ATCCTTG----A-AAA-C-C-G-TTTTCA---T-TGC-G-A--GA-T-T---T-T-G---AA--ATC--AC-CTCA-A-C-GATC-A-AGG-ACAGT---GG----AT-CGTGG-
gi|123023 : TGACG-T--ATTACCA-ATT-ACG-TTGGCCT-AC-ATCTTTG----A-AAAAA-AAG-TTTTCG---T-TGC-G-A--GT-T-T---T-T-A---AA--ATC--AC-CTCA-A-T-GATC-A-AGG-ACAGT---GG----AT-CGTTG-GCT
gi|123024 : TGACG-T--AACACCA-TTG-ACG-TTGGCCT-AG-ATACTTG----A-TAA-A-A-G-TTTTCG---G-TGT-G-A--GT-T-T---T-G-G---AA--ATC--AC-CTCA-A-C-GATT-G-AGG-ACAGT---GG----AT-TGTGG-GCTAA
gi|123025 : TGACG-T--AACACC--ATGAACGTTTGACCT-AC-A-CTTTG----A-AAA-A-AAG-TTTTCG---T-TGC-G-A--GT-T-T---T-T-T---AA--ATCAGAC-CTCA-A-C-GATC-A-AGG---AG----GG----AT-CGTGG-ACT
gi|123026 : TGACT-T--AACACCA-ATG-ACG-TTGGCCG-AC-ATACTTG------AAA-A-AAG-TTTTCG---T-TGT-G-A--GT-T-T---T-T-G---AAAGATC--AC-CTCA-A-C-
gi|123027 : TGACG-T--A---CCA-ATG-ACG-TGGCCCTCAC-ATACTTC----G-AAA-A-AGT-CTTTCAGA-TATGT-GCA--GT-T-T---TGT-G---AAC-ATC--AG-TTCA-A-C-GATC-A-AGG-ACA
gi|123028 : TGACG-T--A---CCA-ATG-ACG-TTGGCCT-AT-ATCTTTG----ATAAA-A-GAG--TTTCA-----TGC-G-A--GTCT-T---T-T-G---AA--ATC--AG-TTCA-ACC-GAT--A-AGG-CAAGTGTGGG----AT-CGTGG-AGTA
gi|123029 : TGACG-T--AACACCA------------------C-ATTCTTGTGAAA-AAA-A-AAG-TTTTCG---T-TGC-G-A--AG-T-T---T-T-G----A--ATC--AC-CTCATACC-GATC-A-AGG-ACAG----GG----ATCCGTGGAACTA
gi|123030 : TGACG-T--AACAGCA-ATG-ACG-TTG----------CCT-------------------------------C-A-A--GT-T-T---T---G---AA--ATC--AC-CTCA-A-C-GTTC-A-AGG-ACAGT---TG----AT-C
gi|123031 : GACG-T--AACACCACATG--TG-T--------C-A-CTTTG----A-AAA---AAG-TTTTCG---T---C-G-A--GT-T-T---T-T-G---AA--AGC--ACGCTC--A-C-G-TT-A-A-C-ACAGT---GG----AT-CGT
gi|123032 : CG-T--AACACCA-ATG-ACG-TTGACCT-AC-ATCTTTG----C-AAA-A-AAG-TTTTCG---T-TGC-G-AAGAT-TAT---G-T-G---AA--ATCA-AG-CTCA-GTC-GA---ATAGG-A-AGT---GGGAATAT-CGTGA-GCTA
gi|123033 : -T--AACACCA-ATG-A-G-TTGGCCT-AC-ATCTTTG----A-AAA-A-----TTTTCG---G-T-C-G-A--GT-T-T---T-T-GTTTGA--ATC--AC-CTCATA-CTGATCGA-AGG-ACAGT----G----AT-TGTGG-ACT
gi|123034 : ACCA-ATG-ACG-TTGGC-T-AC-ATACTTG----A-AAA-A---G-TTTTCG---TATGT-G-A--GT-T-T---T-TTG---AA--ATC--AG-TTCA-A-C-GATC-A-AGGCACAGTCG-GA----AT-CGTGG-
gi|123035 : -TGC-G-A--GT-T-T---T-T-G---AA--ATC--AC-CTCA-A-C-GGTC-A-AAG-ACAGT---GG----AT-C
Alignments
lowQualScore : 2 33 2 2 2 2 33 555555 77777 2 77777 2 2 22 2 2 333 2 2 333 44 55 2 4 6 2 2 2 2 777 5555 2 2
lowQualScore : . .. . . . . .. ...... ..... . ..... . . .. . . ... . . ... .. .. . . . . . . . ... .... . .
lowQualScore : 2 11 1 1 1 1 00 666666 11111 1 99999 0 0 88 0 0 555 0 0 555 88 00 1 2 3 1 2 2 2 444 0000 4 9
consensus : TGACG-T--AACACCA-ATG-ACG-TTGGCCT-AC-ATCCTTG----A-AAA-A-AAG-TTTTCG---T-TGC-G-A--GT-T-T---T-T-G---AA--ATC--AC-CTCA-A-C-GATC-A-AGG-ACAGT---GG----AT-CGTGG-ACTAA
Reference ( family-840 ) : TGACG-T--AACACCA-ATG-ACG-TTGGCCT-AC-ATCCTTG----A-AAA-A-AAG-TTTTCG---T-TGC-G-A--GT-T-T---T-T-G---AA--ATC--AC-CTCA-A-C-GATC-A-AGG-ACAGT---GG----AT-CGTGG-ACTAA
gi|123016 : TGACG-T--AACACCA-ATG-ACG-TTGGCCT-AG-ATCCTTG----A-GAA-A-A-G-TTTTCG---T-TGC-G-A--GT-T-T---T-T-G---AA--ATC--AC-CTCA-A-C-GATC-A-AGG-ACAGT---GG----AT-CGTGG-AATAA
gi|123017 : TGACGGT--AACACCA-ATG-AC--TTGGCCT-ATGATGCTTG----ATAGA-ATAAGTTTTTCGTTAT-TGCTG-A--GT-T-TTGCT-T-G---AA--A
gi|123018 : TGACG-T--AACACCA-ATG-ACG-TTGGCCT-AC-ATCTTTG----A-AAA-A-AAG-TTTTCG---T-TGC-G-A--GT-T-T---T-T-G---AA--ATC--AC-CTCA-A-C-GATC-A-AGG-ACAGC---GG----AT-CGTGG-ACTAA
gi|123019 : TGACG-T--AACAGCA-ATG-ACG-TTGACCT-AG-ATCTTTG----A-AAA---AAG-TTTTCG---T-TGC-G-A--GT-T-T---T-T-G---AA--ATC--AC-CTCA-A-T-GATC-A-AGG-ACAGT---GG----AT-TGTGG-ACTAA
gi|123020 : TGACG-T--AACACCA-ATG-ACG-TTGACCT-A--ATCTTTC----A-AAA-A-ATG-TTT-CG---T-TGC-G-A--GT-T-T---T-T-G---AA--ATC--AC-CTCA-A-C-GATC-A-AGG---AGT---GG-----T-CGTGG-ACTAA
gi|123021 : TGACG-TTAAATACCA-ATG-ACG-TTGGCCT-AC-ATACTTC----A-AAA-A-AAG-TTTTCG---T-TGC-T-A--GT-T-T---T-T-G---AA--ATC--AC-CTCA-A-C-GATC-A-AGG-ACAGT---GG----AT-CGTGG-AGTAA
gi|123022 : TGACG-A--AACACCA-ATG-ACG-TTAGCCT-AG-ATCCTTG----A-AAA-C-C-G-TTTTCA---T-TGC-G-A--GA-T-T---T-T-G---AA--ATC--AC-CTCA-A-C-GATC-A-AGG-ACAGT---GG----AT-CGTGG-
gi|123023 : TGACG-T--ATTACCA-ATT-ACG-TTGGCCT-AC-ATCTTTG----A-AAAAA-AAG-TTTTCG---T-TGC-G-A--GT-T-T---T-T-A---AA--ATC--AC-CTCA-A-T-GATC-A-AGG-ACAGT---GG----AT-CGTTG-GCT
gi|123024 : TGACG-T--AACACCA-TTG-ACG-TTGGCCT-AG-ATACTTG----A-TAA-A-A-G-TTTTCG---G-TGT-G-A--GT-T-T---T-G-G---AA--ATC--AC-CTCA-A-C-GATT-G-AGG-ACAGT---GG----AT-TGTGG-GCTAA
gi|123025 : TGACG-T--AACACC--ATGAACGTTTGACCT-AC-A-CTTTG----A-AAA-A-AAG-TTTTCG---T-TGC-G-A--GT-T-T---T-T-T---AA--ATCAGAC-CTCA-A-C-GATC-A-AGG---AG----GG----AT-CGTGG-ACT
gi|123026 : TGACT-T--AACACCA-ATG-ACG-TTGGCCG-AC-ATACTTG------AAA-A-AAG-TTTTCG---T-TGT-G-A--GT-T-T---T-T-G---AAAGATC--AC-CTCA-A-C-
gi|123027 : TGACG-T--A---CCA-ATG-ACG-TGGCCCTCAC-ATACTTC----G-AAA-A-AGT-CTTTCAGA-TATGT-GCA--GT-T-T---TGT-G---AAC-ATC--AG-TTCA-A-C-GATC-A-AGG-ACA
gi|123028 : TGACG-T--A---CCA-ATG-ACG-TTGGCCT-AT-ATCTTTG----ATAAA-A-GAG--TTTCA-----TGC-G-A--GTCT-T---T-T-G---AA--ATC--AG-TTCA-ACC-GAT--A-AGG-CAAGTGTGGG----AT-CGTGG-AGTA
gi|123029 : TGACG-T--AACACCA------------------C-ATTCTTGTGAAA-AAA-A-AAG-TTTTCG---T-TGC-G-A--AG-T-T---T-T-G----A--ATC--AC-CTCATACC-GATC-A-AGG-ACAG----GG----ATCCGTGGAACTA
gi|123030 : TGACG-T--AACAGCA-ATG-ACG-TTG----------CCT-------------------------------C-A-A--GT-T-T---T---G---AA--ATC--AC-CTCA-A-C-GTTC-A-AGG-ACAGT---TG----AT-C
gi|123031 : GACG-T--AACACCACATG--TG-T--------C-A-CTTTG----A-AAA---AAG-TTTTCG---T---C-G-A--GT-T-T---T-T-G---AA--AGC--ACGCTC--A-C-G-TT-A-A-C-ACAGT---GG----AT-CGT
gi|123032 : CG-T--AACACCA-ATG-ACG-TTGACCT-AC-ATCTTTG----C-AAA-A-AAG-TTTTCG---T-TGC-G-AAGAT-TAT---G-T-G---AA--ATCA-AG-CTCA-GTC-GA---ATAGG-A-AGT---GGGAATAT-CGTGA-GCTA
gi|123033 : -T--AACACCA-ATG-A-G-TTGGCCT-AC-ATCTTTG----A-AAA-A-----TTTTCG---G-T-C-G-A--GT-T-T---T-T-GTTTGA--ATC--AC-CTCATA-CTGATCGA-AGG-ACAGT----G----AT-TGTGG-ACT
gi|123034 : ACCA-ATG-ACG-TTGGC-T-AC-ATACTTG----A-AAA-A---G-TTTTCG---TATGT-G-A--GT-T-T---T-TTG---AA--ATC--AG-TTCA-A-C-GATC-A-AGGCACAGTCG-GA----AT-CGTGG-
gi|123035 : -TGC-G-A--GT-T-T---T-T-G---AA--ATC--AC-CTCA-A-C-GGTC-A-AAG-ACAGT---GG----AT-C
blockSeqs : G TA C A T C TG TGAAA ATAA T TTAT T C AG C A TGC G T TTT AG AG G T C T G T C GTG GAAT C A
blockSeqs : . . . . . . C AT AAAA . GATA . . . . . . . . . C A . T C . . . . CG . . .
blockSeqs : . . . . . . G AT AAA . TA . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . C A AAT . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . G A AAA . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . C A AAA . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . G A AAA . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . C A AAG . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . C A AGA . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . C A AAA . G . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . T A AAA . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . C G AA . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . C A CC . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . C C AA . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . C A AA . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . C A A . G . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . .
blockSeqCons : AAA**
originalCons : TGACG-T--AACACCA-ATG-ACG-TTGGCCT-AC-ATCCTTG----A-AAA-A-AAG-TTTTCG---T-TGC-G-A--GT-T-T---T-T-G---AA--ATC--AC-CTCA-A-C-GATC-A-AGG-ACAGT---GG----AT-CGTGG-ACTAA
finalCons : TGACG-T--AACACCA-ATG-ACG-TTGGCCT-AC-ATCCTTG----A-AAAAAA--G-TTTTCG---T-TGC-G-A--GT-T-T---T-T-G---AA--ATC--AC-CTCA-A-C-GATC-A-AGG-ACAGT---GG----AT-CGTGG-ACTAA
Alignments
lowQualScore : 2 33 2 2 2 2 33 555555 77777 2 77777 2 2 22 2 2 333 2 2 333 44 55 2 4 6 2 2 2 2 777 5555 2 2
lowQualScore : . .. . . . . .. ...... ..... . ..... . . .. . . ... . . ... .. .. . . . . . . . ... .... . .
lowQualScore : 2 11 1 1 1 1 00 666666 11111 1 99999 0 0 88 0 0 555 0 0 555 88 00 1 2 3 1 2 2 2 444 0000 4 9
consensus : TGACG-T--AACACCA-ATG-ACG-TTGGCCT-AC-ATCCTTG----A-AAA-A-AAG-TTTTCG---T-TGC-G-A--GT-T-T---T-T-G---AA--ATC--AC-CTCA-A-C-GATC-A-AGG-ACAGT---GG----AT-CGTGG-ACTAA
Reference ( family-840 ) : TGACG-T--AACACCA-ATG-ACG-TTGGCCT-AC-ATCCTTG----A-AAA-A-AAG-TTTTCG---T-TGC-G-A--GT-T-T---T-T-G---AA--ATC--AC-CTCA-A-C-GATC-A-AGG-ACAGT---GG----AT-CGTGG-ACTAA
gi|123016 : TGACG-T--AACACCA-ATG-ACG-TTGGCCT-AG-ATCCTTG----A-GAA-A-A-G-TTTTCG---T-TGC-G-A--GT-T-T---T-T-G---AA--ATC--AC-CTCA-A-C-GATC-A-AGG-ACAGT---GG----AT-CGTGG-AATAA
gi|123017 : TGACGGT--AACACCA-ATG-AC--TTGGCCT-ATGATGCTTG----ATAGA-ATAAGTTTTTCGTTAT-TGCTG-A--GT-T-TTGCT-T-G---AA--A
gi|123018 : TGACG-T--AACACCA-ATG-ACG-TTGGCCT-AC-ATCTTTG----A-AAA-A-AAG-TTTTCG---T-TGC-G-A--GT-T-T---T-T-G---AA--ATC--AC-CTCA-A-C-GATC-A-AGG-ACAGC---GG----AT-CGTGG-ACTAA
gi|123019 : TGACG-T--AACAGCA-ATG-ACG-TTGACCT-AG-ATCTTTG----A-AAA---AAG-TTTTCG---T-TGC-G-A--GT-T-T---T-T-G---AA--ATC--AC-CTCA-A-T-GATC-A-AGG-ACAGT---GG----AT-TGTGG-ACTAA
gi|123020 : TGACG-T--AACACCA-ATG-ACG-TTGACCT-A--ATCTTTC----A-AAA-A-ATG-TTT-CG---T-TGC-G-A--GT-T-T---T-T-G---AA--ATC--AC-CTCA-A-C-GATC-A-AGG---AGT---GG-----T-CGTGG-ACTAA
gi|123021 : TGACG-TTAAATACCA-ATG-ACG-TTGGCCT-AC-ATACTTC----A-AAA-A-AAG-TTTTCG---T-TGC-T-A--GT-T-T---T-T-G---AA--ATC--AC-CTCA-A-C-GATC-A-AGG-ACAGT---GG----AT-CGTGG-AGTAA
gi|123022 : TGACG-A--AACACCA-ATG-ACG-TTAGCCT-AG-ATCCTTG----A-AAA-C-C-G-TTTTCA---T-TGC-G-A--GA-T-T---T-T-G---AA--ATC--AC-CTCA-A-C-GATC-A-AGG-ACAGT---GG----AT-CGTGG-
gi|123023 : TGACG-T--ATTACCA-ATT-ACG-TTGGCCT-AC-ATCTTTG----A-AAAAA-AAG-TTTTCG---T-TGC-G-A--GT-T-T---T-T-A---AA--ATC--AC-CTCA-A-T-GATC-A-AGG-ACAGT---GG----AT-CGTTG-GCT
gi|123024 : TGACG-T--AACACCA-TTG-ACG-TTGGCCT-AG-ATACTTG----A-TAA-A-A-G-TTTTCG---G-TGT-G-A--GT-T-T---T-G-G---AA--ATC--AC-CTCA-A-C-GATT-G-AGG-ACAGT---GG----AT-TGTGG-GCTAA
gi|123025 : TGACG-T--AACACC--ATGAACGTTTGACCT-AC-A-CTTTG----A-AAA-A-AAG-TTTTCG---T-TGC-G-A--GT-T-T---T-T-T---AA--ATCAGAC-CTCA-A-C-GATC-A-AGG---AG----GG----AT-CGTGG-ACT
gi|123026 : TGACT-T--AACACCA-ATG-ACG-TTGGCCG-AC-ATACTTG------AAA-A-AAG-TTTTCG---T-TGT-G-A--GT-T-T---T-T-G---AAAGATC--AC-CTCA-A-C-
gi|123027 : TGACG-T--A---CCA-ATG-ACG-TGGCCCTCAC-ATACTTC----G-AAA-A-AGT-CTTTCAGA-TATGT-GCA--GT-T-T---TGT-G---AAC-ATC--AG-TTCA-A-C-GATC-A-AGG-ACA
gi|123028 : TGACG-T--A---CCA-ATG-ACG-TTGGCCT-AT-ATCTTTG----ATAAA-A-GAG--TTTCA-----TGC-G-A--GTCT-T---T-T-G---AA--ATC--AG-TTCA-ACC-GAT--A-AGG-CAAGTGTGGG----AT-CGTGG-AGTA
gi|123029 : TGACG-T--AACACCA------------------C-ATTCTTGTGAAA-AAA-A-AAG-TTTTCG---T-TGC-G-A--AG-T-T---T-T-G----A--ATC--AC-CTCATACC-GATC-A-AGG-ACAG----GG----ATCCGTGGAACTA
gi|123030 : TGACG-T--AACAGCA-ATG-ACG-TTG----------CCT-------------------------------C-A-A--GT-T-T---T---G---AA--ATC--AC-CTCA-A-C-GTTC-A-AGG-ACAGT---TG----AT-C
gi|123031 : GACG-T--AACACCACATG--TG-T--------C-A-CTTTG----A-AAA---AAG-TTTTCG---T---C-G-A--GT-T-T---T-T-G---AA--AGC--ACGCTC--A-C-G-TT-A-A-C-ACAGT---GG----AT-CGT
gi|123032 : CG-T--AACACCA-ATG-ACG-TTGACCT-AC-ATCTTTG----C-AAA-A-AAG-TTTTCG---T-TGC-G-AAGAT-TAT---G-T-G---AA--ATCA-AG-CTCA-GTC-GA---ATAGG-A-AGT---GGGAATAT-CGTGA-GCTA
gi|123033 : -T--AACACCA-ATG-A-G-TTGGCCT-AC-ATCTTTG----A-AAA-A-----TTTTCG---G-T-C-G-A--GT-T-T---T-T-GTTTGA--ATC--AC-CTCATA-CTGATCGA-AGG-ACAGT----G----AT-TGTGG-ACT
gi|123034 : ACCA-ATG-ACG-TTGGC-T-AC-ATACTTG----A-AAA-A---G-TTTTCG---TATGT-G-A--GT-T-T---T-TTG---AA--ATC--AG-TTCA-A-C-GATC-A-AGGCACAGTCG-GA----AT-CGTGG-
gi|123035 : -TGC-G-A--GT-T-T---T-T-G---AA--ATC--AC-CTCA-A-C-GGTC-A-AAG-ACAGT---GG----AT-C