lowQualScore : 1
lowQualScore : 9999 33 33 2 2 33 2 2 4 2 55 2 2 2 4444 55 2 55 2 55 2 2 2 333 2 2 22 2 1 2 2 999 22 99 2 2 4 4 4 2
lowQualScore : .... .. .. . . .. . . . . .. . . . .... .. . .. . .. . . . ... . . .. . . . . ... .. .. . . . . . .
lowQualScore : 3333 77 77 7 5 22 2 2 4 2 33 2 2 2 7777 00 1 88 1 00 1 1 1 777 1 1 99 1 1 1 1 666 99 66 1 1 4 4 7 4
consensus : TACATA---TT--A--TAG-AAA-T--TGCT-ACGC-AGGGA-TT-C--G-C-AT-AG----A--A-AC--ATA-T--C-G-ACAAA-G---C-G-A--G-AAAT-C-G--CC--ATTT-CGGT-TA-TT-C-AT-GTAA-TTTATTGAT
Reference ( gi|111456 ) : TACATA---TT--A--TAG-AAA-T--TGCT-ACGC-AGGGA-TT-C--G-C-AT-AG----A--A-AC--ATA-T--C-G-ACAAA-G---C-G-A--G-AACT-C-G--TC--ATTT-TGGT-TA-TT-C-AT-GTAA-TTTATTGAT
gi|111461 : TACATA---TT--A--TAG-AAA-T--TGCT-ACGC-AGGGA-TT-C--G-C-AT-AG----A--A-AC--ATA-T--C-G-ACAAA-G---C-G-A--G-AACT-C-G--TC--ATTT-C-GT-TA-TT-C-AT-GTAA--TTATTGAT
gi|111457 : TACATT---TT--A--TAG-AAA-T--TGCT-AAGC-AGGGA-TT-C--G-C-AT-AG----A--A-AC--ATA-T--C-G-ACAAA-G---C-G-A--G-AAAT-C-G--CC--ATTC-CGGT-TA-TT-C-AT-GTAA-TTTATTGAT
gi|111462 : TAC-TA---TT--A--TAG-AAA-T--TGCT-ACGC-AGGGA-TT-C--G-C-AT-AG----A--A-AC--ATA----C-G-ACAAA-G---C-G-A--G-AACT-C-G--TC--A-TT-CGGT-TA-TT-C-AT-GTAATTTTATTGAT
gi|111460 : TATATACC-TT--A--TAG-AAA-T--TGCT-ACGC-AGGGA-TT-T--G-C-AT-AG----A--A-AC--ATA-T--C-G-ACAAA-G---C-G-A--G-AAAT-C-G--CC--ATTT-CGGT-TA-TT-CAAT-GTAA-TTTATTGAT
gi|111458 : TACATT---TT--A--TAG-AAA-T--TG-T-ACGC-AGGGA-TT-C--G-C-AT-AG----A--A-AC--ATA-T--C-GAAAAAA-G---C-G-A--G-AAAT-C-G--CC--ATTT-CGGT-TA-TT-C-AT-GTAA-TTTATTGAT
gi|111459 : TACATT---TT--A--TAG-AAA-T--TGCT-ACGC-AGGA---T-C--G-C-AT-AA----A--C-AC--ATA-T--C-G-AAAAA-G---C-G-A--G-AAAT-C-G--CC--ATTT-CGGT-TA-TT-C-AT-GTAA-TTTACTG
gi|111463 : TACATA---TTTTA--TAGGAAA-T--TGCT-ACGCGAGGGA-TT-C--G-C-AT-AG----A--AGAC--ATA-T--CAG-ACAAA-ACGCC-G-A--G-AAAT-C-G--CC--ATTT-CCGT-TA-TTAC-GTCGTAA-TTTA
gi|111464 : TACATT---TT--GAGTAG-AAA-TATTGCT-ACGC-AGGGAATTAC--G-C-AT-AG----A--A-AC--ATA-T--C-G-AAAAA-G---C-G-ATGA-AAAT-CGG--CC--ATTC---GT-TATTT-C-AT-GTAA-TTAATTCAT
gi|111465 : TACATT---TT--A--TAG-AT--T--TGCTTACGC-AGGGA-TT-CCGG-C-AT-AG----AG-A-ACATATA-T--C-G-AC-AA-G---C-G-A--GAAAAT-T-A---C--ATAT-CGGTCTA--T-C-AT-GTAA-TT
gi|111466 : ACATA---TT--A--TAG-AAA-T--TGCT-ACGC-AGGGA-TT-C--G-C-AT-AG----A--A-AC--ATA-T--C-G-ACAAA-G-----G-A--G-AACTCC-G--TC--ATTT-CGGT-TA-TT-C-AT-GTAA-TTTATTGAT
gi|111467 : CATAAACTT--A--TAG-AAA-T--TGCA-ACGC-AGGGA-TT-C--G-C-AT-AG----A--A-AC--ATA-T--C-G-ACAAA-G---C-G-G--G-AAAT-C-G--AA--CTTT-TGG--TA-TT-C-AT-GTGA-TTTATTGAT
gi|111468 : ATA---TT--T--TAG-AAAGT--TGCT-ACGC-AGGGA-TT-C--GCC-ATGAG----A--C-ACATATA-T--C-G-ACAAA-T---C-GAA--A-AAAT-C-G--AC--ATTTCTGGT-TA-TT-CAATAGTAA--TTATTGAT
gi|111469 : TA---TT--A--TAG-AA-----TG-T-AGCC-AGGAT-TT-C--G-C-AT-AG----A--A-A---ATA-TT-C-G-ACACA-A---CAG-A--C-AACG-C----TCTAATTT-CGGT-T--TT-C-AT-GTAA-TTTATTGAT
gi|111470 : ---TT--A--TAG-AAA-T--TGCT-ACGC-AGGGACTT-CG-G-C-AT-AG----AACA-GC--ATA-T--C---ACAAATG---C-G-A--G-AAAT-A-G--AC--ATTTGCGGT-TA-TT-C-AT-GTAA-TTTATTGAT
gi|111471 : ---TT--A--TAG-AAA-T--TGCT-ACGC-ATGGA-TT-C--G-C-AT-AGTTCTA--A-AC--ACA-T--C-G-ACAAA-G---C-G-A--G-AAAT-C-G--AC--ATTT-CGGT-CA-T
gi|111472 : AA-T--TGCT-ACGC-AGGGA-T--C--G-C-AT-AG----A--A-AC--ATAGT--C---AGAAA-G---C-G-A--G-AA-T-C-G--AC--ATTT-CG-T-TA-TT-C-AT-GTAA-TTTATTGAT
gi|111473 : --TGCT-ACGC-AGCGT-GT-C--G-CTAT-AG----A--A-AC--ACA-TAAC-G-ACAAA-G---C-G-A--G-AAAA-C-GAACC--ATCT-C-GT-TA-TTAT-AT-GTAA-TTTATAGAT
gi|111474 : T-ACGC-AAGGA-TT-C--A-C-AA-AG----A--A-AC--ACA-T--C-G-ACAAA-G---C-T-A--G-AGAT-C-G--CC--ATTT-CGGT-TA-AT-C-A
gi|111475 : --A-AC--ATA-T--C-G-ACAAA-G---C-A-A--G-AAAT-G-G--TC--ATTT-TGGT-TA-CT-C-AA-GTAA-TTTATTGAT
Alignments
lowQualScore : 8888 33 33 2 2 33 2 2 4 2 22 4 2 2 4444 2 44 55 2 44 2 2 2 555 22 2 2 444 333 2 2 2 2 4 4 4 2
lowQualScore : .... .. .. . . .. . . . . .. . . . .... . .. .. . .. . . . ... .. . . ... ... . . . . . . . .
lowQualScore : 1111 44 44 5 4 11 1 1 2 1 99 2 1 1 5555 0 88 55 0 88 0 0 0 555 88 0 0 222 555 0 0 0 0 2 2 4 2
consensus : TACATA---TT--A--TAG-AAA-T--TGCT-ACGC-AGGGA-TT-C--G-C-AT-AG----A-A--AC--ATA-T--C-G-ACAAA-GCG---A--GAAAT-C-G--CC---ATTT-C-GGT-TA-TT-C-AT-GTAA-TTTATTGAT
Reference ( family-837 ) : TACATA---TT--A--TAG-AAA-T--TGCT-ACGC-AGGGA-TT-C--G-C-AT-AG----A-A--AC--ATA-T--C-G-ACAAA-GCG---A--GAAAT-C-G--CC---ATTT-C-GGT-TA-TT-C-AT-GTAA-TTTATTGAT
gi|111456 : TACATA---TT--A--TAG-AAA-T--TGCT-ACGC-AGGGA-TT-C--G-C-AT-AG----A-A--AC--ATA-T--C-G-ACAAA-GCG---A--GAACT-C-G--TC---ATTT-T-GGT-TA-TT-C-AT-GTAA-TTTATTGAT
gi|111457 : TACATT---TT--A--TAG-AAA-T--TGCT-AAGC-AGGGA-TT-C--G-C-AT-AG----A-A--AC--ATA-T--C-G-ACAAA-GCG---A--GAAAT-C-G--CC---ATTC-C-GGT-TA-TT-C-AT-GTAA-TTTATTGAT
gi|111458 : TACATT---TT--A--TAG-AAA-T--TG-T-ACGC-AGGGA-TT-C--G-C-AT-AG----A-A--AC--ATA-T--C-GAAAAAA-GCG---A--GAAAT-C-G--CC---ATTT-C-GGT-TA-TT-C-AT-GTAA-TTTATTGAT
gi|111459 : TACATT---TT--A--TAG-AAA-T--TGCT-ACGC-AGGA---T-C--G-C-AT-AA----A-C--AC--ATA-T--C-G-AAAAA-GCG---A--GAAAT-C-G--CC---ATTT-C-GGT-TA-TT-C-AT-GTAA-TTTACTG
gi|111460 : TATATACC-TT--A--TAG-AAA-T--TGCT-ACGC-AGGGA-TT-T--G-C-AT-AG----A-A--AC--ATA-T--C-G-ACAAA-GCG---A--GAAAT-C-G--CC---ATTT-C-GGT-TA-TT-CAAT-GTAA-TTTATTGAT
gi|111461 : TACATA---TT--A--TAG-AAA-T--TGCT-ACGC-AGGGA-TT-C--G-C-AT-AG----A-A--AC--ATA-T--C-G-ACAAA-GCG---A--GAACT-C-G--TC---ATTT-C--GT-TA-TT-C-AT-GTAA--TTATTGAT
gi|111462 : TAC-TA---TT--A--TAG-AAA-T--TGCT-ACGC-AGGGA-TT-C--G-C-AT-AG----A-A--AC--ATA----C-G-ACAAA-GCG---A--GAACT-C-G--TC---A-TT-C-GGT-TA-TT-C-AT-GTAATTTTATTGAT
gi|111463 : TACATA---TTTTA--TAGGAAA-T--TGCT-ACGCGAGGGA-TT-C--G-C-AT-AG----A-AG-AC--ATA-T--CAG-ACAAA-ACGCCGA--GAAAT-C-G--CC---ATTT-C-CGT-TA-TTAC-GTCGTAA-TTTA
gi|111464 : TACATT---TT--GAGTAG-AAA-TATTGCT-ACGC-AGGGAATTAC--G-C-AT-AG----A-A--AC--ATA-T--C-G-AAAAA-GCG---ATGAAAAT-CGG--CC---ATTC----GT-TATTT-C-AT-GTAA-TTAATTCAT
gi|111465 : TACATT---TT--A--TAG-AT--T--TGCTTACGC-AGGGA-TT-CCGG-C-AT-AG----AGA--ACATATA-T--C-G-AC-AA-GCG---A--GAAAA-T-T--AC---ATAT-C-GGTCTA--T-C-AT-GTAA-TT
gi|111466 : ACATA---TT--A--TAG-AAA-T--TGCT-ACGC-AGGGA-TT-C--G-C-AT-AG----A-A--AC--ATA-T--C-G-ACAAA-G-G---A--GAACTCC-G--TC---ATTT-C-GGT-TA-TT-C-AT-GTAA-TTTATTGAT
gi|111467 : CATAAACTT--A--TAG-AAA-T--TGCA-ACGC-AGGGA-TT-C--G-C-AT-AG----A-A--AC--ATA-T--C-G-ACAAA-GCG---G--GAAAT-C-G--AA---CTTT-T-GG--TA-TT-C-AT-GTGA-TTTATTGAT
gi|111468 : ATA---TT--T--TAG-AAAGT--TGCT-ACGC-AGGGA-TT-C--GCC-ATGAG----A-C--ACATATA-T--C-G-ACAAA-TCGA--A--AAAAT-C-G--AC---ATTT-CTGGT-TA-TT-CAATAGTAA--TTATTGAT
gi|111469 : TA---TT--A--TAG-AA-----TG-T-AGCC-AGGAT-TT-C--G-C-AT-AG----A-A--A---ATA-TT-C-G-ACACA-AC----A--GACAA-C-G--CTCTAATTT-C-GGT-T--TT-C-AT-GTAA-TTTATTGAT
gi|111470 : ---TT--A--TAG-AAA-T--TGCT-ACGC-AGGGACTT-C--GGC-AT-AG----A-ACAGC--ATA-T--C---ACAAATGCG---A--GAAAT-A-G--AC---ATTTGC-GGT-TA-TT-C-AT-GTAA-TTTATTGAT
gi|111471 : ---TT--A--TAG-AAA-T--TGCT-ACGC-ATGGA-TT-C--G-C-AT-AGTTCTA-A--AC--ACA-T--C-G-ACAAA-GCG---A--GAAAT-C-G--AC---ATTT-C-GGT-CA-T
gi|111472 : AA-T--TGCT-ACGC-AGGGA-T--C--G-C-AT-AG----A-A--AC--ATAGT--C---AGAAA-GCG---A--GAA-T-C-G--AC---ATTT-C-G-T-TA-TT-C-AT-GTAA-TTTATTGAT
gi|111473 : --TGCT-ACGC-AGCGT-GT-C--G-CTAT-AG----A-A--AC--ACA-TAAC-G-ACAAA-GCG---A--GAAAA-C-GAACC---ATCT-C--GT-TA-TTAT-AT-GTAA-TTTATAGAT
gi|111474 : T-ACGC-AAGGA-TT-C--A-C-AA-AG----A-A--AC--ACA-T--C-G-ACAAA-GCT---A--GAGAT-C-G--CC---ATTT-C-GGT-TA-AT-C-A
gi|111475 : -A--AC--ATA-T--C-G-ACAAA-GCA---A--GAAAT-G-G--TC---ATTT-T-GGT-TA-CT-C-AA-GTAA-TTTATTGAT
Alignments
lowQualScore : 8888 33 33 2 2 33 2 2 4 2 22 4 2 2 4444 2 44 55 2 44 2 2 2 555 22 2 2 444 333 2 2 2 2 4 4 4 2
lowQualScore : .... .. .. . . .. . . . . .. . . . .... . .. .. . .. . . . ... .. . . ... ... . . . . . . . .
lowQualScore : 1111 44 44 5 4 11 1 1 2 1 99 2 1 1 5555 0 88 55 0 88 0 0 0 555 88 0 0 222 555 0 0 0 0 2 2 4 2
consensus : TACATA---TT--A--TAG-AAA-T--TGCT-ACGC-AGGGA-TT-C--G-C-AT-AG----A-A--AC--ATA-T--C-G-ACAAA-GCG---A--GAAAT-C-G--CC---ATTT-C-GGT-TA-TT-C-AT-GTAA-TTTATTGAT
Reference ( family-837 ) : TACATA---TT--A--TAG-AAA-T--TGCT-ACGC-AGGGA-TT-C--G-C-AT-AG----A-A--AC--ATA-T--C-G-ACAAA-GCG---A--GAAAT-C-G--CC---ATTT-C-GGT-TA-TT-C-AT-GTAA-TTTATTGAT
gi|111456 : TACATA---TT--A--TAG-AAA-T--TGCT-ACGC-AGGGA-TT-C--G-C-AT-AG----A-A--AC--ATA-T--C-G-ACAAA-GCG---A--GAACT-C-G--TC---ATTT-T-GGT-TA-TT-C-AT-GTAA-TTTATTGAT
gi|111457 : TACATT---TT--A--TAG-AAA-T--TGCT-AAGC-AGGGA-TT-C--G-C-AT-AG----A-A--AC--ATA-T--C-G-ACAAA-GCG---A--GAAAT-C-G--CC---ATTC-C-GGT-TA-TT-C-AT-GTAA-TTTATTGAT
gi|111458 : TACATT---TT--A--TAG-AAA-T--TG-T-ACGC-AGGGA-TT-C--G-C-AT-AG----A-A--AC--ATA-T--C-GAAAAAA-GCG---A--GAAAT-C-G--CC---ATTT-C-GGT-TA-TT-C-AT-GTAA-TTTATTGAT
gi|111459 : TACATT---TT--A--TAG-AAA-T--TGCT-ACGC-AGGA---T-C--G-C-AT-AA----A-C--AC--ATA-T--C-G-AAAAA-GCG---A--GAAAT-C-G--CC---ATTT-C-GGT-TA-TT-C-AT-GTAA-TTTACTG
gi|111460 : TATATACC-TT--A--TAG-AAA-T--TGCT-ACGC-AGGGA-TT-T--G-C-AT-AG----A-A--AC--ATA-T--C-G-ACAAA-GCG---A--GAAAT-C-G--CC---ATTT-C-GGT-TA-TT-CAAT-GTAA-TTTATTGAT
gi|111461 : TACATA---TT--A--TAG-AAA-T--TGCT-ACGC-AGGGA-TT-C--G-C-AT-AG----A-A--AC--ATA-T--C-G-ACAAA-GCG---A--GAACT-C-G--TC---ATTT-C--GT-TA-TT-C-AT-GTAA--TTATTGAT
gi|111462 : TAC-TA---TT--A--TAG-AAA-T--TGCT-ACGC-AGGGA-TT-C--G-C-AT-AG----A-A--AC--ATA----C-G-ACAAA-GCG---A--GAACT-C-G--TC---A-TT-C-GGT-TA-TT-C-AT-GTAATTTTATTGAT
gi|111463 : TACATA---TTTTA--TAGGAAA-T--TGCT-ACGCGAGGGA-TT-C--G-C-AT-AG----A-AG-AC--ATA-T--CAG-ACAAA-ACGCCGA--GAAAT-C-G--CC---ATTT-C-CGT-TA-TTAC-GTCGTAA-TTTA
gi|111464 : TACATT---TT--GAGTAG-AAA-TATTGCT-ACGC-AGGGAATTAC--G-C-AT-AG----A-A--AC--ATA-T--C-G-AAAAA-GCG---ATGAAAAT-CGG--CC---ATTC----GT-TATTT-C-AT-GTAA-TTAATTCAT
gi|111465 : TACATT---TT--A--TAG-AT--T--TGCTTACGC-AGGGA-TT-CCGG-C-AT-AG----AGA--ACATATA-T--C-G-AC-AA-GCG---A--GAAAA-T-T--AC---ATAT-C-GGTCTA--T-C-AT-GTAA-TT
gi|111466 : ACATA---TT--A--TAG-AAA-T--TGCT-ACGC-AGGGA-TT-C--G-C-AT-AG----A-A--AC--ATA-T--C-G-ACAAA-G-G---A--GAACTCC-G--TC---ATTT-C-GGT-TA-TT-C-AT-GTAA-TTTATTGAT
gi|111467 : CATAAACTT--A--TAG-AAA-T--TGCA-ACGC-AGGGA-TT-C--G-C-AT-AG----A-A--AC--ATA-T--C-G-ACAAA-GCG---G--GAAAT-C-G--AA---CTTT-T-GG--TA-TT-C-AT-GTGA-TTTATTGAT
gi|111468 : ATA---TT--T--TAG-AAAGT--TGCT-ACGC-AGGGA-TT-C--GCC-ATGAG----A-C--ACATATA-T--C-G-ACAAA-TCGA--A--AAAAT-C-G--AC---ATTT-CTGGT-TA-TT-CAATAGTAA--TTATTGAT
gi|111469 : TA---TT--A--TAG-AA-----TG-T-AGCC-AGGAT-TT-C--G-C-AT-AG----A-A--A---ATA-TT-C-G-ACACA-AC----A--GACAA-C-G--CTCTAATTT-C-GGT-T--TT-C-AT-GTAA-TTTATTGAT
gi|111470 : ---TT--A--TAG-AAA-T--TGCT-ACGC-AGGGACTT-C--GGC-AT-AG----A-ACAGC--ATA-T--C---ACAAATGCG---A--GAAAT-A-G--AC---ATTTGC-GGT-TA-TT-C-AT-GTAA-TTTATTGAT
gi|111471 : ---TT--A--TAG-AAA-T--TGCT-ACGC-ATGGA-TT-C--G-C-AT-AGTTCTA-A--AC--ACA-T--C-G-ACAAA-GCG---A--GAAAT-C-G--AC---ATTT-C-GGT-CA-T
gi|111472 : AA-T--TGCT-ACGC-AGGGA-T--C--G-C-AT-AG----A-A--AC--ATAGT--C---AGAAA-GCG---A--GAA-T-C-G--AC---ATTT-C-G-T-TA-TT-C-AT-GTAA-TTTATTGAT
gi|111473 : --TGCT-ACGC-AGCGT-GT-C--G-CTAT-AG----A-A--AC--ACA-TAAC-G-ACAAA-GCG---A--GAAAA-C-GAACC---ATCT-C--GT-TA-TTAT-AT-GTAA-TTTATAGAT
gi|111474 : T-ACGC-AAGGA-TT-C--A-C-AA-AG----A-A--AC--ACA-T--C-G-ACAAA-GCT---A--GAGAT-C-G--CC---ATTT-C-GGT-TA-AT-C-A
gi|111475 : -A--AC--ATA-T--C-G-ACAAA-GCA---A--GAAAT-G-G--TC---ATTT-T-GGT-TA-CT-C-AA-GTAA-TTTATTGAT
blockSeqs : AAAC TT AG G G AT T G A A CG C T G TTCT G CA AT G AA A A T CCG TG C G AAC CTA G T C T A A C T
blockSeqs : ACC . . . . . . . C . . G . . . . G AT . T . . . A . . . C . . . . . A A A .
blockSeqs : T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . . .
blockSeqs : T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . . .
blockSeqs : T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . . .
blockSeqs : A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . .
blockSeqs : A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . .
blockSeqs : A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . . .
blockSeqs : T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . . .
blockSeqs : T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . .
blockSeqs : A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . .
blockSeqs : A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . .
blockSeqs : A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . T . . . . .
blockSeqCons :
originalCons : TACATA---TT--A--TAG-AAA-T--TGCT-ACGC-AGGGA-TT-C--G-C-AT-AG----A-A--AC--ATA-T--C-G-ACAAA-GCG---A--GAAAT-C-G--CC---ATTT-C-GGT-TA-TT-C-AT-GTAA-TTTATTGAT
finalCons : TACATA---TT--A--TAG-AAA-T--TGCT-ACGC-AGGGA-TT-C--G-C-AT-AG----A-A--AC--ATA-T--C-G-ACAAA-GCG---A--GAAAT-C-G--CC---ATTT-C-GGT-TA-TT-C-AT-GTAA-TTTATTGAT
Alignments
lowQualScore : 8888 33 33 2 2 33 2 2 4 2 22 4 2 2 4444 2 44 55 2 44 2 2 2 555 22 2 2 444 333 2 2 2 2 4 4 4 2
lowQualScore : .... .. .. . . .. . . . . .. . . . .... . .. .. . .. . . . ... .. . . ... ... . . . . . . . .
lowQualScore : 1111 44 44 5 4 11 1 1 2 1 99 2 1 1 5555 0 88 55 0 88 0 0 0 555 88 0 0 222 555 0 0 0 0 2 2 4 2
consensus : TACATA---TT--A--TAG-AAA-T--TGCT-ACGC-AGGGA-TT-C--G-C-AT-AG----A-A--AC--ATA-T--C-G-ACAAA-GCG---A--GAAAT-C-G--CC---ATTT-C-GGT-TA-TT-C-AT-GTAA-TTTATTGAT
Reference ( family-837 ) : TACATA---TT--A--TAG-AAA-T--TGCT-ACGC-AGGGA-TT-C--G-C-AT-AG----A-A--AC--ATA-T--C-G-ACAAA-GCG---A--GAAAT-C-G--CC---ATTT-C-GGT-TA-TT-C-AT-GTAA-TTTATTGAT
gi|111456 : TACATA---TT--A--TAG-AAA-T--TGCT-ACGC-AGGGA-TT-C--G-C-AT-AG----A-A--AC--ATA-T--C-G-ACAAA-GCG---A--GAACT-C-G--TC---ATTT-T-GGT-TA-TT-C-AT-GTAA-TTTATTGAT
gi|111457 : TACATT---TT--A--TAG-AAA-T--TGCT-AAGC-AGGGA-TT-C--G-C-AT-AG----A-A--AC--ATA-T--C-G-ACAAA-GCG---A--GAAAT-C-G--CC---ATTC-C-GGT-TA-TT-C-AT-GTAA-TTTATTGAT
gi|111458 : TACATT---TT--A--TAG-AAA-T--TG-T-ACGC-AGGGA-TT-C--G-C-AT-AG----A-A--AC--ATA-T--C-GAAAAAA-GCG---A--GAAAT-C-G--CC---ATTT-C-GGT-TA-TT-C-AT-GTAA-TTTATTGAT
gi|111459 : TACATT---TT--A--TAG-AAA-T--TGCT-ACGC-AGGA---T-C--G-C-AT-AA----A-C--AC--ATA-T--C-G-AAAAA-GCG---A--GAAAT-C-G--CC---ATTT-C-GGT-TA-TT-C-AT-GTAA-TTTACTG
gi|111460 : TATATACC-TT--A--TAG-AAA-T--TGCT-ACGC-AGGGA-TT-T--G-C-AT-AG----A-A--AC--ATA-T--C-G-ACAAA-GCG---A--GAAAT-C-G--CC---ATTT-C-GGT-TA-TT-CAAT-GTAA-TTTATTGAT
gi|111461 : TACATA---TT--A--TAG-AAA-T--TGCT-ACGC-AGGGA-TT-C--G-C-AT-AG----A-A--AC--ATA-T--C-G-ACAAA-GCG---A--GAACT-C-G--TC---ATTT-C--GT-TA-TT-C-AT-GTAA--TTATTGAT
gi|111462 : TAC-TA---TT--A--TAG-AAA-T--TGCT-ACGC-AGGGA-TT-C--G-C-AT-AG----A-A--AC--ATA----C-G-ACAAA-GCG---A--GAACT-C-G--TC---A-TT-C-GGT-TA-TT-C-AT-GTAATTTTATTGAT
gi|111463 : TACATA---TTTTA--TAGGAAA-T--TGCT-ACGCGAGGGA-TT-C--G-C-AT-AG----A-AG-AC--ATA-T--CAG-ACAAA-ACGCCGA--GAAAT-C-G--CC---ATTT-C-CGT-TA-TTAC-GTCGTAA-TTTA
gi|111464 : TACATT---TT--GAGTAG-AAA-TATTGCT-ACGC-AGGGAATTAC--G-C-AT-AG----A-A--AC--ATA-T--C-G-AAAAA-GCG---ATGAAAAT-CGG--CC---ATTC----GT-TATTT-C-AT-GTAA-TTAATTCAT
gi|111465 : TACATT---TT--A--TAG-AT--T--TGCTTACGC-AGGGA-TT-CCGG-C-AT-AG----AGA--ACATATA-T--C-G-AC-AA-GCG---A--GAAAA-T-T--AC---ATAT-C-GGTCTA--T-C-AT-GTAA-TT
gi|111466 : ACATA---TT--A--TAG-AAA-T--TGCT-ACGC-AGGGA-TT-C--G-C-AT-AG----A-A--AC--ATA-T--C-G-ACAAA-G-G---A--GAACTCC-G--TC---ATTT-C-GGT-TA-TT-C-AT-GTAA-TTTATTGAT
gi|111467 : CATAAACTT--A--TAG-AAA-T--TGCA-ACGC-AGGGA-TT-C--G-C-AT-AG----A-A--AC--ATA-T--C-G-ACAAA-GCG---G--GAAAT-C-G--AA---CTTT-T-GG--TA-TT-C-AT-GTGA-TTTATTGAT
gi|111468 : ATA---TT--T--TAG-AAAGT--TGCT-ACGC-AGGGA-TT-C--GCC-ATGAG----A-C--ACATATA-T--C-G-ACAAA-TCGA--A--AAAAT-C-G--AC---ATTT-CTGGT-TA-TT-CAATAGTAA--TTATTGAT
gi|111469 : TA---TT--A--TAG-AA-----TG-T-AGCC-AGGAT-TT-C--G-C-AT-AG----A-A--A---ATA-TT-C-G-ACACA-AC----A--GACAA-C-G--CTCTAATTT-C-GGT-T--TT-C-AT-GTAA-TTTATTGAT
gi|111470 : ---TT--A--TAG-AAA-T--TGCT-ACGC-AGGGACTT-C--GGC-AT-AG----A-ACAGC--ATA-T--C---ACAAATGCG---A--GAAAT-A-G--AC---ATTTGC-GGT-TA-TT-C-AT-GTAA-TTTATTGAT
gi|111471 : ---TT--A--TAG-AAA-T--TGCT-ACGC-ATGGA-TT-C--G-C-AT-AGTTCTA-A--AC--ACA-T--C-G-ACAAA-GCG---A--GAAAT-C-G--AC---ATTT-C-GGT-CA-T
gi|111472 : AA-T--TGCT-ACGC-AGGGA-T--C--G-C-AT-AG----A-A--AC--ATAGT--C---AGAAA-GCG---A--GAA-T-C-G--AC---ATTT-C-G-T-TA-TT-C-AT-GTAA-TTTATTGAT
gi|111473 : --TGCT-ACGC-AGCGT-GT-C--G-CTAT-AG----A-A--AC--ACA-TAAC-G-ACAAA-GCG---A--GAAAA-C-GAACC---ATCT-C--GT-TA-TTAT-AT-GTAA-TTTATAGAT
gi|111474 : T-ACGC-AAGGA-TT-C--A-C-AA-AG----A-A--AC--ACA-T--C-G-ACAAA-GCT---A--GAGAT-C-G--CC---ATTT-C-GGT-TA-AT-C-A
gi|111475 : -A--AC--ATA-T--C-G-ACAAA-GCA---A--GAAAT-G-G--TC---ATTT-T-GGT-TA-CT-C-AA-GTAA-TTTATTGAT