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Reference ( gi|89276 ) : ATGCCTTAGTCACAAAT-GGACAACTCCCGC-ACG-AGAGTGGC-AATTTGGGACGCGAAATTC-AAATCTCCATTGTGGCAC-GATAAAACACAGC-GCTCGCCCAT--GCG----C---TCACACT-AATTACTG-ACCC--TGTACGACTGTC-TT-G--ATCAAGTCGGCGA---CGGT--TGGTGGCAAAC---ATGT--CACT-------TGTC---TCGC-GCGA---GTGTGGTAC--TGGCGGC-G-TG-CC-ACAGTGGAGT---GAGACTTGCACCACAGTGGC-T--A-CC-C--C-GTACCACTC--CG--GCGAT------TTGTCGTACTGCGGCAGT-AC----AAT---TGCAATTGA-G-T-GGCACCA
gi|89277 : ATGCCTTAGTCACAAAT-GGACAACTCCCGC-ACG-AGAGTGGC-AATTTGGGACGCGAAATTC-AAATCTCCATTGTGGCAC-GATAAAACACAGC-GCTCGCCCATTGGCG----C---TCACACT-AATTACTG-ACC---TGTACGACTGTC-TT-G--ATCAAGTCGGCGA---CGGT--TGGTGGCAAAC---ATGT--CACT-------TGTC---TCGC-GCGA---GTGTGGTAC--TGGCGGC-G-TG-CC-ACAGTGGAGT---GAGACTTGCACCACAGTGGC-T--A--C-C--C-GTA-CACTC--T---GCGAT------TTGTCGTACTGCGGCAGTGAC----AAT---TGCAATTGA-G-T-GGCACCA
gi|89278 : ATGCCTTAGTCACGAAT-GGGCGACTCCTGC-ACG-AGAATGGC-CATTTGGGACTCGAAATTC-AAATATCCATTGTAACAC-GATAAA-TGCGGT-GCTCGCCCAC--GCA----G---TCACACT-AATTACT--ACCC--CGTACGACTGTC-TTTG--ATC-----GGCGA---CGAC--TGGTGGTAGAC---ATGT--GGCC-------CGTC---TCAC-GCGA---GTGTGGTAC--TGACAAC-G-TG-CC-ACAGTGGCGC---GAGACTCGCACCATAACGGC-T--ACCC-C--C-GTACCACTT--CG--CCGAT------TTGTCGCACTGCGGTAGT-AC----AGT---TGCAATTGA-G-T-GACACCA
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gi|89286 : cataaataggcgactcccacacgaaaatggcaattgtttttgatgggggggactttctgttactttatatctgtaac-GCGA---GTGTGGTAATGG-GGCAG-TA-CC-ATTGTTGCGC---GA---GAATCGCACGGTAGCCGT-T--ACC-C-C--CGTACCATTC-CCGCGATATGTgtgtggtaatggggcagtaccattgttgcgcgagaatcgcacggtagccgttacccccgtaccattcccgcgatatgt
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gi|89276 : aATGCCTTAGTCACAAATGGACAACTCCCGC-ACG-AGAGTGGCAATTTGGGACGCGAAATTC-AAATCTCCATTGTGGCAC-GATAAAACACAGC-GCTCGCCCAT--GCGCTCAC-------ACTAATTACTGACCCTGTACGACTGTCTT-GATCAAGTCGGCGACGGTTGGTGGCAAAC-A-TGT--CAC-TTGTCT---------CGC-GCGA---GTGTGGTACTGGCGGC-G-TG-CC-ACAGTGGAGT---GA---GACTTGCACCACAGTGGC-T--A-C-C-C--CGTACCACTC-CGGCGATTTGTCGTACTGCGGCAGT-ACAATTGCAATTGA-G-T-GGCACCA
gi|89277 : ATGCCTTAGTCACAAATGGACAACTCCCGC-ACG-AGAGTGGCAATTTGGGACGCGAAATTC-AAATCTCCATTGTGGCAC-GATAAAACACAGC-GCTCGCCCATTGGCGCTCAC-------ACTAATTACTGACCT-GTACGACTGTCTT-GATCAAGTCGGCGACGGTTGGTGGCAAAC-A-TGT--CAC-TTGTCT---------CGC-GCGA---GTGTGGTACTGGCGGC-G-TG-CC-ACAGTGGAGT---GA---GACTTGCACCACAGTGGC-T--A---C-C--CGTA-CACTC-T-GCGATTTGTCGTACTGCGGCAGTGACAATTGCAATTGA-G-T-GGCACCA
gi|89278 : ATGCCTTAGTCACGAATGGGCGACTCCTGC-ACG-AGAATGGCCATTTGGGACTCGAAATTC-AAATATCCATTGTAACAC-GATAAA-TGCGGT-GCTCGCCCAC--GCAGTCAC-------ACTAATTACTA-CCCCGTACGACTGTCTTTGA-----TCGGCGACGACTGGTGGTAGAC-A-TGT--GGC-CCGTCT---------CAC-GCGA---GTGTGGTACTGACAAC-G-TG-CC-ACAGTGGCGC---GA---GACTCGCACCATAACGGC-T--ACC-C-C--CGTACCACTT-CGCCGATTTGTCGCACTGCGGTAGT-ACAGTTGCAATTGA-G-T-GACACCA
gi|89279 : ATGCCTCAGTCACAAATAGGCGACTCCCGC-ACG-ATAATGCCGATTTGGGACGCGAAATTC-AAATCTCCATTGTCGCAC-GATAAC-CATGGT-GATCGCACAC--GCGGTCAC-------ACTAACTACTGCCCCCATACGACTATCTTTTATCAAGTCTGCGACAGCTGGTGGCAGAC-A-TGT--CGC-CCGTCT---------CGC-AAGA---GTGTGGCACTGGCAGC-G-TG-CCTACAGTGGCGC---GA---GACTCGCACCATAATGGC-TACA-C-T-C--CGTACTACTC-CTGCGATTTGT-GTACT-CGGCAGT-ACGATTGTAATT-A-G-TGGGCACCA
gi|89280 : ATGCCTTAGTCACAAATGGGGGACCTCCGC-ACG-AGAATGGCGATTTGGGACGCGAAATTC-TAATTTCCATTGTGGCAC-GATAAA-CACGGC-GCCCGTCCAT--GCGGTCACGGGTCACACTAATTACTG--------------TCTTTGATCAAGTTGGCGACGGCTGGTGGCAGAC-A-TGC--CGT-CCGTCT---------CAT-GCGG---GTGTGGTACTGGCGGC-G-TG-CC-AAAGTGGCGC---AA---GACTCGCACCACAGCGGT-T--A-C-C-C--CGTGCCACTT-CGGCGATTTGTCGTACTGCGGCAGT-ACATTTACAATTGA-G-T-GGAATCA
gi|89281 : ATGCCTTAGTCACAAATGGGTGACTAGCGC-ACA-AGAATGGCGATTTGGGGCGCGGAATTA-AAATCTCCATTGTGGCAC-GATAAA-CACGAC-GTCCGCCCAC--GCGGTCAC-------ACTAATTACAGCCCTCGTACCACTGTCTTTGATCAAGTCGGCGACGGCTGGTGGCAGAC-A-TGTCCCCC-CCACCT---------GGT-GCGA---GTGTTGTACTGATGGC-G-TG-CT-TCAGTGATGC---GA---GGCTCGCACCACATCGGC-TA-A-T-C-C--CGTACCACTC-TAGCGATTTGTCGTAC---------------TGCAATTGA-G-T-ATCACCA
gi|89282 : ATGCCTTAGTCACAAATGGGCGACTCCCGC-ACG-ATAATGGCGACTTGGGACGCGAAATTC-AAAT---CATTGTCGCAC-GATAAC-CACGGC-GCTCGCCCAC--GCGGTCAC-------AC--ACTACTACACCC-TACAACTATCTTTGGTCAAGTCGGCGA----------------------------CGTCT---------CGC-GCGA---GTGTGGCACTGG-----------C-ACAGTGACAC---GA---GACTCGCACCATAAAGGC-T--A-C-CTC--CGTACCACTC-CGGCGATTTGTTATACTGCGGCAGT-ACGATTGCAATTAA-G-T-GGCACCA
gi|89283 : ATGCCTTAGTCACAAATGGGCGACTCCCGC-ACA-AGAATTGCGATTTGGGACATGGAATTC-AAATATCCATTGTGGCAC-GAAAAC-CACGGC-GCTCGTCCAC--GCGGTCAC-------TTTAATTACTGCCACCGTACGACT------------GTCGACGACGGCTGGTGA------------------CGTCT---------CGC-GCGA---GTGTGGTAC
gi|89284 : TGCCTTAGTCACAAATGGGCGAATCGCGC-AAG-ATAATGGCGATTTGGGACGCGTAATTC-AAATCTCCATTGTCGCAC-GATAAC-CACGGC-GCTCGCCCAT--GTGGTCAC-------ACTAACTACTGCCCCCGTACGACTATCTTTGATCAAGTCGGCGACAGCTGGTGGC-CAC-AGTGG--CGC-GAGACT---------CGC-AC
gi|89284 : CTGGTGGC-------C-ACAGTGGCGC---GA---GACTCGCACCATAACGGC-T--G-C-CTT--CGTACTAATCTCGGcataacggctgccttcgtactaatctcggttgagatt
gi|89285 : tgccttagtcacaaatgggcgaatcgcgcaagataatggcgatttgggacgcgtaattcaaatctccattgtcgcacgataaccacggcgctcgcccatgtggtcacactaactactgcccccgtacgactatctttgatcaagtcggcgacagTCACAAATTGG-GACTCTCGCCACGTAGAATAGCGATTTGGG-CGCGAAATTC-AAATCTCCAT----GTACTAATAAAACACGGC-GC-CGCC-AC--GCGGTCAC-------ACTATTTACTG-CCCCGTACG-CTGTC-TTGATCAAGT-GGCGACGGCTGGT-GCAG-C-A-TGT--C-T-CCGCCT---------CGC-ACGA---GCGTGGTACTG--GGC-G-TG-GC-A-AGTGGCGC---GA---GGAACG--CCACA-CGGG-T--A-CAG-C--CGTACCACTC-CGGCGATTTGT-GTATTGCGGCAGT-A-AATTGC-ATTGttgagatt
gi|89286 : CATAAATAGGCGACTCCCAC-ACG-AAAATGGCAATT
gi|89286 : AATTC-ATGTCGCCATTATTGCAC-GATA---CACGTC-GCCCGCTTAC--GCGGTCAT-------ACTAATTGTTACCCCCGTACCACTTTCGTCGATAGAGGCGGCGAgtttttgatgggggggactttctgttactttatatctgtaacaattcatgtcgccattattgcacgatacacgtcgcccgcttacgcggtcatactaattgttacccccgtaccactttcgtcgatagaggcggcgagtgtggtaatggggcagtaccattgttgcgcgagaatcgcacggtagccgttacccccgtaccattcccgcgatatgt
gi|89286 : cataaataggcgactcccacacgaaaatggcaattgtttttgatgggggggactttctgttactttatatctgtaac-GCGA---GTGTGGTAATGG-GGCAG-TA-CC-ATTGTTGCGC---GA---GAATCGCACGGTAGCCGT-T--ACC-C-C--CGTACCATTC-CCGCGATATGTgtgtggtaatggggcagtaccattgttgcgcgagaatcgcacggtagccgttacccccgtaccattcccgcgatatgt
gi|89287 : cataaataggcgactcccacacgaaaatggcaattgtttttgatgggggggactttctgttactttatatctgtaacaattcatgtcgccattattgcacgatacacgtcgcccgcttacgcggtcatactaattgttacccccgtaccactttcgtcgatagaggcgCGATTTAGGACGCGAAATTC-AAATCTCAATTTTGGCAC-GATAAA-CACGGC-GCT
gi|89288 : -CACGGC-GATCGCACAC--GGGGTCAC-------ACTAATTACTGTCCCCGTGTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCCG-TAC--CACTCCGGCTTTGTCGTACCGC-GCGATTTGTCCGCTACTG-CGGC-GATGGTC-GTACTGCGGC---GATTTG--TCGTACTGCGGCGAT-T----T-G-T--CGTACGGC----GGCGATTTGTCGTACTGCGGCAGT-ACGATTGCAATTAA-G-T-GGCACCA
gi|89289 : GGCTGGTGGCATAT-A-TGT--CGC-CCG-CT---------CGCCGCGA---GTGT---ACTGGCGAC-G-TG----ACAGTGGTGC---GA---GACTCGCACCACAGCGGC-T--A-C-C-TTACGTACAACTC-CGGCGATTTGTCCTACTGCGGCAGT-ACAATTGCAATTGA-G-T-GGCACCA
gi|89290 : -G-CG-CC-ACAGTGGCGCCGCGA---TACTCGTACCACGGCGGC-T--ACC-C-C--CGTACTACCC-CGGCGATTT