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blockSeqs : . . . . . CA TAG . . . . TT . . T GT . . G . . . . . T AT . . T C A . . . GA
blockSeqs : . . . . . G G . . . . TT . . C GT . . C . . . . . T T . . T A T . . . G
blockSeqs : . . . . . G A . . . . TT . . . CT . . . . . . . . G T . . A . . . . . G
blockSeqs : . . . . . G C . . . . GT . . . CT . . . . . . . . G T . . T . . . . . C
blockSeqs : . . . . . G C . . . . GT . . . GC . . . . . . . . T C . . T . . . . . C
blockSeqs : . . . . . G A . . . . GT . . . CT . . . . . . . . G A . . C . . . . . G
blockSeqs : . . . . . G C . . . . TT . . . CT . . . . . . . . T T . . C . . . . . C
blockSeqs : . . . . . T C . . . . GT . . . CT . . . . . . . . A T . . C . . . . . C
blockSeqs : . . . . . G A . . . . GT . . . CT . . . . . . . . T T . . C . . . . . G
blockSeqs : . . . . . G A . . . . GT . . . AT . . . . . . . . T A . . T . . . . . C
blockSeqs : . . . . . G C . . . . TT . . . GC . . . . . . . . C T . . A . . . . . C
blockSeqs : . . . . . T A . . . . TT . . . GC . . . . . . . . G A . . T . . . . . G
blockSeqs : . . . . . . C . . . . T . . . CT . . . . . . . . T C . . C . . . . . G
blockSeqs : . . . . T . . . AA . . . . . . . . T C . . G . . . . . C
blockSeqs : . T . . . GC . . . . . . . . G A . . T . . . . . G
blockSeqs : . . . . C . . . . . . . . T C . . T . . . . . C
blockSeqs : . . . . . . . T . . C . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . C . . .
blockSeqs : . G . .
blockSeqCons :
originalCons : TGCCTGGTGA--GTCCC--TT--GGA--TCG-A-G----TTGCGAN---G-TT-GC--AAAAAGG-AT-TTGTAAAGG-G--TGCT--ANC-GT--T---G----AGCTTG--AG-C-G-C----CATT-TCC-T-TGGA----GAGGGAAGTTTGTTCCCTG------------ACAGGCG-G--GACCCAG---GAGAACCCCTATGGGTC-TT-GA-G-ACCGC
finalCons : TGCCTGGTGA--GTCCC--TT--GGA--TCG-A-G----TTGCGAN---G-TT-GC--AAAAAGG-AT-TTGTAAAGG-G--TGCT--ANC-GT--T---G----AGCTTG--AG-C-G-C----CATT-TCC-T-TGGA----GAGGGAAGTTTGTTCCCTG------------ACAGGCG-G--GACCCAG---GAGAACCCCTATGGGTC-TT-GA-G-ACCGC
Alignments
lowQualScore : 33 33 33 33 2 666666 9999 2 2 33 2 333 2 33 77 666 33 333 8888 22 2 2 2 4444 33 444 4444 999999999999 2 5 66 333 0 2 2 555
lowQualScore : .. .. .. .. . ...... .... . . .. . ... . .. .. ... .. ... .... .. . . . .... .. ... .... ............ . . .. ... . . . ...
lowQualScore : 77 77 77 77 7 111111 3333 5 5 44 4 111 2 11 55 666 11 999 7777 88 0 0 0 2222 44 444 2222 888888888888 4 7 44 555 3 2 2 666
consensus : TGCCTGGTGA--GTCCC--TT--GGA--TCG-A-G----TTGCGAN---G-TT-GC--AAAAAGG-AT-TTGTAAAGG-G--TGCT--ANC-GT--T---G----AGCTTG--AG-C-G-C----CATT-TCC-T-TGGA----GAGGGAAGTTTGTTCCCTG------------ACAGGCG-G--GACCCAG---GAGAACCCCTATGGGTC-TT-GA-G-ACCGC
Reference ( family-806 ) : TGCCTGGTGA--GTCCC--TT--GGA--TCG-A-G----TTGCGAN---G-TT-GC--AAAAAGG-AT-TTGTAAAGG-G--TGCT--ANC-GT--T---G----AGCTTG--AG-C-G-C----CATT-TCC-T-TGGA----GAGGGAAGTTTGTTCCCTG------------ACAGGCG-G--GACCCAG---GAGAACCCCTATGGGTC-TT-GA-G-ACCGC
gi|35718 : TGCCTGATGA--ATCCC--TT--GGA--TCG-A-G----TTACGAA---G-TT-GC--AAAAAGG-AT-TTGTAAAGG-G--TGCT--AGT-GT--T---G----AGCTTG--AG-T-G-C----CATT-TCC-T-TGGA----GAGGGAAGTTTGTTCCCTA------------ACAGGTG-G--GACCCAG---GAGAACCCCTATGGGTC-TT-GA-G-ACCGC
gi|35719 : TGCCTGATGA--ATTCC--TT--GG---TCG-CCA----TTACAAG---T-TT-GC--AAAAAGG-AT-TTGTAA-GG-G--TGCTT-AGT-GT--T---G----AGCTTG---G-T-G-C----CATT--CC-T-TGGA----GAGGGAACTTTGTCACCTA------------ACAGGTG-G--GACCCAG---GAGAACCTCTATGGGTC-TT-GA-G-ACCGC
gi|35720 : TGCCTGGTGA--ATTCC--TT--GGA--TCG-A-G----TTGCGAA---G-TT-GC--AAGAAGG-AT-TTGTAAAGG-G--TTCT--AGT-GT--T---G----AGCTTG--AG-C-G-C----CATT-TCC-T-TGGA----GAGGGAAGTTTGTTCCCTA------------ACAGGTG-G--GACTCAG---GAGAACCCCTATGGGTC-TT-GA-G-ACCGC
gi|35721 : TGCCTGGTGA--GTCCC--TT--GGA--TCG-A-G----TTGTAAC---G-TT-GC--AAGAAGG-AT-TTGTAAAGG-G--TTCT--ACT-GT--T---G----AGCTTG--AG-C-G-T----CATG-TCC-T-TGGA----GAGGGAAGTTTTTCCCCTG------------ATAGGTG-G--GACCCAG---GAGAACCCCTATGGGTC-TT-GA-C-ACCGC
gi|35722 : TGACTGGTGA--GTCCC--TT--GGA--TCG-A-G----TTGCGAC---G-TT-GC--AGAAAGA-AT-GTGCAAAGG-G--TGAT--ACT-GT--T---G----AACTTG--AG-C-G-C----CATG-TTC-C-TGGA----GAGGGAAGTTTGTTCCCTG------------GCAACAG-G--GTCCCAG---GAGAACCCCTATGGGTC-TT-GA-C-ACCGC
gi|35723 : TGCCTGGTGA--ATCCC--TT--GGG--TCG-A-G----TTGCGAA---G-TT-GC--AAGAAGG-AT-T-GTAAAGG-G--TGCT--AGC-GT--T---G----AGCTTG--AG-C-G-C----CATT-TCC-A-TGAA----GAATGAAGTTTGTTCCCTA------------ACAAGTG-A--GACCCAA---AAGAATCCCGATGGGTC-TT-GA-G-ACCG
gi|35724 : TGCCTAGGGA--GTATC--TT--AGA--TCA-A-G----TTGTGAC---T-TT-GC--AAGAA------------AGG-G--TGCT--GCT-GT--T---G----AGCTTG--AG-C-G-C----CATG-TCC-T-TGAA----GAGGGAAGTTTGTTCCCTG------------ACAGGTA-A--GATCCAG---GAAAACCCCTATGGGTC-CT-GA-C-AACGC
gi|35725 : TGCCTGGGTA--GTCCC--TT--GCA--TCT-A-G----TTGCGAC---A-TT-GC--AGAGAGG-AT-GTGTAAAGA-G--TGCT--ACT-GT--T---G----AACTTG--AG-C-G-C----C----------TGGA----GAGAGAAGTTTGTTTCCTG------------ACA-GCG-GA-GACCTAG---AAGAATTTCTATGGGTC-TT-GA-C-ACTGC
gi|35726 : TGCCTGGGTA--GTCC---TT--GCA--TAA-C-T----TTGCGAAACAG-TT-GC--AGAGAGG-AT-GTGTAA-GA-G--TGCTC-ACT-GT--T---G----AACT-G--AGTC-G-----------TCC-T--GGA----GAAG-AAGTT-GTTCC-TG------------ACA-GCGAA--GACCTAG---AA
gi|35727 : TGCCTGGTGA--A--CC--TT--G----TCG-A-G----TTG-GAA---G-T--GC--AAGAAGG-AGATTGTAAAGG----TGCT--ACT-GT--T---G----AGC-TG--AG-C-G-CGACGTATT-TCC-TGTGGA-------GGAAG-TTGTTCTCTA------------ACAGTC-----GACCCAG---GAGAA--CCTATGGGTCTTT-GAGG-ACCGC
gi|35728 : TGCCTGGTGACAATCCC--T----GA--T-G-A-G----GT-CGAA---G-TT-GC--AAAAG----T-TTGTAAAGGTG--TGCT--AAT-ATACT---GG---AGCCTG--AG-C-G-G----CGCA-TTC-T-TGGA----GAGGGAAGTTTA-TCCCTA------------AAAGTCGCG--GA-CCAG---GAGAACCC
gi|35729 : GCCTGGTGA--ATTCCCTTT--GGA--TCG-A------TTGCGATAG-G-TTAGCTAAAGAAGG-AT-T-GTAAAGG-G--TGCTTAAGC-GT--TTCAG----GGCTTGCAGG-CAG-A----C-TT-TCC-A-TGAG----GAGG-AAGTTTGTTCCCTA------------ACAGGTG-G--GACCCAA---AAGAATCCCGATGGGTC-TT-GA-GAACCGC
gi|35730 : CCTGGGGA--GTCC---TT--GGAATCCGTA-G----TTGTGAC---G-TT-GC--AGAGAGGGAT-GTGTAAAGG-G--CGCT--AACTGT--T---G----GACTTG--AG-C-G-T----CAGT-----T-TGG-------GGGAAGTT--TTCCCTG------------GCAGCAGAG--GACCC
gi|35731 : CTGGTGA--ATCC---TT--GGA--TCG-A-T----TTGCGAA---G-T------GAAGAGG-AT-T-GTAAAGG----TGCT--AGC-GT--T---G----AGCTTG--AG-C-G-C----CATC-TCC-A-TGAA----GA-GGAATTTTGTTCCCTA------------A-AGGTG-GATGA-CCAA---AAGAATCCAGAT-GGTC-TT-GA-G-ACC
gi|35732 : A--GTCCC--TTTGGAA--TCG-A-GCGTCTAGCGAC---GCTT-GC--AGAAAGA-AT-GTGACAAGG-GGGTGAT--A-C-GT--A---GGAAAACCTTG--AG-C-G-C----CATTGTTC-C-TGAAGGGCGAGGAAGGTTTGCTTCCCGTTCGACGAGGCAACAGACC-G--GTCCCAGTGAGAAAACCCCTATGCGTC-TT-GA-C-ACCGC
gi|35733 : -TT-AC--AGAGAGG-AT-GTGTAGATG-G--TGCT--ACT-GT--T---G----AACTTG--AG-C-G-C----CATG-TTC-C-TGGA----TAGGGAAGTTTGTTCCCTG------------GCAGCGG-G--GACCCAA---GAGAACTCTTATGGGTC-TT-GA-C-ACCGC
gi|35734 : G-AT-TTGTGAA------------AAA-AT--T---GC---AGCTTG--AA-C-G-C----CATT-TCCAT-TGAA----GCGGGAAGTTTGTTCCCTT------------ACAGGTG-G--GACCCAA---AAGAATCGCGATGGATC-TTGGA-G-ACCGC
gi|35735 : -TTGTAA-GG-G--TGCT--AGC-GT--T---G----AGCTTG--AG-C-GAC----CATT-TCC-A-TGGA----GAGG--AGTTTGTTCCCTA------------ACAGGTG-G--GACCAAA---GAGAA-CCCGATGGGTG-TT-GA-G-ACCGC
gi|35736 : ----AACTTG--AA-C-G-C----CATG-TTC-C-TGGA----GAGGGAAGCTTGTTCCCTG------------GCA-GCG-GT-GACCCCA---GAGAGCTCCTGTGGGTC-TT-GA-C-ATCGC
gi|35737 : CTTG--AG-C-G-C----GATT-TCC-T-TGGA----GAGGGAAGT--G------A------------ACAGTCG-G--GACCCAG---GAGAACACTTATGGGTC-TT-GA-G-ACCAC
gi|35738 : TTTGTTTCTTG------------GCAGCGG-G--GACCCAG---GAGAATTCTTATAGGTA-TT-GA-C-ACCAC