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gi|116541                     :    TAGTGTTTGTAAAA--T----CGGAC-A-ATATTTAC-TAT-TGA--T-TCAAG-AAATT-GAAA---T-C-GGAC--AATAC-A-CGATCGCA--TTTAA------TAAAA-AA-TC--GATT-ATT
gi|116542                     :         TT-GTAAAA--T----CGGAAGA-AAATTTTT-TATACGA--T-T-ATC-GAAAT-G-AA---T-C-TG-CTTAGTACTA-TGTTCG-A--TT--A------T--AA-A---------T-ATTTG


blockSeqs                     :           T      AC AAAT     G C A      C   AC  AT G C   T     G G  TCC A C  A TT G   T T      C GC  ATACATG   AA  G  T  AG    A
blockSeqs                     :           .      .  A        . . T      .   C   G  . .   .     . A  AT  . .  . .  A   . .      . .   TAA       .   .  T  T     .
blockSeqs                     :           .      .  .        . . A      .   T   .  . .   .     . .  .   . .  . .  G   . .      . .   A         .   .  .  C     .
blockSeqs                     :           .      .  .        . . A      .   C   .  . .   .     . .  .   . .  . .  T   . .      . .   A         .   .  .  .     .
blockSeqs                     :           .      .  .        . . T      .   C   .  . .   .     . .  .   . .  . .  A   . .      . .   A         .   .  .  .     .
blockSeqs                     :           .      .  .        . . A      .   T   .  . .   .     . .  .   . .  . .  A   . .      . .   A         .   .  .  .     .
blockSeqs                     :           .      .  .        . . T      .   T   .  . .   .     . .  .   . .  . .  T   . .      . .   A         .   .  .  .     .
blockSeqs                     :           .      .  .        . . A      .   C   .  . .   .     . .  .   . .  . .  A   . .      . .   G         .   .  .  .     .
blockSeqs                     :           .      .  .        . . T      .   C   .  . .   .     . .  .   . .  . .  G   . .      . .   A         .   .  .  .     .
blockSeqs                     :           .      .  .        . . A      .   T   .  . .   .     . .  .   . .  . .  A   . .      . .   A         .   .  .  .     .
blockSeqs                     :           .      .  .        . . T      .   C   .  . .   .     . .  .   . .  . .  G   . .      . .   A         .   .  .  .     .
blockSeqs                     :           .      .  .        . . A      .   T   .  . .   .     . .  .   . .  . .  G   . .      . .   A         .   .  .  .     .
blockSeqs                     :           .      .  .        . . A      .   C   .  . .   .     . .  .   . .  . .  A   . .      . .   A         .   .  .  .     .
blockSeqs                     :           .      .  .        . . T      .   C   .  . .   .     . .  .   . .  . .  G   . .      . .   A         .   .  .  .     .
blockSeqs                     :           .      .  .        . . T      .   T   .  . .   .     . .  .   . .  . .  T   . .      . .   A         .   .  .  .     .
blockSeqs                     :           .      .  .        . . T      .   T   .  . .   .     . .  .   . .  . .  A   . .      . .   A         .   .  .  .     .
blockSeqs                     :           .      .  .        . . T      .   T   .  . .   .     . .  .   . .  . .  A   . .      . .   A         .   .  .  .     .
blockSeqs                     :           .      .  .        . . A      .   T   .  . .   .     . .  .   . .  . .  A   . .      . .   .         .   .  .  .     .
blockSeqs                     :           .      .  .        . . .      .   .   .  . .   .     . .  .   . .  . .  A   . .      . .   .         .   .  .  .     .
blockSeqs                     :           .      .  .        . . .      .   .   .  . .   .     . .  .   . .  . .  G   . .      . .   .         .   .  .         


blockSeqCons                  : 
originalCons                  : TAGTAGTGTT-GTAAAA--T----CGGAC-A-ANATTTAC-TAT-CGA--T-T-ATC-GAATT-G-AA---T-C-GG-C--AGTAC-A-CGATCG-A--TT--A------T--AA-AA-TC--GATT-ATTTGAACTT
finalCons                     : TAGTAGTGTT-GTAAAA--T----CGGAC-A-ANATTTAC-TAT-CGA--T-T-ATC-GAATT-G-AA---T-C-GG-C--AGTAC-A-CGATCG-A--TT--A------T--AA-AA-TC--GATT-ATTTGAACTT





Alignments
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lowQualScore                  :           .      .. ....     . . .      .   ..  .. . .   .     . .  ... . .  . .. .   . .      . ..  ......... ..  .  .  ..    .          
lowQualScore                  :           9      66 0000     9 9 7      9   33  55 9 9   9     9 8  000 9 9  9 66 2   9 9      9 66  666666666 66  9  8  88    0          
consensus                     : TAGTAGTGTT-GTAAAA--T----CGGAC-A-ANATTTAC-TAT-CGA--T-T-ATC-GAATT-G-AA---T-C-GG-C--AGTAC-A-CGATCG-A--TT--A------T--AA-AA-TC--GATT-ATTTGAACTT
Reference ( family-808 )      : TAGTAGTGTT-GTAAAA--T----CGGAC-A-ANATTTAC-TAT-CGA--T-T-ATC-GAATT-G-AA---T-C-GG-C--AGTAC-A-CGATCG-A--TT--A------T--AA-AA-TC--GATT-ATTTGAACTT
gi|116522                     : TAGTAGTGTT-GTAAAA--T----CGGAC-A-AAATTTAC-TAT-CGA--T-T-ATT-GAATT-G-AA---T-C-GG-C--AGTAC-A-CGATCG-A--TT--A------T--AA-AA-TT--GATT-ATTTGAACTT
gi|116523                     : TAGTAGTGTT-GTAAAA--T----CTGAC-A-AAATTTAC-TAT-CAA--T-T-ATC-GAATT-G-AA---T-C-GG-C--AGTAC-A-CGATCG-A--TT--A------T--AA-AA-TC--GATT-ATTTGAACTT
gi|116524                     : TAGTAGTGTT-GTAAAA--T----CGGAC-A-ATATTTAC-TAT-TGA--T-T-ATC-GAATT-G-AA---T-C-GG-C--AATAC-A-CGATCG-A--TT--A------T--AA-AA-TC--GATT-ATTTAAACTT
gi|116525                     : TATTAGTGTT-GTAAAA--T----CGGAC-A-AAATTTAC-TAT-CGA--T-T-ATC-AAATT-G-AA---T-G-GG-C--AGTAC-A-CAGTTG-A--TT--A------T--AA-AA-TC--GATT-ATTTGAACTT
gi|116526                     : TAGTAGTGTT-GTCAAA--T----CGGAC-A-AAATTTAC-TAT-CGA--T-T-ATC-AAATT-G-GA---T-C-GG-C--ATTAC-A-CGATTG----------------------A-TC--GATT-ATTTGAACTT
gi|116527                     : TAATAGTGTT-GTAAAA--TAAATCGGAC-A-A-ATATAC-TAT-TGA--T-T-ATC-GAATT-G-AA---T-C-GG-C--AATAC-A-CG-TCG-A--TT--A------T--AA-AA-TT--GATTAATCTAAACTT
gi|116528                     : TAATAGTGTT-GTAAAA--T----CGGAC-A-ATATCTAC-TAT-TGAATT-T-ATC-GAATTGG-AA---T-C-GA-C--AATAC---CGATCG-AGCTG--A------T--AAGAA-TCT-GATT-
gi|116529                     : TAATAGTGTT-GTAAAA--T----CGGGC-A-AAATTTAC------------T-ATC-GAATT-G-AA---T-C-GG-A--ATTAC-A-CGATTT----TT--G------C--AA-CA-TCAGGA-T-ACTTGA
gi|116530                     : TACTAGTGAT-GGGAAA--T----CGGAA-A-ATTTTCAT-AAT-CGA--T-T-ATC-GAATA-T-AA---T-C-GG-A--AATGT-A-TAATCG-A--TT---------T--AA-AA-
gi|116531                     : TATTAGTGTT-GTAAGA--GA---CGGAC-A-AAATTTACCTAT-CGAG-TGT-ATT-TAAGT-G-AAAT-T-C-GG-C--AGTAC-A-----------TT--A-------------A-TCC-GATT-ATTTG-ACTT
gi|116532                     :  AGTAGTGTT-GTAAA---T----CGAAA-A-TTATTTAC-TAT-TGA--T-T-ATC-GAATT-G-AA---T-C-GG-C--AATAC-A-CGATCG-A--TG--A------T--AA-AA-TC--GATT-ATTTGAACTT
gi|116533                     :  AGTAGTGTT-GTAAAA--T----CGAAC-G-AAACATAC-TAT-CGA--T-T-CAC-AAATT-G-AA---T-C-GG-C--AGTAC-A-CAATTG-A--TT--A------T--GA-AA-TC--GATC-AATTGAACTT
gi|116534                     :  AGTAGTGTT-GTAAAT--T----CGAAC-A-A-----AT-TAT--GA--T-T-ATT-TAAT-----ATCCT-C-GG-C--AGTAC-A-CAA-CG-A--TT--A------T---A-AA-TC--GATT-ATTTGACCTT
gi|116535                     :    TAGTGTT-GTAAAA--T----TGGAC-A-ATATTTAC-TAT-TGA--T-T-ATC-GAATT-G-AA---T-C-GG-C--AATGC-A-CGATCG-A--TT--ATACATGT--AA-AA-TC--GATT-ATTTAAACTT
gi|116536                     :    TAGTGTC-ATAAAA--T----TGGAC-A-AAATTTAC-TAT-CAA--T-T-ATC---ATT-G-AA---T-C-GG-C--AGTAC-ATCGATCG-A--TT---------T--AA-AA-TC--GATT-ATTTGAACTT
gi|116537                     :    TAGTGTT-GTAAAA--C----TGGAC-A-AAATTTAC-TAT-CGA--T-T-ATT-GAATT-G-AA---TAG-GG-C--ATTAT-A-AAATAG-A--TT--A------T--GA-AA-TC--AAAT-TTTTGAA
gi|116538                     :    TAGTGTT--TAAAAACT----CGGAC-ACATATTTAC-TAT-TGA--T-T-ATCTGAATT-GGAA---T-CCGG-C--AATAT-A-CGATCG-A--TT--A------T--AA-AA-TT--G-TT-ATT
gi|116539                     :    TAGTGTT-G--AAA--T----CGGA----ATATTTA--TAT-TGA--T---ATC-GAATT-G-AA---T-C-GG----AATAT-A-CGATCG-A--TT--A------T--AA-AATTT--GATT--TTTAAACTT
gi|116540                     :    TAGTGTT-G--AAA--T----CGGA----ATATTTA--TAT-TGA--T---ATC-GAATT-G-AA---T-C-GG----AATAT-A-CGATCG-A--TT--A------T--AA-AATTT--GATT--TTTAAACTT
gi|116541                     :    TAGTGTTTGTAAAA--T----CGGAC-A-ATATTTAC-TAT-TGA--T-TCAAG-AAATT-GAAA---T-C-GGAC--AATAC-A-CGATCGCA--TTTAA------TAAAA-AA-TC--GATT-ATT
gi|116542                     :         TT-GTAAAA--T----CGGAAGA-AAATTTTT-TATACGA--T-T-ATC-GAAAT-G-AA---T-C-TG-CTTAGTACTA-TGTTCG-A--TT--A------T--AA-A---------T-ATTTG