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blockSeqs                     :         T      T C   AATAC T   A   C    TCG       CAACGCT  GTACACAT TA  CATGTA CGCCTAAG CG    C AACAACTA       GT GAT  T ATGTAC CA      G    C   T
blockSeqs                     :         .      T A   .     G   .   .    G         .        .        G   .      .        C     . TCGATA         .  C    . ATGTAC .       .    .   .
blockSeqs                     :         .      C .   .     .   .   .    G         .        .        G   .      .        .     . A              .  .    . .      .       .    .   .
blockSeqs                     :         .      C .   .     .   .   .    G         .        .        .   .      .        .     . A              .  .    . .      .       .    .   .
blockSeqs                     :         .      C .   .     .   .   .    G         .        .        .   .      .        .     . A              .  .    . .      .       .    .   .
blockSeqs                     :         .      T .   .     .   .   .    G         .        .        .   .      .        .     . A              .  .    . .      .       .    .   .
blockSeqs                     :         .      C .   .     .   .   .    G         .        .        .   .      .        .     . A              .  .    . .      .       .    .   .
blockSeqs                     :         .      T .   .     .   .   .    G         .        .        .   .      .        .     . A              .  .    . .      .       .    .   .
blockSeqs                     :         .      C .   .     .   .   .    G         .        .        .   .      .        .     . T              .  .    . .      .       .    .   .
blockSeqs                     :         .      C .   .     .   .   .    G         .        .        .   .      .        .     . A              .  .    . .      .       .    .   .
blockSeqs                     :         .      C .   .     .   .   .    G         .        .        .   .      .        .     . A              .  .    . .      .       .    .   .
blockSeqs                     :         .      C .   .     .   .   .    A         .        .        .   .      .        .     . A              .  .    . .      .       .    .   .
blockSeqs                     :         .      C .   .     .   .   .    A         .        .        .   .      .        .     . A              .  .    . .      .       .    .   .
blockSeqs                     :         .      . .   .     .   .   .    G         .        .        .   .      .        .     . A              .  .    . .      .       .    .   .
blockSeqs                     :         .      . .   .     .   .   .    G         .        .        .   .      .        .     . A              .  .    . .      .       .    .   .
blockSeqs                     :         .      . .   .     .   .   .    T         .        .        .   .      .        .     . A              .  .    . .      .       .    .   .
blockSeqs                     :                  .   .     .   .   .    .         .        .        .   .      .        .     . A              .  .    . .      .       .    .   .
blockSeqs                     :                  .   .     .   .   .    .         .        .        .   .      .        .     . .              .  .    . .      .       .    .   .
blockSeqs                     :                  .   .     .   .   .    .         .        .        .   .      .        .                                                         


blockSeqCons                  : 
originalCons                  : CATTGGAA-ATAAGCCC-TTT-----G-AGC-TTT-ATGG--GTTATCCT-------TG--------G--TA------T--------A--TACG-T-----A-------CG--A---TC-T------A--TGTATA-TACT-GAA-AAA
finalCons                     : CATTGGAA-ATAAGCCC-TTT-----G-AGC-TTT-ATGG--GTTATCCT-------TG--------G--TA------T--------A--TACG-T-----A-------CG--A---TC-T------A--TGTATA-TACT-GAA-AAA





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lowQualScore                  :         4      1 0   00000 0   0   0    111       5555555  22222222 88  888888 22222222 88    1 1111111111111  99 888  1 111111 99      1    1   1   
consensus                     : CATTGGAA-ATAAGCCC-TTT-----G-AGC-TTT-ATGG--GTTATCCT-------TG--------G--TA------T--------A--TACG-T-----A-------CG--A---TC-T------A--TGTATA-TACT-GAA-AAA
Reference ( family-833 )      : CATTGGAA-ATAAGCCC-TTT-----G-AGC-TTT-ATGG--GTTATCCT-------TG--------G--TA------T--------A--TACG-T-----A-------CG--A---TC-T------A--TGTATA-TACT-GAA-AAA
gi|112801                     : CATTGGAA-ATAAGCCC-TTT-----G-AGC-TTT-ATGG--GTTATCCT-------TG--------G--TA------T--------A--TACG-T-----A-------CG--A---TC-T------A--TGTATA-TACT-GAA-AAA
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gi|112812                     : CATTGAAA-ATAAGCC--TTT-----A-GGC-TTT-ATGG--ATTATCCT-------TA--------G--TA------T--------A--T
gi|112813                     : CAATGGAA-ATCAGC---TTTAATACG-AGC-TTTCATGG--ATTATCCT-------TG--------G--TA------T--------G--CATG-T-----A-------TA--T---TC-TATGTACA--TGTATA-TACT-GAATAAA
gi|112814                     :   TTGGAA-ATAAGCCC-TTT-----G-AGC-TTA-ATGG---TTATCCT-------TG--------G---A------T--------A--TACG-T-----A-------CG--A---TG-T------A--TGTATA-TACT-GAA-
gi|112815                     :   TTGGAA-ATAAGCCC-TTT-----G-AGCATTT-ATGGTCGT--TCCT-------TG--------G--TA------T--------AC-TACG-T-------------CG--AC--TC-T------A--TGTA-A-TACT-GAA-AAA
gi|112816                     :        A-ATGACCCCACTG-----G-AAA-TTT-ATGG--GTTATCCT-------TG--------G--TA------T--------A--TACG-T-----A-------CG--A---TC-T------A--TGTATA-TACT-GAA-AAA
gi|112817                     : CATTGGAA-AT-------------------C-TGT-ATGG--GTTATCCT-------TG--------G--TA------T--------A--TACG-T-----A-------CG--A---TC-T------A--TGTATA-TACT-GGA-AAA
gi|112818                     :        ataaggaccc-TTG-----G-AAT-TTT-ATGG---TTATCCT-------TG--------GG-TA------T--------A--TATG-T-----A-------CG--A---TC--------A--TGTATA-TACT-GAA-AAA
gi|112819                     :                  -TTG-----G-AAT-TTT-ATGG---TTATCCT-------TG--------GG-TA------T--------A--TATG-T-----A-------CG--A---TC--------A--TGTATA-TACT-GAA-AAA
gi|112820                     :                  -TTG-----G-AAA-TTT-ATGG--TTAATCCT-------TG--------G--TA------T--------ACGTATGCT-----A-------CG--A---TCTT------A--TGTATA-TACTCGAA-AA