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blockSeqCons :
originalCons : TGTGTT-ACGT-T-TTG-ATAGG--TGTTT-G----T--AC-GTTATT-GC--A-C-GTT-T--T--AG-G-A-C-AAG-CA---TAGTC-AGG----TT---TCA-T-T--ACG-TTCG---TGTAG-GT-AT-T----A-TT-ACGTTT
finalCons : TGTGTT-ACGT-T-TTG-ATAGG--TGTTT-G----T--AC-GTTATT-GC--A-C-GTT-T--T--AG-G-A-C-AAG-CA---TAGTC-AGG----TT---TCA-T-T--ACG-TTCG---TGTAG-GT-AT-T----A-TT-ACGTTT
Alignments
lowQualScore : 2 2 2 2 22 4 6666 22 2 1 22 1 1 1 22 44 3 1 1 3 1 555 1 5555 333 1 3 22 4 1 666 2 2 2 6666 2 2
lowQualScore : . . . . .. . .... .. . . .. . . . .. .. . . . . . ... . .... ... . . .. . . ... . . . .... . .
lowQualScore : 2 1 1 1 88 0 2222 88 0 8 55 7 7 7 44 11 5 7 7 6 8 000 8 7777 333 9 8 66 0 9 222 0 1 1 6666 1 1
consensus : TGTGTT-ACGT-T-TTG-ATAGG--TGTTT-G----T--AC-GTTATT-GC--A-C-GTT-T--T--AG-G-A-C-AAG-CA---TAGTC-AGG----TT---TCA-T-T--ACG-TTCG---TGTAG-GT-AT-T----A-TT-ACGTTT
Reference ( family-776 ) : TGTGTT-ACGT-T-TTG-ATAGG--TGTTT-G----T--AC-GTTATT-GC--A-C-GTT-T--T--AG-G-A-C-AAG-CA---TAGTC-AGG----TT---TCA-T-T--ACG-TTCG---TGTAG-GT-AT-T----A-TT-ACGTTT
gi|120001 : TGTGTT-ACGT-T-TTG-ATAGA--TGTTT-G----T--AC-GTTATT-GC--A-C-GTT-T--T--AG-G-A-C-AAG-CA---TAGTC-AGG----TT---TCA-T-T--ACG-TTCG---TGTAG-GT-AT-T----A-TT-ACGTTT
gi|120002 : TGTGTT-ACGT-T-TTG-ATAGG--TGTTT-G----T--AC-GTTATT-GC--A-C-GTT-T--T--AG-G-A-C-AAG-CA---TAGTC-AGG-----T---TCA-T-T--ACG-TT-G---TGTAG-GT-AT-T----A-TT-ACGTTT
gi|120003 : TGTGTT-ACGT-T-T-G-ATAGG--TGTTTTG----T--AC-GTTATT-GC--A-C-GTT-T--T--AG-G-A-CTAAG-CA---TAGTC-AGG----TT---TCA-T-T--ACG-TTCG---TGTAG-GTAAT-T----A-TT-ACGTTT
gi|120004 : TGTGTT-ACGT-T-TTG-ATAGG--TGTTT-G----T--AC-GTTATT-GC--A-C-GTT-T--T--AG-G-A-C-AAG-CA---TTGTC-AGG----TT---TCA-T-T--ACG-TTTG---TATAG-GT-AT-T----A-TT-ACG
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gi|120011 : TGTGT--ACGT-TCTTG-ATAGG--TGTTTTG----T--AC-GTTAT--GC--A-C-GTT-T--TT-AGCG-A-C-AAG-GA---AGGTT-CTG----TT---TCA-TAT--ACG-TTTG---TGTAG-GT-AT-T----A-TT-ACGTTT
gi|120012 : TGT-TT-ACGT-A-TTG-ATAGGCATGTTT-G----TTAAC-GT-AT--GC--A-C-GTT-T--T--AG-G-A-C-AAGCCA---TATTC-AGG----TT---TCAGT-T--AC---TTG---T-TAG-GT-AT-T----A-TT-ACGTT
gi|120013 : TGTGTT-ACGAAT-TTG-ATAGG--TGTTT-GG---T--AC-GTTATTCGC--A-CAGCTGT--T--AGCG-A-C-A-G-CAC--TAGTC-AAGGCTTTC---TCA-T-TCTACG-TTCG---TGTAG-TG-AT-T----A-TT-ACGT
gi|120014 : TATGTC-ACGC-T-TTG-ATCGG--TGTTT-G----T--AC-GT--TT-A-------GTT-T--T--AG-A-T-C-AAG-CA---TAGTC-AGG----
gi|120015 : TGTGTC-ACGT-T-ATG-ATAGG--TGTAT-T----T--AC-GTTATT-GC--G-C-CGT-T--T--GT-G-A-C-AG--------AGTC-AGT----AT---TCA-CAT--ACGTTTTG---TTTTT-GT-ATAT----A-TT-ACATTT
gi|120016 : TGTT-AC------TG-ATAGG--TGTTT-G----T--AC-GTTATT-GC--A-C-GTT-T--T--AG-G-A-C-AAC-CA---TAGGC-AGG----TT---TCA-T-A--ACG-TTCG---TGTAG-GT-AT-TTTAAA-AT-ACGTTT
gi|120017 : TGTTCACGT-T-TTG-CTTGG--TGTTT-G----T--AC-GTTATT-GC--AGC-GTT-T--T--AG-G-A-
gi|120018 : T-AGGT-T-TTG-ATAGG--TGTTT-G----T--AC-GGTATT-GC--A-C-GTT-T--T--AG-G-A-C-AAG-CA---TAGTC-AGG----TT---TCA-T-T--ACG-TTCG---TGTAG-GT-AT-T----A-TT-ATGTTT
gi|120019 : -T-TTG-ATAGG--TGTTT-G----T--AC-GGTATT-GC--A-C-G-T-T--T--AG-G-A-C-AAG-CA---TAGTC-AGG-----T---TCA---T--ACG-TTCG---TGTAG-GT-AT-T------TT-ATGT
gi|120020 : AGG--TGTTT-GCTCGT--ACCGTTATT-GCCTA-C-GTT-T--TTAAG-G-AACGAAG-CA---TCGTC-AGC----TT---CTA-C-T--TCG-TTGG---TGCAG-GT-AT-TA---A-TT-A-GTTT
gi|120021 : TTATT-GC--A-C-GTT-T--T--AG-G-A-A-AAG-CA---TAGTC-AGG----TT---TCA-T-T--ACG-TTCG---TGTAG-GT-AT-T----A-TT-ACGTTT
gi|120022 : TTATT-GC--A-C-GTT-T--T--TG-G-A-A-AAG-CA---TAGTC-AGGT---TT---TCA-T-T--ACG-GTTG---TGTAA-G--GT-T----A-TTAACGTTT
gi|120023 : -C-GTT-T--T--AG-G-A-A-AAG-CA---TAGTC-AGG----TT---TCA-T-T--ACG-TTCG---TTTAG-