lowQualScore                  :                                                               1                                                                                                   3                  1          22222222                        
lowQualScore                  :      333    55555   44 2 2  2  55    2 22      2 2 6666 2 22  3    22 4444  22 333 77777777777  1 22 4444   9999 1          77777 1  44  1      6 7777  1  44 1 1 0  6666 22 1  1    1 1 44     22222222  999  4  22            
lowQualScore                  :      ...    .....   .. . .  .  ..    . ..      . . .... . ..  .    .. ....  .. ... ...........  . .. ....   .... .          ..... .  ..  .      . ....  .  .. . . .  .... .. .  .    . . ..     ........  ...  .  ..            
lowQualScore                  :      222    11111   88 0 0  0  55    0 88      0 0 2222 0 66  8    66 9999  66 333 77777777777  9 66 0000   3333 9          44444 9  55  9      1 2222  9  55 9 9 5  0000 66 9  9    4 9 55     22222222  888  2  99            
consensus                     : ATAAAT--TGGG----ACAT--A-A-AA-CA--ATGC-T--GTTAAA-C-T----G-A--GGGTTTT--C--A-CT--T---T---G-------AT-A--G----AAA----A-CATCTGTTTT-----C-GG--AA-GAAACCAA---GTG-CA--C-T-TCCC----A--A-TG-AACTAT-A--TTTTT----A---AGN--TC-AT--GAATAAAAGTAA
Reference ( gi|102860 )       : ATAAAT--TGGG----ACAT--A-A-AA-CA--ATGC-T--GTTAAA-C-T----G-A--GGATTTT--C--A-CT--T---T---G-------AT-A--G----AAA----A-CATCTGTTTT-----C-GG--AA-GAAACCAA---GTG-CA--C-T-T-CC----A--A-TG-AACTGT-A--TTTTT----A---AGG--TC-AT--GAATAAAAGTAA
gi|102861                     : ATAAAT--TGGG----ACAT--A-A-AA-CA--ATGC-T--GTTAAA-C-TT---G-A--GGGTTTT--C--A-CT--T---T---G-------AT-AAAG----AAA----A-TATCTGTTTT-----C-GG--AA-GAAACCAA---GTG-CA--C-T-TCCC----A--A-TG-AACTAT-A--TTTTTGA--A---GGG--TC-AT--GAATAAAAGTAA
gi|102862                     : ATAAAT--TGGG----ACAT--A-A-A--CA--ATGC-T--GATAAA-C-T----G-A--GGGTTTT--C--A-CT--T---T---G-------AT-A--G----AAAAC--A-CATCTGTTTT-----C-GGA-AA-GAAACCAA---GTG-AA--C-T-TCCC----A--A-TG-AACTAT-A--TTTTTG---A---AGG--TC-AT--GAATAAAAGTAA
gi|102863                     : ATAAAG--TGGG----TCAT--A-A-AA-CA--ATGC-T--GTTAGA-C-T----G-A--GGGTTTT--C--A-CT--T---T---G-------AT-A--G----AAA----A-CATCTGTTTT-----C-GG--AA-GAAACCAAATTATG-CA--T-T-TCCC----A--A-TG-AACTTT-A--TTGTT----AG--AGC--TC-AT--AAATAAAAGTAA
gi|102864                     : ATAAAT--TGGG----ACAT--A-A-AA-CA--ATGT-T--GTTAAA-C-T----G-A--GGGTTTT--C--A-CT--T---T---G-------AT-A--G----AAA----A-CATCTGTTTT-----C-GG--AA-AAAACCAA---GTG-CA--C-T-TCCC----A--A-TG-ACCTAC-A--TTTAT----A---a
gi|102865                     : ATAGATAATGGG----TCAT--A-A-AA-CA--ATGC-T--GTTAAA---T----G-A--GGGTTTT--C--A-TT--T---T---G-------AT-A--G----AAA----A-CATCTGTTTT-----C-GA--AA-GAAAGCAA----TG-CA--C-T-TCCC----A--A-TG-AACTAT-G--TTTTT----AG--AGC--TC-A---AAAAAAAAGgaaaagtaaacaaatcagaaa
gi|102868                     : ATAAAT--TGGG----ACAT--A-A-AA-CAACATG--T--GTCAAA-C-T----G-A--GG-TTTT--C----TT--T---T---G-------AT-A--G-----AA----A-CATCTGTTTT-----C-AG--AA-GAA--CAA---GTG-CA--T-T-TCCC----A--ACTG-AACT-T-A--TTTTTG---A---AGG--TCGAT--GAATAAAAGga
gi|102866                     : ATAAAG--TGGG----TCAT--A-A-AA-CA--ATGC-T--GTTAAA-C-T----G-A--G--TTTT--C--A-CT--T---T---G-------AT-A--G----AAT----A-CATCAGTTTT-----C-GG--AA-GAAATC-A---CTG-CA--C-T-TCCC----A--A-TG-AAC--T-A--TTTTT----A---
gi|102867                     : ATAAAA--TGAA----TCGT--A-A-AG-CA--ATGC-T--GTTAAA-C-T----G-A--GG-TTTTACC--A-CC--A---T---G-------AT-A--G----AAA----T-CATCTGTTTT-----C-GG--AA-GAAACC-A---CTG-CA--C-T-T-CCT---A--A-TG-AACTCT-A--TTTTT----AG--ACC--TC-AT--GAATAAA
gi|102869                     : ATGAAA--TGGG----TCAT--A-A-AT-CA--ATGC-T--GATAAA-C-T----G-A--GGTTTTT--C--C-CT--T---T---T-------GT-A--G----AAA----A-CATCTATTTT-----C-GG--AA-G-AACC-A---CTG-TA--C-TAC-CC----A--A-TG-GACTCT-A--CTTTT----A---AAGC-TC-AG--GAATAAAAGTAA
gi|102870                     : ATGAAA--TGGG----ACAT--A-A-AA-CA--ATGC-T--GATGAA-C-T----G-A--GGTTTTT--T--T-CC--T---T---T-------ATAA--G----AAA----AGCATCTTTTTTTTCTCC-GG--AA-GAGACC-A---CTG-CA--C-T-TCCC----A--A-TG-AA-TAT-AAGTTTTTCA--A---AGC--TC-AT--GAAGAAAAGTAA
gi|102871                     : ATAAAT--TGGG----ACAT--A-A-AA-CA--ATGT------------------------GGTTTT--C--A-CT--T---T---G-------AT-A--G----AAA----A-CATCT------------------------------GTG-CA--C-T-TCCC----A--A-TG-AACTAT-A--TTCTT----AG--AGC--TC-AT--GAATAAAAGTAAa
gi|102872                     : ATAAAT--ATGG----ACATT-A-A-AA-CA--ATGCCT--GTTAAA-C-T----A-G--TG--TTT--C--A-CTAGT---T-----------AT-A-------AAA----A-CATCTGTCTT-----C-GG--AA--AAACCAA---G-G-CAG-C-T-TCCC----A--A-GA-AACTAT-A----TTT----G---AAG--TC-AT--GAATAAAa
gi|102873                     : ATAAAT--TGG-----ACAT--A-A-AAACA--A-GC-TTTGTTAAA-C-T----G-A--GG-TATT--C----CT--T---T---GGATTAAAAT-A--A----AAACA--A-CAT-TGTTTT-----CCGG--AA-GAAAC-AA---GTG-CATCT-T-T-CC----G--A-TGAAACTATAA--TTTTT----AAATAGG--TCAAT--GAATAAAAG
gi|102874                     : ATAAAG--TGAG----TCA---A-A-AA-CA--ATGC-T--GTTTAA-C-T----G-A--GGGTTTC--C--A-CT--T---T---G-------TT-A--G----AAA----A--ATCT
gi|102875                     :  TAAGT--TGGGTATGACATTGA-A-AA-CATAATGC-T--GTTAAAAC-T----G-AAGGGATTTT--C--AACT--T---TTG-G-------AC-T--G----AAATAACA-CATCTGTTTTTC---C-GA--AACAAAACCAA---GTG-CA--C-T-T-CCAAAAA--A-TG-AACTAT-AG-TTTTT----AG--AGA--TC-A----AATGAAA
gi|102877                     :   AAAT--TGG-----ACAT--ACACAA-CA--ATGC-T--GCTAAA-CAT----GCA--GGGTTTT--C--A-CC--T---TTCCA-------TT-A--G----AAA----A-CATCTGTTTT-----C-GG--AA-GAAACCAA---GTGCCA--C-T-TCCC----ATCA-TG-AACT-T-A--TCTTTCTGCA---AGG--TC-AT--GAATAAAAG
gi|102876                     :   AAAA--TGGG----TCAT--A-A-AA-CA--ATGC-T--GTTAAA-A-T----G-A--GGGTTTT--CAAA-TT--T---T---G-------AT-A--G----AAA----A-CATCTGTTTT-----C-CG--AA-GAAAGCAA----TG-CA--C-T-TCCC----A--A-TG-AACTA--G--TTTTT----A---GAGCCTC-ATTGAAATAAAA
gi|102878                     :    AAT--TGGG----ACAT--A-A-AA-CA--ATGC-T--TTAAAA-C-T----G-A--GGGTTTT--C--A-CT--T---T---G-------AT-A--G----AAA----A-CATCTGTTTT-----C-GG---A-GAAACCAA---GTA-CA--C-T-TCCC----A--A-TG-AACTAT-A--TTTTT----A---AGC--TC-AT--GAATAAAAGTAA
gi|102879                     :    AAT--TGGG----ACAT--A-A-AA-CA--ATGA-T--GTTAAA-C-TGATCG-A--GGGTTTT--C--A-CT--T---T---G-------AT-A--GAATTAAA----A-CATCTGTTTT-----C-GG--AA-G---------------A--C-T-TCCC----A--A-TG-AACTAT-A--TTTTT----AG--AGC--TC-AT--GAATAAAAGTAAa
gi|102880                     :                  CGT--A-A-AG-CA--ATGC-T--GATAAA-C-T----G-A--GGTTTTT--T----CT--CCCAT---G-------AT-A--G----AAA----T-CATCTGTTTT-----C-GGGAAA-AAAAC--A---CTG-CA--CTT-T-CC----A--A-TG-AACTCT-A--TTTTT----A---AAGC-TC-AT--GAAGAAAAGTAAa
gi|102881                     :                                                           --GGGTTTT--C--A-CT--T---T---G-------AT-A--G----AAA----A-CATCTGTTTT-----C-AG--AA-GAAACCAA---GTG-CA--C-T-TCCC----A--A-TG-AACTAT-A--TTTTA----G---AGC--TC-AT--GAATAAAAGTAAa
gi|102882                     :                                                                                                                     TCTGTTTT-----C-AG--AG-GAAAAC-A---TTG-TA--C-T-TCCC----A--A-TA-AACTAT-A--TCTTT----AG--AGC--TC-AT--GAATAAAAGa





Alignments
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                            22222222                       
lowQualScore                  :       22    44444   44 1 1  1  55    1 22      1 1 6666 1    22   1  4444  22 333 66666666666  1 22 3333   8888 1          77777 1  44  1      3 7777  1  3     333  22 1  1    1 1 44     66666666  33  4  22            
lowQualScore                  :       ..    .....   .. . .  .  ..    . ..      . . .... .    ..   .  ....  .. ... ...........  . .. ....   .... .          ..... .  ..  .      . ....  .  .     ...  .. .  .    . . ..     ........  ..  .  ..            
lowQualScore                  :       88    44444   55 9 9  9  22    9 66      9 9 0000 9    55   8  3333  55 222 99999999999  8 55 9999   9999 8          00000 8  33  8      2 5555  8  6     222  55 8  8    7 8 33     22222222  00  0  88            
consensus                     : ATAAAT--TGGG----ACAT--A-A-AA-CA--ATGC-T--GTTAAA-C-T----G-AGGG--TTT-TC--A-CT--T---T---G-------AT-A--G----AAA----A-CATCTGTTTT-----C-GG--AA-GAAACCAA---GTG-CA-CTTCC---CA--A-TG-AACTAT-A--TTTTT----AG--AG-CTC-AT--GAATAAAAGTAA
Reference ( family-766 )      : ATAAAT--TGGG----ACAT--A-A-AA-CA--ATGC-T--GTTAAA-C-T----G-AGGG--TTT-TC--A-CT--T---T---G-------AT-A--G----AAA----A-CATCTGTTTT-----C-GG--AA-GAAACCAA---GTG-CA-CTTCC---CA--A-TG-AACTAT-A--TTTTT----A---AG-NTC-AT--GAATAAAAGTAA
gi|102860                     : ATAAAT--TGGG----ACAT--A-A-AA-CA--ATGC-T--GTTAAA-C-T----G-AGGA--TTT-TC--A-CT--T---T---G-------AT-A--G----AAA----A-CATCTGTTTT-----C-GG--AA-GAAACCAA---GTG-CA-CTT-C---CA--A-TG-AACTGT-A--TTTTT----A---AG-GTC-AT--GAATAAAAGTAA
gi|102861                     : ATAAAT--TGGG----ACAT--A-A-AA-CA--ATGC-T--GTTAAA-C-TT---G-AGGG--TTT-TC--A-CT--T---T---G-------AT-AAAG----AAA----A-TATCTGTTTT-----C-GG--AA-GAAACCAA---GTG-CA-CTTCC---CA--A-TG-AACTAT-A--TTTTTGA--A---GG-GTC-AT--GAATAAAAGTAA
gi|102862                     : ATAAAT--TGGG----ACAT--A-A-A--CA--ATGC-T--GATAAA-C-T----G-AGGG--TTT-TC--A-CT--T---T---G-------AT-A--G----AAAAC--A-CATCTGTTTT-----C-GGA-AA-GAAACCAA---GTG-AA-CTTCC---CA--A-TG-AACTAT-A--TTTTTG---A---AG-GTC-AT--GAATAAAAGTAA
gi|102863                     : ATAAAG--TGGG----TCAT--A-A-AA-CA--ATGC-T--GTTAGA-C-T----G-AGGG--TTT-TC--A-CT--T---T---G-------AT-A--G----AAA----A-CATCTGTTTT-----C-GG--AA-GAAACCAAATTATG-CA-TTTCC---CA--A-TG-AACTTT-A--TTGTT----AG--AG-CTC-AT--AAATAAAAGTAA
gi|102864                     : ATAAAT--TGGG----ACAT--A-A-AA-CA--ATGT-T--GTTAAA-C-T----G-AGGG--TTT-TC--A-CT--T---T---G-------AT-A--G----AAA----A-CATCTGTTTT-----C-GG--AA-AAAACCAA---GTG-CA-CTTCC---CA--A-TG-ACCTAC-A--TTTAT----A---a
gi|102865                     : ATAGATAATGGG----TCAT--A-A-AA-CA--ATGC-T--GTTAAA---T----G-AGGG--TTT-TC--A-TT--T---T---G-------AT-A--G----AAA----A-CATCTGTTTT-----C-GA--AA-GAAAGCAA----TG-CA-CTTCC---CA--A-TG-AACTAT-G--TTTTT----AG--AG-CTC-A---AAAAAAAAGgaaaagtaaacaaatcagaaa
gi|102866                     : ATAAAG--TGGG----TCAT--A-A-AA-CA--ATGC-T--GTTAAA-C-T----G-AG----TTT-TC--A-CT--T---T---G-------AT-A--G----AAT----A-CATCAGTTTT-----C-GG--AA-GAAATC-A---CTG-CA-CTTCC---CA--A-TG-AAC--T-A--TTTTT----A---ga
gi|102867                     : ATAAAA--TGAA----TCGT--A-A-AG-CA--ATGC-T--GTTAAA-C-T----G-AGGT--TTTACC--A-CC--A---T---G-------AT-A--G----AAA----T-CATCTGTTTT-----C-GG--AA-GAAACC-A---CTG-CA-CTTCC---TA--A-TG-AACTCT-A--TTTTT----AG--AC-CTC-AT--GAATAAA
gi|102868                     : ATAAAT--TGGG----ACAT--A-A-AA-CAACATG--T--GTCAAA-C-T----G-A-GG--TTT-TC----TT--T---T---G-------AT-A--G-----AA----A-CATCTGTTTT-----C-AG--AA-GAA--CAA---GTG-CA-TTTCC---CA--ACTG-AACT-T-A--TTTTTG---A---AG-GTCGAT--GAATAAAAG
gi|102869                     : ATGAAA--TGGG----TCAT--A-A-AT-CA--ATGC-T--GATAAA-C-T----G-AGGT--TTT-TC--C-CT--T---T---T-------GT-A--G----AAA----A-CATCTATTTT-----C-GG--AA-G-AACC-A---CTG-TA-CTACC---CA--A-TG-GACTCT-A--CTTTTA---A---AG-CTC-AG--GAATAAAAGTAA
gi|102870                     : ATGAAA--TGGG----ACAT--A-A-AA-CA--ATGC-T--GATGAA-C-T----G-AGGT--TTT-TT--T-CC--T---T---T-------ATAA--G----AAA----AGCATCTTTTTTTTCTCC-GG--AA-GAGACC-A---CTG-CA-CTTCC---CA--A-TG-AA-TAT-AAGTTTTTCA--A---AG-CTC-AT--GAAGAAAAGTAA
gi|102871                     : ATAAAT--TGGG----ACAT--A-A-AA-CA--ATGT----------------------GG--TTT-TC--A-CT--T---T---G-------AT-A--G----AAA----A-CATCTGT------------------------------G-CA-CTTCC---CA--A-TG-AACTAT-A--TTCTT----AG--AG-CTC-AT--GAATAAAAGTAAa
gi|102872                     : ATAAAT--ATGG----ACATT-A-A-AA-CA--ATGCCT--GTTAAA-C-T------AGTG--TTT--C--A-CTAGT---T-----------AT-A-------AAA----A-CATCTGTCTT-----C-GG--AA--AAACCAA---G-G-CAGCTTCC---CA--A-GA-AACTAT-A----TTT----G---AA-GTC-AT--GAATAAAa
gi|102873                     : ATAAAT--TGG-----ACAT--A-A-AAACA--A-GC-TTTGTTAAA-C-T----G-AGG---TAT-TC----CT--T---T---GGATTAAAAT-A--A----AAACA--A-CAT-TGTTTT-----CCGG--AA-GAAAC-AA---GTG-CATCTTTC---CG--A-TGAAACTATAA--TTTTT----AAATAG-GTCAAT--GAATAAAAG
gi|102874                     : ATAAAG--TGAG----TCA---A-A-AA-CA--ATGC-T--GTTTAA-C-T----G-AGGG--TTT-CC--A-CT--T---T---G-------TT-A--G----AAA----A--ATCT
gi|102875                     :  TAAGT--TGGGTATGACATTGA-A-AA-CATAATGC-T--GTTAAAAC-T----G-AAGGGATTT-TC--AACT--T---TTG-G-------AC-T--G----AAATAACA-CATCTGTTTTTC---C-GA--AACAAAACCAA---GTG-CA-CTTCCAAAAA--A-TG-AACTAT-AG-TTTTT----AG--AG-ATC-A----AATGAAA
gi|102876                     :   AAAA--TGGG----TCAT--A-A-AA-CA--ATGC-T--GTTAAA-A-T----G-AGGG--TTT-TCAAA-TT--T---T---G-------AT-A--G----AAA----A-CATCTGTTTT-----C-CG--AA-GAAAGCAA----TG-CA-CTTCC---CA--A-TG-AACTA--G--TTTTT----AG--AGCCTC-ATTGAAATAAAA
gi|102877                     :   AAAT--TGG-----ACAT--ACACAA-CA--ATGC-T--GCTAAA-CAT----GCAGGG--TTT-TC--A-CC--T---TTCCA-------TT-A--G----AAA----A-CATCTGTTTT-----C-GG--AA-GAAACCAA---GTGCCA-CTTCC---CATCA-TG-AACT-T-A--TCTTTCTGCA---AG-GTC-AT--GAATAAAAG
gi|102878                     :    AAT--TGGG----ACAT--A-A-AA-CA--ATGC-T--TTAAAA-C-T----G-AGGG--TTT-TC--A-CT--T---T---G-------AT-A--G----AAA----A-CATCTGTTTT-----C-GG---A-GAAACCAA---GTA-CA-CTTCC---CA--A-TG-AACTAT-A--TTTTT----A---AG-CTC-AT--GAATAAAAGTAA
gi|102879                     :    AAT--TGGG----ACAT--A-A-AA-CA--ATGA-T--GTTAAA-C-TGATCG-AGGG--TTT-TC--A-CT--T---T---G-------AT-A--GAATTAAA----A-CATCTGTTTT-----C-GG--AA-G---------------A-CTTCC---CA--A-TG-AACTAT-A--TTTTT----AG--AG-CTC-AT--GAATAAAAGTAAa
gi|102880                     :                  CGT--A-A-AG-CA--ATGC-T--GATAAA-C-T----G-AGGT--TTT-TT----CT--CCCAT---G-------AT-A--G----AAA----T-CATCTGTTTT-----C-GGGAAA-AAAAC--A---CTG-CA-CTTTC---CA--A-TG-AACTCT-A--TTTTTA---A---AG-CTC-AT--GAAGAAAAGTAAa
gi|102881                     :                                                           GGG--TTT-TC--A-CT--T---T---G-------AT-A--G----AAA----A-CATCTGTTTT-----C-AG--AA-GAAACCAA---GTG-CA-CTTCC---CA--A-TG-AACTAT-A--TTTTA----G---AG-CTC-AT--GAATAAAAGTAAa
gi|102882                     :                                                                                                                    TCTGTTTT-----C-AG--AG-GAAAACA----TTG-TA-CTTCC---CA--A-TA-AACTAT-A--TCTTT----AG--AG-CTC-AT--GAATAAAAGa





Alignments
lowQualScore                  :       22    44444   44 1 1  1  55    1 22      1 1 1 1 3333   22   1  4444  22 333 66666666666  1 22   3333 6666 1  22        77777 1  22  3      3 7777  1  3     333  22 1  1   1   1 555     22 4444  33  4  22            
lowQualScore                  :       ..    .....   .. . .  .  ..    . ..      . . . . ....   ..   .  ....  .. ... ...........  . ..   .... .... .  ..        ..... .  ..  .      . ....  .  .     ...  .. .  .   .   . ...     .. ....  ..  .  ..            
lowQualScore                  :       88    44444   55 9 9  9  22    9 66      9 9 9 9 9999   55   8  3333  55 222 99999999999  8 55   9999 4444 8  44        00000 8  55  6      2 5555  8  6     222  55 8  8   8   8 000     55 5555  22  0  88            
consensus                     : ATAAAT--TGGG----ACAT--A-A-AA-CA--ATGC-T--GTTAAA-C-T-G-A----GGG--TTT-TC--A-CT--T---T---G-------AT-A--GAA----A----A-CA--TCTGTTTT-----C-GG--AA-GAAACCAA---GTG-CA-CTTCC---CA--A-TG-AAC-TAT-A---TTTTT--A-G--AG-CTC-AT--GAATAAAAGTAA
Reference ( family-766 )      : ATAAAT--TGGG----ACAT--A-A-AA-CA--ATGC-T--GTTAAA-C-T-G-A----GGG--TTT-TC--A-CT--T---T---G-------AT-A--GAA----A----A-CA--TCTGTTTT-----C-GG--AA-GAAACCAA---GTG-CA-CTTCC---CA--A-TG-AAC-TAT-A---TTTTT--A-G--AG-CTC-AT--GAATAAAAGTAA
gi|102860                     : ATAAAT--TGGG----ACAT--A-A-AA-CA--ATGC-T--GTTAAA-C-T-G-A----GGA--TTT-TC--A-CT--T---T---G-------AT-A--GAA----A----A-CA--TCTGTTTT-----C-GG--AA-GAAACCAA---GTG-CA-CTT-C---CA--A-TG-AAC-TGT-A---TTTTT--A----AG-GTC-AT--GAATAAAAGTAA
gi|102861                     : ATAAAT--TGGG----ACAT--A-A-AA-CA--ATGC-T--GTTAAA-C-TTG-A----GGG--TTT-TC--A-CT--T---T---G-------AT-AAAGAA----A----A-TA--TCTGTTTT-----C-GG--AA-GAAACCAA---GTG-CA-CTTCC---CA--A-TG-AAC-TAT-A---TTTTTGAA-G--GG--TC-AT--GAATAAAAGTAA
gi|102862                     : ATAAAT--TGGG----ACAT--A-A-A--CA--ATGC-T--GATAAA-C-T-G-A----GGG--TTT-TC--A-CT--T---T---G-------AT-A--GAA----A----A-CACATCTGTTTT-----C-GG--AAAGAAACCAA---GTG-AA-CTTCC---CA--A-TG-AAC-TAT-A---TTTTT--G-A--AG-GTC-AT--GAATAAAAGTAA
gi|102863                     : ATAAAG--TGGG----TCAT--A-A-AA-CA--ATGC-T--GTTAGA-C-T-G-A----GGG--TTT-TC--A-CT--T---T---G-------AT-A--GAA----A----A-CA--TCTGTTTT-----C-GG--AA-GAAACCAAATTATG-CA-TTTCC---CA--A-TG-AAC-TTT-A---TTGTT--A-G--AG-CTC-AT--AAATAAAAGTAA
gi|102864                     : ATAAAT--TGGG----ACAT--A-A-AA-CA--ATGT-T--GTTAAA-C-T-G-A----GGG--TTT-TC--A-CT--T---T---G-------AT-A--GAA----A----A-CA--TCTGTTTT-----C-GG--AA-AAAACCAA---GTG-CA-CTTCC---CA--A-TG-ACC-TAC-A---TTTAT--A-G--Aa
gi|102865                     : ATAGATAATGGG----TCAT--A-A-AA-CA--ATGC-T--GTTAAA---T-G-A----GGG--TTT-TC--A-TT--T---T---G-------AT-A--GAA----A----A-CA--TCTGTTTT-----C-GA--AA-GAAAGCAA----TG-CA-CTTCC---CA--A-TG-AAC-TAT-G---TTTTT--A-G--AG-CTC-A---AAAAAAAAGaaagtaaacaaatcagaaa
gi|102866                     : ATAAAG--TGGG----TCAT--A-A-AA-CA--ATGC-T--GTTAAA-C-T-G-A----G----TTT-TC--A-CT--T---T---G-------AT-A--GAA----T----A-CA--TCAGTTTT-----C-GG--AA-GAAATC-A---CTG-CA-CTTCC---CA--A-TG-AAC---T-A---TTTTT--A-ga
gi|102867                     : ATAAAA--TGAA----TCGT--A-A-AG-CA--ATGC-T--GTTAAA-C-T-G-A----GGT--TTTACC--A-CC--A---T---G-------AT-A--GAA----A----T-CA--TCTGTTTT-----C-GG--AA-GAAACC-A---CTG-CA-CTTCC---TA--A-TG-AAC-TCT-A---TTTTT--A-G--AC-CTC-AT--GAATAAA
gi|102868                     : ATAAAT--TGGG----ACAT--A-A-AA-CAACATG--T--GTCAAA-C-T-G-A-----GG--TTT-TC----TT--T---T---G-------AT-A--G-A----A----A-CA--TCTGTTTT-----C-AG--AA-GAA--CAA---GTG-CA-TTTCC---CA--ACTG-AAC-T-T-A---TTTTT--G-A--AG-GTCGAT--GAATAAAAG
gi|102869                     : ATGAAA--TGGG----TCAT--A-A-AT-CA--ATGC-T--GATAAA-C-T-G-A----GGT--TTT-TC--C-CT--T---T---T-------GT-A--GAA----A----A-CA--TCTATTTT-----C-GG--AA-G-AACC-A---CTG-TA-CTACC---CA--A-TG-GAC-TCT-A---CTTTT--A-A--AG-CTC-AG--GAATAAAAGTAA
gi|102870                     : ATGAAA--TGGG----ACAT--A-A-AA-CA--ATGC-T--GATGAA-C-T-G-A----GGT--TTT-TT--T-CC--T---T---T-------ATAA--GAA----A----AGCA--TCTTTTTTTTCTCC-GG--AA-GAGACC-A---CTG-CA-CTTCC---CA--A-TG-AA--TAT-AAGTTTTTC--A-A--AG-CTC-AT--GAAGAAAAGTAA
gi|102871                     : ATAAAT--TGGG----ACAT--A-A-AA-CA--ATGT-----------------------GG--TTT-TC--A-CT--T---T---G-------AT-A--GAA----A----A-CA--TCTGT------------------------------G-CA-CTTCC---CA--A-TG-AAC-TAT-A---TTCTT--A-G--AG-CTC-AT--GAATAAAAGTAAa
gi|102872                     : ATAAAT--ATGG----ACATT-A-A-AA-CA--ATGCCT--GTTAAA-C-T---A----GTG--TTT--C--A-CTAGT---T-----------AT-A---AA----A----A-CA--TCTGTCTT-----C-GG--AA--AAACCAA---G-G-CAGCTTCC---CA--A-GA-AAC-TAT-A---TTT------G--AA-GTC-AT--GAATAAAa
gi|102873                     : ATAAAT--TGG-----ACAT--A-A-AAACA--A-GC-TTTGTTAAA-C-T-G-A----GG---TAT-TC----CT--T---T---GGATTAAAAT-A--AAA----ACA--A-CA--T-TGTTTT-----CCGG--AA-GAAAC-AA---GTG-CATCTTTC---CG--A-TGAAAC-TATAA---TTTTT--A-AATAG-GTCAAT--GAATAAAAG
gi|102874                     : ATAAAG--TGAG----TCA---A-A-AA-CA--ATGC-T--GTTTAA-C-T-G-A----GGG--TTT-CC--A-CT--T---T---G-------TT-A--GAA----A----A--A--TCT
gi|102875                     :  TAAGT--TGGGTATGACATTGA-A-AA-CATAATGC-T--GTTAAAAC-T-G-A----AGGGATTT-TC--AACT--T---TTG-G-------AC-T--GAA----ATAACA-CA--TCTGTTTTTC---C-GA--AACAAAACCAA---GTG-CA-CTTCCAAAAA--A-TG-AAC-TAT-AG--TTTTT--A-G--AG-ATC-A----AATGAAA
gi|102876                     :   AAAA--TGGG----TCAT--A-A-AA-CA--ATGC-T--GTTAAA-A-T-G-A----GGG--TTT-TCAAA-TT--T---T---G-------AT-A--GAA----A----A-CA--TCTGTTTT-----C-CG--AA-GAAAGCAA----TG-CA-CTTCC---CA--A-TG-AAC-TA--G---TTTTT--A-G--AGCCTC-ATTGAAATAAAA
gi|102877                     :   AAAT--TGG-----ACAT--ACACAA-CA--ATGC-T--GCTAAA-CAT-GCA----GGG--TTT-TC--A-CC--T---TTCCA-------TT-A--GAA----A----A-CA--TCTGTTTT-----C-GG--AA-GAAACCAA---GTGCCA-CTTCC---CATCA-TG-AACTTAT-C---TTTCT--GCA--AG-GTC-AT--GAATAAAAG
gi|102878                     :    AAT--TGGG----ACAT--A-A-AA-CA--ATGC-T--TTAAAA-C-T-G-A----GGG--TTT-TC--A-CT--T---T---G-------AT-A--GAA----A----A-CA--TCTGTTTT-----C-GG---A-GAAACCAA---GTA-CA-CTTCC---CA--A-TG-AAC-TAT-A---TTTTT--A----AG-CTC-AT--GAATAAAAGTAA
gi|102879                     :    AAT--TGGG----ACAT--A-A-AA-CA--ATGA-T--GTTAAA-C-T-G-ATCGAGGG--TTT-TC--A-CT--T---T---G-------AT-A--GAATTAAA----A-CA--TCTGTTTT-----C-GG--AA-GA----------------CTTCC---CA--A-TG-AAC-TAT-A---TTTTT--A-G--AG-CTC-AT--GAATAAAAGTAAa
gi|102880                     :                  CGT--A-A-AG-CA--ATGC-T--GATAAA-C-T-G-A----GGT--TTT-TT----CT--CCCAT---G-------AT-A--GAA----A----T-CA--TCTGTTTT-----C-GGGAAA-AAAAC--A---CTG-CA-CTTTC---CA--A-TG-AAC-TCT-A---TTTTT--A-A--AG-CTC-AT--GAAGAAAAGTAAa
gi|102881                     :                                                        ----GGG--TTT-TC--A-CT--T---T---G-------AT-A--GAA----A----A-CA--TCTGTTTT-----C-AG--AA-GAAACCAA---GTG-CA-CTTCC---CA--A-TG-AAC-TAT-A----TTTT--A-G--AG-CTC-AT--GAATAAAAGTAAa
gi|102882                     :                                                                                                                     --TCTGTTTT-----C-AG--AG-GAAAACA----TTG-TA-CTTCC---CA--A-TA-AAC-TAT-A---TCTTT--A-G--AG-CTC-AT--GAATAAAAGa





Alignments
lowQualScore                  :       22    44444   44 1 1  1  55    1 22      1 1 1 1 3333   22   1  4444  22 333 66666666666  1 22   3333 6666 1  22        77777 1  22  3      3 7777  1  3     333  22 1  1   1   1 555     22 4444  33  4  22            
lowQualScore                  :       ..    .....   .. . .  .  ..    . ..      . . . . ....   ..   .  ....  .. ... ...........  . ..   .... .... .  ..        ..... .  ..  .      . ....  .  .     ...  .. .  .   .   . ...     .. ....  ..  .  ..            
lowQualScore                  :       88    44444   55 9 9  9  22    9 66      9 9 9 9 9999   55   8  3333  55 222 99999999999  8 55   9999 4444 8  44        00000 8  55  6      2 5555  8  6     222  55 8  8   8   8 000     55 5555  22  0  88            
consensus                     : ATAAAT--TGGG----ACAT--A-A-AA-CA--ATGC-T--GTTAAA-C-T-G-A----GGG--TTT-TC--A-CT--T---T---G-------AT-A--GAA----A----A-CA--TCTGTTTT-----C-GG--AA-GAAACCAA---GTG-CA-CTTCC---CA--A-TG-AAC-TAT-A---TTTTT--A-G--AG-CTC-AT--GAATAAAAGTAA
Reference ( family-766 )      : ATAAAT--TGGG----ACAT--A-A-AA-CA--ATGC-T--GTTAAA-C-T-G-A----GGG--TTT-TC--A-CT--T---T---G-------AT-A--GAA----A----A-CA--TCTGTTTT-----C-GG--AA-GAAACCAA---GTG-CA-CTTCC---CA--A-TG-AAC-TAT-A---TTTTT--A-G--AG-CTC-AT--GAATAAAAGTAA
gi|102860                     : ATAAAT--TGGG----ACAT--A-A-AA-CA--ATGC-T--GTTAAA-C-T-G-A----GGA--TTT-TC--A-CT--T---T---G-------AT-A--GAA----A----A-CA--TCTGTTTT-----C-GG--AA-GAAACCAA---GTG-CA-CTT-C---CA--A-TG-AAC-TGT-A---TTTTT--A----AG-GTC-AT--GAATAAAAGTAA
gi|102861                     : ATAAAT--TGGG----ACAT--A-A-AA-CA--ATGC-T--GTTAAA-C-TTG-A----GGG--TTT-TC--A-CT--T---T---G-------AT-AAAGAA----A----A-TA--TCTGTTTT-----C-GG--AA-GAAACCAA---GTG-CA-CTTCC---CA--A-TG-AAC-TAT-A---TTTTTGAA-G--GG--TC-AT--GAATAAAAGTAA
gi|102862                     : ATAAAT--TGGG----ACAT--A-A-A--CA--ATGC-T--GATAAA-C-T-G-A----GGG--TTT-TC--A-CT--T---T---G-------AT-A--GAA----A----A-CACATCTGTTTT-----C-GG--AAAGAAACCAA---GTG-AA-CTTCC---CA--A-TG-AAC-TAT-A---TTTTT--G-A--AG-GTC-AT--GAATAAAAGTAA
gi|102863                     : ATAAAG--TGGG----TCAT--A-A-AA-CA--ATGC-T--GTTAGA-C-T-G-A----GGG--TTT-TC--A-CT--T---T---G-------AT-A--GAA----A----A-CA--TCTGTTTT-----C-GG--AA-GAAACCAAATTATG-CA-TTTCC---CA--A-TG-AAC-TTT-A---TTGTT--A-G--AG-CTC-AT--AAATAAAAGTAA
gi|102864                     : ATAAAT--TGGG----ACAT--A-A-AA-CA--ATGT-T--GTTAAA-C-T-G-A----GGG--TTT-TC--A-CT--T---T---G-------AT-A--GAA----A----A-CA--TCTGTTTT-----C-GG--AA-AAAACCAA---GTG-CA-CTTCC---CA--A-TG-ACC-TAC-A---TTTAT--A-G--Aa
gi|102865                     : ATAGATAATGGG----TCAT--A-A-AA-CA--ATGC-T--GTTAAA---T-G-A----GGG--TTT-TC--A-TT--T---T---G-------AT-A--GAA----A----A-CA--TCTGTTTT-----C-GA--AA-GAAAGCAA----TG-CA-CTTCC---CA--A-TG-AAC-TAT-G---TTTTT--A-G--AG-CTC-A---AAAAAAAAGaaagtaaacaaatcagaaa
gi|102866                     : ATAAAG--TGGG----TCAT--A-A-AA-CA--ATGC-T--GTTAAA-C-T-G-A----G----TTT-TC--A-CT--T---T---G-------AT-A--GAA----T----A-CA--TCAGTTTT-----C-GG--AA-GAAATC-A---CTG-CA-CTTCC---CA--A-TG-AAC---T-A---TTTTT--A-ga
gi|102867                     : ATAAAA--TGAA----TCGT--A-A-AG-CA--ATGC-T--GTTAAA-C-T-G-A----GGT--TTTACC--A-CC--A---T---G-------AT-A--GAA----A----T-CA--TCTGTTTT-----C-GG--AA-GAAACC-A---CTG-CA-CTTCC---TA--A-TG-AAC-TCT-A---TTTTT--A-G--AC-CTC-AT--GAATAAA
gi|102868                     : ATAAAT--TGGG----ACAT--A-A-AA-CAACATG--T--GTCAAA-C-T-G-A-----GG--TTT-TC----TT--T---T---G-------AT-A--G-A----A----A-CA--TCTGTTTT-----C-AG--AA-GAA--CAA---GTG-CA-TTTCC---CA--ACTG-AAC-T-T-A---TTTTT--G-A--AG-GTCGAT--GAATAAAAG
gi|102869                     : ATGAAA--TGGG----TCAT--A-A-AT-CA--ATGC-T--GATAAA-C-T-G-A----GGT--TTT-TC--C-CT--T---T---T-------GT-A--GAA----A----A-CA--TCTATTTT-----C-GG--AA-G-AACC-A---CTG-TA-CTACC---CA--A-TG-GAC-TCT-A---CTTTT--A-A--AG-CTC-AG--GAATAAAAGTAA
gi|102870                     : ATGAAA--TGGG----ACAT--A-A-AA-CA--ATGC-T--GATGAA-C-T-G-A----GGT--TTT-TT--T-CC--T---T---T-------ATAA--GAA----A----AGCA--TCTTTTTTTTCTCC-GG--AA-GAGACC-A---CTG-CA-CTTCC---CA--A-TG-AA--TAT-AAGTTTTTC--A-A--AG-CTC-AT--GAAGAAAAGTAA
gi|102871                     : ATAAAT--TGGG----ACAT--A-A-AA-CA--ATGT-----------------------GG--TTT-TC--A-CT--T---T---G-------AT-A--GAA----A----A-CA--TCTGT------------------------------G-CA-CTTCC---CA--A-TG-AAC-TAT-A---TTCTT--A-G--AG-CTC-AT--GAATAAAAGTAAa
gi|102872                     : ATAAAT--ATGG----ACATT-A-A-AA-CA--ATGCCT--GTTAAA-C-T---A----GTG--TTT--C--A-CTAGT---T-----------AT-A---AA----A----A-CA--TCTGTCTT-----C-GG--AA--AAACCAA---G-G-CAGCTTCC---CA--A-GA-AAC-TAT-A---TTT------G--AA-GTC-AT--GAATAAAa
gi|102873                     : ATAAAT--TGG-----ACAT--A-A-AAACA--A-GC-TTTGTTAAA-C-T-G-A----GG---TAT-TC----CT--T---T---GGATTAAAAT-A--AAA----ACA--A-CA--T-TGTTTT-----CCGG--AA-GAAAC-AA---GTG-CATCTTTC---CG--A-TGAAAC-TATAA---TTTTT--A-AATAG-GTCAAT--GAATAAAAG
gi|102874                     : ATAAAG--TGAG----TCA---A-A-AA-CA--ATGC-T--GTTTAA-C-T-G-A----GGG--TTT-CC--A-CT--T---T---G-------TT-A--GAA----A----A--A--TCT
gi|102875                     :  TAAGT--TGGGTATGACATTGA-A-AA-CATAATGC-T--GTTAAAAC-T-G-A----AGGGATTT-TC--AACT--T---TTG-G-------AC-T--GAA----ATAACA-CA--TCTGTTTTTC---C-GA--AACAAAACCAA---GTG-CA-CTTCCAAAAA--A-TG-AAC-TAT-AG--TTTTT--A-G--AG-ATC-A----AATGAAA
gi|102876                     :   AAAA--TGGG----TCAT--A-A-AA-CA--ATGC-T--GTTAAA-A-T-G-A----GGG--TTT-TCAAA-TT--T---T---G-------AT-A--GAA----A----A-CA--TCTGTTTT-----C-CG--AA-GAAAGCAA----TG-CA-CTTCC---CA--A-TG-AAC-TA--G---TTTTT--A-G--AGCCTC-ATTGAAATAAAA
gi|102877                     :   AAAT--TGG-----ACAT--ACACAA-CA--ATGC-T--GCTAAA-CAT-GCA----GGG--TTT-TC--A-CC--T---TTCCA-------TT-A--GAA----A----A-CA--TCTGTTTT-----C-GG--AA-GAAACCAA---GTGCCA-CTTCC---CATCA-TG-AACTTAT-C---TTTCT--GCA--AG-GTC-AT--GAATAAAAG
gi|102878                     :    AAT--TGGG----ACAT--A-A-AA-CA--ATGC-T--TTAAAA-C-T-G-A----GGG--TTT-TC--A-CT--T---T---G-------AT-A--GAA----A----A-CA--TCTGTTTT-----C-GG---A-GAAACCAA---GTA-CA-CTTCC---CA--A-TG-AAC-TAT-A---TTTTT--A----AG-CTC-AT--GAATAAAAGTAA
gi|102879                     :    AAT--TGGG----ACAT--A-A-AA-CA--ATGA-T--GTTAAA-C-T-G-ATCGAGGG--TTT-TC--A-CT--T---T---G-------AT-A--GAATTAAA----A-CA--TCTGTTTT-----C-GG--AA-GA----------------CTTCC---CA--A-TG-AAC-TAT-A---TTTTT--A-G--AG-CTC-AT--GAATAAAAGTAAa
gi|102880                     :                  CGT--A-A-AG-CA--ATGC-T--GATAAA-C-T-G-A----GGT--TTT-TT----CT--CCCAT---G-------AT-A--GAA----A----T-CA--TCTGTTTT-----C-GGGAAA-AAAAC--A---CTG-CA-CTTTC---CA--A-TG-AAC-TCT-A---TTTTT--A-A--AG-CTC-AT--GAAGAAAAGTAAa
gi|102881                     :                                                        ----GGG--TTT-TC--A-CT--T---T---G-------AT-A--GAA----A----A-CA--TCTGTTTT-----C-AG--AA-GAAACCAA---GTG-CA-CTTCC---CA--A-TG-AAC-TAT-A----TTTT--A-G--AG-CTC-AT--GAATAAAAGTAAa
gi|102882                     :                                                                                                                     --TCTGTTTT-----C-AG--AG-GAAAACA----TTG-TA-CTTCC---CA--A-TA-AAC-TAT-A---TCTTT--A-G--AG-CTC-AT--GAATAAAAGa


blockSeqs                     :       AA    TATGA   TG C C  A  AC    C TT      A A T C TCGA   GA   A  AAA   AG CCA GGATTAAA     A AA   TTAA TAAC G  CA        TTCTC C  GA  A      A ATTA  C  G     AAA  TC C  A   T   A AGT     GA AAT   CC  G  TG
blockSeqs                     :       .     A       T  . .  .  TA    . .       . . . . .      .    .  AA    .  .   TCCA         . .    .    CA   .  .         TC    .  .   C      A G     .  T     .    .  .  .   .   . G       .  CA    G   A  . 
blockSeqs                     :       .     A       .  . .  .  .     . .       . . . . .      .    .  A     .  .   TGG          . .    .    .    .  .         .     .  .   .      A G     .  .     .    .  .  .   .   . .       .  G     C   .  . 
blockSeqs                     :       .     T       .  . .  .  .     . .       . . . . .      .    .  A     .  .   G            . .    .    .    .  .         .     .  .   .      A G     .  .     .    .  .  .   .   . .       .  A     C   .  . 
blockSeqs                     :       .     A       .  . .  .  .     . .       . . . . .      .    .  A     .  .   G            . .    .    .    .  .         .     .  .   .      A C     .  .     .    .  .  .   .   . .       .  G     C   .  . 
blockSeqs                     :       .     T       .  . .  .  .     . .       . . . . .      .    .  A     .  .   G            . .    .    .    .  .         .     .  .   .      A C     .  .     .    .  .  .   .   . .       .  G     G   .  . 
blockSeqs                     :       .     T       .  . .  .  .     . .       . . . . .      .    .  A     .  .   G            . .    .    .    .  .         .     .  .   .      A G     .  .     .    .  .  .   .   . .       .  G     C   .  . 
blockSeqs                     :       .     T       .  . .  .  .     . .       . . . . .      .    .  A     .  .   G            . .    .    .    .  .         .     .  .   .      A C     .  .     .    .  .  .   .   . .       .  G     C   .  . 
blockSeqs                     :       .     A       .  . .  .  .     . .       . . . . .      .    .  A     .  .   G            . .    .    .    .  .         .     .  .   .      A C     .  .     .    .  .  .   .   . .       .  A     C   .  . 
blockSeqs                     :       .     T       .  . .  .  .     . .       . . . . .      .    .  C     .  .   G            . .    .    .    .  .         .     .  .   .      A G     .  .     .    .  .  .   .   . .       .  A     G   .  . 
blockSeqs                     :       .     A       .  . .  .  .     . .       . . . . .      .    .  T     .  .   G            . .    .    .    .  .         .     .  .   .      A G     .  .     .    .  .  .   .   . .       .  A     G   .  . 
blockSeqs                     :       .     A       .  . .  .  .     . .       . . . . .      .    .  A     .  .   T            . .    .    .    .  .         .     .  .   .      A G     .  .     .    .  .  .   .   . .       .  G     A   .  . 
blockSeqs                     :       .     A       .  . .  .  .     . .       . . . . .      .    .  A     .  .   T            . .    .    .    .  .         .     .  .   .      A G     .  .     .    .  .  .   .   . .       .  G     G   .  . 
blockSeqs                     :       .     A       .  . .  .  .     . .       . . . . .      .    .  A     .  .   G            . .    .    .    .  .         .     .  .   .      A G     .  .     .    .  .  .   .   . .       .  G     C   .  . 
blockSeqs                     :       .     T       .  . .  .  .     . .       . . . . .      .    .  A     .  .   G            . .    .    .    .  .         .     .  .   .      . C     .  .     .    .  .  .   .   . .       .  G     C   .  . 
blockSeqs                     :       .     T       .  . .  .  .     . .       . . . . .      .    .  A     .  .   G            . .    .    .    .  .         .     .  .   .      . G     .  .     .    .  .  .   .   . .       .  G     C   .  . 
blockSeqs                     :       .     A       .  . .  .  .     . .       . . . . .      .    .  A     .  .   G            . .    .    .    .  .         .     .  .   .      . T     .  .     .    .  .  .   .   . .       .  A     C   .  . 
blockSeqs                     :       .     A       .  . .  .  .     . .       . . . . .      .    .  A     .  .   G            . .    .    .    .  .         .     .  .   .      . .     .  .     .    .  .  .   .   . .       .  G     C   .  . 
blockSeqs                     :       .     A       .  . .  .  .     . .       . . . . .      .    .  .     .  .   G            . .    .    .    .  .         .     .  .   .      . .     .  .     .    .  .  .   .   . .       .  G     .   .  . 
blockSeqs                     :                     .  . .  .  .     . .       . . . . .      .    .  .     .  .   G            . .    .    .    .  .         .     .  .   .      . .     .  .     .    .  .  .   .   . .       .  .              
blockSeqs                     :                                                        .      .    .  .     .  .   .            . .    .    .    .  .         .     .  .   .      . .     .  .     .    .  .  .   .   . .       .                 
blockSeqs                     :                                                                                                                     .                                                                                             


blockSeqCons                  :                                                                                                                                                                                                    G***
originalCons                  : ATAAAT--TGGG----ACAT--A-A-AA-CA--ATGC-T--GTTAAA-C-T-G-A----GGG--TTT-TC--A-CT--T---T---G-------AT-A--GAA----A----A-CA--TCTGTTTT-----C-GG--AA-GAAACCAA---GTG-CA-CTTCC---CA--A-TG-AAC-TAT-A---TTTTT--A-G--AG-CTC-AT--GAATAAAAGTAA
finalCons                     : ATAAAT--TGGG----ACAT--A-A-AA-CA--ATGC-T--GTTAAA-C-T-G-A----GGG--TTT-TC--A-CT--T---T---G-------AT-A--GAA----A----A-CA--TCTGTTTT-----C-GG--AA-GAAACCAA---GTG-CA-CTTCC---CA--A-TG-AAC-TAT-A---TTTTT--AG---AG-CTC-AT--GAATAAAAGTAA





Alignments
lowQualScore                  :       22    44444   44 1 1  1  55    1 22      1 1 1 1 3333   22   1  4444  22 333 66666666666  1 22   3333 6666 1  22        77777 1  22  3      3 7777  1  3     333  22 1  1   1   1 555     22 4444  33  4  22            
lowQualScore                  :       ..    .....   .. . .  .  ..    . ..      . . . . ....   ..   .  ....  .. ... ...........  . ..   .... .... .  ..        ..... .  ..  .      . ....  .  .     ...  .. .  .   .   . ...     .. ....  ..  .  ..            
lowQualScore                  :       88    44444   55 9 9  9  22    9 66      9 9 9 9 9999   55   8  3333  55 222 99999999999  8 55   9999 4444 8  44        00000 8  55  6      2 5555  8  6     222  55 8  8   8   8 000     55 5555  22  0  88            
consensus                     : ATAAAT--TGGG----ACAT--A-A-AA-CA--ATGC-T--GTTAAA-C-T-G-A----GGG--TTT-TC--A-CT--T---T---G-------AT-A--GAA----A----A-CA--TCTGTTTT-----C-GG--AA-GAAACCAA---GTG-CA-CTTCC---CA--A-TG-AAC-TAT-A---TTTTT--A-G--AG-CTC-AT--GAATAAAAGTAA
Reference ( family-766 )      : ATAAAT--TGGG----ACAT--A-A-AA-CA--ATGC-T--GTTAAA-C-T-G-A----GGG--TTT-TC--A-CT--T---T---G-------AT-A--GAA----A----A-CA--TCTGTTTT-----C-GG--AA-GAAACCAA---GTG-CA-CTTCC---CA--A-TG-AAC-TAT-A---TTTTT--A-G--AG-CTC-AT--GAATAAAAGTAA
gi|102860                     : ATAAAT--TGGG----ACAT--A-A-AA-CA--ATGC-T--GTTAAA-C-T-G-A----GGA--TTT-TC--A-CT--T---T---G-------AT-A--GAA----A----A-CA--TCTGTTTT-----C-GG--AA-GAAACCAA---GTG-CA-CTT-C---CA--A-TG-AAC-TGT-A---TTTTT--A----AG-GTC-AT--GAATAAAAGTAA
gi|102861                     : ATAAAT--TGGG----ACAT--A-A-AA-CA--ATGC-T--GTTAAA-C-TTG-A----GGG--TTT-TC--A-CT--T---T---G-------AT-AAAGAA----A----A-TA--TCTGTTTT-----C-GG--AA-GAAACCAA---GTG-CA-CTTCC---CA--A-TG-AAC-TAT-A---TTTTTGAA-G--GG--TC-AT--GAATAAAAGTAA
gi|102862                     : ATAAAT--TGGG----ACAT--A-A-A--CA--ATGC-T--GATAAA-C-T-G-A----GGG--TTT-TC--A-CT--T---T---G-------AT-A--GAA----A----A-CACATCTGTTTT-----C-GG--AAAGAAACCAA---GTG-AA-CTTCC---CA--A-TG-AAC-TAT-A---TTTTT--G-A--AG-GTC-AT--GAATAAAAGTAA
gi|102863                     : ATAAAG--TGGG----TCAT--A-A-AA-CA--ATGC-T--GTTAGA-C-T-G-A----GGG--TTT-TC--A-CT--T---T---G-------AT-A--GAA----A----A-CA--TCTGTTTT-----C-GG--AA-GAAACCAAATTATG-CA-TTTCC---CA--A-TG-AAC-TTT-A---TTGTT--A-G--AG-CTC-AT--AAATAAAAGTAA
gi|102864                     : ATAAAT--TGGG----ACAT--A-A-AA-CA--ATGT-T--GTTAAA-C-T-G-A----GGG--TTT-TC--A-CT--T---T---G-------AT-A--GAA----A----A-CA--TCTGTTTT-----C-GG--AA-AAAACCAA---GTG-CA-CTTCC---CA--A-TG-ACC-TAC-A---TTTAT--A-G--Aa
gi|102865                     : ATAGATAATGGG----TCAT--A-A-AA-CA--ATGC-T--GTTAAA---T-G-A----GGG--TTT-TC--A-TT--T---T---G-------AT-A--GAA----A----A-CA--TCTGTTTT-----C-GA--AA-GAAAGCAA----TG-CA-CTTCC---CA--A-TG-AAC-TAT-G---TTTTT--A-G--AG-CTC-A---AAAAAAAAGaaagtaaacaaatcagaaa
gi|102866                     : ATAAAG--TGGG----TCAT--A-A-AA-CA--ATGC-T--GTTAAA-C-T-G-A----G----TTT-TC--A-CT--T---T---G-------AT-A--GAA----T----A-CA--TCAGTTTT-----C-GG--AA-GAAATC-A---CTG-CA-CTTCC---CA--A-TG-AAC---T-A---TTTTT--A-ga
gi|102867                     : ATAAAA--TGAA----TCGT--A-A-AG-CA--ATGC-T--GTTAAA-C-T-G-A----GGT--TTTACC--A-CC--A---T---G-------AT-A--GAA----A----T-CA--TCTGTTTT-----C-GG--AA-GAAACC-A---CTG-CA-CTTCC---TA--A-TG-AAC-TCT-A---TTTTT--A-G--AC-CTC-AT--GAATAAA
gi|102868                     : ATAAAT--TGGG----ACAT--A-A-AA-CAACATG--T--GTCAAA-C-T-G-A-----GG--TTT-TC----TT--T---T---G-------AT-A--G-A----A----A-CA--TCTGTTTT-----C-AG--AA-GAA--CAA---GTG-CA-TTTCC---CA--ACTG-AAC-T-T-A---TTTTT--G-A--AG-GTCGAT--GAATAAAAG
gi|102869                     : ATGAAA--TGGG----TCAT--A-A-AT-CA--ATGC-T--GATAAA-C-T-G-A----GGT--TTT-TC--C-CT--T---T---T-------GT-A--GAA----A----A-CA--TCTATTTT-----C-GG--AA-G-AACC-A---CTG-TA-CTACC---CA--A-TG-GAC-TCT-A---CTTTT--A-A--AG-CTC-AG--GAATAAAAGTAA
gi|102870                     : ATGAAA--TGGG----ACAT--A-A-AA-CA--ATGC-T--GATGAA-C-T-G-A----GGT--TTT-TT--T-CC--T---T---T-------ATAA--GAA----A----AGCA--TCTTTTTTTTCTCC-GG--AA-GAGACC-A---CTG-CA-CTTCC---CA--A-TG-AA--TAT-AAGTTTTTC--A-A--AG-CTC-AT--GAAGAAAAGTAA
gi|102871                     : ATAAAT--TGGG----ACAT--A-A-AA-CA--ATGT-----------------------GG--TTT-TC--A-CT--T---T---G-------AT-A--GAA----A----A-CA--TCTGT------------------------------G-CA-CTTCC---CA--A-TG-AAC-TAT-A---TTCTT--A-G--AG-CTC-AT--GAATAAAAGTAAa
gi|102872                     : ATAAAT--ATGG----ACATT-A-A-AA-CA--ATGCCT--GTTAAA-C-T---A----GTG--TTT--C--A-CTAGT---T-----------AT-A---AA----A----A-CA--TCTGTCTT-----C-GG--AA--AAACCAA---G-G-CAGCTTCC---CA--A-GA-AAC-TAT-A---TTT------G--AA-GTC-AT--GAATAAAa
gi|102873                     : ATAAAT--TGG-----ACAT--A-A-AAACA--A-GC-TTTGTTAAA-C-T-G-A----GG---TAT-TC----CT--T---T---GGATTAAAAT-A--AAA----ACA--A-CA--T-TGTTTT-----CCGG--AA-GAAAC-AA---GTG-CATCTTTC---CG--A-TGAAAC-TATAA---TTTTT--A-AATAG-GTCAAT--GAATAAAAG
gi|102874                     : ATAAAG--TGAG----TCA---A-A-AA-CA--ATGC-T--GTTTAA-C-T-G-A----GGG--TTT-CC--A-CT--T---T---G-------TT-A--GAA----A----A--A--TCT
gi|102875                     :  TAAGT--TGGGTATGACATTGA-A-AA-CATAATGC-T--GTTAAAAC-T-G-A----AGGGATTT-TC--AACT--T---TTG-G-------AC-T--GAA----ATAACA-CA--TCTGTTTTTC---C-GA--AACAAAACCAA---GTG-CA-CTTCCAAAAA--A-TG-AAC-TAT-AG--TTTTT--A-G--AG-ATC-A----AATGAAA
gi|102876                     :   AAAA--TGGG----TCAT--A-A-AA-CA--ATGC-T--GTTAAA-A-T-G-A----GGG--TTT-TCAAA-TT--T---T---G-------AT-A--GAA----A----A-CA--TCTGTTTT-----C-CG--AA-GAAAGCAA----TG-CA-CTTCC---CA--A-TG-AAC-TA--G---TTTTT--A-G--AGCCTC-ATTGAAATAAAA
gi|102877                     :   AAAT--TGG-----ACAT--ACACAA-CA--ATGC-T--GCTAAA-CAT-GCA----GGG--TTT-TC--A-CC--T---TTCCA-------TT-A--GAA----A----A-CA--TCTGTTTT-----C-GG--AA-GAAACCAA---GTGCCA-CTTCC---CATCA-TG-AACTTAT-C---TTTCT--GCA--AG-GTC-AT--GAATAAAAG
gi|102878                     :    AAT--TGGG----ACAT--A-A-AA-CA--ATGC-T--TTAAAA-C-T-G-A----GGG--TTT-TC--A-CT--T---T---G-------AT-A--GAA----A----A-CA--TCTGTTTT-----C-GG---A-GAAACCAA---GTA-CA-CTTCC---CA--A-TG-AAC-TAT-A---TTTTT--A----AG-CTC-AT--GAATAAAAGTAA
gi|102879                     :    AAT--TGGG----ACAT--A-A-AA-CA--ATGA-T--GTTAAA-C-T-G-ATCGAGGG--TTT-TC--A-CT--T---T---G-------AT-A--GAATTAAA----A-CA--TCTGTTTT-----C-GG--AA-GA----------------CTTCC---CA--A-TG-AAC-TAT-A---TTTTT--A-G--AG-CTC-AT--GAATAAAAGTAAa
gi|102880                     :                  CGT--A-A-AG-CA--ATGC-T--GATAAA-C-T-G-A----GGT--TTT-TT----CT--CCCAT---G-------AT-A--GAA----A----T-CA--TCTGTTTT-----C-GGGAAA-AAAAC--A---CTG-CA-CTTTC---CA--A-TG-AAC-TCT-A---TTTTT--A-A--AG-CTC-AT--GAAGAAAAGTAAa
gi|102881                     :                                                        ----GGG--TTT-TC--A-CT--T---T---G-------AT-A--GAA----A----A-CA--TCTGTTTT-----C-AG--AA-GAAACCAA---GTG-CA-CTTCC---CA--A-TG-AAC-TAT-A----TTTT--A-G--AG-CTC-AT--GAATAAAAGTAAa
gi|102882                     :                                                                                                                     --TCTGTTTT-----C-AG--AG-GAAAACA----TTG-TA-CTTCC---CA--A-TA-AAC-TAT-A---TCTTT--A-G--AG-CTC-AT--GAATAAAAGa