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lowQualScore                  :       ...    .. .   .. .. . . .. . ..   ....  . ..  . ..   .   ........    .. .. ..  ..... ..  .   . .  . .. ..   .... . ..      .  ..  . .     . . ....................   .. ... .. .........................  ..  ........  .  .  . ... ..  ...  .     . ......  . ..  .  ... .  .. . . .     ..  .... .    . .  .  . .. . ..... .  .... ..  ...  ..  ................    .. .....   .   . .  ..  ..   .  . .   . . .   . .   . ....  .   .  .     .   . . . ..   . . .. . .  . .   ... .  ...  . .. ..  .  ...    . .   .......  ...  ... ..      .      
lowQualScore                  :       000    55 4   33 55 2 2 11 2 33   7777  2 55  4 33   2   77777777    11 66 11  66666 88  1   2 1  1 00 22   2222 2 11      4  33  2 2     2 4 33333333333333333333   22 555 88 2222222222222222222222222  88  00000000  0  0  0 555 88  000  0     9 333333  9 44  9  111 9  66 9 9 9     11  2222 7    7 7  7  7 33 7 11111 7  8888 44  999  88  9999999999999999    44 22222   6   6 6  44  88   2  8 6   6 3 7   7 7   7 5555  1   2  1     8   2 2 2 33   2 2 55 2 2  2 2   111 2  333  2 66 11  2  111    2 2   7777777  999  999 11      4      
consensus                     :  TATTATAATCTG--T-TTAA-A--T-C-C--T-A--TTA----TC-G-ATA-A--TTT-GTT-C---GN-AACG--GG-T--CT-----TC-AG-GCG-T-GA-T--AA-TTG-G--T-C--GCTTAT-CT--AA-A-CAAAA-C-A--------A-----------GTG--T---C--C-------------CA------A---TT--GA--------CA-CC-TA-T---GA-CGA--CA-CAGTA-A--T---GG-C--GC-GT---A-AA--A-T-C-GCCGA--TT----A-AAAT-A-TG-CA-T--A-T-----T-CG----G--AA---AT--TC---A--------A---CTTT--G-----AAA-AGC-T-AT--AT--CTT-TG-A-AAA-T-A-TAG-C-TTT-T----TG-ACA-CA-AATAAACTT-G-A-T--GAA-T-G--A-T-TT-T-AAA---A-GC---AT-CT-T--TT-CT---TTGA-T-ATAT-T-C--AA---AA---A--TAACGA-AATTTT
Reference ( gi|74560 )        :  TATTATAATCTG--T-TTAA-A--T-C-C--T-A--TTA----TC-G-ATA-A--TTT-GTT-T---CA-AACG--GG-T--CT-----TC-AG-GCG-T-GA-T--AA-TTG-G--T-C--GCTTAT-CT--AA-A-CAAAA-C-A--------A-----------GTG--T---C--C-------------CA------A---TT--GA--------CA-CC-TA-T---GC-CGA--CA-CAGTA-A--C---GG-C--GC-GT---A-AA--A-T-C-GCCGA--TT----A-AAAT-A-TG-CA-T--A-T-----T-CG----G--AA---AT--TC---A--------A---CTTT--G-----AAA-AGC-T-AT--AT--CTT-TG-A-AAA-T-A-TAG-C-TTT-T----TG-ACA-CA-AATAAACTT-G-A-T--GAA-T-G--A-T-TT-T-AAA---A-GC---AT-C--T--TT-CT---TTGA-T-ATAT-T-C--AA---AA---A--TAACGA-AATTTT
gi|74559                      :  TATTATA-TCTG--T-TTAA-A--T-C-C--T-A--TTA----TC-G-ATA-A--TTT-GTT-C---GT-AACG--GG-T--TC-----TC-AG-GCG-T-GA-T--AA-TTG-G--T-C--GCTTAT-CT--AA-A-CAAAA-C-A--------A-----------GTG--T---C--C-------------CA------A---TT--GA--------CA-CC-TA-T---GA-CGA--CA-CAGTA-A--T---GG-C--GC-GT---A-AA--A-T-C-GCCGA--TT----A-AAAT-A-TG-CA-T--A-T-----T-CG----G---A---AT--TCA--A--------A---CTTT--G-----AAA-AGC-T-ATA-AT--CTT-TG---AAA-T-A-TAG-C-TTT-T----TG-ACA-CA-AATAAACTT-G-A-T--GAA-T-G--A-T-TT-T-AAA---A-GC---AT-CTTT--TT-CT---TTGA-T-ATA--T-C--AA---AAAATA--TAACGA-AATTTT
gi|74562                      :  TATTATA-TCTT--TGTTAA-A--T-C-C--T-A--TTA----TC-G-ATATA--TTT-AT------CGTAACG--GG-T--CT-----TC-AG-GCGGT-GA-T--AA-TTG-G--T-C--G-TTAT-CT--AA-A-CAAAA-C-A--------A-----------GTG--T---C-----------------A------A---T---GA--------CA-CC-TA-T---GA-CGA--CA-CAGTA-A--T---GG-C--GC-GT---A-AA--A-T-C-GCCGA--TT----A-AATA-A-TG-CA-T--A-T-----T-CG----G--AA---AT--TC---A--------AA--CTTT--G-----AAA-AGC-T-AT--AT--CTT-TG-A-AAA-T-A-TAG-C-TTT-T----TG-ACA-CA-AATAAACTT-G-A-T--GAA-T-G--A-T-TT-T-AAA---A-GC---AT-CT-T--TT-CT---TTGA-T-ATAT-A-A--AA---AA---A--TAACGA-AATTTT
gi|74561                      :  TATTAATATCTG--T-TTAA-AA-T-C-C--T-A--TTA----TC-G-ATA-A--TTT-GTT-C---GT-AACG--GG-T--CT-----TC-AG-GCG-T-GA-T--AA-TTG-G--T-C--GCTTAT-CT--AA-A-CAAAA-C-A--------A-----------GTG--T---C--C-------------CA------A---TT--GA--------CACCC-TA-T---GA-CGA--CACCAGTA-A--T---GG-C--GC-GTA--A-AA--A-T-C-G-CGA--TT----A-AAAT-A-TG-CA-T--A-T-----T-CG----G--AA---AT--TC---A--------A---CTTT--G-----AAA-AGC-T--T--AT--CTT-TG-A-AAA-TAA-TAG-CTTTT-T----TG-ACA-CA-AATAGACTT-G-A-T--GAATT-G--A-T-TTAA-AAA---A-GC---AT-CT-T--TT-CT---TTGA-T-ATA--T-CAAAA---AA---A--TAACGATAATTTTt
gi|74565                      :  TATTATA-TCTG--T-TTAA-AATT-C-C--T-A--TTA----ACAG-ATATA--TTT-GTT-C---GT-AACG--GG-TTCCT-----TC-AG-GCG-T-GA-T--A---TG-G--T-C--GCTTATTCT--AA-A-CAAAA------------A-----------GTG--T---C--C-------------CA------A---TT--GA--------CA-C--TA-T---GA-CGA--CA-C-GTA-A--T---GGGC--GC-GT---A-AA--A-T-C-GCCGA--TT----A-AA-T-A-TG-CA-T--A-T-----T-CG----G--AA---AT--TCCA-A--------A---CTTT--G-----AAA-AGC-T-AT--AT--CTT-TG-A-AAA-T-A-TAG-C-CTT-TGTTGTG-ACA-CA-AA-AAACTT-G-A-T--GAA-T-G--A-T-TT-T-AAA---A-GC---AT-C--TTCTT-CT---TTGA-T-ATA--T-A--AA---AA---A--TAACGA-AATTTT
gi|74564                      :  TATTAATATCTGGTC-TTAA-A--TTC-C--T-A--TTA----TC-G-ATA-AATTTT-GTT-----CG-TACG--GG-T--CT-----TC-AG-GCG-TTGA-T--AA-TTA-G--T-CTCGCTTAT-CT--AA-A-ACAAA-CGA--------A-----------GTG--T---C--C--------------A------G---TTTGGA--------CA-C--TA-T---GA-CGA--CA-CAGTA-A--T---GG-C--GC-GT---A-AA--A-T-C-GCCGATTTT----A-AAAT-A-TG-CA-T--A-T-----T-CG----G--AA---AT--TC---A--------AACTTTTT--G-----AAA-AGCTT-AT--AT--CTT-TG-A-AAA-T-A-TAGCC-TTT-T----TG-ACACCA-AATAAACTT-G-A-G--GAA-T-G--A-T-TT-T-AAA---A-GC---AT-CT-T--TT-CT---TTGA-T-ATTA-T-C--AAAACAA---A--TAACGA-AATTTTt
gi|74566                      :  TATTATA-TCTT--C-TTAA-A--T-C-C--T-A--TTA----TC-G-A-A-A--TTT-GTT-C---GT-AACG--GG-T--CT-----TC-AG-GCG-T-GAATG-AA-TTG----T-C--GCTTAT-CT--AA-A-CAAA--C-AT-------A-----------GTG--T---C--C-------------CT----------TT--GA--------CA-CGATA-T---GA-CGA--CAACAGTA-A--T---GG-CC-GC-GT---A-AA--A-A-T-GCCGA--TT----A-AAAT-A-TG-CA-T--A-T-----TTCG----G--AA---AT--TC---A--------AAA-CTTT--G-----AAA-AGC-TTAT--AT--CTT--G-ACAAA-T-AATAG-C-TTT-T-----G-ACA--A-AATAA-CTT-G-A-T---AA-T-G----T-TT-T-AAA---A-GC---AT-C--T--TTTCT---TTGA-T-ATAT-C-A--AA---AA---A--TAACGA-AATTTTt
gi|74567                      :   ATTATA-TCTG--T-TTAA-A--T-C-C--T-A--TTA----TC-G-ATA-A--TTT-GTT-C---GT-AACG--GG-T--CT-----TC-AG-GCG-T-GA-T--AA-TTG-G--T-C--GCTTA--CT--AA-A-CAAAA-CAA--------A-----------GTG--T---C--C-------------CA------A---TT--GA--------CA-CC-TA-T---GA-CGA--CA-CAGTA-A--T---GG-C--GC-GT---A-AA--A-T-C-GCCGA--TT----A-AAAT-A-TG-CA-T--A-T-----T-GC----G--AA---AT--TCA--A--------A---CTTT--G-----AAA-AGC---AT--AT--CTT-TGAA-AAA-T-A-TAG-C--TT-T----TG-ACA-CA-AATAAACTT-G-A-T--GAA-T-G--ATT-TT-T-AAA---A-GC---AT-CT-T--TT-CT---TTAATT-ATAT-C-A--AA---AA---A--TAACGA-AATTTTt
gi|74568                      :   ATTATA-TCTG--T-TTAA-A--T-C-C--T-A--TTA----TC-G-ATA-A--TTT-GTT-C---GT-AACG--GG-T--CT-----T--AG-GCG-T--A-T--AA-TTG-G--T-C--GCTTAT-CT--AA-A-CAAAA-C-A--------A-----------GTG--T---C--C-------------CA------A---TT--GA--------CA-CC-TA-T---GA-CGA--CA-CAGTA-A--T----G-C--GC-GT-----AA--A-T-C-GCCGA--TT----A-AAAT-A-TG-CA-T--ATT-----T-CG----G--AA---AT--TCA--A--------A---CTTT--G-----AAA-AGC-T-AT--AT--CTT-TGTA-AAA-T-A-TAG-C-TTT-T----TG-ACA-CA-AATAAACTT-G-A-TGAGAA-TAG--A-T-TT-T-AAA---A-GC---AT-C--T--TT-CT---CTTA-T-ATTA-T-C--AA---AA---ATTTAACGT-AATTTTt
gi|74570                      :   ATTAT--TCTG--T-TTATTA--T-C-C--T-A--TTA----TC-GTCTA-A--TCTCGTT-T---GT-AACG--GC-T--CT-----T--AG-ACG-T-GA-T--AA-TTG-A--T-C--GCTTTT-CT--CA-A-CAGAA-C-A--------AT----------GCG--TTCTC--C-------------CGCTTCTCG---TT--GA--------CA-CC--A-T---GA-CGT--CA-CAGTA-A--T---GG----GC-GT---A-A-----T-C-GC-G----T----A-AAA--A-TT-CA-T--A-T-----T-CG----G--AA----T--TCCCAA--------A---CTT---------GAA-AGC-T-AT--ATT-CTT-TG-A-AAA-T-A-CAG----TT-T----TG-ATA-CA-AATAA-CTT-G-A-T--GAA-T-G--A-T-TT-T-AAA---A-GC---AT-A--A--TT-CT---TTGA-T-ATA-------AATC-AA---A--TAACGA-AA
gi|74569                      :   ATTA-GATCTG--T-TTAA-A----C-C--T-A--T-A----TC-G--TA-A--TTT-GTT-----CG-ACTT--GG-G--CT-----TC-AG-GCG-T-G--T--A--TTGTG--C-C--G-TTA--CT--ACTA-CAAA--C-A--------------------GTG--TT--C--C-------------CA------A---TT--GA--------CA-CC-TA-T---AA-CGA---A-CAGTA-A--T---GG-C--GC-GT---A-AAATA-T-C--CCGA---A----A-AAAT-ACTG-CATT--A-T-----T-CG----G--AAAC-AT--TCAA-A--------A---CTTT--G------AA-AGC-T-AT--ATCCCTT-TG-A-AAA-TAA-TAA-G-CTG-T----TG-ACA-CACAAT-AACTT-GAA-T--GAA-T-G----T-TT----AA---A-GC---AT-C--T--TT-TTC--TTGA-T-ATAT------AA---AA---A--TAACGA-AATTTT
gi|74571                      :   ATTATATGCTG--T-TTAA-AA-T-C-C--T-AACTTAAAAATC-G-ATA-AA-TTT-GATAT---CGTAACGAAGG-C--TT-----TCTAG-GCGGT-GA-TTCAT-TCGCG--TAC--GCTTAT-CTT-AA-A-CAAGA-C-ACCCCAGTGA-----------GCG--G---T--C-------------CA------A---TT--AATGGAACACCA-TC-TA-TT--GTACGA--CA-CAGCCTA--T---GG-CATGC-GTC--A-AA--A-T-C-GC-GA--TTT---A-AAAT-A-TGCCA-T--A-T-----T-TGAT--G--AA---ATTCTC---A--------A------T--G-----A-----C-T-AT--AT--A----G-A-AAA-A-A-GAG-C-TCT-A----CA-ACA-TA-t
gi|74563                      :         ATCTGGTC-TTAA-A--T-T-CACT-A--TTA----TC-G-ATA-A--TTT-TGT-T---CGTAACG--GGGT--CT-----TC-AG-GCG-T-GA-T--AA-TTG-TC-T-C--GCTTAT-CT--AA-A-CAAAA-C-A--------A-----------GTG--T---C--C-------------CA------T---TT--GAGA------CA-CG-TA-T---GA-CGA--CA-CAGTA-A--T---GG-C--GC-GT---A-AA--A-T-C-GCCGAT-TT----A-AAAT-A-TG-CA-T--A-T-----T-CG----G--AA---AT--TC---A--------AACTTTTT--G-----AAACAGC-T-AT--AT--CTTATG-A-AAA-T-A-TAG-C-TTT-T----TG-ACACCA-AATAAACTT-G-A-TG-GAA-T-GA-A-T-TT-T-AAA---AGGC---AT-CT-T--TT-CT---TTGA-T-ATAT-C-A--AA---AA---A--TAACGA-AATTTTccctttgaaataaaaattaatt
gi|74572                      : tattaactATCTG--T-TTATTA--T-C-C--T-AA-TTA----TC-G-CTA-A--TCT-GTT-G---TA-A-CG--G--T--CT-----T--AA-ACG-T-GA-T--AA-TTG-A--T-C--GCTTTT-CT--AA-AACAAAAAC-A--------G-----------TTGCTT---T--C-------------T-----------TT--GAA-------CA-CC-TA-T---GA-CGT--CA-CAGTA-A--T---GG-C--GC-GT---T-AA--A-T-C-GCCAA--TA----A-AAAT-A-TG-CA-T--A-T-----T-AG----G--AA---AT--TC---A--------A---ACTT--G-----AAA-AGC-T-AT--AT--CTT-TG-A-AAA-T-A-CAG-C-TTT-T----T--ACA-CA-AATAAACTTCA-A-T--GAA-T-G--A-T-TT-T-AAA---A-GCCATAT-T--T--TC-CT---TTGA-GAATA--T-CAAAA---AA---A--TAACGA-AATTTTt
gi|74574                      :        tATC-G--T-TTATTA--T-C-A--T-A--TTA----TC-G-CTA-A--TCT-GTT-T---GT-AACA--GGCT--CT-----TT-AA-ACT-T-GA-T--AA-TTG-A--T-C--GCTTTT-CT--AA-A-CAAAA-C-A--------A-----------GTGCTT---T--C-------------T-----------TT--GA--------CA-TC-TA-TATGGA-CGT--CA-CAGTA-A-------G-C--GC-GT---T-AA--A-T-C-GCCGA--TA----A-AAAT-A-TG-CA-T--A-T-----T-AG----AGTAA---AT--TCA--A--------A---CTTT--G-----AAA-AG--T-AT--AT--C-T-TG-A-AAA-T-A-CAG-C-TTT-T----TA-A-A-CA-AATAACCTT-G-A-G--GAA-T-T--A-T-TT-A-AAAC--A-GT---AT-A-----TT-CT---T--A-T-ATGT-A-T--AA---AA---G--AAACGA-AATTTT
gi|74575                      :        tATCTG--T-TTATTA--T-C-A--T-A--TTA----TC-GTCTA-A--TCT-GTT-G---TA-A-CG--GC-T--CT-----TT-AA-ACT-T-GA-T--A--TTG-AATT-C--GCTTTT-CT--AA-A-CAAAA-C-A--------A------------TGCTT---T--C-------------T-----------TT--GA--------CA-TC-TA-T------TGAGTCA-CAGTA-A------GG-C--GCCGT---TTAA--A-T-CTGCCGA--TA----A-AAAT-A-TG-CA-T--A-T-----T-AGA---G--AA---AT--TCA--A--------A---CTTT--G-----AAA-AGC-T-AT--A----TT-TG-A-AAA-T-A-CAG-C-TTT-T----T--ACA-CA-AATAACCTT-G-AGT--GAA-T-T--A-T-TG-T-AAA---A-GC---AT-A--A--TT-CT---T----T-ATAG-T-CA-AA---AA---A--TAACGA-AATTTT
gi|74576                      :         ATCT---T-TTAT-A--T-T-C--TTA--TTA----TC-G-CTA-ACGTTT-GT---------AACG--C--T--CT-----TA-GA-GC--T-GA-T--AA-TTA-A--T-C--GCTTTTTCT--AA-A-CAAAA-C-A--------ACTAGACTTCTCGCC--T---C--C-------------CG------A---TT--GA--------CA-CC-TA-T---G--CGT--CA-CAGTA-A--T---GG-CT-GC-GT---A-NN--N-N-N-NNNNN--NN----N-NNNN-N-NN-NN-N--N-NGAA--T-CGCCATA--AAAATAT--TCA--A--------A---CTTT--G-----AAA-AGC-T-AT--AT--CTT-TG-A-AAA-T-A-CAG-C-TTT-T----TG-ACA-C--AGTAAACTT-G-A-T--GAA-T-G--A-T-TT-T-AAA---A-GC---ATAT--T--TT-CT---TTGA-T-ATATAA-A--AA---AA---A--TAACGA-AATTCTt
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Reference ( family-774 )      :                                                                      TATTATAATCTG--T-TTAA-A--T-C-C--T-A--TTA----TC-G-ATA-A--TTT-G-T-TC-GN--AACG--GG------T--CTT-----C-A---GG-CG-T-GA-T--AA-TTG-G--T-C--GCTTAT-CT--AA-A-CAAAA-C-A--------A-----------GTG---T-C--C-------------CA------A---TT--GA--------CA-CC-TA-T---G-ACGACA-CAGTA-A--TGG-C--GC-G-T---A-AA--A-T-C-GCCGA-TT----A-AAATA-TG-CA-TA-T-----T-CG------G--AA---AT--TC---AA---CTTT--GAAA-AGCT-AT--A-T--CTT-TG-A-AAA-T-A-TAGC-TTT-T----TG-ACA-C-A-AATAAACTT-G-A-T--GAA-T-G--A-T-TT-T-AAA---A-G-C-A-TC-TT-TT-CT---TTGA-TATAT-T-C--AA---AA---A--TAACGA-AATTTT
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gi|74563                      :                                                                             ATCTGGTC-TTAA-A--T-T-CACT-A--TTA----TC-G-ATA-A--TTTTG-T-TC-GT--AACG--GGG-----T--CTT-----C-A---GG-CG-T-GA-T--AA-TTG-TC-T-C--GCTTAT-CT--AA-A-CAAAA-C-A--------A-----------GTG---T-C--C-------------CA------T---TT--GAGA------CA-CG-TA-T---G-ACGACA-CAGTA-A--TGG-C--GC-G-T---A-AA--A-T-C-GCCGATTT----A-AAATA-TG-CA-TA-T-----T-CG------G--AA---AT--TC---AAACTTTTT--GAAACAGCT-AT--A-T--CTTATG-A-AAA-T-A-TAGC-TTT-T----TG-ACACC-A-AATAAACTT-G-A-TG-GAA-T-GA-A-T-TT-T-AAA---AGG-C-A-TC-TT-TT-CT---TTGA-TATAT-C-A--AA---AA---A--TAACGA-AATTTTt
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gi|74565                      :                                                                      TATTATA-TCTG--T-TTAA-AATT-C-C--T-A--TTA----ACAG-ATATA--TTT-G-T-TC-GT--AACG--GG------TTCCTT-----C-A---GG-CG-T-GA-T--A---TG-G--T-C--GCTTATTCT--AA-A-CAAAA------------A-----------GTG---T-C--C-------------CA------A---TT--GA--------CA-C--TA-T---G-ACGACA-C-GTA-A--TGGGC--GC-G-T---A-AA--A-T-C-GCCGA-TT----A-AA-TA-TG-CA-TA-T-----T-CG------G--AA---AT--TCCA-AA---CTTT--GAAA-AGCT-AT--A-T--CTT-TG-A-AAA-T-A-TAGC-CTT-TGTTGTG-ACA-C-A-AA-AAACTT-G-A-T--GAA-T-G--A-T-TT-T-AAA---A-G-C-A-TC-TTCTT-CT---TTGA-TATA--T-A--AA---AA---A--TAACGA-AATTTTt
gi|74566                      :                                                                      TATTATA-TCTT--C-TTAA-A--T-C-C--T-A--TTA----TC-G-A-A-A--TTT-G-T-TC-GT--AACG--GG------T--CTT-----C-A---GG-CG-T-GAATG-AA-TTG----T-C--GCTTAT-CT--AA-A-CAAA--C-AT-------A-----------GTG---T-C--C-------------CT----------TT--GA--------CA-CGATA-T---G-ACGACAACAGTA-A--TGG-CC-GC-G-T---A-AA--A-A-T-GCCGA-TT----A-AAATA-TG-CA-TA-T-----TTCG------G--AA---AT--TC---AAAA-CTTT--GAAA-AGCTTAT--A-T--CTT--G-ACAAA-T-AATAGC-TTT-T-----G-ACA---A-AATAA-CTT-G-A-T---AA-T-G----T-TT-T-AAA---A-G-C-A-TC-TT-TT-CT---TTGA-TATAT-C-A--AA---AA---A--TAACGA-AATTTTt
gi|74567                      :                                                                       ATTATA-TCTG--T-TTAA-A--T-C-C--T-A--TTA----TC-G-ATA-A--TTT-G-T-TC-GT--AACG--GG------T--CTT-----C-A---GG-CG-T-GA-T--AA-TTG-G--T-C--GCTTA--CT--AA-A-CAAAA-CAA--------A-----------GTG---T-C--C-------------CA------A---TT--GA--------CA-CC-TA-T---G-ACGACA-CAGTA-A--TGG-C--GC-G-T---A-AA--A-T-C-GCCGA-TT----A-AAATA-TG-CA-TA-T-----T-GC------G--AA---AT--TCA--AA---CTTT--GAAA-AGC--AT--A-T--CTT-TGAA-AAA-T-A-TAGC--TT-T----TG-ACA-C-A-AATAAACTT-G-A-T--GAA-T-G--ATT-TT-T-AAA---A-G-C-A-TC-TT-TT-CT---TTAATTATAT-C-A--AA---AA---A--TAACGA-AATTTTt
gi|74568                      :                                                                       ATTATA-TCTG--T-TTAA-A--T-C-C--T-A--TTA----TC-G-ATA-A--TTT-G-T-TC-GT--AACG--GG------T--CTT-------A---GG-CG-T--A-T--AA-TTG-G--T-C--GCTTAT-CT--AA-A-CAAAA-C-A--------A-----------GTG---T-C--C-------------CA------A---TT--GA--------CA-CC-TA-T---G-ACGACA-CAGTA-A--T-G-C--GC-G-T-----AA--A-T-C-GCCGA-TT----A-AAATA-TG-CA-TATT-----T-CG------G--AA---AT--TCA--AA---CTTT--GAAA-AGCT-AT--A-T--CTT-TGTA-AAA-T-A-TAGC-TTT-T----TG-ACA-C-A-AATAAACTT-G-A-TGAGAA-TAG--A-T-TT-T-AAA---A-G-C-A-TC--T-TT-CT---CTTA-TATTA-T-C--AA---AA---ATTTAACGT-AATTTTt
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gi|74571                      :                                                                       ATTATATGCTG--T-TTAA-AA-T-C-C--T-AACTTAAAAATC-G-ATA-AA-TTT-GATATC-GT--AACGAAGG------C--TTT-----CTA---GG-CGGT-GA-TTCAT-TCGCG--TAC--GCTTAT-CTT-AA-A-CAAGA-C-ACCCCAGTGA-----------GCG---G-T--C-------------CA------A---TT--AATGGAACACCA-TC-TA-TT--GTACGACA-CAGCCTA--TGG-CATGC-G-TC--A-AA--A-T-C-GC-GA-TTT---A-AAATA-TGCCA-TA-T-----T-TGAT----G--AA---ATTCTC---AA------T--GA-----CT-AT--A-T--A----G-A-AAA-A-A-GAGC-TCT-A----CA-ACA-T-A-
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gi|74577                      :                                                                                          -A--T-CTC--T-A--TTT----TC-G-CTA-A--TCT-G-T-TTTGTCAAACG--GC------T--CTTTTAGTC-A---GAACG-T-GA-T--AA-TT
gi|74577                      :                                                                                                                                                                                                                                          -----------GCG---C-C--C-------------CG------A---TT--GT--------CA-CCCTACT---G-ACGTCA-CAGTA-AC-TCG-G--GC-GAT---A-AG--A-TTC-GATGA-TTCAAAACAAATA-TG-CA-TA-TAGGTCT-CT------G--AATTGATCTTT---AA---CTTTTGAAAA-AGCT-ATGGA-T--ATT-TG-A-AAAAT-A-CAGA-TTTCT----TGTACA-C-A-AATAAACTT-G-A-T--GAA-T-G--A-TGTT-T-AAAAAGA-G-CAA-TC-AT-TT-GTCGGTTGA-TATAT-TAC--AA---AT---A--TAtggaggttcgtcggtttttccttgcaacttactcacaatcagtgtcttgcttgcattgcgccccgattgtcaccctactgacgtcacagtaactcgggcgataagattcgatgattcaaaacaaatatgcatataggtctctgaattgatctttaacttttgaaaaagctatggatatttgaaaaatacagatttcttgtacacaaataaacttgatgaatgatgtttaaaaagagcaatcatttgtcggttgatatattacaaatata
gi|74578                      : atctctattttcgctaatctgttttgtcaaacggctcttttagtcagaacgtgataatttggaggttcgtcggtttttccttgcaacttactcacaatcagtgtcttgcttgcatt-ATT-A--TGT-G-TACC-GT--AACG--GGGTCATTT--TTC-----C-ACCGGG-CG---GA-T--AAATTG-G--T-C--GCTTAT-CTGAAG-A-CAAAA-C-A--------C-----------GTG---T-CCGC-------------CA------T---TT--GA--------CT-CC-
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Reference ( family-774 )      :                                                                      TATTATAATCTG--T-TTAA-A--T-C-C--T-A--TTA----TC-G-ATA-A--TTT-G-T-TC-GT--AAC--G--GG------T--CTT-----C-A---GG-CG-T-GA-T--AA-TTG-G--T-C--GCTTAT-CT--AA-A-CAAAA-C-A--------A-----------GTG---T-C--C-------------CA------A---TT--GA--------CA-CC-TA-T---G-ACGACA-CAGTA-A--TGG-C--GC-G-T---A-AA--A-T-C-GCCGA-TT----A-AAATA-TG-CA-TA-T-----T-CG------G--AA---AT--TC---AA---CTTT--GAAA-AGCT-AT--A-T--CTT-TG-A-AAA-T-A-TAGC-TTT-T----TG-ACA-C-A-AATAAACTT-G-A-T--GAA-T-G--A-T-TT-T-AAA---A-G-C-A-TC-TT-TT-CT---TTGA-TATAT-T-C--AA---AA---A--TAACGA-AATTTT
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gi|74574                      :                                                                            tATC-G--T-TTATTA--T-C-A--T-A--TTA----TC-G-CTA-A--TCT-G-T-TT-GT--AAC--A--GGC-----T--CTT-----T-A---AA-CT-T-GA-T--AA-TTG-A--T-C--GCTTTT-CT--AA-A-CAAAA-C-A--------A-----------GTGCT-T-T--C-------------T-----------TT--GA--------CA-TC-TA-TATGG-ACGTCA-CAGTA-A----G-C--GC-G-T---T-AA--A-T-C-GCCGA-TA----A-AAATA-TG-CA-TA-T-----T-AG------AGTAA---AT--TCA--AA---CTTT--GAAA-AG-T-AT--A-T--C-T-TG-A-AAA-T-A-CAGC-TTT-T----TA-A-A-C-A-AATAACCTT-G-A-G--GAA-T-T--A-T-TT----AA---A-A-C-AGTA-TA-TT-CT---T--A-TATGT-A-T--AA---AA---G--AAACGA-AATTTT
gi|74575                      :                                                                            tATCTG--T-TTATTA--T-C-A--T-A--TTA----TC-GTCTA-A--TCT-G-T-T--GT--AAC--G--GC------T--CTT-----T-A---AA-CT-T-GA-T--A--TTG-AATT-C--GCTTTT-CT--AA-A-CAAAA-C-A--------AT----------GCT---T-T--C-------------T-----------TT--GA--------CA-TC-TA-TT--G-A-GTCA-CAGTA-A---GG-C--GCCG-T---TTAA--A-T-CTGCCGA-TA----A-AAATA-TG-CA-TA-T-----T-AGA-----G--AA---AT--TCA--AA---CTTT--GAAA-AGCT-AT--A-----TT-TG-A-AAA-T-A-CAGC-TTT-T----T--ACA-C-A-AATAACCTT-G-AGT--GAA-T-T--A-T-TG-T-AAA---A-G-C-A-TA--A-TT-CT---T----TATAG-T-CA-AA---AA---A--TAACGA-AATTTT
gi|74576                      :                                                                             ATCT---T-TTAT-A--T-T-C--TTA--TTA----TC-G-CTA-A--C---G-T-TT-GT--AAC--G--C-------T--CTT-----A-G---AG-C--T-GA-T--AA-TTA-A--T-C--GCTTTTTCT--AA-A-CAAAA-C-A--------ACTAGACTTCTCGCC---T-C--C-------------CG------A---TT--GA--------CA-CC-TA-T---G--CGTCA-CAGTA-A--TGG-CT-GC-G-T---A-NN--N-N-N-NNNNN-NN----N-NNNNN-NN-NN-NN-NGAA--T-CGCCATAAA--AAT--AT--TC---AAA--CTTT--GAAA-AGCT-AT--A-T--CTT-TG-A-AAA-T-A-CAGC-TTT-T----TG-ACA-C-A-G-TAAACTT-G-A-T--GAA-T-G--A-T-TT-T-AAA---A-G-C-A-TA-TT-TT-CT---TTGA-TATATAA-A--AA---AA---A--TAACGA-AATTCTt
gi|74577                      :                                                                                          -A--T-CTC--T-A--TTT----TC-G-CTA-A--TCT-G-T-TTTGTCAAAC--G--GC------T--CTTTTAGTC-A---GAACG-T-GA-T--AA-TT
gi|74577                      :                                                                                                                                                                                                                                            -----------GCG---C-C--C-------------CG------A---TT--GT--------CA-CCCTACT---G-ACGTCA-CAGTA-AC-TCG-G--GC-GAT---A-AG--A-TTC-GATGA-TTCAAAACAAATA-TG-CA-TA-TAGGTCT-CT------G--AATTGATCTTT---AA---CTTTTGAAAA-AGCT-ATGGA-T--ATT-TG-A-AAAAT-A-CAGA-TTTCT----TGTACA-C-A-AATAAACTT-G-A-T--GAA-T-G--A-TGTT-T-AAAAAGA-G-CAA-TC-AT-TT-GTCGGTTGA-TATAT-TAC--AA---AT---A--TAtggaggttcgtcggtttttccttgcaacttactcacaatcagtgtcttgcttgcattgcgccccgattgtcaccctactgacgtcacagtaactcgggcgataagattcgatgattcaaaacaaatatgcatataggtctctgaattgatctttaacttttgaaaaagctatggatatttgaaaaatacagatttcttgtacacaaataaacttgatgaatgatgtttaaaaagagcaatcatttgtcggttgatatattacaaatata
gi|74578                      : atctctattttcgctaatctgttttgtcaaacggctcttttagtcagaacgtgataatttggaggttcgtcggtttttccttgcaacttactcacaatcagtgtcttgcttgcatt-ATT-A--TGT-G-TACC-GT--AAC--G--GGGTCATTT--TTC-----C-ACCGGG-CG---GA-T--AAATTG-G--T-C--GCTTAT-CTGAAG-A-CAAAA-C-A--------C-----------GTG---T-CCGC-------------CA------T---TT--GA--------CT-CC-
gi|74579                      :                                                                                                                                                                                                                                                          ---T-C--C-------------CA------GGATTT--GT--------CG-TA-TA-T---G-ACGTCA-CAGGA-AATTGG-C--GC-G-T---A-AA----T-C-TCCAA-TC----G-AAATA-TG-CA-TA-T-----T-
gi|74580                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 A-T---G-ACGA-A-CAATA-AA-TGG-C--GC-G-T---A-AA--AAT-C-GCCGA-AT----T-AAATA--G--A-TA-T-----T-CG------G--AA---AT--TC---AAAC-CTTT---AAA-AGCT-ATT-A-T--CTT-TG-A-AAA-A-A-TAGC-TTT-T-----G-ACA-C-A-AATAA--CT-G-A-T--GAA-T-GAAA-T-TT-C-AAA---A-G-CAA-TC-TT-TT-CT---TT-A-TATTA-T-C--AA---AA---A--AAACGA-AATTT
gi|74581                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     -A--TGG-C--GC-G-TTAAA-AA--A-T-C-GCCGA-TT----A-AAATA-TG-CA-TA-T-----T-CG------G--AA---AT--TC---AAA--CTTT--GAAA-AGCT-AT--A-T--CTT-TGAA-AAA-T-A-TAGC--TT-T----TG-ACA-C-A-AATAAACTT-G-A-T--GAA-T-GT-A-T-TT-TAAAA---A-G-C-A-TC-TT-TT-CT---TTGA-TATA--T-CAAAA---AA---A--TAACGA-AATTTT


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blockSeqs                     :                                                                            A     .  .    . .  . . .  . .    .     . A   . .    . . .  .  .    .  .   .      .    C       .    .  . .  . .   .   G    . .       .  .   . .     . . A                      .   . .  CAA                        .   .         .  .  . .   .   A  .     . .    . .   . . A      .  . . .     .  .    .     .  .  .  . .     .  .      .   .    .   A    A      .     .    .  .  . .    .  . .   . . .    .   . .     .   . . .         . . . .    . . .  . .  T     .   . . . .  T  .  .  .      .    TTC      .    .   .       .
blockSeqs                     :                                                                            A     .  .    . .  . . .  . .    .     . A   . .    . . .  .  .    .  .   .      .    C       .    .  . .  . .   .   G    . .       .  .   . .     . . A                      .   . .  CAA                        .   .         .  .  . .   .   A  .     . .    . .   . . A      .  . . .     .  .    .     .  .  .  . .     .  .      .   .    .   A    .      .     .    .  .  . .    .  . .   . . .    .   . .     .   . . .         . . . .    . . .  . .  T     .   . . . .  T  .  .  .      .    TAA      .    .   .       .
blockSeqs                     :                                                                            A     .  .    . .  . . .  . .    .     . A   . .    . . .  .  .    .  .   .      .    C       .    .  . .  . .   .   G    . .       .  .   . .     . . A                      .   . .  CAA                        .   .         .  .  . .   .   A  .     . .    . .   . . A      .  . . .     .  .    .     .  .  .  . .     .  .      .   .    .   .    .      .     .    .  .  . .    .  . .   . . .    .   . .     .   . . .         . . . .    . . .  . .  T     .   . . . .  T  .  .  .      .    TCA      .    .   .       .
blockSeqs                     :                                                                            A     .  .    . .  . . .  . .    .     . A   . .    . . .  .  .    .  .   .      .    C       .    .  . .  . .   .   G    . .       .  .   . .     . . A                      .   . .  CAA                        .   .         .  .  . .   .   A  .     . .    . .   . . A      .  . . .     .  .    .     .  .  .  . .     .  .      .   .    .   .    .      .     .    .  .  . .    .  . .   . . .    .   . .     .   . . .         . . . .    . . .  . .  T     .   . . . .  T  .  .  .      .    ATC      .    .   .       .
blockSeqs                     :                                                                            .     .  .    . .  . . .  . .    .     . A   . .    . . .  .  .    .  .   .      .    C       .    .  . .  . .   .   G    . .       .  .   . .     . . A                      .   . .  CAA                        .   .         .  .  . .   .   T  .     . .    . .   . . A      .  . . .     .  .    .     .  .  .  . .     .  .      .   .    .   .    .      .     .    .  .  . .    .  . .   . . .    .   . .     .   . . .         . . . .    . . .  . .  T     .   . . . .  T  .  .  .      .    TCA      .    .   .       .
blockSeqs                     :                                                                                  .  .    . .  . . .  . .    .     . A   . .    . . .  .  .    .  .   .      .    T       .    .  . .  . .   .   A    . .       .  .   . .     . . A                      .   . .  CGA                        .   .         .  .  . .   .   A  .     . .    . .   . . A      .  . . .     .  .    .     .  .  .  . .     .  .      .   .    .   .    .      .     .    .  .  . .    .  . .   . . .    .   . .     .   . . .         . . . .    . . .  . .  T     .   . . . .  A  .  .  .      .    TCA      .    .   .       .
blockSeqs                     :                                                                                  .  .    . .  . . .  . .    .     . C   . .    . . .  .  .    .  .   .      .    T       .    .  . .  . .   .   A    . .       .  .   . .     . . A                      .   . .  CGA                        .   .         .  .  . .   .   T  .     . .    . .   . . T      .  . . .     .  .    .     .  .  .  . .     .  .      .   .    .   .    .      .     .    .  .  . .    .  . .   . . .    .   . .     .   . . .         . . . .    . . .  . .  T     .   . . . .  T  .  .  .      .    ATC      .    .   .       .
blockSeqs                     :                                                                                  .  .    . .  . . .  . .    .     . C   . .    . . .  .  .    .  .   .      .    T       .    .  . .  . .   .   A    . .       .  .   . .     . . G                      .   . .  CAT                        .   .         .  .  . .   .   T  .     . .    . .   . . A      .  . . .     .  .    .     .  .  .  . .     .  .      .   .    .   .    .      .     .    .  .  . .    .  . .   . . .    .   . .     .   . . .         . . . .    . . .  . .  T     .   . . . .  T  .  .  .      .    TAT      .    .   .       .
blockSeqs                     :                                                                                  .  .    . .  . . .  . .    .     . C   . .    . . .  .  .    .  .   .      .    A       .    .  . .  . .   .   A    . .       .  .   . .     . . A                      .   . .  AA                         .   .         .  .  . .   .   T  .     . .    . .   . . T      .  . . .     .  .    .     .  .  .  . .     .  .      .   .    .   .    .      .     .    .  .  . .    .  . .   . . .    .   . .     .   . . .         . . . .    . . .  . .  T     .   . . . .  .  .  .  .      .    ATC      .    .   .       .
blockSeqs                     :                                                                                  .  .    . .  . . .  . .    .     . C   . .    . . .  .  .    .  .   .      .    C       .    .  . .  . .   .   A    . .       .  .   . .     . . A                      .   . .  AG                         .   .         .  .  . .   .   T  .     . .    . .   . . A      .  . . .     .  .    .     .  .  .  . .     .  .      .   .    .   .    .      .     .    .  .  . .    .  . .   . . .    .   . .     .   . . .         . . . .    . . .  . .  C     .   . . . .  .  .  .  .      .    TA       .    .   .       .
blockSeqs                     :                                                                                  .  .    . .  . . .  . .    .     . C   . .    . . .  .  .    .  .   .      .    .       .    .  . .  . .   .   G    . .       .  .   . .     . . C                      .   . .  CT                         .   .         .  .  . .   .   T  .     . .    . .   . . A      .  . . .     .  .    .     .  .  .  . .     .  .      .   .    .   .    .      .     .    .  .  . .    .  . .   . . .    .   . .     .   . . .         . . . .    . . .  . .  .     .   . . . .  .  .  .  .      .    T        .    .   .       .
blockSeqs                     :                                                                                          . .  . . .  . .    .     . A   . .    . . .  .  .    .  .   .      .    .       .    .  . .  . .   .   .    . .       .  .   . .     . . .                      .   . .  T                          .   .         .  .  . .   .   T  .     . .    . .   . . A      .  . . .     .  .    .     .  .  .  . .     .  .      .   .    .   .    .      .     .    .  .  . .    .  . .   . . .    .   . .     .   . . .         . . . .    . . .  . .  .     .   . . . .  .  .  .  .      .    .        .    .   .        
blockSeqs                     :                                                                                                                     .   . .    . . .  .  .    .  .   .      .    .       .    .  . .  . .   .                                                            .   . .  T                          .   .         .  .  . .   .   A  .     . .    . .   . . A      .  . . .     .  .    .     .  .  .  . .     .  .      .   .    .   .    .      .     .    .  .  . .    .  . .   . . .    .   . .     .   . . .                                                                                                   
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                          .   . .  T                          .   .         .  .  . .   .   .  .     . .    . .   . . .      .  . . .     .  .    .     .  .  .  . .     .  .      .   .    .   .    .      .     .    .  .  . .    .  . .   .                                                                                                                                
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