lowQualScore : 1111 11111111 1 1111 33333333333333333333 2222222 1111 11 111111 2222222 11
lowQualScore : 3 3 4444 88 3 0 8 3 3 333 2 5 44444444 2 33 3 555 888888 22 2 2 2 99 6 2 55 33 6 33 44 2 3333 33 22222222222222222222 5555 2 6666666 1 44 22 4444 1 3 22 9 88888 1 11 2 22 7 33 2 8 2 2 33 5555 2 1 2 999 55 666 55 2 33 000000 2 5555555 2 1 2 3333 66666 5555 4 2 2 2 2 00 2 3 11
lowQualScore : . . .... .. . . . . . ... . . ........ . .. . ... ...... .. . . . .. . . .. .. . .. .. . .... .. .................... .... . ....... . .. .. .... . . .. . ..... . .. . .. . .. . . . . .. .... . . . ... .. ... .. . .. ...... . ....... . . . .... ..... .... . . . . . .. . . ..
lowQualScore : 6 4 4444 00 3 4 5 1 1 444 9 0 55555555 9 99 6 000 222222 99 5 5 5 77 6 5 99 44 6 44 44 7 6666 44 11111111111111111111 7777 5 9999999 7 22 44 6666 7 3 33 1 55555 7 33 8 66 6 22 4 5 4 7 77 4444 2 5 2 222 33 111 33 2 11 999999 2 3333333 2 3 2 1111 00000 9999 3 2 4 4 4 77 7 3 33
consensus : ACATGC-TATCTGT-NT-TATGT-CA-CTACAGACTAGGTA-A-CA-G-A-TCACA-A------TATC-TACA--GNCA---CTG------AC-AG-ACC-T-ACA-GACCCT-AC--T--GCTCT--AT-GA-TGA-NG--G--G-A---G--TAT-----CGTAC--CTT-TANA-CCATA-GAGA-CCT--GT-CG-TGGCAGATA-C-TG--GGGATCTGT-----C-A--ACACG--T-TGC--G-GGGGA-CTTA-CAC---GGGG-CGTTA-CA-G-T--C---TTAT--C-A--A----G-AGTC-AC-TCAG--AC-AGGA-A--C-CAT-TC-CA--C-GAA-ATA-C-A-GA-NAGC-CACAGAAACTAGAAT
Reference ( gi|129534 ) : ACATGT-TATCTGT-CT-TATGC-CA-CTACAGACTCGGTA-A-CA-G-A-TCACA-A------TATC-TACA--GGCA---CTG------AC-AG-ACC-T-ACA-CACGCT-AC--T--GCTCT--AC-GA-TAA-AG--G--G-A---G--TAT-----CGTAC--CTT-TACA-CCATA-GAGA-CCT--GT-CC-TGGCAGATA-C-TG--GGTATCTGT-----C-A--ACATG--T-TGT--G-GGAGA-CTTA-CAC---GGGG-CGTTA-CA-G-T--C---TTAT--C-A--A----A-AATC-AC-TTCA--AC-AGGA-A--C-CAT-TT-CA--C-AGA-ATA-C-A-GA-TAGC-CACGGAAACTAGAAT
gi|129533 : ACATGC-TGTCTGT-TC-TATGT-CA-CTACAGACTAGGTA-A-CA-G-G-TCACA-A------TATC-TACA--GGCA---CTG------AC-AG-ACC-T-ACA-CACCCT-AC--T--GCTCT--AT-GA-TGA-TG--G--GAA---A--TA------CGTAT--CTT-TAGA-CGATA-GAGA-ACT--GT-CC-TGGCAGATA-C-TG--GGAATCTGT-----C-A--ACATG--T-TGT--G-GGGGA-CTTA-CAC---GGGG-CGTTG-CG-G-T--C---TTAT--C-A--A----G-AGTC-AC-TTAG--CC-AGGC-A--C-CGT-TC-CA--C-AAG-ATA-C-A-GC-TAGC-CACGGAAACTAGAAT
gi|129538 : ACATGT-TATTTGT-CC-TATGT-CA-CTACAGACTAGGTA-A-CA-G-G-TCACA--------TAT---ACA--GGCA---CTG------AC-AG-ACT----CA-CACCCT-AC--T--GCTCT--ACTGA-TGA-TG--G--G-A---GA-TA------CGTAC--CTT-TACC-CTATA-GAGA--CT--GT-CC-TGGCAGATA-C-TG--GGGATCTGT-----C-A--ACATG--T-TGT--A-GGGGA-CTTG-TAC---GGGG-CAATA-CA-G-T--C-----AT--C-A--A----G-AGTC-AC-CTTAG-ACAAGGACA--C-CAC-GT-CA--C-AAA-ATA-C-A-GA-CAGC-CACAGAAACCAGAAT
gi|129536 : ACATGC-TATTGGT-GT-TATCT-CA-CTACAGACTAGGTA-A-CA-G-A-TCCCA-G------TATC-TACA--GTCA---CTG------AC-AG-ACC-T-ACA-GACCCT-GC--T--GATCT--AT-GA-TGA-TG--GT-A-A---A--TAT------GCAC--CGT-TAGA-TGACA-GAGA-CCT--GT-CG-TGGCAGATA-C-TG--GGGATCTGT-----C-A--GCATG--T-TGT--G-GGGGA-CTTA-CAC---GGGG-CGTTA-CA-C-T--C---TTAT--C-A--A----G-AGTC-AC-TTAG--AC-AACG-A--C-AAT-AC-AA--C-AAA-ATA-C-A-GA-AAGC-GACAGAAAATAGAAT
gi|129537 : ACATGC-TATTGGT-GT-TATCT-CA-CTACAGACTAGGTA-A-CA-G-A-TCCCA-G------TCTC-TACA--GCCA---CTG------AG-AG-ACC-T-ACA-GACCCT-GC--T--GATCT--AT-GA-TGA-TG--G--C-A---GA-TAT------GTAC--CGT-TATT-CCTCA-GAGA-CCT--GT-CG-TGGCAGATA-C-TG--GGGATCTGT-----C-A--GCATG--T-TGT--G-GGGGA-CTTA-CAG---GGTG-CATTA-CA-C-T--C---TTAT--C-A--A----G-AGTC-AA-TTAG--AC-AAGA-A--C-AAA-TT-CA--C-AAA-CTA-C-A-GA-GAGC-TACAGAAAATAGAAT
gi|129541 : ACCTGT-TACTCGTTCT-TATGT-C--CTAC-GACTCGGTA-AACA-GGA-TCACA-A------TATC-TAC---GGCA---CTG------ACGAG-ACC-T-ACA-CACCCTAAC--T--G-TCTAAAT-GA-TGA-TGTTG--G-A---GGTTA------CGTGT--CAT-TATA-TCAAATGAGA-CCT--ATCCC-TGGCAGATA-C-TG--GG--TCTGTGGTTCC-AG-ACA-A--T-TGT--GTGGAGA-CCTA-TGCAATGGGG-CGTTA--A-G-T--C---TTAT--C-AAGA----A-GATC-AC-TT-A--GC-AGGA-A--C-CATGTT-CA--C-GAA-ATA-C-A-G
gi|129540 : ACATGC-TATTTGT----TATCT-CA-CTACAGACTAGGTA-A-CA---A-TT-CC-A------TATC-TAAA--GTCA---CTG------A--AG-ACC-T-ACAGAACCCT-GC--G--AATCT--AT-GA-T---AG--G--A-A---A--TAT------GTAC--CTG-TAAA-ACCCA-GA-A-CCG--GT--C-GGGCAGATA-C--G--GGGATCTG------C-A--GCATG--T-TGT--G-GT-GA-CCTA-CAC---GGGG-C-TTA-CA-C-TCAC---TTAT--C-A--A----AGAGTC-AC--TAG--AC-AAGA-A----CAT-AT-CA--CTAAATATA-C-A-GA-CAG--CACAGAAAATAAAA
gi|129539 : ACATGCCTATTGGT-GTATATCT-CAACTAC-GACTAGGTA-A-CA-G-A-TC-CAGA------TATT-TACA--GTCA---ATG------AC-AG-ACCTT-ACA-GACCCT-GCA-T--GATCT--AT-GA-TGA-TG--G--T-AAATA--TAT-----CG------TT-TACC-TC--A-GAGA-CCT--GT-CG-TGGCATATA-CTTG--GGAATCTGTA----C-A--GCATG--T-TGT--G-GGGGA-CCTA-CAC---GGG---GTTACCA-C-T--CT--TTATTCC-A--A----G-AGTC-A--TTAG--AC-A--A-A--A-TA--TG-CA--C-A-A-ATA-C-A-GA-AAGCTTACAGAAAATAGA
gi|129535 : ATATGC-TATCTAT-CC-TATGT-CA-CTACAGACTAGGTA-A-CA-A-G-TCACA-ATACATGTATC-TACA--GA-A---CTG------GC-AG-ATC-A-ACA-AACCCT-AC--T--GCTCT--AC-GA-TGA-TG--G--G-A---G--TA------CGTAC--CTT-TACA-TCAT
gi|129546 : ATGT-TGTCTGT-GT-TGTGT-AA-CTACAGACTGGGTA-A-CA-T-A-CCCCA-G------TATC-TACA--GTCA---CTG------AC-TG-ACC-T-ACA-GACCCT-GC--T--GGTCT--AT-GA-TGA-TG--G--C-A---G--ATT-----TGTAC--CTT-TAGA-GTGGA-GGGA-TGT--AT-CG-TGGCAGATA-C-TT--GGGATCTGT-----C-A--GCACG--T-TGT--G-GCGGA-TTTG-CAT---GGGG-CGTTA-CA-G-T--C---TTAT--C-A--A----G-AGTC-TA-TCGG--AC-AGGA-A--C-CAT-TC-CA--T-AAA-ATA-C-A-GA-AAGC-AACAGAAGCTAGAAT
gi|129548 : TGT-TATC-GT-CTCTATGC-CA-GCACAGACTCG-TA-A-CA-G-A-TCACA-A------TATCATACA--GGCA---CTG------AC-AG-ACC-TTACA-CACGCT-ACGCT--GCTCT--AC-GAGTAA-AG--G--G-A------TAT-----CGTAC--CTT-TACACCCATA-GAGA--CTGAGT-CC-TGGCAGAGA-C-TG--GGTATCTGT-----CAA--ACATG--TATGT--G-GGAGACCTTACCAC---GGGGCCGTTA-CA-G-TA-C---TTATA-C-A--GAGACA-AATC-ACAGTCA--AC-AGGA-A--CACAT-TTGCA--C-AGA-ATA-CAA-GA-TAGC-CA-GGAAACTAAA
gi|129549 : -TGTCTGT-GT-TGTGT-AA-CTA-AGACTGAGTA-A-CA-G-ACTCTCA-AG-----TATC-TATATTGTCA---CTGAATGGTAC-TG-ACC-T-ACA-GAC-CT-GC--T--GGTTT--AT--A-TGA-TG--GCAG-A---T--TAC-----TGT----CTTATAAG-TTG-A-GGGA-CTT--AT-CG-TGGCAGATA-C-TGTTGGGATCTGT-----C-A--GCACGGTT-TGT--G-GGGGA-GTCA--AT---GGGG-CGTTA-CA-C-T--C---TTAT--C-A--AG---A-AGTC-AC--TCAGCAC-AGGA-A--C-CAT-TC-AA--TAAGA-ATA-C-A-GA-GAG--CACAGAAGC-AGAAT
gi|129550 : T-TATGTTCA-CTAGAGACTCGGTATA-CAGG-A-TCACA-AT-----TATC-TAC---GGCA---CTG------AC-AGAACC-T-ACA-CAC-CT-AC--T--G-TCT--A
gi|129543 : TACCGACATGTTG-A-CA-A-A---ATA-A------GAGC--ACA--GGCAGCTCTT------AA-TG-ATC-T-ACA-GGTCCT-A------GTTC---AC-CA-TGGCAG--A--G-A------TAT-----CTT----CTT-TA------TG-GAGA---T--AT-CA-TGGCAGATC-C-TG--GGTATCTGT-----T-A--ACAGA--T-CTC--A-GGGAA-CATC-CAG---GATG-CTCTA-TA-C-T--C---CTAC--C-A--A----A-AATC-AC-T--A--GC-ACAA-------AT-TT-CAGTC-AAC-ATA-T-ACGACTTGC-TACACAAATGAGAATaaatgatgaatgttggannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnttaggaggtacgtgtcattatatcaaagagacctatcctggcagatactggggatct
gi|129544 : acatgctggagttcctgtgtA-G-A-GCACA-A------------ACA--GCTC---TTG------AT--G-ATC-T-ACA-GATCCT-AG--TATGCAC---AT-GG-TCA-GG--G--G-CT--G--TATGTAGGCGTGCAACTT-TA-------A-GGGA-CAT--AT-CA-TGGCAGATG-CCTG--GGTATCTGT-----C-A--ACAGG--A-TCTCAG-GGAAC-CTCA-------GGTG-CTCTA-TA-GCT--CGCTTTAA--C-G--A----ACAATC--C-TCAG--AC-AAGA-T--G-CAT-CC-CA--T-GAA-AT
gi|129552 : acatgctggaggtctttgtgttacagaacattgaccaatgG-ATC-T-ACA-GGTCCT-AG--T--TCACC--AT-GA-TCA-GG--G--G-CT--G--TAT------GTAG--ATG-TGGA-C-ATA-GAGA-CAT--AT-CA-TGGCAGATC-C-TG--GGTATCTGT-----C-A--ACAGA--T-CTC--A-GGGAA-CCTC-CAG---GCTG-CTCTA-TA-C-T--C---CTAC--C-A--A----C-AATC-TC-T------C-AGCA-ATTC-CA--TC-CA--T-AAA-ATA-C-A-AA-
gi|129551 : G-ATC-T-ACA-GGCCCT-AG--T--TCACC--AT-GA-TCA-GG--G--G-C------TATA----TGTAG--GTG-TGAA-CTTAA-GAGA-CAT--AT-CA-TGGCAGATC-C-TG--GGTATCTGT-----C-A--ACAGA--T-CTC--G-GGGAA-CTTT-CAG---GCTG-CTCTA-TA-C-T--C---CTAC--C-A--A----C-AATC-TC-TCAG--AC-AATT-T--C-CAT-TC-CA--T-GAA-ATA-C-A-AA-GTGC-TACACTAATGAGAATatgctgcactaatgagaata
gi|129550 : -AG--G--A-G---G--TA------CGTGT--CAT-TATA-TCAAA-GAGA-CCT--AT-CC-TGGCAGATA-C-TG--GGGATCTa
gi|129547 : ttatgttcactagagactcggtatacaggatcacaattatctacggcactgacagaacctacacacctactgtctaaaatgatgaatgttggannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnttTA-GAGA-TAT--TT-CAATGGCAAATC-C-TT--GGAATCTGTCA---C-A--ACAGA--TCTGC--G-GGA-A-C----CAG---GGGG-CGGCT-CATG-T--C---TTAT--CGG--A----A-GATCAAC-TCGG--AC-AAG--A--T-CATAAT-AA--T-GGA-ATATC-A-GG-AGGC-CAC
gi|129553 : atgcttttagttctatgtgaacctatggaaactcgcaaaaacaacaggaaggttctggacgagttgtacccccctctacacgtaatgatggatttatatgttgataagaatctA-GAGA-TAT--TT-CA-TGGCAGATT-C-TT--GGAGTCTGT-----C-A--ACAGA--TCTGC--G-GG-GA-CCAC-CAG---GGGG-CGCT--CAGG-T--C---TTAT--C-A--C----A-AATC-AC-TCAG--AC-AAGA-A--C-CAT-TC-CAT-C-AG--ATA-C-A-GG-AGGT-CAC
gi|129554 : tgatgatgggcgatatgtttgcagttatttgA-GGGA-CAT--AT-CA-TGGCAGCTT-C-TT--GGAATCTGT-----G-A--ACAGA--TCTGT--G-GG-GA-T----CAC---GAG------------------------------------A-AATC-AC-ACAG--AC-AAGA-G--C-CAT-TT-CA--T-GAG-ATA-C-A-GG-AAGC-CACcatcaggagaatacaa
gi|129552 : -GAGA-TCT--GT----TGACAGATA-C-CC--AGGATCTGC-----C-ATGATATG--T-
gi|129551 : gatctacaggtcctagttcaccatgatcaggggctgtatgtagatgtggacatagag-GAGA-TCT--GT----TGACAGATA-C-CC--AGGATCTGC-----C-ATGATATG--T-agggaacctccaggctgctctatactcctaccaacaatctctcagcaattccatccataaaatacaaaatgctgcactaatgagaata
gi|129544 : gatctacaggccctagttcaccatgatcaggggctatatgtaggtgtgaacttaagag-GAGATCCT--GT----TGACAGATACC-CA--GGCATCTGC-----C-ATGATATG--T-ggggaactttcaggctgctctatactcctaccaacaatctctcagacaatttccattccatgaaatacaaagtgctacactaatgagaata
gi|129545 : acatgctggaggtctttgtgttacagaacattgaccaatgagagcacaaacagctcttgatgatctacagatcctagtatgcacatggtcaggggctgtatgtaggcgtgcaactttaaggg-GAGA-TCT--GT----TGACAGATA-C-CC--AGTATCTGC-----C-A--agggaacctcaggtgctctatagctcgctttaacgaacaatcctcagacaagatgcatcccatgaaat
gi|129542 : catgctggagtttcttgtgttatcagacatattgacaatgaagcacagaacagtctgaatgatctaccaggtcctatcaacccatgatcaggggctgtatgtaaatcgtggaattaagaaaattca-GAGA-TCT--GT----TGACAGATA-C-CC--AGGATCTGC-----C-ATGATATG--T-agggaacctccaggctgcctatactacctacatacaatcaatcagacaatatccattcaataaaaacaaagtgctac
gi|129545 : acatgctggagttcttgtgttacagacatattgacacaatgagggcacaaacagctcttgatgatctacaggtcctagttcaccatgatcaggggctgtatgtagatgtggactcaagagT-CA-TGGCAGATA-C-TG--GGTATCTGT-----C-A--ACAagggaacctccaggctgctctatactcctaccaacaatcactcagacaatatccataccataaaatacagagtgctacactaatgagaata
gi|129555 : catgctggagtttcttgtgttatcagacatattgacaatgaagcacagaacagtctgaatgatctaccaggtcctatcaacccatgatcaggggctgtatgtaaatcgtggaattaagaaaatAC---GGGG-CGTTA-CA-G-T--C---TTAT--C-A--T----G-AGTC-AC-TCAG--AC-AGGA-A--C-CAG-AG-AA--C-AAA-ATA-C-A-GA-TAGC-CACAGAAACTAGAATgatctcagggaacctccaggctgcctatactacctacatacaatcaatcagacaatatccattcaataaaaacaaagtgctac
Alignments
lowQualScore : 11111111 111111111 333333333333333 11111111 11111 1111
lowQualScore : 3 2 8888 2 2 2 2 2 2 5 2 66666 4 2 00000000 2 33 1 444 111111111 2 2 2 2 22 2 55 22 4 55 2 0 1 22 2 000000000000000 888888 2 77777777 2 1 33 88 4 22 5 00000 2 2 1111 4 33 2 1 55 7777 2 3 2 777 77 555 22 77 2 2 77777777 2 2 22 1 2 2 2 2 6666 88888 6 2 22 2 2 1 2 22
lowQualScore : . . .... . . . . . . . . ..... . . ........ . .. . ... ......... . . . . .. . .. .. . .. . . . .. . ............... ...... . ........ . . .. .. . .. . ..... . . .... . .. . . .. .... . . . ... .. ... .. .. . . ........ . . .. . . . . . .... ..... . . .. . . . . ..
lowQualScore : 3 3 5555 9 9 9 9 9 7 3 7 77777 1 7 55555555 7 22 0 111 222222222 1 1 1 1 22 1 00 99 5 00 1 9 0 88 1 666666666666666 222222 1 55555555 1 7 66 00 2 99 7 88888 2 2 1111 4 11 2 0 77 2222 1 5 1 444 11 888 99 11 1 1 55555555 1 1 99 2 1 1 0 1 2222 11111 7 1 99 2 2 0 4 66
consensus : ACATGC-TATCTGTN-T-TATGT-CA-CTACAGAC-TAGGTA-A-CA-G-A-T-----CACA-A------T-ATC-TACA--GNCA---CTGA------C-AG-ACC-T-AC-AG-ACCCTA-C--T--GCTCTA--TGA-TGANG--G-GA---G--TAT-----CGTA--C--CTT-TANAC-C-ATA-GAGACCT-GTCG-TGGCAGATAC-TG--GGNATCTGT-----C-A-ACACG--T-CGCG-GGGGA-CCTA-CAC---GGGG-CGTTA-CA-C-T--C---TTAT--C--A-AG-A--G-----TC-A-C--TCAG-AC-AGGA-A--C-CAT--TC-CACAA-A--ATA-C-AGANAGC-CACAGAAACTAGAAT
Reference ( family-775 ) : ACATGC-TATCTGTN-T-TATGT-CA-CTACAGAC-TAGGTA-A-CA-G-A-T-----CACA-A------T-ATC-TACA--GNCA---CTGA------C-AG-ACC-T-AC-AG-ACCCTA-C--T--GCTCTA--TGA-TGANG--G-GA---G--TAT-----CGTA--C--CTT-TANAC-C-ATA-GAGACCT-GTCG-TGGCAGATAC-TG--GGGATCTGT-----C-A-ACACG--T-TGCG-GGGGA-CTTA-CAC---GGGG-CGTTA-CA-G-T--C---TTAT--C--A-AG-A--G-----TC-A-C--TCAG-AC-AGGA-A--C-CAT--TC-CACGA-A--ATA-C-AGANAGC-CACAGAAACTAGAAT
gi|129533 : ACATGC-TGTCTGTT-C-TATGT-CA-CTACAGAC-TAGGTA-A-CA-G-G-T-----CACA-A------T-ATC-TACA--GGCA---CTGA------C-AG-ACC-T-AC-AC-ACCCTA-C--T--GCTCTA--TGA-TGATG--G-GA---A---ATA----CGTA--T--CTT-TAGAC-G-ATA-GAGAACT-GTCC-TGGCAGATAC-TG--GGAATCTGT-----C-A-ACATG--T-TGTG-GGGGA-CTTA-CAC---GGGG-CGTTG-CG-G-T--C---TTAT--C--A-AG-A--G-----TC-A-C--TTAG-CC-AGGC-A--C-CGT--TC-CACAA-G--ATA-C-AGCTAGC-CACGGAAACTAGAAT
gi|129534 : ACATGT-TATCTGTC-T-TATGC-CA-CTACAGAC-TCGGTA-A-CA-G-A-T-----CACA-A------T-ATC-TACA--GGCA---CTGA------C-AG-ACC-T-AC-AC-ACGCTA-C--T--GCTCTA--CGA-TAAAG--G-GA---G--TAT-----CGTA--C--CTT-TACAC-C-ATA-GAGACCT-GTCC-TGGCAGATAC-TG--GGTATCTGT-----C-A-ACATG--T-TGTG-GGAGA-CTTA-CAC---GGGG-CGTTA-CA-G-T--C---TTAT--C--A-AA-A--A-----TC-A-C--TTCA-AC-AGGA-A--C-CAT--TT-CACAG-A--ATA-C-AGATAGC-CACGGAAACTAGAAT
gi|129535 : ATATGC-TATCTATC-C-TATGT-CA-CTACAGAC-TAGGTA-A-CA-A-G-T-----CACA-ATACATGT-ATC-TACA--GA-A---CTGG------C-AG-ATC-A-AC-AA-ACCCTA-C--T--GCTCTA--CGA-TGATG--G-GA---G--TA------CGTA--C--CTT-TACAT-C-AT
gi|129536 : ACATGC-TATTGGTG-T-TATCT-CA-CTACAGAC-TAGGTA-A-CA-G-A-T-----CCCA-G------T-ATC-TACA--GTCA---CTGA------C-AG-ACC-T-AC-AG-ACCCTG-C--T--GATCTA--TGA-TGATG--GTAA---A--TAT------GCA--C--CGT-TAGAT-G-ACA-GAGACCT-GTCG-TGGCAGATAC-TG--GGGATCTGT-----C-A-GCATG--T-TGTG-GGGGA-CTTA-CAC---GGGG-CGTTA-CA-C-T--C---TTAT--C--A-AG-A--G-----TC-A-C--TTAG-AC-AACG-A--C-AAT--AC-AACAA-A--ATA-C-AGAAAGC-GACAGAAAATAGAAT
gi|129537 : ACATGC-TATTGGTG-T-TATCT-CA-CTACAGAC-TAGGTA-A-CA-G-A-T-----CCCA-G------T-CTC-TACA--GCCA---CTGA------G-AG-ACC-T-AC-AG-ACCCTG-C--T--GATCTA--TGA-TGATG--G-CA---GA-TAT------GTA--C--CGT-TATTC-C-TCA-GAGACCT-GTCG-TGGCAGATAC-TG--GGGATCTGT-----C-A-GCATG--T-TGTG-GGGGA-CTTA-CAG---GGTG-CATTA-CA-C-T--C---TTAT--C--A-AG-A--G-----TC-A-A--TTAG-AC-AAGA-A--C-AAA--TT-CACAA-A--CTA-C-AGAGAGC-TACAGAAAATAGAAT
gi|129538 : ACATGT-TATTTGTC-C-TATGT-CA-CTACAGAC-TAGGTA-A-CA-G-G-T-----CACA--------T-AT---ACA--GGCA---CTGA------C-AG-ACT-C-AC-A---CCCTA-C--T--GCTCTAC-TGA-TGATG--G-GA---G---ATA----CGTA--C--CTT-TACCC-T-ATA-GAGA-CT-GTCC-TGGCAGATAC-TG--GGGATCTGT-----C-A-ACATG--T-TGTA-GGGGA-CTTG-TAC---GGGG-CAATA-CA-G-T--C-----AT--C--A-AG-A--G-----TC-ACC--TTAG-ACAAGGACA--C-CAC--GT-CACAA-A--ATA-C-AGACAGC-CACAGAAACCAGAAT
gi|129539 : ACATGCCTATTGGTG-TATATCT-CAACTAC-GAC-TAGGTA-A-CA-G-A-T-----C-CAGA------T-ATT-TACA--GTCA---ATGA------C-AG-ACCTT-AC-AG-ACCCTG-CA-T--GATCTA--TGA-TGATG--G-TAAATA--TAT-----CGT-------TT----AC-C-TCA-GAGACCT-GTCG-TGGCATATACTTG--GGAATCTGTA----C-A-GCATG--T-TGTG-GGGGA-CCTA-CAC---GGG---GTTACCA-C-T--CT--TTATTCC--A-AG-A--G-----TC-A----TTAG-AC-A--A-A-----ATA-TG-CAC-A-A--ATA-C-AGAAAGCTTACAGAAAATAGA
gi|129540 : ACATGC-TATTTGT----TATCT-CA-CTACAGAC-TAGGTA-A-CA---A-T-----T-CC-A------T-ATC-TAAA--GTCA---CTGA--------AG-ACC-T-AC-AGAACCCTG-C--G--AATCTA--TGA-T--AG--G-AA---A--TAT------GTA--C--CTG-TAAAA-C-CCA-GA-ACCG-GTCG--GGCAGATAC--G--GGGATCTG------C-A-GCATG--T-TGT--GGTGA-CCTA-CAC---GGGG-C-TTA-CA-C-TCAC---TTAT--CA-A-AG-A--G-----TC-A-C--T-AG-AC-AAGA-A----CAT--AT-CACTA-AATATA-C-AGACAG--CACAGAAAATAAAA
gi|129541 : ACCTGT-TACTCGTTCT-TATGT-C--CTAC-GAC-TCGGTA-AACA-GGA-T-----CACA-A------T-ATC-TAC---GGCA---CTGA------CGAG-ACC-T-AC-AC-ACCCTAAC--T--G-TCTAAATGA-TGATGTTG-GA---GGTTA------CGTG--T--CAT-TATAT-C-AAATGAGACCT-ATCCCTGGCAGATAC-TG--GG--TCTGTGGTTCC-AGACA-A--T-TGTGTGGAGA-CCTA-TGCAATGGGG-CGTTA--A-G-T--C---TTAT--C--A-AG-AAGA-----TC-A-C--TTAG--C-AGGA-A--C-CATG-TT-CACGA-A--ATA-C-AG
gi|129542 : TC-T-TGTGT-----TACAGACATAT-TG-A-CACA-A-TGAGGGCACA-A-------------ACA--GCTC---TTGA------T--G-ATC-T-AC-AG-GTCCTA-G--T--TCACCA--TGA-TCAGG--G-GCT--G--TAT------GTA--G--ATG-TGGACTC-A-A-GAGACAT-ATCA-TGGCAGATCC-TG--GGTATCTGT-----C-A-ACAGA--T-CTCA-GGGAA-CCTC-CAG---GCTG-CTCTA-TA-C-T--C---CTAC--C--A-AC-A--A-----TC-A-C--TCAG-AC-AATA-T--C-CAT--AC-CATAA-A--ATA-C-AGAGTGC-TACACTAATGAGAAT
gi|129543 : acatgctggagtACA--GGCAGCTCTTA------A-TG-ATC-T-AC-AG-GTCCTA-G--T--TCACCA--TG---GCAG--A-GA------TAT-----CTT------CTT-TA-------TG-GAGA--T-ATCA-TGGCAGATCC-TG--GGTATCTGT-----T-A-ACAGA--T-CTCA-GGGAA-CATC-CAG---GATG-CTCTA-TA-C-T--C---CTAC--C--A-AA-A--A-----TC-A-C--T-AG--C-ACAA-ATTT-CAG--TC-AAC-A-T--ATA-C-GACTTGC-TACACAAATGAGAATa
gi|129544 : acatgctggagttcctgtgttaccgacatgttgacaaaataagagcA-G-A-G-----CACA-A-------------ACA--GCTC---TTGA------T--G-ATC-T-AC-AG-ATCCTA-G--TATGCAC-A--TGG-TCAGG--G-GCT--G--TATGTAGGCGTG--CAACTT-TA--------A-GGGACAT-ATCA-TGGCAGATGCCTG--GGTATCTGT-----C-A-ACAGGA-T-CTCA-GGGAA-CCT--CA----GGTG-CTCTA-TA-GCT--CGCTTTAA--CG-A-AC-A--A-----TC---C--TCAG-AC-AAGA-T--G-CAT--CC-CATGA-A--AT
gi|129545 : acatgctggaggtctttgtgttacagaacattgaccaatgACA--GTC-----TGA------A-TG-ATC-T-ACCAG-GTCCTA-T--C--AACCCA--TGA-TCAGG--G-GCT--G--TAT------GTAAAT--CGT-GGAAT-T-A-A-GAAAATT---CA-TGGCAGATAC-TG--GGTATCTGT-----C-A-ACAGA--T-CTCA-GGGAA-CCTC-CAG---GCTG-C-CTA-TA-C-TA-C---CTA---C--ATAC-A--A-----TC-A-A--TCAG-AC-AATA-T--C-CAT--TC-AATAA-A--A-A-C-AAAGTGC-TAC
gi|129546 : catgctggagtttcttgtgttatcagacatattgacaatgaagcacagaATGT-TGTCTGTG-T-TGTGT-AA-CTACAGAC-TGGGTA-A-CA-T-A-C-----CCCA-G------T-ATC-TACA--GTCA---CTGA------C-TG-ACC-T-AC-AG-ACCCTG-C--T--GGTCTA--TGA-TGATG--G-CA---G--ATT-----TGTA--C--CTT-TAGAG-T-GGA-GGGATGT-ATCG-TGGCAGATAC-TT--GGGATCTGT-----C-A-GCACG--T-TGTG-GCGGA-TTTG-CAT---GGGG-CGTTA-CA-G-T--C---TTAT--C--A-AG-A--G-----TC-T-A--TCGG-AC-AGGA-A--C-CAT--TC-CATAA-A--ATA-C-AGAAAGC-AACAGAAGCTAGAAT
gi|129547 : TA-GAGATAT-TTCAATGGCAAATCC-TT--GGAATCTGTCA---C-A-ACAGA--TCTGC--GGGAA-C----CAG---GGGG-CGGCT-CATG-T--C---TTAT--CGGA-AG-A--------TCAA-C--TCGG-AC-AAG--A--T-CATAAT--AATGG-A--ATATC-AGGAGGC-CAC
gi|129548 : atgcttttagttctatgtgaacctatggaaactcgcaaaaacaacaggaaggttctggacgagttgtacccccctctacacgtaatgatggatttatatgttgataagaatctTGT-TATC-GTC-TCTATGC-CA-GCACAGAC-TCG-TA-A-CA-G-A-T-----CACA-A------T-ATCATACA--GGCA---CTGA------C-AG-ACC-TTAC-AC-ACGCTA-CGCT--GCTCTA--CGAGTAAAG--G-GA------TAT-----CGTA--C--CTT-TACAC-CCATA-GAGACTGAGTCC-TGGCAGAGAC-TG--GGTATCTGT-----CAA-ACATG--TATGTG-GGAGACCTTACCAC---GGGGCCGTTA-CA-G-TA-C---TTAT--A--C-AG-A--GACAAATC-A-CAGTCA--AC-AGGA-A--CACAT--TTGCACAG-A--ATA-CAAGATAGC-CA-GGAAACTAAA
gi|129549 : -TGTCTGTG-T-TGTGT-AA-CTA-AGAC-TGAGTA-A-CA-G-ACT-----CTCA-AG-----T-ATC-TATATTGTCA---CTGAATGGTAC-TG-ACC-T-AC-AG-ACC-TG-C--T--GGTTTA--T-A-TGATG--G-CA---GATTAC-----TGT------CTTATAAGT-T-G-A-GGGACTT-ATCG-TGGCAGATAC-TGTTGGGATCTGT-----C-A-GCACGGTT-TGTG-GGGGA-GTCA--AT---GGGG-CGTTA-CA-C-T--C---TTAT--C--A-AGAA--G-----TC-A-C--TCAGCAC-AGGA-A--C-CAT--TC-AATAAGA--ATA-C-AGAGAG--CACAGAAGC-AGAAT
gi|129550 : -T-TATGTTCA-CTAGAGAC-TCGGTATA-CA-GGA-T-----CACA-A------TTATC-TAC---GGCA---CTGA------C-AGAACC-T-AC-AC-A-CCTA-C--T--G-TCTA--AAA-TGATG--
gi|129550 : G--G-AG---G--TA------CGTG--T--CAT-TATAT-C-AAA-GAGACCT-ATCC-TGGCAGATAC-TG--GGGATCTaatgttggannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnttaggaggtacgtgtcattatatcaaagagacctatcctggcagatactggggatct
gi|129551 : ttatgttcactagagactcggtatacaggatcacaattatctacggcactgacagaacctacacacctactgtctaaaatgatgaatgttggannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnttaG-ATC-T-AC-AG-GCCCTA-G--T--TCACCA--TGA-TCAGG--G-GCT--A--TAT------GTA--G--GTG-TGAAC-T-TAA-GAGACAT-ATCA-TGGCAGATCC-TG--GGTATCTGT-----C-A-ACAGA--T-CTCG-GGGAA-CTTT-CAG---GCTG-CTCTA-TA-C-T--C---CTAC--C--A-AC-A--A-----TC-T-C--TCAG-AC-AATT-T--C-CAT--TC-CATGA-A--ATA-C-AAAGTGC-TACACTAATGAGAAT
gi|129552 : G-ATC-T-AC-AG-GTCCTA-G--T--TCACCA--TGA-TCAGG--G-GCT--G--TAT------GTA--G--ATG-TGGAC---ATA-GAGACAT-ATCA-TGGCAGATCC-TG--GGTATCTGT-----C-A-ACAGA--T-CTCA-GGGAA-CCTC-CAG---GCTG-CTCTA-TA-C-T--C---CTAC--C--A-AC-A--A-----TC-T-C--TCAG--C----A-ATTC-CA---TC-CATAA-A--ATA-C-AAAATGC-TGCACTAATGAGAATa
gi|129555 : AC---GGGG-CGTTA-CA-G-T--C---TTAT--C--A-TG-A--G-----TC-A-C--TCAG-AC-AGGA-A--C-CAG--AG-AACAA-A--ATA-C-AGATAGC-CACAGAAACTAGAATa
2 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|129553 ): TGATGATGGGCGATATGTTTGCAGTTATTTGAGAGATATTTCATGGCAGATTCTTGGAGTCTGTCAACAGATCTGCGGGGACCACCAGGGGGCGCTCAGGTCTTATCACAAATCACTCAGACAAGAACCATTCCATCAGATACAGGAGGTCACCATCAGGAGAATACAA
Unaligned ( gi|129554 ): AGGGACATATCATGGCAGCTTCTTGGAATCTGTGAACAGATCTGTGGGGATCACGAGAAATCACACAGACAAGAGCCATTTCATGAGATACAGGAAGCCAC
Alignments
lowQualScore : 11111111 111111111 333333333333333 11111111 11111 1111
lowQualScore : 3 2 8888 2 2 2 2 2 2 5 2 66666 4 2 00000000 2 33 1 444 111111111 2 2 2 2 2 2 55 22 4 55 2 0 1 22 2 000000000000000 888888 2 77777777 2 1 33 88 4 22 3 00000 2 2 1111 5555555 33 55 7777 2 3 2 444 77 555 22 77 2 2 77777777 2 2 22 1 4 2 333333333 7777 22 2 555 2 2 2 2 33 2 22
lowQualScore : . . .... . . . . . . . . ..... . . ........ . .. . ... ......... . . . . . . .. .. . .. . . . .. . ............... ...... . ........ . . .. .. . .. . ..... . . .... ....... .. .. .... . . . ... .. ... .. .. . . ........ . . .. . . . ......... .... .. . ... . . . . .. . ..
lowQualScore : 3 3 5555 9 9 9 9 9 7 3 7 77777 1 7 55555555 7 22 0 111 222222222 1 1 1 1 1 1 00 99 5 00 1 9 0 88 1 666666666666666 222222 1 55555555 1 7 66 00 2 99 1 88888 2 2 1111 4444444 55 77 2222 1 5 1 333 11 888 99 11 1 1 55555555 1 1 99 2 2 1 999999999 3333 99 1 888 1 2 2 2 44 4 66
consensus : ACATGC-TATCTGTN-T-TATGT-CA-CTACAGAC-TAGGTA-A-CA-G-A-T-----CACA-A------T-ATC-TACA--GNCA---CTGA------C-AG-ACC-T-AC-AG-ACCCTA-C--T--GCTCTA--TGA-TGANG--G-GA---G--TAT-----CGTA--C--CTT-TANAC-C-ATA-GAGACCT-GTCG-TGGCAGATAC-TG--GGNATCTGT-----C-A-ACACG--T-C-GCG-GGGGACC-TA-CAC---GGGG-CGTTA-CA-C-T--C---TTAT--C--A-AG-A--G-----TC-A-C--TCAG-AC-AGGA-A--C-CAT-TC-CA--C-AA---A-ATA-C-A-GA-NAGC-CACAGAAACTAGAAT
Reference ( family-775 ) : ACATGC-TATCTGTN-T-TATGT-CA-CTACAGAC-TAGGTA-A-CA-G-A-T-----CACA-A------T-ATC-TACA--GNCA---CTGA------C-AG-ACC-T-AC-AG-ACCCTA-C--T--GCTCTA--TGA-TGANG--G-GA---G--TAT-----CGTA--C--CTT-TANAC-C-ATA-GAGACCT-GTCG-TGGCAGATAC-TG--GGNATCTGT-----C-A-ACACG--T-C-GCG-GGGGACC-TA-CAC---GGGG-CGTTA-CA-C-T--C---TTAT--C--A-AG-A--G-----TC-A-C--TCAG-AC-AGGA-A--C-CAT-TC-CA--C-AA---A-ATA-C-A-GA-NAGC-CACAGAAACTAGAAT
gi|129533 : ACATGC-TGTCTGTT-C-TATGT-CA-CTACAGAC-TAGGTA-A-CA-G-G-T-----CACA-A------T-ATC-TACA--GGCA---CTGA------C-AG-ACC-T-AC-AC-ACCCTA-C--T--GCTCTA--TGA-TGATG--G-GA---A---ATA----CGTA--T--CTT-TAGAC-G-ATA-GAGAACT-GTCC-TGGCAGATAC-TG--GGAATCTGT-----C-A-ACATG--T-T-GTG-GGGGACT-TA-CAC---GGGG-CGTTG-CG-G-T--C---TTAT--C--A-AG-A--G-----TC-A-C--TTAG-CC-AGGC-A--C-CGT-TC-CA--C-AA---G-ATA-C-A-GC-TAGC-CACGGAAACTAGAAT
gi|129534 : ACATGT-TATCTGTC-T-TATGC-CA-CTACAGAC-TCGGTA-A-CA-G-A-T-----CACA-A------T-ATC-TACA--GGCA---CTGA------C-AG-ACC-T-AC-AC-ACGCTA-C--T--GCTCTA--CGA-TAAAG--G-GA---G--TAT-----CGTA--C--CTT-TACAC-C-ATA-GAGACCT-GTCC-TGGCAGATAC-TG--GGTATCTGT-----C-A-ACATG--T-T-GTG-GGAGACT-TA-CAC---GGGG-CGTTA-CA-G-T--C---TTAT--C--A-AA-A--A-----TC-A-C--TTCA-AC-AGGA-A--C-CAT-TT-CA--C-AG---A-ATA-C-A-GA-TAGC-CACGGAAACTAGAAT
gi|129535 : ATATGC-TATCTATC-C-TATGT-CA-CTACAGAC-TAGGTA-A-CA-A-G-T-----CACA-ATACATGT-ATC-TACA--GA-A---CTGG------C-AG-ATC-A-AC-AA-ACCCTA-C--T--GCTCTA--CGA-TGATG--G-GA---G--TA------CGTA--C--CTT-TACAT-C-AT
gi|129536 : ACATGC-TATTGGTG-T-TATCT-CA-CTACAGAC-TAGGTA-A-CA-G-A-T-----CCCA-G------T-ATC-TACA--GTCA---CTGA------C-AG-ACC-T-AC-AG-ACCCTG-C--T--GATCTA--TGA-TGATG--GTAA---A--TAT------GCA--C--CGT-TAGAT-G-ACA-GAGACCT-GTCG-TGGCAGATAC-TG--GGGATCTGT-----C-A-GCATG--T-T-GTG-GGGGACT-TA-CAC---GGGG-CGTTA-CA-C-T--C---TTAT--C--A-AG-A--G-----TC-A-C--TTAG-AC-AACG-A--C-AAT-AC-AA--C-AA---A-ATA-C-A-GA-AAGC-GACAGAAAATAGAAT
gi|129537 : ACATGC-TATTGGTG-T-TATCT-CA-CTACAGAC-TAGGTA-A-CA-G-A-T-----CCCA-G------T-CTC-TACA--GCCA---CTGA------G-AG-ACC-T-AC-AG-ACCCTG-C--T--GATCTA--TGA-TGATG--G-CA---GA-TAT------GTA--C--CGT-TATTC-C-TCA-GAGACCT-GTCG-TGGCAGATAC-TG--GGGATCTGT-----C-A-GCATG--T-T-GTG-GGGGACT-TA-CAG---GGTG-CATTA-CA-C-T--C---TTAT--C--A-AG-A--G-----TC-A-A--TTAG-AC-AAGA-A--C-AAA-TT-CA--C-AA---A-CTA-C-A-GA-GAGC-TACAGAAAATAGAAT
gi|129538 : ACATGT-TATTTGTC-C-TATGT-CA-CTACAGAC-TAGGTA-A-CA-G-G-T-----CAC--A------T-A---TACA--GGCA---CTGA------C-AG-ACT-C-AC----ACCCTA-C--T--GCTCTAC-TGA-TGATG--G-GA---G---ATA----CGTA--C--CTT-TACCC-T-ATA-GAGA-CT-GTCC-TGGCAGATAC-TG--GGGATCTGT-----C-A-ACATG--T-T-GTA-GGGGACT-TG-TAC---GGGG-CAATA-CA-G-T--C-----AT--C--A-AG-A--G-----TC-ACC--TTAG-ACAAGGACA--C-CAC-GT-CA--C-AA---A-ATA-C-A-GA-CAGC-CACAGAAACCAGAAT
gi|129539 : ACATGCCTATTGGTG-TATATCT-CAACTAC-GAC-TAGGTA-A-CA-G-A-T-----C-CAGA------T-ATT-TACA--GTCA---ATGA------C-AG-ACCTT-AC-AG-ACCCTG-CA-T--GATCTA--TGA-TGATG--G-TAAATA--TAT-----CGT-------TT----AC-C-TCA-GAGACCT-GTCG-TGGCATATACTTG--GGAATCTGTA----C-A-GCATG--T-T-GTG-GGGGACC-TA-CAC---GGG---GTTACCA-C-T--CT--TTATTCC--A-AG-A--G-----TC-A----TTAG-AC-A--A-A-----ATATG-CA--C--A---A-ATA-C-A-GA-AAGCTTACAGAAAATAGA
gi|129540 : ACATGC-TATTTGT----TATCT-CA-CTACAGAC-TAGGTA-A-CA---A-T-----T-CC-A------T-ATC-TAAA--GTCA---CTGA--------AG-ACC-T-AC-AGAACCCTG-C--G--AATCTA--TGA-T--AG--G-AA---A--TAT------GTA--C--CTG-TAAAA-C-CCA-GA-ACCG-GTCG--GGCAGATAC--G--GGGATCTG------C-A-GCATG--T-T-GT--GGTGACC-TA-CAC---GGGG-C-TTA-CA-C-TCAC---TTAT--CA-A-AG-A--G-----TC-A-C--T-AG-AC-AAGA-A----CAT-AT-CA--CTAA---ATATA-C-A-GA-CAG--CACAGAAAATAAAA
gi|129541 : ACCTGT-TACTCGTTCT-TATGT-C--CTAC-GAC-TCGGTA-AACA-GGA-T-----CACA-A------T-ATC-TAC---GGCA---CTGA------CGAG-ACC-T-AC-AC-ACCCTAAC--T--G-TCTAAATGA-TGATGTTG-GA---GGTTA------CGTG--T--CAT-TATAT-C-AAATGAGACCT-ATCCCTGGCAGATAC-TG--GG--TCTGTGGTTCC-AGACA-A--T-T-GTGTGGAGACC-TA-TGCAATGGGG-CGTTA--A-G-T--C---TTAT--C--A-AG-AAGA-----TC-A-C--TTAG--C-AGGA-A--C-CATGTT-CA--C-GA---A-ATA-C-A-G
gi|129542 : TC-T-TGTGT-----TACAGACATAT-TG-A-CACA-A-TGAGGGCACA-A-------------ACA--GCTC---TTGA------T--G-ATC-T-AC-AG-GTCCTA-G--T--TCACCA--TGA-TCAGG--G-GCT--G--TAT------GTA--G--ATG-TGGACTC-A-A-GAGACAT-ATCA-TGGCAGATCC-TG--GGTATCTGT-----C-A-ACAGA--T-C-TCA-GGGAACC-TC-CAG---GCTG-CTCTA-TA-C-T--C---CTAC--C--A-AC-A--A-----TC-A-C--TCAG-AC-AATA-T--C-CAT-AC-CA--T-AA---A-ATA-C-A-GA-GTGC-TACACTAATGAGAAT
gi|129543 : acatgctggagtACA--GGCAGCTCTTA------A-TG-ATC-T-AC-AG-GTCCTA-G--T--TCACCA--TG---GCAG--A-GA------TAT-----CTT------CTT-TA-------TG-GAGA--T-ATCA-TGGCAGATCC-TG--GGTATCTGT-----T-A-ACAGA--T-C-TCA-GGGAACA-TC-CAG---GATG-CTCTA-TA-C-T--C---CTAC--C--A-AA-A--A-----TC-A-C--T-AGCAC-AA---------AT-TT-CAGTC-AA---C-ATA-T-ACGACTTGC-TACACAAATGAGAATa
gi|129544 : acatgctggagttcctgtgttaccgacatgttgacaaaataagagcA-G-A-G-----CACA-A-------------ACA--GCTC---TTGA------T--G-ATC-T-AC-AG-ATCCTA-G--TATGCAC-A--TGG-TCAGG--G-GCT--G--TATGTAGGCGTG--CAACTT-TA--------A-GGGACAT-ATCA-TGGCAGATGCCTG--GGTATCTGT-----C-A-ACAGGA-T-C-TCA-GGGAACC-T--CA----GGTG-CTCTA-TAGC-T--CGCTTTAA--CG-A-AC-A--A-----TC---C--TCAG-AC-AAGA-T--G-CAT-CC-CA--T-GA---A-AT
gi|129545 : acatgctggaggtctttgtgttacagaacattgaccaatgACA--GTC-----TGA------A-TG-ATC-T-ACCAG-GTCCTA-T--C--AACCCA--TGA-TCAGG--G-GCT--G--TAT------GTAAAT--CGT-GGAAT-T-A-A-GAAAATT---CA-TGGCAGATAC-TG--GGTATCTGT-----C-A-ACAGA--T-C-TCA-GGGAACC-TC-CAG---GCTG-C-CTA-TA-C-TA-C---CTA---C--ATAC-A--A-----TC-A-A--TCAG-AC-AATA-T--C-CAT-TC-AA--T-AA---A-A-A-C-A-AA-GTGC-TAC
gi|129546 : catgctggagtttcttgtgttatcagacatattgacaatgaagcacagaATGT-TGTCTGTG-T-TGTGT-AA-CTACAGAC-TGGGTA-A-CA-T-A-C-----CCCA-G------T-ATC-TACA--GTCA---CTGA------C-TG-ACC-T-AC-AG-ACCCTG-C--T--GGTCTA--TGA-TGATG--G-CA---G--ATT-----TGTA--C--CTT-TAGAG-T-GGA-GGGATGT-ATCG-TGGCAGATAC-TT--GGGATCTGT-----C-A-GCACG--T-T-GTG-GCGGATT-TG-CAT---GGGG-CGTTA-CA-G-T--C---TTAT--C--A-AG-A--G-----TC-T-A--TCGG-AC-AGGA-A--C-CAT-TC-CA--T-AA---A-ATA-C-A-GA-AAGC-AACAGAAGCTAGAAT
gi|129547 : TA-GAGATAT-TTCAATGGCAAATCC-TT--GGAATCTGTCA---C-A-ACAGA--T-CTGC--GGGAAC-----CAG---GGGG-CGGCT-CA-TGT--C---TTAT--CGGA-AG-A--------TCAA-C--TCGG-AC-AAG--A--T-CAT----AA--T-AATGGA-ATATC-A-GG-AGGC-CAC
gi|129548 : atgcttttagttctatgtgaacctatggaaactcgcaaaaacaacaggaaggttctggacgagttgtacccccctctacacgtaatgatggatttatatgttgataagaatctTGT-TATC-GTC-TCTATGC-CA-GCACAGAC-TCG-TA-A-CA-G-A-T-----CACA-A------T-ATCATACA--GGCA---CTGA------C-AG-ACC-TTAC-AC-ACGCTA-CGCT--GCTCTA--CGAGTAAAG--G-GA------TAT-----CGTA--C--CTT-TACAC-CCATA-GAGACTGAGTCC-TGGCAGAGAC-TG--GGTATCTGT-----CAA-ACATG--TAT-GTG-GGAGACCTTACCAC---GGGGCCGTTA-CA-G-TA-C---TTAT--A--C-AG-A--GACAAATC-A-CAGTCA--AC-AGGA-A--CACAT-TTGCA--C-AG---A-ATA-CAA-GA-TAGC-CA-GGAAACTAAA
gi|129549 : -TGTCTGTG-T-TGTGT-AA-CTA-AGAC-TGAGTA-A-CA-G-ACT-----CTCA-AG-----T-ATC-TATATTGTCA---CTGAATGGTAC-TG-ACC-T-AC-AG-ACC-TG-C--T--GGTTTA--T-A-TGATG--G-CA---GATTAC-----TGT------CTTATAAGT-T-G-A-GGGACTT-ATCG-TGGCAGATAC-TGTTGGGATCTGT-----C-A-GCACGGTT-T-GTG-GGGGAGT-CA--AT---GGGG-CGTTA-CA-C-T--C---TTAT--C--A-AGAA--G-----TC-A-C--TCAGCAC-AGGA-A--C-CAT-TC-AA--T-AAG--A-ATA-C-A-GA-GAG--CACAGAAGC-AGAAT
gi|129550 : -T-TATGTTCA-CTAGAGAC-TCGGTATA-CA-GGA-T-----CACA-A------TTATC-TAC---GGCA---CTGA------C-AGAACC-T-AC-AC-A-CCTA-C--T--G-TCTA--AAA-TGATG--
gi|129550 : G--G-AG---G--TA------CGTG--T--CAT-TATAT-C-AAA-GAGACCT-ATCC-TGGCAGATAC-TG--GGGATCTaatgttggannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnttaggaggtacgtgtcattatatcaaagagacctatcctggcagatactggggatct
gi|129551 : ttatgttcactagagactcggtatacaggatcacaattatctacggcactgacagaacctacacacctactgtctaaaatgatgaatgttggannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnttaG-ATC-T-AC-AG-GCCCTA-G--T--TCACCA--TGA-TCAGG--G-GCT--A--TAT------GTA--G--GTG-TGAAC-T-TAA-GAGACAT-ATCA-TGGCAGATCC-TG--GGTATCTGT-----C-A-ACAGA--T-C-TCG-GGGAACT-TT-CAG---GCTG-CTCTA-TA-C-T--C---CTAC--C--A-AC-A--A-----TC-T-C--TCAG-AC-AATT-T--C-CAT-TC-CA--T-GA---A-ATA-C-A-AA-GTGC-TACACTAATGAGAAT
gi|129552 : G-ATC-T-AC-AG-GTCCTA-G--T--TCACCA--TGA-TCAGG--G-GCT--G--TAT------GTA--G--ATG-TGGAC---ATA-GAGACAT-ATCA-TGGCAGATCC-TG--GGTATCTGT-----C-A-ACAGA--T-C-TCA-GGGAACC-TC-CAG---GCTG-CTCTA-TA-C-T--C---CTAC--C--A-AC-A--A-----TC-T-C--TCAG--C----A-ATTC-CA--TC-CA--T-AA---A-ATA-C-A-AA-ATGC-TGCACTAATGAGAATa
gi|129555 : AC---GGGG-CGTTA-CA-G-T--C---TTAT--C--A-TG-A--G-----TC-A-C--TCAG-AC-AGGA-A--C-CAG-AG-AA--C-AA---A-ATA-C-A-GA-TAGC-CACAGAAACTAGAATa
2 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|129553 ): TGATGATGGGCGATATGTTTGCAGTTATTTGAGAGATATTTCATGGCAGATTCTTGGAGTCTGTCAACAGATCTGCGGGGACCACCAGGGGGCGCTCAGGTCTTATCACAAATCACTCAGACAAGAACCATTCCATCAGATACAGGAGGTCACCATCAGGAGAATACAA
Unaligned ( gi|129554 ): AGGGACATATCATGGCAGCTTCTTGGAATCTGTGAACAGATCTGTGGGGATCACGAGAAATCACACAGACAAGAGCCATTTCATGAGATACAGGAAGCCAC
Alignments
lowQualScore : 11111111 111111111 333333333333333 11111111 11111 1111
lowQualScore : 3 2 8888 2 2 2 2 2 2 5 2 66666 4 2 00000000 2 33 1 444 111111111 2 2 2 2 2 2 55 22 4 55 2 0 1 22 2 000000000000000 888888 2 77777777 2 1 33 88 4 22 3 00000 2 2 1111 5555555 33 55 7777 2 3 2 444 77 555 22 77 2 2 77777777 2 2 22 1 4 2 333333333 7777 22 2 555 2 2 2 2 33 2 22
lowQualScore : . . .... . . . . . . . . ..... . . ........ . .. . ... ......... . . . . . . .. .. . .. . . . .. . ............... ...... . ........ . . .. .. . .. . ..... . . .... ....... .. .. .... . . . ... .. ... .. .. . . ........ . . .. . . . ......... .... .. . ... . . . . .. . ..
lowQualScore : 3 3 5555 9 9 9 9 9 7 3 7 77777 1 7 55555555 7 22 0 111 222222222 1 1 1 1 1 1 00 99 5 00 1 9 0 88 1 666666666666666 222222 1 55555555 1 7 66 00 2 99 1 88888 2 2 1111 4444444 55 77 2222 1 5 1 333 11 888 99 11 1 1 55555555 1 1 99 2 2 1 999999999 3333 99 1 888 1 2 2 2 44 4 66
consensus : ACATGC-TATCTGTN-T-TATGT-CA-CTACAGAC-TAGGTA-A-CA-G-A-T-----CACA-A------T-ATC-TACA--GNCA---CTGA------C-AG-ACC-T-AC-AG-ACCCTA-C--T--GCTCTA--TGA-TGANG--G-GA---G--TAT-----CGTA--C--CTT-TANAC-C-ATA-GAGACCT-GTCG-TGGCAGATAC-TG--GGNATCTGT-----C-A-ACACG--T-C-GCG-GGGGACC-TA-CAC---GGGG-CGTTA-CA-C-T--C---TTAT--C--A-AG-A--G-----TC-A-C--TCAG-AC-AGGA-A--C-CAT-TC-CA--C-AA---A-ATA-C-A-GA-NAGC-CACAGAAACTAGAAT
Reference ( family-775 ) : ACATGC-TATCTGTN-T-TATGT-CA-CTACAGAC-TAGGTA-A-CA-G-A-T-----CACA-A------T-ATC-TACA--GNCA---CTGA------C-AG-ACC-T-AC-AG-ACCCTA-C--T--GCTCTA--TGA-TGANG--G-GA---G--TAT-----CGTA--C--CTT-TANAC-C-ATA-GAGACCT-GTCG-TGGCAGATAC-TG--GGNATCTGT-----C-A-ACACG--T-C-GCG-GGGGACC-TA-CAC---GGGG-CGTTA-CA-C-T--C---TTAT--C--A-AG-A--G-----TC-A-C--TCAG-AC-AGGA-A--C-CAT-TC-CA--C-AA---A-ATA-C-A-GA-NAGC-CACAGAAACTAGAAT
gi|129533 : ACATGC-TGTCTGTT-C-TATGT-CA-CTACAGAC-TAGGTA-A-CA-G-G-T-----CACA-A------T-ATC-TACA--GGCA---CTGA------C-AG-ACC-T-AC-AC-ACCCTA-C--T--GCTCTA--TGA-TGATG--G-GA---A---ATA----CGTA--T--CTT-TAGAC-G-ATA-GAGAACT-GTCC-TGGCAGATAC-TG--GGAATCTGT-----C-A-ACATG--T-T-GTG-GGGGACT-TA-CAC---GGGG-CGTTG-CG-G-T--C---TTAT--C--A-AG-A--G-----TC-A-C--TTAG-CC-AGGC-A--C-CGT-TC-CA--C-AA---G-ATA-C-A-GC-TAGC-CACGGAAACTAGAAT
gi|129534 : ACATGT-TATCTGTC-T-TATGC-CA-CTACAGAC-TCGGTA-A-CA-G-A-T-----CACA-A------T-ATC-TACA--GGCA---CTGA------C-AG-ACC-T-AC-AC-ACGCTA-C--T--GCTCTA--CGA-TAAAG--G-GA---G--TAT-----CGTA--C--CTT-TACAC-C-ATA-GAGACCT-GTCC-TGGCAGATAC-TG--GGTATCTGT-----C-A-ACATG--T-T-GTG-GGAGACT-TA-CAC---GGGG-CGTTA-CA-G-T--C---TTAT--C--A-AA-A--A-----TC-A-C--TTCA-AC-AGGA-A--C-CAT-TT-CA--C-AG---A-ATA-C-A-GA-TAGC-CACGGAAACTAGAAT
gi|129535 : ATATGC-TATCTATC-C-TATGT-CA-CTACAGAC-TAGGTA-A-CA-A-G-T-----CACA-ATACATGT-ATC-TACA--GA-A---CTGG------C-AG-ATC-A-AC-AA-ACCCTA-C--T--GCTCTA--CGA-TGATG--G-GA---G--TA------CGTA--C--CTT-TACAT-C-AT
gi|129536 : ACATGC-TATTGGTG-T-TATCT-CA-CTACAGAC-TAGGTA-A-CA-G-A-T-----CCCA-G------T-ATC-TACA--GTCA---CTGA------C-AG-ACC-T-AC-AG-ACCCTG-C--T--GATCTA--TGA-TGATG--GTAA---A--TAT------GCA--C--CGT-TAGAT-G-ACA-GAGACCT-GTCG-TGGCAGATAC-TG--GGGATCTGT-----C-A-GCATG--T-T-GTG-GGGGACT-TA-CAC---GGGG-CGTTA-CA-C-T--C---TTAT--C--A-AG-A--G-----TC-A-C--TTAG-AC-AACG-A--C-AAT-AC-AA--C-AA---A-ATA-C-A-GA-AAGC-GACAGAAAATAGAAT
gi|129537 : ACATGC-TATTGGTG-T-TATCT-CA-CTACAGAC-TAGGTA-A-CA-G-A-T-----CCCA-G------T-CTC-TACA--GCCA---CTGA------G-AG-ACC-T-AC-AG-ACCCTG-C--T--GATCTA--TGA-TGATG--G-CA---GA-TAT------GTA--C--CGT-TATTC-C-TCA-GAGACCT-GTCG-TGGCAGATAC-TG--GGGATCTGT-----C-A-GCATG--T-T-GTG-GGGGACT-TA-CAG---GGTG-CATTA-CA-C-T--C---TTAT--C--A-AG-A--G-----TC-A-A--TTAG-AC-AAGA-A--C-AAA-TT-CA--C-AA---A-CTA-C-A-GA-GAGC-TACAGAAAATAGAAT
gi|129538 : ACATGT-TATTTGTC-C-TATGT-CA-CTACAGAC-TAGGTA-A-CA-G-G-T-----CAC--A------T-A---TACA--GGCA---CTGA------C-AG-ACT-C-AC----ACCCTA-C--T--GCTCTAC-TGA-TGATG--G-GA---G---ATA----CGTA--C--CTT-TACCC-T-ATA-GAGA-CT-GTCC-TGGCAGATAC-TG--GGGATCTGT-----C-A-ACATG--T-T-GTA-GGGGACT-TG-TAC---GGGG-CAATA-CA-G-T--C-----AT--C--A-AG-A--G-----TC-ACC--TTAG-ACAAGGACA--C-CAC-GT-CA--C-AA---A-ATA-C-A-GA-CAGC-CACAGAAACCAGAAT
gi|129539 : ACATGCCTATTGGTG-TATATCT-CAACTAC-GAC-TAGGTA-A-CA-G-A-T-----C-CAGA------T-ATT-TACA--GTCA---ATGA------C-AG-ACCTT-AC-AG-ACCCTG-CA-T--GATCTA--TGA-TGATG--G-TAAATA--TAT-----CGT-------TT----AC-C-TCA-GAGACCT-GTCG-TGGCATATACTTG--GGAATCTGTA----C-A-GCATG--T-T-GTG-GGGGACC-TA-CAC---GGG---GTTACCA-C-T--CT--TTATTCC--A-AG-A--G-----TC-A----TTAG-AC-A--A-A-----ATATG-CA--C--A---A-ATA-C-A-GA-AAGCTTACAGAAAATAGA
gi|129540 : ACATGC-TATTTGT----TATCT-CA-CTACAGAC-TAGGTA-A-CA---A-T-----T-CC-A------T-ATC-TAAA--GTCA---CTGA--------AG-ACC-T-AC-AGAACCCTG-C--G--AATCTA--TGA-T--AG--G-AA---A--TAT------GTA--C--CTG-TAAAA-C-CCA-GA-ACCG-GTCG--GGCAGATAC--G--GGGATCTG------C-A-GCATG--T-T-GT--GGTGACC-TA-CAC---GGGG-C-TTA-CA-C-TCAC---TTAT--CA-A-AG-A--G-----TC-A-C--T-AG-AC-AAGA-A----CAT-AT-CA--CTAA---ATATA-C-A-GA-CAG--CACAGAAAATAAAA
gi|129541 : ACCTGT-TACTCGTTCT-TATGT-C--CTAC-GAC-TCGGTA-AACA-GGA-T-----CACA-A------T-ATC-TAC---GGCA---CTGA------CGAG-ACC-T-AC-AC-ACCCTAAC--T--G-TCTAAATGA-TGATGTTG-GA---GGTTA------CGTG--T--CAT-TATAT-C-AAATGAGACCT-ATCCCTGGCAGATAC-TG--GG--TCTGTGGTTCC-AGACA-A--T-T-GTGTGGAGACC-TA-TGCAATGGGG-CGTTA--A-G-T--C---TTAT--C--A-AG-AAGA-----TC-A-C--TTAG--C-AGGA-A--C-CATGTT-CA--C-GA---A-ATA-C-A-G
gi|129542 : TC-T-TGTGT-----TACAGACATAT-TG-A-CACA-A-TGAGGGCACA-A-------------ACA--GCTC---TTGA------T--G-ATC-T-AC-AG-GTCCTA-G--T--TCACCA--TGA-TCAGG--G-GCT--G--TAT------GTA--G--ATG-TGGACTC-A-A-GAGACAT-ATCA-TGGCAGATCC-TG--GGTATCTGT-----C-A-ACAGA--T-C-TCA-GGGAACC-TC-CAG---GCTG-CTCTA-TA-C-T--C---CTAC--C--A-AC-A--A-----TC-A-C--TCAG-AC-AATA-T--C-CAT-AC-CA--T-AA---A-ATA-C-A-GA-GTGC-TACACTAATGAGAAT
gi|129543 : acatgctggagtACA--GGCAGCTCTTA------A-TG-ATC-T-AC-AG-GTCCTA-G--T--TCACCA--TG---GCAG--A-GA------TAT-----CTT------CTT-TA-------TG-GAGA--T-ATCA-TGGCAGATCC-TG--GGTATCTGT-----T-A-ACAGA--T-C-TCA-GGGAACA-TC-CAG---GATG-CTCTA-TA-C-T--C---CTAC--C--A-AA-A--A-----TC-A-C--T-AGCAC-AA---------AT-TT-CAGTC-AA---C-ATA-T-ACGACTTGC-TACACAAATGAGAATa
gi|129544 : acatgctggagttcctgtgttaccgacatgttgacaaaataagagcA-G-A-G-----CACA-A-------------ACA--GCTC---TTGA------T--G-ATC-T-AC-AG-ATCCTA-G--TATGCAC-A--TGG-TCAGG--G-GCT--G--TATGTAGGCGTG--CAACTT-TA--------A-GGGACAT-ATCA-TGGCAGATGCCTG--GGTATCTGT-----C-A-ACAGGA-T-C-TCA-GGGAACC-T--CA----GGTG-CTCTA-TAGC-T--CGCTTTAA--CG-A-AC-A--A-----TC---C--TCAG-AC-AAGA-T--G-CAT-CC-CA--T-GA---A-AT
gi|129545 : acatgctggaggtctttgtgttacagaacattgaccaatgACA--GTC-----TGA------A-TG-ATC-T-ACCAG-GTCCTA-T--C--AACCCA--TGA-TCAGG--G-GCT--G--TAT------GTAAAT--CGT-GGAAT-T-A-A-GAAAATT---CA-TGGCAGATAC-TG--GGTATCTGT-----C-A-ACAGA--T-C-TCA-GGGAACC-TC-CAG---GCTG-C-CTA-TA-C-TA-C---CTA---C--ATAC-A--A-----TC-A-A--TCAG-AC-AATA-T--C-CAT-TC-AA--T-AA---A-A-A-C-A-AA-GTGC-TAC
gi|129546 : catgctggagtttcttgtgttatcagacatattgacaatgaagcacagaATGT-TGTCTGTG-T-TGTGT-AA-CTACAGAC-TGGGTA-A-CA-T-A-C-----CCCA-G------T-ATC-TACA--GTCA---CTGA------C-TG-ACC-T-AC-AG-ACCCTG-C--T--GGTCTA--TGA-TGATG--G-CA---G--ATT-----TGTA--C--CTT-TAGAG-T-GGA-GGGATGT-ATCG-TGGCAGATAC-TT--GGGATCTGT-----C-A-GCACG--T-T-GTG-GCGGATT-TG-CAT---GGGG-CGTTA-CA-G-T--C---TTAT--C--A-AG-A--G-----TC-T-A--TCGG-AC-AGGA-A--C-CAT-TC-CA--T-AA---A-ATA-C-A-GA-AAGC-AACAGAAGCTAGAAT
gi|129547 : TA-GAGATAT-TTCAATGGCAAATCC-TT--GGAATCTGTCA---C-A-ACAGA--T-CTGC--GGGAAC-----CAG---GGGG-CGGCT-CA-TGT--C---TTAT--CGGA-AG-A--------TCAA-C--TCGG-AC-AAG--A--T-CAT----AA--T-AATGGA-ATATC-A-GG-AGGC-CAC
gi|129548 : atgcttttagttctatgtgaacctatggaaactcgcaaaaacaacaggaaggttctggacgagttgtacccccctctacacgtaatgatggatttatatgttgataagaatctTGT-TATC-GTC-TCTATGC-CA-GCACAGAC-TCG-TA-A-CA-G-A-T-----CACA-A------T-ATCATACA--GGCA---CTGA------C-AG-ACC-TTAC-AC-ACGCTA-CGCT--GCTCTA--CGAGTAAAG--G-GA------TAT-----CGTA--C--CTT-TACAC-CCATA-GAGACTGAGTCC-TGGCAGAGAC-TG--GGTATCTGT-----CAA-ACATG--TAT-GTG-GGAGACCTTACCAC---GGGGCCGTTA-CA-G-TA-C---TTAT--A--C-AG-A--GACAAATC-A-CAGTCA--AC-AGGA-A--CACAT-TTGCA--C-AG---A-ATA-CAA-GA-TAGC-CA-GGAAACTAAA
gi|129549 : -TGTCTGTG-T-TGTGT-AA-CTA-AGAC-TGAGTA-A-CA-G-ACT-----CTCA-AG-----T-ATC-TATATTGTCA---CTGAATGGTAC-TG-ACC-T-AC-AG-ACC-TG-C--T--GGTTTA--T-A-TGATG--G-CA---GATTAC-----TGT------CTTATAAGT-T-G-A-GGGACTT-ATCG-TGGCAGATAC-TGTTGGGATCTGT-----C-A-GCACGGTT-T-GTG-GGGGAGT-CA--AT---GGGG-CGTTA-CA-C-T--C---TTAT--C--A-AGAA--G-----TC-A-C--TCAGCAC-AGGA-A--C-CAT-TC-AA--T-AAG--A-ATA-C-A-GA-GAG--CACAGAAGC-AGAAT
gi|129550 : -T-TATGTTCA-CTAGAGAC-TCGGTATA-CA-GGA-T-----CACA-A------TTATC-TAC---GGCA---CTGA------C-AGAACC-T-AC-AC-A-CCTA-C--T--G-TCTA--AAA-TGATG--
gi|129550 : G--G-AG---G--TA------CGTG--T--CAT-TATAT-C-AAA-GAGACCT-ATCC-TGGCAGATAC-TG--GGGATCTaatgttggannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnttaggaggtacgtgtcattatatcaaagagacctatcctggcagatactggggatct
gi|129551 : ttatgttcactagagactcggtatacaggatcacaattatctacggcactgacagaacctacacacctactgtctaaaatgatgaatgttggannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnttaG-ATC-T-AC-AG-GCCCTA-G--T--TCACCA--TGA-TCAGG--G-GCT--A--TAT------GTA--G--GTG-TGAAC-T-TAA-GAGACAT-ATCA-TGGCAGATCC-TG--GGTATCTGT-----C-A-ACAGA--T-C-TCG-GGGAACT-TT-CAG---GCTG-CTCTA-TA-C-T--C---CTAC--C--A-AC-A--A-----TC-T-C--TCAG-AC-AATT-T--C-CAT-TC-CA--T-GA---A-ATA-C-A-AA-GTGC-TACACTAATGAGAAT
gi|129552 : G-ATC-T-AC-AG-GTCCTA-G--T--TCACCA--TGA-TCAGG--G-GCT--G--TAT------GTA--G--ATG-TGGAC---ATA-GAGACAT-ATCA-TGGCAGATCC-TG--GGTATCTGT-----C-A-ACAGA--T-C-TCA-GGGAACC-TC-CAG---GCTG-CTCTA-TA-C-T--C---CTAC--C--A-AC-A--A-----TC-T-C--TCAG--C----A-ATTC-CA--TC-CA--T-AA---A-ATA-C-A-AA-ATGC-TGCACTAATGAGAATa
gi|129555 : AC---GGGG-CGTTA-CA-G-T--C---TTAT--C--A-TG-A--G-----TC-A-C--TCAG-AC-AGGA-A--C-CAG-AG-AA--C-AA---A-ATA-C-A-GA-TAGC-CACAGAAACTAGAATa
blockSeqs : C T GTA T A A T A C G C GAGGG A G TACATGT A TT G GCT ATGGTACT A T T C A A GC AT C AA G A TT T TGTATGTAGGC GCAA A CACCCAT T C AG CC T TT T GGTTC A G CGGT TGTGT CT AC CAAT C G C GC CA GCT TC GG T A GACAAA A C AG T C A GGACAC ATG GT T TGG T T A C CT T CT
blockSeqs : . T TCT . . . . . . G . . A . GT . . A . CGA . . . . . . A . C C . T . . AATATATC AAAT . CACCAT . C G AA C . G CA . . GGA ATGTG T A C . G . TG A T . A . . AGA . . . T C . GGAACA GTT . . G . . . . T . AT
blockSeqs : . G CTC . . . . . . . . . C . TT . . T . CA . . . . . . . . A . . T . . GATTACT AC . CATCAT . C G C . . G A . . TG TGTG T A C . A . G A . . G . . A . . . T . . GGAAC TTG . . . . . . . A . AT
blockSeqs : . G CT . . . . . . . . . C . T . . C . CA . . . . . . . . A . . T . . GGTTAC AC . GATGAC . C G G . . G . . . TG TGTG T A G . A . C . . . . . . G . . . T . . ACGAC TT . . . . . . . G . CC
blockSeqs : . T CC . . . . . . . . . A . T . . G . CA . . . . . . . . C . . T . . GTATC AC . TTCCTC . C G G . . A . . . TG TGTG T G C . G . C . . . . . . G . . . T . . AGAAC AC . . . . . . . C . AT
blockSeqs : . G GT . . . . . . . . . A . T . . T . GA . . . . . . . . A . . T . . GATAT AC . CCCTAT . C G C . . G . . . TG TGTA C A C . G . G . . . . . . G . . . T . . GGAAC TT . . . . . . . A . AT
blockSeqs : . T GT . . . . . . . . . A . T . . T . CA . . . . . . . . A . . A . . GATAC AC . AAACCC . C G G . . T . . . TG TGTG C A C . T . C . . . . . . G . . . C . . ATATC GT . . . . . . . C . TG
blockSeqs : . C CC . . . . . . . . . A . T . . G . CA . . . . . . . . C . . T . . TGTAT AC . TATCAA . A A G . . T . . . TG CTCA C A G . T . C . . . . . . G . . . C . . AGATG AT . . . . . . . G . TG
blockSeqs : . T CT . . . . . . . . . C . T . . C . AT . . . . . . . . C . . G . . TGTAT GT . GACTCA . A A A . . T . . . GA CTCA C C G . T . G . . . . . . A . . . C . . ATATC AC . . . . . . . G . CT
blockSeqs : . T GT . . . . . . . . . A . T . . G . AT . . . . . . . . C . . A . . GATTT AG . GAGTGG . T A A . . T . . . GA CTCA A C G . G . C . . . . . . A . . . C . . GGAAC TT . . . . . . . A . CT
blockSeqs : . . GT . . . . . . . . . T . T . . C . CT . . . . . . . . A . . G . . TATAT AC . TATCAA . G A A . . G . . . GA CTCA C C T . G . C . . . . . . A . . . C . . GGAAC CC . . . . . . . A . TG
blockSeqs : . . . . . . . . . . A . T . . T . CA . . . . . . . . G . . G . . TGTAT AC . AACTTA . A A A . . A . . . CG TGTG C G G . G . C . . . . . . A . . . C . . ATTTC TC . . . . . . . T . TG
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . T . CA . . . . . . . . C . . T . . GTAC GT . ACCTC . T T G . . T . . . GA CTGC T A C . G . G . . . . . . G . . . C . . AATTC TC . . . . . . . G . CT
blockSeqs : . . . . . . . . . G . A . . . . . . . . G . . A . . ATAT AG . AATTA . T A C . . G . . . TG TGTG T T T . T . G . . . . . . G . . . C . . GGAAC TC . . . . . . . G . C
blockSeqs : . T . T . . . . . . . . C . . T . . ATAT AG . AGTTG . C A G . . G . . . GA CTCG T C G . T . C . . . . . . A . . . C . . AGAA TC . . . . . . . A .
blockSeqs : . G . T . . . . . . . . C . . T . . TATC . . GACAT . A A C . . T . . . GA CTCA C . G . G . C . . . . . . A . . . C . . AGAT TC . . . . . . . T .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . G . . TATC . . T . A A A . . T . . . A TGT . . C . . . C . . . . . . G . . . . . . AA AG . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . G . . GTAC . . . . . . A . . . . . . . G . . . . . . . . . . . . . A . . . . .
blockSeqs : .
blockSeqCons :
originalCons : ACATGC-TATCTGTN-T-TATGT-CA-CTACAGAC-TAGGTA-A-CA-G-A-T-----CACA-A------T-ATC-TACA--GNCA---CTGA------C-AG-ACC-T-AC-AG-ACCCTA-C--T--GCTCTA--TGA-TGANG--G-GA---G--TAT-----CGTA--C--CTT-TANAC-C-ATA-GAGACCT-GTCG-TGGCAGATAC-TG--GGNATCTGT-----C-A-ACACG--T-C-GCG-GGGGACC-TA-CAC---GGGG-CGTTA-CA-C-T--C---TTAT--C--A-AG-A--G-----TC-A-C--TCAG-AC-AGGA-A--C-CAT-TC-CA--C-AA---A-ATA-C-A-GA-NAGC-CACAGAAACTAGAAT
finalCons : ACATGC-TATCTGTN-T-TATGT-CA-CTACAGAC-TAGGTA-A-CA-G-A-T-----CACA-A------T-ATC-TACA--GNCA---CTGA------C-AG-ACC-T-AC-AG-ACCCTA-C--T--GCTCTA--TGA-TGANG--G-GA---G--TAT-----CGTA--C--CTT-TANAC-C-ATA-GAGACCT-GTCG-TGGCAGATAC-TG--GGNATCTGT-----C-A-ACACG--T-C-GCG-GGGGACC-TA-CAC---GGGG-CGTTA-CA-C-T--C---TTAT--C--A-AG-A--G-----TC-A-C--TCAG-AC-AGGA-A--C-CAT-TC-CA--C-AA---A-ATA-C-A-GA-NAGC-CACAGAAACTAGAAT
2 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|129553 ): TGATGATGGGCGATATGTTTGCAGTTATTTGAGAGATATTTCATGGCAGATTCTTGGAGTCTGTCAACAGATCTGCGGGGACCACCAGGGGGCGCTCAGGTCTTATCACAAATCACTCAGACAAGAACCATTCCATCAGATACAGGAGGTCACCATCAGGAGAATACAA
Unaligned ( gi|129554 ): AGGGACATATCATGGCAGCTTCTTGGAATCTGTGAACAGATCTGTGGGGATCACGAGAAATCACACAGACAAGAGCCATTTCATGAGATACAGGAAGCCAC
Alignments
lowQualScore : 11111111 111111111 333333333333333 11111111 11111 1111
lowQualScore : 3 2 8888 2 2 2 2 2 2 5 2 66666 4 2 00000000 2 33 1 444 111111111 2 2 2 2 2 2 55 22 4 55 2 0 1 22 2 000000000000000 888888 2 77777777 2 1 33 88 4 22 3 00000 2 2 1111 5555555 33 55 7777 2 3 2 444 77 555 22 77 2 2 77777777 2 2 22 1 4 2 333333333 7777 22 2 555 2 2 2 2 33 2 22
lowQualScore : . . .... . . . . . . . . ..... . . ........ . .. . ... ......... . . . . . . .. .. . .. . . . .. . ............... ...... . ........ . . .. .. . .. . ..... . . .... ....... .. .. .... . . . ... .. ... .. .. . . ........ . . .. . . . ......... .... .. . ... . . . . .. . ..
lowQualScore : 3 3 5555 9 9 9 9 9 7 3 7 77777 1 7 55555555 7 22 0 111 222222222 1 1 1 1 1 1 00 99 5 00 1 9 0 88 1 666666666666666 222222 1 55555555 1 7 66 00 2 99 1 88888 2 2 1111 4444444 55 77 2222 1 5 1 333 11 888 99 11 1 1 55555555 1 1 99 2 2 1 999999999 3333 99 1 888 1 2 2 2 44 4 66
consensus : ACATGC-TATCTGTN-T-TATGT-CA-CTACAGAC-TAGGTA-A-CA-G-A-T-----CACA-A------T-ATC-TACA--GNCA---CTGA------C-AG-ACC-T-AC-AG-ACCCTA-C--T--GCTCTA--TGA-TGANG--G-GA---G--TAT-----CGTA--C--CTT-TANAC-C-ATA-GAGACCT-GTCG-TGGCAGATAC-TG--GGNATCTGT-----C-A-ACACG--T-C-GCG-GGGGACC-TA-CAC---GGGG-CGTTA-CA-C-T--C---TTAT--C--A-AG-A--G-----TC-A-C--TCAG-AC-AGGA-A--C-CAT-TC-CA--C-AA---A-ATA-C-A-GA-NAGC-CACAGAAACTAGAAT
Reference ( family-775 ) : ACATGC-TATCTGTN-T-TATGT-CA-CTACAGAC-TAGGTA-A-CA-G-A-T-----CACA-A------T-ATC-TACA--GNCA---CTGA------C-AG-ACC-T-AC-AG-ACCCTA-C--T--GCTCTA--TGA-TGANG--G-GA---G--TAT-----CGTA--C--CTT-TANAC-C-ATA-GAGACCT-GTCG-TGGCAGATAC-TG--GGNATCTGT-----C-A-ACACG--T-C-GCG-GGGGACC-TA-CAC---GGGG-CGTTA-CA-C-T--C---TTAT--C--A-AG-A--G-----TC-A-C--TCAG-AC-AGGA-A--C-CAT-TC-CA--C-AA---A-ATA-C-A-GA-NAGC-CACAGAAACTAGAAT
gi|129533 : ACATGC-TGTCTGTT-C-TATGT-CA-CTACAGAC-TAGGTA-A-CA-G-G-T-----CACA-A------T-ATC-TACA--GGCA---CTGA------C-AG-ACC-T-AC-AC-ACCCTA-C--T--GCTCTA--TGA-TGATG--G-GA---A---ATA----CGTA--T--CTT-TAGAC-G-ATA-GAGAACT-GTCC-TGGCAGATAC-TG--GGAATCTGT-----C-A-ACATG--T-T-GTG-GGGGACT-TA-CAC---GGGG-CGTTG-CG-G-T--C---TTAT--C--A-AG-A--G-----TC-A-C--TTAG-CC-AGGC-A--C-CGT-TC-CA--C-AA---G-ATA-C-A-GC-TAGC-CACGGAAACTAGAAT
gi|129534 : ACATGT-TATCTGTC-T-TATGC-CA-CTACAGAC-TCGGTA-A-CA-G-A-T-----CACA-A------T-ATC-TACA--GGCA---CTGA------C-AG-ACC-T-AC-AC-ACGCTA-C--T--GCTCTA--CGA-TAAAG--G-GA---G--TAT-----CGTA--C--CTT-TACAC-C-ATA-GAGACCT-GTCC-TGGCAGATAC-TG--GGTATCTGT-----C-A-ACATG--T-T-GTG-GGAGACT-TA-CAC---GGGG-CGTTA-CA-G-T--C---TTAT--C--A-AA-A--A-----TC-A-C--TTCA-AC-AGGA-A--C-CAT-TT-CA--C-AG---A-ATA-C-A-GA-TAGC-CACGGAAACTAGAAT
gi|129535 : ATATGC-TATCTATC-C-TATGT-CA-CTACAGAC-TAGGTA-A-CA-A-G-T-----CACA-ATACATGT-ATC-TACA--GA-A---CTGG------C-AG-ATC-A-AC-AA-ACCCTA-C--T--GCTCTA--CGA-TGATG--G-GA---G--TA------CGTA--C--CTT-TACAT-C-AT
gi|129536 : ACATGC-TATTGGTG-T-TATCT-CA-CTACAGAC-TAGGTA-A-CA-G-A-T-----CCCA-G------T-ATC-TACA--GTCA---CTGA------C-AG-ACC-T-AC-AG-ACCCTG-C--T--GATCTA--TGA-TGATG--GTAA---A--TAT------GCA--C--CGT-TAGAT-G-ACA-GAGACCT-GTCG-TGGCAGATAC-TG--GGGATCTGT-----C-A-GCATG--T-T-GTG-GGGGACT-TA-CAC---GGGG-CGTTA-CA-C-T--C---TTAT--C--A-AG-A--G-----TC-A-C--TTAG-AC-AACG-A--C-AAT-AC-AA--C-AA---A-ATA-C-A-GA-AAGC-GACAGAAAATAGAAT
gi|129537 : ACATGC-TATTGGTG-T-TATCT-CA-CTACAGAC-TAGGTA-A-CA-G-A-T-----CCCA-G------T-CTC-TACA--GCCA---CTGA------G-AG-ACC-T-AC-AG-ACCCTG-C--T--GATCTA--TGA-TGATG--G-CA---GA-TAT------GTA--C--CGT-TATTC-C-TCA-GAGACCT-GTCG-TGGCAGATAC-TG--GGGATCTGT-----C-A-GCATG--T-T-GTG-GGGGACT-TA-CAG---GGTG-CATTA-CA-C-T--C---TTAT--C--A-AG-A--G-----TC-A-A--TTAG-AC-AAGA-A--C-AAA-TT-CA--C-AA---A-CTA-C-A-GA-GAGC-TACAGAAAATAGAAT
gi|129538 : ACATGT-TATTTGTC-C-TATGT-CA-CTACAGAC-TAGGTA-A-CA-G-G-T-----CAC--A------T-A---TACA--GGCA---CTGA------C-AG-ACT-C-AC----ACCCTA-C--T--GCTCTAC-TGA-TGATG--G-GA---G---ATA----CGTA--C--CTT-TACCC-T-ATA-GAGA-CT-GTCC-TGGCAGATAC-TG--GGGATCTGT-----C-A-ACATG--T-T-GTA-GGGGACT-TG-TAC---GGGG-CAATA-CA-G-T--C-----AT--C--A-AG-A--G-----TC-ACC--TTAG-ACAAGGACA--C-CAC-GT-CA--C-AA---A-ATA-C-A-GA-CAGC-CACAGAAACCAGAAT
gi|129539 : ACATGCCTATTGGTG-TATATCT-CAACTAC-GAC-TAGGTA-A-CA-G-A-T-----C-CAGA------T-ATT-TACA--GTCA---ATGA------C-AG-ACCTT-AC-AG-ACCCTG-CA-T--GATCTA--TGA-TGATG--G-TAAATA--TAT-----CGT-------TT----AC-C-TCA-GAGACCT-GTCG-TGGCATATACTTG--GGAATCTGTA----C-A-GCATG--T-T-GTG-GGGGACC-TA-CAC---GGG---GTTACCA-C-T--CT--TTATTCC--A-AG-A--G-----TC-A----TTAG-AC-A--A-A-----ATATG-CA--C--A---A-ATA-C-A-GA-AAGCTTACAGAAAATAGA
gi|129540 : ACATGC-TATTTGT----TATCT-CA-CTACAGAC-TAGGTA-A-CA---A-T-----T-CC-A------T-ATC-TAAA--GTCA---CTGA--------AG-ACC-T-AC-AGAACCCTG-C--G--AATCTA--TGA-T--AG--G-AA---A--TAT------GTA--C--CTG-TAAAA-C-CCA-GA-ACCG-GTCG--GGCAGATAC--G--GGGATCTG------C-A-GCATG--T-T-GT--GGTGACC-TA-CAC---GGGG-C-TTA-CA-C-TCAC---TTAT--CA-A-AG-A--G-----TC-A-C--T-AG-AC-AAGA-A----CAT-AT-CA--CTAA---ATATA-C-A-GA-CAG--CACAGAAAATAAAA
gi|129541 : ACCTGT-TACTCGTTCT-TATGT-C--CTAC-GAC-TCGGTA-AACA-GGA-T-----CACA-A------T-ATC-TAC---GGCA---CTGA------CGAG-ACC-T-AC-AC-ACCCTAAC--T--G-TCTAAATGA-TGATGTTG-GA---GGTTA------CGTG--T--CAT-TATAT-C-AAATGAGACCT-ATCCCTGGCAGATAC-TG--GG--TCTGTGGTTCC-AGACA-A--T-T-GTGTGGAGACC-TA-TGCAATGGGG-CGTTA--A-G-T--C---TTAT--C--A-AG-AAGA-----TC-A-C--TTAG--C-AGGA-A--C-CATGTT-CA--C-GA---A-ATA-C-A-G
gi|129542 : TC-T-TGTGT-----TACAGACATAT-TG-A-CACA-A-TGAGGGCACA-A-------------ACA--GCTC---TTGA------T--G-ATC-T-AC-AG-GTCCTA-G--T--TCACCA--TGA-TCAGG--G-GCT--G--TAT------GTA--G--ATG-TGGACTC-A-A-GAGACAT-ATCA-TGGCAGATCC-TG--GGTATCTGT-----C-A-ACAGA--T-C-TCA-GGGAACC-TC-CAG---GCTG-CTCTA-TA-C-T--C---CTAC--C--A-AC-A--A-----TC-A-C--TCAG-AC-AATA-T--C-CAT-AC-CA--T-AA---A-ATA-C-A-GA-GTGC-TACACTAATGAGAAT
gi|129543 : acatgctggagtACA--GGCAGCTCTTA------A-TG-ATC-T-AC-AG-GTCCTA-G--T--TCACCA--TG---GCAG--A-GA------TAT-----CTT------CTT-TA-------TG-GAGA--T-ATCA-TGGCAGATCC-TG--GGTATCTGT-----T-A-ACAGA--T-C-TCA-GGGAACA-TC-CAG---GATG-CTCTA-TA-C-T--C---CTAC--C--A-AA-A--A-----TC-A-C--T-AGCAC-AA---------AT-TT-CAGTC-AA---C-ATA-T-ACGACTTGC-TACACAAATGAGAATa
gi|129544 : acatgctggagttcctgtgttaccgacatgttgacaaaataagagcA-G-A-G-----CACA-A-------------ACA--GCTC---TTGA------T--G-ATC-T-AC-AG-ATCCTA-G--TATGCAC-A--TGG-TCAGG--G-GCT--G--TATGTAGGCGTG--CAACTT-TA--------A-GGGACAT-ATCA-TGGCAGATGCCTG--GGTATCTGT-----C-A-ACAGGA-T-C-TCA-GGGAACC-T--CA----GGTG-CTCTA-TAGC-T--CGCTTTAA--CG-A-AC-A--A-----TC---C--TCAG-AC-AAGA-T--G-CAT-CC-CA--T-GA---A-AT
gi|129545 : acatgctggaggtctttgtgttacagaacattgaccaatgACA--GTC-----TGA------A-TG-ATC-T-ACCAG-GTCCTA-T--C--AACCCA--TGA-TCAGG--G-GCT--G--TAT------GTAAAT--CGT-GGAAT-T-A-A-GAAAATT---CA-TGGCAGATAC-TG--GGTATCTGT-----C-A-ACAGA--T-C-TCA-GGGAACC-TC-CAG---GCTG-C-CTA-TA-C-TA-C---CTA---C--ATAC-A--A-----TC-A-A--TCAG-AC-AATA-T--C-CAT-TC-AA--T-AA---A-A-A-C-A-AA-GTGC-TAC
gi|129546 : catgctggagtttcttgtgttatcagacatattgacaatgaagcacagaATGT-TGTCTGTG-T-TGTGT-AA-CTACAGAC-TGGGTA-A-CA-T-A-C-----CCCA-G------T-ATC-TACA--GTCA---CTGA------C-TG-ACC-T-AC-AG-ACCCTG-C--T--GGTCTA--TGA-TGATG--G-CA---G--ATT-----TGTA--C--CTT-TAGAG-T-GGA-GGGATGT-ATCG-TGGCAGATAC-TT--GGGATCTGT-----C-A-GCACG--T-T-GTG-GCGGATT-TG-CAT---GGGG-CGTTA-CA-G-T--C---TTAT--C--A-AG-A--G-----TC-T-A--TCGG-AC-AGGA-A--C-CAT-TC-CA--T-AA---A-ATA-C-A-GA-AAGC-AACAGAAGCTAGAAT
gi|129547 : TA-GAGATAT-TTCAATGGCAAATCC-TT--GGAATCTGTCA---C-A-ACAGA--T-CTGC--GGGAAC-----CAG---GGGG-CGGCT-CA-TGT--C---TTAT--CGGA-AG-A--------TCAA-C--TCGG-AC-AAG--A--T-CAT----AA--T-AATGGA-ATATC-A-GG-AGGC-CAC
gi|129548 : atgcttttagttctatgtgaacctatggaaactcgcaaaaacaacaggaaggttctggacgagttgtacccccctctacacgtaatgatggatttatatgttgataagaatctTGT-TATC-GTC-TCTATGC-CA-GCACAGAC-TCG-TA-A-CA-G-A-T-----CACA-A------T-ATCATACA--GGCA---CTGA------C-AG-ACC-TTAC-AC-ACGCTA-CGCT--GCTCTA--CGAGTAAAG--G-GA------TAT-----CGTA--C--CTT-TACAC-CCATA-GAGACTGAGTCC-TGGCAGAGAC-TG--GGTATCTGT-----CAA-ACATG--TAT-GTG-GGAGACCTTACCAC---GGGGCCGTTA-CA-G-TA-C---TTAT--A--C-AG-A--GACAAATC-A-CAGTCA--AC-AGGA-A--CACAT-TTGCA--C-AG---A-ATA-CAA-GA-TAGC-CA-GGAAACTAAA
gi|129549 : -TGTCTGTG-T-TGTGT-AA-CTA-AGAC-TGAGTA-A-CA-G-ACT-----CTCA-AG-----T-ATC-TATATTGTCA---CTGAATGGTAC-TG-ACC-T-AC-AG-ACC-TG-C--T--GGTTTA--T-A-TGATG--G-CA---GATTAC-----TGT------CTTATAAGT-T-G-A-GGGACTT-ATCG-TGGCAGATAC-TGTTGGGATCTGT-----C-A-GCACGGTT-T-GTG-GGGGAGT-CA--AT---GGGG-CGTTA-CA-C-T--C---TTAT--C--A-AGAA--G-----TC-A-C--TCAGCAC-AGGA-A--C-CAT-TC-AA--T-AAG--A-ATA-C-A-GA-GAG--CACAGAAGC-AGAAT
gi|129550 : -T-TATGTTCA-CTAGAGAC-TCGGTATA-CA-GGA-T-----CACA-A------TTATC-TAC---GGCA---CTGA------C-AGAACC-T-AC-AC-A-CCTA-C--T--G-TCTA--AAA-TGATG--
gi|129550 : G--G-AG---G--TA------CGTG--T--CAT-TATAT-C-AAA-GAGACCT-ATCC-TGGCAGATAC-TG--GGGATCTaatgttggannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnttaggaggtacgtgtcattatatcaaagagacctatcctggcagatactggggatct
gi|129551 : ttatgttcactagagactcggtatacaggatcacaattatctacggcactgacagaacctacacacctactgtctaaaatgatgaatgttggannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnttaG-ATC-T-AC-AG-GCCCTA-G--T--TCACCA--TGA-TCAGG--G-GCT--A--TAT------GTA--G--GTG-TGAAC-T-TAA-GAGACAT-ATCA-TGGCAGATCC-TG--GGTATCTGT-----C-A-ACAGA--T-C-TCG-GGGAACT-TT-CAG---GCTG-CTCTA-TA-C-T--C---CTAC--C--A-AC-A--A-----TC-T-C--TCAG-AC-AATT-T--C-CAT-TC-CA--T-GA---A-ATA-C-A-AA-GTGC-TACACTAATGAGAAT
gi|129552 : G-ATC-T-AC-AG-GTCCTA-G--T--TCACCA--TGA-TCAGG--G-GCT--G--TAT------GTA--G--ATG-TGGAC---ATA-GAGACAT-ATCA-TGGCAGATCC-TG--GGTATCTGT-----C-A-ACAGA--T-C-TCA-GGGAACC-TC-CAG---GCTG-CTCTA-TA-C-T--C---CTAC--C--A-AC-A--A-----TC-T-C--TCAG--C----A-ATTC-CA--TC-CA--T-AA---A-ATA-C-A-AA-ATGC-TGCACTAATGAGAATa
gi|129555 : AC---GGGG-CGTTA-CA-G-T--C---TTAT--C--A-TG-A--G-----TC-A-C--TCAG-AC-AGGA-A--C-CAG-AG-AA--C-AA---A-ATA-C-A-GA-TAGC-CACAGAAACTAGAATa
2 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|129553 ): TGATGATGGGCGATATGTTTGCAGTTATTTGAGAGATATTTCATGGCAGATTCTTGGAGTCTGTCAACAGATCTGCGGGGACCACCAGGGGGCGCTCAGGTCTTATCACAAATCACTCAGACAAGAACCATTCCATCAGATACAGGAGGTCACCATCAGGAGAATACAA
Unaligned ( gi|129554 ): AGGGACATATCATGGCAGCTTCTTGGAATCTGTGAACAGATCTGTGGGGATCACGAGAAATCACACAGACAAGAGCCATTTCATGAGATACAGGAAGCCAC