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lowQualScore                  :    5 2  4 55  2 2   7 444 2 9    2 2  2  2 999999999999 5555 4   2 0 4 2  77    2 33   2 2 2  2      55 1111111 2     00000 2  2  0 22 22 2   6   44 2  2 44   000  7777 2 2    2 55  000000  2  66 2  2 2  6666   0     4 2 0   888888888 2  2 88888   333  44  2 2      555  4  2      22  66  2  2 4 2   77   6   22 55 44   2    55 2 333  2 333  2   1 2   333 22  2 55 55555   2 22  4  2  55  77   55 2  2    2  4  77 4   6  2  000000  3333 77   55  2 22   2  2  22 2 4  2  22 2  2 55   2 2  22 2  000000000 22   55  2    22 2 99  22   2 2  4444 22 55 4   22     77    2 22  2 22 4  777    2        55555 2  2 2 888888  2   22 44 2 2  333 666666666     8888888888   2    000000000000  2 2   2    4   0000   4444  2 44 2      4 22      
lowQualScore                  :    . .  . ..  . .   . ... . .    . .  .  . ............ .... .   . . . .  ..    . ..   . . .  .      .. ....... .     ..... .  .  . .. .. .   .   .. .  . ..   ...  .... . .    . ..  ......  .  .. .  . .  ....   .     . . .   ......... .  . .....   ...  ..  . .      ...  .  .      ..  ..  .  . . .   ..   .   .. .. ..   .    .. . ...  . ...  .   . .   ... ..  . .. .....   . ..  .  .  ..  ..   .. .  .    .  .  .. .   .  .  ......  .... ..   ..  . ..   .  .  .. . .  .  .. .  . ..   . .  .. .  ......... ..   ..  .    .. . ..  ..   . .  .... .. .. .   ..     ..    . ..  . .. .  ...    .        ..... .  . . ......  .   .. .. . .  ... .........     ..........   .    ............  . .   .    .   ....   ....  . .. .      . ..      
lowQualScore                  :    0 5  7 66  4 4   1 111 4 4    4 4  4  4 333333333333 0000 7   4 3 7 4  22    4 22   4 4 4  4      00 1111111 1     55555 1  1  5 99 99 1   0   88 0  0 88   444  0000 0 0    0 55  000000  0  88 0  0 0  2222   8     0 0 0   000000000 0  0 55555   555  88  0 0      555  0  0      88  88  0  0 0 0   55   0   88 55 88   0    00 1 777  1 777  1   3 1   555 99  1 88 33333   1 99  2  1  00  11   00 1  1    1  2  11 2   3  1  333333  7777 99   00  1 99   1  1  99 1 2  1  99 1  1 33   1 1  99 1  555555555 99   00  1    99 1 22  99   1 1  5555 99 00 2   99     11    1 99  1 66 0  000    0        99999 0  0 0 555555  0   88 88 0 0  555 555555555     8888888888   0    222222222222  0 0   0    0   2222   2222  0 88 0      0 88      
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Reference ( gi|4924 )         : CAT-A-CA-T--GT-G-ATA-A---A-T-TCCG-A-CT-GC-C-T-----A--T-G----A-GTG-AGA-T-TTT-GCCG-A--GCT-A-A-GG-GTGAGA--T-------T-GGGGT-----G-AT-TTGG--G--G-TGA-GAT--T-TT-T--TTT-T-AT----A-T-CAAT-G--AT------TT-GC--T-GT-A-AT----AAAAGCCAT-A-A-TAA---------G-AC-T--T--AAA---AT--AC-T-AGCTTT---AG-TT-CATTTT--TT--AT-TA-T-A-AAA--GCA-ATT--A--T--CAA-GTGT--C-A---CA-A---TC-AAGTT-TCA---G--CA-G--T-----TAA-G--TG-TT-CA--TT--TGA--T-AG-CATT-AG-TC--T-CTA-CT-AA------TG-T--A--AGA--TT-C--TTC-TT-GG--A-G-TA-TC--T-TC-TG-GAC-A-TT--G-CA---------G--GCA--TT-TTTG--G-C--TT--TTT-T-GA----T--A--C-AAC--TTTCA--TGAT-T--AA-AG-G-GA---AACT-AATTGCCA---T-A-CT-A-C------AC-CTT--T--A-A-CA---A-AAA-T-T-TTTTT----------TGG-GGGG------------TG-A-GAT-ATTG-TTA-T--CCG----CG-G--G-TGAGGT-C--GTGAGA
gi|4926                       : CAT-A-CA-T--GT-G-ATA-A---A-T-TCCG-A-CT-GC-C-T-----A--T-G----A-GGG-AGA-T-TTT-GCCG-A--GCT-A-A-GG-GCGAGA--T-------T-GGGGT-----G-AT-TTGG--G--G-TGA-GAT--T-TTTT--TTT-T-AT----A-T-CAAT-G--AT------TT-GC--T-GT-A-AT----AAAGGCCGC-A-T-TAA---------G-AC-T--T--AAA---AT--AC-T-AGCTTT---AG-TT-CATTTT--TT--AT-TA-T-A-AAA--GCA-ATT--A--T--CAA-GTGT--C-A---CA-A---TC-AAGTT-TCA---G--CA-G--T-----TAA-G--TG-TT-CA--TT--TGA--T-AG-CATT-AG-TC--T-CTA-CT-AA------TG-T--A--AGA--TT-C--TTC-TT-GG--A-G-TA-TC--T-TC-TG-GAC-A-TT--C-CA---------G--GCA--TT-TCTC--G-C--TT--TTT-T-GA----T--A--C-AAC--TTTCA--TGAT-T--AA-AG-G-GA---AACT-AATTGCCA---T-A-CT-A-C------AC-CTT--T--A-A-CA---A-CAA-T-T-TTTTT----------TGG-GGGG------------TG-A-GAT-ATTG-TGA-C--CCG----CG-G--G-TGAGAG-A--GTGAGA
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gi|4931                       : CAT-A-CA-T--GT-G-ATA-A---A-T-TCCG-A-CT-GC-C-TCATTCA--C-GCACCA-CGG-ACA-T-TTTTGCCGCA--GCT-AGA-GGCGTGAGA--T-------TCGGGGT-----GCATATTGG--G--G-TGA-GAA--T-TT-T--TTT---AT----A-T-CAAT-G--AT------TT-GCC-T-GT-A-AT----AAAGGCCAT-A-A--GA---------G-AC-T--T--AAA---AA--ACGT-AGCTTT---AG-TT-CATTTT--TTT-AT-TA-C-A-AAA--GCA-AT---A--T--CAA-GTGCTCC-A---CA-----TC-AAGTT-TCA---G--CA-G--T-----TAA-G--TG-TT-CA--TT--TGA--TAAG-CATT--G-TC--T-CTA-CT-AA------TG-T--A--AGA--TT-C--TTC-TT-AG--A-G-TA-TC--T-TC-TG-GAC-A-TT--G-CA---------G--GCA--TT-TTTG--G-C--TT--TTT-T-GA----T--A--C-AAC--TTTCAATCGAT-T--AA-AG-G-GA---AACT--ATTGCCA---T-A--T-A-C------AC-CTT--T--A-A-CA---A-CAA-T-T-TTTTTGGGGGGGGGGGGG-GGGG------------TG-A-GAT-ATTG-CTA-C--CCG----CG-GC-G-TGAGGT-C--ATGAGA
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gi|4933                       : CAT-A-CA-T--GT-G-ATA-A---A-T--CTG-A-CT-GC-C-T-----A--T-G----A-GTG-AGA-T-TT--GC-G-A--GCT-A-A-GG-GT-AGA--TGGTGAAAT-GGGGT-----G-AT-ATGGCGG--G-TGA-GATATT-TT-TGATTT-C-AT----A-TACAAT-G--AT------T--GC--TCGT-A-AT----AAA-GCCAT-A-AATAA---------GCAC-T-----AAA---AT--AC-T-AGCTTT---AG-TT-CA--TT--TT--AT-TA-T-A-AAA--GCA-ATT--A--T--CAA-GTGT----A----A-A---GC-AAG-T-TCA---G--CA-G--T-----TAA-------TT-CA--TTA-TGAT-T-AG-CA-T-AG-TC--T-CTA-CT-AA------TA-TGGA--AGA--TT-C--TTCGTTGGG--A-GATATTC--T-TC-TG-GAT-A-TT--G-C----------G--GCA--TT-TTTG--GAC------TTT-T-GA----T--A--C-AACTTTTTCA--TGAT-T--AA-A--G-GA---AACT-AATTGCCA---T-A-CT-A-C------AC-CCT--T--A-A-CA---A-CCA-TGG-TTTTT----------TGG-GGAG------------TG-ACGATCATTG-TTG----GCG----CT-G--T-CGAGGT-C--GTGAGA
gi|4935                       : CAT-A-CA-T--GT-G--TAGA---A-T-TCTG-A-CT-GC-C-G-----A--A-G----ATGTG-A-A-T-TT---CCG-A---CT-A-A-GG--TGA-A--T-------T-GGGGTTGGGTG-AT-T--G--G--G-TGAAGAT--T-TT-T--TTT-T-AT----A-T-CAAT-GTTAT------TT-GC--T-GT-A-AT----AAATGCCAT-A-ACTAA---------G-AC-T-----AAA---AT--AC-T-AGCTTT---AG-TT-CATTTT--TT--AT-TA-TAA-AAA--GCA-ATT--ACTT--C-A-GTGT--C-A---CA-A---TC-AAG-T-TCA---G--CA-GATT-----TAA-C--TG-TT--A---T--TGA--T-AG-CAGT-AG--C--T-CTACCT-AA------TG-T--A--AAA--TT-C--TTC-CT-TG--A-G-TA-TC--T-TC-T--GAC-A-----G-CA---------G--GCA--TT-TTGG--A-T--TT--TTT-T-GA-------A--CAAAC--TTTCA--GAAT-T--AA-AG-GAGAAAGAACT-AA-TG-CA-----A-CT-A-C------A--CTT--T--A-A-CA---ACAAA-----TTTTT----------TGG-GGG--------------G-A-GAT-ATTG-TTC-C--CCG----CG-G--G-TGAGGT-T--GTGA
gi|4934                       : CAT-A-CA-T--GT-G--TAGA---A-T-TCTG-A-CT-GC-C-G-----A--A-G----ATGTG-A-A-T-TT---CCG-A---CT-A-A-GG--TGA-A--T-------T-GGGGTTGGGTG-AT-T--G--G--G-TGAAGAT--T-TT-T--TTT-T-AT----A-T-CAAT-GTTAT------TT-GC--T-GT-A-AT----AAATGCCAT-A-ACTAA---------G-AC-T-----AAA---AT--AC-T-AGCTTT---AG-TT-CATTTT--TT--AT-TA-TAA-AAA--GCA-ATT--ACTT--C-A-GTGT--C-A---CA-A---TC-AAG-T-TCA---G--CA-GATT-----TAA-C--TG-TT--A---T--TGA--T-AG-CAGT-AG--C--T-CTACCT-AA------TG-T--A--AAA--TT-C--TTC-CT-TG--A-G-TA-TC--T-TC-T--GAC-A-----G-CA---------G--GCA--TT-TTGG--A-T--TT--TTT-T-GA-------A--CAAAC--TTTCA--GAAT-T--AA-AG-GAGAAAGAACT-AA-TG-CA-----A-CT-A-C------A--CTT--T--A-A-CA---ACAAA-----TTTTT----------TGG-GGG--------------G-A-GAT-ATTG-TTC-C--CCG----CG-G--G-TGAGGT-T--GTGA
gi|4936                       : CAT-A-CA-TA-GT-G-ATA-A---A-G--CCG-A-CT-GC-C-------A--C-G----A-GTG-AGA-T-TTTTGCC--A--GCTTA-A-GG-G--AGA--T-------T-GGG-T-----G-AT----G--G--G-AGA-GAT--T-AT-T--AATAT-AT----A-T---AT----AT------TT-GC--T-GT-A-AT----AAA-GCCAT-A-A-TAA---------G-AC-T--T--AAA---AT--AC-C-TACGTT---AG-TT-CATTTT--TT--AT-TGTT-ATAAA--GCC-ATT--A--T--CAA-GTTT--C-A---CA-A---TC-AAGTT-TCA---G--CA-G--TTCTTATGA-G--TGTTT-CA--TT----A--T-AG-CATT--G-AC--T-CTA-CT-AA------TG-G--A----A--TT-C--TTC--T-GC--A-G-TA-TC--T-TC-T--GAC-A-TT--GCCA---------G--GCA--TT-TT----G-CTTTT--TTT-T-GA----T--A--C-AA---TTTCA--TGAT-C--GA-A--G-GA---AACT-AATTTCCA---T-A-CT-A-C------AC-CTT--T--A-A-CA---A-CA----C-TTTTT----------TGG-GGGG------------GA-A-GAT-ATGT-TTA----CCG----CG-T--G-TGAGTT-C--GTGAGA
gi|4937                       : CAT-AACA-G--G--G-ATA-A-------TCCG-A-C--GC---T-----A--T-G----A-GGG-AGA-C-TTT-GCCG-GACGCT-A-A-GG-GTGAGAG-TA------T-GGGGT-----G-AT-TTGG--G--G-TGA-GAT--T-TT-T--TT----------A---CAAT-G--AA------TT-GC--T-GT-A-AT----AAACGCCAT-A-ATTAA---------G-AC-T--A--AAA---AT--AC-T-AGCTTT---AG-TT-CA-TTT--TT--AT-TA-T-A-AAA--GCA-ATT--A--T---AA-GTTTC-C-A---CA-A----G-AAGTT-CAG---G--CA-G--T-----TAAGG--TG-TT-TG--TCAATGA--T-AG-CATT--G-TCCGT-CTA-CT-AAC-----TG-T--ATGAGA--TT-C-------C-GC--A-G-TA-----T-TC-TG-GAC----T--G-C----------T--ATA--TT-TGTG--G-C--TT--TTT-T-GA----T--ATCT-AAC--GTTCAC-TGAT-T--TA-A--G-GA---AACT-AATTGCCA---TCA-CT-A-C------AC-CTT--T--A-A-CA---A-CAA------TTTT----------TGT-GGGG------------TG-A--AT-A-TG-TTA-C--CCG----CG-------GAGG--C--GTGAGA
gi|4938                       : CATGA-CA----GT-G-ATA-A---A-AATCCG-A-TT-GC-C-T-----A--T-G----T-GTG-AGGGTGTTT-GCTG-A--G-T-A-A-GA-GTGAGAGAT-------T-GGCGG-----A-AT-TTTG--GCCG--GA-GAT--T-AA-T--TTA-T-AC----AAG-CGAT-G--AT------TT-TTAAT-GT-G-AT----AGAGGCCATTA-A-AAA---------G-TC-T--TTTAAA---GT--AC-T-AGCTGT---AA-CT-TATTAT--TC--AT-TA-C-A-ATA--ACATTTT--A--T--TAC-GTTT--A-AACTTA-A---TA-AATTT-TCA---
gi|4939                       :  AT-A-CAGT--GTTG-ATATA---A-TGTCCG-A-CTTGC-T-A-----A--T-G----A-GTGGAGAAT-TTT-GC-G-A---TT-A-C-AG-GTGAAG--TA------T-GGGGT-----G----TTGG--G--G-TGATGAT--T-TT-T--TTT---AT----A-T-CAAT-A--ATGAGT--TT-GC--T-GTTA-ATTATTAAGTGTCAT-ATA-CAG---------T-AC-TG-T--AAA---AT--AC-TTAGCTTTT--AG-TT-CATTTT--TTTTAT-TA-T-A-AAA--GCA-ATTTTA--TTTCAA-GTGT--CCA---CA-A---TC-A--TT-TCA---G--CA-G--T-----TAA-GGTTG-TT-CAATTT--TGA--T-AG-CATT-AGGTC--TTCTA-CT-AA------TGGT--AT-AGA--TTTC--TTC-TT-GG--A-GATA-T---T-TC-TGTGAC-A-TTTGG-CA---------GTTGCAA-TT-TTTGTTA-C--TT--TTT-T-GAGAACT--A--C-A-C--TTT-A--TGAT-TTTAA-AG-G-GA---AACT-AATTGCCAGTAC-A-CT-A--------AC-CTT--T--A-AACA---A-CCA-T-TGTTTTT----------TGG-GGGG------------TG-A-GTT-ATTG-TTA----CCG----CG-G--G-TGAGGTCC--GTGAGA
gi|4940                       :    -A-CA-T--GT-GGATA-A---A-T-TCCGGA-CT-GC-C-T--------T-G----A-TTG--GA-T-TTT-GCCG-A--GCT-A-A-GG-GTGAGA--T-------T-GGGGT-----G-AT-TTGG--G--G-TGA-GAT--T-TT-TG-TTT-T-AT----A-T-C--T-G--AT------TT-GC--T-GT-A-AT----AAGGCCCAA-A-A-GAA------------C-T--T--AAA----T--AC-T-AGCTTT---AG-TT-CATTTT--TT--AT-TA-T-A-AAA--GCATATT--A--T--CAG-TTGT--C-A---CA-A---TC-AAGTTGTCA---GAGCA-G--T-----TAA-G--TG-TT-TA--TT--TGA--T-AG-CATT-AG-TC--T-CTA-CT-AA------TG-T--A--AGA--TT-C--TTC-TT-GG--A-G-T--TC--T-TC-TG-GAC-A-TT--C-CA---------G--GCA--TTGTTTC--G-C---T--TTT-T-GA----T--A--C-AAC--TTTCAT-TGAT-T--AA----G-GG---AACT--ATTG-CA---T-A-TTAA-C------ATACTT--T----A-C----A-AAA-T-T-TTTTT----------TGG-GGGG------------TG-A-GAT-ATTG-TTA-CCACCG----CGTG--A-TGAGA-----GTGAGA
gi|4941                       :        A-T--GT-G-ATA-A---A-T-TCCG-A-CT-GC-CCT-----A--TTG----A-GTG-AGA-T-TTT-GCCG-A--GCT-A-A-GG-GTGAGA--T-------T-GGGGT-----G-----------------A-GAT--T-TT-T--T-----AT----A-T-CAATTG--AT------T--GC--T-GT-A-AT----AAAGGCCAT-A-A-TAA---------G-AC-T--T--AAA---AT--AC-T-AGCTTT---AG-TT-CATTTT--T---ATATA-T-A-AAAA-GCA-ATT--A--T--CAA-GTGT--C-A---CA-A---TC-AAGTT-TCA---G--CA-G--T-----TAA-G--TG-TTTCA--TT--TGA--T-AG-CATT-AG-TC--T-CTA-CT-AA------TG-T--AGTAGA--TT-C--TTC-TT-GG--A-G-TA-TC--T-TC-TG-G-C-A-TT--G-CA---------G--GCA--TT-TTTG--G-CT-TT--TTT-T-GA----T--A--C-AAC--TTTCA--TGAT-T--AA-AG-G-GA---AACT-AATTGCCA---T-A-CT-ACC------AC-CTT--T--A-A-CA---A-CAATT-T-TTTTT----------TGG-GGGG------------TG-A-GAT-ATTGTTTA-C--CCG----CG-G--G-TGAGGT-C--GTGAGA
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lowQualScore                  :    . .  . ..  . .   . ... . .    . .  .  . ....... .. . .... .   .   . .  ..    . ..   . . .  .      .. ....... .     ..... .  .    .. .. .   .   .. .  . ..   ...  .... . .   .  ..  ......  .  .. .  . .  ....         . . .   ......... .  . .....   ...  ..  . .      ...  .  .      ..  ..  .  . . .   ..   .   .. .. ..   .    .. . ...  . ...  .     .   ... ..  . .. .....   . ..  .    ..  ..   .. .  .    .  .  .. .   .  .  ...... . .... ..   ..  . ..   .    .. . .   . .. .  . ..   . .  .. .  ......... ..   ..  .    .. . ..  ..   . .  .... .. .. .   ..     ..    . ..  .  . .  ...    .        ..... .  . . ......  .   .. .. . .    .  .....     ..........   .    ............  . .   .    .   ... ..   . . ..       . ..      
lowQualScore                  :    7 4  4 33  2 2   7 999 2 9    2 2  2  2 8888888 11 2 7777 4   2   4 2  33    2 11   2 2 2  2      88 5555555 0     00000 0  0    88 88 0   7   55 9  9 55   333  7777 9 9   9  22  555555  9  44 9  9 9  0000         8 9 5   666666666 9  9 66666   333  55  9 9      222  8  9      66  44  9  9 7 9   22   7   66 22 55   9    88 0 555  0 555  0     0   333 88  0 55 00000   0 88  0    88  88   88 0  0    0  0  88 0   0  0  888888 0 0000 55   88  0 88   0    88 0 0   0 88 0  0 55   0 0  88 0  000000000 88   88  0    88 0 88  88   0 0  2222 88 88 0   88     88    0 88  0  0 8  777    9        22222 9  9 9 111111  9   66 55 9 9    9  44444     3333333333   9    888888888888  9 9   9    8   333 66   9 8 55       8 66      
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Reference ( family-770 )      : CAT-A-CA-T--GT-G-ATA-A---A-T-TCCG-A-CT-GC-C-T-----A--T-G----A-GTG-AGA-T-TTT-GCCG-A--GCT-A-A-GG-GTGAGA--T-------T-GGGGT-----G-AT-TTGG--G--G-TGA-GAT--T-TT-T--TTT-T-AT----A-T-CAA-TG--AT------TT-GC--T-GT-A-AT----AAAGGCCAT-A-A-TAA---------G-AC-T--T--AAA---AT--AC-T-AGCTTT---AG-TT-CATTTT--TT--AT-TA-T-A-AAA--GCA-ATT--A--T--CAA-GTGT--C-A---CA-A---TC-AAGTT-TCA---G--CA-G--T-----TAA-G--TG-TTCA--TT--TGA--T-AG-CATT-AG-TC--T-CTA-CT-AA------T-G-T--A--AGA--TT-C--TTC-TTGG--A-G-TAT-C--T-TC-TG-GAC-A-TT--G-CA---------G--GCA--TT-TTTG--G-C--TT--TTT-T-GA----T--A--C-AAC--TTTCA--TGAT-T--AA-AG-G-GA---AACT-AATTGCCA---T-A-CT-A-C------AC-CTT--T--A-A-CAAC-AA-T-T-TTTTT----------TGG-GGGG------------TG-A-GAT-ATTG-TTAC--C--CGC-G-G--GTGAGGT-C--GTGAGA
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gi|4935                       : CAT-A-CA-T--GT-G--TAGA---A-T-TCTG-A-CT-GC-C-G-----A--A-G----ATGTG-A-A-T-TT---CCG-A---CT-A-A-GG--TGA-A--T-------T-GGGGTTGGGTG-AT-T--G--G--G-TGAAGAT--T-TT-T--TTT-T-AT----A-T-CAA-TGTTAT------TT-GC--T-GT-A-AT----AAATGCCAT-A-ACTAA---------G-AC-T-----AAA---AT--AC-T-AGCTTT---AG-TT-CATTTT--TT--AT-TA-TAA-AAA--GCA-ATT--ACTT--C-A-GTGT--C-A---CA-A---TC-AAG-T-TCA---G--CA-GATT-----TAA-C--TG-TT-A---T--TGA--T-AG-CAGT-AG--C--T-CTACCT-AA------T-G-T--A--AAA--TT-C--TTC-CTTG--A-G-TAT-C--T-TC-T--GAC-A-----G-CA---------G--GCA--TT-TTGG--A-T--TT--TTT-T-GA-------A--CAAAC--TTTCA--GAAT-T--AA-AG-GAGAAAGAACT-AA-TG-CA-----A-CT-A-C------A--CTT--T--A-A-CAAC-AA---A-TTTTT----------TGG-GGG--------------G-A-GAT-ATTG-TTCC--C--CGC-G-G--GTGAGGT-T--GTGA
gi|4936                       : CAT-A-CA-TA-GT-G-ATA-A---A-G--CCG-A-CT-GC-C-------A--C-G----A-GTG-AGA-T-TTTTGCC--A--GCTTA-A-GG-G--AGA--T-------T-GGG-T-----G-AT----G--G--G-AGA-GAT--T-AT-T--AATAT-AT----A-T---A-T---AT------TT-GC--T-GT-A-AT----AAAG-CCAT-A-A-TAA---------G-AC-T--T--AAA---AT--AC-C-TACGTT---AG-TT-CATTTT--TT--AT-TGTT-ATAAA--GCC-ATT--A--T--CAA-GTTT--C-A---CA-A---TC-AAGTT-TCA---G--CA-G--TTCTTATGA-G--TGTTTCA--TT----A--T-AG-CATT--G-AC--T-CTA-CT-AA------T-G-G--A----A--TT-C--TTC--TGC--A-G-TAT-C--T-TC-T--GAC-A-TT--GCCA---------G--GCA--TT-TT----G-CTTTT--TTT-T-GA----T--A--C-AA---TTTCA--TGAT-C--GA-A--G-GA---AACT-AATTTCCA---T-A-CT-A-C------AC-CTT--T--A-A-CAAC-A----C-TTTTT----------TGG-GGGG------------GA-A-GAT-ATGT-TTA---C--CGC-G-T--GTGAGTT-C--GTGAGA
gi|4937                       : CAT-AACA-G--G--G-ATA-A-------TCCG-A-C--GC---T-----A--T-G----A-GGG-AGA-C-TTT-GCCG-GACGCT-A-A-GG-GTGAGAG-TA------T-GGGGT-----G-AT-TTGG--G--G-TGA-GAT--T-TT-T--TT----------A---CAA-TG--AA------TT-GC--T-GT-A-AT----AAACGCCAT-A-ATTAA---------G-AC-T--A--AAA---AT--AC-T-AGCTTT---AG-TT-CA-TTT--TT--AT-TA-T-A-AAA--GCA-ATT--A--T---AA-GTTTC-C-A---CA-A----G-AAGTT-CAG---G--CA-G--T-----TAAGG--TG-TTTG--TCAATGA--T-AG-CATT--G-TCCGT-CTA-CT-AAC-----T-G-T--ATGAGA--TT-C-------CGC--A-G-TA-----T-TC-TG-GAC----T--G-C----------T--ATA--TT-TGTG--G-C--TT--TTT-T-GA----T--ATCT-AAC--GTTCAC-TGAT-T--TA-A--G-GA---AACT-AATTGCCA---TCA-CT-A-C------AC-CTT--T--A-A-CAAC-AA------TTTT----------TGT-GGGG------------TG-A--AT-A-TG-TTAC--C--CGC-G------GAGG--C--GTGAGA
gi|4938                       : CATGA-CA----GT-G-ATA-A---A-AATCCG-A-TT-GC-C-T-----A--T-G----T-GTG-AGGGTGTTT-GCTG-A--G-T-A-A-GA-GTGAGAGAT-------T-GGCGG-----A-AT-TTTG--GCCG--GA-GAT--T-AA-T--TTA-T-AC----AAG-CGA-TG--AT------TT-TTAAT-GT-G-AT----AGAGGCCATTA-A-AAA---------G-TC-T--TTTAAA---GT--AC-T-AGCTGT---AA-CT-TATTAT--TC--AT-TA-C-A-ATA--ACATTTT--A--T--TAC-GTTT--A-AACTTA-A---TA-AATTT-TCA---
gi|4939                       :  AT-A-CAGT--GTTG-ATATA---A-TGTCCG-A-CTTGC-T-A-----A--T-G----A-GTGGAGAAT-TTT-GC-G-A---TT-A-C-AG-GTGAAG--TA------T-GGGGT-----G----TTGG--G--G-TGATGAT--T-TT-T--TTT---AT----A-T-CAA-TA--ATGAGT--TT-GC--T-GTTA-ATTATTAAGTGTCAT-ATA-CAG---------T-AC-TG-T--AAA---AT--AC-TTAGCTTTT--AG-TT-CATTTT--TTTTAT-TA-T-A-AAA--GCA-ATTTTA--TTTCAA-GTGT--CCA---CA-A---TC-A--TT-TCA---G--CA-G--T-----TAA-GGTTG-TTCAATTT--TGA--T-AG-CATT-AGGTC--TTCTA-CT-AA------T-GGT--AT-AGA--TTTC--TTC-TTGG--A-GATAT----T-TC-TGTGAC-A-TTTGG-CA---------GTTGCAA-TT-TTTGTTA-C--TT--TTT-T-GAGAACT--A--C-A-C--TTT-A--TGAT-TTTAA-AG-G-GA---AACT-AATTGCCAGTAC-A-CT-A--------AC-CTT--T--A-AACAAC-CA-T-TGTTTTT----------TGG-GGGG------------TG-A-GTT-ATTG-TTA---C--CGC-G-G--GTGAGGTCC--GTGAGA
gi|4940                       :    -A-CA-T--GT-GGATA-A---A-T-TCCGGA-CT-GC-C-T--------T-G----A-TTG--GA-T-TTT-GCCG-A--GCT-A-A-GG-GTGAGA--T-------T-GGGGT-----G-AT-TTGG--G--G-TGA-GAT--T-TT-TG-TTT-T-AT----A-T-C---TG--AT------TT-GC--T-GT-A-AT----AAGGCCCAA-A-A-GAA------------C-T--T--AAA----T--AC-T-AGCTTT---AG-TT-CATTTT--TT--AT-TA-T-A-AAA--GCATATT--A--T--CAG-TTGT--C-A---CA-A---TC-AAGTTGTCA---GAGCA-G--T-----TAA-G--TG-TTTA--TT--TGA--T-AG-CATT-AG-TC--T-CTA-CT-AA------T-G-T--A--AGA--TT-C--TTC-TTGG--A-G-T-T-C--T-TC-TG-GAC-A-TT--C-CA---------G--GCA--TTGTTTC--G-C---T--TTT-T-GA----T--A--C-AAC--TTTCAT-TGAT-T--AA----G-GG---AACT--ATTG-CA---T-A-TTAA-C------ATACTT--T----A-CAA--AA-T-T-TTTTT----------TGG-GGGG------------TG-A-GAT-ATTG-TTACCAC--CGC-GTG--ATGAGA-----GTGAGA
gi|4941                       :        A-T--GT-G-ATA-A---A-T-TCCG-A-CT-GC-CCT-----A--TTG----A-GTG-AGA-T-TTT-GCCG-A--GCT-A-A-GG-GTGAGA--T-------T-GGGGT-----G-A-----------------GAT--T-TT------T-T-AT----A-T-CAATTG--A-------TT-GC--T-GT-A-AT----AAAGGCCAT-A-A-TAA---------G-AC-T--T--AAA---AT--AC-T-AGCTTT---AG-TT-CA-TTT--TT--ATATA-TAA-AAA--GCA-ATT--A--T--CAA-GTGT--C-A---CA-A---TC-AAGTT-TCA---G--CA-G--T-----TAA-G--TGTTTCA--TT--TGA--T-AG-CATT-AG-TC--T-CTA-CT-AA------T-G-T--AGTAGA--TT-C--TTC-TTGG--A-G-TAT-C--T-TC-TG-G-C-A-TT--G-CA---------G--GCA--TT-TTTG--G-CT-TT--TTT-T-GA----T--A--C-AAC--TTTCA--TGAT-T--AA-AG-G-GA---AACT-AATTGCCA---T-A-CT-ACC------AC-CTT--T--A-A-CAAC-AATT-T-TTTTT----------TGG-GGGG------------TG-A-GAT-ATTGTTTAC--C--CGC-G-G--GTGAGGT-C--GTGAGA
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lowQualScore                  :    . .  . ..  . .   . ... . .    . .  .  . ....... .. . .... .   .   . .  ..    . ..   . . .  .      .. ....... .     ..... .  .    .. .. .   .   .. .  . ..   ...  .... . .   .  ..  ......  .  .. .  . .  ....         . . .   ......... .  . .....   ...  ..  . .      ...  .  .      ..  ..  .  . . .   ..   .   .. .. ..   .    .. . ...  . ...  .     .   ... ..  . .. .....   . ..  .    ..  ..   .. .  .    .  .  .. .   .  .  ...... . .... ..   ..  . ..   .    .. . .   . .. .  . ..   . .  .. .  ......... ..   ..  .    .. . ..  ..   . .  .... .. .. .   ..     ..    . ..  .  . .  ...    .        ..... .  . . ......  .   .. .. . .    .  .....     ..........   .    ............  . .   .    .   ... ..   . . ..       . ..      
lowQualScore                  :    7 4  4 33  2 2   7 999 2 9    2 2  2  2 8888888 11 2 7777 4   2   4 2  33    2 11   2 2 2  2      88 5555555 0     00000 0  0    88 88 0   7   55 9  9 55   333  7777 9 9   9  22  555555  9  44 9  9 9  0000         8 9 5   666666666 9  9 66666   333  55  9 9      222  8  9      66  44  9  9 7 9   22   7   66 22 55   9    88 0 555  0 555  0     0   333 88  0 55 00000   0 88  0    88  88   88 0  0    0  0  88 0   0  0  888888 0 0000 55   88  0 88   0    88 0 0   0 88 0  0 55   0 0  88 0  000000000 88   88  0    88 0 88  88   0 0  2222 88 88 0   88     88    0 88  0  0 8  777    9        22222 9  9 9 111111  9   66 55 9 9    9  44444     3333333333   9    888888888888  9 9   9    8   333 66   9 8 55       8 66      
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Reference ( family-770 )      : CAT-A-CA-T--GT-G-ATA-A---A-T-TCCG-A-CT-GC-C-T-----A--T-G----A-GTG-AGA-T-TTT-GCCG-A--GCT-A-A-GG-GTGAGA--T-------T-GGGGT-----G-AT-TTGG--G--G-TGA-GAT--T-TT-T--TTT-T-AT----A-T-CAA-TG--AT------TT-GC--T-GT-A-AT----AAAGGCCAT-A-A-TAA---------G-AC-T--T--AAA---AT--AC-T-AGCTTT---AG-TT-CATTTT--TT--AT-TA-T-A-AAA--GCA-ATT--A--T--CAA-GTGT--C-A---CA-A---TC-AAGTT-TCA---G--CA-G--T-----TAA-G--TG-TTCA--TT--TGA--T-AG-CATT-AG-TC--T-CTA-CT-AA------T-G-T--A--AGA--TT-C--TTC-TTGG--A-G-TAT-C--T-TC-TG-GAC-A-TT--G-CA---------G--GCA--TT-TTTG--G-C--TT--TTT-T-GA----T--A--C-AAC--TTTCA--TGAT-T--AA-AG-G-GA---AACT-AATTGCCA---T-A-CT-A-C------AC-CTT--T--A-A-CAAC-AA-T-T-TTTTT----------TGG-GGGG------------TG-A-GAT-ATTG-TTAC--C--CGC-G-G--GTGAGGT-C--GTGAGA
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gi|4935                       : CAT-A-CA-T--GT-G--TAGA---A-T-TCTG-A-CT-GC-C-G-----A--A-G----ATGTG-A-A-T-TT---CCG-A---CT-A-A-GG--TGA-A--T-------T-GGGGTTGGGTG-AT-T--G--G--G-TGAAGAT--T-TT-T--TTT-T-AT----A-T-CAA-TGTTAT------TT-GC--T-GT-A-AT----AAATGCCAT-A-ACTAA---------G-AC-T-----AAA---AT--AC-T-AGCTTT---AG-TT-CATTTT--TT--AT-TA-TAA-AAA--GCA-ATT--ACTT--C-A-GTGT--C-A---CA-A---TC-AAG-T-TCA---G--CA-GATT-----TAA-C--TG-TT-A---T--TGA--T-AG-CAGT-AG--C--T-CTACCT-AA------T-G-T--A--AAA--TT-C--TTC-CTTG--A-G-TAT-C--T-TC-T--GAC-A-----G-CA---------G--GCA--TT-TTGG--A-T--TT--TTT-T-GA-------A--CAAAC--TTTCA--GAAT-T--AA-AG-GAGAAAGAACT-AA-TG-CA-----A-CT-A-C------A--CTT--T--A-A-CAAC-AA---A-TTTTT----------TGG-GGG--------------G-A-GAT-ATTG-TTCC--C--CGC-G-G--GTGAGGT-T--GTGA
gi|4936                       : CAT-A-CA-TA-GT-G-ATA-A---A-G--CCG-A-CT-GC-C-------A--C-G----A-GTG-AGA-T-TTTTGCC--A--GCTTA-A-GG-G--AGA--T-------T-GGG-T-----G-AT----G--G--G-AGA-GAT--T-AT-T--AATAT-AT----A-T---A-T---AT------TT-GC--T-GT-A-AT----AAAG-CCAT-A-A-TAA---------G-AC-T--T--AAA---AT--AC-C-TACGTT---AG-TT-CATTTT--TT--AT-TGTT-ATAAA--GCC-ATT--A--T--CAA-GTTT--C-A---CA-A---TC-AAGTT-TCA---G--CA-G--TTCTTATGA-G--TGTTTCA--TT----A--T-AG-CATT--G-AC--T-CTA-CT-AA------T-G-G--A----A--TT-C--TTC--TGC--A-G-TAT-C--T-TC-T--GAC-A-TT--GCCA---------G--GCA--TT-TT----G-CTTTT--TTT-T-GA----T--A--C-AA---TTTCA--TGAT-C--GA-A--G-GA---AACT-AATTTCCA---T-A-CT-A-C------AC-CTT--T--A-A-CAAC-A----C-TTTTT----------TGG-GGGG------------GA-A-GAT-ATGT-TTA---C--CGC-G-T--GTGAGTT-C--GTGAGA
gi|4937                       : CAT-AACA-G--G--G-ATA-A-------TCCG-A-C--GC---T-----A--T-G----A-GGG-AGA-C-TTT-GCCG-GACGCT-A-A-GG-GTGAGAG-TA------T-GGGGT-----G-AT-TTGG--G--G-TGA-GAT--T-TT-T--TT----------A---CAA-TG--AA------TT-GC--T-GT-A-AT----AAACGCCAT-A-ATTAA---------G-AC-T--A--AAA---AT--AC-T-AGCTTT---AG-TT-CA-TTT--TT--AT-TA-T-A-AAA--GCA-ATT--A--T---AA-GTTTC-C-A---CA-A----G-AAGTT-CAG---G--CA-G--T-----TAAGG--TG-TTTG--TCAATGA--T-AG-CATT--G-TCCGT-CTA-CT-AAC-----T-G-T--ATGAGA--TT-C-------CGC--A-G-TA-----T-TC-TG-GAC----T--G-C----------T--ATA--TT-TGTG--G-C--TT--TTT-T-GA----T--ATCT-AAC--GTTCAC-TGAT-T--TA-A--G-GA---AACT-AATTGCCA---TCA-CT-A-C------AC-CTT--T--A-A-CAAC-AA------TTTT----------TGT-GGGG------------TG-A--AT-A-TG-TTAC--C--CGC-G------GAGG--C--GTGAGA
gi|4938                       : CATGA-CA----GT-G-ATA-A---A-AATCCG-A-TT-GC-C-T-----A--T-G----T-GTG-AGGGTGTTT-GCTG-A--G-T-A-A-GA-GTGAGAGAT-------T-GGCGG-----A-AT-TTTG--GCCG--GA-GAT--T-AA-T--TTA-T-AC----AAG-CGA-TG--AT------TT-TTAAT-GT-G-AT----AGAGGCCATTA-A-AAA---------G-TC-T--TTTAAA---GT--AC-T-AGCTGT---AA-CT-TATTAT--TC--AT-TA-C-A-ATA--ACATTTT--A--T--TAC-GTTT--A-AACTTA-A---TA-AATTT-TCA---
gi|4939                       :  AT-A-CAGT--GTTG-ATATA---A-TGTCCG-A-CTTGC-T-A-----A--T-G----A-GTGGAGAAT-TTT-GC-G-A---TT-A-C-AG-GTGAAG--TA------T-GGGGT-----G----TTGG--G--G-TGATGAT--T-TT-T--TTT---AT----A-T-CAA-TA--ATGAGT--TT-GC--T-GTTA-ATTATTAAGTGTCAT-ATA-CAG---------T-AC-TG-T--AAA---AT--AC-TTAGCTTTT--AG-TT-CATTTT--TTTTAT-TA-T-A-AAA--GCA-ATTTTA--TTTCAA-GTGT--CCA---CA-A---TC-A--TT-TCA---G--CA-G--T-----TAA-GGTTG-TTCAATTT--TGA--T-AG-CATT-AGGTC--TTCTA-CT-AA------T-GGT--AT-AGA--TTTC--TTC-TTGG--A-GATAT----T-TC-TGTGAC-A-TTTGG-CA---------GTTGCAA-TT-TTTGTTA-C--TT--TTT-T-GAGAACT--A--C-A-C--TTT-A--TGAT-TTTAA-AG-G-GA---AACT-AATTGCCAGTAC-A-CT-A--------AC-CTT--T--A-AACAAC-CA-T-TGTTTTT----------TGG-GGGG------------TG-A-GTT-ATTG-TTA---C--CGC-G-G--GTGAGGTCC--GTGAGA
gi|4940                       :    -A-CA-T--GT-GGATA-A---A-T-TCCGGA-CT-GC-C-T--------T-G----A-TTG--GA-T-TTT-GCCG-A--GCT-A-A-GG-GTGAGA--T-------T-GGGGT-----G-AT-TTGG--G--G-TGA-GAT--T-TT-TG-TTT-T-AT----A-T-C---TG--AT------TT-GC--T-GT-A-AT----AAGGCCCAA-A-A-GAA------------C-T--T--AAA----T--AC-T-AGCTTT---AG-TT-CATTTT--TT--AT-TA-T-A-AAA--GCATATT--A--T--CAG-TTGT--C-A---CA-A---TC-AAGTTGTCA---GAGCA-G--T-----TAA-G--TG-TTTA--TT--TGA--T-AG-CATT-AG-TC--T-CTA-CT-AA------T-G-T--A--AGA--TT-C--TTC-TTGG--A-G-T-T-C--T-TC-TG-GAC-A-TT--C-CA---------G--GCA--TTGTTTC--G-C---T--TTT-T-GA----T--A--C-AAC--TTTCAT-TGAT-T--AA----G-GG---AACT--ATTG-CA---T-A-TTAA-C------ATACTT--T----A-CAA--AA-T-T-TTTTT----------TGG-GGGG------------TG-A-GAT-ATTG-TTACCAC--CGC-GTG--ATGAGA-----GTGAGA
gi|4941                       :        A-T--GT-G-ATA-A---A-T-TCCG-A-CT-GC-CCT-----A--TTG----A-GTG-AGA-T-TTT-GCCG-A--GCT-A-A-GG-GTGAGA--T-------T-GGGGT-----G-A-----------------GAT--T-TT------T-T-AT----A-T-CAATTG--A-------TT-GC--T-GT-A-AT----AAAGGCCAT-A-A-TAA---------G-AC-T--T--AAA---AT--AC-T-AGCTTT---AG-TT-CA-TTT--TT--ATATA-TAA-AAA--GCA-ATT--A--T--CAA-GTGT--C-A---CA-A---TC-AAGTT-TCA---G--CA-G--T-----TAA-G--TGTTTCA--TT--TGA--T-AG-CATT-AG-TC--T-CTA-CT-AA------T-G-T--AGTAGA--TT-C--TTC-TTGG--A-G-TAT-C--T-TC-TG-G-C-A-TT--G-CA---------G--GCA--TT-TTTG--G-CT-TT--TTT-T-GA----T--A--C-AAC--TTTCA--TGAT-T--AA-AG-G-GA---AACT-AATTGCCA---T-A-CT-ACC------AC-CTT--T--A-A-CAAC-AATT-T-TTTTT----------TGG-GGGG------------TG-A-GAT-ATTGTTTAC--C--CGC-G-G--GTGAGGT-C--GTGAGA
gi|4942                       :                                                                                                 TGAGA--T---------GGGGT-----G-TT-GTGG--G--G-TAG-GAT--T-TT-T--TTA-T-ATCACAA-T-TGA-TG--ACGGGAAATT-CC--T-GT-ATATT---AAAGGCCAT-A-A-TCATCTACCTCTG-AC-T--A--AAA---AT--AC-A-GGCTTG---AGGTT-CATTTT--TTT-CT-TA-T-A-AAAAAGCA-ATT--A--TG-CAAAGTGT--C-A---CT-AGATTCTACGTT-CTATGCA--CA-G--T-----TAA-G--TG-TTCA--TT--TGAAGT-AG-CATT-AGATC--CGCTA-CT-AAGCCAAAT-G-T--A--GAA--TT-C--GTC-TTGG--A-A-GAT-C--G-TC-TG-GAC-A-TT----CAC--------G--GCATTTT-TTTG--G-C--TTCGTTTGT-GA----T--AC-C-AAC--TTTCA--T-AT-T--AAGAC-G-GG---AACTAAATTGCCC---A-A-CT-A-CAAATTAAC-CTCCAT--A-A-CACCTAA-----TTTTT----------TGG-GGGG------------GG-A-GAG-ATGG-TT-C--CGACGCTG-GGTGTGAGGTCC--GTGAGA
gi|4943                       :                                                                                                 TGAGA--T-------T-GGGGG-----A-AT-TTGG--C--G-TGA-GAT--T-TT-T--TAT---AC----A-G-CGA-TG--AT------TT-GA--T-GT-G-AT----AAAGGCCAT-T-A-TAA---------A-AC-TCCT--AAGTACATGCAC-T-AGCTTT---AA-CT-TATTAT--TC--AT-TA-C-A-ATA--ACATCTT--A--T--TAA-AT
gi|4944                       :                                                                                                                                             GA-GCT--TGTT-T--TCC-T-A-----A-T-CAA-TG--AC------TT-GC--T-GT-A-AA----TAAGGCCAT-A-A-TAA---------G-AC-T--T--AAA----T--AC-T-AGCTTTTATAG-TT-CATTTT--T---AT-TA-T-A-AAA--GCA-ATT--A--T--CAA-GTGT--C-A---CAGA---TC-AAGTT-TCA---G--CA-G--T-----TAA-G--TG-TTCA--TT--TGA--T-AG-CATT-AG-TC--T-CTA-CT-AA------TTG-T--A--AGA--TT-C--TTC-CTTG--A---TAT-C--TGTC-TG-GAC-A-TT--G-CAAGGCTTTTTG--GCT--TT-TTTG--G-C--TT--TTT-TTGA----T--A--C-AAC--TTTCA--TGATGT--AA-AG-G-GA---AACT-ATTTGCCC---T-ATCT-A-C------AC-CTT--T--A-A-CAAC-AA-T-T-TTTTT----------TGGTGGGG------------TG-A-GAT-AGT--TTAC--C--CGC-G-G--GTGAGGT-C--GTGAGA
gi|4945                       :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                A---G--CA-C--T-----TAA-G--AGATTCA--TTA-TGA--T-AGGCATA-AG-TT--A-CTA-CT-AA------A-G-------AGAG-TT-CAGCTA-TTGGCGA-G-TAT-CACT-TCATG-AGC-AATT--G-CG---------A--CCA--TT-TTTG--G-C--TT--TTT-TTGA----T--A--C-AAC--TTTC---TGAT-T--AA-GG-G-AT---AACT-A-TTGCCA---T---CT-A--------AC-CTT--TT-ATA-CAAC-AA-T-T-TTTTT----------TGG-GGGG------------TG-A-GAT-A-TG-TT-C--C--CGC-G-G--GTGAGGT-C--
gi|4946                       :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                -GA---AAAT-AACTACTA----------A-A------AT-CTT--TTGA-A-CAGC-A--T-T-TTTTA----------TGA-G---------------TG-A-GAT-ATTA-TTAC--G--CAC-A-C--GTGAGGT-C--AAGAGA


blockSeqs                     :    G A  G AA  T G   G GGA A A    G T  T  A TCATTC  AT T CACC T   G   G G  TT    C AC   T G A  C      GA GGTGAAA C     TGGGT C  A    CG CC G   A   AT G  T GA   TT   CACA A A   T  TT  GGGAAA  G  AA C  T T  TATT         A T T   TCTACCTCT C  T TTT     TAC  GC  G T      TAT  T  T      TT  TT  A  T A T   AG   T   TT CT TT   A    TC C ACT  G GAT  T     G   TGC AG  G AT TCTTA   G GT  T    AT  AA   AG A  G    A  G  CG T   G  A  GCCAAA T TGG  TG   AA  T AG   G    CG T A   T AC G  A GT   A A  TG C  AGGCTTTTT TT   TT  G    TT A TT  CG   G T  GAAC TG TC A   TT     AT    G TT  G  A A  AAG    A        GTAC  T  A C AAATTA  A   CA TG T A    T  TGG       GGGGGGGGGG   T    GGGGGTGGTGGG  G C   C    G   CCA GA   T C GT       C CT
blockSeqs                     :    G .  G A   . .   G .   . G    . .  .  . TC      .  . .    T   .   A .  TT    . .    . . .  .      G  A       .     TGGGT .  .    .  .  .   A   A  .  . G    AT   AA   . .   .  TT  GAGT    .  C  .  . .  T            T . A   .         .  . CCT     .    G   . .      T    G  .      .   T   .  . A .   AA   T   .  CT G    .    C  . .    . .    .     .   .   .   . AT .       . .   T    G   A    .  T  .    .  A  T  G   C  .  C      . GT   GT   G   . .    .    G  . A   . .  .  . G    . .  .  .  C         .    A   .    .  . T   .    . T  .    .  C  A   .      C     . .   .  . A  AAG    .        TC    .  . . CA      .   .  T  . .    .  TTG       .            .    .             . .   .    T   C   .    . T C        C . 
blockSeqs                     :    . .  . .   . .   T .   . A    . .  .  . CT      .  . .    .   .   . .  T     . .    . . .  .      .  A       .     .     .  .    .  .  .   T   .  .  . .    T    .    . .   .  .   .       .  C  .  . .  .            . . C   .         .  . GT      .    .   . .      .    .  .      .   T   .  . A .   .    T   .  .  .    .    .  . .    . .    .     .   .   .   . .  .       . .   A    .   A    .  .  .    .  .  T  .   C  .  .      . T    T    .   . .    .    .  . .   . .  .  . G    . .  .  .  .         .    .   .    .  . T   .    . .  .    .  .  .   .      T     . .   .  . .  .      .        T     .  . . .       .   .  .  . .    .  TTT       .            .    .             . .   .    .   C   .    . . .        . . 
blockSeqs                     :    . .  . .   . .   . .   . G    . .  .  . T       .  . .    .   .   . .  T     . .    . . .  .      .  .       .     .     .  .    .  .  .   .   .  .  . .    T    .    . .   .  .   .       .  .  .  . .  .            . . C   .         .  . T       .    .   . .      .    .  .      .   .   .  . . .   .    .   .  .  .    .    .  . .    . .    .     .   .   .   . .  .       . .   .    .   .    .  .  .    .  .  .  .   .  .  .      . T    .    .   . .    .    .  . .   . .  .  . G    . .  .  .  .         .    .   .    .  . .   .    . .  .    .  .  .   .      .     . .   .  . .  .      .        T     .  . . .       .   .  .  . .    .  TT        .            .    .             . .   .    .   C   .    . . .        . . 
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