lowQualScore : 2 2 55 6666 4 4 2 1 2 222 2 4 2 5555 2 6666 44 0 333 2 666666 2 66 333 2 2 333 2 22 2 2 4 555555 2 2 555 2 2 2 22 6666 2 88 44 1 333333333 4 4 5555 2 2 2 2 333 2 2 2 2 2 22 22 2
lowQualScore : . . .. .... . . . . . ... . . . .... . .... .. . ... . ...... . .. ... . . ... . .. . . . ...... . . ... . . . .. .... . .. .. . ......... . . .... . . . . ... . . . . . .. .. .
lowQualScore : 1 1 00 6666 2 2 1 1 0 777 0 0 0 2222 0 2222 66 3 777 1 111111 1 11 777 1 1 777 1 99 1 1 2 777777 1 0 555 0 0 0 88 2222 0 00 88 9 999999999 0 0 8888 0 0 0 0 555 0 0 0 0 0 88 88 0
consensus : TTTTTCA-T-T--CAA----A-CTCG-C-ATAAT-AT-G-TTCATA-TATGAATGC-TTG-TTAAA--A-T-GCA----TTN-AAAAAAT---C-TGCA------CCTTC-NCA---G-C-AT---AAAAT-TTT--C-A-CA-GCAT-----CT-CCA-TT---T-A-T-A--T----TTA-CAA-TTTT--TTGG---C--C--AAAAT-AGCCA-TTTTGA-G--GA-T-G-ATTT-T---C-AC-A-TAA-TA-G--AA--G-ATAAAAAAA
Reference ( gi|30495 ) : TTTTTCA-T-T--CAA----A-CTCG-C-ATAAT-AT-G-TTCATA-TATGAATGC-TTG-TTAAA--A-T-GCA----TTA-AAAAAAT---C-TACA------CCTTC-TCA---G-C-AT---AAAAT-TTT--C-A-CA-GCAT-----CT-CCA-TT---T-A-T-A--T----TTA-CAA-TTTT--TTGG---C--C--AAAAT-AGCCA-TTTTGA-G--GA-T-G-ATTT-T---C-AC-A-TAA-TA-G--AA--G-ATAAAAAAA
gi|30497 : TTTTTCA-T-T--CAAC---A-CTCG-C-ATAAT-AT-G-TTCAAA-TATGAAAGC-TTG-TTAAA----T-ACA----TTA-AAA--AT---C-TACA------CCTTC-TCA---G-C-AT---AAAA--TTT--C-A-CA-GCAT-----CT-CCA-CT---TGA-T-A--T----TTA-CAA-TTTT--TTGG---C--C--AAAAT-AGCCA-TTTTGA-G--GA-T-GAATTT-T---C-AC-A-TAA-TA-G--AA--G-ATAAAAA
gi|30496 : TTTTTCA-T-T--CAA----A-CTCG-C-ATAAT-AT-G-TTCATT-TATGAATGC-TTG-TTAAA--A-T-ACA----TTT-TAAGAAT---C-TGCA------CTTTC-ACA---G-C-TT---AAAAT-TTT--C-A-CA-GCAT-----CT-CCA-TT---T-A-T-G--T----TTA-CAATTTTT--TTGG---C--C--AAAAT-AGCCA-TTTTGA-A--GA-T-A-ATTT-T---C-AC-A-CAA-TA-G--AA--G-ATAAAAAAAtata
gi|30498 : TTTTTCA-T-T--TAA----AGCTCG-C-ATATT-AT-G-TTCATA-TATGAATGC-TTG-TTAAAT-A-T-GCAG---TTA-AAAAAAT---C-TACA------CCTTC-TCA---G-CAAT---AAAAT-TTT--C-G-CA-GCAT-----CT-CCA-TT---T-A-T-ATTT----TTA-CAA--TTT--TTGG---C--CAAAAAAT-AGCCATTTTTGA-G--GA-T-G-ATTT-TTCAC-AC-A-TAACTA-G--AA--G-ATAAAAAAAta
gi|30500 : TTTTTCA-T-T--CAA----A-CTCG-C-ATAAT-AT---TTCATA-TATGAATGC-TTG-TTAAA----T-GCA----TTA-AAAAAAA---C-TACA------CCTTC-TCA---G-C-AT---AAAA--TTT--C-ACCA-GCAT-----CT-CCA-TT---T-A-T-A--T----TTA--AA-CTTT--TTGG---G--C--CAAATAAGCCA-TTTTGA-G--GA-T-G-ATTT-T---C-AT-A--AA-TA-G--AA--G-ATAAta
gi|30499 : TTTTTCA-T-TTTCAA----A-CTCG-C-ATAAT-AT-G-TTCATA-TATGAATGCCTTG-TTAAA--A-T-GCA----TTA-AAA--AT---C-TACA------CCTTC-TTC---A-C-AT---AAAAT-TTT--C-A-CA-GCAT-----CT-CCA-TT---T-A-T-A--------TA-CAA-TGTT--TTGG---C--C--AAAATAAGCCA-TTTTGATG--GATT-G-ATTT-T---C-AC-ATTAA-TAGG--AA--G-ATAAACAAA
gi|30501 : TTTTTCA-T-T--CAA----A-CTTG-C-ATAAT-AT-AATTCATA-TATGAATGC-TTG-TTAAA--A-T-ACA----TTA-AAAAA-T---C-TGCA------CTTTC-ACA---G-C-AT---AAGAT-TTT--C-A-CA-ACATATGATCT-CCA-TT---T-A-T-A--TATTTTTA-CA--TTTT--TTGGAGGC--C--AAAAT-AGCCA-TTTTGA-A--GA-T-G-ATTT-T---C-AC-A-TAA-AA-G--AA--G-GTAAAAAta
gi|30502 : TTTTTCG-T----AAA----A-CTCG-C-ATAAT----G-TTCATA-TATGAATGC-TTG-TTAAA--AAT-GCA----T-A-AAAAAAT-----TACA------CTCTC-TCA---G---AT---AAAAT-TTT--C-A-CA-AGA------CT-CCA-TT---T-A-T-A--T----TTACCAATTTTT--TTGG---C------AAAT-AGCCATTTTTGA-G--GA-T-G-A-TT-C---C-AC-A-TAA-TA-G--AA--G-ATAAAAAcata
gi|30503 : TTTTTCA-T-T--CAA----A-CTCG-C-ATAATAAT-C-TTCATA-TATG-ATGC-TTG-TTAAA--A-T-ACA----TTT-AAAAAAT---A-TGCA------CCTTCACCA---G-C-A------------------------AT-----TT-CC--TT---T-A-TAA--T----TTA-CAA-TTTT--TGGG---CAAG--AAAAT-AGCCA-TTTTGA-A--GA-T-A-ATTT-T---C-AC-A-TAA-CA-G--AG--G-ATATAAAAA
gi|30504 : TTTTTCA-T-T--CAA----A-CTCG-C-ATATT-AT-G-TTCATA-TATGAATGC-TTG-TTAAA--A-T-ACA----TTT-AAAta
gi|30505 : TTTTTCA-T-C--CAA----A-CTCA-T-ATTTT-AT-G-TTTTTA-TGTGAATAC-TTG-T--AA--T-T-TTT----TTT-ACAGAATGTCC-TGCA------CATTT-ACA---G-C-AT---TATAT-TTT--C-C-CA-GCAT---------CA-TA---T-A-T-A---------A-AGA-TGTT--T------------AAA------CA-TTTTGA-T--GA-C-G-ATTT-T---C-AC-G-TGT-TG-G--AA--G-ATAA
gi|30506 : TTTTCA-T-T---------A-CTCG-C-A-AAT-AT-G-TTCATA-TATGAATG--TTG-TTAAA--A-T-GCA----TTA-AAAAAAT---C-TACA------CTTCA-TCA---G-C-AT---AAAAT-TTT--C-A-CA-GCAT-----CT-CCT-TT---T-CTT-T--T----TTA-CAA--TTT--TTGG---C--C--AAAAT-AGCCA--TTTGA-G--GA-T-G---TT-C---C-AC-A-TAA-T------G--G-ATAAAAAAA
gi|30507 : TTTTCAGT-TG-CAA----A-CTCG-C-ATAAT-AT-A-TTCTCA-TATAGATGC-TTG--TAAAGGA-TAGCA----TTA-AGAAAAC---A-TGCATAGCAGCCTTC-TCA---GAT-AT---AAAAT-TTT--CAA-CA-GCAT-----CT-ACATTT---T-A-T-A--T----TTT-CAA-TTTT--T--G---C--C---AAAT-AG-CA-TTTTGA-G--GA-T-G-AATT-T---CAAC-A-TCA-AA-G--AA--ACATAAAAAAta
gi|30508 : TTTTCA-TGT--CAA----AACTCG-C-ATAAT-AT-G-TTCATA-TATG-ATGT-TTG-TTAAA--A-A-GGAAATTTTC-AAAAAAT---C-TGCA------CTTTC-ACA---G-C-AT----AAAT-TTT--C-A-CA-GCAT------T-CC-------------------------------------GG------C--AAAAT-AGCCA--TTTGA-A--GA-T-A-ATTTAT---C-AC-A-TAA-TA----AA--G-ATAAAtata
gi|30509 : TTTTC--T-T--CAA------CTCGGC-ATAAT--T-G-TTCATA-TAGTAAT----TG-TTAAA--A-T-ACA----TTA-AAAA--T---C-TGCA------C-TTC-ACA-----C-A----AGAATGTTT--C-A-CA--CAT-----CT-CCA-TT---C-A-C-A--T----TTA-CAA-TTT------G---C--C--AAAA--AGCCA-TTTTGA-A--GA-T-A----T-T---C-AC-A-TA--------AA--G-ATAGAAAAAtatata
gi|30510 : TTTCA-T-T--CAA----A-CTCG-C-ATAAT-ATTG-TTCATA-TATGAATGC-TTG-TTAAA--A-T-GCA----TTA-AAAAA-T---CATACA------CCT----CA---G-C-AT---AAAAT-TTTTCC-A-CAAGCAT-----CT-CCA-TT---T-A---A--TA---TTA-CAA-TTTTTTTTGG---C--C--AAAAT-AGCCA-TTTTGA-G--GA-T-G-ATTT-C---C-AC-A-TAA-TA-G--AA--G-ATAAAAAAAagata
gi|30511 : TTTCA-T-T--CAA----A-CTCGGC-ATATT-AT-G-TTCATA-TATGAATGCCTTG-TTAAA--A-T-GGA----TTT-AAAAAAA---C-TACA------CCTTC-TCA---G-C-AT---AAAAT-TTT--C-G-CAGGCAT-----CTGCCA-TT------------T----TTG-CAA--------------------AAAAT-AGCCA-TTTTGA-G--GA-TGG-ATTT-T---C-AC-A-TAA-TA-G--AA--G-ATAAAAAAta
gi|30512 : TTTCA-T-T--CAA----A-CTTT-C-ATA-T-AT---TTCACA-TATGGATGC-TTGGTTAAA--A-T-ACA----TTTTAAAAAAT---T-TGCA--------TTT-TCAAAAG-C-AT---AAA-T-TTT--C-A-CA-GCAT------T-CCA-TTGTTT-A-T-A--T----TTA-CAA-TTTTT-TTGG---C--C--AAAAT-AGGCA-TTTTGA----GA-T-G-ATTT-T-----AC-A-TAA--A-G--AAAGG-ATAACAAAA
gi|30513 : TTTA-T-T--CAATTCAA-CTCG-CGATG-T-AT-A-TTCATAGTATGA-TGC-TTG-TTAAA--T-T-ACT----TTA-AAAA--T---C-TGCA------C-TTC-ACA---G-C-ATTTTAAGAT-TTT--C-A-CA-GCAT-----TT-CAA--T---T-A-T-G--T----TT---------------G---T--C--AAGAT-TACCA-TTTTGA----AA-T-A-ATTT-C---A-GC-A-TAA-T--G--AA--G-A-AAAAAAAta
gi|30514 : A-T-T--CAA----A-CTTG-C-ATAAT-AT-G-TTCATA-TATGAATGC-TTG-TTAAA--A-----A----CTT-ATAAAAT---C-TACA------CCTTC-AC----G-C-AT---AAGA--TTT--C-A-CA-GC-T-----CT-CCA-TTA--T-A-T-A--T----TTA-CAA--TTT--TTGT---C--C--AAAAT-AGCC--TTTTGA-G--GT-T-G-ATTT-T---C-ACAA-TA---A-G--AA--G-ATAAAAAAta
gi|30515 : AT-TT-G-TTCATA-CATGAATGT-TTG-TTAAA--A-T-ACA----TTT-TAA---T---C-TGCA------CCTTC-ACA---G-C-AT---TAGAT-TTT--C-A-CA-GCAT-----TT-CCA-TT---T-A-T-A--T----TTA-CAA-TTTT--ATGG---C--T--AAAAC-AGCCA-TTTCGA-GAAGA-T-A-CTTT-T---C-AA-A-TAA-TA-GTTAA--T--TAAAAAAAtata
gi|30516 : CA-TT---T-A-T-A--T----TTA-CAA-TTTT--TTGG---C--T--AAAAT-----A-TTTTGA-A--GA-T-A-A-TT-T---C-AC-A-TAA-TA-G--AA--G-ATGAAAAAAaata
Alignments
lowQualScore : 11
lowQualScore : 2 2 44 6666 4 4 2 0 1 222 1 3 1 4444 1 6666 44 333 2 555555 1 1 2 2 2 333 2 22 2 2 4 2 55555 2 1 555 1 3 1 22 4444 1 77 44 1 333 22222 3 3 5555 1 1 1 1 333 1 1 1 1 1 22 22 1
lowQualScore : . . .. .... . . . . . ... . . . .... . .... .. ... . ...... . . . . . ... . .. . . . . ..... . . ... . . . .. .... . .. .. . ... ..... . . .... . . . . ... . . . . . .. .. .
lowQualScore : 0 0 88 2222 0 0 0 6 9 000 9 8 9 6666 9 0000 00 555 0 888888 1 7 0 0 0 555 0 88 0 0 0 0 00000 0 9 222 9 8 9 66 0000 9 11 55 4 333 77777 8 8 0000 9 9 9 9 333 9 9 9 9 9 66 66 9
consensus : TTTTTCA-T-T--CAA----A-CTCG-C-ATAAT-AT-G-TTCATA-TATGAATGC-TTG-TTAAA--A-T-GCA----TTN-AAAAAAT---C-TGCA------CCTTCNCA-G-C-AT---AAAAT-TTT--C-AC-A-GC-AT-----CT-CCA-TT---T-A-T-A--T----TTA-CAA-TTTT--TTGG---C--C--AAAAT-AGCCA-TTTTGA-G--GA-T-G-ATTT-T---C-ACA-TAA-T-A-G--AA--G-ATAAAAAAA
Reference ( family-787 ) : TTTTTCA-T-T--CAA----A-CTCG-C-ATAAT-AT-G-TTCATA-TATGAATGC-TTG-TTAAA--A-T-GCA----TTN-AAAAAAT---C-TGCA------CCTTCNCA-G-C-AT---AAAAT-TTT--C-AC-A-GC-AT-----CT-CCA-TT---T-A-T-A--T----TTA-CAA-TTTT--TTGG---C--C--AAAAT-AGCCA-TTTTGA-G--GA-T-G-ATTT-T---C-ACA-TAA-T-A-G--AA--G-ATAAAAAAA
gi|30495 : TTTTTCA-T-T--CAA----A-CTCG-C-ATAAT-AT-G-TTCATA-TATGAATGC-TTG-TTAAA--A-T-GCA----TTA-AAAAAAT---C-TACA------CCTTCTCA-G-C-AT---AAAAT-TTT--C-AC-A-GC-AT-----CT-CCA-TT---T-A-T-A--T----TTA-CAA-TTTT--TTGG---C--C--AAAAT-AGCCA-TTTTGA-G--GA-T-G-ATTT-T---C-ACA-TAA-T-A-G--AA--G-ATAAAAAAA
gi|30496 : TTTTTCA-T-T--CAA----A-CTCG-C-ATAAT-AT-G-TTCATT-TATGAATGC-TTG-TTAAA--A-T-ACA----TTT-TAAGAAT---C-TGCA------CTTTCACA-G-C-TT---AAAAT-TTT--C-AC-A-GC-AT-----CT-CCA-TT---T-A-T-G--T----TTA-CAATTTTT--TTGG---C--C--AAAAT-AGCCA-TTTTGA-A--GA-T-A-ATTT-T---C-ACA-CAA-T-A-G--AA--G-ATAAAAAAA
gi|30497 : TTTTTCA-T-T--CAAC---A-CTCG-C-ATAAT-AT-G-TTCAAA-TATGAAAGC-TTG-TTAAA----T-ACA----TT---AAAAAT---C-TACA------CCTTCTCA-G-C-AT---AAAAT-TT---C-AC-A-GC-AT-----CT-CCA-CT---TGA-T-A--T----TTA-CAA-TTTT--TTGG---C--C--AAAAT-AGCCA-TTTTGA-G--GA-T-GAATTT-T---C-ACA-TAA-T-A-G--AA--G-ATAAAAAta
gi|30498 : TTTTTCA-T-T--TAA----AGCTCG-C-ATATT-AT-G-TTCATA-TATGAATGC-TTG-TTAAAT-A-T-GCAG---TTA-AAAAAAT---C-TACA------CCTTCTCA-G-CAAT---AAAAT-TTT--C-GC-A-GC-AT-----CT-CCA-TT---T-A-T-ATTT----TTA-CAA--TTT--TTGG---C--CAAAAAAT-AGCCATTTTTGA-G--GA-T-G-ATTT-TTCAC-ACA-TAACT-A-G--AA--G-ATAAAAAAAtata
gi|30499 : TTTTTCA-T-TTTCAA----A-CTCG-C-ATAAT-AT-G-TTCATA-TATGAATGCCTTG-TTAAA--A-T-GCA----TT---AAAAAT---C-TACA------CCTTCTTC-A-C-AT---AAAAT-TTT--C-AC-A-GC-AT-----CT-CCA-TT---T-A-T-A--------TA-CAA-TGTT--TTGG---C--C--AAAATAAGCCA-TTTTGATG--GATT-G-ATTT-T---C-ACATTAA-T-AGG--AA--G-ATAAACAAAta
gi|30500 : TTTTTCA-T-T--CAA----A-CTCG-C-ATAAT-AT---TTCATA-TATGAATGC-TTG-TTAAA----T-GCA----TTA-AAAAAAA---C-TACA------CCTTCTCA-G-C-AT---AAAAT-TT---C-ACCA-GC-AT-----CT-CCA-TT---T-A-T-A--T----TTA--AA-CTTT--TTGG---G--C--CAAATAAGCCA-TTTTGA-G--GA-T-G-ATTT-T---C-ATA--AA-T-A-G--AA--G-ATAAta
gi|30501 : TTTTTCA-T-T--CAA----A-CTTG-C-ATAAT-AT-AATTCATA-TATGAATGC-TTG-TTAAA--A-T-ACA----TT--AAAAAAT---C-TGCA------CTTTCACA-G-C-AT---AAGAT-TTT--C-AC-A-AC-ATATGATCT-CCA-TT---T-A-T-A--TATTTTTA-CA--TTTT--TTGGAGGC--C--AAAAT-AGCCA-TTTTGA-A--GA-T-G-ATTT-T---C-ACA-TAA-A-A-G--AA--G-GTAAAAA
gi|30502 : TTTTTCG-T----AAA----A-CTCG-C-ATAAT----G-TTCATA-TATGAATGC-TTG-TTAAA--AAT-GCA----T-A-AAAAAAT-----TACA------CTCTCTCA-G---AT---AAAAT-TTT--C-AC-A-AG-A------CT-CCA-TT---T-A-T-A--T----TTACCAATTTTT--TTGG---C------AAAT-AGCCATTTTTGA-G--GA-T-G-A-TT-C---C-ACA-TAA-T-A-G--AA--G-ATAAAAAcata
gi|30503 : TTTTTCA-T-T--CAA----A-CTCG-C-ATAATAAT-C-TTCATA-TATG-ATGC-TTG-TTAAA--A-T-ACA----TTT-AAAAAAT---A-TGCA------CCTTCAC-------------------------C-A-GCAAT-----TT-CC--TT---T-A-TAA--T----TTA-CAA-TTTT--TGGG---CAAG--AAAAT-AGCCA-TTTTGA-A--GA-T-A-ATTT-T---C-ACA-TAA-C-A-G--AG--G-ATATAAAAA
gi|30504 : TTTTTCA-T-T--CAA----A-CTCG-C-ATATT-AT-G-TTCATA-TATGAATGC-TTG-TTAAA--A-T-ACA----TTT-AAAta
gi|30505 : TTTTTCA-T-C--CAA----A-CTCA-T-ATTTT-AT-G-TTTTTA-TGTGAATAC-TTG-T--AA--T-T-TTT----TTT-ACAGAATGTCC-TGCA------CATTTACA-G-C-AT---TATAT-TTT--C-CC-A-GC-AT---------CA-TA---T-A-T-A---------A-AGA-TGTT--T------------AAA------CA-TTTTGA-T--GA-C-G-ATTT-T---C-ACG-TGT-T-G-G--AA--G-ATAA
gi|30506 : TTTTCA-T-T---------A-CTCG-C-A-AAT-AT-G-TTCATA-TATGAATG--TTG-TTAAA--A-T-GCA----TTA-AAAAAAT---C-TACA------CTTCATCA-G-C-AT---AAAAT-TTT--C-AC-A-GC-AT-----CT-CCT-TT---T-CTT-T--T----TTA-CAA--TTT--TTGG---C--C--AAAAT-AGCCA--TTTGA-G--GA-T-G---TT-C---C-ACA-TAA-T-------G--G-ATAAAAAAA
gi|30507 : TTTTCAGT-TG-CAA----A-CTCG-C-ATAAT-AT-A-TTCTCA-TATAGATGC-TTG--TAAAGGA-TAGCA----TTA-AGAAAAC---A-TGCATAGCAGCCTTCTCA-GAT-AT---AAAAT-TTT--CAAC-A-GC-AT-----CT-ACATTT---T-A-T-A--T----TTT-CAA-TTTT--T--G---C--C---AAAT-AG-CA-TTTTGA-G--GA-T-G-AATT-T---CAACA-TCA-A-A-G--AA--ACATAAAAAAta
gi|30508 : TTTTCA-TGT--CAA----AACTCG-C-ATAAT-AT-G-TTCATA-TATG-ATGT-TTG-TTAAA--A-A-GGAAATTTTC-AAAAAAT---C-TGCA------CTTTCACA-G-C-AT----AAAT-TTT--C-AC-A-GC-AT------T-CC-------------------------------------GG------C--AAAAT-AGCCA--TTTGA-A--GA-T-A-ATTTAT---C-ACA-TAA-T-A----AA--G-ATAAAtata
gi|30509 : TTTTC--T-T--CAA------CTCGGC-ATAAT--T-G-TTCATA-TAGTAAT----TG-TTAAA--A-T-ACA----TT---AAAAAT---C-TGCA------C-TTCACA---C-A----AGAATGTTT--C-AC-A--C-AT-----CT-CCA-TT---C-A-C-A--T----TTA-CAA-TTT------G---C--C--AAAA--AGCCA-TTTTGA-A--GA-T-A----T-T---C-ACA-TA---------AA--G-ATAGAAAAAtatata
gi|30510 : TTTCA-T-T--CAA----A-CTCG-C-ATAAT-ATTG-TTCATA-TATGAATGC-TTG-TTAAA--A-T-GCA----TT--AAAAAAT---CATACA------CCT---CA-G-C-AT---AAAAT-TTTTCC-AC-AAGC-AT-----CT-CCA-TT---T-AAT-A--T----T-A-CAA-TTTTTTTTGG---C--C--AAAAT-AGCCA-TTTTGA-G--GA-T-G-ATTT-C---C-ACA-TAA-T-A-G--AA--G-ATAAAAAAAagata
gi|30511 : TTTCA-T-T--CAA----A-CTCGGC-ATATT-AT-G-TTCATA-TATGAATGCCTTG-TTAAA--A-T-GGA----TTT-AAAAAAA---C-TACA------CCTTCTCA-G-C-AT---AAAAT-TTT--C-GC-AGGC-AT-----CTGCCA-TT------------T----TTG-CAA--------------------AAAAT-AGCCA-TTTTGA-G--GA-TGG-ATTT-T---C-ACA-TAA-T-A-G--AA--G-ATAAAAAAta
gi|30512 : TTTCA-T-T--CAA----A-CTTT-C-ATA-T-AT---TTCACA-TATGGATGC-TTGGTTAAA--A-T-ACA----TTTTAAAAAAT---T-TGCA------TTTTCAAAAG-C-AT---AAA-T-TTT--C-AC-A-GC-AT------T-CCA-TTGTTT-A-T-A--T----TTA-CAA-TTTTT-TTGG---C--C--AAAAT-AGGCA-TTTTGA----GA-T-G-ATTT-T-----ACA-TAA---A-G--AAAGG-ATAACAAAA
gi|30513 : TTTA-T-T--CAATTCAA-CTCG-CGATG-T-AT-A-TTCATAGTATGA-TGC-TTG-TTAAA--T-T-ACT----TT---AAAAAT---C-TGCA------C-TTCACA-G-C-ATTTTAAGAT-TTT--C-AC-A-GC-AT-----TT-CAA--T---T-A-T-G--T----TT---------------G---T--C--AAGAT-TACCA-TTTTGA----AA-T-A-ATTT-C---A-GCA-TAA-T---G--AA--G-A-AAAAAAAta
gi|30514 : A-T-T--CAA----A-CTTG-C-ATAAT-AT-G-TTCATA-TATGAATGC-TTG-TTAAA--A-----A----CTT-ATAAAAT---C-TACA------CCTTCAC--G-C-AT---AAGA--TTT--C-AC-A-GC--T-----CT-CCA-TTA--T-A-T-A--T----TTA-CAA--TTT--TTGT---C--C--AAAAT-AGCC--TTTTGA-G--GT-T-G-ATTT-T---C-AC---AA-TAA-G--AA--G-ATAAAAAAta
gi|30515 : AT-TT-G-TTCATA-CATGAATGT-TTG-TTAAA--A-T-ACA----TTT-TAA---T---C-TGCA------CCTTCACA-G-C-AT---TAGAT-TTT--C-AC-A-GC-AT-----TT-CCA-TT---T-A-T-A--T----TTA-CAA-TTTT--ATGG---C--T--AAAAC-AGCCA-TTTCGA-GAAGA-T-A-CTTT-T---C-AAA-TAA-T-A-GTTAA--T--TAAAAAAAtata
gi|30516 : CA-TT---T-A-T-A--T----TTA-CAA-TTTT--TTGG---C--T--AAAAT-----A-TTTTGA-A--GA-T-A-A-TT-T---C-ACA-TAA-T-A-G--AA--G-ATGAAAAAAaata
Alignments
lowQualScore : 11
lowQualScore : 2 2 44 6666 4 4 2 0 1 222 1 3 1 4444 1 6666 44 333 2 555555 1 1 2 2 2 333 2 22 2 2 4 2 55555 2 1 555 1 3 1 22 4444 1 77 44 1 333 22222 3 3 5555 1 1 1 1 333 1 1 1 1 1 22 22 1
lowQualScore : . . .. .... . . . . . ... . . . .... . .... .. ... . ...... . . . . . ... . .. . . . . ..... . . ... . . . .. .... . .. .. . ... ..... . . .... . . . . ... . . . . . .. .. .
lowQualScore : 0 0 88 2222 0 0 0 6 9 000 9 8 9 6666 9 0000 00 555 0 888888 1 7 0 0 0 555 0 88 0 0 0 0 00000 0 9 222 9 8 9 66 0000 9 11 55 4 333 77777 8 8 0000 9 9 9 9 333 9 9 9 9 9 66 66 9
consensus : TTTTTCA-T-T--CAA----A-CTCG-C-ATAAT-AT-G-TTCATA-TATGAATGC-TTG-TTAAA--A-T-GCA----TTN-AAAAAAT---C-TGCA------CCTTCNCA-G-C-AT---AAAAT-TTT--C-AC-A-GC-AT-----CT-CCA-TT---T-A-T-A--T----TTA-CAA-TTTT--TTGG---C--C--AAAAT-AGCCA-TTTTGA-G--GA-T-G-ATTT-T---C-ACA-TAA-T-A-G--AA--G-ATAAAAAAA
Reference ( family-787 ) : TTTTTCA-T-T--CAA----A-CTCG-C-ATAAT-AT-G-TTCATA-TATGAATGC-TTG-TTAAA--A-T-GCA----TTN-AAAAAAT---C-TGCA------CCTTCNCA-G-C-AT---AAAAT-TTT--C-AC-A-GC-AT-----CT-CCA-TT---T-A-T-A--T----TTA-CAA-TTTT--TTGG---C--C--AAAAT-AGCCA-TTTTGA-G--GA-T-G-ATTT-T---C-ACA-TAA-T-A-G--AA--G-ATAAAAAAA
gi|30495 : TTTTTCA-T-T--CAA----A-CTCG-C-ATAAT-AT-G-TTCATA-TATGAATGC-TTG-TTAAA--A-T-GCA----TTA-AAAAAAT---C-TACA------CCTTCTCA-G-C-AT---AAAAT-TTT--C-AC-A-GC-AT-----CT-CCA-TT---T-A-T-A--T----TTA-CAA-TTTT--TTGG---C--C--AAAAT-AGCCA-TTTTGA-G--GA-T-G-ATTT-T---C-ACA-TAA-T-A-G--AA--G-ATAAAAAAA
gi|30496 : TTTTTCA-T-T--CAA----A-CTCG-C-ATAAT-AT-G-TTCATT-TATGAATGC-TTG-TTAAA--A-T-ACA----TTT-TAAGAAT---C-TGCA------CTTTCACA-G-C-TT---AAAAT-TTT--C-AC-A-GC-AT-----CT-CCA-TT---T-A-T-G--T----TTA-CAATTTTT--TTGG---C--C--AAAAT-AGCCA-TTTTGA-A--GA-T-A-ATTT-T---C-ACA-CAA-T-A-G--AA--G-ATAAAAAAA
gi|30497 : TTTTTCA-T-T--CAAC---A-CTCG-C-ATAAT-AT-G-TTCAAA-TATGAAAGC-TTG-TTAAA----T-ACA----TT---AAAAAT---C-TACA------CCTTCTCA-G-C-AT---AAAAT-TT---C-AC-A-GC-AT-----CT-CCA-CT---TGA-T-A--T----TTA-CAA-TTTT--TTGG---C--C--AAAAT-AGCCA-TTTTGA-G--GA-T-GAATTT-T---C-ACA-TAA-T-A-G--AA--G-ATAAAAAta
gi|30498 : TTTTTCA-T-T--TAA----AGCTCG-C-ATATT-AT-G-TTCATA-TATGAATGC-TTG-TTAAAT-A-T-GCAG---TTA-AAAAAAT---C-TACA------CCTTCTCA-G-CAAT---AAAAT-TTT--C-GC-A-GC-AT-----CT-CCA-TT---T-A-T-ATTT----TTA-CAA--TTT--TTGG---C--CAAAAAAT-AGCCATTTTTGA-G--GA-T-G-ATTT-TTCAC-ACA-TAACT-A-G--AA--G-ATAAAAAAAtata
gi|30499 : TTTTTCA-T-TTTCAA----A-CTCG-C-ATAAT-AT-G-TTCATA-TATGAATGCCTTG-TTAAA--A-T-GCA----TT---AAAAAT---C-TACA------CCTTCTTC-A-C-AT---AAAAT-TTT--C-AC-A-GC-AT-----CT-CCA-TT---T-A-T-A--------TA-CAA-TGTT--TTGG---C--C--AAAATAAGCCA-TTTTGATG--GATT-G-ATTT-T---C-ACATTAA-T-AGG--AA--G-ATAAACAAAta
gi|30500 : TTTTTCA-T-T--CAA----A-CTCG-C-ATAAT-AT---TTCATA-TATGAATGC-TTG-TTAAA----T-GCA----TTA-AAAAAAA---C-TACA------CCTTCTCA-G-C-AT---AAAAT-TT---C-ACCA-GC-AT-----CT-CCA-TT---T-A-T-A--T----TTA--AA-CTTT--TTGG---G--C--CAAATAAGCCA-TTTTGA-G--GA-T-G-ATTT-T---C-ATA--AA-T-A-G--AA--G-ATAAta
gi|30501 : TTTTTCA-T-T--CAA----A-CTTG-C-ATAAT-AT-AATTCATA-TATGAATGC-TTG-TTAAA--A-T-ACA----TT--AAAAAAT---C-TGCA------CTTTCACA-G-C-AT---AAGAT-TTT--C-AC-A-AC-ATATGATCT-CCA-TT---T-A-T-A--TATTTTTA-CA--TTTT--TTGGAGGC--C--AAAAT-AGCCA-TTTTGA-A--GA-T-G-ATTT-T---C-ACA-TAA-A-A-G--AA--G-GTAAAAA
gi|30502 : TTTTTCG-T----AAA----A-CTCG-C-ATAAT----G-TTCATA-TATGAATGC-TTG-TTAAA--AAT-GCA----T-A-AAAAAAT-----TACA------CTCTCTCA-G---AT---AAAAT-TTT--C-AC-A-AG-A------CT-CCA-TT---T-A-T-A--T----TTACCAATTTTT--TTGG---C------AAAT-AGCCATTTTTGA-G--GA-T-G-A-TT-C---C-ACA-TAA-T-A-G--AA--G-ATAAAAAcata
gi|30503 : TTTTTCA-T-T--CAA----A-CTCG-C-ATAATAAT-C-TTCATA-TATG-ATGC-TTG-TTAAA--A-T-ACA----TTT-AAAAAAT---A-TGCA------CCTTCAC-------------------------C-A-GCAAT-----TT-CC--TT---T-A-TAA--T----TTA-CAA-TTTT--TGGG---CAAG--AAAAT-AGCCA-TTTTGA-A--GA-T-A-ATTT-T---C-ACA-TAA-C-A-G--AG--G-ATATAAAAA
gi|30504 : TTTTTCA-T-T--CAA----A-CTCG-C-ATATT-AT-G-TTCATA-TATGAATGC-TTG-TTAAA--A-T-ACA----TTT-AAAta
gi|30505 : TTTTTCA-T-C--CAA----A-CTCA-T-ATTTT-AT-G-TTTTTA-TGTGAATAC-TTG-T--AA--T-T-TTT----TTT-ACAGAATGTCC-TGCA------CATTTACA-G-C-AT---TATAT-TTT--C-CC-A-GC-AT---------CA-TA---T-A-T-A---------A-AGA-TGTT--T------------AAA------CA-TTTTGA-T--GA-C-G-ATTT-T---C-ACG-TGT-T-G-G--AA--G-ATAA
gi|30506 : TTTTCA-T-T---------A-CTCG-C-A-AAT-AT-G-TTCATA-TATGAATG--TTG-TTAAA--A-T-GCA----TTA-AAAAAAT---C-TACA------CTTCATCA-G-C-AT---AAAAT-TTT--C-AC-A-GC-AT-----CT-CCT-TT---T-CTT-T--T----TTA-CAA--TTT--TTGG---C--C--AAAAT-AGCCA--TTTGA-G--GA-T-G---TT-C---C-ACA-TAA-T-------G--G-ATAAAAAAA
gi|30507 : TTTTCAGT-TG-CAA----A-CTCG-C-ATAAT-AT-A-TTCTCA-TATAGATGC-TTG--TAAAGGA-TAGCA----TTA-AGAAAAC---A-TGCATAGCAGCCTTCTCA-GAT-AT---AAAAT-TTT--CAAC-A-GC-AT-----CT-ACATTT---T-A-T-A--T----TTT-CAA-TTTT--T--G---C--C---AAAT-AG-CA-TTTTGA-G--GA-T-G-AATT-T---CAACA-TCA-A-A-G--AA--ACATAAAAAAta
gi|30508 : TTTTCA-TGT--CAA----AACTCG-C-ATAAT-AT-G-TTCATA-TATG-ATGT-TTG-TTAAA--A-A-GGAAATTTTC-AAAAAAT---C-TGCA------CTTTCACA-G-C-AT----AAAT-TTT--C-AC-A-GC-AT------T-CC-------------------------------------GG------C--AAAAT-AGCCA--TTTGA-A--GA-T-A-ATTTAT---C-ACA-TAA-T-A----AA--G-ATAAAtata
gi|30509 : TTTTC--T-T--CAA------CTCGGC-ATAAT--T-G-TTCATA-TAGTAAT----TG-TTAAA--A-T-ACA----TT---AAAAAT---C-TGCA------C-TTCACA---C-A----AGAATGTTT--C-AC-A--C-AT-----CT-CCA-TT---C-A-C-A--T----TTA-CAA-TTT------G---C--C--AAAA--AGCCA-TTTTGA-A--GA-T-A----T-T---C-ACA-TA---------AA--G-ATAGAAAAAtatata
gi|30510 : TTTCA-T-T--CAA----A-CTCG-C-ATAAT-ATTG-TTCATA-TATGAATGC-TTG-TTAAA--A-T-GCA----TT--AAAAAAT---CATACA------CCT---CA-G-C-AT---AAAAT-TTTTCC-AC-AAGC-AT-----CT-CCA-TT---T-AAT-A--T----T-A-CAA-TTTTTTTTGG---C--C--AAAAT-AGCCA-TTTTGA-G--GA-T-G-ATTT-C---C-ACA-TAA-T-A-G--AA--G-ATAAAAAAAagata
gi|30511 : TTTCA-T-T--CAA----A-CTCGGC-ATATT-AT-G-TTCATA-TATGAATGCCTTG-TTAAA--A-T-GGA----TTT-AAAAAAA---C-TACA------CCTTCTCA-G-C-AT---AAAAT-TTT--C-GC-AGGC-AT-----CTGCCA-TT------------T----TTG-CAA--------------------AAAAT-AGCCA-TTTTGA-G--GA-TGG-ATTT-T---C-ACA-TAA-T-A-G--AA--G-ATAAAAAAta
gi|30512 : TTTCA-T-T--CAA----A-CTTT-C-ATA-T-AT---TTCACA-TATGGATGC-TTGGTTAAA--A-T-ACA----TTTTAAAAAAT---T-TGCA------TTTTCAAAAG-C-AT---AAA-T-TTT--C-AC-A-GC-AT------T-CCA-TTGTTT-A-T-A--T----TTA-CAA-TTTTT-TTGG---C--C--AAAAT-AGGCA-TTTTGA----GA-T-G-ATTT-T-----ACA-TAA---A-G--AAAGG-ATAACAAAA
gi|30513 : TTTA-T-T--CAATTCAA-CTCG-CGATG-T-AT-A-TTCATAGTATGA-TGC-TTG-TTAAA--T-T-ACT----TT---AAAAAT---C-TGCA------C-TTCACA-G-C-ATTTTAAGAT-TTT--C-AC-A-GC-AT-----TT-CAA--T---T-A-T-G--T----TT---------------G---T--C--AAGAT-TACCA-TTTTGA----AA-T-A-ATTT-C---A-GCA-TAA-T---G--AA--G-A-AAAAAAAta
gi|30514 : A-T-T--CAA----A-CTTG-C-ATAAT-AT-G-TTCATA-TATGAATGC-TTG-TTAAA--A-----A----CTT-ATAAAAT---C-TACA------CCTTCAC--G-C-AT---AAGA--TTT--C-AC-A-GC--T-----CT-CCA-TTA--T-A-T-A--T----TTA-CAA--TTT--TTGT---C--C--AAAAT-AGCC--TTTTGA-G--GT-T-G-ATTT-T---C-AC---AA-TAA-G--AA--G-ATAAAAAAta
gi|30515 : AT-TT-G-TTCATA-CATGAATGT-TTG-TTAAA--A-T-ACA----TTT-TAA---T---C-TGCA------CCTTCACA-G-C-AT---TAGAT-TTT--C-AC-A-GC-AT-----TT-CCA-TT---T-A-T-A--T----TTA-CAA-TTTT--ATGG---C--T--AAAAC-AGCCA-TTTCGA-GAAGA-T-A-CTTT-T---C-AAA-TAA-T-A-GTTAA--T--TAAAAAAAtata
gi|30516 : CA-TT---T-A-T-A--T----TTA-CAA-TTTT--TTGG---C--T--AAAAT-----A-TTTTGA-A--GA-T-A-A-TT-T---C-ACA-TAA-T-A-G--AA--G-ATGAAAAAAaata
blockSeqs : G G TT TTCA G G G A AA G C G GGA A AATT TT GTC A TAGCAG T A A A A TTT G TC A C A A ATGAT G T GTT G T A TT ATTT C TT TT T AGG CAA A T GAA T G A A TCA A T C A G TT AG C
blockSeqs : . . G C A G . . TG . C . TA . G T . . . C T . . . . . . . . G . . . . A . A . . . . TT T T . AAG A T TG . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . G . . . AA . . A . . . C T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . T . C . . A . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . G . . . A . . A . . . C T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . T . C . . G . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . G . . . A . . A . . . C T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . T . C . . G . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . G . . . A . . T . . . T A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . T . C . . G . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . G . . . A . . T . . . T T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . T . C . . A . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . C . . . A . . T . . . C A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . G . C . . G . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . G . . . T . . A . . . A A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . T . C . . A . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . G . . . A . . A . . . T T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . T . C . . T . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . G . . . A . . C . . . C T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . T . C . . G . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . A . . . A . . T . . . T A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . T . C . . G . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . G . . . A . . T . . . C A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . T . C . . A . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . G . . . A . . T . . . C T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . T . C . . A . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . G . . . A . . . . . . T A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . G . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . A . . . T . . . . . . C A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . G . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . G . . . A . . . . . . C A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . G . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . G . . . A . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqCons :
originalCons : TTTTTCA-T-T--CAA----A-CTCG-C-ATAAT-AT-G-TTCATA-TATGAATGC-TTG-TTAAA--A-T-GCA----TTN-AAAAAAT---C-TGCA------CCTTCNCA-G-C-AT---AAAAT-TTT--C-AC-A-GC-AT-----CT-CCA-TT---T-A-T-A--T----TTA-CAA-TTTT--TTGG---C--C--AAAAT-AGCCA-TTTTGA-G--GA-T-G-ATTT-T---C-ACA-TAA-T-A-G--AA--G-ATAAAAAAA
finalCons : TTTTTCA-T-T--CAA----A-CTCG-C-ATAAT-AT-G-TTCATA-TATGAATGC-TTG-TTAAA--A-T-GCA----TTN-AAAAAAT---C-TGCA------CCTTCNCA-G-C-AT---AAAAT-TTT--C-AC-A-GC-AT-----CT-CCA-TT---T-A-T-A--T----TTA-CAA-TTTT--TTGG---C--C--AAAAT-AGCCA-TTTTGA-G--GA-T-G-ATTT-T---C-ACA-TAA-T-A-G--AA--G-ATAAAAAAA
Alignments
lowQualScore : 11
lowQualScore : 2 2 44 6666 4 4 2 0 1 222 1 3 1 4444 1 6666 44 333 2 555555 1 1 2 2 2 333 2 22 2 2 4 2 55555 2 1 555 1 3 1 22 4444 1 77 44 1 333 22222 3 3 5555 1 1 1 1 333 1 1 1 1 1 22 22 1
lowQualScore : . . .. .... . . . . . ... . . . .... . .... .. ... . ...... . . . . . ... . .. . . . . ..... . . ... . . . .. .... . .. .. . ... ..... . . .... . . . . ... . . . . . .. .. .
lowQualScore : 0 0 88 2222 0 0 0 6 9 000 9 8 9 6666 9 0000 00 555 0 888888 1 7 0 0 0 555 0 88 0 0 0 0 00000 0 9 222 9 8 9 66 0000 9 11 55 4 333 77777 8 8 0000 9 9 9 9 333 9 9 9 9 9 66 66 9
consensus : TTTTTCA-T-T--CAA----A-CTCG-C-ATAAT-AT-G-TTCATA-TATGAATGC-TTG-TTAAA--A-T-GCA----TTN-AAAAAAT---C-TGCA------CCTTCNCA-G-C-AT---AAAAT-TTT--C-AC-A-GC-AT-----CT-CCA-TT---T-A-T-A--T----TTA-CAA-TTTT--TTGG---C--C--AAAAT-AGCCA-TTTTGA-G--GA-T-G-ATTT-T---C-ACA-TAA-T-A-G--AA--G-ATAAAAAAA
Reference ( family-787 ) : TTTTTCA-T-T--CAA----A-CTCG-C-ATAAT-AT-G-TTCATA-TATGAATGC-TTG-TTAAA--A-T-GCA----TTN-AAAAAAT---C-TGCA------CCTTCNCA-G-C-AT---AAAAT-TTT--C-AC-A-GC-AT-----CT-CCA-TT---T-A-T-A--T----TTA-CAA-TTTT--TTGG---C--C--AAAAT-AGCCA-TTTTGA-G--GA-T-G-ATTT-T---C-ACA-TAA-T-A-G--AA--G-ATAAAAAAA
gi|30495 : TTTTTCA-T-T--CAA----A-CTCG-C-ATAAT-AT-G-TTCATA-TATGAATGC-TTG-TTAAA--A-T-GCA----TTA-AAAAAAT---C-TACA------CCTTCTCA-G-C-AT---AAAAT-TTT--C-AC-A-GC-AT-----CT-CCA-TT---T-A-T-A--T----TTA-CAA-TTTT--TTGG---C--C--AAAAT-AGCCA-TTTTGA-G--GA-T-G-ATTT-T---C-ACA-TAA-T-A-G--AA--G-ATAAAAAAA
gi|30496 : TTTTTCA-T-T--CAA----A-CTCG-C-ATAAT-AT-G-TTCATT-TATGAATGC-TTG-TTAAA--A-T-ACA----TTT-TAAGAAT---C-TGCA------CTTTCACA-G-C-TT---AAAAT-TTT--C-AC-A-GC-AT-----CT-CCA-TT---T-A-T-G--T----TTA-CAATTTTT--TTGG---C--C--AAAAT-AGCCA-TTTTGA-A--GA-T-A-ATTT-T---C-ACA-CAA-T-A-G--AA--G-ATAAAAAAA
gi|30497 : TTTTTCA-T-T--CAAC---A-CTCG-C-ATAAT-AT-G-TTCAAA-TATGAAAGC-TTG-TTAAA----T-ACA----TT---AAAAAT---C-TACA------CCTTCTCA-G-C-AT---AAAAT-TT---C-AC-A-GC-AT-----CT-CCA-CT---TGA-T-A--T----TTA-CAA-TTTT--TTGG---C--C--AAAAT-AGCCA-TTTTGA-G--GA-T-GAATTT-T---C-ACA-TAA-T-A-G--AA--G-ATAAAAAta
gi|30498 : TTTTTCA-T-T--TAA----AGCTCG-C-ATATT-AT-G-TTCATA-TATGAATGC-TTG-TTAAAT-A-T-GCAG---TTA-AAAAAAT---C-TACA------CCTTCTCA-G-CAAT---AAAAT-TTT--C-GC-A-GC-AT-----CT-CCA-TT---T-A-T-ATTT----TTA-CAA--TTT--TTGG---C--CAAAAAAT-AGCCATTTTTGA-G--GA-T-G-ATTT-TTCAC-ACA-TAACT-A-G--AA--G-ATAAAAAAAtata
gi|30499 : TTTTTCA-T-TTTCAA----A-CTCG-C-ATAAT-AT-G-TTCATA-TATGAATGCCTTG-TTAAA--A-T-GCA----TT---AAAAAT---C-TACA------CCTTCTTC-A-C-AT---AAAAT-TTT--C-AC-A-GC-AT-----CT-CCA-TT---T-A-T-A--------TA-CAA-TGTT--TTGG---C--C--AAAATAAGCCA-TTTTGATG--GATT-G-ATTT-T---C-ACATTAA-T-AGG--AA--G-ATAAACAAAta
gi|30500 : TTTTTCA-T-T--CAA----A-CTCG-C-ATAAT-AT---TTCATA-TATGAATGC-TTG-TTAAA----T-GCA----TTA-AAAAAAA---C-TACA------CCTTCTCA-G-C-AT---AAAAT-TT---C-ACCA-GC-AT-----CT-CCA-TT---T-A-T-A--T----TTA--AA-CTTT--TTGG---G--C--CAAATAAGCCA-TTTTGA-G--GA-T-G-ATTT-T---C-ATA--AA-T-A-G--AA--G-ATAAta
gi|30501 : TTTTTCA-T-T--CAA----A-CTTG-C-ATAAT-AT-AATTCATA-TATGAATGC-TTG-TTAAA--A-T-ACA----TT--AAAAAAT---C-TGCA------CTTTCACA-G-C-AT---AAGAT-TTT--C-AC-A-AC-ATATGATCT-CCA-TT---T-A-T-A--TATTTTTA-CA--TTTT--TTGGAGGC--C--AAAAT-AGCCA-TTTTGA-A--GA-T-G-ATTT-T---C-ACA-TAA-A-A-G--AA--G-GTAAAAA
gi|30502 : TTTTTCG-T----AAA----A-CTCG-C-ATAAT----G-TTCATA-TATGAATGC-TTG-TTAAA--AAT-GCA----T-A-AAAAAAT-----TACA------CTCTCTCA-G---AT---AAAAT-TTT--C-AC-A-AG-A------CT-CCA-TT---T-A-T-A--T----TTACCAATTTTT--TTGG---C------AAAT-AGCCATTTTTGA-G--GA-T-G-A-TT-C---C-ACA-TAA-T-A-G--AA--G-ATAAAAAcata
gi|30503 : TTTTTCA-T-T--CAA----A-CTCG-C-ATAATAAT-C-TTCATA-TATG-ATGC-TTG-TTAAA--A-T-ACA----TTT-AAAAAAT---A-TGCA------CCTTCAC-------------------------C-A-GCAAT-----TT-CC--TT---T-A-TAA--T----TTA-CAA-TTTT--TGGG---CAAG--AAAAT-AGCCA-TTTTGA-A--GA-T-A-ATTT-T---C-ACA-TAA-C-A-G--AG--G-ATATAAAAA
gi|30504 : TTTTTCA-T-T--CAA----A-CTCG-C-ATATT-AT-G-TTCATA-TATGAATGC-TTG-TTAAA--A-T-ACA----TTT-AAAta
gi|30505 : TTTTTCA-T-C--CAA----A-CTCA-T-ATTTT-AT-G-TTTTTA-TGTGAATAC-TTG-T--AA--T-T-TTT----TTT-ACAGAATGTCC-TGCA------CATTTACA-G-C-AT---TATAT-TTT--C-CC-A-GC-AT---------CA-TA---T-A-T-A---------A-AGA-TGTT--T------------AAA------CA-TTTTGA-T--GA-C-G-ATTT-T---C-ACG-TGT-T-G-G--AA--G-ATAA
gi|30506 : TTTTCA-T-T---------A-CTCG-C-A-AAT-AT-G-TTCATA-TATGAATG--TTG-TTAAA--A-T-GCA----TTA-AAAAAAT---C-TACA------CTTCATCA-G-C-AT---AAAAT-TTT--C-AC-A-GC-AT-----CT-CCT-TT---T-CTT-T--T----TTA-CAA--TTT--TTGG---C--C--AAAAT-AGCCA--TTTGA-G--GA-T-G---TT-C---C-ACA-TAA-T-------G--G-ATAAAAAAA
gi|30507 : TTTTCAGT-TG-CAA----A-CTCG-C-ATAAT-AT-A-TTCTCA-TATAGATGC-TTG--TAAAGGA-TAGCA----TTA-AGAAAAC---A-TGCATAGCAGCCTTCTCA-GAT-AT---AAAAT-TTT--CAAC-A-GC-AT-----CT-ACATTT---T-A-T-A--T----TTT-CAA-TTTT--T--G---C--C---AAAT-AG-CA-TTTTGA-G--GA-T-G-AATT-T---CAACA-TCA-A-A-G--AA--ACATAAAAAAta
gi|30508 : TTTTCA-TGT--CAA----AACTCG-C-ATAAT-AT-G-TTCATA-TATG-ATGT-TTG-TTAAA--A-A-GGAAATTTTC-AAAAAAT---C-TGCA------CTTTCACA-G-C-AT----AAAT-TTT--C-AC-A-GC-AT------T-CC-------------------------------------GG------C--AAAAT-AGCCA--TTTGA-A--GA-T-A-ATTTAT---C-ACA-TAA-T-A----AA--G-ATAAAtata
gi|30509 : TTTTC--T-T--CAA------CTCGGC-ATAAT--T-G-TTCATA-TAGTAAT----TG-TTAAA--A-T-ACA----TT---AAAAAT---C-TGCA------C-TTCACA---C-A----AGAATGTTT--C-AC-A--C-AT-----CT-CCA-TT---C-A-C-A--T----TTA-CAA-TTT------G---C--C--AAAA--AGCCA-TTTTGA-A--GA-T-A----T-T---C-ACA-TA---------AA--G-ATAGAAAAAtatata
gi|30510 : TTTCA-T-T--CAA----A-CTCG-C-ATAAT-ATTG-TTCATA-TATGAATGC-TTG-TTAAA--A-T-GCA----TT--AAAAAAT---CATACA------CCT---CA-G-C-AT---AAAAT-TTTTCC-AC-AAGC-AT-----CT-CCA-TT---T-AAT-A--T----T-A-CAA-TTTTTTTTGG---C--C--AAAAT-AGCCA-TTTTGA-G--GA-T-G-ATTT-C---C-ACA-TAA-T-A-G--AA--G-ATAAAAAAAagata
gi|30511 : TTTCA-T-T--CAA----A-CTCGGC-ATATT-AT-G-TTCATA-TATGAATGCCTTG-TTAAA--A-T-GGA----TTT-AAAAAAA---C-TACA------CCTTCTCA-G-C-AT---AAAAT-TTT--C-GC-AGGC-AT-----CTGCCA-TT------------T----TTG-CAA--------------------AAAAT-AGCCA-TTTTGA-G--GA-TGG-ATTT-T---C-ACA-TAA-T-A-G--AA--G-ATAAAAAAta
gi|30512 : TTTCA-T-T--CAA----A-CTTT-C-ATA-T-AT---TTCACA-TATGGATGC-TTGGTTAAA--A-T-ACA----TTTTAAAAAAT---T-TGCA------TTTTCAAAAG-C-AT---AAA-T-TTT--C-AC-A-GC-AT------T-CCA-TTGTTT-A-T-A--T----TTA-CAA-TTTTT-TTGG---C--C--AAAAT-AGGCA-TTTTGA----GA-T-G-ATTT-T-----ACA-TAA---A-G--AAAGG-ATAACAAAA
gi|30513 : TTTA-T-T--CAATTCAA-CTCG-CGATG-T-AT-A-TTCATAGTATGA-TGC-TTG-TTAAA--T-T-ACT----TT---AAAAAT---C-TGCA------C-TTCACA-G-C-ATTTTAAGAT-TTT--C-AC-A-GC-AT-----TT-CAA--T---T-A-T-G--T----TT---------------G---T--C--AAGAT-TACCA-TTTTGA----AA-T-A-ATTT-C---A-GCA-TAA-T---G--AA--G-A-AAAAAAAta
gi|30514 : A-T-T--CAA----A-CTTG-C-ATAAT-AT-G-TTCATA-TATGAATGC-TTG-TTAAA--A-----A----CTT-ATAAAAT---C-TACA------CCTTCAC--G-C-AT---AAGA--TTT--C-AC-A-GC--T-----CT-CCA-TTA--T-A-T-A--T----TTA-CAA--TTT--TTGT---C--C--AAAAT-AGCC--TTTTGA-G--GT-T-G-ATTT-T---C-AC---AA-TAA-G--AA--G-ATAAAAAAta
gi|30515 : AT-TT-G-TTCATA-CATGAATGT-TTG-TTAAA--A-T-ACA----TTT-TAA---T---C-TGCA------CCTTCACA-G-C-AT---TAGAT-TTT--C-AC-A-GC-AT-----TT-CCA-TT---T-A-T-A--T----TTA-CAA-TTTT--ATGG---C--T--AAAAC-AGCCA-TTTCGA-GAAGA-T-A-CTTT-T---C-AAA-TAA-T-A-GTTAA--T--TAAAAAAAtata
gi|30516 : CA-TT---T-A-T-A--T----TTA-CAA-TTTT--TTGG---C--T--AAAAT-----A-TTTTGA-A--GA-T-A-A-TT-T---C-ACA-TAA-T-A-G--AA--G-ATGAAAAAAaata