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Reference ( gi|11353 ) : AAGGTC-ACTG-GTCAAAGG-TCA-------A--GGTC-ACA-A-TG--CAC-A-T-A----G-TGG--T-TTT-A-CC-A-T-TGTC-T-------G-GG------C-CA--TG-A----C----A-GGC-G---T--A-TA-T-TGC---T------AC--G----T-T-GGCGTTG-C-T-CTTGTT
gi|11354 : AAGGTC-ACTG-GTCAAAGG-TCA-------A--GACC-ACA-A-TG--CAC-A-T-A----G-TGG--T-TTT-A-CC-A-T-TGTC-T-------G-GG------C-CA--TG-A----T----G-GGC-G---T--A-TA-A-TGC---T------AT--G----T-T-GGCGTTG-C-T-CTTGTT
gi|11131 : AAGGTC-ACTG-GTCAAAGT-TCA-------A--GGTC-ACA-G-TG--TGC-A-T-A----G-TGG--T-TTT-A-CT-A-T-TGTC-T-------G-GG------C-CA--TG-A----C----G-GGC-G---T--A-CA-A-TGC---T------AC--G----C-T-GGCGTTG-C-T-CTTGTT
gi|11143 : ccAAGGTC-ACTG-ATCAAAGG-TCA-------A--GGTC-ACA-T-TG--CAC-A-T-A----G-TGG--T-TTT-A-CC-A-T-TGCC-T-------G-GG------C-CA--TG-A----C----G-GGC-G---T--A------TGC---T------AC--G----T-T-GGCGTTG-C-T-CATGTT
gi|11292 : ccAAGGTC-ACTG-GTCAAAGG-TCA-------A--GGTC-GCA-A-TA--CAC-A-T-A----G-TGG--G-TTT-A-CC-G-T-TGTC-C-------A-GG------C-CA--TG-A----C----G-GGC-G---T--A-TA-A-TGC---T------AC--G----T-T-GGCGTTG-C-T-TTTGT
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gi|11420 : G-GTCAATGG-TCA-------A--GGTC-TCA-A-TGGGCAC-A-T-A----G-TGG--T-TTT-A-CC-A-T-TGCC-T-------G-GG------C-CA--TG-A----A----C-GGC-G---TTAA-TA-C-TGT---T------AC--G----T-T-GGCGTTG-CAT-CTTGTT
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gi|11291 : ccTC-ACTG-TTCAAAGG-TCA-------A--GGTC-ACA-A-TG--CAC-A-T-A----G-TGG--T-TTT-A-CC-A-T-TGTC-T-------G-GG------C-CA--TG-A----C----G-GGC-A---T--A-TA-TT-GC---T------AC--G----T-T-GGCATTG-C-T-CTTGTT
gi|11292 : caataAAGGTC-ACTG-GTCAAAGG-TCA-------A--GGTC-GCA-A-TA--CAC-A-T-A----G-TGG--G-TTT-A-CC-G-T-TGTC-C-------A-GG------C-CA--TG-A----C----G-GGC-G---T--A-TA-AT-GC---T------AC--G----T-T-GGCGTTG-C-T-TTTGT
gi|11293 : cAAGATC-ACTA-GTCAAAGG-TCA-------A--GGTC-ACA-A-TG--CAC-A-T-G----G-TGG--T-TTT-A-CC-A-T-TGTC-T-------G-GG------C-CA--TG-A----C----G-GTT-G---T--A-TA-AT-GC---T------AC--A----T-T-GGCTTTG-C-T-CTTGTT
gi|11296 : cAAGGTC-ACTG-GTTAAAGG-TCA-------A--GGTC-ACA-A-TG--CAC-A-T-C----G-TGG--T-TTT-A-AC-C-T-AGTC-C-------G-AA------C-CA--T
gi|11297 : cAAGGTT-ATTG-GTCAAAGG-TCA-------A--GATC-ACT-A-TG--CAC-A-T-A----A-TGG--T-TTA-A-AA-A-T-TGTC-T-------G-GG------T-CA--TA-A----C----
gi|11306 : cAAGGTC-ACTA-GTCAAAGG-TGA-------A--GGTC-ACA-A-TG--CAC-A-T-A----A-TGG--T-TTT-A-AC-C-T-TGTC-T-------G-TG------C-CA--TA-A----C----
gi|11308 : cAAGGTC-ACTG-GT-AAAAG-T-------------GTC-AAA-A-TG--CAC-A-T-AATGAG-TGG--T-TTT-A-CC-A-C-TGTC-T-------G-GG------C-CA--TG-A----C----G-GGT-G---T--A-TA-TT-GC---T------AC--G----T-T-TGCGTTG-C-T-CTTGTT
gi|11311 : cAAGGGT-ATTG-GTCAGAGG-TCA-------A--GGTCGACA-A-TG--CAC-A-T-A----A-TGG--T-TTC-A-AC-A-T-TGTC-C-------G-GG------C-CA--TA-A----C----
gi|11314 : cAAGGTC-ATTA-GTCAAAGGGTCA-------A--GGTC-ACG-A-AG--CAC-A-T-G----G-TGGA-T-TTT-A-C----T-TTTC-T-------G-G---------CAATTG-A----C----A-GGC-GT--T--G-TA-AT-GC---T------AC--G----T-T-GGCGTTG-C-T-CTTGTT
gi|11315 : cAAGGGT-ATTG-GTCAGAGG-TCA-------A--GGTA-ACA-A-TG--TAC-A-T-A----G-TGG--T-TTC-A-AC-A-T-TGTC-T-------G-GG------C-CA--TA-A----C----
gi|11316 : cAAGGTC-ACTGAGTAAATGG-TCA-------A---------A-A-TG--CACCA-T-A----C-TGC--T-TTTTA-CC-A-C-TGTC-T-------G-GG------C-CA--TGTA----C------GGC-G---T--A-TA-TT-GC---T------ACG-G----T-T-GGCGTTG-C-T-CTTGTT
gi|11318 : cAAGGTT-ATTG-GTCAAAGG-TCA-------A--GGTC-ACATT-TG--CAC-A-T-A----A-TGG--T-TTT-A-AC-A-T-TGTT-T-------G-GG------C-CT--TA-A----C----
gi|11320 : cAATGTC-ACTG-GTCAAAGG-TCA-------A--GGTC-ACA-A-TG--CAC-A-T-A----G-TGG--TCTTT-A-AC-A-T-TGTC-G-------G-GG------C-CA--TA-A----C----
gi|11321 : cAAGGGT-ATTG-GTCAGAGG-TCA-------A--GGTC-ACA-A-TG--CAC-A-A-A----G-TGG--T-TTC-A-AC-A-A-TGTC-C-------G-GG------C-CA--
gi|11323 : cAAGGTC-ACTG-GTCAA-----------------GATC-ACA-A-TG--CAC-A-T-A----G-TGG--T-TTT-A-CC-A-T-TGTC-T-------G-GG------C-CA--TA-A----T----G-
gi|11325 : cAAGGTC-ACTT-GTCAAAGG-TC--------A--GGTT--CA-A-TG--CAC-A-TGA----G-TGA--T-TAT-A-CC-A-T-TG---T-------G-AT------C-CA--TG-ATAGCC----G-GGC-GGGTT--A-TA-TT-GC---T------AC--GTTCTT-T-GGCACTG-C-T-CCTGTT
gi|11328 : cAAGGTC-ACTG-GTTAAAGG-TCA-------A--GGTC-ACA-A-TG--CAC-A-T-A----G-TGG--T-TTT-A-AC-A-T-TGTC-A-------T-TG------C-CA--T
gi|11332 : cAAGGTT-ATTG-GTCAAAGG-TCA-------A--GGTC-ACC-A-TG--TAC-A-T-A------TGG--T-TTT-A-AC-A-T-TGTC-C-------G-GG------C-CA--TA-A----C----
gi|11334 : cAAGGTT-ATTG-ATCAAAGG-TCA-------A--GGTC-ACA-A-TG--CAC-A-T-A------TGG--T-TTT-A-AC-T-T-TGTC-T-------G-AG------C-CA--TA-A----C----
gi|11338 : cAAGGTT-ATTG-GTCAAAGG-TCA-------A--GGTC-ACT-A-TG--CAC-A-T-A----A-TAG--T-TTA-A-AC-A-T-TGTC-T-------G-GG------C-CA--
gi|11353 : cAAGGTC-ACTG-GTCAAAGG-TCA-------A--GGTC-ACA-A-TG--CAC-A-T-A----G-TGG--T-TTT-A-CC-A-T-TGTC-T-------G-GG------C-CA--TG-A----C----A-GGC-G---T--A-TA-TT-GC---T------AC--G----T-T-GGCGTTG-C-T-CTTGTT
gi|11354 : AAGGTC-ACTG-GTCAAAGG-TCA-------A--GACC-ACA-A-TG--CAC-A-T-A----G-TGG--T-TTT-A-CC-A-T-TGTC-T-------G-GG------C-CA--TG-A----T----G-GGC-G---T--A-TA-AT-GC---T------AT--G----T-T-GGCGTTG-C-T-CTTGTT
gi|11364 : AAGGTC-TCTG-GTCAAAGG-TCA-------A--GGCC-ACA-A-TG--CAT-A-T-A----A-TGT--T-TTT-A-AC-A-T-TGTC-T-------G-GG------C-CA--T
gi|11367 : AAGGT--ACTG-GTGAAAGG-TCA-------A---------A-A-TG---AC-A-T-A----G-TGG--T-TTT-A-CC-A-C-TGTC-T-------G-GGTGGCGCT-CA--TG-A----CTTCGG-GGC-G---T--A-TACTT-GC---T-------T--G----T-TCTGCTTTG-C-TCCTTGTT
gi|11378 : AGATC-AATG-ATCAGAGG-TCA-------A--AG-C-ACA-T-TG--CAC-A-T-A----T-TGT--T-TTC-A-C--A-T-TGTC-T-------G-G---------CA--TG-A----C----CTGGC-G---T--A-TA-TT-GC---T------AC--GTA--T-T-GGCGTTG-C---CTTGTT
gi|11416 : TG-GTCAAAGG-TCA-------A--GGTC-ACA-A-TG--CAC-A-T-G----G-TGG--T-TTT-A-AC-A-T-TGTA-T-------G-GG------A-CA--TG-A----
gi|11419 : G-GTCAATGG-TCA-------A--GGTC-TCA-A-TG--CAC-A-T-A----G-TGG--T-TTT-A-CC-A-T-TGCC-T-------G-GG------C-CA--TG-A----C----G-GGC-G---T--A-TA-AT-GT---T------AC--G----T-T-GGCGTTG-C-T-CTTGTT
gi|11420 : G-GTCAATGG-TCA-------A--GGTC-TCA-A-TGGGCAC-A-T-A----G-TGG--T-TTT-A-CC-A-T-TGCC-T-------G-GG------C-CA--TG-A----A----C-GGC-G---TTAA-TA-CT-GT---T------AC--G----T-T-GGCGTTG-CAT-CTTGTT
gi|11421 : G-GTCAAAGG-TCA-------A--GGTC-ACA-A-TG--CAC-A-T-T----G-TGG--T-TTA-A-CC-A-T-TGTC-T-------G-GG------C-CA--TG-A----C----A-GGT-G---T--A-TA-AT-GC---T------AT--G----T-T-GGCGTTG-C-T-CTTGTT
gi|11425 : G-GTCAAAGG-TCA-------A--GGTC-ACA-A-TG--TAC-A-T-A----G-TAG--T-TTT-A-AC-A-T-TGTC-T-------T-GG------C-CA--TA-A----C----
gi|11427 : G-GTCAAATG-TCA-------A--GGTC-ACA-A-TG--CAC-A-T-A----G-TGG--T-TTT-A-AC-A-T-TGTC-T-------G-GG------C-CA--TA-A----C----
gi|11445 : CAAAGG-TCA-------A--GGTC-ACA-A-TG--CAC-A-T-A----G-TTC--T-TTT-A-CC-A-T-TGTA-T-------G-TG------C-CA--TG-A----C----G-GAC-G---T--A-TA-AT-GC---T------AC--G----T-T-GGCGTTG-C-T-CTTGTT
gi|11446 : CAAAGG-TCA-------A--GGTC-ACA-A-TG--CAC-A---G----G-TG---T-TTT-A-CC-A-T-TGTC-T-------G-GG------C-CA--CG-A----C----G-GGC-G---T--A-AA-CC-GCCG-T------AT--G----T-T-GGTGTTG-C-T-CTTGTT
gi|11458 : AAGG-TTA-------A--ATTC-ACA-A-TG--CAC-A-T-A----G-TGG--T-TTT-A-CC-A-T-TTTC-G-------G-AG------C-CA--TG-A----T----G-GGT-G---T--A-TA-AT-GC---T------AT--G----T-T-GGCATTG-C-T-CTTGT
gi|11463 : AGG-T-A-------ACTGGTC-AAA-A-TG--TAC-A-T-A----G-TGC--T-TTT-A-CC-A-T-TGTC-T-------G-GG------C-CA--TG-A----C----G-GGC-G---T--A-TA-AT-GC---T------AA--G----T-T-GGTGTTG-C-T-CTTGTT
gi|11474 : G-CCA-------A--GGTC-ACA-A-TG--CAC-C-C-A----G-TGG--T-TTT-A-CC-A-T-TGTT-C-------G-GG------C-CA--TG-A----C----A-GGC-G---A--A-TA-AT-GC---T------AC--G----T-T-GGCATTG-C-T-CTTGTT
gi|11485 : CA-------A--GGTC-ACA-A-TG--CAC-A--------G-TGG--T-TTT-A-CC-A-T-TGTC-T-------A-GG------C-CA--TG-A----C----G-GGC-G---T--A-CA-AT-GC---T------
gi|11488 : A-------A--GGTC-AAA-A-TG--CAC-A-C-A----G-TGG--T-TTT-A-CC-A-T-TGTC-TGCCGACAG-GG------C-CA--TG-A----C----G-GAC-G---T--A-TA-TT-GC---T------AC--G----T-T-TGCGTTG-----CTTGTT
gi|11490 : -A----G-TGG--T-TTT-A-CC-A-C-TGTC-T-------G-AG------C-CA--TG-G----C----G-GGC-A---T--A-TA-TT-AC---T------AC--G----T-T-TGCGTTG-C-T-CTTGTT
gi|11491 : ----G-TGG--T-TTT-A-CC-A-C-TGTC-T-------G-GG------C-TA--TG-A----C----G-GGT-T---T--A-TA-TT-GC---T------AC--G----T-T-TGCGTTG-C-T-CTTGTT
Alignments
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lowQualScore : . . . ....... .. . . . .. . . . .... . .. . . .. . . . . ....... . ...... . .. . .... .... . . ... .. . .. . ... ...... .. .... . . . . .
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consensus : AAGGTC-ACTG-GTCAAAGG-TCA-------A--GGTC-ACA-A-TG--CAC-A-T-A----G-TGG--T-TTT-A-CC-A-T-TGTC-T-------G-GG------C-CA--TG-A----C----G-GGC-G---T--A-TA-NT-GC---T------AC--G----T-T-GGCGTTG-C-T-CTTGTT
Reference ( family-82 ) : AAGGTC-ACTG-GTCAAAGG-TCA-------A--GGTC-ACA-A-TG--CAC-A-T-A----G-TGG--T-TTT-A-CC-A-T-TGTC-T-------G-GG------C-CA--TG-A----C----G-GGC-G---T--A-TA-NT-GC---T------AC--G----T-T-GGCGTTG-C-T-CTTGTT
gi|11131 : AAGGTC-ACTG-GTCAAAGT-TCA-------A--GGTC-ACA-G-TG--TGC-A-T-A----G-TGG--T-TTT-A-CT-A-T-TGTC-T-------G-GG------C-CA--TG-A----C----G-GGC-G---T--A-CA-AT-GC---T------AC--G----C-T-GGCGTTG-C-T-CTTGTT
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gi|11144 : ccAAAATC-ACTG-GTCAAAGG-TCA-------A--GGTC-ACA-A-TA--CAC-A-T-A----G-TAG--T-TTT-A-CC-C-T-TGTC-T-------T-TG------C-CA--TG-A----C----A-GGC-G---T--A-TA-AT-GC---T------AT--G----T-T-GGCGTTG-C-T-CTTGTT
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gi|11154 : ccAAGGTC-ACTG-GTTAAAGA-TCA-------A--GGTC-GCA-A-TA--CAC-A-T-A----G-TTC--T-TTT-A-CC-A-T-TGTC-T-------G-GG------C-CA--TG-A----C----G-GGC-G---T--A-TA-AT-GC---T------AC--C----T-T-TGCGTTG-C-T-CTTTTT
gi|11156 : ccAAGGTC-ACTG-GTAAAAGG-TCA-------A---------A-A-TG--TAC-A-T-A----A-TGG--T-TTT-A-CC-A-C-TGTC-T-------G-GG------C-CA--TG-A----C----G-GGC-G---T--A-TA-TT-GC---T------AC--G----T-T-TGCGTTG-C-T-CTTGTT
gi|11158 : ccAAGGTC-ACTG-GTCAAAGG-TCA----------------CA-A-TG--CAC-A-T-A----G-TG---T-TTT-A-CC-A-T-TGTC-T-------G-GG------C-CA--TG-A----C----G-GGT-G---T--A-TA-AT-GC---T------AC--A----A-T-GGCATTG-C-T-CTTGTT
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gi|11161 : ccAAGGTC-ACTG-GTCAGATT-TCA-------A--GGTT-GCA-A-TG--CAC-A-T-A----G-TGG--T-TTT-A-AC-C-T-TGTC-C-------G-GA------C-CA--TA-A----
gi|11163 : ccAATGTC-ACAG-GTCAAAGA-TTA-------A--TGTT-AGA-A-GG--CAC-A-T-A----G-TGG--T-TTT-A-CC-A-T-TGTC-T-------G-GG------C-CA--TG-A----T----G-GGC-G---T--A-TA-AT-GC---T------AC--G----T-T-GACGTTG-C-T-CTTATT
gi|11164 : ccAAGGTT-ATTG-GTCAAAGG-TCA-------A--GGTC-ACT-A-TG--CCC-A-T-A----A-TGG--T-TTA-A-AC-A-T-TGTC-C-------G-GA------C-CA--T
gi|11169 : ccAAGGTC-ACTG-GTAAAAGG-TCA-------A---------A-A-TG--TAC-A-T-A----A-TGG--T-TTT-A-CC-ACT-TGTC-T-------G-GG------C-CA--TG-A----C----G-GGC-G---T--ATTA-TT-GC---T------AC--G----C-T-TGCGTTG-C-T-CTTGTT
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gi|11181 : ccAAGGTT-ACTG-AATAAAGG-TCA-------A--GGTC-TCA-A-TG--CAC-A-T-A----A-TAG--T-TTT-A-CC-A-T-TGTC---------A-GG------C-CA--TG-A----T----G-GGT-G---T--A-TA-AT-GC---TATGTTAAC--A----T-T-GGCATTG-C-T-CTTGTT
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gi|11183 : ccAAGGTC-ACTG-GTCAAATG-TCA-------A--GGTC-ACA-A-TG--CAC-----A----G-TGGT-T-TTT-A-CT---T-TGTC-C-------G-GA------C-CA--TA-A----
gi|11188 : ccAAGGTC-ACTG-GT-AAAGG-TCA-------A--A------A-A-TG--TAC-A-T-A------TGG--T-TTTTA-CC-A-C-TG-C-T-------G-GG------CGCA--TG-A----C----G-GGT-G---T--A-TA-TT-GC---T------AC--G----C-T-TGCGTTG-C-T-CTTGTT
gi|11193 : ccAAGGTT-ATTG-GTCAAAGG-TCA-------A--GGTC-ACT-A-TG--CAC-A-T-A----A-TGG--T-TTA-A-AC-C-T-TGTC-C-------G-GG------T-CA--TA-A----C----G-
gi|11195 : ccAAGG-TCA-------CT-GGTC-AAA-A-TG--CAC-A--------G-TGG--T-TTT-A-CC-A-T-TGTC-T-------G-GG------C-CA--AG-A----C----G-GGC-T---T--A-TA-AT-GC---T------AC--C----T-T-GACGTTG-C-T-CTCGTT
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gi|11198 : ccAAGGTC-ACTG-GTCCA-----CA-------A--GGTC-ACA-CCTG--CAC-A-T-A----G-TGGGGT-TTT-A-CC---T-TCTC-T-------G-G-------C-CA--TG-A----C----G-GGC-G---T----TA-TT-GC---T------AC--G----T-T-GGCGTTG-
gi|11199 : ccAAGGTC-ACTG-GTCAAAGG----------------TC-ACA-A-TG--CAC-A-T-A----G-TGG--T-TTT-A-AC-A-T-TGTC-C-------G-GG------C-CA--TA-A----C----
gi|11200 : ccAAGGTC-ACTG-GTCAAATG-TCA-------A--GGTC-ACA-A-TG--CAC-A-T-A----G-TGA--T-TTT-A-AC-C-T-TGTT-C-------G-GA------C-CA--T
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gi|11212 : ccAAGGTC-ACTG-GTC-------CA-------A--GGTC-ACA-A-TG--CAC-A-T----------------TT-A-T----T-TGTC-T-------G-G-------C-CA--TG-A----C----A-GGC-G---T--A--A-AG-GC---T------AC--G----T-T-GGCGTTG-C-T-CTTGTT
gi|11213 : ccAAGGTC-ACTG-GTCAGATA-TCA-------A--GGTC-GCA-A-TG--CAT-A-T-A----A-TGG--T-TTT-A-AC-C-T-TGTC-C-------G-GA------C-CA--TA-A----
gi|11214 : ccAAGGTC-ACTG-GTCAAATG-TCA-------A--G-TC-ACA-A-TG--CAC-A-T-A----G-TGGT-T-TTT-A-CT---T-TGTC-C---------GG------C-CA--TA-A----
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Reference ( family-82 ) : AAGGTC-ACTG-GTCAAAGG-TCA-------A--GGTC-ACA-A-TG--CAC-A-T-A----G-TGG--T-TTT-A-CC-A-T-TGTC-T-------G-GG------C-CA--TG-A----C----G-GGC-G---T--A-TA-NT-GC---T------AC--G----T-T-GGCGTTG-C-T-CTTGTT
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gi|11183 : ccAAGGTC-ACTG-GTCAAATG-TCA-------A--GGTC-ACA-A-TG--CAC-----A----G-TGGT-T-TTT-A-CT---T-TGTC-C-------G-GA------C-CA--TA-A----
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gi|11198 : ccAAGGTC-ACTG-GTCCA-----CA-------A--GGTC-ACA-CCTG--CAC-A-T-A----G-TGGGGT-TTT-A-CC---T-TCTC-T-------G-G-------C-CA--TG-A----C----G-GGC-G---T----TA-TT-GC---T------AC--G----T-T-GGCGTTG-
gi|11199 : ccAAGGTC-ACTG-GTCAAAGG----------------TC-ACA-A-TG--CAC-A-T-A----G-TGG--T-TTT-A-AC-A-T-TGTC-C-------G-GG------C-CA--TA-A----C----
gi|11200 : ccAAGGTC-ACTG-GTCAAATG-TCA-------A--GGTC-ACA-A-TG--CAC-A-T-A----G-TGA--T-TTT-A-AC-C-T-TGTT-C-------G-GA------C-CA--T
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gi|11212 : ccAAGGTC-ACTG-GTC-------CA-------A--GGTC-ACA-A-TG--CAC-A-T----------------TT-A-T----T-TGTC-T-------G-G-------C-CA--TG-A----C----A-GGC-G---T--A--A-AG-GC---T------AC--G----T-T-GGCGTTG-C-T-CTTGTT
gi|11213 : ccAAGGTC-ACTG-GTCAGATA-TCA-------A--GGTC-GCA-A-TG--CAT-A-T-A----A-TGG--T-TTT-A-AC-C-T-TGTC-C-------G-GA------C-CA--TA-A----
gi|11214 : ccAAGGTC-ACTG-GTCAAATG-TCA-------A--G-TC-ACA-A-TG--CAC-A-T-A----G-TGGT-T-TTT-A-CT---T-TGTC-C---------GG------C-CA--TA-A----
gi|11218 : ccAAGGTC-ACTG-GTCAAAGT-TCA-------A--GGTC-ACA-A--G--CAC-A-T-A----G-TGG--T-TTT-A-AC-A-T-TGTC-T-------G-AG------C-CA--TA-A----C----
gi|11219 : ccAAAGTC-ACTA-GTCAAAGG-ACA-------C--GGTC-ACA-A-TG--CAC-A-T-T----A-TAG--T-TTT-A-GC-A-T-TGTC-C-------G-GG------C-CA--TA-A----C----
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gi|11224 : ccAAGGTC-ACTG-GC-----G-TCA-------A--AAT--------TA--CAC-A-T-A----G-TGG--T-TTT-A-CC-A-TGTGTC-T-------GCGG------C-CA--TG-A----C----G-GGC-G---T--A-T--CT-AC---T------AC--A----T-G-TACGTTG-C-T-CTTTTT
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gi|11227 : ccAAGGTT-ATTG-GTCAAAGG-ACA-------A--GGTC-ACA-A-TG--CAC-A-T-A----A-TGG--T-TTT-A-AC-A-T-TGTC-C-------A-GG------C-CA--TA-A----C----
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gi|11233 : ccAAGGTC-ATTG---C------TCA-------A--GGTC-ACA-A-TG--CAC-A-C-A----G-TAG--T-TT--A-CC-A-A-TGTT-T-------T-GC------C-CA--TG-A----C----A-GGT-G---T--A-TA-AT-GC---T------AG--G----T-T-G
gi|11237 : ccAAGGTC-ACTG-GTCAAAAG-TCA-------A--GGAC-ACA-A-TG--CAC-A-T-A----A-TGG--T-TTT-C-AC-A-T-TGTC-T-------G-
gi|11239 : ccAAGATC-ACTG-GTCAAATG-TCA-------A--GGTC-GCA-A-TG--CAC-A-T-A----G-TGGTTT-TTT-A--C-A-T-TGTC-C-------A-GG------C-CA--TA-A----T----G-
gi|11243 : ccAAGGTC-ACTG-GTCAAAAG-TCA-------A--GGTC-ACA-G-TA--CAC-A-T-A----G-TGG--T-TTA-A-AC-A-T-TATG-T-------G-GG------T-CA--TA-A----
gi|11244 : ccAAGGTC-ACTG-ATCAAAGG-TCA-------A--GATC-ACG-A-TG--TCC-A-G-A----A-TGG--T-TTT-A-AC-A-T-TGTT-T-------G-GG------C-CA--
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gi|11247 : ccAAGATC-ACTG-GTCAAAAT-TCA-------A--GGTC-ACA-A-TG--CAC-A-T-A----A-TGG--T-TTT-A-AT-C-T-TGTC-A-------G-GA------C-CA--TA-A----C----
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gi|11249 : ccAAGGCC-ACTA-GTCAGAGG-TCA-------A--GGTC-A-A-A-TG--CAC-A-T-A----G-TGG--T-TTT-A-AC-A-T-TATC-G-------G-GG------C-GA--T
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gi|11254 : ccAAGG-T-A-------A--GGTC-AAA-A-GG--TAC-A-T-A----A-TAG--G-GTC-A-CC-A-T--GTC-T-------G-GG------C-CA--TG------T----G-GGC-G---T--A-TA-ATTGC---T------AC--G----TGT-TGCAGTG-C-T-CTTGTT
gi|11255 : ccaaggtagcgtAAGGTC-ACTG-GCCAAAGG-TCA-------A--GGTC-ACA-A-TA--CAC-A-T-C----G-TGG--T-TTT-A-AC-T-T-TATC-C-------G-GA------C-GA--TA-A----
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gi|11261 : ccAAGCTC-ACTG-GTCAAATG-TCA-------A--GGTC-AAA-A-TG--CAC-A-T-C----G-TGG--T-TTT-A-AC-C-T-TGTC-C-------G-GA------C-CA--TA-A----
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gi|11292 : caataAAGGTC-ACTG-GTCAAAGG-TCA-------A--GGTC-GCA-A-TA--CAC-A-T-A----G-TGG--G-TTT-A-CC-G-T-TGTC-C-------A-GG------C-CA--TG-A----C----G-GGC-G---T--A-TA-AT-GC---T------AC--G----T-T-GGCGTTG-C-T-TTTGT
gi|11293 : cAAGATC-ACTA-GTCAAAGG-TCA-------A--GGTC-ACA-A-TG--CAC-A-T-G----G-TGG--T-TTT-A-CC-A-T-TGTC-T-------G-GG------C-CA--TG-A----C----G-GTT-G---T--A-TA-AT-GC---T------AC--A----T-T-GGCTTTG-C-T-CTTGTT
gi|11296 : cAAGGTC-ACTG-GTTAAAGG-TCA-------A--GGTC-ACA-A-TG--CAC-A-T-C----G-TGG--T-TTT-A-AC-C-T-AGTC-C-------G-AA------C-CA--T
gi|11297 : cAAGGTT-ATTG-GTCAAAGG-TCA-------A--GATC-ACT-A-TG--CAC-A-T-A----A-TGG--T-TTA-A-AA-A-T-TGTC-T-------G-GG------T-CA--TA-A----C----
gi|11306 : cAAGGTC-ACTA-GTCAAAGG-TGA-------A--GGTC-ACA-A-TG--CAC-A-T-A----A-TGG--T-TTT-A-AC-C-T-TGTC-T-------G-TG------C-CA--TA-A----C----
gi|11308 : cAAGGTC-ACTG-GT-AAAAG-T-------------GTC-AAA-A-TG--CAC-A-T-AATGAG-TGG--T-TTT-A-CC-A-C-TGTC-T-------G-GG------C-CA--TG-A----C----G-GGT-G---T--A-TA-TT-GC---T------AC--G----T-T-TGCGTTG-C-T-CTTGTT
gi|11311 : cAAGGGT-ATTG-GTCAGAGG-TCA-------A--GGTCGACA-A-TG--CAC-A-T-A----A-TGG--T-TTC-A-AC-A-T-TGTC-C-------G-GG------C-CA--TA-A----C----
gi|11314 : cAAGGTC-ATTA-GTCAAAGGGTCA-------A--GGTC-ACG-A-AG--CAC-A-T-G----G-TGGA-T-TTT-A-C----T-TTTC-T-------G-G---------CAATTG-A----C----A-GGC-GT--T--G-TA-AT-GC---T------AC--G----T-T-GGCGTTG-C-T-CTTGTT
gi|11315 : cAAGGGT-ATTG-GTCAGAGG-TCA-------A--GGTA-ACA-A-TG--TAC-A-T-A----G-TGG--T-TTC-A-AC-A-T-TGTC-T-------G-GG------C-CA--TA-A----C----
gi|11316 : cAAGGTC-ACTGAGTAAATGG-TCA-------A---------A-A-TG--CACCA-T-A----C-TGC--T-TTTTA-CC-A-C-TGTC-T-------G-GG------C-CA--TGTA----C------GGC-G---T--A-TA-TT-GC---T------ACG-G----T-T-GGCGTTG-C-T-CTTGTT
gi|11318 : cAAGGTT-ATTG-GTCAAAGG-TCA-------A--GGTC-ACATT-TG--CAC-A-T-A----A-TGG--T-TTT-A-AC-A-T-TGTT-T-------G-GG------C-CT--TA-A----C----
gi|11320 : cAATGTC-ACTG-GTCAAAGG-TCA-------A--GGTC-ACA-A-TG--CAC-A-T-A----G-TGG--TCTTT-A-AC-A-T-TGTC-G-------G-GG------C-CA--TA-A----C----
gi|11321 : cAAGGGT-ATTG-GTCAGAGG-TCA-------A--GGTC-ACA-A-TG--CAC-A-A-A----G-TGG--T-TTC-A-AC-A-A-TGTC-C-------G-GG------C-CA--
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gi|11325 : cAAGGTC-ACTT-GTCAAAGG-TC--------A--GGTT--CA-A-TG--CAC-A-TGA----G-TGA--T-TAT-A-CC-A-T-TG---T-------G-AT------C-CA--TG-ATAGCC----G-GGC-GGGTT--A-TA-TT-GC---T------AC--GTTCTT-T-GGCACTG-C-T-CCTGTT
gi|11328 : cAAGGTC-ACTG-GTTAAAGG-TCA-------A--GGTC-ACA-A-TG--CAC-A-T-A----G-TGG--T-TTT-A-AC-A-T-TGTC-A-------T-TG------C-CA--T
gi|11332 : cAAGGTT-ATTG-GTCAAAGG-TCA-------A--GGTC-ACC-A-TG--TAC-A-T-A------TGG--T-TTT-A-AC-A-T-TGTC-C-------G-GG------C-CA--TA-A----C----
gi|11334 : cAAGGTT-ATTG-ATCAAAGG-TCA-------A--GGTC-ACA-A-TG--CAC-A-T-A------TGG--T-TTT-A-AC-T-T-TGTC-T-------G-AG------C-CA--TA-A----C----
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gi|11364 : AAGGTC-TCTG-GTCAAAGG-TCA-------A--GGCC-ACA-A-TG--CAT-A-T-A----A-TGT--T-TTT-A-AC-A-T-TGTC-T-------G-GG------C-CA--T
gi|11367 : AAGGT--ACTG-GTGAAAGG-TCA-------A---------A-A-TG---AC-A-T-A----G-TGG--T-TTT-A-CC-A-C-TGTC-T-------G-GGTGGCGCT-CA--TG-A----CTTCGG-GGC-G---T--A-TACTT-GC---T-------T--G----T-TCTGCTTTG-C-TCCTTGTT
gi|11378 : AGATC-AATG-ATCAGAGG-TCA-------A--AG-C-ACA-T-TG--CAC-A-T-A----T-TGT--T-TTC-A-C--A-T-TGTC-T-------G-G---------CA--TG-A----C----CTGGC-G---T--A-TA-TT-GC---T------AC--GTA--T-T-GGCGTTG-C---CTTGTT
gi|11416 : TG-GTCAAAGG-TCA-------A--GGTC-ACA-A-TG--CAC-A-T-G----G-TGG--T-TTT-A-AC-A-T-TGTA-T-------G-GG------A-CA--TG-A----
gi|11419 : G-GTCAATGG-TCA-------A--GGTC-TCA-A-TG--CAC-A-T-A----G-TGG--T-TTT-A-CC-A-T-TGCC-T-------G-GG------C-CA--TG-A----C----G-GGC-G---T--A-TA-AT-GT---T------AC--G----T-T-GGCGTTG-C-T-CTTGTT
gi|11420 : G-GTCAATGG-TCA-------A--GGTC-TCA-A-TGGGCAC-A-T-A----G-TGG--T-TTT-A-CC-A-T-TGCC-T-------G-GG------C-CA--TG-A----A----C-GGC-G---TTAA-TA-CT-GT---T------AC--G----T-T-GGCGTTG-CAT-CTTGTT
gi|11421 : G-GTCAAAGG-TCA-------A--GGTC-ACA-A-TG--CAC-A-T-T----G-TGG--T-TTA-A-CC-A-T-TGTC-T-------G-GG------C-CA--TG-A----C----A-GGT-G---T--A-TA-AT-GC---T------AT--G----T-T-GGCGTTG-C-T-CTTGTT
gi|11425 : G-GTCAAAGG-TCA-------A--GGTC-ACA-A-TG--TAC-A-T-A----G-TAG--T-TTT-A-AC-A-T-TGTC-T-------T-GG------C-CA--TA-A----C----
gi|11427 : G-GTCAAATG-TCA-------A--GGTC-ACA-A-TG--CAC-A-T-A----G-TGG--T-TTT-A-AC-A-T-TGTC-T-------G-GG------C-CA--TA-A----C----
gi|11445 : CAAAGG-TCA-------A--GGTC-ACA-A-TG--CAC-A-T-A----G-TTC--T-TTT-A-CC-A-T-TGTA-T-------G-TG------C-CA--TG-A----C----G-GAC-G---T--A-TA-AT-GC---T------AC--G----T-T-GGCGTTG-C-T-CTTGTT
gi|11446 : CAAAGG-TCA-------A--GGTC-ACA-A-TG--CAC-A---G----G-TG---T-TTT-A-CC-A-T-TGTC-T-------G-GG------C-CA--CG-A----C----G-GGC-G---T--A-AA-CC-GCCG-T------AT--G----T-T-GGTGTTG-C-T-CTTGTT
gi|11458 : AAGG-TTA-------A--ATTC-ACA-A-TG--CAC-A-T-A----G-TGG--T-TTT-A-CC-A-T-TTTC-G-------G-AG------C-CA--TG-A----T----G-GGT-G---T--A-TA-AT-GC---T------AT--G----T-T-GGCATTG-C-T-CTTGT
gi|11463 : AGG-T-A-------ACTGGTC-AAA-A-TG--TAC-A-T-A----G-TGC--T-TTT-A-CC-A-T-TGTC-T-------G-GG------C-CA--TG-A----C----G-GGC-G---T--A-TA-AT-GC---T------AA--G----T-T-GGTGTTG-C-T-CTTGTT
gi|11474 : G-CCA-------A--GGTC-ACA-A-TG--CAC-C-C-A----G-TGG--T-TTT-A-CC-A-T-TGTT-C-------G-GG------C-CA--TG-A----C----A-GGC-G---A--A-TA-AT-GC---T------AC--G----T-T-GGCATTG-C-T-CTTGTT
gi|11485 : CA-------A--GGTC-ACA-A-TG--CAC-A--------G-TGG--T-TTT-A-CC-A-T-TGTC-T-------A-GG------C-CA--TG-A----C----G-GGC-G---T--A-CA-AT-GC---T------
gi|11488 : A-------A--GGTC-AAA-A-TG--CAC-A-C-A----G-TGG--T-TTT-A-CC-A-T-TGTC-TGCCGACAG-GG------C-CA--TG-A----C----G-GAC-G---T--A-TA-TT-GC---T------AC--G----T-T-TGCGTTG-----CTTGTT
gi|11490 : -A----G-TGG--T-TTT-A-CC-A-C-TGTC-T-------G-AG------C-CA--TG-G----C----G-GGC-A---T--A-TA-TT-AC---T------AC--G----T-T-TGCGTTG-C-T-CTTGTT
gi|11491 : ----G-TGG--T-TTT-A-CC-A-C-TGTC-T-------G-GG------C-TA--TG-A----C----G-GGT-T---T--A-TA-TT-GC---T------AC--G----T-T-TGCGTTG-C-T-CTTGTT