lowQualScore : 1 11111111 1 333333333
lowQualScore : 9 2 2 2 2 55 2 2 2 5 2 66 2 2 2 33 2 2 2 2 2 33 2 2 2 6 1 2 99 22222222 2 2 2 0 5555 2 666666666 77 5 2 2 33 3 3
lowQualScore : . . . . . .. . . . . . .. . . . .. . . . . . .. . . . . . . .. ........ . . . . .... . ......... .. . . . .. . .
lowQualScore : 7 2 2 2 2 33 2 2 2 3 2 55 4 4 4 22 4 4 4 4 4 22 2 2 2 7 1 2 77 22222222 7 7 7 7 7777 7 888888888 99 7 9 9 99 3 6
consensus : AACTACAAGTA-AATA-A-AATGC-AG--A-TA-TGAA-TGTCCTAT-TGGT--GT-TTT-GT-TTT--GTG-TTGC-AT-AT-G-CACA--ATTATTCCCTTC-T-C-ATA-TG-T-T--GGCTTAAAC----C---GATCC-AGG-TAAGTG-TTCAA-CGTT----C-CTAGT---------C--AGTTTCG-AAT-TT-G--TTCTG-TT-CTTT
Reference ( gi|100086 ) : AAATACAAGTA-AATA-A-AATGC-AG--A-TA-TGAA-TGCCCTAT-TGGT--GT-TTT-GT-TTT--GTG-TTGC-AT-AT-G-CACA--ATTATTCCCTTC-T-C-ATA-TG-T-T--GGCTTAAAC----C---GATCC-AGG-TAAGTG-TTCAA-CGTT----C-CTAGT---------C--AGTTTCG-AAT-TT-G--TTCTG-TT-CTTT
gi|100085 : AACTGCAAGTA-AATA-A-AATGC-AG--A-TA-TGAA-TGTCCTAT-TGGT--GT-TTT-TTCTTT--GTG-TTGC-AT-AT-G-CACA--ATTATTCCCTTC-T-C-ATA-TG-T-TT-GGCTTAAAC----A---GATCC-AGG-TAAGTG-TTCAA-CGTT----C-CTAGT---------C--AGTTTCG-AAT-TT-G--TTCTG-TT-CTTT
gi|100088 : AACTACAAGTA-AATA-A-AATGC-AG--A-TA-TGAA-TGTCCTAT-TGGT--GT-TTT-GT-TTT--GTG-TTCC-AT-AT-G-CACA--ATTATTCCCTTT-T-C-ATA-TGTT-T--GCCTTAAAT----G---GATCC-AGG-TAAGTT-TTCAA-CGTT----C-CTAGTGAGTAGTCAC--AGTTTCG-AAT-TT-G--TTCTG-TT-TTTT
gi|100087 : AACTACAAGTC-AATA-A-AATGC-AG--A-TA-TGAA-TGCCCTAT-TGGT--GT-TTT-GT-TTT--GTG-TTGC-A--AT-G--ACAACATTATTCCCTTC-T-CTATA-TG-T-T--GGCTTAAAC----C---GATCA-AGG-TAAGTG-TTCAATCGTT----C-CTAGT---------C--AGTTT-G-AAT-TTGG--TTCTG-TT-CTTT
gi|100089 : AACTACAA-TA-AATA-ATAATGC-AG--A-TA-TGAA-TGTCCTAT-TGGT--GT-TTTTGT-TTT--GTG-TTGCGAT-ATTG-CACA--ATTATTCC-TTC-T-C-ATA-TG-T-TT-GGCTTAA------C---AATCC-AGG-TAAGTG-TTCAA-CGTT----C-CTAGT---------CATAGTTTCG-AAT-TT-G--TTCTG-TT-CTTT
gi|100090 : AACTACAAGTA-AATA-A-AATGC-AG--A-TA-TGAA-TGTCCTAT-TTGT--G--TTT-GT-TTT--G-G-TTGC-AT-AT-GCCACA--ATTATTCCCTTC-T-C-ATA-TGTT-T--GGCTTAAAC----A---GATCC-AGGTTAAG-G-TTCAA-CTTT----C-CTAGTCA-------C--AGTTTCG-AAT-TT-G--TTC
gi|100092 : AACTACAAGTA-AATA-A-AATGC-GG--A-CA-TGAA-TGTCCTAT-TCGT--GT-TTT-TT-TTT------TTGT-GT--T-G-CACA--ATTATTCCTTTC-T-C-ATG-T--T-T--GGCTTACAC----A---GACCC-AGG-TAAGTG-CTCAATCGTCCGGGC-CGAGT---------CGTAACTTTGTTAT-TT-G--TTTT
gi|100094 : AACTACGGGTA-AATA-A-AATGC-AG--A-TA-TGAA-TGTCCTAT-
gi|100093 : AACACAAGGA-AATA-A-A-TTC-AGG-A-TA-TGAA-TTTCCTAT-TTGT--GT-TTT-GT-TTG--GCA-TT---AT-GT-A-CA-A--ATTATTCCCTTC-T-C-ATA--G-T-T--GGCTTAAAC----C---GATCC-ATG-TAAGTG-TCAAA-ACTT----C-CTAGT---------C--A--TTCG--AT-TT-GTCTTCTA-T
gi|100091 : ATACAAGTA-AA-A-A-AATGC-AG--A-TA-TGAATTG--CTAT-TGGTTGGT-TTT-GT-TTT--GTG-TTGC-AT-AT-G-AACA--ATTATTCCCTTCTT-C-ATACTG-TGT--GG-TTAAAC----C---GATCCAAGA-TAAATG-TTCAAGCGTT----C-CTAGT---------C--AG-TTCG-AATGTT-G--TTCTT-GT-CTTT
gi|100095 : aacTACAAGTA-AATA-A-AATGC-AG--A-TA-TGAA-TCTCCTAT-TGGT--GT-TTT-GT-TTT--GTG-TTGC-AT-AT-G-CACA--ATTATTCCCCTC-T-C-ATA-TGTT-T--GGCTTAAAC----A---GATCC-ATA-TAAGTG-TCCAA-TGTT----C-CCAGTCGTCA----C--AGTTTCG-AAT-TT-G--TTCTG-TT-GTTT
gi|100096 : TACAAGTA-CATA-A-AATGC-AG--A-TA-TGAA-TGTCTAAT-TGGT--GT-TTT-GT-TTT--GTG-TTGC-AT-AT-G-CACA--ATTATTCCCTTC-T-C-ATA-TGTT-T--GGTTTAAAC----A---GAATC-AGG-TAAGTG-TTCAA-TGCT----C-CGAGTCGTCA----C--AGTTTCG-AAT-TT-G--T--TG-TT-GTTT
gi|100098 : TATAAGTC-ATTA-A-AGTGC-AA--A-TA-TGAA-AGCGATAT-CGGT--GT-TTT-GT-TTT--GTG-TTCC-TT-TT-G-CACG--ATTATTTCCCAC-A-C-GTATTG-T-T----TTTGAAA----C---AATC
gi|100097 : TACAAGTA-AATA-A-AATAC-AG--A-TATTGAA-TGTCGTATCTGGT--GTGTTT-G--TTT--GTGTTTGC-ATGAT-G-CA
gi|100099 : TATAAGTA-ATTA-A-AATGC-AG--T-TA-T----------AT-TGGT--TC-GTT-AT-TTT--GTG-TTCC-AT-TT-A-CATG--ATTATTTCCCCC-A-C-GTA-TT-T-T--
gi|100100 : TATAAGTA-ATTA-A-AATGC-AG--T-TA-T----------AT-TGGTTCGT-TAT-TT-TTT--GTG-TTCC-AT-TT-A-CATG--ATTATTTCCCCC-A-C-GTA-TT-T-T--ttgcaaagatggtaa
gi|100101 : ACAAGTA-AATAGA-AATGC-AGCGACTA-TAAA-TGCC-TAT-TGGT--GT-TTT-GT-TTT--GTG-TTGC-AT-AT-G-CACA--ATTATTCCCTTC-TCC-ATATTG-T-T--GGCTTAA------C---GATCC-AGG-TATGTGTTTCAA-C-CT----C-CTAGT---------C--AGTTTCG-CAT-TT-G--TTCTGCTT-CTttgcaaagatggtaa
gi|100102 : ACAAATATAATA-A-AATGCCAG--A-TT-CGAA--GCCCTAT-TGGT--GT-TTT-GT-TTTTTGTG-TTGC-AT-AC-G-CACA---TTATTCTCTTC-T-C-ATA-TG-T-T--GGCTTAAA-----C---GAT-C-AGG-TAAGTG-TTC-A-CGTT----CTCTAGT---------C--AGTTTCGAAAT-TT-G--TTCTG-TTACTT
gi|100103 : AAATA-AATA-A-AATGC-AG--A-CA-TGAA-TGTCCTAT-CGGT--GT-TTT-GT-TTT--GTG-TTGC-AT-AT-G-CACA--ATTATTCCCTTC-T-C-ATA-TGTT-T--GGCTTACAC----A---GACCC-AGG-TAAGTG-CTCAATCGTC----C-
gi|100104 : ACA--ATTATTCCCTTC-T-C-ATA-TG-T-TT-GGCTTTAAC----A---GATCC-AGG-TAAGTG-TTCAA-CATT----C-CTAGT---------C--AGTTTCG-AAT-TT-G--TTCTG-TT-CTTT
gi|100105 : TTGTTCCCTTC-T-C-ATA-TG-T-TTTGGCTTAAACAATCCAGAGATCC-AGG-TAAGTG-TTCAA-TGTT----T-CGAGTCGTCG----C--AGTTTCA-AA--TT-G--TTCTG-TT-GTTT
Alignments
lowQualScore : 1 11111111 1 333333333
lowQualScore : 2 2 2 2 2 55 2 2 2 66 2 2 2 33 2 2 333 2 33 2 2 2 6 2 2 77 00000000 2 2 2 0 5555 2 444444444 77 5 2 2 33 3 3
lowQualScore : . . . . . .. . . . .. . . . .. . . ... . .. . . . . . . .. ........ . . . . .... . ......... .. . . . .. . .
lowQualScore : 5 1 1 1 1 00 1 1 1 11 2 2 2 11 2 2 333 2 11 1 1 1 3 6 1 11 99999999 5 5 5 0 3333 5 333333333 33 3 7 7 77 1 3
consensus : AAC-TACAAGTA-AATA-A-AATGC-AG--A-TA-TGAATGTCCTAT-TGGT--G-T-TTTGT-TTT--GTG-TTGC-AT-A-TG-CACA--ATTATTCCCTTC-T-C-ATA-TG-T-T--GGCTTAAAC----C---GATCC-AGG-TAAGTG-TTCAA-CGTT----C-CTAGT---------C--AGTTTCG-AAT-TT-G--TTCTG-TT-CTTT
Reference ( family-802 ) : AAC-TACAAGTA-AATA-A-AATGC-AG--A-TA-TGAATGTCCTAT-TGGT--G-T-TTTGT-TTT--GTG-TTGC-AT-A-TG-CACA--ATTATTCCCTTC-T-C-ATA-TG-T-T--GGCTTAAAC----C---GATCC-AGG-TAAGTG-TTCAA-CGTT----C-CTAGT---------C--AGTTTCG-AAT-TT-G--TTCTG-TT-CTTT
gi|100085 : AAC-TGCAAGTA-AATA-A-AATGC-AG--A-TA-TGAATGTCCTAT-TGGT--G-T-TTTTTCTTT--GTG-TTGC-AT-A-TG-CACA--ATTATTCCCTTC-T-C-ATA-TG-T-TT-GGCTTAAAC----A---GATCC-AGG-TAAGTG-TTCAA-CGTT----C-CTAGT---------C--AGTTTCG-AAT-TT-G--TTCTG-TT-CTTT
gi|100086 : AAA-TACAAGTA-AATA-A-AATGC-AG--A-TA-TGAATGCCCTAT-TGGT--G-T-TTTGT-TTT--GTG-TTGC-AT-A-TG-CACA--ATTATTCCCTTC-T-C-ATA-TG-T-T--GGCTTAAAC----C---GATCC-AGG-TAAGTG-TTCAA-CGTT----C-CTAGT---------C--AGTTTCG-AAT-TT-G--TTCTG-TT-CTTT
gi|100087 : AAC-TACAAGTC-AATA-A-AATGC-AG--A-TA-TGAATGCCCTAT-TGGT--G-T-TTTGT-TTT--GTG-TTGC-A--A-TG--ACAACATTATTCCCTTC-T-CTATA-TG-T-T--GGCTTAAAC----C---GATCA-AGG-TAAGTG-TTCAATCGTT----C-CTAGT---------C--AGTTT-G-AAT-TTGG--TTCTG-TT-CTTT
gi|100088 : AAC-TACAAGTA-AATA-A-AATGC-AG--A-TA-TGAATGTCCTAT-TGGT--G-T-TTTGT-TTT--GTG-TTCC-AT-A-TG-CACA--ATTATTCCCTTT-T-C-ATA-TGTT-T--GCCTTAAAT----G---GATCC-AGG-TAAGTT-TTCAA-CGTT----C-CTAGTGAGTAGTCAC--AGTTTCG-AAT-TT-G--TTCTG-TT-TTTT
gi|100089 : AAC-TACAA-TA-AATA-ATAATGC-AG--A-TA-TGAATGTCCTAT-TGGT--GTT-TTTGT-TTT--GTG-TTGCGAT-ATTG-CACA--ATTATT-CCTTC-T-C-ATA-TGTT-T--GGCTTAA------C---AATCC-AGG-TAAGTG-TTCAA-CGTT----C-CTAGT---------CATAGTTTCG-AAT-TT-G--TTCTG-TT-CTTT
gi|100090 : AAC-TACAAGTA-AATA-A-AATGC-AG--A-TA-TGAATGTCCTAT-TTGT--G---TTTGT-TTT--G-G-TTGC-AT-A-TGCCACA--ATTATTCCCTTC-T-C-ATA-TGTT-T--GGCTTAAAC----A---GATCC-AGGTTAAG-G-TTCAA-CTTT----C-CTAGTCA-------C--AGTTTCG-AAT-TT-G--TTC
gi|100091 : AACATACAAGTA-AA-A-A-AATGC-AG--A-TA-TGAAT-TGCTAT-TGGTTGG-T-TTTGT-TTT--GTG-TTGC-AT-A-TG-AACA--ATTATTCCCTTCTT-C-ATACTG-TGT--GG-TTAAAC----C---GATCCAAGA-TAAATG-TTCAAGCGTT----C-CTAGT---------C--AG-TTCG-AATGTT-G--TTCTT-GT-CTTT
gi|100092 : AAC-TACAAGTA-AATA-A-AATGC-GG--A-CA-TGAATGTCCTAT-TCGT--G-T-TTTTT-TTT------TTGT-GT---TG-CACA--ATTATTCCTTTC-T-C-ATG-T--T-T--GGCTTACAC----A---GACCC-AGG-TAAGTG-CTCAATCGTCCGGGC-CGAGT---------CGTAACTTTGTTAT-TT-G--TTTT
gi|100093 : AAC--ACAAGGA-AATA-A-A-TTC-AGG-A-TA-TGAATTTCCTAT-TTGT--G-T-TTTGT-TTG--GCA-TT---AT-G-TA-CA-A--ATTATTCCCTTC-T-C-ATA--G-T-T--GGCTTAAAC----C---GATCC-ATG-TAAGTG-TCAAA-ACTT----C-CTAGT---------C--A--TTCG--AT-TT-GTCTTCTA-T
gi|100094 : AAC-TACGGGTA-AATA-A-AATGC-AG--A-TA-TGAATGTCCTAT-
gi|100095 : -TACAAGTA-AATA-A-AATGC-AG--A-TA-TGAATCTCCTAT-TGGT--G-T-TTTGT-TTT--GTG-TTGC-AT-A-TG-CACA--ATTATTCCCCTC-T-C-ATA-TGTT-T--GGCTTAAAC----A---GATCC-ATA-TAAGTG-TCCAA-TGTT----C-CCAGTCGTCA----C--AGTTTCG-AAT-TT-G--TTCTG-TT-GTTT
gi|100096 : -TACAAGTA-CATA-A-AATGC-AG--A-TA-TGAATGTCTAAT-TGGT--G-T-TTTGT-TTT--GTG-TTGC-AT-A-TG-CACA--ATTATTCCCTTC-T-C-ATA-TGTT-T--GGTTTAAAC----A---GAATC-AGG-TAAGTG-TTCAA-TGCT----C-CGAGTCGTCA----C--AGTTTCG-AAT-TT-G--T--TG-TT-GTTT
gi|100097 : -TACAAGTA-AATA-A-AATAC-AG--A-TATTGAATGTCGTATCTGGT--G-TGTTTG--TTT--GTGTTTGC-ATGA-TG-CA
gi|100098 : -TATAAGTC-ATTA-A-AGTGC-AA--A-TA-TGAAAGCGATAT-CGGT--G-T-TTTGT-TTT--GTG-TTCC-TT-T-TG-CACG--ATTATTTCCCAC-A-C-GTATTG-T-T----TTTGAAA----C---AATC
gi|100099 : -TATAAGTA-ATTA-A-AATGC-AG--T-TA-T---------AT-TGGT--T-C-GTTAT-TTT--GTG-TTCC-AT-T-TA-CATG--ATTATTTCCCCC-A-C-GTA-TT-T-T--
gi|100100 : -TATAAGTA-ATTA-A-AATGC-AG--T-TA-T---------AT-TGGTTCG-T-TATTT-TTT--GTG-TTCC-AT-T-TA-CATG--ATTATTTCCCCC-A-C-GTA-TT-T-T--ttgcaaagatggtaa
gi|100101 : ACAAGTA-AATAGA-AATGC-AGCGACTA-TAAATG-CCTAT-TGGT--G-T-TTTGT-TTT--GTG-TTGC-AT-A-TG-CACA--ATTATTCCCTTC-TCC-ATATTG-T-T--GGCTTAA------C---GATCC-AGG-TATGTGTTTCAA-C-CT----C-CTAGT---------C--AGTTTCG-CAT-TT-G--TTCTGCTT-CTttgcaaagatggtaa
gi|100102 : ACAAATATAATA-A-AATGCCAG--A-TT-CGAA-GCCCTAT-TGGT--G-T-TTTGT-TTTTTGTG-TTGC-AT-A-CG-CACA---TTATTCTCTTC-T-C-ATA-TG-T-T--GGCTTAAA-----C---GAT-C-AGG-TAAGTG-TTC-A-CGTT----CTCTAGT---------C--AGTTTCGAAAT-TT-G--TTCTG-TTACTT
gi|100103 : AAATA-AATA-A-AATGC-AG--A-CA-TGAATGTCCTAT-CGGT--G-T-TTTGT-TTT--GTG-TTGC-AT-A-TG-CACA--ATTATTCCCTTC-T-C-ATA-TGTT-T--GGCTTACAC----A---GACCC-AGG-TAAGTG-CTCAATCGTC----C-
gi|100104 : ACA--ATTATTCCCTTC-T-C-ATA-TG-T-TT-GGCTTTAAC----A---GATCC-AGG-TAAGTG-TTCAA-CATT----C-CTAGT---------C--AGTTTCG-AAT-TT-G--TTCTG-TT-CTTT
gi|100105 : TTGTTCCCTTC-T-C-ATA-TG-T-TTTGGCTTAAACAATCCAGAGATCC-AGG-TAAGTG-TTCAA-TGTT----T-CGAGTCGTCG----C--AGTTTCA-AA--TT-G--TTCTG-TT-GTTT
Alignments
lowQualScore : 1 11111111 1 333333333
lowQualScore : 2 2 2 2 2 55 2 2 2 66 2 2 2 33 2 2 333 2 33 2 2 2 6 2 2 77 00000000 2 2 2 0 5555 2 444444444 77 5 2 2 33 3 3
lowQualScore : . . . . . .. . . . .. . . . .. . . ... . .. . . . . . . .. ........ . . . . .... . ......... .. . . . .. . .
lowQualScore : 5 1 1 1 1 00 1 1 1 11 2 2 2 11 2 2 333 2 11 1 1 1 3 6 1 11 99999999 5 5 5 0 3333 5 333333333 33 3 7 7 77 1 3
consensus : AAC-TACAAGTA-AATA-A-AATGC-AG--A-TA-TGAATGTCCTAT-TGGT--G-T-TTTGT-TTT--GTG-TTGC-AT-A-TG-CACA--ATTATTCCCTTC-T-C-ATA-TG-T-T--GGCTTAAAC----C---GATCC-AGG-TAAGTG-TTCAA-CGTT----C-CTAGT---------C--AGTTTCG-AAT-TT-G--TTCTG-TT-CTTT
Reference ( family-802 ) : AAC-TACAAGTA-AATA-A-AATGC-AG--A-TA-TGAATGTCCTAT-TGGT--G-T-TTTGT-TTT--GTG-TTGC-AT-A-TG-CACA--ATTATTCCCTTC-T-C-ATA-TG-T-T--GGCTTAAAC----C---GATCC-AGG-TAAGTG-TTCAA-CGTT----C-CTAGT---------C--AGTTTCG-AAT-TT-G--TTCTG-TT-CTTT
gi|100085 : AAC-TGCAAGTA-AATA-A-AATGC-AG--A-TA-TGAATGTCCTAT-TGGT--G-T-TTTTTCTTT--GTG-TTGC-AT-A-TG-CACA--ATTATTCCCTTC-T-C-ATA-TG-T-TT-GGCTTAAAC----A---GATCC-AGG-TAAGTG-TTCAA-CGTT----C-CTAGT---------C--AGTTTCG-AAT-TT-G--TTCTG-TT-CTTT
gi|100086 : AAA-TACAAGTA-AATA-A-AATGC-AG--A-TA-TGAATGCCCTAT-TGGT--G-T-TTTGT-TTT--GTG-TTGC-AT-A-TG-CACA--ATTATTCCCTTC-T-C-ATA-TG-T-T--GGCTTAAAC----C---GATCC-AGG-TAAGTG-TTCAA-CGTT----C-CTAGT---------C--AGTTTCG-AAT-TT-G--TTCTG-TT-CTTT
gi|100087 : AAC-TACAAGTC-AATA-A-AATGC-AG--A-TA-TGAATGCCCTAT-TGGT--G-T-TTTGT-TTT--GTG-TTGC-A--A-TG--ACAACATTATTCCCTTC-T-CTATA-TG-T-T--GGCTTAAAC----C---GATCA-AGG-TAAGTG-TTCAATCGTT----C-CTAGT---------C--AGTTT-G-AAT-TTGG--TTCTG-TT-CTTT
gi|100088 : AAC-TACAAGTA-AATA-A-AATGC-AG--A-TA-TGAATGTCCTAT-TGGT--G-T-TTTGT-TTT--GTG-TTCC-AT-A-TG-CACA--ATTATTCCCTTT-T-C-ATA-TGTT-T--GCCTTAAAT----G---GATCC-AGG-TAAGTT-TTCAA-CGTT----C-CTAGTGAGTAGTCAC--AGTTTCG-AAT-TT-G--TTCTG-TT-TTTT
gi|100089 : AAC-TACAA-TA-AATA-ATAATGC-AG--A-TA-TGAATGTCCTAT-TGGT--GTT-TTTGT-TTT--GTG-TTGCGAT-ATTG-CACA--ATTATT-CCTTC-T-C-ATA-TGTT-T--GGCTTAA------C---AATCC-AGG-TAAGTG-TTCAA-CGTT----C-CTAGT---------CATAGTTTCG-AAT-TT-G--TTCTG-TT-CTTT
gi|100090 : AAC-TACAAGTA-AATA-A-AATGC-AG--A-TA-TGAATGTCCTAT-TTGT--G---TTTGT-TTT--G-G-TTGC-AT-A-TGCCACA--ATTATTCCCTTC-T-C-ATA-TGTT-T--GGCTTAAAC----A---GATCC-AGGTTAAG-G-TTCAA-CTTT----C-CTAGTCA-------C--AGTTTCG-AAT-TT-G--TTC
gi|100091 : AACATACAAGTA-AA-A-A-AATGC-AG--A-TA-TGAAT-TGCTAT-TGGTTGG-T-TTTGT-TTT--GTG-TTGC-AT-A-TG-AACA--ATTATTCCCTTCTT-C-ATACTG-TGT--GG-TTAAAC----C---GATCCAAGA-TAAATG-TTCAAGCGTT----C-CTAGT---------C--AG-TTCG-AATGTT-G--TTCTT-GT-CTTT
gi|100092 : AAC-TACAAGTA-AATA-A-AATGC-GG--A-CA-TGAATGTCCTAT-TCGT--G-T-TTTTT-TTT------TTGT-GT---TG-CACA--ATTATTCCTTTC-T-C-ATG-T--T-T--GGCTTACAC----A---GACCC-AGG-TAAGTG-CTCAATCGTCCGGGC-CGAGT---------CGTAACTTTGTTAT-TT-G--TTTT
gi|100093 : AAC--ACAAGGA-AATA-A-A-TTC-AGG-A-TA-TGAATTTCCTAT-TTGT--G-T-TTTGT-TTG--GCA-TT---AT-G-TA-CA-A--ATTATTCCCTTC-T-C-ATA--G-T-T--GGCTTAAAC----C---GATCC-ATG-TAAGTG-TCAAA-ACTT----C-CTAGT---------C--A--TTCG--AT-TT-GTCTTCTA-T
gi|100094 : AAC-TACGGGTA-AATA-A-AATGC-AG--A-TA-TGAATGTCCTAT-
gi|100095 : -TACAAGTA-AATA-A-AATGC-AG--A-TA-TGAATCTCCTAT-TGGT--G-T-TTTGT-TTT--GTG-TTGC-AT-A-TG-CACA--ATTATTCCCCTC-T-C-ATA-TGTT-T--GGCTTAAAC----A---GATCC-ATA-TAAGTG-TCCAA-TGTT----C-CCAGTCGTCA----C--AGTTTCG-AAT-TT-G--TTCTG-TT-GTTT
gi|100096 : -TACAAGTA-CATA-A-AATGC-AG--A-TA-TGAATGTCTAAT-TGGT--G-T-TTTGT-TTT--GTG-TTGC-AT-A-TG-CACA--ATTATTCCCTTC-T-C-ATA-TGTT-T--GGTTTAAAC----A---GAATC-AGG-TAAGTG-TTCAA-TGCT----C-CGAGTCGTCA----C--AGTTTCG-AAT-TT-G--T--TG-TT-GTTT
gi|100097 : -TACAAGTA-AATA-A-AATAC-AG--A-TATTGAATGTCGTATCTGGT--G-TGTTTG--TTT--GTGTTTGC-ATGA-TG-CA
gi|100098 : -TATAAGTC-ATTA-A-AGTGC-AA--A-TA-TGAAAGCGATAT-CGGT--G-T-TTTGT-TTT--GTG-TTCC-TT-T-TG-CACG--ATTATTTCCCAC-A-C-GTATTG-T-T----TTTGAAA----C---AATC
gi|100099 : -TATAAGTA-ATTA-A-AATGC-AG--T-TA-T---------AT-TGGT--T-C-GTTAT-TTT--GTG-TTCC-AT-T-TA-CATG--ATTATTTCCCCC-A-C-GTA-TT-T-T--
gi|100100 : -TATAAGTA-ATTA-A-AATGC-AG--T-TA-T---------AT-TGGTTCG-T-TATTT-TTT--GTG-TTCC-AT-T-TA-CATG--ATTATTTCCCCC-A-C-GTA-TT-T-T--ttgcaaagatggtaa
gi|100101 : ACAAGTA-AATAGA-AATGC-AGCGACTA-TAAATG-CCTAT-TGGT--G-T-TTTGT-TTT--GTG-TTGC-AT-A-TG-CACA--ATTATTCCCTTC-TCC-ATATTG-T-T--GGCTTAA------C---GATCC-AGG-TATGTGTTTCAA-C-CT----C-CTAGT---------C--AGTTTCG-CAT-TT-G--TTCTGCTT-CTttgcaaagatggtaa
gi|100102 : ACAAATATAATA-A-AATGCCAG--A-TT-CGAA-GCCCTAT-TGGT--G-T-TTTGT-TTTTTGTG-TTGC-AT-A-CG-CACA---TTATTCTCTTC-T-C-ATA-TG-T-T--GGCTTAAA-----C---GAT-C-AGG-TAAGTG-TTC-A-CGTT----CTCTAGT---------C--AGTTTCGAAAT-TT-G--TTCTG-TTACTT
gi|100103 : AAATA-AATA-A-AATGC-AG--A-CA-TGAATGTCCTAT-CGGT--G-T-TTTGT-TTT--GTG-TTGC-AT-A-TG-CACA--ATTATTCCCTTC-T-C-ATA-TGTT-T--GGCTTACAC----A---GACCC-AGG-TAAGTG-CTCAATCGTC----C-
gi|100104 : ACA--ATTATTCCCTTC-T-C-ATA-TG-T-TT-GGCTTTAAC----A---GATCC-AGG-TAAGTG-TTCAA-CATT----C-CTAGT---------C--AGTTTCG-AAT-TT-G--TTCTG-TT-CTTT
gi|100105 : TTGTTCCCTTC-T-C-ATA-TG-T-TTTGGCTTAAACAATCCAGAGATCC-AGG-TAAGTG-TTCAA-TGTT----T-CGAGTCGTCG----C--AGTTTCA-AA--TT-G--TTCTG-TT-GTTT
blockSeqs : A T G T C CG C T C TG T G . TT T G AT C AC T C T C T G TT AATCCAGA A T T T CGGG T GAGTAGTCA AT T G G TC C A
blockSeqs : . . . . . G . . . TC . . . . . . GA . . . . . T T . T C . . . G . . CGTCA GT A . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . T T . . C . . . T . . CGTCA . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . T . . G . . . T . . CGTCG . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . T . . C . . . . . . CA . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . T . . A . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . A . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . A
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqCons : **
originalCons : AAC-TACAAGTA-AATA-A-AATGC-AG--A-TA-TGAATGTCCTAT-TGGT--G-T-TTTGT-TTT--GTG-TTGC-AT-A-TG-CACA--ATTATTCCCTTC-T-C-ATA-TG-T-T--GGCTTAAAC----C---GATCC-AGG-TAAGTG-TTCAA-CGTT----C-CTAGT---------C--AGTTTCG-AAT-TT-G--TTCTG-TT-CTTT
finalCons : AAC-TACAAGTA-AATA-A-AATGC-AG--A-TA-TGAATGTCCTAT-TGGT--G-T-TTTGT-TTT--GTG-TTGC-AT-A-TG-CACA--ATTATTCCCTTC-T-C-ATA-TG-T-T--GGCTTAAAC----C---GATCC-AGG-TAAGTG-TTCAA-CGTT----C-CTAGT---------C--AGTTTCG-AAT-TT-G--TTCTG-TT-CTTT
Alignments
lowQualScore : 1 11111111 1 333333333
lowQualScore : 2 2 2 2 2 55 2 2 2 66 2 2 2 33 2 2 333 2 33 2 2 2 6 2 2 77 00000000 2 2 2 0 5555 2 444444444 77 5 2 2 33 3 3
lowQualScore : . . . . . .. . . . .. . . . .. . . ... . .. . . . . . . .. ........ . . . . .... . ......... .. . . . .. . .
lowQualScore : 5 1 1 1 1 00 1 1 1 11 2 2 2 11 2 2 333 2 11 1 1 1 3 6 1 11 99999999 5 5 5 0 3333 5 333333333 33 3 7 7 77 1 3
consensus : AAC-TACAAGTA-AATA-A-AATGC-AG--A-TA-TGAATGTCCTAT-TGGT--G-T-TTTGT-TTT--GTG-TTGC-AT-A-TG-CACA--ATTATTCCCTTC-T-C-ATA-TG-T-T--GGCTTAAAC----C---GATCC-AGG-TAAGTG-TTCAA-CGTT----C-CTAGT---------C--AGTTTCG-AAT-TT-G--TTCTG-TT-CTTT
Reference ( family-802 ) : AAC-TACAAGTA-AATA-A-AATGC-AG--A-TA-TGAATGTCCTAT-TGGT--G-T-TTTGT-TTT--GTG-TTGC-AT-A-TG-CACA--ATTATTCCCTTC-T-C-ATA-TG-T-T--GGCTTAAAC----C---GATCC-AGG-TAAGTG-TTCAA-CGTT----C-CTAGT---------C--AGTTTCG-AAT-TT-G--TTCTG-TT-CTTT
gi|100085 : AAC-TGCAAGTA-AATA-A-AATGC-AG--A-TA-TGAATGTCCTAT-TGGT--G-T-TTTTTCTTT--GTG-TTGC-AT-A-TG-CACA--ATTATTCCCTTC-T-C-ATA-TG-T-TT-GGCTTAAAC----A---GATCC-AGG-TAAGTG-TTCAA-CGTT----C-CTAGT---------C--AGTTTCG-AAT-TT-G--TTCTG-TT-CTTT
gi|100086 : AAA-TACAAGTA-AATA-A-AATGC-AG--A-TA-TGAATGCCCTAT-TGGT--G-T-TTTGT-TTT--GTG-TTGC-AT-A-TG-CACA--ATTATTCCCTTC-T-C-ATA-TG-T-T--GGCTTAAAC----C---GATCC-AGG-TAAGTG-TTCAA-CGTT----C-CTAGT---------C--AGTTTCG-AAT-TT-G--TTCTG-TT-CTTT
gi|100087 : AAC-TACAAGTC-AATA-A-AATGC-AG--A-TA-TGAATGCCCTAT-TGGT--G-T-TTTGT-TTT--GTG-TTGC-A--A-TG--ACAACATTATTCCCTTC-T-CTATA-TG-T-T--GGCTTAAAC----C---GATCA-AGG-TAAGTG-TTCAATCGTT----C-CTAGT---------C--AGTTT-G-AAT-TTGG--TTCTG-TT-CTTT
gi|100088 : AAC-TACAAGTA-AATA-A-AATGC-AG--A-TA-TGAATGTCCTAT-TGGT--G-T-TTTGT-TTT--GTG-TTCC-AT-A-TG-CACA--ATTATTCCCTTT-T-C-ATA-TGTT-T--GCCTTAAAT----G---GATCC-AGG-TAAGTT-TTCAA-CGTT----C-CTAGTGAGTAGTCAC--AGTTTCG-AAT-TT-G--TTCTG-TT-TTTT
gi|100089 : AAC-TACAA-TA-AATA-ATAATGC-AG--A-TA-TGAATGTCCTAT-TGGT--GTT-TTTGT-TTT--GTG-TTGCGAT-ATTG-CACA--ATTATT-CCTTC-T-C-ATA-TGTT-T--GGCTTAA------C---AATCC-AGG-TAAGTG-TTCAA-CGTT----C-CTAGT---------CATAGTTTCG-AAT-TT-G--TTCTG-TT-CTTT
gi|100090 : AAC-TACAAGTA-AATA-A-AATGC-AG--A-TA-TGAATGTCCTAT-TTGT--G---TTTGT-TTT--G-G-TTGC-AT-A-TGCCACA--ATTATTCCCTTC-T-C-ATA-TGTT-T--GGCTTAAAC----A---GATCC-AGGTTAAG-G-TTCAA-CTTT----C-CTAGTCA-------C--AGTTTCG-AAT-TT-G--TTC
gi|100091 : AACATACAAGTA-AA-A-A-AATGC-AG--A-TA-TGAAT-TGCTAT-TGGTTGG-T-TTTGT-TTT--GTG-TTGC-AT-A-TG-AACA--ATTATTCCCTTCTT-C-ATACTG-TGT--GG-TTAAAC----C---GATCCAAGA-TAAATG-TTCAAGCGTT----C-CTAGT---------C--AG-TTCG-AATGTT-G--TTCTT-GT-CTTT
gi|100092 : AAC-TACAAGTA-AATA-A-AATGC-GG--A-CA-TGAATGTCCTAT-TCGT--G-T-TTTTT-TTT------TTGT-GT---TG-CACA--ATTATTCCTTTC-T-C-ATG-T--T-T--GGCTTACAC----A---GACCC-AGG-TAAGTG-CTCAATCGTCCGGGC-CGAGT---------CGTAACTTTGTTAT-TT-G--TTTT
gi|100093 : AAC--ACAAGGA-AATA-A-A-TTC-AGG-A-TA-TGAATTTCCTAT-TTGT--G-T-TTTGT-TTG--GCA-TT---AT-G-TA-CA-A--ATTATTCCCTTC-T-C-ATA--G-T-T--GGCTTAAAC----C---GATCC-ATG-TAAGTG-TCAAA-ACTT----C-CTAGT---------C--A--TTCG--AT-TT-GTCTTCTA-T
gi|100094 : AAC-TACGGGTA-AATA-A-AATGC-AG--A-TA-TGAATGTCCTAT-
gi|100095 : -TACAAGTA-AATA-A-AATGC-AG--A-TA-TGAATCTCCTAT-TGGT--G-T-TTTGT-TTT--GTG-TTGC-AT-A-TG-CACA--ATTATTCCCCTC-T-C-ATA-TGTT-T--GGCTTAAAC----A---GATCC-ATA-TAAGTG-TCCAA-TGTT----C-CCAGTCGTCA----C--AGTTTCG-AAT-TT-G--TTCTG-TT-GTTT
gi|100096 : -TACAAGTA-CATA-A-AATGC-AG--A-TA-TGAATGTCTAAT-TGGT--G-T-TTTGT-TTT--GTG-TTGC-AT-A-TG-CACA--ATTATTCCCTTC-T-C-ATA-TGTT-T--GGTTTAAAC----A---GAATC-AGG-TAAGTG-TTCAA-TGCT----C-CGAGTCGTCA----C--AGTTTCG-AAT-TT-G--T--TG-TT-GTTT
gi|100097 : -TACAAGTA-AATA-A-AATAC-AG--A-TATTGAATGTCGTATCTGGT--G-TGTTTG--TTT--GTGTTTGC-ATGA-TG-CA
gi|100098 : -TATAAGTC-ATTA-A-AGTGC-AA--A-TA-TGAAAGCGATAT-CGGT--G-T-TTTGT-TTT--GTG-TTCC-TT-T-TG-CACG--ATTATTTCCCAC-A-C-GTATTG-T-T----TTTGAAA----C---AATC
gi|100099 : -TATAAGTA-ATTA-A-AATGC-AG--T-TA-T---------AT-TGGT--T-C-GTTAT-TTT--GTG-TTCC-AT-T-TA-CATG--ATTATTTCCCCC-A-C-GTA-TT-T-T--
gi|100100 : -TATAAGTA-ATTA-A-AATGC-AG--T-TA-T---------AT-TGGTTCG-T-TATTT-TTT--GTG-TTCC-AT-T-TA-CATG--ATTATTTCCCCC-A-C-GTA-TT-T-T--ttgcaaagatggtaa
gi|100101 : ACAAGTA-AATAGA-AATGC-AGCGACTA-TAAATG-CCTAT-TGGT--G-T-TTTGT-TTT--GTG-TTGC-AT-A-TG-CACA--ATTATTCCCTTC-TCC-ATATTG-T-T--GGCTTAA------C---GATCC-AGG-TATGTGTTTCAA-C-CT----C-CTAGT---------C--AGTTTCG-CAT-TT-G--TTCTGCTT-CTttgcaaagatggtaa
gi|100102 : ACAAATATAATA-A-AATGCCAG--A-TT-CGAA-GCCCTAT-TGGT--G-T-TTTGT-TTTTTGTG-TTGC-AT-A-CG-CACA---TTATTCTCTTC-T-C-ATA-TG-T-T--GGCTTAAA-----C---GAT-C-AGG-TAAGTG-TTC-A-CGTT----CTCTAGT---------C--AGTTTCGAAAT-TT-G--TTCTG-TTACTT
gi|100103 : AAATA-AATA-A-AATGC-AG--A-CA-TGAATGTCCTAT-CGGT--G-T-TTTGT-TTT--GTG-TTGC-AT-A-TG-CACA--ATTATTCCCTTC-T-C-ATA-TGTT-T--GGCTTACAC----A---GACCC-AGG-TAAGTG-CTCAATCGTC----C-
gi|100104 : ACA--ATTATTCCCTTC-T-C-ATA-TG-T-TT-GGCTTTAAC----A---GATCC-AGG-TAAGTG-TTCAA-CATT----C-CTAGT---------C--AGTTTCG-AAT-TT-G--TTCTG-TT-CTTT
gi|100105 : TTGTTCCCTTC-T-C-ATA-TG-T-TTTGGCTTAAACAATCCAGAGATCC-AGG-TAAGTG-TTCAA-TGTT----T-CGAGTCGTCG----C--AGTTTCA-AA--TT-G--TTCTG-TT-GTTT